##maf version=1 a score=4809 s mm7.chrY 59690 345 + 15523453 CCTTGATATCAAATACAATAAACACTTATTTACAGGAAAACAATCTT-ATTTTATTTCTGT-ATGGTACTCTCAAGTATACATTAACAATATTACTTC--------------TTTTAAGCATTTTGTTG------------TATTTAATAATATGTACAAAGAAAAG-----ATGGAATAGTTAACAGGCAATTTC-----------AAATTCAT------TTCCTTTAAGACTTTGTATTTTTTATAAAGTTTTGGCTAGAACAAGTCTTC-TAGCTTTGGT------AATCATTAAAACAAATTTAAATAATACTGTTATAGTAAATATATAACACTTTACCAGTAAATATATTTACTTTACC-----AAACTTTTAATTACTTTTCA-AAAATCTAATATACTAA s galGal2.chr1 111545340 401 + 188239860 CCCTGCCATCAAACAGACCGAACATTCGTTAACAGGAAAATACTTTGAATTTTATTTTTTTCACGTTATTATCAAGTACACAGTTACAATAATGTCACACATCCCTATATGATTCTATGTACTTTGTTTTTTTCTTTTGTCTTTTTTACAAAGTGTACAGAGGGAAGGACGTATACAATATTTAACAGGGTATTTTTTACAGAACAATAATTTATATTATGTCCTTGTAAAAATCTGTACCTTTT-TAAACATTAAACTGAAACATCCATTCATAGCATTTGCTAAGCAAATTATTTAA--GAATTAAAACTAACCTG---TAACTAATGT-CAGTACATTAACAATAACTATATTTTCATTTTCTCTTTATACAGACAAATACATTTTACAAAATCCACCTGACCAA a score=661 s mm7.chrY 60058 102 + 15523453 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galGal2.chr12 17684192 145 - 19821895 TGGTGGTGCCCGAGCAGGTGCGGAGGAGCCTG---CAGGAGCGGCCGCGGGACTGGGGGGACTGCGTGCGCTGGGCCCGCCGGCACTGGCAGCTCCGCTACCACAACAGCATCGCGCAGCTGCTGCACGACGTGCCGCCCTCGCATGT a score=3632 s mm7.chrY 168772 264 + 15523453 AGCTCTGGAGCACTTTTTTGGTCAGGACCAAAACGCTGTCCACATCCTCTCACCTTTGACATAAACAATGTAAGTGTCCT------TGGGATCTCCCAGGTTGGTGTGTGGGGAGTGGGTCT--------------CTCTACTCTTAACCTG----------------TGGTTGTTAAGCTGACTTTCCTTTGCCATGCCATTCTTTCAGCCCCTGCATCTGGATTATGTGATGGCTGCTGCCAACCTGTTTGCTCAGACATACGGACTAGGAGGGTCCCAGGACTGTGCTGTGGTGGCC s galGal2.chr12 17684416 286 - 19821895 AGCCCCGGTGTGCCCTTCTGGTCGGGGGACAGGAGGTGTCCCCACCCACTGACGTTCGACATCAGCAATGTGAGTGCATGGAGATGTGGGGCCGGGGAGAGCTGCTGGTGGGCAGTGGGCACGGCAGCGGGCAGAGCTGCTCACGCAACCTGAACGGGCTCCGCAGCATGCAGGATGAGCGGCGCCTCCATCCCCCTCTCTCTACTGCAGGACACCCACCTGGCATACGTGGAGGCTGCTGCCCACCTTCTGGCTCACACCTACAGGCT--------------GCCATCCTGCGGTGACC a score=6238 s mm7.chrY 178416 405 + 15523453 GACAGCAACTTTCACATGGATTTCATTGTGGCAGCATCCAACCTCCGAGCAGAAAACTATGGCATTTCCCCAGCAGACCGGCATAAGGTAATAGGAGTCTGTGATGTACGACTGACCCTTGCCCAAACTGATTTTCCTTCATTTGGGCCTTCTGTAGACCCCTACTTCCTCCTATACAGTAATCCCTGGTGGTCACTGTCTTACAGAGCAAACTGATTGCAGGCAAGATCATCCCAGCCATTGCAACCACCACATCTGCTATAGTTGGCCTTGTGTGTCTGGAGCTGTACAAGGTGGTTCAGGGCCACCAACAACTGGAGTCTTATAAAAACAGTTTTATCAACTTGGCTCTGCCTTTGT-TTAGCTTTTCTGCACCTCTGGCTCCAGAGTGTCATCAGGTATGGG s galGal2.chr12 17685092 344 - 19821895 GACGATGACCTCCACTTGAGCTTCATCACAGCTGCATCCAATCTGCGCGCAGAGAACTACAGCATCCCGCCTGCCGACCGGCTGACGGTGAGTGCCGTCCCCGAGGGTC------CCCCTCCCCACA------------------GGGCGGCTGGTGATGCCCCTTCTGTCCT------------------------------CAGAGCCAGCGCATCGCTGGGCGCATTGTGCCCGCCATCATCACCACCACAGCGGCCGTGGCTGCCCTGGCGTGCCTGGAGGTTTACAAGCTGGTGTGGAGATGCCGAGACCTCCGGTGCTACCGCAACAG------CAACTTGTTCCTGTCTGAGTGCCTGTTGTTCCGCA--TCCAGCCCCTGCCAGCCCCCACGTACCGG a score=1410 s mm7.chrY 179364 111 + 15523453 AGTACTATGATCAAGAGTGGACACTGTGGGATCGCTTTGATGTGCAAGGACTGCAACCTAGCGGTGAGGAGATGACCTTGAAGCAGTTTCTAGACTACTTTAAGGTAGGGC s galGal2.chr12 17686568 111 - 19821895 AGTACCGGGGGAAGGAGTGGAGCTGCTGGGACCGGCTGGAGGTGCGTGCTATTGGGGAGGACGGGCAGGCGATGACGGTGCGGGAGCTGCTGGCCTGGCTGCAGGAGGAGC a score=7267 s mm7.chrY 210049 188 + 15523453 AGAAGCTGTGTGTTTTCAGCACCTTCATAAGTGATGGCTGCCATCTGGA------CGATTATTGTTGGTGATTGGAGCTTGTGGAATAAGACATGCTTGCTCATAGTCCTCAGCAAGGACCAGTTTCCAGAAGTTTATGTACCCACAGTGTTTGAAAACTATGT-GCAGATATTGAAGTGGATGGAAAGCAGGTA s galGal2.chr12 17292068 192 - 19821895 AGGATTAATGAGTTGTCCTCTTGTGTTTCAGCTATGGCAGCCATTCGAAAAAAGCTGGTCATAGTGGGCGAC-GGTGCCTGCGGGA--AGACCTGTCTGCTGATTGTGTTTAGCAAAGACCAGTTCCCTGAAGTCTACGTTCCCACCGTCTTTGAAAATTATGTAGCAGATATTGAAGTGGATGGAAAGCAGGTA a score=7633 s mm7.chrY 210237 116 + 15523453 GAGTTGGCTTTATGGAACACAGCTGGACAGGGAGATTATGACTGCCTGAGGCCTCTCTCCTACCCAGACACTGATGTTATACTGATGTGTTTTTCCATTGACAGCACTGATAGTTT s galGal2.chr12 17294804 116 - 19821895 GAGTTGGCTTTGTGGGATACAGCAGGACAGGAAGACTACGATCGACTTAGACCGCTTTCTTATCCAGATACTGATGTTATACTTATGTGTTTTTCAATTGATAGTCCTGATAGTTT a score=7504 s mm7.chrY 210353 129 + 15523453 AGAAAACATCCCAGAAAAATGGACTCCAGAAGTCAAACATTTCTGTCCAAATGTTACCATCATCCTAATTGTGAACAGGAAGGATCTTCAGAATGAAGAGCACA-AAGATGGGAGTTAGCCAAAATAAAG s galGal2.chr12 17296442 130 - 19821895 AGAAAACATCCCAGAGAAGTGGACCCCGGAAGTGAAGCATTTCTGTCCCAACGTGCCTATCATCTTGGTAGGAAACAAGAAGGACCTGAGGAATGACGAGCACACAAGACGAGAGCTGGCCAAAATGAAG a score=15288 s mm7.chrY 210483 425 + 15523453 AGGAGCTGGTAAAACCTGACAAAGGCAGAGATATGGCAAACAGGATTGGCGTTTTTGAGTACATGGTGTGTTCAGCAAGAACACCAGTGATGGAAGGAGAGGGGTTTCACAGATAGCCTCAAGAGCTCCTCTGCAAGCTAGACGTGAGAAGAACAAGTCTGGGTGCCTCATATTCTGAAGCCTTGT----GAAGCATAGCC--------TCTTGCAGTTAA-----TTGCAAGTGCTGGTTATTAATCTTGGTGTCTGCTTACTGGTCTTTTCATTAATCTATAATTTACCTAAGA--TTGCAAATCAGAAGTCATCTTACTACCAGTATTTACAGGCCAAGCATGATTAT--TAATGAT----GCCCAACCTCTCTGACCAGACAGAGTCCTTC-CGACACTGCTCTAACT-GCCCTCACTGTACTC-CACCTGACACTAGCCGCTAATTTA s galGal2.chr12 17297094 449 - 19821895 AGGAGCCTGTCAAACCTGAGGAAGGAAGAGATATGGCAAACCGCATCGGTGCATTTGGATATATGGAGTGTTCGGCAA--AGACCAAAGACGGTGTGAGGGAGGTTTTTGAAATGGCCACTAGAGCTGCTTTGCAAGCCCGGCGTGGCAAGAAAAAGTCCGGGTGCCTTCTCTTATAAAGCGTGGCCAGAGGAAGATGGCCAAGCAGCACCCTGCACTTGAGTAATTTTGAAGTGCTGTTTATTAATCTTAGTGTATGATTACTGGCCTTTTTCATTATCTATAATTTACTTAAGAGATTAAAAATCG--AGTCATCTTGCTACCAGTATTTAGAAGCCAACCATGATTTTTATAACAATCTGCATCAAATTCATCTGTGCACCCAAGGTTAACCTCGACATTCCTCTAACCAACCTTTTCTGCACTCACAGGATATGCCAGGCGCTAATTGA a score=8812 s mm7.chrY 211623 890 + 15523453 AAAGAATTTCTTAACTTCTTGCTTCTTTCTAGAAAGAGAAGCAGTTGGTAACTTTTGTAAACTGGGCTATAACTACTTAATAATAAACATATCCTGCCTATTTTCTGTCAGCTGCAAGAATTCTTGTGAGTCACTACTTCAAAGCTTTACTTCTG----AACAGACT------CCACCAGCAGAGCTC--TGGGATGGGCATCCAGTTTTTTGCAAACTTGCTCAGCCAGAAATGCCCAAGACCACTGCAGCTGTAGCAGAGTTACACAGTTCTGTAGTCTCATGTTATTTACCTTATAGTCACTGTGTAATT-GTGCCACTT--AATGTATGTTACCAAAAAATAAGTATATCTGCCCCAGACTAGATGCAGTATATTTT-TATAATTAGATTTCCTAATACTGATATTTGTGATTCCCACAGAAACTGTATTGCTGCTGCTGCTGCTTCTTCTGttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttcctctcttTTTTTAAAGCACATTTGGAAAA-AAAGTCAGATGGAAAGTTCAGTTTTAAAATTCCCAATTTGTCACTTTCTCTGATAAAATATGGCCATACCTCCCCTATTC---TGCCCTATATATCATTCCAGTACTCCTTTCCA-GAC------TAGGCTAAATAAACAGGAATTTGGTTTCACCCCTGAAGCATTTATACTTTGGAGGTGGCATAGCCCTTCTAAGGTGGATTTCAGGATCTAGCTCTAAGTCACAGTGCT--------------------------------CCTTTCTATATCCAAGTTGCCTCCCAGAGGAGCCACCAGTT------CTTATGGGTTGCTTTGGGTGGGGCTAGAGGGACCTCTCCTCTCCAGCTGACTATACTTCTTTCTGAACCAGTTAATTTCTC---CAACTAATAGTATATAGGCAGTTTTCTAA s galGal2.chr12 17297543 821 - 19821895 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15523453 ATATAACCTGGCAACAACCCTGATATGA--GTTATACAGTGGTTAAGGAAGTGATA-TTTGAAGGACATGCTAT-----GTTTCCTGCATTAAGG--GTCACTGGAGGGT----------TCAGATGTTTCCAGTGTGTTC-------ACTGTTTACGTATATATT-------------TTCTTGTCCATTT---AGATTGTGATGGAGGAAGGTGGATATGAAGCAATCTGCAAGGACCGTCGGTGGGCCCGTGTTGCCCAACGCCTTAATTACCCATCAGGGAAAAACATTGGTTCCCTGCTTCGGTCCCACTACGAACGGATCATTTACCCTTATGAAATATTTCAGTCTGGAGCTAATCTTGTGGTGAG s galGal2.chr32 487583 373 - 1018878 ATGTGTCCCAGTTACAGCTTCTAAATAACCTTTATGTCTTCTGTAAAGAAATGGTGGTTTTAGAGTCATGGAATCACGAGTTTCCTCTGTTAAAGCAGTAATTGCACTGTCTCTGTTTCCTTTGACACTCGCAGCGCATTCCTTCAATGCTGATCACCTCAGTGTTAAACCTGGAGCCGTTCTGTTCTCTCTTCCAGCTGGTTGCAGAGGAAGGAGGGTTTGATGTCGTTTGCAAGGAGAGGAAATGGACCAAAATCGCCACGAGGATGGGCTTTGCTCCTGGCAAGGCTGTGGGTTCGCACATCCGCGCGCATTACGAGCGAATTCTCTATCCTTACAACTTGTTCCAGTCCGGAGCGAGCCTGCTGGTAAG a score=2432 s mm7.chrY 236745 318 + 15523453 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AATACTTGACATAATTTAATTGTACCTACCTTAGAATGGTGATCACTACCCCTGTTTGGATGATTTGGAGGGCCTTGTAGCTGTTGGTCGGGATTTACCTGTGGAGCTAGAGGAATTGAGACAGCTGGAGAATCAGGTACTAACAGCACATTCCTGGAAAGAGAAAGCTTCTAAGACTTTTCTTAAGAAGAATTCTTGCTACACATTGTTGGAGGTGAG s galGal2.chr1 131336564 219 - 188239860 AATCTTTGACTCAGGGAATTTTCTCTTACCCCAGAATGGGAACAACTATGCCTACCTGGAGCAACTGGAGAACTTATCTGCCAAAGGCCGCCCAATACCAGTGCGCCTTGATGCCTTGCCACAGCTGGAGTCACAGGTAGCTGCTGCACGGGCTTGGAGGGAGCGCACAGGAAGGACCTTCCTGAAGAAGAACTCAAGCTACAGTCTGTTACAGGTAAG a score=8328 s mm7.chrY 277646 550 + 15523453 TTTCTCTGTCCTGGGTTCAATAGATCATGGCCTTTAAGGAAGGGGAAGAGAAAGAAAAGGAAGGTATCTTGCACTTACGTCACATCAACTCAGCCAAGCCCAGTCCAATGTCCTCATCGATGAATGCCTCTGCAACCTCCATCTGTATATGTGG-GCAGGTCTGTGCAGGAGTGGAATC--TCTGCAGTGTGATCTTTGTCATGACTGGTTCCATGGACAATGTGTGACTGTACCC----CACCTACTCAGCTCAGTAAGGGCCAGTCATACCTCATCTCAACTGCTAGCTTGGTGGGAATGGGACACCAAGTTCCTGTGCCCACTGTGCATGCGATCAAGGCGTCCACGCCTGGAGACCATCTTGTCATTGCTGGTAGGACTACAGAGACTGTCTGTAAGGCTACCTGAGGGTGAGGCCCTACAGTGCCTCACAGAGAGAGCCATTGGTTGGCAAGGCCGTGCCAGGCAGGCTCTAGCTTCTGAGGATGTGACTGCTTTGTTGAAACAGCTGGAAAAATCCCGCCAACAACTACAGGATGAATTGAGACATAAGAA s galGal2.chr1 131338299 513 - 188239860 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TTAGGTTGGTCAGGAAATTGAGGTCCGACCTGGTATCGTGTCCAAGGACAGCGAAGGAAAACTCATGTGCAAGCCAATCTTTTCCAAAATTGTGTCACTCTTTGCTGAGCACAACGATTTACAATACGCTGCTCCAGGAGGTCTTATAGGTAAGGATGTTCTTTTTATGAAGAGATTTATTACCTAATGCTTATTGAAAACCCTTGTTTGTTACGCTAAAAGTCATTGCTAAGTGAAACCAAAAAGCC---------TATAAGCA---------ATTCAGTGTGTATTTAGAATGAGACAGATAAATGAAATGT--ATGGAAAACCAGTATTTATGAAATAATTTGTCTGAATGTCAGTA a score=11940 s mm7.chrY 356404 270 + 15523453 TTATGAATACCTACATTTTATT--AGGAGTTGGAACAAAAATTGACCCAACGTTATGCCGAGCAGATAGAATGGTTGGGCAGGTCCTTGGTGCTGTTGGAGCATTACCTGAGATATTCACAGAGTTAGAAATTTCCTACTTCCTACTGAGACGGCTCCTAGGTGTACGTACAGAAGGAGACAAGAAAGCAGCAAAAGTGAGTTCATTTTATAGTAACTGTTTCAAAGCAATGAAATATTTTGTTTAGTGTTTCAATCTT-TTTTAGTTAAAAT s galGal2.chr1 76652537 267 - 188239860 TTGTGACGTTCCTCATTATGTTGTAGGTGTTGGAACTAAGATTGACCCAACTTTGTGCCGGGCTGACCGAATGGTAGGGCAAGTTCTTGGTGCGGTTGGAGCATTGCCTGAAATATTCACAGAGCTAGAAATTTCCTATTTCTTGCTGAGACGACTGCTAGGTGTGCGCACTGAAGGAGACAAGAAAGCTGCAAAGGTCTGTACTCTTGTTTATTTTTTTTT------AATGAATTTGAGTATCACGGGCTTTTCTCTGATTTCTGTTAAGAT a 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galGal2.chr1 105734805 232 + 188239860 CCCAGAAGTTTCACATGCAAAACTGTCAAGATCAGACAAATAAGACTGGAAAAAACTTACACTTTCAATATGTGGAGGACAATTGCTGCCTGTTGCTTCAACAGGAATATCATCATATTTCTCAAAGTTAATGCCAGTATTGCTTCCTGAAAAAAGCTCTCTGAAAGTAGAAAAAGA-AGTGTTTTATTTATTAGATGAATTGATT----AGCACTATCACACTGTGTTGTGTAGAT a score=7529 s mm7.chrY 615859 169 + 15523453 ACTTACTGCTCTAAGCGTTCACTTGGTGGAAGTGGTTTTGACCAGTCATCTTCATCTGATCTGTCACTCCAACGACTATGACCACTCCGTTCAAATTTGCCAAATCCAGTTCGGTCACGACCACCAATACCATCATAGTCATTTCGACCATGATCATCGAACCTGAACA s galGal2.chr1 105735042 154 + 188239860 ACTTACTGTTCCAGGCGTTCACTTGGGGGAAGAGGCTTTGACCAGTCATCTTCATCAGACTTGTCACACCAACGGCTATTTCCACCACGGTCAAATCTACCAAAGCCACTCC---------------TATCATAGTCGCTACCTCTTCCACGCTCTTCATACCTAAATA a score=2318 s mm7.chrY 619286 380 + 15523453 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TCAGGCATAATGCGAAGGTCACCCTCTTTATAATCGTCTAAGAGTTGGTACATGTACAAGACAGGATCCTTCTCATAGGTAATATAAAACCATGTGTTCATAATAGGAGCTCGAGCCAAGACCATCCCCCTCCATTCATCTTTTGAGCCATCTTCTGTCTCAAACATATGTTCCACAGCTTTGCCAATCATTGTGTCTGCCAGGTGGGCATCACTAATTCGAGATGAAGCTGC a score=7838 s mm7.chrY 1491076 533 + 15523453 ATGAAAGTCTTCTGTTTCT-----GATTACTAACATCCTTGGTGGTTATTTTTCCCTTTCCAATCTTCCCTTGGTTATATTT---ATCCTGTT---CTTGGTATCAGAAAACTTGCCAGACTATTTGATGCAGCCAACTGGATAGCACAAAAATATTCACTTTATGAAAATCCACAGTTAGAGGAGGAC-CATTTTTATTCA---------------AACAAAGCTGGAATTTGACAGGGTTAAATGCCTTGTA-----TTGAAGCCAATGGCAATCATGAATTACGGATTATTTGCAA-AGTGTGAGGAAAACTTAGCCCTTGGGCCTGCTTACAAAGTTGAGATAAACTTAAAAACAAACCTGGTATTTAACTGTCATATTTTAAAAGTCTTTAAAATTT-------GCAGCATTTCTGGTTACAAAGAATTTCGTAATTAAA-TGCAGTAAAACAGGATTAAATAGATGAGTAATTTTACTTTTGAAATATGGGTAGGCAGAATACTGGATACAGGTTAGTATGAAATTTACTTATAAATTAGAGGGCAGTTTAATTGTTTATGACACATA s galGal2.chr15 8258403 557 - 12438626 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