##maf version=1 a score=3998 s panTro2.chr12_random 34 186 + 2259969 GAGGAGTAGAGATGTCTACAGATTTCTG------------ACTAATGTCATCATTAGTTTTCTTTTTAAATATGCNTGTGGAGGAAAGTTAGTTATTTTACATAAGAGAGAAAGGGTTTGCTCTGAGAGAAGCAGCATATAACTTTCCACCTCTATATTTTAATGTACCTTTTGAGTAGGGTTAGGAGCAGTGTTGGt s canFam2.chr36 12903670 191 + 33840356 GAGGAGGAGAGGCTTCCATAGGCTTCTCGTTGCTGAGGTCACCGAGGTCACCGGCAGGGTC--TTTAACAGGGGGCTGTGGGAGGGATGGAGTTGCTTGGCTTAAGGGAGAAAGAGTTTGCTCCGGAGGAGGTATCGCATCCCTCTCCTCCTCTTTCTTTACTAGTTCTTTTGGAGCGGGGTTGGGGGCCAC-----T a score=7910 s panTro2.chr12_random 1012 263 + 2259969 TCAACACTCTTGGCAGGTGCCAATGTCCTCTCA-----------TCTTTTCTGCTTTTGCAAGAAAAAAAAGAAATTGATTTTTTATGTAGATTTGAAAACT----TCAAGGTTTTAACTCCAAAATATTGTTTATATC-TCCAAATTTAGCACAAATGGAGTTGTACCAGTCTCTC---TCATTCT-GGAGTAGGTTTTAGAAGATTAGTCAATGC---------ACCTTCAGCCATGCTCAGTGCACTGTGTGCCTGATGCTTCATTCCTAGGTGAGAGTTTGGCCTAGG s canFam2.chr36 12903861 290 + 33840356 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s canFam2.chr27 45458234 1277 - 48908698 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ATATTATGCATGCTATTTCATTCCATAATTAA----CATGTCCTTATACAAATAAGA-TTTCATACTATGtttttaaaaattttaataaactttacttttaaaaatagttttagatttacagaaacattgagaagatagttcagggagttcccatatacctatactccatacaaccccacacagttttccctatcaatatcttacattagtttggtgtgtttgttacaatttatgaagcaatattaatatattaggattaactgaagcatacattttatttagattcccttagttttta-ctaatgtca--ttttccttat s canFam2.chr10 6530016 297 + 72488556 AACGTATGCACATTATTTGATTCCATAAGTAATATTTATATCCTTACACAAGTAAGATTTTTTTACTATGTTTTAAAAAGTTTaaatgggctttattttttagaacaattttaggtttacagaaaaattgaga----catacagagagttctcacacactc------------------tgcag-tttctgcattaacatcttccgttgctttggtgcatttgttataacaaatt-agcaatactgataaattatgaccaactgaagtccctattttatttagatttccttagttcttacctgatatcactttttcCTGAT a score=4820 s panTro2.chr12_random 101722 83 + 2259969 TGTTTGGCCACTTAAGATACAGAGTCCAGTTTTCAAAATAAGGAATGGATTTTAGGAGAGTTTTTGATAAGTCAAAGAAACAT s canFam2.chr27 47113001 82 + 48908698 TACTTGGCCACTTGTGATACAAAGACCAGGTTTAAAAATAAGCATTGGATGTTAGGAGGGTTTT-GATTAGCCAAAGAAACAT a score=105433 s panTro2.chr12_random 101805 2144 + 2259969 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s canFam2.chr27 47113196 2229 + 48908698 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s canFam2.chr27 10536668 2733 - 48908698 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CTTGAAAATGCTTTATAGCTCCAAGGATCCACTGAATAAAGGCCAATAGCTTAGCTGG-AGCCCAGCGGCCCTCCACAGGCAGGCTCCCACCA-CCAGCCACATCACCCATCCTTCCTCCCCGTGCAGC--CTGCGCCAGTCACCCAGGATGACCCGGCATTTCCAGAATAC-ACAATGTTCTTTTTCTGCCTTTCCTAATGATAATAAATTAAACAAGATACAAATTTATCACAATTGCAAGATTTTATGATGATGATTTCCAATGTGGTGTTGTGTATGATTCTCCCAATAACTTTATACGGTAGGGACCTAACGTTGCTTCCCTTTTGTTTATAAGAAACTTCAGATTTGGGGCTATTCCAAAAaagctgaattttgct s canFam2.chr26 6637499 377 + 42029645 CTTGAAAGT-CTTTACAGCTCCTATGCTCCACTGGG-AAAAACCAATAGCTTAGCAATCATCCAAAAGACCCATCACTGCCTGGCTCCCGCCAGCCAGTCTTGCCACACACCCTTGTTCCCTGGGAATCCTCTATTCTAGCCACCCAGGGTGACCTCACCTGTGGGGAATGCAACCATGTGCATTTTATGCCTTT-CTAATACCAAT-AATGAAGCAAGATGAAAGACTGTCACATATCCGCCATTTGTATATGATGGTTGGCAATATGCTGTTGCCTGTGACTCT-CCAATCACTCTGTGAGGTGGGTATCCAGTGTGACTTCTCTTTTGTTCATCAAAAACTTTGGATACTGGACCAGTGAGGACAGGCTAGGTTTGGTT a score=14445 s panTro2.chr12_random 201618 566 + 2259969 CTTTCTTTTCAGCCCC-AAAGATCATGAGAGCACGTATTATGCTACTCAGAAAAAATATTATCTATTTTACTTTTCCATATACCCTGAATGTGCTCTTTTCTTAGAAGCAAA------------AAACGAACAATGAATCCCAAGCCCCTGCTGCTGTGTAGATGGGGTTCAAGAGTCCTGCCCTACCAGACATTAGAGAACACAGGAAGAGCCTGGTGCCTGGAGGGGAGAGGGTGTGGCTGCCCTGATGACGGGAAGGAGG--------GGCCCTCTCTGTGTTTTGAGTGTAGCCCACATGACCTGTTTTCTGCTTTA----AAATAAAACATTAAAAGTCCCAATTTCTATTGTTTGTTCCTCCTAGATTCATAGTATGTTAATTGAGTCAATTACCCGTGTGCATTTTTCTCTTCATCTCTCT--TAGGCAAAGTACTGATTTAAATTCAACCCATAGTTACCTGGTCATGTCTGAAGGCC-TGGGCCCATCACATTTGAGCGAATGTGGTTAGATAGATGTGTGATGGCTCAATCCCAGACACCTCCACTTAATGATATTGTGGGTACGGAGAGACACAATACGGAAA s canFam2.chr26 6639634 510 + 42029645 CTTTCTTTTTATCCCTGAAAGACCACAGCAACATTTATTAAATCACCCC-AGAAAATATTCTTTATTTCCCTTTTCCGTGGGT----GGTATGCTCTTTTCTTTGCAACAAATACTGGATACGTAAACAAATGACAACCCCCAAG--------GCTGTGT-------------------------------------------------GAGCTTAGTA----GGGGGAATAGGAGGGTGCTGCTCTGGGGACGAGGAAGAAGACGAAGAGGAGGTTCTCTGCTGGAAGAGTGCAGTTCACAAGGCCTATTTTCTGCTTTCTCTCCAATGGTACA------GTCCCAATTTCTACTCTTTGT--------GATGCAGCTGAGGTCACTTAGGTCAATCACCTGTATGCATTTTCTTCTTAGTCTCTCTCTTAGGCAAAATACTGCCTTAAATTCCATGCAGAGTCATGCAATCATGTCTGAAGGCCGTGGGCCTGTGACATTTGAGGGAATGCCGT----TAGATGTGAGATGCTCGAATCCCAGATGCCTCCTCTTAACACGCTTATAGATGTGGAGAAAAACAGTATtggaa a score=3365 s panTro2.chr12_random 208752 107 + 2259969 TCCCCCCAAAGGTTGATACTTTCCTTATTTATTTTTTTCTTAAATAAAATCAATTATTGTCCATTATA----AAAATGTTAAATCCACAGTAGGGTAAAAA-----TAGAATGTCC s canFam2.chr27 8649732 114 - 48908698 TTTCCACAGAGGCTAGTCATTTTTTCATTG--TTTTTTTAAAAACAAAATCAATGAATATATGTTATACAGAAAAACTTCAAATCCATAGTAGGGAAAAAAATGTTTAGAAACTCC a score=5926 s panTro2.chr12_random 208859 109 + 2259969 AGGAACCACTTTGCACTGCCCTCATTTAGTTCTACGCCACAAAATTAACGATTGTTAATATTTTCTTGTTTATCCTTTCCGAACTCCATTTATTTGTGAGAATGGTGTC s canFam2.chr27 8650027 108 - 48908698 ACAAACCTCTTTACACTCACCTCATCCAGTTCTACTCCACAAAGTTAACAGTTGTT-CTAATTTTTTGTTTATCCTTCTAAAACTCCACTTACACATGAGAATGGTGTC a score=3567 s panTro2.chr12_random 209101 71 + 2259969 TATGTTTTTTATTATGCTTTCCCTTGGACATTTCTTTATTATATTTCGTCCCCTTTTTACAAAACCATTGA s canFam2.chr27 8653940 71 - 48908698 TAGATCTTTTCTTATATTTCTGCTTGTACATATCTTTATTGTAGCTCTTCCTCCTTTTACGAAACCATTGC a score=16171 s panTro2.chr12_random 209172 344 + 2259969 CATATCTGTTTATGTGTCATGCCAAATTCAAATGAGAGTAATAGACTCTCTTGTATTGTGGGGCATCTGTTTAATTTAAACTTTGCCCAAAGAGTTTCCATGAGGGATTTGCTGACTAGTCTTTTCTTGGGATATTGTttttcattttcttttttgctttctttttcctgttcatcttccagctcctttaatgtttcctcttgtttttctccttctctctttctgcctgcttctcctcctctccatttctgctttcccttttATTCATCTTCACTGTAATTTCCATTTGATTGTTCTGAATTTTGATCCCAAGGCATAGCCGGTTGTTTCTGTATAACAGGATC s canFam2.chr27 8654121 305 - 48908698 CATACCTGTTTTACTGTCATGTTAAATTCAAATGCCAGTGATTGGCTATCTCCTCTTGTGGGGCATTTGTTTAACTTAAACATTGCCCAGAGAGTGTCCATGAGGGGTTTGCTGACTAATCGTTCCTGGGGACATCGtt------------------cttccttttcctcttcctcttccagtttttcttctacttccacttctttttcttctcctct------------------ttctCTCCATTTTTCTTTTCTCCT---TTCATCTTCATGATGATTCCTATTTGATTGCTCTGGATTTTGACCACAAAGCATAGCTGGTTCTTTCTGTATAGCAAAATC a score=24422 s panTro2.chr12_random 209764 421 + 2259969 GCATACATCATTATGGCTATCTGCCCAGGGTACCATTGCCCACAAGGACTGGGAATCCTTAGCAAGAAGGGTCTTTGCTGCCTACTCAAAGTCCCACTTTAGAGAGGCATCTACTTTGCAAGAATTCTCAGTTCACAAGCCAACAAAATTTGACATGTTTGTTCAATGCTGTTGGGTATAATTGATTTTAGATTATCCTGATTAAAGTCAGTCTAATTTTCACACTGTTGTTATACCAAAAGTCCCTGCTGAAAACAATTCTTGTGAGGAGCTTCTGACAGTTTTGGCTTGATTACGTTCCATAAAATCTCCCTG-AAGTAGAAGTAACTACAAACAGAGGATATTCAAGCTT----ATGAAGGCTTTAATACTTCAACCCATGTGCCGACAGGGAAAGCTTGATACAGAGAGTGATAATTTCCAA s canFam2.chr27 18934855 398 + 48908698 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CATCC---AACTTGATTATTGTATTCTTCTCAAACAAACAGACTGCTCTTTCTAGTAGCCTTGTTTACAGATATATTTATTTCTCTGTTTTTAAAATCTGATGTATCAGTTATTAATCCTGCTTTGACATAT----TGCAATCATGAAGGCTTGAAAGGGTTAATACAGC-CTTCAAAAGCCTAAGATGCTACCAGAAAATAGCTCAGAAATTGAAAcagtgttcaatcctggctgcatattagaatcagttg----------------------------------------aaatgccttaaaacaaaa---tatatcaaag-cgtaggccctatcctctgagatcctgattgatgtggtctgggaaggggcatagtattgttattttatgtaagcttcccaagtgattttgatgtgcagccacatttggaaaccactgAATGAAGAAATTCTGTATAATTATTTTGAAAGCCAATGAA s canFam2.chr27 18935858 454 + 48908698 CATCTTGACACTTGACTACTGTATTCTTCCAGAGGAGGCACATTGCCCTTTCCAGACTCCTTTATT-----TACATTCATTTC-CTGTTTTTGGAATCTAATTTATCAATTATTAATCCCACTTTGATACAGTAAATGGAATCATAAAAACTTGAAAGGGTTAAAACATCTCCTCAAAGGTGTAAAATGCTACCCAAAAATACCTCAGTATCTAAAAcagtgctcacctgtggctgcacattaaaatcagttgAATGCTTtacacttgatcttagccaaaaagccaagaagTCAAGTGCTTTAAAAAAAAaaagaataccaatgccttaggccctctctccagagtc---------tggcgtctggcatgggac----tccaatttttttctacaagctcaccaagtgagattgatttatagcaaca----gaagccactgAATCAAGAAAT----AATTACTATTTTAAAAATCACTGAA a score=14098 s panTro2.chr12_random 212830 278 + 2259969 TATAAATTTCAATAAATTGAATGTGATTCAAATGATTAACTCAATACCAAAGAAAGTTCACCTAATAACAGATGTCTTTCCCAAG---TAGTAGCAGGATATACAAGTTTTACTAGTACCATCGTCTAGAATTTTACAGAAAACTTCCCAGATGTTCCAAAGTTGGGAATTATTATTTTGCTTGATGCATAAATATAACAGAATGTATATATAATATTTCAGCTTACTGGTTACTCATATCAAGCTATT-AAAACTGGCCCACTCACCACTATAAAACTATA s canFam2.chr27 18936333 269 + 48908698 tataaattttaatatattaaatGTGATTCAAAAGATTAAATCAACACCAAAGGATGTTCACCTAGTAACTGACATTTCTCTGAAGGAATAGTAGCATAATATACAAGTCCTACCAATGCCACTGT----------GCATAAAGCTGCCCAGATGTTCCAGAAGTGGGAATTGCTATTTTGCATGATGCATGAATATAAGAGAATGTAT---CATTATTTCAGCTTATCAATTATTCATATCAGACCATGAAAAAATATCTCAATCACTACTATAAAATGATA a score=6792 s panTro2.chr12_random 218548 260 + 2259969 gagagaATACATCA--AGTTCATACCAATATTTCCCATTTTTATTCAGGACTACAAGGTTTTTT--TAATTGCATCCATTTTATAGACAATCAAAATTTCCCCTTTTTTTTTCA-------CTAAAACTCCCAGTACCAAGTTTTCAACAATACCAACATAATTACTTAGTTGCTGTCCCAGAATA-TATGCATAACTGTTTTAGAATAGCAATACCAACATTTCCCCCAACAATATGATTACTAATGAGAGTGTAATATTTTTGGGGCTTT s canFam2.chr4 12534352 244 + 91483860 gataaaatacattatgagatcaaactgatatttccaattcaaatttagggctacagggttTTTACATAACATCATCAATTTTACA-------------TTTGTTTTTCTTTTCAACCATGCCAAAAAATTTCAAT-------TCTCAAAACCAC-AGCATAATTACTT-------TTCCTATAATAATATACACAAAAATCTTCAAATAATAATATCAACCTTACTCTCCACAATATGATTACTGAAAACAGTTTAGTATCTTAGGGTTTTT a score=13951 s panTro2.chr12_random 219170 286 + 2259969 AATTAGTTATTTCATTTA-------AAATAGGGCCTTTCAAACTGCATTATTTGATGGAATTCTTTACAGCTCCTCTTGCTAATGCAAGTTGGTGACTAATTCCTAAGTCCTAGAAAAATGACTTTTTCTTTTTTTTTTTCTATCTTTAGGGGTTCTGTTTGGCAAGGATCCTT--CAAGAGCCCTGTTAAGAAGACAGAATACTTTTCTC-AAGTGTTAACTTCCTCAATCAAGACAGGCTCTATTGAGAGCTGGATCTCTGTCTTGCCAATAATCTATGCTTTAGATGGGGGGT s canFam2.chr15 22760075 277 - 67211953 aattagttttttttttttttttattaaattGGGTCCGTAAGGTTGCATGATTTGATAAAATTCTTCACAGGTCTGATTGCTAATACAAGTTAGTAATGAATTCTCAAGTCTAAGAAAAAGAACGTTTTCTATCTT--------------GGGGTTGGGTTTGGCAAGGATCCTTTTCAAGAGCCCTGA-AAGAAGACAGAATCCTTTTCTTGAAGTGTTAACTTTCTCAATCAAGACAGGCTCTGTTGAGAGTTGGATCTCTCCC----CAGTGCTCTTTGCTTTAGATGGGGGGT a score=62397 s panTro2.chr12_random 219456 826 + 2259969 TGGGAGG----AGAGTAAATGACTTTCCTGGAACCCAGGAGAATAAG---TGACCTTAGATGACTCCTCCCAGAGACTTCTGAGAAGAAGCTGCAGCTGCCATTTTAGTTTTCTTACAGACGGTATTCTGTGTCTTTTTTT--------------------TTTTAATGGCTTCAAGGAGTAAAATCAAATATATCTTCTTTATGACCATGTCAGGTTCTAC-TTCTGCTAAGTACTAAAGGTTTTCTTAGGTCTTAAAACAAGTGTCAGGGGTGTAAATTCTAT-------------AAAAAAGAAAGAACTGGATGTTCAAAAAACAGATCACATGGTGGCCACTTGAAAGTACAAGTTTATAGCAAATGGCTGAAACTTTCTAGTAATGCTGAAATGATTTTGTTTAAGTGTAATGTTTCCAAATATTTTTCAGGATTCATTTGGGAATGATTAAGATAATGTTACATCTTTTCAGTGTTATGAAAAAGATGGCTTTCAATCGGAGAGAGATTTCAGCAGATCACTAAGGAAATAAA----GCCAACCTAGTCATCTTCTCCCCCTGGTATGTGGAGGGAACGAGCTTTTGTTATTAGGGCACCTCAGGACATGCTAGTTGTCTGCTGTGTATCCAAAAGAATGAAGAACATGCACCCTCAGGAGCTCCCTGAGGAGTTTAGAACTGACTTTTAGTTAGAGTAGGGTATTGCTATCATGCCCATGACAACCTTGGAAC-CTCAGAAGGCATGCCACCAATTTGCTCTGCAGTCCCAGCAAGGATATGGTTCACTGCATTATACAAATATACAAATAAAATGAAAAGGAGGGGTCAGAAGCATCTGGGAATGGGTCAAGAGCAGAGTCTG s canFam2.chr15 22762289 869 - 67211953 TGGGGGGTGGAGGGGTAAATTGCTTTCCTGGAACCCAGGAGAATAAGGAGTGACCTTACATGTCTCCTCCTAAAGACTTCTGGGAAGAAGTTGTAGCTGCCATTTTAGTTTTTGTAAAGACAGTATCCTGTGTCtttttttctttttctttttcttttttttttttATGGCTTCAAGGAGTAAAATCAAATATATCTTCTTTATGATCATGCCAGGTTCTGCATTTTGCTAAGCACTAAAGGTTTTTTTAGGTCTTAAAACAAGTGTCAGGGGTTTTAATTCTATTTAAaaagaaagaaagaaagaaagaaCTGGATGTTCCGAAGGCAGACCACATGGTCGCCACTTAAAAGTACAAGTTTATAGCATATGGCTGAAACTTTCTAGTAATGCTGAAATGACTTTGTATAAGTGTACTGTTTCCAAATATTTTTCAGGATTCATTTGGGAATGATTAAGCTAATGTTACATCTTTTCAGTGTTATGAAAAAGATGACTTTCAATCGGAGAGAGATTTCAGCAGATCACTAAGGAAATAAAACTGACTGACCTGGTCCTCTTCT---CCTGGTATGTGGAGGGAATGGGCTTTTGTTATTAGGGCACCTCAGGACACTCTGGGTGTCTGCTATGTATCCAAAAGAATGAAGAGCATGCACCCTCTGGAACTCCCTGGAGAGTTTAGAACTGACTTTTAGTTAAAGCAGGGTATTGCTATCATGCCCATGACAACCTTGGAACTCTCAGAAGGCATGCCACCAATTTGCTCTGCAGTCCCAGCAAGGATATGCTTCATTGCATTATACAAATATACAAATGAAATGAAAAGGACTGGTCAGAACCATCTGGGAATAGGTCAAGAGAGGAATCTG a score=19378 s panTro2.chr12_random 224409 375 + 2259969 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s canFam2.chr15 26443269 1003 + 67211953 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s canFam2.chr15 26445655 1740 + 67211953 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TATGCATGGTGGTAGCTAAAATGGAAGTGAATATTATCTCAAGTTGTACATGTTTTATATGTGT------GCAAAAAATCAGTAAGTTCCACAACAAAAGCAAAAATAAAGATAAGTTTGGAGGCAGGGCAGAGAGAGCTATCCTTCCTACCTCCCCACCAGATACTGGATTAGCATAGGTATTGGCAGCTCAGAAAATAAGTACAAATCGTTCTACCTGCTTAAGCCACTTAAAGTACTCTTCCTAATAAGTTCTGCTTGTGAAGAATAGCAGTTTTAATTACTAAAATGCTTCCCCTAAGCACAAACTAGGTTCCTGAAATAACTTTGGAACTAGCTTATTGACTACACTGAATGTGCTG-TAAGAACTGATAGAGAAGCTGCCAGGGGTCAAGTTGGCTATAAAGCAAATTACATT-TCAAAAAAAAAAGTTCTGGAAATGTGTATTGAGTTCCAACCTGTTTAAAAGTGTCTTTCTTACTTATCTTCATCTGAAAGCAAGTCTTAGT--ACTACATGGGAATATTCAGCA-TTTTAATGCAATGAATTTCCAGTCTTTCCTTAATTGTAGTCCCATAAAATTTATATTTGAAATAAATTTGGCCAGCACTAGTTTAAATTGGGTTCGATATGTTAAG-CAAATTGTTGTGAGCAATTTAATGTTTTTCTTATTTTAGCAAACTATAGGCCGAAAAATTTTATGTGTTGTTTTTTAAAAGGCAGAAGAAATAAAAGGAAAGGAAAAAAGAATGGGTTGAATAAGTTGAGCCAGAAATTTGTGTTATGTCTTCAAAATATTCTTTTAactcatttcattcaaaag-----catttatt-ggcaccta----ctctgtgccaCAAATAGGAGAAAAGAAAGATAACTAAATCAGTGTTAGTTCATGACTTTTTTCACCACTAGTCTTACTCTTCCCAAAGGCACATGTAAATCAAAGTGTTAACAACTTTAATGCTCTAAATAAATACAGTGTTAACATAGCCAATATGTTCCAGAAAATTTAATACAAACCTATTTTTATATTAACATAA-AATAg s canFam2.chr15 28799955 996 + 67211953 tatgcactgcggttatcaaaatgaaagcaaaTATTATTTCAGGAAGTATATGCATTAGCAGTATAGTTAAGTAAAGAACAGTTAAGTTCTTTGAGGAAAAAAAAATAAAAGATAAATTTGGAGGCAGAGCAGAGCAAACTTCCC-------CTCCCAACCAGATGCTAGATTAACATA----TTGGCAGCTCAGAAAATAAGTACAAATAGTCCTACCTGCTTAAGTCACTTAAAGTACTCCCCCTAATAAGTTCCACTTGTGTAGAATAGAAGTTCTAATTACCAAAATGCTGCCCCTAAGCACAAACTAGGTTCCTGAAATATCTTTGGAACTGGCTCATTGACTACAATGAATGTGCTGCTGAGAACCGATAGAGAAGCTGCCAGGGAAGAGCTTGGCTGTAAAGCAAATTACATTAAAAAAAAAAAAAGTTTCAGAAGTGTTTATTGAGTTCCAACCTGTTTAAAAGTTTCTTTCTTAATTGTCTTCATCTAAATGCAAGTCTCATTAAAATGCATGTAAATATTCAGCATTTTTAAAGCAATGATTTTC----CTCTCCT---TTGTATCCTTATAGAATTTACATTCTGAATGAATTTGGCTGCTGTCCATTTAAATTGGGTTGACTATATTTAGACTAATATTTGTGATCAATTACATGATTTTCTT-CTCTGATGAACCAAAGACCTGAAGAATTTATTGATTGATTTTAAGAAGGCAGAAG----ATAAGGACAAGAAGAA--------------------AATCTGAAATC--TGTTATACTTTAAAAATATTATTTTAACACATTGTACTGAAAAAAAAACCATTTATTCAGCACCTACTACCTCTGTGCTAGAAATGTTAGA----AAGTCTAACTAAATCAGTGTTATCTC-TGATCTTTTTTACTACCAACCACATTCTT---------AAATGTAAATTAAAGTGTTAACAACTTTAATGCTGTAAATGAATA---TATCAATATAATTAATATGTCCCAGATAATTTAACACAAGGCTTACTTTATATTAATATAATAATAG 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GAACTCCCAGAACTGGTAGTCAAACAAAGTATGCATGGATTATTTTTCATGGCTGAAGAAAATTAGTCCCTGTGTGATTTTTGTGGATGGTCCTGGGATCCTTCAGTGCTGTCATGCAAGGGGTGAAGG---TCCACCCAGTAGAAAAATCCTAGATGTGACCTCTTAGAGCCTAAAAAATGAGTCAAAAATGAGTACCAGGAAAAAATATATAAAAGCATGCCCAGATGTAAAAAGAATTTAAGAATAGAGAGACATAGCAGAGACCTTCTGAAGGTCAACTGAAAATACTCCACAAGAAAATCATCTTGCAGTACTTATCAGCTCCACAGGGTTATAACTCCATCTTAAAATAGCACTAATTTAAATAAGGCTGCTCCTGTTCCTATAGAATAATTACAGAAGAAATCAACCACATATA-CCTTTTTCTATAGTGAGTTTCTAACCAAAAGCAGGCCCAAGCTACAC-----------AAAG-----------------------------GGAGAACATTTGACTATAAAG----AAAAAAAAATCAAAGTTTTGATTCATATTATAGATTCAATATTTTCATTAATAATTTAAGAA---ATTTACGATTTAAAAAAGCAAATTGAGGAAAACATAAAAAAAAATATAAGTATGAATGATAGTAAGTTCAGGAGTCACATAATTGACCAAATTTCTCAATTTTATCCAGG--AGACTGGTAAGTGTGGTGACAACTAGATTGTTGTCTTACT-AACGCTTCCCCCATGGTGTTTCATCTATTGGTCACACCGATAGCTCAGGGGATGGGCCTATAGCAGTAATCTTTCCACACCCCACACCCACAGAGATAGGGAATAGAGAGTGTCACGAACTTAACTTAAGCAATGCTGCATATTTCCCAAACCAGTGAGATTTGTTTGGGCGTGGTCCATCAGTCCAATTATCAAGGCATTTGTTAGATAGCGGTGGATGAAAATTATGTTCCCTCTCCATGAATTTGAAGGAAAAGAAATCTACTCTCCAATATTTAATATCCACTTTCAAAC--CTGAGGCAG-AAACACCTGGGAAAAAC----TATATGTAGAAC----------------ATTTATAACAGAGAATTATAGAAAATT---AAACATAGATCCAACTGAACTGACCTGA----AGCCTTACCTTCTATAGGGTTAACTAAACTCCTTGTTTGGTCTGTTTGAGATGGATTTTCT------CTTACTTGCATTGCAAACCACtatatatatgt s canFam2.chr15 28801633 1184 + 67211953 GAACTCCCCAAATTTGTAGTGTAC--AGGTATGCATG-ACTATGTCTCATG--CAATATATACTATTCCCAAGTTACTCTCTGGGGATAGTCTTGGG-TTCTTCAGGGTGCTCA---GAAAGATGAAGGCAGTCTACTAGGCAAAAAG---CTAGGTGTGAACTCCTGTAGCCTGAGAAAGGAGCCAAAAATGAGCACTAGAACAAAATG---AAGAGCAT-CTCAGAATTAA---GACTTTCAGGATACAGAGACCTCGTAGGGAACTTCTGAGAATCACTTGGAAATATCCTGTAAGGAAATCATCTTGAAATACTT----GCTCCATAGAA-TACAAACCTACCTTAAGGTGTTACCAGTTTAAATAAGGATATTGCTCTTCATTTAGAAAATATAGAGTGGACACCAACCTTGTACATCCTTTTCCTATAGATAGTTTGTAGCCAAAAACTGGTTCAAACTACACTTAAGTCACTTAAAGTACTCCCCCTAATAAGTTCCACTTGTGTAGGAAAA-----GACTATGTAGCTATAAAAAAAGCTCAGATTTTTGACTGATACTTCAGATTGAATATTTTTATTGCTAATTGAAGACTGTGTTTTTAGTCTGAAAGAGCAAACTGAGAAAAAAATAAGAAAACATTTATGTATGGA------TAGGTTCAAGAGTCAGATAATTGGCTAAATTTCTCAAATTTTCCCTAGAAAAATTGGCAAGGGTGGAG--GACTAGATTGCAGTCATACTAAACACTTCTTTCAAAGTGCTTCATCTGTTGATCACACTGACAGCTGCAGGCATG--------------ACCTTGTTACCCCC----GTCACAGAGATTCTGGATGGGCCATGATTTGAGTTTAAGCTAGTCCACGTAGGACATATCCCAAACCAACAAGATGTGCTGGGGGGAGGCCAGTCAATAC-CTTCTCAGGGCATCTGTTAGATGGTGGTAAGTGAAAAATATTTTTTCTCTTCCTGGATTTGAATGAGAAGGAATC-ACT-TCCAGCATTTGATAGTCATTTTGGAATAGTGGAGAAAGAAAATACCCAGAGAAAACCAAGTAGATGTAGAGCTTATGTGTGTGTATGTATTTATA------GATTATAAAATGTTTAAAATTATTGCTTCAGACAATTATACATGATCACGGCTTCAC--------------ATTAAA----------GATATGTATAAAGAGGATTTCCtaattaacttttttacattatgatttattatatatatat 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aggcctgggtcctcccctgtactcagaccct-gggtatctggatgcccatagacttccttgctctgac--tcatttttttcacatgccaaacaaagaggttgggaatacatgagctttGTAAGCC--CAGTCTCTGATGGGGAGG-GGAATTCTTCCTCTCTTCATATCTGCCTTTCATCAGACTGTCTGTGCAAACTAGGAGACGT----GATCAGACCACTGCCTGTCCAAATGGAAACAGATGAAATCAGGATGGCTATGCTCCAAGGCCAGAGGC-ATGTCT-AAGTTCTACCTTGAGTTCAAGCTTCTGTAATTTATCTAACATGTAGAAAAATGCAATTTGT-----CCAAGGTCAAGACCATACCTTCATTCATGGAAGGAAGAAACTAC-TTTTTCCTGAAATGATTTCAGCACACCCCTATCTAGAACCTAGAAGGTTGACCAGATAACTTTTTGAGACCCTCTGAAATCTGAATAGATTCTCTTTCTAAGTGGAGGCAAAAAGGAAAGAGGGAACAGGAGG---ATATTTTGACCAAGCAATACTCTATAGCAGAAAGGCCTTGGCCTGTGTGTCATTAGCTGGAACCCCACTGGAACTGAGCATTATTGCTTTACTCCAGTGTGGTACCTTAACTCTCCATGTGCAAATCACTTTGTGAAAGTTAATTAATTTTTGCCGTCCCTGTGGGAACCTGGCAGGGTAAGTTATTGCTAACTACATGTCACCTTCCAGTTCCCTGCAAATGAACTGTAAAGGCCTCTCAG-AGCTAAGCCTTGTATTTACATGAGAATCACTGTATCTCCACCCTTCCTTCCTTCCCACACATCCTATCC------------TAAATCTCTAATA a score=24397 s panTro2.chr12_random 252738 742 + 2259969 acacacacacacacacaGCCGTCCTTTAGGGAG-GGACATTTGCCAGAACCAGATATCTTGGGTGAAGATGTTTAATGCCCTGAGCTGGACCTGGG-TTTTCATCTGGGTTTTCAGTAGGACTCATTCTTTCCAATCCACTGCTGCCCTTATGGCATCCGCAGTATCTCACTGGTACTCTCTCCCCTCTGCTGTTGAGAATCTCCCTATTCTGAACTCACCTCTTCTTAGCTTTTCCCCTGATAACTCCCCCCTCCTCCCCACCACCAGAGCAGGTAGCTTCCTTTACTTCCCCCTA-GCAGGGCTCTGAGGTCAC-----AGATGACCATCAGCCAGAACCTAGGAGGGTTCTTTTGGGT-----CTGCCTCATGGTGCATGGCTTCTTCTATCAGTTCCTTTCCTCCCTGCCAC--TATAGCACTGGGCTCAGTACTCTTAGATGCTAAATTAC------ACAGAAAGTATAACTTCAGTCGAAAATATTTTGCCCAGAGTCATACTGTAAGAAGGGCTTCATCAACACTTTTCAATGTTGGCGG-GATG-TATGGACTTCTCTTTCCACATTTAGTCTTCTCTGTTGAGCCTCATCAGGTTTTACCCACCCCTGTGTCTTCCGTCCCCAACTCCTTCACCATTCCTGCACACATTTCTTCACACCACATACAACAAGCTGCCACTTGATCCTCCACCCCCCAGTTTCTACTTGACCCTTGGCTGACATCTGAAGGAGCTATAGAGcagtggctctcagaatg s canFam2.chr27 44196831 704 + 48908698 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ttactgaggtaatgtgacttatccaaggccagaaagtttgtaaatgtcagaaccaagacttgaacccagaccttctgtttctggatctaatgaactttGAGGCAACCATACCCGTGTCAGCAAACGGTCTGTGACCTAGACTACCCTGAAACATGCCAGAAGAACTACCCAGCTATCATGGGGAAAGAAAAGGACGGGGAGGATAAGTATTAGTGCTCATGACTGTTGCTAACTCTGGTCCTCCACATCTTTGTCCTTCTCTTCCACTGAGAACTCATGTCTCTTGCCCTCACTCTTCTTTCATCTACCTCTTCTTCGTCTCTTCTGCGTTACATAACTCAAAATGATTAGGGTCAGATGGTAGAAAATGAAATAATTAAATAGATACCATTTGAGTTCTGGG s canFam2.chr27 44197535 278 + 48908698 tcactgagaacatgtgacttgtccaaggccacaaagcttgtaaatgtcagaatcaggatttg-accaaggccttttcactctgggtctaatgaattctaagccaaccatacc--tgtcagCA----GGTTATAACCTAGACTACACTGGAATATGCTAGAGGCACTATCTAGCCATTATACTGAAAGAGCAAGAAAGTGAGGATAAATGCTGGTGTTCATGACT-------ACTCTGCTGCCTC--------------------------------------------------CTTCCTACATTTGC----------------------------------------------------------AGGGGAATAATTAAAGACTGCCC---TGGGTTGTGTG a score=21382 s panTro2.chr12_random 254367 526 + 2259969 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GGAGTGTTTTGAGAATGCCTAATAGAAGATAggttgaatatttatgcccacacggt----attaatagttcagagagctctattacagattgctgcccttgttttttc-aatatttttaccaatgacatgaacaaagGgagataaaga-agaatattttgtagtaattgaaaaagttccatccataaggaagatacaacataaataaatttttaggccttagataatatagcagcataatagataaggcaaaaacttttag-aaaaacaaagaaaatttgat-gaaaacaagactttagaagattttaacaaacat--ctaggatttgatacatcagtcaggcaaaaagtacaataaatatataaaatatttaaaactatcaaccaacaagcttaatttaagagataaatatacagtcgtgtatattcacacgccccac-aatagaacacaca---ttcaaatgaaagtaatgcaaaaactg---atgtttttgactacacaggaaagtt---caatagattttaaGAAGTAGATACCTTACTAGtatata a score=6851 s panTro2.chr12_random 254930 130 + 2259969 TCTTTTAATAACTCTCAGATACATTAAATTATAAAAACCAA--------CATTATAGATTATTTAGCCTACATCCTGATTGAAAAATTAAAATGTCAACGAAACTTGGAAGGTCATTGAA-ACACTGCATGACCAACTG s canFam2.chr27 44198679 139 + 48908698 TCTTCCAAACACCTTTAGATGAATTAAATCATCGAAACCAATAAATCAACATAATACATTATTTATTTTACATTATGATTGAaaatttaaaataccaacgaagattggaaggtcattgaatacactggatgaccaattg a score=46438 s panTro2.chr12_random 255459 1230 + 2259969 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CTAAGATTGGTATAAATTTTTCCCACTCATATTTTAATAGGTTAA-TACAAAGGAAATCTTAAA--ATAGGTTGGttttattttaatattttatataaatGGAGTCATGTATTCATTTTTGAATTATTT---ACATGAGTTATTGCTTTTTTGATAAAGA-----GGGCAAAATCAAAAT--AATAAATATATGTATC-AAACCTTGTGATATCCCTGTATTGAAAAATGTGCA---AATCAAAA s canFam2.chr27 17388263 244 + 48908698 CTGAGATTGGTATGAATTTTTCCCATCCATATTTTTATAGGTTCATTGCACAGGGAACCTTAAAATATATGTTGGTTTTTCTTTAAAATTTTACATAAATGGGGTCACATATTTATTTTTGCATTGTTTCCCATGTGAACTATAACTCTTTTAATAAAAACTAAGGAACAAAATCAAAATCAACAAAATAGAACTATCAAAATCATGTGATA-AACTATACTAtaggaagtgcactggatcagaa a score=77929 s panTro2.chr12_random 260481 2012 + 2259969 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TCTCACTGGCCCTGAGGGGCCATCAGCAAAAGTTCTTCATAAGCAAAGCTCTTGTGGCTGCCTGGATGGTG---GAAGGATAATTGGTATGACCAATCATGAGAGGAAAAAAAACCCGTCAATTAGTTCATATCAGAGTATTAACCATAATACTTTACACAAGGAATCAGTAAAAAGGAAATACTATTAAAGACTTCTTTT---TATATTTCTTTTTCTACTATCTTGAAAACTGTGGTAAGAGCCAAGCCCTAGTAAAATACCTACCTATGTTACAAGTGGCCAAAATCCAACATGAGTC----------TGAGTCAGCCTATGTATGACAGAAAGACAGAGAGTGAGAC----------------------TTTAAAGGTACTGAGCTATCTCAAGTAACTCAAGGACAGGGATGGGATTGTTAG--TTTACAAGCAACTGAAACAAGGCATGTTTATGCCATTAGGACCAC-------TCAgaaccagccctcccagctcaccagggtcagttattaaattcaggtattttgaaagtttactataaaacagatctagtattaaaaattaagtaa--------------------------attgtttaggtagtaattcatcaggtctcatcatttcctgatttttttttttttttgctgttatcggtttttatattatctatctggtattttattattatctacactcttga--------aagtatatacattaatggtgtctgtgtgttagaaatactacataataatgtgctgctaggaatctctttcaaactcatattcagtgacatcccattagtggtttgagctcagctatggtaggagaatttacaccacagtaattggcaaatgctacaatcaagacttattttatctttttttttttatctttttatttttttatttttattttatttttattttttttttatcttatttttTTAATGGAGAACTGGTTGTTAA-CATCTTCCAGCATAACAATATTCAGGACTCTTTCTATTTTCTATTTCCCATGTCTTTTATCTCATCATTTTCTGTCTCTGCTTCATTATTTTTGTCTCCCTGTTGGCCAACTATCCCTGTGTTTTTATATGTGTGGCAAGATACGCAGATAC--AGAGGTCTTAAGATTCACCATTTACAAGCAAGTCATTCAAGGATAGTATCATTGCAACAGCTCCTGTGAAGACCAAGGAGATGGACTGAGATCAGAAGAAAT-CCCAGAACAGGGTTGTTAGGTAAATAATCTCAAAAGCATTCATTGTATTACCAG--TAACACCCCTGGCTCAGAGCCTTCCCTTAAAAGAGACTCCCACATAGTTGCTCAGGGAATCTCCAGGAAGTCCATTTCTGGGTATTCTAATTGTCTTCTCCTCAATCTGGCTTCTTGCTACTGTCCTCAATGCAAGCTGGAGTCCTTTT-TGCCAGACTCCAATGGCTAAATTGGTCTCTTCCTCTGAAAGTGGGACCTTGATGTAAGTTTAAGTGCAGGAATAGTCTTTCAAGCTTCCTATAGAGGGCCAATAAAACAGAAAGATTCTTTTTGAAAGCAAGTTAAACTCTCATTGACCCCAGGAAGTTTGGAGGACCCATTTTTCCCAAACTCTCATAACTCTAGTTAATTTGTTGAAAAATGTATTCTATAAAATATGAAGGGTTCTTTTTCAAAATTATTTCAAAGACTATCAACTCTCTTGAGC-TTTCTTCTCAGCCAAGATGATTAAAAAATGCTTACTGGACAGAATGATGCAACTAAAGTCCCTCTACAAAAATGATGTATTATTTTGATTACATGACACACTTAGATATAATCTT--TGCTTGACATAGAAAAAGCAACCACTGCGGAGGTTCCTTGTTAGATTCCATCACGTGAGGATGAAATTCCAGAGGTTCTATTCTTCTTCTTTTCAAAATTGTAAAAATCAGCTCCCTCTCTCAGAGATCCATTTGTAATGAATGACACACAATATCTATTGCTCTTCTGGTTGACTGTTGTACCAAAATTA---TTCATCAACAATATTTTTTTT-----AATTTATCCGTAAGTGAAATACCTGGTAACCCAA------------------------TTTTTCCAACTTC 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s canFam2.chr27 15545238 2400 + 48908698 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s canFam2.chr27 22152780 1269 + 48908698 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atatgcatatgattattaacagattacatagaatggaatagca-tggatctaataatgaccatattctaaagtagttatgggcttaaga-tattcaatatacctctaataattcatatataatatgaataaatctatgattttat-agtgtcaaaattataggtacaactg----------gtttgaagacaatgctaactttagccagaggttagtgcagatTGaattttttactttacttaattttttactttttttaaaaaaat a score=11520 s panTro2.chr12_random 340345 210 + 2259969 aagataatttcttttta-------ttactgacctatgaattctatccacggatcccagg-------------------ttaatagttcctACTTTTAAACATGATCAATCTACAGCAAACAGCCATGCAAAGAATGCATTCATTCCATGAAAATTTAGTGTACTTGATACTG----TTCTAAGGATTGAAGCCTACAATTTGTCCTTGAGGAATTTATATTCTGGTGGAGATAGACATGt s canFam2.chr10 66189395 240 - 72488556 AAGTAAATATTTTTTGAACCAAGTTTGCTGACCCACAAATTTTATCCATGGACCCCATGGGGATCCAAGGACTCTATATTAATAATTCCTGCTCTAAAGCATGGTCAGTCTATAGCAAAGAGCCATGCAAAGAATGCATCCATTCCATAAATATTTCTTATATTTGATAATGATTATTCTGAGGATTGAAGTCTATCAGTGGTTCTTGAGGAATTTATATTCTGGTAGAGACAGACATGT a score=8345 s panTro2.chr12_random 344244 172 + 2259969 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s canFam2.chr27 33729962 1066 - 48908698 ggtcctcagaaggtaccacatgggctgacacctggatctcatacttctagcctacaagatgatagactattg------------gcaagtaactcagtttgtaggactttgttataacatgttataatagccctagtacatgagtacaCCTGGGATGATCATTAATAATGTCCATTACCATGACATAGATTTTCCTATCTGGAAAGTTGGTCTAAAGGATCACAAGAAACAAAATATCTCTTGAATC------TATATGCAAATGACTTCCATGGGGACCCCA-CCTAGTGATGCCATGATAGTAAAGAGTACATGTCGGGGGGGAAAAGGATGCAGCTTGGGACAGACCAGCACATAGACAAATAAAGAACATACCTTTTGGATAAAATTGAATGGTCTGAGAAGACTCCTTGTCCaagttagaatgcggtcattagggtggactctaatccaatatgCCAAATAGATTCCCTCCAAATGCTTTCTCCTTAACTTTTGGGCATTGTCTGATTTTTTTTAAACTATCCTTTATTATACTGTCTAAATCTACCAACCAGAGATTTGTGTGGATTCCAAAGCACTCTCTTTTTAAAAATAAATATCCTGAAAGGGTTTCTATCCTCTACTATTCACACCATTGGCACTG-AAAAGAGAGATTTGAGGTTTGGGAGTGAGA---AGTTAAAGTCAATAGGAAAACCAAATATTATTTCCATATTGCAGACTTGAGT------AAGAGGAGTTAAAGACACTGTGTCACTGATGCTGTAGTTC-TAAGGTGTATTCATTCattcgttcactcaacaagtatttatggtattcctctactcatattaaatgttataaatgaaagaacaaaataaacatggtgtctgtcctga----------------gttggggagaaaggtacagaggatatacagaatattatagtatagggtgcttaaatgcttgtataggggaagtttaggattctatgggtacatatgagaggcatgtcatatg-----------actgagagtcagggaaagtttcctagaataaacattgtataagctaagacttgagaattaaatcagaaatattttagtcaaagagaaggatatagag 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s canFam2.chr15 30332652 1091 + 67211953 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- 48908698 AATAGATAATATGCTAGATGACACA--------GATGTTTATATATTCtccattcactca--------actatataactgctgtggactaggtccaatactaatgagtaaagtactgaacaaaaccaacaagatcccagccttcaaggggcttaGTGTCCAGGAGATTCAACCACTCTGACTCTCAATTAAAGG a score=30436 s panTro2.chr12_random 387592 856 + 2259969 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s canFam2.chr27 25107444 983 - 48908698 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AGGAGAAGTCAGTGGTCATCCTGCCAGTGGTCCATGAGAAGGGG--CACAGCACCCCGAGAGCGGGCCCTGGGGAAGCACACACTCCACCCGGACATGCACAGGGGTGACCTGGCCTCTGG-CCACATGCACACCATCCACACCAGCCCCAGGAAATGCAAGGAAACTTCTCAGAATGGAAGGGAGGCATT-ACGGGACAC-TCCTCATGAC-CCGAAAGGTGTGTCTGAGTCACGACCAGCCCAAATCACAATGCAGAGTGCACCTTTGCAACATCGGGGCTGAAATGATTAAGGTAGATTAAGTTGTGGAGAGAGATGGGCAAGAtgatccctatttcatcacgtgcaaaatggaaacaatat-gacaccga---------ttttcggattgctgtgagggtaacaggggttaatatttgGGATGTGGCT-------GTCAGCACTATACAAA a score=4015 s panTro2.chr12_random 429681 106 + 2259969 ATTTCTTAAAGAAAGAAAGAAAAATCTCTGGAGACCTTTCTTGGCCAGAGCTGCAGGGGGTGTGATAAGGAGCTGTCTCTTTATCCTTCTCACTGACATTCCATTT s canFam2.chr26 4600421 103 + 42029645 ATGCCATAAATAAAGAAAGAAA--TCTCTGGAGACCTCTCTTTGCCAGAGGCTACTGGGGAGT-ATAAGGAGCAGCCTCTCTAACCCGTCCATCAATGTACTACTT a score=3261 s panTro2.chr12_random 432857 107 + 2259969 GGGACTCGAATTGGGGATGTTACAACAGCAACAAACTTTCTCTACTTCAGCCCCTACAAGTCCCCGTATCTTTTAAGGAATCTCTCTT-TCTTCTTTGCCCTTTAAGA s canFam2.chr27 35272851 106 + 48908698 GGGACCAGAAATTGGGCTTGTAGTATGAAAACAGACTTTTCACACTCCAGCCCTT-CAATTCCCTAAACCTCCCAAAGAATTCCTCTTCTCGTCCTTGTC-TTTAAGA a score=22805 s panTro2.chr12_random 432964 523 + 2259969 GTCAAAGTGGTTAAATAGATTGTATGTTAGGGTATGTGGCACAGGGATAAATCCTAGCTTAATTGCT---GCTAGATCTTAGCCTAGCATGTGTGAACAGGTCTTAGCAGACT----ACTTGAAAACTTTAGTGAAAACATTAGTACTGACTCATGATCATGTATCTAATAATTACTC-TTCTAATATTAGGTCCAGTAATGTGTAGTTTTGCTAAGAAATCTAAAGTTATAAATAACATGTTGAAATTTTAAAGTGCTTTGGATGTTGAAATCTGCATGTCAATAGCTTACCTTTTCTCAGG-GTTTTCATGCTAGTAGCTTAGTTATTATCCTGATAGGATGTTTGGAAGTTTCTGGGT-AAGGAAACTGATCTGTTCTTCTGCTGGGCTAGTCCACCTATTTCAGGTCCTGAAAAGCTACTGACCTAGTGGACTTCACACTCCTTGCTTTGTCTTA---GCGTTTGAGTTCTTTTAATTCTGGCTGGTAGCTGACCTGTTTGTTAATACATCTGGAATGAAAAGTCTGTTTTT s canFam2.chr27 35273142 517 + 48908698 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TCTGACTGCTAGCTCTGGTATTATTCTAGCTAACTCCATCTCATTTCTCAGCTCTTTCTGAGAAACTCACTGGCTCTATCTCACT---CCACTCAACCTTACT--GTTTTCCATGTCCCTCCTCTTTTCTCCCATATCACATCCTCTTGTTCCTATCCTTATAAAGGATATGCCATGTCACTCTGGAATAGCTGACTTCCTGTGTA----TCTTCCCAGCCTGTAAGCTCTTTGAAAGTACATTCCACGCTTTATGTGGTTTTTAAAATTCACAAGCCCAGCGTAGCCAATAGTACCATATTGCCTGGTTGTTAGGAAGTTTTCAATGAATGTTGAATTAATGTTGAATACAAGAA---TCAAACTTTGGGGAGAAAGATTATA-------ACAATGTA--------------------AGAGTCTTTAGAAATTCAC s canFam2.chr27 35273659 430 + 48908698 TCTGACTCTTGGTTCTGGTGTCATT-TAGCTAACTCCATTTCATTTTCCAGCTCTTTCCATGGAGCTC------TCTATCTCACTGCTCTACCCATCCTTACTCTGTTTTTCATTTCTTTCTTTTCTTCTGTCACAGCTCCCCTTCCTGTTCCTCTCTTTATAAAGTATATATCATACCACTTGGCAATAGCTGATTTCCTGAGGAACTTCCTTCCCAACCTGTAAGCTCTTTGAAAGTAAGTTCCATGTTTAATGGGATTTTCAAAACTCACAGGTCTACTGTAGTAAATATTACCACAGTGTCTGATTTCTAGGGAGTGTTCAATGAACATAAAATGAATATTGAATATTATAAAGTTCAAACTCT-GGGAGAGGGATTATATACCCCTGCATTGTAGGAATTCCCCAAACCCTAAGAGAGTCTTTAGAAATTCAC a score=3102 s panTro2.chr12_random 434194 59 + 2259969 TACAAAGATCCATTAATTTGACTTCCTAAAGCGGGGTAAATTAAC----TTTACTGAAATGTA s canFam2.chr27 35274289 63 + 48908698 TATAAAGACCCAATGTTTTCACTTCCTAAAGCAGAGTAAGCTAACAATATCTACTGAAATATG a score=7073 s panTro2.chr12_random 434560 254 + 2259969 GTTTCTGTGGAATGGACAACATATTTGGGCCTTAATTTAATATCGATAGTTCATCCAATTAACTCCTTCCAAGGGTT-CTCTGGCAGTGGTTCTTAACTTAGTCCCTGGGGGTGGGGGATGGGCAGGGACTGCATTTCCTGTCACCAAGTGACCTTAGGGCAACAAAATCTCTAGCG-TAGACTGGAAAGTG----------------TGCGACCCATGACT---------TCCCCAGTAATGAGGGA---CCCTCCCTCCTCCATCACTGCACAAAGGGACTG s canFam2.chr27 35274353 266 + 48908698 AGAACTATGAGAAGCACAATAAATTTAGGCCTTAATATAATATTAACACTTCATCCAATTAACTCCT---AAGGGTGACACTGGCAG----TCTCAACTTTGT--TTGGGTTTGGGGGGTTG---------ACACTTCCTCTCATTAAGTAATCCTATGGCAACAGGTTCTCGGGGGATGAGGTGGAAAATGTAGTTTGAAGAAGCCCTGCAGGCAATGCCTATAAATCCACCCCCAGGAGAATGAGATTTCCCTTCCTCCCTTATCACTGCACAATGGGACTG a score=2749 s panTro2.chr12_random 434852 91 + 2259969 TCATCTTTTT-------CTACATTAAGTGTATTTGTATTTTTGTCANATATCTGGTATTTAC-----------GAGTCAGCTATGTCGGTCTATTTGGGTTCCTTTGAA s canFam2.chr15 30887558 102 + 67211953 TCATTTTTTTTTCTTTACTACATTCAGTGC-----TATATTTGTCATATATCTGATTGTCATATAAAGAAGGTGagtcatct--gtcagtctcatttagttcctttgga a score=30452 s panTro2.chr12_random 435364 725 + 2259969 AGCATTATGCCCTTCCTTTAAgctccttttgtagatttttttcctttgttttgattttcaacaggtttactataaaatggctagattttctttgtacttgggattcttgtagcttcttcaattttcggtactatgtcttttgtcagatttgaaaaattattcaCAAGTGGCTCTTTGA-TTTTGTGTTTGCCTATTATTTTGTCTCTTTCCAAAACACTGAGTATATATAGGTCCCAT------TTTATGGTCTCTGTTCTTCAAGATGGATAGTCTTTGATTAATTCA------TTCTTTTAAAATAAGATTATACATTAATGCTCTCTTCTTCAAAGCCAGTCTTCTTCTACACCCACTTACT--ATTTATTAT--GGTTATCAAAAATTTC--AGTGCTAGGGTTTT----CACATTAAACACAC--------ACAATTTTAATTATAGTTCTCTGTTGAAACTTCCAATATTCTATT--TTTCAGCATGTATTAATCATAATTGTTTAAAA-----GTCTGAATTTCATTTCAATATCTAGTAAACCTGAGTGACTATTCTATTACTTAATTTTTCTCTTGGTTTTCAATCATTCGACCCCTATTTTCTAGTAGAATCAATTATTTTTATTTAATTACTGGCCAGTAGAAACTCGT--GGGCAAATCACCTGATTCAGCTGAGGCTGACCTGTTTCTTGTTTGTTTTTCTACAAGGTAGAGCTCTTCTGGCATCCCCACTGAAAGTGTGCAGTACTAACTA s canFam2.chr15 30887660 745 + 67211953 aacaataagcctttcccttggactctttttaaagattttct--cttgtgtttgggtttcagtggttttactatgaagtgcttagattttctttgcatttggtattcttacagcttcttcaatctttggtatcatatcttttgtcagattagaaaaattattggtcagtatctctttgaatctcgcttctgtct-----cttctctctctctAGGACTTTAATTAAATGTACCTCTCATCtttttttttttgtctctgtacttcaagat----attctttgcttaattcaatagatttattttaaaagaagattagacagtaatcctctcttctgcaatgtcaatcttcctttatacccacctattgaattcttcattcagttattaaatttttcttagttctaggattttttttCACATTACACACACCCACACCCACACTTTTAACTATAGTTCTCTATTGAAATGTTCTATATTCTATTCATTTTGGGATATATTA----TGATCAATTTAAGTCTGTGTCTGA---TAATTCTAATATCTACATAACCTGTTGGTCTACTCTATTGCCTAATTTT-CTCTTGATTTTCAATAATTTGGGTCCTATTTTCTAGTGAGATCAATTATTTTTGTTTAATTGATGGCAGACAGAAATTCATTAGGACAAATCACCTGATTCAATTGAGGTTGATCTATTTCTTGTTTGCTTTTACACGAGGTGGA-TTCTCAGTGGGTCTCCACTGAGAGTATGGGGCATGAGCCA a score=4650 s panTro2.chr12_random 436313 137 + 2259969 GCCATTCTTGCTTATTAGTACATGAACTTCAACTCTTGACTTCCTTGTCTTGTGTGACTGACAGGTTCTCTGCTTGGTTTGTA--------GCAGCTATTTTCTTCTTGATTTCTATTTATTTAGTCTATGCATTTTTGTTTTAG s canFam2.chr15 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ctattttatagagataagtgagggacagagaaataaagaaacttaataaaaaatacatagtcatta-gtgatagaagctaaatttaagccaaggcagcaaagtattggctccaa--ctcttggtctggacacga-gctatgcagactttctTCATAATTTAAGATtatatatatatatatatatatatatatatatataGGCTTAATATTTTCAAAATTGTTT a score=16351 s panTro2.chr12_random 439722 505 + 2259969 TACATATCATACCTGTATTTGACCACTTGCATCCAAGCACTGTTAAGTTGCAGATGGTATTGAGGACATTCTCTAATTCCTTTGACTCCAAAATCTTGCACCAGCCAAAATCTTGCACCAGCCAGCAAAGGAAATTACATGATGATCCCTTTTCAATAAGAAGACTGAAGTATTGCATGCAAATAACTTTATCAATA-TCTTGGGTATTTCCAAGATGAATGAATGGGTATT-AATTTACATTTGTATAACTAAAGACTCATTCTGATTATTTCCTCTAA------TTTGCAAATGA-Cttattttcttttaatatttaaactgttttaataaaatt---------aataattataaCCTATGCCAATATTAATAATCATATACTCCAGTCCAGATTATACTCATGATATATTTTATCTCAATAAAATAAAAATTAAAAAGT-TTTCCTCCTTTTATAATAGAAGCAAACTATGTTAATGCAATAAACATATTTAAATATC---TGAGTATATTTCACTTAATAACT s canFam2.chr15 30861055 505 + 67211953 TACATGTTACACTTGCATTTGACAATGTGAATACTGACAGTGGTAAGTGTGTGATAGCCCTGAGTCCATTCTCTCACCTTTCTGA-TCCAAGGTCT--------ACAGTGTCTTACATCAACCAATGAACAAAATCACATAATGATCTCTTTCCAATAAAAAAATTGAGGTATCATATACATATGACTTCACCAATACTGTGGGGTTTTTCCAAGGTCAGTGGATGAATATTAAACTTGCATTTGTAAAAC-AAAGCTTCTTTCTGATTG-------TAGGGAGACCTTACAAATGCTTTTATGTTTCTGCATAATGTAAGGAGTGTTAATTAAATTAATGATAGCAATAATAATAATCAACACTTATATCAAT----ATATAGTTTGTTTCATGGGATATTTATTATATATTTTATCTCACATAAATAAAAATGCAGAACTCTTTCCTATTTCTATAATAGAAGCAAGCTATGTAAATGC-ATACAAATATTTAAATATCTTATGAGGACCTTTCATTTTAAAACT a score=13681 s panTro2.chr12_random 440227 376 + 2259969 ATATTAGAAGTATACAACTTATTTTGCAGTCATTCAAATAGGCAGTATATTATGGCATCTGCCCCTTAACAAGTCTCCTCTGAATGTGTGGTCCAT--CAGTCATTGACTCTTCGGGTAAAATCTATTTCAGTAATGTCCTTAGAGTACTGGTGTGTATTTTTAGCTCAAGAAAATGGAAAACCTTACGCTGCCATTCGTTTACCGATTGGCTCACGAGTTTTCTGCATTATTACTAGATATTGAGAAGAGTAGA--AAGTGAACTATAAGAGTAAAATtataattatcattagtgatcatttgtaagtcacaagacactataataaacacatttatcttctcagtt-attttcacatatgaaaaataataatcatatgta s canFam2.chr15 30861764 367 + 67211953 ATACTAGAGAGACACGACCTATTAGACACTCATCTAGATAAGCCATGCATTAAGGCATCTTCCCC-TGACAA-----TTCTAAATATATAGTCCACCACAGTCAATGACTTTCTGGCTATTTTCTATTTCAACACTGTCCTTAGATCATTAATATATGTTTTCATTTTTTTAAA---GAAAATCTTATGTTGTCATTCTTTCACCCAATAGCTCATAAGCCTGCTGCTTTATTGCTAGATATTAAGAACAGAAGAGGAAATATACCATCATAATAAAATTCTAAT-----ATGTTGATCATTTATAAGGTACCAGAGACTATACTAAAGAAATATACCATCTCAGTTAAATTTCACATATAGAGTTTAAAAATCATACATA a score=43641 s panTro2.chr12_random 441194 1123 + 2259969 CTCTCCTCAGGGAGGCACCCAAGANNCTCAGCCAGcttaatt-cagcatccagtgttcatngactagctgtatggacttcaggcatgttgcttatccactctctgctctgtaaaattgaggaaatcattattcatacctcaaagagtggttataagaatcCAGTCTCTAAGTCTTATCCATCAGATCCAGATATGGAGC----TTCCTGGTGTTTGCCACAaactaaaatgcaggttctaccccctccagacacatgctcaggatatgatggtagtacagggtcaagacactggcacctgacacccctacagaaaggggaagagttggaaacaga--gcagtcactcatcaacagcaattctgaattctcaagagaagacactgtgaagtctctctgccctggcaggacagaaaCTTTCACACTCTGCCACTGCTGCCTTCTGCAAGGATCTGCTTTGCTCCTTGTTCTTTTTGACCTGTGCTCTACCCTCTAGGAGCTCCCCTTATCTTCTTAGACTGCACCTGAAATGAATAGTGACGAGGATGCCCATCTTCGGAGCTGTTTCGTTGTCAAAGGTACCTTCTGTTTACAGAATGCTGGAGACACAATAATGA----AATCCTGAACAGTAAAAGGCTTTTTATTATAGGTTCTGGGTTTCTTTGGCAATTTAATTCCTGCAAAAGCCTAGTAGGCTTCTTAGCTCTGATTGCACTTAGTTCCATGTGATGGTAGCCATACTCAAAGTTTATACTAGATATAATTCTCAGCCTCATTTATTTTATTTATTCCTTCCCCCCACCCCAGTTTCCCAGCATGTCTCT--TATCAATTTCACTGTGATTTTGTGAGACTACATAGCACTGTGGATGGGAAGACCACATCCTTAGTCCTCTCTTTACACTGAGTCATTTAATTAATGTGGAAAGTTTGTAGGACTACTGTTTCTCTTACTGA-----------CAG------GATCTAGAAGCAATTAGCTTTC-AATACTTGCAGACCCTGAATTACTGAACTCTCTTTATTCCCCTCACCCTTTGTAaaacaactttatcaaagtacaattgacaaacaataaactgcacatatttaaagcatacaatttgataagatttggTATGTGTCGAATCTTCTCAAATT s canFam2.chr27 18916310 1044 + 48908698 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s canFam2.chr27 26795536 1182 + 48908698 TCAATATGAATTATAGGGAAGTCTCTGTGTGTGATTTCTTTTTTTGGAAAAAAAAAAATACATGTGGTTTAGCTATTATACAAGATAGTATAATGACTATATACACAAATAAGAATATATGATAGGTGAG--TACTTACATATTATATCAATGAAATAAAGAC--CATATAAATTATACTATTCATCCTGTTGTTCTATTTCATTTTTCTTTTCCCCAGTTAATTTGTAGTCATTTATGTGCCCACTGTGCTATAAACTTGGTATCATTTTTTCCATCTTCATTTCCCCAATTGGTACTTCAACTCAAGTTACCAT---TAAAATTATTGCTACTAAATGTTGATAACCTCGTAACAGATAC--CTTGCATATCTTTATTCTAG-TAAAAACGATCACATATATTGCTTTAAAA-ATTCAGTGACTTGC-CTACCTACATATTAAATTTAAACTCT---GTCTTTATGTGAAGATCTTCTGTAAGGTGCAC-TAGTCTACAAACCCAGTGCTGCTTTACTCTTCCTGGGATATGCACTCATTAGGTCACTGTCCTTTCT-CCTGTCACTGTTCCACACCTTCTTCTGCATTCCTTTTGCAACAGCTACCTCATTCCTGCCCCTGTGCCTTTA----AATTGTTCTTCCTT---AGAATGCCACCTCCTTTT-CTACTTCCAGCTTAACTACATCTCTTCTATGAAAA---ATCAGTTCGCCCTGACTCATTTCCTTTCCCTTCACACCTTTAAAAGCGGCATACAGTTATAAGACATTTATATTCTCATTGTTTTATGTTTATCAATCTTGACTTagggaagaaactatatttatccattgtttgtaccctccactgtgcttagcacagtccagagtatatagcaggaagtcagcaC-TTTATATTACCTAGTCAGTTTCTTACTTGGTATAATTA----ATTGCTAACtataactattacttattgataaagcattctttgccatatgtttctctgagtattttttatatattatgtgatttatttctcacagcaaccctgcaaggtcagttttatttat-cctgaatttgcagattaaagaacactgcctcagtgtcattgcccaaggtcac-tagttcggaactggtattagaatggaattttgccttactTTTAACT---GGTCTAGTAGAAGTACACTAGAAGTAGAAAGCCACAGGTCCTTGAAAGAACTTCAG 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CTCAGCCTTTTATGTTTAGTGTCATCAGTTTGTTTAGTGTCATCTGTTTGTTTCTGATGTTTTAGACAACTTCA--CTATCATAAAAATACATTCATCATAATATACCTTATGTTTAACTTTGGGTTTTATCTGTTATTATTTAAAGAAAGATGTTAACCAGATTTTCACTTTAAGAC--------------ATACAGGCATACA-------------TACGTACAA-ACATAAGTGGATTGTATAGTTCTCCAGGTGCTTGTTATTTCAGGTGGCCTTCCAGTGGTCACTAGATTTCATGCCCCTTTCCCATCTACAAGGTCAACCAATGGTTCTGTGACTGTAGACGTCACTCAGGGCAGACACCTGTTATTAGGCTTGATTTTGCTTTAAGAACATTTAATAAAAGAAGGAAACTGCTCATCATTTCTTGGCTTATTTGTTTTAAAATCACTCACTACACATATTTTAATGGAGAGAAAAAGGAGCATAATTTTTTTAAAGTGTGAATTAAAATAAGTCACAGCAGCATTT s canFam2.chr27 26797281 498 + 48908698 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TCAACTGAGAACAAAGATTTGATTCAATTTGaattataatttgtttataagaataatttataaaataaaGCTTTATGAGACTAACATAAGATATAATTCGAGAATTCAGTTCAGCTTCTTAGGTTTCCCT---CACCTACTGGTTTTTTTGTTATTTCCCTCACCTACTGGTTTTGGTGTCAGTTTTGACTGGTTATTCCAGTTGGACTTCGGATAGCTATAGGCCAAGAATGATAACTACTGTATGTACTTATACAGAGTTCAAACTTATAATGGCTGATCTATGTATACCCTGA-AAAATATACCAGATGCATAAGAACATCACAACCATTGGACATATTTTCTTATGCTAAAATATGCTAGTCTTCAACTAGTATCTTCTTTCACACTATACATATAAATTGTACTT s canFam2.chr15 43563799 387 - 67211953 TTAATCAAGACGTAAGATTTGATTGAATCTGAATTATAATTTGTTTAGAACCAGAATTCATAAAATGAGGCCATATGGGACTAA--TTAGATATAATTAAAGATTACAA---AGATTAGCAAGATTCATTTATCACTCTTCAGTTTTTCTATTTTCTCCT---CCCACTGGGCTTGGTCTCAGTTTTGAATAGCTACCCAAGCCAGGCTTCATACAGCTACAGGACAAGAATGATAGCTATTACATGTATTTATACACGATTCAAATTTATAATAGCTACTCTTTGTATATCCTGGTGAAGAACACCAGAATGGT----------TAACCATTAGATATATTTTTTCATGTTCACATGAATGAA-----GACTAGAATTTTCTTCCACTATAGAAATACAAATTCTACTT a score=3201 s panTro2.chr12_random 450906 203 + 2259969 attttactaatatgaaaatagattaataatataataaGTGAATTCACTTGTGGAGGA------GGTGTGGAATTACTATATATAGCTTATTAAAACAATTGCTGT--CACTAGTTGCACGACAGTAGAGAAAACTCTAATTAGTTATAAATGAGTGTCTGCTGTTAATATCCATTTTAGCATAACTCTCAAGTTCATTATACTATATAAAC s canFam2.chr15 26684538 188 - 67211953 ATTTTAATGGTGCAGAATTAAATCAA--GTATAATTCTTAAAATCAGTAACAGAGGAAGGATAGGTATGGTATCATAAAATA-----------AACAATAGCTTTAGTATCAATTAAACAAAGAT---GAAAATTGTATTC--CCATTATTGAAATGTTACT-----TAACCATTCAAGTATAACGCTCAAATTCACTATGCTATATAAAC a score=27142 s panTro2.chr12_random 453451 709 + 2259969 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TGCTTCCTTGAATCTTCTCCTTAACAGTT-AGATTTGGGATGACCACTGTCTTGTTGTCACATGATTAGAGTTATATGTTATTTGCTAGCCTCTCTTTTACCTGGTCCGGCATGTTTGTTCCTTTAATCTTCTGCTTTAGCCACAAGAGT---GTCAGCCATATACCTCTCTGCCCATTTCCTCTGGCCCCAAATACTAATCTGTTTGGGTCCTTCCAATGTCTTTCTCTGAGGGATGGCACATC---CTAGTATATCAGACTATAGGCCCCAACTCTGTAGGGAATGGGAAAATCTCCCACGACTGCCATTACCATGCTCTTCT-ATTTTCTGAGACCCCCTGCTCTCCTCCTTTTTAAATTTGCCATTTCTGTGCACTCTGTCTGTAAGACCAGACAAACCAGGATTAATGG--TTTCCTGGATCATGCCATGTTTGCCATACCCCTTGGAATCTCAACCTTAGACTATCCAGCTGTCTTTCCCTGGTCCGGTCTTTGTAGCTGGACCAGATTCTGTGCTATCCCCACCT-CATTCTTACTTTACCTGGTTTTTCTCCTCTTTCTTCCACTTCCATGTTTCTGAGGACCCTTCCTACTTCAAGCTCAAGTCCAG-TAGGTATTGCCAAATTGATCTCCTTGTATTAAATGATGCTTCTAATCTAGTTGGAATAATTTTCTTAGCAGatatgtgtgtgtatatatatatgcatgtgtatatatatatatatacacacatat a score=19272 s panTro2.chr12_random 454860 544 + 2259969 GTTTAAAA-TACATATCCTAAACATACAGAGGTTCTGCTAAAATCTAGTTTATGAAACATTCATATATTCTTAGTATCTTTCACCAATTTCCTGATTTACTCCTAAGTAAAATCCTGGCATATTAATTCTGAATAATCTCAG-AAAAATTACTTTAAAATTCAAAATGATAAATATTAGAGGTGTAGTTCAAGGCTTAGCTTTTCCAGGCAAGGAAACAACCAGTTATCATTTTAATTCATTTCTCTAAATGAGTTACTAATCT----AATTTCCAAGATA-AGTTACTCAAAGAATCTCTTTCACATCTTTTTATTTCTGCTTTAAATTTT-------TAAGTAAAAAGA-GTACTGTAAAGTGAC-----------------ATAAAATATCTTCAAAGATAAAA-----AGAATGAAGGAACATTTTATTCTATCATAAGACTCATTCAACAGATATTAAATTCTCTTAGGTGAATTTTCTTTTTAGTCTTTTCAATAAATGACAGCTATTACTTGTATTTTAGAACATGTACACTTCAATACTCAAAGAAATTGCCAGCGATCTCTAAAGGTTCACt s canFam2.chr15 24374252 525 + 67211953 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TATTATTATTATTACAGATGAATCATGTCAGATCACCCTACTGTGAGAAGCTAAAGCCATGCCCACTTGATGATTATATTTCAATAGATCTCATTTTCTTTTTTTGACTGCTACTTTACTCTCTGCCTGCATTAGAAAAAGGAATGGTTAAAGGAGTCCCATTATGGAGAGAAACCAGGAAAAAGCTTTGCTACAAGGCAATAACTAATTCATTATTCTGCAGGGGCTGATATTCATCTATCCTTCAATAAAAGCTAATGGCTCAATAGGCCCAATGCACTCAGCTAATCTAGGAAGAAGTTGATGCTTGGGAACTGGGATTCAATCAAGGATCATGCATAAGTGCTATTACTGCATATAAAAATATACTAATATCTACTTGATATAAAATATGACTAAATTTTAAAAAATCTAACCAATTGGCTTTAGTTTCATCAATATTAAATAGACATTTGAAAGGTGTTAGTTTTTGGATGAGGTACTACTGA--ATATCAACTTGGGTGTTACAGCAAGTTATGATATCTGCTAATTAGAAAATAAGTAAGTAAATCTCTAACCTGGAA a score=37493 s panTro2.chr12_random 457765 1006 + 2259969 TTttatcactgtgtcctt---acgtggctggagagagaaatctgcttggtttcttcctcttcttatgagggtgctaatcccatcatgcagattttatttcttatgagctcattgaaacctaatgacatctccaaaggtccactttctaataccattacattgggggttagagattcaagtcataaatttAAACG----GTCCCCAATATGGAGCCTGTAACAgccagccactgttctaggcgctggggatgcag---tagtgaacaaaggagacaaaaatgccttgcccacatggaacttagagtctcatggggaag----atagtaagataaacatgtaaaataagtagactatttgatgttagtaagtgctataggagaaaaaagaggaaaggaatgctaggaaatataacgtgaaatt-tgggaagaatggtcgagaaagcctttctgagaatcttggttgactcaatctgaataggctatgctgggagaaggca-attgcaaaagacttgagggaagtttagggg-----gtctgttccagacaacgaagcagggtggctca----actggtgtgaattagacagaaagtgtaagggatttggttagagaagtaaaagaaaggcccagaccatgaaggtcattacaattcataatatgaacctcagactttattctgagtaaaacagaagctgttaaaggattttgagcagaggagtggcatgatttgaacattcatttgaacggaataa----------ttctggctgctctgctgaaaagaaactgaagataggaacaagatctgaagcagagagaccagttaggaggcta--ACATGTCAAATCATTAA--GAGATTAGGCAAATGTGTGCTAATCAAGCCTCGTATGAATTGACCAAATGTTTTATTTGCTGCAGAGAGAAAATGTGAATATGATTTTAATGCTAATTTGGGAAGACTTCCAAGAAAGTTGGCATAGTGCACAATGCATTAATCTCTCTCAAACCCTTTGACTGAACAAAAATAACCTTGAATTGGA s canFam2.chr15 24377655 979 + 67211953 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a score=14915 s panTro2.chr12_random 460609 389 + 2259969 tttcactcatctgttcaataacttacaatggttccatctcacCAACATAATAATATTCAGGTTGCCCATGATGGTTCTCTGGATCAATTTAACAGGGCCACAGTTCTTTCTAACTTTCTTCTAAATGTGCCACCTAATTATGGTTGCCAGATTTAGGAtcacaaattatttcatgtgacatttttagacta-aaataattatccattatttatcagaaatttgagtttacctgggtatcctgtatttttg--------------------tctggcaacactaCAACTAATTCCACCATCTCATTTGGAATTAGATGTACAATGGACTCCAGTCCTCAGTAGGCAACA-------ACTTTCATAAGAAATATATTCTGTCCTCATTGCTCAGGGCA-TCTCATCGCCTCCCAGAAGTC s canFam2.chr27 15710416 410 - 48908698 TCTCTTTAATCTGTTCAATGACTAACAATGGCTCCACATTACTCACATAATAATATTCATTTTGCCCCATATGCTTCTCCAGACCAATTCTGTAGGACCACAATTCTCTCT----TTCTTATAAATGAGCCACCTAATTAGAGCTACCAGACTTAGGATtcccaaatattgcatggagcatacttatattttagaaaattaccccttacct----gaaatttaagtttaactgaggatcctgttttttTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTCCCTAGCAGCTCTACACTTAATTTGACCAGCCCATTTGCCTTACTGTTGACAATGGTCTCCAGTGCCAAGTAGGCAGTAGGTAGCTACTTACAGCTGAAATGTATTTTCTGCTCATCTCTCACGCCAATCTCTCCTCCTTCCAGAAGTC a score=8421 s panTro2.chr12_random 461068 175 + 2259969 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aaatatccagaaaaataattaaatttaacagtaagcctccacaagcatttctattaatgtaagggaaaacaagaatgtttactattattgcttctattcaaaat-gtcctgggggctcaaggcaatgaaatacaagaaaaaaaaaagagatataagaattttggaaaaaaagaTGATATTGATTATATACCTTCAAAATCTAAAATTGTATTCATGTTATTAAAACTTA-AAATTATTAAAACCTaaagtataagttactttggaataaatcaaacgagatatttgtaagacctatttggatgaaagtacatagcattacataaggatatgtaaaggacggtg--tgaataaagggagagatgctatgctaatgaatgagaagattATCATGGTA-ttttgctgaaggtaa---acagcggatcctacaagttacatgaaagataaaaagactaagagttagtgaaagagtcatgaataatgaaatgtgggaacttatctgaccaaatatcaaaactttttatagaaccataataataagacagtgagctagtagctcaagaataggc a score=22154 s panTro2.chr12_random 539377 400 + 2259969 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s canFam2.chr26 6205520 1793 + 42029645 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a score=59061 s panTro2.chr12_random 558295 1406 + 2259969 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CTCTTGCATTTT----GGGTATTACTTTCTTTGGCCATTATAAAACAAAATTTCATTAATGTAATCAACATTTTTATTCCAAAAGGACACCATTTCAAGTAGGTAAAGTAAGATATAGATATTTGTCAGCTACCCTGGGGTGCCTGATACAGCATGAGGTTGCA--------TTCCCTGTCCTCCCTTTGCAGGAAGGCTTTGGTAAGGAGGCACATCTAA a score=5162 s panTro2.chr12_random 561582 146 + 2259969 TAAAAAACGTTTTATAACTACAATGAATGTTGTCTTTGAAATA-ATTATGCTGGTTGTATGCACGGGAATCAAAATTATACGTAGT-ACACTGAATGTTCTTTTAGGGAAGTGAAGTTTTCTCTTTTAATGGAACTTTTC-CTTGTCAA s canFam2.chr19 27575818 147 + 56771304 TAAGGAAC-TTTTATAACTGCAATAAGTATTGCTTTTGAAATCTATTATGGTGGTTGGATATAGAGAAATCAAAATCATAAAACTTCCCACTGAATGCTCCCTT-TGGAAATAGAATTTCCTTTTTAAGTAGGCCTTTTTACATGTCAA a score=6836 s panTro2.chr12_random 563156 304 + 2259969 AGCCTGCACAGTAGTAATGCAAGTTTTAAAAATGCAAGTTTGCTTAAGAAAACAATATCTTGCAATACTTAGAAAAATACTTTTTTATGTCTAGGTTATAATGAACAAGTTTAAAATAATATTTTTTTTCCAAAATGGATTCAATATTCAAACATGAAATACTTAGAAGGACAAGGTTTACTACTTTTCAAAGGATATATTGCAATTATGATGATATGTTTTTATAAAATACACTCTATACAGGCTGACATATTGTCTTTTTTCGTTATCCTCCAGGATAAAATAAACACCACGAATAAGTATA s canFam2.chr19 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cttgaatttgctgtttatcattcctgt-----gtatattttattactctcactctttaagtgtataaccgtaagtaacaaatggcattgtttgactcattttcaaactttgaataagtattatcagtatatttatcattatataattttttttcttaatccaagttagatttt-gaggtttacccatgttaatacacataatcaaagttcattacttataactgttggataatgtttcatgtccacaacttatttatccattctcctattagttattaggtttttttccacatttttgctattaaaaactatgctttcatagtgcatagtgtctatgtgcatgcagataag--tttctctacagtacgcacccagaagtagagatacatggaaaactcatgccccgtgtgccattttcagagaaaatactcttttgaatggatgtggcaattcatagacacaccagcagtaaggccactctgttc-acaacctcaccaaaactcagtagcactagagttgttaactttttttaatctgatggatatgaagtTGATTCTTAGATTAGTTCaaaaaagaaa-tgtattgatagttaagtgtgtggctctgctgtaaataatatttacatggccataataatttaatacttaatgcttacttaatcgattattgtaa-----cataaagtatgagaagag a score=3678 s panTro2.chr12_random 565104 120 + 2259969 tagctgtgtgcatttatgtgtgtgcatagg----gtaacagtagttgt-atggtgatggggataatactcacttaaaaaagattaagtcttatgctttttagtaagaagt-----taataatgtctataa s canFam2.chr27 28033439 130 - 48908698 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gtgacatgacaggatttgcttt----aaagatcactctgatggtcatgggacaaatttgctttaagggactgcaggcaacccagttaggagactgttaagctgtc-----------aagaatcttggactgaggtggcagtgatggcaatgaaaactctatggacaatt--agggatgtattttggacatagagtcaacgagagctgctaaca-atgggatg-aggaggagggggagaagccaggattcctaag---tttctggcttgaa a score=80827 s panTro2.chr12_random 568652 1617 + 2259969 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TGTTTTAGAGTCTTCATGATCTAAGTCACTGCGTAGAATCTTAGACCCTCAAATTCTGAGCTCACAATCTAGTTTACTATTTTTTTACATTTTTATATTTTTCGCAATCCAGTTTAAAATTATGTCTATTCAGATGCTCCTAAGGTGATCATTATCCTATTGTGCTACTTTGGAAAACCCAGTTACGAGATGCACTTTGTCAAGGCAATGCACTTGTGTTGCTGTAACCAGAGGAGAAATGATGAGGTCCTTCCCCTTCCCAAATATTGTTAACTCCTGGCTGTTTGGATGAAAGGCCAGTTTCATGTTCTCA-----------------AGTGGGAAGAACAGTGAGTCTGTGCATACTGAGGGGCACATCT------------CTGCCCATGAGCACAGGTGAGATGGAGGCTTCTTAAGCCACTTG-----TTTGCTACAGATCAGCAGAACCATGCT-GGTGACCTGGCTGAGGGGGATTTGGGTGCAAGCCATGAGTGAGTCTTGCTCAACCTTTATCACTTGCTGCCAGTCTGGCATCTTGTATGTGAACCTC-TTCTCTGCAAACGACCATCTTGCTGGGGCTCATAAGGGAGATGTGGAGT-CATTTAGGACT----CCATGATTTGCTTGAAAAACAGATGAAA-GCTTCTTGCAGTATCTACTGTGGACTCTCCTCCCTCCCATGAGTTCTTTTATGAATCCATTTCCTCCTCTGGTCCTTGAAGAAGGGGCTGCCCATGGGCAAATCTGCTGGGTAAATATAAGGATATG----GAAAGATGAAGATGAAAGACTTTAGAACTCCCAGATTTTACTCTGAAGGACTTCCCTGATTGGGAG--TCTCAGGGTTTAGGGTGGAGATCTAATAATGAAG-AGAGAAGGTATTAATCTTCCCTCCCCCATTCATTGCCTGCCATTCTTTTCCCTTCCCGATTGGAACTGCATACTAAGGCTCTCCTGGCAAATGCTACAGACTGAAGTGGTGGAAATGGGTTGTAGAGAAAATGCATGGTTTATAAATCTTTTCCTGAAGAGCTTAGAAAGCAAACTATCCCATCTGCTGTG 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TTGGTGTAT-TCTTTTATACTCTCCAATAG-TGTCCTTTTAGAGCATGCAGCACTTGCCTAAAGATATCAGGTGGCTGTTTTTTTCTGTCTTCAA-CTAAGTA-GGTAAAGCCTAACTGAATATTTAGTTTTCAGATTTCCAGACACCCTTTTACAAACACTTCCTGCTTCTGATTCTAGTTCAGATACCCATAGCCAACAGCAGTAATTTATATTCTAAATCCTTAAAGACAACAGCATGTCTGCATTCCCATTCTAATGCCCAACCAAGAAGAAAACTTGGTGGCCA--------CCTTCCACCTTCCTCTATCTTCTCC-------------CCACTGCCTAG---------TCCAGCCT-CCCACTCTCTCTACGACCAGCCCTGAGTCCTTTGGGGGTTAACAGAGACCGAACACTTGGAAGCCATTGATCAAATGAATTAAAATATGCTTCCCAGAATTCCCCACTCATCCAC-CCACACCCCTCCTCACACATACACAAAGAAAGGTCCAACTCTTTGAACAAAGGTTGCACTTGCAAAAAGCTTCTTCAGTCTTGGAGAAACAGA------CTTTTTCATTGAGCTCTCCCCTGCACTTAAAACAGAAGCCAGTAGAAAAGACCAACCTGAAGCAGAAGGATCTCACACTCCCTCTCCACCTTCCACCAAAAGGAGAGAACCCCCAGGTCCCAACCCAT--CTGGGCCCTGGAGACTCAACCTTCTTCTCAGCTCTCTCCATGGGACCTGAAGATTGCCAGGTCTGGGAAGAAGGGAGCTGG-GAGTGTAAAGACCTCCCAGTGGTTG--------------GGGAAAGGGGAAGCGCGATGGATGAGTGAATTTCACATCTGGCTAACCTCTTTCCTCGAAGAACCAAGTTAGAAAGAGCGTGGAGAAGGGATGGGGAGGGGAAAGTGGATGAGGACTGCTCTTATTATGCTGGGAAACCTCAGTTTCACTGTACAGTGAGGCCTCTGACACGTCTCT--------GGTCTCTC-----------TGTCTCATATGTGAGCAAACAAGAGTTCTCAA--AGGAAGTGGTACCTGAACGACGTGGGATACTTT--------------------------GAAAGCAGGCCTTCACCCTC-----CATCTCCCGGGGCTCCGCGGCCGCCTCCTCCCCG-------CTGTCTGAGCGCCGCCTCTCGGGCGCAG---TAGCTGGGCTCCCAGAGAGGGACGGACCTAGATCTTCATCGGGCGCCCCTTTCTCATCTCTCGGGCTCTGACTCCTCTTGGGGTGCTTAGTTCAAGGCTGGA---CAGCCTAAAAAAACCTACCAAGTGTGGGGTGGGGAAGAAACAGAGCAAAGGCAGGCCGACCCG s canFam2.chr15 44588067 1341 + 67211953 TTAGTGTATCTTTTTTATGCTCCTCAAGAGGTGTCTTTTTAGATCATTCAGCATG-----AAAGATGTCAGATAGTTGGGAATTTCCCCCTTCAAACTAACCAAGGTACAGTCTAATGGAGTATTTAGTCTTCTGATTCCCAAACTCCCTTCCAGTAATACTTTCTACTTCTGATTCTAGTTAAAATGCTTATAACCAGTAACTAACATGTAAATTATGAATCCTTAAAGGCAATGGTGTGTCTGCGTTCCCATTCCAATACCCAAACAAGAAAAAAGCCTAGTTAATAGGCACGTTCCTTCCTCCTTCCTCCATCTTCTCTGCCCCATCTCCCACCTCCACCTAAGTGTAGAATTCCATCCTGACCATTATCTCCAGGACCAGCCTTGAGTCTTT---GGATTCACAGAGACCAAAGCCTTGAAAGCTGTTGCTCAGCTGAATTGAAATATGCTTTCCATACTTCTCTCCCTATCCTCACTACACCCC----CACA-----------AAAGGCCCAGCTCCTTGAACACAGGTCGCATCTGTGAAATGATTCTTCAGTGTTGGAGAAACAAGAAGGCTTTTTCTCCTTGCATTCTGCCTCACATTAATAGTGGAAGCCACCAGAGAAGGCTAACTTGAAGTAGAATAATCTCACATTCTCTCTCCATTTTTCAACAGAAGGTAAGAACCCCCAGGCCTCGACCCTCCGCCTGGTCATGGTAA-TCAACCTTCCTCTCAGCTACTTCCACAGGGTCTGGAGTTTGCTGGATCTGGAAAGAGGGGAGGTGGAGAGTGCAGAGACCACCTGGTGATGGTGAAGCTGAGACACTGGAAAGGGAGA---CTATGAGTGAGGTCATTCCACATCTGGC----------CCCCAAAGAGCC-GGTTAGGAAGGGC-TGGAGTTGGGGTGTGGAGGGAAAAGTAAAGGGTGGCTGAGCTCATCACCGGGGAAAATCTCA--------GTGCAGAGAAGCTTCTGATATGTCTCTCAACCGCCCGCCTCCCGCCCCCCGCCATCTCTCACTTGGAAGCAAA-AATGGACCTAAAGCAAGAAGTGGTACCTCAAGGATTTGGGTTGGTTTCAACCAGCCAGTCTCCCTCAGGGAGGAAAAGCAAAGCCACTTCCTCCCTGTCACCTGGCGGGGC-CTGCGGCCGCCTACTCCTCACGATCATCTTCCTGGGTGCTGCCATTCGGGCGGGAGCTGAGCTGAGCTTCCAGATTGCTGCCGACCTCAGTCTCCAT-GAGCTCCCTACTCTTGGTTCTCTGGCTTCGGC-CCTTTGTGGGCGCCTGGCTCTAGTACTAATCCCAGGCTAGCAGAAGACACCCAGGGATGGTGGGGGAGGGAGCAGAGCCAGAAGGGGCCGATTTG 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ttttctttcttGAAAGAGGAACCAACTGAGATCTTATTGCTGGAGCAAGACTACCAAAAAATTAATAATCAATTCTAAAGGGAGGTCTTTTGTGCTTTATAACAGAATAATATACATTTGAAATTGCTAGATGCTGCTGAAAGCGACTGAGAGgcttctatatacgtgatatgttttttgctctttgtgacaatcttgtgaggtagacatgcatcctccctatattacagatgacgaaatgtgactcagggagagtaagagtctgcccaacgaggttcagcttgatggaaaaactggcatttgaatcaggattgccagaGCAGTGCTACAGAGAAATGTTCCATCCTCCCATTTC------AAACAGTATAATGTGGGAGTGCACCAC-----------------AaaagaaagaaaaagaaaaagaaaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaaaagaaagaaagaaagaCCTGTATTTACTCTGTATAAAGCACAAAAAAT-GGTCATTACCACCGAGGGGATAAATGTCACACTTGTCTGTTGTCTTTCCGTTACTCAGCCAA----TATGTCAAATCTACGGTGAGCAGAGACAACAATCAGAGTCATGTTTCCTGGCCTCTGTATTAACTTCGTCACGGCCCTTAGCCTATCCCGACCTTTGTTCCATAAGAGGACAGGCTTTGGG a score=15059 s panTro2.chr12_random 600749 469 + 2259969 CCATCCACTTCCCTGCC-----CTCAGTACTGGCAACAAATGTGGGTGCTGTCCTCGGTGCTGAGAATCTCCACTCTGGAAGGCATGTATAGTCTGCTCCTCTGTCTTTGCCCCAGGCTGAGGTGCCTTGTCTTAGAAGGCACAAGCACTTCACAGTCACAAAACCTCTATTGTGTAATTCCAGGCTGCACTCCATGTGGGAAAATTAGTAGTTATTTTTCACAAGAGTGACTTCAAAGACAGCCTCCTGCCTCCTTGGCTTTCCCAAGGACATTCTAGGAACAGAAAGTTTGGGAAAGTTTCTGCTTCCTCCTTTTTCACTCTCATACTTGATTTATTTTGTTAGTCCAAGGAAACAGAGTTTATCTATCTATCTTCACAGATTTGGGGAAGGTGGGCAGA----AGCAGT-ATTTGGGTGCTGCCGGAGGTGGGAAGCCTTTCTAGACCAACAGTTACCTTTTGCAAGCAAAGTAGT s canFam2.chr15 44598600 449 + 67211953 CCACTCCCTTCCACACCTAGGGCACCTCACTGGCA-------TGGGTGCTGTCCGCGGTGCTGAGGAGCTCTGCTCTGGAAGGCCGGGATACTCTTGTCCTCTCCC----CTCCAGCCCCCAGCATGCTCTCTTAGGAAGCACA------TCGT-GTCATAAAATGACTATTTTCTAATCCCAGACTACCCTCTGTTCTGGGAAAC-----ATTTTTTTCTCCAAGAGGGACTTAGCGTAGAGCCTCTTGTCTGTCCGACTTTCCCAAGGACATTCCGGGAACGGAAAGTTTTGGAAAGGTTCTTTTGTCTCCTTTCCTCCTCCAAAATTTGA--CGTTTTGTTAGGCCAAGGAAATGGA----ACTCACCAGGCACCACAGCCTTAGGGATGGT-GGCAGAGAAGAGTAGTAATTAGGACCCTGGGGGAGCTAGAAAGCCTTCATAGTCCAACAGTTACCTTTTCCAAGTAATGCTGT 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aGTGACACATTATAGaaatattatggtcttggtgtggggacaaatatcagatgcagacttcagaaagagaaccacccatacatgaaaatgaggtatgtgacagagtgg-gttatcaactgatgg-caaagat-gattattcaacatgattgtacacggacaactgagtctgcagatgagaaaacacagcca-cgtctttacttcacaccatgcaccacagtcaaCACTGTCCTGAAACCTGAGCCTGGAAGGATCCACAGGA--CAGGCTCTGTGGCAGGAAGGTTGCTCAGGAAGGCAGTAAATGCTCACACCCTTACTCACACTGCTGGGGGGCGATGCGGGGGTCCTGCTCACGTTCTGCCCTCCGGTCAGGCATGGGCTGGAAGCAGCAGGTGCATATGGCATGGCTTCCTTGCAGGGCGCACACATAATCCTGGGCTG a score=21848 s panTro2.chr12_random 603499 479 + 2259969 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AAAAACCTTTCTGCTTACTATTGCCAGATAGTAATTTTGCCT--TTTTCCCCTCCTCGGGAAGCACAAGATTCCTAGTTGTTTATCTGTTTCTCTCCGATAATTTCCTCTTAGTTATAA-----AAGCGCCACAAAAAGGTAAAATGCTG-------------TATTTCTAAATAAGTCTGCTAAATAAGGTTAGAGATATTCCTAAATAGGCTGTGTTAAAAATGCAAAGATTGTTCTACATCACATAGGTTTCACCCTCTAAAAGAAATAGAGG a score=19125 s panTro2.chr12_random 604397 744 + 2259969 taaataaataaataaataaatgaaACCAAAAAAATGCAAGTTGCATTTCTCAAGGATGTCAAAAGAGGAATACATTTTTAGAACAACTTAATCTATGTACTTGCAAGCTAAGTCCCAGAAGCCACAGGACTTTGCCTGACCTGCCTAAGCAAAGGAACCCAAAACATCTTTGTCCATTTTGGCCTGTTCCT--------------------------------------------TTTCTGAATTGGCCACCACAACAAAAACAGCCA--GAGTAGGGCC---------------------CCTCTGAACTGTCTACTGTCTTGTGTTGAGGTGG----------------------------TTTCAACACTCATTCTGATTTGAAAGCTCACATTATTTCTGAGAAATAATGATTTGGAGGTGGAGGAGAGAGGGAGCCCTGATCTCTCAGTGTCTACCTATA--TAAAAAGTGTAGAAGCCAA---GCATGTATGTAGCATCACAGACTAAATTAGTCAACTGGGAGCTAGAGCTACAAAATCTCTATAGGGAATAGGGATTTTTTTCACGTTATTTAAGTATTATTTGTTACTATTATTGTTGTTGTTATTTTTACTACCCATTAAGCCACTGGTCTGCTGCTGGTCCCCAAAAGGCTTTCTGTCT-ATTTACTATTTCACAATCTGTTTCCTGAATGGTGTGTTTGAGTGGAGTCAAGATAGAGAAGTTTCTCTAACGCCTCCCAACACCTG-CTCTAAGAGGGGGGAAAAAGAACCCCA---TGTCTTCAACCATCAGAGATACCTAATGTTGCTTTATTCCCATCCTTTCCTTACCAAATGA s canFam2.chr15 36146835 776 + 67211953 taaat-aataaa-aaataaaataaataaaaGAAAT------------------------------AGAAATACATTCTTAG----ACTCTGTCTGTATACTTGTGAAATAAGTCTCAGAAGCCTAGACTTTTTGCCTGACCTGCCTAAGTAAGTGAAGCCAAACTCCTTTTGCCCATGTTGGCCTTCGTCTACCATCCACGGCGGTGTTATTGGTATCGTGATGAGCATCACTGCCTTCCAGATTGCCCACCAGAGCAAAAGCAGCCAGTGAGCGGAGCTGTGGGCGGGGGTTGAGGGGGGTCTCTAAACTTTCTCTTGTCTTGGGCTGAGGTGATCTTCACCCTCATTTTTTTTTCCTTTTTTTTTCACCCTCATTTTGATTTGAAAGTGCACACAGTCCCTGAGAGACGATGACC----------------GGGGAGCCCTGGGCTCTCAGTGTCTACCTGTAGGTAAGAACTGCAGAAGCCAACTGAGGTATAGCTGGCATCGCAG----AATGAGTCAACTCGGGGCTAAAGCCACAAAATCTCTCCTGAGAACGGGCATTTCTTCCATG--ACTGGAGTATCAGTGGTTACCGTTATGGTGGCTG------TTACCATGCATGAGGCCG-TGGGGTCTTGC-GGTCCACTCAAGGCTTTCTGTTTAATGTTCCCCTTCATAGGGTGCTCCCCGAATGACATGTGTGAGTGGTCGCAGGAGTGGGGA-CTCCCCCAAGGCTCTTGGGCATCTGCCCCTCAGAGCAGGGAGGAGGGGCTGCAGTGTGTCATAGGCCCTCAGGG--GCCTACTGTTGGTTCATCC----CACTTCTTTACCAAATGA a score=60178 s panTro2.chr12_random 605176 1252 + 2259969 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s canFam2.chr10 5376095 1232 + 72488556 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s canFam2.chr26 37422307 1051 - 42029645 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GCCAAATGAAACAAAAGTATATGAAN---GGACTANTA-TTTTCTCTTCTTTTC----CAGGGTATTCACTCTCAGGGAGACAA-----ATCATGTGATGCTCCATCATTAAACATTTCATGAAAAGACTGGGGAAATGAGAAACAATTTTTACACTGAACTACATGTTGATATTGCGTTGTCTACTTTGGAATCCACTGAA--------------------------------------------------------GAAAAGTTTGACAAGCTTGAGAGCTGAACCTCTAAGT-TAAGCCTGTTCTGTAGAGGCAGATATTCTTTATAT--ACCCTGCTTCTTAAACATTTCCCCCAAATCCCAAAGCTTAAACT-AGTAAAA-TCAGCTCTAAAACAAAGTCAAATATTGACAGAGGGAAAAGCACACCTATATTTTTCTTGGAAACAAATGAAGTTTGGCTAAATGGTTGTAGGATTCTGGAAAGGGCTTATTCAGAGGAGAGTGGAGCATGCTTTTTGTCTCAGAAGGTGGGAGCAAGCTCACCAAAGAAAAGACTGTAGACTCGCTAGTCCTGGGTGCTGCTGTGGGAGCTTCCAAAGCCCCTCAAGAAGCTGGAGAAGACCATCTCTACCCATCCCACCCACACACACAACACTCCTGCTATTCCTTGGC-TGGCCAGGTCCTTCCACCCTGGGAGTGAAATGTTTTGGCTGCAAATGCTTAGATCCATGGACTACAATAGCCCATAGAGGCAAGGATGAAGAGAAGGATCCAGCGCTTCCGAAGACGGGACACA--CCAAAGGCCACCCTCCCTACTCACTCAACCCCTCTTCTAACCCTCTTTAAGG-CCTCTTTTA----TAACATACTTGTAAATTCTGAATTTCACTTTGTAGAG----CTGCTTGTTTTAATAATATAAA----TTTCTTTTCAATCTTTGAGAAAAACAGATGCACCAAgaagaagaaataataacttcgcctgtgctttccCTGGGTGCCAGAAT--AAGCAGTAAACTCCAAAGCTAGAATAAAAGAAAAA---AAACTCGAGAAAAGTAAG 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ATCAAGTTAGACCCAAATCTCTTTGGTTTCAAATTTCATACATTTCAAAGAA---TTCCATAAGTGATAGCTCTAATTATCCATGTGAGGAAATAGTTTGAATTAAATGGCATAGATTAGCTTATTCATGACATTTTCATTAGCAGAGTAGGAAGAAAGAAGAG----AGATAATGTGAATATCAATAACATTTATAGCTCAGTATAACGAAAAAGCATTTGGAGTCAGAAAGGATTAGTAGAAATCCAG--------CTTAGATACTGTACGACAATGTAGCATCTATCTTCTATGAAATGAGGAAAACAATACATTTTACCGAACATTGTAAAGATAATAATGATATAGTATACACACCCCACATACCTTGTCATTTA------TTTGAAA s canFam2.chr27 13500981 387 + 48908698 ATTAAATGAGGCC-ATCTTTCTTTGACATGCAGCATC-TACATGTCAAAGAAAAATTCCACAAGTGGTAGCTATAATTATCAATGTGAAGAAATTGTTTGATTGAAATGGCATAGATTAGTTTCTTCCTGGCATTTTCATTGGCAGAGAAGGAGAAAGGAAGAGAGACAGACAATATGAATATC-ATAATAGTTA-Agcctaatgtaatgagaaggca-ttgaagccagaaaggatttgtggacacctagcttcgttacttagatgctgtgtgaaaa-gtaacatttatcttctATAAAATGAGGGAAATAATGCTCTTTACTGAACATAATAAAGATTATAATAACATGGAATACACATCCCATACAGCTTCCCATTTCTCTCTTTTTAAAa a score=17308 s panTro2.chr12_random 622605 436 + 2259969 AAAAAATCCCTCGCCCCATTCCTAGAGCAAGCTGAAAATCAAATGCTTGATTGTAAATACTGCCCTGAGTTACAAACATTCAGTGATGGAAATGAAATATCAAATTTTCCCTGTAGTCAGCAATGAGATCGCCAATTAAACAGGTGCAGTTCTATTTTCCGGTATTTGTAGGAGAGAAGGTATGGCTCCTAATGTGAAGACACATTCAGAGCTGCAATGTAATTAAAATGACTC--AATTATAATGTACTGAAGGTAACCACTAAATAGACAGGTGTGAGTAAAGTCCATTTTTGTTTTGTTGAGAATAATACTATGTTTAGCTTAGGAAAAAAATCCTAATACTATGTTTAGCTTAGGGAAAAAATCCCACCAGAAGTCTATAATTCTTTGGTGAATGAAATGTCACCATTTCATTCATTGTGAGAAAAGAGTGCAA s canFam2.chr27 13501594 373 + 48908698 AAAAAATC---------------AGAACAGACTGAAAATCAAATATTCCATTGCAAAACCCACTTAGAGTGGCGCACCTTCAGTAATGGAAAGGAAATATTTATTTTGCCT-----TCATTAAGCAGATAGCCAATTACATAGGTGCAGTCCTATTTTCTGTTGTTTCTATGAGAGAAGGCATGGCTCTTGATGTAAAGATACATTTAGAGCTGCAAAGTAATT-AAATGACTCTAAATTACAACCTACTGAAGGTAACCACTATAGAGACAGGTGTGGGAAAAGTCTGTTTTTGTTTTGTTTAGAGTGACAGGATGCTTACTTTAGG-----------------------------GGAAAAAAA----ATTAGATGTCTGTAATTCTGTGATGGATGAAACAACAC-----------TTGTGAGGAAGGGGTACAA a score=40059 s panTro2.chr12_random 623066 1420 + 2259969 CTcaattcttcata-----gctccccttttatcgtgcccttgtcatgtg--cttcatgttttctccatgaaagaatgagagtatatctt-ctcnnttacntggggctcagccctttgactttaccaatggaatattagcaacatagcgtaactaaaagcttggaaaatgcttgcaacagttgggcttgctctcttgctcctctgtcattgccataaaaacatacccaactgggcccattgatcccaaaaggaaaatgaaagacatgaaggacaaagccaaatcaccccagccaaggccagcctagaTCAACTGA-----GAGGACACGAGAGAGCCTAGATGACATTAACAGTCAC-CCAGCTGAGCCCAGCTGAGATCAGCCAATCCTTAATTGACCTGCAGATCT-------AAATAATGCCTGT----------ATAAAAAATGGCAGCAA---TAAAAACTCTGATTTCAAAGTGCCT------CCACTATGCCATATtattcctaagcctgatactaactac-ccctatgatctcagaaacgttgatctgcttgaacatcaattctccattgtgaaaagggagac--------------------tgaatttctcctacaatggtctccaaattct---------aatattctataattttTATTTTTATTTTATTTACAGAGAGGATTCTGTCATTCCATTATTTGTTTCCTCTTTCTCTTTCTTCTCTCCAAATGATAATGCAATGGTATACAACAGAATCTCATAAACTATTTGTTCATTATT----TCACTTATTTAATAAACTTACAATATGTTGGGCACAAGAACAACTGTATGTTAGGCATAAGATAATGCCCTATCATCAGCAACttataattaagttaaataaaagttaattatgacaaa----taaataaaataaaa---aCTCTCCTGGAATTTTTTTTAAAA---AGTTATTGCTTGCTGTGACAGATAGATAATTATGATGTATCCAGGCTCCATTTTTTTGGAAAGAATATCTTTAGTCTAATAGTAAAGAGGACCCAGTGAACAAATAATCCTCTTTCCATTGATTATTAATCTTCCTCCTTGAAAGAACTGTCTGTGTCAGCCTATCATCCAGGAGTTCCGTCCCACGTTCTCAGCAG------------------------------------------------------TGGGGGCAAGGGGCGGCATGAGTCATATGAACACACCCATAATGATTGTGTCCACCCCACCCCTC----CACAAG-TACATt-------------------------atttgaaggtatagtcttcacaagactgataatataaaacggggaccagggagaggtgggcctctctcatatagatgtggtcgccacaaaagggaaattttg---acagagac-gacagtcgtaccgggagtat--tgtgaagacagggtgagtagacg--catctaccagccaagcaaagCGC-----GGAAAATCTCACCCC-----ACCCCTCAAAAGA--GACCCTCCTGGGACCTTGCTTT----ACTCTACCCCACACACAAAATAATTGTTTTTTAAATCCCTGT s canFam2.chr15 41617469 1523 - 67211953 ctcagtccttcataatcctgccccccatacccatggtctttgccatgtaactttgaagttcctttcattaaagtagaggaatatatcctgatcctgcaccttggattcaaccctttgactctaccagtgcaatattagcaacacagcataaccaaaagcttggaaagagcttgca-caattgggcttccctgctttcccctctgt-----------gaacatatccaagttggccca----------gggaagaaggagagacacagagagaaaattcgaatca----aagtaagcccagcctagatcagctgacttccagACCCATGAGTGAACCCAAATAATCCCAACAGAGACATCTGCTAAACT-AGCTGAGAGCAGCCAATCCTCAGTTAACTCACAGATCTTCGGAATACATGATTACTGTTAAAAACAAAACAAAAAACAGCAACAACAATAAGAACTCTGATTTCAAAATGCCCACTTTGCTACTATATCACACTATTCATAGGTCGGATCCTAACTTCATCCTACGATCTCAGAAACATTGATCTCTTTGAGCCTCG-TTCTCTATTGAAAAACAAAAAACAAAACAAAACAAAAAAACATTAAACTTCTTTTACAAGGGTCTCCAAGGTCTCTAAGTTATAATGTTTTATGATTTT-ATTTCAATTTT-----TATAGGAGATTATATCATTCCGTTGTCTGTTTCCTCTT-------CTTCTTACCAAATGATAAGGCGATGGTATAGAACACAATGTCAT-------TTGTTCATCAGTCTATTCATTCATTTGACAAACTTACTATATGTTGAGCA-----------------------TAAAACAAAGCCCTGTCATCATAAACACata-ttaaatt---taaaaattaattaGGACAAACATTTAACTAAAATAAAAGGAACTTTCTTAAAAATTTTTTCATAATGAAGTTATTGCTTTTACTCATAGGGAGGCAAGTATGTTGTATGCAGGCTCTAATTTTTTAGAAAGACTATCTTTATCTCAGAAGTAAAGGGGACTCAGTGAACAAATAATCATTTTTCAATTGATCGCCAATTTTCCTCTTTGAAAGAGGTATCTACGCCAGCCTATCAGCCAGGACGTCCATCACATCGGCTCAGCAGCTGACTCTTAAGCCCAGTTCTCGAGACTCCCCACAACCTTTCCTTATGTTGTAATGGGGCCTAGAGAC-CCATGAGTCACAGGGACACACTTACGATGAAGTgttaaatcacatcccccgtgacaaaagttacgttagagccctaaatcccagaccccagaatttgaagataggatctttaagagg-taatcaaattaaaatgagatca-taagggctgtatgcccattagacaaat---atccttataaaaggggaaatttgtacacagaggtagacatgcatagaagaaagacaatgtgaagacacaa-gaggagacagccattcacaacccatggagacagtcctgggacaaatttttccctcacagacttcacaaagaaccaaccctgctgacaccttgattttggacttctagcctccaa-------aactattgtttaaatttctat a score=39961 s panTro2.chr12_random 625343 916 + 2259969 ccagagcctttgcagttcctttcataaaagaggtggagccgatttccccatcctttgaatttgtgttggacttgtgacttgccttggccaatgggatatcagcagaggtggggcaaacagaagcctgaaaaagtgcttgtaaatttctgctttcactctagttcctctgcaattgccatgggaaaattaccaggctagcatgtcagacgatgagaggccagtcttgtggagccaagttgtcccagtcatgatccaagctagggccatcccagatcagccaacagctagacaaccaccagacatgtgagtga-ttcaatcaagatcagcagagctgcctggagagcctgcagttaaccacatatgtgtgagcaaggcagcaagatcagataagcccagcccagatCAGCTGAAACCCATGTAAATGTATATT----GTGCT----GTACCCTGATGATTTTGTGGTTGTTT----TGCAGCATTATTGGGGGCAATATATGACTAATACAGGATTAGCAA----TACTTACTGAGTTTGTGAGGACCTGTAAGAAAGGTCACAGCACTTCTAGTAAGTGTTAAATGAATTATGGCCATGGTATTACAATATTTCACAAATTCTTGAGTACTCTGTAGAAATAATGAGTCACCAATATACAATAACACGCTATGTAGCAATAATGATAAGGGGGTTAGAGTGAACCAAGCTAACAAATTGGGCACAGGCTATAATGTGTAAATCTGAGCCTACACTCATGCACATAAACCATTAATAGTATTAAATGTTG---GCTCTGTGCAGATTCTTAGGGACCA-CTTtgag-aaaacaaggctcaaggaaacaaaatgacttgctccaggccacataggtagtaagtggcagagctttcaccagagtttgagatactcataatttgcctaacATGGGA-AACATGG s canFam2.chr26 17816997 858 + 42029645 CCACAGCCTTACCTGGtcctctcataaaagaggtggggtccatttacctgtcctttgaatctatgctagccacatgccttaaactggctaatgggatattatcagaggtgacacaagcagag-----------------------------------ctagtttttctacgactaccatgagaaaatttctaagctagcctg----------------ctgtgtcatggagc-----------aggcat---ttcagctgaggccgtattagatcagataacagccagccaaatcccagacatgtgagtaagtcctgccaaaatcaacagggc-acttaggtaaccagcaattaactatagacatgtgagcaaggcagaaaaatcagatgagcccagcccaggtcacctgaactgcaTATAAATGTTTATTATAGGTGCCATAGGTGCCCTGGAGTTTTTTTGGTTGGTTGTTATGTAGCAATAGTGGGAG-AATATATGACTGATACAGAATTAGTAACATCTACTTACTGAGTT-GTGAGGACCTATGAGAAAGTACATAG-------------TGCTAAATGACTTGTAGCCAAGGTATTATAGTGCTTTACAAACTCTTAAGTATTATGTGGAAGTAAAGAATTACCAATATACAATAACATGCTGTGTAATAATAGTGATAAGAGGTTTGGAATGAATAAAGCTAACAAATTGGGTGCTGAGTATAAACTACAAATATGAGTACATACTTATGCACATAAATCATTCATGATATTATATGATGTCTGCTCTGAGTGAATTCTTAGAGACCACCTCtgagaaaaatgaggcttagagaatcaaaatgacttaatccaggtcacatagctagttagtggcagaactttcaccagaatttgagatatttatgatttgcctaacATGGGATAACATGG a score=6823 s panTro2.chr12_random 626494 144 + 2259969 ATGGGGGTTGAGTATAT------AAACACAAATACTCCACTGCCATTTTCCAG-TTGCCCAAATCAGAAGCTA--AACAATGTATTTCCAAAGCTCACAGTTATTTCCAACCACCATCCATTCATTTGTCTATTCCTTTGGTTACtttttttt s canFam2.chr26 17818367 153 + 42029645 ATAGTGGTTGAGAGCATGCTGATAAGCACAAATACTCCATTGCAGCTTTCCAGATCCCCCCAATTGGAAGCCAGAAATGACATGTTTCTGAAGCTGATAGTTATTTCCAACCATTGTCCATCCATTCATCCATTCTTTTTGCCATTTTTTTTT a score=7361 s panTro2.chr12_random 627492 142 + 2259969 TAAAAATGATGCTTTTAATAT----ATGATAAGCAATAGCCAAGTCTATCACATTTAAACTTCAAGTTGGTAGAGTACAAAATAGACAATGTAA--------AGGTGGCACAACAAAAATTGCCATCTATGATAACAGGGTGAC-TCTTGAATGC s canFam2.chr15 36275619 155 + 67211953 TAAAAATACTGCCCTTAATATTTATGTGATAGGCTATAGCCAAGCCTATTGCATTTAAGTCACAAATTAGTGGAGTACAAAATAGACCATGGAATCATGCAGAGATGACACAAGAAAAATTTCCATCTGTGATAACAGGTGGACCTCTTGAGTCC a score=822 s panTro2.chr12_random 627634 150 + 2259969 CAGTGTCTCCT-----------------------------------------AAGCAAGACCTG--------------------------------------CCTGTGGAC-CCCAAGCTGAGCAGCCAACAAAATGTAATACAACATATAAAGTATTACAAAAG-TGGTGTGGGTACATTTTAGAAA-CAGAATTAATATCTGAAG-----------CGATTTCCTGAAATATGTCTGTGGG s canFam2.chr15 36275928 238 + 67211953 CATTGCCTATTTGAAAAAAAATTCAATAGTAAATCAAAGTGAAATTGGTATGAAGCTAAATCTAAGTCATCATTCTTATCAGCCTTCAAACTGAGAAAGCAATCTGTGGACTCCCTAACTGAACAGCTAACCAGATGCAATAAGGCACAAGGACTTCCATAAGAGATGGTGTGGATGCACTGTAGAACTCAGA-----TACCTGAAGGTGTGTTCTCACAGGCTTCCAAAGCATGTGTGCGAA a score=10035 s panTro2.chr12_random 628219 258 + 2259969 GTCAGGTAAAGTTATTTA--GAGTGCAGTATAGAGATGTCATCCCAGCATTAGTCAGAGCTTAGATTTCTTTAAATTTGTGGAGTGTAGTGTTTTTGAAAGCGTGTTCCTTGAAGTCCTAGAGTCCTCAGAAGCCACCTCAGTGGATGGAGAAAATCGAGCAATTGAGGCCCTGTGTTATTCACCTTTGCATTAGCTGGTATAGCTTTACTTTTATCTTTATGTGTTTTACATAATAGGGTGATGAAGAAGAAttctttc s canFam2.chr15 36276166 237 + 67211953 GTCAGGTGAAGTTATTTCATGAGTTTGGAAGAGAGATGTCATCCAAGCATTGGTCAGGGCTAGCATTTCCTTGGGTTTTCTCAGTCCAGTGTTTTTCTAAATTTGTTCCTTCAAATCCTAT-GTTCTCAGA------------GGATGAGGAGA----AGCAATTGAGGCCCTACATTATTCACCCTTGCTTAAGCTCATGTAGTTTCACTTTTATC------TGTTCTACATAATGGAATTCAGAGTAAGATTTATTTC a score=20500 s panTro2.chr12_random 628690 526 + 2259969 CTGACATTATTTTCTTTACACTG-TACACTTCAGGCATGCTGAACTATTACACATTTCTGGGCTCATCATagtctctcccttacttctgaaccattatatatgctatttcatatgcctggaatgttccctacacccat------------------------------cctac---------tgttac---------------------------------------ttgtctaattcctactcatctgcaagtctcacctTGC--------CTCCCAAACGAAACTACATGGCCTACGTATACCTACATTTTTGTACTCAACCCTGTAACTACAGGGAAGAAGAGACCTTGGGTCAAACACTCAAAACACTCCGGGCCACATGACAAATTTGACAAAAATGTAAGGTACGTCTTCCAACTACCTTCTCTTGTTCTGAATACA---------------TACCCCCAAA-CTGTCAATTATAATTGGCTTCCCATGTAGTTTTGTCTTTAAAGAGTAAATGCACTGGTCCCATTGGTACAG----CACAACTCACATAAAAAATTTGTTGCCCTTTGTAAATTAATA-----CCATTTCAGCCTCTGTACGTTGATAGTATGAGTCTGCTAGAAGAAGA s canFam2.chr15 36279565 617 + 67211953 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tattaatgggatacacaattactagtgctttcacatatcttcattttcacatatcttcaaaatgatctaatgaggtagaatttatcaacattgcctttatgtatgagaacattaagacttaagaaaataagctaattt a score=12247 s panTro2.chr12_random 631119 336 + 2259969 aggaaaatatgtaatttgaccaagattgcacagctactagatgccatttgactaa--cttattgactccaTATAATGTTCCAGGCATATTACTGTAAAAATTACAAACTTACAGCACATCCGAAAG-----TATCATATAATCTACACTTTTT-ATTAATGTGTAGGTCCCCAAATGTCCAACTGG------CATAGAAAAGCACTTATTAACCACATCATTACCTT-AACAGGATCAATAATCAAATTAATTTGACCACTAGAGTTACTTGTGAAAAGGAAGAAGG-----AGCAGGAATTTTCCTCCTAACATAGTTCCCAATTAACCCTGCAACAAACAATATTTCTAGAACC s canFam2.chr27 22015794 336 - 48908698 aggaaaataagcaacttgttcaagattgcacaggtactaaatggtaTTTGACTAATACTTACTGACTCCATGTAAGGCTC-AGGTGCATTACTAAGTAAATCACACAATT-CAGCATCTCTAAAGGGTGGGTAT--TATGACCTATACTTTTTTGATAATGAATAGGTCCC-AAACATCCACTTGGTTTCATCATAGAAGAG---TTAGTAATCACATCTTTACCCTCAAAAGGATCAGTAGTCAAATAAATTTCAACACTATAG----TTGAGAAAAATAAAAGGGCAAGAAGCAGGAGTTTTCCT------ACAGACTCCAGCT--TCTTGCAACAAACTACATTTCTAGAGCC a score=17145 s panTro2.chr12_random 631455 432 + 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canFam2.chr27 46048690 820 + 48908698 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s canFam2.chr15 38934617 1611 + 67211953 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tttctacctcataa---aattgtagattaaatcatatcatccacataTG----------------------------------------GTGTAAGTT-----------------------------------------------TCTATTTTGTTGC-----------AAATGTA----TCATTTCCAATATCATGAATCAAAATTAGGGTTCAGGTTTAGCGAAATAGAGACACATACTTAGCTTTCATGCTAATCAGGTTGCTCCAGCTCTGCTTGGACCAGGGTTGTCTAGCCAGAGTATCAGCCACTGTCCCCACCAAAAGTGAATAGTCCCTTAATTGTCATTTGTTTTTTATTAGCACATTGCTTCTTGTTGGTATAGCTTCATCAAGAATTT------------------------------------------------------------------------TGAAGTAGAGTTAGTAGGACAAGCGTTCCTAGATCTCTGGCCTTGATACTATTTATACAATATGATttgagcaaatattatgtgctaactattgttctaggtactggggttcagctgagaacaaaaaaataaTACTCTACTCATATTCCTTC-CTTGGTTCCTTTACATATCTTACTATAGAGCCCTTTTCATACTAAGTCATAGTTATTTGTTTTTTTATC a score=35211 s panTro2.chr12_random 652260 877 + 2259969 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s canFam2.chr27 42088454 1111 - 48908698 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canFam2.chr15 38745979 430 - 67211953 tagttatagtgatttctgatgtaacttgatttatttttgcatattgttttattgctgatgcta-gcatttttttctttgtggcctttttttttttGCAACCAATTTTGTCTTATGATACATTAttttttcctgctac-----tagttgtgaaatatttacttttct----aacgctatagggtttatc-tggaatttaaaatatttatagtttcaatattctaaatttaatcaatatcatt-----ctttcaagacaatgtaagacccacaga-----ttaatttactcttctcttggtaagttattattgtgctgtattataattctacatatttaactccaTTAAACATTATATTATCTGTT---TCAATATTTGCTTAAatttattcacatatttatcacttcctgtgctttttttctttcattcattccaacc-----tctgagacattttattt a score=60650 s panTro2.chr12_random 684411 1835 + 2259969 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TCAAACAATTGATTAGTCTTTTTCCTTTCC----TCTTCTAGTATGTTTGTTAGTAAATCCTAtcagggctttcacattcgatgtcccctgggacacttgtttc-cagttactcccatggcagtcacctttccatcatttaggtctttgttcaCACGATAGATGGATCATTTATCATCGTATATTGAATGCCATGAGGAAATCTCATAGATGTGCTTCCTGACTATCCAATCCAAAATGGCCTTGGCAATGCTGACCCATGCTATATCCACAGAGTGTAGAAGACTAGTTTTTCAGCTGGTATTTATGAGTAAAGGCATGTTGTCATTTAGAGAAAAATGTTTATCAAAAATGTATTTCTATAGC----CGTCAGCCTCAT---CTATATGTGTCTTCACC-AACCAATGTGCAAAATCTAAAGTCAGTTTCTTGATCAACATTTC---TGTAGGAAAAGATAGGTGAGTAAAGATGATGTA-TTTTCAAGGTTCACTG-----------TATTTAACACTTACATATTTAAGGGTTAACTATTTTCATTCTGTTCTAGaaattaaaaatacttttttttaaataaatt--ttttGTTCCTACTTATAAGCT--CTACACTctgttccatgtgctaaggatctagcagtggataaagcaggcaaaagccTGGACTCGctggaaatcagtaag a score=4197 s panTro2.chr12_random 714936 80 + 2259969 TTCTGTGTGTCCCTTGTATACAAAGGATGTCCCAGATTATAACTCTCTGCTAAGATTTAAGTAAAACGTAAGAATTTGAA s canFam2.chr10 31708000 79 - 72488556 TCCTATGT-TCCCTTGTATACAAGTGATTTCCCAGATCATCATTCTCTGCTGAGATTTGGGTTGGATTCGAGAATTTGGA a score=6098 s panTro2.chr12_random 716790 227 + 2259969 ATATAGTATAATATAAAACAAATAGATGAATAATT--AAGATTTCCTACACTGTAAGTAGTCAATTTC-TGTTAGAAAAACCTTTGTGT--GTAAATTATTGGAACTGATTTGTCCTAATAATTTTAGTTTTTTGGATA-TTTTCTACTAAAATTATCATCCCTTCTATTTTTTAGATTTCAATGTGGTTAT---TAAATTTCATTGTGCAGTCATTCATTTTTTAAAAATTCTAT s canFam2.chr26 8401477 224 + 42029645 ACATGTTTCAGTTTAAAATATAGAGATGAATAATTTTAAGATATCTTACA---TAAGTGGTGAATTTTATGTTAGAAGAATATATCTGTAAGCAAATTATTTGAACCGATTTATTGTTAGAATTTTGATTTTGTTCCCAGTTTTCCACAAAAATCCTAATGATCTCTGTATTTTTAATTTGAATGTGATCATCAGCAAAT----TAGCGCATTCA-----CTTTAAAGAATGCTAT a score=12366 s panTro2.chr12_random 717035 429 + 2259969 aatgggaaagaaaatgagggggtgccattagccagagaggtcagggcaggccatgacagttaaggggacccttgtaggctgagcagcagccggctgtgtggacctctggggagtgtcccagacaggtggaacaggaggtgctaaggcttc--------cctgagctggcaggggtcacagagaaggctggcatggcccaaggaggtaggcaagggagaggagggcacaggccaggtcacagggggctggtaaggagttccggttttattatctgttgggataataatgatgaagtttataatagtgatgaagtttatcccaggaagcaatgtgatcagacttttgttttaaaagttcactttggtggctgcagggaggaaggac-------ctgggggtaggggtgagaata-ccatg------------------ggaaggccc-----ctgcaggagctgctgagg s canFam2.chr26 8401906 439 + 42029645 GATGGCAGATATGGTAGGTAGGTGGCTTTAGCCAGAG-GATCAGGGTTggacctgacaacaaaggggacacttgggggctgagtggcagctggccatgtgacc------------tccctggcaagtggaacaagcagtgcaaagaccttggcactggactgagctggt-gagatcccagagaaggccagtgtggcctgtgg-ggtaggtgagggaaagacggtgccagg-cagatcacccaggactgatgaggagttcaggtcatattatttatgtg-----------tgaag-ggaggccagagatgatatttatgctgggaagtggtgt-attgggtttttacttttaaagctcactctggtggctctggagagaaaggactggttgtcgggaggccttggtggagatagccatggccatccaggcaagcagtggcaggcccgggtgctgtgggagctgccaggg a score=3091 s panTro2.chr12_random 719235 68 + 2259969 TTGGCTTTTTGTGTAACAGCCTCTGGTTTTCAGTGCTGGCAATGAATTTAGGATTNTAGAAAGCACCa s canFam2.chr26 8404493 63 + 42029645 tcagctttttacacaacagcttctggttttcaatactggcaacgaattcagattttttagaa-----a a score=15175 s panTro2.chr12_random 719618 633 + 2259969 GCACCACAGCCCAACACAGCACCCTCAGAGGCTGTCTCTGGCCTGTGCACTGTGCA-GTTGGCACCCTGCGGACTTGACATGTGTTTGCAGACTTGACATGTGTCCTCTTGCGTGGTACGTGGATGTCTCTGGATGGCAGGCAGTGTCCTTGCTTTGGGAGGAAACCTGGATCAGCCAGGGTGGATTCACACCCT-CAGTTGCTGCTCATCAGTGGCAAACAGACG--GCTGCATGCACATCACCACCACCCC--GAGGCCTCATGCTTACCGAGTCGTTTTCCAGCTGCAGTGACAGCACCGTGGTTTGTGGAAGATCACAC---GCCGGactagcttctcagcgctgccttaacacgcggccgtgaaccgggcagctgaaaatggcaggaactttcttctctcacagtactggaggccagcagttggaaatcaaggtgctgcaggaccacattctctggaaggctctgggggaggctgcttccttgccggttccagctcctggtggctgccggcctccttggcgttccttggctgggagatgcgtcactcccgtcttttgtattcgtgtggtgttcttcccgtgtctgttggcgtcatctcccctCCGTGTGTGTCTGTCTTT-TGTCCAAATTCCCCTTT s canFam2.chr26 8404556 575 + 42029645 gcatggcagtccaa-acaatgctttcatggactggctctgcttggtggactgtgcccatttgcaacctgtgGACTTGACATTTGT-------------------CCTCTTTGGCAGTAAGTGGATGCCTCTGGGTGCCAGGCACAGTGCTTGCTTTGGAAGGAAATTCGGATCCACTGGGGAGAACT---GCCCTGCAGTAGCT--------GTGGGGAACAGAGGTAGCTACAGG--AGTTACCTCTGCCCCGTGAGACTTTGTACTCACTGAGTCCCTCCCAGGGTGCAGCCAGGGCACCGCAGCTGGTTGAAGACTGGCCTTGGCtgcatctgcttcctcaggcagctgggtcaagttaccccaaaccgagcagctggaaaccacagcagc-ttattctttcccagctctggaagccagcagttggggatgaagcggtgatgggaccctggtct--------ctcctggggag---ccttccatgcctttcccagcttctggagtttgctggctccctgagcatcccttggcttatagacactccactatctcctctc-----------------------tgtcttctcatgtcatcctgcctttatgtgtgtcctcctccaagtccacacttcgcctt a score=3751 s panTro2.chr12_random 720281 83 + 2259969 CAGTNAACGTGATTCAATTTTCTCCTGATTCTAGCAGAATCAGACNNAACGCTTCTAAGACTAATATATCATAGCTTAGGAAA s canFam2.chr10 55013787 77 - 72488556 CAGCAAAAATTATTCAAGCTGTTCCTGATTGCAGTGGAAT------AAACTGTTCTAAGACCAATATATCATATCTTAGGAAA a score=18940 s panTro2.chr12_random 720525 747 + 2259969 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tttatatataca----------tatacaatt--------------tattaatttGCTCCACTAAACTTATTTTCCCATATGGTTTCTCTCATTTCTAAGGTTTTCAGAAATCTAGTTCTAGGAGTTGGGTAGAGATTGCTTAAGTAGTAAACATTTTTGAACTGACACAATTCATAATAACATAAAAAATAATAGATTAGCAGAGT-CCAACATTGCAATAACAAATATGGTAATATGATATCTCTCCTTATTAAAATATGCATGAATTCTGAAAATCTCGCTTA-TGTCTGATGTATG-TAG----ATATGTCCCCAATATGT-CATGTCCTATCCCTG s canFam2.chr10 55014967 296 - 72488556 TTTATATATATAATATGTATTCTATATGATTATTTGTTGAAGGCCTATTGATTTTCTCCACTAAATTTATTTTCCCATAGGTTTTCTCTTATCTCTAGGGCTTTCAGGAATCTAAT------ATTTGGGGAGAGATTAGTTAAGTGGTAAATAGTTTTGAACTGACCCAAACTCTGAGAACAT-AAAAATAATCAATTGCCAGACTCCCAACATTGTACTTCCAAA----------------CCCT-----------TAGGCATAAGT----------TGGCTTATTTTCTGATgcaggctagaataatgtcttctcaatatgtccacgtcctaatcctg a score=6307 s panTro2.chr12_random 723515 175 + 2259969 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s canFam2.chr26 20371670 1043 - 42029645 agctgtgtggccctggatagattagctaatctctctgagcctcatttctatcttctgtaaag-tggctatagatctccctcatataattgttttaaggattaagtcagaatacgttacgtgttcagagaagtgtctggcacataataagtgctcaggaaacattagctattaATATTAATTGctgctctgtgt--------ctactacaggatttgtcactatctagtatagtgattcagtatggtggttgattaaattgctgtctccctcagtagact--gaattctctggaagtagg-accctggattctttattcccgcatcccaagcacacaca--gtaggcaagcaacacacagttttgaatgcatggaAGAACAGGTAGAGGGATGGGTGAGGGGAGAGCTGTATGGATGAATGGGCGGG----TGTAGTTCAgatggatggagaggtgaatg--------gatgggttaatgaacagatgaatggtgggtggttggatggatgggtaggtggattgatggatagatggattaaggaatggacgatggatggatggatagattgtgacttaatggatagatgagtaggagaactgatggatggatgaaggaatggacaatggatggatagattgtggcttaatggatagatgagtaggtggattgatggatggattaaaggatgatggatggatatattgtgacttaatggatggatgagtaagaggactgatggatggattaaaggatgatggatagatagatggcttgatggatgAACAGGTGGTTTGATtccacaaaagcatggatatggggct--tttgg------atctgtttcaagtgcctagaacaataactggtgcatagtaggagcttagtacttcgtcccggaatgaacagaatGGCATATGGAGGACTGATGAATTCTACCTTGAACCACAGTTAAAACTCCCATGCTGCTCT---GGTTGGGAGGGGCTGTTACCATTCAGGACCTCCAAAGCCTG-CCAGGTAATCC------TGTGCCAAGATTGTCACAAGGCCCCCTGCTGGTAATAATATGAAATCACATTGGC 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s canFam2.chr10 61050868 1256 - 72488556 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s canFam2.chr27 16048557 1657 - 48908698 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s canFam2.chr10 37026292 1077 - 72488556 atatatatatagagagagagagagagagagagcacctgcaatatcctag--actacttagttgctgtggatactgtagtgaaca------aacaatattgtgacccctgaggagtgctgacattctagtaggcatggcaaacaaacaaataacatatattgtcagatg---ggttaagtgctatgaagaaaagtaggaaaaagggcagagagcaatggggcaggagtgggggaggtagtgttttttaagataatgtagactgggaagccctctctaagaagtaacatttgagctgagtttgcaaaggaaagaggaaggggcatgtgaagatgtaagagaagaactttccagacagaggg---------acaaaagcttggaagc-taagcttgcatgggaacttggacagatacggggcagacggtgtggctggagtggagtaggcagggagagagtgggaggagacgagactgagaggtagaaaa----agatcctattgagctttgctaggaaatgagaggagttttagagttgattccaagagtgatgggaagtcactggagagctttaagcaggagggcaacgtgtgattttcatttttaaagactaccctggcttctgggtagagaacagattataacaggagcaaattggagagggagacgggcaccaagtaggcggtattgcagttgttccagtaagaagtaatggtccagggagcaagtagtgcaagtagcaagggtggaagtagtatgaagaatccagattctggatgtattttgaaagttgaatcaaatgattgaccaaaagctgaacaaaggagaacagggaggagtagaggatgatgctaagattttca--cctgagcagcaaggtgaatagtgat---ggctgtctgtgaggtagggcaacaagggaaggcaaatagggaggtggtatggaatc-agggttcagttttagatatatgaactttgagatcttgtttggcatcaacatggac-acatcagataggcctgtgggtgtaagagactagagtacagttggatggtggatactgaggatacatattcaggattcatcagtatatttatgatagataaagcca 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ccacttcctagtcaatcccccccaccctcttttggtccccagactaccccaaaactgacctgctttctatcactatagatgaaatttcgcttttctagtatttcaaatagatggaaccatatagtgtgtacttctttgcatctggcctcttttgtttagcatcactgcttggcggttcatccatgttgttgcatc---agttctttttttattgctgagtattcttttacatggaaatgtctcacaatgtgtttatttgttcacctgttggtgaatgtttggaatgtttctgggtttGAGGTACCCAAAGGAGGAC-TGATAGGAAGGTGAACCCACACTTGCCTTGCTACTTGCTCCTTTTCCAAGCAGTGTTCTTGGCTACTGAAGGTAAATAAGAGAAACAGTAGCAAACTGGGAATCAGATAACCACTACATATTCCTGCTTCGGGACCCTCTATTGAAAGCTTTATTGGCAAAATTGACTTGGGCTTAAGGCTTAGGTGAGGCATTCTCTTCCTCCTGCCTTAAACTTAAGATGCCTTGGATTGTAGATCCACCTCTAACCTAAATTATTCACCCTATTGTAAGCACAAAATTGGGATAGATAGAGAGaatagagctagtgttgagcatatgggttcaggaaccaggctgcacaggttcaagtatcagttcagctaattactggattcatgaccc-tgggcaaggggatttaccttttggtgcctca--gtttttcttctatgaagtggggttaacaatagcaactgcttcctaggattgttgttaggttttaaaa---agtacatgtgtttagaacagtgtctggcacctcagtatgcattcactacatattaaccattgttATTTAAATATTGGCTTCGTGCATTTCTTTCATGCATGCCTGA-TGTTCCTTGAGGTCAGAGATTCATAAATGCAATTAATGTCTTTTGCATTACATGTAGGTGTACCACAGGGCTGAGCTCACCCCAGTTGATTCCTATTTGGGTTCAAATTGAATAATCCATTTCAGGA-AGATCATGATGTCAAGAGCAAAGGAATTGTGGCCGTT 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canFam2.chr15 26180635 658 - 67211953 AGAGTAGAGCCTGACACATCTAAACAAAAAATAAAATGAATATGTTAACTCAGCATCATGTAAACCACTTTTCATTTTTTTCATTACTAGCACAAAGTCGACTTTATGCTTGTTTTTTCTTATATGTATTATTATTCATATGTAGTAATGGTGAATCTTTT---ATTTTGTTGAGAAGCTAGCCATGGAAAAAATCTACAGATTATCATCAGATTATATTTGCACTAACATGACATAGTTTTCTTCAAGGTTTTGCTTAATATTTGAATTTTGAAGAGAAGTCCTGAAGTAGACAATATTACAATATTTAATAAAATGGAAAATGCTGTAGTGTGTTATA-GTAGTGAATCAACTTTCACA-AAAAGTCTCTTAGAATAACAATTTTATTCTGAATAAACATTCTGATCTGTAGGATAAACCCCTGAGGTAACACTGGAGTAATGAATGATAAAACTAATCTCTGAAATTAGAT-------------------------------------------------------------------------ATTTCTTTAGGTTGTTCTCCATCCT----TGGTCTCTGTCTGATGATCTCAGATAAGTCTATATGCT------AAAAAGAATCTCTTAAAATCCAAGAATGAAACAGCCAAAATAAAAGAGAATAAAGTCTACATATTCATGTTTGAAAATTAGGATAATGACATTTTCTAGTAGCCAGAAATGTTATTTAAAAGTCAT a score=4054 s panTro2.chr12_random 745912 86 + 2259969 CACAGGAGAAAAGTCAATCTGTGCTAATAATGTAACCTGGGATC-----------CCATATAATAGAAATTAGCCAGCATCATCAAAAGAAATTTAT s canFam2.chr15 26181506 94 - 67211953 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s canFam2.chr15 26181790 918 - 67211953 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s canFam2.chr27 34283745 1580 + 48908698 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AATTTTTTTGAAGAAAAATTTTGATAAAGATACAGGAATAATAAATAAATATTTCATCT------TACTGTATGATAATAAATAGCAAACAC---AGGGTGATCAATGGCAACAACACTAG--CTCCAGCACTGGGGATA--CAAAAGGGAGAGGTAGGGCTTGTAGCAAACTGCAGTATGCATGTTCCTCATAGACTCATAATAACCACTGCAGTACCAGTCATTGCAACCACAACCACATTCCCAGCAGCAAAAAGAAGGAAGTGAGAAAGGGGGAG--TGGTAAGAGGAATTTAACAAAACATTCTTACCTTCCCAGTACCTTTTGCTCATATCCCTCCTTGGCCATCTCTATCTGCTAAGGAGACTGGGAAACATCATATTTCATCTGCGTACATTGCTGCCACCAATGTTAATGTACagtcagacagacctgagtccaagtctcagctctggcccttatcagccgatgttgttaaagttattttctctctcagaaccttgctttcctcctctataaaatggtcacagtaatacatactttgcaagttatgttttgaggattggaaacgagtatttgtacactacaggattagacaagtctgcaacata-gcaggtttgcacaaaaatgaaatttttattgtGGTTCAGCCACAAAGTCATGCATATATTGATATTTACTAATGGTAGTTcaggtccatctgttatccccaattatgaaacccaaatagttctgaaacctgaaaatt-----gtttgattggttcaaagtcgtttgatgccaaaccctaacctaaatgaacat-aatctattaataatatttatttacatcacttagagtgaatattcatatgtttcagtgaacaaatactagcatg--------tttgattatgggagacttacccaaatcctgctggggtagtagataatataaggtatatgcactatattacacttctgaagtccaaacaattctgaattcc-aaacataactgg--ctaaagtgtttaagaaa-----------ttgtACCCCTATTAGTAGAACATATATTTATGT------GGAAAGCAATGAATAGCTT 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CAGtttattttattttaaaaaataaCTCCCCTGCCCCACTGAACCTTCTCTTTCCCATAACTCTCCCTTGTGTCCTTTCCAGTAGAAGCTTAGAGTTGACTACGCCTGCATGACTCAAATCCTGTTTTTTGCATCATTCCTCACAAGTATCCGT----GGATTATGTTATTCT---GGTTATCCCCTGTTCTTCCAGGGATTTGTTTCAGACACTCTCCTCTTTTTACTTCATATACTTTTTCTGGGCAAACTCACTCATTGTCATTGTTTTTATTACCATCTGTTAAGGACTGAATGTTTGCATATCCTTCAAATATATATGTTGA s canFam2.chr27 29474215 308 + 48908698 AAGTTTATTCCTTT----AAAATAAAATTCCTGCTGCACTGCACCCTCACTTTTCCATAATTCTCTTTCCTGTCCTTTCCGGTAAAA---CTGAGTTGTTTACATTTGCATGAATCAAATCTTGTTTTTTGCATCACTCGTCTCAAGTATCCTGAGCAGGCTTATGTTATTCTCACGGTTCAAATTTTTTTTTTcagggttgtgtttcagactctcttctttttttactccatgtaccctttctgggaaagctctccaattatcattgtttttattaccatc---taaatgctg-atgattac--------caaatctgtatcttga a score=22537 s panTro2.chr12_random 792680 432 + 2259969 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panTro2.chr12_random 793112 87 + 2259969 TACCTTGTACATAGGGTCACAATCAGCCC-GGTGAGCTCAATGACATAGTCTAAGTCTTGCTGGATAATAAAATGGCTTCCATCACCT s canFam2.chr21 27345697 88 + 54024781 TACCTTGTACACAGGATCAGAGTCAGCCCCAGTGAGCTCAATGAGATAGTCTAGGTCTTGCTGGACAATGAAGCAGCTTCCATCACCT a score=3821 s panTro2.chr12_random 793199 50 + 2259969 TGGTTAGCAATGAATCCATCTCTGAAACTTAG-AGGGATAGAACTGGTGCt s canFam2.chr21 27349221 51 + 54024781 TGGCTAGCAACGAATCCATCTCTGAAACTCAGCAGGGACAGAACTGGTGCT a score=2496 s panTro2.chr12_random 801704 149 + 2259969 TAAGAGTAAGATAATCAAGGGAAACAAAATTAACGGTTAAAAAAATGG----TGAAAAAAAAACCAATAAAAAAA------TCAG-----AGTACAGAAATAAATATTTCACTCTACAAGGAAAAAAAAAAGCATTAAGCATTTT-TAAAATTCTGATAACTCAA s canFam2.chr27 2688176 152 - 48908698 taagaagagaacaagaaagaaaaagaaaagtaaaagaacaaaaaatgtaattttttaaaactcgcaataaaaaaaatttctccaggaggaagaccaaaaaaaaa-------------aaaaaaagaaaaaaGAATTTAGCACTTCCTACAATTTCAATAATTCAG a score=4843 s panTro2.chr12_random 802459 110 + 2259969 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48908698 tGCCCTGTTTTTAAAATGTAATAATGCTAGGGAAGTATTTTATGTCATTTACTAGAATGAGATAAAATCTGAAGTATAATATTTAACAATTGTTATGAATCTTATTACATCTTATTGCTTAACTCTTATTTCAATCTTACATTAGGAAATACATTTTCATTTAT a score=17936 s panTro2.chr12_random 803425 438 + 2259969 ttacaggcatgagttaccacacctggcAA------------AAGTCTGATTCTAATGGAAGAAAAATATCAGGTAACAGAGATTTTTACACTCTGGTCTCATAT--TTTACCCACAAGAGAGTTGCATATTTTAATCTTTCTCTGAACTGTCAATTTTCAAAGA-TTTGGGGATTATCTTGAATAAAATAAAGTAGGATAAGAATGCTAAGATAATTAATTCAGATATACATGGTATTTTAAAGTTTGGCGGATTATTATTCCATTGGTAAAATATTCCAT-ATTAACACGGCAAAGGTTATCAACTATGTTTCTTTTTAAGGCAAAACAAAAAAAAAGGGAAATTTTTTTCTTAACCCTTTTTCAATTGTGATTCCATTTTTAAAAACCTCCCTCCTCCTTCTGCTCCAAAGCAATCTCTATGTGCTTAAGCCGTGGAGTCCTTTTTCACTCC s canFam2.chr27 2696687 445 - 48908698 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s canFam2.chr27 45759468 1093 + 48908698 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atattggcctttggctcatggaatttataatgtagCATTAcaacacagcacaatataaaaagcgcaggatttcttgtcacttggatttgggtctgagctgtgttccccactagctaggaaagtttgggcagttgatgtaatttctctggagctcattta-----ccACTGCTTGTTAGATTTGAAGTTCTTCACCA---------TCTTTTACGGCTCAAAAATATT---ATATATTGTTTTGGCTCTAGAGAAACACATTTCAGTGGATGCAACTTGTTCAATGCTATCTTTTAAAAAAATA--------------------------------------------AATAGCTTTATCTCTGTACAGACCAAATATAGTAACAGCACAT----GTATTTACTAAACAAAATAAAATAACCATAAAGAAAAATAAATCAGCTTCAAACAAATATTTTAGTAGGCTTATA-TAATTTACAAAATGTTACT-ATAGAA-AATTTAGGATTAGTA-TGTATTGCTGTAGACAAATGATGGCCCTATGGGAAAACCTTGGCCAGGAAGTTCACCAGAGTTGAGAGTGTTCCCTCTAGCACTGTTTCTTCAGTCAGACAGCCATGATGGAAAAGATGACTTTCCCCAGACCGGTTCAGTGCT-TAGGAAGGAAATAAGGACACTAAACAATGGCTAAACTATAGAGTGTTATGATCTACTTTGAGGAACACTAAAGAGAGTAATTCTCAAAGCCATTCACAGAGTCCACAGTTTGGCATTTAAGGGATTTGAGATCCGAAGACCTTACGTGATCCAGGAATTATCAGTGAACTCGGG---AGTAGAAAAATCCAAGACTGAATAAATCTGGACCTTGATCAACTCT a score=3993 s panTro2.chr12_random 809193 82 + 2259969 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CAAAATAACATAAAGAAAAATCAGACGG-----TTTAAGCGCATAGCACTTGGATAATCACAGCTGTTAAACACA--CCCGGAGTTATACAGGAATGTTTTTCATGCGTTCTAATATCATAATTTACTGCTTAA-GATGAAATTAAAGTGACATAAGAATTGCTGTTTAACTTTTAAAAGTAGAATTCAGAGCAAACAGTTTTCCATATTTCTGAAGAACAAATTAGGAATGGAAAATATTTATCTT---TCAGATTGTTGTACTATTAACCCTGTCATCTGTGCTATCTTTAAATTCCAGGGCTGGAAACAGGATTGTTGAGATATTACCTGAGCATCTGAAACAATTTCAGTCCCTCGAAACTTTGGACCTGAGCAGCAATAATATTTCAGAGCTTAAAACTCCCCTTCCTCCCCTACAACTCAAATATCTGTAAGTCAAGTCTT-TATAACAGAAATATTCACCTATAATGAAAATAGCAAGTCATAATAAAAAATCAACTTTAAGATATAACAAACTCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTACCTGTTGGTGGTGAATCAGCAGTGTAACTTTCTTATTGGTGTGTAATTTACTGTAAACCCAAATAA---------TCAGTCCTTATTGTTGCACTTTTGGATTACAAAAAATTAGATATCCTTTGTTAGAAAAAGTATATGGAGTGAAAAATGCT--TCTTTAA----------AAAATTAAATCATTGCT-CGTTCCATTAATAAATGAGTTTTTTCAAAGTTGGATAAGTATCTCTACCAAGTTTTTATACCCTTCAAATATTCCAGTCCCTCTT-----AGCAGTATGTGTGGATCATAGTCAGCCTTGACCTGCAGGGACCTAAAGA a score=22778 s panTro2.chr12_random 832906 491 + 2259969 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GGAAAACAGCTGAGTTTTTGGCCAGCTTACTCCTTTAGAG-------------------------------------------ATTTGTTGTTAAGCATTTTTAGATTAAGTTTGTAATAATATTTACTCTAGTTCTA-----------CTACTAAGACATGGCTCTTCAGGGATCTC-GAAATTTTTCCTGCTTACTCAAAAACATTTCTTCACTTGGCTTGTAGATAAAAGACATGAAACACATCATTTTACCAATATATTTTCATAT---TTACTGGAGACACTGAGGTGGAGATACTCCTGAATAAAGTATTTTACATGGCAGTGGAAGAGTATAACATTAAAAGGA--AACAAAATCTTAAGAG------------TTAATAGCAACTTCTTTTCATTTTATCTATGTCTTATTCTCTTGTGCT-----GTTGATTTTTTATTCAGATC----TTTTAAGTCACAGATCCTTTCAATATGTTTGTTTTAAATTTTAAGAACtggtatggactgaatagtgtttctctcaaattcatacattgaagccttcacccctgatgttgctatatttggagatacaaactttaaggaagtaattaaggctaaatggggtgataagggtgggatcttaatctgatatgactattgtccttataagaagaataagagatactagagca-tctctttccatgtgtctacatagaga-aaaggccatgtgagaacacagtacaaaggatctgtgtgtaatttgaagagagagatttcaccagaattgaaccctactgacactttaaccatggacttacaacttctagaattgtgagaaagcatatttctgttgttcaagccacctaagtctgtggaattttgttatggcagtccatgcagacta a score=44729 s panTro2.chr12_random 845512 851 + 2259969 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CTTTGGAAGGAAGCATCAATTCTGGCACATGACATCTGTCCTATGTAAGCAGTGCAGGGCCAGAA---CACGAGATGACTCAAAGCCCACCTGCCACAGGTTGATGGATGGCAAACCAGTGAACTGCTGAGACTGGCTCAAACTCCCATCTGCCGCATGCCAGGAAAGAAGCTAGGGCTTCTAGCACAATCATTGATGTCTGTCCAGGTATCTGATATTTTAGTTAAATTTAGACTGGCAATCAATAGAGACCTCTCCGGAGGCCTCATTTTCACAGG--TTCTTACCTCACCAGCGTGTCATTTTGCAGTGGTGAAACCTGCATTCAGGGCTGCTGCCTCTGTTCTTAAGCAATTGTCTGAAG-TTCCCCAGTCCTATCTCCACTTTCCTCCATATCTTAAATCACTTCATCTTGCA-ACAAGGAAACCATGTGACTGATGGCCACTCTCCTCTAGGT-AAATTTACAGATTATCAaatcgcacaatcatggaaaatctacatagagccagattgctttcaaagtctctagtctgatgcactcaatttacagatcaagaaactgagattcaactaagagaagagacttgcccaatgtaatatacaaattaTTTTAGCATTAGAA-ATAggttgggggcaggacactggagtcagattgcctggcttcagattttatctccaccgtattcaagttac-ttatctctctgtgactcagttttctcagctataagatgagactaat---catacctacctcctt-tattgtggtgaagattaaatgag-------acataaatcccttagcacagcttcctcgggcttaaaattagcattagatcaca-ttgcttttt a score=28737 s panTro2.chr12_random 846539 567 + 2259969 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attATTTTTAACATTGATGGAGCTGGTACAGGATTCCACATCTCTTAGTAGGAAAAAC----TGAACTTGTCGGA-------TTTTGGGTGCATCCTCA--------------TAAAAA--------------GGAATTTTTTTAAGGTTTTAGATTTTTTAATGTTTTTCCTTTATAGTATTTAATGTCCCCAAGGCTAATAAACTTGACTAGTATTTCTTAAACTGCATTCCTCAAATGACTAGTCTTCTTCAAAGCTAGGAATTCCTTGAAATTCCTagtttgatggtcagacaagtttaagaaatattggacctttggcttcctcctcccctgcagattaagaatgcacacgaacatattaaagatctaggaagtcctgcaggaaagaagttccaatgttgttatttaagctgttacttcccaaatatacttgaccataaaaTCCTTTTGAATATCCCCACTGACACCGGTTATCACACAAACACAAATTGAGAAATTTTGAATTAGATCAAAGCTTCTTGAAGTCTCCCACTCAAAATCAGAAGCCAAGCCACATCACCTGACATTCCAC a score=71035 s panTro2.chr12_random 850654 1585 + 2259969 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s canFam2.chr15 29815810 1558 - 67211953 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canFam2.chr26 37217832 960 - 42029645 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s canFam2.chr27 10233505 1205 + 48908698 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TGACTCATAAAAAGGAAATAAAGGACCTTATACCCTAACATGGGATGCCAGTTTGAAAGCTTAGTTTTTTCAGATCTGAAGC-AGCTTTTCTCAGCATATTTTTCT s canFam2.chr15 26180266 89 - 67211953 tGGCTCATAAAAAGGAAAC---TGACCT--------------GGATGCCAATTTCAAGAATTTAGTTTTTCAGTACTGAAGCTACCTTCTGTCAACATCCACTTCT a score=25299 s panTro2.chr12_random 868545 738 + 2259969 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tgatttcacttacatgaaatttccaaaattggtaaatccacagggatagaaaacagattggtatttgtcagggtctcaggaaagaagagatgggaaatgactgctaaacgggtagagttttcctttgag-----tgagcaatgtttggaacttaatatgagtggtggttgtagaacagtgtggatggactaaacaccactaaactgtacacttcaaaatggtCTACTAA-AAAAACCTATGGC-----AACATCatcaaa-aatacaattaaaatttttaaggaaagagagtattagagaattatatcacatagttaatgcaaattttattttctggactttatgattttaatagcttaattaaatgtgtgactggttatcattgtcttcatcctaaataaatctcatgtttgttcctgattctatgtttatacatgtg-cattcataatttggggattgttttctttaaaaagagcactgcaatgtgaagaaacttaaatatcctcaaactatccacacttgGGAATAGGAGAAAGGTAAAATGAATCTCCATGTTGCCATATTGGAAACAAGCATTTCAATCAATACAAGGTAAGTTGTGCATCAGGCCTTGAAAGCAATGAATTCCAATAAGGCTGGAAGGAAAAAAAATCAGAAACTGTTAGAGCTGAGAAAAAAGAGAACAAAAAAGGGAGAGTTTGCCAAGTGTATTTGAGTCTACTGAGGGCATAGCTGCCCTTTGGGAGGTTA-CCTGAACAAAAAATATTGAA a score=23225 s panTro2.chr12_random 869296 648 + 2259969 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s canFam2.chr15 34737545 1117 + 67211953 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s canFam2.chr26 17959828 1252 + 42029645 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AAGTGAGAAAGAATCTGATTGGCATAGTTTATTATTGGCATGGGTCACATTGTGGATTGCTAGCCA-ATATAAAGCCAAGGGCTG--------CCAACTCCTACTCCTGTCATCTGTGACCTAGGAGAGAGGTGGGGTGGGGGATTAGGGAGGGGCACAAAAAAAAAACACAGCATCATATTCAGTTCCTCTTAAACTCTGCAAAAAGCTTGCCACCTTTCAGAAAGGCTATGATTGATTTCTATGTG---------TATGGATCAACTTTTGCCCAGCAGGGAGAGGACCTCCTAGAAAAGTATCCACCAAATGCATATGAACAAGATGGTCACTTACAGCTACAACTACTGATCATACCCATAGGTAAAAATGGTTTAACATATAAGGAAGCATGGAAAATACATTTC---AGATTATTCAGAAACCTCTGATACTAG--ATTACTTTGTCCTGCTCTACCAAAGTAAGAAAGGAGATGGCTCTAACCTTGTTT---TAGgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgcgt a score=5214 s panTro2.chr12_random 958672 221 + 2259969 acttacagtggggtgtattggcatgtaaccccattgtaactcgaggagcatgtgTGTATATGTTTTAAAGGGGCATTATCATGTTTTCCTAGTCTTATCTTAACGCCTATTTATACCATCCTGTTTCC-TTAGATACTTGAATGTGTATG-----GGATTTCTT-TCCTAAAATCTTGTCATAAATAGCAAGAATATAGTATAATCATGTTGCCCCCCCAAAAAAAAA s canFam2.chr10 60846738 178 - 72488556 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s canFam2.chr27 4682293 1535 - 48908698 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s canFam2.chr27 17535917 1354 - 48908698 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a score=34290 s panTro2.chr12_random 999848 858 + 2259969 TCTGTGATAAGATTATTGATGCTCTAGGCAAGGTGAAGCCACCTCTGTTAAGGT---CTGGTGCTATCCCTCCTGATAACCATCAGCAAAATGGAAAAGATGCCATGAAGTTTCCCTAAGGTTTCCAAACGGTTTTTGAGGTCAAAAGAAGAAACAAATCTGCTATAATTCGATACAAAATGTGAACACTTATGCAGCCTGGGAAGTTAATTCATCTTGTTTTCCATGCAGGATCTCAACTCCCAAGCCTTATCTCCCCAAACTTCTCATTTTGTGTCCAACTTTAACCTGGATTAAAAAAAGATAAAAGAAAAAGATAAAGAAAACATCAAAATCATCACCTTGGCATGTCTTGACATGTTATGA-CTTATGTATATCATCTTGTTCTCCTGCTT--TACAAGCAAAAGTATCTCAGTAAAGTATCTTTTTTTTTTTGCTT-TAAagagaaagagagagagatggagagagagaaagagagagagagagagagagagagaAcctgctgtgaggactgtagctagctgacagtcttctagtattattccttggagattcatcatggcatttatgatttggccttaccctacccaaac--ttcc---tcaatggctgagcacagcaggggtaatagagccaggccacatctggtcaaattggaaccccctcaaat---ggtcagtctttgctctgtggctccctattggcctggccaagacattcctagagctgttattataatctaaggctgttcctactgaatc-----cacctccctcttctcatgacattgacatgggtgtcagatctgcatcccagtctcaa-actctccctgctaactgcttcctcttccct---------atagccatttcccccaatccat s canFam2.chr15 29646237 832 - 67211953 TCTATGATAAGATTATTGATACTGTATGCCAGATGCTGCCACTTTTCTAAAAATATTTTGATGCTATTTCACTTAGTGATGATAAGGAAAACCTAAAGAATGCCATATAGTTTTCCCTAAGTTCCTCAATGCATTTTGAGGTCATAAGAAGAAACAAACCCATTGCAA----ATGAGAAATGTGAATACTCATGCAGCCTGGGAAGTCAATTCATCTTATTTTCCATGTTGGATCTCGATTCTCAAGGCTTGTCTCCCCAAATTTA-----TTGTGACCAACTTTAACCTAGG------------GGAGAAAAAAGAAAGGAAAAGCATCAAACTCATCACTTTGGCATGTCTCAG------ATGATCTTGTTTATATCCTCTTGTTCTCTTGCTTTATATAGGCAAAGGTTTCTGGGTAAAGTGTTATTTTTGTTTTCTTTATAAAGGGGA-------------GAGAGAGAGAAATAGCAAGAGTGAGCGCCCTTGAGCAcctgctgtgaggcttgtagttagcgaacagtcttctagtgccatactttgggaattcaccacagcatatatgctacaaccttaccttccttgaacatttccccaccaatggctgagcacagtaagggtactagagccagactgtgcctgcccaaattgaga-cccctcaaacgggggtcagtttttgctccaaggctccctgttggcctggccaagactttgtcagagcta-taccgcatcctaaggctctccctgcctaaccttgcttgtttccctctctcc------------tgagtgtcagagctacat--cagtgtgaaggcactcctggcctacttcttcctttctcctgtattcttaacagccattctccccaataaat a score=1311 s panTro2.chr12_random 1000706 53 + 2259969 ctcttccatgtctgtcttagtgtctgcttctctgtggacctgaactgacCAAA s canFam2.chr15 29647266 43 - 67211953 CTCATCTGATTCTGTCCTGGTGTCCTCTTTTCCTT----------TGATCAAA a score=25192 s panTro2.chr12_random 1000817 598 + 2259969 ctgtccttccaatcttgaggcaactaatgacaccctccactgatttcTTTAATAAAATGTTTCTATTGAGAACCACTCACTCAGAGAATAA--ATCAAGATCACAAA-TTTTAGAGCTAGAAGAGGtcttacagataaagaaaaattaaggaacagagaagcttaatgacttcctcTATTTATTTTCT-CCTTTCCTATAGTGCCGTCACCTTCTACTCATTCCCTAATCCAATTCTTGCACGTCAACTGGAACTGATAAGTTTTGAATAGTGAGTTGTAAGTATCAAAGAGGCTGCA-AGCCTC--AATTCAGAGAAAAATTTAGGAAATGATCACCTTCTGAAAGTGATGCTAGGAAAAAAAA---TCAGTATATGGTAGATAAAATTAGCCATCTGTATAAGTAACTCACCCTTGGACTTGGCTTTGAATTTATTACTTTTGTGATCAAGGTGCTTTCCAAGATTCCATCAAGTCACATGGATATAGTCTCAGGAAGACAATCTTCAAATGCGGAGGTACTGTGGAGT-ATAAGTAGTAGACAGTATTGTCTAAAAAAGATGCAAGAATTTTAGCTGTTTAGTTGTTTGATGAG-TTATAGCAGAGA s canFam2.chr15 29647567 575 - 67211953 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s canFam2.chr26 35925320 1089 - 42029645 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GAgtagctaatagtgtcccattttacagttgaggaaacagtggctcagagagaggggaagttatttgactgaagacatactgcttggaggagaccagagtaggatggaactcagatctctgtctcacaatcccaactgctTAACTTCACACCCTATGACAGAAAAAGGACTTAG----------GGCAGGCAGTGAGCTCTCAGTAAATTGTCATGGTTGTTATCGGTAATAATGAACCATTTTTAAATCAGACAGGATTATCAGAGCTGGCATTAATTATTCAGCACAACCTGGGGAGAGCACCTTGCAGTATGCCCTGTATTTAAATTAAGAAGAAGAAAACAGATGACTGAGTGGATCAACCTTTTCCAAAATCTGACTCTAATTATACCCCGAGGGAGTGCCCTAAATCTGCAAACACTGGAAA-ATTGCACCACTGTGACTCAGGAATATATGTTATGCAATCTCTTTTCACCAGGCTCAGGGTTCAGGGTTAGGAAATAATGCCCttatt-gagcatagaaattgtaccgg s canFam2.chr26 28878442 480 - 42029645 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tggcagaAATGATGTGCCTA----TTAACCACTATGCAGGGGGCAAAATCGGGACAGCTATGTGCCAGGTCTCTCCAACCCCTAAGAAAGTTTAAGAAACACTGCATTTAACTTTTTTTTA-ATATCAGTTAGAGAT-GGGAAGGGTGGTGGGATACCACTAACACTTTGCCTTCTACATGGTTGTATTTATTCTA---TTTCAACAAGCATACATTGTCTTTTACAGT s canFam2.chr26 28880403 228 - 42029645 TGGCAGACAGGGTGTGCCTGACTGTTGGCCACTCTGCAGGGGGCAGGAACAGGGCAGGTAAATCCCAAATCTCCCCAACTCCTAGGAAAGTTT-GGAAACGCTGCATTTAAATTTTCAAAACATACCAGAAGGAGGCAGGGAAGGATGACGGGACATTACTAATAGTTTTCTTTATACCTGATTGTATTTATTATGCATTTCCAACAAGAATAAATTTACTTTTGCAAT a score=5039 s panTro2.chr12_random 1008177 86 + 2259969 TAAAATTTTTAAGTCCCAAAGAACATCCAAAAAATCAGGTGAGCAAGTTGAAA-AATATTCCAAGCTATAACTAACCCATTTATTCG s canFam2.chr26 28880889 87 - 42029645 taaaatCTTTAAGTTCTAAAAAATACCCAAAAAACCAGGTGAGCAGGTTGCCATGATATCCCAAGCTCTAAATAGTCCATTCATTTG a score=6423 s panTro2.chr12_random 1008275 134 + 2259969 TAAACCAAATTCCTACAAATCAAATTGCAATCAGTAGCCTGTGCCCAGGGCAGGGTCA-ATACAAACCCTGGACAACTTGACAGTAGAGG-TCTCACCTC-AATTTATAAATACTAAATGTAACCACATAAAATATA s canFam2.chr26 28880976 137 - 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CTGGCTCCCCTTCACTGTTGCTTCTCTCAATGAATGATATCACCAGTTACCTCAACATGAGGTTTAGGATTGACTTCTCATAAGTCAATCTCCCTTAACCTCTTGTCTAACTCCCTACAAAATCCTATACATTTATTCTCCTAAGTACCTCTCAAACCCCTGCCTTCAATCCAAGCTGTGGCTGTCTCTATCCAGGAATGTCGTAATATCCTCTTAACCTGCTCCCCCCCACACCCCATTTTTTTTTTTTGATctcccacttctggagacagcatccaaggttttctttggggattgtccctttccttttctcagaccctgtggttcgggtgggattgcctgtgccattcgactctagaag--tgaacaagtcattcaggcctgactatgagtatgtcttcttctttggctgtaaggattgtttcatggatggatctatgattgttccaagttggatgttccatgttccatgttccaacatggatggatccaagttgttcatcaagtgccagttctgggatagttgctg--actaatgggggttggggggagttctccctctgctaggg-gataatacatgaatattgtttttactct--------aggttgccggctgctatttcacccccaagagaggagattccgcctaaaaa--agccaatgtaatagacaagctgtgcctgtggtgccaagagttacattcctgaaaatgaggttaagtacccagatcccactataccggagcctctgctgttggccgtgctatatggttttgggaccaacaagctctcttttcccttaaaccagtgtaagtgggaactttgttaa----aactgaaagaatcttgcataatacCATTctttgatcttccctgcctattccagccagagttatcatctcagaatgttcatctgatcatctcaaccaccccatttctcc----agtttatcgcatatagattagcaatagaccaaactca---agaggactctcag-gttctgcatgtctgactcctagctacctctctagcattacatctttgtggaggtatcgtcaagtccctgctgtctccactccaaccacctaagggatctttaccagccactttgtcatcaagtgttccctcttgccaaaggaactttccacattc-----tctctgcattg---ctcttccttcCTCCACTTCACCTT-----------CCAATCTTTTAGATGCCAGCTCAGACATTAATTTGA----AGTTTCCCTTGAACTCTTTCACAGTATCATGTCCTCTGATTCTAAGATCTCAAA 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s canFam2.chr27 12742129 1881 + 48908698 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s canFam2.chr15 32563592 1092 - 67211953 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canFam2.chr27 34800022 906 + 48908698 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a score=13001 s panTro2.chr12_random 1063571 376 + 2259969 GCCAGGGTTCTTATCAAAGGGTTCTCATCTCTTCCTGAAGCACCAAGCCATTACCTACTA-AGCATCAGTACTTGGCTGTTCTCTTCAAACCCAGTATGTCCAAAATCAAAGACACC-----ACAGAACTAAGCTCCCCCACGTTTCTCCAAATCCACTTCTTTCCTGGCGTTCCCATTCTCGGTGAGTGATATCCACACCACTCAACTGCCCAGGCCTGACAACTGAGATT---------------------CAGGCACCCAGGCCTGTGGCTTCTCCTCCTCACTCTCACCTGGTGCTCCCTCTCCTCTTTATTGCACCTGGCATTTACTTAATTTAAGCTTCCATCTCTCTTCCTCTGGATTACTGCAGTTGCCTCTTTACTGGCCTTCCTATCTTTAGT s canFam2.chr15 24598594 371 - 67211953 GCTAGGGTTCCTCTCACAG-------------TTCTG-------------CTGCCTACCAGGGCATTGGTACCTGGCCCTTCTCTTCAAAGTTGTTATGTCCAAAAtcaaaaataaccacgtacacaactaaact-cctcatcttcttccaaatccgtccctttcttggtctcccccttctcagtgactaatatcctcacc---cagctgccctggcctgacacctGACACTCGGCCGTCTCTCTAACTCAGGCAGGTGCCAAGTCCTAGGACTTGACCTGCT--GCCTTATTGGGTGCTCCCTCTCCTCTTCACAACACCTGGAATTGACTTAGTTTAAATCCTTATTTCTTTTCATCTGGATTCTGGCAACTGCCTGCCCGCCAATCCTTCTATCTTCAGT a score=23369 s panTro2.chr12_random 1064312 679 + 2259969 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TGTCCCTTGCTT-TCAGAACCTACTCACCTGTTCCCCTGTTCAAAGACTCACCCACAATCCTCCGGGCTCCCTCCACTCCCCTCCctgggagacgggagcctgggttccattcctacctctgtcactaattgtttt-aacactcccttagcctatttggactacagtttcctcatttgtTACATTAATATGGTTCAACTTTAAAATAACAAAGTTCCATACAAATTTTATAGAAAAATG-----TGTGTGGAGCTTTAAAAATGACCAAGTCCCTTTCACTTAATCATCACAGAAAACATTAGCAGTAACATTAACACAATATTTTTAATAAGTGACCTAAGTAGTAATATTAGATAATatcagaaaactaaggcctgagaaaggtcaggagacagatccaaggttacatggagaggagagaatatgaccagacttgaacccattcctctgatgcccaACAC--CACACAGACCCCTGAAATAGAAGGACCACAGTTAGGGTCCCAC-TCAGAGCCCCATAGCCCTTCCTCTGGGTATAACACAGTTCCATGGTCAACATTCATCTCCTTTCAGCTCACCAGTTTAACCCATCAGTTTGACTCCCAACCCAAGCTAGGTGACTAAGGGGAATACATACAACATAAGAGAGAAAACTAGGGTCCGTCCTAAGCAAAATTGGTGAGTGGAAACAGTTTTCCTT-TGTGAGTCTTCC-ATCTTTTGTCCACAATTCCATGT-------CTATTCTTTTGGAATCTAAC a score=6413 s panTro2.chr12_random 1065175 188 + 2259969 ACCTTTCTTGTCTTAATACTGTTCTAGTCCATCCAAaacaacaacaacaacaacagcaacaacaTTTCAATCAAAGAAACATACA--ATACCGCCTCCCCACCTCCTGCAATAAAACAAGTGCTGACACCCACCCTTCCACAAAAGAG-------AAAGGGAC-CCTTTCACCCGACATGAGGGTTTCTTTCACTTCt s canFam2.chr27 11645726 178 - 48908698 ACCTTCATGGTTTTAGTATGATCCTGGCTCCTCCAAA--------------------GAAAATGTTCCAATCAAAAAGCTGTATAGTATATTCCCTTCCCGCCTCCTACAATAAAACAAGTGCTGACACCCACCACTCCACAAAAGGGTAAAGAAAGAAGGACACCTCTTGCTTGACATATATATTTCCTTCATTACT a score=10340 s panTro2.chr12_random 1065699 256 + 2259969 TTTCACATAGTTCTCGCCCTTAGTCCTGTGCTGCCCTGTCTACCTTGGGGCAAAATTTTTCCATCTGCCCCAAGCGCTGTATTCTTATAACCATCCTGACTCTTTATTTATTGTATGTCCTGGATGCCAGCAAGGCCCCCCTCTACACACACACTCAAGAAGGTTAAGGCAAGAGGAAGAAACAAAAAGAGGGACAATTTACTGCCCTTTACATAGCACTTTGTCCTAACAATACCCTTCTAAAGCCctcactgaa s canFam2.chr27 11645904 238 - 48908698 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s canFam2.chr10 36222143 1653 + 72488556 aatagtaaaaatagaaaaaaaaataCCTCTTGATTATTGAGTCATGAT---ATTTTCTTCTAATCTTAAAGAGAAAATTTTAAAAAGTTAATTGTTCGGATTATAAAGAACATATTCTAGTTTCCTATAAAATGACAAATAGTAGTGACATATATGTATTTGCTAGTCCAAATCATAATGCAGAGAAACAGCAATGAGGAACAAATAACTATAGTATGTTACAAATAAGGTAATGCA-CCCTGTGCGCCAATCAAACATATTAACAGTCCTTTAAAACTATGCATCGGATA----ACTGTATAGTGG-TTGGTAAACCAGCATTCTTTACCATGAGCTACAC----------ACTTGAGCAAGAAACTAGCTATGAGGCTGCTGTCATTCATGCCTGTTA-TCAGAAAGA---CATTAGCCCCACAATTACTACTTGTTGAAG--TAGAAAAGGGGGCCTCATTTCATTTAATTATACAATACACAGTTGTTTTTCCTCTAATCATCAGACTGCT-----ATCATACATCACAGGAATATATTATAAGAATTTACCTTTATGTTCTACAAAAACTCCATAAACTTACTGAAACACTTGCTTTCACTGTCATACCGACTGTCACTGAAATTAACAGTAAGTTTAAATTATCCATGGAAAAAAACTTTATAAATCCATGGAACATAACCACAAATAGAAGCTAAATTTTGCTCTGGAACTACTCTCATCATGTAGGTGGCAATTTCAACAAATGACTACAATGAACAGATAATGGTTTTTCTACATGGCTAACTGCAACTGAATAATATGTAGGTTGAGTCAGGCAAGCTGAAATATAAATTTCATATTTTTTTCACAAAACA-AAATGATAAATACTTAGGGAAAGTAAATATCACA--ACTTTACTTACTTTTGCGTACAGTCTTTGTTTGATTAGATATCATATTGACAGCTTCAGATGGCAGACCTACATATACCCCTCCGTAGTTTCTTAATGAAAAGAAGCAGATATAGAAAATTCAGACCAATCTCAATGATACTCTATATTTGCCAAGAGTGATAGAAGCATGGAATACAGCCAACAATTATAGAACTATTTAAACAACTCATGACTTCTCAAAAGTAGGGTCTGAAATATTATTGCACTTAAAAATAAAATT--TTTTCTATGTTAAAAAGAAGCTCTATAT-------GAAAAAAGAAAGCTATGTTGAGTTAGTAGAAGTTTTAGATATTTAACTTGGGATGAGGAAGAAGAAAAGAAATTGGTATTTTTATAACTGAGTACAGTAATAAATATCCATAGAATAACATGTTAATCAGTCAACATACATCAAGAATTCAGAGTGGTGAACAGAG-----TAGTAGGTGCTATGCA---------ACATTTCCCTAG-AGGTAGATACAAACATAAAAGGAGGGGAGAAAGAGCCAACAAGTCATGAGATTAGAGTGCAGTCAACCAGAGGAG------------------AGGGAGAATGAAGGAAGGAAATCCA-TTAGGGAGAATAGCACATCCAAGAACCATAGGACAGAAAACAGTGCAGGCCATGTGCACAGGACAAAACCCAAGCTTGCTTGAA---AGCAAAGATTATGAATCCTGAGCAAGTTCTTTTTCAGATCACATGCTCCTA-CCTGTATTCCATGCACCAGAAGTTTTCTGGGTGTAATCTGTGTTATTGGTGATGTACCACACGGTGTTAA 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s canFam2.chr10 7441839 1217 + 72488556 acacattcacacaattttgggACTACTGCAGATTTTGGCGGGAGGGGGGGCTGTGGTGAGTAATTCAAAAGGTTAATTTGAATTGCATAGGAAAGACAACACCTAAAGAGGACAAAAAAAATAAAATAAAAGTGTTCTGGTTTGTTAGCTTCCAAACAGATATTTTTATATGGAAAGGGTACATTTTTGAAGAACTGCGAGGGAGTTATGTGCAAAAATTCTGTTCATGTATAACAAGATTTGTTCTAATACCTCCTACACACCACTTTTAAAACGCACCCCTCTCCACTTTATAGACTGTTGTCTTGGGAGGGACGGTGACTTGGTATGAGGTGG-TATTTGTAGAACAAAAACCTTGCTACCAACAAAAG-CCTTAATAAAAACAGGAATTTTAAAATGAT---------gataaata--------------gataaatcgataaataggt---------agataga-----ACTTTATAG-TTGCTTCGAAACAAATAAACATAAAAACTAACACCAAGTGAAGATTACAGATTTGATGAGGTGTGAAAAGAATACTGTTCACAAGGCAATTCTCTGTTCACAACTCCTGTTTTCCTAAATCCCTCTATGATATTATATTGGCATGAGGTCTGATATATAGTGTTAAAGAATACCTGTGCAATAAGGGGAGCATGAGTCTTTGCCTAAGAAAAAGAAATTCTTTAACTTTAGTATATGCCCAA-CATTCCTTTTTACAAAAGAGTAATGATGTCAAGG------TTTTTGTGGAAGAGCCTCTGGTCAAAGCCAAAGGACATTTGATAGTTAAATCCAAAGAGG---CAGGAAGTGAATGAAGACAAACAAGAGGAAATGATTATTTGATTGTGGCTGAAAGAGTGGAGCACACAAAGCCATGCAGATTAGCAAACCAAAAGTGCCAGCATTCCTTCTGAGCAGTAATTTCCTGAGAACAAAAAGGCATTAACTCCGTACCCTCAGTGCACAATGCCTACTAATTGCAAGTGATAAAAGTAAGCCTCCTGCTTCTAATCCCAAAACCTCCTACCATATTTCTGTGAATACCATTTGTGAATTTGTTCCCTCTATTTCCCCTATGATAAAAGCACTCCTGGAGGTGGCATAGCTGTTTGGTATGCTTCTGTATTTAAAAATAGACAGATCCAATCAATACAAGGAACAGATGAATT--AGAAAACTTTTGTAAGTGTAAAGATTTATTTACATCATAACTTGTTGCCCAGTAATTTAaaattatgca a score=3007 s panTro2.chr12_random 1070947 64 + 2259969 CCCAT--AGAGACTTTTATTTAAAAAAG----TCTATAATTAAACACCTAAGAAGATACCAATATATGCT s canFam2.chr10 7443594 70 + 72488556 CCCATGGAGAGACCTTTTTTTGAAATAAAAGCTTTATGATTAAATACCTGATAAAATGCCATTATATGCT a score=5428 s panTro2.chr12_random 1071241 171 + 2259969 TGTTTACAAATAT-GAATCTGNTCACTCATAATCTGATATACTTTCNAGTGAAAATTTACAGT-------------GTCTGNCACATTTTGGTAAATTCATTTGAAGTACTTTATAGTTTGTGNNTTGTTGCAAATGGCAT-TTTAAAAATTACTTTTTCTTCAGGTACGTAGGATAGGATAGTAC s canFam2.chr27 10229246 183 + 48908698 tgtttacaaatattggaccttcttgttcacaatcacatatattcttcagtaatattttagagttttctctgaaagggttttgcacatcttgataaatttatttaga-tattttatagctttgttaccgttatgactggtatgtttttcaattgcttttt--gcaggtgtataggaaAGGGTAGTCC a score=24291 s panTro2.chr12_random 1071412 624 + 2259969 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CTTTTAAATTATTTTTTTCAAAAAAGAAGTTTCTTATGCAAGAAAGACTTCCTCTTTTCAATGCTGGGAAAATGTCTTTGAAGCTTTAAAATGTCTTTAAAGCTTTAAAAGAGTGAGCAGAAGTGCCTATAAGCATTT---------TTTTTAATCAAGAAGTCAGGTCTACCTTCACCAACCAATGTTTGCAGTAATGCTGGGAGTTACCTGTCATTCTAGTTGTTTTCTTTCTTTCTTTTCTTTTTTCTAGTTGTTTTCAGTGCAGATTCTGCTGCCCCTCTTATCTCCCTTATGAAGGAGTTCTGCTATGTAAATCAAATGAGGTCAAAGAGATATTCATCTTGAATATGTTACCTTAAGGAAAGGTAGATAGGGCAtttttgttttattttttattttttattttttgtttgtttgttcttAAGGATAAACCAGTAAATATGAATTGGAAACTTTTTGTGTGAGACATAGTTGCTGCAAAGCATGTAAAAATGTATCAAATGTTTCCCTTGCCCTCAAGGAGCTCACATTGTAATTAGCACTGGATGTGTTCTCAAGAAGCTCATTGGCCACAAATTCAGCA----AATTTTAAGACCTCAGA-TCACTGAAAGAGCACTCTACCCCAGAAacacatagtgctttatttaatccttataaaaccccattg--ggggacgtttttactctccccattttagagatTAATCTTCTGAGTATAGGAGTATGCAGTAAATAATCTgactggccctt a score=24173 s panTro2.chr12_random 1072333 453 + 2259969 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AACAACTTGTTGGATCTAATGGTATTCTACCATTGCAAGGCTCCTAGAGATTTTATACCTTGCATGTTAATTAGTTCAAGCATCAATATCAAAACTCAATGTTGTCATTTCT---CCCCTGTTGGCACTCTGGTTAGTCTCTTTAAGACAGACATTTTTCTGATAGTCTGTACCTGTCTAAACT-GCTCATTGACACATTTCCTTGAAATGTGGGAAAGTTAGCCAAGTCACAGTTGCACATTAGTTAAGACAAATATAGGTTTTATAACTGCTTCCTCCTCTCTAATACTCCCCAAGTTCAAAGACTTTCTTTTAATCTCAAAACCACCTACTGACCAGTCTCCTTGCTAATCTCTCTTATTCTTTATTCTCTGTACTCTCTAACATAAGAACTAGCTTTCTT--------------------------------------------------ATGTT------AGAAGTATTTTGATATTGCTGTATTTTCAAATGCATTTG-ATATTGTTTGCATGATACTTTCCTGGGAAAAGGCTAATTGGAACACCAGAAATGAGTAGAGGATGCTGCCTGAGCATTTTATAGCTCAGCATGTTCTAGTTCATTCTGTTCTCCTACTGAGGTAAAATCCCAGAAATTCAGGGGCATGTTCAATGCTTCACAAGCTTTCAAAAGAGAATTTATGCCAATTGTTCACGAGTGAGTTAGAGAAGATCTGCAATAGGAGGCCCCGTAAGAAACTGGGTCCAAGTGCTGTCCTAGAT--------CATCTGAAGAGCCGAACCTCTTTTGAAAGATGGGA------------------------------CTAAAGTCAG--------------GGAAGT---TGATCTCTAGCTCCTAAACCATTTCTTC------------------ATCTCTAGTAGGGATGAAAGAGAAACCTGTAAGGTTAGTGTCAGGTAGGCTGATGGTAAACAGCCTGCCTGTCCTTGAAGATTGAATAAAAGTGCCTCAGCCAAGTGGTTAAGGGCAAGAGGACTGAGTGGGCTACTGTCATTGAAGAGCTGAAGCATAACTTCATATTGAGTCTTAGGGTAAAACCTG-AGGGAGTTGAGGCAATTCCTGTCAGATACTGAGatctccagaaatatgaccttatttggaaatagggtttttgcagatataattaattaagacggggtcatactagattagggtgggccctaaatccagggactggtatatttatagaaggCCACTTGAACCTACCGAGAC s canFam2.chr10 5468623 1242 + 72488556 AAAAGCTTGTTGGATCTAGTGGTATTCTACTGTCACAAGCCACCCAGAGATTTCATATTTTGCATGTTACTTACCTTAAGTCTCACTATCAAAACTCTATGTTGTCACTCCTGCCCCCTTACTGGCACTCTACTTGGTCCCTTTCAGACAGATGTTCTTCTAATAGTCCTTACATGTCTAAACCAGTTCAATGACACACTTCCTACATAT-TGGGAAATTTGGGAAAGTCATAATAGCACATCAGTTAAACTGAATAGAGATCTCATGAT------CACCCCTTCATTCCTTTCTTAGTTCACAAAGTTTCTTCAGATCTCATGATGACCAACTGACTAGTCTCTT---------CTCCCATCCTTGAGTTCTTGTACTTGCTACTGTAAGAACTAGCTTTCTCCAGCAAAGTTCTAGCCAGAAATCTTTTTTTTTTCTAACCAGAAATCTTTAATGGTGCTGAGAAAAATTTTTAAATATTGTTGTATTTTTAAATGTATTTTCATATTGTTTGCATCATA-TTTCCTGGTAGAAGGCTAATCAGGACACCAGAAATATGAAGAGGAGATAGCCTGAGCATTTCTTAGCTCAATATATTCTAGTTTTATCTGTTCTTCTAATGAAGTAGAATCCCAGATATTTAAGGGTATGCTCAACAGTTTACAAGCTTTCCAAAGAGAATTTATGCCAATCTTTGATAAGGTAGTTTAAAAAAATCCACAATAGGAGGCCCCATAAGAAACTATATTCAAGTGCTGTCCTAGAGCAGAACAACATGTAAAGAAGTGCACCTTTTTTGAAGAATGGAAACAATTTTTGAATCTCTGTGGTGGACATGCCTCAAGTAAGTAAATAAAGCTAATAAAAGTAAATGATTTAAGGGCCAAAAGTCAACTTTCCTTGGCTAAGATCAAAGAAATCTCTAGTGGTGATGAAGGAGAAATTGGTAAATTTAGTGTCAGGT---------------AGTCTGCCTGTCCTTGGAG-----CTAGAGGTGCTTCACTGAGAGGATCAGGGATAGAAGGCCTGAGTGGGCCAAGATCATTTCAGAGCTGAAGTATAGCTTGACATAGGGGCCAAGGGTAAAGTCGGAAGAAAATTGAGGTAAATCCTACCAGAGAC--AGATCTCCAGAaatgcgaccttatttgcaagtagagtctttgcagatgtaattgattaagatgagattatgctagattggaataggccttaaacccaatgacaagtgttgctacagaaagccatgtgaacacacagagac 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ttagtggacagctcattaattttcatgacattttttattgctgaacagctctcattTAAAACACAATATAACAAAACCATC-AAT-TTTTAATTTTTTTCCAAAACATATTTCCCTATCAT--------------------TTTTCTAA-ATCTATCTATTTATCTATC--CCTATAAGTATATA----------CAGATATCTGTAT-------------------CTGTGTTAATGTA--GCCATGTCTATTTATTTGTATCTATATCT-----------------TCATCTAATAGAACTGTGAAATTATCAGATTA-CACACAGGAATATTTATACACCAAAGAGGAAGGCAAAAATCTTACATCCAATAAGTGAATATTTGACTGGATGAGTGACACTTGAGATAATTGATGAATTAGATTTTGACAGGCTTATGGCAGCTACTTGGTAAGGTTCTCACTGTTTAACTGTGGTGGATCACAGAACTT-GCTGAAAATAATATTGGCAAGAAAACTA------GTACTCATATGATCTTAAAATCTGCAAGAACATAATAGTAAAATCAATGATTTCTGTTAAGGAGGAACGTTCTGTGTGTGGTATGGTCCCAGAGACTCTGGGCTGATTCTACCTGTTAACAGAGCCTATGTTTCCATATTGTCTGGGTGTCTTCCAGGTTAAATTGGCTGAGCCTGAGCTATATTAGTGGTTCTATAGTAGCAAAATTGCATCTGGAGACCATACGCACACTTTCTTTCTTACCAATTTTCACTTGGTTCTATTTATTGAACTTATAGAAGTGCTGAGTGAGTCATGGCAAGCTGCCTGTCAAGTGAAAGGTGCCATCCAGCCTGGCTGAAGTCAGGAAAGGGACTCCACATCTTTGTAC-TAAGTGGCTGGTAGACAACAGCTTTGCAATTTCACAATTGCATATGTAAGCAATAAAATCACTTTTATTAGATGTACAAAATTTTAGTTGTTAGAGATTCTTTGTCATTTTATTTAATAAGAGAATGCTTTCCATCCAACCTTCCATTGAGATGTCCACTCAGTC--TCTGAATGTTTCCTATACAAGGCTACATAAGTCAAACACTTCCATTGCTTAGCTGTTCAAATTGTTGGCTCCTTCttaaatttt-aattctagatttaaaaaaaaaaaaaaaGCAGAGAAAAACTAGCCTATCTGCCAAA--GTTAGAAAGAGGA----------------------ATAACAT-TGTGGGCTCTAGATACAGGCAACTTAAAAAAAAAAATCAAATAAGAAGTCGTATGGAATAAACTTATAGCAACTTTCAACCATTATCTTGTCTTTGTAAAACACTGCAT------GTTTTTGAAAATAACACTTT---CAATCTTTTTACCTGGTATCTGTCCTTTGCATTTCCCAAGCATTGAACTCAATTCTTTACTCTAAACAaatgactctcaattga------ggggcagttttgttgctcagggaacatttggcaatacctggagatatttttggttgccataactaaagatgatgagtgctactggcatccagtgggtagaggccaggg-----------atgctgatgaatgtcttacaat----aaacag-catggccctacaaaaaaataattt-cctgtctcaaactgtcaattgtttcaaggttgagaaacAGTGATGGAAGGTAACACAAAATTAATGTAATTATTTTAACATAT---ATACTTTTAA-TAGAAGTC--ATTATTTTCTACATTTATGAGAGTGTAT-TAAGAAACAG---GAAAATAACTCAAGGAGTgtcacacgtctagaaa-acatgtcccagttgaacttagatttccct-gattcatagccaatgctttatctgcttcacTTACTGGCATATAATACAATGCTTGCTTCTCATGACAAAGCTAAAATGAATTCAGGACTAGTCCAGTCAGGACTAGATCATGACTCTCATTGTTGGTAATTGGTTCCAAGACA--TAACCAAAACCAGAAGAATTTTGGAAAGCCCTTTACCGTGTTTTTACCTCTTTAGCTATAGTATATCTATCTAAATGTCC---TACCTATAATAATTATTCCAAAAATAATTGAATATTTTCT-TGCTTAGAAATTAATAGGTTGTCTGTCAAGGACTTCT---GCATATCTTCCCTCTCTTTTAGGTGGGAAGCGGGAAATGAAGAGTGGAAACTAGAGTCCT--TATAGTTTACATAAGTCAGTGTCTAGCAAATGTTCA-----TTCCTTAAGTATTAATGTACCATTCCT-TTATACATGTATATAATAGATCATTTGATATAAGTTTGCATAAGAAGGAGAAAACAATTCTACA-GGTTTATGGTCAA 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ctaatgtacaacatgcagactaaagttaataaaattatattgcaAAAGGTGGAGATTTTAA-GGGATTTCTTTTCCATAACCTTTTCATATTTTTTT-TTGTGTTCCTAGGTATgagcatctggttcaccctcctgttttataaattgataaactgaagtctagaaaATTTA--GTTTATACTTCTGGACTTTCCTTTTTTCATGTTACTCtttaaaattattttt-----------aaatatatGACTATACTTTCGCTTTGAAATATTCAAATAAGTCAGAGGCATTAACATAGAAAGTTAACAGTTCCTGTTTCAACCTTTTCTCATCCTACTCTCCCGAAGTAGTCTTTGTTAATACCTTAAAGTATCCTCCCAGAATTTGTTCTGTATATTTCACAGAGAT----AGAAACTTT-GTGAAAGTGTAAATGTCAGCATACTATATATACATGATGATTTTTCTGTGTGCATTGTCTGTTTCCCCGTCCATTTAATCTGCCTCATCCTTT---AACTCCAGAATAGTATCCCCCAAAGAATGGATATCCCAGGATATATTTGATAATTTTCCTATTTGTGAATATTTAGATGCATACcctccctttcctcctccccttctccttctcctccttctcctTCCTCTAAAattataaataatactgctgtgaatattcttatgcatatttttgtac----------atatatctgtaggCTTTAAAATTTTTCATCTCTGTACAAACAGTATAGAATTATCTCCCACCCTTTCTCAGCTCATCCTATCCCCATGTAAGCTTCTGTTTATATGCTGGTCTGATGCTTAACAGCTATTTCAGTAAAGGCCATTTTACTTAGGTTTTTGAAATCAAAACTTCCTTGGTGATTTTAATTACTTA-AAAGACTGTTTCCTG---ACATAAGTCCATATCACAGTTGATTAACATAACACATCCGAGAGAGGCAGTAAAAGTAATGTGGAACCTTtatattgtagtggctaagagcgcagttttctgttgtcagactccttgggtttca 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s canFam2.chr27 18847019 1282 + 48908698 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CTGGCCCCCGACCCCACAGGTTGGCCAACTCGCCTTTCCTTGGCAAGGTCATCCACTCCCCTTGTTG--GTCAAAGCTTTTCTTCATCGGTTATTGACTTTATTTCCCTCACATGCTGCCAGA---CTTAATCCACAGCTGTTTTTTGATCCTGCACCAAGCTGCTACTTCCTGGACGCTGCCAAATGCCCTGTCGTTCCtctcattaccacc-tcttgcttttaaatgccacctatatgctaacagctcctaaattaaggttttcagcacc-aacctct-ccactgaaccccacactcatctatctgcctgccttgtcagcacctccacttaggtatctaagagccatgtcacact-gtttcctaaaaccaacccaaacgtgctcttcataccatgtccctttctcagtgatgggcagccctaaacttga------tagtcctccttgcttcctctcttcctctcacatgcaggcatccagcccacctgctcagctttttgactctacctttggatagatccagacgcctaccacttctcacacaccggctcttaccaatccggtccaatccagca----ctttttgctggattattgcaattatttccctactaggcttcctgcttccacccaaacccttctagaattattctcccagtctgtcatcagagtggtccttttaaaagtcaagttatgtcactcttttgatcaaaactctcaaatggcttcctatctcactcagagtcaaaacagaattcttttcaagaatcg----------------------acaagttctctccttatctgccccacaactccatctttctttgattatgtcccgcaccaacgccacccctagtcactatgattccgcaaa-ctggtttccttgttgctccctacacaccccaggtgcatgcatgttctcactcgctgggatgctgttccctgcctgttggtgtagctcattcccacacttcctttgggtgacttttatcagaggagcccaccctaaactctgaggtagtacagcaactccagccgactgcccactaccatgcttctgagccccttataccgtgtcctttttgcctataacccttctt-ctatatgacatacatttattttctgattcctttattagaatataagccctgtgagggctggagctttgttctgttaggcttcctagcattccaaacagtgtctgccacatagCTTCATGTGtgaacgaacgaatgaatgaatgaatgaatgaaCAGATGAGCATTCCAAGGGTGGGAGAAGCTCTTCTCTCCATTAGAATTACAATTCTTATAAAGCTTTCAAAAGGGTCTCCTTGCTCTCTTAGTTCT---CCCTGCCTTGCA-AAAGAGTTG--ACTGTCTCCCAGATTGCCACGCCTTGGAAAGTTCCTCTCAAAGACAATAAACCAACATGCTAGGATGGAGTCAGAGTTCCTCAACT-------------TTGAATTCCTGGCCTTTGAAGGATGCTGCCCAAGAAGCTGAAGGAGTTCATCGTTTGAGTCTTCACCCCACTGCTCGGATGCCCAGATTTCGCTCACCATCCTCTTCCTTTCTCTCCTTGGCCAATCGT-AGTGTCTTTGTGGTGATAA-AGCTCCCAACCAGCCCAAATCTCCTGCCTCAGGC 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+ 2259969 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s canFam2.chr27 40928495 1056 - 48908698 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a score=4342 s panTro2.chr12_random 1146413 95 + 2259969 AATAACAATTCCagctaaaa---tgtatcgagtatctgctctctgcctggcattgttctaagtcccttttatgtagtatctcatttaata---------------tctcatgt s canFam2.chr27 23237949 113 - 48908698 aATAGTAATTGCAGCTAAAaaaatgtatggagggcctgctatctgcctggcactgtccaaagttccttgcatgtataatctcattcaatactcaTTAAGCATAGTTCTCTTTT a score=13561 s panTro2.chr12_random 1146508 346 + 2259969 attaagtaatattcctatctttatctgacagatgagagaggctaaatgacttcggggtggcagagcattcctgctgcagagccaattcctggaactgccACCACCATGCCACACATTGCTCATTATTTCAGAGCACCTGAT--------GGTACATGACA--CAGCCTTGTGGAGCTAGACTGTATCCTCAGGGGAATGAGACTGGTAACACAATTCTAAAATAGCTATAAAATTCAATGTCTTTTatagggtatttttagtgtggtgaaattattctgcatgatactgtaatgatggagataggacattatgcatttctcaaaacccatacaaccatacagcacaaaaagtgaac s canFam2.chr27 23238260 333 - 48908698 ATtaagtacagttcttatccccattt-acagatgagaatggctgaaagactcagcagtggtAGAGCA-----------GGGCCAATTTACTTGACTGTCT------TGCTTCA--TGACTCATTATTTCAGAGCACTTCATTATTTCAGAGCACACAACATACACCCTTATGGAACTAGACTGTGTTCCAAGGGGAACAAGGCTGGGAACACACTTCTAAAATAGCCACACGGT-CACTGTCTCTcacgggggatttttaggactgtgaaagtatcctgtataatactgca-tggtggatacatgacattaagcactcctcaaa-cccataaaaccatgcaacatagaaagtgaac a score=34966 s panTro2.chr12_random 1147081 666 + 2259969 actaagtcactagtggactttagttaataatcatgtatcaatattagtttatcaatggtaacaaatgtactatgccattgtgatacattaataataaaggaatctggcaagaaggttggggtgagaggagaataaatagagacgctctgtaccttctgctcaatttttctataaatgtaaaacagctctaaaaaagaaagtctattaatttAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTAAGTCAATAGCTCGTTCAGATAGACCCAACTAACAAAGATGAAACTAGCAACGTGAAAATATTTTCATCTTGGAAATCTCCAAACTTTGGTCACTGAGCATTTGTATTTTGCCAGCTGCCTTGCGTTATCTGAAGTGGCAGGAAAATAGTGACAAAAAAACTCAGGCACTTAAAGGGTGCCCTGGGGATGTGTGTGGCTTTTTCT-CCTTCCATATCTTCCCCTGCAGTGACCTCAGCAGCGGGGCAGAACCAGGACAGACAGAGTAAAGTGTGTGTAATTCTCATCCATT-CTGGGCCCTGTGGAATTGGAACTTATGCTTACTGCATTGTCACTTGAACATTAAATCTTAAATGTCAAAATATTCTGCAAAGCAGAGAAAGAATTTCAACATGGTATCCCAAAATCTCTTTTCCATACTCTTCTTGGAAGCTCT s canFam2.chr27 23238593 624 - 48908698 accaagt-----atagactttagctcataatgatgtgttaacgttgattcatcagttgtaacaaacgtaccacactattgcactatgctaataatagaaggat----------------ggggaggaaaaagtacctgggaaatcttcggacctt-tgcttaatttttctgtaaactcaacagagttttaaaaaagaaagtctattaatttAAAATACA----GGTTTTATAAAGTTCATGGCTCTTTCAGATGGACTCAACAAAGTAAG---------------TAAAAATACTTTATTGTTGGAAATCTCCAAACTGTGGTCACTGGGCATTTATATTTCACCAGCTGCCTTACATTATCTGAAGTGGCAGGAAAATAGTGAC--AAAAACTCAGGCACTTAGAGGGTACCCTGGGGATGCATGTGGCTTTTTTTCCCTTCCACATCGTCTCCTGCACCAACCTCAGCAGCTGAGCAGAACAAGGGCAGATAGAATATAGTGTCTGCAATTCCCATCCATTCCTGCGCCCTGTGGAATTTGAATTTATGCTTCCTGCATTGTCACTTGAACATTAAATCTTAAATGTCAGAATATTCCTCAGGGCAGAGGGAGGACTT-ACCAAGATATCCCCAGATCTCTTTTCCATACTCTTTTTGGGAGCTCT a score=43646 s panTro2.chr12_random 1147772 868 + 2259969 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38865626 952 + 67211953 GACAGCTCCTTGGGGAGGTGCACGGGGTGGCACATCCTTCTTCTCACAGCTTTAGCTTCCTGTGAGGCTGTGGAGTCACCTCTGTTTTTTTGGGTCTCTCTGACCTTGGATTATATGGGAAACAGAGGCCAGTGGGTGAAATTGGGAGGCTGAGCTATGATATGTCACTATCCGGCTTAGGGTGGGACACTTTGTCCCCAAAGAGGGAGGGTGACTTCCCACCACACCCAGCCGCAGCACAGCCT---------ACAGCGGCCCGCCCCTTCTCCCCGTCTAACTCTAAAAATATATGCCACGTACGATGGCCCAGTTGCCTTCGGAGGTAATCCAAACCTGGTCAAGGAGCTAACACTCAATTCTTTG----CTGCTTCAGGAAGTCTTAACTCCCTTTAGGATAGCTGGGGTTTGGAGCCTTTTTTGAGGGGGGGTGGGTAGTGGCTGGAAAGTATAAAAGCAGACTTTCAGAGGTTTGCTCCCCTCAACAA---------ACCACCTCACGTTGGTTCCAGCAGCAACTGACTGAAGTCGTGTGCTCACATTGATTTTCACTAATCCAGAAATCTTGTAAATACGATATGTTTCTCTCAAACGTTTCAAACTGGAAGTGGCTCTATCACACTTGCCTAGTCTGACAAAACACCGGGCAGCCTCTGCCAGATCCCGAAGGGAGAAGGCTGTAAGCGAAATTTGGCTCACTCAACATGGTCCTTGAGAAAGACTAAACAAAACAATCACTAACATAACAGGAGAACCTGATGGTAGGACAGATCTTCCTTCCTCTGTAGACTCAGCAGAGTCACCGAATTTCCTACTCACACACAACCTGTTGGGGTCATTCAGATTACTGAAGTGAATGAAACAGGAGAGATTCTATTTCCTCTCAAGTTTTCTCTAGCTGCCCTTGCCCTTTACGGAGGGTCTTTCATGTGTCACT-------TGTCAAATTTCTTCTCAGCCTGgag a score=22856 s panTro2.chr12_random 1149311 512 + 2259969 ATTATGTCCT-ATACGAACCAGTAGAAGaacatagtgactaaaatctcagtattcgtggtgacctaaatttgagttcaagtcacatactacctgtgagacagtgagaaagttatttaaattttctaagcctcagcttcctcatgttaaaataaccttgcagagctattgtgaagtttaaacaagtattttaagtatttatagctctactacacagcaagtgctcagtagatcttaacaattaATATTCTTGTTGATTTAATCGAGTTGTTTGGGAGCCATTAAAAATCATTTTATAAAAAAATCCTTAATCATATGGAGACTAAGGGTGACAAAATAGTGTGTTCATGATGATGCCACATTTGTGCATGCATTTATTCTtac---aaaaaaaac-ccactggaagataatcagcaaaatgtttaaaatgacaacccctaaatgctcaagttctggatggtattaattttttaaattttcttcttttatatatagtcaaaattttccagaataaccag s canFam2.chr27 17823462 495 - 48908698 attatatccCCATATGAGCCagtagtcaa---tagcgactaggatcctagcagtggaattgatacaaatctgagttcaagtcacatactatctgtgtgacaatgagaaagctttttgaagtttttaagcttcaggttcctcatattaaac--agcttgctgagttactgtgaggattaaatgagtacctaaagtatatctagctctactacttggcaagtgctcgatagatcttagcAACAGATATT---GTTGCTTTAATTGAAGTGTTTGTGAGCCATTAAACATCATTTTCTAAAAGAATCTTTAGGCATACTGAGGCATAGGTTTACAAGGTAGTATACATATTAGGATGTCAAATTTGTGCATTCATTCATTCTTGCATTAAAAAAAACACAACAGGAAGATAATGATTAAAATGCTAAAAATTACTACCTTCAAATATTTAAATTCTGGGTGATTTTAATTTTTG--------TCTTATTACCTGTAGACAGAATCT------ATAAACAG a score=24280 s panTro2.chr12_random 1150322 663 + 2259969 acaagttgcagtgcctttgtgcttttcattaccttttggctctttagacagAGCAGCTTTGATACTCAGAAAACTAAAAGTTTAATAATTTAGTAAATGTA-AGTAGTCAAATAATCTCCAGGGGCATAAGACAAGGATCTGTTTCTGCCTTTCTCTATCATTTTTCCTGCTTTCTTAATAAGCACATGTTGCTTGCCTACTCCTGTGGTGAGGAGATGGGATGTTGGAGTTCAGAGATAAATAAGATATAGTTCTTACC--------------ATCAAATGGTTCATCGTTTTAAAGAAAtagcatttgtatag------caatttacaaagcacttt------------ctgtttaattcttatagcaactctgtaaagggtgGAATAGTATGACTATAATGATGATCAATTTATAA-TTAAGACACAAGAGACGTCAGTAATTTATTCCATTATTGGTAAGC-----------CTGGAACA-------------GTGCTATTCCTTGCACTAAACTACCAGTAAATGTATTAGTTAGG--------------------------------------TATATATAACTGTTATACAAGTATCAGTCTCTGGTCTG-TTAGAACCAGCCCAAAGAGCCACCTCTACCTAGTACATGtatgagaactaatctacatttactgctataagttgttgagggcattgtcttctgactcattatcaatgacaccaaatgccatgca------tttttttttcaaaattta s canFam2.chr27 17823957 709 - 48908698 ACAAGT------------------------------------------------AGTTTTGATACTCAGAAACCTGGAATTTTAATCATTTGATGAAACTAGAATAGTCAAATAATCTCCAGGGGTATGAGGC-GGGATTTTGTTCTGCCTTCTCCAGTCTTTTTTTCTATTTTACTAACAAACATATGTTGTTTGCCTACTACCATGGTTAAAAAATGGGATGTTGGAGCTGGAAAATAAACAAGATGAAGTTGTTACTTCATCTTGTTATGAGTCAAAGGGCTCATAATTTCAAAGAAATAACATTTGTATTGCAATTTcaatttacaaagcattttgcacatagacccctgtttaattctcataacaa---tgcaggaggtaggatactata---atagtgatgatcagtatatggtttaaaacacaaaaggtgtaagtaatttattcaattactagtgagctggcccagattctagatcactttattgcaagtctgctattctttcctctaaactacTACTGAATGTCTTAGTCAGGtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgttatatgcatatCAGTATCTGATCTATTTAGAACCTGCTCAAAGAATCCCCTCTATCTGGTTCACCTATGAGAAC--ATACAAatttactactagaagttgttgaagacactgtcttttgactctttgtttactatgtgtaataccatataagctgttggtttttttagaattta a score=9492 s panTro2.chr12_random 1150985 186 + 2259969 gtaatagagaaagttttattttcttccgggaaactatgtgtttcctcctttctaataataaaaattatgcaattgatcatatttgccttgttaatttggcttcccaagaagctcaaagccaa--TAGAATCCATTGTATGGCTAGTAATAGTAGATACATACTAAATATTTGGTGGACGAATGAAAGA s canFam2.chr27 17824871 187 - 48908698 gtactagacaaatttttacattcctagaggaaactatatatctcctcctatctaataacaggaattatggaattaatcatactt-ccctgttgactgggcttcccaagaaacttaaagccaaatttagagcCAGTGTACAATTAGTAATAGTAGGTGTCCACTAAATATCTTGCAGatgaaagaaaga a score=33894 s panTro2.chr12_random 1152819 1027 + 2259969 ATAttctggcagagaaaacaaaaatgcagatgttaaagccttggggtggactaaacttgaacatgtaaacaaacagcaagaaggctggcatggctgcagcagagttagcaaaaggagagtcggataggaggtaggagtagaggcaagggccaaattgtgtacatttttgaggaca-taccaggatgttacattgtatttccaaacacttaggtcaactcattgaaaattttttcactgggggaaaaatgacatgatttgttgctgctgctgctgctgctgctgctgctgcataaaaaggctgtaagtgggacaaaagtagaaaaaggtaagatgatttaggagtctgtggag--aggtccaaatcatagaaaataataatatgggcaaaagtgacaataaaggagacaaaaggggtcatcagactatggatacattttaaagcgacaactaacaaaatt-----------tgtgggcaaagtaagaaagaacaagaacacaaagatgacttctagg-------actgaaaaac--agtatctgatgatgctgtt-actgagatggggatcagtgtgggagcagcaggcttggaggcggccttcaagctcaactgtggtttgttaaatttgtctatacaggtggagatgtttagtagagggttagctatatcatgcatgaactgagaggaaaggcaagactggtgggaaaaa--aattggaactcatGATTTAATAAGTGGAATATTCTAAAAAACAAAAATGCTACCATTCGTAGGAAGAGGAG--AGAATGTGTTTGAAGGTAAGGTGTGAGATACCTTACTTTCTTTGTGTGAAATGGAATGTCCACCAAGAAATTAAATGGCAAGATTTGTGGTAAGCATCCACAACAAATATTTCATAATATTTATT--GAGTTTAAAA------CTATTCACAAATGTG--TCTGGCTAGTTGGACAGATTACCAGATCAACAGCACCCCAAGTTCTCTTACCATGATCAACTCTTAGTAAAGCACAAAAATTTGTACCAATTTTCTACCAATTAATCAGGATTGGTGAC s canFam2.chr15 38847836 983 - 67211953 acattctagctgagagaaca----tgtaaatggaaattccttggggtggaccaagcttgaacatttcaaagaacagcaggaaggccagagtagctgcagcagagttagcaaaaagaaag----gtaagagataaaa-cagaaacgatggccaaat-atgtagaaccttgaggacaattccagaaggttggattttattccaaa-----tgtatgaactcagtggaagtttttccaatgtggggat--tgacgcaatttgct-------------------cagctactatgtgaagaggctaactgtatggcaagagtagaaaaaggtaagaccacttaggtgtttgtagggtaaaggtcaaacaagagtatgtggtaatttgggtgagcatgacag---------cagaaaggaatgttagattatggacattttttaagggtacaactaacagaattaacaaatggaatagatgtgaagtatgatagaataaagacacaaggatgacttttaggtttggagactgaaaaactgaatacctgataatgcctttcattgaaatggggatcagtgtggcagcagtcagcttggaaggggacattgaggtcaactttggcatgttaa-tctttttatccaagta-------tgagtagagagttgcatagtccatgtttgggtagaggagagaagcaagcctggagaGAAATATCAGGAGGAATTAATGATTTAAGAGACAGAATAGTTCTGAAGACAA------CACAATCCATAGGAGTGAGAGCAGGAATGTGTTTGCAGTTAAGGAGGCAAATACACAACTTTCTAGGTATAAAGTGCAATGTCCACCTAAAAACTAAAAGGCAGGATTTGGGGTAAACATCCA-----------TTAAAATGTGTATTGAGAGCTTAAAACAGACTCTGTTCACAGATGTGTTTCTGGCTGATTTGGTA------------AATAGGACCCCAAATTTCCATTCCGTGATCACCTTTCAGTGAAATGCAAAAATTCACAGATTATTTCTACCAATTAATCAGGGTTGATTAC a score=8245 s panTro2.chr12_random 1154218 209 + 2259969 AGACAAAATACAGAAGGAAAACTGCCTCAAGGAAAAAGTACCATTCGAATTTTTAGATGTGTTTTTCTTATGTAAAAATAGGCTAG-AATATTTATAGAAAAT------CTATTGATAACAAAAAACACCTTATAATAACCGGAGATCCACAATTAAACTTTAATGATTTATTTAATGTATTACATATTGTCCACAGAACTCGGATAAATGTGTTC s canFam2.chr15 38848830 196 - 67211953 AGAGAAAATAAGGAAGGAAAAAT----------AGAAGTC-------AAATTTTAGATGTATTTTTCTTATGTAGAAAAGGGCTAACAATATTTATAGCAATTACATTATTATTCAGAAGAAAGAGCAC--TATAAAAACAGTATATTCACAGCCAAATTTTAACGATTCATTTAATGTATTACACATTGTCAAGAGAGTTT-GATAAATGTGTTC a score=9920 s panTro2.chr12_random 1154459 289 + 2259969 AACCCCCAAGTGGCCCACGCATGTACAGAAATGTAAATT-GAATTTGAATAGCTCTAAGTGACACCTTTCCTTCC--CACTCACCCACTGACCTCCGTACCCCTCATAATCTCATATCAGGCCTCAATGGAATGCATCAACATTTCTTGCTTGGCGCCATGGAAGCAAAAGAGATGTAGTGAACGGATGTTTAAAAATTCTAAGATAAAAGAGGTCAGTTTGTTTACAGTTGAACTTACACATCGCGAAAGCAGGAAGTCACATATTCTAAGAGAGTGTAATAAACCAGACG s canFam2.chr27 36514511 282 - 48908698 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aACACAACTTATCAAACACTCAAGATTTGTACATTCAATTGCATCTTAATTATGTCACAATGAAAATATTTATAAATAAAAAGTAGATGGATATAATTCCAAAGGGAATAATGATCATTCTGAG--ACATTAAGACTAACTTAATAGTTCTGAAAAAAAGTT-----ATTATTGTTTTCA------TGATTCTAAAAGTAATGCAGACTTATAAATAATCCCAACAATTGAAAAATGGGTTAAGTAAAATTAGATATCTCTGTATAAATGGAAAGGTGTAAGAGATGGAGTGGCAAGGCTATTTATTCTATATACTACTTGGTAAGT----TTTTAATGGTATCAGTATAGTCATTTCATAAAATGTT a score=12144 s panTro2.chr12_random 1156096 436 + 2259969 CTTATTATTTC-CGTAATNTTACGAGTTCGTTGATTGGGCTCGGAAAGAGCCTTATTCCTTTTCCTCCTGGGTTGCATCCCATGTTCCTTCCTTTATTCCTGGCTTAAT----TTATTGGGGAAACACTTCTTTATAGGTTCC---ATAGGTACACATATGAATAAAGAGTC---CCTACTGTCCAGAAGCTCTACTCCAGTGAAAAGGAGCAGCCTTTGGGAGAGATGCAGGAAATGAGGCTGAAGGGTGTTTGAGAAAGGGCAGAATGG-CCTCATATCCCACTCTGAGGAATTTGCGCTTGATTCTACTGGTCAGGTAAGGATTTCCCGGACTTTGGTATGGAAAACTGTATGGATCATGTTTTTTAAAAGAATTTAATTAAATATTCTTGGTATTGACAACTCATTTTTACTACATTATTTAAATATATACAAACATAAAGCAt s canFam2.chr10 59702987 394 - 72488556 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CAGGTAATATAA--TCCCAACATTTACAATCCTTGTACAATAATAAAACCAAAACAAATTTATATAAGGTAAAACCCAATCTAATGCAAATTAACAAAATTCACTTAATGCAATGGATGTTACTGTTTAACTGAAACCAAATGGCTCCTGGCGTGTGACTGT-GCACTCACAGAAAGCGTGTACGTACATTATTTTAAATTCAATATGCCTAAATGACCATGCGCTAAGTAATGACTCAACTCATCCAATCCTTCTTTCAAATCAAACTAGCATGAAACT-GCCATCCAAAGAGACTGTGGTGATGTCACATAGCCATCACATCCCTTACCTAGGTGTCCCTTTC-------ATTTATTTTCTCA a score=16952 s panTro2.chr12_random 1157522 406 + 2259969 TAAAGACAAATCAACTGGCAGCATTTAGTTATACAAACAGTCATCCAATGATCTAGAAGATGCATCTATTTAAATTTTAAACTGTCCTTGAAATTAAAGTAT--TTTTTTTAAATTTCTGAT-GATACCTTCAGTCCCAAGAGTACATCACTGAAGCCCTTAGCATGCAGTTTGAGGAAATATTATGTAAGTGCTAGGGTCCTgcaacagacagattttgggcaaggaagtgacatgatcagattttcatattagagcaattacaca--aggggcggt-atgatggatagagtaaaggagagaaaaactcagagtaaggaggccacttgggagacaactacaataatttaggcaaaggatgatgaatgatctaaacaaagtcagtgtgagtgatgaggcgtaagaGAATAGA s canFam2.chr10 59703749 405 - 72488556 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ggagagtgaattctatgcaatttcacttat-aaaatcgattagatagatattgatctatactgatagTGGTTATCTAGTAATGGGC--GAAGAGATGTTATCAGTTAGGGACAGGAAGAAGGATTTGTGAGAAAACATG a score=11716 s panTro2.chr12_random 1161755 344 + 2259969 gaaaacttggggca--------------------gggatagatatataattatctttattatggtgatggcttcttcactatacacatatgtcaaacttatcaaattgtattctttaaatatttttcagttttattgaatgtcaatcaatgtttaataaagctgtttagaaaGCAGTATCCACTGAAGGATACAAAAGATTGCTTTGTGGCTAGACATAATTCTAAATCTACCCTTCCACCACTTCTATTCCAACTCAACCAAGAAGCAGATCAGAGAAAAAAAAAATGTCAAGAAGACAAAGACAGAATCCTGGGAAATCTTATTAAT----------ACTTCATTTTAGGGAGAAACGTATTGAAGGGCTGA s canFam2.chr27 33135734 357 + 48908698 gaaaacatgagaaatgccattttggtcagtgatggagatggagatgcaattatcttaattatggtcttggtttcatgggtatgcatgtatatcaaacttgtcaaattgtatt---taaatatgtgcagatt--actgaaagtcaattatacaccaataaagctttttaaaaaGTAGTATACTTTGAAAAATGCAAAAGATTG-TTGGTGGCTGGTCATAATTCTAACTTAACCCTTTCACTTCCCTCACTACCACCCAACTCACATGCAGGTCAGAGGGAAAAAAG--GGCAAAAAGATAAAG------TCCTGGGAACTC-TATTAATCCAGGAAATCACTCCCATTTGGTGGAAAA--TATTAAGAGGATGA a 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s canFam2.chr27 33136518 1015 + 48908698 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TCCATAAATTTTGTGTCATTACTTCTGCTGTGACAACTAGGGAACCAAGCAGACTGCATGGAAACCTTTCCTAGAATGGGCTTCCACCCAAAAGCAATCTGTCTAAAACAAAGAACAAAGCTATAGAAGGAAACCAGGAAGACA-CTTCTGTTTACATCAGGAAGGTTTTTTCCCCCTTCTCTATTTTGCTTGTTGTATCTTTTGAGGAAATTGCAATTACTTTGCTATTTGTTAGTGTCATGTGGTTTACCTTTGGAAGAATC-CAGAATCCAAGGTTTTTCATAGTTGAATGTTGAGTTTTTAGCAGATATTAAAATGATCATTTATTAGGTTCCTAAAGGTATTGCTAACTATCCA-CGGCCATTTGTGATTTGATTTCCTGACTCACATGTCAGTTTTT---GGGAGATCTCCATCAAAATAGTTTAACATGCT------ATAAGCAATGTGTAGAAGAGGACATTCATAAAAtgtcattttcatagttgccttattttaaaaatagcaatgttaagcacttcacttcctggtcagctcaaatgctcttgcattcccactccagcacttttgtcctctcgctagagcttgaacctgttgacccttccccttctcactgtcaataattccctcaggctcactcctgtctcctgatgcagctggaaattcacagttaGACGTAGTATCTTTT s canFam2.chr27 15255705 663 + 48908698 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acactaatgtatatatatactatatatatacttatacacttatatatacttatatatagtatatatacacttatatatagtatatatatactatatatacgtgtatatatacaatgtatatatatactatatatatacttatacacttatatatgtatatataatgt-atatatgtgtatatata-atgtatatatatacgtg----tatatataatgtatatatactatatatacgtgtatatataatgtatatatatactatatatacgtgtatatataatgtatat-atactatatatacgtgtatatataatgtgtatatatactatatatataCTTGTGTATATATAATGTATATATAGTTGTGGTTGTTTACATATCAAATATTTGTGATTTTCTCC----ACAATAGGAGAAAGATGATTGCTTGATAAATACAGGAGGTACATATAAAATTCAAAATTTTCTAACACCCTTTCAATGAGAAAAACCTTTTT-------------CTTAAGGAACTATTGAatatatatatatatatatatatTTTTTTTTTTTTTAAAAACCTACCATTTTCATAGTGTTTCCCACAAAGTAA-TGACCAAAACTATCCAGTGACTACATTTGACCATATTCAATACTGGATGGACTTCACTGCATCactcattgactcagaaaatctcttatgagtgtttgttatacag----------caggcacaatgtatgccacagaaatgcctcagtggagcaaaacaggaaaagctaccagccttcagaggtcttccacggggagagtcagacatta-ataagataattgggtaaaagacatgccatg-ttagatattgctaaataaggatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagaatgcagggaagtggggagagtaagtattgaggggaacgactgaactcaggaggagcatcacta-gaaggaaagttggaataaacacctgaaggaagtaaaggagctaacaatatgagtatccgagagaagagcatgccaggaagatgc-------------------tgaggtcagactat---ggaagaccaaggaagccagggtggctgtcatagagtgaataaggcagagggtagtaagaaatgaaataagagaggcataagaggtgcattatggaggaccttatgatccataacaattattaatactttggcttttactttgaatgcgatttacattggagggctttgagcagaggagacacatgccatgacttaagttatagaaaggtgactctggttactgttttaagaaaggacct s canFam2.chr27 33093991 1157 - 48908698 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s canFam2.chr27 35555929 983 + 48908698 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s canFam2.chr27 35560296 2079 + 48908698 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a score=31661 s panTro2.chr12_random 1199575 796 + 2259969 GGTAGTGTTCATCTTTCTTTGCTGCGGTTGTTCTCACAACCAGTCCTGGCTTAGCATATGATCTTCTATACATGTAAGCAGTAGTAAGTCAACTTTAAATGAAGCCCTCTGTAACATGGCCTGCCTGAGCTGTGGAATTTGGAGCTCCAAAATTTTGCCCTTTGTGCTGTCCGAGGATCATTGGCTTTGA--TGAGCTTGTGGAAGGCAGAAGGAGAGAAGAAAG-TATATTCATGTCATTTTTTTGGAGCCTGCGTTTGTTACAGAGTACGAGCCAGCA-GCCATTTATAGTGAGCATGGTGGACACACAATCCCAGGACTCCTTCTTCGGGTCAC-TCCACTCTTTACCAAACATTTCTAGATTCCATGAAAGTGGCTCTTCCCTTCTGGAGCAGTGCAGCAGTGTGCTTCgtgttatgcacttatcagaccactttgaaatatactttcttcaataccatgcaatcactgaatatactggtgtgtgttttgtgagatgtctcaagcaaggggagatgacttgaaacaagttgtaaaaaaacctgttgaaggaagtagtgttatttaacttgagtagagaggttcagggcagggcatgagagttgccttcatgtatttgaaatgttgtag---ggaaggagattaacattgttctatgtctcctcaaagatc------aggtgcaaggtagagggagacagagttcaactcattataaggaag-acttttGGgtgtgatagttaagaattttgcttctgagatcagggcttcctgaatttaaatccatcatctgctag-tactagccata s canFam2.chr27 35563743 760 + 48908698 GGTTGTGTTCATCTTTATCTACTTGGGCTGTTTTCACAGCCAGACTGGGGTTTTCATGTGGACTTCTACATGTACCAAAAGTAGTAAGTCAACATTAATGTAAGATCTGTGTAACATGGCTTGCCTGTGCCATGGATTTTAGAGCTCCCCAAATTTGTCCTTTGTACTGCCCAAGGATCAGTGGCTTCGAACCTAGCTTAAAGGAAGTAGAAGGAGAGAAGAAAGTTATCTTTATGCTGCATTCCTGGAACCTGTCCTCATTATAGTGTAGGAGCAGGTGCACCAT--------------GTGTACACATCATTCTGGGGCTCCTTCTCCCGATCACTTTCACTACTTACTGAGCATTTCTAGATTCCATTAAACTGGTCCT--CCTCTTGGATCAGT---------------CTCTTATGTTGTgaccag------ttcaaaggtaatttcttcaattctaggccatcagtgagtacactgaggtgcattttgtgagaagtctcaagcaaggggatatgacttgaaccaagtcatataaaaaacagaagtaagagggagt----tttaacttgtg-ggagaga---agggcagggcat--gagttttcttcaagtatgtgaaatgttgtcatttggaaaggggtaaaagttgatctgtgtctccccaaggagcagaactaggtgcaaggtaaagggagcca---ttcagttcatcatagggaagaactttAGAGTGTGATATTTAAGAATTTTG-TGCtggaatca-agcttcatgagtttaaatccacaatctgttggttattagccata a score=57133 s panTro2.chr12_random 1209788 1491 + 2259969 TCAAAATTAGCCACAATAAAGAAAACACAG--TGAATACATTTGAAAGGAAAAAAAATTTTTCTAAAAATCTTGACAATAAGGTAAATGAACTAAAACAAATACT----GCTTCACTCA---------------------------------------ATATTTTGCTATTTACTTAATCCTATTAAATATCCAAGATAAATATCTTCACTAACTTGCaaataaattttaaaaattgaatatt----tgtttttatttgaatataaCTTTTAGCATAGAAAGCAACTTAATAGAAATGAAATGAAAGTAGTAATATTTATTTGAGACAAGAAAACATCTGATTTCTATTAT-----AAAAAATGTTATCCTCATAAGGTTTTGTTTTTCTCATTCTCTAAGTACCTTACATGTAGGATTCCATTCCTCTCTGTAATAGGTGAAAGTGTGTCATGTTTAGGTACTTTTAGTAACTTTTCTATGCTATCTGGCATCTTCTTacacacacatgcacacacacacacacacacacacacacacaGAAAAATATAATGGCACAGAAACTGCCAAGTAGGAACCGACTATTCCAAATGA-TTTTGAACTACCCTTTAACCATA---GTTCTCACAGATTTACAGAGATCAACTACTCAAATTCCCAATGACAGTTCTAGAAAACAAAACCATAGTTCATTTATTTAAGCTAAATTTGAAGTTGGAAGATCGTTTGACTAGCTTCTGGGCATTTGATGTGGTTTTGTACCTGGCATCAAAAATAAGTATGTAACAAATATTATGTACTAACTAGGTTTTCAAGAACCA-TGTATAATATTCAGCACTAGAAGCTGATGAGTAACATG-----------TAAAGTCAAAGAGTAAGGAAAATTGACAAATTGGATTGAAAACTGATAAAGAGCCAAAGATTTTAAGAGATGAAG-----ATCAAAGTTCTAAAAACAACTACCCTTGAGCATAGTTTGCCTGGGAGGGCTGAAATTTATAACATATAGTGTGCAATTATAATGTCCAAAACCACACTGATATCAATTAGCCATGATTTATGCAACCTAAGAAAGATTACCTATAATATTCCTGAAGGACACTCTATAAT-ACAAATTCCA----TTTATAGTTTCTTCTTataactcttttttgtggtcctcttacaagtgaggccctgttgtgtgtcctgagatcacaacagtaa--aagtcagagaatgttcctgtctccatgggtctc-ttctcagtgaagagagacagacatcaaactcttgcacaagtgactgtaattgacaattccagcagtgaagaatatcaagaagaaaatgaagagttaaatgagataaagccctgaaggtggggcaggtgtggggcattactttagataatgtgttcaggaacactctctccaaaagaaaaagtaactttgaggttgagtcttaaataaTGATAGGTGCTCACCTATGAAAAAATAATCAAAGAAAACATTGTGGGGCAGAA-------AGCTGGTCTTTAAC-ACAGGAGTTGCTATAGTCTTGATATCAAACCACAACTGTTCTACCT s canFam2.chr10 65112358 1498 - 72488556 TCAAAATTAAGCACAACAGAGAAAAAATAGAGTGAAGAGTGCTGAA-GAAAAAAACAGTCCTCTA----TTCTGATACTAAGCCTGTTGGACTGAAACAAAGACTCAAAGTTTCATTCATATTCCTTGGTAGAATATGACTGAGATGGAAACAAATAAATATTTTGCAATTTACATAATCCTACGACTTATCCAAGAAGAGTTTCTGCTGAAACTTGCGTATAAACA--AAAAATTGAATCTTGaaatatttttatttgaaattaatttttaGCATTGAAAACAACTAAAGAGATATT---------------TATATATCTGGTATCAGAAAATATCTGACTTTTATTACCCAGAGAAATAAGTTACCTTCATAATAGTTAATTTTTTTCACTCTTTAAACATCTTAAGTGTAGGAATCTTTTTCTTTTACTAATAGAAACCAGGGTACCATATTCAGGGACTCATAATAATATTTGTATCCTATCTAGCATCTTCTTGTATACA----CACACACACACACATCCACACATAGAGCAAGAAAATTATAATGGAACTGAAATTGCCAAGTAAGTATAAATAACTAAGAATGACCTTTAAACTACACTTTAACTGTACTTGTAGTCACAGATTTAC--AGATAGACCACTAAAATCATCAGTGAGACTTCCCAAAAAGAATAATATACATTATATATTTAAGCTACCTTCAAACAAGGGAGGTCATTC------TTTGCTGGCATGTTATGTGGTTTTATACCTTGAATCAAAAATAGATATGAAAAAAATATCATGTACTAATTAGATTTTCAGGAACAGTTTTATAATATTTGGCATCAGAAACTGATGAGTAAGATGTAAGCAGTATATAAAGTCAAGGAGTAGGGAAAATTGACAGATTAGATTGAAAGCTGATGGAGAGCCAAAGA--ACAAGAGATGAAGAAAATATCAAATTTCTTAAA--AGTCATCCAGAAGT-TAGTTTGGCTAAGGGGGCTGACATTTTTAACATATA----------ATAAGAGCAAAAATGACATTGATAACAGTTAGCCCTGATTTATGCAATCTAAGAAAAATTACCTATAATATTCTTTAAGAATATCCTATAATGACAAATTCTATCTTTTTGTTTCTTTTTCTTacaactatttttca-gctcctctactaagctaggccctattgtgagctttgaaatcacagcagtgaataagtcaaggaacgttcctgcttccacggggcccatttgcaatgaagagctgcatacat----------------------taatttac--ttttatttttgaagaacaccaataggaaaataaagagctgaaggag--aaagcattggaggtcgggcaggggtagaacattactttagatagtatattcaggaaaactctat------gatgaaataactttggggttgaggcctacatgatgataggtgctcaaccatgaaaaaac--tgaagaaagaatttgaggggcataaaacaacTAACTGGTCCTTAGCTACCGAAGTAGAAATGATCTTGATATCAAACCACAACTGTTCTACCT a score=2555 s panTro2.chr12_random 1211279 100 + 2259969 TTCCACC----------GGATTTCACTTATGTATATTCACCTTCGATAGTTAATTACCATTTTTATTTAAATA-ACTTTGTGGACTCT-GTCTCTAG-AATACAA-TATAACTC s canFam2.chr10 65114248 113 - 72488556 TTCTACCTTTTCATGAGGATTTTCACTTAAGAATATTCATTTGTGATAGTT-ATTACTACTTGATTTCATATACAGTTTGTAGACTTGAGACTCTAGAAATGCAATTATAGCTC a score=1397 s panTro2.chr12_random 1211413 35 + 2259969 AGATGATTTANAGCACGGAATG-GATATGATCTCAt s canFam2.chr15 42484711 36 + 67211953 agagggtttaaagcagagaaagtgacatgatttgat a score=27944 s panTro2.chr12_random 1211742 744 + 2259969 TTGCTTATTTATTTTTAATCTGGGGAATT--ATGCAgggtacaagagtaaaagaagggagaccaggtaggaggtgatttcagttgtcctgtctagagaagatggtggcttagacaaatgaggtggcaatggagatggagagaggggggtcaatttctaaattctcagagccaacagttctcatctttaaa--ttacataataatatttacttcagaggatagttatgagagttaaatgatacaacatatgaatgcacctagtgcggtgttcaacctataaaaagttctcaacaaatgttaatgctGCTTTTTTTCTCCTATGTTCAAGACACAAAAAACACAGAAGTTTTTCAAAGAGTTCTTTAACAAATATCTGCGATT-----GTATTTCCTTTGGACAAAAAAATGTA-CTTCTAAACTGGCAACTTTAAAGAAGTTTCTGGATTTAAACACTATTTGCACAACCTCTTCTAAACCCAGATGCATTGGAGATTCTTGAGCATATTTTGTGGGAATGTCTTGTTCCTATTTAATTCTGCCCCAGT-ACCTCTGC---TGTTTCTCCATAATTGGTGGTGATTATGTTATGTTGTGGTGATGAGAACTTTCAAAGATGTTTAATTGCTAACAAAGTGCCTGTTGAGAGGAAATAGTTTTTTTCTG---CAGAAACTAGAAGGCATATGTGGAATCTTTCTGCCTCATCTCCCATCTTTAAAAAAT---------------------------------------ACCTCTTCACATGGCTTTTCATGTTCATATATAT s canFam2.chr15 42484747 782 + 67211953 ttgtgttttta-----aatctgaagagtagaagatagaacataagagtgaaagaagggagaccagctaggaagctatttcatttattctgtcaagagaatatggtgagttgaactaaagtggtaccaacggaagtagagagagtggGAGGGATTTCtaaattctccaagcc--taactttcttctttaaaatctgaataatagtatttacttccaatgatggttatgaatgttaaatgggatgatgtacaaatacacctagcatgg-gttcaacctatagaaggttctcaacatatgTCAATGCC-TTTTTCCTCTTCTGTGTTTAAGACACTGGCAAAACAGAAGTTTTCTAAGGAAGCATTCAATAACTATATGCTATTCAAATGTA---CCCATGGTCAAAATTATGCAACCTCTTAACCTCGAAGTTGAAAGAAAATTCTGGATTTCAACCCCACTTGCACAACTGCATCTCCAGCCACATGCCTTGAGGACTC-TGAATCTATTTTATAGGACTATCTTGCT-CTGTTTAATTTTGCCCCGATCACTTCAGCCATCATTCCTCCATAATCGATAGTGTTGGTGTCGGGTGGTGGTGGTGAGAATACTCAACGATTTTGAGGTACTAATGAAGTAACTTTTGAG----AATAATTTTTTTTTGTTCTAGACACTAGAATGCAAACACAGAATCTCCCTAGCATCTGCCTCATCTTTAAAAAAGAAACACACAAAATAGCATCATCAACAAAAACCAATCCAAACCTCTTCACATGTCTTTTCATGTCATTTTATAT a score=18291 s panTro2.chr12_random 1213058 536 + 2259969 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s canFam2.chr10 14108448 967 + 72488556 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a score=4357 s panTro2.chr12_random 1215707 120 + 2259969 TATAGTTCTCTTTCTCAAAAACTTTTAGTTTTTGACTTAACATCTTAAATATAA-ACATCCCATCTGGATATTCAAGGCCCCAAAATCTGACCCTGAAGTTCTTTTCCCAGGTTGTTTTTC s canFam2.chr10 14113490 118 + 72488556 TATTATTCCCTTTCTCAAAGGCTTTCAGTGAT-GAGCCATTATCTTAAAAATTATCCATCCCA-CTGTACATTCAAGACCAAGAAATCTGGCTATAAAAATCTTTT-CTAGATTGtttttc a score=23915 s panTro2.chr12_random 1216478 586 + 2259969 TGTGTTCTGCCCAGATCTCCTTGGATCGCCTGTAGGAGTCTGTG---CTCCTGTTGGACTTCTGTGTgcctgtacttctaaatggcctgcaacggcgactcaccttgagccctgccctagggtaccagagccatttttcccacacacagaaaactgtctgcatacctaggaatgtatgtttccttggggtggcccttagtcaatgagtgattggtgtggatgtatgaaagaccaactgcctggcctccagttgggacaagctctaaggcatgattcattctcctgagctgctctcctgcaggagcaggcgggagctgggactttgcctgatatcgtgccttcgctcagatccttctcc-tccctgtcctgcttctcaaactcccccctgccccaccccggcctcctcacaggc-cactttctctatacatcccttgcccatgaatccacatctcaaggtctgcttcgggagaacttaaactaaggcTGTGTTGTGTGGAAGACAATGGAAGATGGAGCAAGACTTAATCATTGCTCACAAAGACCAAAATCAAATGGAAAGTCCCCTCTATGGACAGTTGACGTTCCTAAG s canFam2.chr10 14117308 543 + 72488556 TGGATCCTGCCCAGATCTTTTTGCATCCTTTTATGGGTCCTGTGTACCTCTTGTTGGGCTTGTGTGtgtccttacttccaaatggcatgcaac------tcactttgagccctt-----ggatactagagctgttta-cccacacacaaa-------ctaagtgcctaggagttgatgtctccttggg--------tggccaaagagtgactggtatgggtttatgaaagaccaactttttagccaccaattgggataaactctgaggcataatttacatccctgagctgccctcctgaagggccaggtagtagctggggctttccttgaaattgtgtttttacttagactcttcccccttcctgtggtgtttctcttaccaccata--------cctagccttctcatgggagcatttgcttagtatatcacttgcacatgaatcctcatct--------gcttctggggaacctgaactgagacTCTGCTGTGTGAAAGTAAATAG-----GAAACATAATTTAATCATTGCTCACAAAGGCCAAAAGCAAGTGGAAAGTCTTATATATGGACAGTTTGCTTTCCTGGG a score=12331 s panTro2.chr12_random 1217064 302 + 2259969 TGGCTCTTTTTGGCTCACAATCAGAAGCATCCAGAGTTCAAAATGCACAGTCCAGATAATGACACACATGAGGACTGAGG-CTTTGTAAGTCTCACATTAACACAATATTACATTTGGCCACATGCCCTGGCCTTTTGACTGTTTACATCCTCAGAATTGAGGGGTGTTTGAGAAGGCCTGCCACCAGGAAGAGTGCCGGTCACTGGTTTATTGAGTGACATTGGACTCTGCCTACTTTCCCAAAGTGAAAATTCTGTTACTACAGCAAAGGCAGTG-CTGAGGAGCAAAATGTATGTGGATGA s 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canFam2.chr27 3166231 555 + 48908698 ATCTCTCTCCACAG------TAACT---------------TATAAGCTGCTTGAGAGGAGAGATGACTATTGTCAT----GGCAATTATTTTCATAATTTTCAATCCAAGAAGTTCAAAGATTATATCTCCATCCTTCAAGGAGGACCTGGAAAGCACtaaataaatatttt--aaataaataaatGATTGAGTGTTTTATTCAATTCTAACTGTTCTCACATTTGAAAGACCCAGATGAAGTAATAGAGCAAGTTCCTAGGGGTGGACAGAAATGTCACATTTTGCCATGAC----AAGGTCTTTTGGAAGTCGTtagggaagctgaatattaaacaaga----caaagtcattgc---tacacatttaaaggacttttacaagaggtttgatttattcttaaagatagaaaacatagaatttaaaacaataggaagaagttgtaggaaagcacctttctgctcagtataaagaaaatctttccaagaagcagagctttttgaacatgaaattgattgccttcaaaaatgtgaaattct----cgacaaaaatattcaagTGTATCTTAATTTGTAATTGGTTTAGGAAGTGCATA a score=3278 s panTro2.chr12_random 1263634 60 + 2259969 TATTTTTTTCCATGTAGATTTCAGAATA------CTAC----TTTGGAGCTAAAATTGCTGTTTCTTTTT s canFam2.chr15 42643194 70 + 67211953 TACTTTTTTCCGTATAGACTTCAAAGTAGATTTCCTATAGATTTTGGAGTTAAATTTGCTGTTTCTTttt a score=43500 s panTro2.chr12_random 1263695 1280 + 2259969 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s canFam2.chr27 9718350 971 - 48908698 cTGGatcttgctctatttttcttcaggactcttacacaccttgctaa--attgttatatacttgttttgtttcattgtgtttattaccatccatctatttgaatataagaggcatgacagtatcagttttcttgtgcttactgctgtatttccagtgcctagaacattgacaggcagataattggcgttcaatcattatttgttgaattaatgaaCAAATTGGTGTATGTGTATGATAGTGAGTGAACAAGTGAGTAGATTGAAGATGGTCATACTAGAAAAAGTATTCAGAAAGGACTTCCCTGAATAGTTCAGATTTCTTCTAGGCTTTGCATTTGTACCTAAAGAAGTGCCCGGGAAAGAATCGGGTACTGCAGAGCTGGAGTGCAGATACCAGCTCCAAGAAATAAAATGCAGATGCCTTATAACTCCTGGGCACCATGTATTCTTTTGAGTTGTACTCTGCTTTGAAAGGTACCATGACTTGGTGGCTCTCAAAAACCTCATTTTCAGTGATTCATTATATACCCAGCTTGAACTTGCTGAAAAATATTCTGCTCTCCCCTTCCCTCCCTTTTCCTGGGCAGATGAAATTGATAGTAGCTTGA-GAGGGAGTCTAGTCTCAGCAATCAAAATTTTTCATACAGTTTGTATTAAATTGATTCGTCTTGT---GTCAGTTAACTGTCAAACATTGATCATGATTTAAGTTT----------------------------------------GCAAAATTCAAGCGGCAGTGGTATGTAGACTGCTGAGATACTGTGAGGATGAATACACTGCCTTTTATATGGGTTTTAGGTAGATCCAC----CTGACAATGTTGTCTTTACACCCAGTCAGATTATTCCAAAATTTAAAATTCAGCTGAAACCCAGATGGTGTTTTTTTTTTT------------TATCATTGTTGCTATTGTTTTTATTATTTAAT-TCCAATAATTGAACACACCACAGTATTGCTTCTTTGG--GGGAAAGATACCTTGGCTCTTCTG 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s canFam2.chr27 9721181 918 - 48908698 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s canFam2.chr15 26592713 1539 - 67211953 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ACTCTATCATCTCATTTAGTCTCTACTTTTGAAAAGAAGGTGCCACAAGAAAGaataatttgtccaaagtcacacatatactcagttgtaaagatgcaacatcaatctgggctcct-gccagtcTTAAATACCCCCCATATCAAAGCAGTTACAAATACAGGCTGTTAGAAATAAGAGAAATGGATTTACCAA-------------------------TAGTCCCATGTTCTAGTGCTTCAGACATGGACAAATATTATTATATAAACCAAAAAGCAAATGACTTGCTAAATAGACTAATAAATAGGAGCCCAACTTATTTATCT-TTGTTTGTCTTGGTCAGGAGCTCATAAATTCACACAGAAGTAGTTTTGATTA----ATAACTACAATTTTTAATAACCAAAATTCTACAAATTTTTAACAATTGTTTT--TTATTAGAGAACAGTATAGGAGTGTAAGAAGGCACAAAAGCAGCAACATAAAGGAGGTATTCAGGTCAATATAGTCTGCCTTTAAAGAATATTTAATGCT-TAAGA-----------TATAATGAAAATGTG-GGGAAATGGATATAAGGATACAGATAAAT a score=15007 s panTro2.chr12_random 1317572 392 + 2259969 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s canFam2.chr27 26668923 1227 + 48908698 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s canFam2.chr27 17908863 2078 - 48908698 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atatttgcagttcatatatctggcaaagaaatcatatccaagtaacataaagaactctcaaaactcaccaataagaaaacaaatgacccgggggggcaaaagatttgagcagtcacttcctcaggaagatatacagattgcaaatacatacttgaaaatctgtgcaacatcagtagtcattagggaaatgcaaattaaaatcacagttatatacattgcatacctgttagaatggttcaaaacaaaacaatggagacaacTGTTTGCttgattaagtgcttatcatttaccaggcacagttctc------ttatatatactaactca---tttgatctttgcagtaacgcttaagagagcaccatcattattcttattttcagatgatacacctgaagcacagataaatcaaattggctacagtcacatggctagaaaatggcagagccaggaaaataa---cacagaatttcatgaacactgtatttattactccaccATATTCAGTGTGTCCTGTGCTTTTGGGGTGTTAAAGTAGTGGTGGTGATCATTCTCCTCGTGTCTCAGGTAT--GTTTTGCATCTGAGCAATAGAATGGGAAAAACGTTTTTTTTTTTTAAAGAAAATTGCTACTGATTTCCCTTTCTTGTATGCATACACCCATACACATAAAATTTGCCATCTGTTTATGAAAAAGTACAGCTTTAATTTCTTTTTATTGCCAGTTTTCAATCTCTGCCCATCAGAATAGTAAAGAAAGGATTCTCCAAAAAAAAA s canFam2.chr27 17913594 721 - 48908698 atatttggaaatcatgtgtctgacaaataaattgtatccaaataacataaagaactgtagaaacttaacattaagaagacaaaccatccaatagg-caaagggtttgaaaagtcacttcaccaagaa---aggcagattacaaataaatacatgaaaagatgcttaacatcaatagactttagggaaatgcaaattaaaatcataattaggtccactgcatccctattagaatgactcaaaacaGAGCAATGAAGATATGTATTCCTttcattaagtgtttaccaggtgctactaacagttctccatgctttacgtatattaatccaccatttgatctttgtaaaactgt------gagcattctcattatctatattttcagataacagatctgaggcttagataaat-----tgtccatagtcacacagctagtaaagggcagaaccaggaAAATATAATTACAGAATTACACGAACACTGTATT----ACTCTACCATATTTGGTGAATCATGTGCTTTGGG----TTAAGTTAGTAGTAATGATCATTCCCCTTGTGCCAAGAGTATATGTTTTACAGTAGA-CATTAAAATGGGGGAAAATATTTT-----------ACAGTTGCTCCTGATTTCCT-------------------CATACCTTCACATTTTTCCATCTGTTTATGAAAAA--AATGTTTTAATTTCCTTTTGTTGCTAACTTTTAACCTCTGCCCATCAGAATAGTAAGGAAATGATGCTCAGAAAAAAGA a score=18030 s panTro2.chr12_random 1356982 647 + 2259969 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canFam2.chr27 1353128 911 - 48908698 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aatataatcagatactgtatgttcaggaaggcagaggaaggcataaacatgttaaggagagacatggatgatactttaaaaaacccccaactgaacctctagagatgaaaaaagacagtgtctgagatgaaaaatacactggatgggacaaacagcagattagaaactgtttaaaaaaaaaaaaaaagagtaatgaatttgaagatggcaacttcagaaactgtacaaaatgaaataaaacacagtgagcaaaaaggctaaaaaaataaGTATTTGAATAGGTACTAAAGTTTCAAAACTCTCTAAATGACAGGATTTAGTAGAATATAATTCACCATGCAGACATTACAAAATT------------CTCTGTAGTACAGTGTGAAGCATT--ATATGTGAATAAGCCAATTTTGTAGATAAAGATGAAATATACTTAACCTACCCAACATATTCTAACCAGTTTCCAAGAGTTCTACTGACCTTTCTATATTCACCAATGTCAAAGTTACATATACAAACTGAGAGGTGGAATCATGGATCTAAGAAGTTTATAA-TGTGCCAAGATACACTTTTTCAACTTTTAAA----AAAAATTCCT--TCTCATTTTGATTTC---TTTCCAAATCTACTTAAAAGCTTTCAAGTCTCATCCT--TTTATTTTTGTTTGACTATTTTTG--------------------ATGTGCTTTTCTACACCAAGCTGAGGGTTAT--GTTAGATTTAAAAGGAAAGCTTCACTAATTAAA-CTTAGCTTGTGTGGAATAAATAATTCAATAAAGAGCTACAGGTTACGAGTATCTTTTACATTTCTATGTTTCATTTGTTTAGTGGAGTGGACCACCATGCTTAGATGTATGACACTCAGAGA-----------GGCTAGTATCTTTAACTGTTTCATTGTTAACTGattatttaaatgattattatagtt-------------aaaaaaaaaaaaaaGCAAAGAGCTACCACCAATCAATGCTGAGCACTTAAGAGGAAATGATCTTGTTTG----AAGCTAGAGTCCGACCGATA--------TTAGTGAGAGCATGAAATTATGACGAAAAATGAAAATATTTCTTTAAAATGTCA 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s canFam2.chr27 8147079 1227 + 48908698 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s canFam2.chr26 28476942 1525 - 42029645 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tttgtttatgtattggcttctttctcactgtaacagcagagttgagtagttgcaacagaggtcatatggcatatagaacatagaacatttactatgtggcccttacagaaaaggtttg-------cTATGCCAGATGCTCAAGCTACCAAGATGCACACACATCATTATGCCTGTTCTCAAATAGTTTACAGATTAGGG-GAGGGATGGAAGAAAAAAAAACAATAACCAACTCTAGTGGACAAATGTCTCTACTAATTGTCTGAACCATGAGAACAAGATTATAAAGGAGGAAATGATTAGTTCTTTCTATAAAAGTTTTAAGAAGGACTTAGAAGAGGAGATGAAATTGAGATTGAACATCACAATGGGTAAGATTTTGCTTAGTGGATA-CCACAGTGTATTTCAGAGGAAGATTCAGTAGGATCAAAGGAGTCAGGAAAGCAAGCAGAAAGCATAGGAACCAGTCATTAGTTCCCCCTTTGTGGCTGCAGCATCTGGTGTGTGCTGAGGGGTGAACAGGAGTAAGTTAGTCTAGTAGTGGGCAGATC a score=39960 s panTro2.chr12_random 1463871 1382 + 2259969 GGTAGTGTTTTTTGCAGACCAGGCCCTCCAACATTTCCCTAGACAGAGTCCTGTTGACCTTTCACCTTCCCCATGACAAAGTCCTTGTACACTGCCTCTG-GGTGTGAGAACACAGAGCCTGTCCTGTCATCCCAGCTTCTCCAG-GTGATGGAAGcaggattacctacatactttgctgggcccactggaaagtgaaaatgtaggattctttgtgcaaaatttattaagcatttcaacatggtaactgcagagcattaaaccaatcatcagggctcttctgagctggccctgGATAAAAACAAGGGCTGCATCTTTGCTCACCGAGACAGTGA-CAACTCAGAAAGTTAAGCGCAGGGTCAGGGACC--CTGGGGTTGTGGTAGGATTTTGTCATGCCTGAACTGCTCAG-----------CCAGGGTATCTTTGAAGCTGAGGCTGTCTGCAGGAAAACTCTCATGGCATTATGTGGAATGTATTGAGGCCATGGCTTTAGGGTGCCTTACATTCTTAGAGAGATTCCCAGTTGACACAGGGCCTGCACATACCCATTAGAATAGAGAAGGGCATAAATGGACCGGTCGTGACCCAAGACCTGTTGCCTGATTTTACTCCTCCTCTACCACTGACTGACTCATTTGGCGTTTTCTTTCTTTGTGTTATTTCGACTCCTAAGACAAAGCTTATGCCTGGCCACTGAGTAAGCTGGGACCCTTCACGGTGCTGTTACCTACAGACAAGGGACTGAAAGGATTCAATGTGAGTATTTAAAATGACCTTACACCAAAGGGCTAATATGAAAAGCCTTAGTAGGGAGTACCTTCTTTTATTTAAAGTGGGAAATCCCCATTAAAATTAAACCTACTGATGATAAGGATGGTGATTT-----------------TTTGATAAACTTCttttagtgatatataacatccttacagaaagtatacaaattgtaagtgtacaactcagtgaattttcccaacgtgaacctacttgtgtaaacaccaagtccattgccagcaacctagaaggccccctggtccccctttccaatcatta-ccctctacaggtaaccactGAGTGTTCTTAACATATATCCAGGTGATAAAGAAGATTTGCTTAATGCAAAACTGCTCACTTCCCACAGGAAGAATTAAATTAATGTATTAGCTAGATA---------------------------------------------------------------------------------------------------TGTGGGTTTT--------------TT------------------------------------------AAATCATTATAAATGGTACAAGCGATAAGGAAAAAATAAGAAGGAAATTTTAGTCTTCAGTGTGAGCAGCTGTTGTTTGAGATAATGTCATCCAGTGGGAATGAAACTTGTAGTGCCTGGTGGAGGCGTCCTATCGAGATGGCATCACTAATATAGTTATATTTGGTTTAATGTAAATAATGGACTTATCGATTTGTATACAACTTA-TTATCTT s canFam2.chr15 45239895 1395 + 67211953 GACAGTGTCCTTTGCAGAGTATGCCCTGGAGCATTTCCCTGGACAAAGCCCCATC-ACCTTCCACCCAC----TTATGAAGTGCTGGTCCACGTTGTCTGCTATGTGACAGCCCAGAGCCCACCCTGCTGTCCCAGCTTCTCCAGCAGGATGGAAACAGCTcctgctacgtaacttgcagggcatcatgcaaaatgacaagatggggtcctttgttcaaaaattattaaacatttcacggcggcaacagcagagaattacatcaagcatgagga-tcttctgagctggccctggatggaac--aggccTGTGTCTCCACTCACTGTGATGACAAACAGCCCAGAAAGTCAGGCAC-GGGTCAGGGACCTGCCAGGATTGTCTGAGGATTTTGTCA--CATGACCCTCACAGAAGGTGTCATCCCAGGGTCTCCTTGAAGCCAAA-------------------CCATAG--TTCTGTAGAACCT-CTGGGGCCGTGGCATCATGATGCCTTTTGCTTTCTTGGAGCTTCCCGGGT--TACAAGAGCCACACATACCAGTTAGAATAGATAAG-----------------------------CTCATTGCTTGATTT-ACTCTTCATATGCCGCTGACT----CACTTGGTGTTTTCCTTCTTTACAT-ATTTCTATTCCCAAGACAAAACCTATGCCTGGCCGCTAACTAACCTGGGACCCTTCACTGTGCTCTTGCCCACAGACAAGGGACTGAAAGGATTCAATGTAAGTATTTAAAA----------------------------------------------------------TAAAGTGGTAAACCCACAACAAAATTAAATCTACTGATGATAAGGATGGTGATTTGGGGCGAGGGAGTGGGGGTAAGTAAA---AGTTTAGTAAAATATGACACCCTGACCACATGTACACTGATTGGAAG------------------------ACATGTACTTGCATGT-------------------CCAGCTTTCTAGAGGGCCCACCAGTGTCCCCTTCCAATCAAGACCCCTTCAAGGGTAACGACTGAGGGATCTTAA-GTATCATCACATGATAAATAGAATTTGCATAACGTAAAACTGCTTACTTCCTGCAAGAAGAATTAACCTAACATATAAGCTGCATATTCATTCCTTTAAAATCATAATATATAATGGAATCcctgggtggctccattggttaagcgtccaactcttgatcttggcttaggtcttgatctcagagttgtgagttctggtcccacactgggttccatgctggattccatgctaggtatggtgcctacttaagaAAAAGTCATCATAAATGATGACAGTGGT--GGAGGAAAGTAGGAGAACACTGTGGTCTTCTACATGAGCAGCTGCTCTCTGAAGTAATATCATGCAGTGGGAATGAAATCCATGATGCCTGGAGGAGGCATCCTATCATGACGGTGTCAATACAGCTGTTACATTTGCTTTAACAGAGATAATGGACATGCTGATGTGCATAAAAGTGGTTTATCTT 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tgggtggatggatggatggatggatggagagatgcatggaggatgcatggataggtggatggatggatggacggatggatgggtgaatggatggatggttggagagatggatggaggatgcatgcatggatggatgaat---gACAGATAG--GAAGATGTGGCTTGCTTTCTCACAAGGATATGC------------ATGTATTTACCTGttcattcattcaaccaatatttactaa--gtctgtcacttattaggAGTTATATGGCAGGAAGAAGGAATTAGCTTCAGttatttattccacaaatattttt-attgtgtgccttctctgtgcaagacactaaagtgagtgatgaatttatagtaaattaaatagttttgtccttatgaagcttgcagtctgctggagaagaGCTtgataataccttgcccaggtatagcatata----tagttgtcagtgctttcacacatcatatcatttgatcttaatgaaaaccctgtgaggttaacaaagcagatactttcatccccactttagattaagtgacttatccaaaatcacattgccagtaaatatcaaagcccaaggactcaagacttctgactctactccagtgcttgctccttccaggacaccaTAGTAATCTTATTTTATCTTTCTTTGGTGTTTTAGGACAATCAAATAAAGCTTAAACTCTATGGAGGCAAAAAGAAGGTAAAAATTATACAAGGGGACATCATTGCTTCCAATGGGCTTCTGCACATCCTTGACAGAGCCATGGACAAGTTAGAACCCACATTTGAGAGCAACAATGAGGTTAGTATTCAGATAAAAGTCACATCAGGCCAGGTCCATCTTCCTTTGTTCCCTGGAGAGTCACATCCAGA--------GCATGCCAGCACTCTGTGCTTGTGCTTCATTTATGCTAGGATCCCGAGCAGAGAGAAGAAGAGGTGGTTTGTCTGTTTCCAATAGAAACCTGAAAATCTCTGCAGAAAGAAAGCAAGAC s canFam2.chr15 45243093 952 + 67211953 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CTCCCTTCACACTCCTACTTACGGGGTTTACAGAACGAGGATCTCTCGGCAAGATCAAACTTGGTCTCCCCTCAT------------------------------------ATAAAATTTGACTGAGCTCCTCCTCGTGAAATGGATTCACCTTTTGTACTGGGAAAAAAAAAAAAAGGTTTTTAAAGTAGTTAAAGTAAAA-AAAAAAAAATAAGGACAGAATCTGCACGA---GGCAAAATTACATTGATATCTTCTCTTAAACAAAGAGGATAGATTTCTTTACAAATTCTGTATGTCCAGATACCATTTAGAAGCAAACTC----TGATTTCACATTGAGGCTGAAAATGTGTATACTCAAAGCTGATAAGAAGCCACACATA-GAGTAATTTATGTCTTATATTTTATGTGATATACTTGACAACATAAATAATCACATAGGAAGGCCTCTGTTTAGCATTGGCAAATAAGAACACAGACTATTTATGTATGGGTGAAAGAGAGTGGAAAGAATTTTAACCTTGAAACTCCTTGTCTATTGACTATTTAG s canFam2.chr10 36531228 531 - 72488556 CTCTTTTCATGTTCCTATTGACAATCTACATAGGACAAAGATCTCTAGGCGAGATCTAACTTGGTTTTTCCTCATTCAAAATTTGAGTGAGAGaaaaaataaataaataaaataaaatttGAGTGAGCTCTTCCTTATAAAATGGATTCTCCTTTTTT-----TAAAAAAAAAA--------------TAGTGAGACTAAGATGAAAAGCAGTAGGGACATAATCTGAACAATACAGCACAATTTCATTGATATCTCCTCTTAACCAAAAGTGACAGGTGTCTTTACAAATTATACATGTACAGACGCCATATGGAAGCAAACTCCATGTGATTTCACACTGAGGTTGAAA-TGTACATACTCCAAGCTAGTAAGAAGCCACACATAAGAGTAATTTATACCTTATATTTTATG--ATAGATTTGGCAGCATAAATAATCACATCTGAAGGCTTGCGATTAGCATTGGCAAATAAGAGCCCAGACTATTTATGTGTAGGCAAGAGACGATGGAAATAATTTTCACCTTGGAATTCCC--ATTATTGACTATTTAA a score=14641 s panTro2.chr12_random 1469966 314 + 2259969 GGATCCTAATCTTGAAGCTGGATATACAAGGAATTTTGTCC---------------TCGTCACatttaatatttattcatttttttaaaaaGGGCAGCAGAA-TAGAAAATGGGGTTTTAATTTTGTAATATCCAGATTCACTTCTGGTTTAATAGGGTGGCACTtttagtgggcattagaatctctgggggaacttgtttaaaatgttgattctcaggcctcatctctcagagtg-ttgattctgtaagctatattgggtgc-aaaaatctgtattttaacaggcatttcatgatgattgatgtgcctctagtccggggaGATTGTAATTT s canFam2.chr10 36531759 328 - 72488556 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48908698 caataaataaataaataCATGTTTGTTTTAGTATTTATGCAAGCAAATACAGTATTTTCAGTAAATAGAAATGAGGGTTGTTAGGTCTTTTCACCATTTAAGAAGGGGTAGAAGTGCTAATTTGTTATATTGTAGCAAAGT---AAAGAGTAAAGAATGTAT--GCTATA-AAATGTAGTGCTTA----------------------------------GCCAAAGGATAT----TAGAGCTTATTAAATTAACACATTCTTAT------AGAACAAATTTAAAATTTTTATTGTGAAGGACAAGAAAACAAAGAAAAAGTAGAATTCAAAGAAATGGTAGTGTTTACCCCAAATTAAATGATAAATATTTTATAGTTAGCAACTAATCATATCTATGTACTTACATATGGAGATAAATTATATCAGTAAGAATACACTTACAAATTATGTTAATATAAATAG---GATTTTTATTTCAATTCCAATAGTGTTTATATTTAG--ATaactgtttgctgctttaatgagatactccttcaacagaagcaaacagaaaaatgaaagt a score=7532 s panTro2.chr12_random 1473820 321 + 2259969 atgcgtcacaaactggtagaacactattacagttgtaatggtgccgtcttaatataaggcaagccctttactggaattgaggaagc-------atgcttcataatgtaagattaattttccaaaccactagtaatatacatttttatca---ttgcatgtacctaatgtgacaagttcaacatataattg-aataaagtgaataagt-aacaatcataaatgggattttaaacacttttctctcagtgcttaacacataaacaaac-cacagagccga---tagaatgatctgaactagacacgtagttatcactcatatgcacacactcacacaca s canFam2.chr27 10383002 325 - 48908698 atgcaatacaagccaggagaaaacttttgc-----taa-agcactgtcacagtataaggcaagaca-ttgttggacatcatgaagcacattttacatttcataataatgaattgattatccaaaccattaacaatg-----tttcataaaatctgtacgtacttaataatatgagttgaacatagatgtgaaataaagggaaggaggaaacaatcataaatggagattcaaacagctccatctccctacttatcaaacaagcagatatatataagtaaggctagaaagtcttaaactagacaattcacaaatatatatatgcacatatatacacaca a score=8762 s panTro2.chr12_random 1474147 307 + 2259969 atactcacatatttaatttcacat-------------atttttcccaaatacacTGTAATCTCATAATTCTAAGCATATTA------GTAAAAAATATAGGACTATGATTTCAATGTAGTA-CCACTAGCCAAGCTTGGCCAGTGGATAGTTAAAAAATAGCTATTCTAATTCAACATTAATTAATACCAAATAAATAACATATAAAACCAGTTTCTCAG-CACACTAGCCACATCTTTGCATACAAAGATGAAGAATATTTCCAGCTtcatagaaaatgttctaactacagtttacctacaatagaagtcaatgaaaa--aatctgaaa s canFam2.chr27 10389580 315 - 48908698 aTACTCATACTTTTAAATTCATATGAAAATTTTCCAAAACTTTCAAAAATACACTATATACTCACATTTCCAAGTATATTAATTAATATAAAACATATAGAACTGTGATGTCACTGCATTAGCCAGTAGCCAAG-TTGGCAATTGG-------AAAAATGTATATGAATATTTGCAATTAACTTTTCataattaaa-aataaataatattaattCCATAGTTATACTAGCCA------TGTTAACACAAATGTAGGCCACATCCAGCTTCATAGAAAATTCTCTAAATATAGTTCACCTAAAATAGTGGTCAGTAAACATCAATTTTAAA a score=6596 s panTro2.chr12_random 1474455 231 + 2259969 cctcaatggttttaaattcagtaatacatatctaaataacatatgggtgaaataaattatcaaaatgaatggtcacaatttttatatgaattataaggaaaatagaa---tgaaaatctctcttgtaaaa-accgattgccctcaatgtacgtatattacaaaagatgacctaaaaattaaattaccattgaatgcactaaaataaattaaaaatagaaaagctaaaattaaata s canFam2.chr27 10390115 218 - 48908698 cTTGTATGGTTTT-AACTCACTAATATATTTCTAATTAACATATGAGCCAAACATATGATTACAATGAATGTTGACTTTTTTTACATGAATTATAAGGGAAATATAACAGCAAAATTTTGTTCTATGAAATAATAATTACCTTAA--GTACACCTATTACAAAACAGAGC--AGAAATCTGACC--------ATACACCAGATGAAACTAAAAACATGAAAGC----ATTGAATA a score=18093 s panTro2.chr12_random 1480653 338 + 2259969 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1481051 253 + 2259969 TATAGGTACAATTGGTCATGTAGCTCATGGGAAATCCACAGTCGTCAAAGCTATTTCTGGAGTTCACACCGTCAGGTTCAAAAATGAACTAGAAAGAAATATTACAATCAAGCTTGGATATGCTAATGCTA-----------------------------------------------------------------------------------------AGATTTATAAACTTGATGACCCAAGTTGCCCTCGGCCAGAATGTTATCGATCTTGTGGGAGCAGTATGCCTGATGAGTTTCCTACAGACATTCCAGGGACCAAAGGGAACTTCAGATTAGTC s canFam2.chrX 19617686 342 + 126883977 TATAGGTACAATTGGTCATGTGGCTCATGGGAAATCCACAGTTGTAAAAGCTATTTCTGGAGTTCACACTGTCAGGTTCAAAAATGAACTAGAAAGAAATATTACAATCAAGCTTGGATATGCTAATGCTAAGGTGAGCTGTGTACTGTGGAACTAGAAATAACTTTGATTATTAAATGTGCAGATAACAAGTTCGAATATTTTCTTCGTTGGAATTTTTAGATTTATAAACTTGACGACCCAAGTTGTCCTCGGCCAGAATGTTACAGATCCTGTGGAAGTAGTACACCAGATGAATTTCCTACAGACATTCCAGGGACCAAAGGGAATTTTAAATTAGTC a score=4335 s panTro2.chr12_random 1481304 47 + 2259969 AGACATGTTTCCTTTGTTGACTGTCCTGGCCACGATATTTTGATGGC s canFam2.chrX 19619055 47 + 126883977 AGACATGTTTCCTTTGTTGACTGTCCTGGCCATGATATTTTGATGGC a score=13140 s panTro2.chr12_random 1481378 342 + 2259969 TGGATTCTTGGTTTTC-CATTTGTCTGCGAgtgatgatgagactagtgatggtgatgaggat------------gagttggtactgatggtgaggaaaatgctgagaatggtaatagtgatggtgataaggtggtgacagttgttaaaattatggtggtggctgatggtga-----gggtagtggttgat-gatggaattggtggaaaggtggaagcagtaatggtaatgatgttggtagctgataaagatgttggtggtagtggtgattgataaagatgactgtgattatattagtggtggtggtgATGAGATTCTAAAAGCTAACTCCCTACTACCTAAAAATGGCAGCAGGAAAAAAA s canFam2.chr26 20963243 352 - 42029645 TGAAATCTCAGTTTTTTCATTCGCCtgttggtgatgatgacagtcatgatattaatgagggtagggtagaagtagtggtggtgttgatggtgatgaatatgctcaggatgaggataataatgatggtgaggaggctagggctgttgacatcatggtggtggctggtggtggttgatggagaccgggtcatcgatagaactggtagtgatgtggtggtagtgacaataatgatgttggcagctgatgaaggtgt-gatggtagagggggttaatgaaagtgatggtggtggtg-----ggtggtgAAAATGAGACTCCAAA-GCTAACTC--TATCATCTAAAAATAGGAGCGGCAAAAAAA a score=17432 s panTro2.chr12_random 1481723 342 + 2259969 CCAGAGATGAGTGATCAGCACTTTTCTTTCCAGAATGCAAGAATTATTGGTGAACGAACTGGCTTAAGGCCAGTACGCCCCCAGATTCGGCTAGAAAGAGAACAGCTTCGCACTGGACCTTCAAACACAGAGGTATGCTCCCATGGCAAGGAAAGTAATGCCCTCTTCCACTCCTCAGATGGCTCTGGCATTTTCAGGGAACAGTCATGTCTGATCTCAGGTTCCACACAGGCTCCATAGCACGCAGgggcagtggtggctaatatcccctcctctataaatggggaaactgaggctcaatgatggttaaggacctgctcaaggttacatagaggggcagtg s canFam2.chr26 20963825 325 - 42029645 cCAGAGATGAACTAGTAACACTTTT-TTTCCAGGATGCAAAAATTGTTGCTGAATTTACTGGTCTCCGGCCAGTTCGCCCCCAGATTCGGCTAGAAAGGGAACAGCTTCGCTTTGGATCTTCAAACACAGAGGTATGCTCTCTTGGCAAAGAAAGCAA-GTCTTCCCATAGCTCTAAGA-GGCTCTGGCATTTC-------CAGTCTTACCTGACATT-GGCTTCACACAGCCTAC-TGGCAGGCCAGGACAGCACTGGCTAACATCcccccctctgta----gagaaactgaggctcagtgatggtacaggacctgctcaaggttacgtagA-GGGCAGTG a score=4990 s panTro2.chr12_random 1482065 155 + 2259969 gtgatgttaatggaggtggtgctgatgagatcaatgttgataatggtg----tgactgggagtggggatggtagctggtgctgatgGAAATGACACTATCA---AGTATGTTAGTACCACAGCAGAGGTGACGATCTCAAAGGCAGTGTTA-------------GCTGCGCTAA-----------------C s canFam2.chr26 20962022 182 - 42029645 TTAACATTAATGGAGATGGTGTGG----------TGTTGATGATGATGGCAGTGATTGGGAGTAGAGGCAGCATCTGGTGCTGATGGAGATGACGCTATGAGTGATGATGTTAATAGTATAGTGGGGATGACAGTCTCAAAGGCAATGTTAATTCATGCTGATTGCAACATTAATGTTAAGTGAGGCTGTGC a score=420 s panTro2.chr12_random 1482220 7 + 2259969 TGTCTCA s canFam2.chr26 20964150 7 - 42029645 CGCCTCA a score=4660 s panTro2.chr12_random 1482227 80 + 2259969 TTGGCAATATTAATGGTGTGGCAGAGATGACAGTATCAATGGCAGTGTTAATGATGGTGGTG-AAATGGTGAATGGGGTTG s canFam2.chr26 20962211 81 - 42029645 ATGGTGATGTTAGTGGTGTGGCAGAGATGACAATATCAATGGTGACAAGAATGCTGGtagtgaaaatgatgaatggagttg a score=10982 s panTro2.chr12_random 1482307 291 + 2259969 GTTTTCTAAAGTCTGTGGTCAAATAACAGGAAAATGTGTacttactggatgtgtacttcgtgtcagacacagcagcaagttcattacatgaatgaccttattaaatctcctctggagctctttgggatagggacagttctccctatgcttcggatgaggaaactggggtgaattaagaggtgaagtcacttgcccaagtcagaccactggtggaaggcagggctgggatgtgatttgaatttgactccaaggctatttc-cagatatccattttgtggctgccccaTCATCT s canFam2.chr26 20964157 239 - 42029645 GTCTGTCAAAACCTGTGGTTGAGCAGAAGGAAAATGGGTACTTAC------------TTGTGTC-----------------CATGacatgaacgaccttactggatctcccctccaactctctgggatagggactgtttcccccatgcttcagat--ggatactggg--ggtctaagatgtgaaagcatttgcctaaatcagacaactg--------------------gtgagttgaattggactccaaagccaTTTTGCAGATGTCCATTTTGTGGCTGCTCCATCGCAT a score=30203 s panTro2.chr12_random 1482598 675 + 2259969 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CTTACTGGTGTTGCTGGGA--TGCCACCATCCTGCCAGGGAACGGAGAGGGCCTCTGGTGCCCGCTGGCTTTGCCCAGAACTCTTCAGGAATTTCCTGAGTCTTCCAGGGCACACGTGCT-------------------------------------ACCTTCTCTCTTGCCTCTCCCAGGTCATCCACAACTATGGCCATGGAGGCTACGGGCTCACCATCCACTGGGGCTGTGCTATGGAGGCAGCCAAGCTATTTGGGAAAGTCCTAGAAGAAAGGAAGTTGCTCAGGATGCCGCCACCCCACCTCTGAAAACACCA--------------CCTCCCCAAGAACTCCCCGCTCCCCTCAGCCAAGCAATCAATATACCCCCCTCTAAGCTATCACTTACCCTTCACATCAGCCCTGGCTCCTTTCTGCAAGAAGCACAAGATGAGAGGGAAATGACAAGATCCATTCCCAGAGGCGAGTCTGGCCCTACCTGGGGCTCACTTTGATCACTGGGGTCTCTCCACTCACTCTGGGCCTGACTGTATGAAGAACAGATGTAGGCTGTTATATTCTAAGTCCTC---AGAAAGGAAAGCTCAGAAAATCAAAGGAGCAA-------------GGAGAAAATTGGAGATAACTGAGGTTAGGTAACTTGAGGACAAATTACACTAACATAT a score=11375 s panTro2.chr12_random 1483273 292 + 2259969 taaaggttctgaaaagtcctgcagcaaagacaactatctgatgttgtttaacccagtgcttgctaaacctatctggctatggaactCTTTTGCCCAGAGCTCCCATGAATGCCATGACACAAATCTGAGAAAATGCTGGAACAGATTTTGTTGTATCTGTTGTGTTTATTGTAGGAGGTTATACATACAACTGGGGTGTGGAGGGGGCAGAGAGGTGAGGCACTGAACTAGTAACACATGGTGTTTGTTCCACATCTAGAATTCCAAATGGCATCAGCTATTCACCGAGTGG s canFam2.chr26 20965847 264 - 42029645 taaaggttctgaaaagtcctgcaacaaagacatctatctgatgttctttcatccaa----tcctaaacttatttggtttggaaACCTTTTTGCCCCGAG----CACTGATGCCACAGAGTGTACTTGAGGGAAGGCTGTAGTAGATTTTG------------------TTGCAGGAAGTCACATGCAGAGCTGGAGTGTGGCGAGGCAGAAGAGGTAAGGCATTGAACTAACA--CCATGATACCCATTCCACATCCAGAATTTCCAACAGTGTCAGTGACCTGCTGAGTGG a score=2849 s panTro2.chr12_random 1487756 82 + 2259969 TAGAAGGATCATGGGGAAA-TCCTGCAACCCACATAGTTCTGTAGATTTTATAGTGGTTGATGTTTACATAGGAAGTCTTCAC s canFam2.chr26 20966112 72 - 42029645 TAGAAGGGGCATGGGGAAAATCCTGCAACCCACATGGCACTGGAGAAATTA-----GGCGATGCTTA------ATTTCTTCAC a score=5923 s panTro2.chr12_random 1488225 164 + 2259969 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ccactgcacccag------------cCAGGACCATGTCTGATGATATTTTGCATCCTCAGTGTTGAATAACATGT----CCAGGACATGCTGGATATTCCATGCATACTGACCACTTGCCATGTTATGATCTGTAAGAGAGTTCTGATGAA s canFam2.chr26 20967565 147 - 42029645 ccactgcaccaagaatgcatgaagatgtggaccatttcttattcttttttgtatcctcagtatttagtatcatgcgtgatagatacatggtagatactcCATGCACACTG----CGTGCCATGACGTGATCCCTAATAGAGTTATAATGAA a score=27776 s panTro2.chr12_random 1491267 905 + 2259969 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GGCTCTAGTGATTCTCTGGTTC--TGGTTCCATTTGTGAAGCCGGGCTGCACTTTATTTCT--GAGATTTTTCTAATCGCTcagaggtgcaaactggcagcccatcaatgaaacctggcctgcaggtcaattgtat-gggctcacacatcatgtaaaggtttttgttacaacatactaaaattgggagatttcctgtaacactctagattctgattttaaagatcaggagctc--------------ccactgtgcaacaaaatcgggtagagctgagcaat-gctgctccctg------gggtctatgcttctcactctgccacaattcttccctCTTCCTGTTGTTCCTTACACCTTT---GTTCCACTCACTTCTGTTCCCAGGCTGTCCTCTGGAGGAAATTAACAACCCATCCCAGCCTTATAATAAAGCTGTGCTTCTTAATTTGAATTAACCTGAGTTCAATTTCTTTTCCTTGTAATTAAAACAGCCTTGATGAGAGTTCTGTGGCAA--------------GGCCCCTCTCAACCATCCCCCATC-ACCAGCC-------TTCTTTCTTCATGCTAACAGAATCCCAATTTAGTGTTCAAGAAGCTGTGGGGTATCGCTTGATCCTATGGGATGGAGCCCCTTCCTTCTCCAGCTCTGGGGGAAGACTTATGCT------------------------------------------------------------------TTTAGACT--------CAGACTTTACAGCAAGAAAACTTCTTGTGATTGTTCCTTCTGCATTCTACCTCCTTTGAAAA--AATCAgatgcccagtaccgtggcagccatcttgtgatcatgaaatttcatgcatagggtcaaatggccaacacacagaggataggagagaagaaaaacaaaaaagaagctgtgttttt a score=1412 s panTro2.chr12_random 1492221 42 + 2259969 TTCTAATGGTTTAAGCCACTATTGACTGAGATTACTGTTCTT s canFam2.chr26 20968798 41 - 42029645 ttcaaatagat-aagatattcttgactgattttactgttgct a score=4549 s panTro2.chr12_random 1492543 123 + 2259969 GGGGAGTCTCTTGATCTTATCATTCAAGGCTTTCTATTGCTTAATATTATATTAAAAACAATGAATTTCCATACTAATTTCAAAGTCAATTCCTAAGATACTGTTTCATCCCATTGTGAACAC s canFam2.chr26 20968883 119 - 42029645 GGGG-GACTCTTGATCTCACCCTTTCAGGCTCTCTGTTAGCTAACATTA-GCCCAAAATAGTGAATATCTATATTCATTTCAAAGTCTATCACTAAGATGCTCTT--ATGTTATTGCCAACTC a score=13452 s panTro2.chr12_random 1492687 283 + 2259969 TTTCAGAATACTTGAAGTACGAGAAAAACAGAAAT-ATATAGCTCTGGCTACATTAAATATCTTTTGCCACTTTCTGAGATCTTTCCTAACTCTAAGAGAAACA-TGGCATTTCCATTAATGAAAATAGGAGCTTTTTGAATAGGATTGTTCAAAATTAGATACAAATGTCCTCAGCTAAAGGTCTCACATATTCAGAAGTTTGGGTGCCTTTTGTGATAGCTCTTGTATCATTTGATAATATTGATTTTTTTGAAAAGGGCAGGCTATTTACAAGGCAAAGAGt s canFam2.chr26 20969215 278 - 42029645 aTAAATAATATTCAGAGTAAGGGAGGGAAAGAAACCACACAACTTTAGCTACCTTGACCATCTTTTACCATTTTCTGAAATCTTTCCTAACACTGAGAGAAACAATGACATTTCCATTAATAGAAATAGGAGCGTTT------GGACAGTTCAAATTTAGATACAAATCTCTTCAGCTAAAGGCCTTGAATATTTCAGAGCTTGGACAACTTTGGTGGCATTTCTTGAATCATTCAATAATACTGATTATTTTTTAA-GGGTAGGCAATATAGAAGGCAAAGAGT a score=51090 s panTro2.chr12_random 1493281 1152 + 2259969 TTTTAACTTTCACTTTCTCAAGTAGAGAAGGCCCTCAACTGTAAACCCCTTTACCCTAGTCTCTGGGAAATATTCCTGCCCACCAAGCACTCTATCCCCACC--AGCCCCCAGCTCCACTGGGTTATTCTAGGGTGAGG-GAGCGGACATGATCATCCAGCAGCGTCTGACCAGCCGGAAGGCAAAAGA--------------GACAAGCAAAAGTTCTGTGTTACCCAGGAGAGCTCAGCTGTCCAGAAATAATTAGAGCTACAGCCACACGTGGTTCAAGGAAATGTGGTTGTCAGAGAGAGACAGAGATCTGCCAAGCCATCTCCTCTTCAACTGCCTGGGCGGAGGGGGCTGCAGCCCACATTTTAGAGACACAGTATTGTTTGCAGTTGATTTAGAACTTGAGCTGGAAGAAGTCCCCCATCATGACATGCAC-----ACCATTAGAAGAAAGTGTTGTCTCCAACAAGCTCA--GCCACAATGT-TGGCTGCCAACGGTATGTCTTTCCCCACTCATTGGAAAGGAGATTATCACACTAAAGCATTGAGATGAATTCTGATGAACAAAGGTAGGCAGACCATTAGGCTGGACTGTCACTAAGACATGATGACA-ATGAATAAACTTAGGCTCTTGCAATGTCCATCACTGACATGTTTTAATAAGAGATGAACGCACAAATT-GGCTTCCTTGCAATGTTTACTTCAAGCAGT--------------AGGTCTGTCTGCTCTGGCCTTTGATGGGATCTGCCAGCTTCCTCCCTCCTTGTCTATGTCCCCTGCCTTCACCATGGGAAAAAAGGGTCCAGTAAACCAAATCCCAGAAGTG-ATGTTGCCTGCGG-------------------AGACCAACTCAAAACCAATTGGCCTCCCCCTGCTTCCTTTGAAAACATATACATTTCACACACCTGAGTCCTCCCACCCCTCTCCACTCCACGGCAGGCTCCATGAATGGAACTCCAGGGGCTGCCTTTGTGTAATGATCAAGACGTCCCTGGACAG-AGGAGCAGCTTCGCATCAGGG--------------AATCCTGGTCCCCTGATCCCCATGGGATGAGATGGTGGGTGTAGCATCCTTCTGGTTTCTCTGCCCATTCAGCTGTCTACCCACGCACAAAACCCAAAGCCCTGGATTTTGGATTTTGTACCTGCAACCTGAGTAAACTTTTTCC---CCTCAAGAGTCA s canFam2.chr26 20969493 1191 - 42029645 TTTAAACATTCATTTTGTCAAGAAGAGAAAACCCTCAACTGCAAGCCTCTTTATCCCAGGGCCTGGAAAACATTCCTGCCCACCAAGCATTCCTACCCCACCCCAGCCCCCAGCTCTTCCAGGTTATTTGAGGGTGAAGAGAGTTAACATGTTCATCTGGCAGTGTCTGACCAGCTGGAAGGCAAAAAATAACAATAAAAAAAGACAGGCTAATGTTTTATGTTACCCAGAGGAGCTCAGCAGACCAGAAAGAATTAGAGCCATAGCCACCCATAGCTCAAGGAAATGTGGGTGTCCAAGAGAGATAAG--TCTACCAAACCGCTTCCTCTCTGGCTGCGTGGGCTGAGGGGGCTACAGT--ATATTTCAGGAACACGGAATTGTTTGCCATCGATCCAGGA----GGCTACAATA-GTCACCCACTGTGACCTCCACTCCACACCATCAGAAGA---TGTTGTCTCCAACAGACTCAAAGTCACAACACATGGCAGTCAATGGTACAACTTGTCCACCTTATTGGAAAG---ATTATCATATTAAAGCATTGAGATTACCCTGGATGGACAAAGTTGGCAAGATCCTTAAGTTGAACTGTCACTAGGACATCATGACACATGGACAAACTTCAACCCTTACAATGTCCATCACCAACATGTTTTAATAAGAGATGAACGTACACATTTGGCTTCCTCAAAATGTTTACTTCAAGCAGGCATCTCCACGCAGAAGGTCAGTCTTCTCTGGCCTTTGATGGGATCCAGCAGCTTCCTCC-TCCTCCTCTAGGCTCCCTGCCTTCACGATGGGGAAAT-GGCTCATGGAAACCAAATCTTGGAGGTGGATGTTGTCTGCTGGCGTCAGCCCTTCCTCCCGAGGCCAACCAAAACCCAACTGACTGTCCTCT-CTTCCTTTGAAAATGTACACATGTCACAAATCTGGGCCCTCCTGTAACTCCACAC-CAGTGGCAGAGAATATCGCTGGA-CCCCAGGAGCTGCCTCTATGTAAAGACCAAGCCAGCCCTTGACAGCAGGGGTAAGCAAGAACCAGGGGGGTGGCGGGGAGGACTCCTGGTTCCCTGACCCTGGTGGGAGTGGGTGGTTGGTGTAGCATCTTTTCAATTCCTCTGCCCATGTAGCCAGTTACCTACCCTCAATATCCAAAGCACTGAA--------------------ACCTGAGTTAACTATTTTCTTTCTCCAAGAGTCA a score=62617 s panTro2.chr12_random 1494721 1124 + 2259969 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s canFam2.chr26 20970684 1202 - 42029645 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s canFam2.chr26 20972931 1221 - 42029645 GCACCCCCAGGCTCTTCTGCATAGGAAagacttgggtttgggtcccagtttctctccctcccagctgtgtggccttggacaagtccctttacctttctaagcct--gttttctcatttattagcaatactactcctttcataggatgggttgttaaggtaaaataagataatgcacacctcaagagctctgcagaaggctcagcatggagtaaCTGGTTGCCATGCTTGGGCTTTTGTCATGCCCACCCCCTCTGTATTTGGAGGTGACACTTACCTGAGCAATGAACGGAGTAATGAGAGCACCCACTCTTGCCATGCCACTGCAGGTGCCCAGGCCCAGTGCTCGAGTTGCCGTGGGGTAGACCTGAAACACAGCCATCA-ATGTGGGCTTGAGAAAATGCAGGATCCTTCCTCCTCTTGAGCTCAGGACTGATGGGACTGACCCCCATGGGCAAGCCTGAAGTTAGCATGAATTACTGGGGTAGTTGGTGACCACATCAAGAGGCGGGAGACCAGGTGGGGATTCTCATCTCAAAGGGGAT-AGAAGTTCAACTGAGAAAGAAGGCAAGAAGCCAAGCTGTGGGTGGGAACCCAGTAAGGGGGTCCTCCCTGCCCTGGGAGGC-CCCCAAAGA---CTCCACCAGGAACTGCAGCCCATTCAGGATTCAGATACTGTTCTTCCTGCC-ACTTTTCATTCATTTACCTTGAAGCACTGGTCACAGCCCTTCAAAGCATTTCATAAAGACCGTAATGGAAATATTTCCACAGTTTCTCAGTGTGTACCCAGGAGTGGCCCTGTGCCTAGCTCTCTCTTAGGCAAAGT-------GACTGTGCACCTTCCAGGCCAAGGTAATTTAGAAGTAGGCACGTCTTCTCCACTCCCTTCCCCAGTCTGCTTGCT-------GGACTCCAAGGCACTGGGGc--aagatttctcaactttgacaccatggacatttggggatgggtc---ctttttcatgatgaggggctgtcctgtgcattgtaggatgtttagcagcatctctggcttctacccactaggtgccagtagcaccttctacacagctctcccggag-----ttgtgacagtctgaaatatctgcaggccttg-taaatgtcctctggggggcaaaatcaccctttgttaaTAGTGGTTGAGGAATTTGcaagatgcaaggaacttgagtccctgaatcactgtggaagtgaa---------------agcatacccatattggactgtttcattc 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2259969 tcctgctacaaacaacagagttatgtggcctgcaaatcctaaaatatttactag s canFam2.chr26 20983410 52 - 42029645 tcctgctcca--cagcagaggtgtatggcccacaaagcctaaagtattgactct a score=12238 s panTro2.chr12_random 1515580 415 + 2259969 tgaccttttatagaaaaaggttgctaacccctgTTTTACGACATTCCCCTGAATCCTTAGTTTAAGCATTAGGATGCTTAGCTTAAGCTT-TCTACTCTTAGGAG-AGGCAATCTGTGCTCAATCAATACCAAACCCTGTGATTGACTCTACAATCGAAGCACATCAGCAGAGCATTTAACACGACTCTCCCACACCCCCACAGTGAGATGGGACTCCACTACCTCACTCAATCCTTATACCAATAAACAAAACTATTAACTATGATTATAGAGGCCTAATAT--AAAAGATAATTGGGCAAACCCCGAACACAAGCAGGAACTTGATTCTTTTATCTTCTAACCTGAGTTCAATGCTGAGAATTTAGTGTTATCTTAAAAGTCAGAATGGCTTAAAAGCACAG-----GCATAAAAAAAGCAT s canFam2.chr26 20983669 340 - 42029645 tggccctttatagataaagtctaccaacTTGTGCTTTGTAACATTCCCCTGGATCCTC----------------TGCTTTGCTTAAGTGGATCCACTGTTAGGAGCATGTGATTTATACTCAATCTACACTAAACCCCAGA------TCTGCAACTGAA---------------------------------------------------------CCACCGACTCATTAAATCCTTGTACCAATAAACCAAACTATTAGCTAATATTCTAGAGCCTTAATATGAAAAAGGTAACTAGGCAAATCCCGCAGACAAGCAAGAACTTGATCCCTTTATCCTCTACCCTGGGTTCAATGTTAGGAAGC-----TTTTTTTAAAAAATAGAATGGTTTGAAAGCCCAGGATTTGCATAGACTTTGTTT a score=7060 s panTro2.chr12_random 1515995 160 + 2259969 ATAGACTTTTCTTTGCATTTGTTTCTTTTTGTCcagaggttcccacctccagctgcacaatagaatcacatggggagcttttaaaactcactaatgcttgggctccacctgctctcccaagtcctgattaaatgggtctgggc---------------------actgtttaaaagcttcc s canFam2.chr26 20984199 168 - 42029645 cTAGACTATGCTTTCTATTTG-TTCCTTTCGTCcagtggtt-ccacctctagctgcacaatagaatcacctggggagcttttaaaagccactaatctctgggtccag-----------agatgctgattaaattggtctgggctttgtttaacctggtgctggtgttgtttaaaagctccc a score=5104 s panTro2.chr12_random 1516456 132 + 2259969 cccgggtgagtctgttatgtggccgtggtggagagccaACTTGGTCCTCAAACTTAATGTGCACATTAGAATTATTGCTCAGGATCATATCCATAAAGCTCTGAGTACTATACTTCATGAGGGCTCTTTAGG s canFam2.chr26 20984367 128 - 42029645 cccaggtgattctgttgtgtggccagagttgagaTACAACCTGGTTCTCAGATTTCACATGCACGTGA-AATTGCTGCATAGGGTCATGGCCACCAGACTC--AGGGCTGTACATCACT-GAGCTCTTTAAG a score=21944 s panTro2.chr12_random 1518596 505 + 2259969 TGACATAAGATGTGGCTCCTCTAAGATTAGCTCCATCGCGACAAGACTGTCCAGGTTTCCACAGAGTGTCTTGGAAACCACAG-------------------------------------------AAGTA------------------------GTACAAGGCCAAGTCCCTTAAGGGCAGAGCCTGGGGTGGGAGTGTGTGCATGAGTGTGTATGTGCCAAGGGTGTGGGAGTAGT-TAGCTGGCAAAGACAACCAAGATACTCACTGCCGCAGACATCTCCTGCCTGGAAGAGTTCTGTGGTGAGTAGAACTAACCCGTAGTAAGAGAATGCATTGGAAAACCTGCCAGGA-GAAAGCAAGAA-AGGTAAAGAAATGATCAGAGGAACACGAGTCCCCTTTCCCTACCCCCTTGGGAAGGGCCAATGTCTACAGCAGCAGGGACCAGTCTTTGG------GCTACACTGGGATTTTGGGGG-CTTTACTGGGGACCTTGAGCAAGAAGATGGTAGGTAAAAAAGCATCACGATATGATCAAAGGGAAGTGATCCTGTGTCCTTTGAAAGACCAAGAACt s canFam2.chr26 20984495 554 - 42029645 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42029645 CAAGTATGGATTCTACAGACTTCCCTAAAATTTCAGATCAGAATGAAACAGTTAATTAATTTCCGATGGTCCCAGGAACTATAACACTCAAGCCTGTAGGACCAGAACATTCTCATCCTGTGATACAGTCACATGGAAACT--GTCATAATCAGACCACAGTAATGAATTTCCTTGGGTTACAATATGTGCTAGCAAATTTAGCGATTTCTGTAGCGTGCAAAAATTAGTCTTTAATTAATTGCTTTTGTATTTGGGTAGTGTTGGCCCAACTGAATCTCATGCATGCAAAGATAGATACCCTCAAC-CTGGTCTCCCTTtttattttttattttttattttatttatttatttatttttttTTTGGTCTCCCTTTTTAAAAATTCTACAGATTCTACACTTGGGCACAGAATAGGTATCTAATAAATGCCTGGTTCAGCTCTCAGGAATGCAGGGGCAGAACTGGAGCCCAGTTCTGTGTATTATCAAAGCTTTCCCCTCCCCTTCCTTGCAATTGAACACTTTTCAGGGCAATCTTCTGCTAATTAGCACCTCTACTCGAAGGTGCATGGGAAAAGTGAGAACTGGTTAAAGTAGAATGCAGAGTGTTA-GCAAGGTCCCTTCTGCACACTGTTCATGCTGTATACATGATTTGGTAGAAAGAAAGTTCAAGGAATAGCTG-AGATTTAACTAGTTGTGGATTTTCAGGTTATTACTCTGTACAAATCCCTCCCTC--------CCATC-----CTGCCCACATCCA---------------------------GATATCAGAAT------------GGCTGTTTTTTTTTAAGGAA--------------AATACATACCac------cactggtggtatccaagg--ccatatgacc--caagaaggcaactta a score=2015 s panTro2.chr12_random 1520952 64 + 2259969 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agtccaattaaagaaaaagactaagaaaataatagt----acaggtgata-cctggataaggcagagatcaggaaagtgatgcttaaaccactgaattttgTAACTGTTGCCTCAGATCAAAGAGTTCTTTGTGCATCACAT-AAAACAGAACCCAAAACAGAGCATAGGCAG---AAGGGAATCAAAGTG-TCAAGAAACAGTTCTTACCATATAAACCAGAGCAACAAAGTTGTCCATCTAAAATGGGGCGTGAAAAGATCCTTCATTCTGCCTCGGTCTTCCTGTTTCAAGACAAGGACATGCTGTTTGCTCTCCTTTTCTCCAGCTGGAC--------------TAGCCAGAGACTGGTGGACACCCACGACTGGGAGGGAGGTTGCTGGTGGGC-TAATGCTCAGGATCCAAGAACCCAGGACTCAATCCCCCAGCACAAAGTCCCCCAGCCCGGTGAGGCCCTCCAGCTAGGATCTAGCAATGTCTGCAGGCTTGATTGCCCAAGGATTGAGACATTCTGCAATCCCCAACCCCAGCCTGAAATCCTGGAGACAGGAAGCCAACTCCATCAGCTTGGCTCCCAAAGACTCTCTGGTAGTCCCATGGACCCAGGGAGTAGACAGTCAGTACAAGAGA-GTCTAACCATTTCATGCTC-------TGCCTAAGCCAGCTCTAGGTCAAGATCACAAAAATTAATGTGCTGA-AAATCAATTCACCAAAAGCCAATGTGTCAAAAGATTGATTA---AAATGACTCACTTGCTAATTTCATATAATTTGCTAATATGTCAAATCTTTGCCCTAGAATGTTCT a score=1163 s panTro2.chr12_random 1522467 20 + 2259969 AAAAATATATGCTATGgccg s canFam2.chr26 20988434 20 - 42029645 AAGAGTATATTCTATGACTG a score=16892 s panTro2.chr12_random 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ATTGGCACATTGGTTTTTATCTATTGACATCCATATCTCTTGACCAATAGGGCCCTAGTATCCTTTGTCACAATTGCCTCTTCCTTACAGGgctgaatatcttctgtgtgcctcttggagtcactccccatcctttcccatcttgccctttgtatgtgctgcac--accagctccctgtcttgg--cttcccactgagggcagccaataagaagccccacaggaaatgggagggaagggggaaggtaagagaggttggggcatttattcctctggctccctctccaccaggtagtcaggggctggctgcatctctcagcaaaagatcacagctcctgtccaacagatcttgacatacaactctctctgtccctc-----tctctctct---ctctctctGGACTG a score=8064 s panTro2.chr12_random 1528322 184 + 2259969 ACAACTACAGTCCATTCCAAaacctggccctccagcctccctatttgttctgg-agcccccaagaaccttccgaagtccccttttgcttaagtgaaccacagtccatttctgttgctgacaatcagaaGTGACAG-AAAAATGTCTAA-CAACAAGTAATGCACTGATTAATAAGAATGGACACCAG s canFam2.chr26 20990334 182 - 42029645 gCAACTATTGTCCATTGCCAAACATGGTCCTTTAGCTTCCCCATCAGTTCTGGGAGTCTGCGAGAGGCTTCCTAAATCCCGGTTTGCTTAAA-----CATAGTTTATTTTTGTTGCTGACAACCAGGGGTGATAGTCAAAATGTCTAAGAAACTGGTACAGTGCTGACCAACCAGAATGGATACCAG a score=3864 s panTro2.chr12_random 1528816 137 + 2259969 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277 - 42029645 atttgcttggcaagaaccccacagaaatgatactaaggtctccccaatgccttacatcagggccacatgatgtcaactcatctcattgctgctgacattaaccttcgtcattggatcaagttgat---------------------------gtctgacagatttctccatcctaaagttatcattttttcatttgtgatcactaaata------ctttgtagggaagaattcagagattatgccaatgtcctgttccccatagaacctgta-tcaccagctttagtattccatccattgacaatttcttt a score=1062 s panTro2.chr12_random 1531259 27 + 2259969 ctaagtcatctaccactgtgatggtaa s canFam2.chr26 20992761 26 - 42029645 ctgaatca-atgctactatggtggtaa a score=4747 s panTro2.chr12_random 1531610 102 + 2259969 caaatggtattttttatttttatcattccttctatatttattagttgacattcaactgtaagaaagagattttccttcttcccttcatcgtatctgtctatc s canFam2.chr26 20992787 95 - 42029645 caggtggtactttttattcccattattctttctacatttagga-ttgatattatactataaggaagag-tttcccttctcccctt-----tatctatctatc a score=4067 s panTro2.chr12_random 1531818 79 + 2259969 atcttctatctatctatctatccatttaatcagtaaggactggaggattccagttttattccatgagttgcaacctgtt s canFam2.chr26 20992882 79 - 42029645 atctatcatctatctattcattcatttaatcactatggacctgtggattcctattttattcagtgggttgtaagccact a score=20686 s panTro2.chr12_random 1532210 443 + 2259969 acctgttattattttgatgctcagactgtcccagatctgcccagtgggagccacttcaagctgattcctattgtctttttggcatgtctccatcattccttgaggtcttccctattttctagcac---aagatattca-gctcatcttatagttctgttgccccagccctggagtctgtcatcacctttctaagaagccctgattccctttggcagaagatggtatttagaaaccaagatctctgtgctcagtgtgctcattgctcctggggtgtcactgctgctggg-cctcttggtggacacagctaagagat-tatctgtc---tgtctatctatctatc-tctatcttacttctctc---cctctctcttcacacactcaccata--------------tctatatctatctgtgtatatttatttaaaaacgagttcatactgatacattccatttcagttcatc s canFam2.chr26 20992961 464 - 42029645 aaccattattcttttgatgctcagactgaccc--atctggccattggaagacttttcaatccaatctcta-tatcttttttacatgcctccatcattctttgagcacttctttactttctggcacaaaaagatgttcaggctcctgatataatttccttgcctcaaccatggtatcagccat---ttttctaagaagtcctggttcctcttggtagaggacagtatttagaaaccaagatctgagtgtggagtgtgctcattgctactggtctgtcattgctcctaggtcttctcagtggacaaagctaagagatctatctatccatcatctatctatctatcatctctcttggtctcttcatttctctctctccacatgcacactatacatctatgtctatttctatatctgtgtgtatgtatttaaaaaaaaatgagttcacactgatactttcaatttcagtccaac a score=16794 s panTro2.chr12_random 1532653 416 + 2259969 accttagggttcattctaaacttcctcacttccatg-ttgcaattcccttctccaataatgggaaattt-gatctcattatcctcaatatggctatgtctttgc----tcaatTTACTTGTTTGCTTAATGTAACCAGCGTCCCAACTGCACTGCCTGCCTC---TGTCTGCTGCTTCCACGC-----TTTCCTCCTTTTCACTTCCTCAGACTTGGGGCATGCTGGACAGGGAAGGGAACTTTTAAACCAGGCCCTGCTCCCACCTACCCCATGTTGCCTTCAATTTTGCTAGAAAGAGGAGGCCATCTTTTCTCTCATATCTCCCACCTAAGCCAGGCATCTGAGCTACTAAATGGCCTCATGTTACTCTCCTAGCTCCTCTTAAGGGGTGGGGGTTGGGGGATAAAGGGAAGTTAATTTCCTTTAAC s canFam2.chr26 20993530 405 - 42029645 aggttagggttctttctagcccttccagtttccatgtttataattcctttctccaacattgagacacccaggcctcattatcctcaatatatttct-tatttgctttatcAATTTATTTGTTTGTTGAATGTAACCAATGCCCTAACTATACTAGCTGCCTCCTTCATCTACTACATTCATGCCCCCTTCTCCTGTCTTTTACTTCTTCAGCCATTGGCCATGCTGGAAAGAGAAGGAAACCTCTAAACTA--------------CTTCTCTGCCCTGCCTTTCATTTTGCTAG---GAAGAGGCCTTCTCTCTTCCCACATCTCCCACCTAAGTCAAGCATATGAGCAACTAGATGGCTTCATATTACTCTCCTCGCTTTTCATAA-----GGGAGATGGGG--TAGAGAGAGACTAATTTCCATGGAC a score=3754 s panTro2.chr12_random 1533069 74 + 2259969 CCTGTGAAGGCAGATGGTG-CTGGGGACACATTTAGATCTCCTAGGATCCCTTTACTAGGTCTGTGTGCCCACCT s canFam2.chr26 20994112 75 - 42029645 CCTTTCGATACAGATAGGGTTTGTAGACCCATCTAGATCTCCTAGGATCCCTTTACTAGTTCAGTTTGCCCAACT a score=23789 s panTro2.chr12_random 1533649 462 + 2259969 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CTCTTTTCTATGAAAAAATAAATACATAAATTTAACTAACATGCTAtttctttctttttcccttctctttccttctctctctcctaccttttcctccctcccttacttctttcctttttttttttctt----------------------------AACATACA--CAGCacactgtcagcgttccacccaaaca----tcctcattcttagcatgtccacgcatgccagtccaccttctaactgccagtacctgtgaccctttccagagaactttctctggtcattaaagcttgcctggccagcctttgtggtaggccagaagtgccgaagaatttaaacttcccgggagtagccctcaCTG---GACAGTTCCCTCATCCTTGAAGTGGGACCATTTGGAGG-ACCTGCGGCTGAGTCTCCCAGAGGAAACTTCTTGCTCTTGAATTTCTGTGTTAGGTTCCGCTT-CAATAAGACAATATGGAAATCTTTTCATGTTAA--TAGAGGTAGATCTACAGC s canFam2.chr26 20995693 513 - 42029645 CCCTTCTCTAC------ATAAATAAATAAATTTAAACAATATA-tctttcctttttcctcccttcccttttcttctctccctcctgtcttc-cctccctttcttccttccttgctttcttttttccttcctccctccctccctcccttccttccttAACATGTATGCAGCATAGTCTTCATGTTTCACCCATACAAATGCTCcaactcttgccacttccatgcatgtccatctagtttccaactgtcagcacctgcaactctcccctg-gtgctttctctggttattaaaacttgctctgccaacctctgtggcagaccaagagtgccaaggaatttaaacttctcaggaggagctctcaacaaatgacagTTCCCTCATCCCTTGAACAGGACAATCTGGAGATACATGCGGCAGGatctcccagactaaactacttgctctagcatctctgtatcaggatctgcttTCAGTAAGACAGTTTGGAAATCTTTCCATATTAACATACATATAGATCTACTGC a score=60331 s panTro2.chr12_random 1536813 1528 + 2259969 attattcttaa-cagctgcatagccttcctcacctcggtagtatcatcatttatttaactgccccctaattatgaatgcttaggttgtgttcaatttcttgcttttgccacctgtgccacaagaaacatctttTCCTATAATTGTTGTGCCCCACATTTGGCCATTATTTATAGCAGTTCATTATGAAAACAAGCTACTTGATCTTTATCCAAAGTATGGCAATTATTATAATCAGACTGAAAAATAAAAGAATGAGCAATGAAATTAGCAATGCCAAGAATCAGCTGATTCTGGCATAAATAAATTCCCACTGCAAATAATCACATTTACAGCACTGGGCAATTAGAGGCTTGCCATTTGGATCACGTGTTTGGAAAGCAAGAACCTGTGATCTCAGCCTGGCATTTTTGCCTGGTCTTTGGAGGAA----------CGAGGACAGACTTTGTGTATAAGCTCATTGTAGACACCAATTTGAAGATCATTCTGAGGCAGGTTTCAAGGTAGAACAGCTGGGCAGCTACCTGAGGTACT-GTCTTTAAAAGCAGCTAAAACACAAGTAGGGCGTGGGTTACCTTACTCCAGGTTTCCCACCGCAGCTGCTTACATAAATGGTGTTT-GGCTGCGGTGCATGGCGCCCTCTACTGGAGGTAAAAAAACACATGGGCCCAGTGCCAACCTGTATT---GATGT-TTTCGTGGAGAGACACGGGGCAGTAACAGGTGATTATCATTTGTTACTTGTTGGTGCTTATTTGCATTTTCTAAATTTTG-TAAAACAAAAGTATATTGTCTCTAATGACAAAAATAAAATTGTatttaattcccttgcttgaattcaagtctatgccttcttgatgtccctccgtagagagaaagtgtaattaatctgggattctacatgtgattcctcttACCTGCC----TTAAAGGGTCTAGAAAACTGTTAAGAACCACCAG-CCTACA-CTCCAGAGTCATTCTCCAAGTCAGTACCAGAAACGCCGTGGATATAAATGATTTAACAGGACCTTCTGACTATATATGCCCGAAACCCCTTTGAAATTGTTGTTCAACATGgtaagggctttggcaccagacacacctggatttgaacccAGTTGC----------AACTGGTCtgccaaagttgctccaatattttccgtcccggtatctatgcacctttgcagtatgactgcagcacgtcccatcaagagttcattttcccctccctgggatctgtgtggccttgtgacttgcttt---------gaccatcagaatgtagcagaaatgatgttatgctagttccaagcataggcctcaagaagctttgtggcttcttcttgctgcctttgacccctgttcagatgccatgggaccaggtgcctgggT--GCC----------------------------------------------CCATGAT--------------------------TcagtggactgaagacacatgagcaagtcccacggagtctagaggagccaccaaactgcctcactgcagaatcatgagttgaattaatcattgttttaaaccatgaatgcaaaggtggtttgttacaaagtagaagcaaacCCTACATTCCAct s canFam2.chr26 20996206 1550 - 42029645 ATTATTTTTAAGCAGCTACA------------------------------------------ACCCTGTTGATGAATACTTAGATGTTTTTCAATTTCTTGTTTTTGCCACCTAAGCCACAAGAAACATTTTTTCCTGCAATCGTTGTGCCCTCTACTTGGCCATTATTTATGGCAGTTCATTATGAAAATGAGCTGTTTGATCTTCATCCAAAGTATGATGATTATTACAATCACACTGAAGAATAAAAGAATGAGCAATGAAAGTAGCAATGCCAAGAAACAGTTGATACTGGTGTGAATAAATTCCCACTGAAAATAATCACATTTATAGCACTTGGCAATTAGAGATTTGCCATTTGGATCACATACTTGGAAAGAAGTGACCTGTGATCTCCATTTGGCATTTCTGCTTGGTCTTGAGGGGAAAGAGCAGTGCCAAGGACAGG-TTTGTGAGCAAGCTC----TAGACACCAATCTGAAGAATCTTCTAAGG-AGGTTTCAAGGTGGAATAGATGGGCAGCTTCCATGAGCATTAATCTTTAAAAGTAGCTAACACACAACCAGGGTGCCAGTTAAGGC------GGGTTTCCATCTCAGTCTTTTAGCTAAGGGGCATTTCTGCCAGAATACACAGCACCCACTACTGGAAAT-AATAAACAATCTGTCCTGGTGCCAACAGGTCTCTTAGATATATTTTGTG----TATATTTTGCAATTAGAGGCAATGATCATTT--------TTGATGCTTATTTGCATTTTCTAAATTTTTCTAAAACGAAATGGTATTACTTGTAATGATAAAAATAAAGTTACTTCTAATTTCTTCGCTTGAGTTAAAGTCTCTTCCCTCTTGCTGCTCCTCCATAGAGAGAAAAGGTAATT-ATTTGGCATCCCAAATGTGA-TCTTCTTTCCTGTCTTAATTAAAGGGAATAG-AAACCACTCAGAACCTCCAGTTCTACATCCCCAGATTCA-TCTCCAAATCAGTACCAGGGACCCAGCAGACATTAATGATCTACCAGGACTTTCTGACTATATAAGCTCAGAATCCTTTCATGACATCTGTTCAA-AT-GTAAGAACTTTGGCATTAGATGGGTGTGGATTTGAACCCAGTTGCTCCAtgtggtagatggtttgtacaaggtgccccactattttccctccctgtatct-tgcttccttaca-tgtcact----------ccatgcaaagtctacttccccaacccttgaatctg---ggccttgagtcttgctctcgttcaatagagaatagaagtgaaatagaagtggtattgtgcccattccaagcttggatctcaagatactctatggcttttgcttgcagatttgaacccctgcccaggtg-caggcgaccaggtgctggggctagccagttggagtttgaggggcttgtggagcacaggtgagtcagctgtggccatgctagcctagccagcccccatccaattcaccagttgactggaaacacatgagtgagcaccactgagccca---gaacaatcaaactgcccaagttcagaatcatgagttcaataaattgttg--ttaagccataaatgt-ggggttgtttgttacaaagcaagaggtaactCCACACCAcatt a score=4727 s panTro2.chr12_random 1539025 197 + 2259969 taataactatctgacctccagcaagtcccttgtga---gctctaagcctcagttttcacatctgtcatatggggataaaacagttgttcaatggaccaagtaaggtagtctgagcagaacatttagcaaagtgcccagcacttgataagcTC-----------------------CATTATT-----------------------------------ATATCTACTTTGGGGAAAGAAAGAAAAGAATGAGGAAGGGA s canFam2.chr26 20997756 229 - 42029645 taataaccatctggccttaagcaagttttttttaacagtctctgagcctcagttttctcatctgtaaactgggagtgataGGGTTG-TCAATGAAC----------------------------AGCATAGTGCTTAGGACTTGGTAAGCACTCAATGGACATTACAATAATGATCAATATTAATGTTACTATTTTTAGTACCAAGGACCAGTATAAACACCTACTTTGGGAGAAGAAATAATAGAAGAAAAAAGGAA a score=3417 s panTro2.chr12_random 1539222 68 + 2259969 GGAGAGAAGGAGGGTTGTAGAAAAGCACAGATCAGGGTAGAGGAATGGGCTCC---TTAATGATCTAATTG s canFam2.chr26 20998197 71 - 42029645 GGATAGAAGGAAGCACATAAAAAAGCACAGATCAGGGCTGAGGGATGGGCTCTTTATTAATAATACAGTTT a score=5653 s panTro2.chr12_random 1539619 157 + 2259969 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TGAAGCAAGGAGATCCAAGAGGTACAAAGGGTAGACTGTCCTGGGTTCTGTGATATACCACCTGGACTCACCCTTCAGGACTGAGGGACATACTCCCTCTGGAATGACCAGgaatgttacctgctaaggactcagaattggggccctgccagaaattgccttgccccaaagtagctactttgcccaaggtcacgctctctttttgagggcacctcatgtccaata--tggctgatgtgaaggtataaaggtccagtccccatgcctcattttggaacaattctaaggagccattccagttctggaactcctatagggt---cag----ctctg-----------------ctcagctcctccctctgcccattcaagctttactcattcccttgcaggtgctgatctcaataattgcttgcacactaatctccatctcacattctgttttctgagatccccacctgtaatagggaccgtatttgtcttgctca-cgctgtatccccagcgtgtagtacaggccagtgccatagtaggtgctcaagaaatatta----aataagtgaacaaaCT---------------GGGCCTTGTGGGAAATTTCCCTAAATTATTGTAACAAGAATTATTATTCCTTACCTTCAACCCATCCTACCCACTATTGCCAGATTAATACTTCTAAAGTACCTCCCCTGCTCAAGAAGTCTCAGTGGCTCCACACTGCCTGTAGGCAATTCCTTTGGCCTGGCATTCAAGACCTTTAGGAAGCTTGCCCTGGTCTACCTGTCCAACCTTAGCTTTCAAT a score=38200 s panTro2.chr12_random 1545828 1013 + 2259969 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s canFam2.chr26 21002410 954 - 42029645 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s canFam2.chr26 21003981 1057 - 42029645 GTTGCTTTTGTTTTGCCAATCATTACTGATAATGGTACTATTTTCTGGCTACATCATACCTCCTTGATGCCAGAAGCCCTAGTGTA-CCATCTCTGCATCCCC-----------------------------CCCAGGCTATGAACATA---GTTGACTGGCTGTCTTGCTGGGTGGCCAGAGCTGGGCGTTTACTTACGACTGGGGGACCCCTCCGATCCCGAAGCCCACCAGGCCCCGGAGCACCAGGATCCAGCTGTACACGGGTGCGAAAGCACTGAGGATGCCATAGTACAGAGTCCAGAGCACACTGATCTTCAGCCCCTGTGGAGAAGGAAGACACCAAGTCACA-GAGCTTCTCAGTACCTCCAGGC--CATGTGGCCCCCAAACCTGTTGAAAGTCATC---AATGGGGTCATGCTAAACAGCAATCCGCACA----------------GATTCTCTGTg-ggatggtgccaacctccagggggaagggctgtgggaaaattctgcagcattcttggttgccccaatgattggcatttaatat--ataggggcctgagatgttagatg-----cagtgcatgagactcaataaagacttgtcttgtatcctgcaccatctcaaattgaactttctacttgcctatcgtccaggtgaaaac---tccatgactatctgtaccttgaccttc-actctattttatata-------------------------gaaataagatttgaatatacacttaattttgcaggaatccaacttctaggtaaatcaaaggaagtttgtgtgtggtttttctggaactttacaaaattgttcttcatttcagaaagccatgttgtcaatggcaacactgcatatggtatttgagtcattgagggaacactccagtatctgtctgcattcatagGGTTTCTACGTGTATCTATGAATAGACTGATCTAAATCT-ATTTCAAAATGTCAAATATAAAGAAAAAAGCATCAACAAAATTCAGTTAAATACAAGTTTATTTATAATCAGAGACAAATATTAACTTCTTT------TTATCTGGACAC--ttgtgcatgcacatttgcatattgaaaataaattt-------------------------------------------------aactaactgcctccttt--------aaaaagttc-----------------------tccattatatca a score=9037 s panTro2.chr12_random 1548090 160 + 2259969 GGATAAAACTATATCAAAGTATAACTGTACTGAGTGATATTTTTACTATGAAGAATAAAACATAATATAAAGGCAG-----TTTCCTGTGCGGGCAAACTCATTTTGAAGTTATTTTAATGAATGACATACTCTTACATCCTCCTAATTTGCAAATGAAACAAGT s canFam2.chr11 36534797 159 + 77416458 TGATCAGAATATATCAAAATGCAACTGTACTGTGTTAGATTTTTACTATGAAGAATAAAAC------TTAAAGCAGTCTGCTTTTCTGTGTTGGTAAACTCATTTTGGAGTTACTCTAATGAGTAACCTACCCTTATATTCTCCTAATTTGCAAACCAAACAAGT a score=3808 s panTro2.chr12_random 1548561 92 + 2259969 GATTTCTTTTTTAAAGTATGTGAATGACTAGGTTATTTTATCTTTGGAAATTTTTTCTGGATAGTTAAGAAGGCGTTATTCAAAGTGTTCAC s canFam2.chr26 21005090 84 - 42029645 GGTTTCTTTTAAAGATGATGTGGGTGGCtattttatttttt------aaattatttCTGGATAATTAAG--GGCGTTATTAAAAGTTTTCAT a score=1965 s panTro2.chr12_random 1548768 80 + 2259969 CACATTTTTAAAGTAAAGAGGGCAT-GTGTTCAATAGGGTCAAGAACCACAGAGGGACACAATGCTTCAAGACAAACATGG s canFam2.chr26 21005174 65 - 42029645 AACAATTTCTAAGTAAAGGGAACATTGTATTTCACGGGGATAA----------------CAATGCTGCAAAACAAACATGC a score=3331 s panTro2.chr12_random 1549167 69 + 2259969 CACATATTCCTGGAGTGTTAATTACCCTTAGAGATTGGAAAAAAAATTAAGAGTAAAC--------AAATACTATTT s canFam2.chr26 21005239 76 - 42029645 TGCGTATTCCTGGAGTGTTAATTACTCTTAGAGACTG-AGAAACAATCAAGGGTGAATGCAATTTAAGGTGTTATTT a score=15548 s panTro2.chr12_random 1549242 406 + 2259969 CACAATCAATGCCAAA--TATGAGAGGGTAAAATGCAAATTTCAAG-GCATTTTCAACCTGCTCTGTGAGGTCTGGTCAGGCCTCTTTCTGCAATACCCTTCCCAGAGCTCCAAGGGCGAGTTCACCTTCCTGTCCCCCAGGGAACACTTCAGGGGGCAAGTATGAAACATACTGATTTT---TTGCT--TTAAGAT-------------------------------------------------------------------------------------------ATTAAACTGAATTAAAGGAGATGAGTGAGGAAATTTGGAAGCCTACCAAATGATTTCAAGTCTTTTAGAaaatgactttatgtggcagagagaatattttaaataattttgcatcacctcacaagaaagttatttttttcatttcagtcttcatttttatgattatgtcaaagagaaagagtccgtgaggtgccagtctgtctttaacacctattta s canFam2.chr26 21005642 497 - 42029645 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aacac-tcttaa---------------tctctatttttaacagattggacaggaggcaactgtaaccaactagaatttagtaacatggttttattttcattgtatttatttttgcagctatttcctttttaggacaattgctactgatttcctatttaggactctctataaagtttccctttccaaaaacatgcatttaagggttttttaaaaa a score=59195 s panTro2.chr12_random 1550393 1572 + 2259969 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s canFam2.chr26 21006772 1897 - 42029645 aGATATTAAGTATATAACAAAACAGATGGGATAGGAATTATCTAAGCCTAGGGAGTTATGGATCTATTGCAACAATAATAAAGCAACATTTCTACACTCCGAAACACACGACTACGAAATTAGTATTTGCCACATATTTACTTACTTCCTTTCTTGTGGCTTAAGCTATCTTAAGAAGGGTTTGCTTTCTTGGAACCCAAGGAGTCTTGAATCAGAGATAGGACATCATTAGCAGCAAAGAAAATGAAAAGAGGGAAAACAGAGGAGGAGAAGAGGAGCGGGTAGAAAAGAGGGCACCCCGACTGGCACCTGAGAGTTAAGCCTCTCTCCAGCGACCGCCTGGGAGCTTCACTACCCCATTGGGGTCACCACATGACCCCATGCCAGGCAGCAAAGACCTGCATGTGACCTGTCCTGCAGGGTCACAGCAGACTGCAGCTAGCTCTGCATTTGCCCACTGATGTCAGGGCTTTCCAGCTGGCCAGGAAATGAGGACTCAGCAACCATTTGTGAGTATTGTCATGGGTACTGCAAAGGCACGGG-CACTGCCAGCT-GCCTCATCCAAGCACT-GCTCGGGACTCTGCAGAAATGTCTCCTGGGCTTTTGAGCTTCTCATTAACTACACTTGTCATTCTGGCCTAACATTTGTTCTGCCTTTTA--GATTGTTGGCCCAGTCTCCCCATTCCCCTCTCTCCCCCTCTCCTtttcttccttcagtaatcatttactgagcatcccctgtatgccaggTTCTAGAGAGAGAAGTATAGACATTATGTATTCATTAAATTGTTCATTCAAttattcacttaacaataagcatatatcaagtgcctgctctatgccagatgctAGAAAAAATGCTATATATTattcgttcattcattcattcattcattcaACATACATGTATTAGACACCTGCTGTGTGCCCAGCACTAAGGGTACTGATAGGCATCATCCATTCAATCATTTGTTCAATATGCATATATTAAGCATCTGTCGCATGCCTGGCAGTCAAGATACCATGATTCATTCATTTATCCCTTCAACATGCATGCACTGAGTGCCTCctgaggtacagcagggaatgtgacagccagagtctctaactttatggaactttcattcCCATGTTGTAAATCACTGTCACATCTTTTTTTTTTTTTCACTGTCACATCTTTACACTGGGtcctcacagcagcc-tgtggaaagaggctgttatttccactcccattttacaaatcagcacagtgagggtcaaagtagttgagtgatttgtccaggaccagca------gtcaaacctggagtcaggactTTCAACTCCGAATGCCATACTTGGATGAGC-ACTGCCCTCCTCCTGGGCCTATGATGGCTCCCATTG-CCTCTGATAGAGG---------------------------CAGCAAGGATAGGTGGGTCCAGGTGAATGCAagagaacttggcctgtcttgtcaacctctactgagctctagccaaaagttgccatcacagaatgtggatcctgggctgccagatagcccaattaaaaaacaaaaacaaaaacaaaacagagctcttcatttttatgcaaaatacattattttttgaagcagaggcaactgatgcaaaatcctatacagcattgtatgggttaaataaaacacatctataggccatgttcagttcatagctccctggtatacaacctGTAGCCTGGAAAGGCTTCAAGCTTCTGCTCTAAGAAGCTGAGGGTCTTGCTACCACTTGGGTGCCAAGTCTGCAGCCTCCAAAAGGAGCATGCTGATGTCATCATCATGAGCATTACTCAGTCCTGGAAGACTGTTGACTCAGTGCCCTTGGTGTCCTCCGGTCCTGTGCAGGACAAGGAAAATTGTCAGGGGACAAGGAGGCT-GGGGATCTTTAAA 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s canFam2.chr26 21009134 944 - 42029645 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s canFam2.chr26 21010079 1113 - 42029645 GAAATTAGGGTGGAGTAGTCCCAGCTGATACAATAAGATGATACAGAATGAACTCTTCACAATAGTGCAACTTGGC---ATCATCTGTGCATTCATTCTAGTGCCTCgtttctcaacccttgcccccttcacacttaggacttggtagttctttgtggtgtggactgtcccatggactttgggatagcaaacagaatc--tgactc------actagatgccagtagcac--ccctcccctcagtggtgacaaccaaaaaacgtccccagacattgccgaatgtcccctgggaggaagggggagataaaatctgcccactccctcccccgttgagaactgctATTCTAGAAGTTGCCAAAATGTGTTCAGAACTCACAAGATTCAGTAAATGGCATTACTGAAAACCCATCTACGAATCTTTTAAAAACCTGAGCTATATAGTTTTCTCCTTCCCACCATAAA-ATGAAGGTATCTACATTCTATAGGGCTACCTCCTGGGAACGCCATAGGCATGACCCACGTTAGTGGCAGAATGAACATACTCTGCCGAGGGATGTCAGGATCATAAGCTAACGATCTTTTTG-------GACTTGTCTGTAAAACAGAGAACAGTCATCCAG---------------------GAAATCACTTGCTGGTCTGGAGAGGATGAGAGAGTGGCAGAAAGTGGCAACAAGGGGATCTGATTTTCATCCATC-CAACTCTGCcactcgagaagtatttatggagggtctgctataaa--aggcaggtgctgtgccaggtgccggggccacctcaggatgcaaaacaggcatagccaccttcctcatgggctttacTGCACTCAC--CAGGCTGccc----tcctgcccctggcagacatcactaattgatcacagagctgtcccactgagccttcc-actcctcaaatccatgtgtctggagtcctctactgaatgattagagcagacacaagggaggacaaacccatttgccCTTCAGTTTCAGGAACTCAATAAATGGTAGCTGTTACTATCAGCTattatctgatccaatctcctctgacataaataaggaaactgaggcccC-------------------------------------------------------------TTTACT--------------------------------------------------------GTACCTCAGTAAAGTTCCTTTTCATGGGTTCCTGCATT---TGTGTGTGTATATGCATGCTTGCCT 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TTAGTCTAAGCcaatcgttttcaaagtatggtccca--------agcattgacattgcatggggtcttgtcagaaatgcTACACTCAGAATTTCAGTTTACATGTGTCCTgtgcctagcatgtgcctggcgttgtacaaagagattca s canFam2.chr26 21012269 148 - 42029645 TTAGTCTAAGTcaatagttctcaaagtatgggctccggaccagcagcattggcatcacctgggaacttgtcagaaatgcTTTCATTGCAATGCCAGCTCACATATGTCCTgtgcctatgatgtgcctggcatggtccaaagccattca a score=11025 s panTro2.chr12_random 1557704 255 + 2259969 tgatttcaaggc----ccTGAGCTGTAAGTTCCCTCTTCCTTCTTGTTTGCAAATCCATTTCATATCATgtctg------ggctctcccaaaagctggctctaagataaggatcctagtaaagatagtttatttgagcagtgattccagtaggggagtggagaagtgagacagggaagggaaggaaggtaattcagggtgtcttcatgaacaggttcccacagcagacactggagctcagtcctgctgggATTGAGAAATGGCTT s canFam2.chr26 21012900 238 - 42029645 CGAGCTCAATGCAATGCCAGACCTGTAAGTTCCCT--TCTTCCTTGTTTGCAAATCCATTTCATGTCAtatctgaggctgggcttcccccaaagcagaccctgacacaagaattctagtacaaacagtttatttaagtggtgatcccag--gaggagtgg------------------ggaaagcagacaattcaaggtaccttcatgagcaagttcccaagg-----accagagctcagtgctgctgggATTAGGAGATGATTC a score=31594 s panTro2.chr12_random 1558272 808 + 2259969 CTTTAGGGCAAGAGAATCAATGCCTTTATCTAGTATCCCTTGACTGCCCC-AGCCAGGGGTAATGAGGAAATGGTTCTGGTCCAGGGGATATGAATAGGCATTGATTG-----TCTAGATTCTGAAATGTATATGCGTGGGCCCCACTAGGAATCTGTGCTTTGAAGAGAGTCCACAGTAGCCTTACAGCAATGTCTTCTCACTGTACTTCAACATCATCCTTATTAGGCCTCCCAATTGCTAATGCAGAACGGGTTTGCTACTTGTCCAGACCATCACCAAGACAACCCAGAGGACATGCGTTTAGAAGAGTAAGTTTGCCTTACTGTTTTCCTGCCGTACTGGTCTGAGATATTTCCCCAGAGTGTGGAGCTGGACATCATGCCTACAAAGACCACCTGTGGGGGGGAAAGACAGTTGTCATTAGACAGAGGATGTGGATCATTGCACAGAAAGGGAACAACAAACGGAAGTGGTGACGTCACCCTCTAGGTAACAGCaatgatctaacattcactgagagcctgccaaggggcaaacacta----agtgcttcccgc--------aagcttcccaacaatcccatggggagggtgctattattattcccattttacagatgagggaactgagactcagagagagaggcaattgcaggatcagcgtcacagaggcgttaagtggcgcagcctgcactggaatcaggcattctggctccagaactagcttttgacAAGTTTCACACCATCCCAAAGAAACA-CTTGCCCTACTGCTGAGAAAATACCAAGGGCTGCAAGGTAGAGGTTGGC----------------ACACAGGAGGCTGG-----C s canFam2.chr26 21013138 814 - 42029645 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tggctaattttaaaagaattaatttccaggtcctcaacttccatacagactctttcctgagaacaagctatgg---ctcttgtctgtttcttgcc-----ccacctttttcaaccaccccctcccacttCTCATTACCCCACCCTCCCATCTCTGCAGTGCATCTCACAGGGCAATGCTT--CGAGGCTAAACCTTTCAGAACACCTCAAAaaggacaccaatgaca-agatacaaat-ccttttgcgactcatctagtttccaattccttt-ttattatttttaaccaaattgaaagagaacctaatgaagccatcagtaaatcagatcactgaaaataatctttcataagcagttgctgtatgctctttagcatat--aacttggaagtcgctgaaaaaaaaaaaaaaaacaagtggcattagtttattgagttgttacaaaactccttcagtcccccctcaa----ttttgatatgtaaataaggt------------------------aaaaatgaaaaataggaagggaattgctgctaaaccccatcttactttagtagaaagtaatcatccaagaatacatgatgtaattgagagacactccataccactcattaagaggtatgttcctgataaaaattcacttgtgttcaacagctatttatcaaaattcattttttcttgttttggtttattgcatataactaaaaactatcatgataactcagtgcaggagaaaaatgtcaacacttaagagccttatgagctcagaaaattaaaaacaataatttaaaatttatatattttggcttaggaaattctgacaag-tgacaaatgacatgctttcgagcagagtaaaacattgctaggataa-------aaCATGGAGAAATG a score=9568 s panTro2.chr12_random 1560920 265 + 2259969 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s canFam2.chr26 21017685 2337 - 42029645 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ttctctctttccctc-ctctctctctccccctccctttc-ttctctctctctcctttctcttctgtctccctccatatctccctctctcATTTCCTCCCTCCCTCCTTCTATGTTGGAATCCTAGGCATAGCTAAGATCAAA--------------------AAGTGTAAATTCAAAATCACCCCATTA------AATATCATAGATCTGGGGATCCATTTGGCATTGAGAAGCTATTCTTTGAATCCATCTCATTTCATCTTGTTTGAATCACTTCATTTCTGTAGTCCATTGAATATGTGATTGTTCCCTTGGCCTACATTTTAATTTTACATTTGGTACATATCTTATGATACAATTTCTCAACCAGCCAATCTGAGTT-TTTTTCTGCCCTTTCAAAGACAGACATCTCCCCTGTAAGGTCATGAGTCACaaaggaatgatcacaaatgttgataattggggacaaa--------atcacattatttttcatattttgtttaacaatgaaaacccaccaaaaataacctaaatacctaataattgagaaatggttacataaataataatccattgaatcaatgggaaattatgcagaccataaaaatatctgcaaggaatgttaatgataatataacagtgagtgcgaaaaacacaaaacaaaactgtatataatcccaggttattgaagaaaaatatacacatgtagaaagggaacaagaaggaaatattctcttatttttgtggtggttaccactggatggtgggatacaggtgagccctcttcctatttatgcttttcttcattttccaacttttccagaatgaacatacattatttttacacttggaaataaaCTTTTTTCAAATGCCAAAAAATGTAGATTGCTACCTCAGGATCCAGAAAGCCCCAGTAAATCTTTGCCCTCTTCTAGTTGGGCTATT---------CCTTCTCAT--------TTTAAAAGAGGGAAGATATTGCCACACTATTAAGCAATCAGCCAGTAGACTTCATTCAAGAGCAATATACTGACCTCTCAAGAGAAAATTAGTGACGCTTAGGAAATTAGAGCTGCTAACCC---CTGAGTGGTCTAATGCATCCCTCAAGAATTAGTACCATATACATTACACTTTCTGGTGTGGGCACTTTCTTTTCAATTTAACTGTAAATATTTCAAGTGATTGCAATTTCAACTGCTATGTTTTAGACAAGTCAAC-AGCTATTAATCCATCTT---TGAACAGAATATAATAACTCCAGCAAACTTCTGAGATGTCCATTTAATTCTCTGGCCTGGACCCGCTAGCTCAACAAGTATCTTagacctggttcaaatcctggcacctctacttagctctaagaccttacacaagtctctttacctatctggtcataggttccctcattt-gcaaaagggaaacctatctatatatctcacaa 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agccatgtggtagtccaggggaacagcatcccaggtagagggaacagccaaaggAATGGCTTGGTTGAGAATTCAGTAGCT----CTAGTTCTTTGGTTTATTCTCACTTGGTTAACCAACCAAAATGGGAGAGAAGGCA--------------CTATTTCATCTTTATGTATTTA----------GATACTAACCAAAGActttgtacctggcactgtgccagatgctgatacaaagctgagcaagaatggtcctctttctcacagagtctgcagtccaatgagggagacagaTAACAGAATCAGTATGGCTC-CAGGAGAAGTGAGAGCATCCCAGATAATGAGTTCATATTCTGAGAAAGTCAAGCAGATGATTAATACTTTTGCTGCATTATGACGTGAGCAACTATTCTTGAAACTATGCACAATAAAATTACTTGTATTTCTCTGTGGCCCTGCCTGCTTAGAATATCTGGATTTTGGGTGACATATTTGCACAAAGGGATATTGGGTCTGAGGTACTGCATAATG-ACTCTTTTT------------GGGGAAATAGCTTCCTAATAAAAACTAACATGTATAGCACACTTAGATTcacctgact----tgcaattttatag--tgttcacaacgtccctaat-----gggactcctgttatc-cacttttttcagatgaaggaattggagttcagtgaggtaaaaggactttcctgaggtcattcaactcaaatgtgacaATTTCCCATCTATGTCTGAATTTGGAGTCTCAGTTCTCGTGGGTAC--CTCTCCCTTGAATTGCTTAG----TGATGAAATTGCTATCCTCATCCTAGTTGCCAGAGTAGACCCCTCTCTCTTCTTCCCCATCCCAAATATCCACTTGGGTTGTCTAAACCAGCCAGATCTACCTGCTTCTCCCTCCAGGGCCCCTGCAGTTGGAAAAGTGGAAAAGAGAGGGTTTCTTGTTTGCACACTTGGGGAAAAGTGGATGGGATAGCATCCAGACTGGCCCTTACTGGGCTGTCCCCACTGGCTGTCTATACTCAGGTCCAGTCTCCAGCGGACCCCTGCCCAGTGCCTGAAGGGTGGGGCCCAAAGCTTAGCACCTTGTTCCCTG--CCCACCTGTTGGGGAAGAGAAATTATTGGGG 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s canFam2.chr27 11927918 1006 - 48908698 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panTro2.chr12_random 1692177 299 + 2259969 aatctctgctttcaaagagcttacattctaatagTTCATCACACTAGAAGGCAAGTTTGTCTCAGATCATCTCCTTCATTATCTTTTTTACCTTTCCTAAATTGATATA----ATCTttacatagatcatgatgag------gaaggaggtaatatatttgaagtgaccactgtggccaagcacagaacattgcaaaatgctttaattttaaaagtatgtgtcctaaatgtagaaggaagcaaatggaaccagagacaggtatgaaagagtgatgtggacttgaatgaataatttcaggatacataaaa s canFam2.chr27 11987071 305 - 48908698 aatctttgctcttatagagcatactttctaACAGTTCACTCCACTGGGATGTAAACCCATCTC---CTGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTCTCTAAATTAACATGATACATCCTTATGCCAATCATGatgaggagaaagaagaaagtaagatgtttgaagtttgcactgtggctgggcagagaacattac-aaatgctcttattttaaaagtatgtatcctaagtgtagaatgaagcaaatataaccaaggatgggcataaaagggtagtatggacttgtatgaataatgtaaggaaaaataaaa a score=2202 s panTro2.chr12_random 1694664 49 + 2259969 CTGACAGCAAGTAGCAG---------------CTACTGTCAGCTTGGTAACCAAAATAAAATCA s canFam2.chr27 11990071 64 - 48908698 CTGATGGAAAATAGCAGTCACCTCCTAATTTGCTCCTGTCACCTTGGAAACCAAAATAAAAATA a score=9479 s panTro2.chr12_random 1695031 175 + 2259969 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ATTTTTGCTCCTGAGGA--TTACAATCTAGTATAGAAAACAAACCTCACGGTTGACTTAAAGTGCAGGATTTTACAAGCATAGTGTTCATTTAGTATTGTATAATGGTATCATACCTTCTGTGTGGAGTGCCTgtttcccatgtgccaagtgctacactggttgtacttcatacaggacctttgca-agtcttcaaaacaatcctatgagggaaatattaa-catcatccacatatagataa---tgctgagctacag-------agaggttagacaacttgctcatcttccaaaaagatttaaactcaggtctgtcatagtccaaaggccagatggtttttaccacAGGGGAAGAGGTGGACCATAGTCATAGGAAACAACTGTATATAGAGAGGAATGATTAATTGAGCTGAACCTAAAAGGACAGGTGGGGTTTTGGTGTGATGTGTTAGGTTGGGTTGGGAAGGTGGATGAAGGAGTTCCTAGGCTGGCAAGAGAGTCTGAGCAAAGTGGGTCTGAATATCCTGC-ATTGAGGAGATGGGGTGGTGGCAGAGTGATCACTCTGTGACCAAAGAGAAGGCTGCAATTTGAGAGGGAGTAAGAGG s canFam2.chr27 11990313 563 - 48908698 agttttgctcttgaggagtttacaacctagtagaaaagacaaaAC--ACGATTAAGGTAAAGCCTAGGATTGTAGAagcatagcgtt----------------------------------tgttgaatgcctcttttacatgtacacagcggtatgccacgtgctgtccatgtagtttctttttttaatctttcacaca-ttctatgaag-aggtattaatcatcctcgttttgtagataagaatgcttcactataacagtgatagagcttagacaacttgttcagctcccacagagatttaaagtcagattggtcatattccaaacactcagttctttgcatcacactgGAAGAGGTGGGCCATAGTCCTAGAAAACAACCATGTA----GAGGAATTATTAATTGAGCTGGACCTAAAAGAACAGCCAGAAGTTTGGTGGGATGTGTTGACTTGGGTCAGGAGGGGTGGAGCAGGAATTCCTCAGGAGGAGGGGTAGTAGGACCAGAGTGGACCTGAGTATGCTGCTGTTGGGGAGCTGGGGTGGAGAC--AGTGAAAGCTGCTTGACCAAAGAGAAGGGTACATCTCAAGGAAGAGTAAGAAG a score=4257 s panTro2.chr12_random 1701518 123 + 2259969 GTGGGAAATTA-CCTAGTGCTATGGCGCCCCCCAGATACGCTTCCAAGCATGCTATTCTAGGGGGTCCTGCATCCAAGAGGCTTACAGACCAAATTAAGATGCTCAAAGTAAATGCTTTGTTAA s canFam2.chr21 29196362 124 + 54024781 GTGGGAAATTAGCTTGGTGTCATGATAGCCTGCCAATATACCACCAAGCAATCTATTCCCAAAAGTCAGGGAACAAGAAGTCTCACAGATCAAATCGAGATGCCTAAATCATATAGTTTATTAA a score=3129 s panTro2.chr12_random 1703236 278 + 2259969 CTCATGAATATTTAATGCATCATTGATTTGGGGACCTTCTGTGTGTTCAGTTTGTGACAAATGTTTGCTGTCTAATGTGGCCTGTGACTATTTAGCCCATGCCCGGCCTCTTCCATTCCTTTCTGTGT-TCTTCACATA---ATGCTTTCTCTACCTTATCTAGGTATGACATAGCCCCTATAT---TGAATTGTGCATATCCCCCTCATTTGTTTCTTTTTCT-------TATTGTCCATAGTTGGATTGAATATTCTTAAACAATACAGCAAACACACAATGCAAGAACC s canFam2.chr21 29196738 242 + 54024781 CTGATGAATCCTGAGAGCTTCATCTG--------CCATATGTATATTCAGTACATAACAAATATTTA--GTCTA-------------------------------------CCCATCCCTTTCTATATATGTTCACACATATATGCTCTACTCAATTTATTT--GTTCAACATGTCACCCAAATAACTAACTTATCTGTGCTCAGTGTATAAGTTTCATCCATTCCATCAGTTTTCTCTATAGCAGCATCAAGTATTCCTTAACAATTCAGCAAAAGC-CAATACAAGAATC a score=6754 s panTro2.chr12_random 1704124 294 + 2259969 AGCCCTTCCGGTGTGCGTGGCCGGATGCTGGGCCACAGAGATTCACAAATTAGCCCTG-----ACCT----CTGGGCTCAAC-TAATGCAGAGTCTTGGTTCTCCACCCAGAAGCCATTCCCAGCCCCTCCTCCTGATTTCAAAGGCCTTCTCCTTCCTTCGC-------TGGAAGCTGAGAATGCCAGATGCCCACTTTTGCAGCCGGTTACGCAGGGAGAGCTTGGGAACTTTTCCCGTCTGGCCAGAGGGATTGAGGGAAGCCTGCTGGGAGCTCCTGGCCACTATTGCTCTTCATGT-GAGAAAGAGA s canFam2.chr26 35632215 310 - 42029645 AGTCCCACCTGTCCACCTGACAAGGCGAGGGATGGCAGGGGGCCACTGACAAGCTCTGCCTACACCTAGACCAGGGCTCGCCAGGGTTCAGCGTCATGGGTGCCCACCCAGGAGCTATTCCCAGCCCCTACTCCATATTCCCAAGTCCTTCTCTCCCTTCTGTGGAGAGGTGGAAACTGA-AATGCCAGATATACAACATTACAGCCTCTTTTAGAGCTGGGGCTCAGAGTGCCTCCAAATCTGGCTGGTGGGAAGAAAGGAAACCCCCT-GGAGCTCCCGGGAGTGACTGTCATCCCAGTAGAGAGAGAGA a score=41722 s panTro2.chr12_random 1705817 1498 + 2259969 TGCACCTGTGCCCCTGACC----GTGGGCGGCACTGCTCCCAAGTGGGCCAGGCTCCTGCAGGGTGCCCTCAGCCCTACCTGCCCCCACCGGTTCACTGGCTTTGGCCCCCAGTGAATTTCAAGTCCTGCTCTTCCTCCTCCATTTTTA-CATTACCCACCTCACTCCTGTGGACATGTTCACCCATGGCCCCTGATAGTTTATAAGGCTGGAGAATTTTCTATATAAGCTTCCAGTTGGAGTTTTCAAGCGGATTGTACTTTCCAAATTCATAAGTAAA---ACTCATCAAGAAAATAATAACTGTGAACTAAAGTTTTTTGGGAA---AAGGTCGGATTGGGGAAATATGTTTCTGGACATTGTCAATGGCTGAGTCCAGTTGT-TCAGACTCCATCAAGCCCTGCGACCTTGTCCTTTGTATCTTCCCCTGG-TGAATCCGTCAGACATGTGGGGCTCCTTTGATTCAGAAAGAAACAGCCCAAA-AACATTTGCATCCCTGCAGAATCCTGGCCCATCACTCAGTGCCTTGACCCTGGGCCTACA-GCTCTGTGCTCCCCTGT--GCCCAGCTGCTGTCTGACCACCGCCGTCTC-----CTGACT---GATGCTGACAC---------CCCTGAGTGTGGAGACAGCCTTCAGCCTGCAGTCAGACTCAGCAGAGGAA-------GGAGCCCGGCCCCGGTCAAGTCCAGTGCAGCCACCCCATGATAGCCATCCACAGCCCCTGCCCTGGGGAACCAACATGGGCAGCTGGGCAGAGACAGTGAGCAGAGCTTGT---CCTGTGGTAATCA--CTGCTCCCCTAGAAAGGTCAGTAGTACC-------------AAGAAGCTGCTCCCAGCCTTAATAAAGTGAGCAGGACTATCTGTGTCCTACCAGTTGACAAGGTCCATATTTCACAAGTGAAGTCTGGATAGTTTGCTGCTGATAGATGTCAGATAGAATTCCCCATCTCCTCCTCTCATCTTCTGGCATTGAGTGACAAGTACCTTCCCTT-------TACTAGTTTTCACCGAATGCA-AAAACTTAACCTCCCGATGTGTTCATTAAACCTCAGTCTCCCTAATAATCTCTCCTCTCCAGAATTGTATTCTTAGGCCACTTT--GTGAAAGAAACTATGCTGTCCCTGCAGAGAGCAGGTAATTACCTT----GCCCATGTCATCCCCAATAGTGATGTATCTTT-GACCTCACTTGATCTTGATTTTCAACACCTCTGTATGCAGGTAGAAAAATTAAGTGCAGCAAATTTCTGTCAGTCCCTAATA----------------GCAGTTTCTTCTT---GCCTAAAAATTCCAAAACCACCTGAACAGAGAAATGTGCTAGATAGCTACTGAG--TTTGTGGT-CATTAGAGAAGTGGTATGTTTAGATGCACCACATAGAACATCAGCCAACTTTATTAGGGCATCGGTGAGCACTGGCCACT---CACT--GACCCACGG---------------TCAGGAGTTGCTGCGGATCAAGCATGTCCCTGCAGTGAGTAATAACCATAAGCAAAGGCAATAATTAGGAGACACCAGTCACAGAGTCGGAGG s canFam2.chr26 35789577 1576 - 42029645 TGCAGCACTGCCCCCCACCTGAGATGGGGAGACTAGATCC--AGTGGCCCACTTTCCTGTAGGCGCCCTTTAGCCTGAGATGCCCC-ACAGG----ATGGCCTTGGCTCCCACTGAACTTCAGACCTTGCCTTTTCCCGTCCACATGCAGCATCACCC-CTTCTACCTGGGGGGCTCCTTTGCGCAGGACCTCCCATAAATTATAAGGTGGGGACATTTTCTATGTAGG-TTCCATTTAGAGTTTCTAAGTAGGTTACAATTCCACAATTCAAAAGTAAAGAAACTCATTAATAAGAGAATAACTG--GACTGA--TTATTTGCGAATGAAAGCTCCAAATGGGGAAATGCATCCCTAGATACTGTCC-TGGCTCCATCCAGGTGGGTCAGGGTATATGGGGCCCGACAACCT-GCCTGCCACATCTCCCCCGGGGCGAATCAG--AGACAAAGCAGGTTCCTTCAATTTAGGAAGAAATAGTGGAAGTGACATTTGTTGCCC--ACGATGTCTGGTCCCTCGGTCAGT-CCCGGTCCCCGTGGCAACATGCTCTGTGCCCTCCTGTCTGCCTGGCTGCTATCTGCTCGCACCTGTCTTGATTGCTGGCTCCAGCTGCTGGTGCAAATCCTTATCATCAGGTTGAGGGCGGAAATCAGCCTGCTGCCT--CCCAGCCCAGGGACAAGCGTGGAGCCCGGCCCCAGTCAAGCCCAGCTAGGTGACCTCCTGATGGCCATCCACA-CCCTCGCCCTGGGGAACCAATGTGGGTAACAGGGAAG-GACAG------AAGCTCGTGTCCCTGTGATGATTGGCCATTTCCCCCAGAAAGGCCAGAGACACCTGCTCTCTGGCTGGAAAAGCTGCTCACAGCCTGCATGACATGGACACGGTGACCTGGGGCCTGGAGGTTGACAAGCTC-ATATTTCTCAAGAGAAAGCGTGGTTGTTTGCCCCTACTGGATGCCAGTTACAAT--CCCATCTCCTCCTCCTACCTGTCAGCTCTGTGTTAAAAGTGCCTTTTCTTGTCCCAACAATAGGTTTATCCAA---CATAAAACATAACTTTAGTTCATGTTCATTAATCCTCAGGCTCCC-ACTCATCTCCCTTTTGCAGAATCACATTCTCAGACCTTTTGTGGTGCAGGAGACAATTACATCCCTGAGAAGAGCAGACAGGTGCCCTATCTGACCCTGTCATCTCCAATATTGATATATTTCTGGATTTCACTT-ATTTCAGCTTTCAACAGCTCTGTCTGCAGGCAAAAGCATTAAATGCAACCAATGTCTCTCAGTTCTAAGCAGAGATCGTAAATGCTTGCAGTGTCTTCTTAAAGCTTGGAAATTATGAGACCATGTAAATAGAGAAATGCACTGGGTAGCTACGGAGACTTTGTGGTCCAAGAGAAGAGTTGTGTGTTTAGATACAGCACACAGAACACAAGCAACCTTCATCAGCACTTCTGGGAGCACCTGCCCCTCGGCACTGGGGCAGACGGGGGGAGGGGAGGGAATCAGGAGTCCTTATGCATCAATCCTGTCCCTGCTGTGATTAATGGACATGGACAGTGGCAGTCATTAGGGAGCCTCCTCCACGGGGCCTAAGG a score=5639 s panTro2.chr12_random 1712862 160 + 2259969 GGGAAGCCCAAATATGCTGCCTACTGGCTGACAAAATTACCTCCAACCTTTACCCCTAAATTATGTGACACATCG-----GAGGGTAAGACAGACATTTTTTTAGGTTCAGCTCACTTACCTCGATTACACTACAC----ATAAAGGTAAAGTAATAAGCCACAAATGG s canFam2.chr26 36744103 166 - 42029645 GGAACATCCAGATTCACTGTTCAATGGCTGCCAAAGTCAACTCCAACCTCTACCCACAAA--ATGGGACACATCGTTGGTAGAGGTAAGAAGGGCATTGTTCTGGGCTCAGCGCAGCTACTTGAATGATTCTATTCATGAATGAAGGTGAAGCAA-AGACCACAACTGG a score=14035 s panTro2.chr12_random 1713261 484 + 2259969 aaattcagcatagatatatatatGCTGAATCTCTGAAGGCGTTTAGAAAATGGACCCATGGAATTCTTTCCGC--AGTTTCCGGTATCATCAGTGTCTCTTGCTAAAACGTCTTCTGAGCTTTGGCAGGGGAGTACATCAACCACACAGGTGCGATGTTTGTGAACAAGAGTCCCACTCATGTCCAATGCTGTAAGCAGTCCCCGCAATTATGAATCTAAAAAGTAATTAACACCAAAGGTGGCCACATTGCTTTCCCACTTAGAGGGGCAAATGAGAGTGCACG-TTAGATTAAGTACAGACTAACACAGCATATGCAAAGTCGGGAGTTTCAAATGAAAAAAACAA-ACCCGGAG---TGAAGTATCCGAGAG--GATACATTTCCAACCATCAAGATAATAAGGAAAAAGGTCAACTGGAAATGGACTTCAACAGGACCTGGCAGTTTCTAATTCTTTGAGAAAAGTATTAACTTTGAGACACATTAAAA s canFam2.chr26 36745066 483 - 42029645 AAATTCAGCAAACA-ATATTTTTTCTGGATCTCCTAAGGCATATGGAAAGTGGAACTATCACAATCTCTGAGCCAAGTG---GATACTGCTGGTATCTCTTTC-AGAGTGCCTTCTCAGCTCTGGCAGGGAATT-TATCAACTGCACAGGTGTGATGTGTGTGAACAGGATTCCCACGGAAGCCAAATGTGATAAGCAGT-CCTGCAATGATGCATCCACAAGGTAATTAGCACTGAAAGTGTCCACAGAACTTCCTCTTTGGGGATGGTAAGTGTGAAAGCACATTTAGATGAAGCAGAGATTCGTGTCACAC-TACGAAGCCAAGAGTTCCAAATGGCAAAAACAAGACCCAGGGGGTTGGTGTGTGGAAGGGATGATATCTTTCTAATCTTTGAGTTAGTGTAGCATGAGGTCCACTACAAATGGATTTAGGTTTGGGTCAGCAGTTTCTCATTC--TGGGCGAAATAATCATTATAGAAGGTACTACAA a score=19548 s panTro2.chr12_random 1714048 726 + 2259969 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GTCAGGAATCACTTCTTTACATCCATAAGGTTTCA--ATATGCATTCACAGAATGACC-TCTTCCCTCAAGGGGATTCCCACTGCTATTTTTTTGAGGTT-CTGTTCATTCTCTGTCCGGTACCCTCTCTCTCTGCCCAGCTCACAGTCCCAA--GGCCCGGAGTGTGGACA-------CCACTT-----CTGCATTTGCACATCAGCCACCCCCTTTCCCAAAGACCAT------ATAGTCAGCAACAGGCAACAGCTTCAAAAATGTCAATCAATCCACACTGCCAGCCTGCTCAAGACCCTCCAG-GGCTTCCCTGCTGACTT------ATGTCCTCACT-CCCAAAGACAGTTTACATGGCTC--TGGGACAAGCACTACCAGAACTTGTTCA-------CTGGGAGGAAACT-CCCTTATTCTAGGTGAATTTTTT-----CTCCTTTTTTTG--GACAATCAAAAACTATGTGCAGATGGAGGATAACTGTGTATCAGA--GTTATAATACTAATTTGCATTTATAAAGTACCTATAATAAAGAAAA-CTGCTATGTAT--CAGATATAAAACTACTATGTATCAAATGCTCTAAAATGGACACAATTTAGGATGCTACCACACTTACTTCTCAGCATGAAATAGAAATAACAGAGGT----ATACACATGGACACACATGCACACCAAATTTCCAAAGCAAAGGAAATAAGGCAGTTATAAGGCACGATCTTTCAAATGAATCTCCTATT a score=21255 s panTro2.chr12_random 1716710 1012 + 2259969 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s canFam2.chr26 37415618 1068 - 42029645 AGCTGCCAAACGCTGACACATGGGTAGTTCTGAGAGCTCCCGGGGCCATTCCAGGACTCTGAGCCAACTGCTC---------CCTCTTCTCAAGCCG--CCCCCATACACACCTCCCTCTCAACTCTCTTTCCAGCC-ATGCCCACGCCTCTGCAGGCACGGGACGGAATTCAGGAGTTACAGAGGAAAAAAGGCTTGCTGTTTCTGAAGGGAATTAAAACGGCAAGCCAAGATCTAAGCGGCCGGGGCTGCTGCCTCCCTATGAATTTTATTTTACAT----GGATTATCCTTGCCCTGAGGTGATGCCGTGTAATACAGTCAAGCTTTCATTTGTCTCCCTTCATAGG-ATTTCTAGTTAAACATAAGTAGCAAACAAGGAAATCACCAAAATGAAGTTAAAGAAAAAAATCTATCAAAAGACTGGACATAAAATCCCATCA-AAACACCATATTATTTCAGGTCAGATGTAAGTAAGTGCAAAGTCCAGCACTTCAAGGAACAAGAATAGCTCCCCTG----GGGTGCGACCGCCACACATTTCTCTGACTGACCC-----TTATCACCCCAGGGAACATGCCAAGTG-GATGAGCCACCAACTCCC--AGAAACACAGAC--AGGGAGGGAAGACATCCTTGTCCCCAGCCAACATCAGAAAATCCTCACACAAGCGAGTCTAGTGCTTATCCTGCTTTGTTCCCAAAGAGATATGGGAATTCTGGAACAAATTATTTCCTTTAAAGAATTTCTGCTATTGCTATCATTGTATTTTGTTTATGTAGATATGATTCCGAGGGTGTGTGCATGAGGCACGTCCCTGCAGCTCCACTTGGAACATGCCTGGCAGGTGCATCCCACAGAGGCCAGACTGAGGGTCTCTGAGCTGCCTCCACAGGCCTCTCTGCATGTCTGGAGTTCAGTGAGGTTTGTGCGCTGCACCATCCAAGGCGTATGGGGACTGCAACGCCTGG--GCACAAGGAAGCTGTGGACCAGCAGTCTGCGGCTTTCCTGCTGGATGCTAAAGTGGACAGCCGTAGCCTCTG-------CACCCAACACCCCTGGCCTCCTGCACTACTCTGATGGCACCTCCCGGGC 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panTro2.chr12_random 1738581 816 + 2259969 TGTACACAAACAACATGGGAGAACCAAAAATGTGTAAATAATTTTTGACCT-ACAGTAGACTGAAATAGAAGGAA---GAGAAAGAAAATGTCCTTCAGTTTTGTTTCTTTTTTCTTTTTTACAACACAAGTGCTCGAAGCCCTTCCATTTTGACAAAGATAAAGAACACCGTCAAGGTGACATGTCTTTGTATGTCAACCTTTCTTGAAAGAGGAAATTCCAGTCTA--------GAAAACATGGTTAAAAAGTAAACTGAAGGGGAGGTTGCATTTTGACATTTCTCAAGAAATGAGCTTTGGTGCAGCTGATGCAGCAATAGGGCTGAGGAATACACATAGACAGGGCATGGATGCCTGTTACCGTTCAGAATCCTCAAAA-GTCGTAATTTAAATCCAACGCCTA-ACAGACGCTGAGTGTATGCAAAACAGGCCTGGAACTCAGAGCCCAGTGGAAGCTTGCTAAGAACTGAAGAGATGCAGATGAAATCATTTTGCTTTTCATCAGCTCCCATTA-GGTTTGTGTCATATAGTGAGTGCCCTACACCTGACTTGCGTGGTGAGAATTACTCACTGAGGAAGGCAGGACTCCTGCTAGAGGGTGAGCCCT-GGGGCACGCTGTGGAACTGGGACCCCTCAGCCTCCTGAGAGAT--GAGCTGG---GGGCTGGGGGTGTCAGCAGAAGCAACCTATTGTTCTCATGGGAAGCTTTGGTGGACCAAGTGCAATCATCAGACCTATCTCCAGGGCTGTCCTTGAAGCTCATGTGTTCTTGCTGCTTTTCCACTGTAAATTCAAACTTTTAAAGCACAGCAATACATTGTGAACA s canFam2.chr26 4233332 744 + 42029645 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s canFam2.chr26 38254566 726 - 42029645 TCTGTGTGCACATGAGCAAAACTGTGTGCAAATGTGTACTTCCGTGTCTGTGTGCACTTGCACATACA----------------------------------------------------------TGAGTGCAGA---CCCTA---ACATATTCACAGGGGC----CCACGTT------------------CATGTGGATGAATAGATGTG----CACATTCGC--------------------------GCGTGGGTGTATTTG------------TGCACATACGTGTGTCACTGTGCGCTT---CCGTATGCAGGTACTTGGCTGTG----------------------------------AGCCTAGGC----ATCTCTTCTGCTC---------------------CGCACCCTGTATGTGTGCGTGTGGCTCTCTATGC----CCGTGA--GCACTCATGTGCCTATGGGTGAGGGTG----------TGGCCTGGGGGGCCCTCCCAGTGGAGGCGGTACCTCTCCGTACGTGAGGGTGTCGTTGTAGGTCCTCATCTCCGGGTACACGTTCTCCAGGTACCACTTAAAGCTGCGGCATTTCAGGCGCTGCCGTAGGGCCAGCCGTTCAGACACGTCCCCAAAGTCCACCCCTGGGTTCTGCAAGGTGGGAAGTGAGGCAGGAAGGGAGCTGGCATTGCCGAGTCCCCAGGGCCAGGTCTCTGCCTGTGA-------TGGGGGACCCCCAAGACC-----------TGGGGGCAGCCCC--------------------------------------ACCCCTTCTCTTCCCCCAGAACCCCTGGAGGTCTG-GGCAGCAGCTCCCGATGGGAAGGG-CCTGCT--------TCTCCAACCTGGACAGATGGCCCCGGGCTGTGGGCTGGctgggaggtcacctctgagccctgggaatatactgcctgactagactg--ctgtttagctgg 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AActatctcaaatttttcatt-----------ttttttatacatctatgctgccattctgggcagttccc--------acct---agattattaatgattgttttagctgagtttaatctgctatttactccattcaataagtatttatatttt a score=28559 s panTro2.chr12_random 1818835 895 + 2259969 ttttTTCAATCTGCTTTTTTCAAATATTTGTATTTCTGCCTCATTTCTGTTTTAAA-GCATTTTGTTCTATCTTACattttgtccctttgtggtaatttttatgccttcctttacagttttacaggttttatacacactagatttgttttatagtcttgacctagctctattatgccaagtttt--gcttctctttgttataactgatgattcatacatggtacatttttcattgatttctgttatgatctatttgtaattgcaagttcctttttagcaaaataaagcttgtattttttttcctataccaaatataatacagcctggattttaagaaggtggttctagagtagtattacttatttccaagagtatctctggatgaggacaactttttttttttttttttttttaacctctgggactggttgtttttgcaggacagagagaggtatagttacatataatatcacctgaggcacaggcttaaggtcttgatttctcaaagggagacattttttcctcacctaaatttacatcaggataaaatttttattttattttctgctgcagctggaggtcacggtatgtccaatattccttt-atcttttgagaagccctttgtagcttcaagatttattgtagcagtctgttttaactcacacccctaaagtgaacacagaatcagcttttgctcctaaccccAGCTTTTGTCCCCTTTCTGTTTGTGCCACAGGAGGTTTTCTTATCTTTCATAAGAACACAGATGATTCATCCATATTATTCAGTGCTTCCACTTGTTTGTAGGGATAAAAGAAAGGTTTTTGCATCACTTTAAATGGCAATTTTATAGAAAGAGGTTTTGTT--TTTAGTTTACTATACTAACAATGCTAGATAT s canFam2.chr27 17045683 834 - 48908698 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s canFam2.chr27 19461221 1628 - 48908698 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a score=9377 s panTro2.chr12_random 1889579 347 + 2259969 TCATTTAAGGTTTTCGAACAGGGCAGGACGTGGCCAGGGTTGTGCTTAGTTGGTTAACTCCGGCACCCAGACTGGAAGCAGGTGTGAGACTCCTGCAGTGGAGACCAGGCAAGACGCATGCGCCTCCTGAGGACCTCGGCC-GAGAGGCTGGCTTCAGGGTGTGGCGTGGGAGGCAGGATG-CTGTCCACTTTTTCTCAGGAGGGGTTTAAA-----TCATCTCCCA----GTCTCCCTTCCAGCCCCGGTTGTGGGAATTAGAA--------------CCTGTACAGCTGGCAGTGGCGCTTC-------CCAAC-----------------CCTGCTGTGAGTCTGAGGGGGCCCCCAGCCCCCT---GGAGAAGCCTTCACCC-TTGCTGAGCACTC s canFam2.chr27 4121023 387 - 48908698 TCACTGAAGGTTTTTGAATAGGGCAAGATGTGGCCAGGGTTGTCCTGGGCTGGATAAATCAACTGCCCAGCCTGGAGGTGAGGAGCAGGCTGTACTAGTATAGGTCAG-------------GTCTCTTTGGGACCTCAGCCAGAGAGGCCGGCTGTAGGGGGTGATGTGTGCAGCAGGACATCTTTCTCCCTTTCTTTAGGAGGGGTGTAACCCCCTTCACTTCCCCTCTTTTCTCTCTATCAGCCCTGGACCTGGGAACAGGAACTAAGAGGCTTTGCCTTGGGTGGCTGTCAGCACCACTCCTGCCCGTCCAGCTGTGCTGATTCCTCTTTCCCGCTGTGCATCCAGGGAGGCTCCTGGCCTCTCTTGGGGGAAGCCTGCATCCGCTCTTGAGTGCTC a score=2457 s panTro2.chr12_random 1890131 55 + 2259969 catgggattaaaatttgctctttaatatcattctaagttaaaaaacaaatttaag s canFam2.chr27 45167915 54 + 48908698 catggtatttttatttgctacttaatgttattttaagtttaaaaatta-tttaag a score=12164 s panTro2.chr12_random 1890516 292 + 2259969 ttttaacatttgtttttatattgtaggatgcaaggtataaatgaaaatattagcattgacctcatatgtagaaacaacacaattacacagttcacattccatagctcatccatgtgtatgtatttcattcttgctaaaacagtagatacgctgcacaaaactagctcagctctttctatctcacttcctgacacccacacacaccagcaacactccctaccttgggatcatggac-actaaggaaggactgaaaggacag-gagctataggctgctctctcttcccctttcctt s canFam2.chr27 45167981 288 + 48908698 tattaccatttatctttatat-----gatgcaaattttaaacggaaatatgaacatttaacttataggtgaaatcaccaaaattacacaattaacatttcataccttgtacatgtttatgtattttgttcttac-agtacagtggaaatactgcacaaaacaaactcaaatgtttttattccacttcttgacacacacacattctacccacacactgtacctttgggttactgatgaataaggcagcactgaaaggaaaaagaactgtaggtcattctgtttcttactctcctt a score=10132 s panTro2.chr12_random 1890926 367 + 2259969 gggttggttagcacagggaagtaac--tccaataagaggatacaacagagcccctcagtcatttgtgtctcttcaaatgtcattgccttctttctgtgtacaa-gcacattctggtttcagtggaaagtgaggcctctccagttggttagtgcccc-gctcactcagtcactgactaacaaccctgcctctactcacagcatgctgagtttcctgcacatcccacagcatggctcc----------------ccagaggcatggagaagatt--atgtgaatggggcggcagggaatggcggccacacacatcacatgtggctcctctgctcctgtgcatgcccccttgtcctacaggacttcgctgacaaaacagaagtgtagagata s canFam2.chr27 45168531 358 + 48908698 GTAttggttaatatagagatgtaacaatagatgaaaaggataggataggctccgttggtcatttgtgtgtcctcaaatgtcattgccttttttttatgtacagtgtatgttctggtttgaatggaaagt-------ctcaggtctttgggtgtccctactca-tcagtcatgacctaacaccctttcct---------------tgtgctccct-------ccatagcatgggtccaccagaattctgtgctcctaagtcattggaaaggctgcatgggaatagg-tgccaaggaatggcaggtactcatatgccatatatctcctctgtctgggtgtatgctcccttgtcccactagactttagttagaaaatacacatttcaagtta a score=14722 s panTro2.chr12_random 1891296 464 + 2259969 ttattaatg------------tgacagcagagtgttaaaccgaatgtggggcactttcaagtgcaggacactatgcaactgacttcgcagg------actca-gaaagtggccctgcctagcacatggccacatagcagatgctaatcaatgtg--ttaagtaaaggaaCGAAGGGTTGTCACCTGATAGAAGATAAACAGTTCTTCTGTTTTTGATACAAACTAAAGGCCTCTCTCCTCCATCACCTTGGAGATCCCACATAAATATCAGAGGGGCACCACTGCCTGTGATTGCCTATCTTTCTGGAGAGGAGAGAGACAGTTGCTCTAATATGTCA----GAGCAAGAGTGA---GAGGGAGGGTATGAGGGGAG-CTGACCAGGCTTATCTGTGAATT-ATCACCGCACTTTGCATGTACTGCAGGC-ACACCTTGTATCC-ATGCTCTTAA-ACATGGTC--AGTG-GAAATAAGCT--ATAGCTCA-TGCCTTCTCCC s canFam2.chr27 45169108 480 + 48908698 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s canFam2.chr27 4316315 1940 - 48908698 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a score=14798 s panTro2.chr12_random 1901066 261 + 2259969 AGACAAATGCGAAAGACTGTGCAGTGGATTATAAAACTNAAGGAGAATTCTGCAGTCAGATTACTTTTCAAGTGTGTCTTCAACTTCTCTCTCCACTTTAAAGAAATGAAAACAGGAAATCACAGATGATGCGTTAAGGGTGTGGTTTAAACAAGAAAGATGACAAAGAAAAAGGCATTGGCTCTGCATCAAAAGATTCATGTAGATATGTAGATATAAATACATACATATATATCGTTTGTGTTAAAATAAATATTTAGG s canFam2.chr27 4978084 256 - 48908698 AAATAATTATAAAATATTGGAGAAAGGATTATAAAACTATAGAAGAATTCTGTGGTCAGATTTCTATTCAACTCTATTTTTAATTTTCCCTTCCACTTTAAAGAAATGAAAACAGGAAATCACAGATGATGCATTAAGGGTGGGTTTTATATAAAGAAGATGACAGAG-AAAAGGCATTGACTCTGTATCAAAAGATTCATGCAGATGTGTGTGTATGTATACATATATATGT----TCTTGGTTAAAATAAATATTTTGG a score=16333 s panTro2.chr12_random 1901625 359 + 2259969 TGTGTATCTTTTTTAATAATTCCT----------TTCCA---AGTAGATCAAAACCTCCTTGAAAGTAATAACCCTG-----TTTCCATTaggactggccacagaatttgttgagcccagtgcaaaatggaagtgtggggctccttgttcaaaacatattaagaatttcatgatagtgacagcagcgcgtgaagctaagtgaggggactg----agtttgaggccctgtgagactgcacaggttgcaT-------------CTCTGATTCCCATCTTTTAGCACAGAACTTGACATACAATAGGTAattctttcactcgacaggtattt------tgcatgcagtatgctaggctctgctctagactctggaaatacagtatggaacaaaaaagagaaaa s canFam2.chr27 4978340 395 - 48908698 TGTGTATATTTTTT-ATGATTCCTAAGATTTACCTTCTATTGAATTGTTCAAGACCTATTC--AGGTAATTACACTGGTATATGTCCATCATGACTGATCATAGAATCCA--GAAAccaatgtaaaatgaaaatgtggggttctctgttcaaaacgtattaaggatttcaagatggtgacagcagagcattaaaccaagtgtgcggcctgtccaagtgtagggctctgtaagcttgcacagatcacataccatggagccaactctgAttcccatctcctagcacagaacctggcatgtagaaaatgattctttaacttaataggtattcattgagagccttcaatgtgccaggcactgctctagactctggaaatacagtatagaacagaagagacaaaa a score=5452 s panTro2.chr12_random 1902470 131 + 2259969 TGGAGCTTAATTTCTATTGACAGTGGTAGGAAGT--GAGAGGGTATACAATAAATAATAAA----TAAGAGATATAAC---TTAGATGGTATTGAGGGATGTGGAGAT-AAATAAAACCGAGAAGAATAGAGAATGAGGGA s canFam2.chr27 4978747 141 - 48908698 tggagcttaatttctattgacagtgttaggaagttagaaaagatatgtaataagtgataaagaagtaaaatatgtggcacattagaagatgttaagtgctatggagacaaaacagggtagaggaaaagggagcataaaggA a score=15750 s panTro2.chr12_random 1902847 514 + 2259969 CCCTTTCTTTCCTTACTCTTAAATTTCAGAGTTCTTCCAGATTCTACTATAAATGACCTTGTTTTATCCTTGTATTACACTTCTGCATACAGGATGATGACTGTTAAATAACTAACCCTGACTCACTTTTCTCCTGA---------------------GGCTG------CTTTCTCTACCCTCCCTTCCCCACCCGCA-CAGGTACTGCCACCATTTCGCCTTCCTCCGTTCCTCATGCCTTAACTTTTTCTTTATTCTTTGTCT--TGGTAAATGGCATCATTGCCTACGGTTCTTCCAATCCCCCTAAACCGAATCATTTGGCAAGTCCTGTTGATTCTGCTTCCTAAATATTACTTAATCCATTCCCACACCCACATCACTTTGGCCACGATGCTCACGCAGACCCTTGAGTTGCGTCT----AAACTGTGACAGTGTCCTCCTTGCCAGTACCTGCCTCTGGTCTCTTACATCCCCAGTTGGCCTCACACTTTTCACT-CTAGCAGTACTGAAATATTTGTACTTGTCCAAATTTAATAGGCTTT s canFam2.chr27 45506251 533 + 48908698 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TCTAAATTAAACTAAACAAGATACATTTCTCTGTGGCCCTTCTTTTaggttgtgttccccaggaagcagactctgagatgg----ttgcaaggatggttattagtaggaagactcttcagaaataacatctatgagcagatttgaactg---------------tgattccatgatagcagaggtttcagccaa-ccccacagggagctctgaggccaggatagccattcagaagcaaaacggttgaccatttgtg-ccctacaatgatcactcagtggatgtaggctgtcaccagagaggggatgtaatcttgagagagacaagcccccttcagcctagggcaattcct----ggaggACTCAGCTCTTGGGTGGTGGGTGTCTTGGTCCTGAAGGTGGCATCTGAGCAGTATTCTACAACATCCACTAC a score=24108 s panTro2.chr12_random 1909647 526 + 2259969 ACTTTTTTCTTTTTCCAAACAACCTTCTTCCCTGCTCGTGATTTGGCATAGTACTTTTTATAGCTACCAGGCAGCTGAGTGAGAGGAA-AGCTTAGGTTGATCCTGCTGCTAAAATCGTGTTTTTTTCAGTCAGTGTTAGGGTTTTTTTTCTACCGTGCCCA-ATATTAAAACT-TAAATAGTATTACTTAAAATACATGTGCACAGTGCATTCCATTTTGTCCAAAGTGTCTTCATGATCATTATATTTCATTTAGGGTTTCTATTTTTTTCTGAGTATTTTTATATTTATGAACAGCTTTCCCTCTTTGCCAAACTGCTTTTATGGGGAAGAAAAAAAAAAACACACATACACATTTTGAGTTTCTCTATAGCAAAAAGAGACTTCCAAAATCATTCCACTGAACTTAGAATGTGACAAACGTTGGGTTTGTTCTTTTAATAAATCCAGGTCTTGTAGTATCTTCATTTGCTCACTTG-----ACTTTGCCTATCTGTACATACTCTGCTCCTGAGGCTGAGCGTGTGGCCT s canFam2.chr27 33444829 509 - 48908698 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ccttcttttcatct----ctgtattctattcctgaacaatttta----ctcctacggcctctagatgctg-tgactccagtgtctattagtgccaaatcacactgctttccttagtgttagatccagaaatcctgactgcccattcggcatctccaagtggacattccatagacaaaataaattcaggctattgaagatgaaacttacattccagacttttcctttcTCTTATGTTA-CCATTTAGGTGGACCAGACCAGT---CACACCCACCTCCAAATCATAAAT-----------CCTATTGGTTAAGGATTCCAATCCTTAAATGCCAGTTTTATCCCCCATCTCATATTCAACATTGACTTCTGAACCTTTCTTAAGTCTGTCCATTCTTCATTCATTCCCATTGTGTTTTTGTATTAATTCCCCCCATCAGCAGCCTTCATCTGGTATAAAAGATTCAAAATTTTCCTTCCCAACTCCAGTGTTCCACCCTAACAACCCCCTATAATGAT-----CATTATAAAATGTAGATGTACTTTGGTGATTACCTTGCTTAAATTAACGAGT-CCTTAGTACCATAGGCAATGTTCCAACTCCTGAGCTGGTCTTGCTCATAGGTCCATCTTATCTACAG-GGAGTTTTAGTACTGGCGAGACCTATGTGCATTTTTGACTCTGCCTGGACCTTTGCTCATTCTGTTCCATATGCTGAAAAGGCTTCTTCTGTTTTACTCTCTC a score=14196 s panTro2.chr12_random 1914165 444 + 2259969 TGCTTTTGTTCATTTCTATGCCTTTGAGTTCTGTGACTATGCTATTTTCTAGAAAATCAtcttcctcctcatcatcatccttctccttcccccctactcctcatgttcatcttcccactccttgctttctcctttatctttccccttctcccagtcctttcccacctccttcttctttgcctAGACTGGAAGCCTCTTCTGTCCTCTTCAAGCAAAAATAAATGCTTTCTCTTCTCTGATCCCATAAGACATTGTGCATAAGT----TAAAATGTTTACACAATGCCATGttgttggttttttttttttttttcagatacattcttccactaacctatatactc-tggaaagaagggagtgtactctaaacatccttatatcccaagaacctagtgccttgaaacagggtagcagcttaacaagtgctgactggaggaatgaaCttatt s canFam2.chr27 33890679 394 - 48908698 TGCTCTTGTTCAGTTCTCTACCTTTGAGTTCTATGCCT--TCAATTTCTTAGAG-----Tcttcctccttctacctgccttccttccttccttct----------------------ttccttcctttcttgttt--------ccttcct----tcctttcttcctcccctcTCCACT-CCCAGACTGGAAGCCTCCTTTATCCTGTCTGAACAGAAATAAACTCTTCCTCTTCTTGGCTTGTGTAAGACATTGCGCATAACTCTACTGAAATGCTTCCTCAGTGCATTGCCATT-------------TTTTTcagatatgtccccaaactgctccatatactcctgggaaggatggactgtattctagtcatcttcatatccctggtacctggtgcactggaacagagtaggaatttaataaacgttgattgaaagaatgaaCTGATG a score=109310 s panTro2.chr12_random 1914711 2204 + 2259969 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s canFam2.chr27 33891073 2193 - 48908698 TATGGAGCTTACTCTGTGGCAATTGAGAACAACAGAATATTTGTCATAAAGGGAGATGAAGAAAATCTGGTTTCTGTGCTTGAAATTGCTCAATATGGAGACTAGAGGCAAGAAATCAAGTTA---AAGGTATTGCAATGCTCTAACTATGGTTTCTGACTAGGGTTTCATTGTGTGTTGTTGGCTTTCTATCAAGGGATATGATTTAAATGGAGGTATGTCTTAACATGTGTAATGCTAA-CTAAGCTATCACAGGTTCTAAAATACTTAGGCAGGAGGCTGATTGCAATTATGTTCACTATAATTTCCTCTCACATGGTACTGTGGTGTCCCCCTAAGCCCCATCTTTATTTCCACCATGCGACATGTGTCATTTATAGTTTCCTGAACCTTCAAAGAGCTATTCCATGGCAACAGACTGCGAGCTTCTAGAAAAGGCCTTAAGGCACTCATTCAGGGACTGCTGTGTACTAATAAATGCTCCTTGAGATGACATGGAAGCTATGTATTAGATGAATTATGCACTTATTCATAAAGAGATCATTAATGAGGTCTTCCTAAACACAAATGTGTCCACATGTATAATATCAACTGGGCAACAGCTCAGAAACCTTGTTGTTCATATTGCTCATTTT-------GAGGAATAGGCAGTGACAGATGACAGCAGATTACAGGGCTGACAGTCTAACGAAGTTTTAATGGTAAT-GTTGACACTTATGGATggta---------cttgagtaagtccttcatg---ggcattattttatttaatcttgaccacaaatct-----------gtaaatctctatttttacacagtaagaaattgagccttagatgggttaaatgactcgctttggatcacacaatccat--gtgagggaactggatttttcacccaatttttctgattccaacacctttgctttAAGCTGCTATTATGACATTACATTGGCAGCTGTTTCCACCACAAGAGTCTGCCTCATGTATGGGGCCAAATCCAAGCTAATGTTTTTCATCTTATCCATTGCTCAATTAAGAAAATTACTGAAGCATGCTTCGGATACCCAGGCTTCATTTCCTCCTTTCTAACAGTACACTGGCTTTCCCATTACTCAAGCCAAGAGTTTCCGGATGTTTCTTCCATTTGAGTCTCTCTTGTCAATATAGTCAGGGGATGGCCACAAGCAAAGCTCAGCTCAGTCAATCTC--TCTCCTGGGGATCTGAATTGCCACAGGGCCTCAAATACCAAAGAAACCACTGGAGTTAATTCATTCTAGGCCCCAGTGGAGAAGATAACTGCACAGTTCTTACTAAAGAGA-CCAATGGAGCTGC-CTGGGCCTGTACCTCCCAGCCCTGGTTCTTCATTCTTCTTGTCAATCTCGTAACACTACATC--------TTCCGTTTTTGCTTAAAATACCCAGAGTCATTTTCTGTGACCTGCAACCAATAAGCGAATTGACTGAAGTGTTCTCCAGTACCTACAAACCTTTCCCTTAAATATTCCCTTATGGAGGACAACATACAATAGGAGTACTCTAAGACAGAAAAGTGAACTTAATGCAACCCTCAAAGCTGTGTGAGAGGTAG-TCAAGTGTGGAGTATCTTGTTATGACTTCAACATCATAATCTTTCCTACTGCAGCCACAGACTGGCCCCAAACCCAATATGAAAAGAGAATCCAGCATTTATCTACCCCCTGACCTGCTAGCTTCTTTGCTGAGCAGTGCAATGAGCCTTTAAACTTCTGCTGCTAGCTGCTTTGGACAGGGGGGAAACACGAGAGGAACGGTGGCAGTGATCTCAACTGCAAAGGCCCTAGCAAGTAGGATA-GAGAGATGGAATATAACTTGTATGCTAAGAAGAATCAATCAATTTAGTGATCTAAAATAAGCTAAATG-ACAAAGACATTTCAGAATCTATACTGGGAAAGTGAGG-------CAGAGAAATGGGCTGTGCTCAGGAGTGTAGGGGCCATGAAGAGAAAGCCACTGGGTATTAAGGTATGGCAAATA----GTAGATATGGGAGTTAGGGGTAGCAAATCAATAATCCTTCTGTGGGTGGGGGCATAACTATCACTCATAAAACTTCACTCTCATCAGTTTGGAAATCATTATAAAATGAATGGCAAATGAGCTGACT--GTAGACTaaaagaccacaaggaacaacaccaacattttaacagtagtcattccaggttaatgagattataggtgatttttGAA 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canFam2.chr20 52744158 258 + 61280721 TTCTGTGTCAGCTACTGGATATCTTTTACCCATCATATATTCCATCTTT----CTTAGGAGAAAATCAATTCTTGTTTTGGCTTAAAAGAGCCTTATTCTGTTTTCCTTGCTAATAAAAAGATGGTATAAATCTGTAAATATGCAAAGTTTATTATGAAGTATAGTCTGA--TCAATTATTTCCAT-------CTTTTGCCCTTTGCCATTCCTTCTGGCTAGGATTTGAATAATTAACTTTGCATT-AAGACAAACCAATTATCGGATAAT a score=58635 s panTro2.chr12_random 1922766 1463 + 2259969 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GTAGGCATTGGGGATGTGGGGCTCTAATCCAGCAAACAGGGTCTTATTGTAGTGTTTGAAGTCAAAGTCCTCCAGCCCTAGCTTGGAGTATTTGATGGTTACCTGAGGCAGAAACAGTCTGAGCAAAATGAAGATATCCTCAGGGTCCCCTAAATCTTCACAGTAGTCATACCTTCCCCAGAACTTCCCCCCGGAGTCCAGGTGGTAGGTGAAGGCTTCTCAACAG-TCCTTCAGTCCTTTCCCTTATGACACCCTTTCCCCAGGGAACCTTTCCCCACATCCCAGAGGGCTCCTTCCTTGGTATCCCCCTGCACCTTGCGGTATTTCTTAGAGATCATGTGGAGATGTGGCTCCTCTTCCCGCCCTATCGGTGACTCAGTGACCTGGCTGAAGCTGTCAAATTCACTGTCTGATTCCTTGAGTCGGTAAGGGATCTAGAATTTTT---AAGAAGTAATTTTATTGGATGTCTTAATTATCTTTGGTTTCTCTCTCTCTCTcacacacacacaaacacacacacacacacacCTTTATCCCCACACTGAACCTTCTAATTTCATGGGGTTTTCAGCAGCCACTGCTTCCTTTTTATTCCTGCTGCCACCACCCCACCTCATCTTAGCTGGACAACTAAGATGGCTTCCACACCAGGCTCTGCACATTCACTCTATCGGGTTCCC-----CCTAACAAACTCTCCCAAAA------TTTCAGTGCATCACTTCCCCCACTAtacactggcattcaaggcttcacaaccgggcctttccgac-cttaacatcttgcgatttccccacactaaccactgctctagccagacaggtccaatc--acagtccccatcagacatgccttttgcagttatgcttcttgagacctctgccaacactgatctctcatcttgaacatgctcccgtgttaccttctacttatcc-atctttcatctttccagctcagtatctacctttctcagtacatcttccccgaccactctggcccagagtaacacttt--ccccaaacagtcccggcactgaatacttaaaaacactccttcagcatttagcaagagaac-------ttgtcacagacaagtcttatctttgccaaccaaatactaaatttcttaaaagcaaaga--ctgtcttctgtgtctctgaatttcccctaatacccagcatggtaccttcaattcagtaggcctcaaaaaaacctttaatgactaaaAGGAAAACCTGCTGAGGACCAGTAAGGAAACAAGACAGGAGAAATGCCAG-GGGCTGCTGTTGGTGCTGAGCCTCTCTCCCCTGAACGTACCTGATTGCGCAGCCTGGTGCGGGGGTTGGGCGCATAGCCAATGAAGCCCACTTTCTTCATGGTGCGGAGAATCTCTGCATCCACAGGTGGCGCTCGCCTGTAATGCAGTAGAGTTCTAGGGCTTGAAG-GTTGTGGTGTCTGGCCATCAAATCCCCAACCCCCAAGGAACCAGAAAAAAAGAAAATACTGAGGGCAGACAAAAATCGGAAAGGAAGACACTACTACAGGGCTTCCTGAGAAATCAGGTATCTCAGCCCTTTCC 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panTro2.chr12_random 1994600 161 + 2259969 ctaaatcaacctcccacctacagctggaaacctctt--cagaacatccGTAGTTCACCATCAATTAAGCCCTGCTTTGAAAATGTAAATCCTTTACTTGTCTTGTAAAGTTATTATTATAGAGTTAACTCTGTCAAGAAACCTTTTCTCATTAATTAGTGCAT s canFam2.chr27 6591169 157 - 48908698 caagtccaatatcctatctacagctggaaatctcttttcaaaacatgcttgacccaccatcaaccaagccccactttgaaAATG---ATCCTTCATTTGCCTCTTTAAGTTGTTAA---ACACTTACTTCTGTTAAGAAACCTTCCCTCATTAATTAATAAAT a score=23089 s panTro2.chr12_random 1995140 481 + 2259969 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s canFam2.chr27 6592067 1012 - 48908698 taaaataaatcaagaactatacaatggctataccctcaatctagtaatcacatctgtgggaatctaccttgaggaatcattagtaaatatggaaaagattataggcaggaggataatatatat------------------------------------------------------------------------------tagatcattaaaacaggggaagaattggaaaatgggtctccaatgtgcttcactggaaaatcagcaaatacactatggtacatttattagagggatcatttatcatgcagctcttagttttgaataatatatgacaacttggaaatatttattcatctaatactaagtgaaaaaaagagcaacaaatgtgtgcttatgattacaactttatttaaaaat-catatgcctaataaaaagggtctaagaagaaatggtaccaaaatgctaaAAAAAAATTGGGCTGATTCAAGGTAAGTTTGGGAGACCTATTCCCTTCTTTTCTGTATTTTCAAACTTTCTGTTATATGGTTGTTTTGTTCCCTTATAGCCTACAAGGAGgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt-----gtgtTTTAATCTATAGAATGAATTTCACTCTACAAAATCGGAGTATGAACTTTTTTCAGAGGTCATTAAGT-------CTAGTTCTTGG----TTTTTTCCCTCTTCTTTTACTTTGCAAAGTGCCCAAGTCTGAACACATACTG--------GGTGTCCATTCAGCAACATGGTGGCAGACAAAGT-GCACATATATTCCTACACTCTGCTTTCCTAGGGCCTCAAGACCATTAAGAGAAATAGCA----ATACTTGATGACACATGGCTTTTAGatgtgccagatactcttctaagcacttcacagatactaatgcattaagtacaacaatctcatgcagtagatatta------taattattattaattattatttcatgtatttatttatttttacagctagagcaaattgagacacata----------------taggtagcta-cttacccaaagctgtccagataagttggtcacagagccagggtttgaatccagggaatagagctcaagtgtctctgctctc 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aaacttagccacttgacagttgtctgatctta-gcaaaatatttcccttctctgtgccttaatcttatcagttcttcagcttttaaatgaggatttgaaa-atcctacagtttaagattcttatgagattgaaatgagataaaatgcctaaactcatttgaataatgattgacaTTTATTCAATAGGTACAAATATTTCATTCTAACTGTACTGTTGGTTTGGGAAGACAAAGAAGCAAGAGGCTCTACTATTTGAGCTAAGAAATCAAATGCACTA-CATCAGAATATA----TTATTCCAGCTGAATTACTGGACTGAGAAAGT a score=15988 s panTro2.chr12_random 2072867 576 + 2259969 TGATACTATACAGTGAGAG-TAAGGAATGCCTATACACCTATAGGTAATCAGGGAGTTATCTTATATTCACCATG-TTCAATGTAAATATTGTATA-catcacctgtaagataca---tttttttcacatat-aacatctgcagtatcaggatgagcctcacactctacaacatgccatactttaa-cggcagtgatttttttgttttcttggtgatacacaaaattaatggtgtatatgacaatcaatggtgtcctaaattcaatgacatGCAGTATCTGACTTGGATACTTGATATGCGCCTACAGCTGGGAAGGCAGAGCACACCTGCCAAAGTCTTCACAGGTCAAAATGTCAAGGTATTGCTCTTTGAAAACCCATCTATGCCACCTCTAGTATTACTGTCTAAATGTTCTTCA-GTGTGTCCACATATTATacagctaagatttattgtcttcttactatagccagacaatattctaagcactttacacatctatcttcacaaccctgtgaagtcggtgttattacccactttcagtctgggtccagtcaggagacagaagccattttagttatttaaa s canFam2.chr10 14879130 566 + 72488556 TGGTTCTGTAGAGGAAGGGATAAAGACTGACTATGGATCCAT-------CCAAGCTTTACCTACAATCCACCGTGGTTCAATGTAAATAccgtatttcatcaatccaaagacatacatttttttccacattttaatatttccaatatcagaatgagcctcaccgtctacaatatatcctcatttaatcggtagcgatgagta-attttcccagtaatgcacagaattaatggagtgtgtgacagtcagtggtgccttagactcTGGGACACGCGGGATCTGACCTGGATACCTCGTCCCCGCCTCAACCCATAAAGGCAGAGCACACCTGTCAAGGCCTTCAAAGGCCATGCAGCCGAA-----------CCAAAGCCCATGGGCCCCACCTCCATGACGCCCTCTGGGGTGTCCCTCATGTGCCTCTCTGGGTTGCCCTGCTCCCACTTACCAGGTTCCTATCGCAGCCAGCCTGTGTTCCAAGCACGTTAGCTGGTGAGCCTCACATTTCTGTGAAGTAGGGGTCACTGTCCAGTTTCCACTGGGATCCAGGCGAGAGATGGAAACCGCACTGGTCCTTTAGA a score=12921 s panTro2.chr12_random 2073443 670 + 2259969 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aGTCTACTGAAGAAAGACAAAGAG----CTGTATAACAACCATAAGAGTTCCT-------------GAAGAGTACAAATACTAAAATAATTTTCTCAATTGGaaaaaaaaaaagcatgtacctactaaaaagaacataccacataacctaaaaatactgactcagaatgaccaacaccaagacttcttttatttaaattattaggctttaacaggaaaaaatatat-tttgggcatctagaagggtatgtgacttataagaaaaataaaattaaatgatcatcagactttttcacagtaatgttttatgacataag-aaatagagtgacactttcaaa a score=8887 s panTro2.chr12_random 2075316 467 + 2259969 atGACAGTGTAAAATAGTACATTTATTGTTAAAATGG---GAGAATTAATAGAACATATGCAATAATAA---------TTTTCTGTAATCATTTCTTTGGTAGTCTTTACATTTTACATACTCTAAGACTACTGTG-------TGCATAATACAGAA-AAATCCTATGTTGTATATTTTAGATTTATATTTATCACATCCATCCTATGTCCTTAGATACAATATATCGTAGGGGTGGGAGAGAAGGAGATACATATGTA-ACAGGGG-----AAAAACTTTAA--AAAGCTATATGGGTCTGGATTTTTTATATAAAATATGTAGATAGAAGTCATGAGTTATTTT-ATCTTCatttttcctagctctgttcactagaaaacgcctagac----tatgataccaaatacagtgagcgtctctagcactcaaatGT--GTCT---GATGCA--TGCTCA-CAAGACAGACTCTAAGAACAGTGATCAATC---GAAGAAAAGCACATGATGA s canFam2.chr11 12858123 487 - 77416458 atgacaatgtagaatag----tttatttttacaatgggaagagaACAAGAAACACATATGCAAAAAAAAAAATTAATGTTCTCAGTAATCACATCAATGGTAGTATTAGTACTGT---CACTCCAAAGCTATTGTGTATCATATATATAATAGAGAATAAAAGAAATGAGTAATGCTGGAACATTCTAT--------TATGCCTTGTGCCCTCAAGAAAGAAAATTCTTA---GTGTGAAAGAAGGATACACACACACACACAGAGGTAACAGAAAAGTTTaatgaaggctctat-ggtcttgaatttgaattaaaaatattaatat-gaactcataaataattttcatcctgatttttcctagctctgtccact-gaaaaggcttagaaacagtatcaatccagtaataatgaacaactctagtgttcaaattttggtcctgaaatgccattgctcagtaagagaaacc---agagaaatgagtgattccagaagaaaagtacaagatga a score=8111 s panTro2.chr12_random 2081169 182 + 2259969 GCCTGGTGATCTTGCGGGAAAGAACCACTGT-GGTCCCAGCTTTGCGCAGAGGTAG--GAGGTGGGCAGTGGAGGTGGGAGTGAAGTCTCAGGAAAAGAGGCGGTTGCCATAGCTG-----------TGTGTGTCTGAGGCTTGGCAGCCAGAGCCATGGACTGTTTGCTGGGCCCGTTAGTGCACCTAGTGGAGA s canFam2.chr2 78480149 194 + 88410189 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s canFam2.chr27 7770484 1761 - 48908698 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atgatataaacagcatgtgacacacagattgttgtaaggatGACAGTAAAGTGTAAGGGCTACAGAAAGCATT-----CCTATTACACACTCAGTGCTGGTAATCTTATTTAGGTAGTTGTCAAAAAAATTGTATGTTATGTAATACAGA-ATACAA-GATATACTGAATATT-------GGAGAAAATACTTGATAACTCAAAAATATCACATATGTTTGGAAGTAAAAGAATTTTA a score=2927 s panTro2.chr12_random 2093418 120 + 2259969 AAGTTTCATTTAATTTATTTGGGTGGCATTTGTTTCCAGTTGTAAAATTTATTTTCTTCACATATATTGAGATTGTATGGAAATTTAAATTTTTTCCATGAAGGTTTTGATAATTTGAGT s canFam2.chr10 17603447 104 + 72488556 AAGTCTCATTT----TAGTTAAGCGGTATTT-TTTCCAATCGTAAAATTTACTCCTTTGACATACATTGAGA--ATATGTCAACAAGAATTTCT-------AGATT--GACACATGGGGT a score=47425 s panTro2.chr12_random 2094097 1469 + 2259969 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panTro2.chr12_random 2113526 1181 + 2259969 GCAAGGCAACTCAGGAAATCTAACAGCCCTGCTAAGCGAAGAATTTAGTATTTCATCATAAACTTGAAAAATCTAGGAGTGCCTCATAGGAGAAAAAGGAAGG--AGGAAAGAGGGACGTGAT-GAGATTAACAAGAAACAGTATGGCCTCA--GCCTCCAACCATGTGCTGAATAAGTTAGTGCAATTATCTTGGGAGGGTAAACACTGATGGCCATTCAAGCTGACAGTGGGAGCCGGACAGTTGACATTTACAACAATGCTCAATGCAAATCAAGGCACTTGCCCC-AGAAATGGAATTTCATAGATTTATTCTGTGAAAGGCCATTTCTTTCACTAGTCTGGGTCAGCAGTTAAGCTGAAAGAGAAATATTTCTATCATTTGGCAAATTTTTTTCCAAAGCATCTAGTTG-----------ATTAGGCAAGAGAGGCCTTTAAAAA--GTCTGATTTCTTGTGTGGTTGTCAGGCAAACAGAATGGGAAAATATCAAAGAGCAATCCCATTTCCAGAAATGATTAAAACAAATATTTCCTCTGAAGTCCCTGGTGCTCTGCGTGGTGATGGGGGACCTCACAGCCCAGGTGTTCTGGAGCCATTCCAGCCCTGCAAATATCATT--TTAACATGCTCCCATAACTCTCAAGGCTTCACCTTAAATAAGCTAAACTTTC----CGTGCCCCTGCTGCCTGCTGTTCCACAGAAATTGATTAAAACCCAGAGCTGTCATTCACAAGTTGGGTGACCTTGAAAAGTCAGAAAGCCTCAAGCAAAGCCTCAGCACTTTGTAACTGCTGTTCCCTTCACCTATATAGTGGTGACCCCCACAACCCTCTGCTACTCTCAGATGCATGAACCta---tttatctgcctcacagcactcaaaataatacttgaaattatctcactatgggtttgcttatttatcacagtcagcttcctgagcacagagacaatacctgctttatgtatctctgaatcctcggctctt--aaaatgattcctagcacctagtagatgctcaataaatatctgt--------------taaataaataaaaatcattccaattatttgagccaaagttttatga------------taataataataaaagttaacacctatctggtagggttgttttaaagatcaagtgagatcatgttaacaaaagcagagcccaacacattaacaggtactaaagatacattaattTAAA s canFam2.chr15 22056679 1213 + 67211953 GCAGAGCAGCCCAGGAAAACCAAGAGCCCAGCGAAGTGGAGAAGTCAGCATTTCATCATGACTTTGGAATACTTGGCAGTGACTCACAGAAGAAGGAAGGAGGGCAGATAAGAGGGGTATGGTTGAGGTTAACAAGAAACAGTGCGGCCTCACAGCCCCCA-CCACGCACTGAACAAGTCACTGCCATTTTCTTGGGAGGAGAAACACTGGGGGCCATTCAGGCGGCCGGGGGGAGCCCGACAGTTGACATTTACAACAATGCTCAATGCAAATCAAGCCACTTGCCCCCAGAAATGGAATTTCATAGATTTATCCTTTGAAAGGCCATTTCTCTGACGAGTCTGGGTCAGCAGTTAAGCTGAAAAAGAAATATTTCTATTATTTGGCAGATTTTTT-CCAAAGCATCGAGTTTTCCAAAGCATCATTAGGCAAGAGAGGCCTTTAAAAAAAGTCGGATTCCG-GTGTGGTCATCAGGCAAACAAAATGAGAAAACATCAAAGAACAATCCCATTTCCAGAAATGATTAAAACAAATACTTCCTCTGCGGTCCCTAGGGTTCCAAGGGTAGGGGGTGGACCTCGCAGCCCAGGTGTCCTGGCCCCCTTCCAGCTCGGCAAATATCTGCAAATAACATGCTCTGATAACTCCCGTGGCTTCACCTTGAATAAGCACAACTTGCCACGCATGCCACTGCCGCTCACTAtgcc---tgaaacggttcaagcccagagc---cactcaccagttgggtgaccttgaaaagtcacgaagctttaagcaaagcctcagtGCTTTGCACCTGCTCTTCCCTCCACCTATCGCCTTGTAAGCCCCACAACGATCAGCCAGTCCCAGATGCA-----CTGTGTTTTACTTCCCTGAGAGcatt-----tgatattttaagttatctcatt-catctttgcttgtttattactgttggcttcctgagaacagagactataactgccttatttatctctgagtccttgatatttaaaaaagaatgcctggtccctagtagat----aacaaatatccataagcggttgttatgtaagtaaatGAAAGACGTTCAGATTTTTTGAGTCAGGGTTCTATAAAAATAATCATACTAATAataataaaagaaaacacttgccttgtaggattactttaaagatcaagggagatcacggtaacaaaagcagagcctgacacattgtaagtagatctataaatatGAACTTAAA 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TGCTCACCTCCTTCCCCCTCATCCCCCTGCCCCAGCTGACATTCCAGACCTAATGTAGAAGCCAACATCCTGAAGTCTGCACCAAGGGGCTGCCCCACAGCTTA-----GCACCTATGCTCCCCAGGAGCAGGCG------AGGCATTCCC------TCACCGTGTGCCAGACAC---------------------------TACCCCC------CGCCACAAGCCCAGCCCAAGCCAGAGTGACTATTTACAGTTCTCCATGTCTGTAGTTAAAGG-TATATGAG---CCCTGT----------AGGCCT----------TCCCCATCAGCTTCCATAGTAA---ATATGGCACAATCTGG--------CACACATACCTTATCAAGCAGGCACAAGAGCAGTCCTATAGCTTGGTCTTAAGCTCA------------GAGACTCCCAGTGCTCTGTCACTTTAGGCTTCGGAGAAGA a score=5759 s panTro2.chr12_random 2118693 261 + 2259969 GGCAGGTACAGCTCCCCTCTGGTTAGAATCAAGATAAAATCCTCTATTAAGCACC-TGACAAGAGACCCAGTATACCCTAGGTCTAGAACACCAGTCCAAAGGGG--AGTCTACTACCTTTGCCGGATTCTTAAATCCTATTCCTGTGATATTGGAGATGCCTGTACAATATTCTACCAATTCACATTTTATGAACAGCTGTTGTTTCAGCAAAAGGAAAATAATTTCTGATATCCTTTACCCCAATTACCATATCCTTCAGGG s canFam2.chrX 9893446 262 - 126883977 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s canFam2.chr7 26384988 941 - 83999179 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TAGCATTCCTAATTCCACGAAGGTCTCTTCTCAGGTAGCTTTCCAGAAATAAAAATTCTAAAATAGTTCATCCTTAGATATGATTAAC-AATAATGGCTCaatatataatatttataatattCTAAGCTACCATCTACTGAAAATGCATTATAAATTCAATAAAATTTGGGGAGGGGACACCACAATACATTCATCGATTGTAATGCAGACCAATTTCAAAAATACAAAAAAGTGATAA--TTAAAAAAAAATTTGACAATATTACTTCTCCCTGGGAAAAATAAAACTGTGTTTTAGTCCAGAGGAATAACTCTCTACTGGTATGGTTTCAAGTGGTGCAACTGGGCGGTGGGAAAGTTAGTGGTGAGGGAGCCTACCC--CACCTTGAATCACACTGTAGGATGCTCTGTCCTGACCCAGCTTTGGAGTGTGAGCAGTGGTT-TTGCTTTTCGACTAGAAAGTAAGCAAAATAATGAGCGGACGTATACAGCTAACTCTCAATTCACTTCAGTAACTAGGGTCAGGATATGCTTGACTAGCCAAATACCCTGAGAAATCAGATTACTGAAAGGCAGTGGCTGGAAAATAAAGA---GACTAAGGGGACACCCTCCCTTTACCATGTGACAAA---GATGGAGTTAAAGTCTCT-----------TTTATTAAGTAGAATCAGATTCATCTCCTCTCTAACAGAAATGCTCACTTGT a score=9774 s panTro2.chr12_random 2122299 157 + 2259969 TTTAATTTTACCCCCCTGTCTTTTCACCACTGAATTCCTGGGCAGCTGGGTTAATGACCAAACAGCAGGAGGACAAGAAATCAAGAGACCTAGATATTCCAGCAACTTAACAATCAAGGCATAACTTACCCATCCCCTTCTCCCTCATGAGTGTTCA s canFam2.chr15 22058716 157 + 67211953 TTTAATTTTATCCCTTCGTCCCTCCAGCGCTCAATTCCTGGGCCACAGGGTTAATGACCAAATAACAGGTTGATAAGAAAACAAGATGCCTAGATATTCCAGGAGCTTAACAATCAAGACACAGCTGACCTGTCCCCCTCTCCCTCACGATTGTCCA a score=2173 s panTro2.chr12_random 2122569 64 + 2259969 CCCTTTTCTGTTAAAAGGAAAAAGTTTAGATGTTTCCCAAAGACAGAACGGTCAAATCTTTTTT s canFam2.chr15 22067094 63 + 67211953 CCCTGCATTTTTATGAGAGGAAAGCT-AGATCCTTCTCCAACACAGAAGGAACAAACCTTTTTT a score=12278 s panTro2.chr12_random 2123144 257 + 2259969 ttttttaatcaatcatcttacttaattctcaaaacaaccttatgtgctaagtcttcttagagcacattattcagatggtgattttgaggttGCCCAGTTAATCAGTAGCACAATTCTCAGCATGTAGC-ATGTAATCCTGAAATCAGCTTTGAATAGAAGTGACCCACTGATGACCAAAGTGTCCTATCATCTCATAGA--TAGTCATCTGggctcacacagtttttttaatgtagtgctacattttaaaatctgacata s canFam2.chr15 22067163 246 + 67211953 TTtttatataaattatcttattacattctcaaaacaaccctatgggctgagtcttcttacagc-cattactcagagcgagacattgaggttACCCAACAAATAAGTAGGACAAATCTCAGCATGTAGCTATGTCATTCTGAAATCAGCCTAGAATACAGGTCAccagctg-----------gctctatcagcctatagagacactcagttgggctcacacaatctttt-aatgtggtgctacattt-aaaatctgacata a score=17064 s panTro2.chr12_random 2123720 524 + 2259969 ttccctttaaaatatcaggtttcccatttcttttgaaaagtgggatgacccagcaacattaggcccacatgttgacaactaactggagctaaagaggaaacagctgACTTGAT-------------------------------------------------------------------------------cacacacacacacacacacacgcacCC-CTACATTCTGTGAA-TGCACACTCAATACATAAAACTGCCTCACTCACTACACAACCAGCCTGGCTCCTGGCCATAGAATACACCTTTGTTCTTTGCTTATCCCAAACTCTAATT-------------------TAGTTCATCCTCCACTAATTTCCTACTTGGAGTCAACTGTTCACACTTATTCTCACTTCTTTTCAAAGTCCTCTTCTCTTTAACTAGCACTGTGGGCTTC-----TAGTCAGCTTCTCACCATGGTCCTTTCCACATTGTTGACACACTAAGTGGATGCCTCACCATCTTCCAGCCCTGGAGTCATTGTTCAAAAGAGAAGCAGGATTTTCTGAGAGG-TGGCTAAAGTTCAGGAG----GCTGTCAAATTCCTGTGACACTAAAATCAGGAATATAGAC s canFam2.chr15 22067409 569 + 67211953 tttcctctaagatgtcagatttcccatgtcttttgaaaactgagaagacttggcaacattaggtccacatggcaacaatcagctggagc---aaaggtcatagcagaccttattgattagatggagactacctcctttccagtctgcctcaacttccagccccctAAACATGCGTGCGCGTGcacgcgcgcgcgcacacacacacacacacacacacccacTACACTCCATGAAATGCATGCACAGTAAATACGGTGGCTTCACTCACTATGAAAACAGCCTGACCCCTAGCCGTAGAACACTCCTTTGTTGTTTGCTTATCCTGGACCTTAATTCCATAGTGGCCACACTTTCTAGTTCATTGTCCGCCAACCTCCTACCTAAAGT-AACTCTTCTCACACATTCTCACTCCGTTTCAAAGTTCTCTTTTCCTAAACTAGCATTCTTGGCTTCTATAATAGTGGACTTTCCTCCTTGATCCTT-------------CACAGTAAT-----------------------------------------------AGCAGG-TTTTCTGAGGGGCTGCCCAAAGGCCAGAAGACTCACTGTTGAACTCCTGTGAAACTAAACTCACGCATATTGAC a score=6307 s panTro2.chr12_random 2125019 143 + 2259969 AATCCCAAAACCATCTCAGTCTCCTACAAGTGATTCTTTGTCCCAGGCCTACTCTACTCAAATTCACCTAGACTGATTTTTAATTAATACTA--GATAAGTAGCTATTCACTTCCCTATGATTTGTTCCCTAAAATTATACATCT s canFam2.chr15 22230822 145 + 67211953 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AATCCATACCC-TAAAATTCTAAATGTCTAC-TTCCCTATTAAAATTCTGTCAAACTAAAATTATAGATTTTTGTAACAATCAAACGGATTTTAGGTTGAGGAAGAAATTGGTGGTATATAATGGAACAAATAATATCAGTGGGTTAATTTTGTGTTATATAAATCTGCCCAAGGATACAAGGATTAACTCACTTCTCTCATGGAAAGTGCTCTAGGGCCTTTATGTTTATAACCAAAGTCCCACCATAGCATTTGG-ACTGTCTCAG--CCAATGGGTACACCATAGCAGCATAGACTCAAGCAGTGGGAAGTAAGGGTAATTCCTCTTTGCTGAAACTGGGATTAAAACTCAATTCTTTAAAGAATAAAATGCAGGACTAACCCAA a score=32006 s panTro2.chr12_random 2131165 733 + 2259969 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catagactataaaataactatataaaatgtga--------ataaaagtcaaccttgaaaatatatacagagaaca---------agtatgtacaaagagt-----------------aactaaag---------------------------ataaa----gtggacacatttaatagtctatttgacatagcagaagtacagtttagtgaactgggagacagagatgaagaaattgcccaaatgcaatagaaaaaaagaaaattaaatgaaaaatatgaaaaagactttaagtgacatggaagacat-gtgagaaagtctaaaataaaagcagtactccaaaagacaaggaaagagaaaatgtggcagaagcaggcttagacaaggtaatgattgaaaactttccagaactgatcaaagactccaactcacagacttagggagtcccccaaatcccaagtaAGTTAAAGAATAATaaatctacacttatatacatcatagtaaaactataaaacaccaaaaaataaataaataaaagaaaaccttaaaagtag--aagaaaaaa-atagattaacctcaaagtgtctagtaactgacttttt-tcagtaacaac-agaatcagaagacagtgga-taacgtcttcagtgggctaacagaacatggctataggcccagaactcaatgcccattgaagagatcttttgaa--atgaagccaaaatgaaggtattttcaggcaaggcaaagcagagtttgctgctaataatgattc------------tttatcagattttctttcttcagaaaaaaatgaaatga a score=51596 s panTro2.chr12_random 2134728 1074 + 2259969 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gagcagcaagtgcaaggcccgagCTGAGTAGATGAGGCTGGGAGCCTGACCAGTCTCAGGCTGAGCAGTGCTCTGTCTTCAGAGG---AGC--TGCTGGTCAGCTTTTTGTCTTGGGATTC-AGAACGAGGAGACATG--AAGACTTTTTACTTGGCAGTGGGAGCTGAAGCTGAAAGGTCCAGGG-GCTGATGAGGCCACGTGTAAGCGAAAGTTCGGGATAAGCAGAAACC--GAGTGCGCTGAGGGAGTGAGATTGTGGCTGTATCCGGCGCCTGGCTGA---GCAGGAGAGTGAACCCCGTGGGTGTGTGTTTGCTGGTGACGTTCCTGGAGCTGTCTTGAAGTCCGAGCTGCCTTGCA-GCTCTAGTCTGC-----------TTCTGTTTTTGGCCTTTCCCAGATAGTTTCA----ATTCTTACTCTCAGTTTGTGAACCTCCCTTCAGTGAACCT-CCCTTCACTTATGCTGGATATCTCTTGCAACCGGATGAGCTTCACTAAAGCACagtcatttggacctggattcgaatccctggttttccactttttagctgtgact--------tatttaatttctgtaagcatcagtatccagtagctgtatccttatagtgttgtacagattaaatgagataataaaagc-aaaagactactgtagagtgtttaacacataggaggtactc------aaaaatTTGTTAGGTACCTTTCTTCCCCTCTCCTTCATGTGTTAA-AGCTTTTTCAGTACATACCCCTCTCTCAGGATTGAATTGTAAATCATGTTTTTTAATTACCCTTCTTGTAATAATTCCTCTACCTCTGTAGTCATGTTTTTCTTTT s canFam2.chr27 45100716 751 + 48908698 GGGCAACAAGTATGAGGTTGCAGCTGATTAGGT-----------------------CAGGCTGAGTAGTGATCTATTTTAAAAGGCGAAGCAGTGTTGATTAGATTTTTCTCTTGGGATTTTAAAACTAAGAAATGTGGAAAGAATTTCCCCCTTGCAGTGGGAGCTGAAGCTTAAAGGTAGAGGGTGCTGAAGAGGCCCTGTGCAAGCTGAAGTTTGGGGTAAGCAGAAGCTATGGGTAAGCAGAGAAGATCAGCGGATGGCTCCATCTGGCATGTGACTGAACAGCAGAAGGGCGA--TCTGTGGGTACTTACTTGCTGGGGAAATTCTTGGCACGCTCGTAGAGGCCGGATTACTTTGTAAGTTCTAGTCTGCAAGAAATCCCACTCTGTCAGTGGC--TTCGCAGAT---TTCACAAAATT-----TCTCAATATGTA----TATTTTCACTAGATCTGCTTTTTACTTATG-TGATTATCTCTTGC---CAGATGA--CTGACTCAAAGAGAACCATATGGACCTTGGTTTGGATCCCTGTTTTTCCTCCTGTTAACTCTGCCTCTGAAAATTATTTAATGTCTGAAAATGTGAATACCCGACAACTGTATTCCTATAGTGTTGTACAGGTTAACTGGGATAATAATAGTGAAAAGGC--CTGTGGAGTGTTTAACACACA------ACTTTATGATCAAAATTTGTTGGATACCTTTTT----CTTTTCTTCCTGTTTGAATGGTTTTTTGATTATGTGCCTCCTTCTTAGTATTGAATGGTC-----TGTTTTTT-----------------------------------------GTTTTTGTTTt a score=3347 s panTro2.chr12_random 2217853 54 + 2259969 CCCCAGA-ATGGCTAACAAAACAGCCAAATACACCTCTGTAAAGACAGAGGGTAA s canFam2.chr25 46329589 55 + 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AGCGTTTACTTCTCCTTTCTTCCTTGAATCACTGTCTCAGAGATAATTAGGTTCAGAAGAGGAGAAAAAAAAAGATGACGTCAACGTGGAGCAGAGTTTTTCTTAGACCTTAGCCTAGCAAGGAAAGAGAAATGC s canFam2.chr27 45102144 108 + 48908698 AGGGTATA-----------------GAGAAGCTGCCTCAGAGA-AATTTGGTTCAGAAGAGGGGGAGGAAAAGAAT----TAAATGTGGAGCCGAGAAGTTCTTAGCTCTTGGTCT-----GATAAGAGAAATGC a score=2337 s panTro2.chr12_random 2218355 52 + 2259969 CTGGTCTCAGTACTGGGAAGCTGTTTCAGCCAGAGCCTCGTGGCTCAGAGAA s canFam2.chr27 45102842 52 + 48908698 TCAGTCTCAGGATTGGGGAGCTCTTCCAGCCAGGGCTTAGTTCCTGTGAGGA a score=43592 s panTro2.chr12_random 2220732 928 + 2259969 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aaaacaacaaacatttatcatctcacggtttttgtgggt------caggagtccatgcatagctttgttgagttctctatgccagggtctcccctgaaagccaaaatcacactcttggccagggctgcagccctacctcaaggtttgactgagagacaatccaatccacacataagctcacatgactgttggcagaaatctgctccttgtgctttatagcactaagggcc--catttcttgatggctgcaggtggagattacccttggttcctgccaggtggccctctccctagggcagctcaccatgtggcaacta----catcaaagctagcaaggaagagggcctgtcagtaagagggatattgcagtctcatgtgacatactaatgtatatgtcatcacatacattccatcacctcttggttaaaggcaagtcagaggacccattcatgctcaagggcagagaattatacaacagcatggatactaagaggcagggatcatcgggcaccatcttagagtctgtctgcTTCAATAATTCACCAGTAAATACCCTCATCAAATGAGCAAAGCTGTGGCCATTCTCTAAAGAAGGCAGGATAGTTAATACCTGAGAAAGGCCAGAGGGTCCTCATTAGCTCAGATTTCACTA----AGTCCTTGCTGTTGTCAGGTTGCACAGGGAAGCAAAGGTCACCTTAAGATGAAAATATTCACTAATTT---CAAATGAGTCCCCACCCAAACAAACCTTTCTCCTCTTAATGCTAGTGTATGTCCTCATAGGTCTCATCTTGCCAGAGC-TCCTCTTGCTG----TGTGTGTCTTGATATACAAATAACAATCAGGCCAATTGCACAGGTGCCTCAAAACAAAATTATTTGAGTACCAGAGGCTTAGGAGAGGCTCTTGGGAAAACTGATGAAGCCCTCAAATAATTTTGCAAAATTGACTCTCGTTTTGATCACGCTGGGCAGTTT a score=7247 s 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s canFam2.chr27 3808678 1445 - 48908698 cacaatgtgaggatgaggaaggaggggcccgcctgcaagtcaggaatagagctctcaccaggaaccaactatgccagcaccttccacttccca-gactctgcagctgggagcaaatgaagttgtg-----aagcc-cccagtctacggtactt-gtcatggtagcctg---------agacaactTCTTTCCGGGTACTATTGTGCTCTTACGGTCCTAAGATACTTCAACTTCACACACTTGGGAGACAACACAGCCCGAAAAGAAGAAGACCTTTCCCACCCCTGCTGCTAACCCAGAGCCACAGCTTGGTCTCGGTGTACAACTGCAACGCTCCAAAACCTGGAGGG-AGCCTGGCCC-CAGCCCGCACATTCTCACCTTCCTGGGGCCTCTGTCTCCCGGCCAGC-TCCACCCTCGGAGCTCTCACGCTACGTAAGAACCTGCC-------ATTAGGATTTATTCCCACCAACCTAGTGGACACCTCCTCCACCAACCTAGTCAATTCTATTCAACCCAGTCCTCTAGGCTGAACCCTACTCTACCTTGATT----CCCTAATGGACAGCAGAGCAGAGTCATTCACAGTATGGGAACTGGACTCGGGTGCCCAACTCTGGAATCCCA-----------GCtcacgttaacagccctaagcctcagcctccgcagctgtaaagacgacacagataccagcac---cagagcgtcgcagagacc--accacctaacgtaatttatgaagagcgcttagcacag--------------------------------GCGGT-----CCCGCCCCAGCGCA--GCTCCGGGGCGCGGCAGGTCCCACGGCAC--GGCCTGCCCT-TCCCCCCACA-GGTTCCCAGCGCGTCAGGAACACACGGGCCCCGCGGGGcccggcccccgcccccccccccgggccagggcgctttcccgctcc-------ccgctcgccct----------------gcccccgcacagcagcccgccgcgcgcgctccccccggcgtgcgcccgctgccctcgcTTCGCCTCGTCCT---------------CACGCGGCACCGCGCTCACC-TCCTCGCCGCCGGGACTGCGGTGCCG-AGGCCAGGCCGACGAGGCGTCCGAGGAGCACAGC-----TCGCCCAGTTTGAAATCGG-GGCGCGCCTCCGTAGACGTCGGCCCCGGGAGGAGCGTGCTGCGTCGCCAcgccccgcgcccccgcgcccccgcgccTGCGCACTCCGGAGCGCG-GAGGGCCCGCCCCTGCGCGCCTGACCTCCCGCCGCGGGGTCGGGGCTGGGCGTTGCTTCTGCGGCCTAGAACCCTGGTGGTTGGCGGACCCTGAGAGCTGGGGTCAGGTTCTGCGCGTTCTCCGTCTGGCCTCCTGCCGGGTGCCCGGTGTTTCAGGGATCCTCCTGCGATTGGCGCCAGATGTACTGAGCGCAGCA--GTTGCTCGACTTAATCAA--ATTGGCCAATAT-----TGACCAAGCACCCAAAGGACGAGATGCTGTAGCCGAGAATCGGGAAGTCCGGATTCCGGTCCTGGCTCTTGTC 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aaaaaaaaggaaaatcttaaaccacctagagaaaaa----agatcacctacaaaggaacaaaaattagaatgaccccaggc-----------------ttcttcacaccgacaaagaaagccagaaaactatgctatataatatcttcaaagtgccaagggaaaacaattgtcactctagaattgagtcaccagta s canFam2.chr27 3824070 190 - 48908698 aaggaaaagaaaaatcttaaaactgccagagaaaagggctaggttactggcaaaggaacaaaaattagaaggacagcaggctttttttttttttttttttttttttagcaacaaagaaaaccagaagacaata--gtatggtatc--caaagtgcc--gagaaagagaattttggtctagaattgtatcactagta a score=4596 s panTro2.chr12_random 2232307 166 + 2259969 caaacaaaaactaagggagctca--cttaag-----agcactaaagaaacttttaaaagctg-actctgcaatgaagagaagtggatgggccccaaaggaaggtcagacatgcaaaaagaaatgtaagaatgtatgtaagtctaaacagtt-----tgtataaaatgatagcagtcata s canFam2.chr27 3824431 167 - 48908698 caaacaaaaaccaagagaacataacattaagatactagcactaaagaaacttctagaaagtgtacttcaggatgaagaaaaatg-----------aaggatggtcagagatacaaaaagcaatgc-agagcgcataacactgcacataatctatagtgtataaagcaacaataatagta a score=4745 s panTro2.chr12_random 2232844 151 + 2259969 tctaatttatgggctagataga----actaaaataatggccatcagaagcttgt-aattgggaaggacagtgattggaatgaatgtCAAGACAGGACAGAAGGTTATAATGCTGGTTTTGGTTCACACTATTTTAAGGTTTGAACGTATGATAAAG s canFam2.chr27 3824598 155 - 48908698 tctaaatgctgggtaaaaaaaagaagactaaaatattcgccaacaaaagcctgtaaagtgggaggggtggcgattggaattCACATCAACACTGGAAGGAAGGTGAAAATACT-GTTTTATTTTAAACCCTGTTAAGCTCAACATGCAGAGTAAAG a score=9122 s panTro2.chr12_random 2234114 263 + 2259969 CAGAAAATAAATGTAAAAAAATCACAGCTAGCTCTAAAATATACTAAGTGCTGTAA-TATGCATCTATGTGACCCCAGATAGGAGAGTAACCAATTCTCTTTGGGTGATGTGAGAACACACTCATGTTTTGAATTCTAAGTAAGTTGGAAACCTAAG---TAGGAAACACCTTGCTGAAACTTTATAATGAATAAAAG--CATCCAGCATGCA--AAAATATGCTTTCTTATTCTCAGGACCCAGAAGGCAATTGAATACAACAGTGGGTG s canFam2.chr27 39500216 261 + 48908698 CAGAAACTAGATTTGTGAA---CCCGGC-AACTTAAAAATCTGCTAAGTGCTACAAATATGTAGCCACCTGACCCCAGATAGGAGAGTAATCAATTCCCCCTGGGGAATCAG---ACATCCTTATGTTTTGAATC---AGTAGGTTAGAATCTTAATAACTGGGAAGCTGCTTGCTGACATTTTTGAATAAATAAAAGGAAATCCAGCATGCAACAAAATACACTTTCTTTTTTCTGGAATCCACATGTTAATCAAATTCAGTAATAGAAg a 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CAATAGAATAATGTATTCATAGAAAGATACTAGAATGGGATA----GATGGCTAAAAAGAAGTAAAATATAAATGTGTAGAAGGTAAGGGAAAAAGAAGGTGTGAAATTGTTTTGCTGATTTTATGAATTCTT-CCATGCATCTATAATTCTTTTAATGCATGT-TATGACACGTGGTTTTATGTAAGAGTTTAAGACAACTGACTACTGTCTTTCTTACATCATAAGACAACATATTGTTTtgcac s canFam2.chr27 39501019 239 + 48908698 CAACAAAATGAGGCATTTACAAGAAGACATGAGAAAAAAAGATGATGACAACTAAAAAGAAGTAATATAGAAATATATA-AAGGCAAAGGTAA--TAAAGTGTGAAATGATATTGTTGATTTTATGAATTCTTACTATATGTCAGTAATTATTTGAATGCATGTCTATGGCACATGATTTTAGGTAATAGT----AAAAACTG-CTATTTTCTTATTTACATCACAAGATAACACAGTGTCTTGTAC a score=45047 s panTro2.chr12_random 2235736 1179 + 2259969 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s canFam2.chr27 39501454 1165 + 48908698 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attctccagtggaaaatcaaggctctgagagataataaacttgttcaaggtcataGAAGGCACTGACTTGGAAG-------CTTCAATCCACAGCA--------AGGTGAAGAGGTGACGAGAAAAAAGGTCTTTATCAACTTA-------TTTTTTTAAACACTATG--AAGTTTGCGGAAGGCTTATTTTTCCAGAATGGGCAAAGGTTATTCTACACAGATCAAGGGGTCAATAAGTTTGGCTGCACTTGCAGCAGGATAATTTAGTTCAGAGCTATGTTCCCTCTGAAATCTCCTTGTGGAATGATAATGTTATTTCCCATAAAATAGAACACAAGAGCTCTCATTTCCTTTGCTAATGAAACCCTCTTTTTCTCAGGCTACTTATCATACTAGGAACCTGCAGCCAGGTTATAATTTAGGGTCTCTTTAACAGTCTCAGGGTCTTATCCAAATTAGGGTCTTCAGCCCCATCAGGTCTCCTGAAGTGGACATGGGGCATTGAAACACTCAAATACTAACCTTTTTGATCAGCTTCCTACCAAACCACCTTCCAGACACACAA--------ATGCACACACTCACC----------TGACCTAGATTGTCTTTGG-GTACTGGAGTAAGCTGGAGCTCCTAAGCTATAACGTTTCCTACAGCACCTGAATCTGGAATGTGGTCACTCCTGGTC s canFam2.chr15 40236512 663 + 67211953 attCCCCAATAGAAAATCAAAACTC-AAGAGGTAATAAAGTTATCCAAGGCCATAGAAGGGACTGACTTTGAAATCTATTCCCTCAATCCCCAGCAGCCACAGAAGGTGAAGATGTGAGAAGCAAAAGGCTCTTTATGAACTTAAAACATTTTTTTTTAAATACTCTGTAAAGTTGGTGGGAGGCTTATTATTTCAGAACTGGCAAAGGTTATTCTACACAACTCAGTTGGTCAATAAGTTTGGCTGCCCTTGAAGCAGGATAATTCAGTCCAGAGC--TGTTTTCTCTGAAATCTCTTTGCAGAATGCTAATGTTATTTCCCATCAAGTAGAATACGA-AGCTCTCATTTCCTTTGTTACTGGAACCTTCCCTTTCTCGGGCCACTCATCACACCAAGAACCTGTGGTCAGGTTATAATTTAGGATCTCTTTAGCAGTCCTA-GGCCCCATTCACATTTGGGTCT-------CATAAG------------------GGGGTGCTGAAAGACTAAAATATGAACTCTC----TCAGCTTCCTACCCAACCACATTCCAGACACACAGAGACATATATGCACACGTTCACCATGTCTCTAGGGGCCAAGAGGGTCTTTGGTAGAGTGGAGTGGGCTGGAGCTCCTAAACAGTAATATTTCCTGCAGTACTCAGATCTGGAATGTGGTTACTCCTGGCC a score=20877 s panTro2.chr12_random 2243922 657 + 2259969 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