##maf version=1
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s galGal2.chr6      90378 267 + 33893787 CTGCTGGA---TGGGCTTTGTAAGTGTTGTAGGGCTAATCCCTGTGGTTCCTTGATTATGAGCATGTGCAGA--GCAGCCGAAGGTACAGTTGCGCATGTAGAGCTAACACACACACAGATTTGCCTTGCAATGCCATGTTTGTGCATGTGTTTCTACAACTGAGAAGGAAACAGGGAGCCTGCCTGCCTTTCTGACTTGTCTGATGTTTTCTTGTTTCTGTTTCAGCATTCAGGATAAATCCTTCAACACCACAGCTTTAGCAGAGTAAGT 

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s galGal2.chr6      93169 274 + 33893787 TCTTGTGTGAGTGAGTTTTGTCAGT------TAATATTTATCCTTGCTGAGAGAAAAAATTCTATTCACCCTC--------TCAGATTCGCTGCTTCTGAACTTCCTCACAATCTTTTTCATTGCATGATGGCCACTGTCTTCCCTGATTCATTAGTGCTAGTCTTTTCTATCTACTGGTATCTTGTTAGTCAAATACATTTCGTCATGCTCAGTTGGCGTATTTGTAACTTGCCTTCATTTATGACTATATTCAGTTAATA-----GATGCTCACTTAGGCTTTCTGCTTCT 

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s galGal2.chr6      95614 163 + 33893787 TTCTGCAGTAGCAGAAATTATTTATCAGCAATTATTTTGTATCCATTTCCAAGGTGTGATGAGGACTCAGACTCTGTTTGTGGAGCTCAAGCAGCCAGTTCCGGCCCCAGGTAT---TCTACTGCAAATTTTGTCTGAAATACACTGGCAACAAGTAAAACTGCCA 

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s galGal2.chr6      97437 207 + 33893787 TTTTAATTCTCTTACAGAGATGATGATAACAAAGAAAATTATCCAGACAATACAGCTATCTTAGAAGAAAGGTGGCTGCCTTTGCAAGACACTCAGCAGCACAAGGAGCAGGCT------------------TTGAAGCCTGACATGGGCAACTTAAAGCTAAGAAAGCCTAAGCCTGTCTCAAAGTTAGAAAATGGAAAAGGCCATGAGGAAAGTCAGGTAAAG 

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s galGal2.chr3     57804245 1020 + 108638738 AGATTTAGGAACATGGAAACTTTCTTCTTTTTCTGTGATTTCTACATCTTTGCCATAATCAGTGATTTGCCTGCCTAT------CTGGGTCTGGGCTACTACTGAAGGGTTATAAA---ACAGCTCTTGTGGATGCA---------------GAAGGTGAGATTGTTAAACTCCAACTTCTTTCAGGGATTCAGGAAAGAAAGTTGATTGGATGGAGAGCTAAAAGCATGCATGAAATTTCTTCTTTTCTTGTTCTATCAACACAGGCCTCCTCTGGTCAGCAGAGGTCTGGATGCTGTCAGCCTTCCCAGTGCTGTCTGCACTGAACAAGTATGGAAGATGCTTCTGCCATGAAGTC--GTTCATCTTGCATACAAACTCTGCTGATGA-------------ACAGGG-------------CCTTCTGTGTGGCCACAATGTGACCAAGCAAATTTCTGTT---AGTGGGTAGAGATTATTCTAGTGGCTTTGGCTT-CTCAAATTGAAAGCAACTTGT-TTGAGCAGCAATCTGTTTATTTAATCA-TTTGCCGTACTGTATGCACAGCTATCAGGTGACAAAAATCCACCTTACTCTGTAAGATGAAACTAACATTTTGTAAATAATTTTTTCTTATCTTGCTCCATCTTTGAGGAATT----AAATCCCCCGATATCAGTTCTTTTTCTCTCAAGGTTCCTCAGATGAAA-ACATGCTGCAGCTCTACAGTTTTCAAGTTTGTGCTTGTCTATCATTTATATTGTTTTTGTTTCAAGGCACCAAGTCAAACTCTGTCCTCGCTTACACTCATGTAACCACAGAGACTTCAGTGTGGCTGCAATCGAGGATAGAATCTGACCAATTGTGTTTGTTTTTA-ATGGGAATATACATGATTTAATGTTGCCTTATCCTTTATTTTAATCTCCCAGGGTAGTCTTAAGAATCAGATGTTGAATCTCAAGAGACTTCTCCCTTGTGAAATATTCTAAATATGTCAGAAAAAAATGTTTTGTCAGTTCCAGCTTGTTGTTTCACCCCAGCCAGCTGGCTGGGTAGTCTTAGCTGCTATACACTGCCA 

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s galGal2.chr3     57808199 160 + 108638738 GATGACAGGAGAGAGAGACTGA-GACTGATTGCAAAAGCTGTAGTGCTTGTCTGAAGTTTTTAGCCTGACTCTGGT-CAGGCCCCAGGTGACCAGCTAATGAAAATAATTCAAACTTTAC-CAAAACAAGAGCCATTTATAATGTGGAAATTCTAGACAGACA 

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s galGal2.chr10    1822770 145 + 20909726 TTTATTCAGTACATAAATGATGTACATTTCTCATTATTTTCCAGTAAGAGGTAAAATGTCCAAACTTTGAGAAATGTCC----AGACTTCGAGGAAA--TCATTAATCCTCCTGTTTTAACCTTTCAAGTGTGAGCAACTTTTAGAAAATA 

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s galGal2.chr10    1822939 1472 + 20909726 TCTTGCTGAACTGTTTCCTTCCAAATGTCTTCCTTAGAGCATGCTTTACTTCTTTGTTTCGTAAGCTGTAGATGATTGGGTTCAGCATAGGAGTTACTACTGTATAGGAAAGAGCCACCAGTTTC-------CTGCTCTTTACCAAGAATCTGGACCTTGGCTTCAAATGTATCAAGCCAGTTGTGCAGTAGAACAGCGTCACCACCACCAGGTGAGCAAAGCAGGTGAAGAAAGCTTTGCGTCTTCCTTCGGAAGACTGCATTTGGAGGATGGTATGGATTATCCGGACGTAAGATGCTGCTATCAAGATAAATGGGATCAAAACAATTGTAACAGTAGCAACAAACACAAGAAGCTCAAATAAGTATGTGTCTGAACAGACCAAATCTAGAACAGGAGCAATATCACAAAAGAAATGCTCAATCTCCTTAGAGCCACAAAAGGGATAGCTAAATAGCCAGCCAGTGAGTCCTGCAGAAAATG---GAATACCAGCAACCCAGCATGCTATGACCATATGAAAACACATTTGCCTGTTCATTCTGGTGGTGTAGTGCAAGGGATGGCATATAGCCACGTATCTGTCATATGCCATGGCACTCAAGAGGAAGCACTCGGAAGTGACAAAGAATATGACAAAGTAAAGTTGCAGGGCACAGGCAGAAAAGGAGATGATCTT---TCTCTCCAACAACAAATCCATAAGCATCTTGGG-----CACTATGTTTAATGTAAAGCAAATTTCAATCAAGGCCAGGTTTTTGAGAAAATAGTACATTGGGGTGTGTAAGGCAGGATCAGCAGTTGCGACTAAAATTATGAGAAAGTTCCCTGTCATTGTGATTAGGAACATGATGAGAATTCCCTCAAAGAGAAGAACCTGAAGAGC-GGTGAGGC-------------AGGAGAACCCCTGCAAGGTGAAGTACGTCTGGTTTTTGAGCCCTGGTTCTTCACCA----------GCTTCCATGTGAAAGAGGAACCCAGCCTGTATCAGCCAATGAGAAAGATAGGAAGTAGAAAACTCTTTATGAGGATGAATATAAAGCAGTGA--------------GCTTCTCTGAAATC-AATTCCATTATTATGTGGGAGAAACAACTATAAATGGGCATATAACA---TTTTGAGAGGTACACTAGAAAAGCAAC------------TTGTCATGAAAACAAGGTAACAAAACAAAACAAA-------AAAAAAAACAATGAGCTGAAGTGCAG-AAGAGATAGGATTTCC--CTTAATGT-TTGCCCACTTTC-ATTTTAAATTAAGATAAAAT--------ACTTCCACATCTACTTTATA---TATCAGTTCTACTGGTATTTTCTCAAACGTAATT--------------------------TTGTCAACAATTAGTGTGTTTTATTTTCA-GTGTGTGAAATAAGAGTTTATTTCTTACTGACCTGTAATCTTTTTTCATTTTTTGAGAAACTATTTTTCCCTGTTCTCACACG--TAAGCACATACATATGCGTACATAGATTTCAAATAAACAAGGGCAAATTGAATT---GTTGAATGTACAGACAAA 

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s galGal2.chrUn    62381098 280 - 165033910 AAAGTAAAATTAATTTTAGCAGTACTCATAAG---------------------GCTTTTATTGGTTATTGGGGTGTCTTTCAGAAATGAACAGGCGTGAGGAATTCTTCCAACA--CTAAGCAAAGGGTACTGAGGTATTTGAAAAAAAC------------AGTTTATCAAAAAAAT-----GTTATAAATTTTGATGAAATTTAAATAAATAAGGAGTGGAATCTGCCAAAACATTTGAAATTATTTAAATAATCCGACCAATTATTAACAATTTTAAATAATACCGTGATGAATTTAAAAAAAGCAATAAATGTTTC 

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s galGal2.chrUn    22990586 246 + 165033910 TGGTTAAGCAATTGTTGTTTTTAGTTAAGGAATTCAAAATGCTGC---------ATTTACTTCTACTACAT------------AAACACAGTAAAAAGTTTCTGAACA----TTTTGTGGAAAAAAAAGCTTTTTACTTGTTTCTCTTTTATCGGATATTGGGATGGAGGTGATTCAAAGCCACAGAAAAGTTCCCAGATCAAAGGAAGGAACTGATTTTCCATGACGTGAGGTTTATTTGCTGTTTTTTTTTTTAACAGTACAAAGTTTC 

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s galGal2.chrUn    13129012 303 - 165033910 GAGCTCTTGTTGGATGTTTTTCATTCCAGAGCACCTGCCGGAAGGGGACTCAGGGTGAAAATGAAGCAGTGGCATGGGTCAGCAGATCCCACACAGAGCAGGA----------------GGAGCAGAACGGAGACAAGCATTATACAGAGCCCTCTGCCAAAGTTTGGACGGAAGTAAC--ACAAGGTACTGTAGGCTGTGGTTCCTT---------CACAAACAGGCACACTGGAA----------------AACAGATAGCTATTTAACTGGCTATACTAAACATTACGCAGCTAGTGCTAACTGCAGTGTACTCTGAAATCCCTAATAACAATTTTAGCTGGA 

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s galGal2.chrUn    140379988 352 + 165033910 ATCATGCTAACAGCAGTGCATTAAGGTAACTGTAGACTCTTCTGAGTTCAAACTGGAAAAAAAAAGT--------CTCTTTCACCAAGAAGGAGAAACTGTCTTTGGTTCTTATTATGGCCATCTTCCTTGTACCGAGGAATGATCTGGAGGTGCTTTTCCTGCCGTGCAGCAGTTGTGAATTCACAG----------CAGCCAGTGAAAAAAAT----GCTTTAGGTTGAGTT-----AAATGCTCTGAAATAGCCAATTC--CTGCCCTTAGCTTTGTGCTCTTCGTGGCTTCTTTTGTGGTGTTGGCTTTATTAATGTTGCTCTGGAAATC---TTTTTGTATTTGTTACAAAGTCTGAGCATATCTGATGTTTTTCTCCT 

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s galGal2.chr14    14797716 85 + 20603938 AGGTACAGGCATGAAATTGCACACGATGGTCAAAGGATTTATATCCTGGGAGGTGGAACTTCCTGGACAGCTTATTCCCTAGATA 

a score=4612
s mm7.chr10_random  1830952 67 + 17068869 AGATCCACACATACAACCTTGAAACAAATGCATGAGAGGAGATTGCAACAAAACCTCAGGAAAAAAT 
s galGal2.chr14    14798440 67 + 20603938 AGATCCATGCATACAACCTTGAAACCAACACCTGGGAGGAAATTGCCACAAAACCTCATGAAAAAGT 

a score=2554
s mm7.chr10_random  1831019 49 + 17068869 AGGTTTTCCTGCAGCCCAACGATGCCACAGTTGTGCTCAAATAAAAGAT 
s galGal2.chr14    14799324 49 + 20603938 AGGCTTCCCAGCAGCTAGAAGATGCCATAGCTGCGTTCAGATCAAAAAT 

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s mm7.chr10_random  1831068 139 + 17068869 GACGTCTTAATATGTGGGGGCTATAACGGAGAAGTGATCCTGGAAGAAATATGGAAGCTGAGTCTGCAGACTTTTCAGAGGGTGAAGAAGCTCCCTGCCACCATGCCAGAGCCCATTTACTTTCACTGTGCAGCTGCCA 
s galGal2.chr14    14799963 136 + 20603938 GATGTGTTTGTTTGTGGAGGCTATAATGGAGAAGTGATTCTGGGAGATGTTTGGAAGCTGAATCTGCAGACTTTCCAGTGGGT---CAAGCTCCCAGCTGCCATGCCTGAACCAGTGTATTTTCACTGTGCTGCTGTCA 

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s mm7.chr10_random  1831207 90 + 17068869 CTTCTGCCGGTTGCATGTACTTCCACGGAGGAGTTGTGAGCATCCATGAAAACAAACAGACTCGGTCTCTGTTTAAGATATGGCTGGTGG 
s galGal2.chr14    14801120 90 + 20603938 CCTAGGCTGGCTGTATGTATGTTCACGGAGGAGTGGTCAATATCCATGAAAACAAACGGACTGGCTCGCTGTTTAAAATGTGGTTGGTGG 

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s galGal2.chr6     22771689 270 - 33893787 ATGCAAACAGCTGCCATT-----AGCAGAGCACTGATACAATGAATTACAAACAAAACCCTAATGAC-AGGACACTGGCAGTGTTGCTTCCACTTGATATTAATTGGGTGACACTTTATTTTAATGGTACATTAATTAATGCAGGATATCAATGGAAGTCCAAG--ACACCCGCATTAATACAAATGAATTCATTATCATCGGTGTTATTACAGGAAACGACAAATAAATCTGTAACTGTGGGGCCCTTCAAATAATAGCCACGAATCATTAGGTATG 

a score=8134
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s galGal2.chrZ     2813227 248 + 33651169 TAGAAATAATATAACTGTTTTCTTTT------ATGTTCAGTAAATTAGCTACATCAGTTAATGTGTATTTTTCTTTATAATTAAATACAGAAAGTATTGAAATTTGTCAGTTTTGTGAAAAAATGTGAGAAATTCTCTTGCTTACTTCCAT-AGGATGTTGATGCTACAAACCCCAACTATGAAATTATGTGTATGATAAGAGATTTCAGGGGAAATTTGGATTATAGACCACTGACAACTGCTGATCCTGTAAG 

a score=5021
s mm7.chr10_random 2638443 181 + 17068869 AACTTGTTTTTTAAAGCTTAACCACAATAATTGTTAAGTAATTTC---TAAAAACCA--TAGCTTATTTTTCATTGCTTTTTATAGCATTTATAAGTCAGTGAAAATCATGTTTTTTAATTCCTAGATTGATGAACATAGGATATGTGTTTGTGTAAGAAAACGACCACTCAATAAAAAAGGTATG 
s galGal2.chrZ     2813991 177 + 33651169 AGCTTTTGCTGTTCATATGACTCACAGTCATTGAAATGTCTCTTCATTTAAAAGTTGGTTAATTAATTCATAACTGAAACTTAGA-----TATAGTTCACTGAAAG----ATTCTTTCTATTGTAGATTGATGAGCACAGGATATGTGTTTGTGTGCGAAAACGACCACTCAATAGAAAAGGTATG 

a score=12257
s mm7.chr10_random 2639107 230 + 17068869 TTTGTTTATTCTTTTAGAAACTCAAATGAAAGATCTTGATGTGATCACAATCCCTAGTAAAGATGTTGTGATGGTCCACGAACCCAAACAGAAAGTAGACTTAACAAGGTACTTAGAAAATCAGACATTTCGGTTTGATTACGCCTTCGATGACTCAGCTCCTAATGAAATGGTTTACAGGTAAGTGAATTTG-TTTTAAAGTAAAATTATTTTCTTACAATTTTATTACT 
s galGal2.chrZ     2814523 228 + 33651169 TTTGCTTATT-TTATAGAAACTTTAATGAAAGACCTTGATGTAATAACAATTCCTAGCAAAGATGTTGTGATGGTACATGAGCCAAAACAAAAGGTGGATTTAACAAGGTACCTAGAAAACCAAACTTTTCGTTTTGATTATGCCTTTGATGAAACGGCTCCAAATGAAATGGTTTACAGGTATGTCTGTATGCTTCTTTTGTGAA--TCTTTTTTTCTTGTTTATTTACT 

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s mm7.chr10_random 2642130 289 + 17068869 GTAAACTTCTGCTATA----TTTTGTCGCTTTTCTAAATATGTATTCAGACAGTATGTATTTTGGGTTGCTTGTCTAAATATGTATTTGTGACACCCTT--TTTCCTTTTCCTTTTAAGGTTTACTGCTAGGCCACTAGTGGAAACAATATTTGAAAGGGGCATGGCTACGTGCTTTGCTTATGGGCAGACTGGAAGTGGGAAAACTCATGTAAGTAGTTTGATAAAAGTTGTATCCTGCTGTGATGCTATAGTCTCCCTCTTACAGTTTAATTACACAGCCTAAAGTTACTGGT 
s galGal2.chrZ     2817854 275 + 33651169 GTCACTTCTTGCCTTAATGTTTATATTGTCCCTCTGGTAGTGGAATCTGAAAGTATTTAT-----GTTTCTTATGTA--CTCGTTTTTGTTTCTGTTTTGGTTTTTTTTTGCATTCTAGGTTTACAGCTCGACCATTGGTAGAGACCATATTTGAAAGGGGAATGGCCACTTGTTTTGCATATGGGCAAACAGGCAGTGGAAAAACCCATGTAAGTATTTC--------TTCTACATGTCAGCAATGGTCTGATTTTTTATGTACAATGCACTTCA-----CTAAATTCTCTGAA 

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s mm7.chr10_random 2642711 295 + 17068869 GAGACCTAAGTG------CTTAGAATCTATTCCTGAATAGGTCTGTTTTTTATTTTCTTTCCA-------AATGTAGACTATGGGTGGTGACTTTTCAGGAAAGAACCAGGATTGTTCTAAGGGAATTTATGCATTAGCAGGTAAGTGTCCTTTGTGTACATAGCTTATGATATTCTTGAATATTATTCAGGTCTGTTTGAATAACGGTTTTTATTTTTATTTTTGTATACACAAGTATACAATTAGTGTATTTGTGTACATAAATAATTATATACACAACATATTAGATCAACTGTTCGATT---TCAGA 
s galGal2.chrZ     2818134 275 + 33651169 GAGATATAAGTTACAGTTCTGTGATTTTTATCATGTTTATTTTCGTTTTTGATTTTCTTATTTTTTATTTAATATAGACTATGGGTGGTGACTTTTCAGGAAAGAACCAGGATTGTTCAAAAGGAATATATGCACTTGCAGGTGAG----------------ACTTTATGGTCTACTGGCTTTTCA--CAAGCAAGTTGAGATCAATGTGTTGTCTTATATTTTC-------------TACAGTCT-----TTTGTACAAACAGTGGAGTCTGTATATTTGGTATCACAGTGAGGCTTTGGTAACATCAGA 

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s mm7.chr10_random 2643533 271 + 17068869 GTGAAAAAGAATAGCTTCTTTTACAACTTTATTTTTCAAACTAATGATTTAATATTTTTATAGACACTATTAACCTAATATTAACTGATTCTTCTAAAAATAGAAAAGAAATTTATAAAATTGCTGTATCTTAACAAACTTTGTATGTGAAATTT-TCGACAGCTCGCGATGTCTTTTTAATGCTGAAGAAGCCAAACTATAAGAAACTAGAACTTCAAGTATATGCAACATTTTTTGAAATTTATAGTGGAAAGGTACGTGAGTTTTGTTT 
s galGal2.chrZ     2818553 238 + 33651169 TTAAACTTGGCTGACTTATCCTACGTGTTTTATTCTCAAG----TGATGAGAAATGCTGG------CTATTA-TGTAATAATGAGT-------------ATTAAATGAAAATGTGTAA-----CTAAATTTTGGTTTATTTTG-----GAAATATATTCACAGCTCGAGATGTCTTTTTAATGCTAAAGAAACCAAACTATAAGAAGTTAGAACTTCAAGTATATGCAACATTTTTTGAGATCTACAGTGGTAAGGTAAGGAAGTACTCTTT 

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s mm7.chr10_random 2644522 348 + 17068869 taccaCAAGATTTATATGATTGTAAATATAATAGTTGATGTCTTTTTAAGCTTTCAATGTTGGACATTGTTCTGAAAATAATAGTCTTATTACTTGTAGACTCCCT---------TTTGTAGAGGTGATTTCTTAAAGCTAGTTT-TCTAATTCAAATATGGTTTTCTAC-----------AGGTGTTTGACTTACTAAATAGGAAAACAAAATTAAGAGTACTAGAAGATGGGAAGCAGCAGGTCCAAGTGGTGGGGCTGCAGGAGCGGGAGGTGAAGTGTGTGGAGGACGTGCTGAAGCTCATCGACATAGGCAACAGCTGCAGGTGAGCCTCACAGCAGCTCTGCCAGGTTAGCTGGTTTATCGTA 
s galGal2.chrZ     2818791 352 + 33651169 CACAGCAAGATTC-TGAGATTGTTA-TGTAATTATTGGGATTTTATCA---TCTGAATGCTTTAT----TTCAAATAATTATTTACACTTCTCTTCCAAACATTTTGCTACAGGATTTGAAACAAATGTATTTTAAAATTATTTCCTCTCCCACTGTTCTATTTTTCTCCCCCTTTCCGTAAGGTTTTTGACTTGTTGAACAGGAAGACAAAATTAAGAGTGTTAGAAGATGGCAAACAGCAAGTCCAGGTGGTGGGATTACAGGAACGAGAAGTCAAATGTGTTGAAGATGTTCTTAAGCTTATTGAAATAGGCAACAGCTGCAGGTATCTTCCATAGC--TTCCACCAATTT------TTCATTGTA 

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s mm7.chr10_random 2644915 394 + 17068869 GTGTTGATGTGTCACTGTGTCCTTAATCACATTGTAGAACATCTGGCCAAACATCTGCAAATGCACATTCATCTCGGAGCCATGCAGTGTTCCAGATCATTCTAAGAAGGAAGGGGAAACTACATGGTAAATTTTCTCTCATTGACCTGGCTGGGAACGAAAGAGGAGCTGATACATCCAGTGCAGACAGGCAAACCAGGCTTGAAGGTGCTGAAATTAATAAAAGCCTTTTAGCACTCAAGGTAAATAAAATGTAATTATGAAAGGCCTTTTA-----------CTTCTGACCTTAAGTTTGATTACTCAGGTGTAAAAAACCTGTATTACCTTGTAAAAGAGGTTTACAAATTTAAATTGTCATGCTGGAAGTTACAGATATTATTGTATGTAGAATTTTTCC 
s galGal2.chrZ     2820359 388 + 33651169 GTTTGTATGTTCCCCTCTTTTCTCCTTTTGTTCAAAGGACATCTGGTCAGACATCTGCAAATGCACACTCATCTCGAAGCCATGCAGTGTTTCAGATTATTCTCCGAAGGAAAGGGAAATTGCACGGTAAATTTTCTTTGATAGATTTGGCTGGAAATGAAAGAGGAGCTGATACTTCCAGTGCAGACAGACAGACGCGGCTGGAAGGAGCTGAAATTAACAAGAGCCTTTTAGCACTCAAGGTAACTGAAATGTTTCCAT----TGCATTTGAGTAGATGGAAGCTTTCTACATAAAATAGCAGTGACCA---TTAAAACAAGTGTTTTTTC--------AGGCTTTGCTTGTCTACATTGTC-TACTGG-TGTGACAGGTAAAATAATGCATTAATTTTTTCC 

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s mm7.chr10_random 2646283 440 + 17068869 TTCTTTAATAAGGCGTAATTCATAAGAAATGTTTCCTTATTTTTTTAGGAGTGCATCCGAGCCTTAGGTAGAAACAAACCCCATACGCCTTTCCGAGCGAGCAAACTCACTCAGGTGCTGAGAGATTCCTTCATAGGTGAAAATTCTCGTACCTGCATGGTAAGGTGGCTTTGGATTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGGATTTGCTTTTATTTTTATCCTGAAGGAGTAAAAATTAAAGATATGGAAGTT----TTAGATTTTTGCTAATTATAATTAATTATTCTTCTATTTAGATAGATTA--CATTTAAGATGTGTCCCTAATAATTTGGTGGAAAGTATTACATGGCAGC-------TAGAACACTT-TTCACTTCTAACCCTGAATACTCCATTTAGGAGGTGTTAGCTTACTCCCAG----------GTTCTCACCGCCCTGGTGGGGATGGTG 
s galGal2.chrZ     2823384 431 + 33651169 TTTCTTAGTATGGGTTGAATAAATACAAAC--CTCTTTGTTCTTTCAGGAGTGCATTAGAGCCTTAGGCCGAAATAAACCTCATACTCCGTTCAGAGCAAGTAAACTTACTCAGGTGCTAAGAGATTCATTCATTGGAGAAAACTCCCGTACCTGTATGGTAAGTTTGTT---------TAGTTAACTGTATGTATG-------------AACAATTTCATAGAGAAAAGCTAGTAATACAGGATATTGTGTTTAGAACTGGTCATTTGCTGCTGGCAATCTGTTGCATTTAAACTTATA-AGCCTAAGAAATCAAGAAAATGTACTATTATATTTGGAGGAACTCTTTCA--GCAGCGATATTTCAGGTAACTCGTTCCCTCCTCTTACTGCTTGCTCTACTT------TTCTAGCTAGGACCTAGCTGGAGTGCTGTTCTGACTGGAGTGGTGGTGTTGTTG 

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s mm7.chr10_random 2647243 94 + 17068869 TTTATAGATTGCCACAATCTCTCCAGGAATGGCATCCTGTGAAAATACTCTTAATACGTTAAGATATGCAAATAGGTATGAAAGCGATTCCTAC 
s galGal2.chrZ     2826031 94 + 33651169 TCTGCAGATTGCTACAATTTCTCCAGGGATGGCATCATGTGAAAACACTCTGAATACTTTGAGATACGCAAATAGGTATGGAAGATGTTACTAC 

a score=-381
s mm7.chr10_random 2647337 193 + 17068869 ATTTTAAAATTTGAAATCTGATACATTAGAGCAGTATATAGTGTGTCT-CTGTGCCTGCT--------AGGAAAACCAGGCAGGGT--GGCACAAACCTACAGCTGTAGCCTTTGCTGATACTGAGGCTGAGTGGTCACCAGTG-CCATGCTATTTCTAACCTTTGACATGAAGTCTGTATCACAGATACCAGAGAACTCCATAG 
s galGal2.chr8     9002303 190 - 30024636 TTTCTGACTTAGGGATTCTACT--ATTGATGCAGAATACGTTTTGACTGCTCTGTCTTCTTTCTTCAGAGGAAGAGTGGCTCGTGTTAGACTTCTACCTA---CCCTATTTTTTGTAGGAAGTATTCCTGGATGGTGACCTCTATCCATAGTGTGC---ACTAAGAATATGGCTGCTGTATTATACAT-------AACCCCACAG 

a score=13630
s mm7.chr10_random 2651838 663 + 17068869 TGGGGATTAATAAAACTTAAGTGTCAACCTATTTATAAACACATATTCTAAAATAATA--CTCTTACAACAGTGTAGGTACTCTTTCTAAACAAA-AGTTGAAGTGTGCATTGTGTGTCTACCGAGAGC----TCTCTTAATTCTCCC---TGTTTTGGTACTGCAGAGTAAAGGAGTTTGGAATTAGTCCTTCAGACATTCCCTTCTCCCAGGGTGGTGGCAGTCGCCCTGATCTCTCTCCTTCTTACGATTATGACGACTTTTCTCCTTCAATTACCAGGTCTTGCTTCATTCTGTACTTAAGATTTTT--CTTTGACTAGCTTGTTTGGAATTGTG---CTGCATATAAACATTTCATT----TTTTTACTTTTGTTCCAAGCCATTTTCCATTTTCATTT-----AGCAGGTGGTGGTTGTACTGCATGGTCTGCATTTTTATGTCC-----TTTATTGATTTTCTTTAAAAAG--------TTTATTTAGAATTTAAAGTCCCATACTTGCGTTTTTC----TTTTTAAAAGATGATGTCACTTTTGTATATTT-------------------GTCTTTATTGTGTGATAAATAGTTTCTTGTCTACAAGGAGATACCGATCCTTGTGATTCAGAAAGTATTTCCTTTCTAAAGTGTGTTAAGTAG-GAAGTGCAGCTTTAAGAAATGACATAATATTCTCATGATCTTTAGGCACTGa 
s galGal2.chrZ     2827622 667 + 33651169 TGCAGATTAGCAAAATT--------GTTTTATTTA-AAACTTATTTTTTATGATGTTAAGCTATTAAAGAAGAATA----------TTAAACAAAGAGTTGTTATTTTAACTGTGTTTA---CAAGAACATTTTCTCTTAATTTGCTGCTGTATTTTGCTGCTGCAGAGTAAAGGAATTTGGAATTAGTCCTTCGGACATTCCCTTCTCACAGGGTAGTGGCAGTCGCTCTGATCTCTCTCCTTCCTATGAGTATGACGACTTTTCTCCTTCAATCACCAGGTCT-ACTTCATTCTATACATGGAATCTTTATTTTTAAGTTTTCGTTTTGGCTATGTAATTTTACAGACCAAATTTTCATTAGTACCCTTGCCTTGAGTCACATATACTTTTCATTTTTATTTTGGTTGGCAGGTGATGGTT---CTGCATGATCTGCAATCATCTTCCCAGTATTCTGTTCATCCTCCTTAAACATCCACCCTTTTTATCCAGGCTTGCTATTTTCCTTCATACATTTAAAAAAATAATAAAATGGTGATGTCACCTTTGTATATTTAGTGGACCAAATCTAATAAGTCTTT-TTATAGAATAATCAGTGTATTTTT-----GAAGTTA--------TTTTAATCAGAGGATATAGTCATTCTCTGGGATACTTGGTTGCAAATTACTGTTTTA-----------------TTCAGAATTTTGGTGGATTTG 

a score=-129
s mm7.chr10_random 2652637 223 + 17068869 CTCTTAGCAG---------AATGAAA--TTATTTCTTA---CTTAGCTATTTTGGCTAAGCAGTATAAACTTCCCTGGTCTCATTAGTGGTTTCTTTATGGATCTTAACAATTTTTCTGTCATAAGATGTAATTATAATTATAGCTTATTTCTTTAAGGTATTTAATATGTATACTTTGCTAACTTTCCCTGATTATGAACAATAATTACAGTTGAAA-------TGAGCGTAAAGTTG---TTTAA 
s galGal2.chrZ     2828289 220 + 33651169 CTTATAACAGCTCGTGAATATTGAAAGATTAATTTTTAAAGCATATTTATAT--GCACAGAAAAAGAAACATGTCAGG---------------CTTTGAGTATTGAATGAACTTTTCTATCATATGTTATTGTTAAGG----AGTTGATGT---TGAGAGTTTGAAGATTCATGCCCTCTTAGTATTT--TGATGAAGAGTAATA-TTCCAATGAAAAAATGACTTTTGCTGAAAGCTGAACTTTAA 

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s mm7.chr10_random 2652909 293 + 17068869 AAAGTGACATCATCAGTCCTGCTGTGCTA-CTGAATTGCTTTTG----TGTTGAAATGGTTCTTTTCTGTTTGTG-------TGCATGACTCTTTGATAATTTCAGA--TATCCTTTGTGTATTTATAGGGTGAAAGAATTGACTGTAAATCCAGCTGCTGCTGGCGATGTCCATCCAATAATGCACCATCCACCGAGCCAGATTGATGACTTAGAGACACAGTGGGGTGTGGGGAGTTCTCCTCAGAGAGATGATCTAAAACTTCTCTGTGAACAAAATGTGAGTAACATAATCTCATTTTATGGA 
s galGal2.chrZ     2828594 306 + 33651169 AAGGTGACATCGTCATCCATATTAAATGAATTAAATTGCATATAAACCTCTAGAACTTTATTTTTAGTGGTGATGGCTACTTTGCATGTAAAGTTACTAATTTGAAAATGAAATATTTTCTAATCGTAGGGTGAAAGAGCTAACCATTGATCCAAGTGCTGCAGGGGATATCCGTCCCATTATACACCATACTCCCAGTCAGATTGATGACTTGGACACACAGTGGGGTGTGGGGAGCTCTCCTCAGAGAGATGATCTTAAACTGCTTTGTGAACAAAATGTAAGTGGT-TTGTAGCATTACATGGA 

a score=8131
s mm7.chr10_random 2656684 114 + 17068869 TGTTTTAAGGAAGAAGAAGTTTCTCCACAGCTGTTCACTTTCCATGAAGCTGTCTCCCAGATGGTAGAGATGGAAGAGCAGGTTGTGGAAGATCATAGGGCAGTGTTCCAGGTA 
s galGal2.chrZ     2830411 114 + 33651169 TGTTTTTAGGAAGAGGAAGTTTCTCCACAGTTGTTTACTTTCCATGAAGCTGTGTCACAAATGGTGGAAATGGAAGAGCAAGTAGTAGAAGACCACAGGACTGTCTTCCAGGTA 

a score=608
s mm7.chr10_random 2657059 36 + 17068869 ATGCATACATAGGATAATAATAAATTTAAGGAACAg 
s galGal2.chrZ     2834489 35 + 33651169 ATACAGCCATTGGA-ATTAAGAAATTGCATGCAGAG 

a score=8734
s mm7.chr10_random 2657163 355 + 17068869 TAAAGTTT-------ATGAAAATAT---TTCATTT---GACTGAA-----TAAAGATGACATGTCTACTAACATTTTTGAGAATATCAGT----TTAAGTATGTTTGAGAATTCACAATGTGTAGGTCAGTCTGATAGGATAGATATTTGTAAAACAACACTTTACAAGTCTTTGTAT------------TGGATTTCTGTTGT-TAGGAATCCATTCGCTGGATAGAAGATGAAAAGGCTCTCCTAGAGATGACTGAAGAAGTAGACTATGATGTAGACTCATATGCTACACAACTTGAAGCTATTCTTGAGCAAAAAATAGACATTTTAACTGAGTTACGAGGTAACTTATTTTCCATC---TTTATGTTTATTTGAACTTTGTGTGGTAT 
s galGal2.chrZ     2834526 378 + 33651169 CACAGTTTTTCTGAACTAAAAATATGGATTCATTTTAAAATTGAAATCTGTTAGAATGAGATAAGTA-----AGCAGTGAGAAATACAGTCATCTTGAGTATAAGTAGTAATTCA-------TCTCTTTGTCTTACAACCTGTACCTTTGCTAA-TATTTTTTTGCTTGTTTTGTTATCTTGGTTGTTTTTTAATAACTGTTATCTAGGAATCTATTAGATGGCTGGAAGATGAAAAAGCACTTCTTGAGATGACAGAAGAAGTAGACTATGATGTGGATTCTTATGCTACCCAACTTGAAGCAATTCTGGATCAAAAGATTGATATTCTGACTGAACTTAGAGGTAGATTGCTTTTAATCACTTTTGTGTTTATT--AGCAATGTGTAGTGT 

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s mm7.chr10_random 2659553 882 + 17068869 CAATACTTACTCCCTTGTTCTTTTCTTATTCCAAGATAAAGTGAAATCTTTTCGCGCAGCGCTACAAGAAGAAGAGCAAGCAAGCAAGCAAATTAACCCCAAGAGGCCCCGAGCCCTCT-AAGTTGGCGTTTGCTACTAAAGGATCCCCAGAATCCCCAATACTGTAACA-ACGGTGGTCCGACTGTAAAGGCCACTTGAACGTTTTTGAAATCTTTTTTTTTTTTTTTTTAACGTTTTTTGAAATCTTAAGTGTGTGGAAAATATCTTGTCC----TTCATCTGAATGACA-TTTCAATTT--TGTGAAACACTCCT---TTGTCGACAAAATGCTTCTAGACCAAGAGGCACAACTA---ATAATTCGGACTAGTGAAGTATTTTGTTTCA-----TTTGCCCAAATAAATAGTGA---TTGCTTTTGGATATCCTTGCCAATTTTATTTAAAGATTGTGGAAGTGATCCAGAAGTGGAAGATAGGGGAAGCCACAGAATTTCC-TTTAACGCAGATCAATTTTCATAGCAAGA----CTGAGCAATTTTGAAC--CCTTTGCGTGCATGCATACCTCATGAGTGATTGTACATACTTTGCCTACTCCTAGAGACACTCGTGCTTACTCATCC---TTCTGTGCCTTGGCTAAGGCTA-TTGACCCTAGA-------TTTCTAAAACAGCCGAGATTAATTACATTCCTTG-TTTGTGACTGTAAATTACCTTTACTGTGTGTACATTTTTACTGTA-TTTGAGACATT--TTTTTGTGTGTGACTAGTTAATTTTGCAGGATGTGCCATATCAATTGAAC-GGAACT--AAAGTCTGTGACAGTGGACATAGCTGCTGGACCATTCCATCTTATGTGTAAA-----GAAATCTGGAATTATGTG----------ATTATAATTTTCTTAGCATTTTCTTTGT 
s galGal2.chrZ     2835226 907 + 33651169 CGGTACTCATTCTCTC--TTTTTTATTAT----AGATAAAGTGAAATCTTTCCGAGCAGCTCTGCAAGAGGAGGAACAGGCCAGTAAACAAATCAACCCAAAAAGACCACGTGCCGTTTGAAAGGGGCCTTTGCTGCTAAAGGAACCCACGAACCCGTACTGCTGTAGCACACATTTGT-----TACAAAACCCAGTG----GCCCTAAAAACTCAACTACTTGAAAGTGTAAAAACGTTAGAAAT-----GTCTGTGG-AAATGTCCTGTTTCTTATTCGCCTGAGTGACATTTTCGATTTTGTGTGAAATGCTCCTATGATGTCTACAAAATGCTTCTAGACCAGACAGCACAACCATGCAGGGTTTAGATCTGTGAAGCACTTTGTTTAAAATATTTCATTTATTCAAATTGTGAATTTTATGTTTGGAAATATTTGCCA--TGTTTTTAACAAT----GAAGTAA---AACTGTGGCTATTA--AAAAATCACAGTGTTTCCATATAACTATGTTCAGGTTTGTTACAGAGATCAGCTGTGCAGTTTTAAATTGTGTTTGCTTGCATGCTCACCTCACTAGTGGTTGTACATAACTTCTCTTCTGC---AGATAGCTGTGCTTACCACTTCCTGTTCTGTGCCTTGATGAAGGCTACTTAACCCTAAACATCCTCCTTCTGAAGCA-CAGCCTTAAGCAACATTCCTAATTTTGTCAATATAAATTACTTTTAGCGTATGTACATTTTTAATGTCTTTTGAAACTTTTATTTTGGTGAGTAGTTCATTCATTTCACAGAATGTGCCATATCATTTGAACAGGAACTGCAAGAGCTGTTAGAGTGGACA-AACAGCTGGA-CATTCCATCCTCCTTGTAAAAATATGGATTCTAGATTTATTTGAAAACCATAAAGAATGATTATATAACACTTTTCTCAGT 

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s mm7.chr10_random 2660451 822 + 17068869 TATGAATTAGTTGGTGTATAGTAAAAAGTAAAG---AAATTCTGAGAGGAGTTTTATTTTAGGATAATACATATATACA-TATGCAGTGT-GTGTGCCAGTGGTGTTAACAAGACTAATAGTGGAATTTGGTCCTTAACAATGCC-------ATTATTTAAGTTGAAGTGTTTA-------------------------TTAACTCACCAAAATTTAATGTACTGTTAAAGGAAACTGGCTTCTGATGCATGA-ACATTTGTATGTACACTGAAAGTAATCCCTAA------------------------TACAAGT--TAGATAA----------ACCAAGCATAGACAGTATGTACCCCTGAGAAGTGTTGATGA--CTTATGAGGCAGGTTATTCCA----AGCTCCATCTAAACCTAGTATGTGATGGTTTTTGAGAATCATATTTCGCCTGTAGATTGATGGCAAAATAGGC-----TACTCTATTAATGGCAGCACTC-ATTTTTAGCTGCTAATCTAAGAAAGAAAACTGGCCAATTTTCATGTAAATATTGTTTA-AAGATATATATATGTATA--TCTCTAGGAGTTTTCCCTTGGTTCCCACTATCTAGTCCAGTAGG-TTAACCAAAGAACCTCCCATGGATCTCTT----AACTCTAGGGAGCCTACTGATG------ACTCAGTGTACCGAGGGGAAATCCATGAAGAG------TCATGAGCCAGG--TTCTTTAC---TTCACTGGTCATA-----AATGATGAGAGTAGCTCTGAGGAATCC---GAACACCATGGTGAAAA------------------CTCTGTAAACATGAAATCT-------AAATCAAATGTAGATTTTTTCACAATATGCTTATTAATAAATGAAATTTATGAAACGAATTTAGAAATAATGTACTTCAATATAATTA-GCTTTGTTTTGGAAGG 
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s galGal2.chr32     445009 198 -  1018878 CTTCTTCACAGTCAGTGGCCAAAGCGCAGCAGCTGAGCTCCACAGGGGCTGGGAAGGCACCCTTATCTGTAGAAGATGACTTTGAAAAGCTAATCTGGGAAATCTCAGGGGGGAAACTGGAAGCAGAAATTGACTTGGACCCAGGAAAAGATGAGGATGACCTCCTTCTTGAACTCTCTGAGATGATTGACAGTTGAA 

a score=14268
s mm7.chr10_random 5838571 748 + 17068869 tatgtatgCCCCAACCCTCGTCAGTGTCCCCACTCCTGTTAGTGTCCCCAATCCTTGTCAGTGTCCCCAATCCTTGCCAGTGTCCCCA--CTCCTGTCAGTGTCCCCACTCCTTGTCAGTGTCCCCACTCCTTGTTAGTGTCCCCAATCCTTGTCAGTGTTCCCCAATCCTTGTCAGTGTTCCCCACTCCTTGTCAGTGTCCCCACTCCCTGTCAGTGTCCCCAATCCTTG-------TCAGTGTCCCCAATCCTTGT-CAGTGTCCCCACTCCTTGTCAGTGTCCCCACTCCTGTCAGTGTCCCCACTCCTTGTCAGTGTCCCCACTCCTTGTCAGTGTCCCCAATCCTTGTCAGTGTCCCCACTCCTTGTCAGTGTCCCCA--CTCCTGTCAGTGTCCCCAATCCATGTCAGTGTCCCCACTCCTTGTCAGTGTCCCCAATCCTTGT-CAGTGTCCCCACTCCTTGCCAGTGTCCC----------CAGTCCTGTCAGTGTCCCCACTCCTTGTCAGTGTCCCCACTCCTTGTCAGTGTTCCCCAATTCTTGTCAGTGTCCCCAC--TCCTGTCAGTGTCCCCAATCCTTGTCAGTGTCCCCAATCCTTGTCAGTGTCCCCACTCCTTGTCAGTGTCCCCAATCCTTGTCAGTGTCCCCACTCCTTGTCAGTGTCCCCACTCCTTGTCAGTGTCCCCA--CTCCTGTCAGTGTCCCCA-CTCCTTGTCAGTGTCCCCACTCCTTGTCAGTGTCCCCAATCCTTGTCAGTGTCCC 
s galGal2.chr11    1101042 751 - 19020054 TCTGTCTACCCCATCCTT--GCAGTGTCCTCATCCCCTGCAACATTGCCATTCTCTTGCAGTGTCCCCATTGTCCTCCAGTGTCCCTATCCTCCTG-CAGTCCCCCTA-TTGTCCTCAG-GTGCCTGTCCTTCTACAATATCCCCAGCCTCTA-CAGTG---CCCGATCCTCCTGCAATGTCCCCATGCTCCTGCAGTGTCCCCATTCTCCTCCACTGTCCCTGTCCCCCTACTGACCTCTGAGGTCCCCATCCTCCTGCAGTACCCCCATCCTCTTGCAATGTCCTCATCCCCTGCAACATTCCCATGCTCCTGCAGTGTCCCCATTGTCCTCCAATGTCCCTATCCTCCTGCAGTCCCCCTATTGTCCTCTAAGGTCCCCATCCTCCTG-CAGTGCCCCTGTCCTA---CAATATCCCCAGCCTCTA-CAGTG--CCCAATCCTCCTCCACTGTCCCCCTGCTCCTCCACTGTCCCTGTCCCCCTACTGTCCTCTAAG-GTCCCCATCCTCCTTCAGTCCCCCCATCCTTCTCCAACATCCCTGTCCTCCTG-CTGTCTCCCCATTGTCCTCTAAG-GTCCCCATCCTCTTGCAGTGTCCTCATCCCCTG-CAACATCCCCATGCTCCTGCAGTGTCCCCATTGTCCTCCCTTGCCCCTATCCTCCTGCATTCCCCCTCTTGCCCTCCAACGTCCCCATCCTCCTGT-AGCGTCCCCAGATCCTCCTTCAACTCCCCATCCCCTG-CAGTGCCC---ATCCCCTGCGGTCCCCC 

a score=9444
s mm7.chr10_random  6725070 324 +  17068869 CAAAAAAAAAGAAAACCC--CAAACTTACTTCTTCGCTGGCGCCTTCCTCGGGAGGCGTTTTGGCTGCCAATGTATTCCATAAAGTTCAAAATGATAAAAAAACAAGAAATCAGTCGCAAGTGCATAGTAACCCTGTAATGTTTCCCTTTTTTCTCTCCTTTTTCTTTTCACTGTTAGTTATATTTAATGTTTTTTTTTAAAGAAAAATATGTATGTAGGTGTTAGGCGAGTCTATACGAAGAGTAGAAAAACCAGAGCAGCG-GGACTTCTCCACTGAGATCCAACAGGCGTGCTGTGATGGCAAGCGAAGCGGGACGGGTGGACC 
s galGal2.chr3     57695354 276 + 108638738 CAGCAAAGCAGAAAGCCCTTCGCACTTACTTCTTCCCTGTCGCCGTACCCTGGAGGCGTGCTGGCTGCCAATGTATTCCATAAAGTTCAAAGCGATAAAAAACCAAGAAATCAGTCGCAATTGCATAGTAACCCTTTGAGAGTTCCACTTCTCCTTTCC--------------GTTCGTTTTTTTTTTTCCTTTCCTTTCGAGAAAAAAACCGAGGT-GGCGCGGGATGAG----------------------CACAGCAGCACAGATACCTGCGCCGATGTCCAAA--------------GCCAGGCTTGGCTGGGCTGGTGGCCt 

a score=1143
s mm7.chr10_random  6725579 36 +  17068869 GCGGCTGCGGCTGTGGCA-GGGACCCCGGGAGCGCAG 
s galGal2.chr3     57696133 37 + 108638738 GCGGCAGCCGCTCCGGAGCGGGGCCCCAAGGGAGCGG 

a score=7962
s mm7.chr10_random  6785531 146 + 17068869 TTCCTTTCCT-CAGTGACCATGCAGCAAGTGGCCAGGACAGTGGCGAAGGTCGAACTCTCGGACCATGTGTGTGACGTGGTGTTCGCGCTCTTTGACTGTGATGGTGAGTG-----GGGTCCCGTGGAGTGGAGAGGGTGCACCCGGCCTTG 
s galGal2.chr6     10712275 152 + 33893787 TTCCTCTCGTGCAGTGACGATGCAGCAGGTGGCCAGGACGGTGGCGAAGGTGGAGCTGTCGGACCATGTGTGCGATGTGGTGTTCGCGCTCTTCGACTGCGACGGTGAGTGACTGTGTGTCCTGTGACCACTGCTGGCTGCAGCCAGCATGG 

a score=11129
s mm7.chr10_random  6787023 361 + 17068869 GATTCATCCTGAGCTAAGGTTGAGAGTAGTTGAGTGTGTGCTGGGCTGCAGAACCCACAGGGTGTAGGGGCTGGAATTTCTCAGTGGCTTTTATCCCAGAGTCCCCACTTACACCTTTGTGTCTCCTCATCCTCCAGGCAATGGGGAGCTGAGCAACAAGGAGTTCGTTTCCATCATGAAGCAGCGGCTGATGAGAGGCCTGGAGAAGCCCAAGGACATGGGCTTCACCCGCCTCATGCAGGCCATGTGGAAATGTGCCCAAGAAACTGCCTGGGACTTTGCTCTGCCCAAATAGTATTCCCACCTCCTGCACCTTAGCACCCTGCAAGCCCTGGAGTGGCCCTTCATGCTGCTGATGCAT 
s galGal2.chr6     10713767 350 + 33893787 GATTCGTATCAAGGTGCAATGCAGAGGAA---AGCGGGTCCTTGGATACAGCTCCCGTTGGGGCT--GGGCTGGCTGCTCC---TGGGCTGGCTGCCGGTGGCTCCGTGTGTTCCTAATGCGTTCCTCTCCTTGCAGGGAACGGCGAGCTGAGCAACAAGGAGTTTGTGGCCATCATGAAGCAGCGGCTGATGCGGGGCCTGGAGAAGCCCAAGGACATGGGCTTCACGCGCCTGATGCGCGCTATGTGGAAGTGTGCCCAGGAGACGGCGTGGGACTTCACCCTGCCCCGGCCCTAACGGGACTGCCCGCGCCGGAGGGCC---GAACCCCTGCCGTAGAGCTGGGACTTGCCGCCGCGT 

a score=13888
s mm7.chr10_random  7418265 396 +  17068869 TCCCTTCATAAAGAGACTGGATGTTGTTTCTTTTGGGCCAGTCAGATATTTCTCGAATACTGAATTAGAAGAAGTAAGATAAAATGGATTTTTTCCAGCCCGGGGCTGTTTCCTCATTCCAGGCAGCACTTCATATTGATCTTCTTCTATTT----CTAATTTTGTTGCCGCTGATTGAGCTGAGCTCTAAATCTTCTGATGGCTTACATGCTGTTAGGATGCAACATTGCTACCAGAAGCGCAATGTAGCAATGTTCTCATTTTAAACTCTAATTTGGTCTTATTTGCAGCAAATTAAGGTGCC-TGATGTGGCACTTTGGTACCAAAATGCTTT--ATTATATGTCTTTCTTTACTCACCTACACAGAAAA-CAAGGACTATGTAGTCAATACAAATGTGTG 
s galGal2.chr1     39340815 389 + 188239860 TTTTTTCCTCAGTAAAATAAATAATGTTACTGTGTACTTTGTAAGAGATTG-TCAACTGCTGAG---GGAGAAATAGAATAGG-------TTTTCTACCTAAGGGCTGTTTCATTATGTCAGACAACACTCTGTATTGATCCTTCTCTATTTATTTCTAATTTTGTTGCCACTGATTGAGCTGAGTCCTAAATCTTGTGATGACTTACACGCTGTTAGGATGCAGCATTGCTGTGTGGAGTGCAAAGTAGCAATGTTCTTATTTTACACTCTAATTTAGTCTGATTTGCAACAAATTAGGCTTCTGTAAAGTAGTATTTTAGTACTCAGAGACTTCTGGTTTCATGT-TTTCTATA---ACATGGGTGGAAACTTCAGTACTGAGAAGTCAGTGAAGAATTTTG 

a score=3703
s mm7.chr10_random    8597788 63 + 17068869 CTACCATGGCTGACAAAATGGACATGTCATTGGAAGACATCATTAAGCTGAACAAGATGCAGC 
s galGal2.chr3_random  976686 63 -  1636275 CCATCATGGCCGACAAGATGGACATGTCCCTGGACGATATCATTAAGCTCAACCGAAGCCAGC 

a score=5188
s mm7.chr10_random    8597953 129 + 17068869 ACTGCAGACCAAAACAACTTCCAGACAAGTGGCAGCATGACCTATTCATTGGAGGCTTCAGGGGTCAAAACCACGTGGATACTGGTGGGAAGCTGTTCCTGTCAAATCTGCACTTCGGAGTGTCAGATG 
s galGal2.chr3_random  977116 128 -  1636275 GTTGCAG-CCGAAACAGCTCCCCGAGAAGTGGCAGCACGACCTCTTCGACAGCGGTTTTGGGGCGGGCGCTGGTGTGGAGACCGGCGGGAAGCTGCTCGTCTCCAACTTGGACTTCGGCGTCTCAGATG 

a score=9080
s mm7.chr10_random    8598082 325 + 17068869 CTGATATTCAGCTACTCTTTGCTGAATTTGGAACGTTGAAAAAATCTGCTGTGCACTATGATCGCTGTGGACGAAGTTTAGGGACAGCACATGTGCACTTTGAAAGGAAAGCAGATGCCCTGAAGGCTATGAGAGAGTACAATGGTGCCTCTTTGGATGGC--------------------------------------------------------------------------------------------CGTCCTATGAACATCCAGCTTGTCACCTCACAGACTGATAAACAATCAAGACCTGCACAATGCAGAAACAGGGGCGGCATGAGAAGAAACCCTGGCTTTGGAGGAATTGGTGCCAGAGTTTCCAGGAGAGGGAAACTTGGATGCAGCCAGGGAAGAGGGAAAGG 
s galGal2.chr3_random  979600 391 -  1636275 CTGTTTCTCAGGAACTCTTTGCAGAATTTGGGACCTTGAAGAAGGCGGCAGTGCACTACGACAGATCTGGACGCAGTCTAGGGACAGCAGATGTGCATTTTGAAAGAAAAGCAGATGCTCTGAAAGCTATGAAGCAGTACAATGGAGTCCCCTTGGATGGTGAGTCTCCGTGGCTGTTGCGTGCTTCTCTGCACAGCTGGTGGCATCTGTGTGCCTGCCATACTCACAGTAACTGTCTGCTTTTCCTGCAGGGCGCCCCATGAACATTCAGCTGGTTACATCACAGATAGACACACAGAGGAGACCAGC-----------ACAGAGGTG--------AGAAGCCGTACTGCCGCGGGAGTCGCTGTGCCAGTCAGCACGGGGAGTGAACT-------GGCCTGTGTAGGAAGCATGG 

a score=943
s mm7.chr10_random    8598445 198 + 17068869 agcaggaggagcagcagcagcagcagcagcagcagcagcaagtactcaaagcagcagcagcagcagcagcagcagcagctgtagaaactcaaag-----cagtagcagctgtagcaggagaagcagcacgagcagtagcaaaagcagcagcagcagcagcagcagcaggagc--agagacaggag----cagcagaaacagtaggagca 
s galGal2.chr3_random  980035 194 -  1636275 ACCAGAATGCACTATAACAGTTGC-----------TTTTTAAAAATCACAGTGTAAACAGAGGTGGCATGACCAGAAACCGTGGTGGTTCAGGAGGATTTGGTGGTGGAGGTACCAGGCGAGGTAGTCGTGGCGGGAGCAGAGGGAGAGGCAG----AGGGGCTGGAAGAACTTCCAAACAGCAGCTCTCTGCAGAAGAACTAGATGCA 

a score=14285
s mm7.chr10_random 10404709 757 + 17068869 TTTATTATGATAACTTTTGAAAATATATCATAATTTTATAGAAAGCAGACATAATTATCATATTTTAGTTACAGGGTCACGGACGGAGAAAAAAGGTGAATCACGTGTACTCTATTTTTGTCTTCTCTGCAC----TTTCATCTGAGAGGCTATCAA------TGTTAAAAATATATAGCTTGTATTCTTTTAAAAGTATCTAAAGTAGATGCT----CTGACCTAACTCTTTTAAATGCATTATAAACAACCTTGTACTATGCTAATGGGACATATACGATGTCACTTTCTAATTTAAA-TAAATCTAAGAGCT-TGTACTGTGTATGATGGCCGATTTGCAATTATGATCCCCGTGATGAGATTTTTCCAGGAAATGAGAGAGGCATTAAAATTTAAATGAAGTTATAGAATGGGTTGGTTTTAATTTCTGACCTGGAGGTCAGCAGTTACTGGGTTTAATGATTCTCCTTTAATAGGGAAATTCCAGGCACATTTGTATAATGAGAAATCATAACTAGTTGTGGGCCACCATGA--AGGATTTTCATTTTGGCATTCTGATCCATTGAAGTCTACTATT----GCTTTAAAAGACTAAGA---CATTT--CATGTTTAAGATATACCTTTATTACCTGAGGTTTAAAGTTATCTTTTATTTACTATA------ATATTTCT--AATTTCCAGGGTTTGGATCAGGGTCACA---CGTATACTCTTGAAATTTTTAAATGCATGTTTTTA-TTGCCTTTCTGGCAACTCTGAAACTACTGT-----GTGTTTTAACCAT 
s galGal2.chr4     34079431 779 - 90634903 TTTTTGATTCTAGCTTTTTCAAATCCATT----TTTAACAGTAGGCT--CTTAAATATTTTCTTCTGGT----ATTTTATGATAGCAATGATAAATATAACTTTGCTTCTGGTATTTTTGCTTCCCCCACCCAGGATATTATCTTAAAACGTATCAAGAATTTTTATACAAATTAGCAACTTATTTTTCTATAACAGAA----AAGTTGAAGACAAACTAAAACTAGAGCTTCCCAAAATGTTATAATCACCCTTATGGTATGCTGATGGGGTAGAAGAAATGCTACTTTTTAATTTAAAATAAATCCAACTTCTGCCTAATGTGTATGGTGGGCAATTTGCAATTATGATCTTCATGATGAGATTCTTCCATGAAATGAGAGGTGTATTATAATTTAAATAGAGTTGTAGATCTGGTTGATTTTAATTTGTGACCCAGGGGTCAGTAGTTATTGGGTGTAATAACCCTCTGGTAATGTGACTCTTCAAGGCACATTTGTATAATGAGAAATCATAACTCGTTATAGG-AAGTATGATGATATTTTTTGCTTTGCTATTCAGATATGCTG--TTCTACCAGTCTCCATTTTATATGCTTAAAATTCCAGTTAACATGTTTTTGCTATAAA---AATCTGTGAAGCTGTTAGCAGCTTACGATTTACTGAAGTTCACATGCTTCTTCAGTTTTCA--GTAGGGAGCTATATTCCATTGCTTATTCTTTTCTAGAAGCTATGTCAGTGTTGTCAGTTGCATTGCTAAAAGCTGTGACTTTGGTGTACACCATGTTTTTGCCAT 

a score=30579
s mm7.chr10_random 11611655 705 +  17068869 AGCATGAAAAGATACTATATAC----ATGTAGCATACACACAAATATATACAAACTCACTTCAAAAAGAAGCCCACACACTTTAGCCAAAGTCTAAGCCTGCATAGATTTAAAAAAAATTATGA--ATACAGTTGTTTAAAAGAAAAAAATGGTGAATAAAAGTTACAGAATGGATATGAAGAGAGATCTTTTCCAAACTTTTATTTGTGCACATTCA---ATTTAAAAAGATAACGTTTACAGGTTCTTTGGTGCCCA-TATTCAGCATACAAAAATGTAAAAGACTATTCACAAATCAAACACATTAGCTCCAACTGGAAAAATAATGACATCAATAAAACAACTGTCGGGAAGTGCACACTGCGACAGCTCTGCCTGTGGG-ACATGGAGATTACTGCGAAAATAAATAGAACGTCCTTTTGTAAAAGCAGCAATGTCATGTCTTGTAAACTTCC-TTTTTATATTACAGCAAACTTTGAAGTAAAATCCAAAGGGACTGGAGCTTACACTGCAGCTGTGAGTCCGA-----GTCTGT---CCTCGGTCACTGTTGGTCCAGTTTTCCTTGT-GTTTTGAGTCCAATGTGCAGCAGGTCTCAAACGGTGCTCAGGTGGAGA--CTAACCAACCAAGTTTGAGTTATAAAATCTCCTTCCTGCTTTCAAACACGAACGGGTAGATCTGTTCCACGGCAGTCGCCACAGCCTTTACATTGGGCCCTG 
s galGal2.chr3     55165356 709 + 108638738 AACATACGTAACTACTATAGATTTCAATCTAACCCACACACAAAATTTTACACAT--ACTACAAATAGAAACAGAAGC-TATCAGCAAAAGACTATTCTTACATTGTTTCAAATTAATTTGCAACTATACAATTTTAATGTAATAGAAAAAGGGAAAGGAATATAACAGAACAGGTATGAAGAGAAATAGTTTCCAAACTTTTATTTGTGCACATTCATCAGGTGAAAAAGATAACTTTTACAGCTTCTTTGGTGCCCAATATTCAGCATACAAAAATGTAAAAGACTATTCACAAATAAAACACA--AGCTCAAACTAAACAAAAAA-----------AAATGTTTTAAAGGTAGTGCACATCGTGACAGCTTTGCTTATGAATACACAGAAATTACTGCAAAAATAAATAGAATGTCTTTTT--AAAAGCAGCAATTTCATATCTTGTAAACTTCTGTTTTTACAATACAGCACTGTTAAGAGTAAAATCCAAAAGGACTGGAGTTTATACTGTGGCCATGAACAAGAAAAAAGTCTGTATTCCTCTGCTATAGTTGGTCCAGTTTTCCTTTTTGCTTTTAGTCCAATGTGCAGCAG-TCTTTAAAGGTGCTCGGTTAGGGAACCTAACCATCAAGTGGTGAATTATAAAATTTATTTTCTGCTTTCAAACACGAACGGGTAAATCTGCTCCACAGCACTGGCAACAGCCTTTACGTTTGGCCCTG 

a score=14198
s mm7.chr10_random 11614047 308 +  17068869 TACCTGTCACTGTGATGCTTCCTGTTGAAAATATCTGTAATGTAGCTCTTAGAGACTTTATCCGATAGCACACGGCAGGATGAAGTTCAGGTTCATAGCTATATAAAAACACAATTATGTTTCGTCATTTCTACAGAATGGC-------AGCTTCAAACTTTGTATGTTATCTCGATTCTCAGAAGACCTACCTGGCATGAGGTCTATTGTTCTTTGTAAATTCTGGCAAACGGATCTCAAAGGGCATGTTACACACTGCCAAAACATTCACCACCTTAAAATCTGTGAAGATGACCTGCGGGAGAGAAGGAGAA 
s galGal2.chr3     55168224 307 + 108638738 TACCTGTAACTGTGATACTGCCAGTTGAAAAAATCTGTAAGGTAGCTCTGAGAGTTTTTATTCTGTAGCACACAGCAGGATGAAGTTCTGGTTCGTAACTA---GAAAACAAAATAAAAGGTCAGAACTCAAAAAGAATAGCTTAAGAGGTATACAAGCACTGTTACTCTTTAAAATTCT-----ACCGTACCTAGCATGAGGTCTGTTATTCTTCGTAAATTCTGGCAATCTGATCTCAAAGGGCATGTTGCACACTGCTAAAACATTCACAACTTTAAAATCTGTGAAAATTACCTTTTTAAAAAGAGAGGAA 

a score=6180
s mm7.chr10_random 11615545 149 +  17068869 TCTTAATTTATAAAATTAA-ATCCTTGAACATGTGCAGTATGCATAGTT---------TTAGAAAATGTTACCTGAAAACCTAGTTTCTGCAGACTACGGGCTAAACGTCTGGCACCAAATTTAGCTTCTTCTTCACTGTAGTTGAAGTAAAAAAAAAA 
s galGal2.chr3     55170052 150 + 108638738 TTTTTCTTTCTAAAAACAATGTCCACAAGCAT-TGCTTAAATCACAATTCCATTTTCATTAGAA----TTACCTGAAAACCTAGTTTCTGTAGACAACGAGCTAATCGTCTGGCACCAAATTTAGCTTCTTCTTCACTGTA----AAGCAGAAAGACAA 

a score=8405
s mm7.chr10_random 11615810 104 +  17068869 GCACTCACCTTGTTGCTCCAGTGCAAATAATTTTTCCTGAGGACCAAATTGTAGCTGTAATTCTAGGTTTTCTAAGCTTCATTAATACTTTCTGGAAAAGAAAA 
s galGal2.chr3     55171286 104 + 108638738 GAACTCACCTTGTGGCTCCTGTGCAAATAACTTTTCCTGAGGACCAAATTGTGGCTGTAATCCTAGGTTTTCTAAGTTTCATTAATACTTTCTAAAAAAGAAAA 

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s mm7.chr10_random 11617850 64 +  17068869 AATAAAACAAAATCTTACACGTAGGTTAAAACACGAATCACATTCTTTTTTTTTTTGTTTGTTt 
s galGal2.chr3     55171431 55 + 108638738 AAAAAAAAAAAATC---------AACTATTACACTAATAATATTTCCTTTACTTTTTGTAGGTC 

a score=12390
s mm7.chr10_random 11618195 382 +  17068869 CCTATCTCTTATCTGTACCTGTAATCT--------------------------------------CCAGGAGAAGGGCCATTTCTACAGGGCTCC-ATGCTGCCCAGTTACACCTAGCA--TAACAAGGTGCTCACAATTCATCTGCACAA-TACAACAGTACCACT----------CAAAGCATGGTCAGATCAGGCTAGAG----------AGTGCACACACTGAAACTCAGACA-------------------CTTACCCCAACATCACGCTTATAAATTACATTTGCTCCCTCCAAAGCAATCTTCCTTAAGTTCAAATGGCATCTTGTTCTAAAAACACAGACTACATTTGTAATTAAAATGTCCAATGCAACATCACTGTCTGCATCCATTGGGGTAGTTTAGAAACTTGGTTC----------CCACCACGAAGATCACATCCTGGGAGAGAAAACAAAATAGTCA 
s galGal2.chr3     55171664 471 + 108638738 CTAATTTCTTATCGGGATATATTTTCTGGAAAAAAAAATCAAATTTGGAGGAGACAAACTAGATCCCAAGGCATAGGAGATCTCATCAGATATCTTATACTTAATAAATAGGCTTAGCACTTGACATGAC-TTCTTAAGCATTCTGCATAACTACAGAAATAAAATTTCTCTATCTACCATACGTGGATATCTGATGCATGAAGTTTTAGCTTAATGAACATATCTAAAAACAGGTAACTGTGTAATGTTAAATCTCTTACCCCAACATCACGCTTGTATATCACGTTTGCTCCCTCTAATGCAATCTTCCTCAAGTTTAAATGACATCTTGTTCTAAAAACACACACTACATTTGTGATTAAAATGTCCAATGCAACATCACTGTCCGCATCCATTGGGGTGATTTA-CAACTCAGTTCTCACACCAGTTCACCATGAAGATCACATCCTGAGAATGAAAACAATAAAGTTA 

a score=3231
s mm7.chr10_random 11820325 50 + 17068869 CAAGTCTGCCAAAAAGGACAAAGACCCAGTAAGTAAATCTGGTGGCAAGG 
s galGal2.chr24      602543 50 -  5910111 CAAGTCCGCCAAGAAGGACAAGGATCCGGTCAACAAGTCGGGCGGCAAGG 

a score=9731
s mm7.chr10_random 11820375 192 + 17068869 CCAAAAAGAAGGGGTCCAAAGGCAAAGTTCGGGACAAGTTGAAAAATCTTGGCCTGTTTTAAAAAGTTACATACGCCAAACTCTGTAAGGAAGTTCCAAACTGTAAGCTTAATGCTGCAGCTGTGATCTCTGAGAGACTGAAGAGTCGGGGTTCCTTGGCCAGGGCAGCCCTCCAGGAGCTACTTAGTAAAG 
s galGal2.chr24      602900 192 -  5910111 CTGAGCAGAAGTGGTCCAAGGGGAAAGTGAGAGACAAGTTGAACAACCTTGTCCTGTTTGACAAAGCCACCTATGACAAACTGTGCAAAGAAGTGCCCAACTACAAACTCATCACACCAGCGGTGGTCTCAGAAAGACTGAAGATCCGAGGCTCTCTGGCGAGGGCTGCTCTGCAGGAACTGCTCGGTAAAG 

a score=5406
s mm7.chr10_random 11822755 101 + 17068869 ATCAAGCTGGTTTCAAAGCACAGAGCCCAAGTTTTTTTACACCAGAAACACAAAGGGTGGAGACGCTCCAGCTGCTGGTGGAGATGCACGAACAGGTTTGA 
s galGal2.chr24      603540 100 -  5910111 ATCAAACTGGTGTCTAAGCACCGAGCCCAAGTGATCT-ACACCAGAAACACAAAAGGTGGAGATGCTCCTGCTGCAGGGGAGGACGCATAGGAAGGTGAGA 

a score=35818
s mm7.chr10_random 12378261 573 + 17068869 TGGAAGATCAAAGTTTATTTT-----ACTACCTACATACAAAAA---CATATTGCACATCAAATAACCAAAATCAAAAAAGGGGGGAGAAAAAAAAAGAAAAAAGGGTAGAAAGAAAATGTGAAAGGTACTCTACTGAAGACTAA-ACATGTAGTTTATACAAAATAAACCTTCTGGAAATTGATCTTTTCAGTAGTTCAGGCTATGTCTGAATGGACATGATTAAT-CAGCTTAGTGTTTCAATGAAAGCTATGTTTGATTTTTAAATACTGTACACTTAAATAAGTAAACCAAACAAAGCCTCAATGTAGAACAGTCACTGCCAATATCACCCAGTATCCCTGCAGATGA-------GTTAATATGTAT-TTCCAGTAGTCTGCAGA-ATTGCCTCTACAAACAGCATTTAAAAAACACA---TTAAACAGACCAGTTCCCAGACTAAACTAATGAAGAAATTACAATTCAGTGCAAAATATTTTAGACTGC--TTCATTCTAGTTTTCCTCAGGTGAAGAAGTGGTTGCATATTATTAAAAATGTAACAAAAGCAGCTAATGCTCTCATAAAGAATATTAAGTTAGGGACCCAC 
s galGal2.chr9     16459328 552 + 23409228 TGGAAGATCAAAGTTTATTTTCTTTTACTACCAGCATACAAAAAAAACATATTGCACATCAAACAACCAAAAC-------------------AAAAATAAAAA------------------------TACTCTACTAAGGACTAACATATGTAGTTTATACAGAATAAACTTTCTGGAAATTGATCTTTTCAGTAGTTCAGGTTATGTCTTAATGGACATGACTAATTCAGCTTAGTGTT--AACTAAAGCTATGTTTGATTTTTAAATACTGTACAGTTTAATAAATAAACCAAACAAAGCCTCAATGTAGAACAGTCACTGCCAATGTCACCCAGTATCCCTGCAGATTATGAGAATTTTAACAAATGTATTCCAGTGGTCTGCAGATTTTTCCTCTACATACAGCATTTAAAAAACATGTATTAAAACAGACCAGTTTCCAGACTAAACTAATGGAGAAATTACATTTCAGTGCAAAATATTTTAGACTGCATTTCTTTCTAGTATTCCTCAGGTGAAGAAGTGGTTGCATATTATTAAAAATGTAACAAAAGCAGCTAATGCTTTCATAAAGAGTATTATGTTAGGGATCCCC 

a score=12490
s mm7.chr10_random 14147707 510 +  17068869 TTTCTTTTTCCTTATGAAAAGTTCAAAACTGGTCTCAGTCACTTGGAAGATCTTTTTGAGATCTACCTTTGCAAGCCTGATTAGAAAAATTTTAACAATCCCACAAAAAAAGCAACAAAAGTGAAATCCATTGAATAACAGAATCCTTTCCCTAAATTATTTTTCCGAATCCTCTGCCAGAGCAAACACATGGTCTGTATTAGTCAGCTGGGTCCGCATCAATGTGTCAGCTGTATGAGCTGCTCGGGGTTCTTTGCC-AAATCTATTACACTAAATCCCACTGTTTTTAAACC-TAACTCCAAACATCCTTTTAAGTTCACAGAACATTCTAAATGTAGCATAAATGTACAACATTCTAAACCATCTCCATTTTGGAGGCA------TTTGAGCCTGTTTCTCTTGAATAAATCT----CACCCTGCACTTCTTTAGGTA--------------CCTGCTGACTGAGAAGAACAAAAGTCATTGCCTTTTGGCACAATGGAGAGAAAGATAAGAAAGctttctttccttccttct 
s galGal2.chr3     48723359 523 - 108638738 TTTTTAGTTTCTTGCAACATGATGAA----TGTGGCAGTAA-TCAGAAGAATTCTCTAAACCCTACCTTTGAGATTTCAATTAAAGGAAGGGTAAAA----CAGAAAACAAAACACAAGAA-GAAATCTGTTGAATAATATAATT-TTTCTCCAAATGATTTTTCCATATTTGCTGCCAGAGCAAACACATGGTACATGTTAGTCTGTTGGGTCTACATTAATTCATCAGCTGTAGGAACTGCAGTGATTCATTTGCCAAAACCTGTTGCACTAAATCCCACTGTTTTTAAATTGTAACTCTAAACATCCTTTTAGCCTTGCAGAAGATTCTGAATGCAACTTATATATATAGCATTTCTAA--AAGTACACTCAGCATACATATATCTTTAAATTTCTCCACTTTTGGTAAAAGTAGTATAATCAGCCCATCACTGGTTGCTTTCAATTCCTCTCCTACCTAGTTACAAAAAGAAATGTCACTCTCATCTAAGACACAGAAGGCTAGAATGTGCTAACTGGTTTGCTTTGCTTCT 

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