##maf version=1 a score=2369 s mm8.chr4 3027379 321 + 155029701 tgtctttatatattacttatcttttttccttacagtttttaataCATTGACTTCCAAAATGACTTCCAAACATGGAGTCTGAGTT----AGTTAAAATGAGAAAACTATTA--ATTACTTTTTTATTTTTTTCTATCATCATTAAATTATCTCACACCTTAGCCCATAAAAAAAGAACAATGCAGAAAATATTAAAATGTGTCAGTTTATTGTTTGATA----GAAAATACTAAAAAAACCTTCAAATTTAAAGGAAGCATTTTTAAAACATGTACTTGAAAAAAAGAAGCTACCTCAAAAACAGATATTTGCATATA-CACATAAATATCA s monDom4.chr5 285496021 285 + 308900514 TGTTTTTAAAAATCTCTTTACTTTTTCTCTTACTGTT------GCATT--TCTCCAAAAT--------AAAAGGGAGTAAATGTTGGGAAGTTGGATCTAGAAAATCATTATAACTAATTTTTTGTTTCCT--------------------------CTAAG---AGATAAGAATGAAGATGAGGGAAATACAGCAGCATATCATATCATACTCTAAAACCCTTCAACTAATTTGAACACTTT--AATGCAAAATAATCATAGCTCTACCAGGTCCTCTAAAAAAGTTCATTTGCATAAAATTATGTATTTGCATATATCAAATACAAATTA a score=2886 s mm8.chr4 3030991 318 + 155029701 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TAAAATGATGATAAGAAGGCATGTTTAAAGAAACAAATGGAAAATATGGAAAAGGAAAATAGCATATTAGATAGGAGATATGAAAATATGTTCAGGAAAAGGAGAGGAGGAAAAAGA-------AAGAAATGA---AAAAATAAAT---------GATTTTAAAACAAAAT-----------------------------GAAGAGGTAAAAAGTGAAGAGAAATGAGACAGCATAAATTTTTTATTAAAACCTGTTATCTTCTTTAATGCAGAAGATTACCAAAATTGTTTTTAATCATAGAAAATTGGAAGGAAAA----------TCACAACTTGAACCTCACAAAATTAAT-TAAAATGTAATATTTGGCAATAAAAAAATGAATAGTAA--------------------------------------CAAAAAAATCAAGGAAAGGAAAAAGGCTAAAGAATAAAGGAATGATA-AGACAGGGCTCAGGTGCTTG-AAAATGATATTATTAATTAAAGAAAGCCTGCATTTGACTTCTATGGTAATGAAAGATTACAGGAACAACGATTATCTTCAAGCTTT-------CAATATT---------------------TTATGGAATTTggggcaactgggtggctcagtggattgagagtcacacctagagacgggagatcctaggatcaaatctgtcctcagacatttctcagctgt-gtgaccctgggcaagt-------cacttgacc----cccattgcctagcccataccactcttagg--ccttggaaccaatacatattattggctccaagatggaagataatg-gttttatatat-------atatatatattttttttaatGGGAACAAGAGCAATATTTTGGGGAGAAAAATTC----CATCAG-AATAAACATA------TTTGATAATTAAAACACT--TCAAGAACAGCTGGATGAGTAAATCTGAGGTTCCCAACTTCCTTTTCAGGCAATCATTAATACAGCATAAGAAGAGAGATGAGATAAACTAGCACAGAAACACAATGGAAAATCAGAATATATTCCTGTCTCATGCTCTGTTCTCTTAATGTGAGACATGAA--GTAATTGCAT-AAGATAATTCTATCATGTAAATTAGATAATATAAACTACAGTTTGGAAAAATCTG---TACTTCTTAGAAATgcatagtaaaataagaggactatactaagagccaaagaacttggattttattcatacctctactgaaatctagtgatgtgattgtgggctagttatttttccattcttggtattatttttttcacctgttaaatggaaaAGCAATTATCTGTTAATTTTCT---CTTTTTACATGTTAAGTGAATATTTTAAAGGACAAATTAGTCTGACCTGAAAAAGGATATCACAATATTTCAAGTAGTGCATAAAAC---CTTTAGGAAGGTATGTCAAATGGAATAGATTTAATATGCAATGAGTTAACAAACAAAATTTAGAGCATGAAAGAATTATACTGATTACTGGATATATTGAAAATACTGTTGTGAGGGAGAGGGGATTATGAAGAAAAAATCCTTAAACTTAAGTATAACAAGGAGAAAAGAATTAAAATATAAAAAAAAG-------AGTCGGGGGGCGGGGAAGAAGAGGAA-------GTCA-----ACATAGTAATAGTAATATTTCCTGGCATTAGGCAAGGAGTGTGGCAGCATTAGGAAAAGGAGTGGAAACACAGAGAAAAACTTTAAAATagaaggaaatagttgaagaaaacaaagaaaaagaaacagaagaagaaaaaTTGAAAAATTCTAAGTGTTAATTGGCAGGGGAGAGACTGTTATGAGGGGGAAAAGTGAAAAAAAATATTTTTTAGCCT---AAAAGAGAAATAGATTT 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AACATAAACCACATACATGTATATTGGTACAGACATAATTTGTGTTTTTATT--------------------------CTAAAGAAGTTATAGGTTCCTCAAGATACCCTTTATA----AGGTGACAAGCTCATCCTT-------CATAGCTCATCTATATACATATACACATCtgtatg--------------------tatgtatgcatgcatgta------tgtatgta--------tgcatgtatgtatgtatgtatgcatgtatgtatgtatACCATCT---TATTTTCT-TCTGGTATAGT s monDom4.chr6 221345259 298 + 244784211 AACGAAGCTCACATACACACATACTTACACACACATATTTGAAGCCTTTATTAACTCTTCTTAATATTTGAGTTTTCCCTAAGTTAATTA-----TTTTCTACATATTATATATATGATAGACGACAAAAAAACTCTTTCACACATGTAGTTTATTTAT---CATATGATCATATGAATGAAATGAATAAAATCCTTTTATATCTTATAATGCACATATAAGATTATATGTAATATCTTGTTCATGC-tgtatataataattcatatctatatgtatatagcttgtgtattctatatatgatataat a score=570 s mm8.chr4 5774701 232 + 155029701 TACAAAAATTATTAAAATTCCTATTTATTGAAAGAAAATTACAAAAGAAAATTATTGGTAATAAGAATTGTCTCCTAACAAAGTCAGTtggtacagcctataatt----tcagctcctcaggaggcagaggcag-gaggatggaaaattca--------aggcttgcctgaggtacagagttaagtccaggAACAACTTAGTGTGATTCTGGATAGGGGTGGGGCATTTGCCTGGCTCAAGAGAT s monDom4.chr1 567506729 239 + 748055161 TACAAAAATTAATTATACCTATATTGAATGATAGAGACCTCCAAAAGTGCTGTCATGTTGA-AAATCCAATCTGAAGGGGATTTTAGGTGATTGGGATTAAAATTAAAACCAGAGCACCATAAGGGAGGTCAAGAAAGGATGGGCAGTTAGGTATAGGCAGTCATAGCAAGAATATTAGGCAAAGTCATGGAAATGATTATAAGGATCCAGAGTATGGATGAAGAA-----CTAAGTCAAAAAAT a score=103 s mm8.chr4 5774933 238 + 155029701 GGTTCTTATCTAGAACAGGAAGATAATAGCAGGTGTCATATCAATTTCCCCAAGATTAAACACTACTGCAAAGTGGGTTATCCTGAGGTAACATAAGCTACCTTTGGTGTGTCATATGTTTAATCTAGCTTTATTTTAGAAAC--------------ATGAGGTATATTATTTGCATAAGTGCTCTACCCCCGGAAATGTAAGGTTTTTTAGAAACAATAAAAAATATACTTTTAAACAACCCTTAGGAGTG s monDom4.chr5 218183112 231 + 308900514 GAGT------TGGGACTTGATGGTAAAAACAGGTTTTAAATTGCATTGTAGAGAATGTAAAAATCCATAAA-----TTCATC--AAGGTAGAGTC--CTTGTATTGTAGAGCCATGTAATT--TCAAATTCCATTCTAAAAATTGAGGTTAGATAAAATGATGAATGTGTTCAACATAATTTTTGTACCTTCAAAAGGATTGAGTTTTTT---AATAATTAAAAA-ACAACAATAAGAAATTCTTATGTTTG a score=1917 s mm8.chr4 5778968 86 + 155029701 TCAATAATGAAATATTTGAAATGAAGTGTCATATAGCAATAACAAAGAAATAGAATT---ATGTATTTACAAGAACACTGGAACTAAAG s monDom4.chr2 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a score=688 s mm8.chr4 5782825 201 + 155029701 cattgattcttggaagcctctactatcc--------caggtctctggcaggtcctaaagat-----------gccgcatcacatcccttacatctgtcagctgcacattttcactcatt---------ctcatggcta--------tctgaccatctctcctgtct-----ttccccacacctcgttctgaaccccccattt-cccctctcactcagctccctccctccatctgccttctatg s monDom4.chr4 80051832 233 - 430141050 tattaaataatggggtccactattatgcacaattttcagcttccatgaagggcctggaaataaattggtttaataaaacaaggtcccatac------tggct--atattttcattcatttgatgacaactcatagtcaagatggagtttg--catactccctattgatatattccccacttatacttgtaggttcttcctctacctccatcattcattaacctctcttcctttgagttccatg a score=243 s mm8.chr4 5783026 90 + 155029701 actattttataaggaaggcccaagtgacaacacttgaatctcacttagaaggtggaaAGCATTTG-----TTTTCAATCCTC-----TACCTTCCCCCTT s monDom4.chr6 92707061 98 - 244784211 acca--ctattcagtcagtcccagaggctccctatgattttaaggatcaaatatgaaatcatttgtttgatttttaaaactcttcattaccttgcccttt a score=1307 s mm8.chr4 5783247 83 + 155029701 GAAAAACAGTTGTAGTGTGAATACTATTATGTTAATATGTTAATGGGTATGACATTTATTCTTTATTCCCAGATTCTAGGCAA s monDom4.chr3 342429732 83 - 526135210 GAAACAAAGCTTTGTGATAAAATGTCATATGGCATAATTTCTAAGGGAAAAGCATTTATTATAGCTGCCTAGATTCTGGTCAG a score=-31 s mm8.chr4 5783409 359 + 155029701 ATGTTACAT-----TTTTACACTTATGCTGACTTCTTTGTTACTTTGGTAGGTCCTTTACTGGTAAAAACAAACGAAACCAAAACCAAAATAAaaataaaaaaaaaaagaaagaaagaaagaatgaatgaatgaatgaacaaatgaaagaaagaaaagaaggaaagaaaagaaaagacagaagaaaagagaaaagaaaagaaaaaagaaaagagaaaagaaaagaaagCTTGCAGATCAAGCTTGCTTCTAAAATCCAAATCTACCTGTTTCCCACCAGAGTAGTTTTTCCATGATATGTACATGTGCCAGAATTAAATGCACTTCTTATTATTTTCTT------TTCTTTAAATGAATGGATGTGGGCC s monDom4.chr3 342429931 335 - 526135210 ATCTTAAATGAGGCTTTTTTTGTGACCCAGACTCCTTTG--GCCTAGGGAATCCTTTCACtttattaaacttaatatatt-------atatgaaaatataagattatattaatgtaatattaatccttttcagaacaatgcttttaaatacataaaacaa-----------aatgcacaagagtataaagaaaGGATAATGAAAGAAAGGTTATAAAAGGAtaaaaag---aaagataa---tttcttttctagtcaagtttta----gttcccctaaaatctgtctaccctttggttgtac-----cccaaattaagaactcttATTGtaatctaactccattattttataattaaataaaccaaggcc a score=-688 s mm8.chr4 5783768 325 + 155029701 AAATTTGAATAACTGTGGCCCAGGTAACATTCCTCCCAGGAGAGAAAAGCCAGTACTGGTGGCATTGCTTCAATCTCAAGGAATTGCTACTATGCTGGTCTGGATGTTAACTTTACAGAGCCCCATTGTTTGTAGGCTTTTCTTGTTCATGAAGGTTTCACTGAGATGCCTTTATCAGTGCTGATAATCTAGCAAGAGCTGAAACAGACCGTATCAATATTGCCTTTCTTTTACCAGCCATAAAAGGTTCATAAGACTTATCCATGCAGTAATGGAT----ACTTTCTTTTTTAACCAATGTCTTCAAAATTAGTTCATGCATCAATAT s monDom4.chrUn 34356796 256 + 174229318 t--tctgaaggtttatgatccaattatcaaccttcc-----------------------ttcttttattcccactcccagagttggcaagcagttaaatctgg--gttaaacatgcatagaaaacatgtttccatattattcattattgtaaatg---------aatgatcttat-------------------aaaaccaaaatataaaatat--atact----------------caaagaaacagtgataagtcatatgcttccatAAATGGGTGAGTACTTTGTTTTTTAACTAATATGTTGAAACATCATTCTATCATAAAAAT a score=641 s mm8.chr4 5788764 381 + 155029701 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ataaaattttataaaataaaatTATCATCTTATAAAAATCATAAAAAAAA-----------------GACTGTGAAGACAGCCTATAGAAAAATCTATGGCTTTAAAGATGCTACTAAAAAGG---CCTTTAAAAATGAAC---AAAGCTAGAAGCCACTA------------TGATGTCTAAGCA-GAAAAAAATAAACATGACAAA-AAATCAAGTATAAACAAGTATCAAATGAAATAAACTCCATTGCTTACCTCCTTCTTATTCCAGTAATAAGCCACAAGCAACAGCATATTGCCACAACAATGCCCCAGATCAAAGATATTGTCAACATTTTGTAAACTTAGAGGGGACTTCTGAGTAGCTGGAGAACTTATGTTTCAATGAGTAAGAAGATGTAGAATACA-GACCTCAGCATGAGTTTTTATATACAGGAGAACACAGATTCATTAACCTGAATTTAAATGGCCAAAACAAACATTTATCCCTTGTTCTATCAGGACTCAAAAAAAAATAATA a score=3299 s mm8.chr4 6202918 388 + 155029701 TGGCCTTGAACTAAGTCCATC-TTCTCAGAAGAGGCTCCAGAACAAGCAGAGAGCTGCAATAGTCGATAAGCCGAAGGTCTGTCCCTCATGTGCTG--ACATAACATTCAAAGCTGGGGACAACAGCTAACACT---------------------------GTGCTTCTGTGTGTAGAAAAAGAAGTAAACACACTACAGA---AGAGCTCACCTACCAAAGATGTGGAGTGTGTTGTAAAGCAAAACAGGCA----GAAGCTTTCCATCCTGGCTTTAATACTGGCTGTCCATGTCATTAACCTTTGGGGAAAATTATTTAAATTAATTTCCAGAAGTATACAGCAACCGATCCTAAAG-GATGTGAACGGTGTGGAACAgtttgttttgtttgtttctttgtttgtttgtttttgcttgattgt s monDom4.chr3 344897127 394 - 526135210 TGGCCTTGAACTAAGTCCATAGGTATCAGGAGAGGTTCCAAAACAATCAAAGAGCTGTAATACTTGATAAATTGAAGGTCTCTCAGACTTGGCCTATCTCCTAAGTTTAGCCATTGTAATTAACAGCAAAAATTTAGCAATAAATGCAAGTAGGGTGAATAATGCTTTTTTATGTTGAAA------TATATTCACCAGAGACATAGAACATAAA-ACTTGAAGGGGGGTGTGTGTGGTATAAATTATTTGGCAACCTGATGCATTCAATCCT-------------------------CTGAATTTCTAAGAAAGAAAATACATGATGGACTAGAGGAAGATTTAGTGGTCAAGTTCAAGGAAAAGAGAATCAAGGAAAATGTTTCTTGTTTTTTCCTCCTTAATTTCTTTAATCACATTTCATTAT a score=20572 s mm8.chr4 6280928 498 + 155029701 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CTAAATGGCCGATGGTATGTTTTGATCAACATCAAATGGAGATGGGGAGGGGGAAAAACAAACTGGTTCTGTGAAAATATCCCTTTTCTCCATTAGAGGCATGCTCATTCAATTTTTATCTTTATATTCCAGTAAGTTATTTTGCTCTCACTG-TTTaacaacaacaacaacaacaacaacaacCCCACAAAAAAATCCTTGAATACTTTGTTTGATTGGATAATTTCAATGTTTTTCTTTTATTATTGTAAAACCGA-----------------------------GGATGATTTTATAAATCTTT----------------TGTAGGTAGCTGTCACATGTAGGGCAATCTCTGTCTCTCAGTAGGGATAAATTACTATAAAGAAAATGATCCTAGATCATTTTTCCCTTAAAGTCAAACATCTTGTTGTTTAAATAAACTTCTTGTttaaaat----------aaaaaaacaacattgcaaaca-----------------------------agtgcaaaagag-gagaaataac---aaatgcaaccttctcaggtcacaatgcatg-aaaataataattagcaag-----ggtacatg-gaaaggtaaatcataaattaattgggaattaaacaatacaattgtctaaaattggtta-----------aagaacaaataatagaaagaattaataacttcattgaaga a score=591 s mm8.chr4 8258352 119 + 155029701 CCCCA----GTCACCACACAGCCTTTGACGTATCTCTAAAGTCTCAGGAAACTTGATTCATACACATAATCCCAGGGAAATCACAAATATCGAGCTTCTAAGAAACAGGCCAATTACCAAAGC s monDom4.chr6 111102296 117 + 244784211 TCCCAATTCATTATAATAAAGTTTAATACAGATCACCCTACTCAAGGCATTTTTCATCCATTCAAATGATCTTAGGG-CTTCAAAAATGTCA-----CCTGAAAATAGGCCTAGAATTTGAGC a score=185 s mm8.chr4 8258534 402 + 155029701 TATATTGCTTGGAGCTTTTGCAAGCCCAAGCTAGAATT---CCCAGTGCTTAATTCTCCTTGAGGTGTGATACTCACCTTGTTAGAGGCCATGTTTTCTCTTTTTCCACTGTCTAGCTTCCAACTGTTTGGTTCAGTAGTTCAATTATGGGCATCTTAGTTGTTCACTATT-CAATTGTTATTCAATGGTC-ATTCCATTATCCTTTTTCTATTGCTTCTTCCTCAATGAAGTAACTCATCCAGCAAGCAAAAATTTTCCCATTGGAAAATTATATTACAAATATTATTTTCTGAAGGAAATATACTACCTTATCTAATATCTAATGACAAGTTTC---------TTGAATCTATATACAAAACAACCCACACAGATAGGATTATATTTGTAATTGTGTCATCGAGATTCACATTT s monDom4.chr1 618190164 343 - 748055161 TAAAATATTTGGACCTGTT---AGCCCAGACTGAATTTGAACTCAGTGTTTA-------TGGCAGGGTGTT-TTTACCCTCTGAAAAACCA---------------CACTGGATAAGC----ATTGTTTGTTTTGACGTGCCAGGAAAAGCCCTGCCAGGAGCACAACACTGAAACTGCTCTGCTGAAATCTAAGCCTTCCTGCTTTCCCCATTACCCTTTTTTTAAAAAA----------------------------CCACTGATATTTTACATT-TAGGTAGAATGATTTGTACTAAATATGTT--------------CAAGGGATAGGTTTCAGCTGAAGGTCAAATCCCATTACAAAAAACCCCAAAGAGCTATTATTTTGTGTCTATCTTTGTCAGTGATAATAGAATTT a score=1958 s mm8.chr4 8297012 90 + 155029701 GGAGGTCTATAGTTTACTGGGGAAGACCTTGAAATAACATCATGTATTCTCATTCTCTTCTTTTCCTTATCTGTTGCTTAATGGTCATAA s monDom4.chr3 347598031 90 - 526135210 GGAGACCATCATTTTATTGTAGAAAATCCTTTTTATACAAGATATCTTCCCTTTATATTCCTTCTATTTTCTGTTGCTCACTAAAAATAA a score=9326 s mm8.chr4 8301152 504 + 155029701 AAATCTCTTACAGAGCACAGCTGTT---AAAATCCAGTAGCCAGGT--AGATATGAGCAATTTCTTTCCAACGTAACTAATAAATGAGAAGCTGCTCTCAAAGCCTCAGC--TAGCATCACTTAAGCCTGGGAAGTGCACGGTGACACTCAGCTGGTGCCTGGCACTGGTGGAGAT-ATCACTGAAGTACTGAAGGCCATGCCAGGAGTCACAACTGTGCCACCTGCATTCTGGCTGGGAATCACAAGCCTGCCAGAAAAAGTCAAACAAGCCTGGTTTGTCCTTTT-CCTGATCCTGGGGGCTAGAGGACACTGTTAACTATCTGCTCCACCTCCCATCTGCAGCTCAACCTTGCTCACAGAGTCACT---GTCCTCCCTAAGACCCACATGGTTCCCCTTGCCAAGTGGTGCCAATCAAGAGCACCTGCCTTCC-CAACTCGATTATTAAGGACTTTAATGGAGTCTGTTTTCCCAGGGTGCTTCCATATCCTTGAGAGGACATTGACGCCCCAT s monDom4.chr3 347603822 490 - 526135210 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atatcc---cctttgcagtctggtgaagtctatg---atgccttagaataatgt---ttttaaatg-----------cataagataaaataatgaagtttacaaaagaaaccaattatattaaaatacattaaagta-aaaataaaataaaat---------------aaccaaat-------acat----atatatcccagtggaattgtttgtca------------------------------------gcttcaagagaagagagggaagaggagagagagagaacataaatcatgtaaccatggaaaattgttttCATTTATTTTTTACATTTGCAAAAAAATGTGTAATTTTATTTAGTCAGTTTTCAT-ATTCTAGATCCTTGAGGAACAAAGCATCACTCGGATCCTGTGTCCAATGGCCTTGGCAGGAAGATTGCTTCTGAATTTGGCTCAAACCATCCCACTATTTCCATGAGCCCTAGTAACTTTTCCCCAAATCACTCCTGTTCTGTTGGGTTTCCCACCAGGAGTTACTGTGTTGTTTTTGGCTTTGTACACATAAGCATGTCTCTTGCCTAACTACAATTCAGTTTCATCTAGGGCATAGACTCCTTTAGTTTTGAGAAGAGCTGTGTGTTTCCTCTGATTTTGTAGGCCTCGCTTGTAGCCAGCAAAAATTGCCTTAGAAGACAACCTTCCAGACATT-TTGCTGTTCTAGAAGCCCTGTTTCTAGCAGGCTTCC-TGAGCTATAAGATGGCAGAAAAAAGA a score=1013 s mm8.chr4 8383708 29 + 155029701 CAAATTGGGGTTTTATTTTGTTTTTTAAT s monDom4.chr4 91976661 29 + 430141050 CAATTTAGAGCTTTTTGCTTTGTTTCAAT a score=237 s mm8.chr4 8383737 75 + 155029701 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GCGGCGACTGAACCTAGCAGGCTCCGTTTCCTCGCGACTCCCCGAGCCCC----------------------GGCCTGGTAGGCGGGGCTCCGGGGTAGGCGGGACTCCGACCGGAGGGCGCGGCCGCGGCTCCTCCCCTCTCCTCCGGCGGCGCAGGCGGCGGCAGCACTTCCGGGTCGGCGC--GGAGGCGGGGCG-----GAGGCGCCGCGGCTGTTATTGTTCCGAAGGGCTGGGCCG----------CTGTGCTCCGCGCTCGGCGCTGTCAGTTCGTCCCGCTGCCCCTCGGCCTTTGCTGCTGGCTCTG-------ACGGCGACCGACGGCGGGCGGG---GCCCGGGTTCGCG-------GCCGAGCGGCGCCGGTGAG----GGCGCGGAGGAGGCGCACAGCGGGAGGAGGAGCCGTGAGCCTGG--CACGGAGCGGCCGCGGCCATGGCGTACGCCTATCTCTTCAAGTACATCATCATcggcgacacaggtgagg---ccggcggcgggccgggggcgaccggggcgg-gcaggcggggcaaacggc---------------ggcggcggcgccgagcggcgcgggtcggggGCGCAGCGCCTCCCTTCCTCCCATCCTCCCTCGG-------------TCCCCTGGCCGCCGCTCCATTTCCGCAGTGCTGGCGCTGGTGACGTGGGCGCTGCGAGCGGCCGCGGCCTGCCTGGGCC-TTCCTTCCCTGCTCCGCCCGGGC--CCGCTGCAGCCAG-----GCCCGCGGCAG------CCGTTTGCCAC------TTCCCGGAGAGTGTGACAGCA--------GCACGGCCGTCCCCG--GGGGGCCCCCGCCTCGA------------CTGTCTCCGC--GGCCC-----------GGGGAGAGAGAGGGAAGTCGAACGAATTGGAGCGTGACGGGCCCCGGTCCAGATTTTTCTCCCTGGTCCCACCTCCCCGACCTGCACGCTTCCGTCTAGGCCCTGGCAAGGCGCACCCTGAAGTGGGACAGCCTTTTGGG s monDom4.chr3 347738739 998 - 526135210 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CATTTGCT--AAAAGTGTGTTTA----------------------CTGGAGGGAAGCAAAAGAAAAGGC-TGGTTATAATGAATGAAAGAAAAATGGGAGTTGTTATTTTGGTGGTGTGTTTGCTATTTATTTACGGACACTGACTTGACATATCCTTTCTGATTAGAATGCTTAGGATCACACTGTGCTGTGGTAAAAATATTTCTTCCTGAAAACCTGGCCTCTAGTACCCTCCCACTGCACACACTTGAATGCACCCATGAGCAAATTGCCTTACAAGTTCTGTTTAGAGTCACCTCAGCTGCTCTCCTCTGATTTTTAAGAGCAAGGTAAGCA--CTATGGAAAACCAGAGGCTGTATATTTAAACAATTATGGATCTCGGTGTCTCTAAACCTTCTGCCTTCCGATCCAGATCAAGGTAGTGTAAGATGCAGATTTTTCCATATCAATAGCAAAGGAGTCTGGTTCCAGATGGTTGTTCCCTGTTTCAAAGCCACCTTCTTATGCCAAAGGAAGGCTGTGTGACCTCCCTCCAAGTAAATGTG--------------AGAATGAATGCTTAAAAAA-TGGTCCTGGGCTATATTTCATGTCCAGCCTAACGTGTTGTGTATGCACAGCTGTTCCTGGCTGGCATGTGGTAGCATATTAAAAGGAAGATGACTATTTTCCATTTTTCCCCT-CTGAAAGCTTGATATGCATATATAGAACTTGTGAAAAAAAATAGGCATAATGAGCCTGGTAAGCAGGGTCTCCAGGCACTAGGCAATGCACATCTGGAGTTTGTAGCATTCTAGAGATAGTTACTTATTCCCAGGAGCTG-AGGCAGAGTGGCAATGGTAGTCTGGTATCCATGGTGAGCTTCCCTATCTCACAATGCCAGgtgtgtgt------gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgATTTCTTGGAAAGGCTGTCCTCTGAGGGAGGGGAGGGGAAGGAGCAGGGAGAGGACAAGAGAAGGGAAAAATAGGAGGAAGGCAATTAGGCGCCACCTTGCACAACCGAGCCAGCTCAGCCTTCTGCAGA------GGTATTGGGAGGGCAGTGGTGGAAGCAGGTGACACATGAGGAGGCTTCTCATTGCCTGTCTGCATTGATGCTTGTTTCTATGGGCACCAACACCAGGGGGAAGAAACCCTGGGGTCACAAATAGAGCAGGGATAACAATAGCAAGCAGAATAAG 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TCCCAGCTCTCAAGCAGACAGCTCAGATTGGATATTTATGTATATAAGAGCTCCCTCGATTTATCAGCCATCTTCTCCTCTTTCACCCTCTTATTCAAACATTTCAACATAGCAACAGATGGTGTTTCAGACTCTTTGGTGTGTTTGGGATTGTTTTGCCATAG----AAAAGGGCTATTTTATGTTTCTTTACTAGGAAGGCTGTGACTATAAATCCCCCTCCATAACTAAGATGTTCAGATTGATGTTATAACTAGCTTTTAAAAACGAAAAGAAATGG----ATCTCAGAAACCCAGATCTCATCCC--------------------------------------TGGA-----CTTTTCTCTAAGAGAACTGAATTCTCCTTTCCAACCATCCTCTCCCATCTTTGTCTTTACTAGATCCTCTTCTCTTTACACCATCTTGTCAATGAAGGAAAAGTCCTCTCTATAAGAGAAAGCTGTCAGCACTGAGAGTGCTCAGTGTAAAAGAGCATAAATCATAGAGCTTTGGCTCATGGAAGGTTACAGCACTTTGCAGCTTTATATGAGCACTTTGTCCCTCTAAGTCAAGGGAGCACAATTCAGTA a score=2943 s mm8.chr4 8958913 329 + 155029701 CCACCCAGATGGAAGGC-TCAGGTGAGAGCTTTGTGTGTGTGCACTTGAAAGGTGAGACCCCCTCGACAGATGCTCTCCACGGGCCTGCTGGCCCTCTTTTCATCAGTGCAGCTGTGTTCCCCAGGGAGCGCTTGGTCAAATGCT--AATTCTTTGCTGGATGCCATGGCATTG---------GGTTGACTCCATATGGTGTTTGCAGGCATCCCAGAAAAACCCACCGCACTTCCTATCTGTAGACCACACTCAGCACAGCAGCAA---------------CAAGCTGGGTTTGTAGAAAAGGAGAAGCATACCTGCAGATTTTTAGCTTAGTTTAGGTTTCTCTATTTTATTTT s monDom4.chr3 348381257 350 - 526135210 CCACCAAAACAGAAGCTGTAATACTTGAGTTACGTGGATATATTTTTAAAAGG-GAGTCTTTCCTTATAGATATGTTTTAAGAACTCATGATTCCTTTTTTGTTAAATGCAGAATTTCCCCCCGGAGGGTCCTGGGTCAAATGTTTAGATTCTACACTTAAAAACATGGGCATGTGGGAGCCCAGTCCCTCCCAGGGGGCATTCTCAGTAACCTCCTGGAAGTTACCCTCCTTTGATATCTGCAAAGCACAATAAACACAGCAGCTAATCTATCGTGTGTTTTATGTTGGTTCAGCAGATAAGAGCTATCAACTAT---GATTTTGTACTGGATTT--GTTTTTTCATTCAATGTT a score=8377 s mm8.chr4 8959785 312 + 155029701 TAAAAAAGAAGAA---AAGT---CAGATATTGGTACCAGTGTGCCTTTAAGACCC-------------ATGGGTATAGATCTTGGTGACTGCCTTCCATAAGCCTTTAGTAACAGACACACCATGCTGAGATTTCCTCAGATTAACATTACGTCGTGCCTGTTCCAATGGGGCAAAGAACAGGTAAAGGAAACAGGTATGGTGGGGCACACATGCCATA-GGTCAGCCAC-----AGAGCACAATATCCTATACCTCACAA------CAGCACAGTACCTTCCTGACAAAAGCCAACACACATGCATGTTAACATGGA-TCTCTGTCCCACAGTAAGCTTTTCA s monDom4.chr3 348382550 339 - 526135210 TAAAACAGCAGAACTGAAATGAATAGGTAATAGGACTGATGTTCCTTTAAGAATCTGTGAGGTTACTAATGGATATAGGTCATGATGACAGTCTTAAATAAACCTTTGGTAATAAACAAATCATGTGGAGTTTTCATAAGATTACCATCATTTTCAGGCTGCTCCAATAGGACAAAGAATGCATGAAGGAAATGAGCATGATAGATCATATACATCATACTGTCATACCCCAAGAAGGGGACAAAA---AAAATCTTTCAAGGAGCCTTGCACAGTGC--TCTTGATAAAAGCCACTAGGAATGTACATTAATATTAATTCTGCATTTTACAATATGCTATTCA a score=27289 s mm8.chr4 8960714 532 + 155029701 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ttgcccagaactgaaTTTTGCTTGTTCTTTCTTCTACTTGGAGGGTCTATAAGATGAAAAT-ATGTAAAACTATGATGC--TTCACTGTTTTAGAAGCAGCTCAGAAATCTTTATGTATAATGATGGGCTAACAACTTCAAATACAAGGTGACATCTTGAGAGATAAGGACACTACTATATTGATTGGACAAATCTATTTGGCAAGACTGTGGTGATATATAGATTAAAAGAAGGAGCTGGTGGGAGAAAACCGAGTGCAAATATCATCATATACTCTCTATAGTTCataaataataataattataataaaaGCTCTGCCAGCAGTTTAAGGATCCAAGTAATATGAATTGATTGTTAACATTTCACTTTAAAGATAGATTAA-TTAATGCTGAATCATACGGTAATTCTTATGGAAGTACTATACATATGACATCCAAATTAATACCAAATGAATTCATTACAAGTAGGATAATTACAATGAATACCCAATGAATTAATAATGACAGGACATTTAGAATTCTAGACATATAAGTATCAT a score=5016 s mm8.chr4 8987517 343 + 155029701 ATGCCATGTCTCTGCTGGTGGAGCTGTACCTCCTCCCCCACCCTGTAGATTTCAGGAAGAGCCAACACAGCAATAGATTCTTTCCACTCAGGCAGACATCAGAAGGGATGAGGGCAGGGAGAGAGTAGCAGCCAGACAAAGACAGAATTACCCCCACATGACTGCCTGCCAAGAATTCCGGCTGCAGAAAGGCTTTGCTGAGGTTT---------GTATTTGTACCCAAGAGGTAAG----AAGGTCTCCGATCAGCAGGAAGAACTCCATCTTATTGTTC-AGTGGACTTCAACTCCA-TAACCTCT-GGCACTTTCTATGCACCACCTC-TTCTTCCAGTGTTTTCTGGATTCGTCAG s monDom4.chr3 348431082 337 - 526135210 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s monDom4.chr3 348502966 1347 - 526135210 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ttaaaaaaaaaCCACTTGGAATGCAAACCTTTTTGAGGTCAACTATTATTTGAAACTTTAGTGTGATCTCTAAATTCTGCAGTGATTTCATTCGTTG-----ACACCTGTTAGGACTGGTTCTGCGTGGAGGAAGCTCTTTGGCTTCTGCTTAGAGTTCTACATCCAGGCAAGTGGCAGCATTCCTCCAGAGGCTCCCCAGGGAGCAAAGCGCTTGTTGGATCTACTTCATTTTAGACTTTGTTCCATTGCTTTTTCTCCCTTGGTCTTGGAGAACA-------------CTGAGAACTTATGAGATTAATTTAGGTCAGATTCGCTGAAAGTCCAAAGTGATGTTTTCTTTTTGCAGGAAAAACCCCAGGGGCAGAGAATGCAGGAAATTGCATGTCACTGTGATGAAAAACAAATG--------AACAGCAGAAATGCCCATCTCTGATCATCAAACATGCCCATCACAGC-TGCCAGTGCAGATGTGTTAAACAGGCAATGGCCAACTGAGCATCCCAA-ACTGGATCCCCTTCGTCTCCTGCCCATTAGTGTTCTCCACAG-TAATTCTCATAGA s monDom4.chr3 166191920 547 - 526135210 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s monDom4.chrUn 85741505 1893 + 174229318 TTATCTTACTTTCAATTATACTAATCAATGGCTCCTTTACCTTAAAAAAATTTAATAATTACCCAAGAAAATTTATGGTTAATTATAACCGCATGGCCCCTAACTATAATATGATATATCTCCACATCAGCCGAAACAAACCGAGCTCCTTTTGACCTAACAGAAGGAGAATCAGAATTAGTATCAGGCTTTAATGTTGAATATGCCGCAGGACCATTTGCTATATTTTTCCTAGCAGAATATGCAAATATCATAGCAATAAATGCCATAACAACAATTCTTTTTCTTGGTCCCTCACTAAACCACAATTATCCACATATTAGTACTACtaattttatatttaaaacaatattattaaCATCAGCCTTTTTATGAGTAGGAGTATCATACCCTCGCTTTCGATATGATCAATTAATGTACTTACTATGAAAAAGCTTCCTACCAAGCACCCTAGCACTATGTTTAATGTTTATTTCTATTCCAATCGCACTATCAAGCATCCCACCACAAATATAAGAAATATGTCTGACAAAA-GAATTATCTTGATAGGATAAATTATAGGGGTTTAAACTCCC---TTATTTCCAGAACAATAGGAATCGAACCTACATTCAAGAACTCAAAATTCTAC--------------------------ATTCTA-----GTAAGGTCAGCTAAATAAGCTATCGGGCCCATACCCCGAAAATGTTGGTTTATACCCTTCCCATACTAATGTCCCCCTATGTATTAACCATTGTTTCGCTCAGCTTATTAACAGGAACTTCAGTAACTCTAATTAGCAATCACTGGTTAACTGCCTGAATAGGCCTAGAAATTAATACACTAGCTATTATTCCATTAATAACTTACCCCCACCACA-----CATGAAATACAGAATCAGCTATTAAATATTTCATAACCCAAGCTACAGCTTCAATAATCCTAATATTTTCTATTATTTATAATGCATCCTTTACTAACCAATGAACCATTAGTCATATACCCAATCAATGAGC------TTCACTACTA---ATAACCCTAG---CCCTAGCAATAAAACTAGGGTTAGCTCCATTTCACTTTTGAGTGCCAGAAGTTACACAAGGAATTCCACTCCTATCTGGCATAATACTCCTAACATGACAAAAAATTGCTCCTATCTCAATTATATATCAGATTTCACCCTCACTAAATATATATGTATTAATAATTTTAAGCATCCTATCAACACTCCTAGGAGGCTGAGGGGGATTGAATCAGACACACCTACGAAAAATATTAGCATACTCATCAATTGCTCACATAGGATGAATAACCATTATTATCATAATTTACCCCACACTAACTATATTAAACTTATTAATTTATTTTACTACAACTATTACTATGTTCCTTATACTTAACCATTCATCAATAACTAAAATTAATTCACTGTCAACCCTATGGAACAAATCCACCCCTATAATTATTATTATCATACTAACTCTTCTATCCTTAGGAGGACTACCCCCA-TTAACAGGTTTTATACCTAAACtttctagcagtttattttgtgatgacaaagaactggaaattgagggg-atgcccatcaattgagtaataaa-----tgaagttttggta-taatgattatgactatactgttgtgctataagaaacgatgagGAtacaaaaactt---tttaatttgaggtatttattttgc---attttgtaactcttt---ctaagtattgcttggttttgaagtctt--tcccttcccaaaggtttgacatgtatgctattctgtgttcgccta---attttcttatagtttccttctttatgtttatcttctgcttgtggatagtgttttttagatccctacaga-----ttgttcagggacattacaccgccactaatggaga---------agtccattacgttcgattatactacagtgtgtttgtctctgtgtacaat 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s monDom4.chr3 166218197 1022 - 526135210 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cagagagagacagagagagaACAGATTACTAAAGTGAGAAAAATAGAGCTGCAAAAGAGAAAAGTAAA---GGGAGAGATGGCAACTTCTTCAAACCCATGTATTAGTCACAG-TCCAGTTACGATTTAAGGCAAGAAGCTGCAGCTGTGAAGGGGAGGATAGAGGGAGGACATGattattattttaaatgtatttatattaaatCATTACTGAAAGGGGCGGAACAGGACTAGGAATTTGCAGCTGGGA---GTAGGGCAGTGGGAACTTAATTCT-CTCCTTAGAAATAGATGTGCTAACTAGGTCTCCAAATAGGT---CAGAGGGGGCATCCTCTGCATCTGGAAGTGGGAGGACCACTGGAGAATGCTAGAGTGTCTGCTTGTCACTTTAAAATATGCTCCTTCCTT-CTCAGTGCAGACAT s monDom4.chr3 166815496 425 - 526135210 CGGTGGGGAATGGGGAGGTGAGGGACTA-TGGGGGCTGGGGACTGCAGCTGGGAAAAGGAAAAAAAAACACAGGGAAAATGTTTTTTATTTTAAACACATGTATTAATCCCAGCTCCAAATAGGCCTTGGGGTGGGAAACTGCAGGTGGAAGGGGGAGGGCAGCTGGAGGACATGattattattttaaatatatttatattaaatCATTGCACAAAGTAAGGAACCAGGG-TGGGAATTTGCAGCTGGGGAATGGAGGGCAAAGGGAACTAGGTCCTATTCCTTTGAAATGGATGTGTTAGATGAGGCTCCAAATAGGATGACAAGGGGGTAGACAGCTGCAGCTGGTAGGGGGAGGGCCACTAGAGAATGCTAGTTTGTCTACCTGTCACTTTAAAATGTGCTCCCTCCTTCCTCACAGCAGCCCT a score=1731 s mm8.chr4 10348701 271 + 155029701 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tttttttttACTGTTCAAGGTTTATTTGGTGTTTTCATTGGCATGGCACTTGGGTGGTTGGTTCCATCATC---CATATGCAGATCTTACATCTCACATAATATTGCAATGCAC-ACTACAGACACATATAATACATAAAATATCCTGTACAACAT-TTATGTACAAGATATGCATCATGGACGTACACACTGGAGCCAGGTTATGA----TTAACTGGGAACTCATTGGCCTAGGCATGTTTGGTGAGGGTGCGCAGGGCAGCAATGCAGCAGGCTCACAGGGTAATGGAATTCTGCACAGTTGGCAGTGTGTCTCAGAGACAGTGGGACTGTCACATTAACC--AGGTTACCACTACACAAGTACCACTTGGCAGCAGGGCAGCG------CTGTGGGGAGTGAGATGTTTCTCCACACCACCTCAACACCACTGT s monDom4.chr1 110139355 372 + 748055161 TTTTTTTTAAGTTATTTGTGTTTATTCAATATTTGGGTTAGTATGACACTTGAGGAATTGGTTGGATTGTTGTACCTATATAGATCCT---TTTTATATA--ATTGAAATGTACAACTACTGATATATAT-----ATATAGTAGACAGAACTGGGTCCTCTGGAAAAGTGATGCA----------------TGGGGCCATGCTGTAGAACCCTAACCGGGAA----------------------GGGGGCCCCCAAAGGTAATCAGTCCATCAG-----CAGAGCATTACAACTGTA------TGGTGGTGTGAATCCAGGAACCAAAAACTGACTTTTGGATCTAAGGGAACTGGGA-ACTGGTAGCACCTACTAGGCAGGCAGTAACATACCTGTGGGGAGCCAACTG------AGCTTGACCACAAGAACACTGT a score=53157 s mm8.chr4 10365927 1253 + 155029701 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s monDom4.chr1 110139968 1305 + 748055161 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s monDom4.chr3 167951019 1212 - 526135210 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s monDom4.chr3 168486558 2114 - 526135210 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ataatacaggatAATTTGGACATgtgtgatgttacatgtctgtaattccagcc-cttaagatgcaaagcaggaaggttgtgggttcaaagacagcctgaac---------------taagtggtgaatctctgtctcaaaataataaCAAATAAAAAAAAAATCTGTTTTAGGCCAATGAATCAGTAAAACAAAAT----AACACAAACCCCAACAACCACAACAAAACACCTGATAGGACATGCATACAATTTGCTGTGTGTTAAAGAGTAAGAAACAGTGGCACAAGCTGCTACTTTGCTTTCCTTTGGAATTTTCAAAGTAA-TGTCTTTTGGCACTCTGACAATTTCAAACAGAGAAGT------GAGACTATTTCTACTCCAA-----------TGACAATATCT---CTTGC-----------CCCCGCATATAG---AGCTAAAAATCCTTGATATTTATAGAAACTG--TGTGTGAAAAGCAAGGGGAA------------------ATATGGACCAGTGAATATG--------GGTATGTCAGTATTACCACCCATGACTGCTCATACACAATTTTTC------CTCAGAATCGTATTGATGATATCAATAGGATATTAACA-----GCACAGAAGGAAAGA-----------------CCAGACCCATTTACATGG--CAGCTCTGTTTCCTTTCCCTGGGTAGATAATGAAGTAGATTCTCTTTTCCCATGACACTGGG-CTGCCTGATATTTTGCGGTGTTACACGACGTGCTTCAGCATCACTAATATATCCCAGCTGGTCTCAACAGCAGGAAAATGTGTCTGGGGG-GCGGGGGTTGACTCGGTTATGGTTACGCATGCTCCAACAGAGGTGGCTCTGT-TGTGTCTATAATTA-GGTGGGGGTGGGAAGTCTGGAGGGGGTGAGAAGAAAGAA--TGAATGAAGGAGGTGGGGGAGGCGGGAGT------------------------------------GAGGAAATCCCAGGAGTTCTGGGA-ACTTGAGATTTTTCAAGCTGTCA---------TTTACCTTT-GCAAAGTTGTGGTTGGTGGCTG--TGTTTACAGGCTGTGGATCTGTAAACAGCACATGTGCAAACCGTTAGCTATTGTTTTGAAAATGGCAGTATGGCCAATCATTTCAATTTCTGTGTTTAAGCATGAGCCAGATGACACTATGTTTTATTTAAAACCGGGCATGTATCATCCAGGGTGGATACCTGTACCTCTCAAACACTTTCATACTCTGTACTAT-GCCATATGGTGCTTGCTTGCAGGTTTTTAAAGTGATTGCTTACTGCCTAAAGGTAGCTTGTCTCAAGATTATAATCCATCTCTTGCTTGAGGGCAGAAATGAACCCATTAATTTAACAGCACACTAATGGGATTGGCAGAGAGATGTTAATTCTATCCACTATTCCTAGAGGATT-----AGTTGAATAGTGGTTAGATAAGAAGGAAAA---------CAGGGCAAAGCATCATTGTGAAAGCTCTAGGGCCATGCCAAAGATGTGGCCAGTGTGTTTTTATATT-------------TACGAAGCCAA-TCATTGCCTAG----AGTCATTATTAAATTAAGGGATATTTTAAACTAT--------------CAAATTATAAAACAAATTGTTCCTATTTTACAACTTC-------GGAAGAAAGTCTGTTTCTTGCTCTGTTTAATCTTTACAAAAACCAGAAA--GTCTGCTAACATTTACTCACTTATTATAAACTAATATGTATGTAATgacaggg----tctcatgaatctctagctggccctgaattcactagttagctaggctggtcttgag s monDom4.chr3 170712279 1829 - 526135210 ATAATCTATGCCTATATCTACATATGTATTTTTATACATGTATATATAGTGCCACGGAGGAAGAGAACTTTATGGGATTTAGATTTTAAAACCCTTAAAACATAATTATTGCAATTTGCTTGGTGTACCTTtgagacaagtgagacccaaagagtagaagggactttcccacaagtatagagtagaagacctaaattttgaacccagattctcaagacctcaa------agccaacAGAGCCTGGGTCTATTCTAC-------------GCAAAGAAGATTGGTCCATGTTCCC----------CGTAAGGAATTCTGAAAGCAAGTGTCCAAGTATTATCTAGCA-TCTAAGAAAGGGAAGTCCTCTTTAGTGTATATCCATCCTGAGCCTGTGCTCTTTATGATATCTGTGCCTGCTCCCTTCCATTCCCCACATTCATGCTAATGAAAGCCCTTTGACATTAATGAGATTTGCCTGTGTACAAAGTGAGTGGAAGGAGACCCCAGAGCATAGACGTGGTCCAGGAAGAATGCTGGCTGCTGCCTGCCTTTCTTTCGGAGCATAATGAACCGTGTTCACTTATTCTATGACCTTGGAATAATGTTAATGATATTAACATGAATGGAATATACATGCATACATTAAGAGGAGCATAAACCCTCGAACCCAGCCCCGGTTTGAAGGGACATTACTGTTTCCTTCCCCTAGGTGGGTAATGAAGTAGATTCACTTCTCCCATGACACTGGGGCTGCCTGATATGTTGTTGTGTTACATGACGTGCTCTGGCATGACTAATGCATCCCAGCTGGTCTCAACAGCAGGAAAgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt----------gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtAGACATGGTCTGGGAGGTACGCATGCGCCCAGGGAGGAAACAGGACCTCAGTGTGGTAGCGCTAGGATTTGTGGGTTAAAAACCCACCACCACCACATTATTTGAAAAGCCTAAGGAAATCCCAGGAGCTCCCTAAGATTTGAACATTATCAAGCTGTCAGTCTCTTCCTTTACCTTTTGCAAAACTGTAGTTGGTGACTGCCTGTTTACAGGCTGTGGGTTTGTAAACAACACATGGGCAAAGCGTTAGCTATTGTTTAGAAAATGACAGTGGGGCCAATAATTTCTATTTCAGTGTTTAAGC-CAAACCAGATGATGCTATGTTTTATTTAAAGCCAGGCATGTACCGAGGAGGTTGGAAACTTGTACCTTCTGAGCACTCTCGTATTGTAGGGTGTTGCCATATGTTGCCTGCTTTCATGTTTTTAAAGAGATTGCCTACTGCCTAAAGGTAGCTTGTCTCAAGTTGATAAACCACATCTTGCTCGAGGGCAGAAATGAAACCATTCATTTAAAGGGACAGCAGTGGGGCTGGTATAAAGGTGTTAATTCTGTTCAGTGTTCCTTAAGGATTTTTAAAGCTGCCACGTATTTCAGCAAGAGGAAAAAGGAAGGGGGAGGAGGGGAGGATGA-AATGAAAACTGTGGAGCTCTACAATAGGCCTGGTAATTGTATTTTGATATTAAGTAGGGGGAAAAAAGAAACCAACTGATTACCCAGACAAAGGCCCATCTACCTTAAGGGCCCTCAGAGGCTCTTGAAATGAAGAACCTGAATTATAAATCAAACCTTTTCTATTTTAGAGCATCCATCTAAATGGGAGAGCTTTCCGGCTCTTCTATTTACCCCCTGATAAAGACAAAGACCTTGTGCTAACATTTGCTCA--------GAATTAGCCTTTGTGTATTTTCAAGAAAGTTCTCTTTTATTTCTAGCCTGCCTTT------CCATTTACCTGGGTAGGATTGGGG 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AAAAAATCATACCGTACCATGGGCAACCAGTAAAGCAATGGTGCTACTGTATAGATAACGATCAGGACCAAAATACAAGATATTAGGCTGGCCACCTGAAAACACACAAAAAAAGCAAA a score=4240 s mm8.chr4 14467802 563 + 155029701 GGTAAAGTAATTAATAAAGGTAATGTGCTTATCATTTGGGCTTTGATGAGTTGTAATTAGCTAAAAAGTTGAAGGGCTTTTAT-GTGTTCCAAGTTAATTTAGTGGGTATGCATTCCAGTGCCTAAGGGAGGCAGAGACGTTGAAGAGCCTGCGCTTTGAAATCATGAAGTGTGAAAGGGGTTTTTTTACAAGTACCCTAGATAAAGCCAAACTTTGAAAATATGCTTAGCGCTCTCTTCAAGTCAGCTAGCTACTA---TACCTATGTATACTTAGTGGTAGCAGCAT---AAAAGGTCTGAAATGG-----ATAGCAAAGCATCCTCGGTTTGAGCATGCACATGAGTTCAGATTCTCTTCCTGTGCAGTTGGACAACAGTGGTTAAGAAATAGAGCTATCACCTCAGCAAGGAGGGTACACTGAGAAT--ATTCTGCCGGCAGCCTTT----------AGTGTTTTTGCTAGATTCTAAATTCATTTCTTGTAAAGTTTGATGAAGAGAATACCATGCAAGTGGGAGAAATCTTTATAAAGCAAAAAGTCTTTAGAGGTGTTCTCTTGTTCCAATCATTCAAAC s monDom4.chr3 172243248 552 - 526135210 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s monDom4.chr3 176001041 1045 + 526135210 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s monDom4.chr3 176185374 1287 + 526135210 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s monDom4.chr2 181305296 1052 - 541556283 gaataagataaaatatataggattgaaaaggaagcca-----------------aatat---gttcatttataatt-----------tcaaaaatattttttaaattaaaaaaattaaaaat-gatgggtcc-caggataaaaatctttgatctaaccaaatcccctcattgacaaatgtagaaataaagtccaaagaagttgtcatttttttctgttatagaaggagcacaattgctatttgaacccag---atgctttgatccaGT--------------------TAAAGTTTTCTACCACACC--AGAACCCTCCTGATGTAGACTTGCTACAGAAA---------------------TATCACTTTGTATG-GTTTCAGAAGTTGTGACTTGGGTCCAGAGGGAGAGATCAGGTCAGCCCTGGAGGTCACCTCTGCAGACATTGGTAACGTTAGCATCAGGCTTCCAGGAGATTAGTGAGAGATGCTCATTCAATAAAGTCAAAAGGATTTTGTCTCCCTAAAGCATTGAGGGAAATGAGTTTATAGATAACTCAACTATGAC-TGGGCCCTCTGGACATTATCCCTTAACTTTCATGGATGCAGCACGTGCTGCCAGCCTCATAGATTTTGTGATTTAGAACCTCTTGCAGCCCTGGGAAGAGAGAGAAGGATTCCTGCTGCTGGGGTCTCCTCCATATTACTGAGGCCGGATAAGTGGGTAGTCAGCCAAATGAGACCACCACTCAGGCTCCTGTTGGTGTGTGTGTGGTCGTTTTACAATTTGCCAATTTCTTACAGTGCTTTAGATGGCTACAATCCCATCATTAAAAAAAAACAAACCCACAAAAACCTCATTATTACT-ATTCGGGCTGTGTAGATCATTTACAATTTTGAGGAAAACCTCCCTCTGCTTTTAATCTGAAACTGGCAAAGGGCTTCACGTTTTCCTTCTCAAGTGCACTTTCTTTCTACAGAGAAATAAATAGGCATTCTGGTTCTTGCAGAATAAGGATAATGAC------ATTGTATCATGCACTGCTCAAAATTCAAGAGTGGGCAGAGGTGTTTTTTTTCTCTCTTTCTGAAAAACTGTTCAGAATGAGTACTAAACAAGGGTT-ATGGGGCAAAG 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AAGCTAAAAATAAATAT--CCTAGATTAAGTGTCT-TTTTCTGATTTAAACAATGCTTTAGAAAGGTAGTTGACTGAATGCCTTATATGTATATTTAGTGATGAAGAGCACTCATAAAGCCTCAG-------------TATCTTATAATGCCTGTCAAT-TAAGGAAAATGACAAACTAGTACTAAAAACCAGACCCACAGGTAAACTGTGAAGCATGCTTCTTAAGGGTTAA-TTCCCAAGTGAAAATAAAGATATATTCAGGAACC--CAAGAAGTCT--GCATTAAGCTCTTATGCAAGCACACTCCAGTCTCCAAAAAGGTGAAAAATGGGCTAAGGGGCTGTCATGCACTACTGTCTGAGTAGGATGGAAGGCAAGA--TGGTCTTTTCAAGTGTGTGCTGTAAGCCTGGAGGAAGAATTGCAATGTCCTTGGAACTGTCCAAGGAGAGGCAAGCGTGGCTGCATAATCAGTGTGCAGAACCCGAAAACCCTGCAACTTATCAGGCAAAGGGACATGAAGGCTACTGCTGC--TGTGATGATGCAAATGAAGGGCAAAATGGTACAAATTTCTGTCTCCCAGAAGGTGTAATTAGGGAACCAAGGTAGAA---------------------------------AAACAGCTACCTCTAGAAATGCAGAAAGGATGCTTATGCA---GACTTCCCCAGGCTTGGGTT-AGCAG-TTAAAAGATATTGTCGATTTTCAGCTCATGCCTCT------ATTTCATATAAAAGTTTGCCTGAGTTACAATTGATAATACTAATAACAGATCACAAAATAGACACAGCACAATATTAATGCAGAAGTCATGAACAGA--------AAGCACTTAAAACATCTGAG----------CCTAGGCCAGATATAAAAAAATAACATATCTATGATAATCAATCTAAAATTATGCACATAAACTCTCATTCTGAATCACATGAACTATTTGACATTCTAGCCAAAGGAAATACCCAGTTCCTCCTAAATGCTTTGGTTTGATAATACAAAAAAATGGCCTGCTCCCATTCCTATTTAAATGGTATTCGTGTTCTATATCATTTACAAGCAG-----TTATAACGATGCACGCATAT--------------GGGGCAGTTGCCATGGTATTTTC----TTTATTATCTGAAG------TTATTCAAGTAGTGTCAGTCCAGGGTCA------CTGTGCAACTTTCTTTGCAAGGGTATT-----------------------------TGTATCTGAGACCTATTGAATACTTTTTTGATATATA-AAGGCAGAGTATATTTCTAGTATTTTTGTGAGTATGCATTG 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s monDom4.chr2 181799566 1427 - 541556283 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s monDom4.chr2 181813246 1046 - 541556283 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ATACTGCGGGGAAGGGGGGCACAAAATTTTGGCATATACTCTAGCATACTCAGAATATTATAATTTTCACTACAATGGATGATGGCCTGAAATTTC--TTTAAGTTAACGTATATATACCTAGTGAACTTGTTACAATGATATTCCTGGTATTTCCTGAATATGCCAT-ATACAAACAAATACCCATCTACCAAA--CTACAAAAAGAAACCCAAGTA-------AGAGTAAACTAAAGAGGAGAATGGTTTTAAAATTAGCTGTTTCAGGAGCTTTTCT-----ACCAAAATTAAAAAAAAAAAAAACATGGCAAGCATTAGACCATTTTGACAGCTGCTTGCTAATTTTTATTTTGTAAACTTGTCCTTTAGAATGCCTCTCCCTAAAGCATCTCTGCTGCTCTCTCATCCCAATGTTATGGTTTTGCACATTGCTAAATCCTAAGCAGATAAACAGATTCAAATAAAATTTGGTGATAAAAGAAAACGGCACCTACTGTATGTTGAGAATTTCGATGGCAAGTTTCAGCTGAACGTGAATTAAAATGGCTAGGTTATAAATCCCCCGAAAATAAGGTTTATAATGGAAATGCTGACAGGCATTTAACGATAGCAGCAGTAGCTGGCACCACTGTAATAAAAGGACTTAAATGAAAAAAAATATGTATGCCTCACAAAGACATGTGGATTTCAGGGTAAAGCTATATGCAGACTCAGTGTAAGGATAGATGATAATATGCCTGAGCAATTATGATGCATGGGTGTTAGTAACAAAGAATCTTGAAACTCAGCTTCCAATCAAATTGTGAAAGAGTTTGAAGAGAAACCTGA--ATGCTACATTCCTTATTACCATTGCCCCCGTACCATCAAGCTCCTACCTAAGTATTTCATTCCTGTTTCAGTGCCAGAGCAGAGAAAAGCTTCTTTAGATACTGACCCTCAGGGAAATGAGATGGGTGTTTCAAGAGCCTATCCC-------------------------TCAGAGTGCCCATTTTAAATGAAGGC------------CCTTTGCTGAAATACAAACAAAACTGTTC--------------------------------------------------CAGAAACATTGCTGTATTTTCCTCAATCATCAAGTGCACAG-TTTCACAGtct-------------------------------ctctcctttctt------------------ccctcctttttttttgtctctttctctt-tccttcttcctgctccttattccctctcttttaactttccccccctcttctcctttctttctCACACAGTTCT 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monDom4.chr2 183244001 921 - 541556283 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s monDom4.chr2 188063361 1054 - 541556283 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TA-CGAGCTACCTCTTCATATTTGCGATCTGCCTCCTCTGC---------GATATACTTGGCTTCCTTCA---------ACTGCATCTCCTGAATT--TCCATTTTCTCTTCAT----CCTTCATTGCCCGGTTCTCAATCACCTTCATT----------------CCTCTCTCACTCTCATCAGCTGCCTTTTCCGCTTCCTCCAGTTTCTGCAGGGCTGTGGCCAGACGTTCTTGGGCCCGGTCCAACTC------TTCCTCAACTAGTTGGATCCGTCGATTCCTCTGAATCCACATCTCCTTCGG--CTTTCTCCCGCTGCT a score=13971 s mm8.chr4 28155327 841 + 155029701 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s monDom4.chr1 460658210 1164 + 748055161 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s monDom4.chr5 117563196 1423 - 308900514 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a score=-2731 s mm8.chr4 28515837 829 + 155029701 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monDom4.chr1 688828242 956 - 748055161 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tcatccatgaatagagaaggctgTCACTTCCAAATCTGAAACTATGAATCTAGAT--AAACTAAAG---------GAAAGAGGATGTCCAGGAATAACATATAGGATAATTATTGGCTAAAGAAGATAACACTGAatt--tatcaagtatttattaagcaccttccacaggcaagggactattagtacttgccaat---gggACTCTGAGAGTTGGATGAAGGCACTCAGTACTCCAGGAAAAAAAAAAGCCATCTGCATTTTAGTAGCAGGGAATGATGCGCTAATATCTGAAATTATAAGGCAATTATCACATTTTCAATTACATACCACATTTGGCAATTAACATTTTGTTAATCATCCAGTTCCCGATTTGATGCGACTTTCTAAAGTAAGTAGCTTACCCTCTACCTCTGT---AAAATTACTATTTATCACCAGTGAATACATAATCAGGTTCTAAACTTTGTATTTGCCTTTAGAACTGCCTTGGGGTAATTAATTCACCTCAGGCAGAATTCATTCACATTAGTGTGTCTATGTAGGAG a score=1407 s mm8.chr4 28753772 140 + 155029701 GCAAACCATCTTAGTCATAGACTATATTATATTCCCAAAGGAGAACAAAAGGCGA-------------GGAAATATTTATTTTCTAATACTTCCCGTATGGTCCTTAGACCTTATTCTTTTCAACATCTCTAAGATGAGGATATAGTATAAAA s monDom4.chr2 189162319 140 - 541556283 GAAAAGGATATTAATAATATATTTTCATATATTCACAGAAGAAAACCAAAAGAAGTTCAGAGTAGAACAAAAACAAGGATATTCTCATA--------ATGTTTCTTAATTTATATGATTTT-----TCTCTAGACCAAAAAAACTACACAAAA a score=789 s mm8.chr4 28753912 155 + 155029701 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aaatggaaaaaaaaaACAGAAATGTATCC---TTTTCCAAGGCAGCACTGGATCCAGAAAAACTAGACTCTATTATTCTT-----GATTACGAATTCAAT--CAAAATATTAAAATACCAGGGAGACAATTTTTTTATGATGAT-----------TACCTATTATAGA-------------CAGAAACTT--CTGGATTTATATATGCATGTATGTCTATAAAGTGGGACTAATAAATGTG--TTACTTTCCTCTGTTAAGACATTACATTGGCTCACATATGTTATTGTTGAAAGACAGAAGCAGATGCTAATGGAAGTGATGTTTAATGATCTGTGACCCTACATACAAAGAATACAGCCATCATAGTCATCTGCTAACCACATCCATGAAGCCCGACAGTGCAAAAGAATTCATGACCTTCAGATCTCAAGCAAGCACCAGCCTCTGTCCAGTAAGTTGAAAGAGCTCAGCTGGAAGAAGAATGAAAAAAGAGTAAACATTTGAACAAGTGTCACATC-CCGTGTGTTGGGCACAAGTGATCTATGTGTAGCTTTCCCT----TTGCCTTCCATTTGCCCCGTCATTAGGGC---------TCTCGGGGCCCAGAGCAGCTGCGGATCACAGAAGGGCATTGCCCCAGTAGGGTGCCAGCCTTTGATGGTGAAGC----CCTGTGTACACAGACAACAGGGTCATCAGCAA-TGTATGAAAAGCATCACAAAGTTCCATGAAA----AGCACCCAAAATGATTCA-------------------ACCTAATCA------AACAAAACCTAACAACACCTACGCACATGTGACATTGTATTTAAGCAAGCTGGGTTCACACAAGGGCAGCATACACAACCGCTCCAGTGACAAATCCCCAGATGCGTTTCTTTTTAAAAATTATTATTACTAGCATAAAAGTTTCACTTTACAGTGAGTATCACAAAGAGGAA-GCAGTTCCAAATTCTTGCGCAACCTGCCATGTTATGGTTAATTTTACAGTCCACGCATGGATACTTACTCAGAGACAAGAACTCTGGATCTCTTGTACAATCCATCAAAAGAGTAGGAATAAACTGTCACTCCCAACTTGAGCTCTGGACATGTTTATTTATGAGCCGCTCTGCTAAAATTGAAAATAAA--------------AAATGAAAATCAAGACAGCAATGCAGAAAGTGGC-GTTGGAGTGTTCTCCCTTACACAAGTGCTAGTTCAAAGCACATAACAGAAAAAGCCCTTAACCAGTTCAGCTTACAA--GTTGAAG--------GCACTGCTTTTCAGTGGGTTGGGTTTTCTATTTTCTCTACTTTAAAGCCCTAAAAACATGATCTGACCCTTCCCAAAATCCATAAGTATAAGGGTAAAT 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agagggaagaagaattgggaattgaacctaggtctcctaacttcagactggtttgctattaactatatcatgttactgctcTGGAGCTTAAAAGTTAAATTTCTGAATTGCAGAAAAAAGTGAAATTTGTTATTTTTTGATGTTCTTTACCCTAATACATTTAACTGATAAtgtgtgtgtgcataagcttgcatgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgCACAGACAGGTCTATAAATTTTACTGGCCTCCCTCTGTTAAGACATTCCATTGGCTTACATACATTAGAGTTGAGAGACAGAAACAGATGTTGATGGGAATAATGCTTAATGATCTGTGACCCTATATACAAAGAAAACGAGCATCATAGTCATCTGTTAACCACATACATGAAACCTGCCAGCGCAATACATCTTATAACCTTCAGATCT---ATGAACACTGGCCTCTTCCTGGTGAGTTGAAAGGGCTTAGCTAATAGGA-------AAAAAAGTAAACACTTGCAAAGGCCTGACATTGCCTTGCATTTAGGGAAAGTGATAAGCATCGAACTTGCCCCATTATTGCCTT--ATTCCCCTCCCAACTAGGACAGAACTTCTCCTTAATTTGCAGAGCCACTGGGGTTCAAAGGAGGGCAATCCAACAGATGGGTGCCAAGCTTTAATGATGCATGGTTGCCTGTGTACACAGATATCAAGGTCATCAGAAAACATGTGAAAAGAATCACTAGGTTCTAAAAAATAACGGCTTAAACAGTGATTCAGTACCTATAGAAAACACCCACTTATTCAGGCAATAACAGAACTTATAGACAACTGCCCAAGTATGACTTTGTCTAGGAGAGAGGGGAGTAAGCATAACC-CATTATAAAGAGAAACTTGG-----AAGCTCTGAGAGGAGATTCTT------AATTATCATTACTTGGACAAAAACTTTTTCTTTGACAGAGT--CACCATGAGGAAAGTGGTTCCAAATTCATAGGCACCCTGCCATATTATGATTAATTTTACAGGCCATGCATGGATGTTTAGTTAGAGAAGAGAACTGAAGAGATCTTGTACAATCCATCAAAATAGTAGGAATAAACCGTCACTCTCAACCTGAGCCGTGAACATGTTTATTTATGAGCCACTCTGCTGAAATTGGAAGAAAAAAAAAGAAATAAAGAAAAGAAAGCCAAGACAGCTAGGCAAAAGGAAGCAATTGAAATAGTCTGTGTTAAGCAACAGTTAATGGCAAACTTGCAACAAAGGGA---CTTTCTGAGCCCATCTTATAAGTGTTCAAGTAGAATATGGAATGGTCTCC-------TGAATTTTATGTATCCTCTATTCAA------TAAAAGAAGGA----AACCTTTTTAATATTCTGAATTCTAAAAGTAAAT 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AACGCAAATATTTAC---TATTCCATTTTTTGAAAaaaaataaat-taaaaataagaacaaaaataaaaaACCTTGCAAGCATTTTCAAATAAAAATTCCACTTCATAAATAAATATAAATGAATAACAATTACTATGTGAACATTAAAAACAATA---ATATATATTTTATGTGATAGAAATATTTTTAAAATCATAATACAATAAGAAAAATCATACTTTAAATAAGTGCTTTTCCAAAGAAGTAATATGACCTAGAAGTAAACTATTAATTATAAAACA---CTTAAAGAATCACCAAGGCAAACTCAGCCAGGTCCATTGATTTCTAAGGGTATGAGATAGGGGAGAAGTTATTAATATGACATTTTGAGAAACTACAAATTATTTTAA-TATTTAGCCAGTACATTGATGGATTATATTTCTACATGTACtatatgtatttatatgtatatatatatatatatgtatatatatatatatatatatataGAGGCATACATAGATATAAATCGAAAGTAAGAACAAAAATACAAATCCTTGCAAACATTTTCACATAAAAATTCCATTTCATAAATAACTATGaacaaataacaataactatgtgaacattaaaaacaaaaatatat s monDom4.chr2 184300561 527 + 541556283 aacaaaaggattcacatttatcccacttttt--aaaaatatagttctggaaatgctagcaacagtaataaga-------------taagaaaaaaagt--------taaaaaaatcaaaataggtaaaga---------ggagat--aaagctttgcctatttactgttcatatgacagtttacttgaaaaaatcctagagaattaacaaagataataattgagacaatagattcagcaaagtagtaac-----------------------ttacaaaataaatccttgaaaatcagc------------ggcatttctatagaataataacaaaacaaaagaaataataaga----gaaatctcattccgggtaattataaaatgcacaaaatatgttgtgattgagctactggaatat-----tac-tgtgctctgtgtgatgaaatatgtgtgtg---atgaatgtaga-acatggaaagatctatatgaactgatacagagtgaagtaagcagagccaggaaaacaacacaagtc------------tacatatcaaaaaa-----tcaaaagtgatggtaacaaaattataaaaattaagagga---ttaaaatgaaaagatat a score=-3349 s mm8.chr4 28759709 602 + 155029701 tatatgtgtatatatatgtgtatacatatatatatatatatatac-gtatgtattacacacacatatatatgttgaacagaatactattgtact-----------ataaagaaaagtgagccatggggtaaat---agatagtactagaaaactttctattgggtaaggtga---------ccaacatt------acatgtactctctcctctgaagctcctagatt----------------taagacttcatatatgtgtatatattctgg-tgtaactacaggaaccaggaaattaaaacaga-----------------ccattgcctgcttgagagaattgaggaatcgatagaaatgggaatagcagtgtacagtaatttggtgtggaaaatgggaacagaagtggctctaattaagaaatagactgggggataaatat---aaaaaagggatagag-gcaattaaaataagcatgtctaaaagt-------------------gatataaAAAATTGTCTTGCTACCTACCTA---AAAATAtctg-------------taagaaatacacat---------------gcaatgtttaagtgaagtttttccatgtagg--ttgacagta-ctccctctgaagactaaagaccatgtaataaaaATGGACATATGTCATAGACAGCAAATTCTAAAATTCCTTCAGGAACTTTGTG s monDom4.chr2 184301140 694 + 541556283 tatTTTTTTCTCTCTTGGTGTTAACTTTTATTTTCCTAGACTTCCAGGGTTTATTACATGCA--TAAATTGGTGGAATAGAATACAACTTAATTCTTTTAAGTGTATAAAAGAAACACAGTTTTATAGACATTTTAAGATACCTCAACAGTGTATTTTAGAGACCAAGGAGTAATTCAATTCCATTATTCAGCTGATAGCTACATACTGTTTTCAGACCACAAGAATGTTAGTAAGCTAACATTAGGATTACA-ATGTCTGGACATATTAAAGATATTATTTCTCCCTCCCTAAAATAAAACCAAAGTAAACTACTATGATTGCTAGTTCTTGCTTGAATTGTTTAAGGTATC-------------ACAGTATTG-ATTATACTTAGAAGTTAAAA---GAAACCTAAACTTCCCC--TTAAACGCATGTTCATGCCATACATTTTTTAAAAAAGTGATTTAACAAAAATAAAGAGAACATATCTGAAAATATACATCAGAGGGAATGAAGACATGAAGTATTTTCTTTCAACAT-CTTATACAAAATAACTTATTCAGACTAGTCTAGGAAACATGCTTTTTGCTCCTTGAATTGGAATGCTTTAGTCTACTTCTTCCATGCATGATGTGTCATCATCTCCTTCAGGAGGTGGCATTTCCTCAGTTATAGCTGCATTGGTTTCTT------CAGTTGTTGAATCATCTTCATCAATTCTAAG a score=23199 s mm8.chr4 28760373 431 + 155029701 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s monDom4.chr2 357254292 1630 - 541556283 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CATACATTTTCTGGCCCCATTGTAGATTCTTACACACCATTTGGTCACATA----CCTTCTTTAGATT---------TATCATTCTGATCATAAAATGGACAACATGATAGACAGTGAATAAAATGTTAATCTCTAGAAAAATCATACTTCAGTATATGTTATTCAGTATGCTTCCCTCCTGTTACATCGATCAGAGTTCCACATAGTTTATAGCACATGTTTCCAGCATGCCTCCTGTAGGTATCATTGTGGAAATCCTGTGCCAAGCACTCAAAACTTCCACCAAATTAATAATCCCAAACTTTGAAAAGAAAACAATTAGAAACATGGAACTGATTAACTTGTAATACATTTTTATCAGAGTAAA-TTTCTCAACAACTGGACAT---TTTCTTGTATAGAAAATTCAAAAGAGGAAACTGGAAAAGAAACAAAGATTACAAAAGAACCCACAGTTGTGAGTGTTCTTTGAAATGCTGTAGTACTTCATCAAAAATGAGGTTTTTGTTTGAGCTGCCATTTGCTAAACATTAAATCATTGCTGAAGAG-TTTTACAAACAACCTGAGTGTTGAATATTTGGTCTTTTGCCCAAGGCAAACACTTTTCATTCTGCTTCTAAACTA-CTCAGATTAAGATAGTTGAAGGAAAAATAAATACAAGACACATTCCTATCTTTTAAAATGGAGAAACATA a score=10666 s mm8.chr4 29309036 573 + 155029701 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monDom4.chr1 497905193 389 - 748055161 CAGTTCACAGATAGCTTTCATTCAGACGAACAAACATTAACACCACATTCACAAAGTACTTACC-ATAAAAGGACTTTATATGTTAATTACTTGTTCTATGAATATTATAA-GCTACTTCA--------ATTATAGAAAGTCAATAAATTAAAGTTAATCAAT----------------TCATTGATACAGCATTAATTTT-------------------------AGCATATATTATATAT--ACATAATTATGGCTATAT----CAGTTATTAA----------ATTCTTATCCATTGAGAAATAGTATAATATATCTGGATTTGGGATCAACTAAACCTTTATATAGACTATCCATATATCCATATAACCATATTCATTCTCATCATTTCAAATTCCAAGAGAATCCACCAGCATGTTCAAATATTTCCTTTTTTCCTTATTAATGACTA----------------CAG a score=-498 s mm8.chr4 29364129 182 + 155029701 TCCTAACATTCTTCTCATTTTAATGTTATTAGTGTTTTCATTAAGTACTTAC-----------TTTTGGC--TAAATAAAATTGAACTTTATTAGTAATGATATGTCTGCATACTCCAGACTT--------TCTTATTACTTATTTCCATAGGAATCTTTACAGAACAAATTTATTTAAAAAAATATCTTGGTGTCAAGATGA s monDom4.chr4 221774481 185 - 430141050 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ataaaaggattttatactttttatagagtataga-----tgtagtttattgagtaatga-ggtactatgggacacatacatacatatatagatggatagataggtaaagagatGACATATCTCtata--taatatat--------------------atatatatatatatatatttataCTAGTAAATTATAGAGTAATGCTATGATAGTCAATATTTATATAGTGCTTCTGTTTGTAGATCAATTTA--TATTGTATATAAAATATAGATATGCATACTTAATcatttatctatccatccacctatccatccatctgtccatccatccatccatccatccctctctctctctctatatatatatatatatgtatatatacatatatacatatatatatatctgtctctctctctctTCatatataaataaaaatatatgatttttttCACTAGCTAAGTGATCAagtgatatagcagaaggatcactggagttctatctagaattctaaagctaattattccactaactatgtgtgcaacccaaaccaagtatcataactctatctagacccttttaaccaagtttatgaaccaatgag-ggggaccagaggcctgccctttgatatcatttccaatcctggcattctatgatctaaattcAGGAGGAAAAAATATT-TAGTATTCAATTTCCTAGCTTGATTATATATTCTTGCAGTTATTATAGTGCTAATGTTTTGGAATGAAGAAAATGTGTGGTTTTGATTTGGTATGAAATGTTGCATCATTCACATTCATATGAATAATGtaataatattgctttctatttatgtagcaccatttttttaccccagggagtgtagaacaatttactaatattatctcatttatcctttcaacaTCTATTTGATATTAGGGACACAGTTCTATTAACTCTATTGATTGGGGaatattattattattttt-----tattCCCTTAAATGAGTAAAGGAGAAAAAGAATGGTTGTCTGATTTTGTGAAGTCAGATTCCCAAATCAGTATTCAAG---TTCATGAGATAGCAATGTACAATCTGGCAGTAC---TGTGACTGAGATTA-TAGAATGTCCCACAAAA 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TTTAACACGTTTTCATTTACCTGTGAAACATTTG---GGGTAC-------AGTTACCCCCTACTCTCTCTTACAAATGTCGATCTAACTCTATGGCACAAAGTTATGTCTGCTTATTGAATTCTACTTGATATTGTCAAGAAATTACACCCCACATGAGGACTCCTTAATGTAATTGCTGTTTCTTTAAAAAAAGAAAATCTGATGTTCAAGTTCAGTGATACAGCCAAGAATAGCAGTTCATATCAGCAGCAAGAAGGGCTGAGCAGCCTTACAGCAAGAGCCCCTTAATCAAAAAGCAATCTTTAGGGATGAGTTAGTGGTACTTTGCCTC-TGGCGATAACCAGATCCCCT-CTTTTATTGTATATTTCCACGGGACTCTAATGATGAAATACATCAGATCTCCTCCCAGGTGAAG--------------TAGAATCACACTTCACCTAT-GCCTTTCTAGGGTCACGTGCTGCTTCTAAAGCCAGAAG s monDom4.chr2 192343365 469 - 541556283 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s monDom4.chr2 192357244 1219 - 541556283 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ATATAAATATATACACATGTGAATCTCAGTTCAAATATGATAATGAGCACATACACATAGAAATGACCACATGGCCCTTACCATGGCATTACTATTCAGCAATGAAATTCCAAGAATTTCCCAGA-AAAGGGAGGGTAAAATCCCAATCAATACCACAGTGCTTCAGAGGGTCAATTGAAGGCAGATGATGATTAGAAGATAGTCATGTCATCCCCAGTGAAATGAAAACAAGAACAAGACTGCCTACAGATTGATTGGGGGTCAAGCCAAATCTCAGTCTGAAACT-GGCCACAAATTATGGTAAAAAAAAAACTCTCCAGGGAAGACTATGATTGGTG----CTTTCCAGCCACACGTTGCATCCTTTAGATACAGACATCAGGGCAGCTTTGGAAACAATTGGAGAATCAAAAGCCCAAGCAAGAGAGGCTTTCTGAAAGGGGAACTATTGGGCCCAAATGCTTTCATTTTTGGTGGAGCGT-TCACACAGCTGCTTTAAAACAAGCTGTTATTATTATTCTGCTTCTCCATTCAAGTCCCTAATGAGGGGCAAAGCCAGCACGCAGCAAGGTAAAGAGAATTTTAGATGAAAAAGTCAACGGGCAGTTAAGAGGGTTGTAACAGCGTCTG--AGCCTTCCAGCTGGA--TGCACGAACTGAAGGAGAAAGAAAAG------AAATTTTAAAGGGAATGGCCCTTTTAA-----TTTTCCTCCCCCTTATTCTTCCAGGAACTCTTAGGTCTTGTCATTTT--TGTAGTCAGAGACATTCATTTAATCACTAGCATACTTTATGAAAGAAAAATGTATAGACCTTCTAGCCCAC--AAATCTATTGCAACGGGTCCAATTTTCATTACCAGAAATAACGAGAGGAAATGAGAAGCAGGTGTGGGAAGGCTTCCCTGAGCAATGCCAGGGCTCTGTTTTAATTCAGCTGGAGGGAAATATGCCCTGCCGCTAGCTCATTGCCTTGCTGCTCACAGACTGAGAGGTCAAGCTATTAAAATCAGCCAAATATGTGCAAATTAATTTTTTTTAGTCCATGCTACTGAACCACTAGCCAGTGGAACATTTGGCT 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s monDom4.chr2 193588349 1252 - 541556283 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monDom4.chr2 194549802 970 - 541556283 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monDom4.chr2 194809387 902 - 541556283 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s monDom4.chr2 194922882 1443 - 541556283 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ttattttaaCTAGGCAAAGAATTTTATTAACCTTTT---CCAGCCTT--TCCCAGGCTTCTTCAGCTTAATT-TGCTGCAAAGAATGAATTAGGTATAAGCAAAAACTGAAAAGAGCGGCAGTGTTCAGCGGGCTTGGGCTTAAAAATATTAGAGATCTAGATTTTATCAGCTCCATAATAAACA--------------------AAAAAGAAATTTAAGAAGCAGTCATG--ATATAAAATAGCAGCTCC-TGTAACTTGTGCAAGGGTCGCCTTCTTCAGAGGTTGCTGCAGTTCAGTTTGCTTTGTTCTTAGAAGCCTCATCAGAATTCTCCAGCAGACCTGGAACTGCATCCTCCTCCTCCTCTCCAGGAGCAAGTGGTGCTTT-CCATCCACAGACTGTCTGGGCAGAGCTT--------------AAAAGAGTCAGACCGTCTGCACCCAGCTGGTTTCAGATGCTGGGAAGCATGGCTATCAACTGCTTCGTCTCAGCGTGGCCTGTAATGGTGAAGGTGTTTGCTGCCATGGATGCCTGAACTTTAGGGTTGTTAAAATGGATCCCTGTTCCTTGGTTG-TAAACATGGTCACCTCTTCAATACCAGAGATGTTGTTTACCCCTAACTTTTCTAAGGAGAGCTGCAGTCTTTTATTGTTTGCTGTGGCTGTTCTGTGAACCACCTTCTTGTTTCCACGAGCGGTTCCTTTCCCACCAATGCCCACTTGTGCCTGCAGCTTGGCGAGT-------------------TTTCTTTCATCTTGTCGGAGTGGAAATGGAGCTG----AAAGGGGAACTAAGGTTCACGCTTGCTCAGGGGGTCTTGGGCACTCAGGCAGACCAGCTGAGATAA--GGCACACACACAGGGACACAGGATGGCAGCTAGAG s monDom4.chr3 361663250 890 + 526135210 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TATACATTTACTTGTCTTCTGGCTTGTTGAAGTAGTAGGTTAGACAACACTTGCCACAATAATGTCTGTCAAAATAGCTAGCCATAAAGATCCCAGCACCACATTCATCAGAAGGACACTCTCGTCTAAGGCAGCTAATCTTGCCATTCTCATCAACCTTATAGTACTTCAGAACAGCAAGCTTAACCTTCTTTCTCTTATGCTTGTTCTTTTTGGGAGTGGTGTAAGACTTTTTCTTTCTCTTCTTGGCACTACCCCGAAGCCTCAGAACAAGATGAAGGGTAGACTCCTTCTGAATGTTGTAGGCAGATAAAGTACGTCCATCTTCCAACTGCTTGCCAGCAAAAATCAATCTTTGTTGATCAGGAGGAATACCTTCCTTATCTTGTATCTTGGCCTTGACATTTTCAATAGTATCGGACGGTTCAACCTCAAGAGTGATGGTCTTCCCCGTCAAAGTCTTTATGAAAATCTGCATCGTGATGCTGGGTCCACCCac a score=492 s mm8.chr4 34578768 163 + 155029701 AAGAGGTGGATTAGACCCAATGACACTGATGAGAGTGACTCATAAGGCCACAAACCAAAGCCAGGCCACAGGGCACA-------CACTCCTCTTATTACTCTCTTCGTGT--------------------GACACTGGTCACTAGGGGTTAATCATT--------------AATGTAAATAATACATGCACATCTTGAGCTTGC s monDom4.chr4 161413241 195 + 430141050 AGAAGACAGAAAAGACAGAA-GAGACAGAGCAGGG--------AATGGGAAGCACAAAGGCTCTGCCATGAAGCACAAGTCATGAACTCTCTTTCTTACTGCTTTTGTACTGGTTTTTTTTATTGATCAGGACATACTTCATTAAGAAGTTGTAAATATGATCCCTGCGCAAATGTAAGTAACATTTCCAGATGTTGAGTTTTC a 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ATGTCTTACTGAGACTAAACAAATAATTTTAGGAAAATAGTAGTATTTCAGAATCTC-AGAAATCAACTTCTTAGAATATTTTTCAAAATTAGTCT-TCAGTACTCATGGAATCCAATGCCCAAACCACTCTGATATTCTTGGCACACAACT-GTTCTCAATACCTTCAAGCTTACTTTTAAATCCCCCATAATCCTGCTGGAAATCATTAAGCAATGAGTCATGG-AGCTCTCTAATGGCCTCCCATAATGATTTTACCATTCACGTCAGAATCATTATTTTTTTTCCTAATCCAGTTTAACAAATTTAGAATCAATTGCTAAAATAACTTCTTGGGAGAGTCTCAGTCTTTTATTTCCTG---CCTTTCCAAGTTGACTAAGGTCAGCAAGTCCCTGGTACCCAAGGCCCTCTAGGGACCAGCTGGCCTAAACTGATAAAAGTTGAAA-GTGTCCTAAA--------AACACTCATTGCTGCTGCTTCTGCCTTCATTGGTAGCCTGGCA-GTAAAAAGTCACAAACTTAATTTCTTCT-------ATCTCCTGTTTGCAGAGCTGAAAGACACTATCCCTAATGCAAAGTCAGAGAGTATACATGGGAATTGATTTAGTTGAATGAGCTGTGGTCACTACATGTCTC-------------CAGAGAATGC-CATGACTGACTAACAAGACAATAACAAACACTGAGCTCAAGAACAGATTTTCAAGACTTGCTC--CAATTCTTACATTTGTATTACCAGTCTCTGTTTTTCTCCTTCCTCCACCA---------CTCTCCTCAT-TCACAGGCAAGCCCCCATCCAC---CACCATCCTGATATCAGGCAAAATAGAA--------ATTTTATAAAGTATTTCTCTGGCAGGTAAACTTTGTCCCAAGTCCATTCCTTTGTTCC a score=21388 s mm8.chr4 34646749 390 + 155029701 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aaaaattctatttcatagctcctggtttttgtgggtcagaaatctaccagtagttgggtttttacctcaggtataggctgagttggggtctcacgaggagctgagaatatctttccaatctatgtgggtttgcctaaactctgatccttgtaggactgaggtt---ccctattatattctgaataccagccaggg--tctattctctgctta--ctagaggctacctgtgtgcttttccatga s monDom4.chr2 16621232 200 - 541556283 aaagatattag--------------------------agtgatttgccattttct---tctttacctcatttgacagatgaggaactgatgcaaacagggttaagagacttacccaaggtcacatag-----------ctaggaagtatatgaggccagatttgcactcgggtagtttctgattcccagtcaggtcctctatccactggctacccTGAAAGCT---CATGTGCCTTCCCCTTA a score=1739 s mm8.chr4 34650685 52 + 155029701 TGATCCTTGCCATAGGCTTAATCTCAACCATCACCAGCCTACCTGTCTAGGT s monDom4.chr2 16621484 52 - 541556283 TTATCCTTCACTTAGCTAAAATTAAAGCCCTTCCCAGCCTATCTGTCTAGTT a score=-296 s mm8.chr4 34674590 124 + 155029701 agcacttaagact-tcaaaacccgGAGGTACCGCCTCCACCCTTCCTCTCTCCTTGGTAGAAATTGCTGGACGCTTCTGTACGTTTCGCAGTTTGTCTTCGCTGACCGGTGAGACTTCGAGCAGT s monDom4.chr1 518098837 106 + 748055161 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TGGTATTTGAGCAAACTATTTACTCAACTTTTTATAGTCAGAGAACTGCAGAAACTGTTAGCTTTCTCATACATTTTTGCACTCTGTCCTTCCACGCTGCTGACAAAAAATaagaaagaaggaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaaggagggagggagggagggagggagggaggaagggaagaagggaagaagggaggaagggagcgaggaagggaggaaagaaagaaggaaagaaagaaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaa s monDom4.chr8 17155553 289 - 308469712 TGTTAGTTGGGCAGAAT-------CCACGTTTC----CCAGGGAATTGTCCACACTGTGGGCTCTCTCATATATTTGTGCATTCAGAC-------------AACAAGaaggaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaa a score=8306 s mm8.chr4 34687384 513 + 155029701 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s monDom4.chr2 197220518 2017 - 541556283 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TTGAATGAA---ACAAGGAGAATTGAACCAAAGAATTGAATCCATTTCCT--------------TGGCCTTTTGGTTCTCCTAATCTAATACTCTAACACTTCACTGATACCTCTCTAATGCTAGATTAAAAATTT-----AGGTTTTGAGGGAAAGAAGACTTTCCCT---ATGTAATA--TAAAAATGACTTATTGGACCCTTGTTTTCCTCCCTCTGAAATATCAACAGAAGCTGGCCATATGATTTCATGTCAACTATGCAAATAGTCTACATGTCAGCCAAGATG-ACACATATCAGAATAAACATGTACACCCACAGGGTCTCTGACAAGATGCCAT-CAATAAGTAATGAGAGACATGGTGCATATTTTAATCTTGGAGTTTGCATTTCCCCCGTATTTT------CATAAACATAGAA------CTGGA-AGCCAAAATTCTTATTAAGCAGAAGTCATAAAGAAAAGCAAATTAAATGTAATCCAGT----TTTTGAACAACAGGCGGGTCAACAAAATCCCAGAATAAAGGCTTTACTCTTTTCAATGATAACTAGAACAGTAGTACAGGACA---ACAATCCTCTGTTGCCTGTACCAAGCTTTCAAGTGCCACAAAATTAGTTGACTATATTAAAAAAAAAAACAAAACAAAACTGGTGGGGGGAAAATACCCAGCAGATGGCACTCCTGCTCTATAGTTCTTTTTTTTTTTTCCCCAGCTAGTCTTCTCTCAAGTCTGCTGTAGATCAGAGAGTTACATTTCAAAAGAAAA------TTATGGATGCCTGCATCAGGAACTACCAGAAAACT--AACCCTTTTTGTGTCAGTCAGAAACCAGCTCCCTGTGGAAAGGATTTAGCTTATTTGACCTTGGGAACTGGAGGCTTAATTTACCCATTGAGAACCAAAATTAGAAGGGGA--GAAATGAACTATGGTTCTGATTTCTTCCAT--------ATAAAAATAAGCTTAGTGATATGGATATATAAGACAAAGAGAAATACATCCAAAAGCATTGCCCACCTCCCTCCAGCCCCAAGGTTCATATGTATGATGAA---CACGAAGCAATGCTTATATTAATTTTATTTGTTAAC--ATGACATTCTGAAGAGAATATTTTCCCCCAAATGAT----AGGAAAAATTCCCCTGATCAGTGGAGGCTATTATAACAAGGGATTACCTAGCATTAAAAATTATGGCTATGTACTTTGGCTGTTCAGAGATAAAAGTATGTCAGCATTCTTTTTTTAAATGGTTGTTTTTGAAAAAGTAAATTTGATTGT--CATGAAGATTCACTATAGGTTTCA 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tttaatagaagaaaaactttaat----tttataaaataGCCTCTAAG-AGACCCTAGGATGTTGCTGAGAAT-TGAGCTCCCAGTTTCATTACAAATAACAACAATAGAAACTGCTGGCCAAGGCAGGGTAATCAATTACAGGTGAC-TGTCAGGAGTGGTATTTACTGGGAAGCAATCTGGGAAGCATGGCAATATTGAAACACAGTGTGAATTGCATTGTTTCTTAATGCCTCT--GCCCTCTGGATACATACAGATGTATACAGATGTGTGGAATACAGGCGTCTTTAAACGACACCATTCTACCTCTCAAGGGATTCCAACTCATCTCTATGAGCTCATCCACATACTATGCAGATTGTTGCTAGGACAATGTGTGTCTTAGGAGTGGGTGAACGCAGGGCTTGGGAGAAGGAGGCAGCTCCTGTTTAATGCACAGGAAACACACTGATGCTAAGCAGAGCTGTGC---AAATTAACACCATCTGGGTTAATAAGGCCGATGTTGACAGAGTTTAAAATTGCTTCCTCAATTAAAAAGCCCAAGGAAATCTATATGTTTGGGTCTCAATGAGGACACACCAAATAGTGACAAAGACTCTT s monDom4.chr6 44639466 585 + 244784211 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tcaaggccatacttgatgatagaaattatataatagtttattttattgttttttgtttaaattttcagtggtggttcattatgtatgactt-tgcataatttattttgtatcaatt-caggtatattttcatatgcatcacatgcttttttcatatt----atttggttcttttg-----gagaaataatatcccatcccattcataaatcagaatgtgtttaaccaataacccagttcatgagtaccCCAAATCATTCTTCATCTATATTGTGTATCTTCCCTTCACTCTTATGGAAGGAtataaactctttaaggtcaaggacattccccttttgtgt-ttgtataacaagcatctagcacaacgcctggaacagtgtgtatttgataaatgca----tgttaattTTTTAAAATTGATAATTGATGTGCTCTTTTATTTGGAAGGCAGAGGAATAGCCGGATATAGTTCTTTCTCTTCTTTCTCTGGTTCCATGCCAAGTATTGGAGCTCTCTCAGAATTCTGGTTTTCTTT---------------TCTGGAAGAT--GAAGAAACAGCTGGCACCAGGAAAAGTAATTCTATTCCATTTGCAGGAATGTTCTAATGATAATGTCTCTAGAATTATTGTTAAATATCATGTCCTTAATTTGTAGAAATCATTTTGACTCAATTTATATATTTGTT--TTGAACTAGAATTTCCCCCTATAGTCCATTTTTTCTAGTCCTTATTAAATATCTCTTTTTCTAAGAAAATTCTCTCCATTTTTAGAGATTCATTTGCCCTTAGTAT-----------TCTCTCAAACACTTGGTGAAAATTATTTA-------------GGGTTGCTGGTTTTAA--AGGGGAGTTGACTGCATCCCAAA---ATCAGTGACTGTAGCTTTGTTGGAAATAGCTGGAGC-TTAAATACCTGGATCCTTACCTAGAAAAATCCTCTAAGTTTCATTGTAGTATTTGAAAGT---GGTTATAACATAAGGAATAC---ACTACCTGACAGGAGTTTAT 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attttaaggcctaaac--cccaaatcatatacccatagatacatataagtgatgtcat-atgttgtt---------gggttt----ttttttgcatttctgtggttctttctc-----cctatgtggatagcattgtttttcctcccaTTTGAATAAGGttatttagtcaatttagaacatt--attccttgttt---------------------acaataatca-ctttatttctctccctcccctccatccccccttcatgcagccaatgcacaattccattgggtattacttgtgtccttgatcagaacctatttccatgttgttgtttacactagga-tattcattcagagtttacatctcc-aaccatatcccttcaacccatgtattcaagcagctatttttcttccatgttt--ttactcccacagtgtttcctctggatatagatagtggtttttctcgtaggttcctcc-------aagttg-----------ttcagggtcattgcattgccactaatggagaagtccattacaatcaattataccacactgtatcagtttctgtgtataatgttctcttggctctgctcctcccactctacatcaattcctcgaggttcttccagttcccatggaattcctccactttattattcctttgaacacaatagtattcgatcaccaacatataccacaatttgttcagccattccccaattgaagggcattcccccattttccaattttttaccatcacaaagagtacagctatgaatatttttgtacatatctttttcc------ttattatctctttggggtacaaacccagcagtgctatggcttggtcaaagggcagacagtcttttagcaccttt--tgagcatatttccaaattgccctccagaatggttggatcaattcaaaactccaccaacaatgaattaatgtcccaattttgccacatcccctccagcattcattactttcctttgctgtcatgttagccaatctgctaggcatgaggtgatacctcagagttcttttgatttgtatttatctggttataagagatttagaacattttttcatgtgcttattaatagtttttatttcgttaactgaaaattgcctattcatgtccgttgcccatttttcaattgtagaatggcttgatttttt---gtacaactggtttagctctttataaatttgagtaattaaacctttgtcagaggtttttgtaatgaagattgtttcccagtttgttatttcctttctgattttggttacattagttttgtttgtacaaaaaactccttaatttgatgtaatctctgccctaatggagtggattgttcttccctctttgagtcaattttaaaacacgtaagagtt--------gagtatttcc----------tatctccaa---------cctctttacccttccagtgtattaatgttctcccccttatctccatgagcttctttgtgacatataaatttacccccat--------------------ttgtttcttttcccatttctttttgtattaacctcttttttta-----agttatagttgtaaata---------------tatatagttata-----------------tagatacaaacatgtatatgtatttatgcatgtgtat---------atctatatacctatttatgtcttgtcccttcatc----ctatacagtttt--tcactgtt-ccctctaagtgtaattcttctagctaccca-ggtgaaaacaaca----tttttt----------aagagttaccaatgacctcttttctt---------------atagggatacttatcattttaacatattgag----tgtcttaaatttttgtt-----ttgttttgttttt--------ctttttttcatatttttaattacattttgatgattctctttatttctgtacttgga----catcacattttctgttcaggcct---ggtcttttctttgaaaattcttggaattcttctattttgttgaatgaccatatttcccctctaagaatattgtcagttttgctgggtagttgattcttggttgtaaacct----agttcctttgttttcagtaatatcattccatgcctttccatccttcagtgtggatgctgccaaatcctgcattatcctcactgtggttccatggtatctgactgacttcttcttggcagcttgtaatatct----tttctttggtctgatagttcttgaatttggctataacattcctgcgtgttatgagttggggattaagtacaggaggcgat-ctatgaattc-----tttcaatctctactt------ttccctcttgttccagaa-tatcagggcactttttttgaataatttcctgtaga---------aatgtgtccaggatttttcttttgtcatggtcttt----tgatagc-------------ccaatgattcttaaatggtc-------tttcctcaaatgattttctaaatcttctgttttgtgaatgagatgcttcatattttcatcatttttttcattctcttggttttgtttatagtgtcctact--------accttgtgaggtcacttaatcctagttgttgtattatggtt--cttaaaaactagatttcatccctggatttttg----gtaatccttctct 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aggaataatggaggaaatggtggaagacgaagtgaaagggttgtgaaatgaggaggaaaagagaagaggaca--------ttttcagggaatattt-----------------tcctttttttcccagtagag-taggatgcaaaggcttcagcaaaaaggaccacaaaggaagagattctactggaag-agaatctagag----cgaagatggtttagaaaatctaatgtaaggagtagg----------------atagAAAATCAATTA---------------GTCAGGAAGTCAGTAAGTATTTATTGATCTGGAATACAAATACAGATAAAAACAAAAACAGTCCCTAACCTCAAGGAATTTACAATCTCATACAAGTAGGAACCACATATGAAGAGAACACATaatcaatcaacaaacat-----------------ttactaagcaggtaccagtgcca-----gacatttggggatacaaagacaaaaAT-AAAGTGGGTCCTCATAGGCTCACAGATTTAGAGCTGGAAAAGGGTTGGAAGAAAGAATTTCCTGCTG a score=20653 s mm8.chr4 40866803 799 + 155029701 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AGGAGGAAGAAATACAAGAACACATGggggctggagggatggta--ctggctgctcttgcagagaaaacccacacagtggatcacatctccagtgccagaggatcagataaccgttct-gacttcc s monDom4.chr6 13504853 117 + 244784211 AGGATGGAGCAAAATAAAAAAGAATCTAATCTAAGGAGAGGATAACCTCATGACACAAATACAGCAAACTGTCAAAGTG-------TCTCCAGTTTTAAAT--CTAGGCTGCTATTCTAGTCCTCC a score=7656 s mm8.chr4 40996325 215 + 155029701 catgcaggccgaacacccacacacataaaataaaTCTAACATATAAATAAATAAAGGGAAGGCACAGAGAGGACGTACCTCTGAGGATTGGGCTCATTTTTCTTGTCTCTTGAATGCCGGATCATTCGACACCTCCCTACTACAGCATTTGGACGTGATATAGACATGCCTTTATGAACTAATCTGCCA--------AGAGTAAAGGGACAGTCATTACCATA s monDom4.chr6 13504997 203 + 244784211 CTTGAATGTCTAAATGCCAT-----CAACTTAAACCCTCCAGAAAAAGGAACGAAGA---------------ACACACCTTTGTGGATTGGGCTCATTTTTTTGATCTCTTGAATGGCGGATCATTCGACATTTTCCAATGACAGCATTTGGGCGTGATATAGACATGCCTTTATAAATTAATCTGTAAGTGTTTTTAAGAAAAGAAAATAGTCATTCTCACA a score=8408 s mm8.chr4 40998345 214 + 155029701 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AAAAAGGTGAAAACCCATTTCAATGTAGCTAT----------AAGCCTGCAGGAACACATAGGGA--CTTACCACTGCCTCGTTCCCTGGAGCAGACAGACTTGACGTTGTACGATGGCTGCCGTGGATCCAAGAAGGAGACATGCGCTTGAGAGCCCACTGCATACACTGACCACTCACTACCATAGGCCAGACACACGTTTTCTCGACAATATGGCAATTTGGTGGAAAGGAGCTGAATAGAGAAGATACACACATTCACGATAACATAAAATGGGCACTGCT s monDom4.chr6 14647768 285 + 244784211 AAGAGTGTGTGAGCTCATATACATGGGCCTGTTGTGGGCAAAGAGCAAGCATGTCCACACTGGGGTTCTCACCACTGCCTCGTTCCCTGGAGCAGACTGATTTGACATTGTGTGATGGCTGTCGTGGGTCCAAGAAGGAGACATGAGCTTGGGAGCCCACTGCATACACAGACCACTCATGGCCATAGGCTAGACACACATTCTCACGGCAGTATGGCAGCTTGATGGACAGGAGCTGAAAACAACAACAACAAAAGAGTATGAGCATAGGACAAAGAAATGGCT a score=4788 s mm8.chr4 41486844 203 + 155029701 TCCCCAGACCTTGGGCAAAAGGTGTTTTGGGCAAATCCACTATGACTCTGGGAGAAAGACA----GTATTCTAGCCCTATGGTAAATTA-------TATAGAACTACCAA-------CTCATGTTCTCACCTTAGACAAGGTATTTTCAGCCTTCCAGAGATGAAAGTAGCCATCTAGTGATACCGCTCCCAACTCCTACAAGAGCAACA-GAAAAGAAGTT s monDom4.chr6 14649421 220 + 244784211 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s monDom4.chr6 119955432 1062 - 244784211 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TCATTTCTGTGCTGTCCCTTGAACTTGCCCAGGCCAGAGATGCACTCGTAAGAGTTTAAATCTTTCCCCATCATTTACTTGTTGGCTTCACTAATTAAGCAGTGTTAATTTCATTTACTGAAAATGGAAATTCATCCACCTCATTTCTCCCTGTTCATCCTCCACACACAAAATCCATCACTC-CGTAGCTGCGGGCTGCGTAAAATTTACAGGACTAATTATGTTGTCAAGTCTCTTTGTAAATACAGTCCATAAAGGCCACTCTGCTTGCCGGGT-GGCATGCAAGGGCATTCC-GTTGTTAGTTTAATTACTGGTTAGTTATTTAGGTTCTCAAATGTTTGCCTCATTTTCCCTAAATCAAATTAAATGTCCTACTTGATGTGTTCTGTCTCCAAGGCCTTGCTCGCTCTTACTTCCCACACTATTTAAATACAGCTCCCAACCTGA s monDom4.chr6 120232515 436 - 244784211 TCCATTGTCCACTATCTCCT---CCTCCTCTGGAAAATTAAGCATTTGGAAAGATTTAAATCTTTCCCAATGATTT----GTCAGCTTCACTAATTAAGTAACGTTAATTACATTTACTGAAAATGAAAATTAATCCACCTCATTGCATCCTGC----CTTCCCTAAGCAAAGTATATCATTCACTGAGTTGTAGGCTGTGTAAAATTTACAGTACTAATTATGTTGTCAGATCTATTAGTAAATACAGTCCATAAAGTGCAATGTGCTAACTTGATTGGAGGGCAGGTTCATTCTAGTTGTTAGTTTAATTACTGTTTAGTCATTTAAGTTCTCAAATGTTTGCTTCATTTTCCCTAAATCAAATTAAATACATACAAATATGTGTTCTGTCTCCAAGG---GACATGCTGTTGTTTCCAGTATTATTTAAAATCAGATTCCTAATTGA a score=16321 s mm8.chr4 41813564 566 + 155029701 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s monDom4.chr6 120358662 1604 - 244784211 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ACTCACAGC-------------ACAGTCAC---------------ATTGAAGGTATTGGGGATGTAGGTGGGGGTGGGCAGGTGCCAGCTGCAGTAGAAGCCCTTGGGGTAAGTGTTGGAGCGGCAGCTGAGCACAGGCTCCCGCGGCGGCACTGAGGG---GGGTGAGGACAGGACAGGGAGGTCAGGGT-----------CCTCTTGAAGCCTC---CGGTCCCCTG---TACTAGTCAGGGGACAGGTGGGCCC---CAGAGCCCCAGCACTCCCCCTCTC s monDom4.chr6 120425843 284 - 244784211 ACTCACAGCAGGAATAGAGGCAAGAGTCACTTACAGAACTGTCACATTGAAGGTGTTGGGTATGTATGTGGGTGTAGGCAAGTGCCAGCTGCAGTAGAATCCCTTGGGGTAGCTGTTGGAGCGACAGTTGAGGACAGGCTCTCGGGGTGGCACTGGGGGAAAGAGAGGGAAAAGGGGATGGGGGGCAGGCTTTGATTTAGCACCTTCAGGATCATCTCACTATCCCCTGCTCTTCTGGTCCCTGGGCTGAGGATGCCTAGCAGTTTGCTGGCACTCTCCTTTTC a score=8747 s mm8.chr4 41854189 439 + 155029701 GAATGGGCAGGTCACAGGGGGGTAGGGGCCAGGCAGGGTTTGGTCTGTCATCTGGCTACTCCTGCCTGGCCCAGGG--CCCTGAGCAGAGAA--GGGTTTGGGTTTCCT----GACAGGGACCAGGTTTCTCagagggaaaagaaggaaagaaaaacaaagaaaaggaagaaaaggaGTGACTTGCTGCAGCTGGAGCCCAGCTGAGGGG--------------CCGGGTGGGCGGAGATGGGG--GTGCTGTGTGAGACCAGG--AGTGAGGCTGTGGGACACTGTGGGATCGGGAGGCCCTGTTGTCAGT-GTGCTGTGAGCTCCAGAAAGCTGGTTTTTATGTCACTGTGACTGCAAC-----GGTGGCTTCACGTGGGAGACTCTTGGTGGCGTGGAGGCTATGTGGGACATGCTGCATGGCTGTGC---CTTGGGGGACCACT---GCTTCATTAGAGGTTGTCTATGAGGG s monDom4.chr6 120439636 451 - 244784211 GGATGGGCCTGCTCCAGGGGAGGAGGGGGATGGCCAG-------------------CAGAGCTGTCTGGCCCTGGGGCCCCAGGGCTGGGAACAGGGCTTGGGTTTCCTCTCTGACAGGGACCAGGTTTCTCagagggaaa-gaaggaaagaaaaacaaaaaaaaggaagaaaaagagCCACTCTGTGCAGCTGGAGTCCAGCTGAGGAGTAGAGGCCCCCCTCCCAGGCGGGGGGATAGGGGGGAGTGATGAGGGAGAGAAGGCAAGCGTGAGAGTTGGAGAGTGTCAGTGTGGAAGGT----TTGTGCGCAGCGGTGTATATGCGATGGTGTACGCCTGTGTGCTGGTGCGACAACCATAAATAGATGTGTTAATGAGTGTGTCTATCGGTACAGGAAGAGCT-TGTCTGGGAAGATGCATGAGTGTGTGTGCATGTGAGCGCACTCCCGTGTTCTTACACG-GGTCTGTGAGGG a score=5096 s mm8.chr4 41855177 550 + 155029701 CTCGACAGTCACACCTGGGGACACAGCATGCTCAGATACCCGAGCACCCTGACTTCCTCT-CGTGGGGTTCCTGAGATGCCTAAGTGACTGTGTCAGCTGGGGACAGTGTCTGAATCCCATTCAGGGCCGTGTGCGTGTTCATGTGTGCGTGTGCCTCTGCTGGCCTGAGGTTTGTTTGTTTTCCTCCTAATTGGCTTGTTTTTCCATGTCC-AGCCCACCAAACCGCATG-TTTTTCCTCTCATCTAGCCAGCCCGCCTGGGCT-GGAGCCCCCAGCACGCATGAGGCCTGCCCGCTGGCCTAGAGAGGAGAAGAGGCAGGCTGCCCACACCCTGGGCCAAGCCAGATCAGGCCAGGGTGGGGCGCGCTGACCCTTCCGCT----------------GCGGCCCTGCCCACGCCACACC-CACACCCCTCCCGCCTGGCATTCAAGGCTCATGGCCTGTCTTAAC---CTTTGCTTGTGGGATCCCTTGAGGTACCCTAAGTTCTGGACTC----------CCAAATACCCTCTTCT----------GCCTCCCACTCACTTCTCCTTGACATTTTTAGCCACAGTCTTTCCC s monDom4.chr6 120440106 549 - 244784211 CTGGAGAGGGACCCCATGGG---TAGGGGGTTTGACTACCTGGGTGCCCA-----CCTCTGAGTGAGGGTGAGCACACACTCgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg---------------tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtAGCTCC-CTGGA--GGGGTTTGTTTGTTTTGCTCCTAATTCAGTTGTTTTTCCATGCCCTTTCCCACCAAACCGCATGCTTTTTCCTTTCATCTCGCCAGCAGGCCAGGGATGGGAGCCCACAGCACGAACG------TCCTAATGGGGCAG-GGGTTGGGGGGGCCGGGTGTATGTGA---GGGAAAGCCCATACATAGCCA--CTCAGGCTCTCCAAACACCCAATTTCCAGGCTGGCCCAGAGCGATTCTGCCTGCTAAACACAGCCCACCTCGTCCCCCCAGCCCCCGAGGTCC--GGCTTCCCCAAACAAGCTTCTACTCTACGCTCCCTGG-----CTCAAAGAGCtggccctgggatcaaggccaaagtcctcagcctggcattccaggccttccacaaactggccccaaactatctctgcagccttATCTCCC a score=12010 s mm8.chr4 41859487 253 + 155029701 GGTCAGAGTCCATAGCAATACTTACAACCCACATGTAGAAGGACTTGGTGGCGCAGGTGCCAGGAGTCACGGTGGAAACAGGCGTATAGGCCACTGTGGCCCAGTTCTAAGCTTCGCAGTATCAGCTGAGAGCCGTTGAGCAGGTCAGGGGCCAGATCTGTCCCGTTTACCCTCCATGTCACAGCTGCGTCCCAGCTCGCTGTCCCACACGGCAGCGTCACATCTGCGCCCAGACGCTCATACTGCACGTGGG s monDom4.chr6 120445119 249 - 244784211 GGTCAGGGGTCATG----TACTCACTGCCCACGTGCAGCAGGGCCTGGTAATGCAGGTGCCAGGAGGAGCCCTGGTAGCAGGCATAGTGACCACTGTGGCTAAGGTCCAGGCCCTCAAGGACCAGCTGGGAGCCATTAAGGTGAGCAGCCTCCAGGTCTGTCCCATTGACCCTCCAGGTGACCGCTGTGTCCCAGGCTGCTGTCCCACAGGGAAGGGTCACGTCTGAGCCCAGGCGTTCGTACAGCACATGAG a score=3796 s mm8.chr4 41860311 389 + 155029701 TCCTCCTTAACTCCCAC---CTTAACCATC---CAGGCTGTGGGCAATAGCAGAAGGGAAAGCAGGCAGACCCTGAGGAAGGAAGCCCTGGGGA---ACTCCTG-GCAACTGTCAACT----TTGTGAAGCAGAAACTGCGTGGGGTGGAGTGGGGTGGGCCGGGGGCCGGGACTGAGGGAGTGATCTGCTCATTCCTCACTTGCCCCCAGGA--GAGGCCTGTCAGAACTAAAACCAA--------------ACCCAGCCCAGGCCAACCCAGGCGTGATGGA----CAGAACCCAGGAG-ACTGGACATAGAAGGATCGAGGGAGCACCTG-------TCCAGAAAGAGCACCAGGTGGAAGAGCCAGCTAGCGAATGGGACAGTCACAGAGGCAGATCCACAGGCAGAGGCAGAGGGGCCAGCATGCA s monDom4.chr6 120446267 417 - 244784211 TTCTACCCAACCCCCACAATCCTGAACACAGAGCAGGGTCTAGACAACAGCGGCATGGGCAGGAACTATGGGCAGAACAGTTGGAGCCTGGAGACAGATCACTGTGCAGCTGTCACCTGGTGTCGGGAATCGAACCCTGGCCAGGAAGGCTTGAGGAGGG--GAGAGAAGGCACTCAGG------CCTGTCAG---CTCACCTGCCCCAGGGGAGGGGGCCTGTCAGAGCCAAAACCAACACCCTCCTCCTCCCCCCAGCCCTGAGCAACCAAGGCGTGACTGAGCTGAAGAACAAGGGAGCACCTGTCagagagagagagagagagaaatagagTATGCATgagacagag-atggggggaaagggggggctagagaaatgtgtag--agagatacagagaaatggagagggaggtaggaggaaacagaca a score=4163 s mm8.chr4 41860840 190 + 155029701 GATCCCTCGTTAACACTC--GCTCATGGCTCCCCTCCC--GAGAGCCACCCCGCTGAGTTGGGGGATTTTCAGAGGCAATTCCTGTTAACGAGCCAATTAAGTT--GGGCCAGT----------GGCCTCTTAATTAGACTTGTTAAC-----ACCACCAGGACTGCTGGGGGAG----GGGGAGAGATTCCCCCAAGGGCTCCTCAGTCACCCC s monDom4.chr6 120449316 201 - 244784211 GGTTTCTTATTAAGGCTCCTGCTCATTATTTCCCTGTCAGGAGAACAGACCTGCTGGGGGGGGGGGT--------GCGGTTCCTGTTAACAAGCCAATTAAGGCCAGGCCTAGTCTATCCTCAAAGAGTCTTAATTACACTTGTTAACGAAGGGCCTCCAATCCT-TTGGAGGAGTGGAGGGCTGGGAGCCCCAC-----CCCCTCAGTCATCAC a score=2571 s mm8.chr4 41862019 57 + 155029701 GCCCTGACGCGGTGACAAATGCTCCAACGGGATCAGCTGTGAAAAGGTTGTTAGAAG s monDom4.chr6 120452246 57 - 244784211 GCTGTGACACTATGACAAAGCCTTTGAAGGAATCAGTTGTGAAAAGATTGATATCAg a score=10086 s mm8.chr4 41868585 335 + 155029701 AGAAGGGGTAGGATACGGCT-----------GAGCACCAGTGGGAGGGAGGGCAAGACAGAGGCAGCAATAGCAATTTCCCAGCTCCA--GCCTCTGGCTGAGGTTGTGGAAAAGGAGGCCGCCCCGATGTGAGTGAGTTGGGGGGGTGGGTATCCGCACCTGCTGTTGTGACCTCCAGA-GCCGGAGATGGGGGCCCGTGGGGGGGGGGACACAGAGATTCCGATGGATTTTGGCAGCAGCCTGGACTCTAAGTGCTCACACACCCCCACCCCCAGCCTCTTGTACCGTGGGGACCCTGAGTTCAGCATGTGCGTGCCCTGCTTGTTGCACGTGTGTACAGGCGTGTT s monDom4.chr6 120477036 313 - 244784211 agaagaggaTGGATGGGGTTCCTGGGTTAGGGAACAAGGGAGAAAGGGAGGGGAGGGGAAAAGCAG----------GTCCCAGGCCGAAGGTCTTTGGATGAAGCTGTGGAAAAAGAGGCCG------------------GTGGGGGGAGATATCAGCACCTGCTGCTATGACCTCCGGCTGCAGCAGGGAGGAGGAGGAGTTGGGGGGGACA---AGATTCCTCTGGATTTTGGCAGTAGCTGGGGCTCTGAGGGCTCA-ACAGTCCCCCCCCAAGTCTCCTTTCACTATGGGAGCATGAGATCAGTGCGTGCATGCCC----CAGTGCACGTGTGTGCGGGCGTGTT a score=549 s mm8.chr4 41871808 387 + 155029701 CAGAAGAAATCAG--ACTGAGGCGCCAGGGG--------CGTGGGGGAT---AAGGAACCCAGATGACAGTGCCCCAAAGAAGGTAGATACTGGAGCCAAAGGAAAGCCAGGCACTGGGGACTGCAGAGAGCTGGGAGGTGTGGACAAATGAAGGCAGGCTTCGGGGATCAAATGAAACTAGGCAAGAGGCCCACAGGATGTGAGAAGAGAGAGATATCAGGAACTCATCCCCCTGTCTAGA-----TGTCACCCCCACACCCTA---GGCCTCTCTCTCGGTAGCCCCCTCCCCCAGG------------------CCGATGGACACAGCCAGAGCCCCCTCCCCTCTCAGAGGCCTGGTCCGCCTGCAGCCAATGGG-----CCCCGGCCCCATCCCTGA-------GACCTCAGGAAGTCCCAGTCCCTCCCACC s monDom4.chr6 120481105 371 - 244784211 CAGTAAAAAACAGGCACTGGGGACCAAAAAGAAACTAGTCATCAGGGATCTAAAGGAAACTAGGCAATA------------------------GAGGCCAAGGAAAACTAGGAAGCAAGATC-----------------------CAATAGACACCAGGCATCAAGGACCA---------AGGAAAAACCCTGAC-----------AGAGACAGTTTTCAGAATATCACTCTCTAGGCCTGAAACTTTGCTTCCCCCAGCCCCCAACTAGCCTCTCCCTTGCCCTTCATTCCCCCAAAGGACCTACAACTCCTGGACCCCCCAAACAGAGATATACCCCCTTCTCTTCACAAAAATACATTTCCTTCAAAGGAGGAGAGATACCCCCCCTTCTCATACCAGAGTTAGGTGACCTCAGAGAGGGGCAGAGACACCCACC a score=8830 s mm8.chr4 41872203 557 + 155029701 AGGCAGGGGGGCTGGGGAGAAAGCGCAGAGAAGAGAGACAGCTTGGCAGGGGGAGCGCCGAGCAGCCGCGgggggcgggggccgaggaaggagcgggaagcgccgc--ggcgggctggcgggctggcgcgggcgggggtgggggGTcc-------------ccgccgcggc------------------------------------ggggcggcgg-------------------------------ggTGACAAGTTCTCGGCCCCGCGGCCGCGCGCACTGACCTGGGTCCCCGCGCAGGCGCCCGGCCGGTGCTCAGCGCTCCGTGGGTCCGACCGGCAGCCTGCGGGCATCGGTCCCCGGGGCTTCCCCACCCCCGAGGGGCCGGGCCGGAGAGCCACGGCCGCGCCGG-AGCCAgcgggcgagcgagagggcgagagg------gcgagcggggaggcgagcgggcCGGGAGGGGGAGGCAGCGCGCCGGGAGCCGAGCGAGCGAGCCGAGGCAGCGAGTGAGGGACGGCATGCAGTGAGGTCATCCTTTGAATCTAATTGTCTGAGTCAGGAGGAGATGTGGCACTTGATGCTGGGGGAGGGGCGGGGAGGGGACCCTCGGCACGGCCGGGGGTGGCGG s monDom4.chr6 120481815 581 - 244784211 aggcaaagaagctggtctgagagct--gagaagagag------tggagaggagtgggaggagaagtagcagggga----ggtagtgaatggaatggaagggGCCCCTTGGGGGGAGACCCGACAGACACACGTGGGTCTGACAGGTCCTAGATCAGTAGCTCCAAAGCAGCCCCCCCCCCATCATGAAAGCAGAAATTCAGGCCCCAGAGGCTGAGGCCTTTCCCCACCCCCAATCCTCACATCCCCAGACCACCATTCCTCATCCCCCTGCTTAAGC-CACTGACCTGGGTCCCTGAGCAGATTCCC-----------------CCGTCTGTCGGCCTGGCCTCCCCAGTGTATCTGCCCCC-------TCTGATACTTGGGGAAGGGGGGAGgagagggggagaggaacagggagacagagagagagagagacagggagaggcacagagagatagggaaggagag-agacagagaggaggaaa-----------gagaCGGAGGAGCGGGCTGGGG---------AGAGACGCTGTGCAGTGAGGTCATCATTTGAATCTAATTGTCTGAGTCAGGAGGAGATGTGGCACTTGATGCTgggggggagggggagaaaa-------aggatggtgggggagggggg a score=1879 s mm8.chr4 41877916 51 + 155029701 CTTCCCATCATGGCTCCCATGACCCTCTCTGTCCTCACCTGCAG-CTTTCTA s monDom4.chr6 120484946 52 - 244784211 CTTCCTCCCATGTCTCCCATGTCTCTCCATGTCCCTTCCATCTGTCTCTCTA a score=8144 s mm8.chr4 41880241 219 + 155029701 GGAGTTCACTGTCCCTCCCTCCCCCCACCCCTGACCCCACAGTGGGCTCTGGAGGAGGGGGGTCAGTCCACTTCAATCTTCTTGCTTTCTGGACCCCCTCCCCAAACCACGCACACATGGTCC--------CCCCCCCaa--ccaatctgcatttcaaagaaaattcactccatatgtttccgattcatttacacttcaactcGCTATGGGGGGGCAGAATGCAGAACG s monDom4.chr6 120496737 210 - 244784211 GAAATTCATTCAGTTTCCCCCTCCCC-CTCCAGGCCCTTCAG------CTGGAGGGGG---------CAATGTTAGCCCCCTCTCCTCCAGGATTCCCCCC---AACCAGGCACACATGGTCCATCCCCATCCCCCCCAAGCCCCATCTGCATTTCAAAGAAAATATGATCCATATGTTTCTGATTCATTTACACTTCAACTCTCAATGGGGGGGGTGGGGGGAGAATG a score=6132 s mm8.chr4 41882976 201 + 155029701 TGAGGGGGATGAATTCTCAAACAGAGAGACTAGACAGAAAGAAAGA-AAATCCTGAATTTTCAACAAGGCGTGAAATAGTCCTGCCCGCCTGAAGCTACTGGAGGGGGGAGGGGGGCCAGGGAGCCAGAAAGCTAGACGCTGGAGAAGCTCGCAGAGGAGAG-GAGTCGTGGAGAGCTGTCCGTCTGGTGACCTCCTCGCGGC s monDom4.chr6 120498603 168 - 244784211 TGGGagagaaagagaccgagacagagacg-gaaacagaAAGAGAAAGAAATCCTGAATCTTCAACAAGGCGTGAAACA-----GCCCGCCCGGAGCTACTGGGGGG----------------------------AGAGACTGAAGGAGCTTG-AGAGGAGCGAGACACAGAGAGAGCTGTCCGTCCTCTGACCTCCCCTCTGC a score=4351 s mm8.chr4 41883409 141 + 155029701 cacacacacacacacacacacacacacacacacG-----CCCCACAAGCGGATTCATACGGATACCCAAGGCACTGGCAGAAGCG--CAGCCATCCCTTTACACTCCCGGGCACTTTGAAGTCCAGAT----ATTTCCCCCTCGAGAAAGAA s monDom4.chr6 120498771 144 - 244784211 cacacacacacacacacacacacactcacgcacagaaatacacacaAGGAGATATAGACATA-------GACATGCACAAAACCATTCTGAGATCCCTTT-CACCCCCAGGGACTTTGATGTCCAGATTTAAATTTTCCCCGAGGGGGAGGA a score=8154 s mm8.chr4 41883658 1090 + 155029701 CCGCCCTGGCCACCTCCCTCCAGCCCTGATCGCCCAGC----TTcaccaccaccaccaccacc--accaccaccaccaccaccaccaccaccaccaccaccaccaccacGC-CCAACCCCTGGCGC----GTCCGG-----ACGTAGGGGGCTGCTGCTCGTGCGCCCCC----------------GCCCCCG----AGTTTGCGGGCAAAGTTTCTCGTGAACTTTCCTACCTCC-----------CCCGACCGCGGGG-----------------------------CCCACGCGTGTC------CCCTCA-----------CTCACTCTACCCGC---ACGCACGAGGGCC-----------GCCGGTCTGTCCGC------CTTGAGCGTTCGAGGGT------------CAAGCC--TCGCGCAGACCG-------------CCGCGGAACACTCACCGCGCCCTCGG----GCCACCCGGGCTCCG-------CGCCGCGCCCTTCGGCCGCT-GCAGGCGGGGAGCGAGGCAGGAGCGCG-------------------GAGCGAGCACTGCGGCCGGATCCCACTGCC--GAACCCCGCGCCGCGC---------------CGGCTGGAgccgccgcctccactgccgccgcc--gccgccCGCTCTGCACCGGCTCCTC-TGCTCTCCGCGGCTTTAACCCCCCCATCCTcctccctccctcgcgcgctccctccctccttccctcGCCCATGTGACC-GCGGgcgcccgctcggccgcgcgcgcccttgctcccctccccctctcgccttgtctccccgcgcctccgctgccgcgcaccacgaccccccct----------------------ccccgccacggcccccgc--gcgcctccgcTTTGGC-----ACGTTCCCGCGCCTGGCACGCGCGGCACGCTCTCGGGGGCACGCTCGCCCGCGCCGGCCTGTGAGCCCCCACTCCCACTCGC-CCCGCGCAGGCAGGAGCCCTACCCCCCGCTGGCACGCTCGCCCGCACTGGCACGCG---TGGCCCCCT----CGCATTCGCCCTTTCTCCGGCGCGCCCTCTGGACGGCTATGGACCCCGTGCTTCACGCGCGCTCGGGCCGCGGGTCTTGCAAACGCGCGCGCACACCCACACCCACT-CCGCCCGCTCTCCTAGGGCGGCCGGGAGCGCACCCACCCGCGAGTGATCGCTCATCACACTCTCAGCTTTGGCCAGGTCTCTCCTG----CACACACGGTCGTCCGTTCTGTCCCTCAGTGTCTCACACGGACACTC s monDom4.chr6 120499427 1271 - 244784211 CCCCCCTCCCCCACACCCCCCAAGGCCAATTGTCCGGCGCTGCTCGGCCCGGCCACCACACCCTGGCTAGCTCTCTAGCTCGCTCGTTCTTCCCCTCCCTTTCGCTCCCGCTCCAGCTCCGGGGGCCATGGTTTGGGGGACACAAGAGGGGTTTCTCCTTCTGAGCCCCCCTACCCAGTCAACTCGGCCCCCGTCGGAGTTTTCGGGCAAAGTTTCCCTTGAACTTTCCTCGCCCCTCCCGCACTCGCCTGGCTGAGGGGCTCAGAGCCCCCCCTCGGGGGGCGGGGACCCCACGCGTGCCCGACGGCCCCCAGAGCCCCGGGCCGCACCCAACCAGCTCTATAGAGAAGGGCTGCCAGCCGTCAGCCAGTCTGGCCGCCAGCCGCCCGGCCGCCTGCGAATCCCACCCACCCCCAAGCCAGGGGCCCGGACCGGGCGGGGGCCACACAGTCCGGCACTCACCGCGCTCGGAGCTCTGCGTCGCTGCCGCCGCTGCAGCCGCCGCCTCCCTTGGCTGCTCTCCGCCCCAGCGCCGGGCACTGGGGCTGCCCTCGCCGCCCGCTCCCGAGCGCGCTCCTC-CCTGGATCCCGTTCCCCGGAGCCCGGCTCCTCGCGcgccgccacaggggctgctgccgctgctgccagcactgccgccgccCTCCCTCCCGCTCTGCACCGGCTCCTCGGGTTTTAAGCTTCTTTAAACTccc-------------cccgcccggcccccctccctc---ccctcgcccatgtgaccagggagcgctc-----gccgcccgcccgcccgctccgccagggcccgcgcgccagctattagctcagccg--gccgcgcgccg-ggccccccCTGCAAGTGTTTCCAGAAATGCGGCTCCGGGACCGCCGTCGCCGCCGCCGCAGCCGTGGCTGCTGGGGCTCAGGCCCCGAGCACCCGC-GCACCCACGCGCGGGCACCCACGGTCACGCACAACCGCGCACTCCCAGACTGGCTCGTGATTTCTCTGTCCCGTTTCCTTGCTCTCTCTAACACACACACACGCACACATACACTCCCTGGCCCCTTGTAGTGCTCTCGCGCTGTCTCTCTcatac-------acacacatacacacacactctcacacacGCT----CCCTGGCTCTCTCCGACACACACTCACACATGCTCTCCCTGGCGCGCTCTCTCATACACT---------CATACAGGCTCCCTGGCTCTCGCACA-CACACTCT---CTCTGGCTTTCTCTCTTCTGTTCTCTCTCACTGTCAGCACTCGTGTTCCC---TGTCTCTAGTACACACTC 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atcagggttttagagaagccattagtccaagccctttactttacagaagtggaaatttatgcccaggg--agactgaatttcccaagatcatacaggcagtaacagtgaggaaaagaacccaagtcctcgagactccaaagcctgggctcttCTCTTGAGGTAAGGGAAAGCGGAGCCTTTG-AGGATAGCCATTCCCCGGGTTCCTGAATCCAGCTTCTCCACTCTCTGGCCCCATATCCCTTGGCCTTCTCTCTTCACTCTCACTGCCCCAGTTGAAGCTGTTTTTTACAACCAACTTCAATGCACTGAATTGAAACTGTCCCTGGCCCAGGGAGAAGGGAAATTTC------TTTCCCGTGTTTTTTCTTTTAATGAACAAAACATTTCAATTTGAACCTAATCCTTCCCTACCCCCACCCTTAACCCATCTACTCTCCACTCCC-------TACAGGCTACTGAGTTGTTGGGGGG-----CAGTTAAAGGATCACCCTCCCTTCTTTCCTCCACCCTTTCTACTTAGGGGAAATAAA---TATGGTTGGGGAATTTTTTTCTTTTTTCCATAAATGATTATTTGGGGTTGGGGGAGtggttttgttttttgggttttttttttgttttttggggtttttgttttttgcttttgGCTAAAAATACCCACTGGTGTGGCCGATTCCCAGAAAGGG---CCAGAGAAACCCTG--GCTCTGGGCACACACTCTCCTCTCCAGACAAGGATCCCATCTCCTTGTTGTTGTTTTCCTGATTT-TTCCCCCTGGATGTTGTTTTAATTATTAATCACATTTTCCATGTTCTCTGGCCAAGCCTTGACCC--TCCCCCATACCT a score=3535 s mm8.chr4 41894369 89 + 155029701 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GTCACGTGTTGGCGACTAGCCAATCATCCAGGGTGGGCGGGGGG-------------------AGACATGGAATGGGGCG---------CTCACCTTGTGTA---------CCTTAGGTCAATTCGTGTGGCCTCACGTCGCATAGCGGAGCCGATCCTGAGCAGCGCCAGCAGGCTTC----AGAGGCGGACGCCAT-GGCAGCGACCTTCCGGGCGAGCGGTAATTGCTGGGC---GGCCTGGACCCGCTAC-GGTGCGGAGCC-----GAGCCT-----TCCTTTTCCGTAGG-------------------AAGTTCTAGTCCCAGAGTCAAGG--TCGGCACTCCTACCCGAGGCC---AGGGTGGCGGGCGAGGGAA-----------GGAGGGGCTTGCAGGCCGTGTGGCACGGAAAGCGTTTA---ACCCTTTAACTCCCCTCCGCCAGCCTATAGCTTCTAGAAACACTGCGCCGACCGAGCGTCCCTGTACTTGGGCCTGCTAGGGCATTAGAGC-CACTCGGGGAAGAGAGAGACAGGGAGTTTTGCTGACTGAT--CCTTGTC---TCTCCCCAGAACACCAGCATATTCGCTACAACCCGCTCCAGG-ACGAGTGGGTGTTAG-TGTCGGCTCATCGCATGAAGCGGCCCTGGCAAGGACAAGTGGAGCCCCAGCTTCTGAAGACAGTGCCCCGCCACGACCCACTCAACCCTCTGTGTCCCGGGGCCACACGAGCTAATGGGGAGGTAAGC s monDom4.chr6 120673878 725 - 244784211 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s monDom4.chr6 120825944 2373 - 244784211 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s monDom4.chr6 123955903 3132 + 244784211 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a score=3064 s mm8.chr4 42734932 1285 + 155029701 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s monDom4.chr6 120825523 1384 - 244784211 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s monDom4.chr6 121522144 1413 - 244784211 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s monDom4.chr6 121528985 975 - 244784211 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s monDom4.chr6 121536723 1351 - 244784211 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TTTTTTCTGTATTTTCTACTGCTTTCAATCTGACCAGTTTTCTTATCACTA--------TTATATGACTTCCT--GTCTTTGATGGTGGACCTCTGA----TAGCTAATCCCTTAACTCCAGGGACTATTTTTTTCTTTGTAAATAGTTA------CTCTGATTGGTGTATCTCATTACTTTCTAATTTCTCTTCTCTTTCTGTTCTGCTGCTGCTGCCAACACTGCTTGACTTTTCTTTGCTAACCCAGTGCATGATGGGAAGGGTATTAGGTTTACTGCAAATGAGGACATACAGCCGGAGAAGGGTATGTTATAATCTTACTTGATCCCAA-GTACATCAGTCAGGcctctccttttccctctccctctccTCAGTGGACTGGTATGTGCTGCTTATGCCAGAGGTGGGGGTGGGGTGCTAGCAAATGAAAGTGGAATAAAACAACCCAGAATCCCTGTTCTGTGTCATGGATA--TGACCTATTCTGACA--GCCCCAAAGAGGCTCTTTGATAGATTTGCCTCGGA---ATTGGAGACA------------GAGAGTAAGGATGGTGCAGCTTCTCCTATTT a score=-1556 s mm8.chr4 43282401 135 + 155029701 TAAGAACATTAAGAGATTGTCGTTAagccagggcacagtagcacatg----cctattatctgagaaatcaagaggctgaa----------gcaggaggcactcaagttcaagtctaccttgc---actacgcagggagtAA---------------------GAATGAGCAGA s monDom4.chr3 480066019 172 + 526135210 TAAGAAC-tagtgaggatttctttctggtagatgtcagggcctcaggtgtccctcccaactctgaaatttggggatcgcatttaaaccctacaacaaaccctgtgatacagatctgattatcccaattgctgatggagaaactgagacctagagaggttaatgggtgctcagt a score=640 s mm8.chr4 43282536 78 + 155029701 AAGCAAAGAGGAGGAGGGAAGGAGGGAGAGAAAATTCTCTGTGTATTTTTAAAGTAAGTTTCTTCCCAGATACTGCCA s monDom4.chr6 121549385 69 - 244784211 AAATCAGGAAGAGCTGGGCAGGCAATAATGGAGCCTGTCTATGT---------GGAATTATCCTCCCAGAGGGGGAAA a score=7634 s mm8.chr4 43282636 243 + 155029701 CAGCCTCATTCTTTTTCTCCTTTTTGTTTTCTCTCCCATTTGTTACTTCCCCATGACTACTGTGGG-TGATTTCTTCTTG-CTTCAGGGTAGGGTGTGAGG---------------------------------------------TGGTGTATT----------CTAAACCCTCA-------------------TGTGGGCAATCATGT--CTGTCCCTCAGGGGCTGGTGTGGATGACCCCGTGGGAGAAGTCTCTATTCAGGTGGACTTATTTACACATCCTGGCACTGGGGAGCATAAGGTCACAGTGAAAGGTAAG s monDom4.chr6 121549478 318 - 244784211 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s monDom4.chr6 121550117 1047 - 244784211 GGACTAGGG----GGAGGTAATCATATGATTC-TAATTGGGCTCTCTCCATCTGGATAGTGGTGGCTGCCAATGACCTCAAGTGGCAGACAGCAGGCATGTTCAGGCCTTTTGTGGAGGTGACCATGGTTGGCCCACACCAGAGTGACCGAAAAAGAAAGTTCACAACCAAATCCAAGAGCAACAACTGGGCTCCCAAGTACAATGAGACATTTCACTTGT--------GAGTAGGGAATATTTTTTAAGGGGACAAAAAATATCCTAGGGATGGGAGGAAAAGT---GGGAATTGAGGATA----------TTAGAAGTTTGGTTTGTGTGG--------GAAAGTGAATTTGCCCAGCTAACTTGGCCCCACTATCTTGTGCTCATAGCCTCTTAGGGAATGAAGAAGGGCCAGATGCCTATGAACTTCAAGTATGTGTGAAAGACTACTGCTTTGCACGTGAGGATCGGGTGCTGGGGCTGGCAGTGATGCCACTGAGAGAGATGGCAGCCAAAGGTAGCTGTGCATGTTGGTGTCCCCTGGGTCGGAAGGTCCACATGGATGAAACAGGCCTAACTATTCTCCGGATCCTGTCTCAGAGAAGCAATGATGAAGTGGCCCGAGAGTTTGTGAAGCTCAAATCAGAATCTCGCTCTTCAGAGGAGGGGAGTTGAGTTTGATATCCCACGTGCCAACTTGGGCAACTGTGCC-TGCCTTCCTTC---ACATCATCAAATTCCCATTCTTCTCCCTGCCAGGCTCATGGAAGTTAGCTGTGTAGTAGCCTTTGAGCATCTGTAGCCAAGAGGTGATGTC---------AGATTTTTCAGGAGAAATTCTAGGTGAGAGAGCCATCTCACAGGGAGGAAATTAGAAAGGGAGGGTAAATCAGGGACACAGAGACTAATATGCCAGG---------GTGGCCA---------GCCAAGGATTTTCCATAA---------GAAACAAATCTGTGTTGATCTCAAGAATCTTCCCTGAAGGATTCTCTCTATTGATGTCTCAACTTACACTCACACTCTCCCCCCCCCCCCCATTTACCTACACATCCTCTTTTCTTATCTCTTCTCTCTTCATCACAGCCTCTT 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AAACATCACTTCAAC-CTAGGTAGGCCTCTAGTGCTCATCCCTGATGCTTCTGAAAGCTCTCTCCTTTTTTTTTCTCTAGGAGAACTAGTGTATCAGGCACAGTCTCCTGATGAAGAGGCCCTTGTCACTGCTGCCAGGAATTTTGGCTTTGTGTTTCACTCTCGAACATCTGAAACAATCACTGTAATGGAAATGGGGGTCACAAAAGTTTATGATCTCCTAGCTATCTTGGACTTCAACAATGTACGCAAGCGAATGTCTGTAATTGGTAGGTGCCCTGATCCTTCTAACATGTATATTATTATTCTCTCTCCCCCTCAAAACATACA a score=6637 s mm8.chr4 43377916 272 + 155029701 AGAATTATTTCTCCATCCAGTTCTTAGCCTCCAAA--GGTAGCACAGAAACAAATGTTATGGGAAACAGGCTCCTGAAGTTCTT---CAGAGAG------CCAAAACAAATTAAACAGCAGGCCTGCATGGTCACTTTGCTTAATTTGCTTATCTTTAGTTCGGACACCTGAAGATCGAGTCATGTTGTTCTGCAAGGGAGCAGACACCATCATCTATGAGCTGCTGCATCCATCTTGTGCATCCCTTAGTGAAGTGACCATGGACCACTTAGATGTAAGTGT s monDom4.chr6 121779143 277 - 244784211 ATAATTATTTTTCTCACAGCTTCATGAGCTTTATATAAGAGGGAAGGCACTAGATCTCATGGCCAGCAGCCTTCCCCTCTTCCTTTCCAGAAGGGTGAGTCCTTAACACACCATA------ACTTGGATTGTGATGACTCTTGTTTTGCTTGTTCTCAGTGAAGACCCCCGAAGGTAAGGTGATATTGTTCTGCAAAGGAGCTGACACCATCATCTGGGAATTGCTCCACTCATCTTGCAAACCCCTCCAAGATATAACCATGGAACATTTGGACGTGAGTAT a 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s monDom4.chr6 121967568 3303 - 244784211 CTGTCCCCTTGGAGGTTACCACCTCTCCCCACTGTTTAATGTGTCT--------------GAATGACTCATGA-TCCCAGGTGCCTGTCAGCCCCCACAATCCCCCAGTGGTCTTCTAAAACATCACAACCAGTTTACAATACTTTCAGCATACTCCTATCAAACTCCCCA---TTTCTATCCTACATATACCCTCTAGCCATACACAACTACAAAGTGTAGGGTTCAAGCTCAGAGCTCAGAACTCTGTTCTCATTTCTCATCAGCATTCGTTCTCTGGAGTTCTGGATCAATCATCTCTACAACCATGAAGGTAACACCCCC--CCAGAT--------ACTCCCTCCAGCCTCAAACTTTGGTTTAACCCTCCGGACT--CCTTTTTAGAGGCTGAGCAGAATGAAGTCCCTGTGTTTGTCACCATGCAGCCTAAGCAAG-------GAACTGCCCA-----GTATTCCCCAACCCCAGCCCAGGTGGGAAGGAAAACAGCTAAGCTGTGACTTTCCTGAACA--------CTGCTGCCCTGTCCCCCACATACGACCAGTTAGGGTCTTCTGGGGGAAAGTGCTCAAAAGTCACCTGTCCAGGGGTGCCTCCCCTTCATATGTACACCCCTACCCTGGAAACCCTCGTCTGTCTCTGGGGCATCCCCCACCTTCCCTCTTCCTTTCAGATATCATTCAGGCCCATTACCAGCCATGGGGTTTCCTGAGTGCAGCTCACACCGTGTGCCCAGGATTATTTGAAGAGCTGCTGCTGCTGCTACAGCCTCTGGCACTGCTGCCCTTCAACCTGGATCTTCTGTTCCAACATCGACTCCTCCAGAATGGCCGGCAGCAGCAACAGCAGAAGGAACTGCTGCGTGTGTCCCAGGGACTGCTTCTCTCAGCCCACTCCACTTTGCAGCTGGCACGCACCCGGGAACAAGAGGGCCATGGGGGCACAGATGGGGCAGCCCCTGGGGAGCGGGTGAAAGGGGTGGGGGCCCCAGCAGGAGGTGAGGAGGAGGAGAAGTTGGTGGCGACTGTAGCAGAGGTGCAAGCAGGCACAGGGCAGGGTGGACGGGCACGAAGTGGGCAGACTGGCTGGTGGTACCAGCTCATGCAGAGCTCCCAAGTCTACATCGATGCTTCTGGTGAGGGTTCCAGATTTCCCCGGA------------------------GTGGTGAGAAGAAGAAAGGGGTAGGAGGC---------TCCCAAGCCCCACCC------CCCCGAGAAGGTGTGGTAGAAGGGGCCGAAGCCTGTCCCACTGCTGAGGAAGCCCCCAGCCGAGATAGGGGCTGGCCTTTCTGGATGGGGAGCCCACCAGATTCTGTGCTAGCTGAGCTGAGGCGAAGCCGAGAGAGGGAAGGGCCCGTGGCCGCCCAGGGAGGCAGTGATGAGGGGACCCAGGAGTCTACTACTGGAGGTATCAAATGGGGGCACTTATTTGGCTCCCGGAAGACCCAGCGAGAGTCCCGGCCACTCAATAGGTGAGCACAGTCTTGGGATTCAGGGAAGCAGATAGAGCATGATGCCTGCAAAGGTCAGTGAAGGAAAGATATAAGTGCTCACATAGAGGACCCTCTCTGTTGTCCTCTCATTCCTCACAGGCTCCCCTCCGAATGGCTAAGCCTAGACAAGTCGGTGTTCCAGCTGGTGGCACAAACAGTGGGTGCCCGCCGAGAGTCCGAGTCCAGGGAAAGCCCTGAAGAAGCACCTGCTCTGGACCTGCCCCCTAACTTGCCCTGGTGAGC---AGGGAAAGAGGTGGCAGTAGACCTGGATACAGGATGTTTGGTGGTTGGCTGGAATGGATTTGACTTCTGTTTCTTTCTCTCCCCAGCCAGGTGCAGGCACTCTGCCACCACTTGGCTACAGGGCCTGGGCAACTGAGCTTCTGCAAGGGGGACATCCTGCGGGTGCTGGGACCAGCCGGGGGTGATTGGCTTAGGTGTGGCAGAGGCTCTGACACTGGCCTGGTGCCCCTGGCCTATGTGACACCAACCCCTACCCCAATCCCTACCCCCAAGGGCACCCATGATTGAAGCCCTTGTGCATGCTGGAGCCCTCTAGGCACCCTCACTTCCCCTAGGGACTCGGAGCCCAGGATGGGGCACAGATTCAGCTCCCCCCACCCCCAGGCTCCATT------CGCCTGATGGGAGCTGAAGGGCCATATCTGTGTACCCGTGCCTGCCCTCCCCATATGCTCTGTATTCATTAATCCCTCATAATGTGTCCTAAGACCTTTGATTCAGACCCCCCCCCCACCCCAAGGAAGGA--AAAAGACTAGGCATCCCTGGGATGCCAAGACTTCAACTCCTCCACCCACCTGAGTAAAAAGAGGGGTTGTGGAGGGGCCCAGGCATGCCATGGTGAGTGTTGTGAGGAAGAAGGAGTAACAGTATTGGGGCTGACCCCTCCCAGGCCCCCCCAGCTATAAATAGGCTGCTGCCAATACCCTGGCCAT----GTAGGGGAGGGTCCAGGCCAATGtttat-------------------ttatttatttattatgcatattaataaaaaaGGTGCTCAGCCTCTGACCC----------TGCTCCTCCCCTATCCTCAGACATCTCTCCCCACCTCCTTCAGCATGACTGGCTT----TGGGGAGAGTGAAAAT---------------------GGAGCTATTTCTACTGGGTTCTGAGTCCCAGAGCATCATGGATGAGAGTCTCATAGGTCTGGCCAAACTGGAACTTATAGCCTGTGAAGCCAAGATAGGCCATCACACAGTGCAGACACAAAAGTGACTAGGAGCCC--CTAGAAAATAACAAGGGCCATGTGGTGTGTACCTTGAAGGCATTTCCCTCAACTAGGGTGTTTACTAGGCTCTGTTCCTT----TCCATTCCTAAATTCCCCCAGGACTACTTGCCGATCAATAGGCAAACAACCTATAGACACctcagatctgccctaacttaggctttaggctaattctcttttgatgccttagtttactcatttgcaaaatgagATTATTTGTGACTCCCTCTGATGCTCTGTCCACCCCATCTGGTGTCCTATAGCAGCCCCAACCTGCTTTACTCAGGCTTTTAGGACCTTTACTGTCCTGTCCCCAAGTCTTTCCTCCCCCCCATCCCAGCCCAGGTCTCTCCTGGCACATAACCCCTATAGTAGGGCATTATGCTTAAGTCTTGTGAGTTAGTCTTAGAAAGAGTGGGAAGAGTATTATGGCCCCTTTGACCCCTGACCACTGGGCACATCTGCCCAAATTCCTGCAGGGCCTGATTGGTGAGGACAGGGTAACTATAGCCGAAGAGGAAACGGGCTCGGGGAACATATCCAGTAAATCCTGTGAGGAAAGATAGGTCCATATTCTAGAAGGGCTCCCTTCTCCCCCTCCCTCTAG 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s monDom4.chr6 121992731 839 - 244784211 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s monDom4.chr6 121996514 1371 - 244784211 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agcttggacattctgtgttctatggtcccttccagcttggacatt-----ctgtgttctatggtcccttccagcttggacattctgtgttctatggtcc--CTTCCATCTTGGACATTCTGTGTtctatg--gtcccttccaacttggacattctgtgttctatggtccCTTCCATCTTGGACATTCTGTGTTCTATGGTCCCT--TCCATCTTGGACATTCTGTGTtctatggtcccttccaacttggacat----------tctgtgttctatggt-cccttccaacttggacattct---gtgttctatggtcccttccagcttggacattctgtgttctatggtcccttccagcttggacattctgtgttctatGGTCCCTTCCATCTTGGA--------------CATTCTGTGTtctatggtccc-ttccaacttggacattc-----------------tgtgttctatggtccc----ttccaacttggacattctgtgttctatGGCCCCTTCCAGTTCTCACAAT-------CTTTGCTCTATGTTCTAAGGCTATTTTCAGCTTTGATATTCTCTTCTATTGTCTAAGGCCATTTTACCTCTGACATTCTTTGTTCTAAGTTCTATGcttgaagaccccttccagttctaacattccatgtccc-atgGCctaaggctcctttcagctct a score=1674 s mm8.chr4 43497453 161 + 155029701 aagaGGAAAGGGACTCAGAAGGAAAAAGCAAAACAAACCAAAAAAAAAAATA--AAAAAAACTGCCAGAAGGGAAAGCTAGAGCAGAATGGAACAAAGTGATTCAAAGTGATTTTATCTGGTGTCTCCTTCAGTATCTTACATCTTTCATTATCttttttttg s monDom4.chr5 229884344 152 + 308900514 AAGGGTAGATGGAGTCCAGAAGAGAAGAAGAGATAATTTGGGGATAAAAATAGTATAGATAGTATTAAATAGTATAAATAAAAAGAAGATAAAAATAGTA--TAGGAGTAATCTCATCGTGTTCCTACTTCAG---------GCTCTCATCATTGCTTTTCTG a score=12916 s mm8.chr4 43498778 477 + 155029701 cattgtgttgaaaaaCAATAACAAAATAAAAAAGGAAGAaaagaaagaaagaaaggaagaagaagaaggaaaaaggaaggaatgaagggaggaaagagagaaagaaaggaaagggaggaaggaagagagaaaggaaggaaggaaagagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagagagagagagagagagagagggagagggagggagaaggagggagaaggagggagaaggagggagaaggagagagaggagagagagagagaggagagagagagagagagagagagagaggcaggC--------------AATGAGCGTGGTTC--------AGTGGTA----TATCACTGATCAATTGCTTAGCATGAATGAGGTCCC--------------------------TGGGTTTGGTTA----------------------------------------------GCACTGAGAGGATAGGGAGGGATAAAGAGAACACATAGAACACAGGCTTCAGAGATTGAAAGAAAAATAAAATTCAGAACACAC s monDom4.chr5 229884862 568 + 308900514 cattttttagaaaagtagcatccaAT--GGAaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaagga-aggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaagg--aaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaagga--aggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaagaaaagaaaagaaagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaagaatagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaaagaaaaagaaagTGATCCCTGTCATTCTGATGATCAAACTTGGCCCTTAGGAAGAGTTGTAAAAATGTACTTGCCTTTCTTCTTTGCAGAGGTAGGGGACCAATAGAAAGAAATCTTGTTGTATTGGTTGGTTTTGTTAAATTGCTCTTTTTAAGTCTTTTTTTACAAGGAAAATAATTTTTTGAGTGTGTATAGGAGGGGTAGGGATAAAGGAAGCAATCAGTACAAAGATCTTTAAAAATCAAATAAAAATAAACTTTGAAACATGC a score=11351 s mm8.chr4 43513865 1055 + 155029701 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s monDom4.chr6 122050439 1106 - 244784211 AAAGCAACTAAAGAAAAGT--AGACGCGCTGAGAATGAGCCCCGTGGAGTTGGTGCG---CATGACGCACTGCCTGCGTAACTATCCAGTTCTTGACTAAGGGCGGCCTCATCGCGCT-CCCTCCGCTCAGTGCTTCAACCGAGGTTGAAGAACTTCTTGGCAGGGAGATATGGAGCTGCGACATAGGCCAGACCGCACGTGCGTGCGTGGCACTTTCTGCCATTGGTCCGGGGACTTTCCCCTAGGCGCA--GATGGGGAACATGTCCCCCGTACGTAGCCTAGGTAACAGGCCTTCAGCAAGCGCCTCCGATCTTTTCATTGGCACACACTTTTATAAAGACCCAAAGAACGTCAGCCCTTTTATATTGTGGTTAGAAAATTTTAGAGAATTTTTTTCAGACTTCCAGAATTAAAGTCCTTTACTTGAGAAACAAAATTAGAAAAGGATAGTATTGCAAAAAATTCATCGAAATAAATAGTATCTCTGGAGAATTTGAGAGAAGTAGCCAGCATACACCCGGAGACCCGTTAGATGAATATA--TTATGTAAATTAAGGGAGTTAGTCACTCGCTCCCGACTGGATGGGCGGGACCAGCTGGGCGCACTGCGT-------GTGTCGTCACGCGGTGCGTCTGCGTCTGCCCCACGTTACAGGGCT--GTGCTGGCCTCCAATTCAGG---CTCGCACCGCCCTCTCGCCATGCCAGCCCCAGGGCTCTGCGGCCAGGTACTGGTCCCG-GCCGCG----CTAGCGCTGCTACTCGTGGGCGTAGCGCTCCGGATCTTCGAAGGTGGCGCCCGACCGC--------GGCCCCCCGCAGGTAATGGGCGGCAGAAG--GAGGGGAGAAGAGTGGCGCGGCC--GGAGATAGGGACCTCCTCGCGCCACTCTGC-GGTCGTGACCCCAACTCTGCTTTCGCTCTGCAGGTGAGCCATCCCGAGACGGACAGCGGAGGACGCCAGAGGAGCCTCGGGCGGCGGGTCCACCGTGGGGGCCGCTGCCCTTGGGAGCCTTGTATGCCGTGGGCGCCCTGGCCTTCGTACTGCGCCGGTGTCTGCAGGTGTGGGGGTCCGGGTCCCTGGGGTGGGGAA----TGG---TTGACGTCCGGAGGGGCGTCCCACTACAGTA 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monDom4.chr6 122051591 900 - 244784211 ctctgaggtatcccctcgcccctgccgataggttacacctcaccagcggcagtaaggtatgctagagggcccgtgccaaagtagggccattacttcatttccgtaggagttgtgaactgatccagccattctgtggcgcaatttggaaccatccacaaagggcgataaaagaatgtgctacctttttatccagccggg----gcactggccgg--------gGCAGGGGGGCAGATAGAAGTGGGCTGCCCCCATCGATGTCACGGGGCAA--ATGGCTCTTACTT---TCCCAGAA---------GAGCAGCTGGCCCAAAAGCTAGCCAAGACGGAGCAACTTCTGGGAGGCCTGCTGGACCAGCTGGACCCTCTGTTTGAGCGGTGAGAGGTGATGGGCCCAGGCCGGGATGAGGGTTATGCGGTTCTGGGGCATGGAAGAAGGCAAGTAGAAGGAAGCCTGACTGGGTATCTCTGCAGTGTGGATGCTCTGGCTGGAGCCCAGCAGGACCTGTTGACCTTAAGGCTTCACACCATCAGCCAGCTGTTAAAGGACAAGGGGCTGGACA--------------CCACCACCACTTCCCAAGGTAGGGG---TCCTTGGATGGAATATCAGATATTTGTGTCTGATATTGTCTGATTTGAGGACTCATGCTGCCCCCCTTCCCCCCCACACACAGAGTACAACCCCCCTATCCATGAGGACCCGAGTGCTGAGGAAGATGATGGCAGTGACCTTCAGACCTGGGGTTGGGGGGAGGAACCTGAGGAGAGAGGAACTGAGGCCTGGGCTCCACATGTCTCCTGGGACCAATTTGGGGAAAATGGAAAATTGTGGGGACTCAGGAGGAGGAAATGGATCACAGGAATCCAAGTCACAGACTAAGGCAGATAGAATGAGATTTAGCCTCTCAGGGGTTAAGGGAA a score=2001 s 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CTACTTACACTGAGCAAACCACCACAAGGTCCTCCCGAATGGCCAAAGACCCTGCTAAGGTGACACTGGGACATAGGGTACAGGGCTCTGCAGACAAAGGTGCCACTCTTCAGCAGGTGCAGTGGGGGCCGAGGCTTGGCCATGAGGAGCACGTCGGAGAAAAGGAAGAACATCCGGGGCCGAGGCTCCCCAGTGGGAGGCACCACTAAAAGCCAGCCCTGCCGTAGGAACCAGCGGCCT-TGAAAATGAGAGCACTGTTATT-GTACAGCTCAAGAATCCGTAGGAACACAAGAGAGACAGGACGTTGGGGAAGGGGTAATGTTACTGTGTGGCGAtgtggaggtcacagaaccaccctggagtcagttttctcctttcacctttatatgcattccagaattgcacaggtcatacagcaagcacattacctactgggtcatcttgccagcccAGCATGCTGGCATAAGCAAGGGGCAACTGAAGGGGCAGAGTCCACGGTCT--ACCTGAAGTCAGCCCTTTTGCCTTGCGCCCACTGAGTAGAGCCTGGACACGCAGCAGATGCTGATCATTCTTCTGACTCTGGCCGATGGCGTGGACCTTCTGGGCCGTCTCACTTACCAGGCGAGCAGCCCCTGGAACAACACCCAGTGCCTTACTTCCAACAGAACATGGGCTTTGAGTGGCTCTTGGTAGTAAAAGACAAGCTGGGGTGGGGGTGGGGGTCTGGGTCCCGTTCTAGCTTCTTGAAGAATGGGCAGGGCAGTTAGGGCCACTGTACATTCCATGGGAGACAGGGACATACCAGACACTGTTGGAG-------GTGAGAGCCAGAGAGGCATTCAGGACAGGCAGCCTCTGCCTGAGCTGAGGAACTAGAACCTACGTGTGAGCTGCTGGTAGTCAGGGCTGTTGGGAACTGTGTTCTCAGCCAAAGCCACGACAAGATTCTCGTACCTAGAAGTGGACAGTGGGGAGGGAAGTAGAGCCAGGCTCAATGCC s monDom4.chr6 122054164 814 - 244784211 CCACTTACACTGAGCAGTCCACCCCCTGCTCCCCCTGAGTGGCCAAAGATCCTCTGGAGTTGACACTGGGCCATGGGGTAAAGGGCCCGACAAGCAAAGGTCCCTCCATATAGGACATGTAGAACAGACCGGGGCTTAGCCATCAAAAGTGCATCAGAGAAGAGGAAGAACATTCGAGGCTTTGGCTCCCCCTTAGGTGGGACCACTAGTAGCCAGCCCTGTCGAAGGAACCAGCGCCCTGTGGTAGAGAGAAGAAGGTGATTAGTATATTTCACAAAG----------ACCAGGGGG---TGACACTGGGAATG------TGCTACT-----------------------------------------------------TCTCTAAAAATATTCTTATATTTTG-AGATCTTGGGGGAGAAGGAT--CCTAAAGGCCTTTGTGG---------------------AGCAAGGGG--ACCAGAGGGGTAGGGGTTAGGACTCTGACCTTTGGTCAGGCCTTTAGCCCGACGACCACTCAGCAAAGTCTGAATACGGTGGAGTTGTCTGCCATTCTCCTGTTCCCGACTAATGGCACTAACGTGCTGGATGGCCTCACTCAGCTTCTGAGCAGCCTCTAAAATGATAACCCCCGCCAAAATGCCA-------------TTTG-------------ATTAATAAAACAACTAGAAAAGAGGTG-------------------------TTAAGGAATGGAGAAGAGA-----------------------AGGAAAAAGGAGACTAAAAGATCCAATTGTGGAGCTAGCATTGGAGTCTGGGATATATTCATGATG------------TTGGCTTGGGGCA----AACATACTTGTGAGCTGTGGATAGTCAGGGCTGTCAGGACCCGTATTTTCAGCCAAAGCTACAACCAGGTTTTCATATCTGGA-----ACAGATGGAAAGAAGTTTTAGGGATGTTAGTTGCC 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s monDom4.chr6 122072796 867 - 244784211 TGGTACCAGGAAGGAGAATGTCCCGTGCATGCCAGTGCCTTGCACCCAGAGCCCAGCCTAGAACGCTGATAAGCTG-----TGCCTGAGCACACACCTGCTTTGC----CAACCC---CCTTTAC---------------------ATAT-------GGGGCAGTGGGCCAGGC-----CAGGAAGACTTTGGTTCCATCACTATAAAAGGGCTCTCTCTGTGAGTCACCCTGCTTCTCT--------GCCCCTCCCC-ACACAGCTTTGGCTCTGCTAGCACGTACAGACCGTAGGCACCACTGCTGGGGTATTCACCTCCCAGTCAGGAAGCAGCATGGCTCCCCCTTGCCCTGGCC---GGCTTCCCCTCCTGTCCCCAGCCAGGGCCCCCATCTGTCTGCTCTTGCTCCTCCTGCTTCTGGCCCCCTCTCACCCCTACAGCGTGGTGGGAAGAGAGAGAGATTCATCTGAGGAGGAGGGAGATCCCCCTGGGGCAGAGGATGGACCCCAAGAGGAGAAGCCACCTGGAGAGGAGCAGCTTTCCAGGGAGAGAGAAACACCTGGCCAGGGTGATCCTTCCAGGGAAGAGGATCCACCCAGGGAGGAGGTCCCACACAGAGAAGAGGATCCACCCAGAGAGGAGGATCCACCCATTGTCCAGGCTTCTC------------------------------------------------------CGGTCTCTGAAGATCCTGA------------TTCCCACAGAAATGTCCCAGAAAAGAAAGGTTAGTTTTCCTTTGCATC--------------------TTTCTGCCCCAAGATCACCCCCTTGCTTCCCCTCCCTCAATTG-----------------------------------------------------gagggagggagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaAGTAAAAGGAGTAAGGACTGCTATGTGTTGAGGCAGGGGAACAGAACAAAGGAAAGAGGTTGGGAGA a score=2509 s mm8.chr4 43529368 84 + 155029701 ACTGGGCTG--TAAGAGTGGGCTTA------TTAATTCTTCTCATTTATGCAGGGGGTGGCCACAGTCATTGGAGCTATGGAGGTAAGACAC s monDom4.chr6 122074931 91 - 244784211 ACTGTGTTGGCCAAGGGGGGGGCCAATGTCCTCAATGCCTCT-ATTTTTGTAGATGATGACCATCAACACTGGCGCTATGGAGGTAAGATGC a score=15965 s mm8.chr4 43529532 782 + 155029701 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GACCTTGGTCCCCCCCAACAGATCTAATCGCTTCCTTTACCGGCCCCTCTCTGGCCCCGCCCTCAGGCCCCCCCCCTTTACTGACCCTCC-------CTGCCTTTGTCCCTGACCTCTCCCTGATCTCCACCTACCTACCGCGGCTCCTCTTGGCCTCGTTCC--------CAGGCGGCCCCCTCTGGCCCCGGGTCTCCCGAGCCTGCGGGGGACACCTTCAGTCTCCAGTGGACATCCGGCCGGACTCCACCTATTTCAGGCCGGACCTGGTGGCCCCCCAGCTCCACGGCTTCTTCCTTCCCCCTGACCAGCCTCTGAAGCTGAAGAACAACGGCCACACAGGTGAGACAGAAGAGGGGGGCGGAACCGAAGGGGAGGAGCCACGGCTGAGGGTGGGGTTCTGGAGGAGAGAGGAGTCATCGATGGCCTTGGGGGGCCGGGCGTGGCCCCGGAAGGCATCGCGCTGGAGGTGGCGGGGTGAGACCCCGGGGCTCCTCTTTCCACTGCTTCTCCCCATCTCTTCCCCAGTGCAGCTAACGCTGCCCCCTGGACTGTGGATGACGATGGGCCTGGGGACAGAGTATCGGGCCCTGCAGTTACATCTGCATTGGGGGGCCCCCGGGGTGCCCGGCTCGGAGCATACAGTCAATGGTCACCACTTTCCAGCTGAGGTGAG-----------CTTAAGATCAATGGCGAGGGCTGGGGGTTAGCGACCTGACCAGCGCACTAGGGAGGTTTGCTTTGGGGGTTTGGGTTCATACATCAGTTCTCCTTCTAGATTCATGTAGTTCACCTCAACACCCGATTTGACACAGACCATGAAGCCTTGGGGCAACCCGGAGGCCTGGCCGTTCTGGCTGCCTTCCTTCAGGTAC a score=2600 s mm8.chr4 43531182 388 + 155029701 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s monDom4.chr6 122082762 1535 - 244784211 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TGGGTTGGGATTCCTTT--ACCT--CAGATCATCAATGGTTTTCTCCAGCTTCGCCACAGACCTCTCAGCAAACTCTGCCCGGGTCTCAGCCTTGGTGGGGAAGAGCATTGGGAGAGAAGTGTCAGACAGTCAGAGGGAGCCCC-----TCTCTTTTCCTTCTCCCCACTCTCGGGGTATGCCCCAGGGGTTCATTCCAGAGGACTGGGGGCTAAGGATGGTGTGATGGTCTTGAGGAAAGGGGAGGGGAAGGAGTTCTCACCTCCTTCAGCTTATCTCCCAGCAGTTTGATCTCCTCTTCATATTTGTCTTCTTTGGTGGAATACTTTGGGGTAACACAAAAATGCTCAGG a score=37926 s mm8.chr4 43539612 1260 + 155029701 CCGAATCCTTCAGCTCCACA--CTGAACCCCTCAGGCTCCTGTCGACCTCCA---TTGAGCCCCTAGCCCTCCTTACCTAAGCCCCCCCCT---CCGCTCTGCCCCGCCCCTTCCTCACGGTCCCTCCC-CCCCCTATACCTTGTCCGCTTGGGCTTCCAGGGATTTCAAGTTGTTGGTAACAATTTTCAGCTCCTCCTCTAGGTCCCCACATTTACTGCAGGGGCGT-----------GTGGCAGGATGGAGCGTGAGGGCA--CAGTGAGGTGAGGCAGTGGGGCG-GGCGGGGGGGGGGGATGGGGTG---------------------GCACAGTGGGGGAGGGGC----------------------------------GGAGGAGAAAAGAGAAGAGCAAAGTGATGAGAGAAGAGTGACAGCAGGCTGAGTTTGGA----AGCCCTGCCCCCGCC------CCGCTCCTG----CTGCAGGAGAGAGAC--AGTAGCCTGAGACGCTGCACTGGG-GAGGGACGTGAGGTGAGTGAGAAAAGGTGCCATTGCCTAGAAAGGCCCAGAGAGGCTACTACCTCCTCCTCTGAGGCTATCAGCGACTTGAGGGCTTGGTCCATGGTTCGAAGCTCCTCCTCCAGCTGTCTGGCTCGGCTGGGGGC-------------GGCGGGCATA-GGTCAGGGGACAGAGC----CTTGTTCCTGTGGCCT--CTGGCCCGGGAAACTACCT---------------------------------------------GACCCCTGTGCACAGTGTCCCCC-------------------AGCTGAGCCCTCAGGCC----------------------------------GAGTTCTACCGTTTCCATTGACACCCAGGGTA---TCCTTACCTCTCAGCCACCTCGGCTCTCTCTTCCGAGCGCTCCAGCTCCCCTTCCAGGATCACCAGCTTCCTGGCCACCTGAGGGGAAGTG---------------------------------------------------------GGAGAGAGAAGCAGGTCAG--TGGTGACCGCCTGGGACTTTGGGGA-----------------------------------CTGCTGGTGAAAGTGAGTGGGACAAGACCGGCACCTCCTCATATTTGCGGTCTGAGTCCTCAGCGATGTGCTTGGCTTCCTTCAGCTGCATCTCCTGCAGCTCCATCTTTTCCTCATCCTTCATGGCCCGGTTTTCAATGACCTTCATTCCTCTGAGAAGCAGGGACAGAAGTGCGTGTGGGGCCAGTGCCAGCAGAG----ATGGGGTCCCTCCCTCTGCAGTCCCTACCCTGCCTTACTTCTGGGCCCCCTTCCTCACCTCTCGCTCTCATCCGCGGCTTTCTCAGCCTCCTCCAGCTTTTGCAAGGCTGTAGCCAGGCGCTCCTGTGCCCGATCCAACTCCTCCTCTACGAGCTGAATGCGGCGGTTCAGAGAGGCCACATCTGCTTCAGCCTGTGGGTCAGAGGTCAGAGGTCAAAGG s monDom4.chr6 122086583 1535 - 244784211 CCCAGTCCTTAATCTCTCCTGTCTTCACCACCCATCCTCATTCC--CTTCCAGTCTTGACCATCTCATCCTCACTTTCCCCTCTCCTCATTAACCCATTCTGGCTGCCCCCATCCTTGATGCGTCTCCCACCCCCTCTACCTTGTCCGCTTGGGCCTCCAAAGATTTCAGGTTGTTGGTAACAATTTTCAGTTCCTCCTCTAGGTCCCCACATTTACTGTACAGGAGTAGGGATGTGAGGGGGCAGAAAAGGCAGTGGGGGAGATCAATGGGATAAGACAAAGGAGAGTGATGGGGGAGGAGGGTGGAGAGAAGAAAAACAAGGAAAGGAGAGAGGATTGTGGGAAGGGCAATTCAGGACAAAGGTAGTGGAGGGGAGATTGTGGAAAGAAAAAAGAAAAGAACAAGGCAATGAGAGCAA---GAGAGCAGACAGAGCTAACATCTCAACCTTAACTCAACCATCCAACCCCTCCTGATCCCCCCAAGCAGGTGGCCCAGCAGCCTGAGGATCAAGAGTGAGCAATGAAGGAGTGATAAGGATGCAGAGAGCCCA--GCCTA-------TCTCACAGGCTGCTACCTCCTCCTCCGAGGCTATCAGGGACTTGAGGGCCTGGTCCATGGTTCGGAGCTCTTCTTCCAGCTGCCGGGCCCGGCTGGGGAGTGGCAGGGAAGCGGGAGGGCGTATGGGAAGGGGACAGGATAGAACCTATCATTGAGGGCTTCCAAGCCTGGGAGCTTACCTCCTATTTGGTGATATGGAATCCCAGGCACCCCCACCCCAATCCTGGACCCCTATTC-CATTGCTCCTGGAGCCCCTTTTATCTTCAGAGGTGAGCCCCAACACCATCTCCCTCACCCTCCATGAACATCCTAATTGTGGAGTTCCATCTTTATCTATCTCTCTCATGGCCCCCTCCTCACCTCTCAGCTACCTCTGCTCTCTCTTCTGAGCGCTCCAGCTCTCCCTCCAGGATCACCAGCTTCCGGGCCACCTGGGGGAAAGGGTAGGGGGCCAAGTTTATACTTGGGGGTGTCTAGCAAATGGGTTAGAAGAACTGAGCTGGGGGGAAGTGCAGGAAGGACTGGTGGAGGCAAGGAGAGTTGGGGAAGAATTGGGCTAACACTGAGGAAGCTTGGGGTTCCCTTGGGGTAGTGGGGAGCACCATGAGGCCTTTACCTCCTCATATTTTCTGTCGGAATCCTCTGCAATATGTTTGGCTTCCTTTAGTTGCATCTCCTGTAGTTCCATTTTTTCCTCATCCTTCATGGCCCGGTTCTCAATGACCTTCATTCCTCTGAGTAGAAGAGATGAGAACAAG-GAGGGATCAGTGTTGGGAGAGGGTCAAGGGGCCCCATTCCCTAAAG--------------GGCTAATGG-----CTCACTGACCTCTCACTCTCATCTGCTGCTTTCTCTGCTTCCTCCAATTTCTGGAGAGCTGTGGCCAGACGTTCCTGGGCCCTGTCCAACTCTTCCTCTACCAGCTGGATACGCCGGTTCAGGGAGGCCACATCTGCTTCAGCCTAGAG----GAGGTAAGAGGTTCCAGG 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monDom4.chr6 122091292 486 - 244784211 cttcacctaaagtcaccctgaaggcttgtgtcaggctctcgattctcaagccagtatcctgtccattaTATGTTGGTGAAAAGGGGGAAAGGCAGTCTATGTTAGGCAGGGCTACTGGAGGAATGGGGCTGGGGCAGGACCAGCCAAGTTGGCTACCCTGGCACCCATGGGTCCTCTGCCCCTA-GCCCTGGGCCCTGGCATGGCCACGGAGCTGACAACTTAATGAGGGTAAATGAGGAGGGGAACATGAACCCACTGCAGGACAGGGACAGAACCCCAGATCAATGTCACTGCCCCTAGCAGTGGGCAGCCAGAGCCAGGGGTCAAGGCCAGGGA-----------------------ATTTCTAGTG-GCCCCTCCGGGGCTGTCACTCACTCATGTAACCTGACCCAGAACTTGATCCTTGGATCCCTGGGTCCACCCTCCCCCTTCCTTCCAGTCCCTATCTCT-----------GGGGTTGTT--------------------------CCTACTTCCTTAAAGCCCTCTCCCTACCCAGTC a score=10101 s mm8.chr4 43543618 288 + 155029701 GGAAGTAGTAGGTGGTTTTGATTCACCTAGTGTCTTGGGCTACTTGTGTAAACCTGCCCTCGGTGGTGTTACAGAGAGGA----AACCTGTCTGTTTTGTGTGCTGGAGAGACCTGGA--TCCCTTTCTCCCT----------TCTTGACCACGCCTGGGGCCCACACTCACGTCGGTGGCCTTCTTCTCAGCCTGCTCCAGTTTCTCCTGGGCATCCTTCACGGACTCGGAATACTTTTCCACCTCGTCCTCTGTCCCCTTCAGCTTCTTCTGGAGGGCCTGCTGCTCTTCCTCCAGCTGTGG s monDom4.chr6 122091822 304 - 244784211 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AAGATGGAGATTTGATCAGCCAG-------CTCTGGGTCAGGCCCCAGAGGCAAGGAAGGAAGATAGGTCTGGGAAGTCtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgcgcgcgcgcgcgcgcgcAGGGGTGGGGGTGCTTCTGGGAGATACTTGGAGATTGTTGGGGGAGAAGAAGGGTAAACGGAAGGACAATCCAGTCAGTAGTGTTAGAAGGCCCTGGGAGGAGAAAGTGACAAGCCCCAGGGAGCTAGGACCCATTGCAGCTTTGTAATGACTGGAGTGGTAACTGGGCACTCTCCAGGCCATGGTGGGTGGGGTGAAGCCTCGCGTTAAGGCTCAACTCTGGAGGGTCCTGTGAGGCCCAGCCCTCACACTGATGAGAAGGCATCGGAGAGCCGACTCCAGGTTGGGGGAGGGCAA--AGGAGGTTACACTGGGCCCCACCTGCTTGCATCGGTCTTCAGCTTGCTTTTTGTCGGCTTCGGCCTGCTCCGCGCGGTCGATGGCATTCTCCTTGTCCAGTTTCAGCATCTGCATCTTCTTCTTGATGGCGTCCATGGCTGCGGTGGGGAGTGGGCTGGCGGGAGAGCGGTGAAGAGTAGGTAGACTGGGCTAGGCGCGAGCTCTGGATGCACAGGG-----GACAGGTCAGGAGGACCAAGAGGGACTGTGATGTCCCAG--CAGCGCGGGCGCCTAAAAGGCGGGGAGGAGCCGGGCGGAGCCGGGGGACCAGGACCCTCCCCCACCAA-GGCCCAAACCTTGTAGGGGCAGAAGCACTGCCCGG-----------------------------------------------------------------------TCTCGGGGC---------GCGGCCGCCCTTTGCGCCCACCCC----------------TCGGGTCCGCCCCCTCGGGTCCCAGCCCCGCCTCCTCTCTT-------CCCCAG--------CCAGCCGTCGGAA---GCAAAACTAGCTCAC-------------------------TGCGGCTGTAAAAA------------------CCTTGGTCAGCAGA-GGCCACAAGACCCTTGGGCCGGGGG----------------CTCAGCGCTTCC--TCTGAGTGACAGGCGGGCCCAGCAGCAGCTGTGGCTGGGGCCCCCGGGGCTATTTCAGGGCGTGAGCTCACGGCAGCTGCCTGGGCACAGAGACCGCGTGCCCTC---------CCCTCGGCTAGCAGCAGCCGCTACCCTTAATTTAGAAGTTTCCTGTAAATCC-CCCCAGATTAAATGTCTCTTGGGAGGCGG---------------ATCTCCTGCACGCCTCGA--------GTGCCTCAGTTTACCCGGGG s monDom4.chr6 122092624 1315 - 244784211 AAAGTGAAGATTTGGGGAGTCAGTACATTGCACATAGCTAGGTCTTAGGGACAGTGAGGAGGCTCAGAACTGGAAAAATGAAGAGGCTGTGTGAGGGGG-----------------------ATGGGTGGGGGGATT---ATAAGGTATCTGG-GACCCTCAGAACGGATCCTGAGAAAACCCTATGGCAGTTTGGGCTGTTTGAGTGGCAGGGT-TGGGGGCCCACATCGAGGATCCTGGGGGTGGAGAGATG------AGCTCCAGAAGTGATGGGATGTGGGCTGGG---TCTGAAGGAAA----GGGCTGAGAGAGCCCTAGAATGAAG---TATTTAAGGAAGGGATTG-GAGACCCAGGACT-----GGATGAGGTGCCATAGG--------------GTTTGGGACGCACAATCCAGAGTTT---CGGGGCCCCACCTGCTTGCAGCGATCTTCCGCCTGCTTCTTGTCGGCTTCTGCTTGCTCGGCTCGGTCGATGGCGTTCTCCTTGTCGAGTTTTAGCATCTGCATCTTCTTCTTGATGGCGTCCATGGCTGCGGCTGGGAGTGGGCTGGAGAGGCTGAACTG--GGGCAAATGGACTGTGC--GGACGGGGTTCGGAAGGAGCCGGGTGGTCGACTGGGTGTATGGACCAGGAGGCACTGAGACGTCCCAACCCAGAGCCGCCGCCTAAAAGGCGGGGAGGGATCGGGCGGAGCCGGGGACCCGGGACCCTCCCCCACCAGCCGCCCGAACCTTGTAGGGGCAGAAGTAAGATCTGGGCAGAAGGGGGAGGGGCAGAAACGAGGTGTGCGTGTAGGGGGAGGGGGGCATAGGCAGTAGGGACTTTACTTCTCGGGTCTCTACCTATACAGCTGCCCCTCGGGATCACCCCAAACTTCTCTGACACAACTGCCCCTCCCCCCTAAGTCCCTCCCTGGCCCCGCCCATTGTGGGTGACCTGGGCTGGAGACCTGCCGTCGGAAGTGGTGACCCTGACCCTCGAGGAGGCTAGGGATAGGGAGAAGTGGCGTCGGGGAGAAGTCCCCAGGAACAGGACGGTTTGCTCAGAATACGGGCAGGAAACCTCGGGGTCTTGAGGAAGAAAGCACCCATAGTCAGGGGGTCCGGGCTGAGTGACACGGGG---CAGCTGCCGC-----CTGCGGTCCCTGGGGCTATTTCGGGGCGTGAGCTCACGGCAGCTGGCGGGGGGCAGTCACTCCCCACCTCCCCACCCCCGCCCTTGGTTTGCAGCAGTCGCTACCCTTAATTTAGATATTTCCGCTAAATCCACCCCGGATAGAATGTCTCCTGGGAAGCAGTCAGGGGCTAGCAGTATTTATTCCTAGCCTTGGCTCTCCTCGTGCCTCAGTTTCCCCCTGG 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s monDom4.chr6 122108810 1603 - 244784211 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tggcttccatgtttacctcttcattttcagcagccacagctgcaggcttggCTTGTGAGGCCAGTCGGCCATAGTCACTGGTCAGCTGGTTGGCAAGAGGGCCTAGCTCTTCAGGGCTGGTGTTTGACTTGGTTACCTGGTGATAAGGAAAGAAGTGAAGTTCTGACCAAG---------CTCAGCTCCCTAAGGGCACTCACTCCTCATGTTCC--AAACTTACCATCTCCTGAACAGTGACAGCAATGGCCTTGGCTGTCCTCACCATGGTTGTCTGGTAATCTACGAATGAGCCTTCTGGGTCACCCATAGGTCCTTCATCTAGCTGAGGGAGGGGGATGAAACGGAGAAAGACTGTCAGGGTCACTGCTT----CTGTGCCAG-----------AGTCCCTCTGGGGTACCCTGTGTCCGCAGGTACCCGAGGCGCTAACCTGGTTGATGGCCTGAGTGATAGAGTCCACCATGCCGCCAACGACTCCTGCAGCACTGGCTGCTTCGTTGAGGGTCGTCGTCAGGTCTTCTACGGCCTCTGTCATCATCTGCACAGCCTCCTCCAGGGCTTCCTGGGTGTGTGCTGCTTGCTAT--GGGGACATGAGGGAAGAAAGCCTTTAGCTCCT-----------GTCTTTCTAGATTGTGCTAACAATTATTCTCCCCGCCCCCTGGGCCTCCTTTC--TACCTTGGGGTTACCACCAGCCTCCTTGGCAGTATATAGCAACTGCAAGGCAGACTCTGCCAACGTTTTAGTCTGGTCCAGAAGTGCCATCTGCTGTGGGTGGCTCAGGGTCTTAGACGCAGCACCCACTGCAGCCAGGGTGAGTGGTTCAAAGTACTGGGCCATTTGGGACACCTGAAACAGACGCTGGGTTCAGTGTCAG---GTACTGTTAA---CCTA------TCTCCTCAGCTCCTCACACGATTCCTTACGTACCTTGTGTCCCAGCTGGGAGGCTTCAGCCCGAGCAGCGCTGGCCAGCGGCTCAATGAGATGAGAAATTTCTTGCACTGCAGTGAGCATCTGGGTGTGCAAAGCCTGGGAGGAAGCAGACATCAAATCTGAGTGTAACTCTAACAGTGCC-CTCTGGGGCAGAACCCCATTCTTCCTTCCTACTGCTTGCGCATGTGATGGTCGTGGGGATGGGACCTGGGGCTTCGTGTGTGCTTCATACGCTAGCACCGAGTTACACCCCAGCTCCCGGCTTCCTTCCATATCT-AATTCCTTACCCAGCTCCAGCATATCCCAGCCTTCGATGTCTTAGTAAAGATTCTTCTGAACT----CCTTCCTTCTCCCCCACACACCCTCC-CTGAGCCTGGACTCTCC--------------ACTCTTCAACACATTTCTC-------CTCACCTCTTGAGAGATTCCTTCACGGGGAGCAAGCTGCTGGCTGACAGCGGCAAGCGAAGCCTGATCTAGGTCCCGCAAGCAGCTGTTCAGAGCCGCAATGGCTGTCTCACACTCCAGCTGCCCTGGGGCTTTGTCCCTGCAGAGACATCACTCTTAAAGTCTCTTTAAAGGCTGTTACTTACCCTCCCCTCCCCTCCGACAGTGTGCCACCTCATTCC--AACTCAGTCATCTGCCACATTGTTTGTCCCCAGCCACACATGCCTCCTAACCCTCAGTACCTCATGCTTGTAATAAGTTTCTTGATGGAATCTGAGACAGTCCGAGAGTGGCCAGCTAGCACAGACCAACGTGGGGGGTCTCGGGGATTGACTGCTAACGCCCGAGCTGTCTGGATGAGCCCTCCAGCACTCTCCAACATTGTCTTAGCAGAGATTACAATGGGCTCCATGGCTGCTCTGCCCTGAGGAGAGAGGAG-GGACGG--AGGCGAGTCTCATGACTTATGCTCACG----AAGGTGAAGTGGCTCGT--GGTGTCTCTGGTGCAG----------------TGCCTC-----------------ACCTCAGGGCTGATCTGGGCAGGGACGCTGGAGAACTCAGGGTTGGAGGCAAAGGCACTCAGGTTATCCACAGCTTCCAGCAGAGGGGCTGTGGCTGCTCGGCACTGGGCACGGTTCTCTTCTGTGAAGTCCCCATCTAGTGCCTGAAGG----GAACAGGGAGCCTTAGGACTTAGCAAGCGGGCACACAAG---TGAAACCCAGGCCACCCTCAAGGGCTCAGAGGACTGG-AAGACTGGATAGACAAGGATAGGAGAATCTAGCAAAA-------------------------GACCCCAGAAAATGAGTAGGAGACTCAGGCAGAGAAGGTGGCTTGGGT-----------CAGGGAACCTGAAAATTCAAACAGTCG----AACCTTGATGGTCTTGACAAGATTGGCTGTACTGTTGGCCACCTCCTTGGCTGACTGTACAAACTGGCGCTTGGCAGTGGGATTGGCAGTCCTAGCGGAAGCCAGGCGACAGCTGTTACACAATGCAGATGTGTGTTTGGCTACAATAGTGGCTGCAGATAACACCTGAGGAGACAGAGATAGAAAAGCTGTGATAAGAGCCGGAAGGAAGAATGCAAACCTAAGGGAGCCATTTCAGAGGTGGAGGACAAAGGATGGCACCTCAGAAGTCTGTTAGGAGGTCTGGGAGAAAAAGGTGCTCAAAGATG-AACAGGACATGGAGGCGGGATAAAGGACAACAGATACATTAATAGAGAAAGATCTAAGTGGGAC s monDom4.chr6 122111513 2606 - 244784211 TGGTTATCCTGCTCACCTCCTCGTTTTCAGCAGCCATGGCTGCAGGCTTGGCTTGAAGGGCAAGGCGGCCATAATCACTGGTCAACTGGTTGGCCAGAGGGCCCAGTTCCTCTGGGCTGGTACTTGACTTGGTCACCTGGGGAAGGGGGAGGA---GAAGTCATAGCAAAATATATTTCTCCCTGCTCCTTCCCCAGGCTCACCCCCAGGGTCTCCTGCACTCACCATCTCCTGTACGTTGACCGCAATGGCTTTGGCTGTTCGTACCATGGTCGTCTGGTAATCCACAAAGGAACCATCTGGCTCTCCCATTGGTCCTTCATCCAGCTGGGATAGGGGGAGAGAACAGG---AGAGTTTCAGA--CCTTGCCTTTGGCTGGGCCAGGAAACAAGACTAGTTCAGGCTGGGTGCCCTACACTC------CACCAATGCAGGTACCTGGTTGATTGCCTGAGTGATGGAATCCACCATGCCCCCCACCACACCGGCGGCACTGGCTGCCTCATTGAGGGTGGCTGTCAGGTCTTCCACGGCTTCTGTTACCATTTGCACAGCCTCTTCTAGAGCCTCCTGAGTATGGGCTGCTTGCTATTTGGGATTAGAAAGGGAAAAAACAGAGGGGTAAGTGGTGAGAAGGGTCCTTCTA-CTTCCTCAAGGTCCCCCTGTCCTCATCCCCTCTTCTTCTTCTACATACCTTGGGGTTGCCCCCTGCCTCTTTGGCAGTGTAGAGCAGCTGGAGGGCAGACTCTGCCAGGGTCTTGGTCTGGTCTAACAGTGCCATCTGCTGGGGGTGGCTTAGAGTCTTGGAGGCAGCACCTACAGCAGCCAGGGTGAGTGGCTCGAAGTACTGGGCCATCTGGGACACCTGAGACAGG-GTGGGGCTAGGGGTCAGCCTGGACAGGGAAGATCCCAGGAGCCTTCCCTTGACTCCC------ACTCCCCAGGTACCTTGTGCCCCAGCTGGGAGGCCTCAGCTCGGGCAGCACTGGCCAGCGGCTCAATGAGGTGGGAGATCTCTTGTACTGCAGTCAGCATCTGAGTGTGCAAGGCCTGAAAAGGAAAGGCCCGGCAACTTTAGCATT-TACTACTGGTCCAGCTCAGGGAGAAAGATGGATGATCCTGTCCTCT-------AAAGGGGATGG--ATGGAGA---GAACTTGGGTTGAG--------------GCTGGGAAGAAG----ACCCAAAATTTTGGTTTCTTGGAGGGTCTCAGACCCTGACCC--CCCAGGTCTGTACTGACTTCTACTCTCCCC------CTTCTACTGGACTTGCCCCTTCTTTTTGTCCCATTCACCTTCCTCCCAGCCTCCTCTCCTCTGGGTGCCATGTTGACACCTCACATCATGGCTAGCTCTAACTTACCTCTTGCGAGATGCCCTCTCGAGGCGCAAGTTGCTGGCTGACAGCAGCAAGGGAGGCCTGGTCCAGATCACGAAGACAGCTATTCAAGGCTGCAATGGCTGCCTCACACTCCCGCTGGCCTGGAGCCTTATCCCTGGGAAGGCC---------ATGTC-CTCTCAAGTCATTCCCTTCCTCATTTCCACATTCCCACAACAGGTCACTACATTCTTTGGGGCACCAATGGAGCACCTCCTCTTTCCCC-----CACAGTGATCCTA----------CCTCATACTGGTGATGAGTTTCTTGATGGAATCAGAGACCGTACGAGAGTGTCCAGCCAGTACTGACCAGCGAGGGGGGTCTCGAGGATTGACTGCTAGAGCCCTGGCTGTCTGGATCAGTCCCCCAGCACTCTCTAACATCGTTTTAGCTGAGACCACTATGGGCTCCATGGCAGCTCGACCCTG-GGAGAAAGGAGAGGATGGTTAGAGAACTAGAAAGCAATATGCTCAGGCAAAAAGGTG-AGTGAATCCTAGGAGGCCGCCTGCCCAGCTCTTTCCCACCCTAATGCCTCTCTCTTCTCCCCATCTTACCTCAGGGCTGATTTGGGCAGGAATGCTAGAGAACTCAGGGTTGGCTGCAAAGGCACTCAGGTTGTCCACAGCCTCCAGCAGGGGGGCTGTGGCTGCTCGGCACTGGGCCCGATTCTCCTCAGTGAAAGCCCCATCCAGTGCCTGAGGGAGGTGAAGGCAGAGTTTGGGGCATTAG-AACAAGGCATACAAAGTCTATAATCTTCCCCATCTTAAAGGACTTTTGGGACAGGTGGGACTGGCT-------GAGAGGGGAAGTTAGGAAAAATGGCACAGATGTTCTGAGTCTGGTGATGGCAAAGAGTAAATAGGAAGAGGAGGCAGAGAAAGGAGACTGGGTGGGGACCAAGGGAGGAGGCCTGGGAAGG-ATATGGCTGTGAAAACCTTGATGGTCTTGACAAGGTTGGCAGTGCTGTTGGCCACCTCCTTGGCTGATTGGACAAATTGGCGCTTGGCTGTAGGGTTGGCTGTGCGGGCTGAGGCCAGACGGCAGCTGTTACACAGTGCAGAGGTGTGTTTAGCCACTATGGTGGCTGCGGAGAGCACCTGGGGACACAGACATCCA-----------TAGAGAAGGCATAAAGAACAAGgaattggagg----atcttggaaat----gactgagtctaccccctt--cagtttacaaaga--------aggaaagtgagctttcagaagtaatatgactt-------gcacaagatctaacagata----attagggcaag----aaatggaac 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s monDom4.chr6 122136529 1339 - 244784211 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s monDom4.chr6 122142111 1119 - 244784211 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CTTGACACTTACTGTGAGTCGGGCTGCCAAGGCCATTGTGTAGGGGTTTGGGGGGTTTGGATGATGTAGTAGCAACCCCTGTACAGTTTCCCCATCATGCTCTAAGCAGAAGGGTTCATTCCACAGCCCTCCTGGGCTATCGTGCCCACCTCCCAGTCCATTCCTCATAGAGAACATGATGGATATATCCAAATCCTCATCACTATTATTCTCCACATCCCACACGAAGACCCCCACAGGTAGGCTGCTGTCCTGGGA-GGGAGAAAGGA--------------------GAGAACAACAAGGAAGTA--TACTCAGGTTATACACCCCAACAAATACCCTTCTATCTTTTAAAGCTTTTTCATTCATCAAAGATACTATCTT----GGGGGAATGAAGGGATGATAC-----------------------ATGACCAC-----------CTACCTTTCAT-GCCTACAGACCTACACCTGAGAGAACTAT-TGTGGAGGTGGGTTTTACCTGATTATCATTAGTTGGAGGTCAGTTTTACCTGGTAGTCATGGGGGAGGATGGGTGTGATCTGGCGACAAGTAAGTGTGACTTGCTGTCCAGGCAGCTGGTAGACGGTCCAGGCTCGGGGGTAGAGTGCATGATAAAAAGCAAAGAATCCACACAGGCCCCAATTCCAGCTCCGTAGGACACTGGGACGCTCCAGGGACAGGACTTGCTGGTACACAGTCTGTCCTCCCCGCCGCAGGCATACGGTGAACTGAAAAAGGAAGATGAAC a score=10295 s mm8.chr4 43594837 146 + 155029701 CCCCCTTCCTTACTTGGTCTGCAATGACTGTCTGGTGCTGGTACATTCCAGGGTTGAGCTGCCAACGACAGAACTGGCCTCTCCAGCCCCGGGTGATAGTGCCTCCTCCAATGCCACCCAGGGGACAACCTAGAAAGAAAGTCAGG s monDom4.chr6 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s monDom4.chr6 122172994 1122 - 244784211 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s monDom4.chr6 122178129 2115 - 244784211 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AATAAATAGATAAATGTGATTTTAAAAAAAAACCACACAGCTTTTTAAGAGAAAAAAAAAAGATTATACAGGG----------AGACAAAGACCAT-----GAAGGTCCATGCACCATCACCACTTG---AAGTGTTTCTGGCCCACCAGGTTTGTCACAGCGGCCTTCACATCCTTGTTCCTCAGGCTGTAGATGATGGGGTTCAGCATGGGGGTCACCACTCCATAGAAGAGGGAGATGAGCTTGTCTGCAAGGTCCTGTTTGTCTGCCCCCAATGGGTCCTTGGATTTGGGCTTCCCGTACATGAACAGGATGGTCCCATAGAAGACAAGTACCACGGTGAGGTGGGCAGAGCAGGTGGAGAAGGCCTTCTTCCTCCCCTCGGCAGAGGGGATCCTCAGGATGGTGGAGAGTATGAAGATGTAGGAGACAAAGATGAAGAGGACAGGGACCCCCAAAAACATTGCATTAGCCACTGCCATGCTGATGACATTGATGGAGATGTCAGCACAGGCCAGTTTCAGGACTGCCAGGATCTCACATGTAAAGTGATTGATGACATTGTCCCCACAGAAGGGCAGTGTCATTGCTAAAGATATCTGCACTGTGGCAGTGATGCTTCCAGATACCCAGGAGCCGGCGGCCATGGGCACATAGGCAGCCTTGCTCATGACCACAGGATATCTAAGGGGGTTGCAGATGGCCACATAACGATCAAACGCCATCATGCCCAGGAGCACACACTCTGTGGCTCCCATGGCGAAGGAGAGAAACATCTGCACGGCACAGCCCGAGAAGGAGATGGTCTTCCTGGGGGTCAGGAAGCTGTCCAGAATGAGGGGGACGGAGGAGGTGGTGTAGCAGATGTCCAGGAAGGAGAGGTTCCCCAGGAAGAAGTACATGGGCGTGTGCAGGTGGGAGTCGAGGATGCTCACCAGGATGAGGACGACATTGCCCAGCAGGATCACCAGGTACATCAGCAGGATGAGCACGAAGAAGGTTTTCTCCAGCTTTGGGTGGGCGGAGAGACCCAGGAGGATGAAGCTGGACACAGGGG------TGGTCTTGTT s monDom4.chr6 106197500 1074 - 244784211 AAGAAATATACAAGGGGATATTTAGGAACAAAAAATATTGATACCAATTAAAAAAAAGAAATATTCAGTAAATGTATCTTCTCAGGCATAAATCATCACTGAATAGATTGTATATCATATCTTCTTAGTAAAACATTTTTGACTCAACATAGTCTTCACAGCTGTCTTTACATCTTTGTTCCTCAGGCTGTAAATGATAGGATTGAGCATGGGTGTCACTACACCATAGAAAAGGGAGATGAATTTGTCTATAATGTCTTGTTTGTTGGAATTAAATGAATCTTTGGCTTTAGGTTTTGCATACATGAAGAAGATTGTTCCATAGAAGATAATCACCACAGTCAGGTGGGCTGAACAAGTAGAAAAGGCTTTGCGCCTCCCTTCTGCTGAAGGGATCCTCAGAATGGTGGCAAGGATGAAAATATAAGATATGGAAATTGATATCAGTGGAATAACTAGAAAAATGAGATTTGAGCCCATCATACTAAGTACATTAATGGTAATATCTCCACAGGCCAGTTTCAGGACAGCCAGAATCTCACAGACAAAATGGTCAATGACATTAGCATCACAAAATGGTACCTGGACTGCAAGGGATGTTTGAACTATGGAATCGATAGCCCCAGCCATCCAAGACCCAGCTGCCATTGACACATATGTAGTCTTACTCATGATGGCAGGGTATCTCAGGGGGTTGCAGATAGCCACATAACGGTCAAATGCCATCATGCTCAGGAGCATACACTCAGTTGCTCCCATGGCAAAAGACAAAAACATCTGCACTGCACAACTGGAGAAGGAAATAGTTTTCTTTGGAGTGAGGAAACTGTCTAGAATTAGGGGTACGGAGGAAGTTGTGTAGCAAATATCTAGGAAAGAGAGATTACTGAGAAAAAAGTACATGGGTGTGTGTAAGTGGGAATCATAGATGGTTGCTGTAATGAGGACTCCATTTCCCAGCAAGATTATCAGGTACATCCACAAGATCAGTACAAACAAAATAGTCTCCAGCTTTGGGTAGTCAGAAAGGCTTAGCAATATGAATTCTTTCACTGTGGGATGATTGGTCTCATT 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tgtctatctcttggtctctgtctctgtttctttctgtctctgtctctctgtctctgtctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctcacacacacacacacacacaGGTCAGTAAACCCTGGTTTTTCAGGTCTCACAACACTCACAAATCAAAGCCATTCTTCTGGAGCTGCCATTTtaaatttataaccatatttatagatatatgt-atatacatatataaatCCTTTCCAAATTTTCATTAAAAATGTAATGAAAATTATTATGTTGCTTATCCAAACTCTAATCCATAGTATGGGAGTAGGGAGACCTTGGAAAATCTTACCTAGATTAAGTTCTCATCCATTTCTATGAATAATCACTTACTTTTTACTATCCTTAAGGAATGGGT---GTGAGAAGGGAAGTCTCCTGTGCAAGGCTTTAGGAGGTGTTATGACTGGTCCTATTCAAGGAAAATGAGCAAGAAGGG-AGTCTTGAGGTTACAAGAGGAGGAATTGGAACCTTTAAGCCAAGGGCTTGCCAGCTCTCTCTGGGTGACTTATAGATGCTT---TGGCCATCTGTGACTGAAAAGCTGAAGAGGTGCCTCAGGAAGAGATGGGATCTCTTAAAGGTTTCTCTTTCCAATTGGTTTTAGTGTTTTGCTCCCCAA-------AGAGTAAAGATCTGTCTGGCTCAAAC----CTCCAGGGTTTTCATTC-TGTGATAGACTCAGGAGTATATAGGTACAGTTGAAAACAGAGTCTAAGTCCTTATCTCAGGAGGAGTCATTAGGAATGAATGCTATTGGGAAAGTAGAACTGT--TTACAGTTCATCACTGACCAGCAGGGGTAGTATATGCTTCAGAATTAATCACCACTTTGGAAACTTTCTTAAGAGATACAAATGGGGAAGAAGTATACTAAGTGAATATCAAGGACAACAATTTTTAGCCCCTAGAAATTTGCCCTCCTTG------AACTTACCTAG-CCTATGTCTTAGCAGATAATGTTCAATTTGGTCCTT----CCTCTCCCAATTTAATGACCAATTCCCATATGTCTGCCTGAACATATCTTTGG-------TTTGATATAACTATATGTAAAAACTCATGTTATTTGTTCATGAAGTGGACTAGAGAGTCCTAACCTCCTGCTGTATTTTTGTTCTGGTTCAG---GTGTTCAGCAG----CCAGCACTGAGGTG 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s monDom4.chr6 106222127 1088 - 244784211 ttatatatatatatatatatttttttCT-CTCTCTAA-ACAAAGGA-----------CAGAGGGCTACAT--AACATGCCAGGACAATAACAGAGCAGATTGGTT-TGAGATCCTTGACAAAGAACCACATTACAGAGGTTTCATTG--------------AGGAGAGGGCTTT----GGATTCAGCAAATTTCTCACAGCAGCTTTCACATCCTTATTCCGAAGACTATAGATGATGGGATTCAGCATGGGGGTGACCACACCATAAAACATGGAAATGAGTTTGTCTGTTGCTTGTAGTTTGTC------AAGAGGGTCCTTAGATTTTGGTTTTGCATACATGAAGAAAATGGTCCCATAAAATATGATCACCACTGTCAAGTGGGCTGAACATGTGGAGAAAGCTTTGCGTCTTCCCTTGGCTGAGTTCATCCTCAGGATGGTATAGAGGATAAAGAGATAGGAAAAAAAAATCACCAGTAATGGTAGAACAAGAAATGCCATGTTGGAGACCACCATAGTAATCACATTGAGGGATATATCAGCACAAGCTAATTTTAAGACTGCTAGGATTTCACAAGAGAAATGATTGATGACATTATTCCCACAGAAAGGTAACTGCATAGCAAGAGCTGTTTGCACTACTGAG---TTAATCCCCCCTGACAACCAGGAACCTGAAGCCATCAGCACATATACAGTCTTGTTCATAATGATGGGATATCTTAGAGGGTTGCAAATGGCCACATAACGGTCAAATGCCATCATGCCCAAGAGTAAACATTCAGTTGATCCCATGGCAAAGCCAAGGAACATCTGTGTTGCACATCCCGTGAAGGAAATGGTTTTTTTTTTAGATAAGAAGCTTACCAGGGTTGAAGGTATAGAAGTGGTTGTGTAACAGATGTCCAGGAAGGAGAGGTTACTGAGGAAGAAGTACATAGGGGTGTGAAGGTGAGAATCAAATATACTTGCTATAATGAGGACACTATTGCCAAACAGAATTACTAAATACATCACAAGAATTAGGACAAAGAAAATGATCTCAAGTCTTGGGTAGCCCGAAAGTCCTAGGAGAAGAAATTCTGTCACA------AAAGTTCTATTTATCCTTTCCATTTCATCACTTTT 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ATACCTCTAAGTCTTTTGTGTTT-GTCTAGACTCCATTTTCTGTATGTC-----CTCTTAGAATTTTGTTTAGAATTTGATCTTCAATGTTGATATTTAGAGGTGGTTCCAGATCAGTTTCTTTTCATCTCTAGTTCTTTATTCTACT---CTTAGATACTGAACTGTGATGTGGTAGTCTTAGGTTTATGTACTGCTTTGTTTTATGGTTTATGACCACATGACATGAATTCTAAAAGTGATGAATCCAAGATGAGAAAAAATTATCTATT-------CATATACACAGTCAAATATACTTCCAGAAAAATATGTAAATAAAAATAACATTTTTAAGATTCCTGATGGACCATAATATTATTCTGGAACCTGAAATGGGTAAAAAAATAACCAAAAATTTGCTTAAATGAATGAAAAATGATAAAAGAGGGAGCATTAAGGACAGGGGAAAGAAAAAT------------AAAAGCTTGTAGCTAAAATAAATGAGTTAGCTTAAGGCAAAGAATCAAGGACTTTTTCATTGTTTTATCAGGATTCATGTTGCAGTGGTTTTAAAAAATTAATAGTAGCAAAACA a score=-317 s mm8.chr4 43841220 168 + 155029701 AAGTGTATTTTTTTTCAGTTTTTATTTTTC--AGTTTTTATTGCTTTTTTCGTTAGTGTACAAAGAACACTTAATTTTCATAGCACTTTTTCTTGGTTCTAGGATATTTTGTACAACCAGTGTCTTGATTCTAAAGAGTCCATGGTCCAGCCCA------GTCACTCACGAAGA----------------------AC s monDom4.chr6 99503678 192 - 244784211 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s monDom4.chr6 26899046 1092 + 244784211 TCAGTGTCAAATGATTTTCTCTGCTATTCCTCAGAGTAGCTATATTGGA--GCTATCTACTGCTGCCCAGG------------TGAA-GAGATCCTACCCCAATCAGAACCTCTCATGTTTCTGACAAAGGGGAATTTCT-CCTCAGGAACTTTTTTGCAGCCTCCTTGACCTCCTTGTTCCTCAGGCTGTAGATGATGGGATTCAGCATGGGAGTCAGCACCCCATAAAGTAAGGAGATGAC------------------TTTGTCTGTTTCTTGTGAGCTCGCTGATGAAGGTTTGAGGTACATGGATAGGGCAGCCCCATAGTACAGAACCACCACAGTCAGGTGGGCTCCACAGGTAGAAAAAGCTTTGTTTCTTCCCTCGGCTGAATTAATTTTCCAAATGGTTGAAAGGATGAAAAAATAGGAAATACAAATTAAGAGCATGGGAATGGGAAGGAGGAGCACACTGACCACCAACATGACCATGTCAATGAGCAAGGAAGTGCTGCAGGCCAATTTCAGCATGGCAAGAATTTCACAAGTGAAATGATCGATCAC---GTTTCCACAGAGAGGCACCTGCAGGGCAGAG----CTTGTTTCTAGGAGTGCTGTGAGACAACCAGTTATCCACGACCCGGCTGCCATCTGTACACAGACCCTTTGGTTCATGACAATGGAGTAGCGGAGAGGGTTACAGATAGCTACATACCGGTCATATGCCATCATGGCCAAGAGGACACACTCAGTGGACCCCATGGCAAGAGAGAGGTACATTTGCAGAACACAGCCCGAGAAGATGATTGTTTTTTCTGTGGCCAACAAATTCACTAGCAAAGTGGGAATAGAAGAGGACGTGTAACAGATGTCCATGAAGGAAAGGTTCCCTAGGAAGAAATACATGGGGGTGTGAAGACGGACATCCAGGATGCTGATGACAATAAGAGTGCTGTTCCCAAGAAGTGTTATCAGGTACATCACCAGGCTGAATGCAAACAGAATCATCTCTAACTTTGGATACTTGGAAAATCCCTCTAAAAAAAAATGGGTCCAAATGGTGTGATTTTCCCCTTTTGTCATGTTTTCCCTCTTTTATCTGTGAAGATGGAAAG---AGAAAGCATTTCTTCAT 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score=1796 s mm8.chr4 43846061 126 + 155029701 GAACAAAATGTGTGTGTGCGTATGTGCATGCACGTACACACACACACACTATta-------------------aataaataaataaataa-ataaatTACACACCCTGAGCTTAAAGGAGGGCAGAAAAGGTGTAGTTTCATAAAA s monDom4.chr5 287748004 143 + 308900514 GGAAATAATTCACGTGTGTGTATGTGTATACAGACACATTCATACATACTCTCATTCATGTGTTGAGTCTTAGAACAGGAATTTGAATGATATAAAATGAAGAGCTAGAG---AAAGGGAAAAAACAACAATTTGATTTTTTAAAA a score=658 s mm8.chr4 43846187 409 + 155029701 ATTACCGTTGAATGGTTTGGGTGGCTCCATTAAAGGCAAATATTAAAATAAATTGCTGTCCTCAAATGTTAGGAAGAAGCCGATGCTTCACTCTGATCCTTTGGCAGA------AGTCTTTTC----ATCCTTAATCTTTTTAAAACATACATTTTAATTCAAATAGAATTACAtcactctctccttccct-tccccccccccccactcctccaaagcaccctccctccaacccttccCATACTCCTACCAGACTCTAAAACTGGTGGACTCTTTGTTGTTGTTTATGTTTATTTattct-tttctcgtacaataaatacatcctgactacagcttcccctctctccctcctctcagtcccc---------cacccccacctctcttcacccccagacccactgttccttcagaaaagagcaggcctttc s monDom4.chr1 167564677 390 + 748055161 ATGTTCTTTGAAGTGT---------AACATAAAaccccattattatggttctccacctacctcttttact--------gttctttcttta-tctgtgtcctttgctgatttgtcagtctcttcctgacttcttaggatggatgatccttagaattttgtgcataaattcctcctggagcctctcttcctttgtctctctcccttctttctttccattccctctctttcctctcctctcccttccctttcattgtcct-------------tcattttttatttctgtctctattccttctctttctttctccctaaaatcttctttccttccttttcttcccctttcctcctttttttcccctcttgttaacttcccctcctctttccttccc----tccTTTATTCCT-----AAAGCACAGGTCTGTC a score=389 s mm8.chr4 43847149 140 + 155029701 gaaccataggatgcacagacataggtgcaggtaaaacacacaca------cacacattttttttttaattaaGGAAAATTAACCTGGACATGCAGCATTCT------------------------CTTTTTGTGTATTGGAAGAGGGGTGTACCTAAATGCACACACATA s monDom4.chr5 289155769 169 + 308900514 gaacc-taggttctcctgaTGTAGAAAAAGTCATAAAGCACAGAATTGATCATATTGATTGTATTAAATTTTTAAAAATTCACAAAGAAATTTAGTGCACTGAGAATTTACAAAATATAGAGAAAATATATATTCCTTAAAAAAGTCTTATTTTTAAACATACACACATA a score=977 s mm8.chr4 43847289 247 + 155029701 TACATAAATAAAAAGAAATCTTAAAAAGTTTCTAAGTAAAAATTAAAACTATAGATAGTGTGCCACAGGAATGGATTATTTAAGAGCCCAACAATTACTGTACTCACGGGCAAGGAAAAACACTTTATATAAAAACATCAGCAAATAAGTCTAGTTATAGGGCTCCTGTTTGCTTGCTTGTCTGCTTGCtttttgagacttggcttctcatttgcccaggctggctccaaacttgctctgtagccaa s monDom4.chr6 99343764 212 - 244784211 TACATAAAATAAAAGAAATTCTACAATATATATCAGTAATAAT---------------TGTCCAATATGGATTTATAATTT-----CTCTATTATTAACATATTCTT---------AAATAACTTTATTT--TAACTTGAACATAGAAATAAAAACATA--CCTTCTGTTTCTATGATT-TCAGTCTTCCCTTAGCATCATAAGATA-CGTTTATTTAAGATAACTCTTACCTTTTACTGAATTTAA a score=722 s mm8.chr4 43851565 301 + 155029701 CACAtctttctttctgtctgtctgtctgtctgtctgtc----------------tgtctTTTGAGAA--------ATATTCAGTAAATT----ATTTTTGTCCATTTTTAATGAAACCTCAGAGACCCTAAGACTGAATTTCTTTTTT----------ATTCTGTAAAAAAATGtctatttatttataattttatacaggaatgtg--------tgtgtttagatgatagctaaccctcgggttttccagttcagctcctcctggattttgcatagcatccattctcccatttc---atctctccctcctcct-----cttccttcttacttttcttctataacagtctaaatct s monDom4.chr2 209101790 349 - 541556283 CACATTCTTCACCTTGTCTTTCCCCTAATTCATCTATTCTCTTTAAAATTTCCATACCTTTTAAAAAGGAAATCAACATTCTCACAAGTCAGGATTTCATTTCATACTTAATTAAAAATCAGAGACCATTCTGGTGAAATTCTTCTTTTCCACTCACAATTTTTTGACATCCTCCATTCTCTTCTCTTCTCCTCGATGGAAATGTGAAGTGACATGTATACAGACAAAAGTGAAACTCTACATATATCC-TTGATTCTTTCCCATTGTCTTCATTGATTTCATGCTTTTCTCTCTAAACATttcctatctactggttccttccctgctacttata----atcaca-tctaaattt a score=406 s mm8.chr4 43856288 223 + 155029701 GACAGGTCCAGTGGCTGGGGTGATAAGTATTTCTGGGGATCCAGACAATACACCAGGGCATCCATTCCATGGTCTTAACTGAtacttctccaggtccagcatgcatataaa-----tccagtggaggatcttgttaaaatgaactttcccagtcagtagatctgctgggggtcaggaaactctgtatgccaaaaagctccc--gggtgatgggtgatgttgacatttcca s monDom4.chr2 256151401 212 + 541556283 GACAGTCTTAGTGA---GGGAAATAAATATTCCTTGGGATCTAGGAAG-----CAAGATGTATACTTCATTTTCTAAGGTGAGATTATTCAACA------ATGAATTTAAACTGTCTCCCCTTAAAACTCTGCCTA----GTGTTGTGATGGTAAAAAGTTGTGTTTTTTTTCCAGACATACTAAATGGAAATCATTTTCCCAAGCAGAGAGTTGATATGGAGAATCTCA a score=91 s mm8.chr4 43856636 1 + 155029701 A s monDom4.chr6 106222258 1 - 244784211 A a 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s monDom4.chr6 145122189 1040 + 244784211 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s monDom4.chr2 33302259 1086 - 541556283 CCCGGGCGGCCTCGGACCTTAGCAGGG----GAGCCCGGGCGGCCTCG-GACCTTAGCGGGGGAG--------CCCGGGTGGCCTCGGACCGTCTTAGCAGGGGAGCCCGGGCGGCCTCGGACCGTCTCGGGGA---GCCCGGGCGGCCTTGGACCTTAGCGGGGGAGCCCGGGCGGCCTCGGACCGTCTTAGCAGGGGAGCCCGGGCGGCCTCGGA-CCGTCTTAGCAGGGGAGCCCGGGCGGCCTCGGACCGTCTCGGGGAGCCCGGGCGGCCTTGGACCTTAGCGGGGGAGCCCGGGCGGCCTCGGACCG--------TCTTAGCAGGGGAGCCCGGGCGGCCTCGGACCGTCTTAGCAGGGGAGCCCGGGC-GGCCTCGGTCCGTCTCGGGGGGGCCCGGGCGGCCTCGGACCGTCTTAGCAGGGG-----AGCCCGGGCGGCCTCGGACCTTAGCGGGGGAGCCCGGGTGGCCTCGGACCGTCTTAGCAGGGGAGCCCG-GGCGGCCTCGGACCTTAGCGGGGGAGCCCGGGTGGCCTCGGACCGTCTTAGCAGGGGAGCC--CGGGCGGCCTCGGACCGTCTTAGCAGGGGAGCCCG-GGCGGCCTCGGACCGTCTCGGGGGGGCCCG-------GGCGGCCTCGGACCGTCTTAGCAGGGGAGCCCGGGCGGC--CTCGGACCGT----------CTTAGCAGGGGAGCCCGGGCGGCCTCGGACCGTC--TCGGGGGGGCCCGGGCGGCCTCGGACCGTCTCGGGGAGCCCGGGCGGCCTTGGACCTTAGCGGGG--GAGCCCGGGCGGCCTCGGACCGTCTTAGCAGGGGAGCCCGGGCGGCCTCGGACCGTCTCGGGGGGGCCCGGGCGGCCTCGGACCGTCTTAGCAGGGGAGCCCGGGCGGCCTCGGACCGTCTCGGGGGGGCCCGGGCGGCCTCGGACCGTCTCGGGGGAGCCCGGGCGGCCTCGGACCGTCTTAGCGGGGGAGCCCGGGCGAG-----TCG--CTCCGCCCCACGAGCCGGAGAAGGAAACCGTCCCTG----------GATGCTTGTCAGTAAGCCCCGAAG--CGGGCCGTGCGGGGGCGCCAGACGAGCCCCCCCCCCCCGTCCCCTCACCCGTGCTCTGGGCCACCTCGGGGGTG 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tgatatgacaaagagatagatagatagatagatagatagatagat---------agatagatagatagatagatagatagatagatataaatagatagacagatagatataaaaccatacaatgtatttttctatttcca----------gttctttctcaattctgtt--------attcctc----aaacaatattgctgttac-tgtacacaatgctc-tcttcattcaaatctttgtactctttgttatttcattcaagtctttcctgtctacttcaaaaatcaacttactcatcactttttatagcacagtagtattccatcacattcatatgccacaacttgtttaggtattgtccaatttatgggcatcctcttaatttcccgctctttgctaccacagagag---agctgctataaatatttta-----------gaacatataggttctttt------cctttatcc-ctga-tcgttttggaaaacagaccaaatactggtattgctagCATTTTTTTTTTCCAAATCAGACCAAGGCTTTTATTTATTCATTTTTTACTTTTAAAATATCCTTCAATAAACTTCTTTCACCAGAGTTTCCTTGCCATGGTCCTTAACAACAACACAACTACAGCCAACCATTTTATGGGGC-----------------------------TTTCTCTCTCTGTCAATTTTACAAACTCCTACCCATCCAGCCAGCTTCTTTGGGCATCAACTTAGATTAAGTTGATTTGGTGCTCAGCACACAGGGTTTCAACCAACTTTACTTATGTAGGTTCATC------------------------CAGTTGGAAGGAAGAACACTAAGATGGGCTTGGCATTGATCTAAGGCTTTGGCAACATCACCAATTCCATGAGCTAAGTCATCATGACTGAGTTCAAGCTTCAGTATTTCTTT a score=3132 s mm8.chr4 44335125 146 + 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s monDom4.chr6 27706116 1069 + 244784211 ttaagtgacttgcccaggtacaca--cagtgtttgaggcttgatttgaacccaggacctcccatttctagacctgactcaatccactgaacttcacagTCATTT--TTGTATGTCAATTGCCTTTGAAAATTACAGCTATGATAGTAATGCAT-AATCATGAAAAATAGTTACTCACAAGCAAATTTCCCATCTTTGCCTTAAAAGAA--GAAACAAAACCCT------CTCAAACTTAGCTGGTCACTTGATCACTTTAGAGAGAATATGTTAGTGAATTAGAAAGCTAACTTTAAAAATATGAGTTAA--TTTTATTTTGGCCTTTCAATTTTTACTTATGTGCAGTAAGATGAATG-------------------TGTTCAGAAGAAATATAACCTTCCTAATCAATATTATTTGCCAATACTACATATTCTTTGTTTCTTCTATCTTGAATTTTGTTTTTTAGGTTTTCATGTTTTTGCAAGTTGAAAATTGATTCAAATTAGGACTTTTATGCATTATTGTGGAATTTAATTTCACACATTATAGATTTTGAAATTTATTGTAATCTCAGCTGAGAACTATTGTTCCGAGTCGCAATGTAATACAGTCTGCTGGTTGAATCTAATTAAGGTGTCGTATCACTTGCATGCAGTATGTTTCCTTGCCTAGAATGTGCTAAAATTCCTCACTTGGGAATAACACTTCACTCAATGCTTCCTGGTTTGATTG-AAAACCCACCAAAACTTGACAGTCCTGTATGTAACTCTGGTTT--GAGTCAGACTTACTTTTGTTTATCTTCTGCATTTTT----AACCTTAAAG-----CTCAATTGCAATTTGTAGCATGACTACTAATAAATTAGACTGAGTATTAATCTTATTAACCTCACCTATGTTCATGTGCCATAACTGTGTTCAAAGATGAGCATTGATATACTGCAGGTCTTGGCATGCAAATATTAGCAAAGCCTTTAGATGACTCATTAAATGAAAGTCAAA-TAAGATAGTTTAAGAGTACAGTTGCTTTCTCGTGACTCtaaattataatttaaaataaaatG---AACATGTTGGGTTATGTGA----GttattttaaaattataaaatataCT 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s monDom4.chr6 27761220 1132 + 244784211 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a score=35487 s mm8.chr4 45083032 624 + 155029701 CACCCACCTTATACATGATTGGTGAGAACCAGGCTGGCATGAAGACAAGATTGCACACACGTGTGGTTGAGCAGTGCTGGTCAATGCTGGCAAGCAGGGCCACCTCACCCAACTTCCCTTGGCCCACAATCTCCACCGGCACCTTCAGGATGATTTCCCCTTGCTCCTCGTACACACCTGGGAAAAGCACGATTCGATCATAGAGGCTGGCCATGGCTAAGGCACTGCCCAAGCTGTCAAACTCATGGCCTGGCCCAACACTCAAGGTGCGTCTCTCCTTCTTCCTGCGGAACAGAGAGAAGCAGATGGAGGACTCCAAGTCCAGTGCATTCTTGGTCCAGGTCTTAGAGGCAAGGTAGTGTTGCTTGAAGGCCTCCCTCCAGGACTCGGGCTCCACATCAGGCTGGTTGGGCCAGTTGGGGTGGCGGCACTCGGTGCAGCCCAGACACAGCTGCCGCCAGCGGGTACTGTCCAGGCTGAGGATCAGCTCATACCAGGCCCTGCAAACCAGGCTGCAGCGGCCCAGGTCAGGGAGATGTAGGTAGGCTAAGATCATACGCCACAGCTCCAGGGGGAGGCCACCCGTTTCCATGGTCACCTGGGA---GAAAGACACAAAAGAAGATT s monDom4.chr6 29211619 627 + 244784211 CACCCACCTTGTACATGACAGGGCTGAACCAGACTGGCATGAAGACAAGGTTGCAGAGCCGTGTTGTGGCACAGTGCTGATCCACACAGACCAGCAGAGCCACATCCCCAAGCTTCCCTTGGCCCATGATCTCCACAGGAACATTCAGGATAATTTCGCCCTGTTCCTCATAGATGCCTGGGAAGAGCACAATCTTATCATAGATGTTGGCCGAGGTCAAGGCACTGCCAAGGTTGTCAAATTCACAACCAGGTCCAACATAGAGAACCCGCCGGTCCTTTCTTCTTCGGAAGAGGTAAAAACAGTTAGAAGACTCCAGTTCCTGGGCATTTTTGGTCCATGTCTTGGCGGCCAAGTAGTGTTGTTTGAATGCTTCTCTCCAAGACCGAGGCTCCACATCAGGCTGATTGGGCCAATTGGGATGTCGGCACTCAACACATCTCAGGCACAACTGGCGCCACCTGGTGCTGTCCAGGCTGAGAATGAGTTCATACCAGGCTTTGCACACGAGGCTACAACGGCCAAGGTCGGGAAGTCGCAGGTAGGCTAAGATCAGACGCCATAGCTCTAGTGGAAGACCACTCACCTCCATGGTCACCTGGGACATAAGAAGCATAAACAAAGGTT a score=1366 s mm8.chr4 45097282 120 + 155029701 GGGACAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGGCAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGGCAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGACAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGT s monDom4.chrUn 101915805 118 - 174229318 GGGGCCATTTGTAGGAGCAGGAGAGGGAG-GGGGCCACCTGAAGGAGCTGGAGAGGGGAGGGGGCCATCTGTAGGAGCAGGAGAGGGAGGGGGCCA-TCTGTAGGAGCAGGAGAGGGAGG a score=6243 s mm8.chr4 45097532 572 + 155029701 ACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGGCAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGGCAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGGCAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGACAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGGCAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGGCAGCCCA-CTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGGCAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGGCAGCCCACTGCAGCAG--GCATGGGTGTGGGGCAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGGCAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGGCAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGGCAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGGCAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGGCAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGGCAGCCCACTGCAGCAGGCATGGGTGTGGGACAGCCCACTGCAGCAGgcatgggtgtggggcagcccgctagagtaggcagggccaactactggaggatactcttaactga-ctcacttcctgcagaagc s monDom4.chrUn 101915785 547 - 174229318 ACAGGAGCGGGAGAGAGGAGGGGGCCATTTGTAGGAGCAGGAGAGGGAG-GGGGCCACCTGAAGGAGCTGGAGAGGGGAGGGGGCCATCTGTAGGAGCAGGAGAGGGAGGGGGCCATC----TGTAGGAG-CAGGAGAGGGAGGGGGCCACCTGAAGGAGCTGGAGAGGGGAGGGGGCCCATCTGCAGGAGCGAGAGAGGGGAGGGGACTTTCTGCAGAAGCGGGAGAAGGGAGGGGGCCATCTGCAGGAGCGGGAGAGGGGAGGGGCCATCTGCAGGAGCAGGAGAGGGGAGGGAGCCATCTGCAGGAGCAGGAGAGGG---GAGGGAGCCACCTGAAGGAGCTAGAGAGGGGAGGGGGCCATCTGCAGGAGCAGGAGAGGGGAGGGGACTTGCTGTAGAAGCGGGAGAGGGGAGGGGGCCATCTGCAGGA-GCGGGAGAGGGGAGGGGCCATCTGCAGGAGCCGGAGAGGGGAGGGAGCCATCTGCAGGAG-------------------CGGGAGAGGGGAGGGGACCATCTGCAGGAGCAAGAGCGGATCGGATCTGAGTACCTGCTGAAGC a score=2544 s mm8.chr4 45151291 128 + 155029701 GGAAATCCAATATAAAGAAAAGGTTTGCAAGAAAAACACTAGAAATGTCTTGTGTATTTACAATAGAATGGAATCCATAAGACCAAATCCATGCACTCACTT-TAGTAGACTGTTTTATTAGCCAAGTG s monDom4.chr8 209355059 123 + 308469712 GGAGGCCCAGTATCCAAAAAAGGAATGAAAGAAAAATTCCTTGGGTATTCTGTGTGTTCATGAAAAAACT---TGCTAAAGCCCATATCC---CCTCCATTTCCAGTAGACATTTTCTTGAGTTAAGTG a score=1779 s mm8.chr4 45156560 59 + 155029701 TTAAAACACTCATATCTGTTATTTTATCCTGTCTCCTCCTTCTCTTCCTCCTCCCTCTT s monDom4.chr8 209355272 59 + 308469712 TTAAGCAGTTCATTTCAGCTACTATCACTATTTGCCTCCTTCCATTCCCCCTACTTCTT a score=7617 s mm8.chr4 45157369 960 + 155029701 TCACCCGGAGGTGTTCAGTGACCCAAGAGTCAGCATC--------------------GCCCTCTGTGCTTTAA--------AGCAAAAATTCAGCACTCCTTGGGGGCCACCAACCCTGTGTCCAGCCCCACTGTTGGGCCCTGGCATTCCTACTAACTCCACCATTATGCCTCAGGAGCAGCTCAATGTGAATTTTTAAGGTGACATCATTCAGGTACTTGGTGGCTTTTCAGATGTGCATACTCTTGATAGCCTAGGCAGTTTCACAGGCATCCTTAAAATAAAAGAAATGTGAAGATCTGAACCTCTTCATTTGCACACTTTTATGACTTTAGAGGGTTTTTCTACTTCAAGAGAGCA-GTGAACTTTTCCACAGGCCACCCCGGACCACTGACAGGAAGAATTCAAACCATCCAATCCTGATGGTCAGAATGAGAACACAATGCACTCTGAACTTAGGAGATAGCAGATGTGCT-AGTGAACCGcctaggttcaaattcagacaccgtctgctgtgaggtgtggggta---agtcttgcttgtaaatggggataatgatggaacttgctttactgggttactgtgacgatcaaacctgctaactagtaagaccggtgcttagaaaatatgctaaccagtgtgggggcagtgcggtctgcacataggaaatgctcagagaaattagccattatCTTGATTAAATTGAAGTCATGTTGTCAGTCTAATCCAAGCGCTTGATTGGATTCAGGAGGCATCAAGTCTTCACAAACTTCATAATTCTAAGTTTCGTTTCTGAGGTGGGTCACTTGCCAAACACATCATCCTAACC-------ACTTTTTAAATGCTCGTTTTATTTACTATTATTGTGTGCATAGGTGTGTATGT-TTGATGTCTGTGTGAGTACAGGTGCTGgtgtgtgcatgcatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgAGaaagggtaacttcaggaggtggatctctccttcca s monDom4.chr3 427210256 885 + 526135210 TAACCTGGATATGCTCAATGACAAGAGAATCCACATTTAAACCCTTAGTTCTGTATTACTCTCTGCATTTTTAGCATATGCAACAAGAATTCAGCATTCTTTTTAGGCCAGTGACCCTGTGTCCAACCCCATTGCTTAGCCTGGGCACACCTGCCAACTTCACCATTACATCAATGGAAGGGAACACACTGTTTCTTCAGTGTAATATCTTTCAAATATTTGGTAGCTTGTCAGTTATGCATGCCCTTGCTAGTTTGGGCTGTTTCACAGGTATTATTGAAGT-----ATACCTGGAGATTTCAGCCCCTTGACTTGA--------GTGATTTTGTAGGG-TTCTCTAGGTCAAGAGAATACCTTGCCATTTTGAATGATTACCTAGGGAGGCTCAAGTGAAGAGCtcaa--tttccagttct--ttgccactacaaagagagcacatacaaatattttaggatatttaggttgttttccctgattagcatatgaaacaaacctaataggggcatttctgagtcaaagagtatacagttttataactctttggacataattccaga--ttgttctccaagatggttg----gattaattc------atagtttcaccaa----caaacaatatatta---------gagtcact-----------------------------atttttccactttccc--tccaatttttgccattttccccttata-------------------------------tatattttagctaattttataggtttgagat--atctcagagttcttttaatta------acatttttccaatcaagaatgacttaaacattgttcatattactatatatca-tatatgcatgtgtatatatgtatttacatataaatatgtata--tatctgtatttgtatatatgtatatatatgtgtgtgtatatatatatatgcatatatatatatacacatttgatttattcatcca a score=-1600 s mm8.chr4 45205534 745 + 155029701 CGGGGTAAGAAAGCTGGG--AAG---CCAGAGCTTAGAAGGGGGGTCATTCCGAGTTCCAGCTTAGGCTGCTGGCCTGGGTGACCTTGGGGTGTCCCTTTCCCCTC---------CCAGCCTCAGTGTTCCCGTGGGG---------------ACGC-TGCGTATCCCCCGGC-----GGGTGAGTTGGGGAAGGCCAGCCGA--GGCAGGGCCTGGGTGGGAGCAGGACCGCCCACTGCGACGGCCCAGGACCTCAGGAGCCCGCGTGGGCGGTGCGTGGGGCTCCT------cccccggggcgggggtcgcggcgccggcAGCT--------GGTGGCCCCGCAGCTGCAG---CCTCAGCACCTGCCGCCGCCAGACGGCGCGG-GCGCAGCCGGGCCCGGCCTCTCCCCCCTCGGGCTGCAGCCGCGGCGCGGGAGGCGGAGCCGGAGCCGAGCCGG-----AGCCCAAGCCGAGCCGCTGCCCGAGCCCGGCC------GGCTACCG--TGGCCG---------------CCGCTGGGCG-----GGGCGCCCCAGCTACTGCTCCCGCCGGCTCCGCGTGCACGCGGGCGGCGCCTCCTCCTCAGGTAAGGGCGAGGCCCCCCGCG---CCGCCGCAAAGTTTTGGGGATACCTGGATCCCCACAGCCCAGGCCTGCGT---CTCTGGGAGCTGCTCCTTGGCTTC----TTCCGCGCCGCCCTCCA----------CGCTGCGCTCCC----GGGTGACCCGCTCCACTCCTCGTGTCCCCTCTCCCGGCGTCCG--TGGCGTGGCCGCCAGCTTGCTTGGGACCTGCAACGGTTAACTCTGTGCATGGGAT s monDom4.chr7 255465161 840 + 262624689 cagggtgaagtgactgggccaaggtctcgccgccaggacgtgggatcgaccccattccaggcccaggct-ctgtccatggtgcctccaagctgccTCCTAACATTGGGAGATGGGCCTGCAGCGCTGTGACCGAGGGGCACCCACGCACGAGCACGCACACGCGCCCCCACGCATGCAGGGGGAGTCCCTGCAGATCGGCCCAACGCCGGGGCTCCAGCTGCGCCAGGAGAGGGAG----GACAAAGAAGGACCTCCAATAAAGGCCTGGAAAGCTCGTTGGGCCACCTGAAGGCTCTCAGGGTCTGGG----AGGACAAGCAGCTCCCTGAAAGGCAGCCAGAGCTTTGCAGAGTCCCAAACCAATGAGCTCTCCTGATGGGGTTCCTCCCCGCCAGACGGGGCCCCCCCTGCCCAATATGGGGGCCCGGCTGGGCTGGGAGGGGGGAGAACCCTGCAGGCTGCCGGCTCTGGCCCTGCCGCTTCCCGAGCTCAGCCTGGAGAGGCCCCCGGATGACCGGAGAGAAAAGAAGGCCGGCCGGCCGGCCCTGAGCGGCCCAGGAAGTCTGCTCTCCGGCTGGGGAGGCACGAAGGC-GCCCAGCAGAGCCAAAGCAGAGAGAGGAGCCCCGAGAGAAGGCCAGACAATGGCCAGGAGGCCGGG-------CAGCAAAGGGCCTCGCTGGCCCTCCGGGGCGGGCCGTGACGTCCAGGCCGAGGGCAGCCCGCAAGCAGAGCCGGCGCCGAGCTCCTCCTGAGGTGAGCCCGAAGGCTTCTGCTGTCCCTCTTCCTTGGAACGGGTCTGCGGGACCATCCGC--GAGAGGAGGCTGAAGAGGGCCACCCTGGCTGCGGGCT a score=9401 s mm8.chr4 45214337 842 + 155029701 CTGTGCTTTTTAGTACATGTCTCATCAGTGCTGCCTAGGCCCACTGTGTCCTCCATGGGGGGTCCTGGCCTGGTGTGTCCTCCATGGGGGGTCCTGGCCTGGTGTGTCCTCCATGGGGGGTCCTGGCCCACTGTGTCCTCCATGGGTCCTCCTGGCCCACTGTGTCCTCCATGGGTCCTCCTGGCCCACTGTGTCCTCCATGGGTCCTCCTGGCCCACTGTGTCCTCCATGGGTCCTCCTGGCCCACTGTGTCCTCCATGGGTCCTCCTGGCCTGGTGTGTCCTCCATGGGTCCTCCTGGC----------CTGGTGTGTCCTCCATGGGTCCTCCTGGCCCACTGTGTCCT--------------------CCATGGGTCCTCCTGGCC--------------------TGGTGTGTCCTCCATGGGTCCTCCTGG--------------------CCTGGTGTGTCCTCCATGGGGGGTCCTGGCCTGGTGTGTCCCTCCATGGGTCCTCCTGGCCTGGTGTGTCCTCCATGGGGGGTCCTGGCCTGGTGTGTCCTCCATGGGGGGGTCCTGGCCTGGTGTGTCCTCCATGGGGGGTCCTGG----------CCTGGTGTGTC----------CTCCATGGGGGGTCCTGGCCTGTTGTGTCCT------CCATGGGGGGTCCTGGCCTGGTG----TGTCCTCCATGG----GGGGTCCTGGCCTGGTGTGTCCTCCATGGGGGGTCCTGGCCTGGTGTGTCCTCCATGGGGGGTCCTGGCCTGGTGTGTCCTCCATGGGCTCTTCTAG--------GCCCTGGGTTG----GAAGG-----CTAAGTGCATTGTTGGAGCCCAGTG---GGATTTGGATTGGTGGTGTTACTGTGTGGCCTGGTGAGTAGCTCTGGAAGTCAGATCCTTCACTGTC-TGACTGCAGCTTCTTAGGTGCTGCTG s monDom4.chr7 255466075 890 + 262624689 CTGTTCCGTGCAGTGGCTGCCCCCGCTGTCCTGGGCTGCCACAGAAGAGCCCCCATGGGTGCTGCTGGCCTACACTGCCCT---------GGGCTGCCCCGGAGGAGCCCCCATGGGTGCTGCTGGCCTA---TGTCGCCCTGGG------CTGCCCCGGAGGAGCCCCCATGGGTGCTGCTGGCCTA---TGTCGCCCTGGG------CTGCCCCAGAGGAGCCCCCATGGGTGCTGCTGGCCTACACTGCCCT----GGG-----CTGCCACAGAGGAGCCCCCATGGGTGCTGCTGGCTCCCGCTGCCCTGGAGGAGCCCCCATGGGTGCTGCTGGCCTACACTGCCCTGGGCTGCCATGGAGGAGCCCCCATGGGTGCTGCTGGCTCCCGTTGCCCTGGGCTGCCGTGGAGGAGCCCCCATGGGTGCTGCTGGCTCCCGTTGCCCTGGGCTGCCCCGGAGGAGCCCCCATGGGTGCTGCTGGCC-----TATGCCGCCCTGGG-----CTGCCCCGGAGGAGTCCCCATGGGTGCTGCTGGCCTA----CACCGCCCTGGG------CTGCCACAGAGGAGCCCCCATGGGTGCTGCTGGCTCCCGCTGCCCTGGGCTGCCTCAGAGGAGTCCCCATGAGTGCTGCTGGCCTACACTGTCCTGGGCTGCCACGGAGGAGTCCCCATGGGTGCTGCTGTCCCCCATTGCCCTGGG---CTGCCCCGGAGGAGCCCCCATGGGTGCTGCTGGCTCCCGCTGCCCT---------GGGCTGCCGTGGAGGAGCCCCCATGGGTGCTGCTGGCTCCCGCTGCCCTGGGCTGCCATGGAGGAGCCCCCATGGGTGCTGCTGGCTCCCGCTGCCCTGGGCTGCCGTGGAGGAGCCCCCATGGGTGCTGCTGGCTCCCGCTG---------CCCTGGGCTGCCGTGGAGGAGCCCCCATGGGTGCTGCTG a score=15502 s mm8.chr4 45222184 796 + 155029701 CATCTAGCTTGCAGATTCCCAGACAGGCAGCATTTTC-GAAGGCAGCGTGGTCCTGGGTCCATTTGTG------TATTTATAGAAGTGAAAGCAAGGAGGGGGAGGAAATAAATTGATTTTTTTTCCCCTTGAACTTTTGAAATTATTTTCTCCACTCCATTTGTAATTGAACCTACGTAGCTATTCTTATTTCTTCCTTTCTTGAGTACCACGTTAGGCCTAAAAATATTAACTGGCTTAGGATGTGGGTTTTGCTAAAATAATTCCCCTT-GAAGTCTTCATGGGGTCC--TCGGATGCTTCAAAATGAGAT------------TTGCAAAGAAGGCTACCCCCTGACATTTATTTTGCCCTTCTGTTTGATGTGTCTTGACCTTCTCTGTC--TAGCATCCTTAGACTCCCATACTGGAGACCACTCCAGTATGTGAGTGGTTGGATAATGGACCCCATCAACCATAAAAGGAAGTGACCTGGGCGGGGGGTGGAGGGATGGGGGTGGGGTGTAGCAGGACTGGGTCCTGTCTGCTGAAGAGGTTGACGCAGGGGCCATTCTGGCATCACCTTATCCTGTAGACGTAACATTAGTCTGCAG---AAAAAGAGATCAGAGCCGGGGAGCATCTCGTTAAATATTAATTATAGTGATGCCTTTTGCCACGCATCTTCAGAGAGCGCTGGGCA-TTCACAGACATTACCTCATCGTTCATCCTCACAGCGTTATTGGGTGAGAAGTCGACAGTAAGGGTTATGGTCTCTGCGCAGGCACGGCATAATAAATATTGTATTACTTTAGATTCAAGT-TGCTAATTGC s monDom4.chr6 29437634 770 + 244784211 CATAAACCTTATATAATATCACATTGGCAATGTTCTCAGAATGAAGAAAGGTCTTTAGTTTCTTTTTGCAGCTATACTTATAGAAATGAAAGC--TTCGGGGAAGGAAACAA-TTGATTTTTTTCCCCCTTGAACTTTTAAAATTATTTTTTACATCACATTAGTAATAGGACCCAAGCAGCTATTCTTATTCCTTCCCTCCTTGTACATGGTTTTAGGACTAAAAATGTTAACTGGCTTAGGATGTGGCTGCCACTGAAGTCATTTCATTTGGAAATGCTTATTGGACTCTGTCCCAGTCTTTCAAATAGGGTTGTGATGCATAATTCTAGAAAAGACTACTTTCTAAAATTTGGTCTCCTCTTTTTCATGTTTTAATCTGTACCTGCAAGTCATCAGCAAGTGCAGCTTAATAAATTAATTGCTTCTTCATTTGGC---------AATGGTGGACATAATTATCCACA------------------------TGTAAGTAT------------CAGTATACCTTGCTTACTTTGGTAACATGAATTTGTTTAATGGACAAACTAGTATGAATTT------TGGGCATGAAATTATTCTACAGAGAAAAGAAAGATCAGA-TCTGGTCGCATCTTTTTAAatattaattaaagcagtaccttttaccacagctctctgaagtggtacaagcatttcacagacattacctcatcattgattttcacaacatttttgtgtaataattatttggcaagtattatgatctccatttGGGGACAGAATATAGTGGATGATGTTATTATAGTTGTTAGCATACTAACTAC a score=8936 s mm8.chr4 45289503 200 + 155029701 GAAGCTGTAAGAAGGCCTGGGAAGTCTCCCACTCATCAGTGACCCC---TCTTCCCCTCTGCTGCCAGGACATCATCCTCACGGTGAAGGAGAAGCTGTCCATCCGAAGCATCGAGTACTTTGCGCTGGCCCTTGAGGAACAGTACAGCATCTCCCGCCTACACCTTCTGCATGAGGAAGAGCTGGTCCAGCAGGTAGGGAGG s monDom4.chr6 29524964 203 + 244784211 GAAAAGGGAAAAAAGAAAAGAAATGCTGTCATTGAAATGTGTCCCTGGTTCTTCTCCTTGCTTGCCAGGACATCATCCTCACAGTGAAGGAGAAGCTGTCCATCCGCAGCATTGACCACTTTGCTCTTGCCCTGGAGGAGCAGTATAATATCTCCAAGTTGCACCTTCTCCATGAAGAGGAATTCATTGACCAGGTAAGTAAG a score=7022 s mm8.chr4 45290976 173 + 155029701 CTTATTGTCTTTGCCTTGGGCA-----GGTGGTAGAAAGGGAAGAATCCCAGGACTCCCGCTGCCTCTTCAGGGTGAGCTTTGTGCCCAAGGACCCCCTGGACCTGCTGAAAGAAGACCCTGTGGCATTTGAATATCTCTACCTTCAGGTGACCAGGCTGTGCTTCCTGGGGTGCCAG s monDom4.chr6 29532374 178 + 244784211 CTAATTGTGTTTAACTTAAACATTGTAGGTGGTACAAAGAAAAGAGTCACATGACTACAGATGCCTTTTTAGACTGTGTTTTGTCCCAAAGGATCCATTGGATCTCCTGAAAGAAGATCCAGTTGCCTTTGAATATCTCTATTTGCAGGTGAGTATATATTATGTCAAGTAGTGACAG a score=9641 s mm8.chr4 45292198 178 + 155029701 TTGCCTAGCTGCTCTGTGTGATCTCTTGCAGAGCTGCAGTGATGTACTCCAGGAGCGCTTTGCTGTGGAGATGAAGTGCAACTCTGCCCTCCGGCTTGCAGCCCTGCACATCCAGGAGCGGATCTATGCCTGTGCCCAGCCACAGAAGATCTCTTTGAAGTACATAGAGTGAGTGGCA s monDom4.chr6 29534584 178 + 244784211 TTTCTCATTGGTTCAATTTTGTCAACTTCAGAGCTGCAGTGATGTGCTTCAGGAAAGGTTCGCGGTTGAAATGAAATGCAGCTCGGCATTACGACTCGCAGCATTACACATCCAGGAACGGATATATGCGTGTGCACAACCCCAGAAGATCTCTTTGAAATACATAGAGTAAGTGGCA a score=1621 s mm8.chr4 45294038 31 + 155029701 CCTCCCACTAGAGAAAGGTACTCCTAATTGC s monDom4.chr6 29538659 31 + 244784211 CCCTCCACTGGCGAAATGGCCTCCTAATTAC a score=10651 s mm8.chr4 45294108 199 + 155029701 CTCTTTGTTGGAACCAAGTGCAATGTAAACATGTGAACATGAGTCCTTGTCTCCAATGTCTTGCGGCAGGAAAGACTGGGGAATAGAGAATTTTATATCTCCAACTTTACTCCGAAATATGAAAGGCAAAGACATCAAGAAAGCCATTAGCTTCCACATGAAAAGAAACCAGAATCTGCTAGAACCCCGGCAGAAGGTA s monDom4.chr6 29538732 183 + 244784211 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s monDom4.chr3 136845176 1086 - 526135210 attttattaatttctcctttgatttttaggatctctaatttagtcttcatctgaggatttttaatttgtttacattctagttttttaatttgcatgtccaattcattgagctctgccctccctaatttgtta-atatatgaactcaaggatataaatttccc-cctgagt-------------acttctttggctgcatcccagagattttgaaaggaagtctcat---cattgtcattttcttcaatgaaattattaattgtttctatg----atttgttctttaactagctgatattggagtattgtgttgtttaatttcccactaattttt------tatttgcctctccatgtatccttactaatt--------ataattttcattgcatt--gtggtatgagaaggt------tgcatttattatttctgctcttttgcatttgtttgcaatgtttttatgc----cctagtacatggt---caatctttgtgaatgtaccatgtgcttcagaaaagaaggtatttttctttttgtccctattt--ctttttcttcgcatatctactaactccaatttttctaagatttcat----------tcacttctcttacctctttcttatttatttttttttgtttcatt--tatctagttctgatagagg----------aagattcagatctcccatccttgagctccactag-------tttctcctttagaaatttggatgctatgcca----tttggtgcatacatgttgagtactgatatttcctcattgtctgtactgcctttt------atcaagatgtaatt-------------------acctccctatctcttttgactagat--ctattttt--tactttggctttgtcagat----atcatgattgctactcctgccttct------ttttctcagttgatccaatagatttggctccatcctcttacttttaccctatgcatgtctaccttcctca---------------------tgtgtgtttcttgtagacagcatatggtagggttttggtttctaatccactctgctattctcttgtgttttatgggtgagttcattccattcacattcat-agttatgatta---ccagctgtgt----------atttcccagctttttgatttcc--------actcctagtcctgcct-tatcttctttcactatttccttctagagcaatgttttgtt 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monDom4.chr1 714356336 151 - 748055161 tttggatcttgagcttggaaatatagctcaaagctttcttgaattttcccccagaatctggggtaaaggaatacatcc-------------ataaaatattgttactcaagtgtttatagatgtttatagtgttaatgtgtTAATGTGTtttatatatataata a score=9616 s mm8.chr4 46261907 692 + 155029701 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s monDom4.chr6 32161487 1783 + 244784211 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TCCTTACCTGGTGCAGGGGGATGACAAGGAAGGCGCCCCCGCCGGCACATTCAGTGACCACAGCGATGAAGTGGGGGTTCACGGCACAGAAGTGGTTGTCGTGGACGCTGCGTGTGATGGGCACAGAGTCGTAGCAGTTCTCTTTGCTGGCGGGCTTGCCGTAGACATGACGGAACTTGGAGCTGCGGTACTGGGGGTGCCATGACATCTGTAGGGGATGGAGG s monDom4.chr6 105785298 224 - 244784211 TTCTTACCTGATGTAATGGAATGACGAGGAAGGCGCCCCCTCCAGCACATTCTGTCACGACGGCGATGAAGTGGGGGTTAACAGCACAGAAGTGGTTGTCATGGACACTCCTGGTGATGGGCACACAGTCATAACAGTTCTCTTTGCTGGCAGGTTTGCCAAAGACATGGCGGAACTTTGAACTTCGATACTGAGGGTGCCATGACATCTGCCAGAGAAGAAAG a score=7656 s mm8.chr4 46626846 233 + 155029701 GACAGAGGGCTCGGTCAGCTGTCGCCTTCTCCTTCGTCCTCGCTGACGCAGCCCTCTGGCGGTGCTCTGCCCAGGGATGCCCGTCTCTGCAAGTACTCCACTTTCAGCAGCTCTAGCTCGCGCAGCTCCGCCTCCAGTCGCTCTCGGTGGGCTGCCCGCAGCTGCCGCAGTTGCTTCATGGGAAATGGGTTCATGTCATTGAAGGCTATGCTCATGAGCTTCC--TGAAAGGAAG s monDom4.chr6 106001089 233 - 244784211 GGCAGAGGATGTGTTCTGTTA--AGTCTCTTCTTCATCCTCACTCATGCAACCTTCTAGTAACTTGCTTTCCTGCCTGGCTCTCTCTTTCAGGAATTCTGCTTTGATGTGTTCTAGCTCTCCAAGTTCAGTCTCTAGCTTTTCCCTGTGCACAGCCCGCCGGTTTCTCAGTTGCTTCATGGGAAAGGGGTTCATATCATTGAAGGCAATATTCATCAGTTTACTGTGAAAGAAAG a score=7737 s mm8.chr4 46627477 153 + 155029701 CTCACCGGCTGTCGCAGATGGTCTTGGTGAAGAAACGCAGGTACTGGTAGATCTCCAGGCTGTCCTGGAGTTGCAGGATCGCTTCCTCATTGTACTTGAAGATGGCCAGAGCATATCGGAACACCACCTAGGGCACAGTGGGGTTCAGGTGGG s monDom4.chr6 106005069 147 - 244784211 CTTACCGGCCATTGCATATTGTTTTGGTGAAGAATCGAAGATACTGGTAGATCTCAAGACTGTCATGAATCCTTAGTATTGCTTCTTCATTGTACTTAAATATAGCAAGGGCATATCGGAATATCACCTGAAAT------GGGTTCAAATGTG a score=730 s mm8.chr4 46627933 131 + 155029701 GGCTTGGACCAGACCCAGGCTCCA---GAGGCAGGGCCGCT--GCTTCCTCTCATATTGCACAGAGCACTTTACAGTTTAGTATCACAGATGGCTCTGGCAGGTGGCCGTCTTTCCGTTCAGTGGGACCAGGCACA s monDom4.chr1 727642861 126 - 748055161 GGCTCAAATCAGAGC-AGGCTCCAACTGACTGAAGGCCTCTCGGCTTCATTTCACCTCTTACA---CTTTTTTCTGCTTGAC-TTAAAGA-----CTTGCAGGGTACAGGGTGGTCCTGCAGTACCCTCAGACGCA a score=10921 s mm8.chr4 46628064 195 + 155029701 CTTACCTTGGTCCCTTCATACAGGAAGGCATCCCAGACCCGCAGGAGGATGTCACTGATGAGAGAGTCGGCGAAGACCACGAGGAACCAGTTGAAAGTGATGAGAGAGAGGTCTACACGGTGCTGCCCCAGGTGCGCAGTCAGTCGGGGCAGCTTCTCCGAGAGGAGGTCCTGGAGCACCCGCTGGTCCACCTGG s monDom4.chr6 106006928 195 - 244784211 CCTACCTTAATTCCTTCATACAGGAAGGCATCCCAGACTCTGAGCAATATGTCACTGATAAGGTTGTCCACAAAAATCACAAGGAACCAGTTGAAGGTGATCAGTGACAGGTCGATTTTATGCTGCCCCAAGTGGGCCATCAACCTGGGAAGCTTCTCTGATAAAAAGTCTTGGAGAACCCGTTGATCTACCTGG a score=8046 s mm8.chr4 46630077 128 + 155029701 CTCACCTGGGATGCAGTCAGTGTCTTGCTGTAGTACTCAGCCGGCAGTATGGTCTCCACAATGGCCACCAGGCACCAGAAGGCACTCTCCTCATCTTCTAGGACCAACAGGGCGATGGCCGCCAGCCT s monDom4.chr6 106009886 128 - 244784211 CTCACCTGAGATGCAATTAAAGTTTTACTATAGTAATCTGCTGGCATTATGGTCTCAACAATACAAACTAGGCACCAGAAAGCGCTTTCTTCCTCTTCTAGGATCAACAGAGCAATGGCTGCCAGCCT a score=17502 s mm8.chr4 46635040 528 + 155029701 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GACTCACCTGTTTAGCCCTTGACAATAGCCGATGGTAGGGTTCTGCCAGGAGAATGCAAGTAATACTCTTCGGAGTTTGGAGATAAATTTAGAAGTGGGGTTTGTAAAGTGCTTATTGTTAGTTAAGGTTCGATTTAAGTCTAGCTCAATCTGCCGAAAGGCTGGGTGCTC-CATGGTTTCACATTTTCTGAGCAGAGAGTC---ATAATGATTGGGTGCTTGGATAGGTTTGACTCGGAGGCTTATCATCCACTTCCAGACCCGCTGGCGGTGCTCAGGGGGGATGCCACTCCGGATCAGATGCTTCAGGTCTGCAGAAGGCATGAGTTCCCCAATACTATTCCATTTCTCACGGAGTGGTTTCTCTACTGCCTCATGGTTTAAGAGATTATTAGATCTTATTTCTAGAGCTTGGATTTTTGCCAGAAGTTTTAAGTCCTCAACTTCATAATCAGGGACAGTCATGAATCCGTAGTCGTCATATTCACT-ATTGAGAAGATAGAAAGTTGACAGTGCATtatgtgtatgtg a score=-1552 s mm8.chr4 46635812 310 + 155029701 cttgcttagggacacaaagcaaa-----cctggaagacaactgccagtgaccctg---gagcccaacagacaca-----acttcctgcttgctgtgcccaaccaGGGTCTGGCTGCAGG--------AGGCAGCTTGAGTAATTGTGGGCGCGGTGGCTATGTGGTCTGTGTGCCTCCAACAGGCCTGCCCCCCTCA-----------------------GCTGTGTGTCCCGCATCCTATGT-----GCCTGAGCCTGGGGAGCCCA--CAGCTGTGTAGTGCTGGCATGTGTGGCCAGCGGCACTAGCGACAAGGATCTCACCATTACCGCTCAGCCCCTCCCTGG-TTGCCCACTGG---GT s monDom4.chr1 727650117 348 - 748055161 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ctttcctttttttccttttttttcatttttttttGCAAGATTCAAATTTCCCAGCTCCTTGTTGGTGGAAA--TTCGGGAAGAGATAATTTCCATTGATCTTCGTTGTGAAGAAATAAAAATTCCATGCCTAAGGCTACAGGGCAGACTCAAGGCAGCTTACTCTCCCCTCCACCTGAGTTACACATGAG-----------GATAGCCTCTGCATCCAGCTTCTCCGGGGTAAGAGCCGATAGTCTCCTTTGAGTAGACTTCTATGTTCGATGTGTCTTCTGGTCCTTGAGTCATTAACCCACAGTTTAGGAAGCACTGATTTTCCACACTTACAGGCCCGAGACCATGACTCGGAAAGGTGGCTGCACATGTCTGTGCCGAGGACTGGCAGTGGGGCTCACACATGGACTGGCACAACTGGCATCCACGCCTCCTATTGATGGTAAGTAGGCATGGTGGAGAATGGGAAGTTGTAAGGACAGCCGACGCTGTATGCTGCAGAG-AGAGGGGAAGAG a score=8581 s mm8.chr4 46688552 210 + 155029701 ACGTGACCACGGTTCTTCTGGGGAAGGCACTTACTGCTCTGGGGAGTTGATGTCCTCTATGGGGTCTTTGCATGTTCTTGAGGGCTCGGTCGTGTTCCACTGGAGCTGAGGGTTTTGATCGAGGTGATTTTTTAGAATGGCCTTTCCTCCATCTGTTGGAG------------ACAACATCACAACTTTTGTTAGGTTGTTTTGTTTTGTTTTAAAATCAAT s monDom4.chr6 86129823 219 + 244784211 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monDom4.chr6 86142415 268 + 244784211 TACCTCTGTGATTTTCATTCTCAGGCGATGATTTTCAGATTGTAGCCCTTCTAGTCGAGATGTGCTGGCCTGGTTCACACTGGTGACTGATGTGGATGTTTTAGAATCTTCTTTCTTTTGATTTTGAGTGAATTGGAATCTTCTGTTCTGTGTTGCTGCATCTGGGTTGGTCCTTAGTGTGATGAGCTGAAAGGGGAAAAACAGAGGTGAAAAGAGACCTCAGGAAGGTTGTTGGTTTGCTCCCACTCTACTCCTCAATCATTCATAT a score=1665 s mm8.chr4 46701155 82 + 155029701 GGAAACACATCAGGAGCGCCCAAACAAACATTAATAGTTTGTTAATTTGGGGTTGATGAGTTTGTGAAGTTTCTGGGGTCCT s monDom4.chr6 86143165 74 + 244784211 GGGGGCATGTAAGCTGGGCCTAAA--------AGGAAGTGGAGGATTCTGAGTTTGGGAGTTTGAGAAGCCTCTGGGGTCAT a score=16412 s mm8.chr4 46702201 309 + 155029701 ACCTTTGGCACAAACACCAGGCAGAGAGTGATGGTGCTACAGAAGATGATGACCAGGGCCACGATGCAGAACTGCACGTTGGGCTGGTCACGTGTCAGGAAGGAGACGGCGGCCCCGATGATGCACATGATCCCCACATTGTACACACTCATCCCAATGTACTTGCTGTCGTTGAGGGCAGGGATGCTCACGTTGCGGGTTTCCCATGCTAAGAAACAACCGAACAACTGAAATGGTGAACAGAAAGGAGAGTCAGTCATTAC----------TGGGAGCAGCCCGGTCTTCACTGCTGGGTAAGCTGCAGGAACGTCT s monDom4.chr6 86149344 319 + 244784211 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ATACCAACCCTTCCTGAAATGGTCTTGATCTCTTTTGAACTGAGGGGTTCAAAATCCACTCCAATATAACCTTCCATAGCTGCTAGGAGATTTTTGCTGAGGCAGGGAGATGGATTGCCTTCAGAATGTGCCAGTTCCCACCAGGAGGGCTCATACCATCCAGGAATGATCCACTGATACTTGCTGCCAAACATGTTTTCATGATATGCCTACA a score=15264 s mm8.chr4 46842915 621 + 155029701 GCCTGAACATCCTAATTAGGTTAGAAATGAACTCAGAGCAAAGCGAGTCCCCAGCTCTCCTACGGAAGCCGAGGTGACCTACTTTGTCATTCAAATGTA-CCACTATATATAGCGGCGGATTGTGCTG-AAATGTCACTCCACTTACCTGACTAAAAC-GTATAATTATAGATTTACTTCTATTCATTCATGAAATGTGTCTTCACTTGATTAAACAGTTCATTCAAGAAAAATCCATTAACACACGGAGCATGTTCAAATACGGCTCCTTCAATGCTGAGGG---CGCCGACAGAGTTAAGATGCTAATTAGGCTAAATAGGTTTTGAAACATCCCAATG-TCTGAATAATTCAGGTCACTTTT----TAGTGGGGCTTCAGCTCCCCAGGAACTACCATTAATTTAAACTAATTAGAAAATTAGCACAGAGATGATCAAGGCAGGAAGAGAT--GGATGGCTTT------AAAATGGAAGAGCTGTCACA-GGAAGAGGGGATGCCTGGTCTGGACGTCCTCAGCAGCCAGTGAGCCAACAGTTAGAAGGAGATTCTGGCCCCAATCCAGAAGGAGGAGGAAGCAGAGGCAGGAG--AATCGGATAATGACAT---AGAAAATGAAGATGATGAAGAAGAAAAG s monDom4.chr6 86521454 608 + 244784211 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224 - 244784211 ACTAATGAGCAACATCTAACTGCTATTTTTAGGATTCATGAAGAAGAATCAGCAGTTGTTTGTCCTGTGATTGATGTCATTGATTGGAATACATTTGAGTACTTGGGAAATGCAGGGGAGCCACAGATTGGAGGTTTTGACTGGAGACTGGTATTCACTTGGCACGTAGTGCCACAGCGGGAACAAAAACGAAGGCGCTCCCAGATCGATGTCATCAGGTCAGG a score=10268 s mm8.chr4 47133378 206 + 155029701 TTTGTGTCTCTTGCATTGAAATATAGGTACTACTTTTTTCTAGGTCTCCAACTATGGCTGGGGGCCTGTTTGCTGTGAGTAAGAGATATTTTGATTATCTGGGGTCTTACGATACAGGAATGGAAGTCTGGGGAGGAGAAAACCTTGAGTTCTCCTTTAGGGTGAGT-----AGTCTTTTGTTTGGACTCATTCTGTGTTCTAATTTCTCA s monDom4.chr6 102600744 209 - 244784211 TTTTTGATGCCTACATTAGAATCAATATTTGAATATTTTTTAGGTCCCCAACTATGGCTGGTGGACTATTTGCTGTGAATAAGAGATATTTTGAGTATCTTGGATCCTATGATACAGGAATGGAAGTGTGGGGAGGAGAAAACCTTGAGTTCTCATTTAGGGTAAGTGTTACAATGAACTATTTGAATGAAATTTTAGT--TAAATTCTCA a score=9173 s mm8.chr4 47134782 414 + 155029701 ATCCCTTGCTCACTGTGTGACCTCCCCTCTCCACCTCCATTGCAGATCTGGCAGTGTGGTGGCACTCTGGAAACGCACCCGTGCTCCCATGTGGGCCACGTCTTCCCTAAGCAAGCTCCCTATTCCCGTAGCAAGGCCCTGGCCAACAGTGTCCGAGCTGCAGAAGTGTGGATGGATGAATTTAAAGAACTCTACTACCACCGCAATCCCCAGGCCCGCCTGGTGAGTGAGAAAACCTCTTCTTCCATTCATGGATAGGAATACCcagccagttctcacaatccacagagccatgttttataaaagctgctacaaatactgaattagtgattttcatgccattgcttctagcaatattaggttcctgtgaggctcacttcaggacataccattcatgtgctctgtttgaggact s monDom4.chr6 102615916 390 - 244784211 AGCACGTGCTGACTG-ATGATTTACCATCAATGTTGTGTGTTTAGATCTGGCAGTGTGGAGGAAGTCTTGAGATCCACCCTTGTTCTCATGTTGGTCACGTCTTCCCTAAGCAAGCGCCTTACTCACGGAATAAGGCTTTGGCTAACAGCGTCCGTGCGGCTGAAGTCTGGATGGATGAATATAAAGAAATTTATTACCACCGTAATATGCATGCACGTAAGGTGAGTTTGTAA-------CTTGAATTCCTGTGTAATGA-ACCCAATAAG-AATCAATTTCATTTTGATTTTCCTCTATTGATGCTGCATTAAAGAATG-----GTGTTTTCCCCCTCATCCCTGCCACC---------TTTTTTTCTGGCTCATTAGCTCAGCTATCTTCAAGCTGTTTTACTTCATAACT a score=7976 s mm8.chr4 47138989 194 + 155029701 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tccctcccttccctccctcccttccttcctttcttccttccttctttccttcAGATAAATC--CTAAGCTTTATTCTTTTAAAAAGGCAAGAACCTCAATCAACTATTGAACAACAGACCCAAAATCTGTCAACAATCCCTGGCCGTCTTCTTGCTTGGTGACTTGGGACCACCCTCACTTGGCGACACTGGGATTGCTCCTTCTGCACAGTTCCCAGGGGTCTGGACAGTCTCTTGAGTTT--TTGGGAATCATTCACAGGTAAGCAGGTCAG--------------GTGAGATA--------------CCTCACACAG---AATAATTGAGAAGCAGGAGC----AAGGAGGGTCTGTCCACTGCTGGAGA-----TGGGGAAGACTGGGAGGTGCTTGC---CTCAGTTCTTCATTGTCTTGTT-----------CACTGGGCTGCAGCATCTTCTCCGTC-------------------------TCTCATTCTTGGCAGTAGAGAAGTAGATAATAAGGTCGAAGTGACCCATGTAGGAACAAGACGAGTTGCCTTGCTGGTTCATAAGATACTCCCTCTTAGTGGTGTCCATGTGGCCTGTGCCTATGAAGTTGGA-------------------CTATGGATGGTACATCAGTCTGTCATTTTGTCACTTCCAGACCAGGAGCTTCTGCTTTCAAAGTTCAAGAGGAGGA s monDom4.chr2 422310552 678 + 541556283 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monDom4.chrUn 12169575 553 + 174229318 ttgacagatgaagttgagtcttagaatcttgtcctgagtcacactggcaagaaatgtccaaactagaccaaaacacattgtctgtggacttgaagtctaacctctcccatactctatcatgccgtctccctTTATTTCAAG---TGCAATGCTAAAAGTTTGATTTAAATTTACTTGTGGAAAGGTACTATGTATGCATAAATGCAAATGGCTTGCACAACATGAAGCAGGTGTGACCATAAAAAGCTGCTTAGTTTTAGTGAATCTCATTACCACTGCCAAGACTCATCCTCATTATTTATCCATCCCCTCAGTTAGCAGGTCTTTGGTGGGTTTTGAAACCTACTGCGCGTAGATTATCTAGTTCCTGGGAGGACCTAACAGTCATAAACTGAAGCTCTAGTTCCTCATTAGGTCAACTGAGGACCGAGAGCAG----GGACTTTAATGGGTAAAATATTTGTCTTTTGTTCCCCAAGAGACAATTGGAAGTGACA--CTGA-AATTCCCCAAAGGATGATGAAAAGAAGCAAATTAGTGATGTGGAGTGTAAATAGGTCA a score=11224 s mm8.chr4 48812278 442 + 155029701 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GATGTTTATGACTttgtt--ttaaga--caggtttttgcttcaaagcccaggctggc------ttcaaattcacaatcttcttgctccagtcacccaaattactgagacttcaggcatgccccCACTGCACATCTG-TTTAAAGCTCTTTATAGCTTTTTTTCTGTTTGCTTGTGTTCCTTGCTCTCTAT s monDom4.chr4 405211633 155 + 430141050 GAAGGTTTTGATTTCCTTATCTAAGAAGCAGATTTTGG-------GCCCAGCCTGGTACATTTTTAAAAATCACATTCTATTTTTTCC------CTTAATTA----------------------AATGTAAAAATGATTTTAAACTTTCTTTAGATTTTTTTTTGAGTCAAATTGTTTTCTCCTCTCTAT a score=1619 s mm8.chr4 49545631 84 + 155029701 CCACCACCTCCCCCCCCCCCTTCATTTGATTGATATTTTTTCTTTTCACCTCTATTGAGTATCACATTTGCAGTTTTCTTCTTT s monDom4.chrUn 127268734 84 + 174229318 CCACCACCGCCTTTTTTTTTTTGCTATTACTGATTATTTTTATTCCTCCCTTCCTTGAACTTCTATTACTTAGTCTTTCTCCTT a score=1808 s mm8.chr4 49546154 233 + 155029701 TTCAGCTCTTTTCTTTATTTAATATCA-AGTACAGCTTCTCACTGTTCTTTATTTTACTCCTTCCACGGTCTCTTCAATAGATGCTGCTTCCGTTCCCTTGATGAGTGCTCCCTACCTTGATGAGTGCTCCCTACCTTGATGAGTGCTCCCTTAACCCCAGATCCCTGTGCTCTTCTGCTCCAATGTACTATTATCCACTTCATCTGATAGTTTTCAAAACATATCTCTTTATA s monDom4.chrUn 85776928 223 + 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ctatacctttccagtagttatcaatttcattaaaaattgattttg--gacagtctaagaggtaaaacaatta------gagttgctttctggttaatttctttagttattagtgat-ttgaaaccttttctcatatgtga-ttattgatatcttatat-------ttctttgtttcagaattgacttc------atggtttaactattaggttgtcatttcattcttttatctctgaatcagttccttgaatattttggatattaga-cttctatcaggagttt------cctacaaagatactttc------cctccccatttaactgtt---ttaatctcattttttcagtggaaaacttttccattttgtgtaat---caaaTTGTTTATTTTGTT-TTATCTTCC--------CCTATCTTTGAT-------------TGCAAAAAGTTCTTtattttttgctcatataatttatgttatgacttttatatatcagtcatcaattcattcagaatttcttttgctatatggtctgagatattTTCTTGTGAGAT-GAGAGTTGACTCCACCT-----AATTCCCTTTTCTAGGTGGATCATCATCT------------------------TCTTAACA------------GAGGAAATA a score=159 s mm8.chr4 49550003 80 + 155029701 CACATTAGCTATAGTAGGTTGAGTTAGCTTGATGACCGTGTTTTTCTAATAATTTCTCCTT-TTCATTAAAGTGCTTGGCT s monDom4.chr3 432014957 81 + 526135210 CATACTAGAGAATGTTTATTTCATTGGGTTTTTCATCTTCCTATCCCAATAATCTCTTCTCAGCCAGAATAAAAAATAGAT a score=132 s mm8.chr4 49550083 194 + 155029701 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s monDom4.chrUn 169355666 2778 + 174229318 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TAAACGAAGTTGATATCTTTTGAT------TTATACAATTTTAATTT--TTTGCTCTTCTGAACTTGTGTACCATCAATAAACAAATATTTCTGAATATAAAGAACCACAGCAAA a score=669 s mm8.chr4 49554465 273 + 155029701 TTTTGGGCTTGGACTTTGGCCTTGTCTTCCCTATGATGTTTGAAATCCTTTGAAAGATTGTCACATATGTCACATACAGTGTGAATTTT----TAAAAATAGT-ATTTTTGTAAAGTGT------AATGTAGGCTTTTTTAAATCCAGGTTTCTCTCACAAGTCTTTTTAGATTGTTAATGGTTCCCCTT----GTCTTTGAAGGTCTTTCAGTTAAC------GCCACATAATTACAATTTGTTTTAGTTTTTTTTTCTTCTTTCTCATTTCTCTTCCCCTGTTTCTCTAACT s monDom4.chr1 591076894 271 + 748055161 tctgaggctggaaatctcatccagctgccCAAATGATGT--GGAGGTCTTCCAAATCTATTTAGAGCTG----ATTCAGTTAGACTCTTGTCATAAGGACAGTGACATTTTCTAATTGCTTCTTGAATGTAG---------AGACCATGTTTTT-------GCCTTTTTTTATACCCAACAGCTTACCCGCAAATCCTTAGCAGACATACTTGTTGACTGAGTAACCA-ATTATACCAACTAGTATTCTCTTTTTTTTTTTCTTTTCTATTCCTAATTGTGTCCTTTACTGACT a score=797 s mm8.chr4 49554738 97 + 155029701 CCCCCAGTCATGCCCTGATTCTTGGGGGGGGAGGGGAGGTGGGA---------TATCAAATTTCTAAGTTTATTACTTTCACCGTTTAGGCAATTCTTTTTTGGTT s monDom4.chr4 347619214 100 + 430141050 CCTCCTGCTGCTGCTGGCTTCTTGCTGGAGTTGAGGAGCTAGGAAGGCTCCAGTCACAGTTCTGTAATTTGTGCACGCCTGCTGGTGAGG------TTTTTTGGTT a score=1285 s mm8.chr4 49554897 104 + 155029701 ACAGTTTGTTTTCTGTCTCTTTCCCTTGATTATTTCTAGTGTCACTTAAATGTCACCTCCTCCTGTATTACAAGTACCTAGTTGGCAGCTTCTCCCCACTTACC s monDom4.chr1 692587301 100 + 748055161 ACATTTTCTGTTTAGGCTCTTCCCTGTGCTTAGTTCTTGGACCACTTAAATG----CTGTTCATCCTTAAAATCCATCTAAAGTGCTCCTTTTAAGAAGTCATC a score=1875 s mm8.chr4 49555010 140 + 155029701 TCAGGGTCTTGTTTTCCTTTACT------------ATTTAAACTTGTTTGGCA--------------TGAGGATATCATATTTCCCCTAAGGACAAAATTTCTTGTACTTTATAAG--TTTATAATAAGATTTTATTTTAGTATCTATTTATTTGATGATCAGAAAGA s monDom4.chr4 405014729 166 + 430141050 ttggagacttggtttcccttacttgcattcctacagtttgaaattatacaaCACCTTACTGAATGAATGTGGGTA--AAATTTCACACACAGATCACATTTTTCTCACCATCAGAGAATTCATACTTAAGTTTTATCTTGACTATGAATTCTCTGATGATGAGAAAAA a score=200 s mm8.chr4 49555150 168 + 155029701 TGGTAGGAACTAAGGTTTAAAGTCATGTAACGGTTCTCGTCATGTTACTCAGAATTCAGAAAATTAATGTAAATAAGATTTCAAT------AGGTTATAGCCCTTCAGTACAAAAGGTATATCAGTAGCTAGGCAAAGTACCTTATATAAATCCTCTTCCCCAGGAAACTGTAA s monDom4.chr1 692587537 158 + 748055161 CTGTTGTACCTAAAAGT----ATTTTTCCCCAGGACCTATTATGCGATTCTTCACATAGAAGATTATTG--AACTGAATTTAAATGAATTGAGGACATGAAACTTCTATTTAAAATGTTTATC-------TGACTAAATATC---AATGAATTCATATTACAGAGAGACTATAA a score=1596 s mm8.chr4 49555467 105 + 155029701 AAAGCTCCTTGTCATTACATTAAAGCCTATATTATCAATGTTCCAAGTTCTAAATTCTAATCTGTGAAAACAATGGCAGAAACATTTGACAATTTCAATGCAAAA s monDom4.chr2 253035403 98 + 541556283 AAATATCTATATGGCTATATTAAG-------TGATTACTAACCAACTTTTTACATTTATGAGGAGGGATACAATGGCACAGATAACTGAAAACATCAATGCAAAA a score=8039 s mm8.chr4 49555572 211 + 155029701 CAAAATTTGAATGAAAAGCAGTGCCTTCTACCAAAAACTGTCTTGAAGACATCACCTGGTTCCTGGAATATAAATCCAAATTCCAATGGCCTACCAATGTGAAT---TCCACCCCCAGCCCCACCATTTCATCCGTCTTTGTCATACTTTGTCACA-----------------GATTTGATA---------GCACCTTGGCTACTTGTTTGAATTTTCTTT---CTAGTTCATTATTCTCTGG s monDom4.chr2 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monDom4.chr6 159653405 180 - 244784211 tctaggttgacaAATTATACTTT-CTCCCAAAAGCTACTGGAAGATACTGTATTTTGTT------------TCTCTACTGGCCCCAGTTTATGAGGCTACAGTTTCTAGCTTCACCTAGCAATGCT--------------------CTTTCCTTGAACCTGTAGTTGATGGAGTTTCTAGTGTAATTTGTCCACAGAAACTCAGGATTTACCT a score=3028 s mm8.chr4 49557658 599 + 155029701 TTTTCTTGGATGAATGTTCTGGAA-----CATAGGGAACTG---GAAGTGTTGAGAGACTAT-TGGGTGACATGCTCATTCTTGGGTTTCAAAGCTGATTTGGCTTTTCTCTTGTGTTTAT-GATTCACA-TGTGTTGTGTTTTCAGAAGTTCAATCAAATGTT-ATCTAATTTCCA----GGGTTGACTGAG---CCATTCA----GGTCTCCAAAATATTT---AGGAGAACTGGAGCCTGGCTGGTGGTGACAGTAT-CTAATAGGTGTAGGAGGCTGTGAAGAGCGACTGGGTGGCAGCAGCACCTGAAGAGCCTGTGTGAACGTACTGTCCTTGGGCCGCCTGGCAGTTAGCCTGAAAACCAAACATAAGAGAAGATACTGAATTAAAGAGCAACAGCGCCTGGTTTGCTACTCTCTTCTACTCATTTGAAACCACCTACCCTTCCATCCAATTATATTAACTCTTCATAGTAATGCTGCTGAATATT--GCTGTTGGTGTCCCTTCCTTCTGTCTTCTCCCTTATTCTCCCAGTGTTCTGGT---TATTTGTTTGTCAGGTTTGAGGC-TCATATTACTCACTGCCCGTTGCTTCCCTCCTTCC---------------TGTCTTTCTAAAAGCAACAACA s monDom4.chrUn 12970280 590 + 174229318 TTTTTGTGAAGATCTGTTTTAGTGAGAGTTACAGGGAGGTGTAGGGAATGGTGAGGAGCTATGTGTGTGTC--------TCTTTATGTGGAGAG---AACTAATGTTTATTCTGAGATTACAGATTTAAAGTGTGTCGTGTTACCAGTAAGTCATCAGAATTTTCACACAATTTCCACTCTGGGTGGAAATAGATTCCCTTCCCAGTAGCCTCCTAATGACATGCAAAGAGGGCAGTGGTGGGGAAGAGGTCCCCAGGACACTAATAGGTGTAACTGGGAACGAAAAGGGATTGGCTGGCAGCAGAACCAGATGAACCTGAATGAATATACTGTCCTTTGGCTGCCTGGCCATTTGCCTGAAA------CATAAGAAA------------AAAGAGGACCG-----TGGTTAATT-------TTTACAGAACAAAAACCCCAAATGTTT--GTCCATGTTTATCAAGGCTT-ATCCTAA--ATGATCAATACTAAGCTGTC----------TCTTTTTTCCCCTTCCTTTGAAGTTCATAACTTTGGTGTATATTTAAATAGCAATAATAATACCTCATATTTCT-ATAGCACTTTGTTTTCaaactgaggctgaagagctcaagtggcttactcaaggtcacaaaa a score=-3430 s mm8.chr4 49558280 560 + 155029701 TAGGTTTTTCTAGCTTCAATGGCCCTCAATTCCCTAACCTCACCTTCATCTTGGGCTGCTTTTACTTGACATTTGTTCATACCATCCACTCTCCTAGAGCTTTAAACATAAACTCCCTGCACACAGTGCCTGTATCTGCTTTGTTCACCCCAGTCCTTGGATCAGAGATGATTTCAAACCTAGTATTTACTAGTAGAC-TAAACTCATTTTGGTCCTTGTTTCTCCTGAACACCTTTCT-GGGTCTTTTCCCAATCCTTTTGTTTTTAAGTAGAATAGCTTTTAtttattctttgacgatttcgtatgtgtaaacagtgcatcttgatcatagaggtaaccccggtcccacttcctccaggaatccccagtacttcacctctgtgcttcgtgtcctgtccattttagtttttgtc---aataacccactgagtctacttagagctgc-ATGTTGAAATTCCTAACAAAATCCTTAAATGAGCACCT---TTCTCTTTGTTGGAA--ATGTTTGTTGAGGAGCACTGGTATACTCCTCAATGCTAATCTCAGGACCTTCGATTTTAATTTCT s monDom4.chrUn 12970900 493 + 174229318 cagattttcttggtttcaaatgc----aaaatactatccttgggatcacct--agatgcTTCATTATTTTGTTTGCT-------TCCCCTGTGGGGGGCACTTCTTTCCTCACTCCCATAACAGCAGCCTCATGTTCTTTCTCATAACTCCAGGTCC------------GATCCTAGCCCCA-----TCCGTGTGGATATAACCTACCTTTTGCCTGCGGTTTCCCTGTCCTTCTCTCTCTAGACTTCCATCTGTCCTTCATCTGTCAGCCACACATCCCTGGGGTCACTCCCTGG----------------------ACCTCGCCATCACAGAG-------CACTCCTGC--CCTTCAGATTTCTCCAGT-TTGGGACTCCCTCTGGCCGACCATGGTCACTTTATCTTCTGCCTCTCCTAATTCAATGAATGTA-----AACTGCTGAACTGGAACTCT-------GTCCTCACTGCAGCTTCCAGGTTCTCAGagtagaaagaatactggctttgaggtcagagaa----cctgagtccaagtcccagttcttctgttttctactact a score=12184 s mm8.chr4 49558900 712 + 155029701 TACAATGCAATTGCTGGTTTTCACCATGTCCTTTCTTGTGACAATTTCCA-----AATGAAAGGCATCTCAAGTTCAGGAAATGAGAAGAAGTGATCTTTTTATCACCTTTCCC---CTGAAGTACCTTGATTGAGAATCGTTTTCTCTTTTATTATCAATTGTCTGCCTAGGGTAGAAAACCCAAACCCCTCTCTAACCCCACTCTTCCTATTGAACTGTCATATCACATTTTTCATACCTAGTAGACACTATCTGATGGAACATTGT---------CCAAACAAGAA--------TGCCAGGCCTCACAAACCAACACTATGAAGAAGACAAGAGAGAACAACTTCTTACCATAGCCCGCTTCATGAAAGCTTCCTGGGTTGCCTTCTTGTTTGCAGCCTTGCCACCCCAGGCAGCCAATGCACTGGCCTGGAGGGCTCTTCCATATGAAAAGCTTAGTTTCCAGGGCCTTGGTAGAGGGCAACGGTTGATAGCATTGAGGTTAAGTGTAGCATCCTCCTCACTCATACCTCCAGACAAAAAGCAGATACCTGCAATGTGAGAGATCATAGTAC-TATA---TAGTCCCAACTTGGAAAAACAAGCAATAGGCCTAAAAGCAATATAA------------------------------TGTCTTAA-TCTTCCTTCTACTGGACTTGTGTGGGACTGGGTCACAGAACTCA-GTTTGCCCTTGCTGAGAAGAGAAGGGCTTTAATAGAGAGGGTAGTGAAATGTTGAAGAA s monDom4.chrUn 12971457 723 + 174229318 tataaggccctttct--ttctcttaatattatattctgtgactctTTCTGCCTTTACTTGAATCCTTGTCTAGTCTAGACTCTAGTGATCAGCCACCTCAATGTCTTCCCTCCCACTCCAGACTCCCTTG-------------TTCTCCTTAACCTTCTACC--CTGCCTGTTGTA------CCAATCCCCCAAATCACCCCCATTTTGCCTTTAGCTTCACTTGCAATGCAAGGCATCGCTAGAGGA-----TGTCAAGAACCATTCTGGCTTGCTCCCAAACTGTAAATCACAGTTGGAAGGCAGAAGAAACAGCCT------GGCAGAGAAGAGAGCTGGTGGCCTTACCAGAGCCCGCTTCACAAATGCCTCCTGAGTTGCCTTCTTGTTTGCAGCTTTGCCCCCCCAGGCAGAAAGTGCACTGGCCTGCAGGGCCCGCCCATATGAGAAACTTAGCTTCCAGGGCTTGGGCAGTGGGCAAAGGTTGATGGCATTTAGATTAAGAGTTGCATCTTCTTCACTCATGCCTCCAGATAGAAAGCAGATGCCTGGAAGAAGAGAAA-AATAGAACATGTAAGCTGAGCCCAACT--GACCATCATCTACAGGGTCTGGAGGAAGTTGGACAGTGTTGGGGGGCGGGGGGGAACCAACTTTGTCTCAATTCCTTTTTTTGCTTGAATTATGTAGGA-----------AACTGATGTTTGCCA--GAGGAACATACAAGAACTGTGCCAGTCTGGAATGTGAAGAACTACAGAA a score=11267 s mm8.chr4 49559797 224 + 155029701 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AGGAGAGCACCTGCTGACAGATGCTGGCATAGCGAGCCAGAGCATTGGCATTTTCTTGGATAGCAAGGCTGGAAGGACACTGGTCAGCAATCCTCAACACAGCACGCCACTTCCCAAAGTCAACTCCATCTTTCTTGTACTGAGCACAGCGTTCAGAGAGGCCATCAAGCCCTGCAAGTCACAACAGAAAGAAGGGAGGGGCTTCTTTGCACCCTGTGCCTAGTTCTTGGGG-CTTCTCATT--AAAGCAAAGGACTTTT s monDom4.chrUn 12977297 258 + 174229318 AGAGTAATACCTGCTGGCAGATACTGGCATAGCGGGCCAGTGCATTAGCATTCTCCTGGATGGCCAGGTTGGAAGGACAGTGGTCACCAATCTTCAGCACAGCCCTCCACTTCCCAAAGTCACAGCCATCCTTCTTATACTGGGCACAGCGCTGAGAGAGTCCATCCAAGCCTATAAACCACAAGAGCAGGA--GAAAAGGCTTCTCTGAGAACGTGCTATAGTTCATGGAGCCCTCTAACTGGGAAGCCAAGAGCCATT a score=5334 s mm8.chr4 49563809 203 + 155029701 AGTCACTCTTCCTCCTTTCCTTCACTTGCCTTCAACTC-TACCCTACCCCGAATTCTTTGTCTTATCA--GTAGACAAGGTTCTTACCTTGAATGGTGGTTTCCTTGTTTGTTCCTGCAAGCGGGGCACCTCCTTGGTCCAACTGTGGATA--AAACAATGATTAGTTCTATGAGGGTCGAGCAGGAGTAAGACAGA-ATTCTCATCTT s monDom4.chrUn 12978999 209 + 174229318 AGTGGCCTTTCTACCCTTTGCTCTCTTTCTTCCTCTTTATATCCAACCCAGGCAGTCATGTTCCATCACAGAAAGCAATATTCTCACCTTGAATGGTTGTTTCTTGATTTGTTCCTGCCAGGGGGGCAGCACCCTGGTCCAGCTGTGAAAAGGAGATTATGAACATTTAGAAGGTGCCAAAGAATGAAGAAGATAAAGATTCTGACCTT a score=14157 s mm8.chr4 49564590 413 + 155029701 TGAAAAGAGAACACTGGAAGAGGAACCTGGAAAGGATCCATCTGA-------GAAAGAGAATGGAAAGCAGTGAGAAACAACG--------GTGCCCTGTTGAGGTCAG-GCCTTGTGCTAGCCAAG--GTGCTGGGAGTTCGCCCAGGAGAAGGCCGAGTGAAATAGGAA---CTGGGGTATTC-------------ACCTTGATGCCCACCACAATTCCCTTCTCCTTGAGAACGTTTCTGAACAGATTTCCCTGGCTGTCCTTCTGGTAGAGGGTCTCGTGGAAAAGGATCACTCCGCCGATGCTCTGGCTAATGGAATTGTCCACACTAAAGAGGAGTTCTCGGAACTGCCTTCGGTTCTCTTCGGTGTTCTCCACCTTTATCCTTTGCAGGCGGTTTCCCATGGTACCTAGGGAGATTGGCCAGAGGTAGCATGCGGGAAAG s monDom4.chrUn 12979428 434 + 174229318 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TGTTATTTGTAAATTCTGTT-GCTCCTTCCCAGAGAAGTCTCAAATGTGGTGATTTCAATAGGAAGTCGGAGAGCTAGTGTATCTGGAGAGACCCAGCAGTTTATATTTCAGAGGGAAGGGCAG-TCTAAACCTGACAGCTTTATTCAGCTTGCCCTGTCAAATCCAGCATGCCAAGAACAATTCTTTCCATCCTTCCTATCAGGTTCGATAC-CACAGTTGCAGTTGGATCTAGCATAAGGGAAGGCAGAGATGTCAAAGAAACAGATGTTGGCATTGCAGAAGCAGATGCTGCATGCTTCACTTGACATGCCAAGAAATTCTATTATTAAAATTCAACATCTGCCCT-----GTGAGATCACACACT-TTAACCAACTTGAGAGTAATTCCTAGTATTCAATTACAGCATCATGCCTCtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtCTATGTTGCGACTTAGAGTTT-TACCCATTTGTATTCAACTA--------------CATTTCTAGATATA-------AGCCTCCTTCAACTATACAAGGCTTTCAAAGTGCTGTGTATGATATAGGTAGATTTAGATGTGAGAAATTTTTGCCCAGATTGCACCTGACTTCTGACTTCTGCAAGCTTCCTTCTTTCTTTTCCCTTGCAGGGTTTGCAACAGTAGGTACTTTGTGTAAGGCTGCCCTTCAGAAGGTAGCATGAAGAGGCAGCTTCAGTTTCTGAGACACTGATGTCCGTCGGAACCCTGGAGTGTTCCTGGTGAGACTTTTGATCAGTAATGAAGGGCGACCTAGCTAATTCTGAGCTCTGAAATCCTGCAT----CCTGGATAAGGTCAGAGATCCAGAGCTAGTTGCCCTAGGAACCTAATTAAAGCCCTGACTCTCTGTGAGAAATTAAACATT----------------GGCAGGAAGGAAGGCACTGGCAGCTGTCAGGAAGCCACTTCTTCAAGGACAGCCGCACCTTGAGAGCACAT--TAAAAGTGTTTTCCTCATCTGCTTTGAGAACTCCT-AAAATTCAGTCCTTTCATCTCTGATTTCACAGCT----TTGAATGACTCTGCAAGTCTGTGCTGTTTTTCCCACGTAGGGAGCTGTGTGCTCACATGACCTCATTTACAGCAGGTGAAAG------TCACACTGAATGGGTTCTGTAATTCAAT-GATGGCTCGTTCATTAGGAA s monDom4.chrUn 160818204 1067 - 174229318 TGCCCTTAGCAAATGCTGTCAGCCCTTTCCTTGAAAAACTTTATACCCTGTGGTTCTACTGGGTACTC--CAAGCTAGAGTA----------CCCATCAATATTTGGTCTTCTGAGCACAGCAGCTCCAACCCAAGCATCCTGCCTCTTTGAGAGTAATAGGAGATTGCATTTCAAAAAGCAGTTTCATTGAATTTCTTATCAAATTCTATGCTCAAAACCACTATTGGATTCAGCAGGAGGGAAGGTACAGATGTCAAAGAAGCAGATGTTGCCTTTGTAAAAGCAGATGCTCCATGCTTAATTTTACATGACAAAAAA-TCTATTATTAAAAGCTAGCATCTGTTTTTTTAGGGGGGATTTCTCTCTCTCAACCAGGTTGA---------------------CAAAGTATACTTCCCCT---------------------------------------------------------TATTTAGAGTTTACACTTATAAATATCAAACTAAGAAGGAAAGATGGAAAATCTAGCTAAGATTGAGTAGTCTCC-CCAAAGAAAGAACAAATTAAGA---TTGTATATTCTTTAAAGATTTTTA---ATCAGAAAT---------------ATCTTATTGCTGAGTCCTG-----------TTGTCTCCCCAGCTGTATGACTGTCAGTGATGGGGA-TCCCTCTGAGGCTTTCCATTAAAGAAAGGCATGAAATTCCAAAGCCAGT----------------------------CTAGAGTATGTCTGCATATGACTTTGATCACCAAGAAAAGAAGAGTCATCTAAGCCCGATGGTTGAAATCCCTCATTCTCCCTCCATAAGGTCAAACATGTACTGCTCACTGCCCCGGGAACCTAATTAAAGTCTAGCCTTTTTGAGATAAATTAAGCATTCAcaggcaggcaggcagacaggcaggcaagcaCCCACAGCTGTCAAGGAACCATCTCCTCAAGGACAGCTGCACCTTGACAGCCCTTCGTTAAAGTGTTTCCTTC-TCTAGTATGTGAACTCCTAAAAAATAAGGCCTTTCATCTCAGCTTTGACAGCTGGTCCTGAAAACCTTAGTGAGTTTGTGTTGCCTTCCCTCCTTAGGGGA--GGGAGCCAATATCTTCTCATCTATGGCCACTCAAAGGGATTTCCACAGTG------------AATCCAATGGATTGTCCTTTCAATGAGAA 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TCCTTTTTAATTAGGAAATACGAACACTTCTATAGCTGTCTCTCTCTTAG---------CATGATGGGTCTTG-TATCTT---------------ATTAATTTCAGATGGGTTTTTATCAGGATACTTTCCAATCTGTTGAGGTTTCTTTGATAGTTCTGAAATTATA----CATTAAGTTTACTattacattactgttaattactttaaatatattcttcacactgagctttgat---attagtacctactatgtttcataaaggattcagtcacaacattttccctgatagctttatgtttaTTTTTATGCATAATATTTTTAGAAAGGGTGGTAGTAGTGGTAGCTGGTGGTAGGATATCAACAGGGAGTAAAGGTAAAAGGACACACATCTCCTTTTAACCCTTGTGCCAACCTGATTGGAGATAAAATCCTCTGTAGTCATTCCAAGCCCTTCATT---------TACTTTGTTTATTAA-CAGTATTTTCATCAACCAGAGAATGACTTAC-TCTTCAGTCTTCACCTACTGTGATCTCTTCCCTTACTGAATACAAAAGGTATGTGATCCAAATACAAGTCTTTAAAAC--------AACCAAAGCTCTTG----GGTAGGGGTTCTGGGGTCTCCCATGTGAATATCTTGAGATGTCCAGATGGTACCATGATAGCCACTCAGCAGATCTCTTTAACTGTGACAATTAACAGCTAATGACACTTAATGCTTTGAAAAGAGTCCAGTGGCATCCATCTGATTAGAAATACATTCCAGGGTAGGATCCAAGAGAGTCAA--GAGTTCCAACTGAGCCATCTGCCTTCTTATTTTCTCCTCTCTTGCCTCTAGAGAAGACTCAACAATATCC a score=23448 s mm8.chr4 49972356 586 + 155029701 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s monDom4.chr5 209834428 3043 - 308900514 GATTTTTAAAATATTCTTGTATATCTGAAA--AATGAATATAACTCACATTCCCATATATCTTTTCATGGACCTCTCACATACA-GTTTGCCCAACATTATGATCAAGACTACAACTTCTTAATTGCTTATGTTGCATCATTTTTGACAAGCTCCAAAAAGAGGAAATATAGAGACTCAGAGAAATAATGCATTGTTCTCTAAGTCTTTTGGAATTTCCATGAAACTTTCTTTTA---------TGtagaatct--tagatatagggttgaaaagacccttagggatgagatcactttcttatgtttttagaagaagaaattgggattttttaaaataaatgtgaatt-----tcccaaaatcaccttt-caagtaaaa--tggcaaaggaaggattcaaacccatatcctctctc------------------taaatcAAATGtcttttgcttt--------caccaataaaa-attgttcctataacaatcagcacatgtatattttatattgatgtcatttaagcatttatggatctt----ttaaaaatcatgttgtttccttttcttctcttgatagaacctaatttaacttctgttttatctggatcataattattactccttttcttccacatgtagctgaaagtgaataaaatatagtccaatatgtcattta--------aatctatatatgttttaaatgtgattcct-------ataagcaacatattatttattgtgtcatattttctaata-cattctTCAACTATATTTCTTAATTCATGTGT-------AATTGATTTTGTTCTTATTTTTTAATTCTA--------TGGTGTCCTGTCATACTT----------------GTTTTTGTT----------AGCTATGTGTTATAT-TTTATTTCCTTATACTTTAC-------------ATTTATATTG-TTAGATCCAAGACATATATACATGCAAATACTGCCATTTCTTCAAATCAatttggcaattccatttttgccagcat--aatctttgttaaat------gtctatggctagccaaaaatAGGAGTTTTGTTCATAA-------ATCACCCTTTGCTACCCT----ATCTCATAAATGAC-TTGTTTTTTTTAATGCAATATTGACTAGATA-----GTGA---------------TGCTTAAGAAGCTTCAGTGACACTAAATTAGCTCCATAATCAAATATAGGTCTTTGGGTTTTGTCA-TTTAATGTCTTTAACTTATGCCTTCAGTTTACCCTTT---CAGATTTA---TTAAATAGTCCCCTCCTCCTACTTCACATTTAATTCAAAATACCCTTTTTGATGTTCCTAATATATGACACTGCTTCTTCTTC-----TTCTGTGGCTAACCAGACTGTGTCTCCTAGGTCCTGCATTGAATGTTCTTTTCACT-----TCTTCTTAGAGTCCTTCATTCAATTAAAAGTTTTGCTT-----AAATTACATTTGCTTCAATAGATA----TTATATGGTGttgcatgttgcgagctaaaatggcctcaaaacaaaggaAGCAGGAGGGACTTGTTTCACTGCAGTGAGAAGGTGAGAAGAGAGATTAACCCAGTGGGTATAGCAATGGGGGGTGGGGGTCAGAACAGAAGAACACAAAACATCCAGAAGCACTTCCATTTTGCCTAAGGCAGCAAAATGGCATATTGGGGAACAATGCTACTTGTTGCCAAA-----CAGCCTGAGCAATGACATAGCAGAG-TAGAAGACTAGGCCAATGCCAGCACTACCTGATTCCATATGACCTAAAATAATAAAAGGGTAGATCAGGGAACA--GCCAAAGAAACCTgaggaaatg--aaatgccagagcag--------ggaatagccaag---tataggacacaacaagggaaacaa------------------tggcagaggaagcag-tgtccagctagacaaaatggctccaaaacttacccacaaaaatctag-------ctgggccatcctgtcaatgtctataccaagggaccaaagacaacccagccttccctaaacctcacaaaaactatactgcaagctttcaacagtattccctttacca---------caggactagagctgaacctcaacagatagatgagttactgaggg------gaaaaatatatga------attgaaaaaatgagcacaatataatgaaa------------------------aaaataaataaatcttagaaagttgttttagtgtca--gagaagatcaaaatataaattaggaagaagacacc------agttttgaaa------aggaaagtgagaaagggtgt-------caggacc-------ctcaaaacacttcacagaa-------cttgaaaagaagataaaaaataaacaatatacaaaatgatagaaacaacttagaaaatacagaatacaacttcctacaattagaatgga--------cttaataa----aaaagaacactg----aagaaaataactcca-----------aaaaaaactggaatgggccaaat------------------------tgaatggg---aggccaaaaaaaaaaagacacagggaaaaaaattccctaaa--------gactaaaatggggcaaatagaaaagaaaaaatctgaaggaagaaaacaaa---ttcctaaacatagaattgagaaaattaaattt-------aatgatctaca---------------agacattggaaaacaagataaaatc-------------aaaggaataaaaaagagagagagggaga--------gaagaaaatctgaaatatctcactgggaa------------aacaactgactt-----------ggaaaatacatctaagagagacaatctatgattcatcagaATCATACaaggagcattaaagagaaatgcaagggaagaag----------------agaaaaggagagatagaaaggagtaaattatgtcacagaaaggcaaatatatgagtcaatacaacagagaagatg--gcagagggctcaatca-atgcttgaactttattctcatcataattatctcaaaataagaata-acacctacagtgaaccagct-atagaaacctatcttatgctaaaagaaggagagaaaagggaataagataaggggagattgacaaaagggggtggattgagggaggtagaggttggaaacaaaacatcag-tgagcaggga--aagactgaaaggagataaaaggaaggcaaaacaggtggaaaataagatggaaggaaacaattagtaatcttaaatataaatgcaaaagggacaaaatcacctataaaaagaaaaatgactatcaga--------gtgaattaaaaatcaatttcccacaataaactgtctacaagaaagacatttaaagaagggagacacat 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s monDom4.chr5 209837523 1753 - 308900514 aagaaaatcagtgatagcaaccatgttcggagataaagcaaatgtaaaaactgatttgattaaaaagataaggaagtagaaaaaatgaaaaatgtctaattaaataccaaattctaaatcatgaaactcaaagctaatactaataaaatagaa--aaataagaccattgagctaataaataagacaaggaaatggtacatgaagaaaaaagtaataaaatagataaatcattagtaactttgattttttaacaaagaatatttttaaaaaatactgatatcaaaaatgaaaaagacaaaatcaaaacc-------aaaaaataagttaagtcatttggggggaattattctctcaaatttatg--tgactaaatctgacagtctaagc-aaacaactgaatatttaaa-aaataaaaactgcccagatttacaaaagagaaaatggaatacttaaacaaccctatcacagaaaaaggaattgaacaaactatcaaagaattccc------taagaaaaggtttccagagccagaaggattcacaaatcaattctaacaaacacctaaataataattaactccaatactatataaactatttagaaaataggggtagaagagattcttctaaactcattttataacacaaacctagtaatgatacttaaagcaagaattaa---aaaagagaaagaaaactaaagaccaatctca---atgaataatgatgcaaaatattttaaataaaatagtagcaaggagcttacatcattatatcacaaagaacat-tacaatgaccatttgggttttactctaggaatgc-gcctgagttcaatattaggaaaactatcagcataagtgattatatcaatacaaaaaaaaaaacaagaaaaatatatgattatccagatacatgcaaggaaaagcccatgacaaaaaatctactccttacaaaaaaaaagga--aaaaagaaaaaaatattagagagcat-------tgtagtaaaaggaactttcc-ttaagtgataaacagcatctttttaaaaccaatggagatacattggaatt-ttcccagtaagatcagcagtgaagtaagaatgaccattatcaccata-ctattaaataatgcattagaaatgctagctatagcaataagatcagacaaagatattgaaggaaatagaactggtaatgaggaaacaaaactttcactctttgcagtttatatgatgttatacatagagaaccccaaagaattgatt-taaaatgaatagaaacatttaataactttagcaaaatttcagaatataaaataaaatcacataaatcaatagcatttctatttatcatcaaaaatgtttgagagatagaaaaggatatta------------tatttcaaatagctttagataacctaaaatacttaggagagtctatctaaaacaacgtcaggaatgacatgaacgtcattacaaagcacttt---tcact-----------ttaagtcagacttaaataattggaaaaatattaattgctcatggataagtcatgtaaatataataaaaatgaatttcctacc----ttaatctac-tatttattgccataccaatcaagctatacattatatact----agaagtagaa------------aaaatcatctagaagaatagaaagtcaagaata--------tataatgaaaattaataaaatacaatgtaaaggaggtttagccataccagatctcaaagggtataaaaggtataacgtaattatcatcacaacaatatgatactgtctaagaaatagggtagtggatcaataga 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s monDom4.chrUn 16076795 1385 + 174229318 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AACAACAgaaagaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggagagagagagaga-gaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaagaaggaag-aggaagagaaagaaagaagaaagaatagaa--aagaaaatatctaataaaaaaatcaaaaaagaaaagaaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaag-------aaagaaaggaaggaaAGCCTCTA------------------------------ATCAACATCCAAGTTTCTGCAAGAGCACTTAGGATAACTGAGCT s monDom4.chr1 396041216 377 + 748055161 aaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaagggagggaggaagggaggtaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggcaggaaggaaggaaggaaggaaggcagggaaggaaggagggaaaggaagtaaggaaggaaggtaggaaaggaggtacggtaagggaaggaagggaggnaTCTGTAATATTACTACCCTAGGAAAGATAACTGTGTTATGGTCCTAGTTTCTAGCAGAGCATTTAAAATAACTGAGCT a score=626 s mm8.chr4 51913247 92 + 155029701 ctggctcagaggaaaaaaggaagg--aggatagagaaaggattatgggaggggtgactgggagtggggcagtgagtgggatgtaaaatgaataa s monDom4.chr3 395429824 84 - 526135210 CTAATtccatgcaacagaggaatgtcagaacaagttgtggaatatgga----------tgtaatgggatattttgtgttataataaatgagtag a score=-792 s mm8.chr4 51913339 457 + 155029701 ttaaaataaTAATATAAATAAACCTTAAAATAAGAAAAAAAC--AAAATTAGTTAGAAATATA------ATAAAAACAAAACAAAATTCCATTCTTAAAATGGTAGTACAACAAAAATGACAAAACATCTAAAGAGAAACAAGGTGAAGAAAGTCAGAAGAATTAATTGTTGAAGTTATAATTCAATCAAGATATTATCAAATTGTCTAATAATGACTATTAAATAGGATTTTGATCCTACATTTCAAAAGTG--TTACATTTAATTTT----------GACATCAACAAAGGTGTAGAAAGAAAACTATGTTTACACAAAGTATAGAGATTTCATCTGGAAGAATCCCATGAAGAGTGAGAATGGTTACAATGAAAACAACCTGAATCTGAACAGATTGACACAGGCCCCTATATGGTAGACCTATTAGAAAATGATATATGTTCTTTACCAGGTTCAGATGCACGAGACATAAAG s monDom4.chr1 467065098 447 - 748055161 ttaaacttatattactgcaaaatcaaaaagtgaaataaaatcttaatactggtgacatgtgcatcaaatataaaaaggagagaaaataaaaaactgaaa----tagtatattacacatgc-----------aagaaaaatataataaaagagtttttaaaattcaagaatatagcttataatc--attgatatactgt---atcagttaagga--aatgtagaatacgaggtt--tctcac----caaaaatgatttccatttcctctcttcatacctggtcatgatccactgtgagtacaagaaatgattgt--cacaaggtaacagttttttttttttataaagaacagtagtagaacatgtaatgaaaattcaaaaagtaccaatatccccagacttataatatcccatttaatgacaatagcaaacaaacccactatcatattttacatgagtctgctgtatgacatttaaag a score=29 s mm8.chr4 51913796 155 + 155029701 TCTTATTCACACACCACAGAAATACTTAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAAA-GAATATAAAGTTCAAGATATAATC-----TAGAGACAGACTCAGGTAAAATCCCATAAAATTGGTGACAAGAAAGCTAGTCTGATTAATCTTTTTAAATTTTAAAAAAG s monDom4.chr3 395430366 145 - 526135210 TTTTGTTTTTCAAAAATTGTGATATTTCAACTAAAAATTGGGAAATAGGCATGTTTATAAACATCAAAAAGGAAGTCTTGGTTGGGGAAGACTGGAGAAAGA----------------ACAAGCATGAAAGTGGGGAAAATCTTCTAGGGAAATAAGCAAG a score=76964 s mm8.chr4 51913951 1386 + 155029701 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s monDom4.chr1 467065693 1443 - 748055161 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a score=-2241 s mm8.chr4 51915337 415 + 155029701 ACATAT--------------ACATATGC-ATGAAAAGCATTTTATTTGTTATACAATCCCAACAAATTGGAA-------AGAGAAGTTATATTT---CTGATAAAAAGTTCAACAAAATTCTGTGGGGTAACATTGTATCTTACAGTGAAAAT--------------CTGAATGGTAAGCTCCTCCTTGCGAGGATAAAAAAGGATTTCTGTGCAATGCTTAGGAGCTATTTCAGTGACTatttggaagtcaacatctatc-ataatagcaaaattaaataaatatttaaatataaatataatgagatacatacaagatttatatgctagaacccaacaaaccact-------------aatatataattaaggatgcaaaaaagtgaaaaattatatcacacttatgattgaaataa--ttagtattattaagaagt--aaactctatctagtttaacctgcaagtacaaa s monDom4.chr3 395431985 450 - 526135210 GCATATGagtggaagagttagcattagcaatgaaaaagatcat-ttcttcatgtaagtctagtgtgaaggaatatactgtgggggaatatatttgaatgaatgagaagaataaaaaa-----gaaaaagaaggaggtttttgaaaatggaattgattttttttcttcctatatatcaagcttctcagtttaaaatgtgggaggaaatatgctggcagacttaaag--------agggataaaatggtttaaaacagctgttgagagtgggaaagaaaattgattacgggagcataAAAATAATT-----TCTCTTAGATTTTGAGCCAATAATACAACAACAAACTTTTCCACAGGAAGAGCAGTTTATTAAGTAAACAGTATAG---AAGTTCATATGACAATGAAGAATGAAGAAACTTTAAATTTGATAATTAGTGCAAATATTAGAGATTTTAATTATCTTATACAAA a score=23175 s mm8.chr4 51933338 831 + 155029701 GataaatattgatttttttaaaaaaaattGGATTTAAGTAGACCATTACAGATATAATATTTATACTGTAAGTACCTT---TTTGAATGTTAAAATAA-----TTAAATTGGAACTATTGAAGGAATGCCTTCCTTATAGATAAACAAAAATAATGG---------ACAGAGATGGTAAATAAGGTGTTAACTAAAAGT----TGCCAGTCTGAAAA-GGCATGGTTTACATTGCTCT--TATCAATATTTATATTACATTTAAGTTCT-GCTACCCACATAAGATGCTTATGCA-----TTTGAAGCTGACTATGTTTTTACATTGAGGCGTTTAATGATAAGTTGCTGTTGGCTGAAATTTAATAGGTTCCTGAGAAAATGTGTTTGCATCTCCAGATTCATAATATCACACTGAGCCAGATTTAGCATTTTATTATAGCAAGAATGGAGCAAGGACTCACATATCTGAGACCCTTTTGAAACAGGACAGAAAAGCCCAGAAGTGGAATGTTGATGGGAAGAGACAATTTATTTTTCTCTACCAGCCTGCATTTAAAATAAAGGTACGTTT-ACCCAGAACAGAGCAGATGGACTGTATTTAGAATAGCCAGAAATAAAGG-TTGTATTATTCAATTCTTCTATTAATTTCCTTTTATTGCTCCCCCTGCC-ACAAAGTTCAGTGTT-ACATGTAGGTGAATTAAGTGAAAGAAAAAC---TATATACCCCTATATATAAAGTGTGATTTATGACAAGCTGTTTATGTCAAGGCAACTTTCAAATACTGTCTAGCTTGGAATATTCCAACTAAAC--AAGCTCAGAAGaaaat----attttg-------------ttaaatgttaatatatttataatttCTGC s monDom4.chrUn 16244120 838 + 174229318 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TAAAATCTTTAAATTATCCAAAT-----CTGTGAATTCAACTGC--ATTTTGAAAAATGTGTTTCATGACAAA--TTATTAAAAAATACAAGAATTTGAATTTCTTGATTCCAAAGTGATGAGTATCATTTGTCTCATAGACTGTTACAAGAAG---CTTTC--TATTTTTTTTTTTGCTTAACTGTGATTCTAATTA---AAAAAAAAAAAAACA--ACCCTGATTCTAAAGAAATAACGAAAAATTGTTTTTCTACTCAACTTAACTTGAATTAACTTCAAGGGGGCATAGTGGCAGTCTGGATATTCACACCAAGTCACCTCCTAGTGCATAATTTGATCTTGTAATTTATTCATAGTTATTTCTTATTAAATGAAGCCTGGTGGCAATATTAGAGTAATAAGGAAGGAAGGCAAAGAAGGCAGATCTTATTTTATTGCCAGAAAA-----TGTTCACTGAGAAGGAAAAAAATGGGACTTACCTATGATCTGTTAATATACAGGTAATTGTTCTGTGGAGTTCTCAAATTGAGCTGCTACAAGAGTTCACAAATTGAGCTGCTATGAAATTCTACTCTGATTTCTACTTT-ATTACACTGGCTGTTTGAAGATGAGATTCAATTAGAGCTTTGCCCTTCTATCCCAAACTCTGGCATCAAGTTAGACAACCCATTTAGTCCCTTTCAGTGGTTCCTGCAACAAGTGT--GGATTCCATCTCTTCTGAGGCTGCCTCGATCTTTTTCTGTATCAGGTATTAAGCACAGTGTGAAAGGAAAAGCTTCATTACTG-CTAAAATTG a score=1722 s mm8.chr4 52357307 52 + 155029701 GAAAATAATCTGAACACAAATTTACCAAGCCAAATACTACCTATATGAGCAA s monDom4.chrUn 16925203 52 + 174229318 GAAATTAAACCCAACACAAATTGATAATAATCAATTCTTCCTATGTAAGTGA 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s monDom4.chr6 144951978 1034 + 244784211 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mm8.chr4 52935399 217 + 155029701 atatacatgtaaatACAATATGCTGGGTCCATTTT-----GTTATTTTTGTGTATAAGTTTCTCACGGTAAATCTAGTCCTTACATAAAAAATTTCTACCTGAATTTTCTCCATTA------AGAGAGCACATCTTTAGATCCCAAAGAGTTTTAATGTTACATCTACAAATTCTGGTTTAATTGACTGGAAATGAATACCTAATGACATGGATTTCTGCAAAAAtgt s monDom4.chr6 145088531 211 + 244784211 ATATACCTGTAAACTAAttatttttgtttttttatttctagttttttttatttttttattttattttttatttctaGTtctt-tata--------ttcccagcatgttgcacaatacctaccacatagtgaatatttaataatcaa---gatttactgattgattTGCCAA-----ACATAATTTTCTTTTAATAAAAAACAAATATCAGGGATTTCTGTAAAAAAGT a score=1887 s mm8.chr4 52936574 111 + 155029701 ACTCTGTCACATGAACAAGTGCCTGACAAAATTTTCAGAATTTGGAATCAAATGAACTAAATATCTACAACACCATATACAGATTACTAATACATATAGTGATTTCTAATA s monDom4.chr6 99303349 107 - 244784211 ACATTGTTTCATGAATTAATAACTAACAAAATGCTTAAAGCTTATAATACAATTAAAATATTATCTA----ATTTTATCCATACATCAACTTTAGGTTgtggttgctatta a score=346 s mm8.chr4 52936685 164 + 155029701 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ttaaaatatttttCTATCATGTGATCAAGACACTAATTTTCAGGTTACAAGTAGTTAGAGTGCCAAAGTCTCAACTAATTTCAGTCCTTTGGGAACAACAATAAAGAGCAGATATTGGTATCTTGTTATTCCATCCATAGAACCATGCACGGCATCTTATT--TGTAACATTCTGTTATTTAGCTTTGAAAATAACACACAA s monDom4.chr5 286437595 167 + 308900514 ttgaattatttttta--caaaagaataagaaaCTGAGAGTCA----AAAAATAGTTACTTTGTAAAACTCACTTATAA--------ATTTGGGGACAAT------------------GTCATTTGACTTATCTTACATTAACTTTTCTGCTATTTCTTATTGTTCTACCATTAT---CTCTATCTTGAACATGAAAACACAT a score=1962 s mm8.chr4 52948023 143 + 155029701 TGTTGTCTAATTTATTGCCAGACTGATGTAAAAATTGTCA-TCAATATGTACATGGCTGAAAGAAATCACACAGACAGAATGCAAGATGAAGTCAAAGTTT----AAAAGAAAAAATCAGTTAGGCACTGCTGGAATAAAACATGAAT s monDom4.chr5 287160335 145 + 308900514 tatttatttattggttgctggac--atagagaaatagtcaataaatgcCAACTGAGTTGAGGGATATCATCCTCATTTTA-AAAAGAGGGACTTACAATTCCTGAAAACAGAAAATTCCATTAGGATCTGCTAGTATTAAGCATGAAT a score=1810 s mm8.chr4 52949551 90 + 155029701 GAGTCAGAATACAAACTAAGACATTTGTAAAAGAACTGTTCAGATAGAATTCTACTTAGAAGCCACCAAGAGAGTATATCCCATGTTCAC s monDom4.chr5 287162780 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agatgggaa----------aaagatggttacacTGATCAAAACATACTTTCCTAGAACTG-------------TTCCTCAGGAGCCAGATAGGGTTCC-----CTTAAGTGCATGCGACGGCAATGGAAGAAGTGCATTTGGAGAGGGTGGACTGCATGGGGTTTTTCTACCGTGGTTGTGGTTTTGGGATCACGTTAGATG-----TAGGAGGCATGCCCTGCTCTGGCA---GGGCCACAGCAGCATTAGGTGTGGGAGAGTGCTGG s monDom4.chr3 454699335 247 + 526135210 AGATGGGAATGTACTCTGGAAAGTTAGT--CAATAAGCATCACGTGCACTATAGGGACTGGGGACGAGACGGATCCTTAGGGGGCCCGGTGAGTCTCTAGAGACGAGGGGGGATGCGAAGGCCCTTCCAGCAGCACA-------------GAGTTTATGGGGAGTCTCTGCAGCGAGTGTGGGAGTGTGACGAGCCTCCAGGGTCCCCGGGTAGCCTGGCCTCTGGGGGTATGAGGTCTACAG-------ACATATGGGGAAGGGATGA a score=8655 s mm8.chr4 53100656 281 + 155029701 TAAGTGGTACTTACTTTCTGACACTCCCTTCTGGCTGGAACCAGGGTGGCTCTTCTCATCAATTTCCTCACCAAACCAGTATGACTTGGTACAAGGAAAATACCAGGGCCTGGGAATTCCATACTGTCCTGAAAGCAAAGCACAAATAACACAGGTATGACCCAAGCT----GGTGCAATCTGAGCATTTCTGACATTGTCTA-GCCAAATCCTCTTTCTCCTTGACCAAC------CCTATGAGAAAGGAATAGGCTGGAGGGAGACGGCTAACTTTTGCTGAAATCTACT s monDom4.chr6 145588834 283 + 244784211 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monDom4.chr6 145602945 917 + 244784211 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155029701 TAACTGGCAAGTTTGGGAAAGAAAACCCGATCTGGTACTTACATGGACTTGTTAAAGTTTCCAACAACACCGGGAGCCTCGCCGGGAGTTGGATAACGGAAGCAGGGGTTGTTGGCATTACAGATAATCCCCTGTACCCAGGGGAGGGTTCCTGCAGACGGCATGGCTTTATTCGGAAAGTGGCCTATT---GAAATCGAGAAGGAAACGCAGAGAAGACATTAGACCTGTGAAGTGATTTTAA----CACAAGC--CTCTCACATCTGTCTGTCTCATTCACCATGTCC---CAGACTTATCAatgttatttatgtgagt-gttctgcttgatgcacatatgtg s monDom4.chr6 145654255 344 + 244784211 TGAGTTACAAGTTGAGAAAAGAAAACAAGCTTTAATACTCACATCGACTTGTCGAAGTTTCCAACAACACCAGGAGATTCGCCAGGGGTTGGATATCGGAAACAAGGGTTATTGGCATTGCAGATAATCCCCTGAACCCAAGAGAGAGTTCCTGCAGATGGCATAGCTTTGTTTGGAAAGTGGCCTGTTGAAGAAAGGGAGAAAAAATTGCATTGGGGAAAAT-GTCCTTTGGAGTCCTTGTGATCATCTCCAGTTATTCCCTAATATGAACTTTTTATACTTCTGATCCAATCAGTCATGTCTTCCCTACAGCACTGAGCAGGTCATGTTGCTGCACATACCTG a score=1138 s mm8.chr4 53150127 71 + 155029701 cctagtatccatggaggccaaaaga---ggtctgtaaactccgctgaaactgaagttacagatgttgtgagcca s monDom4.chr6 145654630 74 + 244784211 TCAAATAGCCATGGAagtcatagaacctgaaatggatatctgcctgaaagggaattcagagatcatctaggcca a score=3007 s 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GAAAACGGAAACAAGTGACGGTGACGTTGCAGCCCACCCCTCCTCCTGGACACCTGCATAATTCTCACCCATACCCCCATCTCTGAACATAG-AGATCCATGCTGAGGGCAATGTTCCTCCCAAAGTGATTGG----------AAATACCTTCTACCCAGGTAACAAAAGCCAATGGGACATTTCCACATCAGTTTCCCAAGGAAG----TGAACAAACAAACCTCCAACAGCACAAGGGGAAAGGCAGTTCTGTGCGCTGGATTTCTCAATGTTCTGAAGTATAACACGCTTGCTCCTGCCCCTGC-ATGAATTTCCAGACACTGGCTGGAA s monDom4.chr6 145677015 315 + 244784211 GAAAGTCAGGAAGAGTAACTCTCCCCTCAAAGTCATCCTCATCTATTGGACAT-------GGTCTCTCACA-----CCATCCTGGGAGGTAGCAAATCAGTACAGAGGAAAACGG------CAAAGAGAAGGGGCGGCAGCAAAAAGGCTGAAGGTTTGAGTAACGAAGGCCAATGAGGGATTTCCACATCAGTTTTCCAAGAGAGCAAATGAACAAATAAACAAACAGAAGGGAGGGGAGAAAGCTGGTACTGTATGTCTTCTTTCCCAACATTCCCAAGGCTAGTAACTCAATTCCACCTCTTATAAAGCAATTCCAGTTACTTGTTGGAA a score=3337 s mm8.chr4 53172802 365 + 155029701 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monDom4.chrUn 152918985 426 - 174229318 ATGAATCTGAACAATTTAAAGCC-CTGGACATATTTCTGTTAATTTTCCCTGGAAAATAATTCATCAGGGTGTGGTTTCCTGGTAAGATCTACCAAACTAAAAGTGTTATGGTTTAAATG---GCTCAGAGAACATTCTAAAAAAAGCCCACAAAACCCGAATCCAGAGATAAACACACCCCAGATTCAGTATTACACATACTCTAAGTTTTAAAAAAATCAAATGAACTCCACAATGAAAACACTGAACTAACAATTCATTTAAATG------TAATGAGATGGCTCTTTTGTATGAATTTTTGAAGTTCAGTGTTACTGTAGATCAATAAATCCTGCACCATTGGAGTTTTTTTTTTAATGCAACTCATTGAAGGGGGGGGGAGGAAAATTTTATAGATTTTAAAGCTTGTAATAGCTTTTCAAATTCAAATGG a score=-447 s mm8.chr4 54249619 657 + 155029701 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AAAGAGGATGTGTTACAGGGGAGAACTCTTACCTCCCTTTCCAAAGCATTA--ACGTATTAAAACAAAAGATCCCTTTCCACCTATGTGAATAGGTTTCCTTCTTAATGAGATTGATCCTTCTTAAAATAACCACCAGAAGATTCAGTAATAAGCACATACCAAGAAAGGAATCCTCAGAAATGAATAAAATCTCCTTTCTATAATGCTTATAAATGA--ATCCACTTACCATTATGTTTTAGTGTTTAAACCTGGAGTTTAGATGCCCACTGACTCATGCTGATTACAGAATGACCTCAGTTGACTTTTTGCTTTTTCCACCCTCTGCTTTTAATATTCTGAAAACTTAGAGCCTTAAAA------AAAGAATTTTTCAAAGAAAAGGAAATTCACCATGGGCATTTTCTCAGTCTCTTTCTCTTATAAGCTCAA---AATAAGAGATACATCAAATAAGATAGTATAGAGATCAAATAATTATCTCCAACATTTCATTTGAGGCAAACTTCAGGTGACAATAAAAGATTTA a score=10245 s mm8.chr4 54391510 316 + 155029701 GAATTTTCCCCATGTTTTTGTTTCCTTTGTTGTAT--CGTGTTCCACGGCTAGC-TTTTGAGATGGCAGCCCAACTGCTGTTTTCAATCCGAGTATTTTATTTAACACACGCTAGCTATTGTTTGCAGACACAT--TTTGACTGGGTCCTCATCTGATGAGCTGTTTGTTTGTTCTGATTGAGTAGGTCACTCATGAGTTCAATTAACCACTTACCCTTCATCTGATGGAGCAAGTGGCCAATTGCACCTGCAATTAGCTAACTAAGGGTTTGGTCATTTCCATAGGCAATTTTGCCTTGA---------TCTAATTGTGGGCTGCAAGA s monDom4.chrUn 153169855 316 - 174229318 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atatgtattgataaatggtttggcatgcattatctccgaattgtcttccaactctggaaatctgcgaAAAACAATTTTAAACTGGTCATTAGTATTTTGTGTTCACCTGTGAGTATAGTGGATGAAGGACAAGGAGAATCATATTACTTTTGAACTAAATTGGAGCT-ACTCAACAATATTCTGAGTTCACAGCTAGACAATAGAGTGACAGAATTAACAAGTGATTTTT-AAATGAATATCAATCAATAACCATCTATTACAACTCAGAAATCAACCGTCTGGCAAATTCACTCTAGTA-----CAGTACATTCATTGTCCTGCAGTAAAAGAAAAGCAGTAGTTACTGGTAAAGAACTGGTTTGATTCTTC------TCAAACAATGTTAAAATGTTAGAGGTTTTGTTGTTATT a score=4243 s mm8.chr4 54536291 599 + 155029701 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s monDom4.chrUn 153365866 1458 - 174229318 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s monDom4.chrUn 153376359 285 - 174229318 aaaatgactcaacaacaacaacaGCAAGGGCAC----TTAACAGAGAGTGATTGACTGTTAGCCAAAGCATTAGTTGGAATATGCACTTTGTACAGAAAGCTGTGAACTTTAGCCTATCCCAAAGGAACCCAGCCTCCTCCTCCAGGTAATCTAATCTCTCCCATCCAACATATTCCAGGGCAATTGACTGTCTTCTGATTCAGACTCTTCCTTTTTCTCTGAGAAGAAGGAAAGAG--AATGAAT--AAAGAGAAAGAAGTAGAAAAAATATGGGCTAAAAGTCTATTGCAG a score=5572 s mm8.chr4 54554960 537 + 155029701 GGGAACAAGGCAGAAAGCCAGACT--------CTGGGCCTGCTTTGGAGCAGCACTCTTG-----GAAGAAATGTCTTGCTGCTCTTGG-CAAGTCTGAGGAAAGAAGAAGACACTCAAAGACCATGTGGAGTGTGCGCAGCTGCATTCGCACCAGGCAGC----AGAGCTCAGCTGAAGAGCTGCTGTCAGCA--------TGGAGATAGGAGGAGCCTGTCCTGGCTTTGAAGCTGCAGGGGATAATGGAGCCACAGTGCAAGCACAGGGCCTTTTATTGACAGGGTGAAAAGAAGCCAGCTGGGGTTTGTCTATAGCTGAGC----------TTCTGGTCCTGTCCCATACTTCTGAAAAAGACCCCCTTTGTTCCTTTGCTGCAGGTGGCACCTGTCATTA---CAGGACATGTAAATAGGATAAACAGCCCCCAAGCTACTGAAGAGGTGCCCCT-------TTCCTGAAATCCATCGAAAA------------------CAGCTCTCCAAGTTCATCTCTCTCACTGTTTCTTTCTCTCAATTGGAGGGTTGAACAGAACGAGGAGAATGCAAGGGCCAGAGGACTCTGCCTTCC s monDom4.chrUn 153377838 592 - 174229318 GAGAATAAGGAAGAAAGCAGAATTTGGGAATCCAGGAACTTCCTCAGTGTGAGAGGAATGAAGAAGAGGAAATGTCCATCTTTTTTTAAACATGATCTAGGAAGTAGGAAGAAGTTAATAGAATGTCTGAAGTGTGTGCAGCTGCATTGGGGCCTGGAGACAATGAGCACTCTGCAGAGAATATTCAGCCTGCATCTCACGCTGGAGGAAAGAAAGAAAACAACTTGCTTTGACACCACAGTTGATAGCATCAGTGCAGCTCAAGTACAGACCCTTTCATTTGCA-GGTGAAGAGAAGACAGCTATAGCCATTGT-TAACTGACCTCAAACTCTTTTCTACCCCTGCCAGGGTTTATTTGACAAAATCCTATTTACAATATTGCTGCAGGAGACATTGATTATTAACCAAAGAAATTTAGCCAGTCCAGAAAGTCTGGAAATGCTTTAAGA---GTCCATAGATGAATCTCCAAAATAAATCAATAAATACAAATAAAAGCCCTCCAGTCCTCCTAGATAAACCATCTC----TTCCTTTCTCTCTGGGGAAGAGTAAAGATGGATCTGATGGTGGCAGAACCTATAGAATTCTACTTTCC a score=4656 s mm8.chr4 54560216 512 + 155029701 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GTGAGCAGAATCTGGAAGGTGAAGAGATCACTGAGTCACAGTTCTCCTCTCTTCCCCACTCCCCGTCCCCACCTCTCTCACAGATCTGCTTTTACTATGCACGTGGAAGCCGGGCATTCCGCAGTTCCTGAGGAGGGTCCCAAAGACCTGCGCTGTCCCCTCTGCCTCTACCACACCAAATATAAACGCAACATGATTGACCACATCGTACTGCATCGAGGTAA-------AGCAATGTCTTGTCTCAGAGCCGCAAGGGTGGGGAGG a score=4716 s mm8.chr4 55073686 411 + 155029701 CTCTGTTTCCTTCTCCCGTGGCAATCTAATGAGATGAGAGATGATGGTAGCTGGCTAAGCCAACCACCTGTGAGCCAGGCAAAAGCGGAGCAGCAGTATGTAGGCAGGGGTTCTTGGCCCTCGGCTTCCTGCCTGGTGTTTTGCCTCTCTCACCTGGCTTCTGATCCCCTAGCCCGTGTGTTGCCAAAGCTGTGCGCCCCATCCCAGCTTGGGTGGAGGCCAT---CAGTGGAGCCGGTGCCCAGAAAACATCAATGGC-GAGTCATCTCTGGCTGTGGCAAATCCACACTGGCTGCAGTCATTCCCCATATTGACGCCCGGTGGGATCAGAGCTTTGACGGCTGACAAGCTCAATGACTTTCCTTGTCTGGGCTGAGA---CTTGAGGAAGAGAGAGGTA-------GAGTGATTCTGCACAGA s monDom4.chrUn 153959681 406 - 174229318 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s monDom4.chrUn 154332191 1082 - 174229318 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GAGAGATCTTAAAATTTGGAAATTGTGTTGGC---AGGGAATCCCTGGAGATAGAGAAAGTCAGGCTGTGGTTGACCCTCCTCCTCAGGCTGTGAGTACTGGAACTCCTCAGTCTCCAGCAGTAGCTGCAGCTGCAGCAACCACGACAGCA------ACTACAACAACCACTTCTGGAGGTAAAGTGACAAATGACAAATGGTCTT---GAGTTTTTAGTATAAGATTATTTAATACGAAATACTTCAGTGGTTAAGCTTCATTCCCAGAATGCTTGAATAAACCTTATGTTTTTTTTTC s monDom4.chrUn 154454503 291 - 174229318 GGGGCATTTTAAAATTTAGAAATTATATGTGTTTTAGGGTATCCCAGGAGATAGAGAAAATCAGTCTGTGGTGGA---TCCCCCTCAGGCTGCCAGCACAGGGGCTGCTCAGTCTTcagcagtggcagcagctgcagccacaacaacagcaacaacTACTACTACTACTACTTCTGGAGGTAAAGTGAAAATTT-----TGGGGTTGGGGAGGAAATACTCCCAAATACACTAAAAGAAAATACTTTGGGGGAAGTGAGTC-TTTCCAGAAGCCTTTATTATAAATAcaggtattccttc a score=10934 s mm8.chr4 55404650 170 + 155029701 ACTTATTGCTATTGTTTTGAAA-----TGTGTGTATTTCAGGCCACCCCCTTGAATTTTTACGGAATCAGCCTCAGTTTCAACAGATGAGACAAATTATCCAGCAGAATCCTTCTTTGCTGCCAGCCTTGCTACAGCAGATAGGTCGGGAGAACCCTCAGCTGCTGCAGGTGACT s monDom4.chrUn 154458754 175 - 174229318 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155029701 ACTTAAATCACCATATCACCATAATTGACGAGTTGAATTTAATTGCT---TCCTTTTTTTTTTTTTCCAGTTAAAGGCATTAGGATTTCCTGAAGGACTTGTGATTCAAGCATATTTTGCTTGTGAGAAGAATGAGAATCTGGCTGCCAACTTTCTTCTACAGCAGAACTTTGATGAAGACTG-AAGGGATTTTTTTGTACCTCACAC-TCACACCAGTGCATTACACTAACCTTGTTCACTGGATTGTCTGGGGTGACTTGGGCTCATATCCACAATATTTGGTATACGGTAGTAGGTTGGTGGGGGTGG---GGGTGGGGAGCTAGGATATAGGGCAGGGATACATACAGTTGCATGTCTGCTTC-AATTAGCAGATGCTGCAGATCCACACAGTGTAAAATACTATACAACCAAACATCCGCCTTTACAGGTCGTTA-----TTCTTCTAAGCAGTAGGTAACTTTTCCTGGG-TTTCATTCTTTCTAGTGTACTAGATCCAGAAATTTAGTGTGATGCCCTGCTTTCTCTTTTCTTTGACTTAACATTGGTTTCTGAAAGAATC-TTTGCTACCTAGAACCTGCAG--TCTGTTTTATGGCAACACTGGATAATGGCTTTTTGAAATTGAGGGGGAAAAATTGGAGCATCTGTAAACAGAAATGCCAAATTATTGATAGTCATCGTTGCTGCTTCACATTAGTATGAGACTGATGCAGAAGGAAGCCCATTC-TTCGTGTTCAGTGCTGGGGATGGGGTGGGGACTTTTCTTAAAACGAAAATAATTACTGCTATTTTAAAATGTCTTGATTATTGAATGTGAGACCC--TCTGACATGATTTGAGAAGCTGCACACAT--AGGCAGAGTCATTTTCCTGTTTACATTGTTTGTTT------GGGGAAGATTGGTAGGGGTCTAATTACTGTTCACTTCCTTGTTGTATTGCAGTAAAAGATTTAAAACAACCATTGCATGTTTGCTTTTGATGTATCCCTTTGTGAAATCAGCACTTCTGGGGCCAATGAAGAAACTGTGCAGCATTCActcccctcccccctcccctcccctcccctccGTAGAGATGTGTTTGATCAGCAAGTCAGGAGTCAAACTGCTGCCTTTAAAAAAACAC---ACAAAAAGCTGATTCAGTTCAAAATTAATGCAAATCTTTCAAAACTGGGTTTCTGATACTTGTGGATGTTTT--TCTTCATTAGATAAGAATGTATTACC-ATTAAATCCATTAGTATTACATTGCTTTC-------------------AAAGAGAAGGTGGGTGGAACTATAATTCAGCATCTTTTACTGCATTTAAA-GATGGGAGCAAACT---TTTGTATGGTTGGGAGATGT-GGCTGGAAAG------TACTTTGGAAAATAT----ACAATCAAGATATTTCGTCTCATATTAAAAGAGAAATCTCAATCACAGTGTTGGCTTTTATTTGGATTTTGCTCATCTCGGTCTTTGTTTGGAAACTCCCTCATCGACATTGCTATTGGATTGTAAAGAGGGGCCCAGTATC-AGTTTGTTGAATTTGTCAAATCTTTT-CCTGGACATAAATGAGACTATTGAAGGAAGTA---------ACGTCCCACCGTCGTGATGCTGTGTGAGAAGATG-GCTTTGCAGA------CCTCCTGCGCAGTCTCTTGCACTGTGTCCATCACCACTTGGTGAGGA----CTCTTAAACTCTCTCCTCATGTGCTTATACCCTG-----TTCCATGAAAATAAATGAGACCATGATTTTCCTTC---------ATGATGTACCATGTTTAACTTTCATGTATTATTCTGCAAA 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a score=-166 s mm8.chr4 55413148 163 + 155029701 TATTGTTTTGCTGCTCTATAGGAAATATGAGGAGGCTGAATTTATATTTGTAAATTTATTTTGCCATCTTTAAGTCACATTTTTGTTTCATTGTTTAAAAGTACTGAAATGTTCCACCCTGTTATG--TTTTCCTGTACTAGATGGCTAGGATTCCAGAGAATTA s monDom4.chr1 636255501 159 + 748055161 tatttattagggatgttctagaaTatatgcaggatgggaaattggactaggcaatctctaaggtctcttcaaattctcaactatATAACATggatctgaatt--taaa----tcccagctattatgaatgtctttgtgctagtgatttaatttctctgggcctca a score=5369 s mm8.chr4 55413317 234 + 155029701 AGTATTTTCAACACACCTGACATTGCATTTCTCattttttaagattttttttttaatttttaatGACGAAAACAATATACCTAAAAGTGAAGCTAC-GGAAAAACCATTTGTTCTTCCCTGTCTTG---------------------------------------------------------------------------------------------------TATCACTCCTCAAACTTTACTTTGGCCTCCCACTTGGCCTTGTGTTTCAAAGCTGGGTCCCTGAACACATCCTTGTTGACAACGGTTTTTTCCAAGGGGATATCCAGAG s monDom4.chr2 193248016 329 + 541556283 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181 + 155029701 CCTCCAATTTGAATTATTTCTGTTGAATTCATT--GCCTGGAGTGGGCTT---------CCTTGTCTGACTGAGGTCAACATAAGCAGGTGATTTTGGAAAATAAGTGCTTTGAAGGACACCTTTTCATGGAG-------AAGGACGAGGAAAGGGTTCTCTGAGAAAAGACCTTAGAATCTAGA-----AGATGAGAGAGAGG s monDom4.chr2 284358544 193 + 541556283 CCTCCCATTCGGATAGTGTTCTTTCATTTCATCCAATTAGACGTTAGATTTTTGCAAACCCTTATTTGAATACCCTCAATATAATGAGTTGTTTTT--AAGTTTAGTTTTTT---------TTTTTTAAGACGCGAAGTAGAGGGCGGGAAGAAGACTGTCTAGAAAAAGGCCTTAGACAAGAGAAATATAAATGAAATAAAAG a score=50 s mm8.chr4 55429378 168 + 155029701 TTTACATTTCCCAAGTGCAACACCCACCTTC---CCGCTCACCAGCTCACTGTCTCCTGCTGTTGATGGTGCAGCAA-----GACTCAGCTGGCTGCTAATGTCTATGTGTGTATGCCTA----CTGAGGTCCCCTTGTAGCAAATTCCTACTTTTACCAAGGCAGTGTCTATGTAGAGG s monDom4.chr2 443585210 169 + 541556283 TTTCTGTTTTCTGTACTTAATTCCTGCCTGTGAATCTTTTGCAACCTAAGTATTTCCTG-------TGGTGCAGGAATCAGGGGTTTCCTTGATCACCACTGTCTCAGTCTATTAATCTGAATTCTGATGCCTTCTTAGTG----TTTTCATTCATATTATTACACAGATTATACAAATG a score=7173 s mm8.chr4 55429564 114 + 155029701 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TCTACATCATTAATTTGAAGAGAACTTGGGAAAAGCTTCTGCTGGCAGCTCGGGCCATTGTTGCCATTGAAAATCCAGCTGATGTGAGTGTCATCTCATCTAGGAATACTGGCCAG a score=11018 s mm8.chr4 56482073 233 + 155029701 AACTGTGCTGAAGTTTGCTGCTGCCATTAGAGCCATTCTCATTGCTGGCCACTTCACACCTGGAACCATCACTAACCAGATCCTAGATGCCTTCAGGGAGGCATGGCTTCTAGTGGTGACTGA-CTCAGGGCTGACCACCAGCC-CCCACAGAGGCCTCTAATGACAACCTGCCCACCCTTGCTCTATGTGACACAGAATCC---CTGAGCTA-GTGGGCACTGCCATCCCATACAACA s monDom4.chr8 262283300 239 + 308469712 AGCTGTTTTGAAATTTGCTGCTGCCACTGGAGCCACACCTATTGCTGGACGCTTTACACCGGGCACCTTCACTAACCAGATCCAGGCAGCTTTCAGGGAGCCTCGCCTCTTGGTGGTCACTGATCCTCGGGCTGATCACCAGCCTCTTACTGAAGCATCGTATGTTAACCTCCCAACCATTGCCTTGTGCAACACAGACTCCCCACTCCGCTATGTGGACATTGCCATTCCATGTAACA a score=5760 s mm8.chr4 56482306 105 + 155029701 AGGGAGCTCACTCATTTCGTCTAATATGGTGGATGCTGACCTGGGA----------------GGTACTATCTCCCATGAACACCCATGAAAGATTATGCCTGATCATTTTCACTTCTACAG s monDom4.chr8 262284255 118 + 308469712 AGGGAGCTCACTCGGTGGGTCTGATGTGGTGGATGTTGGCCCGTGAAGTCCTGCGAATGCGTGGTACTATCTCCCGTGAGCACCCATGGGAGGTTATGCCCGATC---TCTACTTCTACAG a score=5860 s mm8.chr4 56482411 127 + 155029701 AGATTGACAAGGAGGAGCAGGCTATTGCTGAGAAAGTTGTGATCCAGGAGAAATTTTAAGGCAACTGG----------------------------------------TGGCCAACTGGTATGAGGGGGTACAGGTGTTCTCTGTGCCCATCCAGCAGTTCCCCACT s monDom4.chr8 262284735 167 + 308469712 AGATTGAAAAGGAAGAGCAGGCCGCAGCTGAGAAAGCAGTGACAAAGGAGGAGTTCCAGGGTGAATGGACTGCACCTGCCCCAGAATTCACTGCTACTCAGCCAGAGGTGGCTGATTGGTCTGAGGGAGTACAGGTTCCATCTGTGCCCATTCAACAGTTCCCTACT a score=4863 s mm8.chr4 56482538 109 + 155029701 GAAGACCTGAGTGCTCAGCCAATCACAAAGGAGTGGACAGCAGCTCCCACAACATAGGCCATGGAAAGGGTTGTAGCCACCACTGAGTGGTTCTGAGCTCCACTGCAAA s monDom4.chr8 262285158 109 + 308469712 GAAGATTGGAGTGCTCAGCCAGCTACTGAGGACTGGTCTGCAGCTCCTACTGCTCAGGCTACTGAGTGGGTAGGAACTACCACAGAGTGGTCCTAAGTTTTATCCCAGA a score=-177 s mm8.chr4 56482647 102 + 155029701 AG-----GAAAG----GGGAAAGGGTAGAAGGAAAAGAA-----AGTTCCTAGGAGCTGGGAAAAATGTATTCTCTGCTCTAGAAACCAAGATTATTTTCTCT---TTCTCTCCTCTTC s monDom4.chr4 73754468 105 + 430141050 TGCTCTTAATAGTTTTGAAAAAAATTTGACTGAAaataaacatcagtttct------tacaaaaaatatttctgttactgt--------atataatgttctcttgattctcttcatttc a score=14469 s mm8.chr4 56577731 722 + 155029701 CTCTTGCGGACACTGTTACAGGCTGGGCTCTGTGTGCTGTGAACAAATCGGCAGAGATGGAGGGGTCTGTGCAGTGACTACACCAAGTAAAACAAGAAGGCTTTCCACTCCGTGACACACCTATGACTCAGTCTGCCCGGACAAAGCTGGAGGTTAAGTTTCCTTGCC-AAAGCTGCAAGGAGAAACATGACACCCTTTGCTGGCTAGGAGTAGAACACGCTTTATTAACCCGGCCTTAATTATATTCCATTTTGAGATTCAATAGTTTCGATTGCAACACTGCATGAAACCAGGGTGAGTTGCACCCCATGGTACTCCCATTGAC----------------AAAGTGCCTGGGAAGCAGTGACCCGCTTC-TGCCAGCCAG---TTAGGAAGGCAGTGTGGAACCTGTGCCCAGCT-----CTGGGGGAGC-CCCTCAGATGGCTC-------CATCGTGACATGGCT---------GAATTGGCAGCCAGTTAGGTCAGGGAAACTCACTA-------------GAAAAGTCAGAAGTGAATGTGGCACAACTTGTACGGTGTCATAAGTGACCAGGAACTGGAAATGCCACCTTCGCCACCCAGATGAAGTTCTTTTCAACTCATCATTCGCTTCTCTCTATTCTCACTTCTACAAGAAGACAGAAAATGCCCA-----TTAACTCTGAGGTAGGCATATCAG-AGTCAACGCTATCTGAAGTAAGGGAATGAATCATTTACTCTTTA-TTTTGAAGTCAG--TTTCTCCACACATTTTGCCTG s monDom4.chrUn 156163246 769 - 174229318 CTCTTGTAGGTCATGTCATCCATTGAGTTCTATTTCCTTGGTACAAAGCCTGCAAGATAGAGCCAGCTCTGTGGTGACTTCAACAATTGAAACAATA-GCTTTTCTGCCTGATAGCATGCTTCTGATTCAGTCTGCCCTGACAAAGCTATAGATTTTGTTTCCCTGCCTAAACCTGCTGGGAGAAATATGACACCCTTTACTGGCTAAGATTGGAACATGCTTTATTAAAGCAGCCCTAATTATATTCCATTTTGAGATTCAATAGTTTCGATTGCAACACCAAATGAAACTCGCGTGTGTTACACATCGTGGGA----CAGTGACCACAAATGAGGTCTGAAAAGTGCCTCCAAATTAGAAATCCGTTTAGTTCCAAATAGTCTTCATTAGTGAAGACTAGAGTCAGCATCTAGCTGTTTACAGGGGCAGCAACCTGAAATAACTCAAAATTTCACAGTGCAGTGGCTCAATACAGGGAATTTGAATCTCTTTGTTAAATGGACATTAGATATATATGCCACTTTAAAAAGTTAGGGAACAGTGTAGAATATTTTGCATAATATGCAAAGCTATTAGGCAAGCAGGGTACAA--------GACTATATAGATTCATTTTTATGCAATCATTATTCTTCCTAGACTTTCAGTTGTGCAAAAGGAAAAAAAAAAACCCTAATTTTCATTCT-AGACAAGTGCACTAGTAATTAGTGGTCTTT----TCTGGAACTAGTTTGTCTTATCATTACTTTTGCAGCTAGCTTTTTTCTGTATGTTTTATCTG a score=876 s mm8.chr4 56583041 628 + 155029701 AACCAATACCCATCACAACCAAGATTGTATCAGAGATTCATCACAATTTATCTCCTTTGAGAGGCTAGAGAGGCTCCTTTTTGCTCTCTTGAAAAACCCGGGAAATAGCAAAAATGTTAACTAACCCTCCAACGTGTCTGATCAACTCCTCTGTTT--TAGAATATAGCTCCAGACATAC-TTTGGTCTCCTCCACAATTACAAGTCATATTCACTATAACTG--------------CCTGAGGAAGGCCTAGCACTTTCCTAGTAAGCTGAAAGTGTAGTTGAGAATTCACAGTTGCAACTTGTACAAAAATGGGA-----TTTCCAACAGAC----CTACACTCTCCT--CCAAAGAAAGC---TTGTCTGTG---TAAACTTATCTCAAAAACAAAAACT--GAACCAAACTCACAAAAC--------ACTCCTAAGAAGGCTCAAGCTTCACACTGAAAC----CTGCAGCA------GAAACCTCT-AGAGAAGACTGTAGGAAAGAACTGGGTCTTTTCCTTCTTCAAACTGAGGCTCAAGCAATAACTAGCCAAGTGTGACTCAGAAGATGTATCTGAGCTTG-TGAACAAGGCCCCGGGACTCTGGACTGCGTGAT-----CATCACAGTT---------CTTGCCATGAGCAAGCAGAGATGCTGT---GACTCGTACCTCAGATTCTTTCC s monDom4.chrUn 156167585 677 - 174229318 AGCCAAAACTATTTATTAAGAACAAATTATCAGAAAATTAATTCTATTTTACTTAAGGAAGATGTCAG-----------TTTGTTCTCTTGGAGAGAAAAACAAATA--AACAATGATTAGATTCCCATCAATCTTTATTCTGGAACTTTCTGCCCAGTCAGTGATTACTCAGGATAAGCATTTTGTTTCCTCAAATACAATAAATTGTCTCCACAACA-CTGAGCACTTCCAAAATCCCAAGGA--GTTTAGGACTCTTGCTATAATAGGGTAGAACATCACTGATTTTATAAT--CTAATAGGAGAAAAAAGAAAAAAACTCCCCAAAGGGCAAGACTGCTCTCTCCCAGCTAAGCTGAGCCTCTTATCTATACCATGGATCTCTCTTGCATATTCAGTCCTAGATCCACAATCTGAGAATTCCCATTGACTTCAAAGCAGCCTCAAATTTAGAGCCTGAACAAGGCGGGAACAAAGTGGGAAATCCCTCAGGGCAGATTG---GAGAGAACTGGATCTTTTCCCACCAGCAAGTAGGACTCATAGGAGAAGAACCTGAATATGACTCAAAAAGCATTTCTGTACCTGTTGTACAAAG--TAGAAAACTTATACTCTTTGATGGTAATGTCACAGTCTACAGCAAATTTGCCATCAGACAG-GGACATTCAGTTTAGATTCATGGTAGGGATGCTTCCC a score=1418 s mm8.chr4 56585278 192 + 155029701 CTGACCTCTGTTTGTTTTAAAAGAATGTGAGTCTGAGGCTGATTGATA--TTTAAAAAAAAAAATGAAGTTCAAACTTAAGATTCAGATAAAAATGCCGTTAATTTGTTCACTATTAAATAACTATTTTGACCTTCTGTTATATACCAGGAA----TTGTCC--------------------CAGATATTGCCTCAGATTTAATGAGTGAGTTGTTCC s monDom4.chr3 273675556 202 + 526135210 CTAATCACTGTTTATAGTATTC-AATCAGTAATTGATATTGATTGATAATTTTTTGAAAAGAGAGGAA---------------CAACATAAAAACTGGGTCATTTTGAACAGCTTTAGATAACTGTTTTTTTTTTTTGTCAAAATCTATGGAAATCTTGACCAtgtgaatcttaaaactgctcagactctacttcagaagatttgattaagctattcc a score=2910 s mm8.chr4 56587038 119 + 155029701 CTCCAAGCTGAAGCCTCAAGTCACAACAGAGACCTGAATCCATTGTTCTAGA-ACCTGAGCTCCAAGG------------GGATGCCCTTGTCAAGCCTTTTGCTATGGCTGTCCCAGGCTATTCTTCAAAA s monDom4.chrUn 156171800 131 - 174229318 CTCAAAATTTGGGGCTAAAGCCAAAACAAAATTCTGATTTCAT-GTTCTAGAGAGCTTAGCTCAAAGATAGTTTAATTAAGATTAATTTTGCCAAGGATTCTGCAATTGCTGTCATGTGACATTCTTCACAA a score=7202 s mm8.chr4 56595267 698 + 155029701 aggaagggaaggaaggggaggaaaggaagaagggagggagagaaaaggaaggagggagggagggagggagggagggaggaaagagaaaggaaagaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaag-gaaagaaggagagaaagagaaagaaagaaagaaagaaaga-agggagggagggagggagggagggaggaaggaaagagagagagagagaaCTGCAGAG----TCTTAGGGCCTCATTGCTGATCCTCTGAATCAAGGAA----------CTGCAGTCACTGAACCCCAAGATTAACATTCAGGCTACAGAAGGTC--TTCTCTAAGCTGCTT---CTGGGTGGTCACCCTTCGTTCTCTTCATGAGAAGCCACAGAGGAGACACCACTTCCTCCTGGATTCATCATCCCACCTTTAATAATTAGCCTACACTAAGCACCCGGAACA----------TTCCAGAAGGTCACAAACGTAGTTAA--TCTTCATTAATCCCTCTGAGGCACAGAGCTTCCTGAGCTGAGGTACAGCAATGTGAGCAGTGATCTTAGGTGGAACCCTTAAA-TTATAAAACATATTT-----------------------TTACAGAGTGCGACTAGTATTCTT-------TTCAAATATTTTCAAT--------------------------GCTTTCAATT-----------------------------ATTCATGGAGAATTCACATTCTGGTGCTGATGCATTGTTCTGGACCTTTTTCGTCATTGATAATCATCAAGCC s monDom4.chr3 273676673 788 + 526135210 AGATAGATAAATAAagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaaagagaa-agagagagagagagagagagagagagagagagagagagaaagagaaagagagagagagagagagagcgacagagacagagagagacagagacagagacagagacagagagagacagagagaggcagggagggggaagggagagtgagagagaaggtgacagagagaTATTCTTCTGTATTCCTTCAGGACTGTCTCAATGTAGGAATATAAATTCCCAGAGAACCCTTATCTCTATTGTTAAATGTCTGAGAACCCTAAGTCAGTTCTTTAATATATTCAACCTTGCTTGTAAATGTTTGCTTTC--------AAGTTTTTAATTAAGCA--AGTTTTTTTTGG-----TTATTTGTTTGTTTGTTTTTTGTGCACGTCAAGTCTGAAAAACAGATTGTCTTTTTCTGGGATTACTAAGACTGAGTCAAAATCTTAAAAAAAAATTCT------------CTTTTAAGATGGGACAGAGCAATGAAAATTTTAATTACTAATGTAACTTTTCAACTTATAAGAATGACTTAAAACTTCTTAGGAGAGACAAAATTTTAAATTCCTAATTGTTTGCATAGATCAATTCAGATAATATCAAGTTACTGATGGATGAAGCTGGTTATAGGACTTCATTTGCCCCTTGGAAAAGGAAAATAAATGAGAGAGTCATGGAAAACACAAATTCTGGTGGAGACACATTCTTCCAGGCCCTTTTGAATA-AGATAAGAACAAAGCC a score=5335 s mm8.chr4 56597905 206 + 155029701 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CCATGAATCCTGGGAAAACAAGTAATGTTATTTTATCAGATTTTATTGGTCATCAGACAGAC--TAAAATGTGCATTCGTAAAGCTTTGCGTGTGCTGGTGAGATAGTAAAGTGCATTTTAATGGAAAAGATTGTTCTACCTATAGCAACTAAAAAAAGAAGTGATTCACTCTTTAGGCCTGACATGTTTTGAGAGACAAACATGCCTGTAAAGTTGGCCAGACTAGTGGGTGCCAGATGATAATTGACATGGACCCTAAAGCCACAAGATCAAGCCAGGACTTACTCTTGTTCCTCACTGGGGCTCTATGGAGGCCAAACACAGTATACAATTAAATCAAACAGTTGCGGAGAGAAAGAAATAGGTCA-----------------TTTTCTTCTTGTCAAGTCACAGAATGACATACTGTAGATAGCAGGAAAACCATTACTTGAGAAGTTCGTGTATAAAGTGTATGTTGGTGGATAAGCAAGGAAGGATGAAAATCTCATGGAAACAGGAAAACAACCTCCCCTCTTCCCCCACTAATACCATAAACAAAGTAATGGAGTTCCCAACCAAAGAGTCAATTATTTCTTACCTCAAACTTGGATGAGACTCAATGGAGCATTATGAGAGATTTTCTCAGGCACATGAGTAATTGCACAACTCATTAAAAAGTTATAGATGAATATTACTTGAGCCTCAGTTGGAGTGTTATAAAGTATGAATTCCAAAGTAAAATCTGGTTAAGGATTAAGTATGTATGAGAAAAAAACCCCAACACAGAGTAGTGAGGCAAGATTTAAGTCATCTGGAATGCACCTGAACATAGCAGTGGTCACAATGAAATGAAGTTGGGGTGGAGGCAGAGAGAAGTTCAGAATACTAGGGTCAGACTTTGCAG a score=1569 s mm8.chr4 56636367 156 + 155029701 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GAGGGGGGAGGAGGAGGGAGAAGAGGAAGAGAACTAAAA-ATAGTTGAAAATAAAAAATCCCCAATAATCAAGTCGTGTTGACAAGATATTCACAAGTATACAGTCTCAAGAATT--------ATTTATTTATAAGTCTCTT----TTCCTAAAACTCTGATCCTCACCCCAAAGGTACTTGAGCACCTGGCCATCAGCCAGCTGTACTGCTAATGACTTGGTCTTAGAACAGCAGCATAAACCAATGACGACTCCATCCACTGTCACAGACGAACTAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAA s monDom4.chr6 105321106 294 - 244784211 GAGAGTACAGAAAAATGGCAGATAGAAAAAGTTCTGACCCATGGTTATAAATAA------CGTAGCATTTTATTCTTTATTGGGAGCAACTAACAAATACAAGAGCTAAACTGTTCCACTTAAATATATAAGGAAAATTCCTAAAACTCCTAGAGTTTTGATACTTACCCCAAAGGTATTTAAGGATCTGTCCATCAGCTAACTGTAGTGCCACTGACTTGGTTTTGGAATTGTAACACAGACTGATCACAACTCCATCCACAGTGATTGATGAGCTAATAGAAATGAGAAAAGAAATTA a score=1474 s mm8.chr4 56873854 147 + 155029701 TAGCAGAGAGGTAAGTATAAGAGATAATCTTTTTTTTTTACAAAAAGGAGAAATGTCTCTGCTTTTGCTATAGTGGAAGCTATCACTATCCTTTGGAGACACACTGCCTATGTCAATGTAATACATACATACTTTGCACACACAGAT s monDom4.chr6 105321420 144 - 244784211 TAGCAAAGAAAGAAATATAA---AGATCCAGTTTCTTTTAAAACAAACCACAAGGACTATTCTCTACCTGTATTATAACTTATAACAACCATTTCACAAACCTCAACACACACAAAAATGTAAAATATGTTTTGAGTATATACAAAT a score=7842 s mm8.chr4 56875073 211 + 155029701 TGATACCTGACATCCAGCTGGCCTTGCTCCTCATCCACCTCAGAATGGGTCACAGTCAAATGGTGAATGATGGACTGTGAGCTGGAGTGACTGTAGCTTATAGCCAGGAAAGTGTCGTCTTCAACCCAGGTGAGAAAGCTCAACTGCAGTGCGTTTActtcttcttcttcttcttcttcATTGTTCCCGAACTGAATCCTGT-TCAAATATT s monDom4.chr6 105323421 203 - 244784211 TAATACCTGATATTCAGATGTCCACTTTTGTCCTCTGCTTCAGAAGAGGCCACAGTCAACTGGTGAACAACAGAGCTTGGGTCAGTCTGACTATGGCTGACAGTCAAGAAAGTACCTTCTTGGATCCAAGTCAGAAGGCACAAGTTCAGAGGATTTGCTTCCTGATCTTCT---------CTATTCTCAAGCTGAATTCTGTGTGAAATATT a score=7473 s mm8.chr4 56878586 138 + 155029701 CTTACGAGTATCTCTTTTCCAAATGAGGTGTTGTAAGAGGAACTTTAAATCCATTTCCACCCACGGCTCCTAGTTTCACTGTGGAATCCATGTTTGGCTTATCACCTAGAAAACAAAAAATGAAAATATTATCATTGT s monDom4.chr6 105325889 135 - 244784211 CCTACTTGTATATTTTTTCCAGGTGAGGTGTTGTAACAGAAACCTTAAATCCATTCCCCCCCACAGCTCCTATTTTCACTGTGGGGTCTAATTCTGTAGTACCACCTAGAAAAC---AAATGTAATTATCATCATCAT a score=8915 s mm8.chr4 56880638 230 + 155029701 TACCACACTTGTAGACAGAAATCTGGTTACTGGCGTCGAGGACAGCAAGGTCAT------TCCCAAGGTGAGCAGAGAATATGACTTGATTCACTGGATGTGGGATCAGCAGCCGGTAGGTACACATGGGAGGTGGGACGACCGTCTGCCGAAAGACTGTCACCAACACCCTGTCTACACAATGAAAAGGAGGATTAGCCAATGCAGG-----------TATTCAATGTGAAAAGCAGGCAGTAAGC s monDom4.chr6 105326927 247 - 244784211 TACCAGATCTATAGATAGAAATCTGATTATTGGCATCTAGAACAGCAAGGTCACCACTTCTTTTTGGATGTGCGCAGAATGCAACTTGGTTCACAGGATGTGGAAGCAGCAACTCATAGGTACAGAGAGGAGGAGGCACCACAGAATGTTGAAAGGCTGTCACCAATACCTTGTCTTCAATGGAAAAAAACAAATCAGTATATAAAGGATTAGACACAATATTTTAATTAAAAAGTAGGCATTTATC a score=12078 s mm8.chr4 56881788 330 + 155029701 ACTTACTTCCATCAATAACAGCCACATTTGCCAAGTCATTGGCACTATTCCCAGAGCTCCGATCAGTGGTCCAGTGCCAGTCACAGCATAGATACCGCCAGCCCGTACAGAGAACATGGAGTCGACACGGCGTCACCGGGTCCCACAGCAGAGACACGATCTGGTTCTTCCCAGTGGTGCTGAAGGGCAGGCTTTGCTTCAGATACCAGTGATAGTTCCCCACGGTCCAGAGCTGGACTGTGTGTGGAGGGAAAGGAAGGAAAGGCCATCAGAGACCGGAGACCAAGCTGCAGACCATTTGCAAAAGGGGAACAGGTCCAATTTTATATT s monDom4.chr6 105330031 312 - 244784211 ACTTACTTCCGTCAATGACTGCTACACTTGCTAGGTCACATGCATTTTCTCCTGTGCTCCGGTCAGTATTCCAATACCAATCATAGCAGAGGTAATGCCATCCTTGACAGAGGACATGTAATCTGTATGGAGTCACTGGGTCCCAGGTAAGGGACACAATCTTGCTCCTTTTGTTTTTACTAAAGTGCAGATTCTGTTTAAGATACCAGTGATAGTTTCCAACTGTCCATAGCTGAACTG-----GAAGAGAAAACAA--AAGGGCTGTTATAAACTG----------TACAGACT-TGACCAGAAAGACCATATTTCCTATTATTTATT a score=2447 s mm8.chr4 56884175 429 + 155029701 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CTTTCTTACCATAGGATGCTGGTCCTGCATTCTCTTCATAGCTAAGGTCTTCAAGCCAAAGTGCAAGGACTGTGGAATCTGAATTCCATAGTAGCTCATTTACCTGAGAAG---AAAAATTCTGTTGTTATTGTACTTTTAAGTTTTATTGACTTCTCATTCAA-GTTTTCAAAACCCAAATATTTCAATCAACATTGGAAGCATTTCTGTTCCTTTATACAAATCAAGGGTTCCAA----GAACTTCAAGGCTGCTTAGATGACAAGATCTTAAGTAATGCCTCAGGGCTGACTAAACTGATTTCAAAAGTGCTATCTTATTTTTAACTGGTGAATGGCTTTGGCAATGAGGTTATTAATCTTGTAAAATTAATGATAAAATAAATTTCTCTCTTTCCCCAGATACCATTTTCCAAAACA-ATTCACTTCATGTGGTAGGTTTTA-TGTCAGTTGAAATGAA--AGGGGATGATATGAA a score=9019 s mm8.chr4 56884936 252 + 155029701 CCTACCTTAACTTCATCTTTTAAGAAAGGAAGTGTAAAATGTCCATGAAGAAGTCCATTTTTCTCAAAAAACACAACATCTTGCTGGTTGGGTTTATCTTGAGTAGATGCAATCAAACTGCCTGAGGGTCTGAAAGCAGAACCTAAGT----CAGAATAGTCAAAAACGCTCATCCTGCAGGCCCAGAGATTTAGACAAGAGATCTTATTTTCTTCCCAGAAGAA--------------------AAAAATTAATTGAAATCCTTTTTTCCAGTAA s monDom4.chr6 105334136 274 - 244784211 CTCACCTTTACCTGACCTTTCTGGAAAGGAAGTATAAAATCTCCATGAAGAAGTCCATTTTTTTCAAAAAACACAACATCATGTTGGTTAGGTTTATTCTGTGTAGATGCAATCAAACTACCAGAAGGCCTTAAAGCAAAACAAGAGTATTACAATAAAGCCAAGA--GATTTTCCCAacagcaaagaaagtggaagtaaaatgggtacccacttattgggaaactgctgcacaaactatggtatatgaatcgagtgaaatattttcttactgtaa a score=6599 s mm8.chr4 56886074 120 + 155029701 ACTCACTTCCAAGCCAGGGCGGGCCCCAGTCCTGGCACAGACTCACTGGTTGACTGCAAGGCAAACTCTCGGTTCCATACGCGGATCTTCCGAGCCTCTGCAAAGGAGGTAGAGTAAACA s monDom4.chr6 105336527 120 - 244784211 ACTTACTTCCAGGCCAGAGCTTGTCCTAGTCCTGCAACAGGCTCACTGGTTGATTGTAAAACAAGCTCTCTGTTCCATACTCTGATTTTCCGAGCCCCTATAGAGCAAATGGTTTGAAAA a score=6594 s mm8.chr4 56886375 196 + 155029701 AAGGAAAAAAACTTCTCCAGATTT--TAATGTAGGTAAATTTTTAAG--------------TGTAATTTATTTCCATACCTGTTTGTCGACAAACAACACTCACAGCAAAATACTGCCCATCCCCACGCCAGGTAATGTGTGGTCTGCGGTCGTCCCAGGGCAAGGCA---TTCTCAGGCTGAA-GAGAGACACCAGTGTTACTAGGGAATCAACT s monDom4.chr6 105339265 216 - 244784211 AATGAGGGATAATTTCTTGAATTTACtaataaaattaaattttaaaaaGAATTCTTATGGATGCAGTTCATATCCATACCTGTCTCTGGACAAACAGCACTCACAGCAAAAAACTGGCCATCTCCCCTCCAGGTAACTTGAGGTCTATGATCATCCCAGGGCAAAGCAGGCTGTTCATTCTGGGTGAGGAAGAGAAAAGAAACAAAAATATCAACT a score=5357 s mm8.chr4 56888137 196 + 155029701 CCTTACCAACTGCACCGGAAAGGCTGTTGGCCTGCCTTCTGAGCCGTGGAACTGGGTCTGCTTACTGCCCCATCCAACAGTGACAAACTTGCCTACAGTTTTTCAAGAACAAGAAGACAAGTAATAAGCAGAGGAACTGAAATCGAAGCAGTTTCATTCATTCTTCATGAAGACAGTCACTGACAACTCAGGAAGC s monDom4.chr6 105342904 189 - 244784211 CATTACCATTTGTTTACGATGTGCAGCTTGTTTGCCTTCTGATCCATGGAACTGTGTCTCCTTTTTACCCCATCCAACAGTGATAAATTTGCCTAGAGATT-----AAATTTGAAAACA--TAAAAGATAAAATAATTAAGCCAAAAAAACTTCCATTCTTTCCTATCTAAGCTATTCATCAGTAATTATACAAGC a score=5466 s mm8.chr4 56889478 164 + 155029701 AACTTTCGGCTTATGACAACG-AATGTTATGAGTAA--------GAAAATGGGTAAAAC-AGGTCACAGAATGTTTCCAAGAAA------CGCTTACCTTCTCCAAAATCATCCTGGTGGATCTGCTCCTCTGCGATCACTTCAAAGTCTTTTGTCATCATAATCAGGGTCTGTTGAGCT s monDom4.chr6 105343775 180 - 244784211 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s monDom4.chr6 105346012 442 - 244784211 TACTGTAATAATTTCATTTTAAAAATTTTATGTTCTGTCACTAGAAGACA------ATATAAATTCTCTGTGTGGTTCTAATCAAGGAATACCTTTTAAACATTGCCAAAGCCTAGATAACAATTCTATT-------AAGTATAAGGTGAAACACAGAATGCAGTAAT---ATTTCACT-TCAGAAAAATACACTCCCAAGAATA--CTATAACTAACTTAAATGAAGACCTTTACTATAAACACAGGAACCATTTAAGCCACTTTCCAGTTTACATGAAGACATTTATCCAACT--GCCTTTTACCTGGCTG----GTGCTGAGATTACAGAGTATAACATCCCCCGAAGCTGTGGCCACACATACAGACTCCTGATCCAGCAGGTCCTGGATACCCACGATGCAGCCACTGCCATCTTCAGGTAGAAAACCCCCTGATATCAAGGGAATCTCACAGGTTACCTTT a score=8257 s mm8.chr4 56893950 361 + 155029701 ACTAACGTGGAGAAGGAGGTTTGGAAGAAGACAAGTGCAGGGCCAAGGCAGGG----GCTGGCATCTGCATCAGTGACCTACTTCTCTTCTCACAGGATCTACTTCCGTCAGTCCACGTTCTGAGCCAATCAGCACCGTGCCCTGCTCAGCTCGCAGACAGAAACACTGAGGTTTCCCTGGTGCCTGAATGTCCCGAAACTCCAGGGTCCGATGCAACTTCAGATTTCTCATGATGAAGCAATTTCTG-AGGGAAAAAAAAAAAAACAAATTTTCCTCAATGAAACATTAAGTGCTAAAAGAGAAAGGACTACGGTAACAGA----GATAAATGGCCACCCTCACATTGAGAAGGGTTCAGGAAGGAGAA s monDom4.chr6 105352237 355 - 244784211 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s monDom4.chr2 138601334 1627 + 541556283 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aaacTAGATTGTAGAGTAGTTTTGGGGTGGCCTTGGCAGGTTCTGATGATAGTAGAAGAGGTCTCATAAATGGGGCCAAGGCATTTTGGCTTAATCTGTAGGCAAATAAAATGCTA-------TTTACTAAAAGAAGAACTAGGCTTGGGAGGGAGAAGCACGTAGGGCTTAGAATAAGAAAGTTTGAGTCA--CTTAATGGACACCCA--GATGCTAATGTCTGGGAAGGGCTTGGTCCTCTGAATGATGTTCAAGAAGATTAAGGAATTAAATTAGGGAGTCTCCATGGCAATTGAGATCCTTTCGCTATTCTAAATGATGGCAGTCTAAGCGATGTAGAGACA--GAGATAAGATTCAAACTGATTAATAAAAAAATTAATCTTTTCTATTCAATAAGTTTGACCTTTATCCTTATATCCATTTCCA s monDom4.chr2 389484928 362 + 541556283 aaatcaaaatattgggcaatacataggtggtaatcataactctgaatgtgaatgggat-gaactcatccataaaacagaagcaaaa-agcagagtggattagaaagcaaaattctaccatatgttgtctacaagaaacac---acatgaggcagatagacacacacagattaaaggtaaaagactggagcaaaatttattgggcaacaactgaggaaaa-------gaaggcaggagtcccaatcatgatatctgaaaaagtcaaagta--aaaatagg------------------------tctgacta--------aaaggggatgtagggaatgtaattacatcatgataaaaggctgtatggacaacaaggaattT--TGTTTTACACTCAAAAACAGT--------------------TTTTCA a score=8694 s mm8.chr4 57549516 369 + 155029701 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atcttataatctcagaaaatttatggttgaatttattattacttgtaattcg--gcaaataaaatatctttTAAAATATCAATTTACCT---------GCAACTAATAGAGCATATTCTTATGGTTCTCCCAATATGGGCAATATGGATCTTTAGCTCCTATAAAATAATTCAGGTTACCCAATA--------------ATAGAAAGCCTTAATTACATCCCACAGAAA---AATCAAATTATGTTAACAGA a score=1253 s mm8.chr4 58873478 335 + 155029701 ctccttttctgta-ataactacagcttgtgtcaaggtgacacaca----caatcagcaaatacGATTAGGATGTGCTTATCTCACCT-------TGACCCACACTAGGAGCTGTTTCCTAACTAT----------CATCGTT----CCCTCCTTCAAGCCTTGCTCCTTTCACATGTTCTACTGTTAG---CTTCTTCTATTCATTAGCCTTAAATGTTAGCATCCCTCCAGCTTCCTC----------TTTAACACTCTTCTCACTCT-CTCAAGTTAACGCTAGCCATGTTTACTACTT--AAATTATTATACACA---TGCAAAATGTATGC---CTATATATTAAGCTTTCTCAATAATTCAAGAGTAGTCTATTCAAC s monDom4.chr5 289061895 373 + 308900514 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CTAACG---TACAATACGAATGTAAGAAGTGTGGTAAGACATTTAAAAGCCGTACGACCAGTCTTAAACATCACTGTACACAGTAATCCTGGGGA---------------TGGAGGATGGGGGAGGGGTGGTTAATTCAGATCGTGTGCTTATTTAAAAGCTCGAATGATAAACTACCCACTGCATTGATTAGAAGCTTCAGCCTCAATGGGTTCCCAACCAGGAATAGACTTCTTCCCCTTTGGTCCTCTTCTTGAGGGTGGTCAGTTTTGATTAAACCTGGTAAAGTCATGTTGACGTGAAGAAAGCTGTGA---TGTGAAACGATT--CTGAGAAGCCAAACTTAAGTTTCCTTCAAGGAATTCTCCTTTTGGTCTCCCTTTCACTGCcatactg----gaaaagaccatacctggactctcataacctgggttctaacccagtttgccagccaaccactgtgtcaccttaa s monDom4.chr6 193073606 426 - 244784211 CTGGAGAGAAGCCATATAAATGCAGTGAATGTGGGAAAGCTTTCAGCAAGCG---AGCAAATCTTAATCAACATCAGA-AAATTCATTCTGGAGAGAAACCCTTTCAATGTAGTGAATGTGGGAAAGCTTTTACCATCAAATCTCGC-CTTACTCA-------GCATTATAGAATTCACTCCGGA-----GAGAAACCT---TTTAAATGTGATCC--ACTGGGGAAAGCCTTC--ACCATCAGGTCAT-----------------GCCTTAATGAACATCCAAAAATTCATACTGAAGAGA--AACTTTATGATTTTGGGAAAGCCTTCCCCACAGGGCCACATCTTACTTAATATCAAAGAATTCATATTATAGAGTTACATTAAAAGTGATGATGATCAGAAATGTCTCTGTGTGG-----CATATTCTGATACACTCCTCAGCAT-CAAAGCAAGTATTTTGTCAATGTAA a 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244784211 ATCAATAGCCTCATTTAAAGTGTCTTCTCCAAATTAAAGATGTGAGAGAAAGGTATAT--------AATAAGAGGTAG---GAGGTTGCCATGTCTCAGTGTACTTTATAATCTTGCCTATGGTTGGGCCTGTGCACCAGTCATCATGATAATAGTTTTGCCCCCGCTAGGAAGCAGGTAACTCCTTTCTGAATATGATACCCCAAAATAAGAGAATTTTCACCATTCCAGCCTATAACATCAGCTAGGATATAAGCCCTCCATTTAGAATTGGTAACCCTAGCAGGAGGGC-----AGCATTGTGCACTTGGGTAGAGGGTGAGTGCTACCTGTATTGGGTACCACAATGGGGACCTTTGAATACCAAGAGGGCAGCATTCAGGTTCCATATATTTAGAAATATGTTGGGCATCAGTGGGGGAGAAGGAACCCAGGAGGTTGGGGAGATTAAG-----GAAAACTAGGTCT-------ATCTACCTGGGACTTCTGT--------------GGTTCTTTTCCTGTGAAAGTCATTTAGATTCAGCATTAGTT--CAATTAAGATATATGCCTATTTACCTTACTGTGTCAATATGG---AGGGTCCTGTGTAAGTTAGAGCAAGGgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtatgtatgtgtTAACTGGAACCCATGTGACCAGCTCCAACTAGGAATAAATTTGTATATCTT---------GCTCAGAGATGACGTTTAAA---------GCATTAACATGCGATGTTTTTATTTTAAAAATAGGAATTGACGTTTTGGTAAACAATGCTAGTGCTATCAGCTTGACCAACACACTGGAAACACCTACAAAGAGAGTAGATTTGATGATGAGTGTCAACACTAGAGGAACCTATCTTACGTAAGTCG-GAGAGGAGAGGAGCTAAAAATCTCCTAGGGTTTTCTTGGAGGAAATGTTTTAATTACTC a score=8086 s mm8.chr4 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155029701 TTGGTACGGACTTGCTATTTGCATAG--TCATATGGAGTCATATGTGTGTATGTGTGTTCTCTGCAGCCATTCACACTGCTGCTATGGATATGCTGGGAGGATCTGGTGTTGAAAACCAATGTAGAAAAGTTGACATCATTGCGGACGCTGCATATTCCATTTTCAAAAGGCCAAAAAGTTTTACTGGCAACTTTATTATTGATGAAAATATCTTAAAAGAAGAAGGAATAAAAAATTTTGATGTCTACGCAATTGCACCAGGTAATGCTTATATTTGTT s monDom4.chr6 191530017 280 - 244784211 TCAGTTCTTATATTCCATTTGTGTGGCTTGATTTTGTGTGCTAACTTTATATTTTTCTTCTTTGTAGCCATACATACTGCTGCTATGGATATGCTAGGAGGATCTGGTGTTGAAAGCCAATGCAGAAAAGCTGACATCATTGCTGATGCTGCATATTCCATATTCAGTAAACCAAAAAGTTTCACTGGAAACTTTATTATTGATGAAAATCTCTTAAAGGAAGAAGGAATAAAAAATTTTGATGTCTATGCAGTCAAACCAGGtaaaatttatgtttttt a score=5959 s mm8.chr4 59704804 132 + 155029701 GCAGTCAATGCTACCACAAAAACCACATTTTGGAGCTGTGGAAGAAACATTTAGAATTGTTAAGGACTCTCTCAGTGATGAAGTTGTTAGAGCGACACAAGCTGTCTATCAGTTTGAACTCTCAGGTGAAGA s monDom4.chr6 191534036 132 - 244784211 GCAATATCTACAACAACCACGACTAGCTGCTGGAGCAGTTGAAGAAACATTTAAAATTCTTAAGACCGCTCTCAGTGAAGATATTGTGAAAGCTACTCAGGCAGTTTATCTGTTTGAACTCTCTGGTAAGGA a score=7507 s mm8.chr4 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s monDom4.chr6 191739771 1296 - 244784211 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TGGATAACTGGGTATCAG--------TCTATA-AAAAAAGTAGTCTGACTTATTCTTATAACTATTTCTCCAAGATAGGGTTTGATCTTATCTTGTGACCTACTTAGAGAAATTAGCATTT------GCACACT-GGTTATTACTTCCTAGATAGATAATAATGAATATTAACAAGCCTAGCTTAGAGAGGGTAATTTATTAGTGTTTGCTGCATCTCTATTTCTTTGTGTCTTATCGTGTGTTCATTTTTATGCCTCCTCTGTCACACATCCCTTCCAGACCAGCCCTGATTAGTAATTGCTTTGT-TTTATGGCCTCACCTTTCCAATGTGCATTTGA-AAATAAAAGGCTACCCTATATTTATTGACCCCCGTTGATTAACATATAATCT------------TGTGAGTTTAATAAAAGCTATGACTCCTAAACAAAATTTTGTAGTAA a score=19528 s mm8.chr4 59805019 602 + 155029701 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agggtatgatgagttctttctacaataccttgaccttgggaattatagggaatgccagtactatgcttaatgcccatttgagca-caaaactgtttaaagctggcactagcatatcctgggccattgtctgtcttgagtatcttaggctgtggcacagatgccaagcagaagagaacatggctgataacatgtttggtggcctctcccatttgtaaagatgcacagataaaaccactaaaggtatcaacagagacatgaatatattttaactttccaaaggggctgtagttggtgacatccatttgccacaattcaccagaaattagtcctcgggtgttaactcccacatg---tggctcaggtaaaagggtcaggcagcctttacactgctggacaatttgtctagcctgttcatgggtgatggaaaatttaagcctcaaggtatgagcattaagatgatgtaaatcatggacctgttgagcagcagcaagaggagtaatagacaaagcagaagctattacttgagtggcctgatcaactatattgttgccttcagacaaaggtccaggcaagccagaatgagcatgaatatgaccaataaaaaaggggaaattatgagcaagaataagg--ttctgaagt-------------------ttagcaaacattggagat---------gcattgttagaagggcgaatataaggaatg----------gtttctaaaa-----gagggacagaggcagccacataggcgcggtctgaatacaaataaaagaagtttca------gacaatagttcaaata----------ctttaacaatagctgccaatt------caacaagctgcgctgagaagtctgtcataaaacatgagacctccccaccaatattaaaagcagccatacctgaggaggacccatcagtaaaaactaacatagtcctgggaaccgggttttgccttgttctcttagggaaaactacaggtgtcctatatagaaactgaaccaatttatcagcagggaaatgattatcaatcacaccttgaaaggagacacacttaactgcccaa----tcgtcattatttttgagtaaccactgtacctgagaggcataataggggagaacaataacatcagggtctctgccaaaaag------------------tttaagg----gcagtttctcttagcaa------------ccaactgaggatatgtgggcagcactttagagggagaggctggcatgtggacccaaaaaagagatttaagctgccacagcagacttgtgagtgaaaagggagtagggaagacaaggaac-----tggaggggaagttctagggagaaatacccaacattttcctcactaatggcctgttctactttagctagtgacactcgtgcctcttgagttaacatgcatggagaggatggatctgggtctccccgca-gaatgtcaaacaaaggttttaactctcctgtcataagt------tttagataaggacggagccaattaatatctcccaacagacgttgaaaatcattaagagtctgtaaaggaatcttgtcttacctgaaacttttgagagagaat s monDom4.chr3 253284200 1557 + 526135210 agggtgtgaggtgttgatccaa----------accttgaggattatatgggattcctgtcttttgaattatttttaattgtgaagtgaaattagcaagagctt-tagacgtatat--------acattatgttttaaagatttttgaaatacCCATAAACTAAAATGCAGATAGTAAATAAGAGATTACATGCTTTACTGCTTCACCTGTATGGATAGAAGCAAAAATTAGATTAgaaaaactatccacagatacatgaatgaaagaggaacttccaaatggaggataatgtgtaacatccatttgctgtagatggttaggaaggaggcctttgggattaattgcaatagaagatagactaggcagtatgggtaaacatgatgggcaggatttgacaatagatctgacttgttctttagttaatttgaacTGTAACTGTTAAGAGTGGGAATTTTGATGGAATAATTTATGAGATTCTTGGGCTTGTTGGAATGGTGAAAGGGTCATGGCAGTACGTAT---------------ATATACAATACTATTTCCTTCTGTTAATGGTCCTGGTATATTGGAGCGAGAACGAATGTGCATGATAGCAAAGGGGGTTTGATGGTTAATAGAAAGGGATTATAAAGTGGAAAAAAGTTGGTACAGATCAGGAGACAGTGTAGATTTTATTAAGGTTTTTCAATATGTAAAGATGTATGGTATGTGTATCTGCTGTCTGTAAACTTGTTAATGGATAGGGATGGGTATATGGTTAGGGCATGAATA--AGTGAATATAGTTCCACTTTTTGAGGAAACTTTCAATATGCTCTGCTCCTCTCATCACAATTAGCTTTTTGAGGACACAAAAATGACTTGGGAA-----TGGTAAGGCATATATTCTGGGTAGGGAAGTGAATATCTGT-GTTCCAGTTGAGGATCCATCTATAAAGACAGTTGTGACTTGTGAAATAGAGGAACTTAGGACATTTTTTGGAAAACATATAACATGTTGAGAAGCAAACTGTATTAGAGGATTGGAGGGGAAGTTATGGCCAATTTGTCCAGGAAAGTCAGCAAGGGAGATTTGCCAAGGTATAGAAAATTGATATAAGAAAATTATGTGTC-------CCTTAGAAAAGAGAAGGATATTTGTAGATTCTCTAGCAAAAAAAAAAACAAACAAACAAACTATAAAGCTTGGTGTCTTCCTTTGGTAATAAAGGATGATACCATGTAGATAAATATAGAAAGAGATTTGGAGGGAGTATGTGCTAAATAGATCCATTCAAATGGTCCATCTTGATAAAGTAGACCAGTGAGTGAATGTGGGGTTGCAAAAATGAGTAATGAAAATGGTTGGAATGGACCAAACGAGAAAACTGAGAATt------actaagagcttcttgaacttt------ttgcaagtaggcttctggtgttagaattctagatcaaactggatttgggtctcctattaagaatgaaaaaaggaga--------ctaaggtcagaagtggataatttaaaggatggattatccaattaatatcccctaataatttttgataatcattaag----tgtgagataatctaaatgaatggttaatttttgtggccgaac 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aacccaaaaacaagtgaggaggatggatctgaattttctctgga--taaacccagagtccttgactctgaagggcattaa----caagtttttgactagcaaatatataattgttcttgatca------ggtccagcagtcaaaatgtcatccgtgtaatggacaacgtatagattagggtaagacattctgaatggatcaataatttgtgccacatatttctgacaaagggtaggactgttggccatgccttgaggaaggaccctccattggaagcgaggagaaggccctatacaattgaccactggaagggtaaatgcaaagcgtttacaatcttcaggatggagaggaatggaaaagaaacaatcttttaaatcaatcactaactttgcatatcctctgggaatagccaccaaagaggggatcccaggttttacggcccccattgggaccatggttttattatatgctctaagatcttataacaacctccatttaccattttgctttcttataacaaagataggggtgttccaagtcgaagtggaagattcaatgtgtccagctgccaattgttcctgcactaactctatggctgctgacaatttttcgacaggatgggactactggtcaagccagacaggggtatcatctttccatgtaatcttatctgcctgatgtgcagggagagcaatggtccttatgaaaaatgggagttgtaacctaagcctgcacgatctatcttaggggttgcctctattggtgtaggcctcccttggctatttttaccccgtccctgtccagggagataaccatgggtgagcatttcttgagtaatgactttattgggactgcacataatgactctcatttgagaaagaatgtccctcccccataaattaatgggcagaccagggacagcataaggctgaata--aagccagagtttccctcaccatcttcccaagtcaatagctgtgaactctggagagtatttttagattgtccaattccctgtaaatgagttaaagaggcctttagcggccaggcagcaggccaggcactttgtgaaatcacagtggaatcagcacctgagtctaagagaccctcaaag-ctcttgctgtttatcttaaggca----gagtgtagggcggtctttggtaat-tgcttggacccagtaaaggtctgatgaccc s monDom4.chr3 253285777 1073 + 526135210 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attgctagattggaagtgtctaaaggtagaggcagagcttgtgctaaacgttgccctttgaata------taaatattg-gaccttgag---aggtactaactaaaattttaatttctccagtatagtcattatctactaatgagggatggacagtaagttcttttaaagtggcagaagcatgccctaatattag---aaaataaatattgggtggaggaggcacatagaccctcgtgggaaggatttgaacgccatcctcgggtgttaaaactgtgtcggaggcagaacacaagtccaatcctgcgctacctgtagtggctctggagagaccagtggcTGGTTTTTCTGATGGCTGTACCCCGTGGCCAGGAGAAATGGGATG-GTTTTTGA--GACTTGGGGCTGTCCCCCATATCCGTTTCCCTGAACTGGAGGCAGGGGATTCCCAGAAGCATCTGTTTGGGCTCAGCAGGCGTTTATCCAATGTTTTCCCTTTTTGCAGTGTGGACAAAGAAAATTGGGCTGCGTAGGCTGAAAAGAATGGTCAGTAGGTTACACTGGAGCACCTTTAAGGGAAGGTGCAGTGGG---ACACCGTCGGGTGAAGTTTCCAGGCTGACCACACTTAAAACAA-------CTTTTCTGGGGGC--------CGGCTTGCTGAAGAGCTGTGCCTATTGCCATAACAGGCTGAAGAGCTGCACCCATTGTAAGATTAATAGTCTGGGACATCTTGTGAGTAAACATATCAACATCACGGCAAAGATGAATCATCTCATTAAGATCCTTGTCTCTAATCTTACTGCGCAAGATTGCTTTACATGCCGAATTAGCATTCTCATAAGCCAATTGTTTTACAAGTTTATTGTCTGCATCTTCATGACCTAGGGTC---CTCTCTGCAGCCTCAAATAAATGACTCACAAATCACT----ATAGTCCTCCTGGGCTC-CTTGAAT-------------AATTTTTTTAAAGGCATAATAACGGATCCTTTCA 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GCTTATAAGAAGG------------GTACTCATGAGCTCTTCGATAAACCCCTCTCTTTTTACTAAGGCTCGCTAAAATAAA---CTAAAACAGAGAATACATCTACCAAGGAGAACTGAGGAACTAGTGGGTGACTGTGGCTCTAAGCAGGGGAGGCTGTTCCTCCCTCT---CTTCCACAAGCAACATAACAAGGACATTCTTACTAAACAATAGATGACTCTGTAGTTCC----TCTAAGTTCCCTAACTATTTTACAAAGTCATGAAACTCCTA---GCAATTAGCTTGGGAAATGCT----TTACACCATCTGCATTTACAGTGAGCATTTACCTGTTTTTCCAGTGACCTGTGGAGTACATGCCTTTGATCCTGTCACCATTCCAATACTTGATGGCCAAGTCCAAGTTTATTTATGGC------TCTAAGTACTTGCTTATGTTCTTTTCCCTACACATTGCACAACTATACATCTTAAAACATTGATCTTCTCTAAGACTACTCAGTAATAGCTCTCTGCATAGAAATAAAAT s monDom4.chr3 515954874 496 + 526135210 GTaaataacaaggagcttcccatgtgatctcattggctcttcataataaatctgggattttggataggctagttttattatattcctaactcaga----ccatgatctcagaaggactg-------gatgagtgact-tgacccaaaatcctggcagctgagatccaatctaggcatactctgtacacagtactagacaattcacttt---caatcttttagctttcattttcattGTCTAGACATTCAATCCTCTCTTTCTAGGTATGACATCACTGAGTGCATGTAGACTAAATATTCCTATTATTTCATCATCTAGCTTCTCTGTAAGCATTATGtaattcttc--gtgattgctttcaaccttattttttgttctagta----tctaagatcagatgaagaaattcagcactcttttttgcatttatccaaggcataagattttgttatgttccctactccttgaaag------------aagccattacttttcttta------------aatgcctcttttcactaaaataaaat a score=1771 s mm8.chr4 61680255 66 + 155029701 AAACATTTAAAGAGAGAAACAGATGAAAGAGTGAATAGCCACCTCAGTGATAAAATAATTTTATAT s monDom4.chr2 522024351 66 + 541556283 AGAAATTTAGAGGGAGAAACAAGTGAAAGAAAACTTTGAAATGAAAAAGCTGAACCAATTCTGTAT a score=1486 s mm8.chr4 61683035 152 + 155029701 aggatgattgcaagagtaatAAAAGTTAAAAACAGCTGTGGCCAGTATGGACCTGCTGCCTCTTTTACACAAGCTTTATTGGATATGGTGGTAGAAGCAAAAATTTAACCC-----CCAAGATTGGaaaggagatctcagtgagaatttatttggta s monDom4.chrUn 167986076 136 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s monDom4.chr1 295301468 1090 - 748055161 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CCCGGGAAATG---CCCTTTGGAGGGGCT-----GCCCTCTCTTCCACCTCACGTAGCCTACCCATGCTTTGGTCCCTGCCTCTCCCTTCTGATGCCTTCATAACTGCACCGTCACCTGCTCTGTGAGGGCTTCGCCTCAGCAGGCAATTACCTGAGTTCACATGGTTAATTGAAATATTCCTTTTCCTAGAGTTTTAATTCA-CCAGCGTAGTTCCAGGAGCCACAGATAATAAGACCTAATTTATAATTAGGGCTTATCAAGAATCAGCTAATTTCCAGACCCCCGATTCCCAAAGAGAGAGAACAGGGTGGGGGCTTTTCCTCTCT-TTCCAGGGAGTTGCTACCCACGAAGCTCCGAGAGACACCAGGGAGGCAGGAGAACTAATTGGGAGCTGGCCCTCCATCTTGGACAATTTATTAATTGGATTATGGGAAATCTCAGGCCCCA-GGCAAATCCCAAGGAGGCCCCACAACCTCC-CTGGTTTATGGTGAGAATATCAGATGTGGAGACTTAAGATCCAGGTCC s monDom4.chr1 296041905 512 - 748055161 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TCTTGGTTTTTTTTCTGTCCTGAAATGGAGCCAGAATGGATGGTTGATGGACAGCTGACCAA------GTGAAAGACAAGCATAAGATCTTGGCAGAGACCACTAAGGTTAAGGCCTCAGCTAgtctctgacacttagaactggtttggccctgggtaggtcacctaacttgagttttcttagctgtaaaat a score=13840 s mm8.chr4 62423849 588 + 155029701 AGAAAGGGAATTTAAAGTTTG----------GCTTATGGCAGTTGTATACATTCTTTTGTTCTAATTATAGCAGGATTAATCTGGCTTTAATAGATAACtattaataattcatataattatctttaataataaatttCTGTTTAAAAACGCCCATTTGCATTGCTTGTTTCAGGG-AATTCCCTTCAGTTCTGGAG--TCTGGTTAAAGCT----TATAGCAGATTATTAAAGCTTCCATAAGCGGAGATTTAATCAGGCAATCTTTTTTTAAAGAAGTAAGGATCAGTTTCCCATGAAAGAAGATGTCAGAGAAT----TAATAATGTTCAAATAGCTAGATATGTGTTCATCAGAGTTTCAA---GAATTAAAAAAAACC---TTCTTTAG--AGCCAGGAAACCCCTCCTACCTCTGCAAAATGTGCTTTCAGATCCTCTAGGGCCAGATCTCTTGGTTCTGCTGTGGCTTTCCCTTGTTA--------TGTTC-TTTGTTGGACATACAAATGTCCAGTTCAAAAGGGAGAGTGTGACCAAGGGGACTGAAGATATGAATGGACCTTCTGCTGGCTCAGTGGCTCG--------CTGGCTC---------TCTGGTGTGTTTGGACAAAAGAAGGTACT s monDom4.chr1 296071358 617 - 748055161 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TCTTGTTCCCCACCCCCACCCCCATCCCCTAGATGTGGATGTCCTCCAACGGCTGGGCCTCACTGGGAAGAAGTCAGCTGGTGGACGGGCCCCGGGGCTGGCCCCCATCCCTCCAGGAGTCATCCCGTTCCAGTCAGGATTCATCTTCACCCAGAGGACCCGGATTGAAGCTCCCACGGGTGCCATCATTCCTGCCGCCTTTGGCACTGACCTGACCTTGGTGCTGAGCCTGTGTTCCCACCGGGTCAATAATGCCTTCCTCTTCGCTATCCGGAGCAGCAGGAAGAAGCTGCAGTTGGGTGTCCAGTTCATCCCCGGCAAGATCGTTCTCTACCTGGGCCAGCGGCGCTCCGTGGCCTTCAGTTACGATGTGCACGATGGGCGGTGGCACCACTTGGCCATCAGAATCCGAGGCCAGGCGGTCACCCTCATTACTTCCTGTGGGAAGCACCAGCTGCCCATGGATTTGCATTTTAAAAAAGATGAGTCTCTCGATCCTGAAGGGTCTTTCCTCTTTGGGAAAATGAACCAACATTCCGTGCAGTTTGAGGGTGCAGTGTGCCAGTTCAATATTTATCCCTCTGCCAAGGCAGCTCATAATTACTGTACATATCTGAAGAAGCAGTGTAGACAGGCTGACACGTACCGGCCACTCTTGCCCCCCCTCCTTCCCCT---CCTTCCCCAGGACCCTGGCCTCCAGACTGACCCCTCTCTGCAGAGCCTGAGGAACCTGACCACTGTGATGCCTCCGTTGGCATCCTTCCGAACTGCCAAGACCCCCCAGGCCTTGCCCAGAGCGCCAGGCAAAGGCGCCAAGATGACGATGGTACCTTCAGCACTGACCAGCCCTGGGTTGGCGGTGCCTCCCCGCCAACCCGTCAGGACTAGCACTGCCGTTCCCCGGTCATCCCGATCCACTGCAATGAGCAGTTTGGTCTTGACCATACCAGTGACTGAAAGGCCCTCGCCTTTGTCCTCAGGCAAAGCCTCCTCCTCCGGGCTCAGGCCCGCACTGCCCACCTCTCAGAGCAGCTCAACCAAACCTCCCATCCATGCCAGGAAGCCTGTGCCCCCCACACCTAAAGCCAGTGTGGTCCAGACTCCCCATATTCCTGTTAAGCCAGTAACTCCTTCTATCACTGTGGCCCCAACTAAGAGGCCCCATCCCATGGTCAAGGCCGCGCTGACCTCCCCGTCCAAGAGCTTCCCTTCTCCCATGAAGCCGGTGCTCCATGGCCCGCGCCCCGTCCCCGCCAGAGCCCCCCTTCCTCCCACAGTGAAGTCAGCACCTCAGCACTCTGGAATAGCCCCAGCGCC---TCCCACTGCCAGGCCAGTGCCTCCTGCTGTAAGGGCCTCT------CTTCCTGTCGCCACCAAGACGGCGTCCCAAGGCTCAAGGGCCAACATGGCCAGAACCCTTCCTTCCACCAGCAAGCCAGCGTGGGCTTATACTGGCACAGCCAAGCCGGCCCACCCTTCGGTGAAGCCATCCTTGCCAGCCTCAGGTCCTCGCCTAGCTCAGACCCTCAGACCCCCAGGGAAACCGGTGCTGCCTACCACGGGGATCAGACTGCCCGGAACAATGCCTCCGACCATTCACCCAGGCTCTCCTCCTGGTCTCAACTCTACCGGCAGCAAGAGGGTGGCTG-------AGCCCCCTGTGAAGAGGAAATCGAGTCCAAAGAGTACCCCCTGGCCTCCCAGCCTCCCAGGCCCCAGGAAGGCTGCAGAGGCTGCCACTACTGTTTCCTTCTCTCCAAGCCTGAAGAATCTGACTGCCCGGCCCATCCCCAAACAGGCTCAGCTCGCTCTTACGGCTGCCATGGTGCCCACGCAGCATCCACCCTCCAACTCCCAATTCGTGGGTGCTGTCACCCTCTCCCACACAGATGGCTACCTGTTCTTTGACCCCATCGGGCCCACCTTGTTTCCATTGCTGTTGGGTCCTCCGGGGCAGAAAGGGGACCCTGGCTTCCCGGTAAGTCTGGGT--GCTCTGCAT 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tatataattcTGAGAGGGGAAAAGGGGAACAAGAATTCTTACTCC-CTCAAATTCTACTATTCAATCCAGTTTTAGAAACTTTATTTTAGTTTGACAGTTTTTTAAAGCTAACTTGAAAAGATGAACACATTAAAAAAGCCAATCGTGCTTGGAAAATACAGAAATGCATTTTCAGTTATGTTACAAGATATGTGATTACAA--------TTGTCCCTGAAGTTCTTTTTTTCCTTTTTTGCACTGAATGTGATGA-CTTTATTGATGGTACACAAGGTAGAA---------CTCTATGCTCCTCCTCCACACTATAGGGGTGCTTCGGAGCAGGGATGTGAACAGGGCATGGGATCCCCAGCATAGGGGCATAGGTTATTATGGATGTGGGCTCCCCAGTGGTGGAACTACTCTCTTTT------------TTGGCTGGGGATGAAGGTCCACAGCTTTCTACTTTACTCCTTGGAGGTCATGTAATGTACATCATGAGGTCTACTACACGGTGACTGTAACCATATACATTGTCATACCAAGAAATGAGCTTGACAAAATGGTTGTTGAGGGCAATGCCAGCACCAGCATCGAAGGTAGAAGAGTGAGTGCCACTGTTAAAGTCACAGGATACAACCTGGTCCTCTGTGTAGCCCAAGATGCCCTTCAAGGATCTCTCTGCAGCTTGCTTCACCACCTTCTTAATATCATCATATTTGACAGCTTTCTCCATGCGGCAAGTCAGATCCACCACGGACACATTGGGAGTAGGAACATGGAAGGTTATGTCTATGAACTTCCTGTTCGGCTCAGGTATGACCTTACCCACAGCCTTGGCAGCACCAGTGGAAGCAGGGATGATATTTTGGGCAGCCCCACACCCATCATGCCACAGCTTGCCAGAGGAGTCATCTACTGTCTTCTGGGTAGCAGTAATGGCATGGACTGTGGTCATGAGTCCTTCCACAATGCCAAAGTTGTCATGAATGACCTTGGCCA--------AGGGGGCCAAGCAGTTGGTAGGGCAGGAGACATTATTGATGATCTTGATGGGATTATCATATTTCTCATGGTTCACCTCCATCACAAACATTGGGGCATCAGCAAAAGGGGCAGAGATAATGACTCGCTTGGTTCCACCCTTCAAGTGAACCCCAGCTTTTTCCATGGTGGTAAAGACACCAGTGGACTCCACAATGTACTCGGTTCTAGCATCTCCCCATTTAATGTTGGTGGGATCTCGCTCCTGGAAGATGGCAAAGACTTTTCCATTGATCACCAGCTTTCCATTCTCTGCCTTTACAGTGCCCTTGAATTTGCCATGGGTGGAATCATATTGA----AACATGTAAACCATGT--AGTTGAGGTCAACGAAGGGGTCATTGATGGCCACAACTTCTACTCCAC----TGC--AGTTGAATGCTGTCCTGGCCACCAGGTGTCCAATACGGCCAAATCCGTTGACACCGACCTTCACCATCTTGTCTAAGGGATATGAATG---CAGCAGAGGATCTGGGCAATGAGCTTGGGAGAAG a score=-80 s mm8.chr4 63149888 105 + 155029701 aacatgaggttcaagcttgatcacagcataaagccagtgtatgtggtggtac-aagattca--cctgtgaccccagcattcgCCTGTGACCCCAGCATTCACCTGTGA s monDom4.chr2 70940252 100 + 541556283 AAGA--------AATATGGATACTTGGACTTACCCAGTAAAGGTGTAGGGACAAAGATTTAACCTTGTTATCCTAATCTTGATTTCTTAACTCTGATGGCATCTTTGA a score=1416 s mm8.chr4 63151347 97 + 155029701 GAAATGTGATACATTTAAGATACAATAAGATACATTCTGAAGTTTAAAAGAACTGTGTTTCAGTGGGACAGTGCAGAGGGTCAGAGACATCCAGGAG s monDom4.chr3 206550527 97 + 526135210 GAAATGTGACTATTTTCTGATCTAATTAAAGAATTTGGGAAGACAAGGCTACTTTTCCTTCAGTGTGCAAGGCCACAGAATTAGTACTATATAGGAG a score=1558 s mm8.chr4 63151796 112 + 155029701 TATGCAGGTAGCGTGAAGGGTGGGTT---------AACTACCTAGATCAGAGTATAACTCCATTCCTGTTTTAACTAATGCGGAGGCTGATTTAATGTGAAGCAATAAAGACAACAGAAGA s monDom4.chr1 270588241 106 + 748055161 tgtgtgggtagagagaagagggtatatgtgatgaaaactacc-agatttgg---caactgaatggTTTATTTAA-----------GATGAGTAAATGTGAAATATTAAGGACATCAAAAGA a score=1666 s mm8.chr4 63155042 261 + 155029701 TCCCAATACTGGGCAGTGGAGTGTCCAGGATGTGAATGGGGAAGTTGTGAGGAATAAGATATTCTAGTCTGGGAGAGAAGAAGACACCCGCTTCTGATTGGAGAAGA------TTAAGGAAGGGCT----GGAGATGCCAGGTAGAGGTCAG-GAGAAACTCAGTAAGCAGACG-TGAGGTGAGAATTGTAAGGATTTAAGGATCAGGGGTGGGGGGCAGGAAAGAGAGGAGAAAGCAGAAAGAGAAAGAGAGGAGATACGAGA------CAAACCCTC s monDom4.chr3 502572426 258 + 526135210 TCTGAAGGTGGGAGAGTGGAGGA---AGGACCTGCCTGGGGAGG-----AGGAACAGTGTA-----------GAGGGAGGGGGCAGCTCCCTGAGGATAGGGGCAAAGGGGGCCTGCGGATGCACTCAGAGGAGCTCCAGGGTAGGGGAGAGAGTGGGACACAT--GGCAGGGGCTGAGGGGAGAAAGGGCAAGGACAGGGAGTCTGGTGAGGGGACCATGAGGAGGTGGGAAAAGCAGAGATATCAGGGAGAGGGCCAGCAGGTCACCCCAAACCCTC a score=8659 s mm8.chr4 63160149 511 + 155029701 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AATTGAAATGGCATAGTAAGAAAAATAGCACAAAAAAAATCTTCCATGAAAACCTGGGTATACTGTTCCACAAACATCTAATAACATTGGGAAGAGTGGACATCatgaattaacaagcattattaattgct-----------------tactatgtttcaggaatt-gtcttaggctgtggagataaaaatataa-agaatgaaacaatac-ttactcataaggaacttacattctaatggggaagacaataattaca--------catatgTAGGACAAACATA a score=5889 s mm8.chr4 63210896 352 + 155029701 GATACTAATACAGAAGAAAAGCAAATAAACTGATTGACAAAAAAATTGAAATAATCAAA-----------ATTCTGTAGTCTCCAGTGTCAGTTTATTAAATTA----TAACTATTACATATGTTAACA---TATATAAGTTTTCATTTACAGAGATTAGAATTCATACA----------------TGCGATGCATATTAGTTAATTATATACCCAACAACATACAATATGCATTTTACGATGGCAATATGACGTTTTAACATAAAAC-ATTCAACCAATGAAAGCACATGGGGCTTATCAATAAGAATAGGTGAACACTGACATCTGTTCAGCC---TGTATACCCTCTGAAACAAAAGAGGGGTACGCGTGTGTCTTAATGACTTTAA s monDom4.chr1 328536756 382 - 748055161 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TCCTAACAT--ATATTCTGTGCCCTGAGAT------CTTATCTACTTCTGAGGTTCTGTTCCATGATTTTTTTAAATATACCTTGCTTAGAATTCTCATCTTCTAGGCATATTATAAAGTGCTTTTCCTAGTCCAAAACTTCCTACCTAAATTACTGACAGTGGAATTTGTTTCCCCTTCTCCCTACTAGCCTTCATGAAATTTTCTGGGTTTAAGTACATACAAATGATTAAAATTAGGGATTGAAAATAGTCAATCAAAACAGAAGATCCCTTCACAAGTGATGGCTTCTTTGGTCCCTATAACAGGAAAGCCCCAAAGAATGTTTTGTCTTCTTTGGTATAATCCACAAGAGAGATGTCACTGACATTTACCATCAGCTTATCTCCCTCTTGCATAGGAAAAACAGCACCCAGGTAAATTGGAATAAACCAATTGCTGCCTATCTCACAGATGGACTTGGTCCCTGTTAAAAGCTGCGTTGGCTCAGGGTATCTGTCAGTGACTCTGGTGATGACCTGAGTTATGTAATCTGGCTTGGTGGATCGATCCTTCTGATTAATTTTACCACATTCTGGTGTGCTGCCTCGGAAAGTGACTTGTGAATACACAAAGTAGTCTCCTGACTCCGGAATCACTAGGAACTTGTTGGTGTAGTTCATTTGGTTTTTGACGAAAGCAGAACCAAGTTTATGTTCCCACTGGAGAGCCGGCCATGAATCTTTCATGGGAGTCATAGGATTCTGTCGAATAGCTAGGAAGAAACACACAAAAAGTTAGCTTTGCTCACATGGGATCAGTAGACCCCTGTAAAAGAAATAACAGTCACTAAGAAGGACAGAAAATATTCCTTTTAAGCAATATTTAT-TCTTTTTCTTTATTTGTTATCTTTTGGTTTTATGCCATCTTTGTTTTCGAATATATCTAT a score=3926 s mm8.chr4 63219675 83 + 155029701 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TACTGACCATGGAGATATGCTGATGACTCAGTCCTTAGAGACCTCTTCAGGATATTTAAGCTGTCCAATGAACAATTTTCTAAAAACAAAAATCAGAGAAACACAAACGTTTAATCTCTACTTTTGGGAACATCAGATATATTCCTGATAACTCTCCATGGCCC-CTGATTTAGAAT a score=1924 s mm8.chr4 63338984 123 + 155029701 ACCTGACATCACAAAATTCTCCTTTATGCTGCCTTTGTGAGACAACAGCCAGCGCTTCAAAACATATTAAGCAGCTGGCTTGATGCCAAGCATGACTTTTGATTAGCATGATGTGCAAACACA s monDom4.chr1 328772693 114 - 748055161 ATCTGATTCAACAGAATTCCCCTTTATATTGTTTTTATGAGAAAAAAATACATTCTTTTGGA-ACTCCATGCTTGTGGCTAATTTTATAACATGTTTGTTGACTCACA--------AAACACA a score=12821 s mm8.chr4 63346966 919 + 155029701 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TCTGGACCTTTTAAAAAAAGCTAGCTTTCAACTTTATCTCCACCATGCACTTATAGCCTTCTGTAGGCTCCTCTTTCTTAACTCTCTGAAACATTTGAGGAACTACCCAAAAAAGTATGCCCCTGCCAATAAACAAGTCAGTCAGAACCTGGTTCCTCTTTTCTCTTCTGAGTTGTTACTGTTTATCTTAAATAATTTATTGGGTTTTTCAAAGAATACTTCCAGGAAGAACAAAACACAATACAACAAAACAAAAGTTAAGACAGGAAGGAGGGGAGGTTGCCATTGACTTACCTTCCTCTGAACTACTAAGACCATTATAGTCGCCAAAGAAAAGATGAGACACAGAACCAGGGTGGCTGTGGTGAAATAATAATAAGTCCGGCTAGTGGCCCTGAGCTGCCTTGTG------------------ACCGTACCTTCAGACACATTCATGGCTGCCTCAAGAGAAGCATTCAGTTGGAGGGACGTTTGCCGTGGTACAGAGGACATTCTTTATATATCCCCCCTCCACCTCACACCTTATCACCCTTGATCTGATGAGACTCACAGGCCATCTCTGTTCCAAGCAGGATTTTCCCCCTTCATCCTGGATCATGTGACCTGGAAAAAAATCTTCACTGTTTGTCGGATGAAGAAAGACTTCTCTGGGGGCGTGAAGTGAAAGGCAGCAGGCAATGGGAGAAAGAGATGCATTTTC--TTGCCAGGGATTTTGTTGCTGGTCG---TCCTGTGAGCTACATCGAAGGGATCTGATGTCAGAAGGCGAGTGGGAAGCAACCTCACCCCCGGCTCTCTTTGTGTGTGCAGTTGTGTGGAGTGACTTATGTTTCACTTA----CAGTCACCTCA---CTGGTGGTGGCAGCTCAGTGCTTTAGCTAATGCTTTCT--TCTTCCAGAGAGTCATTTCTTCACGATGTTCTCCACTTAAAAGAATTACTAGAGACCCTAGTTCCATTTTGGGGTCAGGAAGACTG 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ATTAGAATCTCATTATGAGAGGCCCTA-AGGTTACATCAAGAGGCCATTTCTGTGTGCCATGGGCA--------GGACAACAGCCTCACTG---TCAGATTTCCCA------CAGAGGACTGGAATTTTAACCCATGACATCATGTTTCATGGCTAAGAGAGGTCTTGACACATATGTTGTGGGTGGAATAAGAGAAGCTGATGATTGATAGAAAAG-----CAAAAGTCCTTTTACATTTACTTACAAGTAGCCACCCTTGCGCTGACAGGGATGCTTTTCTTGTTCTCAAGGATAGCAAAGACTCGAATAAAGTATTCTACCCCTGGCTCTAATTCACGAATGATGGTGGATGTCTGGTCCCCAGGGACACGGAACTGCATTTCCAGACCATCTGAGTTTGTTGGGGTGTAGGTGACAAGGTACTCCGTGACCCTCATTTCATTGTCCCATGCCAGGTTTACAGTTTCTTCTGTCACTTCAGTCACTATGAGGTCCTTTGGTGGGGACACTGCCAGGAAAGAGAAACAATGCTCCTCTGTCAGTAAATTGCCACTGTTTAGCTTTCTAAAATAACAGTAATTTCCTTTGGAGTTCTCTTCCTCCCTTT a score=-162 s mm8.chr4 63501610 193 + 155029701 ACAATAGAGATCTGAAGTTGTCTGTTCTTAAAACACATTGTTCCCAACCTTCTGGACTCAGCCAGAGCTCTACTGAGTGTA-CTAGATACAAGTTCTGTCAGTCAAggggctagagagattacgcagtggctaagagcacttttgttcttgcagaggaccagggttccattcccagtatccaagtaatgactca s monDom4.chr2 67763422 143 + 541556283 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ACTCACCCTCAGAGCAGTCTATCCCTGTGTAACCTTCATTGCAGATGCAGCGGCCTGACACACATTGTCCTTGGTTGCTGCAGTCATTGGGACAGGAGCGCTGCCCACAGTCCAGGCCCGTAAAGCCCTCATGGCAGATACACTGGCCGTCCTCACAGCGGCCTTGGCCATGGCAATCACTGGGGCACCTTTGCTCTTTGCAGTCTTTGCCAGTGAAGCCCTCGTGGCAGATGCATTGGCCATTCACACAGCGGCCATGGCCGTGGCAGTCACTGGGGCAGGAAAGCTCAGCACAGTCAGGGCCAGTGAAGCCATCCTCACAGATGCACTGTCCGTCTACACAGCGCCCCCGCTGGCTACAGTCCCGGGGACAGCGCCGGTCTCTGCAGTCTTCCCCAGTGTAGTCGTCATCACAGATACACATGCCATTCACACAGCGGCCATGTTGGTGGCAGTCATTGGGACAGCTCATCTCACTACAGTCAAAGCCCTTGAAGCCTTGTTCACATATGCACTTGCCCTGTACGCAGAGACCCCGGTTGTGACAGTCATTGGGGCATCGCCGCTGGCTACAGTCTTCTCCGGTATAGCCCTCGTCACACACGCACTGCCCGTTGACACAACGGCCATGCCCACTGCAGCCATTGGGACACTGGAGATCCCCACAGTCAGCCCCTGTGAACCCATCGTCACACTCACACTGCCCGTTGAGGCAGCGGCCACGGTGGTGACAATCGGCGGGACACCGCTTTTCACTGCAGTCTGCTCCTGCAAAGCCCTCGTTGCAAACACACTGTCCCTCCTCACACTGGCCACGGCCCTGACAGTCGTTGGGGCAGGTGAGCTCACCGCAGTCTTCGCCCGTGAAACCTTCTTCACAGTAGCAGGTGCCATTGATGCAGCGACCGCGGTCGAAGCAGTCGTTGGGGCAAATGAGCTCACTGCAGTCCTCGCCAGTGAAGCCCTCGTCGCAGACACACTCGTTCTCCACACACCGCCCACGATTGTAGCAGTTGTTGAGGCAAAGGGGCTCGTTGCAGTCCTCACCCGCAAAGCCATCTTTGCACACACACCTGCCATCCACACACATCCCGTGTTCCTCGCTGCAGGGCACTGGGCAGACTTCCAGGCCACAGTCAGGGCCGGCATAGCCTTCGAAGCACACACAGACCCCGTTCACACACCTGCCCTGGTCATTGCAGTCGTTCGGACAGGCCAGCTGGCTGCAGTCTTCCCCAGTGAAACCCTCGTCACAGATACACTGGCCGTCAAGGCACTGGCCTCTGAGATTACAGTTCCCAGGGCAGTCAGGCTCAGAGCAGTTGGGGCCTTTCCAGCCTGGTTCACAGACACAGCCGCAGCCTTCTGCACTGAAGTTGCCCCGTCCGCTGCAGAAGGGCCTGGTGTCCAGACGACCTGCA s monDom4.chr1 328967998 1418 - 748055161 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ATAAGACACTGTTTTTGGTGAGGAGAAAGCACATGGGGGCCATTAAAGTCTACA------AACTATCCAGTTTCAGTGGCATTATTGTGT--GCTATAGTTGG------GTCATTCTTCATTTTGAATCTTGACCTTCATTACTTAAAGCACTTATTTTAAAATCTGGAGTATGATTCAAGGAGTTTTGGTCCATTGTTAGTTTCATCCCACGACTTGATTCAGCAATTTTTATCTG---TTCAGCTTAATTTTGAATTTCAAAATGCTAAAGTCAGATGGCCAAGTTTAGTGGCCTGAGGAATTGAGGAAATTGCCTAGCTGAATGTTGGGAATTGTTCTGCTCTGGCTGAAGGCTTAGTTAGGGGTCTCAGAGTCAGATCATGTTTGTTTTAAGTTTATAGCATTCACCTGTTTACACCACTTAGTGTCTGTTTCTCTTCACTAGGATTTG--------TTAATTTGATTCTAAAGTCCTCTGAACAAAGGGACAGAAAGCCATATAACATGATTTATTCTCCCTCCCCTCAGCTCAGTAACGTGGCTTAAAAATTTTTAGCCTATTCAACTGAAGAGTATCCCAGTCCTTTTTCCCCCTTATTTTTTTCTTAGTAGAAGTTTCATTACCAACCAAATTTAATCCACAAATCTTATTCCATAAAATATTTCCATCCAGATACAATAATAAGATTCATATTTGTGGTTTAGCTATACTGAAGAAATGCTTAGGT---ATTTGACTAGATCCATTGATACATTTAAGCCACAAACTCTTCAAGTCTGGTATGGTTTCAATTTTTGAAATAAGACTTTTGAAAAGTACTTGCCTT a score=1560 s mm8.chr4 63517323 182 + 155029701 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monDom4.chr1 329168660 959 - 748055161 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s monDom4.chr1 329312033 1293 - 748055161 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s monDom4.chr1 330306056 1237 - 748055161 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GTAAAGGGCCCTGTTGTGGCTCACC------------------ACAGGAACTTCG-CTGCCAAGAAGAAAGGGAAGCCTACTTGCACTCTG-ATGATGACTGATGAGATGGTAGAAGACCTAACCTGCTCTTTGCTTCTTCTCTCCTTTTCTGTCTGGCCGGCTGCTCAGGAGCGGAGTGTTCCACCTCATGCCCGGACCACAACAGTGAATCCATCATTCTGCCCATGAACATGACCATACGAGACATCCCCTACTGGATGAACCCTACACGAGTAGAGGTGAGTGGTTCTCAGCGTCTAAC a score=3579 s mm8.chr4 64814286 187 + 155029701 AGTCTCACCTATATCTCTAGCCACCAGCT-----TTTCTGCCTGAGATTCAGGAGTTGCTTTCTGCCTGCCTACTGCCGATGGAGATC-------TGGATAGCTTGGTATAACCTGATACAG--GGTGTTCTGTTTCTCAAATGAGCTGAGAGAAGACTTTCTTTAAGGGCTTACTCAGCACTCTAGCATGAGGACTTGGC s monDom4.chr1 330524321 185 - 748055161 ATTCTCACTTTT--TTCTAGCTATAAAGTGAGAGTATGAGCCTCTGGCATGGGAACTGCTTTCTGCCTG----------ATGCAGATTCTTCTTATGGATAGACAG--AAAACCCGATACAGAGGGTGTCCCATTTCTCAAACAAGCTGAGGT--GACTAATTCAGATGTCTTACTCAGCACATCAGGTACTGGACTAGGC a score=6910 s mm8.chr4 64814612 870 + 155029701 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TTTTGTGCCAACTGTCTTGGGAAAGGGGGTATGGGGAAAGGAGTGAATTCTTCCTAATTTGAGGAACTCATTTTGG----------TGAAGGGT--------GAAAAGACCAGCATTCCTAGATGGTAGGGCTTGGTATAAAGTGGATCTACTTACTCTCTGTGATTCTCATCCTTAGGGCTTTGAGGAGGGTGTCTGGATATTCTTGCCATCTTGCTAGCCATATTCCCTTAACACAAGGTTGAGAGTGGAAGGCTATG----GAAGATGATACTTTAAGATAGATTTCAGCTACCTCCCTTCCAGTTCCAGGAAAAAAAAATAATCAAACAAACAAACAAAAAAAAACTTGGTTGTAACTGTCGGTTTGTAATAGGTTTTACCTGTGT-------TTTAAAAAAAAATAATG------------------ATGATGATGATAATAAAGTAAGCCAGTTTCTTGCTACAATTAATTCAAGT----------------------CAAAATATATATGTA-----------GTAA-------------GAAATCTGTACAAATAGTGAAGTGAATAGAAGAGA--------------------GGGACTAAAG--AAGAGGAG-TAAAAAAATAAAAAGAAAAAAAATTGCATGATCCAGAACCAAAAAGAGCAAAACATATTTTTAGGTGTCATAAAAAAACACATATTCTACAACTTGAGTAGTGAGTTAGACACAATCTCATAGATTTCCCTAGAAGAGAAAACACAGTGGAGTTTTTAATAACCCTGTTT----TTCCTCATTCATTCTGGTAGGCCCAGGATATAAGGCAAATTTTTATCACTTTGGTAGTAT-------------GGCTATTTGTTTTGTT--------------------TTGGAGAGCGTGCTGTTTTCAATTTTACAAGATCTTAAGATGAAAAAAAT---ATGTATTTGTGCTTTTTACATTATTCAAAGTCTGTATTTCACTAGTATTTGACTGTGCTCTCAATAATGCACTCAGAATGACTGTGCATGATCCAGTTTTCCCAAAAAGCTGCTA---AACAAGACAGGTAATACCACAAGTTTGGGTTTGGACAATCAAACCAAACCAAAT----------------------------------CCTTTATTTGTGTTTTATTCAAATGTTCCCCAATTTCTAAACTGAACATTTGGCCTGGAAGACAGAAAAGAGAA--GCCAAAAGGAAATCTGGCTCAGAAATGAGAGCACAGGAGTTCTGGCCAATTTTTTGT----TTTTGTTTTTGCTAtgatc------aagtcacttaaaacctctccata----cctcagtttctccagctataaaatgaggataataattcttacctatctcat--tgggAGGGACATTTTGGATTGAGGTTTTAAAAC--------CATTTTG----AGAT--------GCTTGGGGACAAAGGCATGG--------------------------------------------------TACATTCCAAGTATTACTCTTTAAGACCAATGAGAGGTGAGAATGAATTCTTGCTAGTTTCCAAGTTAAAAAATGCTATGTTCCTACTTAGAGTCACCTGGGGAAAGAGGCTTGTGTTTTAGAAGATTTCGAGTTTATCATCATCATTATTATTATTATTGTACTTTT--------TTTTTCCTCCTGAATTTTGGCTTGTTCTCCAGCTCTGAGGTCTAATTAAAATCCAATTACTTCCTCCCCATAGAAAGAATAAAAGCCA-TCAGAAGTCAGCTTGTCA-TATTCTGAGGAAAAGTGTGAAGTTGCTTTTAGCCCATTGGGGAAGAAAGCAGAAAAGACAACTTCAGGCAACACCTCAGTTTTACTGAGTTGTTTGGTTTTAAGACGCCACCCCCCTTTTTTTGGTGGGTGGCGTCATTTAAACTATTTTCTCTAAAAAGTGAGAGGTCATGCTCCTTACAAACCACAACCTACCTTCCAAGGACAAAGCAAAGGAGCTTAACTGAACTCCACACCAGCAGTCAACAAAGGGAAATTGGAATAATTAG-GAATTACATTGTTGGGCCTCTGTAATCAGTTACCTGTCTGCAGATATCTATCTCTATA-----------------------TTGatatatatatgcacatgtatataaatatatctgtacatatatgtgtatatatatat--TTAAATGTAATATTTACAAATAAAACTGTGATCTCGTCTAGAGAAAATGTATTCATATTACAAAAGGCTCTTCCATCTTTATGTATCATACTGTACCTTTttattattgttataattattctgattatt-ataattattattattTTGGAATCTGTTTGGCACCTTCTGGAAACTATGGCAAATAACACTTCACATCCCAAGTGCTGAAGATCTGTTTTCATGAACATTCTACTGT-----------------------aaaattaaaaaaaaaaaaggaaaggaaaaaagaggaaaa----------------------------------------aagtaaaCACCCAAAGCAAAACACAATTCAATCTTTATTC-TGTACCTCACGCACGTACGTTTGCTGCTCCTGTTTTGGGGTTTGTTTATTTGTTTGTCTGTTTT-ATGGATCTAATTTAAGTCTCCAAGCCATATATAAAGATGTAAATAGTATAGCTTATTTATTAAGATTGTCATCttttttttttaatttatatttaCACAAATGTTCATCTAATTTATTTTTTTCAATACTGTTTTTAACCATCACTGTCCTGTTTTGCTGTTTGAGAGATTGTTAACCTTCTGTAACCATGGCATTG---TTTCATACTGTTTTTTCCCTGGTCTCAAATACAGGTTTG--------------CAT-TTCACTAAAATTGTCAAAGACAGAAATATTTTGCCACTGTTGATTCCTATACCttaaaattctatattataaaaatatataaCAACTTGTATGCTTAAACCTTTCCTGGTGTGATTTTGTAC-ATCCCAGCAGTAC--GATGGTTTCACAAGTATAGACTCGCACAAATACACACACTTGGGCAGGGCAAGATGATTGTTGATTCTGATCCTGGGGGACTACAAGACCT----AGAAACCAAGGTAATAATATCCAAGGATGTAAAGGCCCTATCTGCAAAG 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monDom4.chr1 331438784 940 - 748055161 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GTAGATATGGACAGTCTCGAAAAAAGTTTTCCACCGATTGCCCAGCAAGAGAGTCCAATTGTAGCATTGGCTGTTTTGCAGACGGATCTTCTCCCAACGAGGGTAGCCAAATTCCCCAAAGGGCATGTTCCAGCCTTCTGAATGGCTCCCACTGAAGGGATTGACATAGACAAAGAACATAGGGTCCAGGCTGCTGTTGCGCATCTGGCAGATACGCATGGACATTCCGATCACCATGTGGATAAAGTCCATGCGGTTCTTGTTGCTTTTGAGAGTGAGGGACATGCGCTTGCGCCACCGAGGGTCAAAAAATGTATCCAGGCGAATCTCATTGCTGATGAAGGTAGTATGGACATAGAGGCGTGAATCCATCTTCTGCAACAGGTACTTCAGTTCCAAGTCCTGGAAGTCCAGGTCGGTCTCAAAGCTGATGAACTGCTCACTCCGCTCAGAGTCCACGTTTTGTGGTTCACAGCGGCCTCTATACAGCTTGTAGCCCTTATTGCAGGAGCCACAGAGTGAGATGTTGGCCAGGCTGCACATGGCACAGCTGTTGTTCCCACCTATGATACATGGGATAGGGCGCTGGCACAGTGTGGTGCTACCATGGCACACACAACTCCTCTGGCTTTCCAGGAAGGTTCCCCAGAACCCATTCTCATTGCAATAGAGAAGTGACTGGACCCTTGCAAGCCACTGTTGAATTGTCCTGT-----GAAAAAGAAGGAAAATGTTAGCTCCCATCAATAGGAATGTGAGGTACATC s monDom4.chr1 334667352 752 - 748055161 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monDom4.chr1 335043279 46 - 748055161 GTAAATAAAAGGACCTGAGTGATTTAACTCAAGAATTTTTCATTTG a score=11946 s mm8.chr4 68731114 723 + 155029701 TTGCTCTACAGGCACTTCAGTAGGCAC-TTTCACATATCTCCTCTTGGAATATTACTAT-GCTGCAAAGGTATGAGATCCCATGTATA------GAGGTGACTCTGTGAAGGTGATTTGCTCAATGCCATAAATTAAGAGGGAAAAATCTGCCTGACTTCAGTGTCTGGTCACTTGACCATCAATTTCAGATATTCAAACCAAGTAATATGCTTTTCTGAGAATGTATTCCCACAGACAACAGAAGAAATGATGCAGGTGCAAACCCAAGGGCAGTTTGTAAAATCAAAGTCTTTTTAAAGTTTAAGTCTAATCAAGCAAGGATAAGA-GATGAATCAATTCTCAGTGTACTAGGTGGTGTACAAATGAATGTATTTGCATACATCCAGGCATGTATCCTTGCCTTACCAAGGCTA---TGAAATGATTTTATTTG--------------AAAAGTATACATAGATTGAAGATAAGTTGGTAGACAGAGAAAATG-GTTTACAAACAGGCAGATGGACTGATAAAAGGAAACTAAGCCT--TCCCAACTACCCTGGGGGTTGACTCCAATAAAACAGCTCTGTTGGAATAATGTAGGGCTTGAGAGATGGGGTGTAATATGCTTAAATGCTTTTACAGTTCCCCATTAAAGTAAGTGGATGGAAATTCATAAAATATTGATAGCATTTGAAATGTGTTCATTCACAGCTCTGCCCAGAATCAGGATCAGGAGTAGAAGGGCTGGCCCAGGCA s monDom4.chr1 335043688 695 - 748055161 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TTTGAACCCAATAGAAAGGAAAGGCTTG------AAATTGAGGTGGTCCTGCACCTGAACCCTGTCCTCATTTTTGTAGCTCCTTCCTCATCCCATGACCAGTAGCCTAGCCCTCAGGTGAAAGCAATTGCCCTGTTTTCGTCTGAATTTTCCTGTTTTCTAGCAAAACTGAAAGAAAAAAAAAAGTATCACAACTACAAGCTGTTCTAAGCCAAGCTGCCCTTAAAAAGATAATCGGATTTACATAATTGGGGGCTGTGAGGGCTTAAATAATTCATCAACGTGGCAGTCTATTTGTAATAGCCAAACAGAGCTGCCAGACTTCAGCAAATAAACACAGATACTTCCTCGTGCCCCAGGGATGTGAGGAGCATCCTCAGGTCTCCCAGAAAAGTGGGGC-AGGCCCCAAGAAG a score=2595 s mm8.chr4 69318286 266 + 155029701 CATGTCACTG--ATGTGGCACACAACTCTCCCTTACTGGTCTTCAATCTCTATTAAACTACTCCCTGTAACAATCTAGTTGCTGTCCTTAGTAACAAAGCATTTT----TACAGCCTT---------------GTGTAAGCAAAGCAGAGATGGGGCAGCACATAAAGGACAGTCATACCCACAAACAGAACTGCCTCCTTCCCAGCAGCTTTGTGGCCAGACATGAAAGGCCTTTATAGAGACATGGA-AATCGTCATGAGAGTCTTTCTTCTCTTGATAATAGTCC s monDom4.chr1 335642852 270 - 748055161 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aagtgacttacccaagatcacactacttgaaagtggagtatccagga-----ctagaacctccagtttcttgattccaagtacagttctcttgccatcgcat-caGAGTGTCCACCTTCTCTATCTCTAATGGGAGCAGAGGAAAAGGAGGAGGGAAATCTACCTGTAGGTGAGTTAGAGGCACAGAGATTTCCAGGACACCCAGCTTCTTCTCTGTAATTTATAGATGTGTGAGCGGGATGATGGGCTCATTACTTACATCCTGTAATTCAAAAAAATGCAGCTGCTGGAGAAAGATCAGTGAGAGTTATAAAAATATGTACATTTGATGGAGTATATTTATATGTTTGTAAATACAGTATGTTATTGCTCAGTGTTATTATATATCTATCATCTTTCTTCAGGTTATTGGAAACATAAAAAACTTTAAAGCACTAAAAAATACAAAGAGCAATAAGTCACCAAGGCAAGTATATCTTCACTGGGATGATTTTATGTCTGAAGAGGTTTATACCTTCAGAAAATAAAGGCCCTGCCTGGGCAGAAAGGGAGGGGCAAAAAGGAGGTATTGCTGGTAGATAGTTCCTGTAGACTCCT a score=6400 s mm8.chr4 69394136 150 + 155029701 CCAAACCACAAAGTGGAACCGTAAACCAAAGTCCAGGCAGCAGACATAGTCAATAGCTTGGACGTGATTTTTAAGTGAAATTAACGATTTTTCAAATATAGATTTCCTCTCCAGGCCTTT-CCTCCCCGACTTCAGAGATTCATGATTCTA s monDom4.chr1 335744609 151 - 748055161 CCAGGCCATAAAATAGAATAATGATTGGAGTATAAAGCATCAGATATAGTCAATAGTATGGATGTGATTTTTAAGTGAAATTAAAGATTTTTAAAGTATAGATTTCCTTTTCTGTTCTTTCCCTGTTTAGCATCTAGGCTCCATATTTCTA a 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tAACAGCACTGTGCAGTTT-ATTAACCATTCAAGTACAGTAGCATCTGGTGAGATTGGGACAGAATTGGGATCGCAAAG-----TGGACAGATATTCAGCATCTAATGGGTTGGAAGAAGC---CACTACATACTC--TTCACAAACGTCTTC---CACAGTCAATACAGTACTAGCCATTAACCCAGCACACCGATTGTGCCCGAGTGGAAAA--GATGCAACGAGAAAAATAGCTACATTAGAAAGAC--CAACACTTTA-AAAAAGAGTAAAACACTTTCAGTTTCTCCCCTTGAGCCCCTAAA--ACATCT-CACGGTCTGGATCTACCTATACGGTCCTACATCGGCTTCTAGACTATCTGTCAGGAGGGA--AAGTAAAGG--ACACTGGCCAGTACAGTCTTTGGATATTTAGGACGGGGTCGGGGAGAAAGTCAGTTCTCGGGACAACTTAGTCAGCCTCAGTCTCATCCGCGGGGTCTTTGGATTCTTTGTTCTTCCGCACCTCTTCCACGTGCTTGT s monDom4.chr4 74925929 516 - 430141050 TAACAGCACTGTGCAGTTTTATTAACCATTCAAGTACAGTAGTATCTGGAAAGACTGGGACAAAGGTCAGGTTTCAAAAGTGAACAGACAGATATTCAGCATCTAACAGTTGGAAAGAAGCATATACTACAGATTCCTTTCACAAACATGTTTTCACAGAGCCAATACAGTACTAGCCATTAACCCAGCAC--CGAGCATACTGGAATAGAAAAAAGATGCAACAAGAAAAATAGCTACGTTAGAAAGACTTCAACACTTTAGAAAAAGAGTAAAACACTTGCAGTTTCTCCCCATTTGCCCCCAAACAACATCTGTACGGTTCGGATCTACCTATGCGGCTCTACGTCAGTTTCTAGAACATTTGTCAGGAGGAATAAAATAAAAGCGACACTGGCCAGTTCAGTCTTTGGATGCTCGGGA-------GGGGGAGAAGCCGG--CTCGGGGTCGGCTAGTCAGCTCCATTCTCGTCGGCAGGGTCTTTGGACTCTCTGTTCTTCCGCACCTCCTCCATGTGCTTAT a score=14711 s mm8.chr4 69412061 193 + 155029701 CCTTCTCTCGCAAGCGCTCCAGCTTGGCCGCCATCTGCGCCTCCCGGTTCTCTTTGTTAGCCTCCATTTTGTGGGTCAGCTTCTCCTCCGCCATCTTGCTGAAGTCGTTGTTCTCCTCGATGGCTTTCTGGAGCACCTCCTTCTCATGCTCCCGCTTCTCCGCGAGCTGCTTCAAGACTTCCGCCTCATGAGA s monDom4.chr4 74926785 193 - 430141050 CCTTCTCCCGCAAGCGCTCCAGCTTAGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTTTCTTTGTTGGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTTTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTTTCTTCAATTGCTTTTTGAAGCACCTCCTTCTCATGCTCCCGCTTCTCAGCAAGCTGCTTTAAGACTTCAGCTTCATGAGA a score=12745 s mm8.chr4 69412254 190 + 155029701 CTTGCGTCTTTCTTCTGCAGCTTCTAATTTCTTCTGGATTTCCTCCAGGGAAAGGTCCTTCTTCTTTGGGGGGGAAAGGGGGAAATCGGGGACAGATTCTTTTGACCGAGGGCTGAGAATCAGCTCAAAAGCCTGGCCTGAAGCGCGCTTCTCCAGCTCTTTCACCTGAATATCAGAAGATGCCATGTCG s monDom4.chr4 74931728 190 - 430141050 CTTGCGTCTTTCTTCTGCAGCTTCTAGTTTCTTCTGAATTTCTTCCAGGGAAAGATCTTTCTTCTTTGGAGGGGAAAGGGGGAATTCTGGAACTGCTTCTTTCGAACGTGGGCTAAGTATCAGCTCAAAAGCCTGCCCAGAGGCCCGCTTCTCTAGTTCTTTCACCTGGATATCTAGACACCACAGGTTG a score=3871 s mm8.chr4 69412444 59 + 155029701 AACAGAAGACAAGAGACTGGCTGTATACTCTACACAATCCAC-TGGCAAGGAAAGCCCTG s monDom4.chr4 74932480 60 - 430141050 AACAGAAGACAAGAGACTGGCAGTGTACTCTAGACAATCCACACGGTGGAGAAAACCCTG a score=-2632 s mm8.chr4 69417531 745 + 155029701 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atcctgaataattctagagatatgcccttCAAGTTTAGTTTAGAGGTTAGAAAGAGTGAAAAAACAGCAACATCATAAATATGGAAGACTCTAGAAAGAATTTTGGAAGAACTAACGTTTATTAGATAACACAAAATAATTAGTCCCTAAGTATTTATAGGTTACATATAACTCTCCAAgcaactcatttcatttcttagggtatcaatttctacttctgtaaaatgaagaagacaaaacagataatcctggaggtct----------cacatagctctaaattttatgatcctgttaattcTGTTCTTATAACCTCAGAATCTAGTACAATGCTTTGGGTTCCATGGGTATTCAATAGCCATTCTTAATTATCTAATTAAA-----AGCATAATAATAGTTAATTTCTTGGGAGGAAATTGGTGAGAAGACCA----TTGTACTGTTAGTGAACATACCAAACAACATTAAGGATATAGGCAGAACAAAAAAAA--------AAACACTGAATGTAGAGGCAGG---GAACTAAAAGCCATAACTGAAAAGCTCCTTGATCTGAAGAAAGTTGTCTTGCCATCTAGGCTTTGATCACTTTATCTCTACAGTTATGGGGTATAGGTCACTTTTGGCTCTAATTATCCATTCTGATA--TTATCATGCTGATGAACTTTTG---------GACAACAGACCCAAAGAGATATGTCAAAGGAATCAGAAACAGCAGATGGCAAAGGAATCTACCCATAAGACTCAAGGAATTTGTAACAAAAC--TGCTAA--CAGATGAAATAGTT-----------------AAATGGCTTTTCACACATCAATTACC a score=1513 s mm8.chr4 69418349 107 + 155029701 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CCTGTTCTTTCAATATCCAATATTTGTTTCAATTATATGAACCTCAAAGTTATAGCTAACTAGTACACATAGTTAAGTGTAATTACATTAGGGGAAAACATAGTAAAGAACCATTAATCACATCAGATTCAAAGTCCCAATGGCTTTCTAATTTCAACACTCATTTA---ATTTTCATTCTCCTGACTCTTAAGCTGTTAAAAAGTTGATACCCTATAAAATCATT-----GTCTTATAATAACCACCCAAATGCAAAGAAAGCAGGAGCAGGACACAAGAAGTCTAAATCCCTAATAAGCTGTGAAACAGGAACCAAGAATGCTAACAAAAGCATTCAGGATTCTCTTAGTGTTTTCTATATAGTCTACATGGAAAAATTGGATGCATGAATGAGAGTGAACTGAGGAAGCAAAGGACTCTGTAAGTTTCAGTAAGTTTGCATGTAATTGGATGCTTCTAAAGTGCTCAAAAACAGGTCACACCAAGAGA a score=9497 s mm8.chr4 69428725 635 + 155029701 ttaGCTATACTTATTTGCCTATCTGAtggaggggaaatggtttatttagcttacaggttttacataattgagggaaatcaaaacagaaactgacagcaggaacctggattcaggaattgaaggcacaaaccatggaaggaccctgatgactgtattgcctcatgacttgggtcacttctcttcttttcctttc-cttatgtttcctttctttcttagtttt----cttttttatttcttctctatgtttcttttatttctttaatttttattgttgtttcttctCCTCtctccctcgctccctctcccttcctccctctcccttcctccctctcccttcctccctctcccttcctccctctcccttcctc-----------cctctcccttcctccctcttccttcctccctctcccttcctccctctccctctc---------------------------------------ccttcctccctctcccttcctccctctccctctcccttcctccctctccctctccctctccctctccccttctccccttctccccctctccccctctccccctcccccctccccccctccccccctccccccctctccccctcccccctctctctctctctctctctctctctTGTTTgtttctctgtatagccctg-gctaccctggaactcacca s monDom4.chr8 263262740 645 + 308469712 TCAGATA-ACTTATTTGCCAAATTTTTAAAATCATAGTTAATAAATTAAGTTTCAAGTATTATTCCTCTGAAG----CCTTATAAATAATTAATTAGTGGAACTGAGATGTGAATATTA-----ACAAA--------------TAATAAGTATACTGACTC----------TCAACTCCTTGCTATTCCTTACACACACAATACTCCATTTTCCTACTTTGGACACTTTACTGACT-TTCCCCATG----CTCTAGctctcta---cctctctctctctctctctctctctctctctctctctttctctctctctctctctctctctctctctcccctctcCCGTCTCCCCGCGCTCCAACCCATAtctctgttgtctgtttctgtccatctctgtcttttggtctctgtctctttctatgtctctgtcGGTCTCTAAGCACTCAACAAATGTTTATTGGATATGCAAAACTAACTTTCCTATAtctctttttctctctgtctctctgtttctgtctcggtctctctgtctctctgtttctctctctctctctctctctctctctctctctctctct---ctctctctctctctctctctctctccctccctccctcCCACCCCTTTCTCT-GCATTATCTCCCTCCTGGATTcttctgcaagaagcttttccccatctttgagctcagca a score=1140 s mm8.chr4 69439281 215 + 155029701 ATCTTCATTTTTGTTAATAGACACTGACTGGAACCCTGAAAATGAAGGAAATAACAATATTTCAAAACTTTC--TAATATGgtag---ttatcaacctgtg-ggttgcagaccctttgaagagtgaatgaccctgtatatcagaacgaatatatacagaacaatcctgtaat-----ctaaaatttacatata---gattcatatcaatagcaaagttagtaatgaaat s monDom4.chr5 118093345 216 - 308900514 ATAGTCTTTTTCTTTATTTCACAGTTATTGTAATTTTGAAAATAAAGTTACCATCAAGTATGTATAAATTTCTATAATATATCAGACATTATTAACCATTGAGGATACAAaa------------aagcaatataaaatacaaaagcaaatacaaaaagcaaaaatccaaaacaaataataaaacaGGCAGATCTTTGATAGATGTC-ATAATCAAATTAAAAATGTAAT a score=772 s mm8.chr4 69440319 85 + 155029701 ttggaAAGATCCTTTGTTCTATGTCTCTCTTT-------CCCCAACACTG--GGTAACATTAGATTAAtttccttttctttttctttttctttt s monDom4.chr4 297407910 94 + 430141050 ttggaattttcctttctttgaaattttttttaaaattaacccttacatagcttttaaaatcattttgactccagtacatatttcctttacattt a score=649 s mm8.chr4 69440404 86 + 155029701 tttcttttttctttctttctttttttttttttttAAATTCTCAACAGACCTTTAATGACTAGGGTGAGTTTAGGAACAAAAGGCTA s monDom4.chr1 439450111 60 - 748055161 TTCCCATTTAATTTCTTT---TTTTTTTCCATGTCAACACAATATAGACTTTTAATTATT-----------------------CTA a score=4877 s mm8.chr4 69440490 113 + 155029701 GATTGTCTGTTCACAGGAATGACAGAAGTGAAGAACTCAGTAGGCTGAATGAGACTGCTGCTGGCGGTAGCCACCACGGCGCATATAGCCT---TCATTTTTCCGGTAGCCATCCT s monDom4.chrUn 47102657 116 + 174229318 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cactctagtgcaa----ttatcaataatatggaaataagtcttgatcaatgacacaagtaaaacccagtggaattgctcagtggaaggaagggagggaaagaacatgaatcatgtaaccatggaaaaatattctaaattaattaattaaataaagcttttcaaaTAAGGGAAAAAAAGAGATTTTTTAAAAAGATGCACAAACATGAAGTAAC-----ATAAATACATGCTATAACTGCACCCCAATCTAAGAACCCCACTAAAAGGCA--AGAAGATGAGATAATCACATTGATTGTTTTGTCTCCATGGCTCTTCTGTCGTCTGGCTTCATCCAATTCCTTCTCTAATTTCTCCCTCTCGTGCTGAAAATCTTCTAGTTCTTGATTAAGCTTTTCAATGTTTCTTTGTAGCCTATGGTTTTCAGTATCTTTCCTCCGATTTTCAGCATGCAGCTGTGTTAAAAGTGTTTCTTTTTCCAGCAAAATGGTCTCAAAATCTTCAACCCCCTGAAAAAG-----GAAAAAAAATATCCACATTCAGACAGTGTTA-AAACAAACCAA a score=3141 s mm8.chr4 69835508 115 + 155029701 CTTAGCTGGAATCTGGGGATCTGGGTTTTTAAGGGATCCTCTCTGCCTTTGGTGGAGTCCGTAGTGACCTCTTTGATTTTGGAATCAAGTTCTTCAACCTG--GGAAAACAACACAT s monDom4.chr1 336386911 117 - 748055161 CTTACCTTGATTTTTTCTATCTGGGCACTGTGGGTAGCTTCTCTTGCTTTAGCCAAGGAAGTAGTCAGCTCTTCAATTCTGGATGTAAGTTCTTCAGTCTTTCAGGAAATAAGACAT a score=12498 s mm8.chr4 69838778 509 + 155029701 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TGGAATGAATTTCTGTTTTCAAATATTCCAAAATGGGTATCAT-ACTGC--------CAAGGTGTAGCTTACGTGGTAATTCT-TTTATGTCAATCCCCAGATGGCTTAACCAGTACCCACTCTTATAGAAATTACTAATGGACAAAAATTCCCATGCTTTGTTCTAATGCCTCTACACTCAACACTCTAGTTCTGTCATATACTTTTTATACAAAGATGAAAAAACAAGATGAGATAGGCTAAAAGCAATCATTTTCATTTATAGTAGCTATCCTGAATAAATCTAAATTAAAATACAGGGCCATACCTCTTTATCTTTTGTTTTTAAGGCCACAGTTAGACCCTGAATTGTTTTATCCCTCTTCAAACCATTTTTCTTTTCAAGAGCAATTTCTTTATCTTTTTCCCTTATGTCCTCCTGAAGAACCTAAATTAGATT-TAAAAAAATTCACTAAGTTGACAAGGCTTAACCATAATGCATTGTTAATACATTTTTAAACATATATTTAATTGCAATTATTCTATTTCATTCATATTGAATTGTGTTTAATGCATCCAAAATGA a score=822 s mm8.chr4 69839579 209 + 155029701 Agataatcagtactgcctccctt-ctgggctgtcgtgaggatcagatgagataatggatgtgaaagtgctttct--acactggcaggcactgtacaaat-tctagctgtcgtgactaAAGGCCCCGGgagcctgggtgttggaatcaaacaagaaaattacccctctcccacctatgtagtcatggg-------caagtgacttcacc---ttctgagtctca s monDom4.chr1 336388278 205 - 748055161 agatgat-aatagtgccaatattacagggttattgtgaggaccaaatgagataatatttgc-aaagttttgcctggacaaaactatgtacttaataaatctctctctctcctttcca---tcctcaggctccc------------ttaacaaaacatcttcattttcttcagtta-gtcctcatgacatggttccaaattcccccaccacattcctagtcaca a score=1627 s mm8.chr4 69839897 270 + 155029701 CTTACACTCAGAATCAAATGAGAGGCAAGCAGAG----AGAAAGTCTTAAATGTGGTCTTAAAATGAA---TCAACATACCTGGATCCTCTCTTCAAAGTGGTTTCTCTCCTTC-----TGCCATT-------CCTAAGAAAAGGCATTCATGAGTGAGCCGAAAGAGGAGTACCCAGAGAGGAGGAGCATCAGAAGGCTTCCCCACAGCCCTTAGAATGAGCC---------TCTTCTGTACTCCCTCCACTGC------TGTGGCCCTCATTAACAAAAGAGCACCCTTCTTGGCCCCACCC s monDom4.chr1 336388585 299 - 748055161 TTTATATTTAGACTAAGAAATAAGGCACTTACAATTTTATGAACTATTGATTA----ATTAAAATATGATTTAAACATACCAAGATTTTCTTTTCAAAGCAGTTTCTCTCATCTCTCAGTTCCATTTGAATAGCCTAACAAAACAAAATACATGTTAACTCCAAAGAAAAATGCACTAAAATCAATTCCTCCAGAAGTATTCTCATTAAACATCATAATCAATTAGTATAAAGCCTTACATACTTAATTTGTGACATTTCATTTGGGTCCCATTAAAACAAGTGTA-CCTGTTTCTCCCTGCCC a score=13615 s mm8.chr4 69841049 366 + 155029701 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monDom4.chr3 419909828 266 - 526135210 gtctgatttgatctcaggtcttcctgactc----aaggctcagtgccctatatactgtgctacctagctgccccAgagaatagatgaacaag-ttgggatgtataaatgtgatggaatactattgttctCATCTCTTAGCAGCATAATGAATTGTGTAATGACTAAAGGACTAATGA----TGAAATATGCCCACTAATGATAGAAAAGTGAGACAA--------ATTTTCTTGGACATACCCATTTGAAAACTTGAAGGAGATACTTGCAATATCTTTTGCT a score=1909 s mm8.chr4 70189952 106 + 155029701 ATTCTGAGTCTGGATCAGGTTT------------TATGAAGAAAAGTTCGAAATCACCTGGGCCAGTCTTG-TCTTCTCTAATACACTCGTGTACACCTACTATGTAAAGCCCTCCATC s monDom4.chr1 591795180 118 - 748055161 attctttgctttgatcagTTTTGGATGACATATTTCTTTAAAAGAGTTTGAAAAC-TCAGGGCCAATATTGATTTTCTGATTTGTACTGATCTAGCCTTTCCATTTAGCACCCTCCATC a score=54859 s mm8.chr4 70191616 1020 + 155029701 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s monDom4.chr6 113949096 969 - 244784211 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aggggacaactaagttaagagattagaatggccaatgatgcagtaaaagagattgagaaaggacagggaaacaggtaagagaacaaaatgaatataggaacatagaaggaatccagagcaggtaggaatatataagatgggtagtatgaaaagttctagcgaaaaaaagaatggagaaaagactattcgattcaatagtaaaaag-----attattggtaactgtggtgttatccatcagtcagctgttgggatcagaagcaaaatggtaggggtttaagaagtgagtgggt-------------aacaaagaagcaaaggcag--------caaacataaacaatctttgtagg-----agtAGTTAGGGGTTTCTTTTTGG---------CACTTCAGTCCTCTCAGAGGAGAAAGGCTTTGTG-GGCAGTTAGAGGGAAGAAGGCCTTACAGGAAAAAAGAGAATTGTTTTGGTGGCTGTTAAAGAATAGATTATTGTAAATAGAAATGATGGTCAAGGGATAAGTTCAAAATCAGTAGATGTAACAGAATCATAAAAAGGATAAAaataaatc---------agtgaatgaatagatgaataagtgaatgagtgaataaaA a score=1512 s mm8.chr4 71537706 952 + 155029701 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CTAACAAGATTATTCTTT-----TTCTAATAAGAGAATGCTACTGAACAATTTCACATATTCTT-TGAACTTTGATTCTACATACAGACTTCTGTGAAAGAAGAATATGTGCAATTTAAGCTTTATAAAATGA------TGTTTCTTTCCAGGTGTCCCACTGCCTAAAATGGATG-TGTCTGAGCCCCTA--ATTGCCAGCTCACCAGTGAAGGGAGCACAG----TGTGCAGATCCTCCAGATGAAGAGGAAGATAGAGTAAAAGAAGACCCCTTGACCATCTCTGAACTAGCGTACAATCCCAGCGCCAGCCTGCTTCCTACCCCAGTGGATGATGATGAAATCAACATGCTCTTTGACTGTCCATCCAGGCTTGAGTTAGAAAGAGAAGACACGGATTCATTTGAGGAACTTGAAGCAGATGAAAATGCTTTTTTGATTGCTGAAGAGGAGGAGCTGAAGGAAGCTCGCCAAGCTTTGTCATGGAGCTATTCAATCCTGACCGGCCATATCTGGGTCAACCCCCTGGTCAAGAGTTTCTCCAGGCTCCTTGTGGTGGGCCTGGGACTGCTGCTGTTTGTATTTCCCCTGCTCCTCCTCCTTTTGGAGTCAGGTATTGATCTCTCCTTCTTATGCGAAATCCGTCAGACACCAGAGTTTGAGCAGTTTCACTATGAATACTATTGTCCTCTGAAGGAGTGGGTGGCTGGGAAGGTCAACATCGTCCTCTACATGCTGGGTTGTTCATAAAATGAATATCTGATAAGACGAAGGGCTATCTTCAATACTAGTAGTAGCATTTTCAGTAGATGCTAGGTTTT---GATTGGCCTTCAGTTGTCAAGAGGTAGTCTTAACTCTTGACTCTTAACTC--TCTTAACTGACTGCTCAAACCTTGAAATAAGTTTTCTGTACTTCATTGAATTTAGTCGATTT--AAATCAAATACAATAC--ATTGAGTTATTCTTCAAAAATGCAGTC-------AGGAAGAAAAAAAATCTCCATAT--------------------------------CATACCATAATAATTTAATACA---TTGGAATTAGGTATTCTTGTTTCTTTTTT-------GTGAACTATAATC-----------AAATTAGAATTTTAGTAAAAATACAAAGTGAATCTTTTTAATATAACCTTTGGTGAAAATAATGACCTCTTACTGATGCCTATACAAAT-AAGTTGATGCTGAGTTTTTCTTTCAGtttttttaaaaaaaaatatttttaCGCGTTCTAACTATTTTGGTAAATTTTTAGCAAAACAGAAGCTTTCTGGAATTATTTGAGTATACCTACTGTAAAACCAAT---------GCACATGGAA---TTTTTTAATGTTTTGGCACTTGATTTTTTT----AAAGATATTTTTTGGCTAACTAATCCATAATTTAT--TACCTGCATATGACTTTGGAAAAAAAATGATAGTAAAAAAACTATAGCAAGTTCTCAAAAACAGATGATTAAACTAGAAGATGTAAGCATGAAGAACATTGAGTTGACATTGTCC---------------------------GGTCTAGTTTTCAGAGTTTT---------------GGACATGATAATCTTATTA---TAATTTAATTTGTGTTCAGT--CCATATATTTGGACTGGGAAAGCAGAGTGTTTTTAAAAGAAATTAAAACTAATTGTAATAGTAAAATTGTAAAGAAGATCAACTAGTTAATTGT-TATTGTTGAC-TAATCTGAGTAAAAGCAAGCAGGAGTTTGGCAAATAGAAGGTAGCAAAGAAGAGTTCT-GCTGAGACTGCTAGGCAAGTGATG-----CTAAGCATGTGGTTGCCTT------TATGGAAGTGATGCTGAT-------------ATATGGCACTC-ATTGTAAAGTGATGTGCACTCACTCTCTGAGTTCACAAAATCATGTTTAGTTAATAAAAATGGACAAAATTTTAAGGTGAATTTTTGGGACCCCTCATGCTTTTCATTGTAATTCTCTGGGTAAAATTTCAAGGTGgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagagagagagagagagagagagagagagagagagagaga s monDom4.chr6 128578216 2071 + 244784211 CTTAGAAAGTTATCTTTTGGACTTTCTAGCACAGGCTT--TTCTGCTAAAGTAAAGATGTCCTTATCTATTTTCCATTCACATAACAATGTCATTGGAAAGA----------AACTCAAGTTTTAAACAGAAAAACAACTTTCTCTTGGCAGGTATTCCGTTGCTGAGAGAAGATGACCGCACAGCCCCTGTGATATCTAGCTCACCAATAAAGA-ACCTCAGAGAATATGGGGACTTCTCAAGGGAGCACGAAGAGAAAATCAAAGAGGAACCTTTGGCCATCTCAGAGCTGGTCTACAACCCCAGCACCAGCCTGCTTCCCACTCCAGTGGATGAGGACGAGATTGACATGCTCTTTGACTGTCCTTCCAGGCTTGAACTGGAAAGAGAAGACACGGATTCGTTTGAGGACCTAGAAGCAGATGAAAACGCTTTTTTGATGGCCGAGGAAGAAGAACTGAAGGAAGCCCGAAGAGCTCTGACGTGGAGCTATGACATTTTGACAGGCAACATCCAGGTGAACCCATTTGTCAAGAGTTTCTCCAGGCTCCTCGTTGTGGGTCTGGGACTGTTACTCTTTGTGTTCCCTCTCCTCCTCGTCCTTTTGGAGTCAGGCATCGATCTGTCCTTTCTTTGTGAAATTCGTCAGACACCAGAATTCGAGCAGTTCCACTATGAATATTACTGTCCTCTCAAGGAGTGGGTAGCAAGAAAAATAAACTTCATCCTCTACTTGTTGGGTTGCTCATAAAATTACCATATTATGTGACTAAGGGCTATATTCAATACTAGCGATTTTTTTTTAAGCAATTGCCTGGTTTTTAGAAGGGTCATGGGGCCATCAGCAGGTAGTT----CTTTTCATTCTTCTTCCATATATAACAGACTGTTCAACTCCTTAAGTTAGCTTTTCATAATTCAATACACTTAAATAAGTGAAAAATCAAATAAAACATTATTTTAATTATAGGCCAGAGTGATGGCCCTATTTAAGTAACCAAAAAGATATTTATTTTTATTGCATTGTAGACTTACTTGCTTACCTGCTGTACCAT-ATAACATGATGCAGAGCTAACTTTTTGCTTCCCTTTTTTTTTTTTAAGTTTGGAGCATTATAAGCTGTAAGGTTCAGAACCTGAATTTTAGTAAAATTGGAGGAAAGCGTTTTTGAATATACTCCTTAGTG-CAACAATCTCTTCTAACCAATGCCTATACAAGCAAAGTTTATGCTGGGTTTTTGTT---Gttttttt---taaaaatatttttatGTGTTCAAAATATTTTGGTAAATTTTTAGCAAA--AGAAGTCTTCTGAAGTTA-TTACGTGTACAGATTGTAAGCTTAATGCACAAATGGCACATGGGAAATTTTTTTAATGTTTTGGCAGTGATTTGTTTTTAAAAAAAATATTTTTGGCTGGACAATTCTGTAATTTGTTATACCTGCATATGA----GATAGCAGACTGTTAGGAAAATGA-TAGAAGAAGTTC-AGGAAACAGAAGATAGAACGGGGTATTTTGTATCTTAAAAAAAACACGACGATATTACCCATGAAACGTGACAAAAATTGCTCTGGTAATCTATTTCTGAATATCTTCCTTCTAAAGTGTAGGGAGACAATATCCTTGTCCAGTCACCTTCACCTGCATCCTGTTATCTTCTATCTCAACTGATGCAGCAGAAAGTCATTGGAAGAGAGTGAAAGTGAATCCTAAGAGGGCATTG-------GGTCCCCATGCTAATTGTACATTATGTACATAACGAGAGAAAGAGAAGGAAA------AGAAAAAAGTAAATAAATAGAAGCACTTCTAGCCAGGATGGGGAGTTGAGGGATGGTAGTTTAACTGTAAGAAAGCCTTGGGAGATATGGATTATATGATGATTTGAAATAATGAAGTGTGGAATCCGGGTGGATAGAAATGTGTATTA-----------TTACAAAAT-ATGTTCAGGAAAAAAAAAGGGAAGAAATGTCAAGGCAAGGATCTTGT-TCCCTCAATCTATTCATCTTGGTTCTGTGAAACTAATTCC--GGCAGTGATTGGGTAGGAAAGGGTGTGTGTACGAGTGTGAGTGTGTGAGAGAGAGAGGCAGAGATAGAGA 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s monDom4.chr1 410406658 1033 + 748055161 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s monDom4.chrUn 139589047 1046 - 174229318 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monDom4.chr2 87741420 176 + 541556283 TGAAATATCATTCATAATAAAGCATATTTAATATAGTAACGTAATGTTTACAAA----ACTTTCCTTTAAGACAATATTGGAAAATAAACATTAAAATTATTATTACTTCTAT-------TTTTATATGAAGATTtttcccagagtcctagagctagagattgataaagtcaagacttgatatccaa a score=2111 s mm8.chr4 79482414 90 + 155029701 GAGGATATGAAATTAAGAAAGCAAGAGTTAAGATAAATAAATCCACATAGATAATA----ATCTCCATGGAAGTGAGAAAGAAATAAAAAAAAA s monDom4.chr1 243682733 90 - 748055161 GAGCACCTGAAAGAAATGAAGCAAGAGTT----TTAAAATAATCATATAAATGAAATGAGAGTTCTATAGGAAAGGAAGAGAAAGGAAAAATAA a score=10340 s mm8.chr4 79499544 864 + 155029701 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AACTATTTATCGAT-TGAATTTCTCCGTTCTTT-----GTGGAGTTATTGGGCAAGAATTCTAATGCTATGTGTAATTGGCTTTTAGGAAAGTTGGGGGGGGGGGTGGAAAACGACATAAAAT-----TTAGCCATTCTTCTGCCTCTAA-----------TGTTAAAAATGTGTTCTACAGGTTGTAGCTGTCAGGGGACTTCAGCAGGGCAACTTTTAACTTAGTAACCTAATATGGGTATGCTCAGCTGAGGCAGGATTTGCATTTCAGTTTCTTAACATCAGGGTTGGGAAGATTTT-GCTGCCCTTCTTGTCTGTGACATACGGTACAGGGGTTGGCTCTGCTTTGGTCCACCTGCCAGTCGAGTTTAAAGTTTCCGAGGCTCGGAGGAACACAATGACTTGGATGAGACCGACTAAAAGGAAAGGACACTGCTGC----AGCAACCAGGAAGCCCTTGAACCCCAGCTAAGCTAACCGTGTCTTTTTCTTTTTTCTTTCTAAAATGCGCCTACACCGCCTACACACAGGACGAACCCACTTCTTTCATTGATCAGATTTTTTTTTTTTTTTCCTGACCGTCTAAGAT--AGTCTGATCCTTGGCGACATATGGCTGGAAAATGAAACGACCCGGGAGTGTGGCCACCTCGTTATTCTG-TGTGGTGTAATACCAGATGGGC--ACCGTGAACCGCGCTGGGATGTGAATGGACAGTTTGAAATGGGAATTTCCCCGCATCGAGCAGGTTCCATTTCTCTCTTGGGTCTCTCGGTATAACGTACTAGCTTTTGCCCTTCTTCTCTGCAGTATCAATTAACTCAACTTGGCGGTGGAGTGGCCAGCTAGGAAAGGA-------------ATGAA----------GCGATCTGGCTAATCTTGCTGGCTGTGGAGCGGCAGAGCCTGAAACTGCAGCC-GGGTGCAGATCTGCCGACTGCGCCCGGGGCATGGAGCGCACGGGCGACCGCGGGGACTCAGGCCCGGC-CAGAGGAGCCCAG------TACTGAGCT-----CCGGAGTCCGCCAGGCCGCCGCCGCCGCCT-------------CCTCGCGCCCTCTGCCTTTACTGTCAGTGTCGCCCCTCGCAAAG----AGTCATGGAAGACAGCCCGCTGCCAGACCTCAGAGACATCGAGCTGAAGCTGGGGCGCAAAGTGCCCGAGAGCCTAGCGCGCTCGCTGCGCGGGGAGGAGCTGG---CGCCTCGGGAAGGGGCTGCGGACCC---------------CAGCGGGGTTGGTGGGagctgcagcagcagcagtagctgcagcagcTTTGCGCCCTCCGTGTCCTCCTCGTCGTCATCCTCCCCTGCCTCTGGCTCTCCACGACGTAGCCACCCCAGCGCCCTGGAGAGGTTAGAGACCAAACTGCACATCCTCAGACAGGAGATGGTGAGT---GTGATGCGT------------CAGAGGCGACTTGGGGACCCGGGGCCTGGGACCCGAGAGGGTGGCACAGG---------------------------------AGCGGGGGGGGGGGGGGGGGG-------------AGAAGCTGGGAGGAGGTGTGCGGGAGCGCGCCTCTGGA----------------------------CTCGGCTACAGCTAAGCTTGAACCCTGAGGACTTTGCTCGGTCACGGGGTGCCCTGG-------------CAGCTCATTCGGCTCTACTTTCTGATAGAGCTACTCCCTGCGCACC s monDom4.chrUn 144573585 1657 - 174229318 AACTGTTTATTTTTGTTCTTTTTTTTCTTCTTTTTAACATAAAATGATTTGGCAGTATCTCAAACGCTGGACTTTCTTTTCTTCTTTGC----------------TGGATAGTGACATACCTTAACTGTCAGGTGACTTTATCCCTTTAACTTGGGATACTTTTTAAAAGTGTAAGGTAAAAGACGACCCTGTCAGAGAGCACCA--AACATAATGCTCATATGAGAGACTTCCTTTAAATGTGGC--------GCCAGTGTTGCCTTACG-------ACCAGTAGGGTTAGAACAATTGGAGTTGCTCTTTTTGTCTGTGATCTACGGTACAAGGGTTGGCTCTCCTTTGGTCCACCTGCCAGTAGGGTTTAAAGTTTCCGAGGATCGGAGAAACACAATGACTTGGATCAAACTGTCCAAAGGAGAAGGAGTCTAGTCCTGTTAACTTCCAGGAAGCAGTTAAACTCCAATTATGCTGAATATCTCTTTTT---------------AATGCATATG-------TACACACGA-------CCGGCTTTCTCAGTGACCAGATTT-------------CTGAGCATACAGGATAAAACAGAAAACTTGGAGACATGTGGTTGGAAAATGAAACAATCCAGGAGTGTTACTACATCATTATATTGTTGCCGTGTTGTTGCAGATGGGCTGTCAGTGAACACTGAAATTATATGAATGGTTAGTT---ATCGGGATTTTTCCCCCCAAAAGATAAACCTGCTTTTAT----------------------------TTATTCATATTTTTTCTGTAGTCGCAATTGTCTACTTTCAGTGG----GTGGCCCCCCAAAATGCAACTTTATAATAATTATGAACTATTTTCAGATGAACCACTGCCTCTAGTTAGCTGTG----GTCCCTACTCCAGTTTGCTGCCTGTGTGAATCTCAAGAGGCTAATACTAGACTATGAAAAGGACGATGAACTCTGCATGCCGCGGTTAGATACAGAGGATAGGAGGAAATCTGCTGCTCCTGCTGCCGCAGCTTGCAAAA--GCTGCAGCTCCCTTTAATCAGAAGAGCCTGGAGTGTGTTCtatttaatttttttttttttttaaGAAAAGAAGAAGCCATGGAAGAAAGCCCACTGCCAGACCTGAGAGACATAGAACTGAAGCTTGGGCGTAAAGTACCTGAGAGCCTGGTACGGTCGCTCCGTGGGGAGGAACCGggcagggaccgagacagagacaaggacaaggacaaggaccagggcagggGGTgcagcagtagcagcaacagcagcagtaacagctgcagcTTGTCTCCTTCTTCATCCTCCTCTTCTTCGTCCTCCCCAGCCTCTGGCTCGCCTAGACGTAGCAACTCCAGTGCCCTGGAGAGACTGGAAACCAAGCTACATCTTCTCAAGCAGGAGATGGTGAGTAACGTGCTGCGCTCCCGCAGCAGGCAGGGCCAGGTTGGGCCAGAGGAGTAGGGGTGCCATAAGGGTGAAAGAAGGGAGGAGGACTGTATGACAAGTGTCGGGATCTAAGCGgggtagaagggagggggtttcaaggaaggaagaaatggagggagagtgtgcgtgatgggagggagggaaggagaaaagaatgaagggagggaagCTACTGCCTAAAGCT---CTTGTTTACACATAACTTTGCTCGGTCAGAGTTCGCTCCAGTCGCAGCCAGATCCTGCTCTTCCCTGTATACTTAGGGATAGAGCTG-TCACTGTGCGTC 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TACAATGAAAGACATGCATAA-TATAGAGGTTTAAATGTCCTGTTGCTGAAATCCTAGGTGTTCTTCAGGGATAGTACACCATCTGATCAGGAGGAGTAAAGCTTTGTTTTTCAGTGGAGCCAGATGTCTGGACACGTTTTAATGAATC----CACTGTGTACCATCTGTTCTAACACTTTCTGCCACCAGCAGTCATGGCTTGCCA----GTGGGTATTGACCTA-AATGGCTGA-GCTTGTATTAGCATGTCTACAGTTGTATGGAGGTTTCCATTGCAGGTTTTCATAGCTGGTTTGTCCCATGGATACAACACAAAACAGTCTAACAGCAATGGTGTCTTATGGTCT---AAGACCTTCCACAGAATAATGACCAGAAACTCTAAAATATGAGGAAAAATTGTTGATCAGCTCTGATTATTTCCCCTGCATCTCTATCACCCTTTAGTATGTTCTAAGTACATGCAAAAGAGAGAGAGAGTTTATTTCCAATAGCTCACTTTAAGTGCAATGACCCATCTGCTACCATATGTCAGACATCTGCTTTCATCACACTCATTTATGATCTTTGAGAGCTGGAAGTGATGAATTAATATTGGATTTATGTTAATTTTTATGTATATGAGGATTGCTTTTCATACATCACTTAATCTGACTGAATTAAGTTTTCAGCACTAA-GATATgagaacatgggaatggaa---ataagaacactggattttattcccagccacc-tttgcaaactaggaact----aaccttt------------------aataaattacttgtatattgtgccctagtttcttt-----tatataaaatgaAACTATAATGAGCCATGTTATAAAATATTTAGTGACATCAT---------GCTAGTATTATCCATGAATGTT a score=2990 s mm8.chr4 80402661 489 + 155029701 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actaattgag---aaattgccttacagttgtatctc-atggaggcatttcct------------caactgaagctcctttttc---tgtgat--agatccagctgtgtcaagttgacacaaaac s monDom4.chr1 446462892 122 + 748055161 ACAAATTGGGCTGGAAATGTTATGCAGTTTCTTCTTTACCAAAACTTTTCCTTTTTCAGTGGTTCCATGAAAGCTTTCTTCTCCTCTGTAGTCTAGAATCAGCCATGGCCAGAT--CTCAAGGT a score=4005 s mm8.chr4 80927668 70 + 155029701 GGTATCATTGAACTTCAGGTCAATCTCCTCCAGAGCCTGATGTTTGTTCTGGACCAGCAAGGGCTTAGGA s monDom4.chr8 247886997 70 - 308469712 GGTATCAATAAATTTCAAGTCAATCTTCTCCAGGGCACGACGCTTGGTCTGTACCAGCAGAGACTATGGA a score=5141 s mm8.chr4 80927738 88 + 155029701 AGACTAAGCACTCCCTTCTTGGTTCCCACCATATAGCCTTTGAGCATGATGAAGTCATTGGTCGCCTCACTACGAAGGACAAAGCCAC s monDom4.chr8 247887418 88 - 308469712 AGGGTGAGGACACGCTTCTTGGTCCCAACAACACAGCCTTTGAGCATGATAAAGTCATTGGTCACTTCACCATAGTGGACAAAGCCTC a score=6746 s mm8.chr4 80927826 101 + 155029701 TCAGTGGGTCGATGCTCTTGTCAGGAAGGTCGTAGTCAGTAGATGCTTTTTTCTTGATCAGTTTCCCATCCTTGATGAGGTAGCCTTGACCAGTCTTGTAA s monDom4.chr8 247887652 101 - 308469712 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aactggaaaggagaaaacaattgaaatgtaaataaagaaaatattcaataaaaatacaaaaaaaagaaagaaaggaagaaagaaagaaagagaagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaagaaaaaagaaTGGTGACA------------TCTACTTTTTT--------CTCACCTCATTCCTT-TTCCATTCTCTGTGGCAAGTGTGCAAGGTAAGCTGAGAATAATGGCCAAGAACAGTT--TTGAGAAAACTTATCCATAACATTATT---CTAAACTCTCTTAGT----CAGATGATAGAATGATCAATGAGGCTG--------------AGTATGGAAGAAGATACC----ATCCATAGCAGTCCAGGATAGTCA----ACATTTTTTTTTCTTATTTTTC----------------AATAAT----------ACCTTTC--------TGCAAAATAAAGAAAAAATAA--------------------------------GTATACAAACTAATTGTCCCAAACCAAACTCCTTATTAAACAAAAGCTCTTTAGGAAAAAATATCTTCTTG--TACCTACTGTAAA-----TTACCATGTTCT---------CAGTGCAATCT-----AACCAGAATATTAAAGAATTTTTAAATGCTATTTTGGTCTACCTGTACTTGGTATTTTGGTAAGAGATGAAAATTATACCTTAGTTAAGTTTAGAATTTTTGACTA--TTAAAGAATTTCTATGTATTAAGGAAAACATATTCAATGAGATGTCGTTGATGAGGTGTCT-CAGGG--------TACTGCTGATTTCTCAGA-AACACTTGTGGTCCTCTCTGAAAGCCTCGTTGTTGTCGGAATTTGGGGTCAGAGGGCCCGTTGAAGAGACCTCTT--GACTCTTCCTTTGTC-------ATCTTAAGTA--GAAAAGCATTCATTTACAAAACCAG------------TTGCATA-------------------TTAAGCAGTGTTCTGGGTGAGAGC---------------------TATTTGAGGAAAAAAACTGCACATTTA---------------------------------------------------TCTTTTGTGAAGCCTGGAAATGGCTGTGCTGGA--GAATGGTTCATGAAACGCCGCC-ATGCTAC-ATGCACACTTGAAATTAGGGAACTGGATCTTAAGTC-ACTCCTTGGAACTCATTTGATATTTCTGTAATTGTATTTGCAAGAAGAGAAAATTAGTTTTAGTTGTGATGAAATGTGTTTTGGCA-----------TGTGTTTCTACTTGTAAGTAATTTTAAAAGGTTATATTTTTCCCCGAGTACACATTTCCACATACCTATTATTACTATGCTACTTTATGCATTAGTATCCTGGGAAGAATTGGA-CCCTTAATGTAGAACCAGGGATTACAGTGTTATCGTCTTTGAGACTTTTAAAACAACTATTAGGAGGATGCTGCAATTACAACACATTAAAATACTTCTAC-------AATTGTGAAAAATACTCTTATAACAATTGCGTCAGCTTTCATCA--GAGTAAATACAGCAAACCTTCAGCTGAACTATATAAAGTGCTAACTATGCAAAAATGATCTCTTTTTTGTTTGTTGGTTGGTTGttttttttttttt s monDom4.chrUn 145184641 1645 - 174229318 aattagcaaagctaaTACCATAAACATATAAACTAGGACTATATATAA-GGAGTTAAAGAAAGAAAGAAGGAAGGAGGTAGGGAGGTTAG-GAAGAACCAAGAGTGAAAGAACTTTAGTGAAAACTAGAAGGGGGCATGAAACAAAAGTATTTTTTTACTTGTTTGGTACTTGCTAATTTTGTTGTTTGTTTCATTTTTTAC----CTTGTCCAAGGCCAG--GAGTCTAGGGGAAAATTACTACTGGTTTTATAGGTTTATTTGTATATTTATTTGACTagaatagctaaatagtgcagtgtataggacagtaaacactgttgggaaatttgattcaagtctagcctcagacacttaatagctatgtaaccataggtaagtcacttaacttctgtatgtctcagttacctcatttgtgaaatggggataattatagctcctaccttccatgattattgtgagaataaataaaaataacatggaaagtatattgcaaatcttaaggcactatataaatgctaactattattatttttgatgattATTCAGTTTAAATGTATTTTAAAAAATTATCCAATGGAGTTTCTATCTTAACAAGTCTTCTCACTTGCTATTATACAACAATGAAAACTCTCATATCCAGAACATTTCAAGTTTTATAAAATATTTTCCTGACAACTCTTCATTACTATTTTG--CAGATGAGAAAAATGTGCTTGAGATA----TAACATTATGTACTGATTTAACTAGTAAGTTTgtatggtggaaagaatgccatattagaagccat--aagacttgtcttcatagcctagctctattacttattacctatataacttttgacatcattggcctcagtttcctcatttatgaaat--------aacagtgttgtgtaagaagctgctttaggctccttccatgactaaatgaatcttatgaAAGGGAAATCTTGAAACTCCAAGAACAGGCGATGCTATTTTTGCATTACCCTAGTACCTGCCTAGTTTCAGTTATTTTATGGGTCAAATCATGTCCCTCCAAACACACAATTATATAAAGTAAAAAA--GCCCAATTAAGTTGGATCTTGTTCTTATTCCCCAATACCCAGAATTAAAAGAGATTCTACTCTATCTCAAAATTACAAAACAAATATTCTAGCTTAATTAATTCTTGCATTGTCACCCATGTTATTACATGAACTAGAAATTAGGAATCTTTATCTTAAGTTTAGTGCTTGGAATTTATTTGAGATTTTT--AATTGTATTTGCAAGTGCAGAAAATTAGTTTTAGTTGTGATAAAATGTATTTTGGCAACACTAGTGCATAGATTTCCTTTTATACATTATTTTAAATGGTTATATTCTTCCCAGAGTACACATTTTCCACTACCTATTATTACTATTATATGTTATGCATTAGTGTCTTGGGGGGAAATGTATCCCTTAATGTATAACTTGGGATTATAATATTATCAT-TTTGATATTTTT-TTACAGCTACTGAGAGAACCTTGCAATT-----ATATTAATATCCTTTTACTGATCCACATACAGGAAAAAATGCTTACGACAAACACCTCCGCTTATAGCACtttttggaaaaggcaaa-------------tatgtgaatttct---tttgcttaa-------cttatttgttacaaggataatatttttcttttttTT 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catataacaagtgaggagttttgaagaaaagagtaacagatatcaaggaattgtatgacagaaagagaagatggaggcaagaagt-------gagggatggcaggggaagagccaagatgctccactggaaaatt----------tttgatgctatgagaaaaatagaaacatcttcagcacattgagtggactctttatggtaggagaacat-agataaaagttaaacagaatgggatcgtagggatctgttttgacctgaaactttggagatgattccagaattaatgaaatcacaaatctactATCTGAGTACTTTAGAAATTTTTATTCTTGTAGAAG-------ACTTGGGTGTAGAGGAGAATATTTGAAAGATGAACAAATATCTCCCCAAATAT-------------GCCAAGTTAAAGTCATATCCGCTGTATGTAGATTGCCATGCTGGCTACTGATGTGGTTCAATATCAAAATTTCTAGGATTATGCCATTATATTAAAGGGGCTAAAGTATATTAATGGGTAGGGGA--------------AATCCCATTAGCCTCAACCATATATG--TGGTTAGATAGCAGTAACATTAATAGCATCCAGTTTCATTTAGAT--CTGTATGGGCTTTTTGAAAAGGC---ACAATTTGTGGAACAGACCCTGTGAAAGTG-------AGAAGGGGCTTTCTGCTACTTG---------------CTAGCTTTGCAT---------------------------TTTGCATCCTTTCTTGGTAG---------------------------AAATAAAATGCCTTTATGCCTATAGGAGATATTCTGGACCTCTTAGGCTATTCTCTACTTCAGGGATATGATCCCCCAAAACACTAATATCAAAGGATGAAAACAGATACCATCCAGGACAAATTTTCCATAACACAACTCCTGGCAGATTACTTCTGCTATGCTTAACTTTGAACACTGAAGCTCATTTTAAAAATGTTATTTGAAGATCAAATGAGGTT------TAACCAACCCACTAGTAGATACAGAGGATTTATCTGCAACCACACTATGACGTTCCCTTAATACCTTTCAGAAACATAAGTGCTTACATCCTAATAGGTTTTTAGCTTAAGATCTAATCATCCACTC--GAATTAAGATGCTTGAATGAAGCCAACTCATTTGGAACTAAGCACTTTAATGTCAACAGAGACATATGGTATTGAGAATGAATTAGAAAGGATCTCTTCTGAGCCATCTATTGGGGGAGCAAGAAGAAGATCCCCCAGCATCATTATTAGTTTACTCATTTATTTCCCAGCAAATAATTGAGAGTAAGATCTTCTTATGAAAGTGGAAATGGTCTAATAATTACTAGTTAGGGAC-ATGGTACATTTACATATGGATTGATTGAATTATCCCCCTGCTCTCTAAT----TCTTTCAACAATATTTTTGTAAATGCCATTTTTTAGTGCAGAATACATACAGTATTGAGAATATATGCATACATAT 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cagatcaaagagaataaatttaacagtcattagactacctgaattctttaacaacaaaaaagagcctagatatcatatttcaagaaatcttaaaggaaaacttccctgatatcttagaaccacaaggcaaagtgtgaatagatagaatccactggaagaaatctcaag-atgaaaactcttgggaatatcatagctaaaatccaaagcttctagctcaaacaa------aaaaatactgcagtcatctagaaagaagttattcaaatacccagacgttatcaggaagtcaggaagagacacaattcagtagccacttctctaaagaa-------gcaaaaaacttgtaatatgatattccagaaagcaaaatatatgggtttgtagtcacgaataac-ttactcagcaaaactgagtataatgccacatgagaa----aaaaatggatc--tttagtgaaataatggatatccaagcattactgatgaaaagacc a score=1612 s mm8.chr4 82668151 149 + 155029701 CCCCACTAGGATTTTGTTTCTC-TTTCAAAATTGATCTA---ATGCTTCCCCTGTGTTCTCCTCCCTCACTTCCCACCCCCATCCCAATCTTACCAACTAAAATCCAAACATTCCATTCTGTCCTTGGTTGTCTTTCCTCCAACCATTCCTGA s monDom4.chr2 426058338 151 - 541556283 CCCCCCAAGGATAAAAATTCTCATTTCAAAA--GACTTATGAATATTTCCCCTTCTTACACCTCTCTCTCCTCTTTCTACTCTCCCTAGCTACACAGAAAACATGAGTGCACTCCATAACACTTCAGGCTCTTATTTCAAACACCAATTATGA a score=1757 s mm8.chr4 82668563 166 + 155029701 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AAGACAAATGAAAGCCATACTCAATTATTTT--ATCATCC-TTGTTCGAGTACTATCAATTTCAAATTTTTTAAAAAATCTATCAATATTCATTGTTT-TAAATGAAGAAAAGTTTCTGGATCTAAAATACTTTAGTGCAAAGTTTATGGACTGCATAGTACTCAGTTTATCTGGGAAATTTCCTCTCTTCTGTAGATTATTTTGCTAGAAACAATCCTTGGAGATGATTGCAAATGCAATAATTACTGAGTTAAATGAAAATAGATTTTTGAGCTAATTCCTTTTCGTGTTATTTTTGGCATGCTTGCTGGAGCAGTGGCATGGTGTAATGTTGACATAACTGGTTTCTTGGAAAACAAAATTTGTGACAATTTGCTCTATTCTGTTCCAGAGACAATCTGAGGCTTTTAAAGTGGGGCTAAAAATGCACATAAATCTGCCCACAC---ACAGCTGCTTCTTGTTTGACATTGTCAAATTTTCTTAATTAAAATTTGAGGTTT-TATGCTCAGCCTTTTTTTTTCTTTTGTAAATTCCAAATGATGATAAGCTTCTTTTAGATCTCTGGAAGCCTGTGAAAAGTCAGATTACAAAGGTCTTAATTGTTTTATCTGAACTCCTGATTCTT--AAGTTTATATTTAGTGC-AATTATGTAAATTCCACCCCCACCCCCCATTCCATCTGAGCCTGAACAGGCTCAACTAATCCTTGGTAGGGAAGAGGACATAATTcataatatagacaaaggagtgcatgacctagagtcagaaagacctaggtttatatactatctcagacactcactaattatattatcttgggcaagtcacaacccatttgagccttcatttcctcatctataaaatggggataatagcacctcccttggagcattgtttgaag--acttaaatggggtaatacccata-aaacactttgcaaaccttaaagtgatatataaatgagccattattaAACCTTAAGAATATTCAAGTTTATTGATTATATATATATATACTTCATAATAATATGACATTATAATAAAGTATCTATTGCTAAGAATAAAATT a score=-195 s mm8.chr4 82686951 283 + 155029701 GCTGTTATTTCAGTGTGTGTCTGCAGCTCAGACCTGAGTGGCCCTCCACAGACAGTG-----GGAATTGCAGCAACATCCCAGGAGGATC--CCACACAGATCCAAAAA--CATGGGGCACAGAG------CTCCTCTAGGTCCCTGCCAATGGACT------AAAGTAGTG---------------GTACAGAATCCAAAGTGTA----------------------TCCAGGTCAGGGTTGTCAGGTTCACACTAGAGTGGC--CCTGGTGATCCAGGGGGCCCTGCT----------CAAACCTTCAATGTTTAAAAGCAAAGCAA-------CCACAGGGAAAGGAACTGAGGAAG s monDom4.chr1 252158724 348 - 748055161 GTTTTTATTTAAGCTTGCATCCACATTGCAGCAGCTAGTGGTCC----AAGACAGTGAATCAGAAAAGGCAGTGATTTGCCAGGGAGTTCTGCCAGCCAAATTCTGGGATCTACAACGCACCCAGGTTTTTCCCCTTTCAATCTTTGTTGAAGAGCTTGAAAGAAGGAAGTGCCAAAACCTAAATCTGTACCAAATATAAATCGAAGGTTTTGTTCCTGCTATTGAATTCCAAACC--TGTTATTAAGCTATGGCAAAAAGAGCAACCAAGTGA------GTGCAATGCTTGTCAAGTCACATTTCTTCAATTTTCAAAGACAAGTCCAATTCTTTCAACTGGAGTGTGTGCTTAGGGAG a score=2931 s mm8.chr4 82687293 458 + 155029701 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monDom4.chrUn 147274385 190 - 174229318 AGGTAGAAGCACAAATGGGAAAGGTAGAAAGAAAAAGATAAGACTTTCATGTTCTTACCTTTCATACTTACTTATTTCATTTCGTAAAGTTGTTTCTGCTTTTTCAATGGTGATCAAGAGATTTTCCGTGAGATCAGGTCTTTTGCCCACTACCATAAAACCATTCCAAATATACATCATTTCCTAGTGA a score=14855 s mm8.chr4 82708845 458 + 155029701 ACGGAAGGAAAACAGTATTTTA--------AACTGACACTATGAACAATTTTGTTTAATGTAAATTTCTGTTGTTACTTTTAAGTAAAGGGAAATATTTTAAAATGTCTGCCACTTGTTTACATAAAGTGTTTCCAAGCATATCGTTAGAAATGATCATTGGAATATTTATTTTACTGGGCTCAGGTTCTTTTATATCATTAAAAACATGTGTCGGCCCAGTAATGCGCTCCAATATGCAGAAATGGCGCTTGTTTAAAGGCCATATGGCTGAGTGACAGTCCCTG-AAATGTAAACTAATGACTCTTCCTAGCAGATTACATTTAATGGGCTAGCACAGGAGAATTTTTTTTGGATCAAAAGCAAATGTGTTTTTGCTTGAAAATATTTTTCTAATGTCCAGATAGTGCCGT-TCATATTTTGAAGGATCTATGATGAGCATGAATTTTAAGTTACGACAGATATTA s monDom4.chrUn 147274583 434 - 174229318 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- 174229318 CCATGTAAAAATTAAAACTTTAAGCCTACAAGTGATAATTTGTGATGAGA----ATTTTCTTTTGAAGAAT-------AGCTTCCATTAAGAAAATTTCTGCATGCTTTTTTTTATTGAAATACTATCTGAACTTAAATATTCAAGTTACAGAAATAC-------CTTATAAATGTAAGAAACTGTACAGAATAGCT--------AGACAAAAATTAGATGGAAAGAGGT---------CTTTGCTTCCTCTAAGATAAAGGTTTATTCTAGTCTTCAAACAGAAGTGAAAAGAAACAGAAGTGGCTACCAGAGCAGGTAAGATCAGCTTTTCAGGAAAG---GACGAACTGGAATAACGCCGGGACTTCCTCACTGCAAACTTCTCCGTTGGGATAGATTTGCCAGCAATTCTCTGCTTCAAGCCCTCCACCTGCCTGTAGTAATTCCCA a score=6983 s mm8.chr4 82712762 221 + 155029701 tataataaataaataaatct-ttaaaaaggaaaaaaaAAAAAGAACATGAAGGGAAAATTCAGATGTGTATTAACA------------CCCCCA---GGGTCTCTGTGACAGAAACAGTATCATGCTCACCTAAACAGAGACACCACATTCTCCTTAGTCGCTGCCACTTCTTCCTCTGGAAGCATGCTCAAAATAGCAGCTTTCAAGAACACATATGTTGCCTTTAGGGGGAAAAA s monDom4.chrUn 147281241 235 - 174229318 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TGAACAATGTCTTGATTCTAAAAAAAACTTGTTGAGGAAAAGATGTAAGGAATAGAAAATCTTTATCCAACAGTGAATTGAATTATAACCAGTCAAAGAAGAAACAGGAAGCCACTGATTAACCAAGAGAGTTGGCCCATAGTCTAGATGCAGAGAGAAGAATTGATGCTACAGACAAAAGCAG-GAAAAATTGACTTTTCTCATGAAGCAGAAAAATTCCAGAGAAGCCAAATTAGTGCTGACAAAAGGATCAAACATGAAGAGTCCTCAGA----CATAGCTTTTTATAG-----AGTTGACCTGGCACTCTTGGCCATCCAGAAGCTGAAGCAAAATAGTGTCCATTGCTTTtacatacataatatacacatatatgtgtgtgttcacatacacattcatataggtatgtggatataattatatatacctgtgtataaacatgtacctatatatgcatttatgtatgtatgtatacaaa--tacataAAAATGAAATCTGAATCTCACTTCCATTCTTTGATTTAATAATTGCGTGAGGAACCATCTATATTCTAAGGAGAGATGGGTTAAATGAGTTCATTAAGTTTTTGGTTTTGTTTGAGTTGGTTTGAAGTTTGGGGTTTGAGTTTGGGTTTTTTGCATCTGCAGCATTCATAGCTTTGAACATTCAACTACAAGCTTTCTTCTGACCGTGAACAAATCTAATACATTTTTTTTTTGTTTTTTCTCTTAACCATGAAACCATTCCTCTGTAACTAGAGAGAGCACCCCTGAATTCCACCTGCTCTTATACCCTGTAATCCTTGTGCTCTCCC a score=6211 s mm8.chr4 83175506 226 + 155029701 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s monDom4.chrUn 147962274 920 - 174229318 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a score=895 s mm8.chr4 83504565 280 + 155029701 CTTTGACATTTCCAACTTGGTTGGAACAACCCTGGAAATGTTTTCTTATCGTCCTCTTGGAAGTGCACAAGTGCTATGTGGCCAGAACCGTCTTCCCAGATCTCCCTTGCTAAGAGTCTTCTTATATCCATGGTCCGGCTGTTCTCTCTGACCTCCTGGACAGCAGATAAAGTTAAGCAGGACGCCCCTCTACCCATCCTGGCTCATATGCCTGAAACCCAACGTGGCATATACTTACGTTCATTCCTTTGT---------AATCTCAGCCACCCTTTC---ACCTCTCATT s monDom4.chrUn 148404472 274 - 174229318 CTTTGACTTTTGTAGGTTGGTAAGGGCAATATTGATGAGGACCTCTTTCACTCTTCTCATAAGTGGGCAAGT--------AGCAAAACCCCTTACTTCCAACTTCCTTTCTTA----TTTCTCTTCTAAATGATAGTCTTATTTGAATCAAATTAATacaca-cacacacacacacacaATTTGATCCTTT--CCATCTTACTTCCCATCCCTG---TCTTCCCCAGAATTGGATTGTTCCCATTCCCTTGTCCAGAATAGAATTTCATTCTTTCCATCTGGACCTATCATT a score=24331 s mm8.chr4 83507366 755 + 155029701 TGCCACCAATAAGAGACTTCAAATGTGCTCAAACCTCTCTGCCTTCAGTGTCTCCCACATGTACACATCTGGAGAAAGCATTTAGCTAT--GAGAAGAAGTGAGCTGTCATTCCCCGTGACCATAG-GAGAACACTTGACGGAACAGTCCCCTCTA-CCATGGGAAGTAGCTTCATGGGTAGCAATCCTAATCGCCCTTTGCAGTGGGTGAGCAGGGTAATGATGCTGTTTGCCAAGGGTCATGGGGAAGGGTGGTGCATGGGGGAATACGTGTACATTCATGGGAGAAAACACAGTCTC-GGGGTTGTAAAATCGATGCCTTTCAAACCCACCCCCAACAG--CTACAGCCCTCCCATCTAAGCCACTCATAACTTTACAACACATTCTCCTTTTGGGATAAAACTTTCCAAGTTCAGTGTCTGCTCCCCAGAGGCCAACTTTTTATGGGAATTTTGTGCTAAATCAGCAAAGCTGCATTCAAGTTGGAGAAATACAAG-------ACACTTTCTCTCTGCCTGCTTGAAAGAGACGGTGAGCAGGGAGCCTCCCCCGAGATCGCT-GTCTCGGGTTGACT---CTTGTTTCTCAGCGTTCCAGG---CTCGGATGTGATCAGACTGAA-GATGAGAAACAGTTTT---------AGCACTGTCTGGATCAATGACAGAGCCAATAAATAGATATTGCCAGTGAATGGAGACAAACGTGAGAGGGCTAAGAGGAAGCAATG----AACAGGGAGATATTATGACAGG--AAAATAATGGCCAAGAACTTCT s monDom4.chrUn 148409169 790 - 174229318 TGCCACCAAGGAGGGACCCAGGGGTTTTTGGGACCTCCCTGACTTCAATGGGATCCACATGTGTACAACTGAGGACAGAATTTGGCTAGTGGGGAAGAAATGAGTTGTCATTTTCAGTGACCTTAGAGAGAAAACTTGATCCAAGAGACTCTTTTTTCCATGGGAAGTAGCTTTGTTTGTAATGCTTCTAATTTTCATTTTCAACGGGTGTACACGGCACTGATGCTTTTTGCCAAGGGTCATGGGGAAGGGTGGTACTTGGGGGAATAGCTAAGCATTCATGGACAGGAATGTGATCACAAGGGCTGTAAAACAACCTCGACTGTACCCTGCTCCCAACAAACTCCCACCCCTCCTATTTCAGTCACTCATAACTTTCTGATAAATTCTCCTTTGGGGCTGAAACTTTCCAAGTTTGGAAGCTGGTCCCAGAAGGGCAA-GTTTTATGGGAAGCTTATGCTAAGTCAGCATAGTTATTTTCAGGTTAGGAAAGCATAAGAAACAATACACTTTTTCTGAATCAAAGAAAAAGAGATTATGA-CTGGGATCATCCTGGGGAGTAGGGAAGTTTAGGGAGACTTTCCTtctttttaagatttccaggtgatttcaatgtgatcacagcaaatgatgagaaacaAGGTTACCAGAAACAGAATTGTTTGGATCAATGGTAGAGCCAATAAATGGATAACAAAGGCTAATGTAGACAGATGTAAAGGAGTCTTGCAGAGGTAATGAACCAACAAAGAAATATTACTACATATCTATACATTGACCAAAACATTTT a score=34181 s mm8.chr4 83517463 645 + 155029701 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s monDom4.chrUn 148438618 1016 - 174229318 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a score=7305 s mm8.chr4 83532683 573 + 155029701 TGCAGAGAGTGGAGAGATCTGGGTCTTAGG-CATGTGAGAAGAGACTCATAGTTGACTTGGGTAGGAATCCACAGAGT----------------CTATGAACAGAGCCCCAGAGATGAGGCACTGTTTATGTCCAAAGGAAATATCCAGACACTTCAGCAGGGCTTGGGACACTGGGGGCTCACAGCTTTGACAGATGGAAAAGGACAAGTGGAACTATCTAAAtccctctccctctccctcaccctctctctctTTCTGACTCTCACAGAAAGGGTCagagagacagagagacaaagagagagagagagaCACAAAGAAACATATTGAAAGAGTTATGAGTAAGCTGTGTTTCTTAGAAGAAAACTGTGATTTAA-AAAATAGCTTTACTTTCAACTTGTCTCAGCTTCCTGGCTCCTGAGAGTCTCAAGCCACATGTCAGTATTTCTGAGTTTTGCCTGACAAAGCAGACTCATGTAGATCAGGAAGAGAGGGGCAGATGGGAGAAAAATGAAGTGAGGACAAAAATCAAGAAACTGAAAGAAAGTTCATTCATGGAGTATCAGAAGAGGTGGCATCTTCCTACCTCCA s monDom4.chrUn 148444405 482 - 174229318 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s monDom4.chrUn 148459856 1065 - 174229318 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TGtctctctctctctctctctctctctttctctctctctcAATCT---GGGTAATAGGGAGAGATGACTGGTAGGTAGAGATGATAACCAGAAACCAAG----ATGGATTTCCCACTCC-----------------------CACCCCCAATCCTCAGCAACTCTTCATAGGGTGATTAGCCAGCAT-CCAGACCTGGACGATGATGCAAAGGGAGATTTGCAGACCCCAGGAGGAGTAAGGTTGGGGGCGAGAGGGGGAAGGGGCTCATTGGAAGGTGGGAGAGAATGGGAAACATGTTTTGTAAGTTTTCCAAGATGTTTTTTTTTTCTTTTCGTTGTTGTTAAGGGCTTTTCATAAGACCTGTTATCCTGTTGGGGTTTACATCATTATTTGATCTAAACCCCGACAATAAGACTACATCTGCTACTAAGCTGTGTTGTAAATGTCTTTAATTTTTATATTTCATCTGAAGGGAGTTGTTAAAGCGAGTTTACGGGGTGATGGCTCTTTGAATAAAAGACATCAATACTCAAGCAGAGCCCTGTATGACACTTAATTTTCCCTCTAATAAGCCCTACTAAAATATTACAAGATTGAAGGGTTTTTTCTTCCTTTCTTTCCTCCTTTTCCACTTTAACTTATCTTCCCATTCT----GCTTTCCCCGCC--CCCCCCTTTtctctctctctctctctctctctctccctTAAAGGACATATTTGAAGAAAACGTTTCTGCCCAGATGACACCACTTCTATTTTCACTGCCAGCCAGATGTGCTCCTGACTTCTGAATAAGAGAAATGGCTCTTTGAAGTTTTTCAAAGACCTTGCTTTTATTTAGATTTTTCCCCTTGCCCTCTTTATTCTTCTTTTCCTCCTTTCTTCCTTGCTTTTTTCCCCCCAGAAACTCACAGGAGTGGTTTT--CTTGG----TTTTTCTTTTCCT a score=2113 s mm8.chr4 83683193 186 + 155029701 AAAAGGAAGCCCCTCTTTCCTCTCTATATGCCAGACATGCTTTCTCAATGGCAACAGAAGAGCAGCAATGGGAATTTAGAGGCACAAGAGGAAAAAAAAACAGATAGGCACCCAAACATTAAATCAGAAGTACCCGCCCCCCACAAGCTAGAGTGCCATAATCACGTGTCCCCCTAACTGCCACCC s monDom4.chrUn 148676890 164 - 174229318 AAAATAAGGTCTCTCATTCTTTCCCCAACATAAAACGTGTTTCTTCTTTTGCTACAGAAGACAACC-------ACCTATTGCCAGGATTGAGAAGAGAAACAGCT-----TCAGCACATTAATTAACAGACATCTCCTGCCTCCAAGC----------TCATTGCCTGTCCTGCCTATTACCATCC a score=13065 s mm8.chr4 83687815 980 + 155029701 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TTTGCTTTTAATTCCTAGATTTATAATAGGCAAAATAAATCTTGCATTTATCTGCATCTACAAAAGAGGATAAAATGTTTCCCTCCTATCAAACATTGACAGttttattttagattttttttttattattattattttGAAAAGTG--CTTTTTGGCAAGGCAGGCGAAAGCAATCTGGAGGCTTGTGTGATGGCTGTTCACACTTGGTAATGAATAAATTCTGTTGGCTTTCACAG-------------------------GAGTCAGAAGGGAGTTGTTGGTTTACT-----AGAGATGTGGCCTGAAAACACCAAGCCAGCTAGCTCATCAGGGCTCCGGATCTCGTGCCCTTCCTCTGGCAAACCATGTGTCGGATGTGGTGGGAAAAAAGAATCTCCCTTTCAGCAGCAGAATGTGTGCAAACTACACCCTGAATTGTCCTATGATGACCTTGCAAATGCAGCACATGCCCTTGTGACCACAAGGCCCGACAACTGTAATTTCCTCTGCTTGTCATCAGAGCTCTCCTGCTGCTGGCAGCAGGCATC------------ACTTGCTCAGGGGCACCTGC----CCTCCCCTACATAATGCATATGTACAAAAAGAAGGTTCAGTAGGACGCCAGCCCCACTT-------------GTTATGCAAACTCGG----------AGTTCGGTAC-----------TCCTGCATGAACTGTGTTCTGTGAAGCCAATGGACGTTTTTGAGGCATTATCTAATGCACTTGCTGAAGTCATTCCAAAGCTCTGGATTAGGCAATGTCTTGGGGGCAGTGCAGTGCACATGTGGAAGAGGATTTCCCCCAGTGATGTCACCAAGGTTGCTTCATTTGTGTGCACATTTTCTActtgctaggctccagacattgctctaaagtgctagtgata----agcccctgattaaggcactgctttctcctagct s monDom4.chrUn 149264198 883 - 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s monDom4.chr1 247807048 957 - 748055161 CAGCCCTGATGTAGAGTTCCAGACAGTGACCAGCAAGTGGAGCCCCGTGTGGGTAAAGATATCTTCCAGTTGGGTTTGCCTCTTCCTATATACATGGACCCTCGTGGCACCTATTGTACTTACCAACAGAGACTTCAGCTGAGCCCCCAGGGTCCA--------CAGGAGCCCTCACAGTCTTTGTGCC-AAGAGCCAACATCT-TTGTATTTCGCTTCAACTAAAATATTAAGTGAACGCTTTCCAAAAGTTTGGCTCTATCCAGATATACCCAAGGTTACTAGAT-GAATAATGCTTTGAAGCAGGATCTAAACTTTTCCTTTTT-----------------------ATTCTATTATGTTTATTTGTAA-CATGTAA------AGTATAAGATGAATATTATTGCTTTTTGTAAAAAAAGAACTACAGCTGTGCTGTGATGAGAATTCTGAAAAAACATCTGTAGATCCCTGCAGTTTAGATTTTAAATGGTTAA-TAGAAAAACAGAGGGGGTTGGAAACCCTCCTTAATATATTCAGATTGAAATATCTCTAGAAAACAAAGAAGAATGTACTGCTTCACAAACGCTTTGGTC-----TGTGGAAGCCCAGTTTTCTCTTACATTCCATCGTGCAGGTTCAAGGAGTGTGCATGCTCTTTCCTAAGAGAAACCTTGCACACCCTTCCCCAGGCTGGGGATCTCTGAACAGCACATCTCTTGCCTCTGTAATTTAGTTTTTTCACTGATTCATACATTTTTTACACTATAGCAATCTGATGCCACTTGATCTTTGTCTATGACTTTACCAAATATAATGATTTCAATGATGTTTTTCAAAGTTTAATAAGTGGAAGATTAGCCTGGAAAACTCTGCTCCTTCTATTTTTCACATGAGAAGAAAAATATGTAAAACTAAAATGCATGTGAACTTTTATGTCAGCACTTCAGCCATTTGCATTATAACATTTGATTA---------AAATATCAAGATTTTAAAGAAATTT 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TTCAAAATGCCATTTCCATGATTTTTATTCTCTTCCCAAGGGTTTTC-------CGAGTCCAGTTTAAATTACTTATGACACAAAAGAAATAGAAACTCCTCCCAAACCCTCCACAGCACACCTAGCACTACAAAACTCTAGGCAAAGAAGTGTAATGCTGAGGCATA-AGTCT---CAGGGGGAAGTGACCCATTTTCAATGAAGGACCAAA----TATGGAAACCGATATAACTTTGTTATAAGACCAGATGTATTGCAGTGATTTGGCAAGAGGAAACCGAGTTACAGGTGTTCTGTCAAGTCACCCTCTAAAAGTCATCTTTGCTTTAAAAAAAGATCTATCATGTGCATAAAATGATTTTAATATATTTTTAGCACTAGAGTAGATGCT----GCATTACCTGTGGGCTGAGCTTTCAGTCTTTTACCTTGGTTTTAGAAAACAGTTATCAACTGCATTTTGTTTCTAGACAGGATCCT a score=14625 s mm8.chr4 84958294 440 + 155029701 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TCCTTTTCTTGCC-------AAGGAAGAGTTGATTTAGATAGTCCAAATACCAAAATATAGCATATGGGCATAATTAAAACAGATCTGAAAAATAGATCTGTGATGATGCTGTGCCCCATTTAAAATATAAAAATCTTTGTAATAAATAGTAAACACAGGAAGAAAATGTCCATAGTGTA-TGTAACATGGAAAAATGGATTTGTTTAAAGCTCAT----TTCCTTTTGTAATT-AATTAGGTGGACTATGATTTCAAAATTTCAACCCAAACAAAAATGAAAATACAATGAAGTTTAATGTGTTAGATGGTTTATTCCAGTATAAAAAGTCCCTCTTTAAATGATTCAGCTGTAATGGAATTTAAGGTCAAATTCACAGATCTGAAACTACTGGTTTAT---ATAACACA a score=23504 s mm8.chr4 84978568 1178 + 155029701 AGAACAGGGATTGTATTTTTGCCTTCTTTCCCATATTCTCTGAATGGCTAAGAGCAATGTGGAGGCTGACTATTGTTGACAGATTGACCAAAT--TCTGAAAAGCCTGTTGCTA----ATTTCAGGTAAA-----------------GGTTTTTGAAGCCCAGGAGAAGATGAGAAGAGTCATTGTGT-CAGTTCCAAATGTAACATTTTTATTTTTTTTTACATAGTCTCTGTTGTCCTTTACTGTATTATTTGCACAAATCCTTCAACACATGGAGAAAGAATG-----AAAAGTTTTGGAGGGGTTATTAT------ATAAGATTTTCTGTGTGGATGGAACCACACCCAACGGG-CCGCACCCAGAGGAGCTTATGTATGTTATTAGGCTCAGGAATGTTAAGTGTGTTAGATTCAGTCCCTGCTGGGCAGTCATGTGACGTAAACAGTGACTCTTAAATGAAGCCGTAATATATGGTTTAACTCCTTAACAGTTTGTGATGTCAT-TTTTATGTGGTAAGAAAAACAAATGCTGTCACAT-TTTAGACTTGAGCCTCCTGCAAGCCAGCACCGAGAGATTAAGTATGTACATTACTAAGA-GGAGAGCATCAATGTAGTGAGATGCATGCCAGAAAAGGGCTGTGAGCTCAAACACTGCTCACAACA-AGTGTGTCAGAGCAGAAAGATGAGCCTCTTGATAAGTTACAGC-CCCAGGAGACC----------------------------------------------------------------CTGTGTTTCCCTT--------TGAAGGAAGCAGAGTCA--TTTTATGTATTTTGATCTGAATGTT----AATTCAAATAAGCATGCTTGTGTAGCATCCGTTAATATTTATGCT--------AACCATGTAAAAGCCCAGAGATACAGTAACCAAGACTAAAG--------------------------------------------------AAAAATCCTTAGGAAAGAGAAAATTAGAGCATCGATTATG-------TTGGGTGGAA-------AGTATATAAAACTCTTGGTTTCCAGTGTTTACTTTCTT-GAAATATGGCTTTGAGTCATTTCTGTGAGCTATACGGAT---TCTACTTTATGATTCCTATCATTTTTATTGTGCACATAATTTAACAGTTGGTGATAGTTGAAGCCGCATGTCTCTGTAGCCTGCTTTATTGTTGAAACAGCCTCGCTCAGAGGAAGACACTTTGAACTGTGT--GCTGCAGGTATGTATATTTTCTTTGAACAATGTGTATGACATTCAACTCGTCAAAAAG-GAACCGTTTGCTTCGCTGAACAGCGTTGTTCTG s monDom4.chrUn 150687573 1349 - 174229318 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TGTCCGCACCGCCACCCTGCTGGGGCGCAGCGC-CAGGGCGCACGGAGCCCAGTCTTGCTGTCCGAGTCGGAGCAGGAGCCGGAGTCCAGGCAGCGGC-CCCGGCAGTCGCACAAGGATCCCCAGCGCCAGCCAGGGGGAGCTGGAAGGAGTCACCTCCGAGACAC-CGCGGAAC------AAGAAGAAAGA--GCGAGTTAGGGGAGGTGG---GCTCCTCTGACACTGCCCTCCTTCGGCGGCC----GGTCCGCCGGAGTAG------AGGGCTACCATGGCATTGGCAG---TCGGGCTGCGGTACCGA---GGGAGCCTGGCCCCCATCCTCTCGAGCACCCTGTGTCTCCTCTACTTCGCCGGACAGGTAGGA---ACAACGCTCCTGCTTTCTTTTC----------CCCTGCCTTCTTCCCTTCCTA---------------------CTTCTGTGCTCCTCTTCCTCTAAGTT--TTCTGCTCAGG----TGTCAGAGTGAGCGGACCAT--GATTTGGAGGGGACGCCCCTCTCTGCCTTCAGCCCTGGGG a score=6348 s mm8.chr4 84997072 380 + 155029701 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s monDom4.chr6 13279562 1117 + 244784211 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GTAAAGCAAG-GAAAAGAAAAGAGAAAGTCAAGGGAAATCTCATGCTAAGAAATGAAATGAAAATTACTCTCAGCACTATTTAAAAGAGTTGCCTAGAGGCCAGATAATCTGAGAAGCTG-AGACAAAGGCTCACTGGTCTTTCAGTTCAGCCAGTCCCAAACTATCCTCAGTATCATGATGACCTTCTGGAGCTTGTTGCCAGTTGCCCTGGTGTTGCT---CTGCTCCAGCACTTTCTGCTCCCTGGGCTGTGATCTGACACA-----AGGCCTCCAGGAA-------GACTTCTCACTTCTGAACCAGATGAGCACATTTTCCCTGGTACCATGTTTGAAGGACAGGACTAGCTTCAACTTGCCAAAAGAAGCCCTGGAGGACAACAAGCTCCAGAGGGGAGATGCCCTAATCATTTTCCATGAGATGCT--CCAGCAGAAGTTCACCCTCTTCAGCCAGAATGCTGCTCCTGTTGCTTGGAATCAGACCCAGCTCATGCAACTGCTCATTGGTCTGGATCAGCAGATAGAACAGCTGGAACGTTGTCTTACACAGGATGTAGAACAAGATGAGCCCTCCTTGGGAAGAGAGAACCCCCTGATGGCCCTGAAGAACTACTTCCAAGGAATAAGCCAGTATCTGCAAGGAAAAGGATACAGCCATTGTGCCTGGGAGGTCACTCGAGTGGAAATCAGGAGATGCTTTCTGTTCTTAAGCAAACTTTCAAGAAAATTCAGGGACTAAGGAAGAAGACAAACTCTCAGTTCCTCAAATAATTG---------CTTCCTCAAAAATAAACATTCAATCATTAGAAAGGTTGATTTTTTAGTATCTACCGGAAAACATCTATATTTGCTGAATTATTTAAAAACAATATAAGCCACCattatattatattataaatatatCAAACAAAAGGAATTTGAATACAGAAAAGTATCATCTGAGCTTGTTAGATGaa--aattttatattttacttttatttatttgttattatttattctaataatattGCTAATATTTATTGTTCAAAGGGGAAATATAACTGTCTGTATTATTTATGTTGGTCCTACTCTTCATTATTATATTTCTCATATAAAATGCATTC--TTTTAAAGAACTATTTTGTTATTAAAAC-TATTTGATTAAGAAATTTCATATGAAAAAAGCAGACTTGATACC 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atatggaaaaagaggtgcaagtattcactgaggaaaataaatctttaaaTTGGGGAATGGCCTTTTGCAAAGATCATTTTTTAAAACATTTA------TTTAACA-ACCAACATACACAAAATATCCATGAAGATTATTGTGAATGATGGCTTTTTCCTCTGTTATTAA-----GTTCTAAAGTGGATTACACTAC---TCTTCATCTGAAAGCTTTGGAAGACTTGAATTGCTTTAGATGAA----TGAAATGC-----TAAAACCTGAGAAGA-----AATAGTATCAAGTTGTCTT-----------ACTCTATATT--------TAGAATAATAATACTAAATAATAGTAGTCTCTAT------------------------------TAGTATTTGGAG---------------------------AACTTTAAATGGGCACAATGTATTTGGTATGAACACCCAATCTGGTCATTCTCTTCTGCTTTCTGCAAATTAGTGCCAATGTGAAATTCTGTGTCATCTTTGAAAGTCAATGGGGAAAACCAATGCTTTGTGTTCATGGTGCAGGCCTATCATCTTCT-GAAGAATCTAAAAAAGTGATTTTTCCTCTTTACATAATAGTATAAATAATAGTG-ATTAAGTTGAGATCCTTAGCCAACCCCCAAAGAGCATTCAGACTGTCAAAAATATGTAGAAGGAGTTAAGATTAAAAGAAA-GTGTGTCAAAAATGAGTTCATTGTATTCCCTTTAATACCTGAAGACCTGAATAGGATTTAAGATTTATC-TATTTGCCAGGGAAACTTAACTATAGTATGGATTCCCCTCTGGGGGATGAGTGGAATTTTCTCTGCAACATTTTTTAATGAGTTAGGAAAACTTCACTGTCACCTAATGATTAGTTAAAAATTGtattcattcattcattcatttaagtatgaatctatccatttgtttatttactttttcaCAGTGGTAGCATGTGAATGCTTTGACCATCTGGCTATCCAGTTTTATGGAGTTTTGGTGAGACAGTGAAATCTCAATTTGGATGATTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTGTT--TTATCCCTGATCGGGCAAATGGAAGAGGCACGTGACTAGAAAGGCAAGGCCTGGGCTCTA-----GAGAGAGGTGCAGCTGCAGACACCTCACATTATTCCATAACCAAGGTAAAAAATAAGATACAAATCAATTTTAGTATCAAAAA-CAGCTCTTACTACCCAAAGGGGACTAAGCAGAATATATAAACACAGAGCAGCACTGCTGTGCTATCCTTTCTAAGGAGAGCTAGGTGCCTAATTAAGACAGTAGGTACAATGCAAGCTGTGGAGACTCAGTTAAGCAGCAAAATCACATTTGGATGCCATGTGAGTCCTTCTCCTC-------AGACTGAAATACAAAATATTGAAGATCACCATTTCTGATGAAT---------TCCTCTTCCCCATTTTATACTCCTTTCAGAGC--CATAGACCAGC-------CAAAGTCTGCCTGCTGGACC--ATAATGAAACCCA------CCTTAGCCCCTCAATGTCTTTATAATGAGTTTGATACCCACAGTGAGTAGGGGGAGAAAGGCTCTCCAAATGCTTTTTCTTTCCAGACTGCTCTGAGGATTCTAAACCTCCCTATCCAG--AGTACATTT-TTACTATTTCCTCTCTATGGGCACAACCCCAGGCTTCTTCCTAACAAATAAAGGCCTTCCAGAGGCAGCAATTACTGCAGCAGGTGACAAGGAGAGCAAAATGAGGAGCTAGTTTGATGGGAAGGGGGTTGACACTGAACATTGGCTGGAGATG------TGGAAAGGGAAATGGAGACTTGGCATGTTGCAAGAAGCAGCTGTGGCTTGGATG 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s monDom4.chr2 402953454 2069 - 541556283 actagaaaaagaacaaattaaaaaagactaaattggaattcctaaaaatcaaaggag--aaattaataaaatt-gaaagtaaaaaaatattgaactaataaataagattaggagctggttctatgaaaaga-----acaaataaaatagagtattggttaatttgataaaaaaaaaaaaagaCCTCAGCTCTTCTCCCAAGCTTGCTGCCAGGA--------TCCTCTGCTG---CAGTCACATCCCTTAGACAAGATGGTGAAGGTCGGAGTCAATGGATTTGGCCGTATTGGACACCTGGTGACCAGGGCAACATTCAACTCCA------GTGAAGTAGATATTGTGGCCATCAATGACCCCTTCATTGACCTCGCTTACATGGTTTACATGTTCCAGTATGATTCCACCCATGGCAAATTCAAGGGCACTGTAAAGGCAGAGAATAGAAAGCTGGTGATCAGTGAAAAACCCATTACCATCTTCCAGGAGCGGAATCCCGCCAACATTAAATGGGGAGATGCTGGATCCGAGTACGTCGTGGAGTCCACTGGTGTCTTTACCACCATGGAAAAGGCTGGGGCTCACTTGAAGGGTGGAGCCAAGTGCGTCATTATTTCTGCCCCCTCTGCTGATGCCCCAATGTTCGTGATGGGGGTGAACCATGAGAAATATGATAACTCCCTCAAGATCTTCAGTAATGCCTCCTGCACTACCAACTGTTTGGCCCCCCTGGCCAAGGTCATTCATGACAACTTCGGCATTGTGGAAGGACTCATGACCACAGTCCATGCCATTACCGCTACCCAGAAGACAGTAGATGGCCCCTCTGGCAAGCTGTGGCATGATGAGCGTGGGGCTGCCCAAAATATCATTCCTGCTTCCACCAGTGCCGCCAAGGCTGTGGGCAAGGTCATACCTGAGCTGAACGGGAAGCTCACAGGCATGGTCTTCCATGTTCCCACTCCCATGTTCCCACTCCCAATGTGTCCATGGTAGATCTGACTTGCCGCCTAGAGAAAGCTGCCAAATACGATGACATCAAGAAGGTGATGAAGCAAGCGTCAGAGGGATCCTTAAAGGGCATCTTGGGCTACACAGAGGACCAGGTTGTATCCTGTG------------ACACCCGCTCTTCTACCTTTGATACTGGCGTTGGCATTGCGCTCAATGACCATTTTGTCAAGCTCATTTCTTGGTATGACAATGAATACGGTTACAGCCACCGCGTAGTAGACCTCATGATGTACATGGCCACCAAGGAGTAAAGTGGAAAGCTGTGGATCTTTATCCCCATC--------------CAAAAAAGAGTAGTTCTACCACTGGGGAGCCCACATCCATAACAACCTATGTCTCCTATGCCAGGGAGCCCATGCCCCGTTCATATCCCTGCCCCGAAGCACCCCTGTAGTGGGGAGAGGAGCATAGAGTCCTATCTTGTGTACCATCAATAAAG-TCATCACATTTAGTGCAAAAAAGaaaaaaagaaagaagagaatcaaatt-atcagtattaaaaatgaaaggggtgattgaaattaaagcacttattcagagctattttgcccaattataaataaataaatctgatactcttgctgagatgaatgaatatttacaagaatataaattgcctagatgaacagaatacttaaataatcccatctcagaaaaagaaa------ttgggcaagccatccatgaattgcccaagaaaaaattctgagggccagatggattcacaaa--tgaattctttttaacagttaaaaaacagttaatcccaatactataaaaacta----------gaaagaaaattatagaccaatttctttaatgaacattgatgcaaaaattttaaataaaatactagcaaaga---gactaaagcaatt-----tatcataaggattattaaccatgaccaggtgagatttataccaggaatgcaaggctggt--ttaatattaggaaaaccattagcagaattgaca----------------atatcaataatcaa-actaacagaaatcatatgatttaacttaatagatgcagaaaatgctttgacaaaatacaatacccattcc--tattaaaaacactagaaaacataggaataaaagagcctttccataaaa 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TACCTTTTGGGGTACCTGGGCGCTTTGGGATATTTCACAGGCTTGTTTCCTTCATCTTCTCTTCTTCTGGCCAGCTCCTCAGCTGAGAGGTGCTGAAACAGAAAAACCATTGGAGCA--AACGACCCCTGGCAAGGGCAAGGCAAAGCTAT-TCAAACAGATTGG a score=6064 s mm8.chr4 94450902 161 + 155029701 GGATGAACCACAAATATGGCCAA-ATTACCTCAAATGTTTGTCCTTCTAAGTCTTTTGCATCACACCAGTTTCCCCATGGATCTCGGACCCTGCGTCTCCTCGTTCGCTACATTCAGAACAA--AAATAAAGGCAAACGTAACAAAATTAGCCTGGTTAAAATC s monDom4.chr2 508147226 157 - 541556283 GAATACACCAAGAACATGGTGGCTGCTACCTCAAACGTCTGTCCTTCCAAGTCTCTTGCATCGCACCAGTTCCCCCATGGGTCTCGTACCCGGCGTCTGCGAGTGCGCTGTGATAAGGAGGATGAAATAAA-TCAAATGTTATCGATCTA------TTAAAATC a score=6680 s mm8.chr4 94452336 208 + 155029701 GCTGCTTACCATAGACTGCAGGCGCCAGGCAAGCTGGTATGCTGCTTCTGCATCCTTTCTGTCGGCCGCTCGTACTTTATCAAGTGGTTGTGGCCTGTTATATACTGCCTGCTCTATTGGGATTCAGGAAAGATAAAA-CAATCTATTATTCTGTACAATCTGTTAATTAGGAAGACATACTATACTGACTACAGCTGAACCCCCATGA s monDom4.chr2 508147776 191 - 541556283 GCAGCTCACCATTGACTGTAGACGCTGGGCTAGCTGGTAGGCTTCTTCTGCATCTCTTCCTTCCCTGACTCGTGTCTTATCAGCTGGCTGGGGTCTGTTGTACACAGCCTGTTCTATTGGAACCCAG---AGACAGAATCGAACTTT-----------ATCAGTTTATTGAAATG----ATTTTAGAGAATATTGATCAATCCTCATGA a score=10055 s mm8.chr4 94453674 275 + 155029701 ATAAGGATAAAATGCCAAGTAAAAGATGTTGGG-----TTTTTATTTTTACCACATCCAAAATTGATTGCTCCTATCAACTCGAGGTATGTATGAATCCGTCCAATACAATTAACATCCCCACAGTTCTTCAGGCCAGGACGTACTGAGGTCTTATTTAAGTATTTCGGTTTGCATATTTCCCTAA----TTAAGAGATGGAAGTACAATTATTT--TGTATGAATAGACATTTTAAAAAAGATTTCTGGGGAAAACttttaatatatgaaatatattaaaatttt s monDom4.chr2 508150177 283 - 541556283 ATTAGCATGTGATGCAAGAATAAGAATGTTGATAAACTTAATTTTTTTTACCACATCCAAAATTGATGGCTCCTATTAACTCCAGATATGTGTGTATCCGTCCAATGCAGTTAACGTCACCGCAGTTCTTCAGGCCTGGACGCACAGAAGTCTTATTCAGATATTTCGGTTTACATCTTTCCCTAATATTTTGGAAAATAAAA--ACCATGATTGCATTTCTACAAAAACATTTTAACACCTGTCATTTCTGAACACTTCCCCTCT-TATTGTATGGCAAAACTTT a score=713 s mm8.chr4 94453973 165 + 155029701 TAACAAATAAATACCCAAGT-------GTCCTTTTTTTCACATGTAAAG-TATCTTTAAAGGATTCAACAACTTACAAATATTTGTAAGAATGATTGTGTTACAAGTATTCTTTCCCCAAAACTAAGCCCCACAGATCCCAGGTATCCCCTAACCTTGAAATTAGAAGCTTGT s monDom4.chr2 508150492 168 - 541556283 TAGGGAATGATTTCTCCAATAGTGAAAATACATCCATGCATGTGAAAAGTTATGTATATAGTAACTGACAAGGTAGAAAAACATATTTGCCT--TTGCATTGCAAT--TTTTTCCTCCAATGTTAAATTCATCGAATTTTAGTTA-CAAAAAAGCTAGAAGCCACAAACTTGT a score=18412 s mm8.chr4 94457083 962 + 155029701 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s monDom4.chr2 508151374 968 - 541556283 ATGAGCTGAATTAAAA------AGGCTCCCAAGAACACAAAAAAGGGAT--TTTGCTTCTTACCACTGATCCAAAATATAATTCCTTATCTTCAAATATCGTTCTGGTGTCTTGGCCTGGCGGCCCTCAAAAAACTCGGGGATGGCCTGCTTCTCCTCCTCCTGAATGGTGGTTCTGTCAACTTCCACCTCCTGCTCAGGTGCTTTAAGCTCCTCCCCATCCTCTGGGCTCTCTTCTTCCACTTGACAGGAAGGGTGAAAATGCACCTCGTTCTCAAGGACATCCTTTGGCTTTTGGCCAACTTCTGGG------------CTGGCTACCTCCTCTCCTTTTTCATCCTGCTTGGAGCTTCCTTCTATGCTGGGAATAGATGACTGATCATTGAGTGCATGGTCAGATCTACCCTCATTGCTACTGGACTTTGGCAGATAGGAAGCAGTTCCTGAGAGAGGGAGGGCCTTCCTCTGATCTTGTGAAGGGCTGGGAAGGTCCTTTCTGGGTGTTGCAGA-AATGGCCC-----AGTCTCGTCCTTCAGGATGAATGAGCCCTCGAGGGTCCATTTTATGATCAGTATTATTGGGAACATCAAATAAGAGAACACTGCTAGGATTCCTTAAGGGGATCTGAAAA---AATTCATCTGATTCATCAGTGATGTTCACTTCTTCATCATCAGATAATGTTTCAATTTTTACAGCATTCAGGTTAGGGTCAGCATGCCCTTGTAAGCCTAATGAAAGCCAGGATTTCTTCCCTGAAAGCTTGTCTGGCACCTGAAGATGACTGCTACTCTTCTGCTTGGGCACACCTTTTTCCAGACCATCTAATTTTGTCTTAGCAATTTTAAGAAAGAGAAAAAGAGAACAAGAAGAT---GACTTTA--CAACTTA-----------ATAAGACAAAGAGAACTCGATTAATCTTAGGCTCATGAGGAGGCTTGAGAGTTCATTAAGTTTTACTCATGCTGCAAACATAAACATTTGtgagcatt 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GCTTCTAGAATAATTTTACAGTAAGT--TAAAATTTCTCT-GTTTACCAGTCCTTGTTCAAACAGCTCTTTCTCTTCTACTGTCCACTTTACTGAATGACTGGCTGGTTTTGCAGGAGAATCTACCCTGA-------AGGAAAAGAGGAATTGCAAACAAAACAAAA---CAAACAAACAAAAAATGAAATGGAACATTCCATATTTATGCAGCTAAAGGTTATAAACCAGTGTTTcttcccaatgctatgaccctttaagtacagttcct s monDom4.chr2 508156580 270 - 541556283 GCTTCTAGGATCATTTTATCTGAAATGATAAAAAGGCTCTTATTTACCAGGCCTTGTTCAAATAGTTCTTTTTCTCCCACAGTCCACTTGACTGAGTGACTGGCCGGTTTTGGAGGTGACAGAGTCCTAACAAAGAGAGAAGAAAAGGAATTATGAACAAAAAAGGATCTCAAAGAAACAATCCAT-ATTCAGTACAACCAGAACTCATGTGTTTATGGGTTTGGCTCAAATTTAGAGTCCCAAATCCAGTAGCATTTGAGGGCACATTCT a score=8032 s mm8.chr4 94462450 304 + 155029701 tcatacacatagccataca-------gagatacaagggaacacacatcattaaaataaaaaGGTTTTAAAAAACACAGA---TACATACATGGCTTTTGATGACTTCTGCAGGCTGCACATGAAAAACAGAAAACAGGAAACTGGT----------AAGTCTCTAAAA----CTGCAATTCAAAGCTTTTAATAGAACTATAAACTGATTTTT-----ACCTGTTTGTGTATTTTTTATTATCCTCCTTTTGATTAACCCAGAATTTTCCTGGAAGTGATTTATTAGATAAATAATACCTAT-ATATTATTAAGGAAACTT-----AAACAATATTAAA s monDom4.chr2 508160079 327 - 541556283 TCATACAAACATTTTTATACTACTTTGAGGTTAAATGTAAAATAACTCAGTAAAA----AAGGCTTTAAAAA-TATAGAAAGTACATACGTGAGTTTTCCTGATTTTGGTGGACTGTAAAAGAGAAAAAGAAGA-AAAATTCTGGTTTCTGTAGTTAACTTTTTCAAATTCTCCGCAAT------CTCCTAATGGATTATCCAACTAATTTTTTTTTTACCTTTTCATGTACTTTTTATTACTTTCCTTATGATCAAGCCAGAACTTGTCTGGAATTGATTTGTTAGACATGTAATATCTGTGAAGTTACTAAGGAAACTTTTTGAAAACATAAGTAAA a score=7298 s mm8.chr4 94464770 357 + 155029701 GTAAGCCATGCTTTTTGCACAGATAAGTGACATGAAACTACACAATCA--------AAATCTGTGGCCAAACAATCTTTATCTAATAATC----ACAGTGGCCTCTTCTGTAATGTTTGCACCAATTCCTTTTTTAGCCCTAAAACCTTTACTC------------TTCTCATAATTGATGAAGGATACTCTTCTTCCAACAGCATTTTCTCAATGATAGCTCTGTTCTCATCACTGATGGTGCTATCCAGAGTCCAAGGCTATTTAAAAACAAAAGAATGGCATGTGTAACTCTCTGTATATATTTTATTACTTAAAA-AGCTATCTTATTTCATTGAGTGAAAG-ATATGATATAAACAATAACAGCTACAACTCACTAGG s monDom4.chr2 508161924 366 - 541556283 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TTTACACATGTTTTTCTTCACCCCATGAATTCTATCACAGCACACTCA-GAGAGAAAGCAAAATGCCTTTCGATTCGGTCCCTACAAAATCATTGTTTCA-CATGTGGCT--GAAAACCTGCTTTTCCAGTCTATGGAGGTGCCACGTTAATTGTTTACATGTGAGGGGGCATGTTTGGAAGAACACATGGGCTTTCCCCCCTCCAAGGCCTTAAAGAGAATTACTTTGGAAGGGAAACTTGGACATGCTGGAATCATTCCTACACATTTTCTGTGGTTTTCATTTAGGACAGGAAGAGA--TTTCCAAGGTTTTCCATGGTTTTATTTGATTTAATTTCATGCTCACTGAGGCTCGTTTCCATCCCAGCC-CCGACACCTTGAACTTGTCATGACTTTACTCCACTCTGTGGCCCTGCTGGGCTTCTGAAGAGCTTTGGGCTTTTAAGC-CTTTGCCTTGGAAAC-AGACTGGGCAGCCTTAATGGCAATCACAGGACATTTTTCTAACTGATCTCAGCTAAGCCACTGAAAATACCAGAGCACCAGGAGGATTCTTCATCCTTTGCCTGGGTCTGGCTTGAAAGGGAATGGAGACCTTGGAGGGCTTTAGCATCTGTATTGTTGGGAATCCAGTTTATT a score=1803 s mm8.chr4 94490515 76 + 155029701 TAAGGGTGCCCAGGGGCTCCTTGCGGCACCTGCCCCA-----GTGTGCCCAACAGTTGGCTGGTTCTGAACCAACTGAACC s monDom4.chr2 508196459 81 - 541556283 TAAGGGTTCCCAGGGTTTCTTTCCAGCATCAGTCTCATGACGGTGTGCTTGCCACCTTGCACATGAAAACCCATGGGAACC a score=12043 s mm8.chr4 94510318 406 + 155029701 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TTTATATACAAAATAGAATGACAAAGT--ATCCGTGTAACAGAGAAGTCATGA---AGTCAATGGAGGTAGACATTTATGTGGTAAGAG---------TACTTTGGGGCCAGGTCACATGTGGACAAAGGCAGC--------TCTTTGGAGTCAACTTGGGAATCAACTTTA-gtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttctttctttctttctttctttctttctttctttctt----------------tctttcttt-------------------ctCAGATCTTGCCTGAGTTTATTTGTAA--------------GAACAGCATAGGACA--------------------CTGGTCATCTG-----CAAATAGTGTGTGGGGAGGTGTGTCA----CAGCAGTC-------CGTCTGTCTTCACACTGGCAGAA------------GCCTTTTCTA--TGGGGCTTTCA s monDom4.chr1 8959457 481 - 748055161 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s monDom4.chr2 509278300 1068 - 541556283 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a score=8455 s mm8.chr4 95336047 190 + 155029701 CTTCACTGCCACCC-TAATGTTTTCTTCTGCTTTCTCCTTTAAGTTTGGGACTCGCTTCATCATTGAAACAATGGAGGCAGCAGGGCACTCTCTCAGTACCCTCTTCTTATGTGGAGGCCTAAGCAAGAATCCGCTTTTTGTGCAAATGCATGCTGACATTACTGGTAAGCCTCAGGGC-AGGGATATAGGG s monDom4.chr2 509280173 192 - 541556283 CTTCTCCATCACCAGTGATGCCCACTTCTGGTTTGTCCTTTTAGCTTGGGACGCGCCACATTCTGGAGACGATGGCATCAGCCGGCCATTCCATCAGCACCTTGTTTCTGTGTGGGGGGCTCAGTAAGAACCCTCTTTTTGTGCAGATGCATGCAGACATCACTGGTAAGTCTGGGAGAGAGGGAAAAAAGG a score=9433 s mm8.chr4 95337694 626 + 155029701 ATCAGCTGGATGGCTCAGCTAAGACACAGGCCTGAAGTCTGCTCTGTGATTCCCCACTTCTTAGCTTTTAGTTACCCAAAGCCACATCCCACCTGGATGGAAGCAGGTTAAAAGCCAGCTTCAGTACAGGGAATGGGGAAAAGAGGACCCTTGAGCAGGGTAGCCAGAGGTGACCTGGGAACAGCCTGGGCAGGCACGACAG-------------CTCAGGGTTTTGTGAAAATGGGCCATCCTCTAGTCATGTGTCCC----TGAGCGTCAAAAAAGCCAGGGAATGCC--ACTTTGCTGCAAGCTCTGCATTGGGAACTGTTGTTCTCTGGGCTGCTGAAT--GGAAGGCTGTTAGTGGCTGTTTGGGTTCAGGCAGAAATTGGA-CCCTTTGTCTCTAACTACTGGCTAGTTACAGTTGTGGACAAAGAGACCTTT--TCTTGGCCTGAAATTCCTCTACTCATG-----------ACTGACAAAGGA-TGGCACAGTGCATCTGCCTTCAAATGCTTTGGCTTCTGCTAAACTCATTAATGCATCCGATAAAATAGCTGACATTCCAGGCAAAGCCTCCCTCTTCCTGCCTTTACCCAGGGCTC-----------AGAGAAAGGAATGCACTTGAGTCTGTTCTGTAAAGAAGCCTGGGGAAAGGTGAG s monDom4.chr2 509282989 620 - 541556283 ATGATCTGGCTGTTTCTGATGATGTTGAAACCTGGAATTTGGCCTTT--------ACTGAGTAGACTTCCATTCCTCAAATAGCCTTCCTACCTTGGCGCCAGCAA-------------TTCTGTTAAAGAAAGCAGAAACAAAGAGACCATGA-----------CACGGTGACCTGTTA-CAGCCTGGATCAGGACCTCGGTGCTAGTGGTGCCCTCTGTTTCTCCCATAGGATTGCTATCAAGTGGCCACTTTTTCTGTATTGGGATCCAGAGAAACATAAGGCTGGCTTCCCTTGCAG-AGACTCAGCTTTGGAAGCTATT---CTCTGGG-GGCTGAAATAAGAGGTCTATTAATAGGTATTTGGATTAAAATGTAAACTGGAATCCTTGGGCTGGAGCTAATGACCAGATACAGTCCAGTACAAAGGGCTCTTTCTTCTGGGCTTGGAATTTCCCTCCCTTTGTAAGGACATTGACTGACAGAGGAATGGCAGAGTTCATCTGCCTTCAAATGCTCCGGGTTCTGCTTAACTCATTAGTCTATCAGATAAAATAGCTGGAATTCCAG---AAGTCTCTCCCATCCATCCCTTCCCCCATCCACCCCAATTCTTGGGAGAAAAGATCAAATTTG------------AAAGCAGCACGATGGAAGGCCAG a score=8277 s mm8.chr4 95341584 282 + 155029701 CTTTGTCCTGTGCAGGCATGCCTGTGGTCCTGTCACAAGAGGTGGAGTCTGTCCTCGTGGGAGCTGCTATTCTGGGTGCCTGTGCCTCAGGGGACTTCACTTCTGTGCAGGTATGTTAGGATCCATGGGTGGCTGTGGTCCCTGCCCTGTCTGAGG-CTGTCTGTCCTCTTGACAGCAGCTCACAGCTTGCAAAACACATAC-AGGATATAATTAGGGAATGATAGGTTGCAGCC---AGAGAATCACAGGCACTCGCCGC-----CTCTGACGTAGTCACTGTGGCCTCCC s monDom4.chr2 509287778 257 - 541556283 CTCCGTCCTGTGCAGGCTTGCCCATTGTCCTCTCCCAAGAGGTGGAGTCCGTCTTGGTCGGGGCTGCGACGCTGGGAGCCTGCGCCTCAGGGGACTTCCCTTCCGTCCAGGTACGTG----------------------------CCTGTCCGGGGCCTGCCTCCGCTCCGG---GCTGTCAACGGCC----AAACACACACAAGGGCATCATTAAGCAAGGCGAGGCTGCAACCCAAGGAGGAGCGCAGCCTCCTGCCTCAGGCAACTCGACGGGGGCCCTGGATCCTCCC a score=17024 s mm8.chr4 95350694 464 + 155029701 AGTGGCTGTTGTCCGTTTCCATGGCTTGCTTACCCAGGAGGATGGGAAGGAGCTAGGGAGAAAGAACTCACGAGAGG----GATATACATCCCTGGAAATGTTATTAATTGGTTGAGTAAGACAAAATGGGGAAATAAAATATCTGCTCTTTACAAAGCAACAGCATCTTCCTCCCTTAGCTCATTAAAAATTAAAAGCACTCTTGGCTTAAGTAGGGCAAATTAGTAATTAAGTGCTACATAATCAACCTGGATAAAC--ATAATGTTGAAGGGGAAGCCAAATTAATCACCCCACTGG---TTTGTTTTTGGCCCATTAATGCCCCTTTTCCCCATGTCCTTCCTGTGGTGCCAGGATGC-TTGCTCTGCTCCTCTATAGCTGGAGGAAGAGTGGGTTGTGACA--GCTGGGCTGACAGATGATGGAGAAGCAGACCTGAAGAAGGTGCGCATGCATTAGGGCTTTATTCAAAG s monDom4.chr2 509298086 470 - 541556283 AGTGAGTCTTATCTATTTCCATCTCTTTTGAACCCAGGAGGTTCAGAAGAAGGGTTGGGGAAGAAATGCCCCAAAGGAAAGGATGCCTTTCCTTGAAAATGTTATTTATTGGAGGAGCCAAATAAGAGGAGGAAATAAAATAGCTGCTCCCTGTCAAAGAAGAGCATCTTCTTTCCTCATCTCATTAAAAATTGAAAGCACTCTT--TTTAAGTAGAGTAAATTACTAATTAAAAGCCTTATAATCAACTTGCATAGACATATAATACTGAA--GAAAGCCAAATTAATCACTCTGTTAGCTTTTTTTTTTTACCCTATTAATGCACCTTTTACCAAAGCCCTTCCTGTGGTGCCAGGATGCATTGGTTCCTTCCTCTAC--TTCAAAGAGCAGAAGAGTGGAACATTGCTGGGCTGATGGATCACAATGGGCTAAAATGGGAGAAGTTGACTGTGTAGCCCAATTAGGTTCAAAG a score=2302 s mm8.chr4 95353223 364 + 155029701 GTAGGGCCTAAGAACTAAATCTCTTTACCAGTCTGGCACGAGAGGAGTGCTAACGTGAAGCACCGCATCAATCAAGAAGGGGAGCAGATGCTGAAGTGTATCAGATGTCAGTAAACAAGCCCACAGGAAGGTCCCTGAACTTGGCATCCTTCAAGCGAAAACACACTACAGCCTTCA-TGTCAGAGCTCTGAA----------CTTTTATAAACTGCAGTAAGTGATATGTGTGGGTTTTTTCCCCCCTGGCTGGACAGCTGCTA-CTGTTCCACTTTCATTTGGAGATGATATGTT--------ATATGTTCTAAGTGTTTTTAATCTGTAATTTTAAAGAATACATTTAGTGCT----CAGAGTATTAG--TGGTTGCCAGCCTGGAA s monDom4.chr2 509301694 370 - 541556283 GGATGGCCCAAGGGTTA------TTGAGTAGCCAGACAGGAGGAAAGCATCAAAGGGAAACACCCCA-CAAGCATGAAGGGCAACAGATGTCACCTTGTATCAGGTATCAGGAAAGAGCCCAGGAAGGCGGCATATGGCCATGG---CCTTGATGCGGACA-----TCCCGCTGTCAGTGACAGGATTCCCAGTGGGTCCGTCCACCTGCCATCTCCCCGCAAGGACACTCACTGGTGCATTTTTCCATGGAGGCAAATGTGCAACCTGTAATACAATCCTTAAGGGGAAGTCCGCTCTGCTAGCATCTCTTCCAATTCTACTTTCTTTTTTCCTTTAAGG--CAAATTTAATGCTCACACAGTGTACTAGGCTGGTAGC---CCTGGAA a score=3071 s mm8.chr4 95390591 100 + 155029701 CATCTCGGGTGTAAGTGCCAGGTCTTGTAGCACCTCCAAGGACAGATTCACCTCTTCCTGAATAATTGGGCTT--GATTCACATGATGAGCTGACATAAGCT s monDom4.chr2 509356260 102 - 541556283 CATCTCAGGTGTGAGTGTCAACATTTGTGGCGCTCACCAAGGCAAAGCTATTTCTTACTGAATAATGGAGTATAAAACCCTCATGACCTGCTAATGGGAGTT a score=8108 s mm8.chr4 95392895 481 + 155029701 AGACACTCCCAGCTGAACACACAAAGAATCTGGTCCCCAAGGAACAGTATAAGGATTGT----------CTGAAGGACTCGACATTGGTGAGATTACAGAAATCATAATATATGAATAAATGAACATATGGAAGAAATCAGGAAAGCCCTCCCATTCTTCCCATATGTAAACCTGGCCTTCAAGTAAAGTCCTTAAGTAAATGCAGATGTAGCCAAACCAGGGACCAGATGGCAAACAAGCACTGGACCAAGAGGTAAAGAAAGCTTTCCATGTTTATTCAAAGATGGGGGAAGTCATAATCCAGAATGCTGTGGT---------------GTTCTCAGAAG-GGTGACCTCAGGTCACATACA-CCCAACCAAGG------CACAGTACAACCAAAACAACATTGA--------CAGAGTTTATAACAATTGTGATTTGCTGTAGAAAAGCCACTACCATCTTACGTGACCAGAATCTGATGTCAAAAGTTGTACGTTTGGGACATGAAAGCAATGGTTGT s monDom4.chr2 509360673 496 - 541556283 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CATCAAAGAATATATAGAcatccaattttagaaccttttagacctaaaaaggccaaaagaaatcatccagagaaaactaattttacaatgagggtcagagagcccatatagttttcccagagtcacatagTGGCCCAGAATTTTTGGACTCAGTGCAGGATTTCTTTCCCCACTGAGCACTATTGTCTCTGTTAAAATAGTCAAGAAGGAA--CACATTGAATTTTCCTACTTCTTTCTGAACTCCCAGG-GTGCTGATGTTCATAAACACAGCTGGATGGGTTGGTGGAGTCTTTTTTTCT a score=20216 s mm8.chr4 95407777 688 + 155029701 GCTAGTCCATAGCACATGACAACCGAGTGTTT--CCTCTGCCCACAGGAGGCCTGGCCACTTCGAGTACTGTCTCCGAAGAAGC--------AGGAGCAGAGGGCTGACT--------GGTATCTCAGCCTTGACACACCAGGGAAGGGTCAAG-TCTATGAATGAGGTCTTTCATGGCTA--GCTACAGGGACCCCAT-TTTTTCCTACAGAAGCCATGCGCTTGC-TTTCAGAAGTGACAATCAAATGTGAACTTTCATGGTTTATTTATAGCTCTGCCTTAG-AGAGATAAAGAAAAGAAGTGATTAAAATGCTATTTTACAAAATATTTTGTTTTAAA----------------AAAGCGTCCATTGTGTGGGCAAAAGGGGAAAAGAAAAGCCACTC----TATTCATTGTGCTGTCTAGACTCTCAAACAAAGAGGATAGCGTGCTGCAAATTGAGATTGTCCGGCCCCCTCCATGCTGACAGAAAGTATGAATTTAGAGCTCAACTTCAAATAAGTCCCTT-TGAACAGAAATATATGGGGAGA---CTATATTTAGCA-TGTGTCAGCATTTCCATAATGAATTCATATTGTTGTACTGTAGTGATTCCCAGATTTACCACAGGCAGAAGAGTCATGCAGTTTCACTTTTGTGGTAATTATCTGGAGAAATTGG--GACTCTCAGCAGTGCTGTTTATGATGACAGCATTGCTGCTGTGCACACTCtctgt s monDom4.chr2 509364442 715 - 541556283 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CCCACTTTGTTCTGTGTTTATTGTTTAACAGGAGGCAATGGCAAGAATGGGAAAAGTTGGGAAAGTTGTGTTCCCCAGACCTGAAGAGAAGAGGTAA a score=5979 s mm8.chr4 95481610 181 + 155029701 ttataaaaatGTGTTAAAAGTTTAACTTTTATAC-TTTTGTTTTAGTGATGTAGCTTGGTTCAGCGAATCTTGGTTAAGCCGAATTAAAGATGATGTTGGAGACAACTGGAGAATAAAGGTATGCA----------------GAAGTGGATGG--GGATTGGGTGGACCACATGATGGAAGAATAGTGGCACTGAGCTCA s monDom4.chr2 509440941 192 - 541556283 TCATTCAAATGATTTAATGGT--GGTTTCTGTGTGTTTTATTTCAGAGATGTTGCTTGGTTTGATGATTCTTGGTTAAGCCGAATCAAAGAAGATGTTGGTGACAATTGGAGAATAAAGGTATCCATGCTGACTAGTTTCCTGAAGTTCaaagacagcttgggtgca----atg--gaaagagtactagctctgaagcca a score=3595 s mm8.chr4 95484134 309 + 155029701 TGTATTTATTTCCTCTTTTTGTTCTACTTTAGGCTAGTAACCTGAAGAAGGTCCTCCATGGAATTACAAGTTACTATCATGAGGTACCGGAAACACCTGATCTTAAACAAAAGTGCCAAGAGTTTGAC------TACTTGTTTTTTTAAGCATCATGTTGGAATGtaatttataattataataattatGTTGCCACTTATAGAGCA-CATAACACTTGTGAAAATGAAAAGGTCTAAGGATTAAATGCATTGGCTTACCAAAGGAAGAAAGAAGATAGTT---TTCATTTTGAAACTTTG--AATTGATTACCTTTATAAA s monDom4.chr2 509444863 285 - 541556283 TATCTTTGACATCTCTCTCTGC---ATTTCAGGCTAGTAATCTGAAGAAAGTCCTTCAAGGAATTACAAGGTATTATCATGAGGTATGAACAACAGGTGACTT------------------GTTTTACCCTTAATTCTGATTTCCTTTCAAATCTAGTCGTCA------TTGAAGTAGTAAGATGCACATTGCTGTGTTTTTAACAGCCTGCTGTTTATAAAAGTGC----TTTTAAAAGAAAAATAAA-----TCACCAGGTGGATACTGCAGTTACTTGGCTTCATTTTTTTTCTTTGCCAATGGACTGCATTTTTAGA a score=8940 s mm8.chr4 95484954 265 + 155029701 TCATGATTTCTTAATTTACTTGAGTTATTTCATGAAGGTATTTCGAATTAACTTTTCTTTAAATAACAGTATAAGTTCTTTGTAGCCTACATAGATGAGTAATCTAGTTTATTTATTTTTAATCTT-CAGTTTTTGGGGCAGCAGATTTCTGAAGAACTTATCCCTGATTTAAATCAAATCACTGAGTGTGCAGATCCTGTGGAGCTTGGGAGGTTGCTTCAGCTAATTCTAGGATGTGCAGTCAACTGTGAAAAGAAGCAAGGTA s monDom4.chr2 509445948 253 - 541556283 TTATAATTTCTTAATATT---------TTCCATCCAAGAATC---AAATATATACTTTTGAAATAATATTGAAAATGTTGCGCCTCATAT-CACATTAGAAGCCTGACTCCATGCTCTTTGATTTTGCAGTTTTTAGGTCAACAGATATCTGAAGAACTAATACCTGATTTAAGTCAAATAACAGAACACTCGGACCCTACAGAGCTCGGCAGGTTACTGCAGCTTATTTTAGGCTGTGCGGTCAACTGTGAGAAGAAACAAGGTA a score=4568 s mm8.chr4 95487778 76 + 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TTTATTATTGTAGGGCTACGTCAGACAAAGCAAATAAACTGGAGTCAACAGTGGAGGTATATCGTCAGAAGCTACAAGATTTAAATGACCTCCGCAAACAGGTGAAATCTTTACAGGAGACAAATATGATGTATATGCATAACACTGTGAGCTTGGAAGAAGAGCTGAAGAAGGCCAACGCAGCTCGGGCACAGTTAGAGACCTATAAGCGCCAGGTGAGA s monDom4.chr2 509452420 221 - 541556283 TCTCTTACCGCAGGACGACCTCAGATAAAGCAAGTAAACTCGAGTCCACTGTCGAGATTTATCGCCAAAAGCTGCAAGACCTGAATGACCTGAGGCGGCAGGTGAAGTCGCTGCAGGACACGAACATGATGTACATGCACAACACGGTCAGCCTGGAGGAGGAGCTCAAGAAGGCGAATGCGGCCCGCACCCAGTTAGAAATGTATAAAAGGCAGGTGAGA a score=6606 s mm8.chr4 95496300 131 + 155029701 TTTTCTGCCCAAAGGTTCAGGACCTTCACACAAAGCTTTCCTCTGAATCCAAAAGGGCAGATACACTAGCATTTGAAATGAAGAGGCTTGAAGAAAAACATGAAACTTTACTCAAGGAAAAAGAGGTGATC s monDom4.chr2 509453184 131 - 541556283 TTTTTGAACCGCAGGTTCAGGATCTTCATCTTAAGCTTTCTGATGAATCCAAAAGAGCCGACACGTTAGCCTTTGAGATGAAACGCCTGGAGGAGAAGCACGAAGCGCTACTTAAGGAGAAAGATGTGAGC a score=7326 s mm8.chr4 95501269 282 + 155029701 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s monDom4.chr2 509456081 289 - 541556283 GGGTCTCTCCACTTTTGTCAGATCATCTAATAACAATT-GGATAGATGTTGATTAGTTTTAAAAAACTTCTTTAAATGTTAAGAATCAAAAGGAAACTGTTAAAATTAAAGCTAAGCTTCTGCTTCCCAAAAAC-----------AGAGAAGTGTTTATTCGCCTTCAGCATGAAAATAAGATGCTTCGATTACAGCAGGAAGGGTGTGAGAATGAGCGGATCGCAGAGCTCCAGGAGCAGCTGGAACAGAAACATCGGAAAACCAGCGAGATGGAGACGGAGCAAAGGTTGCTGGGTCCT a score=6998 s mm8.chr4 95506823 238 + 155029701 AGGTTGAGCAAAGAGCGCATCGGAGAACTACAGCAGCAAATTGAGGACCTCCAGAAGTCATTACAAGAACAGGGCTCTAAGTCTGAAGGTGAAAGTGTAAGTAATAGAGTCCATAACTTGTAAGTTCTCTAATAATTTATGCTAACACTTGTCTGCATTTGAAATGCTAC-------CCTTCTCAT------------------TGAGGGTGCCTTCAAATACCGTATATATCTGCATAGCAGATGCATTGGTTTGCCAACTT s monDom4.chr2 509457014 252 - 541556283 AGGCTCAGCAAAGAGTACATCCGGGGTTTGCAGCAGCAGATCGAAGACCTTCAGAAGACGCTCCAAGAACAAGGCACCAAGGCCGAAGGGGAGAGTGTGAGTGAGACGG------AGAGGTCGGGCCTCTGG-----CATGCTGGGAGCTGTCTGGGGGTGGCGGGCGGCTCTTGCACCTTCACACCCAAATCACTGTTAGGAACGAGGCGACTACCAAATACCGTATATATCTGCATACCAGATGCGGCACTTTGGCAGCCT a score=7899 s mm8.chr4 95507533 1061 + 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s monDom4.chr2 509457895 1020 - 541556283 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s monDom4.chr2 509469708 1791 - 541556283 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monDom4.chr2 509639034 276 - 541556283 tttagttagatacagagacttt-tgct-tgagactaaattatatatatatatatatatgtatatatatgtatatacatatatatatatatatacatatTTTTTTTCTGGAAGTGTGAGTGTTCTTATCCCTAGGTGACTGTAATTGata----attatgtttattttattatttattatttttattatgatttattaaCCATAGCAAGGTTTTTTAAT-AGATTGTGAAAATCAAAGGAAATAATAAAAATGAATATTTTCAGAAAAACATTAGTGATTTAGA a score=341 s mm8.chr4 95591063 122 + 155029701 TAAATCACAGAAACTGCTTCAGTGAGCTTGATTTGTCTGCCTGAGACC---AGTGAATCATCCCTTTCTACCTGTCTTCCAAGAGGAGAACTCAGATGCAGAGCAA--GATGAGGTAGCTACATTCT s monDom4.chr2 509639441 124 - 541556283 TAGCATACAGAAA--GCTCCTG-GAACTCATGTAAACTCTGTGAAACCTCCACCAAAACCACTTTTATTACATGAGTTATAAGAGCAGAAGACAAGTTACCAACAACCAACCAAATATCAATATCCT a score=-451 s mm8.chr4 95591234 97 + 155029701 AGTTCTAACTCTGATGCTCTCTTTGTACCATTACCAAATGAACCATTTCAACAGGCCAGAAGCAATTGTATGTCTACAGGAAGAAGATAGACAAAAG s monDom4.chr2 509639590 76 - 541556283 AGTAAAAGCTTTGGCTCTCTCACTGT----------------tcatatca-----ttaaaaggttttagatatagagctggaagagaccttagagag a score=5713 s mm8.chr4 95591331 630 + 155029701 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s monDom4.chr2 509911905 3076 - 541556283 tttcatgtgcttattaatagttttgatttctttggctgagaactgcctgttcatgtcccttgcccatttatcaattggagaatggattgattt----ttttgtacaattgatttagttctttgtaagtttgagtaattaaatctttgtcagaggtttctatgaagattgtttcccaatttgttgcttcccttctgattttagttacattggttttgtttgtacaaaacctttttaatttgatgtattccagattatttat-----tttgcattttgtaaccctttct-------aagtcttgtttggttgtga-----------agtctttcccttcccaaaggtctgacatgtgtactattctgtgttcg-------cctaattttcttatagt--------------------ttccttctttatgttcaagtcattcacccattttgaatttatcttggtgtag---ggtgtga-ggtgtt---gatctaaacctaatctttcccacacgatcctccaatttttccagcagtttttatgaaatagtggatttatgtcccaaaagctgggatctttgg--------gtttgtcatata-ctgtcttgctgaggtc--------acttatcccgagtct-----attccactgatcctcctttctgtctcttagccagtaccaaattgttttgatgactgctgctttataatatagtctgagatctgggactgcaaggcccccgtcctttgtatttttttttttattatttccctggatatccttgatcctttctt---cttccaa-atgaactttgttatggttttttctaaa-----tcagtaaaaaaatttt-----ttggaagttcattgggtatggcactaaatagatagatgagttggggtaggatgg----tcatttttattatattagctcatcctacccatgagcagttaatgtttttccaattgttcaagtctagttttagttgt----gtggagagtgttttgtagttg------------tgttcatatagttcctgtgtttgtctcaggagatagattcccaagtattttattttttctaaggagattttgaatgagatttctctttctagttcttgctgctgag--ctgtgttggaattttatagaaaagctgatgacttatgtgggtttattttgtatcctgcaactttgcttaagttgttgattatttcgattagctttttggttgaatctctaggattctttaagtagaccatcatgtcatctgcaaagagcgataatttggtctcctccttgcctattttaatgctttc------agtttctttttc--ttctctaattgctactgctagtgtttcttgtacaatatcaaataata------gaggtgataatgtgcatactt---gttttactcc--tgatcttaatgggaatggat-ctagtttatccccattgcagatatt---agttgatggttttacatatatatactgtttatattatttttaggaacggcccttctattcctatgctttccagtgtttttaataggaatgggtgttgtattttataaaaggctttttctgcatctattgaaataatcatgtgatttttgttggtttgtt-gttgatgtggtcaattatgtggatggttttc---ctaatattgaaccagccctgcctccctggtataaatcttacttgatcatggtgaatggtccttctgatcacttgctggagtctttttgctagtat-------cctatttaagatttttg--catctatatt------cattagggagattggtctataattttctttctctgtttttggcctgcctggctttggaattagtaccatgtttgtgtcataaaaggagtttggta--gaactccctctttgcttattatgtcaaatagtttgtatagtattggagttagctgttctttgaatgtttgatagaattcactggtgaatccatcaggccctgggtattttttcttaggaagttctttgatggcctgtgggatttctttttctgatatgggattatttaagaaatctatttcttttcctgttagtctaggcaatttatatttttgtaaatattcatccatatca-cctaggttggtatatttattgccatatagttgtgcaaagtagtttttaatgattgtcttaatttcctcttcattggcg---------gtgagatcccccttttcatccttgatgctgttaatttgcctttcttctttccttttttaaattagattgaccagtattttgtctattt-------tgtctgttttttcaaagtaccagcttctagtcttgtttattagctcaatagttctatcactttcgatttttttaatt-----tctcccttaatttttaggatctctattttggttttattctgtgggtttttaatttgtt-----tgttctcaagttttttgatttgca---tttcaaattccttgatctctgtcctccctaatttgttaatatatgcactcagggatatgaattttcctctaagtactaccttggctgcatcccataaggtttgaaaggatgtctcgccattgt-cattttcctcaacaaaattattaattgtttctattatttcttctctaggtaaccgattttggagtatcatattatttaatttccaattaatttttg-atttggctctccatgtacccttacc--gattaatattttta---ttgccttgtgatctgaaaaggctgcatttattttttctgcttttctgcatttgagtgccatttttctgtgacctagtgtataatctatttttgtgaatgtgccatgtggtgctgaaaagaaggtgtattcctttttgtccctatttatttttctccatttgtctattaactctaatttttctaaaatttcattcacctcttttacctcttccttgtttattttttggtttgatttatctaaatttgatagtggttggttcaagtctcccacta----------atatggttctgatttttaatccattctcttgtctgcttctgttttttgcgggcagaggggttcattgcattcacattcacatgccaactatgtattcccatacaacttattttttttaatctggctctttccttttactctgtctctcctcacaattttt-----tttttattttgttttcaatcactgcc---------tttcccaggtcactctctcttttatcctctctca-cacataacttttctta a score=3928 s mm8.chr4 95661932 483 + 155029701 ggtagcctgcttccctatgtactgcagtctcaggttctgggcgattATGCATTTTCTTTATATGAGGAATTACAATTCTCTTTGAGCTCATAAATTATTTTGTTCCACCCC-------CCATCAAATTG------AGGGGCCAGTAATACAGAAATTTTATTTAACTTTCTTAGCTCAATTTCTTCAA-------TATTTCTTGAATCACCCTCATTCTGTGCCATCTTTCTTCTCTCATGTGAACAAGGCCCAGAAGCTTCAAGGC-----ATATACCATATCTTCCTGTTCTCCTTTC----TCTTTCCTTC---TTCATCAT---CTCTGTCT----AGGAACAGCACAGATGTGGTGGCTGACTGGGGAAAGAGGGAGGTCCAACCTGATCTTCAGGCCTAGCTTCTCATTGACTGTAGACTTGAAGGTACATTTTTGCATAAGAGCAGTGAAGAAAATGAACAGCTCAATCATGGCCAGTTGTTCTCCAGGGCAAGCTCTATTTCCTGCAGGACAAA s monDom4.chr2 509915060 508 - 541556283 gatagcaaggtt---taaacactgcctttta-----ccaacctcatcctcatcttcactaaaatagatttttcacacctctttagg----taagttaatttatcacattccatttcttccttcacacttctcagtataaacctctataacacaactcaattttttgttttggatatcatattatcctactcattttactactacaacctccattgttgtatac--tccttctgatttccaaaatagtgattttaaaaattttagagttataagtatTCCAGGTCCTTCCCCACCCCCTCGACAGGCTTTCCTACAGGTTAATCTTGGGCTCTGTCTCTCGAGAAAGGGCACAGATTTGGTAGGGGACAGGAGAGATGGTCAGGCCAAATTGGAAGTCCAGACTCAGCTGGGTGTCTGGGGGAGCCTGGAATGTGAATCTCTGAAGCAGGCAAGTGAAGAAAATGAAGAGCTCAGGCTGAGCCAGCTGTTCTCCCAAGCAGACCCTCTTCCCTGAAAGGCAAA a score=4085 s mm8.chr4 95681988 283 + 155029701 TCACATCCATTCTATAACATCTTTTTCTCTCC-------AGTGAGGAAGGTCCAGAAGCTTGAGTGTGTACA------------CTATATTCTCTGGTTCTCTTTT------TTCTTCTCCAACATAA-------------CTGTCTAGGGACAGCATAGATATGATGACTTACTGGGGAAAGGG-----CTCATTGTGAACTTCAAGCTCAGGTTCTCATTTATTGGGGGCTTGAAGGTAGATTTTTGCATAAGAGAAGTGAAGAAAATGAACAGCTGAGACATGGCCAGTTGTTT-TCCAAGGCAAGCTCCCTTTCCTGCAGGAC s monDom4.chr2 509972970 327 - 541556283 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s monDom4.chr8 190300874 1415 + 308469712 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CATATCTTCTTTGTCTCCCTATTAGTGGACGACTCCATCTT-GGTGTCTTTCTCTGGGAATGGGAAGCCTTCGCCTCCCCTCCATAAATGCATGATGAAAAAGACCATATGCTGTTATATATCAACATAAATTTCCCAAACAAATGTTCATATCTTTGCAGACACGAAGCTTCTGTTCCCCCATTGCCGGCAGTTCGATAATATTTTTGTGCAGGCATACGGTAGGAAGACCTAGTTACCTTCCATCTCTTCCACTTTGGGCCCACTGCCAACTTTTTTTTCCCTGCACTCCCAAACCAACAGGTGCTTGAGCACATGCCATTTGGACAAGGAGGCGCACACCTTCAAGGCTGCTGACTTGGAGACTCCAAAGGAACTTCTCCTCAACACAGACATAACAGCTTCTCATAAATATTCCAGCCCTTTACTGCTACACCAGGCTAGGCCAGGGATGAATGAACCTTAGAG------ATGGCAAGCTCCGGGGAAGGCAACAAATACTTTTTT---------------------------AGCACAATGAATACAGAGGCTCCTTCCAAGCTTCACCACAGCTCTAGCATTTTCCTCTCTGGGATCCTGACCTT-GTAGTCCCCAATTTAGt a score=5690 s mm8.chr4 96619342 948 + 155029701 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s monDom4.chr2 510553096 1018 - 541556283 ACTAAATGATGATTGTGCTTATGAGCTCAGGAGC---------TTATGacttacctag-gtctttgttttctcatcttcaaaacaagaaggatggattacatggactctaatt--ttccttcctggtctacatctatgaccttatgatttc---tctgtgcctcagtttcctaacttgaagaatgagaaggatggactgc--------atgacctctgaggtcccttccagacacaaat------ctatgaATGTTC------ACTCTGTCAGAGAGAAG---------GAAAAAAATATGCACAGGAATG----TTAAATGAATGGAACAGAGCATAAGGACAAAATTAGGACTGCTGGTTGAATCACATGAATCATAAGTGGAGA-AAAGAAGGAATTTTAAAAAAATCTCCCACGACAAAGAAGACAGTCTGCTCAAGCAACAGCAGGAACTTGAGGAAATCTTGAAAGACGACCAGCTGCT-----TCTTAGACTATTGTCAA---AAAGAAAGAAGAAAAAAAAAGATGGGGAGAGAGTGAACTGACAGGAATCTGTCTGACTCTCAGGCTGGGGGGTGGGGCAGAGAAGTAGAAAGAAGTGACATTTGGAGGGGGGAAAAGAAAGTAAAGTAAACTATATTGGGAAAAAGCCCTGAGCAGATGTAGTTCTGAACAAAGTGCCTATAGATGGGCCCATGGTCTGC-TGTGCAGACTGACTCCCGGGATCAATCCAAGCCAAACTTGGCAGAGGGGGCCCTGGGCAGAGCCAAGAGGTTCTGCTGTTCCCAGCTCTGCCACTCACCCAACTTCTGATCTCCAGCAGCTGTCTCCATGGGGAGGATACTAACTGGTCCCCTTGCTGCTATGTGTTGTTTCTTTCTTTTTCCTTTCCTTCCCAAAGATGGTGTGAGGATTAACAGGAACATCTCTCTGACAAGAGCAAGGTGCCA-GGTAGATGCCAGGTAGCACAGGGCTGCATCCTGTCTCTGGCAAGGTACCACTGCCAAGTGGAGTGT-----AACCTTCTCTCCAGGAGGTGTTGAGTGCTTCAGTGTGAAGT--GTGTCTGTTCAG 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s monDom4.chr1 169881377 1264 + 748055161 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s monDom4.chr2 511412050 1753 - 541556283 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AAGCCTTGGAGGGCCCATCGCTTG-GGTATTAGCGATCTCCAGTCTTCAGAGTTTTCCATCTCCTTTCCGGCTTATTGTTATTATAATGATATCCCGAAGGGATTTCTTATATGCCATGAAACAAGAGCCCTTTAAATTCGTGTGATGGGCTGATCTTGCTATTTCAT-CTCATCTTAAATATAAATGTTTCTGGTACTCTGGATGGAAAGAGAATGGGAGAGCATTATTATGGCAGTGGGTGAGTCTGATGTCTTTTCTCTGCCAGGGACAAGCCAAGACTGGAAATATTTATTGGTTCAGTCCTTCAGCAACATGGTATTAATTGTCTTGGAGTGTTTTGATAGGTAGTTAGCACAAGGGCATTAATGAAAACAACCCCACTTCATTTTAAAATTAACTACTTGGCCATTGAGCAACGGGAGCTGATAAATTATGGCAATAAATTTGTGATGGGGATTTATGTCGTCGTAACTCAGAGCGGGGCCATGGGCATGCTCAGATGGGGTGAGAAGAAAGGGAATGCCAGA a score=1739 s mm8.chr4 97634785 63 + 155029701 AACAAGATTCAGAATTGAATCTGGGAAAATGAACCTGGAAAAATCCCATTGCCT------AGATTAAAG s monDom4.chr2 454320685 69 + 541556283 AGCATAACTCAAAAAGGAAAAGGAGAAGATGAAATAGGAAAAATGAAATTGCTTTCTCTCAGACTAGAG a score=784 s mm8.chr4 97637431 278 + 155029701 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s monDom4.chr2 511865209 1503 - 541556283 aaagaaaaaagggggagggaaagaaggagggagggGGAAAGAT-----AGATATGTGTATGCTTCTGTGAAATTACTTTGGAGAATGTGTCTTCTGAGGGAAAGA----GGACA-------AACTCCAAAGAGCTCCTTTTCCAGGGTATTTTCCTCCATCCCAGATGCCCCTTCTGTCT---------ATCCCAGGCAACAGAAGTGGTTAACAAGGTT-GAGCAATTCTC------CCCCTGTCTCCTCAGCCGCCTCCACCCCCACCTCTGACAGTTGGGTGAAGG------ATCACACCAGTTTGCCAGAAATCGCAAATGCAGTGCGTTTCCCCAAGACATTGAAAAACAGCAATTATAACCATCGCAAACACTTTGA-AATTAATTATTTCTTTTCCATTTAGGCTAATAGTCGTGCCAGGGCAGCGCACCCAGTCATGTTAATCTCCATCGCAACATTTGCTCATTATTCCTGCGTCCCCACCTGCCTTATCTATCTTTATTTGGACGCATACAGAGCGCTTCCTAAATCGTGTGCACCAGTAAATACATTAGCCGGGCCCAATTTTTATGGAGATTTATGCGCCTGCACCGTCGAATATATTCAGTCCCCATAAAAACTTGGCATTTGGGCTCCATTCTCTGGAAAGGCCCTGTGGGGTCCATTTT---CCTGCGGAGGGCGATCTGTCAGGAACCCAAATCAATGCGCTTGAATTATTCA----------------CGCCGATCGGGTCCGGCATTGTAAAAGTTCGCTTCTTTCCATTTACCTTCGCTCTTCA--------CGTGAGCCTGGGGGAGGGG--CAGGCGGGCGGGCGGGCGCTAACGTCTTCTTCTCGGCTGAGGCAGAAGGGAAGTGACTCTGAAATATGGAGCCTCTCTGCCTTGGGGGAAGATTTATGTCTAGCCCATCACTCTCCTCCCGGGGAGAGCGCAGGTGAATGGCAGCCCCCCATTTACACATGCCGGAGGTAACTATAAAAACAGCAATGGGATCGGCTTATCGATTTCTGT--CCTTTCTGGCGCCCACAAATTAGGAAAGGCGCGG--GAGAAGCCCCGGCCTCTCCACAAATTTTAATTAAAACATAAATAAATCATCTTCCTCGCTGCAGTTGCATATAAACAAAGGGAAAGATGGCACCCTTACAAGTCCTTGTCAACATTGGGTGACTAATGACTCACAGGGAAAATACAATCCGAAACAATTGAATTGGAAACAGATTCCCGAGCTAACGAGTATCACATGCGGACCAT------------------CGACACCGAT-------------------------TCAGGCAGAAGGCCTCGAAACCGCAGATCAGGCTTGG--GGGAGGGGCGGGGAGGGG---------GCTCGGTACCGCCATCCTATTTTTTAGCGTTATTAAATAATGTGCAAGCCCACAATAAGCTATTACAGCCGCCTTGCTTTGGCCACATTGCCCTGCCGGCTCCCCTGTCCTTGCCTTGCCGCAAACAATAACCATATGCCACATTGTTTCCAAATGTTTCATCTTATTTCTTAATCCATACGGAGCAAGGACTGATGGGAATAG---TTTGGGTCAAGGAGGGACTT 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AGCTTGCTATTGCTCAAAGCACACAACTGCATTTGAAGGTCACTGTTTGCTTAAAGGACTTGGGGGGAAC-----------TGACAAAGCCTACTTTT-GCCTTTCCTGATGTTTC-TCCACATTTATTTTATGAACATCAAGGTACTGTAAACTCTAGTGCCAACGGGACTAAAGGTTTC-TTCCTCAGAGGACTTGCTTTCTTTGCCTCTG-TGGTAAAACTCTACATCCTTTATGTCATCTTAAGCTGCTCCATTTGG-----------------CCAGTGTGTTCACGCAAAGGATTGACTGAGCCTGC--AGGAGAGTCCTTTCATGGCTT-ATGCACCCCTTTTCAAGCCTGAGGAGTGGCTAAGCAGAGGGAGCTTGATCCTCACATCT-GAGTTTGTACTGTGTTCAGGATGATGACCAACCTCCAAAGCCCTCAGTGCAGCAGGTCAGAA------------------------TAATAAGAGATCAAAGAGAC------TGTATCAGTGTAAAATCCAGCTAGCACTGGTCAACAGTTTACCTGAGTAAGGCAGCTGCT--CGCCATGAAGTTAGCATGACGACTTAAAGACCTTAAGCCAGGCTTGATTCTGAATTTTGCAAGAATTCCGTGCATTTG---GAATATGAGTTTGGAAAG-AAGTCTTATTGGTCTAATGGGGACAAAAGAGAATAGTC-ATGTGCAGCAAATGCTCGTCA s monDom4.chr2 512170048 731 - 541556283 AGCTTTCTGTTGAATCAGCTACATAGTTGCTTTTAAAAGGCGTTTGTCTGTGACAGAACCTTAGCGTCACCCCGGAGTTAGTGATAAAGGTTGTTTTTTGCCCATCTCGGTGTCCCATCCACATTATTTTCAGGAACATCAAAGTACTGTAAGCTTCGACACCAACTGTGCTGAAGATTTCTTTTCACAGAGGATTTACTTCCTTTTTCCTTGATGGGAACCTTCCACGTCCTTTAAATCATTTTAAGCTGCTTCATTTGGAAAAAAAAAAAGTCTTAATAGTGTAGTCCTGGGGTCGCTGGAATGTGGCTACCAGGGGAAATTCTCTCATAGCTTAAAGCAGGCTTTTCAGTGGGTCAGTCCTGGGTGACTGAAGGGAGCACTCTCCTGGTGTGTGGAGTTTGTTGTGTACCGGGGATGAGGACTGACTTCCAGAAACCTCCCTGCAGCAAGACTAAAGGCACCAGGAGACAAGCAGCCACTTAATAAGAGATCAAAGAGGCTCTGTGTGGGTCAGCTGGGAGTCCAAATAGTACACATCAAAGGGCCCCTCTGGCAGGGGGGCCAACGGAGAGATTGAGGTAGCAGGAGGTCTCAGAGATCTGAAGTCAGGGCTGATGGTGAACTTGGGGGGACATTTGTGACTCTGCTAGAATATGAATTTGGGAGGAAAATCCCATTGTGTCCAAGGGGAGAAAAGAGAGAAGCAGACAGGCAGCCAGGGCTTGCCA a score=656 s mm8.chr4 97969700 289 + 155029701 TGAGGATGGATGGAGGCACTGTATTTAGACAGAAACAATTTGTTTCCAACTCATCAATCAACTGAAAGGGAGGAGGTATTTGTGGCTAGTTTAGTTTATCTTCC--------------CAGAGAAACAT------GCTTAGTAGTGTTCTGCATGCTTTTTTCACATTATTCTCAAAGCTCCTGGTCACTAGGATTTATCCCTCCAACCTGGCCCAAGCTCTTCAGAGATGTGATATTTTCTGTTACCAAACATAAAACATGTATGTTTGACTTTGAGGTGTCCAAGTAACTCCTTGGCCTTTTTCCTG s monDom4.chr2 512174051 303 - 541556283 TGAGAGCAGCTTGAGAATCTG-ATTCAGA-----ACACTCTTTCTAGGGATTCTGACCCAGCTGTGGCATAGTAGAAACTCTGGATCAGCTTGTTTTCCCTCCCAAAGCTGGCAGCCTTAGGGAGACATTTTTATGATTGGTGGACCCCAAAAGGGACATTCTGAGGTTTTTTCAGAGTTTGTGGTCCCTGGCCCTTGCCTCTGCTGCCTGACCTCAGCTCAGGGATGATTGGGGGGGGGCTGCCGTGGAGTTTAGACGAGTCTACTTTAACTTTGATTGCCCAGTGGGGTTGCTTGGCTTCCCTCCTG a score=10178 s mm8.chr4 97981371 270 + 155029701 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caGCTTCCATGTGGACAGTGGATGTACTGACCCCGAGACCTTCGTGCAGGCAGTGTTGGATGCCCGCTGTGTGTTTGACATGGGAACAGAAGTTGGTTTCAGCATGTATCAGCTTGATATTGGTGGTGGCTTTCCTGGATCTGAGTATACAAAGCTTAAATTTGAAGAGATCACCAGTGTAATCAACCCAGCTCTGGACAAGTACTTCCCATCAAACTCTGGAGTGAGAATCATAGCTGAGCCGGGCAGATACTATGCT----CAGCTTTCACACTCACAGTCGACATCATTGCTCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaCAACATGTGGAAGGAGCAGCCCAGCTCTGACGATGAAAATGAGTCAAATGAGCAAACCTTCATGTATTATGTGAATGATAGGGTATATGGATCATTTAACTGCATTCTTTGTGACCATGCCCATGTGAAGGCCCTGCTGCAGAAGAGACCCAAGCCAGATGAAAAGTATTACTCATCCAGCATCTAGGGACCAACATGTGATGGCCTTGATCGGATCGTGGAGCGCTGTAACCTGCCTGAAATGCATGTGGGTGGTTGGATGCTGTTTGAGGACATGGGTGCATGCACCGTTGCTGCTGCTTCTACTTTCAGTGGGTTCCAGAGGCCAGACATCTACTCTGTAATGTCACGGCCAATGTGGCAACTCATGAAACAGATCGAGAGCCATGGCTTCCCGCTGGAGGTGGAGGAGCAGGATGATGGCACGCTGCCCATGCCTTGTGC-CAGGAGAGCGGGATGGACCGTCTCCCTGCAGCCAGTGCTTC---------TAATGTGTAGATGCCATTCTTGTAGC-------TGTAAATTTAGCTTGAATTAAGGTATTTGGGGAACCATTTAACTTAATTACTGCCAG-----TTTGGGATGTCTTTGAATT-------------------CAGTAAGGAAGGCTAGGAGATAGGGGGTCACACTTA-CTGTGTTCCTATGGAAAC--TTGGAATGTTTGTTTTATATGGATTTTTATTCAGTTTTCCAACAAGATACTAACGAGTG-CCCTCAGCTGCTGAGCAAGTGTATGTAGCTTGTGCATTGGCTGA----AGCTCA-TGTTGTGACCCATTGTGAAAATAAAGTATCTTGAAATAA s monDom4.chr3 473493783 1135 + 526135210 CAGTTTCCATGTGGGAAGTGGTTGTACTGATCCAGAAACATTTGTCCAAGCAGTCTCTGATGCTCGATGTGTCTTTGACATGGGGGCAGAGTTTGGTTTCAACATGTATCTTCTTGATATTGGTGGTGGCTTTCCTGGTTCTGAAGATGTAAAGCTTAAATTTGAAGAGATCTCAAGTGTAATCAATCCAGCATTGGACAAGTATTTTCCTCCTGACTCTGGAGTGCGAATCATAGCTGAACCTGGCAGATACTATGTTGCATCAGCTTTCACGCTTGCAGTTAACATCATTGCCAAAAAACT----------------------TGTATTAAAAGAACAGACAGGCTCTGATGATGAAGATGAGGCAAATGACCAGACCTTTATGTACTATGTAAATGATGGAGTATATGGATCATTTAATTGTATCCTATTTGATCATGCACATGTTAAACCTCTTCTACAGAAGCGGCCCAAACCAGATGAGAAGTATTACTCTTCTAGCATATGGGGACCAACATGTGATGGCCTCGATCGAATTGTCGAACGCTGTGATTTACCAGAAATGCATGTGGGAGATTGGATGCTGTTTGAAAACATGGGCGCTTATACTGTTGCTGCTGCTTCTACTTTCAATGGATTCCAGAGACCCACTATCTATTATGTGATGTCTGGGCCAGCATGGCAATGCATGCAACAAATCAAGAACCAAGGCTTTCCAGCAGAAGTAGAGGATCAGGATATCAACACTTTGCCATTGTCTTGTGCTTGGGAAAGTGGAATGGAACATCACTCAACAACTTGTACTTCAGCTAGTGTTAATGTATAGATTCTGT--TTGTAGCCATTCATTGCAAGTTTAGCTTGAATTAGAGCATTTTGGGGGACCAGTAACTTAATTCCTGCTAGAGTTTTTAAATATGTTTTAAGACTAGGCCTGGCACAAATGCAACAATATGGAAGACTAAGAGAT--GGGGTCACACTTATCTGTGTTCCTATGGAAACTATTTGAATATTTGTTTTATATGAATTTTTATTCACTTTTCAAATATGCTTCTAAAGATTACCCCTCAGCTGCTATGCAAGCATTTGTAGCTTGTACAATGGCAGAATTGAGCTTAGTGTTGTGACCTGttttaaaataaaagtatattgaaataa 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s monDom4.chr2 512419217 1656 - 541556283 AAATGAGCCTGCTCTCTTCTCTCCCTTCTTAGGAGCTGAATGATGCTCTGGGAATCAGCATAGCCGGTGGAAAGGGCAGCCCTCTTGGAGATATTCCCATCTTCATCGCCATGATCCAAGCCAGCGGTGTCGCAGCCCGTACTCACAAGCTCAAGGTAAGT-----GAAGAAAAAGAGATGGCAGATGAGCAGCACCAGCGGTGAAGTGGACGCTGGAGCTGG---------GCCTGGAGCGAGCGAGGCAAGAGG-GCCAAACACC---GCCGTGGC------------ACCGGACCGCAGATGGGCCGTGTCAGAGTTCC----------------------TTCTCAAAGGCCCGAGTGG---------CTCTTCCTCTACAGCGCCTTCTCTCACTTTTTTTAACCCCCCAT--------------TCAGCTCAAAATTGATTTTTCCATGTAAAGGGTCCTCCCTGCACCCACGAGAAGCAGGATGTTTAGGAAAGTGTGCCTGCTACCACTTAATCTGCCCTTAGCTGGAAAAATGAAGCCGTGAATATCTGACTTCAACATTAGGCTTCCATTGACCCGCCAATTTGAACCCTTCCCTCTTAGCAGCAAGCCTTGGCCTGGAGTCTCATCATTAGGAGATTAGTACCGGGCCATTTTTCCAAGTCACAGACTTAATAATAAAACCCGA-ACCCCCACCTTTTTTCTGCAAaaaataaaataaaataaaataaaGTCTTCTTTGGAATCAT------GAAATTCCTCTTACTTCCTTGAGCACCGATTCTCCAGGGGGAACTAGGGAAGCCGCACAAAGCCCCATACGGGAACGCCAGCTCCCAAAGAATTTCCAGCATTCTGCTCAAATTTAATTTTTCTCTAATGATAGTCATTTCCTTCCACTTTTGTCCTTCTAGGTTGGAGACCGGATTGTCAGCATTAACGGGCAGCCTCTGGACGGACTGTCTCACGCTGATGTGGTTAATCTTCTCAAGAATGCTTATGGGCGCATTATTCTGCAGGTACGGTGATCAATGGGCCACGCAGCTGCAGTGGGGAGATAAGTGGCCTTCAGAAAAGATGGAGCGTCACTGGCAGGAAGCGGCACGGCCCAGCCGGGAAGCTGCCGCCGTGAATTATGCCAGCTGAAAAGCAAGAAATTATTATTTTTATTCAGAAATTCCTTAATGCCACCTATCCAGGCAGTGAACACGACTTTATGAAAGCCTAACGAGGGGAGAAAAATGACTCTGTGCTACGCGTGATAAATCAACAAGGCTGTTGGCTTCCAGGGCTCTTTTGTAAATCCAGGCTGGCCGGGAACGGGAAATGAGTTCTTTCCTCACGCCCAGACACTGTGACTGAGCTGCCCTGTGCATTCATTTCCTCTGCCTTTAAAAGAAGGGGGGAGCGGCGTCACGTGCCTTTTCTGGAGCCCAAAGAGTCGGCCACAGGTTAACTGCCCGGCAA----------AGAGCCGTGATCGAGCGAGGCAGACAATGACTTCTTGGC-------------------CTCAGAG----GGGGAAATAGACGAGAAGCCAGAGGCAT-TTCTCCTGTTAATTACCTCTCCTTCTCGTTCAACGTGTCCCATTTCCACAAGACGGAGGCCAGGCC-AGAACGGAAGGGCAGCA----GCCAGGGCC-------AGCGAGCCACCCCACAAAGTCCGCTTGTAGTGGCCTCGCTTCATCCGGAGCCGCACGATAGTGT--------GGTAGACCGAGCCAGG-CCAAAGCCAGCATT a score=4709 s mm8.chr4 98201784 117 + 155029701 aagtgctgggactaaaggGGGCTAAGTATTGTAAGGGGTTATGGAATTCCACACGAAGACCTCCCAATTTATGTCAAGACTATATTTTCAAAGGTATTGATGTGTTAGAATGGCGGG s monDom4.chr2 512424524 116 - 541556283 AAGGGCTCTGACGGGCTGGGCTTCAGCATCGTGGGCGGATATGGAAGCCCCCACGGCGACCTGCCGATTTATGTCAAGACCATATTTGCAAAGGT-TTGGTTTTATGTAATGGGGGG a score=1560 s mm8.chr4 98206286 133 + 155029701 CATCATGAGAGTTCAGACGGGACAAGCTTTATCCCACGTGCTTCAGAACAGCACTGTTTTGGATTTGGGATATTTTATTCAGATTATAGGATATTTACATATGTGGAAGGG----AATTCACTCAAGCTTCATATTT s monDom4.chr1 289390941 129 - 748055161 CATCATCACATTTTGCAC----TATATTTGTTCCCAAGTAC----GACAAGAACTGGGCTACAATTTTGTCATTTGCTTCAGGTTCTAGAATTTCAACATATGTGTGTGTGTCCATATATACTAAAGTTCCAGACCT a score=14907 s mm8.chr4 98207206 717 + 155029701 AAGTttctcccttcccttctcccttctcccttctcccttctcccttctcccttctcccttctcccttctcccttctcccttctcccttctcccttctcccttctcccttctcccttctcccttcccttctcctttcccttcccttcccttctcccttctcttcccttctttcttcccttcccttcttccttcccttccctttccttcccttcttccttccctttttc---ctttccttcttcctttccttttcctttcctttttccttccctttttccttccctttttcctttcctctttctttctttctttctttctttctttctttctt--tctttcttcctttcctttcctttcctttcctttcctttcctttcctttcctttcctttctttctttctttctttctttcttttttttttttggtttttcaagacagggtttctctgtgtagccctggctgtcctggaactcgctctgtagaccaggctggcctcgaactcagaaatccgcctgcctctgcctcccgagtgctgggattaaaggcgtgtgccaccatgcccggctctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttcttcctttcctttcctttcctttctttctttctttcttttttttttttttttttttttttttggtttttcaagacagggtttctctgtgtagccctggctgtcctggaactcgct s monDom4.chr1 289393501 644 - 748055161 AAGATtctctctttccctccctcc-ctctcttcccccctcttctctctctctctctctctctctctctctctctttctctcctgtcactccctttttctcttttctctgtctctccctccctgtctctcccccttttctatcactccctctttctctcctctctctcttctctacctgtctctccctccatctcccctttttctatcactccttctttctcttttcttctctcgctctcccccctctctgtttctgtctctctccctccctctctctctccaccttttctatcacttcctctttctctcttttcttttctctctctcccctgctcttctgtcactccctctcCCCTTCTCTAATtttctttcttctccttcctcctttactctttctcacttcccttctttctctccctctgtt--------------------------------ctcccttccctccttctctcactgtgcatc----------------------tcccattttctctttttc-----------------attcttctttctccatgttcctttttctattcctttatttcctttgtactttttctcctattctcttctttcCCATCCTGACTTCTAATTTTTCTCCCTGTGTCCCTCTCCATGTCTCTCACTAATGTTTCTCCCAACTGATTTTTCTTTAT------CTTCTTGTTATGGAGGTTGCT a score=705 s mm8.chr4 98208102 329 + 155029701 ATttttatttcttggaacagggtttc---------tttgtgtagccttgactgtcctggaacttactctttagacagtctgacctca------aactcag------agatccattggcc--tccatctccagagtgctgggatta--cagtctcgtgccacca--------tgcctggcATTTCCTTCCCATCTTA------------ATCCCAGGGATTTCCACTGATGCCCACAGTTTTAGAGTCCCATTTTAGAGAGAGTGCTGCCTTC-----------CGTTTGTTCCATGCCTTGTTTTTGTTTGttttcttttctctgagacagggtttctctgtgtagccctggctgtcctggacctccctctgtaggccaggctgg s monDom4.chr1 289394307 374 - 748055161 ACCCTTGCTCCAGGGAA--GGGCTCCCCCAGGGGGTCAATCTATCCATGGCTGCCCTGGAACCTGGCC---ACGTGGCCAGGCCCCACCCAGCAATTTGGGGAAATAGATTCATTTCTCATTCTCTTTTCCTTCTCTTCGTTTTAGTCAGCTTTGCCTCAGCGAGGTTATTTGACTAAAGGAACCCTCCTACATAAGTATGCTGAAAAATCCTAGAAAATTTTACTGATACCCAGAATATTGGGCTCTGGTTTTAGAGAGTGTGCTCCTTCCTCTCCCCTTCTCATTGGTCCCTAGGC---CTTTTGATAGTTTTACAGCCT---AGATTTAATGTGTTCTTGTATTCCAGGACAGAATAATGCTCACTCTCTGGGACCTGTCGG a score=7038 s mm8.chr4 98209824 412 + 155029701 TTTAAATTAAGTCTTTTGATAAGCACAGGCATAAGCTAGCGGTTTT-----AATATTGATTTAATCTGCTTAACACTGGTCTAAGCTGGACTGTTTCTTGTTTGCAGGGAGCAGATGCAGAGGACGGCTGATTAAAGTGAAGTGACCAGATCTTAGCTG-AAATGGCGAGACCCTGGAAGGCATTAC-CATGAGCAAGCTGCCTCCATTCTAAAGCAGCAGAGAGGGACTGTGGCCTTGACTGTGCTGCCGTGAGCTGCGGGTCCTGATCATGACACACTTTTTCACGAGACTGCTG---------CAGAATTCTGC---------GGC----TTCTGGTTGGGATGAACAGTTGCCTCGGCTAAAGCCCAG----CATCATCACTGGCTCTGACTCTGTTTGCAGAAACAGAGCTGCTGTCTCTGCTTCCTGCTCATATCCCTC s monDom4.chr2 512427629 440 - 541556283 TTCAAATCATTCTTTCACATGGAGCCCGGCTAGAGTTAGAGGGCTCTGAAGGATTTACATGTGATCCCCTTC-CATTGGCTGATTGATGGCGCCCTCTTGTTTGTAGGGAGCAGCAGCAGACGACGGGAGACTGAAGCGTGGGGACCAGATTCTGGCTGTCAACGGGGAGGCCCTGGAAGGAGTGACTCATGAGCAAGCCGTGTCCATTCTCAAGCGTCAGAGGGGAACCGTAACACTCACAGTGCTGTCCTGAGCCCCGG---CTCACTGGGGCAAAGTCACCGAGGTAGCTGCTGTGCTGTGGCCAGACCTCTGTACTAAGTAAGGCATCGTCCTGGCTGGGAGGAAAACCAAGCACCAGTGAACATCAGTCCTCAATCTGATCGGCATCTCCTCTATGCTCAGAAG-AGATCTGTGGTTGCATCATCATCATtctctccctc a score=5958 s mm8.chr4 98210271 1091 + 155029701 CTCATCTAATGAGTAGAAACAAAGGTTTAG---CTTGTCATCTTAACTCGTGATTTACTTATGCTAATTTGCCTCTTCAAATAAACCAGAAAACATTAGCAGTGTAATTAACTTCCTCGCA---------ATGAACTATTCATACTCTGCCGCTGGGAATTA-CTGCGTTCTGTTCTGTGTGACTCAGTCAAGTAGACCTCGCATCCCTGCCTCTAGATTGATCTGCTGTTAGTCCTTGGTGATTCGGAGGAGTCCATTTACAGACTTTGTAATC-------------TACTTGGAGTCCTAACAGGCGTTGATT-CTGAGTTTGACAAGCGCACACTGCTCAGCAAGTATGCCTTGGTCTCCACA--------------------GGAACAAGTAACCCTCGAGTT-TGAGTTCCACCCATGCTAGCTCACATTACTGGGACGCTAACTGGGAGTGGTGGGCATCTCAGCAGATCGGAATCACCCGTTCC---------CTACCCCCCTAGACTGCAGGTGAGGAGGTGGAAACCCTAGACCA----CACTGTAGACTGTAGAGATGAGCAAGTTCGATCGGCCTCAGCCTTATCAGAAGCAAG-----TTACAAGTTTGGTTAGCCTTTCTCTCACCTTCGTACCAACCTGCACAGTGGCTCAGCCTGCAGCGGCTGTG-----------------TGCAGCTCGGGAACTTAAAGCAAATGACCTGGGAATC-----AGACACAGAAGTGCTTAGCTTGAGT-TTCCCAGCCTCTA------CCTCCTATTGGCTGA-AGTTCTGTA---------------GCTAAGAAAGCAGCTGTGGCTGAGAGCATCAAGAGT-----------------CCTCAGAGCATGCAATGGGCTGGGAAG--GGAGATGGATGGTCATCACCAAGCACCGTAGAGTCGTCTGTTGAAAGCA--AAGGAAACTACCACGAAGGGTCAGCAATAGACATAGCTTAGCATTCTAGGACTATAACTCGATGCAGCAGAATGTTCAGTAATTACCCAGAA-----TTTAATGGGCCCTAATTTAAAATGTTATTTAATTAGTGAGGATTTTAACTGATATTCCTTTTGAGTAGATGCAATCCCAAAGTGCATTAAC-TCTTG----------TGGCTATTCTAAAGTGCAGAATGCCTCAATTTTATGTTGATGGTGTATTCCAATGACTGGTATTAAGCTTTTTGAGA s monDom4.chr2 512428816 1186 - 541556283 CTCAGCTGATAAGCAGAAACAAATACCCAGTGACTTGCCATCCTGCCC--TGATTTACTAACGCTAATC-ATTTTTCCAGGGAGGCCAGAAAACATTAGCGGTGTAATTCAATTACCAGCATTCTAAGTGATAAAACAG-CAAATTCTCCTACGGGACTTTATCTGTGCTCCTCTCATTAAGTCTTTACCATTGAAACAT---------GCCTCCAATTTGGTCT---------CTGCGATGGTTATAATGAGTCAATTTGCAAGCTTAAAGATGAGAATATGGCCAGTCGTTGAAAACCAAACCGTCATTGTTTTCTGAGCCGATGGAGGCCGC----TTCAGAAGGGAGGCCCATTTCCCCTCAATGTGGTACTTCGTTCAGCTGGGAAGGTCAAGAATCCAGTTCTAAATTTCAACAGGGCCAGATTATATT---GGGGTGGAGGCCGGAGTTCCCCTGGAGTCCAGCTCAGCTCACGTTCCCATGCCAGGGTGCTCCCACCAGCCTCGCCTGGGAGTGAGGGCTTCCCAGCCCCTGGACAGCAGCTCTG-AGACTGTA----TGAGGTTGGTAGCACGGCTGCTGC------AGGGACCAGCTGCCTTCCCTTTCTAGGTCCCCTTCCTGCTTTCTCCACATCAGTCGTTCTATCGGAGCAGACTGGACGGGCCATGGTCAAGGCCTCCAGTGATGCTTCCAATCAATTTAA--CAAAGAACTGGGGAGGGCGGGGAGGGACAGCCGTGCTTTGCTCATGTCTTCCTGGCCTCAGAGCGGCCACGCCATTGCAAGACAGTTGTGCACGCCCTGGAATGCAAATTCAAAAAGTAAATCAGGC--AAATCTTTCAAACTGGTCCTGTACATTTTTACCAAAGGGGGGTGGGTGGGGCGGGAGGCAGGGGAGGGACTG-CTTGTCCAAGATGCTCTTGGCTGCCTGTCAAACTCTTTAATAAGTGTATTAGGAAAAATGAGTGCAGTGAATAGCGTA------TTTAACCATAACCCACTTT-TCTAAGTGGTCAGAAAGTCATAAAAAGCAAATTTTATGGGCTCTCATTTAAAATGTTATTTAATAAAGGTAGATTTTAATGGAAATCCTCTTTGAATCTATGTAATCACAAAGTGCATTAACATGTTGGAATATTACCTGGCTATTCCAAAGCATCGAGTGCCTGAATTTTATGTCCGAAACGTCTT-TGGTGTTTGGCGTTGATTGCTTTGAAA a score=6029 s mm8.chr4 98248085 558 + 155029701 TACACACTTGATTAAAAACAAAACAAAGAAA---------AAAACAGTGCGCTTTAAAACTCCATGTAAAAAGTATTGCTTTTTCTATTGTGC----AAGGGTGCCCTGACCTACCTGCTTGCTACACAGGACTGCAAAGACAACGTCACGAGGAATTCAAAGCCGAAGACGTTTTGAATTTCTGGATGACTCCACTGCAGCCTGCACTCTGCACCCCATGTAGTGTGGGGGGGCTTGGCCTAAGGCAAAACACTACCGAGCATCCTAATGAGCAGA--ATTATATGATGGGAATGTACTGTGCATATTTGACATAGTTTCTGTCTCCAATG---------GTGACCCTCTGGCTGTAACCCCGGCCCTCTCTCAGGGCAAGC---GGGGAGTCCAGAAAAGGAACCTTTTGTTCCTGGTTGCTAATTCTTCT--GCAGCTCCTTCGGCCCCAGGGACCTGCCCGGCTCTGAGTGGGCCCGCAGAAGCTCTGCGATTTCCACGTGGGCAGGTGAATTCAGAACGAGGGACAAAGCTGTTCGGCCAGCCTGCAGgaaagaaagaaagaaagaaaAATCATCCTATCTG s monDom4.chr2 512466444 528 - 541556283 TATCCAGTGGGTTTAAAACAGAAGATGGGAATGGGGGGGGAAAGACGCATTTCTTTCTGTTTCACGTAAAACGTATTGCTTTG-CTGATGTGCTTCTGAGGCTGCCTCGGGGCTCCCGGAAACAAGACAAAACC----------CGACCCG-----------GCCCCCGACGTCCT------CTGGGG---TCCA--GCAGCCCAGCCTCGGCA-----------------GGCCCAGGCCTGGTGCCTAATACGG--AGGCGCCCTAATAAGCGGACAGATACATCGTGGGGGGGGG-GGTTCATCCAGGACGCAGTTCTTTCCCTGGAGGAGCCGAGGAGGGAGCCGCCCGTGACAAGCTCTGC--TCTGCCGGGGCTAGGATGGAGGAGCCCTGAG--GTGAGCCTTTGTACGGGGCTGCCAGCGGCTCTCGGACGCATCTATGGCCCGATGGACCTGCGCTGCTCGGCATGGGCACACAAGAGCTCCGCGATCTCCCCATGGCCGGCCGAGGCCAGGGCAGTGGACAGCGCTGTACGGCCAGCCTAAAGGGGAGAAGAAAAGAAGGAGGAA--GTCATGTCTG a score=10768 s mm8.chr4 98253412 261 + 155029701 CATCTTACCTTGTCAGTCAGGCTGCTGTTGCAGGCTGGGTGTGCCAGGAGCAGTCGTACCAGGTCGGCGTTGCCTTGGTGACAGGCCAGCATGAGGGCGGAAGATCCATCATTGTCCTGCAGGTTGACATCTGCCTGGCAGCTCAGTAGTGCTTGGACCATGTCCTCCCGGTCGTGGCTGACTCCTAACATCAGTGCAGTCTGTCCTCCCTGCACACAGAGTGACAGCCACAAGCTGGAGCAAAACTTCTCAAGGGAATGG s monDom4.chr2 512468075 250 - 541556283 CGCCTCACCTTGTCCGTCAACGCAGCATCGCAGTCTGGGTGGGCCAGGAGGAGCCGCACCATGTCCGCATGGCCGTGGCGAGCGGCCGCCATGAGGGCCGACGTGCCCTCGTGGTCCTGGAGGTTGACGTCAGCGCCGCAGCTCAGCAGGGCCTTCACCATGTGCCCCCGGTCATGGCTCACCCCCAGCATCAGCGCCGTCTGCCCCCCCTGGAGAGAGCAGGAGGACCCTGAGCCG-----------CTGGAGGGAGTGG a score=3302 s mm8.chr4 98257058 297 + 155029701 AGGAAGAGAGGACACAATAGGTAATAACTCTAAAGTATTAAGCTTCCTAAGTGTCCTGGGTCAACATCTAAGTCACTCACAAAGGTTAATGACTGCAGTAGCCAACCA-GCAAAGCTCTTCTCAAAAGGCTGACTAACATTTGAAAGTTGGTTGCAGAAGTTAAGTACAGGTGGAA--TTTTCTGTTTTAGTCTGGAACACAAACCAGATGCTCAGTGACCCTTATGCCAGCCTGTCAAAGTCCCAAGAGCCTTTAAGGAAAATCAAGTATTGGAGCTTTGGATAGACGCTATTTGGGGG s monDom4.chr2 512473552 238 - 541556283 agagagagagTCTGTAATGGGTAATGAC------------------------------GGGCAACCACCAGGTGTTTCACAAGGTC-------------AGCCAAGTGTGCAAATGCTATCTCG------TGACTGGTACCAGTGGAATGTTCCAAAAAGCAGAGCCCAGATGGAGCCTGTCCAGCTTCAGGTTGGGGCACAGATCAGGCACTCACTGACTTCTGCCCCAGCCTGTT---------TGGGACTTGGAGGGAAACGAACT----GCATTTTGGAAGGATGCCATTTGGGAG a score=8506 s mm8.chr4 98257443 246 + 155029701 GGGCAAGGAGCAGAGAGAGCAAGTGCTCTCCACCTACCTGAGTTGCTTGTATGTTCACATTCCCCTCTCTTAAGAGTTTCCAGACAACAGCCATGTCTTCTTTTGTCTCAGCAGAAGCCAAGGGAGTGATCATCACAGCAGTGTAGCCAGCTTTGTTCTGATGATCCACATTGCAGACACCTACAAAGGAAGGAATGGGTGCTGGAACAGTCAAGTTGGAACCAGA-----CTGCCCCTCAACACCTCAAT s monDom4.chr2 512475080 250 - 541556283 gggctcTGTCCAGGGGGTCTGAAGGGGCCGTGCGTACCTGAGCCGCCTGGATGTTCACATTTCCCTGCTTCAGGAGTTTGCCCACCACGCTCATGTCTTCGTCCGTCTCGGCAGAGGCCAGCGGGGTGATCATCACCGCCGTGTACCCGGCCTTGTTCTGGCGGTCCACGTCGCACACACCTGCGGGAGGAGGGGCGAG-ACTGGGCCAAGCATTCCGCAGGGAGGGCTTTCTGCCCTCCGGCTCCCCCAT a score=13035 s mm8.chr4 98263089 427 + 155029701 AGGAAAAGAAAATACGATACAAAAAGACCCTTActgtagtgccagctactcatgag--gctgaggcaggagaatgatttgagtttaggagttc----agggatagctt--gggcaatatagaaagaccccattttataagaaCAAGGAGGTAGGCCTTCAAGGAAGGACAGAGTGTAACAGCCATTTCTGACCTGTGTCCAGCAGTAGCTTGACAATGGCGAAGTTGGAGTGTGACACACTGTAGTGAAGGGCTGTGTTCCCACTTCGGTCAGCCAGGTTGACAAGTAGCTTCAGAAGATATGGAGAGTGAGGCTGGACCTCAAGGAGGTAGGCAGCCACAGCCTCAGGGCTAGATAACTTCCTGCTGGACACACGGAACCACTCCTGACTGATGGTATTCAAGCTTTGCCTCTGCAATG-CAAGAT--TCTGATCAC s monDom4.chr2 512479645 407 - 541556283 agGACAATAAAATA------AAATAAACACCCACT----TGCAACCCTCCCTTGAGAAGCT----CTAGAGTACAAACTGTGGGCAGGTCTGCTCACAGGGAAAGGCTCCGGGGAAAATTGCGAGGCTTCCACCCAGAA-AAGAAAATGGTGG----TCAAAGCAGG-------GGAAC-----TTCCTGACCTGTCTCAAGCAGCACTTTAACAACGGGGAAGTTGGAGTGCGAGACGCTGTAATGGAGAGCCGTGTTCCCATTGTCATCTGCCAAGTTGACGAGCAGCTTCAGGAAATGGGGGTCGCTGGGCTGGAACTCACTGAGATAGGCGGCGACGACGGAAGGGCTGGATGACTTCCGACTAGACACTCGGAACCACTCCTGACTGACGGCGTTCAAGCTTTGCCTCTGAAACACCAAGATGCTCTGATGAC a score=6933 s mm8.chr4 98266683 271 + 155029701 TGACTCACCTCTCAGCCCTCAGATGAG--------ACACTTCCTCCCCACGATCACTTGTGTGGCCTGAGTTTCTGGTGCCTTCAGGGACTCCCTGCCCAGCCTCACAGCTGGGATGCAAGTCTCTGTCCTCCCTGGACTCTGAGCAATCCTGTTTCTTCTCGGTCTCACTGTCAGACAAATCCTCAGGGGAGCTGTCCTCCCCACTGGTCTCCTCGCTAGACGTGGTCTCATAGCTACGGAAG--AGGCAAAGGTCGTTTG----GGTCATCCCTCTTGACCAG s monDom4.chr2 512486955 277 - 541556283 TGGCAGACCTCTCCGACTTGTGATGAGCACCAGCCGCAGCTCCTTCCCC--GCCACTGGCGCTGC------TCCCGGCGCCCTCCGCGGGGCCCTGGACCATCTGCTGGCTTCCCTCCGCAGCTCTGCCCAGCTTGAGCTCTGGGCCATCTCCCTTCTTCTCCGGCTCCCCGTCGGAAGCAGCCTCGGATGCACTGTCCTCGCCGCTGGTCTCCTCGCTGGACGTTGTCTCGTAGCTGCAGGAGGAGAGCAAACGTCACCCACCGCAGCCTTCCCTCGAGGCCAG a score=11396 s mm8.chr4 98268876 265 + 155029701 ATGTGGAGTTTTAACAGGCCATGGGGATTGAGTCCTGCAGGAGAATGAGAAACAGATGTGTTTCCTA---------------------GGGAAGGGGTCCTAAGGACAACAGCGGG--TTAGGTAGCAGGGAAGGCAGTCTGAGCTTCACACGTGATGCTTACCCACCGTTAACCCCAACAAACTGAAGGTTCTTTTTGGTCCCATTACCTCCTGCACGGAAGCCATAGTCTTTCTTTTTCATTATGGATTTAAGGCTGGTCGACGGAGAGATCTCTAGACAGACACA s monDom4.chr2 512495169 281 - 541556283 ATGTGGTCCTCTAGTAACCCA---GGATCTTTTTCTCCAGGTTGTTAGGAAGGAGGCAGATTCCATACGAGTTTATAGGATTCAAGCAGGGAAAGGAAAGAAGAGACGG-AGCGGACATTAGACA--CGGAAAGGCAGTCTG-GCGGCAGGAACGATGCTTACCCACCGTTTACCCCAACAAACTGAAGGTTCTTTTTGGTCCCATTACCTCCTGCGCGGAAGCCATAGCCTCGCTTTTTCATTATGGACTTAAGGCTTGTCGACGGGGAGATCTCTAGGCAAACACA a score=13422 s mm8.chr4 98270309 460 + 155029701 ggTGGAGGGGGGAGGGGCAGGAGTTTCCTTCGGCTCCGGCTCCGGGGCCTGAGCTGAGTAGGCAGAGAGTAACAGGTTAAGGGAACTGAGCAGTTGGTTCTGGATGCTGCTGAGCTTGGAGGCGGGCTGCTTGATGGCGCTGGCCAGCTCCGGGTAGCCATGCTCCAGGCAGTTCCACTGTTCATGGAGAAGCTCTTGAATCTTCTTCACATACTGCCCGATTGTGGCATCTTGTGGGGAACTGGCTGGCCTTCCTGGACGCTCTGCTCCGGGGAGCTCTGAGGTGGCCTCCTCCCTGATCACGGGAGCAGATTCTCTTGTGCTCCAGGAAGACTCTCCTGCTGCCCTGCTCAAGCCCCCAGCTCCCTCCTCCTGGCCTCCCTCCTGCTCAGAACCCTCCTCTTCAATCCGGAGCTCCATGGAGAGGCAGCT-GCACAGGGATGAGGCGAGGATCTGCTCA s monDom4.chr2 512498604 383 - 541556283 GGGGGGCGGGGGCCTGCCGGGGGGTCTCTCGGGCTCTGGC---GGTGACTGGGCCGAGTAGGCAGACAGCAGCAAGTTGAGGGAGCTGACGAGCTGGCTCTGGATGGAGCTGAGCTTGGACGCGGGCTGCTTGATGGCGTTGGCCAGCTCGGGGTAGCCGTGCTCCAGGCACGTCCACTGCTCGTGAAGGAGCTCCTGGATCTTCTTCACGTACTGGCCGATGGAGGCGTCAGGAGGGGAG------------CCCCGCTGCTCCGTGCCGGGGGAGGAAGTGCCGGTGCCCACGCTGGATG-GAGAGC-----------------------------------------------------------CCCCCGGGCCGCCCAC---CTCGGGGACCTGCTCCTCGATCTTGAGCTCCGTGCAGAGATAGCTGGGGCTGGGGGTCGGGGGGGAGACATCCG a score=36922 s mm8.chr4 98270953 1276 + 155029701 GCTCCTGTAG-GGGGTCAGTGTTCACCG-----TGGCATCAGTCCTGTCCGGAGCCTCGCTG---------GCCCTCTCTTGACTAAGCTTTTCTTCTAAATGGGCTACAGTGCACTCCAGCTCTTGAATCCTCTGTTCCCTAGCCTTGGTCTCTTCTTCCTGCTGCTCAAGGGCAGCTCTGACCCGGGCAAGCTCTTCTGTTCTCCCCGACAATTTGTCCTCAAGGGCCAGGACCTGATTCTTCAGGCTGGAGATACTGCTGGTATCAGTCTCCAGCAGGCCCAGGCTTTCCTCCGTTACCCGGATCCCAATGCTCCTCACATCCACTTCTATGGGTGGAGGGGGTGGGATCTCGCTGATGCTCAGCTCGATTTCGTCCAGGGAGAGATCATTCTCAAGGATGGGGGAGGGCAGAGGGGGCGGGCTGGGCGTGGCGGAGCCAGGCGTTAACACCAGCTCTGCTTCTCTCATGTGGTGCTCAATTTCCACTTCCTCTAGATCCATGGGGACACTCTGGACTGCGGAGGAAGGACCTGGCTGAGAGAGGTGACT-TGAAGCCTTGAGGTCACCTTCTTCTGGTTCAGCCCCCTCCCAGACCTGCTCTGGAATTGCTGGCTCTAGTTCCCCCAACTCC-CTGTCTA-----------CTGACTG--GGCCGATGCT-TGGAAACCCATGAGCCCTTCTGCAGGGTCAAAGGCACCATCACACACACTGCCTTCATCCTGGAGCAGAGGGAGGGCAAGAAGTGTGGAAGGGCCTGAGGTCAGGCTGGGCTCTTCGGGGACCTGGTTTTGCAGCAGTGTAGCAGGCATGCTGGATGCTCTCAACAGCTGGGGCCGTCCACTCCCTACATC--------CTCCAGAGAACCAG----CCTCCGCCTGCCTGGCATCCTTTGCCAAGAGAGCCTTCCTGTGGTAGTTCAGCTCACTGCCTTGCACCGAGGCCTGGGGGAGATCACCCAGTGGCAGTGGCTGGGATGGCTCCTGGGTCCCCAGGGATATCTTTCTGGGTA---------CCACAGGAGACCAGTTTTGCTGGGGAGGAACAGCATAGGTGCGGTCCCCACTGTTGGGAAGGCTGAAGTTTCGGGGCAGAGTACTAAACTTAGCCTGCTTGGCTCGTCTGTGGATCGGAATCCTTTTGATGGTGTGTCCCTTCTCAATGTCATCCACATATTTGAGGAAGTCCAAGTCCAGATGAAAACCATACGGGGTCTCCACAGAGTAAGGGTAGCTCTTTGGAGGCTCTTTCTCTTCATCCCCCTGAGAGGA---CTGGTCCTTGCCTAAGAGATAA-AAGGCATA s monDom4.chr2 512498987 1286 - 541556283 GCTCCTGAGGAGGGGGCGATGCCGGCCGGGGGCTGACAGGCGGACTGACCGGGACGCCCTTGTCGCACACAGCGCCGCTCCGGCCCAGCCGGCGTTCCAGCTCCGCCACGGTGCCCACCAGCTCGCGGATGCTCCGCTCTTTGCTCTGGAGCTCGTCTTCTTGCTGCCGAAGGAGGGCCCTGAGCTTGGCCAGCTCCTCTGTCCTTGCGGACAGCTGTCCTTCCAGGGCGCTGACCCGCTGCTTCAGG---------------GGGTCGGAGGGCCCCAGCCCCAAGCTCTCCTCGGGCACCCCAAGGCCCGAGCTGCGCATGTCCATTTCCACGGGGGGCGGAGGTGGGATTTCACTGATGTTCAGCTCCATTTC---CGAGGGGAATTCATTCTCAGGGATGGGAGATGGCAGAGGCGGCGGGCTTGGGGTGGGGGTCCCAGGGGGGGTCCCCAGCTCAACTTCTGGTGCCTTTGGCTCTTCTTCCACACTCTCTAAGACCACAGGAAGGTCCTGGGGAAAGGGAGCCGGGCTCAGGGGACAGCTGTGGCTCTGGAGCCCTT-TGTCCTGGTCCCCAAGTTCTGGCGTGTCCTGGACTAGGTCAGGGATTCCTGGCACCAGAGCTGCCAACTCCTCCATCTGGGGCTGTGAGGATGCCTGCAGGCCGGAGCTGTGGGGATCCGGAAAGTCCTCTACAGGGCCAAAGGCAGCCTCGGAGAGACCGTCTTCCTCTCGGGGCTGAGCCTCGGTGAG------------GCCGGGGCTAAGGCTCTGCTCATCTGAGAGCTTGTGCTGGAGGAGGGTCGCCGGCATGCTGGAGGCCCTGAGCAGCTGGGGCCTCCCCCTCCCACCGTCGAGCTCGGCCTCAGCACACGGGGGGGCCTCCGCTTGGCGAATGGTCTCGGCCAGTAGGGCTCTCCTCCTGTAGCTGATCTCAGCCCCTCCAGCCAAGGGCTGAGCAGGATCCCC---------------GGGGGGTTCCTCCGACCCCAGGGAGGTCTTTCTGGGCAGGCCCGAGAATGCGGAGGTCCACGGCGGGTGGGGAGGAGCTGCGTGGGGCCTGGCCCCACTGTCAGGGAGGCTAAAGTTCCGAGGCAAAGTACTAAATTTGGGCTGCTTGGCTTTCCTGTGGATATGGATTCTCTTAATGGTATTTCCTTTCTCGATGTCGTCCACATACTTCAGAAAGTCCAGATCTAAGTGGAAGCCGTACGGCGTCTCCACAGAATAGGGGTGACTCTGGGGAGCCTCTTTTTCTCCGTCCCTTTGGGATGGCGCCTGGTCTCTGGCTGGAAAACAAGAAGACATA a score=2272 s mm8.chr4 98272244 481 + 155029701 AGTTAAACTGAGGCTATCTGTAACTGTGACCTCACATTATCCTATGAGATTTCTCTCCAGCGCTCCAGCCTCTGAAGGGTGCCGCTGAGCCTATGGACTTGGGGCCTGTGCTGGGATAGCATCTTATCAAATCAATGTGTATTTGGCCAACGTCTGCA--------------------------CCTTCTTATTTTCAATAAGCCTC------AGTTGTTGTTATCATGAACCTGCCTTCAGACCACGAAAACAAAATTGTCTCACGCtgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttTGGGGGGGGTTGCATCATGTAACTGCTGAACTGAAAT--CCAGCCATTTAACAGAGAAAGGTACCAACTGGCAGGTACACATATGGAAGATTCTGAAGGATAAAACAGACAATTTTCTCAGCG--TTCAGAAAGAAG-CTGGTA-TGCCTAAATTAGTTCCAGTAAATCTTGCAAAAGGCTAAGCTATTGATAATTTATGATTCCTGCAT s monDom4.chr2 512500305 461 - 541556283 GGTAGGACGAAGCCTCCCT----------CCCGACACTATCCTGCAA-----------AACCCGGCAACGGCTCAAACATGCTGAAAGGCTGCTGGTCTTGTTGGCTTCGAGGCAACTCGAACTTATTAAATCAATTCATAATTAGGCAGTATCTGCAGGGACAGAGGAGAGAGAGCGCGAATGGCTCCCCATCTGCAGTATGTCACCGGAAGAGCTGGAG-----AGGAATCTGCCTAGA---TACGGCCGCAGAGCAACTCCACACGGCCTCGT--------------TTTGTCAATGGGTTCGACTTG---------------TGTAATTGTCAGGCTGAGATAGCCCAGGATTTGCCAAAATGGGCCACTAATTGGCAATTATATAAATGGAAGGCTTTAAAGGTTGAGCCACCAATTTGTCTGAGCAACTCTACAAAAAAGCCCGGCATTATTCAAATAAACACCAGTAAATCCGGCTGAGCCCAGAGACTTAAGTGATCTAGAATGTCATCAT a score=3331 s mm8.chr4 98277569 323 + 155029701 GATTTCCCCTGCAGACCTCTCCAGAGTCATCCCTGGGACTGGTGGTGATT--AACCCTTTCCA--AACCAACTAACCCTCTGAATCAGGGAAC--AGAAAACCGCCTGCCTACCATCTATCTTCTCCATCGTGAG---TACAAAGTTCAGTATCTCAGGTACTCCACATCCACCGAGTCT---GCGTGATTCCTGGAGAGTTCTGGAAGAAAAGAAAAAGAGACCGTCAGCCCTGCCAAAGCTGGAATACGTTGAAGCTGAGGAAACAGCACAAAG-----AAAGTAACTGTCAGCTGGGCCTTTCTTTCTCCTAGAGATGGCCACAAACCAGCTTTGCA s monDom4.chr2 512508878 310 - 541556283 GGCTTCCCTTAGAGAACTCGACATA-------------CTGATGGCAAGCCAGACGCTGTCCAGCAGCAGGCTGGCTCCTTTCATGGGGGAAGTGAGAAAACAAGCCGCCTACCCTCGGTCTTCTCCATCTTCAGGGCTCCGAAGGGCAGCCTCTCAGGGTCTCCTCATTAGATGAGTCCTCGGCGCGGTCACC---AAGCTCTGAAAGCAACAAGACACAAGTCAGAGGGGTAGTCAATGGAGCCCCAC-TTGACGTTGGGGAAACA----AAAGGCCCAGAAGCAATTGGCGGC---------CCATCTTCCATGGAAGGACGAAGGGCATCATCGCA a score=4279 s mm8.chr4 98347642 65 + 155029701 AAAGGACCATCAGCCTTGGACCTCAGGTGGCTGAAGGAGGGAATGTGTTTGTTGCCTGCCACATC s monDom4.chr1 404307489 65 - 748055161 AACAGGTCATCAGCCTTGGACCTCAGGTTGCAGAGGGAGAAAATGTGTTTGGAGTCTGCCACATC a score=9395 s mm8.chr4 98347707 190 + 155029701 TTTGACACATCAGTAACACCCTTCTGGCAAGAAACTGTCTGCCTAGTGACTGGCAGAATGAAGGCAAAGGCTGACAGAGACGAGTCCTCCCGGTATGCAGCCATGTTGGCTTCCCCAGATGTGGTCTAGAGGTACAAGGAGCTGGG-ATCACTGCCCTGCATAGCAAACTCTGGGCCACAGGAGAAAACAG s monDom4.chr1 404307673 189 - 748055161 TTTGATTAATTTATGGCATCTTTGCAG--AGAAACCATCTGCCGAGTGACTGGTGGGATGAAGGTCAAGGCTGACAGAGATGAATCTTCTCCCTATGCTGCTATGTTGGCTGCTCAGGACGTTGCCCAGAGATGTAAAGAACTAGGCATCACTGCCCTTCACATCAAACTTCGGGCCACAGGGGGAAATAG a score=4130 s mm8.chr4 98347897 89 + 155029701 GACCAAGACTCCTGGACCTGGAGCCCAGTCAGCTCTCAGTGCTT--GCTTGTTCTGGGATGAAGACTGGGCCAATTGAGAATGTCCCCCCA s monDom4.chr1 404309066 91 - 748055161 GACCAAGACACCTGGCCCTGGTGCTCAGTCAGCCCTGAGAGCTCTGGCACGTTCTGGAATGAAGATTGGGCGGATTGGTGAGTTACTCCTT a score=3847 s mm8.chr4 98347986 99 + 155029701 TCCCTACTATCCCTACTGACAGCACTAGAAGAAAGGGGGGGGGATCGTCGTGGTCACCTTCTGTGAACAGGACTTCTCAAATAATTTTCTGTTAATAAA s monDom4.chr1 404309525 94 - 748055161 TCACTCCCATCCCCTCTGACAGCACTCGCAGAAAGGGTGG----TCGTCGTGGTCGCCGACTGTGAATCTTGTTTGCTGGATTATTTT-TGTCAATAAA a score=7639 s mm8.chr4 98384570 570 + 155029701 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s monDom4.chr2 512696713 1019 - 541556283 TGTTCAGGCGACGATAGGCCGGTTTGAGTAAGTGGCGGCGGCGCTAGTCCAGTGGGGAGCTGTTGCCCGCCTCCCCGCGTTCTGTGCCGTCTCCCGATCCGTACGTT---TCGCCTTCAGCCCGCGCGCTC------------------------------------GGGGCCGGTGGGGGCG-GGGAGAGCAGGTCGCGGCTCGATCCCGGCGGCCAGGCCTCGGCCGCACGCGCGCGCC-CTGCGAGGACCC-CGCGAGCTGCCCGCGCTGCCGCCTGCGCCCTTCGAAACCGTACAGCCGCCCGTTAGGTGCCCGGGGGCAGCCGCCGTTCGAgccggccccggagcctgggcgcgccgcgggggtagcggcggcggcagcgctg-ggctcg-gcctgccggggcccgaggccgccgagcc-cgccccggcgTTTCCCAGCGGCGCC-----------------TGGCAGGGTCGCGGCGCCCGGCGCGGGGGTCCTGGCGCCGCGGAAAACGCGCCAAGTCTGCGCCGGCGGCGGCCGCGTCCAGAGCCCCCCTAGCCCGAGTCCCCGGAgccgcggacccccgcc-ccgccccgccccAGGGATGGAGCCGCGCC-GCCGGCCGCTGCCATGAGCAAGTAAGCACGCGGTGCCCTGGAGAAACTGAGGCAACGGGAGGGAGCCGGGATCATCGCTTCTCCCCTCCCCCTCCGGTTTCGCGAGGACCAGGGGGGCGGGGCGGAGAGCTTTGGGGAGACTGGTCGGGCAGAGGCAGATGGGTGCGATTGGGGCCCTCTTGTGTACACCGGGAGCAGACCCGCTGTGTGGGGGGCGGGGCCCACGTAAGGAGTCCTCCCTTGCACC--CTGGTCCCCTATGGCGCTGGCTCCCCACCCCCGCTGTACTGGGGGGGCGCGACCCGGTTGCTCTCAGGCGCGCGGGGTCGTGACGTTAGGAAGGTTGTCTTGGCAGGTGCAGCCGGTGACGGGGAAAGATGCCCGGGGTC---CTGCCCAGTGAGAGCCACGGGCTGCTGGCGGCCAGGGGGAGCCCCAAGAAGAGCCGCCTATCTCTCAAGTTCTTC 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TGTGGGTTTAGTTAAGAATATTGTCGCTGGCTATATAATTGCCTGTGCTATTTTAAATGGAAAGAATTCAGTGTTGTGTTAAAAACCAATATGCCTTTAAGTGATGGCAGTTACAGTGAAAACTT--ATTTGTAGGGAGCTGAATCCCATGTATGAAGGATATCTCCAGCATGATGCTCAGGAAGTATTGCAATGTATCTTGGGAAACATTCAGGAAACATGTCAGCTCTTAAAGAAGGAGGAACTGAAGAACATG----------CCAGGAGAGCTGGAGGAAAAGC-CTTCTCCAAGAGAAGGCAG-TGAAATTAATGCCCCAGATGATGATGGAGTGGCAAGCTCTGCAGATGGGAAGGACAAGATCTCCAAGGGGAATGGTAAAAGGAAAAGCGACAGTGAAGTGGGGAATCCCAAGAAGAAGTCTAAGCTGACCAAGGAGCAGACGTCATCTGAAGAGAACCAGAGACAGACCAGGTCCAAGAGAAAGGCCACTGGGGACACTGCTCGCTCTGAAAGTT-CTCCTGAAGCGACCCCCAAGTGTGCCACTGAAGGTGACCCTGCCCGACCGACCCAGAAGAAATCAAGACTCAAGCTAAACTGGCTAAAGCCCACGACAAAGCAGCCCAGCATCCTTTCCAAGTTCTGTAGTCTGGGGAAGATCACGACGCACTCGGGACCCAAAGGACATTCCAGAGAAGCCGACGATGGCGATCACGAAGAGGATTTCAAGTGTGAACCCAGGAGCTACTTGAAAGATGAGTCTGGGGAGCCTGCACCCCCCGGCAGGAGC---------ATGGAGGACAAAGAAACGCAGGCCTTAAGAAACAAAGGTCAGTATGGACATGGAGTTCCCTC-TGAGGGCTCAGCCCAGGCTCT a score=12139 s mm8.chr4 98424190 192 + 155029701 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s monDom4.chr2 512702565 1693 - 541556283 CCTTTGTCTCTCCCCAAGGTTTGACTGTTATGGTGGCGGCCTTTCCAAGATCAACACTCCCCTGCTGACGCCCCTGAAGCTGTCCCTCGAAGAATGGAGCACGAAGCCGACCAACGACAGCTATGGACTGTTTGCGGTCGTGATGCACAGTGGCATCACCATCAGCAGCGGCCACTACACTGCATCCGTCAAAGTCACTGACCTGCACAGCTTGGAGCTAGACACGGAACACTTCATGGTGGACCAAACGGACGAGATGGGGAAGCCCGACCCCCTGGGCGAGGAGGAAGCCAAGGCTCTGGCCGAAGACTACGACGACGAGGTAGCCTTCAGGGTCAGCGGGAGCTCCCAGGCCAGCAAAGTTCTGAACAAAAAGAACGTTGAGGCCGTCGGACTTCTCGGAGGACAGAAGAGCAAGCCGGACTATGAGTTTTATAACAGCCACAAAGCGGCGAATCCCGAGAAGGTGGTTGGGGCTGCG---GCTGAAAGCAGAAACTCCGAGTCCAGCAGCACCGC---TGGGGCCCAGGAGCTGGACAGAGACAAGGAGCCCAGCGGCCACATGGACGCTCATGCAAACGGGCCCGAAAACAAAGCCTCCTACGTGCTCCAGAGCTTGAAGGAGTATGAGGGCAAGTGGCTGCTTTTCGATGATTCTGAAGTGAAAGTGACGGAGGAAAAAGACTTTTTGAATTCTCTTTCGCCTGCGACATCTTCCACGTCCACTCCTTACTTACTGTTTTATAAGAAAATTATAGAGTGAGTGTATTTTCTTTGTGTATA-TAAACAGATTGGGATA-ATCTTATAAATAGAGGTGACAGCAAGGACTCCTTGAGGTAGCAGCAGCTCATTTGCCTTCGGAAGCTCCCGGGTTACTACTGGTCTCT---AGTTTTCATATGAGTAGCGAAATTTGAATGATTGAAAAACCCTGTTAATTTGTAGAATTCATTTTCCACGTTCACTAACCACTCTGCTGGAGACTAGCAATCTGTGTGCTTCTGAGGACAAACTTGTGTAGTTTCTTGAACAATTTGTCCAAATAGAGCTCTTTAAA-----AACACTTTTTTTAAAGAAGTTTTACAC-CTGTCTTGTATTGGCTTTTAAAAATAAAGTGC-TGTATTTGTATTTTCCATATTTGGGAATAATTCTATCTACTGCCAAAATGTTTATAGATTGTGTGGTTTTGTAATT--AGGAGGCAGCTATCTCATTGCATTTAGTTTTATGACAACGTTATGAAACAGAATCTCTGAAGGCTGTTACA----CACAGATTCTAGAACTTGCATGTTCACACCGGTGTTAATTTTGTGCCTTGAATCACTTTGGAAGGTATATCTCAGAAGGCCTAGGACAGCATCCTTGCCCATCACTATCTTAGGAAGGATTTTATATATACATATATATTTATGATTATGATTTTGTACTTTAGCAGATCAGCCTAGGTTTGGACAGAGTAGTCTGTATTTCTTCATAGTCATATTGCTATATAATTTGTAAATAGGATATAAAGATTTAGAGGTATGACCTTTAGGCTTTTTTTTTTAAGCAGGGAGGGCGATTCAATTTAAAATGCTTCTTAGCAACTATGTATACAAACGCACTAAAGTTTTGTACTTACAGCTTTCTACCCTACAGCATCTGGTTTCTTTTCAAGAACAGAATTTGTGTATATATGTG-GAATAAACATTCATAATTACCTTT a score=2298 s mm8.chr4 98428874 50 + 155029701 AGTGTAAACATTCACATATTTAAT-AGTACCTTTAAAATAAGCATTACTAC s monDom4.chr2 512705647 50 - 541556283 AGTGAAAACATCCACCAATTTAATGAGTACCTTTAACA-GAGCACGACTAC a score=3645 s mm8.chr4 98429276 50 + 155029701 TAGAGTTCCATTTTTCGAAGGCTCATTCGGCTGAAGGAATCTCTGAGGAA s monDom4.chr2 512705931 50 - 541556283 TAGAGGTCCACCTTGCGAAGGCTCATCCGGCTGAAGGAATCCCTGCGGAA a score=10606 s mm8.chr4 98432885 205 + 155029701 CTCTGTGGAGGAAGCACTTAGCATACCTGTGGCAAGTGACAGGCAACACAGCCTTGTATAGCTGAGGGATTTTTCTGTTTATCAGTGGCTGCAGAGCCTCTTTAAGGCGATGGTAATTTCTCTCCAGTTCTCTTTGATACTCCTTTTGATCTGGTCCAATTAAGCTCTTATTTTTTCGTAAGGCATCCTCACACCTAGGGGGTAA s monDom4.chr2 512707215 205 - 541556283 CCCTGCGCTGGGCCCTCCCCAGGTACCTGTGGCCGGTGCCGGGCAGCAGCGCCTTGTACAGCTGGGGGATCTTCCTGCTGATGAGCGGCTGCAGGGCCTCCTTGAGGCGGTGGTAGTTCCTCTCCAGCTCCCGCTGGTACTCCTTCTGGTCGGCCCCAATCAGGCTCTTGTTCTTCCTCAGGGCGTCCTCGCACCTACGGGACGA a score=7953 s mm8.chr4 98434604 135 + 155029701 TACCTTTTAGTAAAGTCCTTGAAACAAAGGCGCAGCTTGTTGTGATGTCTGAAGAGCTTCGGGTCACCAGGTATTTCAGACAGGAAGACCTGGGCAACCTCCAGAGGTCCCTGAAAGATAAAGGAAGCAATGAAG s monDom4.chr2 512707681 135 - 541556283 TACCTTTTCGTGAAGTCTTTGAAGCACAGGCGCAGCTTGTTGTGGTGCCTGAAGAGCTTCGGGTCGTGCGGTATTTCTGACAGGAACACCTGGGCCACTTCCAATGGGCCCTGCAAAGCCAAGAGGGCGGCTGAG a score=-629 s mm8.chr4 98434739 126 + 155029701 TACCCTTGTTCTT------------------------TAGAGTCATGGAGTTTACCCACAGAGCTACAGCACTGACAGCTGCGTGTCCCTTAGGACTCTTCAGAGAGGGTCTGCTCCAGATACTCCAGACAGCTATTTACATTCTTGCCT s monDom4.chr3 96267922 150 - 526135210 AGCCCACATTTCTACCTTGAGCCTTGCAGGCCTAGGACACAGTCACCGCCTTCTCCAGAAGCCCGGCAAAGCTCTCACCTCTTTTTCATGTGGGGCTCTCCGTCCTTGGCCTCTCACCTGTCCTCACGCCCACGCTTGGCTTTCTGGCCT a score=86 s mm8.chr4 98436652 3 + 155029701 CGG s monDom4.chr3 96268136 3 - 526135210 CGT a score=9135 s mm8.chr4 98436655 155 + 155029701 ACCTGGTTTACAGTTGTTCCTACAGACCCCTGGAGGACCATTTGAAGCATTTTGGGGTCTGCTGGATCCTGATGTGTTGCAAATGCCAATTCCTGAGTCTTTTTCTGCATGTCTTCGATAGCAACTTCAATTGGTGTTAAGATTATCTGAGTAGA s monDom4.chr2 512708172 155 - 541556283 ACCTGGTTGACTGTGGTGCCCACGGAGCCCTGCAGGACCATCTGCAGCATCTTGGGGTCGGCGGGGTCCTGGTGCGTGGCGAACGCCAGCTCCTGCGTCTTCTTCTGCATGTCCTCAATGGCCACTTCGATGGGCGTCAGGATGATCTGAGGGGA a score=17339 s mm8.chr4 98437124 274 + 155029701 TTTCCTCCCCCGTGGTGTTACCTCTTCTTTGTGAGTGACATTGACTCTTGTTTTAATGTAAGGAAAGGCATGAGACGTTGTCAGAATGGTCTTCCGTTTGAATTGTTCATGAAGCTCCCCATGAGCACGGCCATCTAAAGTGAAGGGTGTGCAGTACATGAAACGCCGGAGATTATAATTTTTGTCAAAATAAGTGATTCTGTCCTTCATCTCATAGGTGTCAAAGAAGGGCTCCACGTAGGTAATCTGAATATATGCCTGAAGAGGGAAAAGG s monDom4.chr2 512709118 271 - 541556283 TCCCACCCCCCGGCCCCTCACCTCCTCCTTGTGGATGACGTTGATCCTGGTTTTAATGTAAGGGAAGGCGTGGGACGTGGTGAGGATGTTCTTCCGCTTGAACTGCTCGTGCAGCTCCCCATGGGCTCGGCCGTCCAGGGTGAAGGGTGTGCAGTACATGAAGCGCCGCAGGTTGTAGTTTTTGTCGAAATAGGTGATTCTGTCCTTCATCTCGTACGTGTCGAAGTAGGGCTCCACGTAGGTGATCTGGATGTAGGCCT---GAGGGAAGGGG a score=6918 s mm8.chr4 98437500 130 + 155029701 ACCTTGTTTGGATCTAATTTGCACTTGTCTACAGGATTAGAGTCCTTGATTACTTCAAGCACATCCTCTCCAAATCTTTCTCCATAAAATCCCTGGAATGAAGAGGAGGAAA--TCGTTTACAGGACTTTCC s monDom4.chr2 512710517 131 - 541556283 ACCTTGTTGGGATCCAGTTTACACTTGTCCACGGGGTTCGAATCTTTGATGACTTCCACCACGTCTTCTCCAAATCTTTCTCCATAGAACCCCTAAAA-GAGGAAGAAGAAACGTCACCCGAAGGGCTCTTC a score=10513 s mm8.chr4 98438638 548 + 155029701 GCATTCACCTCCAATCTGTGAGAAATCTCTGCGAGTTTGGTTATTGCAGGCTCCTTGTAAACAAATTCCTGTTCATCCAAATCCCCGAACTTGGTTCCATAAAAACCAACACGGAAATAGGTGCCAAACATCCGCTTACCATCCTAGGTTTAGGAAAATGAGAAAATTTAATACAAAGA-CTTTTTGTTTTCTTATATTA--------------------TGCTTAGATTGATATATTATA------AAATTTCCAAAACACTGCAAAAAATTAGCTCAAAATTG-TATTTATTTT---TAAATAAGGGTAAAAACAAATAAAATGGTCTTT--------TTTCATTATT-CCTAACAAGAATTATGCAAATTACATTTCTTATCAAATGAAACAAAATGGTCTTTGTTTTTAAATCCATACAGTTGGGCTATATTAACTTATTTTCCTTATTGAACCAAAAGGTCTTAATATAAAAGTTAATTAAAACACATCACTAATACATTTTCAAGGCAACACAATCCTTCTCTTAGTCTCTTTGAGTATATTAAAAAG------AGACCATG--GACACTAAGAGCCAAGGATAGCATCT s monDom4.chr2 512711368 562 - 541556283 GCACTCACTTCCAATCTGTGGGAGATCTCAGCAAGCTTGGTTATCGCGGGCTCCTTGTACACAAACTCCTGTTCGTCCAAGTCCCCAAACTTGGTCCCATAAAAACCGACACGAAAATAGGTGCCAAACATCCGCTTGCCATCCTAGG-TCAGAAAAGGAAACCATTTCAACGCCAAGAGCAGTCTGACGTCATACGCTACATCTACCTCATAGCAAATGCGTTTCTATTCACAAAATGCATCAGGGCAATTTTTACAAAATGGAAAATTTTATACACAAAGTGGCTGGGCATTTTAAAAAAATGAAGACTGAAAAGAATACTACAGCCCACCCAAACGATTTAATGACTACACAATAAGCAGGTTTAAGGTTAGCACACAAAAGACATGACAGATGATGACC--------TAAATCCATGCAACTGA-----ATTAAGTTCTGTTCTGAGCTACAAGAAAAGGCACCTCTGGCATCAGCATTTAAAACA------------------AGGGTAACGCTGTTTTTTTC--AGTCTGTCTTAGACGATAAAAAAGCCCTGCAGACCCTGTAGACACTGAAAAGTCAAAGGAGCCTCT a score=13992 s mm8.chr4 98444206 443 + 155029701 ACAGTTTTCAGAAAAAATGAAATCACTGAAGCTGTCA--GAGTTAAACAGGAAAATATTCACAAGATAGGAACTTACCACAATAGACAATAGTAAAAGTAGGGAGTAG-GTCAGCAACCAGGGGCAAGAGAGAGAAAACAGAAAGCATTTTAATTAGGGGAATTTCAAAACATTTAAGCAGCAAATGGTAGCAAACACATTTTTAAAATGCAAGCATCCACTTAAGT--TTAAC-AAGTACAGCAAAAACCACACGTGCACCAAGTTCAGACGCTATGAAGCTGAAGACCCAGCACAGGCAGTGACAAGGATGCAAACAGGGAAGCAAGGTCTATGCAACCTCCATGCA---GCACATGA------CGGGAGGATGGTGTTAGTGTCAAAACCAGTGGAGAGGGCGTCGCCCAGGGGTCGATTTAGCATCA---AGCTGACTAGTCAAAAACTGCTCAGAG s monDom4.chr2 512718067 425 - 541556283 ATAGCTCTTTGGCAAAATGGAATTATTGGGGCTTCCACAGAGTCAAAAAGAAAAATATTCACAAAGTACAAACTTACCACAACAGACAATAGTAAAAGTGGGAAGGAGAGTCAGCAACCAGGGGCAAGAGA-AGAGAAAACAAAGTATTTTAATTAGGGAAATTTCAAAACAAATAAGCAGCAAACAGAGG----------TTTAAAATGCAAGCATCCATTAAAGTACTCATCAAAGGAAAGCAGAAAACAAACATGCAACCA---CAG-CTCGAGGTCCCCAGAGGCCGAGCAGAGG--GCGGTCAGGACA-GGACAGAGGAATCCGGTGT-------CTCCATGCACTTGCACACGATGACAGTGGGAGGAAGGCTCTAG--------CTAACGGAG-GGACCAGGTCCAGGGGTCGATTTAGCCCCGGCCAGCTGGCCG--CAGTGGGGGCTCAGAG a score=5413 s mm8.chr4 98445627 296 + 155029701 AGTGCTAACACAGTGGCTCATTTACCAAAGAATCTCATTAGTGAAACGGTTTC--CATGCACTGCCT--AGGACCTCCATATCAGACAGCTCTTAAAATAACTTACAGTAGTTTAACAACATTTCTTTGGTTAATGAATTCAGTTGATAAGCAGACAGCAACAGAATGCCCACAGCTAGCACATGTGGGCAAAGCATTGGCATAAGAAATCTGGTCAAGTCCATCTATTAGTGTCTTTAACTAACTAAAGCATTACCTACCTCCCAGCCAGTGCTCTGTGTAATAAAAAGTAAAAAAAGG s monDom4.chr2 512718966 236 - 541556283 AGTGAGGACAC---GGCTCATTCACCGGGG--TCTCATTAGTGACATCTCTTCTCCATGCACGGCCTCCACCGCCCTCCCGTCAGTGTCGGCACGCAATGACT-------------------------GGTTAATGAAT----------------------------GCACACAGCGAGCACGTGTGG-CCAAGCACGGGCACGAGGACCCCGATGGGGACGGGC----AGCGTCTTTACCTC-CCAAGATGGTACCTACCTCCCAGCCCGTGCTCTGTGTGACAAAAAGCAGAAAAGGG a score=9787 s mm8.chr4 98447325 146 + 155029701 GCTGTTACCTGATGGACGATTTTGCTGAATGCCTCCTGAAGTTTGCCATGAATTGTGGAGAGCTTCTTTGCATCCCGATTAGCTTCATGAATAGGAATGAGTACTTTGTAAACCTCATTAACTGCTTCGTACATGCCCGCCTACAA s monDom4.chr2 512719716 146 - 541556283 GCCCTTACCTGGTGCACGATCTTGCTGAAGGCCTCCTGCAGTTTACCGTGAATGATGGACAGCTTCTTGGCGTCCCGATTGGCCTCGTGGATGGGGATGAGCACCTTGTAGACCTCGTTGACCGCCTCGTACATGCCCGCCTGCAA a score=9489 s mm8.chr4 98450004 226 + 155029701 GAAAGGCAGAAACACTGACATATGTGTCACTTATGGACCTGGAAACTGTGGGACAGAGCGAACAAA----GTCACTTACCATGGAGAAGGAAGCAGCCGCTTGTTCCAGTAAGCCCACCAGTCCCGATTCAGTGAAGTACTTTCCAGAGCAAATGCCTTCTTCATCTGGAGATACCACATCATCTGAGACAGCAGATTCTTCCAATACATTAGATGAAATATTCTAGGGA s monDom4.chr2 512720020 224 - 541556283 GCAGAGCAGAGGCGTCAGTGTGTGCG---CATGTGGG---GGGGACAGGGGGGCGGCGAGGCCCGGCCCTGGCGCCTACCATGGAGAAGGAGGCAGCCGCCTGCTCCAGCAGCCCCACCAGCCCGGCCTCCGTGAAGTACTTTCCCGAGCAGATGCCCTCCTCGTCCGGAGACACCACGTCGTCCGACACGGCCGACTCCTCCAGGACGTTGGACGAGATGTTCTGTGGA a score=13995 s mm8.chr4 98450954 275 + 155029701 GCCTTACTTCCTGCTTCCAAAGGACACAGCAGATCCCTACCTGGAATGTTACGCATCCAACAGGAAGATACTTCCGATCTTCCAGCATGCTCAGATACTCGGCGACAAGGGCTGCGGAGTGGACCAGGCACTGAGCAGCTTCGGCATGATTGCTTCGTTCAGAGTGCTTGCCAGCCATGTTCTGCAACCAGGTCAGGCGCAGGTCTGGAGACGTCTGGTAGCCCTTGGCGATTCTAATCACAACAGAAGTGATTATTAGTGCCACTAGCATCCCG s monDom4.chr2 512720560 263 - 541556283 GCCCTCCCCCCTCCCCCCACGGGGA-----------CCACCTGGAAGGTCACGCAGCCCACGGGCAGGTACTTCCGGTCCTCCAGCATGCTCAGGTACTCGGCCACCAGGGCGGCCGAGTGGACCAGGCACTGGGCGGCCTCGGCATGGTTGTTCCTCTCCGAGTGCTTGCCGGCCATGTTCTGCAGCCAGGTCAGCCGCAGGTCCGGGGACGTCTGGTAGCCTTTGGCGATCCT-GCGGGGACACGAGCGCTCCCGTGAGCTCCGGGCCTCCCG a score=7483 s mm8.chr4 98453350 117 + 155029701 CTACCTGTACATGAGATCAATCAGCATTTCTGGGTCTTCCTGATGCTCCTTCATCTTAACAGTGTCAGAAAGGATCATATGGAGATTGAAGACCAAATCTTGGACCTGCAGT-AGAGA s monDom4.chr2 512720852 118 - 541556283 CTACCTGTACATGAGGTCGATGAGCATCTCGGGGTCCTCCTGGTGCTCCTTCATCTTCACGGTGTCCGACAGGATCATGTGCAGGTTGAAGACGAGATCCTGCACCTGCGGCGAGAGA a score=9480 s mm8.chr4 98454211 171 + 155029701 TTCTCACCTGATCAGGAAATGTGGTTTCCCTCAATTCTAGATCTTCTTCAGCATATGTCAAAATAGTTTTTAGAGAGCGTCTTAAGAATTCTTCATTAAAATTCTGAGACGTACCCACCAAAGAGGACAGTGACATCGTCACTTGCATTTTCACTCTGGCAAAGTTCTGTG s monDom4.chr2 512721025 171 - 541556283 TCCTCACCTGGTCTGGGAACGTGGTCTCCCGCAGCTCCAGGTCCTCCTCGGCGTAGGTCAGGATGGTCTTGAGGGAGCGCCGCAGAGACTCCTCGTTAAAGCTCTGTGATGTGCCCACCAGCGACGACAGGGACATGGTCACCTGCATCTTCACGCGGGCGAAGTTCTGTG a score=10852 s mm8.chr4 98458303 183 + 155029701 ACTTACATTCCCGATCTCAAAGTTCTGCCTCATGAGGAGGTAAAGGGAGGCACTAGCGTGCGACCGGATTGTACTGATGCTGCTACTGCAATGACGGAGAAGCCGGAGGCACAGATCCGCACACTGCTCTGTCTCTTCCTCAAACAAGAGCTCAGGAAACTGTAA--AAACCAGAAAGATGTATG s monDom4.chr2 512721480 185 - 541556283 ACTCACGTTCCCAATCTCAAAGTTCTGGCGCATGAGGAGGTAGAGGGAGGCGCTGGCGTGGGAGCGGATGGAGCTGACGCCGCTGCTGCAGTGGCGCAGGAGGCGCAGGCACAGGTCCGCACACTGCTCTGTCTCCTCCTCAAAGAGCAGCTCTGGGAACTGCAAGGAGACAGGACGGAGGTGGG a score=1413 s mm8.chr4 98458542 106 + 155029701 TGAGAGACAACATTAGTTAAggtcaacag-tactgaacacagcc---agacagg------tgggctgaaatactggccatgtcacttcttaggcggcagtgtgaccctgggcaagt s monDom4.chr2 512721739 109 - 541556283 TGAgaggcagc-tgggt--ggctcagtagatggagagcagggtctggagatgggaggtcttgggttcaaatgtggcctcaggcactt----gccagctgggtgaccctgggcaagt a score=-1143 s mm8.chr4 98459024 206 + 155029701 GCCTGCATTCAGCTACTGAGTTCAG-----GTTCTTCTCAAAACCAAATGATTTTAGACAGGAAGCTGATTATCAATAAATCAGGTCAAGACACGTTCTGAAGACAGAGTCAGAGGCCCAAGGTTCATAACAAATTGACCAGGGAGTGTGGTAAATGACCTT-----GGACA--GTGCTAAAGAAGAAAGTGAAGCCACATATGAAGACCTCAGGTAA s monDom4.chr3 96273133 187 - 526135210 GTCCGCTCCCTGCTACTGACCTCAGTCTGGGCTCTTCCCAGCAC-------------ACATGAAG-----------TGCGGAGGGCCTCCCCACATTCTGG---CAGAGTCCAGGGAGAAGGGCTGGGCACGGGGCT-CTGGGGAG---GCTCTATGCCCTTCCTGGGGACATGGGGACATTCAACTGGGGGATGGGACATCTGTGGCACCTGCCCGG a score=8428 s mm8.chr4 98459230 171 + 155029701 ACTCACTCACCTTTGAGACCAGGGCTCTCTGCGTGGCGAAGCAGTGCTGCAGATAGACTGCACTTTGGTTGCAGGCCATGCTCTGTAGCAGCACTTTTAGCACACCACCCAGGATACTCTCTTTGGATTCCGTTACAGACACAGTCTGCAATTTAAGGATAAAATGTAAGA s monDom4.chr2 512722077 170 - 541556283 ACGTGCCCACCTTGGAGACGAGGGCGCGCTGCGTGGCAAAGCAGTGCTGCAGGTAGAGGGCGCTCTGGTGGCACGCCATGCTGTGCAGGAGCACCTTGAGCACCCCCCCAAGGATGCTTTCTTTGGACTCGGCCAGGGAGACAGTCTGAAAGAGAAACA-AGAGTGGAAGA a score=268 s mm8.chr4 98459401 154 + 155029701 CAGCATGTGTCTATAATGTGGCTAGCTAGGTAAATTATGTGTGAAAACACAAACATTTACAAGACAGGAAAATGGTAAAAACTAGAAGGACTTCAAGAGAAGACACCACACAGTGTTTGGATGGAAGGGAAAAAGGAGTGAAAAGCCAGAGAGA s monDom4.chr3 96273494 115 - 526135210 aagcatggactga-----gggcagggtgggt---ttatgaatggagagac--------------tgggcagagggtggatagatgaagga-------ggaag----------ttgtatggatgagagggaaggtgagatggagggatgagggga a score=7723 s mm8.chr4 98461595 211 + 155029701 TTCCCAATCTTGGCCTGCTGAATCTGTAGTTAAGCTTCCTGCACG-TCTTTACCTGGACGATGATCTCTAGCGTGTCTAAGATGATGAGGTTTGCTTCAGTAGCCAGGTTTCCATCAATCAGTGCTTCGTGTTCTATCTCTGCTCTTGACCT--GATGCAAAATATTGTAAGAAATTTTAGTTATCTTTCCAAAAGGCCAGAAATTAAAAAACA s monDom4.chr2 512722285 204 - 541556283 TTCCCCAGCGTCACGCGCAGATCCTCTCCT---GCTTCCTTCCCAAGGCTTACCTGGACGATGATCTCGAGCGTGTCCAAGATGATCAGGTTGGCCTCAGTGGCGAGGTTTCCATCGATCAGTGCTTCGTGTTCAATCTCTGCCCTGGACCTAGGAAACAAAGCATTCAAGATAATTATG-------TCCAAGGGGGCCTGAGAGGAgccaaca a score=-1438 s mm8.chr4 98464778 359 + 155029701 ctcttgcctctgcacgagcattaactgttgagtcacgggccagcccTCTTCTGAAATGTACTCTGATCACGTTTACCACTCTTTCCCCAGCTTCCTTCC-------TACTTACCCCACTCAATGCTTTCTCTCCTCTATAACCCATGGAGTTCAATTTGTTTCACTCAAATACTCTTGGATGTAGAGCTGCTAAGGGGCATGGTCAACACACATCCGTAACCCTGGCAACAGCTCTTATGCTAGGGGTGAAATTTCTTGATTCAGTTATACTCAGAGTTTCTGCAAAGCCACAGTGGACTTGCAACAGTGGTGACTACAGTCGCAGCTCTTGGAAGTGATGCAGCCCTAGCCAAGAGGAGAAAATG s monDom4.chr3 96274235 305 - 526135210 CTATTGTCTCTTGACGGTCTCCACCCCT----------GCCAGCCCGATCCTT---TGTGTCCCACCCACTTGT-CCACTCTGTCTGAAGTCTGCTTCCAGTGTGTGACGTTCTTCCTCCATCTCACATTCTCCTGGTTCCCGAATGGGCTCCTCTCTAAGACACAGAAGTACACACAGTCACAGAG-------------TCATCAGAGAACCTCCCTACCCGAGCCAAC----CCTGCG---GGAGTAGAGCTCATTG-----GGCAGAGGAGGATGTCCTGCAGA------------------CACTGGAAGCTGCTGGGGCAG----TAGGAGAGAGGTCTGGCTGGCCCAGGGAGCCGGGAA a score=19489 s mm8.chr4 98465137 432 + 155029701 TACCTACCGAGCTGCCCTCGGCTCCGCCGTACCATTTCCTGCCTGGCACCGATGCTCCCCAGAATGGCTTCTTCAAGCTTGGCTCTCATGTCTTTTGATTTCTTAAAAGTTAAACTATTCATTCGTTCAAATACCTTTTTTCCCTAAAA-TGGAAACA--TCAGAAGAGACACTGAGGACA-CTTCCTTCTTCCTTTCTGTGTTATTTTACTTTCTTATAAGTTTCAATGGTATAATGGCTACTTACTTTGTACTCAAAGCAAGATACACACAGGTAAAGCAGATCTAACAACCGGTTCAGCTGGAGGACTGAGAGATCTGTAAACCATTTCTGCAGAACCGTTTCATCTGCATTCTTGAGAACCCAAAGCAGACAGATCAAAAGGCTCCTGCTTGACTCTGCTGAGAAGGTGGTGTGCTGCCGGCCACTCTGAAA s monDom4.chr2 512732158 406 - 541556283 TACCTACCGAGCTGGCCCCGGCTGCGCCGCACCATCTCTTGCCGGGCCCCGATGCTGCCCAGGATGGCCTCTTCCAGCTTGGCCCTCATGTCTTTGGACTTCTTAAAGGTCAGGCTGTTCATCCTCTCAAAGACCTTCTTCCCCTGAGAGCGGAAACACGTCAgggcggccgcccggacgagcccccgccctccccgccgcg------------------------------gccgggccgccccACCTTGTACTCGAAGCAGGACACGCAGAGGTAGAGCAGGTCGAGCAGCCGGTTGAGCTGCAGCACGGACAGGTCGGTGAACCACTTCTGCAGGACCGTCTCGTCGGCGTTCTTGAGGACCCACAGCAGACAGATGAGGAGGCTGCGGCTGGACTCGGCCGAGAACACGGAGTGCTGGCGGCCACTCTGCAA a score=7077 s mm8.chr4 98467718 449 + 155029701 CACCTCGAGGAGACTGCACACGG---CAGTCTGG---GAAAGCTAATGTTTTCACA-------GAGCTCAGCATGCCTCT------GCGCCAGTTAACACACCAGCCTCAGCAGTGGACCTCTTTCTAGATACCTGGTAGTCTAGAAAAATAAAACTAAACCCCCAACTTTTTATAAGAGGCTCATGTTACCGTTGACGTGAGGAGAAAACTGCCAGGTCTTGTCAGCTGAGGGACGGATGTTCCTGCAATTGCCATGGCAACCGTCTGGCTTATCATGCTCCCACTCTCACTGTCATAGTCATCAGGGGCTATACAAATTGGCCTTCCTCGTTGATTGTGTGATTCTGAAAGGGAAAAAGGATGAAGACTTTCGGTTGGCTAACAGTTATAAAGCATGCACCCCGTCCCTGTTCTCTAGGACTCTTTAAGAGAGACCCATCAACTTACACACAcagctgactcctgg s monDom4.chr2 512733341 431 - 541556283 CGCCTCGAAGCTGCCTCAGAAGGGACCCGTCTAACCAGGGAGCCAACCTACACACATCTTCTGAAGCTCAACA-GTTTCCAGGGCGGCCCCGGCCACCCCCCGAGCAGGGGCTGTGCCGCTCCTTCACGG-ATCTGGCTTTCCAGAAAAAAAGA------TCAGTGACGTTTTAA-------------TACCGATGAAGCGAGCAGAAAGCTGCTGGGCCTGGCGAGCTGGGGGACCGGCGTGCCCGCTATGGCCATGGCCACCGTCTGGCTGATCATATTCCCTCCTTCGCTCTCATACTCCTCCATCGCCACACAGCTCGGCCGCCCCCGCTGATTGTGAGTTTCTGGAAAGAGCCCAAAACAGCGATCCT-----------CAGCCCAAGGGCGTTCTCCGCGGCCTTCCTTCCT-----TCTCGGCGAGCCTCCCCTCAAGCCACTGAAGAAGAGGGCTGTCGG a score=14622 s mm8.chr4 98469878 255 + 155029701 TACCTGTAAAATCATACAGTTGAGGTACAGTTTCCATGATAATACCAATAAGAGGTAGGTACAACATAGCCACCCGAGCTTTTATCTGAGGGTCAGAGTACCGTGGGTCAGAGTCGTGAGTGGACAGTAAGTTGTGTACCATATTGATGACTTTCTTATGCAATCCAAACAGTCTATTTAAGAAGGAGAGACAAAGAAGAAGCAATGAGTCACAGAAATTAG-TAATATCGTCAAAACAAATA------GTAAGAGAAGGCA s monDom4.chr2 512734542 244 - 541556283 TACCTGTGAAATCGTACAGCTGGGGCACAGTCTCCATGATGATGCCGATCAAAGGTAGATACAGCATGGCCACGCGGGCCTTTACCTGGGGGTCAGAGTACCGCGGGTCTGAGTCATGGCTGGACAGTAAATTGTGTACCATGTTGATGACCTTCTTATGCAATCCAAACAAACTATTAAAGAAAGGGAG------------------GTCACAGAGATTAGTTAACATCTTTAAAACAAACAAGCTTTACAAGAAAAGGAA a score=10629 s mm8.chr4 98476677 191 + 155029701 ACTTCTCCAGTGTGAAACAGGCATACTCACCCTTCAGCGTCAGGGTCTAGAATGAGTGCAAGCTCAGTCAGCACGAGGCCTGCCAGGTAATGCTGCTGGCGGAAGGGTAAGGACAATTCGAACATGTTTGCAATCTTCTGGTCCTGCACACTGGTGGAGAATCCAGAGCTCTGTTGGGGGTAAGAACTCAA s monDom4.chr2 512742335 186 - 541556283 ACCTTTTCTGCCAGGCAAAGGCTGACTTACCCATCTGCATCAGGGTCTAAAATGATGGCCAGTTCAGTCAATACAAGTCCTGCCAAGTAATGCTGCTGGCGGAAGGGCAAAGACAACTCAAACATGTTTGCTGTCTTCTGGTCTTGTACATTTGTAGAAAATCCAGAGCTCTGT-----GGAAAAACCCAA a score=11458 s mm8.chr4 98479334 187 + 155029701 TGCATACCTGAGATGTTGCAGAAGAAACAGAAGGTGATGGAGATGCAGGCGGGGTGAGCAAGCTGCAGGGTAAGTTTAATGTAACATAGTGCTCATGGCTGCAGATGATTCGCAAAAAGTCCAACCTCAGGGACACCAGGACACTTGGATTTGGCAGTGAATACAGCTTTGCTGATACCTTGGAAGC s monDom4.chr2 512745970 187 - 541556283 TGCTTGCCTGAGACGTTGCAGAAGACACAGAAGGGGATGGTGAGGCTGGTGGCGTGAGCAAGCTGCAGGGCAGGTTCAGGGTGACGTAATGCTCGTGGCTGCAGATGACCCTCAGGAAGTCCAACCTCAAGGACACCAGGAGGCTCGGGTTGGCCAGCGAGTACAGCTTCGAGGATACCTGCAGAGC a score=15826 s mm8.chr4 98481016 377 + 155029701 TTACCTGTTTGTAGCAGGACTTTATGAGGCTAAAAACAAACCCCCTGTCCATAACTGACAGCAGGTCATTGAGAAAGAAGGCAAGGCTTGTGTTGAGTCTCTCAACCATTTCTGTATCCTAGGAGACAGAATAAGCAATGATAATGATGATGGTGATGAAAAAGGTAC----------AGCGGTTGACTCTCAG------CCTGTAAGAGACATCTGTGGGAAGTCATCATCACCTTCTGAAACCGCGACACGACATCGCCAGCAATTGTGCTAACCAGGGCAGCAATATCATCCATAAAACGTTCTGGAAAGCGACTTTTCCTCGGAGCGTCGAGCTTATCATTAAAGTACAAGTGGTGCACCATGCTCTTTACCTGTAAAAGGATACACAC s monDom4.chr2 512746232 373 - 541556283 TCACCTGTTTGTAGCAGGCCTTGATGAGGCTGAACACGAATCCGCGGTCCATGATGGACAGCAGATCGTTGAGGAAGAAGGCGAGGCTCATGTTGAGTCTTTCCACCATTTCTGCGTCCTGGAGGGCAGGAGATGGAAAG------------GGGGTCAAAGAGGAACTCGGCCGCAGGCCGGCTCACCCCGAGAGGTGGCCCGTCGCAGAAGCCCGGCGG-------CCTCACCTTCTGGAAGCGGGAAACGATGTCGCTGGCGATGGTGCTGACGAGGGCCGTGATGTCGTCCATGAAGCGTTCGGGGAAGCGGCTCTTCCTGGGGGCGTCCAGCTTCTCGGTGAAATACAAATGGTGTGCCATGCTTTTCACCTG-AGGAGAAGGCGCAC a score=11104 s mm8.chr4 98483358 434 + 155029701 GAGAACACGTTCAGTTTGCTTACCATCAACTCAAAAAAGAACCAGGCTTGCTGCAAAGCCGACTCCCGAACGCTGCCACTGCAAACGACCCACTGCAAAGCCAGCTCCTCGTGAAAAAGCTATCCAGAGAGAAATCACCATTACTACCAAGCCAGCCCTGCTGATGACACAAACC--------AAATGACAACACAGGGACAAATGAAG------GCGCAATGGGACGAAGCTCAACAGGGCACACGAACA--CTGGATGATGTCATGGACACACCCATTAACGAAACGACTATTTATGCATGAAC-ACAGTGTGGTATGTTCAAAGCTGAAAA-ATTACATGTTATCTTGGAGTAAAATGTAATTTTAAAAGGACAGGCAGGAAACAACTTCCTAAATTGCACTTGCAAATGAAAAACTAAATCAAAACCTCACAACTACAAATTCGATTT s monDom4.chr2 512747528 436 - 541556283 GACCACACACGTCGCCCGCTCACCATCAGCTCAAAGAAGAACCAGGCCTGCTGCAGAGCTGCTTCTCGGACGCTGCCGCTACAGACGACCCACTGCAGAGCGAGCTCCTCGTGGAAAAGCTACCCGGAGGAAAGGCAGAGTTAGTAGAGCGCC--CCCGCCTGGTCAGACAGAGCTCAGGGGGCGATGCCAACACCATGACGAAAGAAACGAGGAAAACAAGGAAAAGAAGCGGGAGGAGGGGCGGGGCCAATCTGGGCGATGCAGGGATGACGTCCATTAACGAAACGACTGGGTCACCATGTACGACAATGGGGT--GCTGGCGGCTGGCCACAGTACATGGTGT-TTGGATTCAATCGGAACCGTACAAGGCCAGAAGGGAAAGAGCCTT-TCGACTGTGCCTGCAAAC-AGAAACCAGAGC---------TAGCAACAGATCCGAGCC a score=8133 s mm8.chr4 98483828 270 + 155029701 ATCAAGTTTGCTGGTACAATTTAGGAAATACCATTACAAATTTAAACTTT--TCTATATGCTACTAAGTTCCAAGTGTTTAAGATGTATTTTTAAAAAG------CAGAAACTTTCTGA--TAATGGATATGTATACAAAGCA-CTTGCAAAGTAGCACAGATTGCTAT------GAAAGGCCTGACAGGGCTGTGCACAAG---AGCAAGTCAGCATCGCTTACTAAGAGTGATAACTTTTCTAACTCATCTTCCTTTCCCTGGAGATTTAAA-ACAAAACAGAAGTAGT s monDom4.chr2 512747992 283 - 541556283 ACAGACTTTGCAGGCACAGTCCAAGGAGCACCTGTGACAATCTGGCCTTTCTTCTTCATGCGATCAGGAGCAGAA--------GTTCATTGTTACAAAATTCCTTCCGCATTCTTATAACATAGTGGATATGCATGTCAAGCAATTTGCAAATTAGCGCCCACTACTTCATATGAGAAAGGACCAACGAAACTGAGCACGAGGGAAGCACGGTGACATGGCTTACTAAGGGTGATAATTTTTCTAACTCATCTTCCTTTCCCTGGAGATTTAAGCACAAAACAGAAGCAGT a score=10533 s mm8.chr4 98484228 600 + 155029701 CAGTGGCATGGCCCAGAGGCTCC-AGACCAG---CACTGTTTGTTCAAATGTAGTTTTAGACACAACAAAATTATTTAAGTATCTCACA-CTGGTTGTATGAGGAAACTCTAAGTTTTTAAATGTTGGAATTACTTTCCCCCTC----------TGTCTTCTTATGAATCTACCTTTTTAGTTGGTAAGCGTCCCGTTAATGTTTGTAAGAAACTTGACGTCTCTGTGTGCGAAGACATACGATTACAACTTCGATCCATAGCCTATGG-GTGAAGGTGAACGAATGGCGAGAGAACATTAACACTGCTGTGGGGCT-------CGAGTCACGGGCTACGCTCAGTTTCAAACATTT----------------------------------AGGCTATTTCT-------GATTGCATTGCGTTATTTTAAGCTGCATTAAAAGCA-----------GTATGGAAACTGCttctttttttttttttttttt---ttAAAGGATTAACTA-----------CCTTAGTGATTATGATACAGAGAGTGCTGCAAAGAATGAAACTTAC----CTGTGTAATCTATACATGCACATATCTAGC----------AAAAACATATAAAAAGCAAAAACATACTTCTCAACTGCTGTCTGATAAAAAAATAGAAATCAAGAATTTTGTACTCAATAAGGGAAATGAAAAC s monDom4.chr2 512748386 652 - 541556283 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TACCTTACTGCCAATGATTGACCGAACTTCATCATCTGGTGATGTGGGAGTCCCAGATATATCTGGGTTACTGTTGCTAAGGCTTCGAGACCGATTTAAGTTAAGGCTCGCAGGTCTCACTGCAGACCTAGCCATTGTGGCATAATGCACTGATCCTCCCAAACCCCCGGGACCT--AGAGTTGCAATAAAGAGCACATAATTAGTAAGAGAGGACCCCTAAAA s monDom4.chr2 512752256 218 - 541556283 TACCTTGCTGCCGATGATGGAGCGAACCTCGTCATCGGGAGACGTGGGCGTCCCGGAGATGTCCGGGTTGCTGTTGCTGAGGCTCCGCGAGCGGTTCAGGTGGAGGCTGGCGGGCCTCACGGCCGAGCGAGCCATCGTGGCGTAGTGCACGGACCCCCCCAGGCCTCCGGGTCCTTCGGGATCGCAGAAATGGAAAC------AAGCAGAAAGGCCCGCTGAAA a score=8957 s mm8.chr4 98495766 185 + 155029701 TACCTGGTGACGGTGAATTAGGGTAAGTATTTGGCAGGCGGAACACATAATAGATATACGATGCGAGAAGGTTGTTTCTGCCATGCTGGTCATGATTTCCTTCTAAGTTTTTGTGAAGTCGATTTATAATTGACGCCATAGCTTCAAAAGATGCTTGCCCTAGATTAACTTTTCAAAAAGAGGAA s monDom4.chr2 512753218 183 - 541556283 TACCTGGCGAGGGCGAGCTGGGGTACGTGTTGGGCAGCCGGAACACGTAATAGATGTAGGAGGTCAGGAGGCTGTTGCGGCCGTGCTGGTCCTGACTGCCCTCCAGGCTCCGGTGCAGCCGGTTCACGATGGACGCCATGGCCTCGAAGGACGCCTGGCCCAGGTTCAC--TTCGAAGACAAGAA a score=13358 s mm8.chr4 98499945 247 + 155029701 TTACCTATTTGGCCAGCAATCACAGGTGGTCTAACAACTAAAAGTATGAGTTTATCAAGCAGAAGATGAAGAAACCGGACTACGGGTTCCAGCTGTGAGGAATTCAAGGCTGAAATGCTGCTCTTCAGTTCACTCTCTAAGTTGTTTTCCATGATCCGCATGTCCCCAATTCGGACCGGGAACATGTGTTCATCCAGAGCATTGACAAGAGCAAAGAATTTGTCTAGATAAGGGTCCTAAAACAAAG s monDom4.chr2 512753852 247 - 541556283 TCACCTATCTGGCCGGCGATGACCGGCGGGCGCACGACGAGCAGGATCAGCTTGTCGAGCAGCAGGTGGAGGAAGCGCACCACGGGCTCGAGCTGCGACGAGCTCAGGGCGGAGATGCTGCTCTTGAGCTCGCTCTCCAGGTTGTTCTCCATGATCCTCATGTCGCCGATGCGCACGGGGAACATGTGCTCGTCCAGCGCGTTGACCAGGGCGAAGAACTTGTCCAGGAAGGGGTCCTAGGAGACAG a score=5623 s mm8.chr4 98501265 98 + 155029701 CTCACTTGTGTATGAATGGATGAAACAGCAACAACTTCAACATTAAATACTCCTTTGTGGTTGTCCACCCACTTCATACCAGGTAGAGGGACCTGAAA s monDom4.chr2 512754792 98 - 541556283 CTTACCTGCGTGTGAATGGAGGACACGGCCACCACCTCCACGTTAAAGACGCCCTTGTGGTTATCGACCCACTTCATTCCGGGGAGAGGCACCTGGAA a score=8157 s mm8.chr4 98507667 171 + 155029701 TTTTCATTCAGCCTAGAGAGTTAAAACTTGCTGGAAGGCACTGACCTCGGGGGAAAGCACTGAATAAGCCTGCGGTGGTTTTTCCAGGGAGACTGGCAGGCAGAACTGCCCTGTCTTCAACCGTCCATTCTGCAGCATTGGTATCCACTTTAAATAAAAAAGACACGTGTC s monDom4.chr2 512756210 166 - 541556283 TTGTCACCCGCTCTAGAATGT-----CGCCGTGAGAGCTACTGACCTCAGGAGAGAGCACCGAATAGGCCTGGGGCGGCTTTTCCAGGGAGACGGGCAAGCAAAACTGACCAGTCTTCAAGCGTCCGTTCTGAAGCATGGGGATCCACTTTAAAGAAGAGGAAAGGGCATC a score=9831 s mm8.chr4 98508636 162 + 155029701 AGACTTACTGTATATCCGACTGGGGTTTCGAGAGGAGTGTTTTGTTTCTGCTGGCAACTAACATGATAAAAAGTAAAGAGCAAGTGGTGGTGGTCAGTTAGCGTGGCGGGGAGCTTGACTTTGATTTCCTCGTGAAAATCAGGAGACCTTCATACAAAGAAA s monDom4.chr2 512756610 162 - 541556283 AGGCTTACCGTGTAGCCCACGGGAGTCTCCAGCGGAGTGTTCTGTTTCTGCTGACAGCTAACGTGATAGAAGGTAAAAAGCAGGTGGTGGTGGTCGGTCAGGGTGGCAGGAAGCTTCACTTTGATTTCTTCATGGAAATCTGGCGATCTGGACAGAAAGCAA a score=7757 s mm8.chr4 98511935 195 + 155029701 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ACAGAAAACTTTGACACAAAGAAGAATGAATTAACAAGACAGGGCTTTATGGACTTGCATCTGATGGAAGCAAATGACCGAGAAGGAGACCCTCTTGACCTGTGGGTGACTCTGCATTCCATGGGCTATAATAAGGCTCTGGAGCTGACAGAGGTAAGATGCTC--AAACGCTGACAGTAACCTTGGTTTCCATGGTATTTGCTCTT s monDom4.chr2 513731280 207 - 541556283 ACAGAGAATTTTGATACAAAGAAGAATGAACTAACCAGACAGGGATTTATGGATCTCAATCTGATGGAAGCCAGTGATCGCGATGGAGATCCCAGTGACCTCTGGGTAACTCTGCACTCGATGGGTTACAATAAAGCCCTGGAAATGGTCGAGGTAAAAAGCACTGAAGCTTTGCCTGTATCTTTAGTTTACGTCCTTCTGTCTTTT a score=9265 s mm8.chr4 99407496 256 + 155029701 TGTTTCCCTCATCAGGCATGCCCATTTGTCATCAACATCTACGCTGAAAGATGCAAGCCAAGAATCAAAGTTGTCCATATGGAGGCATGCAGTGGGCAACTTGAAAAGGCCATTTGCAAATCTGTCCTTGATAGAAGCGATGCTAAAGTCATGGATGGCTATGAAAATATAATCGTACATACTTGCAATTATGACACATGGATAACATCAATTATTGAAAATAAGGTATTA---Aagctttg---cgtcgtggcagtattat s monDom4.chr2 513732872 262 - 541556283 TGGTTCTCCCCACAGGCGTGCCCATTCGTCATCGACGTCTACGCCGATAAGTGCCGGCCCAAAATTAAGGCTCTCCAGATGGAGTCCAACAACGGCCAGCTGGACAAGATCATCTGCAAGTCTGTCATGAGCAAAGGCAGCAGCAAAGCGATCGACAGCCACGAGAATGTCTTCCTCCACACCTACAAGAGCGATTTCCGGGTCACGTCAGTTCTGGACAATAAGGTATTAGTTAGGCCTTGGCTCTCCGTAGCGGTGTTCT a score=9024 s mm8.chr4 99408771 211 + 155029701 TTCTAGAAACAGTTGCTTGGGTCTTAT-TCTCAGGTGTATATCTGTGTTTATTTTTCAAAA-------CTAAAGACTTTTAATTTTCTACAGTCAGATAATAAAGTGATTATTCACATCAATAACGAACTGAGTAAAAACTGTGTCAACAACAGAGGACTCAACATCTTTGCAGTAGAAGTGGCACCAAGATCTACAATGGTAAATGTTACTCTCTTCT s monDom4.chr2 513737301 219 - 541556283 TGCTGGGACTAGGCTGTGGGGCCCCAGATTTCATGGTCGTCCCCGAGTTTATGACTTACAAGTACGGACTAAAAATGTTATTTTTTTTATAGTCAGAAAACAAAGTGATTATTCATGTCAACAACGAACTGAGTAAAAACTGTGTCAACAATCGAAGTCTCAACATCTTTGCTGTGGAAGTGGCTCCCAAGTCGACCATGGTAATTGCTGCTCCTTTCT a score=12625 s mm8.chr4 99427362 1006 + 155029701 AGCCGGACTTTGGCGAAGTGGGCGGGCCGTGGGCAGGCCCTGGGCCATCGTTTCCAGGGCAAGAGCAGAGCGGACCCTGAGCCCTCTGCAGCAGCCAGAGCCGCAGCCACTGTCGCCTCGCAGCCAACCGCCACCATGGTGAAGATCGTGACA-GTGAAGACGCAGGCATATCCGGA-TCAGAAGCCGGGCACCAGCGGATTGCGGAAGCGAGTGAAGGTTTTCCAGAGCAACGCCAACTATGCGGAGAATTTCATCCAGAGCATCGTCTCTACCGTGGAGCCGGCGCTGAGGCAGGAGGCCACGCTGGTTGTGGGCGGGGACGG-CCGCTTCTACATGACCGAGGCCATCCAGCTCATCGTACGCATCGCTGCAGCCAACGGGGTAAG------GGACGCGCGGG------CCGGGCTGAG---CGTGTGCTACGTGCGGGCTTCTCTGG-GCCGGCGCTTCCGTGCGCGCCACCATCCCGTCCCCGCCCCGCGCACGCTCCCTTGACCTTGGCAGTACCCCCGCCCCC--------ACACCCCTATTCGGCTTCCCGTCCACCCCATCCCCCCACACCCCACGTTTCGCAATGGCTATGCCGGGGA-----AAGGTGAGCCCGCCGTGCAGACCCTGCGTGGCGCTGTGCTATTCTGGTCTGGGATTGGGGCACCTCCCGCTGACTCGAGGCCAGGTGTTGGGAGGGCCGGGGTGACCGGAGCACTCATCCCCCTGGGGCGTTAAGCCAGCGATCTGGGCCCGCAGGTGCCAAGCCTCTCTCCCTGCCCTCTGGTTGGCTTGGGAAAGGCGCTTCCTCCCCTGCCGGGCCTGCTGCCTGGGTTCAGGCTTTTGAAAAGTCCAGTCTCT---GCTGGACCTGTTCCACCAAGGGGGCTGGACCTGAATTTTCATTAAAGCAATAACAATATACCCAAGGGCTCTCTTATGCAA---------GCTGTCCTGACAGGCCAGGAAATTAATGCAACGCCCCCAGT--TCCGCCCCCTGGTTAAGAAGGTTAACTGTCTTAATTGAGCAGGTCC s monDom4.chr2 513779221 931 - 541556283 AGCCAGGAGTTGACAAGGCAGCGAGGCCAAGGCCAGGTCCAAGGCGGTG------AGGGCAAGCGGCAGTCCTAGCCCCAGCACCCG--AGCAGCCCCAGCAGCAGC-------------------------ACCATGGTCAAGATCGTGAAATGTCCAGACCAAGGCGTACCCGGAACCAGAAGCCCGGCACGAGCGGGCTCCGCAAGCGGGTGCGGGTGTTCCAGGAGAGCCCACACTACGCCGAGAACTTCATCCAAAGTATCCTGGCCACTGTGGAGCCGGGGCAGCGGCCTGACGCCACGCTGGTGGTGGGCGGCGACGGCCCGCTTCTATATGCAGGAGGCCATCCAGCTCATCGTGCGCATAGCCGCGGCCAACGGGGTGAGTCCAGAGGGAGGGAGGGAAGCCTCTGGGCCCTATCCCTCGCCCTCCCCCCAGGCCTGCCAGTCTCCCGAGCTCCGGTGGGCAGGAgcggggcggggccgggccggg--------gTGGGGCTTGGGACTAGTTCTGGCCCTTACCTTGGGCGGTctcttcctcctcctcgtcgtcgacatcttcctcctcctcctccttccccACCCCCAGGCCTTTGACATTTAAAGTAACCTTTTCCCGAGATTCACTTACGCGGCTGCGC-ATTCTGGCCCCCAGCCGGGG------CCGGCACCTTGAG----AGAGATGAGGGCGCCATCGTGTCCATCCCATTC-CCTTCCTGG------------GCCATGTTGTCCGTAAGGTTGCAAGTTCCTCCCC---------GGCTTCCTTAG-----------CCTTCCCCGCCG------------GGGTTCTGACACCCTCCCTCCCCCCTCCCTGCAGCTGGATCTCCTCCCC------------ACAGACATTTTAATTGGGGC-----------ACCCTTGGGCACTCTTAGGCGAGGGGGATGGGAGGCTCCGGTTGGCCAGGAAATGAAGGTAAC-CTTTTAGTACCCCACCCCCCCATTGGAAGCAATCCCTTGCCGAACTGGGGAGGTTC 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GCCCCTCATTTTGTCTCAAG------TACCCGGAGCAACAGAGTTAGATCCATTTACTTCCAGGCAAG---TAAAGGAACGCTTTGCTTCTGAATCTTCCCCTTCTGGGGT----TGGGAGCTACTGGGGGACAGGATTGACCATTT------CCCTCA------TGACAGAAATAGCCACGGCCAACCCAAG----GGGAATGGAAGAGAATGCGTAATTTCAACTCCGGTGTTTCCTTCCCA-AGAGAAAAATGGAAGACGGCCCCCTCCCACTGCTGACTTTTCTCACAGCTCCTTACCATGACCAGAAACCAGGAACCAGTGGATTACGGAAGAAGACCTACCATTTCGAGACAAAGCCAAGCTACCTGGAGAATTTCATCCAAAGCGTCTTCTTCTGCATAGACTTAAAAGACCGGCAGGGCTCCTCCATGGTGGTTGGCGGAGATGGGAGATACTTTAATACGTCAGCCATAGAAACAATAGTGCAGATGGCTGCTGCCAACGGGGTGGGTAT a score=6078 s mm8.chr4 99454537 371 + 155029701 TAGCTAGCTTCTAGAATTACGCCTGTGCTATGGAG------AGCTGTCATGAGTCGGGGC----AAGGGGAGGATTTGCAGTGTGTTCAGTGGCTTCCTTGTTGACGTTCAGTCATTTGTCCAACAGGAAAGAAAACAAAGGCAGGGCATGCTGTTTGT--AGATCTTGGAAGTCATGTAAAACAGTACCAGGGGTGGGGGCTGGGGGACAGTTGGATGTTAGATGTGAGTCTTTGGGGGAAGACTGTTACAGAGGGATCTGCTTGTAATGACCTGGGGCACAAAGCAGCCCTTTATTAGGGTGAATTTGTGCAGCAGGGTAGAGATAATGGGTCTAAGATGGCAGTAGTGTTAGTAGGCTCTGCCAAAGGGCTGCATTTTGG s monDom4.chrUn 32493039 358 - 174229318 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TCTTCATGGTTTAATGACCTCTGGACTCATACAAATTGGTTGATTTTTCTTTGGTTGGTTTAGATTGGTCGGCTGATCATCGGCCAGAATGGCATCTTGTCCACACCTGCTGTTTCATGTATTATCAGGAAGATCAAAGCAGCTGGTGGAATCATTCTTACTGCCAGTCATTGCCCTGGAGGACCAGGGGGAGAGTTTGGAGTCAAGTTTAACGTTTCTAATGGAGGTAGGTAGTC------CTAAATG--AATGGAACACATTTGTATAA--------CTGAAATTCTGTGAAATGGGTCGATATATACGACTTGACTCTTTCCCCCTTAATAGTTGGttaacaaacatttattgagtatctgc--tatatgccatta--tgtaaagtgcagggaatgtaaa---aaaaaagtcta------atcatcatctc----tgcccttaaggagatcacagtgtaaatgggagaTC a score=5910 s mm8.chr4 99459944 354 + 155029701 TGATGACGCTCGCTTGCTCTGTGATTTGTAGGTCCTGCTCCAGAAGCAATCACTGATAAAATTTTCCAAATCAGCAAGACAATCGAAGAATATGCCATTTGCCCTGACTTGAAGGTAGACCTCGGTGTTCTGGGAAAGCAGCAGTTTGACTTGGAAAACAAGTTCAAGCCCTTCACAGGCA----TGTTACTGTCCCTGC-------CCACCCCCCTCACCCCCCATACACACACACACCTGTGTCCAGCTTGAACAGTTTTTCTTTGGGGGGGTTTATTAAAG-----TGGGTCTTCAGCTTTGGAAAATGGTGGTCTGTGT---GCATTGATGGGATTACTTACTTAACAGGAGTGTGCTTGGGGAGTATG s monDom4.chr6 146073019 366 - 244784211 TGACCTTGCACATATTCTTTTTCATTT-TAGGTCCTGCACCAGATGTCGTTTCAGATAAGATCTACCAGATCAGCAGAACAATCGAGGAGTATGCCATCTGTCCAGATCTCCGAATTGACTTATCTCGACTAGGAAGACAAGAATTTGATCTGGAGAACAAATTCAAACCCTTCAGAGGTAACAGAGCAAACGTCATTTCAAATGATACAGCATCATCACTCTCTGGAT-CATGAGAGCTGGCATTGTCTTAGAATTGTTATTATGGGGGGAACAAAATCAGAGATGTTTGGTGAACCAGATCTCAAGAATAGCTATTTGTGCCCAGCATCTATGTG-----TTGTTAAGAAGGAAGGAGCGAAGGGAATGTG a score=5786 s mm8.chr4 99461420 161 + 155029701 TTTCCTTCTGATCTCGCTTATTCTCACAGTGGAGATTGTGGACTCAGTGGAGGCCTATGCCACAATGCTGAGAAACATCTTCGATTTCAACGCACTGAAGGAGCTACTCTCTGGTCCAAACAGACTGAAGATCCGCATAGACGCCATGCACGGAGGTACGC s monDom4.chr6 146080120 156 - 244784211 TTTCCTTTTGTTTTC-----TGTTCGTAGTGGAGATAGTGGATCCAGTGGATATCTATCTCAATCTCCTTCGGACCATCTTTGACTTTAATGCCATTAAGAGTTTGCTGACTGGACCCAATCAACTTAAAATCCGAGTGGATGCCATGCATGGAGGTGAGC a score=159 s mm8.chr4 99462565 4 + 155029701 AAGT s monDom4.chr6 146081655 4 - 244784211 AAGA a score=14584 s mm8.chr4 99462569 235 + 155029701 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CTTCAGGACCTCTGGTGGGGGCGGCCGCTCTTTGAGAGGCGGACTTGAAGCTCTTTTTCACTTCTCTCTGCTTCTCCCCCAGGCTCTGACCACATTCGTGAGAAAGACGGACTGTGGGCTGTCCTGGCGTGGCTCTCCATCATTGCCAGCCGCAAGCAGAGCGTGGAGGACATCCTGAAAGATCACTGGCAGAAGTTTGGGCGGAACTTCTTCACCAGGTGAGCCGCCCTC a score=12544 s mm8.chr4 99479808 195 + 155029701 CTTCCAGGTATGACTACGAGGAGGTGGAAGCTGAGGGTGCAAACAAAATGATGAAGGACCTGGAGGCCCTGATGCTGGACCGCTCCTTTGTGGGGAAGCAGTTCTCAGCAAACGATAAAGTCTACACTGTGGAGAAAGCGGATAACTTTGAATATAGTGACCCAGTAGATGGAAGCATTTCAAAAAATCAGGTAG s monDom4.chr2 513835455 195 - 541556283 CTCGCAGGTATGATTATGAAGAGGTGGAATCGGAGGGGGCCAACAAGATGATGAAGGACCTGGAGGCCCTCATGTTCGATCGCTCCTTCGTGGGCAGGAAGTTCACGGTGGGCGACAAGACTTACACCGTGGAGAAAGCAGACAACTTTGAATATAGCGACCCAATAGATGGGAGCGTCTCGAGAAACCAGGTGG a score=4501 s mm8.chr4 99526182 141 + 155029701 gaaaaagaaaaagaaTTCAACCACCCTGCAATTACTGAGAACCTCAAAGAAAGAAATGAAAAGTATAGCCA----------TTAGCTTGAAAGTCTA-------------ATGACCCCAAT-CTAAACAGTGCCAGGCATTTTATTCTGCTCACTTGTAGGAGAA s monDom4.chr2 513869696 165 - 541556283 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AATACTCTTCTCTCCATTTTTACAATAAAAATGTTGAGAACACCCACATTGGCGTCCACAACATA-CCTGAAACAGACTTGTGCTTCCTCTCTTCAGCTCTCCTTGGTCTATAACAAGAATGTCCCTTACTCAACAGCAGGTACACTCTGCCATGGCTCAAGACACCTTGCTTCATAGGAAAACCATATTTGTCATTTCCACCACGGATTTGGACCCCATGACCC s monDom4.chr6 13289919 221 + 244784211 AATGCTTACCTTTC----TTTACAATAACCAAGTTGAGAACACTCAAATTGGCATCCACAATACAGCCCCTAACAGATTTACGTTTTCTTTCTCCTGTTCTTCTAGGGCGATAGCAAGAATGGCCCTTACTGAGCAGCAGGCGGACTCGTCCATGAGCCAAAACACCCTGCTTCATGGGGAAACCTTGTTTGTCATTTCCACCACTGATCCGGACCACATAACCC a score=5897 s mm8.chr4 99859861 119 + 155029701 TTCTACTCTTCATCCAGAGCATCAGTA----CTACGGTGGTCACAGGCTTCTCATGGAAAGTGTGACACTTGCACTCACTGTCCATTTCAGTGAGTTTCTGACAGCTGGTGGTTGAG---GAGATA s monDom4.chr6 13290562 126 + 244784211 TTCCACTCTTCACCCAGAGCATCAGCAGAAACTTCAGTGGCCATCCGTTTCTCATAAAAGGTGCGTAGCTTTCGCTCATCATCTACTTCGATGAGTTTCTGACAGCCAGTGGCTGGGAAAGAGATG a score=1792 s mm8.chr4 99859980 52 + 155029701 CTCAGCTTCATCTTCACATGGCCGATCGCCTAGGAGGCACCAAGAAAAGGAG s monDom4.chr6 13292803 52 + 244784211 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tgggcagttggtcaacaagatgatagctaagaa------taagattaggatttct--tgacaatg--gataagaatGATGGCCTTTCCTCCTTTTCCTCTAAGATGGCGCCGAAGCCCAAGAAGGAAGCGGTTGTCCCCCCCAAGACAGAGGCCAAGTCCAAGGCCTTGAAAGCCAAGAAGGCAGTGTTGAAGGGTGTCCATAGCCACAAAAAGAAGAAGATCCGAATGTCTCCTACCTTCAGGCGACCCAAGACGCTGAGACTTCGAAGGCAGCCCAAATACCCTCGGAAAAGTGCTCCTCGGAGAAAAAAGCTTGATCACTATGCCATCATTAAGTTTCCCTTGACCACTGAGTCTGCTATGAAGAAGATTGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTGGATGTCAAGGCCAATAAGCATCAGATCAAGCAGGCAGTAAAGAAGCTCTATGACATTGATGTGGCCAAGGTCAACACACTGATCCAGCCTGACGGA-------GAGAAG-------AAGGCCTATGTCCGACTTGCTCCTGACTATGACACATTGGACGTTGCCAACAAAATTGGAATCATCTAAAC--TATCCAGC a score=4236 s mm8.chr4 100594156 100 + 155029701 TGAGTTTTCCTGGCCTTGTGTCTTT-----CAGGAGGTTCATGAGTTATTACAGGACTATGAGCTAAAGTATTGCTATGTGGACAGGAATAAACGAACAGGTGAG s monDom4.chr3 431036062 105 + 526135210 TGACTTTTCTTGACCTCCTGTTTATTTCTACAGGAAGTACATGACCTGCTCAGTGACTATGAGCTCAAGTACTGTTTTGTGGACAAGTACAAGGGGACTGGTGAG a score=588 s mm8.chr4 100600520 11 + 155029701 TCCTTCTGTTG s monDom4.chr3 431036298 11 + 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TCTTCCAGCCTTTGTTACCTTACTGGATGGGGAACAAGCCCAAAATGCCATCCAGACGTTTCACCAGTATTCTCTTCGGGGGAAAGAGATCACTGTCCAGCTCCAGCCCACGGATGCTTTGCTCTGCATCACCAACCTGCCGCCCTCTTTCACAATAGAAGAATTCGAGGAACTGGTCCGGACATTCGGCAATATCGAGAGGTGCTTTTTGGTCTACAATGAAACCACCGGCCATTCGAAGGGCTACGGATTTGTGGAGTACATGAAAAAAGACTCTGCGGCTAAGGCGAGGTCGGAACTGTTGGGTAAACAGTTAGGAAGCTTCATTCTCTTTGCACAGTGGATGGATGTGAATCAGCTGGCCACCGATCTCATTCATTCTAAGTGCCTATGCGTCGATAAACTCCCCAGGGACCTCACGGACTCCCAAGAGCTCTTGCAAATTTTCTCCTTTAGTCATAAGCCTGTGTTTGGTCAGGTAGGTGCCTTTCCAGATCCCAGGTTTGAAAGCC--AGAGATAGCCACCACAGTAGATGCACACAGGTCCAACTGTTGgttttcaatgagcaatcagcgcaccttggatagccctcattggctacgatgctgccactgtgc a score=11171 s mm8.chr4 100605068 268 + 155029701 TTGTAAACAAATGATCATAAATCAATCTCAGAATCTCTCTTTTTTTAACGTGCCATGTGGTATCAGCTTGCACAGGATGAAGGAAGTCACGGTGGTGGCTTTGCGGTGGTTGAATATAGCACTGCGGAGCATGCCGAAGAGGTTCAGCAGGTGGCAGATGGCATCACCATCAAGGGGAGCCAAGTTCAACTGTCCTTCTGCGCCCCAGGAGCACCAGGGCGAAGCACTCTAGCAGTCCTCATAGCAGCTCAGCGCGCGGTGAGTGGCT s monDom4.chr2 515004705 266 - 541556283 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tgggaactgagtagcctcgagaaccacagag-----cctgcaatggcaggggcgtttactctcttgcccttAGTCTGTCTCCCTATTCTTTTTATCTTATGGGAGATGTGCATAGCAAGGAGCCAGGGTTTCCCTGCCGTCTCATAGCATACAGCAGTG-----AAGGTC--TCGTCCCTAGAC---------------AGGGCCG--AGCCCCAG-----CAGAGCAGTGCACACAGCCCTTCCTGAGGGAGGCCGTGGACAGCGTGGGGCAGTTCT---------------GAGCTA---------------ACAGGCTCTACCTCACTCTGGTTATTTACTCACTCTTTGGTAGTTGTTAAGCTGAAAGGAAATGGC-------CGCTTAATCCAATTC-----ACTT--------CTGAAAGAACACTTGTCTTT----------------ATTTGTCTGACTTTTGACTT-CACCCTT-----------------TGCCGAAGATCTTGGTATTAAGTGAGCAACCTTTTTCCATCTAGAAA-TTTCTATGTGTTCATTGTTAAGAGACTACAACTGATGAAGTGTA--------GGATCTCAATGATCCTAGATC--------AGATCATTAAAAAA--CCTT----ATTTGGAGGACTTATCATTTTTGACT-----GATAATGCTCTCCAGCATTAATTATAAAATCTAAAACTGGTACATATG-TTACATGTTTTATAATGAATTTTACCTGGCCTAATTTATTGCATATACCAGCTTTCATTGA s monDom4.chr2 515031095 766 - 541556283 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GTTAGTTTTCTGTGTCAGCTAATGGTTTGAAATGCTTTTCAAGATGCAAGCTTAATATTAAAAGG-CATATGCATGTGAAGTCTTTAGTATGTTTA-TTGTATAAAGAGTAAACAAAGTGCATATAGAGCGAGACACAGGTTT---GACGTAAACAGGGGCTATGGTG s monDom4.chr2 515032572 162 - 541556283 GTTATTTTTCTATGTAATCGAAC----TAAAATGCTCTGTTCATCTAATTCTTCATATTAAAAAGACACGTGCATGTCGAGTCTTTATTATATTTATTTGTATAAAGAGT-AACAAAGTGCATATAG-GTTGTACACAGGTTGACAAGTACAAGTGGGGGTAACAGTG a score=5694 s mm8.chr4 100651401 130 + 155029701 GGAATTTAAATGTTGTTC-----ATGCTTCTTATTTTAAAAGTGCTTCAAATCCTTCAATAAGGTTCTGAAAAGTTGTCCGGTTAGATGGTTGGAATTCCCAGCATTTTCTCATAAGCTGATAAACCTATGAAAA s monDom4.chr2 515034441 135 - 541556283 ggcacttaaacaatgtctGCCGGATGGGTTCTATTTGATGAGGGCTTCAAATCCGTTGATGAGCTCCTGAAATGTTGTTCGACTGGTCGGTTGGTACTCCCAGCATTTCTTCATTAGTTGGTACACCTGTAAAAA a score=7376 s mm8.chr4 100652354 242 + 155029701 aacactgtagccAGTGTAAGGCCTTCGGTTCTGTTATTCCCCTCCCATGCTGGATAAGGCAAGCTGTAAAGACATTCAAAATGCAGTTCC--------CTTCCCATGAAGGGGACACAGCTACCTCATCAGGACAGTTGGGTGGACATGGCAGACGCTTTCCTTCTTTCAGAGTATTCACAAGCCGTGTCACTGTCATCTGGCCATGAGTTGGGCCTATCATTTTCAGGAACAACTATGTAAAATAAAAC s monDom4.chr2 515035019 247 - 541556283 AACTCTGTCTCCAAAGGAGCGCCCTTCCTCTCCTCGTGTCCCTGCTCTCCCCCCCAGGACCCTCCCCGAGGCC---CAGAGCGGAGCCCCTCACTGTGCCCCTCGTGGATGCCCCACGGATACCTCTTCTGGGCAGTTCTGTGGGCACGGCAGACGCTTTCCTTCCTTTAGTGCCCGCACAAGCCGGGTGACAGTCATCTGGCCTTGAGTGGGACCGATCATCTTCAAGAACATCTGTGCGAAACAAAAC a score=9498 s mm8.chr4 100652937 140 + 155029701 TAACACTTACGGCCATGGGACTAAAATCTGAGTCACAGTAAGTGAGCAGCTCGTGCAGTGTCACTCCAAAAGACCAGACATCAGAGGCGATATAAAATTTACACTGGATTAAACATTCCGGAGCGTACCTGAAAGGAAAG s monDom4.chr2 515036941 140 - 541556283 TAATGCTTACCGCCATGGGACTGGATTCAGAATCGCAGTAGGTGAGCAGTTCGTGTAACGTGACCCCAAATGACCAGACGTCAGAGGCGATATAGAATTTGCTCTGAACTAGACATTCCGGGGCGTACCTGGAAGGAAAG a score=10676 s mm8.chr4 100654067 447 + 155029701 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gtgtctgagtcttcatgaacccatttggggttttcttggcaaaggtactag--aggggttggccactgccttctctggctcttttacagatgaggaaacagaggcaagcaaggtgaaatgacttgcccagggtcatacagctagtcagtgtctgaggc-----cggcttggagcagcctggcaccctgggccccg------tgatgc-cacccag---ctgccttGAGAACCCCCTACAAGTGTACCATCACCGCCATCACGATTATCCAGCTCTGGCTTCGTCTCTTACCAGAAGACAGGACTGTCTCGATCGTCCTTCACCGTGTAGTACTCCTTGTCGGTCTCGATGGCTTTCGTTAGGCCAAAATCCCCGATTTTCACCCGGTGCTCATTCTCCACCAGGACGTTTCTGGCTGCCAGATCTCGGTGAACATACTGACAAGATCCCAAATAGTCCATCCCCTGAGGAAGGAAAGAGAGG a score=9535 s mm8.chr4 100654876 146 + 155029701 TTTTTACCTTACAAATCTGGATGGCATATTTTAGCTGCTGTTTGAGGTTGATTTTGTTCTTATTCTTTGGCAGATACTCCTTTAGGCTTCCCGAAGGCAGAAACTCCATGATGAGCTTGATACCATTGCCTCCTATTTAGGAGAAA s monDom4.chr2 515039593 146 - 541556283 TCCTCACCTTGCAGATCTGCACGGCGTACTTGAGCTGCTGTTTGAGGTTAATTTTgttcttattccgaggaaggtattccttaaggctccccgaaggcaggaactccatgatgagtttaatcccatttcctcctgttcAGAAGCAA a score=13869 s mm8.chr4 100655617 301 + 155029701 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TCACCTCAATGAGGGTCTTGTCTTTGAGAGGAATCTCTCCGTTGTAGCAGATTTCCCAGAGCGTGGTTCCAAAGCTCCACTTGTCAGCAGCCACACTCAGGTTCTTGGAGTCTTCAACACACTCAGGAGCGATCCAGGGGATTCGCTCTATGCACTCTG-GGGAAAGACAACA----GACCCACCTATAGGCCAGCTCCTGGGACCACC s monDom4.chr2 515044782 209 - 541556283 TTACCTCCGCCAGTGTCTTATCTTTCAGCGGGATCTCTCCATTGTAGCAGATCTCCCAGAGGGTTGTGCCAAAGCTCCATTTATCAGCAGCCACACTCAGGTTCTTGGAGTCATCCACGCACTCTGGCGCGATCCACGGGATGCGTTCTACACACTCTGCAAGAAAAGAAACAATAGGATTCCCCTCCACACCCACCACTAAAATTCCC a score=8501 s mm8.chr4 100659732 178 + 155029701 ACATACCTTGCCTGGTCAGCACAGAGACTGGGATGCCAGGGTCACTAAGCTTGATGAACGGGCCAATGTCACTGTCAATGCCCTCACGGGCCAGAAGGAGGTTTTTAGTGCACACATTTCCATGAACCAGGTCTTTATCTTCCTGTAGAATAAAAAGGGTCTATGTAGTAAGGCAGCC s monDom4.chr2 515047286 177 - 541556283 ACGTACCTTGGCGAGACAGCACAGTGATGGGGATCCCAGGGTCACTGAGCTTGATGAAGGGGCTGCACTCGCCGTCCAGGCCCTCTCTGGCCAAGAGGACGTTCTTGGCACATACGTTCCCATGCACTAAATCTTTGTCTTCCTGCAAAGAAGAGAGACTCCA-GTGGTGAGGAGGCC a score=9741 s mm8.chr4 100660667 373 + 155029701 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CCTTCCCCTTGACAATAGACCGGGTCCCCAGGCGGTTCCT--------TTCTCTCTGGGCGTCTTCATCTCCGTTCGCCCCCGCAGCCTCAGCCT----------------GGCTCCGGACA--------CGCCGGGAGGGGAGAGGAGGGGGCGCGGCGGCGGTAGCGTGGAGCCGGCTCCCGGCTTACGTAAGAAGCAGCGAGTCCCGCGCG-GCCAGCCCGGCAGAGGCGGCGCCGCC--CAGCGGGATCCGGGCTAAGTCTGGCCGCGCTCCTTTCCACCGAGGTGTGTGTCTCCCCGGCTGCTCGGGACGGAGGTGGGCCCCTCCAGTTGCAGGCAGCGGCCACTGTGGGGGGAAGCGACAGTCACCGAGAAGCGCCCGGAGAGCTGCTCCC------ACTCTGCCCACGTGCGGGGACCGGCAGGGG-----------------CTTCCCGGAGTTGCGCGC-------CTGGACTGGGCAGC-------AGGGAAGGACTCGGG---------TGGGTCTGACTGACCTCTGAC--------------------CCCAGAGG-------GCCGAGCTTG--------------CAGGCCGggg--gatgggagtgggggtggggtgg-------gggctgcga------------------------------cggttcaccggagcggccggggcccgagg-aggtggcgga---------gggcggggc----cgaggggcggggCAGTCT------TTAAAGCCTCTCCTTTCCCCTGTAGGGGTGGCAGGCGAGTCCCCGCGTGCGGAGGGTGTCGAGGCAGGGGC-----------------TGCTGGGCA-------AAGTGCGCGGGCT----------------GCCGTCCTGGC-------CACCGCCAAAGCCATGGCTTCCAAACTCCTGCGCGCGGTCATCCTCGGGCCGCCCGGCTCTGGCAAGGGCACCGTTTGCGAAAGGATCGCCCAGAACTTTGGCCTCCAGCATCTCTCCAGCGGCCACTTGTTGCGGGAGAACCTCAAGACCGGCACGGGTGAGGAGCTAAGGCGG--------GGGGAGTGAGGGTAGAGACGAGTCTG---GCGGGTTGGTCGGGCCGGGAGCAGG---GCGGTCGCGGGCTCGG---------GTCCCCTcg--------gcgccggcgccctgcccccgcccgcgTGTGCCCGTGCGGGCTTGTACGTGCCGCGGCGCATGCAGCCGGC-----CGCCAGCCTGC--CCGCCCGCCCG------------CGCTGCTTAACCGCGCCC-----------GGGGGAGGCCGAG--GCTGCTCGGCAGCGCCTCGGACTGCACTGGCCGCACGCGCGTGGGAAGGGACCCTGCACGGCAGGCCGAGGGAAACGCGAGCCTCTCGGCGGGGACCCTAACTGGCCTCTCGTGCCGCCTGCCGAAAGCCGAGCCCCTGGGTT--CCCAGTTGTGGT-CCTTCTCAACCGCGGGTCG-----CCTTCCCCC----------GCGAGGAGACGAGCACCGCGCCGCCCACCTGTGGGAGTCGCGGCCGCTGGCGCTCTGGGACTCTGCGGCTCGCTCCCCCACGGCCTCTCGCGCGC-GCTCCAGCCT s monDom4.chr2 515381488 1586 - 541556283 CCGCCCCAAGGACGGCTCATCAGTCACCCAGGTGCTTTCCGAAGGCAATTTTATTTTTTTAATCTCATTCCCTCCCACCCCCACTCCCTCATCCCCAAGTCGGAGAGTTGGGGCTCCGCCCTTTCCCCCTCCCCCTATGGGGCGAGGGGCCGGCTGGCGGGCGAGGGCCCCGGATCAA-TCACAGCCTGCGGTGGGAGCGCCG--CCCCGCTCCCGCCTACccgccgtcgtcgccgccgccaccaccgcggccaccaccgccAGTGGAGATCCGGCTTCCAAGCGAG-------TTCCCACGGCCGGT--GGGCAGCGGTCG-------CAGCTGCAGGCGGAGAC-AGGGTGGGGAGGGGCTA--------GGGAAGGGCTAGAGGAGGCGCTGCTTACTTAACGCTGCCCACGTGCGAGAACTGGGTGGGCAGAGAGGAGGGAACCCCCCCCCCACACACACACACACTCAAACTGGGCGAGACAGCGAGAGAGAGCGAAGGGACCGGGAGGGGTGCGTGGGGCCGGATGGCCTGGGGCAGGGCTTCTGGGTGCATTCCCCCTGGGGTGGGACAGTTGCGCTCGGGGATCCCTCACTCCGGGCCGGGCCCGTTGGGGGTGGGAGCGGAGAGGCTGGCTCGGGCTGCCCTCTGACCCGGTGGGGGTCTTCGTTCTCTCCCAGCCCACCTCGGTGCCCAGGGGCCGGGGTATCTGGCCGGTCTGCCCTggggcggcgcggcgcggggtgcgggccgcgcTGGGGGCTCCAAGTCTCTTCCTTTCTTCACAGGGGCAGC--GCCACCGCCGGCCATCGGAGGGGGACGGGGGCGGGGAAGGGAAGAGGAGAAGAGTTCTGGGCTTTTCCATCAGTCCCGGGTCTCGGGGGGCGGCTTTCGGCTGTCCTTGCGCCCCCTCCCCGCCAG-GCGATGGCTTCCAAACTCCTGCGGGCCGTCATTCTGGGCCCTCCGGGCTCGGGCAAAGGGACCGTGTGCCAGCGGATCGCCGAAAACTTTGGGCTCCAGCATCTCTCCAGCGGCCACTTCCTTCGGGAGAACATCAGGACGGACACGGGTGAGTGGGGAAGGGAGCTGGGACTGgcgtgtgtgcgcgcgtgtgggtctgcgtgtgcgcgtgtctgcctgcgtgtctgcgcgcgcgcgtgAGATCGAGAGAGAAATGACCCTTAGCATGGCTAGCTCTCGCGCTCCCCTCCCACCGCCTTCCTTCC------CCTTCTACGTGCCGGGCCGCATGCAGCCAGCCTGCGCGGCAGCCTGCATCCAACCGGCCGGGCAGGCAGGGCTGCGGATTAACCGTGCCCCACTTGGCGCTGGGAAATGGGGAGGAGCCGCCGGGGA-------GGGCTGCTCTGG-CGTGAGTGCTCGCGGAGGAGCTTCCCCCTG--GGTGGAGGGA---GCGCTGCCTCTGTCCAGCCCCGGGGCTAATCCTGCGGACCTCAGAATTGAGGCAGCTGGCTGGGGCTGGCCCGGAAGCGCCGCCTTCTC-----CGGGTCGAAAGCCCTTTCCCCCCTCCAGCCTCCGAAAGAACCCCGATCCTGCCGAGCCCCAGAGGAAGCCGGGAAGGTT--------------------CCCAGTCCCCTCCGGCCTCCCCCATGCTGGCCGAGCCT 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monDom4.chr2 515429357 942 - 541556283 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s monDom4.chr2 515657332 995 - 541556283 AGGGCTCGATGCTGGAGGCAGGGCGGGGTCAGGATGGGGACCCCGGTGGGCGGCCTCTGCGCCAGGCCCGGCGATCCTCTGGGGTCGAACTGCTGGAATAGGGATGGCAGGCTGTGTGGGGGGGAGGGAATGCGGCCCGACTGAGAGGGGGGCGATCCTGAGGG-AGAGTACCTGCGGAAAGCTGCGTGGGGGCGGTGTGGGTTCCTAAAGCGGGGCGCTGCGGGGCGTGGCGGGATCGAGGGGGTGGAGGGAGGAACCG-AGGGGGCGGGCTTTGCCGCTAATAAGATGTGCTGGGGATGGGGCCGGGCGGGTTTCCGGGGGGAGCCGGTGGGGCTCGGGTCTGGATGCTGGGGAGGTTGGGGTAGCGGGATGG--GAGACCAGGTTCGTCACTCGGGAGGGGGGGCTATCC---TCTACGGATGCTTTGGTATGGAGGTATGCTTCGAAAGGGGGCAGG-CTACTTGCTAGAGGGGCT-ATTTGAGGGCCTGATCAAACGGGGGCTGGGAAAGGTGAATTGGGGGGCGGGGCGAGCTCTGCGCTGGCGGGTCTCTAACTGGGGTGGGGTGGGGGCCACGAAGCTCCTTTGGGG----ATTCTGCGGGGGTGGGGGTG----TGTGATTAGACTGGGTTCGGGG---GTGGAGAGAAGGGCTCCTCTGAATGGTTGAGTGGCGCCTCG--------------ACCCGAGGGGGCGGGGTCCGCGCT-GGGGGCGGGCACTGTCCTGCCGCGGGAGGGACCTAGCTTCTTCG--TGGCTTGGAGA-------------AGGGCGGGCTGAGCT--GGTCCCAC---CAGGCACTGGCTTGGACCGGGAGGGGACGGCCCGAAGCTGAGGCAGGAAACCGGAAGCTGGG---GCTCCCGCTCGGGAGACATGGCCGGGATTAAAGGTACTCTATCCTTCGCCGTCTCCACCTCCCTGTCCCGTTCGCCGTCCCTGCGGGGGTCTCCTTGCAGC-CGGCGCCTAGCCTGGGGTGCTGCCGCCTGTGTCTCTCCACCCGGAGCTCTCGCAGTCTCCC 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TGTCCGCCAGAGGGCTCTCTTATCCCTGTGTGTGCCTTCGGCTCAGGCAAAATGTCTTCATTTATTGTGTTGTCTAAGACCGTTTGCCTG--TGTGGCCTGTCACAAATGATTATTATTGACATTGT---TTTCTCAAAAAAC---------------TAACCTCCC-------GCCCTGCTGCAGAGCAATGCGTACACACACGGGTGGTGACGGGCGTCATTTGTTGTTTTCTTATGTTTGTTTCCATTGGGGGG---AAAGTAGATTGGAGAAA----TGTGCCTAATGGGGAAACCATCGAGGCTGGGACCAGGCTTAATGAGCCACCGTCTAGCTGTAATTAGGCTAACAG------------CTCCATCGTTCAGCCCGTTGCCTTGTTAAGCCTTTTAGCATCTGCGTGCAGTATTTTGTTTGACGTTCTTGATGACTGAGTATCCCAGAGGTTTTCAAAATGGCAGCCATCGAGGCTGATGTCATGGTCTTTCTCCTCTTGCTTTTCAGATCAAGTGGGGAGCCTGTGGCCTGGTGTTAGCTGGCAACGCGGTCATTTTTATCACCATTCAAGGCTTCTTCCTTGCTTTCGGGAGAGGGGATGACTTCAGCTGGTAGCACTGGTGGACATTC a score=86 s mm8.chr4 101155929 297 + 155029701 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TCAGTTTTTAGACAGAGAAAATGATCTCTGTCAAACAATAAATCTGAATTCTAGATGTCTTTTTTTTTTTAAATCAATACTACATAT----------TAACTGGCTACTTTTAAAAAAATGTATATATATATCTTTTAAGGCGCAGCCTGTATTGTCCTGATAGTCCATCTATTCATCCTACGTCTGAGCCCAAAAACTGCGTCTTACAGAGAGACGGCTTTTATGAATGTGTTTTCCAGCCAATCTTTCTATTATCTGGCTATACAATGTGGATCAGGATCAACCATTCTTTAGGTTCACTTGACTCGCCACCAACGTGTGTCCTTCCTGACTCCGTAGGTACGTCAGACTATATTATGTATTTTCCTTATATACGGCTGTCATTTTCTAATTGCACTATATTTTGAAGAAAAAAATTGTTTCTGTTTATAGAGTAATTGAGAAGATGATTGGCTGTAGAAGCTTTCTAGTTT s monDom4.chr2 515808895 449 - 541556283 TTAGATATCAGACAAGCACAATTTTCCCTA--AAGTAGCCTTCATGTTTTCTACAATTTCTTTGTATTTTTATTGAAGACAGAACCTGGAAGGGTCCTAATTGATTGCTCTTA----------------TACCTTTTAAGGAGCAGCCTGTATTGTTCTGATTTTCCAACTACTCATCATGCCTCGGACCCCAAAGACTGTCATTTACAGATGGATGGCTTTTATGAATGCACCTTTCAGCCCATCTTTCTTTTGTCTGGGTATACCATGTGGATACACATCAGCCACTCTTTGGGGTCACTTGAATCTCCCCCAACATGTGTTGTTCCAGATTCTGTAGGTATGTCAAGCTGTTCTTCCTTTACTTCCTAAAATTGGTATTTTATTCCTATCTGGAATATTCCATTAAGATGAA------TCTGACACAGAGTGCAGGTG-GTAGATGATCAGTGATTGTGATTTGCCATTTT a 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AAGGCACTTGGCATAGCATGCAAGTAACGATCACTCCCCTTGTCTTACTTATTTTACAGCTCCATCAAGCTTATGGTTCTGAATCCACATCTGCTAGCTTCCAGGTGCTGGATTTCTGCTCAGTCTATATTGCTCAGGTCCGCTGTAAGAGGCTTGATGGCCTGGGATACTGGAGTAATTGGAGCAATCCCGCCTACACGGTTGTCATGGATATAAAAGGT a score=4709 s mm8.chr4 101272119 131 + 155029701 TATTGTTTTTCAGTTCCTATGAGAGGGCCTGAATTTTGGAGAAAAATGGATGGGGACGTTACTAAAAAGGAGAGAAATGTCACCTTGCTTTGGAAGGTATTT---CTAA-------------TTTCTACC-TTTTATTTTATTCTGAA s monDom4.chr2 515817623 148 - 541556283 TATCATCTTACAGCTCCCACCAGAGGACCAGAATTTTGGGGCATTGTTCATGAAGATCCAATGGGAAAAGAGAGAAATATCACTTTATTTTGGAAGGTATGTTGCCTAATCTTATGCCATTTTTTCTGCCTTTTTTTTTTGTTCAGAA a score=12494 s mm8.chr4 101277778 282 + 155029701 TGAGTTCTGGTAT---AAACACTGTGGTCTGTGTGCTAATTAAATCTTGTGTTTCCTACAGCCCCTGACGAAAAATGACTCACTGTGTAGTGTGAGGAGGTACGTGGTGAAGCATCGTACTGCCCACAATGGGACGTGGTCAGAAGATGTGGGAAATCGGACCAATCTCACTTTCCTGTGGACAGAACCAGCGCACACTGTTACAGTTCTGGCTGTCAATTCCCTCGGCGCTTCCCTTGTGAATTTTAACCTTACCTTCTCATGGCCCATGAGTAAAGGTAAGAG s monDom4.chr2 515825870 279 - 541556283 TGGTTTCTGATACTCAGCAAAATGTGGTTTTTATAAAAATTGA------TGTTTCCAACAGCCTTTGGGGAAAAACCATTCACTGTGCAGCGTGAGGAGATATATAGTGAAGCATTACACTGAGAGCAACAAGACTTGGGCAGAAGACACAGGAAATGCCACGAAAGTCACTTTTCCCTGGACTGAATTAGCACACACGGTCACTGTTGTGGCCGTAAACTCAATTGGTCCTTCCATCGTGAATTTTAATCTCACTTTCTCATGGCACATGAGTACAGGTAAGAG a score=10069 s mm8.chr4 101280455 238 + 155029701 CATTTCTTCTCCTCCCCTCAGTGAGTGCTGTGGAGTCACTCAGTGCTTATCCCCTGAGCAGCAGCTGTGTCATCCTTTCCTGGACACTGTCACCTGATGATTATAGTCTGTTATATCTGGTTATTGAATGGAAGATCCTTAATGAAGATGATGGAATGAAGTGGCTTAGAATTCCCTCGAATGTTAAAAAGTTTTATATCCACGGTATGTGTACTGTACTTTTCATGGATTAGTATGA s monDom4.chr2 515832882 237 - 541556283 CATTCCTTTTTTCCCCTCTAGTAAACAGTGTACAGTCCCTCAGTGTTCATGCAGTAAACAGCAGCTGTGTGGTTCTTTCCTGGATAATAGAACCTACAGAATATACTCTAATGTATTTTGTTATTGAATGGAAAAACCTTGATGAAGAGAATGGAATTAAATGGATCAGAGTGTCTTCGAATGTTAAGAAATATTATATCCGTGGTGAGTTTGAAACAGTTTTAAAATACTA-TATGA a score=5684 s mm8.chr4 101287175 258 + 155029701 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CATTTTCTATTTAGTTGTGCTAACTATTCAATGTGATGTATCCGCAGTGGTTTTCGTTTTGCATTTTGATGTG---TTTACATTGTTTGTACTGAGCTTTTTGCACGTGGATTTTTTTTT-----TTTTTGATTTGTAGCTGCT-TGGCAGGAATTC-ATTGTTATGTAACCCTTGTTCttatat------ataaaaaatatatatatataGTACATTTG---TCTT---TTGTGCTTGTCTTCATTCCATGTGTTTCATAGGATATATCTTTACATGAAGGTATGTATAGAGAAT---------AACAGTTTCAACTCTGTCAATGTCTCTTTCACCATCATTATCTTCAGCAAATGTACCATCAGTTT-TTATTTTCAGATAGCCTCTGGCAGATTCTCACTGTGGCCTGA s monDom4.chr2 515847223 401 - 541556283 CAATCTGTGTGTGTGTGTGAAATTTTTTTTAAGTGACGTACGCACAGTTCTTTCCTATTGGCGCTTACTTTTAAAATTTACAGCGATT---CCCAGCGTCCATCAAAATGAGCCTTTCCTACAGATTTCTGATCTTCTGCTCCTGTGGTGGCATTTCTGTTGTGATGTAACCTTCATT-TTATTTGCTACGATAAACAAAAT-TCCATTTGTTGTGTTTGGTGTCTTGCGTTTTATTTGTCTTCATTTCACGTGCTACATAG----TATTTGTAAACCAAGTTTTTCATAAGGAATCAGTAGCTGCATATTCACACATCTGGGCTTTTCTGTCCTACCAATATCATCTTCTATGACAAGAACATTAGTTTCCTAGTTGGACATGGTGCTGGGCAAA---ACACCTTaacctga a score=23077 s mm8.chr4 101312350 858 + 155029701 TGAGCATTAAAATGTGTCTTTTCTTTTAGCCTGAAACATTTGAGCATCTTTTTACCAAGCATGCAGAATCAGTGATATTTGGTCCTCTTCTTCTGGAGCCTGAACCCATTTCAGAAGAAATCAGTGTCGATACAGCTTGGAAAAATAAAGATGAGATGGTCCCAGCAGCTA-TGGTCTCCCTTCTTTTGACCACACCAGACCCTGAAAGCAGTTCTATTTGTATTAGTGACCAGTGTAACAGTGCTAACTTCTCTGGGTCTCAGAGCACCCAGGTAACCTGTGAGGATGAGTGTCAGAGACAACCCTCAGTTAAATATGCAACTCTGGTCAGCAACGATAAACTAGTGGAAACTGATGAAGAGCAAGGGTTTATCCATAGTCCTGTCAGCAACTGCATCTCCAGTAATCATTCCCCACTGAGGCAGTCTTTCTCTAGCAGCTCCTGGGAGACAGAGGCCCAGACATTTTTCCTTTTATCAGACCAGCAACCCACCATGATTTCACCACAACTTTCATTCTCG---GGGTTGGATGAGCTTTTGGAACTGGAGGGAAGTTTTCCTGAAGAAAATCACAGGGAGAAGTCTGTCTGTTATCTAGGAGTCACCTCCGTCAACAGAAGAGAGAGTGGTGTGCTTTTGACTGGTGAGGCAGGAATCCTGTGCACATTCCCAGCCCAGTGTCTGTTCAGTGACATCAGGATCCTCCAGGAGAGATGCTCA---------CACTTTGTAGAAAATAATTTGAGTTTAGGGACCTCTGGTGAGAA---CTTTGTACCTTACATGCCCCAATTTCAAACCTGTTCCACGCACAGTCACAAGATAATGGAGAATAAGATGTGTGACTTAACTGTGTAATCTCATC s monDom4.chr2 515848187 840 - 541556283 TGATCATAAAAATATGTCTTTTCTTTTAGCCTGAAACTTTTGAGCACGTTTTTATCAAGTGCACAAGAGCAGTCCCATTTGGTCCTTTTCTTCTGGAGCCTGAGCCAGTTTCAGAAGACCTCACTGTGGAAAGAGCAGAGGAGAACAG---------------AGCAACTCTTGGACTCTCTTTTAGTGAC----CCAGAGCCTGAGGAGGATTGTGCTTGTCCTGGTGACCACAGCACCAGCATTGATCTCACCAAGGATGGTGGCCACAAGACAGTGTGTGAG---------CAGAGCAGACAGTGTGTGAAATATGCTATTCTTCTGAATAACTCTAATTCCAGTGCTCTAGAGAACCAGCAAAAGAGTATAAATAGCT---TTAGTAGATGTTTGTCGATCAAAAATTCCCGGTTAAAGGGGTCTTTCTCCAGTAGCTCATGGGAGATAGCTGCCCGGGCCATTTTGATATTATCAGATCAACATCCAGGCACAAGACTTTCCCCTTTCCCATTCTCAGATGGGTTTTCTGAGTTTTC---ACCAGACAAAAACTTCCCTGAAGAGAACAGTGCCCAAAGGCCAGTCTACTATTTAGGGATTACTTCAACCACCAAGAAGAAAAATGACCTTTTTTTGACGGAAACCTCAGGCGTGATGTGTCCCCTTCCCACACATAGCTTATTCAGAGATGTAGGAGTGCTTCAGGACAGTTGTTCAGCCTTGCATCCCTTTGTAGAAACAAACCTCAACTTGGGATCCTCTGTTAGGAAGACGATTGTTTCTTACATGCCACAATTTCAGACTTGTTCTGCTAAAACACAGAAGATAACAGAAAACAAGATGTATGACCTAACTGTGTAACATCATT a score=9045 s mm8.chr4 101373455 121 + 155029701 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s monDom4.chr2 516490461 1324 - 541556283 AAGCCTGTGACGTGGG-GTGGCCCCCGGAGGGGGGACGAGGCCTCCTGGACGCTGAAGAGAACTGTGGGAACCTCCGGGAGGGCTCCCCAGCTGGGCCGCCTCATGTGACTGGAAAGGAAGCCTGACCAAAAAGCAGAACCTTCTCCTCCTCTCTCTAATGAAGCAAGAGCCCCGAAACCAGATTACAACACCGGTGCGCAAGCCGGCA------CAGTTCTGTTATTGAGGAAGGCCAGGGCTGCT-GCCTCAGGGAAGGAGCTGGGGGAAACAGTCCATCAAAGAAGGAAAACGGCAGTGTGGCTCAGGGGGCAGGGAGCCACTGGTGATGCAGTAGAGAGAAtagc-tgtgtgacc-------ctggacaagtcaGCTGTAAAATATACCTCGAGAGATTGTTAGGAGGATCAAAAAAGATTCTTTTTTTTATATATTAAAAAGGGAttcgcacagtgcctggcccgtagtaggagccatatacatgtttattTCCTTCTTGGTGATGCAACCCCCCAAaagtcaatgagctcctctggacctcagtttccctttctgtcaataagagttggactggacgacttctaagaggtcc---cttgcagcCTGAGCCACAGAGGCCCCGCTCTCCATCCTGTGCACTCCTATTTAGTTGCAATTATTTCATGCGCGTCTAAAATTAAATGTCGGGTAGCCTTAGAAAC-----TGAGCCTTTAGCTCTAAAAACGTGAATACTTAAAATGGTCCCCTTGAGCTAATATTGCCAAAAATAAAGCCCCGA-----AGCAATCGAGACAGCCTG---GAAATTAATTTCGAGAGTTTGACGTGGCCCCGGGACGTCGCTGGGCGGGCTGGGTGTGGAGAGAGTCTCCCCCCTTCCCCCTCCCGATCACGCCC----GCCCCCGACCCAGTTCTTCCTCGCAGGCTAGCAGAGGAGGGAGAAGTCCCATCCAGGCCAGACTCCATCTCGGGTTTTCCTGAAACTGACGAACACAACCCACCCCCTT----GGAAGGCTGGAAGCCGGCAGGCTCCGGAGTATTTCAGTTATGCCATTGACGTCAATGGAGTCATTAAATAGATTGCTGGCCCTCCCAGAGGCACATCCCTGCCAGGGACCTAGATACAGACACGTGGGTTTGGGAGTGttttttttttcttcttctttctttctttcctttctttttAAAATGTAAAGCCAGCCATCAGGTCTGGTTGCAAGCCTAAGCAAGGGAGAGAGCCAGGGAAAAGTTAATTCTGTAACCAGCCCAGCTCTAAACTTGTCTTTTTTCTTTttctttccttcttctcttatttcttttcttcctttctttcttatttctttcatt a score=1819 s mm8.chr4 102013097 237 + 155029701 GAACAGGCAATAGAACTCACTGGGTCTTAGCTTATTGTCTTGACTTCCTCTTGTCCAGAGCTGTTT----TCAAGGACCAAGGGTAGCAC-------TCAGACGTCTGTGTACATTTCTCACCC---CTTTCTTCACTGTGTCAATG-------AAGTGAGCTGAGGCCATGGTGGACATCTGACTCACTTAACCAGCAGAGGCAGCCA--------CAACAGATTTCTCCCAATTGTACTCTGGTCTTCACATTTCCAGGGTCCA s monDom4.chr2 516498737 263 - 541556283 gaaatggcaaagtaacttaccaaagttcacataagtgtcagtgctggggcttgaactcaggtctccagactccaaacccaaggccaattccactctgtcaGGAGTTT---TATATCTTTCCCCTGCACTCTCTCAATTATATTTGCAGAGCCGAAAGTGAGCTGACAACCTGGCAATTATCCAGTTAATTTGATCAATGGAGACAGACAAATTGTCTCACTCTGCTCCCCCCAAATGCACTTTGGGTCTTGAATTTCCTGTAACCA a score=2479 s mm8.chr4 102066572 147 + 155029701 AAGTGCTTCTGCTGGTAGGATT-CTCTAATTCCTGTGCAAAGCT---GGAGTGGAAATCAGATCCCTTCTTCCACTTCGTGGAGAAATGCGCCCCGTGCTGTTTTATCTTACAGTCATTTTGCATATCTGCTGATTCCAACAGCTTTGAGC s monDom4.chr2 516576338 136 - 541556283 AAGTGCATCTGCTGCTATAATTACAGTGTTTCCTTTGTCGGGCTCAGGCGGCGGAAACCCGACTCT--------CCTGAAGGAGAAATA-------TGAGAGATCATCTTCCACTGGCTTTGCATATCAGCTTATTAAAAGGGCTTGGGGC a score=5731 s mm8.chr4 102067016 360 + 155029701 GTTGAGACAGCGTTACAAAGGTGAAGAGGAAGAGAGGC--AAGGTATGTGCAAGCCTGGCTTGAAATGAGTTTTATTGAAAACACCTAAATTCATGTTTATGCATTGAGGAGCGTGGAAAAGAAGGCGGAGGAAGCCACCTCCGGGGTTTCTGTGGGTTTTCAA-GTTTGACATACAGGATGTTGAGTTTTTAACCCCTCTTTTACCCTGAAGTGTGTGCATACTGCAGGGATAAACAAAGTCCTGATTCTGTAAAGTGTGCATCCGTGGACAGGCCTTTCTGTTTCCCTGGAATCCCACTTCATTTCTTCCTCTTTCTGTGTCAGGTATTTGATGCCACACACACAAAAGTCTTCGTCTGAT s monDom4.chr2 516576675 329 - 541556283 GCTGAGGCAACCCTGGAGAGCCAAGAAGGAAGGAGGGACGAAGGTATGTGCGAGTCCCTGGTGAGGTGTGTCTGGCT------CCCT----------------------GAGCCTGGGAGAGA-GACTGAGGAAGTTACCTCCTGTGGTTTGGTTGGTTTGCAAAGTTTGACATACAGGAAATTGAGTTTT--AACTCTTGTTTATTCTGAAGTTTG-GTTTGTTAGGGGGTAAACAAGACTACCGATTCTTTGAAACCGGTGTCTGTGGCCAAGGGGTTCCTGTCAGTTGGA--CCAAAAAAATGGACTTTTTTTTCGCCCCTGGGCTTTGAATGCCACACCCACTGGTTTCTTAACATGAT a score=10160 s mm8.chr4 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TGAAAGTCCAGTTCAGAGTTTCCCTGTGACCCTGG-CACGACCAGAAGGGA------AGTCTTGGCTTTGTTTATTATAACAAGAGCCACAAGACTCCC-AGGCCAATAAACATGTTCACGTAAAACTCCAGA-----CAGCTTC------TCTAGACTGGAGTCTTATCATGGGAGACCTCATTTTACCTCTAGGTTAAGGGAGAGAAGTCTATGCCTCGGGCTTG----TCCGGGTCAGTGCTGCTGAGAGTTCACAG-TGACCCACCTGAAGCATTTTTCCCCAGAATGAATGACTGTCCTGCCTGAGAACAGCACAGCCCAACATTTGCCCCCACATGGCCGTAGCGAGCAGGTTTCATTTAGAAGAAAAGCAAAGAGGGGGAAAGCCTCCCTCATTTCTCCTCAGGACTGCAAACACTCAGAAATGACATCACACACCCCACAGAGCCCTGGCATGACTAAGGCA-----GAAGTAGCCTGAGAA--AACTCTGCT--------------------CTGCCCTGAGTTTTAGGGCACAGT----------TATGCAGATGAGCGTCTGGGCGCAGGTTCCCGCCTTCTTCCT---------------CTGAGGAAGTT-TCTTGGTAGATCACTGACACCTCATCCC----------GGCGAGGGGGTGAAAACTTGG-----------------CACCCGCCACCCCACCCCCCTG--------------TCCCGGGCAGAGCACCAGAAAGAGCTTGGAAGCAAGGAGTCGGCAAGCAAACAATGAAGGAGCAAGGGGGCACCGTCAGTGGCGCCGCGAGCAGCCGAGGTGGAGGAGACTCGGCTATGGCCAGCCTGCAGCCACTGCAGCCTAACTACCTGTCTGTGTGTTTGTTTCCAGAAGAATCATATCAGAAACTAGCAATGGAGACGCTGGAGGAACTAGACTGGTGCCTAGACCAGCTAGAGACCATCCAGACCTACCGCTCTGTCAGCGAGATGGCTTCAAACAAGGTAAGGACACCTCTT s monDom4.chr2 516580883 951 - 541556283 TGAGATTCCAGTTCGTGATTTCACTGAGCTCAGGATCCCCAGCAAAAGGGAGCCTGAAGTTTGCTCTTTGTTCCGAAGGATGAGAGCCCCAGGACTCCCCAAGCTCACAAACTTCTTTCTTCTCCACTCCAGGAACTGCAGCTTCCCACCCTCCCGCCTACCTGCCCAAGTCGGAGCCCCTCAGTCCA-----AGG--AAGGGGGCGGAGTGGGGGGCTGAGACTCTGCCCTCCTTCCTAGAGAGGAGCAGGGTTTGGGGCTGGCCCGGCC--------CTTCTAGGCAGCGAGGGAGCGAGGGGCTTGAGGTC------TCCTGGCTTCTCTCCCC-------------------------TTTGGGGAAGAAGCGCGTGGCCACAGTTCCCTTCTCGGTCAGCCCCCAGCCCTC---CTCTCTGCTGTGACATCACACCGCCCA--GGGCTGCTGACTCAGGAAGGCACTGAGAAAGGGGGCGGAGAGGCAGCGCTGCTGCTCCCTCCCTAGGACTCCCCTGGCCTCAGCAGCAGTGGCGGGTGCCCTAATCGTATGCAGATGAG------GCTGCCAGTGCCCGCCTCCTCCCTGGCCTCCTCCTCTCCCTGTGGTGCCTAGCTTGGGAGCTCAGTGACACTTCGCGCCTCCTGCCTGAGCCGAGGGGGCGGGAGCCGGGACGGCATTGGCCCGGGACCCTCGCTGGCGCAACCCTCTGGGGCTTTAGTCCTCCCCCAGGCAG-------GAGCGAGGCCAGAG--AGGTGGCCCCCGGCCTCATGATGAAGGAGCGCTGCGGTCCCTCCAG---CAACCCGAGCCTCCAGCCCG---------CAGCCATGGAGCGGCTGCAGCCAC------CTAACTATGTGTCGGTGTGCTTGTTTGCAGAGGAGTCCTACCAGAGGTTGGCCATGGAAACCCTGGAGGAGCTCGACTGGTGCTTGGACCAGCTGGAGACCATCCAGACTTACCGCTCCGTCAGCGAGATGGCCTCCAACAAGGTAAGGATGCTCCCT 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TGTCCCAAAGCCCATATTTCCATCTTCAGCCAAGTTATATTCTGGTCAGGCTGTGAACCATCTGCCTGCCTAGCCATCTATTTATTGCAGGAAATGGATTCAGCCCCTGGATAGACCGGAGGCCAGTATTTATCATCCAGTTAGGTCTAATC-AAAATATTTTCAGTTTCACTCGGTAAGCGCATAGGGCTCCAGAGAAATGCCTGAGTGATGGGGAAGGGACACCATCTTTTCACCATCACTAAAGTCGCCGATTCTCCAACCCCTCATTGCTCC---------------TCAATGTTTCATCCTGGCCTG--AAGAAATCCAATCTTCCTCCCTAG a score=5378 s mm8.chr4 103006959 441 + 155029701 AAAAAAACAAAACTCTGAGATTGAGCTGGGAGCAGGAAGGGAAGAGGGCTGAGGTCAGAGGTGAAGCTGGACACTGA--GATTAAAGGAATTTGTGTGCTAGAATCCCCTGGGGTA-GTGAGTGGGATGGGGGAGGGGAGAAAATGGGGCGGGGTGA--GGCTGTCAGGTGGTGGGGAGCTGAGGAGGGA-------------------------------ATGGGTTTATCACAGATCCCTCAGGTAAAGAGGGAGTGGGGAAGGCACTGTATGCTCAAATGA-AAGGTG--GGTTGAGGTAGAATCTCAGTCAGATTTCTGCATGCTCTCTCTGCCAGGCTACCA--GAAGGAGAGTACCTGACAGTGCCTGTTAGAGGAGGAGAAATGGAAGAAATTAAGCAGGGTTCTATTTGGGGAACCCCTCGAGAC--TGGTAATGGAGGAGCCCT-GCTGACTGCATTGCCCAGGGAGTCCTGTTTT s monDom4.chr2 33736691 444 + 541556283 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AATAAAAATGGAAGAAGAAATTGCTGCCCTTGTCACTGACAATGGCTCTGGCATGTGCAAAGCTGGCTTTGCTGGGGATGATGCTCCTTGGGCTGTGTTCCCCTCCATTGTTGGACGCCCAATACACCAGAGTGTCATGGTGGGAATGGGGCAGAAGGACAGTTATGTTGGTGATGAAGCCCAGAGCAAGAGAGGTATCCTGACTCTGAAATATCCAATTGAACATGGCATTGTTACCAACTGGGATGACATGGAGAAAACCTGGCATCATACCTTCTACAATGAGCTTTGTGTAGCCCCTGAGGAACACCCTGTTCTGCTTA-----AACCCCTTAAACCCCAAGGCCAACAAAGAGAAGATGACACAGATCATGTTTGAGACCTTCAACACTCCAACCATGTATGTTGCTATTCAGACTGTGTTGTCTCTGTATGCCTCTGGTCGTACCACTGGTATTGTTATGGACTCTGGTGATGGTGTCACCCACACTGTGCCCATCTATGAGGGTTATGCCTTTCCCCATGCCATCCTTCATCTAGATTTGGCTGGTCGTGACCTGACAGACTACCTCATGAAGATACTGACAGAAAGAGGATATAGCTTCACTACCACAGCTGAAAGGGAAATTGTTCAGGACATCAAGGAGAAGCTGTGCTATGTTGCCCTGGACTTCGAGCAGGAGATGGTCACTGCTGCTTCATCCTCTTCCCTGGAGAAGAGCTATGAGCTTCCCGATGGCCAGGTGATCACTATTGGCAATGAGAGGTTCAGGTGTCCAGAGGCCCTCTTCCAGCCATCCTTCCTGGGAATGGAATCCTGTGGCATTCATGAGACCACTTTCAATTCTATCATGAAGTGTGATGTTGATATCCGAAAGAATCTATATGCCAACACAGTCTTGTCTGGTGGTACTACCATGTACCCTGGAATTTCTGACAGAATGCAGAAAGAAATCACAGCCCTGGCACCTAGCACAATGAAAATTAAGATCATTGCTCTCCCTGAATGTAAGTATTCCATCTGGATTGGGGGCTGTATTCTGGCTTCTCTCTCCATCTTCCAGCAGATGTGGATCAGCAAGCAGGAATATGATGAATCTGGCCCATCCATTGTCCATTGCAAATGCTTCTAAATGGGCTGCTAGCAGATGCGTAGCATTTGCTGCATGAG-TATTCACAAAGTAAAAAGTTGCCTTGGCAAA--TATACACCTCATGTTAGCCTCATGAAACTGGCATAAGCCTTCTTTGAAAAGAAACTTGTCCTTGGGGAAGTTTGTATCTGATATTAGACAAATATCGGCACTTTTTAGATTGTTGAAC-TGTTACTGA--TTTGACCTCGTATTCAAGTTAACAGTTGTTCCCTTGGTGTACATTTTAGCATACCTTGTACATATCTTTGATCTAAACCCTGATACAGGTCACT---TCATTTTGACAGGTAAGGCTGAGTTAACTTCTATAGAGAATCAACTTGATAACATGACAATATAGTATCTGGCTGGTTGACACTCAACAGCTGTACAGTTTAGTTCTATAAAGCATCAGATTTGTACAGGGTATCTA--AAGGTCAGATTTCCAGCATCTAAAAGAGCTGACTTATATAATTTCTCTCCTAAGGCTGGCAAGAGTTTATTAAATGTATGTTACATCTTGCCATCATCCTAGCAGGAACACATAAT-GAATCCTTAGGAATTGTTTTTTTTTTCCTTAACCCACTGTTTTACCCCTAAGTCATGGGGCTAAGTTACTCAACCTTGAGTTGCAAAAAAGTTGCATTTACAACCTCTGTAAATTTGTGCATCTAGTTAATTTATGTAAGATTTTTGTAAGTTGCCTTAATGTTCTCACATGACAGTAGAATACCAAAATTTGTAAGTTATCCTAAGAGTTGAGAATTGTAATGCC---CAACACATCATTGTGTAAGGAAAAATAAAAGTGCTGCAAGTAAACTGAAAAAAAAAA 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TCTCCTCATGGCCTAAGAAGACCCAGAGTCCCACAGAGAGTAGCCTTTTCCTCAAAGGTGCTGTGTATCTCCTTAAGCCAAGAATATGAATTCTCTTTGGATATTTTTCTATTTGGATATTAAGCATCTGAGATGGAAACATTCTTTCTATGACTATCATTTCCCTCAT----ATGTTAAATAGAGACAGACTGATTTTTTTT-----------------------TATGACCATGGCTTTGTGTATTGTGAGAACCCTAGTAGAGTACCAGTCTCATGACTGTCACCACTGTCTGTGCCTCC-------AGCCCTACAGGTTTCTACAGTTCTCCTTATTGATGTGATTGGCAACTAACTTGAATTATGTGGGT-CATTGGAAATCCC---CTTTCTCCATGACA----CCTACTTCAATTTTTTTTTTAAATTTTCT s monDom4.chr2 467521137 376 - 541556283 TTTTCCCCTGATCTATGGCTAGCAAGAGTCCCAC-------------TTCCT-----GTTCTGCTGATCTC-------------TATGAAT--------AAGATTCTTCAATTT--------------TGAGACAAAAACATTTTTTCCCCTATTACCATTCCTTACATTCCCATTTTCACACAGTTCAGCCCTCTTCTTTCTACAGTTACTCTAGTTCATCCCCATATGTAAATATCTTTGCCTTCTG---AAATTTTTGTTCTGCTTTATTTTTCAACTTCTATTCATTCTCTGTTTCTTCCTTTGATAGCC-------TTTCCACATTCCCTATCTAGGATGAGCTAGCCCAGAAGATCGGTATATTTCTCTCCATTGCCAATTCCAGACCTCTCCTCTGATATCACTCTGCAGCAACTTTTATTTTAACTTCTCT a score=-1447 s mm8.chr4 103071639 664 + 155029701 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GCTGATGGTTACTATCAGGCCCAGCCTTTATTTTTCTCATGGTGTTTAAAACCCACCAGTTGCCCAATAGTATAATTTCCTAAATGGTTTCATTTCAGCTCTACTAATTAAAGAAAACTGAGCTGCCTTTGAAGGCTTAGTGTGT----------------GTGTGGCTGTCACTGGTGAGTGTCTAGACTGGCTGTCAATCACTGACAATAGCTTGCCGTTCGGGAATAATTTAAGTTTAGGTCTTTCTTTCACTCAGGCATTCATGCTCTGTTATGTGTTTTCATACTGAGTTGAGAACAATCTGGGGTGAGAAACTGTCATGTGTTC------TGAGAGCTAAAAC s monDom4.chr2 33950049 349 + 541556283 GCTAATTGTAGACACCCAGCCTAGGGTTTATTTTTCTCATTATGTTTAAAACCCTCCAGTGGTCCAATATTGTAATTTTCTAAGTGGCTCCATTTCAGCTCAGCTAATTGAACAGATCCAAGCTCATTTTGAAGGTTTTTTTTTTTCCTTTCCTTTTTCTGGTGCTTCAGTCACTGGTAAAAGTCTAGACAAGCTGTCAATCACCCACAATAGCCGACTCCACTGGAATAATTTAAGTTTACACGGCTCTTTCATTCTGGCATTCATACCCTCCTCCATGTTTTCATACTGAGCAGAGAGTGATTTGCGGGGCGGAGTCACCAGAAATTTCAGGGATGGGAGATAAGGC a score=11509 s mm8.chr4 103146448 289 + 155029701 TCTTTTTTACACATCCAACCCGACAGCAAATTGGCTTGCAGAAGATGTAGGTCGTGCTCTGGGCCCGGCATCTGGATGCCTTATATTGTAC-ACTATATTACCGGGGTAATATCGCAGTCTTTATTAGCACCAGCAGGATTTGGGATTCCCATGGGAACTGTTCTTTGCTGTCGGATGTATGAGGCCATTTAATCTCTTTTATCAGATCTGGTGCTGCCTCCCCGCCCCCACCTCCTCTTGCAGACCAATAAAGAGAGATTTTC-AGATTCATTGGTTTGAAAGCTGGCTT s monDom4.chr2 33970923 279 + 541556283 TTTTTTAAACAGATCCAACCTGGGAGGAAATTGGTCTACAGAAAATGTGGGTCATGGCATGACTCTAGCGTCTGGTTTCTTGATATCATGTGAGTCTCTTACTAGAGTAATATCAAAGAGTATATTAGCACCAGTGGGATTTGGGATTTCCATAGGGACTGTTCTTTGTTGTCAGACTCATAAGGCCATTTAATCTCTTTTATCAAATTGG-----ACCTACTCTCTCTCTACT-------CACACAGATAGAAAGAGTTTCTCTGGTTTCATTTGTCAGAAAGCCATCTT a score=2350 s mm8.chr4 103153929 81 + 155029701 TGGTAACAAGGCTATTAATTTCCCAGGGTTTCCTTTATCGAGCCACACAGTGAGGTGATGCTTAACCCAGCAGGAGGGAAG s monDom4.chr2 33990492 80 + 541556283 TGGTTCCCAGGCATTTCCCTGGCCAATGTGTCCTTTATTGCATAGC-CAATGAAGCTCTGCTTACCCTATCAGGAGGGAAG a score=9655 s mm8.chr4 103156367 235 + 155029701 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tttaaaatataattctgttttattttaatGTATTAGTCTAAAGCCCTTTTAAAGGCAACAGGGTCCTTTTAAAAACTAGTTATACAAGGAACT--TCAATATATAAAACAGAATAATGACAGTTGCCTTTGCTTAAAAAGAAAGACCTGAGCCCCAGGTACTTCTTTCTTCATTTATCTCTAATTT s monDom4.chr8 211916748 172 + 308469712 ATTAGTATTATATTTAGGGATATATTAATCAAGTA----AAAACAGTT---AAGGTTTTAATTTTCTTGTGATCTCTGTTTTTCTGGGCAAATAACCAAGACCTAAGCTAGAAT-------TTTGCCTTTCCTTAATTAGGGGGTTTTGAATACTGGAAATTCCCTTTTGCAATGAGCACTCATTT a score=1528 s mm8.chr4 103441217 125 + 155029701 CTAGTTTTATCC-AGGTGCTAATATGACTTTTCTGGGACA-TTCTCCCTAGATATCTGTTGATTTTACCTTTTTCTGCTGTTACCCATGTTTGTTCATGCTATAGATGCTGTATCCTTGTAGCAAAT s monDom4.chr4 214437691 122 - 430141050 CCAGTTTTCCCTGAGTTGCCAGT----TCTTTCTAGCTCAACTCTTTCCATAT-TACCTTACTCCTTCCTCTCTTTATTCAGACCCCTGTTCTATCTAGTTATAAGAGCTCTTTCCTTGTATAAAGT a score=8859 s mm8.chr4 103444467 294 + 155029701 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tcatacaatctaaccctgtcattttatagttgaggaaactgagaatttggaatgatttgacctatgaaacacatttagtaagtgcttaaggaaggacttgaacccgtcttcctgacttcaag---tccagaatgctatccactgcaccatactgcATTTGCTCATGTCACTTATTCCATTTTGGACCCCAATACTTGATCTCCCCAAGTTTATTTTGAAAGCTGAATCTTGCTG-CAAAATTTCTATTTTGATCCATCTGAGCCAAAAAAGCCAAAACAAATTACTTCCCAACAAGAAGGCACCCAGGGAAATAGCACATCCTC-TAGTCACCA----TTTGTTTCCTGCCATTTTGAGCCCCATCTCCTGGCTGTGAGGGTAAAGAGTTGTCTTTCCAGAAAGGCACCCAGGGAATAGAGAATCAAGGAATAATTGACTTGTCTTGCTGTGTTTGTGAGCACGCATTTGTATCTGATGGCAAATGTGAAAGCAGTCTTCTGCGTCAGTCGCCGGCCATCAAATTTCCCCATCTGA--ATGCACCAGGATGGGGAGGCCAATCCC---AAAAGGGAATGTTGTGAATTAGCATTAATCACACCATACCTTACCT--AGCCCTACAAACCGAGCTGCCTGCCTGAGGCACACAGGAGAGGGCATCCTTTGGGTGGATTGGGAGTTGGGGGGTTGGGTGAGGCATGATTTGCAATATAATTTAAATAAAGAATCTGAATCTTTTCCCATATCTCATACATCACT-TGAAAAAGTGATTGTCACATCCTCAGATGATGTGAATCAGCCTGTCTACTAGCTCAGAAAAAGAAAGTTTCCTGGGACATCTCAAGCATGCCCCATTTATTTTGTATT-CTCCAAAGTTTACTTTAGCTTGTTAGGCAC------------AGAAGAAGGCAGAAGAGAAGCT-------TTCATGGTCGTGCAGCTTCTCTCCTGG---------TTGTTGGTTTG---TTTTTGTTTTTGTTTCAAGAAAGGGTTT-------CTAGTTTTTGCTTGTTATTCTTATTCCTGTGGGGCAGGGGAATATCGCAGGTATTCTGACTGTACAACTGTCTGCCTGTTAGTTTCTTGAAGTTATGTATT 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AGATTCCTCAGT-----GAGAGTGTATTAAGCATCCTTCAGAAATTCCCTTGTGCTGTATTAATTT--TATCTTGATTATTTCTGCCATGCACTTACGAAG------AAGGGAGACAGCTATCTGTCTATATTGAATGGTCTCATTTGCGTCTTGCCAATGTAAAGGTACGAACTGAAAAAACCTCCTACATTACAACAG--CAAATTGCTTATGGTAACCATTGCATAATGAA---GGAACACAATGAAGAATTACGGTTCAAATTACTTATCAGGTCTCTTCCATTTTCTAAGTTTTTTTTAAGTAGAAAATTGCACAGTATAATTACAGTAAGTTAATTTGCATTCATATTACAATTCAATGAGCAATTACATTCtttttatttaaaaaaatattttatGAAATGTGATTTGCATCAGTATGTTTCTAGGAAAGAGTGGTGA--------CTTTTTCCTTGTGA s monDom4.chr2 34750949 459 + 541556283 AAGTTCCTCGATTAAAAAAAAATGTATTAAGACTCCCTCTCAAATTCCTTTCTGCCACATTAATTTCTTATCTTGATTATTTGCCCATTGTACTTGGGGGGCTGTGGGGAGGGGAGAGC-ATCTGTGAGTGCAGAATGTCCTCCTCAAGTACCTGC-AATGTAAAGGGATGAACT---CAAACATTTTACATTAAAACAGAACAGATTGCTTACGGTAACCATTGCATAATGAACTAGGGATACAATGAGGAATTACAGTTCAAATTACTTATCAGGTCTTTTCCATTTTCCTAGTTTTTTA-AAGTAGAAAATTACTCAGGATAATTACAGCAAGTTAATTTGCATTCATATTACAATTCAGCGAGCAATTACATTCTTTTTAGTTAAAAAA--ATTTTATAAAGTGTGATTTGCATCAGTATGTTTCGAAAGAGGAAATGGAATTAGCCACCTCTTTCCTTGGGA a score=1696 s mm8.chr4 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TCTTCCGATCAGCCCTTCTCAGTAGATTTCATCCTGCCTATGACCTCAGGACTTTTTTTTTTTCTTGTCTCTATGTAAATTGCTATCTTTTC------AGAGGTGCCTGACAGCCAAGTTTTGCA-GGGCCTCCATTTGTACAGA-GCTGTTATTATGGGATAAGTGTAATGGCTCGTGAATTTTGTGGAGGAAGGGAGGGTCTCCAGATGACTTTGTACAAACCAGCCACGGACCTACTGACTCCACAAGCAGTGCATTAGGCTAAATATTTTTAGCCCATTGACTCTAGAGGTAATAACCCTAAATGCATCATTAAATTTTCATGGGTGAATAACAGAAGCTACAAGAAAAAATCCCCCTCCCCAAGAAAAGCCCCCAAAACAAGCCACCGCTTTAGCTTTATTATCGCTCAGCTG---GAGGGCAGGAGTGTGACCCCTCAAAAGAAGAGTAAACTTAAA s monDom4.chr2 34757958 419 + 541556283 TCTTCCATTGAACTAGTCTCCCAAGATTCTATCCTGCCAATGACCTCA----CCCATTTTTTTCTTGTCTATATGTAAATTGCTATCTTTTTCGGGCAGGAGGTGTGTGACAGCCTCCGTTTGCATGGGCCTCCATTTGTACAGAAGCTGTTATTAGGGAATAAGTTTAATGGCTCGTGAATTTTGTGTAG-AGGGGAGGCTCTCTTGATGGCTCGCTGTGTGCCAGCAATGGACCTCTTGGCTCTCCAGCAAGTGCATTAGGCAAAATATGCTTAGCCCATTGACTCCAGACGTAATGGCCCTAAATGCCTCATTAAATTTTCATGGGTGAGTGAGAGAAGCCATGAGAAAAC---------------------------------CCACTACATTAGTGTTATTATTACACAGCTGGAAGAAGAAAAGACTGTAACC------AAAAAGAATAAAGTCAAA a score=-3231 s mm8.chr4 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AGAATGGAGTAGGGAAAACAAGTTAACTGGGGCCTGCGTGCCCTCAGGGGCACAGGAGGCTGCCTAGAGCGGATTGAAATAGTGACAAGTGCG-GAACAACTTT-------GCCTGGGAAGCGGCAA-TAAAAGGCGGGCT-------GGAGCCGGCCTG--GGCGGCTGGGAGAGGACGCCCCCTTCTGCCAAGGGGCTCGGGGCAAGAAGCTCGCGCGGCCTCCGCTTGGCTCTGCGCCCGTCTACTTGTGAGCATAGAGGCTTGGCTAAAAGCAGGCGCTGGAGAATCAGCAGAGTCCTAGA--GGGGGCTGCAGCGGCTGCCTAGGAGCGTGGCGG--------------GCTCCCAGCGCAAC--CCCCAACCCCACCCCCTGCGACGAACCGCAGGGCGGGGACCCCAAGCTCTTCGCTCCGATCGGTCTCTACTCCCGGGATGGGGGGCGAGCGAGGGGGCTGGAGGAGCGCGACCGCGAGCCGCGGCGCCCCCGCTCGCCTGCTCGTTGGC------------TCTTCCCCTTCGTCGGCG-CCGCGGCGACTCCGCTG--------AGCTGTCGCTCGGAACGCGTT--CCGGCGGCG----------AACAGAGCGCCCTG----GCGGGAGAGGGAGCCGGCGAGGAAGGGCTTGGGACGCTCAGTGGCAGGTGAgcggcggggctggcgcggggcgggggccgcgggAGGAGGCGGG---------TCTGCGCACCGCACGGGGGCTGGTCTCCTCCCCCTGCTCTGACGCGC---GCCCGT------CGCTTCCCGGG---GAGGATGGACCCAGC---TCGGCGCTCACCCGGGCTTCCCC----------GGGCTGGAGAGCGCG---------------------TTTGAG---------------TGCGGCCGCCCGCA----GGGCATGGAGAGCCGTGTCCCGGGCGGCTGCGGCAGCCAAGGAGGATGCTCCGGGGGAGCCGAGGTGAG-------------AGGCGCGGCGGGGGGCACGCGGGGGACCCCGAGTTGAGCGGGCGCAGGTGGCCCGCGGGGACACCCGGCTTCCG------------------------------------------------------CGAGCCCGGGTAGCTCGGCTGGGGCCCGCGAGCCCGGGTACGGAGGAAGGCTTTCGGGGCGCTTCTCTAGGGAGTTTGG----CGCGAGGTGCCGTGCACTAGCGAGT---GCCGCAGTTTTCTATCATCTCC---CACCACTTGCTTGGGAAG----------------------------------------CTACCCTGCGTCTCCTTTCCGGTTGGTCCCCACTTCCTTCGTCC---TACTTCTGAACACTCGGGATCCTCTCTTTAGGCTTGCCTACCCGAGACCCCCTGTGTTCTCCTGCGGCTCTAGCCACCCAAGG----CTGCCTTCT------------CCCACTCTAGAACCTGCGGAGTTCTCCCTAAGCTTCCTCCCTGTCTTGCTGGTGCTACCCGCGGGTCGGACCTCTTCCCCACTCCGCGGAACCTGCACTTCCCTACATCACAGCAGCGCTTTGGCTCTGCCTCGAC-CACTCCATTAACTGGACCCATCCCAATCAAGCCAACCCTTTCCGCAGACACCGGCGCTGGACCGAAACCTTTCTTCGGGTCCTGCGACCAGGTGTTCCCCGTCGCGCTCCCTCCACT--ATTCAGTCCTCAGGCCCTTGGTCACCCGCCACTCCCCTCGCATCCGGCCCTCTTCTACCATAA-----CTCTGTACCCTACTCTCTCGAACGCAAGATAAGGATTTTTCATGCTGGGGAAACTTTGATTCTTTATGGTTAGTCTTGTAAAGGAGCCCTACGATTCAGTCCAAGCCACCAAAGGAGCCTGGAGTCAGGGAGTCCTGATTTAGGGGTAGTTTTGTGTTAAGGCTCCCGGAAGGTACTTGGTGATTCTACAAAGTGTATTTCCA----------------------------------CACCCTGCTGGTCACTGCTTCTGCTGTCTGCATCCCGCAGAGTATGCTTGTGACCCCTGGTGGGAGGGTGAGTCTTTACTGC---ACTTTTAAAGGCGCTTTTTCTTTCTTTCTCTATTTCTTTTGGG----GTTG--GTGTTAGTG--------------GACTCGGCGGGGTGGGCAGAGAAAGCTGCTTTGCAAACTGGTGC-GGCTAGGCTGCCACACGGTCTAGTAG--------TCCACCCTGCACGCCCTTTCACGTTGGG-AACCCG-------------------CCCCAAC------CCCCATCTGCATCACACAAGTCCTCATTGTTGGGGGTCTGCG--GGGTATTTCCGC---CTGGGCTATGAGAGTGAAGGAATGGTATGGGGGCGGGGAGCCCAGGGCTC------TAGGCGACTGTCGGGAGCTGGAGA-----------CTTGGAGAGCGCCGCGGCGCGGGCAAGTGCTAGTTCGGAAATGTGTTTCTGAGGCAGGATTCGTGGCCGCGTGGAGGGGCGGAGGGGGGGGGGCGGAGAGGGAGGGGgaagggagggaggagagaaagaaaagaaagaa s monDom4.chr2 34771404 2472 + 541556283 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AAACCATGTTGCAGGGAGCGGCTGTCAGAGCAGCAGGCTAAGGCTG--CTGGCTATTTTTTTCCTTTGCTGTGACATCTCTCCGTGTGTGCTTGCCTCTGATTTGC-------TCGGATTCTGCCTCTGCCACTC-GGCTTGCTCTCAACCTCATCCAATATTTCTTGTTACCATTTGGGGACCATCTGGACCTCAGCAGTAGTC--TCCCCAAGAAG--ACACAGCATCAAGGAAAGTGATGGACTCCGTTGTGTGTCCTGCCCTCTTCC---TGAAAAGTGGGCTGAGAGCCTGTCAGCCTGCTGACAGGAGCCAATTTCACATTCCTGTGACTCTGA-TTCGCTCCCTTTGCAGGGGCCTGAAGCCATGCCAAATCTTGTTAGGAGGTTTTGAAAACTCCTTGAGTTTTGGCTAATGTGGACATAGGATAATAGAATTTTAAAAGGAGAAGAGAGAAAGGAAGAAAGAGTTA s monDom4.chr2 35185140 465 + 541556283 AAAAAATATGGCCTCAAATGGCTGTCAGAGCAGCCGGC-AGATCTGTCCTCATGTGGTCTTCCCTTTGATGTCACATCTCTCCATGCATAATTTCCTCCAATTTGCTACAATTTCAGTGTCTGCTTGTGCTTTCCAGGCTGAGTTTTACCTCCATCCAATGTTTCTTATTGGCTCTTGAAGGCCATCTGGGCCACCATTGCATCCTTTTCCCAAGAAGTATTTCAGCAAGAAGAGAAGGTGCCTACCCCTCTGTTTGCCCAG--CTCTTCCAAGCGGGCAGTGGGCAGATATTCTCTT--CCCACGGGTAGCAGCAAATGC--CATTCATGGTGCTTTGAGTTCCCAAAACTTTCTGTAGGTAGGACCCAGGACAGACTTTTTTAG--TGTTTTGGAAAGTACCTGAATGTTCACCAGTAAACAATTCAGTCAGTAAGCATTTATTAAG-TATGACTTAAGTCAAGAAGCAGTTA a 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agcaaagagatgagattgagtact------tggctctgcattacaaag-atctggatt----caaatcctacctggagagcagctgagt-----gtgactctgggcatctagatttacatcat--ctgtaaaataagggAAACTGTGATACATCCCTTATCAAAAGgttgcaaggctcaaatgatgtaatgctatacaatcctttgcaaactggaatgtgccatattaatatcatttattatcacttGCTGAATTGGAATGAATGG-----------------AACACACTG------ATATCTTCTT------CGGAGGTGACAGTCTCATGCCTCCTCTAGGTAGTCTCCCATATTTTCACTGGCAGCAAAATGATTTGTTATTGTTGTTGTTGTTTTATGAGA----ACCATTGGGTGTTTGTCAAATTTATTTAAATCATCAATCATGTTGTATAGCTATTTTCTTTTTTATATTGGACACACATAATGAGATTTTGGACACTAAAATGTTTTTTTATTAAAAGCTATGATCTAAAGCCCATATGGGGAGGCTAACTCATAAATCCATAGGAGAAAACAAATTTATAAAGGTTATAAAGGCATAGACTTAA-CTTTTAGACCACGCTTGGGATCA a score=9665 s mm8.chr4 104211450 354 + 155029701 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AATCCCCTTCCAGGGCACCTGCCACCTGGTCGGGCTGTGCCGCCTTGGGCTCTTCTGGAAGAAGACTGACTCCCCCTGGGCACCACGGAGGCCTTGGCTTGGGGCTTCCAGGCCCCCACCATGAGGTGAATTGAATGG-GGTAGGGACGGAGGACAGAAACCTTTAGC----TAAGGCGT----GATTGCAGAAACAG-----GCCTCGGCGATGGCAGAAGACAAGGAAAAA-TCCCGTCATTGCTGACCTCTTTTCCAGATGGCCCCCCGGCCCCCAGATCGGCTCGGCAGGAGCGAAGTCCTTCCAGATCCACGAAG-GCCGGCCTCTCTTTCCCCTCAGTGGAGACTTAACGACTCTAGCAGGGGATTGGGGATTAGGGATGAGAAATCAAATCCCTGCGCTCTCCCCTTTTATCTGC-----CCGGCCCTTCTCGCGGCCACGCACACAGAATGTCTGCTGGTGCTCTTTGGGCAGCCCCAGA a score=14647 s mm8.chr4 104698575 587 + 155029701 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agacaggtgaagtcatgtgACTGCAAAGGACTAGAATGATGAGACTGAGACTTACTGGCTCCCAGGTTGCTGCTCCTTCCTCCCCAGGAAGGCTAGCCTAAAGACCCTCTCCATTTCCCCTCCTGAATGGAACATCTGTAAAGATGTGGGTAGCTGGGCTCTTTTTCACCACAAAAGACAGGAAGAGGCTCTCTCTTACAGTTGGAGACAACCTCCCAACCACTGGCTTGCCGGCCAGGACCCGTCCCTTTCTGTCCCCTTGTGGCTTAATTGCCATGCCTTCCTC-TGTATGAGTTTCCAGACTCTGGGCCAAGCTCCTTAAAAGGCAGGTAGGGGAGAGTTCTCTGCCG-----GCCTGGCAGCCAGCCATCCCCCCCACACCCCTCAGATCCGCTGCTAGCTGCTTCAGAGA----TCAACATAGAAGACATTTTTTTTCCCAAAGTGAAACTTA----TCAGAACTTTGCTGACTGTGGCAGGAATGAAGGCCCTGGGGGTGGGGACCAAGCCTTTGGAGGAG-----------------GGGTGGGGTGCTCATTTTATGACCCAGGAATGAAAACATTGTGAATAATGAATAAAGTCCGAAAGTAGTAAATCTGAGACTCCAGAGAAGGCGAGTAACATGTCAGGGAGCGGTTTAAGCCTTCGCCCCTCCTGCAGAGGTGCG------------------GCCCAAGTTTCATTAA-ATAGCCTTTAAGGGTTAGGATTACAAGAAGCCCAGTCCC-CTGGTTCATAATGATGATTTATGGCTGTGTTGTCGACTCCGCGACCCTTCTGT---ACAAGGGATGGAGAAAATACATAATTTGCTGCTCATTAACTGTGCAATCTGTCAGGGCGGCTCCAGAAGCCATGTGGTCCCGGAGCCTTGCGT-CTGCTAAATGGCTTCAGCAAGGCTGTCCTGG-----AGACACAACTG-CTCCTCCACCATA----GGAAATGGTTTTGATAAGAGTGGCACTAACAAGCTGGTAGC 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agacaagcCAAAATGTGTTTATGAAAAAGTTTATTATGCTCA--CTGAG-----------CTCACCTCGCTGTTACCTTTTGCCCTGGAAGGCTG-----AAAAACCTCTC-----------------------------------TGAGATGCCTGGCCGTGTTTGAGCCCG-------------GGTCCCATTCTTCATCCGGGGGCCGAGGCC--AGCCCTGTGCCGCCGGCTGA------TTTAGCTTCGGCTCGGTGTAGCCTAATTGTGCTATTTCCCCAGTTTATTAGTTTCCAAATGTTGTGCCAGGC-ATTTCAGGGGCAGGTAGAGGAGACTTCCCCTCAGCATGCTCTTGGCAGGCGGCCATCCCTCCCAGAT--------TATATTGCCGGCTGTTTCAGAGAGGAATCAGCGT-GAAGGCATTTTTACTGACA--GTTAAACTTAGGGCTGGAGGCCTCGCTGACCAGAGGAGGAATGGAGGC--TGGGGGCCGGGGAGGGATTCTGGGAAGAGCAGAAGAGATCTTTTCTAGGGGAAGGGCTCATTGGACTACTCTGCTAGCAAAACATTTACCAAAATGGAGCAAATCCTAAAGCTGTAAGACTGGGGACACTCAGCCTTGGTGTA------CACGGTAACCTCGAACCCTCTGCATCA---GGAGAGGCGGGAGACTTTGGGACTGATTTGCCCAGATTTCACTAAGAGATTTCTCAAGAATTGGGATTATAAGAAGCCAGGCCTAGCTGGGTCCTAATGTTGATTTATGGCTCCTTTGTCAGTGCGGCCAACGTCCTGTGGGACAAGAG--GAAGAGCACAAATAATTTGTGGCTTATTAATGGCTTGAGCCTGTGGACCCACTGAAGAAACAGAGCCGGGCAGGGTCACCGCGGACTCCTTAG----CTCACAGGGGCAGCCTTGGGGCCAGGCCACAGATGCCTTCACAGTCATAAAAGGAAAATTGTTTTCCTGACTACAGCA-----AAAATGATAGC 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ACAGTCACCACCTACAAA---------------AGCCAGAGTAAACCAAGAGTTGCTGAGGACACCAGGCATGAAAGGGTTGTAA-GTTCTGGGCTTTCCAACAATAAGCTGCTTTCCTGCAGATGATTTTAATAATCCCCAGCACATGTGTTCTAACCTCTTGATGCTGTACAATATGTGTAACCAAATAAAAGATCTCTCCAGATTTGGAGATTTACTGTTTGTGATGGGAAAAGGCCAACCAGATGACATCATTTATATTCCAAATATGAGCAGCTGCCAAGGCTGGTGATGCTAAGCTGGAGAAATTGAT----------CCGCAGCGTTATTCTATGAAGCAAAAGAAGGGGGGAAAGGTCTTGGCCTGCATGGTGTCTTTTAAAAAAATTTA s monDom4.chr2 36318446 389 + 541556283 ACAGTCACCATCGATGGAGCCTGGGGAAAAGGCAACCACAGGGAGAAAACAGCTGATGGAGAGAGCAGGCGAGGAAGGCTCCCCCCACTCAGGGGCTTCCAG-AACCAGCCCTTCTCCTCCAGATGATTTTAATAATCCCTTTCACATGTGCTGTGACCCCTCGTTGCAGTACAATACGTGTAACCAAATAAAAGATCTCTCCAGAATCGGAGATTTACTGTTGGTGATGGGAAGAGTCCAACCAGGTGACGTCATTTATATTCCAAATCTGAGCCGCTGCCAAGCTAAGGGATGTTTTTCTGGATAAAATGATCTTTTACCCCCTGCTTCTTTCCTTTATGAAACAACA--------CGAAGGCTTTGGCGTGGCTGGCGACTTTGTCAGAAAGTTA a score=3743 s mm8.chr4 105188859 154 + 155029701 ATCTTCTGATTTGAACCACAAAGCTTTTAGAGCGCCAGTATTTTATCTACATTTGATCTTCCCCAGAAATT--GGAGTGGCTTCAAGGCTTCAGAAAGCTCTCTGCCTCGTCTAGACTGAGTCTTGTGGGAAGGTGG---------TTTCCTCTTAGTCCCAGCA s monDom4.chr2 36370662 157 + 541556283 ATCTCCCGAGCAGAACCACAGAGCTTTGGCAGGCCCCGAACCTTATCTAAATTCGATCTCTTCAGAAGATCCAGGGGTGGCTTCTGTACTGCAG--------CCGTCTTGTCTAGACCAAACACTGATGGCGGGCGGGCGGCCCGCTTTCCTCCCTTTGGCAACA a score=8507 s mm8.chr4 105193994 342 + 155029701 TTTATGtctatgaagtaagagggctgtgtttaatgactcccagagtcccttcaagtactctggtgttctGGGTGGCTGCATCTA-GGCACATCATGTTTATATATAAATATTGCTGCCAACACTTAGACACATGTGCTAGCCCGGTGGT--TATTTGTCACTGAAGGAGGACCATTAGGAGGAACTTAAGCCAGCACATATTGAATATTTGGCAATAGAAAGGAATAAAGTGTAGCCAATATGTTGCATGCAATGGTTAGATTC----ATCATGTTGACCAGGGTTAATGAATCTAAAAACTCACTCTACATTACGTAT--TGACTACAATGGAACTATTCATATTGGGGA s monDom4.chr2 36374913 342 + 541556283 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TGGTAGAGCCCTGATGGCTTTCATTTAAATAAAT-ATTTAGCTATCCCATATGGCTGCATCTAAATCCTATCTCTCTGTCAGGTTATTTTATTAC--AGAAACTGGGAAATCCAAGCTTTTCTTTTCTTGTGGATATTACACACTGCTCTCTTTCCCACTACAAGTACCTAGAGACTCAAGTATCGGGTGAAGTCTTTTCA-TTTAAATAAGTAGTGATGGATAAAAGGTGATATACTGAAGAAATAGCTAAATCCAATATGGATAAGAAAATGATACTTCAAAAGTGGTTTCATCTAATATGAGAATTGAACTCTGGCCAGCTTTCACACCTCACCACCTTGACTGTATTG----AATTTCTAGAAGGTAGG-GAATATTAAACATTACTAATGATTGATTGCATCTCAACTTTCAGGTGTTACATGGAACAGACCTTTAAAGGGGGGCGGTAATATTCCTTTAAAGCACATTAGCAGAACTTTTGTCttattttttttttaaaaaaataGATGCCCTGGATATACTATATTTAATCCACATTTTATCCAGGAGTGGAATTCCTTTTTGGCAGAATCATCAATAATTTACGGCATCTCAGGCTTCCCTTCCAAATGCAGAAATTATTGGCTACAAGAGTTCTAGCTGACACATTATAAAATAAAGCTGGCGAATGGATTGCATGAAACTTTGCCAATTCCATACCCATCTGAAGAGTCCC---ATGTTCATCCCATGTCTTCCTTTCA s monDom4.chr2 36517235 682 + 541556283 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agaaaacattttcagatgcatgcaatgaaagccacaagattacaaaggaaaac-acttatcattgaaatgcagctattatcttc a score=43085 s mm8.chr4 105292108 742 + 155029701 ctttgcAGACGCCACTGCCGCTTTTCGCCGCTTGCTGCAGCCATGGTCAACCCCACCGTGTTCTTCGACATCACAGCCGATGACGAGCCCTTGGGCCGCGTCTCCTTCGAGCTGTTTGCAGACAAAGTTCCAAAGGCAGCAGAAAACTTTCGAGCTCTGAGAACTGGAGAGAAAGGATTTGGCTATAAGGGTCCCTCCTTTCACAGGATTATTCTAGGATTCATGTGCCAGGGTGGTGACTTCAC--GCCATAATGGCACTGGCGGCAGGTCCATCTACGGAGAGAAATTTGAGGATGAGAACTTCATCCTGAAGCATACAGGTCCTGGCATCTTGTCCATGGCAAATGCTGGACCAAACACAAACATTTCCCAGTTTTTTATCTGCACTGCCAAGACTGAATGGCTGGATAGCAAGCATGTGGTCTTTGGGAAGGTGAAAGAAGGCATGAACATTGTGGAAGCCATGGAGCATTTTGGGTCCAGGAAAGGCAAGACCAGCAAGAAGATCACCATTTCTGACTGTGGACAACTCTAAT---TTCTTTTGACTTG-CAGGCACTTTACCCATCAAACCATTCCTCTGTAGCTCAGGAGAGCGCCCCTA--CCCCATCTGCTCACAATGTCCTGTAATC--TCTGCTCTCACT------GAAGTTCTTTGGGTTTCATATTTTCCTCATTCCCCTTCAAGTCTAGCTGGATTGCAAAGTTAAGTTTATGATTATGAA--TAAAACTaaataa------gaaaaaaatt s monDom4.chrUn 64568947 762 - 174229318 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TCCTA----------------------------------------------------CAGGGCCAGGGAGTCCTCCAAGGCCTGGGGGGTCCTCCAGGGTCAGAGTGTCCTCCAGGGCCAGGGTGTTCTTCAGGGTCAAGGGTCCTCC-AGAGTCAGGGAGTCCTCCAGGGCCAGGTGGTCCTCCAGAG-CCAAGGGGTCCTTGAGGGCCAGGGTATCCTCCAGGACCAGG s monDom4.chrUn 66258977 227 - 174229318 TCCTGAGGGCTAGCACCAGATGCTTCCGATCTGCTTGATAGAGTGGATGGCTTGCCCCAAGGCCAGGC--TCCCCCAGAGACTCGGGCTCCCCCCAGGGCCCAGGCTTCCCCCAAGGCCCAGGCTCCCCCCAGGGCCCAGGCTTCCCCGAGACTCAGGCTCCCCCCAAGGCCCAGGC--TCCCCCAGAGACTCAGGCTCCCCCCAAGGCCCAGGCTTCCCCGAGACTCAGG a score=6204 s mm8.chr4 105344403 510 + 155029701 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GAACTTTTGGATTTGTGTTATTTATGTTTAAAAATACATAAAGAACTTAAATAATGAAGCTGTGATTTTTCTATTTGGAAT----TCTTTAAAATGTGTGATTATTTCCATAATTTCCCCTC--------AGAAAACACTGCTGTCTGAAACAAGTTCTCAGTCTTCAAAATCTCCATCTTTGTCTTCAAAGCAGCAGCATCAGCCTAGTGCCAGTTCCATTTTGGAAAGTCTGTTTCGCTCTTTTGCCCCTGGAATGTCCACTTTCCGAGTACTGTACAACTTAGAGGTGAGAACCACTTCTTTCTCCTGGATACACTGGGATTGA-TAGCTTGGGGACCAA--GACAGGTCAGTTCATTTGATGTCCCTCGTGACCTCTTAGTGCAAGTGATC--CCAGAAGCTT-CAGAACAGGAGATGAAGCTTC-----------ACTGCCTCGTTCTCTTCTCCA--CACCATTTAACATATTGTTCACTTCATAGAT--------GTCAAATGACTTGGATTAACCTATCTGTGA-ACATTATTGCTTTTATGAAATAGTTTTTCAGTTTGC--------ATGAAAATCCTATAAACTATGACATTTATGTTCTCT a score=7202 s mm8.chr4 105883316 143 + 155029701 AGTGTCAGAGCGACTAACTTGGCTGCTTTGCTCCCCAGGTCCTAAGCTCCAAACTCATGCCCACGGCTGATGACGACATGGCAAGAAGCTGCGCAAAGTCCTTCTGTGAGAACTTCCTCAAAGCTGGAGGCTTGAGGTTTGTG s monDom4.chr2 37428869 143 + 541556283 ATTGCTACAAAGATTAATTGCCCCTCTGCCTCTCCTAGGTCCTGAGCTCCAAACTCATGCCAACAGCTGATGATGAAATGGCCAGGAATTGTGCAAAATCTTTCTGCGAAAACTTCCTCAGAGCAGGTGGTTTGAGGTGGGTG a 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TAAAGAGATCTAA-----TAATTTTCT-----TATTTTTTCTTATAAATAAAAGCTTGGTGGTTAATGTCATGCAGAGAGACTCTATACCTTCAGAAGTAGACTATGAAACAAGGCAAGGTGTTTATTCCATCTGTCTGCAGCTTGCCAGGTACGTCAACCTAACATATTTTGTCTACTGGTCAAGGATGATTTTCTCCTGCCAGACTCATTCTACCACCGAATTCACACATCCCACCCAATTTCATTTTTGAGGACTATAAACATTACTGGTTTCTTCACAAGATGCTCACTATTAATCCTTGTTTTTCATGTCTACCTTTTGAAGATTCTTGCTTGTTGGCCAAACCATGCCCACGTTCTTGGATGAAGATCTCACCAAAGATGGCATTGAAGCACTCACTTCCCGTCCCTTTCGCAACATAAGTCGTCAGTCCAGTCGACAGATGTCCCTGTGTGGTACGCCAGAGAAAGCCTCCTACAGACAACTGTCAGTCTCTGACAGGTCCTCCATCCGGGTGGAAGAGATCATCCCTGCCGCCAGAGTTGCAATACAAGTAAGCA a score=12824 s mm8.chr4 105886401 205 + 155029701 TTCTCACAATA----CCCTTTCCATGCCTCCTTAGACTATGGAAGCAAGTGATTTCACTGCCACCGTAGCTTGTTTCATGAGACTGTCATGGGCTGCAGCTGCAGGACGGCTTGACCTTGTCGGAAGTAGCCAGCCAATTAAAGAAAGCAATTCTCTGTTTCCTGCTGGGATCAGAAGTAGACTCAGCAGCTCAGGTACTGATTTAAAG s monDom4.chr2 37433077 209 + 541556283 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AAGACCACCATGGAAGAGGGGAGAGAGTGCTGCCACTGGGGTGTTAAGGGGAAACC-----TGTATCCTTCTGTTCTGG---CTGTGTCTTCCAATGAAATATCCCATTGGAAAAACTCATTGAAGATCATGGGGAagggcagccagctagcaccatggatagagcattgggtctgggctcaggagggtctgacttcaactgtggcctcaaccacttcctatctgtgggcaagtcgcttaaccctgaaagcttggccggtc---ttagaatgaatactaagatggaag--gtttgggcttaCAGATGTGgaaaa-agagagcgagagggg---------ggagcccccaactatatacaaatgtgaccacacaaatgtggtggagggaggaggggaattctgggaaatcctgaagggggacgaagcccaagggttctgaa--ttctaactatacaACATCTGCCTAGGTGGGAGTTCCCCA-------GCCCTCCAAAACATCCCCGAGACCCTTCCAAATGG a score=11609 s mm8.chr4 105946691 343 + 155029701 GTTGCCCTCGGGCATAAGCGCTGACCCAGAAG-GTCAGGCACAGACC-CTGCTGCCTGTCAAAGGGCTATGGTGGCAGGATGATGGTGGGGTGGTGACTCACCGGCCACGTGGGCAGCAGCCTGTGAGGTCCCACTCTGTGACATGAAGCATGTGCTGCAGTCACTGGACGCTCCGATGATGTCCTTCCCGGGGGCAAAGAGATCCACACAGCGTCCAAAATTAGTCCCCAAAGTCCCCAAGGTAACTGGCTGGTCCTGGGCATTCGTGGCCCCGACTGTGATGACCTGGCATGGTAAAGGAGTGGGTAGCAGAGAAAGCCCAGCGCTGCAATGGGAGAGGCAGG s monDom4.chr2 37512309 326 + 541556283 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CCCCTTCCCAGCCCCCCTACCTTAGGATAGCATTGGCACATGCTCCAGATGACACCCCCGATCACCATGACGCTGCCCATGGCATAGAAGGTGCCGTAGACCTGGGGTCGATCGTGGCTCATAAGGAATGTACCCAGGGATAGCAGGAAGAGGCCCAGCACGATGAAGCCGATTCGGAAGGTCTTCTCATCAGCCATGGTGGCTAACCAGCCCTGGTAGCTAGCTGATCAGCACACCAGCAGGGGACTGCCCGCAATCCTCC------TCAAACGCTGAGCAGGCT-CTCAAGGAAGGATGCTCCAGG-----AGATGGCTGAGAACCAAGGTGATGA--TGCACAGAGCAAGGAGCAAACTCCACAGGCCCAGCTCTCAGCCCTGAGCCCAGCAGGGCAGGTGACACGCTTCAGTGGGCCCAAGGTCCCAGCCATCTAACTTTCTT--CCTGCCACTCTCCTCCCCTGT-GGGCCCAGCTGTTTGGTGATTGTAGCTCTGAACATGGGACAGAGGTGGGGAGGGAGGC----GGGGGAAGTCACAGGGGCTGGG---CCAGTCATGGCTTTGACATCACCTCATTTGCTTA s monDom4.chr2 37586707 547 + 541556283 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CCCTGCCCAACACTGACCTGTAGGGCTCCTTCACAGGGCACTCCACAGCAAGGCGATACAGGTCTCTGGAGAGTCGGTAGAAGTCCCCCTGGCTTGACTTCTTTGTCCTTTCCTGGATGGACCAAAGCAGGCCAAAGAACAGAAGCAGACCACCCACGATGCAGCAGAGGATGATGACAGACTTGAGCCAAG---TTGGGGGCATCTCGGGAGATG--------------------GCTGCTTCACGGTGGCGGGCAGC----------GAGCCAGGCTGGACGGCAACACTGCCTTCGCTCCACGACGCGAAGCAGAGTGTCCCAACCACCAGGACCACTGAGCCACCGACCGTCATGCAGTAACGCACAGTGGAGGCCACCCGGCCTCTGGCGCATGTCTGCACACAGAAGGAGAGAG s monDom4.chr2 37617080 417 + 541556283 CCCTCCTGGGAACTGACCTGTGGCTCCACTTCTCGGCAGGCTCGGCCGTGAGGTAGCCCAGGCTCCGGGGAAGCCGGCTGGGATAGCATCGAGGGGCCGCCCGCACGTTGGCCTTGGCTGACCAGAGCAGGCCCCAGAGGAGGAGCATCCCCCCGACGCCGCAGCAGAAGAAGCTGACGGACCTCAGGAGGGCGCTggggggcgcggcggggggggcgcgggtgccggccacgggggcTGCCCTCCCCGGGAGGGAAGCTTTCGTCTGAGGGCTCAGAGAGGGCTCCATGTCCCCGTCGCTCCACCAGGCAAAGCAGAGCGTCCCGGTGACCAGGACCACCGCCCCAGTGATGGTCACTCCGTAACGGAAAGACGAGGCCACC---CTCCGGTCACAGGGCTGAACAGAGACAAAGAGAG a score=15933 s mm8.chr4 106058592 786 + 155029701 CCCCGGTCAAGGCCAGAGGCTCTCCTGCCAGGGTTGCAGGGTGGTTGTCTGGAGCGCCTCCCACC-----CTGGGGAGGT--AACCCAATGCACAACTGCTTGACGTGTGTCCACGGGAGGCACCACCCAAGGAGGAGATCAAGGGTGGTCCCGCTGCCTCCAGAGCGAGAGCCCTAAACCCCGCCAAGCCCGCCGCTTGCCGACCCTACCAGCGCCCCCAGCCCAGGTCAGCCCCTCCTCGCACGCCGACTAGAAGAGGGTGGAGCATCC-CGGTTCCCGCAGCCAATGAAC-----GCAGCGGCTCCCTG---GTCCGATCCCCGGCGCGGCTCACCATTGGTCGCCGCCTGGGTCTCGGCCCACCGAACCTTGGCGACCCAAGCCAATCGCGAGGCGGCGGGC-CCGACTTACAGGCTCCCGGGGCGGTGGC-GGCAGGCGCTGAGCCGGCGGAGCGCGGAGCGGGCGAAGGAGACGGGCGGCGCGAGCCCGCACCC--TTCCGCGCGGTGCGCCGCGACACCATGGAGCCCGCCGTGTCGCTGGCCGTGTGCGCGCTGCTCTTTCTGCTCTGGGTGCGAGTGAAGGGGTTGGAGTTCGTTCTCATCCACCAGCGCTGGGTGTTCGTGTGCCTCTTCTTGCTGCCGCTCTCGCTCATCTTCGATATCTACTACTACGTGCGCGCCTGGGTGGTGTTCAAGCTGAGCAGTGCGCCGCGCCTGCACGAGCAGCGCGTGCGGGACATCCAGAAACAGGTGAGCGGCGCGGGGCGCGGCTGTGCGCCGGGGTAGCGGTTCTC---TGGGC s monDom4.chr2 37702072 705 + 541556283 CTCCGCTCCTGGTCCGATCCTCTCTGAGCCTCGCCATTGGGCGGC-GCCTGGGTCTCGGCCCACCGAGCCCTGGGGAGGCCGAGCCAATCGGGCAGCGGATCG----GGGCCC------GGACCGGCTCCGGGCTGGGAGTGTCGACGGGCCTGGGCGGGGCAAAAGGAGGGCGC-GAGCGGCGCGAGGCCGGCC--------------CGGGCGCTCCT------------CCCCAATCCGCGCGCCGC---------GCTGCAGCCTCCGCCGCTGCCGCCACTGGGGAACCTCCTGCAGCAAAGCTCTGCTCGGCCGGTCCCCGGGA------------GCCCGCCGCCTGCACAAGATCCCCCGGAGCCT-----------------------GCAGCGCGCGCCGAGAGAACGCCTCCAGAGTCCGCAGCCTGCGTGCGCC------------CCCTGCGCGCGCGGAGAGAACGCCCC-CGGGAGCCTGCAGCGCGTTCCCAGCG------CGGGACGGGATGGAGCCAGCGGTGTCCCTGGCAGTGTGCGCGCTGCTCTTCTTGCTCTGGATCCGGGTGAAGGGGCTGGAGTTCGTCATCATCCACCAGCGCTGGGTCTTCGTGTGCCTCTTTCTCCTGCCGCTGTCCTTCATCTTCGACATCTACTACTACCTGCGCGCCTGGGTGGTGTTCAGGCTCAACAGCGCGCCGCGGCAGCACCGCCAGCGGGTCCAGGACATCCAGAAGCAGGTG---GGCGCGGGGCTGGGGGGAGCGCGTGCAAACAGCTTCTCGCTTGGGC a score=12552 s mm8.chr4 106062255 248 + 155029701 TCCTGAAAGAAGGGCTGTGTGTCCATCCCCCTGGGACTCCCAGATGGAGCCAGCTGAG---TCGTATCCTG--TGGTTACAGGTCCGGGAATGGAAGGAACAGGGCAGTAAGACCTTCATGTGCACGGGGCGCCCAGGCTGGCTCACTGTCTCGCTGCGAGTCGGAAAGTACAAGAAGACCCATAAGAACATCATGATCAACCTGATGGACATCCTGGAGGTGGACACCAAGAAACAGGTGAGggggctgggg s monDom4.chr2 37709775 243 + 541556283 TCCTGAGGGGGAGGCC-----TCCAGCTCCTT-----CCCCAGAGGGGAGCTTCACAGGCCTCCCACCCTTGTTCCCTTCAGGTGCGGGAATGGAAGGAAGAAGGAAGCAAGACCTTCATGTGCACGGGCCGGCCCGGCTGGCTCACCGTGTCTCTGCGGGTCGGGAAGTACAAGAAAACCCACAAAAACATCATGATCAACCTGATGGACATCCTGGAAGTGGACACCAAGCGGCAGGTGAGGGGCCCCGGG a score=6952 s mm8.chr4 106069310 146 + 155029701 AGGACAGTGACCCAGCCTCTCCCCTGTCTA---CAGATTGTTCGAGTGGAGCCCTTGGTGTCTATGGGTCAGGTGACAGCTTTGCTGAACTCCATTGGCTGGACCCTGCCTGTGTTGCCTGAGCTTGA--TGACCTCACAGTGGGTGAGTC s monDom4.chr2 37710459 151 + 541556283 AGAACGCAGGTCCTGCCTTTCTTTTTTCTTATTCAGATTGTCTCTGTGGAGCCTTTGGTCACTATGGGCCAGGTGACGGCGCTGCTCAATTCTGTGGGCTGGACTCTGCCCGTTCTCCCAGAGCTTGAAGTGACCTCACAGTAGGTGAGGC a score=3269 s mm8.chr4 106070151 57 + 155029701 TGCAGGGGGCCTGATCATGGGCACAGGCATCGAGTCATCGTCCCACAAGTATGGCCT s monDom4.chr2 37712760 57 + 541556283 TTCAGGAGGCCTCATCATGGGCACCGGCATCGAGTCCTCGTCCCATCGCTTCGGGCT a score=1899 s mm8.chr4 106071385 31 + 155029701 CCCCCTTAGTCCTCCCACTGGGGTTTTCAGG s monDom4.chr2 37717838 31 + 541556283 CCCCCCGGCACCGCCCACTGGGGTTTTCAGG a score=1190 s mm8.chr4 106083957 58 + 155029701 CCAGGTCTTCTCCCTAGCTCTGTG----TCGCCCACCCATCTGTGTATCTGCCCTCTGGGCC s monDom4.chr2 37721037 57 + 541556283 CCAGATCCCCTCCCTGGCCAGATGAGAACAGCTGGCCCTCCCGGGTA-----ACTCTGGGCC a score=14941 s mm8.chr4 106084256 237 + 155029701 TTCTCTGACCTCTCACTCAGGTCTACCCCATCTGGCTGTGCCCATTCATCCTGCCCAGCCAGCCAGGACTAGTGCATCCCAAGGGAGATGAAGCAGAGCTCTACGTGGACATCGGGGCATACGGGGAGCCACGTGTGAAGCACTTCGAGGCCAGGTCCTGCATGAGGCAGCTGGAGAAGTTTGTGCGGAGTGTGCACGGGTAAGTGACCC--GGGGTCTGGGG---GACACAGGGGCCTCAC s monDom4.chr2 37721094 242 + 541556283 TTCCCTCCTCTCCTCTGCAGGTCTATCCCATCTGGTTGTGCCCATTCATCTTGCCCAGCCAGCCAGGCATGGTCCACCCCAAGGGGGATGAGACAGAGCTCTACGTGGACATCGGGGCCTACGGAGAACCACGGGTGAAGCACTTTGAAGCCAGGTCTTGCATGAGGCAGATGGAGAAATTTGTCCGAAGTGTGCATGGGTGAGTGGACCAAGGGGTCAGGAGCCTGGTCCAGAGACATCCC a score=10824 s mm8.chr4 106084521 307 + 155029701 GCACTCCTTCCCTCCCATGCAGGTTCCAAATGTTATACGCCGATTGCTATATGAACCGCGAGGAATTCTGGGAGATGTTCGATGGCTCCTTGTACCACAAGCTGCGCAAGCAGCTGGGCTGCCAGGACGCCTTCCCTGAGGTGTACGACAAGATCTGCAAGGCGGCAAGGCACTGAG---------------------------CAGGGCA---CCTGGGGAGCCAGCTGCATGGACCTGCTCTCCCTCGCTCG--------CTCCGGCTTCTCTGCTTTCCCAGGTCTC------AGAAAAGAAACC----CCTCCA--CATCCCCgag-gcagcccgatgg-----cttccagggtggctc s monDom4.chr2 37721612 363 + 541556283 GTGTGTCCTATCGCCCCTCTAGGTTCCAAATGCTGTACGCCGACTGCTACATGAACCGGGAGGAGTTCTGGGAGATGTTTGACGGCTCCCTGTACCACAAGCTCCGGAAGGAGCTGAACTGCAAAGACGCCTTCCCTGAGGTGTTTGATAAGATCTGTAAGGCCGCCCGGCACTGAGGCTTCCCGTCCCCCAACCCCGCCAGGCCCTGGCACCCCCTGGGCCTCCCCCTACCCGGGGCCAGGCTCCGCTGCTCTGCCCACCCGTCCGCCTTCTTTGAAATCGCCTTTCTCTTCAGACGAAAAGGATCCGCCTCCTCCGGCCAGCCCCGCTCGCAGACCCATGGAACATCCCCGGGGGCGGCTC a score=24346 s mm8.chr4 106120312 744 + 155029701 GCTGCTGTCTAGCAG---CGAAAGCGGAAACACCTACAGGGCGAGCCCTTGGCCGGCTCTGGGTACCACCCACTTGCAAGAGGTGCCCC-GGACCGCC-------------------------GTGCGGGG------------CTCCCTCCGGGGCCGCCCCATCCACTGTCCTTGGGAGCTAGGGGAGGCCAGGGCAGTCAGGGGCAGCCATGACGGAGGCCGAGGTCGGAGCC----GAGGACCTGGACACCCTTCTCGATGAACTGGACTATCTGCCCGGCCACTTCCACCTGGAGATGCAGCTCAACTTCGAGCCGCGCTCACCCGCTCAGCTGCGCGCCCGGGACCTGAAGCTCCAGCGAGAGGGTCTGCGGCAGGAGCTGGAGCTGGTGGCCACCCCGCAGCTGCCTGCCGTGCGTCACCTCTTGGGAACCTTTTCCTTCTACCTGGAGGAGCTGGGTGATGCCCGCGAGCATTTCCTGGAAGTGGCCCGCAAAGACCCTGGCAACCTCAACGCCTGGGCCAATCTGGCACACGTCTACGGGCAGCTGGGCCAGGAAGAAGAGGAGGAGGCGTCCGCCGGGCGACTGGCCAGCCTCATGGGCCT------------GGAAGGGGACCCCGAGGATGCTGGAGACCCCAGGCTCCGCGCTGCCCGCTGCCTGGCGGAGCAGGGATATGCGCATGGCTTCGACGTGGGCTGTGCCAGTCCAGAGGAGCGCGCGCAGGTGCTGGAGGCGGGCATCGCCCTCTACGACAAAGCGCTGGGCTATGGTCAGCAGGTGGGTG s monDom4.chr2 37792414 772 + 541556283 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TGCCCATCCTTTGCTTTC--TAGATCCCGATAGAAGAGAAAAGGAGCTGGTACTTCACCATGGCAACACTCTTTATCAGGTCAGGCCTGCGTCTGGAGATGGGTTGGGGGGGGGGGGACGG--TGGA-AGGGGATGTGGCCCGGA--------AGCCAGG--CGAAGATGGAGCAGGGGTGGGCGGGCCTTCCCATGGCAAGGAGCCTG s monDom4.chr2 37816742 195 + 541556283 TGACCTCCCTTTGTCTGCGCTAGATCCCGCTGGAGGAGAAACGAGGCTGGTACTTCACAATGGCAACGCTATTCCTCAGGTAAGA---------GGTAATGGGCCAGTGGAGGGAGGAGAGCCTGGACAGGAGGAGGGGTCCTGCCCACACATGGCCGGGGCCAGAGAAGCAGCAGGGGTTGGGGTGTCTCC-----AGAGGGAGCTTG a score=5845 s mm8.chr4 106132303 295 + 155029701 TGGGAGGGGCGGATGGGGTCCACA--ACCCTTTTCTGCCCATAGGCTGGATGGCATCTTTCTGGAGATGGGCAGTGAGGAGCAGAAGAGGCTGCCAGCCTTCAACCGTACTCTGGCCTTGCTCGGAGAGGTCCTCAAGTCCTCAGACTCCCGACACCAAGGTG----------GGAACTCCAGGCAGGGTTGAAGAGTAGTGTCCTCTGTCCTGCTGTCCTGTACCTGG----CAATAGTTCTGTCTGCCTCTAGCCCTGTCTCTCATTGTGTCTCACCCCAGCTCATCTCACAATCATATTGTTTACCCA s monDom4.chr2 37818520 305 + 541556283 TGGGAGAGAGGGACTGA-CCCACTGTATCCTGGTCCTTCTCCAGGCTAGATGGCATCTTACTGAATCAGGGCACTGAGGAGCAGAAGAGGCTGGTTCCCTTTAACCGCACCCTCAAGCTGCTCCGGGAAGTGGTCAAGTCCTCCAGCACCTACCATCGAGGTAATCAGAGCCTGCCAACCCATGCCAGGCC-AAGAGT----CCCTCTTATTCCTCCTCATCTTCCTGGGTTCCTTCAGTCTGGCCTGGCCCCAGCCCCCACCCTCATTCCATCTGAATTCCTGCCTTTTCCCTACCCCATCTGCTGCCTA a score=9314 s mm8.chr4 106133770 182 + 155029701 GCTGGGGCTCTCCCTGCCCCCAACTGCTCCCTAGAAACCCTCTCTTGCTCTCACCCAGCTCTGGCCTGGTGCTATGTCGGCATGCTGCTGGAGAGAAAAGACACCTTCTCTACCACCCCTATGGGTGTCCATGAATACGGGTACTCGGGCACAGAGCCCCTGGACTGCTTTGGCAAGGTATG s monDom4.chr2 37822807 175 + 541556283 GCTGGAGCCTCCATTGCTG--AAATGTCCCTGAG-----CTTCCTTTCTCCCTTTCAGCTCTGGCCTGGTGCTACCTTGGGATGCTTCTGGAAAGGAAAGACACCTTCTCTACCACCCCTATGGGGGTGCACGACTGCGGCTACTCAGGGACTGACCCCTTGGACTGTTTCGGCAAGGTATG a score=1727 s mm8.chr4 106134069 45 + 155029701 CCCCCATTTTCATCTCTCCCCCATGCCTGCTCTGTTCTGCCCAAG s monDom4.chr2 37825265 45 + 541556283 CCCACATTTGCCTACCTACCCGATGAATGGTTTGTTCTGCCAACG a score=11196 s mm8.chr4 106134625 192 + 155029701 CCTTCTTAGGCCATTGAGATCGCCAAGAACCAACCTCCCATTCTGAATCGCCTGGCCAAAATCTTCCACTTCTTGGGAAAGCAGGACATGGCCGTAGGAACCTGCAACATGGTCCTGGCGGTGCTTACAGACCCAGAGCTCAACTGGCAGGCATACTGCACCAGGGCCAAGGTG---AGTGAGCCCCACCTGCCA s monDom4.chr2 37825314 195 + 541556283 CCTCCCCAGGCCATAGATATCGCCAAGGACAACGTGCCCATCTTGAACCGGCTGGCCAAGATTTTCCATTTCCTGGGGAAGCAAGACATGGCCATCGGCACCTGCAACATGGCCCTGGACATCCTAGCAGATCCCGAGCTCAACTGGCAGGCTTACTGCACCAGGGCCAAGGTACCCAGGGAGAGCCACCCACTA a score=8835 s mm8.chr4 106136385 175 + 155029701 GTTACCCTCTACTGCAGGTCCGAATCAGAGCCTATGTCCATGACTTGGAACGAGCCAAGGTGGGGCTCGGGGGTTTGCCTGACAGGAACCACCTGGCCTGTGCCAAAGCTGACCTTGAGGAAGTGGTCAAGGTGTGCCCAAGCCTCAGGACCTACCTAGATATCAGTCAGGTAAG s monDom4.chr2 37825998 170 + 541556283 GTTTCCCCC-----CAGATCCACACCAAAGCATACCTGCGGGACCTGGAACGGGCCAAGGCTGGCCTTGGAGGCCTGCCAGACAGGAATCACCTCACAGTGGCCAGGGCTGACTTGGAGGAGGTGGTCAAGGTGTGCCCAGGCCTGAAGATCTACCTGGACATTGGTCAGGTGAG a score=24383 s mm8.chr4 106136756 611 + 155029701 TCTAATTGTACAtggaagggcttgttcaag---gttaggtgtggcgggactgggactagaacccggg---------tacatcctct--------------cattttcatgctcc--ctcCCCGGTCCCCAGGTTTACTACTACATGGGTGTGGATGCCATGCGGGAGCTGCTGGCAGTGGATGAAGCTGCGCTCAACCAGGCTCTGGTCTTCCTGGCGAAGGCCGGTGAGTTGGAGCTAGGTGACACGCTGCCCGAACTGCAACTGCTGCGCGGCAAATGCCTACGTGTCCAGGGTGAGGATGCCAACGCTGCGGCCTGCTTCAAGCGTGCCGTAGAGCTGGACGACGAGGGATCCAGCCATACCGAGGGCTTCGGCTGCCTGCTCGAGGCATTGCTGGCCCAGTGGAGCCAGGCGCAGCTGAGCGATGGTGAGGTGGGGTACGAGGTGGACGTCTGGCTGCGCCATGCCCAGGGCAAGTATCCGGCAGCACGCCTGCGCCAGGAGCTGCAGCGTGTGTGGCGTGGCCATACGGAAGAGGTCCTGGGTCTGGCCCGGGCCTTAGTAGCCCAGGGACGGCCAGCACTGGTGCGGCTGCTCTTTGAGACCATGG--AGCATGAGGGTGAGGATGCTGGAGGGT s monDom4.chr2 37827202 641 + 541556283 TCTCACTTTAGAGGCGAGGACGGGATCACGCACGTCCTCGGTTGCATGGCCAGGTTTCGAACCCAGGCCTCGGTCTTCCCTCCTCTGCCCATGTGACTGGCCTCTGCCTGCTCTTTCTCCCCTCTCGCCAGGTCTACTATTACATGGGAGTGGACGCCGTGAAGGAGCTCCTGGCCGTGGACGAGGCGGCCCTGAACAAGGCTTTGGTCTTCTTCGCCAAAGCCATGGAGTACGACATGGGGGAGACGCTGCCCGAGATCCAGCTGCTGCGAGGGAAGTGCCTGCGGATCAAGGGCGAGGAGCCCAACGCCGTGGAGTGCTTCAAGCGCGCCATCGAGCTGGATGACAGCGGCTCCCGCCACAGCGACGCTTTCCGCTGCCTCCTCGAGACGCTGCTGGCCCTACTGGGCCAGGCGAGGCTGAGCGCCGGCGAGCTGGGCCGGGAGGTGGAGCTGTGGGTGAGCAAGGCCCAGGGCAAGTACCCGGCCGAGCGGGTGAGGCAGGAGCTGCGGCGCGTGTGCCGCAGCCACCCGGCTGAGGTGGTGGCGCTCTCCAAGGCCCTGGTGGCGCAGGGCCGGCTGCAGCTGGTGCGGCTGCTCTTCGACAGCATGGGCAGCAGTTGGACGGAGCCGCGGCCGAGT a score=72830 s mm8.chr4 106150993 1619 + 155029701 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GATCTAACGCTATGGAACGAATG---CTTCATGGCACATAACTCATTTCCCCACAGATCTGAGTGGTTCCTGCCCTGGGGTGGCATGGAAGGGCTTCTGAGAAGATGGAGGGC-CTTTCCCCGTGTACTGTGGGCCATTTGC----CAGCGGTCACAACATACTCCTTGCAGGCTTTACCATCACCCTCCAGGCAGAGCAAAACGCCTGGTGCTGTCTCATTTCTTCCAGCCTCAGAACCTCCGGGAAGATCAAGTGGTTGGACTAGAGAGCAAGTCTGCCGAAGTGACCTGTAAGAGCCAGAGGCTGATGCTTCAGACGGGGCTGATTCACCCTGCTGGCCCTGGCTGTTACCACTACCTGCCCTATACTGTTCGAGCCATGGAGAAGCTGGTCAAGGTGATAGACCAGGAGATGCAGGCCATCGGTGGGCAGAAGCTTGACATGCCCACCCTGAGCTCAGCTGAGCTCTGGAGAGTCACCGACCGGTGGAACCTGATGGGCAAAGAGCTTTTTCGGCTGCAGGATCGTCATAACAAAGACTATTGTTTGGGACCGACCCATGAGGAAGTCATCACCAGCCTGATGGCCTCTCAGAAGACTCTGTCCTACAAGCAGCTTCCCTACCTTCTCTATCAGATCACACGCAAGTTCCGGGATGAGCCCAGGCCCCGCTTTGGCCTCCTGCGGGGCCGGGAGTTTTACATGAAGGACATGTACACCTTTGACTGCTCTTCTGAGGCCGCTCACCAGACGTATGACCTGGTATGCGAAGCTTACGGCAGGGTGTTTAACCGACTTGGGCTTCAGTTTGTGAGGGTCCAGGCAGCTGTGGGGAGCATCGGTGGAACAATGTCTCACGAGTTTCAGCTCCCCTTGAACATTGGGGAAGACGTGCTTGCAGTCTGCTCCAATTGCAACTTCGCGGCCAATGTTGAGACGCTGGATCCCAGAGATCCAACTTGCCCAGTGTGCCAAGGGAAACTGACAGAAACCAAAGGCGTTGAAGTGGGGCACACCTTTTATCTGGGCACCAAGTACTCATCTGTATTCAATGCTGAGTTCATCAATGCTCAGGGCAAGCCTTCGCTATTAGAAATGGGGTGCTATGGGTTAGGTGTGACCCGCATTTTAGCTGCAGCCATCGAAATGCTTTCCATGGAAGAATGTATCCGCTGGCCTAGTCTGCTTGCCCCTTACCAAGTATGCCTTATTCCTCCCAAAAAGGGCAGCAAGGAAGAAATGGGAATAGAGTTGATGGGGACTTTATATGACGATATCACAGAAGCCTTGCCCCAGCTGAAGGGGGAGGTTTTGCTTGACGACAGGATACATTTGACAATTGGAAACAGATTGAAAGATGCTAACAAACTTGGTTACCCCTTTGTTGTGATAGCTGGCAAGAGAGCCTCGGAACAGCCTTGCCATTTTGAGGTTTGGTGTCAGAACAACAATGAGGTGGTGTTCCTCACCAAACAAGCAGTGATTGATTTGCTACGTAAAGTACAGATTGTCTAAATGCAGAGTCTCTGATCCTTGCTAGGTCCTAAGTTATGTCCTTTCACAATCATGTTATA-------------CTGTAC----TGTTCTCTCTGGAAGCCATGCAGCTGGTGGAAGTGGGGTGCTAATTAGGAGA a score=4449 s mm8.chr4 106165421 117 + 155029701 TCTTACCTCCAGATTCTCTGGGTGGTACTTGTGCTCTGAGTCCCAGGAGGGTGCTTCACTAAACATCGCCATTAGATGGTCAATAAACCTAAGGGAGGAGGATGTGGCTTCTGGGTG s monDom4.chr2 37866451 112 + 541556283 TCTCACCTGGAGATTATCCGGGTGGTACTTCCGCTCCAGGTCCCATGGCGGCAGCTCCCCAAACATGACCAGGAAGTGGTCGATGAACCTGAGAGCGACAG----GGCTT-TGGGTG a score=7174 s mm8.chr4 106165965 336 + 155029701 TACCTGGTGTCCTCATGAAAAGCAGAGATGAAGTCTGATTGCGCGTACTCCGGGTACAGGAACAGCACAGGCCAGCTCAGCCTGCCCTGGTCATCTATACTTAGCCTGGCTCCATAGGGGTTCTCAGAGCTGAGCCCATC---CAGGAGTATCTCAGCTGGACCATTGGAG------GCTGAATCTTCATCCTCACCGGCTGATTCAGAGACAAGCCTGATGTTCCTAGCCTGG-ATTAAGACAAAAACACA-------CACTCGCACAAACCCTATCATGAGGAAGATGCAAACAATGCAAACATATCACTGAAATACACCCTGAAGCTTCCTGAAGGCCCATGTGACCACC s monDom4.chr2 37868095 345 + 541556283 TACCTGGAGTCCTCGTGGAAGGCCGAGATGAAGTCCGTCTGGCCGTGCTCGGGGTACAGCAGCAGCGTGGGCCAGCGGAGCCGGCCGTCGTCGCCCAGACACATCCTGGCCCCCGCGGCGTTCTCGGCGCCCAGGCCGGCGTGTGGGGACGCTCCGTCCGGATCATCCGCGTCGTCCGATGGCTCGTCGTCGTCCCCGGGCGCCGCGGCCGCCAGCCGGATGTTCCTGGCCTGGTTTTCAAACGAAACCGTAAGAAGTGCCTTCGTGCAGCCCCCAGAACCTCGTCTACACAGCGACAGTGAAC--ACCACCGGGGTGCCTCTGGAGGC------AGGGCCAGTGTTCTCCCC a score=5275 s mm8.chr4 106168365 111 + 155029701 GCTTCGAGAACTCACCTTGATGGCCTGGAGCAGAGCCTCATTCTGATGCTGTTCCTTCTTTTCTTTCAACTTTGCCTTCCTCAGATCCCTCTCTTCCATCCTCTGGAAATA s monDom4.chr2 37869424 111 + 541556283 GCTCGGAGCACCCACCTGAATGGCGCGGAGCAGCGCccccttctgggcctcctccttcttctccttcaccttcgccttcCGGATGTCCCGTTCTTCAACTCTCTGAAAGCA a score=5520 s mm8.chr4 106169545 193 + 155029701 AGTCACTAACCTTTAGCTTGTCTGCTTTTGCCCTTATTTCTAGAAGTTTCTTCTCTTTGGCATCAATTTGTAGTCCCTCATCACACCAGTTCACAGCCTCAGCAAAGTGTTTCAGTTCAAGATGGCACAGGGCACCTGCAGAAATCAGAGTCC--TGAGGATCTCAGAACAACATGCTCAGAAAGCACCACCTTG s monDom4.chr2 37869715 189 + 541556283 AGCCACCCACCTTCAGCCGCTCCGCCTTGGCCCGGGTCTCCAGAAGCTTCCTCTCCTGGGAGTCCAGCCTCAGGCCCTCATCACACCAGCGCGTGGCCTCCCGGAAGTTCTTCAGTTCTAGGTGGCAGGCGGCCCCTGAGGGGGAGGGGGTGCTTTTAGGGCCTGAGGCCA------CAGGAGAGGCCCCCCTTG a score=4709 s mm8.chr4 106172311 163 + 155029701 TGATGGCCACCCGCAGCTCAT-----------------GGAGACTCACCTCTTATGATGGCTTTCAGGTGACCGGGCTTTAGCTTCTTGGCAGCCAGCACATCATTGAGGGAAGAACGAACATTGCCTAATGAAATGCCATTAAGTAAAAGAAAGAATAAGCT---TTTCCATCAAAATGCTT s monDom4.chr2 37870975 177 + 541556283 TGGGAGCCAATAGCAGCTCATTCGATGGGGGGGGGGGGGGCGGCTCACCTCTGATGATGGCTTTCAGGTGGTTCGGTTTGAGCTTTCTGGCCGCTGTGACGTCATTCAGAGCCGAGCGCAGGTTGCCTAACAGAG------CATGTGAGGAGGAGAGGACGCTCGCTGTCCATCAGGAAGTCT a score=11088 s mm8.chr4 106174516 242 + 155029701 CATGATTACATACCGAGATAGTACTGTGCTGCTGCCCGGTTGGTATACAGGACAGCATTCAAATCAGGGTCTGCACACTTCTTCTTCAACCCTTCACTGTATGAAAGCACAGCTTTCTTATAGTCTTTTTCTTTAAAGTAGTCATTGCCCTCATCTTTATAGGTCTTGGCTTGCTCTGCAAAG----AAGAGGAAGGAAGCAGCGTGTCATACCTTTTAGAAAGCTCACTGGAAACCTCTATCATG s monDom4.chr2 37871624 243 + 541556283 CACCGTGACTTACCCAAGTGAAACTGGGCAGCTGCCCGGTTGGTGAGGAGCACAGCGTTCAGGTCGGGGTCCGAGCACTTCTTCCTCAGCCCTTCTGTGTAGGAAAGCACGGCTTTCTTGTAGTCTTTGTCCTTAAAGTAATCATTGCCCTCGTCCTTGTAGGTCTTGGCTTGCTCTGTGAAAGGACAAAGGGTTGGCAGCTGTCTCTCCCTCCCTCCAG---GCCTCTTTAGAGCTTCTGCCATG a score=5986 s mm8.chr4 106176072 164 + 155029701 ACTCAACAAGGACACAAAAGAAGTGCTGGGTGACA------------GTAAGATACCTTCTGGATATCGATCATCATCAAAAATCATCGACTGGAGGCAGGCCAAGTCAGGAAACTCCTCGGGGTCAATTTCTGATGGCGCTTTTTTCATAAATAGGGGAATCTTGTCAAATTCCT s monDom4.chr2 37872515 176 + 541556283 ACTTTGTCAGATCAGAAAAGCAGGCCCGTCTGGCACCCCGTGCACCCGCCAAGCACCTTCGGGAGATCTCTCATCATCGAAAATAAGGGACTGCAGACAGGCCAAGTCGGGGGTCTCTTGGGGGTTGATTTCCGTCGGGGCTGCCTTCATGAACATCGGGATCTTCTCAAACTCCT a score=3547 s mm8.chr4 106176580 402 + 155029701 AAACGCAGTCAACTTATACGCAAAACCTCGAGGCGGACGGTTTCTACCAGTGACCAAGCCTCGAGGACCAAGCTCCTACCCCAGAAGCCCCCGGCGCCGCCCACCTCCTCCCACTGATCCTCGCGGAAGCCGCCGCGGTAAGGCTGGCTCTGAAACTTTTCCAGGAACGCGTCCATGGAAGCGTCCTCTGTAGGCTCAGGCTCAGAACTCTCCATGGCAGCTCGCAACTTCGGCGCTTCAGTCCCGGGA-----CCAAGAAACGCGCCGCTCCTTC--CGGCGGCAG-------------GGATGCCCTTCCTTTTGCAGTCCGGGCTGCGCGAGGCTA------TGCCTCTCGGGTTCCGCCGGCCTGGGGGCGTGGCCTGC-------CTGGAGGTGTGGCCT---GACTCCGCGCTTTCCCTCTCGCCCAGCCCC s monDom4.chr2 37873696 404 + 541556283 AACCACAGTTAA-GGGTGAGCGTTAGCTCTGGGCGGGGCGTGCGGGCCACTGACA-------GAGGGGTAAACT----------GAGGGCCAGTGGCCCCGCACCTGCTCCCACGTGTCTTCGCGGAAGCGTCCCCGATACGGCTGGCTGCGGAACTTGTCCAGGAAGGCATCCATCGTGGCCTC------GGCCTCAGCCTCG----TCCTCTTGCCCCCTCCC-----CAGCTCTCTGGGCCCGGGATTGTCCCCCGCTGAGCCCCGCTGTAgcggcggcggcggcggcggcggcggcggcTGCCCCTCCATAGCTGCTCAGCTTCGCACCGGCCTGACCCACTTCCGCCCTCATTCCGCCGGTCCGTTTCGACTTCCTTCCCCACTTCCGGCGCCCAGGCCTGCAGACCCCGCCCTTGCGTTC-CTCCCAACCTC a score=10552 s mm8.chr4 106178555 492 + 155029701 GGCTGGGGCTTATGTCACTGCTTCAGAGACATCTTCCAGGAGGCCAATGCCTGCATGATCCAGGAGCGCCGTTGGTGGGAGGTGGGCAGGTTCTCACAGCTGGGGCTCCAGCGGTGCATACTGGATGGGTCACACACCCATGAATCCCCATACAGCAGTGGCCAAGAGTTCCGCCAGCAAGTGGCCATAATTTGATCCTGGGCCTGGGCAGCGCAGATACACACGGAGGCTTCTGGGTCGTGTCTCAAGATCTCCAGAGCTG------------GGTTGGAGG--AAGAGGAAGCGATTGTTTAGACAGAACTCATCCTTTCTTCCCACCTCCTAGCCTTAGCT-----TAGACACCCTTCTGCAGCATCTTCCCAAACCTTCAGATTGTCACATC----------TTTCAAAGCCTGTATGA--AAATTCCA---------CCTCGTATAGGAAGCCTTCCTAGATTTCCCCAGCCTACCTCCCATCAGCTGTCTCGGTTGCAAAGTGAAAGTGTGCTCTCTTAAGCATTT s monDom4.chr2 37874928 509 + 541556283 GGGTGGGG----TATTGCTATTTTAAAGTCTTCTTCCAGGCCCTCAGCGACTCCACGATCCAGGACCTGCGGTGATGAGCAACAGGGAGGTTCTCTTTGCTGGAGTTCCACCGGTGTGTGGAGGCCGGGTCACAGACCCAAGAGTCGCCCCGGGGAAGGGGCCAGGAATTCCTCCAGCAACTTGCCAGGATGTGATCCTGGGCTTGAGCTGCAAAGATGCACACTGACGCTTCTGGGTCGTGTCTCAAGGCCTCCAGGGCTGCAAGCATGGGGAAGATGGGGGCCAGGAGGGAGGAAAAGAGAGAGCAGAACAGGGGAGGGTTACCCAGGTC--AGCCAGAGCGCCCCATAGGGA-ACTGCTGCTGACCCTTTCTCATCCCTTTGGCTCCCACATCAGCAGGAGCTCCTCACGACCTGCTGGAGGAAATTCCAAGCTCCCCCTCCCACCTGGAAAGCCTCCC----ACCCTCTGGCCCATGGGTCTCTTCCTGTCTCTCGTGC------------TACTCCCCTGAACATCT a score=4325 s mm8.chr4 106179783 175 + 155029701 TGACTTACTAGCTTTCACTTCATTCAGCCGCTCTTCTGTCATCATGTTCTCCATGCAGGGGACCAGGGACCCT----GGATAA-TCCAAGAGGTGA---AGGCACCTTGGTA-CCTGCTCCTCCCACCCTTGGACCAGATGACCTCAGAGACTCTGCCTGCCGTCTTCCAGCCCCATAAACGAG s monDom4.chr2 37876488 179 + 541556283 TAACTTACCCGACTTCACTTCACTTAGGAGTTCTTCAGTCAGCATGCCTTCCATGCAGGGTACCAGGGACCCTTCAAGCACAATTCCAAGGAGTGACTGAGCTGGCCTGTTAGTCTCCTCTTTCTTCCCC---ACCAACCAAGACCCTGGATTATAGCCCACATCT--CAGCCCTTTGGACAAG a score=5965 s mm8.chr4 106181836 136 + 155029701 TTACCTATGAAGATGACAGAGGACTTCCGGAGGGAAGCCCGTGAATTCTTGGCATACTCCAGGCTCTGGTTGAGGAAAGTGAAGACGTTGTCTCGGTGAGAGCTCACCTAAAGCAAAGAGAAAACCCCCAATGTGC s monDom4.chr2 37877437 132 + 541556283 TTACCTATAAATGTGACTGCACTCCTCCGGAGGGCAGCCCGAGGACTTTTGGTATATTCCAGGCTCTGGGTCAGGAACACTAAAGCACTGTCACGGTGGGTGTTCACCTGGGCCAA----AAAACCTCCATTATAC a score=1389 s mm8.chr4 106182961 221 + 155029701 TCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGAAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTTGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTTGGAAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTC s monDom4.chr6 164016912 221 + 244784211 TTCTCATTCTTGAATCCAAAACAATGAAGAGGGAAGGGTCCTTATTTGTGAATCCAAAATGATGAAGAGGGAAGGGTCCTCATTCGTGAATCCAAAATGATGAAAATGGAAGGGTCCTCATTCATGAATCCAAAATGATAAAGAGGGAAGGGTGCTCATTTATGAACCCAAAATGATGAAGAGGGAAGGGTGCTCATTTGTGAGTCCAAAATGATGAAGAG a score=6916 s mm8.chr4 106183182 1197 + 155029701 GGAAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTTGGAAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTTGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGAAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGAAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGAAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGAAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGAAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGAAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTTAGCTCGGAAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTG------GAACCT------TAGCTCGGAAGTGTCCTCAGCCATGGAGCCTGGAACCTT-AGCTCGGGAGTGTCCTCAGCCATG s monDom4.chr6 164016867 1203 + 244784211 GGAAGGGTCCTCATTCACAAATCCAAAATGATGAAGAGGGAAGGGTTCTCATTCTTGAATCCAAAACAATGAAGAGGGAAGGGTCCTTATTTGTGAATCCAAAATGATGAAGAGGGAAGGGTCCTCATTCGTGAATCCAAAATGATGAAAATGGAAGGGTCCTCATTCATGAATCCAAAATGATAAAGAGGGAAGGGTGCTCATTTATGAACCCAAAATGATGAAGAGGGAAGGGTGCTCATTTGTGAGTCCAAAATGATGAAGAGGGAAGGATCCTCATTCGTGAATCCAAAATGATGAGGAGGGAAGGGTCCTCATTCACAAATCCAAAATGATGAAGAGGGAAGGGTCCTCATTCGTGAATCCAAAACAATGAAGAGGGAAGGGTCCTTATTTGTGAATCCAAAATGATGAAGAGGGAAGGGTCCTCATTCGTGAATCCAAAATGATGAAGATGGAAGGGTCCTCATTCATGAATCCAAAATGATAAAGAGGGAAGGGTGCTCATTTATGAACCCAAAATGATGAAGAGGGAAGGGTGCTCATTTGT-GAGTCCAAATGATGAAGAGGGAAGGGTGCTCATTTGTGAATCCAAAATGATGAGGAGGGAAGGGTCCTCATTCGCAAATCCAAAATGATGAAGAGGGAAGGGTCCTCATTCGTGAATCCAAAACAATGAAGAGAGAAGGGTCCTTATTTGTGAATCCAAAATGATGAAGATGGAAGGGTCCTCATTCATGAATCCAAAATGATAAAGAGGGAAGGGTGCTCATTTATGAACCCAAAATGATGAAGAGGGAAGGGTGCTCATTTGTGAGTTCAAAATGATGAAGAGGGAAGGATCCTCATTCGTGAATCCAAAATGATGAGGAGGGAA--GTCCTCATTTGTCAATCAAAAATGATGAAGAGGGAAGGGTTCGCATTTGTGAATCCAAAATGATGAAGAGGGAAGGATCCTCATTCGTGAATCCAAAATGATGAGGAGGGAAGGATCCTCATTCTCGAATCCAAAACAATGAAGAGGGAAGGGTCCTTATTGGTGAATTCAAAATGATGAAGAGGGAAAGGTCCTCATTCATGCA-TCAAAATAATAAAGAGGGAAGGGTCCTCATTTGTGAATCCAAAACGATGAGTCTATGGGGTAACTTTGAGATGGCCTTG---AGGTAGCCTTGACCCTTGATTTCCTGGGCATTTCCAACTCTG a score=5601 s mm8.chr4 106188140 239 + 155029701 ACTCACAAGATACTTGCAAATTTTGGTCACTGTCAGTTGCTGGTTGTCCCAGGGCTTCTGGCTGTAAGCCTTTTTTGGCAACTCCCAGTTCATGAAGGAAGAGCAGCAGACCAGGGTCTTCACACATTTCTGCAGACCAACAGGAAGAAATTACCAGCAGGGTAGAATTTCAGGTCAGCGGATGTCCTGA-GGAAAATGCTTTTAAAACTGGATTTAggggctgatgagatggctcagtg s monDom4.chr2 37881272 233 + 541556283 ACTCACCAAATACTTGCAGATCTTGGCCACACTCTGCTGACTGGGGTCCCATGGCTTTTTGCTATACATCATTTTTGGCAGAACCCATGCCATGTGGTAGCAGCAGTAGGACAAAGTCTTCTTACATCTCTGTAGGCAGATTG--AGAAAGTATGGGATCAAGAGAAT-----AATAACATATGTTTTTATAGGGcatttttctaaaacaacgctgtgaggtaggaaggaaggctaggtg a score=3316 s mm8.chr4 106188900 188 + 155029701 CTCACCTGGCTCACTTTGGCATTGCCCTCCTGTATGATGAAGAGCAAGGGCATCAGCGTGCTGGTCAGCTGCTCCTCCATGGCTTGGGTGCGGGGTGTCTGGAGCTTCTTCACCACTTTTCCGTATACATTGATGCAGGAAGCCCGCACCATTTCTCTTGCCTGAGACAAACAGGAGGCTCCGGTGGG s monDom4.chr2 37881966 181 + 541556283 CTCACCTTCCCCACGACAGGATTCCCTTCCTGAAGTTGCAGGATCAGGGGTACCAGGCTATTCACCAACTGCTGCTCTGTGAGGGGTGTGCAGGGGCTTCGCAGTAGCTGAACCACCTTACCAAAGAGGGTGATGGCCGCCAAGCGCACCTCTTCTCTATTCTGA-------AGAAGGAACCACTGGG a score=6472 s mm8.chr4 106189418 396 + 155029701 CCTCCCGCCCCCACTCCCGATGCCTTACGTCAGTGAAGTGGGGCAGCAGGATCTGCAGCATCTCCACATAGACTGCACTGTCCGTTAGCTTCTTGCCCTGCCCCTTGAAGATTCTCTTGAGGTCATGGACAGCCTCCACCACTAGCATTCCATCCATGTTCTTCAGGCTCTTCACCATGGATGGCAGCAGGCTCTGCACCTTGGCCATCTGTGGGACAGAAGCACAGAGGAGCGTGCTCTGCTTGCCTGGGCCAG---CAGATAGGAGAGCTAGCCT-CCTGTACCTTGCTATCTGTTCTGAACTCCCTCGACCTCTGGTTGTTCCCCGAAGCCTTGTTGGGTCTCCCCGATTCCCTCCTGCTGGGTTGCTGGAGGCTTATCCCCTCCACTGGCCCCGGT s monDom4.chr2 37884484 381 + 541556283 CCCCCAAATCTCCCTTCCTTGCTCTTACATCATCAAAGTGAGGCTGGAGAACCTGCAGAATGTCCAGGTAAATGGAGATGTCACTTGACTTCTTGTCCTGAGATCTCAGGATGGTTTTGACGTTGCTGACTGCCTCCACAGCCAATAAGCCATCTACCCACTGCAGGCCTTTCATCATAGAGGGCAGAAGAGCCTGGATTTTGTTACTCTGTTGGGGAGGAAGAAGAGGAATTAGACTTTGCCTGGGAGTCCGAGGACCAGATTGGAATCCCAGATTAACTGTTCCC---------TCCTGAAATGCCCCTTTCTCTCTCTGT----------ATAGTTAATTCctgcccttttctatctatgtgagcttggcaagcccattctctctccaggcctcagt a score=8600 s mm8.chr4 106190155 216 + 155029701 ACCCTGCCTCTTTCCAGCCCAGGCAGAGCTTCTTCAACCCTCCACTCACCCACCTTCTCAGACTTGCATGCCAGGATGACCAGGCCCCGAATGGACAGCACATTCATGATGGGGTCACGGTGGCTCAGGCCTTCCACCATCCGCCCCAGGGAGTATTCCTCAGGGATGCGACGTACCTGCTCCATGCGGAACAGCTGAGAGAGCAGACAGCATGAC s monDom4.chr2 37885497 209 + 541556283 ACCCTGTGCCCTTCGAATCCTGACAAAGTTACCTC---CCTCAGCTCTCTTACCTTTTCTGTTCTATGGGCCAAGATGACCAGACCCCTGATACAGAGCACCTTCATGATGGGGTCTTCACTACTCAGGCCCTCAGACATTCGGCCCAGGGAGTACTCCTCTGGAATCCGCTTCACCTGCTCCATGCGAAGGAGCTAAGG----AGATAATTTGAC a score=9561 s mm8.chr4 106192239 137 + 155029701 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AGGTGGGGTTTGAGCTGAGAAGGGGACTCAGAGC----AAAGGAAGGGACGGGGTCAATGAAGAGAGAAGAGACATGGATAACAATGGAGAAAGGGGTGGGGCAAGAGCAGTGGCTGTAGGGGAATTGCAGACAGTGACTCAGGAAGCTGAGATAATAGGATCAAAAGTTCAAGGCAGTGCTGGGCAATTCAGTGTGACTGTGTATACAGATAAACAAGGAAAGAGGGAACAGGACTCTGCtgtggctcagaggtagagggcttgcctcgcaggtacaagggtttgggtccaaccctcagcgtcaccaaaaCTAAATAACAGCGTAAAATACAACATGGAAGCAGGGCACTGGCTCAGGATGACGCCACTCCTTCAGAG-----CCCACCTCCCA---CTTGTATGAAGCCATTTTCCTACTTCCTTCTCCCTT-TCCCTGCTTGCCCCGTGTCGTCCCCACCCCC----------CCACCCCCCACGC-----CGCACCTCCAGGATGCTCTTCAGCCCAGTAGGAGTGGGGTCTTCAATAAAGAGGGCATTCAGAAGTTTCTGCAAGGAATCCAAGGTCTGGTAGTAAAGGATCTGTGGACAGGAGGACAGAGCTGCTGGGAGCTTGTTAGACACCACCGCCCTCTGCTGGCACGACTTGTAACTACAAGGGGCTGCCAGTTCCTTCCACAGCAAGGATTCTGGCCATGACTTTGGGCCCTCTC---AGGCCACCAGCTTGAGAATCCAGAACCC s monDom4.chr2 37911793 627 + 541556283 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monDom4.chr2 37965006 177 + 541556283 TGATGAAGACCATGTTCTTAACCCATCCCTAGGTTGTGAAAGC---------TGTCGGCCAGATGGTGACATGATGGACTACCTTCTCAGCACTGGGGATATCAGCCACAGAGATGGCCTGCTGGTCACCTGGCACCATGCTGCCAACAACCGGAGTGAGATGGAGACAGCCCTGAGCAGTGAGGC a score=9658 s mm8.chr4 106240058 175 + 155029701 TCTGCCTCTTGTAAATAGGCGATGTCATGGTCTTAGAAGCCGATGTCACCGTAGAAGGGTTCAACACAGCCAATGAGACCAAGGTGCCCATTATGGCCCACCCTCCAGCCATCTACAGTGACAACACCCTGCAGGAGTGGCTAGAAGCTGTACTGGCCTCATCTCAGAAGGGTAA s monDom4.chr2 37972627 175 + 541556283 TTTCCCCTTGGGACCTAGGCGATGTCATGGTACTGGAAGCAGATGTCAATGTGGAAGGGCTGGGCACAGCCAATGAGACAGGGATCCCAATAATGGCCCACCCCCCTGCCATCTACAGTGACAACACCTTGGAACAGTGGCTGGAAGCTGTATTGCCCAGATCCAGAAAAGGTAA a score=9361 s mm8.chr4 106241041 290 + 155029701 TCCCACTCTTTCCCAAGACCCTCCTGCCCTTCCCTGCT---CTTTCTACT---GAGTAAGTCCAGTTCCCCAGTC-CTCACCCCTTTCCTGCAGGCATCAAACTGGACTTCAAGAGTCTCAAGGCTGTAGGCCCCTCCCTGGACCTCCTTCGGCAGCTGACTGAGGCTGGCAGGATTCGGAGACCAGTGTGGATCAATGCTGACATCCTGAGGGGCCCCAATGTGCCCATCTCAATTGAGATCAATGCTACCCAGTAAGT-----GTTCACCCTCTCCCCAGCTGAGTCCAGCCCTCTTCTG s monDom4.chr2 37973976 302 + 541556283 tccttctggattcccagtccaggtttccctctactgcTTAACTCTCTAGTCTAGAACATTTAAAGCTCTCTAACCACTCACCATTCTTTGCCAGGCATCAAATTAGATTTCAAGAACATCAAAGCAGTTGGTCCCTCTTTGGATCTCTTGAGGAATCAGACAGAAGAAGGGAGAATCCAGAGGCCTGTGTGGATCAATGCCGATGTCCTAGATGGCCCCAATGTCCCCATCCCAGTTGCTGTCAATGCCACACAGTGAGTCAATGGTTTCTCTCCTCTCTGAATGAAACAAGAATACTACTG a score=13388 s mm8.chr4 106243349 347 + 155029701 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monDom4.chr2 38042226 291 + 541556283 CCTGGGCGGCCACCCACAGCGGGCAGC---CCTTACCTTGGTTTGCTGATCCCCCTCTCGCCAGAGGCAGAAGCCAGAGCACAGGGTCTCCCCTCTGGTGCGCTCCGGGGTCTCGGGGTGGGTGGGCAGGGTGACTGACCTGAGGGCGACCACGTAGGGATCCCTAGAACAGAAGTGGGG--AGAGGGGATCGCACACTGGCACCCGAAGAGGGAGCCCCCCACTTTGTGGCCC-------TGGAGGGGACACCCCTTCTTGGCACA-CAGTCT----CTCCCTCTCGGGCCCCGGATT---CACCTCGGG a score=1511 s mm8.chr4 106251758 83 + 155029701 CCTGCCCCAGGGGTCCCCGGGTGGGGCTGTGTAGATATGGGGAGAGGAGCTGGGCTTAAGGCCCTACACAGTCCCGAGCAACC s monDom4.chr2 38042576 83 + 541556283 CCTGCAGCTAAGGCCACTGGGTGGGGTCATCTAGAAAAGGAGGGCAGCTCCGACCAGCTGGAACTCCCTGGTCTCCAGCAGGC a score=4856 s mm8.chr4 106251851 236 + 155029701 GCAAAAACAAGGGACA-------CCCACGAATGTCATGAACAGCCATCTCG------GAGCAAGGCACAGAGC---------------TCTCCATGGCCCTGGACGGGCAAGCTTTCT-----TCCAAAACTTTTCTGACCAAAGGATGCAAAAGGGCCCAGTGGGCTTTGAAACAAAGAGGCTTACCTGGTTGCTAGGGTCCCAGGGGACAGACAGGGCCACTTCTGCCTGCTTACAGGACACAAGGTATTTCCTGAGAGGGAAGAGG s monDom4.chr2 38050276 261 + 541556283 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TCTAATTGAAAACATTTCGGCTCGGGGGCCGCCAGAAGCATCCCAGACCCCGGCCCCCTTTCCTCCCCTCCCCCAGCCTCCTGCCCGTTCCCCAGTGTCGGATGAAGTCATGATCGCTCCGCTGGCTGCAGACACA-----------TGGCTGGGGCGGGCGAGAG----GGGAGGGGG---CGCCCGGACCCCGTTTGGATACTATGGTTACTCGATCAGA a score=10235 s mm8.chr4 106337955 340 + 155029701 CAGCGAAGACGAACAACAATAGCGGCCGCCAGAGGAGGAAATTCCTTCCGGGGTGGACGGCG-CGGGGGGAGGGG---CGCCTGGCTGGAACGCCGAGGCGGCG-GCTGGGCCAATCAGCGCGCGGCCGCCGGCGGTTTCAAGGTgccc---cgcgccgcccgttcccccccccccccgcaccccccctcccgc-gcgcTCCGCTCGGGTG-CTGGAATTGCTGAGACGTTTCCCTGCACGCGCCCGGGTAACACT-----GCGGGGGCTGCTG---------------CCCAGGCCCACA-------CCCCCAGCGCTCCCCGCACCC---------CTCCCGGAGCCCACCACCCGGGGCGACTGAGCGAGCGTTCCA-CTGCAC s monDom4.chrUn 135627257 386 + 174229318 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GCTTGCTGCATCTTCCGA-CATTTTTAAAAATCAAGTCACAGCTGTG-GGAACTTTACACTGTGACCATCATACACAAATATAAAAAGAAGCAGACATGACAGATGAAGCCATGGCTACCTATCAGTCCAATGCTATCGAACACAAAAGACCAGTAAGAG--ACTGTGACCCAGGAGGACAGAGTCACAACAGGGCCT s monDom4.chrUn 84955340 192 - 174229318 GCTCGCTGCCTCTTACAAACTTTTTCTCCCGTCGAATCCCAGCTGCCCTGAGCTTTAGGCTGTGATTGTCATAAATAAATATTTGTAGAAGCAGG-ATGGAAATGCACGCGATGGCTGCCTCATGGAC-----CTCCCGAGCTGGGGGAGTCTGGAAGAGGTGCAGAGACCCTCGTGGTCAGAGGGGCCTCTGGGGCT a score=8076 s mm8.chr4 106791624 366 + 155029701 CCCCTGTGACACC----AATCCCCTCGCCCTTCCCCAGATCCCTAAGCCTAGGTCATC-----ACCTTGTAGCAGATCCTGCCCTCCTGTATCACGTAGAGCCTCTCAGGCAGGGCCGCGTAGAGCTGGCTGCTCTGGTTCTGCATTGTGTCCACCACCACAGGGCACTGGGGGCTCCTGGCCAGCAGCATGCGGGCTGCCCGCACGCGCTCCTGGAGGCTCCGGTGCTGCCGGATGTCCACGTTGTTCTTAAAAGCCCAGCCATCTGCAAGAGGAAGGTTAGACTGCAGCCGCACAGATGGGACAGACAGTTCCCGGAGTTTAAACTCCACCTACCTTTAACAGAAAGCCTC-----ACAAAGCAGT---------GTCCTGTGGGAG s monDom4.chrUn 84957410 366 - 174229318 cccatggggctccctcaaaccgacaagttctctatcagaGCACCCAGGTGAAGCCAGCCCCATACCTTGTAGAGGATGTGGCCTTCCAGAaggatatagaagcgctctgggagggcagcatatttcctggtggccaagtTGTCCATGGTGTCTACAACGATGGGGCACAGCGGCTTCCTGTCCATCAGCAGCCGCGCAGCCTCCATGCGATCCTGGAGGGTGCGATGCTGCTTAATGTCTATATTGTTCGCAAAGGCCCAGCCGTCTAGAAGAGAGAGACGAGTCAG----------GTTAGGAAGG------CCTGGAG----GACTTCA---GTCTGAAAAAGAAAGCCTTTAGGAGAGAAGCAGTGGGCGGCCGGTCCTGGAGGAG a score=9475 s mm8.chr4 106795345 345 + 155029701 TCTTGTTGAAAGCAGACTGTGGAGGGAGAGGCAGTGGGAGGGA------AAGACAGTTCT------GGGCTTCTCTGGTcctccctctttccctcctgtcctcctctctcattccttcccttccCAACTATAACATGGGCTCTGACGATGGGAGAAAGGCAGAG-CAGGAAGAGTGGAGGCCG-----------GGAGTCTCTGTACCTGTGGCGTGAGCTTCTTCAATGTAAATGATGAGGAAATCGGCTGTGGAGGCAAAGTCATCTACGAGTCTCTTGAACTGGTCAAATTTGAGAAGAAATGAAGGTCAGGTGCAACTGCCAAAGTTCAACACCAGGGGCCTGCTGCCTGCAACACAAGGAACCG s monDom4.chrUn 84961303 354 - 174229318 tcttcttgacacctgacccagcCttgagagt---tggaagggacctcagaaaccatcttttccaacATGCTTCTAAGAGTCCCCCCTCCCCCCTCCCATCCTTGGTGGTCCTACAGGCC--TCCTTAGAAGAACACAG----------TGATAGAAACCCAGAGGTTACCATAACGCGGGCCGCCACTCAGGACTGTGGCTGTGTACCTGTGGCATGCGCTTCTTCAATGTAGATAATGAGAAAATCTGCTACTGAGCTGAAGTCTTCCATGATCCTGTGGAACTGGTCAAATTTGAAGATAAAGGAGGGTCAGGTGCAGCTGCCAAAACTCAACACCAAAGGCCTGTTGGCTGCAACAGAAAGACACG a score=13362 s mm8.chr4 106804677 467 + 155029701 CCACCCATCCCC---ACTGCTCCGAGCCCCTGAGCTGACCTTGAATGAAATCCCAGATGTTGCACTTCTGTCCTGAGAGGCAGACCACGGTGCAGTTGGGGGCCAGCCCCCCAAACTCAGCCCTGTCTTCCAGTCTCTGCCAGCGGACCTTCAGGACAAACCAGAAGTACTGGATGCTGAAGAAGGTGGGGACCCAGTTGTCAGGGGCGAATCGGGGGTTCCTGGCCATCCCGGTCTTCTGGCCCATGGCCAGGATGCTCTGTTTGACTCTCCCTGGGAACAGCGTCATTAGCACCTTGCCTACAGCCACCTCCAAGGCCACCTGCAGGAATATCACAAGCCGCT------TCAGCCACAGCCATAGCTGGGGCAGCCCCATCTCAGCACGGGGCAGAAGTGGCTCTGAGCCTGCAGACTGA--AGGAGAGGCCCCAGCCAGACAGCACTGGGTGGAGCTGGACAAAGGTGCAGGCTA s monDom4.chrUn 84962931 468 - 174229318 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monDom4.chr3 21555641 164 - 526135210 CCAAGAGCCCAAAGAGAAGTAAGAGTCCTTTGCTTTCTAATCCCAGCTGGGGGCTTACAAGTGCTCTTGCTC--AGGCTTCTGCTACAATTAAATCTCTGGTGACTTGGAAGGCAGCAATGAGGGAACTCAGCTGAATCTTCTCACTCGTGCCAACAGCAAGCCTG a score=3238 s mm8.chr4 106825509 41 + 155029701 TACTCAATGTCTGCCATTTTGGTCAATAAGTGTATCCGAAC s monDom4.chr3 21557632 41 - 526135210 TACTCAATGTCTGCCATTTTGATCAGCAAATGTATTCGAAC a score=2991 s mm8.chr4 106825550 62 + 155029701 TGAAGATGGAAAGTCAACTCTGTGTACAAACAAGTGAACCTCGGTCAGAATGTCATGCAGCG s monDom4.chr4 167825867 62 - 430141050 TGGAGGTGGAAAGTCAACTCAATATAAAAATAAATTTATCTCTGTCAGGATATCCTGTAAAG a score=9366 s mm8.chr4 106825612 163 + 155029701 CCAAGCCCTTCAGAGTCTTCAGCTCCA--TGATATTTTTGTAGGCGGTGGTGAAGTCCTGATTGAGCATCCAGTCCAGTATATTGGCGATGTCCGTCTTGAGTGGGTGTCCGGTGCACGTGTAGACAGTCTCCTCTGTCACCTTCCCAAAGGCCATATTGGTACT s monDom4.chr3 21560752 165 - 526135210 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CTCCGGCGTCTTGTTTCAGGTCTTCGACAGGATAAAAGGCTCCATGTTGCCCATCCCTGGGCGGAACTTCGTCAGGCTGTATATCCGGAGCAATCCAGATCTCTACGGTGGGTGCTGTGCGGCCACACGTGTTTCCGTCCTGTGGGTGGTGCAGGGAGGGCGTGAGAGAAGCCCAG-GAGGGGGCTGGCCACTGCTATGGAGCCAGTCTCGG a score=7917 s mm8.chr4 106838854 185 + 155029701 TTGAGAAAGAACCTAACAGCGAGCGCTGCATTTCCCCTTCTGTGTCCTCTGGTTGCTTTGCAGGTCCCTTTTGGATATGTGCCACGTTGGTCTTTGCCATAGCAATTAGTGGGAACCTTTCTAACTTCCTAATCCATCTGGGAGAGAAGACATACCATTATGTGCCCGAATTCCAGAAAGGTAGG s monDom4.chrUn 85023751 177 - 174229318 TCGAGGCTGACCGAGGCGGCTGGCGCTCAGT----CCTGCTG----CCCTTTCTCCTTCTCAGGGCCCTTCTGGATCTGCGCCACCCTCGTCTTTGCCATCGCCATCAGCGGGAACTTCTCCAACTTCCTCATCCACCTGGGCGACAAGACTTTCCATTATGTGCCCGAGTTCCGGAAAGGTCGG a score=13254 s mm8.chr4 106842431 258 + 155029701 TGTCACCCACAGTGTCTATCGCAGCGACTGTCATCTATGCCTATGCCTGGCTGGTCCCTCTGGCCCTCTGGGGCTTCCTCCTGTGGAGAAACAGCAAAGTGATGAGCATGGTTTCCTATTCCTTTCTGGAGATCGTGTGTGTCTACGGCTACTCGCTGTTCATCTATATCCCCACAGCAGTAAGTACCATGCGGGTGAGTAGGCAGAGCCCTGCTGTTTTGGGTGGAAAATTAGAAAATTCAACAAAGTATCCCACGG s monDom4.chrUn 85024236 248 - 174229318 TGTCTCCC-CAGTGTCCATCGCGGCCACGGCCATCTACGCCTACGCCTGGCTGGTCCCTCTCGGGCTCTGGGGCTTCCTCCTGTGGAGAAACAGCAAAGTGATGAGCATCGTCTCCTACTCGTTCCTGGAGATCGTGTGTGTCTATGGCTACTCGCTCTTCGTCTACATCCCCACGGCGGTGAGT--CAGGCTGCCCGCTGG---CAGCCCTCC----TTGGGAAGTGGATTCGGGACATGAGCAGagcagcctgggg a score=12099 s mm8.chr4 106842927 205 + 155029701 TCTCTTTTCCCAGGTCCTGTGGATCATTCCCCAGAGGGTTGTTCGTTGGGTCCTTGTCATGATTGCCCTGGGCGTCTCAGGCTCTGTGTTGGTAATGACATTTTGGCCAGCTGTTCGTGAGGATAACCGGCGTGTCGCCTTGGCCACCATTGTGACAATCGTGTTGCTTCATGTGCTGCTCTCTGTGGGCTGCTTGGTATGTTCT s monDom4.chrUn 85025511 205 - 174229318 tctctgtctctAGATCCTGTGGATCATCCCCCAGAAGGCCGTGCGCTGGGTGCTGGTCATGGTCGCCCTCGGCCTCTCGGGCTCGGTCCTGGTGATGACGTTCTGGCCGGCGGTCCGGGACGATAACCGGAGGGTTGCCGTTGCCACCATTGTGACCATCGTCCTGCTGCACACGCTGCTGTCTGTGGGCTGCTTGGTAAGGGCT a score=3285 s mm8.chr4 106848329 111 + 155029701 GTCTCCTTTCCTGCAGGCTTACTTCTTTGATGCTCCAGAGATGGACCAC-CTCCCAGC---AGCT--ATAACCACTCCCAACCAGACAGTAACAGCGGCCAAATCCAGCTAATGGGG s monDom4.chrUn 85026541 117 - 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CTGTCATAGTCACATTGGTTCCATACAGCCTAGTATACAGTCGGTCTTTAATAAATGCCTCTT---TGGTTTT-------------------TTTTAAT-----------------------ACAAGAAAATTATTTTGTTC-TAATTTTTAGTTCC-AGACAGCTCACAAATCCACTGC--CTCTGACAATACC-------------CAGAGTATATGCAGATACACTCATGG-CACAGCTGGAGAGGCAACAACT------TGAGGTTTCTCTACACAAACTATTCTTT-AATGTCGC----------TTAAAAATCCAGACTACACGATATGCGTGGGCAGAAAGCCAGCTGAGTGCGTCTCTT----GACACTAAA-ATGTATTAAACA----GCAAACAGCCAACCCTTACATGATTCACACCAAAATGATGACACCCAAAACCACGTTCCTTTTAAAGGACAGGTCTATCAGTAAAATATTATATTTC-TTTAATACTCT-GCCTGATGCTTCATACACTGTGGGAAAGCTAAGTGTGAGTCTGTTCATCGGCTTCTTGGATAGGCCTTTCCCACTAGCTTTTATTAAT---CAGAGTCACAATTAGGTCATAAATAAACATGTA s monDom4.chr3 44067354 627 - 526135210 CTGATATATATGCTTTTGTTTCAGGAACTTTAATCCAGAGTCGGCGCTTAATAAATGACTGTTGTCTGGTCTTCCCATTATGTTCTCAGATTTTTTAATGAAATAAACAAAAACACCAGTATATAAGAAAATGATTTTATTCCTAATTTTCAGTTCTGATACAGTTTACAAATATGCTTTTACTCTGATAATTCAGCCTTGCCACTAGCAAAGCCACTGAGCTAACACCCATAAATACAGGTTGGGAGGCGATTAACATTCACTATTGTTTCTATACATAAACTATTCTTTTAATGTCGTGTTTTGACAATTGCAAATT--GACTACATAATATAGGTGGGCAAAAAGGCAA-TAAGTGAGTCTCTTCTGAAACACTAAATGTATAATAAACACAGCGCATATTATCAACATTTACATGATTCACATCAAATTGATGACATCCTAAAACGTATTCCTTTTAAAGGATAGATTT-TCAATAAAATATTACATTTCATTTAATACTCTGGTACAATACTTCATACACTGCAGGAAAATTAAAAGTAGGCCTAGTCATCAGCTTAATAAAGGATCCTTTCTCATTAGCCTTAAGTAATAAAAAGAATCACAATTATGTCATAAATAAACAGGCA a score=1551 s mm8.chr4 107151382 142 + 155029701 GAGAGCCACTGTGTGCTGGAGAAGGGGGCTTCCAGGGCCAGAGGGGCCTGCCCCAGACTCTCATCCCTACCTGACTCCCTTCCCTGACCCCGCCACCCCCAGGTGACCCACCTTCCCTTCACTGTCTCCACTCTTCTCCCTC s monDom4.chr2 217272332 128 + 541556283 GGGGCCCAGTGGGGGAAGAAGAAGAGTGATGACTGGAGCAAGAAGACAGTTCCCAGA---TCATCCTCAAGTTG-----------GGGTGAGGCAGCCCCAGGATGGCAACCTTCCCTTGCCTCCCTCCCTTTCCCTCTCTC a score=9134 s mm8.chr4 107155004 343 + 155029701 aaaagaaagaaggaagggaaggaaggaaggaaggaaaagaggaagaaagacaggaaggaaggaaggaaggaagggagagaaagaagaagagaagaagaaaggaaagaaggaaggaaggaaggaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaaggaaggaaggaaggaaggaaggaa----------------gaaaggaagg-------aagaaagACAGACAGACAGG---------AATGAGCAGGCA--CAAAGGCTC-----------TGCTAGGGAAGGAAGGTGCAGAAA---AGGCCTCAGAGG--------------------------CCTGTACAGT------GGAGAGGAGGAGAAGAAAAAGGAGGGGTAGGATGACAGGGCTAGCACTGCCCCCACCCCACCCCCAGCT s monDom4.chr2 217272984 422 + 541556283 AAGagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaag-aaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaGAAATGAAGAGGCAGCAATAGTGGCCTGAGCCCGTGGATAGTCTGGGAAACCTAGGTGCTCTTGGGAAGGATTGATTCCCAGGGTGACTTTAAATAGAGAAGCAGTTAAAAGCCCACCCTCATAGTGGCAAGGGGAGGGAAACCCCAAAACTTGGGAGTCATAGGGCGTTTTCCCTAACTCCACTGACTTTTCTTTATAAATAACCAGAGAAGAAGAAGAAAAAAAAGGAGAAGTGGTAGAGAAATTGTAGCATTGTCTCTCCCTCCCCTCCAGCT a score=-769 s mm8.chr4 107174355 827 + 155029701 GAGAAAGGACACCTATGCTTGAG-----TTTCCCAGGGAAGTGAAGTG-GCTCAGTTGTCAGGACGCTCACTCTCTGGAAGAGGACGAGAGGCAGTGTTGGGCAAAGGTGGATGCTGCAGAACCTGCTGTCAGCATCTCAGGCCCTGGCACCTGCCCTGCACTGTCTGGAGGCCTTGGTGTTTGCGGTACCCAGGCTTGGGGGTCAGGCAAAGGGGGCAGAAGGCTGAACTGAATGGTGCCTTCTGTCCTGAGTGAGGCTTGGGGAAATCAGGGGCCACCTCTAGAAGTGAATTTCATACATGGCTCAGATGGTTAAATTCATTTCT----AAACTT--GTGTTTCACCAGCCCCCACTCTTCAAAAGCCCTGCCCATCCCAG---ACTTTCTCTCCCTTTGTACACCACTTCAACACCCACCCAGGACCCAGAGAACCTT-------------GGAAACCACCTGTGCCCTTC------TAACCTGGAGTAGGAATTCGCTGCCTTCTTACACCTATCA------GTATCCTTTCTCCTATATAACATGAACATGGTGAAAAAATAACCCCCGCCATCTATGCCCGTCCCCA-----CCCGGTGGCCTTCCAGGTGGCCTGCAGCTTAGTTGGACTGCTCCTGGGGAGAGTCCTGGCTGGGCTCGGTGGGTGCTTCTGCATCCTGGTCATCTGTAAAAG-----ACAAAAGGAACAGCTGGATTCAGAAAGAGGATTAGTCACCTGTTCTCAGGTACAGCT---TTCCTACAAGGCCTTCTCTTGTGCCCAGGCCCCTGTGGAGAGAGACTCTGCTTCCTTCTGCTGGGCAAGAGACTGGCTTCTAACCCTGGCCACATGGAACAGACTTGAGTCCCCC s monDom4.chr2 1708983 759 + 541556283 GGGGGGGGATGCCCAGGCTGGAAAGGGCCCCCCCAGGGAAGCGAGTCACACTCACCTGACAGGATGCTCTC---------------------------------AATACAAACGATGCAGAACC----GCCCCCCTCCCCTCCCCCTCCCCCCACTCTCTCCTCTTTGG----CTTAG-GATTGGGACGCCCAAG--GGGAGACCAGGCCCCGGCCCC------CTCCCCCGGA-GCCGCCCACTGCCCAG-GCGCAGC--GGGCGGCCCCTCCCCAACCCCTAAGCAGGAAAGCTGGGCCCAGCGAAGAT--TTCAATTAATCTTTGGGGAAACTTAAGGGCTGGCCCAGCCCTC-CTCTCCG------CTGCCCTGCCGGGGAAACACTCAATTCATTCTTGGCCCAGTGGCGCCCCGACACCGGGCC-AGACCAGCTTCCCTCCCCACAGCGGGCACCCCTCCTCCCCCTCCTGGCCTTCCCTGAACCCCAGTTTTCCAGGCTCCCATCCCGAGTCACCCCACGCGTCACTCCAGCTCATCAGCACCCCTTTGGCACAGCTGCAGCCCCC-----CTGGGCCC--CCCCAGTGTGCCCGAGGACCAGCCTGGGGGC-------TTAGTTGGTCGGCTCCTGCGGAGACGGCTGGCTGTGCTCACACATCACGCCCGCATCCGAGACGTCCGTCAGGGTGGCTACAAGAGAATCA--CAGGCCCAGGCGGGG---------------CTCGAGTCCACCCGGAGCCCCCCCAGGCCT-------CGCCCAGCCTCCCCTG-------------------CCCGCCGGGCTTGGAGCCCCCCCTTCGCCCAGCCCCCACCCGCCGGGCTTGGAGCCCCC a score=2231 s mm8.chr4 107177133 179 + 155029701 CCCCCACAGAGTCTTCCCCATCATGGGGAAGCAGGAATATTCATGTCTTACTGGTATTCTCCTTGTCTGTATCGTAGGTCAGCGAGAAAGATGGTGGAGATGGTGGCGGTGGCGGCGGTGGCAGGAAGTGGAGAGCAGAGAGGTAGCCTGGTGGGAGGAAGTGGGGCTGCTGTGGCTGG s monDom4.chr2 1709742 141 + 541556283 CCTTCGCCCAGCCCCCACCCGCCGGG--------------------CTTACCGGTGGATTCTTTGGCCGTGTCG-------GTGAGAACATT-----------CAGCGGCAGCGGAGGCGGGATGTAGTGGAGCCCCGGCAGAAAGCTCGGAGGGATGAACTGAGGCAGCGGCGGGTAG a score=3950 s mm8.chr4 107178595 238 + 155029701 GGGGCTGCAGGAGACATGCCGGAAGCCTCTTTGTTGAGGGACCCCCAGAGCAGAGGATGAATC-------CTGGCCTTCCGAA--------AGTGGAAAGGACTGGTAGGGTGAAACAGGGACGCAGGCAGGGCACTGCTTGAACGGCTCTCTCTCAGGATTCCCAGCTCCTACCACATGATCAGACTTGAATCTCAGAGGATGCCCT--AAGAAGATAAA--------CAGAGAGGGGAAGTGTTAAGAACACAAACCTGAG s monDom4.chr2 1710712 261 + 541556283 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CAAGCGGG--GTTACCTGGGGAAGGCGCCTTTCCCACCCCGGCACCAGTCTGGGACTCCAGCTTAGAGCCGGAGGCTGCTGGCC----------TGGTACAGGCCGGAGGAACCGTCGGCTGCACGAGGCTGGGCTTACCGTAGTCGGCGAACGGCAGTCGGGGCACGGGCCGCACTGGCCCTGGCACTGGCACGGGCC---GCACTGGCAGGTGCTGATCCGGGTAGCAAAG-----CTCCGGCCTGGGCGCCTGTGGCATGAGCTGGGGCAGCCACGCGGAGGAACGGTCGCGCAGTCCCCCGGGGGCCCCTGGTCCAGGCTGGAAGGTGC---TGGGGCCCGGGCGGCCACTTGGGCCCAGCTGGAAGGTGCTCGGGCCTGGGCTCGGGGCCTGCGGGGGCCTCTCGAGGAAGCAAGTGGCCGTGGGGCCTGGCCCAACGCCTCCCGGAACCGCCCTAGGCAGTGGGCAAATGC----------------------------TGGAGCTCAAGGCGGTGGCCGCCGCTGCTGGAGCCCTAGGAGGCAGCTGGGGACCCTGCGTGCCCAC---GGTCGCCACCTGCTCCTCGGCAGCTTGGGTTCTGAGAACCTTCTGGGCAGCCATGATCTTCTGGCGCTCGGTGATCAGGTAGCACTTGTCACAGATGCACTGCTTCCAGCGGCATTTGCCCGTATGGCCCTTGACTGGTACCAGATAGCCATGGTTCCGGCACCTAGAGCACTTGGGGGCGCGAAGCATCTTGTCGTCTAG------CTGGGCAAGCTCTGCTTCCA-AACGCAGCCACCACTTCCCGAAGCTGCAGAGCAAGTGAAGCAGGAATGAG s monDom4.chr2 1712154 794 + 541556283 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TTTTCTTTCTTTTCCTCCCAGT-CTGGTTTTTGTAGCTCCCCAGGAAGCTTGTTTAGCGAGCTTCTCTTTTCCCCCAGGTGATGGTTAAAGCAGCTTTCTGGAGGATATAA--TTAATTTCCTGACAACCAGTTGTGATGTCAAGCATTGAGCAGTCCTTTGAGAGGTGAATAAGGGGGAGAAGGAGGCGAGCACTTGAAAAACAAAGGCCATATTTACATGCTAATGTCACCAGTGATAAAGATTTGGAAGAATCCTGGGATAATGATTATAATAATGTTATGAATATTTTTCCTTGAGGCATAAGGGTGTCTTTAGAAGATGTTTCTTACAGCCCTTCCCCTAATTTCTCAGTTTTCAAAGGCGAGAATAATTACTTAAAGCAAAAGGCGATCTATTC-----ACCATCCTAAGGCAGTCCTTTTGTCTTCTGTGGTCTGAAAGATGAATGATTTCTTGATTATATGCCAAG-------------------AGATTCTAGCATCATTTAGGAAGGGTTTTTAATAGTTTTGTCTTCTTGAATTCTGACACCTTGGAGAGAGGAGCTG a score=2440 s mm8.chr4 107214726 164 + 155029701 ACAACTTTAAAGAAAGCAAACGTTTATAATCCTGTGTTTTGCAAGCTTTTGCAGCCTTTTCCATCTGTCCTTTATCTTCTTTGCAGAAATGGCTAATTTCTTTCAAATGCTGTAAACTGGAAAAATCTAAAATGCTCATCAGATAAACCAATTTAAAAAAACTA s monDom4.chr2 1763258 158 + 541556283 atatttataaatacataatatatttatagta--atactatgtatatttatatTACTTTTTCATTCTGGAGTTTCTAATTTGGCCAGAAAC----AAGTGCTTTCAAATCCTCTACCTTAGCAAAATCTAGACGATTTTCCACACGAACCCGTCTGAAAAAGCCA a score=669 s mm8.chr4 107214927 139 + 155029701 GACTTGCTTCTGATAAGGTCTCTTTAAGTAGCATTATAATTAAGCCCACACCAA---CGAGCTATGTCTCTGAGAGCGCAGCTGGTCTGGTACTGAGGC--GCATGCGCACTGAGCCTCAGACTTCTGCTGCATCTCAATGACC s monDom4.chr2 1763445 136 + 541556283 GACTGGTTCTTGATAA---TTCTCTGGGCTG--TTACCATGAAGCACATACAAAACTCATGGGTTGATTTGAAGAACCCCACTGG---GGCAGCAGGGCTGGCCTGGGGATGGCCCCTCCCAGTGACCCTGATGCTCAGTGGCC a score=9200 s mm8.chr4 107215698 368 + 155029701 GGGTTCAGCACAGAGGAGAATG---AAAGGCAAGCCACCTGGGGGCACTGTACAGA-GAAGCCAACGGTGGCAA-CCCTATCCCTC---TGGCTTCCCTGCAAACAGTTTCTTTTTACAAATGTGGTTTTGGTATGCAAATCACTGTATGCAGATTTCTGTGTGCAAAATACAGCCTAGAAAAATGGCCTCCCTGCCAAAGAAGATAGGAGATGTTGGCTACCATGGAGAGAAATGGTAGCAAATTC--CGGGTGCCTTCTCCCACTGCTCTGTCTAACAATGTATGGGGTGAGCAGATTTTTGGCATGCTAAACTGAAC--TATTTTGGCTTTAGGTTGTGTGTTCTTGTGATAAAAGTGTGCTTATTGAAGCCTGTAA s monDom4.chr2 1763849 359 + 541556283 GTGCCCATCCCGAAGGAGATCGTGTACGGGGAAAC-----GGGGGGCTTGTGTTGTTGAAGCCTTCCACGGCAAACCCTATTTCCCGGCTGGCTTCT--------GGGTTTCTTTTACAAATGTGTTTTTGGTATGCAAATGATTCCATGTGGCTCTTGGTGTACAAAATACCACCTAGAAAAGCTGGCCTCCTGCCAAAGCATAAGGGAAAAG-------CCATGAAGTGAAATCACAACCCATTTGACACATCTTTCTTTTCAGCGTTCTTTCGAATAAGTTAGGACATGAACATATCTTGGGTTTGCAAAAATTAGCTTTGTTCTGGCCTCAGATTTTATGTTC-AGGGCTGAAAGTGTGCTTGGTGAAGCTTGTAA a score=4517 s mm8.chr4 107218296 364 + 155029701 GAAGCCCGGTTATGGGCT---CAT----GACTAGAATTTTTCTGTGGCCAAGATCAGGAACCTTTATCCTTTTAGCAGGACTCTGAA-----CAGAAGAGAGATCCAACACCAGGAATCCAGGGGAGCCTT----GTTGCTGCT-CCTcccgcccccgcccccacccccgccc----------tcgccccATCCAAGAA-------------GATAAACACTTGAAAGTCTGCCCAGA-TCTTGTAATCTTATTAATCTAACAAAGAGACTCAGTAACTGCCTCAACCAGGGTGATGAGTGTTTACCATGTAATTTGCAGCAAGCTGATAAACACACCCT-GGCTGCAAGGAGGCAGGCACTTGGCAGAAAATGGTGAAAAGGGTTAAGACTAAAGTTTCTGGGTA s monDom4.chr2 1766201 384 + 541556283 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s monDom4.chr2 1948248 1648 + 541556283 gtccgtctcactccagctctggggtcctctgGCCAGGGTGGGGGGGTCAAGA-CAGACTTCCTATAGGAGGCGGCATCGGGGTGT-TAGGGATGACGAAAGAACACGCCAGGTCTGGGGCCCAGCCTGGGTAGAGGCACGGCGCGCCATACCCAAGACGCACATTCCCCTCTCTGGTCCCTCC--AGTGCATTCATCGACAAGGCCAGCGACCGGGCCGAGCAGGCCGTCCTCATCGACAGCCAGCTGCACTCCCCTGAGGGCCTAGCCGTGGACTGGGTGCACAAGCACCTCTACTGGACCGACTCCGGCAACAAGACCATCTCCGTGGCCACCGTGGACGGCGGCCGGAGAAAGACGCTCTTTAGCCACGACCTGAGCGAGCCTCGGGCTATCGCTGTGGACCCTCTCCATGGGTGAGTACCGGCTTGGGGCCGCCTGGCAGGATGTGTGGCTGCTGCCTTTCAGAGGGCCGGCTCTCTGGCCTGGGCGTTACTTGAGAGAAATGGTGGCTGGATTTAGGGCTGCCGATGAGCTCATCGAGCAGGACGGCAGGACGGCTTTTTGGAGAACACGGGGTGGCTTCCTGGCCCCCAAATAGCCCTCATGAATTCAGTGCTTCTCGAGGCCCCCGGCCCCCTCACCTTCCAGTGACCAGCTCTGGGC----AGGCTCC-CCAAAGTGTCTCAGA-----CAGTCCTTGGCCTAATGTGGGTTGAAAGGGCTCTG-----TTAAGAG------------------------------------CTCTGGGGCCAAGGAGCTCTTCC----TCCAAGTGGCTGTGTGACTGTAGGGAAACTCCCC--CAAATGGCAATGTTTGACTAGGGAGTCTGTACATTTCTC-CCAGATAATTTTCTCTTCTGTGACCCCC---AGTACTTTATAGAAT---AGTTTTTGAAAAATATTTGATTGATTGATCAAATTGTTTCTAACGTGCTCCTTGACTtcactaaacattaggtctggaagtgactgtagagatccgctattcta-gctcccttattataaactgaggcccagtagaatgacctgcctaggatcacgcagcccattagtggcaggtctTCCCCCTCCCAACT-------GGGGGCCTTATCA---------TGGTGTCATCC------------CAGCTCCACTGCCATGGCCTCTCACCATTGCTTCTCTGCCCTCTCAGAACTGGTGTTGGGGTCCATTCGGGAAAACTGTAGAGGTGATGTTTAtgaatagaggtgacagggagaccagctttaccccattctatggaagaacttcctgatggccagagctgtccacagatgctatga----gGGATGGTGTAAGATTATCAGACAGATGGAGGTGAAACTAAATCCCTCCATCCCAAGAATCTCTCGATCTTGGACTCTGCATCACATAAGCGTAGCCCCCTGAGCTCCCTGCCCTCCAATGCCTGgggataatccttacagagcacccagcccagctcctggctcaaagagacacttaaaaatgcttattctcttCCT-----TTTTCGCTTAAGTGTTCATCTGCATTGTTTTAAACATTGTCGTGCTTCTCTCCCATCTGGCCCCTCCAGGTTTATGTACTGGTCTGACTGGGGTGATCAGGCCAGGATCGAGAAATCAGGCCTGAATGGAGTGGACCGGCAGGTGTTAGTTTTGGACAACATAGAGTGGCCCAATGGTATCACCCTGGGTGAGTC 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TCTCTGCCCTTCCCTCCACAGCTCCTCCATCTACCTCAACCACGACGCTGGCCTCCCCCACCACGAGGACCGCAGGCACGCGTCTCCCCACCAGCCCCT-----------------TCCTGCC--CCCGGGCCA---CACAGGGGCTCTGAGCCCTGGAGATGCCTCCCTGAGCCCAGGGACAGGCCGCAGCGAGCCCACCATCAGCCCATCCATGCCAGGGCTTCCCAGCCCAGGAAACAGCAACCACTCGCAGCACTGTAAGGA-------TTCCTGTGCTCGCTGCCCTGGAGGGGGGTTGTGGGGGAC a score=7632 s mm8.chr4 107359855 217 + 155029701 CCTAGACAGTAACGTCTGTGTGATCTGTTTGT-----GCCTGTTTCCAAACCCTGGGATAAAATAATTAAGCTTAGCACTTCTTAATTCATTGGGAGCAGTAATTGTCTCTGTTGGAACTGCTCTATCTCATTAACCAGAAAATACCTTTATAAT---------TGCCAGGGGGAGTTCATTTTAAAGGGTAAACCATCTCTCACATTTTTTTTCCATACTTGGCTGGCCC s monDom4.chr2 1958157 230 + 541556283 CTTGGATATTTATCCCTGTTCTCCCTGCCTGCCTAGGACTTGGCCCAGGACCCCAGATGAAAATAATTAAGTTCAGAGCTTATTAAAATGTTGGGCCCAGTAATTGTCACTGTTAGAAATGTCCCGTCTCATTAACTAGTAAATGTCTTTTTAATTGAGTTACCTGCCAAGGGGAATTCATTTTAAGGGATAAACTGTCT-TAGAAATCATTTTCCACATCCCACTGACCC a score=3434 s mm8.chr4 107361590 498 + 155029701 GAAAAAGACAGCAGACTCCATCAACAACAAGGAGGCCTAAGCTCTCTCCTGCCATGTAGCCCCCAGCT--TCCTACcatcttgatgctatgggaaagtataggacttgagtcatg--agtcctgagttcaagtcccaagtctg-tatttatcaaa-atttagtttcctgggtgtgaaataacctctgccctatttgcctcTGGAGTTTTGGTGAAATATAGTAAACTCAATAGTTACACAGTATCTAGGAGCATCATCCTAAAGGAGAGGTTGGG---TGGGTGGCCCTTACAACTTGAGGGCAGGCAGGGCTTGGATTCACAGTGATGGACAGTCATTCTGTAACTGATATTTTACAGATGGGAATGAAGGCAGCCAGATGGGCTCAACAGTCACCGCTGCTGTCATTGGGGTCATCGTGCCCATAGGTGAGTGTGGCCCC-----------AACTAGTAGAGGGCAAAAGGA------------CTCTGTGCCCAAGGTTTGGGGACGACACTAGAGGGATAAAGAAT s monDom4.chr2 1961593 477 + 541556283 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ATTTCTTTGGTCTGTTTCCCCAGCGAGTGGCATTAAGTCTTGAAGATGATGGACTGCCCTGAGGATGGGCCCACCCACTTCGTGCCTCATGGAGTTCAGTCCTATGCACTACTCTCTCTGGATGGTGTGTGATTGGATGAGTGCCATTTCTATATATGGGTCtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgACT--TTTTTTAAATTTATGTTGCGGAAAGGTAACCACAAAGTTATGATGAACTGCAAACATCCAAAGGATGTGAAAGTTTTTATATGTATAATGTTTTATACACTTTTTAACTGGTTGCACTACCCGTGAAGAATTCATGGGACAGCCACTGCTGAGTGACTAACATGATGCACA---TAACCAAACGGGGCCAATGGTACA-AACTTCACTCATCATTTGAATACAGTATTTACAGAGGATGTTTGAG s monDom4.chr2 1965981 460 + 541556283 ATCTCTCTGTGGTCTCTCCCCAGCGGGTGGCCTTGAGCCTCGAAGACGACGGGCTGCCGTGAGGACCAGC------GCCCTGTGCCTGATGGGATCCAACGC-GTGCACTGGACTTCCTGGACACtggacggatggacggatg-----------gacggatgCG-----------GTCTTTGCCTGGGTTGGCGTGTGCGTGTGAACAGGGGAGCGAGGGTGCGTGTCTGTGTGCGTGCTCGTGATTACTTCTTAAACTTGATGTTGCGGAAAGGTGACCACAAAGTTATAATGAACTTGAGACATCCAAAGGATGTGAGAG-TTTTGTATGTATAATGTTTTATACGCGTCTT-GCTGGCTGCCCTACCTG-GAAGAAGGAGCAGACCGGCCCCTGCTGAGTGACTAACTTGACGGGGAAGCGGACCCGGCCTGCCCGGCAGGACAGGAGCTCGCTGACCGTTCAA--AATATATTTATAGAGGGGGTTAGGG a score=2497 s mm8.chr4 107370835 57 + 155029701 TAGAGAGGTGAGAGTATTTATTTTTGGTATGGC-TGGCTCACTGCACAGACTCTGTGT s monDom4.chr2 1966671 58 + 541556283 TAGAGAGACGAGAGTATTTATTCTGGGCCCTGCGTGGCTCTCTGTGTATAGTCTGGGT a score=4309 s mm8.chr4 107373883 914 + 155029701 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AGGCGCTATGCTCCTGGATGGTCTCTGACTCCTCTGGCCAGTCCAGACTCTGCCCGGAGGC---CTGCTCTGGCCACTGACCAGCTGTCGTGTTCTCCAGATGAAATGTGGAAATTGCGGGGAGGTGTCGGAGAAGTGGCAGTACATCCGGCTGATGGTAAGGCCCCCTGGGACA---CCCCGGGCCCAGAAGGGAGGGGGT a score=3746 s mm8.chr4 107389819 288 + 155029701 tgagatctctctgggacccttacgt--ctagctgttacatGACTAGAAATTCTGTTTGCTTCTTGTCAGGACAGCGTGGCGCTGAAAGGAGGCCGAGGCAGTGCCTCCATGGTCCAGAAGTGCAAGCTATGTGCACGGGAAAACTCTATTGGTAGGT--CGGGTGCTGCCTACCAGGCTCTTCCAGGGTGACTGGAAGCAGGCTTGTGT-TGTCAAGGGGTGGACCTAGGTGTGAAATACTAAAACCTGTGCAGGTCTCTCTCTTTCCCAGGCTGTGTCTGGGCACCTGAGTG s monDom4.chr2 1996955 285 + 541556283 TGCGCTCCCTCCCTGCCCCTTTCCTTCCTTGTTAAAACCCG-CTAAATGGTTTCATTTCTAACTG-CAGGATAGCGTTCCCCTGAAGGGGAGTCGGGGCTCTGCCACAATGGTGCAGAAATGTAAGCTCTGCTCCCGGGACAATTCCATTGGTAGGTGCCTGGGGGAACCGCGCACgtgcgt---gtgtgtgtgtgtgcacgcgtgtgtgtacgtatgtgtgtgtgcatgtgtg---tacgtgtgcgtgtgcatgtgtgtgtgtgcatgtgcgtgtgtgtgtgtacgtgtgtg a score=2832 s mm8.chr4 107390136 83 + 155029701 TCCTTTTTATATTTCAGACATTTTGAGCAGCACCATCAAGGCTTACAACGTAAGTTTCCTGCTGTAGTGTCAGGGATGGTGGG s monDom4.chr2 1998606 79 + 541556283 TTCTGTTCTCCTTCCAGACATTCTGAGCAACAGCATCAAGCCTTACGAGGTGAGTGTGACCCCG----AGCAGGGAGGGGGGG a score=6801 s mm8.chr4 107391196 169 + 155029701 GAAAGGGCAGAGGGCATTGGAGGAGGTGGTCTCCATTGGTCCTG------------------------CCTCCTCAATACACTTCCTTTCCAGGCTGAAGACAATGAGAAGTTCAAGACGATAGTGGAGTTTGAGTGCCGGGGCCTTGAACCAGTTGACTTCCAGCCCCAGGTATGTGGCTT----TAAGGCTCTCT s monDom4.chr2 1998850 197 + 541556283 GGGAGAGGAGCTGGCCGGGGAGGGGGGCTTCCCTGCTGAGCCTGGGCGGCCCAGGAAGCACGCTTTCCCCTCTCAGAGCTCCTTCTTCTCTAGGCCGAAGACAGTGAGAAGTTCAAGACAATCGTGGAGTTTGAATGCCGGGGCCTGGAGCCGGTGGATTTCCAACCCCAAGTACGGTGCCTCCCCCAGGGCTCCCT a score=3702 s mm8.chr4 107392746 150 + 155029701 GGTCCTCACAGGCTCCTTCTTTCCCCCACCCTCCCTGCTGCCTTCCTGTCTCCTGCAGGCTGGGTTTGCTGCTGACGGTGTGGAGTCAGGGACAGTCTTCAGTGACATTAATCTGCAAGAAAAGGTGAGACTTGGGGAGCCTGTAAGGTG s monDom4.chr2 1999625 146 + 541556283 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mm8.chr4 107506034 329 + 155029701 GATCCTGAACTGAACCCGAGACCACTCTGCCACCCCAGGTACTTTCCCTTTGGCATTGTCTTCCTGATCGCTGGCAAGATCTTGGAGATGGATGACCCCAAGGCAGTGGGGAAAAAGCTGGGCTTCTACGCCGTGACTGTGGTTTGTGGGCTGGTGGTCCACGGTCTCCTCATCCTGCCCCTACTGTACTTCCTCATCACCAAGAAGAACCCCATCGTCTTCATCCGAGGCGTCCTCCAGGCTCTGCTCATTGCGTTGGCCACCTCCTCCAGGT---AGCCCCAGATGAAGAGCTGAGAGGGTTGGGGTAGGCAGAACAGAACTCTGCCCAT s monDom4.chr2 2200430 332 + 541556283 GGCCCTGTAACAGAGCCGCCACCCTTCTGTTCTCGCAGGTACTTCCCCTTTGGCATCGTGTTCCTGATCGCGGGGAAGATCCTGGAGATGGATGACCCCACAGCCATCCGGAAGAAGCTGGGCTTCTATGCCATCACGGTGGTCTGCGGCCTGGTGGTGCACGGACTCCTCATCCTCCCCACGCTGTACTTTGTCATCACCAAGAAGAACCCCATCGTCTTCATCCGGGGCGTCCTTCAAGCCCTGCTCATCGCCTTGGCCACCTCTTCCAGGTAgaagcaccgacttaaaaacacccggggagggggcgggggatggagagccaggcctag a score=-727 s mm8.chr4 107506446 356 + 155029701 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monDom4.chr2 2232906 760 + 541556283 CCCCGCCCCCGGCTCTTGCCCAGCCCCCCAGCCACGCCCTCCACGTGGGTGGCCGGCAGCCGCCCTACCTGGAGGCTGGAGAGGTCGGCCCACGTGCGCGGCGTCAGCGCCCGGCTCTGGAGCCTGTTGTTGGTGAGGTAGAGCTCTCGCAGCTGCGCCATGCCCGCCAGCGCCCCGCGCGCCACCGCGCCCACGGCGTTGCTCTTGAGCTTGAGCACGTGCACGTTCTTGGGCAGGCCCGGGGGCAGCGTCTGCAGCAGGTTCCCCGACAGGTCCAGGGACTTGAGCAGCCGCAGCTTGCGGAAGGCGTCGCGGTGGACGTGCGCGCTCGTGATCTTGTTGTAGCTGAGGTTGAGCTCCTCCAGGAAGTAGGTGGTGGCGAAGTCGTTGCGGCCGATGGCCGAGATCTGGTTGTGGAGGATCATGAGCGTCTTGACGCGGCGGGGGAGGCCGCTGGGCACGCGCTCCAGGACGTTGTTGTACAGGTGCACCGTGTGCAGCTTCTTGAGGCCCTGGAAGGCCAGCGGGTGGATGCCCTTGGCCTTCAGCTTGTTGCTGTGCAGCAGCAGGTACTCCAGGTGCCGGATCGGGGTCAGCACGTCGGGCCCCACCGTGCGGATGGCGTTCTTCTCCAGGTGCAGCAGCACCAGGTTGCGCGGCAGCCCGGCCGGGACGCGAGACAGGTTGTTGCTGGACAGGTCAAGGTACTCGAGGCTGGAAAGCTTCCTGGAAGAGACAGAGAAGGGGAAGGCAAGGCTGG a score=10590 s mm8.chr4 107519970 249 + 155029701 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mm8.chr4 107739742 76 + 155029701 TGCTAGTTACCTGTATGCTACCATCTCACACTCTGGAGTTGGCCATTTCAAAATAGCTGAATGCTAGAAGACACAA s monDom4.chr2 2448325 76 + 541556283 TGCTAATTACCTGTATGCCACCATCTCACAGTCCGGTGTTGGCCATTTCAAAATGGCCGAATGCTGTAAGACACAA a score=15444 s mm8.chr4 107739921 224 + 155029701 ATGACTCTACCAAATCATCAAGAAGAGAATTCCTCTGGCTTCGGCTCAAGGTCCATGCTTGTTCACCTCTGGATATTAAATGGGCGATAATTCCAGCTGCGAAGTAACTGACTTCTACTTCAACACTGTGTAGGAGACTGCTGATGTGGTCTATAAAATCCTTCCACATTAGTTCAGAATGCAGCTCTTGTACTTCAGCTATGTTGTTCTGGGAGAAAAAGAAG s monDom4.chr2 2448504 224 + 541556283 AGGACTGTACCAGATCATCGAGGAGAGCATTTCTTTGGGTGCGGCTCAATGTCCAGGCCTGTTCACCTCTGGATATCAAATGGGCAATAATTCCTGCTGCGAAGTAACTGACTTCAACCTCAACGCTGTGCAGGAGTTTACTGATATGGTCTATAAAGTCCTTCCACATCAGCTCAGAATGTAATTCTTTGACTTCAGCTATGTTGTTCTGGAAAGAAATAAAG a score=15147 s mm8.chr4 107742646 339 + 155029701 TTGCATCTTACCAAAAGTCCTAGAACCTTTTGTTGAATGGATGACTCAGTTGGGAAAGACTATAAGAGAGAGAGAGAAATAT-----GTAACTATCTAAAGAAACAAATATA---ATAAAGAAATGTTTAAAGAAACTGTGCAACTGTT-----------------------------AGGTAAATTT------CCATTCTCACCTCTAGAACCCTCATGAAGAGCTCCAGCCCTTGGTTTTCAATGAAGTGTCTGCACGTGGTTGGGGACTCATCTGTGAGGTTCCAAAGTGCACTCAAAGTAAACTTCAACGTAGTGTCCACGGAATTCTGATTAGTTTTCTGCTTCACTATTTGAAGAAGTTGCTAAAAGAAAAAGGAA s monDom4.chr2 2451076 382 + 541556283 TCACATCTTACCAAAAGGCCAAGGACTTTCTGCTGAATGGAGGACTCTGTTGGGAAGGACTGTGgagagaagagagaaatagagagagaaagtagagagagagaaagagagagaaagagagaaagagagagagagagaaagCAGGTTTGGTCATTACTTCACCAGGAGGATGGAGCAAAGCCAAAGTTGCCCAGCTGTGCTCACCTCCAGCACCCTCATGAAGAGCTCAAGACCCTGGTTTTCTATAAAGTGTTTGCAGGTTGTTGGGGACTCATCCGTGAGATTCCAAAGGGCGCTCAGGGTGAACTTGAGGGTTGTGTCCACGGAGTTCTGGCTGGTTTTTTGCTTCACTATCTGGAGAAGTTGCTAGAAGAAAAGAAAA a score=5201 s mm8.chr4 107748405 112 + 155029701 ATCAAGGGCCAGTAAACTTACCCTGACAATGAAGAGCTCAGCACCAAGCTGTGCAGTTTGTTCTGTAGAGAGCTGGAAGCAAATACAAGATAAAGTAAATGTCGAAGAATTA s monDom4.chr2 2452975 110 + 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+ 155029701 ggacagccagggctatacagagaaaccctgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaG----AGTCACTGACCCACCTTCAAGTCCTCAGTTGCCTCCTCCTAGTGTTCTCTTACTTCTCTACACTACCAAACCCCCAACACACGTA--------------CAGCTGCCTCCCATTGGCC-TTTCCACCCATGGAAAGGAATCGTATTGAATGTCCACTATCCAGAACCTACATTCTGTGGACCTCTTTGATGATGCAAG-GAGGGTGATGCCCTGCTTCCTGCCAGCACTGAGGAGTCTATCCATATATTAACGATCCAACAGAGA-------------CCCTTACTACTTTTCAAGGGTCTGCCAATAGTTACCATAAAAAGAAACTACTGAAGCTATTTAGGGATGAATTTGCCTACAGTGGTGCTATAATTGAGCCTCCAGAATA---TGAAGTAATTCAACTACAAGATGACCAGAGTAGGGACATAGGACAGTTCCTGATAGAGGGTACAAAGGCTAAGGATGATCAGCTGATCTTTCAAGAGTTTCCAAATGCTCATGGCTCTCGAAAG-----------------GTACAGTGAATAGAATA--TCCCTTCTGTCCCTTGCCATGAGTTTTAAAACCTCAAAGCTTGTATAATGT----------------TCTTGGA-CAGTGTAACTCCTTTATGCAACAACCTGAAAGAATCGAT s monDom4.chrUn 136253179 709 - 174229318 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monDom4.chr2 2944687 665 + 541556283 TGGCCCACTGATGCCA------AGCAACCCGAGATTCCCTCTGCTGTCTCAAGGGCACCCGTCCCTCAGCTTGAACTACATCCAGCAGAAGAAATGACATTTCATGGAAATCAAAGCAAATCAGGTCCTGGATTTAACATTTTAACACAACTCGTTTAGATACAGATTATTTAAATT-TAAGACTGTTTTTAAAG--TGTATCATTTGTATATAGATACAAGCTATAGTTTTTACTAGTATCACCAAAATGAGTGATACAAATTTCATCTATTTTATTACCCTATTTTTAAGGGACTTTTGTGTTTTGTTTTACCTTGATGAACTGTAAAAAGAGAGAATTTAAAAAAAAATTAAGTTCTTTATTTTCTATTAGCTGTATTCATACTTTGGTTGCTTCAGACTTTATATATATTGTTCTTAAAAATAAGAATTAGGAAGGGATTTCATGTGTTTTAAAATTTGTCACTTCTATTCTTTACAGAACTATGTAGTGCCAAAAACTTTTTAAAAGGAAAAAAAATAAAACAAAATTGCAACAACAGGAGTCC-AGGTTTTTTTCTTCTCGATAGTTATCGATTGA--------AACTTCAAAGGGAGAAAGTCAGTTTGCTGGATCTGGAGAAATTCCATTTT--GGTCCTCTTCCTTCTTGAGCCCCACTAATTAGGGTTAGGTCAT a score=4334 s mm8.chr4 108063139 78 + 155029701 AAGTCAAGATGCATCCATTACTCATTTCCCCTCCGGCTCTTCTTGTGGCTTTTCTTAGACCTG---AAATGGAACAGATGA s monDom4.chr2 2950486 81 + 541556283 AAGCAGACGGGCATCCCCTACTCATTCCCCCGCCGGCTCTTCTTGTGGCTTTTCTTCGACCTGCAAAAGCAGCACAAATGA a score=4196 s mm8.chr4 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TGTTGTAGAAGGGGGAAACTGGGTGGGGCATCGTAGA----GAGAGATGATAAGTGAAGAATTCCCTTTTATCATATAGCTTCCATATAGGAATAATAGACGGGTC-----TTTTCCCTTCTATTGGGTAGATGGTGACAGACTTTCAGGCCTTTCTGTTCTATCTACCACCAACTGTAGGTTGCATGTTTCTGCTGTGCCTGACTCTCTCCCCTGTCGAGAGCAGGAATTCCAAGACATCTACAGCTTTGTGGAAAGTAAACTTCTTGATGGGACTGGAGGGTGAGT------AGTGCTGAGTGGACAGGTGGGCGTAGTAAGAGCTCCGTCT----------ACCCAGGGTGTGTGGTAAGCAGAGCCATTGCTAAACCTAGGAGAGTAGACTTCTGCCCTTGGAAGCCTTGGTAAGTATAAGGTActggg----------tttaatccccagcactacataaaatgtagatggtgttga-ggtagaagcaggaagctcaagcgttcaaagccattcttggctacat-----------agtgagttt-gaggcttgcttgggctatgtgggatgtttgtctcaaT-----------TTTAAAGCGGGGAGGGGGGGGTGACCTTTGGAGAGTAAGCTTGCACTAATATAGCC--TTGACTGTAGAATGAATGTCCTCTAACAGGCCTAACTGACCAATTTCCTATAGTGTAGTCTTCACTACTCTTACTTGCATCTCAGGGGTCTTGCTCTTTTTGAACATGTG-----GATGGCATGGA-TTCAGCCTATGTGTATTGTTTTCTTGCTCTAGGTGTATGTACATTTCTGGGGTCCCTGGGACAGGGAAGACAGCCACTGTGCATGAGGTCATACGCTGTCTGCAGCAGGCAGCAGAAACAGATGATGTTCCTCCCTTTCAATATGTTGAGGTTAATGGGATGAAGCTGACAGAACCCCACCAAGTCTATGTGCAGATTTTAAAGGTAGGCTAAGT----------------TATTTGGGGTTTTG-----------------------------GGGAAACAGTTCCTTAGAAACACATGGAAAAGGAAA---------GAATTACTT-----------AATTTTATGTGCACTTCACAAATTTATCCAGAGGTGGCAAAGG----TGAGGCAGGCAGA-----------CTTTTTAGAGGTTA----GTGATTACATGCCAACATGGAAGG-------------AGCCCCTAGCTCA----CAGATGGCG---------------TGGAGAGTGTCTTGGATTTGAATGTAAGCCTTGTTCTTTCATTCACTGGTAACCTTTGAACAGATAATATCCCGCTAGGTAAAGGGACTAGAGTTAGAGGCAGGGTATAGGAAATGAGTAGCTTCTTCTTGTAGACTCATTACTCTTTACTA---------CAGCAGTTGCT--TTTCCCTTGTGCAGAAACTGACAGGCCAGAAGGCAACAGCCAATCATGCAGCAGAACTGCTGGCGAAGCAATTCTGTGGCCAAGGGTCCCAGAAGGAAACCACTGTACTGCTCGTGGATGAGGTGAGGTTCCGGGG s monDom4.chr2 2976402 1475 + 541556283 TGGGGTAAGACCAGGAGAGTCAGAGGGATATTGTAGGAGCTGGGAAAGCAGAGATGAGGCTGGATGCCACAGCAGGTGGCCTT--------AATGATTCATGGTTTCAGGGTTTTCTTTTTTGTTTGTT----TTTGACACTTTCTAAAGTCTTTCTCTTTTGCCTCCCCC-------AGGCTGCATGTCTCTTTTGTGCCTGAGTCTCTGCCTTGCAGGGAGCAGGAGTTCCAAGACATCTACAGTTTTGTGGAAAGCAAACTTCTGGACAGGACCGGAGGGTAGGTTACCCCGATCCTGCCTTATCAGGGGAGCCCAGGGAAAGCTGAGGCTGAGTTCTTAGACCTTGGGTGCA----GATGAGGGTCGT-------CCTGGGACATTTGGCCCACATTTT-------CCTGCTGTGCATATACCACAGAAGAAGCATCTTCTCCATTCGAGGGCCTGCATAATG---AACCAGTGTTTACGGAGGGAGCATCAAGGtg----gcttcagacacttccttgctgtgtgaccatgggcaagtcactttagccccttgccttagccctcttctgccttggcaccaatacagtcatgattcctaggtggaaagtgagggctaa------aaaagaagacTTAAGCTGGTCTAAGCAATTAACTCTT---TGCAAGGC---TAACAAAGCTAAC--AAGAGGTTCCC------TGATCAGTTCCTCTCTTTCTCCC---------------CCTCTCATGAGTGTGTGCCAGTGCTGGCACAGAGCTCCGCCAACAGCTCCG--CTTCTTATTCCAGGTGCATGTACATCTCCGGGGTCCCTGGCACGGGGAAGACGGCCATCGTGCATGAGGTGGTTCGTTGCCTGCAGCAGGCTGCCCACAAAGAGGAGCTGCCCTCCTTCCACTACGTGGAGGTCAATGGCATGAAACTGACCGAGCCCCATCAGGCCTATGTGCAAATCCTGCAGGTGAGCTCAGCACCGGGAGGGCCCTGGGCCTTGGGGTTCCAGCTGTGAAAGATGGCACAAAGTCAGGCGTGGGGGACGATGCCCT-GAGCCATGTGAGGAGGGAGACGGGACGTTGGGCTGCTTGGGATGGGGGGAGTCTGACGTGGGCCTGGAAGGACT-------GGAGGAAACGGGACACGAGGCAGGAAGAGGGGCAGCAGTTGTTCATGGGGCTAGAAGGAGACTGAAGGAGAACCTGCAGGGGAAAAGCGATGCTGGCAAGTAGCCCAAAGCCAGGTGGTGGAGGCCCAGGGCAGCCAGGGAGACTGTTGCGCTTCCTTGGAAGCTTAG----CTTAGTCAGATGGAACCT-------GCTATTGTCCCACCATGCTGGGGG---AGGGTCTGGAGCCTGGGACTGGCA---------------------GCCCCCCACTATTTAACAGCCGAGCCTGAGCAGCTGCTTATTTTCCCACCCCAGAAACTGACCGGTCAAAAGGCCACAGCCAGCCATGCCGCCGAGCTTCTGCAGAGGCGATTCAGCCGGCCCGCACCCAGCCAGGAGACCACCGTGCTGCTCGTGGACGAGGTGAGGTTTGTGGG a score=8853 s mm8.chr4 108103408 207 + 155029701 GTGCTCTGGCTTGGTCTCTGAGTGACATTGTATGTATATTGTCTTT----GGCAGCTTGACCTTCTTTGGACTCACAAACAAGATGTAATGTACAACCTCTTTGATTGGCCTACTCACAAAGGGGCCCACTTGATAGTGCTGACCATTGCCAACACCATGGACCTTCCCGAGAGGATCATGATGAACCGTGTGTCTAGCCGACTGGTGAGT s monDom4.chr2 2977912 211 + 541556283 GTGTCCGAGGCCGGTGTCCGAGCGGCAGCCGCAGTAACGCATCTCCTCCCAACAGCTGGACCTCCTGTGGACCCCCAAACAGGACGTGCTGTACAACCTGTTTGACTGGCCCACTCAGCGCAGCGCCCGGCTCGTCGTCCTGGCCATCGCCAACACGATGGACCTGCCCGAAAGGATGCTGATGAACCGCGTGGCCAGCCGCCTGGTGAGT a score=7241 s mm8.chr4 108104105 186 + 155029701 TAAGGACCAAGCTTGAGGACCTGTGAACAATTTCCCTCCGCAATCTGTCATCTTGTGTCTT----------CAGGGCCTCACCAGGATGTCTTTCCAGCCCTATTCTCACAGCCAGCTGAAACAGATCTTAGTGTCTCGACTGAGGAATTTAAGGGCCTTTGAGGACGATGCCATCCAGCTGGTGGCCAGGAAGGT s monDom4.chr2 2978136 187 + 541556283 TAAGGGCTTCGCTAGTGTCCTGGTG---------CCGCTTCGATCTCTGAGCATCTGTCTTGGGTGATCCGTAGGGCCTCACCAGGATGTCCTTCCAGCCTTACACCTATAAACAGCTCCAGCAGATCGTCGTGTCCCGCCTGGAAGGCGTGAAGGCCTTGGAGGAGGACGCCATCCAGCTGGTGTCCAGGAAGGT a 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s monDom4.chr2 2993871 1432 + 541556283 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CTGCAGAGTGACACTCCAGCACAGGCCCCATTGGCCAAGAAGCCAGCGCAGA---------------CTCTGGT-------CTCTCCATCCCATCTTCTGACTGAGCCCAAGGCTTCAAGTTCTAAGGA------GTCAC-------TGAGTCCATCTGGTAATTTGGAGACA-----------------------------AATAAGACAAAGGAGTGGTAGTCCAGTGGGAT-----------AGGCATGGCCCCAACCATTGTCTCTCTCCTTCTAGTTCGGGAGCAGGTGACACTGCTGGAGGCTCGGAAACTGCAATACCAGCGAGCAGCTCTGCAAGCCAAGCGCAGGCAGGATCTTGAGCAGGCCAAATCCCACTTACGAGTAGCTAAAAGTCTTGAGGCTCAGATCATCCAGGCCCGAGCTGGTCAACCCATTGATCTCTCCAAGGTGAGTCCCACCTAGTTACGCAGGAGGCTGCCTCGTGCAGAGGTGGGGGCTGCTTGATGGGGATGAACAGGAGTGACTTGTGGGCGGAGGTAAGACTTGTACAGAGTGGTGACAGCAGGGAAGGAGCCTTTTGCCCCTTGTAGCCTTAAGATAGACCGTTAGGGAGATAGAAGGAGAAAGGAATGTGTTGCTGTGTTCACAGGTAACATGGCAGGGCCAGTCTAGTAGAAACAGTGCCAGGGATAGAATGGGAGGCAGTGAGTGTCATTGGAGGTGAGTGACAGTATAAAAAAATTTATAGCATGGATTCTTGTGTTTGT-TGGGCTCAGCAAAAGTGTA---ATGTGACTCTTTGGGCCCGAGGGGCCTTATGATCTGGGCAGGTGCCTTCACCGTTGACAGATGAAGAGGGGGACTTCATCCTCATTCACCATGAGGATCTGCGACTCTCCCAGAAGGCTGAGGAGGTGTATGCCCAGCTACAGAAAATGCTCCAGGAGCAGCAAGCGGTCAGTAGCCTCTC s monDom4.chr2 2997601 838 + 541556283 CCTCAGGAAGAAGCCCTGCCCCAGGCCCCAGAGGCCAAGAAGCCAGCTCAGAGGCCTAGCCAAACTTCCCAGGTAGCCAGGCCCTCAGCTACACCGTCC-CCTGAGCCCCAGGGCTCTACCTCCCAGGACACCTTGTCCCCAGCAGGTGAGCCCATGCAGGAGATGGGGGGCAGGGGGGGGAGCCATTGACCCTGGGAAGGGAAGAGTAAAAAGGAATC-TGGTTCTGTGGGACCTCAGAACTCCAGGACTAGGCC-AGCAAAGGTTCTTGTCTCCCCAGCCCAGGAACAGCTGGCCTTGCTGGAGAGCCGAAGACTCCAGTGCCAACGAGCAGCCCTCCAAGCCAAGCGGGCTAAAGACCTGGAGCAGGCTAAAGCCCACCTTCGGGCTGCCAAGGCTCTGGACGTGCAGATTGCCCTGGTGCGCAGCGGCCG-------------------------------------TGCAGGCAGCAG--TGGGGCCAAGGTGGG-----CCTG--GGGGCTGAAAGGGGTTG-----------------------GGATTGGGTATTCATACCAG------------TTACACCGGTTTGCCCTGAAGAACATTCTCAGGACCGGAGAGGGCCAGC-----------CCCTGCCCTTGGGGAGCTT---ACGTTCTCTTCAGTGTGAACAGTG--AGGGGCTGCACTTGTGGCCTTTAG--------GAGGCTTCCCCCGGCA--------------GCCTGGGGTTTGGGGCTTTTGCAGGCTCGCCCCAAGTTCATCTCTGTGTTGTGTTGGGCGTG----------------GGGCAGCTTGCTTCCCCTCTGACAGACGAAGACGGTGGCTTCATTCTCATTCGCCATGAGGAACTTGGGCTCTCCCAGAAGGCCGAGGAGGTGTATGCCCAACTCCACAAGATGCTAAAGGAGCAGCAGGAGGTCAG-GGCCTCCC a 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CAAACTACCTTGCTCACTTGGCTGCCCATCCTTGGCAGGTTTGAGAGGCTTGCGGAGGACCGAAAGAAACAGCTTGAGATCCTGCAGCTAGCCCAAGCCCAGGGCCTTGACCCTCCTAGTCATCACTTTGAGCTGAAGACATTCCAGACTGTGAGGTGCCAATGCCTAAGGGAAACTGGCCCTGTGCAGGGCTAGGGAGGGCAGAAGTTTTGGAGTAGAGCCTAGAGACTCTGCAGTCTTTAGTGAGACATCCCAGTATCGTGGGTATTGGAGTGGGGGAGGTTGCTGTCCTGCCTATAGGGAGGAGCTCAGGGTTGCAGGGTTCAGAGACCAAGG--ACAACCAGCATGGCTCCACCTGCAACTGTGTTCCCCTTGTCTTCTGTCTCGTCTTCTGCACTGTCTTCACTCTGTAGGATCTTCTCAGAACTCAACAGCACAGAAATGCATCTGATCATCGTGCGGGGAATGAACCTCCCAGCCCCGCCAGGTAACC----------------------------------------------------CATGGCCACC--------TTAC--TGAAGGCTGTCCTT---------GCCCGGGTCCTCTTCCTGCTGCC-----------TGGGCACCAAGCTCCGGCTATGCTTTCCAGCCTGACTCCCCTCTTTTCCTCACAGGAGTGACTCCGGATGACTTGGATGCTTTTGTACGGTTTGAGTTTCACTACCCTAACTCGGTGAGG----------------------TGCTGATAGGGTTGGGCGTCTCTGAACTGCAGTGTTGTCTAATTTGTCTCCATCTTTGATAGGCACT------------GCCACAGGGAGGGGCTGAAGACCCT-----CTGGCCCATTTCC---------TGCTTGAG-----TTGCTTT-------------------------CTGCACTTTTGACTCAGCCAAAGTGTTGTGCTTAAACACATGGTTTTTGAGCTCTCAACTTCTCTCATCTCTCTGCTAT----------------AGGACCAGGCTCAAAAAAGCAAAACAGCTGTGGTAAAAAATACCAATTCTCCAGGTGAGTGGAAGGA s monDom4.chr2 2999333 956 + 541556283 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541556283 CCTCCTCTTCCAC---CCTGGG----CTCCCCTCACTCACGCCCACTCCCTCTCCCGGCAGAGTTTGACCAGCTCTTCAAGCTGAACATAAACCGGAACCATCGGGGCTTCCGCCGGCTGGTCCAGAGCAAGGGAATCAAGTTTGAGATTTTTCACAAGGGGTGAGGCCCAGGCCCAGCAACCCCAGAGTGGGAGTGTCCCAGCAGTACCCCCTCACAGATGGgcttgaattcctctggggatggagccctgtgccttccatggcagccccgtaggatattgtcacagaattctttattttgagctgagaGGGCTAAGCTGAGCCTGGCCCCGCGCCCTCTCCTTCCCTCCCTGTTGGGCCCAGGCATCTATACTTTCCAGGGGTCCCCTCAGACCTCCCTCCCCTCTCCCCTCCTTCTCCACCTCATCCACAGATCCTTCTTCAGAAGCGATAAGCAGGTTGGGACAGCCCATCTGAAGCTTGAGCAACTAGAGACCGAGTGTGAAATCAGGGAGATCCTGGAGGTACGGGGCTGGGCCAGGGCAGGATTCCCCGAGGGCTGGGGGCCCCAGG a score=8704 s mm8.chr4 108131081 948 + 155029701 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TCCCAGTGTAGGA---TGACAGTGACCTAAGC--GCCTTCAC-----ATAGCACATATGGCCACCAGCAGACCTCACAACTAAAACATTTTTAAGCTGTAACTGTACTTGGTACTCATTCACCTTGCTCTGTATCTGGCAACCGCAACAGTGATCACACGTACAGGTTCAGAGAAAGTACTAACATCTCC---AAATAGTCTCAT--TTCTAAGTTTCCTGGAT----TGCTTTAAACCTAAAACAGACATTATTCT-GGATAGAAAAG--------------ACAACAGAACAACAGTACCAAAACTAATAGGCACTCCTCACAGACGACAGGTCCTTAGGACTAGACCACTAAAATCAGCTTTCATCTGCTGGTTTAGAGCTTTCAAAGCAAGATGGAATGAGAGCAACCATACAGTACCTTACCCCTTCTACCGGTGAGCCATAGCATGCAATGCCGAAACATAGCAGTGGCAGATGGCATTGGAGTTATTAACTACAGAAAGGATAATGGCAGAGCAATGATGGCTGGCAGACAAGACACAGAAATGCAGATGGAATGAATGCAAACTTGGAGTCTTG-AAGCAGAGCAAAACCTTTCAGGCAAAGGCTGCCTCTAGCTTCAGTTGAATTTACATTTTGAGCTTCACACGGACAAACACTGCAGCCTTCCCAATCAGTCCTT-CAGACTCTTCATGCAGAGGCAGAACCACACTCCTCGATAAAGAACATCAGCAACCTTCTGTAAGCACAAGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCCATTACTCTCGCTTCTCACTGATTTTTATCCTGTAAATTTTTAATCTCCAATCGCAGCCAGATCCACAGTCGCTTCAAATTAATGTGCA----TCCACTGCAGATACAAAT-CCCTGCCTAACCTGCAGTACCACTTCATCCAGAAGGTTCC--------TGTGCAC-TCGTTCATGCAGGGTCAGTTGCAAAACCATTCAAGTCACTCAGCAA-----GCAACCCACGAGAGAAGGGAGGCAGGTAGGACTG----AGGAGAGAACCTCTCTTTTCCGCTCACCCTGGAAGTGGAAGGTTTTCTGATCGACAGTGATTGTGAAGGTGCTGTCGTCCTCGTCGTCTATACCAATCACAGCTCCCTGCGAGACAAAGAGCAAAATCCCAATAAGGCAAACAATGACATCAGCAATATTCACCACTGCTACAGCCCTGGAATACCCGATGCGCTGAGGACGCTGGAAGCAGGCTAGATGGA--------GCAGAGAAATCCGAGAACCTTGTTTTGCTTGAAGAG s monDom4.chr2 3579389 1251 + 541556283 TCTTAGTGAAGGAGCCCTACAGAGACCACACACAGCCTTCACTTTCCAGGGCACA-ATGGACACTGG--GACCGCCCATCCA--------CCGAGCTGGAACAACCAGGACTGCTCA--CACCT--------ATGCAGTCACCACAATATTT-TCACA-ATAAAAAACAAGACAGTGGACTTAAAGGTCCTGAAGATAACCTCAGGGCACTGACTTCTTCAGAAATCATGCATTTAGCC--AAGCAAGCCCCACCCTCAGATAGGGAAGCTCTTCCCGCACTGATAACAGCAGGAGGGTTGCTCTTCTGATAGGCAAACCAGCCCTCCAACAGAAGCCTGAAGCTAGCCGACTGGGGAGAGGGGTGGG--GCTGATCCCCAATGCTCCTAGCAACATGAAATGAGAATGACCATCCAGGACCTTACCCTTTCTACCGGTGAGCCAAAGCATGCAATGCCGGAACATAGCAGGGGCAGAGGGCATTGGCCTAAGGAAAGAGGACAATGATAGTAGCAGAGAAACGACGGCTGGCAGACAAAACACAGAAATGGAGATGGAATGAATGCAAGCTCGTAGTCCTGGAAGCAAAGCACCACCTTGGAGTCCGGTGTGGCCTCCCCCTCCACCACAACT-ACGTCTC-AGTGTGACTCGCACGCCGACTGCAGCCTTT------AGCCTTGGCAGATGAGCCCTGCAAAAGCACAATCGCTCTCCTGGAGAAAGGAGATCAGCGGCAGCCCA----CACCGACCAGC-----CAGCACCAGCCCTTCATTCTCTCCCTTGAATGATTTT-ATCCTCTAAATGTTTAATTGCCCGCTGTTGCCAAAGCCA--GTCTTTTCAGATACATACGTAAGCCGCCATCGTAGAGAAGCCTACCCTGCGGCAGCAGCAGCCCTTTCTCATCCAGCAGGCTCCCCCCACCCTGAGCTCATCATTCACGCAGTATCTGTGGCAGGAACATCCAAGGCATCCAGCCACTACCACCCCCACCAAGAAGATCCCTGCAGACGGGACCATAAAAAGAAAGAATCTCTTCTTTCAGCTCACCCTGGAAATGGAAGGTTTTCTGATCAACAGTTATTGTGAAGGTGCTGTCGTCCTCATCGTCTATACCAATCACAGCTCCCTGTGAAACAAAGAGCAAAATCCTGATAAGGCAGGCAGTGACATCAGCAACATCCCCAGCCACGACACCCCAGGAATGCTAAA--CGGCAAGGACGA-GATGGGGAGCCAAAGGGATTCTCTCTGCAGAGTAAGCTGAGCCACTGACTTTGTTTTCAGGG 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ATCCTGAG-CATTCTTGACTCTCTCCATCTTTGAAAAGACTAGTGTCTTCTCAACTATAACCTTAATGCCTGACTTATAATGTTTATTCCTGACTTTTCTTACTCTTTTCATTTTTTTTTAAACAGAAAGTTGGAGAAATAGATGGATACCTTCCACTAATGACTCCAAATTTGGGCACTTTAGGCTATCATCAGGAAAATTTTATGGAGACATACAAAAAGATAAAGGTTAGT a score=-773 s mm8.chr4 108736484 206 + 155029701 atgactcagcctcctcacttattaaacgggcacagtgcccatttttttttttcagggctgctcagaggctcggatgagaaaatagtgtaatgctctgtgcacagcacctggcacaCCATGTGTGTGAGGA---AATACTGGAGCTTGGTTAA---GTCAAATGCTGAGTCTCTCTAGGC---------------ACGTATGGGGAACTTGAGCCTGAAGCCTC------AAGC s monDom4.chr3 78710257 227 - 526135210 aggactcggttccctcatctataaagtatggggaggctaggtttagggcttttaaag-tacctatttgctctga----aagtttctctgattctttgaG-GCTGTACCTGTTTAAGGGTGTGGGGGTGGGGTCAGGATTGGACCTGGGACAGAAGGCCAAGGTATGACTGGCTGTTGGCCAGAGTTTGGAAGTAGAGTAGTGAGCACTGGGGCAGGAAACCCCTTACCTGAGG a score=11459 s mm8.chr4 108736690 231 + 155029701 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tgctgtttcCCTTCTCTCCCAATGTTGGGGCCCCAGGAAAGGACCCGACAGCTCTGTAACACAATTGTCATTTTTGTGCAGCTTTCTTCCCCACCCTGCCCCCACTGCCT--TTCCAGGCA---------TATGGCTATGAAACTGACCACTGGGACCCAGGAGCCCTTCCTCCTCATGGCTTTC----CATCACCATGATGGAAGTGAAAGTACAGTTGTTGTTGGGCTTTGGTAGGGGAGGGGCATCTTATCCTGGTTTGGATAGCAGAGCTTAACCCTCCCCCCCTCCTATAAATAAAAGGAGTGCTTTGTGTGCCCTGAGA---TAACAGCTTCTTCCAAAAGAAGCCCCATAGGCACAGGCTTTCCTTCAGACACAAGCCCCAAGACAGTGGTCCTCAGTTTTCTC-ACACTGACATCACAAAA----CTGGAGTGTTCCTTAGTGCCTGAGCTGATAGCAGCCTATAGCTCTGAGAAAACAAAAGAAAA a score=10170 s mm8.chr4 108778073 558 + 155029701 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agaagactagttattagacttcttgtaggtaagttcttttg-----ttcaggaaaa--------------tggtaaacta-tattgtgtcatggactttcca--------gccatgacattctgtcattcaatATTTGTAGACAAAAAAAGGAATATGATCTCAATCCACATTAGCATCCCAAAATAAATAAAATCCATTTTTAGGAAATAGTTGGGTTAGATAGATCTCATGTATATTAAAAGGtatatatatatatatattttttttGGAGGAACAACATATTTACTTCAAGCACTA-----AAAAAATATGAGCACAAATGAATGAGTCATGAGCTACATAT-------TAAACCTTTGCCACCAGGAATTAG-GAATTTTATCACTTAGCATTCATGGGGATCATCAAAGTGCTTAGTGTCAAAGGAATGAAACCATCAGAATTTGA--GCAGCTTTGTCAAATAGACACTGAAACATCTGATATGCAGAATATCACTATCCAGGTCTGTTCTTAAATACTGGTGGCAACTCTGAAAGGGATGCTAAA---------------GCACCTCACTATGTACTTTCTATTTCAAACAAAACAGACTTGTTTAAACATCAGTCCAGTTTACATAAACACAATT-----TTAAAGTATAATACGTGTGCAAGAAAGGGACTAATAG----------------------AGCA------------------------------------------------GATAGATAGGTTAACAGAGACCAAAAGGAACAAAAAGTATCCAACTCCTTAGACAGCTTTCTGATGATACTCCGTAGGGGCAAACTCAGAGTCAATGACACTGAAAAGCGCTGAAGAAACTCTTCGCCACATATTTTAAGAAATCATGCAAATTGTTTAACAACAGAGCCAAACTGTTTTCATCAAGGGTAGTAGAAGCCAGCATTGCTCCAATTCTCATAAACAACCATAGCAGGTGAGGTGCACCACAGACCTGCGACATTGGGCCATCGGGGTGATCGGGAAGGACCTAGGAATACTGTGGCCTCTCAAATTTGTAGGGTAGCTGGGTGCCCAGCATGACATTGAAGTACTATTTGATCCCTGCTACCACTTCATTCACACCATACTCCTTGTTGTCTGTGTTTCCCCGTGATTTCTTGTAACTCGCATAATCTTCTAGAATTGAGTCCATATTCTTCTTTGCAGGAAGATGaaaaaaaaaaataaaacaaacaaaaacaaaaacaaaaGAAGCTCTTTTTGTCTGGTAATCAGGTCCCAATTGCCAGCAAGCCAAGGTTTCAGCTCTTCTGGAATATTCACTTTAACTTCAA--CTGCTCATAAATGTTTCCCACTTCCAACCATAGGATCCACTCCAGCCTTTTTTCTTCTGATGTGGTTGAGTTGTCCTGCTGGTACAACTGCCTTCTCCAATTCCAGGAGTTT--TGTTTGTTCTTTTTGGTTTTCTGCATTGATATTTCAGAGGTCTCCAAAGAGCGAGTGATCCATTTGTTCTGAAAAAAGTGCTTCAACATTTTTCTGCAGTAGAGGAGAAGTCTTCTTTCCTGGGGCTGTTC----CTCTCAACTTCCTTTCTGCATACTGCTCCTGATTGGCTTTTTTGAAGTTCTCACTGTTTCTGAAGACTGCTGTCCGCGTATTTGAGTACTCTACTCCTGGGAACCCATTCATCCCAGTTTTTATTCCAACTACTTT------TTATGTGTTTCACTTGCTTGTCCTTTATGGCAACCTTAACACACTTTGCTTCATAAAGGAGCGGCCCAGGAAAACACAACACATGTTCACCCTCATGGAATTTGAGCTTTGGGTCCTGCTTCAGCGCCATTTATGAGCAACTC---TCATCCTCCTTCTTCTGCTTCTCTGCCTCCT-CCCTCAGCCATCTGCCACCACTGCCTCCCTGCACCTGATTACCTTTTCTAAAATAGA 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AAATATAGATCAGAACATCCTCATTGACTGTCAAAAATAAGATTGGAGCAGCATTAAGGCACC-AGATGAAACACAGCAGCACTTATCCACAGTGAAATCTATAAAGTGCTTTCGATTGCTCGGGGGATCTTTAGATATAGCATCATTTTCTCTATCTTATGGATGACTTGGCCACCTCCACCATGAATTTTTCATGATTCCCCTGACCCAGCAGCTCTAGCCTGCCGAGAGAGTAATA---CAGTATTGATTTTGGAGTTAGGTTTCTGCCTTTTTCACCACAACAGTATTTTTGTAGCCTAGAAACCTCAATCCTCTATTACTCATTAGAGACCAGGGCAACTTTTCTTAGATCTGGAATTCAGAAGGAGAATAATTTTGCTGCTAGTG--TCAAAGATAGCCTTTATAGTAGAATTTTAACTGATCTCAATAATGAGAGTAGCTGTTACTAAAAACTATTCTAA----CTGAACCAGCAGTGATATGATTATCAAGAATGCCAGGAAGACAGTAGTTACCTTTCCCTC-GGTAATTAGAATGTTT s monDom4.chr2 5404211 514 + 541556283 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tggagagcaatctggaattatgtccaaagagttaagaaactatatacccttagactgagcaataccattgttgggtctgtttcccaagttgatcagg-gatgc---ttgtcatttggagaatgg-----ctgaacaagttgtggcatctgattgtgatagaatattattgtgcataagaaataatgaacaggttagttaaaaaaatatgaaaagacctacatgaaattatgaagagtgaaatgagcaggatccagagatcatcacaagtagccacagaaatattgtttgaaggttgatttgtttgtgtccacttccagagaaagaactgataaatagaaataaacaagttgtagtttatatatacatgatttttttttgtcaaac---gatgccttcactatagcagagaggggagcaagggaggaagaaacctggaaactttaatgtaacaagcaaacaaataaatAACAAATTTGCAAAAAATTCTATCCAACATTTATCTTTCCCTCCTTAAATGTATCAAAACCCAATTCTGAGGAGCAGAAAACTCTGACACATCCAGCTTCTAGATGCAGAAGCTCATTAGATGTTTGAGTTCACCTAATCAAAGCTGTT-CTTTTAATTGCCTTGGAACAAGATGGTCTTGTGTAAATGAGGTAC-AAGTTAATAATGCTACTGTGTATTTTCAGGATCACTTCCCATGAGTTCAAAACAATCCAT a score=2444 s mm8.chr4 110272314 91 + 155029701 TTGTTTTATTATTGTTTTATCCATTTT-CTTCTTATGTCAAAAAATAAATGCCTCATT--ACATCTGTTGACATTTGTGTTCTCTTATTTTGGA s monDom4.chr2 5522954 92 + 541556283 TTCTGTTTTTATTGTCCTACACGTTTTTCTCCTTATATTCCCCAA--AATGCCAAGTTCTGCATCTGTTGACATTTATCCTTGTTTTTTTTAGA 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AAAAATGTTGTTTTTTATCATGAAGCTGGTGGAATGTGGAAATCAACCATCGCACACATTTTCCCAGCAGAGT-GAGGAATTAATTAGGAGCAATTTGCTGTCAGAAACAATTTCCGTAATTTTCCATTTTAAAAAGCTGAAAAGCGCT-------GAGTTGATTTTATT--------TTTCCATCCTAAAGTGATTTAACTCCTGGGAAGACAAATTGCCCCGAAGCCC a score=12409 s mm8.chr4 110946396 322 + 155029701 TCCTTGGAGTTCTAGACAGATCTCTTTTCTTAACTGCCTAGGTCCCGCCATTGACTTGGAAAAAGTAAAGTCAGAATGTCTCGAGCCCGAGCCGGAGTTACGGAGCACTTTCAGTGAGGAAGCAAATACGTCGTCCTATTACCCCGCTCCTGCGCCTGTCATGGACAAGTATATCCTAGACAATGGCAAGGTAGTGTTTTCAGCTCAATATCCATTCCCCCAGGTGCTTGCTAGTCAAAGGAAAGGTGGAAAGCACAGTGGGGACCTTCTGAAA---CCCTGTGTGGCTA---GCCAGGCAGTCTC---CCAGCCTAGCCCCTT-------GGTGACT s monDom4.chr2 5895918 310 + 541556283 TCTTCGGAGTGGCAGACGGATCTCTTTTCTTGACTGCCTAGGTCCCGCCCTTGAGCTGGAAACAGTCAAGTCAGAGTCCCTTGAACCCGAGCCGGAATTGCGGAAGACGTTCAGTGAGGAGGCCAATACGTCGGCTTATTATCCTGTTCCCGTTCCCGTTATGGACAAGTATATTCTAGAGAACGGCAAGGTACTG-----------------------CCGGGCGCCGGGGAGCCTGCGGGAGGGGGCAGCGCCC-----GAACCCTTCGCCATTGTCCCGGGGGGCCGCCTGCTGGACAGCTCCGGGCCGGCTTAGCCCTTCTTACAGGGGTGACT a 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ttttTTTCTCAAAACTTAAAATAAGCTACCTTCTGTGGCTCCCTCAAAAATGCTGGTTT-----------AAAAAATCA-----------------------CCTTCACTCGACTTAATCGCTAAAGCCCGACAGCATTTCCTGGATTTAGATGAAGACGCCAGTGGGGATTTGAGATTAAAAGCAGGACTTTTATAGGAGGAAATGAAGTTCTCAATGGGG-AAAAAAACTGCTCTTCACACAGAAATTCCACCTTTATCGG a score=3702 s mm8.chr4 111015217 198 + 155029701 TGAGAAAGCAAGAGAGGGCTC--TTACTGTGACTAACAGGCAGGCTGAACTCTCGCCTT-TTACTGTGGAA-AAATCCATTACCGAGAAGTCATTTGTCAAAACCAACTGTTTAGCTGCTTTAATTTACATATTTATCAAGTTTGATTAGAACGCATTGTCTTCCACTTTCATCCTAGCTCTCACATCCCCTGGCCCTCTTT s monDom4.chr2 5933200 174 + 541556283 TGGGAAAGCA---GATGGCTTGTTTATTGCCATTAACCGTAAGGCTGAACTCTCGTCTCATTACTCTGGAAGAAGTCCATTACGG----------CGGTACAGCCCACTGTTTCCTGGCTATGGTTTGCACATCCCTCCCGTGGGAGTGGA-----------TCCGCT----TCCCCGTGCCCATCTCCGGCAGCCCTCCTT a score=10744 s mm8.chr4 111020690 503 + 155029701 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TCACTCCCTCCACCAGAAGGACCCTGGTGCCTCCCCTGGGGATG-ATGAAGCTTGGAAGTGGAGGATGGGGTGCCACGAGTAC----CCATCTCGCACCCCTTCAGAATT---------------ATTTGTCCT----CGGAAAGCCCCGAGCTCAGCAGAAGCTCCGAATCTCGTCTGCCGGCCGGTGATTAGAATGCT-TTTTATGGGCTGCTAAATGACAAACCAATTTGTTACCTGCCTACATAAACATTCACTTGCATTAGCCCCAGA-ATGCTTCATTTTTATTAGCCCAAGCGTTATCGTTTTATGAAGACACAAGGGCTGCATAAAATTAGGGTGCACACGGAAGGCGCAATCTACATTTCCCTCT-GTCAGCACAAGTATTCCAGAGCCAAATCATTTGGGCATGAGGGCAGCCAATGGGCACACTCACAAGGGCAGT-----------GCCCTAGTGATGGCACCCATAGCTTGCCAGCTGCCACGTTGGGCAAAGAGAGCA a score=5523 s mm8.chr4 111024429 199 + 155029701 AGCATCCATCCAGCCTGTTCCTCAGCTGTCTGCTTCTCACATACCGATGTCTCGTCTCAGCTTGACTTTCCACTTATTTCTTACAGAGAATCTCCGTGAAGGGTCAGAAAAGAAGGTGATATTCATCACAGGGCGAGTCCACCCAGGGGAAACGCCATCTTCATTTGTGTGCCAAGGTAAG---CTTGGGACCTCACAGATG s monDom4.chr2 5938819 179 + 541556283 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GGCATGAAA----GCACTGAACTTTTTG-TATGTTTACTATCACGTATTTTATTTCTCTATATATAAAGTTGTTG-------TTCCTAAAATAACAATTATCTGCTTTAGGCTCATATATTCTCATTTATGTATCAGCAGTGAGAAATT----GAGATTTTTAAATTGAAATCCATATAAGT s monDom4.chr4 87228114 181 + 430141050 aaaatcaaattagtcactggttttcttgatttgaaaactagctcctattttattgagcaatttaatgattttttaaaaaaactttccattttattgatc-tcccctttggttttcagaatttctacttcagtttcagtaggacatgatttcccaagatttttatttgcatacccaattaatt a score=2271 s mm8.chr4 111309437 81 + 155029701 TTATCTTTTCTGGAGCTTGTCACTGCAATTATAGTTATTTGAGCAGTGTTTTGGTGCTTTTAAATAGCAGAAGAATTAATA s monDom4.chr1 156266244 77 + 748055161 TTATCCTAT-TAAAACATATTAATGTAATTATAGATATTAACCCAGTATTTCTG---TTTTATCTAACAAAAGAACTAAGA a score=842 s mm8.chr4 111310340 270 + 155029701 GTAAGAAAATTAATTTTGTAATAGTGAGTGGGAATTCTTGGTTTAGGACAACAATGAGAGTTTGTAATGAGACTTATCAAAGTAGTGTGATGGAGGAGAGGAATCAGTCCAAGAGGGTGTGTGATTTGCCAGGAAATATTGTAATTTAGATTTGATAGTTTGACAGTGAAATCTATGTCTAGTTAGAATTTTTTGAATTGCCACTTTATGCCAGAGACAAAACTAAGTGACATTTTTCCTTttttttaaattagatattttcttcattta s monDom4.chr4 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mm8.chr4 111326028 355 + 155029701 CCATAAACACTCAGTAAATGTTCGAATTCACAGTAGTGCCTCTAACTTCATTTCACCATTTTAACCTTTTCTCAATACTATTTTCTC-----AGCTCCTTTCAGCGGCCGCGTGGCTCTTTCCATTTGGATGATGGCGAATGCTGGTCCAACAGAGCAGCCTCTTGTAAAGGGAAATCCCACCGACCCGTCTTTGAGAACAGCATGGACAAGATGTACAGGAACTTATACAAAAAAGCCTGTAGTTCTGTTTCTCATACACAGGAAAGCTTCTGAGACCATCTACCATAAACTGTATAAGCGTCCATGTCAACCTCTCAATGAAAGCGTTTGATGTGATCTGTATTTGTACGCCTTTCTT s monDom4.chr2 6198714 348 + 541556283 CCATAGATTGTTGATTATTGATCATAATAATAATTG-ATTTAAACCTTTGGGTTAACATTTTTAATGTCTCCCCCCACCCCTTTCTCTTAGCAGTTCCTTATATAGGCCACGTCCCTTGGTCCACTTGGATAACGGTGAATACTGGTCCAACCGAGCAGCAGCTTATAAAGGAAAGTCCCATCGAGGCAACTTTGAGAACAGCATGGACAAAATCTATAGGAACTTGTACAGGAAAGCCTGTGGTTCCA------GCACACAGGAAAGCTTATAA---CACCTACGACAAACTGTACTTGC--CCAGGCATGCTTCTCAATGAAATCTGTTAATAGAATCACTTTCTGTGTCTATTTTCT a score=735 s mm8.chr4 111326458 330 + 155029701 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TGCCCCATTATGCTGCCCAAGATCCACTCAACCTACCTCCTGGTTGTTCAGGCCCCTGAGTGGTGTTTGCTTCTTCCTCATCTCCT--GCAGGGCCCTCTACCACTGGCCTCCCTGCCAGTCCTGGAGAGTTGTCATCCTCTGTGTTGTTCACACTCACAGAGGTTTTCTTCTGCAGGTCAGATACGGCACAGTTCCTTGTCCACCAGGTCAGGCGAGCAAGCTAGAAAAAAAGAAGAAACAGTATTTGGAGTCAGAGGACAGTCCTGCTGTGGAGAAGGAAGTCTCATTTGTGGGA------GCAACAGAGAA s monDom4.chr2 6221632 272 + 541556283 TGCCTCTTCCCTCTGCCCCAGATTACCTGGAGATTCTTCCT---TTTGCAGGTCA---------ATCTCATCCTTCCAACTCTCCTCTGTCTGACTCTC-----CTGGGCT----GACAGGTCTGGGTCCCTGTCCCTTGGTGGGTGGGTG----TGATAGTGCCCTTC-----CAGGGCGGGTGCTCTGGAGTTTCGGGTCCACCAGGTTAGGGGAATGAGCTGG--AGGGAGACAATCCAGGGGTTCCAGTCAGGGGTCAAT----------GGGGGAAAGCCTCATGGGGAGGAAGGGTGAGGACAGAGAA a score=10592 s mm8.chr4 111381493 465 + 155029701 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CACTCACAGGCTCGTTGACCCTCTTGCAGAAGATAGCCAGCAGGAAGAGGGCTGTGATGGGTGGGGCTAAGTAGCTGGTGATAGATTGGATGTAGTCAAAGAGCTGCCCACTATTGGAGCTCTGGATGATGGGGATCCAGAGGATGCTGATGACTACCAGGAAGACTACGAACAACCTGTGGGAAGAGCACAGGGTTATGAGAGTGTCATCCATGTGGTCA---TGAGAGTCTGCATGGGAATTAGGAAGGGGAAATGAGTGGTCCCTGGGCCACAGAAGGTCTGT----------AGGTTAGAATATCAAATATTAAGATGCACAAATTTAGATAGTTAAGA-----------TCCTATGACTTAGAGCTCCAGAATTC---AAGAAACCTTTGTTTTCACAC--------------------ACTAGATGGCTTC--AGATTGTTCTGTCCACCAATGAGGAATAAACATACT---TTTCATCCCAGCCATGCGCTGAAAAATCTCTTTCTCCTCTTTGCACTCAGCACTGTCTACAGTGGCTTGCTTTTCTAGAGTGGATCCAGCCTTTCATTGGC--CCCGTGTCTCTGCTTCTTCTTTTTACCCCCTCTTGGCTGATCCTTACTCTTGGTGACTGATTTTATAAAACATAAACAAACCCGATGGAATTTTCTTGGATAGACT s monDom4.chr2 6223146 639 + 541556283 CACTCACGGGCTCTGTGATCCTGTGGCAGAAGATGGCCAGGAGGAAGAGGGCAGTGATGGGGGGCGCCAGGTAGCTGGTGACTGACTGGATGTAGTCAAAGAGTTGGCCACTGTTGGCACTCTGGATGATGGGGATCCAGACTATGCTGATGACCACCAAGAACACAATGAAGACCCT------AGAGAGGAAGAGACAGCGAAGGTCAGGCCAAGGCCCAGACTGAGGGGCAGAGGTGGGCCT-------GGGTGCAAAGGCTTCCTCGGCCCCACGTGTTCTGTCTTGGCCAggaagttatatagtccagcaggaagagccccagact--gggagttaagaaatgggttcagctctgccactaacttcttgtgggtccttgaacaaatctctatttccctatctttaaaatgagagatttagaccagatgatctccagggtccttct------caacGAGCGTTCTATGTTCTAAGGCCCCTCCCAGCC-----CTGACACCCCCTGTTCTAGGCTCC-CTCCCAGCCCTGAC-------ACCCCCTATTCTA----GTCTCCCTCCTATCCCTGACATCCCTGTTCTGGGCTCCCTCCTGTTCTAGTCTCCCTCCTAGCCCTGAC--------ACCCCTGTTCTAAGGCCCCTCCCAGCCC--TGAAATTTCCTGTTCTAGGCT a score=11332 s mm8.chr4 111385246 490 + 155029701 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AAGTGTGCAGACAAAGATATTGAGACAGTGAGATCTGGTCAGCAATTGAACCCAGATAGTCTGTTTGGCTTTTAATGTCTAAGGCCTCTTGGCATAAGTGACTGAGTGAAATATGGCTCTTGTCTAGGTgggagtagtggagcacgcctttaatcccagcctagcat-gtgggaggcagaggcaggtggat-ctttgtgagtttgaggccagtcaagtctacatagtgagttgcagaacatgcaaaactacatagtaagaccctgtctgagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaga---------ACAAAACAAGACATATTAAATGCTGCATAGCCCATAGGAGGTGCTCAGCATGATCAGACACATGCCATTTATGGAAGGTAATGGAGAGGAAATGGGTAGAGTTGTGAGGTTGTTAAGATAGGGCTGGAGGGATATAAATCTCAGAGATGATG-TGTCAATTGGACTTCTGAGG-TGAGTACTCCTTGCTTTTAGCTCCCTGGCTTCTCAGTGGAGGAGCTCCTTGGAGGTCTCTACCTGCCTCTAACCCACGTCCTTCTACCCTCAGGTCCTCACACCAAAGTAGTGCGGCGCATCTTCACCAACAGCCGGGAACGATGGCGGCAGCAGAATGTGAATGGGGCATTTGCTGAGCTCAGAAAGCTGATCCCCACCCACCCACCAGACAAGAAACTAAGCAAGAATGAGATCCTCCGCCTTGCCATGAAGTACATCAATTTCCTGGCCAAGTTACTCAATGACCAGGAGGAGGAAGGCACCCAGCGTGCCAAGCCTGGCAAGGACCCCGTGG----TGGGAGC--------TGGTGGGGGTGGGGCA------GGGGGTGGCATCCCCCCTGAAGACCTTCTACAGGACGTGCTTTCCCCCAACTCCAGCTGTGGCAGCTCTCTGGATGGGGCAGCCAGCCCGGACAGTTACACAGAGGAGCCAACACCCAAGCACACTTCCCGCAGCCTCCATCCTGCCCTGCTGCCTGCCGCTGATGGGGCTGGCCCCCGGTGATGCGTCTGGGGCTGCCCAGGGCCAGCAGGCAGGG---GCCTTTAGGCCCCTGGGTTGCTGGGCTTCAGGGCAGG----TGGGATGAGAAGCAGGTC 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gagtgtg-----ggagagagagagacagagagacagagacag-aatgggagagaga------gtgtgggagagagagacagagaca---------gagagacagagatagaga--------gacagagagggagggagagag---------------agacagacagagagggagggagagacagagagagacagagagagtcagagggagg--gaggagaagaagagagatggaggg-agggaaagagagagagagaaagagagacagagagagagggagggagagagagagacagagagagtcagagggagggaggagaagagagatggagggagggaaagagagacagagaaagagagacagag---atagagaga---cagagagagagggagggggagagagagagagagagagggggagggagagagagagggagagagggagggaggagagga--agagggagagggagagcagagagGAAAATAAAAAGAGAACTTCTGGGGAGGAAGAATGGGTAAGACTAACTGGCTGTTTCCTC---------TCTCTTTGT---------CCTGCCTCC--------------------CAGGTCCCCACACCAAGGTTGTCCGACGAATCTTCACCAATAGTCGGGAGCGCTGGAGACAGCAGAATGTTAATGGGGCATTTGCTGAGCTCCGAAAACTCATCCCCACTCACCCACCAGATAAGAAGCTCAGCAAAAATGAGATCCTTCGTCTGGCTATGAAATATATCAACTTCTTGGCCAAGCTCCTCAATGACCAAGAGGAGGAGGGCAGCCAGCGGGGCCGGGGGGCCAAGGACCCTGTGGGGACTGGCAGCGCGGGCAGTGGAGGAGCCGGGACAGGCCCCGGGGCCGGGACGGCTCCCGACGATCTCCTCCATGATGCTCTCTCACCCAACTCCAGCTGCGGCAGCTCCCTGGATGGCGCTGCAAGCCCTGACAGCTACACAGAGGATTCTGAGCCCAAGCACCCAACCCGAAGCCTCCACCCTGCACTGTTGCCTGCC---GATGGCACCGGCCCACGATGATGGGCC-----CTGCCAGAGGGCAGCCGGGATGGCGCACGCTTGGGGCTTGGGGCAGTGGA----TGGAGCAGGATATTGGGAGGGGGAAAAAGGC 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TTATCCAGATGGAAAATGGAAAAAGCTTATCTGATAAGGACCTTCGTGCTGAAGTGGATACTTTCATGTTCGAGGGCCATGACACCACAGCTAGTGGTATCTCCTGGATCTTCTATGCTTTGGCCACAAATCCTGAACATCAACAGAGATGCAGGAAGGAGATCCAAAGTCTCCTAGGAGATGGGACTTCTATCACCTGGTGAGTGGGTGCTCAAGATGGATGAGATTTCTGTCTTTTGCT--------------AATGGGAAGCTCCTGGCTGTCCCAGCTCTATGTGACTTTTAGAAGGG---CCTCATTTCAGGAATGACC s monDom4.chr2 533721352 318 - 541556283 TGATCTAGACAGAGAATGGAGACAGCTTGTCGGACAAGGAGCTGAGGGCTGAGGTGGACACGTTCATGTTTGAGGGTCACGATACTACAGCCAGTGGCATCTCCTGGCTTTTATATTCTCTGGCTATGAATCCTGAACACCAGCAGAAATGCCGGGAGGAGATCAGGGACCTCCTGGGAGATGAGATGGCTATCGGTTGGTAAGTGA----CCCAGAAATTAGGGCTTGCTTTGTTTTTCCCTCTTTGTGCTCTAGAGGAGAAATCCCTTG--GTCCCCGTGGTATCCCATTCCTGGAATGAACCTCTCCTTCCTGAACCCATC a score=4612 s mm8.chr4 114825645 276 + 155029701 TGGACAAGATGCCCTATACTACCATGTGCATCAAGGAGGCCCTGAGGATCTACCCTCCTGTACCAAGTGTGAGCAGAGAGCTCAGCTCACCTGTCACCTTTCCAGATGGACGTTCTTTACCCAAAGGTATGAACTCC-----CCAGACCAATTCTTCAGGGGCAAAGAAGAATGGGAATTCTATGCTTCTT------CTGCAGTTTTGAACCACTGAAATCCCCAATAGATT-TTCCATGCCTTATCAGTAGTGATG-------AAAGGATTTTTACTTTAAGTTAGAATGTAGT s monDom4.chr2 533722095 288 - 541556283 TGAACCGGATGCCATATACCACCATGTGCATCAAGGAATCCCTCCGACTGTATCCTCCAGTGACAAGCATCTCTAGGGATCTCAGCAAGCCCCTCACTCTCTCTGATGGCCGCTACTTGCCTGCAGGTAACACATTCTACTTTCATGTTCATTCTACAAGTTTAGA-------TGGCTTCCTGTGTGTGGTTGGGAACTGGACTTGACAAACTTTGAAAGAACCTAAAAATTGTTTCTAGCTTGGTAAAAAGGGAGGCACTAAAAAGGGATTTCTAATATAAATTGGTCTATATT a score=997 s mm8.chr4 114826290 443 + 155029701 CTGAGGCTCCAGAATCTC-------ATATAAAAATGGGT--ATACAATAGTTGCTTTT------GGAAG--CTGCCTGTGAATGTTGAATGTGGCAAAGGTTCATGAAAGATAT-TTCATGAAAAAGAGAGTTATCATTTCACTTAATATAATAGTGATTCTCAAATGCTTTCTTGTTCTCACACCTAGGCTTATGATTTTAGGCAAGTAACTCACACTCAGTGCTTCAC-CAAGCCCACTCTACTTCTCTGTGATTAAAATGATGACTCCAGCATGCAGACCATTTGTGTGTTCATATTCTCTGCAGAATATGGGAACTAGTGCCCTACCCATTGGCATAACCAGTCATGCTTTGTACCACTCA----------------CCCCACAGGTATCCATGTTATGCTCTCCTTTTATGGCCTTCATCACAACCCAACTGTGTGGCCAAATCCAGAGGTAAA---------AATGGGTGATGGGACAAGG s monDom4.chr2 533723964 438 - 541556283 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CTAATTTTATTGTCCCTTTCTGACCC-AGGAACTGCATTGGGAAACAGTTTGCGATGAATGAGCTGAAGGTGGCTGTGGCCCTGACCCTGCTCCGCTTTGAGCTGCTGCCAGATCCCACCAGAGTCCCAATCCCCATACCAAGAATTGTGTTGAAGTCCAAGAATGGGATCCACTTGCATCTCAAAAAGCTCCAATAATCTTCACAGGACAAGACAGCTCAAATGGCATGCTGCCTGCCATTCTGTCTTTCTGTCACTTACTCTTTTCCCCAATCCTTCTGCTCACATCTCATTCTTTCTTCTCACCTTGTTCACCTCCACCCACCTTCTGCTGGGC s monDom4.chr2 533727481 314 - 541556283 CTCTTCCCATTGGCTCTTGATGTCCCTAGGAATTGCATTGGGCAGCAGTTTGCCATGAATGAGATGAAAGTGGCAGTGGCTCTGACCTTGCTCCACTTCCACCTGGAACCTGATGCTACTCAGCCTCCACAGCTCTTCCCCAGGGTGGTCCTCAGGTCCAAGAATGGGATCCACCTGAAGCTTACGAGAATCTGAGGGTGCTGGCCTGGAAGGA------------------GGCTGTCCTTC--TCTCCCCACCCCTGACCCATCCAGCCTAGCCCAGGGT---CAGCTCAGTCCCCTTCACCCACCAGTCCTCTGTCTCCCATATTCCTCTTTGC a score=5076 s mm8.chr4 114841640 212 + 155029701 ACTGTAGATTCAGAGAAAGACAGTCTTTTTACTATAAGTACTCAGTATAAAATC-----AGGTAATTCTCCATTTTT--ACTACAGGACAAATGGGAGCAGCTTGTGGGCCAGGATTGCCCTCTGGAGATCTATCAAGACATCTCCTTGATGACCATGGAGACAATAATGAAGTGTGCCTTCAGTTACCAGGGTAGTGTCCAGTTGGAGGAGTGAGTAA s monDom4.chr2 533716506 219 - 541556283 AATGAAGAACATGGGAAAGGGACTGGTTTGCCTACAGTGAGGGAGTCACAAACCTTGAGAGTCTATTCTGCCTTCTTCTGTTCTAGAAAAAATGGGAGAAGCTCATCACCCAGGACTCGAGTCTAGAGATCTTTGAGCATGTCAGCCTGATGACACTGGACACCATCATGAAATGTGCCTTTAGCTACCATAGCAACTGCCAGATGGAGAGGTCAGTGA a score=3676 s mm8.chr4 114842192 171 + 155029701 CCTTTTAGCTGCAGAAATTCTAAATCCTACATTAAGGCTGTTGAAGATCTGACACACCTGATTTACTTGAGAGTGCGGAATGGCTTTCATCAGAATAATACCATCTACAG--TCTGTCCTCCAATGGCCGCTCATTCTATCATGCCTGTCAG---------ATTGCTCATAAACACACAGGT s monDom4.chr2 533717382 171 - 541556283 CTTCTTCTGTACAGGAATGCTGATGACTATATCCAGGCTGTGAAGGAACAGGCAATCCTCGTATTCTCTAGAGTTCGAAATGATCTCTACCACAATGACTTCGTCTACTGGTTCAGTCCTC--AGGG---------CTACCAGGCCCGCCGGTGGGCCCACCTGGCCCATAACCACACAGGT a score=11403 s mm8.chr4 114850422 207 + 155029701 CCTTCATCCAGACAGAGGATGGGAAGAGCTTGTCTGATGAGGACGTGCGTGCAGAGGTGGACACATTCAGGTTTGAGGGTCATGACACCACAGCCAGTGGAATCTCCTGGATTTTCTATGCTCTGGCCACCCACCCTGAACACCAACAGAGATGCAGAGAGGAGGTGAAGAGTATCCTGGGTAATGGAACCTCTGTCACCTGGTGAG s monDom4.chr2 533721349 207 - 541556283 CCTTGATCTAGACAGAGAATGGAGACAGCTTGTCGGACAAGGAGCTGAGGGCTGAGGTGGACACGTTCATGTTTGAGGGTCACGATACTACAGCCAGTGGCATCTCCTGGCTTTTATATTCTCTGGCTATGAATCCTGAACACCAGCAGAAATGCCGGGAGGAGATCAGGGACCTCCTGGGAGATGAGATGGCTATCGGTTGGTAAG a score=6338 s mm8.chr4 114850719 143 + 155029701 TTTCAGGAACTACCTGGACCAGATGCCCTACACCACCATGTGCATCAAGGAGGCCCTGAGGCTCTATCCACCAATACCAGGTGTGAGCAGAGAGTTCAGCTCACCTGTCACCTTCCCAGATAGGCGCTCGTTACCCAAAGGTA s monDom4.chr2 533722081 143 - 541556283 TTTCAGGGAGCACCTGAACCGGATGCCATATACCACCATGTGCATCAAGGAATCCCTCCGACTGTATCCTCCAGTGACAAGCATCTCTAGGGATCTCAGCAAGCCCCTCACTCTCTCTGATGGCCGCTACTTGCCTGCAGGTA a score=11413 s mm8.chr4 114913956 431 + 155029701 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CCTTCATCCAGACAGAGGATGGGAAGAGCTTGTCTGATGAGGACGTGCGTGCAGAGATGGACACATTCATGTTTGAGGGTCATAACACCACAGCCAGTGGAATCTCCTGGATTTTCTATGCTCTGGCCACCCACCCTGAACACCAACAGAGATGCAGAGAGGAGGTGAAGAGTATACTGGGTAATGGAACCTCTGTCACCTTGTGAG s monDom4.chr2 533721349 207 - 541556283 CCTTGATCTAGACAGAGAATGGAGACAGCTTGTCGGACAAGGAGCTGAGGGCTGAGGTGGACACGTTCATGTTTGAGGGTCACGATACTACAGCCAGTGGCATCTCCTGGCTTTTATATTCTCTGGCTATGAATCCTGAACACCAGCAGAAATGCCGGGAGGAGATCAGGGACCTCCTGGGAGATGAGATGGCTATCGGTTGGTAAG a score=192 s mm8.chr4 114957099 91 + 155029701 CAACTCAG-GATGAAAAAGACCCTTGTCTT-------------CTTACAGGAGAGGCCTTCTGGTCTTC-------CCAGTTCCTGTGA-----CTCTTCCATATGGACTTCATTTC s monDom4.chr2 533721556 117 - 541556283 TGACCCAGAAATTAGGGCTTGCTTTGTTTTTCCCTCTTTGTGCTCTAGAGGAGAAATCCCTTGGTCCCCGTGGTATCCCATTCCTGGAATGAACCTCTCCTTCCTGAACCCATCTTC a score=6116 s mm8.chr4 114957190 139 + 155029701 AGGAACCACCTGGACCAGATGCCCTACACAACCATGTGCATCAAGGAGGCCCTGAGGCTCTATCCACCAATACCAGGTGCGAGCAGAGAGCTCAGCTCACCTGTCACCTTCCCAGATGGGTGCTCCTTACCCAAAGGTA s monDom4.chr2 533722085 139 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gagaaaaagaaggtaggagacacaatcctgatatttgacaagccaaagtaaaaatagatctagtcaaaagagatagggaaggtaattacatcctgataaaaggcagtatacaacatatgatcaaagaatgatcatgtattagggcataaaaac--attgcatataagtgcaaaatagcagaaataataatgcaaccttGtattattttattttatttttttGATGTTGTAAAATCAAAGTACTCCTTTATTAAATGAGTTATTTTACACAATATGAACATCAATATAATTACAATTGTAAAAAAAATTTTTATAACAAGGATGGACTGATTTTCAGAATTTCCAAATCAAGGCTCAACTGTACATTTACACAGAATTGTCTTTGCATGAAGCCCAAAAGGGAACAGCATAAAAATGAGTTG--CTGTAGCCCCTTTATTTTTGCTGATCAACTGTT-TGTTAGAAAAGCAGCTGCAGGTTTGTTACCTAAGGTCTGAGATAGTAGAAGAGTAAATAGGTGCCATGAATTCACCTGTAAACAACTTTATGCCTGAACATCAGCCAATTCTGGAGGAAGTGGAGTTTTAGGATGTTTGCTCTCAAAGTGCTGTTTGAAGGTCTTGGGGTCCGGCATTTGTGTCCCACAGACAGTGCAGGTATATATCAAGGCAGCCTTAGCAG----CAGCCTTCTGATCATGTCCTTGTTTCTTTTTTTGTCCAGCTTGTTTTTTGGCATTTTTCTGCTGAGACTGAATCTTCTGCTGTCCACGAGCCATATCGAAGCTGGGCCAGTCCGATGTC a score=-269 s mm8.chr4 115008053 84 + 155029701 AGGAAATGAAGGGCTGAGCCCTTGCACCACTAAGGGCCTCCACCATCTGCCAAGGAAAGAGTGGGCAGACCTGGGAGTACAACT s monDom4.chr8 15686894 71 + 308469712 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s monDom4.chr2 295135224 1426 - 541556283 aaaagaggttaatactaag--agaaatgggaaaagaaacaaaatggggtaaatttatatgttataaagaagcacatggcagtgggggagaaccccaataaactggaagttacccttgga-------gataggaaatactcaattc--ttacatgtattgaaattgactcaaa--gagggaagaataatcaaatccattggggca------------gaggattgatttgagc--------cctatagagaagtagaaaggtaacaaatggactggtggggagggaagcaatacaaggaagggagagtgtgggaggttagtttaaaaaactgtaaagaaaatgaggggaataa--gaagggaggggggtaaaaggggaagtaaaataagggt-------gggaattagggggaatgattaaaaacaaaacaatgtgtgtagaaacaatggtgtagaaagaaatagtgaaagaagaaagggcaggactaggagcaaaaatcaaaatcctagaaaatacacagcttttaatcataactttgaatgtgaatgaaatgacagagtggattagaaaccaaaatcctatcatatgctgtctacaagaaacacacatgaggaaagtagacacacatagggtaaaagaaagcagatggagccaaatctattgggcatcaactgagaaaaagaaggtaggagacacaatcctgatatttgacaagccaaagtaaaaatagatctagtca---aaagagatagggaaggtaattacatcctgataaaaggcagtatacaacatatgatcaaagaatgatcatgtattagggcataaaaac--attgcatataagtgcaaaatagcagaaataataatgcaaccttGtattattttattttatttttttGATGTTGTAAAATCAAAGTACTCCTTTATTAAATGAGTTATTTTACACAATATGAACATCAATATAATTACAATTGTAAAAAAAATTTTTATAACAAGGATGGACTGATTTTCAGAATTTCCAAATCAAGGCTCAACTGTACATTTACACAGAATTGTCTTTGCATGAAGCCCAAAAGGGAACAGCATAAAAATGAGTTG--CTGTAGCCCCTTTATTTTTGCTGATCAACTGTT-TGTTAGAAAAGCAGCTGCAGGTTTGTTACCTAAGGTCTGAGATAGTAGAAGAGTAAATAGGTGCCATGAATTCACCTGTAAACAACTTTATGCCTGAACATCAGCCAATTCTGGAGGAAGTGGAGTTTTAGGATGTTTGCTCTCAAAGTGCTGTTTGAAGGTCTTGGGGTCCGGCATTTGTGTCCCACAGACAGTGCAGGTATATATCAAGGCAGCCTTAGCAG----CAGCCTTCTGATCATGTCCTTGTTTCTTTTTTTGTCCAGCTTGTTTTTTGGCATTTTTCTGCTGAGACTGAATCTTCTGCTGTCCACGAGCCATATCGAAGCTGGGCCAGTCCGATGTC 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TCTTCTGTTCTAGAAAAAATGGGAGAAGCTCATCACCCAGGACTCGAGTCTAGAGATCTTTGAGCATGTCAGCCTGATGACACTGGACACCATCATGAAATGTGCCTTTAGCTACCATAGCAACTGCCAGATGGAGAGGTCAGTGA a score=4452 s mm8.chr4 115108934 131 + 155029701 AATTGATGTTCTGGAATAGATGGAGTGATCAAGATGAGAAAGGATCAGCTGCAGGATGAGGGAGAGCTGGAAAATATCAAGAAGAAGAGACGTTTGGATTTTCTGGATATCCTTTTATTTGCCAGAGTGAG s monDom4.chr2 533720142 128 - 541556283 AATCACTGTCTTG---CAGACCAGGTGATTAAGAAAAGGAAGCAGCACCTCCATCAGGAAGGAGGCTTGGAGGCTATCTTGAAGAAAAGGCACTTGGATTTCCTGGACATTCTCCTCTGTTCCAAGGTAAG a score=12118 s mm8.chr4 115109147 280 + 155029701 GATGGAGAATGGGGACAGCATGTCTGACAAGGACCTACGTGCTGAGGTGGACACATTCATGTTCGAGGGCCATGACACCACAGCCAGTGGAGTCTCCTGGATCTTCTATGCTCTGGCCACACACCCTGAGCACCAACAGAGATGCAGAGAGGAAGTTCAGAGCCTCCTGGGGGATGGATCCTCTATCACCTGGTAAGAGTTCAAGAAG-TAGAAATGCCCTTAT-------TCTTTGGG-TTTGGAGGAG----CCCCTGGTCTCCAGTCTACCTGACCTTAAGGATGGACTT s monDom4.chr2 533721359 293 - 541556283 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mm8.chr4 115236464 174 + 155029701 TGATCAGGGGGCTCAGGCCCAGGATTTCCAACCCTGGA----AGGCAGCTCCAAGTCAGCGAGAGAGTTGGGTGTTGGCTACG---------------------AACCTGGCAGCTCAGGAGTGGGCCCG------CCACTCACCCCCCACAAAAAGATGAAAAAGCGCAAAGAGCTCAATGCGTTGATCGGCCTGG---CTGGTGAC s monDom4.chr2 7887312 208 + 541556283 tgggccgggagcggaggccgcggccgcccAAGGCCGAGCCTGAGCCCGAGCCAGAACAGAGCCGCGGCTGAGCGCGGGCTGCGTCCCTTGGGCGGGCGCGCTGGAGCCCGGCGGCTGTTGCTCGGCCCCGGGCGGCCCCCTCACACCGCCCAAGAAAATGAAGAAGCGCCGGGAGCTGAACGCGCTCATCGGCTTgggcccgggggac a score=3121 s mm8.chr4 115236651 93 + 155029701 AGACCAAGCAAGGCTCAGGCAGCCACCGCCTGCTTCGCACTGAGCCTCCTGACTCAGACTCAGAGTCCAGCACAGACGAAGAGGAATTTGGAG s monDom4.chr2 7887554 93 + 541556283 GGGCCTGGAAGAGCGCTGCGGGCCACCGGCTGCTGCGCACGGAGCCACCCGCCTCGGGCTCCGCCTCCAGCTCCGAGGAAGAGgacgacgatg a score=1513 s mm8.chr4 115236827 93 + 155029701 CAGCCGGGCAAATGGATGAGAAGGAGAGGGGAGTC--------CCTTGGAAGAAAAAGGGAAGTAGGCCTTGGAAAACAGGGAGAAAGGATGTTGGACAGG s monDom4.chr2 7887737 101 + 541556283 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TAGGTATGTTGTGTTTGAAGAGTGTATGCAGAAATTTCATTTCCTAATCATAAAGATGGAAAAAATG----AGAACTAGGTAAGTTCTTTTGAGATT-CAACACAT---------------------TGAATTTTAAATGAGTCGCTTTCCCTGGTGAAAGAACATGAATAAGTAATTGTAAGTTGTTTGTTTGCCATACTTCCATTTATGTAACAAAAGTGCCT-CGGCTTGGCTTGTCTCTCCTAAAAACCCACATCAGATAATGATTATTATGATCCCCTCTGGGCTCATAGACTCCTCAGGATCCCG--------AGTGTCCTCAGGGCTTGCTAACATCATGTATGCATTAGTTAATAGTTGTAGCTCAGGTTATTTATGTCTCTGCCTTACTTCTTTTTCACTTCTAAGTCCTATT-TATTGCATATAGACTTCAGGAAAGAGACCCTCCATGCTGATGGTGTTTGACCACCTGAGTATGGAAAGCATTCATGGGATGGCTTTTCTTTACAGCCTAGCTG---------AAACTC--TATAAGCAATTCAGTGACACAGAGCTGCATTCGTTAGAATGAGTAAT s monDom4.chr2 7892214 537 + 541556283 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541556283 CTCTAATTAGATCCAGCACTTCTCAAAGGAGACCAGCGAGAGCATCATGGCCACTCCATCACCTTCCATGGCCCCAGGCCTAGCCGGGAAAAGCCAAAGAGAAAATTTCCAGCAGGTATTTGTTGC a score=10277 s mm8.chr4 115257243 798 + 155029701 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TCTGGACACATGTGTGTATGAGATCTCCATGACTGG--AATTAAGTTCCTCAAGAACAGAGACTTGGTTACACTCCTGTTGAATTCCATA---CACAGTGAGAGCTGAATAACAT---GATCACCAGATCCCTAGCCACTGGAAATGTGAGACCTTTTAAGACCCTGCATCTGCTCGCTCTTCAGATTTTCTAGGATAATGTTCTCACTGCTTCTCCTTGCCTTCCAGGA---------AGACCAGCCCATTTATCTGGCAGTGAAAGGAGTAGTATTTGATGTCACTTCTGGAAAG a score=9389 s mm8.chr4 115285469 223 + 155029701 ATCCTTGGCTC----CTCACCCAAACTGTTGTGTGTCTCCCAGGCAAGTAGCTAGAGTTCTTGGATGATGTTTTCATCTACGATTACAAAGCCACGCATCCCATAATCAGCTACACATTCTGACGTATCCTTAGTAACAATGGCTGCCTCAGCCTAGCCTTCAAGCCTGAAGAGCATCCCCATTTTAAGATAAAGGATGAATTCTGGTGTTCTGTCTGATAGGTCAG s monDom4.chr2 120561731 217 + 541556283 ATTTTTGGCTCTTTCCTCCCTCAGACTG------GTCTTACAGAAGAGGAGCTAAAGTCCCTGGATGATATCTTCACTAATGTGTACAAAGCCAAATATCCCATCGTTGGCTACACAGCCCGTCGAATCCTAAATGAAGATGGCAGCCCCAACCGGAACTTCAAGCCTGAAGACCAGCCCCATTTTGACATTAAGGATGAGTTCTGA----CAGTCTGCTAGAGCAG a score=8165 s mm8.chr4 115286104 204 + 155029701 TCCCTTCTCTGAGGAGGTGCGATGGAGT--------------GCTTCCTTATTTCAAAGCCCGCAAAGGCCTGCGTGCTTCACCTTTATTTACCTTTTGTCAGGTCTGACCCAGCGGCCTTTGAGTCCCGCCTGGAGAAGCGCAGTGAGTTCCGAAAGCAGCCAGTGGGGCACTCCAAACAAAGTGATTTTATCAAGTGTATGGAGCAGAAGGTAAGA s monDom4.chr2 7939825 207 + 541556283 TCCTTTCCTTAGGGAGGGGCTCTGAAGTAATAAAGTCTGGGAGACACCCCCCTTCCCAGTCCT----GACCTGGTTCCTTC-------CTTGCCTTCATGTAGGTCTGACCCTGCCGCCTTCAAGTCGCGCCTGGAGAAGCGGAGTGAACTCCAGAAGCAGCCTGTGGGACACTCCAAGCAAGCAGACTTTATCAAGTGTGTGGAACAGAAGGCAAGA a score=3643 s mm8.chr4 115288314 261 + 155029701 AAACAGTAACT-CTTAGAGAGGTATGTACAGTGTCATAGAGAGTGGATATGAGTGAGTTCCC-------------AGGAACAGAAGGACTCAGTGAGACTGGCCAC---CTCAGTGGTTTGATTTATTCCctttctttcttcctgcctttcttgctctttctttctttctGTGAGGAAAGTATAGTTTAATAGTCTGTCTCCTCATGTATTTCAGACAGATGCCTTGGGGAAACAGCCTGTGAGCAAAGGATTCACTAAGGACAAGGTAGGTTTCTAG s monDom4.chr2 7940792 262 + 541556283 AGGCAGTTACTTCTCAAAGGCAGCCACAAATAGTCAGGGAAAGTGGCTGAGGATAGGGTACTCTAAGGCACAGTTGGGAAAGGGGAGAGGGGGTGGGCATGTCCACTTGCTTGAAGGTTTGAGGC-TGCCCACAGGTGCTTCAC------CTGACTCTTCCTGTAC--CCACCGGCAAAGTAGAGACCTCTAAACTATTTTCT-------TTCAGACGGAAGCCCTGGGGAAACAGTCTTTGAAGAGAGGATTCACCAAAGACAAGGTAGGGGTCAAG a score=4345 s mm8.chr4 115289141 79 + 155029701 TTCTTCTTTCAAGACTCTCAGTTCAGTCTTCAACGTTGAGATGGTGAAAGACAAAACTGCGGAGGAAATAAAACAGGTA s monDom4.chr2 7942301 79 + 541556283 TCCCCCATTTCAGACTCTCAGCTCCATCTTCAACATCGAGATGGTGAAGGATAAGACTGCAGCAGAGATCCAGCAGGTA a score=11126 s mm8.chr4 115308917 376 + 155029701 TCTCATTGCCTTGCAGAATGTTGTGGAGGCACAGTGCATCGCCAATCAGGTTCAGCTCTTCTACGCCACCGATCGGAAGGAGATCTATGGGCTAGTAGAGACCTTTAACTTCAGACCAAATGAGTTCAAATATATGTCTGTCATCGCTGAGTTGGAGCAAAGTGGACTTGGAGCCGAACTGAAACGTGCCCAGAACCAAGATAAGACTTAGAGGTATCTGGATTGTCTCTTCACAGTG-------TTGGCTCAGTCCT-------GGATGG----CCTGAAGCCCACCCACACCCTTGAATTCCAGAGCTCAGCATCTGCAACAAGCAGTCTGTAAAGAGTTACTGTGTAAGCTTATTGC---AAGAAGTGATTGTGGACATGAGCCCTAATACTTG s monDom4.chr2 7951653 382 + 541556283 TCCTTTTCCCTTTCAGAAAGTCCCTGAGGCTCAGTGCATCGCCAATCAGGTACAGCTCTTTTATGCCACTGACCGCAAGGAGACCTTTGGCCTGGTAGAGACATTTAACCTCAGACCCAACGAGTTCAAATACATGTCCGTCATTGCAGAACTGGAGCAGAGCGGGATTGGAGCTGACCTGAAGCTCCCACAAAAGCCGAGCACAGCCTAGAG-----CGGAGGCCGTCGTCCTGGTGGCTGTCCTAGGGCCAGTCCTAGGAAGGGGATGGGGCATCGTACACACACACACACACGTACACTCATGACCTC----------GCACACATCCTCTCGTGGGCTCCCCGGAGTGTTTATTGTGGGGGGGGGGGATCCCAGAATTGGCGCCTGATTCTTG a score=787 s mm8.chr4 115325980 238 + 155029701 GCGGCGTGGCTGAGCCTGGGGCGGAGCTGGCGTCTCCTCGAGCACTGGCGGCGGGACGGCGGCC--GCGGCCCAGATCAGACTGGTGG--GTAGACGCTGAGACCCGCACGGCGGGATCACAGG-CCGGAGGACGA--CCGGCGCGTTGCGGTGTGGCCGCAGGGACAGAGACCCGGAGCTGTCCACTCAGGCGGAGCGGGTGAGTGAGCGCC---GCGTCTCCGCGCCCCCCAGGGCCCAGTCTTGC s monDom4.chr2 7977297 246 + 541556283 GCGGCGTGGCGGGGGCGGGGCCAGAGCGGGGCGGGCCAAGATCCCGCGAAGCGGAGCCGCGGCCCGGCAGGGCGAGCAATAATCACAGCCGTCGCCGCCACAGCCGCCACAGCCGCCCCCTGTGCCCGGCGGCCGGTCCCCGCTCAGAACGGACCGAGCTCCCGGGTGAAGGAACGGA--CGGACAGACTGTCGTGCCCGGTGAGTGACCCTCCTTGGGACCCCGCCCTCCGCCGGAACTGGCCGGGC 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TCCATGCTTT-TGACATTCCAGAGAGAGATGACAGAGAAGATCTGCCACTGAGCCCCTAACTACCTGGGGAAGATGATGACCTTTGGCCTGAGCTCCTGGGACC-----TGACTGGGGAAAGGCAGCCCCCCTCATGA--CTGT-GGCAGCCACTCTTCTCCTCTGGTGTCCTTCCCCTGAG-----GCCCTCCAAATAC----CAGTTCTCA--TTCTCCAGAGTCTGCCCACATTCTCTCCTGCTGCCAGGGGCCAGGGAGGA---CAAGGCAGGAGGACAGACAGAAAGGA a score=2121 s mm8.chr4 115333939 175 + 155029701 GGCAATGTCTCAGAACTGAGGACAGTGGGAGATTCCCCCCACGGTGGGCTGCAGAATATATTCTGAAATCTAGGCTGTGAAAAGGGACCACAGGGGAGG-GGGGAGGAGGGAAATCTATTTTTGTGAAAAGAAAGATTTTGCTATTTTTTTGTAAAATAAA---AGATACAAACTAAAG s monDom4.chr2 7993127 177 + 541556283 GGCAAAGTTTGAGCCCTGAGGGGATTCCAGGAATCCCACCTCTCCACCCAGCCAAGCAGGGGATTGGAATCACCCTTTGCT--GGGGTCACTGCTGAACCGGAAAGAAGGGAAAATTATTTTTCTTAAGGGAAAGAGTGTATTGTTTTTATTTTAAACAAAGACAAATAAAGAAGAAAG a score=2086 s mm8.chr4 115337044 80 + 155029701 GGCCTTGCTTCTCGCCACGTGTGGCCCTCGGGGCGCAGGCGTGACTCCTCCCCCTCACGCCTCCTTCTGCT--CGGGCCCTC s monDom4.chr2 7998012 79 + 541556283 GGTCATCTCTCCGGCTACAAGAGGGTC-CAAGGCGCAGGCGTAACTCCG--CCCTCGCTCCGCCCTATGCTTCCGGGTTCCC a 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tgaggatccccttcaggcctaacTGTGCAGG------ACTGGAGGATTCTCTAAAATCAAGAGCCGTGATTCCCTGGGACAAAAAGGCCTGC-------------TCTGGTTAGCGGGAGAGGAGAGAGTCC-TTCTGATTCAGCCTGGTGAGCCCTCATGGCAGCCAGGCTTGGCTCTCTTTGCTTCTCTCCTCCTTATTCCCCAAACATCTCTTCT--ACCGTGCTGTGCTTCCAAGGAAAGTGGTAGCCATTTGTTCCTCCTGGGGTCCCTCGGAGGGGAGCAGGCCATCTAGGCCTGAGGC---TGTAGGGTGGGAGGGTCCCCGTGTATGCTGTGGGCGCTGCTGTGTGGGGCAGGCGGATGTGGTATGTATGTGGACAGAGTGTGTGCTGTGTGCTTGTCCAGCTTGGCTGTGGGCAGACCCACTTCCTGTGAACCTCGAGAGGTCTCAGCATCACTGATAAAAACCAAGAGGATGTCGCTGTTGGTCAGATTTCTTTGCAGAGGCCCTAGGAATGTCTTGGCCTCACTGGTGGGGTGGAA-GCTGCCCACTCCTCTCCTGCACTGTCCCCTGACC------------------TTCCCCAC-----CTCTGTCAGA------TTGGGGAAGGGAAAAGGGGATGAGGC-------------TTGGCCCAAAGTCCGGAGAGCTGTGCTGGGTGCAGAGGGAGGTGGAAGTGACTACTGGCGGCCAGGGTCAGAAGGAAAGCA----AGTCTT----CTGGGGGTCCTGGGCTGCTCTCTGCCCCCTTAATCTAGTCACATCATCTGGGGGTGTCCTAGGGCCCCCCCCCCAGGGGCCACCTTACTGA-CTGGCTGCTGTACTTCCCTCCTGCCCCTCCACATCGGCCCATCTCAGGAATGTCTGTGGGATGGGGCATGGATGAG-GGCAGGAAGGGAGGC----AGGGAAGAAGGGCATCCCTGGTGGGAAAGCTCCCAGGAGCCCCTGTGGTTGGAGTGCTGTTGGCTGAAATGAGGTTT----GAGTTCCATGAAG-CTGATTGCTGAGGTCGTGTGTCTGGTCTGTTGCTGTGGATAATTGAGACTCGGCTATACTTAGTTTTGACTTCACCCTTTGGAA------CCTCACCCAGATTGAGCTGCCAGACACTTGACTGTTCTCCCATCTATACGGGAACATTGTGGGATTTACAAAGTGCCACATTCGGTGTGTTTGCTCCTAATAGCTGTTCTGTGCTTGTGGATGGGAACGGTGCACGGAGAACTGCGCCAGCGGGCATCAATCTTCCAGGCAGGCTTGCCATTTCTTTGATAGTTTTCAGCTG--GGGCCCTTAGAGAAGAGGGTAGACTTTTCCTCTGGATGGAGGGACAGGCAGGCAGGCAGGCAGCTCGCCAGCTTCCATTTTAAAGTCCC---AGAGAAAAAAAACCT-GGAGCCTGTGTTTATTGAAGGTTGGTCCAGAAGACTCT--CCTTCTCTTTCTCTTCCCCATCAGTGCACCAGGGCCGTTATTTCAGAAGGATGTAAAGATTTAATTGCTCTGGTGGGGATTTAGACACAGAGGCTTCA-AGAAATCTTATTATTTCCAACTGCAGGCAAAGAGTATTAAGTCTCCATTCTGGATCAGTGGTGTGGTATGTTCTACGAGTAATTTATCTTTAACCAGGCAAGGCCCTCGCTTTAGGGTCTTAAAAGCAGCCCTGTGATTGGTTCCTGGTACATGACTTTATTTATTTCCCCCTCTCAACCTCTTGGTCTTATACCTGCTTTCTTGATCGCTCCCAC--------TTTTGTGCCCACGTC 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s monDom4.chr7 177611797 960 + 262624689 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s monDom4.chr2 8170339 945 + 541556283 CTGAGAGGCTGGAGAGCAGCTGGGGGAAGATGGCCAGTCTCCCAGAAGCC----ACCCATCCTGACATGTCCAGGGAGAAGTTTGTGTAAGTGGATTTAAAGTTTGGATGTGGGTGAGACGAGTTCCCTGGACCCCCCTCCCCTACT--CTCCCATGCTCGGCAGGAGCACAAGGGACCCCTTTGTGTGGGCCTAAGCTCAAAGCATCCCGGCTTTA----------GGGATGAAAGCCCCATCAAACCACAACTTCAGGGGCCAGGGAC-------------------GATAATCCCTCCGCTTTAGCTAAACAAAGCTGGCCCTAAGCCGAGGGCAGCAAAGGGGCCGGGCTGGGGGCGGGGGGCTCCTAAGAAGATGATCCCAAGGCCCAATCTCCCCAGAGTCTAACCAGCTCTGACAGCCCCCAAAAGAGAGGCCTAAActcccctctcctcctctcctcc-ccttccccccaccttccatggcccctgccc-----ctgccctAGCCCCTAACTTGGGTTCCAGCTTGTTTTAAGGGAGAAAAGCTCCCTTCGGCCATCATCTCCTCCAGCCTTTCCATCCTTGTCccttctcgttttccttc--tccctctcctcattctcttttctccctcttttctttaactctttgcttcattcttctctttcacatttccatcttcctccttctgtcatctcatttttt------ctgcctct-cttttcct-----ctttaatcctgcctttctc--tatcttttttct---------------------tcttcttAGTTATTTTTTGGCATCTCTTTCCTTCTCTCTACTATC--------------------TCTCCATATCTTTCTCTTCT-TTTTAAACTTTTTTATTTGCCTTTATGTATATTATTTCTTTCTGCTGCCTTTTCCCATAtccctttcttt-------ccatttctctctctctgtctttgtctctc--------------tgtctctctgtctctctctcc---tcttcctctctccccctTCC-CTCAATCTCAGCTTCTCTTTCTCTTT 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CCTCAGTGTCTGGCTGAGCGAGGATGGGACGACAAGGGGCCAGAAAGGGGGCTCATCAACATTTCCAGCAATGCTAATAGAC-------TATCCTCGGCCACATCCTATTACTGCACACCCCCTCCC-CAGCCCCCCAGCCTAGCTGGCCTGCGCCTCTCC-TCGGCCC-CGGGGACCAGGCATCAGATTGGAGTCAAGATTCCGAGA-GTGTCATTTGCCGCCGTTGAT-GGTGCCGATAATAGGGATGGG---CGGGCGGGCGGGGAGCCGCAGCGCAGAGGCGGATTCTCTATTAAGACTGCTGCTCAGTGCAGCAGCCAGAAAGAAGCAGGCAGGCCTGCGCTGGGCAGACAAGGCCAGCAGAGTTCCATAATGGGATGGGTGGCTTACCTATGGCATTGTCTGCACCGTTAGTGGGGACCACTCTTAGGAGCAGACATACTGGGCTTAGAGAGTGACAAAGGCCAGGAGAAGCAGGAAGAAACCGGGCAAGGCAAGCTCCAGCTGCCCCTGCAGCACTGTCTGCCTCCC-------TCTGTCCTTTTCACTA--CCCGGGACCCAAAGATCCTAGTTGATCAATAGAACAAGATATTTTTGCTCCCTCCT s monDom4.chr2 8178578 559 + 541556283 CCCCTGAGCCTGGC--AGCCAGCACAGG--GAGGGGGTTTCATCCTGGGTGTTGGGCGGCGGTGGCGGCAGCATTAATAGACACTGGGACGCTTCCGGCCACATCCTATTATCGGAGATCTCCCCCCACCCCTCCCCAGCCCAGCT----CGAGCCTCCCAGGCGGCCCACAGGGACCATGAAGCAAATTGGAGCCAAGACTCTCCGATGTGTCATTTGCTGCTTATGATAGGGGCTGATAATAGGGCCAGAGATGGGACTGGCGGGGAAGGATAG-ACGCAGTCGGA-TCCCTATTAA-AGTGCTTCTC--TCCCAGCCCCAGACATAA-TAGGCAGG------------AGAGGAGGAAAGGAGAG--ACAGGCTTGGA--GCTGGCCAGCCACAGTCTTGGTCTCTGAGGCTTGGGGG------TCCCAAGAGAGCAGCTACCCGAATTTAAG------GAAGGAAGGGAGATCGAGCACGAAGC-----------AGCCCCAGCACCCAGCACCCCTCTTTGAGTCTCCCACACCTGCCAGTGCTTCCTGCTGCTCCCTGGGGCCCTGGGTCCTGCCCAACCTGGAGGCAGAG---TTTCTGCTCCCTCCT a score=375 s mm8.chr4 115457922 319 + 155029701 AGAAGGTGTAAGGGAAGGAGGCCTGGGG------GCAGACCTGGATCCCACTCCAATCTGTACT-------------------CCTTACCCTTGCCCCCAGCCTCAGAT---------GGACAGTGGGTTTCTCTCTCCAGGAAGGTAAT-----GGCTTCCGCTGG------------------GAACCAACTGAGCCACTTT------GGATCCAGCCTCTCCTGCCCACCCACCTGCCTGCACGATGCCAGAGACAGGGCAGGGAC----------------AGTCAGTCTGAATGTCCATTCCTTCTGTGAGAAGCC-----------TGAATGGGCAAGAGT----------------ACATTGTAGCAACCTTTATTAAGATCTGACTGGTTATAGGATTCTTTCCTTCTGCAGCATGC s monDom4.chr2 8204201 417 + 541556283 ATAAGGTTTGCtggaaagaggtattgggtagtcagataatctggattcaacttcctctgctacctgaggggccttgatcaagcccctaccctttctctggacctcagAACAGACTCAAGGGTGGCAGTACTAGGCTGCCAGGGTGACCATTGTAGGGCACCCAGAGGTCCCTAGGAGGAGTATAAGGAGCAACCAGTCAACCTCAGAGCCGGGTCCAGGACCCCTCACCTTCCCTTTTGACAGACAAATGCTAATGACATGACAGGGATTGACCAAAAAGGGATAAATAATTCAGATAGACTATT--------GACAAGCCCAGGTCCCGCTTCATTAGCCCAGGGCTCTGGCCTCCCATCGACCATTGGACCTTCTTTCACTAAAAATAAACCCCTTATGGTATTCTAGCCTCCTGCAGCCAGC a score=10075 s mm8.chr4 115467602 288 + 155029701 GCTCCTTCTCCTCAGTCGCTAAGCAGGATTAGCCTCCTCTTCCTCAGGAGGAGGGGGCTCAGCTCCTGCATCAGCCACCAGCTCTGGCCCTAATCCCCCTAGCTTTCTAATCCATCCACGACTTTTCTTAGGCATTAGCGTTGGGCTCTCAGCTCCCAAAGCACC-ACCCTGAAGATGGGA-------------GCTGGGCTCTGAAGGGAATTAGGCCAGCCTC--AGAGGATGGCTGGGCTGACAACTGGAGGGACTCTGGGCATTCCATTTATCTCTCTGCTTTTCCCCTTTAGTCCCCCC s monDom4.chr2 8206488 292 + 541556283 GCTACTTCCCTTCAG-AGCTAAGTGGAATTAGACTCCTCTTTC-----AAGGAGGGTCCCACTCCCCCCAGCACCCCCCAGCTCTGCCCCTAATCTCCCTAGCTTCCTAATCC-CCCACTAC-TTTCTTAGGAATTAGCCCTGGGATCTCAGCTCCCTAAGCACCAACCCTGAAGACAGAACGGAGGCAGGCAGGCAGGCAGCGGGAGGGAATTAGGCCAGACTCCGAAAGGATGGCAGGCCTT-CATCTTGGATGCTTCCCTTCTTTCC---Tctcccccttctcctccccttccctcttctc a score=5479 s mm8.chr4 115469254 668 + 155029701 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cagcagcagcagcagGGCAagggtggggaggaggaaaaggaaggggaggactaggaggtcgtggaggaggaTTGGCAGAAGATCTAAGAAGGCGGGTGGTGGACTTTTGCATTCAGGGCGGGAAGGGCCCCAGGGCTGGCTGTCCCTAAACTCTGGTCCAGCAGCCCTGGATGGGAAGGGCGCAGAGGGCAGGGCAGGGGACGCAAAGGGACTCTTGGATGGCCTCCCGGCAAATGGATCGACTGGGCCCAGGAGGCCAGGATC-TCTGAACAGCTTCTTTCGGCCCCAGGCAGTC---AGGGACTCGGGGTCTCACCGGGGC---GTAATTAGCTTCC-CAGGATTAGCGCCTCCCGCGGCTCGCGTCTCAGTTGACTCTGTCAAATCTCGTTTGCATTTTAAATGGGAGTTTGACAAGGTGGCCAATTTATCTGCTGACGGGGTTAATGGGTATTCGCGGGCCTGGGAGCCCCTGCTAGGGGCGAGGAGAGGGGAG---AGGACGGAGCGTTTGTCCTCCTGCACCACTACCCTCGCCCCATCCTTCTGCTCCTGGGTCCTCCTGCCC----CTCGTCCTCCCTGAACCCACAGCCT-CCGACCTTGCAGTCCTACACCTCCCTTCAGGCTGCC--AACCCTCCTCGGCCTGGCGCTGCTCCAGTACCTAGGTCCTTGTCGTTCAGAAGGAGAAAAAGAAGGACCGGGGAGCTTAGTCTTAACCTGCCACCCCACCCCCATTTCTCTCCGGCTTCAGAAACTTCTCTTCACCCTAGGTAGCTTTCTGA a score=1440 s mm8.chr4 115470051 138 + 155029701 ACTGA--GGGTTCCTGAGGACTGAACCCTGTAATCTCTCTTAGAGGAAGAGCCTCCACTCTTGGAACC------AGCCTCTGAGGCCAGAGCCAGAGTTT--CCCTCAGAGCTGGGTTCACTCACCT--GCTCCACACAGAGCCAGAGGC s monDom4.chr2 8211554 136 + 541556283 ACTGGTCAGTTTCCCAGGTGGGTGACCTTGTTTTGTCTCC---------AGCCACCTCTC----AACCCCGAGAATTCCCAGAAGTCAGAGC-AAAGTCTGCCCCTCAAAGCAAGTCCCTTTCCCCTCAGTCCCATGCAGACCCAGATGC a score=17883 s mm8.chr4 115470284 578 + 155029701 AGACTTCCTGATAGGCCCAGACATTACCTCCCCAAACA--CTGGGTCCATTTCTATG--------CTTTCC--ACGCAGAACTGAGCAAGAACTCAGG------TTTCTAGGAGCCT--AGCCAAAGCCAGGT---GCTGGGCCAGGACAGGATGGCTTGGGGTCGTATGTGAAGATGTCTCCTTCTCTTCCGTTTTGCAGAGTCC-CAGCGCCCTACCCTTCCCCACCC--------------------------------TGGCTAATGTGCCACAATTACCTCCTAAGTGCCCAAACAAATGTGGCTGCTGGGGAAAGTGACACGGGCTCCAGGTGATGGATTCGTGCCATC---------------------------------GGGGAGCCGGGCGGAGCGGGCCCCA-------TGCGGGGGGG----------CAACACTAATATTGTATCAGCGTCGGCGCCGGCGCCACGAGCCGGTGATGAATATGTGTCACTTTACACGGCGC---ACACTCGGGGGCCTGGCTGCGCAGGCATGGAAAATAGAGTGTCTGGGATTAATGATATTGAAAATGATAGAGAGCAGATTGGAAATGGCTTCGCCTGCCCGACCCGCAGAGATGGAAACGTACCTCACAGCTATCTGCCCAGGCTCGGCCCCCACCTGCCCCCCCCCCAC s monDom4.chr2 8211741 675 + 541556283 AGGCTTCCTGGAGGAAACGGGC-TCCCCTCCTCCCACGACCCAGGTCCAAATCTGGGGAGACACCCTCTCCTGGGGTAGGTCAGCCCAGGTCCCCAGGACTCAATGTCAGGGCGCTCTGAGCCACTGCCAGGGAAGGGAGGCGCAGGAAGAGAAAGGAGGAGGCTGGAGGAGGCGCTCCACTCCCCCCTTACAGCCCCCGCAGCCCTCGGCCCCCGGCCCGCTCCCCCCCAAAGCCGAgcggcccccgcccgcccagccgcccggcTAATGGGGCCCAATTACCTCCTAAGTGCCCAAATAAATGGGCGGGCTGGGGCGGGTGACA--GTCTCCAGGTGATGGATTCGGGCCATCTCGGGCTGCGAGGCCGGCGGGGGGGTAAGGGGGAGGGAGGCGGGGGCCGAGAGCCTCGCACAACTTGCGAGGGGGGGGCGGGGGCCAACACTAATATTGTACCAgcgccgcc--cgcccgcccgggccg-TGATGAATTTGTGTCACTTTCGACGCCGCCGCGCACTCGGGGGCCTGGCCTAGCAAGCATGGAAAATGGAGTGGCTGGGATTAATGATATTGAAAATGATAGAGAGCAGATTGGAAATGGCTTC-----CCCGAACCGGCGAGATTGAAACGTACCTCACAGCTATCTGCCGGAGC-CGGCTTCCCCCTTTCCCCCCTTCCC a score=3648 s mm8.chr4 115473766 438 + 155029701 tctctctgttccttcctctccctc---cttccctgcctctctctctccctTAGTCATTTGCAGAGCGGAGATGGCCTAGCCCATCTGGGAGCGAGAGCGCTGCCCGG--TGACGG-----AGGCGCAGGTAATA--GCCGTGTGGAGGAGAGACG---------------------------------------------------------------------TGGAAATTTATGACATTGAAAATGACTGAGGGAGACTGTATGTGTGTgagtgtgggagagcaagaggggggaggggtgggaagggaggaggga-gggCATGTGCACATTGCCGC-CTTACGTATGCTCAAGACCTGACTTTCTTCAAGGGAGGACAGCCTTGTTG---------------GGGTTTAATGCCTGGCCATGCACAAAGTCAGACAG-------ACACACA----GGTGGTGGAACGGTGTGGGAA-------------GGAGAAAGGAGAGGGGGAAGCAGCAACTGCTAGCACAGCTAACAACTGCAGGAGAGCCACCGGTTGGCA s monDom4.chr2 8215598 524 + 541556283 TCTCTCTCCTTCCCCATCCCCCTCACACCTCCATACATCTCTCTCATTTTCAGTAACT-------CAGAGATGGCCTTGCCCATCTGGGAGCCAGGGAGGGAGCCAGACTGGCAGTGATAAGGCGCAGGTAATATTGCagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaaagaTGGGAGGGATGGAAATTGATGACATTGAGAATGACTGAGGGGGAT----------------------------GGGGGGGATGATCAGGCAAGCATTacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacTCCTCCTCCTGTCCAAGGAGCCCAACCTTGTAGAAAAGGAAAGGGCATGGATGGAGAGGCTCCCCATG-AGAAACCCAGAGGGAGTTTGTACACACAGCCTGGGGACAGAGCAAAGTGGAAGACAAGCTCTGACTGGGGAGGGGGGAGGGAGGGGGAACATTGTTATGAGCAGCTCATCATTGCAAATTGGCCCTGAATGGACA a score=10552 s mm8.chr4 115475429 440 + 155029701 GGTGAAGAGTTCACTGGGCTCAGGGGTTGTGGGCCGCAGG------CCTCCCACCCAGCCCCAGTGCCCTGGCCTGGCCCATTGTGGCCGCATAAAAGGTGACGGATGGTTAATAGGGGAGATAACGGGATTCATAAGGGAAATTTATCGGTCACTCTGGTGGTATAAATATGTTTATAGCGGACCAAGGGGAAATGAAGAAGCCCCAATAAATCACCATGAAGCCACCAGCA-ACTAATAG-GCAAGCGGCCTCAGGAACC-CCAGCGTT-----------GGTGC-------------------------------GTGCAGACACCCCCTCTGGCTGCCTGGTAATGGCATGGTGGGGCTACAAACTC-----GACAGAGACTCGACAGGC--CCACGCGATAGCAGGAACAGGACTCCAGGGG--------CCACCTCTGCT----GGACCAGAACTACCTTGCTTTCCTGTGACACCACCCCCACTACACTCCTCACCGAAGGGA s monDom4.chr2 8221712 495 + 541556283 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ACCCCCACCCCCCGCATCT--CCCACTCCTGTCTCTAGACCTCTCTCCCTCAG-TCTCGGGCTCCGTGGCTTCAACTCTCCCCCCCCCCCTCCCGTGGCCTCCTCCCCAGCGGGGCGGGGGAAATCGCTCCGTAAATAGGCGGATGGCCCGGGGCGCTCCGGGCG--------CAGACACTCGTTTTTAGAGCCGGTAATTGACTCCTTTCAGTTGATAATTCATGGCTTGCATATGC-GCTTTAATgcgggcgcccggggaggcgcggcaggcggggcggccgTGCGCAGAGCGAGCTGCAGCACGGCGGGAGCGATCGGGCCCGCC--TGGCGGA--GTCCGCACCACCGGGCCCTCGGGTCCAGGTCCCCCCGGAGGGCAGACGCCCGCTCTGCGGTCCTGTCTGCGGAGCAG-----GACTCTGGGTGGAAAAGGGAAAGGC---------------------TGCAGGGGCGAGGCAGGTCTGCACTGGTGAAGCCTTCCAGGAGAAAGCAAGGGCTGGGAACACGGGGACCTCTTCCCCACGCCGTCAAAGGGGAAACTGAGGCTGGAACTGAGGCAATAGTTCTTATCAGCAGTCCACCAAAC s monDom4.chr2 8226715 553 + 541556283 ACCGCCGCGGGCCGCCCCTGCCCTAGTCCTTTCCCGGGCCCCAGCCCCCTCGGCTCTCCCACAAAGACGCGAGgccgctgccgcctccgccgccgtcgctgccgcctccgccCCGCAGTCCCGCTCGCTCCCT---------------------CGCTCCGGGCGATAGCGCCCAGACGCGCGGGGCC-GAGCCGGTAATTGACTCCTTTCAGTTGATAATTCATAGGTTGCATATGCGGCTTTAATGCgggcg-ggggggaggggcgggggccggcgcgggc-------gggggggttg------gggggggaaggtgggCGACGCCCATGATGGATGGGCCGCATTA--GGGCTTTGGGAATGAGATC--------GCGCCGCTGCCGAGGCCGCGGGCAGAGAGGCGGGGAGGCGGGAGACTCCGAGACTGAGAGGGGGAGGCATGGGGAATGGGGTTGGGGGGAAGAGGAGTGAGGCAGGCCAG-ACTTAGGACGCTTTCCTACGGCCCCCAGCCCAGGACACCCCGGGAAGGCCTGCGCCCCGAGGTCAGA---------GCTGCTGGATTTG-GGCCGCCGCTCTTTCCCCGAGGCCAGCGACC a score=4540 s mm8.chr4 115496225 324 + 155029701 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TTACCTTCTTCAGAATGTTGTCCCACATATCCCCAAAGTAGCCTTTGTAGTGTTCCATCTGGGCATCGTCCTCAGCGGTCACAGTGGTGACAGGCACCACCCCCGCAGGGAAGTCCAGGCAGTTATAGAGAACAGTGTAGCTGATAGCCCCTAGGGGGGGAAAAACACACTGGCTGTGGCAAGCCCTGCCACCCACAGTGCCAACTGTCCACTCTGGGCCTAAGTCACCCTTGTCCCACA----CATAAAATGGCAACCTCA--CCCACAGCTAGGAAAAGTCCTTCT--CCCAGGCCTAGGGTCTGTGGTAAAGCACAGAAGCCAGCAAGCCTCACTGATGCCCATTCTGTGCT-----GTATCCACGCAGTTTCCCTGACCTGGAAGGTGGTTCCTGTTTTCTTGG-----ACTAT---CTAAATCCCACCTAGA--------TTCAAACACCATCTCTGCAAATGGCAGACT s monDom4.chr2 8353515 450 + 541556283 TCACCTTCTGCAACATCTGGTCCCAAATGTCCCCAAAGTAGCCCTGATACTGCTCCAACGCTAGCTCATCCTCCAAGGTGACTGTGGAGACGGGGACCACACCAGCCGGGAAATCCAGGCAATTATAGAGTACAGTATAACTGACAGACCCTGAAACAGCCAAGAAGCATGGTCTG----------------CCAGGGGACCCTCTACACCTTCTTAGAGAAAG-----CTTGGTGTAGATGGGCAGAGAACAAAGACCAAAGTCTAAGAATTGGAGATGGATTCTCTGACCCTGAATTGAGCTCTGGAGGAAGGAAGAAGAACCAGCAAGTCTCTCT--TCCCCGCTCCTAGTCCAGAGGAAATCACACCAGCTGTGTGACCTGG--GCCAACCCCTTCTCTCTGAGCTCCCACTTTCTCCTCGACTTCACCCAGACCTGACTGCCCAAGCTTTACATcagcaattctcaaact a 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TTTGCCTAATCTGTCTGTCTCTCCTCTCCATTTGGCTACAGAGCGTGCCCTGCTGGAGGACCAAGTTCCTGGAGACCTTCTTCTGTCATGTGCTCCGAGGGACCCTGGACCCGGCATCCGACTGGCGCCTCCAGGACAGCCGCTTCTCAGCCCTCCTCCACAGCTCACCCTACGTCACCCAGCTCACTGTCTGCAATGCGCTGCAGGGGGTGCGAGAGCTGGTGGCCGAGGCCCAGCATGGGGCCCTGGAGACCCTGGCCCACTCCCTGCACACACTCAAGTTCCGGCATCTGCTCTTCTCTGATGGGACTGCCCACCGGGCACTTCGGAAGCTACTGCACCGGCTCATTCACCACGGGGCTATCCGGCAGGTGTCCATGTACTCCTGGCCTGTGCCCGAGACCACACTGTTCATCCTCATCCTCACTATGAGTGCGGGGCTTTGGCAGCCAGCTCCCTGCGATGGACCTTGCAGTTTGTGTGGGGAGGACACCCCGGGACGAGCCCCAGTCCGCCATGAGCCTGTCTCCCTCCTGAGGCCTGGCCAGCCATGCCGGAACTCTGCCGAGCGGTCAGCTGCCGCCCTGATGGCCACTCGATGGGAGAATGAGGCCAGG--GAGGCTCA--------------------GCAACAGGCCATGCTTGCGCAGGAGAGCCGGACACTGGGTGAAGCAAACCCCGAG-----------AGTCCCCTC-------------------------------GGTTCATCATCAGCCCCT------------------------CAGACTCTAGCCAGCTCAACCCTACAGCC------------------CCAGGAAGCTCCCAGGAGGAAAAGTCCCTGTACCCATCCCTGGCAGGGGCCTGGGACAGAGCCAGATGACCTCTATGACTTTATCTTCCTCATTGCCAGTGAAAaggaagaggaggaggaggaggagg-aggaagaggagcaggaggaggagaaggaggaggaagaagaggaggaagaggaagagaagAGACAGGGCCATCTGTCCTCTGGG-ATGTGGAAGCCTGGCTGCTGGGACCTTGCTTCTCTTGATGCTGCCCAGCGCTTCCGCAGTATCTCCACCTTGGACTTGTTCACCATTCCGCTGTCCACAGAGTCGACTCTTGTTCTGTGCCACCTACTGAGCTCCTGGGTGTCCCTGGAGAAGCTCACCCTCTCCTATAATGGTAAGGTGTTCCCT-----AGCAGGGCTCTGCTACTAG-TCACAACAA-ATTGAGCCTATC----AGTGCAGAGGCCCAGGAGGCAGGCAGAAA 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CCTCTCATACAGAAAACTGCCTCGAGCAGTTGGAAATGGGATTTCCACGAGGAGCCCAGCCAGCCCCACTGCTCTGCTCTGTCCTCAAGGCCTCAGGTTCTCTACAGCAGCTGTCACTGGACAGTGCCACCTTTGCCTCGCCTCAAGATTTTGGGCTTGTGTTGCAAACACTCAAAGGTA-------------GGAATGGTGAAAGTGGGTAGGTAGGGACCTAACATTGTTCCCTGGGAAAATTAAGCCCCACCACCCATGGTGTGTGTCT---CCTATCCAGAACACAACCTATCCCTGAAGAGGCTGAGCTTCCATGATATGAATCTTGCAGACTGTCAGAGTGAAGTGCTTTTTTTGCTAAAGAATCTGACCCTTCAAGGTAAG s monDom4.chr2 8440608 385 + 541556283 CCTTCCCTGCAGAGACCTGCCTGGAGCAGCTGGAACTGGGCTTTCCCCGCAAGCCACAGGCCAGCAAGTGCCTGTGCCAAGTCCTGGAGGCATCTCCTGCCTTGCAACAACTGGCCCTGGATAACGCCACCTTCACTTCTCCTCAGGAGCTAGGGCTGGTGCTGCAGACGCTGCGAGGTATCACCCCTTATCCGGGAGGGGGCAGATGGGGCGGCGGGGACC---CACTGGGGGCTGCCCCACTCAGGCCCATGGGCCGCTGGCTTCTTCCTCTGCCTCCCCAGAATGCAACCTAGTCTTGCAAAAGCTGAGTTTGCACGACATGAACCTCACCGACTGCCAGAAGGAGGTGCTCCTGCTGTTCCAGGACCCCACTCTTCGAGGTGAG a score=7581 s mm8.chr4 115593683 171 + 155029701 CCTGCTTCAGTCATCTGAATATTCTACTTTCTCTTGACAGAGATTACCTTCTCCTTCTGCCGTCTGTTTGAGAAGCGCCCAGTCCAATTTCTTCCTGAGATGGTTGCTGCTATGAAGGGCAACTCTACACTGAAGGGCCTTCGACTACCAGGGAACCGCCTGGGTAGGGAC s monDom4.chr2 8441178 170 + 541556283 CCAGATGCCATGGCCTGAGAGCACTGCGGTCTCCCG-CAGAGCTCACCTTGTCATTCTGCCGTCTGCTGGAGAAGCGCCGGACCCACTTTCTGCCCAAGCTGGTCACGGCCTTGAAGAGCAACTCAACCCTGAAGAGCTTCCGGCTGCCAGGGAACCGTCTCGGTGGGTAC a score=5221 s mm8.chr4 115594049 107 + 155029701 TGAGTGTTCCTCTCTCCCTCGCCAGGGAACGCTGGCCTATTAGCCCTAGCAGATGTTTTCTCAGAGGATTCTTCCTCTTCTCTCTGTCAGCTGGACATCAGGTATGC s monDom4.chr2 8441402 107 + 541556283 TGACCGGCCTCTTCTTCTTCCCCAGGGAGCTCGGGCCTCGTGGCGCTGGCTGAAATCTTCTCCAGTGATTCCTCCTCCACCCTCTGCCAGCTGGACATCAGGTATGC a score=11688 s mm8.chr4 115594235 259 + 155029701 TTCATGGCATCCCTACCAGTTCCAACTGCATCAAGCCAGATGGGCTTTTGGAGTTTGCCAAACGACTGGAGC------GCTGGGGCCGAGGAGCCTTTGGTCACCTACGCCTCTTCCAGAACTGGCTGGACCAGGATGCAGTCACAGCAAGAGAAGCAATCCGGCGACTCCGGGCTACCTGCCACGTGGTTAGCGACTCATGGGACTCAACCCAGGCCTTTGCAGATTATGTCAGCACCATGTGATGGGGCCCATACCTCACAGG s monDom4.chr2 8441570 265 + 541556283 CTCCTCCCTCCTGTCCCAGCTCCAACTGCATCAAGCCGGACGGGCTCCTAGAATTCTCCAAGCAGCTGGAGCAGAGCCGCTCAAACCGAGGGACCTTTGGCCACCTCTGCCTCTTCCAGAACTGGCTGGACCAGGACCCCAGCGTGACTCAGGAGGCCCTCGGCCGGCTGCGGACCACGTTCAGCGTGGTCAGCGACACGTGGGACTCATCCCAGGCCTTCGCCGACTACGTCAGTGTCATGTGATTGTGTGTGACCTTCCCCGG a score=9663 s mm8.chr4 115594741 580 + 155029701 GTCACTGAGGAAAACACCCCCTACCCCTGCTCTGG---GGTTTCCTGCTTCATTCCTCAAGCAGGCACCCAGGCTTTAGAGAAGTATAGGAATGCCTAACACCAGGCCTCTTCCCTCCTGGGCTTACCAATGTGTTCCCAGGCCTCAGTC--CCTTTCATGCCTTTATTCCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTAAACCAAAAAAGTTTTTCTTATAAAATAAATTTTGGGCAAACATCATGCAGCCCTTCTTGA-TGATTTTCTCCCAGA---GAATAAAACTGAGCAGAGCCTCATGAGGCAGAGAACCCC--CTTTCCCTGTA------------TCCTTTCCCAAAC----------AACTACATCCA---GACCAGCTGATTA----------------------TCAGTGAAGACCGCGCTGCTCCTCATGAGAACGCTGGTGGAAGACGAAGGTGATGGCTGTAGATGAAGCATCCCAGGCAGCCTGGAGTACCTCATCCTGGAGCCCTCGTTTATCTGTGCTGTGGTTCCACTGAGCCAGGTCTGAAGTGCAGTCAGAACCATCAGGGGGTGGCCAGACCTGACGGTTGTTTACACAACGGCGGCAATGCAATCTGGGGTCAGAGGACAGA s monDom4.chr2 8441843 600 + 541556283 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CCCAAGTAGGGCCGTTTCTCCCGACACGA------GAGCCGTGCGTGGGGACAACTAGGAGTAACGGGGCTGATTATGGCCTGGAGTCTGGCCGGAGGAAGGGCTTGGGGCCGAGATTCGGGGATCCTGGGATCTGGCCCTGCATCCACGCCAGTCAC-----------AAGACCCCATCCGGCCCCCCAGGACAGACCCGACAAGCTCTAGACGGGGAGTCGCGTCCAGACTCGGCTGACCGGAGGGGCCTGAG-------CCGGCGGGCCAGTCAGAGACGCCCGTCC-----CAGGCGAACTCGGCTCGGCTGGCTCCGGGACGTACCTCCGGAGGCGGCAGAGCTTCTCGAACAGGTCCAGGGTCTGCGTGTAGTTGGACACCAGGACAACCTTGTCGCTGCTGGTCTGTCGCGTCACAGCCAGGATGTAGTCCAGGACCAGCATCTTCCCTGCACAAAGACCCGAGTCGGGGCCCTTGCAGAGGTCCGAGCCCACAGCCCGCCTCAACCCCTTCCCGGGTCCCCGGGCCACTGGCCGGGCACAGGCTAGACCAGGAACGTCCGTGGGGCAAAAGCCGCCTCCT-TTTTCCCTCGCCCCAAGCAAGAGCCCGCCTGC a score=5714 s mm8.chr4 115597555 130 + 155029701 TGGGTGGGC--TCACCTGACAACTGTGGCTCTACAGCTTTAGAGTTATAACCAGGTGGGAAGATACCCAAAGTGCCCTCAAAGCCATCCTCCTCTGCCACACACTTGTCATAGATTAGAGCTGGATCTGAAA s monDom4.chr2 8444220 132 + 541556283 TGGGCCGGCACCCACCTGAGAGCTGCGGCTCCACCGACTTGCCGCTGTAGCCGGGCGGGAACAAGGCCAGCGCTCCGGCGAAGCCTTCCTCCTCCTCCACACACTTGTCGTAGATGAGGCCTGGGTCTGAGA a score=8127 s mm8.chr4 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AGCAAGTTCATACCTACAACAAACCACCTGCTCAATCTTCACGGGCAGATACTTAGAGAGGATATCAGATGTTCTCCGTATCAGGCACCTAGGGGAAATGGGAAAAGGCACAAGGGAGG s monDom4.chr2 8445706 109 + 541556283 AGCACATGCGTACCTGCAGCAGACCACCTGCTCGATCTTCACAGGTAGGTACTTGGAGAGGATGTCTGAGGTCCTCCGGATCAGACACCT----------GTGATGGGCAGCAGGGAGG a score=7211 s mm8.chr4 115599748 141 + 155029701 CGAGCCTCTCACCTGTTCACAATACCGATGAGCTCCCGCAGACGCTCCTCCCCACGCTGCCTGTCTGCCTCACTGGCAGCTGCATCTCGACTCTTCAAAATTGGCAACTCAAAATGCTTCTTGAATTCATGGGCAGTTCCT s monDom4.chr2 8446082 140 + 541556283 CGGGGCTCT-ACCTGTTGACGACGTTGACGAGCTCCTGGAGGCGCTCCTCGCCCTTCTGCCTGGCAGCTTCGCTCGCGTCTGCGTCTCGGCCCTTCAGGATGGGCAGCTCGAAGTGCTTCTTGAACTCCTGAGCCGTCCCT a score=10903 s mm8.chr4 115603684 167 + 155029701 CTTACCCAAAATGCCAGAATTTACAAAGTGCACCAAGCTGAAATACTCCAGCAAATCATTTTGGATGGGGGTCCCGGAGATTAGCACCCGCCGGCTGGTATTCAAGCTGTCCAGAGCCTGGTAAGTCTGATTCTCAGAGTTCTTTAGCCTGTGGCCCTGCAAGACAA s monDom4.chr2 8446722 165 + 541556283 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ggGGAAGGGGGACAGATCGAGGGAGA--------------TGAGAGGCCTG--------------------GAGCTGCTACAAGAATGTCACATCATCCTGACACTGTCCCCAGTACCAGTGAGCCCCATAGCTGAGGTCAGGACTGGCATCCTCAG---------------------GGACCTCCTCTCCAGGAGGCTTCCGCCCAG--ACTGGACCCCC----------AGTGCTGTGTCAGCCTCTGTCCAGAGCCTCTCCTCTGAGGCAGGAGCCTTTGCCCAGGCCATGCCAGGCCGAGGGTGTCGGGTGCCAGCTTCTGAGAGGCCCTCATCATCAGGCTCAGCCCCTGAGGCCAATGTGTCCAGGTAGCTGCCAATGGAGACACTGTCTAGTCGGTCAACAACAGCAGCTGTGGTGGAGGTGGGAGTGGGGTCAGGTAGGCTCTCCCAACTGCCCCGGTGGGAGCAGGGCTCCGGGCTGCCACCCGTCAGGCTGTACTGACTGCTGGTGAGGCTGCTGCAGCGGCTAGCCAGGGCTCCTCGTTCCTCCAGCAGCCACCGGACTGCCTCAATGCCCTCATTCACTGTGACCAACTGCTGTAATATCTTCACGTCAATAGCTCGAAGGTAAGCCTGGGGAGGGAGAGAAACAGGGCACTGTAGGTTGAGGCCAGG a score=9769 s mm8.chr4 115642146 447 + 155029701 CTCTTCTCCAGCCCAACTCCGGGAACCTGCCCCTGCCCC-----TACAAATATCCCGTTCCCCGTGGCCTGTAGCACCCA------------CACTCACCAGCTCCATCCTCAGCGCCATGATCTTGTCCCCTAGGCCGTGGC------CGGTGCTGGGCGCCCCCGGGAGCAGCACGTCCCCAGAGGTTCCCAGCTCGCACTCGCCTCGAAGCCCGCGGAGCAGTCCTTCAGGGATCTTCCTGCCCACCTTGCCCTCCACGTCTCGCAAGTCCGGCGTCTGGGACTCCGCGGTCCCCTCCATGTGGGCCCAA-----------------------------------GCCAGAACAGGACTGGGCGACCAGG--GTCCGGTTCCCAAGGGTCCTCCCTT---CTCTGCTACGAACGCGGAGCGAAACCCGTGGATccccg---cccgccccgcgcggggggTGGGGTGGGGGAACAGGAGGAGGGCGCCGTAACGCTCAGAAAAGCCGCGCA s monDom4.chr2 8478480 506 + 541556283 CTCCCATCCAGCAGAGCTCTA--ACCCTGGACCTGGGCTGGGGGTGGATTTAACCCTTTGGCCGAGGCCAATGAGAGCTAGGGGGAAGGGCTCACTCACCAGCTCCAGCCTCAGCGCCGTGACCTTGTCGCCGAGGCCGTGGCGGTGGCCGGTTTCTGGCGTCCCTTGGGGAGGCAGCAGCAGCGCGGAGACTGGCTCTCCCTCGCCTCGCAAACTGCGGAGCAGCCCTTCGGGAGTCTTTCGGCCCAGCTTGCCCTCCACATCCCTCAGATCGGGCGCTGGGTACTCCGGGGTCCCCTCCATGCGAGGGCAAGAGGGGCCCCCGGGACGCTTTAACTCCCCCTCCCTGCCCCCACGGGGCGGGGTCGCCCGGACGCCTAGCTCCGAA----CCTCCCTCAGGCTCTGCCTCCGCTGCCGAATGGAGCCC-TAGATCTTGGAGCCCAGTAAAGGTCCAGAGCTTAggggcggggccgggggcggggccTGAGCCCGCTGTGAGGGGCGGCTCA a score=4030 s mm8.chr4 115648096 1083 + 155029701 CAAAATAGTAGCGGAGCAGGTTTCTAATCCTCTCCTCCCCGGCCTGGAAACAGCCTTGCGGGGCTGGGCCA-GGCCTCG-----GAGCTGCAGCCCTCTGATCCTGGCTTGCCCAGTGAGCTGGCCCGAGGTCCCGGAATGC-CGCTTGCTCCGGCTCCGCGGTGCGGGGATGTGCTCTCGCC-CGAGGTCCACTCGTGCGGACCGTAACCCTGCCAGACAGGCAGAGTACGCCGGCTCCCCTCGCGCTGCAGAcgcccggccgcggccgccgccc---TAAGCGCCGCCCGCCGCC---CTCTCACCCCgcggcggcggcggcggcggaagcggcggggcgggccggc--cgggccggggcggggcgcgAGAGGCATGGAGGAGGCGGAggccgcggaggccgcggcgcgcggggccgagctg-tgcgggcccgagcgcggcccgagcggggcccggggccccTGAGCCGTAAGTGCCTCCCAGTGCGGGTCTCAGAGGGGTGATGCGGGCTGGGTGGGTCTTCTGAACCTTCCGGCGTCCCTGATCCCTGAGAGGAGAGGAGTTGAGCCAGATGGGAAGAGACGAGGGTGGAGGATTGGGGTGCAGGAGGTCGCTGTTACTGTTCTACCCCAGGGCTGGGAAGGACTGGGATTTGGACCTTTTAAGGACTGAT--GAATCGTTAAGAGTTGATTGAGTTACTGGCCTCCGCCGCTAAGGCCCTG-----ATCCTGCACACAGTTCCTCTAGCCCCAGGGAATTTTCAGGTGATCCAACTCCTCCAAAGATTTTCTGGCCagacccagagaagttaagccacgttgcctagggcacacagctcagcagtttgctgagAGAAGTCATTCCAGAAGGCATTAAGCTTTGGGACAAGCATCTTACTCTATGTGACTCTATATATAGTCCCCTCAGATTCCTGAAGTCATGGACTGGCCGGGACAGGGGTGACTCCCTAATCCAGTATGGATGACTGGAAGCCCAGTCCCCTCATCAAGCCCTTTGGGGCTAGGAAGAAACGGAGCTGGTACCTTACCTGGAAGTATAAACTGACAAACCAGCGGGCCCTGAGGAGATTCTGTCAGGTAA 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CTGTTTCTGCCGCTGTGTAGGTGCTCGAGGATGAAGCCCGGGAGCAGGGCCGAGGCATCCATGTCATAGTCCTCAACCAGGCCACGGTGAGCT-----TAAGGATGGGAGAGCCCGAGGGCCGAAGCTGGGCTT----GCTTTGCTGATGACCCCGTCTCATAAGAGGGTTTGCTCCTGCCAGGGCCACGTGATGGCAAAGCGCGTGTTTGACACATACTCTCCTCATGAGGATGAGGCCATGGTGCTGTTCCTCAACATGGTGGCCCCCGGCCGCGTGCTGATCTGCACGGTGAAGGTCAGTGAGGCC-CCCTAGCTCTGGCTCT s monDom4.chr2 8485162 313 + 541556283 CTGGTTCT-CAACCCCACAGGTCCTGGAAGATGAGGCTCGGGAGCAGGGAAGAGGCATCCATGTCATTGTTCTCAACCAGGCCACGGTGAGACCTGGCTCATGCTGGGGGA-TTGGGGCCCTGTAGCTGGGCGCTGGAGCCTCACT--TGGCTCCTCCCCAC-------TCAATTCCT--CAGGGCCATGTGATGGCAAAAAGGGTGTTTGACACATATTCCCCCCATGAAGATGAGGCCATGGTTCTCTTCCTCAACATGGTGGCCCCTGGACGGGTGATCATCTGTACCGTCAAGGTCAGTATGCCTGCCCTGTCCTTGGTTCT a score=27300 s mm8.chr4 115651406 1448 + 155029701 GAAACGTAGCCAG--TACTGAGTGAGGCCAGGTCTCCTGGGCCCACACAAGTCATGACTATCTGTTTTGGTCCTCCAGGATGAGGGTTCCTTCCACCTCAAGGACACAGCAAAGGCTCTGCTGAGGAGCCTGGGAAGTCAGGCAGGCCCTGCCCTTGGCTGGAGGGACACCTGGGCCTTCGTGGGACGAAAAGGAGGTGTGGGGACCAA---------GGCTGTCCACCCTGTAGTATCAA----------------------GGGAGGAGAAGAACGATAGGAGAGAGGATGCTGTGGGAAGG-----GAGTAGATTAGAGTCAATGAAAAGGGGCAAGGGTTGGGGGGAAGCCCC----ATTCTCGAGGC-------TGGGCCTTCATTGTCCCTCATTCCTGCCTTTGGCCAGGTCCTGTACTTGGCGAGAAACATTCTAAATCTCCTGCCCTCTCCTCCTGGGGTGACCCAGTCCTGCTGAAGACAGATGTGCCACTGAGCTCAGCTGAAGGTGGG--------------CTTAGTGTGGGTGGGGCTCGGGCAG---CGTTTGAGCAGAGAATGGACATTTGGATCCTCAATGAGGCTGG-----TTTTT----------------------CCTTGCCTGTGTGCTTGGGGCTTCCCCAACAT--------AGCT--------------------------------------------GGTAAGATTCCCGAATCCTGTTGACTTCC---TCCCTCAGAGGCTGAGTGTCACTGGGCAGATACGGAGTTGAACCGCCGCCGCAGGCGCTTCTGCAGCAAAGTGGAGGGCTACGGGAGCGTGTGCAGCTGCAAGGACCCGACGCCTATTGAGTTCAGCCCTGACCCAGTAAGTGG-------GGTCAGGGCAGTGA------GGTTCTGACTCCTTCCCAGCTTAGCAGAAGGCCTTAGGACCAGTCCACAACGTAGGTTTCCTCTGCCTTGATCTGGTAGGGGCTGAGGATGTGTGTATACTAAACTCTGAAG-ACAGGTTGGGGTT----GGGACAGACTGTG-------------TTTCCA------GGGCTGGGTAGACTGTGTGGAAAGACAAGAACAAGGAAGACCCTTGGCCCTTCACTATCTGCTC------------------------TGAGACCCTTCACTGCACTGAGAATTCGTCCC-------------------TAAATGGA-----GATCCTAG-----------TTGGAAGGGGGAA---TAAGGGAAGCTAAAAGCTGT---TTCTCAC----------------ACAGCTTCCAGACAATAAGGTCCTCAATGTGCCTGTGGCTGTCATTGCAGGGAACCGGCCCAATTACCTGTACAGGTGAGCCTGGAAGTGGGCG--GGACTCAGCA---CTGAACAGGGGGTGCTCAGGGAGTGGGTGGTGCTTTAGCTCGACTTCTTGTACGAGGAACTATTAAAGGAGGCAAAAAGGCAGCAGATGCTAAGCCTGTTCTACACAGAGCATATGGGCCTGTTTATAAACACGGGAGTTGTGAA-----------TTGAGAGGAGAAAGAGCCCTAATCTACTTTCCTGGGCTCCTCAGGATGCTGCGCTCTCTGCTCTCAGCCCAAGGGGTATCTCCACAGATGATAACGGTCTTCATTGATGGCTACTATGAGGTGAGTGCGGCTGGGG s monDom4.chr2 8485519 1665 + 541556283 GGGAAGGAGCCAGGGTATGGGAACGGGCC--GTCTCTGAGGCTCAGGGGGCTCATGCCAGACCCATTCTGACCCCTAGGACGAGGGCTCATTTCATCTTAAAGATACAGCAAAGGCCCTCCTTCGGAGCCTGGGCAGCCAAGCAGGCCCGATGCTGGGCTGGCGGGATACGTGGGCCTTTGTCAGCCGAAAGGGAGGTA-AGACACCAGCTTCTGCCTTACTGCCCCTCCCCTCTCACCCACCCGAGGACTGGCCTGGGGCCTGGGGGGGAGGGGGAGGGAGGGCAGCTGAGGCTGCAGAGAAGCCTTGGGAGAGGCCAGAA-CAGGGCAAGGGGGACCAGTCAGGAAGGAGGATCCTAGAGTGCCTAAGGCCAAGAGTTGGGTCTT--TTTCCTCACATTCCCTGCATCAACTAGGTGCTGTCCTTGGTGAGAAACACTCTAAATCGCCTACTCTGTCTTCATGGGGGGAACCCATCCTGCTGAAGACAGACATCCCACTGAGTTCGGCTGAAGGTGGGGAATGGCAGGAGCCAGCTGGGTGGCTGTGGCTGGGATTGGGATGTTGGAAGCTGGAAGAGAAAGTTTGA-CATCCATGGGGCTAGAAGCATTCCTGGAACCCCAAACTTACTGGATACCTGGACTGAGCCCCAGGGGGTGTTGGGACCTGGGGATAGAGCTCTGGAGGCTGGAGAGTTCCTGCCCTCTGGCCTGAGGGATGGGAAGGGGAGATGCCCCAGACCAAATGCCTTCCATGCCCCTCAGAGGCAGAATGTCACTGGGCAGACACTGAGCTGAACCGACGTCGAAAACGCTTCTGCAGCAAAGTAGAGGGTTATGGGAGTGTGTGCAGCTGTGGGGACCCTACCCCCATTGAGTTCAACCCTGACCCGGTGAGTGGGCAGAGAGCCCGGGGAAGGGATCCGGGGGGAAGGAGTTCT------CTCAGGAGATGGAAGCTGAGCCAA-----------------ATCTTGCTTGTTCAGGGAGGAG--GGAGAGGGAGATGGACTTGGGCTGGAGGAACAGACCAAGGCCATCAAGGACAAACAGGGAGACAAGTACAAATCTACAGTGGTGGGTCTGGGTCCTCCTTGTGGACATCCCCTCCAACAGTGTAGTCTCACCCCTTCTATGCCTACCCATCCTGGTTCACAAGGCCCTCCCATAAGCCTCACCTCTGAAATAAGAATAATTCCCAGGTCATACTCAAAGTTCATACAAGGCTCCCTGATCCTGGAGCCTTTTCCTTTGGGGAGGAGAGGCCTCAGTGGGGCTGAGTTCTGTTCATTCTTACTTCCCCCCATCCCCTAACAGCTCCCCAACAATAAGGTTGCCAATGTGCCTGTGGCAGTCATTGCAGGAAACCGGCCTAACTACCTGTACAGGTGAGCCCAGAGGAGGGAGATGGGCTCACCCCCTCTGAAAAGGGAA-GCCCAGGGGGAGG-----------GCTGGCCCTCCT-------CACCTATACAGGTGAGCTCCAA--CCACAGCTCT----CCTGATCTGGGTAGAGCCTCAGGGAGGAGATGGAAGCACTGGTGATCTAGAAATGTGTTTTGTGGAGTGCTGACATCGCT----TCCCATTACCTGGTTCTCCTAGGATGCTGCGTTCTCTCCTCTCTGCTCAGGGTGTGAACCCCCACATGATAACGGTCTTCATCGATGGCTACTATGAGGTAG----GGTTGGGG 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GCCAACTAGGTAGAGCCAGTAATTGATGCTAGATTGGACATGAGGTCCTCTTGGAGGTTGGGGTCGGAGGCAATGAGTGGACAGGACTGCTCAATAGACTGACTGGCCTCTTCCACCCCCCAGGAGCCCATGGATGTGGTGGCCCTGTTTGGTTTGAAGGGAATCCAGCACACACCCATCAGCATCAAGAATGCCCGAGTGTCCCAGGTACTGATTGAGACAGAGGTAGGGTAAGGGAGGGGCAGAGGCCAGGCACC-------TACTCAGGGCCTTCTTGCCTTCCTTTCCACCCAGCACTATAAAGCCAGCCTCACCGCCACCTTCAACCTCTACCCTGTGAGTAT-----GGACAGCTCCCAG-----------GAAGGGAGGGGAGAGTACCCCTGAGTTCCTGACTGGA------------------AATAGTAGGCTGCTTGTTGCCTGGG-ACCAGG---------GGATGCCAGGAATGAGAGTCACCTTTCAGGCTCTGCCAACCCCTTGCATCTCCCATCCTGTCCC--CAGGAGGCAAAGTTTGCTGTGGTCCTGGAAGAAGACTTGGACATTGCTGTTGATTTCTTCAGGTGA a score=12841 s mm8.chr4 115653621 327 + 155029701 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ctcaagttcagggccctGTGTGTCCCATCTAGGAAGTAGGCCCTGTTTCGGCCTTAACTTTTTTTTACCCCAATGCAGTGAGGCCGAGGTTTTGGACCACAGCAAGGACCCTTGTGAAGACTCCTTCCTGCCAGACACGGAGGGCCACACCTATGTGGCGTTTATCCGAATGGAGACAGATGATGACTTCGCCACCTGGACTCAGCTTGCCAAGGTGCCTCAGGCTGCACCTCCCTCAGTAGCGCCCGCATCAACATGCGCTG--CCCCTGCTATGCTAGCAAGAGTCTTTGTTAGAG---AGCTTTCAACCTCAGAACCTTCTCCTACACTCTTACTTCTCTCATCTCACTTCCTGgccaggtatagtgcgggcctttcatgcagcactcgggaggcagaggcaggcaga-----tctctgattcaagggccag-----------ccttggtctacagagtgagttccagaatagcctatgattacac-------agaaaaaccctgtctcaaaaaaacaaaGAAGAGAACCTCTCTTTTAAGCCCTTGCTCAAATCCGT-----ACTCCAGATAATGCTTCCTCTTGA-AGGGTGAGGCT---CCGCAAGGCCTTCAGAGAATC-----------ATCTCCACGGCTTCTTGACCATCTCTTTCTCCTACTCTATCCCT--------------------GCTAGTGCCTCCATATTTGGGACCTGGA-----------------------------TGTTCGTGGCAACC--ACCGGGGCCTGTG-GAGATTATTTCGGAAG-AAGAACCACTTTTTGGTGGT----GGGGGTCCCAGCCTCCC-------CTTACTCGTGAGTCA------------CCCCGTTCTGCCCTAGGAAATGGCCTTCTG---------GGTCTGAAGC----ATGTCCT----CTCCTCTGTACC--GTTCA-TCTGTTATGTTTCAGAGTGAAGAAGCCACCATCAGTCACCCCTATTTTCCTGGAGCCACCCCCAAAGGAAGAAGGAG------CCCCAGGGGCTGCTGAACAAACGTGAAGCCTCCTCCAGGACTCTGCAGGGCTGGGTACTGTG-TACCCCCAGACAGGCTAGCCCGTTGCCCTACCCTGTAGGATTTAGTAGATGCTGGTAGGGGTAGGGCTGGTTTGTTTTTAACATGGAATTTAATTACTAACTCC-------------AAGGGGAAGGATCCCCTGCCCCAACACC--------CCTATTCCTGAGTTTAAGGTCTATTTATTTACTTCCTTGTCAAAGAAGAGCAGGAGAGTTCCCAGGACCTCTTTGGGATCCCTGGGTAGC------TGATCCACTCTTTTCATACCCTGTCCTCCCAGGCCTGG--------------CTCA-------------------------GAACCTATTTATTGACTGTCCTGGGGGCCTTGGGAATAGGCCCAACCCGGGGCCTTTATTCCTCTCTGGAC--CAGGATGCTGCC----------------CTGAGGGTGGGACTGGCTCA------------------TACTCAGGAAAACTGTTGTGCCCAACTGATGG---ACAGGCCCATA----TGGGGTC-----CATGTGCTGACAGACTCACA--CAGAGACCTTTAGACACTGGACCAGGTCTCCTCTTAGCCT----TCTCTTTGTCCAGATTTCCAAAACTGGATAAA--GATGGTC-ATTGATTAAAAAAGAAGAAAACCTCTGGGGGTGTA---TTTTGTAATAGTTTTGTGGGGAGTATGGCGTGGTGGTGAGGG 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score=4349 s mm8.chr4 115661788 109 + 155029701 CTTACCTCTTCCATTGTAGTGTTCCATACTTGGGTGAAATCAGTCTGGTAACCATAGTCTTTTTCGATAGCAGGCACCACCAGGAGTGTCAGGAATTGTTCAGCCTGGA s monDom4.chr2 8502821 109 + 541556283 CTTACCCCGTTCATGGTGCTGTTCCATATCTGGGTGATGTCTGATTGTTTGCCGTAGTCCTTCTTGATCACAGGCACAACCAGCGTCCCGAGCAGGTTCTCGGCCTGGA a score=5026 s mm8.chr4 115661961 117 + 155029701 CCAGTTTTTCTCCCTTTG--------CCCCATCCCAGTG-CCTCACCAATGTGGTGTACACCAAAGCAACCACAGCACCTGCAATCTCAGCGATGAAGATGATGAGGAGGATGGAAAAGAACTGAG s monDom4.chr2 8503207 126 + 541556283 CCCTTTCTGCTCCTTTCGGAGCCACCCGCCCTCCCACCGGACTCACCATGGTGGTGTAGACCAGGGCCACCACCGCGGCAGCTATCTCGGCGATGAATATTATCAGGAGGATGGAGAAGAACTGGG a score=10311 s mm8.chr4 115662132 337 + 155029701 GGGTTCCCCACAGTGAGGCTCCCACAATCCCGAGGAGAGTTTTGGGATCCCAGAGGCTGGTGTCAGGGATGAAGGGGAAACCCTTGGTTGTGGGCCTGGGGAGCTGAATCCAACACACCATCATGAGCACACACTTGTTCTCAGAGTGAGCACCATAGCAGCCCAGGAAACCAAGAATGAAGAGCACAGCACCAGCGGCGATGAGGAAGTAGCCCACGTTGACAAACTGCATGGCACTGGATGATAGTGATCCGAAGACCTTCAGGAAAGATGTCCCATCGACGGACACCCAGATTCCCACAGCCAACAGGGCTGCACCACAGAGCTGAGGACAGAA s monDom4.chr2 8503373 280 + 541556283 GGGCTCCCTGCAG----GCCAGCAGCCTCCCG------GCCCTGCCCTCCCC--------------------------------------CGGGCCTGGGGGTC---------CCTACCGTCAACAGCAGGCATTTACTCTCCTTCTGGGCCCCGTAGCATCCCAGGAAGCCGAGCACCAGCAGGGCACAGCCCGCCGCGATCAGGAAGTATCCCACGTTGACAAACTGCATGGCGCTGGCCGACACGGGGCCGAAGATCTTCAGGAAGGAGGGGCCGTCCACAGACACCCAGATTCCCACTCCCAGCAGGGCGGCGCCGCAGAGCTGGGGGCAGAA a score=3963 s mm8.chr4 115664919 125 + 155029701 CCCACAACCACCAT-ACTTACAAAGATGAGTAGATTGAAGAGGAACATCATGACCTTAATGAATTTGAAGCACTGCATGGTGTGTCCTGGGAA-ACAGACATGCACA-AATTAGGG-------CCTTACCTCCCA s monDom4.chr2 8507725 135 + 541556283 CCCACAGCCCTCAGGACTTACGAAGATGAGAAAGTTGAAGATGATCATGATGACCTTCAGGAAGCTAAAACAGCTCATCTTGGCTCCTGGGGGCAAAGCCAGGGACACAGTCAGGGGGGCGACCCTTCCTTCCCA a score=7958 s mm8.chr4 115698477 188 + 155029701 TTGCCAGTCTTTAAGGTCTACCAGGCCAGGCCCTTCTCGGCCTTTGCTCTGCTTTTCCCTTGTTT-----CTTTTCTCTCTTGGCCTTCAGTCTTTTTCTTTGCCTCTGGTTCATCCACACTGGGTCCTGGCCATGCTGGTCTAGAAGAGTCTTTCTGTTTCTCTTAATTTCAGTTTCCATTTTCATGTCATC s monDom4.chr8 280065009 191 - 308469712 TTTCAAGGCCTTTAAGACTACCAGGCCAAACCCTTTGCCGCTTTTGCT--GCCTTCACTTTGTTTTTCCCCTTTCCCCGTTTTGCCTTTAATTTCTTCCTTTGCCTTGGATGCATCCAAACAGGGTACTGTCCATGTTCATCTAAAAGACTCTTCTTGTTTCTTTTATTATCCACTTCCATTTTTGATTCACC a score=10508 s mm8.chr4 115698688 216 + 155029701 GCCCTTCCTCACACTGCATTTTCTCCTGTAGAGGTTT--GGCTACCACCACGGTTGCTATCTCCTCAACGTCTTTCATTAGAGCATCCCCGTCCACTCTGAGGATACTCTTCAGTCTGTTGAGCTCCCTTGGCGCATTCTTCTTTCTCTTCTCGGCCCGCATCTTCCTCTTCCACTTACTCCGCAGGCTTTTAGCCATGCTTCACCTGAGAGACACAA s monDom4.chr8 280066210 217 - 308469712 GTCTTTGTCCACATTATCTGTTTTCTCTTTGATTTTTCCAGGTGCCACCACAGTTGCAATCTCTTTTACTTCTTCCATTAGAACATCCCCATCTATTTTCAGGATGCTTTTTAGACGACTAAGTTCCTTCGGTGCATTCTTCTTTCTCTTTTCTGCCCGCATCTTCCTTTTCCACTTGCTCCGTAAGCTTTTTGCCAT-TTTTACCTAAAAATAACAA a score=14945 s mm8.chr4 115715089 804 + 155029701 GGGAAAAGGTACGTTTCCATTTTGCCAAGCTTTAAAAAAAAATTTGTGTTCAGATGGTACCTTTAATCATGAAGAACTTTTGGCTGAGTTCCAGGCAGAGTCTGCTGGCACAGAGAACTCTGAGATCATCCACTATATTCAGAACACAGAAGAAAAGTCTCATCCATTTCTGAAAT-----------ATAGGGAAGGGGAGAATG--------------GAGCATATTTGAACAGCTT-------TGTAATAAAGCAATACCAGGGTTTTAAGTAG-GAAGTGCATCCTATCTATTTGGAATTCAGAAAGGTACTATTCTAACT-ATTAAGTGGCATTGTTTTTTATTCTTAGAGCTTCAAAATAAATTAAGTAGCTTGCATAAATCCAAAAGCAATCTCCAAGCTCAAATATATAAATGAAGGCAGATAGAGTTTGTGATTTACCTAAGGTTAATTTAAAGTAAAGAAAGAGTCAAaagaaggaggggaggaagaag-----aggaggaggaagaagaagaggaagaagaggaagaagaagaagaggaggaggaggaggagaaggagaagaa----------------------gaagaagaagagaagaagaagaagaagaagaggaggaggaggaggaagaggagg---------aggaggaggagaaggaagaagaaAGCACCTCCCAAAGCAGCAGG-TTGTGACCCAGAAGTTTGAGCTCTGAAAGCTGAATTTAATCCACAGTCAGGCCAAATATAATCCTGCAGTATGGAAGTGGTCCAGAACACCAGAGCTAACATTTTTTTTTAACCTTTGCCAAAGA-GCCAAAGGCAGTTAAATGCCATG-AATCAGAACCTTGAttctgtttct s monDom4.chr2 8633207 837 + 541556283 GGTATGATATGCATTTCTAGCTGGTAAATCTTAACCATGAACCAT---TTTAAATGGCACTTTTCTTCATCAAACCCTTCTGGCCGCTTAGGGGGCA-----------TTCAGAGAGC-ATGAGGTAATGTAGTA------GCACCAAGAAGGACACCCCCAACCATCTCTGAAGGTAAGCAAGCCACTGGGGGAAGTGAGGGTGAGAGTAGGAAGGGAGGGAATATCTCAATTGCTTAACTTTTTGCAGAAAGCCCAGATAATAGGCCAAGCCAGTAAAGGGCAGTCCATCCCTGTGGAATT--AAAGGATGATGCTATAACTCATTCTCTGGACTTAAGTTGCATTTAAAAAA----AAAAAACTTTTAGAGGGCTGTGTGG--TCAATAGCAATATTA----TCTGATGGATAAATAAAGGCAGATGTAGAGGAAGA---AAGGAGGTgagagaaagagaagaaaaagagacaagaaaagaaaaagtgagagaaggaaggaggaaaagaaagagggagagggagaaaggaaagaaagaaaggaggggagggagagaaagagagaaaaggaaaaagacaggaagagagagaaggaaggagaaaaagagagaaagagggagagggagagaGGAAAGAAAGAAAGGAGGGTAGTAGAGAGGGGGAAGGGAGGGAATTGAGAGGCAGCTTCTAAAGTACCAGCCTTGTGACCCAGGACTTGGCACTCAGGGCGCTGAATTTGCTCCACGCCCAGGCCAAATATAATTCCCCAGTATGGAGGGGAGCCAGAACACCAGAGCTAACAGTCCCTC----CCTTTGCCAAAAATGCCTGGGGCTGCTTAGGGACAAGCAGTGAGAACCTCACTTTTATCTCT a score=3961 s mm8.chr4 115718076 278 + 155029701 GTTGTCAACTCAAACACAATGGGCTTTGTTACTCCAGTGTAAAGAGGAA--ACAGCCGTTTTGGCCTCCTCAGACTGTATTGTATGGCAGG-----ATGGCAATTCTAGGCACAGGTTA---GCTATTCAGGGTTCCCCAGCAAGTTAATTAGCTGTTTCTGAAATGCATGAAAATGTTCAGCATTTTTTCTGAAGCAAGTCTCAGAACTTTAAGCTTGGAAGGAGGGACCTGTGTGTTAGGAAGTGG--GAAACAGAAAAGCGCCTTTTTGGTAGGGGAATGCAACACC s monDom4.chr2 8635637 263 + 541556283 GCTGCCAACAGGAGCACAATGGGCTTTGTTACTCCTGGGGAAAGAGGAAATATAGTCGTTCTCGCCTCCTCGCACGGTATTGTCCTGGGGGCCCCAGTCGCAGTTCCGGACACGGTACACATGCTATACGCGAGGGCCTTGC---CTTGCTGGCCGTTC----------TAATTGTGCTC----CTGCTTCTGGGCC--GCCCCAGATCATTGAGTCTGGGAGACTTGGGC-GTGCTTGGAGAAGTGGCTGGAGCAAGGTGGCG-------GGCAAGGGCCCGAGATACC a score=3451 s mm8.chr4 115719507 88 + 155029701 GGGGGGAGGGCGGGGGAGGAGGTC-------------------CCCTCAGCGCAGTTAAAATGAAACTCTAGTGGTTGGAGCCAGGGCAGAGCGTGAGG--GGAGCCGG s monDom4.chr2 8637806 109 + 541556283 GGGAGGAGGGAGGGCGGCCAGTCCACTCCCCCTTTTTTCCCCTCCCTCCGCGCAGTTAAAATGAAACTCTAGTGGCCGGAGCCCGAGCCGGAGCTGGGACTGCAGCCGG a score=4652 s mm8.chr4 115720218 138 + 155029701 CGACCTGCCCCTGACAGC--GCGATGTACAATACGGTGTGGAGTATGGACCGCGATGACG------------------------------------------CAGACTGGAGGGAGGTGATGATGCCCTATTCGACAGAACTGATATTTTATATTGAAATGGATCCTCCAGGTATTTGAGAG s monDom4.chr2 8637975 182 + 541556283 CGATCAGCCCCCGCGGGACAGCGATGTACACGCCACCGTGGGGCATGGAGCGCGAGGACGGCGGGGAAGGCGAAGGCGAAGGTGGTGAGGGCGGCGAAAGCGAAGACTGGAGGGACGTGACCATGCCCTACTCCACTGAGCTCATCTTCTACATCGAGATGGACCCCCCAGGTGCGGGGGAG a score=10950 s mm8.chr4 115768712 192 + 155029701 TTCACAGGAAGGGAGGAAATAATAAATTAATAAAGATCTATCATCGGGATGGTAAATATGGCTTCTCTGAGCCCCTGACGTTTACTTCTGTGGTGGAGCTTATTAACCACTACCACCACGAGTCTCTCGCTCAGTACAATCCCAAACTCGACGTGAAGCTGACGTACCCAGTATCCAGATTCCAACAGGTAC s monDom4.chr2 8674042 192 + 541556283 TTTGCAGGAAGGGGGGCAACAACAAGCTGATCAAGATCTACCACCGGGACGGCAAGTACGGCTTCTCGGACCCGCTGACCTTCTCGTCTGTGGTGGAGCTGATCAACCACTACCGGCACGAGTCGCTGGCCCAGTACAACCCCAAGCTCGACGTGAAGCTGCTCTACCCCATCTCGCGCTACCAGCAGGGAC a score=206 s mm8.chr4 115768910 72 + 155029701 AGGGGTTCTTGTGGGATTAGTTCATATAATTTTATTCTATTAGGCTTATTGGTTTATATTTATTGACCTAAT s monDom4.chr3 34222760 60 + 526135210 AATGGCTC------------CACTTATGATTACATTTTGACAAGATAACTTCATTACTTACAATTACTTAAT a score=269 s mm8.chr4 115770525 119 + 155029701 CTTTATAAAATCAAAGCATTTTTTGGGTGCTTGCTATCCAAA-----CAGGACTTCTAAAGTTG-AAATATAATTTAAATGTAAATAGACCTGGAAAAACATGTCAGAATTAATAACATTGCTTC s monDom4.chr3 34222912 115 + 526135210 CTTCTTAAAAAAAAACC--TGTATAGTTGTTTTTTTTTAATAAGGGCCAGATTTTCTTAAGTGATGACTATAATTTTAAATTTAATGCAC-------AAAATATTA-ACTTAATTTAAAAGTTTC a score=7321 s mm8.chr4 115770644 250 + 155029701 ATTTTTATTTTCTTCTGTCTGTGT-----AGGATCAGTTGGTAAAAGAAGATAACATTGATGCAGTAGGTAAAAATCTGCAGGAGTTCCACTCTCAGTATCAGGAGAAGAGCAAAGAGTATGACAGGCTGTATGAAGAGTACACAAGGACATCACAGGTGAGGGAGACCCTGCCTTTAGGAAGAAAAGGAAGCTCGAGGGAGCTTGCTCCAG--ATGATCTTTGCAGGATCATGGTTGGCAGATGTTGAACAGTTGG s monDom4.chr2 8674767 242 + 541556283 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GTTGAGGGTAAAGCAATGGAGAGACTAATT--TAGGGAAACTCTGGCCACTCTTCTAGAGACTGGAAAAATAAGCGGTTCCTGGTCTTTCAAAGGGTTCAACTTACTTACCTTGTTCAAGCAGTTGAATTCTGACTGTGTCTTCTCTCT--TGGCAGATGGCTCAATCACAGAGGAGTGAGGCAGAGGCGCCTGAATGCCTGGCTGGGGATCAAGAATGAGGACTCAGATGAGTAAGT s monDom4.chr3 34224817 213 + 526135210 GTTGAGG--AAGACAAGGGACCAA-TACTTGATGTGAGAGCTTTGGCT-------TAACAGCTGACGAAGGGAGCGGCTGCGGGGGATTC-----GTTCTCTGTGATTATAGCGT----GACCTTGATTTTTAATTGTGGTTTGCTTTAAACTGTAGGTGGTTGACTCAAAAAGGTGTCCGACAAAAGAAGTTGAATGAATGGCTGGGCAACGAAAATA------CGGAAGAGTAAGT a score=10672 s mm8.chr4 115790026 181 + 155029701 AGAAGCTATTTTATCAATGAGGAAGATGAGAACCTGCCGCATTATGATGAGAAAACCTGGTTTGTGGAGGATATCAACCGAGTACAAGCAGAGGACTTGCTTTATGGGAAACCAGATGGTGCATTCTTAATTCGTGAGAGTAGCAAGAAAGGATGTTACGCTTGTTCTGTGGTGTAAGTCT s monDom4.chr2 8678863 181 + 541556283 AGGACCTACTTTATGAAAGAAGAGGAGGAAAACCGGCCCCATAAAGACGAGAAGACGTGGTTTGTCGGGGATCTCAATCGGCTACAGGCCGAGGACCTGCTCCACGGGAAGCCCGACGGAGCCTTCTTAATTCGAGAGAGTAGCAAGAAAGGGTGCTACGCCTGCTCCGTGGTGTGAGTCT a score=14933 s mm8.chr4 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GAGGGACAGGACGGTTGGGCGGCCTGGGGGGGACGTCCACAGACTGGGCTGGGGCGGGCGCCGCAGCCCGGACCCAGGCCTCACGGCAGCCTCTCT-CTGGCTCACAGGGCGGACGGCGACGTCAAGCACTGCGTCATCTACAGCACGGCCCGGGGCTACGGCTTCGCCGAGCCCTACAACCTGTACGGCACCCTCAAGGAGCTCGTCCTGCACTACCAGCACACGTCCCTGGTCCAGCACAACGACTCGCTCAACGTGCGGCTGGCCCACCCCGTGTACGCACAGCTGCCCTCCCACTGCAGATAGACGCGCGCAGCGGCCGCTGCGCGGCCCGGAGGCGGGCGCCCTTCCGCGGTTCTGCCCCCAGGCCCGCGGTGGAGGCGAGGGCGCGGCGGCCGGGCCTTCTTTCTGCTCAGACTGCTTGTTTTGCACAAGAAGTGATTCTGTGAATGTGAAGCAGAGGGGCC-GGCGGCCGC-----------------GGGCTCAGGGCGCCT--CCTGCTGTTTGTTGTTCACACTGACGCGCT a score=5582 s mm8.chr4 115800634 207 + 155029701 TTTCCTTACAAATCCTCGCATGTAACTTTGGTACTTTGT--------TGTTTCTTGTGAAGAATCTATTCTGTTGTCTTTGATGTAAT-AAAAAAATTTCATGTAGTTTATGTAAAAA----------TAACTGACTCAGAAGGAAGCCAACTGTGTCTTGTGTTG--------GAACAATTCATA------------ATGTAATTTCTAGACCACTTTTGCAAA-TTGTTCTTGTCACCAAATGTG s monDom4.chr2 8681832 242 + 541556283 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CCAATGGAAAGAAGCAAACACAGGCCAAGATGGTTTCCAGGAGGGTGTATTACACAGGTGAATGTAAGGGAAGC----AAACAAGTGCTAGGTTTGCTTTAAGAGCTCATCTGATGTCAGTGCTAAGTCCTGATGATCTTGCTGGCCCCCAAGTTCTTGGCTTTTCCAGAGCAGGCTGGGCCGGGTTTCT--------GGGCTCAGGGGGTGGGCTCTGCATGGAATGTCCTGCCTCCTGTCGCCTGAGGAATCAGGCACTTCGGTGATGCTCAGGGATGGTTCTTCTTTCTCCATTTGTTCACATTCAGACTCCCATGGCCAGTTCTGGCTGGGGACCTCAAG-AAGCGGATGGGTCAGCCCAGGCACACTTGGT-------------GGCTGTGGCTTCTCCTCC--TCAGGAGACAGGTT-----CTTCAGAAGATTTGGGACCGTGGTATTCGTATCTTGGGAGTTAGCTGGTTCACCTTT--CCTTGTTATGGTCTTGTTCGTG--GATGCTCTGTCTGGACCCTCAATAAGGAATTTCCAGGACCATGTCCCTGGCTTTCCAGAGGTGGAGGTGGCAGCAGAACAACCGGTAGGGGTAAGTTCTGAAAAGCTGGGACAAAGTGCAGTTAGTGCCTGTGTGTGGAGGTGCTGGGCCTTCCAGCAGCCTTCAGAGGGGGTGGGGCTTGTGGG------------------TCCAGACCT------GCTCAGGCTAGGGACTTG-----TAAGGGG--TTGGTAGCTT-----CCTCAAAGGCTTGTGGCCTGCTGAGCTTCCTTGGGG----AGAGCCCAGGAACGTCTACTCGGGGGGAGCCT----AGTGTGGCCCCTGTCACTAGACCTGAGAGT-----------ACAGGGCCCTGCTTCTTTAGATCCCTGTGCAAGAAAGTGTCCTCTTCTGT-ACCCTCTCCTGAACCTTTAGGGAGTAGATTGTGGCTTGCTT-----------------------CTGG--------GTGGGGGGACAATCTTGGCTCCTGTGTGGCCTGGCTGTTCTCAGGCTCCTCATCA---GTGTCATCT------TCTGAGGAGTCTACTT s monDom4.chr2 8698508 1058 + 541556283 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ATCTACCTTCACTGCCCCCACCCATCAATCTTCCCAACACTTATAGATCTTCAAGGTTATGCTCAAAGAGCTTTAGAGTTGGCCTATGGGAAGCAGATGGCTC------AAGTTCATTCC---------AATTTCCCAAGGGATGGTTTCTGATTTGCAGGGGTACCCCTG------------------TACCTGAGTGCACAGCATCTGGGGCTACCCGGTATCCCTGAGGAGGAGATCTGGGAGAGAGGCTGTGGCTGTGT------------GTGGGAGAGCCTGGACCACTCTCCCCTGATGACAAGGAGCGGTTAAGGGAAGAAAGGCTGCGGCTGGTGTGGAGCAAGGAGGCCTGCTTTGTGATTTTCCGGAATAGGGAGCTTCTTTTTCGGCTGTAGAGATAAGGG-GACAGCATACTGTAGGC-------TTGATCAAATGT----------------------------GGGCATCTCAGGGTAGA--------------------------CCTCTGGACCAATTCTGTCTCACCTTTCTTGCCCATCCTTGCCTTTGCTCCGTTTGCTCCTTCGGGCCATCTTGGCTTTATAGCTGCCTTTCCTAGCTGGCCCCACTTTGATTGACGTGTTCTCCAAGGGAGTTGTTGAAATTGATACCTTGTTTCCACTCTAGGAAGCCAAG s monDom4.chr2 8700660 676 + 541556283 ACCCTCCCTCACCTCCTGCCCTGGGCATTGTCCCCCCCCCC-------CCCCAACTCCAGGCCCA----GCCTCATCCTGGACTCTGAAGAAGGAGAGAGCTCCAAAGCAGGGACATTCCTGGGCCTCGGCCTCCCTTGGGGCTGGTTCCC----TCCCGGGGCCCCTCTGGGAGAGGCCAGATCTAGGTACCTGAATGGGAGGCCTCAGGGGGCACTCCGTAACCCTGGGTGGGTGAACGGGGGGCCAGGCTGTGGCTGTGCCCGTAACCGTGAGTTGGGGAGCCCGGCCCGCTCTCTCCAGAGGACAGAGAGCGGCTGAGAGAAGACAAGCTGCGGCTCGTGTGGAGCAAGGACGCCTGCTTGGTGATCTTCCGGAACAAGGATCCCCTCTTCCTGCTGTCAAGAGAAGGGCTACAG--TGCTGCAGGCGTGTGTGTGGATCTGTTGTCTGTGCATCCGTGACTGGGGCAGTCCCAGGGGATGCCAGGCCAGGACTCGCCCCCCCCCCCCCGAGGGCCCCCTCAGGGCTGG-CCTCACTCACCTCTCGGGTCCATCCTTGGCCCGGCTCTTCCTGTTCCTTCGGGCCATCTTGGACCTGTAGCTGCCCTTGCGCGCGGGGCCCACCCGGATGGAAGTGTTCTCAAAGGGTGTCGTTGAGATGGACACCTTGTTTCCGCTCTGCGGGGCACAG a score=-3631 s mm8.chr4 115807047 307 + 155029701 TCTTAC-----TCTTCCCCGCATCTTAACTTAAACCTTTGGATGTTCCATACCAACATGTAAACTAATCAAAGGCTGTTTT--------------CCCTCACAGGATAGGAAATGCTCCAAGTGGCACTCCAGAGGAGTTTAGGAACGGGCAAGACAGCAGTACCTCTCCTGTCCTGACATCAGTCTTACTTGCAGTTTAGAACGGTCTGGGGTTTGGCCAGCAGATGAGGTTAATTACCATA-----TGGAGAAAAACCTCCTGTATTGCACATTCAAATCCTGCATGTCCCTACATCTATCCTTAATGCTACATGTACGCGTACCCGAT s monDom4.chr3 447555452 290 + 526135210 TCCCACGGCTGTCCTTCCCCCATCCTGAGCTGCGCTGGCGCTGGGCCCCTACCTCTCTTGACCCTCCTTTGCTGCTGGCCTCTTGTTCCTCCGGGCCATCTTGGCCTTGTAGCTGCTGCGCCTGGCGGGCCCGATGCGGATGGACGTGTTCTCAAAAGGTGT--------CGTCGTTACGGCCACTTTGTTCCCGCTCTGGAAGCCCCCG----------AGCAAA-AAGGTCACCCCTGACAGTCCTTTGGAAATGTCCTGCTCCAGGGCCCCTCCCCGTCGGG----------CACCTTTCCT------------TCCCCGCCCCAGCC a score=23753 s mm8.chr4 115807354 649 + 155029701 CCTCTCACTCCCCTTATGGCGAGTCCAGGC-----TCACAAGTCCAGGGCAGTCATACATCACACAGAAGCATTCTTAGCACTAACCTTCAGAACCAGCTCCACCACTTCTGTGTGGACTAGCCCATGCACAGGCTCACCATTGACATGGGTGATGAGGTCACCCTGACGAAGCCCTGCTTCACTGGCTGGACCACCATCCTCCACATGCTGCCTC-AGGAAGAGAAAAGCCTTTAATCGGGAGCCTGGTTCTGCTGCTGTTGTGACCCTT------GACTACCACCACCCTCT-----GGTTTCTGTGAGTTATGTGGGCAGTGACCAAAGAAAAGGCAGATAGGCTCTGGTAAGGGGAAGGTGGGAGTACACAGCTGGAGGACAACAACTCTGTCTGGCCAGACATACCCACACCATGTGGTGTACGGTGTAGACATCAGTGTCACCCATGTAGACTCGAATGGCCCGCAGGGTGAAGCCATACTTCTTGCCAGCTCGGTGGATGATGATGGGAGGCCTCAAGCTGCCAAGGGCTGGCAAGAAGTCCCTGCTTGGAGAAGAGTCCCTGGATGATGGATTGGATGACTGGGAATGTGGGGACATAGGGCTGGCCAATGGTGAGCAGGCATGGTGTTCTGGAGAAGCAGAAACCAAGACTTAATGA s monDom4.chr2 8702561 592 + 541556283 CCCTGCGCTACCCCCATCTCTAGCACAGCCAGCCCCCCCTAGCCCAGGG-AGCCCCGCTCC---------CTCCCCAGGTCCCTACCTTCAGGATCAGCTCCACCACCTCGGTGTGGACCAGCCCGTGCACAGGCTCGCCATTGACGTGGGTGATGAGATCACCCTCTCGCAGTCCTGCCTCGCTGGCTGGGCCTCCCTCCTCCACGTGCTGCCTCCAAGAAGAGAGCGGCCCT-------GAGCTCTGCCCAGCCTC-------ACCCTCCCAGGGGGCTCCCACACCGTTCTCTACGGCCACCGATGGATCTTGATGGTACTGAC------------------------------------TGGG--------GCCTGAGCCTCCCCACTCCCTCG---CGGACATACCCAAACCATGTGGTGCACTGTGTAGACGTCGGTGTCCCCCATGTAGACCCGGATGGCCCTCAGGGTGAAACCATACTTCTTGGCAGCTCGGTGGATAACGATAGGCGGCTTCAGGTTGCTGATGGCTGGAGAGAAGTCTCTGCTTGGGGACGAGTCCCGGGAGGAGGGGTTGGAAGACTGGGAGTGAGGGGACATCGGGCTGGCCAAGGGGGAGCATCCATGGTGGTCTGG---AGCAGAAACGGGGGTCCAGTAA a score=-274 s mm8.chr4 115808003 249 + 155029701 TCAGAGGTCTTCTTTGGTTT----ttttggtttttcaagacagggtttctctgtgtagccctggctgtcctcaaactcagaaatctgcctgtctcttcctcccaagtgctgggattaaaggcgtgcaccatcaGAGGTCTTAACAC-----------AGCCATGATCCTAGCTGGCCTAAGCTGTTGACCCCAACCCACTCCTAGTCCACTACAACCCTGCTTGCTCTCTGATGCCCGTGTGCGTACATCATAAACATCAACCT s monDom4.chr4 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ACCTACCGCTGATCACTTGGCCGAAGAGCTCCTCGGGAGTGTCCCCGAAGAAGGGCACGCAGCCCACGAGGAACTCATAAAGGATGACCCCAATGGACCACCTGTCCAGCGGCTTCCTGAAGCCCTCGCGCAGGATCACCTCCGGGGCGATATGCTCAAGGGTCCCGCGCAC--AAGCCGAGGGGGGCCA a score=246 s mm8.chr4 115810968 6 + 155029701 GGCTGC s monDom4.chr3 78348324 6 - 526135210 AGATGC a score=8962 s mm8.chr4 115811610 160 + 155029701 CCAGGCTTTCTTACCTGCTTGTCTAGGAACTCCCGGGCATCCTTTTCAATATGACCCTCATACAAGTTGGTTGTCAAACTCATGAGGCCGATTTTAGAAAGTCCAAAGTCAGTGAGTTTGATGTGTCCCATGGATGTAATCAGAAGGCTGTGGGACCACA s monDom4.chr3 78349795 160 - 526135210 CCATTTCTCCTCACCTGCTTGTCCACAAACTCCCGGGCGTCCTTCTCGATGTGCCCCTCATACAGATTGGTGGTCATACTCATCAGCCCGATCTTGGACAGCCCAAAGTCCGTTAGTTTGATATGGCCCAGGGATGTGATTAACAGGCTGTAACAGAACA a score=-107 s mm8.chr4 115811770 92 + 155029701 TAAATAAAATCATGGAGTAATTTCTCAGTTGTCCCTTAGTACTGATTTAGTACTAGCTTCTGCGTGGTACCAAGG---GACACAAGTGGGGAACA s monDom4.chr3 493387776 83 - 526135210 AGAACATACCC----AATAAATACCAAGAT--------AAGGTGACTTGGGTCTCATTTCTGGGTGGTCTCGCAGACTGGCAAAACTGAAGGGCA a score=172 s mm8.chr4 115812718 17 + 155029701 GAACTAGACAGTGGGCA s monDom4.chr3 493388930 17 - 526135210 GATCCATTCAAGGCACA a score=9810 s mm8.chr4 115812735 269 + 155029701 TACTTGTCAGGCTTGAGGTCACGGTGCACGATGCCGTAGTTGTGTAAGTATTCCAAAGCCAGCACAGTTTCCGCAAAGTACAGGCGTACCATGTCCACAGGTAGGGCCCCGATGTTCTTGAGCAGAGTGGCACAGTCTCCCCCTATAAAGAGCCCAGGCTATCATGAGAAAAAGCTATCATGATCCAGGACCCTGCTCCAGTCAGTTCTTAGGCTTTGTAGAACGTAAGGAAATAGCCTCACAGAACAGCCTGATGCTGGAGCCTGGGA s monDom4.chr3 78351429 237 - 526135210 TACTTGTCAGGCTTGAGGTCCCGGTGCACGATGCCGTAATTGTGAAGATACTCCAAAGCCAGGACAGTCTCTGCGAAGTACATCCGGGCCATGTCCACAGGGAGGGGGCCCATGTTCTTTAGCAGTGTGGCGCAGTCTCCGCCTGCA---AGACCAGGC-----------------ATTAGGGCTGAGTG------------AAGCACCCAGCCCTCACAGGGAAGGGAGGAAGGGCCCCAAAGGACAACCAGACTCTGGGGAAAGGGA a score=12562 s mm8.chr4 115813752 301 + 155029701 ACCTTCTACGTATTCCATCACCATGCATAAGTGACGCTTGGTCTCAAAGGAGCAGAACATGCTGACCACAAAGGGGTTTTCAGCGAAAGTCAGTATGTCGCGTTCCACAAATGCTTGCTGGATCTGGTTCCGTAGGATTAGGTTTTGCTTATTAATCTTCTTCATTGCAAAGCGCTGCCGCGTGGACTTGTGCCGCACCAGAAAGACAGCCCTG-GGAAAGACA------------------------------------GCCAGCCCAGCCCAGCCCCCAGATGCTCT----------CAGCACCTCAATTGTACATTCCATAACCCCAAGCTGCCTCACCATCCCA s monDom4.chr3 78352157 347 - 526135210 ACCTTCCACATATTCCATGACCATACAGAGGTGCCTCCGAGTCTCAAAGGAGCAGAACATACTGACGACAAAGGGGTTCTCGGCAAAGGTCAGGATGTCCCGCTCCACAAACACCTGCTGGATCTGGTTCCGGAGCACTAGGTTCTGCTTATTGATCTTCTTGATAGCAAAGCGCTGGCGGGTCTCTCGATGCCTGACCAGGTACACAGCCCTGCGGGGGGACATAGGGGGTGAACGAGATGATAATCTGTGTCCTGGGGGTCCTCCCGGCCCTGACATCCTGTGCCCTAAGGGTCCTCCGGCTCTGACATTCCACAGTCCCTTACCCC-AGCAGGCCCTCTATCCTA a score=4762 s mm8.chr4 115814318 325 + 155029701 CATACAATTTCAGA-----AGGAAGA----GAGCAAGGGCTGACTCTGCTCTATTCCTGGCCCCAATCTGACTCCATG------CCTTTACCCATAGGCGCCATTGCTGATGAGCTTAATGGTTTCAAAGTCCTCTTCAGAGGGGGTCTTCTGAGATGGCTGAGATACCCCACGACCCTAGAAGGCAAAGGAAAACGAAGGAAGCAGGCATGTTTTTCAGAGCACGTATGCTTGGGGAAGTTGTGCAGTCATAGTACCAGGCCTGCCCATTCTTTCCCAGGAACCCCACTTCCTACTGTTGGCAGC--ACGAACTCCCTATCCCTTTAGATGACCCCCCCAA s monDom4.chr2 8708586 298 + 541556283 CACCCAGCTCCAGACAGACAGGAAGGTCTCGGCCCAGGGCTGGCACAGACCTCTGGGGGGCATGAGAGTGAGGGCACAGACCGCTCCCTACCCGTAGGCACCATTGCTGATCAGCTTGATTGTCTCAAACTCCTCCTCAGAAGGCGTCTTCTTGGGCTGCAAAACAGGCCCGCGGCCCTGGGACACA-------------GAGGCCGGGAT--------------GGAGGCCTTGAGAGTCTGGGGAGCCAT----CCGGGCCTGCCCCCCCTCCCCCCCCAGCC----------CTGGTCAAAGCCAACCATCTCCCGGCCACT---GCTGACTCCCGCAA a score=4785 s mm8.chr4 115814894 87 + 155029701 CTCAGGATCTTTACCTCAACTGAATCATCTGTCTCTGGAGTATCTGGACTGTCATAGCTGCTCAACTGGGCCATTTCTAGAAACATG s monDom4.chr2 8710162 87 + 541556283 CTGAAGGTCATTACCTCGACCGAATCGTCGGTCTCGGGGGTGTCCGGGCTATCGTAGCTAGTCAGCTGGGCCATTTCTGGGGAGAGG a score=6991 s mm8.chr4 115815635 221 + 155029701 CTCACCCTCCAAGGGATCCCGAGTTAGGCCCAGCTGGCTAACGATGTAGCGGGGAATGTCACATTTAATTCCATGTCCCTCTTTGGCATGACCTTCAGCTGCTTCTAACAGGTGGTAAAATTCTTCAGGGTCAAACTCCTGTGCCAGAGAAAAGAGGTGGTCAGAGGAA---GAGATACGAGCAGGTGCTGTGGCCCTT---CTTGGCATTCAAGTACACATCAGAG s monDom4.chr3 78361565 225 - 526135210 CTTACCCTCTAGAGGGTCCTTGGTGAGGCCCAACTGACCAATGATGTATCGAGGAATGTCTGTCTTGATGCCCTGACCCACCCGGGCATGTCCTTCTGCTGCTTCCAGGAGGTGGTAGAACTCTTCTGGATCAAATTCCTG-GCAAACAGGGTGGGGAGAACAGCTGGAATGGAGCCCCAATCAAAAGCACTAATGCCTAAGCTCAGCA-GCAAGTGCCCGACAGAG a score=5751 s mm8.chr4 115817651 157 + 155029701 AGTCCCCACCTGCACATCCAACCTTTTATGCTGACTCACCAGGCATTCCAGGAGGCGAGCTGGGCGAGCAATGATGATCATCAACTTTTTTACCAGCTGTATCACAAAGGCTACATCTGAGCTTTCTGAGCGTTCGTGAGCCT-----------ACACAGAAGAGAAA s monDom4.chr3 78362992 163 - 526135210 AGCCTCCCCCT-----TCTTCCCTGAAGTGCGCACTCACCAGGCACTCCAGGAGCCGCGCCGGCCGGGAGATGACGATCAGGAGCTTCCGAACCAGCTGGCCGATGAAGGAGACCTCTTGGCTCTCTGAGCGCTCGTGGGCCTGTGGGGGTCACACACAGAAGAGGGA a score=12886 s mm8.chr4 115820177 252 + 155029701 CCTCGTCAAG-ACACTTACATCTTGCAGAAGCTTTTCCAAATTCTCTTGAAGTTCATAGAAATAGTGTGACGTAATGAGGCCACTCCGAGATTTATCCAGGCAGTCTCGGGCCATCTCAATCACCTGATGATGAATAAAGCTTAGTGCTCCATCTGCCAAGGGCAACACACTATCTGGAGTGTTAGAGGAAATGAAGTCAGCTAGTCGCTCTTCCATCTGTGCAGTGGCCTGGGAGGAAAAGAAAAGAAAAGA s monDom4.chr2 8712036 253 + 541556283 CCTGGCCTAGCGCGCTCACGTCTTGCAGAAGCTTCTCGAAGTTTTCCTGCAGCTCGTAGAAGTAGCGGGACGTGATGAGCCCGTCGCGGGACTTGTCCAGGCAGTCCCGGGCCAGCTCGATGACCTGGTGGTGGATGAAGCTCAGGGCCCCGTCCGCTAAGGGCAGCACATTCTCGGCGGCGTTCGAGGCGATACACTCCGCCAGCCGCTCCTCCATCTGCGCCGTGGCCTGGGGACCAAAGAGGAGCTCAGA a score=8383 s mm8.chr4 115823992 128 + 155029701 ACAAATCCTTACCTTGGGGAATCTTTCTTTGTACACATGATTCATCATTATTATTTCACTGTCAAAGGAAACTGGGGACCGTCCAGGACTGAAGAAGAAGAAAAGAATCATGTTATTTTAGTGCCAGG s monDom4.chr2 8714657 126 + 541556283 ACAGCCCCTTACCTTGGGGAATCTCTCTTTGTACACATGATTCATCATTATTATTTCACTGTCGAAGGAGATCGGGGAGCGGCCAGGGCTGAAAGAGAAGGAAGGAGTCA--CTGTTTTGCTGGCAGG a score=10287 s mm8.chr4 115825535 186 + 155029701 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CCCCATATCATCTCTTCAGCGACGTGGCCGATGTCACAGCTTTCCGAAGCAACTTGCTCAGCTGGTATGACCAAGAGAAGCGTGACCTCCCTTGGAGAAACTTGGTAAGTGGATGGGACAGA--------GACAGTGGAATGGGAAGTTAGCACTTCGCCCTTTTGACAGTAGTTTTCACCCTTGGTTTTATTGACAGGCAAAAGAAGAGGCCAACTCGGACAGGAGGGCCTATGCTGGTCAGTACAAAGGCTGCTTTGCCTGGAAGTCCTTGGGTTTAGGGGTTGTTCTTACGTTTGAGGGCTAAGAGCTTGGAGCCAGGGTACGTTAGCAGTCCTCTCACATTAATCCCCCTTCCCCAGTGTGGGTGTCAGAGGTTATGCTGCAGCAGACCCAGGTTGCCACAGTGATCGACTATTATACTCGATGGATGCAGGTGATGTTGGGGAGGGAGGGAGAGTTGACTAGACCCCAGAAAAGGCTTCCTCTATCACCCCCATTCTTGACCTTACTTCTTTTTTTTTGTTTGtttgttttttcgagacagggtttctctgtatagccctggctgccctggaactcactctgtagaccaggctggcctcaaactcagaaattcacctgcctctgcctcccaagt-gctgggatcaaaggtg--tgcgccaccacacctggctTTTGACCTTACTTCTTTTTGCCTGTCTTGGGTTTACAGAAGTGGCCAAAGCTTCAAGACCTGGCCAGCGCTTCCCTGGAGGTGAGGACCCCACCTTGGGTAGGGAAGATAGAAACAACTGAGAGAC-----AGACCACTGAACTTTGACCTCTGACCTCCATCTAGGAGGTGAACCAGCTCTGGTCTGGCCTGGGCTACTATTCTCGAGGCCGTCGGCTACAAGAAGGAGCTAGGAA-------------------------------------------------------GGTAAGTGGGTGGGT-------------GCACTGAAAAATAGCCCGGTGTCC---CCAGA-----------------------------TATCTTAAACTGTGAG----------------CTTCCTGCTCCATTAGGTGGTAGAGGAGCTAGGAGGCCATATGCCACGTACAGCAGAGACCCTACAGCAGCTCCTGCCTGGTGTGGGGCGGTACACGGCTGGAGCCATTGCTTCCATCGCCTTTGACCAGGTAA------ACCCATAGCCTGGCTA--TACTTAATGTGAGCGCCCCTT---------------------------------------------ACTCCAAGTCCAGTC--TGACCCCCAGGCTCCTCTTGTG-----CAGGTAACCGGTGTGGTGGATGGGAACGTTTTACGGGTGCTGTGCCGTGTCCGGGCCATTGGTGCCGATCCCACCAGCACCCTTGTCTCTCATCACCTCTGGTAGGGTAATGAGGT---GACGGGAAGTTGGAAAGGGTCTGTTTAAAGGGCCTTT---------------------------GCTTACAGAAGTGCTCCTTACTTTTAGGAACTTAGCCCAGCAGCTCGTGGACCCAGCCCGGCCTGGGGACTTCAATCAAGCTGCCATGGAGCTGGGGGCTACAGTGTGCACCCCACAGCGCCCTCTCTGCAGCCATTGCCCCGTGCAGAGTTTATGCCGGGCATACCAGAGGGTGAGCCTCCAGAGGA----------AGAGGTATTAGAGTGTCCTAGAGAGTGACCCTTGTGCTGTGACACCCTCTTCTGTGTCTCCCAGGTGCAGCGGGGTCA----------GCTCTCAGCCTTGCCAGGCCGTCC------------------TGACATAGAGGAGTGTGGTGAGCACCGGCCCTCACCCCATCCCTGTCCCTTTCAGAGA-----GGTCCCTTTTCAAGCCTGAGTATGATTCTGC----AGTGGGACTAAGCCTCCGCCTGGGCTTGGTACCTAAGGCCCCTTGGCCTGAGCAGGGCTGGGAATCTTTGTTTCCAGCTCTCAACA---CTAGACAGTGCCAGCTTTGCCTCACTTCCTCAAGCCCCTGGGACCCCAGCATGGGAGTGGCCAACTTTCCTCGAAAGGCCAGCCGCAGGCCTCCCAGGGAGGAGTACTCTGCCACCTGTGTTGTGGAGCAGCCCGGAGCCATCGGGGGTCCCCTGGTCCTCCTGGTGCAAAGGCCTGACTCAGGT-----------ACCCAGATATTGGGATGGAGGACAGTCA------TGAGCAACAGA---GGAGTTAGA------------ACAGGCAG------TAGAGGA------------------------GGCTGACTCCATATCTGGCTGCCATCAGGTCTGCT---------GGCAGGACTGTGG---------------------------GAGTTCCCATCTGTCACCTTGGAG---CCCTCAGAACAGCA------------------TCAGCACAAAGCCCTTCTGCAGGAACTGCAGCGCTGGTGTGGGCCCCTCCCTGCCATT----CGTCTCCAGCACCTTGGGGAGGTAGGTTAGCAAAGGTGACAGGGACGAGGGATTCTGGGT--TCACATTCACAGACCTGGTTCGGTCTCTTCCTCCTCCCCCCAGGTTATCCACATCTTCTCTCACATCAAACTGACGTATCAAGTATATAGTCTGGCTCTAGATCAAGCCCCAGCGAGCACTGCACCTCCTGGCGCTCGATGGCTGACCTGGGAGGAATTCTGCAATGCAGCTGTGTCTACTGCCATGAAAAAGGCACC 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CTCACCTGAGCACCAGCAGCCACTTGTCCTATTAGGTATGGGACCAGAACATCAGTGAGTATGCCAAGCAGCTTGTGACTGGCCTGTGGCCTTTGGTAGAGCCATCGTTTGGCCTGAGCCATGGTGCTTGAACTGCCGCCTTCAACCATGTATGTCATTAGGGTCCACTACAAAAAGATGAGGACGGCAGACACAGGATCCCTTGTCTATTCCAGACCTAGGAGCCTGACCTCTCCATGCTCCCATCCACACCCCTGGCCGCATTACCGGAGCACCAGCAAAGCCAATTAGTGGCACACGTCCGGCCAGCCGTTGTCGAGTAAGGGTGATGGCTTGGAACACATAGCCTAACTCTGAAGCCGCTGCTGCTGGATCCCGTAGACGCTCTAAGTCCCGCTCTTCTCTTAATGGCTCTGGAAAGCTGGGTCCTTTGCCAGGTACCATGGTCACCTCCATGCCCAATGCCT----TAAGGGGG s monDom4.chr2 9461951 379 + 541556283 CTTACCTGGGCCCCTGCGGCCACTTGGCCCACAAGGTAGGGGACGAGGACATCGGTCAGGAGACCCAGGAGGCGGTGGCTGGCCTCAGGCCACTGGTACAGCCAGCGCTTAGCCTGGGCCATGGTGTTCGAGCCACCCCCCTCCACCATGTAAGACATCAGTGTCCA----------------------------------------------------------------------------------------------------CGGGGCCCCAGCAAAGCCAATGAGGGGCACCCGCCCAGCCAGCTGGTGGCGGGTCAGGGTGATGGCCTGGAACACGTAGCCCAGCTCCTTGTCCACGTCCACGGGGGCCTGGAGGCGGTCCAGGTCCTGCTCTTCCCTTAGGGGTGATGGAAAGCTTGGCCCTTTTCCGGGTACCATAGCTACCTGCATGCCCATCGCCTGTGGGAAGGGGG a 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GCCCTCACCTGTAGAGTCAGTTCACAGCAAGCCTCGGGAGATCGGCAGGTGCTGAAGAAGTCCTGGGCAGCCCTGGTTTCCCTAAACTCTA--CAAGGGGAGATGGAG-GACAGGACTCAGCCACAAGGTCTTCC-------------------AAAGTTACTATCTTCTCCTATCTTCACCATCTAGAATTTCAGGTTTTATCTAGACCACAGCTT---TGCCCCTGACCTGGTAAGTAGCGGCCTGCCTGTCTCATGCACCAAACGGGAGTATAGTCTGTTTCCTCTCCCCAGGCTGCTCTCAGGAACGTGTCATTCTTCAGCTCCGGGAAATTCTGGAGTCTG---------GAGATCAGGTGAAAGGTACAGGTA--------GGAGTAAATGTCATTA-TGCTAGACTGGGATTCGGGGAGGGCACCGGTCCAGTCAGGCCGTTATCTGCCTACTCCAGACCAGCTTGCAAACCATGGCTCCCCGCCCACCGCCTCCCCTCTATCAAGTGGCGCACAAGCTCCCAGGAGGAGGGCCCCACTAGGGCCTCTTTCCTACACATTTGTCCACTTTCCCAAACTCAAAGAAACTGGAGGGACTAGAGAAGTGGAATGAAGATCCAGTAAGGGGATTAGGGGAAAGGAGTTAATTTGGGGAACCGAGCGGCAAGCATGAGAAGCTGGGATCCCCAAAACGAGAAAGGATCAAAGCTGATGGTCCCAGGTGCTAGTTAGAAGTTCTGAGTCACCTCGAAAGAAAGTCTCGGGACGCAGTCCCGCACGGTAGTCCCTGGAATGGAGACTGCGGGAAGAGGGG-------GGGGCAGGGAGCGGGAAAGGTTCTGTTCCATGACTGCAAGATTTGGAATCTCAGCGACTTGGGTTCAGACTTGGAGAGCTCCAATAAAAATAAGAGTTTAAGGACATATCCCTGAATTGGAAGACTCGGATCAGAAAGTAACGTAGCCACAAGCGCGTGCAGCAGAAAACTCACCCGAACCCGTTCGCCTCCATGG-------------------TAAACAGTAACTGAGCGGTCTCCGCTTTAATCTGA----------------------------GGCTCCGCCCCGACACC--CCAGTCCCCGCCCCTTCCTGAAGAGAACCCTGGGCGGCGCCATATTGAGAACCACGTGA----CCGATCCAGTGAC-----AGCTGTGGGGCTGCCCTCCCTGCTGCCCGTAGGACCCAAACAATTTTTTACCGTAAAGTCCACTGTTGCGACGCA 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GCCGCCCTCC--CCCTCCCTCTCCCCGG-GCCAGGTGAAGCTCCTGGAGGTGATGGAGGTGATGGACAAGGAGACCTTTGAATTCAAGTTCGGCCAGGAGCTGACCTACACCACGGTGCTCAGCGACCAGCGCATGGTGGAGCTTGTGCCCGGCGGGGCGGCCACGGCCGTGTGTTACGAGGACCGCGGACGCTTCATCCGGCTGGTGCAGCAGGCCAGGCTGGAGGAGAGCAAGGAGCAGGTGCAAGCCGGGG-------------------GGCGTCCGGGCCCA---------GCCAAGCTTCCCACCTG-----GGTCTCCGAGGGGGA--------------GGGGAGGGGGAGCGGTGA-GCCCCAT----CCCTGAAG-------------TCCCTGCGC-----TCCGCCTCCTACCCAGGTGGCTGCCATGCAGGCGGGGCTCCTGAAGGTGGTGCCCCAAGCGGTGTTAGACCTGCTGACCTGGCAGGAGTTGGAGAAGAAGGTGTGTGGGGACCCCGAAGTCACAGTGGACGCCCTCCGTAagctgagtgag-tctcggcgcctttcctctctgagcctcagtttcttcatctgtaggttgggtgcagggagggccatcagctgatctctagggatgcttccCCTCACCTTCCTTCTTCCTGTTTCCCATTTCCTCCTATCTCGTTCTGTCTCTGCCGTAGCCCGGTTTGAGGACTTTGAGCCGTCAGACACCCGCGTGCAGTATTTCTGGGAGGCCCTCAACAACTTCACAAATGGTGAGCA a score=6727 s mm8.chr4 116500790 163 + 155029701 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TGCAGAAAGTCACTGTTTCAGACCCCGCTTGC---CTTCCCAGACCC-----TCCCTCCATCTGTGTTTGCTAAAGATGACAAGAACAGCTTTGGATCTTAAGAACCCGCTTCCT---CCCCTACCCCTGTTCCCAATGAACCCACCCCGCCCCCATTCCGGACCTTTCGGCTACAGAGCTCCAGGAAAATGTATATGTTGTCAGCATCCTCGAAATGATGTGAAAAGCGAACGATATGGCGGTGCTGTAGGTCTCGGTGCAACTCTATCTCATTTAGGATCT-------GCGACAGGGG-------------AGTGAAATCCTCATCTTTCCAGGGTTCCCACGCCACCATCCCCTCC------------------------CCATCCCTTGGACCGCAGGGCCT------GGACCCACC-TTCTCGCGCTGATGCGGCTTGGCGACGCGACTCTGTGGGATGACTTTGACCGCGTAGGCTATACCAGACTCGGTGTCAGTGGCTTCATAGCAGCGTGCGAAGCCCCCCTAGAAAGAAGAAGCTGCATCATCGATCTGGGCGCTCCGGAGTGGCCGGATCCG-GCCCGTAGAGCTCC-----TCTCCACCTCCGGAGTGGCCCGGTCGGGTCCGCAGAGCTCCCCTCCACCTCCGTCAAC------------GCTACCCCGGAGCCCCGACCC-ACCTTGCCCAACAAGCGACCCTTGGTGTAGGTACGGCCGCTGAGAGGGTCGGTGATGAGGCGACCAGGAGGATCCGGCGCCCGTGGCCCGGCC----AGCACCTCAGGTTCCGATCGCGGGG--AGGCATTGGCAggcggccccgggccg-gcggggggcgcggacggggcagccgcgcgcgggAAGGGGCGCGGA-GACAAGAAGCCGGCGGCGGGCTCCATGCGGACGGCGCGGCGCAGCGCCTGCCGAGCTGGTTCTCGGTTccgc--ccggccccggccgcgcgTGGCGCTGCCTGGTT---------TCTCTACGCTGCGATCGCGCCAGG----------GCAAG-GGGGAGTCCG-ACGTTTTTATCAATGAACCCCTGCCC---CCTCCCCGGTGTTTC-GTCATCTCGAGCTCCGCCCCTTTCCTGGCTGCCAGGCTT------GGAGAGGCCACGCCCATTGCTCCGCCTT--------ACGTCACCTGAAAGATCTTCCCTTGCCTGGGCGTTCTT--------------------AAAGGCCACT-CCTCCTGCTCTGGCCT----TAAAGGAGCCCCGGTTGAGCTAGTCGCCT--------------------------GGCAGGTGTAACCCTGCTCCGTTTCTCTAGGCTACCCAGTGCAAGTGAC---TCTTTTTTTCCCCTTCATCCTTAGAATGTGTGCT--GAAGTCGGAGT 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GCCCAGCCCAGGCTGGCTGCTTCTCACAGACCTGTGCAATCAAAAGAGGTAGA-------TCCCTAGGGAGAAAGTAAGGGCTCAGCTCAGGGGACGACAGGGTAGAGGAAGAGAAGCCAGG------GGTGGGGCTGAGGGGGAGGGAGCAAGGCAGCC--------ACGCGCGCCCGTGGCTGAGGCTAAGGGG-GCCCTCGCATCTGGAGATCAATTAGCATCAATTACTGACTTCATTTAATTGTCGTCCAAGATGAATTTGTCATTTTTAGCTGGGAATTAATGGGAGACCTTCACCTCTCCC----TGGCAGCAGCAGAGGAG s monDom4.chr2 9841261 316 + 541556283 GCTGAGCCAGGACTGACAAAGCCT----GGCCTGGGGGAGGCAGGGAGGGAGAGGCCGGACCCAGATGGAAACAGACAGAGCCAGGCTCTGGGGA---------GAAGGAAGGTGTGCCGGGAAGGAAGTTGGGGCTGCGGAGGCGTGTGCTGGGGGACCTGGGGGAGGGGCTGGGAGGAGGCGGAAGCTGAGGGGAGCCCTCTCCTCCGAAGATCAATTAGCATCAATTACCGACTTCATTTAATTGTCGTCGAAGATGAATTTGTCATTTTTAGCCGGGAATTAATGGGGCACCTTCACCTCTGCCGGTTGGGCGGCTGGATGGGGG a score=9152 s mm8.chr4 116815860 196 + 155029701 GGTGACAGCTGTTCCTC--CAATCA-ATCACGC----TGTCG-ACAGGGAGGGACGACTGGCTGGCAGAAATTGAGTTT-GCCTCACAGGGGACGATTGAGCAAATTAATAGCCCATTAGCCAAGCGGTGACCTGAGAAATGAAGGTGCAGGGGTTCCTG-------CTCACTCAGGCCGGCTGGGGTGGGGCAGGGCAGGGGAAGGGTCCA s monDom4.chr2 9842380 208 + 541556283 GGTGACAGCTGGCCCTTTGCAATCATATCACGCAGCTTGTCACACGGGCAGGGGAGAGCCTC-AGCAGAAATTGAGTTTTGCCTCACAGGCGACGATTGAGCAAATTAATAGCCCATTAGCCAAGCAGTGACTTGAGAAATGAAGGTGCGGGGGTCCCTGGTGCCCCCTCCCCAATCCCGGCCAGGGTGAGCCCAGGC---GGCGCGGCCCA a score=6337 s mm8.chr4 116820039 351 + 155029701 ACCCGGA----------------ACCCCTGGGCTGCGCTCTCGCTCAGCAATTTCCCTACCAAGAAAGC---TCTAAGGGTTTCAATTACCGGCGC---GTGGGATTTAGTGCCCTGGGCTTCTCTGACTGGAGGAGATTTATTTGAAGGTTTAGTGTCGTGGAGAATTCA---CGTCTTCACTCCCAGGAGCCCAGCTTCCGTCTCAAGCCCCTAAATCAGGAACCAAGATGGGCTATTGTCAGTTACCGCATTAGCCTCGTTAGCGGACCAGGAGGGGTGATTAATAGCAACGCACACACAGCCATCCTC-CTAGTTGCTGCTCCTGCTGCTACTTCTGACCTGGGAGGGGGGTGGGGAGCAGCAGAGCCTGCTC s monDom4.chr2 9842588 351 + 541556283 ACCCCGAGAGGGACGAACAGCCCACCCCAGGGCGCGGCTC---CGCAGGCGCTTCATCTCCACGCCCCCCAGTTTTATGGTTTTAATTCCGAGGACTGGAAGGGGGCGGGTGGGGTGGGGGGCTCAGGCTG----AGATTTATTGGCCGGTTTAGTGTCTCCCAGGCTCCCGCCCCACTCCCCCTCCTGGAGCT--GCTTCCGTCCTGAGCCCCTAAATCAGGTGGCGAGATGGGCC-CTGTCACTGCCCGCATTAGCCTCGTTAGCGCACTCGGAGCAGAGATTAATAGTGGTGTGGCCACCCCCCCCCCCTCTATTCGCCTCCACGGCTGCCCCCC------------GGGGGTGGGGACCA----AGGCTGCTC a score=2583 s mm8.chr4 116820992 395 + 155029701 TATCTGTCAGTCTGAGTTTTCTTTTTTCTCTTCTTGTC--TCTTTTCCCCTCCCTTTCTCAATCACCGTTGAACCACAGTATTAATTATTAGAACCAATTGACTGTTTAGACTCTGATGTTTTAACTAATCACCACTAATGGCAAGCACTGTGGGCAATCACATTCATTTAGTTCCCAGGCAAACCTCTTTACACAGAGCAGGCTAGTGGGAGGGGATC-CAGCAAGAGCAGGGGTTTGGAAATGACAGGGGTGGTCTCTGCTGTCCAGATATAAGACCTTCTCCTGACAGCCCTGG--TGAACCAAGTCCCTTGGGGTTAGGTCAGCTGAGACTTGCCTCAAATGTGGGTTGGTTTCCTTCC--TGACATTTTTTTTTTAGCCCTTTGGCCCCAGTGTCCC s monDom4.chr2 9843090 351 + 541556283 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monDom4.chr2 10195985 503 + 541556283 TGTGTCCTCCGCCTCCTCCTGAATCTATCA------GCCCAGCTCTAATGAGAGAGAGCCATTCATTGTGGG-TGACGTTCCCTGCGGAGACTCGCCAGTGGTATTAATTAAAGGAGAGATACCTGGAGCAGCTGATGGGGGGGAGCGCAGGCCTGCCAAGCTCAAATGCATTAGTGGGGAGATGGCCTCGTTAGCCTAACAGGGCCTTAGGCCTGCGAGAGCTCAGGGAGAAGATTCATTTCACCTGCTGTGAGCAGCCTGTGGGAGGAGGTGCTGCCACGGCGCGGGCGGCCCTCTTCCCACTGCGGTCTCTGCTCTGGGC-CTGGCAGCCCCAAGGGGGCCGTGGCTGGGGCTGGGCCAGCCTGGGCCCCCTTGCAGCCGCCCCTGTCCTTGTTGGCC-------------------GACTGCACTCTTCTGCAGGCAG-----------GCTGGTGCCCAGGCT------------GGACTGGAGCTCCTCGGGCCTTCGGGACGCGCTGCTTTCCCTGGTGGCCC----CGGGGGACGGGAACCTCCTTGAA a score=6286 s mm8.chr4 117102240 613 + 155029701 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s monDom4.chr2 10256333 1068 + 541556283 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a score=8867 s mm8.chr4 117152011 690 + 155029701 GGCTAGGAGAATAAG--------TGAACAGCCCCCATACCCAGCTGGGTGGGCCGGCCCTGCGGTCTTAGCCTCTCTGCTCTGAGACTGAGGGGTCCCTGCAGAGGCTCATGGCACAGGTGGCATGGCCAGAGACCAAATGGACTCTCAGGAGCTTGCTGCCCACCAGAGTTTGGCAAGAGCTAAGCTG----------GCAGGTGGTGGCAACGGGGAGGGTGCC----CCTCTGTGGGAAGAAGTACTAGCCTGTGGTCTCCCCCACATGAGTAGGGTGTCTATCAGAGTCCAGTCAGAATGCATTAGCTCTGTGGCATGGATCTCATTAGTGCCCGTGAGAGGTGTCA--CTGCA--GGAGAAACGTAGGCTCAGGGAGATG--CTTGTACCGAAAGGAAGAAAGGACAGTGACAGCCTTTTCTCTGCCGCCAGCTCACTGGGCCTCCCACC-CTCCTCCTCTCGGGGAGGGGGGTGCTGGCTAATGAGCTCAGCTGCAGTACAGCTTTGGCTTCCCCTCCTTGAAGTTTCCCAGGTCTCTCTGAA-GACCTTGCCCGCCCGGATTAGCACACATGGACAC---------------------------------------CAGCCCCTCCTT------TTGCCCAGCAGGGAGTTCCTTCTGATCA--------------------CCCAGCTCCTCCACAGTAGG-AAGGGAAAGGGGGAGGGGCTAACATGGGGGAG------GGGTGTTGCACCCCTGGGAATGTTC---------AAATCCCTCTGCATCTCAG s monDom4.chr2 10258946 753 + 541556283 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a score=512 s mm8.chr4 117227412 140 + 155029701 GCTAAGGAGAGAACCGACGGAGGAC-----CGCgggcggggggggggggggggggggggggggagggCGAGGAGCGACGTGCGGCCCCG-AGCGCCCTGCGG---GCTCGAGCTGGCGCCAGTCCccccatttgattcttgatctgtca s monDom4.chr1 540395119 147 - 748055161 G--AGCGGGAGCTCAGGCAggcggcgttgacggtggcggcggcgatggcgggggcggcggggcggtggcggtggcggcggcCGATCTGGTAACTTCTTGGAGTAAGCTAGAATGTGTTGAAACTTCTCAGCTTGGTTCTAAGGTTGTCA a score=3611 s mm8.chr4 117295157 311 + 155029701 CTGCTCCTCCTGTGATGATGAAGGGAGCACCTTTGCTCCATCTGC------TCCTCCTGTGATAATGAAGGG-AGCACCTTTGCTCCATCTGCTCCTCCTGTGATGATGAAGGGAGCACCTTTGCTCCATCTG------CTCCTCCTGTGACGATGAAGGAGCACCTTTGCTCCATCTGATCTTCCTGTGATGATGAAGGGAGCACCTTTGCTCCATCTGC------TCCTCCTGTGACGATGAAGGGAGCACCTTTGCTCCATCTGCTCCTCCTGTGATGATGAAGGG-AGCATCTTTGCTCCATCTGCTCCTCCTGTGATGATGAAGGG s monDom4.chr2 5011707 305 + 541556283 CTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGG-------TGGCGTCATCTGTCACTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGGCGGCATCAT--CTAGCGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGG-------TGGCGTCATCTAGTGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGGTGGCATCATCTAGTGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGG-------TGGCGTCATCTGTCGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGGCG-GCGTCATCTATTGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGGCGGCGTCATCTATC--GCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGG a score=2828 s mm8.chr4 117295537 181 + 155029701 GATGATGAAGGAGCACCTTTGCTCCATCTGCTCCTCCTGTGACGATGAAGGAGCACCTTTGCTCCATCTGATCTTCCTGTGATGATGAAGGGAGCACCTTTGCTCCATCTGCTCCTCCTGTGACGATGAAGGGAGCACCTTTGCTCCATCTGCTCCTCCTGTGATGATGAAGGGAGCACCT s monDom4.chr2 103468515 178 + 541556283 GGTGATGGAGGTCATCCTTTGCTTCCTCCCTGCCCTAGGAGGTGATGGAGGTCACCCTTTGCTTCCTCCCTGCCCTAGGAGGTGATGGAGGTCAT-CCTTTGCTTCCTCCCTGCCCTAGGAGGTGATAGAGGTCAC-CCTTTGCTTCCTCCCTGCCCTAGGAGGTGATGGAGGTCAC-CCT a score=2369 s mm8.chr4 117295718 750 + 155029701 TTGCTCCATCTGA------TCCTCCTGTGATGATGAAGGAGCACCTTTGCTCCATCTGCTCCTCCTGTGATGATGAAGGAGCACCTTTGCTCCATCTGCTCCTCCTGTGATGATGAAGGAGCACCTTTGCTCCATCTGCTCCTCCTGTGATGATGAAGGAGCACCTTTGCTCCATCTGCTCCTCCTGTGATGATGAAGGGAGCACCTTTGCTCCAT-CTGCTCCTCCTGTGATGATGAAGGAGCACCTTTGCTCCATCTGATCCTCCTGTGATGATGAAGGG-AGCACCTTTGCTCCATCTGCTCCTCCTGTGATGATGAAGGATCGCCTTTGCTCCATCTGATCCTCCTGTGATGATGAAGGGAACACCTTTGCTCCAGCTGCTCCTCCTGTGATGATGAAGGGAGCACCTTTGCTCCATCTGCTCCTCCTGTGATGATGAAGGGAGCACCTTTGCTTCAGCTGCTCCTCCTGTGATGATGAAGGGAGCACCTTTGCTCCAGCTGCTCCTCCTGTGATGCTCTGCCTCACCAGACCCTAGAAACCATGGAGTGGAGTGACCGTGGCCATGAGCCAAAATACAACTTTCCTCTT----AGTGCTTTCCCA------------------CAGACACTTTGTCAGAATGGCAGGAAAGCTAGATCTCgctgggcagtggtggcgcacacctttaatcccagcacttgg------gaggcagaggcaggggaatttctgagttggaggccagcctggtctacagggtgagttccaggacagccagggct s monDom4.chr2 5012012 688 + 541556283 TGGCGTCATCTGTCGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGGCGGCGTCATCTATTGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGGCGGCGTCATCTATCGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGGTGGCGTCATCTGTCGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGGCAGCTTCATCTAGTGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGG--GCAGCTTCATCTAGTGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGGCGGCGTCATCTAGCGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGGTAGGATCAT--CTGTCGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGGTGGCGTCATCTGTCGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGGCA-GCTTCATCTAGAGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGGCG------------------------------------------GCGTCATCTAGAGCTTTTCCTTCTCTGAAACTGAAGGGCG-GCGTCATCTAGCGCTTTTCCTTCTCT------------------------GAAAC------GTAAAATGA----GGGCAGGGGTTTGCATACCCCCCCCCTCCTTCCAAAGGCTGGCCAATGGCAGAGAGGGGTGGTCCGGGAGCTTTGTGGGAAGGG--GCAAGCCTGAACCTC--------CTGATGGAGTAAACTTCCAGTCTGATCTCCCAAATCACCACCACAGAATGGGAGAAAGTGGGGGGTTGGGGA------GGGGGTGGAGAATAAGGGACAGGAAAACCAGGGAT a score=34542 s mm8.chr4 117322536 1076 + 155029701 gcaaatgctcctcccaaactca---tctatgg------ctccatcagtccctgctttgggcaccGTTATACTGTGCCACactatgcctggagaaacatgaacacacatctactcaccctgcatagggaacctctgacggaacaaagcacggatataccagaatcca-------acttggtaagtcggcgaacttactggtattactt--------ataggaatatgggtgaggagtta--------ctgacagcatcagaagtgactgaacggcagctgcatcacaaagtccatcccagcacccagggctgtgtcagaaagctggacacctgagactcactggacagc-ctgcaggtacaacagTG--TCGCCTTGATGAAGGATGTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTCTTATTTAGTTTTTATT-CGTAATCATAAACTTAACTTTGCAACTCAGCTAGACTTGAAGGGGAAAGAGGAAAATATGGAACCCACAGAACTTC------AGTGAGAGCAGA--GATGATAGGACATTGCGAGCAGATGGGG--TGGGGGTGCTCTCCTGAGCTACAGAAAGAATGGTTTGATGGGTAAAATGCCCGAAAGTCAAAAGAAA--------TTATAGTTGTCCACAGTCAGAAATGGTGATCTTCTTGCTGGTCTTGCCATTCCTGGATGCAAAACGCTCCATGGCTTCCGCAATGTTCATGCCTTCTTTCACCGTCCCAAAGACCA-----------TCCAGCTATTCAGTCTTGGCAGTGCACATAAAAAACTGCGAACTGTTTGCGTTTGGTCCAGCATTTGCAATGGACAAGATGCCAGGACCTGTACGCTTCAGGATGAAGTTCTCATCCTCGA-TTTCTCTCCTTTGACAGACCTGCCGCCAGTGCCATTATGGCGTGAAAATGAA------TGGCACATGAATCCTGGAATAATTCTGTAAAGGGAGGAACCCTTATAGCCAAATCCTTTCTCTCCAGGGCTCAGAGCACGAAAGTTTTCTGCTGTCTTTGGAACTTTGTCTGCTAACAGCTC-AAAGAAGACGTGCCCAAGGGTTCACTGTCGGCCGTGATGTCGGAGTACACGGTGGGGTTGACCATGGCTGCAGCAAGCAGGGAAAAGTG s monDom4.chrUn 109659283 1071 + 174229318 gtaaagactcctctttaatgcaatttccatgaataaacccatatcagtttctgatgttgac-ctatttaacagtgcta----atgactttggggacaagaactttcgttt-cttggtcttca----gaagttatggttgcttagaacatggtgtttatagcatctacagacaaagttgtcaagttga-atatgtacaaatattgctttctctaggatACTACTGTTCGTGGGGACCTGAGGCCTACCTGACAAC--CATTGATAGTTGATCGGCACTTG-------------------------------GTGTT-----GCTGGTTTCTTGA-------TGGAAGGCTCTTTGGTCACAAAGGTTGCTTCCCTTGATGAGGA--------------CTTTTTTTCCAGGTGTAGTTTAGTTTTTATTTCATAATCATAAACTTAACTCTGTTGTCTAGCCAGACTTGTGGAAGGAAAAGGGAAAT--GAAATCCAAAGAGAATTGCAGCAAGTGAGAGCACAAGGATTACAGGGT-TTAAGAGCAGGTGTAAATCAAGGGTGCTCTCTCCAGCTACAGAG-GAATGGTTTGGTGGTTAAGA----CAAAAAACAAAACAAAAAAACTTATTAGATTTGTCCACAGTCAGCAATGGTGATCTTCTTGCTGGTCTTGCCATCCCGAGAACCAAAACGCTCCATAGCTTCCACAATGTTCATGCCTTCTTTCACTTGGCCAAAGACCACATGCTTGCCATCCAACCAGTCAGTCTTAGCAGTACAGATGAAAAACTGGGAGCCATTTGTGTTGGGTCCAGCATTTGCCATGGACAAGATGCCAGGGCCAGTATGCTTCAGGATGAAGTTCTCATCAGCAAATTTCTCCCCATAGATGGACTTGCCACCAGTGCCATTATGGCGAGTAAAGTCACCACCCTGGCACATAAACCCAGGAATGATTCTGTGAAAGCAGTATCCCTTGTAACCAAATCCCTTCTCTCCAGTGCTCAGAGCCAGGAAGTTTTCTGCTGTCTTTGGAACTTTGTCTGCAAGGAGCTCGAAAGTAACCTGGCCTAGGGGCTTGTTTTCGACACAGATGTCGAAGTACACGTTCGGGTTGGCCATGGCTACAGATGGCTGGGATGGGCG a score=208 s mm8.chr4 117323612 65 + 155029701 ACAGTAGCGTCTGCCGGATGTCtc---ttcttggcagctcagcttctctgagagaatctctcagtagt s monDom4.chr1 513323038 65 - 748055161 GCAGTGGCAGAGGCAGTGAGGTTCAGTGTCTGGCGAACTGAACGAAGATGAGAA---CTCTCAGTGGT a score=-132 s mm8.chr4 117323677 63 + 155029701 tcttactgtttctgtaagtttgagaagggaggaacctactccgt---ctggtcagcttcagggact s monDom4.chr1 677556581 64 + 748055161 CCTATATATATATGTC--TTTAAAATtaaagggattgatggggtcagctgggtagctcagtggatt a score=335 s mm8.chr4 117323740 142 + 155029701 tcttgaagtttgtaagtt-gtttacttcctgagtctaagaagcttcccggaggaatggagtgtttTGCCTCCCTTTAGAc----agcagttctcaaccttccaaatgctg------cgaccctttagtacagttccttatggttggtgacacc s monDom4.chr6 208695140 141 + 244784211 TTGTCTGTTCAGTAAATGAACCAACCCTCTGAGACCAGGG-----CCTGAGCTGGTTGGCACCTTTGCCTCCATCTAGGCTCAGGGCAGGTCTCTTCCTCTGCTTTGCTGATTTACTGACCCTCT-------TTCCCCACTGCAGGTGGCCCC a score=9342 s mm8.chr4 117332830 1840 + 155029701 GGGGGAACGCAGGCGCAGAAGGCCAGGGGCCTGGCGGGCTAACTGCAGCC-------CCAGCCCCCCAAAGCGCC-----CCAGGCCTTTTGGCTTC-----GTTCCAAGCCTAGCCCGAAGGGGAGGACATCTGCTTCCTCCAAGTGTCCCAACTGAAGGGCAGAGAGGCGAAGGAGAAGGGGACTCCTTTGCCGAGCCCCACTCCCAGGGGTTCGTG----AGGATCAATCATCAGAAAACTAGAGCCAC------------------TTGTAATCTTATTCCCTGGTAGGAGGAGTCTGAG---------TAGTCGGCACGCGGGAGGGAGGAGATGGGACCAGGGCGGGGGAGGGCGGCCAG--GGGAGCCGCTCAGGGAGGGGAGGGACTTGGCTAGGTTTCTCAAGCCTTCTTCACTCTCCAAACTTTCACCAAACTCTTAGCCCCCGCCT-----------CCCCGAAAC-CAAAACACAACAAGCTCTGGAGGAGCGGCAG-GCAACGCGGCGGGGCGGGAGGACTGGCGGCTGCAGAGAGCCTCGGG---AGGCTGATGCAACTTTCCCTTTAAGAAAGCCACCTGGGCGCACCGCGG-----------TGCGGACCC---------AGCAC----GCCTGGGCCGGGGGCAGCAGTATGGTAAGAGAGCTGGGGGAAGGGGGCTTTGCG-GCCCGAGCCTA-----GGTCTGTCCAGCCGTC-----------GTTCTGGGC--------GTTTCTGTGACTCTGGGAGGCTGAGCCCCAGGATGTGTATGGATGTGTGTGTGGTGCGTGGATGAGATAGCGTTTGCTTG-----------CGGGTATCTGTGG---CTAAGAG-----------------TGTGAGTGCTCGCA-CTGGGATGTCTGTCTCGCCGCGAAGGTCTGGGTAGGTGCGTGTGTCTGTGTGTCATCGTTGTCACCAAGGAACTAAAGCAGACGGGAGGGAGGGTGATTTCGGAATGGAGGGGGTGCGTTGC--GTGCCGACGCC----------------GGCTCGGT-CGGAGGTGGTTG-----GTACGGGGCTGTGCGCGCAGCGCCGGAACCGAAGAGCGTCTTCGGTCTTTCTGGGGCGCCAGTGGGTCTGCCGCGGCCGGGAGCC---------GGCAGCGGGGTCTGTGCCCCGCGTGCAGCCTCTCGCCCCACCTCCTCTCCCAGCC-GTGCTGGCTAT------CTATCTGGGCGCCGCAGCCGGCGGCCTTCCTAATCTGCCCGCCCACT-CGCCCGCCGGGTGCCGGTTCCCGCGCGCCCGCGGTTCCTGGGAA-GCA---GCGAGGAAGAACCCCAGCGCCCTC---CGGTTCTCTTTTGT----CCGCGGCTCGCGTGGCTGCAGCGTTGAGAAGGGATTGCGGGGCGGAGAGTG----GTTTTGG--GGGACTGCTACTCTGGGGGGAAAAAATCCACGCCCTGCCACTCGAGCCTTCACTCTAG---CCTTCCTTCTGGGCATGCTTGCGGCGAGTGCGGGCGGCCACAGGTGAGGC--CTGGTTTCCCGCAGCTCCCGAGCGCCTGCTCCCAGCCTGTACCCCGCAGCAGGC--AGCCACACACGGGCCGGAGCTGAGGCCAGC----------GAGCCGGGAGGGGGCTTG---CCCGCAGACCCG--------------GGAGGGGCCGAGGA---------------------CGGGCGGGGGCGGGGCAAGG-----------GGGCGGAGACCTCGGCACCCGGGTACTTTTCCAC-------CGCGGGGGGCGGGG-CGGCATCC----TCCACGCCAGCT-GAGAGGCGCACACGTGGTGGCTG-ATGTAACGCCCGCCCCCCAACACACCTTGCACACTGATTAAAGCGAAC----CGGTCTCGTTTCGAGGAAGTGGGCACTCCGGGCGGTGCCATGACTCCAAAAGTGACC-GCGCCCCACACTGCCAGCCCGTCCCGGGCCTTCAAGTCCGGCCGGGCAGCTACTTAAAGGGGCCGCACCCCCTCTCGGGTCTGTTTTC--------CATAGGCCACGCCCCT-CGCTAGTC-ACTCTTAAAGGAGCCGCGTACCC s monDom4.chr2 10425598 2029 + 541556283 GGAGGAGGGGAGGGAGAGAGCGGAGGGGCTCAGCCGGGCTGTCCCCCTTCACGCCCGCCAGGCCCAAAAGGAGTCAGCTGCCAGCTCCTCCGTGCTCTCTCGGTCCCGGGCCTCTAAGGAGGGGGCGGTAGGCAGCGCCCCA-----GCCCTGACCGCGAGGTTG-GAGTGGGGTAAGCCCGAGGCTCC------GGGGCCAGCTCCCAGAGGCACTTGGGGAAGGATCAATCGTCCGGACGCCCAAACCCCGGAGGCGGCGGCGGAGCCTGGTAACCTTATTCCTTgggaggaggagcctgggggagacagacggacaggcggcgggggcgggggggtgagaagggggacgggttagggggcgggccgggagccgc----gagggggaggggCTTGGCTGGGGCCCCTAAGCCGTCTTGGTTCTCCAAACTTGCACCAAACTCCGGGCCCCCGCCTCCCTCCCCCACCCCCAACACACACTACACAACAAGCTCTGGAGAATCCTCGGAGCAGAGCAGTCGGGGAGACGGAC--ACCACAGCAGCCTCCGCCTGGGCCAGGCTGATGCAACTTTCCCTTTAAGAAATCCACCTGGACAGCCCGCGGGCCCGCCGGTCTCCGGGCTCGAGCGAAGGAGGACAGGGACCAAGGACCAGGGTAAAGGGAGGCGAAGGGAGCCGGGGAAGCGGTTGTGCGCGCGCGCGCGCGTGTGTGCAGTGTGTCCCGGCATCAGGGGCTCTGTGTCCTGGGCTGGCATCTGTGCCTGTCTCTCTGGGTTGTCTCCCTCCGTGGTGTGTGTGCGCGCGCCTGCATCGGCTGGATG-TACTGCTCTTGCTTGCCTCTCCGTCTCGAGTGTCTGTTGGATCTGGGTGTACCGGGCTCTCCGTGTTGTGAGTGAGGGCATCCGTACTCTCTAGCTCTCCCCCACCCCCACCCAGGATGCGTGTGTGTGCGTGCC--------CGCTTGTGAATCAACGTGCCCGTTGGGATGTTGGATGCCCG---GGATGTGGTTCTTTGTGGGTACCTGTGCCCCTCAGAGCCTGGTGGGGCTCTGTGTGCGAGTGAATGCGAATGTACGCGAgtgtgtgtgc-gcgc----------gcgcgtgtgcgtgtgtgtttgtgtgtgcgcgtgtgtgGCCCCACGCAGTGCCCGTCACTAAGGTAGCCGGGGGAGGGAGCTGCCTG----TTCTCGCC------GCTCTCCGCGCCGGCGCTGGCTACCGCTGACTACCCGGGCATCCCAGGAGTCGGAAGAGGCAGGCGGGCTGCTGGCTGCGCCAAGGGGAGGGAGGGAGCCTGGTGCCCGCCCCCTCGGAGAATGCGTGTGTGTGTATGTGTATGGGCACGCTCTGTCGGGCTTCCTCCGCCGGACCACAGGTCGGGCGCC--CAGCATCGCCCTCTGGCAGCACAGCACAGTCTAGCCTGCTTCGGCCCGGCTTCCCTCTCTTGGG-------------TCCCAGCCACCCGGACCTCACCAGCAAACTCCTTCAGCCTGGG---GGCTGCCGGGCACTCCCTCAGCCCCAGCCCCAGCCGCTAGTTCGATGC-GCTCCCGGAGACCGAAGCGGAG-GGGCACTGGAAGGCGGGCCTggtcagggccaggtcagggtcagggccagcgttagggtcagagtcagggccaggCCCGTGCCTCCCGGACCGGCCACAGGTGAGGGCGGAGAGGCTCTGGAGCCCCGCCTCTCGGTCCCCCTCTGGCTggcgcggggcggggcggaccggggcgcgcggagctcgcgggggcccggTACTTTTCCACGCCATGTGCCGGAGGGCGGGACCGGCCTCCGGGTCCCACTCAAGTGAGGGAGTCCCACCGGTGGGAGTCGTATGAAAACCCGGTCCCCC-----------CGCGTGAGTTTAAGTGGGCATCGCCCCCCCCTTTAGAGGCCGAGG----TGCGGGGAGCCCC----TCCCAGGGGTTTTCGGTGTCCCCCAC----------CCGAGAGCCCTTGCCCCCCATAGAGCGGATTCTT-----------TCCCCCTCCTCGACCAGCTTGCGCAGCCCGAAAAGGCCGCGCCCCTCCGCTTGACAACCCTTAAAGGGGCGACATCCCC 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ggacctttggaagagcagtcactgctcttacacactg------agccatctcaccagcccAGCC--CAGTAATTTTTCTAAT-----AAACTTCTTAGT---CCTGGTAATCCC--TCTCAGACCTACTTATCTCCTCCCCCTAAAACAAAACAGAACCTCTTCCATAGTACTTGTTCTGGAGAGCCCAGAGGGCCTGTCTAGGGTCTTACCTTACTCTGTTTTCTCCACAGCTCTTGAGGCCTGTTGTCTGAAAGGCACTG----------------AACGCAAGAGTCT----GCAAG--TGTGGTCCAGATCTCCAGATCCCCCAACCCAC------------------TGCCACCATGGTAGGAAAAGGTGCCAAAGGGATGTTGGTGAGTA-------CAGGGTCCAGACTTTAGGGAGGAGG--GGCTACTATATAAACACTGCCTGGGAGACCTCCTACCAACTGCTTGCCTTGACATGGGGGCCTAAGAGATTCTACGGGGCCAGGGTTGGCACTACCAGGGC----TCCCAAGTGCCAGGGCTGCCCCAGGCCCGGGCAAGCAGCC s monDom4.chr2 10429276 542 + 541556283 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GCCCCAAGTCTCAGTGTGAGGAGGTGACCCTCTCAGGTCTCTTCTGTGCTATCCTTGATACTTCTGCTTGGCCTCTGGAGCAGGTGTCCCAAGAAGCAAGTCA-CTTGCCAGCACGTGCCCGGGTCCACATGACTGCTGCACGTGTCCCTCCCCCGACTTTC-AGCCCAGATGGTCTCTGCCAGGCCAGCTCAGCTGCCTTCCTCACGGCTCAGTGGCTCCTAGGATGGGGCCGCAAGAGAACCCAGCTGGCCAGGGTGCCTCGAAGCA-AGGGAGCAGCTGGGACGCTTGGGGCCACA----------GGGGGTAGAT-------GAGGCAGTCGTTGCATGTAGACCTAGAGCCTACACGTGTGGGGC-----------GGGACAATGTCTCCAAGGACAGGAGATGGAGGAGGACAGCCTAAAAC s monDom4.chr2 10431306 404 + 541556283 GCCCGAGCCCTGATGGCCTCGAGGTCACCGT---AGGTCCAGCATGT------CTTTGGGCCTCTGCCGGG-----GAGGCAGGGGGACGGCGAGCATGGGCAGCTCTCAAGCATGTGTCTGTGCCTGGAT------CCCACGTGCCACCCCCCATACCTCCCAGCCCAGATGGGCTCTGCCAGGCTGGCTCGGCTGCCTCGCTCACGCCTCAGTGGCTCCCAGGACATGGGCTCCCGAGAGGCCAGCTGGCCACAGAGCCTCTAGGCAGGGGGAGCAGCTGGACAACTTGGGGGCAGATGCAAAGGGTGGAAGTAGATCAGAATGGAGGGGGGCCTGGTGAGAACACAGTGAGTCCCTGCTCGGGGAGCCCTCGGGGTGGGGGTCTGGGGCTGCAGGGAGAGG----GGGGGAGGATGGACTAGATC a score=189 s mm8.chr4 117343715 194 + 155029701 GTTTCCATGTCAGCCATCTTGGTCAGGTGAGCCTTACTT--------CTTCCCATGTCTTTAAACACACAGATTGCCTTGACACTGCGAAGTTTCCCAGTCACTCTGACCCCAGGGTCCTTCGTGCCAGAGTTTCTAACTCCCAGAAGA-CTCTGCAAGTGCCACAGGCCACCCGAGGCTGCCCCACC-----CTGACCTGTTCCCTT s monDom4.chr2 10431756 202 + 541556283 GTGTCCATTCCA--CAGCTGGGAAAGGCAAGGCGAGCTTTGAGAGAACAAGCCTAGTGCTATGATTCACTGA---CCATCCCTCTGCAGTGGCTTCTGGGAAGCAAGGGCGCAGGGTTCCTTGGGACTGCTGTTCTGGACCCCAAAGCACCTCCTCCTTTGCCCCA-GCCCCTCGAGACCCTGTCACCACCGTCTCAGATGTTCTCCT a score=11258 s mm8.chr4 117344780 690 + 155029701 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cattagtccctcagtccattcagcc-atcagtccatccagc-catccaccca------cccatccatcca--cccaaccattggtccatccatccaTCAGCCC--------ATTCTTCTATGGGTCCATCCACCTCTCCGTTCTTTCTCCCCTTCATCCCAGACAACACGCCCAGTCCGTCCCAAGGAATCAGAGCCGGCCTTACCTACCGCCCGGGGATCCTGGGAGCTGGGCCTCCAGCTCGCCCCCGACACTGTCCCTAGGGTCTCCAAGGGCAAAGTGCAGCACTCTAG-------GGCTGTAGCAGGCCCATGCCTTGTCCGAATCTCTGGAAGGGGGCATCCGCGT--GGCTGAGGGTCTCAGCCCAGACGGAGGGGCTCAGGCTGTATCTGGGGCCCAGAGGGT----------GCTGGGTGGGTGTCTCTGGGGCAACCCTCTGGATGTGTGCTGGGGCTGACTCCTGGGGTCTATGAGGTTCCCTTACGGGGCCTGAGCA---------GGGCAGCAGTGGGGCACCTAGCAGTGGAGCGCCTAGCAGGGGGACTCCCAGGG-----CCGGCAGAAGGGGCC-----------TCCTACCTGCCCTCCAGCTCCGCCTTGTGGCGAATACCGAGCAGCAGCAGTCGCAGCTCCCCTCTCACCAGGTCCCGCATGGGCGGGGGCGGGGCCAGCAGCGGACAAGGGGCGGGACTGGAGG-----------TGGAGCTAGGGCAGCAGCCGGCCTTGCAATCCTCCTCCAGAAGGGCTTCCAGGATCTCCACCTGACAAACGCggaagggagggg---------------------------aggggaggggaggTGCTG------GAGCCGGGGCGAGGCTGGGATTTCA-------------------GGTGACCCCACC---------------CCTTGCTGCGAC------------------------------------CCCGCCCCC------------CTCACCTCCGCCCGCAGCTCCAGGCTCAGGTCTACCGCATCCTCGCCCAGGATCCTCTTCACCTCGGCCCGCTCAGGGGGTTGAACGTGCTCCTCCACCAGCCCCCACAGGGACTGAGGGACCTGGCTCATGG------Tggggccccgccccctgccccgccctgccgggcgggggg--------------cTCCCGTGAGGGGGAGGGGCGACCTCACCTTGCCAGTCCAGGGCCCCGCCCCC 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ccccactcactcGCTTGGCTTCGCACTCCCGCACGAAGGCCTGCACCCGCTCCAGCTCGTAATTGTGAGCCAGCTCCGT------------------------------------GGGGGGCGTCAGGGGCCCCGGGGCCCCAGCTTCCCGCTGCAGCACGGCCCCCGCGGGGCTGCTGAAGGCGTCTTCCAT--GTCACCTTCTGCGTACGGGCCACCAGACTTCAAGTCCGAGTTTGGGCT-CAGCTCCAAGGCTGCACTGTGGGGGGCCCCGGAATCTCCACGCGGGTATCCCCACGTGGGTGTCCCCACCTCTC----TCCAACCTGGTCACT----ATTTCCGGGACTACCTCTAGCCTTCACACTCCGCCAATCAGAGCCCGCGATTCTCTTCTTGCCGGGTCAGTAGCCAGTAGCCTACTCCCCCCCTGACCCAATGGGAAGGGGCGTACTTGCCCTGTCTTCCTGACCCGCTGA----GCCGCGAACTTCTCTGGGGGTTGTAGTTTTCCCGG a score=7748 s mm8.chr4 117392388 220 + 155029701 TGATGGAGGACAGAGAAAGGAGGCAGAGGCAGCAGTAAGAGTCCAGG-TTTACTCTTTGGGAACAGGAAGGGGTAAGAAGGGGTGAGGCGGGACACACATGTCCCTCAGTAGTCAGCTGTGTAGTCCGTGCCATGTAGCCCCCGGCAGAGCAGTGTAAATTCCTTCACCATCTCCTTCACCCGTCTCTTGTTTACTCGCTCACTGTAG-GGAAGGGAGAGCA s monDom4.chr2 10521868 197 + 541556283 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AGACTG----CCTCCTCGGCAGCCTCAGCTGCCCGTGACCCACCTCCTTTCGTAAAGGCCCCATCCATCTGACGGTCACACAGACATACCTGCAGTGTGTACCAGAAAGTGAGAGTGAGGGAGCTGGTGGTCTCGTTGACAGGATAGTGGCCAGGGATGCCAGTGCAGAACATGATCATGTTGACGAGTGCCAGGAAGCTCTGCCAGTGCTCTACTTGGTCTAGCAAGGCCCTGTGGGGTGGGGTTGAGGCGTAG s monDom4.chr2 10542465 220 + 541556283 AGACTGGACCCCTCCTTCACCACCTCAT----------CCCACC---------AAAGGAAACAGAAAACTAAC----------------CTGCAGGGTATACCAGAAAGTGAGAGTCAAGGAGCTGGTGGTCTCGTTGACTGGATAGTGGCCAGGGATGCCCGTACAGAACATGATCATGTTGACCAAGGCCAAGAAGCTTTGCCAGTGCTCTACCTGGTCCAGCAGGGCCCTGGCACAGGGGGCAAAGGGGAAG a score=10240 s mm8.chr4 117403361 271 + 155029701 CCCCGCTCCCTACCGAGAGTGGTTCTCGCCCAGGGCCACAGCAATACGGCAGATGCCATGGGAGGTCTCCATGTCCCCATTCTGCACTGCCTGCCGCAGTTGTTCCTGCAGTCCCAGCACCAGAGGAATGAGTTTCAGGAGTGTGTTCACGTACCTAGAGGCATGAGGTAAGGCGGTCCATCAGAGATGTCTGCCCAGCCCCGCCAGCTTTGAGAGAAAGGCAATCTCCCCCGCCTTTACCAAAGCCTTCCTATCAAAAAGAGACCAAGGC s monDom4.chr2 10545893 249 + 541556283 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CTCACCGGCCTGGGGCCTGAGCTCT-----GCAGCCTCCATATCCTGCT--GAGTTG-AGGCTCCTGGTTAGTGAGGCCCGGTGGAGCTGTTCCAGGTAGG------------------GCAACACATGGGTCTAGTGTGCAAAGGCTTGGAGATAGATCATCCTCAGCCCAGACAGCCGCAGGCAGTGGCGGAGAGGTGGTCCACGGTCCTCCAGGTGCTGTTCACGTCCATGAAGGAGACGGCCTCATAGCGAGTGGGCCGGCAGCAGGGCTGGCTGATCGGCCGGG---------ACCCGGGAGGCGACCGTAGGGCC------CCAGCGCCCAGTAGGCTGGCCAGACTGAGATCGTGCTGGGAGCGTGCTCGGCGGCACGAGCCGCTGCAGAAGCGGAAACGTATCAGCTCGTCGGAGCTGTGGCCTAGGCCGAGCGCACTCACCGGCACCAGCTGCGAGCGCAGGCGGCAGCC--GCGCGCATCTGTGGTCCGTGCGCGG----CTGCTCCGGGTTCCTGCACGC--GCCGCGCGTGCCCCGCG---GAGC-----GCAGCGGGAGGAGACTGGAGCGCGGGACCAG--------GCGGCGGGGGTGCGGGCTGAGGAGACTGAGGCGGGGGTCGCAGGGTTCTTTCGCTGCACAAATGC-----------GCAGTGTGTCCC--CCTGGAATGAGGCTTAGTCACTTTCGGAGGTGTGGGTGGGGGGTGTCTAGAGCTAGCCTCGCCCTTGCCCCGCCCTGTCGCGCTCTCACCTACCAGGCAGGTG--------------------GTCCGTGGGGGGCGCCAAGACCGG------------------------------TGAGGGACCGTCGCGAGCGGC--GGGGCTGCGGGACATTGGGTCCAGGGA-----AGCTTCTGTGACGCAGCTCAGCAGGGCTAGAACAGCTAGGGTTGGCCACCA-GGCTGACTGCACAGAGAAAAGGAGACTTAGGGAGGAACAGGACACTTTGGGGGTCGGGAGGGGGTCTTGTCTTGCCCAGATCAGAGACC----------AGTCTAGTC---GGGCTCCTAGCTGGGTGGCAGAGTGTAAGGAAGGGCTTAGATTTAATAGGCATTTG---CTGCTCCCAGGAGCCC------AGGGGAGGAAT--TACCTGAGGGCACGGACCATCAGGAGAAATCCCGTTCCTTTCCTCCAATTACGGCCCCTCCCTCTTGGCATTTCCCCTTTCATA---TCTGATCCCTGCGGCCCTAAGCTATGTCCTACTCTCTTTTTTTCCAAGGAAAGCCAGCGACTCACCTG--CCACCTAGGCCGGAGGC----------------AGTGGGACAATGCAGTAGGCT----------------------------------CTGCAAGTCCCAGT---TCCATAGCTTTCGGCTCCA-GAAGCTCCCATCAGAAGCCTTCGTGGACCCGTTTCCCC 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CTCACTGGCTCCGGGGCTTGGCCCCCAGCAGCTGTCCCTCTCCTCTGCTCCGGGCCGCGGGCCTTTGGGGGGCTTCTCCCTTGGCTGCTCTGCCCGGTGGGCAGGCGGGGAGGTAGGCGGCTGCCGATGGCTTTGGGCTCCAAGAG---AGGGGCCGCCGGCCCTCAGCCTAGGCAACCGCAGGCAGCCGCAGAGAGACTGTCCACCGTCCTCCAGGTGTTGCTGACGTCCATGAAGGAGACGGCTTTGTAGGCTGTGGGCCGGCAGCAGGGGTGGCTGAGCACCCGGACGGAGCCTCCCCCGGGCGGGGCAGGGAGGCGCAGCCGGCCGGAGCGCAGCAGGTGGGCCAAGCTTATGTCGTGGTTGGATCGGACCTTGGGGCAGGCCCCGCTGCAGTACTGGAACCGGATCAGCTCATCAGAGTCATGGCCCAGGCCCAGCTCATGCACCTTTACCAGCTCTGTGTGCAGGTGGCACTCTTGGGCTCTCCTCCGGCCCTGGCTCCGACTCCGGCTTTGGCCTTTTCTACGCTGGCCTGCCCTGCCCTGGGCACGGGCCTTTAGCAGGGGTAACAGCATTGGCTCTGGCACCCGTTCTCTCAGCAGCTGGGGGGAGCCAGGGGTTGCCTCTGAAAGGGAAGGAAAGAGTACATagtggatagaaagccaggcctagagacaggaggtcctgggttcaaatccggcctcatacttcctagctgtgtgaccctggg----caagtcactgaccccccattgcctggtctt-tagcactcccaattttaggacagaagggaagggttttaaaaaaagaGTACTTGGTGGGAGCCTACACCAGACTCCCCTCCCCTCCCCCAGCTTCCTTCTCTTCTGGCCCCCCGCAACCGGCAAAGGAATCTGG-----TAAGTCCGGGCATCCCCTCCCTCTGTCAGTCA-CTCACCAG----------GCAAGACCCGGCCATCAGGGCTGAGGGCTCCAGCGAGGGGCACCCTGGGG----CCAGGGC-TGCAGAGGGCCGGGCACAGCATCAGCATTAGCACGAGAAGGGCCCCGAGGGCTGGGGTCTGATACAGGGGCTCCGGCTGGAGGGGAAAAGGGGATGTCGGGGCGTGGGCGGGATTGGGAGCAGAGCCCGCACCCGGAGACTTTAAGAAGGGGGCAGAGTCATAGCTAGGACTCCTTCCCATCCTCGGAAGCCCCGCCCCCACGCAGGCATTTCCCTCCCTCCCCCTTTGCCCCGCCCATCTCCTGCCTTCTGGCCCCTCCCTCCCAGG---ATGGCC--CCTCCTTCATCTCC-----AGATTGGCTCCTCCCCCGGCCCACCGCAGACGGAGGTTAAACGCAGAGTAAGGAGTGGGGTTGGCCAGTGGGCTGAAGAGACGCGAGACGGTGACTGAGTGTCTGGAGCCTCGGGCCTTAGCCCACCCACCGCTCTCGTCTCCCTGGTATCCCCCTCAAGGGCCTTCCT---CCCGTTCTCCC 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GGAGGCTGGGGGAAGTAAAGGGGTGCCTGTAGTACGGAGCTTACCACTCTCTCCTTGTAGACGATGTACTTCAGCCACTTGAAGTCCTGCCACTTGAAGCCAGCGAGGACAAAGAGAGAGTCTCGTTCATATTGCTCAGGTCGCTGCATGGCGCCCTCAGGGTAGGTGATGCGTAGGGTGGTCTTGCTGCCCACGTCCCTCTCAAAGCCCTTCACAGGTGCTGAGTTCAGTCTACAAAGAGCCGGTGTGGTCAG-GCTGGCC s monDom4.chr2 10642022 257 + 541556283 GGTGCCAGAGGTAGGTCAGGAGGCCCAGGCCGGGCCAGGCTCACCACTTTCTCCTTGTAGACGATGTACTTGAGCCACTTGAAGTCTTGCCACTTGAAGCCAGCCAGGACAAAGAGCGAGTCCTTCTCGTACTCCTCTGGCCGCTGCATGGCGCCCTCCGGGTAGGTGATGCGCAGGGTGGTCTTGCCCCCAACGTCCCTCTCAAAACCCTTCACCGGTGCGGAGTTCAGCCTAGCGA-----AGTGTGGTCTGTGTTGGTC a score=8094 s mm8.chr4 117456999 142 + 155029701 AACTCACCTGATCACAATGTCATAGTCGTCAATCCGTGACCCCAGAGACTTGTTGGCGAGGACCCCTCCATTGCCTACAATGATGCAGCGGCGGCAGTGGAGGCTGAGGAGAG--AGCAGAGGCCTGTAATGGTGGTCCCCAGC s monDom4.chr2 10642443 144 + 541556283 AGCTCACCTGACCACGATGTCATAGTCATCGATCCGGGCTCCCAAGGACTTGTTGGCAAGGACGCCCCCATTCCCTATGATGATGCAACGGCGGCAGCTGAGGCTGGGGGGCGACAGCAGAAGCTCCTTGAGCTGGTCCAAAGC a score=6507 s mm8.chr4 117457899 116 + 155029701 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GGTACAGCGCTGGCTCGATGTAATCCTCCCGGTACCGCGAGTTGATGACCCGTTGCCTCTTCTTTTCTTGCTTCACTTCCTTCTCTGTGAAAATCTCATTGAAGCGCATGTCTGAAGCCACCGACTACAAAGGGAAAGACATGCAAACTGTCACTTTGTGGCCACACAAACAAACACTAAAGGGGCATGTGCCTGCCATGTTCAGGACACATGCTCAGGGCACAGAAAGCTCACTCACCAGTCTAGACTTGACTCTCTTGGGAAGCTCTTCATCGAGTGTGTATACATCATCTCTCTTAACCACCAGCTGCGAGCCATCCTCAAACTCCACCTGACAAGCAAGCAAAGGCCCTTTAGCTAGGGTACCAGAGTCCTGTGGGACCTGCGCGCAGTGGCAGTTTCCTGTAGCTAGAGGAGGGCAACTCGGTAGTAAGGACTTTCCATGTAAGGAATGACGGCCATGCCCGAAGGCACAATACCAAAGTGGATACCCCAGATCTGTGAAGGCACTAAGTGACC------GGCAAGTTCTTTCAAGAGCAAAGACAAGCTTCTTGCCCGAGGAAACACTAAATTAATGAAGTACCCTCCCACCCTCAAACGCCCATTCAAGAACCTTTGGCTACCTGGTACATCTGGATGGGGTGGGAGGCCACAAACTTAGCCCCATAGACTTGGCCATCTGTCCATCTGACTTGAACCACTTCACCTTCAGCAGGAGGCCCCAGTTGGAGACAGTCCTGACTCTGAGGACAGAGCAGAGGAGGAGAGTGAAGCGCAGCTCACCCAACCACAGT------------GCTAAGTGCC-----------AATGACTCAGGAAGG---------------------------ACTTCTGCCCACGCACTGCAGGAAAGGCA--------GCTAGCTCTGGGCTGAAAGCCAAGGTACGGTCCGTCAAACAAGGTCT------GCCTTATTCATCTGCCCTAAGCCCTGCTGCCTCTGGGGGAGCAAGCAAACAAAACAAAAACCCCATTACTCAGTA 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ACCTGCAGTGCACCGTGATGGGCCCATCCTGGCCAAACTGCTCCTTTGTCTTGTGCACCTGCCCGATGAAGTCGATGAAGCCTTCACCTGTTTTGGGTACTCCTTGCTCTGGCCAGTCTGTAAACTGGAACTGTCGGATTGTCCTTGACTGCCCATCCTGGGAGAGAGGGTCAAGGGTCACAATGAAGGTTTGGATGTTAGGTACTAGGCCCTCTAAACCAGGAGCACAACCACCCAGGG s monDom4.chrUn 138545300 225 - 174229318 ACCTGCAGTGGACTGAGATAGGCCCGTCTTGCCCAAACTGCTCTTTTGTTTTATGTACTTGGCCAATGAAATCAATAAACCCCTCTCCAGATTTTGGCACTCCTTGCTCTGGCCAGTCAGTGAACTGAAACTGCCTCACTGTTCGGGACTGACCGTCCT-TTAGAG-GGATCATATACCAGAAGAAGGGTC-------------CAAGGAATTCCATGCCATGACAGCAGTCACGAAAGG a score=7389 s mm8.chr4 117708892 168 + 155029701 AGGGACACATCTGTGTGCATATTCTTTGGCTGACACTCACCCGGGCGTCTGTGACTTTGAATTCACGCAGAATATACTGGGGCATGTTGTACTCAGCCATCGGGTCAACAACGAAGTACTGATAGCGAGCGGAGCGCTCTGCTGGCCAGTACTGGTGACATTTCTCCT s monDom4.chrUn 138549640 166 - 174229318 AGGGGAAAAGCTAAGTGGATGAAATCCTGTTAAC--TTCCGGGAGCATCTGTGACCTTGAATTCCCTTAGGATATACTGCGGCATATTATACTCAGCCATTGGATCTACCACAAAATATTGATACCTTGCTGAACGTTCAGCAGGCCAATACTGGTGACATTTTTCCT a score=8589 s mm8.chr4 117709273 146 + 155029701 AGAAGGGGTGGGCTTACCCTGCCCATCTCCCGAAGCTTGGTCAGCATGACGATGATGGTGGAATTGTGCTCCCATAACATGCGCCAGAAGTCCTCGGTGCTCTCTGCCAGAGGCCCCTGTGTAGCTATGTAGGCCTTCTGCTGTCT s monDom4.chrUn 138552056 146 - 174229318 AGAAGTAATGTACTTACTCTGCCCATTTCTCGGAGTTTGGTGAGCATCACAACAATTGTGGAGTTGTGTTCCCACAGCATCCGCCAGAAATCTTCAGTTGTTTCTGCCAAGGGTCCTTGTGTTGCTATGTAGGCTTTTTGTTGCCT a score=10052 s mm8.chr4 117709582 238 + 155029701 CAAGGTACCAGAAGGGGCACAGTGGGGCAGCAGGGAGAAGCATGCCGACCTGTAGCCATCTAGAAAGCTGGCATTGATGTAGTCTGAGCCCTCCACACCACGGATGGGTTGCAAGCACACTCGGGTCAGCTCATAGGGCATGATGTTCACTAGGCGGTTCTTGAACTTGTTGCAGGGCAGGTTGGCACTGACAAAGCGCGACGTGTGGGCCTTGGAGTTGGCCAGCAACTG-TGAAGAG s monDom4.chrUn 138552794 219 - 174229318 CAATGCATCAGGAGAGTAACAGTAAGT--------------------ACCTGTATCCATCAATAAAGCTGGCATTGATGTAATCAGATCCTTCCACCCCTCGGATTGGCTGCAGGCATACCCTTGTGGATTCATATGGCATAATATTAACAAGGCGATTTTTGAATTTATTACATGGAAGATTGGCACTGATGAATCTCGAAGTGTGAGCTTTAGAGCTAGCTAGACGCTGTTGAAGAG a score=13448 s mm8.chr4 117709848 350 + 155029701 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GCCCCTCCCACCCGGGGGGCCCTGGCGGTCAGCACTGAAACGCGAGCTCCCAGAGACACAGAGGCGCACACGCATGGAGAC-----ACACATGTGGACAGACCGACAC-------GGACGCCCCGAGGGAAGGGGCCGCAAGGCCTCATCCTTGTGGCCGCGGTCCGGCAGGGGGAGCCCCGAGCGGAAGGGTCGGGCCAGGCCCAGCCACAGACGCTCACCTCTTAAAGAGGAGGATGGCGATGACGATGAGGATGATGAGGATGACGGCCAGCACGGGGCCCATGACCCACAGCATCTCGGGCTCGTCCTGCTGCTTGGCCGAGGACACTTCCACGAGGATCTCATCGGAGTAGGGGCTGGCCGCGTACT-GCCTCTGGGGACACA---------CAGCGGGAAGCAC---GGCCGTCAGGGGACGG--TCAGGAGGGGCGCGGGGGTGACCGGGGGCCCTTGGAG------------GAAGGGAGGCTGCGGCGTGCTC----TCCAGGCTGAGCACGGCCGAGGCCGAGGGAGAGAGGGGGCGGGGGGTG--GCTGCACACCAGAG---AGGAGCAGCTGGAC a score=10582 s mm8.chr4 117721014 320 + 155029701 CATAAAGGCGGACCTGCA------CAGCCGAGTGCACACACACACACAGACCCGCTG-----------------TTTCCGTCCATCTGGGCACTTAACACTGCACCAGAGGGTACCAGCGAGGCAGGAGGCAGGTTCTGTCCCCCAGAACCAGGCGCGG-CACTCACCTCTTGAACAGGAGGATGGCGATGACAATGAGTATGATGAGAATGACCGCCAGGACAGGGCCTGTCACCCACAGCATCTCGGGCTCCTCCTGCTGCTGTGCTGGCGTCACCTGGACTACAATCTCGTCCGAGTAGGGGCTGGAGGCGTAGCGCTTCTGGGGTC-CAGGGAAGGAAGCA s monDom4.chrUn 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s monDom4.chrUn 29218716 1021 - 174229318 GCACACACCTTGCTCCACAGGCATGGTCCGCGACTGGATGCTGGGGCTGAgcggccccgggccccgggcggTGTGGGCGCGGACCTTGATGTCGTAGGTGGTGTCCGGCAGGAGGCCGCCGAGGGCGAGGCGGGTGCCCCCGGTGAAGGCCTGCAGCTCGTGCTGGCTGTTGATGTCGCGGTAGAGCACGGTGTAGTTGGTTATGCGCCCGTTGCGCTCGGCCAGCACGGGAGGGTCCCACTGCAGCTCCGTGGTCGACGTGGTCAGCCCCACCACCTGCAGGTTCTGGGGGAAGCCGCTGGGCGCGTCTTCGGGGGTGGCCACTTCCTTCTCGGACGCCTCGCCGGGCCCAGCCCGGTTCTTGGCCGACAGGCGGAAGACGTACGTGGCGCCCTTGTGCAGGCCGGTCACGGTGAAGTGGTGGTCCTCCGGGCCGAAGGCCACCGTGGTGGGCCTCTCCTCGTCCGTGCGCCGGAATTGTAGCCGGTAGCCCAGCAGCTCGCCCGGCACGTCCTTTGGCGGGTGCCACTGGATGAGGGCGGTGTTCATGGCGGTGGCGCTGACCATCATGGTAGGCCGGCCTGGGACTGAACGAGAGGGCCCCCCGCCGCCGCCGTGAGCCGCCCCCTGGCACTCTCTCTGGCCCGGGGCTCGGCGGACACCCCCCCGCCCGGACTCTGACCCCCGGCCCGGGCTCACCTGCCCCCGTGGTGGTGACGATCTTGGGCTTGCTCCGGGCCCCGTCCCCTTTGGTCGTGTAGGCGGCCACGGTGACGGAGTACGTGGTTTCTGGGGTCAGGCCTCCGATGGTCGTCTCCTGGGGA--GCGAAAGAAGGGTCTGGTGGGGTTCTGGGA-----------------------AAGACGGGCGGCCCGGGCGGCCGAGCGGTCC----TTCGGGTCATGTGTGATCTGGCAGG------------------CCCGGGGCTAGCGGGATAGCAGCTCCGAGGTCCCTGCCTTGG---------CCCGGATGGCAACGCTTCAGCCCTTGAACAGAGAGTTGGAGCCCTCTTTGTGCCAG---GGAATAAGGGACC 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CACCGTCAATGACATACCTGAGCCTCAGCCAGCATGACATCCTGGATGATGGGTTGGCCTCGGGGCTCACCATTCTCCAACCGCACATAGGTGACCTGGTAGCCACGAATCTGTCCGTGCTGCTTGTTGGGGACGGGCAGCTTCCAGGAGACATGCACAGCAGTGGAGTTCAGAGGCTCAACCTCTACCTTCCGTGGTGGCCCGCTAGGCACTAG s monDom4.chrUn 138734735 215 - 174229318 CAATATTAGAGAATTACCTGGGCATCAGCCAGCATGACATCTTTCAGCATGGGTTGACCCTTGGGCTCACCATTTTCCATCCTCACATAATGCACTTGGTATCCTCTTATCTGGCCATGCTGTTTATTGGGCACAGGTGAGCGCCATGACACTTTAACAGATGTTGAGTTGACAGCCTCTACCTCGACTTTGCGAGGAGGACCACTAGGAACTGG a score=556 s mm8.chr4 117728824 126 + 155029701 GGGCCAGGCAGAGAAGAG--AGTCAGATATGGAGCAACAGCGCCTGGCTTAGGCACGTACAGCTAACTTTAGGGCCGTGACTCTG-----CACCTGCCCCCTTGGG---AAAGGTTCCAATGTTGTTTCTTTGGCT s monDom4.chr3 442286497 132 + 526135210 gggacagggagacagggggaaggagggaagggaggggagggggtggggtggggTCC--AGGGTTAACGCCA--GCCGGACCCCTGGCCGCCACCTGCCCACTGGGAGCCACAGGTACTGGGGCGTTCCCCGTGGCT a score=761 s mm8.chr4 117729281 127 + 155029701 AGACCATTAAGCCTAAATTTAGAAAATGAGTCTGTCAGGTCCTGTGGAGGGATCTTGGGTGCTTGGCAGACAGCCTCAGGTGGCATGCTTCTCATCCCCACCCCTCCTCATAACAATGTTACCCACT s monDom4.chr3 442287896 115 + 526135210 AAACCCTTGACCCCAGCCCTTGTCATTGGACCTG---GGTCTTGCG-AGGGGGAGCAGGTGCTGGGA-------CTCAGG-GCAGAGCAGTCCACCCTCCCCCTTCCCCCCACCCATGGGGGTCCCT a score=9322 s mm8.chr4 117729408 386 + 155029701 GCAGCCTACCGTCCTCATCGGTGCGCACCAGCACCGGGCTGCTCTCAGGGCCAGGGCCCACATCTGTGTGTGCCCGCACCCACACCCGGTACTCCGTCCACTTCTCCA---GGCCCAGCAGGTCCCAGCTGGAATGCTCACGGCTGATGCCATCCACCACATGTCGCTTACGGTCTTCGCCGTCCACTGCCTCATAGGCCACGGAGTACTGGGTGATAATGCCGTTGCGGCTGTCGGCCGGCGGTGGAACCCAACTTACCCGGACCGTGGTGGAGCCCGTGCTCACACATGTCACCTTCTGGGGAGGGGCTGATGG-----------------GGCTGGGGAAGACAAATGGGGGGAAAGCAGGCAAATGG--AGGGTGGGGACCACAGGCACAGTGACCAAGTAACA s monDom4.chrUn 138735854 405 - 174229318 GCAACATACCATCTTCATCGGTCCGAATCAATACAGATAAGCTCTCGGGGCCAGGTCCAACATCAGTATGGGCTGTCACAGAGATCCGGTACTCAGTCCACTTTTCCAACTGTTCCAAAAGGTACTGGGTAGTGT-CTGAAGGT--ATTCCCACAATCTCATGAGGTTTGTCATCTTCCCCGTCCATTGCTGTATACTTGATGGAGTATTCAGTGATAATTCCATTCTGTTTTTCCACTGGTGGAGGTTGCCAACTTACCAAAATGCTAGTGGAGCTGGGGCTGGTGCAACTAATGTCTTGAGGAGGAGCTGATGGCTCTTATTTTTGGTAGTGGATTAAAAGGAGCGTTTGAGTGAAAGGATAGGAGTGGTTGGGGGGaaaataataaacaaaagaaaaaagtaaaa a score=4229 s mm8.chr4 117732880 158 + 155029701 AGACACTTACTGGACTGTGCTGTACGGGCCTCTACGGTGGGCGTGAAGACGCCCACCCCCAAATCTGAACGGGCAGCCAGCTGGAAGTGGTACAATGTGTCAGGCTTCAGGTCCTCCAGAGTGTAGGAGGAGGTGGGGTCGAAGGTCACCTTGTGCTG s monDom4.chrUn 138739412 158 - 174229318 AGACACCTACTTGACTGCATGGTTCTGGCCGATATTTCGGCCGTGGAGGCACCCAGGCCTTGTGGAGAGCGGGCAGCGAGGCGGAAATAGTATAAACTGTTGGGTTTCAGCCCTTGAAGGCGGTAAGATGTAGAAGGCTCTATGGGAATCCGTTGCTG a score=2605 s mm8.chr4 117733470 172 + 155029701 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CAAAGCCCCT-----ACCTACCTCCCTGCTGTGTCTTGACTTGGATGGTGGGGCTGGGTGGGCCGTCACCCACAGCAGTGAAGGCAAGGACTCGGAGGCTGTAGGTGATGCCAGGTAGCAGGCTGCCCACGGTGGTAAGGAGTCCTGCGTCAGTGTTATGCTTGTGCCAGGCGCTCAAAGGGCGTCGGGAATCTGGGGTATAGTAGACGCGATATCCCCGTACCAGGCCATTGGGCTCTTCAGGTGGTTCCCACTGGACCAGCATGGTGCTGGCGCTAAGCATTCGAGCCTGCACACGGCGCGGAGGGCTGGAGGGTGCCTGCTCCCCCGTGCGTGCTCGCACTGCCTCACTGGGTGGTCCTCGCCCAATGCTGTTAACAGCCAACACACGGAAAGCATATTCCGAAAAGGGGCTGAGGCCACCAATGCTGTATCGGGTGCTGGCCACACCATCCACTTCCTGGAAGGGGCCGTCTGTGCCAGCTGCGCGGTACTGGATGCCGTAGAAGGACACAGGCTCGGTATTTCCAGAGTCCCATGTCAGAGTAACACTGGTGGCGGTTGTCTCTGTCACCACAAGATCAATTGGAGGCTTTGGCAGAGCTGAGGAGAAAGAATTGTTAGATATCATGATTCTGAGGACAAACCC s monDom4.chrUn 138750605 649 - 174229318 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TCCCTTCTCGTGTGTGCTGCCGACGCCTCACA--CGGTCTCCCAA---GGGGGCAGCCGTCTGGGGATTAGATTTCAGCTCTAACTTGGAAGTCTAGTT-TCTGTGCTGACACCCCT--------GGGAAGGGGGGCCTGCGCAGCCATTGGCATCCA--CGGGTGACAGGTTAATGGAGAGGGGCGGAGGGAGCCCGCCCTGCCGGCAATCTGCATCCACTGCCCGAA--TTCTGCG-----------GCCCCCTGAAGGCGGGGGGAGGGAG--GCACTGGCTGCACCGGGACAAAGTACCTC a score=11570 s mm8.chr4 117742833 1146 + 155029701 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s monDom4.chrUn 46546342 1196 - 174229318 TAGCTTGGTATTTTTACAGGAAGTTGACCTCACAAGGCCCAGCCCAGAGCATGCACCCAGCCCTGTCCAGGTCCA--------TGCAGATGTCACGCGTGTGAGCGCA---CGTGTACTATGCATCTACGCGTGTGGACATGCCTAGGCTGAGGAGGGGC--GGGGGACGCTTCAGGCAGGGGCAGCATGCAGGGGGGGCAGGCGAGGAACGCGCGCC----------CCTGCCCCCCAGCGGCCGGGCTGGTC------CTGGGCCCCAGGCCGACAGGCGGAGTTCAGGCGGGCGGGCGGCGGGCAGGTGGGCCTCGGGGGCTCCCCTGTCCCTGTGGCCAGGTCCCAGCTGACCTGCG--------GGGCTGTCGATGGAGAGATAAGAAGTGAAAGAGACCAACCTTCTCGCTGATCTGAGAGATGAGAGTTTGGGTTGATGGCAGAGTGCGATGAGGATGAAGAGGGAATAAAAAAAGACAAGGAGAAACAC--AGAGAGTAAAAACAGGCCAGGCTACGGCTGCCCACACAGCAC-GAGACAGACAGACAGACGGCCTTCTGCCCCGCCCCACCCCACGGAC-CACACGCGCGGCCGGCCTGAGCCCCACACACAGACTCGAGACTGACTCATGGAGA-ACGAGGTGGACGGGGCCGAGGCCCCC------------------GCGGACACTCACGGCAGGAGCTGGGCTGGGGCGCTCCCCCCGGGGGACCTTCCTAGTGGGCCAGAAGGGCTGGACCCAGAGGCTGCACCTGAGAGAAATCCCTGGGA--AGGAGCCCCCCGGATCCCAGCCCCCCTCTGGAGCCTGTGGGACAAAAGAAGTGTAGATGGCTCAGGGCCTCGATGGCAGCGACCTCACCCTGCTCACTGGGCTCTGCGGTCCAGGGCCA-GCCGCGGTAACTGGATCCTGGCTGGGCTGGCCCGAGGGCAGCAGGGAGGGAGCCAGAGAGGCGGCTGTGTCTCCCAGCCCGTGGAGGCCGCATCTGGAGAGTGAAGCCTGACGAGGCGGGAGGGCCGGGGCCCCGAGAGGAGCGGAGGG------GGCCGCGGGACCAGCTGGGGTGGCTCTGGACGCCTCCAAGCTTGGTCACTAACTCCAGAATC---AGACAGGGCAGCCACTCCCGGGGAGGCCAGAGAC----TGGGTGCCA--AGGGCCCTACTCACCCGTGAGCATGGTGGGTAGGGGAGACCTCACAGAGGGAGGCGGGCCAACTCAGTGGGACGAGGCTGGCAGGGC 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GGGCTGCCTCTCCCCAGGGCTGCAGGATGGGCCGGCTACCAAGGCTGGAGGCAGGA---GCT-TGGGAA-------GGTCCCCTCTCCAGGCCTGGCTCTG---GGCTCAGCTCAATGAACTGCCAGCCCAGCTCCTGTCCTGGTCTAACCCCCTGACCCCTCGGGTGTTCGTACTTGCAGTGGGCGAGTCCACGGGAGTTAA-----GAGGAAGGAAGAA----------GTTAACACAAATGGGTG-------------AGTGAGTGTAGACCCGGGGCTGCAGCAGGCGCCGGGGATGAAGTGGACAGTA---AATGGAG-TGACACACAG-------------GCGAGGCggcgtggcgtggcgtggcgtggGGGGCC-------ATGGTCCGCACTCTTACCTCTGATCGGTGAGCCCCCTGGCCAGGTTATGTGGATGCAAATAAGATCAGAGAGAAGCATTAGTACAGAGAGGA a score=312 s mm8.chr4 117750082 54 + 155029701 GGA----AAGCCACACAAAGCCAAATCAGATAAAA--CAAAACACTAGAAAGGGCTTTAA s monDom4.chrUn 138758367 60 - 174229318 GGAGGCTAGGGCTTTGGAAGAAGAATCAAATTAGATTTACAGAATTAAATAAGGTCTTAA a score=1832 s mm8.chr4 117751121 50 + 155029701 ACCCATCTGGAAAAAATACCCATCTCTATGCACGAATGAGGAAAAGGAGG s monDom4.chrUn 138759722 50 - 174229318 ACACATGGGGGAAAAATACTGTGTTTTATGTATTAGTGAGAAGAAAGAAG a score=2514 s mm8.chr4 117753945 936 + 155029701 GGACAGACTGTTAGAGCAAAGGTGAGGCTGGCAGGTCTCTGGGCTAGAAGAACCCACCTGGGCTTCAGGCAAGGAGACAACA---GCACAGC-TCGAGGAAATCAGGGGTGGCAAAGCCCGAGGGAGGGCAGGAGGTTTGCTCAAGGAGGAGGAAGTGCTGTCGGTCACTGTGCGGACA----AGAAGGAAGAGGCCTGCG-----------------------CAGCATCCCGGGGAGTCATGGGCAGGGGAGGGGtggcacggggtctggcaca-------cagcaagcgctacataaatacttgatgaacaaatgCTGCAGACAGCGGGCCTTCCCAGAACTGCTGCCTGCCACAGACAGTCAATGCCATTCCGGGGAGGAGTC--AGGCCTGCGGGGAGGACCGTCTGGCAGCATGGGGAACCTGCCTGGGGGC-------------------ACCCATGAACAAATACAGGGG--------------AGCGGAGCCATGCCGGCCTCTGTGCTGTGCTGGGCAGCAGCCACAAACACTGCCGGACCATTTCCTGCCTTGATTATGGCTGTTTTAATTAACTGCACTACAGCTGCCTCCATCTTGTTGAGTTTTAATTAAATTAAATGAGCTAAC-ACTTCGTGG---------GCTGTCTCAGGCGGCCGTGGCTGGGGCCGGAATCCTGCCCTGCTGGG------------TGTCTCATCACTCCC---TCCTCTTCTTGGGTACCAAAATGGTGTGGGC-------CTGAAAGGAGGGGCTAAGGAGGGGCTGGGACTGGTG------TGTACCTCTGAAGC--CAGAAGAGCCCTAAGAGAAGCAGACACACCAT-----CCTTCATGGTGTTGA------CATCACAGCTGATAGGC------------AGCAGGAAGTCA--------------AGCCACG----TGAGAAAGGCCTACCTT------------CTCCCAGACAG--------------CAGGACTTTTGGAGCCAAGTCTGTGGGTCTGTCCTGAGCTGCTAGCGGGTGTAGAACACAGCCCAGCGGATTCTGAGCCTCGTTTCCCACCCACTCCATCCCTACAA s monDom4.chrUn 46560705 1071 - 174229318 GGCCAGGCAACTGGAGCTGGAGGGAGGACAGCTGAGATCTAGG--------ACACAGCTGGGGCTCGGGGCAAAGGTCAAGAAAGGCCCAGCCTCGCTGGCTGCAGCCCAAGCCAGACCCCACGGGGAGACGGGG--TAGCCC--GGAGCAGCACGT--TTTAGAACAC-ATGCGGACAGGGCAGAGGGAAAAGGCCTGGGAGAGAAGGCTCGGGACGGAGGCCCGGCCTGTGGGCGACGGATGAGCCTCAGAGGGG----AAAGGGGCTGACTTAGGCAGGGCAGCGGGTTGTGAGTCAGTGAGCTCTCCACCACTG--GGAGGCTACAAGTCCTTGGGAGGCTGCAGTGTT-----GACCTCCTAGGACGGGTCGGGGGAGAGTCCTGGGGTCCCGCAGGGGCCCAGTCGGC--CAGGGGAGACCAGGAGGGGAGCCCAGAGTTCGGCTGCTAATACTCCCACACGCAGAAGGGGGTGCCTCCAGAATTCAGCGAGGCCTGGCCAGGCGGTGT------CTGCACTCCAAGGATGCGCAGCACCCCCCCATCCATGGGCCTTATTACAGGTGCCTTCATTAACTGCATTACAGCTGCCTCCATCTTGTTGAGTTTTAATTAAATTAAATGAGCGGACTCCTTCCTGGTGGCCCAGAGCCGTCTCAGGG---CACGGCCGACCTCCCCAGCCTGCCAGGGAGGGAGGGAAAGCATGTTTCCCCCAACCCCCGACCCCTTCCCCAGGGTGGGAGGACCAAGTGAGCTCTCCTCCCCATCCGAGGTGCCAGTAGAGGCTTGGTCCTGGTCAGTGTCTGTCCATATGGAGCTGCTGGAAGGCTGGACGAGA-GCGGCTACTCCCTGACCTCTCCCAGGATGCTGAGCACATCCTCAGGGACGGGAGGCCTGCTCTGAGGAGGCTGGAGGCCACTGTCCATAGGGGCACTCATGGCCCCGAGCAGAGCCTACTCTGAAGGTGTCCGGCACACACACACGTACGCACCGGGGCCTGGGCCCTTCCAGGCAA-TCAGGAGGGCTTCCATGGGCTTCTGGCCTGGCCACACCAC--CTCAGAGGGGTC----CCACGCTTCCGCCGGCCTCCCTCCTCACAG 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CCCCACTCCAGGCCACCCGGTAACCATGGCGACGGCAAAGAGGCGGGTGCCACGGTGGAAGGGCTGCGCGCGCTTGTGTCCGAGCGGGTGCGCGCCTCCGCATCCAAGTCCTACTGGGCGCCGCCCTTCCCGCCCCCACCTAGGCGGAG s monDom4.chrUn 46567462 125 - 174229318 CCCAGCTCAAGCCCATTTGGTTACCATGGAGACGGT-----GGGAGAGGGAATGAGAGAAGAAAAGCGAAGGCCCCTGAAGGGGAGAAAGCAAGCA-------------------AGGCCCCCCCCCCCCCCCCATGGCTTAGGCTGGG a score=2324 s mm8.chr4 117759824 135 + 155029701 CCTGGGGCGGAGTCTGGGCCAGAGGCAGGGGGCTGCACCAGGAAAGCTAACAGATGGAGATGCCTTAGAGGGGAGGGTGGTGGCTGTAAGGGAGAGCACTGGCACCGTCTGTCAGAGAGACCTCTTCACCCGTGT s monDom4.chrUn 46567993 101 - 174229318 CCAGGAGGGGGGTTGGGG---GAGGCCGAG------CTCACACAAACAAACAGATGGAGAC------------AGAGTGGGGGCC-------------TCCGCCGCGTCTGTCGGGGTGACCTCCTCACCCATGT a score=-4391 s mm8.chr4 117759959 526 + 155029701 TTACCCAGCTTCATGGCATCTCTGAATACAGGCCCATATGCGCATGCACATAGACTGGCTCCCCGGGGTGGCACAGTCTGTGAGGCTGACCCCTCCTCTATGCATG----AGTGTATCACCCTGTCCCTGAACACACAGACACCTTAGAAACACGCACAGCCAGGGACCTAGAGAACTACGAGGAGAAAGAGACAGGTGCAAAAATAGAAACCTCCATGTGCCTGTGGCGGGGCATCTGCAGTGACAAGCACCTGTGGCAACAGACTCCTGCAGGCAGATCCAGAGGCGGCATGCAGAGGTGTGGGAACACGGGTGCGAGGACATGCAAAGTCAGACACACACATGAAGAGACACACGCACCTGGAGACACAGTAAGACCAAACCCACAAACAAACCTCTGTGGGTGG------CCAGGCCCCACCCTG---CCCTTTGGCACTCCAAGGAAGCC-CAGGGCCACCTCAGTTCAGCCCCCCAGAACAGCTCCA----TCCTCAGCAGAGACAGGGTCAAGACAGAGCCCTCCCCAAACCTGTAA s monDom4.chrUn 46568095 440 - 174229318 TTTACCAGCCGCCTG----------AGCCGTGTGCACACCCGCACCCACACACGCAGACGGCACGGGCTGGAGCCCCC-------CCCTCCCCTCCACCACCCAGGCGGCAGCGGCCCATCTTCCACTCGTCAAACCTGGCATCTTAAAAGGCTGTTTTGTTTTCTA-ATCGAGAGCTGTTGGGCTCAGCCTGAAGATGGATGACGAGG-----------------GGAGGGGGCTTCACA-----CAGCTCCCCTCGC--------CCACCTGGC--ATTCA-AGGCCTCTCCCTTGGGTGGGGGGTCCCGGTC---------------------CACTCACG-----------------CTTGCCTCCCACCAAGGCC-AACATTCACCCCATTTTCTACAGATGGAGAAGTCAAGGCTCTGGGCTGCTCCCCTGAGCCAGACCTTGGTGGCCACAAGGCTA------GGCAGCTGCCATGGGGAGCTCCAGGGCCTCTCGG--------AGGCTCAGCCTCCGGCCTCTCAAAGCCCGAAG a score=2548 s mm8.chr4 117760485 264 + 155029701 GCTCTCCCGCTCAGTGCCTAGCCTGCAC-CCCACCCCCAGGCTCCCAGGCGGTAAGGGGGGCCCAAGGGGCCTCAGCGCCCATCTCCCTTCGCAGCTTTCAGTCTCGACTTTCAGCTGTTTTTCCAAGAGAAAACTCCCACCTCTTCCAGCACTCAGATTTCATCAAACTTGGCATCTTAAAAGCCTGTTTTGTTTTTGAGTCT-GAGCTGTTTGG---GGCCTGTCGGCAG---------------------CCACGG----CCTCCCCCACTCAGTAATCC---CCCCTCCCTTG s monDom4.chrUn 46568094 248 - 174229318 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CTCCCCCACCCTCACAGCGCTCCCGAGGGAACAT-------------CTGGCCTCGCTGAC-------CATGGCCACAAGG----AGATCTCCAGCCCCCTGACTTGAGGAGCCCCAACCTCGCTGACCACCCGCAGGAACAAGGAGGGCATATGCGGCGGCCCCCATCTCACAGGGGGATGGCAAAGGGGCCTCTGACCTCGCCGGACGCCTCCCAGACGTCCGGCCTCACCGCCCGTCACTCTCGGCCCAGAAGGAGAGGTCTGGCCTCGCCGGCCATCACCAGGACCGTGAGGCGCC---CTCTGGGGTCCCGGCCC----GGCCCGTACCGTCCAGCACCGTGAGCTTGGCACTGACGTTGATCTCGCCCAGGCTGTTCGTGGCCGTACACTCGTAGATGGCCTCGTCACGGTGCACCCGCAGCGGCTGGATCCGAAGCACAGAGCCAGCCCCGTCGTCAAACTCGATCACCTGGCGGAGGGGCACGAGTGTGGGAAGGGGCTCCCCCGGCCCCCACCAGGGGAGTC---CCCCAAGAGAGCCTCCCCCGCCTCTGCT-----CCCTGGAATCCTCAGA----------CCCTGGACCGGGCCTGCCCTGCCCCGGCTCCCCTGCCCTCCATGGCGGTGGTGCGTGGCCTCACCTCGAATCGCTGGGAGCTGACCTTCTTGCCCTTCTTCATCCAGGTGATTCGGGGCTTGGGCTCCCCCGTGGCCTGGCACACGAAGGAGGCCACGCCGCCGGACAGGCCCGTCTGGTCCTCTGGAGCCTTCACAAAGGTGGGTTTACCTGGGACGGA a score=2408 s mm8.chr4 117775255 156 + 155029701 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AGATGGGGGGGGTGTGAGCAGACGAAGGA------------------GGGGTCAGAGG--CTGGGGGAGATGGGGGCTG-AGTCAGGATGGGGGGAATCCATAAGACAGAGGGG---TCAGAGACCCGGAGGGGGGCGCCCCGTCAGGAGAGGGGTGCACATGGGGGAAGGGTCAGAGGCTGGGGGAGATGGGA-------GCCCAGTCAGGAG---------------------GGGGTTGTGCACACTAGGGAGGTGTCA----GAGGCTTGAGGAG-------GTGGGGGCCCGGTCAGGAAGGGTAGGGGGCACACGG--------------GTGCGGGGTAGGGATCAGAGCCTGGAGGGCCAGGCACCAGTCCGTCCCGCCGGGTTTCATCTGGCTCCGGCCGGGTGTGGGGGTGGGGGTCGCTGCCTCACCGCCCCTCCCCGGGAGACAAAGAgccggcggctccc-----------------cgccgggccggccgcccgcccTC----CCTGCGCGCGACGCTTACCTgggccggccccgggaccggagcgcggggctgcgggcccggcctgctccggggcgcgcTCTCGGATCGGCTCCGCTCGGAGGCGGCGGTGgcagcagcgagagcagcggcagcggcagcggcagcgggagcagcagcagcagcagcaatagcagcagcCGGGCCGCCTCCGCCTCAGCGCAGCCTCCGCCTCCCGCTCCGTGAGTCACCGCGGCGGGGAGGGCGCGAGGGAGGCGCCAGGCCGCCGGGGGTGGGACCGGACCAAGGGCAGCCTCAGCCCAGCACAggccgcggcgcgggtggcggcggcggaggcggcggctgctgcagcaacgtccgccggcggggaggagggcgcggcggcctagaggcgg-gaccgggagctttcgggggc-------ggggattg--gacggatgtgggggcggggCCA----AAAGGAGAAACGGCGCTTCCACCGGAGGGGGCGGGACCTGGACGGGAAAGAGGCGGAGCTGCGGAGGGAGTG-GGCGAGGTCTGCAGCCGAGGAGGCGGGGCC--TAGATGGGGAAGGGGGC------GTGATCGTAGTCAGGCTCTCTTTTAGAGGGGGAGGAGTCTGAGGGTCGTGGGCGGGGCCTGGGCAGGGAAGGGATAGGGCTG-----------ATCCTGGAGCTCTGTGGAGGTCGGAGAAGTGGCGCGGAGAGCACCCAGGGG 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AGCCCCTCCTCAGGT--GTATGTGCTGGGGAGGGGGAGGGGCAG--CTGGATGAGTATTTCTGATGGGGCACCCTGCTTCTGTCTACGAACCTCATGCGTGCACCCTTGCCCAGCACAGGCTCCTGCCTTGA-TTGCTGACTTTCACTGGACCCAGGAGCTAGGTTCTTG---ATTGGCATACCTGGAGGGATGTCTTCTGTACACAGTGAGGCTGGCAGCAGCCGCAGCTCCATGATGGCGTCGGCCAGGGCCTGGCGAGCAGCAGCCCGGAGCTTCTCCTCCAGTTGTACTATGCTAATGTTCCCCTTTTCCCACACGTCCAGTCGAAGCCGTGGGGATCCATCCTGAGCTGGA----GGGGAAAGTGGAGGTCACCTGTGGTTGCGGTCCACCCTAACTGCTGCCTGTGCCTTCACAGCACTGAGGGAACACTCCAGCCCCACAGGCTGTCTTACCTG-AACA--ACTGTCCAATGTGTTTGGGCAGCGAATGACCTGAGTCAGCTGCTCAAATTCTTCTTCTCGTAGTGGGTCTGGGGGCCCCGGAGAAGAGGGGGGCCATGATGCCAGTGAGATGGGGGTTCCTCCTTCTTCCACAAAGGCTAGAGTGATGCAGGCAACCCCTGTGAGGAAAGCCATTGGAAGACTCAGCCT-TAGCACTTGCAC--ACAGCCCTCTCCTGGACCCCTCAGCAACCAGGCTCTCTAGCCT s monDom4.chr2 10855607 673 + 541556283 AGGTTCTCCTGAGCTTGGGACTGGCGGGAAGGGGAGAGGGGAAGTGCTGGATGGGTCCCCTCGA-----CTCTTGGCCTCTAGTGAAGCACTCCCTGGGCTC-CCTGGGAACAGCAGACACAACAGTCTTCAGTTACTGCCCCTTCCCAGAGCCAGGG--CAGGTCCCAGGGCAACAACATACCTGGAAGGGCCTCCTCTACACACAGAGGAGCTGGCAGCAGCTGGAGCTCCATGACAGCATCAGCCAATGCATGTCGGGTGGCTCCAcgcaatttctcttctagctgtaagcggctgatattccccttctcccatatgtccagccttagctgcaagacctggccctgacctgggtgggggagaaagtgggggtagtc---agttgaagccaagcttacctccttcc--------------------------ctccagcc--atctttgggcctacctgcagcagtacTGTGTGCTGGGGTGGGGCAGCAGGTGACCCTGGTGAGGCTCTCAAACTCAGTATCCTGTAGCAGGTCCAGGGATCCCAGGGAAACAGGGGGCCAGAGCCCCAATGAGATGGGGGTGCCCCCTTCATCCATGAAGGACAGTGCAATGCAGGCAACCCCTAAGGCAAAAGACTTAAGTAGGTAGAGTCTCCAGGGAATGCCCTGTCTGACTTTCCCTCTCAACTTGAGGGACC---CTCCCCAGCCC a score=4417 s mm8.chr4 117873968 102 + 155029701 ATTTACCTTTGCCACCAGTGCCCTGTCCACCAGGTTTATTATACAAGTAGATGTCCAAGTCGGGGAGGCCACCCTGTGCTGGGAGTGGATGCTGGAGAGAGA s monDom4.chr2 10856336 102 + 541556283 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GCTGGCCAGGGCCAGCTGTTCCCTCACCTGGAAGTGGTGGCGACTGTTGCTGTCTGTATACTTTGGCGAGTGCAGGAAGATGAGCAGGTTCTGCCGCAGATACCAGGCCAACGCCGGGAGCCAGGGTCGACAGGCAGGTGGCAGCACCAGGTGCAGCACCTCTGAGGGGGGGCTTCCAGGTGGCTGAATGAACTGAAACAACAGAGTCCTGGGGTAAGAACAAGGCT--CAACACAAAACAGCCCAGGACCAG-GGCAGGGT---GCCCCGCTGGGGGCACCAGAGGGGCCACAGTCCATTACCTCAACGTCAGCAGGGGTGAGTTTGCAGTTCCGCACAAGCATGACAGTAATGATATCCAAGGTGGCCTCGTCCAGGCGCCGGTGCAGGGCTCGCACTAGCTCCTCTGTGATCTCAGGGCC------------TGTGGGTGAGGTGGAGG a score=7693 s mm8.chr4 117875586 181 + 155029701 AAGCCTTACCTGCCTGTCCTACGCCATGGACCAGCAGCTGGATATGTCTGTCCACTTGGCCCACAGGGCGCACAGCATCTGAACTGCGGCTGGAAGCCATGTCCAGTGGAGAACGAGGAGCCTACGGGGACAAGAGTGGTCAGGGTC----------TAGCTCCAAGAACAAAAGCCGGAGGGGTGCGTGG s monDom4.chr2 10860786 188 + 541556283 AGGCTTTACCTGCCTGTCCCACACCATGTACCAGGAGCTGAATATGTCGGTCCACCTGGCCCACAGGGCGGGCTGTCTCAGAGCTCCGGCTGGAGGCTACATCAAGTGGGGATCGAGGGCCCT---GTGCCAGGAGGGGACGGGATCAGAGGAAAGAGGGAAGAAAGGATGAAAGGATGAAGGGAGGGTGG a score=21032 s mm8.chr4 117875778 565 + 155029701 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TGAAGGGTGTCTCCCGGCCCCATGCTGGTGCCCTTCCCAAGGAAAGGAGC-TAACTATTCTAAGGATAGCAATAGATCCCTGGAAGGTCTGCGGAGCACTTTACAGACTCGTTTTGGGCCCAATTTCACTCTACCTTCTTTCTTTTTTT---------TTTGACTCTTTA--CCTTAC-ATTTTGGAATCAGGCCTG--GCCCAGCCCACCCTCATCCTCGGGGAATCCTTGGTCTTTCCCTCC----TCCTGACACAGAGGGCAGACA--------GGGCGGGGGAGGGGTCTGCAGTGCACCCAACAGGCGGTTTCCGTAGGAacagacagacagacagacagactgccaggagggcacagacagacagacTGCCAGGAGGGCACCCCGAG--------GGGGG-----------------------AGGAAGGGGGAGGCTCTGACACCCAC--------ACCCGGGGCGGGATGGCTGCAGCTCACTGACCGAGCCTGATTGGTATGTGAAGGTCCGTCTTCGATGGAGGCAGCTTTTGCGGATGCAGACCAGGGCCAGGAGAGCGGCCAGAATGGTGAGGCAGGTGGCCGACACGGAGCCCACGATGGCCAGCACCAGCTGCCGGTCCAGGCCCGGGCTCGCTCCTCGGCTCTGCTGGGCAGGGCCCTCGCTCTCCAGCCCTGAGCGGAGGACAGGACGGGATGATCAGAGCTGGTCGGGCTGAGG---CCCAGAGG a score=15299 s mm8.chr4 117976785 321 + 155029701 CCTCTCACCATTGCCCAGAGTGGCCTCTTCTACTGTATTGCTCCAGTCGCCAAGACCCTGCACACTGGCCCGCACACGGAAAAGATATCGTGTGCTAGCATTGAGGCCACGAACAATGATGCTTGTCTCCTCGGGCCTGTCTACATCCATCCACTGTGGGTCTCCTGAGCCCCCGGCCACCTGAATCTCCACGATGTACTTGGATATAGGCCCAGACGGAGCCTCGGGATGCTGCCACATGAGTTGAATCTCAGAGTCTGAGAGGGCCTGGGCATGGAGGTGGCGGGGAGCTGGAGGCCCTGGGGAGATGGGAAGGGGGAG s monDom4.chr2 11026030 321 + 541556283 CCCCTCACCGTTCCCCAGCGTGGACTCCTCGGCCACGTCGCTCCAGTCTCCCGGGCCCTGAGCGCTCGCTCGAACTCGGAAGTGGTAGCGCGTGCTGGCGTTGAGGCTGTGGATGATGGTGCTCGTGTCCTCAGCCCCTTCCGTGTCCACCCACAAGGGCTCCCCCGAGCCTCCGACCGCCTGCAGCTCCACGATGTACTTGGCAATGGCGCCGGCCCGAGCCTCGGGACGCTGCCAGGTCAGCCGGATCGCCGAGTCGGACAGGGCCTGAGCCCGGAGCAGCCGCGGCGCGGGGGGACCTGGGGAGGCGGGGAGGACGGG a score=24363 s mm8.chr4 117977446 1203 + 155029701 CTTCTATCTTCCCCATTCATCCTGGGTGCTCTCCTCGTCCACCCAGTCTCTTGTAACCTCCCGTCATCCCTAGCCCATCCTT-CCCAGAGTGGGCCTACCGCTGGGGGGCAGGTGCACATGCGCAGGGGGTGAGGCAGGGCCCAGGAGGGTACAGTGATACAGTCGCACATCCAGCTGGTAGTGGGTGCCCGGCGTGAGTCCAGTCAGGAGGGCAGTGCGGGCCTGGGGGAATGAGATGTTCTCCCGCCTCTCCTGTCCCCGGGCCCC---ATCCCACAGGCGCAGCAGGAAACCATCACCGGACAGTGGCACCGAG------GGTAGAGACCAGCTCACACGGAGCCTGTCAGGACCCTCCACGTGCCAGCTCTCTAGCCAGGGCTGCAGCAAAGGCTCTGCGGTCAGAGGTCAGGAGGAGTCAGAAACCATCCAATGGGAGCTTGGGACTAAATGGGCCAATAATCGGCAGTGGGCAAGGCTGGAACAAGCCATGGGAAAGGTGGGGGTCGTCTTTGGAGGTGGACCAAGACATACTGAGTGGGCATGGTAGGAAACCCCAAGGGAACAGAAAGGTATCTATCTTGGCTTCTCACCAGGACAGTCAGTAGTCATAAGGGCAGAAGGTCCCCAGCCTCCTTCTCCTCCTTCCCCTGGCCGGCTCAGCTGCACTCGGACATTGTATCCTGTCTTTGGCTTCAGGTTCATTAATGTCACATTCTCACTGGGATCCACTGGGGAGGGTGGTGAGGTGTGCCACACATGCTTGGTCCC-----CAGCATGTCCTGAAGCCACCACTCCCCCTTACTCCCCTCTTCTTTTTGTACCATTCCCTCCCTCCTTTCCATTCCCACCCCATCCTTCACTATTACACAGCACCCCAACCCCTAACTCTGTCCCCACTCACCCACAATGGCAGACCAGGCAATCGTGCTGTCCTGGGGCCGGTAGTGCAGGCGGACAGAGGAGATGGGTCCATCCCCACTAAAGGAGACCAGTGGGGAGACCACAAGCTGACGGCTCTGCTTGGCCAGGAGTCGAGGTGCAGTCAAAGGCACTGGGGGTACTGCCAAAAAACTGGGGTGAGTAAGGG----TTCATGGAGAGGGGAGCAC------------TCTGGGCTTGGACAGTAAGCACCTCC-------ATATCTTGATTCAGATCTGGGGATTATCTATCGTGGTCGGAGGAGACCAA--GTTCAACAGACACTTGGGATGGCTAT s monDom4.chr2 11026355 1061 + 541556283 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a score=7313 s mm8.chr4 117980182 196 + 155029701 CTCACCTTTGACATTGACCTTGAAGCGCCGGCTGTCTTGGCCACCAGAAGTCGATACGCGGCATTCCCAGAACCCACTGTCCCCAAGAGTCAAACTGGGCACTTCAAACTCTGCTGTGGTCCTGTCTGGCTCCACAATGACTTTGGTAGACTGAG--------ACAAGGAGACAGGGAACAGAGAGTGTATGC----------TCCATG-------AGACA s monDom4.chr2 11028147 215 + 541556283 CTCACCTTTGATGTTGACCCTGAAGTGCCGACTGTCCTGGCCGCCGGATGTGGACACGCGACACTCCCAGAGGCCACTGTCTGTGGGGCTCACGGGCGGCACCTGGAACTCCGACGTGGTCTTGTCCACTTCCATGATGGCTTTGGATGGCTGGGGAGCGTTAGCACATAGACAGAG------GCGTGTATTCACGGCCCACATCCATGGAGAGGCAGCca a score=7478 s mm8.chr4 117980378 358 + 155029701 GGTATGAGTCGGTACTGACGATTGCTGGAACACAGACCCCCCATGGCATCCCCTCACCAGTTAGCCTGCCCTATCTAAGTCATGGCCAGGGCAGTGGGCAGGGCCTATAAAAAAGTTCCGTGGATTAGGGATCCAAG-GAACGAACTGTCAAGCTGGT-GAGATGGGGGAGTGGACAGTGGGTTGGGGTAACCAGCGCTGACCAAAAGCATGGTGCCATCTGGCTTGCGAAGTTTCATGCTGCCCCGCACTGGGAAGGGATTCCCGGCAGCTGCACAGTTGATCCGGGGCATCGTCCCTATGTTGAACTCCACCTCTGTGGCCATACTGAGGATCTGGGGGATCCGGTCTAGAGAGAGAA s monDom4.chr2 11028969 336 + 541556283 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s monDom4.chr2 11060126 1403 + 541556283 TTAGGGGGTCGTTGGAAGGTGGG--AGGTTTTGGGATCCCCAGGAAGAATGGAATATGGGAAAGGGCCTGCAGGGCAGGTAAAGGGTTTCTGATTCCAGATAGCACACACGCCCAAGCAGG----ACTAACAT---------------------GTGAGCCAGACCTCTTAGTGA--TGATGGGAAACGGGAGGATAGAGATGGGGGCCGGAGTGTGGAGACAAGCGGTGAAGGTGACCCCTGATGAAGATGGGAGGCCAGAGGCTGGACCTAGAGGCCACCAGTGAAAGTCAAAGGGGTGGCAGCTGCTCTGAGGTCAGTCAGAGGAGGTTGGCGATGCTGGGTGTGGCT------------------GGCAGCCGCCCAGAGATGCTGAAGATGCTGCTGCTTGCTAGTCCCCGGCC---TCGACCTGAGCCTGTAGTTGTGGTGGGCAGGAGGCATCGGCCTCCCAAGCCCGCTTGGTACAGCAGCAGTCCCAATAGCAGGAGGGCCCCCACCACACTCAGGACAATGCCCGCAGTTAGCATGGTGGCCAGGGGCCTGGCTGGGCTGGGGCTGGGGCCAGGACCAGTGGCAGGGGAGGCAGCTAGGCTGGCCAGCACTAGGCCACTGACCAGCAGCACCAGGCCACTGACCAGGACCACGAGACTGTCTGCTCCTCCTCCACTGCGCAACAGGGCCACGTGCTGGGGCTGCCTGATACAGTTCATGTCCTGCACGGCTGAGCCCAGCAGCTGCTTCACCAGCACCAGCAGGGCCAACAGGCAGAGCACAGTGCCCATGGCAAGGCGCCACTCACCAGAGCGGCTGTTGGTGGAGTAGAGCAGGGCCACTCCTCCAGCTCCACAGCCAGCCACTAGGGCCACAGCCACAGAGAAACAGAGAGCAGCACGCCGGGGCTCCTGAGACCACCACAGCTCCACATGCTCCTCCAGTGCATCAAGGGCTCCAGCCATGGGCATGGTCATCCCCTGCTGCTGCAGGCCAGGGGAAGCTTCCAACTGAGCCATCTGCTGCAGCTGTACTGGGGGCTAGGCTGGAGTTAGAGAGGACCAGGGTAGGAGTGTTCTGGGA-GACTGAGGGGGAGTCCCAGGGGCCTCAAGGGCATAGCCCCATGGTTGCCTCCTGCTCCACAGCTGGCCTAGGCCCTGGGGGTCTAGTC-CCTCCACATAATCCACAGCAAAGACATTGTCACCTAAGAGGACAGAGACATAGTTGAGATCCTTGCTTGCTACTCCTGAAAGATACTCTCTTCCTCCAGATTATCTTTCCTAGGAAGATCTCTGTTATCCTCTCTCCAGCACCCTCCCGGGGGTCCTTTGGCCAGTCCTCCTTCCCA------ACAATGCCCCTCCCCTATTTTCCCAATAGGACCTTTCCTCAACAtctttctctcccttccttcccttttttctcttccacctttcaagattcctct a score=959 s mm8.chr4 118041635 563 + 155029701 TTTGCAGAGAGGTTGCCTGGCA-CGCAAGGTGGGTGGGGTAAATGCCCACGCCCCAAGGGTGGTTGGGGGAGGGACCGTGGG----------CGGAGTCTGTCCCAGCAT---TCCTCAGGACTGTGGCTTGCTCATCTGAAGGTGCTGACACCGTCTATTGGGGAACGACCCCAGCGTGGGTGGAGGTTCCCGGTAGTAGAACCCGTGAAAAAGGTGGGGGTGGGGCGTATGGGGCACTCACGGGACGCCTGGCTGTGCTGAATCCGATTTGAGCAGGCAGGACCCAGCAGGTTGGGCGCTCTAGGTCTGTTTCCGGGGAGACGCTTCACCTGCCTAACCTGCACCCAGGTGAGCTGGAAGGAGG--GGGGGATTAACAGGTGCTGTTTCCAGGGCAGGGCCTGAGCC-------AATTGGCTGACGTGGCCCTG------CGACTTCAG----------------TGGGGCTGAGACATTCC-----TGGGAAGGGAGGGGCTTCTGTCCGCTGCTGG-------TAGGTCTGAAACAC-----------------------------AATATGCAGATTGGGTCAGCAGGAG-GAAAGAATGCTGGCCCTCTGCCCCAGTCTGAGCCCTAGCCCACCCCACAACTCC s monDom4.chr2 11067921 585 + 541556283 tttgacaagaggagacatggaggcccgaggagggtcaaagacttgccgaagAGTTCAGGGCAGAGGTGGGGGTGGGGGTGGGGAGGCATACCCTGGGCCCCTCCCTGCAGGAATCTCAGGGATTTCAG-----------GAAGGCACAGGC---------TGAGGACTGACCTGCAGGCAGAGGTGGGGTCCATGGGGTCCAAGGACTGAGAA------GGCTGGGCAGCAGGGAG-------GGGAGGCGTGGA---GCTGAGCCCGGAAGGA--AGCCTAAACCCTGAAGAAAA-----------------TCCAGATGGAAGATTACCAGTCTTCACCGGGCCTCAGGTGAGCTGGGAGGAGGCAGGGCAAACAGCAGGTGGCCCTTC-----CTGTCCCTGAGCCTTCCCTGGATTGGCTGCAGCTGATCTGCCTGCCCGCCTCCAGCCCCCCCCTGCGGGACCTGGGCAGGGACATTCCCCTGTTGGGTAGGGCGGGGGCCTTGCTGGAAACTGAATCTCTTCAATTCCGGGCCACCCTGCCCTGggagaagaaggaaaagggagaagaggaggtgtgggctaggaggggaggaggaATGCTGCCTGT-----CCACTCTGATCCTCTGGTTCCCCCAAATTTCC a score=1470 s mm8.chr4 118043461 92 + 155029701 TACATCCAAATTCAACTCCAGTTTCCTCTCCTCTCCTCCTCTCAGAGACTCTCCCTCTCGCTCCCTCAGATCCACTCCTCTCTCATTCTCTC s monDom4.chr2 11069826 92 + 541556283 tgccTCTAGAATTCTCCCCACCCACACCCTCCATCCTCCTCTCTGTCAGTCTCTGCCTCTCTTTGTGAGTTTTACATCTTTCACTACTTCCC a score=5542 s mm8.chr4 118059696 319 + 155029701 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TGCCTCCTGCCCAAGGGGCCCTCGTT--CCCTCCCCGTGGCCAGGCCAGTGAGGCCTGTCAGCAGCCGCAGCCCACCTCTTCCAGCAGGCTGGTCTTCTCGTGGAGCTTGGCCTCGTAGTACTCGGTCAGCTCCTCCAGCGCCTGGCTCTTGGTCTCCTCGTTGTCCCGGAGCTGTTTCTCATATTCTTCTTGCATCCGCTGAGACTTGAGCTGCAGCTCCTGGTACTTCTCATATTCCAGCAGCAGCTTCTGGTTGTTACAGCACTCT---GGAAGGGACGGCGGCAGACGCGGACCGTGAACGTGGCCCTGCTCCGTGGGGCCGGGACTAGCTGCCCCCGGTGGCCCCCCGAGTCACCTCCTCCCAAAGGGCAGGGCCAAGGG--AGGGGGTGCCGCA---CAAGCGCTGCCGGTGTGCGGCGGGCCCGGTACGG---AGCTCCAAGCTGCAGTCAGAGGTCGACCCTGCCCAGACTGGCCAGACATCCACACATGACTGAGGGACAAAGTGGGACACAGACGGTGAAGGAGAGACGCGGGACAG----AGGCCGTGAACAATAGCTTTTGGC----------TAGACTTGGGAGGAGTGAGGGCCTGGAAGGGGGGGGGAT--CCTGGGGGACGCGGAGAGGAGGAGGAAGGAGCCCCTGCAGGGAACCGGCAGTC a score=4813 s mm8.chr4 118080720 161 + 155029701 ACTGCCCATGCCAACCCTGGCTAACTACCCTTAGCCATGTGGCTCCCCCTTGTGGACTCACCCAGGTCTTGCAGCTCCCGGGTCTGTTTGTCTACGAGTTCCTCTAAGCGCTCTCGGTGACTGATGTCCTGTTTTTCTTTCTCTGTTTTTAACACCTGAAA s monDom4.chr2 11096427 150 + 541556283 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taaaataaaaataaaTAAATTTTAAAAAGAAGAATGAATGAATAAACA-AATAAATAAAATCATGGGCAGAACCATGCACT----GAGTGAGTCTGGTGACAGATGCACTGG----CTGATGTTTTAAGT-CACCAGGGCCCCAGAAGACA-GACTTAGGTCTCA----------CAGTCTTTACCTCTTTGCACCCTCTGACAGAATATTCTTTGAAAGGACGGATGTCATCAATGAGCAGATTCATAAGGCGCAGTTTGTCAGCAAACCCTACCACAATGTAGTGTCCAGAGGGGTGAAGGCTCACTGTGTAGGCCTCTTCTTGGTATTCCTTATATAGCTCCAGTGTGCTG s monDom4.chr2 11116804 351 + 541556283 taagacagaagggaaaggttttttttaaaaaga-taaagaaaaACTCATAGCAATCAGAATCAGAGGTTG--CCTTGGGCTTTAGGAGAGAGGGAGCTACCTCTTTCATGGGGCCCTTAAGGTTCTAGGTTCTTGAATTCCCCAGGAGGCCTGGCCTTGCTTTCAGCTCTTCTGGAAGTTCTTACCTCTCGGCACCCTCGGATAGGGAATTCTTTGAACGACCGGATGTCATTAATGAGAAGGTTCATGATGCGCAGTTTGTCAGCAAAGCCAACCACAGTGTAGTGTCCAGAGGGGTGAAGAGAGATGGTGTATGCCTCTTCTTGGTATTCCTTATACAGCTCCAGGTTACTG a score=9665 s mm8.chr4 118098649 181 + 155029701 TCTTTTTCTC-CTTACTTTGATTCGTAATTCCAGATGCGGACGGAGCGATCCAGAGAGCAGGTGGCAATGAGGGGTTTTCGGATGCAGGTATCGAGACCAGTGATGGATGCTGAGTGCAATGGGTACAGCAGGTACTCGAAGTGGGCAGCCTCTCCCTGGGGAAACCACACAGAGTGAGATC s monDom4.chr2 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monDom4.chr2 11127926 298 + 541556283 CTTTCAGCCCCCTTC----CTTACCCGAATCTCTCGACTCTCCCGGTAGGAATCTTTCTCTTCCATCTTCTCAAAGAGCAGGACTCTCCCTAGCCCAGCAGAGCAGGCAAAGCCCTTCGAATAGGGAGCAATGGCAGACACCTGGGGCA---ACAGATTCTGGCTCTGACCCTTTTCCAAAAAGAGCTGCTCATTGGACATATCGGGAGAACTTGGTACTGGGAATTCAATGAGGCTGCAAAAGGAAA-ATACCACATTACATG----AATCCACAGGAGCC--------TCCAAAAAAAAGGGTGGGGGTGAGGGGG a score=14237 s mm8.chr4 118110772 394 + 155029701 GAGAGGCTTCAGGAGACGCTCATTTTACTTAACTTTGGCAGTGCAATGCAGGCATGCACT---AGCCCAGCAG--AGGGCGCTGTTACCTCTCTGACTCTTGAATGACCTCCAGGCTCCTGGAGCTAGTAG---ACTCCTTGACCATTATGCTTGTCTCCCAGCGCTGATCTCCAGATTCAAAGAGGAAGAGTTTGCCGGTGTCAGTGCCAACAATGACCCTGTCTTCAGACACCCAGGCGTGGGCTAGGTAGTTTGAAGATTCTCCCCTCTGGAAATTGATTTGCTTTAGGGTTCCTTCAGCAAAGCGGAGAAGTTTAAATACCCCACTTCCAGTAATACACACTTGACTATTATCCTGGGAACTGATGCTAACCTGCAAAATGTAAGGAGATTAAAAACA s monDom4.chr2 11133505 390 + 541556283 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TTACCTGGGATGAACTTCTGCCACTTCTGGTCCACGTTGTACTTCACGCAGTGGTTCCCACACGGAAAGATGATGATTTGCTCGTCGAAGAAGCAGATATTGTTGACGACGTGGGCGCGGAGCCCATAGATGTGCTGGGCTTGAGCCACCACAGAGGACATGGCGCC---------------------------------GCGGGGAGCAGGGGCTGCAGAGGTGAAGAGTGACCGTGACCCCTGACCTGTGACCCCGACCGTCC----GCCCAGGCTGGAGCCTCCC-GACCCTTCGGAGCTGGGTTCCCACTGCCCCACCCCCTGAATGTGACCTCTGACCCCAGGGTCCTCGCTTCACCTGGTCCCTGCCTCGTCTCTTTCTCTCTTTTACTC--------------TCCTTA----------------------TTTCTTCCGCTTCGCCTCTCTT-------------------------------------------------AGCGATCTGG---------------------GTTTCCACGGCAACGGTAAACAGGAAAAGGCGTGTTTGCCTGCCGGAAGCGGAAGTATCTATCCGGACGTGAAGGCGGCGG--------GGTTCCGGCGGCGCTTGGGCTGCT--TGGGCTGCTTGAAAAGAGTAGGAGTGTTGGATAGAGGGAGGCAGC--GATGG---CACTGTTAGCTTCAGTCTCGGACTCGGAGACGGATTCGGAGGCGCTCTCGGATGCCGAGGT a score=6634 s mm8.chr4 118119007 464 + 155029701 CTGTAGTTGCAGGATGCGTTTTCCCGCGGACTCCTGAAGCCAGGTCTCAATGTCGTGCTAGAGAAGCCGAAGAAGGCAGTGAATGACGTGGTGAGCTCGTGCGAGGG----------------------------------------TCGGGGTCCTTGGAACAGGATGCGCACAAGCGCTGTGC--------CTCTTGGGAGAC-----CGATTCTGGTGG------GAAAGATGCACCC-------TGCGCTGCGGTCGTCATCCTGTGCGGATATTTGAGCATAGGACTTTGG-------------------GTTTCTGAGAGTCAAACTCGCGGTTCTCATGAGCGCCTTGTCTGACTTA-----------ACCTAGAGTGGCCTGAAACAGTGCTTGGCTGAATTCAGACGGGATCTGGAGTGGGTTGAAAGGCTCGATGTGACCCTGGGTCCAGTGCCAGAAGTCAGTGAGACTCAGCCAACACCTCAG-AACCAGGACCAGAAGAAAGGCGTTAATCCAGAAGACGACTTCCAGAGGGAAATGAGTTTGTATGT s monDom4.chr2 11142048 547 + 541556283 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TCTGCGTTTTAGATTCGACAGAAGCTGCAGACTAAACAGGCCGCCATGGAGAAATCTGAAAAGGCCAAGCAACTTCGAGCGCTTAGGAAATATGGAAAGAAGGTGAGA--AAGAAAGAGCACCTGCGTGGGCCGGGCAGGGCCGGGTGCGCCAGGGCAGACTGTGCTGGGGTTCCTGGTAAAGTGTCTGCTGGTGTCCCTGAGCACAGGTTCACTCGCCACCGTGGCACACCTGGGTGTATCCAGCATAGT-GTGGTAGCAGTGGCTGAGCTGCAGTCTCTAGAGTGATGGT--------------TTGGGATGCAGGGCTGACTTTGTGTCTGTCTCACAGGTGCAAACTGAGGTCCTGCAGAAGAGGCAGCGGGAGAAAGCACACATGATGAATGCCATCAAGAAATACCAGAAAGGTCAGTGTGGCTGT--CTGCTAAGAGTGTAGGGA-----GCCTGGGTCTCAGTACCTTAG-------AACCGAGGG---AGCTCTCTAGTGCTTCCAGTTACCTTGGTTTGAATCTACTGGGCTTATGCTTGGAAAATAGTGCGGGAAC-AAGACATGCTTCTTtttttttgtcgtttttttttttgtttt-----gttttgtgtttgtttgtt-tgttt----gtttgttttgtttttctgag-----acagggtttctctgtgtagtcctggctgttctggaactcactctgtagaccaggctggcctcgaactcagaaatccgcctgcctctgcctcccaagtgctgggattaaaggcgtgcaccatcactgcccggcACAAGATGTGCTTCTTAAGATGCAGTTAGGGAATAGCAGCCATGTCCTGTATGCTCCTAGACATACAGTGGTGCTGATGTGAATGCTCTTCCCTGCACAGGCTTCTCTGATAAGCTGGATTTCCTGGAGGGTGACCAGAAGCCTGTGGAACGCAGTGCAAAGGCAGGAGGTAAAGGCCAGCAGATGAGTAAAGGGTAAGTAAGGGTCTCGGTTTGGATTTGTCT 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s monDom4.chr1 339771313 2193 - 748055161 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mm8.chr4 118432804 177 + 155029701 TTCTATGTGTTACCTGACACATGCCAGCAATAGAGGCAGAAAGGGAAGATACAggttaagaagatgtctcaaaggtaaagcactgat-----gctgttccaggggacccaacagcccaaagctgtg---tcta-accccagttccaggggatatgactactctcacctccacaggccaaacagata s monDom4.chr5 290639526 164 + 308900514 TTCATAGTGGAGAATGA-GCATTTCAGAAATA-------ACATGGTCCATACC--TTGGTAAGGTTACTGAGAAA-AAAGTATTAATCACTACATAACCCAGAACAATATAAAAATGAAGACTTTGCATTCTATACCCCAGTTACA-----------TATCTTCTCGTTCATTAATTAAACCAATA a score=307 s mm8.chr4 118433023 240 + 155029701 aaattaaaaaataaTAGTTTTTATTTAAAAGAAGAAGAAAGGCTTTGTTCTGAGCTCAGT-GGTTAGATCTTGTGCACTCC----------------------------------TCTcaagt----tatgaatctctcaaagcctcattctcttcatctatttaatgagactattgatagtcatggcttgggattgtgatgaatatctaaaGCTTCTCACATAACTCCTGGAAACACCACATAACACATGACATGTCATTtgctgtctcacactttca s monDom4.chr5 290639736 269 + 308900514 AAACCAAAACAAAATTGTATCT--------GAACTCAAAAGACCTTCTTTCTGTCTTAGTCTGTTGACTTTTTTTCCCTTCATTTTTCCTATTTCTCTTTTAAGTAGTTTTCATGTCTCCAGTGAAATCTCAACTCTGCTAGATTTCAACATTTATATCCATTTACTGcatccatcgacatgtatttattaagaatctggctatgtgctaaaga-gcttac-taaatcttggagaCACAAAGACACCAACGAGAGATTTCATGCCTTTACATACATGCA a score=-762 s mm8.chr4 118433264 587 + 155029701 tccatctctgggaagtcagagacaggaaat-----cccctcagcaggagggataagctacactcgc----------tgaaatgatgagcacaagagtcaactgagagaccctgcctcagtgaataagacggagagcaactgaggaaggcttacatatcagtctctggtctcacacatatcatacacatac--acacaAACACACACACTAAGagaaagacagagaggcagacagacagaccgacagacagaGGCATAAACACCATTGA----CATGCAAA----AAACTAGTA-------------AGCAA---------------CTCGATGAAAAGACAGAACAAATGAAACCCAGGCCCATGCA--CATACGGTCAAATGAATAAGGATAGAAGCACATGTGTGCACTGGG-------GACACTGTG----AAGCTCATGTGTGCACTGCACTGGGGACACTGTGTCTCTGT------------CAGGAAAATTCCAACCTC------------------------CCTCCACACACAAAACATCAATTGCAGGTATACTGTGGACTTAAAGGGTAAATCTAAAGCAATCA------AAATGTTTAGACTCAATTCT-GATAGAT---ATCTTTTTTGGGTAAGCAAAAACATAATTTTC---ATGGAGGAAAAAATAATGGTAAGCTAGAAAGCCAAA s monDom4.chr5 241975371 678 + 308900514 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AACCTTTATTGAAGAGCAAGTAAACACGGTAGGTATCCTATGTACAGGC-GGCACATGGTGCCAACTGCATCTGCAGATGTAGCAGTCCATTG---------GAGTTATGCCTTTGTCACAGCCTTAGACAAATTCTGAACTAGTGTACAGTTCAGCTGTGCCAGCGTGCTGATCTTAGCATGCTTAGATGCTGCATACTTGGTTCTTGACAGT s monDom4.chr3 490702288 208 - 526135210 AAACTTTATT--ATGACAAGTA--TTTGGGAGCTATAATATGTACAAAAAGGCACATGGTGCCAATTTTAT-TGCAGATTTCACTACACAGTGCAAGATCAGGAGTTACACTTTTGTTAGTGGCCTGGCTAGATCTTGAATTACTACAGAATTCAGTTGTGCAATAGTGCTGATCTTTGCGTGCTTAGTGCTTGAATACTT-ATTCTTGATAGC a score=6244 s mm8.chr4 118440100 107 + 155029701 CATGTGCTTTGTAAGGCCACAGTTCACCATGACTCTATTCTTAGCCAGGTGCTGCATAACAGGAAGCAGGGAGTCTTCCGTGTAGGGTAGGTAGTGCTGCAGAGTTG s monDom4.chr3 490702719 107 - 526135210 CATGTGTTTTGTAAGCCCCCGGTTCACCAGGATCACATTCTTAGCCATGTGTTGCATTACAGGAAGAAGGGCCTCTTCAGTATAAGACATGTAGTGTTGGAGAGTTG a score=8314 s mm8.chr4 118440207 142 + 155029701 TGTCCATTCACCGTTGTCAAGACTTTCCAGTGCTAAGCAAAAGGCCCCAGCTGCAATTTGAGAAGGAACAAAATGCACCATGTCGTAGTCCAGCATGGAGAGCTCCATGAGGTATTTGGCCAAAGTGTGCTGCTCAACGTCA s monDom4.chr3 490703302 142 - 526135210 TACCCATTCACCATTATCGAGCACTTTCAGTGCCAAGCAAAAAGCACTTGCTGCAATCTGGGAAGGAGGGAAGTGGACCATATCATAGTCTACCATTGTGAGTTCCATCAGATATTTGGCTAAGGTGTGCTGTTCAATGTCA a score=15964 s mm8.chr4 118440349 238 + 155029701 ACCTCTCCGACTTTAGATGCTCTACGGAGGAAGTGCAGAGGCAGAGGGCGACCCAGGCTGAAGTTCAGAACTCTGAGAATCTTCATCTCCATCTGTCTGATCTGGTGCTTAGTGTACGTGTTGTTAGTCACAAAGGCGAAGTCACCTATTTCTGGAGGGTACATCTCCTCATATTTGCTTGCAATAAACATGGCCGTTACACCGACCAGCTGCAGCATCTTCTTGGGCACACAACTGT s monDom4.chr3 490704948 238 - 526135210 ACCTCTCCAACCTTGGATGCTCGGCGTAGGAAGTGCAGGGGTAAAGGACGACCCAGACTGAAGTCTAAAGCTTTGAGAATCTTCATTTCCATCTGTCGAATCTGGTGCTTACTGTACGTGTGGTCAGTTACAAAGGCAAAGTCCCCAATTTCAGGTGGGTACATCTCTTCGTACTTGCTGGCAATGAACATGGCAGTAACACCCACCAGCTGCAGCAGCTTCTTAGGTACACTGTTAT a score=10779 s mm8.chr4 118440587 159 + 155029701 TCTGCATGAACCGATCAATAATGGACACAGTCATGTACATGGTCTCCTGAAGCAGCCTAAATTTCATCTGAACCTGTATTAGCCAGTCAATGAGGATATCTCTCATGTTTCCAGTCACTTCACGACCCTGTAGGTATTTTGGTCTAACTGACTGCTCTT s monDom4.chr3 490706572 159 - 526135210 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CCTCAAGTCAAGGAAGATGG------GAGGGTGAGAAAATATGCTGGGAGAGTCAAGA-CTTGACTTAACAATGG-----GCTCTTCTTGAACCTAGGTGACAGTTTTGGAAACCAGAGACAAAATTGGGGGAAGAGTGGCAACATTCCGGAGCCCAGATCGGAACTGGTACATTGAATTGGGTCCTATGAGGTTACCAGCCACCCACAGGTAAGACCTGGGGCAGGAAAAGAA----------ATTGAATCTAAGGCAtgtgtga---attaaatatctaggag a score=5930 s mm8.chr4 118463076 303 + 155029701 TTTGAGTTCCTCAGCAC--AAGGTTACACTGGGTTTTACCAGAAGTAGCTTCTAATGTGGGACCAGAGGGAACAAGGATGTTACTT-CTGTCTCTGCTCCAGGCTAATCCACACCTATGTCCAGAAGCTTGGCCTGAAACTGAATAAGTTCCACCAGTATGATAGCAACACCTGGTACCTACTCAATGGACAACGCTATCGTGCCTCAGAAGTCATGGCTAACCCAGGAATCTTGGGCTACCCCCTGAGGCCCTCAGAGAAGAACAAAACTGTCACAGACCTGTTCTACCAAGCCATCACTAAGGT s monDom4.chr4 5563021 295 - 430141050 TTGGAATTCCCTACTAGGGAAATCTCTACTGGG-----CCAGAAGAGGTGACCA------GACCAATATAACCAATGGCATTCTTTTCTTTCGGTATTCTAGGCTGGTCCGACACTATGTGAAGAAAATGGGTCTAAAAATGAACACCTTTATCCAGGCTAGTAAAAATACCTGGTATTACATCAATGGTCGTCGGCATAGGACCTCAGATGTATTGGCCAACCCCAACATTCTGGGCTACTCTGTGAGCCCTAAGGAGTCAGGCAAGATGCCCAGTGAACTCTTCCAAGAGGCAATATCTAAGGT a 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s monDom4.chr1 323288840 1229 - 748055161 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CTCAGGCGGAACTCCATGCTGATGATGAACCTGTTGGCCTTTGTGGCTGCTGTGCTTATGGGCTTCTCCAAACTGGGCAAGTCCTTTGAGATGCTGATCCTGGGCCGCTTCATCATCGGTGTGTACTGCGGCCTGACTACTGGCTTTGTGCCCATGTATGTGGGAGAGGTGTCACCTACAGCTCTACGTGGAGCCCTAGGCACACTGCACCAGCTGGGAATCGTCGTTGGCATCCTTATTGCCCAGGTAAGCCAGTT----CTGGGTCTACCTGCTGCCCAGCCTAGGACAACCTCATGGTAGACAGATCCCAGAGCACAGTGACCCCCAGACCCACAGCCT-ACAAGAGCCCTTGGCCTTCACCTGGGCTTCCAGGCCTAGAAGCCTTCATGAGCATGGCA-CTCCTCTCCTGGAGGATCCTCCATCTTTTACTCCTATAGCTGAGTAGCAACCCCCACATGCTGTGCCGGGCACACTTA--------TATGTGGCGTTGTCCCTT--GCTTGTCCTTTATAGTTTGAGCTGGTTTTGCAGGTGAGGGAACAAGAAAGGTCCTTCCCTCCCCCAGCAGCCGGTGGGCAGACAGGGACAGCCCGCTTGGTGGCTGGGATGGATACTGGAGTAGGGCCAGGGCAGGGCACTCACAGTCCCTGGTTTCTTTGT----CCAGGTGTTTGGCTTAGACTCCATCATGGGCAATGCAGACTTGTGGCCTCTGCTGCTCAGTGTCATCTTCATCCCAGCCCTGCTACAGTGTATCCTGTTGCCCTTCTGCCCCGAGAGCCCCCGCTTCCTGCTCATCAATCGTAACGAGGAGAACCGGGCCAAGAGTGGTACG-GGCTGGGCCCTGCCCTCCTCCCTCTCCCCCTGAGCTCGGGCCTTTTCCCCACTCTGAGCCATCCCACCTTCCCTCTGGTCCCACCAGTGCTGAAGAAGCTTCGAGGGACAGCCGATGTGACCCGAGACCTGCAGGAGATGAAAGAAGAGGGTCGGCAGATGATGCGGGAGAAGAAGGTCACCATCTTGGAGCTGTTCCGCTCACCCGCCTACCGCCAGCCCATCCTCATCGCTGTGGTGCTGCAGCTGTCCCAGCAGCTGTCGGGTATCAATGCTGTGAGTACCCCACCTACCCCTTCCTGTGGCCCCAGCCAAGTCCAGGCTCAAGTGTGCACCGCGAGTGAGTCCTGAGGGAAATACTAAGTTCTTCCCGTGGGT---ACACAAAGCAGTGTACCTGTGGAGCCAAAACCTGCAGCAGTATCCACCT-GCCTGGGAAGTGTTGATCCCCCATGCCCCAacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactcacCTTGGGTCCCACACCTACTTGTAACTAGTACAGAGGAAGGAGAAGGCCATAAGCATGGAGGATCTCC---------AATGATCTCCCTTT--CTGGCAGGTGTTCTACTACTCAACGAGCATCTTCGAGAAGGCAGGTGTGCAGCAGCCTGTGTACGCCACCATCGGCTCCGGTATCGTCAACACGGCCTTCACTGTGGTGTCGGTGAGTCTCGCTTTTGGTCGGCAGCCAGGGTCCAGTTCAGGGCATC---------AGGACAGAATGGCAGCCTGTTGTGGGAGCCAGACTTAATGTCAGTAAACGT--------------GTGAGGCTCATTACTCACCCCGTGCAGCTGTCACAGATGCTCAGGGAGGTGAGAAGGCAAGAGCTCTCCCAAGCTCACAGCCTGTGTGCATTA 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ctatgtgactttgggcaaaccaactcttctttctgaatctcggttccttatactgcaaaatggggcagtttggactatacagtctctgaaattcctttcagataacattctatgagcttatg-------attTTCTTCTGTTCCTTCCTCAGGGAAAATCTAAGAAAGTGGGTTTTGCAAAATCCACTGCATTTTCT--CTCTGCTCTGAGAGGAA------GGGATCTGTCTATTCCATTCCCAAGC-TTGGTTTCACAGCAACTTGGGTTGCCAGTTGGATGGAAGAGGGCAGAGAGGAAGG--GGATATTTGAAAGCTCTTC---CGAGAATTAGAATTGGATAGGCA---------AAAGAAATGGAGCCTTACTATC--AGCTCTAATGAGGCTAGCTAAAGGACACTGGGAAAGCCCTCTTGTCATGCCCTTTG-GTCTCTCTCTGACCATACATGAGACCTCTAATTTAATGATATTAACTATTTCTTTGGGTAAGGGA a score=212 s mm8.chr4 118667932 205 + 155029701 GGGAAGAGGCAGGGTGTTTACTCAGCCCCTTCTCAGGATTTCCTGACTGCAAAGGCAAGAAGGGGCTGTTCCGCAAAGTG-----AAGGGTTTGTAGTCTTGGAGGCCACAGCAGGTACTAAAGGCCTCCTCCACCCATCAAGGTGGGCTCTATGCTCTCCCTCACTCTCCAAGCAGGCCTCTCCTTTAGCTAAAATCCTTCTCATCTTG s monDom4.chrUn 79176103 171 + 174229318 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AACTTGCCAGGGTTCAAT--TCATTCCCATAAAGCTGATCATCAAGTTTGCTTATCTGAAGTTTTTGGTCCTATACTTTAAACTGATACCTTC----------------------------AAATTCTGAGCCATGGCAGGTTCCTAAATCGAGGGGAACCTCATGTTCTGAATGTTGTCACAGTTGTGGCAGGCTTTTGTCCCCCCTA-----ACCAGCTACTGTAATGGCTTCCTTAAGTAAGTAGAAGTTCTGAAAAGCTCCTATTATTATAGGGATTCCTGTCACTTGAGATGTAACAGCTCAGGGTGGATTAATGAATGACAGCAGGTTGCCCTGTCTGTCTGGAA----TCTGGGC------CAGCTCAGAGGTAAA--GGCTAAGGAAGCAGAGAAAACC---------------------------CTCAGAACACAGTAGATGTGGGGGAAGACAGGGTGGACTTTGGACCTCATTCTGAGGACAAAGAGTGATGGCACCTCTGGTGATCTG-------GGAAAGACACAGGTTTGAGTTCTGCTGGATTCTAACCTGGGGGACCTTGGGTTCCTGGGAGCCCCAAGGCAGAGACTTCCTCTTTGGACACCCATGGGGAATTAGAGAGGGGGAGG---GCTCATAGGAGCTCCCAGTG-------CCCTTCCCCTGGCCTCACAGGAGTCTCCC a score=33603 s mm8.chr4 118675879 860 + 155029701 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s monDom4.chr4 6005754 978 - 430141050 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s monDom4.chr7 85314278 1805 + 262624689 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ctTACTTTATTttcttcttcttcttcttcttctttttttttttttttgtttttttttttttttgagacagggtttctctgtatagccctggctgtcctggaactcactttgtagatcaggctggccttgaacccagaaatccgcctgcctctgcctcccaagtgctgggattaaaggcatgtgccaccacgccctgctCACTTTATTTTCTTGTATTAAAAACTCTTATGTGGTAGGT----ACAGCTAGAGCCTGGGTCCTCTAAACAGAGATTTTGGTGTG-TTTTTCACAAGATGACCAGTGAATTCCTGATAAGGAAGCTTGGTGAAA-CAGTCTATTTCCAGAGGTCAGGGGTCAGTTAGCTGTAGGTCTTGGAGATGGCATCAAAGGTGGC---------------------AGCACTGCAGCCCCTGGCTGAATTGTAGCAGTCATCTATACTGGCCATCATCAGTAGCTTCTTGGGCACAGGAGCAGAGGCAATGTCAGTTCCTCTTGGGGCAGGAATGAGATGCACCAGCACAGAGCCACA---GCTTGTCACCTTGCATGGAACAGTGTAGGGCTTGCCAATCTTGTTTCCCTAGTAGCTGTTAGGGATGTTTCTTTATAGGGATGATGGGAAGCTTGGCCAAAATGGTGGCCCCTCG-ATGGCACTGGCTACCTCCTTGGAACA----ACACTAAGACCAATA s monDom4.chr1 208353771 619 + 748055161 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ttgagtttcttttgtctgtgtatttatcacagtagcagggaaagaaacacagataACT-----GActagaacttgctatgtagccaggctagccttgaagtgtccctcttgcttcagccatcaaatgtcatcgt----tttaggcatgagccagcgtgcccaactTTGTCATCATTT-----------GACTC--CTTTGTTTTGTTCTGTTTTTTAA----ATCTCTTATTCACAATTCTTTTGTATTTATTGAAACATGTATCTGATTTT----TTTTTAATCAGTTCAGCAAGTGTTTTGGGA-AGTTACGTATAAAACATATGCTAGTCATTGTGAGATAGAAGTTAT--TTGACATGTATTAACCCACTAGGAACCAGGATTCCAGTGGCAGAGACAGGTGCTTAGTGAAGTAGTACAGGGTAGATTTTCTTTTGCC-CTCTAGTGAGTC-ATGCCTTAATTATAATAGCCTTTCTTTACCCCTCCTTCCTCTC s monDom4.chrUn 125101225 450 - 174229318 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aaaaacttccagatgatcataagtgtccaaaagtccaatggattgcctctggaggcactgagttctccatgagttgaagcagaataact---acttgtccaggggatcga-------------------tgctttgggcaggg--actggactagaggaccttg-------gaggtccttcctagcttgagactTCCAGGAAAGCATTT------------CTTTTGCAGTTCCTGATTTTCCTTCCTTCTGGCTAAGGAAAAGCAAGG----TTGAGCTTTGTTTACCTGCACAGAGTGAAGGGGGCATGTTTTCTTAGCTGGACCAGGGAAGACTTTTTGAAAATAGTCTCATGCATATTCAGCATCTGAAGAAGGGGGAAGCAAATGGCTATTTTTAGCAGCTTTGGCTGAAATGCCAGCCCAGAATGGTACCTGCCCTGTAGCCACAGAAGGCATGGGCTTTTCAGAAGCAAAGGTAAGGAAGGGACAATGTC---------------CCTGGGCCCTCTCTGCCCCACCAACGCTTCCTCCCTCTTCACCATCAATGATGGCAAAATGATTGCCTATGTTG a score=3114 s mm8.chr4 119520191 120 + 155029701 CATCAGAGACCACCCATCTGGTCTCTGGGATCTCCCA----------GCTGCTTGCTCCTCAGCCAGCTGTTTGTCTCCAACTGTCCTGTGGTTACAGAATCTTTCTACCGTTCTCAGAAGCCTCTTTCT s monDom4.chr4 7245933 121 - 430141050 CACCTGAGGCCACCCATCTGGTCATTCTGATTGCCCAGCTCCTTGGTGCTGCCTGCCCCCCA--CAGCTATTTGACAACGACTGCTTTTTGGT--CAGCA-----CCACCATCTTGGGGACTTCCTTCCT a score=12711 s mm8.chr4 119520342 364 + 155029701 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GAGTGTCTGGCTTCTCTGCTGTGTT-TTATGTCTGCCTCAGCTCTCTGTGTCCTCCCATGGTCATGCATCTTTGCCTTTGGGTGTCCCTAACCTGCTGAACAAATCCAAGGGTCTCCATCTTCCTAGGTGGGGGAAtcttcctcttctccttcttcttcttccttttattttttttTATCATGACGCCTGTTGCTCATAGGTACAAATCAAATGAAGAATATGTGTATGTGAGAGGCCGCGGACGAGGGAAATATGTTTGTGAGGAATGTGGAATTCGCTGCAGGAAACCAAGCATGCTGAAGAAACACATTCGCACGCACACTGACGTCAGGCCCTATGTCTGCAAGCACTGTCACTTTGCTTTTAAAACCAAAGGTAAGAGATGGGGAGCTTCTGCTC--CCTTCCTGTGTCCAGGCTATTCCTGCCAGAGAGGAAGCCCTGGCCTCATGGGACGAGCCAGGCTGGCTTCTCCCAGAGTCCAACAAGTACTCATGCTGCTGAGCATCAGCTCTATGGGTCCTGGGGAGTTGGCACCAGGCAAAAGTAACCCTTTCAGCTCTCCAGCCACATTCCAGGAAGGGGCTTCCAGCCAT----TATCCAGGGAGAAGGAAAGAGCAGGCAAGAGGGCTCC---CCAGTCCCAGAAACCAGCCCCTGATCCATTCATTCCATCCACTCAGGTTGGAACGCATCCTGGCAAGTGCATTTCCCTGACTAACTGTGTGCACCATGACTTTCTTGGAAATGGTCATAGTTTTCTCCTCATCATTCCTTTCCTTTGGCATAGCTCTGGTGGTTTCCCCAATGGTCCAATAGAACCTGGCATCCATACTTAGTCACAGAAGTCTTGTTATTGTTGGAAGTCCATTCTGCTCTGATCCACA------------AAGTTCAC---ACACAATCCCTACTCACGGCAAGCAAAGTTTGCCCCACCCTCACCCTTACCCTCACCCATTCCCATATTCTCTCCACCTCGCCATCCTCAACTCACCTTCTCTCTGCTCC 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s monDom4.chr4 422440143 881 + 430141050 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s monDom4.chr4 422465078 962 + 430141050 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agggcttaatcaacattagttgatttgaactgaaCAGATTTACCTGGATGAGGTTGGCTGCTGGCATCCTGCGCTTCTCAAAGTGCTTCTGACGATGCTGTTCCTGAACCTTTAGAGCAAAGCCAGAGCCCAGGATGCCCTGAGGAGTGAGGACACAATGTGAGG------GTCAGGGTGGGTCAGGTGAGACCAGG--------------------CTAGAGCACACTAGGGTCTTCAGGA----------ACCAAGCCTTTGACTCTTTTCATCCCAG---------------AGAAGGGAACTCTCTTAGACTGTCCCAGAAGTCAGAGGGAGGGCATTTGTGGCTAGTCTCCATGCAAGAACACCCCCCCCCTCCCACCCCAGTACCATCCCTGGAACAGGACGTTTTGCAGTTGGCTCTGTCTTCCTGATGGAGGTGTCC-CAGGATGCCCTCTTCCTTCCCACCTACTCAGAAATGGTGATGCTCAGGGAC-----------ACTTACAG---CAGGCAAGGCGAAGAAAGAGATGCCCAGTAAGGCAAAGCCGGCTGCTA---------GGACCCGGCCCAACCACGTAT--GGGGGGTCTTGTCCCCATAGCCGATGGTGGTCAGTGTGATCTGTGGGGAGAGAGGCCAGAAGGGCT---CACAGGTCTGGCTCACTTGGGGTCAGGTGGGGCATCTAGCTTCTCAAGGGTTCAGT--GACTGGCA-GGGGTCTGGTCACTTGGGGGAATGGCCACACAGATGATCTGGAAGCAGAGGGGATCTTTTTGCTCAGGGAGTGGTTGTGGCGGCCCTTGGGGGGCAGGAATCAGGAAGGGGCAGGG--------CAGGGGTGGGAGTA---------------TGACATACCGTGCCCCACCATAGTGAATCTGCATAGGAGGAGAAATCGGAGTTGGCATCCTTTTCAGCCAGGTAGACAAGGAAGGAGGCGAAGATAAGGACCAAGAAACCGATATACCAGGCGGTGATCAGCTCCT-GGGTAGAAAGAGGG----------GTCAGGATGGGGAGGCTACGGGGAAGATCACTCCAGCAGGCAGGGAGAGGACGTGATGTCCTGCAGAGGGAGGTCCTCATCCCTTTCCTCTACTGTGACCACCATACCC 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CCCAATTTGGCCCCGCCCAAGCTCCGCCTCTTGCTAGTGCCTAGTGTAGTCTGTAGCAACTTGGTTCCTCTCA--------CCTTTCTCCAGCCTCACCTTACTGTGCGCATAGACCACGGATCCCAACAGCTTCCAGGTGCCACCGCGGCGATCCATACGCACCATGCGCAGGATCTGTAGGAAGCGCATACTGCGCAACGCGGACGTAGCAAAGATGTTGCCTTGTGTGCCCGCAGCTATCACTGCCACCGAGGCCACGAACACGATGAAGTCTGCAGGGC-----------------------AGGGTGTCAAAGTTA-----------CCAGCCCACCCCCTG-TCAAGAC----------------------CTGGGGTCTGG--------------------AACTCCGAGGACATTAAGTGGGTGGGGTTCAGATAGGG---AGGGTC---CACGAAAATTCATGAG------------------------AAACCAGAG-------TCCGGGTCAAGGCTGGGATCAA----AATGCCTCCTTGAGATTTGG------------------AGTGGGGCAGACTAGGGAA-GGCTTTATACCGATGACACAGAAGGGTTTCCTGGCGAAGCGAAAGCGTCCCTGCCATCCTCTGTAGCGACAACAGCATCCGGCCGACCAGACACGGATTATATACTCCAAGCCAAAGACCACAATCATCACGAATTCCTGTGGGGAACCAGGACCCAGATCAGAGCCCAATCCTGAGTTAGGAAAACCAACACCTGGTTAGGTTCCTCTTATACCTGGAAAGCTCTGAGAGTGTTCCAGGAGAGAGGTTACCCTTTCTTTGTCCTCTAGGAAGAACAGAAGCCCAGGTTTGCCCTCATACACAAG------CATCTAGCTTCATAAGATGCTGGTGTTTTTGT-----------TTTTGTTTTTTCTTTTTTCTTCTCCCCGCCCTCAGTTTTCCTGTCATTC------TAGACTCTTAGCCCTGGTTCAGTGGCATTGAACATGGCTCTCAGTTGGTGGAAAG-----CCTTCTGTTGGTGAGGTTTGTTTCCGTTCGGGTGCAGATTGGTGCCTACACATATGCTGTTCTCCCTTGAAGGAGCATCTATGGGGGATTCCCCGCACTCACCAAGATAAGGAGACACTCGTTGGCAAGTTCCTGGTGCTCCTGGATGGTGGACAGTACAGACAGCACCAGGCAGCTGAAGACTAGCAAAAATCTGCAATTGGAGAGTGACCCGGAAGGTTAGATGGCAGAGGGGAGGGC--ATGACTGAGGGACGCTGAGCTGACACCT---CCCAAGCCCTCTCCAGAGGACCTCGGTGTGACTGG 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CCTAATTT---CCAGCCAAAGCTCTTTCCATTCTCATCTCCTACTATGACCATCCTTCCCCAAGTCCCCATTGGGTGGGAGCCCCACCCCAGC---ACCTTGCTGTGTGCATAGACCACGGAGCCCAGCAGCTTCCAGGTCCCTCCACGGCGGTCCATGCGCACCATGCGCAGAATCTGGAGGAAGCGCATGCTCCGCAGGGCAGATGTGGCGAAAATGTTCCCCTGGGTACCAGCCGCGATGACGGCCAGTGAGGCCACGAACACGATGAAGTCTGAAAGGCGGGGAAGAAGGGAAAGAATGTGGGGGGTCCCAAGGACATGGAGGGGCCTCCAGCACGCCCTCCGAGCAGGACCTCCCACTCCTTGTGCTCATGACTGGGGTCAGACTGACCACAAGTTAGGACCCAATTGGCAGGAAAGGGAAGGAGGGGGCTTAGGGTGGGGGCTAGAGTCCCACCCGGAGCCCCGTCTGCCTGGTGAGTGTTAGACAGGGTGAGGACCAGGGAAAGGGTTTGGGGTCAGAACTGGAGGCAAAAGCAAGACCTTCCTGGCACATGGGCAGGGGTGAGAGGATCAAATGGGGCAGAGAGCAGAGCCGCGCATTACCAATGACACAGAATGGTTTCCGGGCAAAGCGGAAACGTCCCTGCCAGCCCCTGTAGCGGCAGCAGCAGCCGGCGGACCAGACCCGAATGATGTACTCCATGCCGAACACCACAATCATCACAAACTCCTGCGGGGGAAAGGGGA------AAGGGCTTGGTCT--GGTTGGGGAGAGGAGCCCCGAGC---ATCCTTCTCATGCCC----AGCCCTGG----CCTCTGAGCTCTGGCTGACCCTTCCTTAGTCCT---GGAGGGGGGGGGGCATGGGGCTCGGGTCACATAAAGGCTGGGCCCTCCGACGCCCTCGGACACTGAGGGATCCCTGAAGGCAGATGCTGTGTCTCCACTCTCACATCTACAGAGGTCCGCGTGTCCCTGCCTCCCACTAGGGAGTCCCCTAATCTTCCTACGGT--------CCAGAGTTCTCTGAGGTTGGAGAGGTACTTCTTCTCCAGCTTAGG---GGCTCCCTGAAGATGCTAGTTGTCTCTCTCTCA-----CTTTCCCATGTGAA--------CAGGGGGGGTTCCCC-------------------AATATTCTT---CAAAGTCTGGGAGCTCCTTGACGG----CAGGGC-TATCTCACTTTCCAACTGGGGGCTTCCTAAAGATACTAGCTATAGg-------ggcagctaagtggatagagagccaggcttacagatgggaggtcctgggttcaaatctggccccagacacttcctag-----ctgggtgatcctgg 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TACAAAATAAGTGACAGGTTACCTTTACATCTTCATCCAATTTCATGATCTTCTTAATACGAGCTAGTGGAAGCTCCTGCACACGGAAATCTTTCTGAAACAAGCAAGCAGAGAGATATAAATAC---ATTATTAATAAAATTATGGACAAAAGAAGGTATCAGA--------AATATATTCAAGCTATCAATGGGGTATGT-GTGTGGAAAAAAGGAAATAGGAAT a score=3227 s mm8.chr4 120279759 365 + 155029701 TTTGAGTGTCACCACTCAATTTATGTACAATTTAAGCCTTACCCCCTCTTGCTTTATTCTGAAAC---TACTGCTATTTAAACACATGTCCAAAAGTGGATATAATTCTAGAAATAAAAAA---------TAACCTTGAAG----AAAAGACATGGTGGAGT--------------GCTAAAATCAGCAATATATGTGCTGAAGTTAGGTATCTCATGAGTGTTCATATGGG----------CATGGCTCTCTAAA-CCCAGTATGATCACCTGGGTATCTATGTTATCATGTTATAGAAGGAGGAACTA----------TTATTTGAATTAATAACCACAAGTAGATTTTCTTTTCTGAAACAAACAGAAAAC--TCTATGTGTCAAAGGCATTC--TAGAAAAATATCACCAGGTTTC s monDom4.chr4 10442518 417 - 430141050 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TCTCTCTCCTTGGGATGGGAACCCCAGAAGGGGCCACCAAGAAGCTTCGAAGCAACATCCGACGGAGCACAGAGACTGGCATTGCAGTGGAGATGCGGAGCCGTGTAACCCGCCAGGGCAGCCGGGAGTCTACCGATGGGAGCACCAACAGTAACAGCTCCGAGGGCACGTGCGTGCACCTGCC-ACCTGGCTTTCCA----GCCGAGAC---------GCCT-GCATCCCCCTCCTGCCCTAGTGTCCCCTGTCCCCTCCTACAT s monDom4.chr4 10587422 254 - 430141050 TCCCTTTCCTTGTA---------TCAGAAGGTGGACCTAAGAAACTACCAAGCAACATCAGGCGGAGCACAGAGACCGGCATTGCTGTGGAGATGAGAAGCAGGGTCACCCGTCAAGGGAGCCGAGAATCCACCGATGGCAGCACCAATAGCAACAGCTCCGATGGCACGTGCGT---CCTACCTACCTGTTCCCCCATATCACTGGGGCATGGGGTGGGCCTGGGACCTCTCCTTTGTAAGAGTCTCAATTATCACCTCAAACGT a score=8723 s mm8.chr4 120384426 260 + 155029701 AAATGTTCACTCCCACTTAGAATAGTATAGTTACACTGTATAGAAGAGAAACTGAGACCCAAGGCTCCCAGATGGAAGGACTCTGCATC----CACCCC------ATCCTAGCCCACCTGCTACCTCACATGTCTTCTGTGTCCTT------CTGCAGGTTTATTTTTCCCAC---ACGGCTTGGAGCTGAAAGCCAGTTCAGTGACTTTCTGGATGGCCTGGGACCAGCCCAGATTGTGGGGCGACAGACGCTGGCCACACCCCCCATGGGTAAATCT s monDom4.chr4 10590014 257 - 430141050 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s monDom4.chr4 10604285 1890 - 430141050 ATCATCTCTTGGCATCTGGCCCACATCCTGGGGAATGCTGGCATTTCTTGGGAACGAGGCCTCAGAACTG------GGTCCTCCGTGGAATGGAAA--CGCACTTGGCTCGTTC--ATCCCGGACTCACGTGGGCTGATTCACAAGGGTGAA-----------CGTGAGCGCGGCGCTGCTCCAGAGAA--ATTCCAGCGAGCCACCCTGAGCTTCTGATGCGGCAGGAGCAGATGCAACATCC-----------------------CGAGGCCCGGCATCCTTCCGAGCCGATTCCTGTGGAAATGAGATGTAGCACAACCCTGGGAGCCCTGCTCAAAACCGGGCTCCTCTCCGCCTCGCCACTCGCTCTTCCAGTGACTGGCAGGACCCCCTGGCCCTCTCCCACCAAGGCTCTGGCTATCAGGATACCTCACATTTTTA------------TAAGATGGCGGCGTGGCCTAAGCCATGCTGTGTCCTTGTGTCTGTCATCTTGTCTGTGTCTAGCATCAAGGAAG----GGAAAGAGAGGCCACCATTGCCTGAACATTGGCATGGATTCCTGGTGGCTGTGGATGGACCAGTTTTAGGCAGAGAGCTCTGCAGGCATCTCAGGCTTTTGAGGAAGGTGAC--AAAGCAGATGTGGGAGCCTTTGGCCGTGTTGTCTAAAGCCTGGAACCAGAAGGCAATGGCCCTGGCTCTCTCTTGCCACCCCC-------------------------------------CTGGCACATATGGAAGGAGGTTATTGCTGTGTGCCTCAGCAACGTTCTC-CAGTCTGAAAGAAGAT--GGGAGCATCCATTAATGTTGTCCTCTCTGGTACCCTCTGCAGCATCCCTCCCCTTTCATTCCTGTTTGTTTCCATTTCACagagaatggaaaaagcaaaaaaaaagaaagaaagaaaagaaaagGTGTGTTTTTTCTTTCTTTCTGCAAAGAAGAATCACGTGTTGCATCTGAAAATCTGTCTGTGATGTTCTGTAATGACTCCTCCAATCC-----------CTGCAGGGGGGTCTTTCTGAGGCCTCGATGCTGACTGAAAGGCCCAAGTCCTGCTGGGAAAGTCTCAGAGCGATGTTTGCGATGCCAAAGAGAGCACAGTGGCTCCCTCTGGCGAGAGCTGCTCTTGTCAAATTGCCCCGATGCCTCGCGAACGTGAGCACTTTTGATGCTGGTGGCCTTGTTTTCTTTTAAAGGGCTCGATCTTTCTGTTTAGCAAAGAAAAGTCTGTCCCCTCCCCGTCACGTCCCCCCTCCTCGCCCAACTCCTCCCTTCATACTGCCACAGACAGAGAGCAGGGAGA---CCCAGGAGTGTGGCCCACTCCCCCCAGAAGGCCTCCAGGGTGTTGGCGCAAGGTGGCACCCCCCAAAAAACCTCTGAGGGTTGGCTTAGTTGGGATTGTAAGTGATGCCAATGGCAGTTTAGGGTAAAACGCCG-AGGCAAGGAGAGCTCATTGAAAATGGCAGCCTGTCCTGGCAGGGGTCCTGAGAAGTCACTCGGTCAGAGA----AGGGGAGTCAGGGGGGCACCCAAAGAACCCTGTTGTGTGGATTAGAGACACCTTGGTTCTACCACTAACCAGCCCTGCATGTGTGTGTGTGTGAGAGACACTAGAGGTCTGTTGTTACCCTTCTCCAGGTAATGGATGATGATTGAGGGCTCTTCCATGGAAgactagaagctcttgaaggtcccttccagctctATGATACAATCAGAATAACAATAGGGTGTTAGG-----ATGATATCCCCCCACCTTCTGAGATGAGGGGCCATCCGGCCTGTCTCCAGCTTGCCATCTCCCACAACAGTGCCCAGA---TGCTTTTGGAACACCCCACTG-AATTTCACAGCCTCCTCTGAGGAACCTGCCTTCTCTCTCCTTCCCCGGCTTTTTCTACCAGGACAGCACATAAAGGGTGTCTTCAAAGACCATCCTTCGTCCTGCTGAAAAGTCA 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GAGAGACGGGAGGGGGTTTGGGGA----AGCATTGCTCAGCTGGCCTTGACC--AGCAAGAAACCTCAAGGCCTTATAGGATTTTCTTTCCAGTGTCCAACCAACTGTCCAGCTGGTGTGAAGGGTCCTCAGGGTTTGCAAGGAGTGAAGGTAAAAG-GGTGGCTTTTCCCGGGAGGGAGGGTAGAGCA-----GGCACTTGGAG-----------------------GGAGCCTGGGG-----------------------CTGACGAATCCA-CTC------------TTCCTTTTAGGGTCATCCAGGCAAACGGGGGATTCTGGGTGATCCTGGTCGCCAGGGGAAGCCAGTGAGTATGAGAACTAAGGGCCAGGGA-TGAGGA---------------CAAGGATTAAAGGGAGACAATCCTACAGAGATCTGCCTCCTTCTTCATCCCTTCCTCTGTCCTATGGGTTCAAGGGGGCA---------GATCCCTGTGCTGAGGGGCAGGAGGCC-----ACTGGGTCTCTTATTGAGTCCCTTTTTC---------ATGTGGTGTGGGACTTCGTGGTTTCTAGTTGACCATTTCTGGTTGTCTGTGTTGGAAAGGTTGTTGATATCTGTTTGTCTTGTGTTCGCCTGTTAGTCTGACTGCTCTTCCTTGCTCTTAGGGTCCCAAGGGAGATGTGGGTGCCTCTGGAGAGCAAGGCATCCCTGGACCACCGGTAAGA---------AGCACCCCACTCTCATGCCCCCTAT----------------------------------CATCTTGGGAGCCCTTTAATGCAACCATTCACCTG--------CTTTGGCCTCTAACTTCTAAAGATATCAGTGTCT----GGCTGGGGT----------ACTTGGATCCGTTGAAAGACAGGCTGGCTGTAGGAATAAGGAGGACAGGACCAAGG-TTGCCCACCAGAAGGCCAGGCTAAGGT------CCAGGCTTGCCACTGTTTCTTTAAATGCTCTGTTTCTTCTCTACATCTGAGCAGCTTTGTACTGTGCAGGAGATAGGGACACTCTG--CCCATTTTAAAGGAGCATCGTGAGAGGTGGGATCAGAAAAGGCATAAGTGAGTTGGGCCTCGCAGCTGTCTCCACCGTCAtttgtttgtttgtttgtttgtttTTGATAGGGCCCCCAAGGCATCAGGGGCTACCCGGGCATGGCAGGACCCAAGGGAGAGAT--GGTGAGTCTGTGGGGGCTGTGAAGGAGTTGCTGTGGCTTCTGGGATCTGAAGTCCATCTAGGACTGA--TCTGCAATCTTTCCTCTT--------CCCCAGGGTCCTCGTGGCTATAAAGGCATGGTGGGCTCCATCGGG--GCTGCTGGGCCACCGGTAAGCC---TGCTTCTGTCTCTAGGCCCTACA 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GGAAGGGGAGAGCGGGCTCTGGAAGGAGAGGATCGCCAAGCTAGCATTCACATGGGCCTGACTCATTGCCTCCCTCCCTGTCTCTGTCTC-AGTGTCCAACCAACTGCCCCGCCGGTGTGAAGGGGCCGCAGGGACTCCAAGGCGTGAAGGTGAGTGCGGCAGCGGCTTCCGGGGCTGGGGGTGGGGCAATCAGGGGAATTGGAGGAGGCAGCCTCTTGGACATGTTTGGGGCCTGGGGGGGGGATGGAGTCCGGGATCGGATCGGAGAATGCAGCTCGGACTTCCTTCGCTCCCTTTAGGGACATCCGGGCCGTCGGGGACCCCTGGGGGAAGCAGGCAGACAAGGGAAACCAGTAAGTACCCGAGATCGCCACTAGCCCTTGAGGGTCTACCAGCCCTCCTCGGGAGGCAGAGGGAGGCTGACGGAGAGAGG-------------------------------AATGGGTGAGAGGGCCCACCCGGGAGGGAGGCCGAGGCTGAGGAG--GGAGGCTGGATGAGGGAGGCTCAGCCCAGGCCCTCCTGACTCCGGAGCTGTCTGAGGATGGACTCCGTTCCTCTTCCTT--CCCTTTCC-----------TTGGAGCGGGGACTG--------CGGTCCTG-----------ACGTCTGCCCTCTCTTC------TCTAGGGGCCCAAAGGAGATGCGGGTGCCTCTGGCGAGCAGGGCATTCCTGGCCCTCCGGTAATGTATCCCGTCTGTCCCCTGCTCTTCTGTTCCTTCTGCGTGAGGGCAAAGGCATAGCGGCCAGCCTCGGGCATGCTTGGAGCCCGGGGCAGTGCCCGCCCAGAGGAAAGGGCTCTGGGGTCTCTCCCTGGGCTTGCCGCCCGTGTATTGGCGGCTGGGGTCTCGCCCTGGGCTTGCGCCCGTGTATTGGC-GGCTGG---------------GGTCTCGCCCTGGGCTTGCGCCCGTGTATTGGCGGCTGGGGTCTCGCCCTGGGCTTGCCCCCCGTGTATTGGCGGCAGGACCTCGGCACGACCTC--AGCAGCTCTGAGC--CTCTACAATCAGGGGCTCTGAGGTCCCTCCCTCACGAAGTCTCGCCCTCCCAGGATTC----------TGGGTGACGCCAGCCCCGGCACTCCCACGAGGGCC-------TCACTGCCCACCTGCTTGGGATTGGA--CACAAGGGAGCAGGGGCTG---GCGCAGGGGAAGTGGCCGGGGAGAGGCCGGGGAGATGGGTTAGGGCAGCAGGGAGGAAGCGCACATCCCCTGCAGAAGGGGTCCTGCTGAGCCCAGCCCCTGCCTCCTTCTGTCTTGACAGGGCCCCCAGGGCATCAGGGGCTTCCCAGGCATGGACGGATCCAAAGGGGAGATGGTGAGTCCTCGAGAGCCCTTGTGCTTCTTCCTGTATTGCCCGCA 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AGCTTGAACAATCTTAGCGGTCATCCACACACCAAGGAAGGGTGTGGCTTGTCCTTCTTAACCCTGTCCCCTGTGGGCTGGTGCTTCCCGAGATGATCGGAGCCTCTCTGCTTGTACACTGTGGCTGCCACAGAGGCTCACGTCACAGG-------TCTTCCCATCGTAAGACTCCCTTGAACTTTACTCCTGAGCAGGGTCCACCAGGCATTGATGGCAAGGATGGGACCCCAGGCATTCCTGGCATGAAGGTAAGAGTAGGGAGCACTCACGGGGGTGGGGGTGGTCAGGCCTGTTCCTCCTCAGG--------CCTTTGAGCCCTGTCACACCAATCCTAGAG--GCTTTAGAACCAGTGGCTC--TCAGTCTGTT----------------TCCAGCAGCTCTTCTTGCTCCTGGATCAGTTTCTCTG---CTGTACTTAGGTGGGAGCCATGAGACCTCAGGCTGGGGTTCTAATCTGTGTTTCTGGTTGTTTGTCTCTCTAGGGCAGTGCAGGACAAGTGGGACGGCCAGGAAGCCCAGGCCACCAGGGCTTAGCGGTAAGTGTCAGTGG-AAGCCACCGAGGCTGCCCACGGG s monDom4.chr4 10719435 501 - 430141050 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GCCGCTTCGCCTTCCCCGGCTCTGCCTCGGTGCTGCTGCTTGTCGCCGGCGTTGTTCTTCGGGCTTCTCCGCTGCC----GTCAGCATGGCCCACAAGCAGATCTACTACTCAGACAAGTATTTTGACGAGCACTACGAGTACC a score=8913 s mm8.chr4 122428193 126 + 155029701 GGCATGTCATGGTACCCAGAGAACTGTCTAAACAAGTACCCAAAACTCATCTGATGTCCGAAGAGGAGTGGAGGAGACTTGGTGTCCAACAGAGTCTAGGATGGGTTCATTACATGATTCATGAGC s monDom4.chr6 243069884 126 - 244784211 GGCACGTCATGTTACCTCGAGAACTTTCCAAACAAGTGCCCAAAACCCACCTGATGTCTGAAGAGGAGTGGAGGAGGCTGGGGGTCCAGCAGAGTCTTGGCTGGGTCCACTATATGATTCATGAAC a score=17174 s mm8.chr4 122428319 325 + 155029701 CAGAACCGCATATTCTTCTCTTTAGGCGACCTCTTCCAAAAGAACAACAAAAATGAAGTGCAGCTGGGATCATCT----AATCTTTTTCAAATTTAATGTATATGTGTATATA-AGGTAGTATTCAGTGAATACTTGAAAAGTGTACAAACCTTTCATCCATACCTGTGCGTGCGCTGTATTCTTCACAACAACAGAGCTCAGTTAAATGCAACTGCAAGTAGGTTGTTTTAAGTTGTTCAAGAT-CATTTCTTGT---------AGTTTTTTCTTAATATAAATGCCTGTTTTAGTTTACCTGT-------TTTGTTAAATAAAGTTTGTATATTGCATTTATATc s monDom4.chr6 243071324 344 - 244784211 CAGAACCACATATTCTGCTTTTTAGAAGACCTCTTCCAAAAGAACAGCAAAAATGAAGTTTATTTGGGTTCTTCACTTAAATTTTTTTCAAACT--ATGTATATGTGTATATATGGGTAGTATTCAGTGAATACTTGAAAA-TGTACAAATCATTCATCCGTACCTGTGCATGAGCTGTATTCTTCACAGCAACAGAGCTCAGTTAAATGCCACTGCAAGTAGGCTGCTATTCAACGTTTAAGATACAATTTTTCTCTCTAGTCGATTTTATCTTTCCTATAAGTGCCTATTTGACTTCTCCTTGAATGACATTTGTTTAATAAAGTTCACGTGTTACATGTATATC a score=5961 s mm8.chr4 122449127 298 + 155029701 AAGAACACAAATAGAAGCAGGC----------AGCTTTGTGTTTCCAG--TTTTTATGAAAATTAATAACATTAATACCTC--------------------ATAGACACATACATACA------CACATCACTATATACATAGTCATTAAGTTATTAATTAGTCTCTGTATAAAACG--TTTCTACATTAGTGTTCCGAG---CTAGGCCCAGTCAGTCCTTGGCATATTCACAGTAGCAGCCCTA--AGGCTTGGCCCAGTGGGCAGGCAG----------TGAGGAGGTGACAGAGCGGTCAGCCTTGCAGTGAGCA-CAGATGTCC----TGGTCCGCTCACCCTCCACTCCTTG s monDom4.chr4 11139898 356 - 430141050 AAGAATACCCAAAGAAGCAAGTCTGAAAATCTATTACCATTTATCCAACttttttatgtaaattaataatattaataGCACCGAGGCAGCTAGTTTTTCAAACAGACATATACAAATAGGAAAACATTTCA-TATGTACACAGTCATTAAGTTATTAATTAGGTTCTTTATAAAACTTCTCTCTACATTAGTGTCTGGGGTCCCAGGGCGGGATCAGTCTCTGG-GTAGTCGAAGTTGCAGCCCCACTGGGGCTGGTCAGTCTGGCTGGGAGCTTCTTCCTTTGGAGAGAGGGCCCAGCTCTGGGAGTGCCGGTGAGCAGCAAGTGCATTCAGTAGTCTCTGTAGTATTCACTCCTTG a score=16708 s mm8.chr4 122450819 510 + 155029701 agagagagCTCTCACCGTAGAGCCTGCAGAGCTTTCTTATTCTGTCGCCGCTTCTCCTCATCAATGGGGTAGAGCTTGAAGAGCAGCAGGCCCAGCAAGATGAGGATGATAGGAGCCATGGTCACCAGCATCTTCAGTGTAAACTTGACCTGTTCTGGCTGGGAGCATCCCTGCCTCTGGTAGTTGGCAAAGCTGTAGAACCAAGTGGGCAAGGAATGGTGAGGATGGGATACCG-----------GAACCCTACCCCTGCTCC---CCTCCTTGCCCAAGA--------CTCACAGGC------------------------------------CACTCACTCGAGACTGAGGGTAGAGACACCCAGTGAGACTCCAGAGGCAAACTTGGTGAAGAAGACATAGAAGGAGAAGAATATGGGCTCGGTGCCAGGGGAGTGAGGGTGTTTCAGGTGGAAGTCATCGATAACGTCAGGCAGCATGGACCTATGCAGAGTGGATGGCGGCAGCCAT----------GAATGACCCT--------------CGCCTAGCTACCAGCCCATATGGTATCCATGTCAATGAGCAGCAA s monDom4.chr4 11142244 589 - 430141050 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ACATCATCGGCTAACCTTACGCCCTGTACTCACCATGATGGCCAGGAGGAGGTTCTGGAACTCATTTCGGAAGTCCAAGGTATAGGTGCAGAACAAGGCAAAGTTACCCTCCACCAGCTGAGGCATGGGACAGGTGAAGGAAATGAAGAAAACAGGTGACTTGGGGAGCCCAGAGACCCCTACTTGCCCCCCACTCCATCCTGCCCGCCCCTCAG------CTTCACCACAGTGCAAATCTTCTCTCACCCCA----------CCCCTATAGGATGTACTCTTGGGATGCACATCTCAGG-----------------------CCCTC---------ACTCACCATGAAAGCCAGGGAGGTAAAAAGGAAGCCGGCAATGAGCTTGACATAGGGGCCATGACCCATGACCAGCCGGAGGCCCTGAAAGAAGGGCATTGACTCAGCCTGCTGGGACTCGTAGAGTTCTAGGGATCAGAGAGGATAATGAGGAGGTGGCA s monDom4.chr4 11145365 473 - 430141050 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TTCCTACCTGGTCCTGTATGTTTCAGAATGAAGTTCTCATCATCAAACTTTTTTCCATAGATAGATTTACCCCCAGTGCCATTGTGGTTGGTGAAATCCCCTGCCTGACACATGAACTGGGGGATGATACGGTGGAAACTGCTTCCCTTGAAGCCAAAGCCTTTTTCATGGGTGCATAGACAACGGAAATTCTCTGGTGTAGGAAAATGAAATAAGTTTAGTTTA a score=228 s mm8.chr4 122632902 66 + 155029701 TTCCAAAC-CAAAATTAAGGTAACCAC--CTAGATATAGGGGGGGCAGGTATAAAAATTAAGGTAACCA s monDom4.chr7 139194144 69 - 262624689 GTTGAAGTACACATTTGGGGTGTCCATGGCCACAGATGGTTGGGATGGGTGCGCCAGTGGAGGCAGACA a score=8395 s mm8.chr4 122635532 147 + 155029701 TCACCTGCGGTCATGGGCACCACATCAGACCGTAGGAGCATCTGAATGCGGCCTGCTGGCTTGTTCCCAATCTTGATGTCCATGTACACCTGAGGATTTGACCGGGCTTTTTTTGCAGTGGGCTCTCCCTAGGTGCAGAAACAAAAA s monDom4.chr4 418513682 147 + 430141050 TTACCTACTGTCATGGGAACAATATCAGAGCGCAGAAGCATTTGGATTCGCCCAGCAGGCTTGTTTCCAATCTTGATATCCATGTACACCTGAGGATTTGCTCTAGCCTTTTTGGCTGGGGGTTCTCCCTAGGGAAGGGTAAAAAAA a score=7685 s mm8.chr4 122637270 226 + 155029701 CTCCCAAAGCTGTGCTCCTTCACCC--CAGCACTGCCCTCACCAATGCTCGGATCTG--CAAGCCC--CTCAGGACGCC------CCTTTCACCCTCACCTCCTGGGCTTCAGCTTTGGGAGGCTCGGGTCCTTCTTCTTCCTTATTCTCCTCAAGAGTCTTCCCAGAAAACTTCTTCAACCAGTCATCATCTGACCAGACTAG----AAGGAAAAGA---CACAGAAAAGTTAAGAAATTCAGA s monDom4.chr4 418515341 243 + 430141050 CTTCCCATTCCACCCTTCTTCATCTGACATAACCCATCTCAAAAGCACTATAATTTATTCAGTCTCTACTCAGGAAGGCTTGGGCCCTGTTAT--TTACCTCCTGGGCTTCCGACTTGGGAGGCTCTGATGCCCCTTCTTCTTTATTCTCCTCAAGTGTCTTCCCAGAAAATTTCTTCAACCACTCATCATCTGACCACACTGGGTGAAAAGAAAAGAAACCGCACCAATGGTATGAGGGCCAGA a score=7904 s mm8.chr4 122637891 129 + 155029701 CACTCACCTGGCCTGGAAGAGCCCTCTTTAATTCTCATTGGCTTGGCCAAATTGACACGAATCGTCCGTCCAAAGAGCTCAGATTCATTCTGAAAAGATTGTAAATCCAGCT--------GCTTAAACTGTCAGGTT s monDom4.chr4 418516590 137 + 430141050 CACTCACCTGGTCTGGAAGAGCCTTCTTTAATTTTCATTGGTTTAGCCAAATTGACCCGAATTGTTCTTCCAAAGAGCTCAGACTCATTCTAAAAGGAATGAGAGTAAAACTGAAATACAGTTGATACTGTGAGGTT a score=2569 s mm8.chr4 122639153 86 + 155029701 AATGAGGATCCCCAGCCATACCATGTTGTCGATAGCTGCTGCCGCATCCTGCCAAG-GAAATGCAAAGTGTAAGTTTAGGCTTGTAG s monDom4.chr4 418522198 87 + 430141050 AGTAAGGAATGGAATACATACCATGTTATCAATTGCTGCTGCTGCATCCTAAAAAGAGCAAATAAAAAAGTGAATTATAAATTGTAG a score=4767 s mm8.chr4 122639822 128 + 155029701 TCTCACCTCTGCCAACTCAAACTCAACAAAAGCAAACCCTCGGTGTTTTTCTGCAAAAA-------AGGGAAATAAACACAAAGATCTAGGTAAC----TGCTATGTGAGGCAAGAGAAGAAAAGAGAACAATCACAAA s monDom4.chr4 418524461 134 + 430141050 TCTCACCTCTGCCAATTCAAATTCAACAAATGCAAATCCTCGGTGCTTTTCTAAGAGAATGAATACAAAGGAATAGTTACAA-----TAGGAAACATCATAAGACATGGAGTTCAAGGGGAAAAGGAGAAAATGACAAA a score=9870 s mm8.chr4 122641111 198 + 155029701 CTTTAATTCTTTCCCTATCGGAGGGTAATGAGCGTTAAAGACACTCAA-----ATGACCCACCTGTTTCATAGTCCAGAGGAATTTGAATATCTGTGATGTCTCCAAAGGGGATAAATGCAGCATGAAGAACCTTGTCGTCCACCTCTTCTGCCAGCCCGCCTGCAAATGAGCCAAGGACCTTCTGAGCCGCTGTCCTACACA s monDom4.chr4 418526008 191 + 430141050 CTGTAATTTTCTCCCTA-----AGATAATGG------AAGAGACCCAATAATCATG-CTCACCTGTTTCATAATCCAGTGGTATCTGAATGTCTGTGATGTCTCCAAAAGGAATAAAAGCAGCATGAAGGACCTTCTCATCCACCTCTTCTGCAAGCCCACCTGCAAATGAACCAAAGACACCCTTCTCTATTCTCCTTCATA a score=2897 s mm8.chr4 122642084 322 + 155029701 CGGAATTGTCCTTCCATCTCGGGCTCA-CACCCTCAGGCCCAGCAA---------------GCCCTCCATAGA----CCCCGGCTG---CTTTCCCCCTTTCCCACATTGCTCAGACTAAGTCTAGCTCCCGCGCCTGCTCACCCACGTACAGCACACGCTTGGTGGTGGCCATCTTGCTCGCGCCCGTTTCCGCCGGAAGCCGGCACTCGGCCGGCCCCCTCGCCGTCGCCCCTCCCCTTAGGTCGGGGCGGGTCTTTGTGCGGCTGCAGGCTCC------GCCCCTTCTTGGCTGTAG-CTCCCAGAGCTGGAAGGAAACAAACCTTG---GTCTGATCAACCTAGATATTAA s monDom4.chr4 418528569 323 + 430141050 CGGAGCCAGACTCCCCTCACTGGCCCAGCATTCTCAGGCCGAGTAGAAAATAAAGGAGGATGCTCCTAAAAGAACCATCCCGGACGGAACCTTGACCTCGGCCGAACTTGA--AGACATAATTT-----------CTACTCACCCACATAGAGAACTCGCTTGGTGGCGGCCATCTTGCGCCCGACTGCGT--------ATCCGGAAGTCGGCGTCTCCCTCTGCCCTTATTTCCGCCC--GGGCCTAGAAGGCCTCTTGCGC-----TAAGTTCCCCAAGGTCCCCCTGCTGCCTTAAGTCTGGTCGTGCTGGGAGG----GGGCCTTGTGCGCCGGCGCAGCCTGGATAGTGA a score=4754 s mm8.chr4 122687023 472 + 155029701 TTTCTCAGAGGAGACCTGAGAGGCCCCATCCATCAC-TGTAGGGACATCCTTTTCACTCAGGCCAAGGTTCAGGCTACTCCCTCCTACATATCCTACAGCCTCATTC-TCTTAGGGGCCTTTCCAGACCACCAGGCC---ACCCTGG--CATGAAAGCTCCAAATTATAGGTGGTCAACACAGCTCACCTTGTATGAGTCACTTTTGCCTTTTATTATGAAGGGGAGGAACAAGACCTGGTTGTTACTGCCATTGCTGCTGCTTGTGGAAGAGCAAA-----------------GGGA--------------GGAGAGGGAAAGAGAAAAATCTCCTGACCAGGGAGCTGTTGTCACCATGGCAACCGCTTCAGCACCAGCT--TCTCTGAAGCTAGGCGAGGGTGTGGGATTATTGCCTCCTTCAGTCCCTCCTACTTTTTACTGTCATCTCTCCACTTGAACCCCCTAACCCCGGACCCCCTAGAAGAAG--------CCTCTGAGCACAGAGGAGGG s monDom4.chrUn 60730628 482 - 174229318 TTCCCTTGGAGATCCCTGAGACATCTTAGTGGTAGTGTAGAGGGAGATCCCATGGCCTCA-----------CTGTTCCTTCTCCTTTCCTCTCCTGAACTCTGACTCCTCACAGCCCCCTCCCCCAACTACTCTTCCTTCCCCCAGGTTCATGCATTCTTGATGTAGGGGGAGGAGTAGCTGGACCACCCTCCA--AGTAATTCTCTACAGTTGTTAATGAGGAGAGGA-------------------GTCCTTGATGCAGTTGGTGGGGAAACAAGAGCCTTTTCCAACCCCGGGGATCCCACTGCCCATGGCAGAGAGAGAAGAGACAATCTCTGGACCAGGGAACTGCTGTTGCCATGACAACCTCCTCAGCACCGGCTTCTCTCTGAAGCTGGGTGAGGGTGAGGAATCGCCCCCTCCTT------CTCTCACTCTGGGCTGCTTGCATTGCTCTGGATCACAGCCCACCCAGGCCTGGGAGGAGGAGGAGGTGGTCCACCCAGCATGGCAGAGGG a score=1848 s mm8.chr4 122690431 60 + 155029701 AGGAAGGCCTGGAGGAACTTGGGAAATGGTTCCTGGGGGACATTGGTAGGAGAGGAGCCT s monDom4.chrUn 60732152 60 - 174229318 AGGAATGAGTGGAGGAATTTTGGGGATAGTCATGGTGTGAAAATGGCTGGGAAGTAGCAT a score=-93 s mm8.chr4 122690823 76 + 155029701 TGAAGGGAGGCAGAGCTCGCTGAATGGGTGGCTGGGGAAA---------TGAGGAGGGACAGATGCTGACAGATGTTAGGAAGAC s monDom4.chr1 728185955 79 + 748055161 TAAAGGGAGCCTGAGCCTA------GGGTGGCCCGTGCCAGCCTCCTGCCAGGCAGGGCTGCCCAGGGGGAGGGGATGGAGTGAC a score=13100 s mm8.chr4 122690899 290 + 155029701 GGGCTCCTTATGGAGCGGGGAGTGTGAAGAAGGGTCCAAGTTGGATGAGATTGGAGAGCCACTTTGCCCAGATGAGGTCCTACCCTGGGCCATGTTGAAG-----GAGCCCTCTGT---CCTCCAGGCCCA-CCATGGGGAAAAACAACAGCAAGCTGGCCCCCGAGGTGCTGGAAGACCTGGTCCAGAACACGGAGTTCAGCGAGCAGGAGCTAAAGCAGTGGTATAAGGGTTTCCTGAAGGACTGCCCCAGTGGCATCCTCAACCTGGAGGAGTTTCAGCAACTCTATATCAAGGTA s monDom4.chrUn 60739072 291 - 174229318 GGGCCCAGCCTGGGGAGGGCATTCTG-----GGGTGCATGAGGGCTGGAA---GGGAGCAAGATTCCCAAGGAAGAGATTTCTCCTCTGCCAAGGCAAGGCCTAAGTTCTCTCTGTGTGCCCAAAGGCTGGGCCATGGGGAAAGGAAACAGCAAACTGGCCCCCGAGGTGCTGGAGGATCTTGTGCAGACCACGGAATTCAGCGAGCAGGAGCTGAAACAGTGGTACAAGGGCTTTCTGAAGGACTGTCCCAGCGGCATCCTCAACCTGGAGGAGTTTCAGCAGCTCTATGTCAAGGTA a score=-1757 s mm8.chr4 122691189 135 + 155029701 CCCGGGTGGGGCGTGGCCTAGTGGGGT--GGACAGGTACCGGGACCCCGAAAGCTGAAAGCTGGCAGAGCTCAGCAGGTTGGGCTAGGTGGGGAGGGTGAAGTTGTTGTCGCACCCCAATAATCCGCACCCC------TGCCT s monDom4.chr1 728186350 126 + 748055161 TCCGGGGCTTGCCCGGCCCTGCCCGGCCCGGAC--------GGCCGCCTCTGGCT-----CTTACCGCGCTCCCCCAGACCGGCCGTGGGAGCCCCCAGGAGCC----TCCCTCCTCCCTGACGCGCCCTCTCTGTCGTTCCG a score=16816 s mm8.chr4 122691324 231 + 155029701 CAGTTCTTCCCTTATGGAGACGCGTCCAAGTTTGCGCAGCATGCTTTCCGCACCTTCGACAAGAACGGCGATGGCACCATCGACTTCCGGGAGTTCATCTGCGCCCTTTCTGTCACCTCCCGTGGCAGCTTCGAGCAGAAGCTCAACTGGGCCTTTGAGATGTACGATCTGGACGGTGACGGCCGCATCACACGGCTGGAGATGCTGGAGATCATCGAGGTGCGGCTGGGG s monDom4.chrUn 60740027 231 - 174229318 CAGTTTTTCCCATATGGGGATGCCTCTAAGTTTGCCCAGCATGCCTTCCGCACATTTGACAAGAATGGGGATGGGACCATCGACTTCAGGGAGTTCATCTGTGCCCTGTCGGTCACCTCTCGAGGCAGCTTCGAGCAGAAACTCAACTGGGCCTTTGAGATGTATGACCTGGATGGGGACGGACGCATCACTCGCCTGGAGATGCTGGAGATCATTGAGGTGCTGTCAGGG a score=16021 s mm8.chr4 122692913 549 + 155029701 TCCTCCCTGCCAGTTGGGTGTTCACACCTCCGTCTTCGCTCCATCAGGCTATCTATAAGATGGTGGGCACCGTGATCATGATGCGCATGAACCAGGATGGGCTCACACCCCAGCAGCGTGTGGACAAGATCTTCAAGAAGATGGACCAGGATAAGGATGACCAGATTACGCTGGAGGAGTTCAAGGAGGCGGCCAAGAGTGACCCGTCCATCGTGTTGCTCCTGCAGTGTGACATGCAGAAGTAGAGGCCGGTGAGGGGCAGGGCCCCTGGCCAGGAAAGGCATGGCAACCTTCCAACCTGATGTCCTCTCTGCTGGCCCACCCCCGGGGGGAGGGGCGTTCCAGCCTCACTCTCTAGCTCACCCACTCCTCTGTCCAAGCCTTTCTCTCCTCAGTCAAGTTCCTCGAGCGACCACCACCTCATTCTGTAAAAGAGACAGGTCCTCTCAAGTAGCCTGTCCTCAGATAGTCTGTCACTAGCTCCACCTCTAGCCTTGGCCTAGAACCAACATCCTTTGGGCTTAGGAGAGTTGGCTT-TTGACCCCAGAG s monDom4.chrUn 60741390 470 - 174229318 TCTTCCCTGAATGGCCAGGGCTCAC-TGTTCTTCTGCCTTCCGCCAGGCTATCTACAAGATGGTAGGAACAGTCATCATGATGCGCATGAACCAGGATGGGCTGACCCCTCAGCAGCGTGTGGACAAGATCTTCACCAAGATGGACCAGGATAAAGATGACCAGATCACCCTGGAGGAGTTCAAGGAGGCCGCCAAGAGTGACCCATCCATTGTGCTCCTGCTGCAATGTGACATGCAGAAGTA---------GGGGGAGCCTGCCCCTGCCCAG----GGCATCTCTGTGTCCTATCCTG--GGTCTCCCTG--------TCCCCAGGG----------------------------------CACTCCTGTGTCCCAGCCCCTTCTGCCCAGGGC---CTCCTCGTGT--------CCTCTTCCTGCCCGCGCCCCAGCCCTCCTCC---------TCCTCAG--AGCCTCTCACTTTCCAACCCTCCGCCCTGGACCTTTCCCCCACAGTCTTCCAGTGTTCTATACTTTTTTTGTCCACCTCAGAG a score=3436 s mm8.chr4 122696883 193 + 155029701 GCCCTGTCCCCTCCGGACATGCTGCTTCTAATTGTGTTCAC-----AGCAACCATCTTCACTGATCAACCCTGTGCCACGTGGTGTGTGTTTTTCCCACTGACAATGAATAAAAGGTGTGACTGTACAAGCTCTGTTCTTTGCTAAACTGGG----CTGGGTGGGGT-------------------TAGGGTGGGGCAAAGGGAAAGAGGCCAGGAAACTT s monDom4.chrUn 60748939 210 - 174229318 GTCCCTTCCCAGCCAGATGTGGAGTTTCCAGCTGTGTCCACGTGGGAGTGACTGTCATAATTGTTAGACCATGTGCAGTGTGATAT----TTTTTTAACAGACAAATAATAAAAAGTGTAACAGTGC-----CTGT--GTAACAATGCTGGGGTTTCTCTGTGGGTTGTATCCTATTATGGCATCCTAGAGCAGAGCTGGGGGGAAAAGATCAGGTTGCTT a score=2336 s mm8.chr4 122703686 38 + 155029701 CCCCCCCACCCCCCACCCCCGGCGGGCGGGGCAGGCTC s monDom4.chrUn 60753787 38 - 174229318 CCCCCCAACCCCCCACCCCCGGTTGGGTGCGCAGGCGC a score=4106 s mm8.chr4 122703724 549 + 155029701 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cctcttccctccttcctgccttctctcctcgtctccttgcctcttccttc---atcccgtctccctctctctcccttctcccccctccctcctcttctcactctcttcttctcCGCTAGAGACTCTGTCCCTGGTC--ATCCAGGATGGATTCTGGGCCTCGGGGGCCCTCGGG--------GACCCCAGAGTCTGGGGGGAAACC--------ACCAAACTGGCAGGAAGCCAAGACTTTCTATGACAGCCTGGCACCAAAAAAGAAACCCAAATCGGTAAGAGACAGCCCGGGAGAGGGGAACCCCAAAGCCTCATGAGGGAGGGACAGAGGGACTGGGAGATGGAAGGATCCCTATTTCCTAGTTAGGGAAATTGCTGGAGTGAAATTtcccctccactcccctcccttcccctgtcctcctcctcctcctcccctccggcccttcctctcccttcccAGTCTCTGGCAGGGGCTGGGTGTTTATTTCAGGAGTTCTG-------GCCCGGGCTTCGTTGGCTTCTC--------------------TTCTCCATCAGAATGCCTTCCCCCTCCCTTCTCCTACCAG------CCCCCAGCCGGGGGTCACAGCCTG a score=10866 s mm8.chr4 122710685 201 + 155029701 TGTTTTACTGTCCCTCCCTCCTACAGCCAAAGCCTCAGAATGCGGTCACCATCGCGGTGTCCTCCAGAGCCTTGTTCCGAATGGATGAGGAACAGAGGATCTACACGGAGCAGGGTGTCGAGGAGTACGTGCGATACCAGCTGGAGCACGAGAATGAGCCCTTCAGCCCCGGGCCTGCCTTCCCCTTTGTGAAGGTGAGGG s monDom4.chrUn 60760934 201 - 174229318 TGGCTCACGTTTTCTTTTCTGTCCAGCCCAAGCCCCAGAACGCCATCACCATTGCTGTGTCGTCCAAGGCTCTCTTCCGCATGGAGGAGGAGCAGCGCATCTACCGGGAGAAGGGCGTAGAGGAGTATGTTCGGTACCAGCTGGAGCATGAAAATGAGCCACTCAGTCCAGGGCCCGCGTTCCCCTTTGTGAGGGTAAGTG a score=9798 s mm8.chr4 122711206 219 + 155029701 TTTGCTGTGTCCCTTCCAGGCCCTGGAGGCTGTGAACAAGCGACTTCGGGAGTTGTACCCTGATAGCGAAGATATCTTTGACATTGTCCTCATGACCAACAACCATGCTCAGGTGGGAGTTCGTCTCATCAACAGTATCAACCATTATGGTAAGCATGGGGCAGGTGAGCATGGGACACCCTACCACACATATTCCCAAGGGGAAGCCACACTGTTTCA s monDom4.chrUn 60764854 212 - 174229318 TTCTCCTTTCCCTTCCCAGGCTCTGGAGGCTGTGAACAGCCAGCTTCGGGAACTGTATCCTGACAGCGAGGACCTCTTCGACATTGTCCTCATGACCAACAACCATGCCCAAGTTGGGGTTCGGCTTATCAACAGCATCAATCACTACAGTAAGTGTAA-------GAACCAGGGACCCACCCACAAACTCTCACCCCCATCCAATCCACTCTAGTCCA a score=9125 s mm8.chr4 122714441 170 + 155029701 GTTTGACCCTGGCCTCATCAGGGACTCTCTATCTCCACAGACCTGTTCATTGAGCGATTCTGCATGACAGGTGGGAATAGCCCCATCTGCTACCTCAAGGCCTACCACACCAACCTCTACTTGTCAGCCGATGCAGACAAAGTGCGAGAAGCCATCGATGAGGGTAAGTC s monDom4.chrUn 60769614 167 - 174229318 GCCTGACCTCAATCTCTCCTCTGACCCTTT---CCCCTAGATCTGTTCATCGAGAGGTTCTGCATGACTGGGGGAAACAGCCCCATCTGCTATCTGAAGGCTTACCATACCAACCTCTACCTGTCCTCTGATGCAGAGAAAGTGAGTGAAGCCATTGGAGAGGGTGAGTC a score=12668 s mm8.chr4 122716343 722 + 155029701 GGCTCAGACTATGTTCACCTCTCTCTGCCCAGGGATTGCAGCTGCCACCATCTTCAGCCCCAGCAGGGATGTGGTTGTGTCCCAGAGTCAGCTTCGAGTGGCCTTCGATGGGGACGCAGTACTCTTCTCCGATGAGTCAGAGCGCATCGTCAAGGCCCATGGGCTGGACAGATTCTTTGAGCATGAGAAGGCCCACGAGAACAAACCTTTGGCGCAGGTGCTACACATTTCCAGAACCCCTGAG---TAATTCCTCATTCCCCGGAACCTGAACTGGCCTGAGTCCAGGGCCAAACCCAGGCTAAGTTCACACACCCACCAGGTCCTCTTACTAAGAGCCAAGCCTTCTCTCTCtttgggttttcaagtcagagtttctctgtatagccctggctgtc----ctagaatttgctttgtagaccaggctggccttgaactca-gagattcacctccctctgc----ctcctgagttctAAAC------CTCACCTCTCTCGCTTGGCTCCTTGCTCCTTTCATTGAGACTTCAC--CCCTTCACTAAGCCCCACCTCCTCGGTCAAGTGCCTTTCTCCAACTCTTGGGGTCTCCAGCATCTTGCCAAGCACTTCTCTGCAGCCTCT--CCTGTCTCCCTGCTGTTTCCCTCCAAACCCCCATCTAAGGTCTCCATCACCTCTCAGAAGTACCCACGCCCCATTCTGAGACTTGAACCCTCCCAAAAGTTCCCACTCCTCCTCAAA s monDom4.chrUn 60772558 705 - 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aTATTGGGGAGAGAGGGGGGGGACCAAGACACAGAGAGATCCAGCAGGCTGCCTCCCTCAGAGCCATGAGCTGG----TATGGAT--CAGGTCTGATGGAGATTTCTGTGTCTAGCCTTCCTGGGTTTTCCAA a score=23402 s mm8.chr4 122718121 404 + 155029701 CATCCCTCTCCTTTTTCCCACAGGGCCCCCTAAAGGGCTTCCTGGAAGCACTGGGTAGACTGCAAAAGAAATTCTACTCCAAGGGCCTGCGTCTGGAGTGCCCGATTCGCACGTATTTGGTGACCGCGCGAAGTGCAGCCAGTTCCGGAGCCCGGGCCCTCAAGACCCTGCGCAGCTGGGGCCTGGAGACGGATGAGGCCTTATTCCTAGCTGGAGCACCCAAGGGTCCCCTTCTTGAGAAGATCCGTCCACACATCTTCTTTGATGACCAGATGTTCCACGTGGCTGGAGCTCAGGAGATGGGCACGGTGGCCGCCCATGTGCCTTATGGTGTGGCTCAGAATCCCCGGCGGGCTGCCGCTGCGAAGCAGTCATTAGGTGCACAGTAGCTGAGCCACCTTGCT s monDom4.chrUn 60773670 399 - 174229318 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TCACTTGGTCATTCTAGGCTATTCAGGTGCAGCAGGTCCCATAGGGTTTCACCCCGCAGG-TCTG-TGCTTCCTCTCCTGGCATGCCCTCACAGTCCTTTACTTTACAGGGTTCTTTGATGCCCGAGCCCTGGCTGTTGACTTCCGGAGTATTGGGTTTCGGGAATGCCTCACTGAGGTCATAAGATACCTGGGGGTCCTGGAAGGACCCAGCAGCCATGCCGACCCTGTCCGGATTCGCCTCCTCTCCCACCTCAAGAGCTATGCAGCAGAGATGGAGCCCTCACCCACGACCACCAGTGCCCTGGCCTTTCCCGTGTGGCCCTGGTCCTTCCTGCATAGCTGTCCAGGCTTGCCTTCCCTGAACAGTCAGCTCGCCATCCTGGGAAGAGTGCCCGGCCCTGTCCTCCCCAGCATCTCTTCTCCCCCTTACCCTATCTCAGCCCTGAGGTCGGCACCAGTGCACAGACCTGCTGGTACCATCCCCCCAACCCGGCGGAATTTGTTGCCCAGCCGAGGGGTGACTTCCACCCAGAGAGCCCATCTTCCTGAGAGGCCAGCTGCCCCTCCACCCACAGCCCTTG------ATGCCAGGGCTGCCAGGA------GCATAGTCCCAATCCCACCATGTTCCCCCACA------ACAGCCCCTGGAGCTGGGAAATCTGATGACAATGTGTCTGGTTCTATCTCCAGTCCATGTCCTTCAGGGCCAACTGGGAGGCCTGCGGGAGCAGTGTTCTACCACTCTTGGGTCTCAGAAATCACTGAAATTGGGGCTTTCTGAGCTGACTTCCCACAA------------------------CCATCCCCTGGGAATGAGGAAGGTTCTTTTTTTTTTCTCTCCCTGAAGCTCTAAAATGGTGCCCTCTT---------TTCTGTTTTTTTTTTTCTCAAATGGCATCTACGCAAAGGCACCTCTCCTCACCCGTCAGAGCCTCGCCCCCCTCACCCTACTCACCACTGATGCTGACAG---CCACCTGGCTTCTCTGCAGCCTT s monDom4.chr4 11557973 973 - 430141050 TCCCTGGGCTCTTC--GACAATTGTAGTGAGTAGGATTCCTTGGAG-----CCCAGCAGGCTCTGATGTTTCCTGT-----------------GTCCTTTGCCCCTCAGGACTCTTTGATGCCCGTGCCCTGGCAGTGGACTACAGAAGCATTGGCTTTCGAGAGTGCCTCACTGAAGTTGGCAGATACCTTGGGATCCTGGAGGGCCAGAGCAG---TACCGAGCCCATCCGGCTTCGCCTCCTCTCTCATCTGCACAACTACATTGCTGAGATGGTGCCCTCGTCAGGGGCTGCCACATTCCTGCCTTGCCCAGCTTGGCCCTGGGCATTCCCCCACGGCAACTCGG--CAGCCTCGAGCCAACTTCCAGTGCCCCAGCAAGGGCCCAGC-CCAGGACTGGCACTCGTAACTGCCTCTTCTCTGGCGTATTCCATCCCCATGCTCCGAACCACCCCTCTCCACCGAATCTCTGGCACCATCCTGCCTTCCCGGAAGAGCTTCCTGAGCCGTCGGGTGCCCACAGGCCCCCCTCGGGCCCGCCCTGCAGGGAGGCCGGCTAGC---CCAGCTCTGGTCCCTGTGGGGAGTGGCGCAGCTTCCAGAAACAGCCACATTGCTGCAGTCCTGCTCTCCTCCCCCTCATGCTCTCCCTCCCCTGCAGTTCCCATTCCTCCTCCCTACACATCGCCCACTGCGCTGAGTCCATCTGTTCAGGGGCCCGCAGGCAGGCTTGGCACTGCCAGACTCTGCCACTCCTGG---------ACTACCGAGGTTGGGGCTTTCTGAGGTGATTCCCCACCAGATTCCTGGCACATGCACAGCTTGCCATTCCCTGGGACCATGGCTGGAGCAGGCCTGGATGGCACCATGATTGATGGAAAGGGCTCCTTCTTCCATCCCCATCCTGTCTCTCTCCTCCTCC-----CTGCTTCTCGAAGTAGCCTCTCC-----------AGTTCCGGTCTTCATGTCCTCCTTCC------TGCCTCCAGGCTCCATCCAGCTCCCCTTCTCCCTT 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attaaaaaagataaacagggaaaatattcctaaaaatatcatagataatccattaacattcatatttaa-------tatatgtgcattgggtagcacaa------aatctaaatac-------acagaggaaa----agctaattgaattgcaagtagaaatagacaataaaactataatcctcttggatataggcaaatctacaaaaaa a score=18209 s mm8.chr4 122760313 308 + 155029701 TTTGTATAAAAGAATGAATGGTCCT----GTTCTCCACCATGGTGCAAGACCAAGGGGAAAAGGAGAACCCCATGCGGGAACTTCGCATCCGCAAGCGCTGCCTCGATATCTGCATCGGGGAGAGCGGAGACAGACTGACCCAGGTAGCCAAGGTGTTGGAGCAGCTCACAGGCCAGACCCCGAGGTTTTCCAAAGCTAGATACACTGTCAGGTCCTTTGGCATCCGGAGAAATGAGAAGATTGCCATTCACTGCACAGTCCGTGGAGCCAAGGCAGAGGAAATTCTGGAGAAAGGTCTGAAGGTGCGAGAG s monDom4.chr1 104062401 312 - 748055161 TTTCTATAAAAGGAAAGGCACCTCTTCTGGTTCACCACCATTATGCAAGATAAAGGTGAAAAGGAATAGCCCATGCAGGGACTGCACATCTGAAAGCTATGCCTCAGCATTTGTGTTGGGGAGAGCGGAGACAGGCTGACTCGGGCAGCCAAATTGTTGGAGGAGCTCACAGGCCAAACTCCAATGTTCTCCAAAGCTCCTTACACTGTCAGGTCTTTTGGAATCAGGAGAAATGAGAAGATTGCCATTCACTGTACAGTCCAAGGGGCCAAAGCCAAAGAGATACTGAAGAAGGGCCTGAAGGTGTGAGAA a score=17042 s mm8.chr4 122760951 318 + 155029701 TATGAGTTGCGGAAAAATAACTTCTCAGATACTGGAAACTTTGGTTTTGGAATTCAGGAAC--------CTGGGCATCAAATACGACCCAAGCATTGGTATCTACAGCCTGGACTTCTATGTGGTACTGGGTAGACCAAGGATCAGCATTGCAGACAAGATGCACAAAGCAGGCTGCATTGGGGCCAAACACAGAATCAGCAGAGAGAAAGCCATGTGCTGGCTCCAGCAGAAGTATGACAGGATCATCCTTCCTGGAAAATAAA-------TTTTATCCAAAAAGCCAATAAAATTTTCTCAGAAATGGAAAAAAAAGaatgaatgaataaa s monDom4.chr1 104062713 318 - 748055161 TATGAGTTAAGGAAAAATAATTTCTCAGATACTGGTAACTTTGGCTTTGGGATCCAAGAGCATATTGATCTGGGCATTAAAAATGACCCAAGCATTGGCATCTATGGCTTGGACTTCTATATGGTGCTGGGCAGACCAGGGTTCAGCTTTGCAGACAAGAAGCTAAGGACAGGCTGTATTGGGGCCAA---------------AGAGGAAGCCATGCGCTGGTTCCAGCAGAAGTATGATGACATCATCTTTCCTAGAAAATAAAGTCCTGTTTTCTATTAAAAGATCAATAAAATGATCACTGGAGTGTAAAAAAAAATAAAAAGGCAGGAA a score=10363 s mm8.chr4 122777095 338 + 155029701 ctcttggaagagtagcaagtgcCTTtaaaataaaataaaataaaataaaataaaataaaataaaataaTAAAAAAAAAGCAAATAACACTTTATTCTGTCATTTTCTTTACAACTGAAACTCTGGGAATTCAAAATTA----ACATCCTTGCCT--------GTGAGCTTCTTGTACACAGCAGAAAAAGTTTGG-------------------ACCTTGTGCTCCACGTTGTTCTGCTGTGCTTTGTCTAACTGAACATTTATGAGCCGGCTGCCATCCAGTTTCACATGAATCCTCTTACCCACAACTTCGCTTGGGAAGACCGAGTCTTCAAGGATGGCACCATGCACTGCTGTCAGGGTGCGGCT s monDom4.chr1 539499977 349 + 748055161 CTTCTTGAGATTTAACATATGCCTACAACAAATGA-AAGCTCAACTATAAAATAAGGAAATCAATTATTCAGAGAAAATCAAATGG-----------GTAATTCAAGTTA-AGCTGAACCACTTTGGAATTTGGCTTATAAAAAGCCCATGACCAAGGACAGGTGAGCCT-------ACATTAGAAAAACTACAACAAATTACTGATCTACATTACCTTGTGCTCCACATTGTTCTGCTGTGCTTTATCCAAATGGACTTTTATGAGTCTGCTGCCATCTAGTTTCACACGGATTCTCTTGCCAACAATTTCACTTGGAAAGACCAGGTCTTCAAGGATTGCATCATGCACAGCAGTCAAAGTTCGGCT a score=9711 s mm8.chr4 122777447 215 + 155029701 ACTTATTTTTCGTATGGCTTTTCCGGGTTGGCTTGGGCAGAATCCTCCTCTGAGCAATGAGGACTATACGCATCCCACTGAACTTTTTCTCCTATTCATGAACTAACCAGACTTGGATTTTCTGGAAAGATTTAAGCTGAGGAACTGGTATAAAAATTACGATAGCTTTCTGACCACCACCAACTTCAATTTCCTTGGCTGTGGTGATGTTGAGT s monDom4.chr1 539506073 213 + 748055161 ACTCAACCTCCCTAGAAGTTTTAAAGTTCTGACAGGGCA--ATATTTACCTGAGCAATGAAGACCACATGTTTGCCACTGAATTTTTTTTCCAATTCACGAACTAGTCGTACTTGGATCTTCTGAAAGGATTTTAGCTGAGGAACTGGAACAAAAATGATGATAGCTTTTCTGCCACCACCAACTTCAATTTCCTAGGATTGAAAAATATTCAGT a score=1874 s mm8.chr4 122777662 34 + 155029701 GCCTTGAGATCTGCGTTCATCTCCAGCTCGAGCA s monDom4.chr1 539509072 34 + 748055161 GCCTTTAAATCAGAGTTCATCTCCAACTCCAATA a score=5911 s mm8.chr4 122777696 115 + 155029701 GCGCCTGAGAGATGCCAGACTCGAACTCATCCAGATTCTCACCATTGGGCTTCCCGATCTTGGCCCTCGAGCCGAGCATGGCTTCATCCTT----------ACAGAGTGCCGGCTTAGAAAGAGT s monDom4.chr1 539510055 123 + 748055161 GCACCTGGGAAATGCCAGACTCGAACTCGTCTGGCTTCTCGCCATTGGGCTTCACGATCTTGGCGCTGGAACTGAACATGGCACCGCCTGTAAAGCACAACACAGAGCGCC--TTTAAGAAGCGT a score=16555 s mm8.chr4 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s monDom4.chr4 11588377 1390 - 430141050 CGCGCTGCCTCTCGGTCGCACGCGCCCCCGGGgccgc-gtagcgccgcgcagcgttgcgccgcgccgc---------gctgcgctgcgctgggct---gggccggggcgggccgg-acggcgccgcccggggcgcgccgtgccCTTTGACCGGCGGCGCTCCCGGGGCGGGGGTATAAATGGGGCG-CGGCGGCCTCGAGGCTGTCTCTCTCTCCGC----TCCTGCCCCTTTGCTCTGTGCTCCCCGGCTTCCCACCCCCTAACCCCCCCCCAAAAGACAAAAA----AAAAAGAACCTAAAAAAACCTCAAGCTCCAAGTGAACAACGAAGAACGGACGCGCGGAG-----------------------------AGACCGTCCGCGGATCGGGGGCTTGGCTTGAGACCTCCCGGCGCCGAGAGAGACCTTTGC----CCCGCTCCGCCTACTCGTCTGCGTGTCAGGCCCCCGCGTGTCTGTCTTCCGTCTCCGTGCTCGGTACCGCGTGTTCGTTCCGTCTCCCACGTGTTTGCCCCCTCCCCCCGTTTT--CTCCCCTCTCCGGCTGGTC-CCCCACGTGGCCCGCCTCGGCCTCCGTGTTCCTCCTCCCCCTGTTGCTCTCGCTCCTGTTCCCGGCCCCCACGTGTCCTTGAACCGT---GTGCCGGTCGCCTCCCTCCCTCCTTGTGCTTTCCCTCCCCACGTCCGCGGCCGC-CGCGCTCCCCCACGTGGCTTCTCCCCCGCGTGCCGCCGCGTTTGCTGCTTCCCTGCCGGCTTCCCTTGCTATTCCCCCACGGGGAAGGCGACAGCTACCACCGCCCGCCTGCGAGGCCTCGTTGAAGGGGGC-TGTCGAGTTGGGGGACCACCCAAGAGGGAATAAGGCTCCTCTCTGGGGGTTCTAAATTGAAGCCGGAAGGCTGAACCGTGGGTTTCGGCCCCATTTTTGTCGTGCTTGTCTGTGTCGCTTGTGTTTCCCCTAACATGCGGCTGTGATTCTCCGGGCTTCGTCTCCACGTTTCCTTGAGGCTTCGCAACCTTTACTGGCTGGCTCAGACTTCTCTTTCCCCTTGTCTGTGGCTAGATTTTGGCCTCGGCCA-AAATCGTAAAAGTCTTGTCTTTTTCTCCCCTTGCTTTGGTTCCAGAAAGAGTTCCTCCTGGCGGGGCTCGGGGTGTTGGGGGGTGGGGAGATGAACACTGCTGCCAGCAGTTACCCCATGGCCTCCCTATATGTCGGTGACTTGCACTCAGATGTCACCGAAGCCATGCTGTACGAGAAGTTCAGCCCTGCTGGACCCGTGCTGTCCATTCGGGTCTGCAGGGACATGATTACCAGGCGCTCCCTGGGATATGCCTATGTCAACTTTCAGCAACCAGCTGATGGTGAGTATGATAGGGATCGGGCTCCTCAGGCTGCACTTCGGGGGCTGGTTTGGGCTTCCGAGGACG 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TACCTTGTTTGTTTTTTTCATCACTAGCTGAAAGGGCCCTGGATACCATGAACTTTGATGTCATTAAAGGCAAACCAATCCGTATCATGTGGTCTCAACGGGATCCCTCCTTGAGGAAATCAGGAGTTGGGAATGTTTTCATTAAAAACCTGGATAAGTCCATAGACAACAAGGCACTTTATGACACCTTTTCAGCATTTGGGAACATCTTGTCCTGCAAGGTGAGTAGTGGTTATTTCCATGGCAAAATTGATGTTTATTTAAAGGGGGTGGAGGCATGTGTAATAAAAAAAAAAT a score=481 s mm8.chr4 122789265 97 + 155029701 TCTTGGCTGGTGAGATAGgggctatctagggagttccaggccagcctggagtatatGCAAGAT------AGTATCGAAGGGAGGGTGCCTTAGAATTTGAGAC s monDom4.chrUn 62760075 100 + 174229318 ACAAAGCCATTGAGAAAATGAATG---GGGTACGTCTGAATAATCTCAAAGTATATGTAGGACGCTTTAAATCCCGCAAAGAGAGAGAACTGGAACTTGGAGC a score=-68 s mm8.chr4 122791118 135 + 155029701 AAACGTAAAGTGGGA-------TAAGAAGCAGGCTAATGGTAGCAGCCTTGGAAGGCGGGGTACGTGGTGGTGAGTGCTGTGAGGTGTTCGGTCCC----AGCTGGTACACCTGGCCAGTGACACCCAGGTGCACTCTGCCTTTCC s monDom4.chr1 500736460 142 + 748055161 AAAGGCAGAATGGGAGTCTGGTTGAGGAGACGGGGAGGGCTACGGAGCTAGAAAGAGAAAGGGAGAGGTGA-GAGGGCTGTTATACATCCGGTGGCCTGTGGGTGGTGGTGCTGCTCTGGG---CTGAGTTTTCTTTCCCCTCCCC a score=20367 s 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s monDom4.chr4 11751712 1004 - 430141050 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s monDom4.chr4 11755569 1023 - 430141050 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AACTTACTTGTAATAGTGCTTTCTGTTCCTCTCCACAGCTTCCAAAGATTTCACTACGCTGGCTAAAAAGTTCGTCCATGGAATCTTTGTGCCGAATGATATCGATGGAGAAAGCCTTTGAAAGAGAAAATGCTATTTAACAAAGAAAGAAAAGCAAACTA------GCTTTCCAggaggcaaggtaacagagaagaaa--gaatactggacttt---tagtcagaggaaatgagctcaac----------tacttaattcctgtgtgaacctggaaaagtcacttatcttctctgacttaattttcttcctctttaaaacaag a score=9528 s mm8.chr4 122893345 208 + 155029701 ATACTTACCTTCTGCACCTGCAGCTGAGCAGTAGTCTGGTCTTGTTCTAGACGAATTGGACCGAGAGCCATCAGCTTCCGCTTGGTTTCAGCAACCCAAGCTAGTTCTGCATCAGCAGCCTGCTCGTACT---AACAGTCAGTAAAAATGAAC-----AGTTACATACAGCCAGCAG--CTCTGTCCGGCA-ACTGTAAACTATCCAACACAGAAAGGC s monDom4.chr4 11766965 219 - 430141050 ATATTTACCTTCTGAACTTGTAGTTGTGCAGTGGTCTGATCCTGTTCCAGGCGGATTGGGCCAAGAGCCATCAACTTCCGTTTGGTTTCAGCCACCCAGGCTAATTCTGCATCAGCAGCTTGCTCATACTATCAAAAGAATGGGAAAACAAACCCATTAGTTAGTATAAACGAGGGGGTCTCTTTCTAAAACACTTAAGTTTACCCAATATAAAAAGGC a score=1532 s mm8.chr4 122895422 227 + 155029701 AAGTGCATGACCAGCTGTGTGACAGTGATGTCTTAGGAAGATGATGAAGATGTGCCCCGCCTCTCCCCAACCACCAAAGCGGAAGGAAAAAG---GGAAACATGACACCTGTGTTTACTAAGA----GTCCCTTTTG----------------------------GCTGGCTGTGCTATTTTGGTTTACAT--------------------------ATTTGAAAGTAATTATAGTTCTTGGTATCTTCCCCTTTTCCATCTAACGCTAAAATAg--tggtgctgcaaac s monDom4.chr4 11768295 288 - 430141050 AAGCACATGGC-AGCTCTGTGCCAAAGGACACTTAGACAAAGGA-AAAGTTAGTTACCATTTTTCTAAGAAAGCCAAAAAAGAGGAAAGAAGTCAAGAAATGGGACCATTCTCCTTCCTGAGCTAGCGTTGCTTTGGAAAAGTGATTGGCACAGTTAATGAGTGGGTTGGCTAGACTGCCTTGGTCTCCTTCAAGCATCAAAGATCTACAATCTATGATTTGACAGAAATTATAGCTGTCTTCTTCCTTCCCTAGTCTGTACAATTCTAAGACAATTTATTGTTTCAAAC a score=18290 s mm8.chr4 122896253 807 + 155029701 TTCTATTTATTTTGAT---CTCATTATTCTTCTTGAGCCTGTACTTATGTAGGTTATAGCACTGGACA-------CCACATATACATCCCATGACCTAAAACACTAGCACATAGCATTATAAACATTACCTGTTGTGATCTCTGAATAGCAGCATCAATTTCATCTACCCTTTGTCCAACAGTGTCACTGATCAGTTTGTACTGCTCGTTGGCATCAGACACAAGTTTATCCAGTCCTTCTCTGGCTCTCCAAGGCACCAGCTCTAGGAGAGCATGGCTCACCTCATTCACTGTGTCCAACACCAGCCTGTGTTCCATGACCTCCTTCTTCAGTTCCTAAGGAGGGAA---AGGTTTTCAGGCCACACCTTGCTAAATTAAGCCCATCAGCAGCAGTGTGTGCTGGGGGGTTGGGGGAAGCCTATCTCCAGCACACA-TCCCAGCAGGGCACTGACCTCCTTCCTTCAGCTCTTTTTTTCTCTGCCTCACATTTTCAATCATTTTGAAACCTGCCTGACTTTCAGCTTAGCTGCTGCTTATTTACAACTGTCTGCAAGATTTGAGTCACACTGTCTGTGTAAAAACAGTGTTTCTT-TCTTTCTATTCCTTAATGCTCTAACTAGGGGCATTTAACATAACAAATACCCACAAAGATTTCTGTGCATCAAGAACTGCTTTTGA---TACTGCAGCAGAATTAGAACTAACTACGAAGCACCTCCCCCATTTAATTCCTTCCCTTGCTTTGTTCTTGTTCTTTTTCTTCTAGTGCCCGCATCCATCTCCCTCGCCTCCTTTTCACTTGTCTTCTGGTCTCCAAACA s monDom4.chr4 11768816 739 - 430141050 TTCCACTTGGTTTGATACTTTAATTCCTATTCTTGAAATTATACCTATATTGGCCCAAG---TGGCCATGCCTTCCCACATGTAG----CAGAGTCCAGA---------CATATAAGTACATTCATTACCTGTTGTGATCTCTGGATAGCAGCATCGATTTCATCCACTCTCTGCCCAATGGTGTCACTGACTAGTTTGTACTGGTCATTGGCATCGGATACTAATTTATCCAGCCCCTCCCGGGCTCGCCAGGGCACCAGCTCCAAGAGGGCCCTGCTCACCTCATTCACTGTGTCCAGCACTAGTCTGTGCTCCATGACCTCCTTTTTCAGCTCCTAGGAAGGGAAGACAGGTTTTCAAGCTAGGTAAAATACAATTA--CCCTTGAGTAGGAA-GTGT------------------------------CACATATTCCCCAAAGGGTTCTGACCTCTTTCCTTCAGTTAGTTTTTCCTATTGC-AAAATGTTCACTCTATTC----CCAACCCGATTTTTTACTTAGCCACTACATGTTAAGAGCCTT--------TCTGAATCAGCCTATCTTTGGGTAAAAATTATTTGTTGTATATCTTCTTTTCAAGTCACTTA------GAAAATAAGAAACAATATGTTTAAGAAATTTTATCTAAAT-----ACTACACTTTAATGTAATAAGGCAGAAATAAACTAATCAACCAATAACTATCAACAAAGAAATGCT--------TTTGTTC-TGTGCCCCTTCCCAGGCTAACTCCATCCAGCTTTGGTCTTTCTTTCCCAC----CCCCCCACCCCCAAata a score=16275 s mm8.chr4 122897198 914 + 155029701 AGAGAGAAAGCAGGAGTTCATTT--GGTTTAGTTCTAAGGT---AAAGGTAAGGA--AATATGATACA-------------------------------GACAAAGATGAAACTTCTTTGCCTGCTGCAGTATAAAATGATGGCTTACCTTCTGTCTTTGCTGAAACTGGGGTATTTGCTCCCCTGTGGGAGACTGTCCTCCACTGGCTGCCAGCTCCTCCTCCGCCTCCCTCAGCCACCCAGTTAGTTCCTCATATGTAGAGTGGAACTTGGTGGCCAGCTGCCGGGCTTGTTCTAAAGTTCTGAGGGCCTTGGAGCTAGTGAGAGTGATGTCCGCATAGCGGGTCTTTATCCCATCCAGCTTCTCCTGGATAAGCAGTACCTCCTCGCCTGTGAAGAACAGCAGCCACTGTTCACACCAAGGAGCTCTCAGCACGGAGAGGAAAGGAGCCTTTTAATACTGTCTTTAAATGAGAGCT-TAAATTTCATAGACTCTTGCTATGTCCTGACTTCACCCAATATCCCAAACTGAGGGGAAACTGGAAATGGAAATGAACCCTTAATCACATAAACTATTTGTGAGATCAAGCTTGAAATCCAATTGCAGGGGTTTCTAGATGTTTCTGAAACTTTACAGACAATGCTGATATTCAATAT------ATTAGGAGGTAGGAGGAAGT--------------GCCATCTATAATCAGATAGAAGACAACTAAGTAGT------TTTCAAAAGGTTTAGCAGAAAAT--GAACAT---GTGACCTGTTTCTGTGGAACACATACAGCAATACAATCAGC--GCATGTCA------------AGCTCCCACAGGCCA---GGAGGACTGGTCAGTGCTGGGTGCTTATGGTCT----------TTAAGGCTGACAAGATGGCTTagaggacctg-gatttggttccaaaaagcatatggtgattcatatcaacctgt----aaatccacttccaggggacaatgccctcttctggcccctga s monDom4.chr4 11772665 948 - 430141050 AAAAAGAAAATAGGGACACATTTTTGGTTTTGATccaaggtcacagagctgaggagtagtataacagaacttaaacccaagggctgacttcctgcctatgACAAAGCAGGAAGTTCTCACACTATT-------AATATGAAGACTCACCTTCTGTCTTTGTTGAAACTGGGGAATCTGCTCCCCTGTAGGAGATTGCCCTCCGCTAGCCATCAGCTCCTCTTCTACCTTACTCATCCAGCCAGTTAACTCATCATGTGTGGATTGGAATTTAGTGGCCAGTTGTCGGGCCTGCTCCAATGTTCTAAGGGCCTTAGAACTACTGACAGTGAGGTCAGCATAGCGGGTCTTAATCCCATCCAGTTTCTCTTGGATGAGCAGCACCTCTTCCCCTGTGGGGAAAAGTAG--------TATGCTGTGAATCATTCATATCCAAGAGGGGAATGCAC-----------------AATCACAGATATATATTTTCTAAATGCCTCCCCTCCCCTCCTTT-------------AAATTTTGACTAAA--GGTTTTTAATATCCCTTCCTGGTGGTTGAAGGAATTTCTGAGACT--------ACTAAAATAGGATGTCTTCTTATACACTTTTTCAGACTTCCACAGAA---TGACATTCAGCATCCTTTGCTTAAGAAGAAAAAAAAACTCTATATAGCCAGTCTTCATGTAGAAGCAGATGTGAGACAACAAAGTCTTTCAGTGTCTCCAGAGATTTAACAGGAAATAAGAACACAGGGTCAACAGCCTCCCTGGA--GCAGCCTGTAACACGATCAGTAGGCTTCTCATAGAAAGAAATTGGCTCACATGGAACATCTAACTGACTGGGCA-TGTGAGTAGCCTAGGGACTAGGCAAGTAGTTGGAGCTGCTCA-----TTCAAGATACCTGTTGTTTGTTTCAGAAGAGCTTGT--CCATTCTTAACAGCTTGGTCTACAGTCTTTTTCCTATTAACAATCTCTTCATTCAAAGCCTGA a score=3363 s mm8.chr4 122898203 238 + 155029701 TTTTCAAAGT----ACCTGTAGTTTGTTTTAGAAGAGCCTGACCATTTTTTATTGCTTGATCTACATTCTTCTTTCTATTAATAATCTCTTCATTTAAAGCCTGAAAGGAAAGAAG-AGCATTAATTT-----CAAATCTATGGCATAA--GAAAGGGAAGCACTCTGAGCGCTTTAAAAGGACA------ACACCTAAAGAGATCCATTAGCAGCTCAGTTTAAAGTCA-GATAGTTGATTCCTTTCTGTATCTCT s monDom4.chr2 306840466 239 + 541556283 TCTTTAAAGTTCTCACCTGTTGTTTGTTTCAGGAGCTCTAAACCATTCTGCAATGCCTGATCAACATTTTGTTTCCTGAGTAGTATGTCCTCTTGTAGAGCCTAAAGACAGGTAAGTAGCATTTATTTGGGCAAAAATTTAAATCCAAAATGAACCTTAGTTTCTCTCAGAGAACTAGAAAAATATTTCACACATTTAAAGAA------------------TAAAATTCATGATGGTGGCTTATTTTCCTCTTCTTT a score=-1730 s mm8.chr4 122899049 256 + 155029701 TATATGTGGTTTCGTT---ACAGAATGCTCTCATCTACTCAAATGAAAACCTA---CTGATCCAT----TGATGTACCTACCCAATGTGCAACTGAGATGGACCTGCCTCTTACCTGTATAATGTAGAATCATTAGTTCACTTGTTAAATACGAGTATTTATTCATGGACCTATCCAAAAAGGACTAGTACTTGGCAACAACTCAACTATGTATATGTATAAATATTCTATGCACACAATAAAGCTGAAGTGTTTGGAATGAAGGG s monDom4.chr2 306840705 177 + 541556283 CATGACTATTTTCATTGGTACAGAATA-----ATCCACTTTAAGCAACACTCCACTCTATTCCATAATTTGTTATAGTCTCTTTTTATTCAACTCATATTCAC--------------TGCAATGACTAATAATCA-------TATGCAGTGTGCACATATATTCATAAATATATG--------------------------------TATCTATATGTCAATATGTTCaa-------------------------------aagaa a score=29977 s mm8.chr4 122899305 547 + 155029701 GAAAAAAGA----------AATTAAAAGAAAAAGAAATG--AAAAGGAACACATATCAGAATGACAAAA---------TAATTCAGTAACATAAGAA--------TGAAAACACAAATACCAGGTGGTCGGCATGCTGTTTCTGCAGGACATCCTGTCTGTAATCCTTTACGAACACTGTACTGAGCTTGTCCTCAACCTCAGCCAGCCAGTTGAGCACCTCCACCTCATCCTCCCCGAACAGCCTAGCATTGAACAGGGCCTGCTCGAGCAGGGATGCTTTCCGACAGCACCGGTCTTGAATTTCACTGTATCGGGCCTGCAATGAGTCTAGCTTTTCTGACATGATGCCCTGCTCTGCCGGACATGTCAGGGAGGAGAGGGACTGCCCAATTTTAACTGCCTGGTGCACATCTGTTGCATGGTTTTCTATTTCTTCCTCTAGAGCCTGGAAATCC-AGATGGAaaaaatgagtaacaaaaaagtaaatg-------------------------aaaaacaaacatgaaacaatgaataacaaataacagaacaaattaaaataaaaatTCACCTGCTGCACAGCAAAAACAATATGAGA s monDom4.chr4 11774000 602 - 430141050 GAAAAAAGATTACCTTTAGGACCGACTAAAATGTAAATGCCAAAAGGAGGACAAATATGAATTGGAAAAAATGAATGATCATTCAGTAACATAATAAATAGGGATGGAAAACACAAATACCAGGTGGTCAGCATGCTGCTTCTGTAGGACATCCTGTCTGTAATCCTTTACGAAGACCGAGCTGAGCTTGTCCTCAGCCTCAGCCAACCAGTTGAGCACCTCCACCTCATCCTCCCCAAACAGCCTGGCGTTAGCTATGGCCTGTTCAAGTAGGGCTGCCTTTCGACAGCACCGCTCCTGAACCTCACTGTAACGGGCCTGCAAGGCCTCTAGTCTTTCAGCCAGCACACCCTGCTCAGCTGGATAGGTCAGGGAGGAGAGGGACTGCCCAACTCTGACTGCCTGCTGCACATCAGCTGCTCGGCTCTCTATTTCTTCCTCCAGAGCCTGAAAATCCGAAGTGGAAAAAATGAACAACAGAAACAAAAATGGGGGGATAGGGGGAGGGAAGAATTAAAATATACACACCAAACAATGAAAAATCAATGATAAAACAAACATAAATAATAATCCACCCTCTGAAGGGCACAAATAATAGGAAA a score=-1035 s mm8.chr4 122899852 137 + 155029701 AGTAACAC---ACAAGCTGCTCCTCTCCC-CTTTGATGTTCAGCTATTAGTCAATGTCTACTTTACTTCAA--------CCCAGT----GTAACTTCTCCAACTAATATGACCTCATCTTAAACTAAAAACTCCAC----AAAACATCTTCTAGAGA s monDom4.chr2 306841446 151 + 541556283 CTTAATTCTTACCACTCTGCTTATGACTAGCTTTCACTATCATGCTTTAAAAGATGCCTTCTCAACCTGAATGTTCCCTCTTAGTTCCAGTAGCTCCCTTCTCTG--GTGAGTTCCTT----ACAGAAAGCTTCACGTTGAGGACACCTTTGAGCTG a score=14021 s mm8.chr4 122899989 267 + 155029701 ATGCTGCAGTTTTTCAGTCTCTACCTCTGGCTC--TGTTTCATCTATGGCAGCACTTTCCTACCTTGTGACGAATAATCTGCTGGTGTATTTTGGCAGTCTGAGTGCCAACAGGTTCCGAGTTAGCAAGCTTTTTCTCTGTGACAGATAAGAAGTCAGAAATAGGCTCAGCTGTCTCATGGAATTGTTTAGCCAGAACCAAGATATCTTCCAGCTGTTTTTGCCTACACAAATACACAGAACAAGTTGCTCAGG-CAGAAAGTCACATTA s monDom4.chr4 11775823 263 - 430141050 ATGGTTTGTTTCTTTAATTTCTTATTGTAGATCAGCGTTTCAT---TATAAACACTT-CCTACCTTGTGGCGCGCAATCTGCTGCTGGATTTTGGCAGTCTGGGTGCCAACTGGCTCAGAATTAGCAAGTTTCTTCTCAGTGACAGATAAGAAGTCAGAAACAGGCTCAGCTGTTTCATGGAATTGTTTTGCTAGAACCAGGATATCCTCCAGCTGTTTTTGCCTATACAAA---AGAGAAGAAGGTGCTTGGGTCAGAGAATTGAATCA a score=687 s mm8.chr4 122900256 82 + 155029701 CGAGTCATGTAGTATTAAAGTCAGTAAAAGGGCAGTCT---------TTACCAGGCATGGTTTAAGTGCTCATAGTAAACAGATACACATA s monDom4.chr2 306842687 88 + 541556283 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s monDom4.chr4 11784547 1054 - 430141050 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cacacacacacacacGGTCTGAATCTGCCTACCTTTGTTGTTGCAAGCTGCTGTTGCAGGACTCCGGGGTCAGAGGCAACTGTGTCTGAGAGAAGCTTCCCCACGCTGGCCTCACAAGTCAACACCCAGGCCTGCAGGCTGTCAGCGCTGCTCTGGAATTGCTGATACTGGCCTAGCAACATGCTCAGATGAGAGCCCAATCGTATACACTAAGCCAAAGAAATAAAAA s monDom4.chr4 11854250 229 - 430141050 CAGGTTTAAGTTTATTTGCTGACTTATTTTACCTTTGTGTTTGTAAGCTGCTGCTGAAGGACTGTGGGGTCAGAGGCCACAGGATCTGAGAGAAGCTGGTTCACCTTGCTCTCACATTCCTCTATCCAGGCCTGAAGACCATCTGCACTGCTCTGGAATTGTTGAGAGTGCTCCAGAAGCATGTTCAGGTGAGAACCTAGTTTGTTGCACTGTTTCAAGAAAAAGGGAA a score=28219 s mm8.chr4 122958529 723 + 155029701 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GCAGCCTTGAGACAAGGGAGAAAAATAGAAGAAAGGAAGGAGGCCATACAATTCAGAAAAAAGAAAAAAAAACAAGACATCTCAGACCAAAGG--ATACTATGGAATGGTCAAGATAAGGGTAAGGACTTTCAGAAGTAGGGTACAGACAAAACTGAAGCCAGAATAAAGAATAAACGTTGAATGAGTAAAATTCAAAGAAGAGAAGGCACAAGG---TTTCTAGAAAGAGTAGATGCTAGAGACAGAACCAGGAGACACTTAGAAATATGTACTGTACTAAATAGGACCAAGGATGTTGAGCCAGAGTCACAAAGAAATGACAAATGTGGGAAGAATAAGACCAGAAGTTTGACTGGACTGTGAGTCAGTGGACAGGGGAAAGGAAATAAGGAACACATAAATCAAGAAGTAAAAAAACCCCAACAGAGCTGTTAAAATGTGACAGCAATCTGAACAGA---AGCTAAATGGAGATGGAGAAATGTGGGAACCTGAGAACTCAACTCCAATTGCACAGAACAAAGAAGAGGCTCTGGAGACCAGCACAGACTGAAAGAGATTTACAAGAAAAGGAAGACATCCCATTCCTTGGTCACCAGAGGATGAAAGGTCACCAGAAGAGAAAAATTAAAGTAGCCAAACAAAAAGGCAGAGGATTTGTTTAGGGATGGGGCACTTCGGGATAGATCTTCCCACAGAGCAAT-----GATTTTCCTATTCAGTTGTTT----CAGAGTTTTAA---TTATAGGTTTTTTTTTTTTAAAGCACTAAACTAGGCCCAAGATCTATTCATAAGAAACTCTAAGA a score=2840 s mm8.chr4 123168343 225 + 155029701 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ccaggcgttcggaaggctgaggcaagagaattgtaaatttgag---ggcagcctaaactatatTTATATATGGTGACACCCAGCCTCCAAA---GGAAGAAAAGAAAAGAAACCTAGTAATTAGGAAGAGA---CTTGGTTTGCACAGTGGCTAGAGTGCCTCTCTCCAACCCAAGTTGCTTTCTTGATGAAATTTGCATTTAAATACTCTCCCGGGAGTTTGGAGTG---AAGCTTTCTTCTAATGAATGGCAAAGGGG---AAGTCCACATGTTTGGCTGATGCT-CCTGTTTTATACAGAGAACATTTTACTAGGCTAGAGGGAACAGAGCTTCTTGGAGGGAAGGAA--GAAAGGCTAACA-----------AAGTGCAATTTTTGTTTTTGTTTTACTTCTTTCAAGCAAGAATCTAAGTTGATTGCCAAACCATACAATCCAGAA--GCTCTGAGGCTCTC----------CTGGGCCTGCTGTTGAATTTCTAAGGA---------------------GTTTGCCTTGGAAGAATC------AGACAGCAGG----------ATGGACTTGGGAGGACACCTAGTGGCAGAGGTG-GGTAATGCAAG--GAAAGAATC s monDom4.chr4 12090626 597 - 430141050 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TGTGCTAATGCTGCCCCTCTGTGTCCAGGGAGTTATACGCCTCCATCCCTGAGGCCCCCACTG----AGTAACCCAGAGAGACAAGACCAAGGCCACCCAGCAGTTTACATTTCCATGACAACCCTCAAAATGCCTACTCAGCCACTTGAGTTACCACAGCAACCAACCAAGCCTTTTTTTCCCAG a score=16879 s mm8.chr4 123186266 325 + 155029701 TCTTACCAGCGACTCGGACCACGGCACGTTCTGCAGGGTCCAGCACAGAATCCTGGCTTTTCCGCTTCTTCTGCTCATGCAGTGGCAGGTTCCAGGGCAAGGTGTCCCCAGGGGGACAAGGAGACAGGCTCCCTGACCGCTCACTCCGGTAAGACCTCTCACTCCGACATGACCTCTCACTCCGACAGGATCGCTCACTGAGCGTTTCTTCATCAGAGGAAGACATGGTCCAAGCAAGAGTGGCTACAGGAAGGACCAGATGTCCT-GGGAGAAGGGATCTGGAAGAGAGAAAGAATACATGTGAAGGATAAAATAAAATAAAGGA s monDom4.chr4 12109495 322 - 430141050 TCTTACCAGCAACTCTGACCACGGCTCTTTCTGCTGGATCGAGTACGGAGTCCTGGCTTTTCCGTTTCTTCTGCTCATGAAGAGGTAAATTCCAGGGTAAAGTATCCCCAGGGGGACAGGGAGATAGGCTCCCAGACCGCTCACTCCTGTAAGATCGCTCACTCCGGCATGATCGTTCACTCCGGCACGATCGCTCGCTGAGGGTCTCTTCATCTGAGGAAGACATCTCCAAAGACGTAGTGAAGACAAGATGGTATGGAAGTCCTCAAGGGCAATGATCTGCAGGAT---AAGTATATATG-GTAGATTAGACCAAGATTCAGAA a score=263 s mm8.chr4 123188402 1615 + 155029701 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s monDom4.chr4 12114635 2064 - 430141050 CAGGGTAGGGGAGCTC----AGGCCCCCTGGTA-CTATAAAGGCACCCCTCAAGTATTCCTGAGACAAGTGAGAACA---TTTGTCATATTTCAGAAATAAATACTCCCTCCCTCTCTAACACACCAAATCCCTTTCAGAAAT---------GCTCGGGTTTTTTTTTTTTC----------CTCCTAA----ACCGT--CTCTTTGTCTCCTTCTTGCCTCCTCCCAAGGAGGTT----TGCTG-----------TCAGTCACCGGGGCAAGCGGCCTTCCTTTGCAATTTCCCCACCTTCATTC--------GAAAATGCCCATCTGACCTCATAAAACACCTGTTTCATCTCAATGCTCCCCAGTTCCTTTCATAAAGCCCTGCTCCGCTTGCCATCATTTCATCTCATAAATTCAGGG----TGCTGTGGAAA---CAGACCCCTTTATGAAGAAGCGCCTCACCTCG------GATCAGGCTCCGG--GTTCATCCCCGGGCTCCCCC---CGCCCTCCGGGTTTCTCTCCGCCCAGAAGCCTCCCCCATTCTGT---CTCCCCCCG---CTTTGTGGCAGGGACACGCGCGCTCGGCTCC--------GCTCCGCTCCACGGAAGGGGGGGAGCCGCCCCGCGTGTCCGCCCAACGAGCGCGGATGACAAAGAGCACCCATCGAGGCGCCGCCCCCCTTTCACGTCCCCCGCCCCAGCTCCCGGCCTGGGGGAGCAGGAAACACGTTCAAGGGGGTCAATGGG---TCGGGAGGCTGCCCGAGGAGGCCGCGCTGAGATCAAACGATCCACTCCCGAGCGGGA--GAGGTAACGGGGATCCCCGAGTCTCCTCCCTTCGCCCTCGGGTACTGACCG--CAAGGGAAGCCAGGGGC---CCACCCCTCCCACATGGACCCCAGGGAGAGAGCCCTTCACCTCATCCCACCCCACCACGGTCTCATTCCCCTAATCTCTCGCCCCGTTTTCGTTCGGAACACACCCACCCAGGGCGTGGGCCCGAGCCCAACAGGGCAAACGCCGAGAGCCCCAC------TGCGCCGCAGGTGCAAGTCCCGAGGGGCAGCGGCGTCACTTGGTGCGGTCAATATCCCCAGGGCGCCAAGAACAGTGTTGGCGCGCCCAGCCCAGGACCCCGCGAGCCCCTGCAGCGTTGGGCCAGCCTGAGATCCCTAGAGATCCCATAGATTAGGGCCTAGCCGCGACCCCACGATCCTCCTCTGGGTAGAACCTCCACGCTCCCGCCACCTGCCCCTGGCAAGCGCTCACTTGCTGTGCGCTCTTGAGCCCCTGGCGTGGCGCGCCGCCGCTCTTGCTTACCCGAGAAGGAGGAGCCGGCAGCAGGCGCCGGCAGCGGGCACTGACAGTAGACAGCTAGCAACGGGCAGCGGGCAGCGGACAGCCGGCAACCTGCAGCGGGCCAGGCGCACCCTGCCTGGACTGGAGCGGCTTCCACAATG--------------GCCGAACCTTCCTCCCGCCCCgcagcagcggaggcggtggcagcggcggcggctgcagcggcAAGAGAGCGAGCGGGAGCTAGAGCTGGAGCCCGAGCCGGCGCAGCCGCCCAGCCAGCTCcccccacccccagcgccgacaccgccccccgctcccggctccccctccgcccACCGAGTGCTCTGCTTCGAGTCAAGCCGCGCTCTCGGGGGGCGGGAGCTGCTCCCCCAACCCTTTCAGCCCGGGGCCCCGCTCAGCTTCCCAGCCATCGCCCCCTTCGATCCTTCCCCTTGCTCCCTTCTCTCTGGCAGTCCAGGGCGGGAGGTCCCAGCCCCCTCCCGCTCACCCCCAGGAATTGGGTCACACCCTCTCCTCCACTAAACCGCTGGTCTCTCCTCTCCCAGCTACACCTCACTCTGCGGACTCCCTCCTCTCCCCACATCCTCGGGCCACCTTCTCTACCTCAAATCTCCTCCCACCTACTCCTGCTGCCTGACACCCTGGGCTCTAGGTCTGGGGCTGCCTTCTCCAGTCCCTCCTTGGCCTTCTCTGGTCTCTCCCTCCCTCGACTCTGGGTCCCCGCTCTGTGAGAGATGCCCAAGCTCCGTGCCTTCCATTCACCAGCTCAGTTTGCCTCAATTCTTCCACATACCCCTCTCCCCTTCCTTCTTACGTCCT 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agaagaagaagaagaaagaagaagaa-gaagaaagaagaagaagaagaagaaagaagaagaagaagaaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaaa s monDom4.chr2 341924935 124 - 541556283 TACATGTGGTTTTGATTGGGGATGACTGATGAAACAGAAAGCAAGTGCTAAGAGTATCAGTAGACCTAAGAATTATGAGGAGATGGAAGATAATCTTGAGAAGTGGAGATTGGAGAAAGAAAAA a score=4677 s mm8.chr4 123215027 253 + 155029701 CTTTATTTCCACATACTTAATACTT--AATGAAGGAGCTTTCCTTAAATATTC-----TCTCCAGGGGAAAACAGAGCA-------------TGACAGCGGCCTCCAGCTGCCC---------------CGCTCAGGGCCTGGGCTCCTCCCTGCCCGAATGGTGAGGTGGAGGGGTGTATTTGCCCTCTTTCATTAGCTTCTCCCGCTGTTTCTTGATATCATGCATTCGCCTCATCTGTCAGGGATAAAAAAAGCATTAAGGCAAAGGGAAACAGGACCCAGAAAG s monDom4.chr4 12160042 280 - 430141050 CTTCATTACTCTAATTTTTAATCTTCCAAAGAAGGTGCCTGTTTTAAGAAATAAGACATTTCTGGGGAACAACAGGGTACACTTTAATCCTTTAACAGGAG--TGAAGCTGCCCAATGTCACCACTGACTGGTCAAGGCCTCGGCTTGTCCTTGCCTGAGTGGCAATCTGGGGGAGTGTACTTTCCTTCCTTCATTAGCTGCTCCTTCCGCTTCATGACCTGTCCCAAGCGTTCAATCTGCATATGGAAAAATAGACAGC------CAGTGAAAAAAAATTCAGAAAG a score=9314 s mm8.chr4 123218132 294 + 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s monDom4.chr4 12179434 2000 - 430141050 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AAGGAAGGAATGGCAGAATTTGATG-ATTAAAGA----AAAATA-AATGGTTAGAGATGAGTTTAAGGAAGTTCTAAGATTATAAA--CTTGAAGAATCAGGAGACTAAGTA--CTGAAAGGTTATTTCCCAAGGACTTCTTTTTGACACTCCTATTTCAGGAAGTCCTTTGGATCTAACTAAATTTTGTTTTTAAATAAGTAATTTTTTAACATATCCCTTGGCTCCCATACAAATCAAGACAGGC--CTTTGCTGAGATTCCCACGGAAGCTTTTTCCTCCTTTTTCCTG---GCAGTCTACACACCAAATCCAATCAC--------------------------AACAATCTTAGGGTATTTAATGATTTTCAAGCTCTG----ATGGCCTATCACTTGGAAACCAAATTTGACACAGAAAAATTCCTGAACAAAAGAACTGGGCCAATCCCTTTAAATTAGTTAAAATGGACCCTGATGTGACCTTCTGTTCTGTGTCATCTCTTCTTATGCCCTCCTTTTTATCCCAAGGCCTTAACTCCCCCCATATAAACTGCAATAATGCCAGATACTTTATTGATGTATTCTATTT-TCCAATTCCCTCTGCCCCC-----TGAAATCCTAAGGTTCTTCCTTTCTCCCATG-CCCGGTGTATTGCTTGTAGTTTAGGTAAGTAAGCACGGGTGTGCAGCACAACAAGAGGACGAGGGTGGCCCCCGGAACCCCCAGA-CACACAGCTGTTCCGGGTTTCTTTTCTT--TCTTAGGGCCCGGCCTCGATTCTCTCTGAGGTCTGGACCACTGAGGGTCGCACTGAGCTGGGCGGTTCAGAGGTTCGCCGGCTGCCCCCCATACCCCAAAAC--TCTGCCCCTG----ATCCCACTCCCC----CTCCCCAGGCC----TAGGCTCCGG------CCTAGCCCGGACTCCAGTATTGGGCCCTGCCCCTTCCCC-TCCGCTGCCCCCCGCCCCGGCTTCCCG---GGCCCACC---------CCTGTTACCCGGGGTCCGCAggcggcgctcgctgccgggcggggacggc---------------ggcggcggctggagctgaggctgaggcggcggcTCAGTGTccgggggccgcaggcccggcgcggggcccggcAAGGGGGCGCAGCGCCGCCGCTTCGGCGAGCCGGGGCTTAGAAGCGCTGCCTCGAACTCCATGGGCCGCTTTAGCGTCGCCCCGCACGCCATGCCCGGGGCCGAAGGACGACTACAACGAGGGCGGCGAGGAGAAAGGTGGTGGAGGCAGCGGTGGCGAAATGGCCCGACCTGCTACGGCGCCTCCGCTTGGGGCTCTCGGGCAGAGCCGGCTCCAATGGCGCCTCCCGCACCCGGCAGCGCCGCCGAGCCCCGCCCCTGTGACGTCAGGAGGACTGCTACACCACCCGTAGGGGGGAAGGCGGTCGAAA------CCATCCGAAAGTGCCTATCTAACCGAGGCTCAGCCGCGGGCGTCCCCTTTTGGGGAAATGGAACCGCCTGATGCCCAAGAAgggcgggggtggggtgggggtgggggtggggAAAGAGAGGGCAGGGTCACCAAGCAACAGCCGGGTGGTAGActcccttccccccctctcctcttcgcctccttcctttccccttctc 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aggtgacagtgaagtccagtgtggaggtgacagtgagtcctagggtggaggTGACAGTGAGTCTCAGTGTGGAGATGACAGTGAGTCCCAGTGTGGAGGTGACAGTGAGTCCCAGTGTGGAGGTGACAGTGAGTCCTAGGGTGGAGGTGACAGTGAGTCTCAGTGTGGATGTGACAGTGAAGTCCAGTGTGGAGGTGACAGTGAGTCCTAGGGTGGAGGTGACAGTGAGTCTCAGTGTGGAGATGACAGTGAGTCCCAGTGTGGAGGTGACAGTGAGTCCCAGTGTGGAGGTGACAGTGAGTCCCAGGGTGGAGGTGACAGTGAGTCTCAGTGTGGAGATGACAGTGAGTCCCAGTGTGGAGGTGACAGTGAGTCCCAGTgtggaggtgacagtgagtcctagggtggaggtgacagtgagtctcagtgtggaggtgacattgagtcccagggtggaggtgacagtgaagtccagtgtggaggtgacagtgagtcccagtgtggaggtgacagtgagtctcagggtgggggtgacagtgagTCCCAGTGTGGAGGTGACAGTGAGTCCCAGTGTGGAGGTGAGGGGTGGCAGGGTTTA s monDom4.chr2 7221339 594 + 541556283 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s monDom4.chr4 13484494 1368 - 430141050 TGCCCTGAG---GGTCTTGGCCCGGGCCCAGGGCCTGAGGAGAACTCGGGTGGCCGAGAGGGCAGACTCGGTTTGGGGAAGGGGCTCGGGGAGGGACTGTGACCGAAGGGG-CGGGGTCCCAGGTGGGGGTGGAGGGGAAGAGA-GCAACCAGGAGGGGGGGTGGGTCCGAGAGGCACTGGGCCGAGTTGGGGGGAGGGGGGCT-GGGGGCGGGGTCCGGGCTGGGCGGGCTCCCGCCCTCACTTCCTCCGGGAGGGGTTAGGGACGTTGTGCTCAGAGGCGCCCACACAGTCTCTGGACAGGAGTCGCCAGAGCCGCACGTCCGGCCCCGGCCCCCCAGGTAAGAGCCACCGCCCGGCGCACCGCGGCGAGCAGAAAGAC--TCGGCCCGCAGGGACCCTGCCCCCCGGCCTCGGCCCAGCTGCAGCTGCGCCCCCTCC----------TCCGCAACCCCATTTAGCCTCCTGGCTAGACCCTCCCCTTGAATTCGGCCCCCCCAGCC----------CACCCC---TCCGACGTCCCAGGCTCCT---CAGTCTCCTCCTGCTGAGGCCGTACTCCTCGGTTGGGACAGGAAGGTGTGGCGGCAGTTAGGGGCGCGGGGGGCGGAGAAGAGTTCCCGAGTGGGGTACAAAGGGTT-----AACGGCAGCTGTTTCTCCGCCTGTC--------CCCGGGCTTGCCTGCCTGTTTGCC-CAGGGTCCCAGCTTCCGAGCGCCCCCAGAGCCCGGGAGACCGTGCAGAACCGAGTGCACAGTCAAAGCCCGGGATGGGAGTGAGCTCCCCG-------------CTGCCGAAGAAACCCCACTGACATCTCCCCTTTCCCCGCCCTTT------CCCTACGGCCGCTGTCTGT-GCTCTCCCGCTGAGA--ACCGGCCGGCTGGCTTCTGA----TCCCGGCCAGGCACTCCCCTGGGAGACGGTGAGGGAGGGCGGGC--------------GGGAGGGAGGCTCCC------GCTGTCCCACTGGG---------------TGTGGGACTGTCGT-----------------------------------GGGGAGCCAAGTTGGAGAAGGAAAAGACAGAAACTCG-------GAGACACC----------------AGGAGCCCGAGACACAACAGGCATTGGGAGACAAAGATGGTGG-----------------------------AGGCATCAGGGGAAGGGAAACAGCCACTCGGAGACTCGGGGGGAGACAGG----CATACCTGGCTAGCCACAAA---------CTTTAATCTTCCAGTCCAGATCTCCGTCCCCGGGCCTCAGCCGCGGGGGA-GAAAGACTGAATGAGCCCGCGGTCCCTGGGCCCATGGATGGGAGCtccatccattcatccatccttccatccatccCCTTCCCAAGCAGCTTTGTCCTTCCAGGCCCCCAGAGGGGAGGGGGGGGGGAGGGAAGAGGAGAATTTGGGTTTGGTGCCAGGCAGCTGGTAGAAGAGAGGGAGAGTTCAATTTCTCCCCTTGAGTATTCTGTCAA 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monDom4.chr4 13494128 668 - 430141050 CCCCACTAGACACTAACACAGGGTGGAGTGACTTACCGTGACCAGCCCTGGCACCGGGAGTGCCTGGTCTGCACCGGATGCCAAACCCCCCTGGCTGGCCAACAGTTCACATCCCGGGATGATGACCCCTACTGTGTGAATTGCTTTGGGGAGCTCTATGCACCGAAATGTAGCAGCTGCAAGCGGCCCATCACAGGTGAGGATTTGGCACCTGTTGGGGAGGGGGATCACTGTGGTAGGGGTT-GGATGGGAGGTACGCTCCCCCCCCCCCAAGTAATGAGAACCCATCATACTGTGGCTGGAGGAGTGGAAGGAGCCTTCTGGGAAGGGGAGGTGAGTATCGAGGGATCTGACCTCACCTTTTCCATTTCCCCTACTCCCTGCAGGACTTGGCGGGGGCAAGTATGTGTCATTTGAGGACCGTCACTGGCACCACAGCTGTTTCTCCTGTGCCCGCTGCTCAACCTCCCTCGTGGGCCAGGGATTCATACCTGATGGAGATCAAGTTCTTTGCCAAGGATGCAGCCAAGCTGATCTCTGAG-GGAGCCTCCCCGGCTGGGGATCTCCCAGGATACTCCCATCTCAAAAC--TGGGGTCTCCTATAAACCCAAATGTCCCCTTGGCTGTCTCATCCCCAACCCAGGGTGCCCCCATTCCCA----CAGCTCCCCA a score=8341 s mm8.chr4 124211262 289 + 155029701 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s monDom4.chr1 116798033 1182 - 748055161 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TGGAGCATTTGGTCTCA----GGAATAATTTTCTTCA----GCATCCTAACTCATCCCATTGTTTTCTAGGAGTTGGCCTCCTTGGGTCTGGACAGACTGAAATCTGCACTCTTGGCTTTAGGACTGAAATGTGGCGGGTAAGAGGCAGGGTCC--------------------------------ATAATCTTTTAACTG-------CTCTGTTATTCTCTTTCTTCACTTGTTCACCATAACCTTTAGAGGGAC------TTAAGTTCCATTTGTCTGACTACTGTTAAACTAGCCAAGTGC---------AGGTGAGACTG------------------CTTGAAGTAATAACTAGGGAATTCTTTGTCTTTT-----CACAGGACACTGGAAGAGCGAGCCCAGAGACTATTCAGCACTAAAGGCAAGTCCCTGGAATCACTTGACTCCTCTCTGTTTGCTAAGAATCCCAAATCAAAGGGAACCAAGAGGTGAGTAACCTGG------------TAGTTTTTGTGTCCTTTTGAT-TAGTTGG--TTCTGTTGGTCCTTTTGCCTGAC a score=6341 s mm8.chr4 124229268 243 + 155029701 TGTTTTGTTCTCAGAGACACTGAGAGGAACAAAGACATTGCTTTCCTGGAAGCCCAGATCTATGAATACGTGGAGATTCTCGGGGTAAGTGCATTCTTCTAG--AGCCTCGCCGCTGCTTGGGGTGGATTACATAGGAAGGAATTTTTTTCTTTTTTTAATGTTCACATAAGGAAGAGGGATGGGCAGTAAACTAATTCACCTCAAAATGTGGTTCTCTT--GACGTCCTTGGCTTCTTTGGGCTCC s monDom4.chr4 13513207 230 - 430141050 TTTCTTATTCACAGGGACACTGAGAGGAATAAAGACATTGCTTTCCTTGAAGCCCAGATTTATGAATATGTTGAGATTCTTGGGGTAAGTATATTACTGAAGGTAATGTAACC---------------CTCCCTGAAAAGCCACCCACCCCATCTCTTTTGGCTTAGGCAGTTTAGAAGAA--AGAAGGAGACTTACTGATGTCAAAAGGTTCTTCTATTTGGACAACCTCAGGTTCTCTACAGTCC a score=16618 s mm8.chr4 124230371 370 + 155029701 CCTCAGGAACAGCGACAGCTCACTCATGAAAATGTTCAGCGCAAGCAAGCCAGGACAGGCgaggagcgggaggaggaggaggaggagCAGATCAGCGAGAGCGAAAGTGAGGACGAAGAGAATGAGATCATTTACAACCCCAAGAACCTGCCGCTGGGCTGGGACGGCAAGGTAAGGTCTCAGGGCCCTCTGTCCCCTTCCATCATGGGCATGCCTGAGCTCGGAAATCTCATGCAGTCGCTTTCCTTTAGCCCATCCCCTACTGGCTGTACAAGCTCCACGGCCTGAATATCAACTACAACTGTGAGATCTGTGGGAACTACACCTACCGAGGGCCCAAGGCCTTCCAGCGGCACTTTGCGGTAAGGAG s monDom4.chr8 45874359 290 - 308469712 CTTGGGGAACAGCGCCATCTCACTAGAGAAAATGTGCAGCGCAAACAGGCCCAGACAGGAGAGGAAAGAATGGGAGAAGAGGAAGAAGAGATCAGTGAGAGTGAAAGTGACAATGAAGAGAATGAGATTATCTACAACCCCAAAAACCTGCCCCTGGGTTGGGATGGCAAA--------------------------------------------------------------------------------CCCATTCCCTACTGGTTGTATAAGCTGCATGGCCTCAATATAAACTATAACTGTGAGATATGTGGGAACTACACCTACCAAGGACCCAAGGCCTTTCAGCGGCACTTTGCGGAATGGCG a score=-724 s mm8.chr4 124230741 132 + 155029701 TTGAAAGCCACTGTTCTTGGGAACTAAGTAGAAACACACCACTTTAGAAAGAGAAGAGGACGGGAGCAGCCTGTGAGGGCCA----TTGGTGTCCAGAGCTGAAAGGCATCAGAGGCTGGGTTGGCGGCTGTAGCC s monDom4.chr1 452294067 123 + 748055161 TCATGATATGAGGCATTTGGCTATTC--CAAATACAGCCCACTTTGCTAATGTGAGC---------CAGGTTGAGGATGCCATCTCTTTGTGGGGCAAGCTGAAA--CCACAGAAGGCTTCTGAACGGTGGCAGCC a score=8157 s mm8.chr4 124231687 257 + 155029701 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TTTTCAGGAAGAATATGAAGACTCCAGTGGAAATGTTGTGAACAAGAAGACATACGAGGATCTGAAAAGACAAGGGCTGCTCTAGT-GCTCG-------GTTCCCTG--------AGAAGCCTGAGA------------AAAGCTTCCCCAACCAAATGTTCTTAAAGACTTTTTGCTATGTAGTA----TCTACCTTGT------------AGAAACCTTG-CAGATTGCAGAGTTGAGATGTGTTTTATC-TTTGTTTTATATTAAAAA--GATCTGTGGGAAAATAAAGCCAGCCCTTGTTTTGGATGTGTTGTTTCTGAAACCCAAGTTTATGAATTTTTTGtttttcttttttgagacagggtttctctgtatagccctggctgtcc----tggaactcactttgtagatcaggttggactcaaac s monDom4.chr4 13519400 417 - 430141050 TTTTTAGGAGGAGTATGAGGATTCCAGTGGAAATGTTGTGAATAAGAAGACATATGAGGACTTGAAACGCCAGGGACTGCTTTAGTGGCTTGGGGACAAGTTCTGTGACTGATTCAGCATCCCAGGATTTGGCATTTTTCTATTCTACACAAGCACATGTTCCCAAAGACTCTGCTACATGATGTAACATTCTAGCATGTCTTGTGAAGACAAGAAATGTGGACATAGTGAAGATTTGAAATATGTTTAAACATTCATTTTATATTAAAAAAGGTTCTGCAAAAAAAATAAAACTGGCCTTGATTTGAATGTGACGTGTTCTAAAGCCCGATAGGGAAGCCATTTCTTtctcttttt--------------tttttttaacccttaccttccatcttggagtcaatactgtgtattggctccaagtcagac a score=1263 s mm8.chr4 124253575 665 + 155029701 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AACTAGAAAAGAGA---GCACTTG-----ACATTTATTTAATTAATACAAATCACAGTAGCACTGAAAAGTGGCTCTACTGGGTAGGGTTCATTACTTAAATTTTTGCTAACAGGGATGTGTGAGGTGGAGGCACCCCAAAGAACCATTAATGCCATCTTTCACGGCTGTTCCTTCATCTTTTGGGACTCTGCAAGCCAGATGACTCC----CACAAGTGATAGGTTTTTGTTTTGTTGTGGAAGAAGAGGAATTTTGAGCC----ATTTAGACTCAATTCGGGACACCGGGAAAAAAAGGACTCACA--TAATCTACCCCCAGGCTC-----AGATTTCAAGGAAGGAAAGGC--CTCAGCTTTGCCCCTACCTACAACGAAGGCCTTGCTGAGTAGGGCCAGACGGCTGCTCAGATTCCTAGATGTCATACTGATTTCTAGCTATCAGTCAAACTATAGAATTTCCTTTTTGAAAAGACTCAAGGAAAAGCTTCTTAGAGGAGGCAGATTATGATCTCAACCTCCGTCCTGAGGGAGAGTGGAGCAAGGCATGAGGTCAGGCTTGAGAAAGGGA--TCGGATGCATGCTGAGCCCCAACTCTG---CCCTCCCTCACTATTTTGGGAGCTGAGCAGCTGGTTACACTCCCTCATTCTACCGACCTACCGACGGAAGTTCAAGTCTAGGAAGGATTTTGGAGTTTCCCTCCATGTCCTAATGCCAGATCCCTTCAAGACCCTGCGTCCTCCCCTGGCTGTTCAC----TGCTGCCGAGGGCAGTGGTCTCTTCTGCGGACCAGCCCCCACACTCTCCCGCCTAAGGAGCTCCATTGGTTCATTCTCCACATCTGGCCTACTCACAAAAGGCAACAACAGCCGGAAGCACCAG--GCTAGCTCAGAGGTGACGGTTCCTGTGGCCTCGTTCAGTCGTGCCACAGTCGGGCTCCTTTCCTTTGTCTGGGACTCGGTGGTTGCTCCACAGCGCGTACTTGGGTCCGCAGGTCCATTCACATCAACCATTGTTCCTTCTCTTTAATGAAATGCTCAGCCCAGCGCCGAGTTAGCTGCAGGTACAAGTTGGGCTGATGCGGCAGGTAGTCCAGGTAGAGGCGCGTGAGGGTCTTCTTGGGGACGGCCTTCTCGATCTGGGTCCCCTCGTGCCACTCGTTGAAGGACGTGATGGAGACAATCTCCGGCCTCACGGTGAGGGCCGCCTGCAGGGCCGTCTCGTAGTACTTGCCATTGACCCGGTTTCGGGTGTTGTGGTTGTTCCAGGGCCTGATGCTAGTGTCGATGTAGCCAGGCCCCACACTCGGAATGAACATCAGATTGTTGGCATCGCAGAAAGTCTTGACCGCTTTCCAGTTCTGGTGAGAGGAGCCAAAGGAGAAGCCGTTGGAGGCAAAGTACGTGTACATGCCGTCAAAGCCGGCCGACAAGATGTCCCGCTTGTGCCCCTCCTCCACCAGCAGGGCGATGAACACGCCGTCGTAGGCCGTGTTCCTGATGGAGTGGGAGCCTGAGGGGGCCAGGAGGTGGGCCCACGCCTCGGGGGGAGTCAGGTAGGAGTCGTAGATGTAGAAGAGGGGCAGGCTCCTGCCCATGCTGTTTTTATAGCGATAGAATGCTCCGTGCGATCCATACCTGAGG-GTGGGAGGCAAAGAC 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s monDom4.chr4 13689686 1162 - 430141050 tgtaaaat---gaggggTAAGAGTGTTTGGGGGGGTAGTGATTTGTGTGGTGATGGATTACTTGGAGGAGAAAGCTTAGCTGGGGCACAAGGAAAAGTCCTTTGTGTATTTGCATGGGGGGTTGGGGT--GGGCCACGAGGACCCTGTTTGGGGCCCGGTAAGCCTTGGGGAAGGAGGTCCTTACCGATGGCAGCGGCTTTGAGCTGGTTCATATGCTCCCGCAAGACCTCAGGATCTCTGGAGCTGTAGGGTCCCAACTCAGGGTAGAAGCTGGAGCCCAGGTCGTCCGGGGGGCTGTGGCGGCCCTTGGGGTAGCTGGCAGACACTTTGGGGTCCCAGTGGGGCACCATAACATGGTCCCAGTGCACATAGCGGCCCTCCCGGCCCCGTGGACTACCGTACCATGAATAGTAGAAGACATGCAGGTCCGAGTAGACTGGCGGACCAGATCCTGGAGCAGGAACAGGGGCCGGGGCTGGGCTCGGACCCGCAGCTGTGCGCGGTGGTGC-TGGGGGAGGCGGCTGCTGCGGAACACGGGCGGCCTCCGCCT---CTGCTGCTGGGGGCCCCGCGGGCACCGGAGCACGGCGCTCAAAAGGGCCCAGTTCTAGTCCTGGAGCGAGCTCCGGGAGCCCATCCGGCGCCTTCAGTGTGCGTAGCCCCATGAGGGTACCAAAGGCAAAGAGCAAAACAAGGAAGAGTGCGATGCAAgcgcggcgccgccgccgggccATGGCCAGCTGCAGGCCTCTCTCCGGCTCAGCC--CCGCCAC-CTACCTACCCCCCGGCCGCGCTCAGAGGCCTTCCCCGCTTAGCCATGGCCCAACGGGCCTCCTGGCCCGGCAGCGACCCAGCCGCCCGCTCCGAACTTCAACTCACTAGCGGCCTGCATCCCATAGAGACGACTTCTGCTTGATTCCAACCTTAAAAAAAAAAAGGTAACAACCAACTCCTCCCGAACTCGCCCTGCAGTACAGGCGGGCCCTGCACACAGAGAATGCAGTCGGCTTGAACCATGTTGCCCAATGCTTTGGGGGTGGGAGTGGGGGGAGGTGGAGAGACCCAATACCGACACGAG-----TCAAAGCAAAACACAACTGCTAACCCTATTGGACTCAACGAACCGAGACTTTCAGATTAAAGTCATATTTTA--TTTGTTCTATGAGACTTTTT 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GCCAGACTCTGAGGTGTCCTCTGTATTGTTGCCTC-------AGTGGGAGGAGATTAGTGGCGTGGATGAACACGACCGTCCCATCCGCACGTACCAAGTGTGCAACGTGCTGGAGCCCAACCAGGACAACTGGCTTCAGACAGGCTGGATCAGCCGCGGCCGCGGGCAGCGCATCTTCGTGGAGCTGCAGTTCACACTGCGCGACTGCAGTAGCATACCAGGTGCCACGGGCACCTGCAAAGAGACCTTCAACGCATACTACCTAGAAACCGAGACCGAC-CTGGGCCGAGGGCGTC----------------------CCCGCCTAGGAGGCA------------ACCGACCCCGCAAGATTGACACCATCGCAGCTGATGAGAGCTTCACGCAGGGTGACCTGGGGGAGCGAAAGATGAAGCTGAACACAGAGGTGCGTGAGATCGGCCCCCTCAGCCGGCAAGGCTTCCACCTGGCCTTCCAGGACGTGGGTGCGTGCGTGGCGTTGGTCTCGGTGCGTGTCTACTACAAGCAGTGCCGCGCCACAGTGCGGGGCCTGGCAGCCTTCCCCGCCACCGCAGCTGAGAGCGCCTTCTCCACGCTGGTGGAAGTGGCTGGAACGTGCGTGGCCCACTCGGAAGGGGAGCCCAGCAGCCCTCCC---CGCATGCACTGTGGTGCCGATGGCGAGTGGCTGGTGCCTGTGGGCCGTTGCAGCTGCAGTGCAGGATTCCAGGAACATGGTGACATCTGTGAAGGTA s monDom4.chr4 13784852 762 - 430141050 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monDom4.chr4 13805803 248 - 430141050 CCTCCCTTCTTC-TCTCTCCCAGGGTCAGAGGGAGCAGACCTATGCCACTGTCAGGACAGGAGCACCTGCTGTCACAGTCAATAACCTGAAGCCAGCAACACTCTATGTTTTCCAAATCCGAGCAGCCTCACCCTCCCTCTCCCCAGAAATTGGAAACTTCACCCCTAGCATAGAAGTTGAGACGCTAGTGGAGGGTAAGTA--------------TCGGGGCATTCAGAAGAAAGG----AGAGGGAGATTCCCCAAGGGAGAAGA a score=5190 s mm8.chr4 124408211 136 + 155029701 ttttTTTCCTCTCTAGTTGCCCCAGGGTCCAGGGACCAGAGCCCTGCAGTGGTTGTCACCGTGGTGACCATCTCAGCCCTCTTGGTCCTGGGCTCCGTGATGAGTGTGTTGGCCATCTGGAGGAGGTAGGTAGTTG s monDom4.chr4 13806181 136 - 430141050 TCCTTTTCCATTAAAGCTGGCTCGGGGTCCAGGAAGCAGAACCCTGCCGTCGTTGCTGTGATCGTTGCTGTAACTGTCCTCCTTATCCTAGGCTTCGGCTTGAGTTTTCTGGCTATTTGGAAGAGGTAAGTGATGG a score=2549 s mm8.chr4 124408700 133 + 155029701 CTGGGATGAAGGGGATTTAGCTCCTTAACTCATTAAATGTCAGAAGGC---------ATCGCGGAGGATGGAATCAAGCTCCAGCTGCTCCTGT-----GCGATTAGGATTC--TCCCGAGTGCCTCGCGGGCTCTGGCCCTCGGGGGA s monDom4.chr4 13806815 141 - 430141050 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monDom4.chr4 13838695 380 - 430141050 TTACCTCTCCTCCACCCACTGGCACAGTAAGGAAGACCTCATTGCTATCAGCCAGGGGGCTGCCGTTCACAGAAACGTTGTAAATCTTCTCTCTGGCTGCTGGAGTGCGTAGGCCTGGAGTCTTGAAGATTCTATAAAAGCAGGAAAGTTTTTGTGAAATCTGCCTACTACAATGAATTAAAAAGCAAGAAGCATGAGCATTTCTATCCCGATCCTACGTCCAGCTATCATTCTCCAACCATTTACTTCTTCCCTCCCAAACCACTCATTTCAAAGAGGAAGTTAAAGTTTAAATT----TAGAAAAACTGTGAGCATTATATGGCTCAACACAACTTGCCTGAGAGAAAAAAGGCTGGAATTACTAAACACGCAACTAGAAAA a score=4327 s mm8.chr4 124423472 146 + 155029701 CACTACTGGGCTCCCCAATCCAACTGTCACTCTCGGTACTCACCGGGAGTCAAACCTAGGTGTCATGCCTGGGGTTGGTTTCACCAGAGACGGCTCCAGCCTGCTCATAGCTGGCGTCACAAAGTCA---TGGCTTAACCTGCAGGGAA s monDom4.chr4 13839815 141 - 430141050 CACCACTGAACTTC---AAGTAGCTTTCA-----AATACTTACCTGGAATCAAACTTGGGTGTCAGACCTGGAGTTGGTCCTAATATAGAGAAATCAGATCTGCCTGTGGCTGGAGTAACAAGACTATTTTGGTTGGACCTGTAAGAAA a score=3275 s mm8.chr4 124424299 172 + 155029701 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gagacctttGAGCAACGCCCCATCGAGTGAGTTCTGCTCTG-GAAGCTCCGGTTTGGGGAATCTGGGTTGCAGCCCAAATA-GTTAAAATGGCAAAGCTCAGTCACATCTGAAGGCAATTTCTTCTCCGTTCATCTGGAATGGAACAGTGCTCATTCAATTAATTGGAAAAACACCCGCTGTCTCTGTGCCATCTCGCAGGCTGGGCCGCCAAGAGCATCCCCAGGATACAGCACGTTGCTCGAGTTTTGCATTTGGAACTCTCCGTCTG-----GGGCTGTAATTTCATTAAGAGTAGCCATGAGGTCAGCCTGCACGCTCGTCCTGGGGCTGCCTGGCACAGAGCCGGCCTCTTGCGTGCCCAGGGAGCTCCCTGGCCCTGCTCAGCCTGACATTTGCAAGGGTTTAAAAGGAACAGATTCCATTTCGAAGCTCTGCTCGGCCTTTAATAAACGTAGC---ACTGTCCATCCAGGAGGGAGCATGCACCCTGTTTTGTCTTTCCCCCAAATTCTGCGTCGATGGGCCACCTCTCTCTTC a score=3372 s mm8.chr4 124463337 364 + 155029701 ACAGGGGAGTACAGATGGCGAAGTGGAAACGGAACCAATGAATGTCAGGCTTATGTTCCTCAGGAAATGGAATGTCATTGTGGTGAGCCCGACTTGGCAAGGCAGACCTACATCTGACCCAAATCATTGAGTTCTCCAGCCAGGCAGCCAGGCCTCCCGAGCATGGCAGCTGCCAGGTGCAGGTGCAAGCCATCCAGAATCCTGGGATATCTGCCGGGCATCATAGAAACAGTCAGGGTGGGGGGCCATCAAATTGTCACCTTCCTGGGTTTGAGAGGAGACACACTGGCCAGCTTGATTGATGTGATCCTGAAATGTGGGCCAGGTCTGGCCCTGGGCAGAGCAGAAAGC----AGGACTGTGTCAG s monDom4.chr4 13904756 331 - 430141050 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CAGAAGGAAACAGGCTGCAAGACTAAGGGAAAGTTTGCCTGGAGTCCCACCTCCTAGAAATCCACAGTCTGCAGGGTGATTTTTTGCATAATCCCTATTAACAGCAGTCTGACCTGCAGCTGTTTTCCTGGCCTCAGCCCTGGGCTCTCCCCCCAGCTCCTAGCAGGCCTCACTGGAAAAATAAATAAATACTTTCTCCATTATCCCATTAGCAACTTCACAGGTTTCCCTTGGGTTAGTTACTTCCCAACCCTGAAGAAAGTAGAAACATGTTTCCCAAA a score=4915 s mm8.chr4 124471053 505 + 155029701 ctccctcagctgccctccCTTC--CTGAGGCTGCAGTTGCACATCTGGCTCCCAAATGACCC---------------CCCCTCCCCACCAGGGGGAAAGGCAAAGCCTGTTGTAGGG---------------------------------AAGGGAGGTT--GGGGATAGGAAGGGCAGAGGGGCCGCTGGC-----CTTCTTCCCC------AGGCTCT--------GATGGGCTCAGAGGCCCTCCCTAGGGAGGCGTGGTGCCCTCTGCTCCCCTCCAGCTTCTCCTGGGAGACAATATGCTTCTCATTAGG--CTGGCGTTGGATTTTGCAAACCGCAAGTCTAATTGTGAAGTTGGGATGGGGAGGGGTGTAAGTAA----------CTGCGCAT---------GGGGGAGCTCAGACAGCCCCTCCTCCCTCGG-TGGCTCTTGGCAC-CGTGCAGGCAGCTGTGCCCCCCAGCCTTCACCCACTACCAGCTTGGAGGGAAGCTTTGAGGACCAGGCTTCTAGAGAAAGCTTGCCAGAGGAAGGGGCAGAGCCAGAGAC----CACAGGCTCTGCTGTTTGTATCTGCTTCCTGGGG s monDom4.chr4 13928737 567 - 430141050 CTGCCCCAAC-ACCCTCCTTTCATCCAAGCTCTGGGACTCACATCTGGTTCACAAATGACCCGATAGGAAGAAGAGTCCAAATCCCGCAGGAGGGTGGGGAGGAGGCCCAGGGAGGGGGCAGCTTGCAGACATATACGGGCAGGTCCCGTAGTGGAGGTCACGGGGGGACGTAGGGCCAGGGTTCAACCGGGGAAGGCTTTTTCCCACTAGGAAGACTTCCTGTAAGAGGGGGACTCC-AGGCAGTGCCGAGCAGGTCTGAGTTTTCCCTTCTCCTTT---GCTCCCTTTCAGAGACAATGTGCTTCCCATTAGGAGCTGGTGTTTGGCTTAGCAAACCGCACGTCTAATTGCGAA-----GGTTTGGGGGCGTGTGAGTAAGGCAGGCAGGCAGCGCATCTCGTGTGAGCGGCAGATCAATCAGGGCTCATTTCCCCGGTTAACGCCCAGCACATCTGGAGACAGCTGTGCCCCCAGCGCTAGCCAGACTGCTATCCCCGGGAGG----TGGAGGGGCAGG----------------GGTGGGGGTAGGGGGAGA---AGCGACTTCTCATGGGCGGTTCTG-AGGTGTCT--TTCCTGGGG a score=3602 s mm8.chr4 124471760 165 + 155029701 CACAGGCTCACAGCAAAGACACTGCATAATGAGTGTGTAACTGAGTTAGGCCCACAGGAGCCTCTG-AAGTCTCCAGTTTCCTCCCCACCCAG-TGGGTCTGTCTGGGTAACTGGGAAGGG---CTGGGATGCCGCC----TTCTCAAATCCTCTCTGAGAGACTCAGCCAGGC s monDom4.chr4 13929675 174 - 430141050 CCCAACTTTGAAGAGGAGAAGCCGTGTAATCACCATGTAACTGAGTTAGAATAGAGGGGGCCATTGCAAGGATATAGTTTCTACCCCACCCAGCCTGGCCTGTCTGGGGGCCTGGGATGAGCACCTAAGGTCTCTTCAAAGGTCTGTAATTCCCTTGAAGAATTTGAGCCAAGC a score=11576 s mm8.chr4 124474663 282 + 155029701 TCTGTCTGTCTTTCTACTCACCCATCCTCAGG--CCACTATCTACCACCAAGCCCTTTCAGGGCTCCCCTGAGCC-TGTCCCCAGCGACCCCCTTCCAGGGAATGTGATGAAAGGCCTATTTATTACACTTCAGCTCGGACAGTTGTTACAGATGTTTCCAATTCGTCAGCCCCCTCACACATCTGTTCCTGGTTGAAGTC--AGAAGAGAAAGAAACAAGGAAAA---AAGTCTCCGCACTTCTCACAGCCTCTCTCACATGCACCGGCTCCTACCTCCCCTCCCCCGC s monDom4.chr4 13937888 288 - 430141050 tccgtctgttcgtctgttc-CTTGTCCTCTGGGACCGCTCCTCACCCCCGGCCACATTAAACACTTCGGTAAGCCCTGTCCCCAGCAACCCCCTTTCAGGGAATGTGATGAAAGGCCTATTTATTATACTTCAGCACAGAAAGTTGTTTCAGATGTTTCCAATTCATCAG-CAGCTCAGACATCTGTTCTGGGTTGAAGGCAGAGAAGGGAAAGAAAAAAGGAAAACTTAACTCGGAGGCATTcacaccccctcacacacatgcacacacaggcccatcccttcacatgc a score=6452 s mm8.chr4 124487480 389 + 155029701 ctctctctccctctccctctctctc-------tGCAACAAAATAAAGCCAAACAAAAGCCCGA-CGCCTGGCGTGGC-TGGTCAGGGAGTTATGCAAGTGTGtaaaaaaataaaataaaataaaCATT-GCGTTTTCGGCATTTAAGGCTGTTTGATTAGGTGCAGAGCGTTAGCCAAGGGCTGATCGGACACAGGAGGCTGGGGCAGCGTGAGAGGGAAGGGCCTCTGGGAGGGGCTCCAGGGTCCCGGACCAGCTTCTATGAACTTGGGGAGGCTTCTGAGCATGAGCCCAGACTCTGGGCATTTGGGGAGCCTCCACTTCCTCAGGCTAGACACCCTGCTGCTCCTCCCTGGTCATTTGA-------CCATCGGGA-------CACCCTAGGGGCCACTCGATCCTTGGC s monDom4.chr4 13969604 381 - 430141050 CTGCCTTTCTTTCTTCTTCCTTTTTAAAAAAATGCGACAAAATAAAACAAATCCAAACCCCCAGTGCCTGGCTTGGCGTATTGGGGGAGTTATGCAAGTGTGtaaaaaaataaaataaaataaaCATTTGAGTTTTCAACATTTGGGGCTATTTGATTAGCACAGGGATTGGGGCCAGCGGCCAGAGAGATGCAGAAGCCAAG--------AAGATGCAA--------GGAGAGCCCTGCAGGG---CAAAGCAGTGGTTGGGTGAGGAGGGGGGAAAGAGAGAGGGAG-CCAGA------------GTGGTGCTTCCTCCCCCTCCCCCCCAAAAGGCTGCTCCTCTTCTCCCCCCTCTTTATTGCCCCCCTTCAAGACAGAGCCCACACTATGGGACATTTTGTTCTCAGC a score=3123 s mm8.chr4 124489957 299 + 155029701 CTAATGAGAAGCTGTCGAAGTGGTTTACATTTGGGGGGTCTGTATCTGACATCTGACGGAATACCAATTCATCTTAAT-GTTGTGGCAGGCAAGGAGGTGAAAGTTCTTCCAGCCCCCCCCCTGCTCAGGCGGAGTTTCCGCCCTCAGCTCCACCCGCAGCCAGCGGAACCCCTTCCTCAGTGTGGGTCCACCCTGTAGGTTCTCCCCTCCCTGACCCATGTGACCTCAGTT-TGTGATCTCTGGCCATCTCAGTCTCCGGCGCCCAGATTC---TTCACCGTGTGCTGGCCCATTCCCAGAGC s monDom4.chr4 13973875 270 - 430141050 CCAAGGAGTAAGGATGGGGATGGTTTACATTT------TCTGTTTGTATCAGGCTCCCAAGCACCAATTTATCCTGATTGAATTTGCAAACAAGAGAGTGAAAGTTATTTCAGCCATGCCCCTTCCCCAGCTGTGTCCCTCCCCTCCCCTCTTC--------------------TCTCCACTTCAGCTCTA--------GCTACCTTCTCCCTGACCACAGTGCCCCCAGCTGTGTCCCTTTTCACCAAGCCACAACCCTACAGCTGGGTCCCCTTCTCCCTTGTCATGCCCCTTAGCTGGATC a score=8864 s mm8.chr4 124492010 390 + 155029701 GGCAGCTGTGGGGCACCAGGGGTGGTGGGGGCATCTCCGCTGGCTCCAGCTCCAGCACCAGGTGGGATCCATCAGGCTCATGTAAACACTTCTCACAGGCAGCTTAACCACTTGAG--TGTGTCTGGCCTTCAAAGCC----AGGGGGAGAGGCCGAGG-----------AGGGAGGAGGGAGGTACCGAACTCCCTCAGGGGGTAATGATTTATCTCCAGTGCAGGTGGGCTCTGTTGGGGCCTCTTTGGGAGGCCAGGGGGGTGGACCGGGCACAGAGGAGCTGAACGGGAGAGGGGAGGGGGCTGGAGGCTCCATACTGAGTATCTCGGATTTCTCATTAGTAAGCCAAAACAACTCAGAACCAATCCGGGTTTCGTAGGTGAAGAGCCCGAGGTTCAAGGAGG s monDom4.chr4 13975601 353 - 430141050 GGCCTTTGGGGGGCACC----------GAGGAGTCCCTGCAGGCTTCGGCTGAAATGCCAGGCAAGATCCCTCAGCCTCACGTAAACACTCTTCCCAGGCAGCTTAACCACTTGAGCTTGTGTGTAGCCTTCAAAGCTTGGGTGGGGGTGGGGTGGAGGGTCTTGGGTGAGGAGGGGAAGGAGGTCCTGAACT-TCTAGCTAGATAATGATTTATCTCCTCCCCTGGCGGGCTC--------------TGGGAAACTAGGG-------------ATAGGAGAGCTG-ATTGTAAAGAGGAGGTTGGGGGATGGTAAAT-CTGGGTGTCTCAGGGCCGGCAGTGAGGGGACGATGGGG--------------GAGTTTAGGAGGAAAAGGGCCAGAGGCCAGGGGAGG a score=5350 s mm8.chr4 124492721 157 + 155029701 GGGGGATTATCGCCATTCTCTGCGTCTCTAGCCAGGACAGGCAGTTGCTGCTATTTGTATCCCCTCACAAAAGCCAGGCCCGCCAGGCCTGCTGTGTCAG-AGTTTCTGTGGCTGGAGGGGAACCCTCACTTCCTTTTCTCCCTCCAACCCCAGAGGG s monDom4.chr4 13978835 155 - 430141050 GGGGGATTAGCCTAATTTTCTGTGTCGTTGGCCTGAGT-GGCGCCTGCTGCCTCTTTTATTCCGGCACAATGGCAGTGGCCGCCCGCCCTGCTGTGTCAGAAGTTTCTGTGCCCCCA--GGAAGTCTCACTCCTCTTCTTCCTGCCCAGTCCAGAGAG a score=9296 s mm8.chr4 124493403 402 + 155029701 TTGGGGGTGGTTCTCTGCTGGCGTGAGAAGACTTCTCATG-----------TGACCCTCTGAGGTGGATTCAAGCAGGACAGGACCTCCCTTTGGACCAATGGAGAAGCCG----GCTCCAAACCCTCTCGGATCCCAGCTAAGGTTATGGTGG------------ATCCGGGCCTGGCTCTCCTGCCACTGACCCAGCCTCAGAGCC-----TTTTAGCAAG--------AGACCACCCCTCCTGCCAGGGG-CCCGGGGCTGGCCAGTGACTATGCGGCTTGGGCTGTGCGTGGTGGCCCTGGTTCTGAGCTGGACACACATCGCCGTGGGCAGCCGGGGGATCAAGGGCAAGAGACAGAGGCGGAGTGAGTACCTGTGAGATTGAGCTGCTGAGGGCCTTGGTGTGGGCGGGACTGGAGAGCCTCTGGTGGCTTCCTTCT s monDom4.chr4 13981307 437 - 430141050 TTATAAGCAGCTGTCCTCGGATGTGACAGTGCCTCTCCTTCCGCCTCTCCCTAAGCCTCCAAGGTGGGG-AAAGAATTTCTGAATTCCCTATGGGGCTGATAGCAGAGCTGCACCTCCCCTGCCCTCCTCCATCACCCTCTGAGATTATGGTGGCTGTGGGCTATGGTCCAGACCTGGGACCCACCTCGCTGACCCAGCCCTGCAGCCACTAGCTGGAGCTAGGTGCCCCCAGACCACGCTGCCTTCCAGGGGGCCAGGAGCTGGGGAGTGACTATGCGGCTTGGACTGTTGGTGGTGGCCCTCATTCTGAGCTGGATGCATCTTGCTGGCAGTAACCGAGGACTGAAGGGGAAAAGGCAGAGGCGGAGTATGTA-----AAGGGCCAGGTCTGAGGTGGCTTGGGGGATGGGAGAAGGGAAGGCCATTGGGAGTTTCATTTT a score=17138 s mm8.chr4 124507199 307 + 155029701 AAAAGGGTCATATCCCATCCTTGTGGGAGCCTAGCAATATGGGGTCTCCTCTCCAGCCACCTTTTCGTCCTTTCTCTACCCTGCAGTCAGTGCTGAGGGGAGCCAAGCCTGCGCCAAGGGCTGTGAGCTCTGTTCAGAAGTCAACGGTTGCCTCAAGTGCTCGCCCAAGCTCTTCATTCTGCTGGAGAGGAACGACATCCGCCAGGTGGGCGTCTGCCTGCCGTCCTGCCCACCTGGATACTTTGATGCCCGCAACCCCGACATGAACAAATGCATCAGTGAGTGTGGGGGTGGGGGCAGGGGCTGG s monDom4.chr4 13989883 293 - 430141050 AAAGAGGTCATTCCACAACCT-------GCTTACCATCTTTG-------TCCTTACCCCCCTCTCTCTCTTTCCCTTCCCTTGCAGTCAGCACAGAGGGAAGTCAGGCCTGTGCCAAGGGCTGTGAGCTGTGCTCTGAGGTCAACGGTTGCCTCAAGTGCTCCCCTAAGCTCTTCATCCTTCTGGAGAGGAACGACATCCGGCAGGTTGGAGTCTGCCTGCCGTCCTGCCCACCTGGATACTATGATGCTCGCAACCCTGATATGAACAAATGTATCAGTGAGTGGGGCTGTCAGGCGGGAGGCTGG a score=6311 s mm8.chr4 124510559 487 + 155029701 TGACTTCCTGTTGCCTTCTTACCCTGTTTCCTTGCCGTGGCCTTCTGAGGACCCCCTGGGCACCCAGAGTGTCTGTATATCCTTTGTTGATTTTCCTCCACTATCCAACTGTTGCAGGGCAGAAGAGGAGGAAGGGGGGCCAGGGCCGGAGGGAGAATGCCAACAGGCATCCGGCCAGGAAGAACAGCAAGGAG------CCGGGCTCCAACTCTCGGAGACACAAAGGGCA---ACAGCAGCCACAGCC---AGGGACAACAGGGCCACTCACATCAGTAGGACCTACCT-----GGGCACAGTGACCGGTCTCCAGATACCTGTGGAAGAGTACAGTGCTGTACTGTATAATGAGAACTTTCCAGAACTGGAGCATCTGGGAGAGTCCACACATACCccatccacccacccatccaactatccatccatccatccatGCACACATATGGCCACATCTGAAAACGTCAacacacacacacacacacacacacacacacacaca s monDom4.chr4 14000378 455 - 430141050 TGCCCGCGTGCTGCCTGCCCGCCCTTCCCCACCCCCTGAGCCTCATCAT--CCACCAGAGCCCTGGGCAAGACC------TCTTTCGGAATTTGTCTTGACATTCTGATTCT---AGGACAAAAGAGACGGAAGGATGGACAGGGTCGGCGGGAGAATGCCAATGGGAACCTGAGCAGGAAAGAAAGCAAAGAGGCCCGCCTGGGCTC---TCCTCGGAGACGGAAGGGACAGCCGCCGCCGCCACAGCACAGAGGGACGGAAGGTCCCATCGCCCCTGCTGGTGCAGCCTAGAGAGGACTCCGGGCCTGGACTCTAGAAAC------AGAAAGCCAGCGCTGCGACGCAC-ACGAGAGCTTAGCCGAACTGGAG-GGCTGCCAAAATACATG---GCCACATGCGGGTACGCGCACG-------------------AGGCGTGCACGTGGATACAC---AAAATACCGACGGGCA-ACACACAC-CAAACGTACACCCACACA a score=2665 s mm8.chr4 124511046 432 + 155029701 caTTCTTGAGGTCACTGAAGACACTTCTATTCTGTGGCCCAGCTGT---------ATATTCAG------------------------TCTTTAATGCTCTTGGAAGACATATCTGAGAGAACCTTTCCCAGCATCTGAAA-----CTAAGGAGTGGAACCTTCTGGAGGAACTTCTGGGACAGC-ATCTGACAGATGG--ATGGCAGATTGGA--GCCAAAGCTGGA---------------------GCAGCTGCCGAGAGGGAGAGAGAGGGAAAG---CGCTTTCCCGG---CTTGAGAGGCACTCCCAGCTGTGAGACTTGATTGTCGGAGATGAGAAT---TATTACACATCCGTGGTAC-ACGTCACGGATGACCTGACT-TGGAAACTGCTTAAAGGTTTATTTCAAATTAAAAAA-GAGAAAAACAAACCCCGGTGCTCCATTCGTTTACAGGGTGTGAGGTTTGGTGGGGACACAGGGGAGC---AAGGAAGGGCTGGGGAG s monDom4.chr4 14001311 486 - 430141050 TGCTTCTAAAGCAGCAGAGGGGAAGCCT--TGGGAGGCCCGGCGGTCCCTTGGCTGCATGCAGAGGTGAGGAGGGGGCCGAGGGAGCCCCCTGGCGCTCGGTGGAAGCAGAGCTGAG--------CTCCTTCGTTTGAGAAGGTTCCTTGAAGGAAATTGTTTTTGGAGAACTTTCCCGGCAGTGACCCGACAGGCAGCAGCGGCTGAAGAGACAAGCAGGGCTGGGCTTGACTGCCAGGTGGACCCCACGCCTCCCTAGAGGCCTGGCCCGGGAAGGGCTCGCCTTCCCCCGCCCCTGTCCCGTGTTTCTGGATGTAAGACTTTATC-TCGGA----AGAATCTCTGTTAAATGTCCCCGGCATGATGTCAGGGGAGACCAGACCCTGAAAACGGCTTAAAAATCTATTTCAAATTAAAAAATGAAAACTACCA--------GCTATGTTCCTTTCCAAGG-GTGAGG-ATGGGGGAGACTGAGGGGGGCGGAAGGGAAGGGAAGGGGAG a score=13127 s mm8.chr4 124518363 476 + 155029701 TGTGTGGGAAAGAGGGCAAGAGCCAGCTCCC-----------------AGGCAGCTGCCAGCC-TTTGATTATTGATTATTGATGGTGTGGTACATTTTCTGCATCCC----------------------------ATTGAACCTGGTCCA--CCAACAAGGCCAGCTTCTTCCTCCAGCTGAGTTTTGTGTCCTCAAAAAGTTGGTTTCT-AGTGGCTCCC-TCTCAATCTCATATGGACCATG-GCTGTTGACTGAGTATTTGGAATGTCTTCAGGTTGAGCCAGGCCTGTCCATAAAATGGGAAGCATTT-GGCGG-TTCCATTGCCTCTGGCTTCCAGTCTTGGCCCTAGCCTGGCTGTCTTCTTCAAGGAGCCG-GGTGGGCCTCCTGCCAGCATGCTTCCCTGGGAAACATCGAAGTGAGTTAAAGTCAACAATGAGTTCATCTCCAAAAAGAGTAAGCC----AGCAGCCCCAGGGTATGGAGACAGGAGGAGGCTGAGCAGAAATGGGGGACAGAAAATGGGATGG s monDom4.chr4 14007756 532 - 430141050 TGTGTGGGGAGGAGGGCAC-AGCCAAGGCCCTTGGGGCCCTCGGTGTACGGCAGCAGCCAACAATCTGGTTATTGATTATTATTATCGGCAGGAGCTTGCTCCATCCACAGGTGAGGCTCAGGAGAGCCCACGGGGAAGAAGCCTGGCCTGGCCTGGCTACACTCATTCATGGTTCAAGGGGGGTTTTGT-TGTTGGAAGAGTCGACTTCCGAGGGGCTCCCACCGCAATCCAATCTGTACCACAAGCTGCTGATTAAATACTTGGGATGTGGCCAGATGGAGCCAGGCCTGTCCATAAAATGGGAGGCATTTTGGCAACTTCTGATGCTCCTGGCACACCGTCCTGGCACATGCCGGCCTCTCTTCTTCAAGGAGTGGCTGTGGGCTGCATGCCATCACGCTTTCCTGGGAAACATTGAAGAGAGTTAAAGTCAACAGTGTACTCATCCCCAAAAGGAATAAACCCCAGAACAGAAGGAAGAGAAAAAGCTGGGAGCAGAGAGACTAGGAGTGAGGGGATGACAAGGAAATAG a score=11055 s mm8.chr4 124521803 461 + 155029701 ATGATCAATGTACCTAAAACCCAAAGGGCTTTATGTAAGATATGTGGCAAGCATCAGCCTCAGAGTGTGACCTAGTGTAAGAAGGGCAAGGATTAGGGAGTCCTTGCATACCCAAGG-AAGTGGCTATATCATTGGAAGCAGAATGGCTGTCGTGGTCAAACAAGGCCAGTTTTCTAAAAGAAAACCCAAACCA-CAAGATGACGATGCCCAGGCT-GAGTGTGTCAAGCTTGACTGCAGATCTGAGAGGTTGC-AGCCCTTAACAAGTGTGAATGTTTTAAGCTGGGAAGAAACAAGAGGAGAAAGGGCCATGTGATCCAGTTCTAAAATTTGTGTTGTTTGAGAGGAAAGTATTGAAGC-------------AATAAAAAAAATTACTTGTTAGAAAAT----AAAATTATCAT------------TAGTCATGAAGGAAAGAAaaggaaggaaggaaggaaggaagAagaaagaaagagagagagagagag s monDom4.chr4 325112915 486 - 430141050 ATGGTGAACGTGCCCAAGACCCGGCGCACCTTCTGCAAGAAGTGCGGGAAGCATCAGCCGCACAAGGTGACGCAGTACAAGAAGGGCAAGGAC-------TCTCTGTACGCGCAGGGCAAGCGTCGCTACGACCGCAAGCAGAGCGGCTACGGCGGCCAGACCAAGCCCATCTTCCGCAAGAAGGCCAAGACCACCAAGAAGATCGTGCTGAGACTGGAGTGCGTGGAGCCCAACTGCAGGTCCAAGAGAATGCTGGCCATCAAGCGCTGCAAGCACTTCGAGCTGGGAGGAGACAAGAAGCGGAAGGGACAAGTGATCCAGTTCT-GAGTTGCTGTTGCTGCCGCTGCCGGTGCCGGCGCTTTGACTTCCCGGGAGAGAAACAATTAAACGTTCTGAAGTTTCCAGCATTTCCGTGCTTCCGTCTCGTGTTTGCTTTGGGGGGGTGAGGGGGAGGCGGAGGAGTGGACAGGGAAGGGACGGCGGGAAGCAGAG a score=11490 s mm8.chr4 124525287 620 + 155029701 TGGGAGCAAGAAGGATGGAGGCGGCCACG-GAAAACCTCAGTATCTTCTTAGGGAGACACTGCCCTAAGGATAAGACTGGCCAT-CTGA--GAGAGTTCCCCAGGGACACGGGGGTTTTAAGGATTGGTTTCT------------CAGACTCTTCAGTGTGACAGTATTCTTCTGGAGACAAGCCAAGGGACCTGGTGAACATTTTTTTTTTTTTGAAAAGTGTTTTTCTAAGGAAAAGGGGGGAGGT----GGGCAGAGG----AGGGGG------AGAATTACACAAAGATTTAGTCTAACAG-CTTAAAAATCAAAAGGGTCACTGGACAGATAGATATCAAATATAATAAGAAACACACTGACCCTGGAGAGATGACTTAATATGGGCCTCCAGGCTCC--TTGAAGCTT-AACAAGTATCTAGAGTTTGGAATTGGACTTCCAATTCCCACATCTGAGGATGC----AGCCAGTGT------------CTTGGAGTTATCTGAGCCAGGCCAAAAATGAAAGG---CTGCTAACAGTACCTCAGAAGGGCACTTCACAGGTT-GTTTATAAGCATCTG---GAGACTACAGGGACCCAGCAATAG--------GAAGGAGCAAAAGATCT-CTGTTTGTTATTCCAAAGTTTAATC-TAGGGACCTTTTTGAAGACCTTttt s monDom4.chr4 14027664 642 - 430141050 TTGGAGCAACAGGGAGTGCAATGGCCCCTCTAAGACCCCAATGTCTTCCTGGGTAGAATCTGCCCCCAAGGCAGGCCTGACCTTTCTGACAGAAAGGTCTCACTTACTAGGAATGGTTCGAGATCTGGTTTCTGGAGCTCACTTTCAGGTCCTTTAAAGTCACATTATTCT-CTGGAAACTCGCCAAGTTATTTAGTGAACTATTTT-----------AAGTGTTTTCCTAAGGAAAAGGATGGAGGTAGGTGGGCAGAAATGCCAGGGGGTAAAATAAAATCACACAACAATTTAGTGTCACAGGCTTAAAAGTCAAAAGGATAGCTTGACGGATCAATATCA-----------AAACACACTGATACTG-----------------GGGGCTCCAGGCCCTAATACAAACTTAAACAATCACCTACAATTTGGACCTCTTCTTTGAGTTCTCACATCAGTATGTGTTCTGGACCAATTTGCCCAGGACCAGCCTCAGCTTACCCAAAGCAGACCCCAAATTAGAGAGCTCTTCTGTC-GTGCCTTGGAA----AACCCACATGTTGGGTTTTAGGGAGCTAAGTAGGGCTACAGAGATTCTGAGACATCTATCTCCCAGGCAGTGAGAGTGCTGCTGGTTATTTTGTCAAAACTTGATCTTAGGGATCATTTTGAAGAGCTCCTT a score=8112 s mm8.chr4 124527546 985 + 155029701 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s monDom4.chr4 14028815 991 - 430141050 CCCCAGCAGGAATGGGTCAGTTCATCATCAAATTGCTAAAGGAGAACCATAAGGGGAATATACTGGTTAAGTCTGAGCTCCCAGCTATACTGGAGATGTGCACAGCAATAAGCTGTCCCTAATTAAGGGCTAATGGTCTGATAGTGGAATGCTGCCCAGGGAAAAGGACTCTCTTACTGCAATGTAAACATCAAGGCAGTTGGGACAAAGCCAAGACATGTATTTTCAGAGTCTGTATGTATAAATTTTAGCCACTACTACCTA---CAGTCTTCCTCTCCAAGGATTTCATGACTCTCCTGAGAAAACAGAAGGAGATTTAATTTATTAGT------CTCTCTATTTATTCTCTAGTTTATTTGTTTCTCTATCTATAGTAGCAGCGTGCTACTTT----GGGATGCTCAGATTATCAAAATTACCCCAGAGATGACTGTCAAG------------GAGGCTACTTATACAGCTGCTTTTGCTGACGGGT---AATCCTGGCCACTATGTTGGCCAGGGAGGGAATaagaataagaacaagaacaaaacaataaaacaagaacaagatcaagaataagaataagaataggaataggaataagaa--------taagaataggaacaaaaataagag--taagaacaagaat----------aagaataggaataaaaacaagaacaagaataagg------acaagaat-taaaacaagaacaag-----------aatgagaatgagaacaagaacaagaacaggaataaggataaga-acaagaatacgaatatgaatacaaataagaacaagaacaaggataagaacaagaacaaaatcaagaataataataggaagaagaataggaataggaataagaacaagaataagaataagaacaagaacaagaataaggaca-agaattaaaaagagaacaagaataagaatgagaacaagaacaagaataggaataaggataagaacaagaataagaataatgatatatgaataagaacaaggatgagaataagaacaaaaataagaacaaaaaataa 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GCTCAGCAAATGCTGTTTGAAGGGTTGATAGGTCAGGCTGTAAAAGTAGATGGGAAATTTG-TACAGTGAACATAAGCAGGGTAGGTGAGTAGAAGAGAAACAACCCACCATATCATCTGGGAAAATAAAACTCTTTGGCAAGACTTCATAACAGCCTGATTCAAAATTTCATAATGAAATTATGTCTCTGATCAAAGCCTGCATGAGCTCATGAGCTGATTTTTGCCATTCGTGTTTATTCTGG----TTTGCACCAAGTTGAAGCATCAGA-AACACATTAATCTAATCTTCTTTCTGGGAGGAGGCTCTT-GTACCCTCATCTGGGGATCAAAGG-----GATGGAGGATTGCAAGGAGGATCTTTAGCCCCT-----CACTGAATGTGCACTTTTGATTGGTTCTTTGAGTCCCCTTAGGCACATATGA------GGGGTAGGGCCTTCCTAGGAGAGTTGAGTCTCCTGACA--------CTTGCCCTTGAGGCAAGAAAAGCAAAGTTTAAGAAGGGAAAGAGACTCCCATCTCTCCTCT-GGACACAGTCTGCTTTTGCTCTAGAAAGAATATTTCGGGGTTTG------------------TTTGTTTTAGACTCAGAGAAGCGCTCAACTGTACC----TCTTTCAACTGGAG------CGCTTCACCACAGGTTTTCTTCTTA--CAAAATGAACTCAGATCCAATGGCCC-----CACACTTCTCATGG-------ATCTTACTCAATCAGCATTTT-TCTGGTCCTTCTCGAAGGCACACA s monDom4.chr4 14033376 765 - 430141050 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TCTTTGTCTCTTTACAAGTAAAGTTGAAACCT--GTTTCCTGGAGTTCCATGTGCTGCTGTTTAGGTAAGTTTAAATGAGCTGTGATTAAGCTAATTTGGAGGTAATTAACTCGGGGAAGGAATCTTTTACTTCTTTAAATGCTGAGTGACTGACTGTTCACTGGGAGAAAG----CTGGTGGAGGAGACGCCCGACTTTGTGGAGAACTGCTTAATTAAAACAGAAGAAACTCAACAACAGAGGGAGAGTTTACAGTCATTAATGAAAAATGAATATTCTTTATCTAATTACGCAGCATAATTAATTGGGTTCTACAACCAGCCGGGGAAGGGTGGAGGGAGACGCTCACAGGAAAGC a score=178 s mm8.chr4 124699175 348 + 155029701 CAGGAAGGCTCAGGCCTGCTGCCCGAGTCCTTTGAGGTC-TCATGGAAAGCCAGAACCTCCCTGG-TGCT------GGATGCCTGTGCCCAGAGCAACTACATTGTCGTTGATGGCTCCCAGTCACCTGTGATTACCTGGGGTGTCTTTGGTGGCAGTTGAAGCCCGTGTCAACCAGCCCAGCCTTCTCTCTTTGTACATTCAACACATTTATTGAGTACTCTTGT-------------------TCTAG-------ACTGAATGAAAGTTC--CAAGCCCCGCCCTCGGGAAGCATGCAggtttgaatc---ctcacgcc----aagctcactagctgca------------------gtaggctccctacgtcttccttctctcatctgtaaaatgggattgacaaa s monDom4.chr4 14274357 350 - 430141050 CATGAagacttaga---gctggaagggaccttacaagtcatcctt-----------ctcccctggctgataggtaaggaaaccaaggcccggaaaggtta-------agcgatgtcttcaaat---------tcatccagg-----ttaggtggcag----agccaggatttaaacGCCTGGCTTCCAATTGTC------------CATTTCTTCATTACTCTAGTGGGGTCAGGATAATTAGGGTctaggtggcacagtggatgagagagcatcaggccc--------agagtcaggaagatctgagttcaactctggcctcagacacttactagctgtgtgaccctggacaagtcacttaatttctgtatgcctcagtttcctcatctgtcaaatgagctggagaaa a score=618 s mm8.chr4 124701457 422 + 155029701 AGCCTTCTCTCCATCACCAGATCTCTGGCTTAGCCA-GTTTTGAGGCGAAGCAAGGTAAGCCGCTCTGGT----------TCGTGGTTCAGACCACGTCTCAGTCCAGGATGAGGCA---TCCAACGTGAGAAACTGGTTGCTAGGAAGTCAACCTGGACCAGGTGGGTTGCCTTCTAAGTGTGCACACTGGCTA-TCCTGGAAGGACCCTCCACCCCTGCTGGAGCCTTGCTATGCTGTCCTCAGTGGCTTCCAATGAGGACATGTCCTCGGTGGAGGGGCAGGAAGAGCGGTAGAAGGCTTCCCGCTGAGCTA-----AGCGGATTACACAAACTGTATCCATTTAATCTCTAAAGTGTTTTGACTTTGTC--TTTAGGAAAGAGAAAGAAGTGGCCCCAGGGGGAG---GGGCCAGGCAAtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtg s monDom4.chr4 14288002 401 - 430141050 AGCTTCCTGTCC--CCCCAACTTTCACTCTTGTTCTTGCCTTCAAGGGGAGATAGAAAAACCACTCTGATCATTCATAATTAGTGTGTTATACTACA---------AGGATGGGGCACAATTCAATG-GAAAGAGTGTTTCCTAGgaag------------atgtggattctagtcctgccctgc-cactgactcctccttgtagactcggaca----------ggtcctttTTTCCTAACCCAAG---------ATAAGAGGAGCTACTAAGAGGGGGTGATTTATGGTAGTTCTA--GCTTCCTGCTAAGTTTCCTTTATCATTCTGTAGATTTGGTTTTAACTTAATCTCTAAAGTATTTTGATATTGGCAGGGCTGGATGAAGATGGAAACAAGCCTGGGGAGAGCAAAGGCAAAGGATAGATTGGGAATGAGGGAGAGTGGG a score=1751 s mm8.chr4 124709838 96 + 155029701 TTCTCACCTTAACATCTACAGTTTCCCACGCCATGCACCAGCCCAGCCTGTCTCCTGTG--------GGGAGGCTGCCAGTTGCCATACCTGGCCTGCTGCTGG s monDom4.chr4 14293654 101 - 430141050 TCCTTTCCTTGGC-CCTACAATATGCC--TCCAGGGACTTACTTATCCTTTCAGATGTGCCCCCACTGTGAGGTTGCCCATGGCTATGCCCTTTCTGCTGCTGG a score=10168 s mm8.chr4 124710316 675 + 155029701 CTGACTCCCTGGGACTGTCCTCTCTAAGACTTACCTCCTCAGA-GGTAACTGATTTCTTTAAACTCGGGAGGAAGAAAAAA--AGAAAAAGGGAGACGGTGAAATAGATTTATGACCATGTTAGAAACATTGGATTGAAGAATTGATCCCTACGGCTAAGTCATTTCCCTCTTTCGTGTAAAATATAAATAAATCTGGGTGACTTAGGCTGAGCGATGAG--TCGGCTGCCATCTGGGT-----GGCGAGACACGCATGCCCTTCAGAGG---CCAAGCCTCCTCCCCTTGACCCC-ATCAATTAGCTGTTCTAAATGGCTCTGGCTTT--CTTCCCTAGG---CGATACTGGC-TGTGCCCTCCCCTTCCCGGGCCCACTGTGGGGTAAATGGACATCTCATAGGA-----TCCCATTCTCAGCCT-------------TGCTG----GACCTGCTGAACTTTAGACCATAACTAGAGA-GCTGGTGCAACGACTGTAACCTG-GCTCTAGGCTCAAGGTGGCTGAGCAGCTCAAGTGTGTGATTGTACAACCTG---CAGCTCCTCTCCCTAAAGGCTTCCCAGATTTCTGGGCTAAGGCAGCCAG-------CGTATCGAGT---CCTAAATTTCTCGGGAGGGAGGCCACTTTCATTGT-CCTGGCTCTCACAGTGGTTTAATTTTAGCACACGTCCCTGGGGTAGCTCTCCTCTCTGTCTCAGCCCAG s monDom4.chr4 14293878 710 - 430141050 CCAATTTCCCTTTAATGTCCCTTCCTATCTTTGCCTGCCCAGGCTGTGGCTTAGTCCTTTAAGCT------GAAGAAAGGAGGAGAAAGAGGGAGACCATGAAATATATTTATTGCCGTGTTAGAAACATTGGGTTGAAGAATTGATCCCTACGGCTAAGTAATTTCCCTCTTTCGTGCAAAATATAAATAAGTCTGAGTGGCTTACGCTGAGTGATGGGCCCCAGCCACACACTGAATTTCACAATGGGAAGTGAGCGCCCTTAAGAGAGCTCCTGCCCGACTCTTTCTGATCCCAAGGAATGCGGTGTTATAAATAGTGGGTGCTTTCCCTTTCGGAGGGGTCGAAGCTCCCATGGGCTATTTC--------ACTAAGTGCAGGAGACTTGGGAAGGTCTTGAAAAATTTTCCCCAGCTCAGCTCCCTCTGTGGCAGGTGCTGCCCTGAACTGCTGACTTCAGAAACATAAATAGACACACTTAATTATTGTTATTATTCTGTTCTCTGGGGGTAGGGGGGCTGGAGTCTTGGGGAATGTGATT-TATAACATGGTTCACTGCTCTTTCTTAATAGTCTCTTCTTCCATTGGGCTGAGTAGGCCCAGACTTTTCCAAATGAGTCACCCAGGGATCTTCGATCAGGAGAC--TTTTTATTCTAACAGGTTTCCCTGGAAGACAGAGCTTGGCA-----TTTTGGGCCAGCTCTTGT-TCTCTCCCAGCTAAG a score=15856 s mm8.chr4 124712167 875 + 155029701 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917 - 748055161 GGGGAATGAGAAGATTAAAGAGA--CTGGGGGTTTCAGGAACTGAGGGAAC-----TGAGCAGCTTAAGGGAAAAGAAGACTGAGGGGCTG--AGGGACCAGGGGGCACCCAGAGGACTGAGGGGCTGAGGGACCAGGGGGCACCCAGAGGACTGAGGGGCCTGGGGGG-ACCCAGAGGACTGAGGGA-CCAGGGGGCACCCAAAGGACTGAGGGGCTGAGGGA---------------------CCAGGGGGCACCCAGAGGACTGAGGGACCAGGGGGCACCCAGAGGACTGAGGGGCTGAGGGACCAGGGGGCACCCAGAGGACTGAGGGGCTGAGGGGCCTGGGGGCACCCAAAGGACTGAGGGGCTGAGGGGCCTGGGGGGACCCAGAGGACTGAGGGTC-CTGGGGGCACCCAAAGGACTGAGGGGCTGAGGGGCCTGGGGGCACCCAGAGGACTGAGGGGCTGAGGGGCCTGGGGGCACCCAGAGGACTGAGGGGCTGAGGGACCAGGGGGCACCCAGAGGACTGAGGGAC-CAGGGGGCACCCAGAGGACTGAGGGGCTGAGGGACCAGGGGGCACCCAGAGGACTGAGGGAC-CAGGGGGCACCCAGAGGACTGAGGGGCTGAGGGACCAGGGGGCACCCAGAGGACTGAGGG-GCCTGGGGGCACCCAGAGGACTGAGGGATCTGAAGGAG-ACTGAAGCCAGGCATGGCTCACTTGGGGCCTT----GGCAGGATC-CTGGGAACGCTGGTGATCTCCCTACAGCACTTACAGAGTGTTGGGCATCTGG---TTTTGAAAGAGGCTCTGGTGGACAGGAACCAGTGCTTGTCCCAGGTAAGTGCCTGTGCTCCTGGGCTGAGATTGGGGTTTCCGCACTTTGACTAGGGCTTTGGTTCT--GAGCCTAGGGAGGTGGAAGAGA-----------GAAGAAATCTATCCTGCCTCTCACAGAGGG a 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agcctttctggtccaaagggctctcctgctagtcctggctccctTCCCTGCCTGGccctcctggcttccctttctccacaggttggctcagcatgccttctccgccttcagcaacattgctgatag-------aaatgtcgagggggaTGttttcatcaatgacttggatggagacag-gctgggcttgctcatTGACCTTAATTTGGTCACTTTTCTGCTCCTCCCGGTAACAATC-----GGAGGAGTGAGGCTCTCCTGCCG---GGCATGCATATTTAACAGTATTATCAA---TGTCGGAGCAAATATTTCCAGAGTGCTGGGAGGCAGCAGGCAAACACCTCCACCCCCTCCA----GTCGCTCCTGGCCTCAAGCAGCTAATGAGTTTCTCCTTTCCCAATCAATGTTCCAGGGAGTTGAGGACATGTTACTTGGATCAAATAGAGATGGATTCAGATCCTTG-GCAAATGACTGCCAAGAAGAACTGCAATATGCAGAGGTGACAAGCCCCAA-CTTAAAGGGCTCTGCACAATAGGCCAGAGAA--GATCTCCCAGAATTGTTTGCAAAGAAATTTTGCATTTCATTATCAAAT a score=2064 s mm8.chr4 124732630 65 + 155029701 TTCTCTCGGCCTGGGATGAGATTTGACTCATGTTTTCGCATAAATATAATAAAAGGATGCTTCCC s monDom4.chr4 14320522 65 - 430141050 TTTGTTCTATCAGGGATGAAATTTGGCTTCAGCTTTTCTGCAGGTATCACAAAATAATCTTTCCC a score=13689 s mm8.chr4 124738992 425 + 155029701 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GTTCCCTTCCCCCTTCATCTCAAATGATTTAAttatttatttctaattcttcttttctttctctctctcttttttttttAAACCAGAAAGCACGTTTTATAGCGGCCTCGCCTTAGCTGCAATTGGGGGAAGTTTATTCTCATGCTAATTGCAAAAGCTAATTGTTCTTATTGCAAAATCCATTATATAGTATATTTATATTGCCGATAATGAGATGTTTGGATTAAATAGCTCACTAAAAGTCAATAAAAAGAAATTCGCTTTACTATTCCTCCTCTCATTTTTCTCCAGCAGCAGGAACACGTTGTTGTTTCTCCCCGAAGGCTTGAATTCATTAAACTGCCTGGAGGAGAGAAGAG----GGAAATAAATTTTTTGT------TTGAAAAGGCATTAGGAGGAGGGGGCAGGAACACAAGTGACAGGACTTTTTCTCCAGGATGTGATGACACCCAGGTGACTAATTGATAAAAAGCGTCTTAATTCTA a score=4094 s mm8.chr4 124748889 134 + 155029701 TCTACAGATGGAGTCCACAGGCTAAAGGAAAAGGGGGAGGGGCCTGAGAAAGCCCCCACTCCATTCCAGGCGGCTGAAATGGCTGTAATCTACAGTCATCTCTATTCACAGACTTCAAAGGGAGATGGGAAGGA s monDom4.chr4 14349325 134 - 430141050 TCCCCCAATGCAGAAAGCAGCCCAAATGACAAGAGGAAAGAGCAATCGGAGAGTCTTGGATCTCCTGGGGTGACTGAAATGGGTGTAATTTGCAACCATCTTTGCTTAACGACTTCAAAGAAAGATGGGAAGAA a score=10892 s mm8.chr4 124750847 430 + 155029701 AAGAAAACTGA---GGATAAAGACTTGATGACTTTGAAT---CCATATCTGCGTGTTTGTGACTCCTGTGACGTGCAGACTTGCTGGGGCTGTCTCTGCATGCGTCTGTGACGATGCCCCTGTGTGTTT-GGTGTCT--GGCCCTGGTGCACACTCCAAGGGCAGTATGAGTAGTGCTTCTAGGGAAGTGAGTGAGTGTGTGTGTGTGTGGTGAACTTagggagggagggagggagggTGAAAGCGTGCCCAGTGGCAGGCATGACAAATGATTAATCTATAGAAATCTATATTCTATTCTTCCATGCGTCCACTCCGCCCTTCTCACGCTCCTATGCATCACCTCCGAAAATCCATCA---CCGGCTCCCAGCCAAGGACAGGC----GGTGAGGAGCGCGCCTGCCTTATTGATGGACTTG--TGGCTGCTTTTTCTACATTTGGA s monDom4.chr4 14351048 398 - 430141050 AAGCAAACTGGAAGGAATACAGGGAAATGGACTTTGTATGTGCAATATGTATGAGTGTGTGGAGCTTAATAAGAGTGCATTT-------------TTGTCAGCTTGCATGAGAAGAAACATGTGTGCATAGGTGCCTAAGGTATTGATG--------GAAGGCCATTGGGGTTTTGCCCCTTTGGGAGTGGATA----------------------TTATGTAGGGAAGG-----GAGTGTGTGCATGCAGTGTGGCAGAAATGACAAATGATTAATCTATAGAAATCTATATTCTATTCTTCCATGCGTCCAGTCCGCTCCACTCACATTCCCATGCATCACCTCTGAAAATCCATCGCCTCCAACTCCTAGCCAAGGACAGGCTTAGAGTAATGAGC-TGCATTCTTTATTGATGAACTTGCCTGGC-GTTTTTTATATATTTGTA a score=3155 s mm8.chr4 124752645 146 + 155029701 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s monDom4.chr4 14771490 1450 - 430141050 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CCTTATTTATCTCATGCCTTTAATCCGTGGGGCACTGTTTTCTCTTCGCATTCCCAGCATTTTAATTGAAAAGCATTTT-----GTATGTGTTCCAGAGCTGGGAAGCCTGTCTCCTGCCTGCCGTGGGAGTCTC---CTTCTGGGACTTTGTTAAGACAAGTCCCGATTATTCttttttttttttaattaaaaaaatttCCCTTGTGAAAGAGGATGGATA--------TCCTCCGGGGGGTGGGTGGGAGCCAACAAGGAGAGAGTGGCACTCAGAGGGGCACTGACAAGGGACTAGGCCTTGAGAAGCAGGGGCTCCATGTTTCCATTGAGAACTATCAGGTAATGAGGCCATTGGCAAAAAAAGCTGAGAAGGAGAGTGTCCCCATGGTGATACTACAGATTGGAAATAATGAAATGGTGGAAGATCCAGAGGGAGTGGCAGAGGTGACTGAAAAGCCTTTGGTACCATGCCGAATGGTAGTTGAGGAAGATGGGAAGAAAGGGGAGACAGAAGGAGATAAGACTCTGGGGTGTGTGAGGAGGGTTCCAATCCACAGGAGACAATTAAACCTTGCCCTATTAAAAGAACTTGATGCTTACAGTAAGATGAAGGCAGCAGAATGGAGAGCTTACTGAATTCTTATAGCCACTGCAAGGAAGGATTATT a score=9791 s mm8.chr4 125004811 282 + 155029701 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s monDom4.chr4 15108583 2236 - 430141050 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TCCTGCCCGGTCAT-TTCCGGCTCACCAAGGACCCA----CTGAGGCAGGAAAGGAAGTAGAAGATAAAAGAG-------GAAGAAATATCTTCTTTCTCTACTGAAGCGAGTGGGG------GTCTGCCGAGCACTAGGAGAGCGCCTCAGCAGGGGGTCTTTGCAGGGCGTGCAGCCTCATCCCAGGCCTCCCCTCCCTTTCCCCGATGCCAAAGGCAGCTTCCTAATTAGAACGTCCATAACCCTCAGCATCTGCTGCAAGAGAATTCAGCGGCTGCTCCGCCACGGAGAAGTCCATTAACTTTATTGCACAGAACGTCAGACGTGCTTCTAGACAGAGCATCACTGCCAAGTGAGATAAACTACCCAGACTTGCCAGAGGGATGG------GCCTCAGCTGGGACCTCGATCCTCTC--TCCTCTCACTGTCCAGTGCCCGAGGTAGTCATATTATGCTACCTTGGAAGAAGGGAG----CCGGGAAGATGGGGACTTCGAAACACAGGTGCAGCCCAAGCAACGAGCCATCAGTGTGCAAGC s monDom4.chr4 15127571 519 - 430141050 TCCAGCTTGGCCCTGCTTTGACTCCCTAAGATCCCATGTTCCACTCCAG--AATGCAGTTGATAATGAAAGAATCTCAATAAACAAACACCTCTGTCCTGGGCCTTGGGCAGGGAAGCAGAAAGGCCACCAATGTCAGGGAAACCTGTTCCACAGGA--TCTCTGCAGGGCCTGTTGGAATGTCTCAAGTCTTCTGCATCTTTCAGAG-CACCAAAGGCAGCTTCCTAATTAGTACATCCATAACCCTGAGCATCTGTTCCCAGAGAATTCA---GCTGCTCCAAGACGGAGAAGTCCATTAACTTCACCACAC-GCATTTTGGACGTGCTTTTAGACAGAGGATTGCTGCCAAGCAAGATAAACTACCCTGGCCTGCTGCAGGGAGAGAAAGAAGACTTTGCTTCCCCTTAGTTCTTGTCCTTCTTCTCCCTGACCTGTCACTTGGGGAA-----------AACTAAGAAAGAAGTTTGTTCTCCAGGAAAAAAAAGACTT-GAGGCA-------AGCCATGGTAGCAAAATGTCAATCTGTTGGC a score=17599 s mm8.chr4 125221783 716 + 155029701 CCCTCAGATGTGC-----CAGGCCTGTGGCTGGCTGTT-ACTTGGGTCTTTCCCAACTCT-TCAGCCTGGAATCCATCTTTGTTTGAGCACCCCACACA----TTG--------GCCCTCCCACCTCC---TCTTAGGTGGCCCAGATCCTGCA-----GGAAGCAGCCGCCGAGTCCTAGTCCTGATGGATGTCTCCCCCAAGTGGGCCTCCCAGCCTCCCTTCTCGGTCTTAGATTCCTTCTTAATATGAATAATTAGCAGAAACACTCAGAGGGGTAGACAGCAGCCATAGCAATCGACCCCAGTGATTTCCGAGCCGCGGGGAGAGCCCAATTTTGCTCCAATCCGGGTGCTGTAAATTCCCATCAAGCTAAGAAAATATAGTGCAATTTAGAAACACTGATACGGCAATAAAACACAGATCTCCAGCAAATGGAATTCGGCAACATCTAAAAATGGAGCCATACATTACTGGGCCTGTGACT-CCCTCCGGGGACGTGATGCTGGGAGAGGCTGAGGGAGCTTCATGCTCAAGTGGCTCTTTCTTTTCCACAGGAAGGCAGGGCCACCCACAGATGGCCC----------CCGAGTCCCCCTCAGGCAGGACCTCTTTCTGGATTCAGGAACGGTCCGGG-----AAGGGTCTTTTCAAAGGGGGAGGACCTAAGGCTG--------------CCCTTGTCACCAAGGGCCCTTGCAGGAGCAGTCACAGAGTGGGAAG-------GCAGGGAGAAAGAACTCACCAGGTGTCCT s monDom4.chr4 15152546 743 - 430141050 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GATAATGGCTCTGCAGATAAATAGACCCCATCTACATGGTCACAATGCTACCAGCTATCCCATTACTCA a score=9396 s mm8.chr4 125237660 787 + 155029701 ggctcacactgtatttctgtcaggac---agtgctgCGCAGTTCAGCACCTCTGATCCTAGGCCAAGTGCGTGGCCGTGATCATTCCTGGAAGCCTTCTGCCCAGCTCTGAGATGGGAAGGTTTGGCTGCAACCTCAGATTCCTTCCAGACCTCTGATGGTCCTGGGGCCCTGGGACAGTCCTCTTTCCCCAGTGGGGCCACAGGCTCAGTCCTGGACCACATGACTCTTGCTGGGTGGGGCCCCCTTGCGGTTGGAGCATCTCTGCCACAGCCAGGCTGCCTGAGGAGCTGCTGCCAAGAAGGCTATCTCGCCTCAGAGAAGTGTTAATAAATATTTACCGAACCCTTTGACAGTGCCCAGGGAGAATACAAATCAGACCCAGC-----------------------------AGGCACTGGA----CTGGCCTCCCCAGGGCT--------GTGGTG--------------AGGCT-------CCAGCAGTGCAGGGCCAGGCAGTCTACTGACCTCCTC-------------------CAGTCTGAACCTGCCCCAATG---TGGCCCCGCAGCACCGTTTACAGAAGCTGCGAAATAGGACCATCTCTCACTATTGATTTTGTGGCTCTCCCCACAA---CCAACGCCCTCGATAACTCACACCATATGGATTTTTCTATAAACCCCCAAATTAATATCTGCAGTGGGCGGGAATATACTATTGCCGGATATGG-GGAAGTCTCCTGGCTGCCATGCTGGGGGTCAGAGA-----------GCATAGTACTTGTGGCTGCCCTGCTGTGCCTGGGCTCGAGCAGG--------CTGACCTCTGCTTTATAGGCATGGGTGCAGGGAAGTACAGCTAAG---------TCTAAATAAGGCTGT s monDom4.chr4 15194470 840 - 430141050 GGCACAGACAG-ATTATTGGCAGGAGGGGAGAGATGGAAAGGGCTGCCCCTCGGATCCTGGG----------GGATGGGAGTGTTGCCACA------CTCCCCA--TTTGTAGTAGGGAG---TAGCTGTA-----------------GTTCTCTCATGCTT-TGCATCACTGGAAA----CTCATTTTCCAG-GAGATTGCTGGGCCTTTCTTGACATTCATAAACGTGGGTGAAAAGGTCCCCCTGGCAGGTATAATCTATGGAAAGTACCCA---TGAATATGGAGCTGTGTCTGAGAAGGCGATGCTGT-GCAGAAGAGTGTTAATAAATATTTACCAAACACTTTGATAGCACACGTGGTGAATGCCAATTAGTCTCAGCTTTTGGAGACTAAAAATAGATACCCCCAAGGGCCTTTGAGCTCCTTCCCCTCCCAGCATTCCCACCCAGTGGCAGCCAGAGCCCCTCTAGGCTAAGGAGCCCAGCAG-GCAGCAGCAG-CGGCCCACTGACCTCCCCTCCTGTCATTGTTGACCCACACTCCATCCCTGCACCAGGGGCCTGGCCCAGC--CACTATTTACAGAAGTCATTAAATAAGACAATATCTCACTATCGATTTTGTGCCTCTCCCCCCGGGGCATACTACCCAGGATAACTCACATGGTATGGATTTTCCCATAACTGCCCAAATTAATATCTGCAGCGGGAGGGAATATAC---AGCCCGTTACGGTGGCAGCAACTTGTGAGCC--TCTGGGGAGAGGGGATTGGAAAAAATGCATCGGA---GTGACAGCTCTTTGG-----GGGCTCTGGTAGGGAATTGCATCAAGCTTTGTAGCAGGGGCAGGTGGGCTACAAGTCCCAGCTGGGGCCCTTACCTCCAAAAaaggtcat a score=3634 s mm8.chr4 125238989 554 + 155029701 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ACCAAGCCGCCCATCAGAATGACACGTCTTGGGACTTCTTGTCATTTCCCAT----CCAAGATTCCATTACGAGGTGTGATTGCTGAAGTAATAGACAGATAGTGGATCTGTGTGAGCCCCGCCTTCACACCGGGCAGCTGCCGGGTTTTTCC-----CATTAGCCATAGGGCTTGACGGACAGTAATGGATTTCATACTGATGC--GAAGCCTGCAGCGGATAATTCCGTGATAACGGTTTATCAG-GCACTGACGGGAG-TAATGGGTAATCACCAGGCAGAAAG-CAAACCCGTCAGGGAGCC-TGGCCT---CCGCCCAGACAGCAGTACCTCTGTTGTGCCA-ACTGCCACCTTCTCAGTCTGCCGCCAACTCTGGTCTGTGTCCTAAA s monDom4.chr4 15202959 386 - 430141050 ACTTAGCTTCCCATTGGGATGGTGCCACCGAGGATTCCCTGTCATTTCATATGAGCCCAGG--TCCATGACAAGGCCTTATTGCAGAAGTAATAGACAGATAAAGGATC------AGCCCCAAATCGAATGCATAGAGCAGCTGGATTTTTTCTTTTCCATTAGCCATGGGGCTTGACGGACAGTAATGGATTTCATACTGAAGCCTGCGCCCAGTGGAGGATAATTCCATGATAACGGTTTATCAGCCCATTGACGGGAGATAATGGATAATCACCAGACAGAGAGCCAAACCCATCCCAGAGCCTTAGCCTGTCCAGCCCAGCTCAGCCTGGCCCTGCTTGGCAGTACCCCTTCCCTCATCCCCCATCGCTGCCTCCTCTCTTTGGTCTGAA a score=4676 s mm8.chr4 125247585 238 + 155029701 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CCTCGGTGGAGGAGGAATATCTGGGAACCAGCTTCTCCTGAACACAGCCATCAAAGTGCCACTAGCTGCCATCTGCTCTGCCCGCCACAGCCTCCTTGGGGATTTATTACCTATTCCCTTCCATTAGCATAAATAATATGGAGTTTGGCTTTCATGATGGTTTACATAATAAATAAAACAGGTCAATTGCCCACAAAACTAGTCTCTGTGAACAGTAACAGATTTAATTAGATTTATTTTACTGGAGCTTTTTTGGAGTGAGGCTCATGTGTCTTGTGCCAGAGAGAAAG--------------TTTCATTTCAGAGAGAACACCTCTTCCC a score=6936 s mm8.chr4 125279760 502 + 155029701 TTTTTTCAGCTTGG----GATGCTAGCAGGACACTGAAGTCATCCTTGAATGGAGAATGTAGGGCCCCTACAACC-----------CTACAGAGCCTTTAAGCCAGCCCTCTCCTTTCCCCTTCCTAGTCAGTTAACCCTGCACTCTGGTGGCTGGCATCTGGGATCAAGGAGAACTCTGTCAC------TTCTCCCCAGCTGGGGTGAAGGA--------------TGGCCTCGAGGCCAGCAGAGCCCTCT-----CCTTCCCGGCAAGAACGGTAGGGGCTTGATTTCTTTCATTTTGAGTCTCCCAAAGTTAATTTAAAGTTTCTCCCTTTTAAATATGCCCGGGCTGCCGAGTGAACAGTAGCGAGCTGCCCAAGGAAAGCAGAGGGAGA-GAGATGATTGTCTGTGCAGATATTGTGGCCTTGTAAATGAAAAACCATGTTCCCAGAAGAGCCTGAGGGAGCAAGGTGAGT--GCTCGGCATCAGGACAGGGACCTGAGATGGAGGAGGAGCCATCCCTGGGGAACTGAGGGGAGATCA s monDom4.chr4 15242627 496 - 430141050 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ATTTTGACAGGTGGTG-GGGAGAATTCACCAAGTTCATTGCGGCCTCTCTGCACCTAATAAAGTGTCAATTAAGATTGATTGTACTGCAGAGGGCTCTTGGGAACCTGGTGGTTTATGCTAATTTT---AAAAAGCCTATTTCATGTGCCTTTAGCTTGAATCATTTCATTAGGTTTATTAAGAACCCAATTGATACATTTCTTGTTGACTCCAGATATTCCTGGGGTGATTAATTCTGAACAATGGAGTTAATTAGTTCTCAGACTTTGGAACACTTATTCCTCTGAGCTGGGGCTTAAGGATCCAGTTTCCAGTCATGGGAACCTCCTAAAGAATGATTTATTTTCTTTTCAAATGAAAGAAATATGAAAAAAGGCATCTCCCCTGAGAAGAGTTGATGGCCATGACTCTCCCAAGAAAATGTTTCTTTGCAgcacaaatacattcttagtagaactgtaaattggtccaactattctgggaagcaacttggagttgcgcaaggaaagtttctaacatattcttaccctttgatgcagaattcccacccttgagtatgtgccacaaggaaacaaaagtcctttatatgccaaaatattcatagcagtgaatgggagagagggggagaggggaagagagagaaagagagagagagagagagagaga a score=3076 s mm8.chr4 125312182 174 + 155029701 CATCCTTTGTCC---AGCC--------CTTTAAC----CAGATGTGTGCTCCACCCATACCAAGTTGAGTCTTTGGCCTCTCAGGCCCCCA--TCCTTCATCCATAGAATGGGGACGGTGACATCTGCCCTCCCCACCACCCCACGCATCTGTGG---TGACATGAGATCACACGTGTAAGAGCCCTTTGAGAA s monDom4.chr4 15294513 183 - 430141050 cattctatgtcctaAAGCCTCTGGCAGCTCTAACATTCTAAGCCTTTTCTCCgccagtccca-----------taacctctttggacctcagtttcctcctctgaagaatggaggtggtaacacatgctctacacagctcacagggctattgtgaggatgaaaagagatcatacatgtggaatcgctttggaaa a score=19829 s mm8.chr4 125312402 573 + 155029701 AAAGGGACCCATTTTA-GAAGTGGGCTTTTTTAAACTCTTTTTTTATATTATTATTCCCTCTTGAAAGGGTTTCTTCTTGTAGCTGGGATTTTTCATCTTGTGTTAAAGAGAGAGAGGGGGGAGAGAGTTTTAAAAATAGCTATTTTAATGAAAAGAACAGCTCCCCTGAAGAACTGGGCAGCCCTTTCTGCCGGCTTTGCTGCC-GAACTTACGGTCCAAATTGATTTTTTTTTCTCCCCTCTTCTTTAAAGGTAAGTGATGAAATACCGTGGGTTTGAAAGGGCTGACATTTTGG-TAGCAATTAAACTCAGGCCCATCTAGCTGCGGCAGCTGGTGGCGGCCCCTCGTTATGGTGGAAAGGCAGTCAGAGGATTAAGGTGGGTTGATCTGGTTCTCTGAAGAGCTATGGCTGCCTTCTGCAGCCAGGTAATTAGATTTAACAAGCTGGCCTGTCCCCTTCGGTCCCCCAACCCTCTTTGGGCAGAGCAGCCAAGCCAGGGAACCCACCTCCCACTCCCACCCAAGAGAGGTGGCAGC--AGGCAAGTCCAGGATGCTAATGAGCACAGTGATGGA s monDom4.chr4 15294725 501 - 430141050 AAAAGTACCCATTTTAAGCAGTGGGCTTTTTTTAACTCTTTTTTT-TATTATTATTCCTTCTTGAAAGGGCCTCCTATTGTAGCTGGGTTTTTTCATCTCGTGTTAAAGAGAGA-------GCGAGAGATTTAAAAATAGCGATTTTAATAAAAAGAGCAGCTCCCCTGAAGAACCCAGCAGCCCCTTGTGCTGTCTGCAATGCCTAAACTCCCGGCCCAAATTGATTTTTTTT----CCTTCTTCTTTAAAGGTAAGTGATGAAATACTGTAGGCTTGAAAGGGCTGACATTTTGGATGGCAATTAAACTGAGCCCCGTGCAGCTGGGGCAGACAGGGCCACCTCCTT--------------------------TCAGCATGGGGTG--------------GGGCCCAGAGCTGCTGTTGGGAGCTTGTTCATCAGCTGGAACCTGCTGGTCC-TCCCCAGGG-------AAGACTGCCCAAGGAGAGCAGCAGAGCCCCTGAGGCTGC----------------AGGAAAGGAACAACTGGGGCAGATCCAGGTTCCTAGCGTCCA-GGTAATGGA a score=10170 s mm8.chr4 125316643 322 + 155029701 CTGCTAGTCTGGCTGTACCAGGCAGTCCCTTCCTCAGTTGCTCAGCAAGTGCCAGAGACACGAGAGAGGGAAGGAAAGCGGATGGCTCTTCAGGAGGCTGGCACCAGTCC-CAAGCAATATGTTCCCAACTTCCTCC--TGCGTGGGTGGCAACGACACGTCCCCAGCCGTCCCCCGCGCCTCTCACCAGCCGTCAACGCGCCCTCACTCTCTCCTTGTGTGTGTTGTCAAATCTTCCCAATATAGCAG-CCTGGAGTCTGTCAACAGTTCTGTTCCATGCCCACTTT----CCCTCTCCAGAGGAGTGCAGCGACAGCCACCTTCCCTC s monDom4.chr4 15301210 317 - 430141050 CTCCCAGTAATGATGAACATAGCAG-CCATCCACCCGTTATTAATCACCTGAGAGGGGCT-------GGGACAGAAAGC--CCGTCTCTGCAAGGGCCTGGCACAGCTCCACGGGCAATCTGTTCCCAACTTCCCCACATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCTTCCTTTGCAGACTCGTCTGCCCTTCATCAGCCATCAACAAGCCT---CTCTCTCTTTGTGTGTGTTGTCAAATCTTCCCAATATAGAAGCCCTGGAGTCTGTCAACAGTTCTGTTCGGCGCCCACTTTTTTCCTCTCCCCAGAGAGATGCAAAGTCTATGATCACACCTC a score=2811 s mm8.chr4 125317421 509 + 155029701 ACTTCCTTGAATCCCTTATAGGAGGTCAAAAAGTCTGATCCAGCTCAGCCTTCTGTCTGGGACTCCATCCTTGGGCACCGTGGCAACCTATCAGCCACCTTCTCTCTGTCCTTACAAGCTGCCCCTG-----TCTCTCCCCCCCCCAAAGGACATGTGTCTCCATCCCCACCAGACCT--TGGCAGATCCTACTCCCAAAGGAATGTGGCACCAGTTCCCATCCCTACTGCC-TTCCCCTCTAGAGGACCCCAGGGTTCTTCATGGGACTCCAGGACACTGCTCAAGGTTCCTAAGACCTCCATAATCCCCCTGCTGTCTGTGATTCACCAAGTGACCCCACAG---GTCAGAAGTCACCACTAATAACACTCAAAGGGTGACATTTATTGCAGTATAGGCAGCCTCTGCTTAGCTCTC---AGGC--TTTGGGGAAATGTCAGACACAGAGTGAATCACTTTTTACGGTGT--CTCCA--GCAAAATGCTTGCCGTGATCTCTCATTTGCTGTCTCTAATTGAAACTT s monDom4.chr4 15310844 476 - 430141050 ACTTCCTGCCCTCCCCT---GGGGGCAAAACGCTTGGGTCCTTCTTGGCTATCTGCCTGCCATT---GCCTTGGGC---------------------TCTTGACTAGGTTCTTGCCTGATCCTTGTGGATGACGTCTTCCTTTCCTAAATGGAAAGGGAACCCAG-------AAACCTAGGGGCAGAGAC----CCCAGAGGAGCTCTGGGC---TCTCCCTCCCAGGAGCCATGCCACTCCAGCAGGGCCTTGAG--CAGCAGGCACATCAGAGAGGC--CCCATGACTCCTCACATCTCCACAGACATCCCATTA---ATATTTTACAAGACAGCCCCACTGCCAGTTAGATAGTGAGACAATTAATTTTTAAACGGTGACATTTATTGCAACACGG--AGCCACTACCTGGCTTGCTGTGGGCTATCTGGATAAATGTCAGTTAAAGATCTAATAATTCCTTACAATTTAACGCCAATGTAAAA---TTGTAATTAGCCATTATTTGCAAGTGGTAATTGAGGTTT a score=9375 s mm8.chr4 125346940 436 + 155029701 GTGGGTGGGAAGAAGGAGGAGGAAGCATGGAGGAAACAGGAAATGGGAAGGAAGCTT--------------CTGAGA-------ATGGCAATG---TGAGGTGAGGAGAAGG---------------------AATGGGG---CAAATGCTGAGGCAGCTCTGCTGAGCCAGATCTAAGGC---TGCAAAGGCTTGAGCCTTGAACCAC----TGGAGAAAGGCCAGGG------------------------------ACATCAAGtggatggatggatggatggatggatggatggatggatggatgg--atggatggatgcatggatgcatggatgcatggatgaatggatggatgcatgtacagatagatgaatgcatggatggatgcatgcatggatgaatggatggatagatggatagatgcatgcatgggtggatacatggatggatggatacatggatggatgcatgcatgggtggatacatggatggatggatacatggatggatgcatggatg s monDom4.chr8 287584517 521 + 308469712 GTGTGTGCAAAGCAAGAGGTGGAAGCATGGAAGAAGGATAAAAGGGGAAGGAAACTCGAGGTTTTGTGGCATTGAGATGGCCAGAAAGCAATGGGCTGGGGTTTGGGTCAGGCTACTTGTGGAGAATTCACCAACTGGGGGCCCAAAGTACAAGGTAA-GGTGCTGGTCCAG-TCAGAGACAGAGGCAAAGAACTGACAAGGATAGCACAGTATTAAAAATGGCCATGAATTATTACCGTCATTATTATTAACCATGACACATATAGGTAATAAATGTATACACATGTGTATGTACAGAGAGACAGAGGGCAAGAAATAGATAGGCAGATGGATGGACAATcagacagatagacagatatatagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatggatggatggatggatggatggatggatggatggatggatggatggatggatgTGTGTTTG a score=2376 s mm8.chr4 125351342 102 + 155029701 TCCTTCCTTGTCTGACTTCCCCTTCTCTTG---CCCCTACTTCCTTATACTCCCCAGACAACCCTACCT-----ATATCCAGTCATCTTGGGTTCCACTTTGGTGATTCT s monDom4.chr8 287587219 105 + 308469712 TCCTGTCTTCTCTGCCTTCCCCTCACCTTGTTTCCCTTATCTTCTTCTCCTCTCCCAACTTCCACACTCCCTGGAAATCTACT-ACCTCGGGTTCATCT----TGATTCT a score=4053 s mm8.chr4 125354832 256 + 155029701 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AGGGACAGCTGGGTAACCAGGCAGATAGACTAAGGACTCCCCCCGCCCGCTGACCCCGACCCTCCTTCGTGTCCCATCAAGTCCAATTGAGTCAAAGGTGCTGATAGATCTCTGGGAAAGATAGATGGGGTAATCAGAGTAAATGAAATTAACATGCACAGGGTAATCAACACTCATTAAGCCAATTTAGTCAAGTGATGACCTCAGTCAGCTTTTATTTAATCATATACTTAAATGTCAAATCAATATGCAAATCTCACCCAGGCCTTTTCCAATTATAACCCATT-AAAACTTTCAAGTAAATCAATGCAGCCAGGCAGGGT---------GGGAGGGCGCAGGGAGAAGGACCCAGTAGCCCAGCCGA s monDom4.chr4 15372157 351 - 430141050 AGAGACATCCAGTCAGACAGACAGATGTACAGACCATCAGCCCATCCCTCCCACCCCAG-------------------GAGAACAATTGAGCCAGAGGTGATGAGGAATCCCAGAGTAAGATCGATGGG-TAATCAGGGTAAATCAAATTAACATGCACAAGATAATCAACACTCATTAAGCCAATTTAGTCAAGTGATGACCTCAGTCAGCTTTTATTTAATCATATACTTAAATGTCAAATCAATATGCAAATTTGGCTTAGGCCTTTTCCAATTATATCCCATTAAAAACTTTCAAGTAAATAAATGCAGCCGGGTCGGGTTTCATCTTGGGGCAAGCAGAACAAGAAGGCTATCAGAGTCCATCCAA a score=13322 s mm8.chr4 125382270 360 + 155029701 CCACCTGGGGAACCCGTCTCCTGCTTCTTTCTCAGCCCATGTAAAAGCAAATGGCGCTGGGCGTGAGCCTTCCTCACATCAGCACAACAAGATGCTTAGTCAATCAAATAGCTGAGCCAAATGAACGCAGCGTGCGGCTCCACGAAGAGGGATCTTTCC------AGGGGAAATGTTATCATTTTCCATTCCTGTTTAATGAATCATGGGAATTACAGCAACATTACAAATGGCTCTCTGTACAGGCTATTACTTTGTTTCTGCAGGGTTCTAATGACAGACCTGCTTCAGTGGGGGGCTCAGCCTGTCTCCCCCCATGCCCCCTGGGCTACAGAGAAC-AATGGTATTATTATAAGTGGTCCCCTT s monDom4.chr4 15396316 350 - 430141050 CTAGCAGGGTTCCCCCTCCCCAGTCTAATTTT-AGTAAATGTAAAACTCCCCAGC--TGGGCCTGCATAATCCGTGCATCAGCACAACAAGATGCTTACTCAATAAAATAGTTCAACTAAGTGATCCCAGCATGTGATTCTGTAAGGACTCTTTTTTTTCAGGGGGGGGGGAATGTTATCATTTTCCATTTCTGCTTAATGAATCATAGGAATTATGGTAACATTACAAATGGCCTTCTTTGCAGCCTATTAGTTTGTTTCTGGAGGGTCCTAATGGAAAGCATGCTTCA-TTTGTATCAGAGCCTG-------------CCCCTGAGCAAAAGAGAATGAATTGTGTTATTATAAGCAGTTACCTT a score=9638 s mm8.chr4 125384523 314 + 155029701 CCTTCCGCCCTCGCCCCAGGTGCCC-GGATACTAATTATAATGACCTGGTGAGTTACAAGACGGTGAAATT-----GCTTCCACCTGAGGTTGTCACGGGCTAGGAAGAAATACCAGG-GCTGGAAATTAAACTGTGC-CAGCAGGCTTGAAGGGGCGGGAGCAGGAGGGAGGAGGGGGCAGGAGGGGAGAGATACCTGCAGCTTATGAGGTGGGGTTTATGGAGTGTCAGCAAGAAGCGTCCTTGGGCAAAAGAGAAAAGATTAGACATTGCTCACC----TGCTGCCGGTCACTAGACATAGACCGTCCCAACAGAAGGTGAAG s monDom4.chr4 15410842 305 - 430141050 CCCTCTTGCCTC-CCATGGGTACCCAGGGTGCTAATGACAATAACCCGGCGAGTTACAAGAGAGTGAAATTAAATTGGTTGCACCTGAAGTTGTCATGGGCCAGGAAGAAATACCGGGCTCTGGAAATTAGACTGTGCTCACAAGGCTGGGAGGGCAGGTTGGAGAGGGGAGAAGAGAG--AGAGGGGAGGAATCCTGGCAGCTTATTAACTGATGTTTATGA----------------GTTCTAGGAGAAGAAATAAATGA-AGGCCAGTACCCACCCAGACGCTGTCGGTCTCTATGAA-ATACCGAACCAGGAAGAGAAGAGG a score=6454 s mm8.chr4 125417360 342 + 155029701 AGAGCCGCACAGGGCTGATATGGTATGTGTGGCGTATAACACTGGAGAGGATCTGCAGACAGAGTGGGGATGGGTGAAGAGCAGAAAATGGCTGCGCGTCCCATCCTCTTGCGTTTCATATTTACTTCTGTTGATGAGATCTCGTCATGCTCGATTACAATTCATAGACTCATGTTTCCAGATTTTATGCACCAAAATGATCTGACTTACAGCGTCACCCCACGCCTGACACTGGCCCCCTAAGCTGCTACTAGACACTGGGCTTGTCCAGGGGTTTCCAGGGGGCCTTCTTTCCGG------GTCCAGTGCCCTCTAGAGGTCATGCCTCAAAAAGCATCCCAGGGA s monDom4.chr4 15478681 321 - 430141050 AGAGCCACTTAAAGCCAAT-----------TACCTGTATTAGAAGAAAGAAGCTGGTGATGGTGCTAGAAGGGGAGGGGGACACATATCAGCTTCAC------TGTCATTCAGTTTAATATTTACTTCTGTTGATGAGATTTCGTCATGCTCTATTACAATTCATAGAGTTGTGTTTCCAAATTGTACGCATCAGAATGCTCGGATTTATGGAGAAAACCCAGGTTCCCCACC--CCCTTTCTGTTGTTGGCGCTAGCTAGTC---TCCAGGGTATTAATGTGAACTTGCCTTTAATTATATCGTCTGCTTCTCTCTGAAGG----GCTGCTGGGAG-GTCCCAGGGA a score=10615 s mm8.chr4 125420408 497 + 155029701 CGTGCGTGcacacacacacacacaca------catatacacatgcgcatacacacTTCATCACCAAA-ATGGATGCACACTACTGCACCCCACCAGCACTCACATCTTCACCCACACACGCACTCACAGATCCTCCAGTGCCCTGTCACACGCTCATAGCTAACTGCCCAAAGAAAAATGCAAGAGCCCCACCCCCACCCACTTGTGCTTGAGAAATTGTGACAAGAAGCGAGCCACTTGTTCCTTTCTTCCTCTCCCCCCCCCCCACACACACACACCCTCCAGGGCAGAGGATTTTCATTTAAAAGTTGCCCGGGCTCAAGCTTTCAGATTACAGTCTACACTATATAGGTTTCCTAAAGATAAGGCTGAGAAATTGATTTCAATTACCAACGTGGAGTGGCTGCACTTCCCA-GCGCCTGAGCGGAACGTTAACCCTGGAGGTCCAGGGGCTGGGGATGAGGAGCCAGCTACAAGCAGGCATGTGGTGCCCGCGCACTCACA s monDom4.chr4 15486745 453 - 430141050 cacacacacacacacacacacacacaATCATCCAGATTCACAAGCTCAGATGCACAAAATACCCAAAGATGTACTCTCACAGGAacacaaaccaaacagacacacc---acataaacatacactcaaa-------cactgacatacc-cacacccacacatgtacacacaaacaggcatacaaa---------ttcataca---GCCCCTGACAAAC-------GGAAGCAAGC-----ACTCCTGGCTCTTTCTCCCTGCTCCTGGCTTCCTCTTTCACTGAGGGTTTTTTTTTTTTCATTTAAAAGTTGCCAG------AGCCTGCAGATTACAGTCTAGACTATATAGGTTTCCTCAAGATAAGACTGAGAAATTGATTTCAATTACCAAAGTAGAGAGGCAGCACTTCCCAGGCTTGTGAGCAGAGAATTAACCCTTGAGAGTCAAGAGCCAAG-----------AGCCAAGAGCAGGCAAACTGTGTTCACCCATGGACA a score=7659 s mm8.chr4 125424718 199 + 155029701 GTTCCCTCTCCGCTCCTCTGCGCCTTAATTAAGTGCTTTCATTTCCCTCCTTCCCA-GCACAGAGGCCCAGCTG----AGATAAGGCATTGATCCCCTCCCAAAGGAGGAGGGAGGCCTGCCGAG--------------CTCTTTGTGGGACAAAGACTGATGGCTTATTAGCAAGGCCTTAATTGTGTGGCCTGAAACTTGAGGAAGTTAGAAGATA s monDom4.chr4 15495783 210 - 430141050 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CATTTTTCCCCTTCTTTGCATAACTCTGGAAATATTGACACTGGTTAGCCAAACAAAG---ACCATTCTTCTCTCATTCCAAGGGGGAGGAGGATGCAGAAAATAAGAGCCTGCTA--TGGCAGGGTCTCCCTTTGTAAGGGAGATATTCAACATAGGCT--CTTCCTCCGAGCAAAGCTGGAATGGTAGGAAGAAATGGGACGGAAAATGGGAGTGAGATACCAATCTATTTACATTTAATTTAATGCTGATGCTCTCAGCTGTCTAGAAATGAA-----CATTGCATT-CAGCACAAAGGATAGGGATGCAGAAGGGAGGGGAAAGAGACACTCCACCCGCAAATGGCAGTAATTATAAATCAAGAGCTTTTCGGTAATATCTGGGTTTCTGTCATCGTTTCCTTGGTAATTAAGGTAGCACAAATAAATCAGGAGAGGGTGGCTGATTTAACTACACCGTGGCAAGGACT---GTGACTTACCGCTGACACTCTGGCATATCCTATCTCCCACC a score=3438 s mm8.chr4 125430473 180 + 155029701 CTAGGCAAACTCAAGCCTGGCCTGTGTCCTAGCTTCTGGGCTCAGACAGCTGATGCAGTGAGCTCGCCTCCCTCCCCTCTCCAGGGTGGATGGGTTTGAATGCAATCTGTAATCCCCTGAA---AGGCCCCTGAGGGACCCATCGGCTCCTTCTAAGGAGCATTAACTCAAACTGTAACCAGC s monDom4.chr4 15510066 174 - 430141050 CCAGGCAG-CTAGAGCCAGACC-ATGCACCCATTCCCCAGCTCAAGGAGGCAGGTAATTTATCAACACTCCCACATGTCTAGAGAATGGATTGGTTTGAATATGATCT-------CCTGAATGCATTCCACTGAGATTCCTGTCTACTCTGTCTCAAGAGCATTAACTCAAACAATAACAGGC a score=7722 s mm8.chr4 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CAGCCAGTGCCCACAAAGGAAATCAGCAGTCGGATCCAGGGCTATCTTGTCTTCCCAATTTCTCGAAGAGAAGATGGGGTATCCCCACCCCTCTGCAACACCACAGAGCTGAGTTGTGTCTTCCAGTTGCCAGAAACCGCTCAGGAGGTGGTCCTCACAGCTTATAACACAGCTGGAGAATCTCCTCCAACCACTGTCATCTTTTGGGAATGTGAAGGTGAGGATGACT a score=4113 s mm8.chr4 125539811 206 + 155029701 CTTTACCTCCAGGTCCAGCTGTGACCGGACTCCATGCCATGGCCCAAGACCTTAACACCATCTGGGTAGACTGGGA--AGCCCCCAGCC----TTCTGCCTCAGGGCTATCTCATTGAGTGGGAAATGAGTTC-TCCCAGCTACAA--TAACAGCTATAAGTCCTGGATGATAGAACCTAACGGGAACATCACTGGAATTCTGTTAAAGGGTGAG s monDom4.chr4 15670048 215 - 430141050 CCCCATTTGCAGGTTCCTCTGTATCCAGTATCCACACCTCTGCCCCAGATGCTCAAAGCCTCTGGGTAGCATGGGAACATCCCCCAGGCCAGACCCTCCCCAGGGCCTATGTGATAGAATGGTGCCTAGCTCCAGTCCAACCAGAGGTTGACTGTGATGGTAACTGGAAGATTGAGTCCAATGGTAGCAGCACTGGGACCCTGCTGGATGGTGAG a score=3022 s mm8.chr4 125540101 513 + 155029701 CCCTATAGAGGCAGCCTCCCCAG-CCTTTTCTGAAACCTTACCTGGGGAAAGTTCTTCCTCCCCTCT------------AGTTCTCTGTTCCAC-------GTTCCCTGTGTGACTTCCATCAAATGCGCTAAAAGAGATCTCTGAGCTTAGCCCCAAGGTCAAAATCAGGCCTTGCAGAAATGGGAGTCTGAGGCTGG----------GTAGCAGAGGTTAGCTCCCACCCTTAGTGCTGTCCCATTTTCTCTCTGCAGACAACATAAATCCCTTTCAGCTCTACAGAATTACAGTGGCTCCCCTGTACCCAGGCATCGTGGGACCTCCTGTAAATGTCTACACCTTCGCTGGAGAGAGAGGTTTG---------------------------TCTACCCACAGTGTTCCCA----------AAATCCTCTCCTCTCTCCCTATCTGGGCTCTAGCAATGGGGAGTATGGGAATAAACACACTCTTTTACTTCTGGCCTCTGAGTCGGGTGTTTTCCATCATGGCTCACAGTGGACTCCCCAAAGCTGGGCAGAAGGTGGGGTAGAAGACAGGGAGCTG s monDom4.chr4 15670888 531 - 430141050 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TCACCACTGGAGGGCAGTGTGAGAGTTCATCTGCAATGAGGCT---TGAGCGAAAG-----CCAGAGTTCCCATGGAAGTTAGTACTAAAA--GACGAAAAAGAAAGAAATGGGCCTGAAGCTCCCATCTTTACAGAGGAAAAATACTTTGTAAAGGGAAGCTCAACACTTCTGCAGCAGCCTGTCATGGACTGGGCTTG----TCTGGTGAAGTCCCTCTATTTAGGTGTCAGAGCATTGCTCTCATGACTAAGAACTTGTTTCTGCCATTGTTCAAGAATGATTCTAGATATTTCCAGGTATTCTAAATGGGCCTAACTCAC-CACACAAATCATGTTGTCTTATTTTTATTTGAACTATGTTTTCCTTTACTTAAAATGTTCATCCCAAATCTATGCAATCTGTTGTAGTATCTGAAGATTGTAAGTGTGACACCTTCACAAAACTAAAAAGCATGAAATTGTTTCAATAGGCGAGCCCTGCCCCAAACCCTCTTGCTAAAGAAGAACTGAATTTCTTGGCCAGATTGATGGGAGGAATGGAAATTAAGAAAACCAGTGGCCCCGAACCAGGATTCCGGTTGAATCTGTTTACCACAGATGAAGAAGAAGAGTATGTTTTATTCTTGTTGGTACTTTAGTGGACCTGTCAGGATAAGTACTCTCCCTCCCTCTAGCCTT a score=4421 s mm8.chr4 125589909 181 + 155029701 AGAAAACAGGTGTCCATGTTCTCATGAGGTGGCTCACCGTACTAGGA-AGAGGAATCATGAACCGTGTAACCTTAGGCCTGTCTCTTCCTGCCTCCT-------GTAGACACGCAGCACTGTCCAGGCCGGAGGAGTTGTCCTATGAAGTCATCAGCATACAGGCTACACAGGTATGTGAGGGGCCTCA s monDom4.chr4 15744651 173 - 430141050 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ACTTCCT--CCTAGACCTTGGGCCAAACACATGTCCACACATGCTTTTTTCCTCATTTCTGCCTTTCCTGTCATTAACAGGACCAGCAAAGGAATGAAGAGCTATCTCGGATCATGGGGGAGTTTGAGGTCCATGATCAGCCCCCACAGAACACCAGCAAAGGTGATGATTTGCTGGCCATGATGGATGAATTGTAACCGTGACCTGGCAAGCCTGAGGTCCCACCTACAGCAGAGACTGCTTAACCATAGCTACCTGAGAC-----CAGTCTAGGACCTTCAGAGATGCTGCTAGTTTTCTACCAAGTGGAGCCTTGATCTATCATACTTGTTTATAGT--GTGACAACTTGTACACACACACTCCCCTTGCTCAGAGCTCTCTCCCAAAGACACCCACCCACACCCACACACACATGCCATTCAGCTAAATTCATTCTGATTTTCAAACTTGCCCTT a score=5185 s mm8.chr4 125594247 248 + 155029701 TGTCATCTGGGACTGGATCTAGGAGATGGGCCAC-CCTTGCCCAGAAACCACGGCCTCCTCCCTCCA-CTCGCCCTGCAGAGATGCGAACTATCTGAAACATACCTGTCCTCCTCTGTAAATAAACAAGAGATACACATCTGTGC--------------TGATGAAGCAATCTCT----GAGTTTCATGCTTCTAGGCCTGCACAAATATTGAGAAAAACAAGTTTATTTGCATGGGAGT---CAGAAA-------------GGGAATAATAAAAAAGAAAATA s monDom4.chr4 15748446 277 - 430141050 TGTCCTCTGGGCC-----CTTGGAGATGAGCCACGAACTGCCAAGAAGAGGTGGCCACATCCCAATAACATACTCCTGAGAAATGCCAGTGATTTCAAACATATCTGTCTTCTTA-GTAAATAAACAAGATAAAAATCTCTAGCCCTAAAGTAGCTCTTTGATGAGGCAATCTTTTGGCGTGTTCCATCTTTCTGGACTCACATAAATACTGAG-AAAGTGAATGTGGTGCAGTGGGACTATCCAGAGACCACAAGAGTACCAGGGGTAAGAAAGAAAAAAAGA a score=1784 s mm8.chr4 125598793 154 + 155029701 AGCCGGAGCCTACAAAGGTGGGAAACTAGACAGAGAAGAGAATTGGGCGTGTGGCGCGCGGCCTCCTGGGACTTGTAGT----CCGCATCCTGCGAGGCGCATGCTCTGATGCTCTGGGTCTTCCGCGGTTGCCATGGCTTCTCTGAGCCTCGGTGGG s monDom4.chr4 15755960 155 - 430141050 AGCAACAACCCGCGTGCGCAGGAGTCGACCGGAAGGAGCAGAAGGACCTGGCGCCGCGAAGCCTTCTGGGACTTGTAGTTTCCTCGCTGCGTTCGCGCGACTGGATCACATGGTCTTGCTTTCCCATAGTCTCC---GCCTCTCTATAGCTCTGGAGG a score=21474 s mm8.chr4 125600085 455 + 155029701 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mm8.chr4 125604442 465 + 155029701 TGTAGTCTGAAGAAGCTCCTGGGGGTGAGGTCTCCCCT--CCTTCTGTGATAGTC----------CAATCTGCCTATCTCTTTTCAAGAAGCCATCTTGAGCTGTTGTGACAGGTGTCATTTTGTTATGGCA-GCACCATCTG---CCAGTGAGCCAGAGTTGG---AGAGCCAGCAGGAGACTGTCACCACCCATGTATGTCCCAGAGATCCATGAGTTGGTGTCCTGATGACAGTTTTTTTTTTTT----------------------TTTAATCTCCT-----CTGGCTGGCACTTTCTCCTCCTCTGCTTT----GTTAAAACTTCTATATTTTGAGTCAGCTG---------------AGAGCCTACCAGGA---GTTGGA-ATGGTGGTGTCAGCGCCCAGTGATTCATCTTACTGGTAATTAGTGAACTGGAAAACCCAAGATTCATCCCTGTCAAAGGCAGGGCTTCCGGAATCCTTTTTCTCCTCACTTTGTCAGAGAGAGGAGCAAAGTGGGCCGGCCTTCTGG s monDom4.chr4 15763593 511 - 430141050 TGCAGGGGGAAGGAGC--CTGGCGGCTCCCTCGCCCCCTCCCTTCTGTGACAGCCAGCAGCTGCTCAGGGAGCCTGTGCCTCGGCAGCCAGCCGTCTCAAGCTGTTGTGACAGGCGTCATTTTGTTGTGGCAGGTACTGTCTGCATCCCCGGAGCAGGAGATGGGGCGGAGAGGGTGCGTGTGTGTCTTGTCACACCCATCTCCCC-ACATCCA--------CGTCCTGCTGACAGGGCTCCATTCCTCCTCCCAGGCTGGCGCCCTTGGCTTGGCTTTCTAGGCACGGGCCGGCCTTCTCTTTTCCTCTCTCCTCGGCCCCCATACTGCCTCACCTTTAATCAGCTAAATAAGGGGGGAGGTAGAACATTGGAGGACAGGCGGGAGATGAGAGTGTCAGTGTCAAAGGGAAGA------AGATAACGAGTCCTTTGGAAAATCCGAAATCATACCATGTCAGGAACCA---TTCCAGGGAC---TTTCCAATATCTCAGCCACATCTTGAGGCAAGGCGTGAGGCCTCTCTGG a score=7047 s mm8.chr4 125605578 129 + 155029701 TGAGTCACC-AGACTGATGCAATCCCTTTAAAGGGCTCATCTGCTGGTGCAAGAAGCTGATTCATGGAGGGCGTGGCTGCTG----AAGGAGGAGAAAGGACG---GAAACTG--GCAGGAGGGAGTGAGG-TAGACAGC s monDom4.chr4 15766352 140 - 430141050 TGAGTCACCTAGCATGATGCAATCTCTTTAAAGGCCCCATCTGCTGCTGCAAGGAGCTGATTCACGGCGGGTGTGGTTGCTGACACAAGGAGGGAAATAGGCTGCCGAAACTGCAGCAGGAGGGACTGAGGTTAGACAGC a score=8746 s mm8.chr4 125625763 380 + 155029701 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TCTCTTTCTTCAAAGAACCCACAGGATAACCATCACCAACTTCTGTCTTGGAAAGCACCTTGTGAGTGAGGATGATTTGCTGAAGGATCAGAGAGGAAGCCCTGCATATATCAGCCCAGACGTGCTCAGTGGTATGTG a score=16316 s mm8.chr4 125638920 701 + 155029701 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s monDom4.chr4 16022411 2190 - 430141050 AGGAGGTGGGGGGCGGGAGCCCCAGCGAAGTCTGGGGGCCATTTCCAGGACTGCGAGCTGAGGACATTTGTGGGTAGTCGTGACGGCAGATTGGCGAAGAATCCCTGGGAGTAACAGG-----CCCTAAATCGGGGGAGACTGGTTCCTAGGCAAGCACATCCCGAAGGCTTCAGTGGCCTTGGCTAGAGGAAGGGAAAGCGGCAgccgcgcggcgggggggagggggggcgcAGCTGTCAGAAGATGC--CACTGAACTGGAGCC------ACGGCCGCAGCTTTTATTTTTAAAACTCCCCACTCCCTAGCAGTCTCGGGCTGAGATGGGGGCGGGAGGAGAGCGGAGGACTCCACGCCCAAGGCGGGCGCCCCCCACCCCCATCCTAGGCCTCCT---GGCCACGCAGCCCACCCAGGGCCTCCCGCCCTGCTGGAAGACTGAGGTCCATCGCCCGAGCCCCAATCCCTAGGCAAATCCGGCGGGTACCTTGAGGGGCGCTGGGGTCCGGCTCCTGGTGCTGGCCCTGGTCCATGGCTGCTGGGCGACGGGGTGGGGTCTGCTCCACTGCGGAACGCCTAGAGATCTCAGCCGCGGAGGCGGCGCCGGTCCGAGCTCGGTGCTTCCCCCACCCCCGTGGCTTCTGGGGGGATAGGACGGTTCATCCCGCCTTGGCTTCCTTtcttcttcttcctcctcctcctcctcttcctcttcTGGAGCTCAGGGGGATGGGTCTCACCCGCACC-----TCCAAATGCAAGCGATTAGGACCCGGGGCCCCCGGTGCAGCTGGCGAGGCCGAGGTccgcgggcgccgggctctcggggcggggcggtgggggtggggggcggcgACGGCCTCAACAGCTGCCCAGTCCCGGCCCGGCCCCGGCCACGGCCCCAGAGCTATTGTACAGATTCCCGGCTCCGGCCCCGGTCTCTCAGCTGGCCTGTACCAAGTGTGTCAATGAGGGGAGAACAGGCCCCCC---------GTTTTTACCCAGCACAGGTGGGTTGAAGGTGTAGCCTTTACTGCTCCGCTTTTAGCAGGGCAGAGAATACTCACAGTGCGAGTACCCCTCTTTACGTGAGGAAAAGAGAGAGGCAAAAAGGGCTTGAGGAAGGGCTTTGG--GGACCTCTCTCCCCTGCAACCGTAGTTTGGTATCGGCCGTCAGAGTGTGGAGACTATGTAGGGAGAGTTGTGAGAGAAGCTGGTGACTCACCACCCCCGGGAAGGGGGGGCACGTGGGCTCCCAACCCCCGCCCCCCCACTCCCAGTCCTCTAGCCAACATGAGAGGGTTGCGGGCCTGGGGTTATAGGAGGGAGCGGTCCAGACGCCACCCCTAGTCCTGAGAAAAAATAAAATCCCAATCGAATATGCCGCTCCCCCTCCCTC------CCCCCTCCTAA-----CCTCAGTGGGCCA----------TTGGGGGAGGGGGATACCAGGAGCTCTCCTCCCC----------AGGCTGCTTCTCTGCCTGTTGCTGGCTCTGGGCTAGACACAGGCAGGGCCCTG--AGGCTCAGCTTCCTTGTCCTAAAACCAGTTGCACACCCCCAGCCCTAAATTCCTTCAATGCCCTAAGGGGTGCCTAG--------TAAACTCAGGCAGATGCTCTGACCCTTTCCCTCCCCCTCCTCCTTCTGGAA----------CTCGTAGGCCCATTCAGGGTCACATCTGTCTCTGCTCCCAATAGTCCCTCCTCCCC-------CTCCTGACCCTGTGGTCTCCTCTGCCTTCCCCTCCATCAGCATCCCCACCCCCTGCTCCCCAGGCCCACAGAGGGAGCTCTGCAGGGGCCAGGAGCCAAGTCCACCGTCCCAGACATTGGACAGAAGACA-GGAGCTTGCTCGGAAAGGTGGATCGATGGAGCTGCAGGGCCTGGTGAGAGATGGAAGCAAGAGAGGGAGGGAATAAAAGAGGAAAGGAAGGGTTTGAGGAGATGGGAGGATAAGACCAGATCTTGCCCACTCTTGGCTTTGCCCTTTGTCCTGACCCGGAGAGGTTCAGGTTGCTGGCTCTTCCATTGTCCAGGGATTAGCCCCTGGCCCAGATGTGAGGCCCCCCCTCTGGGGATCAGATCTCTCCCTGCTGGCTGCTTCCTGAGCTCTGAGCGGACAGACCATCTTCCCTGAAGGTCACTTTCCAGAAGCAGTAGGGCAGTCGGGGAGCCCGGCACCCCGGTACAACAGACTAAAATTCATGCTTTTGGTAACCCGGAAGGAA 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CATTTTTCCTTTCT---TCATAGGTCCAGATGGCAGTGGATGTGAAATTTGTACAGGATACACTGAAAGGAGATGGGGTAACAGAAATCAGGATGCGGTTTATCAAGCGGATTGAGGACAATCTCCCAGCTGGAGAAGAATAACCATTTTGGGACCAATGGAGTTGACCAGCTAGGGCACTTGCTAATTCTCAACCCTCCCCTGGGGTTCTAAAGCCAAAGTGCCCCCACCTTAG-----AGAACTCAGTGACTCTTTAA--GATGTTATATATTCTTCTAATCTTGTTTCCATTTTCCATGCTAATAAAAAACAGACTTGTGTGATATATTCCATTTATCCCACAAGTGTGTGCTTCTGATCTCACTCTACACAGTAGGTACTTATCTCATATTCCAGAGACAGTTCTTCTTTCTGTCTCCTCTTCCCCTAACTAGTAGGATGGAAACTTCTTCACGTCTTGGATCTGAAGGAGCTCAAGCTAACTTTACATTCCTGATTGAATTTTCCAAAGCAAAACCTTCTTTGACCCGATTGGGAGA-AAGCTTGGCGCATCTGTCCATTCTTATAACTTCTGTGCCCTCATGAGAGTCATCAGCAA--------------------------GCTGGGTGGGCGGGCACCTGGAAGGGGAGGAGGTGCTCAATCCTTGGTGACGAGCAATGATGCTG------GCCAGG-AAAGACAGCCAGCAATGCAGGAAACGTTGACTTCTGGGAACACACCCAGGTATTTGTCTTCTGTTCTGCTCTGCTGTTTGGAGGCAATAAGCCCTCTTTTTACAGAGGGTCCATCTTTTATATATACATATATATATAAACTCCTCAATAAAGACACATTCATAAGTTAAATCCCAGACACATCCATTTCCTAATGCTCTCTGCTCAGC a score=5753 s mm8.chr4 125780721 710 + 155029701 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tgcaggtggtagtgaggtggtggtgagcactgatgtgggtgctgggcacagaactcagttcctctg---taagagctg--caagcactcttaactgctaggccacctctccggcccACCTCATGACTTAACATCACATACTGTACAGCTCAATATTCTGCAGTTCATTTAACCATGAGCAGAGCAATGAAGGCTCACATAGCCAGAGGAAGATTTAAAAAGCAAAATCCACTGATGCATCAGTTTTG--CTTTGACAAACTTATAACTTC--AGCTGTTCAC-CTTCAGAAC--------TAGATATCACATCATAAACTTAGTATTTGGTAGA----CTTATGGCAGCCAACCTGTCTGAACTGTCCTTCTGAAACACCATCCCGATAGAAGATTATACGAGTAGGTTTGAATCGGGTTGATTTATAAAATTGGATGAGCAGTTCCCGGACCATGGAGGCCAAGTCCTGGATGATTTCCTGTCGGGGTCTCTGAACTCTTACTGTGGCACAGTATCTGCTTGGATGGGCATCCATACTACCTACAACCT--AGTGGGGAAAAATGAGAAAAAATTAATCAAA s monDom4.chr4 16190924 564 - 430141050 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catacactcagacgtatacacatatatttaaaataaaTATTTTTAAAAGAAAAAGTAGTGTCTATCACATCTTTGCTTTGATTTAGTTGTTAATGTTTGCTTGTAATATTAAGCATTAACCATACATAATAAATAAAGCGTGCGATGTTTTCTCTGGTGTATGAGGactcactcatttaacaaatgtttattagctacaggctgtgtacctgtctgtcattgaacaagacagaagtactcctgccttcatagagtttataATAC----ATAAAATATTTGTGAATAGGTGAATTGTATACTGTTTCACTCATCACACCACAAGAAGTCACGCTTGTGTAA-GTTGTTGAATAC-----AAGAACTATAGAAACTTAGAGCTATTAACTTTTGTGTAGAAC-----------CATTCAGAATAGCACACAAATG----AATTACTTAGAAT-TGATCTAACTTCAGGA---AAACAGTGACAACATACAAAAATTTGTTTGAAAGTTAAAGAAAAAACTAAGAAACTAGATAAGTCAAAAAGTCTTAGCTGGAGCTTTGTCAGAG---TTTCTGAAAGTGCA-GTTGTCACACAGATGTATTGACTTAATTAGTC--GATAACACCGCTCAGTTATGCTTCAGCATCTCACACATGCACAAGTTGGTAACTCGAAGTCACACAATA-TTTGTGAGTTATCTTCTATACCACAAGTTTTAGTGTCTGACTACCAACTTCTCTGAGTGTATATAAGATGCTTAAGCATAAATAAATTATATTATGTAGCTCAAGTGAGAAACACAGTTGCTTCCGAACTTGTGTTTG------------CATGGGGTTTCTTATAAAATCTTCTGGTGATATGGATTCCTAATATACCATACA-ACTTTGTAAAACTGTTTTGGTT----------------AATTGTCCTAAGGGTATTC--TAGCTGCATGGAGTTGGGAAGAGTGAGCTATATATATACTTGG---AGAAAAGATTAAACTT-----ACTCTGTGATAGGTAAGAAGTTTATCATGCcaggtggcagaagcaggcagatctttgtgagttcaaggccagcctggtctacagaatgtg-------ttccaggacagctaaagctacacagagaaaccctgtctgggaacaccccaaaagaaaaagaAAAGAAAGAAATTGTATCATACATGCTCTTGGAGAAGAATGCTAATTGAAGACACTTGGCTATTCTTTATCTCCCTATCCCCAATTTGTCTCCTAATTTTAACTATAAGAACATCACAATATTCTATGTCTGTGAGAATTTGTAGTACTGTTCTCACACTTTATATATGTTT--TTATTTTTATCTTT---AGCTAACTTAAGCAGAGCTTTTGTTGTT 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TCAGTTTCACTTGCTGATGAGTGACTTTGAAAGATGATGTAATCCTATGTTTAAAGAAACTGGTGCTCTGACTTCTACAGGGGGAAAAAAAAAACACCTCTTGCCAGCCTCTGCTCCCTAGGTGGTACTGGCTGGTCCTGGCATCATTGCAGATACAGCCCCATCTGCTGTAGAGTAGAACTAAATTACACTTGAGAGGCGATTAGAAAAGAGTAATGGAGCTGAAAAGTCCTGTTTCCCAGAGTC-----------------------------------------------------------------AGCCGAGTGAGGCAGAGAGGGAAGAAGAGGGGGAAAGCAG a score=4156 s mm8.chr4 126340533 194 + 155029701 gcaaaaagcaaagcaTGCCTGT-GTTACTGCTCT-TCAGAGACTTTGGTTTTCAGTTAAGTTAGCCAAAGATCAAAGACTGCAGCCAAAAATTACTCTTTTTAAGTTGTAATTACCT-ATTTGAGCTATTCCTGA-TTGTACAATTTCTTTCAGCTTTTATGAACCATAGAAAATGGAATTTAACTTGTATCCAGAGT s monDom4.chr4 16981787 196 - 430141050 GCAAAATGAAAGCCTTGTTTTCCATTATTGTTGTCTTAAAAACACCATTTATCACTTATGTTAGCCAGAGGCAAAGGACACTGATCAAAAAAAAGGCTAATTAAACTGGAATTGTTTAATCAGAACCATTCCTGGCCTCCACCATTTCTTTTAACTATTA--AACCACAACAAACAGAACTCAGATTATGTGCAGGAT a score=12304 s mm8.chr4 126341482 614 + 155029701 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GTTGGTTTCACTGCAGTCCAGTCTTTGCTTTGATGCCTTACAAACAAGGAGTGATTTGACTCT-GGCTGACTGCAGTGACATCTGCTGTCAGACTTTATAGTGGCTGCTTCAGACCAGGCT a score=24613 s mm8.chr4 126342934 1029 + 155029701 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s monDom4.chr4 16986451 1060 - 430141050 TTTCTTTTTGTATAGAAATGAACAAGCCACCTGTGGCCAAGATAGTTGGGAATGTAGTAATAACTCTGCCCACTAACACAGCTGAACTGGATGGATCCAGGTCTTCTGATGACAAGGGCATAGTCAGTTACCTCTGGACTAGGGATGAAGGAAGCCCAGCAGCAGGAGTAAGTATTCTGGTAATTTGATGTAAAGTGGTAAAGATATAGGGCCAAAATTTGGGTTCTGtcagcaagtatttattaaatgtctgttatatgctatgca-----ctttaccagATATACCTCATGCT--AAACTTAAAGGA------CCATAGTTCAT-----AATTTCTTTATT------------TTTCCTGATAATCCATTGAGAATTCACATCAGGAATTGATCTGAAT-TGAAGTAGGAGGGCTTAGTGTGATACATAATAGTCAGTACTGTAGGGATCTTAAGAAAGAAGTGATGTTGTTTTTTTCCCCCCAAAATGTCACCTATATTATTCCAACCCACAGGAAGTATTAAATCATTCTGACCATCACCCCATTCTATTCCTCTCCAACCTGGTGGAAGGGACTTACACATTTCACCTAAGAGTGACTGATGCAAAGGGTGAGAGTGATACAGACCGTACTACTGTGGATGTGAAGCCCGGTGAGTCTTTC---TAAGGCCC--------AAGGGAGCA-GTTAGCTTTCACCTTGAGGACAGTCCTTTTCCCCCGAGCATGGTCAGGGCTAGGTA--TGATATCTCGGGTCTTACTGTCCAGTAGGTAGGATGGTTAGATGAATTTCAACACAGGAACATGGGGAGCTTGAGTCATGATGCTTCATCAGAGCCCAGATGCAGAAAACAATTTATTTTTATAAGTTGAGCCCGAGGCTTTATATGACAGCTCACTGAAGGTAAAATAA--CTGGCATCCTTTAAGTTAGCAGATTTGCAGAAATGAAATGTCCTTCTTAAATAGAGCTTTGTGGCTTTTGTTTTGCTTCAAGGCTAATTTGCACTGTAGTTCTGGAGAAGGGGGAAGGACTTATTAGGGCCTTTG--CATTCAAGAGCAT----------CTGGTAAGGATGGAATGGTGACAGCCCACTCTTG 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CTGGCCTCCACCACAG-------CATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGT-TCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCACCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCAGGATTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGCCTCCACCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCAGGATTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGCCTCCACCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCAGGATTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGCCTCCACCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCAGGATTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCACCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCACCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCCATCACAGCATCTTCCTGGGTTCTGGTCTCC s monDom4.chr7 174868907 856 + 262624689 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tttctctctttcttt------cttttcttt--------ctttccttctctctttctctcctttctttccttctc--------tctttccttttctctctttctttctcttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttTTCTTTCAATAtttcttcctccctctctccctccctccctctctctttc-ctttttcttccttttttctcttcttactttccttctatttcctctctttctttctcttccttcctttcttttctttcaatctttcttccttccttcctctctccctccttccctccctctctctccctctccatttccatctccctctccctctctctttctctctccctttccttctccccaccctctgtctctgtctctgtcttgtctctgtttctgtgtgtgtgtgtctctctctctctgtctctctcactctctctctgtttctctctgtctctctctttctctctgtctgtctgtctgtctgtctctctTTgtggaacaa----tgggtagagtactggact a score=4874 s mm8.chr4 127142343 418 + 155029701 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mm8.chr4 127561243 387 + 155029701 TTTTGCCCTTTCTCTCTTCCAGGCCAGAACTGCACATTCCACCTTCAGGGTCCCAATGGCACAGTGGAGAGCCCAGGGTTCCCTTACGGCTACCCGAACTACGCCAACTGCACGTGGACCATCACCGCGGAGGACCAGCACAGGATCCAGCTCGTGTTCCAGTCCTTTGCATTAGAGGAGGACTTTGATGTCCTATCAGTGTTTGATGGCCCACCCCAGGCAGAGAACCTTCGAACAAGGTACCATTCTCTTCCCTCCTTCCTGCTGCAAGCTGCTGTGCCTGAGCCAATCCTGGCGAACAGAGGGAATCTGCTTTGTTATTTATGTTTGCATCA-GCTTGTATTAATTACA----TATATCACAAT-GCGTATAATAAGTTTTGTTCATAAA s monDom4.chr1 193875078 370 - 748055161 TTTTGTTTTTTAATTTTTTCAGGTCAGAACTGTGGAGGATTAGTCCAAGGTCCCAATGGAACTATTGAAAGTCCAGGATTTCCTCATGGCTACCCAAATTATGCCAACTGCACATGGATCATTATCACTGGAGAACGGAATAGGATACAATTGTCATTTCATACATTTGCTCTTGAAGAGGATTTTGATATTTTATCCATTTATGATGGACAACCACAACAGGGCAATTTAAAAGTCAGGTAATGTACACCT----------------ATATTTCCACATTTGGTGCCATCCTTTGGAA------AGCTCTGTGCTGTTACTT-TTTTTGCTTCATGTTAACAATAATCAGAATTTTCTTTTAAAATAACCTATAAGAAGTTTCCTTTGTAAA a score=2025 s mm8.chr4 127569743 64 + 155029701 AAGGCAGCGTCTGGCTGCTTGAAATTAAATTTACAATAGAAGCTGATCAGTTTCTTCTCATAAT s monDom4.chr4 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AGGACTGGGGAGCACAATGATTGAATGG--GAAGACATGAAGCTGGTG------------GTCACCTGTCCCTCTTTT------TGTTTCAGCACCCTGTGGGGGCCAGTATGTGGGTTCCGATGGAGTTGTGTTATCCCCCAACTACCCTCAAAATTATACACGTGGACAAGTCTGCCTGTATTTTATCATGGTGCCAAAGGACTATGGTATG------------------TCTCTTCTATGGTCTACTCACTTTTATCTGAAAGTTAGAAACTCCATAGT----CCTAGCTGAA---------AGTCCAAGGAAGAAAATG-CATAGGATGTGACCCAGAAGATGCCTTTCAGGC a score=8545 s mm8.chr4 127968641 266 + 155029701 GCCTGCCAATCCTCTGCACTGAGATTCCCATG--CTATGTCTCCTCCACAGTGGTGTTCGGCCAGTTTGCCTTCTTCCACACGGCCCTCAATGACATCGTGGAGGTACACGACGGCTACAGCCAGCACTCCCGGCTCCTCAGCTCCCTCTCAGGCTCTCACACAGGTACC------CAGGGCCAGTGAGGGATTGGGATGGGATGGGATGGGTGGAGGTGGTGGGAAGGGGAACATGGGCCATCCCAGGACTGTAGCTGACAATGAGGCCCTGT s monDom4.chr4 19226622 269 - 430141050 GCCTTCCTACTC-ATATGCTGAGTTCTACCTGACCTCTATTTCCTCTGCAGTGGTATTTGGCCAGTTTGCCTTCTTTCATACAGCCCTCAATGATGTAGTGGAAGTTCATGATGGACATAATCAGCACTCAAGGCTCCTCAGCTCCCTTTCTGGCTCCCACACAGGTACTGGATAATATAGCTAAGAAGGGGAGAGAA--GCCTTGAAAGGGGGAAATAAGAGGTGAAAGGGCCAAGGTTTATCCTAAAG--GGAATTTAAAATACAGTTCTGT a 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TCCCCCTCCCAGGTGCTCACATCCAGTTTTTGAACTTCTCCACGGAGCCCAACCACGACTTCTTAGAAATCCGGAGCGGCCCCTCCGAGACCAGCCGCATGATGGGAAGGTTCAGCGGGAGTGAGCTGCCTGGATCCCTGCTCTCCACGTCCCACGATAGCATCGTGTACTTCCACAGCGACCATTCCCAGAACCGGCCAGGATTCAAGCTGGAGTACCAGGGTAAGAACAAGAGTG-------CCACAGTAGCTCACTGCCAACCCTGTGTCTGACCCACAGTCACCCACCTCCCTCGTCTTA s monDom4.chr4 19309535 303 - 430141050 TCCTTTTCTTAGGAGCACATATACAATTCTTGAACTTCTCCACTGAGCCCAACCATGACTTCATTGAAATTCGGAATGGTCCTTATGAAACTAGCCATGTGATAGGAAAGTTCAGTGGGAATGATTTGCCAGGCTCTCTGCTCTCAACATCCCATGAAACAACAGTCTATTTTCACAGTGACCACTCTCAGAATCGTCCAGGATTTAAGCTGGAATATCAAGGTAA-AATGAGAATAAATGAATCTTCCCTCTCTTCTCTATTACCCTATGCTTTGACCTTTCTTGTCCCCTTTCCTCTTCCCA a score=15242 s mm8.chr4 127995474 300 + 155029701 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s monDom4.chr4 425319213 987 + 430141050 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s monDom4.chr4 425355353 1180 + 430141050 AGAGCTCCTC-----------------CCTCTTTCTGA-CACCAGAGTCCACTGG---------------------------CCTGCCCCCCACCCTACCCAGCCCTGGTCCCAGCCCCAGCCCAGAGCAGACAGGAATGTCAGGAGAGGTAGAGGA-AGATTCTCATCCTAGCCAGCACTGGAGGTAGACTGGGGCCTTCTCTACTGGAGTCTCAGAGGAGTCACAGGGCCCAGGGAGCACCATTGTCAGAGGGAGGGGAGGGCCACTCTTAGGACCAGGCAGC-GGAGGCCAAAGCCCCCTCTCAGTCTCCTATGGCCCCCTCTCCCCTCCCCTCCCCAGGCCCTGAAT---GGAAGTCCCAG-AGATGTTGGG-----GGCTCACGGAGGTCCGTGCTAGGGCCCTGCCTGGGCCATAGGCCTTTGGGCTCTGGGGGAGGCAAAACCGGGACCCTGCATTTGGGCTCCGATCCCAGCTCCTCTCCCCTAGCTCCAGGCTCCCTTCCTGCCAGCTCCAGCTCTGGCCCTAGACTCCGGAGTCCAGCCCATTCAGAGGCTACAGTTGTCCCTTGGGTCCAGGGGGCCCCTGGGGCACTTCCGTGAGGTCTCTGCCATCTCCCCTGCTCCCCTGGGCACGGCCCAGCGGAAGGCGGGAGGCCCCCACCCCG-----TGGTTCTCCGTGTCCATCTGTCCAATTTTCCTTTTGATTTTTCCATTTTAGCAGCACCAACTTCTTGGCCAATAAATATGTTTTGTTGTTATTTTTTAAAAAGGAAGCAGAAAGAAGAGAAAACAAAGAAAAACCAACCCAATGAAGGGAGGGGATGAACTAAAGACAACCCAACAGAGAGAGGTTCAAAGTGCTCTGAAATCGTCTTTGGATGTCACCA-AACTGTCCAAAATCCCCCTGCGGCCTTTCCTGCC-GCAGCCGGCCAGA-----CTTCCG-------AGCCTCGTAGCAGTTAATTGGACTGAACTGAACTGGC--GCTCCTTCCTGGAGCCGGCCCGGGGCGGGGGAGCTCGGGGGTGGGGTGTTCTGATTGGTGGTTTCTGTGCCCGCCGGGGGAGGCTGGGGGGCGGGGACACGCAGAGCTGAGGGGGCCCTGGGTTCAGATGAGCGAGATCCGCACAGGGATGCCGGGAGACTCCGTCCTTTGGGGTGAATGGTGGGTGACCAGGTGCTCCACCACAGTGTGTTTGGACATGTGCTTCATCAAATATGTCTCCTGGGGGGGGAGAGA 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CCACCCTGTGGCCACTGCTGACAACTGCACCTTCCCTCG---------CATCCCCGCACCTGGAAAGGCCCCCTCTGCCTCCAGGCACCGGGCAGCTACCAGGCCTCGGGCAAGGCAAGGAAAAGAGAG---GGCCGCTTCCAG-------ATAGAGCCCCAACCGGTCTGACCCTGCAGCCCAGCTCCAGGGCGTCCATCCCCGCCTTCTGGCCATGCCCCAGGCCCCACTCACCGAGGTGTAGGCACGCCCGCACATGCTGCAGCAGTAGGCCTTGGCGTGTTTGATGGCATGGGCGGAGAGGTGGATCTGCAGGGACGCGGAGTCTGTGTATGCCCGGTAACAGTTCGGACACTTGTACGGTTTATCTTTATTGTGCTGTCGCTGGTGAGACTG---AGGGGAAGGCGAGAGTGTGGTGAgg----gccccgcccccgcgccccggccccgccccccgcgTCCTCCAA---TGCCTCCCCCTCCCCTCCTCTGGGCACCACGGCAGGGGGCGCTGACCTGGAGGTTGGAGAGCTGGGTAAAAGCCTTTTCACAGCCGGGATGTGGGCACTTGTAGGGTCTGTCTCCAGTGTGAATTCTGCAATGGCACCCCGGGCACAGAATGAGGTGGGCGCTGGGTACCGGCAGGCCCCAAGGCAG--ACTGCCTCCA a score=18866 s mm8.chr4 128288166 452 + 155029701 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GCTCAGGCCCT-GGCCCCTCCCTGGCCCCCCACCCATTCCAGGCCCCCCC-------TTACCCGTGACGGTGCTGGTGGCGGGCCGGGCGTGCAGGGCCACGTCGGGCTGGGGTACGGCCTGCGGGTGCAGCCCCGGCACCTGCTGCAGCTTGGGCAAGGACATGATGGACTGGCTGCTTTCGGCCGGGGATGGGGGGACCAGCAGGGGCTGCTGAGAGGAGACGGACGTGGGCGGCAGGTGTGGGGGCCGGATCTTCTCTGCCATCAGCTGCTCCTTGATTTTGTTGATCAATACCAAGTTGTCCAGCTGGAAAGGGCAGACG---CAGGGCTGAGGGGGAGCCCCGGCATCCAGCCCACTCTAGACCCTCTCCCGCCGGGCTTGGGGTTCTGGTGGTTTTGTCTGCCTGTCCTGCAGCCTG-TGCCCAAGATGAACCCCCTCCCCCCAGTGGGCCACAGCCAGTGCCCCAGACTGCCCAGGTAGGTGTGAAGCCAGCTGGGGCAGGGGCAGGAGGAGGAGAAAAGCTCTTACCTGGCTGGGCATGGTGGGAGGAGGGGGCCAGAAGTAGGGGTTGTTAAAACGAGGTTCGGCCATCCTGCAGGGAGAGAGAG--ACTGTCA----CAGGGAAGATATCCTCCTCATTGGCCCCTGACCCCCTCCCAGGGTGCCTCAGC-----GGCCCCGACAGGGAGGGAGCCACCCCCAGCCTCTTAGGCTCCTTCTGGAAA--CAGGTGCCAGGGAGCTTCAGGGATGTTCTTCCAAG a score=33746 s mm8.chr4 128307168 1539 + 155029701 CACACAGCTCCTAA----------AGGATCCACAC------TGCTGGAGGACAGGGTGGCAAGAAGGGTCATGTCCTCATGACAGGGATCTTAGCTCCAAACCCTGGGCCCACTTTATGCCCCTAGAGCCAGCCAACTCCCCCAAAT--CTGGGGCTACAATATAGTTCCTTACAATACCACTTTGATACAGAGC-----CTCGTCCAAACGACTCCTCCCAAAACCTCTCACCTCAGCCCTacacacacacacacacacacacacacac----------acacacacacacacacGACATC--CCCACCCACGCAGTTCTGGGGAAACCGGCAGTTAACTTTTCCCAAAAA------CCCTGCAAAGGCG-----------ACTAGCTAGGTGGGAAGAAACAGAGAAA------TGGGCCCCCATATCCTTTCGCG----GCATCTCAGGGCCCT--CAGGGGaagaaaaaaaaaat---cttaaaaaaaaaaaaaagcaagaaagaaaagaaaaCTT---------------------TCAGAGTTAACTTTAAATTCCCAGCCCCCTCCC---CCCAAATCACCCGGCAGCTTCTCTCCCCCTTATTTTTTCCTTTAAAGTGTAATTGTATTGTGTCTCACCTCCCCGAAAGGCTCC--------CGGCTC----TCTCCAAAGAAAAGGAAAAAAGCCAACCC------TTCGGGTGCCCCCTCTGCTTCCAGCCGCCTCTCCCACATTCTCAGACAGTTTTATTAAAATCTTCAGACAAAAGAAAAACAAAAATGGCAGCCTGGCTTATTTTTAAAACAGGACAGGGACGCCATATTCTGCAGATCTGCAAAAAAACGGAGAAATCCGGCACTGGCCGCTCCACCGG---GCCGGCTGCAAAGTGCGCGAACCGCGCCGTTTGCAATCCGTTTATTTGCATTAAGCCCCATGAATCATTGTTTACCGGAGAATTGC-AGCAGGTTTGAATAGCCCGGCTTAGGAAAACACACACGCACACACTCGGAGACGAACCCCAGACACGCCGCGGGAGACGCTGCCTAccccgcgcg--cgcagccgccg---cag---------------ccacggccgccccggggcc-------------------------cggcccgaggcaccggcg---------------------------------acccccgggcccacgcagcgcggccgccccgcgctgacagcg----------ctcgcgcccgcccggcccccgccccgcAACTCGGCGCAACTTT---------------cccgcgggcgggcccg------------------------------ctcccccgcgc----------gccccgggcccgcACGGACCTGGCAGTGCTGGC------GGCGCTCCGGG----------------ACGCGGCCGCAGCCCCGA--------------------GCCCGGCGGCCCGAGTAGGGCCGGGCTGGGGGCTCCCGGCTTcggcggtggcgg-----cggtggcggcggcgcgcggcTGGGGCTCGGT--------------GCGGAGCGGC----GCGCAAACCTTCCGGGTCGCCTGCTGTTCACTTCTGGGTTCTGCAggcgcc---------gcggcggcggaggccggc------------------------------tgtgcagccgcgcggccccggcgcgctggg---ccccgcgagcgagccgcgtc-------------------------------------cggccccccgcctct---cggctgcgcagcccgcccggccccggggctccggcgagtgggcagcgcccggc---------------------gctggcgacggcgaggggagggggccggc--ggggcggggacgggccgcgcgctgggggcccccgctcg s monDom4.chr4 425384094 1910 + 430141050 CATCCAGCCCCTTAGCACCCTGCCAGGATCCCCACAAGGGTTGCTGGA----AAGGATGCAAGAGC-------CCCATATGAAGGAGA-CATAGCTCTAACCTAAGTG---GCTCCATGCC---GGTCACAGCCCATTCATGCAGACTCCTGGAGAGATGGTGCAA------GCACCACCACCTGGGCCAGGGGCAGCCTCTCCATCCAGAAATCCTTCCCCAGCTCCTTCATCACCCCCCAACCCCCCACCCCACTCCAGGAATGACACTGGGGAGGGGGCATTTCCTCCCAAACGGCGTCTCCCCGCTCCCCCAAACACTCGCACCCCCCCAGGCATTCCCTCCGGAGGAGCAGCCCCCTCCACGAGCACCATCTTCCCCACGAAATAACCGTTAAGAAGCAAACCCACCCACTTGGGTCTCCTTACATTCTAGCTTTTTGTCTCACCCGCCCCCGCCAGGGGGGGAAATTAAAAGCTCCCCTCAACAACAACAACAACAAAAAAGGCAAAAAAAAATCCCCAAGCCCCAAACTTTGGGTCCGAGTTAACTTTACCCCCGCGGCGGGCAGCCGGGCCCCGATCGCGGGGCTGCTTCCTT---------TTTTCTCTTTCAAGTGCAATTACATTGTGTCTTGA-GCCCCGCGAGGCTCCAGCACACACAGCCCAAAAGTGCCAAAGAAAAGCAAAAAAAAAAAGCCGTGGCTTTGGGGGGCCCTCTTCGCCTCCAGTCGCCTCTCCCACATTCTCAGACAGTTTTATTAAAATTTTCAGACAAAAGAAAAACAAAAATGGCAGCCTGGCTTATTTTTAAAACAGGACAGGGACGCCATATTCTGCAGATCTGCAAAAAAAGGGAGAAATCCGGCGCTGGCCACCCAGCCGGCGCGGCGGCCGCTGCGCGCGAGCCCCGCTCCATTTGCAATCAGTTTATTTGCATTAAGCCCCATGAATCATTGTTTACCGGAGAATTGCGAGCAGGTTTGAATAGCCCGGCTTTAAAAAAAAAAAA---AAAGAGCCGGAGACACTTCCT-------CCCCCCGAGAGCCTGCCAGCCGCGAGCTGCTGCAGCCGCCGGCCCAGAGCCGGAGCTGAAGCCCGAGTCGGGTCCGGGGCTGCCGGGGGTAGTGGCCCCACATAAGCGACGCGAGTCACGGGCGCTTTCAGGCGCGATCGTGGACCAGAGATCCCGCAGCCCCAGGCCTGCCCCGGGC--CCGGCCCCGGCTGACAGCGGGTccccctccccacgcc--cccgccccgggccccgcaactccgcgcaacttttgctccaggcgcccgccctcgggccggcccgggcccggcctctgtctgtccgtgcgtccgtcccgcccgcgccccggccccggccccggccccGCACAGACCTGGCTCCGCTTGCTCGCGGGCAGCTCCGGGGATGCAACGAGAGCCCGcgccgcctccgcctccgctcgtgcctccgccggggccgccccgctgcccg---ccggccgccct---gcctcccgcctccgccgcggccgGCCGGCCGAGGAGGGCTGGGCTCGGGCTGGGCTCCGCTTCGCTCCGCTCCGGCGGGGAAGCCCGAGCTCAAACCTTCCGGGTCGCCTGCTGTTCACTTCTGGGGGCTGCAGGCGCCGCTACCGCGGCGGCGGCCGAGGCTGGAGGAggcgggcggcgggcaggcggcgggcggcgggcAGGCTCGCAGGCTCGCTCCCCTCGGCTCCTCCGCCAGCCAgccccgctccgggggcgctccccgccgtgtccccgggggccggcgcgggcccccgccTCTCCCCGGCTCCGCTGCGCTCCTGCCCCGGGGGCTCCCGAGAATGGGCAGcgcccgcccgccagcccgcccgcccgccagcccgcG-CTGCAgggggagggggcgggctgggggcgggaggggggcgcgggcggtgcgcgcgtggggg 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tatggacattttgagatgtaattaattcattaagaagttaatggctagatta-acaatattcctttttttgacaagattactggagtgatagaacagaataatgtcatagaaaatcatatgcttagattt----------cagcaaggtatttgataaaattttttcacaatgtccttataaaacaaggtagagagagatggactaaaagatatacatatgtatgtaatatatatatatatatgcacattacacacatggacatgtatatttgaacatatatatgtgtgtatatatatat-atgca-aatacatattcatataCACAGAGAGAGAAACATTGCCCAACCAGTGGTCATAAGTAGAGC a score=-751 s mm8.chr4 128370293 239 + 155029701 AGGAAGGGgccgggcatggtggcgcacacctttaatcccagca--cttgggaggcagaggcaggcaga----------tttctgggttcgaggcc-agcctggtc---------tacagagtgagttccaggacagccagggctatacagaaaaaccctgtcttgaaaaaaacaaaaATaaaaaacaaaaaaacaaaaaaaaaaaaaCagagagaaagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagT s monDom4.chr8 204621996 236 - 308469712 AAGAAGTGGACAGGTCTAGCAGGCCTCACCTAAAA-CCAAGTGGTTTTAGGGAGAAAAGTTAGACTGAGAGCCTAACATTACTGAAACCAAGGCTGAGATTGATCACCTACATGTACTAGGTGAGCTCAAGATCACTCAAAATTGAATGAAAAATCCCTTTCTAGGTTTCTTCCAAAA-------------------AAAGACAAGGTAGACCAAAATGCACTGAATGTGATGACTTTATTGATGGTACACAAGA-----T a score=63520 s mm8.chr4 128370532 1254 + 155029701 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s monDom4.chr3 379826049 1250 + 526135210 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AAACAGACAAGAGGGCAGGCACACAGTAGGTCAGCAGCCTTCCAGACACCAACCAGGACCCTCTCCCCAGGGATAGTGGATAGTGGGTCTACAGCCTTCTCTCCACTGATCTCTCCTTCCTCCTCTCTCTCCCATCTAGTGCCAGCTGCCCTGACCATGGACCCAGGCACTGCCCACCAGCGCCTGATCCTGTCCGATGACTGCACCATCGTGGCCTACGGGAACCTACACCCACAACCACTGCAGGACTCACCAAAGCGCTTTGACGTAGAGGTGTCGGTGCTGGGCTCTGAAGCCTTCAGTAGCGGTGTCCACTACTGGGAGGTGGTGGTGGCGGAGAAGACCCAGTGGGTGATTGGGCTGGCCCATGAGGCTGCCAGTCGCAAAGGCAGCATCCAGATTCAGCCTAGCCGCGGCTTCTACTGCATCGTTATGCATGACGGTAACCAGTACAGCGCCTGCACAGAGCCCTGGACTAGGCTCAACGTCCGTGACAAGCTTGACAAGGTGGGCGTCTTCCTGGACTATGACCAGGGCCTCCTCATCTTCTACAACGCCGATGACATGTCCTGGCTCTACACCTTCCGAGAGAAGTTTCCTGGCAAGCTCTGCTCCTACTTCAGCCCCGGCCAGAGCCACGCCAATGGCAAGAACGTCCAACCACTGCGGATCAACACCGTCCGCATCTAAT---------CTGGGCAGAGGGAGACCAAAGCCTCCTGGGGCTGTGACCACCAGCAAGAGCCTTGCCTGACAGATGGAGGACCTGGACTGCTCAGGCCCACTGTGGCCACCCTGAGACCTCAG---GCCAACTGTTTGTCCCCTCCTCCTCCCCTTCTGCGAGCTGGAGATTGCACTCCGTGGTTGATGCCCTG--TGGCTCTGATCTTAATGGGAT-GTGACATGGCTTCTCCCCAGGGCAGCCCTTGCCCAACCCCTCATCCCCATTCTCTCAGGAACAG s monDom4.chr4 425568753 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AAGATATTAAAACCtaaatatttatt-aatatttatttaCAGAGAAAAGGACATGTGGGAGCCAGCAGCAGAAGCCAAGGTGAGGGACACgactgacagacagatggatggacagatggacagacagacagagagacagacagaccgaccaggaaggcagacaAAGCTGACTGGCGCTGGAGAGGACACAGACACGATTGGAAGGGACAGGATTTATGTTGCATACTTTAACTACAGCGATTGTAAGACTGGGTCTACTTACAGGGCAGAAACACTAGAGGCGGGGTGTGGGGGATAGGGCACAGAGGTCACAAGAGTCCTTGCCTCCTCAGAGAGGTTCCCCACCTCCTCCC---CCCACCTCCCCAGAAGGCATCCATCTGCCTCAGCCCACCACCCCCCCTACCAACCCGTTCTCAGGTAGGGGAGAGCAGGGCCAAGAAGAGATAGAGGGAAGATTGGAGGGTGGCTCAGATGATGCTGGTGGGAGCAAAGACAGGGCCCACACACAGAGTGTCTGCGATCTCCCAGCCACAGGACAGGGGTTTACACATGTCCTCTGTGTCC------TCTTCTGGAGGCAGAAGCCTGCCTCGAACTGCTTCCCTGTAGACAGATAAGAGAGGTGCAATAACAGCa a score=11014 s mm8.chr4 128436680 346 + 155029701 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cttctcccctcCATGCTACCTCCTCCATCCC--CCCCTCCCGGCCGGTC---CGGGG--GCGCGGTTTGTGAGGTGTCCCAGGGCGGGCGCCTGCGCAGTGG---GCTCCGCGCGCGGCGGAGGCTATATAAGCGTTTCGCTCGCTGCCCGTCGGGTTCTGGCTGCCGGAGGGCGGAGGAAGCGGACGTAAAGACGGACGGGCACGTAGCGGCGGCAGCGGCGGCTGCGGC-CGGGCCGAGCCGAGGCTAAGGGGAGGCGGCTGAGGCTAGG--GGGAGGAGTCGGCTCTTCGTTTCGGCCGAAGCCGCGGAGGAGCCCAGTCAACGCAATGGGCTCCGAGAAGGACTCCGAGTCTCCTCGCTCTACGTCCCTGCCCGCGGCCACACCGGACCCCAAGTGCCGAGGGGGCGGCGGGCGGCGACACCGCTTCCTCTCCAGCCTCGTTCTCCTCCCCGCGGGCCGCAGCCGCCGGGCCCGTGCCAAAcccccaccgccggccctggctccggccccggccccggccgagcccccagcgccgcccccacccccgccgccgccg---------ccggccccgccTG---AGGCGCCTCCCGCCGAGCCCGCCCcggaggccgaggttgcggtggcggcggccgctacggtggcggcggcggGCGAGGAGGGCCCTGGGCCCGGCGGTGATGAGGTGGAGTGCCCGCTGTGCCTGGTACGCCTACCGCCCGAACGTGCCCCGCGCCTGCTGAGCTGCCCGCACCGCTCGTGCCGAGACTGCCTCCGCCACTACCTGCGCCTAGAGATCAGCGAGAGCCGCGTGCCCGTCAGCTGCCCCGAGTGCAGCGAACGCCTCAACCCGCACGACATCCGCCTTCTGCTCGCAGATCCTCCGCTCATGCACAAGTACGAGGAGTTCATGCTGCGCCGCTACCTGGCCTCGGACCCGGACTGCCGCTGGTGCCCGGCTCCGGACTGTGGGTGAGCAGCGCTGTCGGGGGCGTGG----GGCGGCCGCCGGGCTCGTGGTTAAGGCCCCTCGCTT---GGGCGGAGAGGCGTCCGCAAAGCGGGGGAT 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s monDom4.chr4 8765809 1411 - 430141050 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s monDom4.chr1 3014207 1161 + 748055161 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a score=341 s mm8.chr4 129057723 96 + 155029701 AGGGACCCAGAAAAGAGTCTTTAGAAGATCAGAGGTAAAAGCGCCTTCCTTCCCTGGGTCCAAAAGGTAGTGGGACCACAATAGCGCCCTCAAGCG s monDom4.chr1 324785920 91 - 748055161 ATGGACCGAGAGAGTGGAACTGACGGGGACAGAAGTAATGAAAGCTTCCT-----AGGAGAGGCATTTGATGGGGCCTTGGTCCCCCCCCCATCCC a score=19370 s mm8.chr4 129057830 551 + 155029701 CAGGGCACCCACCGTTCTCCATGTATTCCGTGATGATGTAGATGGGTTCCTGGGTGACCACTGCATAAAGCCGGACTAGCCGCGGGTGCTGCAGCTGCTTCATGAGGTTAGCCTCAGCCAGGAAGGCGTCGGGGGACATGCTCCCTTGTTTCAGACTCTTCACCGCCACCTTCGTGTGTCCGTTGTAGTACCCTGATGGGGTACGGGTGGAGAAGTTACAGAGGTCAAGATC--------CTGACGAACTAGGCAGCCATCCTG----AATAGGCC---------AGTGTGAGAGGAAGCTCACATTC--TCTCTCCTCTTTC--------------------------------------CAATCAGT-----------------------------CCCGAGGG-----------------TCACACTCACCCATCCA-------------CACTTCCC--------------CGAACTGGCCAGCTCCCAGCCGCTCCACCAACTTCAGTGTTTCCCTGGGAACTTCCCATTCGTCCTCCCACCATGGTTTCTGGGGCTTCTGGGTCTGGCAAGGACGGCTCAACTTTGTGCACAGCCCATCAGAGGCGTCTGCATAGACAAAAGAGAAGGTTAATGCGGTCACTAGAGACCTTGGATGCTCCCTCCAGCCCCTACCCTCTC s monDom4.chr4 9504856 675 - 430141050 CATGGCACCCACCGTTCTCCATGTATTCAGTGATGATGTAGATGGGCTCCTGCGTGACCACTGCATACAGGCGTACCAGCCGTTGGTGCTGCAACTGTTTCATCAGGTTGGCCTCTGCCAGGAAGGCATCAGGGGACATGCTGCCCGCTTTTAGGCTTTTCACAGCTACCTTGGTGTGTCCATTATAGTACCC---TGTGGTAGGGGAGAAGGAATTCCCAGGCACATGCTTGGAGGAAGCTTAAGGTTTGGGCTCCAGCCCAGTGCCCGTATGCCTACATATTTGTTGGGGGAGAAAGAACGAAGTCATCCCCTCCTTTTTCTTCTGGCAGCTGCTTCTCCACACAGGTCCTGCCACAGGCAAACAGCTGGGAAGCACAAACCTTGGGGTGGCAAGACCCAAAGGGCAGGACAGCGGCCTACTCCCAGTGCTCTATCCATGGGGCTAGCCCTCACTTACCCATCCAGACCTCCCCAAATTGGCCAGCTCCCAGCCTCTCCACCAGCTTCAGCGTCTCTCTTGGTACCTCCCACTCATCTTCCCACCAGGGCTTCTGTGGTTTCTGGGTCTGGCAGGGCCGGCTCAATCGAGTGCAGAGCCCATCTGAGACTTCTGTGGGCCCAAAGGGG-----TGCTTGGGTGAGGAGAAGCCCTGAA--CACACAACAGCTCCTCCCTCCCC a score=10868 s mm8.chr4 129058485 288 + 155029701 TGAAGGGGAATGAAAGACGTTTGGAGAG----TCCCTAAGAAGGACTGGGTGCGGGAGAGAGAGA-------GGCTG-----------CTAGGA----TGGGCACAGGTGAAC----GCATTCCGCCGGAGCTCACTGGTGTAATGGCGGACTAGATCGTGCAATCCGGGAAAAGTGATACGAGGGGAGATGTAGAAGCCACCGTTGTCTAGGTTACGGATCTTGTAATGTTTCACCACTTCTCCCTGGTTCTGGTCGAAGTCTCTGACCGACAGGGAAAAGGACCCTGAAGAAAGGTTGGAGATGGGAGGAGGGAAG s monDom4.chr4 9505813 310 - 430141050 TGAACCTGAAGGCTAAGGGTTTGGGGAGGGGGCTCTGGATGAGTTGGGGGTGCAGAACTGAGGGAACAGGTAGGCTGGGCCTGAAGATCTAAGGGGATTGGGGACAGGGAAATCTGGGGCTGTGGCCAGGGCTCACTGGAGTAATGCTGGACCAGCTCATGCAGACCAGGAAAGGTGATTCGGGGGGAAATGTAGAAGCCACCATTGTCCAGATTGCGGATCTTGTAATGTTTCACCACCTCCCCCTGGTTCTGGTCAAAGTCTCGCACAGAGAGTGAGAAGGAACCTGCA--------GGGAATGGGAATAGTCAAG a score=7643 s mm8.chr4 129058923 133 + 155029701 GCTCCGCCCACCAAGCCCTCTCACCCGCAGTGCTTTCGCTTTCCCGGATCAGGAAGGATCCATGCGTGTTCCCGGGCGCCAAAAGCTGCCGCTCGGCGTCCTTACGGCTCAGATTCTTGAAGAACCAACTATA s monDom4.chr4 9507072 133 - 430141050 GCTGAGGTCTTCTAACCCCCTCACCTGCAGTTGTCTCACTCTCTCTGATCAGGAAGGATCCATGGGTGTTCCCAGGGGCCAGAAGTTGTCTCTCAGCATCCTTCCGACTCAGGTCCTTGAAAAACCAACTGTA a score=14259 s mm8.chr4 129059263 521 + 155029701 CCTACTCCCCGGACCACGCCCTGTTCTGAGATCCCTG---------GATGTGAACCCCATTCCCACGGAGGTCTCC------TGCTCACGGTTCAGGCTCCAGGCTGTTTGCTTTCGCCACGAAGTTGAAGGGAATGAAGCCTTCTTGGCCAGTCGTCAGGGACTGAGCCTTCCACCACTCACCGCTCCTGCACCACAGAGACCATCATCATGGCGTATATAGCCACTGGAAACCCCTGAGTCCCCAGTTAGACCAGATCATTACTCCCCTGGATCAAACACTCTGGAGACTTATTTCTACCACATTCCAAAACCCCTCAGCTGAGGCCAGAGCCTGTAATGGGTGCAGGAGGGCTGAGGacacacacacaaacacacacacacacCACATCAGGCAAGGTGGGTTAGAAGTATACTTACTGCTCCAGGATTCGGAGCTGTTCACCCTTCTCAAAGCCCAAGTCTCCATCATGGGAGGGCTCATAACTGTGCAGGGCGATAACCAGGTTGTCTGTAAAGATAAGA---AGAGTCAAGAA s monDom4.chr4 9508616 440 - 430141050 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AAGCCAGCCTGGGGCTGACAGGAACAGTGGAATTCTAGAGACACAGGATGCAGACAAGGTGG-AGAGAAGATGA--AGACAGTATGGACACGAAC-AACCAAGCATCCCCAGGCCGT---ATCATGTTTCACAGGCTGCTGGATG--AAGTCACCTTGCAGCGGGGATGCTGGTGGGAGAGATCCCTCATAGGTGACCAGTGGGTCCCGCACTTCAGAGCCATTCCGGATGGGCAGCTGCGG-GGTAGGAAATGAGGC-------------TGGGGTCAAAGAAAAAAGACAGGATTTGACCCTAGCTCCCTCTCCTCTCCTCTTCTTTCCGTTTC--------------TCCAgcctggttgaaccttgtctctg-aattcaccaactatgtgtac---atttg-------accttaggaaggtcccttcctctagctggg s monDom4.chr4 9509203 439 - 430141050 AAGTCAAAGACAGACCAAGGGGAACCG-GAAACCCCTGAGAGAAGAGGGGGACACAAGGAGGCATACAAGTCAATGAGACAGCAGGCCAGGGAATGAAGTAAAGATATATGGGCTGCCCAATCTCCCTCCACACACCGCTGTGAGGTAAGGTACCTTGTAACGGAGACACAGGTGGGTCTAAGCCATTATAGTCGACCAAGGGATCCCGCACTTCAGAACCATTCCTCATTGGGAGCTGGGGAAATGGAGGACCAAGCACATAACTCTCAATGGGGAGAAGGGCAGAGTCCCATCTCTAACAACAGCTTCTGGTCCCATGCTCATCACCCAGCCTCCTTCAAAAGGGCAGCCCAGACTG--TGAGGAAGGGATCTGAAACTCATTCTCATCCTGTTCCCGACTTGCTGGGAAATCTTGGGGAAATTCCTTTCTTTTTCTGGG a score=6974 s mm8.chr4 129060377 421 + 155029701 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246 + 155029701 GAGTGAGCAGGCAGGGGGAGGGGAGCCCACAGAG-CATTGTTGGGGTTTGTGAGGTAGGAGCTGAAGCTG----TGTGCACCTCAGCTGCAGAGGGAAGGGGGAACAGGAAATGGCGGGGGGGGGGGGGGGGAGGAAGTCTGAGTTGGAAAGTCAGACAAAGAGAGA----AACA-CAGAAACAAAGGCTGAGAGTCACACAGAAGGAAAAAAAAAAAAACAACCCAACCCTGAGAATGACAGAGCCGGCAGATGT s monDom4.chr4 9526653 231 - 430141050 GGGTGTGGGGACAGGGGAAGAAGAGGCCACAGAGACATTGTTGGGGTTTGAGAGGTGGAAACTGGTGCTGGTCTTGCTCACCTCAACTG-AGGCGGGTGAGGGGGCAGGAAAT--------GGGGGAGGGGAAGGAagccaaagatggaaagtcagacaaagagagaggtgaacagcagaaacaaaagct---------atagagggagaggaacaaagaga--caaaaacagagactgagaaa-----cagatgt a score=9104 s mm8.chr4 129079333 271 + 155029701 TCCCCAGATACTGCAAGAGACACCCAAGTCT---------------GCTG-TCAGCAGAGGGTGAAGCGTCTGGCACTGATGTTCATGCGCGTGAGTCCCAGATGCCGCAGCGGTGGGGC---------------------------------CAGAGGCAAGCCAGTC----------CCAGACTCTAA--CTCCATCTCCAGCTCAGCCTCATCCAGAAGCTCCTGGTGCAGGTGACAGACTTGGTCCACTTTCAGTCTGTGCAGCCGGGCCCGCAGCCTGAGCAGCTGCCCTGCCAGCTGCCGGTCCTGAGCCCGCATCTCCTGCTGTG s monDom4.chr4 9527800 332 - 430141050 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GCTCCCCCCACTTACCTGGCTTCAAATTTGCCAATTCTGGTGGAGGTTGTGGTTACATCCATGGCCTCCTGTCCACCACCCAGGACTACCTATAGAAAGGAGGAGGCCCAGGCCCAATCTTTAGGTTAGGCCCTGCCTCTTGGGGTAAAATTATGTTTGCCCTTTAGACAATGCTGTTATCTCTCCCATCAGACTTGGGAGGTTTTCCCTGGAAGCTTCCCTAGGTCTATTGCCCAGCCCCTTTCCCCCCCAGTGTTCCTTTGTTGTAGCATTGAGAGCCACTGTGAGACCTCTTCTCCCTACCTGACTTG-------TCATCAGTCACAGCTACCATTTGT-----AAACAACCCCATT----AGCCTTTTACTATGACTGAGGGATGCACAGGAAAGCCAAGGACTGTCTTACGTGGTCATAGATGGGGGAAAGAGCAGCTGAGTTGACAGGTCGCTCAGTCCTGAATGTTTTCTGGTGCTCAAGTGTTGTGGAGTCAAAGAGCTAAAAACACATATTAGAAAGGGGAGAGATGAGAATAAGGAAGGTCCCCTGATCTGGAGCAGTCAAGTATGC a score=9008 s mm8.chr4 129095824 280 + 155029701 CTCACCTTAGCTGTGTTGTCCTTAGATGCAGTGACAAACATGGTCATGTCTCTAGACAACTGGATGTCATTGATCTGCCGAGAGTGTTCCTTTACGTTCACCAACACCTCTCCAGACTggaggaggaggaggaggaggaggaggaggaggaggaggaggaggaggagTTAGAGCCACTTGCTCGAGTCCCAAGCCACCATTCC------CCAGAAGCCCAA----GCCCATTTTTTCCTTA-----CCCTCAATCTAATCTCTTACC-CCATCCCCTCCCCCTCATTTTTGGTTCT s monDom4.chr4 9541851 252 - 430141050 CTCACCTTGGCTGTATTGTCCTTGGATGCAGTGACAAACATTGTCATATCTCGAGAGGTCTGAATGTCGTTGATCTGCCTTGAATGTTCCTTAACATTCACCATCACTTCTCCAGACTGTGGGAGGAAGGCGTGG--------------------------------------------GCTCAAGGTCCATGGCCCCATTCCCTACTACCAGTAGTCCAAAGCTGCCCACTCTTTGGTGAATGGGCATTTATAATATTGTCTTGCCACCAGCCACTCTCCCTATATCCTGATCCT a score=20321 s mm8.chr4 129097314 428 + 155029701 CTACTACGTGTCCTCAGTGTCATCTGCC---------CCCGTCACGTGGCCCCTTACCTTGGCGCTATACTGGTTGAGCTCTCCGCTCTCGTGGCCTGCGATGACGCACTCCCCGAGGGGGCCCCAGACGGCACTGGTGATCTTGGAATCA---TTACAGGGGATCTTCATGTAGGGCTCGTTGCTGTCTGTGC-----------------CGAGCAGGAGAGGTCAGGCCCTGGG-----ATCTGAAACCACACCCGCCACCTCAGCCCCTCAGTTCGGTCCTCA-------------CCGATCTGGCTTGGATCCCGCAGATCAAAGAAGCTCACGAAGCACTGATACCCCATCTGCTTGTCTGTGGAGAACATGATGATGTTGCCCCCAAAGTCAAAGCCGCAGGTCCGGACAGCTGAGTTGGTCTTGAGTAGGGCCAGCTGCTTCCCTGGAGA--GGCACAGTCTGGGTCACT s monDom4.chr4 9542109 477 - 430141050 CCACTGTTTGTTTCCAACCTCACCATCCAGGATCTTCCCTGGCTCCCCAGCCCTCACCTTAGCACTGTATTGGTTGAGCTCCCCATTTTCATGGCCAGCAATGATGCATTCCCCCAAGGGTCCCCACACGGCACTTGTGATTTTAGCATCAGCATTACAGGGGATCTTCATATAGGGTTCATTGCTATCTGTGTGTGTAGGGGGGAAGTAGATAGATGGTGAAGACTGGCCCCAAGGCTAAACTGGGCCCCACCGTTGCTCTCTGAGTCCCTGGATCCCCTCCCCATCTCAATTCATTACCGATCTGGCTAGGGTCTCGTAGGTCAAAGAAACTGACAAAGCACTGGTACCCCATCTGTTTGTCTGTGGAGAACATGATGATATTGCCCCCAAAGTCGAAGCCACACGTACGGACAGCTGAGTTGGTCTTCAGCAGAGCCAGTTGTTTCCCTAGAGATGGGTACAGGTTGGGTAACT a score=80 s mm8.chr4 129097745 113 + 155029701 GTCTAATGCTATCACAGGGCGGA-CCAGT-----CACGCTCAGTCTCACAGTGTTCCTTCTCTGGTGACTGCAGGTCAGCGC-TCTCCTGCCCGCTGCCACTCTCTGGCTGTTCTCCCAG s monDom4.chr3 103562618 116 - 526135210 AGCAACTGTTGTCA----GCGGAGCCAGTAAGGACATGTTTGGTGTCCCAGTCAGCATCCACACACCACATAACTCCAGTGTGTCCAGTGTAGGTGCCCAGCCTCTCGCCGTTCACTGAG a score=7525 s mm8.chr4 129099162 109 + 155029701 GTGGCCCAGGCTTACCTGTTTCACAGTCCCAGAGACGACAGCTGTTGTCAGCTGAGCCAGTAAGGACATGCTTGGTGTCCCCTGGGGAAGGTGTTAAGAAACATGACTA s monDom4.chr4 9543592 109 - 430141050 GTAGTAGATGATTACCTGTTTCACAATCCCAGAGACGGCAGCTGTTGTCAGCGGAGCCAGTAAGGACATGTTTGGTGTCCCCTGGAGAAGTTATTAAGGAATGTCACCA a score=7342 s mm8.chr4 129101233 159 + 155029701 GGCTAACCCATGGCCAAAAGGATACAGTCAGCATCCACGCACCACACAGCTCCAGTGTGGCCCATGTAGGTGCCTAGCCTCTCCCCATTGACAGAGTACCACACGTTGACGATCTGGAAAGAGTAAAATGATAGGATGGT---CACATCCCAAAATAATCAA s monDom4.chr4 9543894 161 - 430141050 GGCATAGTCAGAGCATGAAGGATACAGTCAGCATCCACACACCACACAGCTCCAGTGTGTCCAGTGTAGGTGCCCAGCCTCTCGCCGTTCACTGAGTACCACACATTGACAATCTAGTGA-AGCAAAGACATCAGTTTTTACCCATGCCCTAAAAGAGGTAA a score=11094 s mm8.chr4 129102213 1212 + 155029701 ctgctgagggagctaattaaagtctccatgttttattaaaa--gggaaaactgtggtttatagaaaaggtaaatgtcatgttcaaagtcacactgcttagtaggagcaggagttagggctcagatctcaagctccgacttaactctccactgttaactatcagtttatTGCCTC--CAATGCAAATGCCTCAAAAGACAATCCC---CAAAGGAAACAAAG-------TGGGATTGAACAGACCACTTGATTCTGTCCTGTCC-------------TGTCCCTGGGCTCCCTTC-----------CAGTCTCCTG--ATTCTCTTCTCCCTGGCTAGG---TACCCTTCCCTTCCAGATTTCCCTGGCGGAATGCTGTCGCCAACCTACCGCGGTATGGGGTTGGTTTTCCCTACTTATCAGAAAAATTTCCCTCCCGCAGGCAGTAAA-----CCTTGTCCACCCGCAGTCCGGG---CGGCGCGAACTcgccccctccgggccccccgccccggacccccggccgc---------------------ccgcccTCA------CGCAGTCGCTCACAGGGTCTTTGGCCACGGTGAAGAGAAGGTCTCCTTCGCGGTTATACTTGATCTGCGTGATGGACCGCTCATGGCCCTGCAGCAGGATGGGTTTCTGTGGGGACAGAACC----GGGGTGTCAGTGCC-----------------GGGAACCCCGTCCCATGCCTACTGAGGCCCCCCGACGGCAGCACGCCGCGC--------CTGGAACTCACCATCCTGGCGGTGACG-------------------CGAGGAGAGAGGCAATGTGAGTGG--GACCGGAAAAAGACTAGGGACGACTTCCGGATGCGGGGGCTCCGCCCTCTCGCTCCCGGAAGTAGAAG-------GGCCTGGCGTTTTCATGGCGGCGTCCTGGGGTGGGTAGCCGGGCCCCCCACCTCCGCGGGCTCCGACTCTGGCTCG----------------------------------GGAGCTCTGTTCTCAG---TCTCCTGGCATCCCCGAGCCTCAGGAA-------TGCTGAGCCAC-GCACCCTGGTCTCACTTCGGCCGCCCT--CTGGGCGGGTCCTCCCGACCGATCACAGCCCGGC----------GGGAAGAG-------------GGAGGGAGGGAGATGGAGCC-----GGGCAGCAGGGTG---CAGGAGGCC-------GGAGGAGGACCCGGGTGACTTTCTGA--------------------CCCTTTGCTTTCAGGGCAGGTGCTTGCTCTGGTGCTGGTGGCCGCACTGTGGGGTGGCACGCAGCCGCTGCTGAAGCGAGCCTCCTCCGGCCTGGAGCAAGTGCGTGAGCGGACGTGGGCCTGGCAGCTGTTGCAGGAGATAAAGGCTCTCTT s monDom4.chr4 9545133 1403 - 430141050 ctactggtgaaataagtttgattattgttccccttttacagttgagaaaaccaagagactgggagaggttaggtgacttgcccagagtcaca-----gagtaaaataatgttctggggct--------ggattcgaacttggatcttc----ctaattcccaggctagtgctctagccataggaacacct-aatagccAATACCAACCACATTAAAATAAGAAATTCCTTCGGGCACCCAGGCCCTTCCCCTCTCCGGTGTCCCACATCTCCAATTTCCCCCTCAGCTCCGCCCAATCAGTGACCCAGCCCTCTACTACACTCTcccccattcctagcctctcccctttcctccaatctctccc-----atctacccccgcccactggctcctgta-------gctccgccctactc-ccggcttccactccctcccacctcttctagcaccgcctctctcctcctacagccccgctccctcctctacccccccttcctccagtcccccacccccacccctcgatcgcttccctctccttcccggtcctcccctctccgccAGCCGCGCGCGCTCACCGGGTCCTTGGCCACAGTGAAGAGCAGGTCTCCCTCGCGGTTGTACTTGATCTGCGTAATGGATCGCTCGTGGCCCTGGAGCAGGATTGGCTTC--TGGGGACGGCACCGGGAGGGGAGTCATTGTCAGAACATGGGCTGGGGTGGGAGCCCCGCTTCG---ACACCTCGGTCCCC--ACCCCAACCTGCTTTGCCCTACCCGCCAGGACTCACCATCGCGGCGGCCGCGGCTACCCCACTCGCACTACCAGACAGCGCGACAGCGTGAGGTACCGACCGGAAAAGGGATGTGCAAGGCTTCCGGTCACGG------TTCTTGGCCGGCACCGGAAGTGGAAGCTTTCCTTTTCCGGCGTTGTCATGGCTGCGACTCTGGGTGAGGAATCCCTCCACCTCCTACCATCACCTATGTCTATATCTCATTTTCCTCTCCTCCACAATAATGATAGTCGGCACTGAGCGCTTTAGTCAGGCATTTCATGGGAGCCTTGGGACTTGGCAGATAACCTTCGTGAATTGCTGCATCCATCTCCCATGATGATTTACCTAGCTGAGCTGGTTTT-----CTAACCACAGCTTGCCTTACCTCCTtgggaatcattatttctattttgcaaatggagaaatagaagctcCTTGGGCAATAGGCTGGCCCAGAGTGACCCGACGGGGAGGGAGGGTCGGTCACTGTTCGGGATGGGGACAAGACTGATGCCCCCTCCCCTACCAGGGCAGATCTGTGCTCTGGTGTTGGTGGCGCTGCTGTGGGGCGGCTCCAATCCGCTGCTGAAGAGGGCCACGGGGAAAATGGAGCCTGTGCAGGAGGGGAACCGGCTAGTGCAATTGCTGCGGGAGACCAAGTCCTTGTT a score=5077 s mm8.chr4 129104454 130 + 155029701 GTTGCACACGCAGGCAGCCCCTGACAGGTCTCTCCTCTTT----CTAGTACCTGATGCCCTTTCTCCTCAATCAGAGTGGATCCCTTCTCTACTACTTGACTTTGGCATCAACAGGTGG----GTCTCTGGCTCGGGT s monDom4.chr4 9546962 138 - 430141050 GCTGCCTGTGTATACTGACCCTAGCTTTTCTCTCACCCTCAACCCCAGTATTTGGTGCCCCTTTGCCTCAACCAGTGTGGCTCCCTGATCTACTACCTCACCCTGGCATCAACAGGTAGGTGTGTCTCTGTTTTGAGT a score=7086 s mm8.chr4 129109314 557 + 155029701 GAGGGAAGAGGGCATGCTGCAAATATTTTATCCTGAGAAAGACATTCTAGGAATTTTTCTTGTTCTAATTGCTCAGATCTGACGTTAGCTGTGCCCATCTGCAACTCTCTGGCCATCGTCTTTACACTGATTGTTGGGAAGGTCCTTGGAGAAGATATTGGTGGGAAAGGTAAGTTGGGTGGCTGCACGTCAGGGCATGGTTGCTTGGGCCTTGGCATACATGAACATTTTCCCGATTCTGACTCCCATGGGTGGTGAGGAGAGGCCTTCCCTCACGTTGCCCTTTGTTCTACCACAGCTCTCCTGCTTGCTTGTGGCCCGCAGTCTCCTTTCCCTGAGCAATCTGGG--GGCAGGGGCTGGGATGAGAACCAGGACCAGGGGTCACCATCTTGTCTTCTTCCTTGGCCCCACTGACCCC--AACCC----CTTGAC--------------GGGTTCTTTATCG-------CAGAAGCAGTGGCTGGCATGGTGCTCACCATCACAGGGATCACCGTGTGCATCACAAGCTCGGTGAGCAAGACCCAGGGCCAACCGTCGCACTCCTGAGTGGGCCAACCCCGACC s monDom4.chr4 9548720 484 - 430141050 GAGGACAGAGAATACATTTCCTAGAGTGGACCCCAGGGAATA-----TAAAAATGTTT----------TTCTCCAGATCTGTCCCTGGCTGTGCCCATCAGTAATTCCCTGGCTCTTGTTGTCACCCTGGTTGTCGGGAAGTTCCTTGGGGAAGACATTGGTGGAAAATGTAAGTAAGATTGCT-------------------------CCTGGGGA-----GATCCCTTTCCAGGCTCTTA--------------------AGAACTTCTGTCTCGGTTACTTAGGTGCATTTAGAA-----------------AGCCCATAGTC------CTTAGAGAGGTGTGGGTTGTTGGGGACTGAGA--------AATATGAGGATACCCCATCTTGtgtccttttcctttctgatttagcacttaacccagtgcttggcacatagtaggcttaatgtttattattgattgaCCCAGGGGCTGCCCTGGGAATGGTGCTCACCATCTCTGGAATCACGCTCTGCATTGCAAGTTCAGTGGGCAAGA--CAGAATAAACAGCAGGAC-CCTG---TGGCCAGCCCCATCC a score=2174 s mm8.chr4 129110961 194 + 155029701 CATGGCTTCTCCAGAACAGGTTGCTGAGGGCTGGGGACAGAGGTGGCTGGGAGTGGTTGTCCCCCAGTTTGTATCTGGAGCTCCCAGCTCTTAAGATGGAGGAGCATGGGCGGAGGTTGGGGCTACAGCTTCAGGCCCAGGCTGGTGTTGCGCAGACA-AGGCCTCTTCTGCTGTCTCTGCTGCCCTCTGGTGGA s monDom4.chr4 9549997 176 - 430141050 CATGGTTGCAGATGGAATGCTGGCTGGGAGCCAGGGTAAGGAAGGGAGGGAGGCAAGTGG------------GGCTGGGCCACTTGGTTTTC----TGGAGCAGCAT---CCAAGTTTGGTTCCACACCACCTACCCTAGGCAACATTTTCCAAGAAACAGGCTTCTTCTACCATTTCTTCTGTCCTCTGGAGGA a score=3467 s mm8.chr4 129111193 399 + 155029701 GCATGGACTGCCAGAGGTCCCCAACCAGGAAAGGCGACTACTGGAT--ATTTGAACGCCTCACAAGG---GAAACAGGAAGCCAGGCTTTCAGAT--------TTAGATCTGCTTAGCC---ACCAGGAAGACGAGCCTTGGAGCCCAGACTTTAGCTCAGATCTCTGCCCATCTTAAGGCTCCCTGGTGTCCATGTGATGGGCTTACCTGATCCACAGGCTCCTCTGTGCGTGTGTTCTCATCCTCATTCACTTCCTGAGCCCCAGCCGTCTCCTTCCTCGGGTATGGAGCCCCATACACTCCCGTAACTCCTAATAAAGAGGCAGCATTGGCCGATGCCCAGGCTGTA--GGGCCCTCAGGCTCCTGTGCCTTCACCTG--CTACACCAGTTGGTTCCCCGCAGCTGTGTCCACATT s monDom4.chr4 9550424 400 - 430141050 gcatggatggggggtgatcagcgtcactgataagtgaat-ctagatctatttgaatgtgatggcagatcTGGGATTAGAACCCAGCCCTTTGGATAGCTAGTTTTAGGCTGGCTTCCCCTTGACCAGGTTGTTAGACATTCCTCTCCAG--CTAAATCCAAAGCTATTTTATTCCTAAGG-------------ACATAAGTCTCCTACCTGATCCAAGGGAACCTCTGTCAATGTAGTCCCATCCTCTGGTACTTCCTGGGCACCTGCTAGTTCCCTCCTGGTGTAGGATGCACCATACACACCCCTTTCTCCTAAAAGGAAGGATG---GGGTACATGTTGACTCTGTATTGGGACCACATGAGCTAGAGAATGCCTCTGGCCTGGATTTCTTCTCTCCTAGCCACTGGGTTCTCCTT a score=7655 s mm8.chr4 129112512 355 + 155029701 CACCTACCCTCTTCCTGTGGGCTTTGTACTTCAGGCCTGGAGGACACCTGCAGT---GAAGGGGAGGTTAGAGGTGGGTC----------------------------------------------AGAGGGCACTCACTTCCTGTGATCC-TCCACCTC------------------------------------AGACAAACCTACCAGCAGCCCCTGGACAGAGAGGGGCTGGGCACCAGCAGCTCCATATAGGGCAGGGCCTTGAATTCTTCTTCTCCAACAGCCACGTAGTAATGGCCGTTCACCAGAGCAGTCCCTG-TGGACAGTGGAAGCCCCTCGAGGGTGCAGAGTCTGTGAGGAGAGGTAACAAGAAAGAGCTGGTGGGTGAAAGGCAACTTCCTACCCAGTAGGCACTGTGCTCCAGCAGAGGACCTGAG s monDom4.chr4 9552072 416 - 430141050 CACCTACCTTCTGCCCATAGGCTCTGGGCTCAGGTCTTGGTGGGTACCTGTAACACAGAAGATAAGGATTTAAGTAGATTGCTCACCTTCAGAAGAATCAAAAAGTTGCCAGGCCAGGACTCTAAAATAAGGCTCTCATATCTCACTGTCCATCCATCCCCATCCCATCTTTATGCATTTCAGCAACACTTCCCAAATCCCAACATACCAGCAGCCACCAGGCAGGGAGGGGTTTGGCACCAGAAGTTCCAGGTAAGGCAGGGCCTTATACTCATCCTCTGATACAGCCACATAGTAACCCCCATTCACCAGGG-ATTCTCTGCCCAATACTGGCACCCCCTCCAGGGTACAGAGTCTGC-AGGAGAGAAA------------------GTAAAGGGCCACCCCTT-----GCAGGGA-TGTACCTTAGAAGATAGCCAGAG a score=7034 s mm8.chr4 129113199 192 + 155029701 GTCCTATACTCACTTGTGTACAGCCCCACTCTGTAACGTAACCTTCTCACTGAGCAGCTTCAACACCGTGTCCCAGTCCTGGATGGCAGTCTGGGACAGCTTTAGACTAAAGGGGGGACTTAGCAGGTCCCCGTTCCTGAACACACTGAGACAG----AGAACAGCCAAGTAAGGGGAAGGATCCCCGAGACTCCT s monDom4.chr4 9553483 196 - 430141050 GCCCAGCACCTACCTGCTCACAGCTCCACCCTTCAGCTTGGCTTTCTCAGTCAGTTGCTTCAGCACTGTACCCCAGTCCTGATGGGAGGTACCTGGCAGGTGTAGGCTAAAAGGAGGGCTAAGCAGGTCCCCATTTCTGAATACCCTAGGACAAGAATAGAATGGGGGCTTAAGAGGGAAAACTCCTGTTTCTTCT a score=1606 s mm8.chr4 129113555 92 + 155029701 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CCCCAGCCAACTCACGGCAACTTCCGGAAACGCTCAAAGCCGGCAGCAACATACTCCCCACCACTCCGAAGCTCTGACAAGTCAGTGACAAGGTGGCCACTATGAGGAGTGTAGAGGGTCCGAATAGCCAGAGGAGCCTGTATGACTGCTGTCACCTCATTAAGAAATGCCTCGAAGGTGGGGAAGCGTCGGTGGGTGACCACTAGCCGGCGTCCTGGGGAGAAGGAGTCTCCATTCCTGTATACCACTATCTTCCTAGCCACAGGGAGCCCAGGAGCAGTGGAAGCCATTGGGCTGCTGACCTAAGCAGGCCAGAGACGCTCAGGCGTTGCTAGGCAGGTGGGG a score=2048 s mm8.chr4 129119449 106 + 155029701 TCTGGGGATCTCAGTGTTTGCTTGAGAATTAGGTACTGGTAGGAAAGaacagagggaagct----------agcccaggcccttatggcaaaaggcccctccccacctgtcaggtc s monDom4.chr4 9556957 116 - 430141050 TCCGGGAGATCCAGTGTTTGTCTGAGAAGAAGATACTGTGGAGGATAGAGGCAGGGAGGCTGTCAGGGGGAAGCCAAAGTTTTTAGGATCTCTGGGGCTTCCCTTCCTACTCGGCT a score=1581 s mm8.chr4 129119653 618 + 155029701 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GACCTCACCTTCTTTCGACTGACAATGGCCTGCTGTAGCCATAGCATTTCCATGGCCAGGTGTCTCTGAAGTCTCTGGAGCT-GGGCAGGCTGGGAGGGCAGTGTTAGCTCCTGTGACCCTGTGTATGTGGAGACATAGAAATGTGTGTC-AGAGATTGCCCCCAAACTGGTCAAAAGTGCCTGTCCC----CTCCAAAAATACCCCCTGCTCCCATTTAGCGCAGACTTGAGATTAGGGAGTGCT-----------------TAGTAGAAGGGAAGAGGAGCTACCTGGGTTCCTTGTCAGCATCCTGTCACCACCCTCCAGTTGAGGGCCAGGACCTTCTTCCT---GGCCAGACTTCACTTTCGGCTGTT-----------CCTTCCAGCCTTGATCTCTCTCCGGTTCTTCATCCTGAAGTCTGCTGGGGGGTTCCCGAACTGGACCGAGAC--TGCTGTCTCCCCCCGC----CCTTGGGGCAAAGGTCCTTCTCTGTTGGGAGGACATTTTGGGGTCCTTTCCA-AACCTCTCCT----------TGCCCCCACCCCTGGAGGGGGAAGGTGAGAATGTGGCTGAGCGGAGAGAAGAAAAGGGTATGTATGTCGGGGTT----CTCTACCCC a score=-445 s mm8.chr4 129120796 896 + 155029701 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TCCGGGGAGAAAACGGGCCTCGGGAGCCAGCGCCCCACCCAGCGCAGC-TGCCCGCCCAAGTCGTCGCCCTCCACCTGCCGCACCACCTCCTCATACTCGGCTCTCAAGCTCTGCAGCCGCCTCCGGACCTGCCGACCCCTCACACAAGCCTGGTGGACA-CACAAGTAGCCGTGGTTAGCC-----------GGGAGCAGCAATCTGGAGGTCCGCAGTGGGGAATCTG--------GGGGCCCGGCGGGAGGAGGGTACGGGGGTGAGGAGGGAGTCCCAGGGCCAGGGCTTCTCCAGTAAGGGTGGCAGTCCTGGCCCCACCTGCAACAGCGTCACGCGTC--GAACAAGCTCCTGAAGCTCCATATTCCG---CCTGGAGAGA------------TAACTGTCGGCCCTCTCCCGGCGCCTACAAAGCTCGTCACAGCTTTGCCCCGCCC------------------------GCGTCCCCATGGAAACGGAATGGCCA-------AGCCAAGGTGCTACTGGGAAAT--ATTCTG-CCTGC----------CCGTTTCCATGAAAACGTC-TCCTTCGTCCCCATGGCAACTA--------TGCCCGGCCCCCACCTTTGTG-ACAACCAAAGTCAATCCTCCCACCACCTCCCCCCCCCACACACACACACACAGGG--------AGGCCTCCCAGCACCCCCGCCCGGATCTTCCATACTCTAAGGCTCAGGATCCCGGGT--------------CAGGACTGAGTGGGAATACCCAAAGAAGACACAGGAGCCAAGCGGACATCCGTCCATCCTTCCGTTTAATTCAGCAATCAGAGGGCCAG------TAGGGCCAGGGAAGATCACAGCCTT----GGTCAGAGATCGAGGCCAGTAAAGT--CAGAAGGCCTGAGGGCA a score=2679 s mm8.chr4 129121692 61 + 155029701 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CTCACCTTTGCAAACTCTGGAGGAGGGTTCTTGCCTCGGCAGAGGTTTGACAGGGCCCAGACTGCATTCCGTGTCATTGTCAGTCGTGTGGACTTAGTAAGGAGTCTGTAAACAAGGAAGCCATAATCTTAGCACTGACCTCCAGCACAGGGCTGTGACCACAGACCCTAGAGTATAACCC-----AGGCCCTAGGACTATC s monDom4.chr4 9605882 186 - 430141050 CTCACCTTTTCGAATTCAGGGGGTGGATTCTTTCCTCGGCACAGGTTTGACAGGGCCCAGACAGCATTCCGGGTCATCGTCACACGTGTGGATTTGGTGAGGAGTCTGAGGGAAATGCAGC----ATATTAA-------GTCAAGCCTAGGGTGGT-----CAGGCCCAGGTATAAAGCCTGGAAGAGACCTCTGGAATATC a score=6175 s mm8.chr4 129157148 168 + 155029701 AGAGCCCCGGGATTACTCACGTTAACAAGGGGTTAAGGATGGAGCAATTCAAGACATAATCCCTGCAAAGCGAGCTATCTCCAGCGATGTTTCCAAGCGCCCACACTGCCTGAAAAGGGAGCAGACAACTGTCACCCAGAGCCTGGCAGCTTCCGTGACTACTTACAA s monDom4.chr4 9607139 163 - 430141050 AGGGGCCAGAGGTTACTCACATCAACAATGGTGGAAGAATGGCACAGTTCAGGACATAATCTCTACAGACAGAGCTGTCACCGGCTATGTTTCCCAGGGCCCAGACAGCCTGAAAGG-----AATAAAATGGCATTCTTAACTATATACCTTGTGTGGCTACTGAGAA a score=11320 s mm8.chr4 129157729 149 + 155029701 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AAAAACCACAAGACACGGG-TCATTGGGAGTACAAAAATATGTCATTTCTTTTCTCCTTTTAATTACATCAGTTATCAAAGAAAGAAGCAGT-CGTAACAAAAATACAGAGCTCTGAT--------TTTTTTTTGTGGGTTTTTTTTTTGGTTGTTTTTTTCTTCCCTCCCCCCTCTCCCCA----CCCC---------ATCCTCCTGAAGTGGCCCAG---------------CCAGCCTCG-ATTCAGCTGAACTTGTGCTCAGGCTGGC---GATGGCTGCTTGAATAAGAGTAGGCCTTGCCCAGCACCAGCCGGTCCCGCAGCAGCTTGAAGAAGGCGTAGTAGTTGCTGAAAAGGATGAGGGCCAGAGAAATGGTCTGATGCCATTTCTCTGAGGAGACCAGTGAATACAGCTGGTAGAAGATGACGGCTCCCTCGAGCAGGAGAAGGATATTAAGGATCCTCAGTGGTTTGCTAAAAAAAAACTGGTGGAAAGGAGCGG a score=10319 s mm8.chr4 129180814 223 + 155029701 CCCACTCCCTCCCTGCCTTGAAGATCAGGCCCCACCCTCCTGCCTGGAAAAGAAAA--CTCACATGGAAGCGGAAGTGGGAGACATCGGAGGGGATGGCCACGTTGTAGTGGCCCACTGCTTTGTAGACATTCTTGCTGTGTTTCACCAGCACACCCTGTGGCCACATGCACTCTTCAGTCCACCTGAAAGCACAGTACAAGAGTACATTTTGTCCCCGGCCCAC s monDom4.chr4 9682446 213 - 430141050 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s monDom4.chr4 9899859 1044 - 430141050 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s monDom4.chr4 10068964 1181 - 430141050 TGACCCTGA--CCCACTGACCTC-GTCCCTCTCCTCTGTCGCAGGGCAAGTGACATAGGATGACCCCGGCCTGTCCCCTCTTACTGTCTGCGATTCTGTCTCTGCGCCTCTCCGCGGCCTTCGACCCTGCCCCCAGCGCCTGCTCGGCCTTGGCCTCGGGAGTCCTCTACGGGGCCTTCTCCCTGCAGGACCTCTTCCCCACCATCGCGTCGGGCTGCTCCTGGACCCTGGAGAACCCGGACCCCACCAAGTACTCGCTGTACCTGCGTTTCAACCGCCAGGACCAGGTGTGCGCCCACTTCTCGCCCAGGCTGCTGCCCTTGGACCACTACCTGGCCAACTTCAGCTGCCTCCGCCCGGCCccggagcaggagcaggagcaggagccggcgcaggGGCAGGCGCGGCCCGAGGAGGACGAGGTG--GGCGGCGGC-------------CTGGAGCTGTGCCAGGGCTCCAGCCCCTTCACCTTCCTTCACTTCGACAAGAACTTCGTCCAGCTCTGCCTGACGGCCGAGCCCTGGGAGGCCCCCCGCCTGCTGGCGCCCTCGGCCCTGGAGTTCCGCTTCGTGGAGGTGTTGCTCATCAACAACAACAACTCGAGCCAGTTCACCTGCGGGGTGCTCTGCCGC-GGGGCCAGGAGTgcgggcgggccgcgggccgggccTGCGGCATTTCCCAGCCGGGCTGCAGCTGCCAGGGGGAGGAGGCTgcgccccccgcccccccggccaccgcgccgcccccgccccccAGCCAGACCCTCTCCAATGCCCTGGTGCCGGCGAGCCCG------CCGGGGGAGGCCGACCTCCATGCGGGCGGCAGCAATGACCTCTTCCCACCCGAGATAAGATATGGTGAGTGCGCCTCCAGCCCCCGCGGGCCGGGGCTCC---GGCTCTGC-------CTCGTGT--------GCCAGCCGCTCCCGGGGCCAAAGGGGCTAGCGGCT---GCCCCTG-ACTCTGCCTGG---AAACGGAGGGAGCAGGAA--------------CGATCCAGGAACAGAGAAGGGACTAGAGAGAAACTGAGGCACGTAGAGAGATGTGTATGGGA---------GGAGCCTGGGGCTT-----AGAGAGAGGAGTGGCAGGG--GGATTGGGGTTCAGAGGAGGGGGAGACTGAGACAGGTAAAGGGGAGA----CTAGGGTACGTGGAGAGAAGAATGGGAGGAGACTGGGGCATAGAA--GAAGGGGGATGCTGAGGAATA a score=4325 s mm8.chr4 129496353 307 + 155029701 TCTCCCAGTGCAGGGGGAACTTTTTGCCCTCCCCCATGAAACATCTGGCATCATGCCCACAGTGTGCACAGTGAGCACCCAGTGGCCTTGCTGTGGCCTCTCTCCCAGGCCAGCTTGGCCTCTAACCACGGTCGATGAAGCCATCC-------GTATGACAGCCAGGCCGTGGGCAGGTTAC-----GGGCCCTGGAGGCTGG--CCTGGGATTTAGTGCCTGCAGGAAGAAATTGAATTTTGCTTCTTTGTCGAACATCAGCGGAGAGCGCCAGG-CGTATA-TCAGGAGGTTTATGGCTCTTCCTCAGTGGCCGCCAGTAC s monDom4.chr4 10072196 299 - 430141050 TCCCCCATCGCATGGGG--------GCAGCGCTCCAGGGACCCCCCAGCCCCCTGGCTGCTGGGTA-ACAGTG------------CCAGGTCCTGGCACCCTGCACCGCCGTGCCTGGCC-CAGATCAAGGAGGCAGGGGCAACGCCAGGCAAGTTAGAGATGCTTCCTGTGAGCAGGAAACCCGGGGAGGGCTGGGGGCTGGAACCTCAGATTTAGTGCCTTCTAGAGGAAATTGAATTTCGTTTCTTTGTTGAACATAACCAAGGAGAGTGGGGCCGTATATTCAGTGGTTTTATTATCCTCCCT--GCGTCCTCCAGGGC a score=2491 s mm8.chr4 129496669 155 + 155029701 GTAGGACCTCCC----------CTATTCTGCTCAGCTAAGGGCAAGTTCTTTTGTTTGGTTTTCCCTGAGGTCCACCAGCCCCAGTGGTTTTGAGTGGATGGAGCAAGCTTTGCCCTCCTGGATGGGCACTGGCTGGGCAGGCTGCCATGTGGAGAGCAGAGCCA s monDom4.chr4 10072560 151 - 430141050 GGAGGAGCCCCCTCCTCAGTTTCCCTTCCACTTGACGA--GAAAGGTATTCCTGTCTGGCTTTCCCCTCGGTCTA-----CGCAGCGGTC----GGGGAGGGAG---GCTCTGCCCACACAGGCGGGCACCATCCAGGCGCTGTGCCATCCGGGGCACCGTGCCA a score=11376 s mm8.chr4 129497414 416 + 155029701 GGCTGGCACCGAGCTACCAGACAGAGGGCAAGGTTTGTGGGGGGTGGGGACAAGCAGAAAGGGATCCTCTGCCAGGAACTGGGGCAGGACAGGGAGTTAGGTTCACCCTCTTTGGGGCATCCTTGAGAGAAGTCAG-CAGAAGACAAAGCAGGATGGACCCAGGATGATACCAGACGATAAAGAGGCCAGGGGC---------AGTGG----GGTGCCTTGGCCCGCC----TCAGAGCTGAGTGCG--TTTGACAAGAGGGTACAGGCGCCTGTTAATTTCACGCAAACTGCCTTTGATAGATCTCTTGTTATTTTTGGTGAGTTGAGCCATAAATTTGTGCCATCTTGC-TGCCGCAATCTGTTAAGTGTGGGGAGAGGAAGAAAGAGAAGGCAGGCAGGAAGGAGCTCTCAGAAGACTGGCACAGAGGCTGGCT s monDom4.chr4 10074699 409 - 430141050 GGCCTGCCCGCAGCTGCCCTGCCAAGCGCCAGGCTGGAGGGGGGCAG--CCCAGGACAAGGAGGCCTT------ggagaggcggccagagggaggggaggg------------gcggcctggcagggagaagagagatgggatatggagcgcagccgtggcgggaggaga--ggggggcggagaagcggggggCGAGTGATAGAGCGGCATCGGCGCCTGGGCCCGCCCGCCTCGACGCTGAGCTCGAGTTTGACAAGAGGGTCTGGGCGCCTGTTAATTTCACGCAAACTGCCTTTGATAGATCTCTTGTTATTTTTGGTGAGTTGAGCTATAAATTTGTACCATCTTGCTTGCTGCAATCTGTTAAGTGGGGTGGGGGGAGTTGTGGGGAG------AGGAAGGAACAGGAAGGAGTAGGGGGTGGAGGCAGCCT a score=2823 s mm8.chr4 129514541 232 + 155029701 CCGACCTTTACCCTCTCCCAGCA---ACCCGTCTCCC----ACAGACCCTGGAGCTGGCAGGTGCTCCCTCTGTCCCCCTGGTGATCGGCTGTGCAGTGTCCTGCATGGCTCTGCTCACCCTGCTGGCCATCTATGCAGCCTTCTGGAGGTAAGTCGGAAGCTGA-------GCAGGA-------TGGGAGGTGGCTGGCTCTCC------AGGGTTAGGCAGGCAGCCAATGCCTCTGCCTCTGCCCACTGTGCCCTG s monDom4.chr3 428186147 259 + 526135210 CTGACATGTCCATTCCCCTGTTATGTATGTGTCTCCCTTTTACAGAACATGGAAAAGGTGATTGTCCCCTCAGTCACACTCATCGTGGGCTGCGGTGTGTCTTCCCTGACCCTGCTACTTCTCATCATCATCTACGTTTCTGTGTGGAGGTAGGTAGGAAACTAACTGGTTCTCAGGATGCCCTTTGGGAAATGGGGGGCAGCCTTTTGGGGGGGTGAGGGTGGGGGTAGTTTCTCAGGAATCCCCTAAATCTGACATG a score=3854 s mm8.chr4 129514773 112 + 155029701 TCAGGTTTATAAAATCAGAACGCTCCATCATCTTGCTGAACTTCTGCCTGTCCATCCTGGCTTCCAACATTCTGATCCTGGTGGGCCAGTCCCGGGTGCTGAGCAAGGCAGG s monDom4.chr3 428191459 112 + 526135210 CCAGGTACATCCGCTCTGAAAGGTCTGTTATCCTCATCAACTTTTGCCTCTCTATCATCTCTTCCAACGCTCTCATCCTCATAGGACAGACCCAGACTCGAAACAAGGTAAG a score=9767 s mm8.chr4 129515591 441 + 155029701 TGCTGTGTGCATGTCACCAG----GCCTGTGTCGTGCTGTGTGTGGGTGCAGGAAGGCGGGGGTGCCTGGC-----AGGGCTCTGGTGGGGGAGGGGGACTCAGGTAGGCGGCTGGCCATGCAGTGC------CTAGGCCTAGCAGTCATTGTGG--------------------GAAGCTGACAGCTCCCACCCTGGCCACTGCTCAGGGC---CACTCCCTCCTATTACCTCTCCCTGCAGGGCGTATGCACCATGACGGCTGCCTTCCTACACTTCTTCTTTCTGTCCTCCTTTTGCTGGGTGCTTACAGAGGCCTGGCAATCCTATCTGGCTGTCATCGGGCGGATGCGCACCCGCCTGGTTCGCAAGCGCTTCCTCTGCCTGGGCTGGGGTGAGCAAGGCCGGTG-------CTGAACTCT--GCTGTTGGGC-CTGGAGTGGCAGGGA----------AAGCCAGGATGTGCTGCTGCCTGGACTCCGGCCCA s monDom4.chr3 428195525 485 + 526135210 TGCTCTGCATATGTCCTGAGTGTAACCCAGGTAGT-CTGAGTCTCAGCTCTGGGGGAAGAGAGTCCCTGTCCTGTGATATCCCCTGTG-----------CTCAGGCTGGCTGTGGCTCCTGCACCGCTCTGCGCCACTCCTCGATGCTCTGGTAGCCTGCTCAGAGGACCCTGGTGAGGAGGCCAGGCTGCCCCATGATCCCTGCT--GTGCTTACCCTCCCTTAACTTCCTACCACTTGCAGGTGATCTGCACCCTGGTGGCTGCCTTCCTACACTTCTTCTTCCTGTCCTCCTTCTGTTGGGTGCTCACCGAGGCCTGGCAATCCTACATGGCTGTTACTGGGAGACTTCGCAACCGCATTATTCGAAAGCGCTTCCTGTGCCTCGGTTGGGGTAAGTGGAACCCGGGATCCCTCCCGTGCTCTAGGCAGTGGGGTACTGGGAAGGAATGGGGGTAAGGCCCAGGCCTGGGAGAGGGGATACCTGGGCTTCATCCTA a score=2252 s mm8.chr4 129517125 229 + 155029701 CTCTCTCTCTCTCATCTGCCCTCCCCTCCCACCCTTCTCGGGGCTCATTCTGCCCCATCTCCCGGTT--TCCCATGTGTTTCCCCCTTCTCCCGTGT----------------------------------CTGTGCCGCCCCCCCGAGGTCGGA--GCGGTGCCCCTGGGCCAGCCTGCTCCTTCCCTGCTCAGCGTGTGGAGCGGTCCC--CAGCCCCCTGCTCAGCTCAGCCTCGGCCAGGAATGCCATGTTAGTTGTGCCCCCTG s monDom4.chr3 428237493 262 + 526135210 CTCCCTTCATCTTGTAGACCTTCCTTCCCTAATAATTTTGGGGTTCCTCCCCTCTTTGCCCCCTTTTATTCCCATGC---CCCCATTTCTTTTGTGTTCTGAGAGCAAAAGGTATTTGGTTATGTTTCAGTCTTTGATTTCACTTCCAG-TCAGATGGCAGTGCCCCTGTAT-GGTCTGGCTTTGAAATGTGCCAAGTGCGGAGTGGTTTCTGCGGCCCAAGAGACAGC--GGCCACCACCAGTAATGCCATGTTAGTGCAGCCCCTTG a score=10688 s mm8.chr4 129519341 200 + 155029701 ACCTTCCGCTGCTGTCC---------CTCTCAGGGCTTCACTCTGGAGTTCCTGCGTGGTACTGCCTCTCCTGGCGCTTACCTGGATGTCTGCCGTCCTGGCCATGACAGATCGCCGCTCCGTCCTCTTCCAGGCACTCTTTGCCGTTTTCAACTCTGCACAAGGCTTTGTCATCACCGCTGTGCACTGCTTCCTGCGCCGAGAGGTGG s monDom4.chr3 428247130 209 + 526135210 ACCTAATGCCCCTGTCCACCATCCTTCCCGCAGGGCCTCACTCTGGAGCTCCTGCGTGGTGCTGCCACTCCTGGCCCTCACCTGGATGTCCGCTGTCCTCGCTGTCACTGACCGGCGCTCTGCCCTCTTCCAGATCCTCTTTGCGGTCTTCGACTCGCTGGAGGGCTTTGTCATCGTGATGGTTCACTGCATCCTTCGGCGTGAGGTGG a score=3347 s mm8.chr4 129519780 367 + 155029701 TTGTGGGGGTACTATGGGGGCTTCAGGCTCAGCTGGCATTTCCTGCCCCTAGGTCCAGGATGTGGTAAAGTGTCAGATGGGTGTGTGTCGGGCTGATGAGAGTGAAGACTCCCCAGACTCGTGCAAGAACGGGCAGCTGCAGATCCTGGTGAGCGAGGAGGCCCAAGCAGATCCCTTCCGCCATAAGTTCCTTACCTTCCCCATCCCATCTGAGACAGAGACTGGGTTCAAGTTACGCTCAGCTTCTGACTGCGAGGAGGCTCTGGGCAAAGGCTCCCCCCACCCCCGTTCAGTTTGCTCCCTACAGTGTGAGGCCATGTTGGGTGGTACCTCTCAGGTGGGAGGACAGAGGAGCTGGGGAGGAAGA s monDom4.chr4 10088562 275 - 430141050 TTGTGTGGGTCTTCTAGTGTCTCGCTAGCGGACTACAATTTCCAGNC----------AGATGTGGTGAA-TGCC-GATTGGGGTTTGCAAGAGCCAGGAGAATGAGAACTCCCCTGGGTCCTGTAAGAATGGGCAGATCCAGGTCATGGTGAGTGAGGTGGGC------------------------------ACCCT------------TGGGAGGGGGGCTGGGCCCA------GCCCCACTTC---------------------CCATGTCTCTCTCCCCCATC-TCCACTTTTCCCCACACCGTGCCGGGTCA------GGGGCTCCCCTTG---GGGAGGCCCGAGG-GCTGTGTAGACAGA a score=5338 s mm8.chr4 129520154 109 + 155029701 CCTTTCCCACCCTGACACATCTCTCCTCCCTCTGCCAACCTGCTCTCTCCCTCTCCA------CCTATAGTCAGACTTTGAAAAGGACGTGGATCTGGCTTGTCAGACAGGTGAG s monDom4.chr4 10089164 115 - 430141050 ctcttccttccctcgcccatttatccttctcccttcctcctttcctccccctccccatttcTGCCTATAGACAGATTTTGAAAAGGATGTGGACTTGGCCTGTCAGACAGGTGCG a score=32421 s mm8.chr4 129520734 877 + 155029701 CATGGAAGCTGAGCTTTGGTTTTCCTAC-------CTCTGCATCTTTTGGAGCCATGAGCCAGTTGTCTTTCTGGTCCCTTTGGTATATGG----------------GCGAGTACCAACCGCCTCCTC----------------AGAACTCAGTT-------------TCCCTCACTGCCCAAGCTCAGAAGCTAAGGCCCCAGCCAAACCTGGACAAGAG-------GGTCTCACCAC-------GGGGTCTCCCTTCCTTAGGGCTTACCCTTTCCTCCCACTTCTG---TCCCCAGTTCTGTTCAAGGAGGTCAACACCTGCAACCCGTCCACCATTACCGGCACTCTGTCCCGCCTGTCTCTGGATGAGGATGAGGAGCCCAAGTCCTGTCTCGTGGGTCCTGAGGGTGGCCTCAGCTTCTCACCACTGCCTGGGAACATCCTGGTACCCATGGCAG---CCTCACCAGGTCTAGGGGAGCCACCACCACCCCAGGAGACCAACCCTGTGTACATGTGTGGGGAGGGTGGCCTGCGGCAGTTGGACCTTACATGGATACGGCAGAGTGAACCAGGCTCTGAGGGGGACTACATGGTTCTGCCCCGGCGGACTTTGAGCCTGCAGCCTGGTGGTGGGGGTACAGCGGGTGAGGAGGCCCCAAGGGCCCGGCCTGAGGGGACCCCCCGGCGGGCTGCCAAAACGGTAGCCCACACTGAAGGCTACCCCAGCTTCCTGTCTGTGGAGCACTCGGGTCTAGGGCTGGGCCCTGCCTATGGGTCTCTCCAGAACCCGTATGGAATGACCTTCCAACCACCACCACCAA---CACCCAGCGCCCGCCAAG------TACCAGAGCCAGGAGAACGTAGCCGGACCATGCCCCGTACAGTGCCTGGTTCCACCATGAAGCTGGGCTCCCTTGAGGTGAGG-GGCTATGGAAAATAGGGAGGG s monDom4.chr4 10089565 937 - 430141050 CATTTCATCTGagtcttggctttgccactgaattgctctgtgactttgg-----acgagtcatttcccctccctgggccgctgccaaatggagggttagactaggtgGGGTGTGACAGATCCCTCTTCTGCCAGTGGGTCAGTCAACACTCGGTCACGGAATCGTTCCTCCCTTAAAGCGAAGG----GGAGCCAGGGCATTAGTCCGTCTGGGAGCGGGGTGGAGGCGGGCACGGCGCCCTTTGGAGGTCCTGACCTCTACCCTGTTTGCCCCCGCC-CCAACATTTGCCCTCCCCAGTTCTGTTCAAGGAAGTCAACACCTGCAACCCCTCCACCATCACGGCCACGCTGTCCCGCCTGTCCCTGGATGAGGATGAGGACTCCAAGCCTTGCCTCATGGGCACAGAGAGCGGGCTGAACTTCTCCCCACTGCCAGGCAACATCTTGGTGCCGATGCCCGTGCCCTCCCCGGGAGTAGGCGAGCCTCCCCACCCGCATGACACTAACCCCGTGTACATGTGTGGGGAGAGCAGCCTCCGGCAGCTGGACTATACCTGGCTGCGGTCTGGGGACCCTGGGTCCGAGGGAGAGTACACAGTGCTGCCCCGGAGGACTCTGAGCCTCCAGCCCAGCGGC------------CGCGAGGAGGCCAAGCGGGCGAGGCCCGAGGGCACCCCTCGTCGTGGGGGGAAGGGGCTCCCTCAGACGGAGGGCTACCCCAGCTTCCTGTCCGTGGACCATGTGGGCCTGGGCCTCGGCCCAGCCTATGGAACTCTGCAGAACCCCTATGGGGTGCCCTTCCAGCCTCCGCCCCCAGCTCCATCTGGTGCTCGCCAGGGCCCCACCCCTGAGCCAGGCGAACGCAGTCGCACCATGCCCCGAACTGTGCCCGGCTCCACCATGAAGCTGGGCTCTCTGGAGGTGAGGAGGCTGTTGGAGAGGGAGAGGG a score=3397 s mm8.chr4 129523489 78 + 155029701 TTCCTCTCTCATGGCCTGCTTGTTGCTCTATAGCGAAAGAAGCTTCGGTATTCGGACTTGGACTTTGAGGTGAGTGCC s monDom4.chr4 10094396 78 - 430141050 TTCCCTCCCAATCCCCTCCCTGCTCACCCCCAGCGGAAAAAGTTGCGCTATTCAGACCTGGATTTTGAGGTGAGAGCC a score=7149 s mm8.chr4 129523567 405 + 155029701 GGTACTGGGAGGGTATG----TTCTACAAGGTCAATTCCTAAAATTATCCCAAGCCCCATTGCAGAGCCCAGTCCTGGGCCACCAAGCCTCCGGATTCCCT-GGGATCTACCCCACTGTCTGGCTCACACCCATTACTGTgaggcagagatagagg--cagggaatgagagagacagagacagagaGAG-----------------------GGTGGAGGGGGAGGCTAGCAGAGGAGAGCAAGAGAAGCCCTAGC-CTTGCCCCAGAGGGATCAACAGGTGCAGGGCAGAGGGCAGGGAGCACTCCTCTGACACCCAAGTGGCCCCT--------AGAAGGTGATGCACACTCGGAAACGGCACTCGGAACTCTACCACGAACTCAACCAGAAGTTCCACACTTTCGACCGCTACCGTAGCCAGTCCTCAGCCAAGGTGAGGG s monDom4.chr4 10094621 416 - 430141050 GGGAATGGGAGGGGACGGCCATTCTCTCAGGCCTGACCC----------CTGACCCTCGTCGTGTAAGCCGCTGCTGGACGAGGCGACGTCAGGGCCACATCTGGACCCATTTTCCATGTAGACGTGTAGC--TGACTGAGGGTCGGGGCGAGGTGTGCAGGGGATGATGAAGGCAGGGGCTGCGGGGGCCAACCCAGCCATTGCTCCTGAAGCTGCTTAGGGAGG------AAGGAGAAGAAAGGCGGCTTTAGGGCTGGTGCTAGAGGGCT----AAGGGGAGGGGAGGGGGT-GGGAACATTTCTC-----CCTGAGTCTCCCCTTCTCCCCCAGAAGGTAATGCACACCCGGAAGCGACATTCAGAGCTCTATCATGAGCTGAATCAGAAGTTTCACACCTTCGATCGCTACCGGGGTCCCACCTCAGGCAAGGTGAGAG a score=13982 s mm8.chr4 129524492 455 + 155029701 CAGCACAGGAGGCATCAAAGCTGGAGCACCTTCAAATCTATGACACTGGGCTCACTGCCCCCCAAGCCCCGAGAACGGCTGGCCCTGCACCGGACAGCAGCCTGGGAGCCCACAGAACCG------------CCAGACGGCGACTTCCAGACAGAGGTGTGAGTGCCACGCCG--GACTGCCCA-----CTGCACAGAAATATATA----TCTATTTTCACACTCCACTTTGGAACTA-----CCAGGAGCCAGCGCCCCTCCCCCTCCC----------------GAGGCTGGGCAGGAGGCGCAG-AGGACTCAGCCT-------------------------------GGCTGGG--GGCAGCCAGA---------CTGGCAGGGCCTGGG---GGGCCAGGG--CCCCTCCTTG-TTCTCAGAGGTCCCTTAGCCACCCACTGGAGCCTCATCTTTGCCCCGGCCTGTCTGTCC------CTGTCCTGGGCTGGGGAGGGGGGAGGGAAACTTTGTTGGGAATAAACTTCACTCTGTGGATTTGGCTGCC s monDom4.chr4 10098165 546 - 430141050 cagcagcagcGACATCAGAGCTGGAGCACCTTTAAGGCCATGACGCTGGGCTCGCTGCCCCCGAAACCCCGTGAGCGGATGGCCCTGCACCGGACACCTCGCTGGGAGTCAGCAGGCCTGGGCCTGGATGCTTCCGACGGTGACTTCCAGACGGAGGTGTGAGC-CAGGGCCGGCGGCCGCCCAGGCATCTATAAATATATATATATATCTCTATTTTCACACTCCAATTTGGAAAAAAAAACCAAGGAGCCAGGGACCCCCCTTTTCTCTTCTCGGTGCGGTCTTGGCCCTTGGAGGGAGACACAGCCGGACTCTGGCTCCAGACCAGGTGGGGACCCTGGAGACGAGAGGGGTGGGCTGGCCTCCAGACACCTGCTTCTGGCCGGGGAGGAGGCAGAATCAGGGGCCCCCTCCTCATTTTTCAGAG--CCTAAAGCCCCAGGCCACCGTGTCTCCTGCCCCCAAGCCTGTCCGTGCGTCTGTCTGTCCCACCCGGGGCTGGGGGGAT-----CTTTGTTGGGAATAAAGTTCGCTCTGTGGATTTGGCTGCC a score=2492 s mm8.chr4 129530713 48 + 155029701 CCCCCTT---CTACCCCCACTTCCTCGGGCTTGTTTGCCTCTTCCTACTCA s monDom4.chr4 10098922 51 - 430141050 CCCCCTTTCCCTCGCCCCACTTTCCCGGTTCTGCTTGCCTCTCCCCACCCA a score=7468 s mm8.chr4 129546540 224 + 155029701 TGGGGAGCCTC----TGCCAGGTGGGGAGCCCCAGTGGCAAGCTGGGGTAATGGAAAGGCCCTTGAGCTTTGCCAACATCTGTGCACATTACCCTAGGCCCAGGAGGCTGCGGTAGCCCCACCCGGCAGCGGCAAGCAGGCTCCAGGGCAGCTGGTGGCGATTAGCAGCGTTGATTACCTCGTGGCGATGCCATCTGGGGTGAGGGCACCGAGCCCAGTCCCATGGGA s monDom4.chr4 10156412 213 - 430141050 TGGGGGTCCTCGAGGCATAAGACAAGGAGGAGGGGGGAAGAGTAGGGAATATCGGAGGATCCTGACGCTTTGGCATC-------CGTCTTTCCCCAGCCCCAGGGGACCTTGGCAGCCCCA-------GCTGTGGGCATTCTT-GGGGCAGCTGGTGGTGATTAGCAGCTCTGATCACCTCGTGGAGATGCCATCTGGGGTAAGGGCACAGAGCCCAGTGCCAGGGAA a score=2550 s mm8.chr4 129548006 215 + 155029701 AGCTGGGCAGTACTCCATTCGCAACCCCGACTGTGCCTGCCCAGCCCTCCTGACAGAGCTTCTGAAAGCCCCACCTCCTGCACTTCCTGCCTGCTGAGCTCAGCGCCTC-GCAGGCCGCACCACTGCCACCACACAT----CTGGGCCCAGGCTCCGTGAGGGGACCACAGTGGGGCGCCTCCATGGCGTAGCAGCGTGGTTAGGTTTCCGCTGACTCAG s monDom4.chr4 10159457 191 - 430141050 AACTGGGGAACTAGACATCTGGGGCCCAGAA-----CTCCCTGCTCCTCCCTGCAGCCCATC-----ACCCCTCCTTTATTCCTTCC--CCTTCCTGGCTTGGTGCCTCTGCTGAACTCAGCACTTTCCCTATGACTGTGGCTGGGAACTGGTTCC-TGAGGG--CTACCCTGAGG--------------AGCACCGTGGTTGGGTTTCCACTGACTCAG a score=-2186 s mm8.chr4 129549550 974 + 155029701 AGTCTTTCCAACCTT---CTGGAGTCCAAGAGGACTCCCTGACCCTACTTCTGTAGAAATGGGGACAGAGCAGAAGGAGTTAATTTAGCACAGG---GTTGGGGAG-----TGGTGCTCTATCCCCTCCTCCC---AGTGCAAGCAG--AGGTTCT------------------ACAGCCTAGGAA----------------TGCTAGGCCCAGGCACTGGAAAAAGCTGACCACCGAGGCTTGGTCAGCAGCCACGTCGCGGGTTCCACGACTATGGAGGAGGGGTCTCTAGTCTTCTCCAGCTTTCT--------------------GGGGTCTCAGCCAAG---------GAAATTAGGGGGGGCACTAAGGAGGTCCCGGGCGCGCCTAG-----CCTGGCCTCCCTCCCGCCAGCCAGCCAGCCGCAGGCGCCCCTTCCAGG-GCAGCTCTGGG---CACGCAGGGTCCCGCCTTGCTCCG-CTCACCCGCAGGCTCACCTGGCTGGGGAAG-----CGGGAC----GGGCGGGCCCGGGCGCAGGGCCAGGCCAGGAGCGCGGCGGTGCAGGCCAATGGCCAGTGCCTCCGCAGCC-----------GCCGAACCCTCGCGGTCTCCCTCCT--CCTCCAGCCTGGCGGGCCGGCCCAGCTGTGTTCCATTAGCCTCTTGGCAGGCCCCCAGCCCCCTGGAACCGCCCTCTTCCCTCTCCAGGAGCGGCCGGCAGTTCCTGCAAGCAGGCGTGTGAGTGTGCGCGCACGCTG---CGCTGCACTCAGTCTAGA-GAACTCAGGACGTGGAAAAGCTGGGGTCAGCGCAGACTGGCAGGGAGAGATCGAGGATCC-----TCCTGTGGGCCGTGGA-----CCCCTGGCCCTGCTTCCCATAGCTGGCAGCCTTAGGGCTGCCAGGATTGCTCAGTGAAGGGCTCCGCGGGCCGTTGGT---AAGTGGGCCAGCACTGGGCTGCTTCTCC--CTCTGAGCTGAAAGGGCATATtctgctactgactcgctatgtgacctggggcaagtggctagccctctctgagg--------gcctcagtgctctttttctg---ccgtggggtgatc s monDom4.chr4 10161468 1046 - 430141050 AGTCTTCCCCCTCTCAGCCGTGGGCCCGGCAGGCCCGCCAGTCCCGGGCTCGCTCTAGAAGGGGACACAGCAAGAGCAGCGAGAGCGGGGCAGGAACGTGGGGGAGACCCCTTGCCCACTACCCCCTGGTCCCCAAGGCCCCGGCAGCCAGGCTCTTGGCCTCCCTCCCCACACCCGGCCTGGGGGCGGGTGCCCAGGCATCTGTCAGACTCAGGCA-GGTAAGTAGGGGACCCCTGGCCCCCACCC--CGGCCCTGTCCCGGCCCCGGCAGCCA--------GACTCTTAGCTCTTTCTCAGATTTCTTTCCATGTTGCTCTGGGGCCGGGAGTCCAGGCAGGAACGAGCCAGAGATTCCGTGGCTAAGGGGGAGGGTCCTCCTCTCTGCCAGCACCCCATGGCCCTTCTCCCACCGTCCTTCAGGATCCGGGAGGACCTCCTTGTCCCCCCTCCCGGCCCCCCTCAGCATCCACCCCTCCTCGGCCTCAAAGCCAGGCT--TCGGGGTAAGGAAGGCTTCTAGGGCTCTGGGGAAGGCCGTGGGACAGGAAAGAGGCAGGAGGTTGGAGGTGAAGG--GATGGGAAGAAAGGCTGCAGACAGGTAGGTGGAGAGGGTCGCACG-GGTCATCCACGTGCCCCCCAATGTCGTGGATC-----------TTTCCATTGGCCAGGC-ACAGGCCCGAGGCCTCGAGGG-------------CCCCCCAGAGGGGCCCTGGAGTAGGTGAGAACCAGAGACAGACTGAGCTCAGGGATGGGGACGGAGCTACCAGCTCAGACGACCTTAGGAAGAGAAAGCTCAGGAG---GAGAGGAAGAGGAGGGAGAAA--AATGATTTCTAGACCCAATGAGAAGAGGATATCCCATCGGCCTCTGCCTCCCCCAG--GGCTATCTCCgaaagcac---actggtccttggag----tcaggagacctgggttcaaatcgggccactaaatgcaagactctccttctctgagc------------ctcagtttct--ctacctgtaaaatTGGAGGCGGGGGGGGGGGGCTCTCTGGGGTGTCCTGCAATTCTGTGATCATTCTATGATTCTGAGAAGTGACC a score=3312 s mm8.chr4 129551948 110 + 155029701 CAGCTGATCTCTCTGGACCAGCATGTTGACATCCTGGGCTCCCGGCCTGTGGGTGCTCGGGCTCTGGGCCACCT---TCAGCCATGGGACAAATATAGGTGAGCTGACACAGG s monDom4.chr4 10163091 111 - 430141050 CAGGGGGCATCCGGAGACCAGCATGCGGGCAGCTTGGGCTCCAGGACTGTGGCTGGTTAGCCTCTGGGTCACCTGTGGTGGTCACGGAGCAGAGAGCAGCAAG--GACTCAGG a score=3516 s mm8.chr4 129552184 49 + 155029701 CCTGTGTGAGTGAGCTGgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt s monDom4.chr4 10163764 49 - 430141050 ccTATATAtgtgatgtgatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt a score=3837 s mm8.chr4 129552265 781 + 155029701 GAGAAGCTCAGTACATGCATCTGTATG----TATTCCTGGATCTCT-----------GGGCAGTGGGGAGGAAACAGGCTCCCTCTGAGGCGCATCTTTACATTTCTTG--CTGTCTAGCGAGAGGGGAAAGAGCAGAGAACCACACTCTCCCTCCAAAA---GGCAACACTTCCGGAAAGCTGC---CCAGCCCCTCTGTTCCCTC----------------TCATGGTC----AGGACTCC--ATCCTCCAGGCATAGGCTCCTCCTTTGCACC--------------------AGCCTGGATCT-----------------------CTGATGACTGCCCACCCCATGGCTCAGCCTCTGGACAGGGAGAGGG-------------------------TGCAGCTTTCCAGGGCTCAAAGCCAAGGGAAATTGACCAGGCAGTCTGCCTGGCCTTGCTGGGTGCCCTCT--GGGCTTGGTAGCTGCATCACCTA-----------------TCCAGGAAGGAGCCATACTCCTAGGG----CCCAAGTCCAGGCATCTGGGGTGTGTGAGACTGCTATTGTatgcacatgtatgtgtgcacaccatgtatatgtgtacatgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgcgcacgcatgcgcacACATGCACATGTGTTTCTGTGTGTGTATTGAGAGTTTTTCCCTCCTTTCCCTCACTGGGTCCCTTAGAGGGCCTGGGGCAGAGGATTTCAACATCTGTAAGGAATCTGGGCCCATTGCCAAG-GGTGAGTCACCCATTGCCTGGGAGATGCTGAAGACAGTGATGGTCTTTCCGGCCAGACTTGGGGGTGGAGATTCCAGTGGGTCACTGTGCCCAGGGACACAGAGCTCT-ATCTTTCAGCTAGGCT s monDom4.chr4 10163839 856 - 430141050 GTGTATCTCTGGGAATGGGTCTGGGTGGGATTGGGTCTGGATCTCCTGCTACATGGAGGTGAGTGGGGGAGAAAGGGGACCCTCCTG----GCCCCCACAGTGTGCCTGGGCTGCCT---GTGAGTGTGTTGGGGAGGGAATGGCCTTCTGCCAGCCCAGCCCGGCCCGGCCTCTCTGCAGCTGCAGACCAGTGCCAGTTGTCCATCCGGACTGCAGAGAGGATCTCGGTCCAATGGGCCTCCTTCTCCTCC---------CCCTTCCTTTGCTCTCTGTGGGATGTCGTGGGGTGGGGGTGGATCTGAGTGGAGCCTCCTCGGGAGGTCCTGTTGCCTCCTCAGCAC---GGTCAAACTCGGGGCGAGGAGGGGGCTACAAAGGAGCCCAGACAGAAGGCTGGGCCATCCCCAGGGTCAGTGCCGGGGGAAATAGCTTTGGCATCATTCCTT------TTGGGTGCCCGCCCAGGGGCCGGGAGAGGCGCTGCTTGCTTCGGGATCTCCGAGCTTGCGGAGGGCCCCAGAGCCCTTGTGTCTCCCCACCTCCAGGC-CGAGGAGCCCCTGGGGCCAGCA--GCAGGCAGGCCGGGGAGTGGGC----TGGCTGCTGGTGCCGGTGCCTGGGGGCGTGCGTGCTCCGGGATCCGTGTGGCTACATGTGCACACGTGTATGTGTGCTTCA---------------------CCCGCTCCCCTCTCCGTGAGTCTCCTCGGGGGC-GGGGGCAGCAGATTTCAACATCTCTAAGGAATCCGGGCACCGTGCCAGGCCATGAGTCACAC-------GGCCGCTGCCGCTGCTGGAGAGGGCCCCTCCGGCGGCACATGGACGTGGGGAGTGCCAGAGCTC-CTGGGCCCA-ACACCCGGGGCTCTCCTCTTCCGACTGGGCT a score=7397 s mm8.chr4 129553501 972 + 155029701 GCGTGTATAGTCATGTATACACCGCTGCATGTAACACCAAGGGT----GCACAAAGCTCATTTCT---TCTGTTCCTTAGGAATAACACTAGAAAGAACATGAGCACGCTCCTCACTGCCTGGGCTCTGACCCACCTAGCATTTCTTGTTTCTTTCACTCCCTGTCATAGTCCCAGCCCCAGCTGGGGTTGTTGGGAGACTGGGGTCTCCGGACTCTG-----GTCCTGTTCTGCTGTTGATTCACTCAGCAGCT---TTGGGACAGATCCCAGATCTCAGC-----------CCTCCCTGCTATGTGCTGGGTTC-----TCCCTGCGCAGCCAGGTCAGAGGCCAAGCTTG-----------------AGCACAGCATTAAGGCAGACTAGGTTAAAGGTCCCGAAGAAAGACTATGGACATGTCCCCTCCTGAGAATTCCCGGAGCTCTGCTGGGCAGTCGCCCTCCTGAGTTCCTAATGCTCCGGGCCAACTCTGTCCCAGGTGAGCGGTGCCCAACTTCACAGCAAGAAGGACTCAAGCTAGAACACAGTAGTGACCCATCAACCAACGTGACTGGTGAGTGC--AGCCTCCGCCAGCCCTTACCCACTTCCTGGAGTAGCCTGTGCTTCTCCTCAGCTGT-GCTTCTCCTCTGGTGTCCCAAAGGCTTCAACCTAATCCGCCGACTGAACCTCATGAAGACATCTGCCATCAAGAAGATCCGCAACCCCAAGGGGCCACTCATCTTGAGGCTGGGGGCTGCCCCAGTGACCCAACCAACTCGGTAAAGGAC--------TCTGGGAAGCCTCCCAGAGTTCATAGTGACCTCAGCCACACCCCAGGAACTCTGACCCTAGAGGCTATTTTGGGTACCCTCCTGCCAAAACTCTA-CCTATTGTCCACCA--CTGGGCTTG------------CAGGGTGGGTTTT---------GTGTGTGCGTGCTGCCTGGAAACCCAGCCTGGATCTCACAGGCAATGGCAGAACCATGTTTAAATCCCACAGTCAC-CCTGAGAATCCCAGGGTGA s monDom4.chr4 10164782 982 - 430141050 GAGTGCCGATCCTTGGAGCCACCGCTGAGTGTGCTCTGAGTGGCCATCGCACAGGGCCGTTCTCCGGCCCTATCCCTTCTTACGCTCACT-----GATGATGAGGAAGCTGCTCTAAGCCTCTCCT-TGTCCC-----GCGTCTCCAGCCTTCTGCCACCCTGGCCAGTGCCCAGGGGACAGCAAAAA------GCAGGCTCAG--CTACGGACTCCACAGCTTCCCTCCTCGGGCCTCGGCGTTCTCATCCATCAAATGGGGACGGTGTCCATCTCTCTGCTCAGGGTTTCTCCCCTCTCTTCTGTTCTGCCTTTACTCATCTCTGTGCCTGATGGAGGAAGGTCCTGTCTGGTTCTCCTGCAGCTATCAGGGCAGGAGGAAGGTAGGGCAGGGCCAAGGCT--------GGACTTC---CCTGTGCCTTCTGGGGACCATAAGCCCCCCAGGTGCCCAAGCTCCCCAGAGCGTGCCTGGAGCTCCTG-CCCGCTCTCTTCTAGGTGGACCATGCCCAACCCTGCAACAGGAGGGCCTGAGGTTGGAGGCCAGCGAAGAATCATCGGCCAACATGACGGGTGAGTGCCGGGGCTCCCCCAGGCC---CCCCGTCCCTGGCATCGCCCGCCCCTTCCCTGAGCCGCCTCAACCCCTCTTCCCTTCCCCAGGCTTCAATCTCATTAAGAGGTTCGCTCTCATGAAGGCCTCCACCATCAAGAGGATCCGGAATCCCAAAGGGCCCTTCATTCTGAGGCTGGGGAATGCCCAGCTTGCTCTCCCCACAGCGTGAGTGACCCCGGGTGTCTGGGGGGGATTCCGAAGAACGGAGGG----------CGCTTCTGTAAGTCTTTCCCCTG-----CCTCTGGGTGGCC-ATTGCCACCGCCCCAGCCCCATGCCCGTTGGTTTGGGCTCGAGTGCCCAGGAACAGGATGAGTTTTCATGGGGCCAGGTCCGCACGCTGCCCAAGA--------TGGCTATTGCAGGC----------------TGGGTTCCCCCGGGCTCTCCAGGGGATTCCAGAGTAA 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TCTGAATCTCTGTCCTTTCTCTTTCCCAATTTGTCAC--AGATCTCCTTGGAAGTCAACAGCCAGGAGCGGAGTCTAGAGCTCCGGGCACAGGGCCAAGATGGTGACTTTGTGTCCTGCATCTTCCCAGTGCCCCAGCTCTTCGATCTGCGTTGGCACAAGCTGATGCTGAGCGTGGCAGGCCGTGTGGCCTCTGTGCATGTGGACTGTGTCTCAGCTTCCTCCCAGCCTCTGGGACCCCGGCAATCCATCCGGCCTGGGGGACATGTATTTCTGGGCTTGGACGCTGAGCAGGGCAAGCCGGTTTCAGTGAGTACTGGGTCCTGGGTTTTGCTCCCACCTCCCAGGGAGCCTTGAGCTCCTGAGGGTGTTTCTGAGCCATTGCCTTAGCTATGTGGCCTAACCAAGCTAATTTAACTTTCCAGGCCCTCTACCATCCAGGTTCT-----ATATGTCTCCAGCATGTTCCTCGAATCTCTCT s monDom4.chr4 10170140 446 - 430141050 tctatctctcagtcctatgattctaccatcttGCCCCTTAGATCTCCTTGGACGTGAACGGTCATGACAAGAACCTAGAGTTCCGGGCCCGTGGCTTGGATGGTGACTTTGTGTCTTGCATCTTCCCTGTGGCCCAGCTCTTTGACCTGCGCTGGCACAAGTTGGTGCTAAGCGTGACTGGGCGTGTGGTCTCAGTCCATATGGACTGCACATCCGTCTCTTCCCAACCTGTGGGTCCCTGGCATGCCGTGCTTCCCGAGGGTCACGTCCTCCTGGGCATGGATGCTGAGCAGGGCAAGCCTGTCTTGGTAAGTGC---GTGCTGGAGCT---------------GGGGGCAGAGAG-----GAGTTCTCTCCAGGGCCAGGATTTTAGC----TGGCACCACCCAG-GGGTGTGGCCTTCCATGAC--------TGGGGGTTCCCCTTGCTGTGACCCCACCATATTTCCCGTGTTCCTCT a score=12281 s mm8.chr4 129556439 342 + 155029701 TCCCCTGCAGTTTGACCTTCAGCAGGCGCACATCTACTGCGACCCGGAGCTGGTGCTGGAGGAAGGCTGCTGTGAGATCTTACCGGGAGGGGTGAGTAGTTGGCTCCTAGCACATGCTGCGCTGGAGAGGGGGC-AGCCTGCACAGGGAC-------------GGCAGAGGTCTGAGGATGCATCTGCCTCTGTGCTG-----------------------------------ACCCTGGCTACCTTTCTCCCACATT----------GCAGTGTCCCCCAGAGACCTCCAAGTCACGCCGGGACACCCAGAGCAATGAGCTCATTGAGATCAATCCTCAGACAGAGGGCAAGGTCTACACCCGGTGCTTCTGCTTGGAGGAACCTCAGAACAGCAAGGTG s monDom4.chr4 10170600 397 - 430141050 TCCCTCTCAGTTTGATTTGCAGCAAGCTCACATCTACTGTGACCCTGCCCTGGTGATGGAGGAAGGGTGCTGTGAGGTATCACCAGCTGGGGTGAGTGTGGGAACCTTGGGAG----TGCACTGAAGTGAGTACCAGCCCTCTCAGAGGCTTGGGATCATCTCAGCACACTCAGGGCAAGGAACCTAGCCCTAGGTGGGTGGGGGGAGAGGCAGGGAGTTTGGGAATCCCAAGACCCAAGGCCTAGTTCTTCCCCCTTAATTTGCCAAGCAGTGCCCTCAAGAGGCCTCCAAAGCCCGACGGGATACCCAAAACAATGAGCTCATCGAGATCAGCCCACAGGCTCAGGGCAAGGTCTACACTCGATGCTTCTGCCTGGAGGAGCCGCAGGACAGCAAGGTG a score=1246 s mm8.chr4 129557180 458 + 155029701 GGGCAGTGTCCCTGCCTACCCA---------GGCAGCATGCCCAGCCTTTGGCTGCAGA-AACACAAGATCCCATTCATTCAATGTCTGTTTTCTACAACATCACATGGG---GGGGGGGGTGCCCGTGGGGGCAGCCTCAGGGGCCTGAGCAAACCCTTGATGATCTGGGAGGTGTCAGATGCCAAGTTGAAAGGGGTGCCTGGCATCCATGTGCTCTGCCTGGATGCCCCATTCCAGCACAGACCCCAGAACCATCCCTCTGTCTGTCCAGGTGGACGCGCAGCTCATGGGAAGAAACATCCAGAAAGCAGAAAGGGGGACAAAGGTAGAGATGGCG-GCTGAGGGGGTGAG--------CCCACGGTGCCC-TCTGTCTGCCCTGCATT-CCCTCTATAAAACCCTTGGAAGAGATGCTGTACTCCCAC-------TCTCTTCCTGCCCGGACAGAGCTTGGCTGCGCAGTGCCAGCTCTGAGAAG s monDom4.chr4 10173605 398 - 430141050 GGGGGAGGCCCCTGCCCCCTCGCCCACTGTGGGCAGCCAGCCCAGGCTCCGACTCTGGAGAACACATGGCTCCATTCATTAGCTGGCTCCGTTTCCCAGCATCCTAGGGGCACAGGGAGGGGGTTTgggaagggag----agga----------------gaggaaggtgaagttggaaggcaaaaaagggaaaggggggccgggagtgaaattg--------ggggg-------------------------------------------aagaggaggAGCAGCACAGGCTCA-------TCAGGTGGCGGGGGGGGGGTC-----TGGGGATGGAGCTCTTTGGGGGCGGGAGATACTCCCAGCAGGGCTCGTCATTCTGCCCTAAGCTGCCCCCTCCCACATTCCT------GATGCTCTCCCTCCATGGCCACGTCTCCCACTGTCAGGGGAGGGCTGGACCGTCC--CGGTAGATCTGAGTAG a score=-501 s mm8.chr4 129557638 314 + 155029701 GGGAGACAGACTGGGCGGGACACAGTACTGG-GCATTCTC-TAGAGAGCT----GGCTCCTGCCTGCGCTT----GTACAGGGGCTTGG----------------AGCAATGT-TTGGTCCCAGGTTCCTCTCCCACTCCCATGCCTCCTTTTTCTCA--GGTCCACCAGGGGACTGGAGTTAATGAGGTGAGCCTTTTGTCTGCACGGGACTCTAGGATTCTGGTGGGGGGGGGGCATCAGTACT--CCCTCCTTGGATAAAGAAAGGTTTGAGGCTTGGA---GCCTAAGGTGTGGGGGTGATGGATAACGGAAACACCCAACATTCCAGAGGGC--CCAACTCTAGG s monDom4.chr4 10174375 325 - 430141050 GGGGAGCATTCTGGAAGGCA------ACTGACGTTTTCTCATAGAGGGCgtagaggggcaagagtgagatttagagtccagagacctggtttcaaatcctgacaccacaatgtcttggtcacatgcccttctc-----cacaggcctcagttttgtcatttgtgagataagaggctggatt------agttgggctctgaggtgc-cGGGTCTGCAAG-----GCTGGGAAGCCCACTGAGGTCCTTATCCTCCCCAGAGGACTAAAACCATGAGGCCCGCACTGGCCTGGTATGTGATATTG--GGGTTCCCTGAACCCCAAGTTTTAGATAAGGTAGAGAACCCTAGG a score=3465 s mm8.chr4 129558230 116 + 155029701 GTGCTGGGTAGGGCTAATCTCAGAGG---CCCAGAATTGAC----CTGCAGGCCTGTTCTTGCTTTTC-AGTGCCCACCCTGTGCCCACAGTGCCCGGGAGAGCAATGTGAGTCAATGAAGGAG s monDom4.chr4 10175626 123 - 430141050 GGGCTGGGGGGGGGCCCTCCTGGGGGATCCCCGAGGCTGACTCAGCTGGTGACCAGGCTTTCTTCCCCTAGTGCCCACCCTGTGCCAGCCGTGCCGTGGAGAGCAATGTGAGT-GACGAGGGAG a score=2639 s mm8.chr4 129559165 570 + 155029701 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monDom4.chr4 10182363 747 - 430141050 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CAGGCCACAGAGCTAATTCTGCTGTTGCTCATC--------AGGGTATCAAGGGAGAGCGAGGATACACTGGCCCCTCGGGAGAGAAGGGCGAATCGGTAAGCTGCAGCATGGGTATGGATGTGAGGTGAGCGTCAAGCAGGGTGCCCCCCCACCCCCACCGCCACCTTCATCCGCTGGACTGGAGATCTTCCTGTGAGGAGGAGCCAGTGAC----------------CCCTGCTGCCCCTGCCCCAGTCACTCCAGCTGCTGCTCTGCACAGGCT----------------GGTGGCTGCGGAGGCGGAGGCAGAGGCTGTGAGGAGATCCTAGCAGGCTTCTTGCAGAGAAGTCAGAGGGAAAGGGCCCAGTCAGCTGGCAGAATTCCCCTCTCCTGCCAAATCAGGGCCAGGAATTtttttcttcttcttcttcttcttctATTGAGGCCACCTTCATGGGGGTCCTACACTGAAGGAAGGAGCTGAGGACTGCTAGCATATGAAGTCACAGGCTCCTGAGTGACATGACTCACCC----AGAGGCCTGCAGCCAGCCAGGGAGTGAGTTAGTGGTGGAGGA-----------GGGCTGGGCTGGAGTCCATGTCTATCTGCTGAAGAACCTCAGCCCTCATAGCCGGGATCTGCTAAGCTAGAGCTGGAGCCATCTCTCCCCTTCTC s monDom4.chr4 10217922 609 - 430141050 CGGGCGGTGGGGCTAATTTTGGCTTTTCTACCTGTGTGCCAAGGGCATCAAGGGAGAGCGTGGCTACACGGGTCCTGCCGGGGAGAAGGGAGAGTCGGTGAGTCACGGCCTCGGAGGGGGTGT--GTTGATCCTGGAAGA----------------------------TTATTCTGGAAGCTGGA-----------GAAGAGGAGACCATCACAGCCCCCACCCTCACTTCCTGCTGCCC---CCTCAGCCTCCCCAGCTGTATCTCATCGTGGGCTCCTCCTAGTCACAGCCGCTGGTGTGGGAG--GGAGCAAGTGGGTGCCCAGAG-CCCTAG--GGGTACCGGCTCTAGAGTGAGAGGGGAGAAGCGCTGG-ACTGGGTAGAAAAGC---CTTCTGGATTGCGAGGGCCTCGCTGTGCGTCCTGATTCTGCCCCCTGCCCCAT---GTCTAtcctca---------tccataaaatgagggggttgggcttggatcacctctcgggtccc---ttccggcttcaaatctaccatcctgtgaGAAACCC---TCCAACCCCGGAG-GATTGATTTCCGGAGCATTCATCCCCAGGGCCAGGACGGGAATCCGGGTCTCCCC--------ACTCCCGTCCTGAGGCTCGGCCTCTATT---TTAGAGCTGCCTCCCTCCCCTCCTTCCTC a score=6778 s mm8.chr4 129588071 295 + 155029701 CCTCACTCCTCATGTTTCTGAGTGACTGATTCTGTTACTTTGCGTCCCCAGGGCCCACCAGGATCTGAAGGCCTTCCAGGTCCCCAAGGTCCAGCGGTGAGTGCCGGGCACggggtggggtggggtggggtggggtggagagtgggggtgggggtggggGAGTGCCCTGGCCTCTCCCTGCGGCCCAAGAGACAGGAAGACTGGGTTCTCATCTGCATTCTCCTCTGTGGCAACAGGGTCCCCGAGGAGAGCGAGGCCCCCAGGGGAGCTCTGGAGAGAAGGGTGACCAGGTGAG s monDom4.chr4 10219209 252 - 430141050 CTTGATCCTTGAACCTTCAAGGTTGCTCATTGGATTTATCTCGGCCTCTAGGGTCCACCAGGCGCTGAAGGTCTCCCAGGCCCCATAGGCCCTGCGGTGAGTA---------------------------TGGAAGGGCTCTCAGGGGAGGTGGTGGGGAGGTGC-------------TGAGAGGAAAGA-AGGCGAGGGCAAGGCACCCATTTTC-TTTTCCTGTG-GGTGACAGGGTCCCCGAGGAGAAAGAGGAGCCCAAGGTGGTGCTGGTGAGAAGGGAGACCAGGTAAG a score=8205 s mm8.chr4 129588482 382 + 155029701 TCCAAGAAGGGGGGGCTGACC--TCCTCATTTCTTCCCTTAGGGATTTCAAGGCCAGCCAGGCTTCCCAGGCCCACCGGTGAGTAAA---GACACAGAAGTTCCCTGTAAGGC----GGTCCCACTGGGAGGAGCAGGGCCTGCCGGATGAAGATGG----ACCTGGGCCAGGGAGGTAGGGGGTGGGAGAAACAGT--------------CCAAGTGGCTGTGATAGA----TTTCAGGAGCCAGGTAACCACGGAGGGTCAGGC--AGATAGATGGCGCCCACCAAGAAGGTAGGGGGAAGAAGCCCCGCCTCCAGCCCTGCCCACTTCTTCATTGACACAGGGTCCTCCAGGATTCCCAGGCAAAGCTGGAGCTCCTGGCCCACCTGGCCCCCAAGCAGAGAAGGTGAGCCG s monDom4.chr4 10220185 409 - 430141050 tcacataGGTAGGAACTTACCATTCCTTGTTTTGTCCTACAGGGATTTCAGGGGCAGCCGGGCTTCCCAGGCCCACCGGTGAGTAGAATTGAATCAGGAATATTGTAGAAGGCCCTTTGCCCTGATAGAAAGAAT-GACCATGAAGAAAGAGGGTGGCTAAAGTGGGTTTAAGGGAGCGGGGTGGGTTAGACATAGGAAGTTAGGGGAATATGAGGTGGCTAGGACAGAGAGTTTCCTGCTTCCAGAAGATG--GAAGCATCATGTCTGGGAAGAGAGCAGGTGCTGAGAGATTCACACAGAGAGATCATGGCTTGAAGTCGGTCCCCTCTGTTCTT---ACAGGGGCCCCCAGGATTCCCAGGCAAAGCAGGACCAGCTGGCCCACCTGGCCCCCAAGCTGAGAAGGTGAGCAG a score=1653 s mm8.chr4 129589757 113 + 155029701 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GGGCCTTGGTGGGTGAGGACACAGGTTCTTA-GGGAGACTGTGTGGAatacattagtta--gtcaacgtagaaccaggacaggaagccagatgtcctg-----------------actcccagG---GACCCCCTAGCATCCCTGGCC--CTGACTTCATTGGGTGTTCCTG-----TTTCAGGGCAGTGAAGGGATTCGAGGTCCCTCAGGCTTGCCTGGGTCCCCTGGGCCACCCGGCCCTCCCGGGATTCAGGTGAGTGTGTGGCCTCTGGGCCC--GATGGCATGTGGGATGGAGTACCTGTGTGAGTGTGTGTGCATGTTGTGGTAACAGTGTGAGTTGGGTAAGAGGTGGAGCCAACCATGGGGCTGGGTCAGACTTCCCTCCTCCTAAGCTCGAGAGCAGCATCTAGCCACGCCTTTCTCGTGCGCAGGGCCCTGCTGGGCTGGACGGACTGGACGGGAAGGACGGCAAGCCTGGCCTGAGGGTAAGATGGGGCTGGATGGGAGG----------------------CAGGAGCCCTCCCT------------------------------------------GCTGATGAGGTG-------AGCTGGAGTCGCC---CTTTAA--------------TCAGGGTATCCAAGTCTCCTCC--------------------CGGCTGGCCTCAGACTCCC----------------CTGAGTCTCTCATGCCTCCTAATAGACTTAGCCAGGTTAAGTGAATTGGATGGT-GACAGAGATACCACTTAGATCCCGAAACCTGGACAGCTGGAGGAAGTAGGCTGTATTCTGGAAAGAATAAGGTTGTAATCATGACAGGCCTA-AGCAGGCTCTGGCTCCTTGGTTGAGATTTTTCTGGGC---AATCAGAGAAATGGGAACATGG----------CAAAGCGGGGGGGGGggggggggttgtggagct-atcaaggtcatttcc---catccttaacaaa--aagaaaccaaaccaaggcccacagag-----------gggctggga--------ctcgttcacagtccccagtcagtcagaggctgagccagactgggaTTTTTTCCC---TCTGTCCCATCTAAGGTTCCCAGCAAATCCTGGGGATGGAGATTCAGAAGCAGAGTGGGGCGGAGAGTGG---------------GTGTGGTCAGGGCTGAATCAAACCTCCTCAATGCTTCC----TTTTCTTTCCCTAGGGGGACCCAGGTCCTGCTGGCCCTCCCGGACTCATGGGACCTCCAGTAAGTTGA------------------------------------------GCTGAAGGAAG------------------------------------------------GAGCCGGGAGCTCTGAGCCCCCCTCCCGGCTCTCCTCGGAGCCTCCATGTCCTCATGCTATGGTTGCAATAGACTCTACTGAT-----ATAGCCTGCGCAGGAAGGTGTGGGGGCATCTCGGGTATCAGATCTCGGGCACCACATCTCCCTGCTTTTCCTTCCAGGGCTTCAAGGGGAAAACAGGTCATCCTGGCCTCCCTGGGCCTAAGGTAAGAAGGAGGAC------TTCAGCTCAACAGACTTCCCCGGTCTCTTCAGACCCAACGCCTGAGTTGGG----CAGCCCAGCCTGGG--------TTTAAACTGCCTGCCACCTGACCCCTGGCTGAGCTGCTACTCCAGGCCTGGCTTCCTGAGGCCACCAGGGCCCAGCAGACTGGGTCGGGATGCTGACACC-----CACCAGCTTG-AAGAGTATC-----AGAGGTCCTCTGGCCAAAGC----CAGAGCAAGATGTCAGAGCTCCCTTGATCCAGGGTCA----ATGTGGGGGTGGGGATACCAAGCCAAACTGCCACCTCTCTCTTTTAGGGTGACTGTGGAAAACCCGGTCCTCCTGGCAGCAGTGGCCGGCCAGGGGCAGAGGTAAGGACTGGGGTTCTGTGGTCATGCGGCCTG---------------GGGCTCCACTAAGTCTGAGATGTAGCCTCTCTGCTGCATTATCTTCCCATTTTCTGCATTAGAGTGGCTGACTTCTCTCCTTGGCCTTCTGGTGTGAAATTTCGCCCGCTCCCCGGCCC-----CCCATCTTGACAGTTATAA------CTGGTCCCCTCCCTAAGAGCACCATTGGACAACCACCCAAAAGGCAGGCCTGGCCTTTAAGGCTAGAGTCTAAAGCTCAGAGCTCTGTCC-----------AGCCCTCCATGGCACCACCACAAGCTCTGCTCATCTCTCCCCTGAAAGTAGCCACGGATGTGCAGGTGAGTGAGTTTCTGTGTCACCTCTTTCTTTCTGATCCTGCAGGGTGAGCCCGGTGCCATGGGACCCCAGGGACGACCAGGACCCCCAGGGCATCTTGTGAGTT s monDom4.chr4 10225442 2299 - 430141050 GGGTTGTGTTGGGGAAAGACAAAACCGTTAACTGTAAAATATTAGAGAAATGTAAGTTATTATTAACCACTATCTAGAACAAGAACCCTGGTTTCCAGTAGTCATAAGTTATACTACTCTTGGGCCAGGCCCACCCCTACCAAGGGTAAGTAGGCTCTATTGACTCTTGCTGGGGTTTTGCAGGGAAGTGAAGGAATTCGAGGACCCTCAGGCATGCCAGGACCTCCAGGACCTCCCGGACCCCCTGGCATACAGGTAAGGGCTT---CACTCGTCCCAGGATACCTGGGGGAAGGGAGCAGCTTCAT---------TCCCTGTGGCCTTCAC--------------------------CAATCCTGTGCCTG----------------TCCTGGGCACGTGG--AACACTTA---ACGTCTCTCTACTTTTCAGGGTCCTGCTGGCCTAGAGGGGCTAGACGGAAAAGATGGGAAGCCTGGTTTGAGGGTAAGATGAAGATGGTGGATAAGACAGACTGGAAAGTTTTGTGGTCAGACTTCCTCCCTCATTCCAGTCCCTACCAAAAAATAAAGTCTTAGAACCCTCTAGATGTTGGGGTTTAATCATGACAAGAATCCTCTGCCTTTGGCAAAGCCATAGATTTCAGGGCCTCCATTTCTTTCCTGATCTCCCTGGTGAGAGCTTCGGCTGTCCTTAGGCACCTGGAAGTTCCTGTTTTTCTGAGGCTTTTTGGTCCTCCCAGAAACCAAGACAAG--AAGCAAGATGAATGATTGCCTAAGTTACCAA---------AGAAACCAGACAGTGAGGCGCAACAAG----------------ATCAGGCTGCAGGCTTCAAAGGCCTGGAACAAACCCCATCTCCTTGTGTCTGGTTTTACTGGGCTTCCATCAGAGAAGTGGGA-CGTGGGatggaatcctaaagcattacaactgcgagggacctcaaaattcatgtagaccagctgcttgcctcctttatagacggggaaactgggccccagccagaagagatttagccagagggagggaatggcaaagccagggccaggaccccagtcctttgatgcctagtcaaggctcAAGTCATTGTCCATTTATCTCCCATTAACACTCCACGTCCCCTTC-----------ATCCAGGAGT---GTGGGAAGGGAGGGGGTTTCTGACCCTCACAGGGCAGACATAACCGGGCCAGACCTCTGTCCTGATACCCCTGTTCTCTTTCCTTAGGGGGACCCTGGTCCTCCTGGACCCCCAGGACTCATGGGGCTTCCGGTAAGTTGAAATGCACAATAAAATCAGGCCACTTAGAATGAATGGATCTCTGCAGAAGGAAGCTTGAAGTAAAGGCCGGAGGACTCCACTCAAAGACTTCCTAAGAAGGGAAGCCATGGGCTCTGGCCTTTCTGCCTCCATCTACTTGTTGCATTCAGAGCCACAAGACATGATT---CTAGATTTTGCTGTTTAATGAAAGAGTACACAGAA------GAAGGTCTTCCTCTTAT------TTGAGAATGACCTCTC-----TTTTTTTCCCAGGGATTCAAGGGAAAAACAGGACATCCAGGCCTCCCTGGGCCCAAGGTGAGTAGTGGGGTGTCCCTTCCTGTTGGGAGTTCTTACGCTCTCCCTGGTGACCTGACAC-TGGGTAGAGGTGCCAGCCAACCCAAGAATGCCCATTGTCATCCTTTAGGCATTCTAGATCTCTCTGCCCC-CTTCTTCCCACCATGCCACATGCAGCT-CTAAGGCCTAGAA---TAGTCCCTGCTGCTTCCCTCACTGGCCCCAGCCCACAGGAGTCCCCTTCTAGAGG--CTCTGGCCAGGGCTGACCATTGCCA-ATGACACGTGGCTTCTGAGGGAGGCCCATGACACACGGGCCTGGGGGCTCCAG------CCGCTCTCT-TCTCTTCCAGGGTGACTGTGGTAAACCAGGTCCTCCTGGCAGCAATGGACGACCGGGATCTGAGGTAAGGCCTGGCTCTGTTCTGCCAAACTGTTTGAATGCCAGCATTCTCAGGAGGCACCGAGTACG---TCTAGCC-CTCCAAGGTAGCACTTACCCA------GACCCAGAGCCCTCGGCTTCCA-----GGCTCTCAGCGGCCTGAACTCGGCTGTTCCCGGGCCCAGCTGCCCAGCCT-ACTGTCGTCATTCCGCCTTGCCCCCTCTC----------------------------------GCCTCGTCTTTGACGATTTCGTCCATCTAATCCAGCGCTGGCCGTTGCAAGGGGAATTTGCCTGGTCTCTTGCACACATCCCTCTGATGTACGGTGTAGGAGAAGAATTAGCTGTGGGTGCGAATTAACTCTCCCGTTTCTTCCCTTTCCCTTGTCCTGTAGGGTGATCCTGGCCCCATGGGGCCACAGGGAAGACCCGGACCCCCCGGTCATGCGGTAAGTT a score=5507 s mm8.chr4 129594890 582 + 155029701 AGGAAGGAGCAATTTCAGGAGAAAAGAA--------------AGCTAATGCAATGT--AGGAACGTTCCTGCTGCC-TAACCGCCCTCCAGTC-------------TGGTCTGTTTGTTAAAGCCATTACTGTGCCATGCCTTGACTCTCATGCCTTGACTCTC---CTCTCCTTAGGGGCCACAGGGTCCTCCAGGCCAGCCAGGTCCACCTGGGCTCTCCACTGTGGTGAGTGACTTCTACCACTTACTCTAAGGAATATTGCTGTTTCTGCT--GTGGGCT--CCTACACCAAGC-----CAAAGGGATGAAGAAATGACTTGCTTTCATTCCCTTCC-TTGGACATCTGTCCTAAAGATGTCTCTTCTGGGATAAGGCAAAGGGCTTGGGCCATCCTAGGGCCATGCCACAGGCACAGGCATGC-------CATCTGTTCC-----------------------TGTGGGGCTGGGCCCC--------------------TGGAACATGGCAAG-----------GGCTTTGTG---GCCTCTGCCTCTCCTTCTCTCCAGAAATCCTCATCCTATTTTATTTTTTTTAGGGCCTGAAAGGAGATCGGGGAGTCCCTGGAGAAAGGGGCTTGGCGGGCCTCCCAGGCCAGCCTGGCACACCCGGACACCCTGGCCCTCCAGTAAG s monDom4.chr4 10230397 654 - 430141050 AGGAAGTCCCAGATTTAGGAAATAGGAAGCAGTTCTTTTTTTAGCCACAGCCATGTTAGGTATTGTTTTCATTACCATCAGTGCCTTCCTTTCCATTGCTGGGCTATGGAGTGTTCCTGTGAGCCTTCCCAGCTGGCCTTTTCCATCCCAATTCGTTCTTTCTCTGTCTCTCCCTAGGGTCCCCCTGGTTCTCCTGGTCAGCCTGGGCCTTCTGGGATCAGTGGAATTGTAAGT-------ACCAATTACTCC------TGTTCATTTTCCCTCCCAGTAGGCCTGCCTAGCTCAACCATGAATAGAGGGAAGAAGAAACCTTTTGTCCCCATTCCACGCCATCTGGTGTCAGCCTCTGGGGTACCTCTGCTCC-CCAATGCA---TGCATATTCAATCTCA---------CACACACATATGCATGCATGCGTGCATCCATCCACTGATAGAGAAAATGGAGAAGAATGGGGAGCCCTGCACCATCTCCCCATAATTACTCATTAGAAAATGGAAGGAATAGGAGTGGGACTTAGTGAATGTTCATGAAACGTTTTCTC---------CCTTCTTGTCTCTTCTCTTCTCCAGGGACTCAAAGGAGATCGGGGAGCCCCAGGAGACAGAGGTCTTGTAGGTCTTCCAGGTGAACCTGGCTCCCCTGGGCACCCTGGACCCCCAGTAAG a score=3762 s mm8.chr4 129596764 215 + 155029701 GAGGCTGTGTTGGGTGACAGCTCATCTTGTTTCCGATGCT-------CTCTGCTCCCCAGGGTGAGCCTGGTTCGGACGGTGCAGCTGGCAAAGAGGTACTGTGCTCCCTGTCCCTGTCCCTTGGGGACACCCCTTCCTGGTCCTCCCTGTGTTCCGTTCCTCATCCCCTCCGTAA---ACACAGCACATGGGGGGCAGACTACCTCCCACAGATACTACACCCA s monDom4.chr4 10233883 203 - 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CTTTCCTCTGCAGGGTGACCCTGGGTCAGCAGGACAGAAAGGCCAGCCTGGAGAGAAGGGGAGAGCTGGCATGCCAGGAGGACCTGGCAAGAGTGGCTCCATGGGCCCTGTTGGGCCACCAGGGCCTTCTGGTGAGAGGGGTCACCCGGGTTCTCCGGGGCCCGCTGGAAGCCCAGGGCTGCCTGGACTGCCTGGAACAATGGTAAGGAG a score=6424 s mm8.chr4 129599159 174 + 155029701 TTCTTCTCTTTCCT-CAGGGAGACATGGTGAATTATGATGATATCAAGAGGTTTATCAGACAAGAGATCATTAAACTGTTTGATGGTAATTG-------GCAGCCGGCTGGGTGGCGGTGGGTAAT--GCTCGCCCTTCCCAGACACTTCTTCACCCAGCCCT------GCCTGCGG------TTTCCTTGAAGCT s monDom4.chr4 10235729 193 - 430141050 tctttctctgtctTACAGGCAGATGTGGTGAATTATGATGAAATCAAGAGATTCATCAGACAGGAGATCATCAAAATGTTTGATGGTAACTGATCATGTATGGCGGTCAGGGTGGGAGAGGGGAACCGCTTCAACCTTTCC---CCTTTCCCCAGGCCACCCTCCGCTGGCCTGCAGTAGCACTCCCCTTGGAGCT a score=13175 s mm8.chr4 129600080 207 + 155029701 GCCTTTGTC--TGCTTGCAGAGAGGATGGCTTACTATACCTCCAGGATGCAGTTCCCCATGGAGGTGGCAGCAGCTCCAGGCCGGCCAGGGCCTCCGGGGAAGGATGGTGCTCCAGGTCGGCCAGGTGCTCCAGGGTCACCCGGGCTCCCTGGTCAGATAGGCCGAGAAGGACGCCAGGGTTTGCCAGGAATGAGAGGTAGCTCTACCT s monDom4.chr4 10237108 209 - 430141050 GCTTTGGTCCTTTCTCACAGAGCGTATGGCTTACTACACGTCCAGGATGCAGTTCCCCGTGGAGATGGCTGCGGCTCCTGGCCGGCCAGGGCCCCCAGGAAAGGACGGGCCTCCAGGCCGACCAGGCTCTCCAGGCTCTCCTGGGCTTCCAGGACAGATCGGCAGAGAAGGCCGGCAGGGCTTGCCGGGAATGAGAGGTAGCTTTGCCT a score=7570 s mm8.chr4 129600374 188 + 155029701 tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtATCTCACGATCCACATGGCTGTCATTTTTCTGCTTAGAAATGGAACTT---AACTCTATTATTtttgtctcaggactgcctggtaccaaaggtgaaaagggagacatTGGTGTTGGCATTGCAGGAGAAAATGGTCTCCCTGGCCCTCCAGGTAGGATAATGCAGC s monDom4.chr4 10237920 191 - 430141050 TGTCTGTGTGTGTCTGTAGAGCTGTACCGGCCCGGCCAGCCCGGTGTAACATTTTCCCATGCAGGTAGGCCTTCTTACTTTCATTGCCCTTGTTTCAGGGATGCCCGGGACCAAAGGCGAAAAAGGAGACACTGGCATTGGCGTTGCTGGAGAAAGCGGTCTCCCTGGCCCTCCAGGTAAAAGGAGGCAGC a score=22676 s mm8.chr4 129601154 2359 + 155029701 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s monDom4.chr4 10238754 2290 - 430141050 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AAGCCTGGAAATACCCATTATCAGCCTTGTTCCTGAGCCTCGTTGGGACTGGGAGTGACAAGGTGGCCGCTCTGCTGGCCATCTCGGTGCCCACCTTGGACGGGAGGGAAGGGGGGTGGAATCCCGAGGCAGAAGTCCCAGAAGTCGGGGCAGCAGTCAGAGACGGTGCGGTTGCAGAAGAGGTCACAGTAACAGGTGGCTCCCAGGTAGGGCAGGGCACACTCGTCAGCACGGCCTCGACAGCACATGTCCTGCTCTTGGCAGTATCTGCCACCGGCGTCCCGGATGCCCCGCAGGTGCAGCCCTGGCGCCAGCTCCCTGCGCCAACGACTCCGCCGGGCCTCCAGGGCAGCCTGGCCAGCCAGCAGCAGCAAGAGCAGCCC-CAGCCAACATCCCCACATGGTGCCT s monDom4.chr4 10305602 384 - 430141050 aaacctgggtctcctttctctaagcccAGGTGAAGGG----GATGGGGGGGGGGGGGGCAAG-----------------CAGATCCCTACATACCTTGGATGAGAGGGAAAGGGGGCGGAATGCCCAGGCAGAAGTCCCAGAAGTCAGGGCAACAGTCGGAGACAGTACGGTTACAGAAGAGATCACAGTAGCAGAGGGTGCCCATGTAGGGCAAGCTGCAGTCATCCTCCCGGCCTTTGCAGCAGAGGTCTTGTGCCTGACAGTAGGAGCCACCTGCATCCCGGATGCCCCTGGAGTGTAGGCCTGGTGCCAACTCCCGGCGACTTCGACCACTCCGGGCACTCAAGGCTCCTGGGCCTGCCAGTAGC----AAGGCAGCCAGCAAGAAGTTCAGCCACATAGTGCCT a score=7553 s mm8.chr4 129712584 340 + 155029701 CCAGCTCCCATTGCC----------AGGCCCAAGGCT---GGAGAAAGCCTCCTCACCCCCGCCATGGCTGCCCTCCATACCCTTCCC------CCTGGACACCTGAGTTGGGGGCTCATGGCATCATAGACAGTTGCGATCGGGAAG--CCATTGAAGGTGGAACTCATGGAGCTACTGTAGGCACCCATGTCAGGGAAAATCAGCCAGTCACCTACATCCAGCTCTGGCAACTGAACCTCTGTCGAAAAAAGCCGGTCATAGGCATCGCAGGTGGGGCCATAAAGCGTGCAGGGGAAGAGTGGGGGCTCCGAGGGGAACTCCTGCA-------GGGAGAGGAGGAGGTGGGGTCAGAGAAGGAAGA s monDom4.chr4 8293181 366 - 430141050 CCAGGTCCCACTTTCCCCTTTGAAAGGGCTCAGAACTCAGGGAGAGGGTGGCCAGAGGACCATCTGTTCATCTCTCCATGCCCAGTCCTGCATTCCTACTTACCTCAGCTCAGAGGGAATGGTA--AAACTCAGCTCAGGCCGTGAAAAACCATTGAAATTGGAGCTTATGGTGTAGGTGTAGGCCCCCATGTCTTCAAAGATCAGCCAGTCACCCACATGAAGCTCAGGCAGCAAGACGTCTGTGGGACCCAGACGGTCAAAAGCATCACATGTGGGACCCCACAGTGTGGAAGGGTAAAGAAGTGGCTTGCAATTGAATTTCTGTATCAGATGGGAAGTAGAGGATGAGGGTTTTGCTAAATAAAA a score=2687 s mm8.chr4 129713635 127 + 155029701 CCCCCTTACCTTCACCACTATGGGTATCCTGGGGACAGGGTCCCTGAGGAAGAGTCGGAAGACTCCATAATGGCCCTCATTAAGGTAGTATGCCAGCTTCCTGTGGCCTCCTGGGAACAAGGAGTGA s monDom4.chr4 8295043 127 - 430141050 CCCTCTTGCCTTCACCACATGAGGTATTCTCGTTTCCTTCTCCCTCCTGATAGCTGCAAAAGAGGTATAAAAACCATCGTTGAGATAGTACATCAGTTTCCGGCCACCTTCATGGAAAAGAAAATAA a score=5777 s mm8.chr4 129717594 239 + 155029701 ACCTAGACAGTGGCT--ACACACCTGGATCTAGGGAAGACTTCTTGACTATGATATTCACAGCAGCTGTGCACACGGACCCCGCATAGAAGCGGCCAGGCTCTGCAATGACCTCGATACCGGTCTCCTCCGGAAAGTACTGGGCCAGGGCAGTGTTGATCACTCTCGCCACCTGT------GGTGACAGATCCTGTCTCTACTGTATCCTGAGTCTAAGCTACTGACATGACTCTCCTCCCTTCCCT s monDom4.chr4 8296606 234 - 430141050 ACCTGCACATCAGCCTGGCACACCTTGTTCCACCACGTCCTTCTTGCCAATGATGTTGAGGGCAGAAGTGCACACTTTAGTGCCATAGAAACGGCCAGGCTCAGCAATGATCTCCACTCCACTGCCTTCTGGGAAATATTGGTCCAAGGCTATATTGATCACAGCTGCCATCTGTAGGCAAGATGATGGTCTCTATCAATACAG-------------ATCTCCTTACCTGATCCCCAAACCTACACT a score=9595 s mm8.chr4 129718773 325 + 155029701 TGAGCGTGCACATGCACTTGACACCCCCACCCAT------TCCCACCCCAAGCAGTTACACCCAGACTGCTACTCTCATTCCTGGGGCCGTCCCTCTCACCTCCTCAAATTTGGCTTCAGAGCCCTTAACTCCTGGGAAGCCCCCTCCAAGATCCAGGAGGCTCATGTGGTGGCCAGCCTTGCAGCCCATCTCAAACACACGATGGCAGTCAGCGATGGCCTGTCTGTAGCTCTCAGGTGTGTGGCAGTCGGAACCCACGTGGAAGCTGAGCGTGGCCATTGGTGTGGAAGACACACAGGTAGAG------ACTGAAGTCAGTGTGAAGAGAGATGT s monDom4.chr4 8299983 326 - 430141050 TGGGCCTGGAAATGTCTTTTCTACCTACATTGGTAGAGCCCCCCATCCTAAGCTGCCTTTTCCTGCCATCCCCCTCCAGCTTTGGATCTTGGCTCCTCACCTCTTCAAATGTAGGCACGAAGTTCTTTTTGCCTGGGAAGCCCCCTCCAATATCCAAGAGGCTCATTGGGTGCCCAATCTGGAGGCCCAGGTCAAACACGTGCCGGGCATCTGCAATGGCCTTGTTGAAGCTCTGTGGTGTCTGGCAGCCAGAACCCACATGGAAACTGAGCAGAGTC-----------AAGCACACTGTCAGTGTTGAGTACAGATGTAGGTGTGAAGACACACGT a score=5300 s mm8.chr4 129720512 197 + 155029701 CCTTGGTTGCCTAGAGATAGAAATAAAAATGGAGATAGGGAAGGCCAGTGCTCACTTACGAGGCCCCCACCACAGCCAACCCCAGCTCTCTGGCAACCTGGAGCAGGTGTCCACATGCCTCCAGATGGGCTCCAAACTTGGTGTGCAGAGGGAAGGTGCTTTGACTGTCCAGGGTCTGTATCCGGAGAACCAGCCTG s monDom4.chr4 8300640 186 - 430141050 ccTTGCCAGCACCCAGGGAGAAGTAA-----GAGTTACTGAAGGCAG------ACTCACCAGGCTCCAACAACAATCACTCCCAAGTCCTTGGCAAGGGTCAATAGATGGCCACATTGGTCCAAGGGAGCCCCAAACTTGGTACTCAAGGGAAACAGACTCTCACTGTCCTGGGTCCAGAGTCTGAGGACCAATCTG a score=7354 s mm8.chr4 129721323 333 + 155029701 TTTTCTTGGGGCCCCCTTCTGCCTGGCTGCTGAGGAT-CAGGTCCCTCTGGCAGGGTCACC-----GGACCTACTGTTTCCAGTTGAA---CGTCTGCCATC-TCACCTAGCCCTCGGGTGGTACCGGGCCAGCTTAATCAGTTCCTCCTCATTGTCGAAGGTCAGAAGCTGCACCCCACAGCGGGCTGCGAACTGGATGTGGGAGACGGCCTTGCAGGGGTTGGCGAAGATGATTCTGGAGGGGGCCACGCCCAAGCCCAGCACTTGTTCCAGCTCTCCCTGGCATGGGGAAAAAGCCAGAGTT---------GGGACTGCCCCCTGCTCCCACCTTT--CCT----GACTCTCTGG s monDom4.chr4 8301682 356 - 430141050 TTTCTTCAGGACTATTTTGTCTCTGGGTTCAGAACATTCCTGTTTGTCCCATGAAACCATCAACCAGCACCTGATGCTAACAGTAAGGATTCTTCTGCCACCCTTACCTGGCAGTGGGGTGGAACTTGGCAATCTTGGCAATCTCCTCCTCACAGTCAAAAGTCATCAGCTGGACCCCATGGCTGGCAGCATATTGGAGGTGAGAGATCTGCTTACATGTATTGGCATAGATGATGCGGGTAGGGGCGATTCCCATCCTCAGAACTTGCTCCAGCTCCCCCTA--ATGGCAGCACAGCAGAGGTCATCCCTCCAGGGGTCACTCCCTTCTGACATTCTTAACCTGGGGGACTCTTTAG a score=8332 s mm8.chr4 129722608 184 + 155029701 GCTCACCTGGCTGGCACAGTCAAAGCCGGTGCCCAGGGCAGCCAAGACGAGCAGCACCCAGGGGTTGCTGTTACACTTGACTGCATAGAAGGGCTGGACTCTGGGCAGGGCCTGGAGGAAGGTCCGATGGCGGCTGACCAGCACATCCAGGTCAGCCACCATGAAGGCATCTTGGCGGCCCTGT s monDom4.chr4 8302660 184 - 430141050 GCTCACCCGACTGGCACAATCAAAGCCAGTGCCCAGGTTGGCCAGTACCCGCAACACACTGGAGCTATTGTTGCACTTCACAGCAAAGAAGGGAGTTACTCGGGGTAGCATCTGCTGGAATGTCTTGTGCTGCTCAGCCAAAACCCCCAGGTCAGCCACCATGAAAGCATCTCTCTCATCCTGT a score=633 s mm8.chr4 129722807 105 + 155029701 GAGGGAGATGGGGGATGGGTTAGGTCCTCAGGGCCTCTCCACTTTATGACGAAATCATTACTCTTCCTCTGACTTTCTTTTCCTTTCTTGGCAATTCACtttgtt s monDom4.chr4 8368590 88 - 430141050 GGGTGAAAT--------GGTTAGG---TGGGGTCATTTCTGGTGGATTAAGGAAGCACTTCCCTGACCTTGGTTGTTTTGTGACCTTTTG------CATTCTGTT a score=2778 s mm8.chr4 129723914 139 + 155029701 CTTACCGAGATGGACAACTCCTTGATCTTCTTCAAGACCAGCTGCCAGGCAGATGCCCCTGGCCCCAAG---GTGATGGGCTCTGATGGCCTCAGGTGTTCTGCAACTCCC--AGCAGATC---------CTTCTTGA-CCTCAGAGGGGGTGT s monDom4.chr4 8305380 154 - 430141050 CTTACCGAGTCTGAGAGTTCCCGGATTTTTTCCTGGAGAATCTTCCAAGCAGAGGTTCCTGTCTCTAGGAGCATCACCTGCTCTTGTAGTTCCCCATGACTTCCAACCCCCTTAGGAGTTTGAATGCAGGATTCTGGACCCTCAGAGAGGATGT a score=9227 s mm8.chr4 129756108 368 + 155029701 GGAGGCACTGAGAATGGAGAATCCTGACTTGAGCGGGTCCTGGAAGAGAGCAGATAGCTGTGGCCAAGGGTGGGCTGACCCTTGTTGAGCCCCAAGGCACCA--GGTAGGCAGGCAGCAGGGC--------------ATTCTCAGCTGAAGTCTCTGTTGGGCAGGAGCAGGGGTGCCACTAGGGTCCACAGGTAGAGGAACAGCCCCGCCCAGCTGGCACAGATCTTCACCCACACTGAGGTCCAAGTGCTGATCATCTTCCGGG---TCTCTCCAGGGCTGGAAC----ACACCATCGGGCTCATGAGCCTGGTCCCCAGTACTGTGACCTCAGTCTTGTTCCCTGACCTGATGAGCCAGCTGAGACATCAAACCTCAACCCTGGCTCT s monDom4.chr4 425605076 353 + 430141050 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GGGCTGGGGGGAGACCACTGGCTTCTAGGATA---GGACTCACCTGTACCAATTGGTGAGTGTCATCATGATGTAGAGGGAGGCTAGGAAGAGGCAGAAGTGGAAGAAGGAGTAGCTGTAGGAGACCCCATCTTGCTCATTGTCATAGGCTCGGCCCT------CGACCCTCTGCTCCTGCTGACCCTCCAGCATCACTGGACTCTCCTCTGTCTGCATCAGGCTGTTCACATGCTTGTTATCAGAAGAGCGGATGCTACAGAGGAAGCAGAGGGGAATGGGTTGAGAC a score=6731 s mm8.chr4 129760509 170 + 155029701 CCAGAGCCCAAGCCCGTGGTACCTAATGAAGAAGGTGCACAGGATGAAGATGACGAGGCCCACAATGCTCGGGGCATCCCACCACACCGTGCTGTAGTCCTCCAGGTCCACCTGGCCTGTTCCATTTTTAGTGGGCAGGTGAGGGTTGCATTTTTGGTCTGGGGAAGGAA s monDom4.chr4 425609184 161 + 430141050 CCAGAGACCA---------TACCTGATGAAGATGGTACAGAGGAAGAAGATGATGAGGCCAACGATGCTGGGTGCATCCCACCACTGTGTAGTGTAGATCTCAGGAGGTTCCAAGCTAGTTGAGTTGGTGATTGGGAGGTTAGGGTTGCATTTCTCATCTGAGGACAGAA a score=5337 s mm8.chr4 129760992 168 + 155029701 TCTCGTACTCACCAGGGACGTTGGATAGGGCAGACCAGGTGACAAACATTGTATACAAGGTTATGACGGAGGCTTGCAGCAGACCCGAGTTGGGCTGAGCATCCTGGCAATGAGAGTTCACA--GGTAAGAGCCCAGGCCACTCAGCCCCCCAGATCACCCACCACTTCT s monDom4.chr4 425609488 169 + 430141050 TCCCTTACTTACCGGGGATGTTGCTCAGTGCTAACCAGGTGATAAACATGGTGTAGGCAGTGATGACAGAGGCCTGGAGCAGACCTGAGTTTGGCTGGAGTTCCTGTTAATCAACAACCACACCAGTGAGGTTCCTTCACACTC-GTCATGAAGACTTCTCCCAAATTCT a score=10005 s mm8.chr4 129762940 261 + 155029701 GCTCACCTGGACCTTGGGCAGGACAGCAATGATGGAGACGCAGACACAGAAGGTGAGATTGAGGCTGATGAAGACCTTGCCCTCATGGCAGGCACCAGACTCCGTGTAGTAGACGAACATCAGTGCCACAGCAGCGATGGACAACAGGTAGAAGAGGAAGGTGAAGAAGAAAAGGCCTGGGCAGAGGTGTGCAGAGCAATGCTCAGATCCAGGAGGCAGAGGGAGGAACACCAGGGGACTGAGCCGCTCTCCTGCCACAGG s monDom4.chr4 425610150 254 + 430141050 GCTCACCTGGATCTTGGGTAGAACAGCCACAATGGAGACACAGATACAGAAGATCAGGTTAAGGCTGATGAAGACTTTGCCCTCCACACAACCTTCTGAGTGGGTATAGTAGTTGTACATGAGGGCTATGGCAGCAATGGAGATTCCATAGAAGAGGAAGGTGAAGAAGAAGAGGCCTG----AAGGTGGGCAAGGCAaaaggaagcttgggctgg--gagccaagagc-ccagtggtccagccctggctcttcccctaaG a score=11871 s mm8.chr4 129765305 692 + 155029701 AGTGTGGAGGCCGGCAGGG----------CACTGACCTGCGTACCAGGCTGGAGAGTCACACTCCTCGGCCTTACACAGCCACCGCTGATTCCAGGAGTGGGCAAAGTCAACAAACAGGATCAGCTGGATGAGGATGAAGAGGAAGGAGCCCACGACGCCAAAGTAGAACCAGACTG------TGGAGAGAGGGCTGTGAGGCAGGGGGCTGGCA--------------------CCACAGGCCCGG-------------CTATGGGGACAGCAGG-------CAGGGCCCCAGGGTTCCCAGCATAGCTTCAGTCAGGCATTCTTTCTCAAACACACAGACTCATTCAGTAGTCTCTCACATCCTCCTC-----TGCATGGAAGACACCAGAGAAGTAGAGTCCCCCTTTCACAGTTTGGCTAAGTAGCGCTCAAGCTAGATGGTCCCCCA-CCCAGAGTGACCCAAAGGCATTAAAGCCA-AGCATCAGGGTGCTAC-CTAGTAAAGAGAATGT-----------GGAAGACCAGCTGCCATCTGGAGTCAGTGAGATGCCAAGGCAA-----------AGAGCCACCTACCCTACCACCCACCCCACCCACC---------------CTACCACCCTCCTTTCTGCCCCTCCCCTCTACTGTCC------------------------------------------------CTGGA---GCCACCTACTCTTGGGAAAGGAGCCATCAGGGATGTAGAAGGCGCCCACAGTGATACCCACAAGGATCAGGAATTTAAAAAACCAAAACCTGCAG-GAGAAATGAAGAGGAGAGCTGAGTGG s monDom4.chr4 425612622 794 + 430141050 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GGAGTGTGCCAGGGTGTAGGTGGCCGCCCCTCACCCGTTCTGGATGGCTGCTCGCGGATCCCGGCTACTGCGGACACAGATCATTAACAGCATGAAGAAGAAGAAAAAGGCTGCTGTGGCAAAGCACATACGGTAGACAGCGCGGAAACCCAGCAGGGAGCCGCAGTCCAGGGGCCCCTGCAGGACCAGGGGTTGCTGGGTCCTGTCCTCACACACCCAGGGCAGCTGTGGAGACAACAGGGAGGATTGAGGGGTCCCACCCACCAGAACCCTGCAGTCTGCCATCAGGTCTGAGCCTGCCTCCATCTCTAAGGCCTGTTTCCCACCCCGTGTTGCTCTAAACACTAAAAAAGGCCACCCAGGCCCCTAATCCATAAACGGCTCCCGCCTAGCTGATCATTTCCCTGATGCTCTC-------CGCCCCACCCCCACCCCTCTTCACCCACCCCCTATTTCAATACTGCTACATGTGGAGCCCTGCTTCCCAGAACGGTTTCCCCTCCTGTCTTCAGTAGAACCACTAAGAGGCCCACGGAACCCCCAGGGAGAGTCGGCCTCT----CTCCGACTTCGACTTCGTAGGGATGGATCCACACTTACGCACTGGCCAAGACAAGAGTCCCACCCTGGGCTTCAACCCTCGAGGGGAGACGCACTCCCGGGACCTGCCTGCAGAGGGCAGTCGTGATGAATAGAATTCTCCTCTGAGATCCACCCTGTAGGAGGTTCAGGTGATCTCCCACCCCTGCCATCTACACACCATCAGTACCTGGAACGTCAACCACCTTACCTTGCCTGTGGAAGGCGGGGCGACCCGGGCGCCTCCCAAACCCCTCCCGGATACTCACCTTGTAAAGCTGACTCTCCACTCCCGGGCTCAGCATGATGATGGACACCAGCACCCCCAAGAAGAGGAAGCTGGTGAAGAGGAGGCGGCTCACCGTGGAGTTGCGGGTTGAGGGGCAACAGCCACATAGGATGCAGGGTGCAGAGCCGCAGAGGCAGGATGCCTAGCGGAGACAGGGAC s monDom4.chr4 425617933 850 + 430141050 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ccccaccccaccccGGCCTCCTGGGAGG---GGGGTGTCG---CGGTCCAAGCTTGGCGAG-----------------CCTCGTAGCTGGAGGGGAAGGGTAGAGGCAGCTGTGGCCGCAGAGGTCCGGGATGGGAGGCTTTCTAGGAAGCAGTGTAGGTG-----------------------------------ATCCGGAGGTGGAAAGGGGAGGGAAAGAAGGGCGGGAGGC----------TGGCCGCAGGAGAAGGCAAAGAGGAGCATGGTGGTCCAGAAATTGAATTCCGAAAGGGAATAGAGCAGATA-GGAGTGTAC---AGAGCCTGGAGGAAGACTAAAGAAAATCAGTGAATTCCATCTGGGAAGAGGTGAAGA----------------------------TACAGCCAGGCAGTCAGCAACAAGCCCTAC----CCCTCCATGTTGGGGTAGTGAAGAGGCCTCTCTCTGGAAGATGCCCTGGTTCTCACCAGCCTGACCTTCACCTACAGTGTGTGCAGCCACCCCTGGGATCAGTCGGAGACGCTGCTGCTAGAGC s monDom4.chr4 425716140 543 + 430141050 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atatcaaaggatctaaaggnaagGGGGAGCGAGAGCGCCGCTTGAGAGCCGATCCGGGGGGCTGAAATCCATCTTCATCCGACCGCTCCGCCCGTGAGTATCTGAGCCCCGCCGGGTCCAAAAGCTACCCGGGACTCCCAGCGAGCCGATGGTCCAGTCATATTGGGGTTCTGGCCCGGCGGGAGCGGGGAGAAGGGCTTTGGAAAAGCCGCCCCGGCCCTGGCTCCCGGGGCTGGCGCTTCCCTCGCTCCGCTCCTAGTACATGTTTTGGAGTCAGCAGCAAGGCCCCTATTGTTATCGAAGGAGGGAGGGGACGCGGAGGGAGGTGCAAACGAGGGAAATCCTCAGCCTCTAGGCCCTGGCCAGATGCATTCAAGGGTTTCTGCATTCAGCT----------TCCCTCCAGACCGGGGGTGGGGGGCGTCCCCCCACCCCTCCCGCCTCCTCTCCCCAGCCCCCTAAA--------------GCCTGG--GGCTCGGGGTGTTCCTTGCACATCATATGTGCGGCTTGGAAAGAGGACTCGATTGTCTCCGTGGATATCCAGAGGCTGAAGGAG-----GGGGGAGAGCCGGGGGCACCCCAGATCTGTCCCACCGGGTGGGGGGCAGACAGGGGGACAACTAGCTAGCCCTGGAGCCAGAGAAAGCTTTTGCCGGGTTAGTGTGGAATGACTAGACCGGGCATGTGGGGGAACTTGGTGGAAAGAAGAGGGATAGATAATGGAATAAGGTGTGGAAGTCCTCCTCAGGAAGTTTCAGAG-GCTT----GGAGGCAGGGTTTGCAGGCTCTGTTGGGCTTTTGTTTACGTGGGAG-------GAGTTGTTGGGGGGCTCGGGGAAGGGGGAGGTTG--TGGGAGAAGTCCCCTG-GTTGGAAACGGAAAGAAAGGAGAAAAAAAGAAAGAGACACGGAGCTTTCCTTAACTGAAAGGGGCTCTACTCTGTTAGTTGCAAGGAAAACAAACGCGCACTCACGCACACACACAAACAAACAGAATATCCTCTTATCCTGTGTGTATTACAATGCTGGACAATTTCAG-CCTCGTCAATGTGCCTGGTAAACA--GGTAATTGGTTATATTTCAGAGTTAACCCTTCTGTAC----TCCAGGGAGAAAGAAATACACTTTGGTAACTTTCTTCCGACGAGG----AATTTTATTGAAGCAGCTTCTTTCTT----------------------------TGAGTGAAGATTTTGTTTTTA--ATAGctttttttctttctttctttctttTGTATACTTCGTGCAATCAAAAAAGGGCTGGTTGCTCTTCATTTCGTGCCCTGAGTTTTTGCTCATTTCCTGTTCTTTTCGGAATATACCGAGTTTGTATTGGAGGGGT------------GGTTTTTAGGCC--TTTTCTTAAACAATAGGTTTGTAGCTTTCGATG------------------------ATGTAGTTTTTATCTAAGTGAAGTGAGCGG---------GGCTTTTTCTT--------------CTGTTCTAATTTTAACTTC-TAAAACACTTCTAAGAGCTGATGATTCTTTATCAAGTCTTCGGAAAATGCTCATTGGATTCTGAACTTTGATTGGTACTTTGTAGTATACACATTGTATTCATTTTGGCCAAGGCCACTCTTGCCTTTTTTGAAGTTAGTATTTGTTTAGTTTGAGGCTTCGTTTAGTTGCTTAAAAATACATTTCTGACCCCAGAATGTTTGTTTTTTA-ATTAAAAACATGTGTGAGGAAACACGTTTTTACC----AAAGCTTTTAAAAGGTGATTAGGAGAAAAAAGTTTTCTTTGTTTGA--AAGTGTGCTAGTCAGTG-----AAAAGGATGATATTATAA--------------------ACAGTTTGAAAGGTTTGGGGGAAAAGAACAGCTCTCATCAGAGTTTCCACTAGTCTGAAGTTACTTCTCATGTGTACAATTATTTGTATCTTTAAAAACCTGTTACAAATGAGGACTTTTTAGCATAGCTTCAGA---CATGTTTGAAGAATCTTTAGTGCA-TGTGGGTTAAATAATTTC---CATTCAGGTGACAG--TGTTAATCTGTGTCCTATCACTGTC--TGTGTTTCCAGATATTGT-------ATGTTAGGACTAAAGTTGAATGCTATCTAGTTATTTGCCCCCCTTCCCCTACAACCCCCTCCCCCCACAATCCCCCTCCCCCCAGTTTTCTGCTCTTGTCTGGCATTGCTTGCCTGCATTAGGTGAAGCAGGAAGTTCCTGGGTGTGCAGATGGCTTTACAAAAGCTGATTGTAT--TTTTAGTTATTTTGACTGGGATTCTCCCCCAAGCCCAGTCCCTTGTCAAAACAAGTTTGTGGT--------GTCCCTCA----------------TGACTAGTTTTGGGGACTGTAGCCGAAGGGGCATCACTA---ATCTTGGGAGTC-------AGAccacctgaggcacttcctca----ctatgtggtccagc--------actggttgcttaacc-ctctctacctcaacttccctttctgtaaagtgaggATAAAAAGACTTGAATTATTTATCTCTGAGGGTGCCTG---TGAGGTGTGCACTTTGTTTTTATTATCCACCTGGCACTGTAATT-GAGGTTTCAATTTGAGAAGTTAGTTTATTTCTAACTGAGGAAAGTTTCAATGTGAGCTGTTTTTTTTTTTTAATTTGCCTTTTTTTCTACCAAATACTTCAATTTCTGTTTTAGGAATTGTCATTGTACACTGTAGCTGCCTTTTAATGAC---------------AACAAATTGATAAGTTAAACTTAAAAGGATTGCAGTTACCCCAGATTCTGCTCGTTGGTGAATTTCAGAGTAGAAAAAATAGGAAATGCATTTGTTCCAAAA--TGGTAATGAGTTTTTGAG 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TGTGTCCTTAGCCTATGTAGAATACCAGTGC-------TTATTGAAAGACCCAAGGGGAGA--------CCTTGGCTCAGCTGACCATGGTGGGTCTCCTGATTCC----CAGACATTGGTTTAT---------CACGAGACATCACTCATAATTTGTTTGGG--CTTCTGGCTGCACTGTGTCACACTTGTGTATC-TTTTTTGTAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAGAGAAGACCTGGTCAGAGTTTCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACTGTCCCCACGGTCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTAGCATGGTGGAGTATGTGTTGAGCTCATCCCCGGGCGACTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTTGTAAGTTGG--CTTGAGGAACTTGTTCCTGTCTCTTTCTTCCCCTTTCCCCCAAAGC-AAATGTGCCTG-TTGAGTTTCCTAGG s monDom4.chr4 426158114 457 + 430141050 TATTTCCTCACTTTATATAGAATACCATTCCAAGGGATGGACAGACAGACAGAGAGGGAGGGAGGTGGCATTTTGCTAAAATGATCAT---------CTGGATTCCAAGTCAGTCATCGGCTTGTGCACTCACTCACTACACATCGCTCTTATTTTTTTTGGAACTTCCAAGTTGTACTCTATTATGTTTGTGTATCCTTTTTTGTAGATCATTCAGTTTCCCAGCCCATCATGGTGCAGAGAAGACCTGGTCAGAGTTTCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTATTGTCCCCACGGTCGGAGAGTGGAGGACTAGGAGTTAGCATGGTGGAATATGTATTGAGTTCATCCCCTGGTGATTCCTGTTTAAGAAAAGGAGGATTTGTAAGTTGGTTTTTTAGAACCTTGCTCTTATGCCTCTTTATTTTTTT-----AAAGCAAAATGTGCTTGTTTTAGTTACTTATG a score=182 s 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ccctCttttttttttttttttttttttttttAAACAGGCTTAATACTTTCCCTCTTAGGAATATGCTAGACAGATTTGAGAGTAGAGAAGTAGG-CTGAAGAAGTATACAGTTTCAATTGGGGGGGAAAGTGGGTGGG-TCAGAACGGGAGCACTTGGTATGATAAGA-TGTCTTCAGTTCTGTA--------------------------------------------------ACATACCTGTCTGTCTGTCT-----------------------------------------TCCCCCATTTGGCAAAA----AATTCTGCAGTGTTCCTTCCTGCCTCTGTGTTGTTTGTAAACTAGACTGTAATGT----CAGGCATGGG-------CACTGTCCTGTCCCAG---TTAGCATTTAGTGTAGTCTGGTGTCCACAGTGGGTATCCATAA----TTAGTTGATGATGATTAGTGAAGCTGAAGCTATTTTTTAAACAGGGCCCAAGGGATGCAGACAGTGATGAAAACGACAAAGGTGAAAAGAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTTGAAGGAGGAGGGAGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTGCCAGTGCAGAATGGGATTGATGCAGACGTCAAAGATTTTAGGTTTGTA-------TATTTTACACTTCTGATTTTTTGGATGTGGGCTGTGGGTTTTTGTT--TTTATTT-----------TAGTCCCTCCTGTCCTGTTTCAGTTTTAAAAATCTAGTATAGATGATGCCATAGAGG------------------TGTAAACTAACTGGTAAGGTGGGATTTCCCAAGAGCTGTCCATGTTTAT s monDom4.chr4 426171088 850 + 430141050 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TATAGATGGGCTGGTTGCCAAGAGGATGGATTATAGATGGGCTGGTTGCCATAAGGATGGGGTAGAGATGGGCTGGTCTCCATGAGGATGGGGTATGGATGGGCTGGTCTCCATGAGGATGGGTGATAGATGGGCTGGTTGCCATGAGGACGGATTATAGATGGGCTGGTTGCCATAAGGATGGGGTAGAGATGGGCTGGTCTCCATGAGGATGGGGTATGGATGGGCTGGTCTCCATGAGGATGGGTTATAGATGGGCTGGTTGCCATGAGGATGGATTATAGATGGGCTGGTTGCCATAAGGATGGGGTAGAGATGGGCTGGTCTCCATGAGGATGAGGTATGGATGGGCTGGTCTCCATGACGATGGGTTATAGATGGGCTGGTTGCCATGACGATGGATTATAAATGGGCTGGTTGCCATAAGGATGGGGTAGAGATGGGCTGGTCTCCATGAAGATGAAATATGGATATGCTGGTCTG a score=1036 s mm8.chr4 131018026 95 + 155029701 CTCCGTCAGATTGGCCTGTGGATAAGTGAGGCTCCGTCAGATTGGCCTGTGGATAAGTGAGGCTCCGTCAGATTGGCCTGTGGATAAGTGGGGct s monDom4.chr8 130972798 95 - 308469712 CTCCATGACGATGGGTTATAGATGGGCTGGTTGCCATGACGATGGATTATAAATGGGCTGGTTGCCATAAGGATGGGGTAGAGATGGGCTGGTCT a score=874 s mm8.chr4 131018121 46 + 155029701 ccgtcagattggcctgtggataagtggggcattgt-------cttcattggtg s monDom4.chr8 130972925 53 - 308469712 CCATGAAAATGGGGTATGGATGGGCTGGTTGCTATATGTCCACCTCATTGTTG a score=12599 s mm8.chr4 131040513 895 + 155029701 CACACACAGAGCCACAGGGtggcattcagagagcacatttatttacaaagcgctttacaaacattaccttacacctccccacagccccctgtgaggtaggtcagtagtcatatctacagtttacagatggggaaattgaggcacgaaatgggggtgtggcctacccCATTATAAAGAGAACTTCCC---ACCCTCCCATCAAAAAAATAACAAAATAACAACAACAAAAAAAGCACTGGTCCT------------CCATTCCAAAGTATCCCTTCTTCCTCTGTACTCTAGGAGCTGACACCA------GCCCTGTTCTAGCCTGCCCCGATCCAGTGG-CAGCCTCACCAAGAGCCACAGGGACCTCAACCCCAGGGGCTGT----GATTCAGCCTTGTGGATTGTCACAGGCCCAAGCTGAGCAGGACTGAGCCATGGAGACCCAA--------------AGGCCAGGGAAGAGGGAGCTGAAGT-ATATCATTCTGCATATACTGGGCCAG----GCAGGGATGGAG-----CCCAGGAGGGAG------GCAC-----------GGGTCCTGTTGCAGGAAAAGCTC----------------------------------AGAAGCA-------GGAGGAAAGCGAGCAAAGCACCCCA------------GGTCTGTAGGGGCAGTGGGATGGAGAATGGAGCTGCA-------------------GGATGCTCAGCGGGTCCCACCGGCGAGACGGGGA-----AGAGTCCCAGCTTCAGGACTCTCGGGGA----------------CTCAGCCCCTGCCAAGTCCCAGTGAGCCTCCACCACGTGCAGAAAGGACCATACTGGGTGCAAACCATGGGTGC-TCTCTGCAGACACTCATTCATTTCTGGCCAAGGACTGTGATGGAGCAGAGGGGCCTGGCCTGGGCTCTCCAGCACTAGCTATTT----TGGTCCAGGCGAGCTTCTCTGCACAGGTCTGCAGGGCCCTCTAGAGGTGGGGCTGATACAGTCTTGCAAAGCTTCTCCTTGG s monDom4.chr4 428117141 996 + 430141050 CACACACAGACCCAGTCCAtggcattcagagagctcttttatttacaaagcgatttacaaacatcagcttgtgactccccacagccccctgcgaggtaggtcagt---catatctacagtttacagatgggaaaactgaggcacagaatggggatgtgacctgcccCATTGTGAAAAGATCTTTCTTGTGCCCATCCGCCAAAGAAA----AAAAGAAAAGGAACGTATGCATCCTTGCTCCTGGGATCACCCAGACATGCAAGTAAACACCCACTTTCTC--------ATGATCCAGCACCCTTTGGTGCTTCCCTCTAGCCT---------CAGTGGGCATACCCCCTGGGGTCCATGGGCTTCCTATTTCCCATGGCTGTCTATAACTTAGTCTTGCAGATTGTCACTCGCCTAGGATGGGCCAAGTTGGGCCATCGAGGACAAAACTCTGAATGAAGGAGGAGCGAGGAGAGGGTAATGAATCAATTTCATTCTCAGGACACTGGGATGGAGACACAGGGGTGGGGGAAAACTGGTCAGGGAGCTCTCAGCACCCCCTGGTTCAGGCATCTGGTTCAGGAAAAAGTTTGGGCTTCAGGGCCAGTACCCCCTTGGGTCATGAAAAAGCATTCTGGGGGAGATACAGGAGATGAGTAACCCAAAGGGATAAACTGGCCTGGATAGGTGAGGGGGAGTAGATCAGTGCCAGATGAACTGACTCATCTGGGTGGACTCACCCTGGTCCCCAGGGTGGAGGAGGGCAGAGAGAGAACATGACCTCTCAGACACAAGGGAAGAGTTAGTGTTCACCCATCAGAGCCTGCCAAGTCCTTG----------------ATGGAGAAGACC--AATGGGTATCCCTTATGGGGGAGTCACAGCTAGGACTCTCTCCTCTTAACCCAGCACCT---------------------GACTGGACTCCCTAGCTCCACTTATTCACCAGCCTTCAAGCAGTTTTCTTCCCTTAGATCTCCCAAGCCCT-GAAAGACTCAGCTGCAATAACTCTTCAAGGTTCTTTCCTGG 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s monDom4.chr4 428131686 945 + 430141050 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s monDom4.chr4 428138267 1586 + 430141050 ggagaaggagagacagacacagagagaaagacaaagagagagacagatagactgaaattgaaagagactgaaattgagagaaagacacagagagaccgcaaga---gagagagagagagagagagagagagagagagag------------------agagagagagagagagagagagagagagagaggatATACTTACTTCTCGATTTATCCGAATCTTAAGGATTCCGGTGAGAGGACAGGTGCCCAAGCCAAAGAGACCAGAGAGAGGGAGATTAGCCCACTGGGCATGGCCATAGGAGGCAGAGGCAGGAGCAGGAAGGGGCTTTGTGGGATATGGATGTGGCAGAAGGGACAGGATCAGGAAGGAAAATGGGGAGAGGGAGGAAGA-------------------GGAGAGGTCACCCTACTAAAATCTC-------AGGGCCCTGGG---------------------GTGGGGATAGCTGGGGCCCTTACCTCTGCCTCAAGGAATGGGAGAAAAAGAAGGAAATAATACAGGGAAAGCAGGACAGGGAAAAGCTGAGAATGGAGAATGAAAGTGTTCTGCCCCTCAGGAGAAGAGGAGGAGTGGGGAATGagggttattcctgtcttcacacctttgctcatgctgtggacctg---cctggaatgccttccctccatctagtcaaatccttgagggcccagaccaaaccctgattcctccaagaagacttccctgactatgacagtggtctgcattcttacaacacctgtcatctgttccatcccctcaagcagcagtaatatt--tagaatctaaatatttcataagcatgagtcctctcttcccacccagattctctgagcaccccccaaggcag-------ggatgatgccttc--tccttctcaggctcccctaaaaaacccctggtac------------aacactaggcacaggtgggtgatcagtcagtacttgctgaactgaaCTAGGACCTCAGATCTCGTCCTTTCCCCTCTATTCTCTCCATTGCTCCCTAACAAAGCTACTGACTTTGCTGCAATATGACTGATCAGAGACAGCAGGATATACTCCCGG----GTAGCACAGTACCCTTC----CCCTCTCAGGCCCCATAGGAGTTACAAGAATACCTGCCACCTCT-GCTCTGTTCTGCTCTGACCCACCTCTGATCC--CTCTGAACCAACCA-CAGCC------------ACATCCACCTTCTGGGATGGACTTTTTCCCTTGCCCTAGTTCTCTCCCTCTGGCTCCTTCTTCTA----------CGGCACTTCACAGAGAAGATGCCCATTCCCTGATGTCTTCTCCAGCCACTCTT--GTATAGAGGCATCATGAGCCCACACGAACCCACTTTCCTTTGGCCAGATCAATCTCCTCCCAGTCCTGAGAACACAAC-TGAATtcaactcaacatttcttaaatgcctctt---atgtgtccagcatta-----agctaaatgctcaggaaataaagaaaacagcccctg-----ccttcaag--gatctaactttctaaGAGGACACCCTTTGCTGATTTCTGGCT--CCATGAGT--CCTCTCC----TCCTCATACAAACCATCCTTCTAAGCCCTcctcttccaagaagccttccttaactattccaga-----ctacagagatctctcc-ctcctctatctgatacattctttaacatgcctcc 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155029701 tcccatgaCAACGTCACACCACCCTGCCAGGTTTCACTCT----TCAACCTGCACAGGCAG-CATTCACAGAGCCCCGCCTCC---------AAGGAACAATCTAGAACA-TTGGCAACTCTCAGCAATTTACCCCC------AAAGATGAGCAATGCAAAATTAGCTTGCGCAGCCACCCCTCTACCAGCAATGCCAG-------------------------GCACCTGAATAGAGGG-TTTCTCCTGAGCCAACA-TTTCTATTGTCAGCCAAGGCAGTGGCCCAGACAAGGGGCCTCCACAATCCCCAGACCCTGCCAGG-CAGACACACTCCCTCCCTAGCACTTAGAATCC---GCATCCCCAAGAACATCCCACCCTGGTTCGGGAGCTCAGGCATTGGCTGAGGAAAGCAGCCATTGTTTCTTCTAC s monDom4.chr4 428145197 419 + 430141050 TCCCCTGCCTCCACTCTCCTGCCCTGCCTCCCTACCCACTCAGCTCTACCTGGAGAATAAGGCAATCTCGGTACCCTCCCTCCCTCTCTCTAGGGGAACAATCTGGAACATTTGGCAACTCCCAGCAATTACCCCCCATTCAGAGAAAAGAAAATCCTGAAAATAGCTGCCACTGCCACCATCC--ACAGCGGTGGCGGCGGCTGCTGCTACGGATTAGTGAGAGAAGCTGAATAGAGGGATTTCTTTTGCATTGGCATTTTCCATTGTAAACCTTTGCTGCTCTC---------AGCTTCAATCAACCTCAAGCCCAGAGATTCCCCCCACACTACCCTCCTGA---TTTGACTTTAGGGAACCCTCCTGAAACTCTGACCTCTGTTAGCCCTCCTGGGAGTGGTCTTCCCAAGG--GTCACTCCATCTCCTAC a score=10818 s mm8.chr4 131065582 202 + 155029701 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155029701 ATGAGAGGCCGGGCCTGGGCAGGGCTGAAGCTACCTAGTGGACTCACCTTTCCTGGCAATTCGGATGCAGTTCAGTCGGGTTTCCTGGAAGTACAGATAAAGGGGCTCAGAGACACAAAAGCCAAACGC s monDom4.chr4 68295864 112 - 430141050 AGGGGTGGCGGGGACGAGATCGGGAACAAGTCG------GGGCCTACCTTTGCGAGCAATCCGAATACAGTTTAGTCGGGTTTCCTGAGGAGACACA-----------AGAGACAGGAAGGGTCAACAC a score=17774 s mm8.chr4 131071523 398 + 155029701 TCCCCAAAGGCTCCCCAC--CCTACCACCCACTATG----CCAGCCTACACC---ACCAGGACCCAGCCGGCCCCTCACCCCTTTCAGGTGGCTTGCTGCCTGGAAATAGATGAGATAGGCCTTTCTGGGCTCAAGCGGTGGGTTCCAGAAGCCACGATAGGTCTGGTTGTCACCCACGGTGAAGGGCATGGCCTCAAGCAGGCTGCTGGCAGCCAGTTCAGCCCCAAAGTAGTGCACCAGGCCGCGAGCCAGGGCCGTCTCAAAGGTCAGAGGTACCGAGAAGCAGTCCTGAGCTCCGGGCTCCCGCCGCAAGCGCCGTGGCCGCTCTTCCTCCACAACCACCTGGTAGACGCTGGACAGGGAGGAGAGATTGCAGGTGACCAAAGAGAGCCTTCAGGTGGTAaag s monDom4.chr4 68296433 407 - 430141050 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s monDom4.chr4 68325583 1437 - 430141050 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s monDom4.chr2 34876333 1461 - 541556283 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AAAAAACAAAAACAGCAAGAGATAA--TTAACTGACATTTTCT---CCACAATC--CTTAAACAAACCATTCTATAAAAAACAATTTCCTCAAGGTAAACTGTTTTGCTCCATTCAACCAGTAGGGTTTTAAAaaacaaacaaaca--aaca--------aacCTAAAAGCATAAGGGAAATACACT---TGAGGTAAGGAAAGCATCTGATTTCAGTTGTGAGATTTGAACCTCTGCAGCAACAATCACTGATTGTCAGTTTAGT-TGGTCTAGATTTCAC--------AGATAGTAAGAATGTTTCAAATCTAGAACAATAAGT---TTGGAAATTTTAAAAAATGGTGAAGAAAGAAAACATGGGGGGAAAGTCTTT------TTAAATAATTTACCTGAAACCAAAAGTTTAGTCCTTTCTTAGAAGTGCCCCATCCCTTTTTATAGATATCACAGCCAATCAGCTGTTACAATGCCACACCTATGTTGTAAGTATCCAGCTCCAGTCATATGCTTGGGTTCCCCTTGTGTGGTCTACTAAACTTCCAAATATTGGTCCC---AAGCACTTACCTGTCAAGTACAAGAAAGGACCTGTCA-----------TCCAGCAAGACAACATAAAAACT---TCCAACAAGAAAATGG--------TGAAGGGGAAGAAAGGTAAATTGAAGAGAAACAACTTCTAAGTTTTCATTCATTCTTAAGAAAATT--ACACACATCCCTAGAGAAATTTCATGTTCTATTCCTCCATAATACTCAGATTCATCTACAAAGACATTTTATTCTCTACAAAGATTTGTTCCATCTTTGGCTTTCATTACTCACCAACTGCAGCTGGATTTACCGGTCCCGAGACAACAGCTTGCCCCATGATTACGATTTAGTTTGATGGCACTTTCAACCACAAGCTA-ACCTGGCAGGAAGAAACACCTTTCCAAACTGAGAGATCCGGTGTCAAGAGGAGACAAGCAGTTCATCCATTCAGTTTACTGCCAAAGCTCAGGAAAGAGCATGATGTCAGGTATCTGTAAGAGTTTTCACTATCCCTGTCCCCAGTCTGAACACTTGTAGATCTTACAAATATTCCTTCATGCCAGCTCTCCTCACACAGGAATGCCTGTCATTCCACTCTGCGCAGCCTAGAGCTGAAATTCAGGAAGGGGAGGAGACTGCCTGCCAATGACATTCTAGCTGCTGAGCTGTATAACTTGAATTATCATCACCCCCCGCCCCCTTGTATT-ATATTAAATTTGGCTGAAACTCACAAGACTCAGAG 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TCCCCCCATCTTACCTCAATGTGCTCCTTGGTGACGAGCCAGGGCCGATGGGCCAGCAGCTTGTTAATCTCATTAAGGTTTCGGAGTTTCTGGGGGACCCGATGGATACCAAGGAGCCACTCAGGGTCTCCACCCACTTGCAGGAACTCTGCCATGTGGAAGCTAATCAGGTAGGAGCACTGGTGCCTAGCAGAGGCCTGCAGG---AGGATGAAGGAGACAGAGCTAAGTAATTTTGA------ATCTTGGGAGGAGAGTTGCCTCCTTCAGAGGA--tgagaggtgtgacaattt a score=9577 s mm8.chr4 131771834 237 + 155029701 GACTTACCATGATGGCAATGTAGTGGCGCCAGGAGCTGGCCAGGGGCCCATCCGTATGCAGCAGCAGGTAATGCAGGCGCCAGAAGCTGCTAAGGTAGTCCGGGTGTAGACCCATCACCACCGCCAGGTTGTCCACCCGCCCTGAGGACATCAGGGCCTCGAGCCCCAGGTGCTGCTCC---AGGCTCTCAGCTCCTTCCCGAAGGATCTGCCAGGCAAAGAAGAGCGCAT-----GGGTTCTCT s monDom4.chr4 69424787 242 - 430141050 GGCTCACCATGATTGCAATGTAGTGCCTCCAGGGGCAGGGCAGGGGTCCATCCACTCGCAGAAGCAGGCCCTGCATCTTCCAGAAGCTGCTGAGGTAGTCAGGGTGCAGGCCCATCACCAGCATGACATTGTCTGGCCGTCCAGAGG---CTGAAACCTCCAGACTTAGCTGCTGCTCTTCAATGGTCTCTGGCCCCTGCTGCAGGATCTGTCAGGATAGAGAGGGGATATACTCCAAGTTCTCT a score=3756 s mm8.chr4 131774579 223 + 155029701 TTTTTATCCTTTGCTCCTAGGGACTGAAGACTCCTAACTGCCCCCACTTCCAAACTCACCTCTTCCACTGGAATGAAAGCGCTGGGCCCTCGAGAGCCTCGCCGAGCCTGGCCCTCCCGATGCTCCTACGGGAAACACAGTGGTTATT--TGGCGGACGGGAGGACGAAGGACTTTCTGTGAGCTCTCTAGCCCCCTTCTCCAGCCCTGAAGGACACTGAGTTTC s monDom4.chr4 69426948 205 - 430141050 TCTTCAACCTTTCCTCCCA---ACTCCAG---TCAAACAGACACCCCTT----GCTTACCTCCTCCACTGGGATGAAGGCACTAGGGCCCCTGGGGAGCCTCCGAGTGGGGGCCATCTTCTGCTCCTAGGGGAAGAAATACTCCCATCAATGAGGGTCAGGAGAATAGGGG------TAGGAGTGC-CTGGCTCCCTCCTCTGGCCT---AGGACATAGGACTGC a score=10867 s mm8.chr4 131781700 1486 + 155029701 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a score=2142 s mm8.chr4 131786983 80 + 155029701 GTTTGATCAGTTGAGCGAGCCCGCAGCGCCCCCTGCAGGCCAGATCTTGCTATAGCTCAACCCCGGTGAACTGAAAAAAG s monDom4.chr4 69444564 76 - 430141050 GTTTGA--ATCTGCATGAGCAGACATCACCCCCTGCTGGTCATGTGCTGCTACAACTCAAAGTTG--TACCTGAGAAAAG a score=3023 s mm8.chr4 131787581 183 + 155029701 TCCTCCCCGACCCCTTGGTGCTCAGCAACAGGCTCTTCTTACGTAAATCG--CGGCGGCCAATGAGCAGACATGTGGGCGGGGTTTAGAATAAGCCAATAGGAGCCTGCAGCGACGCTCTGG--ATAGGACCAGGCATGTTTCCAGGCTGACAAGGCAACTCTCCGAAGCTGTTGAGGAGACCTGAA s monDom4.chr4 69445570 173 - 430141050 TTTTCCCCTTTCTTTTTTTGCTCAGCAACAGGCTC-CCTTTTATACATTGACTAGTGGCCAATTAAAAGGGAGATGGGTGGGATTTAT---------CTGGCAGCCAATAGCTAACCTCTGGGAACAGCTCCAGGAA-GCTGATAGGC---CAAGGCCAATTTCTGACTTGGTTACAAGGGACTAAA a score=9442 s mm8.chr4 131802756 200 + 155029701 TTCAATGATTATTCTTTAGTTGTTGGATCTTCTTCTTATGGCGTTCAATTTGCTTCTGCAGACGCTCTATCTCCTTCGAATGGTGGTCAATCTCATCTTCATGGTGTTTCCTCAGGGCAGCCAGCTGTTCTTTAGTCTTCTCTCTATAAAGAAACAGTGGCTGAGGGATTTAATCCAATCTTTCATCTCAAGGAGATCTT s monDom4.chr4 69454078 196 - 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gggaacttgccTGTGCAGGTAGCCCAAGTGCAGAAAATGCAGGAACGCGAGCCAGCGGCCTGAGGACGGGCCCGGGTGCAAGCCGGCTGGGTCCCCACGGTACCAGGCCCAGCTGAAGAGCTGCAAGACGGCCGAGGCGAGGCCCAGTGAAGCCAGCTGCAGCGCGGTCCACAGCAAGTGGCCCTGCAGGGCGTATTGGCCCGCGGCCCACAGGTCTGCACCCAGATCCAATACGAAGG---------------------CGCCCGTGCCCAGCGCCGTTAGCAGCAGGTCACGGAGACGGCAGACCCGGGGATACCCCGGCATGGCCCCACTTCCTCCCGCCTCCTCTGGCGCCACTCCCGCTC-------------TCGGGACGCCGTCGGAGAAG-------GGTGtccccgccccttccattccgtcccctcctatcccctgcga------cactccaccccttctgtgccgccccttcc---actccatccct-gcctatcccatgtgacgctccgcccct a score=5185 s mm8.chr4 132005469 407 + 155029701 TCATAACACCTCCAGTACGTGCAGGCTTGGCAGCAGAGTCAGTATGAGCAGGAAACCAGGCA---CCAGCTTGGCACCAAGACCATGCAAGCAGGTAGCATAAGTGTTGAAAGCCACGTGTTGTATAGCACAAACGTGCTCGATGCGGCAG--CTGTCCTCACAGGTCAAATGGTTGTAGCTGACCGAGTTATAGACGTAATAACGTTGCAGGATGTGAGGCTCACTGGCAATGCGGGTCAGCGCCGTGTGCATGGA-GCTGACGCTGGCATCCGGCACCTGGTAGGCCTCCGTCAGGCGGTACTCCTGCTCCCACCGTGGGGTCTCTTGTACATTCGCCTGCCTCAGGTTCAAGAAGTAAGTCACCAAGTCCT----GGATTAGAGGCGCAGGGTATGTCAGCAACGAGCAGTTGA s 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monDom4.chr2 367396887 369 + 541556283 TTAATCATCATGCTTAAGATGTTTAATCTT------GCCCTTATGACTCTTGATTTCTTTCTGCAGATGCTGTATCTCCTTCTTGTGGTGGCTAATTTCTTCTTGATGGTATTTCCT-AAGGGCAGCCAGTTGCTCTTTGTTCTTCTCTAAGAAGTACTGCTCCTCCTCGGCCTTCTCACTTCTGCCTAAGGCCCCGCCTGTGTCTCAGATGGAGCCACCGCCTTTACCTCCAAAAGTGCTAAACTGGCTGGAGTCCAAGTTATAGCTCTGGGCCTGCATGGTCCTCCAGCCCCAGAGCCCAAGCCCAAGTCGAGCTGCTGTCGCCACAGTacagcatatagtagggtttgggattctaatctgctctgctatttg a score=6924 s mm8.chr4 132098818 322 + 155029701 GCAACCTCCTCAAACACTAACCTTGGGGTCTCAGGACGGGGATTAGAATCGCTAATGATAATTTTTGTATTCTTTAGGGGCTGATTTTATTTG---TGGTAATTAACAGGGGCAGGGCACCAATTCTCAGGACA------ACTGTCC-------TGGGTCTGACAAGTGTCCTCCGGCAGTAAGACTCAAGACCATACCCAATTGACAAAAGTTACATTTAATTTACAATGTAATAAAGGTTACAGGTAAAAAGCTACACTTAAAGCAG--AAAAGGCCTATTACACAAATGTACAAA--TCTGTACAAAGCTCGTA-CAATGGTTCCTACCTT-GTCTCCTGT s monDom4.chr4 70023494 328 - 430141050 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tcttctgtttcctggccctgtgactgctgcactcaga----ggctctgTTTATCAAAATCCTAGCTGCCCGATAGAGAGGTGGTTAAGCCTGGACTG---CAGTGAGGGCCAAGGATGAAGATTT a score=3416 s mm8.chr4 132266709 492 + 155029701 CTTTTCCTAACAGGTGGTACTTCGGAAAGATCAGTAGAAAGGATGCAGAGAGGCAGCTTCTGTCCTCTGGTAACCCCCAGGGGGCCTTTCTCATTCGGGAAAGCGAGACCACCAAAGGTGGGTTGGTAC---GGCAGACATGCCACCAGACAATAAGGACAGTGGGCTGGTCAGTGCTTGGGTCAGGG---------CCAAGTGGAGGGGCAGAGCTAAGCTGGGCTCTGGGAATTCCTTTG------GGGGCCTCCTCCTGCTCTGAGGGAGACGAGAACTAAAGGACCCTTTCCACCC------------AGGGGCCTACTCCCTGTCCATCCGTGACTGGGACCAGAACAGAGGCGATCACATAAAGCATTATAAGATCCGAAAGCTGGACACGGGCGGCTACTACATCACCACACGGGCCCAGTTTGACTCCATACAGGACCTAGTGCGGCACTACATGGGTGAGCTGCTAAGTGTGA-CTGACCG--TGTTGTCATGACGGGGAGACTGAGGCCTGGAGA s monDom4.chr1 398212739 499 + 748055161 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s monDom4.chr4 70215025 1054 - 430141050 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a score=6812 s mm8.chr4 132296655 235 + 155029701 ACCCGTTGGGGTGGAAA-CTCCCTGGCAACAGCTGATGGATGGGTTGGGGCCTTGACAT-TGGCCTGGGGCCA--------CAGCACAACCCTGGAGGGACCAG----GCTGGGACTGGGGGACTTTGAGGGG------------------AATTTGAGGGAGAAGAATGAGCCTCCTAAATCTTGGAGC--CTCTGGTTCCTCTTCAGC-----CTTAATCTCTTACCAAACCTGCTCTCCAGCTGCTCGGCGGCCCATGTTGCTGGGAGTTG s monDom4.chr4 70218324 274 - 430141050 ACCTGGTGGGGTGCAAATCACCCTAGCAACAGCTGTTGGATGGGAAGGGGACTTCATCTCTGGCACAGGGCCATAGACACTCAGATTGGCCCTGGCAAGGTTGGAACAGCTAAGGTTGGGGTGTAGTGGGGGGGGGGAGGCTCAGAGGAGAAATTTAAGGGAAAAGAATTAGACTCATAAATCTTGGAGCGTCTCTGCTTCCCTTCCCTCACTTTCATAATCTCTCACCAAACCTGATCCCACAGTGCCCCTAGGCCACTGTGTTGGGGTGGTG a score=9143 s mm8.chr4 132297435 236 + 155029701 CATTGCTGCTGGGCCTTGGGGACCCAGGCGTCC------------------TAGCGGGT-GAGGGCGGGTCTCCAGCAGGCGCCCTGCCAAACCCCGCAGCCTGCTCACCAGGAAT-CTTGTTGCTGAGAGATGGAAAATCCCGGCTAGGCCTGCAGCTCATCCCTCCCCTCCGGGAG-GAGGAGGGGCCC------AAAGATTCCTTCCTGCAACCCCCCCCTCC-----------------------------CATCTG----------------------------GGGCAGAGCCCTCCTTGGCAGTGGGTGGGGC s monDom4.chr4 70219559 317 - 430141050 CAGAGCTGCCCAGC-TTGGGGACCCAGGAGCCCAGGGCAGGGGGCGGTCCCCAGTGGGCAGGGGGCGGGTCCCCAGTGGGCATCCTGCCAAAGCCCACAGACTGATCACTAGGAATTCTTGTTGCTGAGAGATGGAAAATCCCG--TTGGCTTGGAACTCATCCCTTCCCTCTGGGAGAGGGGAGGGAACCTGGGGGAGAGATTCCTTCCTGccccctccccccccttttctctctacccttccatccccctactcagctgctcttccccccccccAACTCTAGTCACTGGGCAGTGCCTGCCCCAAGGGTGGGTGGAGC a score=11873 s mm8.chr4 132297671 403 + 155029701 TGGGGGGGGCCCAGGACAGGCCTCTAAGGCCCAGTCACATGTCCTGCAGCCCTGCCCAGTCCACAGTGGGCACCAGGGCACTCTGGAGGCCAAATGAGCCTGTTGCAGCAGAGAAGGGGTGGGGGTAGGGTGCCAAGGGCCAGAAGGGGCCTGAGTGGGGGCTGGGGGCTGGC-CCTGGCCCCACTGGCTCCCCCAGGGTGGAGGGCGAAGAGTTAGTTCTCTCT--TTGGACAGGAAGACGAATGATCCCATTACGGGAGCGTGATTTTATTCCACGTGTCACGGAGTCTGAGATTAACTTGCTCACCAGTCTGTGacaaaccctcacacccaacacacacacacacagagacacacacatgcagaggt--acagagatacacacatccacactgtcacaaacacaG s monDom4.chr4 70220094 380 - 430141050 TGGGGAGGGGTGGGGATAGACAT-GGGGGATTGGTCTGGTAGACTGCCACCCAGCCC--CTGGGAATAGGGGCTACTGTACCATGGAAG------GGGCTTGTGGC--CAGAGAGGGTGGAGCCTTAG-----CCATCTCTTCCTGGGCCTTGTTCCTGGTTTGAGGACCTCCTCCTGGTGGCCCTGGCTC-----------ATGGCGAGGAGTTTGTTCTCTCTCCTTGGACAGGAAGACGAATGATTCCATTACGGGAGCGTGATTTTATTCCACGTGTCAGGGAGTCTGAGATTAACTTGCTCACCAGTCTGTGACAAAACCTCGCATGT-ACACACACTCACACACATACACAGGCTTACAGACTTAGACAAAGACACCCAGGCCCCTACCTACAGAGACACAG a score=6894 s mm8.chr4 132301390 431 + 155029701 GCCCTTTAAGCATCTCACCTGTGAGGTGGGGCTAG--GAGAATTAATTTCCTGTGCTATTTTAATTTTACTGTATTTAATTTGCTATTTATTTTAATTAATTAAC-AGAGTTAATCTCTTATTCTAACTTGCTGCCAGT---------GGTTCCTCTTGCCTTTCAGAGGGGTAGAAGGCCTGGCCAGGTGATACCGGGTTAGCTGTGGGGAAATAGGGGCTCTGGGGAGCATGGTTTCCCCTTTACCTTTGCTA--TCTCAAGGTGTCCCCTATGGCCCCTGCTTCTTTCCCAAGGGGCTTTCCCTACCCCCTTTCCCCTC-CAGGTTGGCATGGGGCTGTAGCTATAGTGTGGTGGCCCCGAGAAGCCTGACTTGAACCTGCCTATATTCT--------TCAATAAACAGTTTGGGCATCCTGGGGTTGTAAGAGAGAATGTGCTTTTTGGG s monDom4.chr4 70224876 432 - 430141050 GTCCTTGAAATAGCTCACCTGTGAGGTGGGGCTGGTTGGGAATTAATTTCCTGTGCTATTTTAATTTTGCTGTATTTAATTTGCTGTTTATTTTAATTAATTAACGATGGGTAATCGCCT-TCCGAGCATCTTGCTGTTTCTCTTCTGTCTTCCTTTTTTTTTTTTTGGAGGGGGGAGACTTGG--GGGTGTTGATTGGTAGGCTG-GGGGAGAT---GGCTTTGGCTTCCTGTACCCACTCCCAAACTCTGCCCCTTCCCAAAGTGAGTTGTCAGATCTGTGCCATCTTC---ATTGGTGTCCCCTAGTTTCCCCATCCTCACAATTTGGTTTAA---TTTatcaagcatgtgtt---------aagcatggattaatgctatcctaagtgtgagggctataaagaaaaccctagaaaatccctgctttccaggagtttacattcttttgggg a score=5248 s mm8.chr4 132309395 349 + 155029701 GGAGAAGGCACCTGGGCTGTGGGTTGAGGAGAAAGGATTCCCCTCCCT--CAGGGTTCTGACCAACTGGCCCCAGGTGGAACCTCTACTGCGGCTCCCCCGCCTCTCAGGGCTTTTTGGCATCGCCTCTGAGCACCGGTTCTTAGCTCCTTCCTTTCATCCCAATGTCACCT-CTGACTCTGGAGTCCGTCCTGGCCTGGTAGGTGGGGGAAGGCAGGGTGGCAGCTGGACCCTT-------GGAGCAGAAACCCTGCCCCTCTAAGCCAGCTGCTGCCAGCCTTCCTGGACTGA-CTCTATGGAAACAGGGGACC-CGGAGACAGAAATAAACTGCCAGGTTTCCGGGGCGGGAGGGAGG s monDom4.chr4 70233467 317 - 430141050 GGGGAGGTCACCTGGCCTAGAGCAGCTGGATTTAGGGTTCCCCCCCTTGTAAGGTCATCGTTCAGGTTCCCTTA-----ACCCTCTCTTCAAGCACCCCAGGCTGT------------ACTTCCCCCCT---------CCCTTATCCCTCCCATCCCATCCAATTGCTTCCTGACAACTTCTGGCTGTGCCACTACCAGGCAGGCGG---------------CAGCTGGACCCTCCAGGGAGGGGGGAGTCTCTCCCCTCCCCTCCCCCAGCTGCTGCCAGCCTTCCTGGCCTGGTTTCTGTGGAAACAGGGGGCAGGGGAGACAGAAATAAAACACTGGGCTT---GGGTGGGGGGGTGG a score=3236 s mm8.chr4 132310783 182 + 155029701 GGGCCCTCCCCAGCCCCGAGCCGGATAGAAGCGG--CCCTCCCCTCCCCTTCCACGTGTCC-CTCCTCCGCGGGTAGCCGAGGGCCCCGGCTAGCGGGACGGGGGCCAGGAAAAAGCCGAAAACAGCGCGGCCGGGCCGCTCCCCTCCCGCTCAAAATAGCCCCCGG---CCGGGGCTGCCACGCATT s monDom4.chr4 70234418 188 - 430141050 GGGCTGGACCCAAAGGCAAGCCGGAGCCAGGCGGGCCCCTCCCCGGGAGTCCCACGTGACCACAACACAGCGGGCAGCCTTGGGTCGGGGGACGCTGACTCTCGGCCAGGAAAAAGCCAAAAACCCCAAGTCTTCTCGGATCTTCGGCCTCCCAAAATAACGCGTGGAGCCCCGGGCGGAGGCGAATT a score=6165 s mm8.chr4 132311032 190 + 155029701 GGGTGGGGGCGAGGGCGGGCCGCGCGGTCGCTCGCTCCCTCGCTCGGCCGGCCCGCATGTGGCTCTCCTTC-GGGGAGCCTTGGCAGCC-CAGGCGGCGCGCTGCGCCGGGATGATGGAGAGCTTCTGGAATTTCCTGCAGCTGGAGAGCGCGAGCGGCCGGGGGAGCCGGCCCAGCGCGGCTCGGGAAGGG s monDom4.chr4 70234953 164 - 430141050 gggcgggggcg-gggcgggcc-cgcag---------------------cgcccggcATGTGGCTCTCCTTTAGGGGAGACTTGGCAGGGGCCGGCGCTGGGAGCAGCCTGGATGATGGAGAACATTAGGAATTTCCTGCAGCTGGA----GCAAGCGGCCCGGGGAGCAGG-CGGCCGGGGCGTGGGGGGGG a score=5457 s mm8.chr4 132311222 501 + 155029701 GGCGCCGAGCCGGCCGACCCCCGCACGCGTCTCCGTAGCCTCCGCCGCCGCCGTCGCCGCTCCGGGGGTG-GGAGAGGTTTCCCGGACCTCCCCCGGGCGAGGCGGGAGGCTCCCCTCCCCCGCCGC----TCCTTCGGGGCTGGCGGGGGTCCAGGCC-------------CGCCCTTCCCCGGCCTGGGCGGCGGACAG--------GGGCCAGGTGCAGGCGACGCCCCTCCCCCCGCCGCCTGGTTTCCCTCTCGGCCCCGTCACCTCCGCCGGAGTCAGAAGCCCTGCGGCC--TCCTGGGGAgggggcgggggcg---------caggcgcggccaccgggcggccAGGTAGCTCGAGGGGCGGCGGCGGCGGCAAAACTCCGGAGCGGCTTCTTTC---GGCCGGCAGACCCGCGCCTCCTGCTCGAGCCGAGGC--GTCGAAGGGCTTCCTCTCTGCCGAAGGCAGGCGAGGCCGTTCGCTCCCAGG--------CCCCCTTCTCTGGCAACGACCGAGCCAGTGGACCGCGGACGGCTGGGG s monDom4.chr4 70235629 485 - 430141050 GGCGTT-----------CCCCTGGAGACGGGTGCGGGGTG------GCGGGGGGTGAGGTTCTGGGGGGACGGGGCGGCTCCCAAGGCCTGAGCCGGCCCCCGCCCTCGTCTCGCCCCTCCTGCCGTGGGTTTTTTCGGGTTTGGCAGGTGTCCAGCCCTCCTCCTCCATGCCGTCCCCCCCAGCCCTGGGCTGAGCAGAGAAGAGAGGGGGCCAGGTGCAGGCGGCTCCCCTTCCCC------------------------------CCTCCCCCCCAGTCAGATGCTCCCGAGCCCTCCCCGGGGAGCGGGAGGGGGAGAGCAGGGATCAGGGGCAGCT-CCAGGCTGCCAGGTAGCCAGAG----AGCAGCGGCGAGAAAACCTGGAAGCAGATTCCTCCTCAGGCCTG-GGACTGGGGCCTCTG--------TGAGGCCTGCTATGGGGATGGTTCTGGACCGA--TCCTGTAGGGCCCCCCAGTCCTGGGACATCTGCCACCATTCTCCAGCATGG---GAACCTGAAGCCCCCAGGTGTGTGTGG a score=1593 s mm8.chr4 132314152 247 + 155029701 agagagacagagggagagagagagagagGGGAAAGGAATGGAATGTGTGTGTGTCAGGGACCAGTCAGTTGCTAGGGATGG---GGTGC---TGAGCATGAGGCGGCTAACT-TGTGGGATGTGTGTGTCCGTGTCCAGAAGAGTCATTGCAGTGACAGTGGATCAGGGTGTGCTCTAGACAAGGAGGCTGGCCATGAGAAGGAAGGAAAACAACCATA------CATAAGCTAGCGGGCTTGGTTTAGGGGCTGTGCTG s monDom4.chr4 70240375 242 - 430141050 agagagtgggggggagagggagagagtccgagagagagagaAGAGAGCCCGTGTGACAGACT------TTGTCAGAGGGAGACAGGCGCCTGTGAGACTGTAGCGGGTGTCTCTGGGAGGAGGGTGTATCCGTGT------GACAGACTGAGGGGGGAGTGGGGTGGGGGGTT------ACAGTTGGATTGTATGTGTCAAGAGTAGCAAATAGTGGTGGGGTTGTCTATGATAGAGGAAGTGGTAGAGAGGGGATGTTG a score=25239 s mm8.chr4 132314442 1252 + 155029701 GCACTATTCGGAATTGCAGTT--GTTCTCTTGTGAAGGAGTCTGTGTGGGGTTGTTGTCAAGGTTTCCTGAGCAGTGACTATCTGGAGGGTGT-GTCTTAAGAGAGTAGG--CAGCCCCTGATCTTTTGGGATGCCATCTGATTGTAT-----GGGGCTTATCAATTGGTATTTTCAGGCTACCGATCAGTCTGGTTCAAATTTTGGGTG------------------CCTCTACTCCTATAGCGCCTATCAAGAGGGAGGTCCCAAAACTGGGTGAAGAGAGGCTGGAAATCTGCCCCTTCTAGTGCCTGTGTAGGTAACAGGCAGGCCTAGGCCGCTCACTCACTGTAATTTTACCACGGTGCCTAAGTCAGGAACAGGCGTGAATTGACCTTTTAACCCCTTCCCCACCGTGGGATTAGATTCTGTTTCCTGTTCAATCTTCTCCAGAACTAGTTCCATCCCG----AGGCACCTCCCACCCCAACAGTGGATAAGCAACCCCAACAACCATTGCCTTCTCTCCCTCCATCCTTATCAGGCCTTGGGGAGAACCTGAGGGCCAGGCTGGTGCCGGGTCTGGCAGG-AGCTGAGGGCCCAGGCGGGAGTGATAAATATTGAAGAGGAGGGATTTCGGTGTGGGCT-GGAGCAGCTGCAGTGGTTCGAGTGTCACACTATCTCTCCCCAGGTTTACTGACCCATTTCCATTCACGCGGCTGCCGGTTTCCTAGCAACGGCAACAGTCCCCCCAGAACAGGCG--GAGTGTGTGTCTGCCATTAGCGACGGCTGCAACTGTGTCAAGGTTACCCCGCTCCCTGCAAACCCACCCCGGCGGGTTTGTTTTCTGCCAGCGCCTGGCACGCACTATGCC---------------AGCCCAGGCAGGGGGGAGAGAAAGAGGGCTGGGGGCCAGCCTTAGGGGCTTGGGTGG-AGGTGGGGGCTAGGAGTAGCTGCAGTTTCCAATCCAGTGGGAGCCAACTTGGATGGAGTCCGAAGCCTCTCCCCCCCCCAACCCCCCATTTGCTGGTGGAAATTCCTGAGCCTGAGGGGAGCAGGGGGTGG---AGCTGTCCCTCGGCCCTGACCCCCGAGATTCCAGAGCCTGGGGGGAGGGGTGTAGGGCTAGGGGCCTCCGGGAGGCCTGCCCGGTCTGACCCCACCTGGCTCGCTCTCCTGCCTGCCCTGGCTTCCTCC---CACTTGTGTTAG--CAGCTCAGGGCTCTCTCTTGCTCTCAGC-TCTTTGTCCCAGCCTCTGTGCCTGGTCTCCCCC----------------------AACAGACTCCCCCGGGGAAGGG s monDom4.chr4 70240662 1179 - 430141050 GCTGTATTGGGAGGAGGAGTCAGGCTGTGTTTGGGAGGGGAGAGGGACAGGCTGT-------ATTTCGACGTCAGGTTGTGTTGGGAGGGGGTCAGATTGGGCAAGTGGGATCAGCC---------TGGGGAGGGAGTCAGACTGAACTCCAAGTGGCT---CTGTTTCTTCTCCTTGTCTCCATCTCTGCCCTCCCCATAGGTTGAGTGGTGGCCATAGAAACCTACCCCCTTCCCCTCTACGCCCCCCCCCCAGGTACAGCATACAA--------GAAAAGGCAGCCAGCCCCGCTATTTTTATACATCCT-----------CAGGCCCTGCCA---CAGCCCCAGTAATTTCACCACGGTGCCTAAGTCAGGAACAGGAGTGAATTGACCTCTTAACCCTTTCCCCGCTGGGGGATTAGACTCAGTTTCCTGTTC---CTTCTCTAGAACCAGTTCCATCCTGCTTGGGGCA-----------------GGGGGGGGTACCCTGGAAGAGGTAGCCAGAGCCCCCCCCTCTCCT----------GGGGTG-----GGGGGCCTGG---GAAAGGGGCTTGGCAGGCAGGAGAGAGCCAGGCAGGGAGTGATAAATATTGAAGAGGAGGGATTTCGTCGCAGGCTTGGAACAGCTGTGG--------ATGTCACACTATCTCTCCACAGGTTTACTGACCCATTTCCATTCACGCGGCTGCTGGTCTCCTAGCAACGGCAACAGTCCCCCCAGAACAGGCGGAGAGTGAGTGTCTGCCATTAGCCACTGCCGCATCTGTGTCAAGGTTACCCCGCTCCCTGCAAACCCGGCTCGGC----TTGTTTTCAGCTGGAGCCCAGCACACCCTGTTCCCCCTGCCCCCCTCCTGGCCCCGGCCAGGGAAACTGAGGGGGAGGGGGGAG-------GAGGGAAACAGCTGGAAGGTGGAGG-------------------------CAGTGGCACCC--------------------CCTCTCCTCTCCCC-CCACCCCATTT--------CAGTTCCTGAACTGAGTTGGGGCGCGGGGGAGGCAAAATGTTTCTCCAGTTTGCTTCCCTAAATTCCAGAGTCCCCGGACCCGagtttaggccccacctcctccaggaagcttgtcttgactAACCCCACCCAGCTCCTGTCACTCAGTGACTTGGCATTCGACAGGCACTTGGGTCCGGCTAGCTCTGGG----TTCTTGGCCTTAGTGTCTTTTGCAGGGTTTCTGGGTTTCTCCTCCCCCTTCCTTCCCACCATCCTTCTAGCACAGCCTCCCTAAGGGCAGGG a score=6812 s mm8.chr4 132315940 200 + 155029701 GCTCTGTAAGCCAGGCTGCAAGGGGTTAAA------------------------------------CTGCCCC---CCATCTTGGTATGTGAGCTCCCCCAGGTTGGGGGGATGGGAGTATGAGGGGTGTCTATTGCCTTATAACCA-CTCATGGTCAGCTCAGACCTGACCAGTCACATTCCTTCCCAGGAGGGTTGGAACTTAGAGCAGAGAGGGCAGAGGCAGGGGCAGAGGCCTGG s monDom4.chr4 70242757 226 - 430141050 GCCCTAAAAGCTGGGCTGAAAAGAGTTAAAGCAGCCCCCCCTCCCCCTGGCTGGTCCTTTCTCCTCCTGCCCCTCCCCCTCGTGGTATGTAAGTCCCCCTAGGCTGGGGGGA------------GGGCTTCAATGGCCTAGTAGCCATCATGTGGTCAGCCTAGACCTGACCAGTCACATTCCTGCCCAGGGGG--CGGGCCCAGGGCCAGAGGGGACAGAGACTTGGTGGGGGGCCAGG a score=9267 s mm8.chr4 132316588 579 + 155029701 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s monDom4.chr4 70246583 1522 - 430141050 GGCCCGGCTTCCCACCTCTCTCCTTGAGAAGCTAGTTCAGGGGGGCCCCGGGG---TTCAGGGTGGGAGCAGGGCCGGTTCCACACGAGCCAGGGAAGTTGGGGGGAATGGAGACCCAGTGGCACCGAAGCAGTTAAGAGACCGATTTGGTCCCTACGTTCCATCAGACAATTAGTGAGGCC--GCCTGACAACATCACACTGAGCC-AGGCAAACCTCTCCCCCCTCCCGCCCCCCCAAGCCCCCCCCACCGGTTCAGCTGTTTATTCTGAGCCTTTAACAATTGGGATTCTGACTTAGAGGAACGGGCGCCCCGCTCTGCCCTCTGACCTGCCGTTGCTGTGGCAACCGGAGCCCGGGTAGGCCTTGGTGACTGTGTTAGGATTACAGATCCTGAATTCACAATCTCCAAGCTCTCCGGTGATGGCAGGCACTAGCATCCCTTCGCCTTGGCCTCGTCACAGTGCTCTGGGTCCCCAGTTAGATGGGGGGAGGGAGCACACTGCAGTGCTT--GGGGTATCCGGGTGCCTGCA-----CTCCCCACGTGGCCACCTCTGGGTTAGAGCAAGACTCCCCCAGAGGTAGGGAGGAAGAGAGGGGGAGCCAGGCTCCTTCACCCCCTCTTCCAGGAAACCTTCCTCCCTTGTGCC--CCTGCCTCCTTGGGCTGAGGGGGTGTGCCGCAGCCAGGCTTGGCTCCCTCCATTCTCTTTCTGTGATTTCTCCTCTCCCTCTCCAGGCAGGGCACC-CCAAGCCCCAAGCTCCTGGTGCCAGGAGCCTGTGCCCCCAAGGTGCTGGCCTCCACAGAAAAGGGGGGGCGCC------TGGCCCAGTCTAGCCCCTCCCAACAGCTCTGCAG-CAACTGCCCTG--TGAAACCTGAGCCAAACGCATCTGGGAGCCTCATGTGCAGACACACATTCCATTTGTGGCC-----GGTCCCCCCCTGGCTCCTGGctcccccctttactcactgttcctgcctccaccccctgcctcagccctgcctccgcctcctcacactcccccttctctcctctgcctcccccccatcactttttgtctcccccactcctcctcctcctcctc---------ctcctcctcttcA--CACACACACActctctctctctctcagtctgtctccctgttgtgtgtctgaatgtttcttctctgactgtctctgtctctctcCAGCTATTCTCTCCCTCAGGGCCTGCAGTATGTCTTTAACTGtctgtctttgtctctgtttttgtccgggggtctctccttgcctcggtatctctggctgtctctgatctgtctttgcctctgtctctgtGTAAATCTTTCTGCCTGTGTC-------------------CTTGTCTCCAGGTCTGTCTCCT-TCCCTACCTGCTCCCCATGGATCTCCTTCAGAG-------------CCAGGAGCCTCACTTGGCCCT-TGTCTCCATCACC---ACCTCTCCCCCTCCCCCAGCTCTGCCTGGCAGGGACTTGGCCGCCCTCCA----TTCTCAGGTCCCTGCTTTGGCCACTGCAGCCTCTGGGAGGGGGTGGGGGGCGAGATCAGCTGCCCTGG 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CATTAGGAATCTGCCAGGCGAGGCGTGGTCTTCTTCCTCCCTTT-TGCTTCTTGGCTTGCTTTCCCAGCTCT----------------GCAAAAGCCTCTGGGTGCGTGTACAGGAACA----TTCTTCTTTAAAAAAAAAAAGAG---GAGGGGTTGGGGGACCTCAAagagagagagagagaaagagagagagagagagagagagC----------------------------------------------------TCTGGTTTGGGTAGAAAATCAACCGGCTCCTTAATCCTTGCC--TGCAACCTCTGCCTTC-----CCAGCCAGCCTG---------------TTGGCTCTAGGCCCTGGAA------------AGAAGGCTCG-----------GCTCCAG-----CAAGAGGCCTAGACCTGTCCcccgcccgcctgcccgcctgcccgcccTCATCCTT--GCCACCT-------CCTTCTC---TTTCTGGGGTCCGCGTGTCTTTTGGAAC------CTGCAGGGGCTCAGCAGGGCTGAGAACATGTGGGAGCTGCAGAGGGGGCTGGTGGGAGATCTCATGGCCCTGCCCACTTGGCCATTTTCTC--------CAGACCAGAGGTTACAGGATCTGCATTGCTCACCCTAGCC-------------------CAGCCCATCCTTCCTCTTCCTGCCGTCAGTT-----GTTTCTCTATGAATCACTCACTGGTCTCTCCACTGCCAGTTCCCCCAGGGCCATCACCTATATGTTCCTATCACTGCTG s monDom4.chr4 353121914 789 + 430141050 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TGTTTGGGGGGGGAGTGGGGAGTGTCCAAGGAGAAGCCCCTTGAGGTCTCCATGTCTGAGTGA---------CCCTTTTTCATTTCCTGGGCTCTTTCAAGCTAATGTCTTACTACCCAGACTTCATACCCAGTTAAGCAGTCAGTAGCTCTGTAAACAGACTTTATTGATTCCGGCCATGGGTGTGCTTTAGGTGGGGGTCCACAGAAGGGTTTGACAAGGCTATGCCCTGGGGACCAGGTTGGTTCTGAGGGGCAGAAGGCCATCCACCCACTCACAGGGCCGCTCCAGGAGTGTCTGCCACAGCTGCTTCTCCTCCGGTGTGGAATCCATCCAGGGCACCTGAAGCCCATAACTGCTGCCTGGATGTGGGTGAGCCAAAGTGGAAGCTACTG s monDom4.chr4 353351642 344 + 430141050 TGTGTTGGAGAGGAAGGGAGGATGTGCAGGAA------CCTCGGGGCCTTTTCCCCTTGGAGAGAATCAGAACCCTCCCAGATCCCTCAGGCCCC--CAAGCAGAC---------CCAGGGCCTTTTAGCCTGT---------GGTAGT----------GACTTTATTGTCCACTTCTCCTCCTGTCCC---------AGCACTTGGCAGGGGCTGGCCCAGCTACGTCCTGGGTGTGAGATTGGTCCTGAGGGGCAGAAGCCCATCCACCCATTCACAGGGCCGGGCCAAGAGCATCTGCCACAGGTGCTGCTCCTCAGGGGTGGAGTCCATCCATGGCACCTGAAGCCCATAGCTGCTGCCTG---GTGGGCAG---AAGGTATAAGCTCATG a score=14446 s mm8.chr4 132525457 302 + 155029701 CCCAGATTATGCATTGTGCCC-AAGCATCCCGAACCTCCCAGCTTGGCTCCCCTCAAGGGCCTG---CTCTGCTCACCTGTACCAAGGCTGAGGCGTGTGCCCCCCAGCTGGCGACTGGCCAGGGCCCCATGGTCCCACAGGGAGAGCTCGGCACAGGCCTGGCGTAGGTCAGCAGGCCCGAAGCCGTCATAAACCATGGTGTGGTTGAACACAGGGCTGAGACTTCTTCGAACCACTCTTGTGCGTTGGCGGCTGGCCCGACTGTCATCAGGCAGCACTGAGCTGTG--ACAGGGTAATAAAGGAGG s monDom4.chr4 353352265 300 + 430141050 CCCAGACCATCTAGTCTCCCCTGAGCAGATCACCCCTC------TGGT--CCCAAAAGGTCCTGGTGCTCTACTCACCGGTGCCCAGGCTGAGGCGAGTGCCCCCCAGCAGGCGACTGCCCAGGGTGCCGTAGTCCCACAGGGTCAGCTCAGCACAGGCCTGGTGCAGGTCAGAGGACTCGAAGCCGTCATAGACCATGGTGTGATTGAAGACTGGACTCGAGCTCCGCCGCACGACCCGCGTCCTCTGGCGGCTGGCCCGACTGTCATCGGGCAGCACCGAGCTAGGGTACAGGGTGGGAGAATGGG a score=8512 s mm8.chr4 132527543 354 + 155029701 GCTGGGGGGACAGGTGGGTCAGAGGTCAAGAGCAG--AAGGGACTAACACCTTAGTCGGCCTCTCACCATTGAATGTAAGTGTCCAGGGATCCTGGTCGCAGTGGTACCAGGCTCTGAGCTTCCTTTACCCAGAAGTGTAACTCCCCACTCTGAGGCTGTCCTCCTCCTGT-------GGGGACACTCCAGTTCAGACTACCACCTCACAGAGTGGGTGGGTCTCCCACCTCCCGGGGCCAGTCCAGCTTAAGCTCT-------CTCTTGGCAGTCACTTACCCTCTGAGCCGGCAGGGACATACTTAAGGGACAGAGACAGCAGTCCACGGCTGGGAAGCTCATCTGGAGATGGAGGAACCTGAAAAGG s monDom4.chr4 353352572 347 + 430141050 GCGGGGGGGAGGGGAGGGCCCGGGGAGCAGGGCAGTGATGGGG-----------GCGGGGCTCTCACCATTGGATGTAGCAATCCAGGGGCCCAGGGCGGAAGGGGACGACGTTCTGTGCATCCTTCACCCAGAAGTGCAGCTCTCCACTGGGAGGGAGCCCCGCACCTGCAGCCCCAGGAGAAAGTCC---TCTGGTTACGCTCCCACCCAGCGGG--------CTGCGCCCCTGCACGAG-CTAGCGTGGACCCCAGCGGGGCCTGCAGCGAGGACTCACCTTCAGCGCCGGTGGGGATGAATTTGAGGGCCAAAGAGAGCTGCCCCCGGCTCGGGAGCCCGTCGGGGGAAGGCGGGGTCTGTGGAGA a score=9389 s mm8.chr4 132527897 430 + 155029701 CGGGGAGTGGAGAAAAACAGGATTATGTGTGAGAAGGGTGTTGGGGACAGGGCCTCTACTGAGGAGCCCAATGGCAACGCTCCCCAGAAGAGGCGCCCTGG--CTGGCAAGCCTGGCCTA-ATGGTATCAGTATGAGGCTAAGTAAGGCTCTGCAAACCGGTCCGTTGGGTGTTTGGTCCAGTGGGCCTGTGGGAATATCAGTGACTGCACATCAGCCCTTACCCGAGGCTGCAGGGGGAGCCAGGTAGCCTCAGAGTCCCAGTTCCATGTGTCTAGGGGCACTTCTACTTCTCCCAGGAAGATGTTGCGACCCAGACTTTCCCGGTGCCACACGGACAGGCTCAGCACGCGGCCTGGGAGATCAGCCTGCTGGACAGAGTGCTGGGGACAGGA-----GGTGAGTT----TCAGAGGCATGCCCTGGCGTCGCTGTGGCTC s monDom4.chr4 353353487 392 + 430141050 CAGGGAGTGAGAACGGAAAGGGGGATGCGTTAGGGG-----TGGGGGCAGAGAA------GAGGATTCATCAGGGGAAGCTGTTTGGAGGAAGAAAGTTGGATCTGAGAGGAGGGGATTGGATGGC--CAGGCAGAATCTGAAGAAGGTCCCGGTAGGCGGGCGTCAGGGTCCCGGGTTT-------------------------------------CCTTACCCGGGACTGCAGGGGCAGCCAGGCGGACTCGGAAGCCCAGTCCCACGTGCTCAAGGGCACCTCTACCTCACCCAGGAAGAGGTTGCGGCCGAGGCTCTCGTGGTGCCACACGGAGAGGTGAAGCACGCGGCCGCCTAGATCCTCCTGCTCCACGGAGTACTGGGGGCGGGAAAAGTGGAGAGTTTAAGTCAGCGCCCCGCCCCCTCACAGCTACGCCCC a score=8181 s mm8.chr4 132528557 151 + 155029701 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ctttcccacagtcactcagctaatCCTAATAATACTAATTGTTTCCCAGCAGCGACCATCACAGCAGAGCCAAAATGGAAGCCAGGTTTTCAGAGCCTTCCCACCCTCTGTCCCATAG----CTGGGCAGGCTCATGCCCTGGAGGACTGGTCTCACCTGACATACTTCCCGTAGATGAGGCAGAAGAGACAGACCTTCACCATGTTCCAGTGGGAGCTGTTGTTGTAGCGCATCAGATTCAGGGCCAGGGCCACGTGGGAGTGGCAATTGTCACAGCAAAGGTTGTGCTGCAGAGGGAGGGGCAGTGGGCATTAGGTGCCAGCCCTGGGGCCGAGGAGGGTGTCCGAGCCACCGCTGCTCCG-CCCCACCTACCATGTGATGCTTATATTCCTCCGACGCCTCATGAACTGCGGTGTCCCAGGCATTGGGCCGACTGGCATGCACTTTGGAGGGGTCCAGCTTCCAGTACCTGAGGGGAGAAGGG a score=3345 s mm8.chr4 132541731 175 + 155029701 CACTCTAGG-TGTTTGGTACAGGGCA-CTCAGGGTGCTGGCTCCTGCTGTGCTTCACAGGGCCTG-GCCTGTAGCTCTGAGCAGGAGGAGC---------------TTGGCCCTGACTAGG-CACAAAGG------CATTC--------------------ACTTACTTGGCAGGCTTTCCGAAGGCCATGTTGTCTTCCTGTTGAGATACAAGAGCAGA s monDom4.chr4 353372711 220 + 430141050 CACTCAGGGCTGCCTCTAGCAGGGCAGCAGGGGGGGATGGAGGCTGCTGTGGCTGCCACTGACTGTGCCCACTACTCTGGGAGGCAGGCACAACCTTGAGCCCCCTCTGGTGCCCACTGGGACACGGGGGTTCACTCATTCTCCAAGTTAAGTTTTTAAGAACTTACTTCACAGGCTTCCCAAAGGCCATATTGTCTTCCTGTGGGGAGAGAAGAGAAAA a score=7722 s mm8.chr4 132543026 109 + 155029701 CTGGGGACTCACCGAAACAAAATAGGGGCCAGCGAAGTCACGAATGACCCCTGCAGATGTGCAGATGCCCATGTGGCCAATGATGGGGAAAAACCACCTGCAGGAGAAG s monDom4.chr4 353374772 109 + 430141050 CTGAGGACTCACCGAGACATAGTAGGGGCCTGCGAAGTCCCGAATGATGCCAGTGGAAGTGCAGATGCCCATGTGGCCAATAATGGGGAAAACCCACCTGCAAGACAAG a score=9006 s mm8.chr4 132549467 498 + 155029701 ACGAGAGCTCTAGGGGACTGGG------GGCTAGCCTGGCCCGGAGTACGGGTTGCTGCAAGTCTGGGGAAAAAAA-------AGCTAGCATGGCACCCCGGAGGATGCTCGGGCCCTCGGCGACTTCGCG----CTGACATCGGA----AGACACTCACGTGAGCACCGGGATGGGTGTCCACACCACGCAGTAGGGGAAGCGGCTCCGCTCCACGTCCAT------------------------------GACAACGCCACCGGACCCGTGGTACTGCTTCATGTCCGTCTCGGCCCCCGTCGGCGTTTCTACTTCCGCCATCCGAGGAGGGGGCGGCGGCGGCTGTAACAGAAGCGGAGAACTCCCTTCCGCTTCCGCCATCCCGCGCGCGTCCCGCTCGGGAAGGCCGACCGCGCCGCCGCTCGCCCCTGTGTCATCACTTCCGGGAGGCGGAGTGTCCTC-----TCGGTCGATC----------------TTCCCCCGGGGAATTGGAGCCTTGTCCTTCTGGGCCCGGCTAGTTTAGCCTCTTTCCCGTGTTTGTAGCGGAGC s monDom4.chr4 353378623 542 + 430141050 ACGAG-GCTCTAAGCGACTAGCCACAACAGCTACCATGACTCG-AGAGGAGATCTTGGCAAAGGTGGTAGGGCAGGGCTGTCTATTTAGCACGGC-CCGAGGATGGGGTGCGGATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGTCTGGGATGGGGTGTCAGGCACTCACGTGAGCAACGGGATAGGTGTCCACACCACGCAGTGGGGGAAGCGACTCCGCTCCACATCCATCCCCACGACGCTGACGCTGCTGCTGCTGGAGCCGCCGCCGCTGTTTCCACGGAACTGCTTCCCGGCTGCTCCGTCCGCCGCC------TCCACTTCCGCCATCCCCTGAGGGGGCATTGGCGGCCGC------AGTAGGGAGCATCCTTCCGCTTCCGCT-TCTGCCATGGCTCTCGCTACCTTCGGCCGTTCGGA--GCCGTTCTGGTCTG---CGTCACTTCCTGGAGATGATGTTCCCTTCTAAATCGGCCGTTCCCCTTCCCTGCCCCCTCTCCCCCAAGCA---GGAACTTAGCTCCTGGGGCCTCGGCCAG----ACCTCCTCTTTCTTCCCCCTGCGGAGC a score=15801 s mm8.chr4 132564515 618 + 155029701 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ggagggaagggaggCTGCTTCTCCCCAGAGGCTGCAGCTGGAGGGCTGCCGCCCAGAGGAAGCACACAGGGCTGGGGGAGGCTGGCATGAACCAACTCCCGGCTCCAGAGCAGGAACCAAGGGGCCAGAGGGAGAGGGAGGCTTGGT------GGTGGAGTGGCCGCTGTGTCCAGTGTAAAGCTCG-------------------------GGGCTGCTGAGGGGGGATGGCTGAGCTAAGGACTTTCCCAACCCCTCCCCCCAGAGCAGCAGGGGACAGAGAAAAGCCATCACTTCTTTGGTCTTTGTGGCGGCTCAGCAT--------------GTGGGTGGGAAGGA-------------------GGGCGGAGAGGGTGCAAAGGGTCCTTAGGAAG-AGCCACCTCAGC-------------------------------AGGGTAGGCCTGGCGGGGAGCTCTGGCAGAAAGGTCACAGTGAGGCCGAGAAGCGCCCCAGGAGAGCGGCCAT-GGCGCGT-AAGGACTCGAATGGGCAGGTGGGTGGGGAGGGAGGGACCCCACCCCGTCACACTGTAGGAAAGGCAAGGCCCTCAGAGA------CAGCGAGACAGCCTAGGAC-AGGCCAGGAGCGGGGG--AGGAAGCTCCACTGCCCCCAGGCAGGTGGCCTGACCTTGCCACTGCGGGATCCTGTTTCC---------TATGCTTCCACCC-----GAACACT--------GGTGGCTGTGGAGGG-------------------------------------------ACCTTCCGGAAAGACC-------ACAGGGGAGCTAGCCCGGGAGTCAGGAGAGTGGCAACAACAGGCCA--------GGCAAGCCTCGGCCAGCAGGGAGTTCCACTCC-------------CTTTCTGTTGCCCGCGGAGGG--------GCTGGG---------CAGTCCGTAAAGACAGCTTCAGCTCTTGCCTCTCCACTGGAGGCTGAAGGATTT--TGAGAAGGGCCAGAGCCTTCCAGAGACACCGAAGCAGGAGGTAAGGGCATACGGAGGGGCTTCCCCTCCTACTTTTCTGCTGGGGCTGGGGACAGTCAAGGGACAATCAGCCCGAGAGTCAGAAAGCCAGCAAGTTGCAGCAATCCCCACCC-ACAAAGTCAAACTAACAAACAAAACAGGGGGGGGGGG--------------AGAATGAAAAATGGGGGTGGGAAAGACAAACCAAAACAGAGCCCAGCCCTCTGATCTCC------------------TGCACAGGGCTGGGTACTGGGGCCAGGAGGGTCTAGCTGGGCCGGCACTGCACCTGGCCCTCTGCGCTGTCCTCGTCATCAGAGGCCCCGGCGCCCCCGCTGCTCAGGCCTGTGATCCGATAGCCCATGTCCAGCAGCATCGCCTCCAGGGGGTTGGCATTCATGCGCCGCTGGTTGGCCTGAGATGCACCCTCCATATCTTCCACAACTCGGCCTGTGAGGTCTTCACTCTGTCAAGAAAAGGCAGGTCTAGTGAGCTCAGGGTGGAGGGACCAGGGTGGAGGGACAGGCA 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actcactcacTCTCCCAGCACCCATGGCTCATAGGGCTCCTCTGCCT---GCTGCTGCTGGGCCCA---CAAGTGGGAAC----ACAGGC-ACGTGGGGAAGTGGGAGACACCCAGCCAATCAGCCAGGCATGCACGCATGAAAATCACACTCATACACACACACAGCCAGATACACTCA-CAACAAACCATAAGGTCTCTCGTGACAAAATCACAAAACCAACCTGCTCTTGCCAACACC----ACCCAGCACTAGAGAAACAACAACGGGGCTGAGGATTTTTTTTTCTTTTAAAAATTCTATGTAGAAAAGAGTTCTATAAAATTGTGCAAAATACCCAGCAGCTTCAATAACACCCATTTCAAGTATTGCCAGCATGTTTGTGTGTGTGTGCATGAGTGTGTGTGTCTCACCCACACTAGGGAGGTGGG----------------AGAGCCTGGTGGAGGGTCTCTGGGGGGCCTGAGGGAAGGGC---TCTCACTGCTTAATCCAAGGCCCAGGAATCTAAGCACATGGATGCTTCCTGGGCCCACTGGCCACAGGCGGGCTGGCTCCCTCTGTTCCAGGAGCCTTAAATAGGGACACTGTCCTCCTC-CTACCATCACTGGACCGCCGGCCCGACCCTATCAGATAGCTCCCAGCAGGGGCCTGGCTGCTTCCCAGGAGTCAATCAAG--------AACAATAAGACAAAGGCAACCCTGAC---GCCAGACTCTGAAATCTGCTCTTCTGCCTGCTAAGCCTTTGGGGCTCCCAAACTTC-CCTGTGACGGCGGCCCACGGTCTCTGGATCTCTTAGACCAGCCAGGCCTGGGGCCTCCTC--ATCCACATCCAACCATCCAGGGCTACACCTCCTCAGCACAGACATGGGTATAAAAGGCAAAGAAATTGGTTCTCTATGGCAATGTGGGCACTTGTCCAGCCCTCCATCTTCCCAACTATGACCAGGTGGAGGTTCTCTTGTCTCACCACTGGGAGCCAG-TAGGGAGTCTCTGGTCATTTTCACATGGCTCCAGGACTTAGGCAAAGGGGAATCCCCCTGGGAT---GGGCCAGGGG---CAGCAACAGAAGAGATCAGGAACAGCCATGAATGGGGAGGGGGGGGAGTGCAGAAATAAATAGGAGGCTTGACATGAGCGTTTGGTAGCTCTGCCCCGGTGGGGGTGGGTCCAGCAGGCACGGGGAGGCAGTGGGCGCAGGGAAGAGGGACTGGCAGCCTGGCAAGCACTGAGTTCCTCTAAGAGTGGCCTCCTACCATGCTGCTGTCTGGCTTGGCTCCACAGGTAGGTTCTTCGTTCTTGGTGGGAGAGGGCAACAGGGTATCAGGCTGAACGAATCCCCTCCGGTCAATCAAGCTTAAAAAA 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monDom4.chr4 354260138 188 + 430141050 TTCCTTCCCCTACTACTTACGTCTTTCAGGGTGATGATATTGGGGTGTTGGCCATAGCGAAGAAGGATCTCTATCTCCTCTGTGGGGTCCCTCTTGCTCTTGTCGATGACCTGGGGACAAAGAAAG--------------AGGGGAGAA------TGGGAGGAG---------ATGGGGATGGAAGACAGGCTACTAGGAGAGGTGTGATGGGGGAG a score=10142 s mm8.chr4 133132793 379 + 155029701 GTCATTGTCCACAGACACTCCCCATCATTTTGCCACAG--GTACACA--CTGGCCT---TACCCCGAGCCCAGCAGCCTTAGCAGAGCTATGGTTCGGAGGCTCACCTTGACAGCATACTCCATGTTGGTGGCCTTGTGGACACAACGCTTACACACAGAGTAGGAGCCCACGCCGATCGTCTCCTTTACTACGTAGCCGTCACTGAAAACCAAGTTCTTCCCGTGGAGTTGCTGCAGGAGACACGAGTCAGCCTGACCCCGGATGCTACGGTGCAGGGGTCATTCCTAACATCAGGCCTTG--GCTCGGTAGAGGTGGCATGGCAAAAGAGAAACAGCCACAAGACCT---GAGTGTCATCTGACCTGTGTGGCCTCAGTCAGGAGTCTG s monDom4.chr4 354260592 377 + 430141050 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CAAGGATGGTGGTCTGGATGGGCTTTTTGGGTGTATGCCTGGGACTCTGTCTCTTTGTGTACCACTCTGTATGACTTCTTGCCCCTGCCCATGAATGAGTCTGGGGGTGTAGACACGGGTTCCATTGTATAAAAGAATAAGtgtgggagccgctgggtcgctcagtggatagagagccaggtctagagacgggaggtcctgggttccaatctggcctcagatactcctagctgtatgaccctgggcaagtcacttgactcccattgcctagctcttaccactcttctgccttagaaccaataaaccatattgattcccaaatggaaggttaagggttaggaaaaaaTGTCTAAAAGAGTATGTACATGGTACACCCCTGCTCACAAAA-GTGAGGTTGG-AGAGGGG----TTTGGGCCAGGCTGGAGAAGCGAAACTGGGGCTAACTCTAGAGGAGGCAAGTGGTACCCAGGGTGGGCCCAGGTCTCTCCTCCTCACACTGCTTCTGATTTTCCCTA------GCGCCGGGTTTACTTCTGCCTACGGAACAGAGGCTTGGGCAGGTGGCTGGCAGTGCCCGAGGATGTAGAGGACATGAAAGCTGGGAGGGTCGTGGTCTCAGAGGTCCGATCCGGGAGCAGCTGTATCTGGTACTATGAAGATGGGCTACTGAAGAACCAGGTATGTGTGGCAAGGGACAGGGAAGGAAGGCATGCCTGGGGCCCCTGGGAACAAAGCCTATCTCTTGGGGGAGACCCAGTCC-----TTTCCCTTAGGAAGTGCCCAAACTAATGGGAGCGATCAGACAAAAAGCCAGGCAG-GGAGATGCCTGCAGA-----ATTTCCTGTGCTTTAGCTTACAAGAGCAGGGTAATGAGAAGGACTGGG---Gtgctactgtattgatagg a score=13961 s mm8.chr4 133364033 591 + 155029701 agaaaCCACAACAACAAAAATCCAGCGAGCGAAGGATGGCTTGAGCATGGGAGATTTCCTAGGCCAAA---TCTCACGATCTTCTGGGGCCTCAGATGGCCCCCACCATGAGCCTACAGGTGATTGGACCTCCTAGCCCAGGCTCCAAAGTAGTACTATGGGCCGAGAGCCGCCTACCACGCCAAACCTGGAGCATCAATGAATTGGGTCACATCTGCAGCCAAATGTTTGAAGGCCAGATCCTGGATGTGAAGGGTAATGTAGGGG--TGGGGTAAGGGTGCATAAGAGGGGAGTAAAAACTGGGCTGCATCCAGCACTCTCTGACCACCTCTGAATTTTCCCCCTCCTCTCCCCCCCCCCGCAGGCGGACGAGGGTATGACCGTGACCATGTGGTGCTGTGGGAACCAACCAAGGACAGACTTTCCCAGATCTGGACTGTCCATGTACTTTGAACCAACCAACGCCATCACCAGTTTCCTTCAGGAGGCTTT-TGCTGGGATGAAGTGT-----------------TTTATACAGATTTTG---CTGTGAAATAAGCTATTTTCTACTAT-GCTGCTGGTGGTCTC-----------GTCTCTGCACCTTGATGTTGGGATGGAGAG s monDom4.chr4 354580953 581 + 430141050 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CCCGGGGGCAGCCACCCTcaggcaggcaggcaggcagacagCAGAACCTACATGGGAAACAGGGTGACTCAGCCA------TCATGGTCATGTGCTGCCAGCC------------AGCCATGTGT-TCcacacacat------acacacatgcacacgca------------------cacgcaGC--GGCAGCCCTGGGACAGTCCAAACA-------CCACCAGAACTATCTGCCTCTGCCAGGCAGGGACCCGGACAC-CACAAGCAGTCAGCACCAGAGGAATGGACATTTAATTGTCTCT---------AGGGCACTCCTAGGATGGGGATGCGGGG----CCTTTGGCAGAGCTCTGGCTGATGGAAGCAACAGAAATGCTCATCAGACAGGGCCA-------GGCAGAGAGGATGCCCCAAGGTGTGGCTGGGGACAGCCATCGTCAGGGCTTAAGACAATCTTTTGAGACTAGTTGGTGAATAAGGAATGTTGCCTCTGGAG--------------GAAGAGGAGGCGGCTGCGGAAAGGGTCTGGG-------------TCTGGGTTTGCAGATTAGGACGACA----------AGGAGTTGGT----------TACAAGGCCTGGTGAAGAGCTAGCTGGATAGGATCGGTGGCCATCCTGAC----TCAGGCCAGCTTCAGGAACTCCTGCAGTGTGTCCTGCTCCACGGCCTCCACGAAGAGTTCATAGTCCTGAGGAAGGGAGGCAGTCACCTGAGTCGAGGTGCAGGGCACCCCAGTTGTTTGCCCAGGTCTGACCCTGGCTGCAGTCCTCCAACACCTCCCAGAACCCAAACCCCATACCCCACAGTAGTGGTTCCCGTTGACAATCTGAGGTGGGGTAGCTTTGGGGTTGCCAGCCAAGGTTCGCATCTCATCTCGAAGGGCGTTGTCCTGGGAGATGTCCACTAGCTGGTATTGGATCCTCTTCCCATCTAGGATGCGGGTCACCTCACTCTGCTGGGACTTGATCTAGGGGCG------GAGGATTGACAGGGTTGGCAGGCAAGCTGAAGGATTTGTGGGAGGAATTCCTTCGGGTGTGAGCAACAGCTTCTATCCTGCCCACTCTGAGGGGAGGTTCTGGCCACTAAGGGATGGGAAGGGTCCAAGGATAGACAGGTAAACTACTAGAGTTTCAGAAAGAAGACGGGCAAGTTCTGTGCATGACAGGGAAGCTAGACTCGGCGAGGGGCAGGCCCTCTCTACAAGACACATCTCCTCCTCCACAGCCGCACAGTGGAGAGGAAGCGGGATTAAAGCGGTCGGGGGTTGGTGCAAG----AGAATGGATGGCCCTATACTGGGGGAATGAGCGTGGGCAGCTCACGCTGGGGATGCCGAGGGGCCCTTGGTG---CGGGGGTTCAGGCTGGGCCCAGCCCTTGGACCAGACCTGGGAGGCCATACCCCGCACCTCACTGCTTCCATCGTGGGGGCGGCTCCCGGGCGCTGGTCGGAGCACAGAG--ACGGCCCACCCTCTCCGGGCGCCGGCCCAGGCACACACTTACTTCTCGGGAGCCGGTGACCGACGTGCTGTAGACGCGCAGGCCACTCATGCTGCAGGCGGG-----------GGACA---------------------CAGACCA-----------------------ACTGAGGGA---------CGGTGGGAGCGGCAGCTGCACGGCTAGGAACTACGCTGCCG-CCGCCGCGCTTGGGAGCGGTTTCCTTCCTGCTCCG-CCCGCGAGTCA-CTGCTCTCGGGACCAATGAGCTGCGCAGGCGGGTAAGGCGGGGCCTGCATGACCCCGCCCTGCTCCGTGGCCTGGAGCCGGGAGGACCCCTGTCCTCTGCAGCTACTTGGCTCCCCCA-CTTCCCCCTCAGCCCCATGCTGGGGACCGGCTAAAAGGCAGAAAAAGCTGGGAAGGCAGGCG-GACCGGTTCAGTTAAAAGCTTTCCCCAGTCTACCCGGGTTGTGTACA 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s monDom4.chr4 354762978 1294 + 430141050 GTCAGAGACCAGAAGGTAAAT-GTCCTCCTATCCCCAGAGTCAAAGGTCAGGTGG------------CTTTGGGCATGGGGGGTCAGGAGGCAGGTGTTCTTTGGGCTCAAAGGA------------------AGTCCCATCCTCAGGTTTAGGAGTCCGAAGGCAGGAGGCCCCTTCAGCTCCCAGCCCAGCCCAAGCTCCAGGTCTGTCTGAAAGTAATTCTTGGTTCTTCTCTTTCCACCTCTGGAACTTTTCAGAAGTCAAAGTGGGATCATTCAGCACCTCATCGAGGGCCTGCAGCTCCTGTAGCTTTGCCTGGGAATCAA------GAGGGACGGGTGCTGAACATTGACATCTCCCCAA-------------------------------------CCCTCATCAG--TCCCCCAACCCAGGGAT----------------TCTCTCC--------TCTTCT----CCTTCCCAAGATCAGGGCTAAGGGCCA--AAGCTGGAGCTAACCTTGAGCGTGCTC-------TGCAGG------------CAGCGCACATGGTGGGCCCGCTCA-TTGAGCTGGG----GGTCGCGAGCACGGC--GCAGGAAAGAGCGGCGACATTGTTCCTGGGTCAGATGTGGGCGCCCCAGAAAGGACACACCTCCTTG-----------------TTGGAGGCCCCGGACCAGGTGCTCCA------------GAGTTCCATCATTGCTGCTGTCTGAGG----CTGGGGATATATGTGGAGCAGGAACAAGGCCTTGACTGGGGTTATACCCCCTCTCCAAACTCCCCTCACCCTCTGATGTCCCCTTCCTTTACCCGACATCTTCCTCC-CCATCTAT----------TGCCTGCCAAGTAC------------------CAGCCTCCCAGTTCATTCCCTCCCTAACTGCAGGGC--CTACCTGTTGAAGGACTATATGACACCCGGGGGCTGCCTTGAGGGGTTGTGGCTGAGGGGGAGCTATCTCCATGGGGAGAGCCCCAGGCTC---CTGGGTTGGGCTGAG---AGACAGGAAC---AGTGTTAGTTCAGGCTTCTCTCCTCTCCTATCTTCC-TCCCTTCCCTCCCCATCCCCTGGA---------TACTCACTGAGGCTGAGCGGGACCCCGTCTCCTCATCTGGGTCTTCTGCTTCTGTTTCACTATAACAGTCTGGTGGAAGAAGGGG--------CAGTTTGAG--------GCCAGGGAAAAGGCTAAGGACTCAAGGCTGCCCTTTCACATGTCCTAGATTATATGGGAGGGTAGGGAGATTGATAAGAAGGTAGACCTTGGTACTATGTGGGGGAAGGTCTCTGGGGAAGAAAAGGTCCTATGCCCCAAGGACCACCCTCACCTTCCTCTCTG---GGTGCAGGAGTTCGGCTATGAGACTGGTACTTGGAGATGCAGGTCACCAGGTGACTCACCCACCTGCCAAAAAAGCAGAAGGGGTAAGTGGTGATG 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aatctcctccccccactcaaatctgatcccatctctccatctcctcccCAAGGGTGCCCCCAGCCTCCTACATCTCCCTCTCTCACTATTTCTTCTTCTGGTCCCGACCACTCTCCAGGCTATAGTTGGAGACATTGACCAGGCCTTCCGCCTTCTCATCCTGGAGGAGACAGATTTGAGGAAGAAGAGAAGACTCAGGAAACTCAGAATTC-TCCAG---TATAGATGAAGCTCTTC----CCAGGGATCTAAGGGAGGAATATCACTCCAGAGATCCTTAGGTGGTGGGGAAGGAGAGAGATGGT---CAAAAAGGCGGCC a score=10680 s mm8.chr4 133504087 205 + 155029701 ACCTACACAAGTGCATATGGGGGTCTCACCTGGGGTTGGCGGTACCAGTATAGGGTGTGTCCCTTGAGCACAAACCAGCAGCGGCGCCAGCGTGGGCCCATAAAGCCACCGGGTACCTTCCGCAGTAGAAGCCATCCATCACAATCCGGCAGACCCAACTCTCGGCAGGACACCCGGCGGCGGCTCAGCCTCGTGGCTATACCTG s monDom4.chr4 354766254 205 + 430141050 ACATATACTGCTTCCCCTACAGCCCTCACCTGGGGCTGTCGGTACCAGTAGAGGGTGTGACCCTTCAGTACCATCCAACATCGGCGCCAACGGGGGCCCATGAAACCTCCAGGCACCTTCCGAAGCAGGAGCCACCCATCACACTCAGGTCGGCCTAACTCCCGGCACGACACCCGCCTCCGGCTCAGCCGAGTCGCCACCCCTG a score=2056 s mm8.chr4 133504766 125 + 155029701 AGAGACGTGTCTAGATCCAGAG-CCCACGCCCCTCCCTGCTGAGTCCTCTTGTTTACCTTGTCAGGGTGTCCCGAAGACTCCAGAGGTTCTGCTGTTTCTTCTGGAAGTACGCCTGGTGGTCCAGG s monDom4.chr4 354767206 118 + 430141050 AGGGAGAAGGCCAGACCTAGGGACTCCTGCCCCTCAGCGCTCAGC--------TTACCTTGTCTGGGGGCTCTGGAGATCCTTGATTCTCCGTTTCCTCTGAGGCTGGCTGGGCTGCTGGCCTGGG a score=5779 s mm8.chr4 133505185 414 + 155029701 CAAGACATACCCTAAGGG-AGAGCTTGTTACCTGGGAGACGGTGGGTTCAGGGGCAGCGATTGGCTTAGCAGGTGAGGAGAGTCCAGGGACGTCTGGGAAGCAACCAGAAACAAAGTGATGGAGGTGACCAAGAGAGTCT-GAAAGCAGATGTGTGTGTGGGAGTGCAGAGCAGGTACCTGTGAGGGGGTCTCTGGCACGGGAATCTTCTTCAGTACCAGGCTGACCTTTGCTGGTTCCCTCAGCAGCTCCCTCAGCATGTTCTTATGGGACCAGCCCACCTGGAAAAC-----------------------GGGGAGGCTGAGTTGG-----------AGGGTT-CTGCAGCAACCCCACACCCTTCCTTCCCTCTCAGAGCTCCCTGTCAGGTCTCACTTGCTTCTCACCACCTTCAGGGAGCTTCCAGGGAGCCCTTTAACCGAGTTT s monDom4.chr4 354768763 435 + 430141050 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GCTGGGTCCTTCTCTAC-------CCATCTAGTCCCC--ACCCTGCCCACGGCTCCGCGCTCTGCCTGGACTGCTCGCTCTTGGTTCCCCAGT--CAAGAGTCAAATACCTCAAGTGATAAGACGGGA---GCTGAGTAGAGAGAAGAGAAAAACCAGGCCCTGCCTAGGGCAAGAGCCAGC-TCCAGGGTGGCAGGGGGCCCAGA-CTTTGGGAGGAGGGTGGCGAGAAGAACATGGTCACAGCAGCA---------TCTCAGAGGCTGCGTGCTCCAACATGGGGGCAGAAGGGACTCCATCTTCCTGAGAAGGGAAAGGG---------------AAGAGTTGAGGCGTTGCACTGGGAAGAGGGTCCGGA-GCCACGACAGGAAATGCGCTTCCAAACTCAGGACtagttgcatatgccaataatcccagcaaacc---tgaaacctgaggcagga--------ggattgctaagagtgtagtctgtgctacctaatt---agcttgagatag---------------caagaccctacctcaaaaacaaaaca-aaaCAAAATTTAAAATAATATCCTAGGAGCTGGCTCTAATTCTA--------------AGACCTGTGGTATCAGTGGTaaactgagg--------catagaa------agattacagttgcttgtcttaaatcacatgactTGAACTCATGTTAGCTGGTA---CTGATCCTCTTGCCTGTTTGAGTGCTTCAACCAAGATACTTCACCACATGGGTGGGCTAGTTCTAGGTCA-AGGCCAGGAACCGGTGGGTGCCCTTTGGTTTGGCCAATGTATCTGGA----GCAACTGGGACAAGGAGAACTG---AGACTGGA---GAGGGTAGGAATGCCGGCCT------------CATCTTTGCCTTGGCTGTCTGCAGGCTGCGAATCCCTACTGGACCAACCGCGGTGGCTCAGTGTCCATGTCTGGAGGTCGTTTCCGTTGCCCCTCGTGCCGCCATGAAGTGATCATGGACCGGCACGGGGTGTACGGCCTGCAGAGGAACCTGCTGGTGGAAAACATCATTGACATCTACAAGCAGGAGTGCTCCAGGTCAG s monDom4.chr4 354910199 1060 + 430141050 GCAAGGTTTTTTTCCACTAATGTTCCCTCTAATCCCCTCATCCTCCCCCC-------TCTTTTGATAAGGCTGTTGACTCTCAAACCAAGAGTTCCAAGAGGCAACTGATTTTAGTAATAAAAGGGGGTGGGGTAAGGAGAGAGGAGAGAGAAACCAGACCCCTCC---AGCTGGAGCCAGCGCCCAGGGTGGCAGTGGGCCCAGAGCCCTGGGGAGGCAGTGGGGATGAGGGAGGGGCTGGGATAGGAGGCAAGTGATCAGGAAGGCAGGGACTTCCCAACTAAGGGTTCACAG------CTGTTCCTGAAAAGGGGGAAGGCTTTCTCCAGAGAGAGAGGGACAGGGTCTTG----GGGCAGATGGACAGGATGCTAATCTGGGAGAGAAGTCTCCAAGTT-------------AGAAGAAAATAATACTAACCAGCTGGTTGTTATTAAAGACATGATCTCATTTGAACTTCCAAGTA---ACCCTGTGagataggaatctaagcctgggaaaggtgaacagacttacccagagccatacagctaggaaatatcttaggcaggattcaaactcagatcctcctaactttcaaccactccatACAAGTTTGTGCTACATCCGTGTAACCATCTGTGAAATGGACTCTTCCTCCTTAGAACTCTTGAgattatagatttctacatctag-cactgggatggacctcagg--ggccattaaatccaaacatctt-cttttacaaatgaggaaactgagacccagga--aaattaagtgacttacccaaggtcatagaggtagtatcagagg-------tgggattggttaatttcatgggaaaaggaggctAGGAAGTAGAGTGTTGCTTAGAAGGGATTTGGGGGTAAGGATACTTCTCTGACATACCCAAACTTCTTCATCCTTCACATCCACAGGCTGCTAATCCCTACTGGTCCAACCGGGGAGGCTC------CATTTCAGGAGGCCGTTTCCGCTGTCCATCCTGCCGCCATGAGGTGATCATGGACAGACATGGGGTGTATGGGCTTCAGAGGAACCTACTGGTGGAGAATATCATTGACATCTACAAACAGGAGTGTTCAAGGTCAG a score=2019 s mm8.chr4 133590766 42 + 155029701 GGAGGAAGCCATAAAGGGAGAAGACAGAAAGAA------GGAACTCTg s monDom4.chr4 354911926 48 + 430141050 GGAGGAAGAGATAAAAGGGGGAGAAGAAAAGAAAAGGCTGGGACTCTG a score=17448 s mm8.chr4 133591652 437 + 155029701 TAGGATGGGGCAGGCAGATGGGACAACCC---TGACCTGTGACT---CTCCTCCACCTCAGTCGGCCCCTGCAGAAAGGCAGCCACCCGATGTGCAAGGAACACGAAGACGAGAAAATCAACATCTACTGTCTCACGTGTGAGGTGCCTACTTGCTCCTTGTGCAAGGTGTTTGGGGCTCACCAGGCCTGTGAGGTTGCCCCTTTGCAAAGCATCTTCCAAGGACAGAAGGTACTGGCTACAGCTGCTGTGCCCTGATGATTCTGGGG--------------------------------GTGGACTTGACCCTTGTGGATGTGCTGAGCCGG-CCTTTCAGGAATAGTCCCTCTGGAGGGACTTCCCAGGCCACAGGGA----CAACAGCCGTTGCCTCCCTGGG-----GGAGGTGG--CTGAGCTCATAGGTTATACTTAGAGCCACTTGAGAGCACCTGGGTGTGACCAGAAGGAAGAGGCCA s monDom4.chr4 354914487 472 + 430141050 TAGGGAGAGGCAAGACAGAACGAGAACCCCACTGATCTA-GGCTGGGTTCCTCC-CCACAGTCGGCCCCTGCAGAAGGGCAATCATCCCATGTGTAAGGAGCACGAGGATGAGAAGATCAACATCTACTGCCTGACCTGTGAGGTGCCCACCTGCTCCATGTGCAAGGTGTTTGGGGCCCACAAGGCCTGCGAGGTGGCCCCACTGCAGAATGTCTTCCAGGGCCAGAAGGTA--------AGAAGACTTGCCC--ATGACCCTGGGGAGGGAAGGGCTTTCCAGCTCCTGCTTCGAGTTGCAGATTGGAGCTCAAGGGATGTGCTGAGGTGGACCTTTCAGGAATAG---CCTTGGAGGGACTTCCCAGGGTGCTGGGAGAAGCAAGTCTCCCTACCCCCTCGGGTCTGAGGAGGTAGGCCTGAGGTCACTTGTTATATTTACTGTCACTTGAGAAGTGCAGGGTGTGGCCACTAGGGAAAAGCCA a score=9937 s mm8.chr4 133593155 205 + 155029701 CCCCAGAAAGAGGGATAGCGACCCTGTTGGTGACTGCTATAACACTGGAGAAACAGCGGGCTCTGAGTCTATTTCTGTCTCTCCCCCCCCCCCTCCCATCCAGACTGAGCTGAGTAACTGCATCTCCATGCTGGTGGCGGGCAACGACCGAGTGCAGACGATCATCTCTCAGCTGGAGGACTCCTGCAGAGTGACCAAGGTGAGG s monDom4.chr4 354915716 192 + 430141050 CCCTAGAGAAA-----AATGTCCCTGCTTCCCTTTGCCTCA----TGGAAGAACAGAGA---TTAAATCTATTTTGGTCTCTCTTCCTCCCTC-CTTATCCAGACTGAGCTGAGCAACTGCATCTCCATGCTGGTGGCTGGGAACGACCGAGTCCAGACGATCATCACCCAGCTAGAAGACTCTTGTAGAGTTACCAAGGTGAGG a score=2533 s mm8.chr4 133594622 83 + 155029701 aaagaaagaaagaga-gaaagagagaaagggagagataaaaaagaaaaagagattaaaaaaaaACagtcggacatggtggttta s monDom4.chr4 354916711 84 + 430141050 agaggaagacagagaagaaagaaagaaaggaaaaaaagaaagaaggaaggaaaggaacaaagGAGGGAGGGaggaagaggatta a score=12503 s mm8.chr4 133594761 557 + 155029701 caacctggtctacaaagtg---------agttccaggacatccagggctacacagagaaaccctgtctcggaaaaacaaacaaacaaaccaaaccaaaccaaaccaaaacaaaAAACCCTCTGGTCTCTTCTTGAGGAGGGTTGGAGCTGGTAAGACAGGGGGGACCA-TCATAACT-----------------------------GCAAGTGGGCTGAGCTGTGGAGTGGAAG--------GGAACAGCTTTGC--TTCCTGTGTGACAGAGACTCTTC-----------TTGCTGCAGATAGTTCCTGGGGCCCTTCTGTCTCAGAAAGTGCGTTGGGACCCCCATGGGA-TGTGACTGTAG-----------------GATTTC------------------------------------------TGTCTTCAGGAGAATAGCCACCAGGTGAAGGAGGAGCTGAGTCAGAAGTTTGACACCCTCTACGCCATCCTGGACGAGAAGAAGAGCGAGCTGCTGCAGCGGATCACGCAGGAGCAGGAGGAGAAGCTGGGCTTCATCGAGGCTCTGATCCTCCAGTACAGGGAGCAGCTGGAAAAGTCCACCAAACTTGTGGAGACCGCCATCCAGTCCCTGGATGAGCCCGGAGGGGCTACCTTCCTCTCAGTGAG s monDom4.chr4 354916857 671 + 430141050 caatatattccccaaattatacttaacaagttgcatttataccagagataaaaagatgg-ttcagaattggggaaaccatgagcataactgtataaaaacaaaaccaccccaaaTGTCTGCTTTTTTGAATCTCATTAGGGTAGGAATCCATAGAAGAGAGGGAATTAGTTAAAACTTGGCCTGCCCTAGAATACCTACCTAGGCAGCAAGAATCCTGAGTTA---AGtgataatcatagctggcatttctatgcatttcatagtttacaaaacattttccaCAAGAAAACTTGCATGGGATAATG--TAGGCTCTTTCTGGACCTAAATTTAGGATGAAAAGACTATAGAAATGTGAATTAAGAAGCAACATAAGGAAGGGATTTCAGAGTAAGGGGATTCAGTCTCTTGACCCGGAATCTCATTCTGTTTCTCCAGGAGAATAGCCACCAAGTAAAGGAGGAACTGAGTGAAAAGTTTGATGTCCTATATGCCATCTTAGACGAGAAGAAGAGTGAGTTGCTTCAGCGAATCACTCGAGAACAAGAGGAAAAGATCAGCTTCATTGAGGCCCTGATACAGCAGTACCGGGAGCAGTTGGAAAAGGCCACCAAACTAGTGGAGACAGCCATCCAGTCCATGGATGAGCCAGGTGGAGCTGCATTCCTGATGGTGAG a score=2505 s mm8.chr4 133597101 59 + 155029701 CTGTTGTTTCTCTCCACAGAGTGCCAAGCAGCTCATCAAGAGGTCAGTGTCCCCAGGAG s monDom4.chr4 354918244 59 + 430141050 CTTCTCTTTCTTCCCACAGAATGCCAAGCCACTGATAAAAGCGTAAGTCTTTCCAAGGG a score=10906 s mm8.chr4 133597629 159 + 155029701 TGAGACCTCACCC-----TGCCTCTCTCCCCACAGCATTGTAGAAGCCTCCAAGGGCTGCCAGCTGGGGAAGACAGAGCAAGGCTTTGAGAACATGGACTACTTTACTCTGGACTTAGAACACATAGCAGAGGCCTTGAGGGCCATTGACTTTGGGACAGGTAA s monDom4.chr4 354919354 164 + 430141050 TGAGATCTCAGCCCATTTTGCCTTCCCTTTTCCAGCATTGTGGAAGCATCCAAGGGCTGCCATCTGGGCAAGACAGAGCAAGGCTTTGAGAACATGGATTATTTCACCCTGGACCTGGAACACATTGCAGACACCTTGAGGGCCATTGACTTTGGGTCAGGTAA a score=6133 s mm8.chr4 133600931 574 + 155029701 AGTCTGTCTGTGTCTCACCATGACCCTGTGTCTGATTTTTCTCTTTCAGAACACCA----------ATGAAGAAGGAGATGAGTGAGACACGCTCTGGACGCA---GAGACGGGGGAGGTGGGGGCAGGCCCATCTCGGGAGGGG---------GTTAGGGCTCCTTGGGGGGTACAATAGGGAAGTGTGTCTTCTCTCTGCTCAGAGAGCAGGGACTAGCATAGGGCTCCCCACCACTGTGTCCAGCAGCTGCTGAAACACAATTGGAAATGTATCCAAA---ACGTCACAGGACACTTTTCTACGTTGGTGCGAAATGAAATATTTTGTA----TGTTTTTAAAATG----TGATTTTTGTATATACTTGTATATGTATGCCAATTTGGTGCTTTTTGTACGAGAACTTTTGTATGATCACGCCTGGTCATTGTGT----GACTGGCGATTGTCACAAAGTGGGAAGGAAGCCAAGACAATAGAGATGCCTACTTCCT--TTCCTTGGTGGGAGGGCTGGGTCTCACTCGG----------TGGCCTAGAGAGGGGCAATGTACTGTAC---AGTGCCCATCCCCA-AACATGGGGATAGGACTGAATTTGTGTTATATGTTGTT s monDom4.chr4 354925597 594 + 430141050 AATCTCCCTTGGGCTCCTATTCACCAGTTTCTTGCCCTTTTTCTTCCAGGAGTACAGGAAGGAGACAGGAAGAAGAACTACAATGAGAAAATCCCCCAAGCCAAGAGAGAAACCAAGGGAGAGACAAGGCCCCACTCAGGAGAGGAGTTTCTGTGATAAGCCTC------AGGTTGAGAGGGGAGGAGGATCCCAACTCTGC-CAGGTAGCAGAGACTGG----ACACATCCCATGGCC-TAGCAAGTGGCCACTTACTCAGGCTTAGAGACTTGTTGAAACAAAAGACACAGGACACTTTTCTACATTGGTGCAAAATGGAATGTTTTGTACAATTTCTTTTTTAATGTCTTTTTTTTTTGTATATAACTGTAAATGTCTATGGAACTGGTGCTTTCCAGAAAAAGACTT---------------TGCATATTGTGCAGAGGAGGGGAAGTTTTTGT----TTGGAAGGGTTTGAAGTGGTCAGAGATGCTGAGGGACTGGGCACCTGGCAGCTGTCCTGGCCCCTCCCTGAGCCACTTTCTGGGCCTAGAAAGAA--AGTGTACTGTACTTTAATGCATATTCCTGTCACACAGGGTACTGACTGAATTTATGTTGCACATTGTT a score=9734 s mm8.chr4 133607447 493 + 155029701 caaaataaaCAAATCTTTAATAAAGAAAAGAAA-------CATACTTTTACA----ACTGAAGCCTCTTATTTAATCCCCCTGCCTCAAGCCATGA--ACGCACACTCCTCTGGGTGGGGT-GACTGGTGCTTCGGCGGAACC--------TTTCTCTTTGGCTTCTGCTTTCCTTCCATCAGG------GACTCACCTCAG---------------------------ACCACGCTCAGCATCTATGTTCCTTCTTTC----AGAATCTTGCCCTCAACCTGTTTGTTTACAG---TGCCAGTAGCA--CTGGGTGACATGGTAAACTCTGCCAGCTTTGCCATGGTGACATTTATGGCGCGTTCCACTTTGATCCATAATTGTTTCTTTGATGTCTGTGGGAGGGCTGTTTTTGTAGAATCATACATATGTGGCCAAAGGAGTAAGTCCACGTAGTCTAA---GCTCAGTGAGCAGCAGGCAAGTGCCTGCCCTCTCTAACCACTGGG---GACACCTTGTCAAATGACTGGAAGATGGCAACTCTGGCTTGAAAGCACCT s monDom4.chr2 73270231 562 - 541556283 CAAAATCCAAGAATCTTTTATTTTAAACAATCATTTATGCCATAAATTCATAGGGGATTGGTTCCAACAGCTCAGGTTCCTTGCCTTTGGTTCTCACAAAGTGTGCTTCTCTTGGTGGAGCAGGCTGCCGTTTCAGCTGAACCCAGGTGCCTTTTTCTTTAGCTTCCTTCTTTTTCTGATCATTTTCCTTGACTCGCTTCAGGAAGCTATCTCTGCTCTTAGAGTGCTTAATATGCTCAATACGCACATTAATCCTCTTGGCTAGAATCTTGCCCTTAACCTGTTTGTTTACAACAATGCCTACAGCATGCTGAGTAACATTATAGACCCGTCCAGTCTTGCCATGGTAACATTTGTGGGGCATTCCCTGCTGAACTGTACCCATACCCTTAATATCTACAATATCACCCTTCTTGTATATTCGCATATATGTAGCCAAAGGAACGACACCATGTTTTCTAAAGGGTCTAGAAAACATGTAGCGTGTCCCCCTCCTCTTT-CCTTTTGTGTTTGTCATTTTGGCAACTCACTGGAAGATGGCGGAGCCGGCGGAAAGCTATCT a score=-284 s mm8.chr4 133614864 302 + 155029701 gcctcgaacctagagatctgcctgactcagcttccccattgctggccttaaatgtgtatgcca-------ccacgccaggcCGA----TTTTCTAGAAACTTGGATTCCAAGGCTTTTTTTTTTCTACAGGATTCCAGGAAGAGTGGGTTTTGTGGTCATCCAGTCCTAACTTAGCAACTCTAGGCAACTCTTAGCAAGTGCTTTTCTCTTTGCTCCAGGCAAAAACTTTAGGTCGCAGTCCGGCTCAGCTCCTTC--GGGCTCCGGG---------------GATGCAGGGGTCAGGTCCTGGGG---GCAGAGCCGCAATTCCCTTTGCAG s monDom4.chr4 355034657 299 + 430141050 GCCGGGAGCCCACTAGCCTTTCT--CTCA-TTCCCCCATCTGAGGCTTCGCCTCTAGGCGCCAGGGGTCCCCCTCTCAGGCCTAAGTTCTTTCTGTCACTCTCTCTTCGGAGGCCGGCTTTGATCTAGGTGAACCCGGGAGAGGCTCGCTCCCTTGCC--CCGCCCCGCACCCCCCCACCC----CATCCCTCTTCCAGTTCTCTTC-CTTTCCTCC-----------------CCCACCTCCTCTCTGCTGCTTCCAGGGCTACAGGTACTGGCCCTTGAGTGGTGCACACGGC-GGTCCAGGGGCGGTCAAGGCGGT------CTTTGCAG a score=4556 s mm8.chr4 133615166 300 + 155029701 CCGGCCACCCTCCCCCCTCCCCGCGGGCTTTTGCACACGACGC----GCGGCGGGCGGCTTCA-----------CACCAGGTGG---------------------CGAGGAGGGCCGGGGATAAAGCGGGCGG---GCGCGGGGCGCAGCGGC-------AGGGCCGGAGCGGAAGGTGGAAG-GTGACTGCGAGCTGCCATCGTCCCGCGCGCAACTTCGAGGGCGCACCGAGAGAGGCG--------GCATGCAGACTATGGACAAGCAGAACCTGCTGGAGAGCACGCGCGGAGCCCGGTAAGTTCAAGCCCCAAGGGGCGGGAAGCTGGGCAG----CATCACACGTACCTCCTC s monDom4.chr4 354934251 355 + 430141050 CCACCCACCCACACCCCTCCCCGCGGGTCTTTGCACACCACGCACCAGCTGCAGAGGTTTTCACGAGCATTAGCCGTCAGACGGAAAAGCGCAGTGAGCCCCGGACGAGGGAGGTAGCAGTTCAGACAGGAGGAGCGTCCCAAGAACACTGGCTCCCTCAGGATCCGGCCCGGGGAACAGGGGCACGCACGCGCACGGCGACCTTCTCCAATCGAGTTACTAAGGTACA-CGTGTGGGGCGGCTAGGGCGCATGGAGACCATGGATAAGCGCTACCTGTTGGATGTCACACCTGGAGTCCGATAAATCAGGGGCCC---GGGCTGGGGGTGGGGGAGGACTCATTCTCCGCACCTCTTC a score=8042 s mm8.chr4 133616066 231 + 155029701 CTTCCTCTTGCCTCCAGGTCCTTCTTAGGATCTCTGTGGAAGAGTGAAGCTAGCCGGATCCCTCC------------TGTGGACCTGCCCGCGGTTGAGCTGGCTGTCCAGAGCAACCATTATTGCCATGCCCAGAAGGATTCTGGAAGTCACCCTGACCCCGAGAAGCAGAGGGCCCGACGCAAACTCTATGTGGCCTCTGCCATCTGCCTGGTGTTCATGATTGGCGAAATCATTGGTAAG s monDom4.chr4 354935964 241 + 430141050 CCTCATTCTCTCCCCAGGTCATATTCTGGAGCTCCTTGGCAGAATGA--CCAGCCCAATTCCCTTGCCTGAGACTAGTGTGGACCTTCATGCCATTGGCCTGGACTCCCAGAGCAATCAGCATTGCCATGCCCAGCAGGGGCTCAGCAGCCCCTATAACGCTCAGAAGGAGAGGGCCCGGCGACAGTTGTACTTAGCATCCTCCATCTGTCTTGTCTTCATAATTGGAGAGGTTGTGGGTAAG a score=10591 s mm8.chr4 133617968 180 + 155029701 GATGTTGCAGGTGGGTACCTGGCACAGAGCCTGGCCATCATGACCGACGCTGCGCACCTGCTCACGGATTTTGCCAGCATGCTCATTAGCCTCTTCGCCCTCTGGGTGTCTTCCCGACCAGCCACCAAGACCATGAACTTCGGCTGGCATCGAGCCGGTAGGGATCTCAGTGGACCGGAG s monDom4.chr4 354936423 179 + 430141050 GGTCCTGTAGGGGGTTACCTGGCCCACAGCTTGGCAGTCATGACGGATGCAGCTCACCTGCTTACTGACTTTGCCAGCATGCTCATCAGTCTCTTCTCTCTCTGGATGTCCTCCCGACCAGCAACCAAGACCATGAATTATGGCTGGCATCGAGCAGGTGAGGGGCT-ATTGAATTGAAG a score=11744 s mm8.chr4 133619384 375 + 155029701 AGGTTGCTGTTGTGGCTGGGCTTT--CTTCCAGAGATCCTTGGAGCCTTGTTGTCCGTGCTTTCCATCTGGGTGGTGACTGGGGTGCTCGTGTACCTGGCCGTGCAGCGGTTGATTTCTGGAGATTATGAGATCAAAGGGGACACCATGTTGATCACTTCGGGCTGCGCTGTGGCTGTGAACCTCATGTGAGTGTGGCCCCAGTTCCCTGTAACACACACACACCCTACACCACCCCGGCC--ACCACTGCAGGCCTCCATCAGCTCCCAAGGGAAGGAGTCTGTGCTCTCCTTCCAGGAGCTGTGAATGATGGGTTTAGAGTTTAAGGCATTCCCTTAGGACAGAATTTCCCCCGAGGTTATGAGTTCTGATACCTGC s monDom4.chr4 354937448 333 + 430141050 AGGCTAGTGTTTGGGGTGGGGTTTGCTTTTCAGAGATCTTGGGAGCCCTGCTGTCAGTGCTGTCCATCTGGGTGGTGACTGGGGTCCTAGTATACCTGGCTGTGCAGCGTCTGATCTCTGGAGACTATGAGATTGAAGGTGGGGCTATGCTCATCACTTCAGGCTGTGCTGTGGCAGTGAATATCATGTAAGTCTGGGTCCTGCCACTC--------TACAAACTCTCCCTCTCTCCAGTTAAACAACCGGACACCACTTCCTGCTTCTCTGGGAGGGA-----------------AGGGAATG-GGATCATGTGT--------------------TGAAGAGACAAATTCCTCCCAGTTTATGTGTGCTGGAGCTTTC a score=7022 s mm8.chr4 133620297 429 + 155029701 TGATGGGG---TGTACCTGCTGACTTCATTGCCCGCTTACCCTGAGATTCAGCTCTGGAGAT-----------TGGGCTCAGAGCCTAGGCAGAGCTCTTTGCCCTGTGGCACTGAGCCAGGGCTGTAGGGCTAGATTGCTAAGCCTG---------AGACGGTCACTGAGTGC--AGAGGCTCAGGATGTCACTCGTCGTCGTCGGGGAGGCCAGCCCTAATGGGTAG-ACTGAGCCTGGCTGACTTGAAACCTCCCCTGGGCTTTG-------TCTGCCTCCACAGAATGGGGTTGGCCCTCCATCAGTCTGGACACGGGCACAGCCATGGGAACAGCCGTGACGACA-----GCAGCCAGC-------------AGCAGAACCCCAGCGTCCGAGCTGCCTTCATTCATGTGATTGGGGACCTTCTGCAGAGTGTGGGGGTACTGGTGGCAGCCTATATCATATACTTCAAGGTTAG s monDom4.chr4 354940910 465 + 430141050 TGAGGGGGCAGTGAGCCTGGTTCCTTCTTTGTACTACCACCTTTTGAATTGACTCTCTAGATCCAATTTGACCTGGGCTCTG---CTTAGAACAGCCACTTAA--TTGGGCCTTGAGCCACATTCC-----CTCAAGTCCTCAACCCTTCCTTTCCCAGAGGTTCCTGTAGTGCTAATGGGGTCATAA---CACTATCTGAAGACAGAGAGGCTAATGCTGGTGTCCAGGACTCTGCCTG--TTGCTCAAGGTCCTGAGTGAAGATTAAAGACTCTTCTCTTTCCTAGAATGGGATTTACTCTTCACCAGTCTGGTcatggccatggccatggccatggccatggACACAATCATGGGACCAGTTCAAAGGAGGAAGAGCAGAACCCTAGTGTCCGAGCAGCTTTTATCCATGTGGTTGGGGATCTCCTACAGAGCTTGGGGGTCCTCGTGGCTGCCCTCATCCTATACTATAAGGTAAG a score=7727 s mm8.chr4 133621210 263 + 155029701 GGAGAGAAGAGTAGAAAATTGACAGACATGGGCCAGAG-------CGAGGCCTGTTCTTACCCAGATGAGAGACCTCCCTGATACAGTGTTCCTGGG--AGGGAAGTAGGGAGGACCCAGGCTGATACTGA---------CGAGGCCCGGGTTTGTCTCCTCCTGC-AGCCTGAGTACAAGTACGTGGACCCCATCTGCACCTTCCTCTTCTCCATCCTGGTCTTGGGGACAACGTTGACCATCCTAAGAGACGTGATCTTGGTCCTGATGGAAGGTGACTT s monDom4.chr4 354949849 268 + 430141050 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AGAGTTTTCTTCCTCTTCACCAGGGTCCTCAGAGGTGTCCTCCTCCGT------CTTCCCCATTTATAGAAAGGTTACCTCCTGGAGCGGCTTTCTCTGTGGTACTTTGATGGGGGGAAGCTTGGTGACTTCAGCCACAAGGAAATTCATCAAAATATCTTCACATTCCAAGAGCTCATCCACAAGGTCCCTTAGTGGAGCAGGCAAGAAGTGGGTGAAGAGGACGTGGTAATACCTG a score=5891 s mm8.chr4 133636624 340 + 155029701 CCCCCCCCACCATGACACAGACCCTGAGCTACCTGCAGTGGGAGTCTCTCATCAGCAATGATGGCTGCCTTGGTCCAGTCGATGACTTCAGAGAAAGGCAGCTCCCAGCGGGGGCTGAGGAGCACGGGGATGCAGCCGGCCTGGGGGGCAGGGCAGTCATTGGGGAGCCCAGCGCTTGCACACATTCACCACCACCCCAGGCCA----CCATCAGCCCCCCTGTTAAGGG---AAAGGACAAAGAGGAGTATTTGGGGGTACAGGGAACCCCCTTCCTATGTGCATGTGCCCAGAATCTCCTGCCAGTGCAAGGGC-AGAGGTACTGAGGCTGGGGAATATCCAGATT s monDom4.chr4 355076542 330 + 430141050 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TCTGCTCCTGTCCCAGCCGCCTCCCACTCAGGAGTTCCCTCCCACTCAGCGGCTCCCCAAG-----------------GGTAGGTT-------------TACTTACTGCTGGGGTCCAGGGTCTTGCTCACAGTGCCTGTCCCAGAGG----------------CAGGCTGA-------------------------GGCGTGGGTGCTTGTGATA---CGCCACCTGCCTTTCTCCTCTGCTACC----GCCAGTAAGGTGGCCCCAGGTTGGGGACTGTGCTGCTGCAGCTTGCCGGGAGCCCCACCTCGCAATGGGTGAGCTTCGGGGAGATACGGGAGCGCTAAATCGAAGCCCGGTCGGAAGATGTCCGAGGAGGGGCTGGCCTCAGCTACCATCGCCTGTCCCA------------GCCTGGTGCAAGGGGCTGGGTAGAGACTCAACACCAGATGGTTCCGGCCTCCGTTCCAGTTCGGAGGCAG----GGGCCCGCAGGCTCCTCTACGATCCTGGCTGGGGAGAAAAAGGAGAAGGCAAGCGTCTGCTGGGCTGAGTGCAGAGTAGCGGGAGCCTTCCAAGGAATCCAGGATCCTGCGCTGAGCCTCAGAGGTCGGACCAGCCGG------GGAGTGCACAAAGATCTTGAGGACCTTTCCCCTACACTTGGAGGTGTCAAAGCAGGCTCCCCAGGTGCAGCTGCTTCCC---------------CGAGAGACCCGAGGGAGCTGTGCGACATCTTCTGGGTTCGTCTCAGACTGGGAGAAACTCTGTAAGAAGGCAGCATCCAGCCAGCGGGGCCAGCCTTGGGAGCGCCCTGGA----AGAGGACCGGGCAACACTGCCAGGCGAAGGGGGAAGACTCCTAGGAGGACGAGGAGGAGCCAGAAGGCTGACAACGCCAGCCAGAAGGACTTTCTTCTCC---ACAGCATGTGGCCACCAA--CAGCTAGGACTAGAAGGAA s monDom4.chr4 355086463 972 + 430141050 TCTCTCCTGGTCCCATTTTCCTCCC--TCCGATCTCCCTTTCCCTTCTGTGGCTCTTTAAGATATTTGAGAAGAATAGGGGAGGTGAAAGGGGAGGCAGGACTTACTGATCAGTGTTGTGGTCCTGTTTACACGGCCCATCTCTGTGATGTTCGCTGGCCTCACCATGGTGATCACTGATGATCAAAATAGTACTCTGGTCCAGGTGGTTGGAAGAGCCAGTGACCCGAGCGTCTAACTGGCTTTCAAAGGCCAACAGGTCCTCTCCAGGAGGGGGAATAAGATGGGCCAGCTGGCCTCGACTCCCACCCCTCTGTGGGTAACTCTGGGGGAAGAGTGGGAGGGCAACATCAAAGCCAAGCCTTAATGTCTCTGGTTTGGGACTGGCTCTGGCCAACATGGCCTGCCCCAAATCAAAGCCCAGATCAGGCCAAGAGCCTGGGTGGAGATGGAAAATGAGATGATTCTGCCCTCCATTCCATAGTGGTAGCAGCTGGGGGCTCAGGGCATCCCCT-------------GGGAGGACAAAGAGA---CAAGCCTCCTCAGGGTTGGCTGTGTGGTAGCCGGATCCCTCGATGGAAGCCAGGACTTTATGGTGAATTTCAGAGATGGGCTGGGTCAGCCCTACAGGGTACACAAACACCTTGAAGCCGTGGCTCTGGCACCTGGAAGTATCAAAGCATGTCTCCATGAGGCAGCCAGGCCTCTGTCTCTGCCACTGGCGGGTGCTACAGGAGGGTGGGCAGGGATCTTTGGTCAGCTCCTCGGGCTCCACAAAATTTGGTAGAAGCTCCTGATCCAGCCATCGGGGCCAGC-TGGTCAGTGTCCTGGGTCTCAGGCTGGGGGGGATGGCAAGCTGTCGGAGACGAGGAGCCCCTAAGAGGACAAGGAGGAGCCAGGAGGCTGAAAATATCAGCCAAAGATATTTCCTTCTCCTGGACTGCATATGTCCACTAGGCTACCTAGGATCAGGTGGGA a 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a score=25074 s mm8.chr4 133801158 392 + 155029701 ACTCACAGGTCTTGGCTCTGTTTTATCCGGTGAAAATCCTTCAGGATGCCCATCATGTCTGCAAAGCTGCTGGCCTTGGACAGAGAGATGCAGTCATCCTCTTCAGATGAGCTGCAGGTAGTTTTGTGTTCTGGTTTGCAACACTCAGGGCTGGCAGAACAAAGTAGGGGGACGGTTGGGAGCTCAGGGACCTCCACCTCCGTCTCCTCGGTGATGTCACTAATGACAAAGGAAGTTGTAGAGTGGAGGGAGGACCCAAAGCAAGGCAAAGGCGAAGAGACATTCGAACTTCCGGAAGAGAAGAAATCTGGTGTTAATGAAGCCGAAGCTGAAAGAGAAAACAACAGCAGGCATCATGGACACTGGGCTGCAGTACAGCCACATCTCTCTCT s monDom4.chr4 355273298 385 + 430141050 ACTTACAAGTCTTGGCTCTGCTTCATTCGGTGAATATCCTTCAGGATGCCCATCATGTCTGCAAAGCTGCTAGCCTTCGAGAGAGACACACAGTCCTCATCTTCAGCCAAGCTGCAGGCAGCTTTGGAATCAGGTTTGCAACATTCAGAGCTGGCAGAACAAAGCATGGGAACCGATGGAAGCTCAGGGCCTTCTAACTCAGCCTCCTCTGTGATGTCACTAATGACAAAGGAAGTTGTAGAGTGGAATGAGGATCCAAAACAAGGTAAGGGAGAAGAGACATTTGAACTTCCTGAAGATAAGAAATCTGGCGTTAATGAAGCCGAAGCTGAAAAAGAAAACAACAG--GTGTTGGTGGGCACTGG-----AGCGGAGACACATAGTTTTCT a score=15371 s mm8.chr4 133802338 242 + 155029701 TGGGGCTCCTACCTGCGTCTGCCGCCACGATTTTAGCGATCTGGCTGCGCAGGTGGCTGAGCTCATCCTGCAGCTCAGTGGTGCGGCTCAGGGCAGGCAGGGCCGGCTTCTTCAGGGCCAGGAGCCTCTCCTCAGAGCCACGAAGGTTGGGCACTGAGGCATTACGTTGCATGACAATCAGAGGGCTAGGCTTCCAGGTATGTCTCAGAGGGCGTGTATCACTCCTGG--GCCAGAGGAAGAGA s monDom4.chr4 355274957 244 + 430141050 TTGGGCTCCTACCTGCATCTGCTGCCACAATCTTGGCAATCTGGCTGCGTAGGTGGCTTAGCTCATCTTGTAGTTCGGTAGTTCGGCTTAGGGCTGGTAGACCAGGCTTCTTTAGGGCCAGGAGCTTTTCCTCCTGCCCTCGAAGGTTGGGCACTGAGGCATTGCGCTGCATGACGAACAGTGGGCTAGGCTTCCACTTATGCCTCAAGGGTCGGGTGTCACTCCTAGAAATTGGGGGAAGAGA a score=8318 s mm8.chr4 133802752 128 + 155029701 TACCTGACCCGAGCATATGTTTCCTCTTCATCTGCAGCAATCCAGGCAATGTCAGCCAGAGTAGGGACTGGAGGGACATCTTTCAAACACAGGTCAGAGATGTTGGGCAGGGTCTGTG--AGAAAGCAAA s monDom4.chr4 355276803 130 + 430141050 TACCTAACTCGAGCATAGGTTTCCTCTTCATCTGCTGCTATCCAGGCTATATCAGCCAAAGTAGGGACAGGGGGCACATCACTCAGATATAGGTCCGAGATGTTGGGCAGTGTCTGTGGAGAGAAGCAAA a score=9171 s mm8.chr4 133804202 146 + 155029701 CCTTCCTGTACACTCACCTCAAAGGATGCCCGTGGACAGGGCTTCAGGGGGAGATTGGTCCCAATTCTTCTTACCACACTTCGAGCAGCCCCATGTGGCTTGTTTTGCCAGATTGGGATAGTCTAGA-GAAGACAGACAGACAACCC s monDom4.chr4 355285649 147 + 430141050 CTTTTGTGTCCCTTTACCTGAAAGGATGCCCGAGGACATGGCTTCAAGGGGAGGTTAGTCCCAATCCTCCTCACTACGCTTCGAGCAGCCCCATGTGGTTTGTTCTGCCAGATTGGGATAGTCTAGGCAAAAAGAAAAACACAACTC a score=3299 s mm8.chr4 133804697 176 + 155029701 CTTACCACATTGGCTTCCATTCCTGATGTTTCAGCCAGCTCCTGTACCTGAAGGACGAGGCACCCACAGGGAAAGCTGGAGGGGTGGCTCCTTCATATCAGGCCATTTCCAGGAGCACGAGGTTTCCTTTCCTGTGAAACAA-CCCCCAGAGATCAGCAGCACTGAGTGGCCACAAA s monDom4.chr4 355287320 139 + 430141050 CTTACAGAGTCTGTTTCCATCTCCGATATCACAGCTGGCTCCC--ACCTGGCAG-------------------------------GGCTTCCTCATGTTAGGCCATCTTTGGGAATAGCAGGTCTCTCCCACTGTAAAGCAAGTCCCCAAAAGGC-----CACTTAGTGCCAATAAA a score=4807 s mm8.chr4 133810671 284 + 155029701 TAAAAAGCTGGAGAGAAGGAAGGTGGGCTTAGTTTCTCCCCACATGTGCAACTGCGAGGACATCAGGCTGGATCCATTTGCGATTTCAGACCCAGCCATCATGCGG--CTGTTGCTGG--GGGGAGCCACTGCCCACTTCTTTCTCCTCAGCATTCAGAGTTTTAAAAAATAT----AGACTGTG------AGAAAGTTCTTATAAAAACACTTTTCTGTATGCATAAAAAAAGACTGG--------CCATGGTCAGCCGTTCAAGCTGTTCACCAAGTCCCCAAAAGTAGCCGATGGGAACTGGT s monDom4.chr4 355292614 295 + 430141050 TAAAAATGGGAAGAGAAGGAAGAG----TTGTTTTCTTTCCCCTTCAGTTACTGTCAAGACATCAAACTTGACCCATCTAGGATTTAGGATCTAGCCATCATAAAGAACAGTTGCAGGAAGGGAATAGAAGTCCCTCTTCTTCCTCC-------GTGAAGTTATCAAAAATATCTACAAACTGTGTGGACTAGAAAGTACAAAGAGGAAAAATACTTTATATGAATATAAAAAAAGGTGCTCCAACACCATGGCCTTGAATACCAACTCAGGACATGGTGCCCTGACCTGGATTATGGGAAGGGGT a score=10670 s mm8.chr4 133811665 209 + 155029701 TTTTACCAGGTCCAGGTCCTCTAGG-------ACTAGGGCTGGAGGAGGGGCAGGCCCCGCCGGAGTCCTTCCCTCAGGAACTGCATGTAGGTAGCTGTGGACGGGTCCTCAAAGCTGGATGAGAAGCTGAAGACGTTATTATTCTCCATGTCTTCAGGCTTCATGGAGGTGATGTCAAGGAAGTAGTTGGCATTGATGTGGTGGACCTAGAGGAA s monDom4.chr4 355295067 213 + 430141050 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TTCACGTTCAG--CCTCACCTTCTTGAAGGGATACATGGCCACCTCCAGGCGCCGGGCAGCCTCTTCCCAGCTCAGCTCCTGATGCCACTTGATCTCCTCAAACACAAACTGGAGGGGTTCTCCTGAGGGCAGGCGGCTGTCAATCATGTTGCCGTCCTCATCTAGGATCACAGAGGGCACCGAGGGGCCCACAGCCTCCAGCTCCATCTGGGCCGGAAGTCAGTGGTGAGGGGTGTCTCAGAGAAGGGCCCTGAGAAACCTCCAGGGACGCTCTACTCTGCAGAAGTGGGGAGACGGGGCTCAGGGCAAGGCCTTGCAGCTGGACATATCTGGGTGGGGGCACCTGAGTGTTCACCTGGGGGACGTAG---CCAATGTCCACCTCCATGTTGCTGGTCTCA-CTGGCCCCATACAGCCACTCCATGTCCACATTCAGGGACCTGAGGATGGCCAGGGTAAAACAACGTC-ACCATCAAAGCCCAGGTGA s monDom4.chr4 355298261 434 + 430141050 TTAACATTTAGGGCCTTACTTTTTTAAATGGGTACATGGCAACCTCCAGCTGCCGGGCTGCCTCCTCCCAGCTGAGCTCCCGCTGCCATACAATATCCTCAAATACAAACTGGATGGGTTCTCCGGAAGGCAGGCGACTGTCAATCACATTGCCATTCTCATCTTGGATCACAGATGGCACTGAGGGGCCCTGGGATTCAAGCTCCATCTGAAGAAAAATGAAGTAGCCAGTGATGAAATGGAG--------------ATCCCCAGAGCATCTCCAGTTTGGAG-AGCAGGGAGGGAGGGATACTGGC---------------------TCTGTGTTGGGGTACGCATGTGCTTGCTTTAAGGAAGCAGCTTCCTGAGCACACATCCCTGGTTAGGACTTCAGCTTGGACAATTCAG--------------------GGGCTCTGCAGAGGAAGCAAGTACCATGACTTCTAGCCTCAGAGCTCAGATTA a score=545 s mm8.chr4 133816377 256 + 155029701 GCTTGGCCCTAGGGCCTTGGCTCTGTGT-TGAGGTGGAGGTGGAGGGAGTGCCAAGTGCCTGGAGATTATCTGAGA-------AGATGGTAGGACTGCTCAGCGGTCTCCTGCTGCCTCTTCTTGGTCACCAAGTGGTGGCACTGGGGATTGAGGGAAGGGCAGAGACTGAAGAGTTTATGTGCCCCCTGATTTCTGAGCTCAGGGATAATagtagtagc-agcagcagcagcagcagc-----------agcagcagAACACAGGAGAAGGGTGC s monDom4.chr4 355310035 224 + 430141050 GCCTGGCCCGGGGCAGCTGGTTCTGGGTGTGTTGGGGACAAGGGCAAATTGTTAGGT---TGGGCATTCTATCAGATGGCAGCAGGTGGCACAACCCCCCAAGGAACTCAT----TGTTTCCTTAGAGATCAACTGCAGGGA------------GGAAGGG--GAAACTGAA------------------------------AGTGATAGTGGCAGCAGCTACCAACCTGGGCACAAGCCAGTCCCAAATACCCAGAGAACCCTGGA-AAGGATGC a score=9346 s mm8.chr4 133816651 161 + 155029701 AGCTCCTACCTGTGATTGGGCACAAACAGCCTGAAGTCACGGATGTGTGTAGCATCTTTGGATAAGATGATATGGCCGGTGAACTGGCCGGGCGAGAACCAGAAGGGGAAGTCAGGAGGCTCGCTGAGCTGAAACTCCGCGTGGATCCTGTAG--GGAATGGA s monDom4.chr4 355310303 163 + 430141050 GGATCCTACCTGTGGTTAGGCACAAAGAGCTTGAATTCACGCACATGGGTGGCATCTTTGGTGAGAACGATGTGCCCAGTGAACTGTCCTGGAGAGAACCAGAAGGGAAAGTGGGGTGGCTCGTTGAGTTGGAACTCGGCATGGATCCTGTGGCCGGAAGGGA a score=8547 s mm8.chr4 133817258 137 + 155029701 ACTCACCGGAACATCACGGTGTAGTAGGAATCGCTGATGGCAGTCAGACAGGCCACGGTGCCCTGAGGGGCAAAGCGGGTCTTCACGAAGGGGCGTGGATGGAACATGCTTAACAGGCGATGGATGATGACCTAGGG s monDom4.chr4 355312316 137 + 430141050 ACTCACCTGAAGGCTACAGTGTAGTAGGAGTCACTGATGGCGGTGAGGCAGGCCACTGCACCCTGGGGCCCAAAGCGCGTCTTCACAAAGGGCCTTGGGTGGAACATGCTCAACAGTCTGTGGATGATGACCTGTGG a score=10822 s mm8.chr4 133817542 247 + 155029701 AGTGCTGTCCTTACCTCCTTGCCCTTGGGCGGTGGTGGGTAGAAGCGGTTGTTGGACAAATAGCCCGTGAAGACGCTCAGCTCCCCGGGGATAATCCACCAGGGCTGGCCCAGCTCC---TGACCTGGAGGGGGCAGGAAGGGCCGGAAGTGGCGGGCAGCAAACGCTGCACTCGGCGAGGCTGCTGTGGTCCAGTTGCGGAGGCCGGACAGAGCGAGGCGGGAGACCTGGGATGGGGAAGCCAAGGCTC s monDom4.chr4 355312967 247 + 430141050 AGTCCCTTCCTTACCTCTTTGCCTTTGGGAGGGGGTGGGTAGAAGCGGTTGTTAGAGAGGTATCCAGTGAAGATGCTTAACTCACTGGGAATGACCCACCAGGGCTCTCCCAGCTCCATATTACTCCTGGGAGGCAGAAAGGGCTTGAACTGGCGAGCAGAGAATTCCATGAGTGGTGAGGAGGGGGTCCTCCATTCCCGAAGCCCAGACAGGGCAAGATGAGAAACCTAAGA---GGCAACAAAGGGTC a score=7126 s mm8.chr4 133819989 187 + 155029701 AGTGGTCCCCCTGTGCCATAACCCAGCCCCGACTCACCCCTAGGAAGCCATCTTTGCTTTTGGTCATGGTCTCCATGAGCAGAGGCTGGAATCGGGCTTCTATGGTAAGAGTCTC---------------------------------CTCGCTGGGGTCATGGGGCAG---TTCCTCCTCCTCGTAGTTGGCCACAGGAACTGACCCTATGGGACAGAGGTG s monDom4.chr4 355314248 223 + 430141050 AGTTACACACCTGGGTCGTTCTCCCTTCTTTACTTACCCCCAGGAAACCATCTTTGCTCTTCGTCATGGTCTCCAGGAGCAAAGGCTGGAATTGGGCTACTACGAACAGCTTTTCCTCTGGGGATAGGTTCTCTTCTATGTATAGTGTCTCACTGGGATCAAGTGGCAACTTCTCTTCTTCCTCAAAGTCAGTAACAGGCATTGCCCCTGTGGGGCACAAATG a score=6724 s mm8.chr4 133823439 195 + 155029701 GGCCCGGGCCC--AATTCCTTTTAGGTT--------TCCCTGAGTGCCCAGCCTCTCTGG-TACCTGTCAGTTTCTCCGCAATGGGTTTGAATTCCTCCGGACTGATGTACATATCCTGGTCAGTGTCCAGCGAGGAAAAGAGAAAGAGGCCATCTGTCCCCAGGACCTTTAATGCCGATTCCTG---CTGGGAAGGAAGGAGCTGAGC s monDom4.chr4 355316567 209 + 430141050 GGCTCGCTCCCTTAACTCCCATGATGTTCTCCCCCATCCATCCACACCCAGATTCTCCCACTACCTGTGAGTTTCTCAGCAATTGGCTTGAACTCCTCTGGGCTGATAGACAGATCCCTGTCTAAATCCAGAGAGGAGAACAGGTACAGGCCTTCTGTCCCCAGGGACTTTAATGCTCCCTCCTGTCCCAGGGCAAAATAGAGATAATC 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tatcaaaaTTTAAAAAGAAACAGCAGCAGGAGGCTAGGAGGTAGT--------------GAGTCAGAAA--AACAGCCTAAGAACGTTGACA----CTGGATAGGACATCTTACCAAGAGACCTCAC--GTTTCACCTGAGTCAAAGGACTGCATCATATCTGGCTGCAGTAGGGAAAGGCT-------------GATTG---GCCTCTCCTAAGATTAACCAGCTCATCCAAGCCCTGGACAGCCAGGCAGGCAAGACAGCTGCTTGGACCACCCCACAA-TACAGACCAAAGACAAAGCAGGACA-----------CTGCCAGCCTATGCTAAG---AAAGCTGCTGGTAAGAGGAACAAACATCCCTGCTGAGAGACTACTTGTCCTTTGAGTGGG-GTCAATACTGTCACTGTATTGGTAGAAAACAGAAATGCTTATTAGCTGGGGGAGATTATATAT--TACAGACTCAAGGGAACTGGTGGTCTTCCT----GCCTTGTGTACGAAGGTGGAGGTTCCTTGTTGCATCA-----AGAGCAGGCAGGGTGGGGTAGCTGGGCCATAGGAAGAC---------------------ACAGGTTAGGTCA-AAGACAAAGA--TCCTGGCTGAGCTGGTGGAAGCTACCAGGGCCAATGATAACAACAGACATGATGAGATCTGTTGTCATTGGGAAGGTAATGTCCTACCTAGGTCCAATCTCTGTGGCTCACATTGCCAAATGTTTGAAAAAGTAAAGGACAAAGAAC-TGTCACCAAAATGGGTTAAATGTACACTGCTGAGTTTCCTGTACATAAATATAACTT s monDom4.chr1 410406654 811 + 748055161 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CCTTGGCCCCAGAGAATAGGCTGGGCTGCCTTGTGGTTGGTCCAGCGGCT--CGAAGCTTTGATAGTCCCTGCTTTGATGCCGAGACCTGTGGCAGTAGGGTGGGGAGAGGTGGGGGGCCCATCCTGTCTGTCTGCTGGAG-GAGGAGTCCTAGACAATTCTGCCTTTGTGAGCCTCACCCCAAGGTATCTTCCCACTGAAACCTGCCACCTCGGAATGGCATGTGGGGA a score=24231 s mm8.chr4 134274452 665 + 155029701 GTTCCTTCTGTGAACACCATCTATAAAGGCCGAATTCTTCATCTACCTGAACAATTATGGGTTTGGAGGATTTAA-AATAATGGTTTCAGCATGTGCTTTGTATAAACAAAGGTTGGGGCAG--GGGGAGAGGCGGGGGCTGTGAGC-CTGGCTCCTTCACGCAGCTAAAAATAGCAACGTGCAAGTCCTTTAATGATGAGGAAGAAA-CTTAAAACGAATCTCTTGGAAAATTCCCTCCCATT-TCCACAGCTCCCTTCCCACCCCCTTCTCTGCCTGTGCAAATGAAGCGAGGGAAGTC---GGGGTGAGGGGTGTGTGTCACGACACA--CTTCCTTCCTGATGCAGAGAAGGAGGG------------TGGAGGAGGCCAGG----TTGGGAACAAGACGTCTGTTCAGGAGCTTGGTGCTGGCTGACACGGGCCTCTGAGCTCTGTGAGTGGCGTTTATAGCCACAGATATGGGAAAGAAAATAAATCTCCCA-GCTCAGCATCTTGCTTCAATTAATAACATAATCAAGTGTCTGGCCTTGTGGAATGGAGGGATTTCAACATCCAAGGCCCCTCTGGCAGGCGGG-----AGAGAAGTGCGCCCCTGGCTAGGC---------GCCCCCAAAGCAATGGGCTGTCCAGGCAGGAGCAGGAA--AGCTGTGGGTGCTTGGGGTACCCTATAGGACAGTAGAAG s monDom4.chr4 356351691 693 + 430141050 GCTCCTCCCTGAGCCCACATTCATAAAGGGTACATTCTTCCTTCACCTGAACCTCGAAGGGCCTGGAGGATTTTTTAATAATGATTTCAGCATGTGCTTTGTATAAACAGAGGTTGGGTCTGTGGGGGAGATGCAGGGAGTTCGGGCACCGGCCGATTGGTAGGGCTAAAAATAGAAAAATGAAAGGCCTGTAATTAGGAGGCAGAAATCTTGAAACAAATTTCTTGGAAACTCCCCTCTCTCCAGCCCCAGAATTCTTCCCCCCACC----------ATACAGATGGAGCAGGGGAAGCCAGAGGGGCGAGGGCTG-GTATCACAACACAGGCTTCCTTCCTGGCGCTGAGAAAGGGGGGATGAGGAGAGCTGAGGGGAGCCAGGGGGGCCAGGAACAAAAAGTCTGTTCAGGAGGCTGATTCTGCCTGACATGCTCTTTTGAGCTCCCCGAGTGGCATTTACAGCTAAAGATATGGAAAAGAAAATAAATCTTCTAGGCCCAGCATCTTGCTTTAATTAATAACATAATCAAGTTTTTGGCCTCCTAGAACGGAACGATTTCGACACTCACTGCTCTTCTGGCAGCTGGGGGCAAGGAGGGGTGAGGGGGTGGGTGGGTAGGGGCTTGGCCCACTCTCCAAGGGGC--TCCCGGAATGACCAGGTATTGGCCCAGGAAGCTC---CTACAAGGTGGGGCAGCAGAAG a score=24205 s mm8.chr4 134297736 677 + 155029701 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TGTTATTATCTTCTCTCTAGGCCTGGTCCTCGCCTGTCCAGTAATTAGCCTGCCCATCTGGGCTTTGTGTAGGAACTCCCTGCATGC-----AACCTG-CCATCGGGA-CCCTGGGAAAAGCTACATTCC-------TTGTGAGCACAAAACCAA-AGTGCCACCTGCGTTTCTCAAGAAACTCtttttttttttttttttttttttttctttttAAACAAAGAAGTACCCGGGAGAATCAAGCCCTCCCAGCCCCCAGCAAATAGTTTCACTCATTCGGCAAATATTTCCCAGCACTCTTGAACACAATTTTTTATTGCTTCTGTTATCTAACGAATACAGGAGACTGACTACAAATTGGTACTTCAAATATTTGTGATGCGTGCGTAATAGAAGAATGATCTCAGCCTCCCCCCACCCCCGAGACCCAGCCCCTCCCTCCTTATCATTTCTAGAGTTCT-GAACCCATGGGAC-------GCTCTCATGTGTAT------ATGTCGTGGATCAGCCAAAATTCTTAATTTCTGGTCTGTCCAGAAAAGCAGAGAGAAGAGAGTGACTG-----CAGATTTGATTAGAATCTTGAGCGATA----GGACTCCAGGCAA------------TGCTGGATGCCTAGGTTAGAGCACTATTTGTTCAGGGAGAAATGCAGCCAGGGA s monDom4.chr4 357295952 579 + 430141050 TGCCTTCATCTCCTAGCTAA-CCTGGCTGTTGCCCTCACTGAAGTG-------CCATCAGCTCCACCTGTTTGCTCTCTCTTCATGCCATGCAGCCTGATTATCTGGAGCCCTGGGAACAGGTGAATTCCACAGCTTCTCTAAACACAAAATCAGGAATTCCATCTGTGGTTCTGAAGATACACTTCCT---------------------------AACCCAGGAGCCTCCCAGGCAGCCCAGTCACCTAAGCCCC-AGCAAACAGTTTCACCAGCCCAGTAAATGCCCCCGTGGA-----GAGCCCAGG--------GAGCCTTTTATCTAAGACACACAG-----------CACAAGGGCATCTGAAATATTTCTACTTCGTGC-----------CTGATCTCAGCTTTGC-------------------------------ATCATTTTTAGAGCTCTTGAGCACACTAACCTATCCAGACTCTTATCAGCAGCCTAGGATGCTGGAGATGGAC----ATTCTTTCTTTCTGGTTGGTCCAGAAAAGCAGAGCCAAGGGCAATACTGACCCACACATCCGATCCTAATCTGAGGTTGCACCACTGACTTGGGGCACACAAAGAGTTCTTGCTCCATGTGTGTCTGGTTGTCATTTTTGACAAAGGAGACTTGTGGCCAAGGA a score=2455 s mm8.chr4 134797482 97 + 155029701 TCCTCCCACACAGGCCTCCATCGCCTCCTGCAGACAGAAAAACAATGTCTGCGCTCGAGCCGGGTTTCTGTCGAAAACGCCGAGAGGATTCATACCC s monDom4.chr4 357300381 97 + 430141050 TCTTCCCCAACAGACTGCAGTATCTTTCTGCATGAAACGGAATGATTTGTGTTCTGGGGTTGCTTTTTTGTCAAAAACCCCAAGAGCATGGACAACC a score=2839 s mm8.chr4 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caggtggatgtctgagtttgaggccagc--ctggcct--------------acacaaagagttctaggacggccagggtgacacagagaaagcctgtcttgaaaaGCAGATGTCAGTCAGCGCTTCCCTTCTTGAGTTGCTCAGCCCCCATCCTGGGGGTGTGACTCAGTGAAGGCAGGGCCAGGCAAGGTGAAGAAGCCCTTGGGATCAGAAAGGGGTCATTCTGGTGTCCTTGCTGCCT--------GGCGGGAGGTATCCCCAGAGACTCCT----CTCTGACCACTTCCTGGAGTCTCTCTGAAGCCCCTAGCTTTGCACAGTATGCTGTCCTGTCAAGGGTAGCTCGAGAGAATCCAGCCCTTTGGGCAGGCTCCAGTTCAGTAATTATGCTAGGCCAATTACACCTGGGTCCACCTAGGGTTCCCTGGGGGATGGGGATTGCCATTCACTGTGGGGTGCATC-----------TTCCCAGGCAGCTATCTGTCACTGCCCTACCCTGCAGAACAGATACTGCATTCCGCCCCAGAGGCAGTCGGCCTCCCTTTAATGTGGAGAAGAATTGTGGGAAATTGCTCCTTTATCCCTCCCAAAC-CTGGGAATCCCC-GAGGCAGA---GAACCTGTGTCTGGGAGTGTCCCAGGGGTCCTAGGTGCCTTCTACAAGTGACCTGCTGTGACCTTGAAGATATCCATTATCTCTAGGCCATTGACAAA s monDom4.chr4 357308531 650 + 430141050 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AATTTAGGTGGGGctagagatggaatcagaaagttctgag-ttggaatcccactttagacacttgccagatt---ggcgaacctgggtaaAATTtctgtctcatggggatgacaataaaaacacccatcttatagggcttcaaatgagtttcaaatgagataatgagatagaattttgtaaacctacataaatactggttatgatgatGCTGAT-------------------------GCTGATGGAAGCTGTTTCAGAAGAGGCCTTATACAAAGTAATTTCACATTATA-----GAGTGAAA---ATGCCTTGACTTTGGAGAATTAAGAAAGGGATAGCTGTGGCACCTATCTGCATAC---------TGCTGGT----AGAAAGAAAATTTCAGTGTTTCCTCTGTTCCTCTCTTACCCCTTTTCAGGctttctgactgtctctttgtctctgggtgtctgcctctgcctccctatctctctccctttgtctctgcctgcttatgtctgtctgtctgATGGTCATAGGtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctccccccctctccctct---ctctctctctctccctctctctctcctccccctcctt a score=4512 s mm8.chr4 134970790 263 + 155029701 GGCAGAAGGGTGGGGTTTATATTTGGGCGGCCCTCTAACCGTGGCTCACCCTCTTCTGTCGCTCCCCAACCCTAGCTATATCA-AAACCGGTTGGCGACCAGTGGAGCATTGTGCAGGTATCAAGGCTCTGGTGTGTCCCCTGATGTGCCTGAAGAAACTGAACCTGTACTCCAAGTTCAAAGGACGAGTACAGGCAGCTTCCGCACACGG---CAGGTCCCCACGGGTGGAGTCCCGGTACCTGGAATACCTTTTTGACGGTAAGT s monDom4.chr4 357601550 254 + 430141050 GGCTGAAGAATGAGGCCAA-----GGCTGACATTCCTAGAGTCAGACACA-TCCTCTGGTCCTCCTCAGCTTTGAAAATGAGACAAACTGGAAGAAGGCCA----AACACTGCTTAAGGATTGCCATCAGGGAGTGTGACCTCACCTGCCTGAAGCATCTGGATCCATTCTTAAAATTCAAAGGGCGAGTCCGAGCAGTG---GTGCAGGGGACCTACTCTCTGTGGGCAGAATCCAAGTACCTGGAATATTTCATCGATGGTAAGT a score=6102 s mm8.chr4 134973276 242 + 155029701 TGACTGGTCCGATTCTGTTTCTGACAGTGGAGCTAGCCCCGCCCACCCTGGTGCTCACCCAGATGGAGAAGATCCTAAGGGTCAACGCTACCTACCAGCTGCCACCTTGCATGCCGTCGCTGGAACTGAAGTACCAGGTGGAATTCTGGAAGGAGGGTCTGGGAAGCAAGGTAGGGAAAGCTTGTGCCGCCCCCAGCTGGGTCTCCT----CCCTGCTTCAACACTGCCTCCTGTACTTCCCTCCA s monDom4.chr4 357603499 241 + 430141050 TGACTGACCTG-TTCTGTGCTTGACAGTGGAACCAGCCCCACCCATACTGACCTGGATACTGACAGAGAAGACCTTAATCGTCAATGCCACCAATGAGTTACCCTCGTGTGCTTATCTTATGAACCTGAAATATAAGGTGGAATTCTGGAAAGAAGGGAGCCCAAACAAGGTAAAGGACAT---AGCAGGGACCAACTATGTACCCTACTCACTCGCTGCAGC-CTTCCTCCTTTGCCCAGCTCCA a score=4863 s mm8.chr4 134975766 184 + 155029701 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monDom4.chr1 445087543 143 - 748055161 TACCTGGGCTTCTTCCTCTTCAGTAAAGTCATTCTTGATATTGAATGTTTTGCGAATCTCTTCTGGAGTTTTCCCCTTGATCATATTTGCAACAGTCTTGCATGTGACATCAAGCAAACCTTTAATGTCTAAGTAGTTTGCAG a score=10970 s mm8.chr4 135028469 144 + 155029701 CCAGAATAAGTTCAAAAAGTATTCCTTGGTCAACTTTCAGGAATTCTTGGTCCCAAACAGGAATATCATCTGTCCG-TTTTCTTTGTTTTCATCATCCTCAGG-GGAGGAGGGTCCTCTTTGTGGTGGGAGCACCACTGAATGACC s monDom4.chr1 445087956 146 - 748055161 CCAGAATAAGTTCAAAAAGGGTTCCTTGGTCAACTTTCAGAAATTCTTGGTCCCAAACGGGAATATCATCTGTTCGCTTCTCTTTGTTCTCATCATCCTCAGGAGGAGGAGGATCATCCTTGTGGTGGGTGCACCACTGAATTACC a score=3475 s mm8.chr4 135028613 61 + 155029701 TCTTTCAGAATTGCTGCATTAACATTTGGTAAAGGAACAGGA------------TCATCATCCATTCCCAACT s monDom4.chr1 445091210 73 - 748055161 TTTTTTAATATCGCTGCATTAACATTTGGCAGAGGAACTGGATCATCATCCCCTTCATCATCCATTCCCAGAT a score=6617 s mm8.chr4 135028674 97 + 155029701 CTTCCGGCACGGCCTTGACGGTCACAGATTGTTTGGCAGTTTCTACAGCAACTTCAAATATCTCTCCATCAGAACTCTGCAACTTTGTCGTAGGCAT s monDom4.chr1 445093941 97 - 748055161 CTTCCAACATGGTCTTGATAGTTACAGACTGTTTTGCAATTTCAACATCAACTTCAAATATCTCTCCATCAGAGCTCTGCAACTTAATTGAAGGCAT a score=53 s mm8.chr4 135028771 77 + 155029701 GGCACTTGGTCTC--AAGACCACAGGCCCCGAGGCTGACGGA---CAGAGTTCATAATCGCACAGAAGtatcgagaacaagg s monDom4.chr5 185796710 81 - 308900514 GGTTCCAGATCCCTGGGGACCTTGGGCGGAGA-GCTGGCAGAGATGAGAAGGCTCCATTGGGCAGAGGGGCAAGTGATAAGG a score=2805 s mm8.chr4 135033077 82 + 155029701 ATGGGGAAGGGCAGTGGA-------GGCCACAAACCTGT--CTGCTTAATCCCACA--CTTTAGTCAGTGCTTTAAAAAGCATCCATGGCTCA s monDom4.chr4 357660331 93 + 430141050 AGGGAGGGGGGCAGGAGAACAGAGAGGCTGCAAATGTATTCCAGTTTAATCTCCCAGCCATCAGTCAGTGCCCTAAAAAAAATCGATGGCTCA a score=4497 s mm8.chr4 135034457 304 + 155029701 ggaaccactgCTCTAGA---GAAAGAAAGAAAAAAAAAAACGCTCCTGCACACTCAGAGCACTTGGGAAGGGAAGTTGCAGATGCTTGGTAGGACGACAGACCGTAAACT----TTGGCTTTCACAGGTTATTGC--GCTCGCAGCCATGACTCTGCCCCACAGCCCTGGGAGTGCCGGGGAGCCCCAAGCCTCCCAGACCGTGCAGGTCCACAGGCTGGAACACAGGCAGGAGGAGGAGCAGAAAGAGGAGCGGCAGCACAGCCTGCAGATGGGTTCTTCCGTGCAGAGGCGGACCTACCGCAGCAGGTGGG s monDom4.chr4 357662267 284 + 430141050 GGAGACATCTCTTTAGAATAGAAGATCAGATAACAAAAGATAACCCTAAAAAT----GATATTTTTAAAGA-----TGGGGATGCTGGG--AGAAGACAAATGGAGAAGCATTATTACATGGGACTGGATGTGGCATGGTCACTGTTAGTATTCTGATCCCTCCCCTCAGGTGAGAAGGGGA------------------CATGGAGATCCACAGGCTAGAACACAGGAGCCAGGAAGAACAACGAGAGGAGAGGCAGCGGAGTCTGCATATGTCCTCTGCCACCAAGAGGAGAACCTTCCGGACCAGGTGAG a score=5085 s mm8.chr4 135035705 107 + 155029701 TTTCTACTGGCAGTGAGGAGGAACAACAGTTCAGCTCTGAAGACTATGCCCTGGCTGCTGCCCTGGCCCTGACAGCCTCCTCAGAGTTGTCCTGGTAAGTCACATGA s monDom4.chr4 357663655 104 + 430141050 TTTCTCCCTGCAGTGAGGAAGAGGAACAGTTTAGCTCCCTGGATTATTCCCTGGCAGCTGCCCTGGCCCTAACTG---CTACAGAGACATCCTGGTGAGCTGGGTGA a score=5440 s mm8.chr4 135036861 168 + 155029701 CAGGGAAGCTAAGCTGAGACGCCAGACCACCACAGTGGAGCTGGAGGAGCGTGGACAGAGGCGGGTAGGCTTTGGCAATGACCTGGAGCGGATGGAGCTGGCCTTCCTACGCACTCAGAGGCTGCTGCGTCAGAGGCGAGACTGGAAGGCGCTGCGGCAACGGGTGAG s monDom4.chr4 357665139 168 + 430141050 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155029701 CAGGCAGGCTACTG-AGGTCTTCAACACGCAGGCAGATACTCTACGCAGACCGCCAGGCCTCCGTGAAGGTGTCCTGTGCCTACAAAGAGGACGAGGGGTTCTACACAATCCGAGTCTCCTCGCCCTTTGGGCCGCAGGAGCAGAGCGCCTATGTCTTTATAAGAGGTAAGGT s monDom4.chr4 357691568 172 + 430141050 CAGGGATGCTGCTACAGGAATCCAAGAGGC-GACAGCTCCAGTACTTGGACCGGCAGGCCTCTGTGAAAGTGTTCTGTGCTTATAAAGAGGATGAGGGACTGTACACAATCCAAGTGCCCTCTCCCTTTGGCTCCAAGGAGCAGAGTGCCTATGTATTTGTGAGAGGTAAGAT a score=9128 s mm8.chr4 135048328 273 + 155029701 AGGGAAGAGGAGATCAGACA--AGTTGGGG--GGACAAACAAATGGCCTCAGGTTGAGGACAAACCCCTTCTTTTCCTGGGTTCAGATGCTGCAGCTGAGAAGCCAGGAGCCCCAGGCTCGCCACTAAACGTCCGGTGTCTGAATGTGCATAGAGACTGCCTGACCCTGACCTGGGTCCCGCCCAGCGACACCCGGGGCAGCACCATCACTGGCTATTCCATTGAGATGTGAGTTGCATTCTGGCGTGACAGAGCCCCTTGGGCAGGGTACTAACAG s monDom4.chr4 357691948 265 + 430141050 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TTCCGCCAGAACCGCAAGATCAACTTTGACCGAGAGAAGGGCTTAGTGGAAGTTATCATCCAACAACTTTCCGAAGATGACAAGGGGTCCTACACCGCCCAGCTCCAAGATGGAAAAGCCAAGAACCAGATCACTCTCGCCCTGGTGGATGACGGTCAG s monDom4.chr4 357722467 159 + 430141050 TTTCCCCAGACACACAAAATCAATTTTGACAGAGAAAAGGGACTTGTGGAACTGATTATTCAAAACTTCTCTGATGAAGACATGGGAACATACACAGCTCAGCTCCAGGATGGAAAAGCTAAGAACCAGATCACCCTGGCCCTAGTTGATGATAGTAAG a score=4638 s mm8.chr4 135073381 101 + 155029701 CTTCACTCATGCCGTTTCCTCCCG---GTGTATTCACAGAATTTGACAAGCTCCTGAGAAAGGCAGACGCAAAGAGAAGAGACTGGAAGAGAAAACAGGGTAAG s monDom4.chr4 357724269 104 + 430141050 CTTAGCTAATGGTGTTCCCCTCCACCTGGGTCTTTGCAGGTTTTGACAAACTTCTGAGGGCCTCAGCTGCTAAAAGGAGAGATTGGAAGAGAAAACAGGGTAAG a score=4218 s mm8.chr4 135073729 222 + 155029701 AGGTGGCGCCCTGGTTCAGCT-TAAAGCTCATGACTCCTGGGTTTGTCCTCTTTCCCTTGCAGGTCCCTATTTCCAGGAGCCTTTGACCTGGAAGGTCACAGATGACTGCCAAGTGCTTCTGTCGTGCAAGGCAAGTCTACACCCCTCCTCCAACCCGGCCATCAGTCCAGTGAGGCATGACCTGTGACTTGTCCCGAAGCCCAGTGCCAATCCTTGCCAACT s monDom4.chr4 357725572 220 + 430141050 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score=2302 s mm8.chr4 135082985 60 + 155029701 CACTGTTCCCTC--TTCTGTGTTTCAGGGCCTTGGCTGTCATTGAGAAGAGTGAGTCCCCGG s monDom4.chr4 357740338 62 + 430141050 CCCTTTTCCCCCATTTCTGTTTTTCAGGCAGGCTGCAATCATAGAGAAGAGTAAGTCCATGG a score=4454 s mm8.chr4 135084481 145 + 155029701 CAGGACTCAACCACTCAGGACATTTCTTTCCATTCCAGATCGGGCTAAAGTGGTAAGGGGCCTGCCAGACGTGGCCACCATCATGGAAGATAAGGTACTATTCC------TTCTGGCCCACAGCCAGCCTGTCCCACACCTGGGTTCCTTT s monDom4.chr4 357742274 146 + 430141050 CAGGAATTTACGGTTAATTCCATTTGTTTTT-TTCCAGATCGTGCCAAAGTTGTCAAAGGCCTGCCAGATGTCGCCACTATTATGGAGGATAAGGTAACAGTTCAGACAATTCTGA-ACACATTCTGCAGATC---TATTTGGATTCTTCT a score=15530 s mm8.chr4 135086214 405 + 155029701 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AGCCAGGCGGTGCTGTGC-CGATGACCCCGTTCT-----CCTCCCTCCTTTAGGATGAGGTGATAGTGAATGACCGGTGGGGCCAGAACTGCTCCTGTCATCATGGAGGGTACTACAACTGTCAAGACAAATACAAGCCACAGAGCTTGCCAGACCACAAGTGGGAGATGTGCACCAGCATGGACAGAGCATCCTGGGGCTATCGAAAAGACATGACCATGTCGACCATCGCCAAGGAAAATGAAATCATCGAGGTAAGAGC s monDom4.chr4 358108688 262 + 430141050 ATCCAGGTGGCTCTATCCATAGTGACTCAGCTCTACTTTTCTTCACCATCTAGGATAAAATTGTGGTTAATGATCGATGGGGCATAGACACTGGGTGTAAACATGGGGGTTACCTTAACTGTAAAGACAAATACAAGCCAAAGACTGTTCCAGAACGCAAGTGGGAGATGTGCACCACCCTTGATAAAATGTCCTGGGGATATCGAGAAGTCATGAACAACAGTGATATTTTGACTTATGTTGAAATCATTTCGGTAAGAGC a score=10603 s mm8.chr4 135206635 349 + 155029701 ATTTCCCCTTTGTGGTGCTAAGGATTGAAGC--CAGGGATTTTTCTCTTAGCATTCCCTAATGTCTGTG--TGTTCTAGACACTG---CCAGGCTTGGTAGTCACACCTCAGTTT--TTATTGTTTCTGCCTTCTTT------AGGAATTGGTTCAGACGGTAAGTTTGGGAGGCAACTATCTTCTCAACATTGGACCAACTAAAGATGGTCTGATCGTCCCCATCTTCCAAGAAAGGCTTCTTGCTGTCGGCAAGTGGCTGCAGATCAACGGGGAGGCCATCTATGCCTCCAAACCCTGGAGGGTGCAGTCGGAAAAGAACAAGACGGTTGTGTGGTGAGCCCTGCCTTCTCTTGTGGTCAGG s monDom4.chr4 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AGCTGAGGGCAATGGATTAGTTTGAAAGAAGCCTAGGGC---AGATGAGCTGTGTACCCCACAGCTTCCTGGAAGGAAGGAAGGAAGAGGATGGAGAGGAGACTGAGCCAATATCGAGGCTCCTGGCT s monDom4.chr4 358114218 114 + 430141050 AGCAGGGGGCAAGGGGGCCACTAGAAGACAATGTGGAGCTCTGCAGGGGGTGTGAACTCAGCAACTCCTCTCCAGGGAGGCAGGGTGAGGATGG--------------CATCCCCGGGGTTCCTGGCT a score=4810 s mm8.chr4 135222570 143 + 155029701 TCTGTGTTGTCCTATGCTAACGCCTGACACTTGGGTTTCCTCATT-----TAAACCAAAGGTGAGCACCTCCTCCATGGGCACTTTGCCAAAGCAGGTGAAGATCGTGGAAGTCGGTCCCCGAGATGGGCTGCAGAATGAAAAGGTAA s monDom4.chr4 358127449 148 + 430141050 TCAGTTATTTCTTATCCCTTCCCCTAGAAATGTGTCTTTCTCTTTCTTCTTGTGTTCAAGATCAGCTCCTCCAGTCTAGATGCATTCCCAAAGCAAGTTAAAATCGTGGAGGTCGGCCCCCGAGACGGTCTGCAAAACGAAAAGGTAA a score=8455 s mm8.chr4 135224419 163 + 155029701 CCTTTTCTGGGTTTCTGTCTACCACAGAGTATTGTACCCACCCCAGTGAAGATCAGGCTGATCGACATGCTTTCCGAAGCAGGGCTCCCCGTGATCGAGGCCACCAGCTTTGTTTCTCCCAAGTGGGTGCCACAGGTGAGCCCAGGCTCT--GGGAGGAGCCTCT s monDom4.chr4 358128611 165 + 430141050 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GCTGTTTCTGGGTTGGG-----GCTGGGGGAGGAGAAGGGTGGTAATGAGAAACAACAGGAAGTTTGGCTCTTTTATTAGCCCCAG--CAAGGCAGCTGCAGGTGAGTAATCTGATCTCTGCGGCGTCCTGTTTTCTCTTCTACCT-CCCTTTCCTCGACACCCACTCACCTGCCGCCAGGGACTGA-------------------------GGGCACCTGACCCGTCACAGACTCTCACTCATACTCACTC--GCGCCCCCACACCCCACAGT---CCTGCCCTCAACCCCAGCAGATACCCAGCTGCCTCAGTTACCAGGAAACGGGGTTGGGGCAGGGCTGGGTGCCACAATGATGCTGACGCCCACTCACAGCCGG-TCTGCCCCCACTACCCACCGAGC---CCCAGCTGCTGGAAGAGCTCCATCTTCC--ATCTGTGGCAATCTGGCTCTT--CCCTGACTCTGTGGGCTCCTGA a score=8267 s mm8.chr4 135406892 775 + 155029701 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CCCAGAAAACAAAATGTCAAAGCTTGGAAGATCCTCAGAGCACAGAATGTTGCTCAGAACACAGACTGTCAGAAGGGGACAGGAGGCCTTCCGGATACCTAGAACCCAAAGAGAGTTGAGCTAGCCCAAACCCAGAGGAGGGTGCAGAGACTCAG----AGGCCAAGGGCTGTTGGGCCAGTCTGGCCCTGTCAGGAGGGTGCAGGGAGGGAGCAGGCCCCG--------GCAGAGGGCAGGGAGGAGAGGCCAGAGG--GAGACCGAGGGTCGGCC--TGGGCTCCCCTCTGGCGGCCTGGCCAGCCccctctccctctcgctctccccgtctctctccTCCCC-----CCGCCCCTCC---CGGCGCCTGGCT--GCCAGGGTGGTTTGCCTAGCTACATTCCTTTGGTTTTCCCACACACTCCCAATCAAAGAGTCCCCAATGCTCTCCAGCTCGCCCTCCCTCGGCCTCCCTCCCCCCTCCATAAATGCCTGCAGAAGCTCTTTTCCACCACCGCCCCCCGCCTTTAATCTGTTGTTCCCAAAGAAAGCGGCTTTTGTTGGGCAGGGGCTTCCGCGGCCGGAGCGCTGGGAAAGGCGCCCCCTCCCCACGGCTCATTATGCACGGTGCCTGTGGCCGGCCGGCCGATTGTGTGTCCTGCAGCTGCGAg--------ggcgggcgggcggccggggagcggg-------aggggacccggggaaaggccgcccgcccggcgccgccccgcgcACCTGGCTCCCGGGCCCCGCCAGCCCGCACAGCGGGCACTGGGCCCCCTGGGCCCCACGGCCCAGGCAGACACCCCGGGGCAACGGGAGGTTCCGAGGAACCCAGGCCGGGCCGGAGGT--GGGAGTGAGGCGCTGCGGGATGGGTGGGGGAA a score=2502 s mm8.chr4 135412228 64 + 155029701 TTTTATAATTTTGGCAGAGGAAGATGCAGTTCCTGGAAATGCTTACAAAATGATTCCTGACACT s monDom4.chr4 358390306 63 + 430141050 TTTTTAAATTTTGGCA-AGGTCAATTCCTTTCCTGGAAAGGCATCCAAAGTGATTACTTACAAT a score=31633 s mm8.chr4 135412292 686 + 155029701 AGGAGGAGATAGTTAAAAGAGGGGAAAAGGAAAAAGAAAAGTTATCTGTGTTCAGATAGAAAGGAGGAAGGTGGAAAGAAA-AGAGAGAAACAAAAGAACTAAAAGAGAAAGGGGGGCTTTAAAGGGCCCCAATTCAGGGGACGTTATCAAGGTCTCAGCATCTGCTATTCACAAG-CCGCTCGCCGG---CTGGGGTGGCGCAGGCCCCGCCCCTATCTCGGG-TGTCCGGCGCTCATTGGTGGGAGA-GGCAGTCGCCGGCCGGTGACTGC--CCGAGGAAAGGTTGCCTGGGACACGCATCCCTGTGTGAACGCATGACGTCCCACCCTGGCGCCAGGCTGTCTGGGGCTGAGTCTTAGATCAACACAGCTGTGGGACCCGGACCCACAGCTGGGCAAAGGAGCGGATTCCTCAACAAAAAATAGGATTGTGGGAAAAGTTCTGAAACAAAAACAGCGCAGACAAAAGCCTTAATGACATCCTTTCATAAAAATAAAAAATGCAAGAGGGGGGAAAATGCTGGTAAAAGGAGCAGAACTGGGAACAGAAAGTTCAGAGGCGTTTGGAGTAAGAGGCTGAGGCCCCGCCACCACTAAACAAGTTGCAGAAGGCCGGGGCGAGCCGACCAGTCTGCTGTGCAGGCAAGAGAGAGTCTTTGGGGTTTAAACTCTATTCACTGATCCCAACCCGAC s monDom4.chr4 358390893 660 + 430141050 agggggagaaag---aaaaagagggaaaagagaaaggaagga---------------agaaaaaagggagaaagaaagaaacaaagaaagaaagaggaagggagaaagaaagaaggaTAAAAAACAGCCACT-TGGAAGAAATGTTATCAAGTTCTCAGCATCTGCAATTTACAAGGCAGTTCCCCAGTTTCCGCGGCCTCTCAGGCCCCGCCCCCTGCTCGGGCTGTCGAGCCCTCATTGGTGGGGGGCGGCATTTCCAAGCCGGTGCCTGCGCCTGAGGAAAGGTTGCCTCGGACACGCATCCCTGTGTGAATGCATGACGTCCCAGGCTGGCGCCAGGCTGTCTGGAGCTGAGAGTTAGATCAACACAGCTGTGGGACAGGGACACACAGCTGGGCAAAGGAGCGGATTCCTCAACAAAAAATAGGATTGTGAGAAAAGTTCTGAAACAAAAACAGCGCAGACAAAGGCCTTAATGACATCCTTTCATAAAAATAAAAAATGCAAGA--GGAAAAAAGCCTGGTAAAAGGAGCAGAACTGGGAACAGAAAGTTCAGAGAAG---GGGGTCGGATGCTGTGGGCCTGCAGCA---AAAGGAGCCGCAGAAGGCATTTGC------ATCCTTCAGCTGTTT--GTGAAAACCTCCCGTTCGGCCCCAACTTCTATTCCCCAGCCCTCACTTAAC a score=32258 s mm8.chr4 135415184 1122 + 155029701 TTTTTCTTTCTCCGTGGAAAAGGACTGGGTCCAGACTGCTCTTATCCTCTTTCCCCTGGTGCTCAA------ATAAATAGTG------TTCTCTGCTTAGACCTCCCTTTCCCTCCTTCTTCTGCAATCTCAGCGCCTAGCCCAAATCTGTTTTCTTCATTGTAACCTCAGCTTCACCGCAATTAATTTTTTCCCCCTCTGGTCACAAGATAATTCCTGACGCCAGTGAGTCTGGAGGTCAGACGAGCAGCAAATTGGGGAACAAGGCGGCACTAATTCCTTACAAGTTTCCCTTGAAAATTCTTGAGAGAGAGAGGAGAGAGAGATCTTTAGTTGTT--CAAGGGATTTATGACCTCAGA--GCTGTGGGTTCGAACCAGTATTGGGGGGAGGGGA-------------------------------------CCTCAGAGAACTTGGGCG---CCTCCAGAAAAGG-CATATTCTTAAAAGTTAATGGTTTTAAGTGATTTTTTTTTTTTTTTCAAATCTGTGCTGGCTCAAGAGCCCCGCCTCTCCTCGGTATCAGCGCTTCCTCATTCCTCGCATCCGAGGCTCCGCTGTCCTCGGCGTCAGACCAGCCTAAGGAAGCCTGTTAGCAATTTAAACCCACTGTGAACGC-----------------CCAGGACCGG----------GGAGGCGGTGCCCAGGGCGGG-------------CGGGGGTGGACCCTTGGCGGTCTGTTTTGAATAAGGG--------------------------------------GGTGTGTCCTAGA---GAGGACTCTATAAGAGTCGGCCGCTGCAGGCGTGCGCGCACTGTTTGCTGCTTT------AGGTGTC-------TCTTTTCC-----TCCCTCTCTATCTCTACTCT--------CCAACATGAAGGCGCTGAGCCCGGTGCGCGGCTGCTACGAGGCGGTGTGCTGCCTGTCGGAACGTAGCCTGGCCATTGCGCGAGGCCGCGGTAAGAGCCCGTCGACCGAGGAGCCTCTTAGCCTCTTGGACGACATGAACCACTGCTACTCGCGCCTGCGGGAACTGGTGCCGGGAGTCCCGCGAGGCACTCAGCTTAGCCAGGTGGAAATCCTGCAGCGTGTCATAGACTACATCCTCGACCTTCAGGTGGTCCTGGCAGAGCCGGCGCCTGGACCCCCGGACGGTCCGCATCTCCCGATCCAGGTGCGAGAGGGAGCCAGACCAGG-CTGCTCTGAGCGTGCGGGCAGGGATGCTG s monDom4.chr4 358394356 1237 + 430141050 TTCTTCTCTTTCCTTGAGGAGTCTCCAAGTCCCCATCTCTTGGAGGTTTTTTAGTGCGATTTTTAGCCCGCCACAAAAAACGCACCCCTTTTTTTCACAGTCCCCCCACTCCACGCCCCTTCC---CTCTCAGTGGCCAAATTAAGTCTGTTTTCTCCATTGTAACCTCAGCT-CACCGCCATTCATTTTTTTTCCCTCTGGTCACAAGATAATTCCTGACGCCAGAAAGTCTGGAGGTCAGATGAACAACAAATTGAGGAACAAGGCGGCACTAATTCCTTACAAGATTCCCTTGAAAATCTTTTGCCTTTTTTTAAAAAAAAGTTTCCTCCTCGCTGTTTGGGAATTTATGACCTCCGACGGGCCTCCGTCCGAACCGAGGTTGAGGGTGGGGGCTGGGTGGGAGGAACCAGCCTCTCGGTCCCAACAGTTTCTCCCGTGGCCTGGGAAGGAACCTAGAGAAAGGGGCATTTTCC---ATGTAAATTATTGTAATTGAGTTTTT----------AAA---------GACCCAGGGGCCCGCCTC------------------CCTCATTCTCGGAATTCGCCACTACACCGCATTCGGTGTCAGGCCAAGCCGAGCAAACCTGTTTTGCAATTAAACAGCTTGTAAAGGCTCCATCCAACTTTTCCCCCTAGACCATTCGTTGAGACGGAGACCGAGCCTGGGGCGGAGTCTATTTGCATAAATGGGTGGGGCAAAGAGAAGGATTTCCTAATAAGAGCGTATAGCGGGCGGGTACGGGGCGTGGCTTGCCCGGTGGGCGTGGTCCAGGTCCAGGCCCCCTATAAGAGCAAGCAGCTGCAGGCTGGAGCGCAGCGTGTTGTCTTCTGACACAAAATATCCACGGGTTCTTCTCCGCTAGTTTCTTTTTTTCTTTACTCCAAGTCCCCCAAGCATGAAGGCGCTGAGTCCAGCCCGTGGCTGCTACGAAGCAGTGTGCTGTCTATCAGAACGCAGCCTCGCTATCGCGCGTGGCCGTGGGAAGAGCCCAGCAGCTGAGGAGCCGCTGAGCCTGCTCTATGATATGAATGACTGCTATTCGCGCCTCCGGGAGCTGGTCCCGGGTGTCCCGCGGGGCACGGAGCTCAGCCAGGTGGAGATCCTGCAGCGTGTCATAGACTACATCCTGGACCTGCAGGTGGTGTTGGCCGAAcccgccccgggggcccccgacgggccgcATCTCGGCATCCAGGT------GGGTGCTAGTCGGGGACCGCACCGGACGAGAAAGGGTGGAGGCTG 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s monDom4.chr4 358429874 1403 + 430141050 AGGCGACAACAGGCACGGCCCCTTTAAGGGAAGAGCCCACTGTTGCAATTGACTCGCTGCAGAATGTATCCTTTCCGGAGG-----------GCGGAGCCTGTGTATGTTGCGCCGACCAATAGGAAGGCGTTGTTTTCCGCGGGAGATCTGAATTTCGCGGCACGCAGTTTGGCGCTAAAAAAAAAAAAAGGAGGAAAAAAGAGACCCAGACCAAGAGAGAAGGGAAGAGAGGAATGGGAGAATTGGGGCAAGTG--GAGCGCTATTGAGGACCAATCCGGGCCCACCCTGGCTAGGGAGCCCCGCAGCCCCCAGGCACCCGGCTGGGCCCCCACCCCCATCCCACCCCCCGCTCCTGCCCCAGGCCTTTCGGGAC---CTGAAGC-CAGGCAAAGGTTTCCCTGCCGGGCTGCCTGGAG---GAGGCGGTTCGGGCC-CCTCCT---------ACCCACCCCGCCCTCCTGCCGCTTGCCGCTGCCTAACCT-------GCTCGGACCCAGG---------------CCGGCCATGCCC----ATCTCCTCCTAGCCCCTGCCGGGCTTCCTGGCCCCAGCCTAGCGCTCTCCTCCTCCGTCCCCAAAGGCTCCAGATCATCGCCCCCGACCCAATGTTGAGGATCCCCAAGGGGGTCTCCCCGGCCCCGGGGGGCTCTGCCCCGGCGGCACCGCAGAA---GCCTCCTCAACCGCTGCAGATCAAGAAGGCCCTGCCGGTGGTGAGCCCCG------TGTGGACACCCGATGTGCGCAGCCCGCAGGGGGGCCCGGTCC------CGGCCAGCCACTTCACGCCGCTGTACCCCCCGATGGTGGCCGCCGTCGCTCCCGCGGCCCCGGGCAGCTGCCTGGACGCCACCCCGCAGGGTCCAGAGATCCG---CGCCAGCCGTGCTTCCGCCGGCCGGCTGCCGGTAATACCCGGGATCCCCTACCTCATTCTTCCCTCTCTTCTCTTTATTCCGTGGCTTCTCCTCCTCCTTCCTGCGGGGAAAACGCCGGACCTCCGGCGGCTCTGAGCCCCCAGGCTTTCTGGAATTCCACAGGGTCCAGTCTCAGTCTGTATATGGAGGGGGGACCCCGGGGAGGTCCCTGGATACTAGGATTTAGCCGAACCCGTT-GTTTGCCAAGCCCAGGAAGCG---TAGCCCTGTGTGCAGGTCAGAGTCTAGCTT---TCCGAGCGTCCTATGGTGCTAACTCCTGTTGCATTCACCCCTGTGCA-----GAAGTAGAAACTGAGGCTGCGAGGGGGCGGAGGCTTG-----ACCTTAGCCGTAAGCGGCTGAAGC-CTAGCGGTCCTTGGACGCCGTGCACTTTGCATTCTCGCCCTCCGAAGCGCTTCGGGCCGAGATTTCTGCGTTCCCCGGGTGGCCTGTCCCGCTTAAGGTCTCTAGGACTGGATTTTCCTTCCCGCTCCGAGCTCCTGGGCTTTAGTGATTTCTGCGGGCCCCTCCC a score=2435 s mm8.chr4 135446799 263 + 155029701 CAGTTATCTTGGTTAGGGGATGAGGCTCTCTACAGGTGAGGAAACCGAGCCGAGTGAAGACATTGCCCAACTCACAAG-GCCAAGAAGTG--------GGGAGGGTGGGGGGGGGTGTCATCCTTGCATCAGACTCCCTAAAAGCCTG------CCAGGCCCAGAGACCATCTCTGGTCCATCTCCAGATGCTGGGGCCCCAGTGCCCCGTGGGCAGGCCTAACCCCCTGCTTACTCATTTTACAAGGGTGTGACCTGGAGCTGCTCCAAGCCCAACC s monDom4.chr4 358431312 251 + 430141050 CAGTTTTCTCATTCTG----TGTGGCTCTCGGCAG-TGGGCTGGCAGGGGAAGCTGCCGAC---TCCTAACACGCAAGCACCCAGGCGTGACAGAGACGAGACGGGGCAGAGGGAAAGGATAGCTGC------CCCCCCAAAACCCCATGACAACCGGCTCCTGGTGGCATCCCAGGCCCCGGCCCAACTCTTCACCCCTCCCTCCCCC-------------CACCCCAGCTTCCTTGTTTTAGAAGGGTGTGACCTGGAGTTTTTCCAAAACAAACC a score=3240 s mm8.chr4 135449913 319 + 155029701 GGCTGTGGTTT----------GGTTTCCCCAGCAGGTGTTTCCCAAGCTTGGCGGGAACGGGGAGGGGCAGCAGGGCCTCAGCTGCTTGTCCTTAAGACACTGGGGAAGGACTCATTGTGTCTCAGTAAAGAAAGAATGACAAGCAGTCCATTCTGGAGGCCCTGGAA------CCTCAAGCTGGAGCCCAAACCGGGATGGGGGTGGGCAGGAGGGAGAGTGTTTGCACTGTTTCCCAATGCGGGCACCTCCCTGGGGT--GTGGCACTGAGCCAGGAAGTCCC-CTGGGCCTG--GGCGGATGCTGGCCCCACCCTGATAAGGGCCAGCTGTGGAGCT s monDom4.chr4 358437772 262 + 430141050 GGCTGTGGTTTTGGGGCTCCTGATTTCCCCAGCAGGTGTTCCCTGAGCTTGGTGGGGTGGG----------------------------------------TGGAGAAGGG----------------GGAAAGGGGGGGACAGGAAGTAAGTTGGGGATTCCTTGGCATCAGGCCCTGGGGATGGAGCCCTCTC-----TGAGGTTGGCCCAGAAG-----------------CTCTGGGTGGAGGCCTGGGCTTTGGGCCGGTGGCACCACGCCAGGAAGCCCTGCCAAACTTGGAGGGGGACACACAGTCTCCCCAGATAAGGTCCAGCTGGGAGGCT a score=5943 s mm8.chr4 135450383 243 + 155029701 ACACAGGAGATGGCTGGCTGTTGCTGGCCTTGCTGCAGGCCAAGTAGGCCTTGCTGCAGCTCATAAAAAAATGTCAAGGAAGGCCTGATTCTCTAACTCTTTCTCCCC--------------CCCCCCTCTGTCTGTCA-------AAGGCCAAAAGGAAGTTGGACCTGGAGGGCATTGGGAGGCCTACGGTCCCTGAATTCCGGACCCCCAAGGGGAAGTGCATCCGCGTGGATGGTTTGCCAAGCCCCAAAAGTAAGAGCT s monDom4.chr4 358438518 246 + 430141050 ACATGGGGGGCAGCTTGCTTCT-CTGGCACAG--ACAGGACAACTGAGGC--------ACTGACGAGGGAGTG----GGAGGAATTGAC---CAACCTCTTTTTTCCCTTTTACATCGATTCCCTTCCTTTGTTTTCTAGGGTTTCAAGGCCAAGAGGAAATTGGATCTGGAGGGAATGGGCCGACAAGGACTCTCCGAGTTCCGGACACCCAAGGGGAAGTGCGGTGGCGGAGAAGGTCTCCCCAGCCCCAAGAGTGAGTGCT a score=14 s mm8.chr4 135450626 132 + 155029701 TCTGATGGGCACCTATGGTGGGGTGGCAC----------GAGGCAGGAGCCCCCACCCTGTCACCAGCGCAGGCGCCTATCAGACAATTCCCTTTTCCAAGGTTTCTTGTGTattctcac----gattgattctgttcagaagata s monDom4.chr1 361030760 129 - 748055161 CCCTTTCTGGCCCCCTGGTTAGACTGTTCAGGACACTGGGAAGCCAGTGTCCCCACGCT-------GAACTGGAGCCAACCAGG-----GCCTCT-----GGTTTCTTCTCTCTCTTCCCCATGAATGGGTGCTGTTTAGGATAGA a score=23 s mm8.chr4 135452237 149 + 155029701 CCTGGT---GCAAGTCTCCTTCCCCCGAGGCTACAGGGCTTTGTGGCAGTGGAGAATCCGCTGCCTGGGTGCTCTGCGCGCTGGACAGCTCTCGGTGAAGGGTGGGAGATAAGGTGTTTCTGAATGGATCTGAACTCGTGGAGAGACCCCAG s monDom4.chr1 361031347 120 - 748055161 CCTGGTTTGGCAACTTCCCAGCCCCACAGGCC--------------CAGGAGGGAA--CACCTCCGGGATCCTCCCTGCC----GCTGCTGTTGCTGGAGGCCAGGGCAT--------CCTGGAAGGATGTGGGCCCT----GAGTCTGTGC a score=17625 s mm8.chr4 135452386 273 + 155029701 GCTGGCTCCCCGAGAGCAGTGTGTGAGTGGGGCCTTATCC----TCCTCAGCCCCCAAGTCTCCTGGGGAGAAGACACGCTATGACACGTCGCTGGGGCTCCTGACCAAGAAGTTCATTTACCTCCTGAGCGAGTCGGAGGATGGAGTCCTGGACCTGAACTGGGCAGCCGAGGTGCTGGATGTGCAAAAGCGGCGCATCTATGACATCACCAACGTGCTGGAGGGTATCCAGCTCATCCGCAAGAAGTCCAAAAACAACATCCAGTGGGTGTGAGT s monDom4.chr4 358442070 277 + 430141050 GCTGGGATTCCCTAAGCCGGGTGTCTGCCTCTTTTTATCCCTTGTCTTCAGCCCCAAAGTCCCCGGGTGAGAAGACGAGGTACGATACGTCTCTGGGGCTACTCACCAAGAAGTTCATTTATCTGCTGAGCGAGTCTGAGGATGGGGTCCTGGATCTGAACTGGGCGGCTGAGGTGCTGGAGGTGCAGAAGCGGCGCATCTATGACATCACCAATGTGCTGGAGGGCATCCAGCTCATCCGCAAGAAGGCCAAGAACAATATCCAATGGGTGTAAGT a score=9877 s mm8.chr4 135453258 299 + 155029701 TGGTGACTAGCCCTGTCTTGGA-GTTTCACCAGCTCCCCTCTGCGGTTGTGCGGGGGCAGCCCTGAGGTGGGGGTCATGACGTTGGGGATTGCTCTGTTCCCAGAGGCAGGGAACTATTTGAAGACCCCACCCGACCCTCCAGGCAGCAGCAGTTGGGGCAGGAGCTGAAGGAGCTGATGAATGCCGAGCAGACCTTGGACCAGCTCATTCAGAGTTGCTCCCTGAGCTTCAAGCACCTGACCGAAGATAATGCCAACAAGAAATATCCTTTCTGCGGGGGGCGGGGAGGGGGCGGGAGG s monDom4.chr4 358443272 297 + 430141050 TGTTGATTGAGCGCATAATGGATGCTCAATCCTCTCCCCTCCCTCGGCCTTCAAGGCC--CCTTGGTGCTAAGGAGTGAGCGCATGGGGCCTCTCTCTCCCCAGAGGCAGGGGCATGTTTGAGGACCCAGCTGGGCCCCGGAAACAGCAGAGCTTGGGGCAAGAGCTGAAAGACCTGAGCGACACCGAGCGGGTCTTGGACCAGCTGATTCAGAGCTGCACCTCGGACCTGAAGCACCTGACGGAGGACGAGACCAACCAGAGATATCCTTCCTG-GAGGAGGGGGCCCAGGATGGGAGG a score=8181 s mm8.chr4 135456424 199 + 155029701 AGGGGAGAGGAAAGCCCTGGCAGGCTGGATGTACACTTTGACAAGGTTGCTTTTCTTAACTTTTCTGCCCCTACACTGGCCTATGTGACCTACCAGGATATCCGTGCCGTAGGCAACTTCAAGGAGCAGACAGTGATTGCGGTCAAGGCCCCACCACAGACAAGATTGGAAGTGCCGGACAGGGCCGAGGTTAGAAGTG s monDom4.chr4 358445410 185 + 430141050 AGGGAAGAGG----CCTTGAAAAGCAGGCTGAAC----------GTTCATTTCCCTTAACCCTGTGGCGTCCACATTGGCCTATGTAACCTACCAGGACATCCGGGCTATAGGAAACTTCAAGGACCAGACCGTGATTGCTGTCAAGGCCCCTCCTGAGACTCGTCTGGAAGTCCCGGACCTGCGGGAGGTGAGGGGTG a score=8133 s mm8.chr4 135458857 251 + 155029701 TCCTCTTCCTCCTCCAGGAGAACCTGCAGATTTATCTAAAGAGTACCCAAGGCCCCATTGAAGTCTACCTGTGCCCAGAGGAGGGGCAGGAGCCAGACAGTCCTGCCAAGGAGGCGCTCCCCTCCACCTCTGCCCTCAGCCCCATTCCTGACTGCGCTCAGCCGGGCTGCAGCACTGACTCTGGGATCGCAGAGACCATAGAGCCTTCAGGTAGGTGGGAGGGAGGCGGGTGTGACTCTACTTCTTCCTCT s monDom4.chr4 358447301 231 + 430141050 TCCCTCTCGTCTCCCAGGAGAACCTGCAGATTTACCTGAAGAGCACCAATGGGCCCATCGAGGTGTACCTGTGCCCGGAGGACAATCGGGAGGCAGGCGGCTCTTCCCAGGAGGCTCCCCCCTCCGACCCTG------GCCCTTTCCCTGG------TCGGTCCAGCAGCCCCAGTAGTTCTTGCAGCCTGGATCTCATTGCACCCCCTGGTAGGTGCTTGGCCATTGGG--------GCCTTCTTCCTCT a score=11740 s mm8.chr4 135478138 786 + 155029701 GGCTTTGGAGGCGGGGCTAGGGAGGGAAGAGGATCGGGGACGGGGGCTGGGAGTCAAGAGCGGAGCCCCAGGAGAACTCTCCCCATCTGTAGGTCTTGGAGGCAG--GGCAGAGTGGGGCCAACGCGAGGTTGGGGCGTGACCAGG-GAGTTAGGGGCGCGGCTTGGA------------------TGTGGCCGGAGAGTGAGGGGGATGG--GGGCGTGGTCAGGG-------AGTTACCAGCGAGTCGGGGCGTGGCCAGGGAGGTAGACAAGTGGTCTGGGGGCGTGGCCGGAGAGAGAAAGGCTGGCGGGCGGGGGCGTGGCGGAGTTAGTTAGGGGCGGGGCGGAGCAGGGAGTGAAGAGGC----------------CTCGAC-TAGGACGCTGC---GGGTGGTGAGACAG-----GCCCTGCG--CAGAGCAGCTATACCAGCACTGTTAAGTGCAGCGTCCCCCGCGTTCC------AGGCAGCTCCGGTGTTTTCGCCTCGTTCCCACCATGCCCGAGCAGCTCAGTGTCGCGGAGTTCCTGGCCGTCACCGCAGAGGACCTCAGTTCCCCAG------CCGGAGCAGCTGCCTTCGCCGCCAAGATGCCCCGGTGCCGCGGGGCGGCGCTGGCACGGGAGGAGGTGAGGGGCCGAGGCGGGAGGGGACCTCAGGTCAACTTGGGG------CCTGGCTTTGACCTTTGCAGGAATGCTTGG---------AGCTAGGATGGCTCTTCGCTGCGCTCCAGAAACCCGCCCCTCTTAGATCTGTGGGAACCGAGCTCATCTCAAACATCTGTGTCCCCAAGGTGG-------AGCCTGGGAAGAGAGGACCAG--------ATGGGATCTCGGGGT s monDom4.chrUn 147308230 856 + 174229318 GACTCTTGGGGCTGGAGT-GGGAGGGATTTGGA--GGGGATGGGGTGCTGGAG-AAGGAATGGAGAACTTTGGGGGCGGGACAAGAAGGAGCGGTTGGGGGGCAATAGGAAGAATGGGG--GACATCGGGATGGGGCGGGAAAAGGAGAGAGTGAGGGGGGGCTCTGAAGGAGGAACGCGATATCTTggggtgggagtgggagggtcttggaggggcgggggcagggtggggttggaggcctaggggtagaggcgggacaaggtggg--gccaagggcagtggggac----tctgagggggcgggcctgggtgggggtggagtggaggagggtgctcggagggggccggcagtaggaggagagaggcgggggtggggCGGGCCCTCGGCCTCGGACTGTGCCCAGGCTGATGAGCGAGAGGCCGCCCGGCGGGCGCAGCGCCGTTCACCGCTCCGTCGGACCCAGCCCGCTCTGCCTTCCCCCAGCACCCCGCGCCCCGGCTGGAACCCGGCCCCCGACATGCCTGAGCAGCTCAGCGTCGCCGAGTTCCTGGCGGTCACCGCGGATGACCTCAGCTCCCAGGGTGGCCCCGCCGCGCTCGCCTTCGCCGCCAAGATACCCCGATGCCGGGGGGCGGCGCTGGCCCGGGAGGAGGTGAGGGGGTGACGCGGGAGGGGGGCGT-GACCCACTCGAAGGGTCCCTCCCTCTCTGAGGGGGGCCGGGGTGGAGGGGCAGAGCCTGACCCGGACACCTCTCTG--GCCCTCCAG--GCCGGTCAGTGTCCGATGTGTGG---CCCAGCC---------CCTTTGCATCCTCGAGCTGGTAAGGTCATCCTGAGTTGGGCAGTCCAGGGCGCCCCATGATGCCCCGGAGT a score=14256 s mm8.chr4 135499393 397 + 155029701 tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtAGGGTCAAATCCTGAAGTCAAGGTCTTCTTACATAACCCCTCTGAACCTT------GGACACTTTGCCT-------CTAGGCCCTGGAAGGAGACCAGGCTATCTTACAGAGGATCAAGAAGGCTGTTCGAGCTATCCACAGCTCTGGTCTCGGTGAGTAAGCCTGGGCCTGGGG--------------------------TCCAGGGCCTGGGACCCAACCA---GGCCTGCAGCCAACTCTGAAAGCCTTTCCTGTCTGCAGGCCACGTGGAGACTGAGGAGCATTACCGAGAGGCCGTGGAGGCCTTGGGGAATAGTCACTTGTCTCAAAACAGCCACGAGCTGTCCACTGGCTTCCTGAACCTGGCTGTATTCACCAGAGAGGTGGCTGCCCTCTTCAAGAACCTGGTGAGG s monDom4.chrUn 39991295 426 - 174229318 TGTGTGGCCCCGTCAGGGGACCTGAGCCCCAGTTTTGAAAAAAAGGCCTTCT------GCCCCGGTGGTCTCTTACAGAGAATGCTCTTTCTTTGCTTCCTAGACCCTTGAAGGGGACCAAACCATCTTGCAGAGAATAAAGAAATCAGTGCGGACGATTCATAACTCTGGCCTTGGTGAGTGAA---GAGGCTGGGGGGAAGTGGGGACAGCCAGAAACCCTTCCTAGGACCTCCCCCCCAATCCTCCAGCTGGCAGCTAACCCATGAA--CTTCCCTCCC--CAGCCCATGTGGAGAATGAAGAACAGTATAGTGAGGCCCTGGAGACCTTTGGGAATAGCCAACTCTCCCAGAACAACCATGAGCTGTCCACAGGCTTTCTGAACCTGGCTGTGTTCACTCGAGAGGTGGCTGCCCTCTTCAAAAATCTGGTAAGG a score=6381 s mm8.chr4 135500346 229 + 155029701 AACCCCAGCCCCTCTCTGCCCCTTCATCTCTCCCTCTCCCTGCCTCTGTGAGTCCTGTGGCTCTCCATTGCCTCC----CGGTACTTCCCTGGACCCTGATCCCCTTGGGGTGGGGTCTCTGCTTTTTGTAGGTTCAGAACCTGAACAACATCGTCTCCTTCCCGCTGGACAGTCTGATGAAGGGGCATCTAAGGGATGGGCGACATGTGA-GTGTCCGTGTGGGAGAGAGGGG s monDom4.chrUn 39994581 213 - 174229318 aatcccttcaccccactgagcctcagtttctgcctcttt-----taaatggattagatga-tctctaaagcttctaaatctgtaactacatggttcCT-----CCTTA----------TCTGTTTCTTCCAGGTACAGAATCTGAATAACATTGTTTCTTTTCCCCTGGACAGCCTGCTGAAGGGGCAGCTAAGGGATGGTCGACAGGTGAGGTTTTTTTGGGGGGGGGAGGGG a score=2023 s mm8.chr4 135500842 222 + 155029701 TGAAAGGAGGTGGCAGAGTC-----ACCTCCTGGGCA---------GGCTGCCCCACAGAGCATGGG-----------------------GAGGGGCTGTCCTCA--TCTGAGTCGCACCATCC------TGGGAACCGCCCAAACCAGACAGATGACTTTTTTTTTTTTTTCTCAGAAGAAGTTAAGGCTATCTAGAAGGGTG---TGGAGAGTTGGGCTGGC-------TAAGGCTCAAGCATCCAGCCCAGGCAAGCCAGGCCAGGGGTCAGCT s monDom4.chrUn 39996187 266 - 174229318 TGAAAGGAGAGGGCAGGCTCCAAGGACCCCCAGGAAAAAGTGTATTGGTTCCCCTCACAAGCATTGGAGCTGTGGTATGTTTACCTCCCTGAAGGTTTACTCCCAGCTCTGGGTCTGTCTTTTCAGTCAGTGGGAACAGCCCAAACCAGACAAGCAGCTTTCTTT-----------GAAATAGGTGGGGTTGGGGATGAGGGAGAGCTGGGGGGTGGGGAGGACCTCACCTTTGGGTTCCTGGGCACAGCCCTGCCTCAATAGGGCAGGGACTGGAT a score=4174 s mm8.chr4 135501363 264 + 155029701 CAGCTGGACAACAAGA--CTCAAGAGTGAGGTTCCCCCTGAAGGCAGCAGAGTGTCCTG-TTTATCCCAGGGCCCCT------GCTACCCTTTGGGCAACTCATTCTTTTC--TCAACTCCAGGATTCCAAAAAGCATCTGGAGAAGGCGTGGAAAGACTACGAAAGCAAAGTGTGAGTGACCTTGGACGGGTGGCCTTCAGGAGAGCACGTCTGC-TCTACATTGAAGAAGGAG-GCTGATTTTGGGATGTG-TCACTTGGG--GTGTCTGGCTCTTTG s monDom4.chrUn 39999505 274 - 174229318 CAGCCAGGCTACAGGAAGCATAATATAGGAGCAACCCCACAAAACCACAGAGAATTGTGGCTTGTGCTGGGGTCCTCCACCAAGCCCCTCTCTTATC------TTCTTTTCCTTGAACTATAGGATTCCAGGAAGCAGGTGGAAAAGGCATGGAAAGACTATGAAGCCAAAATGTAAGTTCTTCTGGGAGATGGGCTGCCCCAAGAGTCTGCCACCACCTCCATCAGAGCAATAGTAATAAtgttgtcattcgatcatttcggtcttgtccaattctttg a score=14479 s mm8.chr4 135512117 443 + 155029701 CATATACAGAGATG--TTGGGGCAACAAGGGATCAAGAGGGCAG--GTGGCAGGGGAAACTCAGCCATGTG-----TGTGTCCAGGCACCAGGAGAGCTCGCCCTGCACTTGGCCATCAGAGTCGCCAGCCATGCTTCCCTGCCGATAGTGGACTTCCTCATCCAGAATGGGTGAGAGCCTGCCTGCCATCAACCCTCGCTGATCCCGACTCCCTCCTTGCCCCACCTCTCTCTTTCCCTGGGACTGGGGATCCCCCACCCCTACTCCTTGCCTGCCTG----------TTTCCCTCCTGGAACCTC--CCTGCAACCCCCTCCTCCTAGTGGCCACTTGGATGCCAAAGCTGCAGATGGAAACACCGCCCTGCACTGCGCGGCGCTCCACGGCCAGCTAGACTGTCTCAAACTGCTGCTAAGAGGAAGGGCTCCCGTGGGGGCAGGTGCGTCGCTACACCTCC s monDom4.chr4 347547029 453 + 430141050 CCTATCCAGGGCTGCTTTGGGTTAGGGGGGG-------GGGCAGTTGTGGCAAGAGGG-CTCACCAGTTTGAATGGTGTCTTTAGACATCCGGAGAGCTCGCTCTGCACCTGGCCATCCGCCTTGCTGACCAGGCCTCCCTGCCCCTGGTGGATTTCATCATCCAGAATGGGTGAGAAGCGATccctccccg--tctccctagcccccttcccatttctgactctcctttccccatcctctgcgcagtagcttctcttcctcctctcttcccttccttggcatctgccctttcccctctctgacctcagccacccaccttctccccACAGAGGCCACGTGGATGCCAAGGCCCCAGACGGGAACACGGCTCTGCACCTCGGGGCCCTGCACAACCAGCCAGACTGCCTCAAGCTGCTGCTCAAAGGGAGAGCCTCTGTGGGCACAGGTGAGGC-TTCGACCTCC a score=7879 s mm8.chr4 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ATGATCTGTGAC---CCTCCCACAGTGAACGACGATGGTGATACCGCCTTGGAAGTGGCCCGGAAGAATAAGCACAAAGAGTGTGAAGACCTGGTGAGTGAGAGGCCAGGACTGGGCTGGGCTGGGCCAGGACCCTTCTTGGCACT-----CTCTCTGACCAACCACCCCTCTCCCCTCTGGCTCGGTGACAGCTGGAACAGGCCCAGGCTGGGAGCCTCCTCCTCCCATTCCACATAGACTATCCCTGGGGGGTTTCCGTGGACCCCGGATCCGAGAGCGAGGAGGAGGAAGAT---GACAAGGTGAGCCCCTGCTTCCCTCCTTGCCCCTTTCCCTCCCCTCCCCCCATCAGGGACCCTCTGGGCCATTGGACTGCTGAG--------------GATTGCAAAGGGGGAAGAGGTCCATCTCCCTCTGCCTTCTGCCTTCTGCCTTCCAGTT--GGTCCATTAGACTAGACGGTGACGTCGTCCGCCATCATTAAG a score=8127 s mm8.chr4 135526533 123 + 155029701 CTCACAGACCACCAGGATCGGAGTGGCAGTCAACGGAGTCCGCAAGCACTGCTCAGACAAGGAAGTGGTGTCCTTGGCCAAAGTCCTCATTAAAAACTGGAAGCGGCTGCTGGGTGAGAGGGG s monDom4.chr4 347580120 123 + 430141050 CTTCCAGACCACCAGGATTGGGATTGCCGTCAATGGGGTCCGTAAGCACTGCCTGGATAAGGAGGTGGTGGCGTTGGCCAAAATCCTCATCAAGAACTGGAAACGGCTCCTGGGTGAGGGAAG a score=4942 s mm8.chr4 135527214 182 + 155029701 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CACTTCACAATTATACCCATTAATAGTGTGGTATTTCTGAACAACAATGTTATCAACTGTGTCATGATCATCACAAGTTACAAAAACAAATCCTCTCTTTTTCCCACTCTGTCTGTCTTCCATAACCTCTATGGCTTCAATCTTGCCATACTTTTCAAAGTCGTCTCTCAGGTTATATTCTTCCGTATCCTCTTTAATACCACCAACAAAAATTTTCTTCACCGTTAAAATGGGCGCCAGGCTTTACAGAATCCTCCCTAGAAACAGCTCTCGTTGGTTCCACCACACGTCCATCATCCTTGTGTGGCCGAGCACACAGTGCAGCATCCACCTCTTCAACACGAGAGTAGGTCGCAACACCAAAGCCTCTGGAACGTTTTGTGTGGGGATCTCTCATTACCACACAGTCTGTAAGTGTGCCCCATTTCTCAAAATGTTCTCTCAAGCTGTCATCTGTGGATTCAAAGCTCAGACCACCAATAAACAGCTTCCGCAGCTGCTCTGGTTCCTTTGGATCACGGCCCTCCATTTTGAGACCAGACTCGCCTCTTCCAACTCGAGTTCAATATGGAACCGAGAGGAAGTGGCTTTCCTTATATCTCAATCTTATGGAGGCTTTTC--------TTTCTTTCCTGTTTTTGT s monDom4.chr1 156263540 639 + 748055161 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GGGACGCAATAAGAGGGGAAATGGAAACAGGGAGGATTAGA-------ATTGCCAGTTCATGCATCAGGGAAGAGCAAGAACCCAGAGAAAATGCTATTGGCTCCATCCAGTCCCACTATGGAATTTTTATCATTGGCCTCCAGCCAGACTGAATCTCCCGCCACCAGCTTGAGGACCACCCCGCCTGTGGTGACCTGGAAGGTGTTGTAGACATAGTCACAGAAGGTGACCACTTTCTCCTTAGCTCCCCCTCGGCTTGTCTTGAAGAGTGTGACACATAGATTGCCCCGGGAGCTGGCATGGTAGGTGAAGTAATAGAGTCCTGGAACCCGGCAACTAAATTTCCCACTACGGGGCTCGTAGTCGCTGCCTTCCCTGGTGATCACACGGTCAAAGCGGATGGGTTGGTCCCTTCGTAGCTGAGAATTGATGGTCCGGGAAGCAGAGAAGGCCGATTTAGCCATGTTACCATAGTCTCCAGATTCACCGGGAGGTCCAGGGGGACCCATCGGCCCCGGGAGGCCTTTGGGGCCAGGGGGACCCTTGGGACCAACTTTCCCTGGGTTTCCAGGATTTCCAGAGTCTCCCTTTTCCCCAATTTCTCCTGAATCTCCCAAATCTCCAGGTTGTCCTGA-----------CAACAGAAAAAAAGAAACT a score=26873 s mm8.chr4 136162033 672 + 155029701 CTTCCTGGAGGAAGAGGTCTGAGTGAGGATGGGGAAAGCAGAGG-----------------------GAGCGAGGTGGGTGGCTGGGGGCTGGAAGCAGCCTGCCG----TTCTAGTCGGGAAACAGTAGGAAACCAGAGAAGACGCTGTTGGAGCCCTCTATGCCCACCATGCCATTGTAGTCATTGACTGATAGCCACACCTCATCGCCCCTCTGGAGCCGCAGGAGGACTCCTCCGGAGCTGACCTGCTTGCTGTTGAACATGTGGTCGCAGAAGCTGGCCACCCTGGCAAGGTTGAGGTTCAGGTGCACGCACAGGTTGGCCGTATGCGATGTGTAGTAGACGAAGTAGTAGAGGCCCGGCACTTCACAGGTGAACTTCCCTGTGCTTGGGTTGTAATGCCCCTGAGGGTTGGTGACCACAGAGTTGAACCTGACGAGGGCGTTGGCCTCTGGGTACTGGGTGGTCTGCCGGGTGACTGTGAATACCGACTGGTGCTTCTGTTTGTATCGGCCCTCCACACCTGGCTCCCCCGGAGGCCCCCTGGGGCCTGGGTCCCCTGGCAACCCTGAGGTCCCCCTGGGGCCATTTTTCCCACGGTGGCCAGGCATGCCAGGCTCGCCCTTCTGACCCTTGGGTCCTCGGGTCCCAGGGACGGCTGGGATTCCTGGAGAGAGAGCAGA-----CAGGAAGGACATGA s monDom4.chr4 348525954 695 + 430141050 ctacttggagga--------gaAAGAGAATGAGGCAAGCAAAGGTGGAAGACTTATTCTTGGGAACTGATGGGGGGAGGTGGCTAAAG-CTGGACCAGTTCTCCTGAGGTCCCTAGTCTGGGAAGAGCAGGAAGCCAGAGAAGACATTGTCAGAGCCCTCGACACCCACCATGCCATTATAATCGTTGACCTCCAGCCACACCTCCTGGCCAGATGTCACGTGGAGCAGGACCCCACCGGAGGTGACCTGCTTTCTGTTGGATGTATGGTCACAGAAGGTGGTCATTTTAGTGCCACTCTGGTACAAGGCCAGGCACAAGTTGGATGTTTGGGATGCGTGGAAGACAAAGTAATAGAGGCCTGGCACCTTGCAGGTGAATTTGCCTGTGGCCAAGTTATAGTCCCCTTGAGGGTTGGTGATGGCTGTGTTGAACTTGACCAAACTATTGGATTCTGGGTGCTCCTGGGTCTTCCGTGTCACTGAGAATACCGACTGGTATTTCAGTTTATATTGGCCAGGGGTTCCTGGCTGTCCTGGCGGACCTTGGAAGCCTGGATCTCCAGGGGGTCCAGCTGGCCCCATGGGACCGTTCTTCCCAGGGTGACCTGGGAGTCCTGGGTCTCCTTTCTGGCCCTTGGGCCCACGTGTCCCAGGAATGGCCGGTATCCCTGTGGAAAGGAGAAACGTTTCAGAGAGGACATTA a score=6095 s mm8.chr4 136164275 414 + 155029701 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GATCCCCAGCTCAGGCCGAGGGGAAAATGAGGAATCCGCTGAAGATGCTGTCGGCTTCAGTGCCCTGGTAAAT---GCGACCCTTTGCGGGGTCCTTTTCGATCCACACCTCGTCCCCTCGTCGCAGCTGAAGCACGGTGCCCCCTGCTAACACCTGAAAGAGCCCCTTGTTGTTGGTGTTAGAGAAACTCAGGGAATCCCTGGGCTGGCCCCCGGAGGAAGACTTGATAAACAGACAAAGGTCCCACTTGGAGATCACTTGGAAGTTGAAGTAATAGAAGCCGGGCACTGCACAGATGAAGCGACCCGTGTGGTTCTGGTATGGACTCTCCTGGTTGGTGAGGACCTTGTCAAAGATAACCACGTTGCCAAGCGTCATTGGGTTCTGCCGAATGGCTGAGAAAGCTGGCCGGGGCTGGTCCCTGATATTGCCTGGATTGCCTTTCACGCCCTTCAGTCCTTGGGGGCCGCTGTCCCCCAGGGGACCACTGGGACCTGGGAGCCCCACATTGCCAGGTTTGCCAGGGGGGCCAGATTCCCCTGGGTCTCCTTTAAAACCTCGGATACCAGTCCGGATGCCAGCAGCTCCTGTGTGCAAAGAGAGCGAGCAGATTG-GTAGATGTGGAGTGGGGTGGGG s monDom4.chr4 348541804 635 + 430141050 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gaacttaaactt--catcacatagtg-----ctgtgtggccttgagcaggtagctgcacctctctgagcctcagtttccacatctgtgaa--------gtgaaaaggacaaGCTTTTCTATCGGCAGGCTCTGCATGAGGGCAGGTGGTAAGATCCCAGCAGACTGCACAGAGGTTCCAACAGGAGCTGACAGATAGCCTGTGCCCACATGGTGATCTCCAGCAGAAGGGCTGG------------------------------CTGCTCTCTCCATGGGCCTTTTGCAGCTCAGTGGGTATGGACACAGATAGGTTTT---CAAGACGCCTCCAGCCTTAGGGAGGTCCCCACCGGCTCACATTTTGGCTGGTCCCCTTATTCTGAGGTGCTGGTCTGAGGCTGTGGTGACT-CTCCGGCTCCCCAGCCAAATCCCAGAGCTGGGTGTGGGCAGGGCAAGCTCCTCCTTAGCAATGAGGGGGGCATGACTTCCTGCTTCTGACAGAGACCTAACCGAGGGTGCTACCACAGAGTGAGCCCCTTT----GCATCTCAGCGG-TTGGGGTGAGCAGGTCACAGCATCAGTGAGAACTTAATACATTGAAAGGCCCGGCTCTCGCTCTAC-GGTAATTAGCCGCGGCGGCCGTGCTCCC-CCTAATTGTCTCTCTCACTCCAGACGGGA-GGAGATCAATAGGAAGAGGCTGCTGTGCGCTG---AAAGTCACAATTAATTAATTGTCAGGCGTGTGTGTGTCTCCATCTCTGTCACATCAAAGGGCCTGG s monDom4.chr4 348584436 707 + 430141050 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TGAATGGAGAGTCTACTTGGGTTCTGGAAGGGGCCCATGAATTCAATCTAACTGATTTGGGGAA-----------GCAAATTCCCAATCTT----------CTTCCAGATGTTTTGAGGTGTAAGATCCCATTCTCTTTAGGTGGAGGGTAAGGGGAG a score=8270 s mm8.chr4 136237224 294 + 155029701 AACCCTTAAAAGCTTAGCTTAGGCCCCGCCCATTCCTCACCAGG---GGAAGGGGCCCGGGGGCTGGGCATGATGAAGTCGTCAGAGAAGGACGGTGCTAAAGATGTAAACGAACCCATGAAATCCCGGTTGACAGCCGTGACCGCTGTAGCTCCAGCCATTAAGCACGGAGCTTTAGCGGCCCTG-AAATACACCTGGGGCGCTTG--TAGCTGTGCCTGCTCGACACAC------------AGGCACACATAGCTGTGCATGAACACACACTTCCTCAGCTCATGGG-----GCTGAACAGCAGGGCAGGGGGAG s monDom4.chr4 348744024 312 + 430141050 AAACCCTAGAGCGGGGGCTCCAGCTCCACCCCGCCTCCTCCCAGTATGCAGAGGGCCTGTGGAGTAG--AGGATGAAGCTGTCTCTGACAGGGGAAACTAAAGATGTAAACGGGAGCATGAAATCCCGGGTGACAGCCGTGACCACTCTGGCTCTAACCATTAAATATGGAGTTTTAACTGCACAGAAAATACACCTGGGGCACTTGTATAAATCTTTCTTAACATcacacgcacatacgccaaggcacacacatgcgaacacacacacacaGTCCCTCA---CAGAGagacttgcagaatattagagctggaaggg a score=11000 s mm8.chr4 136239498 502 + 155029701 CAAGAGGAGAGACCCCCC-CCCTTCTCCTGGTGACCCTGCTTGCTG------------CCCAGAACCTTAGCCCAT--GGCTTGTTTCCCACCGGGACTCATTTAAGAGCACTGGCCAGCTTGCTAGGGGACTTCAAAGATGGTATTTGATGA-GTTTTAGCGGCTTCAGCAAAACTCTAATTTGAATTTCAGGCGGTGGTGTGTGA----TTTCCTCGGTGACAGCTCCGAGGGAT---GCGCAGGCTCGGCTGTCATCCAGGGGGCTTCTCCATTGCTGCCGTGCCTGCCTTCCCGAGGAGGAGAGGGA-----TCTGTGAGGAGCCGGGTTCCATTGAAGC--------TAGGGGAGGAGAGGGCTGAACAAGTGACTAGGAG---GAGACATAATAGCAGA-----GAG------------GGAGggagaaa--gagtgggaggaggagggggaggatggaaaggaggaggcagagga-----ggaggagggggaggagCTGGT----AGTGATAACTAGGAAAGAGAATAGGGGTGAGATTGGAGGATGTGGGGGTAGCAACAG s monDom4.chr4 348746411 561 + 430141050 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gtaagagctgaatatctgtttGCTTCGATGAATAAGTACCCGTTAATGGGCCACATTTCCCAAATCTCATACTCCCCTACATACTACACTGGTTTT--TATTCAACTTATTTCTTTGTGTCAAGAAAGGCAGCTCTGAAGCTAACTCTTTCTAATGGGAATGTT----TGATTCTGCCTGGATC-------------CTGCATGGGGTGCAAAGGTGGGGAGGTCTCTCTTCTTCTATGCACCAGAGCCTCCCTGCTCAGCTTCACCACTTTCAATCCATTTTTCTCCAGACCCCCTAATGATAGACCTGAGTAATCTCCCCTGGAGAGGCGCAGTGGGTTTCTGCAGTGACCTTGTCCTGGTATGTTCAATCCAATGTTCCCAGACGTCACCAGGGAGCACCTGGTGTGAAAAGAGTCAGCAGGAAGGGCTTGTTATGAGGCCAAGCAAACAGTATTTGATGGGGGTGGTAGGGGGAGTTCTCTGAGCCTCCTGCTAATCTCTTTACAGGGGATAAAAAGGACAAG a score=1325 s mm8.chr4 136253367 82 + 155029701 TGGTGACACTACAGTTCCTAAGTCCTCCACAGCTTGTGAG----GTGCTGTTCCTGAC--AGAAGCCTGGACGATGGACTGAGGAACC s monDom4.chr4 348758768 84 + 430141050 TGTTGACATTCCAGTTCCTTACTGGTC-ATATCTTATGGGTCAAGTACT-TTCCAAACCCAAAAGCTCAGATA--GGTGTGGGGAACC a score=6832 s mm8.chr4 136253484 869 + 155029701 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GACTGCCAAG---AATCCAAGGGGAAGCCACGGTGGGTCTTTTTGCATTAATGCTAAAGCTAAGTCTTAAAGCTTTGAGCACCATCTTCTGGTCATTATC-AGCTTTTAAGGCTGCCCT-CTTTGAAGGCTTCATTTACTTCAGGTTTACTACCTAAATAAGCAAGACATACATATTGATGTGGGGTCATTCAATTCCCCTACATGATACTCTTGG-GAGTCTGATCCTCAGAA-----CAAGCACAGGCCTAAAGCAGCTGAGGCATTACCCTCCATGGAAGGACCAAGCCGAGGCTCGTCCCTCCAGAGCCTCGACGGGTGCGAAATCCCAACCTTCTACATTC---ATAGCTCTGAACT----AAGAAGCAGCAGCAAAAAGAGCTTCAAGTCTAAACAAAGCAGACTC-CAATTTCTGCACAGAGATGTGCACAAAGCATCTGGAACAAAAGAATGGCTCTATCTTCTGCTAGAGTTGGTTCCAGGAAGAGTGATGAAGT-GGACATCGCTCTCCAGAGGGGGTTG---AGACCTGGGCTATGGCAGGGATCACAGCTCAGCGTGTAAACACTACATGGGCAGAGTCCAACCTTTTGGCA-CAAGGAGGGGAAGATAAATGCTAGGCGCTCCCTCCAAACTGCAGGAACCTACATCCATCTAATTGCACACCATAATGGAATCAACAAACCATTAATTATCAGATTATATTTTAGGAAACGGCAGATAAAAGGCTTTGGGAAATGGAGTCGTAGAGGGGCCGTGGCCCGGTGGCAACAAGAGAGGCATACAA--AATGGGCTCCTA--CAGCAGTCAGAGCCCCAAGGCTTTTGAGAACCCTTCACAAAGCGGCCAGGAGCTGTGGGCCTGTGGGCAGCCACGGATGCCACTCATGCTACACTTGGGCAGAAATGACTGCACTC a score=21591 s mm8.chr4 136254946 651 + 155029701 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+ 430141050 AAAGGGAGAAAAGGAGAGGGAAAGTCTCAAAGGCAGGGAGGAAGGAAGAGGAATGGACAGACAGGGTTCTA-AGCTT------GAGATTAAGGCACAACTTTCAAGAGCAGTACTGACCTGAATGCCGGCATTTGGCATGAACTTGAAGCAAAGCCAGGGTGGGAAAGAGCTCCTGACATGTCTCACACTCATGGAACTTAATGTCTGTGAAGGAGATGAGAAAATAAGA a score=10865 s mm8.chr4 136259203 259 + 155029701 AAGAGCAGAGGCAATTGCCACG------GTGCCTGGATCGAGGA---------CAGTGAGTCCCT----CCACCCTCAGCTGCATCCCAGCGTCTGTCACCTGTGTGTTCTGTTTTGATGTGCTTCTTGTGTTCGACAGTATTGGAAAAGGTCTTGTCACAGGAGCTACACTGCAGTGATGAGAACTTGGGTGACCGATGGTTCTGAGCAGCAAACACATCTGGGTGGTGCGTCCGATTGTGGTACCACAATCCAGACAATTGCTGTAA-----------GACATTTGG s monDom4.chr4 348767638 285 + 430141050 AGGTGAGGATGCTATTGCTTCAAGAGGAGTGACTGGACAGATGCAGCTTTTCCCAGTCAGTCCCCTGGACTGGCCTCACCAGAAGCCCATCCTT----ACCTGCATGTTCTGTCTTCACATGCTTCTTGTGAGCAGCCGTGCTGGCAAAGGTTTTGTCGCAGGAACCGCATGGCAGAGAAGTGAACTTGGAAGAGCGGTGGTTCTGAGCAGCGAACACATCAGGGTGGTGGGTCCGGTTGTGGTACCACAAACCAGACAATTGCTGGGAATAAGTGAAGGGACATTTGG a score=14476 s mm8.chr4 136260618 286 + 155029701 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s monDom4.chr4 348776087 1037 + 430141050 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CTCCTATTCTAGAATTGCCAGCACAACACAGAAGGACCTCAGTGTGACAAGTGTAAGCCTGGCTTCTTTGGAGATGCCACAAAGGCCACAGCCACTGCCTGCCGGCCCTGTCCCTGCCCATACATCGACGCTTCCCGAAGGTCAGAGCTCTCTCAGGATATAGGCGTATGGCTCATGGGGACATTCTATGTCA------GGAAAACTG--GATACCCACATGGATTCCAGTCCT-AACCTGCTCACAGTCCTGTCCGTGCTCTTTGATATTTTGTGAACCTCATTTTTCCATTCTGTATAATGGATCCATATCCCTTTCTACAGTTGCTATGAGGTCACAGGGGCCAGAGAGGGCATCACGCCACTCTGTGTGTCTTCCTGGGGTTGAGCATGTCAATCCCAGCCCCGAGTTCTACCTTTCTACCCTGACCACT-TGGTCCCCACAGGTTCTCAGACACTTGCTTCCTGGACACGGACGGCCAAGCCACTTGCGACGCTTGTGCCCCAGGTTACACAGGCCGCCGCTGTGAGAGGTAAAGGGGAGTTGACAGGAGCTATGGGTAGGAGAGAGCATGCC--------CTGG-----------CTGGGGTGTGACCGTGTCGTCTC-CCACAGCTGTGCCCCTGGATATGAAGGCAACCCCATCCAGCCTGGCGGGAAGTGCAGGCC---CACCAGTGAGTATTGTGA------------CCACGTCCTGA------CAGAAACTGCTGGGCTG-------GGCTCTTCCCCGT--------CCCGTCCCCCCAACCCCCCACCCCAA------------CTTCCCAGCCCACACCCGGAG--ATCCCTGGCGAGCTGCCCATTCCCACCCACCCTGCCAATGCTTTCCTCCTG-CCTCCAGCCCAGGAAATTGTGCGCTGTGATGAGCGAGGGAGCCTGGGCACCTCAGGGGAGACTTGCCGCTGTAAGGTACGT s monDom4.chr4 349651018 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GGCTGGTGTCTGACCCCCTTGTGCCCTGCAGCGATGTCAGCACAACACAGCCGGTGAGTTCTGTGAGCTGTGTGCAACTGGTTACTATGGAGATGCCACGGCTGGGACGCCTGAGGATTGCCAGCCCTGTGCCTGCCCGCTGACCAACCCAGAGAACATGTGAGTA-CTTTGCTCAGATCCAAGGA---------------------------------------------------------------------------------------------TGGGCTCCTGCTGGAGGACAGGAGGC---AAGCTGGGAAGGGGGC-TCCTG--------------------GGGCCTGACACCTGCCTGCCTGCCTGCCC---------CAGGTTCTCCCGCACCTGTGAGAGCCTTGGAGCTGGAGGGTACCGCTGCACCGCCTGTGAACCTGGCTACACTGGGCAGTACTGTGAGCAGTAAGT----ATGGAGTGGGAAGAGATGGG s monDom4.chr4 349672392 505 + 430141050 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s monDom4.chr4 349678460 1113 + 430141050 CTTGATGGAGAGAATGAGGCCTGGTACTG----ACCAGGCTTCCCTTCTTCTGACTCTAGGGGGACCAGGGGGGCAGATACCCCGGAAGGCCTGGATTCATGGTGGCATCCTACGCCTTCCAGCCACAGAGCCCTCTGACCAAGCCCAGTACATATGCCGCGCTTCCAATAGTGCTGGGCAACACGTAGCCAGAGCTGTTCTCCACGTGCATGGTAAGAGCTGGGATGAGAAGGCTAGGGAATATGAGCAGGGACCTACCTTGGTGTTATAAGCAAGGGAAGAGTTAGGGACAATGATGGGGCTGGGAGAGATGAACCCCAGAGGAGGAGAAGTATGAAGCTATGGAAAAAGGAATAAGCTTGGGTCCAGGGAAAAGGGTACCCCAGGTGGAACTCACTCTGCCTCTTCCGGTCAGGGGGTTGGATGCCCGATGTCCACCCACGTCCTGAGCAGACCCAAGTGCAGGAGGGCCACATCGTGAGGCTGAATTGTCAGGTAACTGGGA-ACCCACCACACAGGATCATCTGGACTAAGGAAGGAGGAAGTTTGCCCCCCAAGGTGAGTACTTCAGAAACCCCtttttttaaacccttaccttctgtcttagaattgataccaagttttggttccaaggcagaagagtggtaacagttaggcaatgatgattaagtgacttgcctagggtcacacaactaagaagtgtccaaggtcagatttgagccca--aaacctccca-------tctctacacctgcctctccatccactaagccacctggttgccccttttttaattttttaaaaataaaaccccttcccttccattttagtatcaattctttgtattggtcccaagacagaagggcggtaagggccagg-caatggggctcCTCTCTGCCTACCCCCCAGGTACACTCTGAAGATACATCCTCTCTCCTGCCCCATACTGTCTTGTTCTGTGTTCCTGACACGTTTCTTGGACTTCGCAGGCACGTGTAGAGCACA---------CCATGCTGTTCATCCCAGATGCCACAGCAGCTGATGCTGGCATCTATGTATGCAGTTCTAACACCCTCACTGGCAGTGCCCAGGCCCGCATGGAAGTGGTGATTGTTCCAGGTATGGtg 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s monDom4.chr4 350002993 1197 + 430141050 GGGGGGGGCCCTGGCTGAGGGTGGTGAGCCAGCTGTCCTGGGCCTACATATGG------CGGCCTTAGAATAAGAGGCTGAGCAGGAGGAGAAGAGTGAGAAGG------------CCTGAAAACAGTGCTGGTTGTGGGGCCAGCCCAGCCGATGGATGTGATTGGCAGTGGTCCATAATGGACCCGATGCAGGATGCGTAGGCCATGACGTGTGGAATGTAATTTTGTTCCTGGACGCCATGCAGGAGATGAGCCATGGGGCCCTTGGCAAACACAGCCACATCTTCACCCCCATGTGTTTCATAGCTCAGGGGCACTGCTGACTGGGCCTGGTAGTTGTCATGAGCTGTGAG---GAGACA-------------------------AGATTGGAGGGTGAGG--------TCTTAACCATCAAGAAAGGTc--------------caagagtggggagatcctgggttca--aatctgaacacttcctaggtatgtgaccctggacaagtcactt--aacccccattgcctagtcc---tgaccactct-tctgccttagaaccaacacataatactaattctaagatggaaggtaagggttaccaaaaaaaaaaaGTCCAAGAGGCAAAAATCTGGAATTTCCCCAATCCATGGGG---AGCAGGGATAGGGCTCC-----------TTCCTTTCATACCAAAATCTGGGAAGAAA--TCTGTGCTCATAGAGTATAG--AGAAACCCA----------CTACCTCTATTCTAACCCCCTCC----CTCCCTTAAACCA-TCTCCCTACACAGAGACCTTCTCATCCACCAGTCTTTA-----AGGGCCTTACCATAGTCCACAGTGGAAACATTCTCCCTCTGGCCAGCCACCACCTTGTAGCCAGGTCCATTTCCATACAGGATAGAGGTGTAGGGTTTGTTGTCGGTGTCACTCACCACGGGGGCAAGCCCTGCAGAGGGGA-GGATTTAGGGTTACCA--GAGACCAGAATTCCTGGCCCAGCTCCTGTGGCCCCAAGTCCTCCCAATGGTCCCCTTCACTTTGCTCCAGATCATGGCATCAG-------CCCATTCTGATGCCACCC--ATGTTAGTTCTAAATTTTCTTCCTTCCATTTTCCATGTCTCTATCTCCCTTCACTTCGCCAGCCTCTCCCCAACTCATCCCAAACAAGGCGAGCCTTTTTCACTCTATCTTGTCCAGT----CAAGTGATCCTCCTTCTTGGCTATTCCCTTCtc-------taaatgtactgtc-----tccccactagactgtaagctt--cttgaaggcaggggcagtct 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monDom4.chr4 350011980 218 + 430141050 GAGCAAGCCAGGAACAATTTGAAATATAATCCTATAAGGACCATTCAGCCACATCAAAGCTGACCCCACCACAGCTGCTTACCACTGTCTTCAGCAGCTTCAACCACAGTCATTTTCAGACCCTGTCTCTTGCCCTTCCCCTATCTTCTTGGCTCTCATCATGCCCACCCAGATGCCTGGGGAGCATCAGATTTAAAGGGCCAGCTGGTTTCCCAGGG a score=7142 s mm8.chr4 137021603 202 + 155029701 TCCACCTGCA-GCCTTGGTTACCTTGTGTCTGGGTTTAAAGCTCTTCCAAATACTGATGAGATCCAGGCCATCTAGCCTTGTACCCCTGGCCTTCTCATCCAGTTCGTATTCCACATCAGTTCTGTTCTTCGGGTACATGTATTTCCGGCCGCCACCCATGATCACCTGAGGGACAAAGGAGCCATCACACCCAGGGTTCTAA s monDom4.chr4 350013033 200 + 430141050 TCCACCCCCTTGGCTTTGGTACCTTGTTCCTAGGCTTCTTTCCCTTCCAGACATCAATAAGGACTTGTCCGTCCAGCCTTGTTCCTCTTGCCTTCGGGTCATCCCCATACTCCACGTCAGTTGTATTCTTAGGAAACATATATTTCCGACCTCCACCCATGATTACCTAA---ACAGAGAAGAGAGAgcacacagtagcttaa a score=5460 s mm8.chr4 137022264 329 + 155029701 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monDom4.chr4 350024650 270 + 430141050 tttagtggctcggtgtttttccaagctgacaATGGGAAGGCCTGCAGATACAGGGATCAGGCTCACCTTGGACAGAGCCACGAAAGGAAACTTGTCCATCTCAAGCTGGAAATCCTCTCCAAGCTTGTGGTGAAGCTGGCCTTTGAGGATCCGGGCAGCGGTCACGGTGGACACCCCCATTCCTGCAGGGGGTGAGCAG----CATATTCTGAGGCCTCCTCCCAAGGCCTCT--GGCGCCAGGAGCCTCCCTCCCCA----CAAGCCCCAAACTGGGGC a score=7525 s mm8.chr4 137027655 183 + 155029701 CCCTCCATTCCAAGCCACACTGCCCTCAGCCCCTCCATTCCCAGCCTCACCATCTCCCAGGAACATGATGACATTCTTGGCTACATTGGTGTTGAGCTTTTGGAGTTTCAGGGCATTTTTCAAGGTCTCTTGGGCTTGCTGTCGCCAGTAACTGGGGTCTCTCTCTTTCTCTGCA-GAGACAGG s monDom4.chr4 350025389 180 + 430141050 CCCTCCAGCCCATGCCTC--TGGCCCCATTCCCCACAGAAGAA--CTCACCATCCCCTAGAAATAGGATCACATTCCTGGCAACATTGGTGTTGAGGTTCTGGAGCTTCAGGGAATGTTGGAGGGTCCGCTGGGCCTGTTCCCTCCAGTACCAAGGATTCTTCTCCTTCTCTGCATGAGAAAGG a score=8057 s mm8.chr4 137177513 498 + 155029701 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TGACTCAGGATGATGGTCTTTTTCTTGTGCCCTCAGCATCTGCCGACAGAATTCCCCAGCCTGGAGGCCTTGGTGGAGCACCATTCAGGAGCTGAGCGTAGCCTTTTCTGCCCCCTGGACATGGGACGTCTGAACCCCTGCTATGAAGCACAGGACTATGGG--------------CCCAGCCGGCCTCCATGGCCCCGTGGCCACCCCAAGCAAGAGCCCCGGCAGCAAGAACTGGGCTA a score=18952 s mm8.chr4 137534303 623 + 155029701 ACCCGGCCAGCTCCGGGGCTCGGGTCGTGCGGCGGCGCCTGCAGCGCGGATCCCCCGTTccccgcccgggcccg--gcctcaggga-cgggcgagcccgggcgcgggaggcggcggcccgggTTCCAGCCCGCACACTTGTCCGCCGAGCCCCTGCCACACCCAGTgcgccccgcggggagtcccggccccctggtgcggccccgcccccgcc--gccaggccccgcc------------ccgcgcgggcTCTGGCTCCACCCCCTGGACCGGGCCACG----CCCCCG----GGCAGC--CATGGCCTCGGAGTCAGTGAAAGTGGTCGTGCGCTGCCGACCCATGAACAAGCGCGAGCGCGAGCTGAGCTGCCAGTCGGTGGTGACGGTGGACAGTGCGCGCGGCCAATGCTTCATTCAGAACCCGGGAGCGGCGGACGAACCCCCAAAGCAGTTCACCTTCGATGGCGCCTACTACATAGAACACTTCACCGAGCAGATCTACAACGAGATCGCCTACCCGCTGGTGGAGGTGAGGGCGTCCCGAGACTGAAGGGCCAGGCTCGGGGCTCCCGGAAAGTGGAGACAGGATAGGTGGGTTAACCCAGCCCCTACCCCAAAAGCCAAGCGAGAAGGCTCCGGGCACAGG s monDom4.chr4 350910784 594 + 430141050 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CCCATCACCCACCCAGGCTCAGACTTTCTCT----CTCCTTACCTCATTGTAGATCCGACTGGAAGCAAAGACTGCCTTAAATGTGGATCCAAAACCAATGATGTTGAAGAAGCACGCTGGCATGAGGCTCTTGAGGGCCACCAGCATGGCCTCCTGCCAGGCAAGAGAGGGATGGATTCTCAGGACTC s monDom4.chr4 351483209 186 + 430141050 CTTATTACTCAATCTGGCAGGGGTCAGCCCTATGGCCTCTTACCTCACTGTAGACCTGACTGGAAGGAAATAAGGTCTTAAAGGTGGAACCAAATCCAATGATATTGAACAGACATGTTGGCATGAGACTCTTGAGAATGAGTATCATGGCATCCTG---GGTAGAGAAAAGAAGAACTATTAGAGCTC a score=4922 s mm8.chr4 137868540 821 + 155029701 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TCCATGTAGTAAGAACAGGAATCCAGGCCCTATGCTTTGGGCACTCAATGCAAAGGGGTTTCTTTGCCCTTTGGTAACATGTAC--TCTACTGATTTTCTTTTACTA------------CAGATG-TGGTGATGGCAACCCCAGAGAGGG-ACAGCCAAGA-GGCCAGGGAGATCCCTGAGCCAGCCAGAGAAGCAAAGCCAACTCCACCCACAGGAAAGGAGCTAGAAGAAGCAAGCCGCTTTGCCTATACTGCTCTTTGTGGGATGTCCCTGGCTTGGTTATTTCCAGAGCCAGAACAAAGGT-AACTGTTTTGACTTGGACTGATAGAATCCTAG a score=9573 s mm8.chr4 138268455 212 + 155029701 AACTATATCTCTTTCTAGCTCCTTCTGCACAGAATTTGTGACGGGCCTGGTGAAATGGCTGCATCTGTCTGAAAGTGTCCTCCCAACCATAATGGCCTTTGCCAGTGGCCTGGGAGGCGAAGGAGCCGACATCTTTGCTCAGACTTTATTGCAGGACCCCATTCTGAGAGACAACCCATCAGCAGTCAGTCAGGTACGTcagcccctgtgtg s monDom4.chr4 352232489 212 + 430141050 AACAATTGTTTCTTTCAGCTCCTTCCGAATAGAATATGTGGAAGGCCTAGTGAAATGGCTGCAGTTACCAGAAAGTGTCCTCCCATCCATCGTAGCCTTTGCCAGTGGCCTGGGAGGAGAACAAGAAGAGGCATTTGCAGAAATCTTATTGAAGGATCCAGTCTTGAGAAATGATCCACTGGTGATTACTCAGGTATCCAGACCTCCTTGGG a score=2728 s mm8.chr4 138270081 61 + 155029701 GTCTCCTTTT-TCCCACAGGACCTCCTGAGCTTCTCACTCAAGAATGGTGAGT-GGATTTGCT s monDom4.chr4 352233309 63 + 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ACTGCCCTAGC-AAAGCTCCCCACCCCCACCCCACCCCATTCCTGCTTCATCTGTGGGATCCTATCTCCT-CAGGTATCGTGGCTGCTCTAACCTGGCCAGCCTCACTCCTCAGCGTCGCCAATGTCATCGACAACCCCTGGGGCGTGTGCCTCCACCGATCGGCAGAAGTTGGCAAGCACCTGGCGCACATCCTTCTCTCACGGCAACAGGTACCCAGGAAT---------GGTGGGGGTGGGGCT----------------GGGAAGGCAGACGGGGAAGC s monDom4.chr4 352266320 276 + 430141050 ACTTCCCAAGCTGACCCTTTCCCCCGGGACTGTTCCCTGGCCCTGATGCTTTC-------CCTGTTTCTTTCAGGTATCTTGACAGCATTGACTTGGCCAGCTTCCCTCCTCACTGTAGCCAACATCATCGACAACCCTTGGGGGGTCTGCCTTCACAGGTCTGCCGAGGTCGGCAAACACCTGGCCCACGTGCTGCTCAGCCGACAGCAGGTAACTAGAAACCGATCACGAAGCGAGGGTGGCTCTTGTCTCTTTGTAGATAGAGACGTTAGACGGGGAGGC a score=5786 s mm8.chr4 138299218 857 + 155029701 CCCTCTGACTCCTGCA-TCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTCCTGCATCCCTCTGACTCCTGCATCTGA--------CTCCTGCATCTGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTCCTGCATCCCTCTGACTCCTGCATCTGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTTCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCAT-CCCTCTGACTCCTG------CATCCCTCTGACTCCT-------GCATCTGACTCCTGC----ATCTGACTCCTGCATCCCTC--TGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGTATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTC--TGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATTCCTCTGACTGACTCCTGCATTCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTCCTGCATCCCTCTGA------CTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGAC----TCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCTCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTCTGACTGACTCCTGCATCCCTAtttatttgttttggattagacagtttctca----ctctatagccc s monDom4.chrUn 1008146 860 + 174229318 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ttACCTGAGCTATGCTGGCCACAAAGAAGGGCAGCCAGGTGACAAAGAACATGCTCAGCAGGATGCCGAGGGTCAGGCTGGCCTTCAAGGCCTTCCTGCTATGCTTGGTGGTCAGACGCCTACTGTCAGCAGACTCCATCCCTG---GGCGTGGTGTCCTGGGCACCTGTGGAAAGGAAAGCCATATAAGTTGGCTGATCTT--------AGTCACAGACTGAACCTCAACCCTAACACTAGACTGAGTCCTAGCATACCAGCAATTAACTGAGCCCTGATCCTTGACTGGTCCC-CAGCTGAGGC--ACTAAGACCAAGTCCTAG s monDom4.chrUn 151346608 313 + 174229318 TTACCTGGACCACGTTGGCTACAAAGAAGGGTAGCCAAGCCACAAAGAACATGCCCAAAAGGATGCCCAGTGTCAAGCTGGCCTTCAGAGCCTTCTTGCTGTGCTTGGCAGCAAACCGTCTGTTCTCACTTGAGGTTGACGCTGCAAAATTTGGGGTCCTTGGCACCTGTAG------AGGACACATGCCTTTGAGGATCCTTAGGGGGGAGCCACAAGTTGACCCTTCACTTTGACCCCAGAGATGCTCC------ACTAGC-ACCATCCCAAAGCTGATTCCAGACTAACCCCTCATCTCATGCAGATTAACCCTTGGTCCCAG a score=33084 s mm8.chr4 138346084 1903 + 155029701 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s monDom4.chrUn 151351072 2198 + 174229318 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CCTTGGTGGGTGGGTGGGGCTCCATGTCTGCCTCCTCAGCTCAGGTTCACAAGGTCACGTTCTCCACCTTGTCCCACA---GGAGAAGTCCAGCGGCCGTACTGCCCATTACAAGTTGACCTCCACGGTGATGCTATGGCTGCAAACCAACAAATCCGGCTCGGGCACCATGAACCTGGGAGGCAGCCTAACCAGACAGGTAGAGCTTCTGCTCCAGCCTC s monDom4.chr4 352642615 203 + 430141050 CCTGGGTGGGCCACTTGTACTCTGTGCATGCTTTCTCTGAC------------------TTCTCCATCTCATCCCCCACCAGGAAAAATCCAGCGGTCGCACTGCCCATTACAAGCTGACCTCCACAGTGATGCTGTGGCTGCAGACCAATAAATCAGGCTCTGGTACCATGAACCTTGGAGGCAGCCTCACCAGACAGGTACAGCCTCGCATCCATTCTC a score=8219 s mm8.chr4 138553818 570 + 155029701 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AAGCGCCGCGAGGCCCCCACCCAGAGCAGGGAAAACAAGGCC--GCCCAGTCCAGGGAAG----CCGAGAGGCCGGAAG--------GCAAGGACCTGCAGGTAAGAAGTGGGGCCGTCCCGGATCCCTGGCCAGGTTGGGCAGAGACCCACGATCCCGCT------CCCCAGGAGGGGACCAGCGCCGGGGACCGTG------------------CAGAGCTGGAGGAGGGTGTAGAAAAGACTTAG-----CTGGGCGCGTCTGGAGTCCCGACCCCCCAG---------CCCGGGACAGCCGCCAGCCCCCTTCATCCTCACCAGTTCAAGATCCACAGCCGGTGTC-----------AGCTTCAG--GATCCGAGCCCGCCGGGATCAGCTGACCTCCGCGAAGTCCCGCCC--CCCGCCGTGGGCGGAGCCTGAAGCTTCGAGTGCGCAGGCGCAGTCTCCATGCTGCGTGCAGCGTCCAGAGCCGTGGGCCGCGCTGCTGTTCGCTCCGCGCAGCGCTCCGGGACTTCGGTCGGGCGTCCTCTCGCCATGTCCCGGCCTCCGCCACC-------CCGCGCCGCCTCTGGCGCCCCTCTCCGGCCCGCTACGGTGCTGGGCACCATGGAGATGGGGCGTCGCATGGATGCGAGTGCTAGCGCCGCTTCGGTCCGCGCCTTCCTGGAGCGCGGCCACAGCGAGCTGGACACGGCCTTCATGTACTGCGACGGCCAGTCCGAGAACATCCTGGGCGGCCTGGGGCTCGGGCTGGGCAGCGGCGACTGCACAGGTAA--CCGCTGCACCCGGCCTCCCCCG--CCCCCCGCACCGAGTAGAGCTGAGCCGGTGCCCGCAACCGGCGTGCACCAGCCAGGATC-TGCATCCAGGAGCTTCGGAAGCTCCGGATCCACAGCTGGGTCTACCCCAAGCTCCCAAGGCAACTGGAGTCCTGAACTAGTGAACTGAACTTTGTCCCGCCTCTCCTTAGAAACTTCTAGTTGCAGCTACCGAGGCGGGTGCGAGGAAGCTTCCTACGCTAATGTTTAGCCTACT-CTGGGCGCTTTGCTTCCTACCGCAATCCCTGCCTCCCGGCCAACCGTTGTCCATAGCC-----------GCCCCCCCACCCCCGACACGCCCCCCATCCCCACCAGGCTTTTTGTTCGTGCCTACCCCTCTTGCCCTCACCACCTCTGCGCTCCTGGAGAAT------GCTTATCATTCCGGTCTTT 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AAGCGCTTAGAG-CCTCCTCGGAAAGAAGAGAAAGTAAAGCCCTGGCCAGTTCAGGCAATGGCCCTGGGAAGCTGGAGGAGAGCGGAGGGGGGAGTTTCAAG---GGTTTAGGGACGCCCCG---CCTTGGAC--------CAGCCGCCCTCCCTACCCCCAACATACCGCAGCAGGCAGACGGTTCGGGCGACAGCAGGATCGGTTCCCGCAGCCCCGGGCGGCTCGGGGGTGTCCAGCAGGCTCGGGTCACCTGATCAGTTAAGACTGCTCCGCCCTCCGGGAGTTGCCTCCCCGCCGTGcctcctcctctcccctttttctcctcctccacctccttcgcctccGTCTCGGCAAGGCTACTTGCAGACGGTCCCTAGAATCCGCGACCGTTCGGCCTTCGC-----CCCGCCCTTCCCGCC----------CCTGAG---TGACGTGTATGGGCGGGGCCTGCGACCGACGCAAATCGCCCAGCAGC--------CGCTGTAGCGGAATCCCTGCAGCACGCAGGTA-----GTATCTCCCCCTCCCCGAACTTTCCGCGTGCAGTAGCCGTGATGTCCTCGAAGGCTC--GAGCTCTGGCCCTGCCGGCCTCCGTGCTGGGCACGATAGAGATGGGCTGGCGTATGGACCGCTCCGCCAGTGAGGCCGCCGTGCACGTCTTCCTGGAGCGCGGCCACCGCGAGCTGGACACGGCCTTCATCTACGGCGACGGCCAGTCCGAGAGCTTCCTGGGCAGCCTGGGCCTGGGCCTGGGCGAAGGAGGCAGTAGAGGTAAGGCAGCCGTTCCCTGCCCTGCCTGGACCCCTTGCACCGGCCTCTGCCCAGCCCTTG--------GGGTCCGCGCCACCTAGACCCGTACAACTTGAACCTC-----ACTCTTCACCCAAAGCCAGA------CCATGCT---GTGGGATCTGAGGCCCTGCAAC----------------CCCAGCCTCCCCC-----ACCCCATGCTGCAGT--------------CCGGGCAGTACCCCCCTTAAGCATTAACCCCAATCCTGAGTGCTGAG------GCTGAGATCCCATCCCCGTCGAAATCTGCAGCCCGTGACCCCCTGATCTTGGCTCTCTATCCCCCGCTACTCTATCCCTCCCAAAAACATTTTGGGTCT---CCTGGCCCTTTTGGGCCTACAGCTTTCACCTGGTGGGAGGGTCCAGAGGTCTTGCATCCCGATCTCT 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ttacctatgtgaccctgggcaagtcatttaacccgttacctagccctgtccattctttagc-----------cttggaaatgattctcagactgtaagggttaaaaaaaaaaaGTCAGCTGTTCAGATATAGGGCTCCACAGAGGACTAACTAGCTGTTGTTTGAATTGAACTCAATCTCTGCTACCTCTTACCTTCTTCTTTCTCCCCAGTGAAAATTGCCACCAAGGCCAATCCTATGGAGGGGAAGTCTCTCCGACCTGAGAGTGTCCGGTCCCAGCTAGAGACCTCACTGAAGCGGCTACAGTGCCCTCGCGTGGACCTCTTCTACCTGCATATGCCAGACCACAGCACCCCCATAGAGGAGACACTGCGGGCTTGCAATGATCTGCACAAGGAGGTGAGAA--------CAAAGGATAAAGAGGGGGCCCTCTAGAACCT-------AGGATGTCAGACCTGGGAAgagtcttagaacagagaat a score=-2232 s mm8.chr4 138586457 72 + 155029701 CGGTTCC------CAGGTTCCTCACCAGCGCAGTC-------------------------------TTCTCTTCCTGGTTCCGTGGGCTGAGCTAAGTTGTAAT----------------------------GAGTC s monDom4.chr4 352722608 135 + 430141050 AGTTGCTGAAGAGCCGGCACTATGCTAGAGCTGGCGATGAACGAAACAGCCCTGCTTACAAAGACGTTCTTTTCCAGTCTAAAAGGG--GAGACAAGTAGAGGTGAAAATAGAAAGGCAGCACCTTGGAGCAGAGAC a score=8967 s mm8.chr4 138586529 152 + 155029701 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AGCCTCCCCCTGTGTCCACTCCACACAGGTTCTGGAAGGAGCATCACTTTCAGGCCATTGCTCTTGTGGAGAAAGCCCTGGCGGCCTCGTACGGGGCCAGCCCTCCCAGCATGACGTCGGCAGCCCTGCGATGGATGTACCACCACTCGGGGCTGCAGGTAAT------------ggcccggcgccgcccc---ggggggccTGAGCTCTTCGGGGAGGG a score=10468 s mm8.chr4 138590145 184 + 155029701 ATCTGGCTGTCTCCCCTT------GCAGGGCACCCGAGGGGACGCAGTCATCTTGGGCATGTCCAGTCTGGAGCAGCTGGAGCAGAACTTGGCCGCCACTGAGGAAGGGCCCCTGGAGCCGGCTGTCGTGGAAGCCTTTGACCAAGCCTGGAACATGGTCGCCCACGAGTGTCCCAACTACTTCAGATAG s monDom4.chr4 352703778 190 + 430141050 AGCTGGCTTTCTCTTCCTCTCTCCACAGGGTGCCCGTGGAGATGCCGTGATCCTGGGCATGTCCAGCCTGGAGCAGCTGCAGCAGAACCTGGCAGCGTCTGAGGAGGGCCCCCTGGAGCCCGAGGTGGTGAGGGCCTTTGATCAGGCCTGGCACCTCATGGCCCACGAATGTCCCAACTACTTCCGCTAG a score=-1199 s mm8.chr4 138590332 312 + 155029701 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ccagcctcCT--ACCTTTCTTGAGGGCAGTGGGCAGCCCCAGCTGCCTCAGCTGTGGCTCCATGGAGTGAGGGAATTGCTTCAGGGGCCCTGGATCCAGGCTCACAGTTAGAGTTGCTTTGTTCCCCGCTCGAGCAAAATCCATTTCTGTATACTTGGTGAACCACCTAAGTCA-----GGGAAGGGTGAGGGTAAAGTTCCTGA s monDom4.chr4 352731220 205 + 430141050 CCAGCGTCCTTTACCTTTCTTGAGGGCTGTGGGCAGACCAAGCTGCCTTAGCTGAGGCTCCATAGAGTGGGGGAACTGCTCCAGGGGCCCTGCGTCCAGGCTGACAGTGAAAGTCGCTTTGTTACCAGCTCGGGCGTAATCCATTTCTGTATACTTACTGAACCACCTGGGATACAAAGAGTGGGGGTGGGGGAGAAATCACTGA a score=4688 s mm8.chr4 138620583 260 + 155029701 AACACCACCATGCAGCCGAAGTCCAGCCATAATGGCTGTGGACTGGCAGGCAGAGGGGAGGACCACAGCAGAGAGGATAACAGAAGCCTGATTACAGACGCAGTCTCAGTAAGAGGCTTGCATCCTTTCAGCTTTCCGTGAC-----GCCCAGCCTTTCCCTCGCTCAGA----------------GACACTCACTCATTCACCTCCTCCTTCGTGCGGTTGGTAAACAGCAGCCCAACTTCACCTCTCAACTTCTTGCTGACCTGAAAAGCACAAGTGAA s monDom4.chr4 352732292 253 + 430141050 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TCTGACAGAGACCGTGCTCTTCAGCAGGCGAGCTGCGGCCTTGAAGGGT--CAATCTGCTCCTGGGCTCTGATGAGAGCGGTTCTCGCCTCTTCCCACTGCACGCTCACCGGCTGTGTTTCCAGGCGTTCCGGATGTCTTTCAGCTTGCTGTTCCTCATGTTGGCCACAGAGAAGATGAAAAGGTACTTGTAGGTGTCCACACATTTCCGAAGCTGTGGGACAATTCATGAGGCTCTGGAGTTGAGGGAC s monDom4.chr4 352734834 243 + 430141050 TCTGCCGAATTCTAAGTTCTT--ACAAGC-AGATTCTGTTTTGAAGTATACCCTTGTATCCCCAGCCCTGGATATGAACAGCTCTC----CCTCAGACCCCCTCCTTACCGGCTGTGCTTCCAAGCGCTTCTGATATCCTTCAGTTTGCTGTTCCTCATGTTTGCCACGGAGAAGATGAAAAGGTATTTGTATGTATCCACACATTTTCGAAGCTGTGGGAAGATTCAAGGGGCCCAGGGGTTAGGCAAC a score=5437 s mm8.chr4 138622506 87 + 155029701 CTTACCTCTTCTATCAGGTTCTGCTTCAGTTCCAAGCCTTTCTTGGCAGTTTTTGTTAAAGAAACTAAAAACCAAGAAAAAGAGATG s monDom4.chr4 352735918 86 + 430141050 CTTACCTCTTCTATCAGGTTTTGTTTGAGTTCTAAGCCTTTCTTGGCAGTCTTCGTTAAGGAAACT-GGGACAAAGAAGAGTACATG a score=11674 s mm8.chr4 138624275 534 + 155029701 CTCTCGGAGAGGCCCCGGCG-TCTCACCCGCGTCCCCCTCGCCCC----CTTGACGCAGGCCCCCCGAACCTACCTTTCTTGTCTCGCTTGGATTTGGGCATCGCGGCAAAGGCACGTGCGGCGGAAGACTGGGCGGCCGGTTAGGACCCGGCTGCCGCGGGGGCTTATGGGACGGCGC----TCGGGGCTGCCCCTCGCGTGTGCCTGAACTGTGGCGAGCCCTCTCTTCCCCGCCTGCGCTCCGCCCAGTGTCCTGAAGGCCACTTCTCTGCCCAGGTCCCGGGTCCCTCCAGTCCCGGCGGCTTCCGAGTCCCGAGCACTCCACCAAGTCCCTCGCGAACCGGTTCCTCTCTATGGCTCTGCGGAGGGAGGGGCTTGAGGCCCGGTGCATGCCGGGCTGGCGGCAGGCGG-------TGCTTGGGCTTCAATCATGGCGGTCGCGGTGGCGTCTGGGTTCTGGATCTGGGCTGCTGTGCTGCTCGTCCCTGCGGCCGCGGTCTACGAAGACCAAGTGGGCAAGTTTGACTGGTGCGTACA---GGTGACG s monDom4.chr4 352737635 467 + 430141050 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CCCTCACCCCTACCTGTGCTCAGTTTCCAGGCACTTGGGCTAGTGGGCCTTCAGGAGTCAGTGAGGTACATTGCAGTTCTGAAGAAGACGACCCTCACCCTCCACCACCTCTCCAGTGGGCACCTGAAGTGGGTGGAGCATCTGCCAGAAAGGTAAGG--CTGTCTTTTCCCAAGTGATG----ACTACCTTGTCCCAATCCCTACAATGCTCTATC--------------------TCCTTGATGGTGCTTGGCCAGGTGCCCTCCTGTTGGC------------ACCATGTGGGA------------GGAGTATGCTTGCACACGTGGGTC------TGAGTGGAAAGGCCGTGGCTACA----TACTTGGA----GTGTACTTGGAAGGGTGGAGAAAATTCAAACTGTGACATGAGAGCTGCCACACAAGGGATCCTCTCCTGCTCA------TGCACACAGGGCTCTGGGCCTTCCAGCCGCTTTTA-----CAGTAGTCAGAGAGACAGCTACAGGGAGGGCGAGGGAGGCTCGGAGCGGTTTCCAGAGGTCTCAGGGGTTAGAAGCAGGAAAGCTAGGAAGGAACGGGGTGGGTAGAGGTCAGGCAGGCATAGG s monDom4.chr4 352752491 613 + 430141050 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CCACACCTATGTTCCTCAGCTTTACCAAACAGCAGCAGAGACAATTGAGAAATAACCATAAGCATGCCGGGTTGGGGAGGGA---CAGAGGGACACCTCCTTCCTTCCTCTTAGTCACCAGATCTAACTTTCAATGCAATTTTTCAGTTCTTAGTC---------ATAGCTCTGattatcattcctcatgttatagctgaggaaactatggccaagacgttggctaagGCCTGAGCTC a score=53048 s mm8.chr4 138846360 1339 + 155029701 GCTAGGCCTGCAGCGCCGCACGCAGGCGAGGGTTTTCTGGGCCGTTGCTGGGCGGAGCTTGAGCTGTAGTCGAAAGGCTCCTCGCAGACGAGTGGCGCAGCTTGTGGGT---GGGCGGAGCCCAAGG---GCCGATAGGCGTGGCCGGGGCTGGAGACC----TAGGAGCCGAGTCTCAGCGGGTGAAATCG----CTGCAATGG--GTTGAGGGGCGTGGCCTATGTCCGCAGAGGGCGGTCCAGGCTAGGGAGGAAGGCCTTCGCCTATAGAG--GGCGGGCCGGGA---AGGGCAGAGAGCAGCTAGGCAGGGGGTGTGGTCTGTG---TCTGCAG---------------AGGGCGGGCCCTGGA-------GGCGTGGTCTGTGCCTGCAGAGGGCGGGGCTCGCCGCAG-AGGGGGCAGCGCCGGCTGAGAGTCCTCTGCGAGCCGCTGCTGCGGCCGGTCCACAGCAGCTCTGACAGTCGCGGCGCAGGCACCGGACCCCTCACCAG--------------CCCCACGCAGCCACCGCGACCTCCAGCTCGTCCCACCATCTCTCCCGACGCAGCGGAGCCGCATCTGGCACCTAA-------------CACCACCCCGGCCG-CTCTGGAgcccgcgcccgccctggcccggccgcgccgggagcccggccccgAGCTGGAGCCGCAT------------CTGGAGCCACGGGCCCGGGGCCCTGAGCCACGCAGCCGGCGCATGGTTAACTCGCTGCTGTTCGGAGAGATGGCCTTGGCCTTCGGCTGCCCGCCGgggggcggcggctgcgcaggcggcggcgg---gggtggcgggg------ccggGCCGGGGCCCTCGCCCGTAACGGCGGCGCTGCGGGACGATCTGGGTTCCAACATCCACCTCCTCAAGGGGCTCAACGTGCGTTTCCGCTGCTTCTTGGCCAAGGTGCACGAGCTGGAGCGGCGCAACCGGCTCCTGGAGAAACAGCTGGAGCAGCAGCAGAGCGAGCGCGATCGGCGGCTGCGCTACAAGACCTTCTCCCGCGAGCAGGCCGTGCAGACCGGGCCCGAGCT-------------GCTGCGGCCGTCGGCTGCGGGAAGCGGGCA-GGCCCTCGGCGCGGCCACCGGCGTCAACGCCAACGCGGTG-GCCCTGGGCGGCCTGCCCCCCGGCG---GCGGCTCGCACCCGCAGCACTACGGTCGCCTGCCCGGGACCATCTGGAGCTACACGCAGGTGCGGCGCACGGGAGGCGGTGGCGTGGAGACTGTGCAGGGCCCCGGCGTGTCGTGGGTACACCCGGACGGCGTAGGCGTGCAGATCGACACCATCACGCCAGAGATCCGCGCTCTCTACAACGTGCTGGCCAAGGTGAAGCGCGAGCGTGACGAGTACAAACGGAGGTGAGTGG------ACGCGCCCCTCCTCCGCC s monDom4.chrUn 128401785 1444 + 174229318 GCTGCCCCTGCGGCCGCCTAGGCGGGCCGGG----TCCAAGACGCAGCCCGGCGGTCTGTGTCCCTGGGCAGAAAAACTGGAAGCCGGAGACTGGCCGGGAGAGCGGGCTGGAGGCGGAGC--AAGGCCGGCGGGTGGGCGGGACTGACTCTGCGGACCGCCGCGGGAAGGGAGGGGTAGTGGGCGGAGCCATGTCCTGCGGGGTCCGTCATGGGGCGTGGCTT-------CGGGGCATTATTTAAACTAAAGGCGTGGCTTCTGGTCCTTGGGGCCGAGGAGCCGTGATCTAGGGCCGCGAGTGGGCGGGCGGAACAAGGAGCCCGAGAGAGCCGCAGCGGGAGGCGGAGAACGGGGCGGGGCATATATGAGAAGGGCGGGGCCTGAGTCTGCAGAGGGCGGGGCTCGCTGCGGGAGGGGGCGGGGCCTAGCTAAACCCCTTCCCGTGCGGCCGCGGCAGCGCCTCCACAGTGTCGGTGACAGCCCCAGGAGTGGCCCCCGCCCGAGCCGCAGTTCCTCTCCCTGCCCCCCTCGCATCAGCGGCGGTCGCAGCCCCGGGTATCCGGCCT--CCGTCTTCGCTCGGCCACAGCTGGGGCCCGAGCATCTCGGCGCGCGCAGCCCCGCCTGGCCCTGGACCCGGCGTCCCCGCTAGCCCGGCCCCGCCGGGAACCCGCCGCAGAGCTGGAGCCGCACTTGGAACCGGCCCTGGAGCCGCGCCGCGGGGTCCCCGAGCCCCGCAGCCGTCGCATGATGAACTCGCTGCTGTTCGGCGAGATGGCGCTGGCCTTCGGCTGTCCCCCcggcggcggcggcggcccaggcggcggcggcccgggcggcgggggtggcgCGGGGCCCGGGCCATCGCCTGTGACCGCGGCGCTGCGGGACGACCTGGGCTCTAACATCCATCTCCTGAAGGGGCTCAATGTGCGCTTCCGCTGCTTCCTGGCCAAGGTGCACGAGCTGGAGCGGCGCAACCGGCTGCTGGAGAAGCAGCTGGAGCAGCAGCAGAGCGAGCGCGAGCGCCGGCTGCGCTACAAGACCTTCTCCCGCGAGCAGGCGGTGCAGACGGGCCCGGAGCTTACCCTCGCTCTGGCTCGGgccgccggttctctgcagcccccccagcccccaccgccgctgcagcccccgccgctgccgccCGGCGCCAACGGCAATGTGCCCCCGGGCGCCGGCGGCTCGCACCCGCAGCACTACAGCCGCCTGCCCGGCACCATCTGGAGCTACACGCAGGTCCGGCGCACGGGTGGCGGCGGAGTGGAGACCGTGCAGGGCCCCGGCGTGTCCTGGGTGCACCCGGACGGCGTGGGCGTGCAGATCGACACCATCACCCCCGAGATCCGGGCCCTCTACAACGTGCTGGCCAAGGTGAAGCGGGAGCGGGACGAGTACAAGAAGAAGTGAGTCACGTATCCCATGCCTCCCCTCCCCC 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ACCGCGTGGGAAGTGTGGTCACCGAGGCTGTATGGAGGGCAAAGTTGTGAAGCGTTGATCTGGAAACCAAAACAAACA-CTGCTGACTGTCACCACCCAGTCCACCAAGA---------------TCTCTTGTTCTGAGTTTGCAAGTCGGGGGGCTTTCCCCCGGGAGAATCCTGACAAAATATCTGAACTTTAA s monDom4.chrUn 128406354 189 + 174229318 ACTGCCAGGAAAATGTGGTCATCAAAACCATAACATTGACAAGGTCGCCGAGCATAGATTTGGAAACCAAAACAAACATCTCCTG--TACCCCCTGCCAGCTCAGAAAAAGAAACCTCCACCTCCTCACCCAAACTGGATTAAAAGAAGCCGGGGCTTTCCACTGGGAGG---TTGGCAAAGGG--TGTACTTTGA a score=2156 s mm8.chr4 138875230 124 + 155029701 GGGGCTGCCTGGCAGCAGGAGGTGTGCGCTGACCATTTGTTCTTCTTGGCTGTTGCAGGTGGGAGGAGGAACTGGCCAAACGCATGAACCTTCAGACCATGGTGGACACGCTGCAGGAGGTAAG s monDom4.chr8 204612100 120 - 308469712 GGGGCATATTGGAACCCGGAGGATTTTG-TGCCCATGTCCTCTTCAT---TCTTTCAGGTGGGAAGAGGAATATACAGTTCGGGTGCAGCTGCAAGAGCGAGTGAATGAACTTCAGGAGGTGAG a score=6234 s mm8.chr4 138877059 117 + 155029701 TTTTTCCGTCCACAGGCGGCGCAAGAAGCCGAGGCTATCCAGGAGGAGATGAACGAGAAGATTGAGCGGCTCAAGGCCGAGCTGGTGGTGTTCAAAGGGCTCATGAGTGACGTAAGT s monDom4.chr8 204612350 117 - 308469712 TTTTCCTGACCACAGGAAGCTCAGGAAGCTGATGCCTGCCAGGAAGAGCTCGCTATGAAGGTGGAGCAACTCAAAGCTGAGTTGGTGGTCTTCAAAGGACTCATGAGTAATGTAAGT a score=8817 s mm8.chr4 138878459 310 + 155029701 CGTCCCTCGCTCATGTAACCCTGCTGTCCTCCCTGCAGCCCATGACAGACCTGGACACAAAGATCCAAGAAAAGGCTATGAAGGTGGACATGGACATCTGCCGCCGAATCGATATCACGGCTAAGCTGTGTGATGTCGCACAGCAGAGGAACTCAGAAGACGTGTCCAAGATCTTCCAGGTGACCAGGGCCGGCCCCGCTCACCT----GGCTCCACCCCAAACCTCTTAGAACAGCCCTGAGCGCCACCATACCCTGTCAGTTCCTTTTTCCTTCCACATCTCGCTC--ACCCCGATCCTGAGAGTCACATGACA s monDom4.chr8 204612933 290 - 308469712 CGTTCCTCACCCTCCT--CTCTTCTTTCTCTGGCACAGAACCTGACTGAACTGGACACAAAGATTCAGGAGAAGGCCATGAAAGTGGACATGGATATCTGCCGCCGCATAGACATCACTGCCAAACTGTGTGATGTGGCCCAGCAGCGCAACTGTGAGGACATGATCAAGATGTTCCAGGTAA---------GTCCCTCTGTCCTTCTAGGCTCCTCAGGAA------CAAGGAGGCCCTGGGC---------CCCAGGCATCTCCCAAGACCCCACACATCTCCCCCGTGTCCTGGCCAGGGGAGGGTTGGGACA a score=586 s mm8.chr4 138878825 184 + 155029701 CTAAGGCCTGGGAGGACAGGCCGAAGAAGGACATGGGAGATCTCCCGGCCCTCCAGACATGTCCCCAGGTGTCCCCAGGTCCACTCTGCACCC--ATTGCTTCTCATGCAGTCTCTTTCTCTGAGATTCCACATT--GTTCCCATGGTGGAGCAGCCCTGACAACTGGGCAGCAATGGGCAGTTCTGG s monDom4.chr8 204613272 155 - 308469712 CAAGGAGCTGGGGGGGTGGGGCGAGGAGTGGCCTCTGAGCTCTCACTAACACCC--Tcttctcccc-----tccct---ctctctctgccctctgtctgcttctctttcc-tctccttcCATGCGCCTCCTTTCTCACTTCCCCAGAAGAAGC----------------------TGGTTAGTTTCAG a score=-6 s mm8.chr4 138879097 803 + 155029701 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TCAGCGCAGt-ttttttctcttcctctattccgtcccctgcct--ttccctttcccctcgtcctctctccttctcctgtttctttg--------tggttcttcttgc-----------cccttctctttctggttctGGATCTGGGTGTAATTAAAGGTCTCCTGTGTAGACAATTCATCTTCA-------------TTGTTGTAGTTATTAGTTCTGTC-ATTGTGTTAAGGGTTTTTTAG---ATCACGTTAGCTACTATACACATCTTTACATGGT--CATAATCAG------------CCCACATGCCTTGTCTCTCTTCTCT-------------CCCGCCTCTCTTAATCCTCGATCCTGCCTT-TTCTGTGTACCTGTCTTTT-----TGTAACTCTCACGTTTCTGTGCTTGTCTTTATAACTCTGTGT-CTTTGT-------CTCTGCCCCAACCTTTCCTGCTGGTTTGTCC--GTCCTTCCTGTCCCCCCACC------------CCCACCCCGCCCTTTCTCCTCACGCACCCGGCCTCGTCTCTGTAGTCTCTGCACTTGTCTCCCATTAAGGTCCCATCCATGGGGGGGC--GGAAGCGGGATCGAAAGCCTGTCATCGAGGAGGACACCTCCGTGTCTGAGAGTGATGGGCCCCACCAGCCTGATGGGGAGGAGGATGAGAGCACAGCCCTGAGCATCAATGAGGAGATGCAGCGTATGCTCAACCAGCTGTGAGTCTCACAG--GCCCTGTCCCAGCAC-CCTCCCCAGCGAGGCC-----------CCCCTTCCTAGAGTGGCTGGAG a score=5128 s mm8.chr4 138885842 215 + 155029701 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GCTGCTACTGCTCCTTTGCT------TCCCCGTGGTTCCCAGCAGCAGGAGGACAGCCTGGAGAAGGTGATTAAGGACACAGAATCTCTGTTCAAAACTCGGGAGAAGGAATACCAGGAGACCATCGACCAGATAGAGGTAAGGATGCGACATGTGGATAGGTCAGCTAGCAGGCCTGTCTAAGGAGGAGCAGTCAG----CTGGGCATTGGTGACAGT-CAGGAGTGCTGGATG a score=9733 s mm8.chr4 138886995 148 + 155029701 TCTCCTTCCAGCTGGAGCTGGCCACAGCCAAGAGCGACATGAACCGACACCTTCATGAGTATATGGAAATGTGCAGCATGAAGCGAGGCCTGGACGTGCAGATGGAGACCTGCCGTCGGCTCATCAAAGGCTCTGCAGACAGGTGCGG s monDom4.chr8 204619703 148 - 308469712 TCCCTCTGCAGCTGGAGCTGGCCACTGCCAAGAATGACATGAACCGACACCTCCACGAGTACATGGAGATGTGTAGTATGAAGAGAGGCCTCGATGTGCAGATGGAGACCTGCCGCCGCCTCATCACCCAGTCTGGGGACCGGTGAGG a score=1814 s mm8.chr4 138888584 78 + 155029701 CACTCCTCGACACAGACTTCTGTCCTCCCTTCTCCGGAGGCCCAGCGGGACCGCTGCTTCCTTCCTTCCTCCACCACC s monDom4.chr8 204623395 75 - 308469712 CAATGCTCCAGCCAGAC--ATGCTATTCCTTC-CCGGAGGGTAAGCCATGCCCCTTTCTCCTCCCTTCCCCAGCCATC a score=4326 s mm8.chr4 138905669 293 + 155029701 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CTCCTTTCCCAGGATCTAATCAACAAAGCCATTGAGGCTGCCCTGGCTGCCCAGAAGGAATGGGACCTGAAGCCCATGTCAGATCGGGCCCAGATCTTTCTGAAAGCTGCAGACCTATTGAGTGGCCCCCGAAGGGCAGAGATCCTCGCCAAGACTATGATTGGGCAGGTGAGAAATGGGCA a score=16779 s mm8.chr4 138909025 331 + 155029701 TCCTAACAGGGCAAGACCGTGATCCAAGCAGAGATCGATGCTGCAGCCGAACTCATCGACTTCTTCAGGTTCAACGCAAAGTTCGCCGTGGAACTGGAGGGGGAACAGCCCATCAGTGTGCCACCCAGCACCAACCACACGGTGTACCGGGGACTGGAGGTACTGCA-----------------GGGCAGGCAGTGAGCCACAGG--GCCTCCTAGGAGCATTGAGCTTCATCTCACAAGCTCCCTCTCCCTCAGGGCTTCGTGGCGGCCATCTCTCCCTTCAACTTCACCGCGATTGGAGGCAACCTGGCAGGCGCTCCGGCCTTAATGGTGAGGACC---GGGGCCAGGGG s monDom4.chrUn 73190221 352 - 174229318 TCCTTCCAGGGCAAAACGGTGATCCAGGCAGAGGTTGACGCCGCCGCCGAGCTCATTGACTTCTTCAGATTCAATGCCCAATTTGCCATGGAGCTGGAGAACAAGCAGCCTATCAGCGTCCCGCCCAGCACCAACCGGGTGGTCTACCGAGGCCTGGAGGTAGCTCAAGCGGGTTTTATGGGAGGGGTGGGGAGGGGGCTCCAGGGAGTCCCCAGGCAGAGCTGGGCTTGACCTC-CCTGCCTGCTCTCTCACAGGGCTTTGTGGCAGCTGTCTCTCCCTTTAACTTCACAGCGATTGGAGGCAACCTGGCAGGGAGTCCGGCCTTGATGGTGAGTGTCAAGAGGGCTGGGAG a score=12466 s 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gatggtggaagtgaggatggggatagtggaagtgaggctttggatgatggaaatgggggatggagatggtgggagtgaagatggaatggtggaagttggagtgaagatgatggaagtgaggttggggatcgtggaag-------tgagggtgaagatgaggatgacgatgatgaaaatagggatagAATCTCAGTGGTGAGTATGATTTGATAAAGAGGCCAGAATTCTCCATAACAGCTGATGCTGTAGATAGCACATTAGCTCTGCAATAGAAAGCAAGATTAAGGTTGATCC-ATGTCCCCTCCTTCTCCCTCTTTC--------------TCCCTCGTGCCTATCCTCAGCTATGAAACGAAGGTGCTGGGCTACAATCTGATGCAGGCCATGCGCTTTGCAGTGGAGGAAATTAATAATGATAGCAGCCTGCTGCCGGGGCTGTTGCTGGGGTACGAGATGGTGGATGTGTGCTATCTCACCAACAATATCCAGCCTGTTCTTTACTTCTTGGCCAAGGAGAACTTCAGTCTCCCCATCCAGCAAGACTACAGCAACTACCTGCCCCGAGTGGTGGCTGTCATTGGCCCTGACACCGCAGAATCTGTAGTCACTGTTAACCACCTCCTTTCCCTCTTCCTTCTCCCACAGGTGAGTCCTGTTCCCTACTTAGTAAGCATCAGGACTTAGGAAGACCTGAGGCTGACTAGATGGTGCAGCAGATAGAGccctgggcaagtcacttaaccctgtttgcctcagtttccacacctgtaagatgaattggagaagaaatggcaaaccaactccaatatc------tttgctctgtgaccctatgcaagtcacttaaccctgttt-gcctcagtttcttcatctggaaaatgagccagagaa a score=29576 s mm8.chr4 138931720 879 + 155029701 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TAAGTACTCGGTCAGCTCTGGAGCACGACTTCCCCTGATAGACGCAG--------AGAGGACATGAACATCTCTGAACGCAACGCTCCGGGTCTATGACTCTCTCTTTTGAAAGCCTTGCTAGGAGACTGTCTCTGCCTGCTGACCTCCCAGAGGTAGAGAAAAGCCATTTGGGGAATTTGATGTCATCCTGCAAGAGAAGAGGACAATGCCCCCGTTGTGAGGAATT s monDom4.chr4 366159971 225 + 430141050 TAAGGGCCCTCCCAGCTCTGAGGGTCTACATCCTCCCCTAAACCCAGGATCTCCTACAGTCTCAGTTCCTTTCTAGTTGCAAAATTCTGA--TTATGACAATGTTTCTGGAAGACCCTTGTTGGAAAATGTCTCAATTTACTGACCTTAAGGGCACAGACAAAAGCCATTTTGGGGACTTGCTTTC-TGCTGTGAAAGATAATTAAAATGCTCTAATTATATGTGGTT a score=2174 s mm8.chr4 139417411 74 + 155029701 TGTAAGGATGGGGAGGGGAGGGGG--ACACTGCCGCTGCCTCTCCGCCCCGAGTGCTCATCTCAGGCTAGGTGAAC s monDom4.chr4 366171109 76 + 430141050 TGCAAAGACAGGATAGATATGGGGTCATATTTCTTCAACCTGCCTGTTTCAAGTGTTTGTCTCAGTGTAGGTGAAC a score=6852 s mm8.chr4 139419906 418 + 155029701 GAAAAGCCCATGGCTACGGCTGTCTGCAAGGAGAGAC----GCTGCCAGTGAGGCTTAGCACCCAAGGAGAAAAGGCAGGGCTAGGAGGAGCAGAGACTGAGGCGAGATGAAGCTGGATGCCTCTGGATGGAGCTGGATGCAGCCGCTTTCTGAAACACCTCATTTCTGCTGTGGTGTTTTATTTCTCTGGTGTGCTGGAGTGGAAGTTTGCCTTTAATCCTTCTCTGACAAGTTAAGTCA---GCCCCTTGTCATTTAAACCCAGCAGGGCGTGAGTCAGGCAGAGAC-ATTGAAAATCACACTTC--AGGCTTAATATAGCTCCGTACTCC--ACCAGCTCGGAGGCCCTTGCAGCAGCTCGGGCAGGGACTCCCACCTCAGCTTGAGGGAGCGCCCTGGCCTGCAGCAGCCTCTGAGTCTAGGATCC s monDom4.chr4 366174849 388 + 430141050 GGACAGCCTACAGCCTGGGCTCTAACCACGATGAGAACAGAGGAGCCCATAGGGTAGAACAAGCAGAGAAGAGTGGGAGGGGATGGGGGAG----------GGGCAGAGGAAG--GGAACTCCCAAGCTGGGG--------------TTTCTGGGA-ACAATATTTCATTTTTGTTATTTATTTTATTTTACATGACAGAATGGAAGTCCACCTTTAATCCTTTCCCGACAAGTAAAAAAACAGCCCCCTTGTCAGTTAAACACAGCAGGGCTTAAGTCAGACAGCGTCTGCTGGAAATCACACTTATGGGGCTAAATTTAGCTCCTGGATTCGGGCTGGCTCAGTGGCTCTGACAGAAGCTCCAGACGATAATCTT-------------GATGCTCCAATGCCTAC--CAGCATCTGAGGCTTGGCCCC a score=11685 s mm8.chr4 139424143 413 + 155029701 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monDom4.chr4 367549864 152 + 430141050 GGGGACCTTACCTTGTCATCTGGGGCAGGGACAAAGCTTAAGAACTCATCCACATGGCCCACAGCCAACCAGTCCACGAAGAGTTCCACAGGAGGCTGGACTTTCTGAGCATACAAGAAGTCCCGGACCACCTGA---GTGACCCTCCTTCCACT a score=-228 s mm8.chr4 140022800 79 + 155029701 GCTGCTCTTGCAGGGATTCGAAGTTATGACAGGCATCGGCGGCAATGAAAAGACACAGTGATGACTCCCATACGGCCTT s monDom4.chr4 62288785 75 - 430141050 CCAGACCT---GAGGATGGGAAGGT-CGACAAAAGAGAAAGGCTTCAGAAAGACACCAGCATGTTCCCTCCTTGCCCCT a score=8012 s mm8.chr4 140023446 702 + 155029701 TGGGGTTGGTGGCCTGGCAGAGGACTTTGGGCTCCTCCCACCTAGGAGA-------GGGACCGTGGAGTCTGGGCTGCTGCT---GTCATGGTATTGACATCCGAACAATTTAAGCTTTGTCCCTGGAGCTTCCTTGGGTGGGGGGAAACTGAGGCACGGCCACTGAGGTCCTAGG--ATCAGTGTCGAACCACAGAAAGCATTGTCCGTTGACTCTGCCTAGACTGTGATGGAGAAGCCAGGCTTTAGAGCTGGTGGGTGACTCCTCAGCTGTTGTGTGGCCTCGGGACTATCCCTTCACTTCCCTGAGCCTCGTCTTCACTGTGAGGCCTTCTTACGTGAGTCGGcttttcttttcccccctcctcctcttccccccttttcttcctcttcctcctagtcctcctcttccctcctctccctcttcccctcctctcccttctccctctc-ctcttcttccctctcctactctccctcctccctcttcccctcctctcccttctccctctcctcctcttccccctcttcctctacttcctcttcctctatttcctctt-ccttctcttcctc---ctcctccttcctcAATCTGTCCCAGCCACCCGGGCCTTCATTCCTGCCTCAGGACATTTGTTCATGTTCTGTCCTATGCTAGGTCACTCGGTCCCAGGACACC---TCTTCTGtgtttttttgttttgttttgttttttgtttgttt s monDom4.chr7 179197054 642 + 262624689 TGGGGCTGCGGGCCTGGCTGAGGACGCTGTGCTGCTGCTGCCTAGGAGACCCGGACTTGCCCGAGAAG---GAGCCCCTGCTCAGGTAAGGGCAGTGTCAG-AGAGCCATCTAG---CAGCCTTTAGGACTACATCTAGTAG-----CTCTTTAGGAC-GCCATGGTCGGCTTTGGCTGTCAAAGTCGGACCTAGGAGACCACTGTCCG-----------------GAGTTG-------CGTGCTTTGGTACTGTTGTTATAGCCTGCAGCTTTTTAAAAATTGTATGCCTCCCCCCTCAACCCCC--AACCATCCCATCTCTCTAA-------------------------CCATCCCAtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctccctctctctctctctctctctctctctctctctctctctct-ctctctctctctctctctctctccctctctccccctccctcccccctctttcc---ctttctcCTGctctctctcttctcaccctgtctctctcggactcggtctctctctgtctctctcggtctctcggtctctctgtcggtctctcggtctctcggtctcggt----------ctcggtctctctctccccccccccccatccccctttgtctctctgtct--ctGTGTTTCTGGCTGGGTT a score=5991 s mm8.chr4 140024505 287 + 155029701 AATGTTTGCTGACCTCTTAG----GTTTGGAGAACATAGGGGAGGCCTTAC-----TGTGGCCTTTGTCACTGTCCCC----TACCCCAGCCACCCCCA--------------------TGTTCTTCTCCTTACCTGGAGTAACC-------GCTATTCCCGATGAGAATTCTGCCCAGTGGGTACTCCTTCCCTCTGACAGTGACTGGGGGACTCACCTCCAGGTTCCCAAAGGCATCCAGCCCAGTGAGCTCTGACATAT---AGAGCTTTCGGGTCACATAGCCAAAATTTGGACCCTAAG----ATGGGAGGATACAATGAGAGAAACGA s monDom4.chr4 367555894 328 + 430141050 AAtatttgtaaagcccttagcacggtgcctggtacatagtaggagatctataaatgtgtgttccttcCCTCTGCTCCCACCTTGTACCAAGTACCTCCAATCTCTGTGCCAGGATGCTCCATCCCTCTCTTTCCCTC---TTACCCAGGCAAGTTGCCCCCGATAAGGATTCTTCCCAAGGGATACTCCTTCCCATTGGCCACAACAGGAGGGCTGACTTCCAAATTTCCAAAAGAGTCGAGGCCACTGA---CAGACTTGTCCCGTGGTTCCCTGGTCACATAGCCAAAATCTGGACCCTGGGCAGAAGAGGAGCGTACAGAGTTAATCACGA a score=6017 s mm8.chr4 140028414 157 + 155029701 GGCTGGAGGTTGGCCAGGCCTACAGGGTTCCTACCATAACTCGCTTGACAGGGAAATCCTTCAGGCCTCTGTCCCTCGGGGAGTCAAAGACCACAGGCAGCGTCTTGTGTGGGGCCTGGATGTAGCCAATCTCCATTTCGTCCTGGAGGGATACAGA s monDom4.chr4 367557503 144 + 430141050 GATTGGGGATGGGCCA--CCTACCAGGATCCTTTTATAG-----------GGAAAGTCCTGAAGTTCTCCATTCCGTGGCGAGTCAAACACCACAGGGAAAGTCTTGTGTGGAGCCTGGATATACCCCAATTCCATCTCATCCTGGGAAGAAGCAGA a score=7731 s mm8.chr4 140029404 655 + 155029701 CTCTCTGCTTGATCCCCCCAACCCCCACCCCTG------CTCCCTCCCTGGTGTGAGGAC---------------------CTTCTGAGGCTCCTTCCTCTCAGTCCATCCCAGGAAGGATCGCCTCAGAGCTGGAGCTGTGACCCAGGAGCCCAAGGCCTGTGTCTGTCCCTTGGCCTCAGGCCAATGGGAGCACGT----ACCTGCATCCATTGGTCATCTATATTCTCCTCCTCGGGGCACACAGTCAGCTTGCACTTGGCTTTCTTGGTCAGAGTAGCTAGTGACTTTAGGAAGTCTTCATTGTCAGAAACCCTAGGGAGATTAGGCCTCATCATCACAGGGGGGTAACAAGGACAGATAACAGACAATCTGTTCGTTCCTCACTCCAGGCTCTCTGAGCCAATTCTGGCTTCCAGAGGCTGAGGGCAGGAGTTATATTTTGCCATTCCCAGAAAATGCACCTGCCCAGAATTCAGAGCTCTCCTTAACGAAC-CCAGACACCCCTCCCCCAGAGCTTCACCTGCACACGTACACCTCCTGGGGGGGCTGAGTGTTGGGGGTCATGATCCAGGGGGCCACACGGAACGTCACACTGTCTTGGAACACCAGGGCCTCGGGGAGCTCCTGATGGGGAGAGGTGAGAAGGGTCGTCATGGTCACTGGCAGGCAGGGTGTAATGCCT s monDom4.chr4 367558717 593 + 430141050 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GGGCACAACAGACCCCA--TCCTGATGCTCCCAGCCCTGGCTACCTCTATTC-CTTAGATGCCCAGGCTAACCCACCCTTAATTCTCCCAGGT-TAAAGGAGGGTCTGGGCC-TGTTTCAATCTGACTGACCTTTTGTGAACTGCTGGTCCCAGATGTCTG----CCCTTG------GCCCTGACTCCAGCTCCATCCACATCTCCCACCCACAACCCCCGCACCCCCTGGCCTTT-----GTACCTGTGCAAACTTATTAAAGTTGATAAGGCTCTGGTTGTTAAGAATCTGATTGATGGAGACGGTCTGGACCCGCCTGTCGCCTGTGAAAGACACAGAGAGGCCTGGGGAGGG s monDom4.chr4 367542991 337 + 430141050 ggtcacattcgaacccaggtcctcctgactccaggagtggc--cccctgtccactgtgctgcctag------------ctgccTTTCCCAAGTACAATGGAGAGTGAGTTCCATTGTGCCACCTAACAGCCCT---GTAGGATTCTTTCCCCCCACTTCTGACTCTCCTTGTTAAAAGCAATAAAGGAGACTTGAGCAGGTTTTCCCATTGGATGTCTTCACTTTCCCCATCCTCTTCCCAGTACCTGGACAAACTTGTTGTAACTGATAAGACTTTCATTGGAGAGGATCTGATTAATGGACATGGTCTTCACCGACTGGCTTCCTGTGGAGGAAGGAGTGAGGA--GGGGAGGG a score=7169 s mm8.chr4 140063232 122 + 155029701 ACTCACCAATGACACCCTCGAAAAGCAGGGACCGGCCATGGCCCCACTTCTGCTTTTCCTGGAATAGCCTGAAGCAGGCGCCAGGGCTGGCCAGGAGGAGCCGGAAGCCCTGTGTGTGGAGA s monDom4.chr4 367548815 122 + 430141050 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mm8.chr4 140201713 513 + 155029701 tccaggacctccctgcgttttagcactggatgtctgtcatgccatctatcacaggc---aagttgagatggacggtcatactaTGTCTCCTTGTCACTGAAAAGGTTGTGGCAAGTCAGACCACGTGCTGGCC----AGCCAAGGCAGATGACTGAAGCTCAGGAGAGGCCAGGGGGTAGCTGGCAGGTCCAGCGCAAGGC---------TGAGGCCACTCAATAGGAGTGCATTGTTGGTGCCTGC------AAGGACAGGCAGCCACGTCGGGGGTGGCAGGCTCTGCACTAATTTGGGGACTCTGACCATCGATGGAGCCTCTTTAAAACAAGGGCTGTGTTGTTCCGGCCTGAGATTCAATCTGCCTGG-TGTTGGCACAAACTGCCAGAAAGCAGCCCCAAATAGAAGATGCATTGTGAGTCACAGGGCATAGTCTACATAGGGAGGAGAAAGCCACCAGCCGCCAGACACTAGGCAGAACAAATCCTCCCACCAGACCCACCTCCCTCGGCTATGGCTCCTCTTGTCCCA s monDom4.chr4 367832171 480 + 430141050 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TCCCCTCCAGGGTCTGAATCCGGGGAAAGCGATTGCGGAAATCAAGAAGATGATGGCGACCTACAAGGAGAAGCGAGCATTGGCTTAACCCAGTCCGTGCTGAGT----------GTGCCTGTCAACTCTGGTGTCAAACAGCTGGAGTCTCCCTAAGTACAGCATATGTAATAAACAT-TTAAGATAAATAGGCGTTACTCTCCATTATTACCAAAGACGGTTGGA s monDom4.chr4 367907002 227 + 430141050 TCCCCTCAAGGGACTGAATCCAGGAAAAGCAATAGCTGAAATCAAGAAGATGATGGCGACCTACAAAGAGAAGAAATCTACTGCTTAGCAAATTCCAAGACTAGTCATGAACCTAATTTATATCTGATCTGACTTTGAGGGTCCTCTTTTTCCATGAATAGTGCATGTCCAAGGACAACAGCAAGTTAAATAAAGAACATGCTACTTTATTAACAAAACTGCTCTGA a score=6281 s mm8.chr4 140265859 627 + 155029701 TCTGTGTTCCAGGGTAGCTCCAGACAGCTCTTCACGGTTCAGGTGCAGACTGAGGCTGTTGTTCAGGGCAGGTGAGA----------------------------CACTGGGTGTCCCTT--------------------------------CCCATGGGGAGGGGTACATGGGAAGT-------CTGGGCCATCCGTTGAGCTGCTGAGTAACTCTCAAAC----------------------------CCTCTCCAGCCTGGAGCTGCCCCCACAGGCCCA---------------GGCAGAGGATGGCCGGAGCCAGGCAGCCGTGGGAGTGACACCAGAGGGCACATGGCAGGACACCTCCGAACTCCACAGGCAGGAAGAGGCAGTGAGTGGCCAGCTGGGCTCTAGACCTCGTCTTGTCCTTCTCTGGGCATCCAGGTCACATGCTGTGTGGGAGGACTGGGCTCACGGTTCTCTGTGTCCCTCTGGCTCTCTGTGGTCCCGAAGGCCTGTGATACTATCTGACCGGCAAGCTTCTCTTTCCCATGATGCTATCCCTCT---CCCCTCCCCCACCTTGTGCGTGTGGATGCTCCACGCCAGGCCACCTCCCACCGGCCTCTCCTCTCTCACCCAGAAGCAGGTACTGCGCTATTATGTCCTCCAAGGTCAACGCTACGTCTGGATGGAAACCCAGCAAGCCTTCTGCCAAGTCAGGTAGAGGCCCCAGGCATGG s monDom4.chr4 367937322 659 + 430141050 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GGCAGGCGGCTGGCTTGGCTTTGCT---------------CGGGGCAGCCACCAGCTCTGTC---------TCCAGTATCCAG---GCAGCCCAGGGATGCTGT----------CAATGCTGCCTCTTGCCTCTCCT--CCAGGCCCTGAATCCCTACTATGGGTTCCAAGCCTTCAGCATCGCACTGTGGCTGGCCGACCACTACTACTGGTATGCTCTCTGCATCTTCCTCATCTCAGCCATCTCCATCTGCCTGGCTCTGTACAAGACCAGAAAGGTGAGGGC--------GAATGGCCTGGCAGG--------GCTGGTCAGGGTGTCCCCAAAGGGCTGCCACCCACTCAGCTCTTCTCATCCCTCTGTCCCACAGCAAAGCTTGACCTTGAGGGACATGGTCAAGCTGTCCGTGCGGGTGCAGGTGTGCCGACCCGGAGGAGGTGAGGAACAGGAC s monDom4.chr4 367939944 457 + 430141050 GGCAGGAAGCTAGCTTTATTTACCTGATAGAGTTCTGGAGCGGCTCAAGCCCCATTGCTGTCCCCTGGTGGTCCAGGATGGAGCTTGCAGCTCAACTGTTCTGTGGTACCCAACCCACTTTCCTCCATCTCTCTCCCAACCAGGTGCTGAATCCTTTCTACGTGTTCCAGGCCTTCAGTATCGGCCTGTGGCTTTGGGACTCCTATTACTACTATGCTGGTTGCATTTTCCTCATCTCAGTTATCTCCATCATCCTGGCCCTCTATGAGACCAGGAAGGTGAGTGCTGCCTCCAGACTGAGCGTGGAGGAGGAAGAAGAGAAGGAGGAGGGCCCTGGAGGGTTCCTGAT--ATCAGCTCTCC---CCCTTCTCACCTTTAGCAAAGCCAGACTCTGCAGAACATGGTGAAGATGACTATGAGTGTGATGGTGCGCCGAGCTGGTGGAGGTGAGGAGAGGGGC a score=7062 s mm8.chr4 140268680 212 + 155029701 GGGGGAGGCTGGAAGTAGGGTGCTACGGGGCGGCTGACCTCACTGGACCCCATGTGACCACAGAGGAAGAGTGGGTGGACTCCAGTGAGCTGGTGCCCGGAGACTGCTTGGTGCTGCCCCAGGAGGGCGGGGTGATGCCATGCGACGCGGCTCTGGTGGCCGGGGAGTGTGTGGTCAACGAGAGCTCCCTGACAGGTAAGCCCAGCCTGCAC s monDom4.chr4 367940732 200 + 430141050 GGATGAGGCTGGAGGAGGCAGGGAACAGAGCTAAAGTGCCCAC----CCTTAT--------AGAAAACGTGCTGGTCGATTCCACGGAGCTGGTGCCCGGAGACTGCCTGGTGCTCCCTGCTAATGGCACGATGATGCCCTGTGATGCTGTTCTCCTGTCCGGAGAGTGCATGGTCAATGAGAGCATGCTGACAGGTGAGGAGAGCCTTCCC a score=7195 s mm8.chr4 140271181 221 + 155029701 CCTCACACCGT----------GTCCCTCCCA--GGGGAGAGCACCCCTGTGCTGAAGACGGCCCTGCCAGAGGGGCCCAAGCCCTACTGCCCAGAGACCCACCGGCGGCACACCCTCTTCTGTGGCACCCTCATTCTGCAGGCCCGAGCCTACGTGGGACCCCGTGTGCTAGCAGTGGTGACTCGGACAGGTACATATGGGGAGATGGGGAGGAGTGCTGAGCTCAGCACGTA s monDom4.chr4 367941530 233 + 430141050 ccTCACACAGTTATCATATGGGTCTCTCCCACAGGGGAAAGTGTACCAGTGACAAAGACTTCACTCCCCAGCAGTCCCATCCTCTACTCTCCTGAGGAACACCGCCGACATACACTCTTCTGTGGAACACTAGTCTTACAAGCCAGGACCTATATGGGAGCTGACGTCTTGGCAGTGGTGACTCGGACAGGTATGAAAGGAGAGGAAGCTGAGGGAGGAAACCTCAGTCTGCA a score=7106 s mm8.chr4 140272411 250 + 155029701 TCCCCAGGGTTCTGCACAGCCAAAGGGGGCCTGGTGAGCTCCATCCTGCACCCAAGGCCCATCAGCTTCAAGTTCTACAAACACAGCATGAAGTTTGTGGCTGCGCTCTCCGTCCTGGGTGAG-----TGGGCCGCGTGTCTCCCTCT----------CAC-CCTGCGGACAGCCC-CAGCCCGGGTGGGTCAGGGTCCCGC--------TCACCCCCTGCTATCTCCCCAGCTCTGCTAGGCACCGTCTACAGCATCATCATCCTCTACCGCAA s monDom4.chr4 367941914 267 + 430141050 TACACAGGATTTTGTACAGCAAAAGGGGAGCTGGTTAGTTCCATCCTCCATCCCAAACCCATCCACTTCAAATTCTACAGAGATGCCCTGAAATTTGTCTTCTTTCTCTTTATTCTGGGTAAGCATCCTAGCCCCTGAGTCCCTCTATTTTGCAACAACACTCCTACCACCAGCCCTCCACTCAAGC---TCATTGTCTCTCTTTGGTCTTCACTCCC-----CCACCCCAGCTACCCTAGGCACCATCTATAGCATCGTGATTCTGATCCATAA a score=10575 s mm8.chr4 140272661 340 + 155029701 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CACTGTCCCCTTGCAGACAGGCACCCTCACGGAGGACGGCTTGGACGTAATGGGCGTGGTGCCCCTAAAGGGGCAGGTGTTGCTGCCACTGGTCCCAGAGCCCTGCCACCTGCCCCTGGGGCCCCTCCTGCGAGCACTGGCCACCTGTCATGCCCTCAGCCAGCTACATGACACCCCGGTGGGCGACCCCATGGATCTGAAGATGGTGGAGTCTACAGGCTGGGTGAG s monDom4.chr4 367944900 228 + 430141050 CCCTACTCCTCTCCAGACAGGCACGCTGACAGAGGAAGGCCTAGATGTTTGGGGCGTGCTCCCCATGAAAGGTCATGATTTCCTGTCCCTGCTCCCAGACCCGAGGCAGCTCTATGGAGGTCCCCTGCTCACCGCCCTGGCATCCTGTCATTCCATTTCCTTGTTGAATGACCAGCCCATTGGTGACCCCATCGACCTCAAAATGGTGGAGTCCGTTGGTTGGGTAAG a score=9320 s mm8.chr4 140274471 393 + 155029701 TCTAGTCCTGCTGGCCCCTTTGCCAAGGCCCCAGGTCCCAACCTTCTTTGTCCC--CAACCAGGTCTTAGAGGAGGGTCCAGCTGCAGGCTCAGCACCTGGGAGCCAGGTCTTGGTGGTAATGAGACCCCCACCC-----------------GGGGGCCCTCGGC--AGCAGGTAAGCTGCAGAGTGACTGGGCCTTTGGGCCTTGGAGTGGGCCTCAGCCAGCCCCTCAGCTCTCCTCCCACCCGCAGGAAGAGCCACCAGTGCCAGTCAGCGTCCTCTGCCGCTTCCCCTTCTCCTCTGCCCTGCAGCGGATGGATGTGGTAGTGACATGGCCAGGGGCCACCCAGCCTGAGGCCTACGTCAAAGGCTCCCCAGAGCTTGTGGCCAGCCTCTGCAGCCCCGAGACAGGTGAA s monDom4.chr4 367946614 414 + 430141050 TCTGGCCATGCCCACCCAGTGACCACGCCATCTGTGCCCTTCTCCCTCTTGCCTATCTTCCAGTTCCTGGAGGAAGAGGGATTGGAGACCTTAGTGTTTGGGACCAAGGTCATGGCTATGATGAAGCCCCCGCCCCCAGAGGAGCAGCTTCATGGGACAGTAAGCTGGGCAGGGCTGCTGGAGGTTGGCTGGAGGGAGGGGCAGAGGAGGAATCGAAGGCCATGCTCACCCGTCTTCTCTTGACCCTTGCAGGAGCCCCTGGAACCCATTGGCGTCCTCCATCGCTTCCCCTTCTCATCAGTCTTGCAGCGGATGAGTGTGGTCATAGTCCGGCCAAAGGAAGCCTTTCCTGAGGTTTACCTGAAGGGGGCCCCTGAGATGGTGGCTAGTCTCTGTATCCCAGACACAGGTGAA a score=-2707 s mm8.chr4 140274894 626 + 155029701 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TGGGCTCAGGGAGTGGGTAGATCTCCCCTTGGTGAATTCTCAGGCCCTCTAGTCCTGTAGTGTAAAATCCAAGTATCCCTAATGTCCAGCA-----TCTCAG---------------ACCACTGCTGTTCCCCAAATCTCTGTGCTCACTCCAAGGAAGCCTCAAACCCCAGGTCTAATCACTCCTGACCCCTCTTTATCTACC-------ACCACCTCCCCCAGTATCCCCTAGAAAGAGCACCTAAATCCCACTCAACCAGCCAGGCTTCCTGTATAGTTTGCACCCAGTG---ATGCCGGTCACTTCTGTTTCTCCAGTGCCTCCAGATTTCTCCCAGATACTCCAGCAATACACGGCAGACGGA-------TTCCGGGTTCTGGCCTTGGCCTTCAAACGCCTGCTTCGTCCTCTCACTTTGGAAGAGACTCATCAACTG-GTCAGGTGGGGATCCAAGAAACATTTCCAACATATTTctttaagccttttattgatctgtgatctccccaggtggggtaagctctctttcagggcagatctcagcccctgcttcagatttgactgtcatccatgtct--aaattcttcataga---agacctttcctaaattctgagACTTATATGTTATtgtaaaaca-atgtgcttgggctagatgacctctgagatccccttgagggccaagggaatgat a score=7045 s mm8.chr4 140275938 430 + 155029701 CTGACCCTATCTCACACTCCTAGGGGACAACCTGCAGACAGCAGTCACCGTGGCCAGAGCTTGTGGCATGGTGGGCGCCCAGGAGCACCTGGCTGTCATCCATGCCACCCACCCCGAGCAGGGCCAGCCTGCTGCCCTCGAGTTCCTGCCAACGGAGTCCTCTGCAGTCATGAACGGGGCGAAGGTGA-------GACAAACCCACCAACACTGGCTGT----------GGCCCACCCAGAGTGACCCCATTCCTTG-----------TCATCTGG-----------CCCAGGCCCAGGCTCCAGGGAGGGAAAGGGCTACTGAGCTGAG---------TTTCCTGACTGCCTGGGTCCCTGTCCAGGCCACAGGCTATCCCACGGTGCCGGAACCCCAGTCCTGTCACCTGGCCCTCAGCGGGTCCACGTTTGCAGTCCTTCGGAAGCACTTCCCCAAGCTGCTGCCCAAGGTACAG s monDom4.chr4 367950349 475 + 430141050 CTGACTCTGGCCAACCCTCC-AGGTGACAACATGTTGACCGCAATTAATGTGTCTCGGACTTGCGGCATGGTGAGGCCCCACGAGCCGGTGGTGATCGTCCATGCCTCAGCCCCTGCCTTTGGCAAACCGGCTTCAATCAAGTTTGTCCCCTTTGAGCACCCCTCAAACGAGGACCGAGCTGAAGTAAGTCTTATGGCAGGTCCAGTAGGGTGGATTTTATGACCTCTGAGCCCACCTCCTTTAACCT--TTCCCTGAGGAACAGGGTGCCTCTAAGGACGTTGCTCCCCAGAGTCTGGGACCAGGGGGAGGAGGAACCCGTTGGCTAAGACCAGGAGCTGTGGGGTCTCACAGGGGTCCATTTCAGTCCAAAGGGTGCACTGTGGAGCTGGCCAGGGAGCACTGCCACCTGGCACTCAACGGGAAGGCATTTGCTGTGATTTTGGACCATTTCCCTGAATTGTTGCCCAAGGTATTG a 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monDom4.chr4 367957159 262 + 430141050 TGCCAATAACCTCCCACTTGCCTCTCCC---CCAGATCAATACTAATCTAGGTGACCTACAGTTCCTGTTCATTGACTTGGCTATCACAACCTCCGTGGCAGTGCTAATGAGTTTCACGGGGCCAGCCCCAGAGTTGGGGGTCTCCCGGCCCCCAGGGGCCCTGCTCCGTGTGACCGTCCTGGGCAGCCTCCTCCTTCAGACTGTCCTGGTTGCCACCATCCAGCTCAGCAGCTACTTCATCACCATCTCCCAGCCCTGGTGAGT a score=8550 s mm8.chr4 140278388 220 + 155029701 CCTCTGCTCTCTCCCTAACCCCACCACCACGGTCCCCAGGTTTGTGCCTCTGAACAGAACTGTGCCCGCTCCGGACAACCTGCCCAACTACGAGAATACGGTGGTCTTCTCTCTGTCTGGCTTCCAGTACCTCATCCTGGCCGCAGCGGTGTCTAAGGGGGCACCCTTCCGCCAGCCACTCTACACCAACGGTGCTGCCGCGTGGGGGGTTGGGGGGCGG s monDom4.chr4 367957903 213 + 430141050 CCCCTTCCCTTTCTTCCTCCCCATCCCTAC-------AGGTTTGTTCCTTTAAATAAGACGATTTCAGGGTCCCAGAACCTGCCCAACTACGAGAACACAGTCATCTTCTGCCTCTCGGGTTTCCAGTACCTCACGCTGGCTGTGACCATGTCTAAGGGGCCCCCTTTCCGCCGCCCCATCTACACAAACGGTGAGGCTTAGGCGAGGGAGGAGGGGAGG a score=7420 s mm8.chr4 140278740 186 + 155029701 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155029701 CGCTCTCCTTCCCTC------TCTCTCTAGCTGTCCTCAACGCCACCACCGCCTCCTCACTCCATGGCCATGAGAGCCGCCTGCCTCTTCCTGCTGTTCATGCCTGGTAA---GCAAGTGGGGATGGGTGGGG s monDom4.chrUn 135199421 128 + 174229318 CGTCCTCTTTCCCCCAGCTCATCCCTCCAGTTTT-----ACCTCCTTCCTGGCTGCCATATTTGTTGTCATGAGAGCTGCCTACCTCTTCCTGTTGTGTCTTCCTGGTGAGTGGTGAGTGGGGTCTGCTGAGG a score=1609 s mm8.chr4 140286164 65 + 155029701 GTCTGGGG---TAGGATGGGTGGGGCTGGCCGCCTGGTGGGGACCTGTGGGGACCTTGCAGGGGAACG s monDom4.chr4 367964421 68 + 430141050 GTCTGGAGAGACAGGCTGGAGGGGAGGTCCTTGATGGTGGGGGGCGGTGGGGACCAGGCTTAGGGACG a score=3959 s mm8.chr4 140288893 1242 + 155029701 CAGAAACAAGTGCTCTCCCTGGCCCCTGGCTGGCTCATGCAGCCTTGGGC---CATCAAGAGGCTCTTC--CAGGAGAGGCCCGGGGTAGTACAGGTTGTAGCAACTCTGAGAAGCCATCATCTCTGCCACCCCAGCTCCCTCACACAGCACTCTGATGACCAGGCCCTGGGCAGGCTATGCTACAAAGGGTGTCTCTCCTGCCCAGGGGAC----CTGCTCAGG---------ACTAGAAGGGTCTCATTTCTCAGGGGTGCCAGGGGGTAGGGAG-----ACGGATGCC----GAGCTCCTGCGAAGCTCCTGGTGTAGCTGTGCCTTCAGTGTGGATACCTG-GAGAAGAGAAGGGCCCAGCGGCCC-------AGGCCCCAGCTGCCTTCAGAGAACGGGGGCTGAGAGAACGGGGCC-------CATGCCACCTGCCTCCTGAGGGCCGGAAGGCCTCTGCTTCTCTTTTGCCCC-----------------------TCATGGCAGCA--------------------------------AGGTGTCTATGCTCT-GGCATCCTTATCCTTTC-----------AGAGGCTGGGCCGTGTGAAGCACCTCTGCCTAGCATCATTCCACAGAGCAAGACCCCTGTGTCCGCTCCCAGCCCTGCCATTACTGGGCTGTCTAGGAGTCCTGGCACTATGAGAGGAGGACTCTGGCCTAA--------------GGAGGACCAGAGAGAGGCAAGGGAGATCTGGCTGGGCCAGGCTCTTGCAGCAGTGTCTGTGACCAAGCTGGGCCCATCCAAGCAGCCACGTTCTACACC--TGGCCAGCCAGAAGTGACGTCACTGGCCAGTAGGCGTC-ATCTCCTTGGGCTCTTGCTAGCATTCTTGGCAAAGAGGCCTCTTTGCCCT---------------GGGATCCCAGGTTACTCAGA---GAGCCCGAGGCTGCTAAGGGAAGCATGCCGTGGAGGGAGATGGTCTGATGGCTTGGAGCC---------AGAGAGTAAGCCCTAGGCCCCGAGATACTGAGGCTGGGGCTGGTACCAGCAGCGATCTGCTTGCTCTTTTCAAGTTGTAGAGGTCATGACCAGTCCTCCCCTCCAGCCCCACACTTCCACCCTGGCCCCGCCTTCTCTCAGGGGAGACCACTGTACCTGCTCCTCGAGCCCTGACACCCTCTGGCGGTGGGCCCGCTCCCGTGCCTCCAGTGTGCGCTCCGTCTGTACCTGGGCACTGCGCAGGCGTTCAACCTCCTGTTGCAGTTCCAGTTG---CTGCTCACCCGCCTCTGGCTGGACCGGATTGTGGTTCCCCTCCAGGGCTACATCCACCTGTGCCT-----ACAGACAGGGGCTGCCAATCAGGG s monDom4.chrUn 135205129 1231 + 174229318 CAGAATCACGTGATCTCAACG--------CTCGAGCAAGAAGCCTGTAGCTCCCCTTGCGGGGTCCCTGTGCAGGGAGACCCCGAGGCAG--CCGGT----GCCACTGAGCACCGCTAGCGT----GCTCCCCGGCCTCTCTTGTCCCACGCCCTGC---CCGGGACCCCAACAGCCCCTGCCAAGCTCTGGGGC-CTCTGGGCCAGGGGCAGGCAATGTTCAGGTCTGGGGTGACGAGGGGGGACTCAGTTTCCAGGGGGAATAGATGTTGGTGAGGACGGAGAGAAGCCCTGGGGGGCCCTGCGAATCTCCTGCTGCAGCCGTTCCTTCAGGGTGGAGATCTGTGGGAAGAGGGGGGGTGTGGAGAGTGTTTAGGAAAAGCGAGCTGGCTCAAGGGATGGAG-----AGAGAGCCAGGTCTAGAgggcaagtcacttaacccccattgcctag----cccttactactcttctgccttggaaccaatgcacagtattgattccaaaacagaaggtgagggcttaaaaaaaataaCTACTACAAAAGGAAACAGTACTAtaggcattattattcccactttacatatggggaaactgaggcacagggagggggcttgacttg-----------agccccaggCTCTTTTGGATAC-ACCAAATATGCTAAAAGGCAGCTGCCTTGCAG-------------AGGGGGAGGCTTTTGCTTTACCCAGGACCCTCATGGAGCATCAGA---AGGAAATGAATAGCTCTCTGGGCCTGG----------------GGTGGACTGGC---ACCCACACAGATGCCCAGGTGCAGAACCCTTTGCCAGGCCTGTTTCCCTCCAACTGCCAACAGCTACCTAAGTTCTGAGGTATCTGCTCTCTTCCTT------------CCTTTGCTCCCCATCACTGGGGACGGCGATGCCAGGC--CCCAGCTCTGAATACTAGcctccca------gcatcctggaaaggtgggtggtaccaggatttacagccccatcttgcagaggagaaaaccgaggctcagagcgattaaCCCCTTGGACTTTAGCAGTAGC------------------------------------CCAGGCCTCTCCTCCGGCCC--------------AGCCCCTGATGCACTCA---------------CATGCTCCTCGAGGCCACGGATACGCTGCCGGTGAACACGCTCCCGGGCCTCCATGGTCCTCTCGGCCTGGGCCTGGGCCCCTCGAAGCCTCTCTAATTCCTGCTGCAGCTCCAGCTGGGTCTGTCCACCTGTCTCCAACAGGGACTGACCCTGTTCCAGCTCCAGA---------AGCTGGGCCTGGGGGAAAAGAAGGGGAGGGAAATCAAGG 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s monDom4.chr4 68480162 973 - 430141050 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s monDom4.chr4 368017404 1324 + 430141050 agggaaaaacaaagattagggaaatatccataaagagaaaactgcttgcttccaggctcacagtgaattagaggcagacctaagactaacatgctggtgtcctgatttc-tagccagggttctctctactgcaaaca---ctACTGGGCAAAGAAAGCAGGGGAGTCGGGCAAGGTAGGCCAGGCCCTGGCACCAATCCCACAGGCCCTTGCGTGGGGGGAACGCGTCCAGGCTGGGCTTCGTCAGACACGGGGACTGTCTACCGCACCCTGAATTGGGAGGATCTTCTCCAG--------------------------------TCCCAGCTCTCTCCCTCCTAACATCTAGCCCC---AGGCGCTGGCT--CTGAAATAGAAAACTACCTCCCAAAGGAGACGGTTTAATGGCCCCAGAGGGATTAGAAAT----------------------------GGGAAAAAACCCAGCTAGGAGCCTCCCGGGGGACATGTCCTGGCCCGGGAACTCT--TCTCTCGTCCCCAGTC--------------CTCCACGTTCTCACCAAGGCTTCCACCTTCTGAGTCAGGGTCTCGTTGGCTCGGTCCTTCTCGGAGTTTTGCTTCTGAAGCTGTTCCACCAGTAAGGTTAACTCGTGCACTCTGGTGGGCCAAGAGGAGGGCACCACTGGTTAGTATTACAGTGGGCCGCGTCCACCCCTCGCCCTTCTCTTTTAACAGGAGCCCCGCGGGCACTGAAACGATATGTTCCCTCCCACAGCGGCATGGATGCTCAATAAATCCGTATACTAAATCCTTGTAATAATAATCATAATTGGAACATCTTTAAACCCTTCACTTCTTTTTGATTCTAAGACCAAAAGTTCTAAATCATTAGTTTTTAAAATAACTGACGCCCTGCATGC-----CATTTGAAAGGAATACAGGAAATAGAGGCATAG--AAAAGGAAGGAAGTCTACCCCTCCCCAGCCCACCTTTCTTCCCTGTCCCCCATGACTTCCTGGGAGCCATCGGAAATGGGATGCGCAGACCCTGGAGTCCTGCCCTAAGCCAC---------AGCTGGCCCGGGATGAATGGCGGCCGGAGCAAGGCTGCGG------TCATGGCTGGTGGCCTGGCTGGTGCCCACCTGCCTCCCCGACTCACTGACCTGGAGCTGAGCTCGGCCTTCTCCAGGTCACTCTTCACCTGGAGCTGAATCAGGTC---------GTGCACCTTGTCCCGCAGCTGCTCCTCCAGCTGGGCTCGCAGCAGGGCTGCCTTCTCCATGGCCGCCTCGCTGCTGCTCTCCGCCAGCCGGAGGCTCCCGCTCAAGCCTAGGCTGGCCGAGTGGATAGTCCGGGAGGTCCTGGCCAGCTCTATGCCCAGCTGGGACAGGTCCCT--GTCAAGGCACAAGAGGGGACT 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ACACAGCAGGGACCC--TACCTGGGTTCTCAGGCTCGGAGAGATTCCGGGTGACGATTTCCCGGATGCAGGCGGGCAGGCGGGAGGGCGCCCCGTCCTGGCCGGGGTCCTGCACCGTCAGGTCCTTTTCTTCCTCTGAGGTCAGGAGGCTGCTTTCCAGTTTCTGAGGGCAGAAAGGCAGAGAGAGCCTGTGTGACAGGGGCCAAGAAGCCAAGC------------GAGCTAAGCAAG---CGTCGCCCAAGTCCCAG a score=1928 s mm8.chr4 140325315 380 + 155029701 CCCCAGCAGGACCTGAAGGGCAGAGAAGGTAGGAGGATCTTGCTGTGCCAGAGGCCAGTAATCCCTAAAGTCCACGAGGGGCCCTTCCCCCACTACTGTGCACTGAGATTAAGGAGTCCCAGCACTGGCCTGTGT------GGCCCCCTGACCTGCAAACTGCAACCCTCGCACACTTCCCCACACTTCCCTCCACTCACCACCTCTCACCACTACTACAAGGTCGGTTCTTCTG-CCCTGCTCTGCCCCTGGACAGGGTGGACACGGCCCGGCCCTCCGG----ACCCACCTGGATCACAATCTCCAGTGCCAGCTGAGCCTGCAGAGATCCTGCCAGCCCCAGGCTCATGGAGA-------------GGGGGGTCTG-------TGGGCACTCCACA--GCCCCCCTCCTC s monDom4.chr4 368052483 399 + 430141050 CACTAGCCAGAGCAGCAGTGCTAAGTAGGAGAGCCAAAGTCTCCCTGCTA-AGGCTTGTTGTTTCT-----CCCCCAGTTTCTCCATTCCCACAGGTGCTCCCCTAGCT---GGGGTCCC--CCTCAGCCTCTCTCACCTGGGCCACCTCAATAACTAATTGGGGGTCCCTCCCTCCCCCTCTAGGTCTCCTTTCCCTGCCCCTTCCCTGC-CTGAACCAAGGGC--CCCCTCTGTCCCTGCCCAGCCCTCACCCACTGTGGGCATCCCCGTGGCCCCCGCTGCCCCTCACCTGAATGACTGTCTCCAACTTGGGTGAAGCCACCGGTGGTCCTTCATCCCTGGAGCTCATGGGGACAAGTGGGGGGAGGAGGGGGCTGGCAGAGCCTGGCACTTAACCCTCCCTCCCTCCTC a score=983 s mm8.chr4 140325811 246 + 155029701 CGTGACTACGCAGGGGGTGGGGAGGGACTCAGAAGGGAGAGGAGGGGAAGAGCAGCAGGAATCAGAGGTGCATGAGGAGGGAGGGCCCAGACAGCACTCAGGGAG-------GAGACCATGAATGGTAGGGA-ACAGTGTTCCCCACTCCCTCCTCCCTCCCCAGTCTGTGGGCACTGCAGCCTTACAAGCCCGGCTG---CCCGAGGCCAG--------------AGTCCCTAGCTCACAGAGCATCTTC-----TCTGACCCGGAA---CGGGCGAG s monDom4.chr4 368053006 274 + 430141050 agagacagagagagagagacagagagacagagagagagagagagagagagag-agagagagagagagagagagagagagagaagggggagagag-acacagagagagagagagagacagagagagagagagagagagGGAT---GATGTCCTCCTCCTTACTCAGGAGCTGGTGACAGCTGCCTGCTGGCCTCAGCAGAGACTCCAGGCCAACCCAGATTATAATTAATCCCTGACTGACGGTTCTCCCCCCTCCATGTGACCAAGGAAGGCGGGAGAG a score=2085 s mm8.chr4 140326756 110 + 155029701 CCTGAAGCTCAC-CTCCCCTTAGACCAAGCAGACTCCCCAAAATGCCTAAAGGGCAAAGCCAGGCCCCTTGGTCTTCAAGACCTGCTGCGGTATCCAAGTCAGAGAGAAGG s monDom4.chr4 368053909 104 + 430141050 CCTGCAGCCCTCTCTATCCCTGGGATGAGGAAACTCCCCTAAAAGCACACAGAACCAAGCCAATCTTCTGAGT-----ATGCTTTTCATTATACCCAAGT--GGGAAAAGG a score=-1981 s mm8.chr4 140338569 1182 + 155029701 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AAACATTTTCTTATTTTAAAAATCCTATAAAGAGAGAGAGTTCTTCATGGTCTCTATTCTTGACTCAGGACTTTCAAGCAAAAAAGGCCAGTCCAAAAAAGAATGAAACCTTTCTGAAGAAGACAATATCAAAAAGGACAAGACGTGAA------AAGGAATTTCAGAGGCT---TGCAGAGATAGCA-TTACTTTAAAAACAGTAGTCCAGGTAACTGCCTTGGATCCCTG-TGAGAGACTCCTCGCTTTCATTCACAGTGCACATAGGAGAAGGGAAAAGGAAGTGGTTGTCTTTAGACAACAAGGCACTCAGAAACCACCCAGAGAAGGCCCAGCCCAACCAGGTCCTTCTTGGCAGGATCTGGAGGAAAGGGTCTCCAGAGTAGGCAAATGTTAGGCTTAATACTCTAGAGAACAGTTTGTACCTGCCCACCCAACCCCTCCTGCTTCTGCCCAGCATGGCTACCATCATAGCTCAGGGCACAACATGGAGGTGGATGACAACTGTCCCAGGAGCCCCTGAGAATGGGGTAGGGAGAGCAGGAGTACAGGATGAGGAGTCCAAAGAGCAGGTGGGCACTGTGGTTGCCAGAGGTAGATCCTCCAGAGGTCCTGGC-AGGGGCAGTTCCCCATGGTTAGTGTAAATTA-TGCAGATCAGCAAAGCAAATATTAAAAAAGAAAGGC-TTAATACAAATGGGTATTTCCTGATCTCCTCCCAAAGGAATTCCTTATCCCTTAGCCTACTGGGAAACCAGGACAGGTACCTCCATTCCTGATCTTAGTAA------CTCTAGTAGATAGAGAAGG---------AGCAGGGGAAGAATCACCCAACCTAATGCTTGCCAATTAAGCTCTCACTTTAAACATAAACACTGTGGTTAGGAGGCTTTAGCCAGAGAATCAACCTGCCCCTAGTCTCATGGGTCTGGATAACCACAAGAAAGGCCTGAAGCCAGAAT-----CCCAGGCTTCTCCAATGGAGAGATCCCCTCCAGCCCTGGAGAAAGAAAACTGGACTTGGCCTCAGATATTTGAGCCTCTACTCTCAGTCTCTC------CAACTCTTGGTCTCTGTGGTCAGTGCTGAATCCTGGAAGTCTTCTACAATGCCCAATCAGACAAGTGAAGCCACAGAGACAGGGAAGCAGGCCCTGAGGGAGGAGAGGAGGAAGAGGGAAAGGAGGCACATTCCAAATGGAGAGGCTGAAGAGAACTGGGTCCTCCACCCTTTGGTCCACAATCAAAGACACTTCTTCCCCAGGAGTCATGTCAGGAAAGCAAAAGGGAGAGCCAGTTTAGAACTGGACCCAGTTTGAGCCCTGCTGAGTCTGGCCTGAAGATGACCTGCGA-------AGGGAAAATTGCTTTTAGTGCTTTTAAAACAAACAGGTGAAGCAGGCCTCT 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monDom4.chr1 539700323 974 - 748055161 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CTTAGGGAAGGAGCTGCAGACCTTGCAAAACCTACAAAGACCCGCCGGAATTCAGGAGCCCCGCCTCCGCCTGCGTCGCCATGGCAACATTTCTGCGCATGCGCTTCGTGGTCAGCGTCTTGACCTGACGGAAGCAGGCTCTGCTGGCAGGACAGAAAAGAAGGGCGGGCTTTTAA-ATCGTCACCCTGCTGGCGGGGACTGTGAAG------GTTGGTG---GTCCCGGGAGTCGGAATTGAGGGGGTAGAGGCGAAG------TGGGGCTCGG--AAGGAGATAAGGCAGAGGGGACTTGTGGAAATACCTTCCCAGGAC----------AAGGATGGGTT------AGTTCCCCAGAGAGCAATGTAGAAGGATGGGGCTATAGAAATGCACCTTCGGGATGGGGATCCAGGTTCCAAAGGAAAGCCAGAGAGAGATT--AAGGACCTCGGAGTCGCCTT------GCGATAATGGTT-------GGCCCTCTCTCCACTTCTACTCCCAG--------TATTCGGACACATCCTTACCTTA------------------------CTGGCGTACTCAAG------------------------------------------CATGGCCAGACCTCCCATGCACGGTTCGGTGATTGTCCCAGACTGGCATGAGACGGTCGAGGGTAAGGAGTACTTAGCCTGCATCCTGCGCAAGAATCGCCGGCGGGAGTTTGGTAAGCGGCACCCCACCTCACCCCACCCCCGTCCCCCAGACCTCACCACGTGCCACTAGTACACT s monDom4.chr4 368344342 757 + 430141050 TTTGGGGCAAGAGAGAGAGACCTTGTTAA---------TGTCCCCCTCAGGTTAATATCCTCCCCTTTCCCTCCCTCCCCTCCACAGGA-----GAGGATGC----TGTATTGTGCCCCTAGGGGTAAGGGAGCAGGGATC--CTGGCTGTGGCCTCTGGGAGGATGGGGTACTATTATTGTCTCCCTA-----GGGTAACGGGAAGCATCTTGTCTGTGTCCATCTGGGGAATGAGAG----GGAGGTAGAGG-GAAGCTTTGCTAATGCTGGGCCAGTGAGAGGAGGCTGGGTGGTGACTTGTAACTCCCCATCTGGGGCCCCGGATCTAGAGCGTGGCTCTTTAAAGATACCCCAGGAAGCAATATGAGGCTAAGGGGGTCTTG---TGTTCCCCCTGGAGATGTCTCCCTG------------GGCAGGGAGAGAATGGAGGGACTGTGTACTTGCCTCTTTGGGGAAATAAGAGCTTGGGTCAGGTAGATTTTCCTCTTTGAGAGACAGAGAAGGGATAGTTAGAGACTGTTTTTCATTAGGTCTTCCCATCAATGTCACAGGTCTGTTGTACTTCAGTCTCCTCAGTCCTCTGGTGAGAACGGAATATCTGGGGAGGGCCATGGCCCGGCTCCCAGCACCAGGCTCTGTGATTGTCCCTGACTGGCATGAGAGCACAGAGGGCAAAGAACATCTGTCATGCATCCTTCGGAAGAACCGGCGAAGGGTGTTTGGTgagtggtaactaagc-cagcagaggccagggacccagatgggtgctaatcccatttctacact a score=11729 s mm8.chr4 140489288 1027 + 155029701 GAACTGACTCCCAACTCCCTGACTCCCTTCTTGCCACAGGGTTGCTTGAACGCCCGGTGCTGCCCCCTTCCGTGGTCATTGATACCGCCAGCTATAAGATCTTTGTGTCCGGGAAGAGTGGTGTGGGCAAGACAGCACTGGTGGCAAAGCTGGCCGGCCTGGAAGTGCCTATAGTACACCATGAGACCACTGGTGAGTGAGTTTAACCCTCAGCTTTGCCTTGGTGTCCTTCCATGGGATGGGGA---------------CAAGAACTTCGCCCT-ggggctggtgagatggctcagtgggtaagagcacccgactgctcttccgaaggtccagagttcaaa--tcccagcaaccacatggtggct-cacaaccatctgcaa-------------caagatctgactcc-----ctcttctggagtgtctgaagacagctacagtgtacttacatatattaataaaataaatttaaaataaattaaaaaaaaaaaaaGAACTTCGCCCTGACTATATTAGTGGGGCTTTATATATAATCATGCCA--TTTCCTCGAGAAGTTGTGTTGTTTGGATTGG---------------TACTAGAGAC------AGTGGTGGCCACATACCTCATGTCTAGTTGGTATTAAAGTTCAAGACTTTCCCATGCCACAGTTAAGTTTCTGCTCCATCATATGTCCCAGGACCTTTGAGGTCTCCCTCTACAAGCAGTGAGACTCCTTTCTCCTGGCGAGGGCCAACTCTGCCTGGTCTACCAAGGACTACTGCAGAGCAAGACTGTTTACGTCCTGAGTCTGAGGAGTCTCTCAGGTCAGGGGCCGAGCCTTCCTGTC------------ACAGTGGTGACCCACAGGGTGGAGATGTATGTCTTCTTCTTAACCCTTCCCATCCCCACCCCCCGATTCCACTTCTGAATGGCGGATCCCAATTCTCCTCAGGCATTCAGACCACTGTGGTGTTTTGGCCAGCCAAGCTGAAGGCCAGCGACTGTGTTGTCATGTTCCGTTTTGAATTCTGGGACTGTGGGGAGTCTGCCCTCAAGAAGTTTGATCACATGCTGCCGGTGAGCTGGG s monDom4.chr4 368346097 931 + 430141050 GGAGTGACTGTCTGAACCAGGGATCACTTATTCCCCTAGGACTGCTAGAGAGGCCTGTTCTGCCGCCTCAGGTGGCTGCCGACACTGCGAGCTACAAGATTTTTGTTTCTGGGAAGAGTGGGGTGGGGAAGACAGCCCTTGTGGCCAAGTTGGCCGGCCTGGAGGTTCCTGTGATACACCATGAAACAGTAGGTAAGTGGTGTTGATAGGAGGGGTGGCCTTGGGTCTGAAATAAGGGACTAACAGCCTCTATTATCTTTCTAAAACTCATCTCTGgggggcaactaggtggcttagtgga--------------------ttgagaagtcctgggttcaaatgtgttttcagagactttctagctatgtgaccctgggcaagtcactttacccccatggcctcacccctaccactcttcta----ccttggaaacaac-acacagtattgatttaagatgggagatgagggttaa--------aaaagaaacaaaACAA----GCCCAAA------------------------------GCCATCTCTCCTGGAGAATCTCCTCTGATTAAATTGGGGTCCCTAGCTCTATTCCCATAGACTCATGTATTTCTGGCC-CTCCTCTGATGTTTGGCTGTACTTA------------TTGCCGGGTCTGTTGTGTGCTTCTGCCCTTTGACAGGTGCCCA----------------------AAGCAGG-----TGCTTCCTGTGGGC-AGGGCTCCCTCCGC---GCCT--CAGGGCCTGCTGAAGGGGCACACTGTCTCC-TCTAGAACCTG------CCCCTGGCTCTTGGCCTTCTTCTTCCTGTCCTGTCTGGAGAGCTGGGGCTGGGGCAGGGACAGGGAATGGAGGCAT---------------------------------------------TGAGCGACCCC---TTTCCCCAGGTATCCAGACGACAGTAGTGTACTGGCCCGCCAAACTGCAGGCCAGCGAACGAGTGGTCATCTTCCGCTTTGAGTTCTGGGATTGTGGAGAAGCGGCACTCAAGAAATTTGATCACATTTTACCTGTGAGTGGGG a score=8404 s mm8.chr4 140490610 185 + 155029701 TAGGCTTGTAAAGAGAATGCAGATGCCTTCCTCTTCCTCTTTTCTTTCACCGATCGTGCCTCCTTCGAAGACCTTCCTGGACAGTTGACTCGTGTAGCCGGTGAAGCTCCTGGGCTCGTCAAGATAGTTATCGGGTCCAAGTATCCTTTGAGTGGCCCCTATtgtggggcagtgggcatggggga s monDom4.chr4 368347767 185 + 430141050 TAGGCCTGCAAGGAGAAAACAGACGCCTTCCTTTTCCTCTTCTCTTTCACCGACCGGGCCTCCTTCGAAGACCTCCCGGCTCAGCTCTCCCGGATTGCCGGAGATGCCCCCAACGCCGTCAAGATGGTGATCGGCTCCAAGTATCCTCGCGGCCTCTTCTCGTGCGTCATCCTGGGCCCGGCAGA a score=13501 s mm8.chr4 140491670 596 + 155029701 gggtttctactcggtctctggagcaagcctcattcaaccaaaaacaggctgcctttcacggc-cccacCCCCTATGATGCTCTCCTGGCAAAGTACCTGTCCCCCTGTGAGGTCCGACCCATATGTTTCCATTCAAAGGGGTCTAGGATCTGCCCTAGACCCGGGGCATAGCCTCTCAAGAGGAGGCCAAGGCTGGGTCGGA----TGGGGCGGCGAGCAGAGCTAGGCACCTTAAC--CCTCCC--GCAGGTTTGATCAGTACATGCACACAGATGTGCCAGCGCGAGACCTCACAGCCTTCCGGCAGGCCTGGGAACTGCCCTTGTTCCGGGTGAAGAGTGTGCCAGGGCGGCGGCTGGCAGACGGACGAACACTGGATGGCAGGGCTGGGCTAGCTGACACAGCCCATGTGCTCAATGGCCTTGCAGAACAGTTGTGGCACCAGGACCAGGTGGCAGCCGGCCTGCTCCCCAGCTCCCCAGAGAGTGCTCCCGGCTGAACGGTGACAACATCCTGGGTAGAGGCTGGTACTGGCGATCCTCACTTCTATCCTGAGGGCTGGCTGGGGAGGGCTCTCACATGGCAGTGAGATAG-GGCATGAGG s monDom4.chr4 368349040 555 + 430141050 GGATTCCTGCCCGGGCTCCG---TGAGCCCCG-------------AGGTTCCTCCTCATGAAGCTCAGCCTCTCCGAGGGT-----GGCGGGGAAGCTGATGCCCAGGGAG-----------------CTGTCCTGGGGGAGGCGGGAGGAGGCCGAGGCGCTCAGCTGGCCATCCCAGG--GAGGTCGGGGAGGCTTAAGGGCATTGGGAAGGCGAT--GCTCTGCTTTCCTTGACTGCCTCCTCATCAGGTTTGATCAGTACATGCACACGGACGTTCCGGAGCGGGACCTCACGGCTTTCCGGCAGGCCTGGGAGCTGCCCCTGCTGCGGGTGAAGAGCGTGCCTGGGCGCCGGCTGGCCGATGGGCGCACCCTGGACGGGAGGGCCGGTCTGCTGGATGTGGCTCATATCCTCAATGGCTTGGGGGAGCACTTGTGGCACCAGGACCAGGTGGCGGCCGGGCTTATCCCTGG--CCCCAGGAGAAGCCCCCAGATGGCGGTGGGTCAGGCTCTGGACGGGGCGTCTGACAGGAGGGGCTC----CCAGGAGCAAGACTGAGTGGGGAGAA---GCAGATGTGCTTGGGACAGAGGCATGGAG a score=6450 s mm8.chr4 140516639 638 + 155029701 TCTGTGTTAGTGCCTGTGGTTTGCTTCATGCCAACTCAGATTCTAACAGCTTTTGTTTCGGCTCTTCCACCAGGCAA----CCCCACTGAGCTATTATTTCTTCACCCCAGTCAGTCTCCCTGtgtttgtttgtttgtttgtttTCGGGACTTCTCATCTGCCTGGGAATCTGG----ACCAGTCTGAGATTTGAGGTGTCTCAGCCTCAGCCTG---TCCCCGGGGCCTC-AAGGGTCTCACC----CTCTGTGGTTTCTCTTCTTCAGAG-----TCTCCAGAG-------CCAGTTCCTGAGCTGTTGTCTCTAAGGCCGCCATTTCTCTGGGTCTCCCTCTTATTTCTGCCAGACTGGGCACTGCCCCTTTGGCCAAGGGGCCTCTGCAGGGGTCCTCGCTGCCCAGACTGCCCACAGCGCAA--------CCAGGCAAGTGT----------------AGGCCCCCGCCCAGCCCCAGCCCGCTGCCTGCTCCCTCCCTCTCTTTGCCTCACCACAGGGTTTGATGAATCAAACTCTTTGTCTGGGTGGGATCTCCCCCAGCCAGCTGGGCAGAGACAGGGCTTCCCT----------------GCCGGAGCAGG--CAGGCGGCAGCAGCTTCAGCTGAAGAGGTGAGG---------------------GGCAAGAGAGAGGCCACAGAGGGCCCAGGGCAGAGG--TTTGAGGGTCTTGGACC s monDom4.chr4 368383850 693 + 430141050 TCTTTGTCTCCGTCTCTGGACTTGGTGATCTCTGCACAG----TAGTCGTCTCCGTCTCTGATTTCTCTCTGTGTGAGAATCTCTTGGGGAGTTCTGTCTCTGAGTGTCTGTCTGTCCTCCGGTAGCT--TTCTCAGTCTGTCTGTGCCGCTGAGTATCTTTCTGGGAAACTAACTCTGTCTGTCTGTGTCTGTGGGTCTCTGCGCCTCTGCCCAAGTTACACGCTGTCTCCGAGGGTTTCCTCATCTCTCTGTCCCTGCCCCTCTTTCTGGCCTTTTCTCCAGGAGGCTTGCCCAGTGGGCGGGCC--TGGTTTTTGGGGGGCCTCTGGGTTGGGGGT---TGGTATTTCTGCCTCAAGGGA----------------AAGGGAGATCTG-GGTGGTTCTCCCCCTTCTCCCTGCC-ATAGAGCAAAGGTGGGGCAGGCCAAGCCTCTCCTCccccagccccagccccagccccagccccagcccccgcccT--TCTCTCCCTTTCCCTGGCTCACCGCAGT-CTTGATGAATCAAACTCTTTGTCTGGGTGGGAGCTCCCAGTGCCAGCTGTGCAGAG-CTGGGCTTCCCCAGAGAGCTTCTCCTTGGGCTGAGCAGAGCCAGGCAACAGGGTCCTGGGCAGAGGAGGTGAGGCCTTGGAGGGTGTGTGGGACTGGGGAGGGGGAGGC-----AGGGGGAAGGGCAGAGGCTTCTCAGGTTGGTGGGCC a score=7260 s mm8.chr4 140518235 456 + 155029701 CCTTCTCTCCTGCAGGCCCAGGAGGGTGACAGAGTAAAGA--AGGAATGGACTGTGGGCCACCTGCAACCCTCCAGCCTCACTTGGCTG---------------------------GACCACCTGG---------------------------------------------CACCGCCCGTCGCCCAGTAGCTGTGTGCCAGCAGGAGAGCCTGTCCTTCGTGGAGCTGCCTCCGAGCCGACTGTGTGTGGATCTCTTTCCCATTGCTCCAGAGGAGCTGCAAGCTCCCGGTAGCCGCTGGTCCCTGGCAACCCCTGCCCCTCTCCAAGGACTGTTATGGCCGACGTCCCCAGGAGGCCCAGATACCCATATCGCCTCCACCAGTGGAGGAATGAGACCCGGCAGGGCTGGCAGCTGGCCTCACTGTCCTGGTGCCCAGCCCCCAACTCTGGTGGAACCGTGGAGTTCTCAGCACATGCAGCCCCAACGCAGGGCCAGCCACAG---TGGCTCAGAGAAGTCAGCCTGTGAGT s monDom4.chr4 368385469 458 + 430141050 CTCTCTCTCTTACAGGCCTAAGTGG---ACTGTGTAGCCCCCAGGCATGGACTACAGACCCTCTCCTAACTTCCAGCCTCATCTGGCTGCCTTTTGCTATGGGGGGTCTCAGACAGGGCCCCTAGGGGCGATCCCAGGGGGACCCACCAAGGGCAGAGAGGAGTTGTCTCCCACCGCCCGCCACCCCGTTGCTGTGTGCCAGCAGGAGAGCCTGTCCTTTGCTGAACT---CCCAAGC---------------CCCTTT---------------GAGCTG------------GGCCCCTGGCCTCTGGAGGTCCCAGCCACTTCTCATGGGCTGCTGTGGCCG-CTTCCTGTGGGGGCTCAGGACACCAGACTCCCT--ACCAG-GAAGCCATCAGCCTTTGGAGAT------GATGCCCTCAGTGAGTT-----------------CCTCGGAGGACCCCGGAGTCCCCAGCATCCAGAACCCCAACGCCGCACCAGCCTCAGTTCTGAGAAGGAGAAATCTGCTTGTGAGT a score=5794 s mm8.chr4 140519013 302 + 155029701 CTCACCCTTAGGGCGCAAGATGCAGGTGTATCATAACGAAGAGGCCACCGGCACCGAGACCCCTACGGGCCTTCTGGAGACTGGCCAGGCTGCGCAAGAGCAGGCTCTGTGTGCTCTAGA---GCCCGGGCCCCAGGAGCTTTCTGGGAACGCCAGAGGGGGCCTTGAGGCACCGGAGCGAAGGCGTTTCTCGGCCTCAGAGCTGATGACTAGGCTGCA---------------------TTCCTCTCTGCGCTTGGGGCGCAGCACTGCCACCAGGGTTCTGACCTCGGGCTCAGGTGCTG---GAGCCATCCGGGAAGGTACCAGCT s monDom4.chr4 368388294 296 + 430141050 CTTTCCCACAGGGAGGAAGATGCGAGTGTATCAGAGGGAAGAGGCTGATG---------------CTGTCTTCCCTGAGGTTGG---GGCCGGGGATCCTCAGCCGCATCCTGCTCTGGAACTGCCACGGACCCTGGGAATGGCAGTGCCCTCCCAGGTGGGCACTAAAGAGCCAGAGAGGAGACGTTTCTCAGCATCAGAGTTGATGAATCGACTTCAGTCTGCCCAGAGAAAGGCCACTTTCTCCCTGCGCCTGGG---------------CAAGGGCCTGACCAAGGACCGAGGAGGGGTCTGGGCTGCCAGGGAAGGTACCAACT a score=3545 s mm8.chr4 140519427 285 + 155029701 CCAACCCCAGCTCTTGTTTTCTGTAGGGAAACTGCCCGTGAGGGAATCCCGAAGAGCCGAGACAAGGGCGGACAGTGTGTCGCTTCCAGGACCCGTCGATCTAAACGAGGTCCACGGTGGTCTGGTGGAACCCAGGTACCCACCTCTCT-----CTTGGGGCTC--------------GGGTTGGGGAGGGATGCAAAGAGGT--CCTGACGCTC-----TTTCCTAGGCTGGACAC-GCAAGACAAGCCGACTCAGGATCCCAGCAGCGCCACTGAGAGGCGCCAGTCCCGCTTCCTCCTTAATTGTACGT s monDom4.chr4 368389527 310 + 430141050 CCATTCCTGAGTCTCACCCAATACAGGGAGAACCCCTGAGAAGGAACAGAGCTGCTTGGAGACAAGGGTGGATGACCTCGTGCCCCCAGCCCCAAGTGGTCCTGGTGAGAGAGATGGCTGCTGGCCCGGTACCAGGTAACTTCCCCTCTGGATGTCTGGACCTCCCAGGCAGCACCAAAGGCTGGGCAGGAA-GAGGGTAGGTAACTTGGTGTTCCCATTTCCCCCAGGCCTGACCCAGTGGAGGAAGCAGCCCCCAAAGCTTGGATACCTCA-TGAGCGGCGCCAGTCACGTTTCCTCCTTAATTGTAAGT a score=14884 s mm8.chr4 140519736 592 + 155029701 GGGAGATGGGGGCCGGGGACGTTGGAAACTGGGGATCCCGCTTTGGGGGGAGCTGGGAGGTAGAGACAGTGTGCTGCAAGGAAGAGAa----ttgcactcccagggactagcaggtgggctggcgtacagttggcgcccaattagtgtttctggcaagggtaaaGAGCTCCCGCTCCCCGCCCCGCCCAGCTGTCCTCTACCAGGAGTACAGCGACGTGGCCAGCGCGCGCGAGTTGCGGCGGCAGCAGCGTGAGGAGGAGGGCCCCGGGGACGGAGCGGAGGGCGCGGAGGAGGGGCCCGGGCCACCGCGCGCCAACCTCTCCCCGAGCAGCTCTTTCCGCGCGCAACGCTCGACGCGGGGCTCCACCTTCTCGCTGTGGCAGGACATCCCCGACGTGCGCGGCAGTGGCGTCCTGGCCACGCTGAGCCTGCGCGACTGCAAGCTGCAGGAGGTGAGGGGCAGGGCTAGAGGAAGGGGGCGGGGATCC---GAGAGGAATAAGGGGC----TGTCAACGTGGAGAAGGGGTGGGA-GAACCTGGAAGAAGAAAAGGACTCAGGA--GCCCG----------------TTGGGGAAGCCAAGAGACAGGGCAGACGGGTGGA s monDom4.chr4 368390939 588 + 430141050 GGGACATTAGAACACAgaatgttagaacatggagccttagaactgggagaag---aaccttagaaaccatttg--gCTGGGAAAGGAAGCTGTTGGATCTTCAAGGTCAGGGTGCTGAGGGTGAGCAGGGTGAGC----------------TGTGAGGACTAAGG-----CTGCCCTCCTCTTC-CCCAGCTATACTGTATCAGGAGTACAGCGATGTGGCCAGTGATCGGGAGTTGCAGAGGCAGAAACACGAGGAGGATGCCTTGGTGGAGGAGGCAGAGGGGGAGGAGGAAGGGCCTGGCCCACCTCGGGCCAACCTGTCTCCGAGCAGCTCTTTCCGTGCCCAGCGCTCAGCCCGTGGCTCCACCTTCTCCCTGTGGCAGGACATCCCAGACGTGCGGAGCAGTGGCCTCTTGGCCATCATTGGCCTTCAGGAATGCAAGCTACAAGAGGTGCTGGG--GGCCCAG-----GAGCCTTGGGATGCATAGAGATGACTCAAGAGCCTTGTGCAAACCAGGGCCCTGGGGGAAATGGATCCAAATCTAGTGTAGACCTCAGGGGTGCCCGTCTTGGGTAGAATTCTTCAGGGAACCCTGGGAAAGAGGTTGGTGGAGGGC a score=-332 s mm8.chr4 140520328 348 + 155029701 GCCCAGAACAGGGCGAGGCCAGAAGCAGGTGATGGGATCTGAGGGGAGGTGAGGGGCTGTCAACTTGCAGGGTGGGTCGGTGTGTGTGTGGCGGGGGCGGGGAGACCTGGGAAGGAAAGGCTAGCCGCAGA--------GCCTGGAGAAATAGACGGGTGGGTCTAAAATGT-AGGGAGGAGCCTATGACAAGGGGG------------------------------------------TGGGCCAGACGTCCAGTGGCTCAGCCAGACTCGGGGACTGTCAAAGCCCAAAGGGTGGGTGAGACGTCCTGGGAAAGTAAGACTCCCCCAAACTAATAGTGAAGCCTGGAGGGGATCGAAGGGGCGGAGCCAAGGACAGGGCGTGGCCAAGCGCCGGCGA s monDom4.chr4 368390892 336 + 430141050 ACACAGAACTTGGAGGGTCCATAGAATAGGGA--AAATCAGAGCTGAGA----GGGACATTAGAACACAgaatg-----------------ttagaacatggagccttagaactgggagaagaaccttagaaaccatttggCTGGGAAAGGAAGCTGTTGGATCTTCAAGGTCAGGGTGCTGAGGGTGAGCAGGGTGAGCTGTGAGGACTAAGGCTGCCCTCCTCTTCCCCAGCTATACTGTATCAGGAGTACAGCGATGTGGCCAGTGATCGGGAGTTGCAGAGGCAGAAACACGAGGAGGATGCCTTGG----------------------------------TGGAGGAGGCAGAGGGGGAGGAG------GAAGGGCCTGGCCCACCTCGGGCCA a score=10822 s mm8.chr4 140520929 300 + 155029701 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CAGTGGGACGTGATGCAGAACATTATGGATGACCAGCCCATCTACATGTACTCTGTGTGCAATGTCGAATCAGGTGAGCAGGACAACTGGCTGCGGACCAACTGGATCTACCGCAGCGAAGCTGAGAAGGTCTTCATCGAGCTCAAGTTCACTGTGCGAGACTGTAACAGCTTCCCGGGCAGGGCCACCTCCTGCAAGGAAACCTTCAACCTGTATTATGCCGAGTCCGACGTGGATTATGGCACCAACTTCCAGAAGCGCCAGTTCAAGAAGATCGATACCATCGCCCCCGACGAGATCACGGTCAGCAGTGACTTCGAGACCCGCAATGTGAAGCTGAACGTGGAGGAGCGCGCGGTGGGACCCCTGACACAGAACGGCTTCTACCTGGCCTTCCAGGACATCGGGGCTTGCGTGGCCCTCCTCTCTGTACGCATCTACTACAAAAAGTGCCCCGAGATGCTGCAGAGCCTGGCCCGATTCCCAGAGACCATTGCCGGATCTGATTCAGCCA------ACCTGGCCAAGGTGGCTGGCACCTGTGTGGAGCATGCATTAGTGGCACCGGGTGGCGAGGAGCCCACGATGCATTGCAATGTTGATGGAGAGTGGCTGGTGCCCATCGGGCAGTGTATGTGCGAGGCGGGCTATGAGAAGGTGGAAGAATCCTGCCAAGGTGAG a score=4823 s mm8.chr4 140582416 279 + 155029701 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cattgggcaagccatttaacttgccttggtttcctcttttgtaaa---ggagattaataactcctacctcccagattcttttgaggacc---aaatgag------atgataattataaagca-cttagcatggtgtctggca-----tacagtcggtgcttcgta------aatgcttgtatcctttccttTTTTTTTTTAAACCTTTACTTATGTCTCTCA---TCCTCAGCCAACCTC--------------AACTTCTCA----CTTGTAAGGGGAGTTGGCAGGTGGTGAGGAGAGGGAGCAGGAGAGTTCTA-------GGAAGGGGTCAGATCCTGTGTATTCTTATCAGGTGAACAAACACCCTGTTTACCTTCTCTCCTCAAGATTTAGTTAAATATCCTCAGTGGAAATCTCTCCAAATTCTTTCTGTCCCTCTTGCAGACCAGTGGCTATACAGGTAGGCCATCCCTTCAACCTCTGGGACAACAGAATTGGGGGCTTTGTTCTTGATACTCTCCTCTCCTTTTCTGCAGAGGGCATGGATCAGGGATGGGAAGGAGAGAGGGATCAGGGCT a score=8021 s mm8.chr4 140588638 242 + 155029701 CCTGTCTCTCC-TTGTGCCTCTCAGCCTGTTCTCCAGGATTCTTCAAGTCTGAGGCATCTGAGAGCCCTTGCCTGGAGTGTCCAGAGCATACCCTGCCATCCACAGAGGGTGCCACCTCCTGCCAGTGTGAAGAAGGCTATTTCAGGGCACCTGAGGACCCACTGTCCATGTCTTGCACACGTGAGTCTTACAGAGATCCAGAGAGAGGTGTGACTgaggcgggggtgggggtggggggtggg s monDom4.chr4 368507371 242 + 430141050 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+ 430141050 gggttaagagacttgccccgggtcacacagctaggaagtgtctgaggtcacatttgaactcagggctttctgactctaggctctataacactttccacttt----gctacctTGAAGAGGGCTTTTCCCATAATAACCCTTGTTCTTCACCCACAGATAAGCCCATGATGATCATAACAGAGTACATGGAGAATGGTGCACTGGACAAATTTCTCCGGGTGAGTCCTCAGGTCTGTGCTATATAGGGTCAGGGGAGGAATGGACATCCCAGACACCCCATGCTCCAGAGGCAGGGGCAGGATGAAGTTTAGGGTTGTCTGCATGCCTTCTTCTACACTGATCCTGTGTCTTTGGGGGTTTTAGGAGAAGGATGGAGAGTTCTGTGTGATCCAGCTGGTGGGCATGCTCCGGGGCATCGCATCGGGCATGAAGTACCTAGCCAGCATGAACTATGTGCATCGGGACCTGGCCGCCCGCAACATCCTAGTCAACAGCCAGCTGGTGTGCAAAGTGTCTGACTTTGGACTCTCCCGGGTCCTAGAGGATGACCCCGAGGCCACCTACACGACCAGCGTGAGT---GAGCTTGGGAGTGCCCGGGCACTGGTTGGGAGGG a score=11529 s mm8.chr4 140594613 208 + 155029701 TCTTGAGTTCTCACAGGGACAGGGGTAACTGGGCTGTGTCTCCCGCAGGGCGGCAAGATCCCTATTCGATGGACAGCCCCAGAGGCCATTTCCTACCGCAAGTTCACCTCAGCCAGCGATGTGTGGAGCTACGGCATTGTCATGTGGGAAGTGATGACTTATGGCGAACGGCCCTACTGGGAACTGTCAAACCACGAGGTCAGCCCCT s monDom4.chr4 368516080 205 + 430141050 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TCCTCAAGATATTCCTACTGAACATAGGGTCTTACTTACCCTAGAACAAAT---TATACAGAATTCTCCTGAAGATTTTCTATGTGGTCTTTCCCCTCCTTCCTACAGCCAGCAAAACTCC-ATTATATAGGTAG----GAGAGAAGGGAGT---------TTCCAGGGTGCT-----CGCCACTGAAAAGAAGTGGGATTGG--CAGGAAGATATCTTTGGGTTTAGGGATAGGACTGGACCTtcagaggtacata-----------------------ggatttaaagctgaaagggaccttagcagtcatatagtcc--aaccctcttattttacagatgaactttaaagaaattcaattatttc-----cccaagttcatacaaatagtaagt--aacaggtcaaggattcaaattcagggattgaattgtatggctccaaatgtggtgctctttccTTTAGAGAAGTA-GAGGCGGGAGAGCAGGATAAGAAAG--GATTTATATG----TGGACCACAATTCAAAGGCATTTA---AATGGGTTTCTCTCTACACCTATACCCATCC a score=60 s mm8.chr4 140595429 49 + 155029701 CTGTAGCAGTTCCATGTGGTTTCCCTGCTAAGGCCACCCCGATGCTTAT s monDom4.chr2 262812206 35 - 541556283 CCCCACTACTTCCTGATAATTTCCC-----------CCCC---TCTTAT a score=12959 s mm8.chr4 140595486 278 + 155029701 AGGTCATGAAAGCCATCAACGACGGCTTCCGGCTCCCTACGCCCATGGACTGCCCTTCAGCCATTTACCAGCTCATGATGCAGTGCTGGCAGCAAGAGCGCTCCCGCCGACCCAAGTTTGCCGACATCGTTAGCATCCTGGACAAGCTCATCCGAGCCCCCGACTCCCTCAAGACGCTGGCTGACTTTGATCCCCGGTGAGTCTTGTGTCCTGTGCCTGAGGTAGCAT-------CCGTG------TTCATTCATATGGACTCCTTGGCTTCTCAGG--ACAACTGGATATCT s monDom4.chr4 368517547 292 + 430141050 AGGTGATGAAAGCCATCAATGAGGGGTTCCGGCTGCCGGCGCCAATGGACTGCCCCTCAGCTATCTACCAGCTAATGATGCAGTGCTGGCTGCAGGAGCGCACAAGAAGGCCCAAGTTCCCTGACATTGTCAGCATCCTGGACAAACTCATCCGGGCTCCAGAGTCTCTCAAGACCCTGGCAGACTTTGACCCCAGGTAAG-CTTCTAGAGAGGTCCTGAGGAATCACAGGGTTGCCGTGGCCTAATCCATTGCTTATGGCCCCTGAACATCCCTGGGCACAGCTGGCCAACT a score=11340 s mm8.chr4 140596301 247 + 155029701 TCCCAGAGTGTCCATCCGGCTGCCCAGCACCAGCGGCTCGGAGGGAGTCCCCTTCCGTACGGTGTCCGAGTGGCTGGAGAGCATCAAGATGCAACAGTACACGGAACACTTCATGGTGGCTGGCTACACGGCCATCGAGAAGGTGGTACAGATGTCCAACGAGTGAGTAGA-CGCCTTGGTGACTTTGCCTTTCATTCACCACTGGGGACAGCCTCTGATCTACGTGTCACTCC------CCCTTCATGgtgtg s monDom4.chr4 368519001 249 + 430141050 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s monDom4.chr4 368520794 1164 + 430141050 GGGCCTTTCCCGGCATGGCA------TGGCCAGGCACTTG---------GGAACGGGGCCATG----CATAGATTCCTTCTCCCTGGGGCCAGCTTC----------CTTTGCAGGGTGGAACCTGGTCGGGGGAGAATTCTGCTACCCCACCCCAGAAGGGGGAGA-ATTACCCTTCGAGGCCTTTTGGGTCTAAAAATAAATGATTATTTAAGCAGCTCAATTTCGGAGAGGTCAGAGGTCTTCATGAGAATAGGCCCCTAGCCTGGAAAACAGGCCCCAGGAGGGATCTGGAAAGCACTTGATG-AGGTCAGAGGGGACCGCTAGAGTCTTGGATCCTGGATCTGGACTGGTCCACATGCTTCCTCTGGGGACACCCAGGAAAGCCACTCAAGTCATCCGCTTGACCAGGCAGCTGGAAGTGGACCCTGCTCGGTCTCATCACTCCTTCCCCAAGGGATTGCCTGTGGTGGGAAACAGCTTGGGGTGGGGGGAGAAGGGGAGGAGACAGGCTGGGGAGACTGGGGGAGTGGAGATGGGGCAGAAA-ATTAGATTAAAGAGAGGAGACAGCGTTCTGGAAGAGATAGATAGAGCTGGAGGAatatatatatatatatatataATAACTTAGAATACTTAAAATTAATAATGAATAAACAGTAATATATAATATTTCCCCCACTTTTCCCAGTGAAGTAACTTCTACAGAGAGGTCCTGGGgctgttcgtccaggggcaaggcatcgcctctttctctgtgcctcagttcctgcctttataaaaataaggggcttaggctgg-gtgatatctaaga---cccccagtctgacattctatgctgttaggactcCTTCCATCTCTGACAGGTTTCTTTGAGATCTAACATTCAATGCTTATCTTTCTCCTGATGTTCACCAGGGTTCCCCTTTTTCTTTTCTCCAAATCCTGTCTGTGAGAGGAAGAGAAACTATCCTACCTCCCTCTAATGGGGAAAAAAGACAATTC--CTGTCCCAAGGAGTCA----ACAGAGAAAAGTTTCAAGGAAATATACCCTCCAGAAAGAATCTCCCAATAGCTCTGGGTTCTCTTTGCTAATCAATTTCCCATGAACAGTCAT---CACTTGGTTTGATGAGTTTGGGGTCT------------TTTAAAGTGAAAGTATTTCATTAAATTCAAGAAATTCTTCAAAGCTCGCCTCCCCCT 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s monDom4.chr3 508654262 1095 + 526135210 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TGGGAAAGGGGGAGCAGGGTCAGAAAGTCGAGCCCCAATGCTAATCTTCTTCCCTTTGGCTT-CTAGACCTTGGGAGCATGTACCTGCAGGACAGCCTCCTGAGTGGGCCCTTGCTGGACAGCAGCCTCCAGGCCTTCTCCTCCTCACTCTCTTCATCCCTTCCTGCTCCTGGCCAGCCTGCTGAGAATTGGGACTCACCTGAGGAGCCATCCACAGTGGAGCCATGGCCTCCCAGTCCTCAAAAGCAGCAGCTGCTGCTAGAAGTGGAACCAGAAGCTGTTGAAGATCAAACCCAAGCAGAGCCCAAGACCCAGCTCCACAGTTCTCTGCGCTATGTGGACAGCAGCTCCCTGTCA------GAGGATGAGGTCTTCTATAACTGAGGC a score=2921 s mm8.chr4 140656000 277 + 155029701 CCAACCTCCACCTGGGCT-CAGCCTGCCCCATTCAGTCTGGGCATCTGCCTGGAAGGTGGGACTGTTTCTCCTGG---------ACTCTCTCTAGTCACTG-GACTGTCTGTCTGTCCTTCCTCT------CTTACCTGGTTCCTCTGTGACCGCCACCCCCCGCCCTGCCCCAC-TTCCCAG-------CCAAGAGGACCCACGTG-----------TCCTCCCT---CACAC-------CCCCTCCCTCTCCCACAGGGTTCTCTGGTGACATTAAAGTAGTGTGTTAATCCCAGATGAACTTGACCTGGTCTTCCTGGGG s monDom4.chr4 368627873 322 + 430141050 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ttCCATTTAATTCatcaagaatttattaggcatgtacaaagcatagtgctagaaacagggactctacaaacaaaagagaaaatgattctactcttaaggagcttacagcctactaaaatgggtgagatcacctctgagggctttagcAACTCTAGATCCTATGACCCAGTGGAGATGGGACTAGGCTAGGGATGGGGCTCGTGTCAGGGAACTGAGTGTGCTATGATGAGCCCAGGGGCTATTGGGAACAACATAGGGGGTGGTAGTAGAAGCAATAACATAGATCTTTGATCAAGACAACAGGATGGTGCTGGGGAACTCCACA-----CCTTTCTCCTCCACCATGCCACCTTATTTAGGAGCTGGGGGGTTTGCCAGCTCAGCAATGGCCTTCTTCAAATAGAGGAGAAGAGAAGAAGATT----GGTATGCGGTGTTTGTGGAAAGAGGGCAT a score=841 s mm8.chr4 140657083 540 + 155029701 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ttagtac---atgttgattgattgtttAGGCTAGGTCCTTGAGTAAGAACTGATCAGGGCTGGGGGCTCAAAACT--------------------GAGGAAGAGTTTTAGCAGAAAACACTGTTCCATACCCACCCCTTGCCAACCCCAACCCCTATTATGGTTCCTACTCTGTGGCAAGCAGCTTTTTGGTAATCCAGTTTGCTCGAATAAACAACACAAATTTGCGATGGCAGAAGAGGTAGGCACAGCCCATGATCCCACAGACAAACCTGGAAAGAGAGGCCAAGAGGAGCCATGA------CTCCAGCCTACTGTTAGGATCCCCAGTGC---CCAGCCCAGAGCCCACTCATCCT-TCTGGGTCTCTGCCCCTTTTTATACCTACTCACCCAAGCAGTACAAAGAAGAAGATCTCTGGTAGGTCGAAGGGTATATCTACTCTGAATCTGGTCTTGAAGAGGGAAGCAATGGTCTCTGGGAGAAAGGTGGGGTAGAGA---GGAGTCACC---------AGCAGACTTTGGCTTACCGGACCCTGCCTCTATCCCACTATTTCTCAAGCACTTGCAATGGTGTCTCCCAAACCCTTTAGCCTGACATTCAAGGCCTCATACATCTTGACTCCTGTTGGCCTTGTATTCCA----------------------CTGTTTCCAGAGAAACTC-AGAACTGGAAGACACATTAGACGGTATATAgggggcatctagggagcccagtggaagagtgccaggtttg a score=-511 s mm8.chr4 140666319 148 + 155029701 aggaaggaaggaaaaaggaaggaaagaagggagggaggaagggagggaggaagggagggaggaaagaaggaagagagaggtgaatggagaggggaaggaaggaGGAGACAATGTGGGGAGGAGTCACAGAAGAGAGAGGGTGGAGACT s monDom4.chr4 368697507 122 + 430141050 aagatggaatgtaaaggtttcaaaataaaTAGAGGAGGTACAggggcaagtaggtagtac--aatagatgaagagccaggtctagagaaaggtgctcctgggttcaaattttat----------ctcagac--------------act a score=10646 s mm8.chr4 140666467 149 + 155029701 AGGTCCCAAAATGGTGCTCACCCTGTTCACTGTTGAAGACCGCCAGGAGACGGAACATGAAGGCCCCACAGGTGGCAGCGAAGAAGCCCCTCCAGTAATTCCAGACGGAGAAGTGAGAGGACATGACCTCGATGCTGAACAGGACACCT s monDom4.chr4 368648278 149 + 430141050 AGATTCTCAATTTCTGCTCACCTTGCTCACTGTTGAAGACAGCCAGGAGACGGAACATGAAGGCCCCACAGACTGCAGAGAAGAAGCCTCTCCAGTAATCCCATACAGCAAAGTGGGAGGACATGACCTCGATGCTGAACAGGACCCCT a score=144 s mm8.chr4 140666616 5 + 155029701 AGGGG s monDom4.chr2 540276282 5 + 541556283 GCGGG a score=2794 s mm8.chr4 140666907 326 + 155029701 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s monDom4.chr2 540277619 1281 + 541556283 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tgtatgactatgggtcaaccttccttgggcctc---agtttcctcctcca----taaaaAAAAATTGCT-TACACTGCCTTCTTC--------ACAGAGAATTCTATAGAAACATC---ACCTCTCAGTGTTATCATTGTTA------TTATCACTTTCCCAAGGAGGAGGGGACTTCAGGTCAGGGTTCTTACCTCCAGAGGAAGGGGTGATGCTCTGGGAAAAGCCAGTAGAGAAAGAGACCATGGCTATGGGATACACAGTCCAAGAAAGGTAACGAAGCAGATGGTTGTCTCCGATTTCTCGATACAGCCACATGTGTGCTAAAAGAGGATCATGGAGGTTGCAGGGCCAAAAGGCCATGCCAGCCTCCACTGTGGTTTTTGGGAAGATGCCCTGTCTGCCATTCTT---CAAAGAAGTACCCC----TTAGCTCTTGGCTTGAGTGGGTGAGTCAGTA-------TCAAGAATCACCAAGAACAGGATAATGTGGG-GACTGGGGACATAAGTG a score=-503 s mm8.chr4 140686269 95 + 155029701 GCCAAGCTTAGAAGAGAGAGGTTTCACCCTCTCTGTGCAGAT----GTGATGACATGGGGGTTGGGGGGTAGACC--AGCAAGGCACAGAGcttgcctaaa s monDom4.chr4 368652186 95 + 430141050 A------TAACAAGGAAATATGGTCAGCTTCCCACTGAGGATGGGGGTGTCTACCTATGACTTCAGGAAtgactttgagcaggtcacttgccttatctaga a score=6180 s mm8.chr4 140686459 197 + 155029701 ATCCCAGCCATGTATAGGAATCCCATCGCCTGGAGCCTTGTGCATGCCAGGGAGGCCT-----TACCTCTGACCACGCGCCCAATAGTGAAGTTCATAGCATAGCTGATCAGAGCCATGAGCACCCCGAGAGCCACCAGGAAGTACCAGTCCTCACCCACACGGAAGAGCCGCTCTTTCAGCCACTCTAGGCCCCCTAGACA s monDom4.chr4 368704087 190 + 430141050 ACCCCAGAGATATAGAAGGAC------------AGAGCTGCTCAGGCTGGCAATGCCTAGAGTTACCATGGACGACTCTGGAGACAACGAAGTTCATGGCAAAGCTGATGATAGCCATGAGCACTCCTAGGCCAACCAAGAAATACCAGTCTTCACCCACCCGGAACAGCTGCTTCTTCACTCTCTCCAGAAAGTCTACACA a score=4383 s mm8.chr4 140687238 133 + 155029701 CTCTGCAGGGGAGGGATAGGCGGCAGTTCTTACCCTGGATGTTTCTGCGGATGCGTGGGCATGGCCCCCAGAGTTCTTGCAGTGGCACTGGCTTCTTGGAGGCGCCCTCACGAAGCCCCACTAATTCCTCCAT s monDom4.chr4 368658052 131 + 430141050 CTCCCTTGGAGAGAGTTTGGCTGT--CTCTTACCTCTGATTCGGCGCTGGGCCCTGGGGCAGGGACCCCAGAGCTCTTGCAAGGCCACAGGACTCCCTGAAGACCCCTCACGAAGTCCCACTAGATCTTCCAT a score=15699 s mm8.chr4 140693688 587 + 155029701 AGAGGCCTAAATTTAGCCAGCAGACAAG-GGGCTGGCCTCGAGCCCAGGGACAGTT---GGGCCTTATAAAGCGCTGGCAGTCAGGGGCCCCGGCACGCTTCCGTGGAGGCCTGGACCCACTCGTTTCTCCAGCCCAGCCCCTGCCCGTCTG-------GACAGGGACC--CCCGCTGCCT-GTGGATGAGCCATCGGACCTCCTCCGCCTTCAGAGCGGAGAGAAGCTTCCGTtcctcttcctcctcctcctcctcctcttcttcttcGGCCTCCCGTGCCCTTCCAGCCCAGGACCCACCCATGGAGAAGGCTTTGAGCATGTTTTCAGACGACTTTGGCAGTTTTATGCTGCCCCACTCGGAGCCCCTGGCCTTCCCAGGCAAGTGCTGGGGCTCTGAGGGGAGGGGAG---GGCCAC----------AGGTGGGGGACATCTGCTCCAGGCCATCGCCGA--GCATGCTGTGGCCACCCACCTGCCAGACATAGGTGCC-----GCATGGGTCACAGCCATATGTGGCTGTCAAGGTAGACCTGGCCACCAAGACAGAT--GTGGCTACGATATAGGTGGGC----TACCTGGGACCCTAGGGGTGAG-ATGTGAATCAAATAG s monDom4.chr4 368733186 590 + 430141050 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CCCAAAGGTAGGGAAGAAAGCTGGCTTCCTCACCTGGGCAGAAGTCTTGGTCCTGGAGGCTAGGCTGATGGAGGAGGCGACAGGAAACTGAGTGTGTGTGAGCTGCTGAGCGGGGGCGTGGTAGGTGCGGACGTCACCGTACCTGTATTCTTGGAACAGCTCACCACTGGAGTGCACAATCTGCACCCCGTGGGTTACGACCACAGGTGGGGTCAGAGGCAGCCCCTGAAGCTGGCTGCTGGGGGTGACCGTGAGAATGCGGGCTTCACCATGAgggggcggggcaggggtagggacagggacagggacggggacaggggctggggccgggACTGCTTTGGCATCTGAAGTCTTAA---CCGCTTCCTTCACCAGTTGCTGGGGGGCCTTGTTGGCTGGTGGCACCTTTACCACCCCCTCTGTGGCCCTGG------------------GCTGTTCACTGACAGCAGTCACATGTGGATGCACCATGATCCGCACGTCCCGGGGAACCGTGTACGGGTGCAACCGGTACTCGGACTGCATGACCAGCACTTCTGACTGCACCGGGGCTGCAGCTCGAGCCACAGGGAGGTGATAATGAACCTCTTCCTCAGGAGGGTGCTGTGTGGCCAGAGCAGGCACACCAGTCGTGGCTGGCTGAGGCGTGCCCACACGCTGTGGGGCCCTCGCCTCTATCTGCTGGGGCTGCAGAGGGGCTCGAGGAGAGTGCAGCGTCTCTGGCCGGATGCTGTAGGTGATGCTGGGCAGGGTGGGGGTGCTCATTCTCACCTCCCCCTGGGACAGGTGACCTAGAGACACTGTCTGAGTGATGCTGTGGGGGGGCATGATGACAGACTGCTCTGGGTGTATGCTGGAGATGAACTGCGGCACCGGGATGCCGGCAGCCAGCATGACGGTGGCGTTGGTGGACAGCGCTGTGGAGGTCGTGCTGCTGGGGTGGCATGGCCTAGGGAACAGGCCTGGTGTAGGCCCAGTAGGGCGAGGTGAATGAGTATCTGGTTTGGGGGTTGCCAAGTGGGCGATGGTCCGATCTGCTGGGGTACTGGGTCCAGAAGGAACATGGTTCACCTCTGCAGGCAGTTTGCTGGGCAGGGCAGGGGGGTGGTGGGGAGTGAGGGTGGGCCCCAGGTTAGCTGGCTGAAGGACCTTGGTCTCGATTTTCAGAGTGACAGGGTCAGCAAGCTTCTTGTTGGTGGTGACGATGCTCGGGGTGAGGACAAGTTGGTTGTGGACGAGCACTGGGGGGGTGTTGATGCCCTGGGTGAGAACCTTCACTGTGCCACCCTGGGTCACAGGGGTGGACACCGAGAGGTGAATGGGCTCGGGCTTCTCCAAGGATGGCCGGTCCGTCTTCACGGAGGAGATCACGGGAGAGGCATTGTATGTCTGGGCAGTCAGTACCAGGGTAGAATGGGCGGCCACGTTGGCAAAGGCTGAAGGGGTCTGAGGGCC---TTTGGGTGCAGACTGGGTCGGGGTGATGGAGTCTGCTTTCACTTGGGACTTGGATACTGACTGCTGAAACTCGATGTCCATTGCGCTGGCTGGAGGGATCTGGCTGATCTTAGCACTGATCCGCTGGGGGCCTTCCGTCTTCTGTCCCGAGTAGCTCAGCAGCACGACCCCTTCTGATGTATTCACCCGCAGCCCCGCGCCAGAGCCCGTGTCTGCTGGTCGGTCATCAATCACTGACATGGACCCAGGGTGGAAGCGGCTGTTCTCATTGCTACTGGCCCGCTGCTTGCCCTTGGC 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CATCCCTTCTCCT-GCCCCCTCCC-CCCTTCCCGCGGCGCGGTCCGAGAACTGCGGCGGCGGCTCTGCCGTTTCCCACATAAACTGGGCCCCAGCCGCCATTTT--AGAGCCATTGCTAGCTGCCTgcccgc---------------------------ccgcggcc-gccgccggccccACAGCTCTCCGGCTCC-----------------------AGCCCGATCTGG---AAGCCCTAACCTCTGGGCCC-----------AACCATCAGCCCGGCCTGCCCCAGTGGGCCGCCACGCCGGGGCAGCCAGGCACGTGCTGGCCTCCCCGGGCCATGGGCATTTCCCAGCCCCAGCCCTCGGGGCAAAAGACCATGAGGGGAATCCGGGCTGGGCCAGTG------------------GGGACC------------GTGCCCCTCTCGCC--------------CTACGATGGGCCTCAGGCCCCACAGATGGGGGCGAA------GGGAGGAAAACG-----------CGGCGCTCTGGAACCCCCAGGCCCAG-------CCGAGCTCCAGGGCAAAGATT-----------------------------------------AAAGTGAGAGCTGGG----CAAGGGGCCCAGCCCCTCCTC----CCCATAGTGGA-------GCGGCTCACCCCAGGTCCCAGTAAGCACAACTCCTTTTCACACGCGGGGGCGCGCTCCGAGAGAACTGCACCTCCCCGGAGCAGAGACTGAGACTACCCACT------------------AATCAATGATCCTCCATTTACAAGACATACAGCAGCCCTTCCAAGGCTGCTTCCATTTCCTGGTCGGAGCTGCTCATGTGCAAGCAACAGACTCTATTTTTCCCATGGTGACTCACTAATAAGGACGCTCCACAATTTTCCCTCACTCACTAAAC---CTAAACAGTGGCAGAAAGGATTAAGAACCAACTAAATTCAGCAAGG------------AGGGAGAGTGAATGGTCATAA-----CTTGGAATTGCCAGATTTCTTCCATACAATTTAAAAATATTTTGTATATTGTTCCAGACTTAGCTCTGCAATGCAAATAATGAATCTTATACTGGGTTCGAAATCTCCCATCGGTTG-CAGTACCCAGCTCTCTCACAAAGAAAAGGGATGTTAACCAACCAATTAAACATGCATTAAAAGCCAACTTTACATATTT----------AACAAATAAAGTTCTTTGGAGGCGA----TTCCATCTTCTCAGCAGAGCCATGCATTTCTTAACCA-------------------ATGAGGATGCCAATGGAAAGTAAAAAAAAAATAC 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s monDom4.chr4 368921354 1039 + 430141050 CAGATCCTGGGGGTAAGGTTGGGGCC--GGCCCGTGGCTCGGG----TGAGGGGAACCGGCAGCAACGGGCTCGGCGGGCCTCCGGC----TCGAGAGGCCGGGGGCGGGGCGCCATCCGCCCGC--AGGGCTCGGCTGCCCGGGCCGGTGCGGGCCTCGGCCGGCA-CCGGCTCAAGAGTTGAGGGAGGCCCGGGGCGTGCGGGCTCGCCTACTCAC------TCACTCACCGTTTGAAATGCTCGATGATCTTCTCCTCCCGCACGTTCTCCGGTAAGTTGCCCACCCAGAGATGCCTGGTTTCCCGGACCATGCTGGGCAgcggcccgggggcggctccggcggcggcggctcctccgcctccccctcctccgccacctcctcctcctcctccgccgcctcctcctcctcctccgcctcctcctcgtcctGCCCCCCCGGCTCCGTGCGGGACCCTCAGCCCcgggaggcgggagcgggagccggagcgggagccggagccggagccggagcgggagcggcggcagctgcggcggcggcagctgcggcgtcggcggcggcggctgcggcgtcggcgtcggcgacggcggcTCCTCCGGCTCCCCCCCGTGCAGACACCATTCCTCTCCCCCAGGTTCTGACTCTCCGGACTCCCCGCTCCGCTCTGGCTCCTCCACACACTCGCACCCGACCCTCGCGCTGCGGCGGCGCGTGCGCACTGGCGGCTTCGgggggcgggagggagggcaggggagggggagggggaaatgaagggggaggggagcaggaggaggagCGAAGCCCCACGCCGACGGCGTCGACGGCGGAGCTCGCCGCCTGCCTAAATCCAGACGCTTTCCACCGGCGCACGCACGCGCCAGCCCGCCCGCCCGCTTTTCTGCTCTCTGCTGCGGGTGCGCGCCCAGA--GAAGTCTCGGCTCCGCTTGCTTTCTAGTCAGGCGCGCAGGCGTGGGGAA-GCGGAAGGGAAAGAGGGAGGGAG-TGGACAGAGACCAAAGCGGGCCGCTCCCTCTATGCGCAGCCGTACGACCAGAGCCGG 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s monDom4.chr4 369086767 1188 + 430141050 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TTCACTTACGGGGCTATAGTAGATATAACATGAGAATAATAAATTAGAACAGAAACCATCTCCACCTGCACATGTGATTAAAGTGGGACTCTGAAGCCAAGCCAAGAGACCGGAATGGAAGAAACTCAAGTAAACAGACTGAATGAAAGCTGAGAGGAAGGGACAAAACAGAAAAACTGGTTAGGGAGCTCAAGACAAACAGACTAGGACTTAAAAAACAAAAGACTATCATGTTTACTTTCATGATCCAATGAAAGGAAGTGACTCAAGTGTCTGGGGTGGATCCTGTTCCTGCCTGAGGGGGGCTAGCCAGTGAACTAGACAAGTGACCCCCCACTTAAAAATCAGCTCTTAAAATAGACACTGAGTTGTCAGGTTACATAGAGC-CAACAGCACTAACCTGAAAAACAGGGTGCTGTTTACAGCTA s monDom4.chr4 369204052 371 + 430141050 TTGACAAAAGGGTTCAAAATTTACAAAATAAAAAATAAATGAATAAGAAGA-----CACTGAAGGCTAGACATGCAATAAATG-------CAAAAGCGggg--gagaggggggaaggggggaggtgtgaggaaaacaagagaa---------aataggaggtagaagacaggagaa--gaTT--GTATCCAAGAGGAAACAAATGAAACTATACTCCTGAGTAGACTGT--TGTTTACTAATCGGATT---TGAAAGGAAATGACTCA-GTGTCTAGTATG-------TTCCTGATTGATGGG-------CAATGCAAATGAAAGAGGACCACCCA----------ACATCTTAAAATAGATACTGTATCATCAGGTTACAAGGCCTGCAGCAGAACAAACTTGAAAAACAGGAGG-TGTTTATAGTTA a score=14699 s mm8.chr4 140995080 596 + 155029701 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CCTTTCGCCATGGGGG--AGGGGACCTCTCCCTCTTCCTTCCTACCTCCTCCCCAGCTCACCTGGCTCTCCGCGGCGGGGATGCCGGACTCGAGCTCGCAGAGCGCGCGGAAGTTGTGCAGCTCGAAATCGGCGTCGACCTGCAGGGAGAAGGTGACCTCGGAGAGGTCCCTCCGCACACAGTACACCGTGAGCAGCATggcccgcggggcgccgccgcccgcAGCCCTCCCGCAGCCGGCTACTCGCCCCGCACAGAGCG--AGCCG--AGCCAAGCCGCAGCCAAGCA------CCAGCAATAGTAGCAGCGCCGCTGCCGCCTTGCGCCTGCTCCTCTGCTAGTCTGGGTCCCTACCGCGGCCAC-CAAGTGCACCGGCCGCAACG-TACCGCACCGACCCGCAAGccctgcccctgccg-----ctgcccctgcccctgcc--cctgccg---------ctgccgctgccgcta----------ccgcc--gccgccgccgc-cgctgcagccACGACAGCGTCGTAAAGGGCGCTCGCCCCGCCCAGTGAGTCCGCGGCGCCACCTGGGCAGGCGGGAGCCGCgggaagaggaggggccagggctggaggagggaggaaaaagggagtgggagggag a score=8072 s mm8.chr4 141018897 283 + 155029701 CTGAGGTCCA-GCTGGGCCCGCGGCTTGGGGTCTGGGGTGGCCACTTGGCGTCCCTCAGCGGGGCTCTTTCGTCCTGGGTGCCCTGGGATCCGCCAGGCTTCAGGTGCCTCAGATACCCCACACCACCAGTCCCCCAGCTCTGAGTCACCGGTACAGCCGGTGGGGGTGGGTGTCTGTTCCATGATGCGCCTGCCCCTGCAGTCCTCCCCCGAGGGGCTGGACGCTGCTTTCATCGGTGTGCCTCTGGATACTGGGACTTCCAACCGGCCCGGGGCAAGGTAAG s monDom4.chr4 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430141050 GTTGTGGGCCAGGGCCTCCATAGCTAAGGCTTGGGATAGCCAGAGAGAATGGAACTACAAGAGTCAGATAGAGATGATAGGCCT---TAAGGGTTTCTAAAAT---AGA---------ATCCCTAAACCATGGGAATCTAGCACACCTCTGACTACCTGGGGAGTGG--AGGAGAAGAGTCAATGGCCCACTTGACTCACCGCAGACTTCCCCTGAAATGTTTCACTGCTGGGTAGCAAAGTGTTGGCAAACTCCTGCTGCCGGTTGCTATAGACATGTACAAATCTCACTGTGTCCTGGCTATTTGCCAAAGCAAAAGATAGGAAAGCTTCGAAATCTGGGGTTG---ACTTTGTTC-CCTCCCGAATCAGTAAGAGCACACAGTACCTACACCAAACCAAGAGAAG a score=10981 s mm8.chr4 141042957 186 + 155029701 GAGCGGCAGAGCCTCAAGTTCTTACTTTCTCTGTCGGTGAGACCGCTTCACAGGGCAGAGTTCATGGAACAACCTCTGGCTGGTGAGCCGGGAGGCCAGCAGGTACTTGTTTTGGGCGATGAAGTCCTCGATGACCTGCTTCTTCAGTCCCCGAGCCTGGAGAAACAGCAGCAAACACTCAGTTGT s monDom4.chr4 369278524 182 + 430141050 GAGAAGAAAAGCCTCAAGCTCTTACTTCCTCTGGCGATGAGACCTTTTTACAGGGCACAGCTCGTGGAACATCTTCTGGCTGGTGAGCCTGGATGCTAGGAGGTACTTGTTTTGGGAGATGAAATCTTCAATGGTCTGTTTCTTCAAACCTCGAGCCTGGAGAA----CAAAGAACATTGGGTTTT a score=10713 s mm8.chr4 141046569 201 + 155029701 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monDom4.chr4 369301305 963 + 430141050 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GCTTATACTTACTCTGCAGCAGGCCCCAGCCTGTGACATAGCAGACATAGTTTCTCGGGAGAATGGTGCCAGCGGGTGGGAGGCAAGCTGTCTGGATGTTCTTGCTCAGGGTCACTGGGCTGGCCAGTTTGATTAAGGCAATGTCATAGCTGGGTCAGGAATAAAGATAGATCAGAAAGTGTTT-TGACTCTACCCGTCTACCTTTGTCATTTCCCATGTATGACCCCAGG---CTGACCCTGCAGGCAG s monDom4.chr4 369393074 244 + 430141050 GCTCTCACTTACTTTGCAGGCGTCCCCAGCCTGTGACATAGCAGACAGAATGGTTGGGCAGGATTGTGCCAGCAGGAGGCAGGCAGCCTAGCTGAATCTGGTCCGTCAGAGGGACAGAGCTGGCCAGTTTGAGCAGGGCGATGTCATTCCTGAGCGTGGTTGAGAGAAA----AGAGAGCATTTAGGAGAGTGGCCTTTTGTCAGCTTTGTTCCCCA--TCTGACCCAAAGAAACTCAGCCAGCAGCCAG a score=4633 s mm8.chr4 141093646 285 + 155029701 TCCCATGGTGTTTGCTTCTCCCTCCTCCACCATTCCCACATGGGCCCCTGTAACTCCCTTCCC--TTCAGAAGAGGCAGAGGTGTGTGGCCGCCAACCCTACCCCTGAGAGCCCCAGACAGGACAGAACATACCCATTGCCGACGTTTTGGGAGTTCCACCTCTGGTGGACCACAAGCTTAGAGACTTGAACAGCAGCAGAGCCAGCTCCGGGGTTGGAGAGGCTGTGTGCGCCCAGCAGCACTCGGTAGGTCTG---ATAGTTGCTGTGAGGGGCAGAGTAAGAGAGAG s monDom4.chr4 369395191 247 + 430141050 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cagacagacagacagCAGAGGATCCCAAGGACAAAGGGAACATCCACAAACCACAGACTAAAACTGAAAGGAGTAGTGGAGTGGTGTCAGGAGAAGAGATGCCTATAGCCAG----ATGCACCTCTGCAG----------------AGCCCAGGACCCCTCAAAGCCCCAGGCTGACCATCTCCCTCTCCT s monDom4.chr2 431021024 160 - 541556283 TGGTCATGAAGGCAGTGAGGAATGGCAAGGCTGATGGAGTGGTAGACGAA------------------------AGTGGGAT-------GGAGATGGGCTGTCTCTGTCCAGCATTCCGAAACCCTACATTCTCCCTCCGTTCCCCATCCCCGCGCCCCTGAGGGCCAGAGTTCCCTTACCTCTCTCCCCT a score=-780 s mm8.chr4 141385156 595 + 155029701 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TCATGTCCCCGGCCTCTGGGGCGCTGGCAAGGCTGAGGGAGGCCAGGCCTGGAAGCGGCCAGAGAAGAGCCCCAGACGGTCAATGTTCCTGTGCAGGACGCTGTGCAGCACCGCTAGGTGGGGGCCCCCGGCCCCACCACCCTCCCTGGAGAAGTCCCTGGCGAAGCGGCCCCGCTCGGGCTGGAAGGCAAACTTCTGGGGCAGGGGGCCGTGCTCTCGAAGGAAGCCCCAGACGCTGAGCAGCAGCAGCCGCACCTCGAAGGGGGCCAGCTGGCTGAACACCTCGTGCATGTTGCCCAAGGTCGGGGGCAGCAGGCTCCCTTCGGCCATGACTGCCACCAGAGTACAAGAGGCCTCCAACTGCCACGGTGACTGGGAGGTGTCCAGGTGGCGAGAGGCCTCCCAGTGACCCAGGAGGGCCGCCAGCAGCCCCCGAAGCAGGACTGAGCAGTAGCAGAGGGCAGGGGGCGCCGCAGCCACCAGCTTCAGCAGCTCGAAGAGCAGTGGGTGCTCCCTGAACCGGCGGCCGATGCGCAGGTCCCGCTCCACTGTGGTTCGAGCATGGTCCTCTGGGGGCCAGGCCAGCTCAGCCCCGGCAGCATCTGGGCACACGCTCTCCACCAAGGTCACTGCCACGGCTTTGGCTGCCTCAGGGCTCAGCGCTGGCGCCCCCCAGGAGTCTGGGCTCTCCGACCCTCCAGAGGCACTACAGCAGTGCACCAGAAGACGAAGAAGGCTCTGCATGTTGTAGGTCACTTCCTGTGGACTCCGGGAATGGGCTGACCTCGGAGGTTTCAGCCCTCGGCCAATGACTCCAGCATGAAACACTGACCAGACGCCTCCAGGACCAGGCACTGCTGCGGTATGCCGCCTGTTGGTCTCCAGCAGGTAGGCTGAGGCCGAAGTGGACGAGGAAGCCGGCACATTCTCATTTCCCCCTTCTCCTTCACCCCCAAACAGCTCGGCATTGCCCCGGTGCAAAGCTCCCTCTACAAGAAGCTGCAGGACTGCTTTGAGGCCAGCTGGGGAGGCCTGAGAGAGCCTTGTGAGCAGGCGGGAAGTAGAGGAGACACCTGGGGGCCCATGAAGCCTCAGGGAAGCAAAGAATCGAGACACCCCAGCCCTCACCAAGCTCAAGAGCTGGGCAGGCAACAAGGCACCCTGAGGAAAGGGGCAGATGGCCAGCAGGGATGAAGCTGCCTCAGCCACTTCTTCCTCAGGGTGCAGCAGGAGTGGAGCCAGATCAGGAAGCTGGGCAGAGATGGCCTCACCAACACGGGCCCCCAGGGCAGTGGGCCCTTCACCACCCTGCTGCTCCCACGCCACCAGCAATGCCAGGTTCCGGAGTAGCCTGGCTGTGAAGGGAGGGAGAAGCGTCCCTGCATGGACACGAGCCAGACAATTGCACAAGGCCAAGGGCAACAAGCCAGAGAGACTGACTACCAGCCCAGCATAGAGCTGTGTGGCCAAGCTCAACTCTTCTGGGCTTCGGGCCCGGCTCAAGAGATGGCCCAAGGCCTCGGGTCCACAGCTGGGTCGGGTGTAGACAGACAGCAGGCCCAGGAGCTGGTGTTGCCAAAGGAAACGCTTTCTCTCCAGCCTCAGGGTTTCCCCACATAGCTCCCCAACATGGCTCCGCAGGGCATCCAGAAAGGGCACAGGGCGGGGAGGTGGAGGAGGACCCAGCACGCCCTCACCAGGGGACCCTCCTCGATTGTGCACCAACTTCTGTAAATGCAACAGCAGCAGCTGGATGAGTCGGTCACAGGCCTCCCGGACAGCATCGGGCACAGCCAGGCCAGGGGGTGTGATGACTGAAGCTGGCATGGCCGTGTCCACCAGGAACTGGAGGAGCCGGTAGGCCCCAGCCCCTGATGCCTGGCTCACTAAGTGTACCGCCAGGCTCAGCATATTGTCCAGTTCCTCTCGACCAAAGGCCTGCA-AGTGCTGCTGAAGCTGGCTCAGGACAGAAGGCGGCTTCAAGCAGTCCACCAGCTCCCCAGAGACGGTTCCCAACAGGGCTGGTGACATGACTGCCAGCTGCAGCAAGAAGGGCACTGTGGCCTGAAGGGAGGGGTCACCCCCCCGCCCCCCCGAGCCTGCTGCCAAGCTCTCGTGGAACATTCTCAGGAGCTCTCGTCGGATGCTGTCCCCATGGCGGGAGGCCAAATGTCCCAGGATTCCCACAACAGAGGCAATCTTAGGCACACGCTTCTCTCCAGGGACAGCTGGGCTTGAGGGGAAAGTGTCCGCTGAAGGGGTTGGAGTAGGACCACCTGTTCCCCCACTGCCCCCTCCAGCCCCACTATGGACACAAAAATCCTTGAGGCCACAAGACAGGACACGAGA-GATGATCGTGCCAGGGAACGAGGAACCAATGTGGGCCACAACCCAGTCAAAGTGTGGGGAATGCTGGACAGAGGTGTCCAAGAGGGCATCCACACAGGCATCAGGACAACTGCCAATGAGCGCAGACAGGCACTGCACATAAATGTCCATCAGGGTCCGGGTGGCCCGGCAACCCATCCACAGTTGCAGCAGCTCATTAAGGGAGCCGGCGGCATGGGGCACCCGCTGGTGGCGGCCAGAGTACTTGCTGCTCAGCTGTCCCATGAGGTCAATAGACCAGGCACTAACCACTGGGGCCCAGGCCTTCGGGTTGGCCCGGATGAACTCAGAAAGCACTTGCTGCACCTCCTGAACAACATCTTCTAGACCAGGGCCCCCTGAAGGCACGTGGGAAGGGAGTGGCGGGCGGAGATGTTGGGGGCCTGTAGTAGCACCATCATCCAGTGTAGCTAGGTGGGCTCGGACACTTTCATCAAAGACACTCCTTAGGTGGTCAAGGACGGCTGCCCGTGCTGGGGGCAAGGAGCGAAGCAGGAGGAGACCACAGCGGGCATGGTCACGAGGTGACAGCTGATGTCCCAGAACTGGATCAACACCAGTTAGAAAGGCTTTTATCTCCTGAGCCAGCTCCTGGGCACTGTGAAGAAGAGAGAGAAGTTAGGCAGG 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TCACAGATCCTTTATAAAATCAACCATAATATTCAGAATTGTCAAGGCACAGGGGAAAATGAAGAAGCCTTTGTCAAAGGTGAAGAGCACTCCATGAAAACCATCTTCAATGTGGTGCCAGCTCACTGGCACCCCCTGATCGTCCAATATCTTCTTATACAACAGTGAGTCATCCCGAAGGACATCAAACTCACAACTCACAAGCAAGGTCTCAGGGAGTCGGGCAATGATGTCCTTGTCAGCAAATAGGGGTGAATTCATTGCCCAGAAGATCTGACTAGTTTCCAGGTAAACATTCTCATCAAAAGGGCCAGGAGACTTGGTCTGGTAGCCTTCCTGTTTGAATCGCTCAGGGATGTTGTGGACACCCACCCTTTCCTCACACTTATCCCGCATCTCAAGGGGTAGATGGGCACCATTCAGGAGAGCAGTTTTCCAAAGGATATCAATATCAAAATATTGGAATACACAGAAGAGGAAGATTTTCTGATTGAGGAATAAGGTATTTTTATAACGTTGGTGGGAAGGCAGCTGTAAATTAATTGCCTGCATAAAGGGATAGATCAGAATCTGAGCTCTTATCTTGGGGAGGTCTGGTTTGGTCACAAGCGTTTGGCAAATAGAAGCCACCATTGTTCCTCCAGCACTGTCACCACAGAAGGTGACATAAAATGGATCCACTCCATAAGTCTCCAGGTTCCTCAAGAAATGGACAGAAGCAGCCATGCAGTCATTTAAACCAGAAGGGTTCCTGTGCTCTGGAGCCAGGCGGTAACTAAAGAAGAGGGGAAAAGCA a score=2995 s mm8.chr4 143825299 118 + 155029701 TACTTACCCCACTGCCATTACCACCGAATCTGTCTCATGGGCCAGGTAACTGCAAGTGTTGTGGTAAGAATCTGTAAGGCAAGAGCAAATCTAATGCATCTCATGAGGAGGATGTAGA s monDom4.chr6 137403319 107 + 244784211 tactcacctaATTGATAGAACCACTGAGTTAGTTTCCCTAGCCAGGAAGCAGCATGTGCTGTGGTAGATGTCTGGAAAATA-----------AAGAGGTTTCATTAGTAGAATATGGA a score=6174 s mm8.chr4 143827724 333 + 155029701 AGCTACCTGCTAATAATTCCCAAAGGG-------------AATGTAGATATAGTTAGGTCAGTCATG-------AGAACCACTTCCTTTCCCATGCTTCAGAAATGCC--TCTTACCAAGGCTACCAAACACACCACCTCCTCCATGGTAAAAGATGATGCCTTTCCGGGGGCCAGAGGAGGTTGCCTTGGGCTGAAACAGTCTCACAGGAATTGTGCCAAAATGCATGTTCTTCACCAACACACCAAAGTTATTCTTTGAT------ACCAAGAGGTCTTGTATAAAGCAGAAAAAGCGGGGCATGGGGCAAATTTTCATCTTCTCCAGTACATTCCCCTGGGGAGACAAAGAACAAAAG s monDom4.chr6 137404337 355 + 244784211 AGTTACAATTTAACACTTCCCAAAGCATCAGAATGCTTCCAATGTGACCAACATAAGGGGAGCAATGCCTATGTGGATCTGATCCTTTTAAGAGGCCAAGGAAAATGTGATCTTACCCAGGCTCCCAATAAGCATACCCCCTCCATGGATGAAGATAATTCCTTTCCTGAGGCTTGCAGATCTTGCCTTTGGCTGATACAACCTCACAGGTACTGTCCCAAAGCATAAATTCTTTACC-ACAAGCTTTGGGTCCTCCTTGACTGGCAGACTAAGAA-----GTACAAAGCGAATAAATGTTAACTTTGAGCAGATTCCCAGTTTTTCACAAATCTTCGCCTATTAGGGGAAAGGGGAAAAG a score=5215 s mm8.chr4 143853817 121 + 155029701 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TTCATCAAGAGGAAGAAATTTGATGATGAGTTGGTGGAAAGTAGCCTGGCAAAATCATCCACACGGGCCAAGGGTGCCACAGGAGTGGAACCAGGGCGTTGCTCAGGGAGTGAACCTTCTTCCAGTGAAAAAAAGA a score=10741 s mm8.chr4 143854216 171 + 155029701 AGGTATCCAAGGCTCCCAGTACTCCTGTACCTCCCAGCCCTGCCCCAACCCCTGGGCTGACCAAGCGTGTGAAGAAAAGCAAACAGCCACTTCAGGTGACCAAGGATCTGGGCCGATGGAAGCCTGCAGATGACCTCCTCCTCATCAATGCTGTGCTGCAGAC-TAACGACC s monDom4.chr8 284285306 172 - 308469712 AGGTGTCCAAGGCATTGAGCACACCAGTACCCCCCAGCCCAGCCCCTGCCCCTGGCCTCACTAAGCGCATGAAGAAGAGCAAGCAGCCACTGCAGGTGACCAAGGACCTGGGCCGCTGGAAGCCGGCAGACGATCTCTTGCTCATCAATGCTGTGCTACAGGTATCACTACC a score=7760 s mm8.chr4 143854387 100 + 155029701 TGACATCTGTCCACCTGGGTGTGAAGTTCAGCTGCTGCTTCACCCTTCGGGAAGTTCAGGAGCGCTGGTACGCCCTGCTCTACGACCCTGTCATCTCCAA s monDom4.chr8 284285654 100 - 308469712 TAACGTCAGTCCACCTGGGTGTGAAATTTAGCTGCCGCTTCACCCTTCGAGAAATCCAGGAGCGCTGGTATGCCCTGCTGTATGATCCTGTCATCTCCAA a score=7879 s mm8.chr4 143854487 108 + 155029701 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s monDom4.chr6 107383402 1075 - 244784211 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s monDom4.chr2 283576783 2352 + 541556283 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s monDom4.chr3 498546173 2040 + 526135210 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a score=9307 s mm8.chr4 144969714 332 + 155029701 catacaggagagaaaccttacaaatgtagtgaatgtgacaaatgttttattcaaaaatgcagtctgataattcatcagagaattcatacaggagagaaaccttacaaatgtagtgaatgtgacaaagcttt-actgagaaagtcaatctgagaaggcatcagagaactcatacaggggagaattcttacaaatgtattgaatgtgacaaatgttttgcccaga-aatcctatcttgtttttaatcac--agaaat-catacattaaagaagccttacaaatgcagtcaatgtgacaaatgattttccca--------caaacttagtctgagaatgcatcagaga s monDom4.chr4 34975166 338 - 430141050 CACACAGGAGAGAAACCATATGAATGTAATCAATGTGGAAAGGTTTTTGCAGAGAGTTCCAAACTTGTTATACATCAGAGAATCCACACTGGGGAGAAACCTTATGAATGTAGTAATTGTAAAAGGGCTTTCACACAGAGCTCCAGTCTCACAAAACATGAGAGAATCCACATTGGAGAGAAACCTTATGTATGTAATCAGTGTGGAAAGGCTTT----CAGACACTGCTCTAGTCTTCATAATCACTTGGAAATCCACATAGGAGAGAAA-CTTATAAAAGTAATCAGTATGGGAA--GACTTTCACAGACAGATCTAAATTTGCTAtaggaaggaaagagaga a score=-180 s mm8.chr4 144970046 239 + 155029701 attcatacagtagagaaaacttacaaaaatgcagtgaatgtgataaatgctttactaataaaggcagactgagaattaatcagataatttatacatttaaaaaaacccttacaagtattttgtatgtgataaatgcagtacccacaacatcag--tctgacaaatcaaca---gatatttcaaacagtagagcaacattataaatgaaatgaatgagatagtcctttaa---caagaaatatcatct s monDom4.chr3 18216071 213 - 526135210 GGTCTTATTGGTGAGAAATCATATCAATGGG-AATGAATAGAAGAAGGCCTTTCACCAAAACAGAATTTGTAAAAT--GTCAGATAATTC---CGGTTGGGCAGAAC---------ATTTTGAA----ATGAATGCTG----CTCTAGTTCAGAAATTGCCCATTCAACACCGGTGATTTCATAATG-----------TATGAATGGAATGAAGTTGGGAAGGCCTTAAGCGCAGCAAATAGCATTT a score=9615 s mm8.chr4 144983820 385 + 155029701 GTCTTAAAT-ACTATGTAGTGTT-TCTCCAGGAGGTGGAGTGTTAGACTAGAGAAAGCAAAGCCATGGGTGAAACCTAATCTTTTCCTTTTTTGCTATTTT--GAGAAAGTTTTTATAGAAAACATAAATCACCGAATGGGCTCCCTAATTCTTTTAATTGCATCAATTCAGCAGAA-----TCCAATTACACTAGACTTTAAGAGGCAGGTATATTTTACTGATTGCATTACCATAATAATGATGGCATAGTAAAAATGG------CGAGCGTTTATAATTCCTCTCATTCTAACATGGCTTATCAAGCCAAGCCATACATGAAGCCTCCTGGCATCTCTGAAAGAGAAATCATGCACACAAACAGCAAACAAAGAGCTGCCTCTGAAAGTCTCCACCT s monDom4.chr8 208369466 352 + 308469712 GTTTTAAATTGTTATGTTGCATTGTTTCCAGCAGATGGAGTGATAGACTAGAGAAAGCAG---------------CCCAGCATTTTTTTTTTCACCATTTTATGTGAATGGCTCTCTATATAACCAGAAGCACTTGGTGGGCTC----------------GCAGTAATATGACAGACAGACCTTCGACTGTATTAGTGCTTAAGAGGCAGATATATTTAACTGATTGCATTATCATCATAATGATGGCATAATAGTAATAGGAGTACTTAGGGCTTATAATACTTCTCATTTTCTAAGTGCTTATCAAACCATA------ATTAAACTGCCTGACATCTTGG--AGAGAAGTTATCTAGTT--ACATCAAAGACAGAGCTTTCT-------TCTTCATCT a score=1206 s mm8.chr4 144992145 113 + 155029701 ACTAGGTTACACCCCTATCCTTCATCTTTACTATTTTTAAATTGCTCCTTACTTTATACCACTTTCTCTGCCACAAGAGGTATACACAAACATTTAAATGCATTATTAAGTAA s monDom4.chrUn 6297092 113 + 174229318 AATAGGTTTTTACTCTATTCTTTAAAAAAATTATCAATCATTTTCTCCTTTTCACCCTCCTTTTCCCCAAAAGCAAATACAAAACACAAAAGCTAATATACATAGTGAAGCAA a score=2316 s mm8.chr4 144993586 98 + 155029701 tagttctaaa---ctgaaaacatataTGCAGGTGCATGTGTGCGTGTGT--ACACACACAAATATATAGATAGAGAGATGATATAGAGATAGACTGGGCTATA s monDom4.chr5 177700691 103 - 308900514 TATTTCCAAAGTCCTAAAATCTTGGAATGGAGTGTGTGTATGTGTGTGTTCACACATGCATGTATATAGAAGAATATTCATTATAGACATaagcagtgtcata a score=-969 s mm8.chr4 144994989 599 + 155029701 CCCTCTCAATGACATAAGTAGTTACCTTCCCTTCCTACAGTCATTACACAGCTTCCCTCTGGGCAACACTGTCCAGGTTATCTAATATCTGG--GTCAACAtttctttttttttttctttttccttt---tcttttctt-------ttGAGTAACTGTCTTTCAGATATTGTCCAAAAGCTTAAGT----ATGCTTTTCCAGAGACTCTGGGTtctctctctctctctctctctctctctctctctctct-ctctctctctctct---------------------------ctctctctctc-tctctctccatct-------ctTGTATGTG------TGCAAGCTCTCGCTCTCATCTCAAC------ACCCCCTTTTATTAGAAATATACT-TTGTCTATATATCCTCaccaaagacattagagcgatggttctatgcaggcaccagctcaccctctccaa--------------gtttaatga---gttgtgtaggtgttgtcttcagca--ataaggcttgctgtcagtttgcagagagcaacctactgtcttggcaacacccagggttatttgggaatttctgtaggacccttttggccaacaactcaacaggatgtattcccagaactggaagcttcatttggtgtcaagacatggctagttgggactccttttc s monDom4.chr2 133822164 640 + 541556283 cctccttactgcctagagtattgaaattcccttcctataggtcttcttgactttacttattccccttgctgtc-aatttttcttatatcctgttgccaaaaaaaccttacattgttctggcttctttggttctttcctcaaaattcttgattagtttcctattgtcttctgagcaaaggttggatttcttaatctgtcactgaagatctacaatctggcatcatctccctatctatttgtttcctcttctactctctgcttatatagtcttagctccagtcaaattgtactactctctcccttataccttaccatctaagagcctttgtttataacattctctgtgcttTCTTTTACCTCTTTGCTAGTTGAATTCTTTTTTTTTAAAGTGTAATACTGTTTATTTTGCTTCA--AAAGACATTTCAGCA----TTCTAAACATACAAAAA---AACCCCTCAAAACATTCTAAATTTTGTTTAAGGACAGGCTTTTTCTTTTTTTTCTCTCGCATCATTGGCCTGGCTTTCTGTTTG---------ACTTACTT------AAACAAGGAGGAGCTCTACAGTTTTTCCATTTAAAACTACTGCACTTCAACTAAAAAGAA---AACCAAAAATCCAGACACTTTTCT-----------CATG-CCAGCTG---CCCCCCACC a score=-427 s mm8.chr4 144995588 313 + 155029701 cctcatcatttgggaatttttttaggatggccttcatatattttagaaagt----cactgaactgggttcgcatactgtccctcaaatgcctgccaattctagctgtctctcactggattcctttcctcaaccccattt-------cccctcctcaaaccccgtattcctctctgggtctatgattagcatt---tatttgatggctaatatttacatataagcaaata-----cataccatat--ttatctttctgggtctgagtaacttcactctgaatgacttttttcgagttctatccatttgc--ttacaaacttcatga------tgtcatttt--tt s monDom4.chr3 285489641 321 + 526135210 cctcatatcttgggcttctctttagacaactccttttgttcttttaataatggtttaccaatctgtcttcacatttccactcttgaaagattcc----ttcaatggcatcttattta--tccatttttagaaatcatttgaaagcttctctttttagaaatcat---------ttgaaatcttcttagaattaaatgtcagattatagatctcttcatatttgtcaaaaattctcatacaaaatcattacctggctgcttctgat--atttatatccaaataaccaattatttgtt------attggcaattaTAAACTTCTTGAattttattttattttattt a score=21567 s mm8.chr4 144995901 524 + 155029701 taatatacattattttattACAAA---TTTAAAAAAAAAACAAAAAAATGCAACATCCTAAAAAATTTT----TTTACTGGTAATACAAATTCCTATGAAGTTTTTTTTTTTTTTGCTAGCATAA-----------GAAATT--AAAAAAGCCATTAAATATTTAGAAACATTCAACATCAAAAGCTTTAAA-TCTAACTGTAGTTGTAGCCCCTGAAAAAGCTACAAACTCTTCTTAAAAAGTA----TTTTCTCTACAAAGAATCTCATCAGCTATACAAAAATCTGTACAGTTTTTATACTGAAGCTAATGTTGAGCTGCACTTGAATTTCACATTCTTAGCAAAATAATTGCCTG------AGCAAATATACTCCACACTTTAGGACAGCCActtattcttcatcctcctcttcttcctcttcatcttcctcctcttcctcctcttcttcctcctc---ctcatcttctggttcgttcttcttTGAGCCTGTTGGCCTACCAGGACCCTTCTTTCCTGCTTCACTTTTGCCCTTGGCACGGTATGCAGCAATAT s monDom4.chr5 212652069 532 - 308900514 TAATGTACATCATTTTATTACAAAATATTTATCTTAAAAA-AACAAAATGCAACA--CTATAAAACTTAAAGATTTGCTA-TGATACTACTTTCTAGGA-------CTTTATGGTGCTACAACAATACACTGTCAAGAAATTCAAAAGAAACCATTAAATATGCAGAAACATTCAACATCAGAAGCTTTAAAATCTATCTGGAGT----GTCCCCTTGAAAGCTTCTA-CTTACATTAAAAAATAGAGGTTCTCCCTACAAAGAATCACGTTACCTATACACAAGTCTGTACAGTTTTTATACTGAAGCTAACAATGAGCTGCACTTGAG-TTCACATTCTTAGCAAAACAATGACTTTCATCACACACAAAAAAATCTTTACAACAGGATATTCATTTACTCTtcatcatcatcctcctcatcctcatcttcctcatcttcatcttcttcctcttcatcaGGCTCATTC---------TTCTTCTTCGATCCTGTTGGCCTGCCAGGGCCCTTCTTTCCTGCATCTCCCTTGCCCTTGGCACGATATGCTGCAATAT a score=12146 s mm8.chr4 144996425 195 + 155029701 CCTTTTCATACTTCTCCTTTAGTTTAGCTACTTTCTGCTCATACGGTTGTTTATCTTTGGCAGATTGCTCAGACCACATCTCACCCAGTTTCTTCGCAGTATCTCCAATAGACAGGCCTGGGTGTTCAATTTTGATCTTTGGGCGATTTTCAGAGCAAAACAGGAAGAAGGCAG---------ACGGTGGTCTCTTCGGAGCAT s monDom4.chr5 212652910 204 - 308900514 CCTTTTCATATTTCTCCTTTAGTTTAGCAACTTTCTGTTCATAAGGTAGTTTGTCTTTGGCGGATTGTTCAGACCATAGTTCCCCCAGTTTCTTAGCAGTATCTCCAATTGAAAGGCCTGGATGTTCACTTTTGATCTTTGGGCGATGTTCGGCACAGAAGAGGAAGAATGCAGATCTGAGAAATGATTGATTTTATAAAGCAT a score=3171 s mm8.chr4 144996649 98 + 155029701 CCTTTGGGAGGAACATAGTTCTTCATCTCCCTGT---------------------CATAA---------------------CGAGCTTTGTCGCTCTTGGCCAAATCTTCAAACTTGGACTTTTCCTTTGAAGACATGGT s monDom4.chr5 212653207 140 - 308900514 CTCTTGGGAGCATTAGGATCCTTTTTCTTTCCTTTCTTATCACCTTTGGGAGGCACATAATTTTTCATCTCCCGATCATACCGAGCTTTATCTCCTTTTGCAAGGTCTTCGAACTTGGACTTTTCTTTTGCAGACATGGT a score=11104 s mm8.chr4 144996747 179 + 155029701 CTTCCATCTCTCGGAGCATTTCTTGGAGAACTCAGCGAAGTTCACCGACGAGTCGGGATGCTTCTTCTTGTGCTCCTCGCGGCAGGTCTGCACGAAGAAGGCGCGTACGAGGACATTTTGCCCCGCGGCTTGTTGGGGTCACCTTTATCCATGATGACGGCTCGGCGTCTGTCTACCTG s monDom4.chr5 212653634 173 - 308900514 CTTCCATCTCTCGGAGCACTTTTTGGAGAACTCCGCAAAGTTTACAGGGGAGTCCGGGTGCTTCTTCTTGTGCTCCTCCCGGCAGGTCTGCACGAAGAAA--GCGTAGGAGGACATTTTGCCCCTCGGCTTGTTGGGGTCTCCTTTACCCATCCTTAA----CAGCTTCTCTCTATCTT a score=5064 s mm8.chr4 144996926 130 + 155029701 CTGCGAGCGCTGCTT--CCCTCAGACCTCCGC---AGAGAGACTTCCTTCCCC-----AAGCTCCGGC-GAGAACTGGTTTCTTGCTAACGCAATCCCCAGCCTCTTGTTTTGCAGAGTTCTCCGCGCCACGGCAACTTGA s monDom4.chr5 212654453 141 - 308900514 CTGTAGGAGCTCCTTGGCTTTCTCACCGTAGCTGGAGCGGCGCTTCCTCCTCACTCAGGGGCTCCTGCAGCGAAATGGTTTATCTCTAACGCAATCCCCAGCCTCTTGTTTTGCACTGTTCTCCCCGCCACTGCAACTTGA a score=-2511 s mm8.chr4 144997056 593 + 155029701 Ccatgatgtcat-----tttttaacagctgaataatgctctattgtataaat-----gtaccacattttatttatccattca-tctgttgacatctaggttatctccattttctggctattat-------gaataaag-----------atacaatgaaatggttgagcaagtgtccttgtggtaggatgaagt----gtcctttg---ggtatgtggctgaaagtggtatagctgggtcttgagatagattcccatctttcagagga---------acccacatgttgatttccataatggctgtgcaagtgtgcactccaccagcaatggaggctcctccaagtttctcttgcgccacatctctgccatcatatgctctcacttgtgttattgatcttaaccattctgacaagtctaagacagaa--ttttaaattagttttgtgtttgttctttaatggctaagg------atgatgaacatttctttaggtgtttctcagacatctgagatctc---tctattgagaattctgtttagatctgttcctcattttttaattgg-----------tttattttttttaaaaagtatatggttccttgagttct--ttatatattttagatactagccctctattggatgtggaattggtt s monDom4.chr3 285491099 634 + 526135210 ccattatatagtagatgtttagaaatgctcattgatGTCCTGAAGAATGATTGGTGAGTTTCAGGTTCTGAATATCAAGAAAGTCTGAAAATGATTAGTGACTTTGAGTTTGAAGAAGATTGTCCTTGCAAAaaaaagagatctgtaacatatgttcagataattgaa-----gtcctt-catcattatgaaatcatactactttgtcagatttatg------aattgtttctctaacacctcagctatttcccctctctgaagagaactgaggtatacccaagtgatgatatcattaatgtttctgccaatat---cttcaccaa-aattccctctatcacaaatatatctt---ctttatgactattgctactttctttctctccttttaccaaatttcttcatttt-acatgaatatttcaaaatctttcaaaatcttattataaacatgtcttacttaccaaagtccctagtgatatttattaagccaaatttcacttcttgctttaagtgctctagttcacctttcatgttactcagacttgtacaccattagatgaatagaccttagaatatttaatttctt---atattata---tctcttaatttctaattatgtctgccagtttct--ttctatattgtagatggtcttagtt a score=-539 s mm8.chr4 144997649 396 + 155029701 taaaaaaatcttttcccattacataggctgttacatggtctgattgatggtgcc--ctttgtcttacagaaagttttcaaatttttgcggtcctgt--------ttattaattcttgatcttagagcctaaactaatggtg--ttctggtcacatagtcttctactgtgccattgactttaagggtagtccccat-tttctattttattatattcagtgtaactatttttatgttgaagtctttgaatcatttagagttgagttttgtgaaaagtactaagtatggatctattttcattcttctacattgagctttctaAATCTTCTGAATCCCCACCTGATCTTTGGCCATGCAGCTGCTTGCTGACATCCTTGCTTAATTTGAAAGGTATGACTTTCTCTCAATCTC s monDom4.chr3 55067507 366 + 526135210 ttaaagaatgattctc--ttacatgagctgttgcacctccttttccatttggccagttctactttttaagctgttactttatttttgtattactttcatttctcttcctcgtttttcttctacctcccttatttatttttgaattccttttaga-attcttcca----------gagcctgaaactaattcctatctttccatggagtt---ttgcatgtaactgctttgatctcatttttccccagccttttttttttaacttttacttttatcttaaaggtggattttgatctcaggctagagta-tgtacactcttaaacttcagtttttcc------------------------cttgctgctacccttacttagtt--atagttctgattttcttcaagtttc a score=14767 s mm8.chr4 145011690 891 + 155029701 agggAGGCTCGCGCCCCGCCCCCCTCTGGAGACTCAGGAGGCTAGTGTGACCCCGCGTAACTTGTCAGTCAAACG------CCTTCCTCCACCCCCCCCCCCCGCGAGGACCTCCCCCCGGGCCG---------CGGTAGCGCGCACGCACGCGCACAGAGTCCCCCCTCACCGGAGCCAGCCACCCTCTCAAGTTGTAGCAGTTGCTTCCC--------GGGCGTGCTCCGTGGGC----GGCCGGTAGGCG---CGGGAGGCTGAGCGAGG--------------------GCAACGCtccaaggatccaaggat----ccaaggatcGGGG--TGCGGGT-----GGCCGCCCCGGGCGATGAGGGGCCATCGCTGAC---------------------------AGGAGAACGAGCGCTCGGCGGCGGCTCGGGCGGACAGCGCGGGCGGCAGCTGCTGAAGACCTGTCCGGACTCC------GCCCGCTAAGGGG-------CCGTCAGGCCTGCC-----CGGCGTCCGCACCCGC-GCGCTCGCCCCAGCGGT-------------------CCACACTTCGGG---TTCCCCTCCG--TCCGCCCTCTTCCG------GGCGTCAGTAACTT------------GTgcggcccgcgcgcccccgccagcc----ccgggaggcggc----agcgcggcgcggggAGGCGGC------------------------------------------AGTGAGGCGCTGTCGGGTGAGGAGCAGCTC--------------------GCGGAGCGCGAGGGCGGCACGGCCGGCCCGGGACGCAGGGGCGCAGGCCCGTCGTGCCTGTGCTCCGCCGATTGCCCGGGCCA--GCCACCGGGG----------GAGGCGCC-----GAGCGCCCGGGTC-----GCCGAGATGTCGTCGCCGTCGCCGCCCGCACCAGTTGCCTGCGCCACCATCTCGGCCTCGGATAAAGTGGATGGCTTGACCCGGAAATCGGTGCGCAAGGCGCAGAGGCAGAAGCGCTCTCAGGGCTCCTCGCAGTTCCGCAGCCAGGGCAGCCAGGCGGACCTGCACCCCCTGCCCCAGCTCAA s monDom4.chr2 120396997 1107 + 541556283 AGTGAATCTCTTCCCCTCCCCTCCACCCCCCCCCCCCAAGCTTAAT-TAGCTTCTCGGTTTTCGTCAGTGACACAAGCTCCTCTTCCTCCCTCCTCCCCCGCCGCAGGCCCCTCCCTCCTGCTGGGTGAACTCCTGGCTAGGAGTGCGGGCGCGCACA-------CCCTCCCCAGTATCCTCCACCCTCACAAGTTGTAGCGGTCGCTGCGCTGCGCTGCGGGGGTTGGTCGTGGGCTGTAGACTGGCAGGCGGGCCGGGTGGGGGAGGGGGGTTTGAACTTGGCGGCGCGGAGCCGAGCGCCTGGGAGCTGGGAGTGGTGTGGAGGGTCAGGGACTGCGGGTCCACCTCCTACTCCGGGT-ATGAGGGGCGGCCACTGACCAGGGGCAAAGAGACACCAAGGGGGTGGGGGGAACATCCCGGCAGCGGCGAGTGGTGGCAACAGCAGTGGCAGCAACAGCTCGGG--CCGTGCGGAGCCCCGGGATGGCCGCGGCAGGGGAGCCTCCCGGCAGGAGTACCAAAAGCGGCAGCGGCAATTGAAGCGCTCTCCTGGACGGCTTTCTATATCCTTCCCTCCCCGCACTCCAAGGAACTTCCCTCCAGCTCCGCCCGCCTTCGACGACCGCAGCCCCTAACTTCTCGCAGCCCGGGAGAAGCGCGTGCGGCGCTGGGAGCCTAGCCCGAGATGGGGCTCTGAAGACGTAGTGGGGAGGCGGCCGGCGGGCCAGGGGCAGGAGGAGCGAGAAGAGGAGAAAAAGGAGTGGAGTGCT-CCGGAGGCGCGGGAGCTTTTGGTTCCCCTTCTCTGGGAGCTGAAGGTGGGGAGGGTGCGGGCAGCTGGGGGTGACGGGGC-CGGGGAGGGGGGGCTTCCGCTCCTCCTTCTCCTCCTGCCGTGACCACCGCCGCCGCCTCCATGCAGCGCCAGCCTGAGCTGCCGGGTTCGGGGGCCGCGATGTCGTCGTCGTCCCCG------------GCCAGCGCCGCCATCTCAGCCGCGGAGAAAGTGGACGGCTTCACCCGGAAATCGGTGCGCAAGGCGCTGAGGCAGAAGCGCGCGCAGGGCTCGTCGCAGTTCCGCTGTCAGAGCAACCTGCCCGAGCTGCAGCCCTTGCCCCAGCTCAA a score=14869 s mm8.chr4 145012581 207 + 155029701 AGATGCCACTTCAAATGAACAGGAAGAGCGTTTCTGCCAGAAGCTACAACAGTGCTGTGTACTGTTTGATTTCATGGACTCTGTTTCAGACTTGAAGATCAAAGAAATTAAAAGAGCGACACTGAATGAACTGGTTGAGTATGTTTCAACTAATCGTGGTGTAATTGTTGAATCAGCGTATTCTGATATAGTAAAAATGATCAGTGC s monDom4.chr2 120449438 207 + 541556283 AGATTCCTCTTCAAATGAAAAACATGAGCTTTTCTGTCAGAAGCTGGAGCAGTGTTGCGTACTATTTGATTTCATGGACTCTGTTGCAGACTTGAAAAGCAAAGAAATTAAAAGGGCAACACTGAATGAACTGATTGAGTATGTTTCAACAAATCGTGGTGTGCTTGTTGAATCAACGTATTCTGATATAGTGAAAATGGTAAGTTC a score=6045 s mm8.chr4 145012789 91 + 155029701 AACATCTTCCGGACACTTCCTCCAAGTGATAATCCAGATTTTGACCCGGAAAAGGATGAGCCCACACTTGAGGCCTTTTGACCTCACTTAC s monDom4.chr2 120456505 91 + 541556283 AATATCTTCAGGACCCTTCCTCCAAGTGATAATCCAGACTTTGATCCTGAAGAAGATGAACCAACCCTTGAGGCTTCATGGCCTCACATAC a score=2761 s mm8.chr4 145012880 39 + 155029701 AGTTTGGTGTATGAATTCTTCTTAAGATTCTTGGAGAGT s monDom4.chr2 120461857 38 + 541556283 AGTT-GGTATATGAGTTCTTCTTAAGATTTTTGGAGAGT a score=9457 s mm8.chr4 145013103 251 + 155029701 taaataaataaatctttaaaaaaaaaagaTTTTTGGAGAGTGCTGATTTCCAGTCCAGCATTGCAAAGCGATACATTGATCAGAAGTTGTCCAACTGCTCCTGGAGCTTTTTGATAGTGAAGATCCACGGGAGCGCGACTTCCTGAAGACCGTCCTAAATCAGATTTATGGCAAGTTCCTTGGCCTGAGAGCGTTCATCAGAAAGCAGATTAACAACATTTTCCTCAGGT------TTATATATGAAACGGAACATT s monDom4.chr2 120465158 242 + 541556283 TATATGATTTAGGAATTAAAAGTAAAATGAGTTTTCAGTTTGATTATTTTTAAAAAAGTA--------------ATTTCTCAGATTTTTTTTAAA-GCTCTTGGAGCTTTTTGATAGTGAAGATCCCAGAGAGCGTGACTTCTTGAAGACGGTTCTGCATCGAATTTATGGGAAATTCCTTGGATTAAGAGCATTCATCAGAAAACAGATTAACAACATTTTCCTCAGGTAAGCAGTTATATGTACAATTTATCCTT a score=2356 s mm8.chr4 145013354 35 + 155029701 TCAGTGGTGTGGCTGAGCTCCTTGAAATATTGGGA s monDom4.chr2 120468177 35 + 541556283 TTAATGGTGTTGCCGAACTCCTTGAGATATTAGGA a score=7645 s mm8.chr4 145013389 109 + 155029701 AGTATCATCAATGGCTTTGCATTGCCAGTGAAAGCAGAGCATAAGCAGTTTCTAATGAAGGTTTTTATTCCTATGCATACTGCAAAAGGATTGGCCTTGTTTTATGCAC s monDom4.chr2 120469315 109 + 541556283 AGTATTATCAACGGTTTTGCCCTGCCTCTGAAAGCAGAACATAAACAGTTTTTAATGAAGGTTTTAATTCCTATGCATACTGCTAAAGGATTGTCTTTGTTTCATGCTC a score=3771 s mm8.chr4 145013498 55 + 155029701 AGCTGGCGTACTGTGTTGTGCAGTTCCTGGAGAAAGCCACAACGCTGACAGAGCC s monDom4.chr2 120470161 55 + 541556283 AGCTAGCCTACTGTGTGGTACAGTTCCTGGATAAAGACACAACACTAACAGAACC a score=4042 s mm8.chr4 145013553 48 + 155029701 GGTGATCAGAGGACTACTGAAATTTCGGCCAAAAACATGCAGTCAGAA s monDom4.chr2 120474869 48 + 541556283 GGTGATCAGAGGATTGCTGAAATTTTGGCCAAAAACATGCAGTCAAAA a score=14727 s mm8.chr4 145013601 249 + 155029701 AGAGGTGATGTTTT-AGGAAAAATTGAAGATGTCTTAGATGTCATTGAACCAACACAATTCAAAAAAATTGAAGAGCTGCTTTTTAAGCAGATATCCAAGTGTGTCTCCAGCTC---------------------------------ATTTC----------------------------------------------------------CAGGTTGCAGAAAGAGCACTGTAATTCTGGAATAATGAATATATTCTTAGTTTGATTGAAGAGAATATAGATAAAATCCTGCCAATCATGTTTGCCAGCTTGTATAAAATTTCCAAAGAACACTGGAATCA s monDom4.chr2 120475183 341 + 541556283 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TCATCAAATTATTCATACTGGAGTAAAACCATTTAAATGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTTAGTCAAAAGAGAAAACTTATTAACCATCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCATTTAAATGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTTAGCTGGAAGGAAAGTCTTATCACTCATCAGAGTACTCATACTGGAGAAAAACCATTTGAATGTAATGAATGTGGAAAAACTTTCAGTGCAAGGAAAAGTCTTATAAAACATCAGAGCATTCATACTGGAGAGAAACCATTCCAGTGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTTAGCTGGAAGGGAAGTCTTATTATCCATCAGAGAACTCATACTGGAGAGAAACCATTTCAGTGTAATGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTCATAAAAGAAGATTTATTATC--------CATCAGAGAATACATACTGGAGAGAAACTATTTGAATGTAATGAATGTGGGAAAGACTTTAGTTGTAAGGAAAGTCTTATTAC-CCATCAGAGAACTCATACTGGAGAGAAACCATTTAAATGTAATGAATGTGGGAAAGCATTTAGCCAAAAGGGAAGTCTTAATATCCATCTGAGAACTCATACTGGAGAGAAACCATTTGAATGTAATAAATGTGGAAAAACCTTTAGTCATAAGAAAAGTCTTGTCGTCCATCAGAGAACTCATACAGGAGAAAAATAATTTAAATGTAATAAATGTGAGAAAACTAATAGTCTTCAGAGAATACTTATCTATCAGAGAAC-TCACTGA----------GGAGAAACCATTGGAATGTATAATCATTGTGAGAAAACTTTTATTGTAAGGGATAATTTTATCAGGCATCAGAGACCTCACACTGCCAAGAGACCATTTGAATGTTAGTC-CTAAGAGAGGCTTTTTTATTCATTAGAGAACTCATGCAGGAGAGAAATAA-----TTTTAATGTGATCCATGTAAGAAAACTTTTAGTCATTAGAGAACACATCTATCAA-------AGAACTCAGTAGAGATAAACCATTGAAATGTAATCAATGTGGGAAAACTTTTAGTACAAGGGGAAACT 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CTTTGAGCTGGGGCAGGGGGTGCAGGTCCGCCTGGCTGCCCTGGCTGCGGAACTGCGAGGAGCCCTGAGAGCGCTTCTGCCTCTGCGCCTTGCGCACCGATTTCCGGGTCAAGCCATCCACTTTATCCGAGGCCGAGATGGTGGCGCAGGCAACTGGTGCGGGCGGCGACGGCGACGACATCTCGGC-----GACCCGGGCGCTC-----GGCGCCTC----------CCCCGGTGGC--TGGCCCGGGCAATCGGCGGAGCACAGGCACGACGGGCCTGCGCCCCTGCGTCCCGGGCCGGCCGTGCCGCCCTCGCGCTCCGC--------------------GAGCTGCTCCTCACCCGACAGCGCCTCACT------------------------------------------GCCGCCTccccgcgccgcgct----gccgcctcccgg----ggctggcgggggcgcgcgggccgcAC------------AAGTTACTGACGCC------CGGAAGAGGGCGGA--CGGAGGCGAG---CCCGAAGTGTGG-------------------ACCGCTGGGGCGAGCGC-GCGGGTGCGGACGCCG-----GGCAGGCCTGACGG-----CCCCTTAGCGCGCGGAGTCCGG------ACAGGTCTTCAGCAGCTGCCGCCCGCGCTGTCCGCCCGAGCCGCCGCCGAGCGCTAGTTCTCCT---------------------------GTCAGCGATGGCCCCTCATCGCCCGGGGCGGCC-----ACCCGCA--CCCCgatccttgg----atccttggatccttggaGCGTTGC--------------------CCTCGCTCAGCCTCCCG---CGCCTACCGGCC----GCCCACGGAGCACGCCC--------GGGAAGCAACTGCTACAACTTGAGAGGGTGGCTGGCTCGGGTGAGGGGGGACTCTGTGCGCGTGCGTGC----------GCGCTACCGCGGCCCGGGGGAGGTCCTCGCGGGGGGGGGGGGGGTTGAGGAAGGCGTTTG----ACTGACAAGTTCCGCGGGGTCACACTAGCCTCCTGAGTCTCCAGAGGGGGCCGGGGCGCGGG s monDom4.chr2 421158177 1096 - 541556283 CTTTGAGCTGGGGCAAGGGCTGCAGCTCGGGCAGGTTGCTCTGACAGCGGAACTGCGACGAGCCCTGCGCGCGCTTCTGCCTCAGCGCCTTGCGCACCGATTTCCGGGTGAAGCCGTCCACTTTCTCCGCGGCTGAGATGGCGGCGCTGGC------------CGGGGACGACGACGACATCGCGGCCCCCGAACCCGGCAGCTCAGGCTGGCGCTGCATGGAGGCGGCGGCGGTGGTCACGGCAGGAGGAGAAGGAGGAGCGGAAGCCCCCCCTCCCCG-GCCCCGTCACCCCCAGCTGCCCGCACCCTCCCCACCTTCAGCTCCCAGAGAAGGGGAACCAAAAGCTCCCGCGCCTCCGG-AGCACTCCACTCCTTTTTCTCCTCTTCTCGCTCCTCCTGCCCCTGGCCCGCCGGCCGCCTCCCCACTACGTCTTCAGAGCCCCATCTCGGGCTAGGCTCCCAGCGCCGCACGCGCTTCTCCCGGGCTGCGAGAAGTTAGGGGCTGCGGTCGTCGAAGGCGGGCGGAGCTGGAGGGAAGTTCCTTGGAGTGCGGGGAGGGAAGGATATAGAAAGCCGTCCAGGAGAGCGCTTCAATTGCCGCTGCCGCTTTTGGTACTCCTGCCGGGAGGCTCCCCTGCCGCGGCCATCCCGGGGCTCCGCACGGCCCGAGCTGTTGCTGCCACTGCTGTTGCCACCACTCGCCGCTGCCGGGATGTTCCCCCCACCCCCTTGGTGTCTCTTTGCCCCTGGTCAGTGGCCGCCCCTCAT-ACCCGGAGTAGGAGGTGGACCCGCAGTCCCTGACCCTCCACACCACTCCCAGCTCCCAGGCGCTCGGCTCCGCGCCGCCAAGTTCAAACCCCCCTCCCCCACCCGGCCCGCCTGCCAGTCTACAGCCCACGACCAACCCCCGCAGCGCAGCGCAGCGACCGCTACAACTTGTGAGGGTGGAGGATACTGGGGAGGG-------TGTGCGCGCCCGCACTCCTAGCCAGGAGTTCACCCAGCAGGAGGGAGGGGCCTGCGGCGGGGGAGGAGGGAGGAAGAGGAGCTTGTGTCACTGACGAAAACCGAGAAGCTA-ATTAAGCTTGGGGG------GGGGGGGTGGAGGGGAGGG a score=420 s mm8.chr4 145308437 152 + 155029701 GGAGAAACTGAGTTTCTTTTCAAAGTTCTTAGTCTTATTAATAAAATGAATTAAAAGTGGACTTATTAGGAAAAGAAAGGGCCCTTTATTAGATCTTGAGAGGAA---AATAACA-----------GTCAAGCAAGTTGCAAATCTTAGCAGTTGCCAGGGAGAGG s monDom4.chr2 283575552 152 + 541556283 ggggaaatttatatcctt----gagttcatatattaacaaattagggagagcagaggttaatgagttggacatgcaaa--------tcaaaaaccttgaaagcaaccaaataaaaaatccccagatgaaaaccaaattagagatcctaaaaatta--agggagaaa a score=-633 s mm8.chr4 145308589 396 + 155029701 GAGATTGAGAGAAAGTCATACCTTTCAAATTAAGCAAGGATGTCAGCAAGCAGCTGCATGGCCAAAGATCAGGTGGGGATTCAGAAGATTtagaaagctcaatgtagaagaatgaaaatagatccatacttagtacttttcacaaaactcaactctaaatgattcaaagacttcaacataaaactagttacactgaatataataaaatagaaa-atggggactacccttaaagtcaatggcacagtagaagactatgtgaccagaa--caccattagtttaggctctaagatcaagaattaataa--------acaggaccgcaaaaatttgaaaactttctgtaagacaaag--ggcaccatcaatcagaccatgtaacagcctatgtaatgggaaaagattttttta s monDom4.chr3 471067337 366 - 526135210 gaaacttgaagaaaatcagaactat--aactaagtaagggtagcagcaag------------------------ggaaaaactgaagtttaagagtgtaca-tactctagcctgagatcaaaatccacctttaagataaaagtaaaagttaaaaaaaaaaggctggggaaaaatgagatcaaagcagttacatgcaa---aactccatggaaagataggaattagtttcaggctc----------tggaagaat-tctaaaaggaattcaaaaataaataagggaggtagaagaaaaacgaggaagagaaatgaaagtaatacaaaaataaagtaacagcttaaaaagtagaactggccaaatggaaaaggaggtgcaacagctcatgtaa--gagaatcattctttaa a score=-2389 s mm8.chr4 145308985 593 + 155029701 aaccaattccacatccaatagagggctagtatctaaaatatataa--agaactcaaggaaccatatactttttaaaaaaaataaa-----------ccaattaaaaaatgaggaacagatctaaacagaattctcaataga---gagatctcagatgtctgagaaacacctaaagaaatgttcatcat------ccttagccattaaagaacaaacacaaaactaatttaaaa--ttctgtcttagacttgtcagaatggttaagattaataacacaagtgagagcatatgatggcagagatgtggcgcaagagaaacttggaggagcctccattgctggtggagtgcacacttgcacagccattatggaaatcaacatgtgggt---------tcctctgaaagatgggaatctatctcaagacccagctataccactttcagccacatacc---caaaggac----acttcatcctaccacaaggacacttgctcaaccatttcattgtat-----------ctttattc-------ataatagccagaaaatggagataacctagatgtcaacaga-tgaatggataaataaaatgtggtac-----atttatacaatagagcattattcagctgttaaaaa-----atgacatcatgG s monDom4.chr3 240643477 634 - 526135210 aactaagaccatctacaatatagaa--agaaactggcagacataattagaaattaagaga---tataatat---aagaaattaaatattctaaggtctattcatctaatggtgtacaagtctgagtaacatgaaaggtgaactagagcacttaaagcaagaagtgaaatttggcttaataaatatcactagggactttggtaagtaagacatgtttataataagattttgaaagattttgaaatattcatgt-aaaatgaagaaatttggtaaaaggagagaaagaaagtagcaatagtcataaag---aagatatatttgtgatagagggaatt-ttggtgaag---atattggcagaaacattaatgatatcatcacttgggtatacctcagttctcttcagagaggggaaatagctgaggtgttagagaaacaatt------cataaatctgacaaagtagtatgatttcataatgatg-aaggac-----ttcaattatctgaacatatgttacagatctctttttTTTGCAAGGACAATCTTCTTCAAACTCAAAGTCACTAATCATTTTCAGACTTTCTTGATATTCAGAACCTGAAACTCACCAATCATTCTTCAGGACatcaatgagcatttctaaacatctactatataatgg a score=4964 s mm8.chr4 145309578 129 + 155029701 TCAAGTTGCCGTGGCGCGGAGAACTCTGCAAAACAAGAGGCTGGGGATTGCGTTAGCAAGAAACCAGTTCTC-GCCGGAGCTT-----GGGGAAGGAAGTCTCTCT---GCGGAGGTCTGAGGG--AAGCAGCGCTCGCA s monDom4.chr5 96245920 140 + 308900514 TCAAGTTGCAGTGGCGGGGAGAACAGTGCAAAACAAGAGGCTGGGGATTGCGTTAGAGATAAACCATTTCGCTGCAGGAGCCCCTGAGTGAGGAGGAAGCGCCGCTCCAGCTACGGTGAGAAAGCCAAGGAGCTCCTACA a score=10882 s mm8.chr4 145309707 178 + 155029701 GCAGGTAGACAGACGCCGAGCCATCATCATGGATAAGGGTGACCCCAACAAGCCGCGGGGCAAAATGTCCTCGTACGCGCCTTCTTCGTGCAGACCTGCCGCGAGGAGCACAAGAAGAAGCATCCCGACTCGTCGGTGAACTTCGCTGAGTTCTCCAAGAAATGCTCCGAGAGATGGA s monDom4.chr5 96246706 172 + 308900514 GAAGATAGAGAGAAGCTGT----TAAGGATGGGTAAAGGAGACCCCAACAAGCCGAGGGGCAAAATGTCCTCCTACGC--TTTCTTCGTGCAGACCTGCCGGGAGGAGCACAAGAAGAAGCACCCGGACTCCCCTGTAAACTTTGCGGAGTTCTCCAAAAAGTGCTCCGAGAGATGGA a score=3362 s mm8.chr4 145309885 100 + 155029701 AGACCATGTCTTCAAAGGAAAAGTCCAAGTTTGAAGATTTGGCCAAGAGCGACAAAGCTCG---------------------TTATG---------------------ACAGGGAGATGAAGAACTATGTTCCTCCCAAAGG s monDom4.chr5 96247165 142 + 308900514 AGACCATGTCTGCAAAAGAAAAGTCCAAGTTCGAAGACCTTGCAAAAGGAGATAAAGCTCGGTATGATCGGGAGATGAAAAATTATGTGCCTCCCAAAGGTGATAAGAAAGGAAAGAAAAAGGATCCTAATGCTCCCAAGAG a score=11946 s mm8.chr4 145310014 193 + 155029701 ATGCTCCGAAGAGACCACCGT---------CTGCCTTCTTCCTGTTTTGCTCTGAAAATCGCCCAAAGATCAAAATTGAACACCCAGGCCTGTCTATTGGAGATACTGCGAAGAAACTGGGTGAGATGTGGTCTGAGCAATCTGCCAAAGATAAACAACCGTATGAGCAGAAAGTAGCTAAACTAAAGGAGAAGTATGAAAA s monDom4.chr5 96247400 202 + 308900514 ATGCTTTATAAAATCAATCATTTCTCAGATCTGCATTCTTCCTCTTCTGTGCCGAACATCGCCCAAAGATCAAAAGTGAACATCCAGGCCTTTCAATTGGAGATACTGCTAAGAAACTGGGGGAACTATGGTCTGAACAATCCGCCAAAGACAAACTACCTTATGAACAGAAAGTTGCTAAACTAAAGGAGAAATATGAAAA a score=22338 s mm8.chr4 145310207 527 + 155029701 GGATATTGCTGCATACCGTGCCAAGGGCAAAAGTGAAGCAGGAAAGAAGGGTCCTGGTAGGCCAACAGGCTCAaagaagaagaacgaaccagaagatgaggaggaggaagaagaggaggaagaggaggaagatgaagaggaagaagaggaggatgaagaataagTGGCTGTCCTAAAGTGTGGAGTATATTTGCT------CAGGCAATTATTTTGCTAAGAATGTGAAATTCAAGTGCAGCTCAACATTAGCTTCAGTATAAAAACTGTACAGATTTTTGTATAGCTGATGAGATTCTTTGTAGAGAAAA----TACTTTTTAAGAAGAGTTTGTAGCTTTTTCAGGGGCTACAACTACAGTTAGA-TTTAAAGCTTTTGATGTTGAATGTTTCTAAATATTTAATGGCTTTTTT--AATTTCT------TATGCTAGCAAAAAAAAAAAACTTCATAGGAATTTGTATTACCAGTAAA----AAAATTTTTTAGGATGTTGCATTTTTTTGTTTTTTTTTTAAA---TTTGTaataaaataatgtatatta s monDom4.chr5 96247911 534 + 308900514 GGATATTGCAGCATATCGTGCCAAGGGCAAGGGAGATGCAGGAAAGAAGGGCCCTGGCAGGCCAACAGGATCGAAGAAGAAGAATGAGCCtgatgaagagga---------agaagatgaagatgaggaagatgaggatgaggaggatgatgatgaAGAGTAAATGAATATCCTGTTGTAAAGATTTTTTTGTGTGTGATGAAAGTCATTGTTTTGCTAAGAATGTGAA-CTCAAGTGCAGCTCATTGTTAGCTTCAGTATAAAAACTGTACAGACTTGTGTATAGGTAACGTGATTCTTTGTAGGGAGAACCTCTATTTTTTAATGTAAG-TAGAAGCTTTCAAGGGGAC----ACTCCAGATAGATTTTAAAGCTTCTGATGTTGAATGTTTCTGCATATTTAATGGTTTCTTTTGAATTTCTTGACAGTGTATTGTTGTAGCACCATAAAGTCCTAGAAAGTAGTATCA-TAGCAAATCTTTAAGTTTTATAG--TGTTGCATTTTGTT-TTTTTAAGATAAATATTTTGTAATAAAATGATGTACATTA a score=-440 s mm8.chr4 145310734 314 + 155029701 aaa-aaaatgaca------tcatgaagtttgtaa--gcaaatggatagaactcgaaaaaagtcattcagagtgaagttactcagacccagaaagataa--atatggtatg-----tatttgcttatatgtaaatattagccatcaaata---aatgctaatcatagacccagagaggaatacagggTTTGAGGAggggaaatggggttgaggaaaggaatccagtgagagacagctagaattggcaggcatttgagggacagtatgcgaacccagttcagtg----actttctaaaatatatgaaggccatcctaaaaaaattcccaaatgatgagg s monDom4.chr3 240645248 321 - 526135210 aaataaaataaaataaaatTCAAGAAGTTTAtaattgccaat------aacaaataattggttatttggatataaat--atcagaagcagccaggtaatgattttgtatgagaatttttgacaaatatgaagagatctataatctgacatttaattctaagaagatttcaaatgatttctaaaaag--agaagctttcaaatgatttctaaaaatgga--taaataagatgccattgaa----ggaatctttcaagagtggaaatgtgaagacagattggtaaaccattattaaaagaacaaaaggagttgtctaaagagaagcccaagatatgagg a score=2316 s mm8.chr4 145312932 98 + 155029701 TATAGCCCAGTCTATCTCTATATCATCTCTCTATCTATATATTTGTGTGTGT--ACACACGCACACATGCACCTGCAtatatgttttcag---tttagaacta s monDom4.chr5 131199720 103 + 308900514 tatgacactgcttATGTCTATAATGAATATTCTTCTATATACATGCATGTGTGAACACACACATACACACACTCCATTCCAAGATTTTAGGACTTTGGAAATA a score=1118 s mm8.chr4 145314479 197 + 155029701 TCTTGTCTAACATGTTGGGACTCTAAGTTATATCCCTAGCACAACCAACAAACCAACGAAATCAAATGTAAAAATGAGAAATAATCAGTTACCTAACAGCTAGAATGTGTTGTAAA----------TTGGCACACAGTATTATTACAatggttaat--cttcatagtctacctgattggttttagaatcatcatggaaacaAAGTATGT s monDom4.chr4 411236116 190 + 430141050 TCTGATCTATAAGGCCAGGACTCTAGGTCAAATCTCTAAGGCAGTTATTAAGTCAGAAGAGTTCA---CAGGCTTGACAAACTTT--------------CTAGGATGACCTGAAGAAATTCCAGCTTTTCCCCATATTTGTACAATAATAGTTCTTTACTTCAAGGTTTACAAAATTGTTTTATGAG--GTCATAGGAAGCCAGGAAGT a score=9707 s mm8.chr4 145322403 385 + 155029701 AGGTGGAGACTTTCAGAGGCAGCTCTTTGTTTGCTGTTTGTGTGCATGATTTCTCTTTCAGAGATGCCAGGAGGCTTCATGTATGGCTTGGCTTGATAAGCCATGTTAGAATGAGAGGAATTATAAACGCTCG------CCATTTTTACTATGCCATCATTATTATGGTAATGCAATCAGTAAAATATACCTGCCTCTTAAAGTCTAGTGTAATTGGA-----TTCTGCTGCATTGATGCAATTAAAAGAATTAGGGAGCCCATTCGGTGATTTATGTTTTCTATAAAAACTTTCTC--AAAATAGCAAAAAAGGAAAAGATTAGGTTTCACCCATGGCTTTGCTTTCTCTAGTCTAACACTCCACCTCCTGGAGA-AACACTACATAGT-ATTTAAGAC s monDom4.chr8 100099894 352 - 308469712 AGATGAAGA-------AGAAAGCTCTGTCTTTGATGT--AACTAGATAACTTCTCT--CCAAGATGTCAGGCAGTTTAAT------TATGGTTTGATAAGCACTTAGAAAATGAGAAGTATTATAAGCCCTAAGTACTCCTATTACTATTATGCCATCATTATGATGATAATGCAATCAGTTAAATATATCTGCCTCTTAAGCACTAATACAGTCGAAGGTCTGTCTGTCATATTACTGC----------------GAGCCCACCAAGTGCTTCTGGTTATATAGAGAGCCATTCACATAAAATGGTGAAAAAAAAAATGCTGGG---------------CTGCTTTCTCTAGTCTATCACTCCATCTGCTGGAAACAATGCAACATAACAATTTAAAAC a score=1438 s mm8.chr4 145330864 187 + 155029701 CCTTCTCTGTGTTTTCTTTTAAACATGTGAACCTTCCTAGAAATCTTTATTTTCAACTCACAGGCCCTTTCCTGCATGGCCACAGACATTGATATCACATCCCTTCTTCATCTACTTAACATATTTATATTCATGGCTGTTAATGTATTTGTGAATGAATCTGTGTACGTGTGTGTGTGTGTAGGAT s monDom4.chr4 388510058 178 + 430141050 ctctctctgtctctgtctctatttctgtctctctctctATATATATGTATATATAATTATCAAATTCT---------GAATATATAAATTAATACATACTCTCTATATTAAGTAATGAACATACTCTCTTTAGAGAATGTTAATCATCTACTATATAAATTTATATGTATGCATATATATAAAGAGT a score=1443 s mm8.chr4 145335541 1043 + 155029701 TGTCACATTGACGTGATAAGAATAATGAATACTGGATACTCAAAGCACACTTCACATCTGTAGGTGTATTATAGGA--TTAAGAA----CATGCATTCTTGGTGGCTCAGTTTGTCAAATACTCTATCAAGTATAATTTGTGTCAATTTCTTCATTTGAATTAAATATACAAAATGCTGCCAGTTTTATTAGACATTTTGAAGGCGATAGTACACTCTTTAAGTTTCCTTCTGGAATGGATCATTTCTATCTCCATGAATTGTTGCACAACATCATATTCTTCTG-----GCTTTCACACCTGACTTCATCATATAATATT--------TGAGGGTGAACAAGTAA-----AAGTTTAA---------TGAAAATGTTTCTTCATT-ATCATATATTCAGAGTTACTGCCA---GCATAATAGTTGACATT-----AGATTTGAAGATTGCATGAAGGTT-TTCAAAAGTTTTCAGATTCATAATAATTCTCT--AGTTTAGAG-CACTGACTGTTGAAAAGAATATTACCCG-TGTAAAACATATGCCACATTTCCC-CAGGAGAACTATTTTTCCCATAAAAAATTTTTTTACATATTTTTTCTGCACTGAAATGAAGTC-AAAGATATTTCAGcatatattatatttgttaagattcttgcctgtataaattatctgttacattctaagagattggc-caaaataaagga---ttcaaaccgtcaatgtatttgaaaagtttcccttttggaagaattctccagtgaattttaagatgatatttct-tgttaaaggattatctcattcatttcatttataatgttgctctactgtttgaaatatctgttgatttgtcagactgatgttgtgggta--------ctgcatttatcacataca------------------------------------------------aaatacttgtaaggtttttttaaatgtataaatt-atctgattaattctcagtctgcctttattagt--------------------------aaagcatttatcacattcactgcatttttgtaagttttctctactgtatgaattctctggtgcattctcagactaagtttgtgggaaaatcatttgtcacattgactgcatttgtaaggcttctttaatgtatga s monDom4.chr4 395165339 1133 + 430141050 tgtagctttttccaaacaggaacaacagagatcagata-tcttaattcacttcagctccagag-------acaggaagccaagagagcccaggagcagttggtgtcc-----tctcaaatcccctttc--------tttgttccaaaatc--cattgtcatttggttcctggcatgtagctagatcttctc-------------ctgcaaaacacttttc----ttacttatatttcaactcatttctctctctttccttcctaTAGCAAATTTAGATCTGTCTGTGAAAGTCTTCCCATACTGATTACTTTTATAAGTTTCTCTCCTATGTGGATTTCCAAGTGATTATGAAGACTAGAGCAGTGTCTGAAAGCCTTTCCACACTGATTACATACATAAGGTTTCTCTCCAATGTGGATTCTCTCATGTTTTGTGAGACTGGAGCTCTGTGTGAAAGCCCTTTTACAATTACTACATTCATAAGGTTTCTCCCCAGTGTGGATTCTCTGATGTATAACAAGTTTGGAACTCTCTGCAAAAACCTTTCCACATTGATTACATTCATATGGTTTCTCTCCTGTGTGGATTTTCTA-ATGTTTACGAAG-ACTGGAGCAGTGTCTGAAAGCCTTTCCACATTGATTACATTCATAAGGTTTCTCTCCTGTATGGATTTTCATATGTTCAGCAAGAGTATAGCTCTGTGTAAAAGCCTTTTCACACTGATGAC--ATTTATAAGGTTTCTCACCAGTGTGAATTTTTGGATGGGCAACAAGTTTGGAGCTCTCTGTAAAAGCCTTTTCACACTGATTAGTTGCATAAGATTTCTTTCCAGCATGGATTCTCTGATGCTCAGCAAATGTGGAACTGTCTGTGAAAGTCTTCTACATTGATTACATTCATAAAGTTTCTTTGCTGTATGTATTTTTATGTGGTTACAAAGACTAGAGCAATGTCTGAAAGTTTTTCTACACTGTTTACATTCATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGGATTCTTTGATGTTTAACAAGTGAGGAACTGTCTGTGAAAGCCTTT-CCACAATTATTACATTC--ATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGGATTCTCTCATGTTTTGTGAGACTGGAGCTCTGTGTGAAGGCTCTTTTACAATTACTACATTCATAAGGTTTCTCCCCAGTGTGG a score=15151 s mm8.chr4 145336584 1464 + 155029701 tttctgtgattatgaacaagataggatttc----tgggcaaaacatttgtcacattcaatacatttgtaagaattctcccct-----gtatgagttctctgatgccttctcagaataactttctcagtaaagcatttgttacattcactacatttataaggtttctctcctgtatgaattctctgatgccttctcagagtgagtttgtcagtaaagcatttcccacattcac--------------------tgcatttgtaaggtttctctcctgtatgaattctctgatgaatactaa---gatgggattttcaggtaaagcatttgtcacattcattacatttataaggtttctctcctga------atgaattttctgatgaatactaagatggcattgttgggtaaagcatttgtcacattcactgcatttgtaaggtttctctcct----gtatgaattctctgatgaactctcagatagcctttgtcagtaaagcatttgtcacactcactgcatttgtaaggtttctttcctgtatgaattctctgatgctttcccagaatgaatttgtcagtaaagcatttgtcgcattcactacatttgtaaggtttctctcctgaatgaattctacgatgaaaactaagatgggatggttgggtaaagcatttgtcacactcactgcatttgtaaggtttctctccagtatgaattctctgatgaactctcagatagcctttgt-----cagtaaagcatttgtcacactcactgcatttgtaaggtttctctccagtatgaattctctgatgaactctcagatagcctttgtcagtaaagcatttgtcacactcactgcatttgtaaggtttctctcccgtatgaattctctgatgctttctcagagtgcatttgtcagtaaagcatttgtcgcattcactacatttgtaaggtttctctcctgaatgaattgtatgatgaatactaagatgggaaggttgggtaaagcatttgtcactttcactatatttgtaagatttctttcctggctttctctgctgactttgaagactgtca---ctctgagtaaagcatttgtcaaattcaccacaagtgtaagTGTTCATTTCACTATTGTTTTGTCTCACAATGGGTTTATGTTTAGAAACCAAAACCTCATCAAGATTTT--TATTTCTGTTGTGTTC------TTTCTTCTCTATGTGGGTTCCTTGATTGAGACTAATGATAGAAGACCCCTTTAAACAGTTTACACAGTCTTTATATGTGCAAACTTCTTTAGTGGTCCCAGTTTTATGTCTTTTTAGGTTTGAGAATTGGAATGTGGCATCTCTTTGGTTAGTGTTATAAGGTGTACTTTCGGAGGATTCATGAATCACATTACTAAGCTCATTACATTTAGAAGACTTCTTTCGGATATGCCCATGCTCATTGACAATGTGCTGTATGTCTTGATCCAAGAACGACTCATTTTTTCCACAGATGCATTGATTTTCT s monDom4.chr4 27118262 1381 - 430141050 ttcctttaatTG-----AAAATATAGTTTCAAAAGGAGAAAGGCTTTCAACACAAACAGCAAAACTGGGAAACTTCTCTCCTTCTTGGGATGAATTCTTGGATGGTAAACAAGGAAGGAGTACTAATTAATGGA---GTTTCATACAGCAC-----------------------TGAACTCTCTTAAGGACAGCAAGATTTGTGCTTTGAGTAAAGCCCTTTCCAAATTCACAACCCTAGATTTTCTAcctctgtgtctggaagctctccctcctcagtgatccctctgggaaatcctagctctctggaaagctcagctcaaggat----cacatcc--------tgtaggaagcctttcctgatctcttagaagtttgcttttagccccagaaatcacactct----------attta----gttatttgggtacatactgttcctcccaatagaatgtaagttcgctgagg---tcagggattgc----atcatttctgtttttgg-atccccattgt-ctagcatagtactttgcataaagtaggccaataaatgttcattaaatggaattgG--------------GTTGAATTCGTTACATTTATAAGGCTTCTCTCCAGTATGGATTTTCTGATGTCTAATCAGGTCTGTACTCCAGCTGAAAGCCTTCCCACACTGATTACATTTATAAGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTTTCTGGTG-----TCTAATAAGTTCTGTGCTCCTGCTGAAGCCCTTCCCACATTGATTACATTCATAAGGTTTCTCTCCAGTGTGATTTCTCTGATGTACAGTAAGGGAGGAGCTCCGGGTAAAGGCTTTCCCACATTCATTACATTTAAAAGGCTTCTCTCCAGTATGTATATTCTGATGTCTAATAAGGTCTCTACTCCAACTGAAGGCCTGTCCACAGTGACTACATTCATAAGGCTTCTCTCCAGTATGAATTCTCTGATGTACAGAAAGGGAAGAACTCCGGATGAAGGCCTTCCCACATTCATTACATTTATAAGGCTTTTCTCCAGTATGAATCTTTTGATGTCGAATAAGGTCAGTGCTCCGTCGGAAGGCCTTTCCACAATCACTACATTCATAAGATTTCTCTCCAGTAT-GAATTCTCTGATGGTAAATA-------AGAGATGAATGTTGGATGAAGGTTTTACCACATTCGTTACATTCATGAGGTTTCTCTCCAGTATGAATTCTTTGATGTACAGTAAGGTTTGCACTCTGCCTGAAGGCCTTCCCACATTGATTGCATTCATAAGATTTCTCTCCAGTATGAATTCTCTG-------------------------ATGGCAA----------------ATAAGGGAT-------GAGTGTTCACTGAAAGCCTTGCCACACTCATTACATTTATGAGGTTTTTCTCCAGTATGAATTCTCTGATGTACAGTAAGTGATGAGCTTTGAGTGAAGTCCTTCCCACATATGTTACATTTATAAGGTTTTTCT 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cctacactTTCTTCTCCTCAGCTGGGGCGGCAGCAGTGGAGGGAGCAGGAACACCAGAAGGTGCAGCTCCA---GCAGCTGGAGCAGGCTCAGCAGCCCCAACATTGCAGATGAGGCTACCAGTGTTGACATTGGCCAGAGCCTTTGCAGACAAGCCAGGCCAGAAAGGTTCAATGCTGACACCAGCTGCTTTAATGAGGGCATTGATCTTAACTTCTGTGACCATCACCTTGTTgtc s monDom4.chr1 163553697 238 - 748055161 CCTCTTTCTTCTTCTCCTCAGCAGGGGCAGCTATGCTAGCAGGAGCAGCACCTCCAGCAGGGGCAGCACCACCAGCTGCTGGGGCAGGGCCACCAACTCCTACATTGTAGATGAGACTACCAATGTTTACATTGTTTAAGGCCTTTGCAAATAATCCAGGCCAGAATGGTTCAACATTTATACCTGCTGCTTTAATGAGAGCATTAATTTTATCCTCCATAACTGTAACCTCATCATC a score=51617 s mm8.chr4 145396613 2248 + 155029701 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monDom4.chr8 183845793 33 + 308469712 gactggg---atatggggaaactagaaatacaagca a score=-493 s mm8.chr4 145510163 150 + 155029701 AATTCTTTATAGACATATATTCCCCTCAGTATGCATATTTTCAGATGCTCAAAACTACAGTAATATGCAA-AATATCTAAGAGGTTCATTATGCACTAAA-GTTTGTACTCTTGTGTAAAGGTATCAGGAGGTACAATTCAGGTACAGGTTC s monDom4.chr1 211392824 109 + 748055161 AGCTCTAAACCAACATATGTTCTATTATGTTTGCTTATATTTGTTTCTTTG---CTATGGCAATATGAAACAATATCATA-----TTATTTTAAACTTGATGTTTCTTTTTTTGT-----------------------------------CA a score=21676 s mm8.chr4 145510313 442 + 155029701 AGCTCTTTATTGGACAAGTTAACAAAAGCAGTGTAGTCAAAAAGACCAAAGCCCCTGTCATCTTCGGATTCCTCGGGCTCTTCCTTCTTTGCTTCCACTTTCTTCT---CCTCAGCTGGGGCGGCAGCAGTGGATGGAGCAGGACCACCAGAAGGTGCAGCTCCA---GCAGGTGGAGTGGGCCCAGCAGCCCCAACATTGCAGATGAGGCTACCAGTGTTGACATTGGCCAGAGCCTTTGCAAACGAGCCAGGCCAGAAAGGTTCAATGCTGACACCAGCTGCTTTAATGAGGGCATTGATCTTAACTTCCGTGACCATCACCTCTTTGTCTTGCAGGATGAGGGCAGAGTAGATGCAGGTGAGCTTGGAGACAGACAC-------------CATGTTGTGGACTGCTGACA-TGGTGCTAGTCGTTGGATGAAGTGAGGGCCTCACCCCAACGTGGCATT s monDom4.chr1 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ttttaggtcacaTCCCTGAGAGCT------AGGATGAAAGACCTTTCATTGACGAGCTGATTtttatttatttatttatttatttat-ttatttatttatttatttattt--atctatctatttatttttttTGGCTGAATGCAGC------GTCTTCATATATTGGCCACTGAGTTACCACCAGGCTTAACAGAGTTCATTTCTTGTTTCATTTCAGAGTGAGCTTTCCTTAGATTTTTATATCTTTGGATAAGGTGTTCACGTCTTGCATATGTATAATTATTCTCTTACCCACTTGTAGGAATTCTCTGGAATTTCATTAA-GTTTGTTTC s monDom4.chr3 18420736 311 - 526135210 ttctcattcatgtctctgattaatcctgaaaggttgagtagtttttcattgat-------tttccccttttgaaattttctgttcatattctttgaccatttatccattgtagactggcagttccccttgtcaatttaaactctcctcttatgtgtttATATACCTGACCTCTGGTGGCTGTGGGCCTTAGCAATTATCCTTTCTC--TGCCTTAGGGAGCTAACACTCCTACAGCCA----ACATTTGGATACGGACTTCATACATTTTACATGTCTAATTCTTCTC----------GCAGGAGCCATCAGCAACACCACCggcctttgtttc a score=1730 s mm8.chr4 145558271 119 + 155029701 aCAGTATACAATCCAAACTGCACACCAAAATTTTTGAAAAGAATGATGATAGCAAATCTTTCATTTGCTGTGAACGTCTATGTAAATCACAGAAAATTCTTGAAGATGAGAGCCTttct s monDom4.chr8 289395613 118 - 308469712 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s monDom4.chr4 28788336 1615 - 430141050 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s monDom4.chr2 283576783 1053 + 541556283 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a score=1793 s mm8.chr4 145637045 99 + 155029701 ATATCACTAT------ACATTTTTCCTTGATTTAAAAAAATAAGGAAAATTCTCAACTTTTGAGAAACTTAGTGATAACTAATATGTTATTCTTAGTATTGGAAA s monDom4.chr6 197395140 105 + 244784211 ATATCACAATGTGGCAACATTTATTTGGATCTTGTTGGGATGAGAAATATGAGCAGACATTCAAAAACTTAGTTATGATTCATACCCTGATCTTTGCATTTGCAA a score=9154 s mm8.chr4 145648625 436 + 155029701 TATGGATTTGTTGATGCTAGACAG-------TCTTCTTAGTTTTAAACTATCTGGAGTCTTAAAT-ACTATGTAGTGTT-TCTCCAGGAGGTGGAGTGTTAGACTAGAGAAAGCAAAGCCATGGGTGAAGCCTAATCTTTTCCTTTTTTTTTCTATTTT--GAGAAATTTTTTATAGAAAACATAAACCACCTAATGGGCTCCCTAATTCTTTTAATTGCATCAATTCAGCAGAA-----TCCAATTACACTAGACCTCAAGAGGCAGGTATATTTTACTGATTGCATTACCATAATAATGATGCCATAGTGACAATGG------CGAGCGTTTATAATTCCTCTCATTCTAACATGGCTTATCAAGCCAAGCCGTACATGAAGCCTCCTGGCATCTCTGAAGGAGAAATCATGCACACAAACAGCAAACAAAGAGCTGCCTCTGAAAGTCTCCACCT s monDom4.chr8 208369412 406 + 308469712 TAGGGAGTTGATG--GTTAGGAAGCTGCTTTTCTGTTTGGCTTCATTTTTTTGTTTGTTTTAAATTGTTATGTTGCATTGTTTCCAGCAGATGGAGTGATAGACTAGAGAAAGCA--------------GCCCAGCATTTT---TTTTTTCACCATTTTATGTGAATGGCTCTCTATATAACCAGAAGCACTTGGTGGGCTC----------------GCAGTAATATGACAGACAGACCTTCGACTGTATTAGTGCTTAAGAGGCAGATATATTTAACTGATTGCATTATCATCATAATGATGGCATAATAGTAATAGGAGTACTTAGGGCTTATAATACTTCTCATTTTCTAAGTGCTTATCAAACCATA------ATTAAACTGCCTGACATCTTGGA--GAGAAGTTATCTAGTT--ACATCAAAGACAGAGCTTTCT-------TCTTCATCT a score=1805 s mm8.chr4 145654706 104 + 155029701 AATAAATGAAAAAATATAATTATCATTAATTGTCATCCT----ATGCTATTTTTCCAGAATGTTTACATTATTATTTTTCTGTGACAGATATATATATATATATATag s monDom4.chr7 152009810 108 - 262624689 AAAAAATCAGAGGGTATGGCATATACTGTTTTTTATCTCTGAAAATCATTTTTTCCAAAATACCTAGCTCAGGTTTGTTATGATTTATACATATATATATATATATGG a score=-73 s mm8.chr4 145654841 380 + 155029701 gagagacagagagacagagagacagagagagagTTTTATCCAGTTTTAAAGCATTAGCAAAATATAAGAAAATTTGAGTGAAATCCACTCTATGtatattaaatgaattttaattttttttaatCCTGACTTTTAAAAAAATGAAGC-----AGTTAATGGGTTTTACAAGGGAGTGCTGCAGTTACCCATGTACGCCATGAGAGGGC-------GTCAAAACTGGCCACTGATACTTAGCTGCAGAAATGATGTCGCTAGATCCCAAGGCATTTCTAGCTTAAAATGGGCAAAAGTTTCTCTGAATAGAGTAAGCGTTTGTTAGTGATATATTTTAGGACACTTTTTCAGTGTACAAAAATTTAACAGTACCATTTCCC--TAAGGTGAGATT s monDom4.chr7 152009991 363 - 262624689 TAAAGGGAGAGA-AGAGGGAGACAAAAGTAATGGTTTTACCAA----AAATCAGAATCAAAACAACAG-GGTTTGGAGCTTTGTTCACTCC-TATA-ATTATTTGAATATCA-----TCTCAATTCTCCACTTTGAAAAGATAGACCTGCCTAGTTTAATTATTTTATTACTGCCTTTTCCGATTTTCTAAAAATCTCTTAGAAGTGCTGTGCATGTCTATA--AGCCAATGGACCT--GCTGTATGAACTTAAAAACAAAGAACAACAGTAGTTTTAGATTA-----GGCA--------TCTAAATACAGTAAAAGTAGATAATTAAAACCTTCTTGAATTTCTCCATATTAGAGAGGGATTT-ACAGGACTGTTATCCATGAAGAAGAAATT a score=1206 s mm8.chr4 145656997 113 + 155029701 ACTAGGTTACACCCCTATCCTTCATCTTTACTATTTTTAAATTGCTCCTTACTTTATACCACTTTCTCTGCCACAAGAGGTATACACAAACATTTAAATGCATTATTAAGTAA s monDom4.chrUn 6297092 113 + 174229318 AATAGGTTTTTACTCTATTCTTTAAAAAAATTATCAATCATTTTCTCCTTTTCACCCTCCTTTTCCCCAAAAGCAAATACAAAACACAAAAGCTAATATACATAGTGAAGCAA a score=2316 s mm8.chr4 145658438 98 + 155029701 tagttctaaa---ctgaaaacatataTGCAGGTGCATGTGTGCGTGTGT--ACACACACAAATATATAGATAGAGAGATGATATAGAGATAGACTGGGCTATA s monDom4.chr5 177700691 103 - 308900514 TATTTCCAAAGTCCTAAAATCTTGGAATGGAGTGTGTGTATGTGTGTGTTCACACATGCATGTATATAGAAGAATATTCATTATAGACATaagcagtgtcata a score=-493 s mm8.chr4 145660443 312 + 155029701 cctcatcatttgggaatttttttaggatggccttcatatattttagaaagt----cactgaactgggttcgcatactgtccctcaaatgcctgccaattctagctgtctctcactggattcctttcctcaaccccattt-------ccccTCCTCAAACCCCGTATTcctctctgggtctatgattagcatt---tatttgatggctaatatttacatataagcaaata-----cataccatat--ttatctttctgggtctgagtaacttcactctgaatgacttttttcgagttctatccatttgc--ttacaaacttcatga---------tgtcattttt s monDom4.chr3 285489641 321 + 526135210 cctcatatcttgggcttctctttagacaactccttttgttcttttaataatggtttaccaatctgtcttcacatttccactcttgaaagattcc----ttcaatggcatcttattta--tccatttttagaaatcatttgaaagcttctctttttagaaatcat---------ttgaaatcttcttagaattaaatgtcagattatagatctcttcatatttgtcaaaaattctcatacaaaatcattacctggctgcttctgat--atttatatccaaataaccaattatttgtt------attggcaattaTAAACTTCTTGAattttattttattttattt a score=21507 s mm8.chr4 145660755 526 + 155029701 taataTACattattttattacaaa---tttaaaaaaaaaacaaaaaaatGCAACATCCTAAAAAATTTT----TTTACTGGTAATACAAATTCCTATGAAGTTTTTTTTTTTTTTTTGCTAGCATAA-----------GAAATT--AAAAAAGCCATTAAATATTTAGAAACATTCAACATCAAAAGCTTTAAA-TCTAACTGTAGTTGTAGCCCCTGAAAAAGCTACAAACTCTTCTTAAAAAGTA----TTTTCTCTACAAAGAATCTCATCAGCTATACAAAAATCTGTACAGTTTTTATACTGAAGCTAATGTTGAGCTGCACTTGAATTTCACATTCTTAGCAAAATAATTGCCTG------AGCAAATATACTCCACACTTTAGGACAGCCActtattcttcatcctcctcttcttcctcttcatcttcctcctcttcctcctcttcttcctcctc---ctcatcttctggttcgttcttcttTGAGCCTGTTGGCCTACCAGGACCCTTCTTTCCTGCTTCACTTTTGCCCTTGGCACGGTATGCAGCAATAT s monDom4.chr5 212652069 532 - 308900514 TAATGTACATCATTTTATTACAAAATATTTATCTTAAAAA-AACAAAATGCAACA--CTATAAAACTTAAAGATTTGCTA-TGATACTACTTTCTAGGA---------CTTTATGGTGCTACAACAATACACTGTCAAGAAATTCAAAAGAAACCATTAAATATGCAGAAACATTCAACATCAGAAGCTTTAAAATCTATCTGGAGT----GTCCCCTTGAAAGCTTCTA-CTTACATTAAAAAATAGAGGTTCTCCCTACAAAGAATCACGTTACCTATACACAAGTCTGTACAGTTTTTATACTGAAGCTAACAATGAGCTGCACTTGAG-TTCACATTCTTAGCAAAACAATGACTTTCATCACACACAAAAAAATCTTTACAACAGGATATTCATTTACTCTtcatcatcatcctcctcatcctcatcttcctcatcttcatcttcttcctcttcatcaGGCTCATTC---------TTCTTCTTCGATCCTGTTGGCCTGCCAGGGCCCTTCTTTCCTGCATCTCCCTTGCCCTTGGCACGATATGCTGCAATAT a score=12146 s mm8.chr4 145661281 195 + 155029701 CCTTTTCATACTTCTCCTTTAGTTTAGCTACTTTCTGCTCATACGGTTGTTTATCTTTGGCAGATTGCTCAGACCACATCTCACCCAGTTTCTTCGCAGTATCTCCAATAGACAGGCCTGGGTGTTCAATTTTGATCTTTGGGCGATTTTCAGAGCAAAACAGGAAGAAGGCAG---------ACGGTGGTCTCTTCGGAGCAT s monDom4.chr5 212652910 204 - 308900514 CCTTTTCATATTTCTCCTTTAGTTTAGCAACTTTCTGTTCATAAGGTAGTTTGTCTTTGGCGGATTGTTCAGACCATAGTTCCCCCAGTTTCTTAGCAGTATCTCCAATTGAAAGGCCTGGATGTTCACTTTTGATCTTTGGGCGATGTTCGGCACAGAAGAGGAAGAATGCAGATCTGAGAAATGATTGATTTTATAAAGCAT a score=3171 s mm8.chr4 145661505 98 + 155029701 CCTTTGGGAGGAACATAGTTCTTCATCTCCCTGT---------------------CATAA---------------------CGAGCTTTGTCGCTCTTGGCCAAATCTTCAAACTTGGACTTTTCCTTTGAAGACATGGT s monDom4.chr5 212653207 140 - 308900514 CTCTTGGGAGCATTAGGATCCTTTTTCTTTCCTTTCTTATCACCTTTGGGAGGCACATAATTTTTCATCTCCCGATCATACCGAGCTTTATCTCCTTTTGCAAGGTCTTCGAACTTGGACTTTTCTTTTGCAGACATGGT a score=11104 s mm8.chr4 145661603 179 + 155029701 CTTCCATCTCTCGGAGCATTTCTTGGAGAACTCAGCGAAGTTCACCGACGAGTCGGGATGCTTCTTCTTGTGCTCCTCGCGGCAGGTCTGCACGAAGAAGGCGCGTACGAGGACATTTTGCCCCGCGGCTTGTTGGGGTCACCTTTATCCATGATGACGGCTCGGCGTCTGTCTACCTG s monDom4.chr5 212653634 173 - 308900514 CTTCCATCTCTCGGAGCACTTTTTGGAGAACTCCGCAAAGTTTACAGGGGAGTCCGGGTGCTTCTTCTTGTGCTCCTCCCGGCAGGTCTGCACGAAGAAA--GCGTAGGAGGACATTTTGCCCCTCGGCTTGTTGGGGTCTCCTTTACCCATCCTTAA----CAGCTTCTCTCTATCTT a score=5064 s mm8.chr4 145661782 130 + 155029701 CTGCGAGCGCTGCTT--CCCTCAGACCTCCGC---AGAGAGACTTCCTTCCCC-----AAGCTCCGGC-GAGAACTGGTTTCTTGCTAACGCAATCCCCAGCCTCTTGTTTTGCAGAGTTCTCCGCGCCACGGCAACTTGA s monDom4.chr5 212654453 141 - 308900514 CTGTAGGAGCTCCTTGGCTTTCTCACCGTAGCTGGAGCGGCGCTTCCTCCTCACTCAGGGGCTCCTGCAGCGAAATGGTTTATCTCTAACGCAATCCCCAGCCTCTTGTTTTGCACTGTTCTCCCCGCCACTGCAACTTGA a score=-2511 s mm8.chr4 145661912 593 + 155029701 Ccatgatgtcat-----tttttaacagctgaataatgctctattgtataaat-----gtaccacattttatttatccattca-tctgttgacatctaggttatctccattttctggctattat-------gaataaag-----------atacaatgaaatggttgagcaagtgtccttgtggtaggatgaagt----gtcctttg---ggtatgtggctgaaagtggtatagctgggtcttgagatagattcccatctttcagagga---------acccacatgttgatttccataatggctgtgcaagtgtgcactccaccagcaatggaggctcctccaagtttctcttgcgccacatctctgccatcatatgctctcacttgtgttattgatcttaaccattctgacaagtctaagacagaa--ttttaaattagttttgtgtttgttctttaatggctaagg------atgatgaacatttctttaggtgtttctcagacatctgagatctc---tctattgagaattctgtttagatctgttcctcattttttaattgg-----------tttattttttttaaaaagtatatggttccttgagttct--ttatatattttagatactagccctctattggatgtggaattggtt s monDom4.chr3 285491099 634 + 526135210 ccattatatagtagatgtttagaaatgctcattgatGTCCTGAAGAATGATTGGTGAGTTTCAGGTTCTGAATATCAAGAAAGTCTGAAAATGATTAGTGACTTTGAGTTTGAAGAAGATTGTCCTTGCAAAaaaaagagatctgtaacatatgttcagataattgaa-----gtcctt-catcattatgaaatcatactactttgtcagatttatg------aattgtttctctaacacctcagctatttcccctctctgaagagaactgaggtatacccaagtgatgatatcattaatgtttctgccaatat---cttcaccaa-aattccctctatcacaaatatatctt---ctttatgactattgctactttctttctctccttttaccaaatttcttcatttt-acatgaatatttcaaaatctttcaaaatcttattataaacatgtcttacttaccaaagtccctagtgatatttattaagccaaatttcacttcttgctttaagtgctctagttcacctttcatgttactcagacttgtacaccattagatgaatagaccttagaatatttaatttctt---atattata---tctcttaatttctaattatgtctgccagtttct--ttctatattgtagatggtcttagtt a score=-633 s mm8.chr4 145662505 396 + 155029701 taaaaaaatcttttcccattacataggctgttacatggtctgattgatggtgcc--ctttgtcttacagaaagttttcaaatttttgcggtcctgt--------ttattaattcttgatcttagagcctaaactaatggtg--ttctggtcacatagtcttctactgtgccattgactttaagggtagtccccat-tttctattttattatattcagtgtaactagttttatgttgaagtctttgaatcatttagagttgagttttgtgaaaagtactaagtatggatctattttcattcttctacattgagctttctaAATCTTCTGAATCCCCACCTGATCTTTGGCCATGCAGCTGCTTGCTGACATCCTTGCTTAATTTGAAAGGTATGACTTTCTCTCAATCTC s monDom4.chr3 55067507 366 + 526135210 ttaaagaatgattctc--ttacatgagctgttgcacctccttttccatttggccagttctactttttaagctgttactttatttttgtattactttcatttctcttcctcgtttttcttctacctcccttatttatttttgaattccttttaga-attcttcca----------gagcctgaaactaattcctatctttccatggagtt---ttgcatgtaactgctttgatctcatttttccccagccttttttttttaacttttacttttatcttaaaggtggattttgatctcaggctagagta-tgtacactcttaaacttcagtttttcc------------------------cttgctgctacccttacttagtt--atagttctgattttcttcaagtttc a score=420 s mm8.chr4 145662901 152 + 155029701 CCTCTCCCTGGCAACTGCTAAGATTTGCAACTTGCTTGAC-----------TGTTATT---TTCCTCTCAAGATCTAATAAAGGGCCCTTTCTTTTCCTAATAAGTCCACTTTTAATTCATTTTATTAATAAGACTAAGAACTTTGAAAAGAAACTCAGTTTCTCC s monDom4.chr2 257980579 152 - 541556283 tttctccct--taatttttaggatctctaatttggttttcatctggggattttttatttggttgctttcaaggtttttga--------tttgcatgtccaactcattaacctctgctctccctaatttgttaatatatgaactc----aaggatataaatttcccc a score=15127 s mm8.chr4 145676339 885 + 155029701 cccgcgccccggcccccTCTGGAGACTCAGGAGGCTAGTGTGACCCCGCGGAACTTGTCAGT----CAAACGCCTTCCTCAACCCCCCCCCCCCCCGCGAGGACCTCCCCCGGGCCGCGGTAGCGC----------GCACGCACGCGCACAGAGTCCCCCCTCACCCGAGCCAGCCACCCTCTCAAGTTGTAGCAGTTGCTTCCC--------GGGCGTGCTCCGTGGGC----GGCCGGTAGGCG---CGGGAGGCTGAGCGAGG--------------------GCAACGCtccaaggatccaaggat----ccaaggatcGGGG--TGCGGGT-----GGCCGCCCCGGGCGATGAGGGGCCATCGCTGAC---------------------------AGGAGAACGAGCGCTCGGCGGCGGCTCGGGCGGACAGCGCGGGCGGCAGCTGCTGAAGACCTGT------CCGGACTCCGCGCGCTAAGGGG-----CCGTCAGGCCTGCC-----CGGCGTCCGCACCCGC-GCGCTCGCCCCAGCGGT-------------------CCACACTTCGGG---CTCGCCTCCG--TCCGCCCTCTTCCG------GGCGTCAGTAACTT------------GTgcggcccgcgcgcccccgccagcc----ccgggaggcggc----agcgcggcgcggggAGGCGGC------------------------------------------AGTGAGGCGCTGTCGGGTGAGGAGCAGCTC--------------------GCGGAGCGCGAGGGCGGCACGGCCGGCCCGGGACGCAGGGGCGCAGGCCCGTCGTGCCTGTGCTCCGCCGATTGCCCGGGCCA--GCCACCGGGG----------GAGGCGCC-----GAGCGCCCGGGTC-----GCCGAGATGTCGTCGCCGTCGCCGCCCGCACCAGTTGCCTGCGCCACCATCTCGGCCTCGGATAAAGTGGATGGCTTGACCCGGAAATCGGTGCGCAAGGCGCAGAGGCAGAAGCGCTCTCAGGGCTCCTCGCAGTTCCGCAGCCAGGGCAGCCAGGCGGACCTGCACCCCCTGCCCCAGCTCAA 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CCCTCCCCTCCACCCCCCC------CCCCCAAGCTTAAT-TAGCTTCTCGGTTTTCGTCAGTGACACAAGCTCCTCTTCCTCCCTCCTCCCCCGCCGCAGGCCCCTCCCTCCTGCTGGGTGAACTCCTGGCTAGGAGTGCGGGCGCGCACA-------CCCTCCCCAGTATCCTCCACCCTCACAAGTTGTAGCGGTCGCTGCGCTGCGCTGCGGGGGTTGGTCGTGGGCTGTAGACTGGCAGGCGGGCCGGGTGGGGGAGGGGGGTTTGAACTTGGCGGCGCGGAGCCGAGCGCCTGGGAGCTGGGAGTGGTGTGGAGGGTCAGGGACTGCGGGTCCACCTCCTACTCCGGGT-ATGAGGGGCGGCCACTGACCAGGGGCAAAGAGACACCAAGGGGGTGGGGGGAACATCCCGGCAGCGGCGAGTGGTGGCAACAGCAGTGGCAGCAACAGCTCGGGCCGTGCGGAGCCCCGGGATGGCCGCGGCAGGGGAGCCTCCCGGCAGGAGTACCAAAAGCGGCAGCGGCAATTGAAGCGCTCTCCTGGACGGCTTTCTATATCCTTCCCTCCCCGCACTCCAAGGAACTTCCCTCCAGCTCCGCCCGCCTTCGACGACCGCAGCCCCTAACTTCTCGCAGCCCGGGAGAAGCGCGTGCGGCGCTGGGAGCCTAGCCCGAGATGGGGCTCTGAAGACGTAGTGGGGAGGCGGCCGGCGGGCCAGGGGCAGGAGGAGCGAGAAGAGGAGAAAAAGGAGTGGAGTGCT-CCGGAGGCGCGGGAGCTTTTGGTTCCCCTTCTCTGGGAGCTGAAGGTGGGGAGGGTGCGGGCAGCTGGGGGTGACGGGGC-CGGGGAGGGGGGGCTTCCGCTCCTCCTTCTCCTCCTGCCGTGACCACCGCCGCCGCCTCCATGCAGCGCCAGCCTGAGCTGCCGGGTTCGGGGGCCGCGATGTCGTCGTCGTCCCCG------------GCCAGCGCCGCCATCTCAGCCGCGGAGAAAGTGGACGGCTTCACCCGGAAATCGGTGCGCAAGGCGCTGAGGCAGAAGCGCGCGCAGGGCTCGTCGCAGTTCCGCTGTCAGAGCAACCTGCCCGAGCTGCAGCCCTTGCCCCAGCTCAA 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TTAAAAAAAAAAAAGATTCTTGGAGAGTGCTGATTTCCAGCCCAGCATTGCAAAGCGATACATTGATCAGAAGTTGTCCAACTGCTCCTGGAGCTTTTTGATAGTGAAGATCCACGGGAGCGCGACTTCCTGAAGACCGTCCTAAATCAGATTTATGGCAAGTTCCTTGGCCTGAGAGCGTTCATCAGAAAGCAGATTAACAACATTTTCCTCAGGT------TTATATATGAAACGGAACATT s monDom4.chr2 120465173 227 + 541556283 TTAAAAGTAAAATGAGTTTTC--AGTTTGATTATTTTTAAAAAAGTA--------------ATTTCTCAGATTTTTTTTAAA-GCTCTTGGAGCTTTTTGATAGTGAAGATCCCAGAGAGCGTGACTTCTTGAAGACGGTTCTGCATCGAATTTATGGGAAATTCCTTGGATTAAGAGCATTCATCAGAAAACAGATTAACAACATTTTCCTCAGGTAAGCAGTTATATGTACAATTTATCCTT a score=2356 s mm8.chr4 145677994 35 + 155029701 TCAGTGGTGTGGCTGAGCTCCTTGAAATATTGGGA s monDom4.chr2 120468177 35 + 541556283 TTAATGGTGTTGCCGAACTCCTTGAGATATTAGGA a score=7645 s mm8.chr4 145678029 109 + 155029701 AGTATCATCAATGGCTTTGCATTGCCAGTGAAAGCAGAGCATAAGCAGTTTCTAATGAAGGTTTTTATTCCTATGCATACTGCAAAAGGATTGGCCTTGTTTTATGCAC s monDom4.chr2 120469315 109 + 541556283 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catcgtagaattcattcaggagagaaaccttacaaatgtagtgaatgcgacaaatgctttacccaaccatcccctctcagtattcatcgtagaattcattcaggagagaaaccttacaaatgtagtgaatgcgacaaatgctttactgacaaaggcagtctcagagttcatcagagaattcatataggagagaaaccgtacaaatgcagtgagtgtgacaaatgctttacccaaccatcccatcttagtattcattgtagaattcattcaggagagaaaccttacaaatgtagtgaatgtgacaaatgctttactcacaaaggctctctgagagttcatcatagaattcatgcaggagagaaaccttacaaatgtagtgaatgtgacaaatgttttactgagaaaaacggtctgagaaggcatcagagaattcatacaggagagaaaccttataaatgcagtgaatgtgacaaatgctttac--ccgaaaatcacatcttagtattcatcagagaattcatacaggagagaaactgtacaaatgcagtgaatgtgacaaatgctttacccaacaatgccatcttagtattcatcagaaaattcattcag--gagagaaccttacaaatgcaatgaatgcgacaaatgctttagtgacaaacacagtctgagaaggcatcagagaattcatacaggagagacaccttacaaatgtaatgaatgtgacaaatgctttacctgaaaatcacatcttagtattcatcagataattcatacaggagagaaaccttacaaatgtaatgaatgtgacaaatcctttactgaaaatggctgtctgagaat--tcatcagagaattcatacaggagagaaaccttacaaatgtaatgaatgtgacaaatgctttacctgaaaatcacatcttagtattcatcagataattcatacaggagagaaaccttacaaatgtaatgaatgtgacaaatcctttactgaaaatgtctgtctgagaattcatcagagaattcatacaggagagaaaccttacaaatgtagtgaatgtgacaaagctttactgagaaagtcaatctgagaa-----ggcatcagagaactcatacaggggagaattcttacaaatgtattgaatgtgacaaa----tgttttgcccagaaatcctatcttgtttttaatcacagaaatcatacattaaagaagccttacaaatgcagtcaatgtgacaaatgattttcc-----cacaaactt------------agtctgagaatgcatcagagaattcatacagtagagaaaacttacaaaaatgcagtgaatgtgat----aaatgct-ttactaata--aaggcagactgagaattaatcagataatttatacatttaaaaaaacccttacaagtattttgtatgtgataaatgcagt s monDom4.chr4 36861512 1342 - 430141050 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TAATGTACATCATTTTATTACAAAATATTTATCTTAAAAAAACAAAATGCAACACTATAAAACTTAAAGATTTGCT-----ATGATACTACTTTCTAGGA----CTTTATGGTGCTACAACAATACACTGTCAAGAAATTCAAAAGAAACCATTAAATATGCAGAAACATTCAACATCAGAAGCTTTAAAATCTATCTGGAGT----GTCCCCTTGAAAGCTTCTA-CTTACATTAAAAAATAGAGGTTCTCCCTACAAAGAATCACGTTACCTATACACAAGTCTGTACAGTTTTTATACTGAAGCTAACAATGAGCTGCACTTGAG-TTCACATTCTTAGCAAAACAATGACTTTCATCACACACAAAAAAATCTTTACAACAGGATATTCATTTACTCTtcatcatcatcctcctcatcctcatcttcctcatcttcatcttct---------tcctcttcatcaGGCTCATTCTTCTTCTTCGATCCTGTTGGCCTGCCAGGGCCCTTCTTTCCTGCATCTCCCTTGCCCTTGGCACGATATGCTGCAATAT a score=15428 s mm8.chr4 145930312 322 + 155029701 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CTTCCATCTCTCGGAGCATTTCTTGGAGAACTCAGCGAAGTTCACCGACGAGTGGGGATGCTTCTTCTTGTGCTCCTCGCGGCAGGTCTGTACGAAGAAGGCGCGTACGAGGACATTTTGCCCCGCGGCTTGTTGGGGTCACCCTTGCCCATGACGATGGCTCTGCGTCTGTCTACCTG s monDom4.chr5 212653634 173 - 308900514 CTTCCATCTCTCGGAGCACTTTTTGGAGAACTCCGCAAAGTTTACAGGGGAGTCCGGGTGCTTCTTCTTGTGCTCCTCCCGGCAGGTCTGCACGAAGAAA--GCGTAGGAGGACATTTTGCCCCTCGGCTTGTTGGGGTCTCCTTTACCCATCCTTA----ACAGCTTCTCTCTATCTT a score=4767 s mm8.chr4 145930813 130 + 155029701 CTGCGAGCGCTGCTT--CCCTCAGACCTCCGC---AGAGAGACTTCCTTCCCC-----AAGCTCCAGC-GAGAACTGGTTTCTCGCTAACGCACTCCCCAGCCTCTTGTTTTGCAGAGTTCTCCGCGCCACGGAAACTTGA s monDom4.chr5 212654453 141 - 308900514 CTGTAGGAGCTCCTTGGCTTTCTCACCGTAGCTGGAGCGGCGCTTCCTCCTCACTCAGGGGCTCCTGCAGCGAAATGGTTTATCTCTAACGCAATCCCCAGCCTCTTGTTTTGCACTGTTCTCCCCGCCACTGCAACTTGA a score=-3458 s mm8.chr4 145930946 988 + 155029701 tgatgtcattttttaacagctgaataatgctctattgtatacatgtaccacattttatttatccattcatctgttgacatctaggttatctccattttctggctattatgaataaagacacaatgaaatggttgagcaagtgtccttgtggtaggatgaagtgtcctttgggtatgtggctgaaaatggtatagctg--ggtcttgagatagattcccatctttcagaggaccccacatgttgatttccgtaatggctgtgcaagtgtgcgctccaccagcaatggaggctcctccaagtttctcttgcgccacatctctgccatcatatgctctcacttgtgttattaatcttaaccattctgacaagtctaagacagaattttaaattagttttgtgcttgttctttaatggctaaggatgatgaacatttctttag------gtgtttctcagacatctgagatctctctattgagaattctgtttagatctgttcctcattttttaattggtttatttgtattttaaaaagtatatggttccttgagttct----------ttatatattttagatactagccctct---attggatgtggaa--ttggtttaaaaaaatcttttcccattacataggctgttatatggtctgattgatggtgccctttgtcttacagaaagttttcaaatttttgcggtcctgtttattaattcttga----------------tcttagagcct-aaactaatggtgttctggtcacatagtcttctactgtgc--cattgactttaagggtagtccccattttctattttattatattcagtgtaactagttttatgttgaagtctttgaatcatttagagttaaggtttgtgaaaagtactacgtatggatctattttcattcttctacattgagctttctaAATCTTCTGAATCCCCACCTGATCTTTGGCCATGCAGCTGCTTGCTGACATCCTTGCTTAATTTGAAAGGTATGACTTTCTCTCAATCTC 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CCCCGCGGAACTTGTCAGTCAAACG----------CCTTCCTCCACCCCC--TGCGAGGACCTCCCCCGGGCCGCGGTAGCGC----------GCACGCACGCGCACAGAGTCCCCCCTCACCCGAGCCAACCACCCTCTCAAGTTGTAGCAGTTGCTTCCC---------------GGGCATGCTCTGTGGGC----------GTCCGGTGGGCGCGGGAGGCTGAGCGAGGGCAACGCTCCAAGGATCCAAGGATCCAAGTATTGGG----GTGCGGGTGG----------------------CTGCCCCGGGCGATGAGGGGCCATCGCTGACAGGAGAACGAGAG------------------------CTCGGCGGCGGCTCG-GGCGG--ACAGCGCCGGCGGCAGCCGCTGAAGACCTGTCCGGACTCCGCACGCCC-------------CTCACGCTCG------------------------------CGCTCGCCCCAGCGGT-------------------CCACACTTCGGG---------CTCGCCTCCGCCCGCCCTCGTCGCCGGGCGTCAGTAACTTGT-gcggcccgcgcg---cccccgccctcccctccgccagccccgggatgcggccgcg----cggcgcggggATGCGGC------------------------------------------AGTGAGGCGCT---------------------GTCCC------------------------------GTGAGCAGCTCGCGG-AACGCGCGCAGGGGCGTAGGCCCGCCGTGCCCGTCCTCCGCCGATTGCCCGGGCCA--GCCACCGC----GGGAGGCGCC-----GAGCGCCCGGGTC-----GCCGAGATGTCGTCGCCGTCGCCGCCCGCACCAGTTGCCTGCGCCTCCACCTCGGCCTCGGAGAAAGTGGACGGCTTCACCCGGAAATCGGTGTGCAAGCCGCAGAGGCAGAAGCGCTCTCAGGGCTCGTCGCAGTTCCGGAGCCAGGGCATCCAGGCGGACCTGCACCCCCTGCCCCAGCTCAA s monDom4.chr2 120397046 1058 + 541556283 CTTCTCGGTTTTCGTCAGTGACACAAGCTCCTCTTCCTCCCTCCTCCCCCGCCGCAGGCCCCTCCCTCCTGCTGGGTGAACTCCTGGCTAGGAGTGCGGGCGCGCACA-------CCCTCCCCAGTATCCTCCACCCTCACAAGTTGTAGCGGTCGCTGCGCTGCGCTGCGGGGGTTGGTCGTGGGCTGTAGACTGGCAGGCGGGCCGGGTGGGGGAGGGGGGTTTGAACTTGGCGGCGC-----GGAGCCGAGCGCCTGGGAGCTGGGAGTGGTGTGGAGGGTCAGGGACTGCGGGTCCACCTCCTACTCCGGGT-ATGAGGGGCGGCCACTGACCAGGGGCAAAGAGACACCAAGGGGGTGGGGGGAACATCCCGGCAGCGGCGAGTGGTGGCAACAGCAGTGGCAGCAACAGCTCGGGCCGTGCGGAGCCCCGGGATGGCCGCGGCAGGGGAGCCTCCCGGCAGGAGTACCAAAAGCGGCAGCGGCAATTGAAGCGCTCTCCTGGACGGCTTTCTATATCCTTCCCTCCCCGCACTCCAAGGAACTTCCCTCCAGCTCCGCCCGCCTTCGACGACCGCAGCCCCTAACTTCTCGCAGCCCGGGAGAAGCGCGTGCGGCGCTGGGAGCCTAGCCCGAGATGGGGCTCTGAAGACGTAGTGGGGAGGCGGCCGGCGGGCCAGGGGCAGGAGGAGCGAGAAGAGGAGAAAAAGGAGTGGAGTGCTCCGGAGGCGCGGGAGCTTTTGGTTCCCCTTCTCTGGGAGCTGAAGGTGGGGAGGGTGCGGGCAGCTGGGGGTGACGGGGCCGGGGAGGGGGGGCTTCCGCTCC--TCCTTCTCCTCCTGCCGTGACCACCGCCGCCGCCTCCATGCAGCGCCAGCCTGAGCTGCCGGGTTCGGGGGCCGCGATGTCGTCGTCGTCCCCG------------GCCAGCGCCGCCATCTCAGCCGCGGAGAAAGTGGACGGCTTCACCCGGAAATCGGTGCGCAAGGCGCTGAGGCAGAAGCGCGCGCAGGGCTCGTCGCAGTTCCGCTGTCAGAGCAACCTGCCCGAGCTGCAGCCCTTGCCCCAGCTCAA 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acttacattaaataaataaataaatatatctttaaaaaaaaaaaaGATTCTTGGAGAGTGCTGATTTCCAGCCCAGCATTGCAAAGCGATACATTGATCAGAAGTTGTCCATCAGCTCCTGGAGCTTTTTGATAGTGAAGATCCACAGGAGTGCGACTTCCTGAAGACCGTCCTGCATTGGATTTATGGCAAGTTCCTTGGCCTGAGAGCATTCATCAGAAAACAGTTTAACAACATTTTCCTCAGGT------TTATATATGAAACGGAACATT s monDom4.chr2 120465150 250 + 541556283 ATTTAAGTTATATGATTTAGGAA--------TTAAAAGTAAAATGAGTTTTC--AGTTTGATTATTTTTAAAAAAGTA--------------ATTTCTCAGATTTTTTTTA-AAGCTCTTGGAGCTTTTTGATAGTGAAGATCCCAGAGAGCGTGACTTCTTGAAGACGGTTCTGCATCGAATTTATGGGAAATTCCTTGGATTAAGAGCATTCATCAGAAAACAGATTAACAACATTTTCCTCAGGTAAGCAGTTATATGTACAATTTATCCTT a score=2264 s mm8.chr4 145947060 35 + 155029701 TCAATGGTGTGGCTTAGCTCCTTGAAATATTGGGA s monDom4.chr2 120468177 35 + 541556283 TTAATGGTGTTGCCGAACTCCTTGAGATATTAGGA a score=7654 s mm8.chr4 145947095 109 + 155029701 AGTATCATCAATGGCTTTGCATTGCCAGTGAAAGCAGAGCATAAGCAGTTTCTAATGAAGGTTTTTATTCCTACGCATACTGCAAAAGGATTGGCCTTGTTTCATGCAC s monDom4.chr2 120469315 109 + 541556283 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ATAGGTGATGTTTTTAGGGGAAATCGAAGAAATCTTAGATGTAATAGAGCCAACACAGTTCAAAAAAATCGAAGAGCCTCTCTTTAAGCAGATATCCAGATGTGTGTCAAGTTCTCATTTTCAGGTTGAGTAACCTAGAGTGGATCTATTTCATTTAAAAACTGATCCTTTTTTTTTTCTTCTGGTTTTAATTTTGCCAAATATCTGTTTCAGGTTGCAGAAAGAGCATTGTACTTCTGGAATAATGAATATATTCTTGGTTTGATTGAGGAAAATATTGATAAAATTCTTCCAATCATGTTTGCCAGTTTGTACAAAATTTCCAAAGAACACTGGAATCCGTATG a score=6633 s mm8.chr4 145947562 91 + 155029701 TTGTAGCACTGGTGTACAATGTGCTGAAAACCCTCATGGAGATGAACGGCAAGCTTTTTGACAACCTTACTAGTTCCTACAAAGCCGAAAG s monDom4.chr2 120476863 91 + 541556283 TTGTAGCACTAGTATACAATGTGCTGAAAACATTAATGGAGATGAATGGCAAGCTTTTTGATGATCTCACAAGCTCATACAAAGCCGAAAG a score=26720 s mm8.chr4 145947653 1106 + 155029701 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s monDom4.chr2 120482914 1315 + 541556283 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TTCAAGAGTTCTAATCTTCAGTCAGATGACAAGAGTATTAGACATTTTGGAAGATTACTGCATGTGGAGAAATTATGAATATTGCAGGTTGGATGGACAGACTCCTCATGATGAGAGACAAGTGAGTTAAATTTGATGGGGAAAAGGAGGGAGAATATTAAGTGACATGATTATTTTTGACATTTATTCTATTTTACACAGGATTCCATCAATGCATACAACGAGCCAAACAGCTCCAAGTTTGTTTTTATGTTAAGTACACGTGCTGGTGGTCTTGGAATAAATCTTGCTACTGCTGATGTTGTGATCTTATATGATTCAGACTGGAATCCACAAGTTGATCTTCAGGCTATG a score=8258 s mm8.chr4 146121516 131 + 155029701 GACTATGCCCATAGAATTGGACAAAGGAAGACTGTCCGAGTGTTTCGCTTTATAACCGATAACACTGTGGAAGAAAGAATAGTGGAACGTGCTGAGATGAAACTTAGACTGGATTCGATAGTAATTCAACA s monDom4.chr5 173417898 131 - 308900514 GATCGAGCACACAGAATTGGACAAACCAAGACTGTTCGAGTATTTAGGTTTATCACTGATAATACAGTGGAGGAAAGAATAGTGGAACGAGCAGAGATGAAACTCAGGTTGGATTCAATAGTCATTCAGCA a score=11538 s mm8.chr4 146121647 215 + 155029701 AGGGAGGCTTGTAGATCAGAACCTGAACAAAATTGGGAAAGATGAAATGCTTCAAATGATTCGACGTGGTGCCACACATGTGTTTGCTTCAAAAGAAAGTGAAATCACTGATGAGGATATTGATGGTATTTTAGAAAGAGGTGCAAAGAA---GACTGCAGAAATGAATGAAAAGCTGTCCAAGATGGGTGAAAGTTCACTTAGAAACTTTACGATGG s monDom4.chr5 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mm8.chr4 146122837 292 + 155029701 CACAGAAACGTAAGATGGACGGTGCCCTTGATGGCCGTGGAAGAAAAAAGAAGCTGAAACTATGAATGCATTTTTGTCTTATAATCACTAACT-------AGTAGTTCTTTAATTTACAGGTCTTCATAAGATGTGCTGGACAGTGCTCAACTGTTATGTCATTCA-GACATCAGGTCCATCTGCTTACTGAGATAGAAACATAGTATGTAGTTTCACTTTTTTTTAAATGCAACCGCTGTGCTGAAA-TTTTTTTATCATTAACAATTGAAGTAATAAAACAGGCTTCATTTATTAAAAA s monDom4.chr5 173432816 300 - 308900514 CACAGAAGCGTAAAATGGATGGAGCGCCTGATGGTCGAGGAAGAAAAAAGAAGCTAAAGCTATGAATGCTTAATTGTTTTGTAATCACTAAATTTTAAAAAGTAGTTCTTTAATTTACGGGTCTTCATAAGATGTACTGTACAATGCTAAACTATTATGTCATTAAGGACATCGGGTTCATCTGTTTACTGAACTAGACACATAGTATGTAGCTACAC-TTTTTTAAAATGCAACAGCTGTGCTGAAATTTTTTTTACCATTAACACTTGAAGTAATAAAATAGGCTTCATTTATTAATAA a score=833 s mm8.chr4 146123665 205 + 155029701 TCCATGTTGGGATGACCATATGTTTGTAAAAAAAAGACTATATTTTGATGTAATTCCTAACCATTTTTGAACATCTGTTAGAAGACTCAGA---GTGAAATGTCTATAGGGTGCAAATCGAACAACCTGTCCTTGATCACTATATAAAAAAATGtccatatttcctc-----ccttgaatattttgttccccaatctaggtagaactaaagca s monDom4.chr3 272817896 201 - 526135210 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s monDom4.chr8 14897768 3486 + 308469712 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s monDom4.chr4 40848732 2481 - 430141050 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155029701 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s monDom4.chr4 41622488 1452 - 430141050 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ttttactgacaaaggcagtctgagaaggcatcagaaaattcatacaggagag-aaactttcaaatgtagtgaaggtgacaaatgttttaatcacaaatcccatcttagtatttatcagagaattcatacaggagaggaaccttacaaatagtttgtatgtgacaaatacaatactcacaatgtcagtctgagaaatcatcagttatttcata-cagtagagaatctttataaatgaagtgaatgagacaattctttaccaagatacagcatcttaaaattcactagagaatacttacagaagaggaacttttcaaatatatcgaaggtATGAATTCTTTATTTTTGCCTATTTCCTAGAATGTAACTGTG------AATGCTAATAAGCTAGAAACTTAACGCATGTATTG--TATGAAGAAATATCTTT----------------GAATTCATTTTAGTCAGAGAAAACATCT--AAGAACTTTTTAAGGGAAAGTATTTCTGT-TGAGAAAAAGGTGGCATATGTTTTATTCATGGCATATTCTTGGCAATACTCAAGGCT--CCACAC----TAGAGAATTAGTATAATT------------ATGAGAATCTTTTGAAAATTTTCATGCAATG------TTCAAATCTTAAATAATGTC---GACTCTGACAATTTG---AAAAAATGTAGCAAGCctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttttttTGGGGGGGGGttggtttttagagacagggtttctctgtatatccatggccatcctgtagaccag-gctggcctcgaactcagtaatccgcctgcctctctctcccgagtgcttggattaaagacatgtgccaccacgcccagttGTAGAAAGCTTTTCATGACACCTTTTTATTTGTTC-ACCCTCAAATGTGGCAAGATGAAGACAAGCTGGGAAGTCA---GAAGATAGT--ATTGTGTAACACTTTCTTTAAGACAGAAATAATCCATTTCAAAAGGAAACTATTTAAGGTCTTTAATACAATCCT-------CAAAATATCTAATAAAACTGG----TAACATTCTGTATA----TTTAATTAAAATGAACCAATTAAGATAAAAATA s monDom4.chr2 522188879 1032 + 541556283 CTTTAATTATAAGAAAAATCTTATTCCCCAACAGGAAACTCACACTACAAAGAAAACATTTTAAAATAATGAGTGTTGGAAAATCTTGAGTTGCCAAACTGTACTTAA----TAGCAGAGAATTGATA---GCAAATGCCTTTGCAGATATGCAGTAGGAAACC------------------TTTCTCTTCAAAAGAACTTTTCATTACCCATCATTTGAATATACTTA----------ATATGGGAAAATTTTCAGTGAATGCAAAGCCTTATAAA----ACATCAGAACTCTCACTGGAGAGAAACCATTTAAATGTAATAAATGTGGGAAAAGCTTCCATCAGCAGTCAAGCTACACTACACATCAGGGAAACGATACTGGTTAGAAAGAGCCTT--TGCATGGAATGACTATGAGAAAACCTTCATTTTATTGCCCACTAGAGAACTCACTGTGG--AGAGAAACCATTTGAAAGGAATGACTTTGAGAAAGCCTTTAGTTATAGGATAAATGT----TATTACCCATACGGGAAAACCTGATTGCAGTATTTGAACCTAGCCATGCAAGGTAAGAAACTAGATTCATTTGTTGCTTAGACACTGGAAT-TGTTGCTCAGTCCAGGACAAGGAGGTCATTCAAATCATAGAAAATCTTCGAGGATCTGGAAATTGATGCAAGGAATTTTCTAAGATACACATTTTAAGTATCTTGTGTACCTAATTTCAGATCTACCTATCTCCAG-------------TTTAATTAGCTGTTTTTTCC-----TCCATTGT--TTCTGTGGTTGGGTTCTGGGATCCAAC---GGTTTTTGACTGTC-CTCTCTGTTGAATGACTTAGTAAA--------------------ACTTGTAATAATTTTTTT----CAGGTTTAAATTTGTTCTTCCCTGACATTCATCA--TTGAAGTCATACTCAAAAACTATTTTAATTTAATGAATTTGAGAAAACCATCAATAAGAATGAAAGAAT-------AAAAAGAAATTGATT--TGTTCTTAAAGGAATCCTTTGTATGTAATGAATGTAAAAAAACTAGAACACAATATTGTGAGAAATgctggatttcgagtaaaataatcagggtccaaata 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CTTCCGGCTCTCTACATGCTTGGCAGTGGAGTGCAGGGATGGGAACTGTGTGTCACTGTATATTTCTGGTGGTCCTTGTGGTGTTTTCCTTGTTGTGGTTAGCCTTGCCCCAGGAGGCCTAAATACACCACTGGGCATTGCTGGCTCCGGGGTTTCTGTAACTGTTACTGGAGCAAGGAAGCGCCTGTACCGGAATGGTTTTATTCCAGGGACCTGAAGATTTTTCTGCTCCATTGCCACC s monDom4.chr8 267689058 236 + 308469712 CTTCCGACTTTCTACATGCTTGGCAGTGGACTGCAATGATGGGAACTGTGTATCGCTGTATATTTCTGGTGGTCCTTGTGGTGTTTTCCTTGTTGTAGTCACCCTGGCACCGGGAGGCCTGTATACACCACCAGTCATAACAGGTTCTGGGGTTTCTGTAACTAACAT-----AAAAAATGATTTGGTGAAAAAACAGTAAGCTTATAGGCACAGAAAAATATTTTTGCTTCCTATCAACC a score=3644 s mm8.chr4 146590026 40 + 155029701 TGGATCTTCTCTCTTCTCATTATCATCTTCTTCCTTTTCA s monDom4.chr8 267690352 40 + 308469712 TGGATCTTCTCTCTTCTCGTTATCATCTTCTTCCTTTTCA a score=5522 s mm8.chr4 146590066 79 + 155029701 CTTATTTGCATTGCCTGAACTCTTAATCCGCTGTAATCAACCTCTCTTTGCTCAAATTCTTTCCACTCATTTTCATCCT s monDom4.chr8 267698589 79 + 308469712 CTTATCTGCATTGCTTGAACTCGAAGCCCACTGTAATCGATTTCTTTTTGCTCAAATTCTTTCCATTCGTCTTCATCCT a score=35445 s mm8.chr4 146598205 1832 + 155029701 CCACATTTTTCCCAACAGAAATACTATCCCTTAAA---AAGTTCTTAGATGTTTTCTCTGACCTCAAATGAAGTCAAAGATATTTCTTCATACAATGCATGAGTTAAGTTTCTAGCCTGTAAGTATATTCACTGTTATATTCTAGGAAATAGGCCAAAAGG---AAAGGATTCATACCTATAAtatatttgaa--gtttgtcttctctaagtattcactaatgaattataagatgatatattttggtaaaggattatct-cgttcacttcatttataaagattctctactgtatgaagtaactgatgatttctcagactgacatggtgaatattgtatttgtcacatgtaaactatttgtaaggtttctctcctgtatggattttctgatgaatactaagatggaattttcgggtaaagcatttgtcacattcactgcatttgtaaggattctctcctgtatgaattctctgatgaattctcagactgcctttttcagtaaagcatttgtcacattcactgcatttataaggtttctctcctgtatgaattctctgatgaatattaagattggatttttgggtaaagcatttgtcacattcactgcatttgtaagggttctctcctgtatgaattctctgatgaatactaagatggaattttcgggtaaagcatttgtcacattcactacatttgtaaggtttctctcctgtatgaattctctgatgactattaagatgggatttgtgggtaaagcatttgtcacattcactacatttgtaaggtttctctcctgtatgaattctctgatgaatattaagattggatttgtgggtaaagcatttgtcacattcactgcatttgtaagggttctctcctgtatgaattctctgatgaattctcagactcccgtttttagtaaagcatttgtcacattcactacatttgtaaggtttctctcctgtatgaattctctgatgactattaagatgggatttgtgggtaaagcatttgtcacattcactacatttgtaaggtttctctcctgtatgaattctctgatgaacgctaagatgagatttttgggtaaagcatttgtcacattcactacatttgtaaggtttctctcctgtatgaattctctgatgcatactaaaactgaatttgtgtttaaaacatttgtcacattcactgcatttgtaagggttctctcctgtatgaattctctgatgaatattaagatgggatttgtgggtaaagcatttgtcacattcactacatttgtaaattttctcttctgcatgaattccctgatggatactaagatggatctgatgggtaaagcatttgtcacttttactacttctgtaaggtttctttccatgataaattctctgctgactttgaagtttttctctctgggtaagatatttgtcaaattcactacatttgtaagggttcactccagtat------TGTTTCGTTTCACCATGACTTTATGTTTAGAAACAAAAACCTTCTCAAATTCTGCATTTCGGTTGTGTTTTTTCTTCTGCAGGTGGATTCCTTGATT-GAGACTA----------ATGGTAGAAAACAAACTTACACTGTTTACA----GAGTCATTGTATTTGCAA--ACTTCTTTAGTGTTCCTGGG--------------CTTAAGTCTTTTTTGGTTCGA--GTATTGAAGAGAGCTGTGATTAGTTTTGTAAGGTGTACATTGGGGGGATTCAAGAATCA---------------CCTTGATAAGCTTGTCCCATTTAGAAGACTTCTCTTGAATATTCACGTGTTCATGGACAATGTACTGGCTCTCTTCACCCAAGACCTTCCCATACTTTCCATGTATGCAATGATTTTCT s monDom4.chr2 19136865 1866 - 541556283 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a score=3732 s mm8.chr4 146665537 63 + 155029701 TTATGAATGAGGCAATTTATTAAC----CCAGCATCCTTTGTTCTAATGCTTCTTGTTGGCAGCTGC s monDom4.chrUn 60865659 67 - 174229318 TTACGAACAAGGCAATTTATTAATGAATCCGGTGTGGTCTGTCCTAATGTTTCTTGTTGGCAGCTGC a score=4568 s mm8.chr4 146665600 57 + 155029701 CACCTGTCCAGAGATCCTGTCCAGATCTCTCTGCCCCTGAGGTGTTAGCTTGCGGCC s monDom4.chrUn 60866194 57 - 174229318 CACCTGTCCTGCGATTCTGTCCAGGTCTCTCTGTCCCTGAGGTGTCAGCTTGCGGCC a score=11499 s mm8.chr4 146665657 185 + 155029701 CCCATCTTGGTCCTTTTCCACCATTTTCAGCCCCTCCAGGGCTTGGAGGACCCGGAGGGCCACACTCTTAGAGCCTCTGCTGAAGTGGCTAGGTCTGACACCGTTTCTCTGCCGTCCTCCATAGATCTCGGTTATGGAACCAACCCCCGCACCACCTCGGAGGTACAGGTGCCTTGCTGTGGAAG s monDom4.chrUn 60866971 185 - 174229318 CCCATCCTGGTCCTTCTCCACCATCTTGAGGCCCTCCAAGGCTTGCAGGACCCTTCGGGCCACGCTCTTGGAGCCTCTGCTGAAGTGACTGGGCATGACCCCGTTGCGCTGGCGCCCACCGTAGATCTTGGTCATGGATCCCACACCAGCACCACCCCGCAGGTACAAGTGTCGGGCTGTAGAGG a score=6820 s mm8.chr4 146665842 99 + 155029701 CAGCTCGTGTGTAGAATCCGTTCTCATCATATGGGGCAAGCTCTTTATGTTTGGCCAGCTTGACTGTGTCCACCCATTCGGGGACTTTCAGCTTCCCGG s monDom4.chrUn 60867429 99 - 174229318 CAGCCCGCGTGTAGAACCAATTCTCATCGTAGGGCGCCAACTCCTTGTGTTTGGCCAGCTTAACCGTGTCCACCCACTCGGGCACTTTCAGCTTCCCTG a score=3506 s mm8.chr4 146665941 67 + 155029701 ACTTTTTGAGGAAGGCTGCCAGAGCTCTGACGAACTCCTGCTG------GTCTTTTACAGTAACTCCAGAAAT s monDom4.chrUn 60867915 73 - 174229318 ACTTTTTGAGGAAAGCAGCCAAGGCCCGAACGAACTCTTGCTGGTTCACGTCCTTCACCGTGACTCCCGGCAT a score=2268 s mm8.chr4 146666008 36 + 155029701 CATGCGGCCTCCGCGCTGCCAGCCAGGGGAAAGGGA s monDom4.chrUn 60868158 36 - 174229318 CGTGCAGGCTCCGCGAGGCAAGCCAGAGGAAAGGGA a score=-278 s mm8.chr4 146674510 50 + 155029701 tctgcctcgcctccgaagtgctgggattaaaggcca------gcgccaccacgcct s monDom4.chr7 237389141 56 + 262624689 TCAGCTTCACAGCTGGAAATGGAGGATGAAGGTACACTTGATGTACTTCAGCAGCA a score=15492 s mm8.chr4 146674560 350 + 155029701 ggctGGAGGTGTCTACTAAAAAGGGGACGCCTGCTACTTTACTCCAGAATTTTGTGAT--AGACCAGGAATACATTCTCACTTAGAAAGCTGCAGGTTGGTCCCGCCACATGCTGACTGCTACAGT-----TTTCCCTCTTCTTTCATTTCCCTGCCCCCATTTCTTTGTTGTACATAAAGTAACTGGTGTATGTACACAAGCATAGTGCTCTCTCTTTCTTTTCCTTTTTTAAACGAAATGGCCAATGTTCTGTTCTGGTTGACATCAGATGGAGATGGTCTGGGG----AAAATACTGGGTCTCTGAAGACA-CCCCCCTCTCCA-TAGTGCCATGCTCATTCAGTTtttgtttttttgtt s monDom4.chr2 214180792 349 + 541556283 GACAGGAGGCATTTACTAAAGAGAA----CCTGCAACTCTACTCCAGAACTGTGCTCCCAAGGAAAACAATACATTCACAATTAGAAAACCAAGATTTGGTTCCTCCACATCCTGACTACTGCAGTATAGTTTTCTCTCTTCTTTGATT-CCCTTCCCCCATTCCTTTATTGTACATAAAGTAACTGGTGTATGTGCACAGGCATAATGCG---------TATTTTTTTTTTTAACTAAATGGCCGATGGTATGTTTTGATCAACATCAAATGGAGATGGGGAGGGGGGAAAACAAACTGGTTCTGTGAAAATATCCCTTTTCTCCATTAGTGGCATGCTCATTCAACTTTTATCTTTATATT a score=3797 s mm8.chr4 146717406 428 + 155029701 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AGGTCACCATTACCTCCTTCTGGCATCCCCTGAGCTTTCTGGATTCTGGCATTGACGACCTCCTTGGCAGACACAAAGAAGATGCGATCCCCCGCTTGGGCCCGATCTACCACTCCCAGTTCATCCACCAGGAAGCTGGTACAACGTTCCATGTGCTGCCTCCGGACCTGG-------AGA--------CCCAAGCCAGAGAAAAGTGAG-------GCTCCAACAAGCCCAACCTGCACCTCACTGGCAGCAGCACTGGACAGATACTACTTCCCAGAGGGGCAGGGCAACTATGATTTGGAAACTACAAGTCTGTCACCTTTTTCCAGATATTTCTACACATAAGAAAAATGAGAGCAAGTCTATAAACATGTTCCAAGCAAGAAAGCATATTTTTGCTACTTAATATTGCTCTCTCTCCCCCTTCCTAATTTATTCCTCAGAGTAGA-------------CCTACAGGAAGCAGACAGACTTTCTTTTATCTAAATTAAAGCAAACCAAGCTCTAGTTGTGTTTGTCCCCATGAAAATGTGCTGTATGTTATCTGTTGAAACTTTGGGAAGACATGGCATGTAGTGGAG---------------AGCTTCAGAGGGCCAAAA------------CTGTGtccctgatctaccctcaccacccaggggattttggaaaagtc--------------------------------------ccttgcttctctgagtct-------cagtttctttctctg---tgaaatggcagagtcagaccagatgatgacctgtggtctctattagctctaCAGGCCATTTCCTTGGACATCTTGATGCCAAGTGTAGACTATCTGGGGGAGGGGAGATGGAATGGTAAGTTC-----------CAAGGGAAGAAAGAAGCTGAACC---CTGTGGCTTC-----ACCCCCAGCAGGGCTGGGCAA------------------GGCAG-----------------------CACAAACCTCCTCCATGTACTCTGGTTCTGAGGCAGAGGCATCCCAGCGATTGTTGAGGATGAAGATATTGGGGCGAGAAAGGCGTTCACTCACTTTGTGGAAGAATTGCTTCTCCTGGAAACAAGAAAGCCCAGCTCAGGGGAGGCTACC-ATTATGGCTGGCCTGGCTGGCCACTAAAAGgggggaaggggagaaaagaggaaggaggaaagggggaagagaagagggaggggTTACCGTCTGCATCAGTGTGGACTCTGAGTTGGCCACCAACACAAACACATCTGCATCAAGGCAGAACTTGTCAATCCAGCTGTCCAGTTCAGTAGTGACGTCAATCCCAGGGCTAAAGGTCACAAAAGGAA 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ttaatttctgcctcagttttctcatcaa--------------aggaaacacttaaattgcttcagcatctttaccaagaaaatcccaaatggggttacaaagagttggatggacatggatgaaatgactgaacatcaaaaataTCCTTCAAGGGTTTCAAATATTCCAGAAAACTAAGCAAATAAAATATGAGGGTGAGGTGAGGGAAAAGAGG a score=8995 s mm8.chr4 146738351 173 + 155029701 AAAGTACTCACCGGCCAAAAAAAGCCACCTTCATGTGCCGCCTGGCCAGCACTTCGCTGATACCCCTGACCTTGGACAGGTACCCTTTGACGTCCAGGACCTGCTCTTCCGTGGTAACCGGGTCCAGTTCTGTGTTCCTGTGGGTGTCTGGAGAG-AGGATGACAGTG-GGTCAG s monDom4.chr4 358552177 175 + 430141050 AAGGGCCTCACCTGCCAAAGAAGGCCACCTTCATGTGCCGCCGGGCTAGAACCTCACCAATGCCCTTCACTTTGGCCAGGTAGGCTTTGACCTCCAATACCTGCTCTTCGGTGGTGACAGGATCAAGCTCCACATTTCTATGGGTATCTGGAGAATAAAATGAGATTGCAGTCAG a score=1657 s mm8.chr4 146740744 100 + 155029701 ACAACGTCACGTGAGTGAATGGCTCAGGGCAGAGGAAGGCCGGGCTCTGGGAAGGCAGAGCAGAGCTACTGCTCAATAAACACG--CTGTGATCTACAATCA s monDom4.chrUn 97569813 102 + 174229318 ACAAAGCTGGACGGGGGAATGGCCAGAGTCTGGGGAGGAGCAGGGCTGATGAGGGCAGAGAAGTCTTCCAGCTCAGGGGAGGAGGACCATGGTTTACAGTAA a score=12767 s mm8.chr4 146742240 213 + 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agggctacacaga--gagaccctgtctcaaaaacaaaaCAACAACAAATAAAAACCCACAAACAAACAAACAAAAGAATTGTTTTTCA s monDom4.chr3 49731110 78 + 526135210 AGTGCTCCCCAAATTAAGACCCT----------CACAGCGATAGCAAACAAATTCCCACAAGCTGGAAAAGAAAAGGATCTCTCTTTA a score=5925 s mm8.chr4 146881655 174 + 155029701 GAAGCACTCAGTCCTCTCACTACACCAGTTACCCAGGACAGCATCTGGAACACCTCACCTCATAGTCTTTCCTTGGAAGAATCTCATCCTCTTCTTCCTGTGTCTCCCCAAGGATGGTCTAGAAAAACAGATTCACAGAATGGAGATCTTTTAATGGGTTAAGGGTACAAGGAG s monDom4.chr4 358750975 162 + 430141050 GAACTGATGAGACCACTCAATGCCTTAGTTACC------AACTTTTAGAAC--CTTACCTCATAGTCCTTTCGGGGAAGGATCTCATCATCTTCTTCTTGTGTTTCTCCAAGGATAGTCTATAAAAATACATCCAAA----AGAAAGTTTTAAGCAGAATGAAAGTGGAAATAG a score=9155 s mm8.chr4 146882345 546 + 155029701 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TTCGGTCACCCTCCTCAGCCCTGCCTCTGTTCTC---AGGGAGAGAACATCACTAATGCCCCTGAGCTGCAGCCCAATGCCGTGACGTGGGGCATCTTCCCGGGTCGAGAGATCATCCAGCCTACTGTGGTGGACCCCATCAGCTTCATGTTCTGGAAGGTAAG--GGAGTGGGAGGGAGTGGAGGACCCTGGCTACCGTGAGAGCCCTGGCCAGACA---------------ATAGTCCCAAACACGTAGCCGAAAACCATACCCCAGGCAGGGTAG s monDom4.chr4 358770566 270 + 430141050 TTCTGCCATTCCCCTTTCTCCCTACTTCTTTCTCCCTAGGGTGAAAACATCACCAATGCCCCTGAGCTTCAGCCCAATGCCGTGACATGGGGCATCTTCCCTGGGCGAGAGATCATCCAACCCACGGTGGTGGATCCCGTCAGTTTCATGTTTTGGAAGGTAAATTGAATTGAAAATTGATAG-----TCTCCCTCCTGCCAAAGCC---GATAGGTATAGTTCTTTTCTGGTGTTGCCACTCACATGGGGCTAAAGGAGACTGACCAGACATTGCAG a score=12182 s mm8.chr4 146899078 294 + 155029701 TGTTACCTGGGTGGCCTGCAGGGAGACAGCAGGGGCCCAGACCTGG--------AGGTACCAGCCGTGCTGACCCTGCTCGTGTGTCTCTGTCCACACGTAGGATGAGGCCTTTGCCCTGTGGATCGAGCAGTGGGGCAAGCTATACGAGGAGGAGTCGCCATCCCGCATGATCATCCAATACATCCATGACAACTATTTCCTGGTCAACCTGGTGGACAACGAGTTCCCGCTGGACAGCTGCCTGTGGCAGGTGGTGGAGGACACGTTTGAGCTGCTCAACAGGC--ATCCCACGGAGAGAGA s monDom4.chr4 358770921 282 + 430141050 TTTTTCCAGGGAGGGATGTTGGGCT----CTGGGCCCTACCTCTTGTCCAACCCCAGGACAGCTCCTGCTGACCTTGTTTCT------------------AGGATGAGGCCTTTGCCCTATGGATTGAGCAGTGGGGCAAGCTGTATGAAGAGGAATCCCCATCTCGCATGATCATTCAGTATATCCACGACAATTACCATCTGGTCAACCTAGTGGACAATGAGTTCCCATTGGACAACTGTTTGTGGCAAGTCCTAGAAGATACCTTTGAGCTCCTCAGCAGTCCAGTCCAATAGTGAAAGA a score=-981 s mm8.chr4 146900541 609 + 155029701 CTACACCTGAGCCACTGTAAACTGTTTCCAGGAGCACAGGCTGCTGCTAGTTCTTCTCATGGGC-TCTTGGCTACCAAACGCTGGTGCCACTTTTCAAAGGCTTGGAGGCAGG-GCAGGAAG----------------TACTGCTTGTCTCAGGCTCCCTCCAGGG-----TCTGTACTGGGC---CTGTCAGACTTGACACCTAAGCCATGTT----CTGTGTGTCTCAACCAGAGGCCCTT---TCCTTTGCCCT-----------------GGCAGCCAGCCCACCCTGTCTCTGCCCAAATATCTAGGC-----TCAGAATAGACTGGACTTGT------GACCCGGGAAGCTATGCCCCGTGACCTGCAAACAAGACATCTGTTCTGGACGCAGG---------CCCTGCAAGGACCA-GCATGGGGAGCCACTGCCACAAACAGACTGGTTCTCTGAGTGAGTGAAACTGATACTTGGCTGGGCTTGAGGCCCCTAGTCAAGGGCTCTAATGTCCAGGCTGTGTGCTCTGTAACCAATGGCCAATTC--------------------------AACTGA--------ATGAGGATAGCGCAGGGTGGTGAGCAGGGACACCCTCC-------CCTCTCCCTGGCTCAGCCTGGAGG-----------------TGGCACTGGTCTTGGAGGGCTGGCTGGGTGAACCAAG-----GTAAAGTCACCTGGAAAAGGAC s monDom4.chr4 358773375 704 + 430141050 CTGCCCCTCGACCCCTGATAACTG------------------GCTGGCACTTCCTCTCCTGGGCACCTGGGCTGCCCAGCTCTGGTACCATCTTCCAAAGGCCTGAAACCAAGCGTGGGAAGGTAATGGGGAACCATTTGTTGCCTCCCTGAAACACTATCTTTAGCTACTCCTGTTCTGGGCTCTCTGCCCAGCCTTCAGGATCAGCC-TGTTCATGCTAAGAGGCTGCAACAGCTGTCCTTGAGTTCTATCCCCTCCCCCTTAGGAAAACTAAATAAAAAGCCCTCCACACCCC--CACAACCCCCAAGGCAGCAGCCAGGGCAGAATGCATTAGCCCAGAATATCTGGAAAGATATG----GAGAACTGCTTAAAATGAAGTAGGCCCAGAAGGAGGAGTGTACCCCCTTGTGTGCACTAGGCATCTGTATC--TTGCCTTGAATAGG------ACTTGGGGGAGGGGGAAAGCTATTT--CTGAAACCAGGACCCTTGGGT--GGTATCTGAGGGCTGAAGTTGGGGCTTGAAACTCAAAAGCCACTTCTGACCTCCCTTAACAGCCCAAATAGAAACTAATGCCTCTCCTTAGTATGTTTTAGGGTG--AGGCAGGGGGGATCTCTGGAGGGGCCCAGCCCTGGCAAAAACTAGAGATCTCGGGAATGCAGCCCTGCCACAGGCCTGGAAGCCTTTAGACACTGACCCTGGCCTCCGAGCAAATACCTGAGAGAGGAT a score=2381 s mm8.chr4 146901169 470 + 155029701 TGTAGCTGTTGAGCCACCCGGAGCTGAAGGACCTTTTTCTGCCATGTCCTCCACGCCTGTTCCAGGTGCCATTGTCTGAGCTAC--AGAGAGAGTTGATAGAAAAGA---------TCCTCTGCCATCCTGTCAGC--CCTGGCCCTTCTGCTGCCACCCCAGGGTGA----AGGAGATGT---------------GACAAGGGGCCATCACC----------------TAAGAAATGTTAATAAGTGATCACACCTGAGCCCATCCCTAAGGCTTTGGGCATGAGGTGCAATTAGTAGTTAGTGCCTCCA----GCTAGCCAAGGG-----ATACATAGGATGAGTGG-----------------------------GGAGTTGTTCCCAGGGCCTCTGCT------TGGTACAGAGGAGCTGAGCCTCCCTACCAGAGCCCAAGA----------CAGCTGCTCCACCCAGTGAACATCTACCCAGCGCTGCCATGCCCTTGCCAGGCTCCAGGCCT-------GCTGGGAA--------------ACCTGACTATGCCAACACTATAGGTACCTGTCCCTGCAGGCCAAG s monDom4.chr4 358774095 578 + 430141050 TGCAAACGCAGGCCCACTTGAAGCTGCAGCCACTGCCTCCGCCACTTCTCCCAGCCCCATTCCAGCCACCACTGCCTGACCTGCTTGAGGGCAGCCCAAGGTCAGGAGTGGGGGAGCCACCTCCCCTCCAGCCAGATGCCTGCCCCGTT--CCAGCACTTCCAGATGACATGGGGAGGTGTGTGCTCCTCGGCCAGGAGAAAGGGCCTTTAGCCTCTTGCGGAGTCTGTTGGGCATCTTTAAAGAGTGG----AATTAGGaccactcttctgccttggagc-cgatatacag--------tattgactccacgacagaaggtaaggatttttaaaaaaataaaGAGTGGAATTAGGGCTGGCTGGCCTATAAAATAGAGGAGGTGACCTCTGGGTCCCTTCTGACTTGGGAAACTAATTCAATGATCCCCTCCAACAAGGCTCACCAGTGTCCGTCCCAGTTGCTCTGCTCCCTGGGCATCTATCCAGCATTGCCAGACTTCTGCCAGTCTCCTTGTTTTTTGTTGGCTGTGAAACCTCCGAAGCATTACCTCATGTCTCCACCTCTGTAGGTATTTCCTCCTGGAGAGAAAG a score=7750 s mm8.chr4 146911839 152 + 155029701 ACCATTTGCAATCCTGCACTGCCGCAGCACCTCATTGAAGCCCTCACAGAGCTTGACATCGCTCTGGTTCTGAGCACACTCCAGAAACTGCTTGATCTCTAGAGAGCAAGGTCCAAAAGACTGCTGGTTCTGC------------AGCTGGGCTCCCTGAGGCT s monDom4.chr2 33183034 164 - 541556283 ACCATTTGCAAACCTGCACTGCTTTAGCACCTCACTAAAGCCCTCGCACAGCTTCAGGTCACCCTGATTCTGGGCACACTCTAAGAATTGTTTCATCTCATAGTGGCAGGGGCTGAActgctgctgctgctgctgctgGTACCCAGGCTGGGCTCCTTGAGGCT a score=13979 s mm8.chr4 146911991 253 + 155029701 CCTGGTAAGTGATGTCGGGCTTTGCGGGCTCAGCACTGCCACCTCCACTGAAGCCCCCAGTGATGGCGTGACCCAGGGTGTGCCCCACTGCAGAGCCCACAGCCACACCGGCCGCGGTGGTAGCCATCTGGGCCATCAGGCCTGGCTGCCGGGGCGCAGCGGCAGGTGATCCAACTGCAGATGGCGCAGCTGCTGCTGGAAGCTGAGCTGCAGGTGCTCTTCGGGGAGCAGCCCTCCTCTGAGGGGCCCGGCT s monDom4.chr2 33183739 247 - 541556283 CCTGGTAGGTGATGTCAGGCCTTGCTGGCTCAGCATTACTCCCACCACTGAAGCCTCCAGTAATGGCATGACCAATAGTGTGCCCAACAGCTGAACCCACTGCTACTCCTGCTGCAGTGGTAGCCATTTGGGCCATTAAACCTGGCTGCCTTGGGGCAGCAGTAGGAGGGGCCACTGCAGATGGTGGGACTGCTGCGGGAGGGTGAGCTGCTGGCGCT------GGTGCAGCTCTCATTGGGGGTGCCCGACT a score=3793 s mm8.chr4 146912244 52 + 155029701 GGCCGGAGGAGTCACCCGGGAAGTGCGGCTTCGGCTTCCACGCGGCATCCTA s monDom4.chr2 33186392 52 - 541556283 GGCCGGGGGCGCCACCCGGGAGGTCCGGCTTCTGCTTCCGCGCGGCATCTTA a score=3947 s mm8.chr4 146924102 347 + 155029701 GGTAGCCTGGAGAATTAGGACTGGG---CTCTTCTCCACTGAGAAGCTAG---AGGCTCTTGACCTCCAA------------GGGCACATGACTCAGGCCACCTCTGTGATAGGGAATGGCGGATGCCCCACTGTAGGT--CCAGGTAAAGAAGGTTTGAACAAGAATCCTGCTGGGGAC--CAGGACGACCAGGGACAGCTTCAGTACCCCCGGGGGACAGCTTGGCCCTTGTTCTCCAGGCTTGCAAAGGGGTCTGC---AGCAGCGTCTGATGATGAGTCAATTGTCTGGTAGGCACTGTGCTCCTGAGAGGGTCCGAAGAAATCTAGAGGACAGGGACATGTGCATAGAGAAAATGAGACCCTGGGGT s monDom4.chr4 358824547 347 + 430141050 GTTGGCCTGAGGAAGCAGAGATGGGGAGCCATTATCCAGTGCTCTCCTGGCTGGAGCTCATAAGCTCTGACAGGAAACGGTGAGGTGAATAGATTAAGTGTCCCCAAGGTCAGTGAATGA---ATGCCCAGCATTAGATGATGAGGAGGAGAAGGATGAGATCTAGAT--TTCTGGGGACATCAAGTGGGAAGGGAGC----TCAGAA------GGGACGAACTGTTGGCTTGCTTTCCAGGTCTGCATAGGGGTGTGCCAAGGCAGGGTCCTCCTGGGGGTCAATGGTCTGGTATGCGCTGCGCTCCTGCAAGGGGCCAAAGGAACCTGAAG---------ATATGGATGGAGGAAG-GAGAGGGTGGGTT a score=11081 s mm8.chr4 146925333 237 + 155029701 AGGGGAAGGCGGGGTAGAGCAGGACTTACCGGGGCGGAGGGGGAGCTCACCCCCTCGTTCACGGTGCATGTGGTAGACGAGGCAGCAAGAGAAGGGCTTCAGCAGCAAGCTGAGGATGGCCATGCCGGCGCCGAAGCGGCCAGTGTC---CCCAGTGGCAACACTCGAGTAGAAGATGCTAATGTAGATAATGTCCAGGAAGATGGTGGCAACCAAGCCACCAAGAAACTGCAAGGGACA s monDom4.chr4 358826219 234 + 430141050 ATGGGAAGGGGAGGCAGC------CTCACCTACACTGAGGATGAACTCGCCCCCTCGTTCTCGGTACATGTGGTAGGCAAAGAGGCAGGACAGGGGCTTCAGAAGGAGGCTGAAGATGGCCATGCCGGTACCGAAGTGCTCTGTGTCGGACAGTGTATGCCCACGTGGGTAGAAGATGCTGATGTAGATGATATCCAGGAGGATGGTAATGGCCAGACCAACTAGAAACTGCAAAATACA a score=6438 s mm8.chr4 146926051 318 + 155029701 TTTCCCCACTTC---AACTCACCATGCCTATGGCATCTATAGAGTCCCGCTGGGCCACAGCCCACACACCCAGGGCCAGGATAGTGAAGTTGCCCCAAGCATAGGAGCTTGAGAACACCAAGCAGCCCCT-GCACAGAGAGACACACACTATCAATCAGCTAGTCACCAACTTGAGGTGCCCACCCCGTCCACACAGTTCCTTCCCCCTGTTCCAGGG---TCTTAACCTCCTCTGAGAATAGTcactcctgccccct----------gcaggcagttattgaaatagcaggcagtgtgaatcagatcatgtgactcctcca-agccaaccttccc s monDom4.chr4 358828837 312 + 430141050 TTCCCCCAATCCCTAAACTCACCATAATTATGGCATCCAGGGAATCTGGCTGAGCAATGGCCCACACCCCCAGGGCCAGGACGGTGAAATTAGCAAAGGCATAGGAGTCTGAGAATGTCAAACAGCCCCTGGCAAAAGGAGGCACAGTCAATC---CCAATAGAGTCAGAATTGGG-----------------ACAAGTCCCTTCTCCTTTCTCATTGCACTCTCTATTATTTTAAAAAATATATGCTTATGGCCTTTTTTCTTTATATCAGACATTTCTTTAAAAAAAAAAC----CCAAACACTTCCTCCAATTAACCCATAGCAAATCCTCCC a score=2216 s mm8.chr4 146927569 269 + 155029701 CTGTCCTTATCCCACTGTGTAGATGGAAG-------ATAGATCCAGCCCTGCGCCGAACGAACTGCTAAATGTGATGGACTGAAACAGTGCAGAATGGGACCTGGCCAGGCAGACAGGACCCGGGAGCACTGACCCCAGGTGACACAACACACAGCCAGAAGACGTGGA-TACAGCCAGACACCCAGAGTCACTTACCAGGTTGTCAACAGCCAGTGAACCAGGAGAATAACCTGT---AGCACAAAAACAGGGGTTGGATAAGTC-------TGTGAGTGCAAAGG s monDom4.chr4 358832444 261 + 430141050 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GACTGACCTTCCATGCACATGCAGTCGTCGAAACATTTGTTGTTGAGGCCGCGGTTGTGGGGTGTGCAGAGATGTTCCCGGAGGTCACAGCAAGTTCCTGGCAACATAGCAAGCACATGTGGTCAGCCAAGCTGAGCGGCTCCTCCCTGCCTGCCGCCTGCCCTACAGAGTCCCACCGGACAGGAGATCCATCATATGTGTGGC--AGGCCATGCCCTAGCA--------------GGCCATCTGGTGTGCA-AGGCTCTGGGCCGGGACCGCTGCTGGATGTCATGGATAAAGTCCCCAGAGACGGGTGGCAGAGAC-TTGAGCCTCCCCAGATGGGCCACTTGATTGATCAT--GGGAGGATCAAAGGTGGTGTGGGGTTTTACTTCCCAGGGATGGGGTTGTAACAGCTAGGGGTGCCAGAGGTAGAGTCTGCTGagagctgcaaggggcctccgggatcatggaccaacaacatcct s monDom4.chr4 358872806 450 + 430141050 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GGAGGTGGTCTTTAGATCTGGGGTGCTCCTGCACCCCAGCAGA------------GCCCTGGGCCT---------TCTTCAAGCC------CCCTCGGCTGAAGAAAG--------------CTTAGGATACCCAGACAGATCCTAT--TTCATCTCCTAGTGAGTCCACTGTCCCCCCCCCCCTTCCCCCAAATTAAACCTAATCTTGTGTTGACTCTGCTGAGCAGGGAGAATAATGCAGGAGATTAAGACAAGATGGTATTCAGTCTCCTCCAACAAAAGCCAATTAATTGCTGGTAGGATTATC s monDom4.chr4 359009044 305 + 430141050 ggaactgggctctagatcggtggc-ttctaggaccccggttgacgctctcaaatctCTCTGGGTCTGAGATGATATTGTCAAGCCGGCTCTCCCCCTGCTGGCGGAAGTGAATATTGACAAACAAAGATAATCCAGTCGGTACCCGCCATTCATTGAAAGATGA-TTTAGTATTTTTTTCCCCCT-CCTGTAAATTAAGCCTAATCTTGTGTTGACTCTGCTGTACAGGAAGAATAATGAATACAATTAAGATGCGATCTTGTTCATTCTCTTCGAACAAAAGACAATTAGTTGTCAGCAGGGTTATC a score=13600 s mm8.chr4 147017562 599 + 155029701 agaaagaGGGAATCGGGCGGGGAAAATGATTTTCTCGC-TGGCGTTTCCAGGGGAATTAAATCCTCTTGCTCGTCACCAGCGAGTGGAATAATCCAATCTATGAGG--CAGAAGCCCCCTCCTATTTATTGCAGAGCCTTTGACCTAACAGTATCGGG---CTGCGTTTGAAATCAGACCATCCCGGGGAGGGAGCGCCGGAGGGAGGGAGCG-----CCAGCCCCCGGACCAATTACTCTGCTCGCCGACACCAGAAAAATGAATTATTCCCCG-AAAGCAGCCTCCTCGGCTGATGAATTCTGCACTGCAGAGCTGCGGAGTTCTCCCAAATTGAATCGAAGCTTTGAGAGATGTTTAAAACCAGGTGGAGTGTGTATTGGTGGAGAGGGGGTCCGACAGCCTTAGGGGCTTCGGCTGCTGGCAGGGGCCCAGGGAGGGAGCGAGGGATAGCCCACTTTCTTGCTGCAGCGGTCTCCTGTGCTCAGCTGGGGCGAAATGCTTTGTTCCCAGCCGgaggctcagaga-ggccaggttgtctgtctgaggccacacagtgagcaggtaacCATGGCA--ACCTGGTACCTTTCCGTCCCTGTCCTCCGGGCCTT s monDom4.chr4 359013555 567 + 430141050 AGTAAGAAGGTAGAAAGAAGAGAAAGTGATTTTCTCGCCTGGCATTTCT-GGGGAATTAAATCTTGTTTTTCGTCACCAGTGAGTGGAATAATCCAATATATTAAAACTAATGGGGCCCACGTATTTATTGTGGTGCATTTGACCTAACAGAGTTTTATTCCTGCATTAAGAATAAAGCTGTCAAGGGAA---------GGAGGCAGCAACCTCCCCCCCACCCCCCAGAACAATTAATCCCCTCACCAACACCGGAAAAATGAATTATTCTCCGAAAAACAAGCTCCTCAGCCGATGAATTCTGCACTGGAGATCTGGCGAGCTACATCAAATTGGATTTGGTTTCCAAGCAACATTTAAACCCAGGAGGAAAGGGTGTTGGGGGGGGGGG---------------CGGGATGGAGATACTG--AATAGACCAGTAAGATTAATAGGGCT-TCCGGCATCCTCACTGC--------CCATTGCC---CTGGGGCTAAG------GCTGCTTGTGAGGGGCTCAGGGACCACCAGGTGCACTTTATCAAATTCTATGTTGGG--GGAGGTCAAGGAAGGAATTGGAGACCCTCTAAACCTGTCCCCCTCGCCCT a score=11204 s mm8.chr4 147019459 384 + 155029701 TCCCCATTTCCAGCTTCT-------AGAAAGAGACCT-AGAATCCACTATTGGTCTCCCCACCCGCCCCCTTTAAGCACTTAAAGAACAGACCAGAACTGATAGCTAAATTAAACCTGCTGAGAGCGCCTGTTTAATTGAAAATGCCATCTGTAATTTAAATGTCAGAATCAGGGATGGTTATTGCAGCC-GCCTTGAAGACTGGGTCTCATTTCACAGTTTCAAAACAGA--CCAAGGGAAACAGCAAATGGACCATGGCCGGCGGCATCGTGGAGCGATTAATAACTTCTCTGG-------TCCTGCTGAGCCCCAGCTTCG----GTGGCTGCCCAGT--ACGGAAGG---------------CTCTGGATGGATGGGGGCTGGGAGCTTTGGGTTCGGGGATC---AGCCCCTGCCTCTCCT s monDom4.chr4 359021924 410 + 430141050 ttccttctctcAGCTCCTTCTGGAGGGAGAGAGAGGTGAGAGTACATCGACAGTTTTCTCAAAC----------AACACTTAAAGAACAGAGCAGAACTGATAGCTAAATTAGACCTGCTGAGAAGGCCTGTTTAATTGAAAATGCCATCTGTAATTTAAATGTCAGAAT-GGGGACAGTGATTAAAACCTGCCTTGATTATCAGGGTTGCTTTCACAGTTTCAAAACAGACTCCAA---ATTCTGCAAATGGACCACAGAGCATGGCACTATTGGGCAACTCATAGATTCCAGGGGTCCCTCTCCTAAAGAGCTCCTGCTCTGGGATGTGGCCTCTGAGGCAAGGGAAGGGGAAGGAAGAGCTGTCTCTAGCTG--CTGATGCCATCAGGCTCAAATTCGACCATCCAGAGACACTGCCTTTCCT a score=1937 s mm8.chr4 147021656 52 + 155029701 GAAGGGAGGGTGAGGGAGGCCCAGCATTCATTTCCTGGGCCTTTGC---CACCAT s monDom4.chr4 359022732 55 + 430141050 GGGGGGTGGGAGAGGGAGACACAGAATTCATGCTCTTGACTGATGCTTACACCAT a score=7888 s mm8.chr4 147026100 506 + 155029701 GAGAGCTCGAACAGCGCTAGAGCAGAGCCCCCAGCCTGGACTCCCTCCTTTTCCAGAGTAAGCCCCTCCCATCGGAACCCAAGACCCGCCCCCTCCGGTAATTATAAGTAACATTAAAACTGCCTCCCGGAGCAAGTTATTACT-TCCAAGAATAATAGTC--TGTTACTACAAGAAACTAATTAACAGCATGCAATGAGGGAGAA--AAATTCAATTAATTAGTGGTTTAATAAGCACTCCCAGTGACTCAGGCCCAGCTTGGGGGCCTTAGGGTGGGAGAGAGGAGCCTCTCAGGGGCTGGGTTGGGGGTGGGGGTGAGACTGGGGCTCAGCACCCCGTGGGGCCAGGGCGACTCCTGAGGCCCAGCAGAATCTAGGAAGAGAGCTTC-------CCTGTTGGGTTCAGCCCTGGTTTTGCAGAGTCCCTGCTGGG--CCGGCCTTGGCATTCATTGGTCCCCTTGTTACATCGCAGGGTTCTCTTAGGGTAGGATTGTCCCTGTGTGGTGGCTTGGT s monDom4.chr4 359031075 446 + 430141050 GAAATCTCTACAACAGCTGGCCCAG----CCCTGCCCAATCTCCCTCCTCTTTT------------------------------CTTTCTCCTCCTGCCAATTACGTGCAACATTAAAACTGGCTCATGGACCAAGTTATTACCACCCAAGAATAATCGCCGCCTCTGCTACAAGAAACTAATTAACAGTATGCAATGAAGGAAAAATAGATTCAATTAATTAGTGGCTTAATAAGAACCAGCCATTACTACAGGCTTGATTGGGGA---------AGGAGAGTGGGG-----TGAAGGGTGGCAAAGAGCTGGGG----GAATGGAAGTTTCTACCCCCCAATATAGGCATATCTCCTAAGGGCTGGTTCAGTGTGGAAAGAGACCTGCAggaaagaacacaggatgaagccagggc----cagggatccagcttggttcctgccttggattccctgtatgaccttg------agaaagattat------------ttctccctttgctgggtcttggt a score=5108 s mm8.chr4 147028335 276 + 155029701 CCTGCCTTCTCCAG----CCCCTGCGTGTCCCCTATCAAAGCAGCTGCTGTGGGCCAGCCGT--TTCCAGAGGGAGGCCAATA-GGCGCTTATTGAATGTATGGTTTTAATTTATGACAATTCTAATCCCATTATGGGT-TCTCTTTTGTCTGCAGCCCGCACAGCAGCGTTTAATTACGGCCAACCTAGAATTCCCCGGCACAGGGGACCTTGCCTGCCAG-CCTCCACCTTCCCCAGTCTGAGGGAGTTTGGTGGCCCTA-------CAGAGGGGAGGGGGGCTCCCTGG s monDom4.chr4 359033343 271 + 430141050 CCGGGCTTTTCCAGGGCACCGCAATTTATTCCTGTCAAAGGCTGCCATTGTGGTTCCATCGTCTTTCTAGCATGAGGCTGATAAGGCATTTATTGAATTTATGATTTTAATTTATGTCTATTCTAATCCCATTATACTCACCTCTTTTGTCTGTGCTTAGCTTGGTAAAGCTTTGCCGTTGCAAAGTAAGGCT---------------------CTTGCCAGACCTATATATTCATTTTCCAGAGGGAACTTGGTGGTTCAAGCAGTCTAGGAGGGAAGGTATGTCTTCTGG a score=16275 s mm8.chr4 147034241 499 + 155029701 GTCACACAGACCCACAGTGACATGGGAGGGAGTTTCTTTTCCTTTCATCTGTACTTT-TTGCCTCCTGGTCCCTGGTGCTGCACA--TAGTCCCCCCTTTTTCTGTGATGTTCGCCATTCTAATTAAGTGGAAAAGGCTTTTTACTCCATACAATTCTCCAGTTATGAATAATGATACTGGCTCATAAATGAAAATCGCTTTTCTATTTAAATTCTCTGTGtaatttttttttttctgatttaaaaaaaaaaaaaaGGAATTAGGAGCCCAGAGCTCTTGGGTCATTTGCAAGTTATTCATTTTAAGCAGAGCCCTTAGCTAGCTCATTAATGGTGAGAGTGGGGCCCCAG---TTAAACGCAAGGGTGTTAATTACCTTGTGGGCTTCCATG--GGAATAGATTGCTGGCTCCTAGGTTA-GTAAAAGTTTGGTAGGGAAACA--CAATTCTGTTCTAGAATCCATGAGGAAGGGAGCCTGGCTCAAAGAGATCTTATGAAGACATATG s monDom4.chr4 359047575 490 + 430141050 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CTGTCCCACCCAGAACTGCAGCTGCCAGTGTTGTGAGGTGGGGGATCAGGGTGAGGGTGGCCACCTTCCTCCAGGTTCCCACACTTTCTTTCTATGTCCCCTTGAAATGGGGAGGGGATACATGCTGCAGGGT-ATTAACTAGAGAATAAAACTCCACAACATGAGAGCAAGGGTCAACTGCCTGACGATATAACATTTTTTATTGCTTCGCTCTTCATGGGTGAGAGGAGG---------TCTCTGTCATGGTGATCATG----------------CTGTGTGGGCATCA-----------CAGGC--GGTTC--CTGCTGGCCTTGGCCTTGACCTTGACCCAGTGTGGCTCTTAAAAGCCCCTCTGGGTTGGAGATCAGATCTTCAGGTTTCCTTAGAGCTGGAG--AACAGGATGGGGAAACTGAGCCTCACAGAGCCCCTC s monDom4.chr4 359050361 421 + 430141050 CTGGCCTGTGTAAACTGGCTGCTGTCAGGGAACTGGTTTTGAGGAGAAATATTGCTGTCTTTCCTTCTCCCCCTCTCTCTCCTCTTTCTCTCCATTGGAC--TGAAAATGGGAGGTCATAAATGTGGCAGGTTCATTAACTAGAAAATACA-TTTCAAACCATACAAATGAAATTCAACTGACTGGCAAAATAACATTTTTTATTGCTTTGCTCTTCATGGGTGAGAGGGAGAGTTTAGTCTCCTTGTTGGGATGGTTCTGAAAAGagaaagagcccttgcctgggaatcagatcaggatctcaggcctggttctgctattaactgcttccttaaccatagacaaatctcttttt-------ctctctgggtc-----tcagttct----atctcatgacagatgaaagcaacagcctggaaga------cccctcagatctcttc a score=1809 s mm8.chr4 147048427 69 + 155029701 TGAGAGGACCCGAGTCTGGCTC-CTGAAGCCTGGGCCTCTGGGTGACTTGTGGTTCAGAGTCTGAGCCCT s monDom4.chr4 71058119 70 - 430141050 TGAGAGGAAAAGACCTTTCTTCTCTACCACCTTGGTCTCTGGGGGTGTTGCGGTTGGGAATTAGGGCCCT a score=12667 s mm8.chr4 147048510 325 + 155029701 CAAGACATAGAACAGCTGGGGCTCTAATCTCCGGGCTTTGGAAAGAAGCGTCACCCTCCCCAG------CCATCTCTGGGCACATTATTCACGGGTTCATTACTGTTTAATTTAATCACCAAATGCCATCCAAATGCCGTTTATTCTGCCTTCTCACCAGAGACCTACCTATTTATTTCACATTTCAAATGGGCTGCTCATGATCCTGTCGTT-GGGGCTTTATTTCGTAATTCATTTGGTGAGTTCTGACAAGCTGAAAATGA----------------TGCCGCACAGAACCACCTCCCAACCCTCCGCGCATGGGCTTTTTCCTTAATGGTCCTCCCCTGTGCCT s monDom4.chr4 71064598 334 - 430141050 CAAGGCATTCAGAAGAGAGATTCCAGAGCCCCCAACTTTG------AGCAGCATCATGCCTGGAAAAGCCAATCCCCAAGCACATTGCTCATGAGTTCATTACTGTTTAATTTAATCACCAAATGTCATCCAGATGACATTTATTCTGCCTACTCCCCAGAGATTTACCTATTTATTTTACATTTCAAATGAATTGCTCATTATTCTGTCATCAGGGGTTTTATTTTGTAATTTATTTTACTGGCTCTGACAAGTTGAAAATGAGCCCTGTTCTTCTCTGTGTTGCACAAGCTCGACT-CCAGGCATCTGTTCAGGGGATTCC-------CAGCCCACCCCAAAGCCT a score=4476 s mm8.chr4 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ATCTTCTCATTACACATACATTTTCAACACTGTCAGAGTTTAATTTGTTATAAAAAGCTGGAAACAGCAGCGCCGCGTGTAAACAGCAAACAGAGGAAAGACTGCTCTT------TGCGAACT--TGACCTGGCCAGTTTCCACAGCCAGATAATGAGCGGGGTCGCTGTCAATGGTGCTGAATACGGGCGTCCCTAGGCGACCTCTGTCCGACGTGCTGAAACGCCCCGTTCCAT--TTCTGACT-----GTGCCTGGGCCCTGCCCTGGGCACTGGGTGGTCACACCCAGCTTCGCTTCCTTCCTT--CCTTCGATCTTCAGTTC s monDom4.chr4 359090644 322 + 430141050 ATCTTTTCGTCAGGCATACATTTTTAATGCTGTCAGAATTTAATTTGTTATACAAAGCTGGAAGCAATAGAGTT-TGTGTAAATAGCAAACCGTGGGGAGATTGCTCTCCACAGATGCGAACTGCCAACACAGTCTATTTCCAC-GCCATTTAATG-TCTGAGTCACTGTCCACGGTACTGAA-ATAAAATAGCCAGGATGCTCCCCGACC-AGGCAAGGGAACACCTCTGTCCATGGTTCTGAATACCAAACTCCTAGTGCTGACAGTTGCTATCTGGCACTCCCACTCCACCACCCCTAATCCCATGCCCTGCTGCCTCCAGGTC a score=19078 s mm8.chr4 147075859 693 + 155029701 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GGAGTGGATGGGGACATGTCTTCAAGATAAGCACACTACATGAGGCTCCCAGGCTCACCGACTCAAAGGCCATGGAGATCCACTGCACACGGCCCTCTTTGACACCCACTGCCCCGTGGGATAGCTGCCCTGGCAGCAGGTTGGGCTCAGGCAGCTCCTTGCACTCGGGGTGCAACATCTGCAGGAAGGAAGAGATGCTGTATCCTGTAGGGAGAAGCAAAGAGGAGGTTGCAG s monDom4.chr4 359121650 225 + 430141050 GGGGTTGGTAAGGGGAT--TATCAAGGTCTCTATACTTCCCG---CTCCC----TCACCGACTCGAAGGCCATGGAGATCCACTGCACTTTGCCCTCTCGTACCCCCACAGCCCCATGGGACAGTTGGCCAGGGAGTAGGTTGGGCTCAGGCAGGTTCTTGCACTCAGGGTGTAACATCTGTAGGAAGGAGGAGATGCTATAGCCTAGAGAGAGAAGAGGGGAGAGAGAGACAG a score=10941 s mm8.chr4 147093507 262 + 155029701 CCTCACACGGTCCCCAGCCGTGACCACACATACCTGATGGCAAGCACTGGGCCCCGCCTGGCTTCACTAGCTCCGAGTTGCCCGCGATGGCCTTGCAGAGGCGACACAGGTGCCCGATCTCTTTGAAGAGGTCAAAGCTGCTGTCGTAGATGACGCTGCCCTTTCCCAAAGAGACACA--CCGGCCCGGGCACTCAGTGAGTTGCGGACTCAGTCCCAAACTCCCCTTCCCCACCGCAGGGGACAGACCCTGCAGCAGCTCCCT s monDom4.chr4 359122629 259 + 430141050 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CCCCACCCAACTCTCTCCCACCCTCCAGGAGCAGCACATGCCAGGGCTGCCA----TGGTCCCCTCCCCACCATGGAC------------AGGGCAGCCCAGAAGGAGAGAGGCTA----TTTCCCCCC-----TCCAGCAGAGG-CCCGTTTCCAGCCAAATGAATAATTCATTGTAAATGACTTTGAGATGAGTCGAGGTTCCATGTTGCCACCTGATTATGTGTACCGTAAAAAGCAATGACAGTAATTTATCTCCTTTCCCTCACAGGGCGGGCT---GGGCAGGGGAGGAGAGGCTCGGTGCCTAGTGTGGGGTCATGAATCATTCCTTTTAGCAGTTAGGTTGCCAGCTGCCGATGCCTTTACTGATCTGACATTAAATAATTCCAGCCTTGGTCTGGGGGT-----------------CTGACTTGTCTTCCCTGGGGGAGACCTCGGGGGAG---------CTGGAGAAGCAGGGCCAGTGCCCATGGTGGGGGGGAAGGAGGCTCTGCGTGGTCTGACCTCATTAGTTCAGCCAAGACTTGACTTTCTTCTCTCTAAGATCCTTGGAC-TGAGCCAGAGCCTATA-CTGCAAGGGACATCCTCTACCTCCCATC--AGCTGTGTGGGCCGCACAGAGACGGGCAGCAAGGACATGCTGTTGGGGGA----TTGTCCTCAGCTTCCAACTCCAGGCAGCTAAGAGGCAGGG s monDom4.chr4 359375529 705 + 430141050 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CTGTCCTTAGTGGGCCCAGCCCTCCCTGCCGCCCAGGTCTCACCTTTTCGGAGCTGTGCGCACTTGTCCAAGCAGTTGTCGTTGTCCTTGTCCTTGGTGCTGAAGACGGTGTTGTTATGGTAGAGGAGGGCGTCCTTCCCCACGTTGCCACTGTAGTTCCCCAGGAAGAGGCGGTAGCTGTTCAGTTCATTGCCCAACGCAAAGTAGCTATACTCTGCGTAGCGTGCATTGCCCTCCCAGTCCTGAAAAGGAGGAGCAGAG----CATTAGGGAAACCATAAAGGATTCGTTTCTGCAG------------ACCTCGG--TCCCTTCCTCTCTCATGAGCGCCACGGCTAAACATTTCTTCAGAGGTGGAACTCTGGTAAGACTATTGCAGGTTGCCATGTTAGCTAGC---AGTCAGCAAACGAAGGTCTGAGAGCAAACTTGGGTCTGGTCTCACCGTATGGCCTGG----ATTGCTTGTCTGCAACCCTTCA------TGTCTGTCTGAAGGGGCAGATGTGTGGTTTGTGTTAAATCTCATCCTGAGATGCGGTAGGAGTAAGTGAGGACAT-CATGCTTGAAGCCATCTAAAGGGGCCACCACACAGCATCACTGTGGC---TTGTACTTAACAAGATCCCAGAGCAAAGGAGATGGTGTTTTCTTTCCATCCCAGTAACTATGCATTTACCCTGTTCTGCCCTGGGTCTTCCTGGACCTCGCTTGGAGACAGAAAAACAGAAAGCTTTCAGGAGCATTGCTGCACTGACTGAGCACACCTAGAGTGAGTAGACTGTGGTGATGCCTATGAACCATGTGTGCAGTGGGCCTG----GGCCAGACGGGGCCTTGCAGCTCGAGC--TTACCTCCAGCTCCACACGAAGCCGGCTTGGCTGCCTGGTGAGCCGGTGGATATGTTCATTCCCCAGCCAGAAGTCACCTCGGATGCTGCCAAACCCTTGCTTATACTGTCTCCAGTCTTGGTAGAAGGAGACAAGGCCACTCTTACGTCTCTGGATGATGGTCCAGCCTCCTCCTGAAGTTTCCATGTCACAGAACACCTGAAGCAGAGAGG 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+ 155029701 CTCCATGCCCTTCGCTCTTC-CTTGCAGGGCCATCTGTCTGGCTTGCATTCAGCCTGCTGTGTTCCCATGGATCCTCCCTGTCAGGTCAAACAAGGACAGGCCTCGCCCAGCGCATGGAGCTCTGACAGGTAAATCAATCAAGCTTTTCTGGTTC--------ACAACA------GGCTTTGGGCGGTCCCCTCTCCTCAGACGGACAA s monDom4.chr4 359714258 209 + 430141050 CTCCTTTCCTTTTCTTCTTCTCTTACAGGGTGATTTGTCTGACATGTACTATCCCAAAGACTTGTTCCTGGCCTTTCTCTTTGGAGTCAAAGGAGGACAGACCAGACCAGGTGGTGGAAATTTCAACTGGTAAATAAATCAGCCTTTTGAAGTTTTGGGAGGAACAGCATCCACTGACTTCCAGGAGATTCCTTTGCTGAGAAGGGGAA a score=6203 s mm8.chr4 147498608 139 + 155029701 CTCTGCCTCCTCACAAGTATCTTTTTGTCTCACAGAAAAGGTCGAGTGCTTCTCAGACTACATGACCCTGCAGATCCCGAGTAGTCACGTGCAGGGTTTGAAGCAGTGGCTGGTCGGGGTCCTGCGCCTGCCGGGTAAG s monDom4.chr4 359717826 139 + 430141050 CTCTTCTCTCTCCTGAGTATTTTTGCCTTTGGTAGATGACATTCAGTGCTTCTCAGATTACATGGCATTACGGATCCCCAAGAGCCACATCCAAGGCCTGAAGCAGTGGCTGTTCAGAACCCTGCATGTACCAGGTAAG a score=30982 s mm8.chr4 147500171 662 + 155029701 TCTGGGAATTCGAAAGTGCTGTCTGGGACTGGTGTGTCCTGAATCCTGAATTGGCCCTCGGATGG---------TCAGCCAGGCGGCGATGCCTCTCAGGAGTTGGAACAGCATCTGTGTATTAAAAGGCCACTTTTCCAGGAGAAAAACGCAGAGGATACATTAAGCTGTCGCCTGTTCTTTGGAAAGCCATTATTAATGGAAAACAATAGATTAATAGTTTTAAAACGCTTGTTCAATAAGTAATTTTTATGGCTCTGGATAGAGCCCATTAAACATTTCTGTGTGTTATTATAAAGAAGTTTTAAGTGTAAAATCATAAAGTCGATAATCAGGGAATTAGTCACAGCAGCCAGCCACAGGCCATTAGTTTTAGGCGCTGTCAGAGACACCTGTGGCTTCGGAGGGAAACTGTTTCTTTTGCTCGG----CAGCAGCACCAGGTGGGGATGCAGAAACGATGTTGCCTGCGATGCTGCCTGCTGCCTCCCATAAAGTTGAAGGGACAGAAAGCAGGTGCAAGCAGTG-GGATGCAGGCAAATATTTACAAAGTGCAGACGTGAATGGGAAACCAAAGCGACCCAGGTCAATTTGCACATCCAGGCTTAGACACTTTATTTCCCCAGTGAG---CTGCCTTTCAGA-----------GCCACAGGCTCGGCCTTGATCTGCTGCTAAAG s monDom4.chr4 359720316 674 + 430141050 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score=10517 s mm8.chr4 147580728 215 + 155029701 AGCATAACAAGCAGGCTCTTCTAGGAAACTTCGGAAACGGAAGGGAGGCCATTAGGAAATTTACATTTGCGAATATGATGTTTAATTAGCAATACCAATAAATTAATAGGAGAATCTTGCTGCGGTTCGGGGTTCATAAAACA----------------------------CCAGCCTCGGCT-AGCAGAAGGA----GAAAGCAGCAGCTCTGGCTGACAGAGAGGGGACGGTGGGCTGTTCCAGGT s monDom4.chr4 359834569 246 + 430141050 AACGTAACGAGAAGGTTCTTTCTGGAAACTTCAGAAATGGAAGAGAGACCATTAGGACGTTTACATTTGCAAATACGatatttaattaacaatattaataaattaataGAAGAATCTTGCTGAGGTACCAGGTTCATAAAACATTTGACTTTGACGTGCCAGTGAGTGTAGCCAGCCCCAGCTCAGCAGAGAGATGCTGAAAGGAGCTCGTTTCCTGGGCAAGGATGGGCC--TGGACTATTCCAGGT a score=5578 s mm8.chr4 147582508 338 + 155029701 gagtgagtgagtgaatgaacgaatgaatatcaggatgaatgaggggggcaagtgaatgaatcaatgactgactgactggacaaaagaatgaatgaaccaggaaggga-aagaatgaatgggtgTGATT--ATGAATGCCAAGTAGAAGGGGCTAGAGACAGGACAGTTTCTTCT----GAGCCCTG-GTCCCCACTGTGAACCTGTTTCCCCCAACTGTTTATTCTGTTGTGTAAAGTGCATAGGAAACATGATAATAATTAAAGCAGACACAACAACAGGTAATTAATTGCATTTCCCAAATTTGATCCATGCATATGAATGAGC-GGGAGGTCACGGATTGGGTT s monDom4.chr4 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155029701 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s monDom4.chrUn 118694455 2359 + 174229318 GAAGTATCTCAGC---AGCCAAAGAGCAACTTTGGAGGCGTGACAGTTCTACGGACCAATCCCCCACAACTGTTTCCAG--GAGTGACAAGCAGAAATTCAGCTCCTCTTAAAAAAATTGTTTGCCATGAGGTTGAGGGAGAAAA-TAGATATGACG-TGAGGAATATGCCTCATATTTCATGGAAGAGGTG----GTCTGAAAGAGAACCGAGCTTGGGCTTGTGTGCTGGTGAGG-GACACGGCCTGAGACAGAGACACAGGGGGACATAGGAGGAAGAGAACAAATTAGGAAAGATAGAagaaagacagacagacagacagacagacagacagagacatgggagggggaggagagagagacagagaagagagaaaagagagagaaagaaggggggagaaaggagatagacagagacacggatagagacaaagaaggaaagggggagagagagCCTGAGAATCATGTAGACAGACAGACAGACAGAGAGGGAAAGGGGGgagggaaagaggaagagagagagggagagagtggggaggagaaagagagagagagggacagagaggaaaaaagacaaacagataggcacagagagacagggagagacagagacagagagggacagagggacagagaggaatagggagggagag-agaaagagaagagagaaaagagagGGAAAGAAGGGAGGGGAAAGgagatagacagagacagggatagagacaaagaaggaaagagggaaagagagagagactgagaatcaggaagacagacagacagagagaaaggggggagggaa-------agagggagagagaaaaagacagaCAGGCAGGCACGGATGGACA---------GACAGAGATGCCAGCCATAGG----------------GTTAGGTATAGAGCAGTTCTCAATAAAGTGGGCTGCAG----------AGTGAAGGCTGGGTATT--TTGTACAAATAGGCCCATATGTGTGAG---------------------CATGTCTCGGTGC------------CCGCCTATGT-TACCCCTGCAA-GTGTGAACT---TCTGAGTGTG--------TGTAATTAGGATCCTG---CCCATGTGAGCGTGTGCGATTGTTT------GAGGTGAACGTGTGTGTGGAA------GGATGAGGTCACACTTTCCGTCC----GGGCCATGTCGGGGAAGAGCAA----AGAGGGGGTGACCATCGGGAACCCAGCTATGACACATGTCTCGGAGCGATAGTGAGCTGCGAATTGCCCCCTGTGAGCTGGCTGGTTCATCTGACACTTGCTAAGGCTGAGACCACCTGTTCTGCTATCAGTCACCAGAGGAAAACAGAGCTTTCCTGAAATGGGGATTTCAACAGTGAG-CTGGTTTGGGAGTGGGGGTGGGGGCCGGGATCCCCACTCCCTGCGGCTTCTCAGAGGTCCCTCTAGAATGTTCCTCCCAAGAAAAGGGGGATCGTCCAATAGGATGACTCTTCCAGCCTCAGAGTTGAAA---AAGGACACCCT-GATCCCTAACACACTCTATGAAAATTTGGGGGAGCAGTCCCTGAAGTGGGGGGGGACAGTTGAAGCCCAGGGAAGGGCGATTGGCTGGTGCTTCCAGAAGGGCATGAGGAGGCACCTTCTGTGAG---CTGGAGCAGTGAGGGAGCAGCCCCTCTCAGATTTGGGGTGCCACGTTTGGGGGGC-CAGTGCTTTGGGGCGCAGACAgctgggctgggctggcttgggctgggGGCAGGGTGCTGGCATC-AGGCAGGGCTTTGGCCTTGGCC--CGGTCGCCCGGCGCCTGGGGCAGGCAGTGCCATGCCCTGGCCGTGCCC-GCCTCAGATGGCTTGTTAATTTCATCGTTTTGCCCCGTTATGGCTCCCCCAGTTGCCACAGCTTTAATAAACAAGCATTTCGGTGACCTTCCCCTTGCGGACAGCAGCCCTTTCAGCCCTGTAGGAATCCCGAGCTCTGAACATTTATAAATAATCCTTCTCTCAAGTTCCACAACAGGTGTGCCCTCCCTCCCTCTGCCCCCTCCCCGGCCTGCCCTAAAACTGAACAGTTTCACCAAGCAAAGAGAAGCCGCCTGCCCGCCCGCCCCCGGCTGTCTTAAAGGGGTCGCTGGCCGGCCACTGCTCCCAGG--GCCTGCCTGCCTGTGGCTAGAAGGCTGGCACTGGCCTCCAGTCT--GGCC--------------TCCACCCCCTCCCTCTGCCTCCCCAAGAGAGGCCTGGGACCC--CTGAGACCCCGAGGATGGTGCCCGCCCGACCCCCTCTTTCTCCAGCTCCTTCCTCTCCAAAGTTCTCAGCCCCAGAGGCCTAGAGCCAGGAGTGGGCTCCCAGACCCACCGGAGACAT-GGAGTGGTGAGCCACCCA--------CCCCCTGGGTTTGAACTCAGGACCCCCAA----GTCCCATCTCTGGGCAAAAAGGCCCCCTAATCCCCTCCCCCACA---------ACACACACTCTTCCTGCTCT 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a score=17475 s mm8.chr4 147767019 344 + 155029701 tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgCACGCGCGCGCAGCCATGCATACAAACACAAGTAGGCAGGCACAAGTGTGTGTTTGCTCAGTTTGTGTTTTAAATCTCCCCTGGGTGGTAACTCTCTTTTTTCTCCCCCTTCCTGTTTGGCTGTGACCTGGGGGAGATTGATAGCCAGCCTGTGCGGTGGATGCTAACAGTTCCCCTGATTTATAGAGTTACTTACGCTAAGTGAGGCCACTTAGACGCGTCTGGATAGTAAACCTTTTAACTGAACTAAAAGAAAAAAAAACATAATAAATAAATAAA-CAAAGGGGGGCAAGCTAGGGCCCGGTGACCAAGCCCCGC s monDom4.chrUn 152713924 296 + 174229318 tgtgtgtgcacctgtgtgtgcGTGTGTGCTTGCACGCGGC--------------------GGCGGGCTCGCGTGTGT-----------------TTTAAATCTCCCCTGGGTGGTAACTCTCTCCTCTC---CCCTTCCTGTTGGGCTGTGACCTGGGGGAGATTGATGGCGAGCCTGTGCGCTGGATGCTCGCGGCTCCCCTGATTTATAGAGTTACTTACGCTAAGTGAGGCCACTTAGACGCGTCTGGATAGTAAACCTTTTAACTGGACT-------AAAAAATCATAATAAATAAATAAAGCCGAGGGGAGC--GCGGGGCTCCGGGGGCGGGACGCCTC a score=11392 s mm8.chr4 147768272 304 + 155029701 CCCCATGCGCCCCCACCCCAGGGGACTGGCTGCTGGCCCCCGCCTCCCCACCTCCTGATATACAGCAGGCATTAGGCCGCCCAAAGGGGATACTGCATCCTTAGGAAGAAATATGTCCTCATTTTTCTTAAACACCGTTTCCACTGAGTGAAATGTTTAGAAGGGACGCGCAGGGAGAACTTTATTTCCTACCAGGGAGTTCAGAGCCACCAAGCAGAGACCATAAAGCACGGGAGCCCGGTGGCTGAC--AGGCAGCCTG----------------GCCACGAAATACGTTACTCATGG--GGGCAGAGGTAGGGGGCTGCCA s monDom4.chrUn 152714367 309 + 174229318 CCCCCTGCGCCTCCGGGACAGGGCTCC-----TTGGGCCCGGCCTCCCTGCCTCCC--CTCGCCGCAGGATTTAGACCTCC----GGGGCTCCGGCATCCTTAGGAAGAAATATGTGCTCATTTTTCTTAAACACCATTTGCACTGAGTGAAATGTTTAGAAGGGACGCACCGGGAGAACTTTATTTCCTACCAGGGAGTTGGGAGCTGGCGTGGCGAGCTCATAAAACACCGGGG-CTGCTCGCCGACAGAGGCGCCCCGACCCTCTCCCTGGGCCGCCCCGGGGCAGCCCCCCCACGGACGGGCA---GCCCGGTGCTGGCA a score=10017 s mm8.chr4 147768855 204 + 155029701 GGAGAGATTCATGCCATATCGGGCCCTTCTCCCGAGGCACTCCCTTCATTCGATTTCTGAAGCTGGCTGATTTGAATATTTATAAATATCAGTAAATTATTTATTGTAGCAATCTGCTGCACCATTTTATCCATCGCGGTTAACACTTTAGGAGGCTCCGAGTTATGGGGACAGGAAGTGAGGTTGAAGAGGaaatgggacagg s monDom4.chrUn 152714676 196 + 174229318 GAAGGGAGCCCAGCCCCCTCCTGTCCCTCTCCCGGCCCTCCCCCTT---TCCATTTCTGAAGCCGGCTGATCTGAATATTTATAAATATCAGTAAATTATTTATTGTAGCAATCTGTTATGCTAGTTTATCCATCGCGGTTAACACTTTAGGGGACTGCG----GTGGGGGCCGG-GGAGAGGCTGCAGAGGGGTGGAGGAAGG a score=-25 s mm8.chr4 147774679 373 + 155029701 CTGTCCACTATGGGTTTGGCTCCCCAGGGTTTTGGCTGTCTGTGG----GACCCCCGCTGGCCC----------------CCTCCCTGTTTGATGCTGCCTGCCCTTCAGAGCCTT----CTGTTTCTCTG-CCATATATAGTGAGGCCTCGGCTGCCTCCTGCTATTTTTAGCCCTTTTCCCTGGTCCCTGAACCACTTCATCCAACAATCAGAGCCCACTCCCAGGCCAGCCCCCAACCTGTGCGTCTGTGGCTCGGGCTTGTGCTGACCCATCAGCTTGCCAAGGCCACCAACCATCTGTAAG-------CTCCTTGGATCACTCGGGGTGTCAGAGGGATATCTGACTATCCTCTGTCGTGTCTAGT--GGGGTCCCACCCCCACTTCGATGGCTCAGAGCCC s monDom4.chrUn 172044388 374 + 174229318 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CCCTACACATGTATCC--AGTCCTGCCTTCCTCTCCTGTCTCTCTTCTCTGCCT--------GCCTAGTGTTTCCCTTCAGCCTTGCCCCACGTATTTGCATTGCATGCTGG-----GGGCTCCAAACC---CTGGCCTTTACCCAGGCTAACTGTAGTCCTGGCTGGGCCTCAGCCCTCCCTGCT------------CAGGGTAGCATA-CTCCTGTCAGAGATGGGCTAACTGAGCTCCTCTGGGCTTCTGC--------------CACTAAACTT-----TTTTAATACCA-----CCCTGAGTGCCTCAGAGTGATACAGGGCCAGGGGAGAGGAGCC--------ATGGCCCAGGGCAGGGAGCTGCCCATCAGATGCTCCTGGGGC-CTGAGGCCACCCCCATCCGCT--AATTGGCT----GTGCCCTGTGTGTCTT--ACCAGGAACGGATTGCCCACAGATAAACCAGCTGTCACCGAAGATGTAAACATTTACCAGAAATATATTGCCAGGTAGGCCCT--CGGGGAGGAGCCTGTGGACAGAGGTGTGTGTCCCGGGG---GGGCGGGGGGG----AGCCAGGATGCCTAAGGACTGTGAAGCCACCTG------CGTATTAGTTTGTCCCCAGGGCAAAGGGG----CTGCTTTCTCTACATCTCCTTTCTCTGTGTGTCTAACCTCCTCCAAAGAAGCTACTCCTGTGTCCATGTCCTTTT s monDom4.chrUn 172052048 694 + 174229318 CCCCACACCTGTGGGCTGAGCTCAGCGCTTCTCCCTTGTCAGTTCTCTCGGCCCCTTCCCTCACCCTGTGCCTTCCCACCGCCT-ACCCTCCATTGTTCCGGGACGTGACAGCGGATGGGGTCAGAAGCAGGCCGTCCTGTGTCTTCCTTACCTCCAATCCAGG----AACCCGCTTCCTCTAGCTTGTGAAGGGTTCCGGGGTCTTATGTCTCCCTCCGGGGACGG------TTCGTTCCCCTGGGCAGCCTCGAGCCGGGAGCAGACACCTGGCCCGGGCATTTCCGTGCCAGGACCCCGTGAGGG-----GAGGGATGAGGGGCTGGGTGGTCTGAGCTCCCCTCTAAGGGGCTAGGCCAGGGAG-----------AAGCTCCGAGGTCACTGGGGCCATCCCCCGCCTCTCTAATCGGCTCTTTGTGGCCTATGTGTCTCTCCCCAGGAACGGATTGCCCACAGATAAACCAGCTGTCACTGAAGATGTAAATATTTACCAGAAATATATTGCCAGGTAGGCCATTCCTGGAGGGGGCCGGAGTGGAGAGAAGAGGGTCCCCAGGCCTAGGCAGGAGGGCTACAGTCATG--GCCT-----CTGTGGAGCTGGCCAGCATGCCGTAGAACTTTTTCCCTC---CGCGGGGGTCACCCGCTCCCTCTGGCGGGCCCCCCTC---GACTCCAGCCTTGGGTAGAGCACCTCTCTGTGCTCCCGAGGCCTCTC a score=380 s mm8.chr4 147778767 175 + 155029701 TGGGTCCTGTCTTCATGTGGCACCTTGGAGAGAGTGCAGACCA----CACTAGAGCTGCTGGAGTTAGGAGGAAG---GGAAGCCCTAT-------TCTCCTGCTGTGGGATCCCAGGGGGAGACCCCGGTGAGGCCAGCCTTGAGATCCATCCTGAAGGAGGAAGGCT-----TGGCAGATGAAGCTCCGTCT s monDom4.chrUn 172052872 194 + 174229318 TGGGTCCGTTCTTGCTCTTGTCTGCTGTGGGCAAGACGGCTTAAGTCCCCCAAAGTGGATGGGGCTGGAGAGAAGTTTGGGGACCCCAGCTGGGCATCTGCCACTCAGATACCTCAGGAGATCTCCCCAAAGCAGGGGGCCTGGGGGAGAGGTAGGGAAATGGGGGGCTGCCCATGCCGGCCGGCCCTCCATCT a score=11501 s mm8.chr4 147779023 516 + 155029701 TCTTCACCCTCTGTCTTCTCTTTACTGTTATCACTACTGTTAGTGCCTCAGCAGATGGCCCTTTTGGCAGCTTCCATTGAAATACTGA-TTGCCCGTGG---CTCTCCCCATACAGTGGGGCTTGTCCCCACCCC--CATCTCCAAACAGTGCGTCATGCACAGAAGGCAACAGGCTGGCTGAGTGAAGCGCCTCTCCAGGGCTGTCAT-----GGACGGCTTTCCCCAGA---GTGGCT--GGCCCTTGTCTGGCCATCACCAAGGCTGTGAGAGCCACGCCCTAGCACGGCTCGGCCCAGAGAGGGGCCATTCAGCGTCCAGCAGCGCAGGGCTCTTGGCC-----GTGCACTTGGCTGGAAAGTGAGCTCCCTGCCGCGGGAAGCCAGACAGATGCTGTGCTTTAAAAATTCATAACTCTGGACTGTTTCAAGTGTCAGGAAAAGCCCAGAACGCAGAGAGAGCCTTTAACCCCTC-------TCCACAGCAGGCCAGGACTGG---CCTAGCCAGCGGCCCCTCCCGGGTTGAGCTGCCAGTG s monDom4.chrUn 172053144 518 + 174229318 ttattattattattattatcatcattattattattatcattaGCGCCTCAGCAGATGGTCCTTTTGGCAGCTGCAGTTTAAATATTTATTTGTGTGTAGCCCCCCTCCCCCCACAATCGGGGCCGCGCCCCCCTCGGCCTCTCCCGCTCAGACGCCGTTC----CAGGGAACGGGCCGTCCAAACTGGCCGAGCTTCCACGCGCGCTGCACGGGGGACGGCG----ACAGAGACGTGGCTCCGGCCCGGGGCCG--CTTCATCTGGGCTCTGAG-GCGGCATCCCAGCGGCAGGCGGGC--GGAAGGGGCC------------GGGGAGGGGGGCTCCGCGCCGCCCGGCGAGCTGGGCGTGAGTGTGAGCTCCCCTCTGTGGGAAACCAGACAGATGCTGGGCTTTAAAAATTCATAACTCTGGACTGTTTCAAGTGTCAGAAAATGCCTGCCATGGAGATAACCCTTTAGACACCTCCTCGGCATCCGCCGCAGGGCAGGCCCCGCTCCCCAGCCCCCTG-CCCTCCCGGCCAG---TGCCAGCG a score=1569 s mm8.chr4 147779881 170 + 155029701 CTCGGGCCTGGGTTCTAGAAGAGTCCTTTCAGGGACTGGCGT-------CCCTGAAAGAGATGGGTCTGACCCTCCCACTCCTGTCTTCAGGTTCTCAGGAAGTCAGCACTGCGGTCACATCCACTGCGCCTACCAGTACCGTGAGCACTATCACTGCCTGGACCCGGAGTGCAACT s monDom4.chr4 364224555 164 + 430141050 CCCGGGAGTGGTCTTGGGGGAAGGTCCCGCCGGAGCTGCCGCGCACATCCCACTTGTGACACCAACCAGACCCTCTCACGGCT-----CCGGCTCTCTGGTC-TCTCCCCTGCAG-------CACTGCGAGTTCCGGATGCGAGGCCACTACCACTGCCTGCGGCCCGGCTGCTACT a score=83 s mm8.chr4 147781378 1423 + 155029701 CCTCTCTGAAACAG------------------CCTGGTGTGAGCAGAGGGGGGCCGCTCTCTGGGCCTGAGATGGTGCAGACACTGGTACAGCCCAGCCTTCGATGGTGCTCGGGG-----------CCACTGCTTTTTACTCAATATGGCAACGTTGCCTGCCTGGCCCATCTGTAGTGGGTGGGAGGGCTCCGTGCCCAGCGGCCATCCACTAAGGAAGTCCTGGAGCTAAAGGTGACTTCTAGGGTCCAGCCCTTGTCCAATCCTAAGACTTTAGAGATAGAGTCACCAACTAGGACCCCTCCATACCTAGCTTCTCT------AGAAGGTGGCCCCC------TCAATCAAGCCAA-----AGGTATGTGGGGTCTAAAGACCAACCCTCTGCAGACAGATTGCT-----GTCACTCCCTGGGAAGGCTGGAGG------GGCACTGGAAGTTTGCTTTGCTTCCGAGCCTGGGTTAACCTGAGGAGTTTGAGGTTCGGAGGTGTCAGTCTTCCCTGAA---TAGAACCCCATGGTCCTGGCTCCAACCACAGCACTGGGCTCAGTTGGCCCAGGAGGACCAGACTTGCACCCCTAACCGCTGTTCT---------------------------GGCCTACGCAGGTGGGATGTAACAAGGTATACACAAGTACGTCGGATGTGATGACTCACGAGAACTTCCACAAGAAGAACACCCAGCTCA------TCAACGATGGC------TTCCAGCGCTTCCGA-GCCACG--------GAGGACTGCGGCACAGCTGACTGTCAGTTCTATGGACAGAAGACCACACACTTCCACTGCAGGTAAGTGAGTGACTGCCCACTGAAGGCTGCAAGAGGGACCGGCAGGGAACCAGGCCATGGATCACCAGGGCCCTGT--------TCTTGCTGGGTGTC----GGGGCTGCTTAATGGCCCTGCCTTCAGTCTTCCCACGAGACCCGGTGTCAGTCTCCTTGTGTCCTCCGCAGGCGCCCTGGCTGCACATTCACCTTCAAGAACAAGTGTGACATCGAGAAGCACAAGAGCTACCACATCAAGGATGATGCCTACGCCAAGGACGGCTTCAAGAAGTTCTACAAGTACGAGGAGTGCAAATACGAGGGCTGCATGTACAG---CAAGGCCACCAACCATTTCCACTGCATCCGCGCCGGCTGCGGCTTCACCTTCACCTCCACCAGCCAGATGACCTCACACAAGCGCAAGCACGAGCGGCGGCA----------CATCCGGTCCTCGGGGGCCCTGGGGCTGCCGGCCTCCCTGCTGGGCGCCAAGGACACGGAGCACGAGGAATCCAGCAACGATGACCTCGTGGACTTCTCTGCCCTGAGCAGCAAGAACTC---CAGCCTGAGCGCCTCCCCCACCAGCCAGCAATCGTCCGCATCCCTGGCCGCTGCGGCTGCCGCCACCACTGCTGAGGCCATCCCCAGTGCCACCAAGCCTCCCAATAGCAAGATGGCAGGCCTGCTGC--CCCAGGGCCT--GTCTGGTTCCATCCCCTTAG s monDom4.chr4 364233164 1481 + 430141050 CCTGTTTGAAACAGAGGTGGAGGGCTGAAGGCCTTGGAGGAAGATGAGGGGGGCCA---GCAGGAAAGGGTGTGGTTCTTGCTCGGCTGCAGGCCGGGCTGTGCTGGTCCTGGGGGGCttctttaaccctcaccttccatctcagaatcagtac-ttggttccaaggcagaagagcagtctgccc-agggggacgtgcccag-ggtcacccagctggggag------------------------gggcccaggccgaatttgaacctgggacctccgcctcta---cacctgcctGGCTCCCCTCAGTTTTTGTTTGtttttaaataaaaacttgcctacagtgtttgagtacggctaaggactaggcggttgggatctgagggca---cctttgaacccgggatgtccgggggctatccactgggccacctggcagtcctcaGGGATTGGGGCTTTCCGGCCCTCTGCGGCC--AGTCAGTCAGTCAGGCGGGCGGGCGGACAGGCTCAGGGCACAGCGAAGCTCAGAAAGTCACCTTCCCGGGTCAGGGGAGGACACCGAGGCTGGCGGCCTCCTCGGGGCGGGGCCTCACCCTCCTCCCGCTCTCTTCCCTCCCCCCAGGGAACACCATCACCATGCCGACGGCGTCGGGGGCCAAGAAGCGCTTCTGGATCATCGAGGACATGTCCCCCTTCGGCAAGCGCCGCAAGACGGCGTCGTCGCGCAAGATGCTGGACGAGGGCATGATGCTGGAGGGCTTCCGGCGCTACGACCTGTACGAGGACTGCAAGGACGCGGGCTGCCAGTTCTC---GCTCAAAGTCACGCACTACCACTGCACGCGCGAGA---ACTGCG-GCTACAAGTTCTGCGGGCGCACGCACATGTACAAGCACGCGCAGCACCACGACCGCGTGGACAACCTGGTGCTGGACGACTTCAAGCGCTTCAAGTCGTCGCTGAGCTGCGACTTCGC-CGACTGCCAGTGGTCGGGGAACAGCACCCACTTCCACTGCCTGCGCTGCGGCTTCCGCTGCACGGACAGCACCAAGGTGACGGCGCACCGCAAGCACCACGGCAAGCAGGACGTGATCAGCGCCGCGGGCTTCTGCCAGTTCAGCTCGAGCGCCGACTGCGAGGTCCCCGACTGCAAGTACAAGCTCAAGTGCTCG---CACTTCCACTGCACGGCCCCGGGCTGCAAGCACACCGTGGTGGGCATGTCGCAGATGGACTCCCACAAGCGCAAGCACGAGAAGCAGGAGCGCGGCGAGCTGCTGCCCGCCGTCAGCCCCGGGCCCGACGGGCTCCC-GCCCGGCGCCCCTGAC------CACGAGGCGCCTCgcggcggcggcggcggcagcggcgacggcCTGGGCCTGGACAGCTCCCTCAACCTGGGCGCCGACCCCGGCGGCT--------CCCTCTTCTTTCTCCAGAGC-GCCGCCGCCG-----------------GCCTGGGCCTCAACGACTCCCTGGACCTGAGCAAGAAGCCCCCCGAGGCCCAGGGCCTGGGCCTGGCCGAGCCCCCGCAG 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CCTCTTCTGCCTCCCATAGCTTCCACTTCCGGACAGAGGGAGGAACAGCAAAAGGAACCCCAGAGGCTTCCTTCCCGACCTCTGCTGCTGAGACCAAACCTCCCTTGGCACCCTCGTCCCTGCCAGCACCTCCTGGCACCATGGTCGCTGGATCTTCT---CTGGAGGGGCCTGCTCCCAGCCCGGTCTCTGTGCCCTCCACCCCCACCCTGCTCGCCTGGAAGCAGCTGGCTTCCACCATACCCCAGATGCCTCAGATTCCCTCCTCAGTGCCTCACCTGCCCACCTCGCCCCTGGCGACGACGTCTCTAGAGAGCGCCAAGCCTCAGGTCAAACCCGGGTTCCTCCAGTTCCAGGACAAGTGAGTCCCTC-CATGAGCCGGCACCTG---TCCCTGTGTCT--------------------------TGGGAGTGGGTATGGCCAGGGCAGCAAGGAGGCCCTGCTCCTCGCCTCGCAGAGTTACACTGGCTGCCCTCAGCCTCTGGGACTTAGTTTTCCAACTGTATGCTTGTACCGAGCAGCCAGTAAGTGGGGGGATGAGGGCGCAAGCGACCTTACCCCCAGTGATCCG------TTGGGATC-----CTTCAAGGACT----GGCTGGGGTGAGCTA--------GGTATGGGGGTCCCTCAGGAAACTTCCTGGTCCTACAA----AAAGGCTGTGTT------CCCTTGGGGTCACCTTGCTGGCCAGCTCTGTGGTGC-----ATACC----CAGGCTGAGTCAATAGGACAGGGAAGGCATGGATGGGAGCAGGGCCT-------------------AGGCCCCTCAAAGTCCACACCGTGGTC---------------AAGGGTGGAAGGAACCTTCTTCACTTAATGGTGGTGGCTTCTTGCGGCGAGAACGGTGACT----TTGTATCATAAAGTGTGTGGCTTCCTGTTCTCAATAAAAAGTAATAAATTGGATT---ATTTATACCACCTGAGTAACAGCTGTCCTCCCTCTCTGAGAACC---------TGGGGCTGGGCCCATGG-----CACGGAAGGGTACAGGGCTCTTTTGTCTCTCTCCTGTTTCCTGTACTCTCCTCCTTTCCTGATGTGGTAGCCTCCTTAGCTTCCTGAACCAGCCCAGAGCTCCCACCATGGGTCCATTCTCTGGAGAACACA s monDom4.chr4 364220275 1151 + 430141050 CCCCTTCTCCTTT--ATAGTTTCCACTTCCGGACGGAGGGAGGAGCGGTAAAGGGGAGCGCCGAAGCGTCCTTCCCAAGCACGGTGGCCGAGGCCAAGGCCTCGCTGGCCCCATCTTCCCCTCCGGCACCCTCGGTCACCACCGCCGCGGCAGCGTCCGGCCTGGAGGTGCCCGCTCCCAGCCAGGCCGCCATGCCCTCTGCCCCGACCCTCCTCGCCTGGAAGCAGCTGGCTTCCGCCATCCCCCAGATGCCTCAGATCCCAGCGTCGGTGCCCGGCATGGCCGCTTCGCCCTTGGCCACCACTTCTCTAGAAAACGCCAAGCCCCAAGTCAAACCCGGATTCCTCCAGTTCCAGGAGAAGTGAGTCCCTCGGATGAGCGGGGAGGGGAGCCCCCCGGGTTTCCCCTTCGGTGGAGCAGGGCCCTGTCTGTGTTTTGGCTTCGCCAGGG--GCCGGTCGGTCAAGGTTTGTCCCTGGTCGAGATGCTGCTGCTAACGCCCTTCCCTCCCGTCTCGGCTTCCCACCGGAAG-------CGGGTCTCCTGGACGGGCTTGTTTGGCGGCCCAAGAGCCTGTGCTCGGGGTGCCTCGGGCAGATTGGGGCTGGAAGCAGCAGGGATCCCGGGGATGGGGTGCCCCATCCCCCCCTGGACCAGTCTCcctcag----tctcctcatctgccgatgggtagggctggactagcaggcctctggggtc-ccgtccagcccCGTTCCACGGGGCCCCGGAAGCCGTGGCAGTCCGGCTTTCTGGGAGGGGGCAGGCGCA---GGGAGAGGGGTCCTCGTGCCACCCCCCGCAGACGGCCTCACACAGGTTGGCTCAGGGCCTTGGGGATGGTGCGGGGGGGCGGGGGGGGTCCCCCTGCCCGGGCAGCGGTG-------GCGGCAAGAACAGTGATTGTACTTGGATCTCTGCGCCCGCGGCTTCCTGTTCTCAATAAAAC-TAATAAATTGGAAGTAAACACACACCACCTGCGTTAAAGCTGTCCTCCCTCTCCGAGAGCCCCCTGGGAGTGGGGCTCTTCCCAGGGACCCCCGCGCTAGTTTCCAGAA------TGTCCCTGGGCC-TTGGATGGAATCCCCGCCTGTTC------AGCCACCTTCCTAGGGGCCAGAAGCACCCTGGG---------AGGAGTGCTGAATCGGGGGGACACA 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AGCACTCCCCAGGTCCCTAGGTT-CTCTGGGTAGGCGG-----GCACTGTAGGCCTCAGTTGACCCTGGGATGTCCCAG----CAGCTGTGAGCCCTGGCGGGATTT--GACACCAGGCACATGCTACCACTTGCTCACACCCCACGGTAGTGGCGCTTCCTGGTAGAGCTGCCCACCCATCTGCAGTCTGTCAGTCAGCCACATCCACACAGTGCC-ATGTCTTGCCAGCCAAGCCCTTGCTGGCACCCAGCCA-GGAATGGCAGCAC-TATCCATTATTTTTATGCCCAAGAAGTTAATGCAGTCCTC-TTATCTCTAATCCTGGGGTGTGG-CCTTGGAAACTACATGTCCCAGCATGCACTGCTCTGAGCACCCTGTCTATGGCAAACCCCCATCTACCAGGCAAGAGTTCCCAAAAGGAGACAGGGATGCATGCTGGGATCTGTAGTCTCTAGCTGAATGTTCCCGTTGAGCAGGAGGGTGACCCACTGTGTTCCCCTCGATTACACTCCTGGTGACTGAGGAGGGAACCCTAACACAAACCCAGAGAGGACATCAGCGGGAGGGCTTGGG-ATGCCAATGACCTTCTGGGCTGTGGTTTCCTTCTAGCGATCCATGCCTGGCGACGGACTGCAAATACGCCAGCAAGTTCCACTTCCACTGTCTCTTCGGGAACTGCAAGTACGTCTGCAAGACCTCGGGCAAGGCTGAGTCCCACTGCTTGGACCACATCAACCCCAGCAACAGCCTGGTGAACGTGCGAGACCAGTTTGCTTACTACTCTCTACAGTGCCTGTGTCCCAACCAGGTCA---------------GTGAGGCGGGGCGGGGGAGGCTCAAGGCCCAGGGCAAGCTTCTCCTGGCAGAGACTCCACTTTTCACACCATTTTAAAGTTGGCCTGCACTAGACACTGG----AAAGGACACCCACTGTCTGTCCCCAGAGCCC------CTAGAGGCCCCTGGGCAGG s monDom4.chr4 364221714 865 + 430141050 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AAGACAGATACCATTTCCTT---ATGGATGTTTGTCACCTGGCAACTATTTTCTTCTTCTCAGCCTGTGAACTCCTGGCCATTGATAAGTCCCTGACGCCGATCACCCTGGTCCTGGCTGAGGACGGGACCATAGTGGATGACGATGACTACTTCCTCTGCCTTCCTTCCAATACGAAGTTTGTGGCGTTGGCCTGCAATGAGAAGTGGATTTATAATGATTCCGGTAAGAAATGCAGGC s monDom4.chr4 364411018 238 + 430141050 AAGATGGACTTAATTCCCTTTGTAGGCCTGTATTTAAGGTGTCTTGTACTGTCTCC--CTTAGCATGTGATATCCTGGAGATTGACAAGTCTTTGGAGCCCATCACTTTGGTCCTGGCAGAAGATGGCACCATAGTGGATGATGAAGATTACTTCCTGTGTTTACCTTCCAACACCAAGTTCGTGGCCCTCACTTGCAATGAGAAGTGGACATACAGCAATACAGGTGAGAAGCTCTGGC a score=8631 s mm8.chr4 147951547 216 + 155029701 CCAGCGTTCTCTCT------GTATCAGATGGAGGGACGGCTTGGGTTTCCCAAGAGTCCTTTGAGGC---AGATGAGCCGGACAGCAGGGCAGGGGTGAAGTGGAAGAATGTGGCCAGGCAGCTGAAAGAAGATCTGTCCAGCATCATCCTGCTGTCAGAAGAGGACCTCCAAGTAAGTCTCCTCC-----ACAGCCCGCGACACTCA-CCGGCCTCTACTGGCCAAGAAC s monDom4.chr4 364412784 231 + 430141050 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aaaaaaaaaA------AAAAAAAGCAAACAGAAAGTACCTAGGAATATCCTTATCAAGCAAGAGCCTGCAGAA--ACAGAAAATGCCTTCGTTAGTCCAGC---AACCAAAAGA------CAGACAGAAAGAAAAACAAACAAAT--ATATACGAAGAAATAGAAACACACAGAGAAAAAATATTTTTTAAAAA--GGGCAAAATAATGC s monDom4.chr4 364539570 210 + 430141050 AAAGGAAAAACTTTGCATAAGAAGCAAACAAAAAATACCTAGGCATATCCTTATCAAGAAAGATCCTGCAAAAATATAGAGAAAGTTCTTGTTAGTCCAGCCAAAAGCAAGAGAAGAAAGCAGAAAAGAAAAAAAAAAACCCAACCAATCTGCTGATAAATAAAGAGAAACAATTAGAAAACAATAGTAGACACTTAGCCAAGAGAATGC a score=8612 s mm8.chr4 148042225 129 + 155029701 TCCTACCTGCTGGAGCTGTGGGCAGCCTTCAGGGACTTAGCAGAGATGATGTTCAGGGAAAGAACAGCATCAACTGCAGCTTCATCTACCTCCGGTTTATTCCTAATCCGACCTAAAAGAAGGGATAAA s monDom4.chr4 364541352 129 + 430141050 TCCTACCTGCTAGAGTTGTGGGAAGACTTCAGATACTTGGCAGAGATAATGTTCAGAGAGAGAATGGCATCAACGGCAGCTTCATCTACCTCAGCTTTATTCCTGATTCGACCTGGGGAAAAGGGTAGA a score=6571 s mm8.chr4 148042913 260 + 155029701 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GCTTACTTGAACTGGCAGAATATGTCTGCATACTCTGGGAGAATACCACTGGCTTGCAATACCGTCACACGGAAAGTGAATGCACTGCCCAGTTTGAGATGCTCTCCAACCTCTTCAGGAAATCCTTCCATCACCATTTTGCCATCTAGCAAAGTGCCTGACTTCAAGTCTAGAGAGGAATAAATGACAAGTGTGTGGCTGAGATTATGTACAAATTTTCTTACGAAGGCAC-----------------------AATCAGAGCCTCTCATCCTGCTCAAAGGCAGAAACACCCCTTCCCCA---------TCATCAA-------CTTTTGTTCACTTACCTGGTTCATTCCCTCGAATGATTTCTTCTGGAGGAGTAATAATGTCAGAGCTCTGACCCTGCCCTTCCACAATCCTAAGTTCCTCAAGGGACAGCCCTGAGCGGGTCATGGCAACTGATGAGAAATCACTCTAAAAACAAGGCAAG------AAGTCACATGTGATCAGGTATTCCGATACTGGTTTC--TTTGAATTTTTTATTCTGTCTCAAAAAAGGATCAGTGTTTAAAAATGTATAAGTAGTGT----GGAAAGGAATTATAGCTCTATTACTTATACATTCTTATTCTTATTTGAATAGTTAAAATATAT------TTTCATTTAAAATAGTTTTGTTGTAATAACCACTTTAAa a score=8302 s mm8.chr4 148057803 202 + 155029701 ACTTTCCTCAAAAGTCCATTTACTTCCTTTTGTTTCCTCAAGGTGTTCATTCCTTCTTCCCCAAAT-ACTTCTTACCTGATTAAAGTATTCATTATCAAAAGATATTTTAGCTGTTCCCGACTGCCGGATTCCAGAGCCATAATCAGGGGCTTCTTCATCCGCTAAACAGAAAGAAA---------GCCAGCAAGGACT-GAATGGAAGTACG s monDom4.chr4 364564719 211 + 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a score=8797 s mm8.chr4 148173634 514 + 155029701 GTGGGC------------GCTGAAGACTGCAGAAGGAACAGCCATGGACAGGGAAACATTTACAGCCAAAGTGAGCGGAGTGCTCTGTGGC---------TTTTGGGTACTTTCTGGATCCAATGTCCCTTTTCCTGGTGGTGGTGCTGGGGACTGAGCCTG-GGAATGTACACAGTTGGGCAAGGGCTCTGTGCAGGCCCAGCCATCTTTTCCTTTTTGTTTGAGACAGTGTTGTAATTACACTG-----TCGGAACTTACTTGCCATGAACAGGCTCTCCCC-TTCTGC--TTCATCCACCCCGGTAGCTGGGACTACAGGCCTCGCGGCACCGGCCAGCTCTCAGTCTCCCGCACGGTCTGGCTGCACTCACTGGCCTCCTACCTGGCTCCAGCATGCTCTCAGTCAGCATCTGGCGGTTGAAGGGGTCGGTGGGGGAGTTGAGCAGATGCCGCAGGATGATAGAACGGTCCATGACGGTGCCAGAGGGCAGTCTCACGGGATCGGTCATCAGGGTGTCCATCAGAGGGTCTGTGGAGACA s monDom4.chr4 364755689 447 + 430141050 ATGGGCTATTTGGCAAAAGTAGTAGGGAGGAAAAAAAAAAACCA-GGATAGGGAAGGA-----AGGGAAGAAGAAAGAGGCATTATGTGGCAGAGATGAACAACGGGCATTTTC--------ATGTCC-TTTGCATGGTT----TAGTGAGACCAGACCCTGCAGAATTTGTGGAATTGGT---GGAGTTTTGATGAACCCA----------------TATTAAAGAAA----TGAATTTAGCCTGATCTTTTGTAAGTCAGTAGGCA-GAAAGGGCTCAACATGTTTTGCAATGGTATTGCCCCTGTACCTGAAACTGC---------------------------------------------------CCATTGAAAT---ACCTGGCTCCAGCATGCTCTCTGTCAGCATCTGTCGATTGAAGGGGTCAGTGGGGGAATTCAGCAGGTGCCGAAGAATGATCGAACGGTCCATGATGGTGCCAGAGGGCAGCCTCACAGGATCAGTCATCAGGGTGTCCATTAATGGGTCTGAGAAGATA a score=12606 s mm8.chr4 148175116 217 + 155029701 ACTTGCCTCTGAACTCGTCCGGGGCATCGCTGTAGTCTATTTCTGCCCGCGCATTCTTTGCCACGATTTCCTCCACTTTCTCTGCAAGAAGTTTAAACTTCTCTATTGCGATGGTGGATTTGATTCCCGCCTTCCGCATCTTTGAAATGACTTCTTCAAACAGTTCCTTGCTGTAGGATCGCTGCACACAAGGAAGGT-CACGTAAGATGAGAATACA s monDom4.chr4 364757097 217 + 430141050 ACTTGCCTCTGAATTCATCTGGAGCATCACTGTAATCAATTTCAGCCCGAGCATTCTTGGCTACTATCTCCTCCACCTTCTCTGCCAGCAGCTTAAACTTCTCTATTGCGATAGTGGACTTTATTCCTGCTTTGCGCATCTTCAAAATAACCTCTTCAAATAGCTCTTTACTATATGATCTCTGAAAATGAGAAGTTTCCATGTAAGA-GAGAAGGCA a score=14278 s mm8.chr4 148178838 483 + 155029701 GTGCAGACCACAGATGCCAACCACACGGCTCAGTGCCAGGCCTCCTGATGAGATGGGCC----TCCTCAGTGCTCACCTGGTCATCGGCGATGGCTTTAGCAAAGCGAGCACAGTCCAATTGTAAATAAATATCTGTCAGTTGGTCCAACAGCTTCTTTGGCTCAAAACCATACTTCTCTGGGTTTTCAACTTTCAGGTCCCGGCACTTGGGTCCGCAGAGCTGCTGCAGGTTAAAGTTCAGCATGGCTGCTAATCGGGGACCAAGCTCCTAGGAAATGAAGGACAACAGGACGGTCCAAGCTGCTGCAAAGTCCAGGCCCAGAAGCTCCTACCCCAGTG-GGAATGGGCTGCTCAATCTGCAAAGCACCCCTGAATTGTGCTGAGCTGC---AGCACAAAGCTAGAGAAAGCATTGGAATCAAACATCTCCCCCGCCATTGATCTGAAAACCCCTATAATGGAGTGGTCT---GATTGCATAGAGATGAACGC s monDom4.chr4 364763256 441 + 430141050 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CAGAGCCCGTACAGGCGCAGAGGCGGTTCTCACCCGAGGCAGCTGGTCCCACTGTTCTTTGTTCTTCATCTCTTCTTGCACTTCATGGATCCGCTTCAGAGACTCCAGACTTTCGTCCAGTAAAAAGGTCGTGTCATTTATTAGCATATTGATATACCGAACGAACTGCTTTCCAGAACTGAAAGGGCA------------ACAAGACAGTGTGT----GGTGAACACCTGGCTGGGCACGGAGA----------------------GAGAATGTAAGC--CTCCCCAGGT----ACCAAGACTCCCCGTGACACTGCAAATCCTGTCGCAGATGATATAGCTGGAGTT--------TAAGGACTGCCAATTAACTCTCTCCTTAGATTTTGTTACTCCCTT s monDom4.chr4 364768234 392 + 430141050 CAGGGTCCTTTTGGGGACACA-----TCCTCACCCGGGGCAACAGGTCCCATTGTTCCTTGTTCTTCATTTCTTCTTGCACTTCATGGATCCGCTTCAAGGACTCCAGACTCTCATCCAATAAAAACGTTGTGTCATTTATCAGCATGTTTATGTACCGAACAAACTGCTTCCCAGAACTGGAAAAGCAAGCAAAATGCATACATGTTTATGTATCACCGCCAAGAAGCTAAAAGGGCTCTGAGAAGGCAGAATAGATGTTTTCCAGAAGAATATAAGCGACTACCTGGATGATCAATAATATTCCCTACGACACTACTGTTCTTGGCAT-----ATGTAATTTGAGTTATTCTTCACATAGATCACAGACTAATTGTTTCAATGGATCTTTGTTCTTCCTT a score=11749 s mm8.chr4 148188305 171 + 155029701 AATACTCACTTGAACTCCTCCATGAAGGTGCCATGGTGAGCTATGTTTTGCCAAAGGCTTTTAAAAATAGTGCTAATGTGATAGCGAATTGTGAACTTGTCATAGAACTCGCTGGTGGCTCCAGTATGCTCGACATCTAAGGAGGAAAG-----ACAAAGGGACTCAGACACACAT s monDom4.chr4 364776059 176 + 430141050 AATACTCACTTGAACTCTTCCATAAAGGTGCCATGGTGGGCTATGTTTTGCCAAAGACTTTTAAAAATGGTGCTGATATGGTATCGGATTGTGAATTTGTCATAGAACTCGCTGGTGGCTCCAGTGTGTTCAACATCTAGAGAAGAAAGGAGGAAAAAGTGTAGTCAAAGCTACAT a score=17966 s mm8.chr4 148191667 370 + 155029701 TGAAACAACCTTGGGTCAAGTACATTACCACATACCCCAGGGCCTACTCTGAAACCCACCTGTATAGAACTTCATGAGGGACGGCACCAGCAGTTTGGTAGAGAGAGGATGGTTCTCAATCATCTCAAAGAACTTCTGAGTTCTCGGCTGGACAGAAGGGTTGGTCATGAACATGACCTCCACCAGCTTGGCCACTAGGTAAGGGTTTCGGATGTAGTTCTGGTTGCACAGCATCACAACGAGGAACATGACAATGTCCTGAGTGCAGGGCTCATAAAGCACCTGAGGAGAGTATCT--GTAAAGAGGAGAAA-ACACATGGTGAGT------CTCGGAG--AGCTCGCTAGGCCGGGAAGGAGACAGGGTCCAGCAGAGG s monDom4.chr4 364780146 370 + 430141050 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s mm8.chr4 148201399 259 + 155029701 AGAGGGCCAGGCCCACATCACTCACAGAGCTCTGTCAGCCGCTCATTCACATCCTCCATCGTTGCATTTATCCGTGTCTCATCATTCGGGAGAGTGATCCGACATCTTGGGTGGAATATGTAAGTGGGGTCAACTGTTTCTAACTTGATTTTTGTACTTAGCTGCTGCAGGACCCAAAGGAGATTCAGCATAAACCCGTCTGTAGACACCAACCGATCATCTGCCTGTGACATAAGACGTGAAGCAATTGAAACAATTG s monDom4.chr4 364790610 257 + 430141050 AGGGGAGCAAGAAATCAACACTCACAAAGTTCAGTCACCCAACCAGTCACCTCCTCCATGGTTGCTTTCACTCGTGTCTCGTCACTTGGGAGAACAATACGACACCTCGGGTGGAATATATAGGTGGGATCTATTGTCTCTAGCTTGATCTTTGTACTTAGCTGCTGCAGCACCCAAAGGAAATTCAGCATAAATCCATCTGTAGACACCAACCGATCATCTGTCTGTGAAACAAGAAAGGA--CACTTAAAATAGTGG a score=9861 s mm8.chr4 148202988 194 + 155029701 ACTCCTACCTGCATCTGGGCTTTCTTCATGTTGGCATTGACAAGGGCCGCCATGTAGCTGAGAGCCGCTTCACGAGTTTCGCCATTTAACAAAATACTATGTAGAATCTTGAAAAGTTCTTGCTAAA--TTATTTTCAAAATGAAAAAA-CAATTGATTTCTTTTTTACTTTAAAAAGAGCCTCCCACTCCCCATCT s monDom4.chr4 364791278 183 + 430141050 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a score=19046 s mm8.chr4 148224464 843 + 155029701 GCATAGCCGCCTGTGGGGCTGGGTGGGAAGGTAAGGCAAAGGATGGGCTGAGCGCTGGCACAAAACTCCATAAACTGGCAGAGGGGGCGGGGCTCGTTTCATAGAGGCTGAGTTAGTTG------------AGAGACCGAGGGAAGGGAAAAAAAAATCAAAGAAA-AACTTGAGATAACT-------AAAATGGG----------------------------------TGTCAGTTTTTAAAGGATAGCACAT-------------------TTATACTACACACTCTAGGAAT----------TTAAGTAGATAAGCATTTGAAAAATGA--CCAGCCTCTATAATCACTACA-CTCATGTCGGTGACCCCTTTCAAAGAGTACCGTAGCACAGACAGCCACGTGTGTCTAAAATTTAACCAACAACCTAACCACAGAATGCTAAGAAATCCAACCAAGGAATGGTAAAGCCACATCCAATGGCCACATCCCCTTCCCCCTCTCTCCTCCCACATG----TCTGAGACACAGATCAGCCCTGTGAACCCGAACTCAACAGTCACAGCT-GTTTTCCACCAGTGAGACAGCAGA---GAACCACACTGACCTAGACAACGAGCTGGTGCTGAAGGAGCCCATGTTGCAGAACATGGGGCTTGTTCCTGAACTGGAGCCAGTGTTCAGCATGAGATTGCGGTCTGGTGACCGAGCTGCCGTGGCGATGGGCTGGGATGTGGCTGTCAGACTGGCAAATGGATTTTCATCTCGTGTCTGAGTTGACATCATCAGTACTTCCATTAAAATCTGGCCAATCAGATCCTTAAAATCAGAGAACACTGTTGGGAAGGCAG---AGTGAAAAGCAGG--------------------TTATTCATAGGTCCTCACTTATACCATCCTAATAAGCCAAAGAGCCAGGCCGATTCTGATTCTGTGTG s monDom4.chr4 364813419 898 + 430141050 GCACAGATATCGGAGCGGCTGCATTGGAAGGTGATGTACAAGAGGAGCTCATCACTGGCACATAGCTTGAGAAAGGGGTATTGGGAGTTGGACTAGTGTCATAGAGGCTAAATTAATTGTTGAAAGGAAAAAAAGAGAAAGGGGAAGAAAAAGGCAATTGAAGAAAGAACATAGGAAAGATTACACAAAATATAGGAAAGTTTACTTTCCAACATTATGTTTCCCTCTTCTGTGGGCCCATAAAGCAAGGACCATACCTGTCTTTACCTTTGAGTCCTTCAACACACATCTGCCATGCATACATTCTTAATGAGCTAAATGCTGGACAATTAGATTCAGCATTTCTGATTCCCACATCTGAAGCTAATTATACTATTAAGACA-TACCATC-------------TGTTTCCCAAAACTTAAGTTTCCAATATTATCATAAAGCGGAAA--------ACCAAGAA--GACAATACCACCTCTGATG-----------------CTCATTCCACCCCTAAGGAGCCCTGAAAAAGAAACTTCCTGTATGG------------TATTCCTAGCTAGGTTTGGTTCAAGGACACATCCAAATGGAACCATGCTGACCTGGACAATGAGCTGGCGTTGAAGGAACCAACATTACAGAACATGGGGCTCGTTCCTGGATTGGATCCCGTACTAAGCATCAGGTTTCGGTCTGGTGATCGAGCTGCAGTGGCAATTGGCTGGGATGTTGCTGTCAGACTGGCGAAAGGATTCTCGTCTCTAGTTTGAGTGGACATCATTAGCACTTCCATTAAAATCTGGCCAATCAAGTCCTTAAAATCAGAGAACACTGTTGGGAAACCAGGACAGAGAAGATTAGGGTCATCTGTATCACAGAGGTTTATCCACAGGTCA-AACATATGCCAAC--AAGAAATCAAC-ATCAAGGTCAA-----AGTCTGTGTG a score=8718 s mm8.chr4 148227205 582 + 155029701 aaagcttgctgctcttccacagaaccccacctcggtcctcagcg------cccacactgggtg--cctcacagccctgtgtaactccaactccagggagggatctaacgctctcttctagcttccagaggtacctgagcatagatatatgcaccatacacacagcacacacacatacataaaaa-caaaTTTTAAAAATCACTTAGCAATACTCTCAGGGAA------GAAAGTGACCACACAGCTGTGTCCCCACC------------------CCGTAACAGGAACTGCAGTCCCA--------------------CAGCAAGAGGACAGAGACCCTCATGGCCTGACATCCCGTATGGAGTT----------------GCTCTGACAAAGAGTCCCACCTTCTTTTGGGTTCTGTTTAAACTGCGCAGAGAGAGAAGAAAGGAAGATGACATCTCTGTCGCGGTCCTTCCAGGAGACACGGAAGATCTTACAGACCAGCTGTAAGGCTTGCTCTTCAGACACCTCAGGACCTGAAGAAGGCTCCTAGTGGGGAGGAT--GTGAGAGTTAATCTGTAGTAGAAGACATGCA------TTAAGACATTTTGTTCTGATCTGATTCA-----TTTATTAACAAGGATATTTTTAAATGCATAAA s monDom4.chr4 364815802 646 + 430141050 AAATTCTGTGTCTGTCCCACACTGGCCCAA---GGCCCCTAGCAAGTCATTTCATCCTCAGTGGCCCTGGCAACTCTTTATGAATCCAGGTCTCTGAAGA---CTGTCATTCTGCATTGGAAGATAGAAGT-TCTGCACACCAAAAAAATCATCA-GTTCAGAGCCCTGACCCTGAAAGAAAAGTCTTATTTCAAAAGAC------CAATAATCCAAAAGAAATAAGGGGAAATGAACAGTCAGGT-TGGCCTCACCAATAGATATCCCTACTGTTAATAACAAAAGCCAAAAGCCTAAGAGACAAATTTAGATAATCCAGCATGAAAATA---ACCTTCAGATTCTAACTTGCTTTATTACGATTAACAAACTGAAATAAGACAAGACAGAAATTTGTACCTTCTTTTGGATTCTGCTTAAACTGTGCAGAAAGTGAAGTCAAAAAGATGACATCTCTGTCCCGGTCTTTCCAAGAAACACGAAAGATCTTACAGACCAGCTGTAAGGCCTGTTCTTCTGATACTTCAGATCCTGATGAAAGTTCCTTTCAAGAAAGAGTAAAGAAAAAAAATTTGGGGGGGAGGGGACACAAAATTTCAAATGCAGTTTTGTTAAACATGAGTCAAACATTTCTATAACAAGTAACATTTTACAAAATTAAA a score=7123 s mm8.chr4 148228916 118 + 155029701 TCACTGACCTTGTCACTCAGGCTCCGTTTTTCTCTTCGGTCGTTCTCGTCCACCTCCATATTCTCAATTCCCGAATCCACATCCACCTGGGACATGCTTTAAGTACAGAAGACAAACA s monDom4.chr4 364825833 117 + 430141050 TCACCAACCTTATCAGAGAGGGTCCTTTTTTCTCTGCGATCATTTTCATCAACCTCCATATTTTCAATTCCTGAATCTACATCCACCTGGGACATGCTTTAGGGAGA-AAGAAAAACA a score=11310 s mm8.chr4 148230876 163 + 155029701 TTACCTTTTCTCACAGGAGACACCGTCAATATCCATGCTCTGGGAACGGGAGAGGGACTGAGACTGTGTCTCAAGGCTGTTGGAAGGTGAGCTGCTGAGAGAACTGACGCCTTCGCTGCTCTGGCTCCGATGGGCAACTCCTACACAGGCAAGGCAAAAAGAG s monDom4.chr4 364827694 161 + 430141050 TCACCTTTTCTCACAGGAGACGCTGTCAATATCCATGCTCTGGGACCGAGAGAGAGATTGCGACTGGGTTTCAAGACTATTAGAAGGTGAGCTGCTGAGAGAACTGACTCCTTCACTGCTCTGGCTTCGATGCGCGACTCCT--GAAAGCAATGTGAAAAGAG a score=2089 s mm8.chr4 148242228 64 + 155029701 GGGAAGGAGATGGGTTTGCAGAAGTCTTCACTAGTCACTATCAAATGAACAGACAGAAGCAAGA s monDom4.chr4 364828633 64 + 430141050 GAGACGAAAATGGAAGCACAGAAGTTATCTCTAGTAACAGTCAATGGGACAGCTGGAACTAGGA a score=14435 s mm8.chr4 148242372 243 + 155029701 CTTCCAGGTTGGAGGCTGAGGCTCACCTGCTGCACCTATGGGGGAGGTAGCTGGGGTCATGTTGTGGACATTGAGACCAAGACTCTGGGAGGGGCCTGGGGCTGATGCAGCTATTGGAGGTCCCGGAGGGTTCTCCCTCTGGGGAGATGTAAGCGGGGTGGTCGGCTGGGAGGTCTGTCCACCAGCAAGTCGTGCCAGGCGCCTCCGTCGAATCTACAGAAGAGGAGAGAAAGGACATTCTGT s monDom4.chr4 364842419 243 + 430141050 CTTCCCAGGATTAAGCTAAGGCTTACCTGATGCACCTATTGGGGAGGTAGCTGGGGTCATGTTATGGACATTTAGACCAAGATTATGGGAAGGGCCAGGGGCTGGTGCTGCTACAGGAGGGCCTGGTGGGTTTTCTCTCTGTGGAGAGGTAAGTGGGGTAGAGGGCTGTGAAGTCTGTCCACCAGCAAGTCGAGCAAGGCGCCTCCGTCGGATCtaaaaaaaaaaaatttaaaggtaattttt a score=2104 s mm8.chr4 148268627 195 + 155029701 CCACGTACGCGCATGCTCCATCCCTGGAGAATTTTAGTGAGTAAATAAACATGAGGAGACCATAGCCAAAAGTGGAGCACCGGCCTCTTCCAACCGACCTGATGACAGATGACGACTACTTTCATAATACTGCAGGGGAAGCTTACGGGAAGCAGGGGAAGAAATTAAGCCAGCTGGGATCTCGAAAGGAATGCT s monDom4.chr4 364870509 185 + 430141050 CCATCAATGAGCATATCCTA-CCCAGGGGGAGTTTAATGCATAAATAAATACAATGACCACTTTAGGACAAAAACAGCAGCTCCTCATCACAACTAACCTAATAGTATAT----CCTACTTTCTCTTCACTGTGGTGTAGTTCTTTGTGAACCATCAGAAGGAACTGAG-----GGGACTTCCCAGAGCCCTGCT a score=1807 s mm8.chr4 148268822 138 + 155029701 TTCAATTTGTAAAACGACAAGGGGAAAAAAAAAATCAACTGAG--------------GCATAGAAATCCCTAGT-TCCCTAACTGCCTCTGCTTTCCTGATGATCCC----ACACAGTACAACCCAAGTT---TGAGGGGGAGGGGTCCTGACAAAAGTA s monDom4.chr4 364871024 160 + 430141050 TTCAATAGGTGACATGACAAGTAAAAAAAAAAAAGCAACCTGGAAAGCCAGGAACTAATATGGACCTCCTTCTTATACACTACAGACCCTGTCTCCTCCATGAgtctgtcaagtcagtaaactccaacttacaaaatgccgagagctcctgaagaaagca a score=16933 s mm8.chr4 148269200 1494 + 155029701 AAAACCCCCGACGACGCAGACACACACAATATACCACGATCTAAATCGCGCCCCTCTTTCTCGAACACC------------CTTTTAAAAAGATTGAACACCTTCAAGATGC------------------TCCTCACC--------ACCCCACCCCCGTCTTCAGACCCTAAAAGAAAGAAAAGCGAGTGGAGTTCCGAATGAAGAAA-CGAGAGAGAATAAAGGAGAATAAAACG-------AGAGACCCTCTTGCATTC-----TCTATCTCTG-GAGAATTTTAGTGATCGAGTAAACATACTGAGACGGTAGCCC-AAAGTGGAGCCAAGGGCTTCTTACAATACAGCCAACCTGATGATGAATGACTACTTCCATTATATTTCATTATTCTTGAAAATGCCAT--------CTCCGTTGCCTCCCCAATCCCA-----AGAGCCCGACACCACCAGGGCAAAAATCTG-TCCCCATCCAAAGCGCCAAAGAGTTGCCAAGTAATCCTTTCAAGGTGCCCCCCCC---CACGCCCCAGCCTCC---TCACCTCGTCAGCGCTCAGCTCCTCCATCGCTTTCCTCTTAATGGTGAAAGGCGTTAGAGAGATCCTTCAGTTCTTGAGACCAGGGCGGGAGCAAAGGAAGAGTGGAAGGTATCTATC---------GGGCTGTCTGGTCCCCCAATGGGGGAGGTTTCAGAATTGCATAGTCAGAGGTTAAAAACTAAGAACACGAGGCACTGAATCGCCTTGGCTTCGGCCGCTCGCACCGCCGCAGCCTCCTCCAGCAGCAAGCGCCCAGAGCTGCCG--CCTCTGGCCACGGCCACCGCTATGGGGTCCTCTCCAGGCGCC----ACTGACTCCCCTCAGCTTCCCAGGTTACCCAGGGCGGGCGGCGCGGTCTCCAGCTCGGCTCGTGCCCGCTGCGCGCCGTGTCTTCGTGGCGGTGACGCGGCAGCTGCGTTTT----------TTTCTCCCGCAGACCCTGCTCCGGGT---CCCACCCCTGGGCC----------------CAGGCGGGAACAGCTCC-----ACTGCACACTGGATGCCCCCGAGGCG--CGGCGACCCTACAGCAGCC-------------------CAGGCAGAGCCCAGCACCGGACCGGGAAGCCCCTCCCCTCTAAAAGCAGGCCAGGCTCGCC----------CCGCCTCCACGCGAGAACCCCGGTGGGGGGCAGGGGAGGGAC-GGGACTGGCGAAGCCCTCGCTGGAAGCGTAAATCCTCCTACCCCTCCAACCCTACTCTTACCCCCTCGCCCCACCAAGAATTATTCATCAAAACAACAGGGCGGCCATCTTTGAAAGGGGTCACGTGACCCTCGCCGGGGAGGCGGGGCTTCTCGCTCTGGGATTCGCCAGCCAATAAGCA-GCGGGCGTCGCGCCGCCGAT-TTCCTCTTCGCTT---------GCATCCTGTCCCCGCCCCCTGCC--CCACCCCCTCTTCCCT---------------------GAGCGGCGCCAGGCGGGGGGAGGGGCGAGAGGGGCTGCTAAGAGGAGACGAGGAGGAGGCGGGGCGGACAGTCACCATGGAGACTGAGCGGAGGCGAGGGGCGCGGTGGGCGGGGCCCAGGTA---GAATTGCTGAGGGCAGGATG s monDom4.chr4 364871351 1589 + 430141050 aacaacaacaacaacaaaaacCCACACAATACATTAGAA----AATTGTTTTTTGTTTTTTAAAAAACCTGACATGAGGAACTTTTAAAA---TTAAAAAACTGCAGAGTTCAGCCTGAGCCTTCCTATCTCCTAATCCAAATCCAGCCCCCTCCCTTTCCCCAGATCATCTAATTAAGG---------------CCTAGCCAAGAATTCCAGGGAAGTTCAAGGTAGAGAAGATGCTCTGGGAATGTTCCCTTTCTAGTCACCCATCCAACTTGGTGAGAAATCCAGGTGCCCAGTTCCACCAGGGGGTGGCCAGCCCTGGAGCAGAACCAAG---TCTATTCAATGCCACCCGCC-GCTGCCCCCT-ACTCCCTCCCCAATACTGTATCGCTCACACATATTCTATGGCTCAGGCTCAGTCACA----CAATCTCACACTCAGTCTCACACACTACCAT--------TCTGCTTCACATTCTTCACAC---ACACTGTCTCAGTGTCTCACACACGGCGTCACCCACATGCACTCTCAAGTCCTCCTCTCACCTCATCAGCGCTCAGCTCCTCCATCGCTTTCCTCTTAATGGTGAAAGGCGTCTGGGAGGG-----GGGCGTGGGGGCCGGGGC-----------CCGGGTCCTAGGCTCCCCTCTTCGGGCGCGGGCAGGCGGGCTACCCCGACGGGGCGCGCTCAGAATTGCATAGTCAGAGATGAAGAGAGGAGAA----------GGAAACCCCCAGGAG--GGGTGCTCGGGGAGGGCAAGGGGGCTCCGCCTG--GGCGCGCGTAGCCGCTGAGCCTGAGGCCGCCCGCGCCGCTAGGGG---------AGGCGCCTAGCcccggcccggctcggc---ccggctcggcccggctctgc----ccgCCCGCAGCTCGCAGACCGCCGCCGCCGGGCAGGCTCCGCGTGGCGGC--CGCTGCAGCTGCAGCCTCGGCGCTCGCTCTCTCCCGCGCCCCTCGGCTCGGGTGGCCCTTCCTTCGGGGCTAGCGGATGCGGGCTGCGGGCGGAACGAGCGCTGAAGTACTGCGGGATCGAAGCCTCTCCGGCGGTCAGTGACCCTCCTGCTGCTGCTGCCGCCGCCGCCTCCTTGGGCAAGGCCGGCcgccacgccacgccacgccacgccccgcTTcgccggcctgtctttccgcccgcccgcctgcctgcgcgccAGAGCCCCGCCGGGGGCCGAGGAAGGGGCCGGGAGTGCGGGTGCGTCGGGCCCGAGCGCGAAGCCTCCTACCCCTCCGCCCGCCGCTGGCCCCCCTGGCCCCACCAAGGATTATTCATCAAAACAACAGGGCGGCCATCTTGGAAAGGGATCACGTGACCCCTGTCAAGGAGGCGGGGCTCCCGGCCACTGAAGGAGATGACCAATGAGAGCGCGGGCCTCGACGCGCCGGCGTTCTTTTTCTCTTAGCGGCGAGGCCCCCCAGCTCTTCCTCCTGCCTTCTCTCCCCTCCTCCCTCTCCAGCCCAGCAACTGCGCGGggaggcgggagaagggagaaggagagaggcgggcggggcgggggcagggagtgggaagtcggacggacggctgccatggcaaccgcgcgggggagggcag------gggcagggcgctaggacgtgaactggaggaggcgggacg a score=3419 s mm8.chr4 148271516 138 + 155029701 ACTAAAATAGTTACAATTTGTTTGCTACATGCTAAAAATGGG-AACATGACTATTAGATATGCAAAGAGTCTGTGAGTAAAATTAAATCGCTGCAGGCTTTTCAGGACTGCATTCTACTTTCCAGGAAATGAATTCTGT s monDom4.chr4 364875139 134 + 430141050 ATTGGAGCAGTTACAATTCTCTTCGTATTGACTTAAATTTAGTAACCCAACTGCTAGATATTTAAGGAATTTGTGAGT-TAATGAGGCAGCTGAGGGCTTTGTAAAAT----ATGTGCTCTCCAGGAAGAGAATTCTTT a score=4725 s mm8.chr4 148293670 143 + 155029701 TATCAGGCTCTCTGGAAGGTTTGCTTGCACACCTGGCCTTCGCAGAACATTTCCTGG-----GACA-GGAAGGGAGGGA-------AGAAGAAAGAAAAGAA-AAAGTTGACGTATGTTTTCAACAGTCCTGATACCGAATGTACAGTCTTCTCCAT s monDom4.chr4 364922182 142 + 430141050 TCTCAGGCTCTTTGGAATCTCTGTTTGCACACTTGACCTTCACAGAACATTTCCTGGAGTTAGACATGGAAGGGAAGGATGAGATCAGGGGAGGGAGGAAAACAAAATTGAGAT----------CAGCCCT-----TGAGAACACAATCTCCTCCCT a score=7528 s mm8.chr4 148296605 167 + 155029701 CCCTCCCCCAAAATGTTTTCAAAAGATCAGGACAGATCAGTACCAGGTGGAGCTGGTCCCCTTCGATCCAGTGGCTCCAGCCTCTGTTTTTCTTCTCTCCTCTCTGTACGCAAGTGAGTTTGTCATTCTCCCAGGTAACCAGGCTCTGCAAGGAGGGAGAGAGAAAC s monDom4.chr4 364923520 160 + 430141050 CCTTCCCCCAAGAGGGAATCCAGAGCTCA-------TAAATACCAGGTATAATTCGTCCCCTTCAATCCAGTGGGTCCAACCTCGGTTCGTCTTTTCCCCCTTCTGGACACAGGTGAGTCTGTCATTGTCCCACGTGACCAAACTCTGGAGTAAGAGAAAGGATAAC a score=11605 s mm8.chr4 148297106 230 + 155029701 TGCTGGCTAAGTGAGAGCCCTAGCCCTTAGCTGC-------TGCCTAAGCCCTTACCGTGCATTTTCTGTTATCCAGGCCTTTGTTATCCTCCTCAAACTCTTCTCCAACTTTGAATTTTACAAGGTAGTTCCTGAGGCTGCTGCACGTCTGGATGGTGAAGGAGTCCCCATTTTGCTCAATCACTTTCTGTGGCTTCAGCAACTTGGCAATCTTACGAGTTGCAAAGTCAATACCT s monDom4.chr4 364923702 237 + 430141050 TTCCAGCCCAGAGAAGTTCTTAGGTGTCAGTTACCAGTGATTTTCTCCATCCTTACCTTGCATTTCCTGTTATCTAGGCCTTTGGTATCCTCATCAAACTCTTCTCCCACTTTAAACTGGATGAGGTAGTTCCGGAAGGTGCTGAGTGTATGGATAGTGAAGCTGTCGCCATCTTGTTTGATCACTTTCTGTGGCTTCAGCATCTTGGCTACTTTCCGTGTGGCAAAGTCAATGCCT a score=9716 s mm8.chr4 148301148 555 + 155029701 TCTCCTAAGCTCCCATGTGCGGGGCGTGGGCACGCGTGGCTTCCCGCTGCGCCTGCAGGCCACTGAGGTCCGCATCAACCCCGTGGAGTTCAACCCGGAGTTCGTGGCGCGGATGATCCCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTGTGCAGGCAGCGGACACCTTAAACTTGGCCGAGGTACCCAAAGAGCCGACTGAAGGCTATGAGCACGACGAGACATTTTTGAGGAAGATGCACCACGTGTTGCTTGAGGTTGATGTACTGGAGGGCACCCTG------CAATGCCCAGAATCTGGTCGTCTTTTCCC-CATCAGCCGCGGGATCCCCAATATGCTGTTGAATGATGAGGAGACTGAGACGTAACCTTGCTAGCCGCCACTTTGGTATTTTGTTGACTGTGTGTTTCTGTTGTACGGTCTGTTAAA--TAGACGTGTCATGTGTGACCCCCAAACTCCCCCCAGTGACTCACCGACCACCGTGTACT----TGAGCTCCATAGTATATTTTTTTTTCTCATTAAAGGTTCAAAACCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaCAGTA s monDom4.chr8 199792465 534 - 308469712 TCTTTGCATCTCCCAAGGTTGGGGCCTTTG-------GTCTTCCAGTTGCACATTCAGACCTCTGAGTTCTGCATGATCCCTGTGCACTTTAACCCAGACTTCATGAAGTTCACAACTCTGAAGATGGAGCTCCTGAGACCAGTGAAGAATTAGAGCATGGGAAACTTATCAGAACTGCCCAGACAATTGAATTTGATATATGAA-AGGATGAAGAATCCTTGAAGAAGGTGTACCATGTGTTGCTAGAGGTGGACTTTGGAGAAAGCATCCTAACTTGTCTATGTGTAGAATCTACATACCTGCTCCCTCATGAGCCAAGGAATCCCCAACATGCTACTGCAGGATGAGGAG--------GCAACATCTTAAGCCTCAATGT----------TTTCCCCTGCATCTCCTTTGT---GTCTATTCAGGTTGATTGTCTCA-GAGTTATTCCT---CGTCCACTTGAAGTACCCAGACCACAAAGTCCTGTGGTAGATTACATTTGCTATATTTTTTCCTCAATAACGGTTCAAAAAC-AAAAGCAAACCAAACAAAAAAAgaacaata a score=2048 s mm8.chr4 148302940 40 + 155029701 AATCTTGCTTGGCCACACTACTTAGGAGAGACCTCAGGGG s monDom4.chr4 364926604 40 + 430141050 AACCTTTCTTGGCCATAATACTTTGGGGAGCCTACAGGTG a score=984 s mm8.chr4 148312419 117 + 155029701 TTTTTTAATGGTCTTAT-TTAAAACATTCATCTCAGTCACGGATC----TTAATTCCCTGGTGGTTTGTTTTTTTTTTTAAAT-CGAACCTTTATCTTTCAGTTGATGAAACAGGATGATGGC s monDom4.chr4 364958937 122 + 430141050 TTTTAAAATTCTCTCAGACTATATCATTCATCACAGCCAAGGTTTCAGATAAAAATGCAAAACTTAAGTTTTTTTTATTATATATTAACTGTTAACTCTT-GTTTATAAAACAAGATCCGGTC a score=22504 s mm8.chr4 148312616 412 + 155029701 CTTGGCCTCTGCGGCGTTCCTCTGCAGAGGAGCCAGGGTGACCCCAGCATTCCTGCCTTCGCTCTCCGTGTTGTACAGCTCATGCTTCTCAATGTACTCTTGGACCAGGTCCGGTACCAAGTAGCGGATGCTCTGGCCCCTCCTGAGCGCCCTCCGGATCTTGGTGGACGAGATGTCATTGGTGATCCACTCGTTCACCAGGTGGATGTTGCTCTGATGTCTCCACAGCACATCGGACTCGTAGATGAATTTCTGAGCGTCACTGCCAGCCCGAGTGATACAGATGAGCCCAAAGTTGGCCACGATTTGCGTGATGTCCTCCATCTTCCACAAGTTGGGCACGCTGAAGGACTCCAGTAAATCTGCCCCACACAGCAATTTCACCTTGGGCACACCTCGAAGGGAGAATCAA s monDom4.chr4 364959133 412 + 430141050 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a score=9183 s mm8.chr4 148389491 282 + 155029701 TCTCCCCGTCTCCTTGCAGGTGTCCCCAGAACTGGGCC-AGGGGGATGAACCGCGAGGGAGCACCCGGGAAGAGTCCGGAGGAGATGTACATTCAACAGAAGGTCCGCGTGCTGCTCATGCTGAGGAAGATGGGGTCAAACGTGAGTGC---------CTGTGGGCTGCAGGGCGCCTCCTGGATCCCCGGGAACCAGGAAAGGGCTGTGGGCCTGGGGATCACCTGTTGCCAGTTCAGGCCCCCCAAGCCCACAGTTCAGGGAGCACTGCTGAGATTATC---TCTCCACTGCA s monDom4.chr4 365086320 268 + 430141050 TCTGTCCCTTGCTCCACAGGAATCTCTGGAGTTGGACTGAGGGGAATGAACCGTGAGGGAGCTCCCGGGAAGAGTCCGGAGGAGATGTACATTCAGCAGAAAGTTCGGGTCTTGCTCATGCTGAGGAAGATGGGATCAAATGTAAGTTCCCTGTCACACTAAGAGCTGTGGGCCAGCGTGGGAAACGCTGTCACCCCGGA----GTTGTGA---TGGGAGTTGCCTGGGGTGAG----------CCAAGCTCC----------ATCCCTGCGGAAGTCATCCTGTCTCCACTCCA a score=6314 s mm8.chr4 148389982 364 + 155029701 CCTGAACGTTCCTACCTGCCCTGCGCCAGAACAGGCACTGAGCTAGATCAAAGGGAGTGGCCAGGCGTGTGAACTTCAGGGACCTGGTTTTCAGGATGGGAGCAAGACGTGACTGCTAGACACTAACGAGGTCAGAGGGGGAGGTGTG-------------GGGGACAGCAGGTGCAGGGACTTGGGGGGACAGGTTCACCCTCATCTCATCA--CAGCACTCTCACCCTT-CAGCTGACCGCCAGTGAGGAGGAATTTCTGCGCACCTATGCTGGGGTCGTCAGCAGCCAGCTCAGCCAGCTGCCACAGCACTCCATCGACCAGGGTGAGC-------------CACGGGCCAGGCGTCAGCCAAGCCCGAGCACTGAGCAGTGGTTTTTTT s monDom4.chr4 365087406 370 + 430141050 CCTGAAAGGCCCCAGC-------CACCAGAGCTGGAATGCTCAGAGCCCAGTAGAGGGTGCCAGGTAGCCGAGATCGAGGGAC---GGTTGCAGGGGAGGACCCTGCT----CCCCTAGACAGGAACATGG-------AGGAGGCGTGCACCTTGGTGTTTGGAGACGGCACCTTAACAGCC--AGGGATGCTTTCTGCCCTTCACCCGGTCAGCCATCTCTGTTCCCCTTGCAGCTGACAGCCAGTGAGGAAGAGTTCCTGCGGACATATGCAGGGGTAGTGAGCAGCCAGCTGAGTCAGCTCCCGTCACACTCCATTGACCAGGGTAAGTTGGGGCAGCGGCACAGGGAGCAAGCGGGTGTCCGGTGGGACAGCTGGGCAGCAGCATTTCT a score=1836 s mm8.chr4 148393197 267 + 155029701 AGGCGGCCAAGGGATCTTATACATCTGTCCACTAGGTGGCACTCTCTCTCAGCAGATGACAAGGCTCCACCCTAGGGTTCCTAGA----CCTAGACAGGATTTCC----AGCATCTTCCTTTAGATTGTCCTTCTCAACAGAGATCCTGAGGTGGAATCAGCC--ATAGGACAGTGCCCAGTCTC------ATTTACTCTTGCCCCC----TGAGGCTGGAAGGGTCTGGTACCTGCGTACTCCTCTAC-ACACCACAGCCCAGCA----GTGTTTATAGAGAGTAGGCAGG s monDom4.chr4 365090072 273 + 430141050 AGGCCACAGTGGAAGCTT-----TCTGTCCACTAGGTGGCAGGCTATCACAGCAAATGG-GGCACCCCACCCCAA---TCCCAGCCTCTCCTAGATGCTCCTCCCCAGGAGGATTTTTCCTGCGTCTGGTCTCC------AAGCTCAGGGAGAAGAACTAGCCTGATGGGGCTGCTCCTTGGCTCCATGCTCTCCTCTCAGGTCCTCCTGGTGAGATGACAGTGACCTGG--CCTGGCTGCTGCTCTCCTGCCCCTCGGCCTCACACTTGGGGGTGGTAGAGA--ACGCAGG a score=2820 s mm8.chr4 148397878 225 + 155029701 AGGCTCCTTCTAGAGGGTGAAATCAGTCAGTGCTGAAATTAGAGTCGGCCCAGGGAGGATTC----ACTGTGGGACCTGAAGCTCAGACTCT-TAACTTTAATCAACACTTCTGTGAGAATTACCTGGAACCCAGTAACAAAGCTGAGCCAGAAGT-CACGTGTG-GTTCAGAAATCCATGGGGATCTGACTCCTAACTCCTGTCACTGAGAAGAAAAGGAAGAGTGACAAA s monDom4.chr4 365091438 223 + 430141050 AGGCTTCAGCTTCTGTGTGCG-TAAGTCAGTG--------AGGACAGGCCCAGTGAGGATCACAGAGCTCTGGGAAATGAAGTTAATCTTCTCTGACTTTAATCAACGTTTACCCAAGAATTACCTGTAACCTAATAAGAAATGTACATCCCATGTACACGCACGCGCACACACACACGTGTGCACATACACAAGCAGACTTTCCAGGGAGAACAATCTGAAGAAAGGCAAA a score=4367 s mm8.chr4 148399991 254 + 155029701 TGGAGCCCAGTAGGCGCCACTGAGCCTCCT-----------GCTGCTAAGTCCTTGGTGAATCAGAGCCCACTGTTCCCATAGCAACTCAAGTGTGGTGCTACCTTGGGTAAAAAGCA--TCCGCTGG-GAGCTTTG-GGGTATCAAAGCGGAGGTGTATAGAACACCTGGCTCAGAGCCTTGGGCTGCTAAAAACAGCACATGCTGCC-----CAGTGGGTGTG---GGTTTATGTGGAAGGCAGCCCAGCACAGGGTGAGCACCACCCTCACTCC s monDom4.chr4 365093815 267 + 430141050 TGGAGCCTGGCAGGCACCCTGGAGCCTGGTACCTGCCCTTGGCTGCTGAGACCTTGGTGGCTCTATGGCTGCTGTTCCTATGGCAACAGAAGTGTCTTGCTGTCTCTAGGAGAGAGCAAGGCTTCTGGAGAGCCTGGAGGGCAACCAAGCTGAGGCGTGGGGCAGAGCGAGCTGGGAGACC-------ACACAAACAACTCCTGCTGCCATCCTCAGGCCCTGTGTCCAATATCTTTTCCAGGCAGCCCTGGCCC---TGAGCTCTAGCCATACACC a score=4340 s mm8.chr4 148401778 199 + 155029701 ACAAACAGACCAGTGACCCCATTGTCTGCCTCCCGCCC-CCAGCCAGGGGCCAGCTTCCCTGTTTCTATGCTTCTGCATATTTGTCATTTTTCTCTCCCCAGTCACTTGACTAGCTCCACTGAAGGGCCAAAGCTGGCATCAGGCGTGGGATGGAAGGGCCAGTGGATGCCTGCCCCACCCTG-TCCAGAGAGCTGAGCCT s monDom4.chr4 365097563 181 + 430141050 ACAAACCGGCTAATGACCC-ATTGTCTGGCCTCAGCCTGCTGGCTGGGAGCCAACTTTCCTG--TCTAAGCTTTGGCAGGTTGATCATTTTCCCCCTCC-----------CCAGCTCACTTGAAGAAGCAGAGCTGGGAGAGGACACAAG-TAACAAGACTAATAA-----TCCCCAGCTCTGATTCAGAGAGCAGTGGCT a score=7368 s mm8.chr4 148405873 491 + 155029701 aaaaaacagccagca--caCTTGCTGTCTTCAGAGTACAGGACATGGACCCATGAGCAGTTT----GCAGAGCCCAGTGATGGGGATTTGAGCT-TCTCTAAGGAGCCAGTGGCCCATT-TCCTCCTGG--GGACCCAGTGCTATTTTTGCACATGCAGCTCTCTGCAGAGGCCCAAGG-----------TCCCTGCGAGAAAACCCACGAGGCAAGTGAGGAAGGAAGAGAGTGGGTT----------GTCTCCGTT-CATTGCCCCAGAAGCATCTTCTGCTGACGCCTCCCCAGCACGGTCTTGCTTCGACCCCCT--CATGCCTAGCGAGCT-----GGAGGCAGCCCTCAGAGAAACCAGCATCTGTTAGACACCCAGCTCAGCCACCACACAGGGTATGACGTAATCCTGG--------------CGACAGTCCTGCTTGCAGTGATAGTGCATGGTCCCAGGACTGGAGTGAGAACAG-------------------AGAAAGGATCTGAGGGCTTCTCAAGCAAGAAGCCAGATGTCTGCGCTCCTTTCTGGAGG s monDom4.chr4 365100308 543 + 430141050 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TCCCAGTGAGCACAGCCTTTCTGCCTTGTCCTGATTCCAGAAGCCATTAGCAG---------TTCTTGTCCCCTGGTCT---------------GCAGGTGCAGAGGACGTGGTGATGGCGTTTTCCAGATCGGAGACGGAAGACCGGAGGCAGTAGCTG-GAAGCCCCTCGGAACTCCCTGGAAGCTGCAGATGGCCAAGAGATCTGTGTGGCTCCTCTGCCGGTTGAGTG-----------GTAGCAAACCACCGTCTTCTTACCCTTTGCACCCCTTACCCCATCCGACCCT-----------CCCCACCCAG--CCGCCACTCAGCAGGGC-TGGCATCAAG----------GTGGTT----TGTGATTGGCTTAAAGGGATGGACT-TGAGATTGGCTGCAGGAAGAAACCTTTTTA-TTTTTAAATCTTGACCAACGGAAACCTTTTATTTTTATTTCTGACTCTTTATTTTTTTAAACATTTGCGCCTCGGTATCTGG--------CTTCCCCGGAAGCTCTCCGA-GCTCTGGTGCTTTATTTAGGTCATTTTTAGGAATGTGAAGAGG-CCTGATTGGTTGCTT-AAACTGGAAAAGGGTTATGATTGGCTGGCTAGTGGGACGTGGTCTTTTCTTTGATTGGCTGTAGGTGTTCTGTTCACATCACCGACTTCCTCTGTTCTGAAAGCAGAAAACAGGGTTTGGGATAT----TGTTATATTTGACTTGAAAAAAAAAAGAAAGAAAGA-----AATGAAGTGAGCTTTGCAATATTTATTACACAAAGAGCTGGCTGCTGCCTTCACGTAGTGGGTTTGTGTTTGGATTTGATTGGCAGTAAGATG-----CGGGTTTGGTTTCCCATTGGCTCACCCCTGACTCCCGTTGCTATGGTCTTTCTTCC-----------------------------ACTCTGCTGGTT--ACATGAGGCCTGAGGGTA----CACCTGGAGAATGCACGTGCTTTAATGACCACACCTGCCTCCACCAGCGAAGGGACCCC---AGGGACGCGAGCGCGAGCGGGGTCCACAGCTGGAGAACAGGCCCCC-AAGGGGCTTTGTGTTCTCCTGAGCCAGCAGCCCAGAGCTCAGGGGTGACCGGGAGGCAGGATTGA 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a score=4812 s mm8.chr4 148410073 191 + 155029701 CTGCCTCGAGGCCAAGCCCTGGTGATG----------------GTGTGTGCTCTGTCTTAGCAGTGGTTCTCGGCTCAGCCTCTGAGGGAAAAAGATGCAAGTATCGATGTGGCTTCTTATTCTAACTGAAAGTCTATCTAATGGAGAAAAAAAATAACAATAAAGATTTTTCACAGCTTGCT--GGGTGAG-CTGAGCTGGTTTTTCTC s monDom4.chr4 365108357 206 + 430141050 CTGGCCCTGGGCCTAGCCCTCGTCAGGCTAGCATACATCTCTCTTGTGTCCCCAATGACAACTCTGATCT--GTCTCATCTTCTGAAGAAGAAAAGTGAAAGTGTTTCTGTGGTTTAATCTTTTGACTAAAAATGTAACTGTTGGGG--AAAAAATAACAATAAAAGTTTTTAATAGCTTGACAAGGATCAGACTGAGTCGATTTCTTCC a score=8038 s mm8.chr4 148419961 948 + 155029701 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s monDom4.chr4 365144265 1062 + 430141050 AATTGTGGCTTGCTGGAAAGGAGAG--AACCCATAATTGAGTTAATTGCCAGAATGCCAGATATGCAATTAATATGCCACGGGAACAAAGAGCAAATACACTAATCGCACATAATTGGACTTAAAGTACACCCTCCGAAGAACTCCGTAACGGGAGCTCTGCTGTTTATGCTCCTTTTCAAATTAGCGAAGAAGAATAAATTACCATCTATTCCCCTTTC-CCCAGCCAGGAGGGTCCCCGTGGAAGAGCTGGGAAGGGGAGAAGGGAGGTGGTGAGGCTCAGGCTCGAATTGCCATCAAGATCCCCCGGACCCACTTCCATTCCCTCCTCGTGCTTCGACAGGTTCACTGGCCCAGCCCCGGGAGGATCCCTCCCTCAGTGTGGGCAGGAGCCCAGTGTGGCCGGAGAATCCAGACCTCTCCTTGGTATTCCTGCAGTAGCTGGGCATTGAGACCAGCTGGGCTCCGGGGCAGCCAGGCAGTCAAAGCATCAGCAGACATGCCCCCGGGGGTGGCAGAGATGCGCCTGTAATCTGGGGGCTGGGAGCG---GCTTTGTTCTTTCCCACATGGAGGGACGATGACTCA---GGCTGTCTATTTCGGGCCCTGACGTGGTCCTGAGGATGGGTTCTGGGATGTGACA---------TGCAGTTTCTCTCTCCTCCGGGATCTCGGCGGTTGTGAAAAACGGGAGGGAGCAGATGTCAGGACACCATCCCACTTCCAATTGTGGAGCAGCAGACGCAGGCTATAtcggaggacccgagttcaaattccagacccacctcttattccgcctatgaccttgggcatgtccttcgagctttcggagcttccctg-gctttgcccatacctttgaaacgtatgtgtgtttgactaggtgacccttaaTACCATCTTCTTCATGAAGCACTGAtttatatccccagtattttgcatagtccctggcacatagtaggtgcttaagcaatactaatgattgactaatCTCCCTAATTCCTAAAACCCTTCCAAACTACCTTGCATTTACCCTCA----------------TTctctctcctcccctc--cttctttctctccctccct 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s monDom4.chr4 365248348 1046 + 430141050 CACGCGCACCTCTGAGGCCGTCCAGCCCCCGCCCCTGGCTCCAG--CTGTgggcccccccagccccccgcc----ccgggcgcccccTCACCGCAGGTCCAGCCCCTCCTGCTTCCACAGCACGTCCATGAGCTGGATCATCTGCAGGGTGAGCATGTCCTGGCGCAGGTCTGCGGAGCCGGGAGAGAACAGG--------GGGGCTCCCTCAGCGTCTGGGCGGC---------GTCccgggcc-------------------gggccgggccgggcGC--------------CCCCCGCACTCACCGTCGCCGTTCTTGAAGATGATGCCCACGTGGCTGTCGGCGCCCCCGGCGGCCTCCTCGTTGCTGTACACGATCCACAGCGGCTTCATCTTGGAGTCCATGAAGGTGCACTGCTCCACGCTGCGAGGACGGGCAGGGGGTCTGCGGGGCGCCCCGGCTGGGCCAGCGTCCCGGACCAGGGTGGGGAGCCCAGGGGAGCTgtgggccggggcctcccggggtggggcagggcggggctgggagggggctggccggaggcgggggcgaggcgaggACCGTCTGCCTTACCAGACTTCAGACAGTAAGGTACTGGGGTTCAGGGGAGATTGCACGTTCGAGAGGGCCTCTAAGTAGGTCTCCTGCCTCATACACACATGCATCAGCTCCTTGGTCTGCGGCTTGGTGGTCTTCTGGGAGCTCACTTTGACAAAGTCATTCAGGGCCTTCATCTTGTTCAGTGCCTCCCCCTGGCCCGGAGACAGAGGGCCGCGCTGAGTCCCCCGGGGAGTCTCTgggccc-----ggaggccggcccccg----cccctcccccgc----------accccggcc---ccTCACCTGCTTCATCAACACCTTCATGTGGTGGTTGCTGCCCCGGCAATAGGCCTCCATGATGAGGCCAAAGCGCAAAGCCACTGAGGGGACGTGCATCTCCGAGCTAGGGGGAGAGAGCTGGCTCACCCTCCCGGGCACGGCGAGGGGTCCGTCC--GTCTTCCCCCTCCAGTTGTCCCCGGCCCTG--GGCTCCGAGACCAGCTGCTCATTGCCTGGCACATAGGCTGGCTGGGCCCAGGAG 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CACCAGCTGGGACTCACGTCAGCTTCCGAAGGGACTTGATGGCGAAGGAGCCCACGTAGCAGTCGGGAAAGCTAAAGTCCAGAAGTTCCAGGGCGCTCAGCACAGGCAGCTCGGGCCAGGAGCACAGCAAATAGAGCATCTGGGA--------------CAGCTTGGT-----GGTCAGGTAGGGGTGGGCGGGAACTGTCCATCTGCCCCGGGGCTGTCTTCCCGAACCCCCCTCTCTACTCACCTGGGCCACATCCTCGTGTTTATTCCACTTGGTGACCAGCAGCAGGCGGGCCAGCGCCTCTGGGAAATGCTCCTGGACTTCGTGGCGCATCTTCCACACCAGGTCCTTCTCATGTTCGTACAGTTCCCCGGATCCCCGCCGTTCCAGGATCTCCCGCAGCTGCAGCTGCTG--------AGGGGCGCAGACAGGGTGAGGCC-TCCAAGCTCCACGCCCAATCCCAGCTCCCCCATTCCAAGACCGGA--------------GCTCACCTCCTCCTCCGTGATGCGCCCACGCTCCCCGTGACGCCCCAGCTCCAGGATCTGCAGAATGGATGAG---GCTCT----CACTTATCCT s monDom4.chr4 365251256 585 + 430141050 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cagcattaggattgagacccaGGGGACTAGAAGGAA------AGGGTCTTCACTGACCTTCTCCAGAGCGGGGAAGTACACAGGGTGGGGGGCCACCTCAGGCAGGTAGATGACCAGGGCAGCGGCACTCTCCGTGTTGGGGTTCCCGCGCACTGTACCCGCAGGATTCAGCAGCTCTCCCTTCTCATCTGGACACAGGG-------ACAGATGCAGCGGTGTGTGTCAAGTCACTTGCTTGGGGACCTCT-ACCCCCTGCTAGCTGCTCCCCTG--GGGCTGGGCCCACCTGGGACAGAGGGCCACATGTAGAGGCAGCGCTCCCCCGTCTTGAGCTGATCTTTGTAGTCGAATAGCATGAGGTTGGCCCAAGCGATGGGGCAGTCCTGGGGAAGGACACCAGCGGGTTAGGGCCAGGCACAAAAGC---------CCCATTTGCTGACCT----------CGGAGGGAAGGCC--------AATTGGGGAGGGGATCTGGGCTTCAAGGGTAGACTCCCAGATAGACTCAAGGGAAGACCCTGTTTGAGAAGA----------------GGGAGGACCAACTGCCTTGCCCTAGTGACAAAACGAGCCCAGGCTGCATCTCGGCTCCTGGCTCACACCCAGTATGCATCAGCAGAGTGAGAGTGAGAGCCACTTTAAATACTGGAATTGGTGACTAGGGGCCCA s monDom4.chr4 365251841 669 + 430141050 CAGCAGGAGGGT--AGCCCCGGGGCGCGAGGGGAAGCACTGGGGGGCCCCCACTGACCTTCTCCAGAGTAGGGTAGTACACAGGGTGGGGAGCCACTTCGGGGATGCAGATGACGAGGGCTGCGGCACTCTCGGTGTTGGGGTTACTCCGCACAGTGCCCATGGGGTTCAGCAGTTCCCCCTTCTCATCTGGGAACGGAATCAGCCCACAGGAGCCATAAAGCGGGCC--GCCCCTGCCCTAGCCCCCTCCGGCCCCCTCCCTCAGGAAGCCCTGGCGGCCCGGCTGTACCCGGGACGGAGGACCACATGTACAGGCAGCACTCGCCGGTCTTCAGCTGGTCCTTGTAGTCAAACAGCATGAGGTTGGCCCAGGCAATGGGGCAGTCCTGGGGAGGG----CAGAGACCTGGGCTGAAGGACGGGGCCCTtcgctcgctcgctcgctcgcCCCCAGATGCCGCGGCGGCACCGCCGAGCCCAAGATCGGAGAGGGGGCCTCCCTCGTAGGAGAGGCCGCTGAGGCTGGGGGAGGGAAAGGACCTGCCCACGGTCACCCCTCGCCCCTTCTCCCGAGCCTCCACTCCCGTTTCTTCCTGA-GGACCGGGCAGAGGGTGC--CCGGACTTCT-CCCCCTACCCAGAATGGGCCCTAAGGGGGAAAG--------------------GGAAGGGG-----AGGGGCCCA a score=16588 s mm8.chr4 148501004 296 + 155029701 GGGGCACTGAAGGGAGGCCCTCCC------AGCCAGCCAATACTCACCGCCTTCTTAGACTTCTTCTTTGTGGAGCGTGCCTTCTTAGCCTTCTCCACGACGGCATAGAGAGCAAAACAGAGTCGAGCCATGCGCGGGAGGTCACAGACGCTGATATCGAACTCCAGTCGCTGCTTCCACACGGGCTCTGAGCATACATTCACCTCCGAGCTTGACACAGTCTTGCACAGCATCTCATTGCCATGGAAGAGCCCGGCCTGAACAACCAGCTGGGGGTCGGGGTGGATTAATGGGAGGAGAGG s monDom4.chr4 365252510 302 + 430141050 GGGGGGCAGCAGGGAGGCTGGCCCTGGGCAGGCCCCCGTCCACGTACGGCCTTCTTGGACTTCTTCTTGGTGGAGCGGGCCTTCTTGGCCTTCTCGATGACGGCGTAGAGGGCAAAGCAGAGCCGGGCCATGCGGGGCAGGTCACAGACGTTGATGTCGAACTCGAGCCGCTGCCTCCACACGGGCTCCGAGCACACGGTCACCTCAGAGCTGGACACCGTCTTGCACAGCATTTCATTCCCGTGGAAGAGGCCAGCCAGCACCACGAGCTGGACGGGAGAGCAAGCACAGGGGAGGGGAGG a score=24131 s mm8.chr4 148502148 863 + 155029701 GTGGCTCCCTCATCTG-ACCGGGGAGCCCCCTACCTTCATCCGCTCGTCAGCATTCACTTTTCGGCCCTCGATCAGCTCAATGGAGAATGGCTGTTCCAGGGACCACAGGGACACAGAGGAGGGCT----GGGGAAGTAGGGAGACGGAGTGAGTGGCAAAGAATAAGATACCTCTCCTCTTTTTATCAGAAAACCTGTTGTGCACATGCACAAGGGTCCCCAATACCCCTAAGAGCCACAAGAGGACAGTGGAGGCTGCCCTGTAGTTCACACAGATCCCAACAGGCCCCTGGTCACCCAATCACAGGCCCCTGAACCCATGGGTCTCCTGCTTTCATCCCAGCAGACCAAGAATACACCACCTCACCTTCTTGGCAGGGATCGGGGGAGGTTTGGCACGTGGTTTCTGTACTTGGGGGGCAGGATTGCTCTGCTCATCCCGCATAGCAAGGATGGAGGAGGAGTGGACCATGGTCAGATGAGGGGTCAGCCCGCTGTGTAGGCAGCTGCAGATGTACTGGAAGAGAGGGGCTGGGTGAGCTGCTGATGGGGGGGCACCCGCTCATTCCCTAAGTCGGTTCCCTTGATGTTCCCGGGACCACATTCGGGCAGACGGGAAGGCTTACCTGAAAGTGGCAGAGCGGGTAGTTGCCGTAGAGGTATTCGTGCCTCCCGTTCACCTGCAGGGCATATTCCTCAGGCTGCTCCACCAGAGGCTGCCGGAACACTGTGGCCTTTTTTCGGAGGGCACAGGCCATCAGTGCCAGGGGCATGTCCTTGGTGGATACCTGGAAGGTGAAGCTCTCCTGTAGGAAGAAGGAGGTCAGCCTTCTGCTCTGCAGTCCGAGA--GGCCTCTAGGGCACAGAG s monDom4.chr4 365253746 746 + 430141050 GTGGGTGCACCGTGTGCACCGAGGGCAGCCTTACCTTCATCCGCTCATCGGCGTTCACCTTGCTGCCCTGAACCAGCTCGATGCAGAAGGGCTGCTCCAGGGACCACAGAGACACGGAGGAGGGCTACATGGGAGAGCCAAGGCCCATGACGGGGTGCAAAGGCTGGGGACCCCC----------ACCGGGCTCCCCTCTGCACACA-------GGGCACCCCCCACC-------------------------AGGCTCCCCT-----------------CTGCAGGCA---GGGCACCCC----CAGGCC-------------GCCTTTCCCTTCCTGGCCGGGGGCCGCA-----------CGCACCTTCTTCACGGGGATGGGGGGCGGCTTGGCCCGGAGCTTCGGGGCCTGGGCCGGGGGGTTGCTCTGCTCGTCGCGCATGGCCAGGATGGAGGACGAGTGGACCATGGTGAGGTGGGGGGTGAGCCCCTTGTGCAGGCAGTGGCAGATATACTGCAAGGAGAGGA------GGGCGGCTGCAGGGGCGCCCCGGGCTTGCT------GCTGCTGCCGCCCAGGCTC---GGCCCGCACCCTGAC------------TCACCTGGAACTGGAAGAGGGGGTGGTTCCCATACAGGTACTCGTACTTGCCGTTCACCTGCAGCGTGTAGTCCTCGGGCCGCTCGAGCCCCGACTGCCGGAACACGGTGGCCCTCTTCTTGAGGGCGCAGGCCATCAGCGCCAGGGGGAGGTCATTGGGGGACACCTGGAAGGTGAAGCTCTCCTGGGGGGAGCGGAGGGGGGG------GCTCAGCCGGGTGGGGCCGGCCAC-AGGGCCCGGAG a score=31549 s mm8.chr4 148503469 665 + 155029701 GAAGGAATGGGGGAGGGGCTCACCTCACTGCCCTCGAACTTCACGTTGACCAGCAGGGCTCGGTTGCTGACACGCAATAAGCCGGCCCGCCAACCCCTTGCTGAGGGCTCCAGCTGCAGGGGGAAGCTGTACTGCAGCCATTCCACCCAGCCCAGCTGCTGGCGGTGAGCAGCAGCCTCTTCACAAAACTGGCGCATCTTAGTGCGGAAGTCGTTTACTTCCGGGTCCCGCAGGGAATCAAACTCATGGAGACCTTTTCGAGGGGACGAGAGGAAGAGATCAGGACAATGTCAAGGCACGTGGGGCCAGCCTCCTGC------------TCCCGGT---------AAGTATACCTTTGCCAATGAGGAGGCTGATCTGGGAGTTAATGAGCTTCTTCACGCGGTCCCCCTCTCGGGCCACGAGGCGCAGCACGGGCAGGAAGGGCTGGATGTCGCACAGCCTCCGCTGCTCATCCTCCAACTCCTGCTGCTCCGCCGTCTGGTTCACACAGGTGAACACATAGGCCTCGGGGTCACTGAGCATGTGGAAGAGTGGCTCATACTGTGCACGGTGCCACAGCACCTGGGAGAGAGG-------------------------GTCACAGTTAGCCCTTACAGGGCTCCCACAGGGG----CAGAGGGAGACCCCG------AGAAGACAAA--------------------AGCTCGCACACCGGAAGACTAGCCATGTCGATA s monDom4.chr4 365254492 726 + 430141050 GGGGGAATGGGGG---TGCCTACCTCATTGCCCTCAAACTTGACATTGACAAAGAGGTTCCTGTTGGGTGCCCGCAGCGTGCCGGCCCCCCAGCCATGGGACGAGGGCTCCAGCTGGAGGGGGAAGTTGTAATGCATCCAGGCCTCCCAGCCCAGCTGCTGCCGGTGGGCCGCGGCCTCCTCGCAGAACTGGCGCATCTTGGCGCGGAAGTCATTGACTTCGGGATCCCGCAGAGAGTCGAATTCATGCAGCCCT------GGGGACAAGGGGGGCAGC----GGCGCTGTGACGGCCCTTCCGGCCCCCCTCCCCCCTTGTCCCCACTTCCCGGCCGGCCGGCCAGGCTCACCTTTGCCGATGAGGAGGCTGATCTGCGAGTTGATGAGCTTCTTCACACGGTCCCCCTGGCGGGCCACGAGCCGCAGCACGGGCAGGAAGGGCTGGATGTCGCACAGGCGCCGCTGCTCGTCCTCCAGCTCCTGCTGCTCGGCCGTCTGGTTGATGCAGGTGAAGACGTAGGCCTCGGGGTCGCTGAGCATGTGGAACAGGGGCTCGTACTGGGCATGGTGCCAGAGGACCTGGG-GAGAGGCCGGGGCTCACTGTACCAAACGCATGTCGCCCTGAGCCTCGCCACAGCCCTGGGAAGGGGGCCCAGTGGCTCAccccattttacagaggacaaacgggctaagaaaaagcaagcagctcgccca-aggaagcccaggcttctcaaca a score=11048 s mm8.chr4 148506807 321 + 155029701 GCCCTGCTCCTGAGAAATGGCAGCCAAGGCTGCCTGCCTCTGGTCAGTTCC-----CACACACAGTTTTTGCCCTGAAATTCTGTGTCTGTGAACAGTGTCTCCCTGAGCATCAAGGTGTGAGAAGCGGCCATGGCTCTACCTGCTTGATGGTGCTGAGGTTGGCATTGCGGGACACGGGGAAGTTCAAGTAGACCCCTGTGGGCAGCAAGAAGTCAACAACCACGCTCTGGCTCTCCTCTTTGGTCCAGAACTCCATGGGGCAGTCCACCCCAGGGGGCATCCTGTTGTGTTACTTCTCTGAGGTCTGTTTTCCTGTGGGAAAGG s monDom4.chr4 365257467 297 + 430141050 GCCTCAAGCCAGAGGCAGGGCAGCCAAGGCTTCTGGGAGCTTGTC--CTCCAGCTGCAAACACAGG-----------------GAGGCCTCAGACGGCCAGGCGCTGAGGGCCCGGCCGCAGGGAGA----CTGG---TACCTGCTTGATGGTGCTGAGGTTGGCATTTCGAGAGACGGGGAAGTTCAGGTAGACCCCCGTGGGCAGCAAGAAATCGACCACCACGCTCTGGTTTTCCTCCTTGGACCAGAATTCCATAGGACAGTCGACTCCCGGGGGCATCCTGCTCCG---CTCCTCTGCTATGAGCTGCCCTGGAAGAGAAG a score=2276 s mm8.chr4 148559196 69 + 155029701 TTTTTATTTTTTTGCTTTTGTAAAGAAAAATAACATCGTGTTTAT-ATATGAATCAAAACATAAAAGGCC s monDom4.chr4 365373610 70 + 430141050 TTTTTAATTTCCTTTTTTTTTAAAGAAAAATAAGGTTGTCTTTTTCGCTTGAAACACAGAACAAAACTCC a score=6553 s mm8.chr4 148560528 364 + 155029701 GCCACAGCTACAGTAGCAGTAGTGTCCCTGGGGCCAGGCAAGCCTGTCAGAGATCCCTGGTTTTGGGTTCAGAGTGTCAGCACCAAACACAGTTGATGTTTGCAGTCTGTTGGGTGGACAGCAGGTATCCTGAGGTCAGGGACTTGACCCAGG--AGGTCAAGGCAGAGACAGAGCCCCTCGGGGAGGGATCTCAGCGCCA-GTGTCGGAAGCAGCATGCACCTGGCACTGC------CCTCGGGAAGGGCACTCGGAGG-TCAGCGCAGGCTCTGGTACAGGTAGGCCGAGGTGAAGAGAGCATTGACTGCCAAACTCACAGCCAGGAGGCCCCGGACCAGGGAGGGACTGACACGAGCTGAAAGCAGGACAC s monDom4.chr4 365375920 346 + 430141050 GCCAGAGAGATGCAAGCAGGAGT-TCCCTGGAG---AGTGAGTCGGCCG-----CCCTGGAAGGGGG----GGTCTTTGCCACCGGCCCCCCAAGGTCTTTGGTGGTGGTGGTGGGAGCAACAAGCATTC--------GGTCCTTGAGCCAAGTAGGGCCTGGTGGGAGGGGGAGC------AGGATAACCTGCGGCGACAAGTGTCCCGGGCC-CTTGGGGCTGGCCCGGCAGGGAGCCAGGGGACGAGGGGCGGCAGGCTCAGCTCAGGCTCTGGTACAGGTAGGCAGACGTGAAGAGAGCGTTGGCCGCCAAGCTCACGGCCAGGAGGCCTCGGACCAGGGAGTTGCCGAAACGACCTAAAGGAGAGAGAC a score=4544 s mm8.chr4 148561659 617 + 155029701 CTCTAAGCACAGGAGCCCTGGGCTACCCATGGCTACCGAACATCTGACGTGGGGCTGGGGCAGCTGGGGAGATGAACCAGAAGAACCACCACAGGGAGTAGCTTTATCATTGTCCCCAGAAGGGGGCTTGGGACT---------GGCTCTCCCACCCTGGGT------------------CACAGACCTTTCCAGGGAGTGGTCTCCTCTGAGCACCCTTTGGTGGTGGTGTCTACGACGCAGGTGGAGGACTGAGACGACTCGTCCTCTTTCTTGATGGAGTGGCTACTGCGGGCGCTGTCTCTGGCCAGCATCGACCTCATCTCTGTGGACAGAAGAGTGAGCATCCTGCTGTGCTGCAGCTCGACCC--CACGGGCTTCCCTGCAGCTCTGCTCCAGGCCCT--GGACAAG---------GTCACACTGCTCACCTCTCGGAGC----GGCACAGGGTCAGGGCAGCAAA--TGAGCACTGAGCGGTACCAGCATGTCCTCTGGGCAGCGAGCATCACTGAGCCCGTGTGGCCAAATCTACGCACACTTACAGC--CCAGAGCAGAGAGCCACACACCCCATGTGAAAGTCTGAGTTTTAACAGAGTCCA-----ACTAACTTTTAAAAACGCTTGTCAGTGTAGAAGGGTGCGGGCAAAACGAGAG s monDom4.chr4 365378668 639 + 430141050 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GTCCTCCCCCCTGCAGTCACTGCTGCTTCTCTGACCTTCGGGGCCGGAACCTCCGTGGGCCTGTCGATTTCCTCGTAGCCACAGCTGCGGTGAAGCCCACCAGGCAGCACAGGGACGTGGTACTGAACTTGAGTGTGTCTAGCCAGCCGGGTGAGGCAGCCTGTAGATAATGCTCTGCCAGGTGCAGCCCCAGCAGCAGGGCCCAGAGGCAGGTGGAGAAGGCATCGATCCGCCGGAGCCTGTGGGAGAGAGCAAGGTAAGTGTGTGCCCAGAGGACAGTACAGAGCCTCCCTGTCAG-TTCCCGTGCCACGCCCTATCTCCATTGGACCC s monDom4.chr4 365406599 317 + 430141050 GGCCCTCCCCCGTCTGTCACTGCTGGAGCTCTGACCTTCGGGGCCGGTATCTCCGCTGGCCCGTTGCTTTCCGGGTAGCCACAGCTGCAGTGAGGCCCACCAGGCAACACAGGGATGTGGCGCTGAACTTGAGTGTGTCTAGCCAGCTGGGGGGGTCCATGTCTAAGTAGCGCTCCATCAGGTGCAGCCCCAGGACCAGGAACCACAGGAACGAAGAGAAGGCGTCAATCCTTCGAAGCCTGTGGGGAGGAGGGGGG---------GCCCATGGGCCAGT-----GAGTCACTGTCAGAGTTCCTTGACCCCTAGGAGTCCCACTGGGGCC a score=15436 s mm8.chr4 148571658 574 + 155029701 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TGTTCCATCCAGGCTGGCCAATCCTCTTGGCTCTCACGGGGGTCCCTGCAGTGATTCAGCTCCTCTCTCTGCCCTTCTTCCCTGAGAGCCCCCGCTACACTCTGATTGAGAAAGGAGACGAGGAGACGGCTAGACAAGGTACTGAGACTCAGGCTGCTCACCCAGGCTCTCAGTGCACAA---------AGGGGAGTGGAATGGGCAG s monDom4.chr4 428769815 200 + 430141050 TGCTCCCTCCAGGCTGGCCTGTGCTCCTGGCAATCACAGGGATCCCCGCAGTCCTGCAGCTCCTCTCTCTGCCCCTGTTCCCAGAGAGTCCCAGGTACACGCTGATTCAGAAAGGCGATGAAGAGCAGGCCCGGAAAGGTACCCAGAAT--------GCCCTCTAATTTCCAGTGCCTGATCCTTCTCTGGAGAGGTTGAAATGGCAC a score=10954 s mm8.chr4 149002120 353 + 155029701 GAGAGCAGAGAGTTTGTGCAGGGTGAGCAGTGGTGACTGGAGGAGGGGAGGGGGGAGATGCGAGGGCGTATGAGGCCTGAGCTTTGGAGAAGGTCCTGGCTGAGGTGCAATAGGGCAGAAGGTGAGTGTGGTGTACCGCTTCTCTGCTC---TGCAGCTCTAAGGAGGCTGCGAGGTCAAAACTACAATGTGGAGGCCGAGATGGAAGAAATGCGCACAGAGGAGCGCACCGAGCAAGCCGAGGGTCGTCTGTCCGTACTCAACCTCTTCACCTTTCGGCCCCTGCGCTGGCAGCTGATCTCTATCGTTGTGCTCATGGCGGGCCAGCAGCTGTCCGGGATCAACGCGGTGTGTGG s monDom4.chr4 428770063 336 + 430141050 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s monDom4.chr4 429551185 1236 + 430141050 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GATCCCTTGTCACTGTGTTGGGGTGAAGGGACTAAATTGGCCTACCTCTGTAGTGAGCGCCCGACTTAGACCCCCCTTTTTACTTCAGCAGAAGGCATCCAGCTCTGCACATGAAGGCCGTCTTAGTGACCCTCAGCTCAGTGGCCCGGGTCACATGCGACCCTCCTTCGAGCCACCACCGACCACAATCGCTGCTGTGCCCCCATATATTGGGCCTGACACACCTGCCCTCCGGACACTGAGCGAATATGCTCGGCCTCATGTCATGTCTCCCACCAACCGCAACCACCCCTTCTACATGCCCCTTAATCCCACCGACCCCCTGCTGGCCTACCACATGCCTGGCTTGTACAATGTTGATCCCACCATCCGCGAGCGGGAGCTCCGAGAGCGCGAGATCAGAGAGCGCGAGATCCGGGAGCGGGAATTGCGGGAGAGGATGAAGCCAGGCTTTGAGGTGAAGCCCCCAGAGCTGGACCCCCTGCACCCAGCCACCAACCCCATGGAGCATTTTGCCCGGCACAGCGCCCTCACCATCCCTCCTGCAGCTGGCCCCCACCCCTTTGCCTCTTTCCACCCGGGCCTCAACCCTTTGGAGCGGGAGAGACTGGCACTAGCAGGTCCTCAGCTGCGGCCTGAGATGAGTTACCCAGACAGACTGGCAGCCGAGCGCATCCATGCTGAGCGTATGGCATCACTCACCAGCGACCCCCTGGCACGACTGCAGATGTTTAATGTCACTCCACACCATCACCAGCATTCACACATCCACTCCCACCTCCACCTCCACCAGCAGGATCCTCTCCACCAAGGTGTGTACCCAATTCAGAAGCA---AGGCTGGAGGCAGCTTCTGTCCAAGAATCACACTTCTTTCTGTGCTCTACACCT----GGGCTTCCTTCGGCAGAGAGGCCT--CTAGAGAAGCCTAGTCCTGTGCTGTGGGTAGGAGACAACAGATCAGGGCTCTCATGGCCTT s monDom4.chr4 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GCTCCCTGGTTGCCCTTATGGAGTGCACG-------------TTCCCTTTTTGTG-----TCAATTCACTTCCTCTCTTTTCCTGTAGCAGAAGGCATCCAGCTCCTCGCATGAAAGCCGGCTCAGTGACTCTCAGCTCAGTGGCCCGGCCCATATGCGGCCCTCCTTTGAGCCCCCTCCGACCACCATTGCTGCTGTCCCACCGTACATTGGGCCCGACACACCTGCACTTCGGACTCTTAGTGAATACGCTCGACCCCACGTGATGTCACCCACCAACCGCAACCACCCTTTCTTTGTTCCCCTCAACCCCACGGATCCCCTCCTGGCCTATCACATGCCCGGCCTCTACAACGTGGATCCCACCATCCGGGAGCGGGAGCTCCGAGAGCGGGAGATCCGGGAGCGGGAGATCCGGGAGCGGGAGCTCCGGGAGAGGATGAAGCCGGGCTTTGAGGTGAAGCCCCCCGAGCTGGATGCCCTGCACCCAGCCACCAACCCTATGGAGCACTTTGCTCGGCACGGTGCCCTCACGATACCTCCTACTGCAGGACCTCACCCTTTTGCTTCCTTCCACCCGGGGCTGAACCCCCTGGAGAGGGAGAGACTCGCCCTGGCTGGTCCCCAACTGAGGCCTGAAATGAGCTATCCTGATAGACTGGCGGCCGAGAGAATCCATGCTGAGCGAATGGCCTCCCTGACTAACGATCCCCTGGCCCGGCTGCAGATGTTTAATGTGACGCCCCATCACCACCAGCACTCACACATACACTCACATCTTCATCTCCATCAGCAGGATCCTTTACATCAGGGTGAGC------CTCTGGGGCACACAGGGTGGGGAAAGCCT---TCCACGTCTCCAGAGTGCCTTTGGGCGCTCACCCTCGCCGGGCCTGCTGGAACAGTGCATCCTCCCCAGGGAAGCTGGGGGCT--------AGAAGGAGAAAGCAG-CCAGTGCTCTGAAGGCCTT a score=11175 s mm8.chr4 149462171 201 + 155029701 GACCTGAGTCTGTCTG-TCTGTTTGTTTGTTTTAGGTTCAGCAGGCCCAGTTCACCCCCTGGTTGACCCCTTGACTGCTGGCCCTCACTTAGCTCGCTTCCCCTATCCCCCGGGCACCCTCCCTAACCCTCTACTTGGACAGCCCCCTCACGAGCACGAGATGCTGCGCCACCCAGTTTTTGGTAAGAAATCACTGGAGGAC s monDom4.chr4 429616289 202 + 430141050 GACCTATTTCCTTCTGGTTTTTCTCCATTTTCCAGGTTCAGCAGGTCCCGTGCACCCACTGGTAGATCCCCTGGCAGCTGGCCCTCATCTGGCCCGGTTCCCTTATCCCCCTGGCACCCTCCCCAACCCTCTGCTTGGACAGCCACCCCATGAGCATGAGATGCTTCGCCATCCAGTTTTCGGTGAGAATTCTCATGTGTAC a score=14774 s mm8.chr4 149462785 245 + 155029701 GACTTGTTTTTGTAGCAGAGC------CTGTTTTGCGCTTGGCAGGCACCCCCTATCCCCGAGACCTGCCTGGGGCTATTCCACCCCCCATGTCAGCAGCCCACCAGCTTCAGGCCATGCATGCCCAGTCAGCCGAGCTACAGAGACTAGCCATGGAGCAGCAGTGGCTGCACGGACATCCACACATGCATGGTGGCCATCTGCCAAGTCAGGAGGATTATTACAGGTGAGGTGAG-------------GGGGGCACAGGCTTC s monDom4.chr4 429617748 263 + 430141050 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TTTTCTCGTTTCTCACCAGTCGACTGAAGAAAGAAGGTGACAAGCAGTTATAAG---TTATTTATTTGTTAATGCTGGCTGTGGAAACCCCAGTTCTAGGGGGCAGAAACAGGACATTT-ACATCTAGTAGGGGCTGCAAGAGCAAAGAGGAATATCGTCTAAAGATTTCTCTATATATTTAAAA---CCCACAACTAAA-ACACATCTGCATAATAGTGTTTGTTTGTTGAGAGGATTTCCTGAGACTGGTTTGGGTCTCCCTGCATGACAGTCCCC-CAGAAACTTGGTGTGTCCTGGGCTGGACTGA-CACCCAGAAAGCTTACCTGCGAGCTTGGGGTTTGGCTTGA-GTTCTCTTTT----CCTTGATTTCTCAGTAGGTGCTAGAGTCCGTTCACACCCTTCACTGTGCGCGCAGACAC---TGAGGCACGTGGGCTC---------------TGGAACCCGCAGGGTTTGCAGAGAGGCGG---CATATGAGTTTGAAATCCAAGAGCtataatttttaaaaaatct---tttattttaataCATTGTAGGAAATCTTCATAATTTGAGA-------CAGTTCTGCAGCATGGCTTTTTACATCTGTAAATA-AATAATTTTAGAA--------GTCTTTTTTTCTTTCCACAGACGACTATTCTGATCTATTTTTT-CCAGCCATGTCACAAAGTGTGAATTCCTACCAGCTATTGACAGAGTACAGAGTTGattttttaataaaaagt-------tatatataattatCCCTTTAATTAAAGGGAACAGATGGGCGTTTCTAGTTTTAAGCAGGCAGGAGCTTGGGACTAGGTTTGGTCACAGCAGCGAGCATCCAAGGGTTGGCAGGGACAGTGTTACAGGCTCTTTATT---------------TTGCTGCTTTGATTTTGCTTCTGTCTGCCCCTCACATGTG------CAGTG--GCAGGCGTGT-TTGAGCGAGCCTCCTTCCTTATTCATAGGGATTCAGT-GTTGACTGTTCCCTGGTGTCCCCGCTGTCCTGTGTCGTCTGGTATAGAAAGCGCATGTTTCTGTATCGGTGTCTGA-TGATAAGTTTCCTTGG------AGTTTTATGCACATGTTTGATTGTTCTAGATAAATTGTCATAAACATTCTAGGAAGTTC----AAGA----AAATGATGCAGTACCCAGCACATGAAAGACCTACAACATGTGCTTGCCAAAGGAATGTTAGAATCTGCTCATGTGTGTGT 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AGTTTTTGACACCAGAAGGCTGTCTCCATGGCAACGGGGTCAATGGGAAATGGCAG--GCGCCTTGGTTTAATTTTCGCTCCATCCTTGTTGACAGCAATAAAGGCCTCGTTTCTGATTTCTTGGTTCAACTGGATGGAATTGTCACCAGATTTAACTTTTCATAACCTGACACCCATACACTATTCAATTCCCC-TTTCCTCTC-CAACTGCTGGCCTGCCAT a score=6575 s mm8.chr4 150000914 294 + 155029701 GGAAGCGTGCTACTATGACTGGCCACCAGGTGGCGCTAAATGACCAGGAACTGGT-CTAGAA-----GGCGCAGGGAAGGCGCACCCTTGTTGATTTTATGTCTTGATACTCCATAATCACCAGGATTACAATCTAAGCAAAAAAGCAAGACAAATAAACA-----CCTGCCCCATGAAGAGTTT----GTCTTCGTTTGAAAAAAATCACGAGAAAACATGATAC---TTTGAACGTACC-CCCTAAGGCT---CAGGTGAGCA-CCAGTGAGCCTCTTGGGACAGATGGGAAGTTGCTGTGGGGACTGGGTGGGG s monDom4.chr4 42210537 307 - 430141050 GGAGGTTGGATTTCAGCATCAGCCACCAGATGGCAGTCGTGGATTAGGAACCATTATTAGAACCTGATGTGCAGAGGCTGAAAGCCTTTGTTGATTTTACTTCTTAATATTCTATAATCACCAAGATTACAATCTAAGCAAAAAACCAAAACAAACAAACAGAATCCCCACCCTCACACTGGTTCTTGGGTCTTTGTCTG--AATAATTATGAGAAAACAAAAGATGGATCTGAATAGGCAGCTCTGGGGCTTCCTGGGTTAGCAGCCAACGAA------GGGAGAAGGCAGGAAGGGCTCCAGGGAT--GATGGGG a score=8996 s mm8.chr4 150004202 547 + 155029701 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TCCAACCAACCAAGAAGTCTTGTATCCATTATGCAACAGGTGAAGAGATGGCTGCAGATTAGAATTTCCCTTCACTATCCACACACACAACATTTTGATTAAATCCCTGACAGCTCTGCTGTAGGGCAGAGAAATTTGGAAACATCAGGAAGTCAAACTGTGAAGTCTTTGAAAGAATGTGATTTATGGGAAAATGTGATGAAGCTAATGTGCTTGGCTCCTGAGTTTCGAGGCATGCCTGATTCTGGAGCCCAATCCGATGCTTTCTTGGCTCACGGTGCACCTCTGTTCCCCCCTTCCCCCAACGCAGCGAACGGGCGCCCTAGCCATGTTCCACGTCGGATCCGAATCGG-----AGGCTTTTATTTGGCTTATATTTCCCGAGGTG-TGTTTCCCAGGATGGGCATCC--ATAAACAGAGACATGTACATGCATACGCACTCTGAATAATTGTGCGGAGCTCCTCGCTCCCTCCTGAGACCAGAGAGAGCCAAGTGTTATTAGATTTATGGGGAGTTTGCTGTAGTTTTACAT-AATTTCCTTGATGCACTGCCGCTTTTGAACAGGCTTGCACATTTCCCT-TCGCCGAAT---GCGTTGGAGTCCTAGCCTGATCTCCCTCCCCG a score=4122 s mm8.chr4 150006704 231 + 155029701 CTCTGGCAAGCACTGGGAAGCCTCGTGGTTTTCTCAGTCTGGGTGAGCCAGCCTAGCTGGTAGGGGCAGGAAGGATGGTGGTACCTGCAGCAACAAGGGTCCTTGGCTCCCTGGAGCCTTGGCCATCTGTCTTGGTGACTCGCACCTGACAGATGCTGCAGAAAGCTCCACTTTGCCGATGAAATGG--ACTCAACTCAATTACGGAAAGCCCTTTGTCACCCAGGCTGAGCA s monDom4.chr4 42225152 203 - 430141050 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s monDom4.chr4 42268059 946 - 430141050 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AAAAATTAGATTTTAATGACCAATGAAAGTCAGACAGTGGTGAGTGATGTATTTGCATAGCCAAGACAATGTAATCTTATCAGATTTAACTCTCCAGTCTGAGGCAGATGTTTGGAATCCATTTATAGGAAGGGCTTGATTGAAACTGCCTTCCTCTGATTACATTCTGTTATCTGTGTGGTTGAATTAATTTTACAGTTGTCTGAATTATTGATATAGTTTGTGTGCAGCATTTTGGAAATTTGGGAGGAGTAACTGAGACATAAGAGAGTTAACTGGAAAGCCCTACTGGTTCTTGTAAAACTGCTGCAGCAGCAAGCCTGGCACCCAGTGGTTTAGCCTAAAGGGAGACAAAAGCAAAATCGTGAATAAATGATTCCTTATTAAATTCCAGAGATTAGCTAAAGAAGTTTGGTGCCTATGTTTTGGAAGGGTCAGCATTTCTCTCTTCCATATTAACTTTAAACATGAGCAGAATCATTTGCATCTTCTTCCTCTTTTTTAATTAGGCCTTAAAATATACAATGCGGCCTGAAAAAAGAAATCAGGGTCTTGCCTAGAGAAGCAGGGGTGTTGTGTCAGTGACAGCTAAGTCAGCTTTGG a score=7007 s mm8.chr4 150796581 143 + 155029701 GGACTGAGGGGAAA---TTCATGTTGTACATTGTTTGATTTTTCTTTTTTTTTTCCATTGCAGTGCTTAGTGATCCCCAAACAAGAGCTATCTATGATATATACGGGAAGAGAGGCCTGGAGATGGAAGGATGGGAGGTAAGAGAA s monDom4.chr4 43464004 141 - 430141050 GAATTGACAGGAAAACATAAATCTTATACTTTGTGAACACTTGCCTTTTACTTT-----GCAGTTCTCAGTGATCCCCAAACCAGGGCCATCTATGATATATATGGGAGAAAAGGACTGGAAATGGAAGGATGGGAGGTAAGAGAA a score=2504 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CTTCCGTTCACTTGCTACCAGCAACTGTCTTCTCTTAGGCGCCCTTGACAGCCACAGACACAGCCATCCTCTCTGGAAGTCTCTCCACCCAGAATGGCAACGGCGGCGGCTCCGTTAACTTTGCACTCCGACGTGTCACCTCTGCAAAGGGATGGGGAGAGGTGAGAGCAGCTG s monDom4.chr4 43502540 174 - 430141050 CTTCAATATCTTCAATACCAGCAAATGTTGTTTCCTAGGCACCCTTGACAGCAACAGACACAGCCATCCTCTCTGGAAGCCTCTCAACCCAGAACGGGAATGGAGGAGGTTCCATTAACTTTGCCCTTCGGCGAGTGACCTCTGCAAAGGGATGGGGAGAGGTAAGAGTAGTTG a score=5545 s mm8.chr4 150814313 473 + 155029701 CAGGCAGCC----AGGACAGACAGGATGGACGCACCAGGGAGACCTTCCTGTTATAGGAGCCAGCACTACAGGGAGCCGTGTGGAGTTACACAGCTGCC-CACAGCAGAGGGTGTGGACCAGCA-----GTCTCCTTTCCCTCTGACCTGAGCCAAGGGAGGTCAGAATGCAGGACTCACTTGTCTACAGTCGGGGCTCCCTGTGGATCTGGGGCAGAGAGAAAACTGAAACATTAGGGGTCTGTCCAGCCCTTGTCCAGAGCCTGGCCAGGTGCAGGCCAAGCCCCGGGCCTCTGCTATAGGAGCAACAACA-GCAATGAATGCTTTCTTTCTCTGTTTATTTTTC--------CAAACAGTTGGAGTTTGGAGCTGGAGACCTCCAGGGGCCTTTATTTGGTCTCAAGCTGTTCCGTAATCTCACCCCAAGATGGTAAATATGC-ACGATAACTCCTGTCTGTGCTGTGTTAACTTAGGATGTTAGAGATG s monDom4.chr4 43503332 455 - 430141050 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GGTATCCCCCACTCGTTTGCGTTGATCAGCTATCAACATAAATTCCAAGATGATGATCAGACGCGTGTGAAGGGTTCCCTCAAGTAAGTCTTG------------------------GCCAGCTCATCGCTGCCTCCAGCAAAGAAGTGGGTTGGTTTAGTGCATTTTTTCTGGTTAAGATGGGCTGG-------------GGTGGGG------------------GCCGTGGCAGATAGGT----GTGATGGAG------CAGCTGTCATCGGCTCTGTGGTTGTTTGTATAACTA----GTTATGGGC--------------------------GGGAGAGAAGGTGGGCCA---TTGTCTGCTTCCCCCTCCCCATAATGAATGAAGATGAAGTGGCGCTGCGAAGTCTCTCCTAGTCTCATCCTCTCTGGTTTGGCTATTCTAGGACGGGTTTCTTTGGGACAGTGGTAGAATACGGAGCAGAGAGGAAGATTTCTAGGCACAGTATTTTAGGAGCTTCAGTCAGCATCGGCATCCCACAGGGTGTGTCTCTCAAAATCAAGTAAGT a score=11895 s mm8.chr4 150820723 190 + 155029701 TGGGGTTTGCTCTTGTGTCCTCGCAGGCTGAACAGGGCCAGTCAGACCTACTTCTTCCCCATCCACCTGACGGATCAGCTGCTCCCCAGCGCTGTGTTCTACGCCACCGTGGGGCCGCTGGTCGTCTACTTGGCAGTGCACAGGCTGATCATCAGACCGTACCTCAGGGCTCAGAAAGAGAAGTGAGTTT s monDom4.chr4 43507859 190 - 430141050 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monDom4.chr4 43509512 353 - 430141050 CTAGCATCTTGGTTCATTGGCAGGTTCGGCTGATGCAGGAATCCGTTCGCAGAATAATCGAAGCTGAAGAGTCCAGAATGGGTAA------AGGCCCCCGTCAGCTT----------------------TCTCGGGTCTCCAGGGGAGAGGGCGGGCTCCAGGGCCACTTCTTTGGTCTGTAACTGCATGCGCT--CCCCAGGACTGATCATCCTGAACGCCTGGTATGGCAAGTTTGTCAATGACAAGAGCAGGAAGAATGAGAAGGCCAAAGTGATCGATGTGACCGTCCCCCTACAGTGCCTGGTAAAGGACTCCAAGCTCATCCTCACAGAGGCCTCCAAGGTA------CTGGCTTCCT-GGCGCCTCACAGCCAGAGTCCAGGT a score=7910 s mm8.chr4 150823684 273 + 155029701 CAGGGCTGACC-----TGACCCTCTGTTTTGTGTG------CAGGCAGGGCTGCCGGGGTTCTATGATCCATGTGTCGGGGAGGAGAAGAGCCTGCGAGTGCTGTACCAGTTCCGAGGTGTGCTCCACCAGGTTATGGTGCCTGACAGTGAGGCCCTGAGGATACCAAAGCAGTGTGAGTAACTGCCTCTCGCTCTCCCTTCCCTGTGCAGGCAGGTTCATCAGTGACAGCTAC-TGGGGTCCTAAAGACCCAGAGATGCTTT-------GGCCCAGGGACTTGCCTAGAGC s monDom4.chr4 43510342 285 - 430141050 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CCCAGAGCTGAGCAGGATGTCACAGAAATAGAAACATTTTCTTATCAACCCTAAGCCTG------TCTTTCCTCCTACAGCTCACAGGATTGATACAGATGGATAAATCTTGTGGGAAAACAAGGGGTCAGTACCCGAGT--CAAGACGCTGCAAAACCTCTTTTCCTGGGAGTCTGCAAGTTTGAAAACACATGAAACAGAAACCTCCAGATGTTTTTATTTTGTATTATTCCCGTAGAAGGTCATTTACCAATTATGGGAAGGGGCACATGAACACGCCAGCTTTCACAGGTACTGTAGTACTTTGGCAATACTGCCCTCCCCTAGAACTGCAGAGCTGACTGATGGCTGTTTCCTCAAGGAGCCTGGGGGCCCAGATTGTGGCCCTGCTGGGAAAAGGGCCACAGGGGGCCCAGAGCCCTGAGGCCTTCTGTCATATCCTCCAGCATCTGAGCTGACAGTGACCCATCCATCCCAAATGGTTCTTTCATGAGGTATCTACGGAACATCATGCCCTCCCCCTTAGTTCTGGGGACTTCCCGCAAACCAAGT--------GGAGCCATGGTGTGGCCCCCATGACCGAGAGACTGG--GCGTCCTCCCCATCCGAGCTTCCTCCCACCAA-CATCCTTGTCTTGTGATGATTTACTGAAAAGTAGATTTGGAGACCTTCTGAATTTACCAAA-TGCTTGTTACTTGAGAACAATGTATCTGGAAGCTATCTCTGCCTCTCCACTGCTTTA a score=7097 s mm8.chr4 150826796 763 + 155029701 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s monDom4.chr4 43531582 1021 - 430141050 ggaaaaaaaaT--------TGTTTTTTACATCGTGCAAAATGGGAACTTGTATCAAGGATGCAGGCC--------------CCTCATCCA--------------AGAGATCGTCCCGGCTCTGCCCCAACAGAAGCAGCTCCGGGAG--GGTGTGAGCACGGCCAGGACCA-----GGGGTCACTGGCCCAGCACCCC-CTCCACAGCGAGC----CCGGGCCGGGGAAGGGCAACATCA--------------------GGCTAGCTCTACAGACACTTACGGTAAA-GACGGACACTCGGGA---------AGCGGAACACGTATGGCTGTCCCCTCGGGAATCCTCGGGGCCGCAGAAGCCTCCTCCCACCCTCACCCCCAGCCTGCCCCAGCTGTCCAGAGCGCTCCCGCCCACGCGCCCTCCCCCGGCTCCCCGCTGCGGCGGCGTGAGTGCGCCCTGGCTGCC----------GGAGCGAGGCCGG--CAGCGGCTTTGGCCAACAAAGATTCGCCGTCGTCACTGGCTATGTACAGTTTGGATGTACCCGGGACAACCCGTCCTTCTGCTTAGGCACCTCGATGTCAGAAGGGCAATGGCTGCACC-----TTGCAGTTCTGTGCTCGGATTCGGGAAAAGTGACCCCAAAGAGGAGCGGCCCTTCCGGCTCTCTCTCTGAAGTCGGCTCCCGCGCCAG-TCAGTCCAGAAAGAGCTTCCGGGAGCCCATGCGGGAGCGGTTGGACCGGCGGATGTCGAACTTGGAGTCCCGGCACTTTTGGCAAACAAACACTTCGGGGACGTTGGATTTCCGGATCTTTGCGCAGGACAGGTGGATCCAGGTGTGGCACTCGTTACATTCAATCATCGGCCGCCCCGCAAAAGGCTTCATGCAGAAGCAGGTGACGAGATCCCAGGAATCGTCATCTACGGCAACAGAAACAAGTGAGGACGGGCCGAAAGGAGGACCCCCCCATCCCTTT---CCTAGCCGTCCGTCCAGACCTCGGCCCTGACGGGCGAGGGACCGGATGGGGTGGGGCACAAGCTGGCCTGACTGTCCCCCCCCCGCCCCCCCTCCAGCTAGTGTGCTCTCCCCTGGTCCCTCTTGAG 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AGGGAGGGCGGGAGCGTCGCGAGGTTCGT---CGGGAAATGTAGTCCGGGTTGACT--GGACTTCGTCATGTGGGGGTGTGGCCCGCTCGGCGC-GCTGCCTTCTGGGAGTGGTAGTCCCTAGCGTTGCGCCCCGGC--GTCTAGAGACTATCTCAGAACTCCAACTCCCAAGA-----------GGCTCTGCGGCAGCG-----CACGAATGCGGAGGCGGTGCTGACAGGATTCCGGAGCTTCAGAGC---GGGGGAGGTGCGGGGGCT--CCCACCGCCCAGCTGGTGGGGGAGGGGCGGCAGCCCG---CGGGCTCCGCG----GGGCGGGGTCGAGCAGCGGCCTGGGTCTCGGAGG------GCGGCGGCCCGGGCTCCGCTTTCTCCCGTGGGGCCTCAG----CTTCGGCCTTTGTGGGGCGGGGGTGTCCGGGCTGCTGGAGCAGGATGGGGG s monDom4.chr4 43536605 442 - 430141050 AGAGAAGCCCTGGGGGTCGGGGAGCTTCTTTGCGGGAGAAGGGGCC---ACTGACTCCGGGCGCCAAGGAGCCCAAAAGGGGCGAGCGCGACGCAGCCTCCCTC-------------CCCTCCCCCACCGCCCCGGCTGGCCCAGGG---ATCCCGGGAC-CCGCCCCCGGGGACAGAGGGGCGGGGAGCTGGGGGAGGGGGTATCGAGACTGGGGGGGAGGGACTCCCGAGACTGGGGAGAAAAGGGGTGCGGGGGGGGGTGCCGGGGGCAAACCCCCGGGAAGCTGGGGGAGGCCGGACGCAGGACAGAATCGAGAACCGAGCGGCGGGCGGGAGAGAAAAGGGATCGAGTCCAGGgaggagaggagaggagagaagggaagagATGGAACCCTGGGGGCAACAGGGGTCTGAGACTGGGGAAATAAGCAGGTGATCGAGCGGGGGGAGGGGGGAGGGGG a score=892 s mm8.chr4 150840426 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GGGGGTGGCCGCCTCCCCAGGAG-----TGCCGGAGGGCTGGCGCCCTCGCCCCCACCCTGCTCT--------GATGCGTCAAGAAGTTCGTTTCCAAAGTCAAAGCCGGGGGTGGCAGAGGGGGAGGG-AGAGGGAGAGCTCCTTCTTCCTTCCTGTGGTGCCTACCTGGGCCTTGTTGGACTGAACTTAGCCATGGTCAGTCTCATTTCTTACTCCAAGGTTAGCTCCCCAGGGCCCCTGTTCTAATTAAGCAGGACCTACCGAACCGGCCCCCTCTGGCTCTCCTCCCGCCCGCCCCCTCACAGAACCCTTATTGTT-TCCCTAATTGGCTTATAGAT--------GACTAGGGCTGAGTGTGGGAGCCCTGCCTCGCCCAGCC-----CAGCCCCTGCTCTGTTTTAGGGTCTGGGGGGGCCCCCAAA---AAATTTTTATTccccctcccccccccccccccccccccGGGCTCTGAGCAGGAAATATTTTCTGCAGGGCCTTTGAGTCAGGCACCTTGCTTGCATTTGATATAGGCTCGAAGTCACGTGGTGTGTGGGCTGCCCTTCCCAGCGAGTGTAAACAGAGTCACATGGTAACTGATTTTCTTCCCGGGAACTTGGCTGGGAACCCAAGGCAGTGCCGAGTCACTCCCGGTGGGTCGGGGCCAACCCAGGTCTCAGGGTCCT-----ATTTTTGTCA a score=27728 s mm8.chr4 150855829 719 + 155029701 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TCTTGTCCCCTTGGGGCACCACCCCAGCACCCTTAGA-CAGCACCTCATTACTACCAGCCTGTAGCAGGACCCCTCCTGCCTTCAAGGGCCTCTGGGGGTCTTTACAGTCCTGAAGGTCTTTGTCTTCAGGGCTGGCTGGGATGCTACTGGGCTTCAGTGCTTGCTGGAATCTTTCCTGGGGAGAGGAAGGGCTCTCACTCTGTCCAAGGGGACTAGGTTTGGCCCCATGAGGGCTCTGGGGAGAGCAGGGCTGCTGAACACTAATGCCCGTGTAGAAAACTCTGACCACTTCTTCCTCTTCAGAGTCAGGTGGCCACTTCAGGTGGCTATTCAAATCCTCAGGGATGGATGTCTCTGGGCTGGCCAGCTCCTGTCCCACAAAGTCCTCTGGTTTGAAGCTTTGGCATAGCTCTACAACCTCAGGTACATGAAGCTCTCTAGCTGCCAGGAGCACCTTATCCCGGTTCCCTGCAGTGAGGGCAAGGTGGCCCGTGTAGAAAAAGTCCAGCAAGAGGCCAAAGATCTCAGCAAAACCAGCAGGAAGGCTCACGCTGCCCACCGTGCCATCCCCATAGAGGCTTTGGAAAAAGTGGCTGCAACAGGCAAGGACACTCCAGTGGGCCTTGAATACCAAGCCCCCCACATCCAGGGTGGCATCGCAGTACTGACCCTTCTCCCGCTGTTTGTTGAGCTCCTGCAACACTCGCACACTGTGTTGAACAAAAGAGCCATCCATCATCTGCAGAGAGGAGAGGTAGGAGTGATACCTTTGTT a score=1196 s mm8.chr4 150870970 663 + 155029701 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GGATCATGCCCATCAGCCAGAAGACAAATGTATGCAAACA--CAGCATACACAAATGCACCTGATTTGTTTAAAATGCCAATCCTGGAGGGTTTTGGTTTTTTGTTTTATCTGCAGGAAGGAAAAAAAAAATCCCAGGTGGA----TTTCCTGAGAGGTGGCCTGGTGG---TTAAATCCAGGAGGTTTGGCTCTCCTGTCTCCAACCCGGCAGGGTGGGCTTTTGCATAATGTAAATAGGGCTCTGGGTGGGACCTCCAAGCTTCTCTCCGG-GCAACTGAGGGCTGAAGTCACCGATGATGCGCTGCAGACGCCGGCCGGGAGGGGGCGCCAGCCGCCCCGCTGCTCTTCCGCTGGGGGCGG-GGTGACGCGGTCTCGCGAGATCGTCCCGCCGGAGGGGTTCCGGGACAAGCATGGCGGAGTCGGAGGTGTTACACC--GGCGGGCTCCGAGCCGCTCTTCCTGGCTGCGGGTACGCAAAGCCCGGCCCCACCTCCTCCTCAGCCGCCGGGGCCGCCGTCGGTTTGGGGTCCTGACCCGAGTCGAGCTGCGACGCCTGCGACGGCGGCTGCTGCGGGCACACGCGTTAGGCGGGGACTGG s monDom4.chr4 43577663 503 - 430141050 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monDom4.chr4 43581029 333 - 430141050 TTGTTCTTTTTCCCTGCTAGTCTTTCTCCTTCATTGGGAAATGTCGGCTTACCTGTCTCTATGGCCGAGTGCAAGTATTTGGTTTTATCATCAGCCAGGGCCAGCCGGCCTATGACCTTTACTCACCCCACACCAACTGTGCCCTGACTTTTGAAGCAATTAGCTACTTGATGCCAGAGAAAACCATAAAGGATATGAAGTTCGAAGTCCGGTCTTTGATCAAAGATCATATTTCTTCAGGTAACTAAAAAATCTAGATAGTGACCACTGTTCATGCCTCATat-atattaagcatataatatattcaggacattgtgct-agcccccatgggag a score=1856 s mm8.chr4 150885295 195 + 155029701 TGTCTTGCTCTTCTTTGGCAGATGACAGAAACTGGGTGGTGCGGTACTTCCCTCCTCTGGGCTCCATTATGATTCTGGAACGGATGCAGTCTCGTTTTGTGGACTTC--CTGAAGACCTATAAGTGCTCCTCATACGTGCTCCTGCAGGAGGTAAAGCCAGTGTTCCTTGATGCTTTGTGCCAGAGCAGTCACCCCT s monDom4.chr4 43582993 186 - 430141050 TTTTTTGTTCTTTTT--GCAGCCAATGCATTTCCCATGATGAAGCAGTTTTCTCCAATGTGTTCCATCGTCATGCTGCAACGTCTGGAGACCCCTGCTATGGACTTCGTCCTCAGTTATCCAGCTTTTTCTCACCTTTTCTC--------AGGAAAGGTAGTA-TCCTTCATGTCCTTTGTAGAATTGATCCCATCT a score=6861 s mm8.chr4 150890312 142 + 155029701 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Tttttttttaattaatattttttattacatattttcctcaattacatttccaatgctatcccaaaagtcc----------------cccataccctcccccccC-------------------CAATCTCAGATATCTTGACAGTCGC-----AACCCAAATGATCGGGAGGGTGGCCTTCTCCAGATCTC-------CTTGTTCCTATCGATAAGATGAAGAAGTTG-----CTCGCCTGGTTGCTCACCCTCCCTGACTGTC-----------TCCACACTCCCTCGGCTGGCTACTGGCTAACCTGTACCACCCTCCCT-CTAGAAGCTGACCAGGCGGCAGTGCCACCAACAGGAGGCAGTGTGGGAACTCCTCCACACAGAAGTCTCCTACATCCGGAAACTACGTGTGATCACCAACGTGAGTGTGGGAACCCAGGG s monDom4.chr4 43708619 417 - 430141050 TTTTAttttatttttttagattttttgaaaattttatttaatta-atttagaatatttttccatggatacaagattcatgttctttcccttcccccccccccccatagctgattcccatagtgcaattccactgagttttacatgtgtcattTAGTCTAAATGTCCA------CAGTTCTTTCAAAGTCTATATCCAACTTCCTTTTACTAGAAATGCGTAGAACCTGGATTCTTCGGGTCATCCTTTACTCCCTCTACCAGGCAGGAGTGAGAGTCCTCAATTCCTC-------------------TCTTCCATCCTCCTTTCCAGGATCTGACCCGGAGGCAGTGTCATCAGCAGGAGGCAGTGTGGGAACTGCTCCATACAGAGGCTTCCTATATCAAGAAACTTCGAGTAATTACCGATGTAAGTGTGTGTGTGCCGGG a score=4645 s mm8.chr4 150951246 92 + 155029701 TCCCCCCACAGCTGTTCCTGTGTTGTCTTCTTAACCTACAAGAGTCGGGGCTCCTGTGTGAGGTGCGACCTGGCCTGGGGCGGCGGCGGGGG s monDom4.chr4 43710352 89 - 430141050 TTTTCCCACAGCTCTTCATGTGCTGTCTTTTGAACCTGCAGGAGTCTGGGCTCCTGTGTGAGGTGAGA---GGGTCAGTGGGGAGACAGGGG a score=6350 s mm8.chr4 150951389 371 + 155029701 CTAAGTACCTGGCCTGGAGTGGCAGCG-GCAGCGGTGGGGGAGGTACGGGCTTGAGCGGGGCTAAATAGGAGGAGTGAGTGGGTGGGCCAGGGTGGAGCCAACCCACACTTGTGTACGCCC---AGGTTGAGGCTGAGCGCTTGTTCAGCAACATTCCTGAGATCGCCAAGCTACACCGCGGCTTGTGGGGCAGCGTGATGGTGCCAGTGCTGGAGAAGGCGCGGCGGACGCGGGCGCTGCTGCAGCCCAGCGACTTTCTCAAAGGCTTCAAGATGGTATGAGCAAAGAAGC-----GGGAAAACTCCCAGGGCTG--GAAAGGCTTCCTCGCTTGGGTGGTGTGGGAAGCGCCTGGAATCTGGAGGTAAC-AGGTGCTGTTG s monDom4.chr4 43710855 367 - 430141050 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TGGAGTACATGCGCGGCCTGCTGCGTGACAACGATCTGTTCCGGGCATACGTCACGGTGAGGGCCTGGATGC-AGGACTG------GGCGGCACAGCTGGGTGGGCGGGTCCTAAAAGGGGCGTGGTTAGGACTGAGCTCCACTCCATTCCCCTTA--GTGGGCGGAGAAGCACCAGCAGTGCCAGCGGCTGAAGCTGAGTGACATGCTGGCCAAGCCCCACCAGCGGCTCACCAAATACCCACTGCTGCTCAAGTCGGTGCTAAGGAAGACAGATGATCCCCGCACCAAGGAAGCCATCGTCACCATGGTAACCTGAATGTGAGCAGAATGTCCTAGGCTCCATCTCTCCCAGATCCTAAGCCCCATCACCT s monDom4.chr4 43711620 347 - 430141050 TGGGGGCGAAgtgatggctgatgggtga-ggctatgggtgatgACTAACTGTAATGGAGGGAGCCAAAGTGTGATGACTGATAGTGGGGGAAGGAAGTAGGGGAGAGGGTGCTGGGAAGGGTCC-------------CCCAACCCTGTCTTGGTTACAGTGGGCGGAGAAGCACCAGCAGTGCCAGAGGCTGAAGCTGAGCGACATGCTGGCCAAACCTCATCAGAGGCTCACAAAATACCCGCTGCTGCTGAAATCAGTGCTGAAGAAGACTGATGACCCACCAACCAAGGAGGCCATTGTCACCATGGTAACCGG---GCAGGAAGGAAGGGAGGGGC---------CCCAGATACGCATACCCACAACCT a score=7954 s mm8.chr4 150952199 165 + 155029701 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TTGGTCTTACCATGTTCTCCACTGTGCGCAGGTAGCGGGTGCAATGACTGTGGCCATTGTAGTCCGAGAGATCTGCGGCTGTGTAGCCCTCCCGGTCCCGGATGTCCAGCTCTGCTCCGTTCACTACCAGGATCTGGCAGCACTG--AGGGGAAGAACGATCGGGGCAGTGAGGGGGGCACCGTGGGGCCAGGGGAGCTCATGCCACTTCCCGACACAACAGA a score=24883 s mm8.chr4 150982448 747 + 155029701 AGAGGGCGACAGCGTCCCAGTCTCCGGCC-CCGCCCCAACCACGCCTTCGCCCACTTTCCAGCCCCGCCCCTCTCGGGCC-GCCCTGACCTCCAGTTCCCCGTTCTCAGCAGCGTCATGCAGCGGGGTTCCGCCCCACAGGTCCTGCGAGATCTCTGCCCCGTGCAGCAGGAGCCAGCTGAGCACTTTGGTGTGGCCGCGACTGGCAGCAAAGTGCATGGCCGTGGCGCCGTCGTGGTCCTGCTCTGAAAAGCTAACGTCTGCAAAGCTCACCTG---TAGGGAGGGGCGGGGCAGAGGGCGGGGCTTGCGCTGGGTCCCCCTCCTGGCCCCGCCTCAGTCCCAGCAGGCCCCGCCCACTCCCAGGGCTGTACCGCCCTGTGGTCCTCAGCTCACCAGCCACACCAAGACTGGGTTGTGGCCCATCTGTGCTGCGGCATGTAGGGGTGTCATGCCGTCTTGGGCGCGCAGGTGCGGATCTGCACTGCACTCCTGCACAAGGTACTTCGTCACTTCCAGGTGGCCCTCCTGGCACGCCAGGTACAGGGGCGTGGCACCGTTGTTGGTTTGGGCATTCACTCCCCTGTGAATAGGCAACACCCAGTGTGGGCTCTAGATG--------CCCGCTGCACTCTCGTCAAAAAACTCCTTCAACCTTTAGCTT-----GGCTCTCTGGAGTGCTGAAAGTGGCAGGTAACAAAGAGGCTTTGTCACAGGTT-------------GTCCGAGATCTTTGGCTCAGTTCTATAATGCTGTCCCTC s monDom4.chr4 43756418 734 - 430141050 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AGGGAGCCCTTCTCTTTTCTGGG------GTTTGCTTTAGGATCAGAGGATTTGGGGTGCAGTTAAAGATATCAGGCACTAGATGGGGGTGTAGCCTAGATCCAA a score=11486 s mm8.chr4 150992650 214 + 155029701 GTCCTTACTCAGGGTAATGCCCGACCAGAAGCTTCAGCGAGGGGAGGTCTCCTTTGGCGGCAGCGTAGTGGATAGGCAGGGCGCCCGTGTCTGTGGTGATGGCCGAATTTGCACCGCCCTGGTACAGCAGCCACTTCACCACATCCGGGTGGCCAAAGCGGGCAGCCAGATGCAGGACTGTGGCACCAGAGTTATCTTTTTCCTGTGGAGGAGA s monDom4.chr4 43784020 214 - 430141050 GTTCTTACTTTGGATAGTGCCTTGCGAGAAGTCGAAGTGAGGGGAAGTCTCCCTTGGCGGCAGCATAGTGGATGGGCAGGGCTCCGGTGTCTGTGGCTGAGGAAGGATCGCTCTCTCCATAGCGAAGTAGCCAGTCCACTATCTCAGGGTGACCAAACCGGGCAGCCAGATGTAGGACCGTGGCACCAGAATTGTCTTTGTCCTATGCAGGAAA a score=16948 s mm8.chr4 150995693 604 + 155029701 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GCCTCTTAG-GCCCACTCACCTCCACTCCACAGCCTCCCTGTGTGAGCAGCCACTGCAGACAGGCCAGGTGGCCGGTGGCTGCAGCGTCGTGGGCCGGGGTGGCTCCGTTCCTGGCGCGGGCAGTGGCGGGCAGGTTCGCCTCCTCCACCAGGAATCGCAGGCAGTGCAGTTTGCCCGTCCGGGCTGCGTGGTGCACCGGCAGAGCATCCAGCGAGTCACGCAGAGTGGGCAGCAACGAGCCGGCCCGATGCAGCGCCTTCAGGGCCTCTAGGTCCCCCTGACGTGACGCCTGCAAAGCTTTCTCCAGGGCCATGGCG--GCCCTCAGCGTCCTGGGGGCGCCATCCGTTATATCTCCTAAGCCCGGACTGGCGCCCGGCTCGTGGGGCCGAGTCTCAG--GCTGCTGACCCCCGCAGCCCT----GGATTCCGGTCCCACTCCCACCCCCACCCCGG-----GGGGGCCTGGCTACTGTCCTTGTGCCCCAGAAAAGACTCCTTTCTCTACCTAACCTTGTCTCTGCCCCGGACTCCGAAAGGGTCCGCGCTGCGAGAACGC---AGCAGGGCTCTCCCCAGGAATTGAGGGAGATGGCTTGGACTGCCCAGGTGACCCCCTCTCTTCTCCCGCTCGTCCGCTGGGCCTCTGCCTCCGCCCTCTGTGGCC a score=3175 s mm8.chr4 150999848 84 + 155029701 TGAATATACTTTCTTTATTGAGGGGTGACAAACAAAAACAAAA-----AGAGCAAACATGTAAAAACCCAGGGTGCTAGAAATACAAAC s monDom4.chr4 85197637 85 - 430141050 TGGTTAGATGTCCTTTAT--AGAGGTAGCAAACCAAAACAAAATGAAAGGATCAAACATATAAAAACT--GGGCGTGAGAAATAGAAAC a score=1989 s mm8.chr4 151000483 26 + 155029701 TTCTCCTTGATTAGTAGCAGGTTAGG s monDom4.chr4 85198026 26 - 430141050 TTCTCCATGATTAGTAGTAAGTTAGG a score=6438 s mm8.chr4 151000745 150 + 155029701 AAGAGGTGGGGTGGAGACGGGGTGAAGACGAGGGAAGAGCTGTCCTAGGGCCCCTCTCTTCATGGGATCCCAAACTGTACAACCAGCTCTTCTTTCTCGTCCACGCAGATCTGAGAAAGTGCACTATAGGCATATGCAGCTATCTTAGAG s monDom4.chr4 85198065 146 - 430141050 AGGAAATAAAGGGAAAAGGAGGCAGGAACAAGGGAA-AGATCTCC---AGATATTATCCTCACGGGACCCCAAACTGCACGACCAACTCTTCTTTTGCGTCGACCCGGATCTGAGAAAGTGCACTATAGGCATAAGCAGATATTCTGGCA a score=8807 s mm8.chr4 151000895 129 + 155029701 ACCTGCTGCAAGTCAGAGAAGGGGATAGGCTCGCTGGCCAGCACTTGGTGGGGCTGGCTGGTGAGAGATGGCAGCGGTGGCAGCTTCTTCCAATGGGTCAGACTGCTGCTAAGCACAGCCAAGCGGGTA s monDom4.chr4 85198667 129 - 430141050 ACCTGCTGCAAATCTGCATAGGGGACAAGATCACTGGCAAGCACTTGGTGGGGTTGGCTGGTGAGTGATGGCAGTGGTGGCAGCTTCTTCCAGTAAGTCAAGCTACTGCTCAGGACAGCCAGGCGAGTA a score=3590 s mm8.chr4 151001024 48 + 155029701 CTGTACTGCCTTGCTCGGTCCGTGTACTCATGCTGTTCCATGCCCTGG s monDom4.chr4 85199234 48 - 430141050 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CCCCAGGGTTAAGGGAAGCAGTCCCTCTTCTGTGTGCACTGCCTCCTCCTGGGAGAAGACAAGGAGCATCATGGTCCGGTGGCAGGCCTGCCCTTCTGTCCTTTACTGGC-CATGTTACTG-GAGAGGCCCTCACATTCTGAACATCCCCTTTTCTTTTTGGGAATGGCATCGAGGCTGGACTTTTTGTTTTTGTTTTTGGCTATTTTTGCCTGTTGTACTTAGAGCCTCCTGACTTCAGCGCCCCCCAGAGCTGGATCTTATTTGTGATGTGTGAGCCCTTTCAGAGATCTCACG--GCTGCTCTGTTTTGCCTACAGGATAATGCTTCCAGATGATGCCAACGTTGCAGGCAATGTTCACGGAGGGACGATTTTGAAAATGATTGAAGAAGCTGGGGCTATCATTAGTACCCGACACTGTAACAGCAAGCATAGAGTAAGTAGTTTGTGTGTG-------TGTGTGTGTGGGGGGGTCACCTATCACCAGGCCT-TGCCCGC--TGCCCTGGGAAAGCTGGGCCCTCAGGCACGGTGCCTCAATGGCCTGGCTCTGGCCCTGGTGGCCAGTGTGCCCAGTCGCCTGGCCCCTGTGAGGAGGCTTCTGGAGCTTCCTTCCCAGCTCTCAGCCTCTCT a score=10398 s mm8.chr4 151061461 294 + 155029701 AGTTTTGCAGAGCATCTCTG--TCATAAGGACTTGCTGGGCTGGACTGGGCT-GATGGCTTTTTCTGGTCTTTGC---AGGAGCGCTGTGTGGCTGCCCTGGCACGGGTGGAGCGCACTGACTTCCTGTCACCCATGTGCATCGGCGAGGTGGCTCATGTCAGTGCAGAGATCACCTACACTTCCAAGCACTCTGTGGAGGTCCAGGTCCACGTGATGTCGGAGAACATCCTCACAGGTAACTAACTCCCAGGTGCTTCTCACCAGCCAGCACGCTCAGCGGTAGCATCTTTGAGCACGG s 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s monDom4.chr4 44122528 1365 - 430141050 cttttcctctcCATTTCAGATAGCCATCCGGGCCTGTTTTCTTGGCTTTGTCTTCGGATGTGGTTTGCTGCTAAGTTTTAGCCAGTCTTCTTGGAGTCACTTTGGCTGGTAAGCAATCTCTCTCTATGATTTGTTTTTT-CAGTGAGGGGGTAGGATGGGTTGGTGTGAATGGATCAGAAGTAGCCCTTCATTCTGCCTTTCAACCTCTTGATTATGGTATTTCATCTCTGACTTG--------CTGAAGGCTGTTCTGTACTCAATATCAATTAATTCACCTCCAGTTTCTGGTCAGATTCTTAGGTCTCAATCATTAGGATTAATCATCTTCATCTGGCCCTGTTGTTGGCAGGAGACAGTTCTGAATGAAAA----TCTCCCTGCA----------GGTGTCCCTTACCTG----TTCAGTGATGTGTATCATCCTGACCTGAATGGGAATCAGATC---AATGACATAAAAGTGAAAGGCTCTGTTTGGATTCATAGGCCTTTTCCATCTCTAATTTCTATTAGGTCACATCTAGTGCATCCCCCACGGGCCATTGTAGGATTTTCCCCTACAATATGATTTCAGTCCCTTGAGCCTTCTAGTCCATGACCTGGATTTGAACCAGTGACCTAAAGGTAAAAAGCTTTATATCCTCTTATCAATGCTATGAGCCATCTAAGCCTTCTTTACTGGAATTATGTTGCAGTTATGTTTGAACTTTATAACTGACATACATTGTATCTTTGTTTTATACGATTTCTCCTTTTTCATGCTTTCTCACATGC---AATGGCCATTTTTAAGAAGTCCAGGCAGTAT-TCAATACAGTAACCTA-----ATGTTTT---CTTGTTTATGGAATTGAAAAACA-----GTCCCAGTAAAA-------ATTCTTGCTATACAAAAAAGGTGTGATGCTGCAAGTG-----ATGACTGGCTTTG---GAATGGGTGACAGCAAAACATTTTGTTGACTCATTGAACAGATTCACAACTCAGCTCTGTATTTTGGTTCACTCTAGACTCTGCCATCTAGCTCTACTTTTCTTTTTTCTTTGTTT-TAGGTATATGTGCTCCTTGTCTTTATTCCATTACTCTGAGTATTTAGTGACAGCAGTCAATAATCCCAAAAGTCTCTCCCTGGACTCCTTTCTTCTGAACCATAGTCTGGAGTATACAGTAGCTGCTGTCTCTTCTTGGATAGAGTTCACAGTTGAAAATTATTTTTGGCCAGGTTGGTATGTATAGCTTTTCCCTCTGGGTATGAAAGTTTAAGAAGAATGGCATTTGACTATCTCTTGGGTATAGAGAC-----AGTTTTTCCCCCTGTTCAT---------CTAAAGTATTTAGGAAGGATAAAT----CTTTCTGCTGGATATCGTTCCTTGATTTTGAATCGAGGGCATAGTTACCAACCTTTT 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TCTCTTCTCACCTAGGCTCTAGTCGTTCCTTCACTTTGGCAATAGAGCGGACGTAAGGAGTGATCTGCTTGGTGATGTTGGTCAAGTAGTTGTTCTCCTGCCTCAGCTGGAACAAGTCATAGAGCTGGGCTGCCAAGAACAAGAGACCCTAAAGT-TCAGCTTTGGG a score=335 s mm8.chr4 151155473 93 + 155029701 ACTGGGCAAGAACAAGGGGGTGTGCGTGAACCGTTAGTGGCTGACTGGCCCCTCCCCTGCGCCCATGCAGATTAACAGTGAGCACCGCTGC--CA s monDom4.chrUn 107661796 89 + 174229318 ACTGGCCGCGTGCTCGCGGGCGTGTG---GCAGTTTTTTTCTGCCTGGCTCTTCCC--GCCCCCGCCAGAAAGCGCGGGGAG-ACTGCGGAAGCA a score=3876 s mm8.chr4 151155566 81 + 155029701 GGGACCTTCATAGATCTCCTGCTGGGTAGCTACTCGCTGGTAGGAGTCCTCCCAAATCTGAAAGAGAAGGGCGGAGTGCTG s monDom4.chr4 44136114 81 - 430141050 GGTACCTTCATAAATTTCTTGCTCATTTGCTACTCTCTGATAGGTTTCCTCCCATTTCTGAAAGAAAAAATGAGAGAGTTG a score=10215 s mm8.chr4 151155853 228 + 155029701 CTCCTAGGAGAGGT--TACCTCCTGGAAGATGGCTCTCCTGCCTTCCAAGGAGGCATACTCAGAAGCGATCTGCGTGTCCAGCAGCAGGGACCTGCGCAGGATATCCCCCATGATCTCCGCCTTGATGAGGGAGTGGTGCTTCGTGAGGTCTCGGTGCAGTTCCTGGACCTGGTCCTTCAGGTTCTGCACCTCCACCTGCAGACCCTGTGGCCAGAGATGGGAGGGGGCG s monDom4.chr4 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ctccctccccGGCTTACCTGGGTCGGACATTCCAGATCGCAGTTCGCACAGCGCACCGCCTCCTCGCCGTCCGAAGAGCCGTCCACCAGGAACTGCAGCAGCCGGTCCACAGGCGGCAGCCCATTGGCTCCCTTCACTACGGACGGGTGGCTGCGGGCATGGGAGAGGCTGAGGCCGGGTGGCCCCTCTCTGGCCCGAGTCCCCAGTTCCCTTCCTGTCACACTTTCTCACCAGGACCTAAATATAGTTGAGAGGCGCCGGGGAA--AGGGTCCGACACCTGCCTCTTGTTTTTTCTATTAATAGCCTCCA-----TTCCGAGGCCTCCTTTCTGCCCCAGCCCCCGGGCTGGAAGAATGTGTTCTCCTCTGGGGCTTCTAGCCTTCCTTTCCTCTCCCTCCCCTCCTAGTAC-----TAGTCCGCTCACTTCTTTGCACGACTGCTTTACCCTGGTC----------GGAATGATTGCAATA---GTCACTCAAC a score=10381 s mm8.chr4 151162062 387 + 155029701 CTTACTGGCACAGTGGACAGGACAGGCGGCCATCGGTGGCCCGGCCACGCAAGCAGCCAGTGCAGAAGTCGTGGAAACAGTCCAGCAGGCACGGGCGCTCGTACTGTCCGTGGCACAGCGGACACACAAGTGGATGGCCACTCGCAGCATCCAGGGCACTTAGGCCCTCCAGAGGCGCAAAAATTGCTCCAGACATTTATATGGAAGAACAAGACAAACAGGACAAAGGCTGAGATTCCTGGAACCCTGTTACGTCCCTCTTACCTGG---CTCTCCTGGATAAGGCTTAGCCAATGGCTTTGGGATGCTAGAATGCGAAGCCCCTAGAGGCCCAGCAGGGA--CAACAATGGGA-GTCCCTCTGCTCTGGCTCTGCGGGGGAGTGGTTAGCC s monDom4.chr4 44147369 367 - 430141050 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s monDom4.chr4 44179153 1233 - 430141050 CCCAGCCTGACTCTGGTACCCCTTCCTCCTCTCGTT-----TCCCTCTCCGTGGCCTTG---GAGGGGTGCACAGCCG---ACTGGCTGAGGACTCCCGAAGCCTCCGAGGCCACCACGGAACTACA---CGCTGGGCCTCGAGACGCCCCTCCAACCAGGCCCGGGCCTCAATAGCTTTCTTGGGCCCGACCCCCTCCGAGACCTCCCCGGAGTCCCAGGCTCTCTCCAGACTGGTCTCCCCAAGTTGGTCCCGGGTGCGAACTCCTGGCGCTGCCGGAACGATGGGATGCGGTTGCCACGGCAACCAGACTGGACGTCACAATCCGGGCATGTGTGCCCCCACCCCACCCCCCACCCCGCCCCCccgccgtgccgccggcgctgccgccgccgccgccTCCCTCCCTCTGCCGGCGGGCGGCTGCGGGACTCCGGCTGGGCTGCGGGGCGCGGGTGGGCGGAGCGCTCCGGAGTGGAGGAACCAGGGCGCTCCCGGGGTTTTTCGGGGAGCTTAGCGAAGCGGACGGGAGGAGGAGGGAGGTCGGGGCCCGGGGCTG-AGATTTGGGGGGCGGGGGGGTACGGGTAGCCGCCATCTTCTCGCCAAGCCGGCCTCGCCCGCCGCGCCCGCAGCTCCGGCAGCGCACGGGTTAAGCCTGGCACCGCGCCCCGCGGG-GGGGGACTCCCACCTCCCCTCCCCTCCCCCCCCGTGCCGGGCATGCGGGGCCCGCTGGGCACAGAGGAGGAGCCGCTGCAGCTGCCCGAGGAGGAGGAAGAGGAGATGGAGAACGACGAGGACATGTCAGGTGAGCGGGAAGCACCCGTGGTGCACGGGCGCAAGGCACAGGGATGGTGAGCGGGAGGAGGAAAAAGCTGGGCACGGGCCCTGGGGCAGAGGCAGCGCTCGAGATCCGCTTGCGGGAGGAGGGAGAAGAGGAAGGGTAGCGGGCACAGGCTGGGCAGGGCAGGAGAGGGATCTGCGCCAGGTTGTCATGGAGGGGTGGTTGGGGAGG-TTGCAGAAGGATCTGGGCCCCGGCTCGGGAGGGGGCGAGATGGACAGCCCTCTAGACTAGGGGCACTGGGTACTGGGGAGACTGCGTGCGCCTAGGGTAGCGGGGGTGGGGGGAGTGATTGCATCGGCTGGAGGCTGGGCACCGGGAGGGCCCAGGAGGGGGGCGGCGTGGGCAGCGCCCTAGTTGCCCTCTGTGCTGGAGGGGGCTGGGCCGCCTTTT--CTAGGTCTCTCTGGGT a score=1818 s mm8.chr4 151195303 152 + 155029701 CTGCCTGCTGGGTTCCAGCTCTGCCCACTGCCCTCCTACCCAGCTCTGGAGTGTGTCTTGGCTGAGTCCTGTCCAGGCCA-------GGCTTTCGGCTTTAGCAAGC--------------------CCCGCCCCTTATCCGTGCTTTGCACAGGCTGTTGCTGCTTCTGCTAGACATC s monDom4.chr2 281163106 175 + 541556283 CCGCCTGCTTGCTTGCTCCCCCACTCCCTCCCTCCCTGCCCGCCCCGGGCTTGAGGCTGGGCAG----CTTTCCGGGCCGGTGGGCCGACCTGCTGGCCGAGCGGGCCTTGACTCCCCTCCCCCAGGCCAGCCCCCTCCCCCCGCTCTGGGAGGGAGCCTGCGGCCGCGGCTGAACGCC a score=6654 s mm8.chr4 151196691 262 + 155029701 GCCTGCCCCTGCAGACCC---CAGTGGGAGAGGACAGGGCTCTGCTGTTCTCTTGCCTCC------------AAACTGGGCAAACCATTTCCTTCCAGGGACGGTATCTTGCTG-------------------------GTGGGTATGCTATGACTGTAAACACCCTCATCTCCATATAAATGGGCCATTTTCTGCCTGTACAGACAGGAAACACAATC----CAGTCAATTTTAAGAGCTGCCTGATTTACCTTTTTCTATGGTTGAGGTGGAGTGGCCAGCCTGGAGACAGGCTTGTACCGTGG s monDom4.chr4 44242743 295 - 430141050 GCCTTCGCACCCATACCCAGTCTGGGGGAGTGGGGAGGA--------GCACCTTGCCTCCTGAGTGTGAAGAGAGATGAGTAAAAATCTCCCTCCAAGGGCTAGCATCGTGTTGTGTTGTTTGTTGGTTCTTTTCCCCAGTGGGGATACCGTGGTTTTAAGCACCCTTATCTACATATAAATGTGCCATTTTCTGCCTGTACAGACAGGAAACTAAATCAAGGAAGCCAAGCTTAAGAGTTACCTAAATTACCTTGTCT--TGGATG-GGTGGGGGGTCAGGAAGGGGGGGGGGCTTCCGCCACAG a score=10908 s mm8.chr4 151197331 201 + 155029701 CTTTTCCAGGGGAGCAATGACGAGATGTCAGACAACGAGGAGGACCTGGAAGAGAAGTCAGAGAGCGAAGGTAGCGACTACTCCCCCACCaagaagaagaagaagaaactgaaggagaagaaggagaagaaggagaagaaggagaagcggaaaaagaGGGGTGAGGATGAAGATGATAACGACGACGGAGGCTTGAAGGTA s monDom4.chr4 44244256 192 - 430141050 CTCTTCTAGGGGAGTAACGATGAGCTGTCTGATAATGAAGAGGAGATGGAAGAGAAATCAGACAGTGAGGGAAGCGACTATTCTCCTaataaaaagaagaagaagaagct---------caaagagaagaaagagaaaaaatccaagcggaaaaagaaggatgaagaggaggatgagaatgaagatggagGTTTAAAGGTA a score=1972 s mm8.chr4 151197762 55 + 155029701 ATAGTGTGCACTCAAGTTTGGTGTTGGGAACCTCTTGCTTGGAGCAATTTGGGGA s monDom4.chr4 44245945 55 - 430141050 ATGGTGACAGCTCAAATTATAATCAGGGAACCCCCTGCTTGGGACCATTTGGGTA a score=9243 s mm8.chr4 151199753 252 + 155029701 CACTGTCCCAGGGGAGGGTGAGAGCTGTTGTTAGCTTGCAGACTGCCCCTTTCTTACTCTCTCAGAGCAAGGAGGTGGGTCAGAAGGGC-----CCGTGCGTCTGACCCCACCTCTGGCCATGTCTCTGCAGGAGCCCAAGTCCTCGGGACAACTCATGGCGGAGTGGGGGCTGGACGACGTGGACTACCTGTTTTCTGAGGATGACTACCACACACTGACCAACTACAAAGCCTTCAGCCAGTTCCTCAGGTGGGC s monDom4.chr4 44247426 254 - 430141050 CAGTTTTCTTGGAGCTTGAGAGAGATCTT-TTCTTTTAAAGAACACATCTATAAATCCCTCTCCCCACAAAAAACTGCCTTAGGGGGGAAATGGCAGCGTGTCT--CCCTATCTTTTCTTTGGCCTCTGTAGGAGCCCAAGTCTTCGGGCCAGCTCATGGAGGAATGGGGCTTGGATGATGTGGATTATCTGTTCTCTGAAGAAGATTATCACACTTTGACCAACTACAAGGCCTTCAGCCAATTTCTCAGGTAAGC a score=437 s mm8.chr4 151200006 8 + 155029701 AGGGGCTG s monDom4.chr2 281169588 8 + 541556283 AAGGGATG a score=358 s mm8.chr4 151200189 83 + 155029701 GGCCCCCCGTCCTGGGTCCTTCTGTGGGGAATGGCCTGCTTAGGCCTGTCTCTGGTCTGCAGCCTAAATGAAAACACTCCAGA s monDom4.chr2 281169995 83 + 541556283 GTCTCCCCATCCAGAGAACAACTTCAGTGTTTTATATCCCTAAATCCCTGGTTGGTATCCTTCCTGCATGCCCACAGCTCACA a score=-76 s mm8.chr4 151200293 82 + 155029701 TGCTATGGCCTCACTTTGTCCTTCCCCAGCCCCTACTGGGCTAGCCAGGGGCTACTGGGCTAGCCACACC-TCGCAGGCGTGA s monDom4.chr2 281170100 80 + 541556283 TGTTTTGACCTAGCATTGTATTTTCTTGGTCACTATTACTTTA--CTGTAGCT-TAGGAATGGTATCATTATCTGATATCTGA a score=17903 s mm8.chr4 151200375 346 + 155029701 GAGAAAGGGGTGTCCTCCCTCACTTTCCCGTCTCTCTCCCGCAGGCCCCTTATTGCCAAGAAGAATCCGAAGATCCCCATGTCCAAAATGATGACTGTCCTGGGGGCCAAGTGGCGAGAATTCAGCGCCAACAACCCGTTTAAGGGTAGCTCGGCAGCAGCAGCTGCGGCGGCCGTGGCCGCGGCCGTGGAGACAGTGACCATTGCTCCTCCCTTGGCCATCAGTCCCCAGCAAGTGCCCCAGACTCTGCCCATACGAAAGGCCAAGACCAAAGAGGGCAAGGGTAAGGCTATGGGTGACTGGGCACCGGCCCTGTCTGGCAGTTCTGCCCTCTAGATCCTACAGG s monDom4.chr4 44250645 319 - 430141050 GGGATGTGGGTGTCATTCTCTTCCTGCCTCTGTCTCCCACACAGGCCTCTCATTGCCAAGAAGAACCCCAAGATCCCCATGTCAAAGATGATGACGGTCCTGGGGGCCAAGTGGCGAGAATTCAGCGCCAACAACCCATTCAAGGGGAGCTCGGCGGCAGCCGCGGCAGCAGCAGTGGCTGCTGCCGTGGAGACAGTCACCATTGCTCCACCGCTGACCGTCAGCCCTCCTCAGCCCATCCAGCCCTTGCCTATCCGGAAGGCCAAGACCAAGGAGGGCAAAGG--------TGAGTGAC-------------------GCGGCTCTGCCAGCCAGACCCAGCAGG a score=2845 s mm8.chr4 151203482 134 + 155029701 TTCAGAGCGAGGAGGA---------TGAACGGGAGGACTCAGACTTGGACAATGCCAGCATCCACAGCTCTTCTGTGCGTTCTGAGTGCTCTGCAGCTCTGGGCAAGAAGAACAAGAGGAGGC----------GCAAGAAGAAGAGGAGTAGG s monDom4.chr2 281171231 149 + 541556283 TCCAGAGTGATGAAGGCCCTGAGCCTGAAGCTGAGGAGTCTGACCTAGAGAGTGGCAGTATCCACAGTGCCTCAGGCCGGCCTGATGGCACCAC----CCGAACCAAGAAACTGAAGCGAGGCCGGCCAGGAAGGAAGAAGAAGAAGGGTGAG a score=11439 s mm8.chr4 151204365 170 + 155029701 GACGATGGTGACGGCTATGAGACAGACCACCAGGACTACTGTGAGGTGTGCCAGCAGGGAGGCGAGATCATTCTCTGTGACACCTGCCCGAGGGCATATCACCTAGTCTGCCTGGACCCGGAGCTGGAGAAGGCTCCAGAGGGCAAGTGGAGCTGCCCACACTGTGTAAG s monDom4.chr2 281171563 170 + 541556283 GAGGAAGTTGATGGCTATGAGACGGATCACCAGGATTACTGTGAGGTGTGCCAGCAGGGCGGGGAGATCATTCTGTGTGACACCTGCCCTCGTGCTTACCACCTTGTCTGCCTTGATCCTGAGCTCGACAGAGCTCCTGAGGGCAAGTGGAGCTGCCCCCATTGTGTGAG a score=-1828 s mm8.chr4 151204535 67 + 155029701 CCGTGGC----TGAGGTCC------------------------------------------------------GGACTAGGGTTGGCAGGCCATCGCCTGGGG---------------ACACGGCTCAAGGTGCATCCAC s monDom4.chr8 204563591 140 - 308469712 TACTTGCCAGATATGGTCCCTTTAGACCTGGGAGAGGATGTATCCTGTGGGGATTATGGGAATGGAACTTATGGGATTTGGGGGGAAAGGCATTGGTTTGGGGGAAAAGAAAGGTAAAAAACGGGGGGGGGGGCACCTAG a score=11652 s mm8.chr4 151204602 251 + 155029701 CTGGACTCCTCCCTACaggagaaggaggggatccagtgggagccgaaggatga------------tgatgaagaggaggaggagggcggctgcgaggaagaggaggatgaCCACATGGAGTTCTGCCGCGTGTGCAAGGACGGTGGCGAGCTCCTGTGCTGTGATGCCTGTCCCTCCTCCTACCACTTGCACTGCCTCAACCCGCCGCTGCCGGAGATACCGAACGGTGAATGGCTCTGCCCGCGCTGTACAGTGAGTGTTAT s monDom4.chr2 281172067 257 + 541556283 CTTGACTCTT------AGGAAAAGGAGGGAGTACAATGGGAAGCCAAGgaagaagaagaggaatatgaagaagaaggagaggaagaaggggagaaagaggaagaagaTGATCACATGGAGTATTGCCGAGTATGCAAGGATGGAGGGGAGCTACTCTGTTGTGATGCCTGTATCTCCTCTTACCACATCCATTGCCTGAATCCTCCATTGCCAGACATTCCCAATGGTGAATGGCTATGTCCCCGATGCACTGTAAGTATCAT a score=332 s mm8.chr4 151206633 40 + 155029701 TTTCAGCCCTGTGACTTAACCCTGAACATGGTGACCATCC s monDom4.chr2 281172570 33 + 541556283 TTTTATCTCTGTCTTTTTCTTCTG-------TCATCATCT a score=13567 s mm8.chr4 151206673 220 + 155029701 TCTGTTCACAGTGTCCCCCGCTGAAGGGCAAAGTTCAGCGGATCCTACACTGGAGGTGGACAGAACCCCCGGCTCCCTTTGTGGTGGGGCTGCCAGGACCAGAGGTGGAGCCAGGCATGCCCCCGCCCAGGCCTCTGGAGGGCATTCCTGAGAGAGAGTTCTTTGTCAAGTGGGCTGGTCTCTCCTACTGGCACTGCTCCTGGGTGAAGGAGCTACAGGT s monDom4.chr4 44257845 220 - 430141050 TCTGTTCTCAGTGCCCTCCCTTGAAAGGGAAAGTCCAACGGATCTTACACTGGAAATGGACAGAGCCTCCTGCTCCCTTCATCACTGTGCTGCCCCCGCCTGATGCTGATCCAGGCATCCCTCCGCCGAAGCCTCTGGAGGGCATCCCTGAGCGGGAGTTCTTTGTGAAATGGGCTGGGCTGTCCTATTGGCATTGTTCCTGGGTGAAGGAGCTGCAGGT a score=15151 s mm8.chr4 151206893 445 + 155029701 GAGACCTGGGGCCGCATGGTTATG-----TTTGTCTTGGTGTGAGCCTG-----GGGTTCCCCCAGGCATGGTTGGGAGCTGGGACTAGC--------AGCTGTGAAGGAGG---CTTGTTCCACCTAGGAGAGGGCTTGGGGGCTGAAGGGCT-----------GGTCCGGGAACTGGGGTGAGCGGCCGGTCTCCCGTGCTCTGTGACTAGTTGGAGCTGTACCACACCGTGATGTATCGCAACTACCAAAGAAAGAATGACATGGACGAACCGCCACCCTTTGATTACGGCTCTGGCGATGAGGATGGTAAGAGCGAGAAACGGAAGAACAAGGACCCTCTCTACGCCAAGATGGAGGAACGCTTCTACCGCTACGGCATCAAGCCCGAGTGGATGATGGTTCACCGCATCCTGAACCACAGGTGAGGGTGTTGGGTAGCACCTGCCGGGTGAGGGCTGTCCAGGCTTGCCTTT s monDom4.chr4 44258355 465 - 430141050 GAGACATAGGTTCCCTTGGCCGCAAACACTGTGTCTTTGGTGAAGCCTGCAGGGGAGATGTCTCCGTTTGAGTTGGGGAAGAGATATCTCTCTGTCTGAGCTGGGAAAGGGGTGTCTGGCCAAGTTCAGGAGGGAGATACAAAGAGGGAGGTGTCTATTTTTTTAAGTCCTGGGGCCTTCTTGAC--ATCGCTTTCTCTGCCCTGGGGACCAGCTGGAATTGTATCACACGGTGATGTACCGGAACTACCAAAGGAAGAATGACATGGATGAGCCACCACCCTTTGACTATGGCTCTGGCGATGAGGATGGTAAGAGTGAGAAGAGGAAGAACAAGGACCCCCACTACGCCAAGATGGAGGAGAGGTTTTATCGCTATGGGATCAAGCCTGAATGGATGATGATTCACCGGATCCTGAACCATAGGTGAGAAGG----------AATGAAGAGGGTGGGGTGACCATGGCTGCCATT a score=10238 s mm8.chr4 151209819 338 + 155029701 CAGAATACTAGGAGACCATGGGTGTGAG--TGGATGGGCGTTTCATGTGGG--GCCCTGCCTGGGACCTAAATTTGT----GAGCCTCTCCCATCCCGTGCCTCCTG-----TGTTGCAGCTTTGACAAGAAGGGGGACATACATTACCTGATCAAGTGGAAGGACCTGCCCTACGACCAGTGCACCTGGGAGATTGATGAGATTGACATTCCCTACTACGACAACCTGAAGCAGGCCTACTGGGGCCACAGGTGTGCCCAGTGCTGGCAGCCAGGGTGTGGGCGGGGCTCCCGCTCGTTCGCTCGCTCGCTTGGTCTGAGTTTTGCTCATCTGTATCTGATGTTTCTGCT s monDom4.chr4 44261214 343 - 430141050 CAGGATCTGGGCAGCTCATGAGTGTGAAACTAGATATAAATTATAAATGGAAAGTCCTACAAAATGCCAGTGTTTCTCTTGTATGATCCCCAAATCCATGTCTGTTTGGTTCTGCTGCAGCTTTGACAAGAAGGGGGATGTGCATTACCTGATCAAGTGGAAGGACCTTCCCTACGACCAGTGTACCTGGGAGATTGATGACATCGACATACCCTACTATGAGAATCTGAAGCAAGGCTATTGGAACCACAGGTATG----GAGGCTGAGGCTGGGGACTGGGGGCTCCTCTCTGGCCTCCCtttcttctttttctcca----ttcctcatttcttccttcaattttttct a score=6501 s mm8.chr4 151210158 152 + 155029701 AGGGAGCTGATGCTGGGGGAAGATGCCAGGCTGCCCAAGCGGCTGGTGAAGAAGGGCAAGAAGCTGAAGGACGATAAACAAGAGAAGCCACCCGATACGCCCATCGTGGACGTGAGTGGAGACAGGGTGGAGGTGGCGGTGTGGCATTAGCG s monDom4.chr4 44262071 151 - 430141050 AGGGAGTTGATGTTAGGAGAAGATTCCCGGCCACCCAAGAGACTGAACAAGAAAGGAAAAAAACTGAAAGATGACAAACTGGAGAAGCCCCCGGAGACACCTTTAGTGGATGTGAGTTG-GGCAGGAGGGGGCAGGGGGATGGGGATGAGAG a score=14046 s mm8.chr4 151211069 209 + 155029701 CTCCTACCC---CAGCCCACAGTCAAGTTCGACAAGCAGCCGTGGTACATCGACGCCACAGGAGGCACGCTGCACCCTTACCAGCTGGAGGGCCTTAACTGGTTACGCTTCTCCTGGGCCCAGGGCACCGACACTATCCTGGCTGACGAGATGGGTTTGGGGAAGACAGTACAGACCATTGTGTTTCTCTATTCTCTGTACAAGGAGGTGGG s monDom4.chr4 44264152 212 - 430141050 CTTCTCCCCAAACAGCCCACTGTCAAGTTCGACAAGCAACCATGGTACATCGATGCCACAGGGGGCACCCTCCACCCTTATCAGCTGGAGGGACTGAACTGGCTGAGGTTCTCCTGGGCCCAGGGCACAGATACCATCTTGGCCGATGAGATGGGGCTGGGGAAGACAGTCCAGACCATCGTGTACTTGTATTCTCTCTATAAGGAGGTAAG a score=16745 s mm8.chr4 151211617 223 + 155029701 TCTCTCTGCAGGGCCACTCCAAGGGGCCTTACCTGGTCAGCGCGCCCCTGTCCACCATCATCAACTGGGAACGGGAGTTTGAGATGTGGGCGCCTGACTTTTACGTGGTCACCTACACGGGGGACAAGGAGAGCCGCTCTGTGATCCGTGAGAACGAGTTTTCCTTTGAGGACAACGCCATTCGCGGTGGCAAGAAAGTATTCCGCATGAAGGTGAGTGCTGT s monDom4.chr4 44264647 223 - 430141050 TCCCTCTCCAGGGTCACTCAAAGGGGCCATACTTGGTCAGTGCGCCCTTGTCCACCATCATCAATTGGGAGAGGGAATTTGAGATGTGGGCACCTGACTTTTACGTGGTTACTTACACGGGGGACAAGGAGAGCCGATCGGTGATTCGGGAGAATGAGTTTTCCTTTGAGGACAACGCCATCCGGAGTGGGAAGAAGGTTTTCCGCATGAAAGTAAGAGCTGT a score=18695 s mm8.chr4 151214264 396 + 155029701 TCCCTGCCATCTCCTTCCATGTTCTTGCCTC-TCCCCAT--AGAAGGAAGTGCAGATCAAATTCCACGTGCTGCTCACCTCTTATGAGCTCATCACCATTGACCAAGCCATCCTGGGCTCCATCGAGTGGGCCTGCCTCGTGGTGGACGAGGCCCACCGGCTCAAGAACAACCAGTCCAAGGTAGG----------------AGGCACCGGCCGTGGGG---------------------------------------CTTATCCCGCTG------GGCATGGCCACGGCTCTGTGCCTCCTCACACCCCATCTCTTCTCCCCAAAGTTCTTTAGGGTCTTGAATAGCTACAAGATCGACTACAAGCTGCTGCTGACAGGGACCCCCCTCCAGAACAACCTGGAGGAACTGTTCCATCTCCTCAACTTCCTGACTCCAGAGAGGTTCAAGTGCGTCCCCC s monDom4.chr4 44267922 452 - 430141050 TCTCTGTCTTCATTGTCCAAACTCTCCTCTCCTTCCCATGCAGAAAGAGGCACAGATCAAGTTTCATGTCTTGCTCACATCCTATGAACTCATTACCATTGACCAGGCCATCCTGGGGTCCATTGAATGGGCCTGTCTTGTGGTAGATGAAGCTCACAGGCTGAAAAACAACCAGTCCAAGGTAAGCCATTGTATCCAGGAGAGGGAGTGGATGGGGGAAAACCAGTGACAGGCAGAGGAAAGCAGGCTGTAACTGCCCTTTTCATAGTACTTAGTGGAATGACCAGGGCTAGAATGATCTTCCC------TTTCTTCTCCCTA--GTTCTTTAGGGTGTTGAATAGCTACAAGATTGACTACAAGCTGCTGCTTACGGGGACACCCCTGCAGAACAACCTTGAGGAACTGTTCCATCTTCTAAACTTCCTGACTCCAGAACGGTTCAAGTGAGTCATCC a score=14337 s mm8.chr4 151215344 237 + 155029701 GCTTCTGACACTTACCCCGGCTCTTTATTGCAGCAATCTGGAAGGCTTCTTGGAGGAGTTTGCTGACATATCCAAGGAAGATCAGATCAAAAAGCTGCATGATCTATTGGGGCCGCACATGCTTCGGCGGCTCAAGGCCGACGTGTTCAAGAACATGCCGGCTAAGACAGAGCTGATTGTCCGAGTGGAGCTGAGCCAGATGCAGAAGTGAGTG-------CTGGAGGCTCACCCTGTCCTGCA s monDom4.chr4 44268783 244 - 430141050 GCCTCTTTCTTTTATCTCCACTTCTCTCTGCAGCAACCTAGAAGGCTTCCTGGAGGAGTTTGCTGATATTTCCAAGGAAGATCAAATCAAGAAGCTGCATGACTTGCTGGGGCCCCACATGCTGAGGCGACTGAAGGCTGATGTGTTTAAGAACATGCCAGCCAAGACGGAGCTGATTGTGCGGGTGGAGCTAAGCCAGATGCAGAAGTGAGTTTTCCCCCTTGGGCTCCCAGCCCTTCCTCCA a score=-1651 s mm8.chr4 151215616 205 + 155029701 CACCCCTTCCCGCAGGCCCCAACTGGCTTTCCTGACCATTTCCTGGGGTTGACAGGAGTCCTT-----------------------------GCTCAGTGATTTCCTTCCCC---CTCCATCAATTGCAGTGACTACGGTCAGGCTGCCTCA------GTTGTAG------------------TAATGTCTCCCATTGACGTTTTATCCATACCTGGTGCCTGGGGCACCACCAACCCTTCTGAAAGTAGAG-CCTGCCCCT s monDom4.chr8 204568708 251 - 308469712 TATTTTTTTCCAATATCCACATTTGG--TTCTAGAGCATCTGATGGTGGGGACAAGTGTGATTTGAAGATGCTCTCATATAACTGTCATGGAACACATGGACCATTTTCCCCAATTTGAATCAAATTC--TGACTACTTGCAAGCCACCTTATGGCCTTTTTTAGGTTCAGTCTAATTATTTTTAGGCTCTAGGCCTAGCATCTTTCTAATTTTGGGTTCCCAGG--ACCAAAAA-----AGAAAGGAAGAGACCTGGGTCT a score=11318 s mm8.chr4 151215873 160 + 155029701 CCTGTTGCAGGAAGTACTACAAGTTCATCCTGACTCGGAACTTTGAGGCGCTCAATTCCAAGGGGGGTGGCAACCAGGTGTCTCTACTCAATATCATGATGGATCTGAAGAAGTGCTGCAACCATCCGTACCTCTTCCCTGTGGCTGCTGTGGTGGGTTC s monDom4.chr4 44270398 160 - 430141050 CCTGCTGTAGGAAATACTACAAGTTCATTCTGACCAGAAATTTTGAAGCCTTGAACTCCAAAGGCGGTGGAAATCAGGTGTCTCTGCTGAACATCATGATGGACCTGAAGAAGTGCTGCAACCACCCGTATCTCTTCCCCGTGGCCGCCGTGGTAGGTTC a score=9694 s mm8.chr4 151217241 141 + 155029701 ACAGGAAGCCCCTGTACTGCCCAATGGCTCCTACGATGGCAGCTCCCTGGTCAAGTCTTCGGGGAAGCTCATGCTATTGCAGAAGATGCTCAAGAAACTGCGGGATGAAGGGCACAGAGTGCTGATCTTCTCCCAGGTGAG s monDom4.chr4 44272484 141 - 430141050 ACAGGAGGCACCAGTCTTACCCAATGGTTCCTACGATGGCAGCTCCTTGGTCAAGTCTTCTGGGAAGCTCATGCTCCTACAGAAGATGCTGAAAAAGTTGCGTGATGAAGGACACCGGGTTTTAATCTTCTCTCAGGTGAG a score=-629 s mm8.chr4 151217934 155 + 155029701 TCTTTTGGGGAAATGGGAGTGAACCGGAGGCTTATGTCTGAGGCTAGGGATGGAGGCTCCTCTGCAGAATGGTGGTGGGTGATGGGTGAGGCTGGGGCTGCGTTCTTTTTGGGGAGGCCTACTTT---AGACATATTAACCCCCACTCCGGGCGTCTC s monDom4.chr2 281180539 130 + 541556283 TTTTTTAAAGAAA----AGAGAACAGCAGG---------AAGTCTAGGGATA---------TTTCAGAAGAGTAGGATGGAATACGAATAGATAGGTTCCTGTGACCCTTCTGTTTCCTTACTGTCCCAGACAGCCCCTCCATCTTTCC------CTT a score=9688 s mm8.chr4 151218089 165 + 155029701 TGTTCTCCTACCCATGGTGG-----TGTGTGTCCGCATTTCT---TGTAGATGACCAAGATGTTGGACCTCTTGGAGGACTTCCTGGAGTACGAGGGCTACAAGTATGAGCGGATCGACGGTGGCATCACTGGGGGCCTCCGGCAAGAGGCCATCGACAGATTCAACGGTACT s monDom4.chr4 44275164 173 - 430141050 TGGTTTTCTTCCCATGGTCACCCACTTTGGGCACCTATTTCTCCCTCCAGATGACCAAAATGCTGGACCTGCTGGAGGATTTCCTGGAGTACGAAGGCTATAAGTATGAGCGAATTGATGGTGGGATCACGGGAGGTCTTCGGCAAGAAGCTATCGACAGATTCAATGGTACT a score=9643 s mm8.chr4 151218686 343 + 155029701 AACTCAGCAGGGCC--TGGCCTCAGCGGGGCTTTGCGAGCCCAGCAGATGTGGCTGCCTCTCTGGAATCATAGCTTCTGCCCTTGCCTCAGTCAGGGACCTTTGCTCC--------GGTTCCTGGCCTCCTAGCTCC--------TTCCACCGACCCCTGCCTAGCTGTGCTTGTTAACTCACACATGCCCGTTGGCCTCTTTCTCAGCTCCTGGGGCCCAACAGTTCTGCTTCCTGCTCTCAACACGTGCCGGTGGCCTGGGCATCAACCTGGCCACAGCAGACACGGTCATCATCTATGACTCGGACTGGAACCCTCACAATGACATCCAGGTCTG-TGCCTCGTC--TCCTGCTGCGCTCT s monDom4.chr4 44277273 344 - 430141050 AATACAGAAGGGTTAATGGCCCTAGGGAAG------GAACTTGGTAGGGGTAGCTGGCTGACT-----------TCCTGCCCACATCTCAGCTAGGTTGCATCTTCCCTTGGGGGAGGAGAGTGGCTCTATAATTCAGGATTTAGTCCCAGAGCCCTGTCCTCTCTCTTACCTCTTGATGTGGGGCTGACCTTTATCCTCTC---CAGCTCCCGGAGCCCAGCAGTTCTGTTTCCTCCTCTCCACCCGGGCTGGTGGTCTGGGCATCAACTTGGCCACTGCTGACACCGTCATCATCTACGACTCGGACTGGAATCCTCACAATGACATACAGGTCTGTTGACTCACCATTTTTGCAGGGCTCT a score=16685 s mm8.chr4 151219762 410 + 155029701 CTGCCTCACACTGAAGTCCGCACAGACGCACAGTGCACCTCCCCCTATGATCAGACTGCCCCTGCATGGCCACGGGCTTACAAACATGGTCCTCCCTGGTGTGCCCCACTGTGGCTGGGAGCCTGGAGTCAAGCCCCGGGTG-CTGAGCTGTGCTCTGCCTCCCCACCCCCCAGGCCTTCAGCCGTGCTCACCGCATCGGGCAGAACAAGAAGGTCATGATCTATCGCTTCGTGACACGGGCCTCCGTGGAGGAGCGCATCACTCAGGTGGCCAAGCGTAAGATGATGCTCACACACCTGGTGGTGCGGCCTGGCTTGGGCTCCAAGTCGGGCTCCATGACCAAGCAGGAACTGGATGATATCCTTAAGTTCGGGACAGAGGAGCTTTTCAAGGACGACGTGGAAGGTGGG s monDom4.chr4 44280161 387 - 430141050 CCACCTCTCTGTGAAGCACTAAGAGTCACAC-------TTCCCCTCA-------ACGATCCATGCCTGTGCCCGCACGTTCACACACTCCCCTGCCCATTAGCTATCTCCTGAGCTGTGCTTCT-------AGTCCGAGGCATCTGAGGGATGAATGACCGACTC---CCACAGGCCTTCAGCAGAGCCCACCGCATCGGCCAGAACAAGAAAGTCATGATTTACCGCTTCGTCACAAGAGCCTCCGTAGAGGAACGAATCACCCAGGTCGCCAAGCGCAAGATGATGCTCACGCACCTAGTGGTGCGACCTGGCCTGGGATCGAAGTCTGGGTCCATGACCAAGCAGGAGCTGGACGACATCCTGAAGTTTGGGACAGAGGAGCTCTTTAAAGATGATGTGGAAGGTAAG a score=4477 s mm8.chr4 151220263 232 + 155029701 CTCCCAGCCTGTGACACCCCTTAGAGTTGGCTAGGGTGGCGTCTCTGCTTGCTTCCCATCAACCCTTGCTGTTCTTCAGTGCCCTGAAACCATGTTCATCC--TCCTCTGCCTCTCA---GGCATGATGTCCCAGGGCCAGAGGCCTACCA---------------CACCCATCCCTGACATACAATCTACCAAGGGCGGAT---CTCTGACCGCCGGCGCAAAGAAAAAGCACGGCAGCACCCCGCCAGGTAGG s monDom4.chr4 44284024 243 - 430141050 CTTCCAGCTCTAAATAATTTTGAGAGCTG------------TTCTCCCTCCCTCCCCACAAAGTCTGCCTGTAGCACCTCCTGCCCGAGCCGGCCTTGCCCGATGCTTTGTCTCCCATTAGGCATGATGCCTCAGGGTCAGCGGATCAACATGCCTGAGCCCGTGGCGCCCGCCCCTGATGTCCAGGCCTCCAAAGGTGGTGGCACCTTAGCAGCTGGGGTGAAAAAAAAGCATGGCAGCACCCCACCAGGTAGG a score=13824 s mm8.chr4 151220704 310 + 155029701 CCCCGCGGATGGTCCTGACCACCTTACAACTGTGTCTACACGATGTGTCCT-GCCCACCCCGCAGGCGATAACAAAGATGTAGAAGACAGCAGTGTGATCCATTATGACGACGCAGCCATATCCAAGCTGCTGGATCGGAACCAGGACGCCACGGATGACACCGAGCTGCAGAACATGAACGAGTACCTGAGCTCCTTCAAGGTGGCACAGTATGTGGTCCGCGAGGAAGATGGCGTGGTAAGG---------------CCTTTTGAGTGCTCTGGGGC-CCCGCCTCATGGCCATACTGCCCCTTGCAGCCCCACCCCCGGTAGCT s monDom4.chr4 44286301 309 - 430141050 CCCAGAGGCTGGCCCTTGCCTCATTG------------------GTGGCCTCTCTTATTGTGCAGGTGACAACAAGGACGTGGAAGACAGTAGTGTGATCCATTATGATGATGCCGCCATTTCCAAGCTGCTAGATCGGAACCAGGATGCCACGGATGACACAGAGCTGCAGAACATGAATGAGTACCTCAGCTCCTTCAAGGTGGCCCAATACGTGGTCCGGGAAGAAGATGGAGTGGTAATGGATGATGTTTTTCTACCTTCTGGGTTCTCTGTTGCGTCAGCCCCCTTTCCTTCCACCTTACTCTGGCTACATCTTGGGGGGCT a score=98 s mm8.chr4 151221313 102 + 155029701 AATAGGCAACCCCCCTCGCTTGTCCCATGGGCCTGTGAAGGTGGGTGAGGTGTGGCAGAACAACTGGGTGTGCCCGGCTATCTCCCACAT---------CTACATC---CCCAG s monDom4.chr8 204579793 104 - 308469712 AATAGTTTAAATGTCTTGAGTGGCCTAGAAGCTT-TGAGGATCTATGTAGAATGG---------TGATGGTGGCCACCCATACCCCACCTAAGTTTTGATTGCATCTGTCCCAG a score=12384 s mm8.chr4 151221415 183 + 155029701 GAGGAGGTAGAGAGGGAGGTGATCAAGCAGGAGGAGAACGTGGACCCTGACTACTGGGAGAAGCTGCTGCGCCATCACTATGAACAGCAGCAGGAGGACTTGGCCCGCAACCTGGGCAAGGGCAAGCGCATCCGCAAGCAGGTCAACTACAATGATGCCTCCCAGGAGGACCAGGGTGCGTGT s monDom4.chr2 281184407 183 + 541556283 GAGGAGATAGAGAGAGAGATCATCAAGCAGGAGGAAAATGTGGACCCTGACTACTGGGAAAAGTTACTGAGACATCACTATGAGCAGCAACAGGAGGACCTAGCCCGAAACCTTGGCAAGGGTAAACGTGTTCGAAAACAAGTCAACTATAATGATGCTGCACAAGAAGACCAAGGTGAGGGT a score=213 s mm8.chr4 151221598 7 + 155029701 GGTGAGC s monDom4.chr8 204580086 7 - 308469712 GGCCGGC a score=2029 s mm8.chr4 151221920 72 + 155029701 CTTGGCCTTGG----CTGCCTGAGGCTGGGGCGGGCCCCTTCCATG---CCCCTCTGCTTACAGAGTGGCAGGATGAGC s monDom4.chr8 204580100 77 - 308469712 CCTGCCCTTGGGCCGCTCCCCTAGG--GCCGTGGGCCCCGCTCATCTGCCCTCTCTCCCTCCAGATTGGCAGGATGACC a score=4430 s mm8.chr4 151221992 79 + 155029701 TCTCGGACAACCAGTCGGAGTATTCCATCGGTTCTGAGGATGAGGACGAGGACTTTGAGGAGCGACCAGAAGGGCAGAG s monDom4.chr2 281185099 79 + 541556283 TCACAGACAACCAGTCCGAATATTCAGTGGGATCAGAAGAAGAGGATGAGGACTTTGATGAGCGACCTGAAGGTGGGAG a score=-1120 s mm8.chr4 151222092 147 + 155029701 GGTTGTTCCGGTGCTGCAGGGGGGGGGGGGTGACGGCCGGGTGGGGTGGGCTAGGGTGCCCATGGGAGCTTTAGGAGGAGGAGCTGAGGGTCTCCTCATCCTGAGGGGCTGGTGGAGCCTCTGCA--CCCCAGCCTGAGGGTCTGTGGC s monDom4.chr8 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TCTTTGGTCACTCTCCCTCCCACTGTCTGTTAGGTGCTGGGGTTCAATACCCGACAGCGGAAGGCCTTCCTGAATGCAGTGATGCGTTGGGGGATGCCACCACAGGATGCCTTCACTTCTCAGTGGCTAGTACGGGACCTGAGGGGCAAAACAGAAAAGGAGTTCAAGTGA a score=5097 s mm8.chr4 151223162 90 + 155029701 agGGCCTATGTATCACTCTTCATGCGCCACCTGTGTGAGCCGGGCGCAGACGGCGCGGAGACCTTCGCAGACGGCGTGCCCCGGGAGGGC s monDom4.chr2 281186548 90 + 541556283 AGGGCCTATGTGTCTTTGTTCATGCGACATCTCTGTGAGCCTGGGGCAGATGGCTCTGAAACCTTTGCTGATGGTGTTCCCAGGGAGGGG a score=5500 s mm8.chr4 151223252 147 + 155029701 CTGTCTAGGCAGCACGTGCTCACGCGTATTGGGGTCATGTCGCTGGTTAGGAAGAAGGTGGGTGAGTAAGCCTCTACTAG----CCTTCTGGCTGGCATGTGGCCTTGGCACTGCCTCTG----GTGGGGGGCAgccgccaaaggataaatgccc s monDom4.chr4 44292369 153 - 430141050 CTTTCTCGACAGCACGTGCTCACCCGGATTGGAGTCATGTCACTAGTTAGGAAGAAGGTGGGTGAGTAGACTTTTACACGGGGCCCTTCAGG--GATGTCTATCCTGGTTCCTGGCTCTGCTCAGGAGAGGGCATGGGTCTAGGGGTGGGAGACC a score=-521 s mm8.chr4 151223399 445 + 155029701 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GATATCTGGTGCTGATGACACCTAGGTGACAGTGGGGGTTCTTACCTCTGGAT--CAGCTGA----------CTACAACTCTT---CCCCAATGTCCAGATTCCAGGGATGCCCACTGACAGAGGGGATGGTGAGGAGAAGCATGAGAACCTTGAAAACAAAGAGAGATCCCGAGAAGAGAGGAGGGAAGAGAATGAAAAGATTGATCCCTCCACAGATCAGCTGCTCAAAGGTGCCTGTCTATCCAGAAGCCCAGGCTTTGACCACCCCACACCCTAGGGTTTGGGACCTCCCAGGCCA---TCAGGTTCACCACCTTCCTGCCCATGCAGGAATGACCAGATCTCTTCTACTCTTAGACCCACAGGCAGTCTCCTGGCCTCCCCTGGGAGTAAAGGAAGGCTATTTCTTTA---ATATTCTGAGAGGGAGCATGTAGCCAGACTTGGACCTCTAGGCTCCTTCTCCCAGCA--------TGGTCTCAGGATAAGC-TCTGCCTAGGACAGTTCA---TTCCTTCTGGCTTTTTAGTTATGCCCAATTTCCCTGTCTTGTGCCTTCCAGATGATG a score=7897 s mm8.chr4 151226618 242 + 155029701 TCCAGTTGCTGGACAGGGCTTTG-------AGTAATGCCTTCTAGATAGTTGGTGAACATG-GCCTGTCCCCTCCCCC--CAGATGACCCCAAGACTGAGGAGAAGGAGCCCGGGGAGACTCAGCAAAACGGCGACAGAGAGGAAGATGAGGAAGGCAAGAAAGAAGACAAAAATGGGAAATTCAAATTCATGTTCAACATTGCAGATGGCGGTTTCACAGGTA------CAGAGGCAGAACAGTAGACGGGACCCGG s monDom4.chr4 44303095 258 - 430141050 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GGCCCTTCTATCTTGCAGTACTGAACCAGCTGGAAGAACTTTTGAGTGACATGAAGGCTGATGTCACCCGCCTGCCCTCCATGTTGTCCCGGATCCCGCCTGTGGCCGCTCGCCTGCAGATGTCGGAACGCAGCATCCTGAGCCGCTTGACAAACCGAGCCGGAGACCCCACCGTCCAGCAGGTCAGGCTGGCCCAGCTGGGCCTGGAACCTTCCCCCAGGGCTCCATGCCCCCAGCTCGGGCCCAGGAGTTTTCTTCCCAGACGCTCCCTCTTTCCCATCCCTCACTCTGGTCGTTCCCACCCCCTCCATCGTGGGGAGCCAGGCTAACCTGCCTGCAGGGTGAGGTTCTGGGTGGAGAAGGGAGAGAGGCCGCATTGAAACCTCAGTCCTCGCCCTCCAGGGTTCTTTCGGCTCCTCCCAGATGTACAACAACAACTTTGGGCCAAACTTCCGGGGTCCTGGACCAGGCGGGATTGTCAACTACAGCCAGATGCCCCTCGGCCCCTATGTGACTGGTAGGTTGGACGTATCTAGCCCATCCTAAT--GGAGAATTTTTAAGCGGCAAATTTCAGGGGACCA--CAAACAAAGCCAAAGGACAGTAGGCAAGCCAGATGTTTTCTTTCTTATCAATAGATATTTAGCCGTTTCCAAGATTTTCCTCTGTTGCAGTTCTCATTTCCAACTGAGGTAAGGTGACCCTTATTTCTCTCTGCTAACCACATTCTATGGTTCCATCCTCCAGGGGTTATGGTTTTCTTTAGGTCTTCCATCCA a score=-2 s mm8.chr4 151229945 401 + 155029701 CTGTGTGTGTATGTACATCTGTATGTGCACATGTGTCCTTGGCTC-CATGTGGTCATAGCTTtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgGACATCTGTATGTGCACATGTGTCCTTGGCCATGTGTCATTGGCCCCATTGGCCCCATGTGGTCAt--gtctttgcatgtgtgtgtgtatgtgcacatgtgtcc--ttggccatgtgtcattggccccatgtggtcatggctttctgtgtgtgtatgtgtgtgtgtacatctgtatgtgcacatgtatTCTTAGCTGTGTGTCACTGGCCCCATTGATCACTGCTCCCAGCCTAAAGCCCTGTCCTGCCTCCACTGTCCTGCATGATGGTCCATCCCATGGACAGTTGCTGCTTGTCTCATACCCACAGT s monDom4.chr4 44321362 381 - 430141050 ctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatcatatatctctataattttatctgtctatctatccatctat-tacctatctgtctatctatccatccactcatctatctatccatctatttatcattctat-----ctatgcacccatccatctatccattcattcatctatctacccatctatctatctgcccatctatc------------tgcccatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatcttcctattaatctaccccatctatccacccatatatttagctttc---tttctgtctattagtcca-cctattga---tttattcatttatctaccctatagt a score=3342 s mm8.chr4 151230500 753 + 155029701 AAGCCAGAGGACCTGGGT------------AAGCTTCCAGGCTGAGCCTATTGGATGCTGG------GACTCCAGCCAGCAATTAGGTGCAGCTCACATCAAGTCCAGAGGCCAGGGCAAGGAGATCTT-----AATTCTGGGCCTCTCTGATCATAACTGTGACCAGTGTGAACAGCCAGGTGCCTCTGGCCACCTGGCCACCCACTCTTACAATCAACTGGTTTGCCTTTTACAGCCA---------AGCCACCTGCCCAACCCCCGCGGGAGAGAAAAGCTACAGCCCTTTTAGGAGTTGGTGCGGTGTTGGGGTACAAAAGGGAAACCATGAAATTCTATC-ACACGGAGGAC--AGGCCCAGGCTGGCTGCGCAAGA-GTCCAGAAGTGCCACCTCATCGTAGTTGAAGCCTTCTTCCACACGGCATCCCATCTACAGCTA----------------------------------------------CGCCTGGCAAGGTCCTGGCGCCTTTTCCAGAGTGACTGACTTAGAGGAAATTCCATTTACCTGTAAATTTTTTTTTTGGCACTTTCCTACTGAAGATGCAAACATGTTTGTCTTGATAAAAAGTTGGATGACGTGTGGAAGAT--TCAGATTCACGACACTCCTGTCTGT---------CACCGGCTCCAGACCTCAAGGGGAAGCTCTTTGGAGGCCCTTGGTGCTGCTGCTCTATGGATTCAACTGCGGCCGAAGAGAATGCAGCATCCAGTGCTCT--GGAAACCCTTAGTCTGCCCCCCG---------CCCCCGTCTGTACCCGTGTGACTGCTCCAGACCCCTGCCTGCTTGGGACCCT s monDom4.chr4 44321887 811 - 430141050 aaggaatttgacctgagtcacccaggtagtaagtgtctgaattgggatcatctaagaatggtcttctgagaccaaCCACTAAGTGTGGTCAGCTCTGATTTGG---GGATCCCCCTCCAAAGTCATCTCTTCAGAAGCCAGAAAAGCTGAGGAGTTGGCAGAGAGCAGTGGG--------GGGGATTGGGGATAGTTAACCCCTCCCTCTC------------TGTGTCCTT-ACAGCCACGCCCACTGGGCCACCTGCCAGCCACCCC---GAAAGAAAAGGAGCTGACTCCCTTAAAGATGGTGCTGCTTTGGGACG-AAAGGGGAAACTCAGTGATGTCATCTGCATTGAAGACTAAGTCCTAGCCCTAACGGGCCAGATGTCCAGAAGTGCCACCATGTCATATCTCAAGTGTTCTTCaaaaaaaaaaaaagaaaaaagaaaaaagaaagaaaaaaaaggaaaaaaagaaaaaagaaaaaacaaaGAGCAACTTAAAAAAACCCAAC-CCATTTCCAGA---ACTT-CTTAGAAGGGATTCCATTTATTTGTACATCTTTT-----GCACTTTCTTATTGAAGACTCGAAGA-GTTTGTCTTGAT-AAAAGTTGAATGAATTATGAAGGATTATAATGTTAACAGTATTTATGTCTCTGTTTTTATCAACATGCATAAAGTCAAGAGGGAAACCTCGCTGGA-GCCCCCATTTCTAGACTTGTGAACCCTCACCTACCAGTTAAGACAAGGC-----TCAATGGTCTTGTGTAGCCTCCTGTTTGCCTCCTGATTCTTCTCACCATAACTGTGTTTGAGCAGCTGCATGCACCGTCTGCCCACTTCTGCTCCT a score=1550 s mm8.chr4 151232660 109 + 155029701 CATCCCTTCCCTGAAGACTTCCCCCAG----------------GAGTCTTGCT-CTGTCCATCCATCTCTGCTTCTTCCTGGGCCATACCCACCCTCTGTGGCCTTCCCCTCTCCACAGCCACCTT s monDom4.chr2 281192477 126 + 541556283 CACCCCGTCCCAGGGGCCGTCCTCCAGCCCACATCCCACCCCTGGGGATTGCTGCCAATCCTCCACCTTCCCCACCCCCTGGGCCACCATCAGGATAGGAGCCCCTTTCTCCTTCACCCCTATTTT a score=4894 s mm8.chr4 151233444 194 + 155029701 GAGGAGGAGGCCAACCTGCCCAATTTATATACCCGAAAGTTTACAGGTCGTGGCGCGTCAGCCCAAAGTCTTTGGTGTCCCTGCGTTTATGGATATTTCCCTCTTAATTTTCAGATTTTTTTTTTTAAAAACAAAAGTATTTTTTTAGGTATGATAAACCCGGAAAGGGCCTGTTGGGTATGTGTGTATGTCCT s monDom4.chr4 44326854 170 - 430141050 GAGGAAATTGGCAACCCTCATGTTTTATGTAACCTGATGTTTACAG---------------CCCAAAGTCATTAA-GTTTTTGTGTTGA--GAAATTTG--TCTTAATTTCTAGATTTTTTTTA--AGGGAAAAAAGTATTTTTTTAGGTACGAT-AACTCACAATGGATTTG-CGGGTGTACGTGTTTGTACT a score=862 s mm8.chr4 151236542 78 + 155029701 TTCTTCTTGAAGGATAAGC-----AGAGGTGGTGGGCTTGGGCGG-GAGCCTCT---GGATGTCCCCCTAACTGATGCCATCCCCTG s monDom4.chr4 44334255 87 - 430141050 TTTTTCCAAGAGGATGAGCTGAGCAGAGACAGCCTGTCGGGGCGGAGAGCACGTTGGGGGAGCCTTCCTCACCTGGACTGTTTCTTG a score=9978 s mm8.chr4 151236643 361 + 155029701 AGTGAAGAAGCGGCAGGCGGCATCTGGCGGTGACTTTGGAGGTCGATTCCCTGTCACGTCTGGGCATAGTGATTTCCCTTTGGATGTGAACCACACTCTGCATTTGGCTTTGGAACAGCAGAAGCGAGCGAACAG-AGACGAGG----AGGGAACCGGGAACTGTCC----------GGGTGGGGCACGAGGGGTGGGGAGTAGACTTAGGATCTATAGTCCTTTTTGCTGTAGGGTTTATTGCCCAGAATGCTGTCGATCTCGTGGACGATGGAAGACGACAATTTTGGAAGGACCTGCATGCAAGGATAAGAGTGTAGCTTGGCCTGGGGGAGAGGAGGGTGACT------TCCCAGTGTCTCACGGCTCCTACTCTGTG s monDom4.chr4 44334364 365 - 430141050 AGTAAAGCAGCGTTATGTGG--TCTCACAGCAACATCTGAAAGATCTTCCCTGGGACATCTCGACACA------TATTCTTGGATGCAAAA-GCACATTGC-CTTGCTTCAATAACAGCTTAAGCAAACGAACAGGAGACTAGGTAGGAGGGGAAAAGTAACTGTCCAAGCAGATCCGGGTGGGAAGGGAGGGAGGAAGGG-AGGGTTAGGATCGATAATCCTTTTTGCTGTAGGGTTTATTGCCCAAAATACTATCAATCTCATGGATGATGGAAGACGACAATTTGGGAAGAACC----TGCAAAGACAAACAGCCTGTGGGTCATGGGTGGCCGGGGGCTTGCTGGAATCTTCCAGTATTCCTC--CTATTGGTCTGTG a score=7270 s mm8.chr4 151237476 177 + 155029701 GTGAAGCTGTGTCT---CCAGGAAGGCTGGGGATACCTGAGCCCACCACCGGGGCCCCCGCATCTCACCTGTATTGCTCCAATGTTCTCCATAAGTTGTTCTGCATTGGAAGCACCCAGAAGCACGGAGCTGACACCCTCATTCCTCAGGCACCAGGCTGTGGGCAGCGAGACCAGAGGT s monDom4.chr4 44335311 174 - 430141050 GTGGAGCTGCCACTGGCCCCGGGAGGCTGT-----CCTCAGCCTCCCCCCATG-CAGCAGGGCCTCACCTGTATCGCACCAATGTTCTCCATTAGCTGGTCCGCATTAGAAGCACCTAGCAACACGGAGCTGACGCCCTCGTTCCGCAGACACCAGGCTAGGGCGAAGAGGAGAAAAAGT a score=10284 s mm8.chr4 151238073 278 + 155029701 CCCAGAGCCCATTTACCTATGGCCAGCTGGGGTAGGGTGCAGCCCAGGCGTTCGGCAATGGCCTGCAGTTCCTTCAGCTTGGCCTGCTGGCGGCGACCCTCCTCACTCAGGATCTTGTCCTTCAACCACTGGTAGCCCTGGGA----AGGGGAAAGCC-CAGGTAAGGGAAGGTCCCTGGACCTCTC-------GATGCAGGTAC------TCTTCCTCTAGAG------------------ATTCCTTCCTGGGCTCTTTTGTCCCCTGGCCTCATGCTTGGCCCTGGGCCAGACTT-AGACTCTTTCATATCA s monDom4.chr4 44337999 315 - 430141050 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AGACCCAAAGAAGTCCAGAGGA--CTAGGGCTGGAAGCAGAAGATCTG-------GGAAGGCCACGACTTACCTATCTTGTGGAATAACTCTGGGAGCTGCACCTCCACCTTCTCCCTCTGGAACATGTGATATTCAGCTTGTTCGCAGATCGGTGGGATTAGGTTAAATTGCCGAGCCACTGAATAGGCCTCCTG a score=9839 s mm8.chr4 151240541 314 + 155029701 GGGCGTCACCCTACCATGATCTCCATGGAGCTCCAGCGTGATGTGCCCCAGTACATGGCCATCCCCTGGT-TGATGACATGGGTCATGGCCCGCACGGTCTCTGAGAGAGAGAAAGAGAGAAGGGAGACCACGTTTGGGATAGCTGGGGCTCAGGGCCAA--GCCTGGGGATAGTCT-GCAGATGCA--GGTGGGGTGCCAGG-------AGGAGGGAGCAGGCTGCAAAGGCGTCTTGCAAGCAGTGTACTTCCTGGCTCCCGGAGTTCGGTGTGGGTGTCGGGAAGGGGAGATTCCCCGAGGAAAGAAAATGGACTTGAAGACAA s monDom4.chr4 44344557 308 - 430141050 GGGCCCCCCAGTACCATTATCTCCATGGAGCTCCAGCGGGATGTGCCCCAGTACATGGCCATTCCTTGGTATGATGACGTGCGTCATGGCTCGGACGGTCTCTGTCACAAGGGAAGGGGAAGTCGAG-------TGGGGAGAGGTTAGGATAATGGTCTGCTGCTCGGGGAGCATCTGGCAAATTAAATGGCAGGACACCAAGGGAAGAAGGGAGAGAGTTTACAGCAAAGACATCTTGCAAGCAGTGTATCTCCAGGCT-TCAAACTTGAGTAC-----------AGGAGGGGTTTTCAGGGGGAAGGAAGTAAAAACAAACAAAA a score=2592 s mm8.chr4 151241964 286 + 155029701 GGTTGTTAAAAGAGATCGTGGCCCTGGTGGGGTGAGGGCTGGCTCCATGGATTCCCAGCAGGTCTGATACAGTGCTTGCAAGGTTGACAGCCAAAGGCAGGGAAGGAATGGA-----GAGGGGCAAGTGTTTCTAAAATCACAGTGGTAACATCTGCCTCAGCTCCGAATGCTCCACCCATCCCAGAGGCAGATCCCCACCTGGCGATGGCAGGGACCGAGGGAGAAGGGAGGGAAGGAAGAAGAAAATGCTGGGGCTGTT------CTGGGAGCCTGCCTGCAAAGGGCACTGGGG s monDom4.chr4 44346014 266 - 430141050 GGTCCCCAGAGACGTCTGGGGCACTGGGCAGGGAAGG--------CAGGAAGGCCC--TAAGAATAATACAGTGCTTGCAAGGCAGATTGCAAAATGTAATGTGGAAATGAAAGTCTGAGAAG-AAGTGTTTCTAAAAATAAGTCCTTAGCAT----TTCACCACCAGATCCCCATCCAGTTCCATGGGTCAA---CTTCTTGGCTATCAAAGGACT---GGGAAAAGTGAGGCCACTGA----AAAAGGTTAGGTTTGCCCCCAAACTGGAATTAAGCCT------TGCACTGGGG a score=6684 s mm8.chr4 151244681 165 + 155029701 GACAGTCACCAGAGCAGCTGGCTCTGCCCTGCATGA-GTTGGCTAAGGGGATAACTGGTCGACCTACCTTCCATGGGCGTGTTGGGGTCTGGGCGGTTGGCAAAAACCACATCCACGTACTCCAGCTGCAGCCGCTCCAGGGACGCTTTCAGTCCTGGGAGAAGAA s monDom4.chr4 44347126 159 - 430141050 GACAATCAC------ACCTGGGTTTGGGTGGGGAGATGGTGGCTGGTGTTTTATCAAGAGGACCTACCTTCCATAGGAGTGTTAGGGTCAGGCCTGTTGGCAAATACCACGTCCACGTACTCTAACTGTAGCCGTTCCAAAGAGGCTTTCAGCCCTAGG-GAAGAA a score=5018 s mm8.chr4 151245719 72 + 155029701 CTCACCTTCAATTATGTGCTTCCTGGAAAGGCCTCTCTCAGTCTCCGCTCTGAAAAACACGTCAACAGGGTG s monDom4.chr4 44350958 72 - 430141050 CTTACCTTCTATTATGTGTTTTCTGGACAGGCCTCTCTCTGTCTCTGCTCTGAAAAACAGGTCAACAATATG a score=3411 s mm8.chr4 151246685 217 + 155029701 AATAGCTGCCAGTCTGTGGGTGGCTGCACAGAGGTCAACATACCCTCCCTCCCCAAGACTACGCTATGGCCCTGTCCCCAGCCTGGTCTCTGCAGGAGCCTGGGCTGTGGTGA-------GCTGCCACTCTGGG--AACACTGCAATCTCTGCACTTACTTTCCACCCCAGAAGATCTTGGTGGTGATGACAAGGCTGGACCGTCTGCAGGGCAGAAGAGAGGGAG s monDom4.chr4 44351197 210 - 430141050 AATTCCTGGAGGTCTGACAGTGGTCTCCCCTCAGTGGACAGGCCCGGGATGTCCTTGACTATCCTATGG----------------ATCACTTCACAAGATCGAAGGGTAATAATAGGACTGGTGCTAGTCAAAACAAACAAATAAGTAAATTGACCTACTTTCCTCCCCAGAAGATTTTGGTTGTAATGACCAGGCTAGATCGTCTGTAAAACAAAGGAAAAGAGG a score=2986 s mm8.chr4 151248351 70 + 155029701 CCTTCCTTGTGTGCCCTGG-AGACAGACCACAGAGAACTGGAAA---ATTACCTCCATCCCTTCTTCTTAATGA s monDom4.chr4 44354790 73 - 430141050 CTTTCAATGTGGGCAGTGGGAGAGTGACCACAGAGAA-TGAACGCTCATTACCTCCATCCTTTCTTCTTAATGA a score=1020 s mm8.chr4 151248421 64 + 155029701 TGTTCCCTAATACCACTTCAGCTCTGTGAAGCAAGAGAGAA-AGAGAGGCAGACATGGGGATTTC s monDom4.chr2 281213527 61 + 541556283 TATTGCCCAGTGTTCGTTCTGCCCTAGAAAAGGGGAAATAATAAAGGAGCAG----GGGGCTTTC a score=5145 s mm8.chr4 151258585 326 + 155029701 AGGGATACTTAGAAAAACAAAACTGGGGCTCTGCTCCATGCTGCGATTACCATGCTCAACTTGTTCCTCATTAAATGATGGTATTGGTTCTGCCATCTGCCACCAGGCTTTCCGGAGAAGGGATACGAGGGGACAGTTCACCTCCAGGCTGACAGCTGTGTATGTAGGTCTGGTCAGTGGGGACAGGAGCGTCACCGCACCAGGCCTG-------CATGGTGGCAGTTACT-----ATGCCGTCATGCAAAACACCAGAACACAAAAATAAGCCACGTGTC--TCCTCCCTTTAATTAAAACTTGATGTGATTATAAAATAATTGGTC-CAAGTCCCTAAA s monDom4.chr4 44378855 327 - 430141050 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TGGGGCTCATC---------TTTATTCCTCCACAAATTCACCAGGCCCTAAAAATAGCCCATCCCAGCTACACAACAGCATGAGCTGCCCAAGTAGGAAAGAACAGAGATTTGCAGATCGAAACAATCTGACAAGGAATAGCTGGAAGCTCA-CCACTCCCCAAGGGGCA-ACCTGGCTTCTCCTCATACCTATATTTCATCCCAGGCTGCTTCATGTTGGGGTCGCTGGATGGAGGAACGTTGTGCACGGACAGCTGTCCCAGGCTCCGGGCCACCATGGCCACTGCCCGGAACTTGCTCCTGGTGCCCAGGCTGGGGCTGCCGGCATTCTGCCGACCAAGTCTGTCTTCAGCACCTCGGCCCTTCAGGCTATGTTCTGAACATACAAAAGACACCTGCATGGTG a score=15263 s mm8.chr4 151269397 236 + 155029701 CCCTTACCGATACTTCATGCCTGTGCGCTGGGCGGTGCAGCCGTCCAGGGAAAGGCCGTGCATTTGGAGGAAGCTCTCCATGTTCCTGGCCTGGGCGGCTGCCCGCACCTCCCTCAGCCGCTGCAGCTCCAGGGTGTCTGTCTGGCGGACTGGATGCAGGGTCCAGTCTGAATGGCATCTGCTGCTTACGCTCCGCAGACTCTCGCTGTATGTCATGGACAGCATGATGGCGCCTG s monDom4.chr4 44413871 236 - 430141050 CCCTTACCGATACTTCATGCCTGTTCTCCGGGCTGTACAGTTGTCGAGGGAAAGCCCATGCATGCGGAGGAAGTCCTCCATATTCCTGGCTTGGGCTGCCACCCGTACCTCTCGAAGTCGTTGAAGTTCCACCGCATCTGTCTGGCGGATGGGGTGCAGGGCCCAGTCTGAATGACACCTACTGCTAACACTCCTCAGGCTCTCGCTGTACGTCATGGACAACATGGTACCACCTG a score=3134 s mm8.chr4 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s monDom4.chr4 44513805 1489 - 430141050 CTTGGCAAAGCAAAAAGAGCAAGAGTTTAGAGCAAGAAGTTTAAAAGGAACTTTTCAAAGGCC--AGTCATCAGATC-TGCAATGCTGCAGGGCTAAGGAGGGGATGGCAATGCTTTTGCTGCTATATTTAAATTAATTGACTAGAGCAAAGGATTACATGTTTCACTTGGAATTCCAGAGAAACAAGCAAAGTTCTGGAGAGGGGCTTGAACTCTGGTAGGCTGGCTGTGGTCTGAACTAGCTTCTCT-------------GATGTATTAATTTCCATAAATGCTAATAGGCCATTTCCCTAACAGCTATTACTT-ATGTCACCTCCCCTTGGTTAGAGTTCAAGAGAAAGGCAGAAAGCTGAAAGGAGGGGTATGTAGAAGCCCAGCTGGGGACCAGAGTTTCCCTATAGGACTCTGGATTACTATCTACTTGTTCCCCAAGAGCTCTCTCTGATTTGAGGTTCATGTATCCCTGCTTCCCTCCCCATAGGCCAGATCCTCACAGTGCAGGGGAGCAA--ACAGTTACCAAACCC--------------ACAAAATGCTGAATCACAAAGCTGAGGCATAGACAGGGAAGTGGGGGTGGGGACCAGGGGACAAAGAG------------------AAGAGTTACTGATTTTAAAAGGTTTCTACCTAGAGCATATCCTGGGTCTCTGGCCAGAGTGTAACTCTGCTTGGGGCTCTTTGGAGAAGTATGAAGTGGGGAAAGGAGAGTGTCTGAGTCCTTGGGGGATGTCCTATCTGGCCTGGCCTGGCATTGACTTGAGAGGGATGTACTTGCAGCAGCTGCAGGAGGAGGAAGTGGTTAAGCAGCCAGGC-CACCAGCCTCACAGAGAGAGAAACTGCACAGGGGAGGGGAGAGCACTCAGACACCCAAGCACTCCATGCTGGGTCTTTGATGGGGAGTCAGAAGGCAGATAAAAGAGGAGGAGGAAGAGGAAGGTGGCAGGA-AGGGCTGGCAGTGATGCTATGCAGTATGGGTGAGCTCACAGGTTGAATAGA----GGGGAGCATGGAAGAAAAAGAAGCTTCATAAGGGAAGACAGAGAGAAACCAGAAAGGGGGTGAGAAGACAAAAAAGGATCTAAGA--AGAAAGGGAGGAAAAAAGGATGAAG--GAACAGTGCTCAGGGCATTGAAGAAGGAAAAAAAGGGAAAAGCAGAAGAAATATATGTGGGGGCTGCAGATGAGTAAGAGGTGGGAAACCTGGATTTCAGGGAAGATAGAAAAAGTGAAGAAAGGATTTgagaatggagaaggcagg---aaggagaagggatggagatgaaaggagaagagcg-catggatataggacaaggaaaaggaacagagatggagatgggaaagggatagagatggagtgggaaagaggaatagaga--tgggaagggaaagaaggaatggagatggagaggggaagagaagggatggagatggggaaaggacaagggatggagatgggaaagggatagaaatagggaggaagaagagtggagatgggaaagggatagaaatag a score=10325 s mm8.chr4 151321153 658 + 155029701 CAGCGCAGCCTCGCAGGTGCCC--GCCGGGGTCTCCCGGCTGCACTCACCTGGGGGCCT------CCAGCTCCGGATCCCACGCCCCGTTCCGGATCTTCCTTCCTGCCCTGCCCTT---GCGACTTTAGCACCCCCGAATCCCGCTCGCTCCGGCAGGTTCCGCCCGCAGCATCTTTACCTCGTGGGACTCCCTCGGCCACGCCCCTAGCAGCCTATTATTGGCTATGCTTCACGCCAGTCACAGTCTCATTGGCAATGGCCAAGGCAGTCCATGCAAATCATGCAGCTCCCGCCGATGCGTGGATTGGCGGGCGCGCGCAGAGTCAGAATCCTTGGACTCGGGTTCTCATTGGCCG--------CGCGG-CCTTGACG-CAAAAGTGACGTGGGGCGGGTTCTGTGCTGAGTGAG---CGGTATCCCT------CAGGCCCGGGCTCCACGCG-TGGGTGGC-GGTGGATTGGGTGACCCCCTC-----------GGTCAGCACTGGACCCACGACTCCTCGG----------------GTTCCGCTGGGCACCGGCAGCCCGATCGCTGGATCCACGGTGCGGGACGTGT--------TCGGTAGC-GTGGATCCGGTGCCCGTCTCCTAGGTAA-CGCGCCAG--CAAGGACTGAACCA---AGTGCGGGGGAAGTCAGCGTGTGTTGGAGTCGCGGGTGGCAGCAGAGCCTCGAAGAGGCCTCAGGG s monDom4.chr4 44516231 710 - 430141050 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CTGGTCCCATTGCTCAGGTGGAGTAGTTTCAAGGTGACCTCTAAGCTCGGCAATTCCAACTGCTTCTCCTGAGAACTT--AAATGTTTGTTTTACTGCTGAGAGAGGAGGAGGGCAGTGTTCATAGCATCAGTATGCGCAGGTGTAAATACACA-GGTGAGGCTCTGACAGGCTAACGGCCCAGCAGGGCTCTGCCAACAG--CGTGAGTCCG-GGAACCCGAAGCATAACTCTGCCTCGGCCCAGCCACCTGTCAGCTCCAAGTGGTCATTATTTCATCATTTTGCAATAAAAGATAATAGAATAACGATTTATAGTTCGAGGCTGATGTGTTAATGCGTCCCTCTGTTAT-CCTCACTGACAGTCTGTGATTACAGTAACCACTTTCTGGGTGACACCGTGGTAATGACGCCTTAATAGGAGTGTTAGCCGGAATTTCAATCACAACCCA--CTGGCAAACCTCTGCCCTGCCTGG--CGCTGTCTGCAGGGGGCATCTTTGTGCTCTGCTGGGGGCTA s monDom4.chr4 44564668 515 - 430141050 CGGACCCAAGCATTCAGATAGAACCATTTCAAGGTGACCTCTAGGCTATGGGATGATTATTGTTCCATGTGTGGAATTTAGAACGTTTGTTTTACTGC-GGGAGGGAAAGTATGTGGTATTTGTAAAACTGATATGCAGAGGTATAAATATAAAAGGTGCAATGATGACTAACTTACCTTTAGAGTGGGCCTCTTTAACGGTTCCTGAGCCTTTGGAAACAGAAACATAATTCTCTCTTAGTCCAACCACCTGTCAACAGTAAGTGGTCATTATTTCATCATTTTGCAATAAAAGATAATAGAATAACGATTTATATCTCATGGCTGATGTTTTAATGCGTCTCTCTGTTATCCCTTGCTGACAGTCTGTGATTACAGTAAACGTTTTCTTAGTGACACCATGGTAATGACTCGTTAATAGAAGGATTATTCCAAGTTTAAATCAAATGGTAGGAAGACTAGCCTCTGTCCCTGCAGGATCTTTGTCTTTGTGAGA-----TTGCCTTCTCTTGGGGGCCA a score=8649 s mm8.chr4 151340437 187 + 155029701 CTCTGTCACAGCCCTTGTACTTCCACACGACCTTGAGCCACCCCAGCATCGTGGCTGTGGTAGAAGTGGTCACCGAAGGCAGGAAGAGGGACGGCACCCTGCAGCTGCTGTCCTGTGGGTTTGGAATTCTTCGCATCTTTGGCAATAAGCCAGAATCTCCCACCTCTGCAGCCCAGGACAAACGGTA s monDom4.chr4 44567143 187 - 430141050 CTCTGTTTCAGCCTGTGTATTTCCACATGTCTTTAAATAATCCAAACCTTATTGCGGTGGTGGAAGTTGTTGCCGAAGGCAAGAAACGAGATGGGAGCCTCCAGACAGTGGCCTGTGGGTTTGGGATTCTGAGACTCTTCAGCATCAAACCAGAGACTCCTGATTCTCCTGCCCAGGACAGACGGTA a score=5520 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s monDom4.chr4 44591271 1118 - 430141050 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CTTGGTTTGCACACTGGGTGGGAATCCATCCTTCCCAGTGAGCGCCTTTAAGACTTGTTGTTAATTCAAGTGTTTTATGATTTCACTTGATTAATGTGTTTATTAAATTGTAATTATAGCTGAAAGTGAGATTTGGTTCTGGTGTCCAGGGCTCACATTTCTCTTAAGAAAACAAGGATGATAAATGAGTCAAATTTACGTTTAGACTCTTCTTCTGGGTTTCTTTTGGGGGCAGACTCTCCTGGGTTTCAGCTCCAATATATGGTGGATTCTGGGTTCCTCAAGTCTGGAGAACAGCGGTGGTTCATCCATTATCTTGCTGTGCAGACCCTACAGATCGATGTCTGGGATGGAGATTCGCTGCTTCTCATTGGGTCTGCAGTAGTGCGGATGGAGGTAAC a score=11072 s mm8.chr4 151390728 286 + 155029701 TCTTCTCCCTGTT--GTAGCACCTCCTCCGCCAAGGGCGGCCAGCTGTTCAGGTCTCACACGAACTGGAGGTCGTGGCCACTGAGTACGAACAGGAAATGATGGCCGTGAGCGGCGATGTGGCTGGCTTCGGCAGCGTCAAGCCCATCGGAGTCCACACGGTAGTGAAGGGCCGCCTGCACCTGACCTTGGCCAACGTGGGTAAGAGCCTGGCAGCTTCACATGGCCCGCCTGGTTTTGTGCCATTTATCTAGCACCCGTCTCCCCAGCCGGAGCATGAGGGGAGCAC s monDom4.chr4 44648268 278 - 430141050 TATTCCCCTGGTTCTGCAGCATATCGTCCGCCAGGGTCGAGCAGCTGTTCAAGTCTCTCATGAGCTCGATGTTGTGACAACAGAATATGAACAGGATACAATGGTGGTGAGTGGAGATATTACAAGGCCTGGCACTGTTAAACCCATCGGAGTCCACACTCTGGTCAGAGGCCGTCTACACTTAACTTTGGCCAACGTGGGTAAGGAGCCCCAAGCTTC------CTTGAATGGTTTTGT-CTTTATATCTGGCTACCTTAGCTCCA---GGAATatgaggataggac a score=3318 s mm8.chr4 151391534 141 + 155029701 GGGCGATTTTCCTGGTAAAATTGAAAGCATAAGACCCGTACTGGGAGGCGGTTGTG-------AGGATGGGACGGAGATTTCTGTCTTTC-----TATTAGGGATTTTTCCATTCCTCAAAACCCAGCCTCCTTTTAAGTCCAGGAGCCCCAC s monDom4.chr4 44649440 148 - 430141050 GGGTGAATTTCTTAGCAAAATGGAAAGCGTAA---CAATACCAGG-GACTTTTGAACCAAGACAGGTTGGGGCACATAGTCCTTTCTCTTGTGTTTGATGAGGAATTTTCCATTTCTTAAAAATCA-CCTGAATTTAAGCCCATGAGCCATAT a score=16413 s mm8.chr4 151391709 428 + 155029701 GCGGGGCGGGGCGGCAGTGGCACAGGAGTAGACGCACAGCTCATTAAGTCTGGTTGGAGGCTTCCGCCTGCTTGTTTACAAATGTAAA-TCCAAGGCGGCCTGGAAAACAGACAATATGGAAACAGCAAAACTCAATTAGGTTCCGGAGAAATAAACGAGGCTCCCATGAGGAGGGGGACGCTGCTCCTGCTCCAGAGCCCTCGAGACTC------CGGGAGCCGCGGGCAGGACGCGCCCAGCTCCCGCCCTATGGGGCCTTTTTATATTTAATTCACCGGTGCACACAGATGTGCAGTGACTCCAGGTTTGAAAATCTTATCTCGGGGAAGAAAGATGGGCCCCGTTACGTGTTATCTTAAGCTGTCATTTTCGTACTTTGCCTGCATGAGGGAGATAAGGCAGTGGGGACCAGCGCCCGAGGTAGCCAACAC s monDom4.chr4 44649623 423 - 430141050 GCCGTCCCTGGCAGCAG--GAATCTGAGTTAATGCACAGCTCATTAAGTCTGGTTTGAGTTTTCTGCCTGCTTGTTTACAAATGTAAAATCGGAGGCAGCTTTGAAAATAGACAATATGGAAACCGCAGAACTCAATTAGGTTCTGGAAAAATAACTGA-------ACGACATGTGAAAAACAGGCATTATTCAAAAGCTCCCAGCATCCACAGCTCCAGAATGGCGAGGAGCATTCTTGCTTCCTAGAATGTACTGGTTATTTTTGTATTTAATTCACAAG--CCCACAAATGTGCAGTGACTCCAGGTTTTAAAATCTTATCTTCAG-AAGAAAGATTAGCTCTATTATATGTTATCTTAAATTGTCATTTTCATACTTTGCCTGCAAGAGAATGATAAGCTCTTGGGAAAGAGAGTCGGAGACACACAACCC a score=2268 s mm8.chr4 151392237 113 + 155029701 GAAATGTTATGGCCTTCATTTCTTTAGAAGACCAGTAATTCCACTTGGCGTAGCAGTCATGTTTCAG-CAAACGGGAGGCTGGCTGCGGGGGCCTTCAGTGTGACAGACACAAA s monDom4.chr4 44650173 114 - 430141050 TAAACTTTATGGCTTTTATTTCTTTATAAAATTAGTTATTATGCAGTGAGCAGCAGGACCACTCCTGAAAAATTGGATGATGACTGTGTAATTATTTAGGACTACAGGAATAGA a score=5325 s mm8.chr4 151395586 152 + 155029701 GGGTGCTTTTCACTTAGGTCACGCTTGTGAGCCGAGAGCAAGAGGTTCCAACTTGCTGCCGCCATCCAGGTCTCGGGTCAT---CTCAAATGATGGAGCCAGCTTCTTCTCTGGGGGAAGCCTCCTCATACCCGGAGGCCCCAAGCGTGAGTTGA s monDom4.chr4 44656902 155 - 430141050 GGCTGATTTCAATTTAGGTCATGTGTCTGAACAGAAATCAGAGGATTCCAACTCGTTGCCTCCTTCACGATCGAGGATCATTTCCTCTAGCAATGGGACTAGTAGCTTCTCTGGAGGCAGCCTTCTTAGTCTTGGAGGCCAGAGAGGTAAGCCAA a score=6314 s mm8.chr4 151398290 251 + 155029701 ACCTTGACCCCCGCTCTGGCCTTTTCCGTAG---GAAAGCGTGTGGTACAGGCCCAGAGGCTGGCTGATGTGGACAGCGAGCTGGCCGCCATGCTGCTGACACACACTCGAGC---TGGCCAGGGGCCCCAGGCTGCAGGCCAGGAGGCAGACGCTGTGCACAAGCGGAAGCTGGAGAGGATGCGGCTGGTGCGCCTGCAGGAGGCTGGAGGGGACTCTGACAGTCGCAGGATCAGCTTGCTGGTGAGGGGCCTCCT s monDom4.chr4 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TTTCTCCATTTCCAGGTGCTCCTGTGGGG---ATGCCTGGCGAGGATCCCCCAGTGCATGTTCGATGCAGTGATCCAAATGTCATCTGTGAGGCCCAGAACGTGGTA--TGCCACCAACGTTAGCCCTACCTTGAGCCGATCCTTGGGGGAGC------CCCTCCCATCTTCCCTCCATGCCCG-------AATCCTCCCT---TTGGGCTCAAGCTGGGGT-------------------------CTGTATGCAGGGCGGGAGGGCTGTCC-----------------TCACATCCTGAGGGGGCCTTGTGGAG---------GAGCTTCCGAGT-------------CCTCTGCTAGCAAAGCCATTTCTTCCCCGAGTCTCTCAGCCTGAGTTTTGAGAAAAGGCACGAGGAGGA-------GAAGCAAGCTGAGCCTGGTAATTTGAGGCACTTACTAATTGCCATTGTGCAGA-GGCTGAGGGCACTAATTGTATTATGACTGCTTAGGAAGTTAGATGGAG--TCTGTGGAATGTAATTATTAAAATCAATATAAGATCA-AGAAGCTGTGATCTTC-----TCGAGCAGAGAGCTAAACAGT-----------GAAGACTTGTGT-------------GGGAAGGGGCT-----GCGCACACCTGCCTGGCCTCACC-----------CAGCAGGGGGTGG---------GAACCAACG-----------------------------------------------GGTGCCTCCTGCTGTGC-TCGGCAGGGCCCCGGTGAGCCGAGAGATGTGTTCCTTAAGGTGGCCAGTGGTCCAAGCCCGGAGATCAAAGACTTCTTTGTCGTCATCTATGCGTAAGCA--CAAACCCTGGGACTAGAGGAAGTGG s monDom4.chr4 44684957 900 - 430141050 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TTTGCCTCAGTA--TCTTAAGGTGCAAGGC-----TGGGTGTGAACATCTCTTG------TTCTTTTTTTTTTTTTTTGACAATAATTGCTTTTTAAATCATGTAAGTGGGTTAATTCTAGGACGAAGCATACCAGGTGGAGGAATTTTCTTTATTTGTTCTTTATCGTAAGTGAAAGAGCAGATAAATTAATGAGACTGAGCTCTATTTTATTAAGTATGGCTTCCTTTTTTGATTTACACACATTTT-ACCTTTTGGATTGCTTTTAAAGAAGGTTATGGCAAGAGTGAACCTATTCATCTTCCCAGTGTATTTAGTTTCCTTTCATAAATTGTGTAGATTGCATTTTAAGGTAGTGGAAATTGGATCTAGCCTTTAAAAAAATTGCTGAGGCCAATTAGCTGTTATAGTGTTTAATTATGGGAGAAGTGCTCACACCTACAGCCAGCCATCAAGTAAAATCTTCCTGAAAAAGCTTTT a score=6559 s mm8.chr4 151431447 429 + 155029701 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AGCTCCCTGCCTCTCCAGCTACTGTATAAGTACT-----TGAAGTCTGGAAAAACACC---------AGCAACTGAGATCACATTTATTTACATGGGAGCGACACTGGGAGGTACGGCCAGCCTTACTTAATGGATTCCTTTAAGATTAAAGCTGTCAAATATCAGATACAAAATCTTTATACAACATGAGCTACTCTATTAAGTGCACTCAATCACAACCAGGCTGAGGGACTTTTAAATGAAAGAATGGCTCACCGAAAAATGCATTCGACAAGTTGCCAAAAATAAAAAATAAGGCGTGTTGTGGAGAATGACAAAAAATGGCAAACAGATATTGTCAGAGCATAATAAAGTTGAGACGGATGGTGTTGGAGGGGAAATTTTACAGCGCGTCCTGGCTCATGCTGGAGACATCAGGCCGGCAGGCGTGCATCAGGGTCCATCTATCTCTTTTTCTGGTTCCTGGAGATTGAGCATGAAAAATGACAAAGGATGAACTAAGTAAACATCCCATATTTCACTCTCTGAGAGCTCACCTCCCTGGGTAACTCCAACCAGAGCTCAGACACAGGACTCATGGATGGGGCTTCTGGCAGAGATGGACTTCCAAGGCTTGA---ACT----CCCCAAGATTGGCCTGGGAGACCTCTGG a score=17635 s mm8.chr4 151447616 521 + 155029701 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TAAAACCAGTGACCTGCAAGTTGAGGGCTCCAAATCCCATTACCAGTTTCCATGGTCATCTCAGCCTTTGTCCTCTCCTCCCTGTTTACATCTCAGTCTGTCAAGGGCTGTTACAGTCTTGTAGTTATGATTTTGTCAAAGGCTGGGAGCTGCAACTGCATCTTTAGCAGCTGGAATAATTTTTCCTGTTTATGTGAATTAAAAAAAAAGTAACGGCCCATTTTACTACCCCCCTCCAAAGCACCCTTTTCTTCTTGTTTCCCAATTGTAATGTTGAATGATCTTATTTAGAACAAAAT-GGGAAGCTATTGTTAGTATGGGGATAGATCAAGAGACCATAAAAATGTGTCAGAATGTGCCATGACAAATCTAGGTTATTTTTCTGCAAAGATATTTTGTGGTACTGGATTGAAAGTCAAACTCAGCTTCAAAGCATATAATGTTCAAAGTGCTTTCATGGTCTTTGATATGATGCTGTGCACCCATCACTTTAGAAATAGGGGTCTTCTCTAGCAGGTGTATGAGTTG-----GCATGCAGATTAGGATG a score=4353 s mm8.chr4 151487220 265 + 155029701 TCTCAGCAACATCTGTTGGGAAAAGATGAGAGATACCATAAACCCGTGGCCTCACTTCCATGGCCCAGC----CACGTTCTGTTCCC-AGCCTCGTTGGAATTCAGGCTCTGACACAC-GGGCTGTCTCTTGGTGGTGCTGTGTGT------GGGATCCAGTCTACGACAT--CGGTCTCTTTTTGGCTGACCTTTTTGCTTTGAAATTGCCTGTCACAGAGCATGTTATACCCAGAGGTCAGGACAGGGCT--TTATTTCATTCTTCTGTTGGGGAAAAA s monDom4.chr4 45047259 271 - 430141050 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CACAGGACACCCTCAGGAAAGGCCCCTCAGTTGGACTGAGCGGAATCAAAATGAAAAACGGAGAGTTAGATTTCACAGGACACAGTTAGAG-GGAGGGAGCACTGGGGAGGGGACACAGGGTGGGGCTCCAGGAATGGGTGGGGAAGAAGAGGT--------GAAACAA--------AGGGGGATATGgagagag-----aggaagagaaagagag--ccagccagccagagacagagggggagagacagacagacagacagagagggggagagacagaccgacagagacagagagggggagagacagacagagagggggagagacagactgacagagacagagagggggagagagggacagggagagacacagacaaacagagaagaggagagacagacaga---cagacagagaggggga-gagacagacagaca-gagagggggagagacagaccgacagagacagagagggggagaga---gggacagggagagaCACAGACAAACagagaag----aggagagacagacagatagacagagagggggagggagataaacagagacagagagggggagagacagagacaaggacagagacagacagacaaacagagacagaagggagagagagacagacaaagacagggggagagagggacagagGGTCacaggcagacagacaggcagacagacagagag a score=1803 s mm8.chr4 152373793 48 + 155029701 GGCAATTGTGGTGTCTACCAGGATGCAGCTCCTCTTGCAGGGAGAGAA s monDom4.chr4 46855629 48 - 430141050 GACAAAAGTAGTGTCCTCAAGGATCTTACTCCTATGCCAGGGAGATAA a score=10115 s mm8.chr4 152374172 559 + 155029701 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TGTTAAATGCCAATAGtttttatttattttattttatttttGCATGAAATTGAAAGCTTTCCAAGTCCATAAGATAAAATCTTTGCCTGAGCCTTCTCTTTTTACCTATTTCCTTCAGATTTTTTCCCCCTAAACCATAACTGCCACTTATAAATTATGAATTCGGTCTCTGGCCTCTCCTGTTCAGTTGTATAACCTTGTTATGTTAACATAAAAATTAAACACGAGAGATGAATCAGCTAAATTGGACTCACTTATAGAGATCAAAACCACTGTAGCATAGCAGTAGGAACAGG-GCCAGGAATGGAGGCA-CAGAGG a score=1869 s mm8.chr4 152445789 51 + 155029701 TAAATAAACACAGAGAGAGAAACAAACAGATAGGAAAAACTAGGAGAGACT s monDom4.chr4 47051598 51 - 430141050 TAAATTCAGAGAAAAAGAGAAACTGAGAAATAAGGCCAAATAGCAGAGACT a score=6165 s mm8.chr4 152448208 185 + 155029701 TAAATGCCATGCTTCCAGGGAGTGCAGCCAGGGAAAGTTCAAGGTAATAATATCAGGACTCGCTCAC------TCCCTTTCTTTTGACATTTTACTGCAAAGCGAGA-------------------TCAGATGGGTATATTTAGTTCCTTTTGTTGGTGAACGTTTCAAAGGTGCTTCTGTG-TGGCTCTCATTAGCATCAGGTATGCAAA s monDom4.chr4 47056350 211 - 430141050 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CCCTTCTCAAACATGGCGGCGACGGGGGTCCCAGGGATGTGCCCTTCCCAAACATGGCGGCCAAAACGGGCGGGCCTCCGCGCGAAGGAGACGTCCCTTTCCCAGCGTGGCGGGAA-CCTTGCCCAGCTTCCGGCGCTCCGCCCGCGGCTCGCCGTCCGTCGGGGAGGCGCGCGCTGCCCGCTCTGCACGCGGAGAGCACGTGACCTGGAGACGCCGGCCCCTGATTGGTG-ACGTGGCG-ATGACATCAGACGCCGCGCGCGCGCTCAGAGCCG--------------CGCGATTGAGACTTGGCGGAGGAGCGTTAGGCCGGGGCGCTCA-----------------------------CTCATGAGGAGCAGGAAGGTGAGGGGCC------------------CCCGCAGGCGGGGTGCGCGCCGCCGAGCCGCACTCTCCCAGGGGAGCCGGCGGGGGGC--GGGCGCCTCGAGCCCCGCCCCTGGGAGGGGAACCCGCACTCCAGGCACCTCCACCCGCCCCAGGCGCGGGGCTCCAGGCTCGCTCCCCGGGGTGAGGGCCACCGGGACCCGAGCTTTGCCCTCGGCCGTGCGGGCTACTGCCCGGGCTTCCTGGCCTCTC s monDom4.chr4 48173068 564 - 430141050 CTCCGCTCAAACATGGCGGACACTA----CCCAGT----CGCCTCTCACAAGCGTGGCGTTT----CGTGCG------CTCGCGCAGACCCCGCCCCCTGAGCCGCGCGCCGCTAAGCCCCGCCTACCCTCCGAC----CGCGTGAAGCCTGCCCTCAGTTGGGG---------------GCCAAACGTGTTTGGGTCACGTGACCCAGCGCCGCCTTGTCCTGATTGGTGGAGGTAGCGGACGACGTCGGACTACGCG-GCG-GCCCGGTGCTGGTGTCTCCCGTGGTCTCGGGTCAGGTGCGGTAG-GGAGCGTTAGCCCCGGTAGCTGAGGACGCCGTGGTGGCGGCGGCGCCTCAGACTCATGAGGAGCCGGAAGGTGAGGGAACCCTGGCCCGTGGCCCAGGCCCGGGGGAGGGGAGGGACCCGCGGAG-----TTTGGCCGGGGGGAGGGGCGAGGAGCCTGGGCAATAGGGGGGCGG-----GGGCGAGAAAGGCAGACACCCAACCCCCCCATCCTCCACCTTCACCCCCTCACATTCACCCACCCC------ACCTCGGTCGAGACTCGATTTGTGACGTGAGCC---CATTGTCCTGTCCGTG----CTGGTCTCTC a score=4867 s mm8.chr4 152803524 143 + 155029701 TCTCTGAGCTTTAC---TCTTGTCTAGCTTACAGGTGGAGTGCGGTCCTCAGCACGCCTTCGGGCCCGGAGTTACTCTTCAGCCAGCTTGGCCTCTGCCAGGGACGTTACCAGCTCCACATCTGCTAAAACAACATGTCTGGTGAG s monDom4.chr4 48179412 146 - 430141050 TCTCTAATCTCTCCATATCTGATTTAGCTTGCAGACGGGGTGCGCTCTTCAGCACGCCTAAGGAGCAAAAACTACCCAGCCACCAGAGCTGCTTCGGCTCAAGAAGTTGATGTCTCCAAAACTACAAAAACAGTGTGTTTGGTGAG a score=11882 s mm8.chr4 152804280 548 + 155029701 TGCCTCTGCTA-ATGGGTCTGATTTTCTCTTACATTTTTCTTTCTTGGCAGGCTTCCTCATCACACAAAGCTACGGACAGACGAACTTCCAAAAAGTTCAAGTATGACAAAGGTCACCTTGTGAAGGCAGAATTACAAAAACTTGACCCTAAGAGTGACATTTCTTCTTTGCCAAAAGTGGCCCCCGTGGCTCCTTGTGAAAATAAGTTTGCGGAGGAC------------------------AGTGCTGAGGCTGCTGTCTCTG--------TACCAGAGAGCAGAGAG----------------CCGCCTCAGGGCTGCTCCACGCCTGCGAGTGAGGAACCCTCAGTAAAGGCTGAGAATGGCCTGTC----CACAGAACCCAGCAGTGCC--GCTGCAGCCCAGGAGCCCGATGACAGCTCTGCCGGACAGGCAGAGCCTGTGCCCAGGACAGAGGAGGTGCGGGCATCCGTGCTTCAGATGGACAGCAGCATCTTTCTAGATGATGACAGCAACCAGCCCATGCCTGTGAGTCGCTTCTTCGGGAATGTCGAGCTTATGCAGGTGAGTGTTGCCTCCTCCTGCCTCTCCTGCAGTGCC s monDom4.chr4 48180670 600 - 430141050 TGCTCCTGATAGATATCTCTAGTTTTTCCTTAAGCTCATCTTTCTTGACAGGCTTC---ATCTCACAAAGCAACTGAGAGGCGTGCTTCCAAGACACTCAAGTATGAAAAAGATGGTTTCACCAAGTCAGAATTACAAGAACTAAAAGCCAAAAAAGAAAAAACTTCTTTGCCAAAAACTGCATCTGAGATCTCGAGTGAGAATGAGCCTTTGGTGTATGCTGAACACAAAGCATTGCTGATGAGTAATGAAGCAAATACTTCCAAGATTTATGAACAGCAAACAGAAAGGAATGAAAACGGCCTTTCTCATCATGGCCACTCCAGAGATGTGGAGAACAGCTGCTTAGCAAAGACTGACAATGACTTGGCTCTGCCCAAATGTAAAGAAAACCTGGTGGAAGAAGATGTCTTTAATCACAGTACTGCTCTGCTTGGTGAGGCTGGGCCAGAGGCAGCTGATCTCCAGAAGACACCTGCACACATAGACAGTAGCATCTTTATAGATGAAGACAGCAATCAACCAATGCCCGTGAATCGATTCTTTGGAAATGTCGAACTCATGCAAGTAAGATTCAAACATTTCTTTTTCTTTTGAAAAACC a score=7163 s mm8.chr4 152805258 125 + 155029701 AGACTGAAGTCATGCTTTCTTCCCCTCTAAGGATCTGCCACCAGCCTCTTCATCTTATCCTTCCATGAGCAGAAGAGAATTCAGAAAAATGCACTTCAGAGCCAAAGATGACGAGGATGACGCTG s monDom4.chr4 48182184 123 - 430141050 AAACTGAATT--TCCTATTCTTTTATCCAAGGACCTTCCTCCAGTCTCTCCACCTTGTCCCTCCATGAGTAGACGGGAATTCAGAAAAATGCACTTCAGAGCCAAAGATGATGATGATGATGATG a score=6042 s mm8.chr4 152813735 195 + 155029701 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CCCTGAGCCTCTCTGCTCCAAAGAGGCTCTTCTCT------GTTT-----GCTCCAGACACCCTGGCCACCATGGTCATCCCAGGCCA---CATACCTTCAAACCAGGATGGGTCCTGCTCCCGGGTCTCTGCAGTAATATTCTGGCTCACGTGATGCAGAAGATCGGCCAGCAGCTTTTGCCTCAGTGGGGCCTGCTCATCTGACAGCAGTTGCCGTGCAGCCTGGATGACGCCGGCATGTGGCTCATTAAACACACTGAGGAAACGTGTGATGTCACTCACATCTGTCACCACCAGGAGACAAACAGAAACACATTCATGCTGTTCTGGCTCCAAGAATTCAACCCA---AAGACTGCCAGACATCAGGACTCTGGGGTCACCAACCCTTTCCCTGACCTGACA s monDom4.chr4 48208380 401 - 430141050 CTCTCAACTTCCTAGCTCAGGAGAGCACCTTCCCCCGACAAGTCTCAAGGAAGCTAAAAAGCCTGCCCTCCAAAGGAGCAATAATCCAGAACATGCCTTCAAACCATGGCGCATCCTCCTCTCGGGTTTCTGCCTGGATGTTCTCGTTAATGTTGTGAAGGAAGTCCGCCAGAACCTTCTGCCTCAAAGGAGCTCGCTCATCAGTGAGCAGCTTCTGAGCTGCCTGGATGACGTCTGCTTGCGGCTGATAGAAGATGGTGAGAAAGCGGTGGATGTCGCTGATGTCTGCCACCAAGAAGAAA-AAACAAAGCAAGATGCATCCAGCACTTTAGGAGGGAGCTCAGTCCACACAGCACTGCGAAGGCT----ACCATGGGATCAACAGAGGCTTCTGGGACTTCCCA a score=3451 s mm8.chr4 152818664 132 + 155029701 ACCTGGAAGCGGACGCAGCCCTTACGCAGCAGCTCCTGGCAGCTCCGGGCCGCCACGCCGAACTTGCAGGCGCTATGTAGGGCTCGCAACTTGACGCATTTGGGTTGGCGGAGCACCGCGCACATTGCAGGG s monDom4.chr4 48222837 123 - 430141050 ACCTGAAATTTCTGACATCCTTTCAGCAACACTTCCTGGCAGCTCTTTCCCGCCACCCCGTATTTGTCCTGGCTGTGTAGCGCCCGCAGCTTGA-------AGGTC--CGGAGCCTCTTGGACTTTGCAGAC a score=2027 s mm8.chr4 152818796 540 + 155029701 CTGCGGTACCGTAGCGACACTGGACTTGTAACGTTCCTGCCCGGAACTGTGGTGCGTAGACGCGGCCCGGAACTCTTTTCTCTACGTAGGTAGGTGCAACCGGAAACGTCCGACTGCAGGACCTGTCCCCAGCCAGAATCCTCGAGGCCTGGATGCGCACGCAGGCGCCGGCGGGCGGACGCGCAGGCGTACCGCGCGGGCCGGCCTGGTTGCTATGGGAGC-GCAGCTGCGGCCCGGGCCCTGGGCAGAGGCAGCCCGGGCTGCTCCTCTGCTGCCCTCCTCAGAGGCCCGGGGTGGGGGCGGCTGGACCGAGACCCCTCCGAAGATAGCGGAGGCCGACATCGCAGCGGCCCCGCCTGGTCGTTTCCGCGGCGCTCTGTGACCCTGCGTGGCCTCGGTCTTCGGCAGGCACCCGGGGCGGAGGCTCCCTGACACCTGGCCTTGGAGGGAC-------TGCG---CGGCCAGTGCCTGTTCCAGGCCTCCCTGCAGCGCATCTCAGCCTTCGTGTCCGG---AATCGGATTCGAGCCCCGCCTTGTCCTCGTC s monDom4.chr4 48223210 472 - 430141050 CTACAGTTCCCATAAGACGCCGGAGTT-------TCGTCCCCACGGTGCAGGTGCGCAG---TGGGCGGG--CCTTCCGCTCTGCGCAAGT--GCGCGACTAGAGGCGGGGACCGGAGGGGAACGAAGGGGAGGAGAAT----GAGGGCGGGGTGTGCAGCTCGGCGCGTGCGCACCGGGACCCTCGCCCGCCAGGCCTG--GGCTCGGTTGTCATGAGAGCCGCGGCGCTGGCCCAGGCGATGGGTGGAGGCAGCGGCGGCTGCCGCTCC-------------GAGGTGCGGGTGCCGGGCAGCTGG----------------GGGCGGCGGAGGAGGAGGCGGCGAGGCCTACGCCTACGC-------CTGCGCTCTGCGGACTGGAGC-----------------GGCGGCTGCGGCTGCTGCTGCTGAGTAGGTGGTCGGGGAGAAACGTTTAAAGGCGATCCTGCCCCTTCCCCTCCC---CCTCCCTCCGGGGCCT------CTTCCAGCCCGGCCCGAGGAGACCCTGCCCCTGCCCCGCCCCTCTC a score=301 s mm8.chr4 152819357 400 + 155029701 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GTATGACATGAACTAACAC------------TACTTCTAACCCTGGGTTGGATTCGTTCAC-------AGAGCTCTTCCCTGCTCTTCTGGACAGCCAGTGTGTGCAGAATGCCCCACAAGATTGGATTTGTAGTGGTCAGCTCCTCTGGACATGAAGATGGCTTCAGTGCCCGAGAACTAATGATCCACGCACCAACCGTCAGTGGGTGGAGATCACCAAAGTAAGGCTGGGCTGAGGGGTGGGCATGA--GAGCGCATCTCTGAGTGAATACATGGTGGGCTTTACACCTCCTGGTCCAAAAACATGAAATGCATGTCTAGACAGCTATATGGTATATTTCAGTGAAAA-------------------------------------CTAAATTAAATCATTAAAAT-------------TAAAGTACATTTTTTCTCTTGGAGT--TTCTGAGAGGACCCAGT--AAGCAGCACCCCTCCCTCTGTGCCTGAGCTGAGGGACGGGA s monDom4.chr4 48232127 489 - 430141050 GGATGATATGAATTCATAACAAATTCTGGAATAATTCTGATATTTCTATGGGTTCTTTTACTTTTTAAAAAACCTTACCCTTTTTTTATGAACAGCCCAACCGCACAGAATGCCACACAAGATTGGGTTTGTAGTCGTCAGTTCATCTGGACATGAAGATGGTTTCAATGCAAAAGAATTAATGGTCCATGCACCAACTGTTAATGGATGGAGATCACCAAGGTAAAAATAAA-TAAATGATAAATatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaat------------------gaaAAGGAAATGGAGGGTGAGGTAACAAAATTGTGTCACTCAGGGACAATGGATGTTTTCTTGAATTCTAAGCCCTTGGTTTCATTTTAAATAAAATGATCAAAAGTGTAAAGTGGTCATAAAGCCCACTTCTATAATTTGGTTCATTATAATCTGACCCCCTTGAAGTAGCATCCATATCTGTGTCTTGAAACTTAGAGAATGGA a score=12662 s mm8.chr4 152824955 201 + 155029701 CATGTTTGCTTTCAGATTCTGCCAGTTTCCACAAGAAATCGTTCTCCAGATGGTGGAGAGGTGTCGAGTAAGAAAGCTGCAGTTACTTGCTCACCAGTACATGATCTCTAGCAAAGTCGAGTTCTACATCAGTGAAAGCCTGCCTGAGTACTTGGTGCCATACCAAGCAGAGAGGTTCCGCAGACTGGGGTAAGAAGGACA s monDom4.chr4 48235173 201 - 430141050 CATACTCTCTTTCAGATTTTGCCAGTTTCCTCAAGAAATTGTCCTTCAGATGGTGGAGAGATGCCGAGTTCGAAAACTTCAGTTACTTGCTCATCAGTATATGATTTCCAGTAAAATCGAGTTTTATATTAGTGACAGTTTGCCTGAATATTTTGCACCATATCAAGCAGAGCGCTTTCGAAGGCTTGGGTGAGAATGAAA a score=9368 s mm8.chr4 152825195 385 + 155029701 GTGGATTGTGCCTCTTGCCCTCTGTGACCTTCCTACACACGCCTGAGATTTCATTTGCTTAAGAGGCACATTCCACATCTGTGGGGTTCAGCGGCAGCTGCGTCTAGGGTGGGAAGCTTTTCTCAAGCATGTTA------ATTGGCGCATGCAAGGTCCCTAGGTTTTGTTTCAGGCCTTGTGG-GGTTCGGTGGGAATG--GGGATGGCTTTCTCAACTGTACTTGAGCAGTAGCTT----------------------TCCTTTCAGCTATGTCTCCCTCTGTGATAATGAGAAGACAGGCTGCAAAGCCCGGGAGCTCAAGTCTGTTTATGTGGATGCTGTGGGGCAGTTTCTTAAACTGATTTTTCACCAAAACCATGCCAACAAATACAACATATATAATCAGGTGAGATT s monDom4.chr4 48235729 403 - 430141050 GTAACTTTTATTACTAGTTCTCATTCGGCTTCTTAGATAC-----AGAGCTTTTTTCCCTTAGAAGTATATTGCTCCAGACAATAATTCAGCTAC----TCATTAAGGGGCGATTTCTTTTTTTCACCAATTTTCACTGTATTAGGTTGGGTTGGGTTGTTGTTTTTTTTTTTAA----TATGACTATCCAGTAGGAACAAAGGAACAATTTACTTAATTGCACATGCTTATTGACATAAAATTCTTTAATTTTGCTTGGTCCTTGCAGTTATGTGTCTCTCTGTGACAATGAAAAGACAGGATGTAAGGCTCGAGAACTAAAATCAGTTTATGTGGATGCTGTAGGACAATTTCTCAAGTTGATTTTTCATAAAAACCATGTCAATAGATACAACTTATATAATCAGGTAAGATT a score=5348 s mm8.chr4 152826802 234 + 155029701 AAAGGGCTAAGGCGCTTCAAACATTGCACGTTTAACTTCTAATGATGTAACTGTTT--CTTAGGTGGCTTTGGTTGCAATAAATATCATTGGAGACCCTGCAGATCTGGGTGATGAAAGCAATATTGTAAGTATGAAAGATTCAtttcttaag------atttatttattt------------attaattatatgtaaatacactgtagctgtcttcagacactccagaagagggcatcagatctcgttacaga s monDom4.chr4 48238779 248 - 430141050 AAGGGACCAAAATGCCTCATACCCTCCGTGTTTAATTTCTGTTGTTTCGATTTTCTATTTTAGGTTGCTTTAGTAGCAGTTAATATCATCGGGGACCCTGAAAACTGCAGTGATGAGAGCAATATCGTAAGTTTGGGAAGTAAAGTTCCAAAGGAAAAAAATTAATTACTTCTAAATGAAAGCATTTCTTGGAAAAAAGTATAATCAAACTGTCAGCAAA------AAAAAAAACTAACAAAATTAACTGTAAA a score=1748 s mm8.chr4 152827173 307 + 155029701 TCTCGTCACAAAATGTATCAATTCAGAAGCT-GTCATACAACTATGATTGACTGTCAGA---GAAGTTAGCAG---CCATTTT---------CCTTAAGAATT--CTAACTG------CTCGTGCAGAAGAC-CAGGACCACTG---AGCCCTGCTCACACCTCTCTGTTAAGAAGTTGTAAAA-------TTAAGACTTGTCGTGTCCATTGTTTGCTGAGAG----------TCTAAGAGACTA--TTTTGTTT-----------CCAAAGACCTCTAGGGAGAAGCTGATCGACCACTACCTGGGCCACAGTCCCCACAATCCTGAGGACCCAGCCCTAGATGGAACTTTCTCTGGGTAAGA s monDom4.chr4 48239147 354 - 430141050 TACCTTTACAACATAGTTTTCTggggcagctaggtatagcacagggatagagtgccaggcctggatttggaaagacctgtgttcaaatgaggcctcaggtatttcctacctgtgtgaccctgggcaaatcacttacatccattgcctagccttagaatcgatacttagt--atgaattctaaaacagaacgtaaagttttttttaatagtttttctgttttgagtatacaatcctCCATGATACTAAGTTTGGTTTTTTCCTTGTCCCCAAAGACCTCCAGAGAGAAGCTGATTGACCATTATCTTGGTCAGAGTTCA---------GAGGACTCTGGATTAGATGGATCATATATTGGGTAAGA a score=11627 s mm8.chr4 152828686 184 + 155029701 TTCTCTCCTTAGGCGATCTGACTACATCTCTCCACTTGATGACTTGGCTTTTGACATGTACCAAGACCCTGAAGTTGCCCAGATCATCCGCAGGCTGGATGAAAGGAAACGGGAAGCTGTCAAGAAGGAGCGCTATGACCATGCAAAGAAACTGAAGCAAGCGATCGCTGACTTGCAGAAGGTA s monDom4.chr4 48242686 184 - 430141050 TTTTTCCTTCAGGAAACCCGACTATATTTCTCCCCTGGATGATTTAGCCTTTGATATGTACCAGGATCCAGAAGTTGCACAAATAATTCGCAAGTTAGATGAGAGGAAACGAGAAGCTGTCCAAAAGGAGCGTTATGATCATGCAAAAAAACTGAAACAGGCTATTGCTGATCTGCAAAAGGTA a score=9246 s mm8.chr4 152829083 203 + 155029701 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GAGGGAGAGGGTGCTCAGTGCTGAGTACAGGTGAGGGAGAGGGTGCTCGGTGCTGAGTACAGGTGAGGGAGAGGGTGCTCAGTGCTGAGTACAGGTGAGGAAGAGGGTGCTCGGTGCTGAGTACAGGTGAGGGAGAGGGTGCTCAGTGCTGAGTACAGGTGAGGAAGAGGGTGCTCGGTGCTGAGTACAGGTGAGGGAGAAGGTGCCCTATCCTGAGTACAGGTGAGGGAGAGGGTGCTCGGTGCTGAGTACAGGTAAGGGAGAGGGTGCCCAGTCCTGAGTACAGGTGAAGGAGAGGGTGCTCGGTGCTGAGTACAGGTAAGGGAGAGGGTGCCC--GATCATGAGTACAGGTGAGGGAGAAGGTGCCCTATC-CTGAGTACAGGTGAGGGAGAGGGTGCTCGGTGCTGAGTACAGGTGAGGGAGAGGGTGCTTGGTGCTGATTACAAGTGAGGGAGAGGGTGCTCAGTGCTGAGTATAGGTGAGGGAGAGGGTGCTTGGTGCTGAGTACAGGTGAGGGAGGGGGTGCTCAGTGCTGAG s monDom4.chrUn 69629564 537 - 174229318 GAGTGGGAGGGGCCTTAGGACAGAGAGTGTCAGAGGGGGAGAGGCCTTAGAACTGAGAATGTCAGAGGGGGAGGGGCCTCGGAATAGAGAATGACAGCAAGGGAGGGGCCTTAGAACTGAGAATGTCAGAGTGGGAGGGGCCTCAGAGCAGAGAATGTCAGAGTGGGAGGGGCCTTAGGACAGAGAGTGTCAGAGGGGGAGAGGCCTTAGAACTGAGAATGTCAGAGGGGGAGGGGCCTCGGAATAGAGAATGACAGCAAGGGAGGGGCCTTAGAACTGAGAATGTCAGAGTGGGAGGGGCCTCAGAGCAGAGAATGTCAGAGTGGGAGGGGCCTTAGGACAGAGAGTGTCAGAGGGGGAGAGG---CCTTAGAACTGAGAATGTCAGAGGGGGAGGGGCCTCGGAATAGAGAATGACAGCAAGGGAGGGGCCTTAGAACTGAGAATGTCAGAGGGGGAGGGGCCTCAGAGCAGAGAATGTCAGAGTGGGAGGGGCCTTAGAACTGAGAATGTCAGAGAGGGAGGGGCCTCAGAGCAGAG a score=6675 s mm8.chr4 152831930 484 + 155029701 CCCCAAGGAGCACCAGAGGACTCGGTACAGACTGTCTCACTAGGAGGCTGTGCCGGCTCTGAGGCCTCCCATAGCGAGCGTGTGCATTGCTCTGTGTCG---TACAGTAAAAGAATGTCCTCACACTAGTCTGAGAGGAAATGGATGACCTTTCTCCTGCGCCGTACGTCGGCTGAACCAGAAGGGTTCCACCAGGCTGTGGAGGAGGCA-----TCCCGGGCAGAG---------------CCCCCACCCAGAGCATCA-------------GCTCCACAGCACTTGGCTCACCTCTGCTTACCTTACAGACGGAAGTCCTGCCCTATGATGAACGGCCTCTTCCTGTTACTCGGAAGCAGTTGGGGGAAGCATCTGCAGAGGCAGAAGTGAAAGAGGCAGACAGTGATGTCCGGAGGCGGGGTGTCGCAGGGGAGCCAGAGCCCTTGACAGAGAAGGCCTTGAGAGAAGCCAGTGCTGCCATCGACACCTTAGGCGAAGCCTTGGTAAAAAAGGAAAA s monDom4.chr4 48246543 484 - 430141050 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ataaatatttgctaaagcaTCCCTGGGCTCAGCCTGAGA------AGCTCTCAGCAAGGACAGCCTGCATCTCCTGTCAAT---------------------CCCCTTCCTTAATTTGTTCAATCGTTTAGAGTGTTCTGCAGCCTCATTTTTTTTTTAAGCGTGCTGTTTCTTCAGGGTGATACATTTGTGTTGCAGGACACGTGGA-------------CGCTGAATCCTGGGCACTTTGGTCCTGGGCTTCTCGTCCTCTGTGTTTAGGGGCTTCTGACAGCATGTGGGTGGATATCATCTTCTTCAGAGAAATTAAAAAGCTTTTGGATTTTGCTAGCATTTTTAGGTTCCAACCATTGAACGTGGAGCCAGAGTAGCAACTGCCAGTCCAGGAAAtctctctctctctctctctctctctctcctctttgcctctgtctctctatctctctgtctctgtctctgtctctttcCCAAGTTACCATCCACAA----------ACAGACTTGTGCTAGCTCTCTCCAGTTCTTCCCGGTCTGTAAGAAGAATGCCCTTTG--------------------------------CCCCTTGCATCATGGGAAAACCTTGCTTGCATTTCCACCACTGAC-TGGACCCCATCACCCTTCCACTTGCTACCCAGAGAACCACCAGTTACTTCTGCTTCTCACACACCATATGAAGCTGTGTTCACTGCCCACGTCGATGACTTTCTGACAGCCGGTGGCAGGGAAGGAGATAGTCAGCCTCATTTTGGCACAGCCAACAGCCTAGAAAGCACCATGACAAAGACCCGACTTCCATTTATCCCCGGTTGCCCTCTGCTACACACATTTGTCTTTCCTCACCCAAAGCTGTGTTCTCCATCCTGTTCACTGTAA s monDom4.chr4 208365663 843 + 430141050 attaaattttcttaatttttGACTGGATTCAGATTTAGAGACTGAATCTCCCAGGGAAGGCATGCTGCAGCTCTTAATGATGTGTTGTTGTTTTTCTTTGGCTTCCTTCATTCTTTTAGTCAAAAGTTTAGCATATTCTGCTGATTCTTCCTTGTTCTGGATACATTGCTTCTTCAAAGTAA--CATTTGTGCTGGGAAACGTGGGGAGTCACTCACCAGTTGCTGTATTTTAGAAGCCTTGTTCC-AGGTTTCTGAGCTTCC----TAAATGGGTTTTTTCA-CATACTTCTGGATATAATCCTCCTTAGATGAGTTGAAAAGTTTGTAGATTCTACTAACTCTTTTGGGCTCCAGGAA-------AGGATACATGGTAATATCTATTAGTGCTGA-------------------TATACCTTTCTCATCTTCA-------TTTTCAATAACTAAACTGAGGTCATT----------TAGGTTGGTATCCACAATATAGCCTCTACAGATTCATATTTTCTTTCTCTAATTCTCCTAGGGCAATTGCAAAAATGGCCTTTACAAAACAGCAGGTAGAAAAATCTGAGTCAACCCACTTTGTTTCATAAGAAACCTTGTTTTTCCTTTGTACCACTAATATGGACTACATAGACATTCCATTTTTTACCATTCTAGTGACCA--TATATAAATTTCTCATAAAAGGTCCATAGCT---TCCACTCATTACATCAGTGAATTCTTGGCAGCTAGAGACTAGGAAAGAAATAGTGAGTTTCTTCTTTCAACAGCCATTTACCTCAAATTTTCCATAGGAAAAA------GGCCATGAACCCTTTGTTGAGTCCTCCTTC---CTGATATCTACTATCACTAAAGG--ATTCCCTCCTTCCTTATCTCCAGAA a score=7302 s mm8.chr4 152900049 180 + 155029701 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s mm8.chr4 152907676 212 + 155029701 CCACTCACGTGCATGTAGAACATGTCCTCGTCCCCGTGGCGTCTCTTCTTCACGTTGGTACCCAGGGCAGGGATGGCAGGGGGGCTCTGCTTGAATGCTAGA------------------------AGGCAGGTCGGGAAAGATAAATGAGCCAGAG-AGCAAAGACTGAGATGCCCAGGTGAACACCTGCCATGGGTGT-GGTGTGCACACAGGGCAAACCTAGGCTGGAAGGAGCT s monDom4.chr4 48485491 238 - 430141050 CTACTCACAGGCATGTAGTATATTTCCTCATCCCCGTGTCTCCTCTTTTTCACATTGGCCACCAGGGCAGGGATGGCAGGCGGGCTTTGCTTGAATGCTAAAGTGAGACAGGGAAGACCATTCGTTAGCAAGGACAGTAGAGGAGTATGGACAGGGGAAGGGGAAGATGAGACGGGGAAGGGTGTATCAGCCATGGCAGTGGGGGTGGGAATCTGATAACAGTCTGCTAAGAGGGGCT a score=10081 s mm8.chr4 152908106 179 + 155029701 ACTCACCACGTTTGCTGGCAGCTCCATTTTTGGTGGTACTTTCATTCAGAGCCTGTTGCTCCCGGTAATGGTCTTCATCAGCTTTGCGGTCACGGCCAGGACAGGCACAGATGCGACCCTCGAAAGACCGGCGGCCCAGGACCTGTCCACTGTTGGGTCGGCA-------CAGCGTGGCTGTGAGC s monDom4.chr4 48489334 186 - 430141050 ACTTACTGCGTTTGGTAGCATTCCCATTCTTGGCTGCACTCTCATTCAGAGCTTGCTGTTCCCGGTAATGATCTTCATCTGCTTTTCGGTCCCTGCCAGGACAGGCACAGATCCGACCCTCGAATGACCTCCGGCCAAGAACCTGCCCACTGCCAGACAAACAGAAGCAGCAACTTACCCGTGAGC a score=10968 s mm8.chr4 152908391 188 + 155029701 GCCCCCCCACGGCCCCACCTCTACCATCC--------TTCCACGGCAGACTCACTCCCGGGTCTCCAGGGTGATGATGACAAGGATGGGCCTCCGATTCATGCCCCCCACACAGCTGCTGTTACACATGAAGTTGTACAGGATGGTGGTAAATTCTGTTCCCACCTGTCCACAGGGGAGACAGGGGAAGGGCTTAG s monDom4.chr4 48491689 194 - 430141050 gtctcatctcatccTGACTCATTCCATCCAATCCCAGTTCCCCCGGTGACTCACTCTCTGGTCTCCAAGGTGATGATGATGAGGATAGGTCTCCGGTTCATGCCCCCCACACAGCTGCTGTTGCACATGAAGTTGTACAGGATGGTGGTGAATTCTGTCCCCACCTGTTCTCA--GGAGAAAGGAAAAAGGCACAG a score=294 s mm8.chr4 152908579 49 + 155029701 TATCAGTCAGCATGCA---GGGCCCACCTTCTAAGAAAAGGACTTGTAGCTG s monDom4.chr7 259242762 51 + 262624689 TGTCA-TTGGCAGGGATGTGAGCTGAACTTTGCATTTGATGACTCTTAGCTG a score=7304 s mm8.chr4 152910785 154 + 155029701 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AAGAGAAGAGAGCCCAGAGAGGGAAG-AGACCACCTGGACACCTCAAAACACTCTCCAGAAGGCAAGCCTGCAGCTAGCCTGGAGCCAAAGACCCTATTAACAGCTCCCAACACTTCTACCAACCAGGGAGCTGGAAGCTAGGGCTGGGAGGGGGATGTTTTCCTCTTCCCTGAGAGAGGCATGAAAAAACTGCACTCAATTTGGAATTGTACTTGAGAAAAATACTAATTATCTATCAGTTACCAGCTGGCTGGCGTGGCGAGGAGTTGAGTGTAGGGAAGGAGAGGAGGCTGCCTGCCATCTGCAGCAAGTACGGGCAGCTCTGGCTAACTGAGGGCCCTGATAGCTTCAAACAAGCAGGCAAGCTCCCTGCATGCCCCATCTTGCATGGTGATGATGCTTCCATGCCCCCTCCTGCCTCCCCTCCCAAGGAAAAAAAAACCTCAGCAGGGGGTCTTCTCACAGCCAACCTAGGTGCAAAAAATCTCATTTCCAATGTTTGTCCCACCTCCACCCC-------CTGTATCGATAAGAGGCTGG a score=23331 s mm8.chr4 152925118 643 + 155029701 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GGCAGCTTCACGCCAAAGCCCAAACAAAGATGACCTCTTTGCAGCGCTCCTAGGGCAGACTATCTTGGGGACCCTGAGCATGGCCAGAGCCACC--------AGCCTCAACAGTCATCTCAGAAGTATCCAACCCAGGGGCTTGGGCAGCAGCTCTAC------CACCCTGACCAGACGCCAGCCAAGCCTCCCATCCCACATCCCACTTCCTGCCCAGCCCGGAGCTGCTGATCC--------TCGAGAGCTGC---------CCCAAGGATGAACAGAAGCAGAACCTGTCCACTCTCCA-----GCCTACCCCTCTGCCATCAGGCAGTCAAGAGAACGTCTCT-CTGAACCCCAACCATGGCA--GACTCTGCCAAGCCCCCTAGGTGGATGGCATCAGGCCTCTAAGCAGACCCTATACCAGG-----------CACGTTACACCTACCGTGGCGAGGTGTCTCATGGGGTCACCGACGTAAAGCATGGTAGGCTCGTGGGGGTCTGCACACGCTGAGGAGCTGGTGTGCCGCGGGACGAGGCATGGG-TCTGGGTGGCTAGGTGGGGTAGGGGTAGACTGGTGGCTGCCCGGTGGGGTGG--ACTGAGGGGTTGAGGC-TCTGTGGCTAGGAAGGCAGGAGCGGAGGATGCTCAGAGGCGTGCGGACTGAGAGTTGGCATTCTCACCCTGCC-CATCTCCCTCATTTCTGTCAACTGGCTGCATCCAACAACAAACC---GGGGCCCGCCCCTTTATTCCTTATGACTATTCATCAA--CTCAGGGCAGGCCTCAGCTTGCCCGGAGATGTGTTGGACCGCACCAAGCAGGCTGAGCAGGGGGAGCA-GGTGGGGATGCAGGGTCAGTGGCT--------GGCTTGG--AGATCATACACTC----------CCACTCGGACCCTTCTAAGCTGCCAC-TCAGGGAAGGCTCCGGAGGGCTGT-GGCAGTCACCTACAAACAGCCTACACTCTAAAGCATGAGCAGTCAGCCCTGGTCCTGGAGACCTTTGCAGTCTGGGTTGGGTCACCCTGAAGGA-AGAGATGGTGCC s monDom4.chr4 48601805 1025 - 430141050 GGCAGCCCCAAGCTGTAAACCATCCCCAAATGG---------AAGAATTCAAGAGTCGGCTCTCTTCAGTGGCC---ATCTGACCTGTTCCACCTCTGCTCCAGCTTCCCCCATCCTCCCAGAGTCACTCAA----GGAGAATAGCCAGGACCCTTACATTTTGCCATCTTTCCATATCCTAG--AATCCACTCCCCCCACATC--AGCTTCAGTCCTCCTCCCAGCAGACCATCCATCCCACCCCAAAAACATCATCTGGATACCAAGTGCCAACCATGATCAGAACATCCCATCAAACAACAGGTGCCTGCCCCCAGGA----AGACAGGCAAAAAGGTGACCCTGCTGAACCCGACACCTTGCAAGGACCCTGGGAAAAACTGGGGGAAAAAGGAAGGAGA-----AAGCCCATTTTCTACAAAGAGAGGATGAAATAAAGAATACTTACTGTGGTGAAATGCTGCATTGGGTCACTAATGTACAGCATTTTAGCCTTCCTGGGAACTAAACACAACTGGGAGCTTTCCGGCTCCAAGAGGAGGCATGGGGTCAGGGAAGATGGTCAGGGACTGAG------GATGAAGGCAAGGTGGGGATGCAACCTAGAGATCGCCTCACCCGTGGCTAGGGAAGCAGGTACGGAGGATGCTCTGGTACATGGGTTGGGTTTGTTGGCATTTTCCCTTTTTTTCATCTTCCTTAGTTCTGTCAACTGGCTGCATCTAGCAACAAACCCCATGGCCCACCCCCTTTATTCCTCATGACTGTTCATTAAAGCACAGGGCAGGTCCCAACTTGCCCAATGATGTATTGGACTGCACCAAGCAGGCTGTGGAGGGGGGGAGCGGCTAAGGCGGAGGGACGGTACGTACAACCGCGACCCAGCTAAATCTGACAAGCCGGAGAAGGGCAGCCTGGTCACTACCCCAATACCATACCCGGGAGGGTCCCAATGAGTCATGGGGAAGCATCTTCAAACAGGGCATCTGCATAAGGGAGAAC-----------GTCTTTATGACCCTG------CTGGTTGCATCTCACCGAAGGGCAGTGATGATGCC 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GGCGGGAAGGCAGCGCGGGCACTCAGCCGTGGCGGGAGGAGGGCCGGCCACCCGGGCCCCTGGCTCCCACGCGCGCCCCGCCTCCCCAGCTGGCTCTGCCCGAGTCGGGGTCTGGGCCCC----GCTCCTCCCGCCTCCTTCCCGCCGCCGCTTGGCGCGCGTCGCCCAGCTAGCCCCAG---CGGGGTCT-----CCTCCTCCGCGGGGCCCGCAAGCTGGTAGCCGGAGTCTTGGTCGAAGCGGGACCGGACCGCGACCTTTGGCGG---GGCTCAGGGCGCCAGGA-----AGGGTGCGCAGGCGCCGAGGGGGTGGACACAGGGC-GCCCGACGCCCTGTACTCCCTCTGACTCTCTCCTCCGCCTT--------CTCCCCAGAT----GCCCATCTACCCCGATCCCCCTCGCTGCCCTTACTGTCCTAAGCCTGCAACCCAGGGGCTCAGGAGTGCCCTCAG--CGGGGTGGCTGCGCCTCTTCCA--GGGCTCGCCCCGGCCTGAGAAAACCGAGAGGACCGACTGAAACTGAACATTGAAAGCCCCGGAGGAGAACCGTTGTCGTTCGGCCAGCACCAGCGGGGTTCCGTCTCTGAGAACGGCT--CGAAGCCCCCCTCGATTTGCCTGGCAGAGACCACAGCCCGCCTGGAAAGAGGGTCGAGCGCAGACCCTCTGGGTTGGACTCTTCA-AAGTCCAGCCAGAAGTTGCGCCTCCTGATACCTACACACCCCGGGGG-----CCACGGCCTGCAGTCCGGGTTTCCTAGCCCAGGGTATCAGAGTCTTTCCTTGGATTG-----------------GTGTGCTAGGCGATGCCCAACGGATGCCCACAAACTGTGCA----CATAGAGCGGCTCGGAGTTA-------GTCAGGGGACTCTTCTCTGGCTCAAGAAGTCTTCTTCACC---ACCCGCCAT-----------CTCCCCTCTGGGC----------AAGTGAGCGGTCTCCGGTGCCCTCATCTACCACGCAGACCCGTAGTCTGGCGCACAGAAGGAGTTGGGTCCTTGTGGGACCCCTTAGTGGCACTGCAGAGTGGTCCTTGCCCAAGGTGTTCCCACATGCCCTGGAAGTCGCTTTAGTGCAGCTAGTGGCGTTGCAAGGGAGGTGGGT-TGGAGCAG-------ACCGAATCTCTCTCGAACTCGAAAGCCTGACCTGGTGTTAGGCCAATAGCTACGAGGAGTAATTATTTGCGAG---CTGCAGATTAGAGACAAAG----------------ATGAATACCAAGCAAGAGTTTGGGACTGGTTGGGAACAGAAAATGCCAGGAC s monDom4.chr6 39983808 1227 - 244784211 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agatctggcattctatccactgagctacctaaatgtgcccACCAGTACTGTTTTTGATGCTTAATTAAAAGATTAGATGGAAGATTTGTCTCTAGGAGTAATCTAGACTTTGAATTGTTAAAGACTGGTGGAAAAATTTTGTT---ATCTTCCAAAGGAATTTTCAATCTTCCCCCTTTTTTCCCTTTTGTTTAAGCATTTCTATCCTTACAATGGATTGTATAGCTTAAACAAAAACCTTTAGGTGTAAAATATAATACATATAAGACTTAGGAGTTCAGAAGGAGACCGATTTACAGTCTACAAAAGCCTTGGTCTTTTCAAGACACCCATTATTTTGGTATGTGTTTTATAAAGCAAAACCTTTTTCACATTT-AGGCTTCTTGTGTCCAGTACCGTTTAGTGGTTCGAGATGTGAGCACTCTCCAAGTCCTTCAGCTGTACACATGCCTAGACCAGATCCAACACCTAGAGTGGTCCGCAGATTCTCTCTTTATACTGTGTGCTATGTACAAACGAGGGCTGGTACAGGTAAGTGACA a score=7825 s mm8.chr4 152990263 585 + 155029701 TCCTCTGTGTTTCTTTTATGAATCAAGGTCTGGTCACTCGAGCAGCCAGAATGGCACTGCAAGATCGACGAGGGCTCTGCGGGGCTGGTCGCTTCCTGCTGGAGTCCAGATGGCCGCCACATCCTGAACACAACCGAATTTCATGTAAGCTGG-----------------------CCAAACGTAGCCCACTCTGTTCTT-CGCCTAAAATAGCCTGGGAATGTGAAAGTCTGGTTCTGGAGCAGTATTCAGGCCAGAGTTCATAAACAGTATAATTTTTAAACTCT-------ATTTTAAAGAAAAATAGGACATTAAAAggagttggcaagatggctcagtgggtatggctcttgctaccaagcctTGCCACATGGTGGAGGGTAAGAACGACAGATGCCCCAAAGTTAGAGTAACAAGGGAAAATGTATGTCTTCTGTA-ATGGGCTGTTACAGGCTGCAGTGCTCA-TGCTGACATCTTAAAGGGACAGGTGCTCATGTTGACATCTTAAAGGGACAGGTGCTCATGTTGACATCTTAAAGGGACAGGTGCTCATGTTGACATCTTAAAGGGACATTTGGCCTGGGCT----TTTGGCTGCATATTTGAGTGTTTTCT s monDom4.chr4 48695389 590 - 430141050 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monDom4.chr6 39985524 280 - 244784211 CACACTCTTCCCCTTCCACTTGGTATCAAACATGTTGGCGAAGTAGCTGCTGCGGGCACTGAGGATGCATCG-GTGGGCACAGAA----GGATTTCCCGTGGACGATGAAAACGAT---GTCGCTCTGGTAGCCCTGCTC----CAGGAGCCTGGGGGGAGGGGGCTG---GGTGGGCAGGGGCACGG-------------AGGGGAAGGGGCCATGGGCCATGAGGGGGAAGTGGCCGTCCTCTCC-----------TCCCCACCCCCTGCACTCTCCCCGGGGCCCTCCCAGGCCC--AGCAGATCCCCCTTTCCAGGG a score=4696 s mm8.chr4 152992487 92 + 155029701 TTCTCTCCCCTT------TCCCTGGCAGCTGCGAATCACGGTCTGGTCCCTGTGCACCAAATCTGTATCTTACATCAAGTATCCCAAGGCCTGCCAGC s monDom4.chr1 95814877 94 + 748055161 TTCTCTCCTCATGGAAAATTCCTG----CTGCGGATAAGAGTCTGGTCCTTGTGTACAAAATCTGTATCCTATATCAAATATCCAAAAGTCTGTCAGC a score=5104 s mm8.chr4 152992579 609 + 155029701 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AAAAAACCTCTTTGGGCCT--GTATTATACGGTATCATAAATAGGAACACAATTTAGATTCATTCTAGAAAAAGTTTGACTTCAGACCAAACTTATATTTACAAAACAGCTACTGTCACCCACAACAGTAGCTAACCAAGGCAAGGACTCGGTCCAGCTAGAGTGGACCAGTCTGTTGGCTACTTTTGCATTTGGCTTCCTAAAAAGGAAAAAAAAAAGATGAAGCTTTAAAATATTACAATTGACACTAAGTAAGTGTAAACATTTGTGGCTACAGGCACTGGACAGCAGGTACCTCTCCCTGT--------GGAGACGATTAACCTCACATTCCATTCTAAATGACGTCATTCTCACCTTTGTAAGAACATGCTAGAGTAGCTGCATTGGGAAATGTCAAAAGAAGCAAAAATCCACACACTCAAGAAAAAGCACTAGAAGTCATTAGAAAATAAAATACCAGCTAATACAACTGACAACTGGATTCAATTTGCCCTTTGTGTATAGCTTGTATTGTTGTCGAG-TGTCTAATATCTGAA-----GTCTGTAATTCACTTTACTACTCATAACCCTAGAGGTGAGTAACCATTACATTTCCTTCGACTTATGAGCA-----------CACCCTGAGCCCTCCATCTCCTTTTGTTATAACACTCAAATGACAACTTCTATAGCAAGTGGATTGTGAAATAGGAAGTTTAGAAGCCGATTTTGCCTCTTGACATAGAGTAGCCCAGCTTGGCCTCATTGTTGATGAAGGACATGAGCCCCACGTAGGTCTCAATAAGAAGAGGGCGCTCCAAGACCAGCAATCCATTGGTCCGACCTGGTAAGGGGAATTCTTTCTGGGCCCTCTTGACGGCTTGAATTAATAGGGCCTTGAAGCTTCCCAACTTTAAAGACAAGAAGAAAGCAA-GTTAGCTTCCAGCCAATA a score=11002 s mm8.chr4 153003046 200 + 155029701 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monDom4.chrUn 77417494 164 - 174229318 TCTCTCCCCCTGTCCTGGTCACTATAGTCTGTTTGGATGACACCTTTGGCCATGACTGCAGCCTGACATGTGATGACTGTAGGAATGGAGGCACCTGCCGCCTTGAGCTGGATGGCTGTGACTGCCCTGAGGGCTGGACCGGTATCATCTGCAATCAAAGTAAG a score=9543 s mm8.chr4 153099747 194 + 155029701 TGAGTTCGGCTGTTGGTAATCCTGGTGTCTCCCTGTCATCCCCTGTAGCTTGTCCTCCAGACACTTTTGGGAAGAACTGTAGCTCTCCCTGCATCTGTCAGAATGGTGGGACCTGTGACCCGGTGTCAGGAGCCTGCCGCTGTCCCCCAGGCGTCAGTGGAGCCCACTGTGAGGATGGTGCGTGTAACCCCCCT s monDom4.chrUn 77421021 189 - 174229318 TGAGCAGGGCAGTGAGT-----TCATGTCTCTTCCATCCCCTCTGCAGCTTGTCCCCAAGGGACCTTTGGAAAGAATTGCAGCTCCACTTGCAGCTGTCAAAATGGCGGGACCTGTGATGCTGTGACAGGGACCTGCCGCTGTCCACCGGGGGTCAGCGGAGCTCACTGTGAGGATGGTACGTTGGTCCTCTCT a score=9108 s mm8.chr4 153101869 166 + 155029701 TTCTTGATTCTCTTTAAACTGTTCCCCACAGGCTGCCCCAAGGGCTTCTACGGCAAACACTGTCGTAAGAAATGCCACTGTGCTAACCGGGGCCGGTGCCACCGCCTCTATGGGGCCTGCCTCTGTGACCCAGGCCTCTATGGCCGTTTCTGTCACCTTGGTGAGT s monDom4.chrUn 77422383 166 - 174229318 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TGGCCTTTGTGTCTCAGGGTGTCGCCAAGGCTACTTTGGGCCCGGCTGCGAGCAGAAGTGCAGGTGTGAGCATGGGGCCACCTGTGACCATGTCAGTGGGGCCTGTACCTGCCCAGCTGGCTGGAGGGGAAGCTTCTGCGAGCACGGTAAGCTGAGTG--CAGGCTGGG--------CCCTGAGTGCAGG s monDom4.chrUn 77442632 190 - 174229318 TTGTCTGTGTGTCTCAGAGTGTCCCCAGGGCTGGTTTGGGCTGAGCTGCAGCCGACGGTGCCAGTGTGACAACGGAGCCGCCTGTGACCACGTCAGCGGAGCCTGTACCTGCGCAGCCGGCTGGAGGGGAACCTTTTGTGAGCGTGGTGAGTCCAGTGGTCCCCCTGGGTCACCAACCCCGGGGTGCTGA a score=5155 s mm8.chr4 153109034 228 + 155029701 GGGCAGGGGTCTCTGGCTCTGGGCCTCTTGTGATTGCCACCTCTGTCTGTAGCCTGTCCTGCTGGCTTCTTTGGGTTAGACTGTGGCAGTGCCTGCAACTGCTCCGCCGGGGCCCCCTGTGATGCTGTCACTGGCTCGTGCATCTGCCCAGCTGGCCGCTGGGGCCCACACTGTGCCCAGAGTACGTAAGGGGTC------CCGTCCTGGGT---ACTGTGGGGAGCATGGGTTCTT s monDom4.chrUn 77446832 231 - 174229318 GGGCAGGGTCTCCTTCCTCACTGCCCAGTGACTGTGTCTCCT------ACAGAGTGTCCTGCTGGGTTTTTTGGCCTGGAGTGCCGGGGCGCCTGCCAGTGTGCCAACGGGGCCCCTTGTGATCACATGAGTGGCAGCTGCCTCTGCCCTGCTGGCTGGATCGGACCAAGCTGCAACCAGAGTGAGTCACGGTCCTCCCTGCCCCTTTGGGCTGAGCTCTGGGGATGGCGTGTCCTT a score=7604 s mm8.chr4 153109333 277 + 155029701 CGTGTCCATCCCTCTTATGGCTCTGATGAGGGGTGGCTCTGACACCCTGGCAGATCTACCCAGTCCCCTGGTTCCTCCTGCAGCAGTC-CTCTGGCTATGTTCCTGA-CGGCTCCTCTCCTATTGCAGCTTGCCCACCTCTCACCTTTGGGCTTAACTGCAGCCAGATTTGTACCTGTTTCAATGGGGCCTCTTGCGACCCTGTCCTTGGGCAGTGCCACTGTGCTCCTGGCTGGATGGGACCCACCTGCCTGCAGGGTAAGCCATGTGTAGGAGCTCA s monDom4.chrUn 77448113 276 - 174229318 CTTGTTTGTCCTCCTCTCGCCCCTCTCCAGCCCCAGCCTCGACACCCACCGGGGGCT-TCTAGCTCCCAGCCTTGTCTTCTGGCCACCTCCCTGGCCAGAACCTAAATCTGCTTCTCTCCT--CGAAGCCTGCCCAGCTCACACCTACGGGGAGAACTGTAGCCTCTCCTGCAGCTGCTTCCATGGAGCCTCCTGCAACCCAGTCAACGGGCAATGCCTGTGTGCCCCCGGCTGGATGGGGCCCACCTGCCAACAGGGTGAGTTCTGGGTCCCAACTTA a score=7122 s mm8.chr4 153109902 296 + 155029701 CTGAGGTTTGCTTCTGCTTTCTGGGCCTCAGCCTGCCCTGCTGGCCTGTATGGCAAGAACTGTCAGCATTCCTGTCTCTGCCGAAATGGAGGGAACTGTGACCCCATCTTGGGCCAGTGCACGTGCCCAGAGGGTTGGACCGGCTTGGCCTGTGAGAACGGTGAGCA-GTCTGACTTGGGTAGAGGACATCCT------TTGGGCTAGGAGGATGGGCTATGGAGGGGAC--AGCATCCTAG-----GGGTGGCTTTAATGTCTTCCCTTC--------TACCCAAGGTGCAAGAAGGTTGGGCTGGTGTCTCCTGGG s monDom4.chrUn 77448841 311 - 174229318 CTGAGTTTT---TCTGTTTCC----CTCCAGCTTGTCCAACAGGCCTATATGGATCGAATTGTCACCAGCCTTGCCTGTGTCAGAATGGTGGGACCTGTGATCCCGTCTCAGGCCACTGCCTGTGTCCAGAAGGCTGGAATGGTCTGGCCTGTGAGCAGGGTGAGCCTGAATGAAAGGGCCAGAGCAGATGGGAGGGGATGTGGATAGGGAGAAAGTCTGATGATGGGTCTGAGCATCCTGGGTGTCGGGTGGGGTCCCCATCATTTTTTCATGAGATGTATTCCATCTCCCTAAAGCCTAGGGTGCAGTTTCATGGG a score=6995 s mm8.chr4 153110198 188 + 155029701 CAG--AGCCCTAGCCC--------AGAAAGTTAGACCCTCTTTTCTACTCCAACCTTTACAGAGTGCCTTCCTGGACACCATGGGGCTGGTTGCCGGCTCAACTGCAGTTGCCTTAATGGGGGCACATGTGACCGTCTTACTGGCCACTGCCGCTGCCCAACTGGCTGGACTGGGGACAAGTGTCAGAGCCGTGAGTG s monDom4.chrUn 77452762 198 - 174229318 CAGGCAGCCCTGGCTCCTTCTTGGGAACATTGGGGTTCTCTCATCCTTCTTGGCTTTCCTAGAATGCCTCCCTGGGAAGTTTGGAGCTGACTGTCAGCAGAGCTGTGACTGCTTGAATGGGGGCCACTGTGACCGGCGCACAGGGGAGTGCACCTGCCCAGCTGGTTGGACCGGAGACAAGTGTCAGAGCCGTAAGTG a score=4713 s mm8.chr4 153110496 696 + 155029701 GGGCCTTCCTGCTGTGCCTAAGAGGCTAGCCTGATTGGCTGGTTTGCTTCTATTTTGGGGAGA---------GGCTCCAGAGAGGAAGCTGTGGTCTCTGGATTTGAACCT----------TGTACTGCCCAAGGCTCCATGATTGCAAGATGCTGCCCAGGCTGTGGCTTTTCTGCCCATCCTTGTTCTCCCTCCAGGCTTCAAACCCCCTCAGCATCT---------GGACAAGTGGACACTGGGCTGGATACTTACCTGTCCGACCTCTCTGAGTCTTCCCCTCTCTGCTTCCCCTTCTGCATAGCCACTGCCATTTGTAGACCCAGCCTAGAGAACCCCTC--------ACTCAGACCCAAGCCCCGGGGCCACTGATGCTGAGAAGCCAAGTTGG---GAGGCTTCAGGGAGACC---CTGTGACTCTTCTTTTGTTATTTACTGGTCCCAGCTTCTCCTCCCTCACTTTCCATGGGCAGAGG----CCCTGGAGCTATAATTCCCA------------ACCTTCTGTCTGTCTCTCACGCTACAGCCTGCGTCAGTGGCATGTTTGGGGTTCACTGTGAGGAGCACTGTGCCTGCCGG--AAAGGTGCCA-CCTGTCACCATGTCACGGGGGCCTGCCTCTGTCCCCCAGGATGGAGGGGCTCACACTGTGAACAGGGT-AAGCAGAGATAAGTTTATGGACCATTGGGAGGGAGCTGGTGCTGCAC-------------AGCC--ATCTCGGGGATCCCCACTGCT s monDom4.chrUn 77454619 696 - 174229318 GGGTCTCCCTGCCCTG---------------TGACTCGCTGTCTTGTAGCTGTGAGGGGGAGGAGAGAGGGTGGCACCATGTGGACAGCTG----CTCAGGACT-GAGCATCCCTCTCTCATGCCCTGCCGGAGCCTCCCTGCCTCCCTCCTGGCTCTCCTGCTGTGGTGCTTCTCCTAATGCCTGGCAGCCTC---AGCCCCAAGCCTGCACAGTGCCCCATGGGAGGGGAGAGGCGGGCCAAGCCCTGGGTGCCC-CCTGGCCG--------GGGCCCTGCCCTCC--GCAGCCCC----------CGACTTCAGCTTGGGGTCCCGG------AGACTCCTCCGCCTGCTGCTCTGACCCAGTGGCTGAGTCCCA----GCCAGGAACCTGACCTGGCCAAGGGTCTGAGCAAGCCCAAACCGGGGCTCGTGTTTGTCTG---------CCCAGAGT--------GAGGTTTTGATGGGCTGAGGAAAGCCCCAGAGCGGACGGCCCCCCCGACCCCCCTCACCTTTTGTCCCTCTGCTTTGCTGCAGCCTGTCCAGAGGGCACGTTCGGGCTGCGCTGCGCTGAACGGTGTGACTGCCGGCCGGGGGTACCAGCCTGCCACGCTGTCACGGGCACCTGCCTCTGCCCACCCGGCTGGCGGGGCCAGAGATGTGAGAAAGGTGAGGCTGCGAGAG------GGGCCTGCGGAGGGCCTGCGGTGCTTCCCCCTTCCATATGGGAGCCTAGTCTCCGTGATCCCCTTTCCT a score=7834 s mm8.chr4 153111192 160 + 155029701 CCGTTCCCAGAAAGCTTACCT----CATTCTACACTTCCCACAGCCTGTCCACGTGGCTGGTTTGGAGAGGCCTGTGCTCAGCGTTGCCACTGCCCGCCTGGTGCCTCCTGCCACCATGTCTCTGGAGAGTGCCACTGTCCACCCGGCTTCACTGGGCCTGGCT s monDom4.chrUn 77456268 164 - 174229318 CCTTCCCCAGGGGGCTCTCATGGGTCCTGCTCTGCTCTCTGCAGCCTGCCTGCCAGGCTGGTTTGGGGAGGCCTGTGCCCAGCGCTGTTCCTGTCCTCCTGGCATCTCCTGTAACCACATCACTGGAGAGTGCGGCTGCCCCCTCGGCTTCACTGGCCTCGGCT a score=7123 s mm8.chr4 153111352 694 + 155029701 GTGAGCAGGGTAGGTGCTCCTCCAACACCTGCTTTGTGGAGAGGGACAACTGGGGGATTCCTGAGG-------GTTAGGCCAGGCCTGACCCAGGCCGA--CCTATTCCTAGCCTGCCAGCCTGGCACCTTTGGCAAGGACTGTGAGCACCCGTGCCAATGTCCTGGTGAGACCTGGGCCTGCCACCCTGCTTCAGGGGCCTGCGTATGT----------------------GCTGCTGGTTAC---CATGGCACCGACTGTCAGCAACGTGAGT----------CAGGGG-ATCTGGGGTTCTGTCTGCCATTCTGGTATGTAAGGTAGAGGGG---------GCAGCTCTCAAGGTTGC-----------------------CATGTGCAGGGGTG-------------CTGCATGTTTGAGTTCACCTCCAGCTTGTGTAGCAGACCTCC------------------------------------ACCCCTCTCTCTCT-------GCAGGATGCCCATCTGGGCGCTATGGGCCAGGCTGTGAACAAATTTGTAAGTGTCTCAATGGTGGGACCTGCGATCCAGCCACGGGAGCCTGCTACTGCCCTGCTGGGTTCCTTGGGGCCGACTGTAGCCTTGGTGA------GAAACCAGGTTGTGAGCC------TGGGTAG-----TATATTGCTGAGTTTCTGAGGAAGGAGGCAGGGCCCTGCTGGCCAGCCTACGGGAGGACAGCCCCCTGCCCACCTGCTTCCCGGACTCTCGAGTTCCCTGTTAAT-TATCTAAGCTAGAGTGGCTTTGAGGACGGTGTGAGGGCATCAGTGTGACC s monDom4.chrUn 77458570 810 - 174229318 gtgagggGGGTAAGAA-------AGTGCCTGCTCTCTGCCAAGTAACTGAGTTGAACTTGCTGAAGAGGACGAGGGAAGCTTGGCACGTCTCACGGTGTTTCCTCTCACCAGCCTGTCGGCCTGGGACCTTTGGGGTGAACTGTGGCCAGGTGTGCAAGTGCCCCGGCGAGAACCAGGACTGCCATCCGGTGACAGGGGAGTGTGTGTGTGCCCCCGGCTTCCACGGCAGCGGCTGCCGACTCCGTGAGTGCCACTCGCCCTCCGGACCCCGGGCACCCCCTTGGCAGGAGCATCTCCTCCCTTGTCTCCCCT----GGATCCAAGCTAAAGCCGAGTCAAACAGGAGCCCCCCAGCTCGCACCACCTTCTTTCCTCCTCATTCCCTGCGAAGATGAGAACTCCTGGCTCTCGGGAAGCTTGTGGTCCAGCTCCTCTGGTCCTCCAGGCCTCCCGGAGGAGGAAGATAGGCAGCGGCTACCCACTGACCACCCCCCTCTCTCTCCTCTCTGCAGGGTGCCCCTCTGGGCGCTATGGCCCTAACTGCGAACGCCCGTGCGGATGTCAGAACGGGGGCTCCTGCGATGCCAGGACAGGCACCTGCCGCTGCCCTCCTGGATACATCGGTGCTGACTGTGCCCTAGGTGAGTCGGGGAGACCGGGCTGAGGGTCaagcatttgttggctccctacggtgcctagtcactgagctgggagctagag--------------atacaaaaagacagacccat-----cctgcctcaaggagattccattctattgCtattatccccaatttacag-----ttgaggaaactgaggcagatagagtttaacc a score=5180 s mm8.chr4 153112355 161 + 155029701 TCACCTGC--CCCTCTCCACAGCCTGTCCACAGGGTCGCTTCGGCCCCAGCTGTGCCCACGTGTGTACATGCGGGCAAGGGGCGGCATGTGACCCAGTGTCGGGGACTTGCATCTGTCCTCCCGGGAAGACGGGAGGCCATTGTGAGCGCGGTGAGTGTCTGC s monDom4.chrUn 77464042 163 - 174229318 TCACTTGCTTCCTATTCTACAGGGTGTCCAGATGGGAGATATGGCAAAGACTGTGCCCACGTGTGCAACTGCGGGGAGGGAGCTACCTGTGACCCTGTCCAAGGCACCTGTATTTGCCCAGCTGGGAGAACTGGCCCCCACTGTGAACAAGGTATGGGGCAGC a score=2589 s mm8.chr4 153114517 45 + 155029701 CCACCAGGGCGTGCAGGAACCACATGTGACCTAGGTGAGTGTGGG s monDom4.chrUn 77473259 45 - 174229318 CCGCCAGGGAGGATGGGAGCCAAGTGTGACCTGGGTGAGTGCAGG a score=6957 s mm8.chr4 153115397 149 + 155029701 CCTGCCTCTACAGATTGCAGAAGAGGCCGCTTTGGGCCGGGCTGTGCCCTGCGCTGTGATTGTGGGGGTGGGGCTGACTGCGACCCCATCAGTGGGCAGTGCCACTGTGTGGACAGCTACACGGGACCCACTTGCCGGGAAGGTGAGTC s monDom4.chrUn 77474850 149 - 174229318 CTTGTATCCCCAGAATGCAGGGGGAATCGCTTCGGCCCTGGCTGCACCTTGAGCTGTGGCTGTGAGGGGAGTTCTCACTGTAATTCCCTCAATGGTCAGTGTGTCTGCATGGAAGGCTACATTGGGCCCACGTGTCGAGAAGGTGAGTC a score=3535 s mm8.chr4 153118001 248 + 155029701 CCACCTGCCTGCCAGGTCCTTCTGGTGCTAGGCCATGG----------------ACTGCTGCAGCC----------------------AGCCAACTGTTTACCTGGAAATGTAGTCCAGACCATATTTATAT-AAGGTATTTATGGGCATCTCCAC-----------CTGCCGTTATGGTCCTGGGTCAGCTGGAAGCTGCCTGACCCCAGAACTTAGGCAGTGGCCTGTGGGGTCTCC--------------AGCAAGTGGGATCAAGGGTTTTGTAAAACCCAGTGAGTTAAAGGCACAGTGGTGTCCCC s monDom4.chrUn 77481397 303 - 174229318 CAATTCACCAGCAGGCTTCATCTGGTGCTAACCAATGGGACTGATGGCTACCGGACTGCTCCAGCCCCACCCTGTCCTGTTCTGGGGCGGTTCCTTGTTTACCTGGAAATATAGTCCAATATGTATTTATGTAAAGATATTTATGGGCAGCTGTACCAAGTCAGGTTCTGGGGGGACAGCCCTGGTGCTCCTGAAAGGCACCAG-----AGGGGCTGTACAGAGCCCCGGACGGCGTCCCCCCACTCCATCCTAGGAAGGGGGACGGAGTGTTGTTTTCAGCTGAGCGGGC----ATCACAGAAGTGTCCTC a score=9500 s mm8.chr4 153122736 190 + 155029701 CTTTGAGCAGTCGGTCCAGCTACACATCCGTCTCCACCCGCAGCCGCTCCATCCTGCGCACGTTGCCTTCCACGGCCACACGGCTGGTGATGGAGTGAGCAAAGCTCTCGGGAAACCAGCCGGTCTCTCCGTCCCGAAGCCGCTCCCCGTGTAGCCAACCTG---AATGCAGACAGCAGATGAGAGG-GAGCCC s monDom4.chrUn 77483257 189 - 174229318 CTCTGACAAGTCGC-----CTACACGTCTGTCTCCACCCTAAGCCGTTCCAGCCTGCGCACGTTGCCCTCCACGGCCACCCGGCTGGTGATGCGTTGGGCATTGTCCTCGGGGAACCAGCCAATCTCCCCGTCGCGAAGCCGCTCTCCATACAACCAGCCTGTTTAAGGGGGGGAAAAGGAGTGAGGAGAGCTC a score=7321 s mm8.chr4 153123493 129 + 155029701 TCACCGTCCTCTTCCTGCAGGACCAGGACGATGTCAGCCTGTTGCAGTGTGATCTCATCAGCCTGCTTGGCAAAGTACGCCTTGGTGACCTCTACCTGGGGGAGTTCTGGGGGGAAATGGAAAGACAGC s monDom4.chrUn 77484074 129 - 174229318 TTACCATCTTCTTGCTTCTGGATCAGGACCACATCTGCTTGCTGGAGGGTGATCTCATCAGCCTGTTTGGCAAAGTAGGCCTTGGTGATCTCCACCTGGTGTAGGTCTGAGGGTGAGAACAGAGACAGC a score=5295 s mm8.chr4 153123948 192 + 155029701 CCAGCTGCCGAGTGAGGCACCCTGGCGATGCTGCGGTGTGGCCTGGGTTCCAACC--AGCTCAACCCCAGGACTGTAACCCACA--CTCACCTCCTTTGTTGGTGATGCCCTGCCACTGTCTCTCCTTGTAGGTGAGTGCTGTGATCCACCGGGCCCGGTCACTCCTGGAGGGAGGCCACAGAGCATGTAGTTGAG s monDom4.chrUn 77486095 191 - 174229318 CCAGAGCCAGAGTTATGCACTCCAGC--TGCAGGGAGGAGGCCTGGCTGCCCGCCCCAGGCCAGCTCCCTCCCTCCCAGCCTGAGTCTCACCTCCTTTACTGGCTAAGCCTTGTCCCTGGTTCTCCTTATGCTCCAGGGCTGTGATCCACCGGGCCCGGTCACTCCTGTGGACACGAGAGAAAACA---AGCTGAG a score=9065 s mm8.chr4 153124538 283 + 155029701 CACATCCCATCCTCACGGGACTCGAGCT---CcatgcaggcacgcacgcacgcacgcacgcacgcacTCCCCTCCAGTTAGGT--------CCCACATCTTACGCAGAGTCGGACGACAGCAGTATCTGCTCCTGGCGGCCCTCGCTGTTATGTAGCAGGTTCACCTGGAATGGGTAGGGCACGGAGGAGCTGCGGCTGCTGCCTCCTGGCAGCAAGGGCTCCGAGGGTTCCAGTTTCCTGACCTGTACGTGGTCTAGCTGCGCGTAGTCTTGGACCAGGTAGCTTTCCTCACT s monDom4.chrUn 77489694 292 - 174229318 CACAAACCATCCACAGCGTCCTCAAAGCAGCCCAAAGGGGCAGGGGC-CACACCTGCCCTC-TGCTGTCCCCAGTCTTCAGGCTGGGGCTACCCCCAACTTACGAAGAGTCTGAAGACAGCAGGATCTGCTCTTGCTTCCCCTCGCTGTTCCTTAGCATGGTCACCTGGAAGGGGTAAGGGATGGACGAGCTGCGATTAATCCCTCCTGGCAATGAGATTTCATCTGGCTCCACCTTCTTGACCTGGATCTGGTCCATCGTGGCGTAATCCATCACCATGTAGTTTTCCTCACT a score=8921 s mm8.chr4 153125056 225 + 155029701 CTCCCCATA-----CCTCCTAACCCCCAGCTGCTCTGTAGCCTGGCAC--CTGAAGACCAGTGCCTACCTTTTCTTCTTGGTGACAACCAGGACATCATTGAACAGGAACAGATAACACGTGGGTCGGCTGGCGATTTTCCTAAAGATACTGGATTCCTCCAAGAGGAAGAGCTCCCCACGCTTCAGCAGCCAGCGAGAGGCGGAGATGAGCGGGAGGGACTAGGGAAAAAG s monDom4.chrUn 77490686 231 - 174229318 CTTCCCATCAGCCCCCCCAAAGCCCCCAAGGGCCACGTGATGAGGAAGGGTTGAGGAGGAGGGG-TACCTCTTCTTCTTGGTGACTATCAGGGCATCATTAAACAGGAAGAGATAGCAAGTTGGCCGGCTGGAGATTTTCCGGAAGAGGCTGTGTTCTTCCACCAAGGAGAGCTCCCCTCTCTTCCGAAGCCACCTGGAGGCAGAGATCAGAGgaaaggcctgggagggaag a score=6903 s mm8.chr4 153125610 176 + 155029701 GCCCAGTAC--------CTACCTTGACCTTGCCGAAGTCCAGCTGCATGTTCAGTGTGTATATCTGCTCTGTGCGCTCCATCTTGTGAGCTCCCTCGTTACACTGCTTCACCAGCTGCAGGGTTCAGTTTAACACGGATTGGTCCATAGGGTGCCTCCC--CTGTGCCCCACCCAGGGTCTCTCTT s monDom4.chrUn 77498537 176 - 174229318 GCCCAGTACAAAGCCTCTTACCTTGATTTTGCCAAAGTCCAGTTGCGTTTGCAGGTTGTACATCTGTTCCGTCCTCTCCATCTTGTGAGCCCCCTCATTACACTGTTTCACCAGCTG------TCAATACAACATG----GGCACAGAAGGTAGGTCAAGGTCCAGCACTACCCAGGAACCCTCCC a score=6113 s mm8.chr4 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score=10429 s mm8.chr4 153157065 575 + 155029701 CCAGAAAACAGATTCTTCTTTGACACATTT---------------------------------------------------TTTTTCTCCTCTTAATGCCCCATCCC-CCTTTTCCAAAATGGGGCCTTTTTCC--TCAGTCTTTTATGTGGGGACTGGGCTGTGAGAAGACAGAGTCCACTTGTCAGCAATCTTCTGTC--AGCCCCTGTTCCC----GTTCCCTCTGGGGTTCTCTCAACAATACAGCCATTATCGGCCC-CTCTCAGATTCCATTGAGTTTTCCTCT-CTCTCCAGGGCTAATGAGGAGCAAGGCTGCCAGGTTGGACAAA-ATGGGACAGTTTTCACT------CCACT------------GGAGCCCCAGAGTGGTGAGCTCT-GGGAAACACCATTATGGGGGATCTGTGGGTCACTATCATGGCGTTTGGGAGAGGCACTTTTGGGGGTGTGGTCT-TCAGTTAGCTTTGAGATTCAC-------------GGTGAACGGAAATGTACTTCCC----AAGAGCGTTTCACGCCACCCTGGG--CTTCAGGATCCTGGGCAAGCGCCAACGCTGACCATCCAGGCTTATGA-TCTCACTGGCAGTTCGTCAATCACGGTGGGGAGGAAA--CAACCTGCACTCCACCCACGCCCACTGCACTCC s monDom4.chr4 49604951 677 - 430141050 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a score=12830 s mm8.chr4 153189115 166 + 155029701 ACTCACATATGAATGGCTTCACCGTGCTGTGGATATGCTTGTGCTGTTTGAGGCCAGAGGATGTGGCGAAGGTCTTGCCACAGTCAGGGCAGGCATGGGCCCGGGCACCGACATGCTGTGAGCGGATGTGACGCTGGAGGTTGCTGGGGTCCGTGAACACCTGGGG s monDom4.chr4 49672405 166 - 430141050 ACTTACATATGAAAGGTTTCACCGTGCTGTGGATATGCTTGTGCTGTTTGAGGCCGGATGAGGTGGCAAAGGTCTTCCCGCAGTCTGGGCAGGCATGAGCCCGGGCACCCACGTGCTGGGAGCGGATGTGCCTCTGGAGGTTGCTGGGGTCCGTAAAGACCTGGGG a score=12338 s mm8.chr4 153189791 207 + 155029701 TACCTTGACACAGTTTTCACATTCGAAGCGCTTGCCACTGTCGTGAGACATCTGGTGGCGGATGAGGTTGGACTTCCAGTTGAAGGCCTTGGGACACTGGTCACATTTGTACTCACGCTCTTCCGTGTGGACGATCATGTGTTGCTCCAAGCTGTGTACAGGGGATGGG---------AATCACTATAGGGTCCGTTTGTCTGGAAGAGGAGGTCC s monDom4.chr4 49674977 213 - 430141050 TACCTTTACACAGTTTTCACATTCAAACCGCTTTCCACTGTCATGGGACATCTGGTGGCGAATCAGGTTGGACTTCCAGTTGAAGGCCTTGGGGCACTGGTCACACTTGTACTCCCGCTCCTCCGTGTGGATGATCATGTGCTGTTCTAAGCTGGGCATCGGAGAGAAGGGAGAGGTCATTGACCTGCAGGCTCGCTT---TGGAGGAGAAGAGCC a score=-700 s mm8.chr4 153189998 120 + 155029701 TCTACCC-TGTATGGCTTGTTCTCCTGTATG--TGGCCCCTTGGAGGCCCCATCACACTGCAGGGAGATTGGAATGCGTGCAAACTCTACCTCTGTCAGGTCA--CTGGGACGAGGGCAGAGGAA s monDom4.chr7 27489476 124 - 262624689 CACACTTACGAAGAAGTCGTTAGCTGATTCGACTGATCTCGTTTAAAAATAATGAGATAAGAAGGAAATTGGAG-GCACGAGGGCTCCGTACTTGAGAGTCAAGCTTGAAACAAATGCAGAGAAA a score=10797 s mm8.chr4 153190488 398 + 155029701 AAATGAGA-TATGTCACAGTGGTAAA--ACAGCTGCTGGGGGTGGGGGGGCGCTCCTCTTGGCGGCACTAGCAACTCCTAATCC-CCTCCTCCCTGGGGACTCTACCTCTTCTGTCCCCGGG--ATGACCGTTAATCTTCATGAGCAAAGCAGTAATATATCACGGCCCGTTAATTACGGGGCCCAGCCATCCGCGTAGA-GCAGAAACGCCTGCTCCTCTAGCTCTCAGAGATTGTATCTTTT-----------CCCTGTTGTTAATTGTGATTTATGTGTTTATGTAAAGAAAACACGGACCCTCCTCAGCCCTGCTCTCTTGCTAAGCGCTCAGGCAGGGATCTGCCCACGCATTTA--TTCACAGTCATCTGTTCAGGGTGGAGGGTCTGCTGTCCCCGGGGAGTCTGTGATGG s monDom4.chr4 49676589 409 - 430141050 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AGCTCGGGTTCCATCAGCAACTTTCCCGGCTGAACAGGAACGCAACAGAAAAATAAATCCCTGCCTAATGGCTT----GAAGACCGAGGAGCTCACAATTACACGGCACCCGCATCCTAATCT---ACAACCGCAGCTCAAAAGCGCTCAAGAG-TCTACTCCAAATTCCTGCGGCGATAAGGGGCTGGCTGCATTTAGCCGGGGCTGGGATAAAAGATTTTTTTATGATAATTATCTTAGTGAGGGACGAGTTTGCATTTCCTTTC-TGTGAGGTTCTGAATTTAACTAGGGTGTGTGCTTGGGGGGGGGGC-GGGTAGTAGCTGTTGGGGTGGTGAAGAAGTGATCTTGACAGCAGAGGTTAGGGAAGTCAAATATTTGATGTCAGACTATTATGTGTGGAAAGTAATTAACTCCCAAATGTTTGATCAGTTATTAGGAAAAATGTAGA-GTGGGTTATTTAATATCAGGGGGTAGGGTGTGAGTGTGTAGGGGGACAAGAATCAAAGCTCTAAAAAGAACCTTTTGGAAGAAAGGAATTTCAACATACAAACACAACGACGGC-TCAGG----ATTCTCCTCTGGGTTCAAAATATTTATCCTCTGTGGG-------------TCTCCGGTGTTGGCTAAGATTCA--CAGGTCCTCTCAAGGACCACCTTAGGGAAATGGAAACCTCCCTCTTGCTGTACA-AGTCTTGGCAATTTGTTTTTTTGTTTTCTCATTCACCCAATTAAAATGAAATTAGAGT--------CAGAGAGGATCTGGCTGGTAAAATGGTCCTCCTGC s monDom4.chr4 49687920 776 - 430141050 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s monDom4.chr4 49729657 1121 - 430141050 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AGGTGGAGACAGAGGACCGGTTTGAGTGGATTGGTGGAAGCTCCATTGGAGGAGGCACCTTCTGGGGCCTCGGGGCTCTGCTCACCAAAACAAAGGTATT--------CCCTGCAGACCGTCCACCCTGTGGCCCTTAGAGGGGCCGTGGCGCATGTCTGC-------AGAAGCCACTCCCAAGACTCT----CTCCTGGCTCTAGTGAGAGGTCTTGGATCCCCGTGACTG--AGCTCTTTGTACTCTGAAGGGCAAGG--------------------------GCTTTGAACTGCCGGAGCTCTGCCAGC------TCAGTGGTCCAGCATCTAGCTTTCCAGGCCTGCC-----------------CTTGCCCCTTATGCTGGG------GAGGGCCATTCACGTCTGACTGTGCAGTCTCCTCTCTGCTAT s monDom4.chr4 59957388 421 - 430141050 AGGTGGAGACAGAGGACAAGTTTGAGTGGATTGGTGGGAGCTCGATTGGAGGAGGCACCTTCTGGGGGCTTGGCGCTCTGCTTACCAAGACAAAGGTATCAACAAGTACTTTGTAGGATTTCCTTCCTG--GTTCTTTGAAGGAAAGAGATGTGTGGCTTTTCATTCTAAAGGTCCTTCTCAATAGTCCGTGAATTATGGTCCT---------TATTATGTACCAATGCCTACAAACCCCCATTTCTTTTCTGGGTAGGGTACTATTGCATGCTCTTCTAAGAATCACGTTAAATGTGGTTGGTTCAAACAGCAGATTTTTAATATTCAAGCACAAACCTGAACTGGGCCACCAATAAGACATTGGCATCCTGGGACATGAGACTGGGAGGCAGGAGGTAAAGCCACATTTG----TGGGGCCTTCCCACGACCAT a score=10992 s mm8.chr4 153814623 231 + 155029701 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186 - 430141050 TGACTTCTTTGCTTTCTTTCCCCAGTTTGATTTGCTGGAAATGGATCGGTTAGAGAGGCCATTGGTTAATCTGCCCCTCCTCCTAGACCCATCTTCTTATATCCCTGACACTGTTGACCTCACAGATGATGCCATGGCCCGGAAATACTGGCTTACCTGCTTTGAAGAAGCACTCGATGGGGTAAG a score=6617 s mm8.chr4 153820055 245 + 155029701 TGGCAGGTGGTGAAGCGAGCTGTGGCCAGCCAGCCAGAGTCCATGGATGCAGTTGAGAGGGCAGAGAAATTCCGGCAGAAATACTGGGGCAAACTGCAGACCCTCCGGCACCAGCCCTTGTGAGTCCTGTGACCCCAGGCTAGTCCCTGCCTGTGGCCACTGAGGAAGGGTTCCCTTCTTAGCA-CAGGGACCTCGACTGGCATGGTGGGAGGATGAAGCCCACGCAGCAAGGTCTTTTCCAGCTG s monDom4.chr4 59975690 223 - 430141050 TGGTAGGTGGTGAATCGGGCTATAGCCAGCCAACCAGATGCCATCGATGCAGCTGAACGTGCTGAAAAGTTCCGACAGAAGTATTGGAATAAGCTTCAGACGCTGAGACACCAACCATTGTGAGT-------CCCTGTACTTTCCCCTGC----------------AGCATCACCTCCAGTGCAGCACAGACTCCCCTGTGCCTGCAGATGGGCTGCCCCCAACCCTGAATGGTTCCCTCTGGCTG a score=5971 s mm8.chr4 153820319 411 + 155029701 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GTCAAAGACTGTGCTTGAGGACTGTGCAGTTCTTAAAGAGTCACGTCCCGCTTAGCCTCC------AGGTACTGCCCCTTTGCAATATGGAGTTTCC--TCTTAGAGAAAGCCTTCCTTGTCATCCATGCCCCTGAGTCAGTCTGGAGCAGGAGCCTCTGGCGCAGTCTCCAGAAATGGGCTCCATCGTCCCGTAGCTCCTCAGCCCTCTGCCCAGAACCACACCCTCAACCCATAAGGG----TTTGGTGGCTCT---GCTGTTATGTTGTGCTTTGATTCTCCATATGGAGCGGCTCAAGCTAA---CGGGCTTTTTATTCATAGCTTTTTTTCTTTGTC----------------CAGTGTTCTGGAATCTGAGCCACAGTTTGGATTTGAAGAAGCCAAGAGGAAATTACAAGGTATGGATGTTCTAGGCTC a score=2096 s mm8.chr4 153822132 224 + 155029701 GAAACAAGCCCCT---GACACTAGG------------CCTCAGCTTCCC---------------TGACTA----------------GAGTTCCTGTCTCCTCAC---------AGAACGGCCCTGGCTCGTGGATTCCTACACCAAGTGGCTCCAGAGGTTAAAGGTATGTAAGGTGCCGCTGCATCTGCCCTTGGGGGTTGGAGCACAGAGTC-------TGGACCTA----GCCAGAGAGGGTGGCCACCAAAGTCATTGGGCTTACGGTGACATGGGTGTGACACAT s monDom4.chr4 59980847 286 - 430141050 GAGACAAACCTCCTTGGAGGATGGGAACAAAAGTTCCCCCCAACTCCCCTTTGGTAACTGTGGATGGCTAAGAAGGCCTCAGTAACAGGGTTCTATCTTCTGGCCTTTCCTCTAGAGCGCCCCTGGCTAGTGGACTCCTATGGGGAGTGGCTGCAGCGGTTAAAGGTAGGTGTGTGTCCA----GACTGTCCAAGTGAGTGCTGGCCCAATGCTGTCGGGATGGACCCAAGATGCAGCTGGGGGTGGGGAGCAAGCACACTGCTCTGGCTTTGGGATGGGCATTACCCCT a score=16573 s mm8.chr4 153822674 954 + 155029701 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TTGGAAACTCCTGTTCCAAACTGAACATCCTGGTTTTGTCTTACAGGGTCCCCCTCATAAATGTGCCTTAATTTTCGCAGATAACAGTGGAATAGACATCATTTTGGGAGTCTTCCCCTTTGTCAGGGAGCTACTCTTTAGAGGAACAGAGGTGAGTGTGTGCCCATATGTGTCCATAACTGGAGACCCTTGTCTCTCTCACTGTTG--AAATTTGGAGGTGACTGGGGGTTCTGATG---------------AGAACTATAGAGAAAGAAT-CAGACCCTAGCAGTGAATG-GCGGTCCAGTTAGCCACGGG--GGCCCTCCAGACGTGG----------TCCTACTTCTGGAGCTGTCTGG----GGTTCCTAGAGAGCACCTTGGTGTGAGTC---TCCAAG-GGCAGACAGA------------------GCTCCTGAGCCCTTCATTC----CCCAGCTCCACCCATTTGTGTATTCTTAAAGATCCTGGCTCTTAGACAAGCCCTGGCCTTAAATGCTAAGCGGCAGAAGCCACTGTTAGTCCTGAGCCTGAGGAGGCGCCGCCAGCAACCGTCCCCTCTGGGCC-----AGCGACGGGGCCGGT--------GCTGATGTGGCCCTTTTTGCCGTAGGTCATATTAGCCTGCAATTCTGGACCTGCCCTCAATGATGTGACCTACAACGAATCTCTCATTGTGGCCGAGCGGATAGCGGCGATGGACCCCCTCATACAgtgagtgtgtgtgtctgtctgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtct-----gtgtctgttgtgtctgttgtgtgCCTCGGGTCTGTGTGGGCACTCCCTTGCTCCCTGGTGGTATTTCAAGCGCCCGTGTTTGATTCTGCCTAGATCGGCACTGAGAGAGGACAAGCTGCTCTTGGTACAGACCGGCTCGAGCTCCCCCTGCTTAGATCTAAGGTAATCCAGGAGT--GTCAGCTGGCTCTGCATGG 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s monDom4.chr4 59996484 2335 - 430141050 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a score=15874 s mm8.chr4 153829900 1735 + 155029701 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gtatgaacaaaatagaagagaaagggaagctatcagggagaaagggaaggaaaggcaaaaggatgaaagagagaagaggagatacaag-------agagaaagagaaggg---gGGAATAAGCAGAAAATGAGAAGGGATGACCAGAGAGGACAAGAGCAAAAGATGACTCCTCAG----GGCCTTCCATCCTGGACCTGCTTCATAAATGGATGGTTTTCCGGCTCCAGATGGCCCCATCATATCAAGGAATAATGTTACAATCCATGTCACATGAGTTGA-AGAATCAAAAATGTCAATGAGGAGGCAGAGGAGGAAGAAAGGGAGGTGACTAGTCTGAGAGGCATGCAGGTCGGCCGGCGGCGGCGGTCACTACACCTTCCTGAGACAGGTCGGGGGGTACCTTCAAGGCTCCTAACCATTCTCTGCTTCTAAAAGTAGACTTTGGACGCAGAGAAGCCCACTGTAATACCAAACAGACAGAGTAAAGGCAAATCAGACAGCAACAACATTGGGGGGAGAAGGATAATTGGTCAGCACACCTGGAAAGAGCCCCACAATACAGAGAAACCACAGGTGGGGACAGGGTGgggagggagaaagggagggaa a score=7081 s mm8.chr4 153832910 96 + 155029701 TACTCACCTTACCACTAATGTCACTGACAGCCACATGAACAAAGATAGAGGCCTCTTCCATCCCTTCTAGGTACACATGCCGGTAGCCTGGAGCAA s monDom4.chr4 60010483 96 - 430141050 TACTCACCTTACCAGAGATGTCATTGATAGCTACATGAACAAAGATGGAGGCCTCTTCCATCCCTTCCAGGTAGACATGCCGATAACCTAAAACAA a score=12136 s mm8.chr4 153833214 172 + 155029701 CTTACCTGGCATTATGCTGCTGAAGGCTAGTGTCCTCTGGCCGATGAAGTCACGTCCAATGGGGTCATGGTCCCAGACCAGGAAGCGTACAAGCGCAATCTCTGGCATGTGCACGGTGAACACCAGTGTCTCCTCCCACATGGGGTTGAATCCTGGAGATAGCGAAGAAAGG s monDom4.chr4 60012502 170 - 430141050 CCCACCTGGCATCATGCTGTTGAAAGCCAACGTCCTCTGTCCGATGAAGTCCCGTCCAATGGGGTCATGATCCCAGACCAGGAACCGAACCAGTGCAATCTCCGGCATGTGCACTGTGAACACCAGGGTCTCTTCCCACATAGGGTTGAAGCCTGGAGGT--CAGAGAAAGG a score=6401 s mm8.chr4 153833524 118 + 155029701 CTCACCGTTGTCGTCCACCACTCGGGTCTGCTCCTTGCTGCAGTCCACGGGGAGCCCAATGACCTCCACCTCCACGAAGGGGTCGATGATCTAG-----AGACAGGGTGA-GGGGTGGCACTGG s monDom4.chr4 60013161 124 - 430141050 CCCACCATTGTCATCGACGACCCGGGTCTGCTCCTTGTTACAGTCCACAGGTAACCCGATGATCTCAACTTCCACAAAAGGGTCAATGATCTAGAAGGCAAACAGGAGAATGAGGTGGTGGTAG a score=7900 s mm8.chr4 153833663 288 + 155029701 CCACCTCACCC--ACGCAGGCTTGCC-CCTACCTCCCCACGGTCGCCCAGCACCGAGTCCCGTGGTTTGGGCAGCTGCTGGCCACTGATGATCCTCAGGGCCAGCTGCTTCTTGAGCTGCCCCGGCAGGGGATCCTCCGAGTTGGGGTTGAAGACACCTGAGAGGATGCAGGTGTGAGCCAAGTACACAGCTGACACCACACCCCTACCTGTTGGTCTGTGGGGCTCTGGTGAAAAAGAGCCTTAGGG--AAGGGTCAGAAAGCTTTGGCCTGGGACAGGATA-GCTGCACTGG s monDom4.chr4 60014100 274 - 430141050 CTACTGCACCCTTATCCAGCATTCCCACTTACCTCTCCTCGGTCACCCAACATGGAGTCCCGTGGTTTGGGGAGCTGCTGCCCGCTGATAATTCGAAGTATCAGCTGTTTCTTCAACTGCCCTGGGAGAGGGTCTTCAGAGTTGGGATTGAAGACACCTAGTAGA----AGATGGGACCAAGAGAAACAA-----AACAGAATGTTCTCTCTAGGTC--AGGGACTCCAATGGGGAAA----TTGGGAGCAAGGATC-----TCTTTCCCACTGGATGGGATGCCCTTCACTGG a score=8602 s mm8.chr4 153834480 139 + 155029701 TCCCTCACCCTGGCACATGCACTGGGGTTTGAGCACGTAGCCACAGTCACCGTTGGCGCTGAACTTGGCCCTGTTCAGCTGTAGCATCCGCCCCTCTGACTGGTAGTTCAGGGCAACTGAAGGGAAGACAGAAACCCAG s monDom4.chr4 60016477 139 - 430141050 TCTCTTACCTTGACACATGCATTGGGGCTTGAGGACATAGCCACAGTTCCCGTTGGCATTGAATTTGGCGCGGTTCAGCTGGAGCATCCTTCCCTCTGATTGGTAGTTGAGGGCAACTGTGGGGAAAAACGTGACTGAG 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ctgtctcttctctatccagaggcagtcctttgtccccccgccccccaggacagataccccttgccccctcccttg-ttcccttccccttctccctcaccctccatctcctgtctttgtct-ctgactccctgccctctctccctctggggtaaataaatcccctttgtgctgagaattggtcttgggTGTTGG--GGGCCAACTCCAGGTTCCCTACAAGCAGAGCCTGGG-----CTCCCACTCACATCCCCATTGAGGAGCTTGCAGTCATCCTCCATCTCATCAGCACTGTCCTCATCAGATACTTCGCCTTCTTCTGCATCCTCACTGATATTGGCAGGGAGCTTCTTCCCCTGGG-----------GGAAGAGGTAGATAACGGGAATCCA s monDom4.chr4 60046896 389 - 430141050 CTGACTTCTGAACTTCTAGTAGGAGTCCCATATGCCATTTCTTGAGGATGCTGCTACCCTGAGCCTCAATCCTGGCTTTAGATACGCTACTTCCTGGGCTCTAGTCAACTTCACATGCCTTCTGA-----TGGCATCCCTTTACAATGGGAATGAAAATTCCTGAAGACCTTAGATTTATGGCTGGTTTGTGGCTAGTCTGAGTCTCATGTTCTTACC--CAAGACCCGAAGGACTCTATAACTTACATCTCCATTCATTAGCTTGCAGTCATCATCGATTTCATCAGCGCTGTCCTCATCAGATACATCCCCCTCCTCTGCATCTTCACTGATATTTGCTGGGAGTTTCTTCCCCTGGGTACCAGAAAAAAAAAGTGTCAGATGGTGAGACTACA a score=10273 s mm8.chr4 153842640 458 + 155029701 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monDom4.chr4 60059363 263 - 430141050 ttcacattgggagttaggatcagagccgaaatgagttcccaggactgactgaaccaagccTCATCTTGCCTAGATATAGAGAGGTGGATCCAGGGAAATCAGAGATCCCAGAGGGTGTCACTCACTCATTCTTGACGAAGGCGTATTTGTTGATCGTCTCAATGACATCTTTAAAGAGGATCTTGGAGGTCAAAGTATAACCATGGTGCACGATAGGTTCCCCATCTGGTCCATCCCAACAATCCACTGAAAAGGGGCAAAGA a score=151 s mm8.chr4 153843998 3 + 155029701 GAT s monDom4.chr7 14541975 3 - 262624689 AAT a score=-167 s mm8.chr4 153844019 178 + 155029701 CTTGGCTGTGTGAACCTGGGGAGG---CTTAGTCCCTGGGCTCCAAGCATGGGGGGAGGGGCAATGTCTGACCTCTCAGTGGTGAACAAAAGGGACCCTGCCAGAGACCCCACTCTCCCCCGCTCACGACTCCCCTGTGG----CATTAGTCCAAGCCCATTTCCTGA-----AGGAGGTGCCGTCTACA s monDom4.chr7 14547961 163 - 262624689 cttagctgggtgacactgggcaagtcacttagcctctgtttgcc----------------tcaatttc------ctcatctgt----ataatgggcataataatggtccccacctcccagggttgttgACACAAATGGTGTGATCATTAA-cttggcacagtgcctggcacagagtaagtgctagctatt a score=14915 s mm8.chr4 153844197 257 + 155029701 GCGGAGACAATGCTCCTTGGTGCCGGAGGGCAGAGACCAGATG--TTCTTACCCTCCACACAGCGGCAGCCGGCCTGCAGGACCCAGGCATACATGTCCACCCGAGACTGGGACATGAGCTGGTCACCCACGAGGTAGGTGTTGTGGGACGAGGTGATGAAGTAGTGACTCAGCGGCTGCGTCATGTCTTGGTGCACTCTGTTGTGCTCAGGGTTGAAGATGTCACCGGCGGGGCTCCGGGTGTAGTTGGTAAAGCCTG s monDom4.chr4 60061508 255 - 430141050 GCAGGGATAAGGCT----GGTACCTATGGCAATAGACCATCCCACCTCTTACCTTCCACACAGCGGCAGCCAGCCTGCAGGACCCATGAGTACATGTCCACCCGAGACTGGGACATGAGCTGGTCCCCAATGAGGTAGGTATTATGGGAAGAGGTGATAAAGTAGTAACTTAACGGATAGGTCATGTCCTGGTTCACTTGGTAGTGCTTGGGGTTGAAAATGTCTCCCTCTGGACTCCGGGTATAGTTTGTAAAACCTG a score=6221 s mm8.chr4 153844594 511 + 155029701 CTCACTCACCATCAATCCCCAGCATCCCCttgctcttattttccaggcaaggctcaaactgctcaatgatgttctgacagctctccagggtcacaccgttcatctaggccaaagc------agaggcacaagccc-----aggctagct------cattcAT------------------AGCATGGACTGTAGTC------TATGTCAGTCAGGCAGTTCCCCCTTCC--TCCCACCAGT---------GTCA---CCATCTCTTGCCCTTGTCTCTGCCATAGGGTGGCATCTGGCAATGACATTAGGGTGGGAAAGCAGGTGGGGGCCATCCCAAGGGTAGTGTGGTAAAATGATGAGCGTTAACGGGCAATTTCGCAAAATGTGGAATTGCTTGGGAAAGAGGTCTCCGTGAGACTTCTTGTCTAGATCaggctggcctttg---------gggaca-----------agagttggggactgtcttgattatattaatcagggaggaagacccaTGTTGTGGATGGGCCTtgtcatggtttgaatatgcttggcccagggagtggaggtgtggccttgttgg s monDom4.chr4 60069584 528 - 430141050 CTCACTTACCATCAATGCCGAGCACCTCCTTACTCTTGTTCTCCAGGCAAGGCTCAAATTGCTCGATGATGTTCAGGCAGTACTCCTTGGTTACATCTGTCATCTAGAATGAAACCGTCATAGAACCATCAGTCCACTAGAGGCTTGCTGGTCCCCACTCATCACCAGCACCTTCCAGGGGGCAAGCACAGTGTCCCAGACTTGGGTCACCCAGCCAAATCCTCCAGCTAGGGCCATCAGCAGCTGGGGAGTCACAGCCAGCCCCTGCCCTTTCCTCTCCCTTAGG--GGAGTCTGACCATTTCTCT------GAAAGGCCCATGAG--------CTCAGGCCATGGGGCAAAGCCAAGACGGACTGAGGTCAAT-----AAGACG----ATTGATTAATGA---------------CCCTCATGTATAGACCTGACTGGCTTTAGAGAGCCAGAGAGACAAGCAATGAATCAGAGTCAGGGGCTTTGTAGGGAAGA--------AGAGGAGGATCAA---TAAGAATTAGGCAGGTAAT-------ATATGTTTGGCGGGGAAAGAAGTGAAGTTGCTCTGTTTG a score=12089 s mm8.chr4 153846550 259 + 155029701 TCACCTTCTGCTCCACCTCCAGAAAGCGCTGCAGGTCGGAGGCATCCAAGTGGTCCTTATGGTTGCTGTAGGTCAGCATGAGCAGGTAGAGGTCTCGGCGGGTAGACATCATCTTGTAGAAGGCGCAGAATTCCTCAAAGCCTAATGTCCCCTGATGGTCATCTGTGTCCGCCTCCTGTGACACCCAACCTGGGGTCACCATCCGTGCTGCAACCTTAC-TACTCCCAGTGTCAAGCCCAGCTTCCCTTCCTCTGCCACT s monDom4.chr4 60079912 251 - 430141050 TCACCTTCTGTTCCACTTCCAAGAAGCGCTTCAAATCCTCTGTGTCCAGATGGTCCTTGTGGTTGCTGTAAGTGAGCATGAGCAGATAAAGGTCCCGGCGGGTAGACATCATCTTGTAAAAGGCGCAGAACTCGTCAAAGCCCAGCGTGCCCTGGTTGTCATCTGTGTCTGCCTCCTGGAACATAAAG--------AGCCACATGGGGTATGACCCTACATGAACTCAG-GTCCTCCTCCTTGTCCTCTCCTctggctct a score=8435 s mm8.chr4 153849201 507 + 155029701 TGAGTGTGCGTGGATGTGTGGATGTGTGTGGGTGTGGGGTGTGGTGGGAGCAGACTCAACAGAGCTGTCAGACCATGAGTGTGTATGGATGTGCGCATGTGTGGGGGTGGGGAGAGCAGACACAGCC---AAGCTGTC-------------------------------AGGCAAtgtgtgtgtgtgtgcatgtgtgcctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaggagagCTGTCAGGCTATGAgtgtgtgtgtgtgtgtatgtatgcatatgtgtgcatgtgGGAGGGGGGAAAGACACAGCAGAGCTATCGACCATGAGCAtgtgtgtgcatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgCATGCATGGGGAGGTAGACATAGCAAAGCTGTCAGGC---CATGAGCATATATAtgtgtgtatgtgcatgtttatgcatgcgtgtgtgtgtgtgtgcgtgcctgtttgtgc----------ctttgtgt s monDom4.chr6 30907485 452 - 244784211 TGAGCGCGCGTGGGTGCGAATTTGAGAGTGAGT-TGAGAGAGAGAGAGGGCGTTTCTTAGAGAGC---------GTGTGTGTGGGTATATGTGTGTGTGTATGGGGGAGGGGAGAAGAGAGAGAGTCTTTAATTTTTTTATAAAAAAGACAGAGAGAGGGGGGAGAGAGAGGGAgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg------------------------------------------------------------tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatatatatatatgtatgtg--------------------------------tatatatatatatatatatttatatatatatatatatatatatatatatatatatatatacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatTTGCTCAGTTTTTTAGCTTTGtgt a score=3054 s mm8.chr4 153849943 106 + 155029701 GAGGTTCCCAAAAGACAGAAGTAATTACAGACAATAAAGGATGCA-------------------TTTTCATAACTCCTAACAGCAGGGTGTTTGGGGGTCATGGCAAAGTGGGGTGGCTAATGAG s monDom4.chr4 60097309 118 - 430141050 GATATTTCGAGATGGAAACTCTAATTACAGACAATAAAGGCCGCAGCTACGGCTCAAGGAGGGATTTTCATAACTTCTAACAATGG-------GGGATGCATTGCTAAGTGAGGAGGCCAGAGAG a score=1316 s mm8.chr4 153850074 71 + 155029701 TTGATGGGCCGTGTGTGTCTTTAAGGCTG-GGGATTATTGGAGACCAGCGAGTGACTGGATGCATCTGAGTG s monDom4.chr4 60097472 69 - 430141050 TTGGAGGGCtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgagtgtgtgag---agtgtgtgaatgtgtgtgtgtatatg a score=11618 s mm8.chr4 153850388 266 + 155029701 GCTCAGCACTCACCCTGAACATCTGTTTCACCCTCTGCCGGGGCAGGTTCACGTTGAGTTTATGTAGCAGCTGCAGAACCTCACTGATGCTCAGGCTGCCGTCCCCGTTCTTGTCAGCCTCATCAAACGTCTGCTTCAGCCACTTTGGGGCTGAGTTAGGGGCCAACACAGTCCATGGGCCTGACCTGGCCTACTCCTCCCTCCAGCCTAGGAGGCAAGGAGC---------AAGAGTCCCCAGCCCAAG--CACCCCCCCTTATCTTCCCTTCACT s monDom4.chr4 60102099 274 - 430141050 GCCCATTGCTTACCTTAAACATCTGTTTCACCTTCTGCCGGGGAAGGTTCACATTCAGCTTATGAAGGAGCTGGAGCACTTCATTAATGCTCAGGCTTCCATCCCCATTCTTATCTGCCTCATCAAATGTCTGCTTCAGCCACTTTGAGGCTGAGTTAGGGGCC-ACACGACAGTTGGGACCCCAACAGC--ATCCCTTCATGCAGCCCAACACCCAAACATCCCCTGCCTGATTAAATCCCTCCCCAGGGCCATCTCATCTCATCCTCCCATCCCT a score=14645 s mm8.chr4 153850691 281 + 155029701 TCCCCACCCCTGGAGCCTAAGGATATTGGTCCCTGGTACGCTGGCGACGGGCTAGGCTGTCTTCATCGCTGATGCCAGCCATGAGGTAGCGAAGGCCGGTGACCCAGGTACGTGCCTCTTCACTGCTGGGTGAGACCAAGTCCAGCGACTCTCTGTGGCTGCCATGGTAGATGCTGAAGCAGCAGTTGGGGTCAAAGCTGCTGTCCGGGTAGCGCTGGAAGATTTCAGACTGCCGGCCCTCACTCACCTCCTGGATGGAGTCGATGGAAACTGCAGGCAAG s monDom4.chr4 60104421 281 - 430141050 TTCCCAATTCCATTCCCAAAGGATATTGGTCACGAGTTCTCTGACGTTTGGACAGACTATCCTCATCACTGATCCCTGCCATCAGGTACCGGAGACCCGTGATCCAGGTTCGAGCTTCTTCCCCACTGGAGGACACCAGGTCCAGTGACTCCATGTGGTCCCCATAATAGATGCTGAAGCAACAGTTGGGGTCAAAACTCCCATCAGCATAGCGCTGGAAAATCTCTGACTGCTTCCCCTCACACACCTCCTGGACGGAGTCAATAGAGACTGTGGAAGAG a score=9691 s mm8.chr4 153852784 183 + 155029701 ACTTACTCTTGGCTTTCTCGTTCTTGCGGGAGGGACGCCATCGGAGGCAGGAGCGGTGCTCATCCAGGTAGTAGAAGCGGACCAATCCCTTGGAGCTGCCACGGAGCTTCACCATCTGGGTCCCCTCTTGCATGGCACTCATGCATCGCTCCACTAGACACAGGTGGACACGCAACAGagaca s monDom4.chr4 60112475 183 - 430141050 ACTTACTCTTGGCCTTCTCATTCTTCCGTGATGGCCGCCAACGGATACATGACTTGTGCTCATCTAGGTAGTAGAAGCGGACTAGGCCTTTAGAACCACCTCGGAGCTTGACCATCTGAGTCCCAGCCTGCATGGAACTGATGCATCTTTCCACTAGAGACACAAAAAGAGAGAGGGGAGACA a score=1872 s mm8.chr4 153861933 48 + 155029701 ACAAAGGACACCTTAGGCTGGGAGGAAAGAAGGGACAGGAGGGAAGGA s monDom4.chr4 60117147 48 - 430141050 AAAGAGGGCATTTCAGAGAGAGGAAACAGAAAGGACAGGAAGGCAGAA a score=2086 s mm8.chr4 153883418 66 + 155029701 ATCTGCTCCATAGTCTAA----TCAGCCGGTCAGTCTCTCCAAAGTCCCTCTTATTTGTCATAAGACATG s monDom4.chr4 60251991 70 - 430141050 ATCTTATCCATTCCCCAAGTTGTCAACCCTTCACCCTCTCCAAAGACTTTTTTATTTGTTaataaatctg a score=1390 s mm8.chr4 153884160 454 + 155029701 CCGGCTGGCTAGCTGCTGCCACTGGAGA-----------CGTCTCCAGGAGCCCTTCCTCCGTCTGCCTGCGATGCTGCCTGTTATACAACAGACCTAAGAATAATC--------TAAAGGGCGGTCGCAGATGAGCGCCTCGCCCTGGGACCCCTCCAGCTGGGGAGGTGG-GAGGAACCACTGGAAAAGGGCTGTGCTCCTTATTCAAGACTCAGTCTGTGTGGAGGCCATGTGCCCTCTGCCCTGTGGCTCC----CCCATCTCTAGCACCTGGGAGACCTACTGCATGCAATCCTGGTTCCCTTCCCCAT-----CCACAGCTCAGGGTGACCAGGGAGTCCAGAGGCTCCACGGCCACCTGTGCCTACAGATCTTGGGGTCAAGAGT---CCTGGCCAAGAGATG--GCAGCTGC-AGTTTTGGCTGGACATATTGATGCCTGGGCCCTAGAGGACAACCCGGCAGCCAAGGGCAGACAGAGCC s monDom4.chr4 60253420 422 - 430141050 CAGGCTG--TGGCTGTGGAGACTTAAGAAACAGCAGCCTCGTCTCCAGGAGCC-TTCCTCAGCTCGCCTG------------TTATACAACAGACCTAAGAATAATTCAGGGGAGTGAGGGGAGGAGGCAGGGGA-----TCATACATGGAGGTAGACAGAGGATGAGGAGATGAGGAAGCA---------GCCTTTG---CTTGCTCTGGCCTCCACTCCTGATGGG------------CAGCCCCAAGGCTCCAGGTACCTTCTTCTTCAGGTAAGGAAATTCTCACGGCCGA----GATGCCCTTCCCTACAGGTGCCTCTGCCCCTGCAGAGTGAAGGGATCAAAGGTTTCAGTTCCTCTTTT-------CATCTGGGGCTGAGGAATGAAGCTCCCCCAGAAGTGCCCCGGCTTCTCCTTTTGGATGGAGA-------GCCCAGGGATTTCGAGACAAGCCCCCTCCC-----CAGCCAGAGCC a score=9084 s mm8.chr4 153884726 399 + 155029701 GCAGCAGGTGGCAGGCAGCCTTCAGGTTACTGGCACAAACTCTGGACCAGGCTCACTACCCCTCCC---TCCCGGGAGCAGGAGGCAGGGCGGGT-GCAATGCTTGGCAGATAATGAAGTAGTCCTGTTAGGTGCAGAGTAACTGAGTCTATACAAATTGGCCCGTAGCTCTTCATCTATTGCAGGCATTAAAAATTAAAATCCAATTACAACTCATATTGTCGAACCTGGCTGCTGCCGATTACAGCAAGCCGAGTGTGGGGTGGGGGATTATTGTAACCTGAACTACTGGTGGTGGTGCTGAGAACCCCAGGCACCAGGGCTTCCTATCCCTGGGAGGGCCTGCAGGAGGCCTCTCTCACTTGTAAGGAGCAAGACCTGCAGGAG--TCCCAGGACCCAGAGG s monDom4.chr4 60255762 389 - 430141050 GCTGCAGGTGTGAGTCTGGCTCCTCGAAATCCGCC---GCTCTGGCTCAGTCTCCCCATCTATTTCCTTTCTAGGGAGCTTGTGGGAGAGTCCATAGGAATAGTTAGCAGCTAATGAAATAGTACTATTAGGCGCCCAGTAACTGAATATAGACAAATTGGTCCATAGCTTCTAATCTATTCCAGACATTAAAAATTAAAATCCAATCACACCGATTATTGTCGGATCAGACTGCTCCCGCTTGTGGCAATCAAGG---AGGGGGTGAGATTA-TGTAACCT----CATTTCTGCATCTTCAGTGCAAGGGAGGAGGCAGCTATTCCAGAACCTTTCGGGGGCTCCAGGAGG-----CTCTCTCCTGGGGCTTGACTCCTGGAATAAGTCCCCAGAATACAGAGG a score=1452 s mm8.chr4 153886546 257 + 155029701 CACCAAGAGAGCCTTGGACCTCTCTGCCTGTCCTGCTGCGATTCCACATGCG----CACCCGTGCCCAAACGGCTAAGAGAAGCAGCTGGGCCC--CCGCATGCGGCTCTGGAACCGCAAGTGCCCCCTCCCTGAGCACAGCCCCGACCCGGGCCAGGAGCAGCGGCGCCCCCGCGCGTCTACCCGCCCCAGCCCTGCGTCTGCAGCAACAGGAGCGGCACCTACTGTGCTTCTGCGGGGCGGCTCCCGCGTCCATTGTCTCC s monDom4.chr4 60261760 232 - 430141050 CACAGACAGAGTCT--GACCACTGAACTGGCCCGGcacacacgccacacacgtatacacacatccacatacacacacaTGCAGAGATTTGGCGCTGCAGAATACTGTT--AGAAGAACAACTGCCCCCTA---------------GGCTGCTGGGAGAAACCGAGGGACCCAC-------CACCTGCCCCAGGAGGGAG-----AGAAATTTCCAATCCACCTACTGTGCTTCTGTGGCTGGCTTCCCACATCCATTGTCTTC a score=1907 s mm8.chr4 153889280 48 + 155029701 CTGAGTCCCAGTCTCTTGTCCAAGCAGATCCTTGTGGTATGTGCCAGG s monDom4.chr4 60263755 48 - 430141050 CCGGATCCCACCCTTTTCTCCAGCTGAACCTTAGTGGAAGGTGCCAGG a score=6163 s mm8.chr4 153910650 330 + 155029701 CCGCTTCACCCTCCAAGCACAGACCACACCCCTCCC--CGGGTAGCCCCAC-------CCCTATGTCGTGGACACGCCCACTA-------CTCCGCCTCCACAGATGTCACGCCTAGGCTCCGCCTTCGCCCGCGTGGTGTTCGCAGCCTCAGCCCCACGACGGACGCACGTCGAGCGTCACAGGCCCCGCCCACGAGGTGCGCAGGCGCGGTGC-----------GAGCTCTGCGATTCG-GGCCATGGCGCGGGCGGGTGCC------CCTGAAGTGATCCGGGCAGCGCAGAAGGACGAGTACTACCTGGGAGGCCTGCGGAGCGCGGCGGGTGAAGCGCTGCACAGCCTAGCGGGTGAGC s monDom4.chr4 60365610 344 - 430141050 CCGCCAATCATTCTGGGTTCGAATCACCCGCCGCCCGCCAGTTGGCCCCACGTAGGAGCTCTCTCCAGTGCCGGGTCCCTTTAAGACTTTCCCCGCCTCC-------TCTCCTCAACCACCCGACCCCGCATGGATGTGTAACGCGTAATCTACGCGACGGCGGTCAC-------------CAGGCCCCGCCCTTTGGGCGCCGAGGGGCCGTGCCCACAGTCGGGAGGCTGGGAAAATCGTGACCATGGCCTTGGCACCTGCTAATCAGCCGGAAGTTATTCGCGCCGCGCAGAAGGATGAGTATTATCGGGGCGGCCTGCGAAGCGCGGCTGGAGCGGCCCTGCACAGCCTGGCGGGTAAGC a score=4517 s mm8.chr4 153911357 418 + 155029701 AAGGGCAGCAGAGGAGGTGAAGGGAGAGA-CGAGTTGTTGAGGGTCGTCTTAGGAGTGACTTGACT------------TGGACTTTACCTGCCCTTCGGGAGTgacagggtttctctgtgtagccctggctgtcctggaactcactctggtcagtctgga--------------ctcgaaatctctgcctcccaaatgctgggattaaaggcgtgtgccaccactacccggctGGGAgtcatcttaagagaaccacttcacctctctagagcta---------------------atatttttcttctctcaggtgcaaagaaatggctggaatggaggaAAGAGATCGAGTTGCTCTCGGACATAGCCTACTTTGGCCTCACCACAATTGCAGGTAGCTG-------TCTGTGCTCGGCAGGTCC---TGGGCACTGAGGGGCCCA---CAACCCACCCAGGTCTGGA--GGGGATGCTT s monDom4.chr4 60366844 454 - 430141050 aacagccagagagaagggggaaagatggagtgtcttgttcaggaacTCTTTGGCCTCAACCTGTCTCTATAGGCTAACTACACATTGTCCACTCTCAGGAA---------TCCTTCCATGCAGTCCA------CTTGGTCTACACTCTGTTCCCCTTGGAGGATGTACCATCTGTCCTACACCTTGGCGTCCTTCATGCCaggactttgcaca-atgcc--cagtacacagcaagtg-----cttattaatgcttcttgactattatATTGCTCTGGCCTGGTCTCACTGGCACCATCCCTTGGGCCTTTCAGGTGCTAAGAAATGGCTGGAGTGGAGGAAGGAGGTGGAGCTACTGTCAGACATAGCCTACTTCACCCTCACCACATTTTCAGGTAAGTGAGTCAGAGATGTGTGTGGAGAATCCAAGTGAGCGCT----GGCCTATCTCTCCTTCCTCAGGTCAGGATTTGGGAGACTT a score=16510 s mm8.chr4 153912459 419 + 155029701 CAGGCTACCAGACCCTTGGGGAGGAGTACGTTGGGATCATCCAAGTGGACCCATCCCAGCAGCGTGTGCCCTCCAGGCTCCGCCGTGCAGCGCTGGTTGCACTGCATGCTGTCTTGCCCTACCTGCTAGACAAGGCACTGCTGCCCCTGGAGCAGGAGCTGCAAGCCGATGGCGATGCTCCCCGGGCTTCACAGGGCAGTCTGCTACCTGGAGGACGCAGCCGATCAGGGGCACGGCGCTGGGTGCGTCACCACGCAGCCACC--CTGACTGAACAACAGAGGAAGGCCCTCCAGCGGGCAGTCTTCATCCTGAGACAGGGCTTCGCCTGCCTCCATCGGCTCCACGTGGCTTGGTTTTATATTCATGGTACCTTCTACCACCTGGCCAAGAGACTAGCAGGGATCACGTATGTAAGTAGC s monDom4.chr4 60368981 419 - 430141050 CAGGGTACCAGACTCTTGGGGAAGAATATGTGAACATCATCCAGGTTGACCCATCCAAGAGAAAAGTTCCTTCTTGGTTTCGCCGAGCCACACTGGTCTCTTTGCACACCCTTGTGCCCTATGCACTGGACAAAGCCTTAGTCCATCTCGAGCATGAGCTGCAGGCCGAAGTGGAGAGTGCCAGGCACCTGCAGAACAGCCTTGTGCTTGGTGTCCGCAGTAGGTCGGCGGTGCGGCGATGGGTTCACAG--ATGGGTCCACCATCTGTCAGAGCCACAGAAGAAGACGCTCCTGCGCGTAGTGAACTTTCTAAAACACAGCATCACCTGTCTCCGCCGGCTGCACGTGGCCATGTTCTACATCGATGGGATCTTCTACCACCTGGCCAAAAGGCTCACAGGCATCACATATGTAAGTAGC a score=15919 s mm8.chr4 153914178 401 + 155029701 CTTAACAGCTCCGCACTCGTCGCCTGCCTGGAGAGGACCAGAAGGCTCGCACTAGCTACGGACTGCTGGGGCTGATCTCCCTCTTGCATCTGGTGCTGTCCATGGGGCTGCGGTTGTACAGCTTCAGGCAGAAGCAGCGAGCCAGGAAGGAGTGGCGGCTGCACCGCAATCTATCCCACCGCAGGTGTGCA------------------GGGAGCTTGAGGTACTTTGGTATGCCCCGATTTTGTGA-----AAGGTGT----ATTCACCTGT--GTACTTA----CCCCCATAGGAGTTCCCTTGAAGACAGAGCCGTGTGCAGAACCCCACTCTGCACCCTATGCTTAGAGGAACGAAGACACTCCACGGCCACACCTTGTGGCCATCTCTTCTGCTGGGAGTGCATCACCGAGTGGTGCAACACCAAGGTA s monDom4.chr4 60370837 429 - 430141050 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TTTATATAAAGACTAACACAAGAAAGGGGACACTATCTTTAATAAAGTCTGGAATTAAAAAGTCACTTAATAAAAT-TTTAGAG-----TTGTTTTATCACATCAAAAAAGTTTACATGCAGGTCATAGTTCTATTTTTTTTCCATAGAAAATGAAAAGCTATGTGTTAAAACCCACAAAATTGGTCTGTTACTGCCATTTGTGTTGAGTTCTGAAGGGGATGAATAAAGGAAAAAGGGTAATCCAGAAACCAAAATCAAATCAAATAAGATAAAACCCAAAACAAAGCCAACCCCACTTCTTTAAGTATCAAAGAAATGTGTCAAAATAATTTCAAACAATGaaaatatatatatttatatatttataattCAGGGCCCTCAAAAGAAATCATGGTCATTAAGAACAAAGTTTTGAGTCATTATGAAAAGAGCCGA-ACTTTAAACATCTTTAGTAAGATGCAATTAGGAAACTGGCATTAGATCCCCATACACGGTTACTTGAAAATCACCTTTAAAATGTTAAGTTCTTT--------AGGAAAAAGGC a score=19060 s mm8.chr4 153918500 434 + 155029701 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CGGGGACACTTACCCGGGGCACCCTCCGCTTGTACTTGTTGGCATAGTCGAACTTCTCCTTCACGTCGTCCAGGCAGCGGCCAAGGCGGGCCTGCTCCTCCTTGCCCGTGTAGTCCTGGCTCAGCAGGATGTAGGCCCGCCAGTTGGCTGAGTCGAAGCCCCAGTGGCAGGTCCGGTTCTCCAGGGCCTTGTGCGAGTGTACAACGAACTTGTGCGGCGGGTACATGAGGCGGCAGTCGAGGCACTGGATGCAGGCAGCGCTGGGACTGCTGTACAGCTCGGGCACCAGCAGCCCTTTGCACTTGCCGAAGCACTCGTGGTACACGCGGACGCTGCGTTCGCTGAGCTCCAGGCCCAGCGCCAGGCTGGCCGCCAACTCCTTCTTGCAAGGCGGCGGGTAGGCGCCGCCGTAGAGCAGCGCGTTGCACAGGCGCTCGGCGTCCGTCTTAGTGATGAGCCCGCAGGAGGGCGCGGAGAAGGGCAGGATGCCCATGACTTTGAGGATCTCCAGCTGGTCGGCGGTGCAGCGCGAGCAGTAGATGTGCAGCTCATCGCACACGGAGTTGATCTGCTGCAGTGAGAAGTCGCGCAGCACCGAGTTGAGGATCTGCGGCAGGCACAGACGCTTCTCACCTCCCACCACGAAACAAGAGATGGTCTCCCCTTCCAGCACGGTCTCACAGCGCTCGGTGGAGCGGTCCGACGGCATGAAGAAGGGCCCGGGAAGCACGGGCGGCGGCGGCTGGATGGCAGGCAGGTGCAGCACGGGCGGCGGCTCCGCGGCAGTGGGCACCGGCGCCGGCACTGTGGCCGC s monDom4.chrUn 85273073 806 + 174229318 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aaagacagagagagTGAATGTTATAGAAAAAGACACATACACGCAGAGAGACAGAGAGAGTATTAAAGAGAGACAGAGGCAGACACACACACACACACagagagagagagagag-gagagag-gagagagagagagagggagagagagagagagagagagagagagagagagagagaaagagagagaATGAGAATGAGAATGAGTTAAAg s monDom4.chr4 353290839 209 + 430141050 aaaaacaga-aggtaaggttttaaacagaaaGGCGAATATATGGATAGAGAGATAGAGAGAGCCAGTGAGATAGAGAAACAGACACACACACACagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaaagagagagtgagagagagagtgagaaagagagagagagacagagacagagagacagagagagatagag a score=1249 s mm8.chr4 154122602 180 + 155029701 TCTACAGGAGCAGAAGCAG-GGTATGCAGCAAACTGTCTGTCAGTGGGGCTGGGGGG-----GGTGCGGGGGGGGGC-----ATCCTTACGCACCACAGGGTACGAGCCCCCCACTCTGCCCTGAGTCAGAAAGTGTCAGGGGAACTGAGCAACAGGAGGAAGAAACTGAATGGCTGCGGAGACTGTTATT s monDom4.chr4 353297540 184 + 430141050 tttataaaagaagaaactgaggcccgcagagagcagtgacttctagaggcaGCTGGGTCACTGGCCCGGTGGTGTGTCTATGGTCTGTCTGCAAAACTGCCAAC-AGCTGCCTTGCCTCCCTCGAG-----AGGTGTTAGGGGAATGGAGCAAAAGAACGGAGGAGA-GAAGAGGTGGGAAACCTGGCATT a score=1912 s mm8.chr4 154125610 97 + 155029701 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monDom4.chrUn 85604794 30 + 174229318 TTGTTTTTCTTTAAAAAAAAAAAAGAAAAG a score=9409 s mm8.chr4 154189207 436 + 155029701 ACGCCTGGCAGGAAACCCACAGGAGGGTCCTGCCTCACTCACCGGCTTTC--TCTGCTTCCTCTTCAGCACAGGATTCTTTAT--------------------------------------------GCTCTACCG-AAGGTGGGCGTGCAAGGAGGCATCTTCCGTCCCTTTAAGGGAGCCGATGCTGCTACGTCCCCTGGCCTCCGGACCGACAATGGGCAGGGTGGGTCTCCAGATCGACAATGGGCAGGGTGGGCT--ACTGCTGGAGG-AGCAGACATCTAATAGAAGGTTGGCTCTCCTGCTCCCCGCCTCTCACATCTCTGCCTCCTCCTCATGTCTCCAGGCCCGGGTGGTACCCGGCTCCCCTGGGAAGCTACGGCCGGCAGCTGAGGCACGCGCTAAAACACGGCGTGGATACGGAGGAGCTGACGTCACACGGAAACAAGCGTCTCTGTGCTGAGCCTGCCGGAC---AGGATGAGGG s monDom4.chrUn 85605184 456 + 174229318 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s monDom4.chr2 437631719 895 - 541556283 ggggccggCCTCCCCCTGACGGCGCGTGTCCGTGCGGCCC--AGGGAACGCGGCCATCGTTCTCCGGAGCAGGCTCAAGGTCAAGGTGGTGAAGGAGCTCCGGGAAAAGAAGGGCCCCGTGCTGCAGAACGGCATCGACGAGAACGGCGTGCTGGCGCCCGGCCTGGACAAGG----ACAGCCCCAAGCACATGGTCAACTACCAGGTgg-------gcggcgcccgggcccagggccgaagggggg------cggggcggg---------------------------------------------------------------cTGGGGCCTCAC--------------------GCCGGCCTTGTCTCGTAGGTCCTGAATGAAGTGGTCATCGATCGCGGTCCCTCCTCCTACCTTTCCAACGTCGACGTGTATCTAGACGGACACCTGATAACTACGGTCCAAGGGGACGGTGAGTGCTGGGGGCTTGGGTCCGAGCCAGCCGCCGGGCGCGGGGCTGCGCGGCAGAGACTCGGGAATGGCGCACGGTGGTTCTCCAGGGAGAGGCCGCGCTTGGCCCCAGGCGCCCCCTCGCCCACAGAGGGTCGCGGCTCACTGTCCCCGATTGTGTCTCCCACCTCAGGAGTGATTGTGTCCACCCCCACCGGGAGCACAGCGTATGCCGCCGCCGCAGGGGCCTCCATGATCCACCCCAACGTCCCCGCCATCATGATCACGCCCATCTGCCCGCACTCGCTGTCCTTCCGGCCCATCGTGGTGCCCGCAGGAGTGGAGCTCAAGGTTGGTGGGGACGC-CCCGGCCCTCCCAGCTAGCCGGGAC------CCCTGGG---GCGGGGCTGTGTGGATGCTCCCCT-----------TCTCGGCCCCCTCCCTCCATCACCTCGCCACAGCCGCTTCCGGCCTGT-----CTCCTTGGCCCCAAAGTGCCCGTCGACTCCCTCT-----CGGTCCAGAACGGGGCCCAGAGCCCGGGAGGCGCTCGGAGC 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GGGCCTCGGG---CCTGCCGCCCCTTCCTCCCGGCCCGGACGTCCAGAGCCAGCTTCCCAGGGGCTTCCTTGCTGC-TTTTTCTAGATCATGCTGTCACCAGAAGCTCGGAACACGGCCTGGGTTTCCTTTGACGGGCGGAAGAGACAAGAAATCTGCCACGGAGACAGGT------------------GAGTGTTTGCCTCCGCGTTTCCCCTC----------------TCCTGGAGGGTCCGC----------------------GCCTCACCTGGGTCCCGTCCAGTCCTTGTCCCTGTGGGCCC-----CCCCTCCAAGGTGGGCTCGGGGCTGGCCAGGTGAACCCCGAGGGCACCCGCACTACTCGTGGAGCAGGTGCCGAGGTGCTGCCCT-----CCTCTGGGGGCTGAAGGGTGTGTGGAGCTCCGGGAGGTCAGGCGCTGG------GTCTGCCTGGGCAGGGCCCC---------CAGCAGCACCCGGTCCTAGGAGGGGCCCCAGAACTCTGCG a score=6280 s mm8.chr4 154432923 711 + 155029701 CCACCCTGCCTCACCTCTGGAAGAAGTT---GCCTCGGTCCCTTGGAGTCAGAGACCTGGAGTCTGGCCATCCTTTTAAGGATCCAAAGTAGCTGCTTGCATTTAGACAAAGCGAGGCCCTGGGAGAGAGCTTTGGCATAGGGAGAGCATTTTG-TTACTTGGAAAGGCACTTTGTTTACCCAAACAAATTTCTCTTTCCCACCAAAGCATCAGCATTACCACCTCCTGCTACCCGCTGCCCTCCATCTGTGTGTGCGACCCTGTGAGTGACTGGTTCGAGAGCCTTGCCCAGTGTCTGCACTGGAATGTTCGAAAGAAGCAAGCTCACTTTCCAGAGGATGAGGAGGACAGCTAGACTACATTTCCC---AGCTTCCAACCTGCGCAGACCCT---CAAGCTCTTGGGGGCCTTCCTTCTCTTGCTCTCCTGCTGGCCTTCTGGCTGACCTAGCCT----------------------------------------------TGACAAACCACATGGCTGT------------------CCAGGCATC----TATGTCCTGCCTGC---CTTGCTGGGAGAGCTTGG-----GTCTGCCTTTTGCAGAACAGATCAGCT--TTTTAATGTTTTTAA-AACCTCTTTTTCATTTCTAAAAAAGCAAAATGAGAACTGGGCTGGGTGTCCTACATCTCTCCCATGGGCCCCCGTATCCCCCTGAGATTCCCAGGTCAGGAATT---------CCCATAAATCAGTCTGTT------------GAAATTCTGAGGGGGTCAGAATGAATTGATCTTCCTTTTG s monDom4.chr2 437633171 789 - 541556283 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AAATTCTTAATGTTTCATATTGTTAATATCTTAAAATTTTGTTAATTGTTAATGAAGGCCTTATTACTATTTTCAGATTCTTTCAATAAATAAACTTGTTTAAAAAAA-ATTGAGTTAAGTAACAGC-TTTCTTCTGGCTCAACTCCAGG s monDom4.chr2 437635568 147 - 541556283 AGATTCCTAACGTTTCCTACTCTTCATACTCTGGAAATTTAT-GATTGTTGA--AAGCATTTATTACTATTTTCACATCCTTTCAATAAACTTTTTTCTTAAAAAGAACAAAGGGCCATATGGCAGCATTTGTTGTGGTTCCTCTCTGGG a score=18619 s mm8.chr4 154453790 653 + 155029701 CCTCAGCATGTCAGCAGCAGCGAAATCCCAAGTGCCGGAGGAGGCAGCGCCTGGCTGCGAGGAAGAGCCCAAGGGAAAAACACTTCTCACTTGGGGG---------TCTCTATTTGGTC------------------ACCGAAGTGAGAAGATTGTCTTTACCAAAGGTGATGGCAGCCCAGAGGAGAGCTTGCTCACTGTCACCATCACAGAGACCACTGTCATTGAGTCGGATCTGGGTGTGTGGAGTTCAAGGGCTCTCATCTACCTCACACTGTGGTTCTTCTTCAGCTTCTGTACACTGTTCCTCAACAAATACATCCTGTCCCTGTTAGAGGGAGAGCCCAGCATGTTAGGTAATGTCTCCCTGCTCTGTGTTGCACTCCTGGTAGCCCCAGTGATGAGTGACCACAGGCCACCTGGAGGGAGGAAAGGGCTAAGGGGACTTACCCAGATGTGCTTGTGGAATGAATGTGATATTCAGTGCTCGTGTGTGGGAAACTCGTTCTCAGCTTGGCCTCATGCTTCCCTCCACAGGTGCTGTGCAGATGCTGTCAACAACGTTAATTGGATGTGTTAAAATATTTGTTCCTTGCTGTTTATATCAACACAAAACCCGGCTTTCTTACCCACCCAATTTCATCATGACTATGCTCTTTGTGGGCCTCATGAGGTAAAAA s monDom4.chr2 437711234 591 - 541556283 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TGATCTCCGATCCTTTTCAGGTTTGCCACCGTggtcttgggcctggtcagcttgaagaatgtggctgtttcatttgctgaaacggtgaaaaGCTCAGCTCCCATCTTTACGGTCATCATGTCCAGGATGATTCTGGGGGAATACACCGGTGAGTGGTCAGTTGG a score=8429 s mm8.chr4 154456407 165 + 155029701 TCTTGTCAGGGCTGCTGGTCAACCTGTCCCTCATTCCAGTCATGGGAGGACTAGCGTTGTGCACTGCCACGGAAATAAGCTTCAACATCCTGGGGTTTTCAGCTGCGTTATCCACCAACATTATGGATTGGTGAGTCACCAAGCACAGGGGAATGATGAAGGAGG s monDom4.chr2 437714030 164 - 541556283 TCTGTCTAGGCCTGCTGGTCAATCTGTCCCTCATCCCAGTCATGGGTGGCCTCGCACTCTGTACAGCTACCGAAATCAGCTTCAACGTCCTGGGTTTCTCTGCAGCTTTGTCCACTAACATCATGGACTGGTGAGAC-CTAAGGCCAGAGAGCAGGCGAGGAAGG a score=6406 s mm8.chr4 154459348 108 + 155029701 TTATTTTGTCTTTGTTCTAGTTTGCAGAATGTTTTTTCAAAAAAGCTTCTCAGTGGGGACAAATACCGGTTCTCGTAAGTATCTCTAGTAAGAGGATTTCTAATTTTT s monDom4.chr2 437715803 108 - 541556283 TTTTTTTTTCCTTTTTCTAGTCTGCAAAATGTGTTTTCCAAAAAGCTTCTCAGCGGGGACAAATACAGGTTTTCGTAAGTATCCCTGATGCCTGGATTCTTGGGTTTT a score=5899 s mm8.chr4 154459966 114 + 155029701 TCTTCTGTCGCTGCAGGGCCCCGGAACTGCAGTTCTACACCAGTGCTGCTGCTGTGGCCTTGCTCATTCCAGCATGGACCTTCTTCATGGT----GGGTTTCCAGCCCGGCATCCGCC s monDom4.chr2 437717160 118 - 541556283 ttttcttttGGTGTAGTGCCCCAGAGCTTCAGTTCTACACAAGTGCTGCCGCTGTGGTCATGCTCATTCCTGCTTGGATCTTTTTCATGGTGAGAGGGGTTTTGTGCAGGGATCGGCC a score=8709 s mm8.chr4 154461206 370 + 155029701 AAACATTTTATGTTCTCATTAGCAGTGCACAGGAGTTTCAGATCCTTCTGTAGCACTCCATGGACATCCTGAGAGTCCTGACC--------AAGGGAACAGCGCTCTCAGTGTTCCTGATTTTCAGTTACCCGGCTCCAGTGACATCATATTCTCTCAGCAGTGACAGTGACAGGGAGACATAGGCCAGAAGAGTGTCCTTTTGTTTTGCCCAT---------AGGATATCCCTGTGATTGGAAGGAGTGGGAAGAGCTTCAGCTACAGCCAGGACATCGTGCTGTTGCTGCTGACAGATGGCGCCTTGTTTCACCTTCAGAGTGTCACTGCATATGCCCTGATGGGAAAGATCTCCCCTGTGACGTTCAGGTGAGT--GGAACATTAG s monDom4.chr2 437719775 360 - 541556283 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CAGTGAGGCATGACCTGTGCCAGGTGCTGTGGGAGGAAGGGTGCTCCCTGTTGACCCTCTTGCTGCTTCTCCCTTTCAGTGTGGCCAGCACGGTGAAGCACGCGCTGTCGGTCTGGCTGAGTATCATCGTGTTTGGGAACAAAATCACCAGCCTGTCGGCCATCGGGACAGTCCTGGTGACCATCGGCGTGCTGCTCTATAACAAGGCCAAGCAGCACCAGCAGGAAGCCATGCAGAGCCTGGCCATGACGGCCAGGCCCAGTGCTCCCGAGGACACAGAACCGCTGGTTGCCAAGGACTTTAAGCCTTACAATTGACC a score=21014 s mm8.chr4 154469300 378 + 155029701 AGGTTGCTTGAATTGTTTTTCTTTTTGCAGTGTTTTAACTCAAATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACGTTAGATGAAATTCTCCAGGAAAAGAAACGAAGGAAAGAACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATGTAAGCTATGTTTTT-TAAGTAAGTGGTTTTCTTAAAGAAGATTTAATTTCTTTGCCCTCATTTTTCCATTAGAACAACGCTTCTTCGGTGAAGTTCTTTTGTACTTCCAAATGTCACAGGTGAGCCCAAAATCTATTCTAAAATTAACAAAAA---CATTCATATACTCAGTTGACGTTGAAGATAGATTAATAACACACTGAAGCTGTATCGAAATGAGAATATCT s monDom4.chr2 437736713 373 - 541556283 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TCCCAGATTAATCCCTTGGGGTTTGCTTTCTAGGAGATCGTGGTGGGCAGCAACATGGACAAAATCTACATCGTGATGAATTATGTGGAGCATGACCTCAAGAGCCTCATGGAGACCATGAAGCAGCCCTTCCTGCCAGGTACATCCCCTGCTCCCATCTGGGGCACCTGTGCCCACACCACCATCCACCCAACAGAACTG--------TGGGGTGTGTACTGGTATCCCTCACTTCC--CAGGCCCCTGG----CTTAGAGCCATAGCCAGGACAGGGCCAGAGCTTGGCACTGTCTTGGT---------------------------CCCCTGAAAATGGGAGG---------AGGGTCTTGCCAC---------GTTGGGGCTT-------------CCCTTGGAGGCCTGACCC----------------------CATGCAGGAACCCGAGGACTTCTCTGTTGTTGCCCCT-----AGGGGAAGTGAAGACGCTGATGATCCAGCTCCTGAGGGGGGTGAAGCACCTTCATGACAATTGGATCCTTCACCGGGACCTAAAGACTTCCAACCTGCTGCTCAGTCATGCGGGCATTTTAAAAGTAAG a score=6888 s mm8.chr4 154492257 138 + 155029701 CTTACAGGCCACCCTGTCCTTGTTATAGGTGGGCGACTTTGGGCTGGCTCGGGAGTATGGTTCACCCCTAAAGGCCTACACTCCAGTTGTTGTAACCCTGTGGTATCGTGCCCCAGAACTACTGCTTGGTGCTAAGGT s monDom4.chr2 437772107 138 - 541556283 CCTGCAGTGTTCTCTGTTCTCCTTTCAGGTTGGCGATTTTGGGCTGGCCAGAGAATACGGCTCCCCCCTGAAAGCTTACACGCCGGTGGTGGTGACCTTGTGGTACCGGGCCCCAGAGTTGTTACTAGGAGCAAAGGT a score=8539 s mm8.chr4 154492418 219 + 155029701 CCTTCCTTGCCCGATGCCCTATGGAAACCTCATTTGAACCTG--TGGCTGACACTGATGTGGGTCTGTATGCTTCTAAACCATTTCT-TCTGGATTCTTAGGAATACTCCACAGCTGTGGACATGTGGTCGGTAGGCTGCATATTTGGAGAACTGCTGACACAGAAACCTCTGTTCCCTGGGAAGTCAGATATTGATCAGATTAACAAGATTTTCAAGGTGA s monDom4.chr2 437772457 202 - 541556283 CCTTCCTCGCTCA---------------CCCTTTTCAGCTTGCTTGGATTGTCCTGCTCTGA-----TCTCCTCCTCATTGACCTCTGTCTGGACTTTCAGGAATATTCCACGGCGATAGACATGTGGTCAGTGGGCTGTATATTTGGAGAGCTGTTAACTCAGAAGCCCCTATTTCCAGGGAAGTCAGAGATCGACCAGATCAACAAAGTCTTTAAGGTGA a score=6387 s mm8.chr4 154492672 512 + 155029701 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s monDom4.chr2 437783181 1037 - 541556283 cgcccCGGGGCTCCTCCGGCACAGATGCTCACCTATCTTCAGGTCGCTGGGCAGCGCGGGAGCCACCTCCCTGAAGGTGAAGGGGGACACGCTGCTCCACATTCGGAAGGCAGCCCCCAGCCCCCTGCGGGTCTCGCTCTGATTGATGAGGTTTCGGGGATAGGACAAGATCCTGGGGCGGGGAG-GGGGGACAGATCAGGGGGCGCCTCCTTCCCTGGCCCGGCCCTTCTTGCCACCCTTCCC-CACCCTCAGATCGTACTTGTAGGTGAGGTTGAAGTGGTCCCAGTGAAGCCGGGATGGGGTGATGGTGTAGCGCTTCCTGCGGGCTTTGGG---GGGCAACAAGCGTTCTCGGGGGGCCTGGGTTCCACGGAGGCTGTCGGGGCCCGGCAAGCTGACGTCTTCCT---TAAAGAGAGCAGAATCAGAGGAGGCGGCCCGGGGACATTCCTC--TCCCCTAGAATCACCAGCACCAACGCGCCCTCCTC---------------------------CCCTCCCCCA-------------------CCAACCACCCATCTGGGCGC-------------CTGGTCCAacagacagacagac------agacagCC------------------------------------------------------TGGAGAGAGTGAGGGTTGAACACACGTCCCTTCTGCACCTACTGTGTGCCAGGCGCAGGACGCCGTCTGCCCAGACAGCCGAGGAGACGGGA---CAGAGACAGTGGCAGAAAGCC-----CAGGCCGGCTGCCAGGACAGACAGACAGGGACACACGAGACAGCCGGGCAGCACGGCC-TCCGTC--CTCACCTGAGACCCCCTCGCTTCGGGGTCAGCCGTGTCCTTCAGCGTCAGCAGCAGGGCCAGGGCAGGAAGGAGGCAGAGGAGGCCCAGGAGGGCTCGGTAGGAGGGCATCCTGGCTGTCCCCCCGGGAGGTTCTGCTGGGGGGTTCACTCCAGGCCCCATGGCGATCTCTGGCCCAAAACTGGGGGGAAGGTCTCACTTGGGCTGCATGG----------------GCAGGGCTGGGGCCAGGCCGGTCCAGGCTGGGGGGAGATGCGGCCCCTGCCGTCCAGGCC--CGGGGAGCTGAGCCTCCAGCCTCACGAGCTGCTGCTCTGAACAGACT 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TGAACCTCTGGGCAAAGCTCCGAATGGCCTGAGCCGCACGGCTGTCGGTGACCACGTCAAGCGGGCACTTGCCCCAGTGGTTGGCATAGCTCACGTCGGCGCCCTCTTGGGCCAGGAAGCAGGCCATGGCGATGCCCACCGTGGGCTCTGCACCACCCAGGAAGCTGGAGGCCTGGAGCTGGGGGGGAGGGGA-ACAGGGGGCCGGGTCAGCCCTCCGGGGCAGAGCTGGGGGGAGCAT a score=32399 s mm8.chr4 154499887 1296 + 155029701 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s monDom4.chr2 437795141 1458 - 541556283 AAGAGCCCGGCTCCTTCATCGGCACCAGCGGCCTCGATGGGCGGTGCCAGCAGCTGGTGCTTCTCCAGGGCGATGTGCATGGCCGTGTCCCCGGCCTCATCCTCGGCATTGATGTCGCTGCCGGCGCCCACCAGCAGGGGCAGCAGCGCCACGTGGGCCTGGGTCACGGCCAGGTGGAGGGGCAGCTGGTGGCGGTTGTTGCGGAGGTTCACGTCACAGCGGCCCTGTGGCAGAGGCAGAGGCGCCCCGGGGTGGGGTGGGGTGGTTTATGCCCCGCCCCTTGGCCCCCCGCAGCATCCGGCCAGGGCTCC--GCATTGGGGAGGCCACCCCCCTCCCGGCCCCGCCCCCTTCCTCCCCCCACCTCTTTGATGAGGGTCTCGGCCACTTCCCGGTGGTTGTTGAGGGCGGCCAGGTGGAGGGCCGTGAAGCCGTCGTCCTTTTTGGTGTCTACTAGCTGCCGGGCCCGGGCCAAGATTCTCCGGACGGCTCTGCTGAGAGGAAAAGGGGC-TCGAGGGACCGCAGCCTGGGCTACTTGGGCTGCCCAGAGGAGTTGGCAGGAGGCGGGGTTGGAGCCGGGCCTCTGCCTCCAGGTCTGGGCTCCTACCGCTGAGGCCCCGCCCCCGCCGGATCTTCCCGCCCCCCTCCTTTCCCATGGGGCATTGGGCGCTCACAGCGTGTTGCCTTTGAGGGCAGCGTGGTGGAGCAGGTTGAAGCCTTGGCAGTTGGAGGCGGTGAAGTCGATGGTGGGCACCTCGGTGAGGATCTCGATGATGCCCTTGGTGTCTGCT------GAGATGGCACAGTGCAAGGGGGTGTCTCCACACATGTCCTGC-------GGGAGTGCCCAAGGACTCAGCTCAGGCCCCGTGCCCTCGGGCTGGAGGCCCCCCAACGCCAGGACAAGCGGGCAGGGCCCAGGGGCCGTTCTCCAGGGACATCCCCGGGAGCCCCCTTGATGTAAAGGCTAGGGCACCACGTACGGGCAGATTGACGTCACAGCCTTGCTCGCACAGGACGCACGCCACCTCCGGGAAGCCCTTGCGGACGGCCACGTGCAGGGCGGTGCACTTGGCGTTATTGATCAGGTTGAC-GCAGGCTCCGCGGCTCACCAGCACCCGGGCCACCTCGGCCTGGTTCCTGAGGGAAGAGACGAGGGCGCCGTCGTGGGGGCTGGGCGGGGGC-----GGCCCTG----------------GGCCCTGCCCGCGTGCCCACTGCCCTCCGTGGCACCTTACCCGAAGGCCGCGTAGTGCAGCGCGGCGTCCCCCTCATCATCCCGCAGGTCTGTGCCCGCGTGGGCCTGCAGCAGCAGCCGCACCAGCTCCACCTGGCCGAGATAGGAGGCCACCTGGAGGGCCGTCCGGCCCTGGTTTCTGACATCCACCTGCAGGGTCGGGGTGGGTCAGGCCTCTGAAGGTGCCCGAGGGTGGGTGCCCGCTGACACTCCCCCCCACGAGGGCAGAGAGTCAC 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GCTCAGCCCAGCCCCCTAGGCACCTTGGTGAGAGCCCCAGGGTGGAAGGTCCAGCGGGTCTCGTGGTTGAACTGCACACGCACGTCCCCACGGTCTGTGATGCGGTGCACGGTGCCCATCTGTCCGATAAACTGTGGCGGGTCACGGAGGCTATGGCTGGGTCAGGCTGGACGCTTGGGGCAGGAAGAGGGATGG-----------------------------------------------GGTCCAAAGGACTT s monDom4.chr2 437797989 243 - 541556283 GCTCTAACCAGCACTC-----ACCTTGGTCAGGGCACCAGGATGGAAGGTCCAGCGGGCGTCACTATTGAACTGGACCCGCACGTCGCCCCGGTCGGTGATGCGGTGGACTGTCCCCGTCTGGCCAATGAACTGCAGC----CACGGGAAAT----CAAGGGCAGGAGGGCGGCAAGAGGGAAATAGAGGCAGAGAATGTTTTCTCCATGGTGTCACCTCCCCTCCTAGCCAGGCTCCCCCAGGCCCGGGGGTCTT a score=20231 s mm8.chr4 154502908 702 + 155029701 AAGAGGTGGCTC--ACCTCTGCCATCCTAGGGTTCCAGCCACCATGGCCTTCTTGCATATCCCTTAGGACATCTGTGTCCAGCAGACACTTGACCTTGTCCCCACGCTGGAA---------------------------------------GGGCTGGCC------------ATCAGCACTCACCCTGCGCTGCAGCT----CTGCTGG----------------------------------CTTGCCTGGGGG--GAGGGTGGCAGGCTAGGCCT------------------CAGGAAGCA------------------------ACCTGCCC----------ACCCCAA----------------ACAGGACATGCTAGGGTGACA----CGGGCACAGCCAGGGCAGGAG-----------------GGCAGCTGGTGTCAGAGTCAGCCCCATACCAAGCTTTGGGAGGTGCTCCTTGTAGTAAAAGCCGCCAGCTGCCTCACCAACACATCTGAGATCCACCTTGCCCTTGTGGCCCACTCGGTACACGTTCGTGGTTCCATCTGCCCACGTCACACTGGCCACACTTCGGCCTGTCTCCACATCCCAGCCACGGATGTCCACCACACGACCTGTCTTGCCTTCCCCTCCTGGGAAGACAG-------CATGCACACCGAC-AAGCTTAGAGTGTGTCTTGAG--------GCCGAGCTGTGACTGGCTT------------------------------TGCCTCCGTCT----------------------CTCTCCAGCCACCACTCACCATCTTGTGAGCCCCATTCCCAGTCAGGGCCTCGTACCACCTTAGCTCCTTGAAAGATGCCCCTCAGTGGGATCCGAGGGAGGCCCTGTCGGGGGCTCAGCGTAACCCTGTAAGAGA--ATGAGTTTGAGCCATG s monDom4.chr2 437798298 954 - 541556283 AAGGGTCAGCCCCTACCTCGGCCATCTTGGGGTTCCAGCCTCCGTGGCCCTCCTGCATCTCGCGGAGAATATCCATGGCCAGCAGACACTTGACCTTGTCTCCATGCTGGAAGGGCGGGCTCTCGGCACTGGCCTTCCGCTGCAGCTCGGCGGGCTTGCCTGGATTGGGACGGTCAGCACCCCAGCTGAGTTTATGCTAGGGCTGCTGGGTACACCTCTGTCTGTTTTCTAAAACCCTCCCCATTGGCCTTAGAGTCGAGTCtggggggctgtgcctggtccagggccacccggccaggaagcacctgaggccatatcggaaccccagacctctcctcCATTCAGAGCCCCGGGGCAGAGGCAGCAGCCACAGGCCACAAGGCGAAGACAGCTCTGGGCTCTGCAAGGTCTGGGGCCCCCACCCCCACCCCCTGCCCCTGCCCCAAGGCCCTGAACTGTACCTAGCCGAGGTAGGTGGTCTTTGTAATAGAATCCGCCGGGCGCCTCCACTACACACTTGAGGTCCACCTTGCCCTTGTGCCCCACACGGTAGACGTTGGTTGTGCCATCGGCCCAGGTCACGCTGGCCACGCTGCGCCCCGTCTCCACGTCCCATCCGCGGATGTCGATCACACGGCCTGGCTTCCCCTCACCCCCTGGGAAGACAGCGCTGGTCATCTCCCCTGGCTGAGCCCAGCTTCCCCCTCGGGTTCCCAGAGCCCAGCTCCACCTGATTTGTGCGGGGATGAGCCCCAGTGAACCAATGGTGCCCACGTCTCCAGGACCAGGCCTGCCTCCCCCTCCCCTTTCTCCACTCACCATCCTGATTGCCCCATTCCCAGTCTGGGCCCCGGAGGACCTTGGCGCCTTGGAAGATGCCCCTCAGGGTGATTCGAGGAAGGTTGTGGCGGGCACTCACGGTGACTCTGCAAGAGAGCATGGCACTGAGTCCTG a score=13444 s mm8.chr4 154504640 237 + 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ggggaggggGCGCGCGCCAGGCTCCGCGCTCTGCCCGCCCGCCTCTCCAACGC-GCCTGCCTCGCAGGCTCTGGCGGCGGCGACGGGGGG----CGGAGACGCGAGGAGGAGGGAGCCGGC--TGGCCGCTGCAGCGGAGCGCGGGGAGAGTC---------AGAGGATCATAG--GGCTGCGGCTGCAGGAGCCGGCCTGAGCGGCGCGCCCCCGTCCCCTCGCCTGGGAGATGCCCCGGGGGCGCGGAGGGCCCGGAGACCGGCGTCGCAGTGGCCATCCGTGCCCGCGCCCCAGCCCCTGCGCCGGCCGCCCGCGTGACCTTGGCGCAGGGCGCCGCAGCTGAACCCCCAGCCGCGATGAGCGCGCCCCCCCGCCAGCCCGCGCTGCCTTGGCCCTGgctgttgctgctgctgccgctgttgctCCCGGCCCCACCGTcccgcgcccgcggcgactccgtgccgcccgcgccgccgccgccgcccAGTCCCGAGCCCGAGGCGGAGCCCGGCCCCGACCCCCCGTGGTGCCCATACAAGGTGCTGAGCGAGGGCCAGGAGGCCGGCAGCGGGCGCTTGTGCTTCCGCAGCCCGGAGCCCGATTTCCGCTGCCAGCAGCGCCTGTGCAAGGCGTACCGCTCGGCGGGGCGCACGCTGGTGGCCAACGTGCTCCGCAACAGCAGCGTCCTGCTGCAGTggcgcccgccgcccgccgcgccggcccgcgAGCTGCGCGGCTTCGCGCTCAATTGCTCCTGGGACGGCAGCTACACCCGCTTCCAGTGCGACCGCGTGCAGCTCGGCGCCTCCTGCCGCGACTACCTGGTCCCCGACGTGCACGACAGCGTGCGCTACCGCCTGTGCCTGCAGCCGCTGCTGCGCCGGCCTCGGCGGGAGCCTCCGCGGCCCGGTGCCCCTCCCGCACCCAcgccaccgccaccgccgccgccgccTGCCGAATGTGTGGAGTTCGCTGCCGAGCCGGCCGGCATGAGGGACATCGTCATCGCCATGACGGCCGTCGGGGGCTCCATCTGCGTCATGCTCGTGATCATCTGTCTCTTGGTGGCCTACATCACCGAGAACCTCATGCACCCCGCCTTCGGGCGTCCCAGGGGCCGCAGGCAGCCTTGAAGGCCCAGCCACCGGTCACTGCCGCTGCGCTTAGGGAGGACCGGACAGCGGCCAGCAGGGCTGGTGGCCAGAGACTGGGATTGTATCCGACCCCTGAAGTGGGGCCATCAGGCCCT---TCTGCTCTGCTGCCTCGGACTTCGCCCTGAGGGGCTCCCTACGGACTGGCCTGGCCCGAACCCAGACTGGGTGATATGGGAA 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CTTACCGCCTGGTGCTGCCTTGTTTCTTCATTTAGTGTCTTCCTTCTCTCTTCTCCTTGTGACCGAATCTGCTCATTCCTCAGCTGCTCCAAAGCGACTTCATATTCCTTTGAGAAGAAGGACAACCCACAGCCAGGGAGTGATCAGTCCGAAAGCCA---CGGCAGGGTCCTGATTCCTCAATG-------TTGTATTAGTACCTATCACTCTGGGTCCAGC-------TCTATCTGACAAAAGCTGACCCCAGTGAGTGGACCTGCCTCCACTGAGAACATTG a score=5985 s mm8.chr4 154600882 163 + 155029701 ACAGCTCACCTTGAGCTTGGACTGCTGTTCCAGCTGCAGCGTCTGCTCCTGCATCTGTGCGAGACTCAGTGCCTCCTTGGCATGGCCTGCAGGGAACAGAAGAGAGGGTATTACTACGCTGCCAGTCAACATTATCTGTGTGGCTAAAAATGGAACCTCTCAC s monDom4.chr2 438058422 150 - 541556283 ACAACTTACTTTAACCTTTAACTGCTGTTCCTGCTGCAAGGTCTGTTCCTGCATCTGTGCAAGACTGAGCGCTTCCTTGGCATGGCCTAGGGGCAAATGGGGAG---------CAATGCTGAAAGAGGAC---TTCTGT-CAGTTAAGAATGCCATCACACAC a score=11219 s mm8.chr4 154604399 595 + 155029701 GGGTCTCCCCCAATGCAGGACGGCTATGACCAAATGTCCCATAAGCGGCCATTCAGGTCACCTGAAAGGTAC------GGCTGCGAACGACCACTGTGCTGCTAAGACGTCAAGAGGACCAAAGTCCTAAGGGCAGCAG--CTAGTGCCTCCGAGAGAAAC-----------------CTCCCATTTCCCAGGGCCTCGGCCCGCCAAG-------------CCCAGCCCGCGCACTCACGCGAGTGCTCCAACTCGCGAGCCGCTTTGGCCGCACGTTCCAGGCCCGTCGGGTCGAAGTTGCTCCATTTGTCCTTGGGCGATGGCCGGTCTCCCGCCCCG------CGGTCACCGCCGCCCTCCGCCCCGGGTTGAGCGGGCGGCAAGGGCAGCGGAGGCCCTGTGCCTTCGCCCTTGGGGCCC---TTGATGCCGAAGAGCCACGACATGG----------------TCTGCAAGCTCCGCG---CGCCCTCGGCGGACCGTA---CCGGAGCGTGACTCGCGAGGCTCCTCGCAGTCACCACGCGCCGCGGGCGCGA-CTCACTGCGCAGGCGCGAGCCACACCCCTT----CCTTCTGGACGACGGAAACCTAGGAGG----GTCAAGACGTTCTCAGCCGCCGGATTGGCCGCTGACATAGGGACGCC s monDom4.chr2 438065694 654 - 541556283 GGAACGCTCCCAAAGGGGGTAGCCAGTGCCCATATGTAGTG-GAGTGGCAA---AGGACCCATGGAGGGGACAAGGCGGGCTTCCAGATCCACCTATGGAG---AGACCCCAGACAAGGGAAGGTTCCAACCTCCCTAGGCTCAGTTTCCCCGAGAAACACAAGGAGAGGGTGTGGGGCTCGCGTTTCCAGGACCGTGAGGCCGGGAATAGGAGGCATGCCCCCGGGCTGACCCACTCACGCGAATGCTCGAGTTCGCGCGCCGCCTTGGCCGCGCGCTCCAGGCCCGTGGGGTCGAAGTTGCTCCATTTGTCCTTGGGCGCGTGTCGGTCCCCACCACCGCCCGTCCGGTCCCCTCCACCGTCCCCTCCGGGC---GTGGGTGGCAGGGGCAGCATGGACCCCGGGCTCTCGCCCTTAGGGCCCTTATTGACTCCGAAGAGCCACGACATGACAGGGCGCACCCCTTCCCTCCCAAGTCCCCGACTCGCGCCTGCCGAACTGAAGAGCCTACACACGCGGCGCGAGCCTTCACGCG--------GCGCCCCGGGCGCAAGCTCAGGAAAAAGAGCCCGCCCACAGGCGGTCGGGCCCTAGAAAGAACGGGTATGACGGATGTTACGTGAAGGCTGTTTC-GCCTTCGGATTGGCTGCTGGGACTATGATTCC a score=9590 s mm8.chr4 154614125 368 + 155029701 GTTCAGGGCTCCCGCGGTCC--AGCCTCCGGCCGCATGGACTGCGGAGCACGGGTCCGCGCGCCAGAGGCC-------------GTACAGGCCTTAGCCGACAGCGCCCTCTGGCGGCCGGAGCGGAAGGCGGCAGTCACAGTCACCAGGTAAGTGGTGCAGGGCGTCAGGCCCTGGACGGTAGTGCTGTTCTGGCCTGCTGGCACCTCCACGCGCTCTAGGGACCCGCCC---TGCAGAGGTCCGAGCTGTACATGGTAGCCGAGAGCGGAGTCCGGGCCAAGCGCGGGGGCCCAGCTTACGCGGAGGCTGCGCGGCCTCGCATGCGAGATGACGATGCGTTCTGGCCCGGCCTCCTCTGCG---AAGAAAGAGGATAGTTGCGTGGA s monDom4.chr2 438089156 380 - 541556283 GTCTGTGTCTCCCGCAGTCGCGAACCCCTGGATGTTGGTCCTCCAGGAGGATGTTCCTTGCGCCCAACCTCCTCACCTTCCTGCGTACAAGCCTTAGCAGACAGAGCTTTCTCACGGCCAGACTGGTAGATGGCAGCCACAGTGACCAGGTAGGTGGTGTTGGGTGACAGATTGTCCAGCGTGGTGCTGTTCTCGGTGGCGGGCACCTCCAGGAGTT---GGGCACCACCCGCAGGCAGGGGTCCGTACAGGACCTGGTACCGGAGCAC---ACCCA---CGGGTGACGGGCCCCAGCTCACATGAAAGCTGTGAGGCTTCCAATGGGAAATGAGGATCTGGGCTGGGCTGACCTCTTCTGTGGGTGGGAATGGAGAGGGGAGCCTGGA a score=10529 s mm8.chr4 154614493 371 + 155029701 GGAGTGGTCTTCCCATGCCA----CCCTGCCCTCCCACGAGTGCCCCT--------------GCCTCACCTTGCAGTGTGCGTACTCGCACGTGCTGCGGCCTCAGGAGGTGCACGTTGGACTCAGGCAGCAGTGATACTTCATAGTCTGTGTCCGGGTCGAGATCTGTCCAGGTCCAGCTGGTAGCATTCCCGGGCAGCTGTTGGCGTCTTGTGGTTGCCAGTTTGCCGCTAGGTACCAATTCCAGCACGTAGTAACCAGAGTCCGCTGTCAGCAGGGGCGGCCAGGACAGGCGGAAGCCACTGGACAGAACCTCCGAGGCATGAAGCTGTTGTGGCTGCATCGCATCTAAGGGTGGTTTAGTGCTGGAGTCAGGGAGCAGAAGTGAC s monDom4.chr2 438089731 388 - 541556283 GGGGGGGGCATCCCCTTCCAAACCCCCAGCCCTTCTTCTTCCTCCCTTCATTCTCCCCCAGAGTCTCACCTTCCAAGGTAGTGACTTGGATAGTCTGTGGGGCCAGGTACTGCAGGTTGGACTCGGGCACCAAGACCACCTTGTAGGTGGTGCCGGGCTCCAGACCATCCCAGACCCAGCTGGTCTCATTCCCAAACAATTGGCGGCTCTGCTTGGCTCCTGGGTTGGCGCTGGGGGCTACCTCCAACAGGTAGTAGCCAGAGTCACCGGACAGCAGGGGTGGCCATACCAGGCGGAAGCTCTGGGACGTGACATCAGTGGCGTGGAGCTGCTGGGGCCGCATTGCCTCTGGCCATGGCAAAAGAGGAGAAAGAAAGAG-AGAAGAGAC a score=25690 s mm8.chr4 154616421 666 + 155029701 ATGGGTTCTCCCTG--GTCTCCACACAGATCCTC-TCCCTGCAGCAAGCTGTCAGCTA----GGGATTCACAGGACCTGCCTCTTCCCACCTACCAGTTATGGAGCCCCGCAGCTCCCGGGCAATGATAGGAAGATCATCCACATCCACAAAGTGTAGGTGCTTCTCGGCAGGAGCCGAGGCAGCTGCCAACAGCTCCAACAGGTTGCCTCGGCCAGTGCTGACAATGAAGATGGTGACACCCAGGTCCTTGAGCTCCTGCATAGGGGGGCCCACGGGGTCGCTGGAGCCACCATCTGTCACCCACACCAGCACCTTGGGAACCCCTGGCCGGGCACCTGCTTCCTCAGCAAACAATTGTTCTTTGGCATAAGCCAGTGCCAGGCCTGTGTTGGTATCACCCATACGTTGGGGTGCAACACGGATGGCATCCTGTATAGCCTGGCCTGAACTGTACTGGTCAAAAGTAAACTCTGTGTGAGGCTGGCTGCCCACGTGCACCAGACTAGCACGCAGAGCCCCGGGTCCGAAAGACATCGTAGCCACCAGCTGCCCCACAAATTCCCGAACTCTTGAGAACTCATAGTGTGACACGCTGGCTGAGCTGTCCAACAGGAACAACAGGTCCCCCTGGGGGTCTGATGCTGTGGAA------CCTAGAGGAAA---------AGACAAGGGGT s monDom4.chr2 438094156 672 - 541556283 ataagttctgcctgaagtctaacctcagactctcatgctTTCTGCACATGGTAGGCTTCCCTGGGGTCGAGAG----------------CCTACCAAGAATGGCGCCCCGCAGCTCGGGGATGATAATCTGAAGGTCATCCACATCCACGAAGCGCAAGTGTTTCTCGGGGGGCTGGGAGGCAGCAGCAGAAAGGTCCAGGAAGTTGCCCCGACCCGTGCTGACGATGAAGACGGTCACCCCCAGGTCCTTGAGCACCTGCATGGGAGCCTGCACATCGTCGCTTGAGTCGCCGTCGGTCACCCACACTAGTACCTTGCGCACGCCAGACCGAGCACCTGCCTCGGTGGTGAACAGCTGCTTCTTGGCCAGAGCCAAGGCCAGGCCTGTGTTGGTGTCCCCCATCAGCTGCTTGGCTGCCTGGATGGCCTCCTGTGCAGCAGCTCCTGAGTGGTGCCGGTCAAAGGGGAACTCAACAGTGGGCTCACTGCCCACGTGTACCATGCTGGTCTGCACAGACCCTGGGCCCAAGGGCAGCGGTTGTACCAGCTGCCCCACAAACTCCTTCACCCGGGAGAATTCGTAGTAGGACACACTAGCTGAGCTATCCAGCAAAAAGAGGAGGTCACCATGAGCAGCTGAGGATGGGGTAGCAGGGCCTGGCAGAAAAAGATGGACAGAGAAGGGGT a score=2804 s mm8.chr4 154635139 256 + 155029701 TGGAGCAGGAACTACGGTGGATGAAGCTGGTCTGGGAGGAGGCCCCAGCAGACAAGACAGAGCGACCTCT------------TACATCTCCGGGCTGGA------GTACTCTGTTCCAGGCAGTGTGGTGGGGTGCTCCTAGCCTGGTGATGCAGCTGCTGAGACAAGGCTCCAGTGTGGAGGAGAGGTGAGCTTCATGACTAACTAGCCCTAGACT-CTTTCTCTGGC--TGGGACTGAACGTCTGGGCAGCATTATGACTTCTTTCATACCCCAC s monDom4.chr2 438115973 275 - 541556283 TGGGGCAGCACTTCATGGACCTAGAGATGGGGGATGCTAAGGCCCAGGAGAAGGAGGAAGAGCAGCCTCTGGGTCTCCTTCCTGCCTCAAAGGGCTGGGACCAAGGCCAAGTGATCAAGGCCATTTGGAGAGGCCAACTGGGCCTGATGAAGCAGTTGCTGAGGCAGGGGACCTGCATCAATGAGAGGTGAGCAGCCGCATC--CGAGCCCTAACCCAAGCCCCCTGGCATTGAGGTGGAAGACTCAGGCTTCCtttcgtttgttttcaacccccac a score=14955 s mm8.chr4 154636591 478 + 155029701 TCCTTTTCTTTTCCAGGACATTGAGGTCCTGCTGGACCATGGGGCAGACCCAAATATCAGGGACAGAAACAACCGCTCTGCACTCCACAGGGCTGCCACTGGTGGGCATCTACGAGTTACACAGCTGCTAGTGGCTAAGGGCATTGAAATAGACGCTCAGGACTCTCTGGGCCTCACACCTCTGCACCATGCTGCTCGAGGCGGCCATGTAGAAGTTGTCAGCCATCTCCTGGACAGGGGTGCACACATCAATGCTGCTGGCTGGCTCCACAAGACCCCTCTGCACCTTGCTGTGGAGAATGGCCACAGCACCACTGTGGAGCTTTTGCTGAGCCGAGGAGCCAACTCCACCTTGAGGACACAGTGGGGTGAAGCGGCCCAGATCCCATAGGGTGTCTGCCCCAGGCATGGCCT-----GATTTCCTGTGCTAACTAATCGTTTTAGAAACTACAGAAAGATAAGAAGCGTAGAGCTagccag s monDom4.chr2 438121727 463 - 541556283 TCCTTCTTGTCCCCAGGTGGTAAGGCTGCTCTTGGATCATGGAGCAGAGGGAGCTCTTCCAGACCAACATGGCCGCTCTGCCCTCCACCGGGCTGCTGCTGCAGGCCACCTTCCTGTGGTCCAGCTGCTGGTGGAGAGAGGAGCTGAGGTGGATGCCCGGGATGGACTGTATCTCACACCCCTGCACCATGCAACCCTGGGGGGACACACTGTGGTTGCCAGCTACCTGCTGGACCAAGGAGCAGAGGTCAATGCCGCTGGTTGGCTTCACAAGACTGCCCTGCACTTGGCCTTGGAGAAGGGTCATTGCTCCATGGCAGAGCTACTACTGAGGTGGGGGGCCAGCCCCAACCTGCGGACACAGTGGCTGGAGACTGCACAAGACC-------TTGCTGGCCCAGGCA-GTCCTCTTAAGACTCTCTGT---------TCTCTTCAGAAAGGCC---AAGAGGAGATATGCAAGGCTGGGCAG a score=4781 s mm8.chr4 154647440 186 + 155029701 CTTCGGGAGCCCATCATGGTCTTCCTCACGACGCGGCTCTGGCTGCGGAACCGCCTCACCGATCGCTATTGGCGGGTTCAGGAGGTGCTGAAACACGCTCAGGTGAGTGCGCGAGTCGCGGCCCGAGGCGTGGGGCGGGGGTGGAGGGCCGCGCTGCCATCCCGACACCCTTCTCCCCTCTTCTTC s monDom4.chr2 438128050 169 - 541556283 CTAAGGGAGCC----ATGGTGCTGCTCACGGCGCCGCTAAGGGTACGCGCCCGCCTCACCGACCGCTTCTGGCGGACCCAGGACTTGCTGCAGTACGCCCGGGTGAGTGGCAAAGCCTCAGAGCTCCCCCCGCCCC------------CCACTCT-CCAGCCTAGGATCCTTCTCCCCTCCCCCTC a score=7092 s mm8.chr4 154647626 124 + 155029701 ATCCAGCATTTTCGGGGAAGGAAGAATCGCTGCTACCGCCTGGCCGTCAGGGCGGTGACCAGAGCCTTCGTTAAGTGTACGAAGGCCCGCAGACTTAAGAAGCGGAACCTGAGGACCGTAAGCC s monDom4.chr2 438131685 124 - 541556283 ACATAACACTTTCGGGGAAGGAAGAATCGCTGCCACAGGTTGGCCGTCAGGACGGAGACTAGTGCGTTCGTAAAATGTAGCAAAGCCCGGAGGCTGAAGAAGAAGAACATGAGAACAGTAAGTC a score=6493 s mm8.chr4 154650693 98 + 155029701 TGTTTTAATTCTAGCTCTGGATTAATCGAATTACAGCTGCCTCCCAGGAACATGGCTTAAAGTACCCAGCATTCATTGTCAACTTAATTAAGGTAAGT s monDom4.chr2 438132666 98 - 541556283 TATTTTCATTTCAGCTTTGGATTAATCGAATTACAGCCGCTTCCCAAGAACATGGTTTGAAGTATCCATCATTTATTAGCAATTTAGTCAAGGTATGT a score=11724 s mm8.chr4 154652206 249 + 155029701 tgtaccaccacacctagTGTTCTCAAGTGGTTTCTGATGCTT----ATTATAGGCTGTGGTTCTTTGTCTTTCCAGTGCCAGGTGGAGCTCAACAGGAAAGTTCTTGTGGACCTGGCCATCTATGAACCAAAGACGTTTAAATCTTTGGCTGCATTGGCTAAGCGGAGGCAGCAGGAGGGATTTGCTGCAGCTTTGGGGGATGGAAAGGAGCCTGAAGGTATCTTTTCCAGAGTGGTGCAGTACCACTGAAGG s monDom4.chr2 438134761 253 - 541556283 TGGGCTCTCACTCATAGTGGGAACCAGGGGCTTCTGAGATTCTATGCTTTTGTGATGTCATTTCCTTTCTCCTTAGTGTCAAGTGGAACTCAACAGGAAAGTCCTTGCTGACCTGGCTATTTATGAACCCAAGACTTTTAAATCTTTGGCTGCTTTGGCAAAGAGGAGGAGAGAAGAAGGTTTCGCAGCTGCTCTGGGGGATGAGAAGGAGCCGGCGGGGATCTTTTCCCGGGTGGTGCACTATCAGTGAAGG a score=-1132 s mm8.chr4 154655842 463 + 155029701 gtagagagaaggctgaccttgaacccacacagatccgcctgcctaagtgctgggattaaaggcacatctgcccttttaatgctggcagatccaccccacagctGTTCCAGAGCCCGAGGACGGAAGGGAGGGCTGAGAACTAAAGACTCCGAACTAAGTCGCGGTGTAACGTCGTGCACGTGGGACTGTGGGAGAAAAGTTGTTCTGTCCCAACCCCCAAAGAAAGGCGCCCTTCTAGAACCCCTTTTGCCAGGCAGGAGTTCCGGTTCGGGCCAGG--CCGCGGAGCCAAGTGGGTAACGAGCAGCCCCACCCGTGGGTGCTTCCGGCGTCGGTGCCTGACG----CGACACTGACGGACTGGTCGTACGGCCAACGGCGTCGAGACAGCGGTGACG----------TTCAGCCAATGGGAGGGGGCGGGGCGGGGCGGCCACGATCGTCTCGAGCAGCCGCCCTGACGGGAAGGGCC s monDom4.chr7 246466536 408 + 262624689 GTAGAAGGGGGCCAGCGCTGGAACCCC------TCCGTCTGTCTAAGAAGTGCACC--AGGACTAGTCTTGCCCCTTCTTGCGGGAGGA-----------GGTGCTCCAACGC---GGGGCTTAGGAGAGATC-GAGGGTAAAGGGCCCAGGACCTAGTTG------------ATCCACA---GACTTTCAGGAAAGTCTCGTAGGACGCCCAGACC--AGCATAGGGCCAGGTTTAGCTCCTCTGGGCCAAGGCAG----------TTGGGACAGGAACTACTTTGCACGGTGCGTGGTGA----CGTCACCGGCGGAGGCGTCAG----CGGGGCGTGACGTTCCCGGCAC-------CTGGCAG--CGGCGGGAGGAGCCGAGCAGCCGCCGAGGACTCTGGTTATTCTCGCCGCGGGTTCCGGCTGCGTTGGGCGTGCGCGGAGCTC----GCAGCGACCATGGCGTCCGGGCCT a score=15014 s mm8.chr4 154656305 339 + 155029701 CGAGAAGAGTCGGCGGCACAAAATggcggcggcggcggccggggctgcggggttgatggctc---cggcgtcggcggcCTGCTCTT---------CCGGCTCGGCGGGAGCGGCCCCGGG-GTCTCAGG-----GGGTGCTGATCGGCGACAGGCTCTACTCGGGCGTGCTCATCACCTTGGAAAACTGCCTGCTGCCCGACGACAAGCTCCGCTTCACGCCGTCCATGTCGAGCGGCCTCGACGTCGATACGGAGACGGGACTCCGCGTCGTGGGCTGCGAGCTCATCCAGGCAGCCGGCATCCTGCTCCGCCTGCCGCAGGTAAGGGCCGGGCCGCGAGCTCTGCAGGGGCCGTT s monDom4.chrUn 142922876 345 - 174229318 CGAAGAAGCACGAAGACCCAAGATggtggcggcggcagc------tacgggagccccggctgtagcggcgtcagcggccggctcgggtggcggggccggcggggcggcggcgTGCTCGGGTGCCTCGGGCCCGGGCGTGTTGATTGGGGACCGGCTGTATTCAGGCGTGCTCATCACGCTGGAGAACTGCCTGCTGCCCAATGACAAGCTGCGTTTTATGCCGTCCGTGTCGAGCAGTCTGGACCCCGACACTGAGATGGGTCTGCTCGTCGTGGGTTGAGAGCTCATCCAGGCGGCCGGCATCCTACTGCGCCTGCCACAGGT--GGCCATGGCTACAGG----GCAGGTGTTGTT a score=17 s mm8.chr4 154656644 208 + 155029701 CGCCGGCCGAGGGCCGAGGGCCGGGCCTTTGTTGTCGTCCCGGCCCCCGGCCCGGAGCTCACCGGACCCAGGCGACG-AGGTCCGAGCCTGTGCGCTCCGCAGCCTTGAAATAACCCGCACCCGCCATCCCTTCCCCTTCCCCTTCCCCCTCCGCCGGAGCCGAAGCCCTTTTACCCCCAAGAAAGCCTCGCGAGACCCAAACCCTTTG s monDom4.chr7 246467319 178 + 262624689 CGCT-ACGGTGGGACTCGAGTGGG------GGTGGGGGAGGGGCGCCCAGCTCGGGCCGCACAAAATggcggcggcgccgggccgggcTCGTG------GCTGAC---------CCCGCGCTTCCGGTCTCTTCGGCTGCAGGTGGCGATGGCGACGGGGCAGGTGCTGTTTCACC---------GCTTCTTCTACTCCAAGTCCTTCG a score=13247 s mm8.chr4 154656946 434 + 155029701 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s monDom4.chr2 438266179 1447 - 541556283 CCCCCCTTCCATACACGCTCTCCCAACTGCACAAGCCCCCTCTCCGCTTTACCACCCCAGGCCCA--TGAGGCCC----CTCTCCAAAACCCAGAGCATTCTCTACTCAGGCTCACTGACCCTTCCTCAGTCCAGTTGCCTCTCTCGGCCCCACAGCCACACCTCCAGGGTCAGGGG------GCAGCACGGTGGTGTCCGAAGCTAGCCTGAGCCAGCCTGCCGGAGCCCGCGCTCTCCTGCGTTGCCAAAGCCTCCGCATGGTGTGGACGCAGGACCGCCTGAACGATCGGCAGCGAGTGGTCCACTGGGACCTGAGTGGTGGCCCTGGCAGCACCCCACGCCGACTCCTGGACATGTATTCTGCCGGGGAGCAGCGCGTCTATGCCTCTAGGGACCACAACCGCCTCCTCCTGGCTCCCTCAGCCTTCCAGGATGGCAATTTCTCTCTGATCATCCGC-------TGTAAGAAAGCGATGGGTTCTGGAT--------------AGCTCTGGCCAGGGGTGCGAAGGGAGTGTGGAAGGAAGGGAAGCCCT--TCCCCATCTAGAAGGGGCTCCGGTGGTTCTCTGGGGGTGG---------CGGGCAGGGAGGTGGAAGAGCGAGTCC----TTCCTGGTTGGGCTTGAAGCCCCAGTTTTTCTCTCCATCTCCATCCCTTGTCTCCTATCTGCGCCTGGCAGCTGTGGAGGAGCAGGATGAAGGCTTGTACACCTGTAACCTTCACCACCATTACTGCCACCTCTACGAGACCCTGGCCATTCGTCTGCAGGTCACCGATGACCGTGAGTGCCCCGGAAACTTGCCTTGTCCCTCTCCTAAGACCCTGGTCCCAGAAGGTGTGCGTGGCCTCACTCACTTCCCCCGCCAGCCACAGGGACCCCCGAGACTTCCACGGTCCCGCCACGTCCCCTCCGATCCCCACCATGACCCCAGCTGCCTT---CTGCTCCCCTCCAGCCATGGAAGCTGGCGCCCACTGGGACGGCGAGAAGGAGGTCCTGGTGGTGGAGAGGGGCTTCCCGGCGCTGCTGACATGTGTGAACAGAGCCCAGGTGTGGACCGAACGACACATAGAGGAGGAGCAGCAAGTGGTCCACTGGGACCGGCAGCCTCCGGGCGTCCCCCATGACCGTGCTGACCGCCTGCTGGACCTGTATGCCTCAGGTGAGCGGCGTGCCTACGGCCCTCCCTTTCTGCACAGCCGCATGGAGGTCAGCAAGGACGCCTTTGCCCGGGGAGACTTCTCCCTGAGCATCGACCCCTTGGAGCGGGCGGACGAGGGCACCTACTCCTGTCACCTGCACCATCACTACTGCGGACTCCACGAGCGGCGCATCTTCCACTTGGCTGTCTCGGAGCCCTTGCCTGAACCCCGAGGCCCTGCCCCAGCCCCTGAGGACACCCCCAGCAACCGTACCAGCCAGAGCCGAAGCCCGTCCCCTGCTGGTACGTGGGGTCTCTGGGGGTCAGA a score=8896 s mm8.chr4 154686209 323 + 155029701 gggtttc---ttctaggctgtcctggaaccaggc----tgggctcaaactcaccgagatctgtctgcctctgcctcctgagtgatgagattaaaggcatgtaccaccatcacctggctTGCAGAGGTTTTCTGATGCTTGCTACTTACATCTAGATCCCACCCTGACCCGAGGCCACAGCATCATCAATGTCATTGTCCCAGAGGACCACACACATTTCTTCCAGCAACTGGGCTATGTGTTGGCCACGCTGCTGCTCTTCATCTTGCTGCTCATCACTGTAGTCCTGGCTACACGATATCGTCACAGCGGAGGTGAGGCT--GGGCCCTTG s monDom4.chr2 438270057 304 - 541556283 GGGTTTTGAGTTCTGAGCTGACCC----CCAGGCCTCATAGTCTCAGATTGGTTCAGAGTTGTTCAGACTTGCGTGCTCTGAGTCCGTGTTCCAGACTAGAACCCCTAA------------------TTCCTAAGGCTCATTTTTTA------GATCCGCCGGTGGTCCAAGGCCACAACGTCATCAATGTCATCATCCCGGAAAGCCGGGCACACTTCTTCCAGCAGCTGGGATACGTGCTGGCCACCTTGCTACTCTTCATCCTTCTCCTCATCACCGTGGTCCTCGCCACGCGTCATCGGCGGCACAGAGGTGAGTCCCAGGAGCCTTG a score=3795 s mm8.chr4 154686643 171 + 155029701 TGCCCAACTCTCCTCCCAGACCTGTCCTGCCCTGGCCTCCTAAACTGCTATCTCCCTTTAGGAAGGATGTGAACATGGTGGAGTTTGCTGTAGCCACAAGGGATCAGGCTCCATATAGGACTGAGGACATCCAGCTAGGTAGGGGTGAGAGCCACAAGGGTCCAGGGGAAG s monDom4.chr2 438270789 161 - 541556283 tgtccccccccccccccattgctaacctgtctctacctctc----------ccctttccAGGAAAGATGTTAATTTGAAGGAGTTTTCAGCAGATTCAGCTGATTTGTCTCAGCTTAGGAGCGAGGACATCAGGCTGGGTAGGGAAAGGGGGAACATGCTCCCCTGGAGGG a score=4208 s mm8.chr4 154686818 126 + 155029701 TTTTGGAGTGGCACTTATTATTAT--------TTTTTTCCCCAACCAGATTACAAAAACAACATCCTGAAGGAGAGGGCTGAGCTGGCCC--ATAGTCCTCTGCCTGCCAAGGATGTGGATCTGGATAAAGGTGAG s monDom4.chr2 438271081 131 - 541556283 TCCTGGGGTGATATGAGCTCTTATGGCTCTCCTCCTTCTCCCTCCCAGATTATAAAAACAACATCCTGAAGGAGCAAGTGGAGCTGGCCTTGGGAGTC-----CCAGCCAAAAACATCGACTTAGACAGGGGTGAG a score=2593 s mm8.chr4 154687076 164 + 155029701 AGACATTAGCCATTTTCTT--------GGCTTCCAGAGTTCAGGAAGGAGTACTGCAAATAAATGGACCCTGAGCTTCTGGCTGGGCCAGCAGCTCTGTATCAAAGGACATCTCCCTGACCCTCCTGCGGTATTCCT--GGCTCTTCTCAGCGGCTGGTCCGACTTACCTAGAA s monDom4.chr2 438272359 155 - 541556283 AGCCAGTCTCCATTTTTTTCCTCCTTTGGTGTCTAGAGTTCCGGAAGGAATATTGCAAATGAA--GAGTCCGGGCATCCGGCCCATCC------------TCAGAAGA-----TTCCGCTTCCCCATCGTTGCCCCTGGGGTCCCCATCGTGGCCTCCTCCCACTCACCCAGGA a score=15847 s mm8.chr4 154691057 958 + 155029701 GCGCTCGGAGAGACCCGACCGG--------CCAGGCCTTCTG-AGcccgcccagtccc--accccggtt----------gccccgcccgtgcgcaagccgtagccccgccccgccggacccgctctgcgcgtgcgcagtcccgccccgcccGCGCTGCGGGCGACTAGTGACGTCACCGGCCCCGAAGCGCCCTCCGGCGGCGGCGCGCTCCACCCCAGCAGGCGGTT-CGTGAACAGCCCGAGGGGGCGGCGGGCCGCGGGAGCCCTCAG----------AGCC---GCTTTCCCTGGCGCCCGCTCCGGGGCCGCggcg-gatgggcggccgcgg--gccgc----ggggcgacaggcggggaacgggt------------gcgagccgggacc----gggaggggcggccgcgccaaggg-----gccgcggggcggccgggcggggcgcgggccggcggTTTGGGAGGGCGCCCCGCGTCCGAGAGGCGAGCCGGGCCCTGACGCCGCGCGGGTTCCGCGTCGCCCCTGCCGCGCC--ATGGCGGAGACCAAAATCATCTACCACATGGACGAGGAGGAGACGCCGTACCTGGTCAAGCTGCCCGTAGCTCCCGAGCGCGTCACGCTGGCCGACTTCAAGAACGTGCTCAGCAACCGGCCGGTGCACGCCTACAAATTCTTCTTCAAGTCCATGGACCAGGACTTCGGGTCAGTGGGCCGCGCGGCCTGGGCAGGGGCGCTGGCCTCCTCCCGCGCCTGTGTGCACGAGCTGGCACCTGTCCGCGCCGGCTGGGCT--TTCGGGTCTGGGGACGTCAGAGAGCGCCCCCGTCGCCGGCAACCCTGCTGCGCATCTACAGCAGGTGTAGGTAGAGTTTCTGCGCCCAG---------TGACCCTGAGTGTGGCAAGCTGGGGTTCCGAGCCACTGACTACCCTCTGGGTAGGCCAGACAGTTCTT----TCTGACGGACAGGC------GAGGGCCCAGGCTTTCTGACCACCATCCACTGGTGCTCCTGTGCCCAGCTGG s monDom4.chr2 438286174 984 - 541556283 GCGCTGGGAGCCCCCGATCCGGGTTAGGCGCTCGCCTGTCTGTGGCCCGCTCGGGCTCTGACTCCGGTTCCGGCTCCGAGCCCGGCCTGTCCCCGTCCCGTCTCCAGACCGCCTCCAGCCAAcccggccggtg----gccccgcagcccccaccccg-ggccggcgtccgaggcggcctcccccggcgcgcccg--ggccggggctcg---------gatgggcggccgcgggggcagcgcg-gggggcagcagccggcgcgccgccTCCGCCTGGATCTCGGCCTCAGCTTCCCCTTGCGCCTGGCCCGGCCTCCCCGCACGATCAGCCGCCGCCGCCGCCGCTTCTGCGGCCTGGACCGGGGCCTGGGCCCCGCTGGCCCCGACAGCCGGAGCCCCCAGGGCCCGGCCTCCGCTCCTGGGGCCGCGGTCGTGGTCCGCCCGGGCTGCGCGCTGAGCCCTAGT-----------CCCTGCCTCC----------TCTggccccggcgcccc-cgggcccgggctcccccgacccgccccccATGGCGGAGACCAAGATTATCTACCACATGGACGAGGAGGAGACGCCCTACCTGGTCAAGCTGCCCGTGGCCCCCGAGCGGGTCACGCTGGCCGACTTCAAGAGTGTGCTCAGCAACCGGCCAGCCCACTGCTACAAGTTCTTCTTCAAGTCCATGGACCAGGACTTCGGGTCAGTG------GCGGCCCGGTGGCGGTGGGTGGCGG------GCGTGCGTGGGGGCGGGCAGGCGGCTGGTCCTGCC-TCTGGCCTTGTCTGGCCCTGACCCAGTCTCTGGCCGGGtctgtctctg--attctggccctgtctctgcctccggccttgtctctggccttgcctctggctctgtctctggccctctctgtttctgGTTCTGGCCCTGACCCGGTCCCTTTCCCTGGCCTTGGCCTGGTCTCTGTCGGGATCTCTGGGAGGGGTGCTTTGGAGGGCCCCAACCT------CTCCCTACCCGGGGGCACCTGTTCTCTGACAG a score=706 s mm8.chr4 154692051 118 + 155029701 CTCCCTTCTCTCTGGTTAAGCACAGAGCCT---GATGCGTTCCTCCTCTGTGGATGGAAACCCGGGGCTCA-------GGACTGC--CCTGGTGGGTGTGCAG-----TTTATGCGGGGGGTGGGGGGTGGGATC s monDom4.chr2 438287182 128 - 541556283 CTTCCCCTCCTCTCATTTGTCCCTGAGCCTTGGGATAGGTGTATC-------AGTGGGCTTCAGGGGCTCCTCAAATTTGACTGCTACTCCAAGGGGGGGCAGAAGTATTTAAGTGAGGGGAGGCAGGCCAGACC a score=2171 s mm8.chr4 154694695 81 + 155029701 AGAGCAGATTTCTCCTTGAGGTGGATCACTGGGGGTGGCTGGTAGAGTCCAATGGCCACAAGGATCTCTCCAGGAATTCTA s monDom4.chr2 438295685 70 - 541556283 AGAGCGAATTCCTTGTTGGGGTGGATCTGTGGGGGTG-------GAGGCCCAGGGCTGGGCAGAGCTTT----GAATTCGA a score=13169 s mm8.chr4 154697190 380 + 155029701 GTGACATAGGGCTTTGTTTGACCACAGGGTGGTGAAGGAGGAGATCTTCGATGACAATGCCAAGTTGCCCTGCTTCAATGGCCGGGTGGTTTCCTGGGTGAGT-----CTATGG-----GTGGCCCCAGCAGAATGGTGAAGGTGGGCTCTCCCTGGGAGACGTAAAGTAACTGGACAAAGGTAGGCAGCAGTGGGGTGCCTGTG-----------GGGGT------------GGTCTTGACGCAGATGGCCATCCAAGGCCTCACTCTTCCTTCACAGCTGGTCCTGGCTGAGGGCGCTCACTCGGATGCAGGGTCCCAGGGCACTGACAGCCACACGGACCTGCCCCCACCCCTTGAGAGGACAGGCGGCATTGGGGACTCCAGGCCCCCCTCCTTCCAGTAAG-GCCCCTT s monDom4.chr2 438310609 402 - 541556283 GTGTCTCACTGCTTCCTCTCTCCTCAGGGTGGTGAAGGAGGAGATTTCAGATGACAATGCCAAGCTCCCCTGTTTTAATGGAAGAGTGGTTTCCTGGGTGAGTGAGATCCAGGGACTTTGTGGCTGGGGTTGACATCCAGAGATGGACAGGCGGTGGGAGG-----GGGTCTTGGGCCAGGG--GGAAGGGGAGGATTGGCTCTGATTTCATGCCAGGGGCTCGCAAAATCAGGAGCTTGGGGCAAGGGGAGGCTCA-----TCTCTATTCCTCTACAGCTGGTCCTGGCGGAGAACTCCCACTCGGACGCTGGATCTCAGTGCACTGAGAGCCACACAGACCTGCCTCCGCCTATTGAACGGACTGGGGGCATCGGGGACTCCCGGCCACCCTCCTTTCAGTAAGCGCCTCCT a score=-1422 s mm8.chr4 154697582 179 + 155029701 CTCTGCCATTGCTAGATACTTGCTACCCAAGACCCACCTGGGAAG-AGTGAAGCTGACAACATAG----CAGGGGC-------CTACAGTTGTGTGGGAGGCACCTTCTAGAACTAGGGTCCTGCCTGGGGGTTTGGGGACCTGGAATCATTTGAGGTAATGGCTGTCGGCAACCTGGTCTGCCCAATTCC s monDom4.chr2 261383081 124 - 541556283 TGTTGGTGATGGGAG-----------------------TGGGAGGAAGGGAAGGAGAGAATATAGGTTTCTGGGGCTAGCTAATAACAATTG------------CTTTTAGGA--AGGATCCCATC-------------ATCTTTAACCTCTTTCTATGAT-----------------TCTACTCTATTCC a score=6325 s mm8.chr4 154697773 183 + 155029701 TCTATGCAGTCCAAATGTTGCCAGTAGCCGGGACGGAATGGACAATGAGACAGGCACAGAGTCTATGGTCAGTCACCGGCGGGAGCGAGCCCGACGTCGAAACCGCGA---------------TGAGGGTACTATGG----CTGTGTCTGCCCAGATCTGGAGCCC-------AGGCTTCCCTTGGTATCCCTTTGGTATACTCCAAGC s monDom4.chr2 438313504 206 - 541556283 TCCCCGCAGCCCCAACGCTGCCAGCAGCCGAGATGGGCTGGACAATGAGACCGGCACGGAGTCTGTGGTCAGCCACCGGCGGGACCGGCACCGGCGGCGGAATCGGGAGGGCCATGAAGATGGTGAGAGTATGGGGGGGGCCTTTCTCCCCCCAGG---GGGGCCCTCCAAAAGGGATTTCTCTAATGACTCTCCCACAGTCTCCCAGC a score=5863 s mm8.chr4 154697956 324 + 155029701 CTGGAAGTATTCC---ACATATTCTTCCAAGCAGTGATCCTTGGGTAGAGGTCCCAGCCT----GGTACTCCTAGCCCCTGTGGCCC------CAGAGTTA-------------CTGCATAAACTTTGAAATGCACAGGCCACCCGCATTCTGTTAGGACTGAAGT-CCCACAGTCGTACCC----ACCCTACTGTCC----CCACAGCTGCCCGGACCAATGGGCACCCGAGAGGGGATCGGCGGCGGGACCTGGGACTACCTCCAGACAGTGCATCCACTGTACTGAGCAGTGAGCTTGAATCTAGCAGCTTTATTGACTCAGATGAGGAGGACAATACGAGCCGGTGGGTGACGTG s monDom4.chr2 438313892 335 - 541556283 CTGGAGATACTCCCAGAGGAGCTCCTC----------TCCTTGACAGCAAGGCCCTGCCTCCTGGGGCCGGCTATCCTCCAAGGCCTGGGTCACGGAGTTATGCAGGAGGGCTGCTGGGAAGATCTGGAAGATCTTAGTGTAGCTGCG--------GGACAGAAGTTCCCAGGGACATTCCCCTTGACCGCTGTGCCCACTGCCACAGCCCCTCGGATCAATGGACACCCGAAGCTGGAGCGTCGCCGAGAGCCGGG--CACTTAC-GAGAGCGCCTCCACCATGATGAGCAGCGAGCTGGAGTCCAGCAGCTTCATTGACTC---TGAGGATGAAGACACCAGCAGGTGGGCACCGGG a score=11335 s mm8.chr4 154698360 269 + 155029701 CTCAGGCTGAGCAGCTCCACAGAGCAGAGCACCTCCTCTCGGCTAGTTCGGAAGCACAAATGCCGTCGTCGGAAGCAGCGCTTGAGGCAGACAGACCGGGTA-----GGCAGCAGGTGGGTG-----------GGGTGTCTGCTCTGAATGGTGCCCACACAGCCCCTCACTGGGTCC-------CTCCGCAGGCATCCTCCTTCAGCAGCATCACAGACTCCACCATGTCCCTGAACATCATCACCGTCACTCTCAACATGGGTGAGGCCTTGT-GGGCTGTGGGTGCCTGC s monDom4.chr2 438315164 293 - 541556283 CTCAGGCTGAGCAGCTCCACTGAGCAGAGCACGTCATCTCGACTCATTCGGAAGCACAAACGTCGGAGGAGAAAACAGCGAATGCGCCAGATTGACCGGGTATGGAGGGCAGGGGGTGGGCGACAGTGGGGGTGGGTGGGCGAGTTGGGGGCTGAGGGCCTAGTCCCGCTCATTGTCCTTTCTGTCCCCACAGTCCTCCTCGTTCAGTAGCATCACTGACTCCACGATGTCCCTGAACATCATCACGGTGACACTCAATATGGGTAAGGCAGAATGGGGCTCTGAGGCTCTGC a score=12430 s mm8.chr4 154698675 156 + 155029701 CCTCCTGCAGAGAGGCACCACTTCCTGGGCATCAGCATCGTGGGCCAGAGCAACGACCGGGGTGATGGCGGCATCTACATTGGATCCATCATGAAGGGCGGGGCCGTGGCTGCTGATGGCCGCATTGAGCCGGGCGACATGTTGCTGCAGGTGGGA s monDom4.chr2 438315780 156 - 541556283 CCTCCTCCAGAGAAGTATAATTTCCTGGGCATCAGCATCGTGGGGCAGAGCAACGACCGGGGTGATGGCGGCATCTACATCGGCTCCATCATGAAGGGGGGTGCCGTGGCCGCTGATGGCCGCATTGAGCCCGGGGACATGTTGCTGCAGGTAGGA a score=17834 s mm8.chr4 154698846 597 + 155029701 TGGGGACAAGAGGCACCCACAT--CCCACCACCAACCCCTG-ACCCCACAAACCCCGTAGGTGAACGATGTCAACTTTGAGAACATGAGCAATGACGACGCTGTACGGGTGCTTCGGGAGATCGTGTCCCAGACAGGGTGAGGTGGGA-GCCAAGTGGGGGTGGGAGTGGCACAGGATGGGAGGGGCTGTGCGGGCCTCACTTACAACATGGT-CTGCTCAACTCTGTAGGCCCATCAGTCTCACAGTGGCCAAGTGCTGGGACCCAACCCCTCGGAGCTACTTCACCATCCCAAGGGGTGAGTTAC-CCCATGGAAAGGTGGG-------------GTAGGGTGGGGTTTCTGTGTTCAGTC----------------------------------------------------TGGGGG--------------------------TCTTTCTTGTCTGCCTCT-------GTGCTGCCCCCC-----------TACTTACCACCTGTA-ATCCGTTG--------CTGTGGAAACTATGCAGCTGACCCAGTGCGACCCATCGACCCGGCTGCCTGGCTGTCCCACACAGCAGCACTGACGGGTGCCCTGCCCCGCTATGGTACGAGTCCCTGCTCCAGCGCCATCACACGCACCAGCTCTTCCTCACTAACCAGCTCAGTGCCTGGCGCCCCACGTAAGTGGCAGCTCACAGGACCCC s monDom4.chr2 438316654 712 - 541556283 TGGGCGAGGGAGCCAGCTGCCTGCCCCTCCCTCATCTGCTGTGCTCCTC---CCCCAAAGGTGAATGATGTCAACTTTGAGAACATGAGCAACGACGATGCAGTCCGGGTCCTGAGGGAGATCGTGTCCAAGCCGGGGTGAGAAGAGAAGCCTGGGGAGGGCCGGAGGG--AGAGGGTGTT-GGGGTCGAGGGGGACTCGGGTGAGTGACGCCGCCCTTCCCCCCTTCAGCCCCATCAGCCTCACGGTGGCCAAGTGCTGGGACCCCACCCCCAGGAGCTACTTCACCATCCCCCGGGGTAAGCCACGCCCTTGGGGCTGTGGGTGTGTCGGAGCCGATggggcggggcggcggggcgcggccTAAACTGGAAGACTTCTTGGAGATGGTGAGGGGAAGCCCTCGAGAAGACCATTGGGAGCTTCCAGCGATGGATCCCAACCTAATTCTCTCTCTCCGGCCCCTCCCATCCTTTCTGTTCCCCACGTGTGTCCGTCCTCCCCTCCCGTCTGTCCGTCTGGCTCCGTCCGCGGGGCGCTCACAGCTGACCCGGTGCGGCCCATCGATCCGGCCGCGTGGCTGTCGCACACGGCGGCGCTGACGGGAACGTTCCCGCGCTACGGTACGAGCCCCTCCATGAGCACCATCACATCTACCAGC---TCCTCACTAACAAGCTCTATTCCTGACGCAGAAAGTAAGTGGCGGCCCAAGCGCCCCC a score=-2603 s mm8.chr4 154699443 266 + 155029701 CCC---CCACCCAAGGAAACTGAGGTTGAAGGACAATGGTCAGT----TCTAGCTTTGAGCTTT------GGTGCTCATCA--------------------GAGCTATTACAGGGGCCCATTACATATG--------AAGGTTTTGTTTGCTTCCAACACCTTCACAAATGTGTACACAAAGAT----ACATGTACATATCCCT-----------CCAGGCCTGGC------CATACTGGTCATCTGCATGAATTGAGGGTCCTGCCAGGCCTGTGCGGAGGGGGGAATTGGGAGGACATGGCAGCCTCTGCTTTGCTTTTCTGCTAC s monDom4.chr2 537803327 308 + 541556283 CCCTTCCCTCACAGGCAGACGGAG-----AGGACGAGGACGAGGAGAGCCTCACTGGGAGCCTCACTGTCGGCCCTCCTTAATTAAAGGGGGTCAGAGATTGAGAGCTGGAAGGGGCCTCTGAGGCAGGCGGACGCCGAGGTCGGGCATGCTGGGAACAGGGCCACAGC------CAAGAGGGTTTCCATGTTTCCGTATCTCTGGCACCTTGTGCAGCGTCTGGTACATCACATATACGTCATTCTTTCTTATTGGATTT--------AACTGAATTACGGGAGGCAGGAGGCCCACA-GCTAGCCTTTCCTTCCATTCCGTTCTAC a score=650 s mm8.chr4 154699776 109 + 155029701 ACTGTGGGACGGGGA-AGAATCTCCCGGTCTTAGCTCAAGTTTCGATGAGGGGCATCTCCCAAGGATGGGAGATAAGAGGTTTGACCCTGGCCCCTGCTCTCAACCCCAT s monDom4.chr2 537803716 86 + 541556283 actgagggaggcagagagattctccaggtttc--ccca------gatggaaagtagct-----------gaggcagga--tttgaacccaggtcct---cttgattccag a score=9333 s mm8.chr4 154699885 213 + 155029701 GGAGGTTCACGCTGTGAGCCTGGGCTCAGGGAA---GTGTGCTCTGCAGAGCTTGAGGAGGCACCGCTGACTGTGAAGAGTGACATGAGTGCCATTGTCCGCGTCATGCAGTTGCCAGACTCAGGACTGGAGATCCGGGACCGCATGTGGCTTAAGATCACCATTGCCAATGCTGTCATTGGTGAGTCC--CTGGCTGTGTGGGAAGGGCCCCGTCTG s monDom4.chr2 438318115 213 - 541556283 GGCGGTCCAGGCTGAG-----GGACGCAGGGGACCTGTCTCCCTTTCAGAACTGGAGGAGTCTCCCCTGACGGTGAAGAGTGACATGGGGGCCATCGTGAAGGTCATGCAGCTGCCGGACTCGGGCCTGGAGATTCGGGACCGGATGTGGCTGAAAATCACCATTTCGAACGCGGTCATCGGTGAGTGTGGGTGGCACCCTGAGAAAGGTGCCCCTTG a score=13030 s mm8.chr4 154700157 230 + 155029701 CCAGGGGCGGATGTGGTGGACTGGCTGTACACACACGTGGAGGGCTTCAAGGAGCGAAGGGAGGCAAGAAAGTATGCCAGCAGTATGCTGAAGCACGGTTTCCTGAGGCACACCGTGAACAAGATCACCTTTTCTGAGCAGTGCTACTATGTCTTTGGCGACCTGTGCAGTAGTGAGTAGGGGT--GCGGTTGGGTAGGGTTGCTGTGGCCTCATTCATTTGCCTTCACTTA s monDom4.chr2 438318711 225 - 541556283 CTAGGGGCTGACGTGGTAGACTGGCTGTACACGCATGTGGAGGGCTTCAAAGACCGGCGGGAGGCCCGCAAGTACGCCAGCAGCATGCTGAAGCACGGCTACCTGCGGCACACCGTGAACAAGATCACGTTCTCTGAGCAGTGCTACTATGTCTTCGGGGACTTATGCAGCAGTAAGGATGGGCGGGAGGTTGGGGGGAGCCCCTGGG-------CCAGTCACCCCCAAATA a score=14643 s mm8.chr4 154700387 317 + 155029701 CccctccctccctccctccctGCCAGACCTCGCATCCCTGAACCTCAACAGTGGCTCCAGTGGAGCCTCAGATCAGGACACACTGGCCCCACTGCCCCACCCATCAGTACCCTGGCCCTTGGGTCAAGGCTACCCCTACCAGTACCCAGGACCCCCGCCCTGCTTCCCGCCTGCTTACCAGGACCCTGGCTTCAGCTGCGGCAGCGGCAGTGCTGGGAGCCAGCAGAGTGAAGGTGAG-------AGGCGTGCCACCCCTCCTCCCACTCCCTCC------CACTCCCACGCTCTGCCTGGCCC-------CGACGCTTCCCTCTGTGCTCCTGCTG s monDom4.chr2 438319665 334 - 541556283 CTCTACTCTGCTTCCTTTCC--CCAGATCTGGCAGCCCTCAATCTCAACAATGGTTCTAGCGGGGCCTCGGATCAGGACACATTGGCCCCGCTCCCCCACCCGGCGGCACCGTGGCCTGTAGGGCAGGGCTATTCCTACCCCTACCCTGTGCCTCCCCCGGGCTTCCCTCCTGCCTACCAGGACCCGGGCTTCAGCTACGGGAGCGGGAGTGCAGGGAGCCAGCAGAGCGAAGGTGAGGCCCCCAGGGCCCAGCGCCCAGCACCCCGCCACCGCCGCCGTGCCTTCCCAGGCTCCCCCGGCCCCTGGGCATCAGCTTCTCCCTCT-TGTTTCTGCTG a score=864 s mm8.chr4 154700995 206 + 155029701 AAGCATATCCCAGGGATATTGAAGATCTTGAAGGGTGGGTGTCCCTCAGGAGGAGATGGACTGATGTGGAGGTCTTAGGC--AGAGTGGGGCACACTTGTGCTACAAGGTCCAGAGAAAGACTCA-----GGAGAGGTTGGGC-CAGAGGG-------TGGCAAAGCCCAAGGGGAAGCTATCGAGTGAATCCTGACCATGGAC-----AGGCCCTTGCATGTACC s monDom4.chr2 438320895 222 - 541556283 AGGCACACTACTGGGAGATGGGTCA----GTAATGTTGGGGGCATGGAGGAGGAGATGGACTGAGCTAGAAGGCTTGGTCCTGGAGCTGAGCATGGAGGAGAGGGAAGGCAAGATTGGAGCCTGAGAGATGGGGATGCTGAGTGCAGAGGGGCAGATTTGGTGCAGTTGTAGCTGCCAGCATCCAGTGGGGGGTGTCCTTCGGCCACAGAGACCCCTGGATCTATC a score=18446 s mm8.chr4 154701252 957 + 155029701 CTGGTGTGTGACTTG-TGCTAT-CCCTTGCTTTGTGCTGAGCAAGCCTTAGACTGAAGGACT---AGCAGAGTGGA---CTCTCGGG--CCGGTAAGCC------------AGGTCCCCCTGTGTCCCTCTCAGCATGTCCCCAGCCAGCACG----------------------------------TGTTTTCAGG---TTCCCACTACTTTCAGGACAGGGG---------CTAAGCAAATTAGATGAC-CAGGGTCCTGGGGTTGGGTGGACCCTGGTTGGGTCTTTG----------GGTGGTGAACCCAGGATGGCTA--------------ATGGGAATGCTGGGCACACAGGGCCTTCGCTGGTTTTTAGTTTCTCA------------------------------------GCTGTAACATTAACCCTTGGTT----CAAGCATTGGGGTTAGGTGTGGGGTGCC-------AGGCTGGCCCCTGTTGTCCCTGC----------------------------TGTCTGCCACTGCCCCTAGCTTCTCGCCTCTCAGCTGTTCCTGGTATCTGCATGG---CTGCCATTCCCCTACC---ATCTCC-------------AGGCTTACCAGGTCCTGCCCTGAC-------TGTCTGGGAGCAGCT----------------------GGTGG--CCCTGGAAGTGGC--------------CAGGCCTCG---TGCTGACTCTGTTGTCCCCTTCCCTCCCCCTAGGGAGCAAGAGCAGTGGGTC------------CACACGGAGCAGCCATCGGACCCCAGGCCGAGAG---GAGCGCCGGGCAACTGGAGCTGGGGGTAGTGG------CAGTGAATCAGACCACACAGTACCAAGTGGGTCTGGTAGCACCGGCTGGTGGGAGCGGCCTGTCAGCCAGCTTAGCCGTGGCAGTAGCCCTCGAAGTCAGGCTTCAGCTGTTGCCCCAGGGCTCCCCCCACTGCACCCCCT------------TACAAAGGCCTATGCAGTAGTGGGTGGGCCACCTGGAGGGCCACCCGTCCGGGAGCTGGCTGCTGTCCCTCCAGAACTTACAGGTAGCCGCCAGTCCTTCCAAAAGGCCATGGGAAACCCCTGTGAGTTCTTTGTGGACATCATGTGATGATCAACCAATGTCTTCAGCGCTG--------CCTGTGGCTGAGTCTGTG s monDom4.chr2 438321789 1223 - 541556283 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TAGATATTGTATCAAAGCCCGAGTGTCTGTATAGTTAATATATAGCTGCATCTGTGTAAATGCCGCCTCCGTGTAAATGCTATTTTAAACACTAAAAAAAAGCTTTTAATTTTATGTGATTCCTTGGCCTCCTGTCTTTTCTTCCTGGCCTCTGGCCTCTGGCTGCTTGGCTCTGGGCGCCAG--CCAGCGCCCTACTGAGTGCTGAGCC---TCTGGAGCTGTCCGCAGTGCTGAAGGCTTTCTTTTTCTGGCTTCTCCTGACGCTCCCTTCCCCATACCTGGGGCTCTTTCT---GCCCTGGCTGGT--------TCCCTTTTTCTTGTCCCTGCTCGCTGTCAGAAGC a score=36926 s mm8.chr4 154703807 1162 + 155029701 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s monDom4.chr2 438326267 1178 - 541556283 TTTTGCTTTAGAGGCTACACAGAACTTGGAGAGGGGGGTCGCCAGGGGCTTCTTGGGGCCAGAGAGGGAATGGCCAGGATTGACCGT--------TGAGGTCAGGATGTTACTGGGGTTGGGGCAACTGTGGGCCATGGGATCTTGGGTTAGAGCCACAGTTCTCCGGGATCTGGGGGTGCCCTGGGCCGAGCCCTAGCCCATCACTGGCTCCTTCTCTTTTCTGGCTTCTCTTCCTGGGCTTCTCCGCTGGCCCGAGGTCCCAGCTCCAGAGAGCTCTGGAAGAACTCCTGAGTGTTGAGGTGCGGCTCCCAGAGGAGCAGGTAGCACTTGGGCAGGTAGAAGGCGGCCAGGATGCCCAGGGCACTGAGCAGGATGGCAGTCATCTGCATGGCCGGCTGGTAGACCTTGTGCACATTGGTGAAGAGCGGGACGAAGGAGAGCCAGATGATGAAGTAGACCAGCATGGCAAAGGTGATGCCCCTGGCCAGGTTGTAGCGCCCGGCCTGGCTCTGCACCATGAAGGTGCCCAGGAAACAAAGGAAAGCCAGAGCCACATTGACCGCGTGCACCACGCCAAAGCTGAGCCAGGAGCTCACGCGGCAGTGCACCAGGGCCTCCCGGGGCAGCGTCTTCCAGTCGGTCTCCAGGGCCTGGGGGAACGCGAGCAGGTACCAGGTGCAGAGTGCCCCCTCTGCTAGCAGCAGCAGGGCCACGAGCAGCCAGGCCCGGGTGCCGTGCAGCCAGCCATGCAGCCGCTCGGCCTGGCC---TGGGAACTCCGATGCCAGGAAGGCCTCGGCTGCCTTGAGGAAGAGGGTGCTGAGGCAGCCGGTGAGCGGCAGGTGGACGAGGGGCTGCTGAGCCAAGCAGCTGAACCAGCTGGGCCGGCCTGGGAAGTGGAGGACGCTGAGGCTGACCAGGGTCAGGCAGCCCAGCCCAAAGCAGCTGAGGCTGCCCCCTGAGGCTCGCACCAAGGGGGAGCCCCAGTGGTAGCTGAAGAGCCCCAGAGCCCCCAGGCTCAGACCCACGGCCAGCACCATCAGCAGCAGCAGAACAACTACCACCGGCTCTCCCCACCCCAAGAACTTGATGGTCCGGGGAAAACATTGAGTGCTGAGATCAGGAGACCACTGGTCTGAGGCACAGGAGGTGCACATCAGGTCATCTGCAAGACAGCCAGAGAGAGA 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cttcctccctccttccttccttcctCTCTCTCTCCACATGTCCTGAGGCTCCTGGCACCTGATTCCCTGGGCTGTGCCAGCGGATCTGAGATCGGTTGAGTTTCAGGTCCCCTTGGAAGGAGCCTATGGTGAGGAGCTCCGGGTCCATGTTATCGTGCCAGACCCACAGCTTCAGGTCATAGATCATGTCCACATTCCCGTTGTCATCAAACTTCAGGGTGAGGGAGCGGGCGCGGAAGCTCAGGTTATACATCTTGCTCACAAGCTGTAGGGATGAGAAAG a score=27388 s mm8.chr4 154705644 824 + 155029701 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CTGTGAC-CTGTTTGCCTTTGCCCCAC-AGAATTTCCGGCTGGTATCCTCAGAGCAAGCCCTGAAGGAGCTGGGCCTGGCAGAGCACCAACTTCGCTTCACCTGTCGTGTGCACCTGCAGGACACACGCAAAGAACAAGAAACAGCTTTACGTGTGTACAGCCATCTCAAGAGGTGCG----------------------------------CCCTGGCCTTT----------------------------------TCCTACCCTCAACAAGCAG------GGTGAGGCAGGGGTCTAACTATGCCTCTCCTTAGCACCCTCAAGGACCACTGTGTACAGCATCTCCCCGATGGCTCTGTGACTGTGGAGTCCATTCTAATCCAGGCTGCCGCCCATTCGGAGGACCCTGGTACCAAGGTGCTATTGGTCTCCTGGACTTACCAGGTAAGGAGCATGGGCATCACTATTACTCCTGTAGG--CCTCACTTCCTTGGAATTGTGTTGTTTGCAGTGTTTAACTGTGGCTCCCTTCCTTACAGGATGAAGAGCTGGGAAGCTTCCTCACAACATTGCTCAA---AAATGGCCTTCCTCAGGCTCCCAGCTGACAT--------GTATCCACCAGGAATCCACTGCTCTT------GTCTCTTGCTGTTCTCCCAGCAGGACCAGGGCTTCGGCCGAGAGGCGGG s monDom4.chr2 438392028 685 - 541556283 CCGTGACATTCCCTCCCTCTACCCTGCCAGAATTTCCGGCTGGTGTCCTCTGAGCAGGCCCTCAAGGAGCTGGGCCTGGCTGAACATCAGCTTCGCTTCACCTGCCGAGTGCACATCCATGACACCCGCAAGGAGCAGGAGACGGTGCTGCGTGTCTACAGTCACCTGAAGAGGTGAGGAGGAAGGGGCGCCCTCCCCCACAGCTAGGGTTCCCCTGGACTGTGGCTTTAAGGGGAGACCCTGGCACAGGTGCAGAGCCCTCTCCCCTCCGGCCAGGGCTCAGGTCTGGCAGCCGTGTCCATCTGTCCTCTTCTAGCGTTCTGAAAGCTCATTCCGTCCAGCACCTGCCCGATGGCTCAGTCATGGTGGAGTCCATCCTGATCCAGGCCACTGCCCACTCGGAGGACCCAGGCACCAAAGTGCTCCTGGTCTCCTGGACCTACCAGGTGAGAGCCCCAGGCTGGGTGTTTGCTCCCTCGGGGCACCCGCCTCCTCCATTTCCTGTTGGCT-CAGGGTTGAA--ATGGCCATAGACCTT-----------GGGAGGGAGGCTTTATCTGTGCCGAGCTCCGTGTAGGTGACCGGCCGGGGCACTCCTGGGGACATACCGCACGGCTTGCCCCAAG-GCCTGCTGCTCCCACCTGGGTCTCTCCGTAGTTGCCAAGCTGG-CCAGAGCCCAG--CGGGGGGCGGG a score=1037 s mm8.chr4 154738250 133 + 155029701 CTCCTCCCCAACCTCCAAGCTGCTGAGGAAGTCCCTGGCTGGCAAAAAATAGGCATGGGGCAGGAGGGGATGCCTCAGGTCCTTGGCTGAGGAAGGGAGTGCTGAGAGACTCCCGGGACAGAATGCTGGCCCC s monDom4.chr2 438392820 115 - 541556283 CTCCTCCTCTGTCTCGGTGCGCAGGATGAAGAGCTGGGCAGCTACCTCACATCGCTGCTGAAGAAAGGGCTCCCGCAGGCCCCCAGCTGAGGG------------------CCCGGCCCCAGGAGCTGCTCCC a score=1 s mm8.chr4 154738439 411 + 155029701 AGCTCCTGCTGCAGCCC---CTCCCAGTTTCTGGCTCCCTGGCCAGCTGCAGCTCT--CCATGCAGCTGTCTGGGCTGTCAGGCCTGCTTGGGGAGCACTGAATTGGTCTCTCCTAGGCAGATAGTTACATCT--GTGTTCTGGAAC----TTCTGGCTCGCGTAGTGGCCAGAATCCTGGAACAG-----AGCCTCCTGTGGTAGCCTGTGTTAGGCTTAGATAAAGGACTTTTTTTTCCCCCCCCCACCAAGCCGGACAGGCTGTGCAGCATCCATCAAAGGCATGGCTGCCAATGGTTCACTCGGATGCTGCAGCTCTGTCCCT--------------------GTCCCTCTGAGCTTTAGGAATCACGGTGCCTAAGCCC---------TTACGAAGGGATGAGGCTGATGGCCGGGATCTTCGAGGGTCCGTGGCTAGGGCAGCCTGGCCA s monDom4.chr2 438392994 394 - 541556283 AGGGCCTTGTGTGGCCCCTGCTCTGAGCCTCGGGGCCTCAGTCCTGCTTCCGCACTGACCTCCCTTATGCCTGG----------------GGGGAGTCCAAAGCTGATAAGCTCCAGGAGGGCAGGCAGGGCCTGGCGTTGTGCATCCCAGTTCCACCTCCCCTCTCCTCCAAGTGCCTAGAACAGGGCTCAGCCACCGGAGCCTGCCTTTTAAGGACGGAAATTAAAAA-------------CCAAAAGCCACCCG--CAGCCTTGGCGCCCTCCTTC---------GCGGCC----TTTTATTCGTCTGCTGTAGCTCTTCCACTCAGACTGCCCACGACGGACGGCTCCTCCGGGCCTTGGAGCCAGGGGTGCCACCGCCCACCTCTGAGCCCCGGACAGATGGGGC------------------AGGGCCTGGGGCTAGTCCAGATGCGCCA a score=3750 s mm8.chr4 154739789 347 + 155029701 GGAGGGTGTTTATCGCTCTCAGCCCCAGT----TTCCTGGAGCCCCATTCTGGCAACAAAACCCCTGGGGGGATGCAACAGGAAATGAAACTCCAAGTGATC-----TAACCACCCAA-----TTCTTGT--TGCAGGGCAACTATTGATGAGGTAGAAACAGATGTGGTTGAGATCGAGGCTAAACTGGACAAGGTAAGAGACA---------GAGCTGGTGG-TACATAGAGTGCCCAACACTACTGTGCGCACTCCAAGCCCAGCCTGGGA------CTATGGGATGACTCCAGGTATAGCTGCC-------TGTGTCTGAGATGCCTATTG---------GTTGGGAAATAGCTGCTGTGTTTGCTGTGCCTAGTGTGAC---------GGGGAGGGGAA s monDom4.chrUn 140020223 400 + 174229318 GGAGGGT-TCTGGAGCTCCAAAGTCTGGTGGCTTCCCTGGTGATTCCTGGGGCCACTGAGGCTGCCGGGATGGGGGCAGGGGAGGCTCGTCCCCTTGGGGCCACCCTTCACTTCTCAAGCTGCTTCTTGTCTTCCAGGGCAACCATAGACGAGGTGGAAACAGATGTGGTGGAGATCGAGGCCAAACTAGACAAGGTGAGAGGCCGGAGGCTCTgggctggggactggggattgggccggagctgggggtggagctTCCTGGCC---CCTGGCATGTGCTCCATGGTGCGTGTCTACCCCTTGCTGCCATGACCACGTGTCCGGATTCTCTTCAGCCCGCCTGTGCTGAGTAGCAGCTGCTGGATCTCACGCTTCCTGCCTGGCTCAGGCTGGGGGGAGGGGAA a score=8467 s mm8.chr4 154740314 308 + 155029701 CCAGCTTGGAGAAAGTCAGGCCCTCATTTTG---CCCACTCTGTCCCACTTGTAGCTGGTCAAACTGTGCAGTGGTATGATTGAAGCCGGCAAAGCCTACGTCACCACCAACAGGCTCTTTGTGAGCGGTGTCCGAGACCTGTCTCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATCTCGGTGAGGCACCAGTATGGTGTGGTG--GGGGAAGGGAGAAAGCCCCCTAAGGGGTGTCTAGATCATGAGCATTGGGTGGTCTGCGCTCTTCTTCAATACATCTAACCCCAACCTGTGGGCAGAGA-GGAGTCTTTGGGGA s monDom4.chrUn 140022258 282 + 174229318 CCAGAAGGGAGAACACC----CCTCACTCTGGGCCTCTTCCCTTCTCCCCTGAAGCTGGTCAAACTCTGCAGTGGCATGATTGAGGCTGGCAAGGTCTACATCACCACCAACAAACACTTCGTCAGCGGGGTGCGGGACTTGTCTCAGCAGTGCCGCAATGATGAGGTCGTCTCGGTAAG--------AGGGGATGGCACTGGGGCTGGGGGGAAG--------GGGAGGCTTGGGTTGGGGCCAGGGGATGA-----------CTCCCAGA-ATCCACCACCAGCCCATTGGCAGAGGTGGGGTGGGCAGGGA a score=4914 s mm8.chr4 154740622 120 + 155029701 CTTGAAGGAGACACTACCTACGTGGTCACCCCAGTGTGATCTCCCCCTTACTTTTCTTAAGGAATGTCTGCAGAGGTTTGGAGACAGCCTACAGGAGATGGTCAACTATCACACGGTGAG s monDom4.chrUn 140024121 112 + 174229318 CTTCCGAGAGCCAGTGGCC------CCACCTCATCCTG-TCTCCCCCTT-CTTTCCCCCAGGAATGTCTACAGAAGTTTGGAGACAGTCTTCAGGAAATGATCAACTACCACATGGTAGG a score=5587 s mm8.chr4 154742638 123 + 155029701 CCCCAGTAACCTTCACTCTGCCTCTATCCCAGATCCTGTTTGACCAGGCCCAGAGATCGGTGCGGCAGCAGCTCCACAACTTTGTCAAAGAGTAAGTGACCAGAACCGGAAGCCCCCGGCCCC s monDom4.chrUn 140025865 116 + 174229318 CCCCAAATCCCTTCCTTCCGGATGT-TTCTAGATCCTGTTTGACCAGGCTCAGCGGTCCGTGCGGCAGCAGCTCCACAATTTTGTCAAAGAGTGAGT------ATGTGCTGGGCCCCGACCCC a 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s monDom4.chr4 48821879 1098 - 430141050 TTTCCCTTTCTCTCCCAGGGTTCCTTGATCATCTGTGAATTCCTTCTCCAAAATGGGGCTGATGTGAACCAAAGAGACAGCCGGGGGCGGGCACCCCTCCATCATGCCACCTACCTGGGTCATACGGGGTGAGCACCCGTCACAACAGGGCCAAGCTAGGCCATATGGATGGTTTGGGGGGAGGGAAGGGGGTTGTGTGATCCTGGGCC----------CCCATT-------GCTTCTTT-CCTGACCTTCCTCCCCCTTGTAGACAGGTTTGTCTGTTCCTAAAGCGTGGGGCTGACCAGCACGCCTTGGACCAAGACCAGCAGGACCCTCTGGCCATAGCTGTCCAGGCTGCCAATGCTGATATTGTTACTCTGTGAGTGGGGACGCCTGGGGCCTGGCCTTTGGTCAGAGCTGGGGGAGGGCCCCAGAACACGAGAGACCCCGTGTGTGTACATATGTGTGAGACCCCTGACAGGCGCTCTCTGTCCCCCATGCTCTAGGCTTCGGCTGGCTCGGATGAACGAGGAGATGAGGGAAGCTGAGGGACCCCTTGGACAACCAGGTCAATACCCAGGCAGCAGCCCTACTGAACTCCAGTACCGGAAGTGTATCCAGGAGTTCATTAGCCTTACTATTGACGAGTGTTAGCATCC-------------------AGGGCCCTGCC--ACCCCCTTCCTTCTTTGTTT------------TGTCCCTGAGGGATGTAG----------------------------GGGGAGTGTGGGGGGAGAAGGGGAGTCGGGGCCCCAGAAGC-----GAAGCCCAAAGCCTGTGACTTTCCCTGCCCTGCATTCTGACAGCTCAGCCAGGGTCCGGGGATGGCCCTAGGGCCCCAGTCCATGTGCCATGGAAGGTGGGGAGGAGGGACCTC---------------TCTCACTGGGAGGCCTCTGGAGCTTGGGCTCATTCCCCTTCCTGGGTCTAGTCTG---ATAGAGCCGCCCAGGTCCC--ATGGCCTCTGAGTCC---CCGGCCCCCACCCCCACCTCGCATG-CTCCATGGCCAGGCCAGATCCCAGCCTGGTCCTGTCCTCTACCCACAACCCCTCTTGGCCACCCCCCAAC-CACCCCATGTCATCGGGGGTGGAGAGAGCTTTCTCCCACCCTAGGCTCTCACATGGGTCTCTC-CTCATATCCC 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monDom4.chr4 48997397 90 - 430141050 CACTCTGTGAAGAGATCCTTAAAAGGAGAGTCTCT------------------ACAAAAAGACGA---TATATGTAAACTGTTAAGATTAATGGATGGCTTCTACATTCTT a score=1512 s mm8.chr4 154834790 125 + 155029701 AAATTCTTATCTATGCAAGCATACAATATTTATAAATAGGTCTAAGCAA---ACTGCATTATATTTATCAACCTCTATCCACTGAGACAAAAATTCTAACCTAGTTGACTTGAAAATCAAGTCAAACC s monDom4.chr4 48997644 124 - 430141050 AAGCTCCTCACTATACATATTTACAGTATTTATAAATATATCACAGTTAAGCACTGAACTGGATTTACAGTACTGCCTTCCCCTAGAGACATAC----GGCCAGCCGACCATTAAATACAGCCACTCC a score=43466 s mm8.chr4 154835420 996 + 155029701 CCGGCACCTGCAGTGACATCAGGGAACGCCCTCCTTGCGCTGGCAGCACTGGGAGGGTGGAGCTGACCAGTCATAGACATAGGAAAGGCGCAACTGCACCTCATGCTTGCACAACCGGCCCTCATGCAGCAACATCTGTTGCTTCTCCAACATGTCCTCTGGGCTTTGCTTGTGTGTCACCAGATACTGATTGTTGCAGCCTCGAGATTTGTACTCCGTGTCGAAGCGTGGGTCGTGCTCCCGTTGCACATCCACTGGTGCCAGCCAGGTGCCCAGCGATACGTCTTCACTGTGCCACGCGCGCAGGTACTCGCGGCTGAGGCGCAGGTAATGCACCAGGTCCGCAGAAAGGACATAGCCACCGCCCAACGCGTAGGGCAGGTAGTAGTCGCAGAGTTGCCAGGCTGCTTCTCGCCAGCGACCTCCCGGCTTGACGCGCCCGCGCCCGGAAAAGAAGCCCCAGTAGAGGCGCCGGCGGCGTGCGGGCTCCCGTGCGCGTAGGTCCACCAGGATAGCGTCCAGGCGCGCAAAGGAGTCGTCGTCCGCCTTGAGCACGAACTCGAAGTCCACGCGCTCATCCAGCCAGGTCAGCATGGCCAGGACCTTGGCCGTGAGGTTCTCGTAGGCGTCGCGCAGGGCGGGCAGCAGCAGCAGGTCCCCGTGCTGCGCCTGCTCGAGCTCAAGAGCGCGCCGCTCCTCCGAGCCTAAGCCGCCAGTGCCCACGGCGAAGCGCGCCCACACGTCCTCGGGTCCGCCACGCCTCTCCGG----TGCCAGCCACGTGCTGCGCACTGCGGTGCGGCGCTCGACCGCGCGGGGCGCACTGGCCACCAGCACCGCCAGGAAGGC-CTTAGCGCGGGGCCGAGCGGCTCCGGAAGCGGAGG-GCGTCT-------------------------------CGCCCTCGGAAGCGCAGCGCGCCAGGTACAACAGAGTGGTGCCGCAGAACGCCAGGCCGCCTAGGCCCAGCGCCACCCGGTGCCGCCAAGCGCGCCGGAATACCTTCAT 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caaagactggctacaAA------------------GGAATGTGCCATCACCCCTGGCCTGGTCTGTCTGTCTTTGTAGACTGTCAGGTTGTGGAGCCAGCCATCAGCCTTCAGCTTTCCTGGCAGTGCTAGTAACCCAGAGAC----TTTGTAGTATCCAGGGCTCTAGTTTGAGCTGTGATTTCCCTTTCTTCCTTGCTACCTCTTACTCCAGCTCTCGGTTCACACCTTGCAGGAGTCCCATGGTC--------TGGCTGG-TGGCAATGACGCCCAGGCAGAGTTCCCTCTGTGGTCTAGCTGCTCATGGCCTCTGGTTCTTGGGCCTTGTCCTTCTGATGGATGCAACCGCTAGACCTGCCAACCACTCATCTACTCGGGAAAGAGCGGCTAACAGGGAGGAAAATGAGATCATGCCCCCAGACCACCTGAATGGGGTGAAGCTGGAGATGGATGGACACCTCAACAAGGACTTCCATCAGGAGGTTTTCCTGGGAAAGGACATGGATGGGTTTGATGAAGACTCAGAGCCACGGAGAAGCCGGAGGAAGCTGATGGTCATCTTTTCCAAGTAAGT s monDom4.chr4 49009377 564 - 430141050 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CCTCTTAAGTTTAAGCAAAACCTTGTGGAGCCTTATGAGTGTTTGCGTTCGTGTCCATTGTGCCTGGA-TAGTCACAGATGTGCCTCTTGCAGCACAGGAAGTCCTTGGGAACCTCAGAGACCGATGGTATCAGGCAGACAATCCTCCTGCAGACCTGCTGCTGACTGAGGACGAGTTCCTTTCATTCCTTCACCCTGAGCACAGCCGGGGCATGCTCAAGTTCATGGTCAAGGAGATCTTTCGGGACTTGGGTAAGACCT--TTCCGCACTGTGA------CACTGTTTTCGGCCCGAGGGTAAC s monDom4.chr4 49037791 296 - 430141050 CCCCTCCAGCCTATAGGAAAC--TGGGGTATCATATGTGTG---GCATCCATGATCAT-----CTGCACTAATGAGGTGATTTCCTTTTTCAGCCATGGAAGTTCTTGATAACCTCAAGGATCGATGGTATCAGGCTGATAATCCTCCACCCGATCTACTGCTAAATGAAGAGGAGTTCCTGTCCTTTCTTCATCCAGAACACAGCAGGGGCATGCTGAGATTTATGGTCAAAGAAATCGTCCGGGACTTGGGTAGGTGTTTCTTCTGTCTTGTCAGTCCTTCACCCTGCTCAGATCAGGGGTGAC a score=12911 s mm8.chr4 154852882 271 + 155029701 TAGTGAGTTTCAGGTAAAGCCC--CAGCTGAACACTTACCT---CTCTTCAACCCCTTATCTGCAGATCAGGATGGTGATAAGCAGTTATCTCTGCCCGAGTTCATCTCTCTGCCTGTGGGTACTGTTGAGAACCAACAAGGCCAAGACATTGATGACAACTGGGTGAAAGACAGAAAGAAGGAGTTTGAGGAACTGATTGACTCTAACCATGATGGGATTGTGACCATGGAGGAGCTAGAGGTGAGCAAGGGAACTCATGAGTGTTGTTGTGTCC s monDom4.chr4 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s monDom4.chr4 49569534 979 - 430141050 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a score=2024 s mm8.chr4 154978895 67 + 155029701 GTAGCTCCGGGCTCTTCTAGTCCTGACCCCATCGAGACTTCCCAGCCCCCTCCCCCCAAGACGCAGC s monDom4.chr4 49570955 67 - 430141050 GCAGGGCTGGTCCCTCCCTTCCCCAGACCCAGTCATGCTCCCCAGCCCTCCCTGCCCAACACGCATC a score=3078 s mm8.chr4 154979562 172 + 155029701 GGACCCGGTGGCCCATCCCCGAGTCACATCTGAGATACACCATA------TCCGAATCTGGCTCACTGCTCTGAACCAGGTTCCCCTCCTCCAGGAAACGTAAGATGTCAGCAGGCTCCAGCTGGACTTCTCCAGCCTTCGTGGAGCCCACTCAGGTATTACTACCA---GAGCTTCGTGG s monDom4.chr4 49577491 165 - 430141050 GAGCCCGGAGGTGCA---------CATACCTGCAGTGCACCACAATGGGGCCAGAGCCCGGGACACTGCTCTGCGCCTGGTTCACCTGGTCCAGGAAGCTGAGGACACCCCCAGGCTCCGTGGGGACC-------CCGTGGTCTGGCCAGCTGAAGTACTGGTAGTGTGTGACCTTCCTGG a score=1382 s mm8.chr4 154982575 125 + 155029701 AGCCCTGGGTCTGGTGCTCAGCCATGTTGCATAGCCACCTTCAGCTGCAAGT----------TGCAATTCTTGCCATTATTGGAAGCACTTGTT----------GTAGAGGGCAGTGCTTAGCCATA-TGTTCTACAGAGCAACAC s monDom4.chr4 49578752 146 - 430141050 ATCCTTGAGCCTCCCTCTCGGACACATGCTGCACCCGCACACAGCCGTAGTCCTTGGTACAGTGCTGATCCGGCCAGTAGCGAAAGCACTTGTTCTGGGGGTGGGAAGACGGGGATGCCCGGCCCTGCTGGGATACACGGCAAAAC a score=3593 s mm8.chr4 155009056 106 + 155029701 CCACCCGGCTGTCAAGTACAAACACAGTCCCTATTTTAAGGTTTTCAGACTTTATTTCATGGTATTTGAC-ATTGACACATACTGAGTTAGTAACAA-GATACCATGC s monDom4.chrUn 53087461 103 - 174229318 CCACCATGTTACAAGACACAAAAAC-----TTATTTTCAAGTTTTCAAACTTTATTTCATGGCGACTGACAAAAGACACACACAAAGTTAGTAATGGTTACATCATGC a score=9323 s mm8.chr4 155010146 360 + 155029701 TCTCTGCAGCACAGCTGCCCGGACGGAAAGGAGGCCAGGCCAGCAGTCCTTCTGGCCAACGTGCAGT------CAAGAAAATCATATA----AAAATGCAACAAGTTTACAAAAATAGAAAATAATTACA----------GGAGGGAAGGTGGCAGCTCTAGTGGCAGCTCAGAGAGTGGGGCAGGGTCTTAGCTCTGGTTTGGTGACAGCGTCCTCCAGCAGATGCAGCTGGCGATGGCCCACTACCACGTCCCGCAGACAGCCCACAAAACCCGTGCCATAGGCCTTGGGGAGAGCCTGCCCCACAGGAAGCTTCTGTAGGCCTCCTACAGGACGGAAACAGATTAGCAGGCAGTGATGCTGACACACGGGGCCCGCC s monDom4.chrUn 53089506 372 - 174229318 TCTCCCCAGAGCTGGGGTGAGGATGGAGGG------AGGTCTGCATTTCCTCCATCCCCCAAGAGGTGGGCAGAGGGGAAATTATATATAAAAAAAAGCCATGAGTTTACAAAAATAGAAAATAATTACAACGACTGGCAGGAGACAGGGCTGGAGATGGATGGGGGCATCACGGGGCTGAGCAGTGCCGTAGGGTGGGCTTATGTAAGGCGTCCTCAACCAGGTGCAGCTCCTTCTGGCCCACCACCACTCCCCGCAAGCAGCCCACAAAGCCTGTGCTGTAGGCCTTGGGTAGGCTGTGCGCCACAGTCAACTTCTCCAGGCCCCCTGGGAGA-GAAAATCGAGTAAGAGA-AGTAGGTCAGGCAAACCCTGCCTGTC a score=6756 s mm8.chr4 155010657 334 + 155029701 TATAGTT-TGAGAGCCTTGGGTATGCCCGCCCCTGGCCAGTTCCAAAC-----------ACTCACCAAGCCACAGGGCTCCATCTGTGTCCAATTGTGTGGCACCCAGCGGGGAAGAGCCAGTCACAGGGGCTTCATTGCCCACCTGAAGGGAACCTTCCCTGTGCTCCCTAGGAGATGTGTGAGA-CAAAGCTATCGAGAGCATCCTTCCTACCTCCTCTAAGACCTAGATAGCACATTTTCTCCATCATATGCCTTGTAGATACCACACCCTGAAAGTTACACTATATGTTATCCTGGCAGGCGGTGGCTGGCTGCTTCTCCTGTGTCTTTTTACTATTCCCTCT s monDom4.chrUn 53090946 333 - 174229318 TATTGTTGTTAGGGCATGAGAAATGCCTTTCCTTCCCCGCCTTCCACCCTGCAGCTGCAGCTCACCCAGCCATAGGGCTCCATCTGTGTCCAGCTGTGTGGCCCCCAGAGGGGAGGATCCTGTCACCGGGGCCTCATTGCCGACCTGGAGGGAGCCTTCTCTTTGTACCCTGGGTGGAGGCAGAGAGCAGGAAGGCTGAGTTATTGCTTCACACATGCAC--AGAGCTCCCAGGCACAT----GCCACAGTCTGCTTCCTCCAGGTAGCCCAGTGAGATTGCCACCCT--------CTGACAGGCAATAAGAGTCCTCTGCTTTGGTGGGTTCAATCTATCTCCTAT a score=15956 s mm8.chr4 155011055 608 + 155029701 TGTTGTTCTCAGTGGACTTCACTGACCTGTGAGCCCTGACTCGAAGCCAGCGGTTGGTGTTGACCTTCACAGTGGAGCGCAGCACAACTGGCTGGGAGCCTAGGTCATAGCTCAGTTGTAGGTGCCCATCCACAATGGCCAGAGCCATGTAGTCTGCACGTTCTCCAACCTTTCCAATCCACAGCACCAGCCCCTGCGTGGCCTCAGTGCGTAAGCTCAGCTCAAAGTGGTTGCTCTGCAGCGCTTTCTCACTAAAAAGTAAAAGGATGGGGTCAGGGGCTTCCAGGGTGGTAGGCAAGGGGTGGGATAAGTGTGGGTGCTGTTAGCGCT--ACTATCATAGAGACCAGAAGCTGGTGTTCAGACCCAGGCAACTGAGTGGGCAGGGCTA-ACACCAACAATGCAACA-----AAGGAGACACAGTAGACAAGGTCAACTAGACAAAGTTGATCAGAGAGATGGCAGACAAGAGGCAAGCACATGGCAATGTAATGTGCTGGGTCTCTCAAGTACTGCCATGTGCTTACCTGAAAAGGGCCCGGGAATCCAGAGTTTCGGGGCTTAGAAGCAGGAAGAGAG----GGAAGCAGTAAGCAGGAGGCAAGACAGGCTAAATG s monDom4.chrUn 53091994 557 - 174229318 TGTCCCTCTCCCCACCCCCTGCTGACCTGGACGCCTTGACCCGGAGCCAGCGATTGGTGTTAACAGGCACCGTAGAGTGCAGGACGACGGGCTGGGAGCCCAGGTCGTAGGTCATCTGCAGGCGGCCGTTGACGATGGCCAGCGCGATGTAATCGGCCCGCTCTGTGCCCTTGCCGCTCCACAGCACCAAGCCCTGCATGGCCTCTGTCCGCAGGCTCAGCTCGAAGTGGTTCTCCTGCAGGGCCTTCTCAC------------------------------------TGCGGGGCACAGGATGGGCT--GTCAGGGAGCAGCCGCCCCTCGGCCATGACCGAGGCCAGCC-CAGGCATGCACACACGGAGGTGGGGGAGGACAGACCCAGACACCGAGAGACCGAGAGATGGAGAGGGACGCACGAGACCAGG------AGACA--------CAGAGAGGC----------AGGCAGGCAGGGAGGAAGGGAGGCCCCAGGGGCCCCGGCACCCGGGCACACGCTCACCTGGGCAGGACCCCGGAGTCCATTGCATCAGGACTTAGAAGCAAGAAGAGAGGGAAGGAAGCAGTAAGCAGGGAGAGAGGCTGCTTGAGCG a score=5349 s mm8.chr4 155012292 114 + 155029701 AGCATGGACATGAGTGAGTGCCAAGGTATGA--CTAGAGCCAAGAGCCTACTTACGCTGGGATCTCATTGGTCAGCTCGCTTGTAAACAAAGAGACAGAGATAGTGAGAAGGAAGG s monDom4.chrUn 53093845 116 - 174229318 ATCAGGGACGATGATGGGTGTCCAATAAGGAGGATAGGGCTACTGTGCTACTTACGCTGGGATCTCATTGGTCAGTTCGCTTGGAAACAGAGAAACAAGGACAGTGAGAAGGCAGG a score=3186 s mm8.chr4 155012526 58 + 155029701 CGTTACCTCTCAGTCACAGCATTGAGGTACTCGATGTAGGTCCGCCCATCAAAGGCCA s monDom4.chrUn 53094214 58 - 174229318 CATTACCTGGTGGTCACTGCATTGTGATACTCGATGAATGTGCGTCCATCAAAGGCAA a score=13660 s mm8.chr4 155012587 914 + 155029701 TTTCTAGGTCCCCCACTGACTTCTCAACTATCCCTGGGAGACAGATGGGATGGAATGGCCTCAGGTGAGAT--CTCCAGGCCGCGTCAAGTCTCAGCCCTGGGCTGCCA------GTGCTCACCCTTCTCGCAGTGCAGCCCAGAGAAGCCCCCAGGACACAGGCACTCATAAGTGGCTTCCCTCGGGATACAGGAGCCCCCATTAAGGCAGGGGTTGTCCACGGCCTGGGTACAAGGGTGGCCTGCAAAAGGCGCTACATCTACTGCCCGCAACACATGCTCCTGAGTCAGCAGCTGATGGCCTCTTAGAGACACCTGAAGAAGAGAGGAGGGAGCACCTTAATGAGACAACCCTCACCGGGGACTTAAGCCCCTCATACAATAACCCT---------CTCCACCCCCCACCCCCCCGGAGAAACCTGGCTGGTGCCCATCTCCGTACCAGCTGGATGGCACCATCAAAGCCGGAGGCCACTGCAGCGCCCCGAGCCAGCTTGCTGAAGTCAGGAGCTCCCCCCACATAGAGGGGCTCCTTGAGGTTGAGCATGGTGTGCGGGACCTA---------------CAGGAGACACGGGGTAAAGGGT-------CCTGTATGATCCGCCCA---CTTGGCTGGAGTATG--------------------CCCAATTGCTTGATGCCCCACACCT-ACCCCAAA----------CTACCTAGGAGGCAGTATTAATCCCACGGAAATGGCAGATTGGGCCTTAGTGGGAAAGGGCTACTCTAGGAATGGCTACAAAAGATGGTGAGTTGAGTTGGGTAAGAGGTCAACAGTACCTTGCGGGATTTCTGACAT----CCGGAGAGCAGGTGGGGGGGTTGCAGAGCAAGAGCCAGAGAGCAGTGGGAGCAAAAAGGAGACAGACCGAGGCACAGGGCAGACAGAGAAAATAGTTCTGTGAGAGGTGGCTATCAGGGTCTGTGAAGCCCCCGGGG s monDom4.chrUn 53094563 915 - 174229318 ttcctaaatctaatcttgatctctctagctatggtagaagAAAGCCAGGATGGCATGGCTCCAGCTTGCCCTGCTTCTCTCCCAAACCAGCCT--GCCCCCCGCAACCAAGCCCTGGCCTCACCCTTCTCGCAGTGGACCCCCGAGAAGCCCCCCAGGCACAGACACTCATAGGTATCCTGCTGGGGAGAGCAGGAGCCCCCATTGAGACAGGGCTGGCCCGAGGCCTGGGTACAGGGGTGGTCAGGGAAGGAGGAGATCTCAACAGCATCACGGACATTCTCTCTTGTCAGCAGCTGGCGGCCCTTCAGGGAGACCTGGAGGCAGGGGAAGGAAGGGACG----GGTGTGTCCACTATCGGGGGGCGATGCCCCATCTCTGGCTTCCCTAGAAGAGGCTTCCACCCCACTTCTCCA----------TCACTAGGACAGCTCT---TACCAACTGGATGGCCCCGTCAAAGCCTCCAGAGACAGCGGCCGCACGGGCCAGTTTGCTGAAGTCAGGAGCACCCCCAACATATAGCGGCTCCTTCAAGTTGAGGACAGTGTGTGGCATCTGGGCAAGGGGGAAAACCAGGAGAATCCGAGTCACAAGTGGGGAACCCAGACTTTACCTCACATGCCTTCCCTTGAGTCTGAGAGTTTAAGACACGACTTCCCCAACCACTCCCCTCCCCATTCCTGATCCCAGAGACAATGGCTCGACCCAGGATCCATTA--GAACACACAGAAATGGTGGAC-------------GATGAGATCTCACTAG--------ATGCAGGACAGGAAGTTGGGAATGGGAGGGGA--GGCAGT---------TACTCCAGACACTGGATCTGAGTGAAGATGGAGGT--------------------GAGCAATGGGAAACAACAAGGGACAGGAGGGAAGGCAAGACA-ACAAACAATTCAATTCCTAGAGTGCagat--ttagagctggaagagctctcagag a score=17733 s mm8.chr4 155013524 708 + 155029701 CAGGGTGTGGGAGG----------TCTAGACCTTCCTCATGTCCTGGATACTCACCGGAGATTCCCCTAGCACACGGGGCCCATCACCCACTTGAAGGGCACCCTTGCGGCCATTTCGTTCCAGGAATACCCTAACCCAGGTGCCCAGGGCTATGGGCTCTTTGCTCCTGCAAAAAGGTATGAGTAGACTTTGGTCTCTGCTCACCCAGAGCCCAAGTGGCACTGGCATAAACCCCTGGTATAGATACTGTCATCCCAACCTCAGGCAGTCATTCAGGTCCTCCTTGTGATCTGTGCAGAACGTCTTGAGCCAACCCTGGTTAATGCCTAGTCTCGATCCCATATGCCCACCTGATGATTGCAGCCCCCTTGCCAAGGTCATAGCGGAACTCTAGGTGCCGGTTATGCAGGGCCAGGGATACAAAGTCCCCCTTGCCATCCGTCTTCTGCCCATTGTAGAGGAGTAAGCCACTGGGCCCACGAGCCAAGAACACCATCTCCAGCGCCATCTTCTCCCTGGGGTCAT-GTGGAGTTGTGGGAGTGTGTCACCG-----------TCTCCTCGTCAGGTT-------------------------------------------------AGCTCCCTTCCCTTAGCCCT----------------------------------------CCTTCCCCACTAACCCTAGGTCTCTCTCGAAGGTGTGCAAGCCTTTCAGTTCCAGGTAGGAGAAGCCATTAAAGTCAGCCAGGAAGGGCCGGGAGCCAGCATTCTCCAGGACTATGGAGGGCCAAAGAGATG s monDom4.chrUn 53096612 773 - 174229318 CAGGGTCAGGGTGGAGTCCCCCATTCTAAGACTCCCTCCAGTTC-----ACTCACCGGGGACTCTCCCAGCACTCGGTCCCCATCATTGACCCTCATGGCCCCCTTCCTCCCATTCCGCTCCAAAGACACTCGGGTCCACTTGTTCAGGGCTATGGGCTCCTTGCTCCTG---GTGGGTA---GAAGACAGGGCAGTGTGAGAACACACAGCCCAGCTCAGAGCTCCCTCAGCCC-------------TGTCCAGCTGGCCCCAGGCCACAGCTTAGTCTCCCCT---GCCTGGCCCAG--------GAGCCA-----GGTGCAATCCTAGCCCTAATC------AGTCACCTGATGACCGCAGCTCCCTTGCCCAGGTCATAGCGATATTCCAGATGCCCACCGTGCAGGGCCAGGGACACGAAGTCACCTTTGCCATCTGTCTTCTGCCCGTTGTAGAAGAGGCCGCCTCTAGGACTCTGGGCCAGGAACACCACTTCCATGGCCATCTTCTCCCTGTGGTGGTCGGCAAGTCTTCCCAGTCATTCCCCGTAACAACAGCATCTTCCCGTCGGTCTCAGCTGGCCTGTAGGGAAAGCCGAGATCTGGACCAAAGGCTCCCTCCCCACCCCCCTTACCTTGGCCTTCGGTCCCCCCCCCACTCCTCCCTAGAGCTGACTCCCAGTCCCAGCCCCACTCACCCCCGAACATCCCCAAAGGTATGGAGGCCTTTCAGCTCCAGGTAGGAGAAGCCATTGAAGTTGGGAAGGAAGGGCCTCGATGGGTCTTGCTCTGTGACTGAGGAAGGAGGGATAGAGG a score=10985 s mm8.chr4 155014291 429 + 155029701 CCCTAACTGGATCTTATACCAGATCCCAAATCAACCTAAGAATTTGACCCTA-----ATCCGTCATCCATCCCGGCAGTTCCTTG-----ACCTTACCTGTCTCACAGAAGGAACCACTGCGTCCCAGGGGGCACGCACACTTGGCCCCACCCCTGGAAAGCACATGGCAGGGGGCTGACCCGTGGCAGGGGTTCGGTTGGCAGGGGTTCTTTTCATCTGCACAAGTTGGGCCTGAGGGGAGATTGGATA-GCGGTTGCAGGA------AACACG-----------TCTCTTCCCACAACACC-----------TAGATTCCTTCCC------------------GGG-------CACCAGGCTAGT------------TCTCACCAAAGCGGCCAGGTGGGCACTGACAGAGGAACACGCCAGCCTCCAGGGCCTGGCAGAGGGCCCCGCCATGGCAGGGGTTAGGTGAGCAGGGATGGTCTCCGCATTCCCCCACACCAGAGC s monDom4.chrUn 53098207 502 - 174229318 CCCCAACTGAATCTGC--CCAGGACCCAGAATTCCTAGTGGTTGTGCCCCTATCTCTGCCCCTTATTCCCCTTCCCCTTCCCACGCACCAGTCTTACCGGTCTGACAGAACTGGCCCCCACGCCCCATGGGGCATTCACACTTGGCACCCCCCTCAGGCAGCACTCGGCAGGTAGCTGCCCCTTGGCAAGGGTTAGGCTGGCAGGGATTCCTCTCATCAGCACATGTGGGGCCTGGGGATGGGTGGGTCATGAGATTCAAGGACTAGTCAACAAGAGCTCCTGAGCTCTATTCCAACACCCCCATCCCTGGTCATACCTTCCTGCCCTTCCCCACCCTGCCCCATGGGTGACCTCCGCCCCACTCATCCGCACTGCCAGCCTCACCTTCTCGGCCCTTTGGACACTGACAGTGGAACATATCAGCCTCTCGGGCCTGGCAGGTGGCTCCATGGTGGCAGGGGTTGGGCAGACAGGGGTTGTTCCCAAA-AAGCCCACCCCTGAGC a score=6626 s mm8.chr4 155017308 271 + 155029701 CTGTCCTCAAGCCCTTTGCCTGCTGTTCACTCACCTGGACAGTTGGAGCCTTCTGAGTCCAGTGAGGGTGTCTTGCCATCTGAGCAGCAGCCCAAAGGTGAGTTGTAACAGGAAGCCCTCTCGATGGGTGGCCCGTGGGTCACCACAACGCTGCCCACCGGGGGCTCAAGTCCT------------------GGGGAAACGCAGTC-------TAAGCCCAGCCCCGGGGAGGAGCCACTCTTGGGCTCTGCCCCCACATCACCCTCAAACCTGCCCACACATCCCTGAGGCCCTG s monDom4.chrUn 53101196 289 - 174229318 CTATCCTCCGGGGCCCT--CGGAGGCCCACCTACCTGGGCAGTTGGTGCCCTCAGCGTCCAGGGCAGGCGTCTCGCCATCCGAGCAGCAGCCCAGCGGCAAGTTGTAGCAGGAAGCCCTCTCGATGGTGGCAGTAGGGGCAGCCACACCCCCTTCTTCCAAAAGCTCCGTTCCTAGAAGCAGATGGGATTTAAGGGGAACAGAGCTGAGTGGGCAACCCCAGCACGGGGCCGGAG-AACCCTTGAGGGGCACCCAGGCCAGGGCCACGACCCT---CACTCAT-CCTGAGGGCAAG a score=4709 s mm8.chr4 155017579 229 + 155029701 CTCACCCCCAGACCCGCCCCCACTGGCCTCCTCATCGCCACTGAGCTCCTCATCGCCACTGCCGTTG---GTGCTGCCAGATTCCCTGAAGATCGCTGTAGCAAGACTGGCCACATCAGAGGGTGTGGCTG---------------CAGTGCTCCTGGGGGTGCCGACTACGGTCTGAGGTGATGTGG--------GTAAT----------------GGGGTGGGCCAATCATGGGCAGTAGT----GCTGGGAGACAGAGGAAGGCTGCTGTGG s monDom4.chrUn 53101769 272 - 174229318 CTCACCTGCCGACCCTGCCCCGCTGACCTCCAGATCACCACTGAGCTCCTCGTCCCCGCTGTTGTCATCCGCACTGCCCGACTCAGAGTAG---GCCAGAGTGGGGCTGGCAGCAGAGGCGACCGGGGCCGTCAGGATAGGTCGCACCGTGCTCCTGTGGACCCCGGCCGTGGTCCACGTTGGCATGGAAGGCCACGTGGTTGTCCTGTGCAGACCCGGAGTGGTCCGGACAGGAACGGCGGGCCGAGCTGTGGTCCGGCGGACACCTGCTGTGG a score=5286 s mm8.chr4 155017970 127 + 155029701 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155029701 CTCAAATACTCACTGGGACAGCCAGCCAAGCCCACACCCTGGGCAGCAGTGACATTGTCCTGGCAGCAGCCATAGGGGGTTTGGGCACAGTGTGGGGAGGCCATAGGTAGCAGTGGAGCCAAGGTAGG---GCCTGAG s monDom4.chrUn 53107215 132 - 174229318 CCCACACACTCACTTGGACAGCCGGCCAGGCCAACACCCTGCGCCCTGGTGACATTGTCCAGACAGCAGCCATAGGGGGTCTGGGAGCAGTGCAA------CACCGGTGGCGGCGGGACCATTGTCGGAGTGCCTGAG a score=10629 s mm8.chr4 155020011 380 + 155029701 CACTCACCCCGGCAGGCTCCCTGAGCAGCGACGTACAGCTCTTGCCGCGCTTCACATCTGGCCTTCTTCAGATGGCACTCCGTGCTATAGGTGACTCCATCTGAGCCACACACCTGAGG---------------------AGTGGGGTCAACCTCAGCAA-----CCTTG--GCCCTCAGCGCACCCACCCTGGAACCATGGGAA----AGTTGGGGTACTCACTGGGCTTTTAAGGACACTCTGGCAACTAAAGTCACAGACACACGGCCCGTCTTCTGAGTCCTCATCCCAGACACCACCATGCTGCCGACACAGCTCCTGCTCACACGCATTGTCTTCCCCAGACCCAGAGCCCCCTGAGCCACACTCAGC---------TGCAGGAAAACA--GAGCGGTCACCATGAGGTCTCCTTCA s monDom4.chrUn 53107452 423 - 174229318 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