##maf version=1 a score=4461 s mm7.chrY_random 418 300 + 30114534 AGTTCTCAATTTTTTTCAGCAATGAGTCAAGTGGCAGCGGAAAGTACGGCCGGCCTGGACCAGCAAGTAAGTT-----GAACCTATATATAAGA-CGCTCCTTC------TTCCCCTTTGTTTTAACTTGG-CCATGGCGCAGTATTAACTAAACGCTTAAACTCTTGTGTTGTCTGTACTG---------GAGTTCTGGCGCCCCATAAAAATCTGAAAAGTAATGAAACTGAACAAAATGGCGTAGATGAGAAAAGAGGGGATAGCAATGACATTA----------CAGATTTCTCTACAGGCTTCGCATAATGGCGGCTTTTATTTGCG s bosTau2.chrX 20052697 318 - 48857030 AGTTCTCGGTACTCTTCAGGGATGAGTCATGTGGCGGTGGAAAATGCGCTCGGGCTGGACCAGCAGGTGAGCCGCAAGGAGCCTAC---CGGGATTGTTGCTGCAGGAATCTCTCCCCCGATCTAACCTGGTTTGTGGCGCAGTGCTACCTGGTACCCTAAGTTCCAATTTTCTGGGTCCCTTAGGCTAACGAGTGTCAGTGCCCCG---------GGGCTGTGGGGGAACGGG--AAGGTGACGGGAATGCTGATTGTGGCTGTCGCAGGGGCCCCAGCTTGGCCGGCGGTATTGTCCCCGGGCAGAGCACAATGGCGGCTTTTGTGTGTG a score=4828 s mm7.chrY_random 2566 192 + 30114534 TATCTATTTTACAGTTTGTTGGTCTTGACCTGAAATCATCAGATAATCAGAATGGAGGAGGAAATACAGAGAGCAGTAAGTA------------------------------------TAAAAAAATAATTAA------------TTACAGAAATTTTTCTAGGTTTTTGCTATTATCATTAGCCTTAAT----------AATTACTTTACATTTAA----TTCTTTTTCTGTTTTTAATAAGCACAGGATGTG s bosTau2.chrX 20055523 249 - 48857030 TAACTCTCTTCTAGTTTGCTGGCCTAGACCTGAACTCTTCAGATAATCAGAGTGGAGGAAG---TACAGCCAGCAGTAAGTAAAATATTTTATGCATTTACTGAATATTAGAGCTTTTTAAAAAAATTGTCAGAATATAGTTGATTTACAGTGTTGTTACTTGAGTATTAAAACCATAATAA--CTTAATGTTTCATTGGATTTATTTAAAATTTAGAAATTTCTTTTCCAGTTTTTACTGTGTAAAGAATGTG a score=6167 s mm7.chrY_random 3962 177 + 30114534 AATTTTCCTAGAAGAATACTATAGGGTTTCAGTTTTACATTTTGTCTTTTAGAAGGGCGCTATATACCTCCTCACTTAAGGAACAGAGAAACATCTAAAGGTATGTTGT---ACCAGATTTATAGATTGAACTTTTGCTTT-TTTAGAAGTTAGATTTTGGATTCAGTGAGTATACCTCAG s bosTau2.chrX 20057085 171 - 48857030 AAGTTTTTTGGAA------TGTGAAATTTAACTTTGTCATTT---CTTTTAGAAGGGCGCTATATTCCTCCTCACTTAAGGAACAGAGAAGCTACTAAAGGTAAGTTTTTTGAGCAACTTGGTATACTTAATTATTGCTGCATTTAAAAATTGGAGCTTAGGGAAAGTGAG-ACACCTCAG a score=9929 s mm7.chrY_random 6500 156 + 30114534 TTTGTTCTTTTTTTCCTTGAAAGGGGTCTGTGATAAGGACAGTTCAGGATGGAGCTGTAGTAAAGATAAAGATGCCTACAGCAGTTTTGGATCTCGT---GATTCCAGAGGGAAGCCCAATTATTTCAGTGATCGTGGAAGTGGATCCAGGGGAAGGTA s bosTau2.chrX 20058837 159 - 48857030 TTTGCTTTTGTTTTTAATTGAAGGATTCTATGATAAAGACAGTTCAGGGTGGAGTTCTAGTAAAGATAAGGATGCATACAGCAGTTTTGGTTCCCGTAGTGATTCAAGAGGAAAGTCTAGTTTCTTCAGTGATCGTGGAAGTGGATCAAGGGGAAGGTA a score=1154 s mm7.chrY_random 6994 28 + 30114534 tttcttttctttgctctagtttgacaca s bosTau2.chrX 20059440 28 - 48857030 TTTTCTACCTTTTATCCAGTCTGTCACA a score=12098 s mm7.chrY_random 7360 195 + 30114534 AGTCTTGATTA-----TTCTGCTGTTCAGGTTCGATGATCATGGTCGAAATGACTATGATGGTATTGGTGGTCGTG---ACCGAACTGGATTTGGCAAATTTGAACGGAGTGGTCATAGTCGTTGGAGTGACAGATCAGATGAAGATGACTGGTCAAAACCACTTCCACCAAGTGAACGCTTAGAGCAGTAAGTTTTTAAAAT s bosTau2.chrX 20059922 200 - 48857030 GATTTTGATTAATTGCTTGTGCTGTTCAGGTTTGATGATCGTGGACGAGGTGACTATGATGGCATTGGCGGCCGTGGTGACAGAGGTGGTTTTGGCAAATACGAACG---TGGAAATAGCCGCTGGTGTGACAAATCAGATGAAGATGATTGGTCAAAACCACTCCCACCAAGTGAACGCTTGGAACAGTAAGTTTCTGAAAT a score=9307 s mm7.chrY_random 7909 168 + 30114534 AATTGTTGTGAAACTATTTCCTTCTATTAGTAATATA--TAATGATCATCTGATTTCAGAGAACTTTTTTCTGGAGGAAACACAGGGATTAACTTTGAGAAATATGATGATATACCAGTAGAAGCAACTGGAAATAATTGTCCTCCTCACATTGAAAATGTAAGTTTTTT s bosTau2.chrX 20060129 169 - 48857030 AATTGTGATGAAGCC-TTATCAGCTCTGTGTAACAAACTTAACAATCTTCTGATTTCAGAGAACTCTTTTCTGGAGGCAACACTGGGATTAACTTTGAAAAATATGATGACATTCCAGTTGAGGCAACAGGCAACAACTGTCCTCCACACATTGAAAGTGTAGGTATTTT a score=4568 s mm7.chrY_random 9377 61 + 30114534 AGTCCCATATGCTTTGATATGACTGAGGGAGCATACATGACAAAATGTGGCTACAGCTTTT s bosTau2.scaffold9592 3529 61 + 27352 AGCCCCATCTGCTTTGATATGATCGAGGAAGCATACATGACGAAGTGTGGTCACAGCTTTT a score=8480 s mm7.chrY_random 9438 99 + 30114534 GCTACAAGTGTATTCATCAGAGTTTGGAGGACAATAATAGATGTCCCAAGTGTAATTATGTTGTGGACAACATTGGCCATCTCTATCCTAATTTCTTGG s bosTau2.scaffold9592 13446 99 + 27352 GCTACAAGTGTATTCATCAGAGTTTGGAGGATAATAATAGATGTCCCAAGTGTAACTATGTTGTGGATAATATTGACCATCTGTATCCTAATTTCTTGG a score=6686 s mm7.chrY_random 9537 77 + 30114534 TGAATGAACTCATTCTCAAACAGAAGCAAAGATTTGAGGAAAAGAGGTTCAAATTGGACTACTCAGTGACCAGCACC s bosTau2.scaffold9592 20554 77 + 27352 TGAATGAGCTCATTCTCAAACAGAAGCAAAGATTTGAGGAAAAGAGGTTCAAATTGGACCACTCAGTGAGTAGCACC a score=2196 s mm7.chrY_random 9614 35 + 30114534 AATGGGCATAGGTGGCAAACATTTCAAAATCTACT s bosTau2.scaffold9592 21283 35 + 27352 AATGGCCACAGGTGGCAAATATTTCAGGATTTGTT a score=12219 s mm7.chrY_random 17072 216 + 30114534 AATGTAGCAACCAGTTTTTGTTTTTATGTTACTTGACT--TTCTTTTACAGTTCAGTGATATTGAGATGGGAGAAATTATCATGGGGAACATTGAACTTACTCGTTACACTCGTCCTACTCCAGTGCAAAAACATGCTATTCCAATTATTAAAGAAAAAAGGGACTTAATGGCTTGTGCTCAAACAGGTAAGATCATTTTATAAATAACAAAGATTGT s bosTau2.chrX 20060875 218 - 48857030 AATGCTCCAAATAGCATTTCTGCTTGTTTACCCTGATGAATTTCTTGACAGTTCAGTGATGTTGAGATGGGAGAAATTATTATGGGAAACATTGAGCTTACTCGTTACACTCGCCCAACTCCAGTGCAAAAGCATGCTATTCCTATTATCAAAGAGAAGAGAGACTTGATGGCCTGTGCCCAAACAGGTAAGCAGACTTGATGAAAGTAAAAAGTTGT a score=47853 s mm7.chrY_random 17970 639 + 30114534 agagagagagagagagagagagagagaa-------agGCCCCAGTCACTGAGCCACCTTCGAGGACTCAGCTGCCTACCCCGCAAGCCCCCTCG----------------------------------------------------GAATCGTATC----------------TCGTATTGTATGTCCACTATCCTGAACCTCAACTCTTTCGACCCCTTTGCTGATGCAAGTAAGGGTGATGACATGCTTCCTGCTGGCACTGAGGATTATATCCATGTAAGAATTCAACAGAGAAACGGCAGGAAGACCCTTACAACTGTCCAAGGGATCACTGATGAATACGATTAAAAGAAACTAGTGAAGGCGTTTAAGAAGAAATTTGCCTGCAATGGTACTGTAATTGAGCATCCAGAATATAGAGAAGTAATTCAGGTACAGGGTGA-TAGTGTAAGAACATACACCAGTTCCTGATAGAGATTGGACTGGCTAAGGATGATCAGCTGATGGTTCATGGGTTTTAAGTGCTTCTGGCTCTCTGAAGCTTAAGTGCGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCTTGCCACAAGTTTAAAAACCTCACAGCTTGTATAATGTAATCATTTGGGGTCCGCTTTTAACTTGGACTAGTGTAACTCCTTCATGCAATAAACTGAAAAGAGCCAaaaaaaaaacaaaacaaaa s bosTau2.scaffold749 4090 715 - 356932 AGAAGTATATAGTAAGATGAATAAAGAACTAATATAGGCCCCAGTCACTGAGCCGCCGCCGAGGACTCAGCAGCCTCCCCCTTGAGCCCCCTCGCTTCCCGACGCTCCGTCCCCCCTGCCCGCCTTCTCCCGCCGCCGCCTTCCGCAGGCCGTTTCCACCGAGGAAAAGGAATCGTATCGTATGTCCGCTATCCAGAACCTCCACTCTTTCGACCCCTTTGCTGATGCAAGTAAGGGTGATGATCTGCTTCCTGCTGGCACTGAGGATTATATCCATATAAGAATTCAACAGAGAAACGGCAGGAAGACCCTTACTACTGTCCAAGGGATCGCTGATGATTACGATAAAAAGAAACTAGTGAAGGCGTTTAAGAAGAAATTTGCCTGCAATGGTACTGTAATTGAGCATCCAGAATATGGAGAAGTAATTCAGCTACAGGGTGACCAGCGCAAGAACATATGCCAGTTCCTGGTAGAGATTGGACTGGCTAAGGACGACCAGCTGAAGGTTCATGGGTTTTAAGTGCTTTTGGCTCACTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCTTGTCACAAGTTTAAAAACCTCACAGCTTGTATAATGTAACCATTTGGGGTCTGCTTTTAACTTGGACTAGTGTAACTCCTTCATGCAATAAACTGAAAAGAGCCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa a score=665 s mm7.chrY_random 18614 66 + 30114534 caaaaaacaaaacaaaGagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaag---------aaagaaagaaagaaagaaa s bosTau2.chr10 50575884 74 + 70001009 AGGAAACTTTAATATGTAGGAAGGCAGAAA-ATAGAGGAAATGGGAGTTTCCACTAAGAGAAAACAATTAAGAAA a score=23727 s mm7.chrY_random 19720 1043 + 30114534 TAGTACTTTATCATTTCTTAAT---TTTTCAAAGTTAATAATCCAGGTTTT-------------------------TCTAAACAGGGTCTGGAAAAACTGCTGCATTTCTACTACCCATTCTCAGTCAGATTTATACAGATGGTCCAGGAGAGGCTTTGAAGGCTATGAAGGTGACAGtttttaatttttgtgtcctggtgttttctttgtgtgtatacttataaacagtgtgcatgcagtgtcctcagaaggtagaagagaacattaaatAGGAATTGGAGACATTTGTGTGTTTCCAGTTCAAATAATTCTTAAATTACATGTGGCACTGTGGTTTGGTTAACTTTAAAAAATAAGTTGTAACTGGAGAGcagagtattggggtttgattcccagcattcatgtggctcctcacaaatgtctgtaactccagggtactttctggcttttgccagaatatatacacagtgcacctacatccatgcaggcaaaacattcatgcacagaaaattaaaCAATTTACAAATATAACAGGTAAAATTTTGGATAATAGACACTAAAATTATACTTAACTCTTAGGAAAATGGAAGATATGGTCGCCGTAAACAATACCCAATCTCCTTGGTGTTAGCCCCAACAAGAGAATTGGCTGTGCAGATCTATGAGGAAGCCAGAAAAGTAAGCATAGCCTTTAATAATTTGGTCTTTTTCTTAATTTC-----AGTGTTTC-------TGTAA-----------------CTAATAA----TTTTTTGCTTATAGTTTTCATACCGATCTAGAGTCCGTCCTTGTGTAGTGTATGGTGGTGCTGATACTGTTCAGCAGATTCGGGACTTAGAACGTGGATGCCACTTGTTAGTTGCCACACCAGGACGTCTAGTGGACATGATGGAAAGAGGAAAGATTGGATTAGATTTCTGCAAGTATGTTAATTTTGATAAGAGAAATAAGTCTTCTATATATATAATAGGCCTTGTGTATATATGCTGTGGTATACTGGTCTTTCA-----TGTAAAAA-----TTCTTCATACTATTAGGCTCATTAAATGGGACCTCTTCATGTAGTCCGAG-----CTAGACCT------CAGAGT s bosTau2.chrX 20062181 841 - 48857030 TAAAACACCATCATCTACCAATATATGTTCAAAAGTAATAAGCCAGTTTTTCTGTGGTTAAATGAATATGCTTTTTTTAAAATAGGGTCTGGAAAAACTGCAGCATTTCTCTTGCCCATCTTGAGTCAGATTTATTCTGATGGTCCCGGTGAGGCTCTGAGGGCCATGAAGGTAA---------ATATTTCTGT-----------------------------------------------------ATAAAATGGGAAAGCTTTCTAAATGACAGTAAGA----CTTGCAT---TCTAATCTGTATAATTAGTAA-------------------------CAGCATTTACATGTAATCTGTAAATTG----CAGAA----GGGGATT------------------------------ATGT-TGTAA-----------------------------------------TGAACCTATA------------------------AGAGAGGAT------GTTAACAAGTTTAATA---------------------------AATTAT------TTCTTAGGAAAATGGAAGATATGGGCGCCGCAAACAATACCCAATCTCTTTGGTGTTAGCACCAACTAGAGAATTGGCCGTACAGATCTATGAGGAAGCCAGGAAAGTAAGTATGCCTTTCAGGTTATTGGCCTTCTCATTGATTCTGATGAAGTGTATTATGACCATGTAAAAATCTTGGTCTTAAATTTAATAAATTTTTCTTTGCTTATAGTTTTCATACCGATCTAGAGTTCGTCCTTGTGTGGTTTATGGTGGTGCTGATATTGGTCAGCAAATTCGAGACTTAGAACGTGGATGCCATTTATTAGTTGCGACTCCAGGACGTCTAGTGGATATGATGGAAAGAGGAAAAATTGGATTAGACTTCTGCAAGTATGTTAATTTT--------------------TAAATGTGTGAAATGCATTTTTTA-------------------GTCTTCCAACTTTTATAAAAAGTTAGCTCATTGTAATTTTAGT----TTAAGTGA----TTTTAGTAGAGGCTAAGAATTACCAGACCTTGAGACCAGAGT a score=21760 s mm7.chrY_random 20916 639 + 30114534 TATAATAATTAATAGAATAATTTACCCAACAGTTAAATATAGAACCCAA---------TAAGAATCTA------ATACTTTTTATTAATAGATACTTAGTATTGGATGAAGCTGATAGGATGCTGGATATGGGATTTGAACCTCAAATACGTCGTATAGTTGAGCAGGACACAATGCCACCAAAGGGGGTTCGTCACACTATGATGTTTAGTGCTACTTTTCCTAAGGAGATACAGGTACTATTTGTTACAATTTTATTTTAGAACATTTTAAATAAATTTTGGTGATTTATGTATTAC-ATAGATAATTTAAGTTTTTGGGTTTTATTTTTCTTTTCATTTTCAGATGCTTGCTCGTGACTTTTTAGATGAATATATCTTTCTGGCTGTAGGCAGAGTAGGATCTACTTCTGAGAACATCACACAGAAAGTAGTATGGGTTGAAGAACTAGACAAACGGTCATTTTTACTTGATCTCTTAAATGCAACAGGTAAAATT-----ATGAATCCTGTATTTAATAAAATGAAAATGCCTGTAAAATTTGTCTTTAGTTCCCAGTATTACTTTATAGCACCATTTTTTTCTGTATGTGTGGTTTTGTGTGTGTCTCTGTCTGTATATATATTTGGGTATCTTcttcatttgctgagacagtct s bosTau2.chrX 20063115 557 - 48857030 TAAACTACCTGAATGAATAATTAACTGTGCTTATAGAAATGGAAACTACCTTTTCTTTTCAAATTCTAAGCTGGATTTTTTTTCATGGCAGGTACTTGGTGTTAGATGAAGCCGATCGGATGTTGGATATGGGGTTTGAACCTCAGATACGTAGAATCGTTGAACAAGATACTATGCCACCAAAGGGAGTTCGCCACACTATGATGTTTAGTGCTACTTTCCCTAAGGAAATACAGGTATTGTTTGCTGCAGATCTTTCTTA-----------------CTTAGGAATTTGTTTCTCTCAATAGATGATAAAA-----------CAATAATTTTTTTC--TTTCAGATGCTTGCTCGTGACTTCTTGGATGAATATATCTTTTTGGCCGTAGGAAGAGTTGGCTCTACCTCTGAGAACATAACACAGAAAGTAGTTTGGGTTGAAGAGTCAGACAAACGGTCATTTCTGCTTGATCTTCTAAATGCAACAGGTATAACTTTAGCATCAGTCTGGTG-----------------GCTTAGGTAATCTATTT----------GGATCACCTT-TAGTGC----TTTTCCT---------------------TCTCATCCAATACAT--------------------TCTGTTGAGACAGTCT a score=25137 s mm7.chrY_random 21667 462 + 30114534 ATCTTTCCCAAATCACTAAGCTTATTAAATGTTAGAATAAGCAGTGGTATCAAGTTATTGTTAATAAACAAAACCTTGTAATTT------TTCAGGGAAGGATTCATTGACTTTAGTATTTGTGGAGACTAAAAAGGGTGCAGATTCGCTGGAGAACTTCTTATTTCAAGAAAGATATGCGTGTACTAGTATTCATGGAGACAGATCACAGAAAGATCGAGAGGAGGCCCTTCACCAGTTTCGCTCAGGGCGAAAGCCAATTTTAGTGGCTACAGCTGTATGTATATTTTAATTTTTAGTTATTTAGTCTGACTG---------TTACTTAATTTTAATTAG---------------TATTATTTTTCAGGTGGCAGCAAGAGGTCTAGACATTTCAAATGTGAAACATGTTATCAATTTTGATTTGCCAAGCGATATTGAAGAATATGTGCATCGAATTGGCCGCACAGGACGTGTAGGAAACCTTGGTAA s bosTau2.chrX 20063672 481 - 48857030 ATTTGCCTCTATTCGC-AAGTTTACTAAGTGCAAAGA---------GAACCAAGCCACTATTAGTGACAGAAACCTTGTGGTATTTTAACTTCAGGCAAAGATTCACTGACCTTAGTGTTTGTGGAGACCAAAAAGGGTGCAGATTCTCTGGAGGATTTCTTATACCATGAAGGATATGCTTGTACCAGTATCCATGGAGACCGATCTCAGAGAGATAGAGAAGAGGCCCTTCACCAGTTCCGCTCAGGAAAAAGCCCAATTCTCGTGGCTACAGCAGTATGTAAAATTTAA-TCTTATTTTCTAGGTCAGCATGTTCAACTATTTACTTTGTTTTAAATGGACCATAGGTAACAAAAATTATTTTCTAGGTAGCAGCAAGAGGACTGGACATATCAAATGTGAAACATGTTATCAATTTTGACTTGCCAAGTGATATTGAAGAATATGTACATCGCATTGGCCGTACAGGACGTGTGGGAAACCTTGGTAA a score=29873 s mm7.chrY_random 22957 879 + 30114534 AAACAATAGGAAACTACTTTGTGGAAACATAGACCTTACATATTTTAAAAAACT-TTTTAGGACTTGCCACCTCTTTTTTCAATGAGAGGAATTTGAACATCACAAAAGATTTGTTAGATCTCCTTGTTGAGGCTAAACAAGAAGTGCCTTCTTGGTTGGAAAGTATGGCTTATGAACACCACTACAAGGGAAGTAGCCGTGGACGTTCTAAAAGGTAAGC----------------------------------------------------------ATTGTTT---------------TGAGCTTTTCA-----------TTATTATAGTTTGTTTAGAG-------------------------------------------------------------TTAAC-AGAATT--GTTATTTTAATTGGATATCATTGTTTTTTTCTTGCAATAGCAGATTCAGTGGAGGATTTGGAGCCAGAGACTATCGACAGAGCAGTGGTTCTGCAAATGCTGGATTTAATAGTAACCGTGCCAATAGCAGCCGAAGTAGTGGTAGTAGCCA------CAACAGAGGATTTGGTGGAGGTAAATTTTTGTGGttgttttttgtttgtttgtttgtttgt----ttgtttgt-ttTTTCAGAGTAGAA---GAGAT-TTTTTTTTTGTTTCTTGCTCTTAATGATGTTTTCATGATAAATTATAA-----GAAAAAATAATGCTATACAGTG---------AGACTTTTTTTCTTATTTTATATAGAATAATGGTAACAGTAAATAAATTTTTTTCCTTGATAGGTGGCTATGGAGGTTTCTACAATAATGATGGTTATGGAGGAAATTATAACTCCCAGGCAGTTGACTGGTGGGGCAATTGAATTTGT----------ATCATTATTTCATAC-AGCTAATATGGAAACCACATGTAACTTAGCCAGACTGTA--TTGTGTAGCTTCAAGAACTTGCAGTACATTACCAGCTGTGATTCTTCTAAAAG--------TTCATGAGAGCTCAAAGTCACAAGAAA----TTAAGCAACAACCTGTA s bosTau2.chrX 20064365 1048 - 48857030 AAAGAATATTGTGCTGCTCTGTGGAAGACCTTAATTTATGTACTTTTTGGAACTGTTTTAGGCCTTGCCACCTCATTCTTTAATGAGAGGAACATAAATATTACCAAGGATTTGTTGGATCTTCTTGTTGAAGCTAAACAGGAAGTGCCATCTTGGTTAGAAAACATGGCTTATGAACACCACTACAAGGGTAGCAGTCGTGGACGATCCAAAAGGTGAGTTAGAAATAATGTGTATTACTAAATAATGTGTATAATGGAGAGGGGTGTGATTTTTAAGGTTATTTAAGTGACCTTCAGTGTCAGCTTTTCACAGCTAAGGCCTTATAAAATTCCTATTACAGAAAAGAAGGGCTGGGTGGCATCGCTTGAACTGGAAAATCGGAAATTGGTCCTTGGGAATTTTTAACAAGAATTGCGTTATCTTTA-TGTAAACTAACATTTTGTCCTTATAGTAGTAGATTCAGTGGAGGATTTGGTGCCAGAGACTATCGACAGagtagtggtggcagcagttccagcttcagcagcagccgcgccagcagcagccgcagtggtggaggtggccatggaagcagcagAGGGTTTGGTGGAGGTAATGTTAAATTTTAACCTCATGCCTTTGGGGAGGTTTTTGCCCTTTTTCATCTTTTTCAAAGCGTAATTTAAAATATTGGGCCCTGTAGATTGCTTTTTGTAAT-TTTACATCAAAATATTTAAAGAAGGGAAAGATTGTATTACACAATGGATGACTTAATACTTTTTTTTTTTTTTAATCT--------------------------------CTCATTAGGTGGCTATGGAAGCTTTTACAACAGTGATGGATATGGAGGAAATTATAACTCCCAGGGGGTTGACTGGTGGGGTAACTGAACCTGCTTTGCAGTAGGTCACCCTGCCAAACAAGCTAATATGGAAACCACATGTAACTTAGCCAGACTATACCTTGTGTAGCTTCAAGAACTCGCAGTACATTACCAGCTGTGATTCTCCAATGAAATTTTTTTTTTAAGGGAGCTCAAGGTCACATGAAGAGTCGAAAGGAACAATCAGCA a score=48149 s mm7.chrY_random 23860 1445 + 30114534 AATTTTTGTAA-CTGGATTAATTCACTTCCTGCTTGGTTGTACCCTAAACAGCATTTATAATTTGTGAGTGAGGATCA----TTTGTTAATGTACTATGACTTTTAACTTTAAACAACTT----ATTTAATGTCCTGTTGTCTCAATAATGCTCAAGATATAAATTGTTTT------AATAAGTTAATTGAATTTTGGCTACAAGCAAACCTTGGCACACAAGTGTAATACACCTTAATAGGAATCA---ATTCATTGCTAAGTATGATGGTGAATGAACTTAT-------CCTGGATAATAAATTTTTGGTATATGCAGAGT----------------TGTTGGTAAAACTTCTTTTT----TAAGTTTGTAATGTGGCAGAC-ATACAAAACTAAAGTTCTGAACTGCTCACTATATCCTGCATTGACACTTAGAACCTTAAAGTATTAAA------------------TATATGATTATATATGGTTATATCCTT-------------TATTTTCAAAAGCACTAATGCAGATAACTACAGTGATTCCTCATTTACTGTTT-------TAAGTAATT------------TATATTGGCATACTCCTACA-TGAAAGTTTAAAATTTTGGTGAAGAATTTGGGATA-----TAAAG------------TTTAGGTATATTTAATGCCTGCCATGCATAAA----AAATGGTAAATTACTAGGTGACTATGGCAATGACCAGACCTTATTAAAGCTTTG--TTAATTCTGGTCT-TTAATGCATGCTAGTGTTGGTGTTTTTTGGTCAAGAGAGTATGAACAG-----ATTATGCAGCAGCAGGCTTTACTTT---TACACAGTCAGGTTTTTCTGTAACAACTATGTTGAAATGTAaaaataaaataaaataaaataaaaAAGGCTTACATACATACTATGTAAA--------TATAAGAATAAAAAATTGAAATTGCTGAGATCTCACAGGTTGGATTTATGTAC-TAATTATACATGATGGTCAGT--------ACAGTGCAGTTTTCATCTATTTTCGTTGCATAGGTTTCCATTGTA-TTATAGTC-----ATATTTTAATTGGCCAAAAATG---ATTGTCCCTCACAAAAAATGCCTTTTCC---TTTGAG---------AATTTCCTGGAAAGAATACAATAAATTTAAAAACGTAAGTCCTTAAAAATACTAT---AAGTTGATAAATTTTTCTAAAAGTGCAATAGATTTTCAAGTGTATTGTGCCTTGTATTAAAATTT---TAAAGTAGGTGTACTTGACAGTATTATCAAGGTCATTTGTTACGGTGCTATTTCAATTA-TAGAAGTTTAGAC---TGTACA--TTGCCCATAACTTTTTACAAAGTACTTATTTTATTGCACATGAAGAGAATTTTATATGTGTATCTTATGTACAAGTCCTTGAAGTTCCAA--------------TTGGATATTGTTGATTACAGTGTGTCAA-----------GAACTTGGTTCAGAAAATTTTCCATGGACCAT-AGAATGATAGTTAAGA--AAAACTATTTGCagcctgaagtggtggcacacgcctttaattgcagcactcaggaggcagaggcaggtggatttctgaat s bosTau2.chrX 20065468 1559 - 48857030 CATTGCTGTAGTTTGGATTAACTCCCCTCCCAAC---CCCCATCCCAAACTGCATTTATAATTTGTGACTGAGGATCATTTGTTTGTTAATGTACTGTG-CCTTTAACTTTAGACAACTTTTTATTTTGATGTCCTGTTGGCTCAGTAATGCTCAAGATACCAATTGTTTTTGACAAAATAAATTTACTGAACTTGGGCTAAAATCAAACCTTGGCACACAGGTGTGATACAACTTAACAGGAATCATCGATTCATCCATAAATATTATAAGGAAAAAACTTATGCAGTAGCCTGCATTAGGGCTTTTTGATACTTGCAGATTGGGGGAAAACAACAAATGTCTTTGAAGCATATTAATGGAATTAGTTTCTAATGTGGCAAACTGTATTAAGTTAAAGTTCTGATTTGCTCACTCTATCCTGGATAGGTATTTAGAACCTGATAGTCTTTAAACAAGCCATTCCAGTCATGATGAGGTGATGTATGAATACATGCATACATTCAAAGCACTGTTTTCAAA---GTTAATGCAAGTAAATACAGCAATTCCTCTTTCAGTGTTTAGGCAGATCATTAATTATGAGCTAGCCAAATGTGGGCATACTATTACAGGGAAAGTTTAAAGGTCTGAT----AACTTGAGATAGGGTTTTAGGAGAATTCATCTACTTAGACTTTTTAAATGCCTGCCATAAGTGAAATTGAAATGGTAG---AATGGCTGACCACAGCAATGACCAGCCCTCATTAGGGCCCTGGATGATTTTTGGTCTAATAACGCATGCTAGTGTTGATGTTTTTTGGTCAAGAGGGTATGAACAGGAAGAATTAAAT-GCAGCAGGCTTTCTTTTAAATGCCGATTCATATTACTCTGTTCAAGCTGCGTTGAGATGTTAAACT---------------------GGCTTAC-TATAGACTTTGTAAAAACGGCTCCAGAAGAGTAACAAACTGAAATCTTTGAGATCACACAGGTTGGAAATATGTACATAACTGCACAAGGT-GTCAATTCTGCTACACAGTGCAGTTTTAGTCAGTTTTAGTTGCATAGGTTTCCATTGTATTTATAGTCTGTTTATGCTAAATCTGGCCAAAGATGAGCATTGTCCACCAC-TAAAATGCCTCTGCCACTTTTGAATTCTGTGCTAATTTTGTGGCCAGAATGCGGT-GATCAAAATGCTCAATCTTTTTACAGTGGCATAGGAAGATGGCAAAAATTTCCTAAAGTGCAATAGATTTTCAAGTGTATTGTGCCTTGTTCTAAAACTTTTATTAAGTAGGTGCACTTGACAGTATT---GAGGTCATTTGTTATGGTGCTATTTCAATTAGTCTAGGTTTAGGCCCTTGTACATTTTGCCCATAACTTTTTACAAAGTACTTCTTTTATTGCACATTCAGAGAATTTTATATATATGTCTTGTGTGCGTGTCCTTAAACTTCCAATCTTATTTTGTCTCTTGGAGATTGTTGAACGCAGCTTGTCTAGGAAGGGGATGGGACTAGATTC-TAAAATTTATTTGGGACCATGGGAATGATAGTTGGGAAGAAAACTATTT----------------GCACACGAC---------------------------------AGATTTCTAGAT a score=26721 s mm7.chrY_random 25439 796 + 30114534 ACTTTTTGCTGCTAG-GTTGTGTAATATTTATTGAACATTTTGACAAATATTTATTTTTGTAAGCCTAAAAATGATTCTTTGAAAGCTTAAAGAAACTTGACCAAAAGACAGTATTAAAAAAAACACTGGTAT-------TTGATTGTCACTGTAT--GTGAAATAGTATATTTT-GGGTAATGTGAGCTTTTTAATGTTAAGTTCTACTAAA--CTTGAGTCAAATTGATCTAACCCAGTATTAGTGATGTAGCTACACTATTTTTCTTTTTTTCTTTTGACAAAATGAAAGGCAATTGGAATAATGAAAATTTAAAACATGCCAAGGTTTTGATGTA-----TTTAAGATATTAGTGAAA-----------ACTAAAA----------ATTTTCTCAGTTTGTTTGAATTTACCTTACT-TACATGATCTATTTGTTCAGTATTGTAACTGTCTGGCATATTTATAATCTTCAAACATGTGGTTATATCT-TTGTATTGCCATAATCAGTGATGTTTTACATTCAG-------------------TTTATCAGCCAGCAATACTTTCAGTAAATAA---------------------------TACACTAAATTTGCTGACTGTAGACATGGAACTTTAAGTTTCTATAAAGTTAGTAATTGCTTTATTGTATTAGTATTAGGTGCTAGCACTGCATATGTCTGATCTATTCTCATTTTATTAAAATAAAAA--GTATAGCAAAATGT------TTACTGTAACTTGTGACTTAATGTTC-------------TTGTGAACTTGCATGCTTGAACTGTTGGAA-ATCTCATTTTT---AGTTAATAAAAGAAGGTATTTGTAAAGTACACTGTTATGTATGTGTTTGCTTT--TTAGTTAATAAAAGA s bosTau2.chrX 20067027 878 - 48857030 ACTTTTTGCTGCTAGTTTTATGTAATATTTATTGAACATTTTGACAAATATTTATTTTTGTAAGCCTAAAAGTGATTCTTTGAAAGTTTAAAGAAACTTGACCAAAAGACAGTAC----AAAAACACTGGCACTTGAATGTTGAATGTCACCGTATGCGTGAAATTATATATTTCGGGGTAGTGTGAGC-TTTTAATGTTAAGTCATATTAAACTCTTAAGTCAAATTAAGCAGACCCGGCATTGGCAGTGTAGCCATA--------ACTTTCTGATGTTAGTAAAAACAA----AATTGGCGACTTTAAA--TTAAATCATGCCAAGGTTTTGATACACTCGTCTTAAGATATTAATGAAACACTTCAAAACACTGATACGAAGTGTCCATATTCAAATATTGTGTGTTTTTGTTTCGTTGTGTGTATTTTTTTTTTTCCA----GTGAATGTCTGGCTCA-TTGCAATCCTGAAACATGTGGTTATCTTTGTTGTATTGGCATAATCAGTGAC-TTGTACATTCAGCGATAGCATTTGAGCAAGTTTTATCAGCAAGCAATATTTTCAGTTAATAAATAAGGTTTCAAAAATCATGTAAGAATGACGTTAAACTTGCTGAATGTAAAGATTGAACCTCAAGTCACTGTAGCTTTAGTAATTGC-TTATTGTATTAGT-TTAGATGCTAGCACTGCATGTGCTGTGCATATTCTGATTTTATTAAAATAAAAGTTGAACTGCACAGTCTCTTTTGTTGTTGTCAATTGTGGTTTATTATTAGGTGAAAATAAAGTTGTGGTCT----TGCCTGAAGAGTTGTAAGATGTAATTTTTTGGGGTTGCCATCCAGTGCTGATTTTGAAATA-ACTCTTGGATACAGAATTACCCTGCTTTGTTAATAAAAGA a score=5981 s mm7.chrY_random 41138 197 + 30114534 TAGCAAGTTTAGCTGCACTGGTGATGACGCAAGTCAACAAAAGTCACGTGGGATAAAACGGTTGCTTCCATTGGA-----AAGCCTGGCTTTAGGGAGAGGTTATGGACGTTACGTGCGGTTCAC--ACTGACGGTATTATAACAACTTTATGCGGATGCTAGCGAAGTTTGATATTCTAA-GAACTTCGCTTAGGTTCTGCAAC s bosTau2.scaffold4077 30836 205 + 70888 TAGCAAGTTCAGTGGAGCCACGGCTGACGTGAGTCAACAAAGGTCACGTGAAGCGAGCCGGGCATTTCGATTGGCTGCATCAGCCGGGCAGGGAGGGGGGGTCACGGCGGCGGCGTGGGGTTCGCTGTGTGACACAATTACAACAACTTTGTGCTGGTGCCGGGGAAGTTTGTTTCTCCAACGAATTCCCCCCACATCCCTCAAC a score=11347 s mm7.chrY_random 41408 408 + 30114534 GTTTCCATGAAATCTTACGGATTATCTCTCACTACTGCTGCC---------------CTAGGTAATGAGGAAAAGAAAATGGCGGCGGAAAAGGCTAGAGGCGAGGGCGAAGAGGGGTCCTTCAGTCTCACAGTCGAAGAGAAGAAGGCGCTTTGTGGATTAGATAGGTACGCACTGCTAATACTTACAGGTTGTCTTTCTCTCTCCG---GGTTCAAAAGACTCTCC-AGGAGGCCTGACTGCATCTTGCTTGCGGTGACGAC-------TCGCTTTCGCCTAGCACTGTTAACAATGTTTTGG-------------------GAGATTTTTTACTGAT--GTC-------TTTCTGTGATCATTAACAAGAGCCATGTATTTCT-TCCACAGCAGCTTCTTCGGGTTCTTGACCCGATGCAAAGATGGCGCCAAGATGAAGACGCTGTTGAACAAGGTCAG s bosTau2.scaffold4077 31329 459 + 70888 GTTTCCATGAAATCCAGCGGAGTGTCGCTcgctaccgccgccgctgccgccgccgcTTTCGGTGATGAGGAAAAGAAAATGGCGGCGGGAAAAGCGAGCGGGGAGAGCGAGGAGGCGTCCCCGAGCCTGACAGCCGAGGAGAGAGAGGCGCTCGGCGGACTGGATAGGTATGGGTCGCCGTCACCCAC---CCGCCCGGTCTGCTCCGGACGGTTGGCGCCTCTCTCCGGGGAGGCCCGAGCGCGGTTCGCCTCTGGCGGCGGCGGGGCGGGCACCTGGGCTTGGCGCTCTCGGTGCCGTATCCGCCGCCGCCGCCGGGGCCTCGGGATCGTGCAGGGATGGGTCGGGAGGGTTGCTG-GAGCTCTAACGAGCCGCGTGTGTCTCTCCCCACAGCCGCCTCTTCGGGTTCGTAAGGTTTCATGAAGATGGCGCCAGGACGAAGGCCCTACTGGGCAAGGTAAG a score=3485 s mm7.chrY_random 42323 100 + 30114534 TTTGCATTGTCATTTAGTTAT----TGGCTGCTGGTATCAATC-AAGATGGTGGGAAATAGAGGGAGGAGAGGGGAAATGAAACAGTTTTAGAAAGGAAACAGGG s bosTau2.scaffold4077 32495 105 + 70888 TTGGCACTGTCATTTAGTTAAGTAATGGCTGCTCCTGTCGGCCCAAGATGGCGGGACAGGGTGGGAGGAGAAAGTGAAGGGGGGGGTTTGGGGGAGGGAGGAGAG a score=2150 s mm7.chrY_random 42756 56 + 30114534 TTGTTACCATTATATAGTTTCCGTTCTAATGAAAATCAGTGATTATAAACTTGATA s bosTau2.scaffold4077 32928 56 + 70888 TTGCATCCATTAAACATTTTCTTTTCTAGCTGAAATCAGTAGCTTTGCATTTGATA a score=11060 s mm7.chrY_random 47102 192 + 30114534 TAGAGTTTTATTTTAATTGTAAATGTTTCTATGTTTCATTTTTAGGCAATTCACTTCTATGAGTCTTTAATAGTAAAAGCTGAAGGAAAAGTGGAATCAGATTTCTTTTGTCAATTAGGTCACTTCAATCTCTTACTGGAAGATTATTCAAAAGGTAATTCTT----TTGtttaa-aatatctaatttatatttata s bosTau2.scaffold794 246148 196 - 345187 TAGGGTTTTGTCTTTTTCTTAAATGTTTGTGTTTTTT-TTTCTAGGCCGTTCGCTGCTACGAATCTCTAATCTTAAAAGCTGAAGGAAAAGTGGAGTCTGATTTCTTTTGTCAATTAGGTCACTTCAACCTCTTATTGGAAGATTATCCAAAAGGTAATTTTTCCCCTTGTTAAATACTGTTTGATTTATATATGTA a score=4778 s mm7.chrY_random 62342 137 + 30114534 TGAGAGTTTCTTTTTATTATCTTTTTGTGGAAACATGAA------------------GCACAGCTTGattaattattatcattattattattttaGCATTGTCATCTTACCAGAGATACTACAGTTTACAGACTGACTACTGGAAGGTCAGTACA s bosTau2.scaffold794 257146 151 - 345187 TGGGAGTTTTGTTGTAATGTTTCTT----GAAACTTGTATTAATTGATTTTGAAATGGGACAGAATTATGACTCATGCTTGTTTTCTCTCTTTCAGCATTATCTGCATACCAGAGGTACTACAGTTTACAATCTGACTACTGGAAGGTTAGTGCA a score=6533 s mm7.chrY_random 87405 155 + 30114534 TGATATATGTAACA-ATGGAAA-ACATTTAATAAAAATTATTTTTG--------CTTTACAGAATGCTGCCTTTTTATATGGTCTTGGTTTGGTCTATTTCTACTACAATGCATTTCAGTGGTAAGTTCACTACAAAtgtgagtctccccactctcgtggctttt s bosTau2.scaffold794 269490 158 - 345187 TAACATATGTATTAGATATAAATGCCTTTCTTAAAAGTCTCTTTTTTTCCCTTTCTTTTCAGAATGCTGCCTTTTTATATGGTCTTGGTTTGGTCTACTTCCATTACAATGCATTTCAGTGGTAAGTT-------GATGTAAAACTAGTAACTCCAGTTGTTTCT a score=10701 s mm7.chrY_random 89508 285 + 30114534 TTTTTTTTTTTTTCCCTTTTTACTGACATTTCAACAAATATTAGGAAACTAAAACATTTCCTGTATAATAGAG------AATACA---------TATGTTACAG-----------ACATAACTTTTTAA---------TATTTTGTGTGTGTGTGTACCTTCTCTTTTCAGGGCAATTAGAGCTTTTCAGGAAGTCCTTTATGTTGACCCTAATTTTTGCAGAGCCAAAGAAATCCATTTACGACTTGGTTTTATGTTCAAAATGAATACAGATTATGAATCTAGTTTAAAGGTATGTGATTGAAGTTTTTCAGGTGTAC s bosTau2.scaffold794 277637 303 - 345187 TCTTTTTTTTTTAAGCTATCCATTGACATC------AGTTTTATAAAACTGG--CATTTCCTTTAAAACAGAATTGCATAAAACAGAAATTTACTGTGTTACCATGAAAAAATTCATGTAATTGTTAAAAAGTAAAGATATCTTTTGTCTATGT---------TCTTTCAGGGCAATTAAAGCATTTCAGGAGGTGCTTTATGTTGATCCCAGCTTTTGTCGAGCCAAGGAAATTCATTTACGGCTTGGGCTTATGTTCAAAGTGAACACAGACTATGAGTCTAGTTTAAAGGTAGGTTGTTGGGTTTTATCAAAGATAC a score=5575 s mm7.chrY_random 97489 155 + 30114534 AGTTTTGTA-TTATACTATAATTTACAGAATTTTAAGTTAAATGAAGAAAAGTACTTTA--------ATGCTTAACCTATTAATATTTTCTCGT-TTGCAGCATTTTCAGCTGGCCCTGATCGACTGTAATGTCTGTACTTTGTCCAGTGTCGAAAGTAAGTGTT s bosTau2.scaffold794 289959 151 - 345187 AGTTTCATAATTATATTAAACCTTATATACCT--------------GAAAAGTATCTTGTATGACTGATTTTTAGTGCGTTAATTTTCTCTCTTCTTGCAGCATTTTCAGTTAGCTTTGGTTGACTGTAATCCCTGCACTTTGTCCAATGCTGAAAGTAAGTATT a score=5404 s mm7.chrY_random 100084 192 + 30114534 tttataatgtatatattatatt---aCTCTCTTTAAACTTGGCTAAATTGAAATTTCCTT------TTCTTTTCTGATCCATTACAGTTCAGTTTCATATTGCTCACTTATATGAAACCCAGGTAAG-GTTTTAATTTATCTT--TTTAAATAAGTTTTTCCTTTTGTTAGTGTGACAAAATATGCGAGAAAACTTAATAGTGT s bosTau2.scaffold794 293775 201 - 345187 TTTATATTTTACATTTTATATTCTTACTTATATTTATCCAGACACTACTGTAATACAGTTGTTGACTTATTTTCTCATCT-TTGCAGTTCAATTTCACATTGCCCACTTATATGAAACCCAGGTAAGTGTTTTAACTTAGCTTACTTTAAAACACTCATACCATTT-TAAGTGGAATCAGATACAC-AGATAATTTAATGAAGT a score=8119 s mm7.chrY_random 110254 245 + 30114534 TTTTGTTTTTCTGTCTTGTTTTTTCTGaata-----aaattttattattgtttatttactttaaattaGGGATATTTATACTAAAATATGTATTATCCAATTTTTTTCTAAATATCTGTTTCCCTTCTATTTCTTAGAGGAAATACCATTCTGCAAAGGCAGCCTATGAACAACTTTTACAGATTGAAAGCTTGCCATCACAAGTCAAAGCAACTGTATTGCAACAGTTAGGTACATAGAAAC-TTCATTT s bosTau2.scaffold794 307025 237 - 345187 TTTCATCTTTCAGT--TGATTTTTTAAAATATGCTGAAATATCAGTATTGTATAAG-ACTTAACAT--GAGCTAATTCTTTAAAGATGTTAATTTA-----TTTTCTTTAAATCTTTTTTTCC----TGCTTTTTAGAGGAAGTATCATTCTGCAAAGGAAGCTTATGAACAACTTTTGCAGACAGAAAACCTTTCTGCACAAGTAAAAGCAACTGTCTTACAACAGTTGGGTATGTAATAATATTCACTT a score=10793 s mm7.chrY_random 112109 381 + 30114534 ATTATAGGTTGGATGCACCATAATATGGATCTAATTGGAGACAATACCACCAAAGAGAGATATGCTATTCAGTATCTCCAAAAGTCATTGGAGGAAGATCCTAATTCTGGTCAATCTTGGTATTTCCTTGGAAGGTAAGGC--------CAGATTCTTAGACTGT-CTATAGTTGATCTACACTTAAAAATT-------------------GGTTTACTAATATTATACTTGGTGATATTTTAATTTCAACTATAATAACTACTAAGAGGTGAGAATGAATAAGAAATGAATTT-------------TTTCTTTA---------------------AAGTTTTCTTATTTTGTTCATTACAGTTTATTTTCATATTATATTCTGACTGG-------------------------AGTTATTTAATAGGTtttttaattagctttttctttatttacatttcaaatgct s bosTau2.scaffold794 309648 460 - 345187 ACTATAGGATGGATGCATCATACTGTGGATCTCCTGGGAGATAAAGCCACCAAGGAAAGCTATGCTATTCAGTATCTCCAAAAGTCCTTGGAAGCAGATCCTAATTCTGGTCAGTCCTGGTATTTCCTTGGAAGGTAAGACTGATTTATCAGAAACTTAGGTTTTGCTTTTGTTTAT-TGCAGCTAAGAGTTTTAAATTATCTGAAATAGCAGTTTACTAATAATGTGATCAGTATATTTTCCCTTTTAAATAT-TTTATAATGAAGATTTCTAGATAAAAAATAAAAGAACTTCTGAATGTGGTAGTTTTCTTATACCATCATCTGGTCCATCAGGATATTTCTTGTTTTGCTTATTGGATTTTCATTTGAC-TTAAATTATTGCTGGTTTTCAAAAACTCTTGGCGGATACTAATTATTCAGTCAGGTATTTAAATGCCTTTCCTTTTG-----ATTTCTAGTGTT a score=10025 s mm7.chrY_random 115566 515 + 30114534 ACATTAAAAAATAGTGTTTGACTGCTTTTATTTAGTTAATTTCAAAAAGTAAAACTAAATTC--ATTACTGAAGT--TCCGAATAAGTAATTTTTATGTAGATCA--AACT---CTCGTAATGTTGGAAAAAACA----TTGTGCTACTTAAGTATGGGTTTGTATGTTTAACCCTTAA-ATAACAACATTGAAAAAAAAAGCCATTCAGTGGAGTTCATTAGTAC---AATGTGTTAGCAGATCACTTACCAACAATTGAAGTATATTATATGTCAGCATTCTTATATAAAAGTAGATCTATGTAATGTCACTCA---------------TTCATAAGAGCTAGTCATCTACCCTCTTTAAGGATAAATCATTTTGGCAAATCAGCTATGCATTGATGAG---ATTTTATTTATAACTGTGTATATTT---------CCTTTCAGGTGTTACTCATGTATTGGGAAGGTTCAGGATGCCTTTGTATCTTACAGGCAATCCATTGATAAATCAGAAGCAAGTGCAGACACATGGTGTTCAATAGGGTAAGCCTATCTTT s bosTau2.scaffold794 314559 536 - 345187 ATATTAAAGATTTGT-------TGCATTTATTTTTATTATTTAAGAAAGGAAAACTGAAATCTGATTCAGCAAGTCTTACCAGCATGGAATGTTTTTCTTGGTTTTTAACTAATTTCTTACTCTTTGGAAAACCAGAGATCAAGTTGTATAAGTATAGTGGTGTGTATATATCTCTCAATATTATTATATTGAAGTGATATGGCATTTAACTATTTTAATAGGTGCTAAAGTATGCTGCACTATTAAACACTATCAGATAGTCTATAATATAG---------CTTATTGAAGGGTTAAT---TATAGTGTTATTGACATGTATATTCACACTTCACATAAATTTGTTCTCT----TATTAGATTTTTATTTGCTTTGACAGTCTTTCAGCACATTAATCAATGCATATTAATCATATTTTCTTATTTTTTTCCCCTCCCCTCTTAGGTGCTATTCAAGTATTGGGAAAGTTCAGGATGCCTTTATATCTTACAGGCAGTCTATTGATAAGTCAGAAGCAAGTGCAGATACATGGTGTTCAATAGGGTAAGACTTTGTTT a score=58841 s mm7.chrY_random 116767 2117 + 30114534 TCATTATTTTTCTTTCTAGTGTGCTGTATCAACAGCAAAATCAACCTATGGATGCCTTGCAAGCCTATATATGTGCTGTACAGTTGGATCATGGACATGCAGCAGCCTGGATGGACTTAGGTATTCTTTATGAATCTTGCAACCAACCCCAGGATGCCATTAAATGCTACTTAAATGCAGCTCGGAGCAAATCTTGTAATAACACCTCTGCACTTACATCAAGAATTAAGTTTTTACAGGTAA----TCTCAAG---AGTATTATAAAGGACAAATTTTCTAATATAATAAGTGACAAATAGAATGATGCCTGAAAAGTCTTAAAATGATCTTTCCTTTTAGTTATATTTGTTTtatgtgggtgttcatatgtgtgttatgagactaatttggaagacaaagtacagtttgtgtgagtcagttcactttttcatcatattgatcttgaagattaaacttaggttctcaagcttCCCACTGAAGCATTACAATAGCTCCTTTATTTGTCTCTGGGTGTTAACTATCTTAGTATCTTGAAGTATTACTTTTAATTCTA-GTAAGATAGGTAGAATTT-AAAACATTTTTTCTCTTGATATGATGTTGT-GATGCATATCAGTTTACATGCTGTACATTTTATTAGGCACTTTTCAATGT--TATTGACATTCTAAACTTGTCATA--ATTTCAGTAAAAAAGGACATGAACCCCGACTTTCATGTTTGGTTGAAAATTCATGGGAAGTATATGGCAGCT-TGAAAAGTGTGAGGATAGA-------TCTGTTCTAATTCTCCTAAA--TATATATTAGTT----ACTCTTTATAGTTAAATATTTATCCAAGTCCCCCAATTCACAGTTATATTTCTGTAAGAATTAATTACCTATAGCATTGAGGAAGATTTAGTGGACTTTATCTTACTTAAATAGGCTTGTGTTAAATTTGCTTTTTACATAATTTTTCCTAGGCTCAGTTGTGTAACCTTCCACAAAGTAGTCTACAGAATAAAACTAAATTACTTCCTAGTATTGAGGAGGCATGGAGCCTACCAATACCCGCAGAGCTTACCTCCAGGCAGGGTGCCATGAACACAGCACAGCAGGTGAGAA-----GTTATCTTCTGTAGGTGCCCAGCTTTTAAGGTTTTTTGCTGTCCAGTCTATAGTAATCAAAAACTTACTATATTAAATAGTGGATTAGATTCtttaaaatgtaaaaatctttaaattaaaatatttaaCTGCAAAGTAGTTTTAGATCAAAATGGGACTCCCTTTGAGGTGGGAAGGTA-CTTGGTATACCAGTTTAAAATCCTCATGTAACTTCATGATTTGGAAGTAATTTTTTCTGTGACCAAGTTCATTATTAAAAtgttgttgttgttgttgtt----------gttTTTTAAA-GAAGGTATCCATTTGTCTAGTGAT--------------------------------------------------------------------------------------------AAATACGAATAAATAGAATCATATTTTTAACTTCTTAAAAACTTCTATGATTTGTTAGGCTTACAAAACTTACAATCCAAATATTGAACCTGTATTACACTCTAGTCAGATAC------CACAGAAATACCTGTTGTTATACAT-ACTTATGATACTGAAATTAAAAAAGCTTGCCCACTTCTACTACAAGAAAAGAA----CTATTCCAACAA------ATGTTTAACAGATACA------------------------------------------TGTA-----------------GTCCCTTACTTTCTGCATGTTGATCTCTAAGGGTAAAG--------------CCTTTTATAATCTTTGCCTTGGCTTATATTTAGAAG--AGTGAACTATCTATGTTCATTAATACTTTCATTTGTTGATTTTTCT---------ATCACAGTAAAGTAGTTTTACACCACTATTTGCTGACATTAAAATAAATATAATGTTTACTATATAATGGACA-----GTCTTAACACTACTC---TGAAACACAGATAAGAAATAAGCCTCTTTTAAAAATGTGTTTGGAAATGGGTGTTTAGATAGTGTTTGAGT-----------------ATTTAAAAGTA--------------------CATA----------TATTTGTAAAGATTTCAATTAATAATTGCCGTTCTTTCATTAGACAT--AGTTAA---TATGGATTTAAACAAATATTCCTAA----TTTTTGAAATAAAATTTTTTCAGAGTGTTTCTGATACCTGGAATAGTGTCCAGACAGCTTCACATCATTCAGTACAGCAGAAAGTTTATACACAGTGCTTCACAGCACAGAAATTACAGGTA s bosTau2.scaffold794 315188 2193 - 345187 TCTTAATTTCTCTTCCCAGCGTGCTATATCAACAGCAAAATCAGCCTATGGATGCTTTACAGGCCTATATTTGTGCTGTACAATTGGACCATGGCCATGCTGCAGCCTGGATGGACCTAGGCACACTCTACGAATCCTGCAACCAGCCTCAGGATGCCATTAAATGCTACTTAAATGCAACCAGAAGCAAAAGTTGTAGTAATACCTCTGCACTTGCAGCACGAATTAAGTATTTACAGGTAAAATGTTTAAATCGCAGTTTTTTAAAGG-CACATGTTTCCCCATGACACTCAGGCAGGAGGAGGGTGGCTGGGAAGTTTG---------------TCTAGTTGTCTTTT---------GATGTCTATA-----------------ACTTG-----------------------------------TTTCCAT-------ATTTTG-----TAAACATA----------------------------CCATAGCT-------------------------TGTAATATTATTTT--------ACTTTTCATTTTAAGTAAGATATACAGTATTTTAAAAGATGCTCTTTTGTGCATTTACCCTGTTAATGCATATTAATTTACATA------ATTTT----------TTTCTATGTACTGTCTACATTTTTAAGTTGTCATAGCATTTTAG-AGAAAAGAACACGAACACTGTCTTTCACTCTTGCTTGGAGTTTCATGAGAAG------ACAGCTATAAGAACTCTGAAAACAGAGCTCAGCTTTGTTTTAATTCTCACAAAGGTTTATATTCCTTTTTCCCTCATTATACTTAG-TATCTTTCTGAAACCCCAAATTAA-GGATCTATTTTCTTAAAAAC-AATTAGTTATAGCATTTAGGAAGATTTAGTGGACTTGCTCTTACTCAAGTAGGCTTGTGTTAAATTTGCTTTTTACATAATTTTTCCTAGGCTCAGTTGTGTAACCTTCCACAAGGTAGTCTACAGAATAAAACTAAATTACTTCCTAGTATTGAGGAGGCGTGGAGCCTACCAATCCCCGCAGAGCTTACCTCCAGGCAGGGTGCCATGAACACAGCACAGCAGGTGAGAAGTTGGGTTATGTTCTGCAGGTGCCCAGCTTTAAGGGTTCTT-----TTCAATCTGTAGTAGTC--AAGCGTATTTTACTAAGCACAGG---AGGCTTTTATTAATGAAAAGACTCTTG---------ATTTAATTGTGAAGGGAATTTAGATCAAATTAAAACTCCCTCTGATACGGGAAGAAATTTTGGGGTGCCAGTTTAGAACCTTTGTGCATTTTCATGGTTTTGAAGGAAATTTC----------------TTAACATAATGCTGCAGTTTATTTAATTTTTGAAACAAGTTTTTCAAAGGAAGGTACACATTACTCCACTGATGATTCATTTGATTTTCAATAATTACCATTCAGCGATGTCCACATAGATTTGAAAAGTATGCAGCTTGTAAAGTTGTATAATTTGAAGGAATGAATTAAGAATATATAGAACCCTATTTTTGTCTTC-------CTTCTGTGATTC-TTAGGCATGTAAACCTCATCATCCAAATACTGAACCTGTATTAGGCCTCAGTCAGACACCAATTTCACAGCAATCCTTGCCACTACACATGATTCCTTCTAGCCAAGT--AGATGACCTGTCCAGTCCTGCCAAGAGGAAAAGAACATCTAGTCCAACAAAGGTATATATTTTAGAGAAATAGAAAATCCCAGTCAAGAAAGAAATTCCTAACTGCCCTGAACTTGTGCAGTTTGAACATCTCCTGTCCTTTATTTTAAATCTGTGGACATCAATGAGTGAAAGGCTTGAGTTTTTTCATTCCAAATTCTTAGTATCATATTAAATATGGAAAGTAGGGATAAATTTGCATTCATCAAATCAT---TTTATTCATCTCCCTGCCGTTAAGATCTCAACACAACTTTTCATCATCACTTTCTACTGACATTAAAATAAACTTAACATTGA--ACCTAGTGGACAGTGTGGTATTTAGGTTAGTCATTTGGGCCATAGTTTAGGGGTGGGCCTTTTTGGGTGGCTAATTAAAGAATCAATATTTTCTTAAGTTTTAAGTTCCCAAATTTACTATGCATGTAAAATTACTTTTAAAAGAACTAAATGTCATAACATCTTTTTTATATGTAAATATTCCAATTCATAGTCATTTGACCTCCATTAGTCATTATATTAACTCTATGGATTTAACCAAATATTCTTTAATTTTTTTTTAAATCAATTTTCTTCAGAATACTTCTGATAATTGGAGTAGTGGCCATGCAGTGTCACATCCTCCAGTACAGCAACAAGGTCATTCATGGTGTTTGACACCACAGAAATTACAGGTA a score=13707 s mm7.chrY_random 120436 410 + 30114534 CTTCCAGATCATACAAGCA-----------CATTTTCTTTTTGTGCTTGAAGATGAGACAAATAAGAGTTTGCCCAAGTACAAATTTTTGGAATTCCTAGTAGACAACCAATACCTGACACATCACTGCCTACAAATTC------TGTCCAGCAACCATATGTTGCTCTGAT-AGAGCACCTAGATTCTGTCAGTATGAGGGTCACACTGCTTGTTTTGAAAAGTTTTTGTCAGGTGGATCTTTCTTTGGAGGTTATGGCCCTTTAGGTATATCCAAATTTTTAGGAAATAG------TACTATGGCAGAAAATAATTATTTTATGGGAAATGGAAATAATGGAAATATTCCTTACATGTCACAAAATACATGTATTCTACCTTATAACTGCATAAATGTGACTA------CAAGAGGGCCTTGGAGAAAACAACTGTTT s bosTau2.scaffold794 318975 436 - 345187 CTTATGGGCCACACAGGCAGCATTGATTTTTATTTGTTTTTTTTTTTGACAGATGAGACAAACAGGAGTT-ACACAGGTACGATCTACTGGAATTCCTAACGGGCCATCAG---CTGACTCATCACTGCCTACAAACTCAGTCTCTGGCCAGCAGCCACAGCTTGCTCTGACCAGAGTGCCTAGCGTGTCTCAGCCAGGAGTCCGCCCTGCCTGCCCTGGGCAGCCTTTGGCCAATGGACCCTTTTCTGCAGGCCATGTTCCCTGTAGCACATCAAGAACGCTGGGAAGTACAGACACTATTTTGATAGGCAATAATCACATAACAGGAAGTGGAAGTAATGGAAACGTGCCTTACCTGCAGCGAAACGCACTCACTCTACCTCATAACCGCACAAACCTGACCAGCAGCGCAGAGGAGCCGTGGAAAAACCAACTATCT a score=36751 s mm7.chrY_random 127926 1334 + 30114534 TTTAAATATAGTCTCATAAATTAAAAA----TATATTGTTGGAACATGTAATTTACAAAGCTCAGATAATATACATTGTATATTAGGTTTATTAAAAAATCATAACTC------TTAGTTTAT-TTG---TGTTCATGACTGTAATGCATATGTATTGTAACTTAAGTCTAAT----------------AAATATAGTATTTTTA-ATGTGAGAGTGTTGTATGAAATTCTCAAACTTTTATTCAGAAAAAATTGGGAAGGGGCATTAGTAAATGGAATCAGATCAAGT----------TTTACTCTGAAAATTTTAAAATGTTG-------ATTATAGACAGT--------------------GTTAGAGATATTTTGTACA-TTAATTACTTATTTTTGGTGGCTTT----ATTTAACATTTTGTCATGTGTTCATGGAGTTTA--TAATATTTAAATCAAGTT-GTTTTCTTTCTTTTC----------------TTAGAGTT-----TTGG-------TAAAGATCAACAACCTCCATTTCAAACTGGGTCCACACGATATCTCCAAGCAGCTAGCACTAATGATCAGAATCAGAATGGAAATCATACTCTGCCTCAGAATTCAA------AAGGGGATGCTCAAAATCACTTCTTA---CGTATTCCTACCTCAGAAGAACAAAAGATCATTAACTTTACCAAAGAGAGCAAGGATTCAAGAAGTAAATCCTTGACTTCTAAAACAAGTAGGAAAGATAGAGACACATCTAATATCTGTGTTAATGCAAAGAAGCATTCTAATCATATTTATCAGATCTCATCAGTTCCGATTTCCAGCCTTAATAATAAAGAATCTGTGTCACCAGATTTAATAATTGTAGACAATCCTCAGCTTTCTGTC---TTAGTTGGAGAAACTATCGACAATGTGGACCATGACATTGGAACTTGTGACAAAGTCAATAATGTTCATCTAGCCATTCACAAAAAGCCTGATAATCTTTCTGCTTCTTCACCCTCTTCAGCCATTTCCACAGAAACACTTTCTCTAAAGCTCACTGAACAG------ACACACATTGTTACCAGCTTTATCAGTCCTCACAGTGGATTACACACAATTAATGGAGAAGGGCATGAGAACTTAGAGAGTTCTGCCAGTGTTAAT---------GTTGGCCTCAGACCTAGATCTCAAATCATACCATCAATGTCTGTGTCCATATACTCCAGTTCAACAGAAGTTCTGAAAGCGTGCAGGTTAGTGTGTTTAAAGTTCATTTGAAGGTGGAAATGATTGACT-CTGTCGACATAAGAAAGCATGAAATATAACTGAAA-----CAAAATACTATTATTTCTTTGTAAAGTGTGTGAAA--GACTATATAGTTA---GACGGGAAGAAGGCAGTTTCATATGCAGGGTGTTTTTTTCTTAGCCTTAGATGATGATATAGTGCTTGTT s bosTau2.scaffold794 323310 1426 - 345187 TTTAAAAATAGGATT-TGAATTAGAGAAGCATAGATTTTTAG------TAATTATAAAGGTTTAATGAATTATCTTTCTGTATTAA-TCTGTTAACAGGTCACAGATCAGTGAGTTAGTTTATATTGATTTGATCATGGCTTTAAT---TATTAATGATAATATATGTGTATTTATCCATGCTGATTTTAGATATA-TATATATATATGTAAGAACTTAATTTAAAATTTTCAGTGCTTCATATGAAGTAATTT---ACGCCACACCAGCAA-TTGAATCATATTAGATAGGATGGGAAGTCTCTCTAAAGGTGTTAAACACTTGGTGGCTAATTATAGGTACTTATGATAACTTCAGAATTTGGATCAAATTATCTTATACAACTAGTTGTTTAGTAGTTTTGCTTTTTAATATTTTAAATTCTGT-ATATACCCTCTGAGTTTGCTTAATATTAGATTTAAACTAGTTTTCTTTCTTTTTAGGGGCTTCACAAAGGTCAGAGTTCACATTTGGCAGGTCCTAATGGTGAACGACCTCTCTCTTCCACTGGGCCTTCCCAGCATCTCCAGGCAGCTGGCTCTGGTATTCAGAATCAGAATGGACATCCCACCCTGCCTAGCAATTCAGTAACACAGGGGGCTGCTCTCAATCACCTCTCCTCTCACACTGCTACCTCAGGTGGACAACAAGGCATTACCTTAACCAAAGAGAGCAAGCCTTCAGGAAACACATCGATTGTGCCTGAAATAAGCAGGCACGCTGGAGAGACACCTAACAGCACTGCCAGTGTTGAGGGACTGCCTAATCATGTCCATCAGGTGACGGCAGATGCTGTTTGCAGTCCTAGCCATGGAGATTCTAAGTCACCAGGTTTACTAAGTTCAGACAATCCTCAGCTCTCTGCCTTGTTGATGGGAAAAGCCAATAACAATGTG------GGTACTGGAACCTGTGACAAAGTCAATAACATCCACCCAGCTGTTCATACAAAGACTGATAATTCTGTTGCCTCTTCACCGTCTTCAGCCATTTCCACAGCAACACCTTCTCCAAAATCTACTGAGCAGACAACCACAAACAGTGTTACCAGCCTTAATAGCCCTCACAGTGGGCTACACACAATTAATGGAGAAGGGATGGAGGAATCTCAGAGCCCTATGAAAACAGATCTGCTTCTGATTAGCCACAAACCTAGCCCTCAGATCATACCATCAATGTCTGTGTCCATATACCCCAGCTCAGCAGAAGTTCTGAAGGCATGCAGGTTAGTGTG-GGAAATTTCATCACAAAGTGAAAATGGTTGACTACTGGCCTGCTCAGAATGT-TGAAATATGATTTGAATCTTCTAAGATA------------TGGAAAGTAAGCAAAAAGGATGATGTAGTCACTCATCTGAAATAA--CAGTTTGAGGAGAATTGTGTTATTGT-----------ATATTGTCATAATTTTTATT a score=2228 s mm7.chrY_random 129313 101 + 30114534 TACTACTGTCTCTTTTTTCTTATTAGAGTTGATAGCTGTAATA------------CTGGGGGTAAAAT-TGATAGTGAGTTAAATCTTATGTGGTAGAGAAAATGAAGCCTAGA s bosTau2.scaffold794 324799 114 - 345187 TGTTACTGCCCTCTACTGGTTACTGGAGTTGTTGGCTTCGGTGTGATTGGCTGCTCTGGGAATTGAACAAGAGAACGGGTTAAATCATATTTGGCGAAAACAGCAAGGCCTGGA a score=7657 s mm7.chrY_random 132622 1108 + 30114534 ttttgatttttaaaaaaaaataaagt--atacattatgtattttatatttttttCTCT-TTTTAAAGGAGTCTAGGTAAAAATGGTTTGTCTAATGGTCATATTCTCTTGGATATATGCCCACCTCCAAGACCACCAACTTCGCCATATCCTCCTTTACCAAAGGAGAAGTTGAATCCACCCACTCCTAGTATTTATGTGAGTCTGA-TTAACTAAATAGAAATAAGTCAA-----TATTATGGACTAACTTG-----AATGATACTATAAGGTAAATTAAT---------CTTTAGGGAACAATAAATTTTTACTCCTAATGAGTTGAATATATCAGAAATAGATACTTGTATTATGAAA---------ATTACTTTAAAAATAGGTGCTCTTAATGTAAATATAAAAAATGTTTATTATCTAGTCTCTGGAAGAAAATTTTGTTTACAGATGGTGAATTAAAGGATATTTTTAATGGATT-----ATTAGCTCACTGAAACAAAACTTTTCTATTGTTAGCT-----TTTAATGAATACTTCTCTG----------------TATCCATAGTTTTTCTAACATTTGTCAGCAGTAAAAAAGCTGATGAACTTTTTTTTATCAAATTTGTCATTCTTAAGGATTGTAAAGTTGCAATGAGGTATCAAAATGACATGAA----TCTAGTGCCACAcctagcacttggaaaaattggccttctgatctctatgaattagaggatattttgttcttcatgatgagttttcattctagccaggaatacgtagtaagactctAAGCAACATAAAGCAAGCCCCAA--------ACCCAAGATAA-------CACATTTTTTTTTTCTGGAAGTATTTGTATTCTCTATCCTTGCTCATTTTT--CCTAAATGAAA-----TAATGAAAATTCTAGGCAAGTAAGTAATAATGTAGTATAATGTTGtacatgtgtgtatacataaatatatacatataatatatacatatatatcata-----catattcatataTGTGG----GTTGTATTGATTGTCTTCTG------------------TCAACACATT------------ACATAAATCTTATTGTATAAAAAGGTTTGAAAAAGAG---------------------------------------------------ACTTGTAAGAGGTGGGAAACTTTAAAAAAATGTTGAAAATAAAAACAAAATTTAGATTTGTTCCTTTTGGGCCTAACTAGTT--CATTTTACATGTT s bosTau2.scaffold794 330261 1155 - 345187 TTCTGTGTTCTAAATAAATGTACAGCTGATTTATTCTCCCTtttttgtttttgtttttgttttAAAGGAACCTAGGTAAAAATGGCTTATCTAACAGTAGCATTTTATTGGATAAATGTCCGCCACCAAGACCACCATCTTCACCATACCCTCCCTTGCCAAAGGAAAAGTTGAATCCACCTACACCTAGTATTTATGTGAGTCTGAATTGACTGACTAGAAATAAATCAAACCAGTGTT-TGCACCTACCTGTCTTTCGTAAGATCTTGCTTTAAATCAATATGGATGCCCTTTAGGAAGCATTAAAATT--ATTGGTGGCAGCTTGAATGTTTTGGGAGAAAACGAT-GTATTCAAAAAGATTTTGTAATAGCATTTAAAACTTGCCTTCTCAG-----ATATTAACTGTAATTATATTACAGTAGCACGAA--ATACTTTTTTTA-----------TTACCCCTAATTTTTAACAGATTTAGGCAAAAACCACTTAAAAAGTAACTTTTTTGAAGTAAGCTGTGTTTTAAATCTGCATTTTACTAGTTGTAAGAACCTTAACATTCATTCTGTTTTAACCATCTACCAA----AAAAATACTTA----CCTTCCTCAAAAAAAGGTGT------TGAAGAATATAAAAT-GCGATGATAGAT----ATGTCATTAAAAGACTTAATAGATTATTTAGAACT---GAGGATTAGTTTT------------ACTTAATAGACATTTAGA-----------------CATCTTATATAGGAAGTTG--ATAAGAGTTCAGTCAA-----AGCAACTCTTACTTATCTTTCTCCAAAATAGGTCCTCCTACCCTATTTCTTTCCA-------------TCTTCCCATTTCCCCACTTCTACCCCAAATGAAAAGTTTTATTGA---TTTTAAACAC------------------TGATTTTTTTTCTCTCCtttttaataaagat---cacataacataaa---atttatcatcttaaccatttttaagtgtatagttcagtggtgttaagtatattcttattgttcagaccagttctccagaacattttcatctggcagatctgaagtttaatactca------tttaaaaaacagctccctcttccctcgtctccccagcccctggtagccatcactctgttttctatttgtatgaatttggctacgttagatacctcatgtaagttaaatta---tgcacagtttttctttttgtgactgacttattttcatttaaagtgtc a score=8183 s mm7.chrY_random 133816 721 + 30114534 CAAAGTTGGAAAAAATTTGCA-----TTAACTAAAATATTTGTCTGTCACCTTAGAAGTCCTAATGTGATATCAGAAATAACTAAAAAAAAAAAAAAA----ATCATTGTAAAGTTCTCTTTTTATAAGGAAAAAATATAGGTATT--------TGTAATTCACAACATTATAGTAATGGTTAGGAATGTGAATGTATTTGTTACAAATTTTAAGTTACCAAATTGATGAAAAAAATGAAATGTTCATATATCTTAATCAGTTTCCT------GAGAGTTAATGAAATATTTTAACTTTATAGTTGGAAAATAAGCGAGATGCCTTTTTTCCTCCATTACATCAATTTTGCATCAATCCAAAAAACCCTGTTACAGTAATTCGCGGTCTTGCTGGAGCTCTTAAGTTAGGTAAGTTTAAAAATGTTTGAACATTTTCATTATCAGTGAATGTAGAATAGTAGTAGTTCATTGGTTTATTTTTAACATGTAGAATCTTTTACT-TCTATTTATTTTT------------GTATTTTTAATCTTCTGTCTCCACTTCTCTCAGCTACCTCTTTCTTATTTCTTTTATTTTCACCTTTTTCTTCCTC--------------------------TTTTCATTTCTTCATTTGTAGACCTCCACTTCCTCTTTTTTTTATCTCCATGTTTCTACCTGTCTCTACTCAATGAATGTGTGTCAACTTTCATAGTTTATTAATCCTTTAAAATTTTCAGAGTAATTTGTACCTCTTTTAAATACCATTTGA s bosTau2.scaffold794 331464 662 - 345187 taaggctgaataatattTAAACCGTTTTGATTTTGAAGTTTAAATTTCATCTCACGTGTTTTG------TGCAAGATATAATGGACAAGAGAAATGTATGTGGTTACTATCTAATTCCAATT--AGAATCAAAAGACATGGTGATAAAATACTATAAAATATAAAAAATAGAAGTAATGGCACATA----GAATGCATTATTTA-----TTTAAATTGT----------AAAAATGTGAATTTGACATAATTTCTAAAAGGTCTGCTTTTATAGAGATCTAACAATATATTTTAATTTTGCAGTTGGAAAATAAACGTGATGCTTTCTTTCCTCCATTACATCAATTTTGTACAAATCCAAACAACCCTGTTACAGTAATACGTGGCCTTGCTGGAGCTCTTAAGTTGGGTAAGCTTTAAA--------------------TAAGAAAAAG--GAAAAGTAT----------GTGTATTT--------------CCTTTACTATCTATTAACTTCTAAAGCACTAGCAGAAACTTTATTCTTTTGTTGTAATTTTTCACA------------------TTTTCATTTTAATATTTTCCTGTCTGAGAAAGAGAAGGAAGGAGGGAGGGAGTATTACTTTTTTAATTC-------------------TGCTGTTATTTTTATGCTGTTACATAATTATG--------ATTTAGGTTGACTAATAGAAATTTTTAAT---GTAAGATTCAGGTAAAACTTGATATTACTATTAAGTAGCCTCCTA a score=19845 s mm7.chrY_random 134743 311 + 30114534 AAAAGTTTAAGCTCTTTCAAAATTTTATTATAGTGAGTGTAATTTTACTTACCAAATA---TTATTTATTTATGAAGATCTTGGACTTTTCTCTACCAAAACTTTGGTAGAGGCTAACAATGAACATATCGTAGAAGTGAGGACCCAATTGTTACAGCCAGCAGATGAAAACTGGGATCCCTCTGGAACAAAGAAAATCTGGCGATATGAAAATAAAAGTTCTCATACTACAATTGCTAAATATGCACAGTACCAGGCCTGCTCCTTCCAGGAATCATTGAGAGTAAGTTTGTTTTACATTCACTTTGGGAAAA s bosTau2.scaffold794 332311 303 - 345187 AAAAATAAAAGCACttttaaaaat--attattccaaatatatttttatttattaactacatttatttatttataaaGACCTGGGACTTTTCTCTACCAAAACTTTGGTAGAAGCTAACAATGAACATATGGTGGAAGTGAGGACACAGTTGTTGCAGCCAGCAGATGAGAACTGGGATCCCACTGGAACAAAGAAAATCTGGCATTGTGAAAGTAATAGATCTCATACTACAATTGCTAAATATGCACAGTACCAGGCCTCCTCTTTCCAGGAATCATTGAGAGTAAGT---------ATTTACTTACTGAAAA a score=24148 s mm7.chrY_random 149082 1128 + 30114534 TTTTGTTTAATGAATAGGAAGAAAATGAAAGAAGAACACAAGTTAAAGACTATTCAGATAATGAATCAACATGTTCAGATAAGTAAGTAACTGTAGGCGGTCATGTAGTTTTCTTGTTTCAAAGTCGTGCCTTCACCTTTTTTTTTCCCCCCCTAGTTCTGGAAGGAGACAGAAAGCACCCTTTAAAACCATAAAATGTGGGATTAACATTGATCTGTCTGATAACAAAAAGTAAGTCTTCTATCCCAGTACTATTTGTATGAATGGAAACAAAGAGGATTTCTGT-ATTGGAATTGTGTATTTTCATGTTCCTTTTCATGTCTACTATTTTGATTGAAGACCTTATGACTTCAAAATTATTTTTACAGGTTACTACTATAgttttttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgATttttggttttttgagacagggtttctctgtgtagactgggctgtcttgcaactcactgtgtagaccaggctggcctcgaactcagaaatcctcctgcct-ctgcctcccaagggcagggattaaagtcgcgtgccaccactgtccCAATTATTAACAATAAAAGAACATCCTTTTTTTAGTTCTTTCTTCTTACTGAAGAAGACCAAAGAGTTAAGCTGTCAACATTTAAAAATA-GAAAGTGAAttttcttttcttttttttttttttttt---------ttttttttCTCTAGGCTATACATTTTATTCTTTCAGTGACAT----------------ATATTTTTGGACATTTTTGTCTTTGGAAA---AACTCTTTACTACTAGTTATGTATTGACTTTTCCTTATTT-ACCACAAGATGTTTTAAGAACAACTTAATTAATTTTCATTACA----TTTACAGAAGTTTTCACTGTGAACTGTTATTT-ATTGCAGGTGGAAGTTGCAGTTACATGAGCTGACAAAGCTTCCTGCTTTTGTACGTGTTGTATCAGCAGGGAATCTTCTCAGTCATGTTGGCTATACTATATTGGGGATGAATTCAGTTCAACTATGTATGAAAGTTCCAGGGAGTAGAATACCAGGTGATTGAAATGACCAAACATCTTGCTTAGTTGAAAGTAATCA----------CATTTGTAAAAGACATAGCTTATTTTTACCatttattcttaat s bosTau2.scaffold794 334906 991 - 345187 TTTTGCTTAATCTACAGGAAGAGAATGAGAAAAGAAGTCACCATAAAGACCACTCAGATAATGAATCTACATCTTCAGATAAGTAAGTAATTTGTAATGTCCACTTAGTATTTCTGTTTAAAAGGCATGTTTCTAATATTGTCTCTCTCTCTA-AGTTCTGGGAGGAGAAGGAAAGGACCCTTTAAAACCATAAAGTTTGGGACCAACATTGACCTGTCTGATGACAAAAAGTAAGTCTTT----CTAGTAGTGTTTCTGTTAACTGATACAAAGAGGTGTCCTGTTAGCATGACTGAGAATTGTCTAGTTTCCT-------CTTCTGTTTTGTT------CCTTGT-----------CATTTTTCTAAATTAATA-TGCAGGTTTTAGCCAAATTATTT----------------------CTGCTAGATTTT------------ACAATTATTTTCT------------TTGACTTAAAACTC-TTGTATACATT---------------TTCAAGACCCTTCTATATGTTGTTGCACAATCACaa-----------------------------aattat-aattatataaaaatatatttgta-------------------aaataaaattatacaatta-------------taaaaataaGGAAGTCAGTTTTTTTCTTTAATTTTTATGCTTTTTGTTAGGATGTTTTCTTTGCAAAATTTAAAAATTTAAGTATTCCAGAGTTTTCCTATGCAAAAGTAAAATATTTATAGA----TTTGTTTGCAGGAAGTAAAATATTTA----TAGATTTG-ATTG--TTTTTCTGATTGGAACATAAGGTTCTTAAAGT-------------TTTTTACTACACATATTTATAGCAGGGTTTCATTCGATCTGTTTTTTTATTGCAGGTGGAAATTGCAGCTACATGAGCTGACTAAACTTCCTGCTTTTGTGCGTGTTGTATCAGCAGGAAATCTTCTAAGCCACGTTGGTCATACCATACTGGGTATGAACACAGTTCAACTATACATGAAAGTTCCAGGAAGCAGAACACCAGGTAACTTTTATGAACTAACACTTGACACA---CAAATTGATCAAAATGTGAACCATGCAAGAGAGACCTGGATTCTTTT---CATTTATAATGAAT a score=5594 s mm7.chrY_random 151973 128 + 30114534 TCTCTTTTCTTTT-CAGGTCACCAAGAAAATAACAATTTCTGTTCTGTTAACATAAATATTGGTCCAGGTGATTGTGAATGGTTTGTTGTACCTGAAGATTATTGGGGTGTTCTGAATGACTTCTGTGA s bosTau2.chr19 41006426 129 - 56387648 TCTGTCTCCTCCTGCAGGCCATCAAGAGAACAACAACTTCTGCTCGGTCAACATCAACATTGGCCCAGGAGACTGCGAGTGGTTCGCGGTGCACGAGCACTACTGGGAGACCATCAGCGCCTTCTGCGA a score=9653 s mm7.chrY_random 155741 201 + 30114534 CTTCCTCCCAGAAATAATTTGAATTTCCTGATGAGTTCTTGGTGGCCGAACCTTGAAGATCTTTATGAAGCAAATGTTCCTGTTTATAGGTTTATTCAACGACCTGGTGATTTGGTTTGGATAAATGCAGGCACTGTTCACTGGGTTCAGGCTATTGGGTGGTGTAACAACATCACCTGGAATGTTGGTCCACTCACAGGT s bosTau2.chr19 41006652 201 - 56387648 CTCTCCTCCAGGCACGGCGTGGACTACCTGACGGGTTCCTGGTGGCCAATCCTGGATGACCTCTATGCTTCCAACATCCCTGTGTACCGCTTCGTGCAGCGCCCCGGAGACCTGGTGTGGATTAATGCGGGCACCGTGCACTGGGTGCAGGCCACCGGCTGGTGTAACAACATCGCCTGGAACGTGGGGCCCCTCACCGGT a score=1443 s mm7.chrY_random 156841 99 + 30114534 CTTTAAATATAATCTTTCAGTGCATTTATACTTTTCAGAAGTGATGG----------ACTTAGAAGTGTCATAATAGGGTTCTT-ATATATTTTGTTCATTTTTGTTACT s bosTau2.scaffold2508 62 108 + 112310 CCTTAAAAATATTTTTGTAATAT-TGTACAATTTTTAGAATTGGTGTTGATGGTATCACCTAAGAAAGTGATAGTGGTTATCTTCATATCTTTGGTAC-TTTGAGTTGCT a score=6316 s mm7.chrY_random 156940 171 + 30114534 TTATAACATTTTCTGTCTTCCTAGCCTTCCAATATAAATTGGCAGTTGAACGATATGAATGGAATAAATTGCAAAGTGTCAAGTCAGTAGTACCCATGGTTCATCTTTCATGGAATATGGCACGAAATATCAAAGTCTCAGATCCAAAGCTTTTTGAAATGATTAAGTAAG s bosTau2.chr19 41006975 170 - 56387648 TCGTGACCCTTTCTGGCCTGC-AGCCTATCAGTACCAGCTGGCCCTGGAACGATATGAGTGGAATGAGGTGAAGAATGTCAAATCCATTGTGCCCATGATTCACGTGTCCTGGAACGTGGCTCGCACGGTCAAAATCAGCGACCCCGACTTGTTCAAGATGATCAAGTGAG a score=9684 s mm7.chrY_random 184085 187 + 30114534 AATATTCAGTATTTAATTTCTCTTTAAAATTCACC--------CATTATAGATATTGTCTCCTCAAGATTCTAAAGCATTGTCAGACTTTGAGAGAAGCTCTTGTTGCAGCAGGGAAAGAGGTTTTGTGGCATGGGAGGATAAATGATGAACCAGCTCCTTACTGTAGCATCTGTGAGGTAAGTATCCTTTCTTA s bosTau2.scaffold2508 12535 195 + 112310 AATATTCAACATTCAGTTGCTGGTCACAAATAACTTTCCCCCACACTCTAGGTATTGTCTTCTGAGAACTCTGAAGCAGTGTCAGACATTGAGGGAAGCTCTCATTGCTGCGGGAAAAGAGATTATATGGCATGGGCGAACAAAAGAAGAACCAGCACATTACTGTAGCATTTGTGAGGTAAATAATTGTTCTTA a score=2419 s mm7.chrY_random 184867 98 + 30114534 ATCTCAGAATTTCAAGATATCAGTACACAATAAAAGTACAGATGGTGACAAAATAGATTTAGTGTAGTGCAAGTCCAGGCAGGTAGTTACTGAACCCT s bosTau2.scaffold2508 13288 98 + 112310 ATCTTGAAATTTTAAACTGGGAACACTCCAGGTGTAGACAGATGCCAGTAAACTGGATATAGTTCAGTACAGTTTCAGGCAGATCATTGTTCAGTTCT a score=9600 s mm7.chrY_random 244287 565 + 30114534 ctggagcctgtcctgctt-gctactgtacatactcctacagcatgtttatggcagtagggtatattagaatggttacatttgccAGT---GGCACAAAAAGGAATAGTCATTGCTTATTCCTCCCTGGTAGCCAAATTATTAGGTAAAGGGAGAAAAGGGA----------------TAAAGAG-----AGATATGGTTACTCCTTATACTGCAGACCAACATAACATT-TTCTTATGAATC-TGAGCAATGGCAGATTGC-----ACAATTAGGATATACAGGGACCTATTCT-TATCACTTGCCTAATCACCCCTTATTATATTTCATTATAGGACATCAAATCATCTTTCCTCTCAGAACTGAGTCAACCTCCTTGCC----TTCCCCAAGCAGCACTGGTGTTTACTGAAGGCTCAGCTTCAGGGCAGGCTGCTTTGATTATTGATAGCAACAAAGAATCTCTCCCTACCCAAGAAATTTCTGCTGAGCAAGTGCAATTAATAGCAATAATCATTGCTTTTAAAATACTTTAAACCAAGTCCTTTAACTTATATACAGACTCTCAGCATATTGTCAGATTATTTCCTTATATAAAGAC s bosTau2.scaffold8684 14621 585 + 31727 CTGGCAACTCCTCTGCTTAGCTACTCCAACTGTGCCTATGGGAGTTTTATGGCAAAACGGCCCCCTAGAATGGGTCCATCTCCCCGCCCAAGCTCAAAAAG---TAGTGGCTTCTTATCCAGGACTGATAGCTATGTTGATATTAAAAGGGAGAAAACGGAGCATTGAATTGTTCAGTAAAGAACCAGCAGAAATTGTAATTCCATATAATAAAGAACAACTTGATGCCCTTCTAATGTTTAATGAGGACTGGCAGATTGCCATAGGAAATTATTGTAGTCAA------ATTCTGCATCATTTACCTTCGCATGTTTTGCTGAATTTTATATCCAGACATCCAGTTATTTTTCCTGTCAGATGTAAA-CAATCTCCTATTCCAAATTCTCAGA-------TAGTTTTTACTGACGGGTCAGCAAATGGTAAAGCCTCCATAGTCACTGAAAATCACCAAAAGGTTTTAGAAACACGGGAAACTTCAGCTCAAAGACCTGAAATAACAGCAGTCATAGAGCCTTTTGCTATGTTTGCAGATGAAGAATTTAACCTTTATTCTGATTCTCAGTATATTGTCAGGTTGTTTCCACACATTTAAAC a score=5295 s mm7.chrY_random 246459 662 + 30114534 AGAAATTGTCTTTTCTCTATTGGACATGTTCAAGTTCATTCTATGCTTCCTGATCCTATAAATGGAGGGAAGGATTAACTTAATTTCTTAA-CAAAAGC----TTGTTGCTTTTCCTAAGAAGG----------TAACTTA--GCATGATCTTAACATTAC------AAATCACCATT-----GAGCTCAGAGAAACT--------GGTCCTGCATTCCTGCAGA-GCTGTC--------------AGTTAAGCT-TGAGAATTATCCCCTGATTAGCCTATGTCCTTGTGATTTAAAACAGACAAATGTTACTTATGTCCTGTC-TTTTGAAAGTTAGCCTTTACTCCGGTAGGTATGTACACTTAATTCTCATTGCTATTTATGTCTTTTCCTAACTTGGGAAAACTTTTACTGTATCAAAGTTGTATGATACA---GTATTTGTTTCATTAGTCTATA-ATACCAAGGGCTTAAATTTCAGGCAATGTCCTTGCCTAAACTTAAAAAGCCCTTAAAAATTGGTGTTTGACTCTTAGTTTC------------TCACTGACATCAACTATAGTTTACAGGGACAGACTATTGTACAGTGAGCTCATCAGACCTTAAAAGATATAGACATCtaaattacaa-aataaaattataattaatCATCTCCTTATGATACTTTATAGAA-----------CAATAAATA-AGTATATTTTTTC----------AACTTCCCTAGCCTCTATAAAATA s bosTau2.scaffold8684 15276 739 + 31727 AGAAATAAAATATTTTTCATTGGACACATTCAGGCTCATTCTGGATTGCCCGGCCCTTTAAATGCCTTTAATGACTTGGCTGACTTGTTAATCAGAAATACAGTGGCTACGGTGATTAAGGAAGCCAGAGCCTCTCACTTACTTCATCATCAAAATGCTACTGCTTTAAGATATCATTTCCAAATTCCCAGAGAAACTGCTAGGGAGATTGTGTGCTCTTGCTTACACTGCCCCACTGTTTATAATAGTCTACCTATGGGAGTTAACCTTTG--CAGTCTCAAACCTAACATACTCTGGCAAATGGACGTAACTCATATCTCTTCATTTGGAAAACTTTCCTTTGTTCAAGTAACTGTAGATACCT-TTTCTCA-TGTCATTATTGCAACTGCTCATACCGGAGAGGCAGTTAAAG-----ATGTTATACAACATATCTTTACTTGTTTTTCATATCTAGGTCTGCCAAAGGCTTTGAAAACTGATAATGCCCCTGCTTATACTTCTAAGTCTTTTCAGGAATTTTGTTTA-----CAGTTTCAAATTAAACACAATACAGGCATCCCTTATACTCCCCAGGGACAAGCCATTGTGGAAAGAGCACATCAAATATT-AAAGGTTCAAATTCAAAAATTAAAAGAAGGGAAGTTTAAGTATAGCTCTCCCCATCAAATCTTGCAACATGCTCTTTTTGTAATAAATATTGTATTTTTTTTTTCAAATCAAGAGTTTTTATTGTCTCTTTAAAATA a score=32119 s mm7.chrY_random 249896 975 + 30114534 TGCCACAGAGCCTCAGCTGTGGTGCTCCCTAT-TTCTTCAGATGTCCAGCTCAGTCCTGTCCAAGAAACGCAAAGTGTCTGGACCTGACTCTAGTCTGGATTCTAGTTGGTCTCCTACCTATTCTGTGATGTTTGGCGTGCCCCCAGGGCCAACCAACGTGAGTATGACGTTTGTAAGGATGGAAACAATCAGTGGGGGTGGTA------AAGTACTTTCCAAAT----GTCTTA---GTCTCATTACTATTTTTTC----TTCCCTGGAACT-----CTCTGCTCATCTTTAGGAAATGTCAAAAAAT---AAGGAAATGGACATAGATGAAAGCCTTTACTCCCGCCAGCTGTGAGTAGTACCCAGGACGGGAAATGGAGATTGAGAGAAGGCACAGAGTGG-------------GGCA-GACCCTAACCTAGAGT----TCTTTGCTGACAGGTATGTACTCGGCCATGAGGCAATGAAGCATCTCCAGGCTTCCAGTGTACTGATATCAGGCCTGCAGGGTCTGGGTGTGGAAATTGCCAAGAATATCATCCTTGGTGGGGTCAAGGCTGTCACTCTCCATGATCAGGGCATTGCCCAGTGGGCTGATCTGTCTTCCCAGGTATTATCTCTTTTTGGCTTCTCCTTGCTTAGGTCCCAGC---GTGTGCACTGCATGTGTTTCAGTGTTATCTTCCTACCCCCT-TTTCATAGTTCTGCCTACGTGAGGAAGATATTGGTAAAAACCGAGCTGAGATATCCCAACCACGCCTTGCTGAACTCAACAGTTACGTTCCTGTGTTTGCCTACACTGGACCTCTAATTGAGGAGTTCCTTAGTGGTTTTCAGGTACCCTGGAGTATCCCCATGCC---TCCTCT-----CTTATTCCAGGTTTGTT---------GCCATTTA---GGTTGGCACCTTGTGTCAGATCTGGTTCTGG----AAAACTAGGAGATGTAGGTAGCAGGTAGA----------GCTCCCCAGAGGGGCAGATTCT-------CTTATAGAAAGGTGTTGTGTTATAGT---GAGACTGAA s bosTau2.chr27 15969478 1047 + 31566707 TGCCCCAGG--CTCACTTCTGATTTCTTTTATGCTCTCCAGATGTCCAGCTCGCCGCTGTCCAAGAAACGTCGCGTGTCCGGGCCTGATCCAAAGCCGGGTTCTAACTGTTCCCCTGCCCACTCCGTATTGTCCGAAGTGCCCTCGGTGCCAGCTAACGTGAGTGTGTTCTTCCTA------GAGACTGGCAGGTGGGGTGGTGGGTGGGAAACATCTTCTGTATCCCTGTCCTGTCTGTCCCGTCCCTCCTCCTGCACATCTCCCTGAACCTAGTGTTCCCCTCCATTTCTAGGGAATGGCGAAAAATGTCAGTGACGCAGACATAGATGAAGGCCTTTACTCCCGGCAGCTGTGAGTGGGGCCGAAGTTGGACTGTGAGG--TGGGAGGGGGCTCTGAATGGATAGGGTCAGGAGGGCGTGACTCTGACCTGTGACACCCTCTAACCCGGCAGGTATGTGTTGGGCCATGAGGCAATGAAGCGGCTCCAGACCTCCAGCGTACTGGTATCAGGCCTTCGGGGCCTGGGCGTGGAGATTGCCAAGAACATCATCCTCGGTGGGGTCAAGGCTGTCACACTGCATGACCAGGGCACTGCCCAGTGGGCCGACCTCTCCTCCCAGGT-TCCTCTTTCCATCCCCCTTCTTTGCCAAGGCCCCAGCCCTCTGGGCTACACAGCCAGTTCACT----TCTTCCTACACTCTCCTTTGCAGTTCTACCTGCGGGAAGAAGACATAGGAAAAAACCGAGCTGAGGTCTCCCAGCCCCGTCTCGCTGAGCTCAACAGCTATGTGCCTGTCAGTGCCTACACCGGGCCCCTTGTGGAGGACTTTCTCAGTGACTTCCAGGTACCATAGG----CCTCATGCCCAGTTCTCTCAGAGCCTAGCTCTGGTTTATTCTTTTGATAAACATTTAATGGGCTAGC-CTGTGAGTCAGGTTTCCCGCTAACGCTGCAGCAAGGAAATGCGAGCAGGCTTTAGGCCCTGGGCCTGCCTCTTTAGGAGGAATATTGTAAGCCAACAGGTGGGAAGgcatagtggttatgtgcagagactgaa a score=15881 s mm7.chrY_random 251088 592 + 30114534 AACTGTTCTCTGACCCTTGTTATACCTGATGCC-------------------------------------------CATTGAGACTTGTGTG----------------------------TCCAT--GTGACAAAAGGCTATGCCAGCTGAGCCTGGGTGTTGGATTC--TTCACCCTTCT-----CCCTCACTTCTGTCAGCTTTTTTATTCTCTCACTCC-------ACCCCAAACCTGGGCCTATTATTCTTTACAGGTAGTGGTTCTTACCAACACTCCTTTGGAATATCAGCTGCAGGTGGGTGAATTCTGCCATAGCCACGGAATCAAGCTGGTAGTAGCAGACACTCGGGGCCTAGTTGGGTGAGTG--CTTGCCTTTGTCTAACTTCTACCAAACATAGGCCAAG---AGACTCCCAAGCCTTCAT--------GTCCTCCTCCACCAACCAGTTTTGAAATGATTTTTCATTATTTT--CCTGTGTGGTGTGAACGTCACCTGAT----------------CTG-----------------TCCCAGTACCTTGAGTG---CTGGAAGGCCC--TGTGCTTGGT-CCAAAGCATCACTCCTTTTGCCTCCTTCCCTAGACAACTCTTCTGTGACTTTGGAGAGGAAATGATTCTCACTGATTCAAATGGAGAACAGCCACTCAGTGCCATGGTTTCAATGATCACTAAGGTAAGGAGGTGAGCC s bosTau2.chr27 15970988 729 + 31566707 AGCTGTTATCCAGACTCTGTCCTCCCAGTTGCCTCTTTACCTTGCCTGCCATAGTCTAGGGATTCACATTTCCTTTCATTGAGTTTTGCTTGGGCTGAATCTGATACGTGGTAGATACTTTCTGTTTGTGATAGAGAGCTGAACCAGCAAAGCCTTAA----GGACCCCGTGAGCCCTCCTATCAGCCCTCCTCTATGATTGCTCCCTTTACCCTTCACCCTGGTGCTGGGCCCTTGCCTGAGCTTCCACCTCTCCACAGGTGGTGGTCCTCACTAACAGCCCCCTGGAGGACCAGCTGCGGGTAGGTGAGTTCTGTCACAGCCATGGCATCAAGCTGGTGGTGGCAGACACCCGGGGCCTGTTCGGGTGAGTGCCCCTGCTCTTTTCCACCCTGACCCCTGCCTTGTCCAAGAAAAAACCCCCAAGCTCTGACTGCCCTCAGCCCCCCTTAGGCCTTTGGGTTTTGGATGCTGCGTGTTTACCTTGCCTCACGTAGCATGAGCACAGTCTGATTCCCAGCAGTGATGGGCTGATTTGCTCAGCAAATACTCACTGCATCTTGAGGGACACGTGCAGTCTCAATGTGCGTGGGACTTGGGCATCAGCCCTGTTGCCTCCCTCTACAGGCAGCTCTTCTGTGATTTTGGAGAGGAAATGATCCTCACTGATTCCAATGGGGAGCAGCCGCTCAGTGCTATGGTTTCTATGGTCACCAAGGTGAGGAGGCCAGCC a score=9296 s mm7.chrY_random 252224 190 + 30114534 ACTCTTAATCTTCTTTT----TTCTTTTTCCCCAACCAGGAGAATCCAGGGATTGTCACCTGCCTGGAGGACTCCCGGCATGGATTTGAAAGTGGTGACTTTATCTCTTTCACAGAAGTTCAGGGCATGAGTGAACTCAATGGCATTGGTCCCATAGAGATCAAAGTTCTGGGTAAGGGAAGCCTGGGGAAGGA s bosTau2.chr27 15971770 194 + 31566707 ACCCTGAGCCTGCCTCTGAGGTACTCCTCCTTCAACCAGGACAACCCCGGTGTTGTTACTTGTCTGGATGAGGCCCGACATGGCTTTGAGAGTGGTGACTTCGTCTCCTTTTCGGAAGTACAGGGCATGATTGAACTCAATGGAAGTCAGCCCATGGAAATCAAAGTTCTGGGTGAGCTAGGGCCAGGGGGGAA a score=58456 s mm7.chrY_random 254544 1639 + 30114534 CATCTTTTTCATCT--TCCAGGTCCCTATACCTTTAGTATCTGTGATACCTCCAGCTTCTCTGAGTACATCCGTGGAGGCATTGTCAGTCAAGTGAAAGTACCTCGGAAGATCAATTTTGTGAGTA--GGTGGTGAGGGGCTGTGA---ATAGAAGGACTCCTGCT-----TTTGAGATTTATAGGTTGTTCATATCTGGTC--------------TCGCGATGCTCCATTATCCACAGAAACCCCTACTTGCCTCGCTGGCAGAGCCAGAGTTTGTGGTCACAGATTTTGCTAAGTGCTGTCATCCTGCTCAGCTCCACATTGGCTTCCAGGCCCTGCATCAGTTCTGTACTCAGCACAGCAGGCCTCCTCGGCCCCATAATGAGGTAAATGAGTGGGAAGCCAGCCAGGG------ACCT-------------CTGATTTGTCTGTTT-CCTGTACCTGTT-CTTCCTCCAGTAGGGCCTGATAGGCTCTATCCCGGTTCCTTTTGTCCAACCAGGAGGATGCTGAGGAATTGGTGACCTTAGCCCAATCTGTGAATGCTCAAGCTTTGCCAGCAGTTCAGCAGGATTGCCTGGACATCGACCTTATCCGGAAGTTGGCCTATGTAGCAGCTGGGGACCTGGCACCCATGAATGCCTTTTTTGGTGGTTTGGCTGCCCAGGAGGTCATGAAGGTCAGCCCTAGTGGGAAAGGGTGTGGCTGGTGTGTGCT---------TCTGATGCCATCAC-TGTCTTTT---------AGTCCAGTTAGGCTCCTGCTACTGACAACCTTCT-----TTCCCCAGGCTTGTTCTGGAAAGTTTATGCCCATTAGGCAGTGGCTGTACTTTGATGCCCTTGAATGTCTCCCAGAGCACAGAGTGGCCTTCATGGAAGATAAGTGCCTGCCAGTAAGTCTGTGGGGACAGTGGGAA----ACTTTGGGAATGTCTTGAGGAAAGTGTCACTCTAACCTATCTGTACTCACTCACATAAATCCAGCACCAGAACCGTTATGATGGGCAAGTGGCTGTATTTGGATCAGACCTACAAGAGAAGCTTGGCAAGCAGAAATACTTCCTGGTGATT----------GACACTAA----------------TGGCCTCTGTTCACCCTTTCTGAAAGGATCTTTCTTTCCCTGATCCCTTTGGGGAGGTGTCTTTTGGTTTTTCATGTCCTCATCACATCACCT----CTTCTGTTTTGTGGTGGGTTGAGGAAAGGCTTCAGGTATCTCTTTTTCTTTCCCTCCTCTCAGTC---ACCCATAGGAG-----------TGTGCATCCCTGTGAACGGAATGTTTGTTACTACTCAGTCTTGTGTTCAGTTGGTGTTTTCTTTTGGGTGTAAAGTTAGCAT-------------ATGCCATCCCTGTTCACTCTGA-CCAGA-----------------TGGTTTACCAACTTCTAGGTAGGTGCAGGTGCCATTGGCTGTGAGCTGCTCAAGAACTTTGCCATGATTGGCCTCGGCTGTGGGGAGGATGGAGAAATCACAGTTACAGACATGGACACCATTGAGAAGTCAAACCTGAACAGGCAGTTTCTCTTCCGTCCCTGGGACATCACAGTGAGTAACATGG------------------------CATAGCTTTCTT---TCTCCTATTTGATTCTTTCCTAAA----TGGCTTAGATGTTTGtcccctcctctccactct-cctcacctcccattcccctctcct-------------cccttccTTTTTTTTTCCCTTTACTTCCCTCCTTTTTTTTTTTC s bosTau2.chr27 15972416 1804 + 31566707 CATTTTCCCTGTCTATCCTAGGTCCTTACACCTTTAGCATCTGTGACACCTCCAACTTCTCTGACTACATCCGCGGAGGCATCGTCAGCCAGGTCAAAGTACCCAAGAAGATCAGCTTTGTGAGTGTGAGGGGCGGTGGGCTGTGGGGGATGTGGGGGCTGGGGCTGGGTATCTCACGGTTCTCAATTCTTCTCTTCTGATTCTTTTTTTTTTTTTTCCTGATGCCCTGCTTCCCACAGAAATCCTTGCCAGCCTCCCTAGCAGAGCCTGACTTTGTGATGACAGACTTCGCCAAGTATTCCCGCCCTGCCCAGCTACACATTGGCTTCCAGGCCCTGCACCATTTCTGTGCTCAGCATGGCCGGTCCCCTCGGCCCCACAATGAGGTGCGTGTGGGTGAGCCAAGCCAGGGCAGATGACCTTAGCACTGCAGGCCTGTTCTGCCCCTCTGTCTACACCTCTCACCCCCGACACAGTGACCTAACAAGCGTGCTCTTGGTTCCTTTGGCCCCACTAGGAGGATGCAGCAGAGCTGGTGACCATAGCCCAGGCTGTGAACGCTCGATCCCTGCCCGCAGTGCAGCAGGGCAGCCTGGATGAGGACCTCATCCGGAAGCTAGCATATGTGGCTGCTGGGGACCTGGCTCCCATAAATGCCTTCATTGGGGGCCTTGCTGCCCAGGAGGTCATGAAGGTCAGCGTAGGTGGAAAAGGGCAGGGTTGGGGTAGGCCAGGCGCCTACCTGCCTCTATCACTTGTCCCATCTGCATGAGGCCCCAGGTAAGCACTGACTACTTCCCCTCTCCTGTCCATTCTCCAGGCTTGCTCTGGGAAGTTTATGCCCATCATGCAGTGGCTGTACTTTGATGCCCTTGAGTGTCTCCCTGAGGACAAAGAGGCCCTCACAGAGGACAAGTGCCTCCCGGTATGTGAGTAGGGCCCTGGGGGAGGTGACATAGGTGGCATTTCTGGTGAGGCTGCTCTCTGACCTTTCTCCCTTTGCATTCCT-----CAGCGCCAGAACCGTTATGATGGGCAGGTAGCTGTATTTGGCTCAGACCTGCAGGAGAGGTTGGGCAAGCAGAAGTACTTCCTGGTGAGTGATCTGCTGGGACACCTGCTTCCTTCATATCCCCTGGCCTCTGGCTACCTGTTT--ATGGGGTCTCTTGCCACCTGA---------GGGAGTGTCTTTTGGTTCTT-GTATCTGTATCACATGACTTGTGCCCCCTTTTTTTTTTTTTATCTTGGGAAAGCCT--AGTATGTCCTTCTGTTTCCCCCATCTGTGCCTCTGCCCTCAGATGACTAGGTTATTTTCACAGTCGTGGCACTTAAAGATGTGGCACTAGACACCCCT-------CTTGCTGTTTTCTGGGGAGTGAGAGTATAGAGTGATGAGTGACTTCATGCTGACCTGCATCACCCTGACCCAGACTCTCTGTGTCTTTTCTTGGTT----GTCTTCTAGGTGGGCGCAGGGGCCATTGGCTGTGAACTGCTCAAGAACTTTGCCATGATTGGGCTGGGCTGTGCAGAAGATGGAGAAATTGTTGTCACAGACATGGACACCATTGAGAAGTCAAATTTGAACAGACAGTTTCTGTTCCGGCCCTGGGATGTCACTGTGAGTGTGATGGGGGATGGAGGTGGTACTTTGTCATCTTGTTTTTCTCTTGTCTTTTGTTCCCATTCTTCCTAGAAAGGGGGCTTTACTGCCTTTTTCTTTGCTTCAGCTCTCCCTCAGTTTCTGTCACTCGTTCACTGAACGCTGAGTACCCTTCCATTGAATCCACCGTTTTTCATCTCCTGTTTTCTTTTC a score=2097 s mm7.chrY_random 257313 71 + 30114534 GACTCAATCT----GTCTGTG----------GTTTTATTCGGG-----------TTACTCTGGATGTCATTAATTGAAAGTAGAGTAGTTGTTGGG s bosTau2.chr27 15975294 96 + 31566707 gactcaAACTTCTTGTCTGTATGCTAAGATTGTTTTGTTTGGGGGAAATGTTCCCCAGCCTAGGTGCCATTACCTGAAAGAACAGTGGATGTTGGG a score=27399 s mm7.chrY_random 257763 725 + 30114534 GAGCCTGGTTGACTTTGAGCCTTGTTCTGCCCTTTATGAGATAAATC--------GTGGGATATCTCTACAGACTTT-----GTTGCATCAGTATGTGGGAAAC--AGCTCTGTT------TTTCATATTCCCACCC-----AGAAATTAAAGTCTGAGACTGCTGCTGCAGCAGTGCGTGACATAAATCCACACATCAGGATATTCAGCCACCAGAATCGAGTAGGCCCAGAGACAGAACACGTCTATGATGATGAC---TTCTTCCAAAAGCTGGATGGTGTGGCCAATGCCCTAGACAATGTGGATGCTCGTAAGTTTGGAGTTGAGTGAGGAGGGCAAGATCAGGGTAGAGTGTATGAGGTTCTTGTGTTCCTGTCTTGCCttggtttttcgagacagggtttctctgtgtactctcggctgtcctgtaactcactctgtagaccaagctgacctGTGTTCCTGTCTTATGTAAGCTTGCGTGCTACTCATCTGCCATT-TCTTCCCATCTCCCTGAAGGATTATACGTGGACCGCCGTTGTGTTTACTATCGTAAGCCTCTGCTGGAATCAGGCACGCTGGGCACCAAGGGCAACGTGCAGGTGGTTGTTCCCTTCTTGACAGAATCTTACAGCTCAAGCCAGGACCCACCTGAGAAATCCATCCCCATCTGCACACTGAAGAACTTCCCTAATGCCATTGAGCACACCGTGCAGGTGATCAACCTTGGGAGGAATGGGAGGTGGAAGGG s bosTau2.chr27 15975526 677 + 31566707 GAGCTTCCTGAACTCAGGGCCTAGTTCTTCGCAGCATTAAATATGTCAACCTTCAGGAGGACAGCTCTGTAGGGGTTCTCTGGCTGCAC----ACATGAATAACTGAGTTTTGTTCCCCCATTCCCCACTCTCACCTCCCCTAGAAATTAAAGTCTGACACAGCTGCTGCAGCTGTGCGCCAGATGAATCCTCATATCCGAGTGACAAGCCACCAGAACCGTGTAGGTCCTGACACTGAGCGCATCTATGATGATGATGATTTCTTCCAAAACCTGGATGGTGTAACCAATGCCCTGGATAATGTGGATGCCCGTGAGTTTGGAGGCGGGTGAGGAGG------TCAGGGGCCAATGCGTGCG---CACGTGTGTGTGTATG--------TTTTGGAG---GTGTCTGTCTTCCTGCCTCCTAATGTTCTGT---------------------------------------------------CTTGCCACTCATGTTATGTTGTGACCCCACCCCCC---AGGCATGTACATGGACCGCCGCTGCGTGTACTACCGTAAGCCACTGCTGGAGTCGGGCACACTGGGCACCAAGGGCAACGTGCAGGTGGTGATCCCCTTCCTAACAGAATCTTACAGCTCCAGCCAGGACCCGCCTGAAAAGTCCATCCCCATCTGCACACTGAAGAACTTCCCCAATGCCATCGAGCACACCCTGCAGGTGATCAGCATTGGTGGGAGAGAGCAGGGAACAGG a score=24427 s mm7.chrY_random 260268 1098 + 30114534 CTTCACCCAGAACAG-----TCTTTACTAAAGGGTTGTCTCACTAAGAACTTTTTTTGTGT--------GTTTGTTTGTTTGGCCTTTGCTGACATGCATTTGTTTGCTCTGTCTGTAGTGGGCTCGGGATGAGTTTGAAGGGCTCTTCAAGCAGTCAGCTGAAAATGTTAACCAATACCTCACGTAAGTAAC-AGACAAACCAACAGCCAACAGAA-ACCAATCAACAAAGGCGTCCT-------TCTCTGCTCGCTTCAATGCACATCCTCGGTAGATGCTTTGGAT-AATTAATGGTTGA---TTGAGCCTCATGCTGGTGGTAgatgatgatgatgatgatgatgGGAAGTGGTCAGCATTGACATTTTCCCTGGAGAAAGAAGGCTTGCCCAGAAACCTTACTTCT-AGGCCTCTGAAGTAATCCAGGTCTTTGTATT-----------GGATAGGGACCCCAAGTTCATGGAGCGGACACTGCAGCTAGCCGGCACCCAGCCTTTGGAAGTACTGGAGGCCATACACTGCAGCCTGGTCCTGCAGAGGCCACAGACTTGGGCCGACTGTGTGACTTGGGCCTACCAGCACTGGCACACCCAGTATTCTCACAACATCCAGCAGTTGCTGCACAACTTCCCTCCAGCACAGGTATTACATACTTTGTGGATGTATTTGGCTGA--GCAGATTTCCAGGAAATTGGAATCTTACTGTCCTCTGTCTAGACATGGCTTCGTCCAGG---CAGTCTAGCTGCCACAGGCACCACAAGGCAAGCTGTAGGCCAGTACTTGGTGCAAGC---ATTTGTGTTTTCCTTCTTCTGTCAGCCAGGCAAG--------TTTCTTAGTTTCCTTCCCAGCTGCACCTGTGGGCTGAGTCACAGCTGAGTTCCCTTTGAGGGCTGTAG---TTGCAAGTGAGAAATTTTATAGTTAAGCATACAGTGATCCA--AGTGGTTCAAGTCCCAGCTGTGTTTGACACTGGGTCCTGT--CATGCCTAATGTCTTGGTAAG---CCATATTTGTGAAGTAGGTATGATAATGG----CTTATGGGCATT-TAGAAAGGACTAACTTGCATTTCTTATTATTGACTCATATACA----TTGGTAAGTT----GAACTTGCCG---TGTGTTTGGCTCATTGTGAATTTC s bosTau2.chr27 15978335 1119 + 31566707 CTTCTCCCAGAGCAGCTATGTTCTTCCCATTGGATTTGTTCACTGATGGTGTTTCTAACGCTTCCAGAAGTCCGTTTTGTCCACCATTGCCCCCTGTAATCTGTTTG-----TCTGTAGTGGGCTAGAGATGAGTTCGAAGGCCTCTTCAAGCAGCCGGCAGAAAACGTCAACCAATACCTCACGTAAGTAACCAAATGTCCCCTCAGCCCACCCCCTGCCTGCCAGTCAAGGCATCCTGGCTGCTTTCCTCATTGCTGTGACACCCAGCACAGGCACACTTCTCAAATGAATCTGTGAATGAAGCTTGAGCCTCATTCCATTGGC-----------------------------GGTCAGGATTAGC--TTTCTCTGGAGAAAGTGAGGTTGCCCTGGAGCCC-ACTCCTGAGGCCGCTGT-GTAATCCTGCCCCTTTGACTCCCCCAATTCCTGATAGAGACCCCAAGTTTGTGGAGCGGACCTTGCGACTGGCGGGCACTCAACCCCTGGAGGTGCTGGAGGCCGTGCAGCGTAGTCTCGTGCTGCAGCGGCCACAGACCTGGGCTGACTGTGTGACCTGGGCCTGCCACCACTGGCACACGCAGTACTCTAACAATATCCGGCAGCTGCTACACAACTTCCCTCCTGATCAGGTAATGCCCACTTGCCAGGTCCACTTGGCAGAATGCTTTTTTTCCGTAA--TGGGAGCCTGCTGTGAGTTCTC------TGGCTCCTCCTGGGGATTATTCCAGCTGTGGCACATGCCCCAAGGTGTGGGGAGTCTCAGAAAAATGATTAAACTTGACCTTTTTTTGCCATCCCCTTTCCTTCTAGCAAGAGACTTTCATTTTTATTTCCCTT---------ACCTGTGAGGTGGGC--TGACTCATCCACCTCCTAGGACTGTAGCGATCATAGAGGAGAAATCTTcgagttaagagctcaggaaatcagtgggggttcaactccaagcaccatttg-cacttgggcaagtcacatagcttctctctacttcagtttccttgtcagtaaagtagaggtggtaataattacctcatgagggttcttgtgaggatttcttggtatttgttaatattaactca-gtacagtacctggcaggtcataagagtttgttaaGCTGTGTCTTGCACAGAGTGAGTGCC a score=18373 s mm7.chrY_random 261366 508 + 30114534 CCAAGAATGGTGAA----------CCTAGGCTTCT--------------TGGCCTGAGAGTGCTTCTCCCTCGG----TGCTGTTCATATCTTTCTC-------TTAGCTTACGAGCTCTGGAGCACTTTTTTGGTCAGGACCAAAACGCTGTCCACATCCTCTCACCTTTGACATAAACAATGTAAGT---GTCCTTGGGATCTCCCAG-------------GTTGGTGTGTGGGGAGTGGGTCTCTCTACTCTTAACCTGTGGTTGTTAAGCTGACTTTCCTTTGCCATGCCATTCTTTCAGCCCCTGCATCTGGATTATGTGATGGCTGCTGCCAACCTGTTTGCTCAGACATACGGACTAGGAGGGTCCCAGGACTGTGCTGTGGTGGCCAAACTCCTGCAGTCTCTGCCAGTCCCCAAGTTTGCTCCCAAGTCTGGCATCAGGATCCATGTTTCTGAGCAGGAGCTGCAGAGTACCAGTGCCACCACCATTGGTGAGAATGCTTCACCATTCGTTCAGGGATCATCTGTGTTCTTTCCCACTCTGCCTTTCCTC s bosTau2.chr27 15979568 545 + 31566707 CCAGGGCTAGTGAATAGGGCATACCCAAGGCCCAGGTGAGAAGTTAGGATTGCTGGAGAG-GCTCCAGTTTTAGATCCTGCTCCTCAAAAATCTCTCCACTTCTTTAGCTCACAAGCTCAGGAGCTCCATTCTGGTCTGGGCCCAAACGCTGTCCACACCCACTCACCTTTGATGTCAGCAATGTAAGTCTCCTCCTTGGGGTCTCCTAGGGTCAAGTGGAGAGTGGGTGGGAGGGAAGGAGGCCGAGACGC-CCCAGGTGAGGGCAGACGTGCTCACCCTTCTGGGCCCTGCC-TTCTCCCAGCCCCTCCATCTGGACTACGTGATAGCTGCTGCCAACCTGTTCGCCCAGACCTACGGGCTGACAGGCTCTCAGGACCGAGCTGCTGTGGCCACACTCCTACAGTCTGTGCAGGTCCCCGAGTTCACCCCCAAGTCTGGAGTCAAGATCCATGTCTCTGACCAGGAGCTGCAGAGCGCCAATG---CCTCTGTGGGTGAGGATGTTTGGCCCCTCTGCCAGGAGTTA--------CTGCCCCACTGGTCCTCTGCCC a score=9157 s mm7.chrY_random 263178 266 + 30114534 ggcGCCTCTCCCTTTCAAATGCTTT---TACATAAACTCCACTTCCCAGTCCAGATTTCACCTTGGGCAGTACAATGGGTTCACCAGAGACCATGGTGTCCTTTGCTTTCTGCAGATGACAGCCACCTGGAGGAACTCAAGACTGCACTTCCTACTCCAGACAAGCTGCTTGGATTCAAGATGTACCCCATTGACTTTGAGAAGGTATTTGGTGTGGG-----GAAGCTGGGGTGGTTAGGATG---GCAGGCGCAGGTGCCTAGCATAGGCTTTTG s bosTau2.chr27 15981086 276 + 31566707 GATGTCTTTCCTTTTCAAATCCTTTGTTTCCCTAAACACCTTTTGCCCCACTTGTTTCTACCTCAGACCCTGGCCTTGGGTCTAAAGCGTTGATGGTGTCCCTCTCTCCCTGCAGATGACAGCCGTCTGGAAGAGCTCAAGGCTACACTGCCCAGTCCCGAAAAGCTCCCTGGGTTCAAGATGTACCCTATCGACTTTGAGAAGGTGCTGGCTGGGGGCCCCAGCAGGCAGTGGGGATGGGATAAACATAGGTG-GGATGGACAGAACAGGCTTCTG a score=5208 s mm7.chrY_random 265528 115 + 30114534 GTAGGTCTTGGTAATTGCATTAGATTGGCCTTGGTGACATTGCCCAAGATGGTAGTGCAGCCTGTGGTGCTATGTTACC---TCTCAGTGCTGGTCATCAAAAGGAGCTTCTTGGGTA s bosTau2.chr21 25551956 118 - 49724630 GTAGATCTTGGAAATGGCATCGAAGTGGCTTCGGTGAAGTTGCCCAGGGTGGTGGTGCAGCCCTCAGCAGAAGGGTAGCAGTTTTCAATTCTGGCCATCAGCAGTAGCTTCTTGGGCA a score=19782 s mm7.chrY_random 271031 483 + 30114534 CTCTCTTAATTCTCCACTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAAACAAAACAGGATGACGACAGCAACTTTCACATGGATTTCATTGTGGCAGCATCCAACCTCCGAGCAGAAAACTATGGCATTTCCCCAGCAGACCGGCATAAGGTAATAGGAGTCTGTGATGTACGACTGACCCTTGCCCAAACTG-ATTTTCCTTCATTTGGGCC-TTCTGTAGACCC--------CTACTTCC-----TCCTATACAGTAATCCCTGGTGGTCACTGTCTTACAGAGCAAACTGATTGCAGGCAAGATCATCCCAGCCATTGCAACCACCACATCTGCTATAGTTGGCCTTGTGTGTCTGGAGCTGTACAAGGTGGTTCAGGGCCACCAACAACTGGAGTCTTATAAAAACAGTTTTATCAACTTGGCTCTGCCTTTGTTTAGCTTTTCTGCACCTCTGGCTCCAGAGTGTCATCAGGTATGGGACCTGCAAGAATAGGAAATG s bosTau2.chr27 15981552 462 + 31566707 CTCCCTTAACCTCTCACTCCTAAAA--------------------------GGATGATGACACCAACTTCCATATGGATTTCATCGTGGCCGCATCCAACCTCCGGGCAGAGAACTATGACATTCCCCCTGCAGACCGGCACAAGGTGAGGCAAACCCAGACCCAACGTTCCACCCCCTCCCGGGCTGGATTTGCCCACATTTCATCCCTTCTTTAGACTCAGCCTCTTCTACTCTCAACTTCCATCTTCCTTGATCCTTTG------CTGCCTCACAGAGCAAGCTGATTGCAGGAAAGATCATCCCAGCCATTGCCACAACCACAGCAGCCGTGGTTGGCCTTGTGTGTTTAGAGCTGTACAAGGTGGTGCAGGGGCACCGACAGCTCAACTCCTACAAGAATGGTTTCCTTAACTTGGCCCTGCCCTTTTTTGGCTTCTCCGAGCCCCTCGCAGCACCTCGTCACCAGGTGAGGGTCT----ATATTAGGAAGTG a score=24310 s mm7.chrY_random 272037 757 + 30114534 AGTACTATGATCAAGAGTGGACACTGTGGGATCGCTTTGATGTGCAAGGACTGCAACCTAGCGGTGAGGAGATGACCTTGAAGCAGTTTCTAGACTACTTTAAGGT-AGGGCTCCTTCGTCTGTGAACTTCGCCT----TTGTGGGGTCTTGCCCACTTGATTTAGCAGCAATGTCCATCTCACAGTCATCACTCCTGTCTCTTCTAACCTCTGCAGACAGAGCACAAGCTGGAAGTCATCATGCTGTCCCAGGGTGTGTCCATGCTCTATTCTGTCTTTATGCCAGCCAGCAAGCTCAAAGAACGGTTGGATCAGCCGTGAGTTAGCCTCTGGGCTGATGGGAGTGGAAGCCTTGGATGGGATTCTCAACAACCCAGTGTGGTTCCCCATTCTTTTTCTACAATCTGCTGCCACCTTTAATTCTATGTTTGTTTGCTTCCTTCTTAAGTCTCCTGCTCTTTGATTTCAGGATGACAGAGATTGTGAGCTGTGTGTCAAAGCAAAAACTGGGCCATCATGTGAAGTCACTTGTGTTTGAGCTGTGCTGCAACAGTGACAGTGGAGACGACATAGAGGTTCCTTATGTACGATACATCATCCGCTGATC----TCTT---------ACTGACTCCG-----TTCTTTCAGATCTCTCAGTCTATATCAAAACC---------TTTCTAGTTATG--------AGGAAACCTCAGTTTGAACCTCCTTGTTCCTAAGAACTTTTTAGTGCTG-TTTTTACATTGTTAAGAACTGAAATTCATAATAATAAATTTTCAGCC s bosTau2.chr27 15982904 751 + 31566707 AGTACTATAACCAAGAGTGGACGTTGTGGGATCGCTTTGAGGTACAGGGTTTGCAGCCTAACGGTGAGGAGATGACCCTCAAACAGTTCCTCGACTACTTCAAGGTGAGAGCCCTTTC-----TGACTCTCACCCCACCTGGGGGTGGCATGTGCAGGTGACTGACTGGCC-TGTCCACCCC---TGTAACACTGCTGTCCTCCCCCTCTTC--CAGACAGAACATAAGTTGGAGATCACTATGCTGTCCCAGGGCGTGTCTATGCTCTACTCTTTCTTCATGCCAGCCGCCAAGCTCAAGGAACGATTGGATCAGCCGTGAGTT--------GGGTGGTGGG------------------GAGCCTCAACTTGCAGCTGT-----CCCACTGCTGCTC-ACTGCCCCCAGCTACCTGCCTCTTCTCACTTACCTTTTGCCTTCCTGACCCTCTGCTCCCTTGTCCCCAGGATGACCGAGATTGTAAGCCGTGTGTCGAAACGAAAGCTTGGCCGCCATGTGCGAGCACTGGTGCTTGAGCTGTGCTGTAACGATGAGAGCGGCGAGGATGTTGAGGTCCCCTATGTACGATACACCATCCGCTGATCCGTGTCCTCTCCTGTAGACTGACCCCAGATCCCCTCTCCAGATCCCT---TCCATCCCAGGGCTCCCATTTGACCTCTGGCAGTGGCCCAGCTAGCCAGGCTTGGTGTTCTCATCCCCCTACCTGAACTCCTCTTGCCGCTGCTTTCTACCTTGTTCGGAACCT-GACTCCTAATAAAGAATTGTTAACC a score=9473 s mm7.chrY_random 302753 154 + 30114534 AGTGATGGCTGCCATCTGGACGA------TTATTGTTGGTGATTGGAGCTTGTGGAATAAGACATGCTTGCTCATAGTCCTCAGCAAGGACCAGTTTCCAGAAGTTTATGTACCCACAGTGTTTGAAAACTATGT-GCAGATATTGAAGTGGATGGAAAGC s bosTau2.chr22 10519138 158 - 48330986 AGCAATGGCTGCCATCCGGAAGAAACTGGTGATTGTTGGAGAT-GGAGCCTGTGG--CAAGACTTGCTTGCTCATTGTCTTTAGCAAGGACCAGTTCCCAGAGGTGTATGTCCCTACGGTGTTTGAGAACTATGTGGCAGATATTGAAGTGGATGGAAAGC a score=9792 s mm7.chrY_random 302907 121 + 30114534 AGGTAGAGTTGGCTTTATGGAACACAGCTGGACAGGGAGATTATGACTGCCTGAGGCCTCTCTCCTACCCAGACACTGATGTTATACTGATGTGTTTTTCCATTGACAGCACTGATAGTTT s bosTau2.chr22 10523497 121 - 48330986 AGGTAGAGTTGGCTTTATGGGACACAGCTGGGCAGGAAGATTATGATCGCTTGAGGCCTCTCTCCTACCCGGATACCGACGTTATACTGATGTGTTTCTCCATTGATAGCCCTGATAGTTT a score=8538 s mm7.chrY_random 303028 130 + 30114534 AGAAAACATCCCAGAAAAATGGACTCCAGAAGTCAAACATTTCTGTCCAAATGTTACCATCATCCTAATTGTGAACAGGAAGGATCTTCAGAATGAAGAGCACA-AAGATGGGAGTTAGCCAAAATAAAGG s bosTau2.chr22 10527310 131 - 48330986 AGAAAACATACCAGAAAAATGGACTCCGGAAGTCAAGCATTTCTGTCCCAACGTGCCCATCATCCTGGTTGGGAACAAGAAGGATCTTCGAAACGACGAGCACACAAGGCGGGAGCTGGCCAAGATGAAGC a score=24755 s mm7.chrY_random 303158 421 + 30114534 AGGAGCTGGTAAAACCTGACAAAGGCAGAGATATGGCAAACAGGATTGGCGTTTTTGAGTACATGGTGTGTTCAGCAAGAACACCAGTGATGGAAGGAGAGGGGTTTCACAGATAGCCTCAAGAGCTCCTCTGCAAGCTAGACGTGAGAAGAACAAGTCTGGGTGCCTCATATTCTGAAGCCTTGTG----AAGCATAGCC-TCTTGCAGTTAATTGC-AAGTGCTGGTTATTAATCTTGGTGTCTGCTTACTGGTCTTTT-CATTAATCTATAATTTACCTAAGATTGCAAATCAGAAGTCATCTTACTACCAGTATTTACAGGCCAAGCATGATTATTAATGATGCCCAACCTCTCTGACCAGACAGAGTCCTTCCGACACTGCTC-TAACTGCCCTCA-CTGTACT-CCACCTG--ACACTAGCCGCTAA s bosTau2.chr22 10527946 430 - 48330986 AGGAGCCAGTAAAACCCGAAGAAGGCAGAGATATGGCAAACAGGATTGGTGCTTTTGGGTACATGGAGTGTTCAGCAA--AGACCAAAGATGGAGTGAGGGAGGTTTTTGAAATGGCCACGAGAGCTGCTCTGCAAGCCAGACGTGGGAAGAAAAAATCTGGGTGCCTTGTCTTGTGAAACCCC-TGCTGCAAGCACAGCCCTCATGCGGTTAATTTTGAAGTGCTGTTTATTAATCTTAGTGTATGATTACTGGCCTTTTTCATTTATCTATAATTTACCTAAGATTACAAATCAGAAGTCATCTTGCTACCAGTATTTAGAAGCCAACCATGATTATTAATGATGTCCAACCCACCTGACCCACCAGGGTCCTTCTGACACTGCTCTTAACAGCCCTCCTCTGCACTCCCACCTGACACACCAGGCGCTAA a score=295 s mm7.chrY_random 303579 23 + 30114534 TTTAAAGTTCTGTGGGTTTTTTT s bosTau2.scaffold8207 11992 23 + 34245 actatagtccaccaggctcctct a score=222 s mm7.chrY_random 303941 142 + 30114534 ggactgaaaccccttcagctc---cttgggtactttctct---------------atttcctttagtggggac---tctggactcc-----atccaatggttgcctatgagcatctgcct---ctgtatttgtcaagcaccgagacactag-----------------------------acagctatatctggctcctg s bosTau2.scaffold8207 12349 197 + 34245 ggactgaag---tttcagcttcaacatcagtccttccaatgaatattcaggactgacttcctttaggatggactggtttgatctccttgcagtccaagggactctcaagagtcttctcccataccacagtttaaaagcatcaattctttagtactcagctttctttatagtccaactctcacatccatacatgactactg a score=44138 s mm7.chrY_random 304295 894 + 30114534 ttCAAAGAATTTCTTAACTTCTTGCTTCTTTCTAGAAAGAGAAGCAGTTGGTAACTTTTGTAAACTGGGCTATAACTACTTAATAATAAACATATCCTGCCTATTTTCTGTCAGCTGCAAGA-ATTCTTGTGAGTCACTACTTCAAAGCTTTACTTC--TGAACAGACTCCACCAGCAGAGCTCTGGGATGGGCATCCAGTTTTTTGCAAACTTGCTCAGCCAGAAATGCCCAAGACCACTGCAGCTGTAGCAGAGTTACACAGTTCTGTAGTCTCATGTTATTTACCTTATAGTCACTGTGTAATT-GTGCCACTTAATGTATGTTACCAAAAAATAAGTATATCTGCCCCAGACTAGATGCAGTATATTTT-TATAATTAGATTTCCTAATACTGATATTTGTGATTCCCACAGAAACTGTATTGCTGCTGCTGCTGCTTCTTCTGttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttccttcctctcttTTTTTAAAGCA----CATTTGGAAAAAAAGTCAGATGGAAAGTTCAGTTTTAAAATTCCCAATTTGTCACTTTCTCTGATAAAATATGGCCATACCTCCCCTATTCTGCCCTATATATCATTCCAGTACTCCTTTCC---AGACTAGGCTAAATAAACAGGAATTTGGTTTCACCCCTGAAGCATTT--ATACTTTGGAGGTGGCATAGCCCTTCTAAGGTGGATTTCAGGATCTAGCTC--TAAGTCACAGTGCTCCTTT------CTATATCCAAGTTGCCTCCCAGAGGAGCCACCAGTTCTTATGGGTTGCTTTGGGTGGGGCTAGAGGGACCTCTCCTCTCCAGCTGACTATAC-TTCTTTCTGAACCAGTTAATTTCTCCA---ACTAATAGTATATAGGCAGTTTTCTAAA s bosTau2.chr22 10528376 840 - 48330986 TTCAAGGAATTTCTTAACTTCTTGCTTCTTTCTAGAAAGAGAAACCATTGGTAACTTTTGTGAATTAGGCTGTAACTACTTTATAACTAACATGTCCTGTCTGTCATCTATCAGCTGCAAGGTACTCTGGTGAGTCACCACTTCAGAGCTTTACTCCTTTTAACAGATTTCATTGGCATAGCTCTGGG-TGGCTATCCAGTTTTTTGAAAATGTGCTCAGCCAGAAAGGCCCAAATCCAC-GCAGCTGTGGTAAAGTT--ACAGTTCTGTGGTTTCATGTTAGTTACCTTATAGTTACTGTGTAATTAGTGCCGCTTAATGTATGTTACC-AAAAATAAATATATCTACCCCAGACTAGATGTAGTATTTTTTGTATAATTGGATTTCCTAATACTGATATTTGTCATCTTCACAGAAAGTGTATTGGT--------------------------------------------------------------TTTTTTTTTTTTTTTTAAAGAAAGTGTATTTGAAAATAAAGTCAGATGGAAAATTCATTTTTTAAATTCCCGTTTTGTCAGTTTCTCGGATAAAAGATGGCCATGTCCCCCCATTTCGGCCCCACAT---GTTCCAGTACCCCCTTCCCCAGAGCTGGGCTAAGTAAGTAAGAATTCAGTCTTCTGCTTGAGGCACTTAGACACTCAGAAGGTGGCATAACCTGTCTCACCTGGACTGCAGGGTCTGGCTCTGTAGTTCACAGTGCTCTTTCTTCTCACTGTATCCAGGTTCCCTCCCAGAGGAGCTGCCAGTTCTCTTGGGCGGCCCTCAGT----------TTCTCTCTCCTCTCCAGCTGACTAAACTTTTTTTCTGTACCAGTTAATTTTTCCAACTACTAATAGAATAAAGGCAGTTTTCTAAA a score=11857 s mm7.chrY_random 327090 162 + 30114534 CATGAAGCCAGGATCTGACGACTTTCTACCGCCGCCTGAGTGCCCTGTGTTTGAGCCCAGTTGGGCGGAATTCCGCGATCCTCTTGGCTATATAGCTAAAATCAGACCCATTGCGGAGAAATCAGGCATTTGCAAGATACGCCCACCTGCGGTAAGCCTCTG s bosTau2.chr25 13919591 162 + 41414979 CATGGAGCCGGGGTCTGACGACTTTCTACCGCCGCCGGAGTGCCCGGTGTTCGAGCCTAGCTGGGCGGAGTTCCGAGACCCTCTTGGCTACATTGCGAAAATCAGGCCCATCGCCGAGAAGTCGGGCATTTGCAAGATCCGCCCACCCGCGGTAAGGCCTTG a score=6370 s mm7.chrY_random 327673 87 + 30114534 AGGATTGGCAACCTCCTTTTGCTGTAGAAGTTGATAACTTCAGATTTACTCCTCGAATTCAGAGGCTAAATGAACTGGAGGTAAGAA s bosTau2.chr25 13923565 87 + 41414979 AGGACTGGCAGCCACCCTTTGCTGTTGAAGTGGACAACTTCAGGTTTACTCCCCGAATCCAGAGGCTGAACGAACTAGAGGTAAGAA a score=10062 s mm7.chrY_random 328534 155 + 30114534 TGACCGTTTTCTTTCCCAGGCCCAGACCAGAGTAAAACTGAACTATTTGGATCAGATTGCAAAGTTCTGGGAAATTCAAGGTTCTTCCTTAAAGATACCTAATGTGGAGAGGAAGATCTTGGACCTTTACAGCCTTAATAAGGTAAGATTAGTTA s bosTau2.chr25 13925893 155 + 41414979 TGAGCCATTTCTTCTCCAGGCCCAGACGAGAGTGAAACTGAACTACTTGGATCAGATTGCCAAATTCTGGGAAATCCAGGGCTCTTCCTTAAAGATTCCCAATGTAGAACGGCGGATCTTGGACCTCTACAGCCTCAGCAAAGTAAGAACAGGTT a score=12957 s mm7.chrY_random 328882 209 + 30114534 GTTTACGTATATATTTTCTTGTCCATTTAGATTGTGATGGAGGAAGGTGGATATGAAGCAATCTGCAAGGACCGTCGGTGGGCCCGTGTTGCCCAACGCCTTAATTACCCATCAGGGAAAAACATTGGTTCCCTGCTTCGGTCCCACTACGAACGGATCATTTACCCTTATGAAATATTTCAGTCTGGAGCTAATCTTGTGGTGAGGGT s bosTau2.chr25 13926295 209 + 41414979 AATCACGTCCCTTCCTGCTTGTCCTTACAGATAGTGGTGGAGGAAGGTGGCTATGAAGCCATCTGCAAGGACCGTCGATGGGCTCGGGTGGCCCAGCGCCTCAACTACCCACCAGGCAAAAACATTGGCTCCCTGCTGCGCTCCCACTATGAACGCATCGTTTACCCCTATGAGATGTACCAGTCTGGAGCCAACCTGGTGGTAAGAAT a score=8287 s mm7.chrY_random 329601 161 + 30114534 CAGCAATGTAACACAGATCCATTTGACAGTGAAGAAAGAGACAAGGAATACAAACCTCATAGCATTCCTCTTAGACAGTCTGTTCAGCCATCAAAATTCAGTTGCTACAGTAGACGAGGAAAAAGGCTACAGCCTGAGGTAAA-------CTATTTTTCTAATAACTT s bosTau2.chr25 13926849 168 + 41414979 CAGCAGTGCAACACACGTCCATTTGATAATGAGGAGAAGGACAAGGAATATAAACCTCACAGTATCCCCCTTCGACAGTCTGTGCAGCCCTCCAAGTTCAACAGCTATGGCCGGCGAGCCAAGAGACTGCAGCCTGATGTGAGTGCTTCCCTACTTTTAACAGAACTT a score=9712 s mm7.chrY_random 339551 175 + 30114534 TCTCCTTTGAATTTTTTAATAGCCAGAACCCACAGAAGAAGACATTGAGAAAAACCCAGAGCTAAAGAAACTACAGATATATGGGGCAGGCCCCAAGATGATAGGCTTGGGCCTCAAGGCTAAGGAGAAAACTCTGAGAAAGAAAGATAG---CAAACAACCAGGTGAAATTTAAATA s bosTau2.chr25 13927705 175 + 41414979 TTTCCTTC---TTTCCTCCTAGCCGGAACCCACAGAAGAAGACATTGAAAAGAATCCTGAGCTAAAGAAGCTGCAGATCTATGGGGCAGGCCCCAAGATGATGGGCCTAGGCCTCATGGCCAAGGATAAGACTCTGCGGAAGAAAGGTGAGGCCTGACAGGCTGGGGAAGTGTGAAGA a score=6170 s mm7.chrY_random 339794 208 + 30114534 ACTTTTGATCCTCCTAGATAAAGAAGAAGTGACATGCCCTGCAACTATTGTAGTGAAGGGGGAAGCCAGTGAGTTTGGAAAGGTGACATCAGCATTTTCAGACAAGAACT---------------------TAAATCACAGTTTTGAACCTTGTATGAAGATGACTATGCAGCTACGGAACAATCACAGCAGTACCCAGTTTGTAAGGATTTACCAGTGATTTTGTGAT s bosTau2.chr25 13927937 226 + 41414979 GCTATTCTCTCTCCCAGATAAGGAAGGGCCTGAGTGTCCCCCTACTGTAGTGGTGAAGGAGGAGTCAGGCGGGGACATGAAGGTGGAGTCAAC---CTCACCCAAGACCTTCCTGGAGAGCAAGGAGGAGCTGAGTCACAGCCCAGAACCCTGCACCAAGATGACCATGAGGCTCAGGAGGAACCACAGCAATGCCCAGTTTGTAAGGACCCAGCCCTGACTTCCTAAT a score=34597 s mm7.chrY_random 391778 766 + 30114534 GCAGGGCTCAGTATTGGCTGTGGT-GGGGTGTCCAGAACACTGCTCCTAGTCTTTACAGTATATGTGGGTTGAACACCCCCAGGGCATCACGGAAGCTGAGCGAGAGGCTTTTGAGCTACTCCCAGATGATGAGCGTCAGTGCATCAAGTGTAAGACCACGTGTTTCCTATCAGCCTTGGCCTGTTATGACTGTCCAGATAGTCTTGTCTGCCTTTCCCATATCAATGATCTGTGCAAGTGCTCAAGGAATCGACAGTACTTACGGTGAGTATGGGTCTTACATGAAAGAGATAG--------AGGAAATACAGATATGGCCCATATATTCTTTTCT---TGTTCTTCCTCTAGGTACAGGTACACATTGGATGAACTGCCTGCTATGCTACAAAAGCTGAAGATTCGAGCTGAGTCATTTGACAACTGGGCCAACAAAGTACAAGCAGCCCTAGAGGTGGAGGATGGTCGGAAACGGAGTAAGTAAT--AAAAATTGAAGAACCTTTAAGCTATGATCAGTTATTTGTTTATTATTGACTTACTTTCTTCAATATTCTAGAAAACTATCTTCTGGTAACACTCTATTGGAACTTTGACTCtttttttttttttttttttaaGGTTTTGAAGAGCTAAGAGCATTGGAATCTGAGGCTCGTGATAGACGATTTCCTAATAGTGAGCTGCTTCAGCGATTGAAGAAATGCCTAACTGAAGCAGAGGCTTGTATTTCCCAAGTTCTTGGACTGATCAGTAACTCAGAGGACAGGTATGTTAG s bosTau2.chr25 13942957 752 + 41414979 GTGGAGCTCAGTGGTGGCTGAGTTAGGGGTTTCTGCAGCCCTGTTCTGGTTCTATATAAT-----------GAACACCCCCAGGGCATCACTGAAGCTGAGCGAGAAGCTTTTGAGCTGCTCCCGGATGATGAACGCCAGTGCATCAAGTGCAAGACCACGTGCTTTCTATCAGCCCTAGCCTGCTATGACTGCCCTGATGGCCTTGTCTGCCTCTCCCACATCAATGATCTCTGCAAGTGCTCCAGTAGCCGGCAGTACTTGAGGTGAGCAGGGGGCCTACCTGGGGGAAGTGGGCTGAGGAGGGGGATGTAGAACTGGGCCAGATGTGCTCTTCCCTGTCCTCTTCCTGTAGGTATCGGTACACCTTGGATGAGCTCCCTGCCATGCTCCATAAGCTGAAGGTCCGGGCTGAGTCCTTTGACACGTGGGCCAACAAAGTGCGAGTGGCCCTGGAGGTGGAGGATGGGCGGAAGCGCAGTGAGTGATGGGGGGACGGAGGGACTCCACAGGCAAGTTCTATTCCCT-----------------TTTCTTCTGTACCCTCCACCCCCTTCCTCTGCCTTTACTCAATACTGCCTACTCCTTGCTGCTCTTATTCTCTCTCCAGGCCTTGAAGAGCTGAGGGCACTAGAGTCAGAGGCCCGTGAGCGGAGGTTTCCTAACAGTGAGCTGCTGCAGCGACTAAAGAACTGCCTGAGTGAGGCAGAGGCTTGCGTGTCCCGGGCTCTGGGGCTGGTCAGCGGCCAGGAAGCTGGGTATGGCAG a score=5015 s mm7.chrY_random 401004 125 + 30114534 AACCTCCTTTCTTCCTACAGGTTACAAACACCGCAAATCACCCTTACTGAACTACAGCTTCTTCTCAAACAGATGGGCACTCTGCCCTGTACCATGCATCAGATTGATGAAGTTAAGGTGAAGAG s bosTau2.chr25 13944295 125 + 41414979 AAACTCCATAGCCCCCACAGGATGGCTGGTCTGCAGATGACCCTTGCTGAGCTCCGGGCCTTTCTGGACCAGATGAACAACTTGCCTTGTGCCATGCACCAGATTGGGGATGTCAAGGTGAGGAG a score=18752 s mm7.chrY_random 401933 453 + 30114534 TCTTCATTTTTATTCTAAAATTTTGCAGGATGTTCTTCAACAGGTGGAATCATACCAAATTGAGACCCGTGAGGCTCTAACTTCACTGCCTTACAGTTTAGAAATACTTCAGTCCCTGATGGAAAAGGGTCAGCAGCTTCGTGTGGAAGTGCCTGAAGCTCATCAACTTGAAGAGCTGTTGGAGCAGGCACAATGGCTAGATCAAGTGAAGCAGGCCCTGGCTCCCTCAGGCCAGAGGCACTCTTTGGTTATCATGAAGAAGCTTTTAGTTATGGGAACCAAGGTAGCCTCCAGCCCTTCTGTGAACAAAGCTCGAGCAGAGTTACAAGAACTGCTGACTATTGCAGAATGTTGGGAGGAAAAGGCCCATTTTTGCTTAAAAGCTAGGTAAAGAATAACCTCTTCCCATTTGTATTTTCCTTGTGGCCTTTATTGAGTCTGCTTCAGAGTATA s bosTau2.chr25 13945328 430 + 41414979 TTTTTGTTTGTGTCCTG-------GTAGGGTATTCTGGAACAGGTGGAAGCCTACCAAGCTGAGGCCTGTGAGGCTCTGGCCTCATTGCCGTCCAGTCCAGGGCTCCTGCAGTCCCTGCTGGAGAGAGGGCAGCAGCTTGGAGTGGAGGTACCTGAAGCCCAGCAGCTCCAGCGGCAGGTGGAACAGGCACAATGGCTGGATGAGGTTAAACGCACACTGGCCCCGTCAGCCCGAAGAGGCACCCTGGCTGTCATGCGGGGACTGTTGGTAGCAGGTGCCAGTGTGGCCCCTAGCCCTGCTGTGGACAAGGCCCAAGCCGAACTGCAGGAGCTACTGACCATTGCCGAACGCTGGGAGGAGAAGGCCCACCTCTGCCTGGAGGCCAGGT-AGGTCTAGCTTCTTCTC---------CTCCCTG----CTCTACTGCATC--CTTCAGAGTTTA a score=31221 s mm7.chrY_random 403946 1354 + 30114534 TCTTTTCACCATTACTTTTAGCCAAAAGCATTCTCCAGCCACTTTGGAAGTTATAATACGTGAGGCAGAAAACATCCCTGTCTACCTACCTAACATCCAGTCTCTGAAGGAAGCTCTGACTAAGGCACAGGCTTGGATTGCTGATGTGAATGAGATTCAAGTGAGGATCATGATTTTTTTTTCTTCTCCTCCTGCTGTTCTTCCTCCTCTTTCATCTTCCTTTTagattg-attgattatgtatgcagtgctctgcctgcctgtatac------ctgcagaccagaagagggcaccagacatcattacaaatggttgtgagccaacatgtggttgctgggaattgaactcaggtcctctggaaggacagctagtaactcttaacccctgagccatcatctctccagccccCAGAGGATCACATTTCTTACTTTGCTACACAACCTACAAGGTGAAGAGAGACCATTCTATTTCAATTTTATATAGAGTTGGGTTTGTGGGAGGAATTGAAGATGGAAATTTAGCTAAGTTAAGGTAATCAGGATAAAAAAACAAGGAATGAAGGGATGATTTGGGCTCAAACACAGAAAGAGTTTGGCCAAACAAGAGTAAAGAAGCAAGTGAT--TAGATCAGCCCTAATTATTTTGATTCTGAGTCAGCAAAAGGAAGAATTTTGTGAGAAAATTATTTTGCCATTTTTCCTTTTTCAAAATAAGTCTGTATTTCATCTATACTGATTATATG-GTACAATATATAACCTCTCAA--------------------AAAATCTAAAAATACTTGACATAATTTAATTGTAC-----------CTACCTTAGAATGGTGATCACTACCCCTGTTTGGATGATTTGGAGGGCCTTGTAGCTGTTGGTCGGGATTTACCTGTGGAGCTAGAGGAATTGAGACAGCTGGAGAATCAGGTACTAACAGCACATTCCTGGAAAGAGAAAGCTTCTAAGACTTTTCTTAAGAAGAATTCTTGCTACACATTGTTGGAGGTGAGATCTGGTTCCTTTTACCACATCATTTTCTGTGCCTGACCCTGA-------GCACATAAGTGAACATGAATTT-------TCGAGACATCTCAGGGAGATAAAGGGCAGTAATTCCCCCTTTTTCT--CTGTTAATAGGTTCTCTGCCCATGTGCAGATGCTGGTTCAGTCAGCACCAAGCGCAGTCGGTGGATTGAAAAGGAGATGGGATTATACAAATATGACACAGAATTGCTGGGGCTGTCTGCACAGGACCTCAGGGACCCAGGGTCTGTGGTAAGCAGCTT-GACACAGAGAAAATGTAGCTTATGGGTATCTCACTGAGAAGAAGATAGCCTAGCAATGGTTTGTTGTATGGGTTGGTTGCCCATAAGCAGACCATTTA s bosTau2.chr25 13946279 1180 + 41414979 TCTTTTTTCC-CTACCTTTAGGCAGAAGCATCCACCAGCCACGCTTGAGGCCATAATTCATGAGGCAGAAAACATCCCTGTTCACCTGCCCAACATCCAGGCTCTCAAGGAGGCTCTTGCTAAGGCCCGGGCTTGGATTGCTGATGTGGACGAGATCCAAGTGAGGACCCTG----------TTGCCCCACCCACCCTTCACCCCAG------ATCTTCAGTCCAGATGGGAGAGATGTCATACACTGCGTTGTTCTGGGTTGAGTTCGGTTGGCTAGAGCGAGGAAGGGGGCA----------TAGCACATTGTGAGGAGGCAGAACGTGCTTGGTGAGCAGTG--------------TGAAGAACGG--------------------------------------------------------------TTGC-------------------------------------------------GAGGCTGGCCTGAGGGA--------AGATAGGATGCTGGTTAAGATGAG-----------------------AATGGTAGG-------GGGCAGGGAGGCTAAAAGAGGCCAACCACAACAGCGTAACTGGTCTGGTGGTCCTGGGGACTGCCTGGATATCTGGAGGCTGATCCAGTGGATGTAGGAGTTGGAGGAGAGAGCCAAGTAGGCATA---CCTTCCTTAGGATGAGTCT---TTTCTTCTGGCTCAAGACTGTGAGTCCAGTCCAT--CTTCCCAATTCAGGGCCAGGGACAGAGTAGCATCAGTAGATGCTGGC--GAGTTGAATTGAGCTTTCTCTTGCCCTGTCCCAGAATGGTGATCACTACCCCTGCCTGGATGACTTGGAGGGTCTGGTGGCTGTGGGCCGGGACCTACCTGTGGGGTTGGAGGAACTGAGACAGCTAGAGCTGCAGGTACTGACAGCGCACTCCTGGAGGGAGAAGGCCTCCAAGACCTTCCTCAAGAAGAATTCTTGCTACACTCTGCTGGAGGTGAGGCCTGGGACCTGAC-CCACAGCCTCTCCTGCCTCTGACCCAGATGAGACAGCTCATGTGAGAATGTGGGTTTGGGGGCTTTGGGGTATGGGAAGGAGGGGAACCCCAGACATTCCCTTTCTGCCTGCCTGCCT-CAGGTGCTCTGCCCGTGTGGAGACGCCGGCTCAGACAGCACCAAGCGCAGCCGTTGGATGGAGAAGGAGCTGGGGTTGTACAAATCTGACACAGAGCTGCTGGGGCTATCTGCGCAGGACCTCAGGGACCCAGGCTCTGTGGTAAGGAGCTTAGGCCCAGA--------------------------TGGGGAGAAGA--GTCTGGCAATGAT--AGTATCTGAGCCTGGTGACCATGGGCAGACCGCTTG a score=41427 s mm7.chrY_random 405337 702 + 30114534 GGGTGCTTAACAGCTTTTCTCTGTCCTGGGTTCAATAGATCATGGCCTTTAAGGAAGGGGAAGAGAAAGAAAAGGAAGGTATCTTGCACTTACGTCACATCAACTCAGCCAAGCCCAGTCCAATGTCCTCATCGATGAATGC---CTCTGCAACCTCCATCTGTATATGTGGGCAGGTCTGTGCAGGAGTGGAATCTCTGCAGTGTGATCTTTGTCATGACTGGTTCCATGGACAATGTGTGACTGTACCCCACCTACTCAGCTCAGTAAGGGCCAGTCATACCTCATCTCAACTGCTAGCTTGGTGGGAATGGGACACCAAGTTCCTGTGCCCACTGTGCATGCGATCAAGGCGTCCACGCCTGGAGACCATCTTGTCATTGCTGGTAGGACTACAGAGACTGTCTGTAAGGCTACCTGAGGGTGAGGCCCTACAGTGCCTCACAGAGAGAGCCATTGGTTGGCAAGGCCGTGCCAGGCAGGCTCTAGCTTCTGAGGATGTGACTGCTTTGTTGAAACAGCTGGAAAAATCCCGCCAACAACTACAGGATGAATTGAGACATAAGAAGCCCCCTACCTTGCCTTCAGGCTTTGCCTTTGACTGTCTCACAGAGAATAGTGGCAAGGATATCCTTAAGGTAAGCTGT-CAGGCCTACTTTTT-ACCCTCAGATTTCTATATTTTAGACTATTAAGACCCTACCTTTA s bosTau2.chr25 13947524 698 + 41414979 GGGTGCTGACCTCTCCTCCCCTGTCCTGGGCACGGCAGATCGTGGCCTTCAAGGAGGGGGAACAGAAAGAGAAGGAGGGAATCCTGCAGCTACGCCGCACCAACTCCACCAAACCCAGTCCACTGGCATCATCGACCACAGCTTCCTCTGCAACCTCCATCTGTGTGTGTGGGCAGGTGCCAGCCGGGGTGGGAGCTCTGCAGTGTGACCTGTGTCAGGACTGGTTCCATGGGCGATGTGTGTCGGTACCCCGCCTCCTCAGTTCCCCAAGGCCCAGTCCCACCCCATCCCCACTGCTGGCCTGGTGGGAGTGGGACACCAAATTCTTGTGTCCGCTGTGCATGCGCTCACGGCGCCCACGCCTGGAGACCATCTTGGCACTGCTGGTAGCGCTGCAGAGACTGCCTGTGCGGCTGCCTGAGGGTGAGGCCCTACAGTGCCTCACAGAGAGGGCCATCAGCTGGCAAGGCCGTGCAAGGCAGGCTCTGGCCTCTGAGGATGTGACTGCTCTGTTGGGACGGCTGGCTGAGCTTCGCCAGCGGCTGCAGGCTGAACCCAGGCCCGAGGAGCCCCCTACCTACCCTTCAGCCCCCGCCTCTGACCCTCTCAGAGAAGGCAGTGGCAAGGATATGCCTAAGGTGAGCTGTGCAGCCCAGCTCTTTGACCCTCAAATTCCTGTCTCCT---------AGCCCTTGCCCTTA a score=7682 s mm7.chrY_random 406322 301 + 30114534 AGAGCCTGATTTTTTTTCAATTTTATTAAAGTAATCCATTCCTGCTCT---TCTTCTCAGGAAGAGGAGGAGTTGGTACTAAATGAAGAAAGGATTAAAAGTTCTGAGAAGATTGTTCCAAAGGAAAGTTCATGTAAAGGAGGTATGTCTAGGTGTTGATAGGCTAATGAATACATACCACCAAAATGGCTTTCTGT-GTCTTCAGCTCTTTTGTAGTAAGGAGAATTAG----AGCAAGGTCATATTCTAAAAGAACTT-TCCCCA-AACCCTCCAGATAAGGAACTGCTGCCTTCACTTTTATCCCAAT s bosTau2.chr25 13948395 295 + 41414979 AGGACCTGGTTCTTC--------------AGTTATCACTACCTTTTCTTGATCTCTTTGGCAGGTGCAGGGGTTGCTAGAGAATGGAGACAGCATGACCAGTCCTGAGAAGGTAGCCCCGGGGGAGGGCTCAGGTAAGAGAGGTAGGTCTAAGTGTGGGTAGGCT-GTTAGTGGATCTCACCAGAGTGA-TCCCTGTGGTCCTTAGCTCTGTCGTGGTAGGGGGCAGGGGTATAACCAGGAGTAGCCTCTAACACAACCTGTCCCCGCAACCCCCCAGACCTGGAGCTGCTGTCCTCGCTGTTGCCACGGT a score=4512 s mm7.chrY_random 406631 161 + 30114534 CCAGTACTGGAACTGCCTGAAGCCACCCGGGCACCCCTAGAGGAGCTTATGATGGAAGGAGATCTACTTGAAGTTACCCTAGATGAGAACTACAGCATTTGGCAGCTGCTGCAGGCTGGGCAGAATCCCAATCT---AGAGCGCATTCATACACTTC-TGGAGGT s bosTau2.scaffold383 423167 161 + 504643 CCAGTGCTGGAGTTGTCGCCAGGAGCTAAAGCTCAGCTGGAGGAGCTGATGATGGTGGGAGATCTCCTGGAGGTGTCCCTGGACGAGACTCAGCACATATGGCGGATTTTGCAGGCCACACA----CCCACCCTCTGAAGATAGATTCCTGCACATCATGGAGGT a score=3685 s mm7.chrY_random 455301 82 + 30114534 TCCTTTCTTTCCTCCTCATGCCTTACATCGCCTGCCCTTGATGTGAACTGGCAGAACAACACTACCTTTGCTCCCAGTGCAG s bosTau2.chrX 5354891 74 - 48857030 TCCGCCCTTTGCTTCTC------CGCAGCCCCTGCTCTCGACGTGGACTGGCAGAACAACACTACCTTCGCCTCC--TGCAG a score=10416 s mm7.chrY_random 474472 537 + 30114534 ggggCTTTCACTGGGGCTGCCCTTGACGTTGCCTGCACTAATAGTTATGAAGTCCATGGCAAGTAGCTGTTGAA-CTTTATATATTGTTTTTTAGTAAGTTTCGTACAACTCAATATACAAAGTCAGTCAGAGTAAAGTCCTCGTAATAAGGCTACACCTA-TGTTTACTGCCCGTTCTTCCAGGCCAGATTCTTAGTCAGCCTTTAATCCGCCATTTTACAGCCCCGCCCATAGGCTTGTGCGTTTTGTGACGCGA-CAGCGGAGGCCACAGCC-ACTTCCTTCTTTCGTGAGCAAGATGGCGGGCGGAGAAGCCGGTGTCACTCTCGGGCAGCCGCATCTTTCTCGTCAGGATCTTGCCACTTTGGTGAGATTTTCCTTCCTGAAC---TGCTATGTAAAGTCCATAGTGGGGA-----------------AAGCGTTGGGTTTAGGTTGTCCTGGCAGTTTTGGGGCGCGAG----AAAGGAGACCGGT-----------------------GATACCGACTGTATTTCAGTCAGTGACCAAACCCTGGAACCGAGAGCTTGTCGTTGAGGCTTTATTAATGTGG s bosTau2.chrX 10872064 562 - 48857030 GGGGCCTTTATTGGGGCTGCCCGCACCGTTGCCTGCACAAATATCCAACAGATCTGCCGCGAGTAGATCCCGAAACTTGGCCTTGTGTTTTTCAGTCAGCCTGCCGGCAGGCACTATACAAATTAATTAAGAGACAAGTCCAAACAGTGAGGCTTCCGCTGCTGCGGCCATCCTCCTCTCCCAGGCCTGGGCCCTAGCCAGCCCTCCCGTCACCGCTGCTCCGCCCTGCACTAGGGGTCCTGCG--------CGCGGTCAGGCAGGGACGCGGCCGACTTCCTTCCTCTCCGGGCAAGATGGCGGGGGGCGAGGCTGGTGTGACTTTAGGGCAGCCGCACCTTTCTCGGCAAGATCTCGCCACTTTGGTAAGGCATGGCT--CTGGAAGTATGCGCTATGCGCTCAGGAGTGGGGATGACCGGGCCTCCCGCAAGGCTGTGAAACGAGGCGGTGCCGGGCGGTCAGGAGCATGAGTTAGGAGGGAGACCTGCCCGGCGCCCAAAGCCGCGCTCGCGCTGCCCCACGCGCTTCTGTCAGT---------------CAGGGAGCTGGGCAT-GGGGCTGTGCGGTCGTGG a score=7323 s mm7.chrY_random 475274 211 + 30114534 AAAAAGTAAGATAGAGACAGGAAAAACCCCTTTAAAAATAGGATCAGGAAGGAGATGTGTATTGTAA--ACCCATGGGT-------TATAGGAAAACGTTGGTTTCTCCTGAAAGGCAATGGTCT----TAAAAATGTCTCCTTGCAGGATGTTACCAAGTTGACTCCGCTTTCACGTGAAATTATCAGCAGACAAGCCACAATTAATATAGG-----TAAGAACAACT s bosTau2.chrX 10872816 223 - 48857030 AGAATGCAAGATTG-TACAGGAAAAGCGC-TTTAAAAGTAGAA----GAGGGCTATTCAAATGGTAGCGAGCTGTAGGTAACAATGTAAAGTCAAAATTCTGATTCATCTTATGTACAGTGATTTAACATAGAAATGTTTGATTGCAGGATGTTTCCAAGTTGACGCCACTTTCACATGAAGTTATCAGCAGACAAGCCACAATTAATATAGGTGAGATAAGAATAACT a score=-201 s mm7.chrY_random 475485 25 + 30114534 GTT----------------AATTGGTAGTTG---AAACTATTCT s bosTau2.chrX 10936295 44 - 48857030 GGTCACGTAGCTCATGGGAAATCTACAGTTGTAAAAGCTATTTC a score=3853 s mm7.chrY_random 475565 92 + 30114534 GACTCCAATTGTCC-CAGTTAGAATGCTACAGATCTTGTAAAAGTAGT-TACCTAAAGAATTCCCATCAGATATTCCAGAAATCACAGGAATCT s bosTau2.chrX 10936430 94 - 48857030 GACCCAAGTTGTCCTCGGCCAGAATGTTATAGATCCTGTGGAAGTATCACACCTGATGAGTTTCCTACAGACATTCCAGGGACCAAAGGGAACT a score=22985 s mm7.chrY_random 475941 388 + 30114534 AAAGTACTTGCTGTAGTTATGTGCAT----AACAGCTTTTTGTTTTTTGTAGGCACAATTGGTCATGTTGCTCATGGAAAATCTACAGTTGTAAAAGCCATTTCTGGTGTTCACACTGTCCGATTCAAAAATGAACTAGAAAGGAATATTACCATAAAACTTGGATATGCTAATGCCAAAGTACGTAATATACTGTGGAAGTAGGAACT---ATTTAATTAGTAATTAT-----TACAAAAATTCATTATTGTCT--TTGAAATTTTCAGATTTATAAGCTTGATGACTCAAGTTGTCCTCGACCAGAATGTTACAGATCTTGTGGAAGTAGTACACCTGATGAGTTTCCTTCAGATATTCCAGGGACCAAAGGAAACTTCAGACTAGTCAGGTGATTATTT s bosTau2.chrX 10873916 402 - 48857030 AAAATATGTGGTGTAACTGAATGCACTTGAATTAATTTTTTGTACTTTGTAGGTACAATTGGTCACGTAGCTCATGGGAAATCTACAGTTGTAAAAGCTATTTCTGGAGTCCACACTGTCCGTTTCAAAAATGAACTGGAAAGAAATATTACAATCAAACTTGGCTATGCTAATGCTAAGGTGAGCTGTGTACAGTGAAATGAAAAACTCAACTTTAATTGTTGAGTGTGCAGATAACAAATCCAAGTCTTGTCTCATTGAAACTTTTAGATTTATAAACTTGATGACCCAAGTTGTCCTCGGCCAGAATGTTATAGATCCTGTGGAAGTAGCACACCTGATGAGTTTCCTACAGACATTCCAGGGACCAAAGGGAACTTCAAATTAGTCAGGTGACCTTTT a score=11334 s mm7.chrY_random 477488 269 + 30114534 TATTGGTTGATTTGAAGACTGATGATTATCT----CTCCATTAGACATGTTTCCTTTGTTGATTGTCCTGGTCATGATATTTTGATGGCAACTATGCTGAATGGGGCAGCAGTGATGGATGCAGCTCTTCTGTTGATAGGTAAA---GTCAGAATTGGTTTAGTTAAGTCAGTGT-----AAGTCTAAGA------ACTT---------TTAGAGTTGTTAAGGACCAT------------AAGATAATATAAATGGAAAATTTCCAACAAGAAAACCAAAAATACTAATTCTAAT----CAGCTATCAAAA s bosTau2.chrX 10876582 306 - 48857030 TATTGATTGATCTTAGGATTGATGGTTATTTTTTACTTTGTTAGGCATGTTTCCTTTGTTGACTGTCCTGGCCATGATATTCTGATGGCTACTATGCTGAACGGTGCCGCAGTGATGGATGCCGCTCTTCTGTTGATAGGTAAATACATCAGAATTGGTTCCAACAAATCACTGTGGAGCAAATCCAAGATGGAATACTTAAAGGAAAACTAAGGCCTTTAAGGACTACATCCAGTATCTAAAGGTGACAGGAATGAGAA----CTAACATGTCAACCAGTATGAC--ATCCTTGTCTTCCAGCTATCAAAA a score=4105 s mm7.chrY_random 478426 100 + 30114534 CAGACTAAAGAACAGTACAAACAGAAAGTTATATTTATACAGGGTAAGAGCCCATAATACCTAAGAATCACCTTGATAGACAGTAGATGTACATTAAATA s bosTau2.chrX 10878019 97 - 48857030 CAGGCTAAAGAACAGTATGAACAGATCCTTGCATTTGTTCAAGGTAAGAAGCCATAATACCTAATAAAAATCTTCCT---CAGTGATGGTAAAATAAACA a score=14741 s mm7.chrY_random 478756 207 + 30114534 CATTTTTTTCCTTTTAAATCAATTTAGCTGGTAATGAATCTTGTCCTCAACCTCAGACTTCTGAACACCTGGCTGCCATTGAAATTATGAAGCTAAAACATATTTTGATTCTGCAAAATAAAATTGATTTGGTGAAAGAAAGCCAGGCTAAAGAACAGTATGAACAGATACTTGCATTTGTACAGGGTAAGATCTCATAATACTTGA s bosTau2.chrX 10877877 206 - 48857030 CATCTTTTTTATTCTTTATCA-TCTAGCTGGTAATGAGTCTTGTCCTCAGCCTCAGACATCTGAACACTTGGCTGCTATAGAAATCATGAAACTGAAGCATATTTTGATTCTACAAAATAAAATTGATTTGGTAAAAGAAAGCCAGGCTAAAGAACAGTATGAACAGATCCTTGCATTTGTTCAAGGTAAGAAGCCATAATACCTAA a score=12676 s mm7.chrY_random 480191 155 + 30114534 AATTTTGCCATGTAGGTACAGTAGCCGAAGGAGCTCCTATTATTCCAATTTCTGCTCAGTTAAAATACAATATTGAAGTTGTATGTGAGTATATAGTAAAGAAAATTCCAGTACCTCTAAGAGACTTTACTTCAGAACCCCGACTTATTGGTAAG s bosTau2.chrX 10879317 155 - 48857030 AATTTTGTCTTATAGGTACAGTAGCAGAAGGCGCTCCTATTATCCCAATTTCTGCTCAGCTAAAATACAATATTGAAGTTGTCTGTGAGTACATAGTAAAGAAAATTCCAGTACCCCCAAGAGACTTTACTTCAGAACCCAGACTTATTGGTAAG a score=8354 s mm7.chrY_random 480716 366 + 30114534 TAATTCTTCTCTTTCTTGGCTAGTTATTCGGTCTTTTGATGTTAACAAACCTGGCTGTGAAGTTGATGACCTTAAAGGGGGTGTAGCTGGTGGTAGTATTTTAAAAGGCGTATTAAAGGTAAATTATATTCTAAAC------TTTTTATTGCAACTCCTATTTCCCATAAAGTAAGTTAAAATCTATAGGTTTTTTTTTTTAAGGAAAAATTTTACTGTATATTGTGTTCTTTATTTTTAAGAAGTTTTAATGGAtatttttgtatttatgaatgtttgtatgtatatatgaataccatacgtgtacctggtaccagaagttggatctctctggaatttgagttagtctgttatgaactgccatgaaaatga s bosTau2.chrX 10880713 313 - 48857030 TAATTTGTTTTGTTTTCTTTTAGTTATTAGATCCTTTGATGTCAACAAACCTGGCTGTGAAGTTGATGACCTTAAGGGGGGTGTAGCTGGTGGTAGTATTCTAAAAGGAGTATTAAAGGTAAACTGGATTTTGATTGTTGTGTTTTTGCTTTATTTTTTCTCTTGTCCTAAGTAGGAGAATAG-TATAGACACTCCAAATTGAAAAATAATTTTTTTCTTCGTGGTGTCTAGTACTT------------GATGTAGATTTATTTGTTTACTAGTATATCTTT----------------TGAGTGT--------------GTTTGACCTC----AAACTT------------CATAGGCTTCTATGAATATGA a score=14176 s mm7.chrY_random 481314 397 + 30114534 TGATAAATTGGTTAAAAGTAATTGTGTAAATTGAGTTGTCATTTCAAAAATCT-GTTTATGTTCATTTTATTATTTTTAGAATGTACAAAATTATTTTTGCAAATGGGATAGATAAT-AGTTTAGTAGTCTTCCTTTTGGTAC-----ATACTACATTAAAAGGCTATTGCTAATCTCAAGAATGTCATTTATTTGTTTGTTTT-----AGGTGGGACAAGAGATAGAAGTGAGACCTGGTATTGTTTCTAAAGACGGAGAAGGGAAGCTTATGTGTAAACCAATCTTTTCCAAGATTGTATCCCTTTTTGCAGAACACAATGATCTTCAGTATGCTGCTCCAGGTGGTCTTATTGGTAAGAATTTTATACTCATTGATA-AATATTTGTTCTTGGGTATTTGATTACTT s bosTau2.chrX 10881055 387 - 48857030 TGATAGGTTTGTTCAAAACATTTGGATG------GTTCTGAATTTGAAGATCTCGTCCA----CATCTTTTTTTTTTAATAGTG---------ATCTTTGAAATAAGGATGACTTTTCAGTTTTGTGGTCTTCCTGTTAGAACTTTTCATATGTAATGAAAATGGTGTTG----TCCCACAAATTCtaattattaatttatatttttaCAGGTGGGCCAGGAGATAGAAGTCAGACCTGGTATTGTTTCCAAAGACAGTGAAGGAAAACTCATGTGTAAACCTATCTTTTCCAAAATTGTATCGCTTTTCGCAGAGCATAATGATCTTCAGTATGCTGCCCCAGGAGGTCTTATTGGTAAGGCTTTTCCTCTCATCCCTATGGGGTTTTTTGTTTGCCACTTTATTTCtt a score=1947 s mm7.chrY_random 481781 98 + 30114534 AAGTGTGACATGCAAATAAATAGTTGGTTAAGATTTTGGTTTTATAATATATGAT------ATATGAATATGAGTATATTCATAAAGCAGAAGGCATTTTGCTT s bosTau2.chrX 10881527 101 - 48857030 GAGCAGGGTAGGGGAATGTATATGTGGTTAAGCTGTTGATTTTAGGTCATATGATGATTTCGTATGTTTGTGAAAATTATTTTTAAGCAAGA---ATTTTGGTT a score=15258 s mm7.chrY_random 483986 435 + 30114534 TGGAGATATTAGTTTTATTTAGGTAAAAGGCAAATAAAAATGTATGTATTACTATGTAGGATTTATGTTAGTCTATATAGAATTATTGCTTCAGTTTTTTTATGAGTTTTAAACAAAATATAAAGTTATGAATACCTACATTTT--ATTAGGAGTTGGAACAAAAATTGACCCAACGTTATGCCGAGCAGATAGAATGGTTGGGCAGGTCCTTGGTGCTGTTGGAGCATTACCTGAGATATTCACAGAGTTAGAAATTTCCTACTTCCTACTGAGACGGCTCCTAGGTGTACGTACAGAAGGAGACAAGAAAGCAGCAAAAGTGAGTTCATTTTATAGTAACTGT----TTCAAAGCAATGAAATATTTTGTTTAGTGTTTCAATCTTTTTTAGTTAAAATGGAATTGTAAAA------GAAGTAAATAAATTGGAACTTTCTATAA s bosTau2.chrX 10882710 407 - 48857030 TGAAAATATAAGTTGTAT---------------ATTAAAATGTGTAGGTAGGTATGTG----CTGTACTAGTTTGAATAAGTTTTTTGGGTAAACAGCTTTATAGG----AAATAAAATGTTGGACCATATATATCT-TATTTTGGATCAGGAGTTGGAACAAAAATTGACCCCACTTTGTGCCGGGCTGACAGAATGGTGGGGCAAGTACTTGGTGCGGTTGGAGCTTTACCTGAGATCTTCACAGAATTGGAAATTTCCTATTTCCTGCTTAGAAGGCTTCTAGGTGTTCGCACTGAAGGAGACAAGAAAGCAGCGAAAGTAAGTAC---TTGGAGTGCCAGTGACGTTAAGACCA------------GTTTTGAGGTTC-ATACTTTTTAGTTAAGATAGGATTAAGAAAAGAGAGAAGGTAAATAAATTTGACTTCCCGAAAA a score=14535 s mm7.chrY_random 487429 206 + 30114534 ttttttttta-----taattttCCTAGGTTCAAAAGCTATCCAAGAATGAAGTACTCATGGTGAACATAGGGTCCTTGTCTACAGGAGGCAGAGTTAGTGCAGTCAAGGCAGATTTGGGTAAAATTGTTCTAACCAATCCAGTATGCACAGAAGTAGGAGAAAAAATTGCTCTAAGCCGACGAGTTGAGAAACACTGGCGGTAAGTTTCTT s bosTau2.chrX 10883327 211 - 48857030 TTATTTTTCACCACTTGATTTCCTTAGGTACAAAAGCTGTCTAAGAATGAAGTGCTTATGGTGAATATAGGATCCCTGTCGACAGGAGGAAGAGTTAGTGCAGTCAAGGCTGATTTGGGTAAAATCGTCTTGACTAATCCTGTGTGCACAGAAGTAGGAGAAAAGATTGCACTTAGCCGAAGAGTTGAGAAACACTGGCGGTAAGTTTATT a score=13964 s mm7.chrY_random 492252 608 + 30114534 AAGTAAAACT-GTTGTA--AAGTGATTATGTGATAATGCTGATGAAATGGATTTAAA-TACATGATTTCCTTCTATTTTAATTTTGCAGTTTAATTGGTTGGGGCCAGATAAGAAGAGGCGTGACTATCAAGCCAACAATAGATGATGAATG-------AGATGATACATTTGGATGAAACCAGGAATTTTTTCATAACAGTCTTAGAG-ATATTTTCAAATCTAAAAAGTAGGACATCTAAAGAAGGAAATAAATTTCACAGCTTATTATTATATTAGTAAAAATTGCCAGGTTATTTTCATTTTCAGTAGAAAAAAATTGA-------------------TGTCTGTAAAAAAAAATGACA--AACTTCTTGATACATTTAATCTGCAATTCAACAAATAGTATT---------------------------ATTGTTGTAG-CTTGATAGTTA----------ACAACTG----TTGCTGT-------GCACCACTGAACTTACAGTAAAGAAAGTTT---TTCTTAT------------------------------GTTTGAAGGATTGTTACTCTAATAAAAACTTG----------AAGGCTGGATTCAATTTTGCCTCATATTTTACAGTGCTTT--------AAACTT--AACACAAATTAATTGGTTCAAAATTGTATTTTTGAGCATT-GAGCTCATTTACATGGAAAATGTCTCTGTAATTTTTCCTCCTCT s bosTau2.chrX 10886725 720 - 48857030 AAGTAAAACTAGTTGTGTCATGTGATTATGTGCTAATGATAATGAAGCTGATATAAAATTCATGATTTCTTT-TATTTTCATTTTGCAGTTTAATTGGTTGGGGTCAAATAAGAAGAGGAGTGACAATCAAGCCGACAGTAGATGATGACTGAAGAATTAAATAACAGATCTGAATGAAGTTGGAA--TTTCTCTTAACAATCTAGGGGTATATTTTCA-----GAACAGTAGT-----------GGGAAAATAATTTCACAGCTCATTACC---TTAGTAGTAGCTGTAAGATTATTCTCATTTTTTGGTGATGAAAATTTAACCTCTAGTACTGAAATAGAGCCTACAATAAATATAGAAATTAGCATCATGTTGGATTGAATCTACATTTTACCAGAAATTAATCATTCCCAAATAATGTCTAATTTATACATCAGTGCAGATTTGAAAGGAAACTGTTTGCTACAACCAGACTTTGCTGTAGTAGACATACCACTGAATCTGTTTGAAATAAAGTCTTTGTTCTTATTTTTCATGATTCATCTTTGAGTAGCTCCAGGTTTGAAGGATTGTTGTAGCAGTAAAAACGTGCAAATTCTCAAAGACCAACTTCCCTTT--CCCCATATTTTATGTTGCTTTATTTTTTAAAATTTTGAGTGAAAGTAGATTCAAATAAAATTATCCTTTCAGGCATGAGGACTTGTTTCCATGGACATGGCCTTTCTCTCCTTTCCCTGTCT a score=4701 s mm7.chrY_random 520828 316 + 30114534 GCCAACCTCAGCAATCCTGTTGGAGCCAGGGAATTTGTGTGCACACAACCAGTTGAAGAAAGTGAGTCTAGTAGTTTCTTGCATGCAGTTAGCATAACCATGCTCTGCCTGTCCAATCAACTCTATTATACTGGAATCTGACTCTTTGTATACTGCAGAAAAGGAGTGTGGAATAGCACAGGGATCACCATACCCCTGCCCATGCAACACCCCATAACCTATGACCATACATTCCAACCATGCTGAGCTGATAGTCCTTCGTGACAATATCATTCTGGAAGTATGGGTTTTCACTAAAGAAAAACATTATCCTGCA s bosTau2.chr12 24053395 235 + 48608624 GCTGACCTCAACAATCCGGTTAAACCTTGGGCAGTTGTGTTCAAACATCCAGTTGAGGAAATTAAGGCTGGTGTTGTCCTGGCTATAGCTGGGACCTCC--------CCTGTTC----------ATAATCCCAGAACC-------------ACTGGGCTAGAGTCAAGTGAGAC-------------------------------------------------ACCATACA-TCCAATGATGCTAAGGTGATACTCCTTAACAATCACTTCCTTCCAGAAGTAGGAGTTGGTCTAAAAGAAAAACATCAACTTGCA a score=3653 s mm7.chrY_random 521291 99 + 30114534 CTGCCCAGACACAATTCCAACTCACCTCAAGCTCAACATGTAGTTCAGTAAGTCTTCATCTTGGTTGCTGATGATGGACGACATCTGTGGATGGAACAT s bosTau2.chr12 24053637 98 + 48608624 CTGCGCTGGCCCAGTTCCTGCAC-CTCCAAATTGATCATGTAGTTAAGGATGTCTTTATCTCAGTCACTGATCATGGCTAACATATGCGGGTGGTTCAT a score=4223 s mm7.chrY_random 522365 152 + 30114534 CCAGAAGCCTGGGATGCCCTGGATTATGGTCTTTCTGCACTTAAAGTGAGATTTGCGCATTTTGGCCACCTTTGC-TTTAATCCAGGCAAAAGCTCCACTACAGCGGCCGTTCACAAAGCTGAGCTCCTGTTGAAGAAGTTCCAGCTTCTCCA s bosTau2.chr12 24053751 152 + 48608624 CCAAAAGTCAGGGATGCCATGGATGATGGTCCTTCTATGATCCAAGTGAG-TTTTCCCTCTCTGACAGATCTTGCGTTTGAGCCGTGTGTAGGTCCCACTAACTCGGGCAATGACAGTGCCCAGCTCTAACTTCAGGGCTTCCAGTGCCTCCA a score=11019 s mm7.chrY_random 538053 709 + 30114534 cttgctactgtacatactcctacagcatgtttatggcagtagggtatattagaatggttacatttgccAGT---GGCACAAAAAGGAATAGTCATTGCTTATTCCTCCCTGGTAGCCAAATTATTAGGTAAAGGGAGAAAAGG----------------GGTAAAGAG-----AGATATGGTTACTCCTTATACTGCAGACCAACATAACATTTTCTTA-----TGAATCTGAGCAATGGCAGATTGCACAATTAGGATATACAGGGACCTATTCT------------TATCACTTGCCTAATCACCCCTTATTATATTTCATTATAGGACATCAAGTCATCTTTCCTCTCAGAACTAAGTCAACTCCCTTGCCTTTCCCAAGCAGCACTGGTGTTTACTGAAGGCTCAGCTTCAGGGCAGGCTGCTTTGATGGCAACAAAGAATC----------TTTCCCAACCCTAGAAACTTATGCTGAGCAAGTGCAATTAATAGCAATAATCATTGCCTTTAAAATACTTATAAACAAGTCCATTAACTTATATACAGACTCTCAGTATATTGTCAGATTATTTCCTTATATTGAGGCAGCTCCACTGCCATCTAGCCACTCCACAATCTTAGCTCTACTTTCAAAACTACAGGTGTTAACTCAATCTAGAGAGTGTCCTTTTTTTGTAGGTCATGTTCGAGTTTATACAATGCTTCCTGGTCCTATTCATGAGTGTAACTG--TTGGTTGATTCTCTGACAAAGG s bosTau2.scaffold14712 4026 736 + 9028 CTAGCTACTCCAACAGCACCTACGAGAGTTTTATGGCAAAACGGCCTCCTAGAATGGGTCCATCTCCCCGCCCAGGCTAAAAAAGTAGTGGCC---TCTTATCCAGGACTGATAGCTACATTGATATTGAAAGGGAGAAAACGTAGCATTGAATTGTTTGGTAAAGAACCAGCAGAAATTGTAATTCTATATAATAAAGAACAACTTGATGCTCTTCTAATGTTTGA---TGAGGATTGGCAGATTGC------------TATAGGAAATTATTTTGGCCAAGTTCTGCATCATTTACCTTCACATGTTTTGCTAAATTTTATGTCTAAACACCCAGTTATTTTCCCTGTTAGGTGTAAATACTCTCCC----ATCTCAGATGCTCAAATGGTATTTACTGACGGGTCTGCT-AATGGCAGA--GCTTCTATAGTTACAAAAGATCAGCGTAAAGTTTTACATACGCAGGAGACTTCGGCCCAGAGAGCTGAACTCACAGCTGTTATAGAGGCCTTTGTTATGTTTGCAGAGGAGGAATTTAACCTTTATTCTGATTCTCAGTATGTGGTCAGGCTGTTTCCACACATTGAGACTGCGATCCTGCCTGAGAATAAAACTGCAATATTTCACTTGTTAACTAAACTGCAGCAGCAAATTTGGAGACGAAGCCGAGCATATTTTATTGGTCACATTCGGGCTCATTCTGGATTGCCTGGACCTTTAAGTGCCT-TAAATGACCTGGCAGATTCACTAACTAAGG a score=3834 s mm7.chrY_random 538776 130 + 30114534 ATGGAAGCAGTAGAGAGGATAGTTCTTAGCTCTGAAGCAAAAGATATTGTTTTAAAACAACTGGCCTTTGAGAGTGCTGCACCTACTTTTCTATCTCTTCTAAAGTCAATTAAAAAAATCTGGAAATGTA s bosTau2.scaffold1342 14302 129 + 254761 ATGGAGGGAGTTCACAGAGTAATTTCTAGTAATGAGGCAGCTAATATATTGGTAAAACAACTGGCATTTGAAAATGCTAATTCTACCTGCCAGGCCATCCT-ACGTCCTATAAAAAAATCTGGGGAAATA a score=3391 s mm7.chrY_random 539154 248 + 30114534 TGACATAGTTGTCTGAAAGACTACCACTGGCATAAGGAATGTCAAACTAACTTTCATAAAAATGGTACTGCTTTATCTGGTGCTACTATAATCCTTAATAATACAGAAATTTTATCAAACCAGGGAAACTGT-GAGGGACCTACCTCTGGTCCCTCAAACAATAGAGGTAATTCAACAGCCTCAGGTGACCAAGCCATT-----TATCAAAGAAAGACTCTCC--AACAGCTGCAGGTAGCACAGGACTGTACCTC s bosTau2.scaffold1342 14729 221 + 254761 TGCCCTTGTTGTCAGAAGGGATATCACTGGGCAAAGGACTGCAGATCAAAGTTCCATAAAAACAGAACC----------TTGCTAGT----TCCTGACCAGC---------------AGTCAGGAAACCGGTAGAGGGGCCAGCCTCAGGCCCCGACAACGACTGGGGCAA--CAACA-CTACACCCATTCAAACCCTTCGTCCCATCACAGA---GCTCATCAGAGCAACCCCAGGCAGCGCAGGACTAGACCTC a score=1726 s mm7.chrY_random 540217 146 + 30114534 TCTATTGGACACATTCAAGTTCATTCTATGCTTCCTGGTCCTATAAGTGGAGGTAATCATTAATTTCTTAACAAAAGCTTGTTGCTggggctggagagatggctcagtggttaagggcactg-----attgcttttccagaggtcctgagt s bosTau2.scaffold14712 5933 117 + 9028 TTTATTGGTCACATTCGGGCTCATTCTGGATTGCCTGGACCTTTAA---------------AGTGCCTTAA---------------ATGACCTGGCAGAT---TCACTAACTAAGGTCACAGTGGCTTCTGCTTTTGAAGAAG-CCCGAGC a score=3469 s mm7.chrY_random 540492 463 + 30114534 TGCTTGTTGCTTTTCTTAAGAAGGTAACTTAGCATGATCTTAACATTACAAATCACCATTGAGCTCAGAGAAACTGGTCCTGCATTCCTGCAGAGCTGTCAGTTAAGCT-TGAGAATTAACCCCTGA-----TGAGCCTTGTGATTTAAAACAGACAAATGTTACATATGTCCTGTCTTTTGGAAAGTTAGCGTTTACTCCTGTAGGTATGTACACTTAATTCTCATTGCTATTTATGTCTTTTCCTAACTTGGGAAAACTTTTACTGTATCAAAGATATGATACAGTATTTGTTTCATTAGTTTATAATA----------CCAAGGGCTTAAAAATCAGACAATGCCTTTGCCTAAACTTAAAAAGCCCTGAAAAATTGGTGTTTGACTGACTCTTAGTTTC------------TCACTGACATCACCTTTAATTCACAGGGGGTATTATACTATTGTACAGTGAGCTCATCAGACATCTAAATTACAAA s bosTau2.scaffold14712 6128 404 + 9028 TGTTCGTTCCTGTTCT----------------CATTGTCCCACTACTATAAAT-----------------------------------------------AGTTTGCCTATGGGAGTTAACCCTCGCGGTCTTAAACCTAATGCACTCTGGCAGATGGATGTAACTCACATCTCTTCATTTGCAAAATTGTCTTTTGTTCATGTAACAGTAGACACCT-TTTCTCA-TGTTATTGTTGCAACTGCTCGCACAGGGGAAGCAGTT--------AAAGACGTAATACAACATCTCTTT-ACTTGTTTTTCATATATGGGTCTGCCAAAAGCCTTGAAAACTGATAATGCTCCTGCTTACACATCTAAGTCTTTTCAGGAATTTTGTCTAA---------AGTTTCAAATTAAACATAATACAGGCATCCCTTATAATCCACAAGGA----CAAGCCATTGTGGAAAGAGCACATCAAACGCTAAAAACCCAAA a score=5432 s mm7.chrY_random 541782 339 + 30114534 TTACCTTAGACATTACAACTTTAATTTCTATCTTGGGGTCAGTTGCAGCTTCTGCTGCCTCTCTAGTCCAACAGGTACATACTGCTAATCATGTTTATTCCTTGACAAAAAATATTTCTTTAGCACTGTTTATTCAGGATAGAATTGATAGAGGTTTGACAGATAGAAAATGGTTGTCATCCT-------------TTACATA--GGAACTCAGGTTCATAATTTAAAAACCCATTTAACTATCTCATGTCATGCCAATTTTAAATGGATTTGTATCACCTCTCTGCCCAACTATGGGTCAGAAATGTTCTGGGAACAGATACAAGCACATCTACATGGTGTGTGGAACAATTC s bosTau2.scaffold14712 8306 349 + 9028 TTATCTTGGGAATAGCAGCTTTGATAAGTGCAATTACTTCTGTTACTGTGGCAGCAATATCATTGACTCAACAAGTACATACTGCTCAATATGTTGATTCTATGTCCAAAAATGTTTCTTTAGCATTGGCAACACAGGAAGCTATAGACAGGAAATT-----AGAAATGAGGGTAGATGCCCTAGAGGAAGCAGTAATACATATTGGGACTGAATTGCAGGCTTTAAAGGTGAAAATGGCATTGTCCTGTCATGCTGACTACCGGTGGATATGTGTAACACCCCTGAAAGTAAATGAGACAGATTTTGAATGGGAAAAGATTAAAAACCATATTTCAGGTATTTGGAACAGCTC a score=12280 s mm7.chrY_random 627699 502 + 30114534 TACTATGCAAAG---AGAC-CTCAGTTAAATGTATGTCAGTGACTCCAAA-ACAGCTTTTCTTCTCTACCTTTCTTTATATGGCACAGAACGAC---CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATTGACAATTCCCACGGTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAGTGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172711 539 - 45915461 TATTTTGCCAAGTTCAGACATTCAGCTAAAAGGGCAGAAGAAACTCCAATTGCATTCTTTGTTGACTAGGTTGTTTTGTA--GCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38820 s mm7.chrY_random 631094 1288 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTATGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCCTCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGTAGAATTTCTCATTGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACGGCATCTATGGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCAACTTGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACAAAAATTTGAGAGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGGTGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCTAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGACAATCCTTCCGTGTTCTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAATGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGT---TTTTTTTTTCCTGTGTTAGCTATATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTATTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGAAGAATAAGGAAATGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTACAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTGGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------AGATTT------------CTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGA-GGCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10767 s mm7.chrY_random 637991 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=6374 s mm7.chrY_random 649905 341 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTACTAAGatatatatatcttatatatatatatattatatatatatataatatatatatatatatatatatatTATCACAAAGCTCTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATGTATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130465 304 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT----------------TATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAA-------------------------------CCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9387 s mm7.chrY_random 650600 314 + 30114534 ACTGAATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGTAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGACTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAAATTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14456 s mm7.chrY_random 654997 376 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGCGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGACACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=12280 s mm7.chrY_random 664602 502 + 30114534 TACTATGCAAAG---AGAC-CTCAGTTAAATGTATGTCAGTGACTCCAAA-ACAGCTTTTCTTCTCTACCTTTCTTTATATGGCACAGAACGAC---CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATTGACAATTCCCACGGTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAGTGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172711 539 - 45915461 TATTTTGCCAAGTTCAGACATTCAGCTAAAAGGGCAGAAGAAACTCCAATTGCATTCTTTGTTGACTAGGTTGTTTTGTA--GCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=27119 s mm7.chrY_random 668024 731 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAAGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCACCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGAGGGTTGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACAGTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=8920 s mm7.chrY_random 695337 494 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAACTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTACTTATAATCAGAAGTGCTGGTAA-ATTTTAAAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTTTTTTTTAATTTTATCACAACGTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATACATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAATCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAA--TTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGCC-------AGCCAACATTCTATATG------GGCAACACTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=36936 s mm7.chrY_random 697696 1135 + 30114534 ATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCAGGCACACTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGATTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTTGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATACGATTGAAAAAAA--------ATGTTTGTTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTAGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAAATGGATTTTTAGGAAGAAGCAGAGAAAGACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529137 1181 + 48857030 ATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAA--TATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=8545 s mm7.chrY_random 704253 478 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAAGATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATA----------TTTTACTAAATCGATGGAAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATATTGTTGACTTCTGTATTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAAGGATATGTTTCCATAAAAATAAGTAATGCCAAT---ATCGTTAATCAAGTAGAAAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATTGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGAGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGTTGATAT-------CATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCgtttgaataattgtgt s bosTau2.chr17 20172806 480 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATT-AGCAGAAA----------------------------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACTTTAT a score=3870 s mm7.chrY_random 737863 73 + 30114534 GATTATGTGCATAAGCTTATGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACTTGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=20984 s mm7.chrY_random 754471 667 + 30114534 ACTTCTATCTGACACCTTGGATAGAATTCAAGTCTGGTCTTATTTCAATGATGTAGATCTTGGGTGTAAAGATGCATCCAAGCATCACTGTACTGGATGCCAAGATTGAGAAGACCTCTACAGCAGCCATGACCATGCCCTTAGTCCTATGTGAGTCATGGAGGAAGGTGACATAAACACTGCAGAATCCTAGCACGACAAAGGTCAGGAACTTGGCTTCATTAAATGTTTCAGGAAAATTCTTTGCCACGAAATCCACAGTGAAGCTTCCAAGGGCAAGGCAGGTCAAGTATCCCAAAATTCAGTAGAATGCAGTAACTGAACCCTTGTTGCACAAAATGATTA--TCATTATCATCAATATCAACAAATATCAATATCAACAAAATGAGGAGAAACTGAGAGCCAGATTACCCACA-GAATACATTGAT-ATGGAACATATCAGAAGGATGTATTTCATTGAACATGATAAAAGGAGGTTCCTTAAACCTCTTCCAGGTTCTGTGATTATGAAAGCCAA-ACTACAATGATTGTTTTGGCAAGCAATGTGGAAACAGACACCATGAATACAATTCCAAAAGTGATTTGTTGTAAGGCTACATTTTTTTCTGTTAGGAAGACCAATGAAGAAAAAGGAGCATGAGAAAATGGAACATGAGTGACATGAGTA s bosTau2.chr7 54723649 662 - 69141744 ACTTATTCTTTAAACTTTTCAAAGAGTTTTTATCAGTTCTTATAAGAACAATGTAGTACTTTGGGGCAAAGATGCAGCCTAGGAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGATGATCTCCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGCAGATAGGGAGGAAGGTGACCCAGACACTGAGGAGCACCAGCCTGCTGAAGGTCAGGAACTTGGCTTCACTGAAGGTGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGAAAGCCAAGGAGAAGGTCCCCAGGGCTAAGGAGCCCAGGTAGCCCAGGACACAGTAGAAGGCAGTGACCGAGCCCTTGTTGCACACGATGAGGAGCTCCTTGGGCTCAG----AATGAGTGTCCATCTCAAGGAAAGGGGGAGAGGCTCCCAGCCAGACTCCACAGATGATCACCTGGATCATGGAGTACATGGGAAAGACATA----GCAGGTCCTGTTAAGAGCAATCGCCTCATGGTTCTTCCTGGTTTCCTGGCCTTGAATGCCAAGATCACAGGGACGATTTTGGCCAAAACAGTGACCACAGCCACAGTGAACACAGCTCCAAATGTGGTCTGTTG-GAGGATGGAGGTGGCTGTGTGGGGACGACTGATAAAGAGTAAGGAGCA-GAGGAAGCACGGGAGGAGGGAGATGAACA a score=9862 s mm7.chrY_random 770011 492 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAACTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTCTGAAATTCCTTGTAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTTTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGGCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=36133 s mm7.chrY_random 772327 1237 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCACCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAAAGTAAACTTAT-------AGGATTGAAAAAAATGTTTATTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATTACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAA--GAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGGG-----AAAGAGTGATAGATAAAAGGAATGTGGCCTTGTTACACAAAGTGCAACCCAGAAAACTGATCCAAAGAGATTCATAAAT s bosTau2.chrX 28529095 1282 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA------GAGTGAAATCTTGGGGTTGAGAG-GAAACCAGGATAAATTGAGTAAAGAGGGACACAAAT a score=9692 s mm7.chrY_random 778912 456 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCTGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAGGATTAAGGGATATGTTTCCATGAAAATAAGTAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGGAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC---TACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-------TCCTTTATTCTtttgaataaatg s bosTau2.chr17 20172806 473 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATG a score=11453 s mm7.chrY_random 823723 277 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAAAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4837 s mm7.chrY_random 826514 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=13918 s mm7.chrY_random 830775 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTATTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGTTGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13197 s mm7.chrY_random 836124 556 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGCGTGCATAAGTAGAT-ACTCCACTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACTTTTTTGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA--------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=11443 s mm7.chrY_random 916075 422 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGAAGAAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAAAGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTAT----TACTTG----------ATTACAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38765 s mm7.chrY_random 919627 1288 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTATGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCCTCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCATTGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAATAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACGGCATCTATGGACAGGAGCTCTGCAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTTGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACAAAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGATTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGGTGACAGTGATGTGTTTATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCTAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGACAATCCTTCCGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAGAGTACAGAAATGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAA----GTTTTTTTTTCCTGTGTTAGCTATATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTATTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACGTCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGTCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGAAGAATAAGGAAATGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTTGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------AGATTT------------CTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGA-TGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=3962 s mm7.chrY_random 977382 73 + 30114534 TGCACACGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCAGACACACACACACAA----ATACACACAAGCTTATACACATAATC s bosTau2.chr14 47301233 77 + 50711261 TGCACATGTGTGTACATGTGCATGCCTGCATGCACACACACACACAAATTTATATACAAAAGCATACAAACATTATC a score=12949 s mm7.chrY_random 993021 1302 + 30114534 GTTCAGAT-TTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAGAAATGTCACGTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC----AGA---------------CAGAATTGTCAATCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGTACAGAATGTAA--AGAATATTTAAAGTCTAGAAAA--------------TTTGGCAGAGTT-------ATGTTTCATATCATAAAAAAATACAA-----------TACAATAATAAGTT---GCTTCCCACTGTCTTTCATTATCTGTGTTATCCACACAATTTTTTGTGTATTAGGAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTTGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATT----AGGGCCCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAATGGCTATAATGTTGACTGCCATACAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACACGATGATAAGACTC--TGTCTTCCTT-----CAGTGTTACCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCACGGAAGTTTGGGAAACACAAGAAGACCTGAAAGCCAACACAAACCTAAGAAACTTGTAAGCATTTGAAGTC----------------------CACTTAAAGATCTC-ACTG--------------------------TCCATAAAAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGGAA---TTTTTAAATGATTGCATACCACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAATTTGTG-----ATTT---CATAATTTTAAATGAGTATAGCAGTTTTCTCTATAGAAAAGTTTGAGCATT--------TAATTTAT------TGATAAGGTCAGTGCATGAGAGCTTATGTACCCTCTCCAACATGGTATGCATCTGATACTCGAAGGTCTCATCCACTAGTAGTCTG-GCAGAGAAACACATGTGACTTATACTTTTGGTCCCAATTAGAAGCAGGGTAGATTGAATCC--TAGGTTTATGTTGAAATAATAACTGCTTGGCCAGG s bosTau2.scaffold5600 1080 1466 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCA---CAAAAAGGAATCTAAACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTAT-------AAATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCTATCTA-CATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAG------CATTAAG-------------CAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACTTAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCATCTGAG-TACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGTATGGCTGTTCAGGCATTGCTTCATATGTATGGA------TGCTTTGCAGGAAGATCTGGAGATTTTGCAAACTGATTTATTCAGAATGGTAAGGAGAGC-CCTGTGGCCTCATGG--TCTTGTAGACTCAGTGAACATTGGATGCTAGGAGGGAATGT------GCAGTCAGAGCAGGGTAAGGCCTGTGACTTAAA-----------AGTGAAAGCCAGGTCAGACAGAAACTGGTTTGTTcatgttgggattttagttcccggaccagg a score=4837 s mm7.chrY_random 995692 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=4933 s mm7.chrY_random 996015 608 + 30114534 taataataCAGTGAGACTGATGAGCCTGCA---GTGACAGGACTTTAGCGTCTATGATAGAATTTGAGTCAGGCATTGTGTACTCACACATTAACTATGAGGATCTTGCTTAATTTTGTGTTCATAGAACTGGAATATCTCATGGATCTTTTCCCCC--TCTTAAATTCTGAGC--ATGTGAAGAAAAGTGATGTTTCTCTTTCTTATAAAATTAAGCAG---ATTCCATAAA-----------ATCTTATCTTCTCCCACTTCTAAATAAGCATTTT--------------------------------------------------------------------CGTTTAAT-------------------TTATTGCCATG---------------TTGTATGCTTTAACTGTTTGGTAGTTGTCTGTTAATTTTTGGTTGATCTT------------ACATATAAAGCAAGTTTGATAAAAATTTGGTATGGAATTTTATGCATTTTATAATTGTAAAAATATTATGTCCACTCACCTCAAAGTGCTCTGTGGTTATAAATTGG--------------CCTCTCAGTTAGTAA-TACACAACACAAATTCAATTCCACTTAACCCTTCTGAAAATTACCTTGCATGGTATTGTCTGATTTGA--------AGCTAATAAATCTATTTAACTAAACCAGAGACATTTGTGTTAGGAAGGAAACTACTACTGTCTGTTTTTTAGAAAATGAA---AAAGATACTTCT s bosTau2.chr3 39007038 713 + 85360813 TAATAGCCGAGTGAGAATAATGAACTAGCAACAGAGACTGGACTTTACCTTTTATGACAGAAATTGGGTCATACAT-------TCAC-------------------TGTTCATCTGTATGTTTTTA--------------TATGTAGCTTTCCCCCCCTCCTTGAATTTTAAACATATATGAGGAAAAGTGATATCTATACTCCTAGTTTTGGTAAACATTTCATCACATAGAAGGAAATATTTATCTTTTTCTCTCACCTTTCTAAATGAGGGTCTTAAATATTTCAATTTGGAAGGTGAAATCTACACAGCAGATTAAGTGCTAACCTCTAAATTATAACACTCAGTTTAATCTTTCTGTTGGGCAAAATGTTACTGGTGTGACATAGTATAATGCCTTATACATATTATCTGCTTAGTGATAATTTTTT--TACTTGATTGATTTTTATCCAACTTAAGCATGAAAAGCAAGTCTGTCA---------TGCAGAATTTCCTGTAAAATATGAATTCACAAAT-TTTTGT-CATTTAACTCAAAATGATAAATGGACATGGAATGAAACTAAAGAGATATTTTTAAAGTAAACAATTATATAATGTAACATCTGTTGTAATCACCTTTGTAGGGAATTGATTTTGAATTTATTCTCTGACTTGAAAATGCATAGTAGGTACATTTCTTTAACTGAACCTACTTAACATTTTTCAGAAAAGAAGCTACTCC---CTGTAGTTTAAAAGATAAAGttaaaaaaattttt a score=13526 s mm7.chrY_random 1002220 556 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGTT-----TGTAAATAAAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCTTCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTAATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTCTTTG-AAGCACACTTTCAGTGTTCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTGTGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAATGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTGTTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCCGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTT--------------AAAATTTCCAGTGTATCCTTATAAGACTAATACA----TGG--TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA-------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=18575 s mm7.chrY_random 1071094 962 + 30114534 GCACTTGTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTAGTGAGTTGGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATTCACTTTCAGTCCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTT-TTTAAACTGATTCTTTGAGAGGTCATGTTT-TGTAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAACTGAGGCTATAAATGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTCGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCGAAGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGGAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGAAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGGCTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGGGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTAGCACCCCCTTTCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCTATTTACTGTCAGAATATCCACTCTTTTCCTACAA------TAGGGGGTA----------------------ACTTGTATTCTGGC--------TAATTCTGTATTCACT------GTGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACTTCTTTGA------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGTGTAGGAAATTATAAGTATCGATTCAGAT-AATATATAACTTTTGAGAATTAGCTTCACATTTCTA--ATGTCCACACAAAATAGCTTT--CTTGATTTAAGTTACTGTTGCTATGTTTCACTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTC--AGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagctccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=2847 s mm7.chrY_random 1072080 224 + 30114534 TAATATTGAAAAGAAATTACAATT--TTTCACTTTGAAATTAAATCTCTGAAGATGATAACTTAACTTGTGTTTGGAAAAGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA-------------TCATTATTAATA------------TCAGCAGTATAAGGTTGTTCAAACAAAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAACGAAAATAAATGAATAGTA-GGTTTGT-AGCATTTGGCACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 19916 255 - 102126 TAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATACCTGGAGATCCTCCCATTTTAAATGAGAAGACCTAATCCAGAAAT-----TTTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=3854 s mm7.chrY_random 1100786 107 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCCATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGCTTTTAA s bosTau2.chr5 36527708 112 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGTTTGGTTTTTTAAA a score=3335 s mm7.chrY_random 1101222 70 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAGAAA---TA---TACTTTCAATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=7417 s mm7.chrY_random 1102714 438 + 30114534 AGTTTTCCTTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTACACTTAAACAAGAAAATGATTAAAGATATTTAAAAAT---AAAGAAGTTCTATTTTGACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---ATAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAGCTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGatttttttatttgttttatatatataaatataa---CCAGCAAGTGAAATTTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTTAAACATAGACATTTTTTTTTCTCAGTTCACCACCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528206 455 - 76426644 AGTTCATATTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGA---AGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTT-TAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=5893 s mm7.chrY_random 1103447 418 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCA--TCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCCTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACTAAATATATGTATATTTTTA-CAATAACATGAAATAAAATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA---ATGTGTTCACCACTTACATACAAT--AATAATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=20880 s mm7.chrY_random 1105443 1300 + 30114534 aaatgcctagtcgttttcattgatagagtatgca---atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagataatggaacttaatttagtttcatatgctgaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtttt--------ttatggtaccaaccactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAAAGAACACTCAAAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCCCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCA---------TTTACGTTTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacctaacacacacacacacacacacacacacatacacacacacatatatatacaTGTAC----AAAATTTAATTATATTTCAATGTGTTTT-TTTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAACTAAAATATACAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCAAACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATATAATTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGGTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGGGTCAT----TTTGAAGAAAAAATAGATGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530122 1369 - 76426644 AAATACC-AACAGCTTTTATATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAACA--ACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTTTATTA--------------------------------------------------------TATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATAA---TTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGGAT---TTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=2977 s mm7.chrY_random 1113743 94 + 30114534 ATATTTTTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=12871 s mm7.chrY_random 1135484 1058 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTAAATCACTAAGAAATAAAACTACATCTGTGTTCCTGGTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGATGATCAAGTCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC----AGA---------------CAGAATTGCCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGTTTCCCACTGTCTTT--------CATTATCTGTGTTATCCACACAT---------TTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTAACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTAGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATT----AGGGCCCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGACTATAATGTTGACTGTCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGACT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACATGAAGACCTGAAAGCCAGCACAAACCTAAGAAACTTGTAAGCATTTGAAGTC----------------------CACTTACAGATCTC-ACTG-------------------------TCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGTAA---TTTTTAAATGATTGCATACTACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAACTTGT s bosTau2.scaffold5600 1080 1221 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-----AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCTATCTA-CATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAG------CATTA-------------AGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACTTAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCATCTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=4513 s mm7.chrY_random 1138165 84 + 30114534 CTATGCAGATTCTTTGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACCGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006495 84 + 85360813 CTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=5581 s mm7.chrY_random 1138486 597 + 30114534 AGTGAAACTGATGAGCCTGCA---GTGACAGGACTTTAGCGTCTATGATAGAATTTGAGTCAGGCATTGTGTACTAACACATTAATTATGAGGATCTTGCTTAATTTTGTGTACATAGAACTGGATTATCGCATGGATCATTTCCCCCTCTTAAATTCTGAGC--ATGTGAAGAAAAGTGATGTTTCTCTTTCTTATACAATTAAGCAG---ATTCCATAAAAG------CTTATCTTTTCC-----CACTTCTAAATAAGCATTT----TCTTTTAAT-----------------------------------------------------------------------------------TTATTGGCATG---------------TTGTATGCTTTAACTGTTTGGTAGTTGTCTGTTAATTTTTGGTTGATCTT------------ACATATAAAGCAAGTTTGATAAAAATTTGGTAAGGAATTTTATGCATTTTATAATTGTAAAAATTTTTTCCACTCACCTCAAAGTGCTCTGTGGTTATAAATTGG--------------TCTCTCAGTTAGTAA-TACACAACACAAATTCAATTCCACTTAAACCTTCTGAAAATGAACTTTCATTGTATTGTCTGATTTGA--------AGCTAATAAATCTATTTAACTAAACCAGAGACATTTGTATTAGGAAGGAAACTACTACTGTCTGTTGTTTAGAAAATGGA---AAAGATACTTCT s bosTau2.chr3 39007047 704 + 85360813 AGTGAGAATAATGAACTAGCAACAGAGACTGGACTTTACCTTTTATGACAGAAATTGGGTCATACATT-----------CACTGTTCAT-------CTGTATGTTTTTATAT--------------------GTAGCTTTCCCCCCCTCCTTGAATTTTAAACATATATGAGGAAAAGTGATATCTATACTCCTAGTTTTGGTAAACATTTCATCACATAGAAGGAAATATTTATCTTTTTCTCTCACCTTTCTAAATGAGGGTCTTAAATATTTCAATTTGGAAGGTGAAATCTACACAGCAGATTAAGTGCTAACCTCTAAATTATAACACTCAGTTTAATCTTTCTGTTGGGCAAAATGTTACTGGTGTGACATAGTATAATGCCTTATACATATTATCTGCTTAGTGATAATTTTTT--TACTTGATTGATTTTTATCCAACTTAAGCATGAAAAGCAAGTCTGTCA---------TGCAGAATTTCCTGTAAAATATGAATTCACAAATTTTTGTCATTTAACTCAAAATGATAAATGGACATGGAATGAAACTAAAGAGATATTTTTAAAGTAAACAATTATATAATGTAACATCTGTTGTAATCACCTTTGTAGGGAATTGATTTTGAATTTATTCTCTGACTTGAAAATGCATAGTAGGTACATTTCTTTAACTGAACCTACTTAACATTTTTCAGAAAAGAAGCTACTCC---CTGTAGTTTAAAAGATAAAGttaaaaaaattttt a score=15258 s mm7.chrY_random 1142365 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGTTTATATCTCTGTATCCTCATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAGAGATGTCCAGATTCTGAGTATTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTCAAAAACGTTTCATCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTCCCAGCACAATCACTTCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATCTCCACATAGTTGATGCAGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGCCCAAGCCCTACACATTTGAGCTTAGGAGATT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=12876 s mm7.chrY_random 1147690 560 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTTAA-TGTA-TGTT--GTATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCCATGC------TTTGCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTACTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAGT--AGATACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGAAGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGG------CTTTGTGATTAAAAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTGTTGGCTGAGATTCTTCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGTCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA-------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=13992 s mm7.chrY_random 1313538 558 + 30114534 TACTGATAAGCCTGACTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAACGCTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTTAATCACAAAG------CACTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATATATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACGAAG--ATTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATCGAGCGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC-----TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14029 s mm7.chrY_random 1319033 369 + 30114534 AATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAGGGCTTGGGCATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCTGCATCAACTATGTGGAGATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGAAGTGATTGTGCTGGGAGCAGACTCCTCAATATTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGATGAAACGTTTTTGAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGA----GAATTGGATGGTACCCTGCAATGCTCAGAATCTGGACATCTCTTCCCTATAAGCTGCAGGATACCCATTATGGTGTTGAATGATGAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTGGGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCCA-TATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4313 s mm7.chrY_random 1322646 597 + 30114534 AGAAGTATCTTT---TCCATTTTGTAAACAACAGACAGTAGTAGTTTCCTTCCTAATACAAATGTCTCTGGTTTAGTTAAATAGATTTATTAGCT--------TCAAATCAGACAATACCATGAAAGTTCATTTTCAGGAGGGTTAAGTGGAATTGAATTTGTGTTGTGTA-TTACTAACTGAGAGG--------------CCAATTTATAACCACAGAGCACTTTGAGGTGAGTGGGAAAAAAATTTACAATTATAAAATGCATAAAATTCCTTACCAAATTTTTATCAAACTTGCTTTATACGT------------AAGATCAACCAAAAATTAACAGACAACTACCAAACAGTTAAAGCATA-----------ACAATGCCA-------------------------------------------ATAAATTAAAAG-------------------------------------------------AAAATGCTTATTTAGAAGTG-----GGAAAAGATAAGC-TTTTATCGAATCTGCTTAATTGTATA--------AGAAAGAGAAACATCACTTTTCTTCACAT--GCTCAGAATTTAAGAGGGGGAAACGATTCCACGCGATAATCCAGTTCTATGTACACAAAATTAAGCAAGATCCTCATAATTAATGTGTGAGTACACAATGCCTGACTCAAATTCTATCAAAGACGCTAAAGTCCTGT---TAATGCAGGCTCATCAGTCTCACT s bosTau2.chr3 46353062 704 - 85360813 aaaaatttttttaaCTTTATCTTTTAAACTACAG---GGAGTAGCTTCTTTTCTGAAAAATGTTAAGTAGGTTCAGTTAAAGAAATGTACCTACTATGCATTTTCAAGTCAGAGAATAAATTCAAAATCAATTCCCTACAAAGGTGATTACAACAGATGTTACATTATATAATTGTTTACTTTAAAAATATCTCTTTAGTTTCATTCCATGTCCATTTATCATTTTGAGTTAAATGACAAAAATTTGTGAATTCATATTTTACAGGAAATTCTGCA---------TGACAGACTTGCTTTTCATGCTTAAGTTGGATAAAAATCAATCAAGTA--AAAAAATTATCACTAAGCAGATAATATGTATAAGGCATTATACTATGTCACACCAGTAACATTTTGCCCAACAGAAAGATTAAACTGAGTGTTATAATTTAGAGGTTAGCACTTAATCTGCTGTGTAGATTTCACCTTCCAAATTGAAATATTTAAGACCCTCATTTAGAAAGGTGAGAGAAAAAGATAAATATTTCCTTCTATGTGATGAAATGTTTACCAAAACTAGGAGTATAGATATCACTTTTCCTCATATATGTTTAAAATTCAAGGAGGGGG-------------GGAAAGCTACATATAAAAACATACAGATGAACA-------------------GTGA-------ATGTATGACCCAATTTCTGTCATAAAAGGTAAAGTCCAGTCTCTGTTGCTAGTTCATTATTCTCACT a score=4362 s mm7.chrY_random 1323501 84 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATATGTAAACCATTGCCAAGTTGAGAGGCTAAGAATCTGCATAG s bosTau2.chr3 46354234 84 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAG a score=12250 s mm7.chrY_random 1325208 1057 + 30114534 ACAAATTGTACAACCCTTTAGGCACAGGAGTAGTATTCAATCATTTAAAAAGTCC---AGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCAGAGAGATGGATAACTAGTATGGACAGTGAGA---------------TCTGTAAGTGGACTTCAAATGCTTACAAGTTTCTAAGGTTT--------------------GTGTT-----GGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGACAACTACCT----------TGCTTACACTGAAGGAAGACAC--AATCTTATCATGTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGGCGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCA-AGAGCCCTAATAGCATTTTA---CATCTCTTCTGAGATAAGTGAAGATTTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGTATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTGTGAACACAGATGTCAAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAAGAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAGTGTGTGGATAACACAGATAA------------------TGAAAGACAGTGGGAAGCAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGGCAATTCTG---------------TCT----GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCGTCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGAAATATTTGAAGGAATGGTCTCtcacattcaatacagttaaacaggattctctcctgtataaaatcattgatgTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCACCAGGGACACTGATGTAGTATTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAG--------ATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTA--AGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCTTAATGCTAGAA-TTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTT-CTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=2977 s mm7.chrY_random 1354139 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAATAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=20531 s mm7.chrY_random 1361403 1271 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAAAGAAATTTATCTATATCTATTTTACT-TGTAGACATGGAATCACCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACCCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGGAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAATGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATA-TATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGACTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCTTAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTCCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACACTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGAATATTTTAGGTGACATA-----TGTTTTGCAC----TGTCTTTACTAAGGCAATGCATGAAAAATAA-----------------------------------------------------ATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAA-AAAACACATTGAAATATAATTAAATTTT----GTACAtgtatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgcgttacttgtgtgttgtgtgtgtTTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAA--ACATAAA-------TGAAAACCTCTCTGATAATATGATAGGGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTTTGAGTGTTCTTTTTCATATTGGTATGAAATGTACCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTTATATGGATGTACagaaattcaatgaggaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaa-------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgggttgagcatatgaaactaaattaagttccactatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatat s bosTau2.chr5 39895153 1350 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTTGAATATGTGGGAATA-AATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTAACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAA---AATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA------------------------------------------------ATAAAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGT--TGTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT a score=5897 s mm7.chrY_random 1364244 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATTTTATTTCATGTTATTGTAAAAATATACACAT-ATTTAG--TCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTACCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGGTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGATTATT--ATTGTATGTAAGTG-----GTGAACACATTATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=2227 s mm7.chrY_random 1364740 106 + 30114534 ATGGCTTTGTAGGAATTATTAAAGTTATGAAATAATAAAATGGGAATTTGACCTCAGGTGTAC-----------------CTCATACATTAATAACACTATAATTAT-CCTGCTTTATTAAACA s bosTau2.scaffold10439 16855 123 - 23754 ATAGTATTGTGGGAGTCACTTAAAATGGGGAACTGCAAACTGGGAATTTAATCT-AGATGTATACACATGGTGAAGAAAACTGATACTTGATTAACCCTTTAATCCTAACTATTTTGTTCAGCA a score=6540 s mm7.chrY_random 1364958 335 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAATGTCTATGTTTAAAAGAGCCAACATGGAGAATAATCTGAAGTACTCGTTTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTG-GttatatatatatatatataaaataaagaaaaaaatatCTACCTTTTTTTGTCTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTTTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCA s bosTau2.chr5 39897983 362 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA-AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAA-------GTTGTTATTCAGAACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT----TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATA a score=6162 s mm7.chrY_random 1374522 713 + 30114534 TATCTACTGTATTTGTCTGACTCAGTTGGGATAAGGATTTACTTGGACCCAGCTTCATTTGTCACATCCACTTTTC---------AAGTATAAAAA-----------AAAAAAATCACATACTCCATCTACCAACA----TGGGAGACATTATTTTTTGATATGCAGTTTTCCCCAACAGTG--GAATGACAAGAAGACCAGAGCCATCCCTTAGGACAGGGAC---AAATGATCCAAAAGTACTATTCTCTAACCTAGGACAACCAATGTCAATAATTTTATAT---------GTCTCTG-------CAAACCTAGATTATG-----------------GCTGATCAACTTCATTGAG-------------------TCATTGGC---AGCACTCAGAGTGG----------------------GCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTATCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCCTATAAACAAACTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTATATTTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTTATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAAACTGTTTTTGG s bosTau2.chr13 39957119 841 + 62721844 TATTTCATGCATTCGCATGACTAGATCAGGTCAGGGGGTCGCTTGGACCTTGCTTTAC----CATACTCACTTCTCTTGCCAAGGAGATGTCGAAACTTGTGTACTTAACAAAACAACCTATTCTATTTGTCAACACTAATGCCAGACATC-CGTTTTGACCC-CAGTTCCCCTCC-CAGTGAAGACTGGTTAGAGG------TTCACCACTTAGAAGGAGGGCTCTGGATGAACCAGA--CACAAATTACGAATTTAGAAAGCCCATGGTTAGAGGTTCGCCACTCAGACGGAGGCTCTGGGTCAGCCCGACATAGATTACGAATTTAGAAAGCCCAGTGATGGTGCACTTTGATGAGAGTGCTGCTCACAAAAACCCCAGTAACCCCAGTACTCTGAATGGTGGAGGCTTGTCATGGGAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGGGT-GATATG-----AAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAA--TGTCTTTAG a score=3805 s mm7.chrY_random 1376079 97 + 30114534 CCTGGTAGACACAAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTCTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGGCCTGGATAGATTaaaaaa s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=3741 s mm7.chrY_random 1376411 389 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAGTTGAACTAGTACTTAAG------TTT--TTGGGGAAAACTGACCTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAAACTTCT-GCTGGAAGCCCCACATGCCTGGGCCAATCATTCTTTAATGCAGTCACTTAGGAAATTCAA---------TGGTGTGGATTCCCAAAACACTTTGAACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCTCTGACAGGACCGAAAAAAATG------TCAATGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTATTGGGGACTAACTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATT----TGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataata-------ttataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTA----AAGACCTGATGGGATGACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4506 s mm7.chrY_random 1377048 201 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAAGAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAAATCCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAA-TCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=17903 s mm7.chrY_random 1387359 968 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAAAGAAACATAGGTACAGTAACTTAA----ATCCAGAAAGCTATTTTGTTCTGACATTAAGATTGCACAGCTAATTCTCAAAAGGTGTATATT-ATCTGAATCGATACATATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGCCTAGCAGGAT--TGTTCTG-TTACTT---------AAATTCAATGTTT-------------TCAGAGATGGCAAAAGACCAACTAGAAATTCAGATAAGCACA-----------------------------GTTAATACAGAATTAGCCAGGA----------ATACAAGTTACCCCAGA--TTGTAGGAGAAGAGTGGATATTCTGACAGCAAATAGCTTTTAAATATAAACTCCTGAGATAAGTTGGAGTTAAAAAAAAAAGAGAGGGGGTGGAAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCAAT-GAGGCAATGGCACAAGGAAATAACTGG-TTGATAGAAAGTGTCCCTG-AGTTTCTGAATGA-TGCAAGCCTTTATTGCTGCATAGCCAAAGGGAAACAGAAATCCTTCACAAAACTCAAAGAGAG----GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCATAGAAAA-CTGGCAAAGTGTACAAAACAGGCAAAACAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGTAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTCAGTGTACCAATTTCTATA-AAACATGATCTCTCAAATAATCAGCTTGACTAAGTGTTTAATAAATAATCCTGTGCAACTATATTCCAGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTATCC-TGTTGTG-CTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGACAATG-AATAAGAACCCAACTTGCTAACTGTGACAGACAAAACAATTCTTTAAGGCCACTAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaag---gaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCTGACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGT--TAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=18823 s mm7.chrY_random 1406213 957 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAGCATAGCAACTGTAACTTAAATCAAG--AAAGCTATTTTGTGCAGACAT--TAGAAATGTGAAGATAATTCTCAAAAGGTATATATC-ATCTGAATCGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTAGCCAGAATACAAGCTACCCCCTA--TTGTAGGAAAAGAGTGGATATTCTGACAGTAAATAGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGGAAGGGGGTGCTAAAACATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AAAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGCCTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTCCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACGAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTATACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGATTTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTGAAAGTGAATGGCCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGACATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGATCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCCAACTCACTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCAC s bosTau2.scaffold2750 82839 1044 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCC--CTGACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAAC a score=3285 s mm7.chrY_random 1492386 89 + 30114534 TTTCTAACCTAAAACATGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCGGACACATACACACAAATACACACAAGCTTATACACTT-----AATCCTGGAT s bosTau2.scaffold1279 929 84 + 261576 TTTCTAATT----AAATGTGTGTGCCTGCGCATATGAGTGTGCACATGTGCACACACATACACAC------ACACACTTCCAAGAAACCTAGAT a score=12850 s mm7.chrY_random 1508613 1302 + 30114534 GTTCAGAT-TTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATATATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC----AGA---------------CAGAATTGTCAATCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGTACAGAATGTAA--AGAATATTTAAAGTCTAGAAAA--------------TTTGGCAGAGTT-------ATGTTTCATATCATAAAAAAATACAA-----------TACAATAATAAGTT---GCTTCCCACTGTCTTTCATTATCTGTGTTATCCACACAATTTTTTGTGTATTAGGAATAAAAGAAATGAGTATTTCTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTTGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGAT-----ATAAAATGCTATTAGGGCCCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAATGGCTATAATGTTGACTGCCATACAATACC-AAAACAAAGATTGAGGTAAATTTAT----GAACACGATGATAAGACTC--TGTCTTCCTT-----CAGTGTTACCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCACGGAAGCTTGGGAAACACAAGAAGACCTGAAAGCCAACACAAACCTAAGAAACTTGTAAGCATTTGAAGTC----------------------CACTTACAGATCTC-ACTG--------------------------TCCATAAAAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGGAA---TTTTTAAATGATTGCATACCACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAATTTGTG-----ATTT---CATAATTTTAAATGAGTATAGCAGTTTTCTCTATAGAAAAGTTTGAGCATTTAATTTATTGATAAGATCAGTG----AATGAGAGCTTATGTACCCTC----TCC----AACATGGTATGCATCTGATACTCGAAGGTCTCATCCACTAGTAGTCTG-GCAGAGAAACACATGTGACTTATACTTTTGGTCCCAATTAGAAGCAGGGTAGATTGAATCC--TAGGTTTATGTTGAAATAATAATTGCTTGGCCAGG s bosTau2.scaffold5600 1080 1466 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCA---CAAAAAGGAATCTAAACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTAT-------AAATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATA-CAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCTATCTA-CATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAG------CATTAAG-------------CAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACTTAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCATCTGAG-TACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGTATGGCTGTTCAGGCATTGCTTCATATGTATGGA------TGCTTTGCAGGAAGATCTGGAGATTTTGCAAACTGATTTATTCAGAATGGTAAGGAGAGCCC-TGTGGCCTCATGGTCTTGTAGACTCAGTGAACATTGGATGCTAGGAGGGAATGT------GCAGTCAGAGCAGGGTAAGGCCTGTGACTTAAA-----------AGTGAAAGCCAGGTCAGACAGAAACTGGTTTGTTcatgttgggattttagttcccggaccagg a score=4837 s mm7.chrY_random 1511285 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=4785 s mm7.chrY_random 1511608 603 + 30114534 taataataCAGTGAGACTGATGAGCCTGCA---GTGACAGGACTTTAGCGTCTATGATAGAATTTGAGTCAGGCATTGTGTACTCACACATTAACTATGAGGATCTTGCTTAATTTTGTGTTCATAGAACTGGAATATCTCATGGATCTTTTCCCCC--TCTTAAATTCTGAGC--ATGTGAAGAAAAGTGATGTTTCTCTTTCTTATAAAATTAAGCAG---ATTCCATAAAAG-----------CTTATCTTCTCCCACTTCTAAATAAGCATTTTCA--------------------------------------------------------------------TTTAAT-------------------TTATTGCCATG---------------TTGTATGCTTTAACTGTTTGGTAGTTGTCTGTTAATTTTTGGTTGATCTT------------ACATATAAAGCAAGTTTGATAAAAATTTGGTATGGAATTTTATGCATTTTATAATTGTAAAAATATTATGTCCACTCACTTCAAAGTGCTCTGTGGTTATAAATTGG--------------CCTCTCAGTTAGTAA-TACACAACACAAATTCAATTCCACTTAACCCTTCTGAAAATGAACTTGCATGGTATTGTCTGATTTGA--------AGCTAATAAATCTATTTAACTAAACCAGAGACATTTGTGTTAGGAAGGAAACTACTACTGTCTGTTTTTTAGAAAATGGAAAAGTTA s bosTau2.chr3 39007038 702 + 85360813 TAATAGCCGAGTGAGAATAATGAACTAGCAACAGAGACTGGACTTTACCTTTTATGACAGAAATTGGGTCATACAT-------TCAC-------------------TGTTCATCTGTATGTTTTTA--------------TATGTAGCTTTCCCCCCCTCCTTGAATTTTAAACATATATGAGGAAAAGTGATATCTATACTCCTAGTTTTGGTAAACATTTCATCACATAGAAGGAAATATTTATCTTTTTCTCTCACCTTTCTAAATGAGGGTCTTAAATATTTCAATTTGGAAGGTGAAATCTACACAGCAGATTAAGTGCTAACCTCTAAATTATAACACTCAGTTTAATCTTTCTGTTGGGCAAAATGTTACTGGTGTGACATAGTATAATGCCTTATACATATTATCTGCTTAGTGATAATTTTTT--TACTTGATTGATTTTTATCCAACTTAAGCATGAAAAGCAAGTCTGTCA---------TGCAGAATTTCCTGTAAAATATGAATTCACAAAT-TTTTGT-CATTTAACTCAAAATGATAAATGGACATGGAATGAAACTAAAGAGATATTTTTAAAGTAAACAATTATATAATGTAACATCTGTTGTAATCACCTTTGTAGGGAATTGATTTTGAATTTATTCTCTGACTTGAAAATGCATAGTAGGTACATTTCTTTAACTGAACCTACTTAACATTTTTCAGAAAAGAAGCTACTCC---CTGTAGTTTAAAAGAT---AAAGtta a score=13749 s mm7.chrY_random 1517828 556 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGTT-----TGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATGCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCTTCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTG-AAGCACACTTTCAGTGTTCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTGTGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAATGGTTTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTGTTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCCGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTT--------------AAAATTTCCAGTGTATCCTTATAAGACTAATACA----TGGTTTT--AAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA-------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=19807 s mm7.chrY_random 1587189 963 + 30114534 GCACTTGTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTAGTGAGTTGGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATTCACTTTCAGTCCAATGATGCAGCCGGTATATAGATGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTGAGAGGTCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTCGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCGAAGAGCAGTTTTTGATCTTGTTGGATGGAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGAAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGGCTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGGGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTAGCACCCCCTTTCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCTATTTACTGTCAGAATATCCACTCTTTTCCTACAA------TAGGGGGTA----------------------ACTTGTATTCTGGC--------TAATTCTGTATTCACT------GTGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACTTCTTTGA------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGTGTAGGAAATTATAAGTATCGATTCAGAT-AATATATAACTTTTGAGAATTAGCTTCACATTTCTA--ATGTCCACACAAAATAGCTTT--CTTGATTTAAGTTACAGTTGCTATGTTTCACTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTC--AGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagctccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=2847 s mm7.chrY_random 1588176 224 + 30114534 TAATATTGAAAAGAAATTACAATT--TTTCACTTTGAAATTAAATCTCTGAAGATGATAACTTAACTTGTGTTTGGAAAAGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA-------------TCATTATTAATA------------TCAGCAGTATAAGGTTGTTCAAACAAAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAACGAAAATAAATGAATAGTA-GGTTTGT-AGCATTTGGCACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 19916 255 - 102126 TAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATACCTGGAGATCCTCCCATTTTAAATGAGAAGACCTAATCCAGAAAT-----TTTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=3854 s mm7.chrY_random 1616966 107 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCCATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGCTTTTAA s bosTau2.chr5 36527708 112 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGTTTGGTTTTTTAAA a score=3335 s mm7.chrY_random 1617402 70 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAGAAA---TA---TACTTTCAATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=7709 s mm7.chrY_random 1618902 436 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTACACTTAAACAAGAAAATGAATA----AAGATATTTAAAAATAAAGAAGTTCTATTTTGACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAGCTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGATTTTTTTATTTGTTTtatatatatatatatatatataACCAGCAAGTGAAATTTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTTAAACATAGACATTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCAAT----------GATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAA----TCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGA---AGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTT---CAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTT-TAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=5762 s mm7.chrY_random 1619633 418 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCA--TCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACTAAATATATGTATATTTTTA-CAATAACATGAAATAAAATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA---ATGTGTTCACCACTTACATACAAT--AATAATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=20758 s mm7.chrY_random 1621629 1286 + 30114534 gttttcattgatagagtatgca---atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagataatggaacttaatttagtttcatatgctgaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt-------tttttatggtaccaaccagtgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAAAGAACACTCAAAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCCCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCA---------TTTACGTTTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacctaacacacacacacacacacacacacatacacacacacatatatatacaTGTAC----AAAATTTAATTATATTTCAATGTGGTTT--TTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAACTAAAATATACAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACA--------TAATAA--TCCATAAATTATATTCCTAAGACTATGTGCAAGACTTCTGTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCAAACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATATAATTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATATAGGGTCAT----TTTGAAGAAAAAATAGATGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530133 1358 - 76426644 GCTTTTATATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAACA--ACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTTTATTA------------------------------------------------------TATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAATAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATAT----GACACT-TTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATAA---TTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=2977 s mm7.chrY_random 1629883 94 + 30114534 ATATTTTTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=13122 s mm7.chrY_random 1651590 1058 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATATATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCTGTGTTCCTGGTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGATGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC----AGA---------------CAGAATTGCCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGTTTCCCACTGTCTTT--------CATTATCTGTGTTATCCACACAT---------TTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTAACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTAGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATT----AGGGCCCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACTGTCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGACT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCCAACACAAACCTAAGAAACTTGTAAGCATTTGAAGTC----------------------CACTTACAGATCTC-ACTG-------------------------TCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGGAA---TTTTTAAATGATTGCATACTACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAACTTGT s bosTau2.scaffold5600 1080 1221 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-----AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCTATCTA-CATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAG------CATTAAG-------------CAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACTTAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCATCTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=4513 s mm7.chrY_random 1654270 84 + 30114534 CTATGCAGATTCTTTGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACCGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006495 84 + 85360813 CTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=5917 s mm7.chrY_random 1654603 597 + 30114534 AGTGAGACTGATGAGCCTGCA---GTGACAGGACTTTAGCATCTATGATAGAATTTGAGTCAGGCATTGTGTACTAACACATTAATTATGAGGATCTTGCTTAATTTTGTGTACATAGAACTGGATTATCGCATGGATCATTTCCCCCTCTTAAATTCTGAGC--ATGTGAAGAAAAGTGATGTTTCTCTTTCTTATACAATTAAGCAG---ATTCCATAAAAG------CTTATCTTTTCC-----CACTTCTAAATAAGCATTT----TCTTTTAAT-----------------------------------------------------------------------------------TTATTGGCATG---------------TTGTATGCTTTAACTGTTTGGTAGTTGTCTGTTAATTTTTGGTTGATCTT------------ACATATAAAGCAAGTTTGATAAAAATTTGGTAAGGAATTTTATGCATTTTATAATTGTAAAAATTTTTTCCACTCACCTCAAAGTGCTCTGTGGTTATAAATTGG--------------TCTCTCAGTTAGTAA-TACACAACACAAATTCAATTCCACTTAACCCTTCTGAAAATGAACTTTCATTGTATTGTCTGATTTGA--------AGCTAATAAATCTATTTAACTAAACCAGAGACATTTGTATTAGGAAGGAAACTACTACTGTCTGTTGTTTAGAAAATGGA---AAAGATACTTCT s bosTau2.chr3 39007047 704 + 85360813 AGTGAGAATAATGAACTAGCAACAGAGACTGGACTTTACCTTTTATGACAGAAATTGGGTCATACATT-----------CACTGTTCAT-------CTGTATGTTTTTATAT--------------------GTAGCTTTCCCCCCCTCCTTGAATTTTAAACATATATGAGGAAAAGTGATATCTATACTCCTAGTTTTGGTAAACATTTCATCACATAGAAGGAAATATTTATCTTTTTCTCTCACCTTTCTAAATGAGGGTCTTAAATATTTCAATTTGGAAGGTGAAATCTACACAGCAGATTAAGTGCTAACCTCTAAATTATAACACTCAGTTTAATCTTTCTGTTGGGCAAAATGTTACTGGTGTGACATAGTATAATGCCTTATACATATTATCTGCTTAGTGATAATTTTTT--TACTTGATTGATTTTTATCCAACTTAAGCATGAAAAGCAAGTCTGTCA---------TGCAGAATTTCCTGTAAAATATGAATTCACAAATTTTTGTCATTTAACTCAAAATGATAAATGGACATGGAATGAAACTAAAGAGATATTTTTAAAGTAAACAATTATATAATGTAACATCTGTTGTAATCACCTTTGTAGGGAATTGATTTTGAATTTATTCTCTGACTTGAAAATGCATAGTAGGTACATTTCTTTAACTGAACCTACTTAACATTTTTCAGAAAAGAAGCTACTCC---CTGTAGTTTAAAAGATAAAGttaaaaaaattttt a score=14952 s mm7.chrY_random 1658470 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGTTTATATCTCTGTATCCTCATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAGAGATGTCCAGATTCTGAGTATTGCAGGGTACCATCCAATACATCAAACTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTCAAAAACATTTCATCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTCCCAGCACAATCACTTCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATCTCCACATAGTTGATGCAGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGCCCAAGACCTACACATTTGAGCTTAGGAGATT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=13617 s mm7.chrY_random 1663833 555 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCCATGC------TTTGCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAATATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTACTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAGT--AGATACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGCGTTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATTATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGTCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA-------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=11492 s mm7.chrY_random 1874524 277 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAATCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4837 s mm7.chrY_random 1877335 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=13824 s mm7.chrY_random 1881574 375 + 30114534 TGGTGGCTAAGA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAATATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTATTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGACTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13810 s mm7.chrY_random 1886939 558 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGAGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTATTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAAGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA---------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=11190 s mm7.chrY_random 1968178 422 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTCTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCATCTCCCAGGAGAAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAAAGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTAT----TACTTG----------ATTACAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38593 s mm7.chrY_random 1971732 1287 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTATGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCCTCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCATTGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTATGGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGAAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTTGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACAAAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGGTGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCTAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGACAATCCTTCCGTGTTCTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAATGTAAACATATAGGACTGGAAGAAA---AAAAAGTTTTTTTTTTCC-TGTGTTAGCTATATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTATTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGTCATGCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGAAGAATAAGGAAATGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTTGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------AGATTT------------CTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10767 s mm7.chrY_random 1978617 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAACGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=7510 s mm7.chrY_random 1990535 300 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAAAACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatatatatatatatatatatatTATCACAAAGCTCTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATGTATAGTACATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130465 304 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT---TATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAA---CCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9946 s mm7.chrY_random 1991189 314 + 30114534 ACTGAATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14447 s mm7.chrY_random 1995598 376 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGCGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11860 s mm7.chrY_random 2005242 413 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGTTCCCACGCTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=27241 s mm7.chrY_random 2008550 731 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAAAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAAGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGAGGGTTGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACAGTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATAACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=9514 s mm7.chrY_random 2035813 494 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTACTTATAATCAGAAGTGCTGGTAA-ATTTTTAAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTTTTTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATACATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAATCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGGCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAA--TTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGCC-------AGCCAACATTCTATATG------GGCAACACTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=36497 s mm7.chrY_random 2038136 1171 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCAGGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTTTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATTGAAAA----AAAATGT-TTGTTTTCCTGTGT--TGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGTGATGGAC---TATGGTAGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGACTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAAATGGATTTTTAGGAAGAAGCAGAGAAAGACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=7973 s mm7.chrY_random 2044728 494 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATA----------TTTTACTAAATCGATGGAAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATATTGTTGACTTCTGTATTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAAGGATATGTTTCCATAAAAATAAGTAATGCCAAT---ATCGTTAATCAAGTAGAAAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATTGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGAGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGTTGATAT-------CATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCgtttgaataattgtgt s bosTau2.chr17 20172806 480 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATT-AGCAGAAA--------------------------------------------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACTTTAT a score=3870 s mm7.chrY_random 2078333 73 + 30114534 GATTATGTGCATAAGCTTATGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACTTGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=21412 s mm7.chrY_random 2094986 667 + 30114534 ACTTCTATCTGACACCTTGGATAGAATTCAAGTCTGGTCTTATTTCAATGATGTAGATCTTGGGTGTAAAGATGCATCCAAGCATCACTGTACTGGATGCCAAGATTGAGAAGACCTCTACAGCAGCCATGACCATGCCCTTAGTCCTATGTGAGTCATGGAGGAAGGTGACATAAACACTGCAGAATCCTAGCACGACAAAGGTCAGGAACTTGGCTTCATTAAATGTTTCAGGAAAATTCTTTGCCACGAAATCCACAGTGAAGCTTCCAAGGGCAAGGCAGGTCAAGTATCCCAAAATTCAGTAGAATGCAGTAACTGAACCCTTGTTGCACAAAATGATTA--TCATTATCATCAATATCAACAAATATCAATATCAACAAAAGGAGGAGAAACTGAGAGCCAGATTACCCACA-GAATACATTGAT-ATGGAACATATCAGAAGGATGTATTTCATTGAACCTGATAAAAGGAGGTTCCTTAAACCTCTTCCAGGTTCTGTGATTATGAAAGCCAA-ACTACAATGATTGTTTTGGCAAGCAATGTGGAAACAGACACCATGAATACAATTCCAAAAGTGATTTGTTGTAAGGCTACATTTTTTTCTGTTAGGAAGACCAATGAAGAAAAAGGAGCATGAGAAAATGGAACATGAGTGACATGAGTA s bosTau2.chr7 54723649 662 - 69141744 ACTTATTCTTTAAACTTTTCAAAGAGTTTTTATCAGTTCTTATAAGAACAATGTAGTACTTTGGGGCAAAGATGCAGCCTAGGAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGATGATCTCCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGCAGATAGGGAGGAAGGTGACCCAGACACTGAGGAGCACCAGCCTGCTGAAGGTCAGGAACTTGGCTTCACTGAAGGTGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGAAAGCCAAGGAGAAGGTCCCCAGGGCTAAGGAGCCCAGGTAGCCCAGGACACAGTAGAAGGCAGTGACCGAGCCCTTGTTGCACACGATGAGGAGCTCCTTGGGCTCAG----AATGAGTGTCCATCTCAAGGAAAGGGGGAGAGGCTCCCAGCCAGACTCCACAGATGATCACCTGGATCATGGAGTACATGGGAAAGACATA----GCAGGTCCTGTTAAGAGCAATCGCCTCATGGTTCTTCCTGGTTTCCTGGCCTTGAATGCCAAGATCACAGGGACGATTTTGGCCAAAACAGTGACCACAGCCACAGTGAACACAGCTCCAAATGTGGTCTGTTG-GAGGATGGAGGTGGCTGTGTGGGGACGACTGATAAAGAGTAAGGAGCA-GAGGAAGCACGGGAGGAGGGAGATGAACA a score=9770 s mm7.chrY_random 2110501 492 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAACTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTCTGAAATTCCTTGTAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTTTTTGCATGA-AAATAGTTCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=34872 s mm7.chrY_random 2112829 1170 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACACTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAAAGTAAACTTAT-------AGGATTGAAAAAAATGTTTATTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCATCGCAGGCTG-GAACAGTGCATACATCTAATATTGCA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAA--GAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGGG-----AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=9906 s mm7.chrY_random 2119407 458 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCTGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATGAAAATAAGTAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAGAAATGA--TATAAACTATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-------TCCTTTATTCTtttgaataaatg s bosTau2.chr17 20172806 473 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATG a score=21826 s mm7.chrY_random 2230147 839 + 30114534 ATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGATGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAATTTCTAGCCAATCCTTCCATGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGTTTTTTTTTTTTTACTGTGTTAGCTACATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTAAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAA--GGAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGTTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTGGGGAAAGTGGGAGATTTAAAAGGAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA-ATAGACTCAGAAA----TAAGAGAAAATCAGG s bosTau2.chrX 28529512 885 + 48857030 ATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCAT-CTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAAGAGGGACACAAATACATTTAGAAGAAGTTCAGG a score=11059 s mm7.chrY_random 2236548 398 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAC--AAAGCTTTTTTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATGTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACTTACT s bosTau2.chr17 20172806 405 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCT a score=5676 s mm7.chrY_random 2248469 152 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatat s bosTau2.chr3 45130465 181 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT a score=2595 s mm7.chrY_random 2248677 124 + 30114534 CTCACACAACTTTTTAAAAATCCTAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATATATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130670 99 - 85360813 CCCACCCCACTTCTTAA-------AACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9608 s mm7.chrY_random 2249155 314 + 30114534 ACTGCATGCACAGACCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTGGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13805 s mm7.chrY_random 2253505 377 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGTGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTACAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAAATATCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGC-CTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11860 s mm7.chrY_random 2263192 413 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGTTCCCACGCTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38040 s mm7.chrY_random 2266565 1358 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGTTACCCACAAGACATCTGCCCAGGTTTGGTGTTGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTGCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCAGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGGGGGTTGTGCTAGCCCAGGTTCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTTTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAAAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTATCAAATTCTAGCCAATCCTTCTGTGTACTTCATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGAAGTT----GTAAA-ATCATAAAGTACAGAAACGTAAACGTATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGTTTTTTGTTTTTTTTTTCCTGTGTTGGCTACATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGCTCTAAAAATTTAAAAGTGT-----GACATGATATTCTGTGAGTTAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAATATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGTGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAA--GGAACAG--CTTCTCTGGTCTGCATGT-------------AGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGAGATAGCAGCAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGAGCATAGGTAGAAACTCTGATGTGAACACTGAAGGAGAAACAAAAAGTTGGGGAAAGAGGGACATCTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACACAGAAAACTGATTGAAATAGACTCAGAAATCAGAGAAAATCAGGTTTCATTTGAATAATGA s bosTau2.chrX 28529038 1328 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAA--TATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAG----TGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCAT-CTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCT---TGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAA--------GAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA---ATGGAGAGGCTTCTAGGGG------GAGGGATAACCTAAGA----GGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGG----------TGTTGAA------GAATAACAGA-----GAGTGAAAT---CTTGGGGTTGAGAGGAAACCAGG-ATAAATTGAGTAAAGA a score=11281 s mm7.chrY_random 2273532 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTTTTCACAATT--TTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTTTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATCCTATAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATCAACAA-AATTAATTGCACATCAACTGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCATACAAATAAATAATGCCAATGTGATTATTCA--AGCAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGGTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTTTTGTGCAAATAACCCTAACCTCTGAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATACTACGAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCAG-TAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=19608 s mm7.chrY_random 2295510 963 + 30114534 GCACTTGTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTAGTGAGTTGGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATTCAGTTTGAGTCCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTGAGAGGTCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTTGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCTAAGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGAAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGTCTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGGGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTAGCACCCCTTTTCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCCATTTACTGTCAGAATATCCACTCATTTCCTACAA--TAGGGGGTAACTTGTATTCTGGATAA-------TTCTGTATTCACTG---------------------------------TGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACATCTTTGA-------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATAAGTATCAATTCAGAT-AATATATACCTTTTGAGAATTAGCTTCACATTTCTA----ATGTCCGAACAAAATAGCTTTCTTAATTTAAGTTACAGTTGCTATGTTTCACTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTC--AGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=2622 s mm7.chrY_random 2296487 112 + 30114534 TTAAGCATGATAATATTGAAAAGAAATTACAATT--TTTCACTTTGAAATTAAATCTCTGAAGATGATAACTTAACTTGTGTTTGGAAAAGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA s bosTau2.scaffold2750 19906 115 - 102126 TCAAACACTCTAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATA a score=2192 s mm7.chrY_random 2296625 96 + 30114534 TTGTTCAAACAAAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAACGAAAATAACTGAATAGTA-GGTTTGT-AGCATTTGACACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 20067 104 - 102126 TTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=4366 s mm7.chrY_random 2322863 200 + 30114534 TATTGTACAGTTAATAATTTTATGTCACaaaataatattatactaataattatttaaa-CTGTGTCTTATACTG-CTAATATGGTTTCACATATACATGGGAGTTTGGTAGCCTCAGGAC------TCTGTCCAGGTAGCTGGATCATGTTAATCAATTTTACACTCAGATTGCCATTCATTTTATTTTTAGTTGCCAATTTCAAGGG s bosTau2.chr13 22763104 205 - 62721844 TGTTGTTCTGCCAATAAATTAAGATCCTTAGCCA---TTTCATTAGTAATGATTTCAATCCCTGCCTGGAGCTGGATAATTCTGTTAAGCGTGTAAATTGGGGTTTGGTAGCCCCAGGACCCATCTTCTGCCCATGTAGCTAGCCTGTAGTATTGGATTATGCGTTCAGGAGACCACTCATCATCTTTCCAGTCTCCAGTCTGTAGAG a score=4137 s mm7.chrY_random 2323256 390 + 30114534 GATTTCTAAATGGTCCCCTCTGGTAAGTTGGAACAGGAAGAAAATTGTACAGCTAGTCCCCAAAACACACAATCCTGAT---TAGGTGAGAAAAAGTATAATCGAGGCTGTGTACCCAACATATCCAGTATAGCCC------ACAAAGGGCATGGTACCTGATACCTGCA-TTGACATTTTTTTTCGGTCCTGTCAG------AGATTAGAGAAACTAGACAAGGAATAGATGTTTTGTTCAAAGTGGTTTGGGAATCCACACCA--TTGAATTTCCCAAGTGACTGCATTAAAGAATGTTTGGCCCAGGCATGTGGGGCTTCCAGCTGAAGT-TTAAATCACC-CTTCCATTAGGTAGGTCAGTTTTCCCCAACAACTTAAGTATT----AGTTCAATTTTGGTtttggtttt s bosTau2.chr13 22763349 395 - 62721844 GACTCCCAATGATTCACCTTAGGCTAGGGAGAGTAGGAAAAAGGAAGGACAGATAGTCCCCAATACACATGCTCCTGACCTGTTGGCTGGTAAAATTGTATGTGCGTTAGT----CCCACAAATCCAATATGATCCTTCTGGACGAGGCCAATGG---------CCTTCAGTGGACAAGTC------ATCCCATCAGGTCTTTAAATGGGGGATGCTTGTTAGAGGGTGAGGATTAGGCTCTGTATAGTTTGGGCATCCCCACCAACCAGAAGTATGaatattataatattataatatttttGGCCAAGACAAGTGAGTTTTCCTACTGGAACATTGAATAATTGGCCCCACCATGCCAGACAGTTTTTGTCAATTAAAGAAGTCTTTAAATGCCAAATTCTGACCCTGGTCTT a score=3781 s mm7.chrY_random 2323871 96 + 30114534 TTTTTTATCTATCCAGG-CCATAGTTCTTCCATGTTAGTTTTTTCACATGCATGGCCAAAATACACCCTTAGCTACTGGACTCTAGTGTCTACCAGG s bosTau2.chr13 22763786 97 - 62721844 TTCTTTGGCTTCCCAGGGCCATTGGTCTCCCATGTTAGTTCCCCCACACACATAGCAAGAAGTAACCATTAATATCTGGGCTATGGTCTCTGCCAGG a score=6066 s mm7.chrY_random 2324814 707 + 30114534 AAACAGATTTCTTGCTATGGGAGCAATGAGAAATGGGCTAATTTTTATTTCCTCATGAAAAGAATGGAAGA-TCTGGATGT---CACTTAATGCATGATAGAAACTCTCTTGACATTTAACACAGACCCTGTGATCGTGCCCTTTCC----------------AATCTGCCAGCCAGTATTCTGTCAGGGGTTTCTTAAGTTAGTGATATTGAAATTAGAATGTTTCCAGGTCCCTAGTTGACAGTCTGATGCAGAAGGCTCCTTTTGAAGGAGCACCATTTTTGCACT--------------------TGTAGTGCCAGGTTGTTCATAAGATGTGCTTCCAGTAGGAAATGT--AAAAATGGGCTTTAGGGGTACATCTGGCCAGAGTTGAAGGAT----GTTCACATATATAGTTATCATTTAGCCTGTATGC----------------------CCACTCTGAGTGCT---ACCACTGA-------------------CTCAATGAAGTTGATCAGC-----------------CATAATCTAGGTTTG-------CAGAGAC---------ATATAAAATTATTGACACTGGTTGTCCTAGGTTAGAGAATAGTAACTTTTGGATCATTT---GTCCCTGTCCTAAGGGATGG--CTCTGGTC-GTCTTGTCATTCCACTGTTGGGGAAAACTGCATATCAAAAAATAATGTCTCCCA----TGTTGGTAGATGGAGTATGTGATTTTTTTTTATACTT-----------------------GAAAAGTGGATGTGACAAATGAAGCTGGGTCCAAGTAAATCCTTATCCCAAATGAGTCAGACAAATACAGTAGATA s bosTau2.chr13 22763886 839 - 62721844 AAAGACATTTTTAGTTTTGGCTGGAATAGGAAGAGGACCACTTTCAGTCTCTTCATAAAAAGAATGGAAGAGCCTGTGTGTGGAAATCCAGAGAGGAATAGAAATGCTCTGGAATAGCAATGCAGTTCCTG-GGTCAGGACCTCTCCTATTAATATAGATGCTGATCTGGTGACCCTCTTCCCATCTTGAGTCCCCAGGGTTGAAGACAGTGAAATTGACTGGGTTACACGTCCCCAGCTTACATTTGGGATCAACAGTTCCCTTTTGGAGGAGTGTTACTTTGTCCTTATTCTCCCAGGTCACCTCTATATTTTCCCAGGTTGCTCATCTGACACAGGCCCAGGTCAATCTGTGAAGAAAGGGGCCTTCATATCAC------CCAGTGTTATGGGATACTGGCTTACACATGTATTTGTCATTGAATGTGCATTCTTGTTCCCATGACAAGCCTCCACCATTCAGAGTACTGGGGTTACTGGGGTTTTTGTGAGCAGCACTCTCATCAAAGTGCACCATCACTGGGCTTTCTAAATTCGTAATCTATGTCGGGCTGACCCAGAGCCTCCGTCTGAGTGGCGAACCTCTAACCATGGGCTTTCTAAATTCGTAATTTGTG---TCTGGTTCATCCAGAGCCCTCCTTCTAAGTGGTGAACCTCTAACCAGTCTT-------CACTG-GGAGGGGAACTG-GGGTCAAAACG-GATGTCTGGCATTAGTGTTGACAAATAGAATAGGTTGTTTTGTTAAGTACACAAGTTTCGACATCTCCTTGGCAAGAGAAGTGAGTATG----GTAAAGCAAGGTCCAAGCGACCCCCTGACCTGATCTAGTCATGCGAATGCATGAAATA a score=3640 s mm7.chrY_random 2326400 107 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCAATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGCTTTTAA s bosTau2.chr5 36527708 112 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGTTTGGTTTTTTAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 2326837 71 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAAGAAATATA-----CTTTCTATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=7523 s mm7.chrY_random 2328337 425 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTATACTTAAACAAGAAAATGATTAAAGATATTTAAAAAT---AAAGAAGTTCTATTTTAACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGatttttttatttgttttata--------tatatataCCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGAACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTCAAACATAGACATTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTACTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGA---AGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTT-TAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=6001 s mm7.chrY_random 2329057 420 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACCTTAGT-ATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGTTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGTATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACtaaatatatatatatattta-caataatatGAAATAACATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAAATTATGTAATAACTATTTGG----------------------------------------------ATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA---ATGTGTTCACCACTTACATACAATAATA--ATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=20302 s mm7.chrY_random 2331065 1316 + 30114534 aaatgcctagtcgttttcattgatatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagataatggaacttaatttagtttcatatgctcaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt------ttttttatggtaccaaccactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAAAGAACACTCAGAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCCCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCA---------TTTACGTTTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacgtaacacacacacacacacacacacacacacacacacacatatatatatatatatatatatatacatgtaCAAAATTTAATTATATTTCAATGTGTTTT-TTTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAAATAAAATATACAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCACACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATATAATTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCATTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTACCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGAGTCAT----TTTGAAGAAAAATTAGATGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530122 1369 - 76426644 AAATACC-AACAGCTTTTAT--ATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAACA--ACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTT-----------------------------------------------------------------TAT-TATATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=3108 s mm7.chrY_random 2339409 94 + 30114534 ATATTTCTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=12252 s mm7.chrY_random 2361150 1059 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCTGTGTTCCTGTTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATGAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGATGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC--AGACAGAATGG-----------------CCAAGCTAAGGAAAAATAGCATATTG---CAGAGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGTTTCCCACTGTCTTTCA------------------TTATCTGTGTTATCCACACATTTTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTAGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATTATG----GCCCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACCGTCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGACT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCCAGCACAAACCTAAGAAAGTTGTAAGCATTTGAAGTC----------------------CACTTACAGATCTC-ACTG-------------------------TCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGGAA---TTTTTAAATGATTGCATACCACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAATTTGT s bosTau2.scaffold5600 1080 1221 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-------AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCT-ATCTACATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAG----CATTA---------------AGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACTTAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCATCTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=4632 s mm7.chrY_random 2363823 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAACTGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=5475 s mm7.chrY_random 2364144 602 + 30114534 aataataCAGTGAGACTGATGAGC---CTTCAGTGACAGGACTTGAGTGTTTATGATAGAATTTGAGTCAGACATTGTGTACTCACACATTAATTATGAGGATCTTGCTTAATTTTGTGTACATAGAACTGGATTATCACATGGATCTTTTCCCCC--TCTTATATTCTGAGC--ATGTGAAGAAAAGTGATGTTTCTCTTTCTTATACAATTAAACAG---ATTCCATAAAAG-----------CTTATCTTCTCCCACTTCTAAATAAGCATTTTCA--------------------------------------------------------------------TTTAAT-------------------TTATTGGCATG---------------TTGTATGCTTTAACTGTTTGGTAGTTGTCTGTTAATTT--TTGGTTT------ATCTTA--CATATAAAGCAAGTTTGATAAAAATTTGGTACGGAATTTTATGCATTTTATAATTGTAAAAATATTATTTTCACTCAACTCAAAGTGCTCTGTGGTTATAAATTGG--------------CCTCTCAGTTAGTAA-TACACAAAACAAATTCAATTCCACTTAACCCTTCTGAAAATGAACTTGCATGGTATTGTCTGATTTGA--------AGCTAATAAATCTATTTAACTAAACCAGAGACATTTGTGTTAGGAAGGAAACTACTACTGTCTGTTGTTTAGAAAATGGAAAAGTTA s bosTau2.chr3 39007039 701 + 85360813 AATAGCCGAGTGAGAATAATGAACTAGCAACAGAGACTGGACTTTACCTTTTATGACAGAAATTGGGTCATACATTCACTGTTCA----------------------------TCTGTAT------------GTTTTTATATGTAGCTTTCCCCCCCTCCTTGAATTTTAAACATATATGAGGAAAAGTGATATCTATACTCCTAGTTTTGGTAAACATTTCATCACATAGAAGGAAATATTTATCTTTTTCTCTCACCTTTCTAAATGAGGGTCTTAAATATTTCAATTTGGAAGGTGAAATCTACACAGCAGATTAAGTGCTAACCTCTAAATTATAACACTCAGTTTAATCTTTCTGTTGGGCAAAATGTTACTGGTGTGACATAGTATAATGCCTTATACATATTATCTGCTTAGTGATAATTTTTTTACTTGATTGATTTTTATCCAACTTAAGCATGAAAAGCAAGTCTGTCA---------TGCAGAATTTCCTGTAAAATATGAATTCACAA--ATTTTTGTCATTTAACTCAAAATGATAAATGGACATGGAATGAAACTAAAGAGATATTTTTAAAGTAAACAATTATATAATGTAACATCTGTTGTAATCACCTTTGTAGGGAATTGATTTTGAATTTATTCTCTGACTTGAAAATGCATAGTAGGTACATTTCTTTAACTGAACCTACTTAACATTTTTCAGAAAAGAAGCTACTCC---CTGTAGTTTAAAAGAT---AAAGtta a score=14488 s mm7.chrY_random 2368075 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGCAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13893 s mm7.chrY_random 2373438 558 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCAA--AAAACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAAGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA---------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=10767 s mm7.chrY_random 2454527 513 + 30114534 TACTATGCAAAG---AGAC-CTCAGTTAAATGTGTGTGTCAGTGACTCCAAA-ACACCTTTCCTTCTCTACCTTCCTTTGTATGGCACAGAACGAC---CTGTAAATAATTAAAATATGAAAACAAAACTTTT---TCACGAATTTAGGTTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAAGAGAAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTTCCTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAAAGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTAT----TACTTG----------ATTACAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172711 539 - 45915461 TATTTTGCCAAGTTCAGACATTCAGCTAAAAGGGCAGA--AGAAACTCCAATTGCATTCTTTGTTGACTAGGTTGTTTTGTA--GCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38606 s mm7.chrY_random 2458113 1288 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTATGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCCTCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGTAGAATTTCTCATTGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACGGCATCTATGGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCAACTTGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACAAAAATTTGAGAGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGGTGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCTAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGACAATCCTTCCGTGTTCTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAATGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGT---TTTTTTTTTCCTGTGTTAGCTATATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTATTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGAAGAATAAGGAAATGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTACAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTTGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------AGATTT------------CTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGA-GGCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10767 s mm7.chrY_random 2465009 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=5618 s mm7.chrY_random 2476922 359 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTACTAAGatatatatatcttatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataaatatTATCACAAAGCTCTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATGTATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130465 304 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT--------------------------------------------------------------TATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAA---CCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9387 s mm7.chrY_random 2477635 314 + 30114534 ACTGAATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGTAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGACTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAAATTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14456 s mm7.chrY_random 2482021 376 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGCGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGACACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=12271 s mm7.chrY_random 2491439 485 + 30114534 TCAGTTAAATGTATGTCAGTGACTCCAAA-ACAGCTTTTCTTCTCTACCTTTCTTTATATGGCACAGAACGAC---CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATTGACAATTCCCACGGTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAGTGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172732 518 - 45915461 TCAGCTAAAAGGGCAGAAGAAACTCCAATTGCATTCTTTGTTGACTAGGTTGTTTTGTA--GCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=26933 s mm7.chrY_random 2494820 731 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGTCATCCCTCATGAAGAAGAAGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAACGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGAGGGTTGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACAGTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGA-----------AAAAG------------ATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=9208 s mm7.chrY_random 2522108 494 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTACTTATAATCAGAAGTGCTGGTAA-ATTTTAAAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTTTTTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATACATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAATCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAA--TTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGCC-------AGCCAACATTCTATATG------GGCAACACTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=36803 s mm7.chrY_random 2524464 1135 + 30114534 ATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCAGGCGCACTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTTGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATACGATTGAAAAAAA--------ATGTTTGTTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTAGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAAATGGATTTTTAGGAAGAAGCAGAGAAAGACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529137 1181 + 48857030 ATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAA--TATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=7945 s mm7.chrY_random 2531021 498 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAAGATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATA----------TTTTACTAAATCGATGGAAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATATTGTTGACTTCTGTATTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAAGGATATGTTTCCATAAAAATAAGTAATGCCAAT---ATCGTTAATCAAGTAGAAAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATTGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGAGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGTTGATAT-------CATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCgtttgaataattgtgt s bosTau2.chr17 20172806 480 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATT-AGCAGAAA------------------------------------------------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACTTTAT a score=3870 s mm7.chrY_random 2564619 73 + 30114534 GATTATGTGCATAAGCTTATGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACTTGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=21198 s mm7.chrY_random 2581202 667 + 30114534 ACTTCTATCTGACACCTTGGATAGAATTCAAGTCTGGTCTTATTTCAATGATGTAGATCTTGGGTGTAAAGATGCATCCAAGCATCACTGTACTGGATGCCAAGATTGAGAAGACCTCTACAGCAGCCATGACCATGCCCTTAGTCCTATGTGAGTCATGGAGGAAGGTGACATAAACACTGCAGAATCCTAGCACGACAAAGGTCAGGAACTTGGCTTCATTAAATGTTTCAGGAAAATTCTTTGCCACGAAATCCACAGTGAAGCTTCCAAGGGCAAGGCAGGTCAAGTATCCCAAAATTCAGTAGAATGCAGTAACTGAACCCTTGTTGCACAAAATGATTA--TCATTATCATCAATATCAACAAATATCAATATCAACAAAATGAGGAGAAACTGAGAGCCAGATTACCCACA-GAATACATTGAT-ATGGAACATATCAGAAGGATGTATTTCATTGAACCTGATAAAAGGAGGTTCCTTAAACCTCTTCCAGGTTCTGTGATTATGAAAGCCAA-ACTACAATGATTGTTTTGGCAAGCAATGTGGAAACAGACACCATGAATACAATTCCAAAAGTGATTTGTTGTAAGGCTACATTTTTTTCTGTTAGGAAGACCAATGAAGAaaaaggagcatgagaaaatggaacatgagtgacatgagta s bosTau2.chr7 54723649 662 - 69141744 ACTTATTCTTTAAACTTTTCAAAGAGTTTTTATCAGTTCTTATAAGAACAATGTAGTACTTTGGGGCAAAGATGCAGCCTAGGAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGATGATCTCCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGCAGATAGGGAGGAAGGTGACCCAGACACTGAGGAGCACCAGCCTGCTGAAGGTCAGGAACTTGGCTTCACTGAAGGTGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGAAAGCCAAGGAGAAGGTCCCCAGGGCTAAGGAGCCCAGGTAGCCCAGGACACAGTAGAAGGCAGTGACCGAGCCCTTGTTGCACACGATGAGGAGCTCCTTGGGCTCAG----AATGAGTGTCCATCTCAAGGAAAGGGGGAGAGGCTCCCAGCCAGACTCCACAGATGATCACCTGGATCATGGAGTACATGGGAAAGACATA----GCAGGTCCTGTTAAGAGCAATCGCCTCATGGTTCTTCCTGGTTTCCTGGCCTTGAATGCCAAGATCACAGGGACGATTTTGGCCAAAACAGTGACCACAGCCACAGTGAACACAGCTCCAAATGTGGTCTGTTG-GAGGATGGAGGTGGCTGTGTGGGGACGACTGATAAAGAGTAAGGAGCA-GAGGAAGCACGGGAGGAGGGAGATGAACA a score=9862 s mm7.chrY_random 2596782 492 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAACTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTCTGAAATTCCTTGTAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTTTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGGCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35627 s mm7.chrY_random 2599100 1237 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACTGCGATGAGAGGATTTTAAATATTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCACCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAAAGTAAACTTAT-------AGGATTGAAAAAAATGTTTATTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATTACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGGAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAA--GAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAAAATCTCT-------GGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGGG-----AAAGAGTGATAGATAAAAGGAATGTGGCCTTGTTACACAAAGTGCAACCCAGAAAACTGATCCAAAGAGATTCATAAAT s bosTau2.chrX 28529095 1282 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAG------AGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGA-GAGGCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA------GAGTGAAATCTTGGGGTTGAGAG-GAAACCAGGATAAATTGAGTAAAGAGGGACACAAAT a score=9598 s mm7.chrY_random 2605684 458 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCTGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATGAAAATAAGTAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGGAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-------TCCTTTATTCTtttgaataaatg s bosTau2.chr17 20172806 473 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATG a score=11370 s mm7.chrY_random 2654126 277 + 30114534 GTTCAGATTTTATAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4837 s mm7.chrY_random 2656948 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14254 s mm7.chrY_random 2661215 375 + 30114534 TGGTGGCTAATA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAATGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13459 s mm7.chrY_random 2666599 556 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAACGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCACTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA--------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=21577 s mm7.chrY_random 2747141 837 + 30114534 ATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGATGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCCAAAAAGTTTGGAAAGGTTGTTTACCAATTTCTAGCCAATCCTTCCATGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAAGTTTTTTTTTTTTACTGTGTTAGCTACATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTAAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACATCTAAAATCATA------CATGCTAAAA--GGAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGTTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTGGGGAAAGTCGGAGATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA-ATAGACTCAGAAAT------AAGAAAATCAGG s bosTau2.chrX 28529512 885 + 48857030 ATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCAT-CTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAAGAGGGACACAAATACATTTAGAAGAAGTTCAGG a score=10802 s mm7.chrY_random 2753531 399 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTTTTTTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATGTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACGAAGTGACATGGACACTTACT s bosTau2.chr17 20172806 405 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCT a score=5770 s mm7.chrY_random 2765468 152 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAATAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatat s bosTau2.chr3 45130465 181 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT a score=9599 s mm7.chrY_random 2766223 314 + 30114534 ACTGCATGCACAGACCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTTCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=27211 s mm7.chrY_random 2830723 731 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGATACCCACATGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAAGAGGAGGAGGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCATTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAACGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGAGGGTTATGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGGGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=9118 s mm7.chrY_random 2858109 497 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAACTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTACTTATAATCAGAAGTGCTGGTAA-ATTTTAAAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGtttttttttttttaattttatCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATACATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAATCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAAATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGGCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAA-----TTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGCC-------AGCCAACATTCTATATG------GGCAACACTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=36596 s mm7.chrY_random 2860410 1195 + 30114534 ACCACAACAGGTCTACAGCCAGGTAGAAGACAATACATCTGAAGAGTCTGAGCATGACATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCAGGCGCACTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTTAGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAATATCACTTAAATTGAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAAGATTGAAAAA---AAAATGT-TTGTTTTCCTGTGT--TGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTAGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAAGAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAAATGGATTTTTAGGAAGAAGCAGAGAAAGACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAAAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529102 1216 + 48857030 ACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=9156 s mm7.chrY_random 2867006 462 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAAGATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATA----------TTTTACTAAATCGATGGAAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATATTGTTGACTTCTGTATTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATAAAAATAAGTAATGCCAAT---ATCGTTAATCAAGTAGAAAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATTGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGAGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGTTGATAT-------CATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCgtttgaataattgtgt s bosTau2.chr17 20172806 480 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATT-AGCAGAAA------------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACTTTAT a score=3870 s mm7.chrY_random 2900836 73 + 30114534 GATTATGTGCATAAGCTTATGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACTTGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=9691 s mm7.chrY_random 3025741 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAGTGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGGTCTGTGCATGCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=7208 s mm7.chrY_random 3026409 302 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATATATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAGAG-CTTTGTGataatatatatatatttatatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTATTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230044 304 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTT-------TTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATA---ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10786 s mm7.chrY_random 3038244 394 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATACATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAAAAAAGCTTT--GTTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=20078 s mm7.chrY_random 3044234 812 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCCAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTAACTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTTGCATGC-----------AGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTTATAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCTAACACAGTAAAAAAAAAAAAAAACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACATGGAAGGATTGGCTAGAAATTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCGTCTTTTCTGGTGTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTAACTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGAT s bosTau2.chrX 20326666 852 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATA--TTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGAT a score=9036 s mm7.chrY_random 3073393 466 + 30114534 acacaattattcaaacGAATAAAGGA-----------ATGAAAAAGAAAATG-------ATATCAACTAATA-------AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCTCAGGTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCAGCAATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCACcacacacacacacacacacacacacaTTTCTACTTGATTAACGAT---ATTGGCATTACTTATTTTTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGGGAAATGTTGATGTATAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAATACAGAAGTCAACAATATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAGATTTTCCATCGATTTAGTAAAA----------TATAAATATGATTTTAAAAGAAGGC--AACACCCTGAAAAAGTCTT--ATTTTCATCTTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742175 480 + 45915461 ATAAAGTCATCCAATTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC----------------------------TTTCTGCT-AATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=36982 s mm7.chrY_random 3079280 1193 + 30114534 TCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATACCAGAGATTCTATCTATG-TCCTGTCTTTCTCTG-CTTCTTCCTAAAAATCCATTTTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATA-----TCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATACACTGTTCACAGCCTGCGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCTACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCAACACA-GGAAAACAAACATTTTTTTCAATCCTATAAGTT-TACATTTCTGTACTT---TGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGGAGGTCACTGAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGAACTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGTGCGCCTGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGATGTCATGCTCAGACTCTTCAGATGTATTGTCTTCTACCTGGCTGTAGACCTGTTGTGGT s bosTau2.chrX 20326712 1216 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCC------TCCCCCTAGAAGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATA--TCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCTTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGT a score=9148 s mm7.chrY_random 3082271 496 + 30114534 TTTCTGCCTTGACAACATCCATGGTGGTTATTTTTCATGTTCCAACCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTCTTATCATAAATATTGCCAGATTCTTTGAGGCAGCACACTGGATAGCACACCAATTTTCACTTTATGAAAACCCACAGTTAGAGGAGAACTATTT-TTATGCAAACAAACCTGGAATTTGACAGGGATAAATGACATGTATTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAAATTAAAAAAAAAAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAAT-TTACCAGCACTTCTGATTATAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATGT--GTAGACAGAATACTGGACACAGGTATGTATAAAATTTACTTACAAAT s bosTau2.chr17 25750424 451 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAGTGTTGCC------CATATAGAATGTTGGCT-------GGCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAAT-AGTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAACTTGGA-CTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAA----TTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCAT a score=27239 s mm7.chrY_random 3109328 731 + 30114534 GAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAGAGT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTACTGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACAACCCTCCTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTCACCCTTAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCTTTTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTATTCTACATGGCTGTAGCGCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTATCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20327276 716 - 48857030 GAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=11888 s mm7.chrY_random 3112950 413 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAACCGTGGGAATTGTCAATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14327 s mm7.chrY_random 3121835 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGTAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCACACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9470 s mm7.chrY_random 3126294 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGTCTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCCGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTACTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGCTTTGTGCATTCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=7335 s mm7.chrY_random 3126962 288 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATACATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAGAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAGAGCTTTGT-------GATAATATATATATATCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230044 304 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACA-TGG-----TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATA-ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10664 s mm7.chrY_random 3138795 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAAACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCGTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=38616 s mm7.chrY_random 3144772 1285 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCAAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCATTTCCTAATCTTCATGC-----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGGAATGAAACTTTCATCTTCATTTGACGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAATAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATATAGCTAACACAGGAAAAAAAAAC-----TTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACATTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTTTCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTAGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCACCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTTTGTTGTACCGCTTTGCCAACCAGGGCTCTGGCAAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCCGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGAGGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCATACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAG------------AAATCT-----------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=8163 s mm7.chrY_random 3148085 486 + 30114534 TTTCCCTGTTCCAAAC-----TTTCCCTGGTTATCTTTCAA---------CTGTTCTTAGTGT-CAGAAATGGTGCC-----AGACTCTTTGA-GGCAGCACACTGGATAGCACATCAAAATTCTGTTTATGAAAACCCAAAGTT-AGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGTGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGGTCCTGCCTTCAAAGTTGTGATAAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTTTAAATT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTTATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATATATTCGATAATTTTACTTTTGAATTA--TGGGTAGACAAAATATTGTACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTA-GCGGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750424 495 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCT---GTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGTGTATTGAAGTGTTGCCCATATAGAATGTTGGCTGGCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAATAGT-TTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11229 s mm7.chrY_random 3149205 422 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGTAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACTTTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTTCTTCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATAATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14155 s mm7.chrY_random 3231181 558 + 30114534 TACTGATAAGCTTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC---------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14488 s mm7.chrY_random 3236717 374 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTGGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCACCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 3241293 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=3273 s mm7.chrY_random 3241382 68 + 30114534 TTCACAGACCAAGTCCTCATCGATGACAGAAACTGTGGCTATGTACTGTG-TTTATACTTTATTCCTCA s bosTau2.chr3 39055378 68 + 85360813 TTCATAGACCAGCTCCTCATCGATGG-AGAAATAGTGGGTATTTACTGTGCTTTTTGGTCTATTCCTTA a score=3426 s mm7.chrY_random 3242670 55 + 30114534 CTTTCATGAACTCACAAGCCAGGATTCACTTCTCTGACTACACGGCCATCTTAAG s bosTau2.chr3 39056262 55 + 85360813 CTTTCATGAACTCGCAAGCCCCGATTAGTTCCCCTGACTCCGCTGCCATCTTAAG a score=12072 s mm7.chrY_random 3242979 1058 + 30114534 ACAAATTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAATGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAACTTTCTTAGGTTTGTGCTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGATGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTACAAGGGC----CATAATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAA---------ATGTGTGGATAACACAGATAATG--------AAAGACAGTGGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGG-----------------CCATTCTGTCT--GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTCATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCAACAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCT---------------TAATG----CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATG-TAGATAGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3215 s mm7.chrY_random 3265609 152 + 30114534 aaGAATGTTCTGTGTAAAGTTTTG--TGTGTGGTAAAAAAAAATGGCCTACCAGTCTACTATATTTCTTG-----CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893437 152 + 76426644 AAGAGTATTGCATGTAAAATACTGGGTATGTGATA---------TTCCTTCCAAAACAATAAATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=13092 s mm7.chrY_random 3272763 751 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAAATACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAAAAAACCACATTGAAATATAATTAAATTTT----Gtacatgtatatatata s bosTau2.chr5 39895153 839 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCA-----CCTTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA a score=9925 s mm7.chrY_random 3273674 419 + 30114534 TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaaa-----aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39896104 418 + 76426644 TGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6043 s mm7.chrY_random 3275680 422 + 30114534 AAAATTTCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCatattattg-taaatatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTGCCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT-----TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=8046 s mm7.chrY_random 3276397 423 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAAA---------ACAAATAAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTAAAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT---TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3297 s mm7.chrY_random 3278256 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAA-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 3278657 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=6021 s mm7.chrY_random 3279643 706 + 30114534 TATCTACTGTATTTGTCTGACTCATTTGGGATAAGGATTTACTTGGACCCAGCTTCATTTGTCACATCCACTTTTC-----AAGTATA-------------------AAAAAAATCACATACTCCATCTACCAACA----TGGGAGACATTATTTTTTGATATGCAGTTTTCCCCAACAGTGGAATGACAAGAC-GACCAGAG--CCATCCCTTAGGACAGGGAC---AAATGATCCAAAAGTTACTATTCTCTAACCTAGGACAACCAGTGTCAATAATTTTATAT---------GTCTCTG-------CAAACCTAGATTATG-----------------GCTGATCAACTTCATTGAG-------------------TCAGTGGT---AGCACTCAGAGTGG----------------------GCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957119 839 + 62721844 TATTTCATGCATTCGCATGACTAGATCAGGTCAGGGGGTCGCTTGGACCTTGCTTTAC----CATACTCACTTCTCTTGCCAAGGAGATGTCGAAACTTGTGTACTTAACAAAACAACCTATTCTATTTGTCAACACTAATGCCAGACATC-CGTTTTGACCC-CAGTTCCCCTCC-CAGTG-------AAGACTGGTTAGAGGTTCACCACTTAGAAGGAGGGCTCTGGATGAACCAGA---CACAAATTACGAATTTAGAAAGCCCATGGTTAGAGGTTCGCCACTCAGACGGAGGCTCTGGGTCAGCCCGACATAGATTACGAATTTAGAAAGCCCAGTGATGGTGCACTTTGATGAGAGTGCTGCTCACAAAAACCCCAGTAACCCCAGTACTCTGAATGGTGGAGGCTTGTCATGGGAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 3281196 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGataaaaaa s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=4231 s mm7.chrY_random 3281522 390 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACCTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGGCCAAACATTCTTTAATGCAGTCCCTTGGGAAATTCAA---------TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---GTCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataata-------ttataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4366 s mm7.chrY_random 3282110 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTGATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=2192 s mm7.chrY_random 3307447 96 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTGTCAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCGTTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA s bosTau2.scaffold2750 81955 104 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAA a score=2417 s mm7.chrY_random 3307569 112 + 30114534 TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCACAGTGAAA--AATTGTAATTTCTTTTCAATATTATCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 82105 115 + 102126 TATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=19486 s mm7.chrY_random 3307695 963 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATTAAGAAAGCTATTTTGTTCGGACAT----TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATTGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATACAAGTTACCCCCTA--TTGTAGGAAATGAGTGGATATTCTGACAGTAAATGGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAAGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCACT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGACTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACAAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCTAACTCACTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=4591 s mm7.chrY_random 3385845 200 + 30114534 TATTGTACAGTTAATAATTTTATGTCACaaaataatattatactaataattatttaaa-CTGTGTCTTATACTG-CTAATATGGTTTCACATATACATGGGAGTTTGGTAGCCTCAGGAC------TCTGTCCAGGTAGCTGGATCATGTTAATGAATTTTACACTCAGATTGCCATTCATTTTATTTTTAGTTGCCAATTTCAAGGG s bosTau2.chr13 22763104 205 - 62721844 TGTTGTTCTGCCAATAAATTAAGATCCTTAGCCA---TTTCATTAGTAATGATTTCAATCCCTGCCTGGAGCTGGATAATTCTGTTAAGCGTGTAAATTGGGGTTTGGTAGCCCCAGGACCCATCTTCTGCCCATGTAGCTAGCCTGTAGTATTGGATTATGCGTTCAGGAGACCACTCATCATCTTTCCAGTCTCCAGTCTGTAGAG a score=4268 s mm7.chrY_random 3386242 390 + 30114534 GATTTCTAAATGGTCCCCTCTGGTAAGTTGGAACAGGAAGAAAATTGTACAGCTAGTCCCCAAAACACACAATCCTGAC---TAGGTGAGAAAAAGTATAATCGAGGCTGTGTACCCAACATATCCAGTATAGCCC------ACAAAGGGCATGGTACCTGATACCTGCA-TTGACATTTTTTTTCGGTCCTGTCAG------AGATTAGAGAAACTAGACAAGGAATAGATGTTTTGTTCAAAGTGGTTTGGGAATCCACACCA--TTGAATTTCCCAAGTGACTGCATTAAAGAATGTTTGGCCCAGGCATGTGGGGCTTCCAGCTGAAGT-TTAAATCACC-CTTCCATTAGGTAGGTCAGTTTTCCCCAACAACTTAAGTATT----AGTTCAATTTTGGTtttggtttt s bosTau2.chr13 22763349 395 - 62721844 GACTCCCAATGATTCACCTTAGGCTAGGGAGAGTAGGAAAAAGGAAGGACAGATAGTCCCCAATACACATGCTCCTGACCTGTTGGCTGGTAAAATTGTATGTGCGTTAGT----CCCACAAATCCAATATGATCCTTCTGGACGAGGCCAATGG---------CCTTCAGTGGACAAGTC------ATCCCATCAGGTCTTTAAATGGGGGATGCTTGTTAGAGGGTGAGGATTAGGCTCTGTATAGTTTGGGCATCCCCACCAACCAGAAGTATGaatattataatattataatatttttGGCCAAGACAAGTGAGTTTTCCTACTGGAACATTGAATAATTGGCCCCACCATGCCAGACAGTTTTTGTCAATTAAAGAAGTCTTTAAATGCCAAATTCTGACCCTGGTCTT a score=3781 s mm7.chrY_random 3386862 96 + 30114534 ttttttatCTATCCAGG-CCATAGTTCTTCCATGTTAGTTTTTTCACATGCATGGCCAAAATACACCCTTAGCTACTGGACTCTAGTGTCTACCAGG s bosTau2.chr13 22763786 97 - 62721844 TTCTTTGGCTTCCCAGGGCCATTGGTCTCCCATGTTAGTTCCCCCACACACATAGCAAGAAGTAACCATTAATATCTGGGCTATGGTCTCTGCCAGG a score=5798 s mm7.chrY_random 3387805 706 + 30114534 AAACAGATTTCTTGCTATGGGAGCAATGAGAAATGGGCTAATTTTTATTTCCTCATGAAAAGAATGGAAGA-TCTGGATGT---CACTTAATGCATGATAGAAACTCTCTTGACATTTAACACAGATCCTGTGATCGTGCCCTTTCC----------------AATCTGCCAGCCAGTATTCTGTCAGGGGTTTCTTAAGTTAGTGATATTGAAATTAGAATGTTTCAAGGTCCCTAGTTGACAGTCTGATGCAGAAGGCTCCTTTTGAAGGAGCACCATTTTTGCACT--------------------TGTAGTGCCAGGTTGTTCATAAGATGTGCTTCCAGTAGGAAATGT--AAAAATGGGCTTTAGGGGTACATCTGGCCAGAGTTGAAGGAT----GTTCACATATATAGTTATCATTTAGCCTGTATGC----------------------CCACTCTGAGTGCT---ACCACTGA-------------------CTCAATGAAGTTGATCAGC-----------------CATAATCTAGGTTTG-------CAGAGAC---------ATATAAAATTATTGACACTGGTTGTCCTAGGTTAGAGAATAGTAACTTTTGGATCATTT---GTCCCTGTCCTAAGGGATGG--CTCTGGTC-GTCTTGTCATTCCACTGTTGGGGAAAACTACATATCAAAAAATAATGTCTCCCA----TGTTGGTAGATGGAGTATGTGATTTTTTT-------------------TATACTT-----GAAAAGTGGATGTGACAAATGAAGCTGGGTCCAAGTAAATCCTTATCCCAAATGAGTCAGACAAATACAGTAGATA s bosTau2.chr13 22763886 839 - 62721844 AAAGACATTTTTAGTTTTGGCTGGAATAGGAAGAGGACCACTTTCAGTCTCTTCATAAAAAGAATGGAAGAGCCTGTGTGTGGAAATCCAGAGAGGAATAGAAATGCTCTGGAATAGCAATGCAGTTCCTG-GGTCAGGACCTCTCCTATTAATATAGATGCTGATCTGGTGACCCTCTTCCCATCTTGAGTCCCCAGGGTTGAAGACAGTGAAATTGACTGGGTTACACGTCCCCAGCTTACATTTGGGATCAACAGTTCCCTTTTGGAGGAGTGTTACTTTGTCCTTATTCTCCCAGGTCACCTCTATATTTTCCCAGGTTGCTCATCTGACACAGGCCCAGGTCAATCTGTGAAGAAAGGGGCCTTCATATCAC------CCAGTGTTATGGGATACTGGCTTACACATGTATTTGTCATTGAATGTGCATTCTTGTTCCCATGACAAGCCTCCACCATTCAGAGTACTGGGGTTACTGGGGTTTTTGTGAGCAGCACTCTCATCAAAGTGCACCATCACTGGGCTTTCTAAATTCGTAATCTATGTCGGGCTGACCCAGAGCCTCCGTCTGAGTGGCGAACCTCTAACCATGGGCTTTCTAAATTCGTAATTTGTG---TCTGGTTCATCCAGAGCCCTCCTTCTAAGTGGTGAACCTCTAACCAGTCTT-------CACTG-GGAGGGGAACTG-GGGTCAAAACG-GATGTCTGGCATTAGTGTTGACAAATAGAATAGGTTGTTTTGTTAAGTACACAAGTTTCGACATCTCCTTGGCAAGAGAAGTGAGTATG----GTAAAGCAAGGTCCAAGCGACCCCCTGACCTGATCTAGTCATGCGAATGCATGAAATA a score=3854 s mm7.chrY_random 3389391 107 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCCATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGCTTTTAA s bosTau2.chr5 36527708 112 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGTTTGGTTTTTTAAA a score=3297 s mm7.chrY_random 3389828 71 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAAGAAATATA-----TTTTCTATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=8046 s mm7.chrY_random 3391328 423 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTACACTTAAACAAGAAAATGATTAAAGATATTTAAAAAT---AAAGAAGTTCTATTTTAACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGATTTTTTTTATTTGT---------TTTATATATATACCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTCAAACATAGACATTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGA---AGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTTTAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=6174 s mm7.chrY_random 3392046 422 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGCAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACtaaatatatatatatatattta-caataatatGAAATAACATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA-----ATGTGTTCACCACTTACATACAATAATA--ATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=20606 s mm7.chrY_random 3394047 1312 + 30114534 aaatgcctagtcgttttcattgatatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagataatggaacttaatttagtttcatatgctcaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt------ttttttatggtaccaaccactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAATGAACACTCAGAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCGCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCA---------TTTACGTTTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacgtaacacacacacatacacacacacacacacacacacacacacaTATATATATATATATACATGTACAAAATTTAATTATATTTCAATGTGTTTT-TTTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAACTAAAATATACAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATCATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCACACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATATAATTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGAGTCAT----TTTGAAGAAAAATTAGATGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530122 1369 - 76426644 AAATACC-AACAGCTTTTAT--ATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAAC--AACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTTTAT--------------------------------------------------------------TATATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=3215 s mm7.chrY_random 3402370 152 + 30114534 ATATTTCTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG-----CAAGAAATATAGTAGACTGGTAGGCCATTTTTTTTTACCACACA--CAAAACTTTACACAGAACATTCtt s bosTau2.chr5 36533055 152 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATATTTATTGTTTTGGAAGGAA---------TATCACATACCCAGTATTTTACATGCAATACTCTT a score=12111 s mm7.chrY_random 3424115 1058 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCTGTGTTCCTGTTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATGAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGATGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC--AGACAGAATGG-----------------CCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGTTTCCCACTGTCTTT--------CATTATCTGTGTTATCCACACAT---------TTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTAGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATTATG----GCCCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACCGTCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGACT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCCAGCACAAACCTAAGAAAGTTGTAAGCATTTGAAGTC----------------------CACTTACAGATCTC-ACTG-------------------------TCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACATTGGAA---TTTTTAAATGATTGCATACCACTCCTGTTCCTAAAGGGATGTACAATTTGT s bosTau2.scaffold5600 1080 1221 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-----AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCT-ATCTACATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAG----CATTA---------------AGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACTTAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCATCTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=3426 s mm7.chrY_random 3425427 55 + 30114534 CTTAAGATGGCCGTGTAGTCAGAGAAGTGAATCCTGGCTTGTGAGTTCATGAAAG s bosTau2.chr3 46304496 55 - 85360813 CTTAAGATGGCAGCGGAGTCAGGGGAACTAATCGGGGCTTGCGAGTTCATGAAAG a score=4837 s mm7.chrY_random 3426770 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14132 s mm7.chrY_random 3431046 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGTTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=14021 s mm7.chrY_random 3436415 555 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTGACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGCTTTGT----GATTTAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAAGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=10566 s mm7.chrY_random 3518366 422 + 30114534 CTGTAAATTATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGAAGAAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGCCAAAGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTAT----TACTTG----------ATTACAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=39222 s mm7.chrY_random 3521933 1290 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTATGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCCTCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCATTGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACGGCATCTATGGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTTGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACAAAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGGTGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGATGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCTAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGACAATCCTTCCGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAATGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGTTTTTTTTTTTTCC-TGTGTTAGCTATATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTATTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACGTCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTCCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGAAGAATAAGGAAATGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTTGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------AGATTT------------CTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10767 s mm7.chrY_random 3528797 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=7335 s mm7.chrY_random 3540732 288 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGATATATATATATTATC-------ACAAAGCTCTCACACAACTTTTTAAAAATCCTCTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATGTATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130465 304 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT-TATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA-----CCA-TGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9470 s mm7.chrY_random 3541374 314 + 30114534 ACTGAATGCACAAAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGTAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACGGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGACTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14447 s mm7.chrY_random 3545782 376 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGCGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=12149 s mm7.chrY_random 3555419 502 + 30114534 TACTATGCAAAG---AGAC-CTCAGTTAAATGTATGTCAGTGACTCCAAA-ACAGCTTTTCTTCTCTACCTTTCTTTATATGGCACAGAACGAC---CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATTGACAATTCCCACGGTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172711 539 - 45915461 TATTTTGCCAAGTTCAGACATTCAGCTAAAAGGGCAGAAGAAACTCCAATTGCATTCTTTGTTGACTAGGTTGTTTTGTA--GCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=27556 s mm7.chrY_random 3558818 731 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAAAAGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTGAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGAGGGTTGTGCTAGCCCGGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACAGTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAG---------ACTCTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=8994 s mm7.chrY_random 3586108 494 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTACTTATAATCAGAAGTGCTGGTAA-ATTTTAAAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGTTTTTTTTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATACATGTCATTTATCCCTGTCAAATTCCAGGTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAATCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGGCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAA--ATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGCC-------AGCCAACATTCTATATG------GGCAACACTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=36955 s mm7.chrY_random 3588398 1192 + 30114534 ACCACAACAGGTCTACAGCCAGGTAGAAGACAATACATCTGAAGAGTCTGAGCATGACATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCAGGCGCACTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAAATCACA---AAGTACAGAAATGTA-AACTTATAGGATTGAAAAAAATGTTTGTTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTAGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAAATGGATTTTTAGGAAGAAGCAGAGAAAGACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529102 1216 + 48857030 ACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=8976 s mm7.chrY_random 3595011 468 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAAGATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATA----------TTTTACTAAATCGATGGAAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATATTGTTGACTTCTGTATTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATAAAAATAAGTAATGCCAAT---ATCGTTAATCAAGTAGAAAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATTGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGAGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGTTGATAT-------CATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCgtttgaataattgtgt s bosTau2.chr17 20172806 480 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATT-AGCAGAAA------------------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACTTTAT a score=11584 s mm7.chrY_random 3653830 277 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4632 s mm7.chrY_random 3656646 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGAGGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14263 s mm7.chrY_random 3660908 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13040 s mm7.chrY_random 3666260 558 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACCTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGCGTGCATAAGTAGAT-ACTCCACTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGCTTTGTGATTTAAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=20021 s mm7.chrY_random 3801942 963 + 30114534 GCACTTGTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTAGTGAGTTGGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATTCACTTTCAGTCCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTGAGAGGTCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTCGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCGAAGAGCAGTTTTTGATCTTGTTGGATGGAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGAAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGGCTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGGGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTAGCACCCCCTTTCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCTATTTACTGTCAGAATATCCACTCTTTTCCTACAA------TAGGGGGTA----------------------ACTTGTATTCTGGC--------TAATTCTGTATTCACT------GTGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACTTCTTTGA------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGTGTAGGAAATTATAAGTATCGATTCAGAT-AATATATAACTTTTGAGAATTAGCTTCACATTTCTA--ATGTCCACACAAAATAGCTTT--CTTGATTTAAGTTACAGTTGCTATGTTTCACTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTC--AGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagctccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=2978 s mm7.chrY_random 3802929 224 + 30114534 TAATATTGAAAAGAAATTACAATT--TTTCACTTTGAAATTAAATCTCTGAAGATGATAACTTAACTTGTGTTTGGAAAGGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA-------------TCATTATTAATA------------TCAGCAGTATAAGGTTGTTCAAACAAAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAATGAAAATAAATGAATAGTA-GGTTTGT-AGCATTTGGCACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 19916 255 - 102126 TAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATACCTGGAGATCCTCCCATTTTAAATGAGAAGACCTAATCCAGAAAT-----TTTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=4581 s mm7.chrY_random 3828384 164 + 30114534 attatactaataattatttaaa-CTGTGTCTTATACTG-CTAATATGGTTTCACATATACATGGGAGTTTGGTAGCCTCAGGAC------TCTGTCCAGGTAGCTGGATCATGTTAATGAATTTTACACTCAGATTGCCATTCATTTTATTTTTAGTTGCCAATTTCAAGGG s bosTau2.chr13 22763137 172 - 62721844 ATTTCATTAGTAATGATTTCAATCCCTGCCTGGAGCTGGATAATTCTGTTAAGCGTGTAAATTGGGGTTTGGTAGCCCCAGGACCCATCTTCTGCCCATGTAGCTAGCCTGTAGTATTGGATTATGCGTTCAGGAGACCACTCATCATCTTTCCAGTCTCCAGTCTGTAGAG a score=4107 s mm7.chrY_random 3828746 391 + 30114534 GATTTCTAAATGGTCCCCTCTGGTAAGTTGGAACAGGAAGAAAATTGTACAGCTAGTCCCCAAAACACACAATCCTGAT---TAGGTGAGAAAAAGTATAATCGAGGCTGTGTACCCAACATATCCAGTATAGCCC------ACAAAGGGCATGGTACCTGATACCTGCA-TTGACATTTTTTTTTCGGTCCTGTCAG------AGATTAGAGAAACTAGACAAGGAATAGATGTTTTGTTCAAAGTGGTTTGGGAATCCACACCA--TTGAATTTCCCAAGTGACTGCATTAAAGAATGTTTGGCCCAGGCATGTGGGGCTTCCAGCTGAAGT-TTAAATCACC-CTTCCATTAGGTAGGTCAGTTTTCCCCAACAACTTAAGTATT----AGTTCAATTTTGGTtttggtttt s bosTau2.chr13 22763349 395 - 62721844 GACTCCCAATGATTCACCTTAGGCTAGGGAGAGTAGGAAAAAGGAAGGACAGATAGTCCCCAATACACATGCTCCTGACCTGTTGGCTGGTAAAATTGTATGTGCGTTAGT----CCCACAAATCCAATATGATCCTTCTGGACGAGGCCAATGG---------CCTTCAGTGGACAAGTC-------ATCCCATCAGGTCTTTAAATGGGGGATGCTTGTTAGAGGGTGAGGATTAGGCTCTGTATAGTTTGGGCATCCCCACCAACCAGAAGTATGaatattataatattataatatttttGGCCAAGACAAGTGAGTTTTCCTACTGGAACATTGAATAATTGGCCCCACCATGCCAGACAGTTTTTGTCAATTAAAGAAGTCTTTAAATGCCAAATTCTGACCCTGGTCTT a score=3781 s mm7.chrY_random 3829364 96 + 30114534 ttttttatCTATCCAGG-CCATAGTTCTTCCATGTTAGTTTTTTCACATGCATGGCCAAAATACACCCTTAGCTACTGGACTCTAGTGTCTACCAGG s bosTau2.chr13 22763786 97 - 62721844 TTCTTTGGCTTCCCAGGGCCATTGGTCTCCCATGTTAGTTCCCCCACACACATAGCAAGAAGTAACCATTAATATCTGGGCTATGGTCTCTGCCAGG a score=6246 s mm7.chrY_random 3830307 705 + 30114534 AAACAGATTTCTTGCTATGGGAGCAATGAGAAATGGGCTAATTTTTATTTCCTCATGAAAAGAATGGAAGA-TCTGGATGT---CACTTAATGCATGATAGAAACTCTCTTGACATTTAACACAGACCCTGTGATCGTGCCCTTTCC----------------AATCTGCCAGCCAGTATTCTGTCAGGGGTTTCTTAAGTTAGTGATATTGAAATTAGAATGTTTCCAGGTCCCTAGTTGACAGTCTGATGCAGAAGGCTCCTTTTGAAGGAGCACCATTTTTGCACT--------------------TGTAGTGCCAGGTTGTTCATAAGATGTGTTTCCAGTAGGAAATGT--AAAAATGGGCTTTAGGGGTACATCTGGCCAGAGTTGAAGGAT----GTTCACATATATAGTTATCATTTAGCCTGTATGC----------------------CCACTCTGAGTGCT---GCCACTGA-------------------CTCAATGAAGTTGATCAGC-----------------CATAATCTAGGTTTG-------CAGAGAC---------ATATAAAATTATTGACACTGGTTGTCCTAGGTTAGAGAATAGTAACTTTTGGATCATTT---GTCCCTGTCCTAAGGGATGGCTCTGGTCTTCTTGTCATTC--CACTGTTGGGGAAAACTGCATATCAAAAAATAATGTCTCCCA----TGTTGGTAGATGGAGTATGTGATTTTTTT-------------------TATACTTGAAAATGGATGTGACAA--ATGAAGCTGGGTCCAAGTAAATCCTTATCCCAACTGAGTCAGACAAATACAGTAGATA s bosTau2.chr13 22763886 839 - 62721844 AAAGACATTTTTAGTTTTGGCTGGAATAGGAAGAGGACCACTTTCAGTCTCTTCATAAAAAGAATGGAAGAGCCTGTGTGTGGAAATCCAGAGAGGAATAGAAATGCTCTGGAATAGCAATGCAGTTCCTG-GGTCAGGACCTCTCCTATTAATATAGATGCTGATCTGGTGACCCTCTTCCCATCTTGAGTCCCCAGGGTTGAAGACAGTGAAATTGACTGGGTTACACGTCCCCAGCTTACATTTGGGATCAACAGTTCCCTTTTGGAGGAGTGTTACTTTGTCCTTATTCTCCCAGGTCACCTCTATATTTTCCCAGGTTGCTCATCTGACACAGGCCCAGGTCAATCTGTGAAGAAAGGGGCCTTCATATCAC------CCAGTGTTATGGGATACTGGCTTACACATGTATTTGTCATTGAATGTGCATTCTTGTTCCCATGACAAGCCTCCACCATTCAGAGTACTGGGGTTACTGGGGTTTTTGTGAGCAGCACTCTCATCAAAGTGCACCATCACTGGGCTTTCTAAATTCGTAATCTATGTCGGGCTGACCCAGAGCCTCCGTCTGAGTGGCGAACCTCTAACCATGGGCTTTCTAAATTCGTAATTTGTG---TCTGGTTCATCCAGAGCCCTCCTTCTAAGTGGTGAA------CCTCTAACCAGTCTTCACTG-GGAGGGGAACTG-GGGTCAAAACG-GATGTCTGGCATTAGTGTTGACAAATAGAATAGGTTGTTTTGTTAAGTACACAAGTTTCGACATCTCCTTGGCAAGAGAAGTGAGTATGGTAAAGCAAGGTCCAAGCGACCCCCTGACCTGATCTAGTCATGCGAATGCATGAAATA a score=3854 s mm7.chrY_random 3831779 107 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCCATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGCTTTTAA s bosTau2.chr5 36527708 112 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGTTTGGTTTTTTAAA a score=3335 s mm7.chrY_random 3832215 70 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAGAAA---TA---TACTTTCAATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=7250 s mm7.chrY_random 3833716 431 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTACACTTAAACAAGAAAATGATTAAAGATATTTAAAAAT---AAAGAAGTTCTATTTTGACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAGCTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGattttttttatttgt---------tttatatatatatatataaCCAGCAAGTGAAATTTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTTAAACATAGACATTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTATTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGA---AGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTT-------CAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTT-TAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=5762 s mm7.chrY_random 3834442 418 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCA--TCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACTAAATATATGTATATTTTTA-CAATAACATGAAATAAAATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA---ATGTGTTCACCACTTACATACAAT--AATAATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=20670 s mm7.chrY_random 3836431 1308 + 30114534 aaatgcctagtcgttttcattgatagagtatgca---atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagataatggaacttaatttagtttcatatgctgaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt-------tttttatggtaccaaccactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAAAGAACACTCAAAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCCCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCA---------TTTACGTTTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacctaacacacacacacacacacacacacacacacacacatacacacacacatatatatacaTGTAC----AAAATTTAATTATATTTCAATGTGTTTT--TTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAACTAAAATATACAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCAAACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATATAATTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGGGTCAT----TTTGAAGAAAAAATAGATGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530122 1369 - 76426644 AAATACC-AACAGCTTTTATATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAACA--ACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTTTATTA----------------------------------------------------------------TATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATAA---TTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=2977 s mm7.chrY_random 3844715 94 + 30114534 ATATTTTTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=3962 s mm7.chrY_random 4073959 73 + 30114534 TGCACACGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCAGACACACACACACAA----ATACACACAAGCTTATACACATAATC s bosTau2.chr14 47301233 77 + 50711261 TGCACATGTGTGTACATGTGCATGCCTGCATGCACACACACACACAAATTTATATACAAAAGCATACAAACATTATC a score=9188 s mm7.chrY_random 4108321 411 + 30114534 AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTCACAGGTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCACCCATCATTTACAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCTCCCcacacacacacacacacacaTTTCTACTTGATTAACCATATTGTCATTACTTATTTTTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTGAAATCGTGGAAAATGTTGATGTACAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAAAACAGAAGTCAACAGGAATGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAAATTTCCCATCGATTTAGTAAAATG-------TTATAAATATGATTTTAAAAGAAGGCAACACACTGAAA--AAGTCTT--ATTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCCTTTC---------------------TGCTAATTGAG-GATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=27947 s mm7.chrY_random 4114163 1025 + 30114534 GGCCACATTCCTTTTATCTATCACTCTTTCCCCAAATTGATGTTTTTCC--CTCAGACTTCATACCAGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCCTTCTTCCTAAAAATCCATTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCCTTGCTCACTATGCAGACCACAGAAGCTAAGCCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGTTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCAACACA-GGAAAATAAACATTTTTTTTCAATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTT---TGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGTAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTAAACAGTAGGATTGGCTAGAGCTTTGTAAACAAACTTTCTGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGTACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCACCTCAGCCAGAGGAGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTTATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTTAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGGGCGCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAATATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTCCGTAGT----GTCCGTAGACACTGTCAATTCCTTCATACTTCACCAAATAAAGAAAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGA s bosTau2.chrX 20326739 1032 - 48857030 GGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTA---GAAGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCTTCCTTTCCCCC--ACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCT-----------------CCTT-----------AGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGGTT-ATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGT--GAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGA a score=5742 s mm7.chrY_random 4255638 253 + 30114534 TTTGACAGGGTTAAATG------ACATGTGTTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATAGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAACTTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAATTTACCAGCACTTCTGATTATAAGGAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAG-GATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATG s bosTau2.scaffold1094 48464 248 - 285174 TTTTACAGAATCAAATACCTGTCACATGTGAAGGAAACA---GTAATTATGAATTATGGATCATTTGCAAGAAGTGATACCAAATTAGTTTCTGGGCCTGTTTCCAACGTTGGAGTGAATTTATGACAAACTGGATATTGATGAAT--GGTTTCTAAAGTCTGTTGAATTTGTCAGCCTTGCCTATGAATGAGGATTTGTTAGGTCAAATA-AATGAAACGGTAATGAAATAGATTG------TTTCTTTATGAAAAATG a score=3854 s mm7.chrY_random 4385629 107 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCCATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGCTTTTAA s bosTau2.chr5 36527708 112 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGTTTGGTTTTTTAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 4386066 71 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAAGAAATATA-----CTTTCTATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=7670 s mm7.chrY_random 4387566 424 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTACACTTAAACAAGAAAATGATTAAAGATATTTAAAAAT---AAAGAAGTTCTATTTTAACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGATTTTTTTATTTGTT----------TTATATATATACCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTCAAACATAGACATTTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTACTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGA---AGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTTTA--AGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=2572 s mm7.chrY_random 4388102 106 + 30114534 TGTTTAATAAAGCAGG-ATAATTATAGTGTTATTAAAGTATGAG-----------------GTACATCTGAGGTCAAATTCCCATTTTATCATTTCATATCTTTAATAATTCATACAAAGCCAT s bosTau2.scaffold10439 6776 123 + 23754 TGCTGAACAAAATAGTTAGGATTAAAGGGTTAATCAAGTATCAGTTTTCTTCACCATGTGTATACATCT-AGATTAAATTCCCAGTTTGCAGTTCCCCATTTTAAGTGACTCCCACAATACTAT a score=6392 s mm7.chrY_random 4388285 418 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGCAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTAAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGa----tttaaaattttaac-aactatttacta--aatatatat-atatattta-caataatatGAAATAACATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATAATGTGTTCACCACTTACATACAATAATA--ATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=19445 s mm7.chrY_random 4390286 1315 + 30114534 aaatgcctagtcgttttcattgatatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagataatggaacttaatttagtttcatatgctcaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt------ttttttatggtaccaaccactgattttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATGTACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAATGAACACTCAGAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCGCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCA---------TTTACGTTTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacgtaacacacacacacacacacacacacacacacacacatatatatatatatatatatatatatacatgtaCAAAATTTAATTATATTTCAATGTGGTTTTTTTTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAACTAAAATATACATATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCACACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATATATTTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAGTCATTT-------------TGAAGAAAAATTAGATGATTCCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530122 1369 - 76426644 AAATACC-AACAGCTTTTAT--ATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGC-AAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAAC--AACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTT-----------------------------------------------------------------TAT-TATATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTT-CATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=3108 s mm7.chrY_random 4398601 94 + 30114534 ATATTTCTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=5822 s mm7.chrY_random 4418289 381 + 30114534 GGAAACTGGATATTTTACAACCAATTATCTGGTCCACTTGCCTACCTCTGGTTATCCCAGTTTCTCCACCTAAATTCGT-TACTGATAATTTCCTCAGTATGCAGCCTGCCATG--ATTCACAGACAGTTACAACA----ACTGCTTCTG----ACTCAGTATTAAATTGAAGTCCTTTCTCTTCTTCAG-GAATGTTAATATTtgacgatatacaaatgcatttatctgaggtagaatgggctatgct--aacccatggaagaagacactctacagtgttgtaatgctggccatctacaagctaaccACCTGACTAGTTTAACTGGTTAACTATAACTCCTTTCCTTTGTGTATACATTGTGTAACCTGGACTGT------AACAGTGAAAATATACTCT s bosTau2.chr25 343523 384 + 41414979 GGGAACTGAGTACCTCCTGGGCTGTTTGCTGATCC-CTTGCCTACTTTCTGCCATC----TTGCTTTAAAATAATTCATGTGCTATTAGTTCCTTTAGTGACTGGCTTACCTTGTAGTTCATGGC---TTAGAAGATTGGGCTGCTTCTGTAGTGGCAAGTACTGAGCTGAAGCCCATTCTCTTCTTTAGAGCTTGTTGACATTTGAAGAAGTGGCCATGTATTTTTCCCAGGAAGAATGGGAGTTACTGGATCCCAC-TCAGAAGGCCCTCTACAATGACGTAATGCAAGAAAACTATGAGAGTGTCATCTTTCTA--------GGTAAAGTTTCTCCCCTTCACTTTGCCTAGGAGTGGACTAAACTGTCCTGTTGTTGGCATACTGAGGATGCACCCT a score=12356 s mm7.chrY_random 4420333 1057 + 30114534 TTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCTGTGTTCCTGTTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATGAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGATGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC--AGACAGAATGG-----------------CCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGTTTCCCACTGTCTTT--------CATTATCTGTGTTATCCACACAT---------TTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTAGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATTATG----GCCCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACCGTCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGACT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCCAGCACAAACCTAAGAAAGTTGTAAGCATTTGAAGTC----------------------CACTTACAGATCTC-ACTG-------------------------TCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTAGAA---TTTTTAAATGATTGCATACCACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAATTTGT s bosTau2.scaffold5600 1081 1220 + 52585 TTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-----AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCT-ATCTACATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAG----CATTA---------------AGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACTTAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCATCTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=3426 s mm7.chrY_random 4421644 55 + 30114534 CTTAAGATGGCCGTGTAGTCAGAGAAGTGAATCCTGGCTTGTGAGTTCATGAAAG s bosTau2.chr3 46304496 55 - 85360813 CTTAAGATGGCAGCGGAGTCAGGGGAACTAATCGGGGCTTGCGAGTTCATGAAAG a score=4837 s mm7.chrY_random 4423004 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=13909 s mm7.chrY_random 4427233 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGAGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACATGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCAAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13371 s mm7.chrY_random 4432590 558 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTGACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGAGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTTTACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTATTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAAGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA---------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=11293 s mm7.chrY_random 4513657 422 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAACAAAACTTTT---TCACGAATTTAGGCTTCTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGGAGAAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAAAGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTAT----TACTTG----------ATTACAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38685 s mm7.chrY_random 4517200 1287 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTATGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCCTCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCATTGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTATGGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGAAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTTGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACAAAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGGTGACAGTGATATGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCTAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGACAATCCTTCCGTGTTCTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAATGTAAACATATAGGACTGGAAGAAA---AAAAAGTTTTTTTTTTCC-TGTGTTAGCTATATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGCTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGAAGAATAAGGAAATGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTTGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------AGATTT------------CTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10542 s mm7.chrY_random 4524098 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAACGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=7537 s mm7.chrY_random 4536009 296 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAAAACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatatatatatatatatatTATCACAAAGCTCTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATGTATAGTACATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130465 304 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT-TATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAA-CCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9946 s mm7.chrY_random 4536659 314 + 30114534 ACTGAATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14447 s mm7.chrY_random 4541051 376 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGCGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11796 s mm7.chrY_random 4550724 413 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTTTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATTGACAATTCCCACGGTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=26896 s mm7.chrY_random 4554040 731 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAAAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAAGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGAATTCCCACCTCACCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGAGGGTTGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACAGTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=9300 s mm7.chrY_random 4581342 494 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTACTTATAATCAGAAGTGCTGGTAA-ATTTTAAAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTTTTTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATACATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAATCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGGCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAA--TTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGCC-------AGCCAACATTCTATATG------GGCAACACTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=36580 s mm7.chrY_random 4583659 1171 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCAGGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTTTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATTGAAAA----AAAATGT-TTGTTTTCCTGTGT--TGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTAGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGACTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAAATGGATTTTTAGGAAGAAGCAGAGAAAGACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=7825 s mm7.chrY_random 4590251 502 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAAGATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATA----------TTTTACTAAATCGATGGAAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATATTGTTGACTTCTGTATTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAAGGATATGTTTCCATAAAAATAAGTAATGCCAAT---ATCGTTAATCAAGTAGAAAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATTGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGAGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGTTGATAT-------CATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCgtttgaataattgtgt s bosTau2.chr17 20172806 480 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATT-AGCAGAAA----------------------------------------------------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACTTTAT a score=3870 s mm7.chrY_random 4624007 73 + 30114534 GATTATGTGCATAAGCTTATGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACTTGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=21412 s mm7.chrY_random 4640609 667 + 30114534 ACTTCTATCTGACACCTTGGATAGAATTCAAGTCTGGTCTTATTTCAATGATGTAGATCTTGGGTGTAAAGATGCATCCAAGCATCACTGTACTGGATGCCAAGATTGAGAAGACCTCTACAGCAGCCATGACCATGCCCTTAGTCCTATGTGAGTCATGGAGGAAGGTGACATAAACACTGCAGAATCCTAGCACGACAAAGGTCAGGAACTTGGCTTCATTAAATGTTTCAGGAAAATTCTTTGCCACGAAATCCACAGTGAAGCTTCCAAGGGCAAGGCAGGTCAAGTATCCCAAAATTCAGTAGAATGCAGTAACTGAACCCTTGTTGCACAAAATGATTA--TCATTATCATCAATATCAACAAATATCAATATCAACAAAAGGAGGAGAAACTGAGAGCCAGATTACCCACA-GAATACATTGAT-ATGGAACATATCAGAAGGATGTATTTCATTGAACCTGATAAAAGGAGGTTCCTTAAACCTCTTCCAGGTTCTGTGATTATGAAAGCCAA-ACTACAATGATTGTTTTGGCAAGCAATGTGGAAACAGACACCATGAATACAATTCCAAAAGTGATTTGTTGTAAGGCTACATTTTTTTCTGTTAGGAAGACCAATGAAGAAAAAGGAGCATGAGAAAATGGAACATGAGTGACATGAGTA s bosTau2.chr7 54723649 662 - 69141744 ACTTATTCTTTAAACTTTTCAAAGAGTTTTTATCAGTTCTTATAAGAACAATGTAGTACTTTGGGGCAAAGATGCAGCCTAGGAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGATGATCTCCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGCAGATAGGGAGGAAGGTGACCCAGACACTGAGGAGCACCAGCCTGCTGAAGGTCAGGAACTTGGCTTCACTGAAGGTGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGAAAGCCAAGGAGAAGGTCCCCAGGGCTAAGGAGCCCAGGTAGCCCAGGACACAGTAGAAGGCAGTGACCGAGCCCTTGTTGCACACGATGAGGAGCTCCTTGGGCTCAG----AATGAGTGTCCATCTCAAGGAAAGGGGGAGAGGCTCCCAGCCAGACTCCACAGATGATCACCTGGATCATGGAGTACATGGGAAAGACATA----GCAGGTCCTGTTAAGAGCAATCGCCTCATGGTTCTTCCTGGTTTCCTGGCCTTGAATGCCAAGATCACAGGGACGATTTTGGCCAAAACAGTGACCACAGCCACAGTGAACACAGCTCCAAATGTGGTCTGTTG-GAGGATGGAGGTGGCTGTGTGGGGACGACTGATAAAGAGTAAGGAGCA-GAGGAAGCACGGGAGGAGGGAGATGAACA a score=9892 s mm7.chrY_random 4656124 492 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAACTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTCTGAAATTCCTTGTAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTTTTTGCATAA-AAATAGTTCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35526 s mm7.chrY_random 4658452 1171 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTTAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAAAGTAAACTTAT-------AGGATTGAAAAAAATGTTTATTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCATCGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATTGCA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTATTGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAA--GAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGGG-----AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=9823 s mm7.chrY_random 4665016 458 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCTGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAAGAATAAGGGATATGTTTCCATGAAAATAAGTAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATAGGTTATGCAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAGAAATGA--TATAAACTATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-------TCCTTTATTCTtttgaataaatg s bosTau2.chr17 20172806 473 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATG a score=5602 s mm7.chrY_random 4756435 528 + 30114534 ATTCTCCTGGATTGCTGCTGTCTCATTCTT-CGTATTCCTCTTTATTTTACTGAGAAATATTCTGGGGTTATGTGGTCTCC----CAGAAATCTGTGGGCGAGCATTCTGCCTCCTTA-CTCAATATTCACCTCCATCTCCTTCCTCAA-------------------------------------------------GACCAATAGAACAGACAGT------AGCAGCATCAAAGTTGACGTGACTTTGCTTAATTTAGTCCTCTAGATGTCCCATTCCAGAACAAC-----TTAGCATTCAAATTTGGTCCAGACCTTCTGA-CTTGAACatctattacaaaagggggttgtgagggttaagtgtgctaggaaatatacagcacctttaagatcagcacccagcaG----CAGATGAATGGAAGAGGTATTGTTAAT------TCACACAAAACAGTTCTCCTTGATGATCATCTTTCCTTCCTGTTATTTTCC-ACCAGTCGTCATGGTAACATCATAATCTTA-------------------AAAGTGACCATCA----TCTCTACATGGTCCTGGCTACCTGACTC------------ATAAGCAG--ACATCTG---AATTTTCCTTTTGTACTTATACT s bosTau2.chr2 48813261 626 + 86543008 ATTTACTTGAGTTGCTGACATCTCATTTTTTCCTGTTCATTCTTATACTTTTGTGAAGTATTTTGGAA--GAGAGGACTGCAAAGCATAATACTTTAACTGAACATTTTTGTTTTTAATCTCTAAATTC----CCATTTTCTTCCTAAATTTCATGCTTGACCCTGCAAATAGTGTGATGCTATCTCACTTCCAAACAGATCAATATAAAATACACTTTTAACAATGGCATC-----TGAAGAAACATGATTTATTTTGGTCAGTCAG-TGTCAAATTCCAGAACAACAAGTTTTGTGCTTCTAACATCATTGAAATCATGTCAGCTTGACTGTCTAT-Acataaagttgttg--aatattaagtttgttaataaatgtaaagcac--ttaagaaaaatatttggcaGGTTTAAGTTTTATATGAGAGCTGCtattattatattttaatataaaataattCTTC---AAAGCCATCTTTCCTTCCCATTATTTTCCTACTTCTCTCTGTGGTTATGTCATATTCTTAGCCACATAGGTTCAATGTCAGAGTGATCATCAACTTTCTCTCTTGTTTCCCTTCCACTTTATTCCTACTTCTACCTCTAGGCAAACACATCTGATTATTTCTACTTTTGCAATTGCATT a score=6856 s mm7.chrY_random 4757306 522 + 30114534 TGTTCGTGGCGTTGCTGCCACCACCCTGAGATCCAGCTGCCTCACCTCACTTCTGTACTTAG---CTTCAGCCAGCTGCTGTGGTTTCTTCCATTGTTTAATTCCCTAAGCAGAGCACAATGGAGCTCACTCTC-----------TCCTGACAGCAACTGACACAACAGCATCCTACCTAGCTCAACATCTGCACATGAAGTAGTTCTCCGCATTAATATATATGCCCTTTCTTCTACTGAGCCTGTCCATCAAATGAGAATATTCACACAAATATTTTGTAGTATATAAGGTGTTGCATGAGGTATG--TTTTGGGTTGTATT-TCACTCAC--------TTTTAATCAGTCTTTAGGAGAAAATTCTCATCAGCGTTCTCTAGAGTGTTATTATCAAATCGATGTGACAGCA------------------------TTTAAGATTGATGTCTTTT---AGACCAAAAAAAATGCAGTATCAGTTTTTGGAATATTTTACTGCC-ACAAACACACAT-------------GTTTTATGAAGAAAATA-TGAGCAAATTTTAAACAACTTCACATTTTGTATTTTTTTT s bosTau2.chr2 48813887 563 + 86543008 TGTTCCGGATGTTACTGCCATCAGTCTGGG--CCAG--ACCTCACTACA-TCATGTGTCTGGTAACATTAGTTACACAGTTTTAGTTCTTCTCCCATCCAGTTTTTCTA-TACAGCATTATCAGATTCCCTTCCCCAGGTGATTTTCTTCCAAGGTATTGGAAACACAGCATCCTGCCT----CAGCCTCTTCACACCAAATACTCCTGCTCACTGGAACATATTTCTTTTTTTAT-------CTGTCCATTAAATGAGAGTATTTGTGAATACACTTTGTGAAGTATAGAGTCCTCTGTGAGATTTTACTGTTATGCTACATTGTAACTTAAGCTGTGGGTTTTAATCAGTTGTTAGGAGAATATCCT-ATTAGTGTTATCGATAGTCTGATTCTTGAATAAATGTGACAACACCAGAAAAAAACTCATAAAAACCCCTGAAGATTAGTGTGTCTTTAAAGGGTTAACTTAACTAAATGTCAACTT--------TATTACTTCCTTTAAATATAAATTTTTTCATTTTCATTTTTATGTAGAAAAGAGTGACCAATTTTAAGAAAACTTGATACTGTAGATTTGTGTT a score=4350 s mm7.chrY_random 4758201 135 + 30114534 TTGTTTTCCCTCTTTTCTATTCTGTTAAATAAAGCACTATGATATTAGGTCCAAATCTGCAACAGATAACAGTGTAGTTAATATTTAGCTTAATA------AGTGTAGAAA---GATGTCTTCAGAAACAATTTATTTCAAAGC s bosTau2.chr2 48814454 144 + 86543008 TTGTCTTTCCCTTTTTCTACTGAGTTGAGTAAAGCATTGTGAAAGCAATTCCAAATCTGTGATGGAAAATTGTATGAATAATATTCAGGCTCATGGATCATAGCTTAGAAATGCAATAACAACTAAAACAATTCACCTGAAAAC a score=19245 s mm7.chrY_random 4759620 887 + 30114534 TCATTTCTAAATCTGTCAAAGTGGTATATCCAAAAGTAAA-CAGGTAG-----GTATCCAGTGAGTTTAGCAG---TATAAATTCTCACCAGTCAGACACTACTAGAATTGGTTTCATCCAAACAACAGTTGTTTCATAGTTTTTCATTCATTAAGAAAATGATCAATAAAGCCATTATCCTTTGTTCTGCTTTCGAATACCAACTGCTGTAGTCTAAGTCATGTCCAATTCTGTATTGTA--------TGATTAAATTTAATCAAGGTTTTTATATTCCCTCTTCTAAATTCAACATTGGCATTTTCTGAAGAGGTTATTGGATTGCTGTCAAATAGAAAGTATCTGTAGACTCTGAGCATGAGTGCATACTGGAAAATCAGACATTTCTAAA-TATTTTAATGACACATCCACC--TTTGTGACTATGTGAGCCTTCCATGAGTTAACCTCTTGTGAACCTATGATAACTATTGATCCAATGAAGAGTCATCTGGTTAAATGAAATGAAGACAAAGGAAATGAAAATGCTACATTTTATTCAGCTGACTGCCAATTGCATTGCTCTACAATTGTTTTCT-GTCTGACCCAGGGCTGGGTGTGCGTATTATCACATTTCATTGACATTCAACCTCAAGGTAAAGATGGATGCACATCTGCTGTC----------ACCAGGCTAGATTTAAAGTGCAGG-GCAGAGGCTTAC----TTTACGCACCATTTGTTAGCAATGCATTC---ACAGGTTCCATGTGTCTTCACTATAA-GTAAGGGAAGGTTGACAGTAAACTGTA-----GGGATTCTTAGTAAGTCCTTACTTACTTAATGTAGCATCTGCATTAAGATTGTTACCAACTACAAGGGTACCATGTATACTCAGCTAGGATATTTACCA-------GAAAAAACTGGGAGGAT--CAACCTTAT s bosTau2.chr2 48820395 870 + 86543008 TTGTTCTTTAGTTTGTCAAAATGAAACATCTAGATCCACATCAAGTAATCCACGTATGGACTGGGTTTGATGGGACTATAAACTCTAATCA-------------CAAATCATTCTCACC---AGAGCAgttgcctcat----------tcactaagaaagtcatctataaaaccatatt--tttgttctgctttataagatcaactgctaacaactgaatcatatcccattctgtatcatgaaattggtttattgaatttattcaagatttt-gtatttattcttttaaattctgcttcattattttcCAAAGAAACTATCAGATTGTCCTCAACGATAAAATGCCTATGGAACCTGATTAAGGATTTGCGGTAAGAAATGTGACAAGTTTAAAGCATTCTTAGGGCTCTTCTGCCATCTTGTGAATATGCAAACTCTCCATGGCTTAACATATAG-GATGCTATAATAGCCTGTCATTCAGGGCAGAAGCATCTGATTAAATAAGGATGAGGGAAAGCAAAGGAAAAAAAT-CACTTTAAT-----------------------TCTTCAACTGTTCTCTTGTCAAGCATAGGATTAGGTAAATGATTTATCACTTTTTATTGACACCCAATCCTAAGAGGAAGATACATACAGATCTGTTCTCTTTGTACCCTACCATACTGGATTTAAAATCTGGGCGCTTAGGCTTGCGTCTTTTTCCCAGCATTTGCTAGCCATGTGTTATAAGCAAGTTCCTTGAATCTTCATTTTAAAGTGGAGAGCAAATGAGACTAAACCTTACAAAGAGAAGTCTCATTAAGTGCT-----------------ATTTGTATTAAGATTATTACTAACTACAGGACAGCACTATCTACTGCGCTAGAATATTTTCTATTAATGGGTAGGAATGGGGAAAACACCAACCTTCT a score=13872 s mm7.chrY_random 4760682 476 + 30114534 ATCTGTAAGACATAAAATGTATTTATCAATGATTCAGAACTTAGACTGCACGATTCCCTTTCTGTGATACCTTT--ACTTTTTGGCCAATGAGTTCATTACCATTTTT-ACACTCTACACTGCTTGATCAGATCT-------CTAAGAGAT--AATCCAGAGATTATCTGCAATTATTCCTGCAATATTCAATTCACACACAG-TGTTTTGTTTTATGTCTCTGG-GATGGTGCCTTCCAGGTCATGGAAGTGCAGGGATGATTCACTGCTGAGATCCATCA-CAGGTCGCCCTGACTCCAGAGTGGATTTGTGTACTACAACACTAGTCCATAGACTGACAGGAGAGAAAGTGCTCCTAACAGGCCTTGGCCATAAATTGTTTTAGTCCAAGTGAGAAGGAAGAATGATTTGAGAATGAATAGGTGGGAAGGAAACTCCATAGACCTTTTGATTCTTTCTTGAATTACATACACATGAGGGCAGGGCACC s bosTau2.chr2 48821486 481 + 86543008 cactccagtatATAAAGTACATCTCCATATGAATCAGAACCTAGGAAGCTTTACTTTCTTTTTTGTATATCTTTTAAGTTTTTGTTCACTT-TTCCATCAACATTTCTCACCTCCTACAACCTTTAATAAGATCTTTTGAGACTGAAAAATCAAATCTAAACAGTGCTTGC-------CTTGGAATTTTTACTTCTTTCAAAACTACTTTGCTTTTGTGCTCTGGTAAAGGCGTGCTACAGTGCAGAGCAGCACATGGATGATCCACTGCTGTAATCTATCAGCAGGGCTCCCTGGCTCCAAGATGGATTGTTGTATTACATCATCAGCCCAGAGGCTGACAGGAAAGAAAGTGCTCCAAACAGACTTCTTTCATAAATTGTTTTAGTTCTAATGA-AAGAAAAAATGATTCGAAAGGGTATAGATGAGTAGGAAAACTTACTATACCTTCAGCTCTGTATTGAATTATATGTACATGAGAGCA-GCCACC a score=7217 s mm7.chrY_random 4761323 342 + 30114534 TGTGGACATTTGCTTTCCTAGCACAAGTGCTTAATTAACCACCTGCAA-----TGTATCCTGTTTGGGTAGCAGAATCATCACTGAACTAAAATATAAACATTTTCAAATTCGTCTAAGTAATACATGACATGAAACTTTGCAACTCTATCAAGAGAAACTAGACAAGAGTCTTTTCAGCTACACTTTAATCTGATGTCCAGTCGAATTTTAGTACATTTGATGAAAGTATATGTAAGATAAAAATAATGACTGAACCTTTAAGTCCAGTTCTCATTTCTTT------AAACATTC-TTAAAAATGTACAGGAGTATCACGTTTCAGAGAGTGATGAGTCAGTCAGGTGGTTTT s bosTau2.chr2 48822362 331 + 86543008 TGTATACTGTTGCTCTATTAACCCAAATGTTTAATTCACAACTTTCAGCATTCTGTATCCTTACCAGGTAACAGATTTATCACTGAACTTAAATATACCTGTTTT-ACATTTATACATGAAAAATGTGAAACAAAAATTTGCATTCTTTTTAAGGAAAAGAAGTCATGAGCCAT----GCTATCTGTGTACTTGATATTTAGTAGGGTTTTCATAAGTTTGTTGAAAGAATTGGTA----------GACTGCTATATAATTAAATC----TCTCCTTTCTTTTTCTAAAGAAATTAGTTTGAAATATATAGTAACATCACATATTTTAGAAT----AGTGAGTCAAATGTTTTT a score=14067 s mm7.chrY_random 4761689 1076 + 30114534 TGAAACTAACAGTTTA--------ATTGAATTGTATGTAAAGCATAGGCTTAGATAGATTGAAATAGGTGTTTTAATTTGCTGAATTCCATCTGGTTTATGTTCAAATTAAATGGTATAAT-AATAAAGTGAGTTTTAGGAGAGAGCCTGTTACTTCTCTTGTCCCAGTTTTGCATCCTATGCATCAATTTCCCATGACAGGCTCTGCTTGTT-AAAATAAATAGTGGCACATTTTATGGCACTGGCAAGAGAAAGACTG-TCTTGAACATG-----------------------------------------------AGCCTACTA----------------------------------------ATTTGCTTGACAT----------------------------------TGTCTAATAACTAATTGTGTGCCTT----AAATGTCCTCATGGCTGAAAATTTCAATGTTAAAACCTTTAATTCCCTTCTGACACTACTAATAACCTTGGGTAAAATGAGTTCACAATCATTTGTTTCCAAGCTCTCAAAATGCCAGCACTATAAATCATACCAAATTTGGGATCCAAATGTGCAATATCCCATCACACCCAAAAAGGACCATTTCTATTTCCTCAAATGACTTCTCCAATAG-CCTTGAACCCTCTCCTCAGTCCAGTCTCTGATC--TCAGTTAGAATTCCAGGAGAGCAAGA-----ATATCCTGGACTTGTCAGTTTTATCAGCCCAGGCCATGCAAT---GACTTTATTACTGTTTTCCAAAATATATGTTGATAT---------------------------ATAATCT-TTATTTATTTACCTGTGAAATTACGGGTTCTGATATAATCCTTAATATAGACTTTAAATT-AGAGCTCTGAGACTTTGAATAATACAGGTTTTGTCCATTGAAAAAATTCCA------TGGAATTTTCTACTGACATTT----TATCCACTGTGTAATTTGGAGGCATGGATATAGCACTAAAACTTACCCATAAATTTCTATTTCTAGAATCTCATGATACTTATTAACCCTTAAAGCTGACATGTGGTAGAGGAATTGGGAAGTTTTAAAGAATTTCAGTAGCAAATTATTAAAATAAAATTCTTTTGTGAAA-GCTATAGGACATTTTCCCAAACAACAAACAACAACAACAACAATCAGACTCAGAGCAAAATCAAAGACTTCCATAAGAGAACACTATGGTTTGAGCTC--TCCATGAT s bosTau2.chr2 48822734 1230 + 86543008 taaaattaGGTGTCTATTATCATCAGAGAGTTGTATGAAAAACATAAATTTTGCAAGATTT-AATGTGTATTTTAATTTGCCTACTCTGTTGTTTTTTATCCT-AAATTAAATAGCATCATGAACAAAATTAGTTTGAGGACAAAGTCTGTTATATCGATTATCCTGAATATGCTCCCTCTGCATCATTTTTCAATTGTAGAATTTGCCCATTGAAAATAAATAGCTGCACA--TTATGCTATGATCAAAGAGAACTCTGATCTAGAATGTGCTGTGTGTgctcattcatgtatgactctttgcaaccccatggactatagccctccaggctcttctgtccatggaaagttacatgcaagaatactggagtgggttgtcatAATATGTGGTTGTAAACTAGTTTCTACCCTTTTCTATTTAATAACTCATTTAGTGTTTTTTTAAGAGATCTTTCATGTGGaaaaattaaatattaaagtatttaatttCCTTCTAAGGCCACTAATAAAATAGGCTGAAATGAATTCATAAGCATT--TTTCAGAACTCTTATAATGCCAGCACCTCAAATCATATTTTACTTTATTTTGAATTTTCAGGTATTACATTATTCCCAAATTTGAAACATTTAGTTACATCAATAGACTTCTTTCATAGTCCCAGGACTCTCCTTGCCACCAATTTTCTCACCTTTCACTCCAAGTTTTGTGGCCTTGAGAAGCTCACATTCCG--CATGTCAGGGTCTCCAGCTTGGGTGACAAGGTTTCAATTCTGTGATTCTTCTCCCAAATGTTTATTTCTATGCCCAATGAATCATTCTGGTCAATATAATAATGTCTTCCTAATTTACTTGCTGAACCCCACATTTTAATGCAATCTTT-ATATAGGGTTTATATTCAGATATTTGGATCTTTCGATGCCAAGAGTTTTCCC-----AAGGCTTTCTATCGCTTTGGAATCT----CTAATCTTTAAAATATCCACTCACTATTTAAGTGGCATGGATATTGCACAGAAGATTATCATTAAAATTCCATTCCCAGAATCCTGTGGCATCTATTAACCTCTTCACCTCTCATGTGCAGTAGGCATTAGT-ATTTATAAAGTGCCTCAGTATTTAATTATT----TTAGATTA-TTtgtgaggtatcacaatcttttttcaccattttcag-----agtgaggaaaatgagactcggag---gttaaaagacttgcccaa---agtaatataatcctagtaCAGTCCATGCT a score=568 s mm7.chrY_random 4762810 58 + 30114534 ATGCTAGACATGGG---------------------GTTTAATCTATTTTTTTTTGCCCCACACATAGGAGGAAAATAAT s bosTau2.chr2 48824004 76 + 86543008 ATGCTTGCCATTGGCAAAATTGCCAATAAGAAAATCTTTGAAATATTTCTCTT---CTCCCACCTGTGGTGAAAATATT a score=9905 s mm7.chrY_random 4763010 1046 + 30114534 TTTGTACTTAATATTCATGTATTATTTCATTTTCAAACTATGTGTTTGGTTAGTAGAATCAAATATTTTTAATATGGTGCTTTTCTAAACTATTTGGAAGACAAGTTAAGATATTAGACTCTATAATTATATCATTTTTTAGCCCAAATT----------------CTCATGGGA------TGGAACTTTATTAAATTCAGTCATACAAATTGTAGGAAAAAAAAGTGTTCATATAAAAATCTCCCTAATCCTGTGGCTTATACCAACATTTGGGATTTTTAAATAAATATCCT-----CAGTGTTTAAACTT-----------------------------------TATGTTACTAATGATTTCTCA------------------GTACTGCTA-------CTAATGATTC--ACTCTATTTTT------------ACATAGGTATAAT---------------AAA---------------ATAACTTGGC---------AGTGACATTAAAACCACTCCTCTAGGATGTGTAGGGACGACAGCATT-TGTGTTTGTAGAGAGCAGTGTTCATGCAGGTGGGATCA------------TCCCTTCTCCATGGCATTTGTTTCCTTCTGGGAAGGG-----GTGACCACAGATGCTCCCTCTG--------TCCTCTTCTTCCAGAAAGTTTACAAA-TGTACTGTGTGTTCCAGTGAAGAACCCTGAAGGA----TCAGTAGCAACTGTTGGATAGCGACTGTTATCC-------ACAAAGC--AGTCCAGTCAAATCGTTCACGTTGGACCTAAAAAAACTAAGAGCACACATT-----TTCAAGTGTGTGCATGCAGCCGTAGAGACACTAATGTTCAAGCAT-----------------TTTAGGCATGGTCACTATACATCACTTATGAACAGAAAAAAAAAAGATACTAGGAATGTGAATGCTTTGCTCTAAAAGGAAGGACAGACCA------------------TAAGTC-TGCCTGAGCTCTAATGTG-AGTAG-GGCTTGCATGGAACAC----AACAATGTGTT---TGGTCAGGCTCAAAGTAGGCA--TTTCATACTATGGTAAGT--TAAACATTGATGATGCATTAAT-CTATTGTAAAATGTAGTTATCGTTTATAAGATGGAAATATACTGATACATGTAAATTACATTTCTGTTTATTTTCTGTATTCAAAACTTGGCAAATACTTCAGAAATTTTAGACATGTATGCAGTCTCCTTCAGC s bosTau2.chr2 48824173 1234 + 86543008 TTTGTACTTAACA--CATCCATGAGTTCTGTTTTGGGTTCAGATTTCTGGATGTAAAATCAGTTTTGTTGACTATTGTATTTTACTGTGTAATTTAGAAGTCATGTGGGGAAATAGGAAAATGCAACTGTAT-ATTTTTAAGTGGAAAATACCCTTCACCTTTTACCTTACAGTACCCAAGTAAAGCTTCATTAAATATATTTATATCAATTGAAT--ATAAGAAGCAGTCAAATAAGAATTTCCTTGAATCTGTTACCTACAGAAACATTCAGAATTTTTAGAATAAAATTCTTCATACAATATTTAAAACTGTCTTAACTATAGTTGTACACAAATATAAATAAGATAAATCACTAATAGCATTTTAAAAGTTCTGGCCATCCAGggactgccatggtggtccagtggttaagactctgtgcttccaatgcaaggggcacaggttcaatccctgactggggaacaaagatcccacatgccatacagcatggccaaaatcaaaataaaaTTCAAATCGT--------GATGTAT-GGAAAAACAGAATTCTGCATTTATACTGAGAAGCTTTTCTGCAGGC--CATCAGCTGTTAAAAGTCCCTTTCTCTAATGAGCAGACTGCCTCCTTGGGAAGGAGAAAGCCATTACAGCTTAGAATTCTGaatttttttttttttttttaaGGAATGTTGTAAATTGTTTTGTCTGCTCAAGTGCAGAATAGTGAAAGAATGGTGAATGATGACTTTGTGATATAGACTGCTATCCAAAGGGAACAGAACAGAGGCCAGGTACATCATTTTAATTGGATCT--AAAAATCAAAAGCATACACTTGAAATGCAAGT-TGTGTGTGCAATCATACAGACACTCATGCACACTCACAGTTAATATTGATATCATTTGGCCATAATTTATATGCATAACATAGGGACAG----GAAAGAGTTCCTAGTGATGTGTATGACTTA-TCTCAACTGAAAGATGACTCAGGTTTGATGACTCAAAACTAATTCATGCATGCTTTTAACTGTTCAGTGGTAAATTTTATGGAAAACATCAAATAAAGAGTTACCTAGTCAGGCCTGAA-TAGGAGATTTTTATAATCTGACAAGCTATAAATATTTAATTTGAAATGATGCTATTGTACAACATAGAAATAATTTAGAA-----AAATATACTGA-----------------TTTAACTGTGCACTAGACTGAACATTTGAAAAGTATTTCAGAATTTGGGGCTATGTAGACACTCTACTTCAAC a score=3368 s mm7.chrY_random 4765173 53 + 30114534 ATGGAGGGGCACATGGATATGTGTGTGCTCATGTGTGCACACACACACACACA s bosTau2.scaffold439 374580 53 + 479824 ATAGTGTGGCACATGTGCATGCTTGTGCACATGTGTACACACACACACACACA a score=6210 s mm7.chrY_random 4765289 419 + 30114534 TTTTTCCCTGTGCTTTATTTTCCCAATTTTTTATATTTCAAATATACTTTTCCAATCTAGGAGATCTACTTCAGAAAGTAAGAAAT---TAGAGTGTACAATTTTTATATTTATTGAAGAGCATTA----GTATTCTTATAAGAGTAGTGATTGCTCTGATCTGTAATGATTTCTGCTTAAGGTCTTTGTGCATAAGTTTCATTACTGTTCATGTTTAAATATATATC--ATTTCACGAATATGAATAGATAAT----TATAAGTCAATATCTTTGTCATGGAAAAATCTTAATATGCAATATTAAGAATCTATATATAAT-TGATTCTATTCTGTTTTATAGTGAGAGGATAATAATTTGATGCCAAACTAAAATCTGCTTCTTGGTAAATAGGTATCAATACACAGAAAATTGTAAGATTTTATATTCAAT s bosTau2.chr2 48825513 406 + 86543008 TTCTCCCCAGTTACATATTTTAT-AGCTTTTGATTTTATAAAACTACTTTAAAAAT-------AGCTAACTAGAATACTAAACAACAAGTAGAGTACTAAATTTTAAAATCTACTGAGAAACATTCATCTGTATTATGATTAGA--AGGAGTGGCCATACTTGGTGATAAATTCTCTTTGATTCCTTCATTCATAAGCTCCATTACTGGT----TTTAGAGATATATCATATGTGATAACTATGAAAAAATAACTAAGTACAAGGCACTGTCTTCAGCAAGGGAGA--------ACACACTACTGAAACT---TATGGAACACAATTATTTTCAGTTTTATAGATAAGGAATAATTATTTGGATACCAAGTAAGAAGTGGTTCATAT--ATTAAGTCTAAACATTTTTTAAAATGCAAGATTTTTGATTTAAT a score=54247 s mm7.chrY_random 4766942 1718 + 30114534 TTTATAAAATAAACAATGC----CTTTTTTTGTATTATCTGTTTAAAATGCTATCTCTGTACCTGTAGCAATGAGTGGAAGGACAGAGGCCACCCCCTAGGTATTTCAGAAAAAAACCTGTTTTTCTCCTGATTTACTCAGATACCTGACCCCAGACCGTATGCTTTCTTTTTCC-TTTGCATTATAAATATAATGTTCTCTCTTCTCCACACAGTGTGT-TAGTCAGCCTAGGTGTTATTCAATAGAGCCATTCCAACATCTACTGTGATTGATTTATTTAGAAATACCTCCAGTCCAAA-TGAGAATGAAAATAAATGGAACAGATGAAA-TGTCCTGCTGCAAG--AGAGCTACAAATTGAGGTTAAGAGTAATTGCTTTGGCATAATTGTTATTTGTAATCTTAGAACAAATGCAAATCCCCCATTAGGAGCAGTAAATCCAGTGCTTAAAGTAGAAGATACGTATTTC-----------ATGGGAAGCCTCAGCAGAATGCTAAGTTCAAGAACA-TAACATTTTCTCAGGTCTTTCATTCAGACGAATAGCTT-TAGGATCTGGAGGACACGGGCGG--ACCTTAGAAAAAATGATTACTGAAACATGATTTATGAGCTTTCTGTGTTTTCTTTATCCAAAACACTTTATGAGGACTTTGTCTTTGTACAACCTTAAAAATGTGCTTTATTTTATAAACACTCTGCATTCTGACTGTGTCTGGCTTCCAGAAAGTATAATGAGTTCTTCATGGTTATTCATTTCCACAC--TTATCACTGGAGGAGATAATAAGGAGAAGTTATTATC-----TTTAAAGTGATGAGAGAAAGCATAC-------CTCTGTGGCATTCCCAAGGTCATGACTGCATTGTGTGGTAGACAT-GGGAAGGGTGCCAAGGATATGGAATTTGA-CTCAATGTAACTAACATGTCCTCATTTCTCAGATTATTTTTTAAGG-CAGAAGGTTGTTATTGCCAGCAGGGATCGTGATAATCATAGTTATAAACCAAATGTTGTCATTTGGTTCTGTAAATATCCATCAA-TGTAGGGCCAAGATTATTACATAAGAAACACCACCTTCACTTTAAAATGAGTTGTTTGC---------------TATTTTGAACTAGCAAGTTAAAGCCGAGTTAAGATAAAATTGTGTTCTTGGAGACATTGCAAGGTAGCTTGTTGTATTCCTTACGTAGGAGGCACAGCAGAATTCCAAGGTCCATGTGTACTTTTAAGAATATTTATGAACACGAGAATTAGCCAACAA----TGAGAAGATAGTTGTAGTTCACTGACTTGGACAAAGTGGTGTGGGCACAGTGGGAG---AAATGTGCTGTCATGTGGCATTGCAGCAGACCAATGTAAAACCTCTGTGCACAGGCAGGGGACGGT------GTGGCTGAGGTCGGTCACCAGGCAAAGTTCTTTAGTTTCTGATGCTGAAATTGGTAACCTTTTAATATTGTTTTTGAGATATTTGCAA-AAGAAATTTGAGGATGTTACAAATATA-CCTAAACTTGAATTCTTGGttttataaatatttaacaattaatattttCCCTAC--------ATAAAAACAACAATGCTTAAGCTGTGGCAAAACCAAGAGTGAAATAAACTCTGTGAGACAGATGAGCATTTGTGCTTAGGGATGAGGAAGTTACtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtAATAGAGAGGGGAGATGTGCATTTtgcatgcatctggaagc s bosTau2.chr2 48826990 1663 + 86543008 TTTATAAAGTAGGCAGTGTATTATTTATTTTATATTTTCCACTTAAAATGCTATCTCTGTATTCACAAGAATAAGCAGAAAGA-AGAGCAAAGTATTAAGCTAATCTAGGGGAAAAGTT--TTTTCCCTTAATCTATTCAGATAACTGACCC-ACAAAGCATGCCTTCTTTTTTTACTTGATTTATAGTTATAATTTCCTCCATTCTCCACACAGCGTGTGTAGTCAGTCTAGGTGTTATTCAATAGACCTGTTCCAACATCTACTGTGATTGATTTATTTAGAAATACCTCCAGGCCAAAATGAGAATGAAAATAAATGGAACAGATGAAAGTGCCCTGCTGCAAGCAAGAGCTACAAATTGAGGTTAAGAGTAATTGCTTTGGCATAATTGTTATTTGTAATCTTAGAACAAATGCAAATCTCCTATTAGGAGCAGTAAATCCGGTGCTTAAAGAAGAAGATGAGTATTTCACTGCCTGGCAATGGGAAGCCATAGCTGAATGCTAACTGCAGTGACATTAAAATTTTGTCAGGTCCTTCACTTGAACTAATAATGCATGGGATACAGTGGATACAGGAGTTCACCTCAG--AAAATGAGTATCGAGGTATGATTTATTCCCTTTATGTATTTTTTTTTTCCAAAACACGTTATAAAAACTTTGTGTTTGCAAACTCTT---CATGTGCTCTTTCTCAAAAATACTTTATACTTACACTGAGTCTGGCTTTCGTAAAGCCTGATgtgctttttatgattatgagtctttacaccttcatcactgaagtagatgataagatgaagttattatctttattttaaagagatcagaatagaaacattgagaggttcagtgactttcccaaggttataaaatcat--tctgataaatctgggGAAAAGCATAAAGTACATGTAATTCAAGCTCATTTCATCTACCATATCATTCTTCTTCAGATCATTTTTTAAAGTCGGTAGGTAATTATTAGTAGT-GAAATTATGATAATCACAGTGATAAACTAAAGGTTGTCGTTAGATTCCTCAAATATTCAACAACTGCAGGGCCAGGATTATGATATAAGAAAGGCTGTATTTATTTTTAAATGAATTGCTTGCCTCACAGGAGAATAGTATTTTAAACTATTCAATTAAAGCTTAGATAGGATTAAATTGAGTTCTTGGCTACATAATAGG-----------------TTATGAAGAATA---AGTGAGATTTCAAGGT-CATGTGTACCTACAAGATTATTTAGAAACA-AAGAAGTTGCAGAAAAGACTTGAGTAGATAAAACCGATTGTGTGTATTTGAGAAAGTA--ATGAGTACAGTGGAAGAGAAAATATATTGTAGTG-----TTGCAATTGAGTAATGAAAAACATCAGTATTCAGACAGTTTCTGGTATATACATAGTCAGGGTCAAATGTCAAGTGGATTTTTTTAGTCTCCCTAACTGA---TCACACCATCTTAATACTATTTGCTAGATGTTGGCAAGAAGAAAGGTTAGTGTGATATAATTGTATTTTAAACTTAAAACACTTACTTTGTTGATTTTTAAA---TCATGCCTTGTCAACCCTTGAGAGGAAGGAGGGCAATGCAGAGTCCATGGCAAAGCC-AGAGT-AGTTACACTGCTTTAGGCAAATGG--------------------------------------------------------------------------GTGTGTTTCAACTCTAGAGAAATGGAACATG-------------TCTGGGAGT a score=9885 s mm7.chrY_random 4768808 307 + 30114534 CCCAAGGTCCTATTCTGGTGAATTCCTTTTGCCTGGGACATCTTCCT----ATAGAACC-ACATCCAGTAGTAATGGTTGGTCTCTGC---------------TCAGTGGTACTGTGGATTAAGATGAACGGCCTTTCTGAAACAGCGACAGAGTAAGAGCAGTATAATCCCAAATTGATGCAGTGAGACCATTTACTTTTCTTT-----AATAAAGGAGCAGTCAAG---TGTTTACGCTTACTGCTGCCATGTCCATATAAAAATAAT-TGTCTGTTCTTTTTAGTTTAGTCAGAGGACAGAGAAGTCACAGAAGCATTACAAAGGACAGAaaa s bosTau2.chr2 48828760 331 + 86543008 CACAAAGCCACCCTCTGACACCTTCTTTTAACATATGACCTCCTCCCTCCAATAGAACCTACA-----TAGGAAAGCTTTTGATCTGCCTTCACAGTTAATCATTTATGATGCCCTGGATGGGGAGGGACATTTTTGCCAAAACAGTGATAGAATTATAGCAATATAATCCCAAGCTGATTCAGTGAGACCATCTATTTTTCTTTAATAAAATAAAAGAGCTGTCAAGCACTATTTATACCCCCTGCTGCCATTTCTATATGGAAAGAATGCAGCCCCTTCTTTCAATCTAGTAAGAAGGCAAAAAAGTCACAGAAGAGTTAGAGACGAAAGAAAA a score=7274 s mm7.chrY_random 4769245 487 + 30114534 CTTAAACACAGTGAAAAACTAAAAGTGTCCATTAGCCTATGTTACAGGGATGAGCG-AAAGCATCCAGGACAGTGATGTCTCATGAAGTAGTCCCTTCCCTTACAGAAGAAAGC----TGTGCTGTGGGATGTAAACGAACTCTGTGTCTTCAGCA--TTTTCCTTCTCGGTTCTGTAGAAGATAGTATGTTGTCCAATTTACTGTGGGAAGC--ATCTTGCTGAGGG-----ATTTGACTAATGAAGAAAATGTAAACATGTGC-ACTTCTTTTCTGAGTTCTTCACTGAGGAATATCTCATAATGGCATCAAAAGGCAATGTGG-ACTC---CAGAAGTATGTTGCAGGTTACTGATGACTCTAATGGATGGACAACTGT-CTTGTCAATTTCTTCCTACTGCTCATTTCCAGT-TGCTACTGCCTCATTTATATGGAGCAGATCCAGTGAACAACTTTTTTAT--TTTTATTTTCAACCGACTCTTAAAAGTAAAAATTCCCAACTT s bosTau2.chr2 48829091 483 + 86543008 ATTAAACCCAATGCAGAAGTGAGAGAGCCTTTTAGCATGCATTCGGGAGATGAGAGTAAAATGTCAAGGACACCAGTATCACGGGAA-----TCGTTCCCTCCAAAAAGAAACCACCAGTCACTGAGGAAGG---------TTTGCAGCTTTATCACCTTTTCTTTCTC-TTCTTGTAGTCTACAATGTGTTGTCCAATTT-TTGTGCAAATCTGACCTAGCTGAATGGTTGCATTTAGCTAACAAAGAAAATT--AACAAGTGCAAATTTATTTTTGAACAGTTTGTAGAGAAATGTCATGCAATTATGGCCAAAACAGATGTGGCATTCATTCAGAAATATTTTACAGGATACAAATAGCTTTAATGAAGGGTCAAAGGTGCTAATCTTTACCCTCTTAAAGCTTAGTATTAATCTACTAATGATTTATACATATAAAGCCAATGTGGGAAAATCCTCACTTATAATTTTATTCCTA---------TGAAGATGGTAAATCTCACCTT a score=-409 s mm7.chrY_random 4770118 241 + 30114534 CCATGTCTCCTGTGGAACAAGAGGAAATTCATGCTCCTAGTCTGCATCAGTCCTGTGTTTAGTCTCTGTGATAGGAAA-----GACATCTTTATTTGGACTC-------------atagtccatc--ttgaagggggcaccatgagagtagatgcatgaggcagctggctactttgtatctgaagtcagggagcagaataatatgaatgggaggctctgctaccgtttagttttgtatgtatttcagggccacagtctgca s bosTau2.chr2 48829793 208 + 86543008 CCTTGGGAACTGTGGAAAAAGAATA----------------------------TGTGTTTGCTACTTAAAAAAAAAAGAAACCGAGATATTTAAGTGGGTTTTGAAAGATCAGCAAGAGTCTAACAAGTGATTGGAGTGCAGAGAAAACAGATTTA-----CATTTGATT--TATTTCTTTGCAGACAAGGAGCAGGATTTCACTAA------GTTTTCCT--------GTTTTCCATGTG----AGAGACATGGTTTATA a score=17119 s mm7.chrY_random 4770592 1351 + 30114534 CATACTAATAAGCCTGGC---TTGTTAAATCTTGAAGGC---TTGAAGGCTT------------GAAGCACTGTCTAAGGCTACCCATCTCCAATAGAGCTAAGATCCTCTTCTTCAGAGCCATACTACCCATGCCTCT---CTTTATTGCAGACTATCCA--------TGGTTTA-------------TTTTCAATATCATCCTTTAGGCT--------CCCAGGGACAAAGACAAGAAA-------------------ACTCAAAAGACCTGAAAGAGAGTCTGCTTTGTAGAAGGTCC-------------------TGGCTGAGAAGA--GACAATAACAGCATTT-GGAGGAATGTCTCTGGACACATTTTGAATTTTCAGCCAAACTTTCACTGGCCATACAGTTGGTATGGGTGACTGTATGTGTGTTGTATatcc--tggactaatgctctctc---cctttaccgttcatatccttaactcacagagc-cagcaatcttgtcttcaaatcttttcttcaattctattcccgcctcttttt--------aatctgcactgtcattgccttaatataggaaggacttcatttttcacctggacaatattgcaataacctcttaactggtctccGAGTTGCAATAAATGACTATTAAATTGAAATGGTTGAATTGCTTAAAGTAACATCATTTATTTGGAAAATAAATCAACCATCAAGTACCTGCGGCCTGGTTACATGCTCTTAACTTTGTTATGGGTTGCAGGTTAGTCAG-GGAAACCACACTCAGGGACTCTCAAAACACCCACAAGATACAAAAGTCTTTCTTTCTAAGTAATTAATTTGTTAATTTATTAAtgaaacaaggtctcactttgtagttctggttatcctggaactttctttatgcatcagcctgggcttgagttcacagagatcctcctacccctgcctctgagggctgggattaaaCGTAAGATGCTCAGCATTTCTTCACGTTCATGGTGTATATGAGT--CTTGGGAACATTACATGA--ACAGAATCAGTA-GTTGAGAGTGAGATCAGATATTCTTCATTTCCTATAG--TCTCAGATAATGTAGGTACCACGGCTTTGTGCTAAAACTTAGATGTTTATTACAATATGCTATAAATTTTATGGTGTGTCTCACAGTG-----AAGAAAAGATTATAAGA-CAGGGTGGTTTCATAGAAGTAGTAGAGGGTAGGATGAG-AAGACCCTGGGTCCAGAGAGAAGTGTGGGATAAGAGGCT---TGTCTGTGCTGTATTACA--------GTTAAAACTCACCCCACTTCCCATTTCCTCTCCAATGCCTTTCTGGATGCCTATTGGACAGGTATGACCAGACAGTCTCGACCTGCTCTTAGATCCTGCCTCTGTACCGTTTATTCTTTAGTGTGTGTTTAGAAAAATTATGCCAAGAAAAAAATGTGCTTTTTCCAT s bosTau2.chr2 48830234 1294 + 86543008 TATGCACATATAcctggctatttattaggtcttgagagctctttgcgggagttccctcatctgagaagcattttctgaaatcatccattccaaatctagattcaatatttctccttagggccac-cagcccatggctgttacctttat--catatcacttacttcattctgtttcagttgccagtttgtttttctgtgtcctctgttaggctgtaaattccttgagggcaaagaccaaataatattgaataagcttttttatctatagcatctgggaaaaaacctaccctctggaaggtaccaactcaataaatatttgttgGCTGGGAAAAAGAAAAGTAGAAAAATGCAGAAAGAATGACTCTGAATAAACTTGGCA-TCTCATCTGATCTTTAGTTGGCCAGAAAAT---CATAGGTGATTATA-----GTCACCTCACCCATAGGTCATGTCTTTCTCTCACCTTCACTTGTCATATCTGTAATGAGCATAACATACCAATCTTTCCTTCTAGATATTTCTT---TTCCTTTGCCTCTTCTTCTTCTttttcaaatctctactaacattgccttaat----gccgtacatcatttttcacctggacaatattgcaataaactcttaactggtctcccagttGCAATAAATGTCTATTAAATTGAAATGGTTGAATTGCTTAAAGTCACA-CTCTTATTTTGAAAATAAATCAGCTAGAAAGTACCTGCTACCCACCAACA----ATAAGCACTATTATGTGCTTTGGGGGAGTCAGAAGAAACAGAGCATAGAAACTACCATTCTACTCCCAAACCACTA----------------------------------------------------------------------------------------------CAATGTGGGCCTG--------GAGAACC--------------ATGAGAA-----------------------AGtgcttcttaaagtgcaccatgcatacaaatcacctggggatcctactgaaatacagattcagtaggtcttggttgacacctgagattttggatttctgataagttcctgggtgatgctggtgtcactggcctatgcaccattct-----ttcagtagAA-AAACATTAAAACCCATTAAGTGACTTAGAGTGGCCTTATATGAAGATTCTAAGGTCAAGGAGAGTTC--AGAGGCAGTAGGAGATAAAATGAGAAAGTCTCCAAGTTGAGATAAGAATATATGCTAAGAAAATAGAAGTTCATACCCTATTCCAAGTCAGTTGTTAAGACTTGGCTCATTTCTCCTATCCTTTCTAAAACCTTCCTGAATCACCCTC------GTATAATCACACTG-------CTGTTCTTTTTCCCAGTTCCT----TATCTGTCCTCTGAACTGCACTCAGAAAGATTGTTCTAAAATACAAATCTAATTTTGCCAC a score=155 s mm7.chrY_random 4772017 257 + 30114534 caactgcgtagtcaaaactggccttgaacttataatctactagttttaacctctgaagtgctatattacaggtatagaccactaagtctggATTACCTTTACCGACTTTTGCCATCATGTGTTCTTTACATTGTAAGTTCGACACTGCTGCCATAAGTATCTTTCTGGCTCTCCAGCCTCACTTTCTCTGAGATCC--AACACATCAGAAAGTCTTGCATACCACTTTATCATGGGCTGCCTAACAGCTTTTCATGAGC s bosTau2.chr2 48831633 203 + 86543008 AAACTGTGTTGCCAGACTTTACTTTGAGCT------------GTCTTATCCT------TGCT-TTTCACAGGC-TGCACC-CTTTGTTGGAAAGCCCTGTTCCCATTGT--CTGTCCTGTTTTTCTTGTCTTGCAAG---------GCAGAGTTAGATATCTCAATGCC---------------TCTCTTAGTTCCAGAGTACATAATATA-------ATATCACCT--TCATATGTTTTATTTCACCCCCATATGAGC a score=14617 s mm7.chrY_random 4772639 790 + 30114534 acaaacaaaAAGCTCATGAC----------AACAAGGCCAGAAC-----GTGATAA---TTCAGTA-------------------------AAACCAGAGGAGA--------GGAGAGAAGAGAAGAGCT------CACAGAAATAGAACTAGGAGGG-AAGCATTCACTCATTCCCTACTAAGTTCTGTTTCTCTAAGGATGCAATGCCATGTGTACACACAGTGTTTAAAACTCAAACCATGCTAGAAGTACCTACGCAATTACAGCTCATTT---GAAATT-GCACAAAAGGCAGAAATGTGTAGGAATAACCCTGGGCAAG--CACCTAACAACTTGCCTTGTTCCTGGAAGGTGTGTCTAAGATGT----------AGAAATGAAAGTATATATATTGACAACAGCAAATGTTTCTCCTGCTTATAGATAGCATGGCTGTGATTCTAGATGGAATGCCTGA---ATTAATTTTTAGTTATACTTGAGGCTCAAGTCTGAGTGCAGGAAAGCAAATCAAAGATGATTTAGAATATGAAC--AGTATGCCTTATGAC----CCAAGGAAAAACCATGCAAATGAATATAGTAGTAAACAAAAATAGTATTGTTAGTA----TTTTGGAATCTATCACCCAAAAGAAACAG--AGAAATCAAATGCATTGAGTAAAATTATAAGCAAGCAGATGAAATTCTTAGAAGGTTACCTGTCCTTT--GGTGACTAAATT---------AAATTGTTGCTACATGGAAATTTCCCataattaatataaaaataatttaGCAAAGAATAAATGA--TTAAAATTGTTCAATGTATCTCACCCCAAGTAAAAATGACTGAAGTTAAATATTAATTTAAATAGAAATATTGATGCAAT s bosTau2.chr2 48832292 866 + 86543008 ACTAAAAGATAATTTATAACAGCACTAATAAACAAAATCAGTGCCTATTGTGATGAGATTTCAGTATGCTGAAGATGTAAATGTTGGGGTGAAAAGGGAGGAGAAAAAGAAGGTAAAGGAGGGAAGTGCTAGGAAACACTACAACAGGAGCAGGAAGACAAATATGTA-TCACTTCTGCATTGTCTCTGTTCCCTTGTACATGC----CCACATATGCACATGCCATTCATAATTTAAGCTGCCCTAAAAATG-CTACCAAATTAAAGCTCATCTCCAGAAATCAGTAGAAAAGGCAGGAAAGTGTATGATTACTCCTTTTCCAGGTCACTTAAT-ATTTGCCTAAGTCCTGAAAGTTATGTCTCAGATATTGGATTGAACTGAACTGAAAGGTCTCAGGATGAGAACAATCAATGTTCCTCTTATTTACAGAAGACATGACTAGGCTTATGGACAACATATGTGAATTATTATTTTTCAGTTGAAAGTGAAGTTCAACCTTGAATGTCAGGGAACAATTCAAAGATGGTTCCAGATAAAAATAAAGCATACCTCATACCAAGTCCTGAGAAAAGCCACATAAATGATCACATTATTAAGAGAGAA-AATATATTTAGCATCTTTTCTGGA--CCACCACTCAATAGAAAAATGCAAAATCCAAAAATATTAGACATAATGATAAGCAATCAGACCGA----TGGAAAGATTACTTGCCATTTACAATCAATAAATTATATTATCAAAATTATTCTTACTCAGAACTT--ACATCATTAAT-----AGGAACCTGACAATGAGTAAAAGAACTTAAAAGTATTCAGTCTATCTCACCCCAAACAAAAAGCACTAAACCAAA-----AATTAAAGTAGCAAAATCAATAGAAC a score=5323 s mm7.chrY_random 4773429 208 + 30114534 TTATTCATGTTATACTAGTGTCAAAGTAAATA-GGATTAATCCTAAAATCACTTCATATAATTCATCTATAGCAATTAAATACATAGAATTAAATTC---CTGCAAGATTACAATG----CTTTTTATGTTCTTTGGCTTTTTCATA----TTGTTTTCACTACTTCAGAGTGATTGCAAGATTGCATATGAAATGACAGGTAATATTAAACAGATATGA s bosTau2.chr2 48833384 218 + 86543008 TTAT--ATGGTAAAGTATTGTCACATTACATAAGGATTAACCTCAAGGTTACTTCATATTATTCTTCTATAGCAATTAAATATATGTAATTTTTCCCCATCCCCAAAATTATAACATTACTTTTCTATATCATCCTTCATTTTAATCATTTTTATCCCCAGTACTTTAGAGTGCTTAGCAGGTTGTAAGTTCAATATGGATTGAAGTTGAACAAAAATGA a score=9731 s mm7.chrY_random 4779537 458 + 30114534 catttattcaaaAGAATAAAGGT-------ATGAAAAAGAAAATGAAATCA-------ACTAATA-------AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCACAGTTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCAGCCATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCACCCCACACCCACACACACATTTCTACTTGATTA--ACCATATTGGCATTACTTATTTTCATGGAATCATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGAGAAATGTTGATGTATAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAAAACAGAATTCAACAGGATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGCAGAAGATTTCCCATCGATTTAGTAAAATA-------TTATAAATATGATTTTAAAAGAAGGC--AACACCCTGAAAAAGTCTT--ATTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742182 473 + 45915461 CATCCAATTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC--------------------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=35853 s mm7.chrY_random 4785417 1171 + 30114534 TCTATCACTCTTT-----CCCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATTCC-------AGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCCTTC--TTCCTAAAAATCCATCTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTGCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAATGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCAACACA-GGAAAATAAACATTTTTTTCAATCCT-------ATAAGTTTACTTTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTTAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGTAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAAAATTGGCTAGAACTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCAAACCAGGGCGCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAAGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCAACAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCAAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGA----TGTCATGCTCAGACTCTTCAG---AGGTATTGTCTTCTAC s bosTau2.chrX 20326712 1223 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATAC---GTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCTTTTTCTTCCTCATACT-TGCAGACAAGGTGTGGTCATCAAC a score=9976 s mm7.chrY_random 4788417 491 + 30114534 TTTCTGACTTGACAACATCCATGGTGGTTATTTTTCATATTCCAACCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTCTTATCATAAATATTGCCAGACTCTTTGAGGCAGCACACTGGATAGCACACCAATTTTTACTTTATGAAAACCCACAGTTAGAGGAGGACTATTT--TATGCAAACAAACCTGGAATTTGACAGGGTTAAATGACATATATTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGAAAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAAATTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTT-TAAAATTTACCAGCACTTCTGATTACAAGGAATTTCAGAGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAGATGAGGTAATTTTAGTTTTGAAATATGT--GTAGACAGAATACTGGACACAGGTATGTATAAAATTTACTTACAAAT s bosTau2.chr17 25750424 451 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAG---TGTTGCCCATATAGAATGTTGGCTG----------GCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAATA-GTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAACTTGGA-CTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCAT a score=20955 s mm7.chrY_random 4803925 668 + 30114534 TACTCATGTCACTCATGTTCCATTTTCTCATGCTCCTTTTTCTTCATTGGTCTTCCTAACAGAAAAAAAATGTAGCCT------TACAACAAATCACTTTTGGAATTGTATTCATGGTGTCTGTTTCCACATTGCTTGCCAAAACAATCATTGTAGT-TTGGCTTTCATAATCACAGATCCTGGAAGAGGTTTAAGGAACCTCCTTTTATCAGGTTCAATGAAATACATCCTTCTGATATGTTCCAT-ATCAATGTATTC-TGTGGGTAATCTGGCTCTCAGTTTCTCCTCCTTTTGTTGATATTGATATTTGTTGATATTGATGATAATGA--TAATCATTTTGTGCAACAAGGGTTCAGTTACTGCATTCTACTGAATTTTGGGATACTTGACCTGCCTTGCCCTTGGAAGCTTCACTGTGGATTTCGTGGCAAAGAATTTTCCTGAAACATTTAATGAAGCCAAGTTCCTGACCTTTGTCGTGCTAGGATTCTGCAGTGTTTATGTCACCTTCCTCCATGACTCACATAGGACTAAGGGCATGGTCATGGCTGCTGTAGAGGTCTTCTCAATCTTGGCATCCAGTGCAGTGATGCTTGGATGCATCTTTACACCCAAGATCTACATCATTGAAATAAGACCAGACTTGAATTCTATCCAAGGTGTCAGATAGAAGT s bosTau2.chr7 14417433 662 + 69141744 TGTTCATCTCCCTCCTCCCGTGCTTCCTC-TGCTCCTTACTCTTTATCAGTCGTCCCCACACA--------GCCACCTCCATCCTCCAACAGACCACATTTGGAGCTGTGTTCACTGTGGCTGTGGTCACTGTTTTGGCCAAAATCGTCCCTGTGATCTTGGCATTCAAGGCCAGGAAACCAGGAAGAACCATGAGGCGATTGCTCTTAACAGGACCTGC----TATGTCTTTCCCATGTACTCCATGATCCAGGTGATCATCTGTGGAGTCTGGCTGGGAGCCTCTCCCCCTTTCCTTGAGATGGACACTCATT----CTGAGCCCAAGGAGCTCCTCATCGTGTGCAACAAGGGCTCGGTCACTGCCTTCTACTGTGTCCTGGGCTACCTGGGCTCCTTAGCCCTGGGGACCTTCTCCTTGGCTTTCCTGGCCAGGAACCTGCCTGACACCTTCAGTGAAGCCAAGTTCCTGACCTTCAGCAGGCTGGTGCTCCTCAGTGTCTGGGTCACCTTCCTCCCTATCTGCCACAGCACCAAGGGCAAGGTCATGGTGGCCGTGGAGATCATCTCCATCTTGGCCTCCAGTGCTGGGCTCCTAGGCTGCATCTTTGCCCCAAAGTACTACATTGTTCTTATAAGAACTGATAAAAACTCTTTGAAAAGTTTAAAGAATAAGT a score=3870 s mm7.chrY_random 4821086 73 + 30114534 TGCACAAGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCGGACACACACACACAA----ATACACATAAGCTTATGCACATAATC s bosTau2.chr14 47301233 77 + 50711261 TGCACATGTGTGTACATGTGCATGCCTGCATGCACACACACACACAAATTTATATACAAAAGCATACAAACATTATC a score=36160 s mm7.chrY_random 4860154 1193 + 30114534 TCTATCACTTTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATACCAGAGATTCTATCTATG-TCCTGTCTTTCTCTGCTTCTTCCTAAAAATCCATTTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATA-----TCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCATAGCCTGCGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCTACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCA--ACACAGGAAAACAA-ACATTTT----TTTTCAATCCTATAAGTTTACTTTTCTGTACTTTGTGATTTTTTACAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGGAGGTCACCGAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGAACTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCCCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGTTCGCCTGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGATGTCATGCTCAGACTCTTCAGATGTATTGTCTTCTACCTGGCTGTAGACCTGTTGTGGT s bosTau2.chrX 20326712 1216 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCC------TCCCCCTAGAAGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCTTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTT---ACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGT a score=26933 s mm7.chrY_random 4890283 731 + 30114534 GAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCGTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTACTGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACAACCCTCCTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCATTTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTATCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20327276 716 - 48857030 GAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=11935 s mm7.chrY_random 4893915 502 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGTCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAACCGTGGGAATTGTCAATGTGCAATTAATT-TAGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG---GTCGTTCTGTGCCATATAAAGAAAGGTAGAGAAGAAAAGCTGT-TTTGGAGTCACTGACATACATTTAACTGAG-GTCT---CTTTGCATAGTA s bosTau2.chr17 25742211 539 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGC--TACAAAACAACCTAGTCAACAAAGAATGCAATTGGAGTTTCTTCTGCCCTTTTAGCTGAATGTCTGAACTTGGCAAAATA a score=14447 s mm7.chrY_random 4903643 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGCAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCGCACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9601 s mm7.chrY_random 4908142 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGTCTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTACTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGCTCTGTGCATTCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=2683 s mm7.chrY_random 4908810 118 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATACATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAGAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAG s bosTau2.chr3 40230044 99 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACA-TGG-----TTTTAAGAAGTGGGGTGGG a score=5676 s mm7.chrY_random 4908974 152 + 30114534 atatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230167 181 + 85360813 ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10422 s mm7.chrY_random 4920654 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACTCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTTTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=38543 s mm7.chrY_random 4926623 1287 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCAAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCATTTCCTTATTCTTCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTTCTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGACATTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAATAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATATAGCTAACACAGGAAAAAAAAAC----TTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACATTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACAGGGAAGGATTGTCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTAGAACCATCTTTTCTGGTTTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCACCTCCTGA---TCTCTCCTCAGCAAGAGGAGTG------TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTTTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCAAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCCGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGTAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGAGGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCATACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAAC--TTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAG------------AAATCT-----------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=8370 s mm7.chrY_random 4929964 462 + 30114534 GTTATCTTTCAA---------CTGTTCTTAGTGT-CAGAAATGGTGCC-----AGACTCTTTGA-GGCAGCACACTGGATAGCACATCAAAATTCTGTTTATGAAAACCCAAAGTT-AGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGTGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGGTCCTGCCTTCAAAGTTGTGATAAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTTTAAATT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATATATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAGACAAAATATTGTACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTA-GCGGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750450 469 + 45915461 GTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGTGTATTGAAGTGTTGCCCATATAGAATGTTGGCTGGCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAATAGT-TTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=8605 s mm7.chrY_random 5009254 476 + 30114534 acacaattattcaaacGAATAAAGGA-----------ATGAAAAAGAAAATA-------ATATCAACTAATA-------AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCTCAGGTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCAGCAATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCACcacacacacacacacacacacacacacacacacacaTTTCTACTTGATTAACGAT---ATTGGCATTACTTATTTTTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGGGAAATGTTGATGTATAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAATACAGAAGTCAACAATATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAGATTTTCCATCGATTTAGTAAAA----------TATAAATATGATTTTAAAAGAAGGC--AACACCCTGAAAAAGTCTT--ATTTTCATCTTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742175 480 + 45915461 ATAAAGTCATCCAATTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC--------------------------------------TTTCTGCT-AATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=9208 s mm7.chrY_random 5017494 494 + 30114534 TTTCTGCCTTGACAACATCCATGGTGGTTATTTTTCATGTTCCAACCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTCTTATCATAAATATTGCCAGATTCTTTGAGGCAGCACACTGGATAGCACACCAATTTTCACTTTATGAAAACCCACAGTTAGAGGAGGACTATTT-TTATGCAAACAAACCTGGAATTTGACAGGGTTAAATGACATGTATTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAAATTAAAAAAAAAAACTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAAT-TTACCAGCACTTCTGATTATAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATGT--GTAGACAGAATACTGGACACAGGTATGTATAAAATTTACTTACAAAT s bosTau2.chr17 25750424 451 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAGTGTTGCC------CATATAGAATGTTGGCT-------GGCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAAT-AGTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAACTTGGA-CTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAAT--TTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCAT a score=27250 s mm7.chrY_random 5044639 731 + 30114534 GAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTACTGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACAACCCTCCTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCTTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTATCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20327276 716 - 48857030 GAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=11683 s mm7.chrY_random 5048283 413 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATAATCTAT-ATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAACCGTGGGAATTGTCAATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14652 s mm7.chrY_random 5058013 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATATCAGCTAGTTGGCTATTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGCAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCGCACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9813 s mm7.chrY_random 5062487 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGGTCTGTGCATGCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=7484 s mm7.chrY_random 5063155 247 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATGTACTATACATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAGAG-CTTTGTGataatatatatatatatatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTTTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTA s bosTau2.chr3 40230044 228 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTTTT-AAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATA-ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCA a score=10553 s mm7.chrY_random 5074982 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTAAGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCCAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=39008 s mm7.chrY_random 5080950 1288 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCAAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCATTTCCTTATTCTTCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGACGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAATAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGACAAAGACCCTTATATAGCTAACACAGGAAAAAAAAAC---TTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACATTTCTGTACTCTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTGTCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTAGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCACCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGAATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTTTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCAAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCCGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGAGGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCATACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAG------------AAATCT-----------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=8404 s mm7.chrY_random 5084393 364 + 30114534 TTAGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGTGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGGCCCTGCCTTCAAAGTTGTGATAAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTTTAAATT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATATATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAGACAAAATATTGAACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTA-GCGGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=10996 s mm7.chrY_random 5085409 422 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGTAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACTTTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATAACCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTTCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGA---AAAAGTTTTGTTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=13960 s mm7.chrY_random 5166023 557 + 30114534 TACTGATAAGCTTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTCAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC--------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14191 s mm7.chrY_random 5171571 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCACATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCACTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 5176099 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=3273 s mm7.chrY_random 5176188 68 + 30114534 TTCACAGACCAAGTCCTCATCGATGACAGAAACTGTGGCTATGTACTGTG-TTTATACTTTATTCCTCA s bosTau2.chr3 39055378 68 + 85360813 TTCATAGACCAGCTCCTCATCGATGG-AGAAATAGTGGGTATTTACTGTGCTTTTTGGTCTATTCCTTA a score=3426 s mm7.chrY_random 5177493 55 + 30114534 CTTTCATGAACTCACAAGCCAGGATTCACTTCTCTGACTACACGGCCATCTTAAG s bosTau2.chr3 39056262 55 + 85360813 CTTTCATGAACTCGCAAGCCCCGATTAGTTCCCCTGACTCCGCTGCCATCTTAAG a score=11980 s mm7.chrY_random 5177802 1058 + 30114534 ACAAATTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCTACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAACTTTCTTAGGTTTGTGCTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGACGGTCAACATTATAGCCACTGAAATTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGC----CATAATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAATAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAA---------ATGTGTGAATAACACAGATAATG--------AAAGACAGTGGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGG-----------------CCATTCTGTCT--GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTCATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCAACAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCT---------------TAATG----CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3202 s mm7.chrY_random 5200530 101 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATATTTCCGTT s bosTau2.chr5 39893490 106 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATATATGTGTT a score=23268 s mm7.chrY_random 5207664 1768 + 30114534 TTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATT--TTAAAAATTATATGTGGCTGAATTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAAAAAACCACATTGAAATATAATTAAATTTTGtacatatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttacgtgtgtgttgtgtgtgtTTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAAACGTAAA---------TGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGCGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaa------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattttatggtataccagatcataaattttcaagaggcagacatttgc----agaaagatcaagag---atgattaccagtgactacaaaa---------------------------------------aaaaaaaaaaaac---------aaaacaaa--aaaaaaacaaaaaaaccacaatat----------atcagagttca----------aagaagagagaaagcttatttattggtttcacctgggctctgttg----tttatattaaaaaaccaactcaatt---------------tggtaaa---------tcagttCAGATT---TACCAAAATCAGATTTACAAATCA--GATTGTTAGACTA--CCATGCATGTT--GCATGGCAGTA----ACAACAAAAATAAACAGAATTGTTA-TACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39895182 1922 + 76426644 TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCCTTACTACTCATGGGTA--CAAATTATGAGAAGTAT--TATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA--------------------------------------------------------------ATAAAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT----GCTTCCTACCTAACACTTTGTTAATATgaag---tttgctattaatactatgtagaggttatagttattgataatgacaaaatctaggttatgagtatgtaagtaatagataaagtagggtgaagggcaaaaaccattggttgaaaacaggccaagaaattgaaagatcagcaatattggaaggatcatctgtgttgacgtagaactcaagaagaattaagacaTGTTT------------TGAGCACTGTTGAGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGATTATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACATTATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAATTTTATCCAAATAGTTATTACATAATTTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=7617 s mm7.chrY_random 5209727 423 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAAA----------ACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA-AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCTTC---TCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3336 s mm7.chrY_random 5211579 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTAAAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=6143 s mm7.chrY_random 5212966 706 + 30114534 TATCTACTGTATTTGTCTGACTCATTTGGGATAAGGATTTACTTGGACCCAGCTTCATTTGTCACATCCACTTTTC-----AAGTATA-------------------AAAAAAATCACATACTCCATCTACCAACA----TGGGAGACATTATTTTTTGATATGCAGTTTTCCCCAACAGTGGAATGACAAGAC-GACCAGAG--CCATCCCTTAGGACAGGGAC---AAATGATCCAAAAGTTACTATTCTCTAACCTAGGACAACCAGTGTCAATAATTTTATAT---------GTCTCTG-------CAAACCTAGATTATG-----------------GCTGATCAACTTTATTGAG-------------------TCAGTGGT---AGCACTCAGAGTGG----------------------GCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957119 839 + 62721844 TATTTCATGCATTCGCATGACTAGATCAGGTCAGGGGGTCGCTTGGACCTTGCTTTAC----CATACTCACTTCTCTTGCCAAGGAGATGTCGAAACTTGTGTACTTAACAAAACAACCTATTCTATTTGTCAACACTAATGCCAGACATC-CGTTTTGACCC-CAGTTCCCCTCC-CAGTG-------AAGACTGGTTAGAGGTTCACCACTTAGAAGGAGGGCTCTGGATGAACCAGA---CACAAATTACGAATTTAGAAAGCCCATGGTTAGAGGTTCGCCACTCAGACGGAGGCTCTGGGTCAGCCCGACATAGATTACGAATTTAGAAAGCCCAGTGATGGTGCACTTTGATGAGAGTGCTGCTCACAAAAACCCCAGTAACCCCAGTACTCTGAATGGTGGAGGCTTGTCATGGGAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 5214520 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATAAAAAA s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=3923 s mm7.chrY_random 5214864 367 + 30114534 AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACCTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGGCCAAACATTCTTTAATGCAGTCACTTGGGAAATTCAA--TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958127 368 + 62721844 AAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataatattataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4366 s mm7.chrY_random 5215424 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTGATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=2192 s mm7.chrY_random 5240878 96 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTGTCAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCGTTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA s bosTau2.scaffold2750 81955 104 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAA a score=2826 s mm7.chrY_random 5241000 113 + 30114534 TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGTGAAA-AATTGTAAATTTCTTTTCAATATTATCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 82105 115 + 102126 TATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=19157 s mm7.chrY_random 5241152 938 + 30114534 CCTTTATAGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATTAAGAAAGCTATTTTGTTCGGACAT----TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATTGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATACAAGTTACCCCCTA--TTGTAGGAAATGAGTGGATATTCTGACAGTAAATGGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAAGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGACTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACAAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCTGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCTAACTCACTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82865 1024 + 102126 CTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=11085 s mm7.chrY_random 5263756 437 + 30114534 TTCAAAGAACGAAAGC-------ATGTAAAAGAAAATGAAA---TCTAGTAATAAGT-----------GTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTCAGAGGTTAGGGTTATTTGCACAAAAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAACCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTGCT--TGAATAATCACATTGGCATTATTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGACTTAGTTAAAAGCGTGGGACCAGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTGATAATGGGACAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATAAAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAA--AATTGTGAAAAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742189 466 + 45915461 TTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=308 s mm7.chrY_random 5269807 116 + 30114534 TCAATCAGTTTTCTGCGTTTCACCTTGT-GTAACAAGGC--CACATTTCTTTTAAATGTCCCTCTTTCCCCAACTTTTTGTTTCTCCTTCAGTGTTCACA-------TCAGAGTTTCTACCTATGC s bosTau2.chrX 28007355 124 + 48857030 TCAATTTATCCTGTCCGTTTTTCCTCTTAGCCCCAAGATTTCACTCTCCCTGTTATTCTTCACCCTCTTCCAGTTGGCTGCCTCCCACTCTTAGGTCACCCTCCCCTTAGGAGCCTCT--CCATTC a score=37868 s mm7.chrY_random 5269923 1196 + 30114534 TCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTGCTGCTATCTCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCT-------------ACATGCAGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCACCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATATTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTAACTCACAGAATATCATGTC-----ACACTTTTAAATTTTTAGAGCAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAAAAAACAAAAAAACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATACGTTTACGTTTCTGTACTTTATGAT-TTTAC----AACTTCAAGAATCTTTGGCACCAGAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACAGAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTTTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGAACCTGGGCTAGCACAACCCCCCTTCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACTGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGTGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGGAGTTGACCTAGCACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGATATCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTAACATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20326788 1204 - 48857030 TCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTC--------TTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACA---AGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATA----TTTTGTGTTTCTCCAAATCATATA--TTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=8645 s mm7.chrY_random 5273067 360 + 30114534 TTAGAGCAATAAATATTTTATTCAAACAAAGCAGGAATTTTACAGGGTTAAGTACCTTGTATTGAAGTTATTTGCAACTGTGAATCATTGATTTTTTGCAAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGTTCCTGCTTACAAAGTTGTGATGAAGTT-----AAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTT-TAAAATTTATTAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTAGTAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATAGATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAAACAAAATATTGAATGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTAT-CAGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCA-------CTTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=12065 s mm7.chrY_random 5274122 413 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGCGTGGGAACTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGttataaat-attattttaaa------aaaaGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14102 s mm7.chrY_random 5283833 377 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCTTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCACTACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGTAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCACACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAG-GCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9813 s mm7.chrY_random 5288241 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGGTCTGTGCATGCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=2595 s mm7.chrY_random 5288909 124 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATATATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAG s bosTau2.chr3 40230044 99 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTT-------TTAAGAAGTGGGGTGGG a score=5676 s mm7.chrY_random 5289083 152 + 30114534 atatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230167 181 + 85360813 ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10692 s mm7.chrY_random 5300759 398 + 30114534 AGTAAGTGTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGAACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATACATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAAAAAAGCTTT--GTTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742250 405 + 45915461 AGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=20838 s mm7.chrY_random 5306738 815 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCAAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTTACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCTAACACAGtaaaaaaaaaaaaaaaaactttttttttCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACATGGAAGGATTGGCTTGAAATTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGAT s bosTau2.chrX 20326666 852 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATA----TTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGAT a score=13805 s mm7.chrY_random 5387533 559 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTTAAATCACAAAGCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGTGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13787 s mm7.chrY_random 5393061 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACAACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACACTGCAGTTCTTAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 5397579 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=11584 s mm7.chrY_random 5400178 277 + 30114534 TTCTGGTGTCTTAGAAGCCTTGATTGTCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTCTGAAGGAATGGCCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTCT-GGCACCAGGAACACTGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 51228 277 - 52585 TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=35827 s mm7.chrY_random 5494819 1181 + 30114534 ATTCTTTTATCTATCACTCTTT-----CCCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATTCC-------AGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCCTTC--TTCCTAAAAATCCATCTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTAATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTGCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAATGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCAACACA-GGAAAATAAACATTTTTTTCAATCCT-------ATAAGTTTACTTTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTTTAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGTAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGAATTGGCTAGAACTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCAAACCAGGGCGCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGTAGAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACTCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGA----TGTCATGCTCAGACTCTTCAG---AGGTATTGTCTTCTAC s bosTau2.chrX 20326703 1232 - 48857030 ATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTT----ACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCTTTTTCTTCCTCATACT-TGCAGACAAGGTGTGGTCATCAAC a score=9770 s mm7.chrY_random 5497828 492 + 30114534 TTTCTGACTTGACAACATCCATGGTGGTTATTTTTCATGTTCCAACCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTCTTATCATAAATATTGCCAGACTCTTTGAGGCAGCACACTGGATAGCACACCAATTTTCACTTTATGAAAACCCACAGTTAGAGGAGGACTATTT-TTATGCAAAAAAACCTGGAATTTGACAGGGTTAAATGACATATATTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGAAAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAAATTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTT-TAAAATTTACCAGCACTTCTGATTACAAGGAATTTCAGAGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAGATGAGGTAATTTTAGTTTTGAAATATGT--GTAGACAGAATACTGGACACAGGTATGTATAAAATTTACTTACAAAT s bosTau2.chr17 25750424 451 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAG---TGTTGCCCATATAGAATGTTGGCTG----------GCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAAT-AGTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAACTTGGA-CTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCAT a score=21458 s mm7.chrY_random 5517193 667 + 30114534 TACTCATGTCACTCATGTTCCATTTTCTCATGCTCCTTTTTCTTCATTGGTCTTCCTAACAGAAAAATATGTAGCCTTACAACAAATCACTTTTGGAATTGTATTCATGGTGTCTGTTTCCACATTGCTTGCCAAAACAATCATTGTAGT-TTGGCTTTCATAATCACAGAACCTGGAAGAGGTTTAAGGAACCTCCTTTTATCAGGTTCAATGAAATACATCCTTCTGATATGTTCCAT-ATCAATGTATTC-TGTGGGTAATCTGACTCTCAGTTTCTCCTCCTTTTTTTGATATTGATATTTGTTGATATTGATGATAATGA--TAATCATTTTGTGCAACAAGGGTTCAGTTACTGCATTCTACTGAATTTTGGGATACTTGACCTGCCTTGCCCTTGGAAGCTTCACTGTGGATTTCGTGGCAAAGAATTTTCCTGAAACATTTAATGAAGCCAAGTTCCTGACCTTTGTCGTGCTAGGATTCTGCAGTGTTTATGTCACCTTCCTCCATGACTCACATAGGACTAAGGGCATGGTCATGGCTGCTGTAGAGGTCTTCTCAATCTTGGCATCCAGTACAGTGATGCTTGGATGCATCTTTACACCCAAGATCTACATCATTGAAATAAGACCAGACTTGAATTCTATCCAAGGTGTCAGATAGAAGT s bosTau2.chr7 14417433 662 + 69141744 TGTTCATCTCCCTCCTCCCGTGCTTCCTC-TGCTCCTTACTCTTTATCAGTCGTCCCCACACAGCCACCTCCATCCTC-CAACAGACCACATTTGGAGCTGTGTTCACTGTGGCTGTGGTCACTGTTTTGGCCAAAATCGTCCCTGTGATCTTGGCATTCAAGGCCAGGAAACCAGGAAGAACCATGAGGCGATTGCTCTTAACAGGACCTGC----TATGTCTTTCCCATGTACTCCATGATCCAGGTGATCATCTGTGGAGTCTGGCTGGGAGCCTCTCCCCCTTTCCTTGAGATGGACACTCATT----CTGAGCCCAAGGAGCTCCTCATCGTGTGCAACAAGGGCTCGGTCACTGCCTTCTACTGTGTCCTGGGCTACCTGGGCTCCTTAGCCCTGGGGACCTTCTCCTTGGCTTTCCTGGCCAGGAACCTGCCTGACACCTTCAGTGAAGCCAAGTTCCTGACCTTCAGCAGGCTGGTGCTCCTCAGTGTCTGGGTCACCTTCCTCCCTATCTGCCACAGCACCAAGGGCAAGGTCATGGTGGCCGTGGAGATCATCTCCATCTTGGCCTCCAGTGCTGGGCTCCTAGGCTGCATCTTTGCCCCAAAGTACTACATTGTTCTTATAAGAACTGATAAAAACTCTTTGAAAAGTTTAAAGAATAAGT a score=3870 s mm7.chrY_random 5534372 73 + 30114534 TGCACAAGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCGGACACACACACACAA----ATACACATAAGCTTATGCACATAATC s bosTau2.chr14 47301233 77 + 50711261 TGCACATGTGTGTACATGTGCATGCCTGCATGCACACACACACACAAATTTATATACAAAAGCATACAAACATTATC a score=9158 s mm7.chrY_random 5565953 466 + 30114534 acacaattattcaaacGAATAAAGGA-----------ATGAAAAAGAAAATG-------ATATCAACTAATA-------AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCTCAGGTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCAGCAATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCACcacacacacacacacacacacacacaTTTCTACTTGATTAACGAT---ATTGGCATTACTTATTTTTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGGGAAATGTTGATGTATAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAATACAGAAGTCAACAATATTGAATCCATTGTTTCTTGGAGCTGAAGATTTTCCATCGATTTAGTAAAA----------TATAAATATGATTTTAAAAGAAGGC--AACACCCTGAAAAAGTCTT--ATTTTCATCTTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742175 480 + 45915461 ATAAAGTCATCCAATTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC----------------------------TTTCTGCT-AATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=36696 s mm7.chrY_random 5571840 1193 + 30114534 TCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATACCAGAGATTCTATCTATG-TCCTGTCTTTCTCTGCTTCTTCCTAAAAATCCATTTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATA-----TCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTGA------GTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGCGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCTACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCA--ACACAGGAAAACAA-ACATTTT----TTTTCAATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTAAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGGAGGTCACCGAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGAATTGGCTAGAACTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGTGCGCCTGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCATGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGATGTCATGCTCAGACTCTTCAGATGTATTGTCTTCTACCTGGCTGTAGACCTGTTGTGGT s bosTau2.chrX 20326712 1216 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCC------TCCCCCTAGAAGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCTTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATAC---GTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGT a score=8862 s mm7.chrY_random 5574835 494 + 30114534 TTTCTGCCTTGACAACATCCATGGTGGTTATTTTTCATGTTCCAACCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTCTTATCATAAATATTGCCAGATTCTTTGAGGCAGCACACTGGATAGCACACCAATTTTCACTTTATGAAAACCCACAGTTAGAGGAGGACTATTT-TTATGCAAACAAACCTGGAATTTGACAGGGTTAAATGACATGTATTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAAATTAAAAAAAAAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAAT-TTACCAGCACTTCTGATTATAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTT-AAATATGT--GTAGACAAAATACTGGACACAGGTATGTATAAAATTTACTTACAAAT s bosTau2.chr17 25750424 451 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAGTGTTGCC------CATATAGAATGTTGGCT-------GGCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAAT-AGTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAACTTGGA-CTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAA---TTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCAT a score=27250 s mm7.chrY_random 5604611 731 + 30114534 GAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTACTGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACAACCCTCCTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCTTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTATCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20327276 716 - 48857030 GAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=12132 s mm7.chrY_random 5608287 454 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCAATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAACCGTGGGAATTGTCAATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTAGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG---GTCGTTCTGTGCCATACAAAGAAAGGTAGAGAAGAAAAGCTG s bosTau2.chr17 25742211 487 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC-----TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGC--TACAAAACAACCTAGTCAACAAAGAATG a score=14316 s mm7.chrY_random 5618026 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGAATTTAAGTGGCCTGCAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCGCACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=10040 s mm7.chrY_random 5622484 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTAGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGCTCTGTGCATTCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=7213 s mm7.chrY_random 5623152 288 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTAATTTATGATATACTATACATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAGAGCTTTGT-------GATAATATATATATATCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230044 304 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTTTT-AAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATA-ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10252 s mm7.chrY_random 5634951 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTCATAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGCTCACAATGGAGCAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTTA--AATCACAAAAAAGCTTTG-CGTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=575 s mm7.chrY_random 5641015 77 + 30114534 CCACATTAATTTTAAATGTCCCACTTTCCCCAAATTTTGTTTCTCCTTCAGTCTTCACATCAGAGGTTC-TACCTATG s bosTau2.chrX 28021607 71 + 48857030 CCACATCCTTTCTTAAGCAGCCACCTTCCCT---TTTCCTTTCCCCCACAGCC----CATCTCTAGTTCATTCTCCTC a score=38269 s mm7.chrY_random 5641092 1172 + 30114534 TCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTACTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCAAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCGGAATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGAAGTTCTTTCCACTGTA-------GGCCATCTCGTC-CAGCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTATCAAAGACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAAAAAA---ACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTGGCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTACTCCACCCAGTTACCAATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCTCTCAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCAGTACGTAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGATCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACTGTGAGAAATTCTGCAGCTGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTGTTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCACACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326787 1187 - 48857030 TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAAT-----------------------CTTTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=11269 s mm7.chrY_random 5645191 513 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGTAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACTTTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTTCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGA---AAAAGTTTTGTTTTCATATTTTAATTATTTACAG---GTCGTTCTGTGCCATATAAAGTAAGGTAGAGAAGGAAAGGTGT-TTTGGAGTCACTGACACACACATTTAACTGAG-GTCT---CTTTGCATAGTA s bosTau2.chr17 25742211 539 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGC--TACAAAACAACCTAGTCAACAAAGAATGCAATTGGAGTTTCT--TCTGCCCTTTTAGCTGAATGTCTGAACTTGGCAAAATA a score=4167 s mm7.chrY_random 5839495 73 + 30114534 GATTATGTTTATAAGCTTGTGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCTGCACACACATGCACATGCACACACGTGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=5742 s mm7.chrY_random 5958146 253 + 30114534 TTTGACAGGGTTAAATG------ACATGTGTTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATAGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAACTTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAATTTACCAGCACTTCTGATTATAAGGAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAG-GATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATG s bosTau2.scaffold1094 48464 248 - 285174 TTTTACAGAATCAAATACCTGTCACATGTGAAGGAAACA---GTAATTATGAATTATGGATCATTTGCAAGAAGTGATACCAAATTAGTTTCTGGGCCTGTTTCCAACGTTGGAGTGAATTTATGACAAACTGGATATTGATGAAT--GGTTTCTAAAGTCTGTTGAATTTGTCAGCCTTGCCTATGAATGAGGATTTGTTAGGTCAAATA-AATGAAACGGTAATGAAATAGATTG------TTTCTTTATGAAAAATG a score=14266 s mm7.chrY_random 6058275 557 + 30114534 TACTGATAAGCCTGACTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAACGCTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTAATCACAAAG------CACTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATATATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACGAAG--ATTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC----TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14029 s mm7.chrY_random 6063789 369 + 30114534 AATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAGGGCTTGGGCATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCTGCATCAACTATGTGGAGATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGAAGTGATTGTGCTGGGAGCAGACTCCTCAATATTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGATGAAACGTTTTTGAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGA----GAATTGGATGGTACCCTGCAATGCTCAGAATCTGGACATCTCTTCCCTATAAGCTGCAGGATACCCATTATGGTGTTGAATGATGAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTGGGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCCA-TATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4566 s mm7.chrY_random 6067441 597 + 30114534 AGAAGTATCTTT---TCCATTTTGTAAACAACAGACAGTAGTAGTTTCCTTCCTAATACAAATGTCTCTGGTTTAGTTAAATAGATTTACTAGCT--------TCAAATCAGACAATACCATGAAAGTTCATTTTCAGGAGGGTTAAGTGGAATTGAATTTGTGTTGTGTA-TTACTAACTGAGAGG--------------CCAATTTATAACCACAGAGCACTTTGAGGTGAGTGGGAAAAAAATTTACAATTATAAAATGCATAAAATTCCTTACCAAATTTTTATCAAACTTGCTTTATACGT------------AAGATCAACCAAAAATTAACAGACAACTACCAAACAGTTAAAGCATA-----------ACAATGCCA-------------------------------------------ATAAATTAAAAG-------------------------------------------------AAAATGCTTATTTAGAAGTG-----GGAAAAGATAAGC-TTTTATCGAATCTGCTTAATTGTATA--------AGAAAGAGAAACATCACTTTTCTTCACAT--GCTCAGAATTTAAGAGGGGGAAACGATTCCACGCGATAATCCAGTTCTATGTACACAAAATTAAGCAAGATCCTCATAATTAATGTGTGAGTACACAATGTCTGACTCAAATTCTATCAAAGACGCTAAAGTCCTGT---TAATGCAGGCTCATCAGTCTCACT s bosTau2.chr3 46353062 704 - 85360813 aaaaatttttttaaCTTTATCTTTTAAACTACAG---GGAGTAGCTTCTTTTCTGAAAAATGTTAAGTAGGTTCAGTTAAAGAAATGTACCTACTATGCATTTTCAAGTCAGAGAATAAATTCAAAATCAATTCCCTACAAAGGTGATTACAACAGATGTTACATTATATAATTGTTTACTTTAAAAATATCTCTTTAGTTTCATTCCATGTCCATTTATCATTTTGAGTTAAATGACAAAAATTTGTGAATTCATATTTTACAGGAAATTCTGCA---------TGACAGACTTGCTTTTCATGCTTAAGTTGGATAAAAATCAATCAAGTA--AAAAAATTATCACTAAGCAGATAATATGTATAAGGCATTATACTATGTCACACCAGTAACATTTTGCCCAACAGAAAGATTAAACTGAGTGTTATAATTTAGAGGTTAGCACTTAATCTGCTGTGTAGATTTCACCTTCCAAATTGAAATATTTAAGACCCTCATTTAGAAAGGTGAGAGAAAAAGATAAATATTTCCTTCTATGTGATGAAATGTTTACCAAAACTAGGAGTATAGATATCACTTTTCCTCATATATGTTTAAAATTCAAGGAGGGGG-------------GGAAAGCTACATATAAAAACATACAGATGAACA-------------------GTGA-------ATGTATGACCCAATTTCTGTCATAAAAGGTAAAGTCCAGTCTCTGTTGCTAGTTCATTATTCTCACT a score=4587 s mm7.chrY_random 6068284 84 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATATGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAG s bosTau2.chr3 46354234 84 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAG a score=3259 s mm7.chrY_random 6069991 758 + 30114534 ACAAATTGTACAACCCTTTAGGCACAGGAGTAGTATTCAATCATTTAAAAAGTCC---AGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCAGAGAGATGGATAACTAGTATGGACAGTGAGA---------------TCTGTAAGTGGACTTCAAATGCTTACAAGTTTCTAAGGTTT--------------------GTGTT-----GGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGACAACTACCT----------TGCTTACACTGAAGGAAGACAC--AATCTTATCATGTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGGCGGTGAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCA-AGAGCCCTAATAGCATTTTA---CATCTCTTCTGAGATAAGTGAAGATTTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGTATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTGTGAACACAGATGTCAAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAAGAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAA------AAGTGTG--TGGATAACACAGATAATG--------AAAGACAGTGGGAAGCAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGGCAATTCTG s bosTau2.scaffold5600 50284 851 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAG--------ATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTA--AGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCTTAATGCTAGAA-TTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTT-CTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTG a score=11824 s mm7.chrY_random 6070767 278 + 30114534 TTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCGTCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGAAATATTTGAAGGAATGGTCTCTCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCACCAGGGACACTGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 51228 277 - 52585 TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=2977 s mm7.chrY_random 6098794 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAATAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=20433 s mm7.chrY_random 6105863 1272 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAAAGAAATTTATCTATATCTATTTTACT-TGTAGACATGGAATCACCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACCCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGGAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAATGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATA-TATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGACTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATGTAATTCTTAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTCCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACACTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGAATATTTTAGGTGACATA-----TGTTTTGCAC----TGTCTTTACTAAGGCAATGCATGAAAAATAA-----------------------------------------------------ATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAA--AAAACACATTGAAATATAATTAAATTTT----GTACAtgtatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgcgttacttgtgtgttgtgtgtgtTTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAA--ACATAAA-------TGAAAACCTCTCTGATAATATGATAGGGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTTTGGGTGTTCTTTTTCATATTGGTATGAAATGTACCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTTATATGGATGTACagaaattcaatgaggaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaa-------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgggttgagcatatgaaactaaattaagttccactatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatat s bosTau2.chr5 39895153 1350 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTTGAATATGTGGGAATA-AATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTAACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAA---AATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA--------------------------------------------------ATAAAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGT--TGTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT a score=5897 s mm7.chrY_random 6108714 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATTTTATTTCATGTTATTGTAAAAATATACACAT-ATTTAG--TCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTACCATGCATGTTGCATGGCAGTATCAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGGTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGATTATT--ATTGTATGTAAGTG-----GTGAACACATTATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=2349 s mm7.chrY_random 6109210 106 + 30114534 ATGGCTTTGTAGGAATTATTAAAGTTATGAAATAATAAAATGGGAATTTGACCTCAGATGTAC-----------------CTCATACATTAATAACACTATAATTAT-CCTGCTTTATTAAACA s bosTau2.scaffold10439 16855 123 - 23754 ATAGTATTGTGGGAGTCACTTAAAATGGGGAACTGCAAACTGGGAATTTAATCT-AGATGTATACACATGGTGAAGAAAACTGATACTTGATTAACCCTTTAATCCTAACTATTTTGTTCAGCA a score=6326 s mm7.chrY_random 6109428 333 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAATGTCTATGTTTAAAAGAGCCAACATGGAGAATAATCTGAAGTACTCGTTTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCT-AGttatatat--atatatataaaacaaagaaaaaaatatCTACCTTTTTTTGTCTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTTTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCA s bosTau2.chr5 39897983 362 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA-AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAA-------GTTGTTATTCAGAACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT----TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATA a score=6256 s mm7.chrY_random 6119685 396 + 30114534 GAGTGGGCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTATCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTATATTTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTTATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957523 435 + 62721844 GAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGGGT-GATATG-----AAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 6120929 96 + 30114534 CCTGGTAGACACAAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTCTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATaaaaaa s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=3750 s mm7.chrY_random 6121260 389 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACTAGTACTTAAG------TTT--TTGGGGAAAACTGACCTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAAACTTCT-GCTGGAAGCCCCACAGGCCTGGGCCAATCATTCTTTAATGCAGTCACTTAGGAAATTCAA---------TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCTCTGACAGGACCGAAAAAAATG------TCAATGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTGTTGGGGACTAACTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATT----TGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataata-------ttataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTA----AAGACCTGATGGGATGACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4506 s mm7.chrY_random 6121890 201 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAAGAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAAATCCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAA-TCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=18283 s mm7.chrY_random 6132922 970 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAAAGAAACATAGGTACAGTAACTTAA----ATCCAGAAAGCTATTTTGTTCTGACATTAAGATTGCACAGCTAATTCTCAAAAGGTGTATATT-ATCTGAATCGATACATATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGCCTAGCATGAT--TGTTCTG-TTACTT---------AAATTCAATGTTT-------------TCAGAGATGGCAAAAGACCAACTAGAAATTCAGATAAGCACA-----------------------------GTTAATACAGAATTAGCCAGGA----------ATACAAGTTACCCCAGA--TTGTAGGAGAAGAGTGGATATTCTGACAGCAAATAGCTTTTAAATATAAACTCCTGAGATAAGTTGGAGTTAAAAAAAAAAAAGAGAGGGGGTGGAAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCAAT-GAGGCAATGGCACAAGGAAATAACTGG-TTGATAGAAAGTGTCCCTG-AGTTTCTGAATGA-TGCAAGCCTTTATTGCTGCATAGCCAAAGGGAAACAGAAATCCTTCACAAAACTCAAAGAGAG----GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCATAGAAAA-CTGGCAAAGTGTACAAAACAGGCAAAACAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGTAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTCAGTGTACCAATTTCTATA-AAACATGATCTCTCAAATAATCAGCTTGACTAAGTATTTAATAAATAATCCTGTGCAACTATATTCCAGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTATCC-TGTTGTG-CTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGACAATG-AATAAGAACCCAACTTGCTAACTGTGACAGACAAAACAATTCTTTAAGGCCACTAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaat-----gggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCTGACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGT--TAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=18433 s mm7.chrY_random 6151767 956 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAGCATAGCAACTGTAACTTAAATCAAG--AAAGCTATTTTGTGCAGACAT--TAGAAATGTGAAGATAATTCTCAAAAGGTATATATC-ATCTGAATCGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTAGCCAGAATACAAGCTACCCCCTA--TTGTAGGAAAAGAGTGGATATTCTGACAGTAAATAGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGGAAGGGGGTGCTAAAACATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AAAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCACCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGCCTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTCCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAC-AGGCAAACGAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTGAAAGTGAATGACCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGACATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGATCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAATTAATAGGAACCCAACTCACGAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCAC s bosTau2.scaffold2750 82839 1044 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCC--CTGACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAAC a score=5742 s mm7.chrY_random 6250983 253 + 30114534 TTTGACAGGGTTAAATG------ACATGTGTTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATAGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAACTTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAATTTACCAGCACTTCTGATTATAAGGAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAG-GATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATG s bosTau2.scaffold1094 48464 248 - 285174 TTTTACAGAATCAAATACCTGTCACATGTGAAGGAAACA---GTAATTATGAATTATGGATCATTTGCAAGAAGTGATACCAAATTAGTTTCTGGGCCTGTTTCCAACGTTGGAGTGAATTTATGACAAACTGGATATTGATGAAT--GGTTTCTAAAGTCTGTTGAATTTGTCAGCCTTGCCTATGAATGAGGATTTGTTAGGTCAAATA-AATGAAACGGTAATGAAATAGATTG------TTTCTTTATGAAAAATG a score=14266 s mm7.chrY_random 6351120 557 + 30114534 TACTGATAAGCCTGACTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAACGCTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTAATCACAAAG------CACTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATATATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACGAAG--ATTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC----TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14029 s mm7.chrY_random 6356634 369 + 30114534 AATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAGGGCTTGGGCATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCTGCATCAACTATGTGGAGATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGAAGTGATTGTGCTGGGAGCAGACTCCTCAATATTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGATGAAACGTTTTTGAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGA----GAATTGGATGGTACCCTGCAATGCTCAGAATCTGGACATCTCTTCCCTATAAGCTGCAGGATACCCATTATGGTGTTGAATGATGAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTGGGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCCA-TATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4566 s mm7.chrY_random 6360286 597 + 30114534 AGAAGTATCTTT---TCCATTTTGTAAACAACAGACAGTAGTAGTTTCCTTCCTAATACAAATGTCTCTGGTTTAGTTAAATAGATTTACTAGCT--------TCAAATCAGACAATACCATGAAAGTTCATTTTCAGGAGGGTTAAGTGGAATTGAATTTGTGTTGTGTA-TTACTAACTGAGAGG--------------CCAATTTATAACCACAGAGCACTTTGAGGTGAGTGGGAAAAAAATTTACAATTATAAAATGCATAAAATTCCTTACCAAATTTTTATCAAACTTGCTTTATACGT------------AAGATCAACCAAAAATTAACAGACAACTACCAAACAGTTAAAGCATA-----------ACAATGCCA-------------------------------------------ATAAATTAAAAG-------------------------------------------------AAAATGCTTATTTAGAAGTG-----GGAAAAGATAAGC-TTTTATCGAATCTGCTTAATTGTATA--------AGAAAGAGAAACATCACTTTTCTTCACAT--GCTCAGAATTTAAGAGGGGGAAACGATTCCACGCGATAATCCAGTTCTATGTACACAAAATTAAGCAAGATCCTCATAATTAATGTGTGAGTACACAATGTCTGACTCAAATTCTATCAAAGACGCTAAAGTCCTGT---TAATGCAGGCTCATCAGTCTCACT s bosTau2.chr3 46353062 704 - 85360813 aaaaatttttttaaCTTTATCTTTTAAACTACAG---GGAGTAGCTTCTTTTCTGAAAAATGTTAAGTAGGTTCAGTTAAAGAAATGTACCTACTATGCATTTTCAAGTCAGAGAATAAATTCAAAATCAATTCCCTACAAAGGTGATTACAACAGATGTTACATTATATAATTGTTTACTTTAAAAATATCTCTTTAGTTTCATTCCATGTCCATTTATCATTTTGAGTTAAATGACAAAAATTTGTGAATTCATATTTTACAGGAAATTCTGCA---------TGACAGACTTGCTTTTCATGCTTAAGTTGGATAAAAATCAATCAAGTA--AAAAAATTATCACTAAGCAGATAATATGTATAAGGCATTATACTATGTCACACCAGTAACATTTTGCCCAACAGAAAGATTAAACTGAGTGTTATAATTTAGAGGTTAGCACTTAATCTGCTGTGTAGATTTCACCTTCCAAATTGAAATATTTAAGACCCTCATTTAGAAAGGTGAGAGAAAAAGATAAATATTTCCTTCTATGTGATGAAATGTTTACCAAAACTAGGAGTATAGATATCACTTTTCCTCATATATGTTTAAAATTCAAGGAGGGGG-------------GGAAAGCTACATATAAAAACATACAGATGAACA-------------------GTGA-------ATGTATGACCCAATTTCTGTCATAAAAGGTAAAGTCCAGTCTCTGTTGCTAGTTCATTATTCTCACT a score=4587 s mm7.chrY_random 6361129 84 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATATGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAG s bosTau2.chr3 46354234 84 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAG a score=3259 s mm7.chrY_random 6362836 758 + 30114534 ACAAATTGTACAACCCTTTAGGCACAGGAGTAGTATTCAATCATTTAAAAAGTCC---AGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCAGAGAGATGGATAACTAGTATGGACAGTGAGA---------------TCTGTAAGTGGACTTCAAATGCTTACAAGTTTCTAAGGTTT--------------------GTGTT-----GGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGACAACTACCT----------TGCTTACACTGAAGGAAGACAC--AATCTTATCATGTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGGCGGTGAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCA-AGAGCCCTAATAGCATTTTA---CATCTCTTCTGAGATAAGTGAAGATTTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGTATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTGTGAACACAGATGTCAAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAAGAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAA------AAGTGTG--TGGATAACACAGATAATG--------AAAGACAGTGGGAAGCAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGGCAATTCTG s bosTau2.scaffold5600 50284 851 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAG--------ATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTA--AGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCTTAATGCTAGAA-TTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTT-CTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTG a score=11824 s mm7.chrY_random 6363612 278 + 30114534 TTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCGTCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGAAATATTTGAAGGAATGGTCTCtcacattcaatacagttaaacaggattctctcctgtataaaatcattgatgTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCACCAGGGACACTGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 51228 277 - 52585 TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=2977 s mm7.chrY_random 6391639 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAATAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=20433 s mm7.chrY_random 6398708 1272 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAAAGAAATTTATCTATATCTATTTTACT-TGTAGACATGGAATCACCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACCCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGGAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAATGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATA-TATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGACTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATGTAATTCTTAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTCCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACACTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGAATATTTTAGGTGACATA-----TGTTTTGCAC----TGTCTTTACTAAGGCAATGCATGAAAAATAA-----------------------------------------------------ATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAA--AAAACACATTGAAATATAATTAAATTTT----GTACAtgtatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgcgttacttgtgtgttgtgtgtgtTTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAA--ACATAAA-------TGAAAACCTCTCTGATAATATGATAGGGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTTTGGGTGTTCTTTTTCATATTGGTATGAAATGTACCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTTATATGGATGTACagaaattcaatgaggaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaa-------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgggttgagcatatgaaactaaattaagttccactatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatat s bosTau2.chr5 39895153 1350 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTTGAATATGTGGGAATA-AATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTAACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAA---AATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA--------------------------------------------------ATAAAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGT--TGTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT a score=5897 s mm7.chrY_random 6401559 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATTTTATTTCATGTTATTGTAAAAATATACACAT-ATTTAG--TCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTACCATGCATGTTGCATGGCAGTATCAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGGTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGATTATT--ATTGTATGTAAGTG-----GTGAACACATTATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=2349 s mm7.chrY_random 6402055 106 + 30114534 ATGGCTTTGTAGGAATTATTAAAGTTATGAAATAATAAAATGGGAATTTGACCTCAGATGTAC-----------------CTCATACATTAATAACACTATAATTAT-CCTGCTTTATTAAACA s bosTau2.scaffold10439 16855 123 - 23754 ATAGTATTGTGGGAGTCACTTAAAATGGGGAACTGCAAACTGGGAATTTAATCT-AGATGTATACACATGGTGAAGAAAACTGATACTTGATTAACCCTTTAATCCTAACTATTTTGTTCAGCA a score=6326 s mm7.chrY_random 6402273 333 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAATGTCTATGTTTAAAAGAGCCAACATGGAGAATAATCTGAAGTACTCGTTTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCT-AGttatatat--atatatataaaacaaagaaaaaaatatCTACCTTTTTTTGTCTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTTTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCA s bosTau2.chr5 39897983 362 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA-AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAA-------GTTGTTATTCAGAACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT----TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATA a score=6256 s mm7.chrY_random 6412530 396 + 30114534 GAGTGGGCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTATCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTATATTTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTTATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957523 435 + 62721844 GAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGGGT-GATATG-----AAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 6413774 96 + 30114534 CCTGGTAGACACAAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTCTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATaaaaaa s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=3750 s mm7.chrY_random 6414105 389 + 30114534 aaaaccaaaaCCAAAATTGAACTAGTACTTAAG------TTT--TTGGGGAAAACTGACCTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAAACTTCT-GCTGGAAGCCCCACAGGCCTGGGCCAATCATTCTTTAATGCAGTCACTTAGGAAATTCAA---------TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCTCTGACAGGACCGAAAAAAATG------TCAATGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTGTTGGGGACTAACTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATT----TGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataata-------ttataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTA----AAGACCTGATGGGATGACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4506 s mm7.chrY_random 6414735 201 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAAGAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAAATCCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAA-TCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=18283 s mm7.chrY_random 6425768 970 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAAAGAAACATAGGTACAGTAACTTAA----ATCCAGAAAGCTATTTTGTTCTGACATTAAGATTGCACAGCTAATTCTCAAAAGGTGTATATT-ATCTGAATCGATACATATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGCCTAGCATGAT--TGTTCTG-TTACTT---------AAATTCAATGTTT-------------TCAGAGATGGCAAAAGACCAACTAGAAATTCAGATAAGCACA-----------------------------GTTAATACAGAATTAGCCAGGA----------ATACAAGTTACCCCAGA--TTGTAGGAGAAGAGTGGATATTCTGACAGCAAATAGCTTTTAAATATAAACTCCTGAGATAAGTTGGAGTTAAAAAAAAAAAAGAGAGGGGGTGGAAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCAAT-GAGGCAATGGCACAAGGAAATAACTGG-TTGATAGAAAGTGTCCCTG-AGTTTCTGAATGA-TGCAAGCCTTTATTGCTGCATAGCCAAAGGGAAACAGAAATCCTTCACAAAACTCAAAGAGAG----GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCATAGAAAA-CTGGCAAAGTGTACAAAACAGGCAAAACAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGTAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTCAGTGTACCAATTTCTATA-AAACATGATCTCTCAAATAATCAGCTTGACTAAGTATTTAATAAATAATCCTGTGCAACTATATTCCAGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTATCC-TGTTGTG-CTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGACAATG-AATAAGAACCCAACTTGCTAACTGTGACAGACAAAACAATTCTTTAAGGCCACTAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaat-----gggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCTGACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGT--TAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=18740 s mm7.chrY_random 6444613 957 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAGCATAGCAACTGTAACTTAAATCAAG--AAAGCTATTTTGTGCAGACAT--TAGAAATGTGAAGATAATTCTCAAAAGGTATATATC-ATCTGAATCGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTAGCCAGAATACAAGCTACCCCCTA--TTGTAGGAAAAGAGTGGATATTCTGACAGTAAATAGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGGAAGGGGGTGCTAAAACATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AAAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCACCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGCCTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTCCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACGAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTGAAAGTGAATGACCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGACATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGATCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAATTAATAGGAACCCAACTCACGAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCAC s bosTau2.scaffold2750 82839 1044 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCC--CTGACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAAC a score=20318 s mm7.chrY_random 6554168 963 + 30114534 GCACTTGTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTCGTGAGTTGGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATTCACTTTCAGTCCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTGAGAGGTCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTCGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCTAAGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGAAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGGCTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGGGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTAGCACCCCCTTTCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCTATTTACTGTCAGAATATCCACTCTTTTCCTACAA------TAGGGGGTA----------------------ACTTGTATTCTGGC--------TAATTCTGTATTCACT------GTGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACTTCTTTGA------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGTGTAGGAAATTATAAGTATCGATTCAGAT-AATATATAACTTTTGAGAATTAGCTTCACATTTCTA--ATGTCCACACAAAATAGCTTT--CTTGATTTAAGTTACAGTTGCTATGTTTCACTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTC--AGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagctccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=2716 s mm7.chrY_random 6555155 224 + 30114534 TAATATTGAAAAGAAATTACAATT--TTTCACTTTGAAATTAAATCTCTGAAGATGATAACTTAACTTGTGTTTGGAAAAGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA-------------TCATTATTAATA------------TCAGCAGTATAAGGTTGTTCAAACAAAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAACAAAAATAAATGAATAGTA-GGTTTGT-AGCATTTGGCACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 19916 255 - 102126 TAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATACCTGGAGATCCTCCCATTTTAAATGAGAAGACCTAATCCAGAAAT-----TTTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=3854 s mm7.chrY_random 6583928 107 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCCATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGCTTTTAA s bosTau2.chr5 36527708 112 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGTTTGGTTTTTTAAA a score=3335 s mm7.chrY_random 6584364 70 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAGAAA---TA---TACTTTCAATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=7539 s mm7.chrY_random 6585864 432 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTACACTTAAACAAGAAAATGATTAAAGATATTTAAAAATAAAGAAGTTCTATTTTGACTCTAAATGTATAACTGCT-------------AGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAGCTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGatttttttatttgttttatatatatatatatataaC-CAGCAAGTGAAATTTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTTAAACATAGACATTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAA--------------TATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACGACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGA---AGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTT-TAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=5762 s mm7.chrY_random 6586591 418 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCA--TCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAATATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACTAAATATATGTATATTTTTA-CAATAACATGAAATAAAATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA---ATGTGTTCACCACTTACATACAAT--AATAATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=21139 s mm7.chrY_random 6588577 1288 + 30114534 aaatgcctagtcgttttcattgatagagtatgca---atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagataatggaacttaatttagtttcatatgctgaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt-------tttttatggtaccaaccactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAAAGAACACTCAAAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCTCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCA---------TTTACGTTTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacctaacacacacacacacatacacacacacatatatatacaTGTAC----AAAATTTAATTATATTTCAATGTGTTTT--TTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAACTAAAATATACAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCAAACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATATAATTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGGGTCAT----TTTGAAGAAAAAATAGATGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530122 1369 - 76426644 AAATACC-AACAGCTTTTATATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAACA--ACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTTTATTA--------------------------------------------TATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATAA---TTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=2977 s mm7.chrY_random 6596835 94 + 30114534 ATATTTTTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=10797 s mm7.chrY_random 6657696 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCTTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTAAGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=39061 s mm7.chrY_random 6663699 1288 + 30114534 TTCAATCAGTTT-CCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCAAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCATGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCATTTCCTTATTCTTCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCTTTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTTTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAATAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATATAGCTA--ACACAGGAAAAAAAAAAACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCGATATGTTTACATTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTGTCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTAGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACATATCACTGTCACCTCCTGATCTCTCCTCAGCTGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTTTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCAAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAG-GTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGAGGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCATACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAG------------AAATCT-----------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=8507 s mm7.chrY_random 6667137 364 + 30114534 TTAGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGGGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGGTCCTGCCTTCAAAGTTGTGATAAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTTTAAATT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTCATAGGTTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATATATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAGACAAAATATTGAACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTA-GCGGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11088 s mm7.chrY_random 6668117 422 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGTAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACTTTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATAACCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTTCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGA---AAAAGTTTGGTTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=13991 s mm7.chrY_random 6749607 557 + 30114534 TACTGATAAGCTTGCCTACCCGAGTCTCAGCATAAAAGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTTAAATCACAAAGCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCT---------ATGCAGTAAG---------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13835 s mm7.chrY_random 6755126 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCAACAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTTTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 6759646 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=3273 s mm7.chrY_random 6759735 68 + 30114534 TTCACAGACCAAGTCCTCATCGATGACAGAAACTGTGGCTATGTACTGTG-TTTATACTTTATTCCTCA s bosTau2.chr3 39055378 68 + 85360813 TTCATAGACCAGCTCCTCATCGATGG-AGAAATAGTGGGTATTTACTGTGCTTTTTGGTCTATTCCTTA a score=3426 s mm7.chrY_random 6761040 55 + 30114534 CTTTCATGAACTCACAAGCCAGGATTCACTTCTCTGACTACACGGCCATCTTAAG s bosTau2.chr3 39056262 55 + 85360813 CTTTCATGAACTCGCAAGCCCCGATTAGTTCCCCTGACTCCGCTGCCATCTTAAG a score=12454 s mm7.chrY_random 6761349 1058 + 30114534 ACAAATTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAACTTTCTTAGGTTTGTGCTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGACGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGC----CATAATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAA---------ATGTGTGGATAACACAGATAATG--------AAAGACAGTGGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCCTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGG-----------------CCATTCTGTCT--GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTCATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCAGCAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCT---------------TAATG----CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3108 s mm7.chrY_random 6784057 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=20915 s mm7.chrY_random 6791189 1272 + 30114534 TTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAAAAAACCACATTGAAATATAATTAAATTTTGTACATGTATATATATATATATAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttacgtgtgtgttgtgtgtgtTTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAA--ACATAAA-------TGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGCGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATATCTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaaa-----aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895183 1339 + 76426644 TTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA----------------------------------------------------ATAAAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6174 s mm7.chrY_random 6794049 422 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCatattattg-taaatatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTGCCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT-----TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=2572 s mm7.chrY_random 6794548 106 + 30114534 ATGGCTTTGTATGAATTATTAAAGATATGAAATGATAAAATGGGAATTTGACCTCAGATGTAC-----------------CTCATACTTTAATAACACTATAATTAT-CCTGCTTTATTAAACA s bosTau2.scaffold10439 16855 123 - 23754 ATAGTATTGTGGGAGTCACTTAAAATGGGGAACTGCAAACTGGGAATTTAATCT-AGATGTATACACATGGTGAAGAAAACTGATACTTGATTAACCCTTTAATCCTAACTATTTTGTTCAGCA a score=7587 s mm7.chrY_random 6794766 424 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAAA----------ACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA--AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCTTC---TCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 6796619 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 6797020 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=5807 s mm7.chrY_random 6798008 706 + 30114534 TATCTACTGTATTTGTCTGACTCATTTGGGATAAGGATTTACTTGGACCCAGCTTCATTTGTCACATCCACTTTTC-----AAGTATA-------------------AAAAAAATCACATACTCCATCTACCAACA----TGGGAGACATTATTTTTTGATATGCAGTTTTCCCCAACAGTGGAATGACAAGAC-GACCAGAG--CCATCCCTTAGGACAGGGAC---AAATGATCCAAAAGTTACTATTCTCTAACCTAGGACAACCAGTGTCAATAATTTTATAT---------GTCTCTG-------CAAACCTAGATTATG-----------------GCTGATCAACTTCATTGAG-------------------TCAGTGGT---AGCACTCAGAGTGG----------------------GCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACTACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957119 839 + 62721844 TATTTCATGCATTCGCATGACTAGATCAGGTCAGGGGGTCGCTTGGACCTTGCTTTAC----CATACTCACTTCTCTTGCCAAGGAGATGTCGAAACTTGTGTACTTAACAAAACAACCTATTCTATTTGTCAACACTAATGCCAGACATC-CGTTTTGACCC-CAGTTCCCCTCC-CAGTG-------AAGACTGGTTAGAGGTTCACCACTTAGAAGGAGGGCTCTGGATGAACCAGA---CACAAATTACGAATTTAGAAAGCCCATGGTTAGAGGTTCGCCACTCAGACGGAGGCTCTGGGTCAGCCCGACATAGATTACGAATTTAGAAAGCCCAGTGATGGTGCACTTTGATGAGAGTGCTGCTCACAAAAACCCCAGTAACCCCAGTACTCTGAATGGTGGAGGCTTGTCATGGGAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3805 s mm7.chrY_random 6799561 126 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGGCCTGGATAGATAAAAAAAAAAAAAGAACTGGATTCCTGTAATCCTTT s bosTau2.chr13 39957961 117 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTG---------GGAAGCCAAAGAATTAGATCACTAGAGACCCTT a score=4107 s mm7.chrY_random 6799881 391 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACCTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGGCCAAACATTCTTTAATGCAGTCACTTGGGAAATTCAA--TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataatattataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT-------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4591 s mm7.chrY_random 6800471 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=2183 s mm7.chrY_random 6827008 96 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTGTCAAATGCT-ACAAACC-TACTAATCAGTTATTTTCGTTA----TTAAATTTACAATGAATAAAATTC--ATTTTGTTTGAACAA s bosTau2.scaffold2750 81955 104 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAA a score=2622 s mm7.chrY_random 6827130 112 + 30114534 TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGTAATTTCTTTTCAATATTATCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 82105 115 + 102126 TATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=19477 s mm7.chrY_random 6827256 963 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATTAAGAAAGCTATTTTGTTCGGACAT----TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATTGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATACAAGTTACCCCCTA--TTGTAGGAAATGAGTGGATATTCTGACAGTAAATGGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAAGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGACTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACAAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCTAACTCACTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=11096 s mm7.chrY_random 6849862 437 + 30114534 TTCAAAGAACGAAAGC-------ATGTAAAAGAAAATGAAA---TCTAGTAATAAGT-----------GTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTCAGAGGTTAGGGTTATTTGCACAAAAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAACCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTGCT--TGAATAATCACATTGGCATTATTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGACTTAGTTAAAAGTGTGGGACCAGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTGATAATGGGACAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATAAAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAA--AATTGTGAAAAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742189 466 + 45915461 TTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=308 s mm7.chrY_random 6855947 116 + 30114534 TCAATCAGTTTTCTGCGTTTCACCTTGT-GTAACAAGGC--CACATTTCTTTTAAATGTCCCTCTTTCCCCAACTTTTTGTTTCTCCTTCAGTGTTCACA-------TCAGAGTTTCTACCTATGC s bosTau2.chrX 28007355 124 + 48857030 TCAATTTATCCTGTCCGTTTTTCCTCTTAGCCCCAAGATTTCACTCTCCCTGTTATTCTTCACCCTCTTCCAGTTGGCTGCCTCCCACTCTTAGGTCACCCTCCCCTTAGGAGCCTCT--CCATTC a score=37526 s mm7.chrY_random 6856063 1195 + 30114534 TCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTGCTGCTATCTCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCT-------------ACATGCAGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTTACCACCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATATTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTAACTCACAGAATATCATGTC-----ACACTTTTAAATTTTTAGAGCAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAGAAAAACAAAAAACTTTTT-TTTCTTCCAGTCCTATACTTTTATGTTTCTGTACTTTATGAT-TTTAC----AACTTCAAGAATCTTTGGCACCAGAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACAGAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTTTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGAACCTGGGCTAGCACAACCCCCCTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATATTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACTGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCTTTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGGAGTTGACCTAGCACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACCCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAAACCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTAACATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20326788 1204 - 48857030 TCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTC--------TTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACA---AGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACA----CTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATA--TTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=8523 s mm7.chrY_random 6859210 360 + 30114534 TTAGAGCAATAAATATTTTATTCAAACAAAGCAGGAATTTTACAGGGTTAAGTACCTTGTATTGAAGTTATTTGCAACCGTGAATCATTGATTCTTTGCAAAATGATAAGGCAATCTAGCTCTTGTTCCTGCTTACAAAGTTGTGATGAAGTT-----AAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTT-TAAAATTTATTAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTAGTAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATAGATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAAACAAAATATTGAATGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTAT-CAGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCA-------CTTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11646 s mm7.chrY_random 6860181 413 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGCGTGGGAACTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGTAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14233 s mm7.chrY_random 6869900 377 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCACTACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGTAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCACACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAG-GCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9682 s mm7.chrY_random 6874325 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTCCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGTCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGGTCTGTGCATGCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=2595 s mm7.chrY_random 6874993 124 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATATATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAG s bosTau2.chr3 40230044 99 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTT-------TTAAGAAGTGGGGTGGG a score=5676 s mm7.chrY_random 6875155 152 + 30114534 atatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230167 181 + 85360813 ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10489 s mm7.chrY_random 6886829 398 + 30114534 AGTAAGTGTCCATGTCACTTCGTAGTATA--TCTTAAATCATTACTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACAATACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATACATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAAAAAAGCTTT--GTTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742250 405 + 45915461 AGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=20051 s mm7.chrY_random 6892823 812 + 30114534 TTCAATCAGTTTTCTGTGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCAAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCATTTCCTTATTCTGCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTTACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCTAACACAGTAAAAAAAAAAAAAACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATTTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATACACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACATGGAAGGATTGGCTAGAAATTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACAATCTTTTCTGGTGTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGAT s bosTau2.chrX 20326666 852 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCAACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATA-TTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTT--GCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGAT a score=10682 s mm7.chrY_random 6973141 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAAT-------ACGATGTTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=38280 s mm7.chrY_random 6979112 1288 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCAAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCATTTCCTTATTCTTCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTTATTTGATCTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAATAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATATAGCTAACACAGGAAAAAAAAA---ACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACATTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGAACACGGAAGGATTGTCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTTTTTAGAACCATCTTTTCTGGTGTACATCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCACCTCCTGA---TCTCTCCTCAGCGGGAGGAGTG------TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCTCTCAAATTTTTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCAAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGGGCTCCTGTCCATAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGAGAACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCATACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAG------------AAATCT-----------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=8332 s mm7.chrY_random 6982558 364 + 30114534 TTAGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGTGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGGTCCTGCCTTCAAAGTTGTGATAAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTTTAAATT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTCACAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATATATTTGATATTTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAGACAAAATATTGAACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTA-GCGGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11210 s mm7.chrY_random 6983537 422 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGTAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTAAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTTCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGA---AAAAGTTTTGTTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=13925 s mm7.chrY_random 7064611 559 + 30114534 TACTGATAAGCTTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTTAAATCACAAAGCCCTCACACAACGTTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTCAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14263 s mm7.chrY_random 7070180 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 7074685 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=12491 s mm7.chrY_random 7076388 1057 + 30114534 ACAAATTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGACAGTGAGA---------------TCTGTAAGTGGACTTCAAATGCTTACAACTTTCTTAGGTTT--------------------GTGCT-----GGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGACGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGC----CATAATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAA---------ATGTGTGGATAACACAGATAATG--------AAAGACAGTGGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGG-----------------CCATTCTGTCT--GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTCATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCAACAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAG--------ATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTA--AGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCTTAATGCTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3108 s mm7.chrY_random 7099073 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=21171 s mm7.chrY_random 7106156 1296 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAAAAAAAACACATTGAAATATAATTAAATTTT----GTACATGTATATATATATAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttacgtgtgtgttgtgtgtgttTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAAACGTAAA---------TGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGCAGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaa------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895153 1369 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATG-AAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA------------------------------------------------ATAAAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6234 s mm7.chrY_random 7109033 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCatattattg-taaatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTACCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=7362 s mm7.chrY_random 7109748 424 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAA----------AACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAACTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACT--TAAAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT---TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 7111601 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 7112002 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=5395 s mm7.chrY_random 7118222 282 + 30114534 ACCTGGCACTACAAGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957658 300 + 62721844 ACCTGGGAGAATAAGGACAAAG-TAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 7119351 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATAAAAAA s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=4054 s mm7.chrY_random 7119673 390 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACCTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGGCCAAACATTCTTTAATGCAGTCACTTGGGAAATTCAA--TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAACAAAACATCTAATCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataatattataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4591 s mm7.chrY_random 7120259 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=2192 s mm7.chrY_random 7145173 96 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTGTCAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCGTTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA s bosTau2.scaffold2750 81955 104 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAA a score=2397 s mm7.chrY_random 7145295 112 + 30114534 TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAATTGAAA--AATTGTAATTTCTTTTCAATATTACCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 82105 115 + 102126 TATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=18946 s mm7.chrY_random 7145421 963 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATTAAGAAAGCTATTTTGTTCGGACAT----TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATTGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATACAAGTTACCCCCTA--TTGTAGGAAATGAGTGGATATTCTGACAGTAAATGGCTTTTATATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAAGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AAAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGACTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACAAAGTTTCTATGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTGTATA-AAACATGACGTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCTAACTCACTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=20196 s mm7.chrY_random 7296696 963 + 30114534 GCACTTGTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTCGTGAGTTGGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATTCACTTTCAGTCCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTGAGAGGTCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTCGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCTAAGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGAAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGGCTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGGGCACTTTCTAAT-ACCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTAGCACCCCCTTTCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCTATTTACTGTCAGAATATCCACTCTTTTCCTACAA------TAGGGGGTA----------------------ACTTGTATTCTGGC--------TAATTCTGTATTCACT------GTGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACTTCTTTGA------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGTGTAGGAAATTATAAGTATCGATTCAGAT-AATATATAACTTTTGAGAATTAGCTTCACATTTCTA--ATGTCCACACAAAATAGCTTT--CTTGATTTAAGTTACAGTTGCTATGTTTCACTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTC--AGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagctccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=2716 s mm7.chrY_random 7297683 224 + 30114534 TAATATTGAAAAGAAATTACAATT--TTTCACTTTGAAATTAAATCTCTGAAGATGATAACTTAACTTGTGTTTGGAAAAGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA-------------TCATTATTAATA------------TCAGCAGTATAAGGTTGTTCAAACAAAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAACAAAAATAAATGAATAGTA-GGTTTGT-AGCATTTGGCACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 19916 255 - 102126 TAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATACCTGGAGATCCTCCCATTTTAAATGAGAAGACCTAATCCAGAAAT-----TTTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=3854 s mm7.chrY_random 7326461 107 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCCATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGCTTTTAA s bosTau2.chr5 36527708 112 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGTTTGGTTTTTTAAA a score=3335 s mm7.chrY_random 7326897 70 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAGAAA---TA---TACTTTCAATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=7707 s mm7.chrY_random 7328397 432 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTACACTTAAACAAGAAAATGATTAAAGATATTTAAAAAT---AAAGAAGTTCTATTTTGACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAGCTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGatttttttatttgttttatatatatatatatataaC-CAGCAAGTGAAATTTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTTAAACATAGACATTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGA---AGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTT-TAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=5674 s mm7.chrY_random 7329124 418 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCA--TCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGATACTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGA--CTAAAT-ATGTGTATATTTTTACAATAACATGAAATAAAATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATAATGTGTTCAC-----CACTTACATACAAT--AATAATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=21173 s mm7.chrY_random 7331107 1290 + 30114534 aaatgcctagtcgttttcattgatagagtatgca---atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagataatggaacttaatttagtttcatatgctgaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt-------tttttatggtaccaaccactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAAAGAACACTCAAAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCTCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCA---------TTTACGTTTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacctaacacacacacacacacatacacacacacatatatatacaTGTAC----AAAATTTAATTATATTTCAATGTGTTTT--TTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAACTAAAATATACAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCAAACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGAAATGATATAATTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGGGTCAT----TTTGAAGAAAAAATAGATGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530122 1369 - 76426644 AAATACC-AACAGCTTTTATATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAACA--ACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTTTATTA----------------------------------------------TATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATAA---TTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=2977 s mm7.chrY_random 7339391 94 + 30114534 ATATTTTTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=13611 s mm7.chrY_random 7361053 1057 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATATATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCTGTGTTCCTGGTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGATGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC----AGA---------------CAGAATTGCCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGTTTCCCACTGTCTTTCA------------------TTATCTGTGTTATCCACACATTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTAACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTAGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATT----AGGGCCCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACTGTCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGACT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGTTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCCAGCACAAACCTAAGAAACTTGTAAGCATTTGAAGTC----------------------CACTTACAGATCTC-ACTG-------------------------TCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGGAA---TTTTTAAATGATTGCATACTACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAACTTGT s bosTau2.scaffold5600 1080 1221 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-----AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCTATCTA-CATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAG----CATTA---------------AGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACTTAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCATCTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=4587 s mm7.chrY_random 7363728 84 + 30114534 CTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACATATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006495 84 + 85360813 CTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=5712 s mm7.chrY_random 7364068 597 + 30114534 AGTGAGACTGATGAGCCTGCA---GTGACAGGACTTTAGCGTCTATGATAGAATTTGAGTCAGGCATTGTGTACTAACACATTAATTATGAGGATCTTGCTTAATTTTGTGTACATAGAACTGGATTATCGCATGGATCATTTCCCCCTCTTAAATTCTGAGC--ATGTGAAGAAAAGTGATGTTTCTCTTTCTTATACAATTAAGCAG---ATTCCATAAAAG------CTTATCTTTTCC-----CACTTCTAAATAAGCATTT----TCTTTTAAT-----------------------------------------------------------------------------------TTATTGGCATG---------------TTGTATGCTTTAACTGTTTGGTAGTTGTCTGTTAATTTTTGGTTGATCTT------------ACATATAAAGCAAGTTTGATAAAAATTTGGTAAGGAATTTTATGCATTTTATAATTGTAAAAAATTTTTCCACTCACCTCAAAGTGCTCTGTGGTTATAAATTGG--------------TCTCTCAGTTAGTAA-TACACAACACAAATTCAATTCCACTTAACCCTTCTGAAAATGAACTTTCATTGTATTGTCTGATTTGA--------AGCTAATAAATCTATTTAACTAAACCAGAGACATTTGTATTAGGAAGGAAACTACTACTGTCTGTTGTTTAGAAAATGGA---AAAGATACTTCT s bosTau2.chr3 39007047 704 + 85360813 AGTGAGAATAATGAACTAGCAACAGAGACTGGACTTTACCTTTTATGACAGAAATTGGGTCATACATT-----------CACTGTTCAT-------CTGTATGTTTTTATAT--------------------GTAGCTTTCCCCCCCTCCTTGAATTTTAAACATATATGAGGAAAAGTGATATCTATACTCCTAGTTTTGGTAAACATTTCATCACATAGAAGGAAATATTTATCTTTTTCTCTCACCTTTCTAAATGAGGGTCTTAAATATTTCAATTTGGAAGGTGAAATCTACACAGCAGATTAAGTGCTAACCTCTAAATTATAACACTCAGTTTAATCTTTCTGTTGGGCAAAATGTTACTGGTGTGACATAGTATAATGCCTTATACATATTATCTGCTTAGTGATAATTTTTT--TACTTGATTGATTTTTATCCAACTTAAGCATGAAAAGCAAGTCTGTCA---------TGCAGAATTTCCTGTAAAATATGAATTCACAAATTTTTGTCATTTAACTCAAAATGATAAATGGACATGGAATGAAACTAAAGAGATATTTTTAAAGTAAACAATTATATAATGTAACATCTGTTGTAATCACCTTTGTAGGGAATTGATTTTGAATTTATTCTCTGACTTGAAAATGCATAGTAGGTACATTTCTTTAACTGAACCTACTTAACATTTTTCAGAAAAGAAGCTACTCC---CTGTAGTTTAAAAGATAAAGttaaaaaaattttt a score=15258 s mm7.chrY_random 7367851 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGTTTATATCTCTGTATCCTCATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAGAGATGTCCAGATTCTGAGTATTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTCAAAAACGTTTCATCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTCCCAGCACAATCACTTCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATCTCCACATAGTTGATGCAGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGCCCAAGCCCTACACATTTGAGCTTAGGAGATT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=13638 s mm7.chrY_random 7373234 558 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCCATGC------TTTGCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTACTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAGT--AGATACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGG------CTTTGTGATTAAAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGCGTTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGTCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=11156 s mm7.chrY_random 7542427 277 + 30114534 GTTCAGATTTTATAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTAAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4837 s mm7.chrY_random 7545212 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14254 s mm7.chrY_random 7549463 375 + 30114534 TGGTGGCTAATA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAATGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13459 s mm7.chrY_random 7554853 556 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAACGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCACTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA--------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=21066 s mm7.chrY_random 7635455 836 + 30114534 ATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGATGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCCAAAAAGTTTGGAAAGGTTGTTTACCAATTTCTAGCCAATCCTTCCATGTACTT-ATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGTTTTTT--TTTTTACTGTGTTAGCTACATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTAAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACATCTAAAATCATA------CATGCTAAAA--GGAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGTTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTGGGGAAAGTCGGAGATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA-ATAGACTCAGAAA----TAAGAGAAAATCAGG s bosTau2.chrX 28529512 885 + 48857030 ATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCAT-CTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAAGAGGGACACAAATACATTTAGAAGAAGTTCAGG a score=10179 s mm7.chrY_random 7641849 401 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTTTTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATGTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTAGGAAGTGACATGGACACTTACT s bosTau2.chr17 20172806 405 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTG----CTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCT a score=5975 s mm7.chrY_random 7653786 152 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCATTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAATAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatat s bosTau2.chr3 45130465 181 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT a score=9599 s mm7.chrY_random 7654527 314 + 30114534 ACTGCATGCACAGACCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTTCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14139 s mm7.chrY_random 7658875 377 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGCGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGC-CTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=12145 s mm7.chrY_random 7668625 432 + 30114534 TTATATGGCAGAGAACGAC---CTGTAAATAATTAAAATATGAAAAA--AAAGCTTT-TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGTTCCCACGCTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172784 466 - 45915461 TTTTGTAGCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=37331 s mm7.chrY_random 7672022 1195 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGTTACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATAATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATTCCCACCTCGCCAGAGACCTGGTTGGCAGAGCAGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGAAGGGGGGTTGTGCTAGCCCAGGTTCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAAAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTCTGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGCCAACGATTCTTGAAGTT----GTAAA-ATCATAAAGTACAGAAACGTAAATGTATAGGACTGGAAGAAAAAACAGTTTTTTGTTTTTTTTTTCCTGTGTTGGCTACATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGCTCTAAAAATTTAAAAGTGT-----GACATGATATTCTGTGAGTTAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAATATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGTGGTGAACACTACGTACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAA--GGAACAG--CTTCTCTGGTCTGCATGT-------------AGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGAGATAGCAGCAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGA s bosTau2.chrX 28529038 1204 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT-GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAG----TGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCAT-CTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCT---TGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAA--------GAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGA a score=308 s mm7.chrY_random 7673217 116 + 30114534 GCATAGGTAGAAACTCTGA-------TGTGAACACTGAAGGAGAAACAAAAAGTTGGGGAAAGAGGGACATTTAAAAGAAATGTG--GCCTTGTTAC-ACAAGGTGAAACGCAGAAAACTGATTGA s bosTau2.chrX 20849551 124 - 48857030 GAATGG--AGAGGCTCCTAAGGGGAGGGTGACCTAAGAGTGGGAGGCAGCCAACTGGAAGAGGGTGAAGAATAACAGGGAGAGTGAAATCTTGGGGCTAAGAGGAAAAACGGACAGGATAAATTGA a score=10677 s mm7.chrY_random 7678940 437 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTTTTCACAATT--TTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTTTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCTGGAACAGTACAGTCAATCCTCCAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATCAACAA-AATTAATTGCACATCAACTGGTCCCACACTTTTAACTAAGTCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCAGTACAAATAAATAATGCCAATGTGATTATTCAT--GCAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGGTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTTTTGTGCAAATAACCCTAACCTCTGAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATACTACGAAGTGACATGGAC-----------ACTTATTACTAGA---TTTCATTTTCTTTTACAT-------GCTTTCGTTCTTTTAA s bosTau2.chr17 20172806 466 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCAG-TAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAA a score=19199 s mm7.chrY_random 7700961 963 + 30114534 GCACTTGTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTAGTGAGTTAGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATAGACCATTCAGTTTGAGTCCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTGAGAGGTCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTTGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCTAAGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC----CTCTCTTTGATTTTTATGAAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGTCTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGGGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTAGCACCCCTTTTCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCCATTTACTGTCAGAATATCCACTCATTTCCTACAA--TAGGGGGTAACTTGTATTCTGGATAA-------TTCTGTATTCACTG---------------------------------TGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACATCTTTGA-------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATAAGTATCAATTCAGAT-AATATATACCTTTTGAGAATTAGCTTCACATTTCTA----ATGTCCGAACAAAATAGCTTTCTTAATTTAAGTTACAGTTGCTATGTTTCACTCAGATAATCGATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTCAGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=2622 s mm7.chrY_random 7701938 112 + 30114534 TTAAGCATGATAATATTGAAAAGAAATTACAATT--TTTCACTTTGAAATTAAATCTCTGAAGATGATAACTTAACTTGTGTTTGGAAAAGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA s bosTau2.scaffold2750 19906 115 - 102126 TCAAACACTCTAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATA a score=2192 s mm7.chrY_random 7702076 96 + 30114534 TTGTTCAAACAAAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAACGAAAATAACTGAATAGTA-GGTTTGT-AGCATTTGACACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 20067 104 - 102126 TTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=13167 s mm7.chrY_random 7807676 557 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCCGAGTCTCAGCAAAAAAGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGTGGAGT-ATCTACTTATGCACGCTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATT-ACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC---------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14049 s mm7.chrY_random 7813208 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCAACAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 7817770 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=3273 s mm7.chrY_random 7817859 68 + 30114534 TTCACAGACCAAGTCCTCATCGATGACAGAAACTGTGGCTATGTACTGTG-TTTATACTTTATTCCTCA s bosTau2.chr3 39055378 68 + 85360813 TTCATAGACCAGCTCCTCATCGATGG-AGAAATAGTGGGTATTTACTGTGCTTTTTGGTCTATTCCTTA a score=3426 s mm7.chrY_random 7819162 55 + 30114534 CTTTCATGAACTCACAAGCCAGGATTCACTTCTCTGACTACACGGCCATCTTAAG s bosTau2.chr3 39056262 55 + 85360813 CTTTCATGAACTCGCAAGCCCCGATTAGTTCCCCTGACTCCGCTGCCATCTTAAG a score=11547 s mm7.chrY_random 7820370 277 + 30114534 TTCTGGTGTCTTAGAAGCCTTGATTGTCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGAAATTTCTGAAGGAATGGCCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTCT-GGCACCAGGAACACTGATGTAGTTTTATTTTTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 51228 277 - 52585 TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=9437 s mm7.chrY_random 7841212 407 + 30114534 AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCACAGTTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCAGCCATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCACCCCACACCCACACACACATTTCTACTTGATTA--ACCATATTGGCATTACTTATTTTCATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGAGAAATGTTGATGTATAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAAAACAGAAGTCAACAGGATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGAAGAAGATTTCCCATCGATTTAGTAAAATA-------TTATAAATATGATTTTAAAAGAAGGC--AACACCCTGAAAAAGTCTT--ATTTTCGTATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC--------------------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=2622 s mm7.chrY_random 7846557 122 + 30114534 TTCATCTTAGAATATTTTTGTTCCTCAGTGTCCTTTTCTCCTTTGTGTGT-CCTTTATTGTTTTTAAAGGTTACCATCAATTTAATCTTTCTTAACTTCTACCTGGTCTCTTTTCTGCATGTT s bosTau2.chrX 28021335 122 + 48857030 TTCTTCTTAGAAT-TCCTCCTTCCTCAGTGTCCCTTCCCTTCTGGAGTGTCCCTTTAGTCTCTCCCCTGATCTCTGCCAACTTTTCTTTCTCTCCCTTGCTCTGGACCTCTTCTAAACATCTT a score=35814 s mm7.chrY_random 7847029 1171 + 30114534 TCTATCACTCTTT-----CCCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATTCC-------AGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCCTTC--TTCCTAAAAATCCATCTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTAATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTGCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAATGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCAACATA-GGAAAATAAACATTTTTTTCAATCCT-------ATAAGTTTACTTTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTTAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGGAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGAATTGGCTAGAACTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATACATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCAAACCAGGGCGCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAAGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGCTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCTATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGA----TGTCATGCTCAGACTCTTCAG---AGGTATTGTCTTCTAC s bosTau2.chrX 20326712 1223 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATAC---GTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCTTTTTCTTCCTCATACT-TGCAGACAAGGTGTGGTCATCAAC a score=9892 s mm7.chrY_random 7850029 492 + 30114534 TTTCTGACTTGACAACATCCATGGTGGTTATTTTTCATGTTCCAACCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTCTTATCATAAATATTGCCAGACTCTTTGAGGCAGCACACTGGATAGCACACCAATTTTCACTTTATGAAAACCCACAGTTAGAGGAGGACTATTT-TTATGCAAAAAAACCTGGAATTTGACAGGGTTAAATGACATATATTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGAAAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAAATTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAAGTTTT-TAAAATTTACCAGCACTTCTGATTACAAGGAATTTCAGAGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAGATGAGGTAATTTTAGTTTTGAAATATGT--GTAGACAGAATACTGGACACAGGTATGTATAAAATTTACTTACAAAT s bosTau2.chr17 25750424 451 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAG---TGTTGCCCATATAGAATGTTGGCTG----------GCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAAT-AGTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAACTTGGA-CTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCAT a score=21403 s mm7.chrY_random 7865395 667 + 30114534 TACTCATGTCACTCATGTTCCATTTTCTCATGCTCCTTTTTCTTCATTGGTCTTCCTAACAGAAAAAAATGTAGCCTTACAACAAATCACTTTTGGAATTGTATTCATGGTGTCTGTTTCCACATTGCTTGCCAAAACAATCATTGTAGT-TTGGCTTTCATAATCACAGAACCTGGAAGAGGTTTAAGGAACCTCCTTTTATCAGGTTCAATGAAATACATCCTTCTGATATGTTCCAT-ATCAATGTATTC-TGTGGGTAATCTGGCTCTCAGTTTCTCCTCCTTTTGTTGATATTGATATTTGTTGATATTGATGATAATGA--TAATCATTTTGTGCAACAAGGGTTCAGTTACTGCATTCTACTGAATTTTGGGATACTTGACCTGCCTTGCCCTTGGAAGCTTCACTGTGGATTTCGTGGCAAAGAATTTTCCTGAAACATTTAATGAAGCCAAGTTCCTGACCTTTGTCGTGCTAGAATTCTGCAGTGTTTATGTCACCTTCCTCCATGACTCACATAGGACTAAGGGCATGGTCATGGCTGCTGTAGAGGTCTTCTCAATCTTGGCATCCAGTACAGTGATGCTTGGATGCATCTTTACACCCAAGATCTACATCATTGAAATAAGACCAGACTTGAATTCTATCCAAGGTGTCAGATAGAAGT s bosTau2.chr7 14417433 662 + 69141744 TGTTCATCTCCCTCCTCCCGTGCTTCCTC-TGCTCCTTACTCTTTATCAGTCGTCCCCACACAGCCACCTCCATCCTC-CAACAGACCACATTTGGAGCTGTGTTCACTGTGGCTGTGGTCACTGTTTTGGCCAAAATCGTCCCTGTGATCTTGGCATTCAAGGCCAGGAAACCAGGAAGAACCATGAGGCGATTGCTCTTAACAGGACCTGC----TATGTCTTTCCCATGTACTCCATGATCCAGGTGATCATCTGTGGAGTCTGGCTGGGAGCCTCTCCCCCTTTCCTTGAGATGGACACTCATT----CTGAGCCCAAGGAGCTCCTCATCGTGTGCAACAAGGGCTCGGTCACTGCCTTCTACTGTGTCCTGGGCTACCTGGGCTCCTTAGCCCTGGGGACCTTCTCCTTGGCTTTCCTGGCCAGGAACCTGCCTGACACCTTCAGTGAAGCCAAGTTCCTGACCTTCAGCAGGCTGGTGCTCCTCAGTGTCTGGGTCACCTTCCTCCCTATCTGCCACAGCACCAAGGGCAAGGTCATGGTGGCCGTGGAGATCATCTCCATCTTGGCCTCCAGTGCTGGGCTCCTAGGCTGCATCTTTGCCCCAAAGTACTACATTGTTCTTATAAGAACTGATAAAAACTCTTTGAAAAGTTTAAAGAATAAGT a score=3870 s mm7.chrY_random 7882583 73 + 30114534 TGCACAAGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCGGACACACACACACAA----ATACACATAAGCTTATGCACATAATC s bosTau2.chr14 47301233 77 + 50711261 TGCACATGTGTGTACATGTGCATGCCTGCATGCACACACACACACAAATTTATATACAAAAGCATACAAACATTATC a score=8736 s mm7.chrY_random 7915874 476 + 30114534 acacaattattcaaacGAATAAAGGA-----------ATGAAAAAGAAAATG-------ATATCAACTAATA-------AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCTCAGGTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCAGCAATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCACcacacacacacacacacacacacacacacacacacaTTTCTACTTGATTAACGAT---ATTGGCATTACTTATTTTTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGGGAAATGTTGATGTATAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAATACAGAAGTCAACAATATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAGATTTTCCATCGATTTAGTAAAA----------TATAAATATGATTTTAAAAGAAGGC--AACACCCTGAAAAAGTCTT--ATTTTCATCTTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742175 480 + 45915461 ATAAAGTCATCCAATTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC--------------------------------------TTTCTGCT-AATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=36305 s mm7.chrY_random 7921776 1194 + 30114534 TCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATACCAGAGATTCTATCTATG-TCCTGTCTTTCTCCGCTTCTTCCTAAAAATCCATTTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATA-----TCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGCATTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCTACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCA--ACACAGGAAAACAA-ACATTTT---TTTTTCAATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGGAGGTCACCGAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGAACTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCACCCCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGTGCGCCTGCGAGGTGGACCTCCCTCACCTGAGGAAAATCTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAATGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGATGTCATGCTCAGACTCTTCAGATGTATTGTCTTCTACCTGGCTGTAGACCTGTTGTGGT s bosTau2.chrX 20326712 1216 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCC------TCCCCCTAGAAGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCTTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATAC---GTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGT a score=9210 s mm7.chrY_random 7924773 497 + 30114534 TTTCTGCCTTGACAACATCCATGGTGGTTATTTTTCATGTTCCAACCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTCTTATCATAAATATTGCCAGATTCTTTGAGGCAGCACACTGGATAGCACACCAATTTTCACTTTATGAAAACCCACAGTTAGAGGAGGACTATTT-TTATGCAAACAAACCTGGAATTTGACAGGGTTAAATGACATGTATTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGataaaattaaaaaaaaaaaaaCCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAAT-TTACCAGCACTTCTGATTATAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATGT--GTAGACAGAATACTGGACACAGGTATGTATAAAATTTACTTACAAAT s bosTau2.chr17 25750424 451 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAGTGTTGCC------CATATAGAATGTTGGCT-------GGCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAAT-AGTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAACTTGGA-CTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAA-----TTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCAT a score=26366 s mm7.chrY_random 7952036 730 + 30114534 GAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTTTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATTCTTCTTGTAG-TACTGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCATAACCCTCCTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCACCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCTTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTATCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20327276 716 - 48857030 GAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=11967 s mm7.chrY_random 7955674 502 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCAGATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAACTGTGGGAATTGTCAATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAA--ATTCATGAAAAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG---GTCGTTCTGTGCCATATAAAGAAAGGTAGAGAAGAAAAGCTGT-TTTGGAGTCACTGACATACATTTAACTGAG-GTCT---CTTTGCATAGTA s bosTau2.chr17 25742211 539 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGC--TACAAAACAACCTAGTCAACAAAGAATGCAATTGGAGTTTCTTCTGCCCTTTTAGCTGAATGTCTGAACTTGGCAAAATA a score=14316 s mm7.chrY_random 7965420 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTTATAGCAGCTAGTTGGCTATTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGCAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCGCACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9601 s mm7.chrY_random 7969879 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGTCTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTACTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGCTCTGTGCATTCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=2775 s mm7.chrY_random 7970547 118 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATACATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAG s bosTau2.chr3 40230044 99 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTTTT-AAGAAGTGGGGTGGG a score=5470 s mm7.chrY_random 7970737 105 + 30114534 atatatCTTAGTAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTA s bosTau2.chr3 40230167 105 + 85360813 ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCA a score=9983 s mm7.chrY_random 8031672 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTCTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGCTCTGTGCATTCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA--TAGCTCTTT-------TAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=2775 s mm7.chrY_random 8032342 118 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATACATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAG s bosTau2.chr3 40230044 99 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTTTT-AAGAAGTGGGGTGGG a score=5676 s mm7.chrY_random 8032508 152 + 30114534 atatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230167 181 + 85360813 ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10553 s mm7.chrY_random 8044187 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAATGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=38467 s mm7.chrY_random 8050178 1287 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTCTCCCAAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTTACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCATTTCCTTATTCTTCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTACGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAATAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAACGACCCTTATATAGCTAACACAGGAAAAAAAAAC----TTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACATTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGAACACGGAAGGATTGTCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTATAGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCACCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTTTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTTTGGCAAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAGCCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGAGGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTTGTATACCATACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAG------------AAATCT-----------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=8332 s mm7.chrY_random 8053620 364 + 30114534 TTAGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGTGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGGTCCTGCCTCCAAAGTTGTGATAAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACAAGTCATGTTTTAAAGGCCTTTAAATT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATATATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAGACAAAATATTGAACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTA-GCGGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11088 s mm7.chrY_random 8054623 422 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGTAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAGGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACTTTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTTCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGA---AAAAGTTTTGTTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=13206 s mm7.chrY_random 8135896 556 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGTGGAGT-ATCTACTTATGCACGCTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATT-ACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC--------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14132 s mm7.chrY_random 8141461 375 + 30114534 ATCTCCTAAGTTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4806 s mm7.chrY_random 8146110 79 + 30114534 CCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354244 79 - 85360813 CTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=11359 s mm7.chrY_random 8148717 277 + 30114534 TTCTGGTGTCTTAGAAGCCTTGATTGTCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATCGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTCTGAAGGAATGGCCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTCT-GGCACCAGGAACACTGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 51228 277 - 52585 TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=10067 s mm7.chrY_random 8218668 492 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTCTGAAATTCCTTGTAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTTTTTGCATAA-AAATAGTTCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGGCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=36084 s mm7.chrY_random 8220961 1194 + 30114534 ACCACAACAGGTCTACAGCCAGGTAGAAGACAATACATCTGAAGAGTCTGAGCATGACATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTATGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCAGGCGCACTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATC----AGGTGATAACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAAAGTAAACTTAT-------AGGATTGAAAAAAATGTTTATTTTCC-TGTGTTGGGTACTTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCAATACAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATTACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACGTAGAGGAGCAGGGATGGCAGTAAAAGATGGATTTTTAGGAA--GAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGGG-----AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529102 1216 + 48857030 ACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGA-GAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTC---ATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGT----AAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGA--AAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=9860 s mm7.chrY_random 8227582 458 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCTGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATAAAAATAAGTAATGCCAATATGGTTAATCAAGTATAAATGTGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAGAAATGA--TATAAACTATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-------TCCTTTATTCTtttgaataaatg s bosTau2.chr17 20172806 473 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATC-CTCAATTA-----------------GCAGAAAGGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATG a score=11584 s mm7.chrY_random 8275908 277 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4837 s mm7.chrY_random 8278700 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14263 s mm7.chrY_random 8282953 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13239 s mm7.chrY_random 8288300 558 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGATACTCCACATTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGCTTTGTGATTTAAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGT---------TGAAGCTGTTTAATATTTTAAA----ATTTCCAGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=3870 s mm7.chrY_random 8407624 73 + 30114534 GATTATGTGCATAAGCTTATGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACTTGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=21545 s mm7.chrY_random 8424223 667 + 30114534 ACTTCTATCTGACACCTTGGATAGAATTCAAGTCTGGTCTTATTTCAATGATGTAGATCTTGGGTGTAAAGATGCATCCAAGCATCACTGTACTGGATGCCAAGATTGAGAAGATCTCTACAGCAGCCATGACCATGCCCTTAGTCCTATGTGAGTCATGGAGGAAGGTGACATAAACACTGCAGAATCCTAGCACGACAAAGGTCAGGAACTTGGCTTCATTAAATGTTTCAGGAAAATTCTTTGCCACGAAATCCACAGTGAAGCTTCCAAGGGCAAGGCAGGTCAAGTATCCCAAAATTCAGTAGAATGCAGTAACTGAACCCTTGTTGCACAAAATGATTA--TCATTATCATCAATATCAACAAATATCAATATCAACAAAAGGAGGAGAAACTGAGAGCCAGATTACCCACA-GAATACATTGAT-ATGGAACATATCAGAAGGATGTATTTCATTGAACCTGATAAAAGAAGGTTCCTTAAACCTCTTCCAGGTTCTGTGATTATGAAAGCCAA-ACTACAATGATTGTTTTGGCAAGCAATGTGGAAACAGACACCATGAATACAATTCCAAAAGTGATTTGTTGTAAGGCTACATTTTTTTCTGTTAGGAAGACCAATGAAGAaaaaggagcatgagaaaatggaacatgagtgacatgagta s bosTau2.chr7 54723649 662 - 69141744 ACTTATTCTTTAAACTTTTCAAAGAGTTTTTATCAGTTCTTATAAGAACAATGTAGTACTTTGGGGCAAAGATGCAGCCTAGGAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGATGATCTCCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGCAGATAGGGAGGAAGGTGACCCAGACACTGAGGAGCACCAGCCTGCTGAAGGTCAGGAACTTGGCTTCACTGAAGGTGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGAAAGCCAAGGAGAAGGTCCCCAGGGCTAAGGAGCCCAGGTAGCCCAGGACACAGTAGAAGGCAGTGACCGAGCCCTTGTTGCACACGATGAGGAGCTCCTTGGGCTCAG----AATGAGTGTCCATCTCAAGGAAAGGGGGAGAGGCTCCCAGCCAGACTCCACAGATGATCACCTGGATCATGGAGTACATGGGAAAGACATA----GCAGGTCCTGTTAAGAGCAATCGCCTCATGGTTCTTCCTGGTTTCCTGGCCTTGAATGCCAAGATCACAGGGACGATTTTGGCCAAAACAGTGACCACAGCCACAGTGAACACAGCTCCAAATGTGGTCTGTTG-GAGGATGGAGGTGGCTGTGTGGGGACGACTGATAAAGAGTAAGGAGCA-GAGGAAGCACGGGAGGAGGGAGATGAACA a score=9389 s mm7.chrY_random 8439771 492 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAACTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTTCATTTAATCTCTGAAATTCCTTGTGATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCCTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTTTTTGCATA--AAATTAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCT-GAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35881 s mm7.chrY_random 8442059 1206 + 30114534 GACAGTGTGATTTAGCACAACAGGTCTACAGCCAGGAAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTGAGCATGACATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTAAGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTACTGTGTACTTTATCAAAATTCTTGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAAAGTAAACTTAT-------AGAATTGAAAAAAATGTTTATTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTTTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAAAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATTACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAA--GAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGGG-----AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529089 1229 + 48857030 GAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=9487 s mm7.chrY_random 8448491 458 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATACGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCTTCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATGAAAATAAGTAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-------TCCTTTATTCTtttgaataaatg s bosTau2.chr17 20172806 473 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATG a score=11370 s mm7.chrY_random 8497164 277 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATAAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4806 s mm7.chrY_random 8499985 79 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGG s bosTau2.chr3 39006490 79 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAG a score=14263 s mm7.chrY_random 8504351 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13236 s mm7.chrY_random 8509701 555 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGCGTGCATAAGTAGAT-ACTCCACTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA-------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=11386 s mm7.chrY_random 8591223 423 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAACAAAACTTTT---TCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGGAGAAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAAAAATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAAAGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCTTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTAT----TACTTG----------ATTACAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATAT-AGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38859 s mm7.chrY_random 8594778 1288 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTATGGTATACAACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCCTCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCATTGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTATGGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGCTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTTGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACAAAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCAGCTGAGGAGAGATCAGGAGGTGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCTATAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGACAATCCTTCCGTGTTCTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAATGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAA---GTTTTTTTTTCCTGTGTTAGCTATATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTATTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGAAGAATAAGGAAATGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGAAGTAAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTTGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------AGATTT------------CTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10553 s mm7.chrY_random 8601659 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCATTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=7450 s mm7.chrY_random 8613572 298 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatatatatatatatatatatTATCACAAAGTTCTCACACAACTTTTTAAAAATACTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATGTATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130465 304 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT-TATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAA---CCCACCCCACTTCTTAAAACCA------TGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9983 s mm7.chrY_random 8614226 314 + 30114534 ACTGAATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAAGAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTA-------AAAGAGCTA--TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14530 s mm7.chrY_random 8618611 376 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGTGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTAGTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11888 s mm7.chrY_random 8628362 413 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATTGACAATTCCCACGGTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=27250 s mm7.chrY_random 8631686 731 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAAGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGAGGGTTGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACAGTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=3363 s mm7.chrY_random 8696905 332 + 30114534 CATCATTTGTCACAAGTACAGTTT-----AAATAAATAC-------TATAGAAAACTTCATATTTTAGACAAATAAAAGGAAATTGTATTAGGTAATATATTATAACCTGGGTTCGTGtctaagcattttatagatattatttttgtt-gctttc-----taaaattcatgtcatcttatagatataatataa--------attgttatacccattttattgatgaagaaataagacaaagataaattaagtTATT-AAATTTACATTATTG----------GCAAAAGG-----TCAT-TTCCCACAGGGTGGCTCTGCAGCTGCCTGTGGCAG------------CAAATTACTGAGAGTCTTATCACTTTT-TCTCAGATATCAA s bosTau2.chr2 48796379 359 + 86543008 CATAATTTCTTTCACATAGAACTTGAGTCAAATAAATAAATCTTTATGTTTAAAGTTTTATATTTCAGATAACCAGTGGTAAAAT----------ATAtactgtatgctagaggtat-tccaagtattttatatgtattatttcattcagccttcatagacaaaactc---------------tatgagacaagaactgttattattatccacattttatggatgaggatataagacagaaagaaagtaactttctgaaagttgtatgacagttcctgggctgcaaaagtattgttcatactccagcagtatagtccagaAACT---TGGGGCTGAACTATTCCATCCCATTAACAGTGGGTCATATTTCTCCTCTCTGCAACATTAA a score=31603 s mm7.chrY_random 8697286 1566 + 30114534 AATGAGCAATTTCatt--aaaaataataaatttgaaaaataaatCGAAGAAAGGAATAACCTTCAAATTAACTTTTTCTCTTCTCCCTAGTTGTTCACTTAGAAGCTAAATAATTTT----------AATTGATTTGTGATTATATATATGAAAATAAATTCTTAATATTACTCTCATATATACATATGGAAGTAAAATACATATATACATATGGGAGTAATATTAAGAATTTATTTT-AATTTCTTCTCTCAAGCCTCATCATTTGTTTTGCTTAAAGTAATTAAAT-------GAGATAAACTTGAGTAAAAGCAAAACTTCAAAAAATGGCTGTGAAGTGTTTTTTAATAGTGTCTTAGCTGGTTTTATAATTGTTGTTTCAGTTCATTT--CATTTTTCTAGCCTTCCTGTAG--ATTAAGTACTCTCAGATTTTGCATGCCATTTAAGTAATAGTTTTTACACTGTTTTTCATTAAGAAATTAACAAGGAAAAGTGATTCTTTTAATACAAGCAAATTATTTTTCAGGCAGTTTCCAGGGATAAGATTATACCCTTCAGAAAG--CATGAGTAATTTTGCTATTCAGTGACAACAGTAGATGAGAGAA------CGTGCGTGCTTCCTAATGTTTTATCCTGTCATGTGAAGAAGACTCTGTAACTCTCAAAACTCAAATTCCCTCCTGTG-AGGAAATGGAACCTCAGAAGTCAGTGGTTGGCTGTATGAGGAGAAGCTAT-GGTTCACATACAGAGA----AGGTTGATGAGAAAATCAATTAATTCTCTGAAAATATCACCCCAAGAAAATATATCTCAAAGCTGTACCCCTTA----AAAGAAATATGTTTATATCATACTA-CCACCTCATACTAATTTGT--------------TGATAAATTTTAT---ATGATTTACTGAGCCAGCTAATAAATATACTCAGGATCCATTGTTTGCTAGGCAGGCAGACTCTGGTCCTGAGTACGGGCCAATGGGGATTAGATTCTAGCTTGATGAAA--------CTGGTTGGGAAGCAGGGAAAGATGAGCAGTAAAT-GGCCAGCAGAAAATGAATAATGGGACTTTAGTT--CAAAAGTTACACAAAAAGAAATCAAAGACCAAAACACAAGGAC---CAGCCCTTTGCTTTAGTTTTATAAATTAAACATGAAGCACACGAAAATGTGTGACTTACTACTATCATTTATCTTGTTTATAGCATGTGTATAAAACATACACACAACTGAAACACACAGATTCTATGAATCTAGTTTAAGAAGCAAAACCATATAGAGTCCTCTGGGCC---------------CTTCTCTCTTA--ACCCTCTTTGGACACTGCCATAATTTTTAATTATGTGTTCATCATTTGCTTAGTTTCCCCAGTGATTTTCCAGCGTGCATCTGTTCCTAAACATGCAAATTAGTTTCCATGTTTCATA-------GAAACTGCATGAATTAAATGGTTTTTAACCATATAGCTTTTCACTACTTTAACTGGTTTTAACAATACAACTATCAACTACTTCAACTGGTCTTATAGAGTCTGCTTGTTGGCCTTTGTTTCTGATGTTCATCTGTGTTGATGAATCTTCGTTTACTTTTGGTGCTTCAGATAATATTTCTGTGTG s bosTau2.chr2 48796807 1490 + 86543008 AATCAGTAATTTTTTTTTACAGAGATTAAATTTTAAAGAAAGAGTTGAGGAGGAAGAA-----CAGGTTA-----------CTTCATAAATTGTACAGGCAAAAGTTGAAAGttttttttttttattaactgatttagaaaaatatatatatatattaGTTAATGACTCAATTCT-------------------------------------TGGGGATGACA-----AATTTATTTTTAATCTCTACATTAAAGAATTATTATTTATTATTTCTGAAATAATTAAATAGCCAAAGAGTACAATTTGAGTAAAAGCAAAATCTTAAAATACATATGGTAAATGTTGCTTAATGGCTTCTTAGCTCATTTTATAATTGTTGTTACACTTCAGTTAACATTTTTCTGGTCTTTCTTTGGTAATTAAGTTCTTCTGGCTTTTCCATACCATTTAAGTCATAGTTTTT-TACTGTTTTTCATTAA---ATTAACAAGAAAAAGACGTTTCTTTAATACAAGCAAATTATTTTTCACGGGGTTAACAGGAATAGGATTACATCCTTCAGGAAATTTACGAGTAATTTTCCTATCCAGTGATAG-AATAGATGAGAGGAGCATTGCTCAAGTGTCTCCTGATCTTTAATCTTGTCACGT---TGATATTCATTAGATGCCAAAATCCAAAAGGCCTCCCATGAAGAAAATAAAATCACGTGTGTGGATGGTCAGCTATTCAAGGAGGAGCAATGGGTGCAGGAACAGGAAACTCAATTTGATGAGAAAATGGTTTGAGTCACTGAAGATAT------AAATAAATCCAAGTACAATCTAAGGCCCTTATGGGAATGAAACATAGATACCTAAAAATGTCTCCCTCACAATATTCTGTAGTTAATACCTCTGTGATACATATCAGCTAGTGattcattaaatgaacagatcactatgtttagcacctagtaagtgt----aagatactatcttatttttagcactgaactatatagaccaggtaccagtttaatgaagcctgcagtctggtggggaa--agggagagacacataataaacagattatcaataaatgaataaggtgatttcagatggtgataagtataaaaaaataaaacAAC-ATGAATACATAGTGACTGATGGCC---------AATTTAATACAT-----------------AAAATGT------------CATTATTTATATTATTTATTCCATATTTATACCACATATATAGAACTAAAATTCCCAAATGCTTAAcatctagctttagaaataaaac---atggaatcctctttgtacgctgctgatctcagcttctcccttaccaccgcattgagaatttgccaccatttttaagcctgtgtttgtcatttgcttgattttcctagtgattttaccacacacatatatacctga-----caacagagtgtcta-gttttacatacttacaatgttacaaaaatgaaat------------catagcttttccc-------atttgtt-------tgcaacta---------------gatttttttaggtctacat-------tttgtttctgatatgcatccatgctgatgcatattcatgcattttcaatacaatatgtaatattcctgtgtg a score=8391 s mm7.chrY_random 8699036 472 + 30114534 CAGTTCTTCCAGCCGTTGATGTGTTTGTTCCCCC----------TAAGTTTAGAATTTATTAAAAAGTTCTTTCTGGTTGAATGTAACTACTGA-----CAAAGGCTAC--------TAAAGCAACGACAACTGACTCATTA----GGATACTTTGTATCCATAGAAAGAAATAAGGTGCTTAAGATAAA--------GTAGAGAAAACAGTACAAAACACATTATAGAAACCGGCGCTGCATGTGGACTTTGTAAGTAAGTCATCAGTCTTAG--CCCTGACATGGTTTCTC-CATTTTCCAACAGATT--TGACAGTAT----TCCAGTAAAAGGACC-----------------TTTGTGAGATGACTCCACAGTGCCCTAGACATCTAAGATGA-GGCATTGTTCTTGATTTGAAAAGTTGCAATGCCTTTTAGTAAATGTTTTTGCCCTCACAAAAATGATGAAATGA----------------AAAGGATGGTTAAATCTGAAATTCAATTCTTCCTAAAGTATCCACAGAATTTTATTAAATA s bosTau2.chr2 48799661 519 + 86543008 CAGCTATTTAAACCTCCAATGTGTTTATTTTTCTCCATCAGACATGAGTTTAGGATGTTTTAACAAACTCTTCATAGCAAAAATTAATTACTGATTAAACAACATCTACAGACTGAATACAGCAATATTGCTTGATTAATTAATGTGTCTACCTTGTATTCATAGAA-GAAATAAGGCATTTAAGGTAAAATAAATAGGTAAACAAAGAAACACATTGCACTTTAAAGAAA-----------------------AAATAAATCATCAATCTTAAATCTCTGACATTACTGCTTGCATTTTGCAGCACATTGATTGCACCATAACATCTTATGGAAAAACCCAGATAATAACATTCTCTGTTTTGAAGGACTAGAAAATACCCT-GAAATTTAAGATACTAGCATTATTCTTAGTTTGTAAAATCATAATACATTTTAGT--ACTTTTTTG----CACCATAAGGCTAAAGTACATAGTTACAATATTTTAAAAGATATTAAAATCTAAACTCCATATCTACCTAAAATATTAACACTATATCATTCAGTA a score=56622 s mm7.chrY_random 8702235 2637 + 30114534 CATATTTTTTCCTTTAAAATGTTTTG--TAAAGCAAGTCTATGAGAGTAAAACATTTCAGTTTGTGAAAACTCTGCTTTAAATGGGGTGGTGAG-----------------TTAAAACTGGATTG----------GAACCTTATGCATCAATGTGGGCTATGTACA-GGATACCTAGTGCACCTACCTAGCCGCTCAGATTAGCCTCCCTTTCATCTTTA-----AGAGCTATCTTCTCCTGATCCAGCCATTACTCTTTAGTTGTGCCA-ACTACAGCTAAAACCG-ACGTTATCAAGCTGAACTGGGATTTGTGTCAGAATGTCGTGGGTAGCACCAGTAAATATTCCTAGGTGTCCCTAGAATTCCTCTGTA------------ACAGAGTCGTTTTGGTGGGGACTGGGTGTAATCAGGGACCATCTTTGCCCCCTGCAGGTCTGTCTGGCTATAGCCAGTTATCACTATAG------------------TTGCTAACTCTTCTAGGAAAaaaacaaaacaaaacaaaacaaacaaaaaaaaaaaacaCCCAAAAAATCCAAGACTGAAAATCTTGATTGTTTTTTAGCACTAGCTGTCTATTTTCAAATTCTGAAAAATACATTTTTTTAAATTaaactttgtgtgggccaaacaaaatgcatcactggctggatctggtccaggggatgctagttgagaacctGAGATATCACCCA-CCCAAGGCTTCACAGTTATTCAAAGCAGA-AAAGGGAGGGTGTGAGAAGTAATTGGGCTATTGTGAAGCGGAGTTTCTTAATATATTTGGAAAGGCCTCCACTTCAAACACTGCATATGAATAATACATGATAGTGACATGTATATTATTGTACTTTAAATATAAATGTACTGCTACACTAAAATAACTTCTAAATCCTCCTCTTGTTCTTAGTTGCAGAACAAATTTGCATGACCCAATTACCAACATTCTGGTGTGCAGTTAGCAAAAAAACATGCTTTGACTAAAGACTGCGCGTGCAAAAAAAGAATGTGTGTGCCATTCAGTGAAGAATGTGACATGACACGGTTTCCAGTCACTATACTGAACAAGGAATTCTGAGTTCCGCCAACGACAAGCATTAGCCATCCTCCCATTTGATT-GGAAGTATAGATGTTTGCCTC--TTTGTA-GGTTTTGC--ACTGTTTAAAGAAAAGCGGTAGGAAAATGTGTCATTTTGGGATGTGTTAGTTTT-TCTTCAGTGTCAGCATGTTAGGTTATGTTGAGTAGCAGGCACAGGATGTCCAGAGCAATCCTACAGGAATCTAA-------TTTAGAGAT----GGATGAGGTGGAGTCCACAGCCCAGATCTAAATGGTAGATCCTTCTCCATTAC-TGCAGGCACATACATAAATATAAA-----TTGCAACATTGTCGAATCTGCTCATTTGGCAATGTAT---GAATCAGCACCATACCATTGCAGTACTTAATAGCGTTCTCTCCTTCTAGCT---CTCCTGTCTAGGTTCCTTTAAATTCACTTTCCCTAACAAATGACTACCACCCAGGCATCATCACTGAATTTACTAGCACTTCAATGGCTGAATTTATTTCCACATAAATACACAAAATGTGTTTGGTGCATACACAA--TAGAAAAAGACCTTTAATTT-------------CCATAAAGCTAAG--GGATTGTTGAGTAAGGGGTCAAAAGCTGTATAGCATTCATAACAATGG--------GTCATTTCATTCCTCCATAGTttcagcaaatattcacctagctcttactatgtgtctttccacagtataagggtagatgatgcaatggcaaaAGAAAATATTATTTTTCATGCTGCATGGTTGCAAACGTGCACGATCACATCA---TGCTAATATAAACACAC-------AGGGCAAGCTATAGAATATTGGCATTTTGAACCTTGTGTAAGAAAATTACTTCCTTAAACATGATTCTGTACTTGTTGCATATT--AATTCTCCATTTACATCTGACCGTCTTGTCAGTAAAATGTTTTTCCTTTCTGCTGGTTGTTTGTTTGTATAAGGATACAATGGAGAAGTAAAGTCTTAACAGTAGAGCAAGAAAGTTCCTATAATATCATTCATCAGGTGTGATCTCATTTGCTTATCAT--TTTTCCATTTAAAAAGGAGACAAACCTTTCCAAGTTGTATTAAAGCGCTCGCCACATTTCT---TGGATTTTACTAATCAGAATTGAAACACACAGCTCCTGACTTAGCCTGGATTCTTAAACAAGATGCCAGTGATGGCTGAC---CTCA---AACACCGAGTGCAACCTGAATTTAGCTACTGCTGGTTAATTCTGCTCTTCCTTCACTCTGCTCCTTTGGGGTTTCT--GTCTTCTGACTTTCCTAGTCATTAAGAAC-------TCAGTAGCCAACT-----TTATCCTAGACCCTTTATGATTCTCTGCTGCACAAAGAGGAGTCAGATATACTTGGG----TTACTTTTATGTTCCTGTACTTTGTAATTGTTCTGCTTTGTTTAGCATTGCTTAGCATGCTTTTATTGATTTTCATGTCAAGTTGAAGTTATCTTCACATGCAAGGTCAGTTAAG--------------TTTATATTTTATGATCTTTCAGCCTGTCAGTACTCTGTAAAAAATGATATAGTCACTGAACGAATCTTAACAAACTAAAAACAATTTCAAATAAAA---TAAGTCAACGATCTCTAAGAAAATTTGATGTGACTTAGAAATAAAAATTAAGACAGCATACAATGGTTAA s bosTau2.chr2 48800999 2598 + 86543008 CATACTCTTTTCTTTAGTAGGGTTTACATAAATCAAGTTTAAGAAAGAAAGAAAATTCAGTTCATGGAAACTGAGCTTTAACAACGATGAAAAACACCTTTTTAAGAGACTTGAAAACTTGATTCTTGAAGAAGCAGACATGATTCTTCAAGATGTTTTATAGATGTAGCTTCCCAGTG-ACCCACCTGATAATTGAAATTTCTTTACCATTCATCCCCAGTTACAGAAATAGCATC-CCAGAAGTAGTCAGTATTTTTCATTCATGCCAGACTACAGCTAATGCTATAGACTATGAAATTGAACCAGGCTGTGTGTAAGGATGTGATGAGTAGCATC--TACATATTCCCAG-TACCTGAAGAAGCCCTCTTTAGACTGAGGGAAGACAAATGATGCATGATGGGGCCTGCATGAAATCAGAGCATAAGGGTGTCCCCTACAGACctactgaggtacagaaaattgttgccatgaagaagtgtaggctcccttttcccagctctttt--gattttaacaaaa-----------------------------------------gggactgaaaatctggatttgtgt---gtaatagcttcctttttctagattcttgcaaatgatctttaagacattgcacactatgtgggcaaaaca-----catcactagctggatctgacccatgaagtgccagtttAGAGGCTGTAATATAATTCGGCCTGAAGATTTACACCTGCTGAAATCAGAGAAAGGGAGGATATGGGAATTAATTAGATTATTGAGAATAAGAGTTTCTTAATATATTTGGAAAGACCTCCACTTCAAACACTGCATATGAATAGTGCATGATAATGAGATGAATATTATTGTACTTTAAACATAAATGTACTACCACATTAAAATAGCTTCTAAATCCTCCTCTTGTTCTTAGTTGCAGAACAAATTTGCATGCCCCAATTACCAACATTCTGGTGTGCATTTAGCAGAAGAACA--CTTCTAC-------------------AGAAGAATGTGTGT--CATTCAGTGAAGAACGTGACATAACAGGCTTTCAAGCTACTAAACTGAACAATGAATTTTTAATTTTGTCAGTGACAAACATCAGCTATTCTCCAATTTGTTTAAGGAGTATGGGTGTCTTCCCACGTTTGCACTGTTTTTCTAATTTTTTAAAAATAGACCTTAGGAAAATGCATCATTTATGAATGCACTGTTTTTCTATTCAGTTTCAGTCATATAGATTCCAATCAAAAGT-GACATAATATATCCTGGACAATCTTACAGAAGCCATACATTGCCTATAGAAGTTTCAGGATGAGAGTAATTATTC---------CTAAATGGTAGTTACTTCCCCATTACTTACAGATGCATAAATAAATAAATACAATCTTACAACACTGTC--CCCAGCTAATTTGAAAATATATAACAAATTGCCATGATCCAATAGCTACATTTA----CATTCTTTCCTACTTCCTACGCTTTTGCCTATATTCCTTTAAATTTATTTTCAGTAACATATAATTAATACTCA-GCAGCATAACTGGATTTACTAGCAGTTAATTG------TGTCCTCCCACTTAAATACATAGA----TCTTGATTCAGACACCATCTACACATATACATGTATTCTGAGAAATTTTGTGTTATAAATCCAAGTAGGATTATTAAA-AAGGGGTC-AAAGATATA-AGAATTATTGATAATGACTCTTTGTGTGGTTTCAACCCttcatttattcgtcaaatatttacttagcacctgctatgtgcctgactggagtacaggtgtgtacaacaca-----aacaGTAAACCTTTTATTACGTAT------ACTACACATTTCCACAATTATATTATTCTGCTATTATAGACCTACCAAAGGAAGTACAAATTGCCATATTATACCATTTGAAACCTGGTGCAACA-------------GTACATGAGCCCA---TTGTGACATTTTCCCCTCCTCTTCTTCTATGTG-------TATGAATAGAATATTTACATTTGC--------------------AAGGACCCAGTGAATAAGGAAGTTCTT--------------AAGGTT----TGACTTCATCCAATAGTCATGACCTCATCTAGCTCTCATACTTTTATATTTAATAAAGAGTAAAATCTTTCAGAGTAACAGTAAACCCATC-CCTGATTTCTACCAGGGTTCCGTTGGCCAGAATTGGATCACAGA---TATGTCCTGGCCAGAAATATTGAGCAA-CCATCAGTAGCATCTGGCACACTTACTTAACATCCTTTAACACTCCAATTTAACATCCTCTCTTAAATGTCCATCTTCCCTCATACTACTCCTTTGAAATATCTTCTTTTTCTGACATCTCCACCTGTTAAAATCCTACGTTTCAGTAGTGAACTGAAACTTGTCTTGAAGTCTACATATGCCTCTCCTTCCCAAGAGAAGAACTTCTGTATTTTAAACATTCAGTCTGTCACTACCTTCTTTTCTAATTTTTAGGCTTTGTTTAATAGTTGTTAGTATGCATCT-TTTCTTTTGGTATCAAATTATAGACATCTTTGAATGTAAGGACAGTTGTGTTGTTGTGTTTTTTTTTTTTTTTTATGGTTTTAAAAGCTTTTATCACCTTCC--TAAATGATATAGGCACTGA-----------------AAAAATATTTCTGAATAAAAATTTAACCCAGAGAATTCTAAAAATATGT---------------TACAAACCTGAACATCATATGATAGATAA a score=7295 s mm7.chrY_random 8707784 461 + 30114534 gttgga---gaaggaggaaccatgttcagaacatattatatga-----------CTGTTTTTTCA-ATTTAAAAAAAAACTTCCCTTCTTCCTCC-TTGCATCCTGCTTGCTTCTGTGGGT-TTTGACATGGCTACTTTTGTGTCAAACTTACTGACCATGGTCACAATTATAAGAACTTT------TCTTAACCTCTCTGCTCTAGCCTCAGTTTGCATTTCTCTGGACTATTGATTTGCCCTATG---TCTAAGTTCGAATACAGTTAGATTTCCAGATAAATTATGTAT--GATCTAAGCACAGACTAGCTAAGTTGCAT---AATTCTAAAAATAGTGTTTCTTCATTATCCTTTATAGAGCCTTCAGATAACATCCATTGTGCAGTGCAGACATGTTTGTACCTCTTTGTGTTATGTTGATGGATGTCCTTGGTGGGCTTTGCACTACAAAGGTA-GCTGACCCAGAGAGCTGCACAGTTGATTTAGA s bosTau2.chr2 48804739 476 + 86543008 gttggacatgactgagtgactaagcacaGCACATATAAACTGATCAATTGGTCTCTACTTGTTAATATTTAAAAAT---TTTACTTTCTACCTTAATTACCTCCTGACAACGTCTACATGCATTTGAAATAGTTGCTT--ATATTGAACATGCTGATCATGTGCACTATTTTTCAAATATTCTGATATCTTGGCCATTGTAT----GTGTGTGTTTGCATTTCTCTGGAATGTTGAATTGTCCTCAGGCCTCTAAGGTAGAACATATTTATGTTCCCAAATAAATTTCTCATAAGAATTTATCTCAAACAGATTAAGTTTTCTTGAATCTCTATAATTAA---TTCTTTGTAAACCTTTACATAGTCTTCAGAAAACAAGCACAGCTTGGTTCAGACTTATTCAGATCAT----TGCTATGTTGATGGGT-TTTTTTGTGAAATCTAGTTTTTAAAAGTATTTTTGCATCGAGGACTGAGTGGCTGATTTAAA a score=3458 s mm7.chrY_random 8708321 179 + 30114534 TACATGTGGACAGAAGGACAATTTCAAAG--CCATAAAACA--TAAACTATAGCTTAGGTGAGAAGAATCATATCATGAGCATTCATTTCACAGTTTTTAGTGTCTTATAACGTGGTTAGGAAAAAAAAAATGAATGCTAGAGAAGGAACGCCTGAAACAAAACCTTGTTTAAACACCTCTGT s bosTau2.chr2 48805350 167 + 86543008 TACATATGGACAAAAGATTTGTTTCAAAAACCCATTTCCTAGTTAAAAGTTAGCTGAGGAAAAAAAAAAAAAATCTCAAACATTCATT--AGAATTTTTGG-ACCTCACAATGTGA--AAAGAAAAGAAAATGATTATGAAGGAAAGAATACAC-ATACAA----------AAACACCTCTGT a score=2348 s mm7.chrY_random 8708640 109 + 30114534 ACTTTGCAGAGAATATGATATGGGTGTGTTTGTATCTGTGCATTCAACATCATGTATAAATTTA--GTCTGAATGATACCTAATGAACTTGAGATTCTTCATGAGAATAAA s bosTau2.chr2 48805908 103 + 86543008 ACTTAGCAAAATATAATATCTACCTACCTACCTATCTGTCTAT--------ATACATAAATATATCATCTGAACCATATTTAGCATACTTAGGATTCTTCACCAGAAGGAA a score=60868 s mm7.chrY_random 8709689 2159 + 30114534 TAGTATGTTTTC-----TATTTCTTTTTAAAAAGCAAGTTACAACTTGAATTTCAGAAACTTGAAACtttaaatt-----------------------------------------aaaattgttttataatatatCACATTTGAATTTTCAAATATTAACTTTGAA-------AATCATTTAAATGTGCATAGTATTACTAGCTTATTGTGCTCAAATGCAGTCAAATCATCAAAATAATTTGCAAAAAAAA----------ATAAAGATTGGCCCAG---ATTTATAAAGGCTGAT-----GAGCCATTCCA------------CTCATGGCAATGGCA--------------GCTTTCTCATTTG-TATGGTT-----TTAATATTCACAAGAA--TAAACCAC-----------------------CTGTGATTCATTTC-ACATGTGATCAGCGA--AAGGACAAAACAGTTTTTACGG--AGTTATCCT-AACAGAATATACCTCTGAAACAACTACTGGAAGACCA-----GACCAGAG---------------TGAGTGGCTGTGTTTCCTCTCTCTAAGCACACATCAGCAGAAGGCATCTGAACAGGATAGTGCTCTCCAAAACTGGAGAGATGATGCTTTCttttatttttttaataaaaaataatcaatactaaattgatttaaaataaCCTGTATTATGAAGTCATAGTATAATTACACTTTAAGAAGCTGTGATGGACAACAATGAGATTGCATTTCCTTGGAAGAAAGTGGTGACCTTGGCAATTTAATACAAAGTCCT-TGTCCACAGACA---------------GACATAAGGTAAGGCACTCAGTCTTTTCTTCCTAAGATTTCCCAGGTCATGGCCTT-TGAAGGGATATTACTAAAAGGGATTTTGCTGGGCCAGAAAGTACAAATGAAAGATGGTTGATGAAATGTGTGGCGAGGAG-----AATGCTCGATGCTATAGAGCTAAAATGAACTATGTTTTGTCTCCAGGGCGGCCATGACTTAATGTAATGCAGCCACGAACATCATAAATCAAGAGTCCTCAGAGAACAGTGAGGGAGACAGTGGTTAAAGAGAAACTGCCCCATGCCTAGAAGAGGTTATGAGTACTTATACCTGCTTGTGCACACATGCCTTGTCTTACATGCTTGCACATACATGCATACGTATGCATACTATATATACACATTGCATGTCAAAGATTTTAATTTTCCCTTCATAAATGCACCGTAGTTCTTTGGAATATTTTGGATACGCAGGTATTATGAGATTAAAAGTCTATCATTTTAACTTCAGCTAGCACAACTTGAATTTTTTTTTCTGTTTTAGAAATACTTAAACCTTCGCTTTGCTTTGTCTGTTCTCAGAGATGA------------CTAGGTAGAGGCTGTTTATGTTTCTTTCTTTTAAGAAAGTCTTGACAGCTGCTCCCTGGGGAGGAGATCTTGCTTTTTAAATTTTTATTAGGCTACAGTATCTGAAATTTGGAGAGCAGACATTAGCCTTTGAGGTGCAGTATTTGATGGCATGAATCTTTTAAGCTGTAGTACTGGGAGAGAAGGTTTTAGAGATTTTCTACAGACCATTTGTCAGGGGATGGTGAAGCATTTGTGAACAATACATAGTTAAAATGTGCTCGTGAACTTTTCATTAGATGATATGGGGAAAATCATACTGGCATGGTTTTTTTTCTGGAAGATTCAATGACATGTCAACTCACACAGCTACTAAGGGCACAATGGATTTTTTTTTT---------CTGCTTAGCACTCATTTTCATACAAAAGAATTGTCTCCCTAACTAGAGTTGCCTTATATTATATAAGTTGTATGCAGCATAAATTGCCATGAAAATAGGAAAGAGCATGGAAAGTGAATAGAGGAGTGTTGACATGAATAAAGAAATAAGGATGGTGAA-------------GTTTGTGTTC---CCTTTTTAAATGT------------------AAAGAAAGTCTGCAATGTTTTCTGAGATCAAAGCAGGCCTTAGAGAAATCCCTCTACAAGCCCCTTCCCCGGGAAACTATGCTTCGCCTCACC------------TAAGAAGTATCTTTATCTTAATTTGTAACTTAGTTACAGCCTTTTAAAAGCAGCACCTTTCTGTAGTAACAGGGATTGGGAGGAGACTAAACTTGAGGCATGCCTTTGATATTTTAAGTATTACAATATACAGAGTGTGAAAAGAAAAACC-CCAGCCTTAACTAACT-GGCCATGAAAAGTGGTGGTACAAAGCTCGTAGgagctatcagatatggttgctggaaactgaattcaggtcccttgaaagaacagcaagtattctttactcct s bosTau2.chr2 48807571 2229 + 86543008 TAATATGTTGTAGAATATATGTTTTTTTAAAAA--------TAAACTGAACTTT-GAAACTTAAGGATTTAAATTTTTTGAGTGCTATTTATATTTTTATGTTTATATGTTTTTGTGGAGTAGCATTTTCAATTACCAAATTTCAGTTGCCAAATGGTTATTTTTAAGTTTTTTATTCCTTTAGCAATACTAGATTATAGTAGCTTTAAGTATTTGGACACAGTCAAATTATCAGTATAATTTGGATAAGAAATAATGGATGAATATAAATTTAATCACTTCATTTAAAAATGCAGATAACATGAGTGAATTCATCTAAATTTATTCCCATAAAAGAATCACTATTTTTCCAAATGCCATCTAATTCAACGTGGTTATCTTTTGTCATTTACAGAAAAGTGAACTACAACATAGCCAAAATAAAATATAACTGTGATTTATTTCCATATGTGGTTAGTGGCTAATGGCAAAA---TTTTGAAGGTAACTCATCTTCAATGCATTATATT--------AGTTATTAGAAAATTAAGAAGGATCTAAAACTATCATTATTCTTTAAGATGGCATATTTTTCTTCTCAAAGCAGAAATTAGCAGAAAGATCCCAGGCAAAACATGGTTCATAGAAG--AGAGAGTTTATGCTTCT-----------------GAGAAAGTCAATATTAAACTGATTTTAAATAAATTTCTTTAAAGAGTGGTAGTATAAT-ATACTTTAGGATTCTACAATGGAAAA--ATGAGATTGCATTTCTGTGGAATAA-GTGGTGATTTTTCCAACTTAATCTAGGGCTCTCTGTCCTCAAATAAATTGTTCCACGGATGACATAAAGTAAGTCGTTTGGGCCTTTCTACACAGGGTTTTTCAAATCAAGCTTTTGTGAAAGAATATTACTACAAGGAATTTTACTGAACCAGAAAGTGTAAATGAAGGATCATTGATGAAATGTGTTGAGAGGAGGGAAAAATGGGAAATGCTGCCGAACTAAAATGAACTTTGTTTTGTCTCCAGGGCAGTCCTGACTTAATGAAATGCAGCTATGAGTAGAATAAATCA-GCCTTTGCATAGAGAGTTGACAGTGAAAGCACTTAAAAAGAAACCACAATGTCCCCAAGATAGA--------------ATCtgtatgtg----------------tatatgtttgtgtatatgtgtttgtgtgtgtata--------------------tAAAAGATTTTCATTTTCC-TTCCTAAATACATCTGATATATTTGAAACATTTTTGTTCCTCAGTTATTGAGAGATCAAAAGCCCATCATTTTAACATCAACTGGCATAACTTGAATTTCTTTTTTTATTA-----------AAAACTTGCCCTTACTATGTCTTTTTTCAAAGACAAGACTTTGGTACTCTAGGTGGAGGCTGTTTATGTTTCTTTCTTTCAAGAGATGCTTGACAGCTGCTCCCTGGAGAGGAGCTCGGACTCTTTAAATTTTTATTAGGCTTCGGTATTTGAAATTTGGAGAGTAGACATTAGCCTTTGAGGTGCAGTGTTTGATGGTATGAATCTTTTAAGCTGTAGTACTGTGAGAGAAAATTTTAGAGATTTGCTACAGACCATTTGTCAGGGGACAATGGGGCATTTGTGAACAGTATACAGTGAAAATACGCTTGCAAACTTTTCATTAGACAATAT-AGGAAAATCTTACTGGTATGTTTTTC-------AGGTTTCAGTGATACGTCAAATAGCATAGCTACTGAGGATGTAATGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTACCATTTAGTTCTCATTTTCACACAA-------GTCTCCTTGGCTAGAGTTGTTTTATATTGTAGAAGTAGAATATAGCAAAAATTTTAATGAAAATAAG-CAGAACATGCAAAGTAAATAACGGTATATCAAAATGAATAAA-AAATAAGGGTGGCAAGAGCTAGAgtgcgtgtgtgtgttcatatctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtAATACAAAAGAAGCCTTGTGTGATTTCCAGAAAGCAAAAGAGACCTTAGTGAAATCCATTT-TATGCACATACAGAAAGGAA-TGTTATTCCTTTCATTTTTTTTTGTTTGTTTACAATGTTTCCGTCTTCATTTGTAATCTAGT----------------------ATTTCCATGATAACATAAACTGGCAGGAGGCCAAATTCAAGGCACATGTTGATTATTTCAAATAGCAGGGTACATAGGCTGTGAGAGGAAAATTCACCAGCTTTAACCAGCCAAGGCATAAAGAACAATGGTAAAGAATTAG--------ATGAAAAAAGGTT-------------------TTTCTTGAAAAAATAGC-ATCATGCTCTGCTTCT a score=11784 s mm7.chrY_random 8714145 571 + 30114534 TTCAGCACTGTCCAG--ACTTTCTATGTTAGTAGAGGCCAC-----------CTCATATCTATTGGAGGGAATCTCATTTATTTTTAGTTTCTTGTCTAAAATTATATGTCTGAAGTCTTCAGAGAGCATGTGAAGAGATATAAAAATTTTCTCTCTGCAAAATAAAGACAAGATTTTCCCTGAATAACAACTGGGTCAAGTCAGAAACAGCCCATCTGCTCTTCATCT----TCCTGCTGGATAGCACAGCACCTACTGTAAAA-TCTCCTCACTTGCTCCCTGGAGAATGCACACTGCCGTCTAAGTGAAAGAACTTGTTCTTTGTCCATACTTGTCTGAGTTCAGGGCACTCCGAAAGCCAGGCA-GGAGACAGATATTCATGAAAGTCTTCACTTTACTATGATCTATTTACCTAGGTGCCTGCTATTAAATTTTGATCTG--TTTTAAACTGCCATTTGTCAGTCAATT----------------GCAAACAGTTCTCTAAAATGGTCAAATACCAGAAAACTGAAATTTGCA-GTCAGTTTTCAATTGCTGGGATCA---TTTTAGACATTCAGCGCTAGAGCTTGATATATGGGTCAGTGGGTAA s bosTau2.chr2 48811587 585 + 86543008 TTCAGGCCTTTCTGGCAACCTTCTGTGTTAATCTAGACTGTGGTAACAGCTGCTCACAATTACTGGATGCCTTCACCTTTTTTTTAGTCTTCCTTTCTAAAATCTTGTTTCTGAAATCTCCACAATGTACATGAA-AGACATAAAAATTTCCTTTCTTCAGGGTAGAGAAGAATTCCCTCCTGAGTAACCACTGAGTCAA--CAGGAACAGCCAGGTTGATACTCATCCAGGATGCAG-TGGACATCATTGTATTGGTTATAAAAATAGCTTGAGTAGCTCCCTAGGGAACGGCTGCTACCACGGAAGTAAGACTTCCTATTCTTTACCCGCAGCTCTCCGGATTTATGGCACTCTGAAAACCAAGTGTGAAGTAAGATACTTGAGAGA-TTTTCACCCTA----GCTGTCTGTACCTGCCTGACTACAGTTAAGTTTTGATCCGTATTTAGAACTGATAAGAGTCACTCAACTACCAGCCAACCAACCAACAAACAAACCAGTGAAG-GGCCAAATCCAAGGAAATAGTCATTTTAAGGGCAGTTTTTAATTGAGAGAAACATTTTTTTAAAAATTCAGCTCTAAATCT-----------------GATAA a score=15511 s mm7.chrY_random 8714897 937 + 30114534 GACTTCCATGTGTACTCAGTGGGAAacacacacacacacacacacacacacacCAGCTCTACGTATAATATCAAGATGTTGACTGTGCAGTCACTGAATGCAACAACTTCATTTCTGATTAATAAAAATCAAGGAATAAATAGCTATGTGAAAAGTACATATTTGGGAG------ACAGAAAAGAAAATAAAAAGGGATTTTTTAAATCTTTTGTTAAGGGGATGAGGAGGGAAAGAAAGATCTGTGAAGAGGAACCTAGGTAGAAAAA--AATATGCAGAGAGGCAGCAAGAGGGGAG--CCCCAGGCTATGGGGCTGATGTGTTCCTCAAGTTCAGCAGAGGCTCTGATCTCACAGCTCATTTGTACAGGAGTCATCAAAGTGTGTCATCCCC-----TCCCCCAAAGCAATGCGGTGAAATTCCAATGAGGTTTCCAGCTATGATCCAATAACCACTGCTCTCTAACTGCTCTTATACTG------CTAACCTTTGGT-GGTATTTAACAAGCACCTTGACAGCCCCCA-GGGAAACTGGTTACACTCTCTTAGATT--------ACAGCCACAGGGGCACTGTTCCTTGAGTTCTTGTCGTCCTCAATGTGAAATCAATTTCGACTGGGGTTTTTCTATTTCACCTA--------CATTCAGCATGCTTGTTGAGTTTTAGCGTGGATAATTTTCTCCTTGCCTGGCACAAAACCCC---AAAATTCACTTTTTTTTTTTTGCCTGCTGTTCTCAAACAGAACTCTTTACTTG-----TCTCTCGTAACTTGTAGTTTCAGACACTTTCACACTTACAAAGAAGTTAT--AAATTATGCAGAGAACTTTGCGATTTTTCTAATGGTAATA---TATCACATTAGTAGTCTGCC------TTTTCCCACTCAGCAGTATGTGAAGAAGTTGTCCACCTTCCAGTCTAGAAGATCCCTGTCTCTGAAGTACATCAGGACTCCTCTTTCTCAAA s bosTau2.chr2 48812172 910 + 86543008 GACTCACATGTGTATTCACT---AAATACACA---ACTCAATTTTATAAAGCCCAATTT----------------ATTCTGATTATGCAGACA----------------------TGAAAGATAAAAAAAGAGAAACAGA-ATCTA-GTGAA--------ATCTGGGAGTGGAAAAGAGAAAGAAAGCTCAATAGGGA-----AAATTATTTTGGT--------------GGAGAGAAATATTTATAAAGAGAAGATCACACAGAAAAGCTAAAATTTAGAGAGGCAGGAAGGGACAAGTTCTCTAAGCTATGAGGCTGATGTGTTAATCGAGTTAGGTTGTTGGTCTGACTC--CAGTTCATCTGTACCATAACCATCAAAGGAAGTGATCACCTGTTATCCTTC-------TCCTTTGAAATTGCAATGAGCTTCTCAGCAATTATACACTAGCCATTGCTCTTCAACTATTCCTATTACATTTAGTTTAACCTTGGGTAGGCATTTAACAAGATGCCATGCAGCCTCCATAGGGGATTGATTTCATTCTCATAGATGCATTGTTAACATCCATAGCAATATTATTTCATAGATACTTTGGATGGACCAGATGAAATCAATTTCTTATGGAA-TCTTCTTTTTCATGCAAATAAAAGTATTCAGTCTGTTCCCTGA-TTTTAGCATGGATTCTTTTCCTTTTACCCAACTCCAGAGCCTTCAGATAGGCACACACGCACATAAGCACAGGCTTTACGAACAGAATCCAATACTTGTTTTTTCTTTTTTAGCttctatttgtaaataacttcaaacttaaagaagatttatgaaaattatatgaaaaacttcaagatttttcaaatgttaatattttaccatactggcattctctctcattattttttacctcagtcatttgtgagaacattgtagacctgtagatcctaatcatctctttctcc-aaatgcttcagtatttccACCTCTCCAA a score=5602 s mm7.chrY_random 8716636 528 + 30114534 ATTCTCCTGGATTGCTGCTGTCTCATTCTT-CGTATTCCTCTTTATTTTACTGAGAAATATTCTGGGGTTATGTGGTCTCC----CAGAAATCTGTGGGCGAGCATTCTGCCTCCTTA-CTCAATATTCACCTCCATCTCCTTCCTCAA-------------------------------------------------GACCAATAGAACAGACAGT------AGCAGCATCAAAGTTGACGTGACTTTGCTTAATTTAGTCCTCTAGATGTCCCATTCCAGAACAAC-----TTAGCATTCAAATTTGGTCCAGACCTTCTGA-CTTGAACatctattacaaaagggggttgtgagggttaagtgtgctaggaaatatacagcacctttaagatcagcacccagcaG----CAGATGAATGGAAGAGGTATTGTTAAT------TCACACAAAACAGTTCTCCTTGATGATCATCTTTCCTTCCTGTTATTTTCC-ACCAGTCGTCATGGTAACATCATAATCTTA-------------------AAAGTGACCATCA----TCTCTACATGGTCCTGGCTACCTGACTC------------ATAAGCAG--ACATCTG---AATTTTCCTTTTGTACTTATACT s bosTau2.chr2 48813261 626 + 86543008 ATTTACTTGAGTTGCTGACATCTCATTTTTTCCTGTTCATTCTTATACTTTTGTGAAGTATTTTGGAA--GAGAGGACTGCAAAGCATAATACTTTAACTGAACATTTTTGTTTTTAATCTCTAAATTC----CCATTTTCTTCCTAAATTTCATGCTTGACCCTGCAAATAGTGTGATGCTATCTCACTTCCAAACAGATCAATATAAAATACACTTTTAACAATGGCATC-----TGAAGAAACATGATTTATTTTGGTCAGTCAG-TGTCAAATTCCAGAACAACAAGTTTTGTGCTTCTAACATCATTGAAATCATGTCAGCTTGACTGTCTAT-Acataaagttgttg--aatattaagtttgttaataaatgtaaagcac--ttaagaaaaatatttggcaGGTTTAAGTTTTATATGAGAGCTGCtattattatattttaatataaaataattCTTC---AAAGCCATCTTTCCTTCCCATTATTTTCCTACTTCTCTCTGTGGTTATGTCATATTCTTAGCCACATAGGTTCAATGTCAGAGTGATCATCAACTTTCTCTCTTGTTTCCCTTCCACTTTATTCCTACTTCTACCTCTAGGCAAACACATCTGATTATTTCTACTTTTGCAATTGCATT a score=6978 s mm7.chrY_random 8717507 522 + 30114534 TGTTCGTGGCGTTGCTGCCACCACCCTGAGATCCAGCTGCCTCACCTCACTTCTGTACTTAG---CTTCAGCCAGCTGCTGTGGTTTCTTCCATTGTTTAATTCCCTAAGCAGAGCACAATGGAGCTCACTCTC-----------TCCTGACAGCAACTGACACAACAGCATCCTACCTAGCTCAACATCTGCACATGAAGTAGTTCTCCGCATTAATATATATGCCCTTTCTTCTACTGAGCCTGTCCATCAAATGAGAATATTCACACAAATATTTTGTAGTATATAAGGTGTTGCATGAGGTATG--TTTTGGGTTGTATT-TCACTCAC--------TTTTAATCAGTCTTTAGGAGAAAATTCTCATTAGCGTTCTCTAGAGTGTTATTATCAAATCGATGTGACAGCA------------------------TTTAAGATTGATGTCTTTT---AGACCAAAAAAAATGCAGTATCAGTTTTTGGAATATTTTACTGCC-ACAAACACACAT-------------GTTTTATGAAGAAAATA-TGAGCAAATTTTAAACAACTTCACATTTTGTATTTTTTTT s bosTau2.chr2 48813887 563 + 86543008 TGTTCCGGATGTTACTGCCATCAGTCTGGG--CCAG--ACCTCACTACA-TCATGTGTCTGGTAACATTAGTTACACAGTTTTAGTTCTTCTCCCATCCAGTTTTTCTA-TACAGCATTATCAGATTCCCTTCCCCAGGTGATTTTCTTCCAAGGTATTGGAAACACAGCATCCTGCCT----CAGCCTCTTCACACCAAATACTCCTGCTCACTGGAACATATTTCTTTTTTTAT-------CTGTCCATTAAATGAGAGTATTTGTGAATACACTTTGTGAAGTATAGAGTCCTCTGTGAGATTTTACTGTTATGCTACATTGTAACTTAAGCTGTGGGTTTTAATCAGTTGTTAGGAGAATATCCT-ATTAGTGTTATCGATAGTCTGATTCTTGAATAAATGTGACAACACCAGAAAAAAACTCATAAAAACCCCTGAAGATTAGTGTGTCTTTAAAGGGTTAACTTAACTAAATGTCAACTT--------TATTACTTCCTTTAAATATAAATTTTTTCATTTTCATTTTTATGTAGAAAAGAGTGACCAATTTTAAGAAAACTTGATACTGTAGATTTGTGTT a score=4228 s mm7.chrY_random 8718402 135 + 30114534 TTGTTTTCCCTCTTTTCTATTCTGTTAAATAAAGCACTATGATATTAGGTCCAAACCTGCAACAGATAACAGTGTAGTTAATATTTAGCTTAATA------AGTGTAGAAA---GATGTCTTCAGAAACAATTTATTTCAAAGC s bosTau2.chr2 48814454 144 + 86543008 TTGTCTTTCCCTTTTTCTACTGAGTTGAGTAAAGCATTGTGAAAGCAATTCCAAATCTGTGATGGAAAATTGTATGAATAATATTCAGGCTCATGGATCATAGCTTAGAAATGCAATAACAACTAAAACAATTCACCTGAAAAC a score=19181 s mm7.chrY_random 8719820 887 + 30114534 TCATTTCTAAATCTGTCAAAGTGGTATATCCAAAAGTAAA-CAGGTAG-----GTATCCAGTGAGTTTAGCAG---TATAAATTCTCACCAGTCAGACACTACTACAATTGGTTTCATCCAAACAACAGTTGTTTCATAGTTTTTCATTCATTAAGAAAATGATCAATAAAGCCATTATCCTTTGTTCTGCTTTCGAATACCAACTGCTGTAGTCTAAGTCATGTCCAATTCTGTATTGTA--------TGATTAAATTTAATCAAGGTTTTTATATTCCCTCTTCTAAATTCAACATTGGCATTTTCTGAAGAGGTTATTGGATTGCTGTCAAATAGAAAGTATCTGTAGACTCTGAGCATGAGTGCATACTGGAAAATCAGACATTTCTAAA-TATTTTAATGACACATCCACC--TTTGTGACTATGTGAGCCTTCCATGAGTTAACCTCTTGTGAACCTATGATAACTATTGATCCAATGAAGAGTCATCTGGTTAAATGAAATGAAGACAAAGGAAATGAAAATGCTACATTTTATTCAGCTGACTGCCAATTGCATTGCTCTACAATTGTTTTCT-GTCTGACCCAGGGCTGGGTGTGCGTATTATCACATTTCATTGACATTCAACCTCAAGGTAAAGATGGATGCACATCTGCTGTC----------ACCAGGCTAGATTTAAAGTGCAGG-GCAGAGGCTTAC----TTTACGCACCATTTGTTAGCAATGCATTC---ACAGGTTCCATGTGTCTTCACTATAA-GTAAGGGAAGGTTGACAGTAAACTGTA-----GGGATTCTTAGTAAGTCCTTACTTACTTAATGTAGCATCTGCATTAAGATTGTTACCAACTACAAGGGTACCATGTATACTCAGCTAGGATATTTACCA-------GAAAAAACTGGGAGGAT--CAACCTTAT s bosTau2.chr2 48820395 870 + 86543008 TTGTTCTTTAGTTTGTCAAAATGAAACATCTAGATCCACATCAAGTAATCCACGTATGGACTGGGTTTGATGGGACTATAAACTCTAATCA------CA-------AATCATTCTCACC---AGAGCAgttgcctcat----------tcactaagaaagtcatctataaaaccatatt--tttgttctgctttataagatcaactgctaacaactgaatcatatcccattctgtatcatgaaattggtttattgaatttattcaagatttt-gtatttattcttttaaattctgcttcattattttcCAAAGAAACTATCAGATTGTCCTCAACGATAAAATGCCTATGGAACCTGATTAAGGATTTGCGGTAAGAAATGTGACAAGTTTAAAGCATTCTTAGGGCTCTTCTGCCATCTTGTGAATATGCAAACTCTCCATGGCTTAACATATAG-GATGCTATAATAGCCTGTCATTCAGGGCAGAAGCATCTGATTAAATAAGGATGAGGGAAAGCAAAGGAAAAAAAT-CACTTTAAT-----------------------TCTTCAACTGTTCTCTTGTCAAGCATAGGATTAGGTAAATGATTTATCACTTTTTATTGACACCCAATCCTAAGAGGAAGATACATACAGATCTGTTCTCTTTGTACCCTACCATACTGGATTTAAAATCTGGGCGCTTAGGCTTGCGTCTTTTTCCCAGCATTTGCTAGCCATGTGTTATAAGCAAGTTCCTTGAATCTTCATTTTAAAGTGGAGAGCAAATGAGACTAAACCTTACAAAGAGAAGTCTCATTAAGTGCT-----------------ATTTGTATTAAGATTATTACTAACTACAGGACAGCACTATCTACTGCGCTAGAATATTTTCTATTAATGGGTAGGAATGGGGAAAACACCAACCTTCT a score=13610 s mm7.chrY_random 8720882 476 + 30114534 ATCTGTAAGACATAAAATGTATTTATCAATGATTCAGAACTTAGACTACACGATTCCCTTTCTGTGATACCTTT--ACTTTTTGGCCAATGAGTTCATTACCATTTTT-ACACTCTACACTGCTTGATCAGATCT-------CTAAGAGAT--AATCCAGAGATTATCTGCAATTATTCCTGCAATATTCAATTCACACACAG-TGTTTTGTTTTATGTCTCTGG-GATGGTGCCTTCCAGGTCATGAAAGTGCAGGGATGATTCACTGCTGAGATCCATCA-CAGGTCGCCCTGACTCCAGAGTGGATTTGTGTACTACAACACTAGTCCATAGACTGACAGGAGAGAAAGTGCTCCTAACAGGCCTTGGCCATAAATTGTTTTAGTCCAAGTGAGAAGGAAGAATGATTTGAGAATGAATAGGTGGGAAGGAAACTCCATAGACCTTTTGATTCTTTCTTGAATTACATACACATGAGGGCAGGGCACC s bosTau2.chr2 48821486 481 + 86543008 cactccagtatATAAAGTACATCTCCATATGAATCAGAACCTAGGAAGCTTTACTTTCTTTTTTGTATATCTTTTAAGTTTTTGTTCACTT-TTCCATCAACATTTCTCACCTCCTACAACCTTTAATAAGATCTTTTGAGACTGAAAAATCAAATCTAAACAGTGCTTGC-------CTTGGAATTTTTACTTCTTTCAAAACTACTTTGCTTTTGTGCTCTGGTAAAGGCGTGCTACAGTGCAGAGCAGCACATGGATGATCCACTGCTGTAATCTATCAGCAGGGCTCCCTGGCTCCAAGATGGATTGTTGTATTACATCATCAGCCCAGAGGCTGACAGGAAAGAAAGTGCTCCAAACAGACTTCTTTCATAAATTGTTTTAGTTCTAATGA-AAGAAAAAATGATTCGAAAGGGTATAGATGAGTAGGAAAACTTACTATACCTTCAGCTCTGTATTGAATTATATGTACATGAGAGCA-GCCACC a score=7182 s mm7.chrY_random 8721524 342 + 30114534 TGTGGACATTTGCTTTCCTAGCACAAGTGCTTAATTAACCACCTGCAA-----TGTATCCTGTTTGGGTAGCAGAATCATCACTGAACTAAAATATAAACATTTTCAAATTCGTCTAAGTAATACATGACATGAAACTTTGCAACTCTATCAAGAGAAACTAGACAAGAGTCTTTTCAGCTACACTTTAATCTGATGTCCAGTCGAATTTTAGTACATTTGATGAAAGTATATGTAAGATAAAAATAATGACTGAACCTTTAAGTTCAGTTCTCATTTCTTTAAACA---TTCTTAAAAATGTACAGGAGTATCACGTTTCAGAGAGTGATGAGTCAGTCAGGTGGTTTT s bosTau2.chr2 48822362 331 + 86543008 TGTATACTGTTGCTCTATTAACCCAAATGTTTAATTCACAACTTTCAGCATTCTGTATCCTTACCAGGTAACAGATTTATCACTGAACTTAAATATACCTGTTTT-ACATTTATACATGAAAAATGTGAAACAAAAATTTGCATTCTTTTTAAGGAAAAGAAGTCATGAGCCAT----GCTATCTGTGTACTTGATATTTAGTAGGGTTTTCATAAGTTTGTTGAAAGAATTGGTAGACTGCTA--TATAATTAAATCTCTCCTTTC--------TTTTTCTAAAGAAATTAGTTTGAAATATATAGTAACATCACATATTTTAGAAT----AGTGAGTCAAATGTTTTT a score=14292 s mm7.chrY_random 8721890 1076 + 30114534 TGAAACTAACAGTTTA--------ATTGAATTGTATGTAAAGCATAGGCTTAGATAGATTGAAATAGGTGTTTTAATTTGCTGAATTCCATCTGGTTTATCTTCAAATTAAATGGTATAAT-AATAAAGTGAGTTTTAGGAGAGAGCCTGTTACTTCTCTTGTCCCAGTTTTGCATCCTATGCATCAATTTCCCATGACAGGCTCTGCTTGTT-AAAATAAATAGTGGCACATTTTATGGCACTGGCAAGAGAAAGACTG-TCTTGAACATG-----------------------------------------------AGCCTACTA----------------------------------------ATTTGCTTGACAT----------------------------------TGTCTAATAACTAATTGTGTGCCTT----AAATGTCCTCATGGCTGAAAATTTCAATGTTAAAACCTTTAATTCCCTTCTGACACTACTAATAACCTTGGGTAAAATGAGTTCACAATCATTTGTTTCCAAGCTCTCAAAATGCCAGCACTATAAATCATACCAAATTTGGGATCCAAATGTGCAATATCCCATCACACCCAAAAAGGACCATTTCTATTTCCTCAAATGACTTCTCCAATAG-CCTTGAACCCTCTCCTCAGTCCAGTCTCTGATC--TCAGTTAGAATTCCAGGAGAGCAAGA-----ATATCCTGGACTTGTCAGTTTTATCAGCCCAGGCCATGCAAT---GACTTTATTACTGTTTTCCAAAATATATGTTGATAT---------------------------ATAATCT-TTATTTATTTACCTGTGAAATTACGGGTTCTGATATAATCCTTAATATAGACTTTAAATT-AGAGCTCTGAGACTTTGAATAATACAGGTTTTGTCCATTGAAAAAATTCCA------TGGAATTTTCTACTGACATTT----TATCCACTGTGTAATTTGGAGGCATGGATATAGCACTAAAACTTACCCATAAATTTCTATTTCTAGAATCTCATGATACTTATTAACCCTTAAAGCTGACATGTGGTAGAGGAATTGGGAAGTTTTAAAGAATTTCAGTAGCAAATTATTAAAATAAAATTCTTTTGTGAAA-GCTATAGGACATTTTCCCAAACAACAAACAACAACAACAACAATCAGACTCAGAGCAAAATCAAAGACTTCCATAAGAGAACACTATGGTTTGAGCTC--TCCATGAT s bosTau2.chr2 48822734 1230 + 86543008 taaaattaGGTGTCTATTATCATCAGAGAGTTGTATGAAAAACATAAATTTTGCAAGATTT-AATGTGTATTTTAATTTGCCTACTCTGTTGTTTTTTATCCT-AAATTAAATAGCATCATGAACAAAATTAGTTTGAGGACAAAGTCTGTTATATCGATTATCCTGAATATGCTCCCTCTGCATCATTTTTCAATTGTAGAATTTGCCCATTGAAAATAAATAGCTGCACA--TTATGCTATGATCAAAGAGAACTCTGATCTAGAATGTGCTGTGTGTgctcattcatgtatgactctttgcaaccccatggactatagccctccaggctcttctgtccatggaaagttacatgcaagaatactggagtgggttgtcatAATATGTGGTTGTAAACTAGTTTCTACCCTTTTCTATTTAATAACTCATTTAGTGTTTTTTTAAGAGATCTTTCATGTGGaaaaattaaatattaaagtatttaatttCCTTCTAAGGCCACTAATAAAATAGGCTGAAATGAATTCATAAGCATT--TTTCAGAACTCTTATAATGCCAGCACCTCAAATCATATTTTACTTTATTTTGAATTTTCAGGTATTACATTATTCCCAAATTTGAAACATTTAGTTACATCAATAGACTTCTTTCATAGTCCCAGGACTCTCCTTGCCACCAATTTTCTCACCTTTCACTCCAAGTTTTGTGGCCTTGAGAAGCTCACATTCCG--CATGTCAGGGTCTCCAGCTTGGGTGACAAGGTTTCAATTCTGTGATTCTTCTCCCAAATGTTTATTTCTATGCCCAATGAATCATTCTGGTCAATATAATAATGTCTTCCTAATTTACTTGCTGAACCCCACATTTTAATGCAATCTTT-ATATAGGGTTTATATTCAGATATTTGGATCTTTCGATGCCAAGAGTTTTCCC-----AAGGCTTTCTATCGCTTTGGAATCT----CTAATCTTTAAAATATCCACTCACTATTTAAGTGGCATGGATATTGCACAGAAGATTATCATTAAAATTCCATTCCCAGAATCCTGTGGCATCTATTAACCTCTTCACCTCTCATGTGCAGTAGGCATTAGT-ATTTATAAAGTGCCTCAGTATTTAATTATT----TTAGATTA-TTtgtgaggtatcacaatcttttttcaccattttcag-----agtgaggaaaatgagactcggag---gttaaaagacttgcccaa---agtaatataatcctagtaCAGTCCATGCT a score=9814 s mm7.chrY_random 8723193 1046 + 30114534 TTTGTACTTAATATTCATGTATTATTTCATTTTCAAACTATGTGTTTGGTTAGTAGAATCAAATATTTTTAATATGGTGCTTTTCTAAACTATTTGGAAGACAAGTTAAGATATTAGACTCTATAATTATATCATTTTTTAGCCCAAATT----------------CTCATGGGA------TGGAACTTTATTAAATTCAGTCATACAAATTGTAGGAAAAAAAAGTGTTCATATAAAAATCTCCCTAATCCTGTGGCTTATACCAACATTTGGGATTTTTAAATAAATATCCT-----CAGTGTTTAAACTT-----------------------------------TATGTTACTAATGATTTCTCA------------------GTACTGCTA-------CTAATGATTC--ACTCTATTTTT------------ACATAGGTATAAT---------------AAA---------------ATAACTTGGC---------AGTGACATTAAAACCACTCCTCTAGGATGTGTAGGGACGACAGCATT-TGTGTTTGTAGAGAGCAGTGTTCATGCAGGTGGGATCA------------TCCCTTCTCCATGGCATTTGTTTCCTTCTGGGAAGGG-----GTGACCACAGATGCTCCCTCTG--------TCCTCTTCTTCCAGAAAGTTTACAAA-TGTACTGTGTGTTCCAGTGAAGAACCCTGAAGGA----TCAGTAGCAACTGTTGGATAGCGACTGTTATCC-------ACAAAGC--AGTCCAGTCAAATCGTTCACGTTGGACCTAAAAAAACTAAGAGCACACATT-----TTCAAGTGTGTGCATGCAGCCGTAGTGACACTAATGTTCA---------AACAT--------TTTAGGCATGGTCACTATACATCACTTATGAACAGAAAAAAAAAAGATACTAGGAATGTGAATGCTTTGCTCTAAAAGGAAGGACAGACCA------------------TAAGTC-TGCCTGAGCTCTAATGTG-AGTAG-GGCTTGCATGGAACAC----AACAATGTGTT---TGGTCAGGCTCAAAGTAGGCA--TTTCATACTATGGTAAGT--TAAACATTGATGATGCATTAAT-CTATTGTAAAATGTAGTTATCGTTTATAAGATGGAAATATACTGATACATGTAAATTACATTTCTGTTTATTTTCTGTATTCAAAACTTGGCAAATACTTCAGAAATTTTAGATATGTATGCAGTCTCCTTCAGC s bosTau2.chr2 48824173 1234 + 86543008 TTTGTACTTAACA--CATCCATGAGTTCTGTTTTGGGTTCAGATTTCTGGATGTAAAATCAGTTTTGTTGACTATTGTATTTTACTGTGTAATTTAGAAGTCATGTGGGGAAATAGGAAAATGCAACTGTAT-ATTTTTAAGTGGAAAATACCCTTCACCTTTTACCTTACAGTACCCAAGTAAAGCTTCATTAAATATATTTATATCAATTGAAT--ATAAGAAGCAGTCAAATAAGAATTTCCTTGAATCTGTTACCTACAGAAACATTCAGAATTTTTAGAATAAAATTCTTCATACAATATTTAAAACTGTCTTAACTATAGTTGTACACAAATATAAATAAGATAAATCACTAATAGCATTTTAAAAGTTCTGGCCATCCAGggactgccatggtggtccagtggttaagactctgtgcttccaatgcaaggggcacaggttcaatccctgactggggaacaaagatcccacatgccatacagcatggccaaaatcaaaataaaaTTCAAATCGT--------GATGTAT-GGAAAAACAGAATTCTGCATTTATACTGAGAAGCTTTTCTGCAGGC--CATCAGCTGTTAAAAGTCCCTTTCTCTAATGAGCAGACTGCCTCCTTGGGAAGGAGAAAGCCATTACAGCTTAGAATTCTGaatttttttttttttttttaaGGAATGTTGTAAATTGTTTTGTCTGCTCAAGTGCAGAATAGTGAAAGAATGGTGAATGATGACTTTGTGATATAGACTGCTATCCAAAGGGAACAGAACAGAGGCCAGGTACATCATTTTAATTGGATCT--AAAAATCAAAAGCATACACTTGAAATGCAAGT-TGTGTGTGCAATCATACAGACACTCATGCACACTCACAGTTAATATTGATATCATTTGGCCATAATTTATATGCATAACATAGGGACAG----GAAAGAGTTCCTAGTGATGTGTATGACTTA-TCTCAACTGAAAGATGACTCAGGTTTGATGACTCAAAACTAATTCATGCATGCTTTTAACTGTTCAGTGGTAAATTTTATGGAAAACATCAAATAAAGAGTTACCTAGTCAGGCCTGAA-TAGGAGATTTTTATAATCTGACAAGCTATAAATATTTAATTTGAAATGATGCTATTGTACAACATAGAAATAATTTAGAA-----AAATATACTGA-----------------TTTAACTGTGCACTAGACTGAACATTTGAAAAGTATTTCAGAATTTGGGGCTATGTAGACACTCTACTTCAAC a score=3368 s mm7.chrY_random 8725363 53 + 30114534 ATGGAGGGGCACATGGATATGTGTGTGCTCATGTGTGCACACACACACACACA s bosTau2.scaffold439 374580 53 + 479824 ATAGTGTGGCACATGTGCATGCTTGTGCACATGTGTACACACACACACACACA a score=6127 s mm7.chrY_random 8725479 419 + 30114534 TTTTTCCCTGTGCTTTATTTTCCCAATTTTTTATATTTCAAATATACTTTTCCAATCTAGGAGATCTACTTCAGAAAGTAAGAAAT---TAGAGTGTACAATTTTTATATTTATTGAAGAGCATTA----GTATTCTTATAAGAGTAGTGATTGCTCTGATCTGTAATGATTTCTGCTTAAGGTCTTTGTGCATAAGTTTCATTACTGTTCATGTTTAAATATATATC--ATTTCACGAATAT----AAATAGATAATTATAAGTCAATATCTTTGTCATGGAAAAATCTTAATATGCAATATTAAGAATCTATATATAAT-TGATTCTATTCTGTTTTATAGTGAGAGGATAATAATTTGATGCCAAACTAAAATCTGCTTCTTGGTAAATAGGTATCAATACACAGAAAATTGTAAGATTTTATATTCAAT s bosTau2.chr2 48825513 406 + 86543008 TTCTCCCCAGTTACATATTTTAT-AGCTTTTGATTTTATAAAACTACTTTAAAAAT-------AGCTAACTAGAATACTAAACAACAAGTAGAGTACTAAATTTTAAAATCTACTGAGAAACATTCATCTGTATTATGATTAGA--AGGAGTGGCCATACTTGGTGATAAATTCTCTTTGATTCCTTCATTCATAAGCTCCATTACTGGT----TTTAGAGATATATCATATGTGATAACTATGAAAAAATAACTAAGTACAAGGCACTGTCTTCAGCAAGGGAGA--------ACACACTACTGAAACT---TATGGAACACAATTATTTTCAGTTTTATAGATAAGGAATAATTATTTGGATACCAAGTAAGAAGTGGTTCATAT--ATTAAGTCTAAACATTTTTTAAAATGCAAGATTTTTGATTTAAT a score=55225 s mm7.chrY_random 8727126 1696 + 30114534 TTTATAAAATAAACAATGC----CTTTTTTTGTATTATCTGTTTAAAATACTATCTCTGTACCTGTAACAATGAGTGGAAGGACAGAGGCCACCCCCTAGGTATTTCAGAAAAAAACCTGTTTTTCTCCTGATTTACTCAGATACCTGACCCCAGACCGTATGCTTTCTTTTTCC-TTTGCATTATAAATATAATGTTCTCTCTTCTCCACACAGTGTGT-TAGTCAGCCTAGGTGTTATTCAATAGAGCCATTCCAACATCTACTGTGATTGATTTATTTAGAAATACCTCCAGTCCAAA-TGAGAATGAAAATAAATGGAACAGATGAAA-TGTCCTGCTGCAAG--AGAGCTACAAATTGAGGTTAAGAATAATTGCTTTGGCATAATTGTTATTTGTAATCTTAGAACAAATGCAAATCCCCCATTAGGAGCAGTAAATCCAGTGCTTAAAGTAGAAGATACGTATTTC-----------ATGGGAAGCCTCAGCAGAATGCTAAGTTCAAGAACA-TAACATTTTCTCAGGTCTTTCATTCAGACGAATAGCTT-TAGGATCTGGAGGACACGGGAGG--ACCTTAGAAAAAATGATTACTGAAACATGATTTATGAGCTTTCTGTGTTTTCTTTATCCAAAACACTTTATGAGGACTTTGTCTTTGTACAACCTTAAAAATGTGCTTTATTTTATAAACACTCTGCATTCTGACTGTGTCTGGCTTCCAGAAAGTATAATGAGTTCTTCATGGTTATTCATTTCCACAC--TTATCACTGGAGGAGATAATAAGGAGAAGTTATTATC-----TTTAAAGTGATGAGAGAAAGCATAC-------CTCTGTGGCATTCCCAAGGTCATGACTGCATTGTGTGGTAGACAT-GGGAAGGGTGCCAAGGATATGGAATTTGA-CTCAATGTAACTAACATGTCCTCATTTCTCAGATTATTTTTTAAGG-CAGAAGGTTGTTATTGCCAGCAGGGATCATGATAATCATAGTTATAAACCAAATGTTGTCATTTGGTTCTGTAAATATCCATCAA-TGTAGGGCCAAGATTATTACATAAGAAACACCACCTTCACTTTAAAATGAGTTGTTTGC---------------TATTTTGAACTAGCAAGTTAAAGCCGAGTTAAGATAAAATTGTGTTCTTGGAGACATTGCAAGGTAGCTTGTTGTATTCCTTACGTAGGAGGCACAGCAGAATTCCAAGGTCCATGTGTACTTTTAAGAATATTTATGAACACGAGAATTAGCCAACAA----TGAGAAGATAGTTGTAGTTCACTGACTTGGACAAAGTGGTGTGGGCACAGTGGGAG---AAATGTGCTGTCATGTGGCATTGCAGCAGACCAATGTAAAACCTCTGTGCACAGGCAGGGGACGGT------GTGGCTGAGGTCGGTCACCAGGCAAAGTTCTTTAGTTTCTGATGCTGAAATTGGTAACCTTTTAATATTGTTTTTGAGATATTTGCAA-AAGAAATTTGAGGATGTTACAAATATA-CCTAAACTTGAATTCTTGGttttataaatatttaacaattaatattttCCCTAC--------ATAAAAACAACAATGCTTAAGCTGTGGCAAAACCAAGAGTGAAATAAACTCTGTGAGACAGATGAGCATTTGTGCTTAGGGATGAGGAAGTTACtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtAATAGAGAGGGGGGATGTGCATTTtgcatgcatctggaagc s bosTau2.chr2 48826990 1663 + 86543008 TTTATAAAGTAGGCAGTGTATTATTTATTTTATATTTTCCACTTAAAATGCTATCTCTGTATTCACAAGAATAAGCAGAAAGA-AGAGCAAAGTATTAAGCTAATCTAGGGGAAAAGTT--TTTTCCCTTAATCTATTCAGATAACTGACCC-ACAAAGCATGCCTTCTTTTTTTACTTGATTTATAGTTATAATTTCCTCCATTCTCCACACAGCGTGTGTAGTCAGTCTAGGTGTTATTCAATAGACCTGTTCCAACATCTACTGTGATTGATTTATTTAGAAATACCTCCAGGCCAAAATGAGAATGAAAATAAATGGAACAGATGAAAGTGCCCTGCTGCAAGCAAGAGCTACAAATTGAGGTTAAGAGTAATTGCTTTGGCATAATTGTTATTTGTAATCTTAGAACAAATGCAAATCTCCTATTAGGAGCAGTAAATCCGGTGCTTAAAGAAGAAGATGAGTATTTCACTGCCTGGCAATGGGAAGCCATAGCTGAATGCTAACTGCAGTGACATTAAAATTTTGTCAGGTCCTTCACTTGAACTAATAATGCATGGGATACAGTGGATACAGGAGTTCACCTCAG--AAAATGAGTATCGAGGTATGATTTATTCCCTTTATGTATTTTTTTTTTCCAAAACACGTTATAAAAACTTTGTGTTTGCAAACTCTT---CATGTGCTCTTTCTCAAAAATACTTTATACTTACACTGAGTCTGGCTTTCGTAAAGCCTGATgtgctttttatgattatgagtctttacaccttcatcactgaagtagatgataagatgaagttattatctttattttaaagagatcagaatagaaacattgagaggttcagtgactttcccaaggttataaaatcat--tctgataaatctgggGAAAAGCATAAAGTACATGTAATTCAAGCTCATTTCATCTACCATATCATTCTTCTTCAGATCATTTTTTAAAGTCGGTAGGTAATTATTAGTAGT-GAAATTATGATAATCACAGTGATAAACTAAAGGTTGTCGTTAGATTCCTCAAATATTCAACAACTGCAGGGCCAGGATTATGATATAAGAAAGGCTGTATTTATTTTTAAATGAATTGCTTGCCTCACAGGAGAATAGTATTTTAAACTATTCAATTAAAGCTTAGATAGGATTAAATTGAGTTCTTGGCTACATAATAGG-----------------TTATGAAGAATA---AGTGAGATTTCAAGGT-CATGTGTACCTACAAGATTATTTAGAAACA-AAGAAGTTGCAGAAAAGACTTGAGTAGATAAAACCGATTGTGTGTATTTGAGAAAGTA--ATGAGTACAGTGGAAGAGAAAATATATTGTAGTG-----TTGCAATTGAGTAATGAAAAACATCAGTATTCAGACAGTTTCTGGTATATACATAGTCAGGGTCAAATGTCAAGTGGATTTTTTTAGTCTCCCTAACTGA---TCACACCATCTTAATACTATTTGCTAGATGTTGGCAAGAAGAAAGGTTAGTGTGATATAATTGTATTTTAAACTTAAAACACTTACTTTGTTGATTTTTAAA---TCATGCCTTGTCAACCCTTGAGAGGAAGGAGGGCAATGCAGAGTCCATGGCAAAGCC-AGAGT-AGTTACACTGCTTTAGGCAAATGG----------------------------------------------------GTGTGTTTCAACTCTAGAGAAATGGAACATG-------------TCTGGGAGT a score=9885 s mm7.chrY_random 8728970 307 + 30114534 CCCAAGGTCCTATTCTGGTGAATTCCTTTTGCCTGGGACATCTTCCT----ATAGAACC-ACATCCAGTAGTAATGGTTGGTCTCTGC---------------TCAGTGGTACTGTGGATTAAGATGAACGGCCTTTCTGAAACAGCGACAGAGTAAGAGCAGTATAATCCCAAATTGATGCAGTGAGACCATTTACTTTTCTTT-----AATAAAGGAGCAGTCAAG---TGTTTACGCTTACTGCTGCCATGTCCATATAAAAATAAT-TGTCTGTTCTTTTTAGTTTAGTCAGAGGACAGAGAAGTCACAGAAGCATTACAAAGGACAGAaaa s bosTau2.chr2 48828760 331 + 86543008 CACAAAGCCACCCTCTGACACCTTCTTTTAACATATGACCTCCTCCCTCCAATAGAACCTACA-----TAGGAAAGCTTTTGATCTGCCTTCACAGTTAATCATTTATGATGCCCTGGATGGGGAGGGACATTTTTGCCAAAACAGTGATAGAATTATAGCAATATAATCCCAAGCTGATTCAGTGAGACCATCTATTTTTCTTTAATAAAATAAAAGAGCTGTCAAGCACTATTTATACCCCCTGCTGCCATTTCTATATGGAAAGAATGCAGCCCCTTCTTTCAATCTAGTAAGAAGGCAAAAAAGTCACAGAAGAGTTAGAGACGAAAGAAAA a score=7282 s mm7.chrY_random 8729399 452 + 30114534 CTTAAACACAGTGAAAAACTAAAAGTGTCCATTAGCCTATGTTACAGGGATGAGCG-AAAGCATCCAGGACAGTGATGTCTCATGAAGTAGTCCCTTCCCTTACAGAAGAAAGC----TGTGCTGTGGGATGTAAACGAACTCTGTGTCTTCAGCA--TTTTCCTTCTCGGTTCTGTAGAAGATAGTATGTTGTCCAATTTACTGTGGGAAGC--ATCTTGCTGAGGG-----ATTTGACTAATGAAGAAAATGTAAACATGTGC-ACTTCTTTTCTGAGTTCTTCACTGAGGAATATCTCATAATGGCATCAAAAGGCAATGTGG-ACTC---CAGAAGTATGTTGCAGGTTACTGATGACTCTAATGGATGGACAACTGT-CTTGTCAATTTCTTCCTACTGCTCATTTCCAGT-TGCTACTGCCTCATTTATATGGAGCAGATCCAGTGAACAACTTTTTTAT--TTTTATT s bosTau2.chr2 48829091 457 + 86543008 ATTAAACCCAATGCAGAAGTGAGAGAGCCTTTTAGCATGCATTCGGGAGATGAGAGTAAAATGTCAAGGACACCAGTATCACGGGAA-----TCGTTCCCTCCAAAAAGAAACCACCAGTCACTGAGGAAGG---------TTTGCAGCTTTATCACCTTTTCTTTCTC-TTCTTGTAGTCTACAATGTGTTGTCCAATTT-TTGTGCAAATCTGACCTAGCTGAATGGTTGCATTTAGCTAACAAAGAAAATT--AACAAGTGCAAATTTATTTTTGAACAGTTTGTAGAGAAATGTCATGCAATTATGGCCAAAACAGATGTGGCATTCATTCAGAAATATTTTACAGGATACAAATAGCTTTAATGAAGGGTCAAAGGTGCTAATCTTTACCCTCTTAAAGCTTAGTATTAATCTACTAATGATTTATACATATAAAGCCAATGTGGGAAAATCCTCACTTATAATTTTATT a score=17150 s mm7.chrY_random 8730747 1350 + 30114534 ATACTAATAAGCCTGGCT---TGTTAAATCTTGAAGGCT---TGAAGGCTT------------GAAGCACTGTCTAAGGCTACCCATCTCCAATAGAGCTAAGATCCTCTTCTTCAGAGCCATACTACCCATGCCTCT---CTTTATTGCAGACTATCCA--------TGGTTTA-------------TTTTCAATATCATCCTTTAGGCT--------CCCAGGGACAAAGACAAGAAAAC-------------------TCAAAAGACCTGAAAGAGAGTCTGCTTTGTAGAAGGTCC-------------------TGGCTGAGAAGAGACAA--TAACAGCATTTGGAG-GAATGTCTCTGGACACATTTTGAATTTTCAGCCAAACTTTCACTGGCCATACAGTTGGTATGGGTGACTGTATGTGTGTTGTATatcc--tggactaatgctctctc---cctttaccgttcatatccttaactcacagagc-cagcaatcttgtcttcaaatcttttcttcaattctattcccgcctcttttt--------aatctgcactgtcattgccttaatataggaaggacttcatttttcacctggacaatattgcaataacctcttaactggtctccGAGTTGCAATAAATGACTATTAAATTGAAATGGTTGAATTGCTTAAAGTAACATCATTTATTTGGAAAATAAATCAACCATCAAGTACCTGCGGCCTGGTTACATGCTCTTAACTTTGTTATGGGTTGCAGGTTAGTCAG-GGAAACCACACTCAGGGACTCTCAAAACACCCACAAGATACAAAAGTCTTTCTTTCTAAGTAATTAATTTGTTAATTTATTAAtgaaacaaggtctcactttgtagttctggttatcctggaactttctttatgcatcagcctgggcttgagttcacagagatcctcctacccctgcctctgagggctgggattaaaCGTAAGATGCTCAGCATTTCTTCACGTTCATGGTGTATATGAGT--CTTGGGAACATTACATGA--ACAGAATCAGTA-GTTGAGAGTGAGATCAGATATTCTTCATTTCCTATAG--TCTCAGATAATGTAGGTACCACGGCTTTGTGCTAAAACTTAGATGTTTATTACAATATGCTATAAATTTTATGGTGTGTCTCACAGTG-----AAGAAAAGATTATAAGA-CAGGGTGGTTTCATAGAAGTAGTAGAGGGTAGGATGAG-AAGACCCTGGGTCCAGAGAGAAGTGTGGGATAAGAGGCT---TGTCTGTGCTGTATTACA--------GTTAAAACTCACCCCACTTCCCATTTCCTCTCCAATGCCTTTCTGGATGCCTATTGGACAGGTATGACCAGACAGTCTCGACCTGCTCTTAGATCCTGCCTCTGTACCGTTTATTCTTTAGTGTGTGTTTAGAAAAATTATGCCAAGAAAAAAATGTGCTTTTTCCAT s bosTau2.chr2 48830235 1293 + 86543008 ATGCACATATAcctggctatttattaggtcttgagagctctttgcgggagttccctcatctgagaagcattttctgaaatcatccattccaaatctagattcaatatttctccttagggccac-cagcccatggctgttacctttat--catatcacttacttcattctgtttcagttgccagtttgtttttctgtgtcctctgttaggctgtaaattccttgagggcaaagaccaaataatattgaataagcttttttatctatagcatctgggaaaaaacctaccctctggaaggtaccaactcaataaatatttgttgGCTGGGAAAAAGAAAAGTAGAAAAATGCAGAAAGAATGACTCTGAATAAACTTGGCATCT-CATCTGATCTTTAGTTGGCCAGAAAATC---ATAGGTGATTATA-----GTCACCTCACCCATAGGTCATGTCTTTCTCTCACCTTCACTTGTCATATCTGTAATGAGCATAACATACCAATCTTTCCTTCTAGATATTTCTT---TTCCTTTGCCTCTTCTTCTTCTttttcaaatctctactaacattgccttaat----gccgtacatcatttttcacctggacaatattgcaataaactcttaactggtctcccagttGCAATAAATGTCTATTAAATTGAAATGGTTGAATTGCTTAAAGTCACA-CTCTTATTTTGAAAATAAATCAGCTAGAAAGTACCTGCTACCCACCAACA----ATAAGCACTATTATGTGCTTTGGGGGAGTCAGAAGAAACAGAGCATAGAAACTACCATTCTACTCCCAAACCACTA----------------------------------------------------------------------------------------------CAATGTGGGCCTG--------GAGAACC--------------ATGAGAA-----------------------AGtgcttcttaaagtgcaccatgcatacaaatcacctggggatcctactgaaatacagattcagtaggtcttggttgacacctgagattttggatttctgataagttcctgggtgatgctggtgtcactggcctatgcaccattct-----ttcagtagAA-AAACATTAAAACCCATTAAGTGACTTAGAGTGGCCTTATATGAAGATTCTAAGGTCAAGGAGAGTTC--AGAGGCAGTAGGAGATAAAATGAGAAAGTCTCCAAGTTGAGATAAGAATATATGCTAAGAAAATAGAAGTTCATACCCTATTCCAAGTCAGTTGTTAAGACTTGGCTCATTTCTCCTATCCTTTCTAAAACCTTCCTGAATCACCCTC------GTATAATCACACTG-------CTGTTCTTTTTCCCAGTTCCT----TATCTGTCCTCTGAACTGCACTCAGAAAGATTGTTCTAAAATACAAATCTAATTTTGCCAC a score=125 s mm7.chrY_random 8732171 257 + 30114534 caactgcgtagtcaaaactggccttgaacttataatctactagttttaacctctgaagtgctatattacaggtatagaccactaagtctggATTACCTTTACCGACTTTTGCCATCATGTGTTCTTTACATTGTAAGTTCGACACTGCTGCCATAAGTATCTTTCTGGCTCTCCAGCCTCACTTTCTCTGAGCTCC--AACACATCAGAAAGTCTTGCACACCACTTTATCATGGGCTGCCTAACAGCTTTTCATGAGC s bosTau2.chr2 48831633 203 + 86543008 AAACTGTGTTGCCAGACTTTACTTTGAGCT------------GTCTTATCCT------TGCT-TTTCACAGGC-TGCACC-CTTTGTTGGAAAGCCCTGTTCCCATTGT--CTGTCCTGTTTTTCTTGTCTTGCAAG---------GCAGAGTTAGATATCTCAATGCC---------------TCTCTTAGTTCCAGAGTACATAATATA-------ATATCACCT--TCATATGTTTTATTTCACCCCCATATGAGC a score=15407 s mm7.chrY_random 8732845 745 + 30114534 GTAAAACCAGAGGAGA--------GGAGAGAAGAGAAGAGCT------CACAGAAATAGAACCAGGAGGG-AAGCATTCACTCATTCCCTACTAAGTTCTGTTTCTCTAAGGATGCAATGCCATGTGTACACACAGTGTTTAAAACTCAAACCATGCTAGAAGTACCTACGCAATTACAGCTCATTT---GAAATT-GCACAAAAGGCAGAAATGTGTAGGAATAACCCTGGGCAAG--CACCTAACAACTTGCCTTGTTCCTGGAAGGTGTGTCTAAGATGT----------AGAAATGAAAGTATATATATTGACAACAGCAAATGTTTCTCCTGCTTATAGATAGCATGGCTGTGATTCTAGATGGAATGCCTGA---ATTAATTTTTAGTTATACTTGAGGCTCAAGTCTGAGTGCAGGAAAGCAAATCAAAGATGATTTAGAATATGAAC--AGTATGCCTTATGAC----CCAAGGAAAAACCATGCAAATGAATATAGTAGTAAACAAAAATAGTATTGTTAGTA----TTTTGGAATCTATCACCCAAAAGAAACAG--AGAAATCAAATGCATTGAGTAAAATTATAAGCAAGCAGATGAAATTCTTAGAAGGTTACCTGTCCTTT--GGTGACTAAATT---------AAATTGTTGCTACATGGAAATTTCCCataattaatataaaaataatttaGCAAAGAATAAATGA--TTAAAATTGTTCAATGTATCTCACCCCAAGTAAAAATGACTGAAGTTAAATATTAATTTAAATAGAAATATTGATGCAAT s bosTau2.chr2 48832380 778 + 86543008 GTGAAAAGGGAGGAGAAAAAGAAGGTAAAGGAGGGAAGTGCTAGGAAACACTACAACAGGAGCAGGAAGACAAATATGTA-TCACTTCTGCATTGTCTCTGTTCCCTTGTACATGC----CCACATATGCACATGCCATTCATAATTTAAGCTGCCCTAAAAATG-CTACCAAATTAAAGCTCATCTCCAGAAATCAGTAGAAAAGGCAGGAAAGTGTATGATTACTCCTTTTCCAGGTCACTTAAT-ATTTGCCTAAGTCCTGAAAGTTATGTCTCAGATATTGGATTGAACTGAACTGAAAGGTCTCAGGATGAGAACAATCAATGTTCCTCTTATTTACAGAAGACATGACTAGGCTTATGGACAACATATGTGAATTATTATTTTTCAGTTGAAAGTGAAGTTCAACCTTGAATGTCAGGGAACAATTCAAAGATGGTTCCAGATAAAAATAAAGCATACCTCATACCAAGTCCTGAGAAAAGCCACATAAATGATCACATTATTAAGAGAGAA-AATATATTTAGCATCTTTTCTGGA--CCACCACTCAATAGAAAAATGCAAAATCCAAAAATATTAGACATAATGATAAGCAATCAGACCGA----TGGAAAGATTACTTGCCATTTACAATCAATAAATTATATTATCAAAATTATTCTTACTCAGAACTT--ACATCATTAAT-----AGGAACCTGACAATGAGTAAAAGAACTTAAAAGTATTCAGTCTATCTCACCCCAAACAAAAAGCACTAAACCAAA-----AATTAAAGTAGCAAAATCAATAGAAC a score=5454 s mm7.chrY_random 8733590 208 + 30114534 TTATTCATGTTATACTAGTGTCAAAGTAAATA-GGATTAATCCTAAGATCACTTCATATAATTCATCTATAGCAATTAAATACATAGAATTAAATTC---CTGCAAGATTACAATG----CTTTTTATGTTCTTTGGCTTTTTCATA----TTGTTTTCACTACTTCAGAGTGATTGCAAGATTGCATATGAAATGACAGGTAATATTAAACAGATATGA s bosTau2.chr2 48833384 218 + 86543008 TTAT--ATGGTAAAGTATTGTCACATTACATAAGGATTAACCTCAAGGTTACTTCATATTATTCTTCTATAGCAATTAAATATATGTAATTTTTCCCCATCCCCAAAATTATAACATTACTTTTCTATATCATCCTTCATTTTAATCATTTTTATCCCCAGTACTTTAGAGTGCTTAGCAGGTTGTAAGTTCAATATGGATTGAAGTTGAACAAAAATGA a score=9467 s mm7.chrY_random 8739714 447 + 30114534 catttattcaaaAGAATAAAGGT-------ATGAAGAAGAAAATGAAATCA-------ACTAATA-------AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCACAGTTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCAGCCATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCACCCCACACCCACACACACATTTCTACTTGATTA--ACCATATTGGCATTACTTATTTTCATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGAGAAATGTTGATGTATAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAAAACAGAATTCAACAGGATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGCAGAAGATTTCCCATCGATTTAGTAAAATA-------TTATAAATATGATTTTAAAAGAAGGC--AACACCCTGAAAAAGTCTT--ATTTTCATTATTTA s bosTau2.chr17 25742182 462 + 45915461 CATCCAATTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC--------------------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTA a score=36421 s mm7.chrY_random 8745584 1171 + 30114534 TCTATCACTCTTT-----CCCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATTCC-------AGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCCTTC--TTCCTAAAAATCCATCTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTGCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAATGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCAACACA-GGAAAATAAACATTTTTTTCAATCCT-------ATAAGTTTACTTTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTTAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGTAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGAATTGGCTAGAACTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAGGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCAAACCAGGGCGCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAAGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGA----TGTCATGCTCAGACTCTTCAG---AGGTATTGTCTTCTAC s bosTau2.chrX 20326712 1223 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATAC---GTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCTTTTTCTTCCTCATACT-TGCAGACAAGGTGTGGTCATCAAC a score=9976 s mm7.chrY_random 8748571 491 + 30114534 TTTCTGACTTGACAACATCCATGGTGGTTATTTTTCATATTCCAACCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTCTTATCATAAATATTGCCAGACTCTTTGAGGCAGCACACTGGATAGCACACCAATTTTTACTTTATGAAAACCCACAGTTAGAGGAGGACTATTT--TATGCAAACAAACCTGGAATTTGACAGGGTTAAATGACATATATTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGAAAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAAATTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTT-TAAAATTTACCAGCACTTCTGATTACAAGGAATTTCAGAGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAGATGAGGTAATTTTAGTTTTGAAATATGT--GTAGACAGAATACTGGACACAGGTATGTATAAAATTTACTTACAAAT s bosTau2.chr17 25750424 451 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAG---TGTTGCCCATATAGAATGTTGGCTG----------GCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAATA-GTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAACTTGGA-CTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCAT a score=21543 s mm7.chrY_random 8763977 667 + 30114534 TACTCATGTCACTCATGTTCCATTTTCTCATGCTCCTTTTTCTTCATTGGTCTTCCTAACAGAAAAAAATGTAGCCTTACAACAAATCACTTTTGGAATTGTATTCATGGTGTCTGTTTCCACATTGCTTGCCAAAACAATCATTGTAGT-TTGGCTTTCATAATCACAGAACCTGGAAGAGGTTTAAGGAACCTCCTTTTATCAGGTTCAATGAAATACATCCTTCTGATATGTTCCAT-ATCAATGTATTC-TGTGGGTAATCTGGCTCTCAGTTTCTCCTCCTTTTGTTGATATTGATATTTGTTGATATTGATGATAATGA--TAATCATTTTGTGCAACAAGGGTTCAGTTACTGCATTCTACTGAATTTTGGGATACTTGACCTGCCTTGCCCTTGGAAGCTTCACTGTGGATTTCGTGGCAAAGAATTTTCCTGAAACATTTAATGAAGCCAAGTTCCTGACCTTTGTCGTGCTAGGATTCTGCAGTGTTTATGTCACCTTCCTCCATGACTCACATAGGACTAAGGGCATGGTCATGGCTGCTGTAGAGGTCTTCTCAATCTTGGCATCCAGTGCAGTGATGCTTGGATGCATCTTTACACCCAAGATCTACATCATTGAAATAAGACCAGACTTGAATTCTATCCAAGGTGTCAGATAGAAGT s bosTau2.chr7 14417433 662 + 69141744 TGTTCATCTCCCTCCTCCCGTGCTTCCTC-TGCTCCTTACTCTTTATCAGTCGTCCCCACACAGCCACCTCCATCCTC-CAACAGACCACATTTGGAGCTGTGTTCACTGTGGCTGTGGTCACTGTTTTGGCCAAAATCGTCCCTGTGATCTTGGCATTCAAGGCCAGGAAACCAGGAAGAACCATGAGGCGATTGCTCTTAACAGGACCTGC----TATGTCTTTCCCATGTACTCCATGATCCAGGTGATCATCTGTGGAGTCTGGCTGGGAGCCTCTCCCCCTTTCCTTGAGATGGACACTCATT----CTGAGCCCAAGGAGCTCCTCATCGTGTGCAACAAGGGCTCGGTCACTGCCTTCTACTGTGTCCTGGGCTACCTGGGCTCCTTAGCCCTGGGGACCTTCTCCTTGGCTTTCCTGGCCAGGAACCTGCCTGACACCTTCAGTGAAGCCAAGTTCCTGACCTTCAGCAGGCTGGTGCTCCTCAGTGTCTGGGTCACCTTCCTCCCTATCTGCCACAGCACCAAGGGCAAGGTCATGGTGGCCGTGGAGATCATCTCCATCTTGGCCTCCAGTGCTGGGCTCCTAGGCTGCATCTTTGCCCCAAAGTACTACATTGTTCTTATAAGAACTGATAAAAACTCTTTGAAAAGTTTAAAGAATAAGT a score=3870 s mm7.chrY_random 8781148 73 + 30114534 TGCACAAGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCGGACACACACACACAA----ATACACATAAGCTTATGCACATAATC s bosTau2.chr14 47301233 77 + 50711261 TGCACATGTGTGTACATGTGCATGCCTGCATGCACACACACACACAAATTTATATACAAAAGCATACAAACATTATC a score=36114 s mm7.chrY_random 8820149 1195 + 30114534 TCTATCACTTTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATACCAGAGATTCTATCTATG-TCCTGTCTTTCTCTGCTTCTTCCTAAAAATCCAATTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATA-----TCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCATAGCCTGCGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCTACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCA--ACACAGGAAAACAA-ACATTTTTTTTTTC----AATCCTATAAGTTTACTTTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGTGTATAGACATAGATATGGAGGTCACCGAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGAACTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCCCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGTTCGCCTGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGATGTCATGCTCAGACTCTTCAGATGTATTGTCTTCTACCTGGCTGTAGACCTGTTGTGGT s bosTau2.chrX 20326712 1216 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCC------TCCCCCTAGAAGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCTTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATA--TTTGCCTACATATAC---GTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGT a score=27158 s mm7.chrY_random 8850275 731 + 30114534 GAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTACTGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACAACCCTCCTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCATTTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTATCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20327276 716 - 48857030 GAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=10682 s mm7.chrY_random 8903928 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAAT-------ACGATGTTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=38683 s mm7.chrY_random 8909898 1289 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCAAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCATTTCCTTATTCTTCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTTATTTGATCTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAATAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATATAGCTA--ACACAGGAAAAAAAAAAACTTTTTTTTTCTTCCAGCCCTATATGTTTACATTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGAACACGGAAGGATTGTCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTAGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCACCTCCTGATCTCTCCTCAGCTGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCTCTCAAATTTTTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCAAGGTGGGCATCCCGCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGAGAACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCATACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAG------------AAATCT-----------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=8415 s mm7.chrY_random 8913343 364 + 30114534 TTAGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGTGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGGTCCTGCCTTCAAAGTTGTGATAAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTTTAAATT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATATATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAGACAAAATATTGAACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTA-GCGGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=10398 s mm7.chrY_random 8914275 422 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGTAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACTTTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCTTTCATCCTGATTTAGGAAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTTCTCCTGGAAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAACCTAAATTCGTGA---AAAAGTTTTGTTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14164 s mm7.chrY_random 8953627 558 + 30114534 TACTGATAAGCTTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACGTTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC---------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14141 s mm7.chrY_random 8959194 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATACAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 8963720 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=12409 s mm7.chrY_random 8965423 1058 + 30114534 ACAAATTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGACAGTGAGA---------------TCTGTAAGTGGACTTCAAATGCTTACAACTTTCTTAGGTTT--------------------GTGCT-----GGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGACGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGC----CATAATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATTGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAAAATGTGTGGATAACACAGATAA------------------TGAAAGACAGTGGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGG-----------------CCATTCTGTCT--GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTCATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCAACAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAG--------ATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTA--AGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCTTAATGCTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-------TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=4973 s mm7.chrY_random 8968160 343 + 30114534 ACAGTCCAGGTTACACAATGTATACACAAAGGAAAGGAGTTATAGTTAACCAGTTAAACTAGTCAGGTGGTTAGCTTGTAGATGGCCAGCATTACAACACTGTAGAGTGTCTTCTTCCATGGGTT--AGCATAGCCCATTCTACCTCAGATAAATGCATTTGTATATCGTCAAATATTAACATTC-CTGAAGAAGAGAAAGGACTTGAATTTAATACT----GAGTCAGAAGCAGTTGTTGTACCTGTCTG-----TGAAT--CATGGCAGGCTGCATACTGAGGAAATTATCAGT------ATCAAATTTAGGTGGAGAAACTGGGATAACCAGAGGTAGGCAAGTGGACCAGATAATTGGT s bosTau2.chr25 41072650 348 - 41414979 ACAGGACAGATTAGTCCACTGCTGTGCAAAGGGAAGGGGAAAAAG--AAAC--TTTACCTAGAGAGATGACAGTCTCATAGTTTTCTTGCATTACATCATTGTAGAGGGCCTTCTG-AGTGGGATCCAGTAACTCCCATTCTTCCTGGGAAAAATACATGGCCACTTCTTCAAATGTCAATAAGCTCTAAAGAAGAGAATGGGCTTCAGCCAAGTACTTGCCACTTCAAAAGTGGCC----CAACCTTCTGAGCCATGAACTGCATGGTAAGCCAGTCACTAAAGGAACTAACAGCACATAAATTAATTTTAAGT-GAGATAGTAGAA----AGGAAGTAAGCACG-GGATCAGCAAACAGGT a score=3108 s mm7.chrY_random 8988088 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=20717 s mm7.chrY_random 8995170 1312 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTATTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAA-AAACCACATTGAAATATAATTAAATTTTGtacatgtatatatatatatatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttacgtgtgtgttgtgtgtgttTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAAACGTAAA---------TGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGCAGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaa------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895153 1369 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA-ATA-------------------------------------------------------------AAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6234 s mm7.chrY_random 8998063 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCatattattg-taaatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTACCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=7617 s mm7.chrY_random 8998778 423 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAAA----------ACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA-AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCTTC---TCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 9000629 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3897 s mm7.chrY_random 9001030 120 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAATT-CAGATAACCTTA s bosTau2.chr5 39898824 126 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAATGACATATGCCCTTA a score=2192 s mm7.chrY_random 9034694 96 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTGTCAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCGTTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA s bosTau2.scaffold2750 81955 104 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAA a score=2611 s mm7.chrY_random 9034816 112 + 30114534 TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGTAATTTCTTTTCAATATTACCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 82105 115 + 102126 TATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=19243 s mm7.chrY_random 9034942 963 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATTAAGAAAGCTATTTTGTTCGGACAT----TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATTGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATACAAGTTACCCCCTA--TTGTAGGAAATGAGTGGATATTCTGACAGTAAATGGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAAGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AAAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGACTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACAAAGTTTCTATGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACGTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCTAACTCACTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=10790 s mm7.chrY_random 9057567 437 + 30114534 TTCAAAGAACGAAAGC-------ATGTAAAAGAAAATGAAA---TCTAGTAATAAGT-----------GTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTCAGAGGTTAGGGTTATTTGCACAAAAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCAAATAACCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTGCT--TGAATAATCACATTGGCATTATTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGACTTAGTTAAAAGTTTGGGACCAGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTGATAATGGGACAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATAAAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAA--AATTGTGAAAAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742189 466 + 45915461 TTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=605 s mm7.chrY_random 9063572 148 + 30114534 AAACCTGATTTTCTCTG--ATTTCTGAGTCTATTTCAATCAGTTTTCTGCGTTTCACCTTGTGTAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCTCTTTCCCCAACTTTTT-----GTTTCTCCTTCAGTGTTCACATCAGAGTTTCT---------------ACCTATGC s bosTau2.chrX 28021507 159 + 48857030 AGATTTCACTCTCCCTGTTATTCTTCACCCTCTTCCAGTTGG----CTGCCTCCCACTCTT-------AGGTCACCCTCCCCTTAGGAGCCTCTCCATTCCCAGCCCCTTCCCACATCCTTTCTTAAGCAGCCACCTTCCCTTTTCCTTTCCCCCACAGCCCATCTCTAG a score=37320 s mm7.chrY_random 9063720 1196 + 30114534 TTTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTGCTGCTATCTCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCT-------------ACATGCAGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCACCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATATTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTAACTCACAGAATATCATGTC-----ACACTTTTAAATTTTTAGAGCAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAAAAAAACAAAAAACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATACGTTTACGTTTCTGTACTTTATGAT-TTTAC----AACTTCAAGAATCTTTGGCACCAGAGTATAGACTTAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACAGAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTTTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGAACCTGGGCTAGCACAACCCCCCTTCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACTGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGGAGTTGACCTAGCACTATGGTCTTCCATTGATTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTAACATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20326788 1204 - 48857030 TCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTC--------TTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACA---AGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACA----CTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATA--TTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=8523 s mm7.chrY_random 9066873 360 + 30114534 TTAGAGCAATAAATATTTTATTCAAACAAAGCAGGAATTTTACAGGGTTAAGTACCTTGTATTGAAGTTATTTGCAACCGTGAATCATTGATTCTTTGCAAAATGAGAAGGCAATCTAGCTCTTGTTCCTGCTTACAAAGTTGTGATGAAGTT-----AAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTT-TAAAATTTATTAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTAGTAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATAGATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAAACAAAATATTGAATGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTAT-CAGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCA-------CTTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11642 s mm7.chrY_random 9067924 382 + 30114534 TGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACATGATT---AATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGCGTGGGAACTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAAATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742256 399 + 45915461 TGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGC-TAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14100 s mm7.chrY_random 9077627 377 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTAATTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCACTACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGTAGGCCCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCACACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTC-TTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9813 s mm7.chrY_random 9082042 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCATTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGGTCTGTGCATGCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCATA---------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=7005 s mm7.chrY_random 9082710 306 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATATATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAGAGCTTTGTGATAatatatatatatatatttatatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTATTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACCGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230044 304 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTT-------TTAAGAAGTGGGGTGGG---TTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATA---ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=20894 s mm7.chrY_random 9092149 837 + 30114534 AATTTTCTCTGATT---TCTGAGTCTAT-TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATCTCCCACTTTCCCCAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTAACTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCACCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTTACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCTAACACAGTAAAAAAAAAAAAACTTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTTTACTTTATTATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACATGGAAGGATTGGCTAGAAATTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGAT s bosTau2.chrX 20326637 881 - 48857030 AACTTCTTCTAAATGTATTTGTGTCCCTCTTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATA-TTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGAT a score=7568 s mm7.chrY_random 9167093 294 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAAAACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatatatatatatatattatCACAAAG-CTCTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATGTATAGTACATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130465 304 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT-TATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9946 s mm7.chrY_random 9167741 314 + 30114534 ACTGAATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14139 s mm7.chrY_random 9172156 377 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGCGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGC-CTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11796 s mm7.chrY_random 9181791 413 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATTGACAATTCCCACGGTTTTAACTAAATCATGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=27027 s mm7.chrY_random 9185113 731 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAAAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCAAACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAAGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGAATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGAGGGTTGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACAGTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=9167 s mm7.chrY_random 9212425 495 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTACTTATAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTAAAAT-CCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTTTTTTTTAAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATACATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAATCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGGCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAA--TTTGTCATAAATTTT-CCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGCC-------AGCCAACATTCTATATG------GGCAACACTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=36538 s mm7.chrY_random 9214742 1172 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCAGGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTTTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAATATCACTTAAATTGAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATTGAAAA----AAAATGT-TTGTTTTCCTGTGT--TGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTAGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGACTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAAATGGATTTTTAGGAAGAAGCAGAGAAAGACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=8222 s mm7.chrY_random 9221337 486 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAAGATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATA----------TTTTACTAAATCGATGGAAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATATTGTTGACTTCTGTATTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAGTAATAAGGGATATGTTTCCATAAAAATAAGTAATGCCAAT---ATCGTTAATCAAGTAGAAAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATTGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGAGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGTTGATAT-------CATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCgtttgaataattgtgt s bosTau2.chr17 20172806 480 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATT-AGCAGAAA------------------------------------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACTTTAT a score=3870 s mm7.chrY_random 9254222 73 + 30114534 GATTATGTGCATAAGCTTATGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACTTGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=21038 s mm7.chrY_random 9270809 668 + 30114534 ACTTCTATCTGACACCTTGGATAGAATTCAAGTCTGGTCTTATTTCAATGATGTAGATCTTGGGTGTAAAGATGCATCCAAGCATCACTGTACTGGATGCCAAGATTGAGAAGACCTCTACAGCAGCCATGACCATGCCCTTAGTCCTATGTGAGTCATGGAGGAAGGTGACATAAACACTGCAGAATCCTAGCACGACAAAGGTCAGGAACTTGGCTTCATTAAATGTTTCAGGAAAATTCTTTGCCACGAAATCCACAGTGAAGCTTCCAAGGGCAAGGCAGGTCAAGTATCCCAAAATTCAGTAGAATGCAGTAACTGAACCCTTGTTGCACAAAATGATTA--TCATTATCATCAATATCAACAAATATCAATATCAACAAAAGGAGGAGAAACTGAGAGCCAGATTACCCACA-GAATACATTGAT-ATGGAACATATCAGAAGGATGTATTTCATTGAACCTGATAAAAGGAGGTTCCTTAAACCTCTTCCAGGTTCTGTGATTATGAAAGCCAA-ACTACAATGATTGTTTTGGCAAGCAATGTGGAAACAGACACCATGAATACAATTCCAAAAGTGATTTGTTGTA------AGGCTACATTTTTTTTCTGTTAGGAAGACCAATGAAGAAAAAGGAGCATGAGAAAATGGAACATGAGTGACATGAGTA s bosTau2.chr7 54723649 662 - 69141744 ACTTATTCTTTAAACTTTTCAAAGAGTTTTTATCAGTTCTTATAAGAACAATGTAGTACTTTGGGGCAAAGATGCAGCCTAGGAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGATGATCTCCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGCAGATAGGGAGGAAGGTGACCCAGACACTGAGGAGCACCAGCCTGCTGAAGGTCAGGAACTTGGCTTCACTGAAGGTGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGAAAGCCAAGGAGAAGGTCCCCAGGGCTAAGGAGCCCAGGTAGCCCAGGACACAGTAGAAGGCAGTGACCGAGCCCTTGTTGCACACGATGAGGAGCTCCTTGGGCTCAG----AATGAGTGTCCATCTCAAGGAAAGGGGGAGAGGCTCCCAGCCAGACTCCACAGATGATCACCTGGATCATGGAGTACATGGGAAAGACATA----GCAGGTCCTGTTAAGAGCAATCGCCTCATGGTTCTTCCTGGTTTCCTGGCCTTGAATGCCAAGATCACAGGGACGATTTTGGCCAAAACAGTGACCACAGCCACAGTGAACACAGCTCCAAATGTGGTCTGTTGGAGGATGGAGGTGGC--------TGTGTGGGGACGACTGATAAAGAGTAAGGAGCA-GAGGAAGCACGGGAGGAGGGAGATGAACA a score=9892 s mm7.chrY_random 9286325 492 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAACTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTCTGAAATTCCTTGTAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTTTTTGCATAA-AAATAGTTCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35683 s mm7.chrY_random 9288654 1171 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTAATTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAAAGTAAACTTAT-------AGGATTGAAAAAAATGTTTATTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCATCGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATTACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGCAAGAAGGGGAGAAAGACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGGG-----AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=9906 s mm7.chrY_random 9295231 458 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCTGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATGAAAATAAGTAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAGAAATGA--TATAAACTATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-------TCCTTTATTCTtttgaataaatg s bosTau2.chr17 20172806 473 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATG a score=14263 s mm7.chrY_random 9377545 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 9382086 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=3273 s mm7.chrY_random 9382175 68 + 30114534 TTCACAGACCAAGTCCTCATCGATGACAGAAACTGTGGCTATGTACTGTG-TTTATACTTTATTCCTCA s bosTau2.chr3 39055378 68 + 85360813 TTCATAGACCAGCTCCTCATCGATGG-AGAAATAGTGGGTATTTACTGTGCTTTTTGGTCTATTCCTTA a score=3426 s mm7.chrY_random 9383479 55 + 30114534 CTTTCATGAACTCACAAGCCAGGATTCACTTCTCTGACTACACGGCCATCTTAAG s bosTau2.chr3 39056262 55 + 85360813 CTTTCATGAACTCGCAAGCCCCGATTAGTTCCCCTGACTCCGCTGCCATCTTAAG a score=12344 s mm7.chrY_random 9383788 1059 + 30114534 ACAAATTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAACTTTCTTAGGTTTGTGCTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGACGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGC----CATAATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAAAATGTGTGGATAACACAGATAA------------------TGAAAGACAGTGGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGG-----------------CCATTCTGTCT--GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTCATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCAACAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCT---------------TAATG----CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-------TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=4323 s mm7.chrY_random 9386525 342 + 30114534 ACAGTCCAGGTTACACAATGTATACACAAAGGAAAGGAGTTATAGTTAACCAGTTAAACTAGTCAGGTGGTTAGCTTGTAGATGGCCAGCATTACAACACTGTAGAGTGTCTTCTTCCATGGGTT--AGCATAGCCCATTCTACCTCAG-ATAATAAATTTGTATATCGTCAAATATTAAC-ATTTCTGAAGAAGAGAAAGGACTTGAATTTAATACT----GAGTCAGAAGCAGTTGTTGTACCTGTCTG-----TGAAT--CATGGCAGGCTGCATACTGAGGAAATTATCAGTA-ACGAATTTAGGTGGAGAAACTGGGATAACCAGAGGTAGGCAAGT---GGACCAGATAATTGGT s bosTau2.chr25 41072650 348 - 41414979 ACAGGACAGATTAGTCCACTGCTGTGCAAAGGGAAGGGGAAAAAG--AAAC--TTTACCTAGAGAGATGACAGTCTCATAGTTTTCTTGCATTACATCATTGTAGAGGGCCTTCTG-AGTGGGATCCAGTAACTCCCATTCTTCCTGGGAAAAATACATGGCCACTTCTTCAAATGTCAATAAGCTCTAAAGAAGAGAATGGGCTTCAGCCAAGTACTTGCCACTTCAAAAGTGGCC----CAACCTTCTGAGCCATGAACTGCATGGTAAGCCAGTCACTAAAGGAACTAACAGCACATAAATTAATTTTAAG----TGAGATAGTAGAAAGGAAGTAAGCACGGGATCAGCAAACAGGT a score=2977 s mm7.chrY_random 9406440 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAAAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=21663 s mm7.chrY_random 9413520 1295 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGCAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAAAAAACCACATTGAAATATAATTAAATTTT----GTACAtgtatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttacgtgtgtgttgtgtgtgtTTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAAACGTAAA---------TGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGCGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaa------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgattaggcattt s bosTau2.chr5 39895153 1369 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATA------------------------------------------------TATAATAAAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6234 s mm7.chrY_random 9416394 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCatattattg-taaatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTGCCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=7617 s mm7.chrY_random 9417109 423 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAAA----------ACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA-AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCTTC---TCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 9418961 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 9419362 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=6095 s mm7.chrY_random 9420348 706 + 30114534 TATCTACTGTATTTGTCTGACTCATTTGGGATAAGGATTTACTTGGACCCAGCTTCATTTGTCACATCCACTTTTC-----AAGTATA-------------------AAAAAAATCACATACTCCATCTACCAACA----TGGGAGACATTATTTTTTGATATGCAGTTTTCCCCAACAGTGGAATGACAAGAC-GACCAGAG--CCATCCCTTAGGACAGGGAC---AAATGATCCAAAAGTTACTATTCTCTAACCTAGGACAACCAGTGTCAATAATTTTATAT---------GTCTCTG-------CAAACCTAGATTATG-----------------GCTGATCAACTTCATTGAG-------------------TCAGTGGT---AGCACTCAGAGTGG----------------------GCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCACTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACAATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957119 839 + 62721844 TATTTCATGCATTCGCATGACTAGATCAGGTCAGGGGGTCGCTTGGACCTTGCTTTAC----CATACTCACTTCTCTTGCCAAGGAGATGTCGAAACTTGTGTACTTAACAAAACAACCTATTCTATTTGTCAACACTAATGCCAGACATC-CGTTTTGACCC-CAGTTCCCCTCC-CAGTG-------AAGACTGGTTAGAGGTTCACCACTTAGAAGGAGGGCTCTGGATGAACCAGA---CACAAATTACGAATTTAGAAAGCCCATGGTTAGAGGTTCGCCACTCAGACGGAGGCTCTGGGTCAGCCCGACATAGATTACGAATTTAGAAAGCCCAGTGATGGTGCACTTTGATGAGAGTGCTGCTCACAAAAACCCCAGTAACCCCAGTACTCTGAATGGTGGAGGCTTGTCATGGGAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 9421901 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATAAAAAA s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=4160 s mm7.chrY_random 9422225 388 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACTTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGGCCAAACATTCTTTAGCAGTCACTTGGGAAATTCAA---------TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataata-----ttataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4591 s mm7.chrY_random 9422810 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=2192 s mm7.chrY_random 9449517 96 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTGTCAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCGTTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA s bosTau2.scaffold2750 81955 104 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAA a score=2622 s mm7.chrY_random 9449639 112 + 30114534 TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGTAATTTCTTTTCAATATTATCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 82105 115 + 102126 TATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=19272 s mm7.chrY_random 9449765 963 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATCGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATTAAGAAAGCTATTTTGTTCGGACAT----TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATTGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATACAAGTTACCCCCTA--TTGTAGGAAATGAGTGGATATTCTGACAGTAAATGGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAAGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGACTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACAAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCTAACTCACTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=10535 s mm7.chrY_random 9472324 437 + 30114534 TTCAAAGAACGAAAGC-------ATGTAAAAGAAAATGAAA---TCTAGTAATAAGT-----------GTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTCAGAGGTTAGGGTTATTTGCACAAAAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAACCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTAC--ATGAATAATCACATTGGCATTATTTATTTGTACTGAAACATAGCCCTTCTCCCTGACTTAGTTAAAAGTGTGGGACCAGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTGATAATGGGACAAAACAGAAGCCTGGAGGATTGACTGTACTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATAAAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAA--AATTGTGAAAAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742189 466 + 45915461 TTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=37291 s mm7.chrY_random 9478417 1251 + 30114534 CTTTCCCCAACTTTTTGGTTCTCCTTCAGTGTTCACATCAGAGTTTCTACCTATGCTCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTGCTGCTATCTCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCT-------------ACATGCAGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTACGTAGTGTTCACCACCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATATTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTAACTCACAGAATATCATGTC-----ACACTTTTAAATTTTTAGAGCAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAAAAAAACAAAAAACTGTTTTTTCTTCCAGTCCTATACATTTACGTTTCTGTACTTTATGAT-TTTAC----AACTTCAAGAATCTTTGGCACCAGAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACAGAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTTTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGAACCTGGGCTAGCACAACCCCCCTTCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACTGCTCTGCCAACCAGGTCTCTGGCGAGGTGGGAATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATTATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGGAGTTGACCTAGCACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTAACATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20326741 1251 - 48857030 CTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTC------CCCCTAGAAGCCTCTCCAT---TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTC--------TTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACA---AGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACA----CTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC-ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=11800 s mm7.chrY_random 9482646 432 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGTAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAAGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGCGTGGGAACTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA-AAAGCTTT--TTTTTCATATTTTAATTATTTACAG---GTCATTCTCTGCCATATAA s bosTau2.chr17 25742211 466 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGCTACAAAA a score=14139 s mm7.chrY_random 9492338 377 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGCAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCGCACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAG-GCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9599 s mm7.chrY_random 9496746 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGAAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGGTCTGTGCATGCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=5770 s mm7.chrY_random 9497672 152 + 30114534 atatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTATTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230167 181 + 85360813 ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10915 s mm7.chrY_random 9509368 400 + 30114534 AGTAAGTGTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATACATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAAAAAAAAGCTTTGTTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742250 405 + 45915461 AGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=21697 s mm7.chrY_random 9515323 839 + 30114534 CCTGATTTTCTCTTA----TTTCTGAGTCTAT-TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATCTCCGACTTTCCCCAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTAACTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGATGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTTACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCTAACACAGTAAAAAAAAAAAACTTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACATGGAAGGATTGGCTAGAAATTGGTAAACAACCTTTCCAAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGAT s bosTau2.chrX 20326633 885 - 48857030 CCTGAACTTCTTCTAAATGTATTTGTGTCCCTCTTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGAT a score=21185 s mm7.chrY_random 9620940 810 + 30114534 ATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGATGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAATTTCTAGCCAATCCTTCCATGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGTTTTTTTTTTTTACTGTGTTAGCTACATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTAAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAA--GGAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGTTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTGGGGAAAGTGGGAGATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529512 852 + 48857030 ATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT-GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCAT-CTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10923 s mm7.chrY_random 9627340 399 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAC--AAAGCTTTTTTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATGTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACGAAGTGACATGGACACTTACTG s bosTau2.chr17 20172806 406 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTG a score=5323 s mm7.chrY_random 9639265 151 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAATAACACATAAATGGCTCCAAAA-CTCAGCCAAGTCTATTAAGatatat s bosTau2.chr3 45130465 181 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT a score=9813 s mm7.chrY_random 9639982 314 + 30114534 ACTGCATGCACAGACCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14222 s mm7.chrY_random 9644340 377 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGTGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTACAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTAGTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCACCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGC-CTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11860 s mm7.chrY_random 9654176 413 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGTTCCCACGCTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=37795 s mm7.chrY_random 9657522 1195 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGTTACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGTGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGATTTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGATGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTGCTAGGTCAACTCCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCAGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGAAGGGGGGTTGTGCTAGCCCAGGTTCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCACA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAAAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTCTGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGCCAAAGATTCTTGAAGTT----GTAAA-ATCATAAAGTACAGAAACGTAAACGTATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGTTTTTTGTTTTTTTTTCCTGTGTTGGCTACATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGCTCTAAAAATTTAAAAGTGT-----GACATGATATTCTGTGAGTTAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAATATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGTGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAA--GGAACAG--CTTCTCTGGTCTGCATGT-------------AGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGAGATAGCAGCAAAAGATGGGTGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGA s bosTau2.chrX 28529038 1204 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAA--TATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAG---TGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCAT-CTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCT---TGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAA--------GAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGA a score=308 s mm7.chrY_random 9658717 116 + 30114534 GCATAGGTAGAAACTCTGA-------TGTGAACACTGAAGGAGAAACAAAAAGTTGGGGAAAGAGGGACATTTAAAAGAAATGTG--GCCTTGTTAC-ACAAGGTGAAACGCAGAAAACTGATTGA s bosTau2.chrX 20849551 124 - 48857030 GAATGG--AGAGGCTCCTAAGGGGAGGGTGACCTAAGAGTGGGAGGCAGCCAACTGGAAGAGGGTGAAGAATAACAGGGAGAGTGAAATCTTGGGGCTAAGAGGAAAAACGGACAGGATAAATTGA a score=11020 s mm7.chrY_random 9664445 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTTTTCACAATT--TTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTTTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATCCTATAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACTGGTCCCACACTTTTAACTAAGTCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAATAATGCCAATGTGATTATTCA--AGCAGAAATCTGGCAAGGTTAGGATGCCTTTGGGTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTTTTGTGCAAATAACCCTAACCTCTGAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCAG-TAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=19355 s mm7.chrY_random 9686529 963 + 30114534 GCACTTGTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTAGTGAGTTAGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATTCAGTTTGAGTCCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTGAGAGGTCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTTGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCTAAGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGAAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGTCTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGGGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTAGCACCCCTTTTCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCCATTTACTGTCAGAATATCCACTCATTTCCTACAA--TAGGGGGTAACTTGTATTCTGGATAA-------TTCTGTATTCACTG---------------------------------TGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACATCTTTGA-------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATAAGTATCAATTCAGATT-ATATATACCTTTTGAGAATTAGCTTCACATTTCTA----ATGTCCGAACAAAATAGCTTTCTTAATTTAAGTTACAGTTGCTATGTTTCACTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTC--AGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=2622 s mm7.chrY_random 9687506 112 + 30114534 TTAAGCATGATAATATTGAAAAGAAATTACAATT--TTTCACTTTGAAATTAAATCTCTGAAGATGATAACTTAACTTGTGTTTGGAAAAGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA s bosTau2.scaffold2750 19906 115 - 102126 TCAAACACTCTAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATA a score=2192 s mm7.chrY_random 9687644 96 + 30114534 TTGTTCAAACAAAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAACGAAAATAACTGAATAGTA-GGTTTGT-AGCATTTGACACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 20067 104 - 102126 TTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=3854 s mm7.chrY_random 9716641 107 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCCATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGCTTTTAA s bosTau2.chr5 36527708 112 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGTTTGGTTTTTTAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 9717078 71 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAAGAAATATA-----CTTTCTATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=7924 s mm7.chrY_random 9718577 423 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTACACTTAAACAAGAAAATGATTAAAGATATTTAAAAAT---AAAGAAGTTCTATTTTAACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGATTTTTTTTATTTGT---------TTTATATATATACCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGGGTACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTCAAACATAGACATTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGA---AGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTTTAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=6234 s mm7.chrY_random 9719295 420 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACtaaatatatatatatattta-caataatatGAAATAACATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA---ATGTGTTCACCACTTACATACAATAATA--ATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=20881 s mm7.chrY_random 9721300 1314 + 30114534 aaatgcctagtcgttttcattgatatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagataatggaacttaatttagtttcatatgctcaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt------ttttttatggtaccaaccactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAATGAACACTCAGAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCGCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCA---------TTTACGTTTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacgtaacacacacacacacacacacacacacacacacacacatatatatatatatatatatatacatgtaCAAAATTTAATTATATTTCAATGTGGTTTTTTTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAACTAAAATATACAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCACACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATATAATTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAA--AATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGAGTCAT----TTTGAAGAAAAATTAGATGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530122 1369 - 76426644 AAATACC-AACAGCTTTTAT--ATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAAC--AACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTT---------------------------------------------------------------TAT-TATATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACC---CATGAGTAGTAAGGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=3108 s mm7.chrY_random 9729622 94 + 30114534 ATATTTCTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=12272 s mm7.chrY_random 9751396 1303 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCTGTGTTCCTGTTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATGAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGATGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC--AGACAGAATGG-----------------CCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAATGATACAATAGAATTCTACGTTGTTTCCCACTGTCTTT--------CATTATCTGTGTTATCCACACAT---------TTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTAGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATTATG----GCCCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACCGTCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGACT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCCAGCACAAACCTAAGAAAGTTGTAAGCATTTGAAGTC----------------------CACTTACAGATCTC-ACTG-------------------------TCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGGAA---TTTTTAAATGATTGCATACCACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAATTTGTG-------------ATTTCTTAATTTTAAATGAGTATAGCAGTTTTCTCTATAGA-----AAAGTTTGAGCATTAATTTAT------TGATAAGGTCAGTGCATGGGAGCTTCTGTACCCTTTCCAACATGGTATGCATCTGATACTCGAGGGTCTCATCCACTAGTAGTCTG-GCAGAGAAACACATGTGGCTTATACATTTGGTCCCAATTAGAAGCAGGGTAGATTGAATCC--CAGGTTTATGTTGAAATAACAACTGCTTGGTCAGG s bosTau2.scaffold5600 1080 1466 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-----AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCT-ATCTACATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAG----CATTA---------------AGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACTTAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCATCTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGTATGGCTGTTCAGGCATTGCTTCATAT-------GTATGGATGCTTTGCAGGAAGATCTGGAGATTTTGCAAACTGATTTATTCAGAATGGTAAGG--AGAGCCCTGTGGCCTC-ATGGTCTTGTAGACTCAGTGAACATTGGATGCTAGGAGGGAATGT------GCAGTCAGAGCAGGGTAAGGCCTGTGACTTAAA-----------AGTGAAAGCCAGGTCAGACAGAAACTGGTTTGTTcatgttgggattttagttcccggaccagg a score=3426 s mm7.chrY_random 9752708 55 + 30114534 CTTAAGATGGCCGTGTAGTCAGAGAAGTGAATCCTGGCTTGTGAGTTCATGAAAG s bosTau2.chr3 46304496 55 - 85360813 CTTAAGATGGCAGCGGAGTCAGGGGAACTAATCGGGGCTTGCGAGTTCATGAAAG a score=4837 s mm7.chrY_random 9754068 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14049 s mm7.chrY_random 9758308 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTAATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13930 s mm7.chrY_random 9763666 558 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTGACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAAGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA---------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=11201 s mm7.chrY_random 9858629 422 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAACAAAACTTTT---TCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGGAGAAATAAAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAAAAAT-AATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAAAGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTAT----TACTTG----------ATTACAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38981 s mm7.chrY_random 9862181 1288 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTATGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCCTCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCATTGTTGGAAGGAATGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTATGGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTTGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACAAAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGGTGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCTAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGACAATCCTTCCGTGTTCTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAATGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGT---TTTTTTTTTCCTGTGTTAGCTATATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTATTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGAAGAATAAGGAAATGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTTGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCAAAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------AGATTT------------CTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGTTGAGAG-GAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10889 s mm7.chrY_random 9869075 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCATACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=7315 s mm7.chrY_random 9929923 190 + 30114534 GATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16962 186 + 41832 GAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCACC-ACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTGG---GCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 9934299 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=3142 s mm7.chrY_random 9934388 68 + 30114534 TTCACAGACCAAGTCCTCATCGATAACAGAAACTGTGGCTATGTACTGTG-TTTATACTTTATTCCTCA s bosTau2.chr3 39055378 68 + 85360813 TTCATAGACCAGCTCCTCATCGATGG-AGAAATAGTGGGTATTTACTGTGCTTTTTGGTCTATTCCTTA a score=3426 s mm7.chrY_random 9935694 55 + 30114534 CTTTCATGAACTCACAAGCCAGGATTCACTTCTCTGACTACACGGCCATCTTAAG s bosTau2.chr3 39056262 55 + 85360813 CTTTCATGAACTCGCAAGCCCCGATTAGTTCCCCTGACTCCGCTGCCATCTTAAG a score=12185 s mm7.chrY_random 9935758 1303 + 30114534 CCTGACCAAGCAGTTGTTATTTCAACATAAACCTG--GGATTCAATCTACCCTGCTTCTAATTGGGACCAAATGTATAAGCCACATGTCTTTCTCTGC-CAGACTACTAGTGGATGAGACCCTCGAGTATCAGATGCATACCATGTTGGAGAGGGTACAGAAGCTCCCATGCACTGACCTTATCA------ATAAATTAATGCTCAAACTTT-----TCTATAGAGAAAACTGCTATACTCATTTAAAATTAAGAAAT-------------CACAAATTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAACTTTCTTAGGTTTGTGCTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGATGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGC----CATAATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAA---------ATGTGTGGATAACACAGATAATG--------AAAGACAGTGGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGG-----------------CCATTCTGTCT--GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGCTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTATATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTCATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCAACAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50039 1466 - 52585 cctggtccgggaactaaaatcccaacatgAACAAACCAGTTTCTGTCTGACCTGGCTTTCACT-----------TTTAAGTCACAGGCCTTACCCTGCTCTGACTGC------ACATTCCCTCCTAGCATCCAATGTTCACTGAGTCTACAAGACCAT-GAGGCCACAGGGCTCT--CCTTACCATTCTGAATAAATCAGTTTGCAAAATCTCCAGATCTTCCTGCAAAGCATCCATAC-------ATATGAAGCAATGCCTGAACAGCCATACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCT---------------TAATG----CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATG-TAGATAGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3108 s mm7.chrY_random 9958591 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=20005 s mm7.chrY_random 9965681 1316 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTAAT-ATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTTCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTTGTAGAAAATAATGAAAAA-AAACCACATTGAAATATAATTAAATTT--TGtacatatgtatatatat-atatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg---------tgtgtgtgtgtgtgttacttgtgtgttgtgtgtgtTTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAAACATAAATGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGCGGAAAAATCTATAATGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATATCTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaa-------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895153 1369 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAA------TTAACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATAATAAAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTG---GTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATC------------AGCATAAGT-CATACTTCT------------------------------TGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6234 s mm7.chrY_random 9968578 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCatattattg-taaatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTACCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=2572 s mm7.chrY_random 9969075 106 + 30114534 ATGGCTTTGTATGAATTATTAAAGATATGAAATGATAAAATGGGAATTTGACCTCAGATGTAC-----------------CTCATACTTTAATAACACTATAATTAT-CCTGCTTTATTAAACA s bosTau2.scaffold10439 16855 123 - 23754 ATAGTATTGTGGGAGTCACTTAAAATGGGGAACTGCAAACTGGGAATTTAATCT-AGATGTATACACATGGTGAAGAAAACTGATACTTGATTAACCCTTTAATCCTAACTATTTTGTTCAGCA a score=7587 s mm7.chrY_random 9969293 424 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAAA----------ACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA--AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCTTC---TCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 9971146 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 9971547 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=2192 s mm7.chrY_random 10001122 96 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTGTCAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCGTTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA s bosTau2.scaffold2750 81955 104 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAA a score=2622 s mm7.chrY_random 10001244 112 + 30114534 TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGTAATTTCTTTTCAATATTATCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 82105 115 + 102126 TATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=19468 s mm7.chrY_random 10001370 963 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATTAAGAAAGCTATTTTGTTCGGACAT----TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATTGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATACAAGTTACCCCCTA--TTGTAGGAAATGAGTGGATATTCTGACAGTAAATGGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAAGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGACTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACAAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAATGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAAACTAACTCACTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=10965 s mm7.chrY_random 10023955 437 + 30114534 TTCAAAGAACGAAAGC-------ATGTAAAAGAAAATGAAA---TCTAGTAATAAGT-----------GTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTCAGAGGTTAGGGTTATTTGCACAAAAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAACCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTGCT--TGAATAATCACATTGGCATTATTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGACTTAGTTAAAAGTGTGGGACCAGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTGATAATGGGACAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTATTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATAAAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAA--AATTGTGAAAAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742189 466 + 45915461 TTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=308 s mm7.chrY_random 10030026 116 + 30114534 TCAATCAGTTTTCTGCGTTTCACCTTGT-GTAACAAGGC--CACATTTCTTTTAAATGTCCCTCTTTCCCCAACTTTTTGTTTCTCCTTCAGTGTTCACA-------TCAGAGTTTCTACCTATGC s bosTau2.chrX 28007355 124 + 48857030 TCAATTTATCCTGTCCGTTTTTCCTCTTAGCCCCAAGATTTCACTCTCCCTGTTATTCTTCACCCTCTTCCAGTTGGCTGCCTCCCACTCTTAGGTCACCCTCCCCTTAGGAGCCTCT--CCATTC a score=36883 s mm7.chrY_random 10030142 1195 + 30114534 TCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTGCTGCTATCTCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCT-------------ACATGCAGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCACCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATATTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTAACTCACAGAATATCATGTC-----ACACTTTTAAATTTTTAGAGCAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCCAACAGAGGAAAAGAAAAACAAAAAACTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATACGTTTATGTTTCTGTACTTTATGAT-TTTAC----AACTTCAAGAATCTTTGGCACCAGAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACAGAACGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTTTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGAACCTGGGCTAGCACAACCCCCCTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACTGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAAACTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACATAGCACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACCCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAAACCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTAACATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20326788 1204 - 48857030 TCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTC--------TTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACA---AGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTA----CACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC-ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=2717 s mm7.chrY_random 10032603 108 + 30114534 GGAAAACTTTCAGCTTTCTATAGCTATGAGGGTCCCATTCACTTCATAAATGTACTTACCCAAAGAAAATGTCTTAGTCA-TCAAGATTCTGTCTTTTGAAACAGACCA s bosTau2.chr17 25749565 106 + 45915461 GAAAATCATTCTGCTT---GGGACTATAGAACCTTCAATCACTTAATAAATGGATCGCCCCACACAGAATGTCCTAGCTAGCCCAGATACTTTCTTCTGAAGGGGAACA a score=8523 s mm7.chrY_random 10033290 360 + 30114534 TTAGAGCAATAAATATTTTATTCAAACAAAGCAGGAATTTTACAGGGTTAAGTACCTTGTATTGAAGTTATTTGCAACCGTGAATCATTGATTCTTTGCAAAATGTGAAGGCAATCTAGCTCTTGTTCCTGCTTACAAAGTTGTGATGAAGTT-----AAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTT-TAAAATTTATTAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTAGTAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATAGATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAAACAAAATATTGAATGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTAT-CAGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCA-------CTTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11515 s mm7.chrY_random 10034278 413 + 30114534 TATGTAAAAAAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGCGTGGGAACTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGTAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14233 s mm7.chrY_random 10043967 377 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCACTACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGTAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCACACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAG-GCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9730 s mm7.chrY_random 10048386 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGTGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTC-AGTGTTGCTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGGTCTGTGCATGCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=5770 s mm7.chrY_random 10049264 152 + 30114534 atatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTATTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230167 181 + 85360813 ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10987 s mm7.chrY_random 10060943 452 + 30114534 AGTAAGTGTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATACATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAAAAAAGCTTT--GTTTTCATATTTTCATTATTTACAG-ATCA--TTCTCTGCTATATAAAGGAACATAG--AGGAGGAAATCTGTTTGGAGTCACT s bosTau2.chr17 25742250 462 + 45915461 AGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGC--TACAAAACAACCTAGTCAACAAAGAATGCAATTGGAGTTTCT a score=20809 s mm7.chrY_random 10066936 809 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATCTCCCACTTTCCCCAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTAACTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTTACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCTAACACAGTAAAAA--AAAAAACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATACTATACACATAGATATGGATGTCACCATGAAAGTTGATAAAGTACATGGAAGGATTGGCTAGAAATTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGAT s bosTau2.chrX 20326666 852 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGAT a score=13401 s mm7.chrY_random 10144894 557 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAACAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGTGGAGT-ATCTACTTATGCACGCTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATT-ACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC---------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14263 s mm7.chrY_random 10150445 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 10155010 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=11492 s mm7.chrY_random 10157636 277 + 30114534 TTCTGGTGTCTTAGAAGCCTTGATTGTCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGATTAATGAGGTGACATTTCTGAAGGAATGGCCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTCT-GGCACCAGGAACACTGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 51228 277 - 52585 TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=20595 s mm7.chrY_random 10246709 711 + 30114534 AGAATTCAAGTCTGGTCTTATTTCAATGATGTAGATCTTGGGTGTAAAGATGCATCCAAGCATCACTGCACTGGATGCCAAGATTGAGAAGACCTCTACAGCAGCCATGACCATGCCCTTAGTCCTATGTGAGTCATGGAGGAAGGTGACATAAACACTGCCGAATCCTAGCACGACAAAGGTCAGGAACTTGGCTTCATTAAATGTTTCAGGAAAATTCTTTGCCACGAAATCCACAGTGAAGCTTCCAAGGGCAAGGCAGGTCAAGTATCCCAAAATTCAGTAGAATGCAGTAACTGAACCCTTGTTGCACAAAATGATTA--TCATTATCATCAATATCAACAAATATCAATATCAACAAAAGAAGGAGAAACTGAGAGCCAGATTGCCCACA-GAATACATTGAT-ATGGAACATATCAGAAGGATGTATTTCATTGAACCTGATAAAAGGAGGTTCCTGAAACCTCTTCCAGGTTCTGTGATTATGAAAGCCAA-ACTACAATGATTGTTTTGGCAAGCAATGTGGAAACAGACACCATGAATACAATTCCAAAAGTGATTTGTTGTA------AGGCTACATTTTTTTTTTCTGTTAGGAAGACCAATGAAGAaaaaggagcatgagaaaatggaacatgagtgacatgagt-agctgatgagaaatgtggaaagacatagaaggaaggacaggaagaaagttagagagtaagaaag s bosTau2.chr7 54723671 704 - 69141744 AGAGTTTTTATCAGTTCTTATAAGAACAATGTAGTACTTTGGGGCAAAGATGCAGCCTAGGAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGATGATCTCCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGCAGATAGGGAGGAAGGTGACCCAGACACTGAGGAGCACCAGCCTGCTGAAGGTCAGGAACTTGGCTTCACTGAAGGTGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGAAAGCCAAGGAGAAGGTCCCCAGGGCTAAGGAGCCCAGGTAGCCCAGGACACAGTAGAAGGCAGTGACCGAGCCCTTGTTGCACACGATGAGGAGCTCCTTGGGCTCAG----AATGAGTGTCCATCTCAAGGAAAGGGGGAGAGGCTCCCAGCCAGACTCCACAGATGATCACCTGGATCATGGAGTACATGGGAAAGACATA----GCAGGTCCTGTTAAGAGCAATCGCCTCATGGTTCTTCCTGGTTTCCTGGCCTTGAATGCCAAGATCACAGGGACGATTTTGGCCAAAACAGTGACCACAGCCACAGTGAACACAGCTCCAAATGTGGTCTGTTGGAGGATGGAGGTGGC----------TGTGTGGGGACGACTGATAAAGAGTAAGGAGCA-GAGGAAGCACGGGAGGAGGGAGATGAACAAGTCGGTGACATCCCCAGAGAATCATCAAATTCAGGATGGTCAAGTCCTTGGGGAGGGAGGCAG a score=9621 s mm7.chrY_random 10262288 485 + 30114534 AAGTAAATTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAACTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTCTGAAATTCCTTGTAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCATGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164593 444 - 45915461 AAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35824 s mm7.chrY_random 10264601 1171 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCCCAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGATAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTTCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAATCACA---AAGTACAGAAATGTA-AACTTATAGGATTGAAAAAAATGTTTGTTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGGCATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGTATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAA--GAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGGG-----AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATG-GATTGTGGGGGAAAGGAA-------GAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=9884 s mm7.chrY_random 10271199 407 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCtttttttaaaatcatatttataa-------tattttaCTAAATCGATGGGAAATCTTCTGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATGAAAATAAGTAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAG-TAACGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=11584 s mm7.chrY_random 10319661 277 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4837 s mm7.chrY_random 10322489 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=13946 s mm7.chrY_random 10326763 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTAGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCATTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGGATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGT-GGTGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13280 s mm7.chrY_random 10332090 556 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCACTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGAGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAATGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA--------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=11584 s mm7.chrY_random 10473985 277 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4837 s mm7.chrY_random 10476770 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14263 s mm7.chrY_random 10481058 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCAACCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13178 s mm7.chrY_random 10486430 556 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACCTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGCGTGCATAAGTAGAT-ACTCCACTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCATTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA--------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=20458 s mm7.chrY_random 10564031 820 + 30114534 ATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGTTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGATGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAATTTCTAGCTAATCCTTCCATGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAAAGttttttttttttttttttttACTGTGTTAGCTACATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTAAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATATACCTAAAATCATA------CATGCTAAAA--GGAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGAAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGTTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTGGGGAAAGTGGGAGATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529512 852 + 48857030 ATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAA---------TATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCAT-CTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10570 s mm7.chrY_random 10570436 398 + 30114534 CTGTAAATAATAAAAATATGAAAAC--AAAGCTTTTTTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATGTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTGCAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TACACTACGAAGTGACATGGACACTTACT s bosTau2.chr17 20172806 405 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCT a score=7150 s mm7.chrY_random 10582381 308 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAATAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatatatatatatatatatatatatTATCACAAAGCTCTCACACAACTTTTTAAAAATCCTAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATATATAATATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130465 304 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT-----TATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAA---CCCACCCCACTTCTTAA-------AACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACTG--------------GAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9468 s mm7.chrY_random 10583043 314 + 30114534 ACTGCATGCACAGACCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTTTTTGTTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14233 s mm7.chrY_random 10587399 377 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGTGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTACAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTAGTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGC-CTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11504 s mm7.chrY_random 10597096 413 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGCCTTCTGTTTTGTCCCATTTTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGTTCCCACGCTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAAGCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=37636 s mm7.chrY_random 10600469 1196 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGTTACCCACAAGACATCTGCCCAGGTTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGGGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTGCTAGGTCAACTCCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCAGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGAAGGGGGGTTGTGCTAGCCCAGGTTCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAAGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACATTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAAAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTCTGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGCCAAAGATTCTTGAAGTT----GTAAA-ATCATAAAGTACAGAAACGTAAACGTATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGTTTTTTGTTTTTTTTTTCCTGTGTTGGCTACATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGCTCTAAAAATTTAAAAGTGT-----GACATGATATTCTGTGAGTTAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGCAAGGAATATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGTGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAA--GGAACAG--CTTCTCTGGTCTGCATGT-------------AGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGAGATAGCAGCAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAAA s bosTau2.chrX 28529038 1204 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAA--TATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAG----TGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCAT-CTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCT---TGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAA--------GAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGA a score=616 s mm7.chrY_random 10601665 148 + 30114534 GCATAGGT---------------AGAAACTCTGATGTGAACACTGAAGGAGAAAC-----AAAAAGTTGGGGAAAGAGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTACACAAGGTGAAATGCAGAAAACTGATTGAAATAGACTCAGAAAT--CAGAGAAAATCAGGTTT s bosTau2.chrX 20835364 159 - 48857030 CTAGAGATGGGCTGTGGGGGAAAGGAAAAGGGAAGGTGGCTGCTTAAGAAAGGATGTGGGAAGGGGCTGGGAATGGAGAGGCTCCTAAGGGGAGGGTGACCT-------AAGAGTGGGAGGCAG----CCAACTGGAAGAGGGTGAAGAATAACAGGGAGAGTGAAATCT a score=10528 s mm7.chrY_random 10607404 437 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTTTTCACAATT--TTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTTTATTAAATGAAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATCCTATAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATCAACAA-AATTAATTGCACATCAACTGGTCCCAAACTTTTAACTAAGTCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAATAATGCCAATGTGATTATTCA--AGCAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGGTTATTTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTTTTGTGCAAATAACCCTAACCTCTGAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATACTACGAAATGACATGGAC-----------ACTTATTACTAGA---TTTCATTTTCTTTTACAT-------GCTTTCGTTCTTTGAA s bosTau2.chr17 20172806 466 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCAG-TAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAA a score=9036 s mm7.chrY_random 10734756 466 + 30114534 acacaattattcaaacGAATAAAGGA-----------ATGAAAAAGAAAATG-------ATATCAACTAATA-------AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCTCAGGTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCAGCAATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCACcacacacacacacacacacacacacaTTTCTACTTGATTAACGAT---ATTGGCATTACTTATTTTTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGGGAAATGTTGATGTATAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAATACAGAAGTCAACAATATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAGATTTTCCATCGATTTAGTAAAA----------TATAAATATGATTTTAAAAGAAGGC--AACACCCTGAAAAAGTCTT--ATTTTCATCTTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742175 480 + 45915461 ATAAAGTCATCCAATTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC----------------------------TTTCTGCT-AATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=36982 s mm7.chrY_random 10740643 1193 + 30114534 TCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATACCAGAGATTCTATCTATG-TCCTGTCTTTCTCTG-CTTCTTCCTAAAAATCCATTTTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATA-----TCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGCGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCTACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCAACACA-GGAAAACAAACATTTTTTTCAATCCTATAAGTT-TACATTTCTGTACTT---TGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGGAGGTCACTGAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGAACTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGTGCGCCTGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGATGTCATGCTCAGACTCTTCAGATGTATTGTCTTCTACCTGGCTGTAGACCTGTTGTGGT s bosTau2.chrX 20326712 1216 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCC------TCCCCCTAGAAGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATA--TCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCTTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGT a score=8934 s mm7.chrY_random 10743633 496 + 30114534 TTTCTGCCTTGACAACATCCATGGTGTTTATTTTTCATGTTCCAACCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTCTTATCATAAATATTGCCAGATTCTTTGAGGCAGCACACTGGATAGCACACCAATTTTCACTTTATGAAAACCCACAGTTAGAGGAGAACTATTT-TTATGCAAACAAACCTGGAATTTGACAGGGATAAATGACATGTATTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAAATTAAAAAAAAAAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAAT-TTACCAGCACTTCTGATTATAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATGT--GTAGACAGAATACTGGACACAGGTATGTATAAAATTTACTTACAAAT s bosTau2.chr17 25750424 451 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAGTGTTGCC------CATATAGAATGTTGGCT-------GGCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAAT-AGTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAACTTGGA-CTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAA----TTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCAT a score=27464 s mm7.chrY_random 10770703 731 + 30114534 GAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAGAGT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTACTGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACAACCCTCCTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTCACCCTTAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCTTTTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTATTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTATCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20327276 716 - 48857030 GAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=11888 s mm7.chrY_random 10774325 413 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAACCGTGGGAATTGTCAATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14327 s mm7.chrY_random 10784073 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGTAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCACACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9470 s mm7.chrY_random 10788536 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGTCTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCCGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTACTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGCTTTGTGCATTCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=7335 s mm7.chrY_random 10789204 288 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATACATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAGAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAGAGCTTTGT-------GATAATATATATATATCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230044 304 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACA-TGG-----TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATA-ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10664 s mm7.chrY_random 10801042 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAAACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCGTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=38737 s mm7.chrY_random 10807024 1286 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCAAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCATTTCCTAATCTTCATGC-----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGGAATGAAACTTTCATCTTCATTTGACGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAATAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATATAGCTAACACAGGAAAAAAAAAC----TTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACATTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTTTCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTAGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCACCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTTTGTTGTACCGCTTTGCCAACCAGGGCTCTGGCAAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCCGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGAGGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCATACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAG------------AAATCT-----------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=8163 s mm7.chrY_random 10810338 486 + 30114534 TTTCCCTGTTCCAAAC-----TTTCCCTGGTTATCTTTCAA---------CTGTTCTTAGTGT-CAGAAATGGTGCC-----AGACTCTTTGA-GGCAGCACACTGGATAGCACATCAAAATTCTGTTTATGAAAACCCAAAGTT-AGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGTGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGGTCCTGCCTTCAAAGTTGTGATAAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTTTAAATT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTTATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATATATTCGATAATTTTACTTTTGAATTA--TGGGTAGACAAAATATTGTACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTA-GCGGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750424 495 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCT---GTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGTGTATTGAAGTGTTGCCCATATAGAATGTTGGCTGGCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAATAGT-TTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11229 s mm7.chrY_random 10811462 422 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGTAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACTTTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTTCTTCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATAATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=26813 s mm7.chrY_random 10900210 731 + 30114534 GAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTACTGTAAAACAAATCCTACATGATTGGCACCTGGGCTAGCACAACCCTCCTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGATGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCTTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTATCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTATCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20327276 716 - 48857030 GAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=11870 s mm7.chrY_random 10903872 413 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCTCTTCATCCTGATTTAGTTAAAACCGTGAGAATTGTCAATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTTGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14185 s mm7.chrY_random 10913608 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATATACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAAGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGCAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCGCACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9815 s mm7.chrY_random 10918109 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTACTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGCTCTGTGCATTCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=7568 s mm7.chrY_random 10918777 294 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATACATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAGAG-CTTTGTGattatatatatatatatatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230044 304 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTTTT-AAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATA-ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10767 s mm7.chrY_random 10930594 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=38129 s mm7.chrY_random 10936579 1294 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCAAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCATTTCCTTATTCTTCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAATAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAAAAAAACAAAAAACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACATTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACAATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTGTCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCC-GAACTTTTAGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCACCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGATACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGAACTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTTTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCAAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCTATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCGATAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGAGGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCATACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACA----CTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAG------------AAATCT-----------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=8415 s mm7.chrY_random 10940027 364 + 30114534 TTAGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGTGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGGTCCTGCCTTCAAAGTTGTGATAAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTTTAAATT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATATATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAGACAAAATATTGAACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTA-GCGGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=10957 s mm7.chrY_random 10941013 422 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGTAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACTTTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTTATCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGGACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTTCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGA---AAAAGTTTTGTTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=13916 s mm7.chrY_random 11022979 559 + 30114534 TACTGATAAGCTTGCCTCCCGGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTTAAATCACAAAGCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13927 s mm7.chrY_random 11028521 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGGGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGAAATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 11033045 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=12618 s mm7.chrY_random 11034747 1057 + 30114534 ACAAATTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAACTTTCTTAGGTTTGTGCTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGACGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGC----CATAATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAATGTGTGGATAACACAGATAA------------------TGAAAGACAGTGGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGG-----------------CCATTCTGTCT--GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTCATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCAACAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCT---------------TAATG----CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=4759 s mm7.chrY_random 11037499 343 + 30114534 ACAGTCCAGGTTACACAATGTATACACAAAGGAAAGGAGTTATAGTTAACCAGTTAAACTAGTCAGGTGGTTAGCTTGTAGATGGCCAGCATTACAACACTGTAGAGTGTCTTCTTCCATGGGTT--AGCATAGCCCATTCTACCTCAGATAAATAAATTTGTATATCGTCAAATATTAACATTC-CTGAAGAAGAGAAAGGACTTGAATTTAATACTGAGC----CAGAAGCAGTTGTTGTACCTGTCTG-----TGAAT--CATGGCAGGCTGCATACTGAGGAAATTATCAGTA-ACGAATTTAGGTGGAGAAACTGGGATAACCAGAGGTAGGCAAGT---GGACCAGATAATTGGT s bosTau2.chr25 41072650 348 - 41414979 ACAGGACAGATTAGTCCACTGCTGTGCAAAGGGAAGGGGAAAAAG--AAAC--TTTACCTAGAGAGATGACAGTCTCATAGTTTTCTTGCATTACATCATTGTAGAGGGCCTTCTG-AGTGGGATCCAGTAACTCCCATTCTTCCTGGGAAAAATACATGGCCACTTCTTCAAATGTCAATAAGCTCTAAAGAAGAGAATGGGCTTCAGCCAAGTACTTGCCACTTCAAAAGTGGCC----CAACCTTCTGAGCCATGAACTGCATGGTAAGCCAGTCACTAAAGGAACTAACAGCACATAAATTAATTTTAAG----TGAGATAGTAGAAAGGAAGTAAGCACGGGATCAGCAAACAGGT a score=3016 s mm7.chrY_random 11057444 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGTCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=20341 s mm7.chrY_random 11064591 1311 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAATGAGAGAGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGATATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAA-AAACCACATTGAAATATAATTAAATTTTGtacatgtatatatatatatatatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttacgtgtgtgttgtgtgtgtTTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAA--ACATAAA-------TGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGCGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTTTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATATCTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaaa-----aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895153 1369 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAATCCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA-ATA-----------------------------------------------------------AAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6043 s mm7.chrY_random 11067479 422 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCatattattg-taaatatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTCCCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAATCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT-----TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=7617 s mm7.chrY_random 11068196 423 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAAA----------ACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA-AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCTTC---TCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 11070048 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3808 s mm7.chrY_random 11070445 111 + 30114534 CAAATTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898820 116 + 76426644 CCATTTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=5847 s mm7.chrY_random 11071748 396 + 30114534 GAGTGGGCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957523 435 + 62721844 GAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3903 s mm7.chrY_random 11072989 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAACTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATAAAAAA s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=4163 s mm7.chrY_random 11073312 788 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACCTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGGCCAAACATTCTTTAATGCAGTCACTTGGGAAATTCAA--TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATCTAAAGTACTagccaggtggtggtggcacttgactttaatcccagcactttggaggcagaggcaggcagatttttgagttccaggccaggctgctgtgcaaagtgtgtttcaggacagctgggggtatacacagaaaccctgtcatgaaaataaaaaaAAAAAATCTAAAGTACTGGTAGTCGCAAAGTAAATGGTGTGCCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGCATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958100 640 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataatattataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGG-------------------------------------------------------------------------------GAGTCCCCG----------TATATAAAG---------------------------ACAGAGGCCCCACCA---------------------AAAAGCGCAGGT---------------------CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=2192 s mm7.chrY_random 11099326 96 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTGTCAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCGTTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA s bosTau2.scaffold2750 81955 104 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAA a score=2622 s mm7.chrY_random 11099448 112 + 30114534 TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGTAATTTCTTTTCAATATTATCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 82105 115 + 102126 TATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=19477 s mm7.chrY_random 11099574 963 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATTAAGAAAGCTATTTTGTTCGGACAT----TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATTGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATACAAGTTACCCCCTA--TTGTAGGAAATGAGTGGATATTCTGACAGTAAATGGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAAGGGGTGCTAAAGCATTCAGAAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGACTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACAAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAGCTATATACCGGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCTAACTCACTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=9041 s mm7.chrY_random 11196130 462 + 30114534 acacaattattcaaacGAATAAAGGA-----------ATGAAAAAGAAAATG-------ATATCAACTAATA-------AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCTCAGGTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCAGCAATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCACcacacacacacacacacacacaTTTCTACTTGATTAACGAT---ATTGGCATTACTTATTTTTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGGGAAATGTTGATGTATAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAATACAGAAGTCAACAATATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAGA----TTTTCCATTGATTTAGTAAAAT------ATAAATATGATTTTAAAAGAAGGC--AACACCCTGAAAAAGTCTT--ATTTTCATCTTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742175 480 + 45915461 ATAAAGTCATCCAATTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------------------------TTTCTGCT-AATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=36378 s mm7.chrY_random 11202014 1193 + 30114534 TCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCGGACTTCATACCAGAGATTCTATCTATG-TCCTGTCTTTCTCTGCTTCTTCCTAAAAATCCATTTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATA-----TCTCCAATTACTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGCGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCTACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ATACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCA--ACACAGGAAAACAAC-CATTTT----TTTTCAATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGGAGGTCACCGAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGGATTTGCTAGAACTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGTGCGCCTGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGATGTCATGCTCAGACTCTTCAGATGTATTGTCTTCTACCTGGCTGTAGACCTGTTGTGGT s bosTau2.chrX 20326712 1216 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCC------TCCCCCTAGAAGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCTTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATAC---GTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGT a score=9139 s mm7.chrY_random 11205010 495 + 30114534 TTTCTGCCTTGACAACATCCATGGTGGTTATTTTTCATGTTCCAACCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTCTTATCATAAATATTGCCAGATTCTTTGAGGCAGCACACTGGATAGCACACCAATTTTCACTTTATGAAAACCCACAGTTAGAGGAGGACTATTT-TTATGCAAACAAACCTGGAATTTGACAGGGTTAAATGACATATATTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAAATTAAAAAAAAAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAAT-TTACCAGCACTTCTGATTATAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATGT--GTAGACAGAATACTGGACACAGGTATGTATAAAATTTACTTACAAAT s bosTau2.chr17 25750424 451 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAGTGTTGCC------CATATAGAATGTTGGCT-------GGCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAAT-AGTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAACTTGGA-CTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAA---TTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCAT a score=26822 s mm7.chrY_random 11232219 731 + 30114534 GAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTcttgttgtcatccaggagctgatagaagtagagagctggatacttcttgtaggtactgtaaaacaaatccttcatgattggcacctgggctagcacaaccCTCCTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCTTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTATCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20327276 716 - 48857030 GAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=11888 s mm7.chrY_random 11235870 413 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAACCGTGGGAATTGTCAATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14447 s mm7.chrY_random 11245601 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGCAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCGCACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9815 s mm7.chrY_random 11250054 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTACTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGCTCTGTGCATTCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=7232 s mm7.chrY_random 11250722 294 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTACTTAGTATTTTATGATATACTATACATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAGAG-CTTTGTGataatatatatatatatatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230044 304 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTTTT-AAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATA-ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10562 s mm7.chrY_random 11262567 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATACATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=38523 s mm7.chrY_random 11268551 1288 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCAAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCATTTCCTTATTCTTCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTTTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAATAC--ATTTTATTGGCAAATATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATATAGCTAACACAGGAAAAAAAAA---ACTTTTTTTTTCTTCCAGCCCTATATGTTTACATTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGAACACGGAAGGATTGTCTAGAACTTGGCAAACAACCTTTCCGAACTTTTTAGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCACCTCCTGATCTCTCCTCAGCTGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCTCTCAAATTTTTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCAAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGAGGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCATACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAG------------AAATCT-----------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=8210 s mm7.chrY_random 11271994 364 + 30114534 TTAGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGTGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGGTCCTGCCTTCAAAGTTGTGATAAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTTTAAATT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAACACAGGGTGAAATATATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAGACAAAATATTGAACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTA-GCGGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=10791 s mm7.chrY_random 11272978 422 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGTAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACTTTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGGAAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTTCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGA---AAAAGTTTTGTTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14103 s mm7.chrY_random 11353477 556 + 30114534 TACTGATAAGCTTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAAATGAAATATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTCAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC-------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14328 s mm7.chrY_random 11358994 399 + 30114534 ACAACATGAAACTTC---------TCACATACTATCTC-----------CTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGAAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16733 415 + 41832 ACAACAAGAAACTTTCATTTTGTTTTAAATAATATGTCTTCTGAACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 11363560 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=12275 s mm7.chrY_random 11365264 1058 + 30114534 ACAAATTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAACTTTCTTAGGTTTGTGCTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATG------CTTACACTGAAGGAAG-ACTCAGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGACGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGC----CATAATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAA---------ATGTGTGGATAACACAGATAATG--------AAAGACAGTGGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGG-----------------CCATTCTGTCT--GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTCATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCAACAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCT---------------TAATG----CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3108 s mm7.chrY_random 11388081 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=12571 s mm7.chrY_random 11395375 687 + 30114534 TTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAATAAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATAAAAAAAAACCACATTGAA s bosTau2.chr5 39895182 717 + 76426644 TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAA--TATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAA a score=10175 s mm7.chrY_random 11396179 495 + 30114534 ATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAAACGTAAA---------TGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGCGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCCATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaa----aaaacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895995 527 + 76426644 AAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTTTC---TCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6234 s mm7.chrY_random 11398260 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCatattattg-taaatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTGCCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=7925 s mm7.chrY_random 11398975 422 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAA----------AACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTAAAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT---TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 11400826 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 11401227 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=5918 s mm7.chrY_random 11402214 706 + 30114534 TATCTACTGTATTTGTCTGACTCATTTGGGATAAGGATTTACTTGGACCCAGCTTCATTTGTCACATCCACTTTTC------------------AACT------ATAAAAAAAATCACATACTCCATCTACCAACA----TGGGAGACATTATTTTTTGATATGCAGTTTTCCCCAACAGTGGAATGACAAGAC-GACCAGAG--CCATCCCTTAGGACAGGGAC---AAATGATCCAAAAGTTACTATTCTCTAACCTAGGACAACCAGTGTCAATAATTTTATAT---------GTCTCTG-------CAAACCTAGATTATG-----------------GCTGATCAACTTCATTGAG-------------------TCAGTGGT---AGCACTCAGAGTGG----------------------GCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTACGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957119 839 + 62721844 TATTTCATGCATTCGCATGACTAGATCAGGTCAGGGGGTCGCTTGGACCTTGCTTTAC----CATACTCACTTCTCTTGCCAAGGAGATGTCGAAACTTGTGTACTTAACAAAACAACCTATTCTATTTGTCAACACTAATGCCAGACATC-CGTTTTGACCC-CAGTTCCCCTCC-CAGTG-------AAGACTGGTTAGAGGTTCACCACTTAGAAGGAGGGCTCTGGATGAACCAGA---CACAAATTACGAATTTAGAAAGCCCATGGTTAGAGGTTCGCCACTCAGACGGAGGCTCTGGGTCAGCCCGACATAGATTACGAATTTAGAAAGCCCAGTGATGGTGCACTTTGATGAGAGTGCTGCTCACAAAAACCCCAGTAACCCCAGTACTCTGAATGGTGGAGGCTTGTCATGGGAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3805 s mm7.chrY_random 11403767 126 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGGCCTGGATAGATAAAAAAAAAAAAAGAACTGGATTCCTGTAATCCTTT s bosTau2.chr13 39957961 117 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTG---------GGAAGCCAAAGAATTAGATCACTAGAGACCCTT a score=4137 s mm7.chrY_random 11404087 390 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACCTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGGCCAAACATTCTTTAATGCAGTCACTTGGGAAATTCAA--TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataatattataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4386 s mm7.chrY_random 11404673 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTCATTAACATGATCCAGCTCCCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=11453 s mm7.chrY_random 11468777 277 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAAAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4837 s mm7.chrY_random 11471568 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=13918 s mm7.chrY_random 11475833 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTATTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGTTGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13298 s mm7.chrY_random 11481202 557 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTGTTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGCGTGCATAAGTAGAT-ACTCCACTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACTTTTTTGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA---------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=11443 s mm7.chrY_random 11561168 422 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGAAGAAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAAAGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTAT----TACTTG----------ATTACAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38765 s mm7.chrY_random 11564719 1288 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTATGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCCTCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCATTGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAATAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACGGCATCTATGGACAGGAGCTCTGCAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTTGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACAAAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGATTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGGTGACAGTGATGTGTTTATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCTAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGACAATCCTTCCGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAGAGTACAGAAATGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAA----GTTTTTTTTTCCTGTGTTAGCTATATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTATTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACGTCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGTCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGAAGAATAAGGAAATGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTTGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------AGATTT------------CTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGA-TGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10339 s mm7.chrY_random 11571588 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTAAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGTTGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=5554 s mm7.chrY_random 11583519 152 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTACTAAGatatat s bosTau2.chr3 45130465 181 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT a score=2775 s mm7.chrY_random 11583741 118 + 30114534 CTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATGTATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130670 99 - 85360813 CCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9946 s mm7.chrY_random 11584213 314 + 30114534 ACTGAATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14447 s mm7.chrY_random 11588600 376 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGCGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11710 s mm7.chrY_random 11598233 502 + 30114534 TACTATGCAAAG---AGAC-CTCAGTTAAATGTATGTCAGTGACTCCAAA-ACAGCTTTTCTTCTCTACCTTTCTTTATATGGCACAGAACGAC---CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGTCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATTGACAATTCCCACGGTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATCTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172711 539 - 45915461 TATTTTGCCAAGTTCAGACATTCAGCTAAAAGGGCAGAAGAAACTCCAATTGCATTCTTTGTTGACTAGGTTGTTTTGTA--GCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=26366 s mm7.chrY_random 11601637 730 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTTTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAAGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGAGGGTTATGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACAGTA-CTACAAGAAGAATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAAAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=10790 s mm7.chrY_random 11676905 437 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTTTTCACAATT--TTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTTTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATCCTATAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATCAACAA-AATTAATTGCACATCAACTGGTCCCAAACTTTTAACTAAGTCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAATAATGCCAATGTGATTATTCA--AGCAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGGTTATTTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTTTTGTGCAAATAACCCTAACCTCTGAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATACTACGAAGTGACATGGAC-----------ACTTATTACTAGA---TTTCATTTTCTTTTACAT-------GCTTTCGTTCTTTGAA s bosTau2.chr17 20172806 466 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCAG-TAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAA a score=19569 s mm7.chrY_random 11699025 963 + 30114534 GCACTTGTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTAGTGAGTTAGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATTCAGTTTGAGTCCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTGAGAGGTCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTTGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCTAAGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGAAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGTCTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGGGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTAGCACCCCTTTTCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCCATTTACTGTCAGAATATCCACTCATTTCCTACAA--TAGGGGGTAACTTGTATTCTGGATAA-------TTCTGTATTCACTG---------------------------------TGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACATCTTTGA-------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATAAGTATCAATTCAGAT-AATATATACCTTTTGAGAATTAGCTTCACATTTCTA----ATGTCCGAACAAAATAGCTTTCTTAATTTAAGTTACAGTTGCTATGTTTCACTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAAGGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTC--AGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=2622 s mm7.chrY_random 11700002 112 + 30114534 TTAAGCATGATAATATTGAAAAGAAATTACAATT--TTTCACTTTGAAATTAAATCTCTGAAGATGATAACTTAACTTGTGTTTGGAAAAGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA s bosTau2.scaffold2750 19906 115 - 102126 TCAAACACTCTAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATA a score=2192 s mm7.chrY_random 11700140 96 + 30114534 TTGTTCAAACAAAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAACGAAAATAACTGAATAGTA-GGTTTGT-AGCATTTGACACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 20067 104 - 102126 TTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=4460 s mm7.chrY_random 11725488 200 + 30114534 TATTGTACAGTTAATAATTTTATGTCACaaaataatattatactaataattatttaaa-CTGTGTCTTATACTA-CTAATATGGTTTCACATATACATGGGAGTTTGGTAGCCTCAGGAC------TCTGTCCAGGTAGCTGGATCATGTTAATGAATTTTACACTCAGATTGCCATTCATTTTATTTTTAGTTGCCAATTTCAAGGG s bosTau2.chr13 22763104 205 - 62721844 TGTTGTTCTGCCAATAAATTAAGATCCTTAGCCA---TTTCATTAGTAATGATTTCAATCCCTGCCTGGAGCTGGATAATTCTGTTAAGCGTGTAAATTGGGGTTTGGTAGCCCCAGGACCCATCTTCTGCCCATGTAGCTAGCCTGTAGTATTGGATTATGCGTTCAGGAGACCACTCATCATCTTTCCAGTCTCCAGTCTGTAGAG a score=4100 s mm7.chrY_random 11725886 390 + 30114534 GATTTCTAAATGGTCCCCTCTGGTAAGTTGGAACAGGAAGAAAATTGTACAGCTAGTCCCCAAAACACACAATCCTGAT---TAGGTGAGAAAAAGTATAATCGAGGCTGTGTACCCAACATATCCAGTATAGCCC------ACAAAGGGCATGGTACCTGATACCTGCA-TTGACATTTTTTTTCGGTCCTGTCAG------AGATTAGAGAAACTAGACAAGGAATAGATGTTTTGTTCAAAGTGGTTTGGGAATCCACACCA---------TTGAATTTCCCAAGGGACTGCATTAAAGAATGTTTGGCCCAGGCATGTGGGGCTTCCAGCTGAAGT-TTAAATCACC-CTTCCATTAGGTAGGTCAGTTTTCCCCAACAACTTAAGTATT----AGTTCAATTTTGGTtttggtttt s bosTau2.chr13 22763349 395 - 62721844 GACTCCCAATGATTCACCTTAGGCTAGGGAGAGTAGGAAAAAGGAAGGACAGATAGTCCCCAATACACATGCTCCTGACCTGTTGGCTGGTAAAATTGTATGTGCGTTAGT----CCCACAAATCCAATATGATCCTTCTGGACGAGGCCAATGG---------CCTTCAGTGGACAAGTC------ATCCCATCAGGTCTTTAAATGGGGGATGCTTGTTAGAGGGTGAGGATTAGGCTCTGTATAGTTTGGGCATCCCCACCAACCAGAAGTATGaatattataa-------tattataatatttttGGCCAAGACAAGTGAGTTTTCCTACTGGAACATTGAATAATTGGCCCCACCATGCCAGACAGTTTTTGTCAATTAAAGAAGTCTTTAAATGCCAAATTCTGACCCTGGTCTT a score=3781 s mm7.chrY_random 11726503 96 + 30114534 TTTTTTATCTATCCAGG-CCATAGTTCTTCCATGTTAGTTTTTTCACATGCATGGCCAAAATACACCCTTAGCTACTGGACTCTAGTGTCTACCAGG s bosTau2.chr13 22763786 97 - 62721844 TTCTTTGGCTTCCCAGGGCCATTGGTCTCCCATGTTAGTTCCCCCACACACATAGCAAGAAGTAACCATTAATATCTGGGCTATGGTCTCTGCCAGG a score=5847 s mm7.chrY_random 11727446 396 + 30114534 AAACAGATTTCTTGCTATGGGAGCAATGAGAAATGGGCTAATTTTTATTTCCTCATGAAAAGAATGGAAGA-TCTGGATGT---CACTTAATGCATGATAGAAACTCTCTTGACATTTAACACAGACCCTGTGATCGTGCCCTTTCC----------------AATCTGCCAGCCAGTATTCTGTCAGGGGTTTCTTAAGTTAGTGATATTGAAATTAGAATGTTTCCAGGTCCCTAGTTGACAGTCTGATGCAGAAGGCTCCTTTTGAAGGAGCACCATTTTTGCACT--------------------TGTAGTGCCAGGTTGTTCATAAGATGTGCTTCCAGTAGGAAATGT--AAAAATGGGCTTTAGGGGTACATCTGGCCAGAGTTGAAGGAT----GTTCACATATATAGTTATCATTTAGCCTGTATGCCCACTC s bosTau2.chr13 22763886 435 - 62721844 AAAGACATTTTTAGTTTTGGCTGGAATAGGAAGAGGACCACTTTCAGTCTCTTCATAAAAAGAATGGAAGAGCCTGTGTGTGGAAATCCAGAGAGGAATAGAAATGCTCTGGAATAGCAATGCAGTTCCTG-GGTCAGGACCTCTCCTATTAATATAGATGCTGATCTGGTGACCCTCTTCCCATCTTGAGTCCCCAGGGTTGAAGACAGTGAAATTGACTGGGTTACACGTCCCCAGCTTACATTTGGGATCAACAGTTCCCTTTTGGAGGAGTGTTACTTTGTCCTTATTCTCCCAGGTCACCTCTATATTTTCCCAGGTTGCTCATCTGACACAGGCCCAGGTCAATCTGTGAAGAAAGGGGCCTTCATATCAC------CCAGTGTTATGGGATACTGGCTTACACATGTATTTGTCATTGAATGTGCATTCTTGTTC a score=3854 s mm7.chrY_random 11729036 107 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCCATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGCTTTTAA s bosTau2.chr5 36527708 112 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGTTTGGTTTTTTAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 11729473 71 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAAGAAATATA-----CTTTCTATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=2823 s mm7.chrY_random 11729757 140 + 30114534 AAATCAACCCATGTACCTTCTTTATTTGTATCTCTTACCTTTGGAAACTAATA-AGATA-ATGAATCAAAAAATAAATAAATTTCAATTATCTGTATGAATGAAAACAATTTTAAATGTTAAGAAGGTTAAAAAAA-TCACTA s bosTau2.chr5 36527994 133 - 76426644 AAATAAGAACATTAACCATCTATACTTGTGTTTTCTACCTTTTGGAAGTGATACAAATACACGAAGCCAAAACT---TGCAATTAAATCATTTTTATTGCTAAAAG-----TTAAATG--ACAAATGTTAGAAAAATTCACTA a score=7587 s mm7.chrY_random 11730972 424 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTACACTTAAACAAGAAAATGATTAAAGATATTTAAAAAT---AAAGAAGTTCTATTTTAACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGATTTTTTTATTTGT----------TTTATATATATACCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTCAAACATAGACATTTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGA---GAAGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTT--TAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=2572 s mm7.chrY_random 11731508 106 + 30114534 TGTTTAATAAAGCAGG-ATAATTATAGTGTTATTAAAGTATGAG-----------------GTACATCTGAGGTCAAATTCCCATTTTATCATTTCATATCTTTAATAATTCATACAAAGCCAT s bosTau2.scaffold10439 6776 123 + 23754 TGCTGAACAAAATAGTTAGGATTAAAGGGTTAATCAAGTATCAGTTTTCTTCACCATGTGTATACATCT-AGATTAAATTCCCAGTTTGCAGTTCCCCATTTTAAGTGACTCCCACAATACTAT a score=6305 s mm7.chrY_random 11731691 422 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACtaaatatatatatatatattta-CAATAACATGAAATAACATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA-----ATGTGTTCACCACTTACATACAATAATA--ATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=8645 s mm7.chrY_random 11733700 531 + 30114534 aaatgcctagtcgttttcattgatatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagataatggaacttaatttagtttcatatgctcaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt-----tttttttatggtaccaaccactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGATATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAATGAACACTCAGAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCATTATAGATTTTTCCGCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCATTTATGATTTA-GCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacgtaacacacacacacaca s bosTau2.chr5 36530122 484 - 76426644 AAATACC-AACAGCTTTTAT--ATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAAC--AACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCA------------------------------AGAAGT--------ATGACTTATGCT------GATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAAC---TAACAGAAAAACCCTCA a score=12908 s mm7.chrY_random 11734285 749 + 30114534 tatatatatacatgtaC----AAAATTTAATTATATTTCAATGTGTTTT--TTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAACTAAAATATACAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCACACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATATAATTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGAGTCAT----TTTGAAGAAAAATTAGATGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530652 839 - 76426644 TATATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=2977 s mm7.chrY_random 11742040 94 + 30114534 ATATTTCTAAAACACATACCTCCAGATTTATCTAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=11505 s mm7.chrY_random 11763784 1059 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCTGTGTTCCTGTTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATGAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGGAAATGTTTAACAGATGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC--AGACAGAATGG-----------------CCAAGCTAAGGAAAAATAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGA---------TAA-------TTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGTTTCCCACTGTCTTTCA------------------TTATCTGTGTTATCCACACATTTTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTAGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATTATG----GCCCTTGTAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCACTGGCTATAATGTTGACCGTCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGACT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCCAGCACAAACCTAAGAAAGTTGTAAGCATTTGAAGTC----------------------CACTTACAGATCTC-ACTG-------------------------TCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGGAA---TTTTTAAATGATTGCATACCACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAATTTGT s bosTau2.scaffold5600 1080 1221 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-------AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCT-ATCTACATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAG----CATTA---------------AGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACTTAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCATCTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=3426 s mm7.chrY_random 11765097 55 + 30114534 CTTAAGATGGCCGTGTAGTCAGAGAAGTGAATCCTGGCTTGTGAGTTCATGAAAG s bosTau2.chr3 46304496 55 - 85360813 CTTAAGATGGCAGCGGAGTCAGGGGAACTAATCGGGGCTTGCGAGTTCATGAAAG a score=4837 s mm7.chrY_random 11766458 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14263 s mm7.chrY_random 11770747 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=14185 s mm7.chrY_random 11776124 557 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAAGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA--------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=11843 s mm7.chrY_random 11944262 513 + 30114534 TACTATGCAAAG---AGAC-CTCAGTTAAAAGTGTGTGTCAGTGACTCCAAA-ACAGCTTTCCTTCTCTACCTTCCTTTATATGGCACAGAACGAC---CTGTACATAATTAAAATATGTAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGGAGCAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TGATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TGATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172711 539 - 45915461 TATTTTGCCAAGTTCAGACATTCAGCTAAAAGGGCAGA--AGAAACTCCAATTGCATTCTTTGTTGACTAGGTTGTTTTGTA--GCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=37883 s mm7.chrY_random 11947797 1286 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCCAGGTTTGGTGTGGTATACCACAGCATGGCTATAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAATGAGGCTTAGCATTGCATCCCTCATCAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCAGAGGAATATTATCGGCTGCAGA-TTTCTCACAGTTGGAAGGAAGGTAATGAGTCTGTTACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGTTCAACTGCCAAAAAACCCTTCTCTTTTCTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTACAGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCAGTACAACACAAATTTGAGGG-GAAAATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGGTTGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA------------CACTCCAACGGCTGAGGAGAAATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGTTTGTTTACCAAGTTCTAGCCAATCCTTCCGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAA----GTTTTTTTTTCCTGTGTTGGCTATATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATTTAAATGTGT-----GACATGACATTCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGTCAGGAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATTGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAAGTTGGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAAAG------------------------ATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAA---GAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAA--TGGAGAGGCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10986 s mm7.chrY_random 11954726 395 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTTTTTTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACTGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCAAGTAGAAATCTGGCACGGTTAGGATGCCTTTGGCTTATATGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGAAAATAACCCTTACCTCTGATAAAAGACAAG-TAATGATATAAAA-TATACTACGAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATC-CTCAATTAGCAGAAAGG---GGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=5236 s mm7.chrY_random 11966661 105 + 30114534 TAATAACTCTGTCTCTCTCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatat s bosTau2.chr3 45130541 105 - 85360813 TGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT a score=2653 s mm7.chrY_random 11966824 118 + 30114534 CTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATATATAATATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTGCACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130670 99 - 85360813 CCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACTG--------------GAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=10215 s mm7.chrY_random 11967296 314 + 30114534 ACTGCATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAAACATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCCAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCATTGCATAGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14063 s mm7.chrY_random 11971671 376 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGTGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCGACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTAGTGGGAAGTTCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTGGCTGCTATGAACAGGATAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGCTTAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGAAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=9888 s mm7.chrY_random 11981352 321 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTT------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATCGA-CAGTCCCACGCTTTTAACTAAATCAGGATGAATGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGATTAATCAATTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAA s bosTau2.chr17 20172806 337 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCC-TCAATTAGCAGAAAGG---GGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAA a score=36998 s mm7.chrY_random 11984393 1185 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCCGAAGAGGCTTAGCATGATATCCCTCATGAAGAAAAGGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGCCCTGAGGAATATTGTCTGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGGAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAAACCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCGAAAGTAGTATTTCCTCAGATGAGGGATGCCCACCTAGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGGGGGTTGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGTTCCAGGTCTCTACGATTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCTAGGAGAAGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGAGTGCAGTACACCAGAAAAGTTGGTTCCAAATAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCACATTATAGCCAATCCTTCTGTGTATTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAG-----ATTATTGAAGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACGTATAGGACTGGAAGAAAAAAAAGTTTTTTTTTTTTCCTGTGT--TGGCTACATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCA-------TG-TGTTTCGCTCTAAAAGTTTAAATGTGT-----GACATGACATTCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAATATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGTGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAA--GGAACAG--CTTCTCTGGTCTGCATTT-----------AGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTAGAGGAGCAGGGATAGCAGCAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGTACAGA s bosTau2.chrX 28529038 1204 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGA-GAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGT--AAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAA--TATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCAT-CTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCT-TGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAA-AGGAAGAG-------AGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGA a score=648 s mm7.chrY_random 11985578 111 + 30114534 GCATAGGTAGAAACTCTGATGTAAA-----------------CACTGAAGGAGAAAC-----AAAAAGTTGGGGAAAGAGGGACATTTAATAGAAATGTGGCCTTGTTACACAAAGTGAAACGCAGAAAACTG s bosTau2.chrX 20835362 126 - 48857030 AACTAGAGATGGGCTGTGGGGGAAAGGAAAAGGGAAGGTGGCTGCTTAAGAAAGGATGTGGGAAGGGGCTGGGAATGGAGAGGCTCCTAAGGGGAGGGTGACCT-------AAGAGTGGGAGGCAGCCAACTG a score=17683 s mm7.chrY_random 12013223 927 + 30114534 CCTTAAACAATTGCTTTGTTTGTCACAGTTAGCGAGTTGGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGGTTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGTCTCACATCAGTGGCAACACATGGGCCATTCACTTTCAGTCCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTT-TTTAAACTGATTCTTTGAGAGGTCATGTTT-TGTAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTCGTTTGCCTGTTTCATACCTTGCCAG-TTTTCTAAGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGAAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGATACACAGCAATAAAGGCTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGGGCACTTTCTAATAG-CTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGTTTTAGCACCCCCTTTCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCTATTTGCTGTCAGAATATCCACTCTTTTCCTACA---------------------ATAG-------GGGCTAACTTGTATTCTGGC--------TAATTCTGTATTCACT------GTGCTTTTCTGAATTTACAGTTGGTCTTTTTACATCTTTGA-------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATAAGTATCGATTCAGAT-AATATATACCTTTTGAGAATTAGCTTCACATTTCTA--ATGTCCGCACAAAATAGCTTT--CTTGATTTAAGTTACAGTTGCTATGTTTCACTCAGATAATCTATAAAGG s bosTau2.scaffold2750 18247 1014 - 102126 CCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTC--AGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAG a score=17192 s mm7.chrY_random 12026990 966 + 30114534 GCACTAGTGGCCTTAAAGAATTGTTTTGTCTGTCACAGTTAGCAAGTTGGGTTCTTATT-CATTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAG-CACAACA-GGATAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATTCAGTTTGAGTCCAATGATGCAGCTGGAATATAGTTGCACGGGATTACTTATTAAACACTTAGTCAAGCTGATTCTTTGAAAGGTCATGTTT-TATAGAAATTGGTACACTGAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTACTTTACTGACACAGAAACTTTTTTTGCCTGTTTTGTACACTTTGCCAG-TTTTCTATGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC----CTCTCTTTGATTTTTGTGAAGGATTTCTGTTTCCCTTTGGCTATGCAGCAATAAAGGCTTGCA-TCATTCAGAAACT-CAGGGACACTTTCTATCAA-CCAGTTATTTCCTTGTGCCATTGCCTC-AGTGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTACCACCCCCTCTCTTTTTTTTAACTCCAACTTATCTCAGGAGTTTATATTTAAAAGCTATTTGCTGTCAGAATATCCACTCTTCTCCTACAA--TCTGGGGTAACTTGTATTCCTGGCTAATTCTGTATTAACTATGC----------------------------------------TTATCTGAATTTCTAGTTGGTCTTTTGCCATCTCTGA-------------AAACATTGAATTT---------AAGTAA-CAGAACA--ATCATGCTAGGCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATATGTATCGATTCAGAT-AATATACAACTTTTGAGAATTAGCTGTGCAATCTTAATGTCAGAACAAAATAGCTTTCTGGAT----TTAAGTTACTGTTACTATGTTTCTTTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTA--ACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTCAGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttc-cttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgc-ttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=3768 s mm7.chrY_random 12027967 256 + 30114534 GATTTAAGCATGGTGATATTGAAAAGAAATTTCAATT--TTTCACTTTGAAATTAAATCTATGAAGGTGATTACTTGACTTATGTTTTGAAAAGTTTTCTGTG-AATTTTTCTAAATA-TTGGATATGTTTTTTAAACATATCACTATAAATAACAGCATT-------GTAATGTTGTTCAAAT--AACATGACTTTTATTCATTGTAAATGTAA----TAATGAAAATAACTGAATA----GGTTTGT-AGCATTTAACACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 19903 268 - 102126 GGCTCAAACACTCTAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATACCTGGAGAT----------CCTCCCATTTTAAATGAGAAGACCTAATCCAGAAATTTTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=4805 s mm7.chrY_random 12038782 200 + 30114534 TATTGTACAGTTAATAATTTTATGTCACaaaataatattatactaataattatttaaa-CTGTGTCTTATACTG-CTAATATGGTTTCACATATACATGGGAGTTTGGTAGCCTCAGGAC------TCTGTCCAGGTAGCTGGATCATGTTAATGGATTTTACACTCAGATAGCCATTCATTTTATTTTTAGTTGCCAATTTCAAGGG s bosTau2.chr13 22763104 205 - 62721844 TGTTGTTCTGCCAATAAATTAAGATCCTTAGCCA---TTTCATTAGTAATGATTTCAATCCCTGCCTGGAGCTGGATAATTCTGTTAAGCGTGTAAATTGGGGTTTGGTAGCCCCAGGACCCATCTTCTGCCCATGTAGCTAGCCTGTAGTATTGGATTATGCGTTCAGGAGACCACTCATCATCTTTCCAGTCTCCAGTCTGTAGAG a score=4039 s mm7.chrY_random 12039229 389 + 30114534 GATTTCTAAATGGTCCCCTCTGGTAAGTTTTAACAGGAAGAAAATTGTACAGCTAGTCCCCAACACACACAATCCTGAT---TAGGTGAGAAAAAGTATAATCAAGGCTGTGT----ACCCAACATATCCAGTATAGCCC------ACAAAGGGCATGGTACCTGATACCTGCATTGA------CATTTTTTTCGGTCCTGTCAGAGATTAGAGAAACTAGACAAGGAATAGATGTTTTGTTCAAAGTGGTTTGGGAATCCACACCA---------TTGAATTTCCTAAGTGACTGCATTAAAGAATGTTTGGCCCAGGCATGTGGGGCTTCCAGCTGAAGT-TTAAATCACC-CTTCCATTAGGTAGGTCAGTTTTCCCCAACAACTTAAGTATT----AGTTCAATTTTGGTtttggtttt s bosTau2.chr13 22763349 395 - 62721844 GACTCCCAATGATTCACCTTAGGCTAGGGAGAGTAGGAAAAAGGAAGGACAGATAGTCCCCAATACACATGCTCCTGACCTGTTGGCTGGTAAAATTGTA--------TGTGCGTTAGTCCCACAAATCCAATATGATCCTTCTGGACGAGGCCAATGG---------CCTTCAGTGGACAAGTCATCCCATCAGGTCTT----TAAATGGGGGATGCTTGTTAGAGGGTGAGGATTAGGCTCTGTATAGTTTGGGCATCCCCACCAACCAGAAGTATGaatattataa-------tattataatatttttGGCCAAGACAAGTGAGTTTTCCTACTGGAACATTGAATAATTGGCCCCACCATGCCAGACAGTTTTTGTCAATTAAAGAAGTCTTTAAATGCCAAATTCTGACCCTGGTCTT a score=3864 s mm7.chrY_random 12039846 96 + 30114534 TTTTTTATCTATCCAGG-CCATAGTTCTTCCATGTTAGTTTTTTCACATGCATGGCCAAAATAGACCCTTAGCTACTGGACTCTAGTGTCTACCAGG s bosTau2.chr13 22763786 97 - 62721844 TTCTTTGGCTTCCCAGGGCCATTGGTCTCCCATGTTAGTTCCCCCACACACATAGCAAGAAGTAACCATTAATATCTGGGCTATGGTCTCTGCCAGG a score=12365 s mm7.chrY_random 12075379 1058 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATACAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGATCATTCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC----AGA---------------CAGAATTGCCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATATCATAAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGCTTCCCACTGTCTTTCAA------------------TATCTGTGTTATCCACACATTTTTTTGCATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTTGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTATTTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATG-----TAAAAGGCTATTTTGGCCCTTGAAG----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACCGCCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGGTAAGACT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTATTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAATACAAGAAGACCTGAAAGCC-----AACAC--------------------AAACCTAAGATACTTGTAAGCATTTGAAGTCCACTTACAGA---------------TCTCACTGTCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGAAGTAAAGTGACTTTGATTATTTTGGCTTTTATTACACACACTGGA--ATTTTTAAG-TGATTGCATACTACTCCTGTGCCAAAAGGGTTGTACAATTTGT s bosTau2.scaffold5600 1080 1221 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA---AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-----AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCT-ATCTACATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAA-TTCTAGCATTAAGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACT--TAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCAT--------CTGAGTACTTATCTCTGTAGAAGGCATAGGGC-ATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=4709 s mm7.chrY_random 12078059 84 + 30114534 CTATGCATATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAAGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006495 84 + 85360813 CTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=4543 s mm7.chrY_random 12078383 596 + 30114534 AGTGAGA-CGATGAGCCTGCA---GTGACAGGACTTTAGCGTCTATGATAGAATTTGAGTCAGGCATTGTGTACTCACACATTAATTATGAGTATCGTGCTTAATTTTGTGTACATAGAACTGGATTATCGCATGGATCGTTTCCCCC--TCTTAAATTCTGAGC--ATGTGAAGAAAAGTGATGTTTCTCTTTCTTATACAATTAAGCAG---ATTCCATAAAAG------CTTATCTTTTCC-----CACTTCTAAATAAGCATTT----TCTTTTAAT-----------------------------------------------------------------------------------TTATTGGCATG---------------TTGTATGCTTTAACTGTTTGGTAGCTGTCTGTTAATTTTTGGTTGATCTT------------ACATATAAAGCAAGTTTGATAAAAATTTGGTATGGAATTTTATGCATTTTATAATTGTAAAAATTTTTTTCCACTCACCTCAAAGTGCTCTGTGGTTATAAATTGG--------------CCTCTCAGTTAGTAA-TACACAACACAAATTCAATTCCACTTAACCCTTCTGAAAATGAACTTTCACGGTATTGTCTGATTTGA--------AGCTAATAAACCT-TTTAACTAAACCAGAGACATTTGTATTAGGAAGGAAACTACTACTGTCTGTTGTTTAGAAAATGGA---AAAGATACTTCT s bosTau2.chr3 39007047 704 + 85360813 AGTGAGAATAATGAACTAGCAACAGAGACTGGACTTTACCTTTTATGACAGAAATTGGGTCATACATT-----------CACTGTTCATCTGTAT-----------------------------GTTTTTATATGTAGCTTTCCCCCCCTCCTTGAATTTTAAACATATATGAGGAAAAGTGATATCTATACTCCTAGTTTTGGTAAACATTTCATCACATAGAAGGAAATATTTATCTTTTTCTCTCACCTTTCTAAATGAGGGTCTTAAATATTTCAATTTGGAAGGTGAAATCTACACAGCAGATTAAGTGCTAACCTCTAAATTATAACACTCAGTTTAATCTTTCTGTTGGGCAAAATGTTACTGGTGTGACATAGTATAATGCCTTATACATATTATCTGCTTAGTGATAATTTTTT--TACTTGATTGATTTTTATCCAACTTAAGCATGAAAAGCAAGTCTGTCA---------TGCAGAATTTCCTGTAAAATATGAATTCACAAATTTTTGT-CATTTAACTCAAAATGATAAATGGACATGGAATGAAACTAAAGAGATATTTTTAAAGTAAACAATTATATAATGTAACATCTGTTGTAATCACCTTTGTAGGGAATTGATTTTGAATTTATTCTCTGACTTGAAAATGCATAGTAGGTACATTTCTTTAACTGAACCTACTTAACATTTTTCAGAAAAGAAGCTACTCC---CTGTAGTTTAAAAGATAAAGttaaaaaaattttt a score=15363 s mm7.chrY_random 12082284 376 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTCATCATTCAACATCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAGAGATGTCCAGATTCTGAGCATTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTCAAAAATGTTTCATCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCCCAGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTCCCAGCACAATCACTTCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATCTCCACATAGTTGATGCAGATTTCAGTGGCCTGAAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGCCCAAGCCCTACACATTTGAGCTTAGGAGATT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=13061 s mm7.chrY_random 12087587 555 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGATTAACA-GTATTAAGGCTTTCTGTTTG-AAGAACACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATAAATAGAAGATGAATTCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGG------CTTTGTGATTAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTGTTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAAACATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGAAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATAGT--TCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=3374 s mm7.chrY_random 12155009 110 + 30114534 CATGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCGGACACACACACACAAATACACACAAGCTTATACACATAATCCTGGATATATGGTATAAATAAGTCATGATTTTTTTTTCTGTTC s bosTau2.scaffold13132 11938 98 + 14321 CATGTATGCATGTGCATATGTGTGTGTGCACACACACAC----ACACACTGACT--------TCATCCTTCCTTTCTTCTGCAGAAAAGTCATGTGTTTCTCCTTGGCTC a score=9203 s mm7.chrY_random 12182099 412 + 30114534 AGTGGCCATAACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCACATGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGTTTCTGATCAGCCATGATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCCCCATACACACACACACACACATTTCTACTTGATTA--ACCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATTGTGGGATATGTTGATGGACAATTAATTCCTATTCATAACGGGATAAAACAGAAGTCAACAGGATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAGATTTCCCATCGatttaataaaatattataaat-atgattttaaaaCATGCCCTGAAAAAGTCTTA-----------TTTTCCttttttttccatttttattagttattt s bosTau2.chr17 25742254 397 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC----------------------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCT-ATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAA------CCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCT--TTAAGTATTT a score=35202 s mm7.chrY_random 12282129 1135 + 30114534 TCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATACCAGAGATTCTATCTATG-TCCTGTCTTTCTCTGCTTCTTCCTAAAAATCCATATTTTGCTGCCATCCCGGCTCCTCTAAGTCATA-----TCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAAGCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCCACAATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGCCAT-GTCACACGTACTAAT----TTTTAGAACAAAAAAA---TTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCA--ACACAGGAAAACAA-ACATTTT----TTTTCAATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTTCAATTTAAGTGATATTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGTAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGATCTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGGTCCATCATGTCTGGTGTACTGCACCCAGGTACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGAGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGACATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTATACCTCTCTGCCAACCAGGACGCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTAATTTGTGAGGCAAGACCTTAATATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCATAGACACTGTCAATTCTGTCGTACTTCACCAAATAAAAAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGAT s bosTau2.chrX 20326712 1181 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCC------TCCCCCTAGAAGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCTTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAAT a score=3855 s mm7.chrY_random 12359484 267 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTTTTAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCATTA----TTAAATTTATAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA---CTTTATACTG----CTGTTATTAATAATG---------------ATGTTTTAAAAAATTCACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGAAATTTCTTTTCAATATTACCATGCTTAA------------AGAAGGCATTTCTCCATTTTTAATCCACTACTC s bosTau2.scaffold2750 81955 307 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAAAATTTCTGGATTAGGTCTTCTCATTTAAAATGGGAGGATCTCCAGGTATGTAT-AATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGAGCCCCATAAAggagaaggcaatggtaa---cccagtccactactc a score=19294 s mm7.chrY_random 12359757 937 + 30114534 CCTTTATAGATTATCTGAATGAAACATAGCAACTGTAATTTAAATCAA----GAAAGATATTTTGTGTGGATATTAGAAGTGTGAAGCTAATTCTCAAAGGGTGTATATT-ATCTGAATCGACACTTATAATTCCCTACCCATTTTACAACACAACAAGTTCT----CATGCCTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAAT-------TTAT------TGTTTTCAAAGATGACAAAAGACGAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATATAAGCTACCCCCTA--TTGTAGGAAAAGAGTGGATATTCTGACAGTAAATAGCTTTTAAATATAAACTATTGAGATATATTAGAGTTAAACAAAGAAAGGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGTCACAAGGAAATAATTAGATTT-TAGAAAGTACCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGCCTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACAGAAATTCTTCACAAAAATCAAAGAGA-----GGAGCGAAATAAACACCTTCCATCCAGCAAGATCAAAAACTACTCATAGAAAAA-TGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACGAAGTTTCTTTGTCAGTAAAGTAGGATCTTCAATTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTCAGTGTATCAATTTCTATA-AAATATGACCTCTCAAATAATCAGTTTGACTAAGGATTCAATAAATCATTCTGTGCAACTATATTCCAGCTGCATCATTGGACTGAAAGTGAATGGCCCATATGTTTCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGTGC-TTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCTAAATATGAAAAATTAATAGGAACCCAACTCGCTAACTGTGACAAACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82865 1024 + 102126 CTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaacagtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCTGACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAAA--ACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=3705 s mm7.chrY_random 12420536 234 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTTTTAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCATTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA---CTTTATACTG----CTGttattaataatga-------------tatttttaaaaatta-aCAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTATGTAATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGAGAAA--AATTGAAATTTCTTTTCAATATTACCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 81955 265 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAAAATTTCTGGATTAGGTCTTCTCATTTAAAATGGGAGGATCTCCAGGTATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=19692 s mm7.chrY_random 12420784 963 + 30114534 CATTTATAATCCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAATGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATCAAG--AAATATATTTTGTGCGGACAT--TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTGTATATT-ATCTGAATCGACACTTATAATTTCCTACCCATTTTACAACACAGCAAGTTCT---TCATACCTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGAAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATACAAGCTACCCCCTA--TTGTAGGAAAAGAATGGATATTCTGACAGTAAATAGCTTTTAAATATAAACTATTGAGATAAATTAGAGTTAAACCAAGAAAGGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGTCACAAGGAAATAATTAGATTT-TAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGTAAGCCTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACAGAAATTCTTCACA-TAAATCAAAGAGA-----GGAGCGAAATAAATACCTTCCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCATAGAAAAA-TGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACGAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGTAGGATCTTCAATTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTCAGTGTATCAATTTCTATA-AAATATGACCTCTCAAATAATCAGTTTGACTAAGGATTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATTCCAGCTGCATCATTGGACTGAAGGTGAATGGCCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCAATTTGCC-TGTTGTGC-TTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCTAAATATGAAAAATTAATAGGAACCCAACTCGCTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaacagtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCTGACAACCCATCAAA-AGATTTTTGCATCAAAA--ACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=13146 s mm7.chrY_random 12491990 557 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTTCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAACACTA-TGAGAACACTTTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCTTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAGTAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGCA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC---------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13770 s mm7.chrY_random 12497519 370 + 30114534 AATCTCCTAAGCTCAAATGTGTACGGCTTGGGCATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAA------ATCAACTATGTGTATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTGTACAGGGAGCAGACACTTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTACCAGGACGAAACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAATGCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAAATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4195 s mm7.chrY_random 12502054 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTATTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTTTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATATGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=12385 s mm7.chrY_random 12503757 1062 + 30114534 ACAAATTGTGCATACCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGACAGTGAGA---------------TCTGTAAGTTGACTTCAAATGCTTACAAGTTTCTTAGGTTT--------------------GTGTT-----GGCTTTCAGGTCTTCTTGTATTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAAATACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTCATGAAT----TTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGGCGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA----CTTCAAGGGCCAAAATAGCCTTTTA-----CATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAATCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---AAATTGCTATGGACACAGATGTAAAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTCCTAATACAAAAAA------AAATAATGTGTGGATAACACAGACAATG--------AAAGACAGTGGGAAGCAACTTATTATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTGCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACATTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTCCCTTAGCTTGGCAATTCTG---------------TCT----GAGTTT---------------------------------------------------TCTGACTAAGAACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCGTCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTCTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCACCAGGAACACTGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAG--------ATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTA--AGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCTTAATGCTAGAA-TTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGC-TGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGTTTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=8122 s mm7.chrY_random 12548913 486 + 30114534 TAAGTGAATTTTATATGTACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTCCTTATAATCAGAAGTGCTGCTAA-ATTTTAAAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGTTTTTTTTTATTTTATCAC-AAATTTGTTGGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCTATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGCTTTGTTTGCATAAAAA--TAGTCCTCTT-----CCAAGTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACTAAGGGAAAGGCTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGATGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164591 446 - 45915461 TAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAGTCCAAG-TTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGAT-----TAAACT--ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35167 s mm7.chrY_random 12551233 1243 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCACACGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGACAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGAAGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGGTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTTGCCAGCGCCCTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGACGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGAATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGATTTTTTTTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACCACTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGTAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCTTTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTACCTGTGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATGCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGCTCTAGCAAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAATATCACATAAATTGAAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATTGAAAAA---AAAATGT-TTGTTTTCCTGTGT--TGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAA----ATTAGTACGTGTGAC-ATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGCTTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGA-----TCTGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGTAAGAAGCAGAGAAATACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGATGGGG------AAAGAGTGATAGATAAAAGGAATGTGGCCTTGTTACACAAAGTGCAACCCAGAAAACTTATCCAAAGAGACTCAGAAAT s bosTau2.chrX 28529095 1282 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAG---CGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG-AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA------GAGTGAAATCTTGGGGTTGAGAG-GAAACCAGGATAAATTGAGTAAAGAGGGACACAAAT a score=9545 s mm7.chrY_random 12554174 461 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTGCTAAATCGATGGGAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTGTACATCAACATTTTCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCACAAAAATAAGTAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGTGTGTGGGGGGGGTGGTGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCgtttgaataatt s bosTau2.chr17 20172806 476 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACT a score=8943 s mm7.chrY_random 12603668 407 + 30114534 TTTTTCATTAAACCTTGAACAGAATTTTTCTCTGATCTTAACAAAATTGCAAAGTACATGGGGGATAAAGGTGCACATTCTCAGGTGTGCATGGAATGACAATATGTTGAAGACCTTATTAGCCTCCATGTCCTTACACTATGTGCCATATTGGAAAATAAAAAATATACCCTAGCCAATGCAGAACACCAGCATGCTGAAAGTCAAAAAAATGGCTTACTTGAATATGCCAGGGAGATTTCTAACCA-AACTGTCACTGTGTATATCTCTAACACAAGGTAGACCTGTTATTGCAAGAGACAGTAAAGGGCAGTAA------CATTGGTGCACTCTAGGATATGGGCCT---GTTCTAAGTGTACATCCATATCAACAAAGAGAATGAAAATTTGCAGCCTGATTGCATAAAGGAT s bosTau2.chr7 54723651 416 - 69141744 TTATTCTTTAAACTTTTCAAAGAGTTTTTATCAGTTCTTATAAGAACAATGTAGTACTTTGGGG-CAAAGATGCAGCCTAGGAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGATGATCTCCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGCAGATAGGGAGGAAGGTGACCCAGACACTGAGGAGCACCAGCCTGCTGAAGGTCAGGAACTTGGCTTCACTGAAGGTGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGAAAGCCAAGGAGAAGGTCCCCAGGGCTAAGGAGCCCAGGTAGCCCAGGACACAGTAGAAGGCAGTGACCGAGCCCTTGTTGCACACGATGAGGAGCTCCTTGGGCTCAGAATGAGTGTCCATCTCAAGGAAAGGGGGAGAGGCTCCCAGCCAGACTCCACAGATGAT a score=20252 s mm7.chrY_random 12606955 701 + 30114534 ACTTCTATCTGACACCTTGGATAGAATTTAAGTCTGGTCTTATTTCAATGATGTAGATCTTAGGTGTAAAGATGCATCCAAACATCCCTGCACTGGATGCCAAGATTGAGAAGACCTCTACAGCAGCCATGACCATGCCCTTAGTCCTATGTGAGTCATGGAGGAAGGTGAAATAAACACTGCAGAATCCTAGCACAACAAAGGTCAAGAACTTGGCTTCATTGAATGTTTCAGGAAAATTCTTTGCCACGAAATCCACAGTGAAGCTTCCAAGGGCAAGGCAAGTTAAGTATCCCAAAATTCAGTAGAATGTAGTAACTGAACCCTTGTTGCACAAAATGATTATCAATATCATCAATATCAACAAATATCAATATCAACAAATATCAATTTCAACAAATATCAATATCAACCAAAGGAGGAGAAACTGAGAGCCAGATTGCCCACA-GAATACATTGA-CATGGAATATATCAGAAGGATGTATTTCATTGAACTTGATAAAAGGAGTTTCATTAAACCTCTTCCAGGTTCTGTGATTTTGAAAGCCAA-ACTACAATGATTGTTTTGGCAAGCACTGTGGAAACAGACACCATGAATACAATTCCAAAAGTGATTTGTTGTAAGGCTACAATTTTTTTCTGTTAGGAAGACCAATGAAGAAAAAGGAGCATGAGAAAATGGAACATGAGTGACATGAGTAA s bosTau2.chr7 54723649 663 - 69141744 ACTTATTCTTTAAACTTTTCAAAGAGTTTTTATCAGTTCTTATAAGAACAATGTAGTACTTTGGGGCAAAGATGCAGCCTAGGAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGATGATCTCCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGCAGATAGGGAGGAAGGTGACCCAGACACTGAGGAGCACCAGCCTGCTGAAGGTCAGGAACTTGGCTTCACTGAAGGTGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGAAAGCCAAGGAGAAGGTCCCCAGGGCTAAGGAGCCCAGGTAGCCCAGGACACAGTAGAAGGCAGTGACCGAGCCCTTGTTGCACACGATGAGGAGC----TCCTTGGGCTCAG------------------------------AATGAGTGTCCATCTCAAGGAAAGGGGGAGAGGCTCCCAGCCAGACTCCACAGATGATCACCTGGATCATGGAGTACATGGGAAAGACATA----GCAGGTCCTGTTAAGAGCAATCGCCTCATGGTTCTTCCTGGTTTCCTGGCCTTGAATGCCAAGATCACAGGGACGATTTTGGCCAAAACAGTGACCACAGCCACAGTGAACACAGCTCCAAATGTGGTCTGTTGGAGGATG--GAGGTGGCTGTGTGGGGACGACTGATAAAGAGTAAGGAGCA-GAGGAAGCACGGGAGGAGGGAGATGAACAA a score=48378 s mm7.chrY_random 12718284 1727 + 30114534 TCTCTCATTTTTTGTGATATGTAAAAATAGGTGGTTCTTCCAGGCCCTTAAGATCTTTAATTTGCATTTT-----TGTATTTCACAAAGTTGAAGTGTCCTATTTTACATCTCTTTCCACTTT--CTATCACCTGGCATTTGT-------TTGCTGT-TTTCCATTTCCTGGCTCCATGGTACCATTGT--TTGCCAGGG-------------------------------AGCCCCACATGTG------GCCCGCTGAGCT--GTCAATGCAGATTTCCTAGACACCAGTGCCAGCTTAGAGCTCGCCCTTCTTTCT-CCTGGCTTCTCTCG-------TTTACACATGGACTCGGCCTCACCAGCTCCTGAGGATTGGGAGAAAATAGCTCAGTACAGAATCAGTTTGGTCCTCGTGCAGATGTAGTGACATGTTGACAGCTAGACTC------GGGAAATTGAGCTGTCACCAGGTTAATTCTCAGCTTCATGAAGAAA-GACTTAGCCCAGCACTTCAAAGCCTGAAAAAAATTAAACCTGCCTCTTAATCTAGTGTTCCAAATTTCAGAAGAA----AAGTGGGAAACCCTGGGCTCA---CGTGGGTTATCTCAGCGCCCCAC------------CATCACTTGCAAGAAAGATGCGCTGCTCTTCT-------CCTGGCTTCCCGGGTGCAGGCTATGATGTGTCCTTTGTCTTAAATTCATCCTCTTCTCAGAGGCGGGGAAAACAGTAAACAAAACATCTCATGGACCTGTGCTGAC-----TCGGATGCTGTC----------ATTCTGTCATAGCCGAAGAGTCCGAAAAGGTTTCC-----CACCTAGGCATAACTCAAGGGGAAAAATCTTTTTTTTAA-----TGTTTAAATAAAGAAATCTACCTCAGTTGACAGGATTCCACCTGTCCTAGGGTTTCTTCAGCTCTTCAGTCTTACCTGCTAGGTGTCACT-GGGCAGTGCTCTGCTTGTCTGACCAAGCAGGCTGGCGAGGCACAGCCG-AGCAGAAGTGTCTCAGTGTC-CTGTAATGACCT-CTTCTAGCATGTTGCAGTTTTATATTTGTTAAGTTGATAAGTGATATGAATGTATAGGCAATTGTGTATGTTTTCAAAAAGGACAATGAAAATTTAAAATGTAGCTTCCACACTTGTGCATAATTCCAAACTATCTTATTTT-ATCAGTGTTAAATAGCTTTT-GTACAG-CTTCAGCCCATTTTCCAGACGTGTGCTGTTTTATACGGGAAGTAAC--TCATGATCTCACATCTCACGGAGCTGT-GTTTACACATCGCAAATTTTTAA-CTTAATGTGTTTTTCAGAATTAACTTTTTTGGAGGGAGGAAATTCCCCACTTGCTAAATGATACTAAACTGTTGTCTGGACTCTTAAGAATCAGGTCTTTGGATTTTATAAACT--AGTCTGTAGCTTTTTAGGTTCTTCGTTG--GTTGGATGTAC------ATAGAGAATATAAAACAACTCTCAGATTCTTTTAAGCGTCTGAAGTTTTC--CTTGGATGCACACTCGGTCGGGTATTATGTTCACGCAGACTTTCAGCATTAAATTGAAAAGGTCCACCGCTTCTCTTAGTTAATGTGAACCGTTTGTTT-TTATTGTGTTTGGTGGAGAAG-------AATAATACACTTCTTGCCTAAATCCAGAAGCCCCCTTTGAATGTTAATTTTTTAAAATGTTAGAATTTGGTGAAC-----ATCTGGAACATGTATATGCATTATTTTTAAATTTCAGTG--TTTTAAAAAGCAGACCATTCTGGGG----TGTGTTTTTATTGATCTTTCATTAAGAGAAATTGATAGGACTGgttttggttttgg s bosTau2.chr17 20793398 1807 + 45915461 TCTCTCTTTTTTTAAGG-ATGTGAAGCGCAGAGGATCTT---GAGACTAAAAATCTTTAATTTGTATTTTATGTCTTTCTCTCATAAAAGTGATGT---CCATTTTATCTATGTTTTCTGTTTTCCTTTTGCCTGACGTCTGAGATGAGACGGGTATATTTAGAGTCCCTGGTTCCATGACACCATGGTGGTTGTCGCGGGCCTGGCCCATGGCCGCCCTCTCCCCATCTGAGTCCCTTATGTGTGATGCACGTGCTGAGCGAGGTCA---CAGCGTCCCCA-----CTGCACCAGCTTTGAGCATCCCCCAGTCTCTGACCCCCTTCTCACGGGCCTGTTCTGGACACTTTCCCTCCCCTGCCACCCTCC-AGGGTTTACAGACAATAACTAGATGCAAAATCAGT-----------GCAG--GTAGCGGCCTGTGGAGCATTAGACCCAGCCCAGGGAAGCTGAGCTTTAAAT-GGTCAATTCTAAGCTTCATGCAGAAAAGATGTGGCCCAGCCCCTGGGAGCC--AAGAAAACTAGCTTGGCCTCTGCATGCCCCCCTCC----CCTAGAAGGAGGTGACGAGGGAGACCC----CTCAGGACATCAGGCAGCCC-GCCCCTCACGGCTGCCGCCTGCACCACAGACCAGGAATGT-TGCTGCTCTTCTGTAAACCCTCCTCCTCTCAAGAACATCC----ACCTGTTCTCT--CATAAACTCAACCTCTTCCCAAAAGTGG------------AAAAAGAATCTCATGGAACTGGGTGGAGACACGCCAGACACCACCCCGGGGCCGGGTTCTGTCTCAGCCACAGAGGTAAGGAAGGGACCCGCCCTCGCCCAGGCCCACCTCAAGAAGAAAGCAAAATTTTAAAAAAAAATGTACAAATAGAGAAAACTACCTCAGTTGACAGGATTCCACCT---TTAGGGTTTCTTCAACTTTGACGTCTTACCTGTTGAGTGTACCTCTTGTAGCATCTTGCTTGTC--------CAGGCGAATGGGAGGCAGACGGAGCGGGTGTGCGCCAGCGTTGCCGTGCGGGCCTTCCTCCAGCATGTCGAGGCTTAATTTTTCGTAGATTGATGAGTGATACGAATGTAAAGATACTTGTGTACGTTT--AAACATGACAATGAAAACTTAAAATGTAGCTTCCATACTTGTGCATAATTCCAAAGTATTTTATTTTTATCAGTGTTAAATAGCTTTTTGTACAGGCTCCAATCCATTTTTCTGAAGTGTGCTGTTTTTTAATGAAAGTAACGATAAACTTTTCACATCCCATGAAACTGCCGTTTACACATTGCAACTTTTTAAACTTATCATATTTTTCAAAGTTAACTTTTTTCGAGGGAGGAAAATCCCCACCTGCTAAATGATACTAAACTCTTGTTTTGGCTCTT-CTAATTAGGTCCTGAGATTTTATAAAATTCAGTCTGTAGCTTTTTAGGTTCCTCACTGGAGTTGGTTGTACATAAAAATAAAGAATATAAAGTGACCCTACAGTTCTTTTAAATATCTGAATTTTTCCACTTACATGTGCTTTTGA--AAGTATTTTGTTCATGCATACTTTCACCAATAAATTGAAAAAGTCTTGAGCT--TCTTGGTAAATGTGAACCATTTGTTTCCTATTGTGCTTTGGGGGCAGGAACCTTTAATAATATAATATTTGCCTAAATCAAGCAGCCCCCTCTGAATGTTAATTTTT--AAAAGTCCATATTTGGTGAACCATAAATCTTGGAAGCAAGACTGCAATATGCTTAAATTTAAGTGGTGTTTTAAAAGGAGAAAATTCCAGGGTTGATTTGTTATCATTGAAGTTCCATTACAACAAATTGATAGGAC----TTTGTTTTTGA a score=5185 s mm7.chrY_random 12720222 114 + 30114534 TGAGCGGTGTGGATACAACTATGAGTAAGTGGAAA-CTTTTTCCTAAAACAACATTCATGTATTTATTCGATCCATTTTTCTGTGACATTTGGTGCAATAAACTTTTTGAATTTA s bosTau2.chr17 20795205 115 + 45915461 TCAGTTAAATAGATATCAGTATCAATGTATGGAAGTCTTTTTTCTTAAAACTTGTTCACATATTACTTTGATCCATTTTTCTGTGGCATCTGGTGCAATAAACCTTTTGAATTTA a score=9490 s mm7.chrY_random 12736468 517 + 30114534 TGGCATGAACAATTAAAGTGTCCTCCA--ATTTTAAGTA----------------AATTTTATACTTACCTGTGTCCAGTACTCTGTCTAC--ACATATATCAAAAGTAAAAATACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTCCTTGTAATCAGAAGTCTTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTTGTTGATATCAGGTTTGTTTTAAGCTTATCACGACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTCCAAAATAACCCATAATTCATAATTGCCATTGGTTTCAATACATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGCTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGCGAAAATTGGTGTACTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGTGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTAAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAA s bosTau2.chr17 20164542 494 - 45915461 TAGCATGAAAACTTTAAAGCACATCCATAATTTGAAGTAGGATTATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAA----CTAGTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAAGTGAC-------TCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAGTCCAAG-TTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG------GTCT-----TGCCAGCCAACATTCTATATGGGCAACACTTCAATA----CACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAA a score=2520 s mm7.chrY_random 12738573 178 + 30114534 TCTTCACCTGCTCAGAAGTTCTCGTAGAGAAGAGTCTTGGTCCAGCATTC--------------------ACTCCCAACCCAT--------GATCATTAAGTAACTCATATATATGACAGAGGCAACAGCATTGTGTCTGGTTTAAATAGGTAAGATCTTCAGTCCAGGCAATGGGCAAGTATGATATTTGAAGAGAGAATGGAAG s bosTau2.chrX 28528176 206 + 48857030 TCTTCGTCAGCCCAGCTGTCTTCCTAGACACGCTCCTCGCCTAAGGATCCTTCCCTCCCAGCTCTTGCAAACTCCGAACTCGTCGCCTGCTGATCCTCTTTCACCACAGGTTCACAGCGGAGGCAGCAGTGAGGTGTCCGATTTGGACACGTGAGACCTGCGGTCCCCCGACTTGGGGAGGTGGGCGCTGGACTAGAGAATCGGAG a score=36242 s mm7.chrY_random 12738792 1243 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTTGGTCAACTGCCAACAAACGCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGAAGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTTTTGACTCACAAAGTAGTTTTTCCTTAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGTGCCCTAGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAACATAGCTCTGAGGAAAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTAAAGGACTGGTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTACCCGCTCCTGGATGCCTACAAGGAAGGTAACTTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCAAGATCAGGTGATGACAGTGACTTCTTAATAGATACCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGTTCCAAAATGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAGTTTCATGATGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAATATCACTTAAATTGAAAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATTGAAAAA---AAATTGTTTTTTTTTCTCCTGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTTAATAAAA-------TTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTTAACACTTTGT-----TGAAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAATGTTGCAAGTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGTTAAAATGGAA-AGGACTTAGCTGCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTACAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATGTGTAGGAA---GTAAGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAATAAGTTGGAG------AAAGAGTGATAGATAAAAGGAATGTGTCCTTGTTACACAAAGTGAAACCCAGAAAACTGATCCAAAGAGACTCAGAAAT s bosTau2.chrX 28529095 1282 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGA----GCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA------GAGTGAAATCTTGGGGTTGAGAG-GAAACCAGGATAAATTGAGTAAAGAGGGACACAAAT a score=10046 s mm7.chrY_random 12744146 405 + 30114534 CTATAAATAATGAAAATATGGAAAT--AAGACTTTTTCAGCGTGTTT-GGCTTGTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGAGAGGAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGCCTTCTTTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTGTACATTAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATATGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGGTTAATCAAGTAGAAATGTGTGTGGGGAGGGGAGGGGGCTAGGATGCCTTTGGATTATTTGGAA-TGATGGCTGATCAGAAACTTGTTATACAAATAACCCTAACCTGTGAGAAATGAAAAGTAATGATATTAAC----TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATAT-AGCCAGTAATGCCAGTGCGATC-CTCAATTAGCA---------------GAAAGGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAG--ATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=7234 s mm7.chrY_random 12746083 425 + 30114534 TCACTTCAT--TCCTCTTCAACATCAGAAATCTCAATTTACAGAAAG------TGATATGATGAGATGTAGTTTTAGATAACTCTTTTTTTTTTCTTCTCTGAGTAGCTTTCACTTAAAGTCACAAAGGAAAAATAAACATAACAGGAAAGAAATTGAT--ATTCAAATGCCC--TTGACAACCTCATAACATTCTCCATAGTGAATATAAACTTTTAAA-TTAGAATTCCCACGGAGATGAGACACTTGAAAAATCCTTACTCTCAGA---TAGGCTTTGGTATTTCATTTCTTTGAAAAGGAAAACC-AATATA-AAAAGACAAA--CCTAGATTTTTTTGTGCACGAGTTGAATCAGAAACATTTGATAA---------------------------TGTGCAT--------ATATATATATGGAG---------ACATCTGGAGAACCATAAGCCCCTTATTAGCATTAAAA-ATTCCTGATGTCA s bosTau2.chr17 20180130 479 - 45915461 TTACTTCATGCTCTTTTTCATCTTTAGAAATCTCAATTGATATAAGAACTAGATGCTAGGGAGAAATAT---TTTAAATAA------TTTCTTTCTACATTGATTA-TTTGCACCTCCAGTCTCAAAGGAAAAAAAAATCAGACTATAAAGTACAGGAACAATCCAAGGACCCAATGCAAAACCCTATT-CATTTTCTTTAATAAATAGCAGTTTTGAAAACTAGAATTTATAAGGAGATAATATATTTTTGCAAGCTTTAATATTTGAATGCAGGGTTTGATATTTCCAGCCTCAAGAAATGAAATTCTAATAGATAAAAGACAAAAGCTAGAATCCTTTTGTGGAAATATATAATCAGAAGCTTTTGATAATAATAGGGCTTATTGAGATGCTTACTCTATACATACAAAAGGATAGATTTATGGAGGTCAAGGGAACATTTGGGGGATTTTCAGTGGCTTAATAGTTTTAAAAGATCCCTAAAGTTA a score=3801 s mm7.chrY_random 12775991 54 + 30114534 TGTGTATTTGTGTGTATGTTTCCGCACACACATGCACATGCACACACATGTGCA s bosTau2.chr17 34070347 54 + 45915461 TGTGTGTATGTGTGTGTGTTTGCACGCACACATGCACATGTACACATATGTGTA a score=13627 s mm7.chrY_random 12991350 556 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCGGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAACACTATTGAGAACACTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCATTACTGGATTCACCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCACAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGAACACTGAAAGTGTGCTT-CAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGAAGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACA-----AACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC-------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA--CCA----TGTATTAGTCTTATAAGGATACACTGGAAATTTT--------------AAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=4798 s mm7.chrY_random 12997494 596 + 30114534 TCCATTTTCTAAAAAACAGACAGTAGTAGTTTCCTTCCTAACACAAATGTCTCTGGTTTAGTTAAATAGATTTATTAGCT--------TCAAATCAGACAATACCATGCAAGTTCATTTTCAGAAGGGTTAAGTGGAATTGAATTTGTGTTGTGTA-TTACTAACTGAGAGG--------------CCAATTTATAACCACAGAGCACTTTGAGGTGAGTGGACATAATATTTTTACAATTATAAAATGCATAAAATTCCATACCAAATTTTTATCAAACTTGCTTTATATGT------------AAGATCAACCAAAAATTAACAGACAACTACCAAACAGTTAAAGCATACAA---------------CATGGCAATAA-------------------ATTAAACG--------------------------------------------------------------------AAAATGCTTATTTAGAAGTGGGAGAAGATAAG-----------CTTTTATGGAAT---CTGCTTAATTTTATAAGAAAGAGAAACATCACTTTTCTTCACAT--GCTCAGAATTTAAGA--GGGGGAAAAGATCCATGAGATATTCCAGTTCTATGAACACAAAATTAAGCAAGATCCTCATAGTTAATGTGTGAGTACACAATGCCTGACTCAAATTCTATCATAGACGCTAAAGTCCTGTCAC---TGCAGGCTCATCAGTCTCACTGtattatta s bosTau2.chr3 46353077 698 - 85360813 TTTATCTTTTAAACTACAG---GGAGTAGCTTCTTTTCTGAAAAATGTTAAGTAGGTTCAGTTAAAGAAATGTACCTACTATGCATTTTCAAGTCAGAGAATAAATTCAAAATCAATTCCCTACAAAGGTGATTACAACAGATGTTACATTATATAATTGTTTACTTTAAAAATATCTCTTTAGTTTCATTCCATGTCCATTTATCATTTTGAGTTAAATG-ACAAAA-ATTTGTGAATTCATATTTTACAGGAAATTCTGCA---------TGACAGACTTGCTTTTCATGCTTAAGTTGGATAAAAATCAATCAAGTA--AAAAAATTATCACTAAGCAGATAATATGTATAAGGCATTATACTATGTCACACCAGTAACATTTTGCCCAACAGAAAGATTAAACTGAGTGTTATAATTTAGAGGTTAGCACTTAATCTGCTGTGTAGATTTCACCTTCCAAATTGAAATATTTAAGACCCTCATTTAGAAAGGTGAGAGAAAAAGATAAATATTTCCTTCTATGTGATGAAATGTTTACCAAAACTAGGAGTATAGATATCACTTTTCCTCATATATGTTTAAAATTCAAGGAGGGGGGGAAAGCTACATA--------------TAAAAACATACAGATGAACA-------------------GTGA-------ATGTATGACCCAATTTCTGTCATAAAAGGTAAAGTCCAGTCTCTGTTGCTAGTTCATTATTCTCACTCGGCTATTA a score=4715 s mm7.chrY_random 12998318 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCGAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=12310 s mm7.chrY_random 12999776 1302 + 30114534 CCTGGCCAAGCAGTTATTATTTCAACATAAACCTA--GGATTCAATCTACCCTGCTTCTAATTGGGACCAAAAGTATAAGCCACATGTGTTTCTCTGC-CAGACTACTTGTGGATGAGACCCTCGAGTATCAGATGCATACCATGTTGGAGAGGGTACATAAGCTCTCATGCACTGACCTTATCA------ATAAATTA--------AATGCTCAAACTTTTCTATAGAGAAAACTGATATACTCATTTAAAATTATG---AAAT-----CACAAATTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTTTTATGGA--------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAAGTTTCTTAGGTTTGTGTTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTTCCCAAGCTTCCGTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGGTAACACTG-----AAGGAAGACA--GAGTCTTATCATCGTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTGTATGGCAGTCAACATTATAGCCATTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CATCAAGGGCCCT----AATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCAAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTCCTAATACACAAAAAATTGTGTGGATAACACAGATAATGAAAGACAGTGGGAAGC---AACTTATTATTGTA-----------TTGTATTGTTTTTATGATATGAAACAT-------AACTCTGCCAAA--------------TTTTCTAGACTTTAAATATTCT--TTACATTCTGTACCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGATTGACAATTCTGG--------------------TGAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCGTCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATTTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGtttcccacattcaatacagttaaacaggattctctcctgtataaaatcattgatgTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCACCAGGAACACTGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAA-ATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50039 1466 - 52585 cctggtccgggaactaaaatcccaacatgAACAAACCAGTTTCTGTCTGACCTGGCTTTCACT-----------TTTAAGTCACAGGCCTTACCCTGCTCTGACTGCACATT------CCCTCCTAGCATCCAATGTTCACTGAGTCTACAAGA--CCATGAGGCCACAGG-GCTCTCCTTACCATTCTGAATAAATCAGTTTGCAAAATCTCCAGATCTTCCTGCAAAGCA------TCCATACATATGAAGCAATGCCTGAACAGCCATACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTA-CTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTG-------------CTTAATG------CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATG-TAGATAGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATTT-------ATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTTTAGATTCCTTTT----TGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3436 s mm7.chrY_random 13017286 51 + 30114534 TGTGTATTTGTGTGTATGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACATGT s bosTau2.chr17 34070347 51 + 45915461 TGTGTGTATGTGTGTGTGTTTGCACGCACACATGCACATGTACACATATGT a score=18405 s mm7.chrY_random 13113381 957 + 30114534 GTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTAGTGAGTTGGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGATCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGTCTCACATCAGTGGCAACACATGGGCCATTCACTTTCAGTTCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTGAGAAATCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTCGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCTAAGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGGAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGGCTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGTGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTTT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGTTTTAGCACCCCCTTCCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCTATTTACTGTCAGAATATCCACTCTTTTCCTACAA--TAGGGGGTAGCTTGTATTCTGGCTAA-------TTCTGTATTCACTG---------------------------------TGCTTTTCTGAATTTCCAGTTTGTCTTTTTACATCTTTGA-------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAGGCATGACGAACTTGCTGC---ATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATAAGTATCGATTCAGAT-AATATATACCTTTTGAGAATTATCTTCACATTTCTA--ATGTCTGCACAAAATAGCTTT--CTTGATTTAAGTTACAGTTGCTATGCTTCACTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18243 1044 - 102126 GTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTCAG--GGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactactgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=2827 s mm7.chrY_random 13114352 112 + 30114534 TTAAGCATGATAATATTGAAAAGAAATTAAAATT--TTTCACTTTGAAATTAAAACTCTGAAGATGATTACTTAACTTGTGTTTGGAAAAGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA s bosTau2.scaffold2750 19906 115 - 102126 TCAAACACTCTAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATA a score=2100 s mm7.chrY_random 13114490 96 + 30114534 TTGTTCAAACAAAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAACGAAAATAACTGAATAGTA-GGTTTGT-ATCATTTGACACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 20067 104 - 102126 TTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=17826 s mm7.chrY_random 13132207 969 + 30114534 GCACTAGTGGCCTTAAAGAATTGTTTTGTCTGTCACAGTTAGCAAGTTGGGTTCTTATT-CATTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAG-CACAACA-GGATAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATTCAGTTTGAGTCCAATGATGCAGCTGGAATATAGTTGCACAGAATTATTTATTAAACACTTAGTCAAGCTGATTATTTGAGAGATCATGTTT-TATAGAAATTGGTACACTGAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTACTTTACTGACACAGAAACTTGTTTTGCCTGTTTTGTACACTTTGCCAG-TTTTCTATGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC----CTCTCTTTGAGTTTTGTGAAGGATTTCTGTTTCCCTTTGGCTATGCAGCAATAAAGGCTTGCA-TCATTCAGAAACT-CAGGGACACTTTCTATCAA-CCAGTTATTTCCTTGTCCCATTGCCTC-ATTGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTTCCACCCCCTCTCTTTTTTTTTTTAACTCCAACTTATCTCAGGAGTTTATATTTAAAAGCTATTTGCTGTCAGAATATCCACTCTTCTCCTACAA--TCTGGGGTAACTTGTATTCCTGGCTAATTCTGTATTAACTATGC----------------------------------------TTATCTGAATTTCTAGTTGGTCTTTTGCCATCTCTGA-------------AAACATTGAATTT---------AAGTAA-CAGAACA--ATCATGCTAGGCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATATGTATCGATTCAGAT-AATATACACCTTTTGAGAATTAGCTGTGCAATCTTAATGTCAGAACAAAATAGCTTTCTGGAT----TTAAGTTACTGTACCTATGTTTCTTTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTA--ACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTCAGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttc----cttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgc-ttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=17826 s mm7.chrY_random 13202366 969 + 30114534 GCACTAGTGGCCTTAAAGAATTGTTTTGTCTGTCACAGTTAGCAAGTTGGGTTCTTATT-CATTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAG-CACAACA-GGATAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATTCAGTTTGAGTCCAATGATGCAGCTGGAATATAGTTGCACAGAATTATTTATTAAACACTTAGTCAAGCTGATTATTTGAGAGATCATGTTT-TATAGAAATTGGTACACTGAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTACTTTACTGACACAGAAACTTGTTTTGCCTGTTTTGTACACTTTGCCAG-TTTTCTATGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC----CTCTCTTTGAGTTTTGTGAAGGATTTCTGTTTCCCTTTGGCTATGCAGCAATAAAGGCTTGCA-TCATTCAGAAACT-CAGGGACACTTTCTATCAA-CCAGTTATTTCCTTGTCCCATTGCCTC-ATTGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTTCCACCCCCTCTCTTTTTTTTTTTAACTCCAACTTATCTCAGGAGTTTATATTTAAAAGCTATTTGCTGTCAGAATATCCACTCTTCTCCTACAA--TCTGGGGTAACTTGTATTCCTGGCTAATTCTGTATTAACTATGC----------------------------------------TTATCTGAATTTCTAGTTGGTCTTTTGCCATCTCTGA-------------AAACATTGAATTT---------AAGTAA-CAGAACA--ATCATGCTAGGCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATATGTATCGATTCAGAT-AATATACACCTTTTGAGAATTAGCTGTGCAATCTTAATGTCAGAACAAAATAGCTTTCTGGAT----TTAAGTTACTGTACCTATGTTTCTTTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTA--ACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTCAGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttc----cttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgc-ttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=4506 s mm7.chrY_random 13214096 201 + 30114534 TATTGTACAGTTAATAATTTTATGTCACaaaataatattatactaataattatttaaa-CTGTGTCTTATACTG-CTAATATGGTTTCACATATACATGGGAGTTTGGTAGCCTCAGGAC------TCTGTCCAGGTAGCTGGATCATGTTAATGGATTTTTACACTCAGATTGCCATTCATTTTCTTTTTAGTTGCCAATTTCAAGGG s bosTau2.chr13 22763104 205 - 62721844 TGTTGTTCTGCCAATAAATTAAGATCCTTAGCCA---TTTCATTAGTAATGATTTCAATCCCTGCCTGGAGCTGGATAATTCTGTTAAGCGTGTAAATTGGGGTTTGGTAGCCCCAGGACCCATCTTCTGCCCATGTAGCTAGCCTGTAGTATTGGA-TTATGCGTTCAGGAGACCACTCATCATCTTTCCAGTCTCCAGTCTGTAGAG a score=3637 s mm7.chrY_random 13214535 381 + 30114534 GATTTCTAAATGGTCCCCTCTGGTAAGTTGGAACAGGAAGAAAATTGTACAGCTAGTCCCCAAAACACACAATCCTGAT---TAGGTGAGAAAAAGTATAATCGAGGCTGTGTACCCAACATATCCAGTATAGCCC------ACAAAGGGCATGGTACCTGATACCTGCATTGA------CATTTTTTTCGGTCCTGTCAGAGATTAGAGAAACTAGACAAGGAATAGATGTTTTGTTCAAAGTGGTTTGGGAATCCACACCA--TTGAATTTCCCAAGTGACTGCATTAAAGAATGATTGGCCCAGGCATGTGGGGCTTCCAGC-AGAAGTTTAAATCACC-CTTCCATTAGGTAGGTCAGTTTTCCCCAA--AAACTAGTTC----------AATTTTGGTtttggtttt s bosTau2.chr13 22763349 395 - 62721844 GACTCCCAATGATTCACCTTAGGCTAGGGAGAGTAGGAAAAAGGAAGGACAGATAGTCCCCAATACACATGCTCCTGACCTGTTGGCTGGTAAAATTGTATGTGCGTTAGT----CCCACAAATCCAATATGATCCTTCTGGACGAGGCCAATGG---------CCTTCAGTGGACAAGTCATCCCATCAGGTCTT----TAAATGGGGGATGCTTGTTAGAGGGTGAGGATTAGGCTCTGTATAGTTTGGGCATCCCCACCAACCAGAAGTATGaatattataatattataatatttttGGCCAAGACAAGTGAGTTTTCCTACTGGAACATTGAATAATTGGCCCCACCATGCCAGACAGTTTTTGTCAATTAAAGAAGTCTTTAAATGCCAAATTCTGACCCTGGTCTT a score=3781 s mm7.chrY_random 13215145 96 + 30114534 TTTTTTATCTATCCAGG-CCATAGTTCTTCCATGTTAGTTTTTTCACATGCATGGCCAAAATAGACCCTTAGCTACTGGACTCTTGTGTCTACCAGG s bosTau2.chr13 22763786 97 - 62721844 TTCTTTGGCTTCCCAGGGCCATTGGTCTCCCATGTTAGTTCCCCCACACACATAGCAAGAAGTAACCATTAATATCTGGGCTATGGTCTCTGCCAGG a score=6248 s mm7.chrY_random 13218545 334 + 30114534 TGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAAAAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAGACAAAAAAAGGTAGATATTTTTTCTTTGttttatatatatatatatataa---------CCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGACGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGTTGGCTCTTTTAAACATAGACATTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528299 362 - 76426644 TATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGA-----------AGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTTCTGAA-------TAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTT-TAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=5868 s mm7.chrY_random 13219173 420 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACGTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTACCTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTATTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATTTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGA--CTAAAT-ATGTGTATATTTTTACAATAACATGAAATAAAATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATAATGTGTTCAC-----CACTTACATACAAT--AATAATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=20105 s mm7.chrY_random 13221174 1278 + 30114534 atatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagatagtggaacttaatttagtttcatatgctcaacccaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt-------tttttatggtaccaaccactgatttttctttttcctcattgaatttctGTACATCCATATAAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAAAGAACACTCAAAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCCCTATCATATTATCAGAGAGGTTTTCA-------TTTATGT--TTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacgtaacacacacacacacacacacacacacacacacacacacatatatatacaTGTAC----AAAATTTAATTATATTTCAATGTGTTTT--TTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAAT-----------------------------------------------------TTATTTTTCATGCATTGCCTTAGTAAAGACA----GTGCAAAACA-----TATGTCAACTAAAATATTCAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAGTGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGGAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTAAAAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGTCACACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGAAATGATA-TATTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCATTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTCCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGGGTCAT----TTTGAAGAAAAATTAGGTGATTCCATGTCTACA-AGTAAAATAGATATAGATAAATTTCTTTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530141 1350 - 76426644 ATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAACA--ACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTTTATTA--------------------------------------------------------TATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATT---TTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGTTAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATT-TATTCCCACATATTCAAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=3099 s mm7.chrY_random 13229425 94 + 30114534 ATATTTCTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAAAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=12049 s mm7.chrY_random 13257452 1058 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGCCCCTGGTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAAcatcaatgattttatacaggagagaatcctgtttaactgtattgaatgtgaGAGACCATTCCTTCAAATATTTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC----AGA---------------CAGAATTGCCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAAAAA----------------ATTTGGGAGAATTATGTTTCATA--TCATAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGCTTCCCACTGTCTTT--------CATTATCTGTGTTATCCA--CACACT-------TTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTCTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTTGACATCTGTGTTCACAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATACTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAAATCTTCACTTATCTCAGAAGAGATG---TAAAATGCTATTAGGGCTCT-TGAAG-----TCAGAAAGGATTAATATTCATGGCACAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACCGCCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAACATGATAAGATT--GTGTCTTCCTTCAGTGTAAGCA----------AGGTAGTTGTCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCC-----AACAC--------------------AAACCTTAGAAACTTGTAAGCATTTGAAGTCCACTTACAGA---------------TCTCACTGTCCATACTAGTTATCCATCTCTCTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACT---GGACTTTTTAAATGATTGAATACTACTCCTGTGCCTAAAGGGTTGTACAATTTGT s bosTau2.scaffold5600 1080 1221 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-----AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCT-ATCTACATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAG-AAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAA-TTCTAGCATTAAGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACT--TAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCAT--------CTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=3511 s mm7.chrY_random 13258753 69 + 30114534 CCAGGAGGATTCTTCTTAAGATGGCCATGGAGTCAGAGAAGTGAATCCTGGCTTGTGAGTTCATGAAAG s bosTau2.chr3 46304482 69 - 85360813 CCGTGCGTATCTCGCTTAAGATGGCAGCGGAGTCAGGGGAACTAATCGGGGCTTGCGAGTTCATGAAAG a score=526 s mm7.chrY_random 13260029 100 + 30114534 TTTCTTGCTTTCTCCTGTTCCTTCATCGTGAGGAATAAAGT-ATAAACAGAGTA---------CATAGCCACAGTTTCTGTCATCGATGAGTACTTGGTCTGTGAAATAT s bosTau2.chr8 45375602 98 + 62115791 TTTCTTGCTTTATTTTGATCTCATACCTACAAAAAGGCAGTTATATTCAGAGCATCTGGAACACACATACACATTTTT------------GTGTTTCATTTTTGCAGCTT a score=4587 s mm7.chrY_random 13260130 84 + 30114534 CTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACATATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006495 84 + 85360813 CTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=4047 s mm7.chrY_random 13260442 596 + 30114534 AGTGAGACTGATGAGCCTGCATTA---ACAGGACTTTAGCGTCTTTGATAGAATTTGAGTCAGGCATTGTGTACTCACACATTAATTATGAGGATCTTGCTTAATTTTGTGTACATAGAACTGGATTATCGAGTGGAATCGTTTCCCCCTCTTAAATTCTGAGC--ATGTGAAGAAAAGTGATGTTTCTCTTTCT--------TATACAATTAAGCAGATTCGATAAAA-GCTTATCTTTTCC-----CACTTCTAAATAAGCATTTT-------------------------------------------------CTTTTAATTTAT-------------------------------------------TGGCATTGT-----------TATGCTTTAACTGTTTGGTAGTTGTCTGTTAATTTTTGGTTGATCTT------------ACGTATAAAGCAAGTTTGATAAAAATTTGGTAAGGAATTTTATGCATTTTAT-AATTGTAATTTTTTTTCCACTCACCTCAAAGTGCTCTGTGGTTATAAATTGG--------------CCTCTCAGTTAGTAA-TACACAACACAAATTCAATTCCACTTAACCCTTCTGAAAATGAACTTTCATGGTATTGTCTGATTTGA--------AGCTAATAAATCTATTTAACTAAACCAGAGACATTTGTATTAGGAAGGAAACTACTACTGTCTGTTGTTTACAAAATGGA---AAAGATACTTCT s bosTau2.chr3 39007047 704 + 85360813 AGTGAGAATAATGAACTAGCAACAGAGACTGGACTTTACCTTTTATGACAGAAATTGGGTCATACAT-------TCAC-------------------TGTTCATCTGTATGTTTTTATATGTAGCTTTCC-------------CCCCCTCCTTGAATTTTAAACATATATGAGGAAAAGTGATATCTATACTCCTAGTTTTGGTAAACATTTCATCACATAGAAGGAAATATTTATCTTTTTCTCTCACCTTTCTAAATGAGGGTCTTAAATATTTCAATTTGGAAGGTGAAATCTACACAGCAGATTAAGTGCTAACCTCTAAATTATAACACTCAGTTTAATCTTTCTGTTGGGCAAAATGTTACTGGTGTGACATAGTATAATGCCTTATACATATTATCTGCTTAGTGATAATTTTTT--TACTTGATTGATTTTTATCCAACTTAAGCATGAAAAGCAAGTCTGTCA---------TGCAGAATTTCCTGTAAAATATGAATTCACAAATTTTTGTCATTTAACTCAAAATGATAAATGGACATGGAATGAAACTAAAGAGATATTTTTAAAGTAAACAATTATATAATGTAACATCTGTTGTAATCACCTTTGTAGGGAATTGATTTTGAATTTATTCTCTGACTTGAAAATGCATAGTAGGTACATTTCTTTAACTGAACCTACTTAACATTTTTCAGAAAAGAAGCTACTCC---CTGTAGTTTAAAAGATAAAGttaaaaaaattttt a score=14335 s mm7.chrY_random 13264184 369 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTCATCATTCAACACCATAATGGGTATCCTGCAGCTTATAGGGAAGAGATGTCCAGATTCTGAGCATTGCAGGGTACCATCCAATTC----TCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTCAAAAACGTTTCATCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTCCCAGCACAATCACTTCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATCTCCACATAGTTGATGCAGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGCCCAAGCCCTACACATTTGAGCTTAGGAGATT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATA-TGGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCCCAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=13523 s mm7.chrY_random 13269497 559 + 30114534 TACTAGCTTTGACGCTCGATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAAT--CTTCGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGAAACAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATATACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGTG------CTTTGTGATTAAAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGCGTTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAATGTTTATGCTGAGACTCCGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGT------GGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=8316 s mm7.chrY_random 13444206 481 + 30114534 TTTAAACGTACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ATATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATGTATTTCATCCTGTTGTACTGCATTTAATCTATGAAATTCCTTATAATCAGAAGTGCTGGTAA-ATTTTAAAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTTTTTTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGCTTTCAATACATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGCTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTCCTATCCAGCGTGCT-GCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164600 437 - 45915461 TTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAA---TTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAGTCCAAG-TTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACTA--------TTTCAGTGCATCGTCCTGGTCTT-----GCCAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=393 s mm7.chrY_random 13446486 82 + 30114534 GGAAGCCACAAGACAGTGTGATCTACCAAAACAGGTCTACAGCCAGGTAGAAGACAATACCTCTGAAGACTCTGAGCATGAC s bosTau2.chrX 20848372 72 - 48857030 GGAGGCCGAAGGGCAG----------CAAACCAGGGCTGTTGCAGGAAAGGCCACTGGGTCTGCAAACATGATGAAGAAAAA a score=36057 s mm7.chrY_random 13446568 1137 + 30114534 ATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGGGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGATGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGGCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACAGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTCTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGGGCCCTGATTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACATCTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCTAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTACCTGGGTGCAGTACACAAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAAGTTGTTTACAAAGCTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTACATATCTATGTCTATATTCTGGTGTCAAATATCACTTAAATTGAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATTGAAAAAAAAAATGTTTGTTTTCCTTTTTTGGGTACC-------TATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAA---TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACAGGACAAGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAGAATGG-ACAGGACTTAGCTACTGTCGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAA--GAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529137 1181 + 48857030 ATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTG--CTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=9672 s mm7.chrY_random 13453112 409 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTT--TTTCAGCGTGTTGCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTGTACATCAACATTTTCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATAAAAATAAGAAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTATGTGTGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTCAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGTGAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA----------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=4075 s mm7.chrY_random 13488369 73 + 30114534 GATTATGTGTATAAGCTTATGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCTGCACACACATGCACATGCACACACATGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=36473 s mm7.chrY_random 13603714 1238 + 30114534 GTAGAAGACAACACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGA----TATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTGTAGGGCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTACGACGGAATTGACAGTGTCTATGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATATTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAAAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCGTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAATGATCCGGTCCTCTACGTTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATC----AGGTGATGAAAATGACTTCTTAATAGGTACCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGATCTAGCCAATCCTACCGTGTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATTGAAAAA---AAAATGT-TTGTTTTCCTGTGT--TGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAA----ATTAGTACGTGTGAC-ATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGCTTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAA--GAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGGAAAAAGGAATGTGGACTTGTTACACAAAGTGCAACCCAGAAAACTGATCCAAAGAGACTCAGAAAT s bosTau2.chrX 28529095 1282 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGA-GAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTC---ATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGTTG-------AGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAAGAGGGACACAAAT a score=3596 s mm7.chrY_random 13633360 54 + 30114534 TGTGTATTTGTGTGTGGGTTTCCACACATACATGCACATGCACACACGTGTGCA s bosTau2.chr17 34070347 54 + 45915461 TGTGTGTATGTGTGTGTGTTTGCACGCACACATGCACATGTACACATATGTGTA a score=3601 s mm7.chrY_random 13692192 200 + 30114534 AATAAATTAGAATATGTTTAAAATATTCAGTTTTGTTGCTCATTTCCTGAAAAGAAAAAAAAAATCATGACTTATATGTACCATAT---ATCCAGGATTATGTG----TATAAGCTTG---------TGTGTATTTGTGTGTGTGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACGTGTGCA--CGTACCTAACTTATTT--------CTAAACATATAGCTTACTA s bosTau2.chr20 12004866 222 - 42952723 AATAATTTCAAATTTAATTCATATCTTCCATCTACATAATATATCCCTGGAAGAAGAGTAAATAT-ATAAAATGTA-GTACTACACTTCATTGAGTATTATATGACAGTATGAAGCAGCATTTTAAATGTGTATCTGCGTGTGTGTGTACACGCACATCCACACATGCACACACGTGCtcagtcatgtctga-ttatttgtggccccataaacg-atagcctacca a score=10099 s mm7.chrY_random 13750867 1133 + 30114534 TCTTTCACAGACTATGTTAATCTAACAACATTTCCCCCTGGA-----TGGTTTCCATTTCCAAAGTTGTGTTTGCCA---------TGACTCAATATTTCATCTCTATTCAGATAAATCCTCTCAT-----------ATACCA-CATGTTAATTCAGAAAGGCTCATTTGTGAGTCATGCCAAGGAAGCGGTATGAACTTGGGGCATACAGAAGAGGGAAAGA---------CACAAGAGCAACAGAAGTATCATTAAGCTGGATACTACTCTAGAATACTGCATGCTATTCATGTATCCTGGGGATCCAGAAATTCATCTAGACTGGA-CCCTAGTTATCCATTGGAAGGATGTAGTCCGAAGCTTAGCCTATTCACTGGCAGCTCCCATAGCTTTGAACTGATCCAATGATTGTTATCTTCCACAATCAACCCAGTAGTATGCAAGGTACATTCCCTTTTACAGTCAAAAGCCC---GGAAAAATAAAAGAAA---GCACTGTACTGTGTGCTAGGGTA-GTGCTCAA-AGACGGTTTTGCCAATCTGCACTGAATCTATTA-CACAACTG------------------CAAAGGTATGTGGCACAGGCAATCCAAGGATC---ACCATGCTTCCCATTTTATCTCCCCAGTCTATATATACACTCCCAACTCTACACACTATGCTCCTAATCCTAGGGA-------TCATTTAGAGGTCTCATAAATACCACCATGT-ATACCCCCAGAAGATGAGAGAAGTTTGAAGCACATCGATAGATTTTAAGTCCG---ACAATTGTTGATGTCATCAAAAC-AATTTTCTGAGCTGTGTTGTGCTTTTGTCAAACGATGTGGCTA-GAATGGCCCTGCCAAGATCTAAAGCAGAAATAATAGTTTtttatttgtttgtttgtttgtttgtttgtttTTCTATTATTATATTGGAACATGTCATCATCAATTGCACTTCCTCAGTCTAAAATAACAGGTGATATTTAG--TTATTTGCTG--CTATCTCTAAAGTCTGGGCAAGGCAACTCCTGTGATTCTCCAAGCCTTGCTTCTTACCAGTTCTGGGCTATATGCTGTCAG------GATAATGTTCTAAACAGGgaactctatggatatccacatttcaatagttttccc-ttcaaaaatatagtaaaaaaaa-------tccaattgtacatttattttagtatttctggtcaacatt s bosTau2.chrX 34452455 1144 + 48857030 TCTTTCACAGCCTCCATCAG------AACGTGTGCCCTTGAAGAACTTAACTTCCTTTTCCACAGCTGCACATGCCTGGCCCGCTTTGACTGAAAAGACCACCTCCATTCAGATGACAGCACTAATGgcagagcctgagacaagcatctggatgcaggcag-ttcactgg-gaggggagcctaggaaacagagcgaa---------------ggagggaaggaagtaaggctcataaagactacataa-cactgtcaagctggttaccactgtgg-----cccatggacatcatttccactggggaTCCA-----CCATATGTATTGGATCCCAAATTATTCATCTTAAGGACAGAGGCCAAAGCTTTATTCATTCACTACCATCTTCCTTAGTTTGCAGGTGGCCCAACAAGCGTTACCTTGCCCACACTTTCCAGCATTAACTGAACTGTGTTCCATGGCATAGAAGAAAATCCTAAGACAGAATAGAAGAAAAATACCTCTCATGGTGTGCTGGGACACAGGCTGGACAGGGGATGTTAGCAATGTCCATGGAACTTTTCACCACAGCTATGCTAAAATCAAAAGGGCCAAGGACAAGTGGCTCAGAGTACAGAAGAGCCTGTTACAGGCCCTACA-TTCAGCTCTCCAGGCTATGAGTCCATT--CATTTCTCCTGACTAAACCCATCAACTCCATGAGCTCTCTCCTTTCAGATATCCCACAGACACTTTCAACTCACAATGACAGAAACTGAGAAGAGTCTGGAGCACACCCATGGATCCAAACTCTAGTTGCATTTGCTGATAGCAGCAGCATGGGCTCCCTCAACTGTG-AGTGGGTTAGCCAGTGGATGAGACTCTGAAGGCCCCTGCCAGGCTCT-----GGAAGCAAT---------------------------------------TCTTCCTGAATTGGGACATG----AATTAGAGAGATGGTCACATCCATAAAGAAGAGGTGGAGCTCAGGATTGGGCACTGCCCTTTCCCCATGTTGGGGGCAATGCACCTCCTATGGTGGTCATGGGCCTGTCGCTTGCTGGCTCCAAGATCCAGGCTATCAGGTCACAGATACCTGTCAAAATGCATCgtccagcagaggttcaactgtcgctcctccccccacccacacacaatgcaataaaagtcttgcttccaattacacacttctttcaatattcctgctcaatatt a score=3705 s mm7.chrY_random 13918783 234 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTTTTAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCATTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA---CTTTATACTG----CTGttattaataatga-------------tatttttaaaaatta-aCAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTATGTAATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGAGAAA--AATTGAAATTTCTTTTCAATATTACCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 81955 265 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAAAATTTCTGGATTAGGTCTTCTCATTTAAAATGGGAGGATCTCCAGGTATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=19692 s mm7.chrY_random 13919031 963 + 30114534 CATTTATAATCCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAATGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATCAAG--AAATATATTTTGTGCGGACAT--TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTGTATATT-ATCTGAATCGACACTTATAATTTCCTACCCATTTTACAACACAGCAAGTTCT---TCATACCTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGAAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATACAAGCTACCCCCTA--TTGTAGGAAAAGAATGGATATTCTGACAGTAAATAGCTTTTAAATATAAACTATTGAGATAAATTAGAGTTAAACCAAGAAAGGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGTCACAAGGAAATAATTAGATTT-TAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGTAAGCCTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACAGAAATTCTTCACA-TAAATCAAAGAGA-----GGAGCGAAATAAATACCTTCCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCATAGAAAAA-TGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACGAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGTAGGATCTTCAATTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTCAGTGTATCAATTTCTATA-AAATATGACCTCTCAAATAATCAGTTTGACTAAGGATTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATTCCAGCTGCATCATTGGACTGAAGGTGAATGGCCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCAATTTGCC-TGTTGTGC-TTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCTAAATATGAAAAATTAATAGGAACCCAACTCGCTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaacagtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCTGACAACCCATCAAA-AGATTTTTGCATCAAAA--ACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=13146 s mm7.chrY_random 13990239 557 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTTCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAACACTA-TGAGAACACTTTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCTTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAGTAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGCA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC---------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13770 s mm7.chrY_random 13995768 370 + 30114534 AATCTCCTAAGCTCAAATGTGTACGGCTTGGGCATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAA------ATCAACTATGTGTATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTGTACAGGGAGCAGACACTTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTACCAGGACGAAACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAATGCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAAATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4195 s mm7.chrY_random 14000299 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTATTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTTTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATATGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=12385 s mm7.chrY_random 14002002 1062 + 30114534 ACAAATTGTGCATACCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGACAGTGAGA---------------TCTGTAAGTTGACTTCAAATGCTTACAAGTTTCTTAGGTTT--------------------GTGTT-----GGCTTTCAGGTCTTCTTGTATTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAAATACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTCATGAAT----TTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGGCGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA----CTTCAAGGGCCAAAATAGCCTTTTA-----CATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAATCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---AAATTGCTATGGACACAGATGTAAAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTCCTAATACAAAAAA------AAATAATGTGTGGATAACACAGACAATG--------AAAGACAGTGGGAAGCAACTTATTATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTGCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACATTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTCCCTTAGCTTGGCAATTCTG---------------TCT----GAGTTT---------------------------------------------------TCTGACTAAGAACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCGTCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTCTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCACCAGGAACACTGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAG--------ATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTA--AGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCTTAATGCTAGAA-TTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGC-TGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGTTTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=8122 s mm7.chrY_random 14047159 486 + 30114534 TAAGTGAATTTTATATGTACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTCCTTATAATCAGAAGTGCTGCTAA-ATTTTAAAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGTTTTTTTTTATTTTATCAC-AAATTTGTTGGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCTATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGCTTTGTTTGCATAAAAA--TAGTCCTCTT-----CCAAGTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACTAAGGGAAAGGCTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGATGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164591 446 - 45915461 TAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAGTCCAAG-TTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGAT-----TAAACT--ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35167 s mm7.chrY_random 14049479 1243 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCACACGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGACAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGAAGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGGTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTTGCCAGCGCCCTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGACGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGAATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGATTTTTTTTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACCACTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGTAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCTTTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTACCTGTGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATGCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGCTCTAGCAAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAATATCACATAAATTGAAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATTGAAAAA---AAAATGT-TTGTTTTCCTGTGT--TGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAA----ATTAGTACGTGTGAC-ATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGCTTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGA-----TCTGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGTAAGAAGCAGAGAAATACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGATGGGG------AAAGAGTGATAGATAAAAGGAATGTGGCCTTGTTACACAAAGTGCAACCCAGAAAACTTATCCAAAGAGACTCAGAAAT s bosTau2.chrX 28529095 1282 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAG---CGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG-AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA------GAGTGAAATCTTGGGGTTGAGAG-GAAACCAGGATAAATTGAGTAAAGAGGGACACAAAT a score=9545 s mm7.chrY_random 14052420 461 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTGCTAAATCGATGGGAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTGTACATCAACATTTTCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCACAAAAATAAGTAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGTGTGTGGGGGGGGTGGTGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCgtttgaataatt s bosTau2.chr17 20172806 476 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACT a score=3597 s mm7.chrY_random 14163515 242 + 30114534 TAGTAAGCTATATGTTTAG--------AAATAAGTTAGGTACG--TGCACACGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCGGACACACACACACAAATACACA---------CAAGCTTATA----CACATAATCCTGGAT---ATATGGTATATATAAGTCATGATTTTTTTTTCTTTTCAGGAAATGAGCAACAAAACTGAATATTTTAAACATATTCTAATTTATTAATAGTTTATTCTTC-----TTTCTCTTACAAATTCTACGGTGCAGAT s bosTau2.chr20 30947635 262 + 42952723 tggtaggctat-cgtttatggggccacaaataa-tcagacatgactgaGCACGTGTGTGCATGTGTGGATGTGCGTGTACACACACACGCAGATACACATTTAAAATGCTGCTTCATACTGTCATATAATACTCAATGAAGTGTAGTAC-TACATTTTATATATTTACTCTTCTTCCAGGGATATATTATGTAGATGGAAGATATGAATTAAATTTGAAATTATT----TTTTAACCTCCAAATATTTATCT----AATTCTACTGAGTACAT a score=3596 s mm7.chrY_random 14222428 54 + 30114534 TGCACACGTGTGTGCATGTGCATGTATGTGTGGAAACCCACACACAAATACACA s bosTau2.chr17 11845060 54 - 45915461 TACACATATGTGTACATGTGCATGTGTGCGTGCAAACACACACACATACACACA a score=36737 s mm7.chrY_random 14250789 1238 + 30114534 ATTTCTGAGTCTCTTTGGATCAGTTTTCTGGGTTGCACTTTGTGTAACAAGTCCACATTCCTTTTTCCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATACC-------AGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCCTTC--TTCCTAAAAATCCATCTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAAGCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCAT-GTCACACGTACTAAT----TTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCA--ACACAGGAAAACAA-ACATTTT---TTTTTCAATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGTAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTACACGGTAGGATTGGCTAGATCTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGTACCTATTAAGAAGCCATTTTCATCACCT----GATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAACGTAGAGGACCGGATCATTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTTTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAATATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCATAGACACTGTCAATTCCGTCGTACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGCCCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGATA----TCATGCTCAGACTCTTCAG---AGGTGTTGTCTTCTAC s bosTau2.chrX 20326653 1282 - 48857030 ATTTGTGTCCCTCTTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCT-------CAACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATAC---GTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTAT---GAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTC-TCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCTTTTTCTTCCTCATACT-TGCAGACAAGGTGTGGTCATCAAC a score=4084 s mm7.chrY_random 14362179 73 + 30114534 TGCACATGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCAGACACACACACACAA----ATACACACAAGCTTATACACATAATC s bosTau2.chr14 47301233 77 + 50711261 TGCACATGTGTGTACATGTGCATGCCTGCATGCACACACACACACAAATTTATATACAAAAGCATACAAACATTATC a score=9559 s mm7.chrY_random 14390880 409 + 30114534 AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTCACAGGTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCAGCCATCATTCTGAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCACCCCACACACACATACACACATTTCTACTTGATTA--ACCATATTGGCATTCCTTATTTTTATGGAAACATATCCCCTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGGAAAATGTTGATGTACAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAAAACAGAAGTCAACAGGATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAGATTTCCCATCGATTTAGTAAAATA-------TTATAAATATGATTTTAAAAGAAGGCAACACGCTGAAA--AAGTCTT--ATTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC----------------------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=12516 s mm7.chrY_random 14396700 599 + 30114534 TCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTTCCTCAGACTTCATACC-------AGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCCTTC--TTCCTAAAAATCCATCTTTTCCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACGACAGTAGCTAAGTCCTGT-CCATTCTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTGCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCTTGTCCTGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA---TTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCA--ACAAAGGAAAACAA-ACATTTT---TTTTTCAATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTTTCAAT--TTAAGTGATATTTGACACCAGAATATAGACATAGATATGTAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGAGCTTTGTAAACAACTTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTTGTGTACTGCAC s bosTau2.chrX 20326712 635 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGA---CTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTAC a score=3597 s mm7.chrY_random 14594443 242 + 30114534 TAGTAAGCTATATGTTTAG--------AAATAAGTTAGGTACG--TGCACACGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCGGACACACACACACAAATACACA---------CAAGCTTATA----CACATAATCCTGGAT---ATATGGTATATATAAGTCATGATTTTTTTTTCTTTTCAGGAAATGAGCAACAAAACTGAATATTTTAAACATATTCTAATTTATTAATAGTTTATTCTTC-----TTTCTCTTACAAATTCTACGGTGCAGAT s bosTau2.chr20 30947635 262 + 42952723 tggtaggctat-cgtttatggggccacaaataa-tcagacatgactgaGCACGTGTGTGCATGTGTGGATGTGCGTGTACACACACACGCAGATACACATTTAAAATGCTGCTTCATACTGTCATATAATACTCAATGAAGTGTAGTAC-TACATTTTATATATTTACTCTTCTTCCAGGGATATATTATGTAGATGGAAGATATGAATTAAATTTGAAATTATT----TTTTAACCTCCAAATATTTATCT----AATTCTACTGAGTACAT a score=3596 s mm7.chrY_random 14653368 54 + 30114534 TGCACACGTGTGTGCATGTGCATGTATGTGTGGAAACCCACACACAAATACACA s bosTau2.chr17 11845060 54 - 45915461 TACACATATGTGTACATGTGCATGTGTGCGTGCAAACACACACACATACACACA a score=36737 s mm7.chrY_random 14681710 1238 + 30114534 ATTTCTGAGTCTCTTTGGATCAGTTTTCTGGGTTGCACTTTGTGTAACAAGTCCACATTCCTTTTTCCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATACC-------AGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCCTTC--TTCCTAAAAATCCATCTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAAGCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCAT-GTCACACGTACTAAT----TTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCA--ACACAGGAAAACAA-ACATTTT---TTTTTCAATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGTAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTACACGGTAGGATTGGCTAGATCTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGTACCTATTAAGAAGCCATTTTCATCACCT----GATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAACGTAGAGGACCGGATCATTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTTTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAATATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCATAGACACTGTCAATTCCGTCGTACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGCCCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGATA----TCATGCTCAGACTCTTCAG---AGGTGTTGTCTTCTAC s bosTau2.chrX 20326653 1282 - 48857030 ATTTGTGTCCCTCTTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCT-------CAACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATAC---GTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTAT---GAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTC-TCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCTTTTTCTTCCTCATACT-TGCAGACAAGGTGTGGTCATCAAC a score=9723 s mm7.chrY_random 14821134 407 + 30114534 aaatacctaataaaaatggaaaaaaaaaAGAAAATAAGACTTTTTCAGGGTGTTT-GGCATGttttaaaatcatatttataa-------tattttattaaatCGATGGGAAGTCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAAGAATTAATTGTACATCAACATTTCCCAAGATTTGAATTAAATCATGAATAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTACTGCCAATGTGGTTAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAACTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTTTGAGAAATGTAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTG s bosTau2.chr17 20172810 386 - 45915461 AAATACTTAA---AGATTGAAAAATAAAGG---------CTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATAT-AGCCAGTAATGCCAGTGCGATC-CTCAATTAGCA-----------------GAAAGGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTG a score=11456 s mm7.chrY_random 14926249 511 + 30114534 TACTATGCAAAG---AGAC-CTCAGTTAAATGTGTGTCAGTGACTCCAAA-ACACCTTTCCTTCTCTACCTTCCTTTATATGGCACAGAACGAC---CTGTAAATAATTAAAATATGAAAAC--AACGCTTT-TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGGAGCAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCGGGACGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGAAATGCCAATGTTAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGGGAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172711 539 - 45915461 TATTTTGCCAAGTTCAGACATTCAGCTAAAAGGGCAGAAGAAACTCCAATTGCATTCTTTGTTGACTAGGTTGTTTTGTA--GCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=39086 s mm7.chrY_random 14929806 1288 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTGTGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCATCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCACAGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGATCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTACGGATTGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACACATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATTGGTAACTGGGTGGAGTACACCAGAAAAGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGCCAATCCTTCCGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGGTTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGT---TTTTTTTTTCCTGTGTTGGCTACATAAGGGTCTTTGATAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGCTG-GACGAGATGGCC-------TACAGTGGAAAGAACTTCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-AAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATTCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATTGATGTTTAGTAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAAGTTGGGGAAAGTGGGACATTTAAAATTAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAAAG-----------------------ATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAG--TCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10542 s mm7.chrY_random 14936744 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCGAAGGAACAATACAGTCAATCCTATAGGCTTCTGTTTTGCCCCATTGTGAACAA-AAGTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAAA-TATACTATGAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=34733 s mm7.chrY_random 15069888 1246 + 30114534 CTGATTTTCTTTGA----TTTCTGAGTCGCT-TTGAATCAGTTT--CCTGGATTGCACTTTGTGTAACAAGGCCACATTCCTTTTATCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTC-------AGACTTCAAACCAGAGAT---TCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCTCCTACTTCCTAAACATCCATCTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATTTCTCCAATTCTTTCTCA------CTATGCAGACCACAGAAGCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTATATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTTTTTCCACCATAGTC------CATCTCTACCA--ACAAAGTGTTCACTAAGAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAATACAA--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGGTTGTCAAAGACCCGTAAGTAGCCAACACA-GGAAAACAAACATTTTTTTCATTCCTATAAGTT-TACATTT--CTACTT---TGTGATT-TTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGATGTAGATATGTAGGTCACCATGAAACATGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGAAATTTGTAAACAACCTTTCCAATCTTTTTGGAACGATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGTACCTATTAAGAAGTCACTGTCATCACCTGATCTTGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGATGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGTTGATAGATGTAGAGGACAGTATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAACCAGTCCTTTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCAAGTTTTCCTCAGAGCCATGTTTCCCCTCAAATTTGCATTGTACCTCTATTCCAACCAGGGTGCTGGTGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCCGTGGAGCTCTCTGTCCGTAGACACTCTCAATTCCATCATACTTCACCAAATAAAAAGAAGGGTTTTTTGGCAGTTGACCTAAAATGATGGCCTTCCAATGGGTGAGAGGCGCATTACCTTCGTTCCAACCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATACCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGA----TGCCATGCTCAGACTCTTCAG---AGGTATGGTCTTTTAC s bosTau2.chrX 20326634 1301 - 48857030 CTGAACTTCTTCTAAATGTATTTGTGTCCCTCTTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCT--------CAACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCT--TTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTC-CAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCTTTTTCTTCCTCATACT-TGCAGACAAGGTGTGGTCATCAAC a score=5849 s mm7.chrY_random 15073172 228 + 30114534 TTTGACAGGGTTAAATG------ACATGTATTGAAACCAATGGCAATCAAGAATTATGGATTATTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTTCAAAGTTGTGATGAACTTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAACGGTTTTTAAAATTTACCAGCACTTCTGATTACAAGGAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAG-GATGAAATAGAT s bosTau2.scaffold1094 48464 229 - 285174 TTTTACAGAATCAAATACCTGTCACATGT---GAAGGAAACAGTAATTATGAATTATGGATCATTTGCAAGAAGTGATACCAAATTAGTTTCTGGGCCTGTTTCCAACGTTGGAGTGAATTTATGACAAACTGGATATTGATGAATGGTTTCTAAA--GTCTGTTGAATTTGTCAGCCTTGCCTATGAATGAGGATTTGTTAGGTCAAATA-AATGAAACGGTAATGAAATAGAT a score=15655 s mm7.chrY_random 15079491 376 + 30114534 ATGTGACA---GCATGAAATTTTTAACCTATATTCTCCTACGCTCACATGTGTGGGGTGTGGGCATGCATGGCTTCTGTCTGAGCCTGCAGGACACTTAAATCCACATCAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCATGGCAGAGATGATCCCCAAAGTGTAGTGGGAAGTGTTTGTGAAGGCAGCAGACACCTCAATCTTGGCCAAGGTACACAAAGAGGAAACTGACTGCTATGAACAGGACAAGATGTTTTTGAGGAAGATGTACCTACATGTGGCTAGAGATTGACATACTGGAGGCTATCCTAAAATATCCAGAATCTGGTGTTCTTTTCCCCATCACCCCCAGGATCCCCAATATGCTGTTT----AATGATGAGGA s bosTau2.scaffold2757 13743 377 + 101657 ATGTAACATAAACATGAAGCTGCTCACCCACAATCTGCTGAGCTTGCATGTGTGGGGAGTGAGGCCCTGTGGCTTCCCTCTGCAT-----GGCCACTGAGGTCCATACCAACCCTGTGGAGTTCAACCCCAACTTCATAGCATGTATGATACTCAAAGTGGAGTGGGAAGTGCTTCTGGAGGCTGCCAACAGCCTGCATCTGATCAAGGTGCCCAAAGAGACGATTCAGGGATATAAGCATGACAAGAAATTTCTGAGAAAGAGGCACC-ATATACTGCTGGAGGTGGATATGTTGGAGGGCATCCTGCAATGCCCAGAGTCAGGATGTCTATTCCCCATCAGCCATGGGATCCCCAACATGTTGGTTGCTGAGTGGTGAGGA a score=7515 s mm7.chrY_random 15083472 646 + 30114534 TCCATTTTCTAAAGAAAAGACAGTAGCAGTTTCCTTCCTGATGAAGGTGGCTTTGGTTTAGTTAAATAGATTTATT--------AGATGCAAATCAGAAAATACCATCTAAGTTCATTTCCAGAAGGGTTAAGTGGAATAGAATTTGTGTTCTG-ATTTACCAACT---AAGATACCAATTTA-----------TAACCACAGAACATTTTGACATGAATGGaaaatatttttatatttataaaatGCATAATATTCCATACCAAATTTTCTAT--CAGACTTGCTTTACATG--TAAGATCAAaaataaataaataaataaataaataaataaataaataaataa-ataaataaataaataaactaaaAACTACCA--------------------AAGACTTAA-----------------------AGCATACAATATG----GCAA-----------CAAATTGAAAAA---AAAATGCTTATTTAGAAATG-----GGAAAAGATAAGCAAGCTTTTTTTTTGCAAT---CTTCTTAATAGTATAAGTAAGAGAAACATCAGTTTTCTTCTCAT--GCTCAGAAATTAAGAGGGGGAAAACATCCATGCCACAATCCACTTATATACACACAAAACTTATCAGGATCCTCAGAATTAAAATTATGGATAAGTACACAATGCCTGACTCAAATTCTGTCATAGGAGCTAAAGTCCTGTCACTGCTG---GCTCATCATTCTTAC s bosTau2.chr3 46353077 688 - 85360813 TTTATCTTTTAAACTACAGGGAGTAGC---TTCTTTTCTGAAAAATGTTAAGTAGGTTCAGTTAAAGAAATGTACCTACTATGCATTTTCAAGTCAGAGAATAAATTCAAAATCAATTCCCTACAAAGGTGATTACAACAGATGTTACATTATATAATTGTTTACTTTAAAAATATCTCTTTAGTTTCATTCCATGTCCATTTATCATTTTGAGTTAAATGACAAAAATTTGTGAATTCATA------------TTTTACAGGAAATTCTGCATGACAGACTTGCTTTTCATGCTTAAGTTGGATAAAAATCAATCAAGTAAAAAAATTA-TCACTAAGCAGATAATATGTATAAGGCATTATACTATGTCACACCAGTAACATTTTGCCCAACAGAAAGATTAAACTGAGTGTTATAATTTAGAGGTTAGCACTTAATCTGCTGTGTAGATTTCACCTTCCAAATTGAAATATTTAAGACCCTCATTTAGAAAGGTGAGAGAAAAAGATAAATA-TTTCCTTCTATGTGATGAAATGTTTACCAAAACTAGGAGTATAGATATCACTTTTCCTCATATATGTTTAAAATTCAAGGAGGGGGGGA------------AAGCTACATATAAAAACA-------------------------------TACAGATGAACAGTGAATGTATGACCCAATTTCTGTCATAAAAGGTAAAGTCCAGTCTCTGTTGCTAGTTCATTATTCTCAC a score=4337 s mm7.chrY_random 15084416 105 + 30114534 CAAGAAGTACTGAGCACCTAACAA-ATTGTCCTTTAGTTCCTCATTTAGTC-ACAGTAGCATCTACAAACCATTGCTAAGTTCAGAGGCTCAGAATCTGCACAGCAA s bosTau2.chr3 46354216 105 - 85360813 CAAAATGTAAACATCACC--ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAA a score=11473 s mm7.chrY_random 15087824 811 + 30114534 TTCCTTGAAAATAGTCAATGTCACAGGAAAAAATCGGGGT---GACAACTACAATGGTAACACT-----CAAGGAAGACACAGTG--TTCTCATGCTATTC----ATAAATTTACCCAATTTTTTTGTTTTGGTCTTCTATGGCGATCAGAATTATAGCCACTGAATCTATACCATGGATATTAATTCTTTCTGA------CTTAAAGGGTCCTAATAGCATTTTA---TATCTCTTCTGAGAAATAGT-GAAGAATGA--------AATCATA----------GTTTGTGTTACCAGA-----------CACGAAAGCATAGGG--TCTGAGAAAAAACATAACTATGGAC--------TCAGATGTCAAACAAATACTCAATTTTTTTATTCCTTAAGTAACAAACAAAAATTGTGTGGTTAAAATTGAAAATGGAAGGCAGAGGGAAACAG--------TGTAGACTTTCTATCATATCTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTTCCAAAT----------------TTTCTAGACTTTTAACGTTCATTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTCCCTTAGCCTGGGAATTCTG---------------TCT----GAGTTTC---------------------------------------------------CTGATTATGTATGCTATGGTGTCTGAGAAGGCTCTTTCGTCTGTTAAATGTTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAACGTGGGTCAGCTGGTGTTCAATGAGGTAACATATCTGAAGTAAGAGTCTCCCAAATTCA--ATAATTAAAGGGCTTCTCTCCTGCATGAAATCTTTGACGTTTAACTTAGTTTATATTACAACTAAAGGTTTATTGGTACCAACAACATTGATATAGTTTTATTTTTTGGTGAGTCAGATAATGCATTTTAAAATCTGAA s bosTau2.scaffold5600 50535 969 - 52585 TTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGG-ATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATTTATAAAGAATTTTCCAGGTATTGC-TGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTTTAGATT---CCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGTTTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAAGGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAA a score=2310 s mm7.chrY_random 15108185 109 + 30114534 TTTTCAGGAAGTCTCATTTTAG----------TTTTTCCTGGCTCCTAAGACTC------------CAAGTGTTCTCTGGTACATTCGTCCTTACTGATCTCCAGGCAACTAGACTTGGCAGGATCAGAGT s bosTau2.scaffold30214 495 131 + 1670 TTTTCAGGCAGCCTGAATGTGGCCTTGTCTGCTTTTCTCTGCTGCCCATGATCCTGCCTTACACAGCAGATGCTCTGAGGCACATTAGCCCAGGGTGTTCCCTAGGCAACTAGGATTGGCGCTGTGGGATT a score=8489 s mm7.chrY_random 15108294 388 + 30114534 GGAAACTGGATATTTTATGGCCAGTTCACTGGTACACTTGCCTA------GTCATCTCAGTTTCTCCACCTAAATTTAT-TACTGATAATTTCTTTAGCATGCAGCCTATCCAATGATTCACAGGCAGGCCCTACAACAACTTTGGCT-------------CCAGTACTATATTTAAATTCATTCTCTTTTTCAGGACATGTTAACATTTGAAAATACAGAAATGCATTTCTCTGAGGAAGAATGGGCTATACTGAACCCTTCCCAGAAGACACACTACAGTGTTGTAATTCTGGGCAACTACAAGCTAACTACATATCTAGGTAAA-TGTAACTCCTTTCCTTTATGTACACATTGTGTAATCTGGACTGT-----GCTCATGAAAAATACACCC-TGGAAGAAATTCCCTGTT s bosTau2.chr25 343523 402 + 41414979 GGGAACTGAGTACCTCCTGGGCTGTTTGCTGATCC-CTTGCCTACTTTCTGCCATCT----TGCTTTAAAATAATTCATGTGCTATTAGTTCCTTTAGTGACTGGCTTACCTTGTAGTTCATGG------CTTAGAAGA--TTGGGCTGCTTCTGTAGTGGCAAGTACTGAGCTGAAGCCCATTCTCTTCTTTAGAGCTTGTTGACATTTGAAGAAGTGGCCATGTATTTTTCCCAGGAAGAATGGGAGTTACTGGATCCCACTCAGAAGGCCCTCTACAATGACGTAATGCAAGAAAACTATGAGAGTGTCATCTTTCTAGGTAAAGTTTCTCCCCTTCACTTTGCCTAGGAGTGGACTAAACTGTCCTGTTGTTGGCATACTGAGGATGCACCCTTGTGAGAGAGTCTCTGTT a score=9892 s mm7.chrY_random 15110463 400 + 30114534 TGCAGTTCAGATTTTAAAATGCATTATCTGACTCACCAAGACATAAAACTACATCAGTGTTCTTGGTGCCAGAAAACCTTTAAT------ACAAACTTAGTTAAAAaccaaagatttcatacaggagagaagccctttaactgtattgaatttgGGAGACTATTACTTCAGAAATGTCACCTCATTAAAAACCAGCTGACCCACATTTCTGATCATCCCAATACATGTA--ACTTGTGTGAGAAATGTTTAACAGGCTATGGAGCATTCTCTCAGACACCAGAACATACA-TAGTCAGGAAAC--TCAGGCAG-ATTCCCAGGCTAAGGACATTTATCA--TAATACAGGGACAGAATGTAAAGAAGGATAAAAGTCTAGAAAATTTGGAAAAGTTATATTTCTTATCATAAAA s bosTau2.chr25 346573 405 + 41414979 TGGAGCTCTGATCTTAATAAGCACTTAACAACACACCAAGGAATAAAACCATATAAATGCTCATGGTGTGGGAAAGGCTTCAGTCAAAAGACAAATCTCCACACACACCAAAGAACTCACACTGGAGAGAAGCCCTTTACTTGTCATGAATGTGGGAAAAAATTCAATCAAAATTGCCACCTTATTAAACATCGGAGAACTCACACAGGTGAGCAGCCTTACACCTGTACCACGTGCAGGAGGAAC-TTCAGCAGACGCTCAAGCCT--TCTTAGACACCAGAAACTCCACCAGTAAAGGGACGTTTGTTCAGTGTCCTCAGTCTAAAGAAATTTATCAAGTGGAACTTGACTTTAAAGTTAAGAAAAATACAAAATTATGAAGCATGAAGA------ATTTTTCATCAGGAAA a score=7576 s mm7.chrY_random 15110945 246 + 30114534 GCCTCGAGGAGGCTATTGGGGTCCAGATTAGGGGTCCTGGGCTGGGAGGTACCCATCCCTGGTAATATCCTTAAGCCTTCGGCCTGTGCTCCCTTTTCAGCATCCACGATGTTGCTTTGCCTCCTTTGTCTTTTCATTAGTTATCATGGGGCGCAAGTTCAATCCTACAAAGAAG-AGAAGCTTGGACCTGGCTGAAAGGCCCGAAAACAGAAGGGTGTGGAGACTGAACTGGTC-AGTTTTTGCCTG s bosTau2.chr5 60610230 230 + 76426644 GCCTCGAGG-GGCTAGGGGGCTGCTGAGTCGAGGTTCTGATGGAGCCAGTGCCCTTTCCTGATC----------GTCTGCGATCTGCCTTTCTCTTTCAGCACGT------TTACCATCTCCCGTTTTTGTGTTCCCCAGG-ACCATGGGGCGCAAATTGGACCCTACGAAGAAGGAGAAGCGCGGGCCGGGCCGAAAGGCCCGGAAACAGAAAGGTGCAGAGACCGAACTCGCCAAATTCTTGCCTG a score=3163 s mm7.chrY_random 15111191 48 + 30114534 CAGCTGGCTATGAGAATTCCAAGAGGCTGTCAAGTCATGCTTGAAAGC s bosTau2.chr5 60611868 48 + 76426644 CAGGTGGTGATGAAAATTCTAAAAGGCTGTCAAGTCGTGCTCGAAAGA a score=4779 s mm7.chrY_random 15111239 91 + 30114534 GGGCAGATAAGAAGAGGGGAAGGTCTGTTGATGTCCCTAAGCCAAATATGTCTCCTGGGATCAAAACATTGCCTGGAGAGTTATCCAAAGG s bosTau2.chr5 60612092 91 + 76426644 GGGCAGCCAAGAGAAGGTTGGGCTCTGCTGAAGCCCCTGAGACGAATAAGTCCCCTGGGGCCAAACCGTTGCCTGGAAAGCTACCAAAAGG a score=7730 s mm7.chrY_random 15111333 159 + 30114534 AGGCAAGAAGCACCTAGCACCAATTCAAAGCATTGATGGGGGAAAG----------------ATGATGAAATGACCCAGAGGGACCTTTGGAGTTCTGAGGACAGTGATGAAGATATGGTGGATGCCTATGGAGCTGCCTCTAACTCGGAGGATGA----------GAAGGTAAAGTGGTTGGCT s bosTau2.chr5 60612425 185 + 76426644 AGGCAAGAAGCGCCCAGCACCAACCCATAGCAGTGCAGAGGAGGAGGAAGACTCTGAAGGGGACGGTGTGGTGAACCAGGAGGACCTCTGGGGCTCCGAGGACAGTGATGCCGGTATGATAGATGACTATGGAGCTGGCTCCAACTCAGAGGATGAAGATGAGGATGACGGTGAAGAGGTGAGCT a score=2514 s mm7.chrY_random 15111492 35 + 30114534 ATTGAAAGAGCTGCCCTGGAGCAGAAAGCCCAGGA s bosTau2.chr5 60613532 35 + 76426644 ATTGAAAGGGCTGCTCGAAAGCAGAAGGCCCAGGA a score=11041 s mm7.chrY_random 15111542 343 + 30114534 CCAGTGGAGtgaagaggacaatgatgaagataatgatggtgatgatgttgTGTTCCCTGAGTCCTAAACCAGAAAGGATGTCAAATCAGAGAGAGATTTCCAGATTAATGTGGAAGATGAGGAAGCCTTTGTGCTGCCTCCTGCTGGGGAAATGGACCAGGAT-------------------------------------------GGT-----------------------------------------------------------------------CAGGCTCCACACTTGAAGCAAGTTCACAAGCGGAAAC---------TGAAAGTGCTGCGTTATTTTGGAGATCAGCAAGAAGAGGGCTGGTCTCTAGCTGAGTATCTGAGTCGGTTTCAGAAGTACCTGGCCAGTTAT---------GGAGACTTCCTGTTGAGCAAGCTCATGGACCTGTTCCCTCTATCTGAG s bosTau2.chr5 60613705 472 + 76426644 CCAGTGGAGCGAGGCAGAGACTGATGAAGAGGAGGAAGAGGAGCAGGT---GTCTGCAGAGTCGGGCCCCAGAGAGGACGAGGAGTCTGAAGGGGGCCTGCAGATCAATGTGGACGAGGAGGAGCCTTTTCTGCTGCCCCCTGCTGGGGAGGTGGAGCAGGATATCCTTCCAGAGCAGGGTGTGGGGGGATGTGTTTGTGAGAAGGGGTTTCCAGGCCTGCCATCCCCCCTCCCCATTACAATCACACCGGGAAACAGTTCCTTAACGGGCCCACATACCCAGGCTCCAGACTTGCAGCGTGTTCACAAACGCATCCAGGATATAGTGGGTGTGCTGCGTGACTTCGGGACTCAGCGGGAGGAGGGTCGGTCTCGCTCGGAATACCTGCAGCGGCTTCGAAAGGACCTGGCCACTTACTACTCGTACGGCGACTTCCTGCTGGGCAAGCTCATGGACCTCTTCCCTCTGTCCGAG a score=5147 s mm7.chrY_random 15111885 89 + 30114534 TTGATCTAGTTCTTAGAAGCTAATGAGTTGCCCAGGCCAATCACCCTTAGTACCAACACTTTGGAAACTCATCGCTGAGACCTTGCTCA s bosTau2.chr5 60614323 89 + 76426644 CTGGTGGAGTTCCTGGAAGCCAACGAGGTGCCTCGGCCCATCACCCTCAGAACCAACACCTTGAAGACCCGGCGCCGGGACCTTGCTCA a score=8175 s mm7.chrY_random 15111974 224 + 30114534 GTCT-------------CTGATCAATCGTGGGATTAATTTGGATCAACTGAGTAAGTTGGCAAAAACTGGA-TTGTATTTTATGATTCTTCAGTGCCC-------------------------------------------------------------------------------------------CGAGTACCTTGTTGGACACTATATGCTGCAGGGTACGTCCAGTATGCTGCCTGTCATGGCCCTGGCACCTCAGGAGCATGAGCAGACCTTAGATATGTGCTGTGCTCCCGGCAGGGGCAGGGGGTGGGGGGCAGCTACAT s bosTau2.chr5 60615140 318 + 76426644 GTCTTAACCTCTAGGCACTCATCAATCGTGGAGTTAATCTGGACCCCCTGGGCAAGTGGTCCAAGACAGGACTTGTGGTGTATGACTCTTCGGTGCCCATTGGTGAGTGCGCCCCCGCCCCAGAGCCCTTCCACCCCTGCCCTCGTCCCAGCGCGTCACCTGCAGGCTGTCCTCCACAGGGGCCACGCCTGAGTACCTGGCCGGGCACTATATGCTGCAGGGGGCCTCCAGCATGTTGCCTGTCATGGCCTTGGCACCCCAGGAACACGAGCGGATCCTGGACATGTGCTGTGCCCCT-----------GGAGGAAAGACCAGCTACAT a score=8838 s mm7.chrY_random 15112198 140 + 30114534 AGCTCAGGTTACAAAGAACACAGGTGTGATCCTTGCCAACTTTGCCAATGCAGACTGCTTTAAGAGAGTGGTGGGCAACCTGCATCGCTTGGGAGTCACCAACACCATCATTAGCCACTATGATAGACACCAGTTCCCTA s bosTau2.chr5 60615942 140 + 76426644 AGCCCAGCTCATGAAGAACACAGGGGTGATCCTCGCCAACGACGCCAATGCCGAGCGGCTCAAGAGCGTGGTGGGCAACCTGCACCGGCTGGGGGTCACCAATGCCATCATCAGCCACTACGACGGGCGCCAGTTCCCCA a score=6120 s mm7.chrY_random 15112338 95 + 30114534 AGGTGGTAGGGGGCTTTGATCGAGGGCTACTGGATGCTCCTTTTAGTGGCACAGGAGTCATCCCCAAAGTCCCTACTGTGAAGACGAACAAGGAG s bosTau2.chr5 60616207 95 + 76426644 AGGTGGTGGGCGGCTTTGACCGAGTCCTGCTGGACGCTCCCTGCAGTGGCACCGGGGTCATCTCCAAGGACCCTGCCGTGAAGACAAACAAGGTG a score=15310 s mm7.chrY_random 15112433 339 + 30114534 GAGAAGGACATCTAGCGCTGTGCCCAACTTCAGAAGGAACTGCTGC---------TTAACTCAGTGATCTCTATCTCTAAGACCAGAGGCTACCTGGTCTTCTGCACCTGTTCTATTACAGT-----------------GGAAGAGA-----------------------------------------------------------------------------------AAGAACTAGAGGGTGGTAGACTATGCCTTGAAGAAGAGGAATGTGCTACTGGTACCCATCGCCCTGTACTTCTGCCAGGAAGGTATTACCTGTTTTCAAGCAAGGTGTTTTCACCCCACTCTGCGTTCCACCCCATGCTTCTACTCTCACTTTCAC-ATAAGGATGGCTTCTTTATCTACAGGTTCAAGAAATTTTCCAGTTCTAGTCCCCAGCCCCAT s bosTau2.chr5 60616435 449 + 76426644 GAGAAGGACATCCTACGCTGTGCCCACCTGCAAAAGGAGCTGCTCCTGAGTGCTATTGACTCTGTCAACGCCACCTCCAAGACAGGGGGCTACCTTGTCTACTGCACCTGCTCCATCATGGTGAGGCCTGTTGGGGTGCGGGAGGGAGCTAGCCTGGGGCTGCCATGCCCTCAGCACCCCTTCAACTCCAGCTCTGCTTTCCTTCCGTCTCCCCCACACGTCAGGTGGAGGAGAACGAGTGGGTGGTGGACTATGCCCTGAAAAAGAGAAACGTGCGCCTGGTGCCCACCGGCCTGGACTTCGGCCAGGAGGGCTTCACCCGCTTCCGGGAAAGGCGCTTCCACCCCACGCTGCGCTCCACCCGCCGCTTCTACCCTCACACCCACAACATGGATGGCTTCTTTATTGCCAAGTTCAAGAAATTCTCCAATTCTATCCCCCAGTCCCAA a score=17715 s mm7.chrY_random 15112772 837 + 30114534 GCAGGAAATTCGGCAGCAGCTACTCCTACAGA---------GCCTGACCTGAAGGATCAGGTCACATCAAAGTCTGAGAACGGTAGTTACCCCACTAAGAAAGCCCATGGGACTCTGAAGGAAAAGCAGCAGTTGCTGAGACAGCCACATTCCAAGAAGCC---CTTCCAGAAGTTGAACAACATTGCCAAAGGGCC------AGGAATGTCCACTGAATCTGTTGTCCCAGATGCCCAAGTGTCCACC-----------CCTCAGTGAGTCTGCTGGGAAAGCCGAATTGAGCAGGAAAGGAAAGAGGGCCGAGAAGCTGAAGCAGCGGGGACCTAAGTAGAAGCTCTACAAAGAGCCTCCTGTTCCAAAGCAGAGCATCCCTCCCAGTAGTGAGGACTTCAGAACACCTGCTGTGCTGATTCCCTCTGAAATTCTTGACACCCTAAGGCCTAATGACTGTGCTCCTTCCCTTGGGAAAGAaaaaataataataaaaacaaacaaaaaaaaaacaacaaaacaaaacaaacaaacaaacaaacaaaccccaaaaaacaaaaaaccaaaacaaaaacaaaaacagaaaGGAAAGCAGCAGTTCATACAGCAACCTGCCAACTCAGCTGCTTTCCTGAAAGAAGATGCTGTCCACAAGGGGCGCCCAGCCCCCTTTCTGTCTCCCCACAGTTCCACCAGGCACCCATCAGCATAAAGGAGGAAATCATTGTCAAAGGGCAGTGGCCAGCCTCTGTTGTCTTAAGTGGACCTCGAAACTC-ATTGGCATTTCT-CTTGGTTGTACCTTTTTATCCTGATGCAAGGCTGGCTTAACCCTGTGCATACATATGAAATTTAACATACATATTT s bosTau2.chr5 60617998 761 + 76426644 GCAGGAAATTCTGCGACATCCACCCCCACAAACCCAGACTTGCCCAACGTGAATGGGCAGGTGACCCCCAAGTCTGAGAGTGGCAGCCCATCTACCAAGAAGGCTGGT---------CAGGCAAAGCAACGGCTGCAGAAACAGCAGCATCCCAAGAAGTCTTCCTTCCAGAAGCAGAATGGCATCTCCAAAGGGACGGACACAGAATTGTCTACTGTGTCTGCTGTCACAAAGGCCCAGGCGTCCTCCAAGCTCCAGGACAGTAGTCAGCCGCCCGAAACAGCAGCAGTGGTCAGGGAACCGAAGGAGGCTGGGAAGCTAAAGCAACATTCACCCAAACTGCAGTCCTCCAGGAAAGCTGCCTTCCGGAAGCAGCATGCTCCTCCCAAGGCCATGGACACAGACTTGCCCGCAGCACCATCCCTCTCCAAGACCCAGGCCACACCCAAGCCTGAGGACCGTGACCAGCCCTTTGGAAA--------------------------------------------------------------------------------------CACCACAGGGGCTGA----GAAGGTTAAGCAGCAGGTGGCAGAGCAACCTTTCAAGAAAGCTGCCTTCCAGAAACAGAATGGTACCCCCAAGGGACCTAAGACTCCCACCATGTCCTCCTGCAGTTCCAGCCAGCCCCCGCCAGCAAAGAGGAGAAAATCTCAGTCCAGAGGCGGCCGCCAGCCTGCGCTGACTTCAGTGGATGGTTGAACTAGACTGCCATTGTTACAGGGTTGGAACTCTTTCCTC---TGTGAGGATGGCTT---CCCAACCATGGATGTGAAATTTA--ATACATGTTT a score=4557 s mm7.chrY_random 15114771 87 + 30114534 TTACTATGCAGATTCTGAGCTGCTGAACTTGGTAATGGTTTACAGATGCTGTTGTGAGGTAGAGGAGGAACTAAAGGAAAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006492 87 + 85360813 TTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=4717 s mm7.chrY_random 15115115 277 + 30114534 taataatTCAGTGAGACTGATGAGC---CATCAGTGACAGGACTTTAGCTTCAACGACAGAATTTGAGTCAGGCATTGTATATTTATCCATAATTTTAATTACGAGGATCTTGATTAGTTTTATGTATAAATAAGTGGATTATTTCATGGATGTTTGCCCCCTCTTAATATCTGAGC--ATGTGAAGAAAACTGATGTTT---CTCTTAATTATAATATTAAGCAGATTACATAA--------ATTTTTGTTTATCATTTACCATTTCAAAATAAGTGTTT----AATTTCAATTTG s bosTau2.chr3 39007038 253 + 85360813 TAATAGCCGAGTGAGAATAATGAACTAGCAACAGAGACTGGACTTTACCTTTTATGACAGAAATTGGGTCATACATTCACTGTTCATCTGTA-----------------------TGTTTTTATATGTA--------------------GCTTTCCCCCCCTCCTTGAATTTTAAACATATATGAGGAAAAGTGATATCTATACTCCTAGTTTTGGTAAACATTTCATCACATAGAAGGAAATATTTATCTTTTTCTCTCACC-TTTCTAAATGAGGGTCTTAAATATTTCAATTTG a score=11680 s mm7.chrY_random 15125701 330 + 30114534 TGGTGGTTAGCA-AGGCTAACTCTCTGTCTCCTCATCATTCAAACGCATACTGGGGATCCTGTGGCCGATGGGGAAAAGACAACCAGATTCTGGGCATTGCA-----TCCAGAACATCAATCTCAAGCCACACGTGGAGACATCTTCTTCAAAAAAAATCTCGTCCTGTTCTTAGTCATCAATTGTCTCTTTAAATACCTCCGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTGTCTGCTCAAGCACTGCCCACTTCAAGTGGGG-ATCATCAATTTCAGGAAATCAGAGTTGAAATCCACAGGGTTGTTGCAGATCTTGATGGCTTGTAGGCACAGTTGGAAGACA s bosTau2.scaffold6942 24684 334 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATA-TGGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCCCAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGGTG-CATCTTTCTCAGAAATT-CCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCA a score=1712 s mm7.chrY_random 15126031 65 + 30114534 GGCATATTCACGTTCCAGACATTTGAGCT-AGGATATTAAAGGTGAGCAGTTTCATGT---TGTCACAT s bosTau2.scaffold2757 87845 69 - 101657 CAGGGCCTCACTCCCCACACATGCAAGCTCAGCAGATTGTGGGTGAGCAGCTTCATGTTTATGTTACAT a score=5401 s mm7.chrY_random 15150027 523 + 30114534 tgggtagcctatctgatt------gtctccttcat-----aaagagagacaat----cacttaaaG-------TGATCATTAATAAAGACAA-CTAGAAGCACCTGCTGCAAAGAAACACTGTATATTGTAACAGAGTAATG--------------CCAGGGCAGATCCTTT-----CTCTCCGGTGTGTATACACCTAGGTGAGCACAGGGACCACCACACAGGGACCATCCT-TCACTGTACTGATTTTAAGAGAATCCTTAAAAAAAGTCT-TCATAAAATACTTAA-GAAGTG--GGATACACTGCAGCAAAGTGAAATACTCAATACTTATGTAACTGCA---------GAGCATAAATCTCAGAAAATAAGACAGTGAGGGATCAGTACAGAGACTTTTTGGGGGATATGGGTTCACAAATGAAA-----CTTTATTTACAAGATCTGT-ACATTTTCTTTGAGAACAGGAAGAATTTTATACATCTTTCTTTACAGATTTCTCACTTACTAAAT----AGTCAATAAATATTTGCCTATATGGTCAAAATTTTTCATTTCAATAAATTCAT-TGGTATCACAG s bosTau2.scaffold1796 48057 575 - 178708 tgggcaacctatttgacttttctggctttcctcatttgtaaaagagaaatgatgatactctcacaggcaattgtaagaattaagtgaaacaatctagaagtactcagtaccatggtacactgta----agaactcagtaactggGATAACCGGCACCCACGGACGATCATCTGCACATTCCTATGCATGTGTGCCTCTATGTAAACACATTGG--ATGGTGTAGAAATGGCTTTGTCTTATTACTGACTTTAAAACAGGGTCTAAGGAAGATCCACCACAAAATACTCAAAGCAGTATTAAATATTCTACAACAAACCAACACATTAAATGGCTAAATAATGGTCAGACAGTATGAGTACAAAGTTCGAGAAACTATGCAAAATAGTCCTGGCATAGAGTATTTTGCTGGGCT-----CTCAAAAATGAAATCAAACTTTTATCACGGTATCTTTTATAAACCTTTTGAAGGCAGGAACTATTTTATACATCTCTGTACCC----CTCTTAGTCTCTAGACCCTAGGTTTTCAAGTATTTGATGATATGACTATAAATTTTCATCTCAGTTAAGTCGTCTGATTTCACGG a score=4971 s mm7.chrY_random 15151220 132 + 30114534 ATGTTGGCATGTGCCTCTTGCAGAGTAAAATAATA----TTTGTAAGTTAAAATTCCAAATATTATAAAAA---GTCTTTTGGCAGTAGTATGTTCTCAGTAAAGTTTAGATAAAAATACAGAATTTAGAGGTAGctac s bosTau2.scaffold1796 49230 135 - 178708 ATTTTGGCATCTACTACTGCCACAATATGGATGTACGTTTTTTAAAGTTAAAATAACAAATA----AAAAATATGGCATCTGGCAGTAGTATATCCTCAGTATCGTTTATACAAAAACACAAAATTTAGAGGTAGCTGC a score=25132 s mm7.chrY_random 15152424 906 + 30114534 CATGTCACACACTTCATGGAAATATATTGGTGGCCTTTGAGGGTATTAATAAATGTTTTCAATCAGT-------TGTGAATCTCT--ATGTAGTACACGTTAAATGTTTTCAACTATGTGAAATCAGCAGGAGATTTTGCAACATTAATAATTAGTTCCAGTTCAAAGCAGTATTCCTCCAATTAA--GCCTATGTTCAATACCTAATGGAGTTTTCCTGTGGAACAAGAGAGTCTTTGAAATCACAGAAGCT---TAGAAGTAATGATTGAAATTTTGTCACTCGTATTTAGCGAAACAGAAATTTTCAGTGACTCAAGCTTTAAAAGCTTTATTTAAATCCTTCAACACAATTCTTACCCCAAGCATCTAAATTTATATTGTGCTTACAACTTAATAAACCCATTGACTAGGCTGTTGTAAAATGTCAAGTAGCTGTAGGA--CCTTTAGGAAAAAGCAAGTATAGTTCCATTAACTGAGATACCTTAAGAAC----TCAACACAGTGAAT------------CTCACAGTAGCTACAAACACAGTGTGATTTTCGGAAGTCTGGCAGCTTTGATTCTC-AGGTACTCATCTGTGAATTGAAAATGCTGGGTACACTAAT-GTTCAAATTCATTTCTATGCATATCATTGATTAACTCTGTAATTCAATGTTTC--ATTGTAGGGTGCTGCCTTTAATACATAGAAATAATT-GATTCCCATTCAATTTTTAACTTGA------GATGATAAAGCAAGACATAAAAACTATAAACA------ATAGGTGATTTAATGAACAATTAATAGTAATGTATTCTTCTCATTATCAGTCTGATCAAATTGTGAAATGCT-ATTACTGTCTCCTTAAGCTACAACATGTGGCACATTCCACTATCTACCTCCTGTCTCTTTTTCTTTTTCCAAGAAACTACTATATTCATTTCTTAAATA s bosTau2.scaffold3323 69518 932 + 85139 cATGTTCCGTACTTGACTGAAATATATTGGTGGCCTTTGAGGGTAATAATAAACATTAGCAATCAACAAAAATATCCCAATCTCTTTATGTAGTGAATAGTAAA-GTTTTTAACTGTGCATAATCAGCATGACATTTTGCAACTTTAATAATTAGCTCAAGTTCAAAGCAATATTCCTCCAAATTGTTGTCTGTCTTCAACTCCTAGTTGAGTTTTCCTGTGGAAGAAGATAGTCTTTGAAGTCACTGAAGCTCTGCAAGAATGATGATGAAAATTTAGTCATTTATATTTAACAAAACAGATATTTCGAGTGCCACTATCTTTGCAAGCTTTATTGAAATCCTTAGATGTCTTCTTTTTCCCAAGT-TCTAAATGAACAATATGCTACCAACTTAACTAAGCAATAGTGTATGCTTTCATGAATTGTCAAATAGCTGAAGTACTCTTTTAGTGGA----AAATATTTTTCTTTTGCCTGTGCTAGCTAAAGAGTGTGGTATACATAGTAAACAtagtcccagggctgggagtaact-----cactgtgtgactttaggaaagctgccttctcaggttctctgggtacccatttgtgaaatgaacaggttggacaagtcaatcacttcaattcttttcagtac-taatattctatgactatattgttcAGTGTTTCAGATGATAGGTGGCCATC---------AAGTAATAATGAGAATCTCTCTCAATTAAAAATTTCATGGTTTGATCACAAAATAAAAAACAAGAGCACCacacaaaacagatatatagtttaatgagttattgtaagtggagcaggtgtgtacccaccatctggttcaagaaataaaacactgacaacctcccccatgaacattttcgtgtgttgcatctcaatatcagtttcatctttc---ttcctcttcaaaataaccactatcttcacttttaaaata a score=3275 s mm7.chrY_random 15154111 439 + 30114534 TTCAGAGGAAAGATATTGACTGTATAA-ATTCACAGCTATTTTCAAG---------GTTTGTGTTTGGAGGA--AATGAGATGAAAAT--------CCCCCACCCAAATTCCTGTAATATTAAATAACTATCTGGCTGTCATCTGTTCACCTTC-CCTTTTTTAACAAAAAAA-TAACACCAATGTTCAAAAACAATTTTTTTTCTGCAGTCAATTCTCATAGAATTGG--TGTCCAGCCTTGTAGAATGGAAGCTCAACTTTATAAAAAATGTGTAAACTTAGTTGGTTAGCATTTCTCTTGGTATGCAGACATGTTTTTTG-----ATGAATGGGTTATTTCCCAGAAACTTTTTTTTTCAATCTACATTTGTAATTTTCTCTGTAAGCCAAAACCAGTTATCATGATTTATTATAGAAAATTATAGTTTGGGTTTATTCCATGTGAAGAAAATGAATTACAAATA s bosTau2.scaffold3323 74706 420 + 85139 TTTAGAGGAAATATGT---CAGGGTAATAGTCACAGTTATTTTTTAAAATAACTTCGTTTACTTTTGGAAGATAGAGAAAATGAGAATATTTACGTTTTTTTCTCTTTTCCCTGTGCTTCTAG----TTCTCTCATTGTCATCTGTTCATTTTCTCCTTTTGTGACAAACAGGTTGGTGTCAAGTTTGAAAATCAG----TTTTCTAGAGCTATTTCTTAAAACACAGATTTTTCATGACTTGGATAGAGGTGGGCTAGTTCAATATCTCATG--------AAATCAATTGGAATTCCTCTGAATATAATAATGCTTTTTTTGGACTCACTAATGCACttt--------attttatttttttaatttat-ttatttattttaattGGAGGCTAA----------------TTactttacaatatcatagt---ggtttttgccaaat-attgaaatgaatcacccata a score=8749 s mm7.chrY_random 15161419 153 + 30114534 ccccgaacgtctcagagccctcacaccagctgctcccatgtgtacatgcgggtgggtca---gcacagtgccctagctttctgccctaagaagcagtAAGCACAGGGGCAGTGGAAGTGGCAGTGAGTACCCTACCTGAACCAGGGCACTTTCTGG s bosTau2.scaffold2787 3816 151 + 100805 CCCCGCGCCTCCTGGAGCCCTCCCCCC-GCTGCTCCCATGCGC----GCGGGTGGGTCATGAGCACAGCGCCCTCGCTTTCTGCCTTAAGAAGCAGTAAGCACAGCGGCGGCGGCGGCGGCAGTGCGGACCCTGCCTGGACCAGCGCGCTCTCTGG a score=30772 s mm7.chrY_random 15166410 910 + 30114534 AAATGCCACAGTTAAAATTTAGGAAACTAAGATATACTTGTGTG---TATTTATAAG-TCAGTGAGCTCatttttaaacaatttttaaaaaatatt-tGGCACCAAGAAATGTTTCTTCTTTCCCACTGATGTCAATTATTAGATTAGTTCTAGATTTTTAAACCCAAATTTGTTCTGGCTGGGTTTGAAATTTTGTTTAAAGTTGCAAGTCTTTATCTTTCCTTGAAGTGATTTGTCACAGAGTTGATGCTTTTGAATACTGTTACAGCTTATATAACTGAATCTCTTATTGTTTTCCCCTGGATCCTGGAAATTTTAAGGTTAGAATATTTTGTCTG---GGGGTGGGGCATTA-CTGACCTCAACCCTTTTCATTTTCAATCTCATCTTTTATCTAAGCCCCATGACAAAAACAAGGTCCCAAGTCTTTAAAGATACAATATTATGTCTTCCTCT------TTTTAGAGAAAATAACATCAACTGAAAATGCCTTCTGTCTGAAATATTTTTTCTTTGAACATGTAGACAGCTAAAACAACTGTTGAATTTCTTTATGCAATAGTTTTATTTCAGTGGCGTGA--TTAGAGTGCCATAGCTTTGCTTAGATCTGGTACATCAGCTTTAAAATATGATTTA-TCTTCGCCATTGTTTA--GATGATACCAATATATTATGTGTGTATCATTCTATAGTGTGAAGTAG-GCTACTATACAAATGTTCTGCGATGTTTTGATATTTCTAGAATAGGATAA----AAACCATCCTCTAAATTTAAGGTTTATGCTATT-AAAATATGATTATGAAC-------------TTCAAAATAATGTCCAAAT-TGAAAGCTAGCGTGACTCTATGTACTAAGTAAGCTAGGATGTTGAAG-CAATAATTTTCCTGGAAGGCATTCTCATTAGAAGAAAGGAAAATATAAGAAAAAA s bosTau2.scaffold3323 79099 934 + 85139 AAATGCCACAATAAAAGCTTGGGGAACTAAATCCGATTAGGGTAGTATATTTAAAGGATAAATGAGCTCATTTTATAAGAATCTA-ATAAAATATCATAGTGGAAAGAAATGTTTCTTCCTCCCCATTGATGTCAATTGTCAGATTAGTTCTAGATTTT-AAACTTAAATTTGTTCTTGCTGGTTTTGAAATTTTGTTTAAAGTTGAGAGTTTTTATCTTTTGTTGACCTATGCTGTCATGGATGGGATGCTTTTGATTTTGCTTCCAGCTTCTATAA-TGGAGCTTTTCTTTTT-------GGAACCTGGTAATTTTAAGATTAGAATTCTTTGTTCGAAAGGAACCAACCATTGGCTGACCTCAACCCTTTTCATTTTTGATCTCAG-GTTCATCTAAACCCCATGATAGCACCAAAGTCCAAAGTTTTTAAAGATACAAATTTCTTTTATTCTCTATTCTCCTTTAGAGAAAATAACGTCAACTAAAAACTCCTTCTGTCTGAAATTCTTCCTCTTTGTGTTTGAGGAAAGTTAAAATGGCTCTTAAATCTCTTTATGCAAAGGTGTTATTTCAGTGTCTTGACCCTCGAGT-CTTCAGCTTCAGTTAGAGCAAGTGCTTTATTGTTAAAAGATGATTCATTCTTCAATACTAATTAATGTGGAAATTTAGTTAAAATATGTGAAATATTCTGTAATTAGAGGTAGAACTTCTAAAACACAATTTCATGATGGTCTATAATTTCTGGAAATGGATAAGAGCAAATCACGTTACAAATACAGGGTTTAAGCTTTTAAAAATAGTATTGTAAACATTTTTTAAAAATATCAAAGAACTTGCTAAATAGGAAAACAGGAATGAATCAGTGTA-TCAGTAATCCACAGGCCTGAAGCCCACAATTCACCTGAA----ATTCTGTCTGGAACAAAAGGAAGTATAAGAGAAAA a score=3819 s mm7.chrY_random 15168813 397 + 30114534 tgattttctgtggtt-tagtggggt--accaTATTTCTTTTGGTACAGTACTTTGCAGCAAGCTGACAAACTTTTCCCT-GGGTGTCAGCTAGCAGATACTCGCTTGCTTGATTTTGTTTTGTTTTCAA----------GTGACTTTAATTGTGGCATAATGTAGGAAATGAATATATAGAATATCTTTTTTTTAAACTTCTGACTATTGTGCAATCGCTGTATACACTATAA----GGTGCTCAAATCCCAGTCCCACCTACTACCAAATTTCTATTCTTCCTAATTT-------------TCCCATATTTAAAGACATTGTCTCCCAATTTACTTACAAGAATATT-----------------GTTCTTTATTGTTGTGAAGATGTATTG------ATCACTATTTGTATATTTTA--TCTTCTTT----------TAATTTATTCTTCTCC---TAGTCTTTT s bosTau2.scaffold3323 83136 435 + 85139 TGCTTTTCTTTAGTTACAGTGGCTTCTACCAAAACTGTTTGGCTA----GCTTTGCACTCCTGTGACAAGGTTCTCCTGAGGGTGTAAGCTAATGA-------------TTTTTTTGCCTTGTAGACAAATTTACCTGTGTGAACTTGACTGTGTCAT-----------TTAAGTTTGAGAATATCTTAACTGCAGTGCTTTCCCAAGTA-GCAATTCTTGTATAAACCTCAGACTGGCTGCTCAAACCTCAATCCTGCCTACAGCTGAAGCTCTACTATTTCTAGTTTTGTTTTTTTTTTCTCCCTAGTTTTGAAATATTTCCACACTATTAAAT--ATAGAATATTTGTGGACCTTTGTGGTAGCTCTCTATGATTGTGGGGGTTTTGTGGCTATTATTACTATTAAAATGTTTTATGTCTTCATTTATTGAGTACTATTTTATTTATTTCCCATTACTCtttt a score=6080 s mm7.chrY_random 15174045 187 + 30114534 AAAACAAACCTAGATATAATACATGGTGATTTCATAACAGCATCTATGTTGTACCTTGAAGTAACAGAATGGTTTGGCTTGGAGAAGATGACATCACCTTTGAAAATATTTGGAATTGATCTGGCATATACAATGATTT-AAAATGAGGT----ACAGTTTTGGAAATTGATTTCTTGTGCATTACGGTACA s bosTau2.scaffold9557 4312 192 + 27512 AAAAAAAGCCTTGATATAGTGCATGGTGATTGGATAATGGCGTCAATACTGTGCTGTGAAGTAGGGAAAGGGTTTTGTTTAGGGTGGAGGGCAATAAATTTAATGATATCCTGAAATTTTGTTCCATGCTGAATTATTTGAAAATTTCGTACAAACAGTTTCTGGAATGGATATCTTGTATATTATGGCACA a score=9787 s mm7.chrY_random 15185877 203 + 30114534 ATGGAATTGGAAACTGAAAACCAAAGAACTATGGAAGAAAGGACTGAGaagagaaaagaaaa-aaaaaagaaaaaaaaaagaaGTGATCTCAGCTTAAACCTGTGCTTGCAGATACTGCTAAACAAGTTGACTTCTGGTGTAGAGATGCAAACCTTCACAAAGACAGGTTTCTGTGGGAGTA-ATTGAAAAATCTAAAGATGGAT s bosTau2.chr6 4969519 202 + 69624268 ACAGAAATGGAAGCTGAAAGT---GGAAATaaagaaaaggcaatggaagaaagcatagaaaagaaaaaagaagaaaaaaagaaaCGGTCTAGAGTTAAACAGGTGCTTGCAGATATTGTGAAGCAAGTGGACTTCTGGTTTGGAGATGCAAATCTCCACAAGGATAGATTTCTTCGAGAGCAGATAGAAAAATCTAGAGATGGAT a score=9214 s mm7.chrY_random 15186080 186 + 30114534 ATGTGGACACATTACTCCTCGTGTCTTTTAACAAAATGAAGAAGCTGACAACTGATGGGAAACTAATAGCCAGAGCACTAAAAAACTCATCTGTTGTAGAG-------------------------------------------------------------------------TTGGACTTAGAAGGGATCAGAATGGGGAGGAAAAAGCCCCTAGTTGACAGACCAAAGGATGAGGAAGAATGCAAGGTATATGTGG s bosTau2.chr6 4969873 259 + 69624268 ATGTTGATATATCACTTCTTGTGTCATTCAACAAAATGAAAAAATTGACCACTGATGGAAAGTTAATAGCCAGAGCACTAAAAAGTTCTGCTGTTGTAGAGGTAAGAATTGTTACATATATTATGTGTCACATGATACTGTTAATTAATACTGACTTTATGTACTGTTTTAAAGCTGGATTTAGAAGGCACCAGAATCAGGAGGAAAAAGCCACTGGGTGAAAGGCCAAAGGATGAGGATGAGCGGACAGTGTATGTGG a score=18535 s mm7.chrY_random 15186266 693 + 30114534 AGTTGCTTCCAAAAAATGTTACTCATAGCTGGATT-----------TGGGAAATGTGGCAATGTAGTTTACATAAGTATTCCA--TTACACGTTTACTTGG-ATCATAAGGGATTTGCCTTTGTGGATTATGAAACAAAAAATCAAGCAGCAACAGCTATTGAG----------------------------------------------------------------------------------TTTCTGAACAACCCAATAGAAGAAGCACCTAGAAAACCTGGTATATTCCTCAAGACAGAGACAAGGAAGCCCATCCCT---------------------TCCTTATCAATAGCT---------------------------------------------------GAAGAGAAGAAAAAG--------GAAAAAAGGCAGAATAAAGAAGGAAGACAGTGTGCAGACCAAAGAGTAGGCTGTGGAAAGCAGCAGCTCAGGCGTGTTTTAAGCCATAAAGAGACTAAAGACTGCCTCTGAGGGTTCCCGAAAGAGAAATCCAGGAAGTTCTAAAGTAACCTGTAAAGAAAAAGAAAAA--GAAGGAAACCT---------------CCTCTCACCAAGGCCAaaacaaacaaacaaa-------caaacaaacaaa--------------aaaaAAGAGCTCAGAAGG---------ATGGTGTCAGCCAAACAACTGCTGAGGTCTCCAAGGAGAGCAGAG-----------------------------------------------------------------------ATGTAGAATTCTA---CTCTACTGAGGAAGAGAAGGAGACAGGAGACAAAAAAGGTGACTCACTCTCAAAGGTCAAGAGGAAGCATAAGAAAAAACGTTAGGAGAGACATAAAATGGGCAAGGAGGTTATACCATTGAGAGTACTGTCCAAG s bosTau2.chr6 4970262 983 + 69624268 AATTACTTCCCAAAAATGTTAACCACAGCTGGATTGAGAGAGTCTTCGGGAAATGTGGCAATGTTGTTTATATAAGTATACCACATTATAAATCTACTGGGGACCCAAAGGGATTTGCCTTCGTGGAATTTGAAACAAAAGAACAAGCTGCAAAAGCTATTGAGGTAGGTCCACAACCTAAAAGAAAGAGAAAGAAAATTACTAAGTGTCTTAAACAGTAACAAAATTTTGCTTATTTCATTTCAGTTTCTTAATAACCCGCCAGAGGAAGCACCAAGAAAACCTGGTGTATTTCCCAAGACCGTGAAAAACAAGCCCATTCCTGCGCTCAGCGTAACTGGTGAGTTATTATTAAATACTTTATTTACACTTAGATGAAGTAAAATAAGTAAATAAAATAACATTGTTACAGAAGAAAAGAAAAAGAAAAAAAAGAAGAAAGGCCGAACAAAGAAAGACGACAATATCCAGACCAAGGAGTCAAATATGGACGCGAGCAAGGAAAGTG-GCTGTAAG-----AAAAGATCAAGGACCACATCTGAGAGCTCT-GAAGTAGAGGTTACTGAACCCCAAAAGCAACCCACAAAGAAAAAGAAAAAACGAGAAAAAACTGAAGTATCCAGCTTACCTTTAGTCAAAGCAGGGAAGAGGAAAAGAAGCGGCTCTGAAGATGCAGACTGCCTCACTCCCAAAGTGAAAGTTAAGAAAGTGTCACAGAAAGACGTTAAAAAAGAAGCTCCAGAAGTTTGTAAAGAAAACAAAGGTATTTCTGACTTTATGTTTAGGATTAGATAAGGAGGGGTTTCTTCTTAACTCATGTCTTTATTTCTGTTAATTTAGAATTAGAAGTCTCTACGGAAGAGGAAAAGGATACTGGAGATATAAAAGACGGATCCCTACTGAAAGCAAAAAGAAAGCATAAGAAAAAACATAAAGAGAGGCATAAAATGGGAGAAGAGGTTATTCCATTACGAGTACTATCAAAG a score=6841 s mm7.chrY_random 15186959 130 + 30114534 ACTAAATGGATGGATTTGAAGAAAGAGTATTTGGCACTGCAAAAAGCTAGCATAATTTCTCTAAACAAATATAGAAAACCTCAAATAAAATTGGAATCAGAAAGGGAATAAACCTATGAAATGCCTACCA s bosTau2.chr6 4973155 124 + 69624268 ACAGAATGGTTGGATTTGAAGAAAGAGTATTTAGCACTGCAAAAAGCCAGCATGGCTTCTTTAAAAAAA---ACAATATCCCAAATAAAATCACAATCAGAAATGG---AAACAAATGGAGTACCTACTA a score=9063 s mm7.chrY_random 15187206 160 + 30114534 AAGATATTTTGGCCACAATCTCAGATGTTGTTTAAATTGATTTGCTAGGAGGAGATACTGAATCCTAGGCTAGATTCAAAACCCCCGAGGATGCTCAGGCAGCAATGAATGCAAGGAGTGAAATTAGAAAGAAGCACTGTTGG-AACCTGATGTCCTTTCT s bosTau2.chr6 64860851 161 - 69624268 AGGATACTTTGGCAGCAATCTCAGAAGTTGTTTATGTTGATTTGCTGGAAGGAGATACAGAATGCCATGCTAGATTTAAAACTCCTGAGGATGCTCAAGCAGTAGTAACTGCACATTCGGAAATTAAAAAGAAACACTGCTGGCAACTAGAGATTCTTTCT a score=6465 s mm7.chrY_random 15187366 91 + 30114534 GGTGATCACGTGCAGAGGTACTGGCAGAAGATTTTGGTAGATAGAGTGGCCAAACTTAATCAAACTCAGGAAAAGAAAAGAGGCACAGAAA s bosTau2.chr6 64861263 91 - 69624268 GGTGATCATGAACAGAGGTATTGGCAGAAGATTTTGGTAGATAGGCAGGCCAAACTTAACCAACCTCGTGAAAAGAAAAGAGGCACTGAGA a score=6171 s mm7.chrY_random 15187457 357 + 30114534 AGCTAATCACCAAAGCTAATAAGATTAGACT-GACTTAAGACTCAGCAAGCCAGTCAGCACATTCGATTCTCTGAGTATGCCTGAGAAGACTACAACTTTTGGGGTTCCTTGCTGAATCATTCT------TAGAGCT-------GGACTGTC------------------TGAAGGATGTTGTGCTGAGATCTGCATTAGAAAAGAAAAGAAAAAAATGTTAGCTCCTCAATATCTCAATAAGTATTTTCTAATAACAAGTGCATTTTGTGTCAGA-TTTTTTAATGAGCACT-CTTTTTTTGAAATTAT-----GCAAATTGACTTTGTATGATTTCATAGAC-AATGTGTTT---------------------------------TGAACACaacaaataaataaataaataaataaataaataaata s bosTau2.chr6 64864521 408 - 69624268 AGTTAATCACCAAAGCTGAAAAGATTAGACTCGAA--AAGACTCAACAAGCAAGTCAACACATAAGATTTTCTGAATATGACTGAAAAA-----AATTTTTTGTGTACCTCTTCAGATTTCACTGGATACTAGAGCTATTCTTAGGAATATCTTTTTTTTATGGTGATAATGCATAATGTTTTTCTAAAACCTACATT-----------TAATTAAATACTTGTTCTTTGACTTGTAAATA--CTTTTCCTGGACACAGTTACATTGTTTACCACAGTTTTTCTGTAAACGTTGCATTTGTTGAAATTATATGACACAAATAAACCTGG--TGATTTAGAAAATAAATGTGTTTGAAATTATCATTAAGTTTGATGTTTTTATATTACGAAAACAACATATATGCAAAAATAATACTATCTAAATAAATA a score=14358 s mm7.chrY_random 15189438 611 + 30114534 GGTGAAGGCTGCTAGTATTCCCCC--ATATCCATTCTTCCTTTCATGTATGTGAGTCAAAGTTTTGTTGTACATTGGGTCCTT-----TGTCAAATACTACATTTCTTTTGATTTCTAGCAGGGAAAAATATACAGCCTTGTGACTAATTTTCA--CATCTGAATGTAGACAGAAGTGATTTA-CTCAAATTTGGCCTATTAATTTGAAGGGAA------------------------TAT---------------TGGAACA-AAAAATGATGTCAGGAGCTTCTCAGTTGTCTTGGACAGGGAAATAGTAGCTGTGTATTGATGATGGGTAGGACAGCAATATCTTATAAATAAGCAGACTCCCTGCTGATTTTGAAGTTGCCTGCATAGATTTTGATATGTAAGCAAAA--GTTCTCTTTAGTTGAAAACAGCTATTGTTTTGAATTTCAGAATTACAGCAGCTAAACCAGCACGTGGTCTAACACAGGCATTATTTCTATTCAAAGAGTAGGAAAAATTCTGAGTGGTTAATTGTGTACTTGCCAATAAGTAGCCTAGTTGATCAATGTGAAATCTC-------------------ATGGCTTAAGAAGATGAGAGTATACTGTCGTATCAGTCTTCTCCATTTACAATGAGAATTACAC----AACAACTTTTTTTCCCAt s bosTau2.scaffold9557 10111 674 + 27512 ggtggagattgctaattgacccctgaaaattcattctcactttcatatataggaatggaatttttgttgggcacatgatcaacataaatgtcaaagactacattttatgggctctgcgatagttctgtaaggctagccatgtgaccagattttggtcaatggaatatgaacagaagcgatgtgtctcatgtctagaccattcatttaaaagaaagggaaatctcctgtcttgtgtctttatgtccttcctttaggctggaatgtaagcatgataacaggagctataagactttcctggacaagtagatggtagctatgtattgatgatatctg----atcagtatgcttgaaggaaccaggatccctgctgattttgaaactgcctacccaagttctgatgtgaaagaaaaataaatctctcttatttaag-cagctagtattcaaggttttA-CTTTATAACAGCCAACACTGTATTTAATATAACATAGGCACTATTTCTAGAAAAGGATTAGAAGAAATTCTTAGTG----ATTGTGGACTTGTCAATAAGTGAACCAACAGATCAAAATGAGAATTCTGCATTGGTAACCTTGGCAAAGGCTCATAAAAC--AGAGAACTCTGCTGTAGCATCTCTCTCCATGTATAATGGAGAAAATACTTAAAGCAGATTTTATTTTCAT a score=28470 s mm7.chrY_random 15192449 733 + 30114534 aagaaaaaagaaaaaaaaaaaacTAAATCTAACCAAAAGCTCAGGGCCATTCTCAG---------AGATGTCTTCTTAACTTTTAGGGGCTGAGTGACTTTCTAGGTGTTATTTTTGCCTTGGATGATCAGTTGGAGAAAACTGAGGGATCAGTTGGAGAAAACTGAGGTTTTTAATTTAACAGATGG-TTTGATATTACCATTTCTTTTTGACAAGGAAAGCAGAGCAAGCTGAAAATACATTCAACAGAAATGTTGACATGCAAAAAAGTATTATGGCTAT-TGTGTCACTATGAAATGAGTCAATAATTAA-GTATGAAAT---TTTTTCTGTG-TACACAAAGCAGTGAATTGTTACTGTGATTAATTAATAATTTAATTGAAGCTAAGGGCTTTAATCAATCTTAAAAACTGCTTGATGTAAGCATATCACAGTGAAACCTCCATATCAAAATACATAAAAGACTTTCTATTCAAATAGCATGTTTGGAAACCCTCATCCTTCCTTTCTGGGAAGCATCCCTGGTTAATGCTGCTTATTTAGGAAGAAA-------GGCAGATCAAAGGAACAGT------------CAGTTTCTTAAAGTGTCATCTCAAAAGGCTG--TTATATTTGATAAGAAATTTG---TGACTGATTATTTTAGAAATGATATCATCAAGATCTTTTTGTATAACTTGAAATTTTAAATATCTATTGCACCTAATATAATCAAATTATATTTATTTGAGACAATGTTGCTACAAATATACCA s bosTau2.scaffold9557 10949 727 + 27512 AAGAAAAAGTAAAAAGAAAAA--------TAATCA---TCTCAGTGCCATTCTAAGCCCTTAGAGGGATGTCTTCATACTTGCAAGGAGCAGAG-GACTTTGTGCCTGATAATTTTGCTCAGAATGATCAGTAGGAGAAAACGGAGG----------------------TTTTGAATTTAACAGATGGCTTTAAAATT----TCTCCTTTTGACAAGGAAAGCAAAGCAAGCTGAAAATTTAT-CAACAGAAATGTTGATCTGTAAAG--GTAGTACAGCTGGGTGAACTACTATAGGATGAATCAATAATTAAAGGATGATTTCCATTTTTCTGTGATACACAAAGCAATAATTGACTGTTGAGATTAATTAATAATTAACTTGAAATAAAAGGTTTTAATCTACCCTGAATGCTGCTTATTGTAAGCATACCACAACCAAACACACATATCAAAACAGAGAAAA----TTCTATTCAACTAGCAGGTTTGGGAAACATCATACTTACTTTCTGAAAAGTATCCCAGGGAGATGCTGATTAGTCAAAAAAAAAAAAAAATGACTGATCAAATGTATAGTTAAAAGAGGGAACACTTTTTAAAAATATCAGCTCAAAAGACTGAATTATGTTTGATAAGGGATTTGGAATGAGTGATTATTTTAGAAATGATATTATTTAGGTCTTTT-GTATAATTGGTGATTTAAAATATCCATTGCAACCAATTGAATACAATTAGAGTTCTTTGAGCCTTTGATGCTGCAAATAAATCA a score=29958 s mm7.chrY_random 15193212 687 + 30114534 ATAGGAAGCACTAAA--TAAAAGTGAAGAAACCCAATACCTCCTCCTATCTCTGATGCAAAATAAGTGCTGGCAAAAGATTTTTTTAGTTCTGAAATTCTTTGATTTCAAAACA----TTCAACCTTAATAATTACAAAATTTTGTCATATGTTCCTTTGAACCTGAAATTTGAATGGAGCA----TTACAAATTTTAATTTGTAACCAATTATGATTCAGACTTTAGAACTCAGACCTCAGTATAATGAATGAATTGCTTTTGTTTGTTTCTTTGTTTTTTCTGATTAGGATTGATAAAGGAGAGTCAATTATAGATGTATCTACCTGATTGAGACCATTCATAAATGCAAACAAATCCAGTCCTAGAGTGCAAAGGAGGTTATATCTGCCTATTATATGCAAAAATGACTTGTGTTCTTATTAAAAAGTACAGCTTGTTCATTAAGTGTTATGAATAGAATAAATGGATTTGCTTTTCATAG---CTTTAAAGTGAAATGGTACTTACTATACTGGAATTTTGGAAAAGCATGTGATTTAGCAGAAAAGTGTTTTTATGTTACAGGTTTTACAGGCTTTTGGTTTTTAGGAGAAGTTCATTAAATGAATTGTACCCATATATTTTCAACTCAGAGCCCATATAATAAGCTATTCTATAAAGTCAGCTTTCTTTATAGGATTGCAAGACATTA---------------------------------------------------CATAGA s bosTau2.scaffold9557 11928 728 + 27512 agagaaaacactaaaatgggaaaacatgaagccgagggtcttgtcctagctctgccaataactcagtgtTGCCAaaggtctcttctaattttgaa-ttctgtgattTCCAAAAGAAATCTTAGTCTTGCCAATGATAAAATTTTGTTATGTATGTTCCTGAATTTGAAATTTGCATGGAAAAGGATTTAGAAAATTTATTCCGCTACCCATTATGATTCAGATCTTAAAATTCAGACCTCAAT-TAATGAATGAGAGAAT---------------AATTTTTCTGGTTAAGGTTGATAAAG---AGCCAATTAAAACTGTATTTACCTGATTGGGACCATTCGTAAATACAAACAACTCTATTTTAGGAGAGCAAAAGAGGTTACATCTGCTTATTATAGGGGGAAATGACTTGTGTT-TTATTAAAAACAATAGCTTGCTCAT-AAGTATTATGAATAGCATACATGGGTTTGCTTTTCTCAGAGATTTAAGAGTGAAATGATACTTAAAACACTGGAATGT-GGCAAAGCATTTGATTTTGAAGAAAGGAATTTTTATGTTTCAGGTTTTCCGGGCTTTTGGTTTTTAGGAGAACTTCATTAAATGGACTATAACCATATATTCTCAACTCACAGCCCACATAATGAGCGATTCCATAAAGTCACCCTTCTTTATATGATTGTAAAGTATTAAACCAgagaaggcaatggcaccgcagtccagtactcttgcctggaaaatcccatgga a score=28171 s mm7.chrY_random 15193899 973 + 30114534 GTGACCTAATGTCATCATTGTTTTCTATTTGTATCTATTAAAAATCCCTTTAGAGAGATCTCGA-----TTCACTACTCAACTATAGAACACTAAATGAGAAAGACAGAAGGGTATAATGAATCACATTTTTGTCACATAAAATGACCCAATAATTTTCTTAAACT---------AAGATATTTGCATGCAATTAGTATTGGTAGTCGAGTGACAACTCAATGTATTTCTTCTATACTCTT-TTGAATGATGATGATAAGTCCATGTCATTAGTAGAAGCGAATCCTCAGATGGTTGTTCCAGTACTTGGCAGCATTCAAAATAACTCCAATCAGCAACAGATACTTCTGTCAATATTTTG-AGTCAGGATTTAATTAACATGAATTT--CCCCTTAAATCTCATATTCCATGGCAGTAATATTCTTTATTTGCCAAAATACTTTTTAACCATGTTTGACAGATGGATGTCTCTCTTTGAAAGACAAGTCAAATAGCCAATGAGATAAAAACAGCAGCAAAAACAAACCTCACCAAATAGCATCTGCTTATTAGAAGTAGAAATTTTAGGA-------------------------------CTTAACATACACTTTTTAAAGAAG---ACATTTATGTGTCCAAATTTAACAAGTACTGAATCATTCCTTTCTAAACCTGTGG----------TATCTGCATAATATCAATATTAGTCAAAACCTACTTATAAGATCTGCTTTAAAGTAAAACTGA-------GAACCTTC--------AAAACAAATACCAAAGTCGTAACC----ATAACTGTACTTTGCAGTGAAATAGAAGGTGAGTACTTACAGATATGATCCAATAAAAATGAAGTCATTATGGCTCATAGCAAG--CCAAGTCCAATACCTGGTATCCTTGAAA--------ATACTAAAACATGATGC----------------------TGAGAAAAGCGGAGG----TGGAAT--TGATATAATAGTACATGAAACACCTTGGATT------ACCATTAGAACCTAGAGACAAGTCATGGGACAGATACTACCTCAGAGATTCTACAATGAATTAAT s bosTau2.scaffold9557 12895 1066 + 27512 GTGGCCTGGTATCATTACTATTATCTACTTGTGATCATTGAAGAATCATTGA---AGAACTGAAAAACTCTCACTATCCTACCACAGAACACTACATGAGAAAGATAAGAGGATACCACGAATTATACTTTTAT----TTACATGAGCTAATTATTTTCTTAAAACAAGGGCTGAAAGGTATTCGCTTAGAACTAGTCCCAGTAATAGAGTGACAACTCCATATATTCCTTCTAGACTCTTATTTTATAATGATACTAACTTTATTTCATTAGCAGAGAAGAATACCCTGAAAGTTGCCTTAGTACTTGGCAACATTCAAAGTCGCACCAATCAGTGGCAGCTACTTCTGTCAATCTTTAGAAGCAAAAATTAAATTAAAATGAATTTTACCCCTCAACTGTCATATTCCATGTCAGTAGTATTCTTTATTTGCCAAGATACTTTTTAACTGAGTTAAACAGATGGTTGTCTCTCTTTGAAATACATGGCAAAAAGCCA---AAATAAAAATTAC-----------------CAAAATAGCATGCTTCTATTAGAAATAGGAATTTTGGGATTTTCTATGTTTGAAGTATATTATCTGGAGGCTTAAAATATCATTTTTAAAGAAAAATAAGCTTATAAATCCAAACGTATAAGATGCAGACTCATACCTTGTTAAACTTGAAGCTTAGGGTACTGTATGCATAATAATAGTGTGAATTATAAGCTAC-----AGAGCTAAATCAGAGtgttatgggttcagttaacccctcccccccaaaaaaagaataatgaagttctaactcgtagtacctgtaatgtgactttatttggaaataggatctttgtagatttaatcagcataagttgaggtcatactggattagagtgagacctgaaccccatgactagtgcctttgtaatgggagagatatttaaagatgacatgcgaaaagggaagaaggctatgtgaggacagaggaagagattggagtgatgttactataagtcaagaaatgccaaggattgcattaaccaccagaaactaggagaggagcgtgggacagagtctccctcagagcccctagaaagaaccagt a score=15523 s mm7.chrY_random 15197067 679 + 30114534 AATAATGCAGCATGGGAAAGTATTAAGAAATAATTTCAAA--------------AGTAATTTTTGTGGGTATTTCAGGAATTTGGCCATGACATTTACCAAGCATGTGATGAGTCAGCTGCTGTGGCTAAGACATTT----TTTCCTTGTGTATGTAAACGTTCCTACTGATGCTGTAAACAGTGTTCAAAGTTA--TTTTTGCTAATTTGTTATGTATGCTTTGAAAAGGGGGTAAACATGTATGAATAGTGATGAGAATAAATATCTTCCAGTCATATGACATTTATGTTCTTCTAGAGATCAAGGTAATTTAACTAGCTTTACTTCCTTATGACATTATCTTGCAGTGGCTATGTGTATAACATCTAGAATTAAATGAATACAAGTTTAAGT-----CAAAGATCAGTATCTTTTTGAGCTTTAAG---------TAGCTATCTGGTCTCTATTGATTTTCATGTTGTTTTATTTGGATCTGTAAAATTAAAAAATGA-TAACACCCACATCAAAGCACTCCACATTTTTATAGCTGTTCAACAAATGTAAGCAGTGGAGGTCCAAATTGTCAAATGCATA----GTAATTACCATATTAACATTAATAGCTACTGCTGCTATCTATAGTCCT---ACTCTTGTTGTCGTTCAAGGATTATTAT--GTCTCACTGAAGCAAGCTGATAAGATAATAGGGCAGAAAAGGAATAAGGAATAA s bosTau2.scaffold46371 480 711 + 1236 AATACTGCAACATGTGAATATATTAATGAAAGATTTAAAATCTTCTACTAAAAAAGTTATTTTTTTGAATATT-CTGTTACCAGGCCATGACACATGCCACCTAATTGATGATTCAGCTGATATAGCTGTTAAGCTGGATGTCCTCCTGCTTCCCTTAAGATTCCTGCTGAAGCCACATACACTTCCTAGTGTTGCTTTTTTGGTCATA-GTTCCGTATACCTTGAGCAAGTGATAAGCATATATAAATATTGAGAAGATTACAGACCTTCCAATTACATAGCACTTATAGTCTCCCAGAGATCACGGCAGTTC-ACTAATTTCACCTCCAaaggacacaattatacaatggttaagtgcataacttccagagtcaaatggccctgggtttaaatctgaacataggttgatctctttattagctgtctgactttgaccaagttacttaatctctcttgttcttc---tttttttttttttatctgcaaaaagggaaaaagactggtagctgcctctgagcattgaggaaaaaggtagctaattaattattgtaaagggttgag---caaaatactaagtatgtattatgtagtcaatatctaaa---tgatagctGCTGTTGCCACCACCACTGCTGCAGCTGTTCTTGTTATTAGAGCATCATTAGAAATCCCACAGAAGCAAATCAGGAAGGGAAAAGGACAGGCAGAGAATAAGGAATAA a score=17014 s mm7.chrY_random 15198108 348 + 30114534 AACATGACTCTCAGTATATTACTAACACCCTAAGTAGGTATTCTTTAACACAGAATCAAGTTACAAAATGTAATATACATTTTAATTGCATCTTTGTTATCTATCTAAAAA-TGCAAGAGAAATAATTACTTAATATTCTGTCGCCAA---------GATTTTTAATGAATAAATTCTCCATTCACATTAAAAATTTTAGCACTTATCAGCAATTATGAGTGTAAAAATAAAGTATAATGATAAAATAAAGC----TGCATAAAAATTATGCAGAAACATGTCTGGTAGTTAATTAATATGTAGTGTTCAAAGTATTGAATAGAAGCACCAGATCATCATCTTAAGTGCAAATATTAAGGTG s bosTau2.scaffold8383 1685 347 + 33335 AGCATGATTCCCAGTTCGTTACTTACACCCTA-GCAGGTATTCTCTATCACAGGATCTATTTACAAGAGATAATATGCATTCTAACTGGATCCTTGTTATCTATCTAAAAACTGCAAATGAAATAACTACTTAACATTCTGCCTTCAACATTTTATCCATTTTCAATGACTAAATTCT---TTCACATTAAAAAATTTAGCACTTATCAGCAATTATGAATATAAAAATAAAGTCTAATGATGTAATAAAATACAGTACAT-AAAATAGTGCAGAAATGTAACTGGTGGTTAATTAAGAGATAATGCCTGCAGTACTGAATAGTGTCATC----------CTTTGGCACAAATGTTTAGGtg a score=7743 s mm7.chrY_random 15198456 299 + 30114534 AAGAAAGTCACTATTTTATGAGTATGTAAACAATTTTTAAACATTATATTTATTTGTAATGCATTCAGATTTGTTTATATGTTTGAGGTTGACTAAGAAAAGGAGAGCTCTGTAGACTAATAGTATGATATGTCTAGTTTACTCCTTGCAATAG-TTGCATTTCTGTCCTATGATAAAATATTCCTTCCTAATATTAGTGTTTCTATTTGTAAAATGACAA--ACATCTCTACTTTAGTTACATCATGAGTTTCTGATATATACAGCAGTAGAAAGACAGAAAAAAAAAGTAAATCAATAAG s bosTau2.scaffold8383 2254 284 + 33335 AAGAAAGTCATTATTTTAAGAGCAGAAAAGTAATTTATAAACA-------TATTTATGCTGCAGCCTGATTTAGGAATACCACT--GGATGACAAAGACAAGGAGGGTTATGTAGAAGAATGGTGTTCTTGTGCCCATCTACTC--TGCAACAGAATGCTTTTCTATTCTAATACAAAGTGCTCTATCTTGACTTGAATTTTCTTCTTTGTAAAATAAAGAACACATCTCTGCTTTAATTACTTCATATGATTTTTATGATTTCA-------AACTAAAGAAAAAGAGAGAATATTGACAAG a score=5694 s mm7.chrY_random 15222508 189 + 30114534 TAGAGCACTTATTTGAAATGTCTTGGATACTAAAAGTAA-AGTACCAAATTAAATAATTCAAGAGAAAAGA---AATGGATAGAGAC------AGGAGTTGTCATATATTGAATATGT--TTGCAAATGGATGTCAGGTATTGTGTGGCTCATTAGGTTTTTAGACTTTTAAG-GCAAATTATTTTAAGACCCAAATACTAC s bosTau2.scaffold7682 21147 201 - 37185 TAGAACATTTAGTT-AAATGCTACAAATGCCAAAAATAATAGTAGCAAATGAAATCATCTGAGAGAGAAGAGAAAATAAGAGGAGATTTTGGGGGGAGGTATCAAATTAAAAATATATATTTGCAAGTAAACACAAAGTATTTTGTAGCTCTTTTAATTTTTAGGTTAAAAAATGCAAAATAATTTAAGACCTAAATGCTAC a score=18921 s mm7.chrY_random 15222984 656 + 30114534 AGTAGTCACCTTTTATTTAGAATAAAGATTGCATAAAATAA----ATAGAATCTTAAATTTTCAAGG---CTCTCCTATACTGTTTAAATGTTTTGAAATATTCTGAAACTATATGATTAAAAAA---AAAACAAACAAACACACACACACATGACTTATTTAACCA--AAAGACGGTCATA----------------------------GAAGTATTCATTTCTTTCACTC------------------------------AGTTCTTAAAATTATGTCTTAAAGTTTTCTCCCCAAATAAATATTCCTGCTTTAGGACATTTGTTTAGTCAAATGAAACAAGA---AAATGTGATAATATGACAATTTGTCTTACAAAGCTTAAACAGAATTGAAATTATGAA-TTTTACGTGATTGTAGATGGAATTTGTTAATAAAATATTTACCTGCAGCTAATTCCAAAA------------CATTACTTTAGTAAGTGTCAAGTACATTTGACTTTTAAAATGAGTCTATTTGGTAGGAATATATAGTGCATTAACAGAATTTAAATGATTGAAACAAGTGGTATAGGAGTAGAAGGAGCAAAATACACATTTATGGGACTCAAAAGAGATCATAGCATAGTAAAATGTGGAAAAATAGATACTATGCAGCATTCTTATTAAATCAAATCTTGCATATGCAGAATTTGATTTTTACATAATTTTATTAAGTTGGTGACATGCCTA s bosTau2.scaffold7682 21363 727 - 37185 AATATCCATTTTATATTTAGAAGAAAGATCCTTTAAAAAAGGAAGATAGGCTCTGAAATTTAAAAGAAGACTTCTATTCATTGCTTAAATATTTTGAAAT--TTAAAAATGGTAGGTTTCAGCAAGGTAAAACAGGTGATCCTCTGTGTTTTTGATTTATAAAAATATGAATGTCTGTGATGCTTTTAATAGAATTGTGAAACTAGATATGAAGTATTCACTACTTTCACTGGTTTGGGGGATTATAAAGATTTTATTACAGAGTTCTTAAAAAGATGGATTAATCTTTTCTTCACAAGCAGATGTTCCTACTATAGGGCATTTGTTTAGTCAAGTGAAGCAAGAAAGAAATGAGGCAATAGGACAATTTGTCATTCAAAACTTAAACAGAATTGGAATTGTGAATTTTTATGCTACTGTAGATGAATTTTATTAACAAAATGTAAGGTTTCAGAGAATTTCCAAGAAGAAGAAGAGTTATGACTTTTGTAAATGCCAAATATATTTGACTTTT-AAATTAATCTACATGG-AAGAAAAAATATCAAATTACCAGATTTTAAACGGTTGAAAGAAGTTATACAAGAGCTAAGG----AGACTATGTCTCTGTGGCACCAAAATAAGACTACAGTAAAAGAAAATGTGTGATATTAAGTAGCATAGAACTTTGCTATGGAACTAATTATTACATGTACAGAATCTAATTTT-------TTTTCTTAGGCTGGTCATATTCCCA a score=7385 s mm7.chrY_random 15224120 987 + 30114534 TTGTCAATGCAAGTGTTATTAATGATCCATGATGTTTATTCCAAGCTGAG----------CACTAAATGTGAGTCACTGAAGTGCCAGATTGTTTTGAAAA---CAGTTTTC---------------------ATCAGCAAATAATAAGATGCAAATGACCACAAATCCTGTATAAAACA-GCACAGATAA-------ATCCATTAATTACT--CTCAATTGATCATTTCAAGTAGGTTTTTTCCTTTTAAAGATACTATAGAAATGAATTTAAAGATTATGCAGTTCATCATGAATATAATGATCAAGTCTCTAAGCT-------------------------------GTAAAATTCATGTACATTAATCATTTAT-----------TGTTATCT--TAT-----CCTAAGAG-AGTGGTAAGATCATTC-AATACATAACCATATGAGAGCTTCAGGATGTTTGGAAGATGAGTCAGTTATGTTGGAGCTACACTTTTACAACAAGCACAAATTTAGGCTTTCCT-----ATTAAG--AAAGCACAAATAACGTTAGTAACACTTATCT----ATATTGCTTTTGAACTTTTA-------------ATAAATATAAACAGAGAGGCATCCCATTCCCATTTATATTTCAGGGAACATAAGTTTTTTTTTTTTTTCTTTTCA--------TATACAGCTGTTATCTCAATTTGCATT-TTAAATATAGCAAACAAATTATTT-----CATAAAATTTGCAGAGTAGCGGTTGAGATAGACATTTAGCAACTAAAGAAAGAATTTAATTACCAGTGATGAACAATTACTAGTGATAGGAAGGAATGAGA--GAAAGATCGTGTTAGAGGAATGTTG------CAGGAAGCAGCAGGCAAACA---------GCAGAGAAGGGGTTCCTTGTAAAAATCTAATTTTTATCGATTTTGATCTAATTATTAATCCCCCTAAGTAAAGACACTCAAAAAAGGGGGACAgggg--ctgatgagttggctcagtggttaagagcactgactgctcttccaaaggtcctgagtt-----caaatcccagcaaccacgtcgtggctcacaacc---------------------------------------atctgtaatgagatctgataccctcttctggtgtgtct s bosTau2.scaffold7682 23198 1118 - 37185 ttgccaATACTGGTGGTATG-------CATGATGTTAATTCAAAGTTGAGTGTTTATGCTCCTTACGTTTTACTCACAGAACTGCAAGAATGGCCTAAAAGAGTCAATATTCTACTGGCAAACCTGACTTGTTACCAGTAAATAAACAGATGCTGATGACCAATAATCCAGTGGCAAACAAGTATAGGAAATACCTATGTCAATGTATAACTTGCTTTATTTATGATTTAAA------TATGACCTTTCCAAAAGAATCTTGACAATAATTTGAGACT---GTTGTTCA-CACAGAAATAATAATCAA---TTTAAGCCTGCTTCTTAGGGAAGGGTTTGTTCCTGCTAGGCACAGATCATGTACCTTGGTCATTCATGAGGCAAGTGCTGCTATCTATTATGGAAGCCAAGGAACAGCTGTTATATCATCCTAGTGTACAGCAAC-CGAAAGCTTCAGAATATTTGGAAGATGAGTCCATCATCATGGAAACAAA---TCAGAGGAAGCCCTGCCATGTTTTTTCTTCTAAGATTAAACAAAAAGATAAATAAAATCAATATTACCTATTACTTAATATTGGTTTCAAGTTACtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtATATATATATATTTCattc--acttatt----------caaaaggtatttttgaatgtctatttggtgccaagtgctccgctatgatttgagtatgcaccagtgaatatgatagacaaggtccctaccctcacataacttacagtttaggggaaaagacttatgttaaacaaataaagaaaacatttaattacagtttataatgagctattagtactaggaaggaattaaataggaaaatcattagagaataatgtggtggtggcaaaaggtagcaggaaaatatttagataggataaaaagggattccctctaaggaagtgac--------------agctaagt-tgaaagctTTAGGGTAAAGTCA-----AAACTGGCTATTGAGATTCTGAAGATCT---TCAATGCTTCA-AGCTCT--CTGCTtgtgcttagtcgctcagtcatatctaactctttgcaacc---ccatggactgcaacccgccagactcttctgtccatgggatcctccaagcaagaagactggagtgggctgccacaccctcttccaggggatct a score=8865 s mm7.chrY_random 15225258 630 + 30114534 CTTTCCTAAATGTCAAAAGGAAGC-----GTCTCTCATTTCAG-AAACCAGGTAAATATTAGCAAGAGAAATGTGTGGTGAGGTAGAACATGATCAGATATAACCAGTAAGTGTAGAATAT--ATTTGCTGAAGTTATTATTTAGTACTTGGAATGTTGAAAGAACAATAAACTTAAAATATAAATGATTTTT---------ACTGATATTAAATTTTTTTTCTGTAATTAATACAATGATGTGATTTAAGACCTTACTCACTCTTATTC-ACCAATCTACTTGAATTAAAGAATTTCAAGTTGTATTTTGTCTCCATGACTATTCTCTAGTGTCCATTTAACCCCT----GGCCTCATAAGAAAATTCTCAAGATTCAAAGTACATTATTTCATCAGATATATAACAATAGAATATTGTCTCTACCAGAGCCATCTTATGTTCTTTCTCCATTGTTACCCACTTTCTGAAGAAA--------TCATGTAGAGTGTACAATAT-------ACATGAATTTGGCAAGTTAAACC-ATCCTTATACTACTATTATTTGATT-CATAAATTTTGA--GTTTCAGGTTATACCAATCGGACCTACTAATAGGTTGTATAATTCTTTC------AAATTTAAATACCTTAACAGGAGACACCAGCTCTTTATCATTTTATCT s bosTau2.scaffold7682 24574 648 - 37185 ctgtttcagaagctgaaatgaggccagtagtcttgtggtacggtcagccaggtaaagaatagcaagggatgcttttgggcaggtagatggggctcagatGCAGCTTTACATTATAGGACATGCATTTGGGGGCATTAGTG------ATTTGGGGGGCTGTCAGAGCAGTAGTTTTTAAAGATAAACTTCTCCCCCCCCCCCCACTGTTTAGAAATATTTCCC-----ATCAATTTGTTAAGGCAGACCAAGATTTTACCTACTGTTATTTTACTAATCTACC--AGTGAGAAAAGTGAAAGGT---TTTTCTCTCCATGGCTACTCTCTGCAGTCCCTATAACTTCTTTCTGTTCTCATAGGAAAATTTTTGATATACAAAGCAGATTACTACATGGTTAAGACATCTGTAAATTATTTTCTCCATGAACACCATCTGATGGTCTTTTT----------TTCCTTATTGGAGAAAACCTCTCTTCATAATTGGCATGCAAACTTTTAAGGAAATCCATTTTCCAGGTGAAAAAGAACATTATCTTATCATCTTTTTACTGCTGGAACTCTGAAGATTTTAGAATCTGTCTATCTGAACTATCAGTAGACAGTGTATTTCTTTCTTACTAGCATGTAAACTCCTTAAGAGCAGATATCAGGGCC---TCATTTTATTT a score=27430 s mm7.chrY_random 15225914 1250 + 30114534 CATAGAATAAGCTTCCAGATACCAGAAG-TTTATGCAAACAAAATAACAAAAGTTCTGTTATACTTTTAGATTGCATTAATTTT--CATATTGATCTATTTC-TTTACCGTCATTCTGGTTTTGGTGAGTAAGAAAATGGAAAGAAAAGTAGGAGCCAAAAGGTTCCTTGGGGATTTTTATTTCTTTGTTCTATTCCATTTAAATATCTAtttgtacttccccatataaattataaactctagtgaaggaagatactataattatcttgttc-ctagtatggcttcttgtcctagcacCTCTCCACATGTTCAAAAAATTATTTGACTAATTACTAATGTTTATCTTTAATTTTAAATTAAACATATGGTCCTCTCTTGAAAATAACTATTCTTATGGAGTCTGTAGGAACTAAGGATGAATTGT--AAATGCCTGAGAAACAACATAATTAAATATGTGAAAGCAAACACT--AGTTTCACTTGAAAAT-ACAAACCAAAGACTTTCAAAATCAGTGGAGGTAAAATCAGTCTATCCACAGGTTTGAACCAAGCAGGAATGTGGAAAAAAATTCCAGAGTGAATGTTGATAATACATATTA----AAATATAGAACTGTGACTGAATAAAAGCCTTGAATTAGAAT----AGTCATTTCTTCTCCCAATAATATTGAAATTCAATTCATAAATGTAGGCTTTATATAGTGAAAGACTGAGATTCTTCCACCCACCTCATAGGAAACTCTTCCATCTCTGCATTGTTTGTGAATTTCTCACAGCATTTAGTTTTATGGAACATTTTCAAGTAGCATATTCCTCTATACAATGACACTTGGGATTATATAAAACCCATGACTAACATATTTGCCACATGATTTTATTAGGACACTAACAGCACTTTCTCGCATAGT--------AAAGGTAGGTCAGCCATAAGAAATTTACTTCAGTAATAAAGCAAGGAGGTAACA-GGGCAGAGAGTAAGTAGTATCTATTACATTATAATGCTTAGCATTCATTTCACTTTTCTTTACTTTTGAACCTACTGACTACACCACTTAATATATTTTGCTCATATATTTCTGAATCTAGATTttttatggtacctttccaaactgtctctagtctagagcatgtgatttgatttggcca--gggatgtaggaaaaaaaaatgcaagcaaatacttgtaaagtctttatgcaGTTTTGTTTCC--TCTCTGATTTCTGCTAACATCATAGCAATATGCCTGGTTTAGCATGATGGAAGAATG s bosTau2.scaffold7682 26176 1150 - 37185 CAGAGAATGAGCTCTCACATATTAGGAGACTTACATAGACAAGCTAG--AGTGTCCAGCTATGTTTTTAG-TCACATGCATTGTGACCTACTCATTCACTTCCTTTATAGGTAT-CTGTTTTCAGTGATTAAGAAA-TGGGAAGAAAAGTGATGGC------------TTAGGATTGTGATTACTTTCTTCAATTATATTTAAATGT-TATATGT-cttcac----taaattttaagctctagtgagggcagacaccacggttgtcctggtcaccactgtggctcccacaccagcCTGCACCCCACCT-CCCATGGAATCACTTGACTAATTATTAGGGATGGTGATTTGTTTTAAAGGGGATA----GGCCTACCTAAGGCACAACTCTTCT----------------ACTAACTGAAGGTTGTTCAAATACTTGAGGAAAAAC-----TAAATACACAGGATCCAGAGATGGAGATTTACTTCAGGATCAAAAAGCTTAAAGTTCAAAGCCCAGTGGAAATAGAATTAGGAAACAGGTAGGTTAGGAATAAGTAAGAAGGTGGGAGAGAACTCTGGGGTAAATATTTAAAATACTACTTGCTAGAAAAATGG---TAGGACTGACTAAAAGCCCAGAGCTAGAATGAACAGTCATTACCTTTCTGAACAACACTGAAATTTAGTTTAGAAGTATAGGTTTTATATCTTGAAGTACTGAGAATCACTTATTT-TTTCATATAACACTC--CCATCTGTGAAATGTTTATGAATTCCCCAAGGCATT-AGTTTCATGGAACATTTCCAGGTGGTATATTCCTCCTTTCTATGACTCCTGGGAATATATAAAATACAGGACAAACACTTTTGCCACAAAGTTATATTAGGAAATTCTCAGCAACTGCTATTATAATTATAACTCATAGATATTTCACCCCTGAACACACTTCTTTACAAATGAAATGAGGAAGGAGAATAGGCAGGATGCAAGTAAGGCCTATACTAATATAAAGGTTAAAGCTTCTTTCACTCTACTTT---------------------------------------------------------------------------CTTCCAGACtgactctgctcttggctatgtgacttgctttggcaaataagatgttaacaagattaatgtaggcagagactttcaaagttcaagtgcatttttgtttcctttctttgacctttgccaatgtcatgacaagatgtctgggcaggcttgctggaaagatg a score=25529 s mm7.chrY_random 15227648 960 + 30114534 ATCTCTA--TGTTGAATGAATTCATACTGAGGATGGATGCTTGCATAATTGTTTTTGATGAAGAGTTTGGGGAAGTGAAACTGAACA--------------------GAAAGAAAATAGAGAATACatttttaaaatcatattttaaaataaatatttctataaaaaCTGTAGCTGAGCACCCCCCCTTGAACT-TCCAATGTTATATGTGTTGTCAATAGATCTCTAAGTAGGCATTAGCTCCAGGGTTCTCATTAGAAACTTTTAAATAGGCTAAAACGAAATAACATGAGATTAAAATGGGCAACATTCACTTGTATATTTAATACCAAGCCAAAGCTTTCAAACTAGAATTATTATGATAATTTAAAACCAATTCAACCAGCACTCTGAGATACTGATATCACACTGAGTACTTCCA---------------TTACTATTAAAATTGAGTAATTCCTTCCAATCTAAAACTGATGCATA-CTGAAGCCATTAGGGTTTTGGCAGAGTAGGATCAAATTTTAAATAAATGTGATATTAACAATGACAACTTCTAATCATTGCCTTCTTTGTCTAGAAAGATTTCTCAGAAATATCAAGGATGAAAAAAAAAGAAAATAAAGAGGAAATCTATCT-GTCCTTCATTCATCAATTTAAATAGATTTAAACCGAACTAGTTCATTTCCAGCATATTGATTTTTCATTGTACCAGTATCCCAGTTCTAAAAATAAACTTTTTTTTTTCTTTTTCACGAAAACTGCTAAGTGAATGAATTGCTTTCATAGCTATATGGTGAAATATTTATT-----------------TACCTTATATTTTTTGGGCATGTCACAGCTGTGAATTATTTTGTTTGCTTTCTTGATTTTTGAAAATC-----TTCAAACTTGGCCTTCTCTCTAGGTGGGAGA---TTAGCTCCTAGT------------------TGTATATGGGAATATGTAAACATTGTTGAAAA-TCCCTAAAC--AAATAAATTTCAGACGGTAATCCATGCATTAAATGCCTA s bosTau2.scaffold7682 28117 1009 - 37185 ATCTCTAGTTGATAGTTTAGTTCAGATAGAAGAGGAATGATTGTACATCTGTGTCC--TGGAGACGTTGGAAAAGTGAGACTGAATGAATGTATGGATCTTTGCTGGGGAAGCAAAT---GAGTACACTGCTTTGTTAATATTCTAATATGAAGAATTTTTTAAGAATTGTTTCTGAGTTTTTCTC--TGAACTCTCCAATACAGTATATATCATTTGTAGTTTTCTAACTAGATCCTAGCCCTGGGGTTTCCATTATAAACTTTAAAATAGACTAGACTGAAATCACATAAGATTAAAATGG-CAACATTCATGTGTGTAATGAATGCCAAGAAAAAGCCTTCAACCTGGAATTATTGTGATAATTTAAAACCAATCCAGCCAGCATCCTGAGATATAGATATAATGTTGAGTCCTTCCAACACAGGAATTTGCTCTACATTTGGTAGCAAAGAGTTTCACATATTCTGAAATAGATGTAAACCTAAAAGTATTAAGGTTTTGACAGTATAGCCTCAAA-ATTAACTAAACATGATAATAATGATGACAACTTCTAAACTTAGTCTATTGTGATTAGCAGCCTCTCTCAGAAATAGCAAATA-ATGAAGAAAAGGAAGTGATGGGGCAAGATATTTGGTCTGCCATTCACTACCTTGTACAGACTGAGAAATAAATGGCTTATTT---GCATAGTGAAGCTCCCTTCTGTT----------TTCTATAAATAAACTT---------TCCCCCACTAATTCTTCCAAGTGAATAAATTACATTTAGAG--ATATTGTTGAATATTCATCCCCAGAGTTCTGTCTTGTACTTGATATTTTATAGGCAAGTCACATATATTAATTGTGTTTTTTTTGTAATTTGTTTTGATAAATAAAAGGTTGAA--TTGAACACCTCTTTAGGAAGAAGAGACTGATATCCAAGTTTTACAAGTGtatatatatatatatatatatatatGAGCATGGTTGAAGATTTCCTAAACAAAAATGAAACCCAAAAGAT-ATTCAAGCATGAATTGCTCA a score=8924 s mm7.chrY_random 15228626 503 + 30114534 AATCTATAGAGGATTGAATTTCTAAAGTCCTGTCTATAGGGACATGGTA------ATGG-----AATAGTGGTAGATTTTCTATAAAACTTTTTCTAGTCAAATAAACAACTGTATTAAACCTTAATGAGATTTT---TACTCTGAATATAAAAGTATACTGAGAAAAACAAAATCCAGTTTACTATTAATATTAGTCAGTTAA-TAAATGTTAATTAGTACTACCTCCAAATTTTTCATGGTTGATTTGCACATATCTGTTGAATTGTATAT-TGCCCCTGAAAAGATTACTCAAAACTTGA-AAGTTTTTCCTTTATTTCAGTAGCATGAGTTTCAGAAATGAAAGAGATATCACATTTTGAAGGCCATTTTATTGAAATTATATTTATTAGTATACTTCATTTTAAGAAAGAATTCTATTTCATCCAGT--GTTTGATTT--CTAGAAAGTCACTATTATGATAATTTCCATTTGAGTATACAATTTAGAAATACAATACAACCAAGAGAGaagtaaatga s bosTau2.scaffold7682 29453 508 - 37185 AGTCAATAAGATACTACATTTTTGTCACCCTTTCTAAATGGCCATGGTCTATTTTATAGGTAGTAAAAACAATAGATTT-AGATATGAATTTTTCTAGTCTAATATACTTCAGTGATACATTTAGTAGACATATTGAATATTGTGAGTATAAAAGTAGCCAGAAAATGAAAGAGTC-AATGTA-GAATAATATTAGCAAAATAAGCATAGACTTATTGATATGATTCCCAAATCCTCTAGAATTGATTTG---------GTCAATTTGTCTGGATGTCCTTAAAATAACTTGTTAAGACCTGAGAAAGTATTTTATTGTACCAATAGCTTGAGTTCCAGAAAT-AAGGCAAGAGCAGAT---GAAGGACATTTTAATGTAGTTATGTTAATCTGCCTTATTTTTTTGAATACATGATCACTTCTCATCTGATTTGTTCTATTTGACAAGAAATTGACTGCTGTGAAAATGTGCAATTGAATATAAACTTTAGAAACAGAATATGACACAGATTCAAGGGAATGA a score=18458 s mm7.chrY_random 15252711 750 + 30114534 aAAACAGAGTCAAAAAGCTAAATATTCAAATTAAAATTCAAAATTAGAAGTCAAATAAAAATAAAATGTTTTTAGAAATTG-ACTGGTTGTATTCTATGTATCTTTTTGGTTCTTTCATTTCAT---------TGGAATTACTTTTTGAAATTTTAGAGTCAGTAGAAATA----GTCAAAGACAGAGGAAG----------------------------------TATTGGTGAATTGGAAATAGGTTATATACTCCAAAATGGAATTTGATGAATTTCTTTAA--------CTCCAGTC-TCTCTTTT---------CCCCAGAGTTGATAAATCAATTGATGTAGCTTCCATTACAAAAGATGATGAAGAAGATAGTTCACTTGCAGAGAATGAAGTCATTTAGTAGTGGCCTATGACTAAGGTTGAATTTTATAGACTTTTATATTTCTAGCTTGGGTTTTTACTTGCCTCGTTTTTCTAAACATCGTTCTTTCAGTTACGGCTGAGGTGTTTGTTTTT--CACTGTTATTCTTTTTATCAGCATGCAATTCCATTGCCTATGATCATGAAAAATTAGACTGTGCAGTAAGTATCAAGTTAAGATATCGTTCTGTGAATAAATGCAGAAATGTAAACTTGCAACCTGACCTTCAGATTTTTAAACCCTACTCTGCTTCTGTGCTCATTT-TTTTTAATCTTTTAACTGAGAAAAGGTG-------TTAGTATGAAATGCTTTACAACATATGCC-TACTGAAGAGGCATTTTATGACTTCCTTGAGTGGCACTAAACCTCATTTCACTGAGCTTGCTTTATAA s bosTau2.scaffold2476 4449 743 - 113929 AAAACAGAATCAGAATTCC-----CCCCAAATAGAGTCTTCAACTAGAAGTTTATTCA-----------TCTTCCAAATTGTATTTGTCATCCTGCATTAGTCTCCTCAGCTCTATAATTTAATAAACAGTAATGGCATCA-TCTTTGAAACATAAAAGTTAATAGGAAAAAAAGGTCAAAGAAAAAGGAGGgtttatttttagtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttAGTGGAAATTGGTTATATAATCCAAGATTAAATTGGACTGTGTCCTATGATTTGGTATCTTCAATCCTGTCATTTACTAAATCCCTTCAGAGTTGA---ATCAATTGATGTAGCTTCCAGTA----------------------------TGCCATGAATAAAGTTATTTAGTCATATCCCATACATATGATT----------------TCTTTTTCTGTTTTTGGTTTTTACTTGCCAC-------CAAGTAACATCATTCCAGTAAATGCTGAGGTGTTTGTTTTTACCAACAGTATTTTCT--------GTGGAGTTTCATTGCTTATGGATATGACAAATTAGAGTGTGCAGTAACTATAAAG-----GTATCTTTCTGTGAATAAGGTCAGCAATATAAATTTGAACTCTGATCTTCAGATTTTTAAACTTTTCTTTGATGTCATGCTAAATTATTTTTTGTTCTTAAAAAGAGAAAAAGGGGGTTAAGTTATTATAAAATGCTTTACTATTTAGACCATATTGAAGTGGCATTTTATGACTTTCAGAAGTGACAGTAAACCAAATTTCACTGATCTTATTTTATAA a score=23516 s mm7.chrY_random 15253461 722 + 30114534 GTCACAATGCATTTTTAAAAGATGAAATATCAATTCATTCTGCTGAATGTACTTCATTCTATAGATGATAAATATAACAAAGGCAAGAACAGGTTCTCTAACTATAAAACTATTCTTGCCTTGTTTCAAGAGAATTAAAGAATAAATAACTTAGGAAAATGTAAAACTTAGAGTGTATATGTTTGTATTCTATCAGAGATCAAAAGCTGTCAGCAACATCTGAAATATTGAAGAAGCAAGCAATTTACTTCTTAACTCTTCATTCCTATGGGTTCAAAATAAATTCCCTAAAATGTGGTTATTATTTTATGTGGTCTACTTTTTTTCTTACTTTCCCTTTAATTGGGACTTCTTTGTTTGAAGTTCACTGTGATTACATGATTATATGTGCTTACTTTATGGATAACAAATG---TCTATATGTTCCTTTA--GAGGTCCATATACCATGCAGTCACTCTGACAAAAAGCCATCCAGAGTTGTTTGGTTAACAAT---------------ATTCACCATACTTTTTCAGGAACATGATTATTGTCAGGATTTTATAATTGTCTTCACTGATTCCTCATGGTTTACAGT----AAGTAAAATACC--TAAGCTTTAATGA---ATGGCATT-CTTGACCATTTCAGTACATATGTTTGGATGACATGTTTTCTTTTGCCAAAATTAAGAA----GAAGGCACCAT---AAACAACTATCATAAATCAGAACTATGCAACACACATTGTAGGATCAGGAAG s bosTau2.scaffold2476 5604 742 - 113929 gtCACAATGAATTTTTAAA-GATGGGATACCAATTCATTCTACTGAGTGTAGTTGGTTCTGTAGATGATAAATATCAAACAGGAAAAAGTAGGTTTTCTAACTATAAAACTGTTCTCACCTTGTTTCAGGAGAATTAAAGAATAAATAACTCATGAAAAAGTAAAACCAGGAGGGTGTACGTTTGTATTCTGTGTGAGATTAAAAGCACCCAGCTTTAACTATAATACTGTAGGAGCATTCAAGTAACCTATTAACTATT--TTTCCATGGAATAAAAATAGATTCTCCAAAATATGCTTCCCTTTCTATAT--TTTTCATTTCTTCTTACTTCCTCTTCGACTAGGACTTATTTGTTAAAA-------GTGGTTAAGTGA-TATGTGGGCTTCTTTTATGGACTGGAAATGTGCTATATATGCTCCCTAAAGGAGGTTAAAATATCACCTAATCACTTTCAAGAAAAGCCTCAAAATATTATGTAGACAACCATCCTTTTATCAGGGTAATCTTCTATACTTTCTCAGATACTTGACTGTCACCTTGACTTTAGAGTTATCCCCAATAAATCCTTGTATTCTAAATTCCACACACAAAATTTCATTGGGGCAAAATGAAACATAGAATCATTTGCCCATTT---TACATACACTGGGCTTG-ATCCTTTATTATGCCTGAATTAAGGAGAGGGAAGGTGCCTTTTAAGGCACTCAGGATAACCCAAACTCAGGCAGCAAAACTTTCAGGACAAACAAG a score=4761 s mm7.chrY_random 15254223 221 + 30114534 ATATATCATTTTTATT----GTTCCCTCTGTCTAATTCTTG---TTATGATTCAGAACTGAT--ATATAGGTCACTTGCATATAATTTCAGCATACTATCTTTTTGATAGTATATATCTTTGTTCACCCTACCCTTAGTCATTCAATGCCACTGAAATAACTTAAAACACTTTTACACAACAATTTCTATACATGTTATTTTGGCCAAAATATTACTTTATTCTAATAAG s bosTau2.scaffold2476 6618 212 - 113929 ATGTATCATTTCTTTTTGTAGTTAATTCCATTAAACACCTGGTGTTATTGTTCAGGTCTGGTCCATATAGATCAGGTGTATATAATTGTA---------CTTATTGGAAGTATAGGTCCTTGTTATCTTTTCCCTTAGTCATACAGTG-----GAGAT--CTGAATGCACTTCTATAAAAAA--TTTTATCCCTGTTATTGGAGATAGGGCAGAGATTTATCCCCATAAG a score=12694 s mm7.chrY_random 15258134 469 + 30114534 GCTTTTGTTGGAATGAAAATCTCATGAGAATTACACTCAAATAATGTTGCTCAACTATTGAAAAAACCTTCATGACTAATTATTTACTCATGCCAATTTACCCAC-AGGACAGGATATATGTCATAGTTTTGATCTCTGTCTGGATTAGTTAGGTTTATTTAAAATGCATGGCTAAA-----TACCCCAGACGTTAATCTTAGATATTCCAAATGAGCAGTCTGTGTCACAAAGTTCTGCTAGGTGTGAGA-----AGGTCAATAAATCATTGAAAAATAATTACCTTTCCTTCTGCATAAACAATTCAAAGCATTCACACTACTGATCTTTGGTCAGCAATGTCAT-TTGTTTACACGAAAGATAGCACTTTATTACTGTAATTACTTTCAAAGTAGGAAAATGAATGATTTTTAAA--GATTGTGTCTACTTTTGGCCCTCTAATGAAAATAGTTATGCTAATTATGG----CTTTacacacaca s bosTau2.scaffold2476 37451 468 - 113929 GCTTTCACTAGAATGAGAATCTTAGGGGCATTTTACCCT--CTGTGTTTCTAAATTAATGAGACA-CCCTGATGGCT---TATTTACCTTGGCTCTTTTTCTAATTAGGCTATGGCTGATGTCATAGTTT-GACCCCTTTGTGGGTTGGTTAGCTTTATTCAAT-TACATGGCTACAGGCTGCACTCATGACCCTAGTCCTTAGCCTTGCAAATGCTTGTTCCTGGGGA--------TGCTGGGTCAGAGGGCTACATGTAAATGAACCAGTGAAAAG--ACAGTCCTCACTTCTGGATACACAATTCAAAGCATTTAACCTACTGATCTTGGGTCAATAGTGTCATCTTGGTTAC-CAAAAGACAATACATCACTACTGTAATTACTTCTGAGGCAGTAAAAAAGAATATTTTTAAAAAGGTTGTGTCTACACCTTGTCCCCTAATGAGAATTATTATGCTCACTGAGGTACTCTTTTCCCACACA a score=15128 s mm7.chrY_random 15258749 1066 + 30114534 acagaaagCACAGCTTTTAGGCATTAAAAATGTTTTCAAGTAAATCTTTTCCA-TTCTAAAGTTATAAGAAAATCAAATCTGTCCAGTGCAGTTTTAGTTTTATTTGTAAGAATTATATCACACTACTTTTAAATGCTTTAAGTTTTGAA-TGTTCTTATATGATTCATAATACTGACCCTCCTTATGGAGCAGATCATTAATTGTAATTTTGAGTAGCAGtttatttttattttatattaaCTCAAAATACGTGGCCTGGAAATTTTAA----CTGTTGTTACAGGTATTTTTCCGAAAGGCATGAATGAAAGAAAGAAAGAATGCATGAATGTTAGATATTCTATCAATAACTAAAGATTATTTATATGATAACTAAAGGTAACTTATATGTTAGAAATACTTACTAAAAGTGACTCTGTAAGTTGAGAAAGAAAAGGCACAGGCACTGAGGATATAAATAAATATGTGTgggcaagtgagatagtggaaagattaagatcattggctgctgttccagaatttctgagtttaatttccagcaaacggatggtggctcatgaccacctatatatggatctgatgccatcttctggcatgCAGGGGTACATTTGACATAAAGACATAACATTCATACATTTAAAAATACCTAAATAAATATAGTGTAAAAATAAGACTTTGCTGATGCTTAGCAGTTtttttgtttttgtttttgtttttCAATTTGGGGAAACATGGTATACCTCATTTGTGTTTGTTTTACTGTGAACTAGATTGTGCTTGAAATATTCATAGCTTTATATTTACACATCCCTTGGTCATTGGTTTCTTATTCATAATTATTAGGGAATGGAGTACAAAAAGAAGAATGATATATGCCTTTAGAATTAATCGACCTTTCTTATCATGGGACTGAACTCTGGCAGAAGAATGGTATGGAACCAATGAATGAGAAAaaacaaaaaaacaaaaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaaAACTGGATGTTTCCTGATTTGATATGCTGGCATAGAACTGTCTCTATGGTAATATGTT s bosTau2.scaffold2476 37919 775 - 113929 ACATGATCCATGATCTTTAACTGTCTAAAATGTTTTAAAATGACTCCTTTCCAACTGCCATGTCTAAAGAAATTAAAATCTATACTGTTTAGCTTTAGTTTC--CCATGGCAACAGTGCCACACAACTTA-ATATATTTTAGGTACCGAAATATTGGCATCAAGTTCCTAATGTTAACTTTCCTTATG-AGCAGTACAGTATCCATAATTCTGACTTGTAATTTATTCTTATTCCACATTAAATCAAAATATGTATATTGGAGAATTGAAGGAACTG--------GAGATTTCTTTGTTAGG-------AAGTGGATAAATGAATGAATAAATGTTCGGCACCCAGACAGTCATCAAAGGT-ATTTTTACAA------------------ATGT--GGACTACTTGTAAAAGCAAACAAAATAAATCACAGAACAAGTGACACAGAAGCTAGAGATATGAAG-----------------------------------------------------TCAGGATTTTCTGCTTTGA-------------GGGTAGGGA--------------------GACCAAGTGCTATAAT---GCATGCAG---------------ACTGTCATAATATTTGTA--------------------------------------------------------------------------------TTTTC-------GGGAACATGGTATACCCGATTTAGGTTTGTTTTCCTGAGATCTAGACCAGGCCTGCAGTATTTATAGCTCTTAATTTGATCATCCTTTAGATGTTAGTATCTCATTTATAATTGTTGGAGAATGGGGGA-AAAATGAAAGATGACTTATGCCTTTAGGGTTAATCTGCCTCTCTTCTCATTGGACTCAACCTTGGCAGAAGGATGCTGTGGGACCCATAAATCAGGAAGA-----------------------------------------------------------------TATCCTGATTTGATATGCTGACATAGGCCTGTCTCTGTAGTAATATGTT a score=19316 s mm7.chrY_random 15261487 1196 + 30114534 CTTTAATGCTCTGAACAACCTGTTCTCTTTATCGAAATGAAAATTCATGTGTGTGACATACTCGGTCTAGTTGGTTGTTTAATAATATGAAATTATCCTTATTCTTTTTCCTCTTCATTTG-CACAGAAACTGTCAGTGCCCATTACTTAAATTAAGTTGAGAGTGTGAGCAGATAGTTTGAAAAATGAACATTTAGCAAATGCACTTTTCTAACGAAAAGGAGCTTG-CCAAATAGTGACCTAGCTGAAAATAGTACATTGGACATAGACTAAAAAGCAATTTAATTTGAAAAGTTTTTGGCAGTTCAACTTGCCTGCCATATTTCTACTTATTTCAGATCC-TTTATGAACATTTCTTTGC--TTTTCTAAAGAAGGG--AATTGAACCTGTCTGTACTGTTGTAGGAAGACAACACCAA-ATTTCAGGTATCAGTATGGCTTAGTAAAACATGTAGAAGTATTAGAACATA-ATTTCTCTTATAAATGCTAATTACAATGACAATTAAATTATAATAGTTTCAGTGAGAAA-ATTTATAGTTCCTCATATGCCAGGAAGTTATTTTAAGGAGATGATACATTCTCT-TTGTAGTATATGTAAACATGTATTCTGTATAATAAAGGAATTATGGCTTCTGCATTGTGATTCTTCATAGACTTACTAATGTGTACTTCTTTAtcctgtttgccatttatgataggaggtcttagatctcatccattgattccaactttttttcagcttctttttaccaaaattttcaactataatatacccttaacactct--agatctataatataaatgagccctttcttcttttataagttgacctggttaaggtgttttatGATATTGATAGTTGGTATTTTGGATAAGATAGACCCTAGATAAAGGAAGAAGCAATTCCCACAATCATTTCTCCACAACATGGAATCTATTTCAACAACAGTGAAGGGTTCACAGTGACTCTAATTTTCTTTT----------GCTTACTAATTATTCAGTGTCATTTGGAAGAGTTGGCAGTAATCTTTGAATAAACAGATTTTAAAATGATAAGTTCTCAAATTGGGGTTTCCATGTTTAATTTTTAGATTAGGCTGGATTTTCTTCTATTTACTGAATTAAATTGAATTTCATAAAAACTACAGCCTATTTTGA-----TGCCTTGCATAAATA-------TAGTGATCTTCCCACTTTTAGTAGAAGGAAA s bosTau2.scaffold2476 38694 1007 - 113929 CTTTAATGCTCTGTTGAACCTGTTCTTTTTAGTGAAATGAAAATGCATGTGTTTTACATACTTGGTCTAGTTGGTTGTTTGATAAAGTGAGATTTCCCTTATTCTTTTTCCTCCTCATTTTCCACAGAGACTGCCAGT------------------GTTGAGAGGGCTAGCAGATAGTTTGAAAAATGATCATTTAGGATATACTGTTCTCTACTAACTTTGAGTACATCCAAATAGTGATCCAGCTAAATGTAGTCCACTGGACACAGACT-AAAGTTAATTTGACATCAAAAGTTTTTAACAACTGAATCCAGCTTCCAGGCTTCTAGCTACATGAGAGCTATTTCAAAAGAACTTTTTGCCATCTGCGTAAGAAGAGACAAATGTACC--------ATGTTGTAGGAAGACCACATAAACATGACAGTTTCAAGAACTGCTTGATGTCACATGTGTAGGTATTAAAATATGCCTTTCTCTTGATAATACCACTTGAACAGGCAGTTCAATCATGCTAATCTCAGATATACATATTTAACGTTTTTT---TAAAAAGAAG--AATTGGTAGAGAAGATTCATCCTCCATCACCATATACTAAACAACATGCAGTATATAGTAAAGGG-----------------------------GAGCCTACTGAGATGT-TTTCTGTGTCTCCT------------------GGTCTT-------------------------------------------------------------------CCTTAGAATTCTGAGGGCCTCAAATA----------CTTCC-------------------------------------------TAGTTGCAGGTTTGAGTTGGATCTACCCCAGAAAGAATGAGAGTCCATTCCC-TAAAGACCTATACATAACCTGAAGAATACTGGAACAATAGTATA----------TGACCTTGTATTTCTTTTTTCCCTCTTCATCTTCCAATTAGCCAGTGTCATGTTGAAGAATGGG-AGTACCCTATGGATATACAGA---TAAAA----ATATTCCAAAATTG----TTTTTTTTTTTTTTGTTAATGTAGGTCAGAGCTGCCCACACCCCTTGAGTTGAATTAAAACCTTTGAAGTTTGTAGTCTATTTTGATATTTTGCCTCGTAGAATTATTTATTTTTGTGACTTTGAC-TTTTTGGTAGAGGGAAA a score=3916 s mm7.chrY_random 15266456 173 + 30114534 GCCTCCTCCTCTCCAGTTGTTTTCTAACTCCACAGCTGGAACAGATTTTCTTGTCCTATCCTTAGCTATAGCCTTTCTTTTACTCAGCTGTCTAGCAGGATTTTCTTTAGGGTATGCCATTTTAACTTCGCAACGGCTGGAGCCAATGAAATGGTACCTGTTTTCTAAGACCT s bosTau2.scaffold2476 33717 146 - 113929 GCCTATTCCTCCCCAGCGGTTACCTTGCCTGGCAAATGGAA-----TCTCTCTAACTCCCCTAGGCTGTGACTTTGC----------------------ATATTCTTTCCGGAGTATAATTTTAATTTCACACCGCCCAGAGCCAATCAGGTGGTATCTGGTTTCTAACAGCT a score=20608 s mm7.chrY_random 15266629 1091 + 30114534 TTCTAACGGAGTTTTCATCCATGTATTTGATAAAGCCGAAAGCTCTTCTTTCCCGTGTATCTGAACACAGTGGAAGCTCTATAGCCTCTATCTGCCCAAATGTGCCAAAGTAAGCTCTTAT-TTTTTCTTCAGACAACCGTGGGTTCAGC--CCACCCACAAAAATCTTTTTGTTGGGGAATTGAGATTCAAGGGCTTTAGCCCTTTTAAATTCTATTTTCTTGCCATCAACTTTGTGATCTTTCACTTGAAGCACCTTCTCTACTGTGGCACTGTCTTTGAAAAGCACGAATCCAAATCCCCTAGACAGACCGGTATTTGGGTCTGTTTTTATAATAAAATCTATTATCTCACCAAACTTAGACAAGTATTCTAGAAGTACCTGCTTGCTCATTTCTTGCGAAAGTCCCCCGATGAACATCTTACTGGCATCCTGTTGGTTCTTGGTGGCATCGATTTTGAACCCTTCCCGGAATTG-CTCTGTTTCATTATCCTTTTCCACAGCGAGGCTGGCAGTATTCATGGTAGATAGGCTGGATGGAGGTGATTTG-ACTGTTGGATAATCACGGGCCTAGGCATAAATGGTGGGGGCACAGCCGTCCTCAGGGAGGAGGGGAAATTATTGCACAATAGTGACGAAATAGAAACAAGCATTATAACTAGAGCCAACGCAGGAGC---TGCTTCGTATCCTAAACTGAGGGGGGGGCGTAAGGAGGGTGAGGAGGGGCGGTGCCCGGGGGTGCA-GAGATAGTGTCTGATTTGTCCCTCAATGGTGTTGAAGCTTGCCATGTATAAAGCAGGCCTGCCTATAGACTTTCTTTTTGTGCTTTTAAGGCCTGAAAAAGGAATAGTATGTTA--GAAAAGGAAGCCTTT------TCGTTGTTGTTTCTGTCTTTTCAGTCTTTTCATGTTACATCTCTTTGAATTTTGTTAAAACCGATTTATTTTTTCTGGAATTTTCCTTGAATGT-TGAAAAATCA---ATTCATTTC-ATACTTTAGATGAGTTTCATGTTAATCTTAACTATTTGGAAT-AGGGCTGAG-ATGGGAAAGAGATACAAAG-TTGAAA--CATCCTACA-GGAAAACAAAATGTCTATGGGTT s bosTau2.scaffold2476 34363 1029 - 113929 ttctcacttgttttttGTCAGTGTACGTGATAAAACCGAAAGCTTGTCTTTGGTTTGTTCTTGGACACAGTAGAAGCTCAATATTATGAATCATGCCAAATGCCCCAAAACACTCTCTGATATTTTTCTTCAGACATCCGAGGATTCAACTCCCCCCCACAAAAATTTTTCTTGAGGGGAATTACGAGTCCAAGGCTTTAGCCCTTTTAAGATTGATCACTTTGCCATCCAGTTTGTGCTCTTTAACTT----------TTCAATGGCGGCCTTATTTTTGAAAAGCACAAATGCCAAGCTTCTGGAAAGTCCAGTGTCTGGATGGGTTTTAAGAGTAAAGTCTATGATCTCACCAAATTGGGTCAAGTATTAGAGAAGAGCTTGCTTAGTGATATTATGTGCTATTCCCTCGATAAACATTTTACGGGCATCATTCTGATTCTTGGTGGCTTTGATTTGGGATTCCTCAAGGAGCTGTTTCTCTTTGATTTTGCTAATC----GTGAAGCTCATGGCATCTCTGA-AGAGAGGCTGGTGGCTGCAGAGCCGTGTCACTGACTAAAAGCTGACTGAGGCTCAACTGACAGAGA-------------AGGGGGATATGGGAATTG--GCGGGAAAATGATGAAACAGGGA----TGTGGTGACGTGAG--ATCTTGGGAGTGAGTGGTTTGAGCTTTGAAATGAG---------------CTCTGAGGAG----AGTGCCTGGTTGTATGTGAGAGTGAGCGGGATTTGCC---------TGGCGGAAGTTGGTTTGCTTCGGGCA--------TGTGAAGTTTCTGTC-------------CTTAAGAAAAAAATAATAACTCAATAAAAAGAAAGTTTGTCAGGAGTCGCAGCAACTCC--TCATCTTGTTCTTTTCAGATGGCATCTC-TTAAGTTTTGTTAAAACTTGTTAGTTTCTTCAAG-ATGAAGCCTGCATGTCTCAATGACCACTTGTTCATTGCTCTCCTTTCCGTCCTTTTCCTGTCCGCAGCAA-TATTTGGGGTCAGGGATGGGAATGGAGGTGAGGTGGATAGACTGAAAAGCGGACTACAGGGAAAGCACAATGCCTGCAGGTT a score=7750 s mm7.chrY_random 15333311 421 + 30114534 CTATTTACTATTTA-CTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCCATGCTGT-------GCATGTGTGTTGACACAATTAAGTTTCATCTGGAGACC----------ACATATGAAATGCAAATATTGTGTGTTAAATCTTTCTTCA-TGTTGCTGT-----------------------------------ACACT-------------------TTCAGTGTGCATAGCTAGAT-ATTCCTGTTTAGTATTTTATTATACACTATATATAACATACAGTGTATA-TGATGAATCCAGTAC-TGCATTTTTGAAATGTTGTGTGATAGCTTGGT-GATTTAAAAAAAAAAAGTTTTCAAGGGTCTTGGCTGAGACT-TGCAGTCTTGTATTTGTTCTTTTCTAATGAATCAAAATTTCCTTTTATTCTGTGATTGTGAGAGGCAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAGAGCCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGCATTC s bosTau2.chr3 40229840 508 + 85360813 CTTCTTACTGCATAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGG------AAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAA--------------AATTTCCAGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGGTTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=15330 s mm7.chrY_random 15339350 1066 + 30114534 TCTTGTTTCCCTCACTCCTTTC--TTTCCTTAGGAAGAAATGTCAATCCACTGGT--------------------ACTTCAGTTGTGAATGGTGGTACCAAGGGGATTACA---------GTAAAATGGTTCCTATAGCACAAGATAATGAATGAAGTGAACCAAGATGGGCATTTCAGCACTAAAAGGTGAA--TTGTGCTGAACAATAATGCATCTTTGCAAGATGATTCAACCCAGAGCAGTTATGACAGCTCCCAGACTAAATGTCACTCTCACATGAGTGCTCAGCAGTAGTTCTTGACCTTCTCTTACATGCAAGGACTTATACCACTAGAGGCTTCAAACCAGCTTTAGGAATTATGTGATCAGTGGCTGATGCCAGAGACCAGTTCAAAAGAACTGATCTTAGAATCTCTGGAAATACAGCAGTTCCTAACCATTGTGCCACAGGGAATGAACTACTGGGTGAAAAAGCATCATCCCAAAGATGCCAGACATGCCGTGGCTCTGGTCAGCTCTTTGAAGACACAGCCACATGCAGTGCCCAGTGAGGTGAGACCAAAGATTTTTTAT-TATCAACAATGACA-----TAAAACCCAGGTAAATATGTCTTGTTTGAAAGTTATCAAATAG--TGGGACAGCTCTCT----TTCCCTTAGAATGGCTAGGCAGAATCC---ATTAC---CTTTTGATATTCACTTTATTAGTCTGGGAGTTCCTAGCAAAGACTTTCATGGCCTTAAAGGGGGAAAGTGAGTAATTTTTGTCTTTTTTAAGGCCGG---GAATTGACAGTGGTGGACCTGCT----CTAGCAGATCTAAGAATAGAAGCCTAAAGACTTCAGAAACAAAATTGAAAGGCCAGAAAGGGAAGTTAAGGGGTGATTTAGTAACTGTCA----CAGCACTTACA----CAGATGAAGTAGAGGGTAAAGAACCAGAG-----ATTAGACAACATTGGGGAGAGTA-AACGGTAGAAAAAATACAGCAAGCAAAA---TGAAAATATGTCAG-----AGAAGTATGCCAAGAG--AGGTAGAGAGATTCTAAATGGTGGGGC-TAATAATCGCT----TTTGAAAATACATCCCTGAGTTGAGAGTGAATGTTCTCCTCTGTCCTGTCTT s bosTau2.scaffold16262 4595 1121 - 6750 TTTTTTTTCCCTCCCCTCTCTCAGTGCCCTTGGGGAGAAG-ATCCACTCATTGGTTTTGTACCAAAGCTGACAAGGCCTCAGTTATCA--GGTGGC-CCAGGAGGATGTCACAAATAGAAGAAAAGCTGTTCCCAGAGCAAATAATGATGAGCCCTGTGAA--GGCGCCTGCATGCTTGTACCCACATGTGGAGGTTTTACAGGGGACTAAGAGGTCTGTGAAAGAGAGTTCCAATAAGAGTAAGAAATCCAGCCCACAGATGGGCAGTCTTCATCCTGAGAGTGCTCGCCAGCACTTCCGGAGATTCTGTTACCATGACACACCTGGACCGTATGAGGCTGTCAGCCAACTGCAGGAATTATGCTCTCAGTGGCTGAGGCCAGAGATCCACTCAAAAGAGCAAATCTTGGAATTGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTGGACGTTCTGCCCAGTCATATCCAGAACTGGGTGCAGAAGTATCATCCACAGAACGTCAAAGAGGCTGTGGCCCTGGTAGACCGCTTTCAGAGAGAATGTGGTGGAATAAGCAATGAGGTGAGCAGAAAGATTCCTTATATGTACACTGTGAAAGAGGGTGAAAGAGGGGTCAATA------ATTGGAGA---ATGAGATGGATTAAGTCACTCTTCTGTTGTTCCTTTAGAATAACTAAGTGCAATCTGAAATCACAGGCTTGCACTGACAGCTTCTCAGGTTGGGGAGTTCCT-GAGAGTCTTTTCCTGGCCTTAGAAAAAGAAA-----TGCACTTTGCCCTCTTTAGGGCCAGGGTGAATTGAAGGTGGTGGGCCTGGCCTAGCTAGCATGGCCAAGGAGACAGGACTTAGCAGCCAAGAAA------TAAAAGGCAAGAAA---ATGCTAGGAAGGGAGGAAAAAACCTCCAAATGCAGGGTTTTAAAGGTCAAAGGCAGGAGAGGGTAGC-AGCCAAAGTATAAATCAAACCTTTCTGGGGAGACTGCAAAGAAAGAGAAGAAATGGAAAGAGAAAAGGGGAAAAAGGATCAGAAACAAGATATAAGCTCACAGTAAAATGGAGAAAATCAGAATGCTGAGGCGTGGTGCTCTCTGGGCTGGGAACACACATCGCAGGGCC-AGGATAAAAGTGTCTCCGTGGCCTGCCTT a score=7827 s mm7.chrY_random 15382795 589 + 30114534 TGACTTCAAGAAT-GTTTAATGCTAAAGAGGGTCTTATTTTTCTCCAGATGTCTCCTTTCACCCACCCCATATAT----------ATATATATATAGTAAAAGTGTGGTGAGTCCCTGTATGCACATTATCAAATGTTTCTGATTCAACTTGTGCACAAA-GCAATCTAGATTCTGTCTTTT-TGCATTGATGCTCCTTTTCAGGGAAATG-AAATACCAAAGCCTA---TCTGAAAGTAAGGATTTTTCAAAAGTCTCATTTCCTTGGGAACTCTAATTT-AAAAGTTTATGTTCATTATGGAGAATGTATTATGAGCTTGTCAAGGGCATTTGAATATGAATTTCTTTCATGTTATG------TTTATTTTTCCTTTGTGACTTGAAGTGGAAGCTACTCACAAAAAAAAGAGGTATCTAAAACTACTTCTCATTATCACA----CTTTCTGTAAGTTGAGATTTTTGATGTTGAAGAGGA--ATGAAGTGAGG-----------GTGCAGATTTTGTCCACATAACTCCTAAAAGAAAGAGCAATAGGCATGTTCCATAAACACATGTATTCGACACCCCAA-TGAAATTGCATGGGTA--CTGGCTAAATCTAAAGTCCTTGTAAATGA s bosTau2.chr17 25734852 611 + 45915461 TAACTTTAGGGATCTTTTAAAACTATTAAGCCACTGAAAATCCCCCAAATGT-TCCCTTGACCT---CCATAAATCTATCCTTTTGTATGTATAGAGTAAGCATCTCAATAAGCCCTAT-----TATTATCAAAAGCTTCTGATTATATATTTCCACAAAAGGATTCTAGCTTTTGTCTTTTATCTATTAGAATTTCATTTCTTGAGGCTGGAAATATCAAACCCTGCATTCAAATATTAAAGCTTGCAAAAATATATTATCTCCTTATAAATTCTAGTTTTCAAAACTGCTATTTATTAAAGAAAATGAAT-AGGGTTTTGCATTGGGTCCTTGGAT-TG---TTCCTGTACTTTATAGTCTGATTTTTTTTTCCTTTGAGACTGGAGGTGCAAATAATCAATGTAGAAAGAAATTATTTAAAA-TATTTCTCCCTAGCATCTAGTTCTTATATCAATTGAGATTTCTAAAGATGAAAAAGAGCATGAAGTAAAACAAGAATAATTACGTAGGCACTGTT--CATGCTTCTTAGAAAAAGGAGGAGGAAG-ATGTT--ATGAGAAGAATGATTagatttaccaagtaaaattgc-cggataccccagttaaat-taaatttcagataagtaa a score=10913 s mm7.chrY_random 15384770 435 + 30114534 ATGAAAAAGAAAATGGAAT----------CAAGTA----ATAAGTGGCCATGACACTTGGTAGTATAATTTAT-ATCATTA-CTTTTCATTTCTCACAGGTTAGGGTTATTTGCATAACATGTTTCTGATCAGCCATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCACCTTAACCCCACCCCCCACACACTCACCATTTCTACTTGATTA--ACCTCATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATAGTGGGAAATGTTGATGTACAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAAAACAGAAGTCAACAGGTTTGAATCCATTGTTCCTGGGAGCTGAATATTTCCCATCGATTTAGTAAAATATTATAAAT-ATGATTTTGAAAC------AAGCC-AAACACCCTGAAAAAGTCTT--ATTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742212 443 + 45915461 ATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC-------------------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCT-ATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=36747 s mm7.chrY_random 15390806 1171 + 30114534 TCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATACC-------AGAGATTCTATCTATGCTTGTTTTATCCCC----TACTTCCTAAACATCCATCTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCGTATCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCATAGAAGCTAAGTCCTGT-CCATTTTTGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTTCAACATTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCCACCATAGTC------CATCTTTACCA--ACAAAATGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTCATTGGCAAAGATACTGGGGTTGTCAAAGACCCATAAGTAGCCAGCACA-GGAAAACAAACAT---TTATTTTTTTCAATCTTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTTTGATTTTTTTAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACGTAGATACGTATGTCACCATGAAACATGATAAAGTACAGAGTAGGATTGGCTAGAAATTTGTAAACAACCTTTCCGATCTTTTTTGAACCATCATCTATGGTGTACTGCACCCAGGTACCTATTAAGATGTCACTGTCATCACCTGATTTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACATAGAGGACCGGGTCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAACCAGTCCTTTAAGAAAGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTATCCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTTTTGTACTTCTCTGCCAACCAGGGCGCTGGCAAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGAACTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAAGGATGGCCTTCCAATGGGCGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAACATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTTCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGA----TGTCATGCTCAGACTCTTCAG---AGGTATTGTCTTCTAC s bosTau2.chrX 20326712 1223 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCC--ATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTT--ACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCTTTTTCTTCCTCATACT-TGCAGACAAGGTGTGGTCATCAAC a score=9466 s mm7.chrY_random 15393826 478 + 30114534 CAACATCCATGGTGGTTATTTTCCATGTTCCAACCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTATTATCATAAATATTGCCAGACTCTTGGA-GGCAACACACTGGATAGCACACCAATTTTCGCTTTATGAAAACCCACAGTTAGAGGAGGACTATTT-TTATGCAAACAAAGCTGGAATTTGACAGGGTTAAATGACATGTATTGAAACCAATGGCAATCGTAATTATGGATTATTTGGAAATAAGTGGACAACATAGATTTTGGGCATGCTTACAAAGTTATGATGAACTTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTT-TAAAATTTACCAGCACTTCTGATTATAAGGAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAAATGAGGTAATTTTACATTTGAAATATGT--GTAGACAGAATACTGGACTCAGGTAAGTATAAAATTTACTTACAAAT s bosTau2.chr17 25750436 439 + 45915461 CAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAGTGTTGCCCAT--------------ATAGAATGTTGGCTGGCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAAT-AGTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGA------TAACTATGAGTCACTTGAAAA-----------ATTAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCAT a score=8179 s mm7.chrY_random 15396303 429 + 30114534 AGTTCAGATTTTAAAATGCATTTTCTGACTCACCAATAAATAAAACTACATCAATGTTGTTGGTACCAATAAACCTTAATTGTAATAATACAAACTATGTTAAACACCAAAGATTTCATTCAGGTCAGAAGCCCTTTAACTAT--TGAATTTGGGAGACTATTACTTCAGAAATGTTAGCTCATTTAACACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATCCATGACACCTGTGTGAGAAAACGTTTAACAGACGATGGAACCTTCTCAGAACCCATAAAATACATAATCA---GGATACACAAACTGAATTCCCAGGCTAAGAGAATTTAGCATATTGCAGGGACAGAATGTAAGAAAGGTTAAAAGTGTAGAAAATTTGGAAGAGTTATGTTATGTTTCATTTCATAAAACGATATGTTAGAATGTATACA s bosTau2.chr25 346576 418 + 41414979 AGCTCTGATCTTAATAAGCACTTAACAACACACCAAGGAATAAAACCATATAAATGCTCATGGTGTGGGAAAGGCTTCA--GTCAAAAGACAAATCTCCACACACACCAAAGAACTCACACTGGAGAGAAGCCCTTTACTTGTCATGAATGTGGGAAAAAATTCAATCAAAATTGCCACCTTATTAAACATCGGAGAACTCACACAGGTGAGCAGCCTTACACCTGTACCACGTGCAGGAGGAACTTCAGCAGACGCTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAAACTCCACCAGTAAAGGGACGTTTGTTCAGTGTCCTCAGTCTAAAGAAATTTATCAAGT----GGAACTTGACTT--TAAAGTTAAGAAAAATACAAAATTATGAAGCATGAAG-AATTTTTCATC-------AGGAAACTTTGGGATATAAACA a score=3326 s mm7.chrY_random 15492592 70 + 30114534 TGCACATGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCGGATACATACACACAATAACACACAAGCTTATACACTTA s bosTau2.chr17 11845060 68 - 45915461 TACACATATGTGTACATGTGCATGTGTGCGTGCAAACACACACACA--TACACACATCCCAAAGCATTTA a score=10098 s mm7.chrY_random 15524769 403 + 30114534 AGTGGTCATGGCACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTAATTTCTCACAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGTTTCTGATCAGCCATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCCCCCGCCACACACACATTTCTACTTGATTAACCACATTGGCATTAATTATTTGTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGGGAAATTTTGATGTACAATTAATTTCTATTCATAATGGGATAAAAAAGAAGTCAACAGGATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAGATTTCCTCTCGATTTAGTAAAATATTAGAAAT-ATGATTTTAAAC-------AAGCC-AAACACCCTGAAAAAATCTT--ATTTTCATATTTTCATTATTTATAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCCTTTC-------------TGCTAATTGAG-GATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=35364 s mm7.chrY_random 15535867 1241 + 30114534 ATTTCTGAGTCTCTTTGGATCAGTTTTCTGGGTTGCACTTTGTGTAACAAGGCTACATTCCTTTTATCTATCACTCTTT------CCCCAACGTTTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATACC-------AGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCTTAC---TTCCTACACATCCATCTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGCAGCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTTATATTAGATGTATACACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTTCA-----ACAAAGTGTTAACTAAAAGCATGTCAT-GTCACATGTATTAAT----TTTTAGAACAAGACAT--ATTTTATTAACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCC-CAACACA-TAAAAAAAAACATTTTTTTTCAATCCTATAAGTTTACATTT--CTGTATTT-TGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACGTAGATATGTAGGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGAACTTTGTAAACAACCTTTCCGAATATTTTAGAACCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGTACCTATTAAGAAGTCACTGTCATCACCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACATAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAACCAGTCCTTTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTTTCCTCAGAGCCATGTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTTTCTGCCAACCAGGGCACTGGCGAGATGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTAGTGAGGCAAGACCTTAAGA-TTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCTTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAAAATGATGACCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTCATTACCGTCCTTCCAACCGTGAGAAATTCTGCAGACAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTGCTCCTACATTTCTTCTTGAGTGA----TGTCATGCTCAGACTCTTCAG---AGGTATTGTCTTCTAC s bosTau2.chrX 20326653 1282 - 48857030 ATTTGTGTCCCTCTTTACTCAATTTATCCTGGTTTC-CTCTCAACCCCAAGATTTCACTC------TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTA--TACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGC----TCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTT-TTGAGAAATCTTTTTCTTCCTCATACT-TGCAGACAAGGTGTGGTCATCAAC a score=34881 s mm7.chrY_random 15571795 1116 + 30114534 CTATCTATGTCCTGTCTT-----------TCTCTCCTTCTTCCTAAAAATCCATCTTTTGCTGACATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATAGCTTACTCACTATGCAGAACACAGAAGCTGAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCAATGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCAACTCTTTCA-----ACAAAGTGTTAACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAAAAAAACAA--ATTTTATTAACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAAACCCATAGGTACCCA--ACACAGGAAAACAA-ACATTTT----TTTTCAATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACAAAGATATGTAGGTCACCATGAAATTTGATAAAGTACACATTAGAATTGGCTAGAAATGTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTCTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGTACCTATTAAGAAATCACTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCAGATCCTTCTTGTAAGAAATGTAAAACCAGTCCTTTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTTTTCTCAGAGCCATGTTTCCTCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTATGCCAACCAGGGCACTGGTGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTATTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTTATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGGCAGGCACATTACCTTCCTTCCAACCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACCTTATTCCCCAGAGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGA----TGTCATGCTCAGACTCTTCAG---AGGTATTGTCTTCTAC s bosTau2.chrX 20326796 1139 - 48857030 CTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCTTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTT------CCTTCTCCTCT-------------------CCTCTCCTTAGACAAGACC----AGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATAC---GTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCTTTTTCTTCCTCATACT-TGCAGACAAGGTGTGGTCATCAAC a score=5434 s mm7.chrY_random 15574614 253 + 30114534 TTTGACAGGGTTAAATG------ACATGTATTGAAACCAATGGTAATCATGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAAGACAACATATATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAAGTTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAATTTACCAGCACTTCAGATAATAAGGAATTTCATAGATAAAGTGCAGTAAAACAG-GATGAAATAGATGACGTAATTTTACTTTTGAAATATG s bosTau2.scaffold1094 48464 248 - 285174 TTTTACAGAATCAAATACCTGTCACATGT---GAAGGAAACAGTAATTATGAATTATGGATCATTTGCAAGAAGTGATACCAAATTAGTTTCTGGGCCTGTTTCCAACGTTGGAGTGAATTTATGACAAACTGGATATTGATGAAT--GGTTTCTAAAGTCTGTTGAATTTGTCAGCCTTGCCTATGAATGAGGATTTGTTAGGTCAAATA-AATGAAACGGTAATGAAATAGATTG------TTTCTTTATGAAAAATG a score=35916 s mm7.chrY_random 15624716 1270 + 30114534 GCAGGTATGG---TACTTGAACACAGAATGAAAGCCACAAGACAGTGTACCAGGTTA-CTGTGGCCTATCACACCAGTTCTACTGCCATGTAGAAGAAAATACCTCTGAAGAGTCTGAGCATAACATCCCTCAAGGAGAAAAGAAGGAGGAAGCCTTTTTTCCAAGCCCTGAGGAATATTGTTGGCTGCAAAAATTCTCACAGTTGGAAGAAAGGTAATGAGCCAGTCACCCATTGGAAGACCACTGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGCATGACAGAATTGACAACATCTATGAAAAGGAGCTCCACAGTGATGAGAAGATTTTAAATATTAAGGACTTGCCTCACAAACTAGTGTTTCCTCAGGTGAAGTATATCCACCTCGCCAGTACCCTGATTGGCAGAGTGGTACAATACAAATTTGAGGGAAAACATGGCTCTGAGGAAAACTTGAAGCGGGTGGTTCTAGACCAGGTGACAATCATGAAGGTCAGGTTTTATATTACCTACAAGAAAGATCTGGCCTTCTAAGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACTCCCCGGGCTGAGGTGAGATCACATGATAACAGTGACAACTTCATAGATAACTAGGTTCAGTATACCAGACACGATAGTTCCAAAAAGATTGGAGAGGTTGTTTACCAGATTCTAGCTAATCCTTCTGTGTACTTTATCAAGTTTGATGGTGACCTCCATATCTATGTCTAAAATCTGTTGCCAGAG----ATTCCTTAAGGTGAAAA--ATCACAAAAGTGCAGGGATGTAAACTTATAGGTTTGGAAAAA--------ATGCTTGTTTTCCTGTGT--TGGCAACTTAAGTGTCTTTGAC-ACCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTTCTCTAAAATTGAAACATA---------TGACATGACATATTGAGAGTGAACACTT-----TGGTGGAAAACACAGGC---TATGGTGTAAGAAACTTCAGAGGAAGAAAAAAGTTTCAATTTAGGCTGTGAATAGTACATACATCTAATATCACA------CATGATAAAATGT-ACAGGACTTAGCTTTTCTGGTAT-----GCATGGAGAGGAAGCAATTGTAGATTGGACTTGGAGAAGCAGGCATGACAGCAAAAGATGGAAGTTTAGGA---GGTAGGGGAGAAGGACAAAACATAGGTGGAATCTCTGGTGTGAAG-------TCAGAGGGAGAAACATAAAGTTGGGG------AAAGAGTGGCAGATAAGAGGAATGTGGTCTTG s bosTau2.chrX 28529038 1293 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCT---CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCAAA-AGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAG----GCAAATATAT-GATTTGGAGAAACACAAAATATG-TTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAA---AAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGA-TGGATTGTGGGGGAAAGGAA-------GAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-AT-GGAGAGGCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA------GAGTGAAATCTTG a score=3937 s mm7.chrY_random 15647240 107 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTATGGGAATA-----CAAAAATCCATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGCTTTTAA s bosTau2.chr5 36527708 112 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGTTTGGTTTTTTAAA a score=3651 s mm7.chrY_random 15647679 71 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAAGAAATGTA-----CTTTCAATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=7669 s mm7.chrY_random 15649219 381 + 30114534 AATGATTAAAGATATTTAAAAAT---AAAGAAGTTCTATTTTGACTCTAAAAGTATATCTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAGACAAAAAAGTTAGAGATTTTTTTTATTTGT---------TTTATATATATACCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTTAAACATAGACTTTTTTTTTCTTAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528244 417 - 76426644 AATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACGACTTAT----TAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGA---AGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTTTAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=2786 s mm7.chrY_random 15649712 106 + 30114534 TGTTTAATAAAGCAGG-ATAATTATAGTGTTATTAAAGTATGAG-----------------GTACATCTGAGGTCAAATTCCCATTTTATCATTTCATATCTTTAATAATTCCTACAAAGCCAT s bosTau2.scaffold10439 6776 123 + 23754 TGCTGAACAAAATAGTTAGGATTAAAGGGTTAATCAAGTATCAGTTTTCTTCACCATGTGTATACATCT-AGATTAAATTCCCAGTTTGCAGTTCCCCATTTTAAGTGACTCCCACAATACTAT a score=2013 s mm7.chrY_random 15649832 60 + 30114534 TAATAGCAGTCACCTCAGTCAGAAATAATTCAAAATAATAAGTAGTTAAAACTTTATAAT s bosTau2.chr5 36529421 60 - 76426644 TGATAGCATTTAGCACTTATATAATGAATTCAGAATGGAAAATAGTTAAGAATTTAAAAT a score=6162 s mm7.chrY_random 15649895 420 + 30114534 TAAAACATATTTAGATACCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCATTTTTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGAGTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACATTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATGGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACTAAATATATGTATATTTTTA-CAATAACATGAAATAAAATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA---ATGTGTTCACCACTTACATACAAT--AATAATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=17753 s mm7.chrY_random 15656229 1417 + 30114534 tatatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagatagtggaacttaatttagtttcatatgctcaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt-------tttttatggtaccaaccactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACGAAAGCAGGCGCATTTCATACCAATATGAAAAAGAACACTCAAAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCATTATAGATTTTTCCCCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCATTTATGTTTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacgtaaaacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaATAGAATTTTCCCCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCA-------TTTATGT--TTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacaaacacaacacacacgtaacacacacacacacacacatgtaacacacacacacacacacacacacacacacacacacatatatatacaTGTAC----AAAATTTAATTATATTTCAATGTGTTTT-TTTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTAAAGACAGTGCAAAACA--TATGTCAACTAAAATATAGAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACTTTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAGAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTAAGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCACACATATTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATAAAATTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAA--AATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCATTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGGGTCAT----TTTGAAGAAAAATTAGGTGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAA s bosTau2.chr5 36530140 1322 - 76426644 TATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTATTA---------TATTTCATATCAACGTGGAACA--ACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCA------------------------------AGAAGTATG-ACTTATGCT------------GATTCCAGAAATATTTA------------------------------------------------------------------------------TTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTTTATTA-----------------------------------------------------------------------------TATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAA------AGAACAGTTAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACC---CATGAGTAGTAAGGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA a score=2986 s mm7.chrY_random 15664630 94 + 30114534 ATATTTCTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACGTACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=13305 s mm7.chrY_random 15688648 1135 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTTAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC----AGA---------------CAGAATTGCCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATATCATAAAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGCTTCCCACTGTCTTT--------CATTATCTGTGTTATCCACACAT---------TTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTTGACATCTGTGTCCATAGCAATAT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATT----AGGGCCCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACCACCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGACT---TGTCTTCCTT-----CAGTGTTACCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCCAACACAAACCTAAGAAACTTGTAAGCATTTGAAGTC----------------------CACTTACAGATCTC-ACTG-------------------------TCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGGAA---TTTTTAAATGATTGCATACTACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTAAAATT-TGTGATTTCTTAATTTTAAATGAGTATAGCAGTTTTCTCTATAGAAAAGTTTGAGCATTTAATTTATTGATAAGTTCAG s bosTau2.scaffold5600 1080 1299 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-----AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCTATCTA-CATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAG------CATTAAG-------------CAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACTTAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCATCTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGCCAACTTGTATGGCTGTTCAGGCATTGCTTCATATGTATGGATGCTTTGCAGGAAGATCTGGAGATTTTGCAAACTGATTTATTCAG a score=4701 s mm7.chrY_random 15691328 83 + 30114534 TATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006496 83 + 85360813 TATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=4884 s mm7.chrY_random 15691673 597 + 30114534 AGTGAGACTGATGAGCCTGCA---GTGACAGGACTTTAGCGTCTATGATAGAATTTGAGTCAGGCATTGTGTACTCACACATTAATTATGAGGATCTTGCTTAATTTTGTGTACATAGAACTGGATAATCCACGGATCATTACCCCCTCTTAAATTCTGAGC--ATGTGAAGAAAAGTGATGTTTCTCTTTCTTATACAATTAAGCAG---ATTCCATAAAAG------CTTATCTTTTCCT-----ACTTCTAAATAAGCATTT----TCTTTTAAT-----------------------------------------------------------------------------------TTATTGGCATG---------------TTGTATGCTTTAACTGTTTGGTAGTTGTTTGTTAATTTTTGGTTGATTTT------------ACATATAAAGCAAGTTTGATAAAAATTTGGTATGGAATTTTATGCATTTTATAATTGTAAAACTTTTTTTGCACTCATCTCAAAGTGCTCTGCGGTTATAAATTGG--------------CCTCTCAGTTAGTAA-TACACAACACAAATTCAATTCCACTTAACCCGTCTGAAAATGAACTTTCATGGTATTGTCTGATTTGA--------AGCTAATAAACCTATTTAACTAAACCAGAGATATTTGTATTAGGAAGGAAACTACTACTGTCTGTTGTTTAGAAAATGGA---AAAGATACTTCT s bosTau2.chr3 39007047 704 + 85360813 AGTGAGAATAATGAACTAGCAACAGAGACTGGACTTTACCTTTTATGACAGAAATTGGGTCATACATT-----------CACTGTTCAT-------CTGTATGTTTTTATATGTA-------------------GCTTTCCCCCCCTCCTTGAATTTTAAACATATATGAGGAAAAGTGATATCTATACTCCTAGTTTTGGTAAACATTTCATCACATAGAAGGAAATATTTATCTTTTTCTCTCACCTTTCTAAATGAGGGTCTTAAATATTTCAATTTGGAAGGTGAAATCTACACAGCAGATTAAGTGCTAACCTCTAAATTATAACACTCAGTTTAATCTTTCTGTTGGGCAAAATGTTACTGGTGTGACATAGTATAATGCCTTATACATATTATCTGCTTAGTGATAATTTTTT--TACTTGATTGATTTTTATCCAACTTAAGCATGAAAAGCAAGTCTGTCA---------TGCAGAATTTCCTGTAAAATATGAATTCACAAATTTTTGT-CATTTAACTCAAAATGATAAATGGACATGGAATGAAACTAAAGAGATATTTTTAAAGTAAACAATTATATAATGTAACATCTGTTGTAATCACCTTTGTAGGGAATTGATTTTGAATTTATTCTCTGACTTGAAAATGCATAGTAGGTACATTTCTTTAACTGAACCTACTTAACATTTTTCAGAAAAGAAGCTACTCC---CTGTAGTTTAAAAGATAAAGttaaaaaaattttt a score=14455 s mm7.chrY_random 15695407 376 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTCATCATTCAACACCATATTGAGGATCCTGCAGCGTATAGGGAAGAGATGTCCAGATTCTGAGCATTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTCAAAAACGTTTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTCTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTCTCAGCACAATCACTACCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATACACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGCCCAAGCCCTACACATTTGAGCTTAGGAGATT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=14011 s mm7.chrY_random 15700758 555 + 30114534 TACTAGCTTTGACAATCAATCTTGT---GCAAAGCTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTTAATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTCTTA-GTGTTACTTCATATACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGG------CTTTGTGATTAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTGTTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATAGT--TCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=9651 s mm7.chrY_random 15777462 479 + 30114534 TTTTATACGTACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTCCTTATAATCAACAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATACATGTCATTTAACCCTGTCAAATTTCAGCTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164599 438 - 45915461 TTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAGTCCAAG-TTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35970 s mm7.chrY_random 15779761 1131 + 30114534 ACCACACCAGGTCTACAGCCAGGTAGAAGACAGTACCTCTGAAGGGTCTGAGCATGACATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGAAAGCCTTCTTCCCAGGACCTGGGAAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACAGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAATGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTTCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCACCCTGGTTGGCACAGATGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTATAGGACTAATTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGATCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAAATCAGGTGATGACAATGTCTTCTTAATAGGTACCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGCTCTAGCCAATCCTACTATGTCCTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAAATCACA---AAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATTGAAAAAAAATGTTTATTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTTAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTTAACACTTTGT-----TGGAAAAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACATTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGCTTCTGTGGTCT-----GCAGAGTGAGCAAGGAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAAGAAGGGGAGAAAGACAGG s bosTau2.chrX 28529102 1150 + 48857030 ACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTG---TACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGG a score=403 s mm7.chrY_random 15780892 74 + 30114534 ACATAGATAGAATCTC-----TGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAAAACGTTGGGGAAGGAGTGATAGATAAAAGGAA s bosTau2.chrX 20849551 78 - 48857030 GAATGGAGAGGCTCCTAAGGGGAGGGTGACCTAAGAGTGGGAGGCAGCCAACTGGAAGAGG-GTGAAGAATAACAGGGA a score=9942 s mm7.chrY_random 15786369 405 + 30114534 TGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATATTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCTTGTTGACTTCTGTTTTAACCCATTATGAATAAGAATTAATTATACATCAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATAAAAATAAGTAATGCCAAT---ATCGTTAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTTACCTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT s bosTau2.chr17 20172807 400 - 45915461 TGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATT-AGCAGAAA-------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=38344 s mm7.chrY_random 15862286 1289 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCCAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGCC----ATCTCTTC----TAGGAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCTAACACAGGAAAAAAAAACTTATTTTTT--TTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACTTA-----AAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTGGCTAGAAATTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCATCTTATCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGA---TCTCTCCTCAGGCGGAGGAGTG------TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTTGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCTTCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGATGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTAGACATCCCTCACCTGAAGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGTGTTTCTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCGTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCACACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAAT-----------------------CTTTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=9002 s mm7.chrY_random 15866789 301 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACTTTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATACTGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATT s bosTau2.chr17 25742211 313 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATT a score=11203 s mm7.chrY_random 15867677 413 + 30114534 TATGTAATAGAAAATGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTACTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AATGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=13523 s mm7.chrY_random 15948413 556 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCATACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATTC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGGTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC-------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13654 s mm7.chrY_random 15953936 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGCCTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAACAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTTTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAGGAATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 15958653 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=35833 s mm7.chrY_random 15991033 1173 + 30114534 TCTATCACTCTTT-----CCCCCAAATTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATTCC-------AGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCCTTC--TTCCTAAAAATCCATCTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAATTCATATCTCCAATTCCTTGTTCACTATGC-----AGACCACAGAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCATAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTGCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAATGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATGTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCAACACA-GGAAAATAAACATTTTTTTCAATCCTATAAGTT-TACATTTCTGTACTT---TGTGATTATTTTTTTAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGTAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGAGCTTTGTAAACAACCTTTCCAAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACATTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAAAGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCAAACCAGGGCGCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAAGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCCTACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGA----TGTCATGCTCAGACTCTTCAG---AGGTATTGTCTTCTAC s bosTau2.chrX 20326712 1223 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTT--ACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCTTTTTCTTCCTCATACT-TGCAGACAAGGTGTGGTCATCAAC a score=5639 s mm7.chrY_random 15994243 253 + 30114534 TTTGACAGTGTTAAATG------ACATGTATTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATGAATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAAATTAAAACAAACCTGATATTTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAATTTACCAGCACTTCTGATTACAAGGAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAG-GATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATG s bosTau2.scaffold1094 48464 248 - 285174 TTTTACAGAATCAAATACCTGTCACATGT---GAAGGAAACAGTAATTATGAATTATGGATCATTTGCAAGAAGTGATACCAAATTAGTTTCTGGGCCTGTTTCCAACGTTGGAGTGAATTTATGACAAACTGGATATTGATGAAT--GGTTTCTAAAGTCTGTTGAATTTGTCAGCCTTGCCTATGAATGAGGATTTGTTAGGTCAAATA-AATGAAACGGTAATGAAATAGATTG------TTTCTTTATGAAAAATG a score=20872 s mm7.chrY_random 16009538 667 + 30114534 tactcatgtcactcatgttccattttctcatgctccttttTCTTCATTGGTCTTCCTAACAGAAAAAAATGTAGCCTTACAACAAATCACTTTTTGAATTGTATACATGGTGTCTGTTTCCACATTGCTTGCCAAAACAATCATTGTAGT-TTGGCTTTCATAATCACAGAACCTGGAAGAGGTTTAAGGAACCTCCTTTTATCAGGTTCAATGAAATACATCCTTCTGATATGTTCCAT-ATCAATGTATTC-TGTGGGCAATCTGGCTCTCAGTTTCTCCTCCTTTTGTTGATATTGATATTTGTTGATATTGATGATAATGA--TAATCATTTTGTGCATCAAGGGTTCAGTTACTACATTCTACTGAATTTTGGGATACTTGACCTGCCTTGCCCTTGGAAGCTTCACTGTGGATTTCGTGGCAAAGAATTTTCCTGAAACATTTAATGAAGCCAAGTTCCTGACCTTTGTCGTGCTAGGATTCTGCAGTGTTTATGTCACCTTCCTCCATGACTCACATAGGACTAAGGGCATGGTCATGGCTGCTGTAGAGGTCTTCTCAATCTTGGCATCCAGTGCAGTGATGCTTGGATGCATCTTTACACCCAAGATCTACATCATTGAAATAAGACCAGACTTAAATTCTATCCAAGGTGTCAGATAAAAGT s bosTau2.chr7 14417433 662 + 69141744 TGTTCATCTCCCTCCTCCCGTGCTTCCTC-TGCTCCTTACTCTTTATCAGTCGTCCCCACACAGCCACCTCCATCCTC-CAACAGACCACATTTGGAGCTGTGTTCACTGTGGCTGTGGTCACTGTTTTGGCCAAAATCGTCCCTGTGATCTTGGCATTCAAGGCCAGGAAACCAGGAAGAACCATGAGGCGATTGCTCTTAACAGGACCTGC----TATGTCTTTCCCATGTACTCCATGATCCAGGTGATCATCTGTGGAGTCTGGCTGGGAGCCTCTCCCCCTTTCCTTGAGATGGACACTCATT----CTGAGCCCAAGGAGCTCCTCATCGTGTGCAACAAGGGCTCGGTCACTGCCTTCTACTGTGTCCTGGGCTACCTGGGCTCCTTAGCCCTGGGGACCTTCTCCTTGGCTTTCCTGGCCAGGAACCTGCCTGACACCTTCAGTGAAGCCAAGTTCCTGACCTTCAGCAGGCTGGTGCTCCTCAGTGTCTGGGTCACCTTCCTCCCTATCTGCCACAGCACCAAGGGCAAGGTCATGGTGGCCGTGGAGATCATCTCCATCTTGGCCTCCAGTGCTGGGCTCCTAGGCTGCATCTTTGCCCCAAAGTACTACATTGTTCTTATAAGAACTGATAAAAACTCTTTGAAAAGTTTAAAGAATAAGT a score=8437 s mm7.chrY_random 16013128 340 + 30114534 AGGCCCATATCCTAGAGTGCACCAATG------TTACTGCCCTTTACTGTCTCTTGCAATACCAGGTCTACCTTGTGTTAGAGATATACACAGTGACATTT-TGGTTAGAAATCTCCCTGGCATATTCAAGTAAGCCATTTTCTTGACTTTCAGCATGCTGGTGTTCTGCATTGGCTAGGGTATATTTTT---TTTCCAAGATAGCACATAGGGTAAGGACATGGAGGCTAATAAGGTCTTCAACATATTGTCATTCCATGCACACCTGAGAGTGTGCACCTTTATCCCCCATGTACTTTGCAATTTTGTTAAGATCAGAGAAAAATTCTGTTCAAGGTTTAATGAAAAA s bosTau2.chr7 14417744 349 + 69141744 AGGAGCTCCTCATCGTGTGCAACAAGGGCTCGGTCACTGCCTTCTACTGTGTCCTGGGCTACCTGGGCTCCTTAGCCCTGGGGACCTTCTCCTTGGCTTTCCTGGCCAGGAACCTGCCTGACACCTTCAGTGAAGCCAAGTTCCTGACCTTCAGCAGGCTGGTGCTCCTCAGTGTCTGGGTCACCTTCCTCCCTATCTGCCACAGCACCAAGGGCAAGGTCATGGTGGCCGTGGAGATCATCTCCATCTTGGCCTCCAGTGCTGGGCTCCTAGGCTGCATCTTTG-CCCCAAAGTACTACATTGTTCTTATAAGAACTGATAAAAACTCTTTGAAAAGTTTAAAGAATAA a score=3890 s mm7.chrY_random 16026763 76 + 30114534 ACTTGCACAAGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCAGACACACACACACAA----ATACACATAAGCTTATGCACATAATC s bosTau2.chr14 47301230 80 + 50711261 ATTTGCACATGTGTGTACATGTGCATGCCTGCATGCACACACACACACAAATTTATATACAAAAGCATACAAACATTATC a score=9918 s mm7.chrY_random 16053852 466 + 30114534 acacaattattcaaacGAATAAAGGA-----------ATGAAAAAGAAAATG-------ATATCAACTAATA-------AGTGGCCATGACACTTGGTAATATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCTCAGGGTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCAGCCATCATTCTCAAATAATCCAAAAGCATCCTAACCCCACCCCACCCCCCCCACACACACACATTTCTACTTGATTAACGAT---ATTGGCATTACTTATTTTTATGAAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGGGAAATGTTGATGTATAATTAATTATTATTCATAATGGGATAAAACAGAAATCAACAAGATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAGATTTCCCATCGATTTAGTAAAATA-------TTATAAATATGATTTTAAAAGAAGGC--AACACCCTGAAAAAGGCTT--ATTTTCATATTTTCATTATTTTCAG s bosTau2.chr17 25742175 480 + 45915461 ATAAAGTCATCCAATTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC-------------------------TTTCTGCT-AATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=35701 s mm7.chrY_random 16059679 1235 + 30114534 ATTTCTGAATCTCTTTGGATCAGTTTTCTGGGTTGCACTTTGAGTAACAAGGCCACATT-TCTTTTATCTATCACTCTTTCCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATACC----------AGAGATTCTATCTATGTCCCGTCTTTCTCCGCTTCTTCCTAAAAATCCATTTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTTTTGCTC---------------ACAATGCAGACTACAGAATCTAACCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGCGTTGCAACTTTCATCTTCCTTGGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCAACACA-GGAAAACAAACATTTTTTTTCAATCCTATAAGTTTATATTTCTGTACTT---TGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGGAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGAGCTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGGGCGCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGA----TGTCATACTCAGACTCTTCAG---AGGTATTGTCTTCTAC s bosTau2.chrX 20326653 1282 - 48857030 ATTTGTGTCCCTCTTTACTCAATTTATCCTGGTTTC-CTCTCAACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAA-CACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGCCTCTCCATTTCTGACCC--CTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTA--------AGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCTTTTTCTTCCTCATACT-TGCAGACAAGGTGTGGTCATCAAC a score=9103 s mm7.chrY_random 16062755 489 + 30114534 TTTCTGACTTGACAACATCCATGGTGGTTATTTTTCATGTTCTACCCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTCTTATCATAAATATTGTC-----AGACTCTTTGAGGCTGCGCACTGGATAGCACACCAATTTTCACTTTATGAAAACCCACAGATAGAGGAGGACTATTT-TTATGCAAACAAACCTGGAATTTGACAGGATTAAATGACATGTATTGAAACCAATGGCTATCATGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTAGTGATAAAATTAAAAAAAAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTT-TAAAATTTACCAGCACTTTTGATTATAAGGAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATGT--GTAGACAGAATACTGGACACAGGTATGTATAAAATTTACTTA s bosTau2.chr17 25750424 446 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAG---TGTTGCCCATATAGAATGTTGGCTGGCAAGACC----AGGACGATGCACTGAAA-------------TAGTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAACTTGGA-CTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGAT-------AACTATGAGTCACTTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTT--ATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTA a score=19986 s mm7.chrY_random 16104755 668 + 30114534 tactcatgtcactcatgttccattttctcatgatccttttTCTTCATTGGTCTTCCTAACAGAAAAAAATGTAGCCTTACTACAAATCACTTTTGGAATTGTATTCATGGTGTCTGTTTCCACATTGCTTGCCAAAACAATCATTGTAGT-TTGGCTTTCATAATCACAGAACTTGGAAGAGGTTTAAGGAACCTTCTTTTATCAGGTTCAATGAAATACATCCTTCTGATATGTTCCAT-ATCAATGTATTC-TGTGGGCAATCTGGCTCTCAGTTTCTCCTCCTTTTGTTGATATTGATATTTGTTGATATTGATGATAATGA--TAATCATTTTTTTGCAACAAGGGTTCAGTTACTGCATTCTACTGAATTTTGGGATATTTGACCTGCCTTGCCCTTGGAAGCTTCACTGTGGATTTCGTGGTAAAGAATTTTCCTGAAACATTTAATGAAGCCAAGTTCCTGACCTTTGTCGTGCTAGGATTCTGCAGTGTTTATGTCACCTTCCTCCATGACTCACATAGGACTAAGGGCATGGTCATGGCTGCTGTAGAGGTCTTCTAAATCTTGGCATCCAGTGCAGTGATGCTTGGATGCATCTTTACACCCAAGATCTACATCATTGAAATAAGACCAGACTTAAATTCTATCCAAGGTGTCAGATAGAAGT s bosTau2.chr7 14417433 662 + 69141744 TGTTCATCTCCCTCCTCCCGTGCTTCCTC-TGCTCCTTACTCTTTATCAGTCGTCCCCACACAGCCACCTCCATCCTC-CAACAGACCACATTTGGAGCTGTGTTCACTGTGGCTGTGGTCACTGTTTTGGCCAAAATCGTCCCTGTGATCTTGGCATTCAAGGCCAGGAAACCAGGAAGAACCATGAGGCGATTGCTCTTAACAGGACCTGC----TATGTCTTTCCCATGTACTCCATGATCCAGGTGATCATCTGTGGAGTCTGGCTGGGAGCCTCTCCCCCTTTCCTTGAGATGGACACTCATT----CTGAGCCCAAGGAGCTCCTCATCGTGT-GCAACAAGGGCTCGGTCACTGCCTTCTACTGTGTCCTGGGCTACCTGGGCTCCTTAGCCCTGGGGACCTTCTCCTTGGCTTTCCTGGCCAGGAACCTGCCTGACACCTTCAGTGAAGCCAAGTTCCTGACCTTCAGCAGGCTGGTGCTCCTCAGTGTCTGGGTCACCTTCCTCCCTATCTGCCACAGCACCAAGGGCAAGGTCATGGTGGCCGTGGAGATCATCTCCATCTTGGCCTCCAGTGCTGGGCTCCTAGGCTGCATCTTTGCCCCAAAGTACTACATTGTTCTTATAAGAACTGATAAAAACTCTTTGAAAAGTTTAAAGAATAAGT a score=8536 s mm7.chrY_random 16108343 342 + 30114534 AGGCCCATATCCTAGAGTGCACCAATG------TTACTGCCCTTTACTGTCTCTTGCAATACCAGGTCTACCTTGTGCTAGAGATATACACAGTGACATTT-TGGTTAGAAATCTCCCTGGCATATTCAAGTAAGCCATTTTCTTGACTTTCAGCATGCTGGTGTTCTGCATTGGCTAGGGTATATTTTTTTTT-TCCAAGATGGCACATAGGGTAAGGACATGGAGGCTAATAAGGTCTTCAACATATTGTCATTCCATGCACACCTGAGAGTGTGCACCTTTATCCCCCATGTACTTTGCAATTTTGTTAAGATCAGAGAAAAATTCTGTTCAAGGTTTAATGAAAAA s bosTau2.chr7 14417744 349 + 69141744 AGGAGCTCCTCATCGTGTGCAACAAGGGCTCGGTCACTGCCTTCTACTGTGTCCTGGGCTACCTGGGCTCCTTAGCCCTGGGGACCTTCTCCTTGGCTTTCCTGGCCAGGAACCTGCCTGACACCTTCAGTGAAGCCAAGTTCCTGACCTTCAGCAGGCTGGTGCTCCTCAGTGTCTGGGTCACCTTCCTCCCTATCTGCCACAGCACCAAGGGCAAGGTCATGGTGGCCGTGGAGATCATCTCCATCTTGGCCTCCAGTGCTGGGCTCCTAGGCTGCATCTTTG-CCCCAAAGTACTACATTGTTCTTATAAGAACTGATAAAAACTCTTTGAAAAGTTTAAAGAATAA a score=9667 s mm7.chrY_random 16132273 467 + 30114534 acacaattattcaaacGAATAAAGGA-----------ATGAAAAAGAAAATG-------ATATCAACTAATACG-------TGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTACTTTCATTTCTCTCAGGTTAGGG----TTATTTGCATAACATATTTCTGATCAGTCATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAaccccaccccaccccaccccacACACACACAATTCTACTTGATTAACGATATTGGCATTACTTATTTTTTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGGGAAATGTTGATGTATAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAATATAGAAGTCAACAGTATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAGATTTCCCATCGATTTAGTAAAATA-------TTATAAATATGATTTTAAAAGAAGGC--AACACCCTGAAAAAGTCTT--ATTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742175 480 + 45915461 ATAAAGTCATCCAATTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAG--TGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCCTTTC-----------------------TGCTAATTGAGGATCG-CACTGGCATTACTGGCTATATAT--AAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=35887 s mm7.chrY_random 16138098 1249 + 30114534 ATTTCTGACTCTCTTTGGATCAGTTTTCTGGGTTGCACTTTGTGTAACAAGGCCACATTCCTTTTATCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTC-------AGACTTCACACCAGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCTTAC---TTCCTACACATCCATCTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAAGCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGCGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCCA----ACATAGTCCATCTCTTC----CAACAATGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCA--ACACAGGAAAACAA---ACTTTTTTTTTC----AATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGGAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGAGCTTTGTAAACAACCTTTCCGAACCTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACTTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCTAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGGGCGCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTTAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCA----------GGCTCATTACCTTCCTTCCACCCATGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGATGTCATGCTCAGACTCTTCAGAGTTATTGTCTTCTACCTGGCTGTAGACCTGTTGTGGT s bosTau2.chrX 20326653 1275 - 48857030 ATTTGTGTCCCTCTTTACTCAATTTATCCTGGTTTC-CTCTCAACCCCAAGATTTCACTC------TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATA--TTTGCCTACATATAC---GTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGT a score=8956 s mm7.chrY_random 16141157 496 + 30114534 TTTCTGACTTGACAACATCCATGGTGGTTATTTTTCATGTTCTACCCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTCTTATCATAAATATTGTC-----AGACTCTTTGAGGCTGCGCACTGGATAGCACACCAATTTTCACTTTATGAAAACCCACAGTTAGAGGAGGACTATTT-TTATGCAAACAAACCTGGAATTTGACAGGGTTAAATGACATGTATTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATGGATTCTTTGGAATGTAAGAGGACAATATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTT-GataaaattaaaaaaaaaaaaaaCCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAAT-TTACCAGCACTTCTGATTATAAGTAATTTCATCGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAGATGAGGTAATTTTAATTTTGAAATATGT--GTAGACAGAATACTGGACACAGGTATGTATAAAATTTACTTACAAAT s bosTau2.chr17 25750424 451 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAG---TGTTGCCCATATAGAATGTTGGCTGGCAAGACC----AGGACGATGCACTGAAA-------------TAGTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAACTTGGA-CTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAA-----TTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCAT a score=675 s mm7.chrY_random 16170270 90 + 30114534 AATGTGACAAACTTCATGAGAATA---AGGAAGTTTAAGCACTCTGTTCATAAGCAGCATTTCTGTGACACTTTGCAAATGTGA--AATTAAATG s bosTau2.chr9 43451125 92 + 64650424 AATTTGACAAAATTCATGAAGACATCTAGAATGCTTTCAC---CAAATCGTAGACATAAATATAGAAATCATCATCAAATTTGATGAAGCAGATG a score=26739 s mm7.chrY_random 16170361 731 + 30114534 GAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACAACCCTCCTCCAGTTGTACTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGATCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGAACTAGAACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGCAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTATCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20327276 716 - 48857030 GAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=11899 s mm7.chrY_random 16174069 413 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAGACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGCATGGGAATTGTCAATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGTTTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=13218 s mm7.chrY_random 16183890 376 + 30114534 TCTCCTCATCATTCTACAGC----ATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCA-------------TTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATACACTTTGGGGACCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGCAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCACACATGTGAGTTTAGCAGGTTGTAGATTAGCAGTTTCACAC---TGTCACATTGGAGTTCTTG s bosTau2.scaffold2757 87535 386 - 101657 TTTCCTCACCACTCAGCAACCAACATGTTGGGGATCCCATGGCTGATGGGGAATAGACATCCTGACTCTGGGCATTGCAGGATGCCCTCCAACATATCCACCTCCAGCAGTATATGG-TGCCTCTTTCTCAGAAATTTCTTGTCATGCTTATATCCCTGAATCGTCTCTTTGGGCACCTTGATCAGATGCAGGCTGTTGGCAGCCTCCAGAAGCACTTCCCACTCCACTTTGAGTATCATACATGCTATGAAGTTGGGGTTGAACTCCACAGGGTTGGTATGGACCTCAGTGGCC-----ATGCAGAGGGAAGCCACAGGGCCTCACTCCCCACACATGCAAGCTCAGCAGATTGTGGGTGAGCAGCTTCATGTTTATGTTACAT----GCTCTTG a score=9833 s mm7.chrY_random 16188307 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCCGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGAGTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGCTCTGTGCATGCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=7558 s mm7.chrY_random 16188975 288 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATATATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAGAGCTTTGT-------GATGATATATATATATCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230044 304 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTTTT-AAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATA-ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10665 s mm7.chrY_random 16200794 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTTGTAGTA---TTTCTTAT-ATCATTACTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAATGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCAT--CTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=39071 s mm7.chrY_random 16206776 1286 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTC-CTTTAAATGTCCCACTTTCCCCAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTCTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCAGTTGATGTTCCTTCCACTGTGGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAATAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCTAACACAGGAAAAAAAAAC----TTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATGTGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGAAAGGATTGGCTAGAAATTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCACTCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAAAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTAACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGAATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCTATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGACATGCTATGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGTTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCACAACAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAAT-----------------------CTTTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=8085 s mm7.chrY_random 16210072 516 + 30114534 TTTCTGATTCACCAACATCCTTGGTGGTTATTTTCCCTGTTCCATACTTTCCCTTGTTATCTTTCAACTGTTCTTAGTGTCAGAAATGGTGCC-----AGACTCTTTGA-GGCAGCACACTGGATAGCACATCAAAATTCTGTTTATGAAAACCCAAAGTT-AGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGTGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGGTCCTGCCTTCAAAGTTGTGATGAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGACCTTTAAAAT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATATATTTGATAATTTTACTTTGGAATA--TGGGTAGACAAAATATTGAACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTA-GCGGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750424 495 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGTGTATT-------------------GAAGTGTTGCCCATATAGAATGTTGGCTGGCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAATAGT-TTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGACTAGTTCTCTT---TTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11190 s mm7.chrY_random 16211325 422 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGTGTATGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCATACAGGATTCACTGTATTTCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AATGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=10606 s mm7.chrY_random 16288824 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTCATAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGGCAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-CGTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=575 s mm7.chrY_random 16294887 77 + 30114534 CCACATTAATTTTAAATGTCCCACTTTCCCCAAATTTTGTTTCTCCTTCAGTCTTCACATCAGAGGTTC-TACCTATG s bosTau2.chrX 28021607 71 + 48857030 CCACATCCTTTCTTAAGCAGCCACCTTCCCT---TTTCCTTTCCCCCACAGCC----CATCTCTAGTTCATTCTCCTC a score=38269 s mm7.chrY_random 16294964 1172 + 30114534 TCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTACTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCAAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCGGAATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGAAGTTCTTTCCACTGTA-------GGCCATCTCGTC-CAGCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTATCAAAGACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAAAAAA---ACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTGGCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTACTCCACCCAGTTACCAATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCTCTCAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCAGTACGTAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGATCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACTGTGAGAAATTCTGCAGCTGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTGTTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCACACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326787 1187 - 48857030 TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAAT-----------------------CTTTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=11578 s mm7.chrY_random 16299172 511 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTCCCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATTATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATAACATTGGCATTTCTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCGTCCCGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTGCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA-AAAGCGTT--GTTTTCATATTTTAATTATTTACAG---GTCGTTCTGTGCCATATAAAGGAAGGTAGAGAAGGAAAGGTGT-TTTGGAGTCACTGACACACATTTAACTGAG-GTCT---CTTTGCATAGTA s bosTau2.chr17 25742211 539 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGC--TACAAAACAACCTAGTCAACAAAGAATGCAATTGGAGTTTCTTCTGCCCTTTTAGCTGAATGTCTGAACTTGGCAAAATA a score=10475 s mm7.chrY_random 16412778 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTCATAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTATTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGGCAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-CGTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=39296 s mm7.chrY_random 16418803 1289 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTAATTTTAAATGTCCCACTTTCCCCAACTTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTACTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCAAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGAATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGAAGTTCTTTCCACTGTA-------GGCCATCTCGTC-CAGCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTATCAAAGACCCTTATGTAGCCA--ACACAGGAAAAAAAAAACTTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTGGCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTACTCCACCCAGTTACCAATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCAGTCCGTAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGATCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACTGTGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGCGGTATACCACACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAAT-----------------------CTTTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=11242 s mm7.chrY_random 16423122 511 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTCCCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAAAAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATAACATTGGCATTTCTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCGTCCCGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTGCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA-AAAGCGTT--GTTTTCATATTTTAATTATTTACAG---GTCGTTCTGTGCCATATAAAGGAAGGTAGAGAAGGAAAGGTGT-TTTGGAGTCACTGACACACATTTAACTGAG-GTCT---CTTTGCATAGTA s bosTau2.chr17 25742211 539 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGC--TACAAAACAACCTAGTCAACAAAGAATGCAATTGGAGTTTCTTCTGCCCTTTTAGCTGAATGTCTGAACTTGGCAAAATA a score=10549 s mm7.chrY_random 16503218 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTCATAGTATA-TTTTATATCATTG-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTATTTATTTATACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGAGCAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCGTTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=39014 s mm7.chrY_random 16509225 1290 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTAATTTTAAATGTCCCACTTTCCCCAACTTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTACTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCAAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGAATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAAGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTGGAAGTTCTTTCCACTGTA-------GGCCATCTCGTC-CAGCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTATCAAAGACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAAAAAAAACTTTTTTTTTTCTTCCAGTTCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTGGCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTACTCCACCCAGTTACCAATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGTAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACTGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCAATCCGTAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGATCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACTGTGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATGCCACACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC-ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAAT-----------------------CTTTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=11632 s mm7.chrY_random 16513545 512 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTCCCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCGTAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATAACATTGGCATTTCTTATTTGTATGAAAACATATCCCTTCGTCCCGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATTTTTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTGCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA-AAAGCGTT--GTTTTCATATTTTAATTATTTACAG---GTCGTTCTGTGCCATATAAAGGAAGGTAGAGAAGGAAAGGTGT-TTTGGAGTCACTGACACACATTTAACTGAG-GTCT---CTTTGCATAGTA s bosTau2.chr17 25742211 539 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCT-ATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGC--TACAAAACAACCTAGTCAACAAAGAATGCAATTGGAGTTTCTTCTGCCCTTTTAGCTGAATGTCTGAACTTGGCAAAATA a score=10542 s mm7.chrY_random 16622034 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTCATAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTACTT-TTGTTCACAATGGGGCAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTTCGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=39086 s mm7.chrY_random 16628073 1288 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTAATTTTAAATGTCCCACTTTCCCCAACTTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTACTAAACATCAATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGAATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTT-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGAAGTTCTTTCCACTGTA-------GGCCATCTCGTC-CAGCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTATCAAAGACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAAAAAA---ACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAACCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTGGCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTACTCCACCCAGTTACCAATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATGTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCAATCCGTAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGATCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACTGTGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCACACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGA--CTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAAT-----------------------CTTTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=11456 s mm7.chrY_random 16632405 511 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTCCCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATAACATTGGCATTTCTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCGTCCCGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTGCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA-AAAGCGTT--GTTTTCATATTTTAATTATTTACAG---GTCGTTCTGTGCCATATAAAGGAAGGTAGAGAAGGAAAGGTGT-TTTGGAGTCACTGACACACATTTAACTGAG-GTCT---CTTTGCATAGTA s bosTau2.chr17 25742211 539 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGC--TACAAAACAACCTAGTCAACAAAGAATGCAATTGGAGTTTCTTCTGCCCTTTTAGCTGAATGTCTGAACTTGGCAAAATA a score=3962 s mm7.chrY_random 16799313 73 + 30114534 TGCACACGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCAGACACACACACACAA----ATACACACAAGCTTATACACATAATC s bosTau2.chr14 47301233 77 + 50711261 TGCACATGTGTGTACATGTGCATGCCTGCATGCACACACACACACAAATTTATATACAAAAGCATACAAACATTATC a score=8907 s mm7.chrY_random 16833259 398 + 30114534 AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCACAGGTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCACCCATCATTTACAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCTCCCCCCCCCACACACACACATTTCTACTTGATTAACCATATTGGCATTACTTATTTTTATGGAAACATATCCCCTATTCCTGATTTAGTTGAAATCGTGGAAAATGTTGATGTACAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAAAACAGAAGTCAACAGGAATGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAAATTTCCCATCGATTTAGTAAAATG-------TTATAAATATGATTTTAAAAGAAGGCAACACACTGAA---AAATTCTTATTTTCATATTTTCA s bosTau2.chr17 25742254 390 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCCTTTC------------------TGCTAATTGAG-GATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTA a score=29299 s mm7.chrY_random 16839043 1011 + 30114534 TCTATCACTCTTT------CCCCAAATTGTTGTTTTTCCCTCAGACTTCATACC-------AGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCCTTC--TTCCTAAAAATCCATTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAATCATATCTCCAATTTTTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGGAGCTAAGCCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCAT-GTCACATGTATTAAT----TTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGTTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCAACACA-GGAAAATAAACATTTTTTGTCAATCCTATAAGTTTACATTT--CTGCACAT-TGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGTAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTAAACAGTAGGATTGGCTAGAGCTTTGTAAACAAACTTTCTGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGTACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCACCTCAGCCAGAGGAGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCGTCTTTCCCCTTAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGGGCGCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAATATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCTTCATACTTCACCAAATAAAGAAAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGA s bosTau2.chrX 20326712 1059 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCT------CTCTTCCTTTCCCCCACAATC-CATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGGTT-ATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGA a score=8311 s mm7.chrY_random 17019975 423 + 30114534 AGTGGCCATGACACTTGGTAGTAGA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCACAGGTTAGGGTTATTTGCATAAGAAGTTTCTGATCAGCCATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCCCcatacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaTTTCTACTTGATTA--ACCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTATTTCAAATCGTGGGAAATGTTGATGTACAATTAATTCCTATTCATAACGGGATAAAACAGAAGTCAACAGGATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAGACTTCCCATCGatttaataaaatattataaat-atgattttaaaaCATGCCCTGAAAAAGTCTTA s bosTau2.chr17 25742254 355 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------------------------------------------------------------------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCT-ATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAA------CCTAATAAAAGCCTA a score=13676 s mm7.chrY_random 17123228 559 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCGGAGTCTCAGCATAAATGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAACACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTTAAATCACAAAGCCCTCACACAACATTTTAAAAATTCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTAATCCATAGATGAAACATGTATATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATTAAAACACATGGC------ACAGCATGGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGCTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCC------ACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14867 s mm7.chrY_random 17128749 376 + 30114534 AATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAGGGCTTGGGCATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCTGCATCAACTATGTGGAGATCTACCCTGACTTCCTGGCCCAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGAAGTGATTGTGCTGGGAGCAGACACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGATGAAACGTTTTTGAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAATGCTCAGAATATGGACATCTCTTCCCTTTAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATGAGGATACAGAGATATAAACT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4707 s mm7.chrY_random 17132262 599 + 30114534 AGAAGTATCTTT---TCCATTTTCTAAACAACAGACAGTAGTAGTTTCCTTCCTAATACAAATGTCTCTGGTTTAGATAAATAGGTTTATT--------AGATTCAAATCAGACAATACCATGAAAATTCATTTTCAGAAGGGTTAAGTGGAATTGAATTTGTGTTGTGTA-TTACTAACTGAGAGG--------------CCAATTTATAACCACAGAGCACTTTGAGGTGAGTGGAAAAAAATTTTTTACAATTATAAAATGCATAAAATTCCTTACCAAATTTTTATCAAACTTGCTTTATATGT------------AAGATCAACCAA------AAATTA-------ACAGACAA-------------------------------------------CTAACAAACAG-TTAAA------------------------GCATACAACATGCCA---------------ATAAATTAAAAGA----AAATGCTTATTTAGAAGTG-----GGAAAAGATAAG------CTTTTATGGAAT---CTGCTTAATTGTATAAGAAAGAGAAACATCACTTTTCTTCACAT--GCTCAGAATTTAAGA--GGGGGAAACGATCCATGCGATAATCCAGTTCTGTGTACACAAAATTAAGCAAGATCCTCATAATTAATGTGTGAGTACACAATGCCTGACTCAAATTCTATCATAGATGCTAAAGTCCTGTCAC---TGCAGGCTCATCAGTCTCACT s bosTau2.chr3 46353062 704 - 85360813 aaaaatttttttaaCTTTATCTTTTAAACTACAG---GGAGTAGCTTCTTTTCTGAAAAATGTTAAGTAGGTTCAGTTAAAGAAATGTACCTACTATGCATTTTCAAGTCAGAGAATAAATTCAAAATCAATTCCCTACAAAGGTGATTACAACAGATGTTACATTATATAATTGTTTACTTTAAAAATATCTCTTTAGTTTCATTCCATGTCCATTTATCATTTTGAGTTAAATGACAAAAA--TTTGTGAATTCATATTTTACAGGAAATTCTGCA---------TGACAGACTTGCTTTTCATGCTTAAGTTGGATAAAAATCAATCAAGTAAAAAAATTATCACTAAGCAGATAATATGTATAAGGCATTATACTATGTCACACCAGTAACATTTTGCCCAACAGAAAGATTAAACTGAGTGTTATAATTTAGAGGTTAGCACTTAATCTGCTGTGTAGATTTCACCTTCCAAATTGAAATATTTAAGACCCTCATTTAGAAAGGTGAGAGAAAAAGATAAATATTTCCTTCTATGTGATGAAATGTTTACCAAAACTAGGAGTATAGATATCACTTTTCCTCATATATGTTTAAAATTCAAGGAGGGGGGGAAAGCTACATATAAAAAC------------ATACAGA----------------------------TGAACAGTGAATGTATGACCCAATTTCTGTCATAAAAGGTAAAGTCCAGTCTCTGTTGCTAGTTCATTATTCTCACT a score=4670 s mm7.chrY_random 17133155 84 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGTCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAG s bosTau2.chr3 46354234 84 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAG a score=12924 s mm7.chrY_random 17134861 1050 + 30114534 ACAAGTTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTAGTATGTAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAAGTTTCTTAGGTTTGTGTTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGATGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----TTTCAAGGGCCCT----AATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAG-----------------------------TGTGCATAGTCTATGGTACCTGAAA---CCAGAGGATAGTGTCTAAGAAAACATTGCTATGGACACAGATGTCAAACAAAAACATAGGTATGGATACAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAT--------------------GTGTGGATAATACAGATAATGAAAGACAGTGGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTTTTATGATATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACCTTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGGCAATTCTG---------------TCT----GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGGTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTTAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCACCAGGAACACTGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTG-------------CTTAATG------CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATG-TAGATAGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAG-----GCTGAGTAAGCAGA---CAGATACAAACA--GGTA--ACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAA-GCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTTTAGAT-----TCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3108 s mm7.chrY_random 17163290 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=20808 s mm7.chrY_random 17170363 1280 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACCCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAATGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAGAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTTGTCTAAAA--AGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATAAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAATGA------------------------------------------------------ATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAA-AAACCACATTGAAATATAATTAAATTTtgtacatgtatatatatatatatgtgtgtgtgtgttacatgtgtgttgtgtgtgtttatatTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAAACGTAAA---------TGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGAGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGAAATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTTTGAGTGTTCTTTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTCGTTACTGTACTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAAT-TTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagataaatcagtggttggtaccataaaaa-------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttacattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat---tgcatactctatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895153 1369 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCCTT--ACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA--------------------------------ATAAAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGT--TGTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATATATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=5897 s mm7.chrY_random 17173214 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATTTTATTTCATGTTATTGTAAAAATATACACAT-ATTTAG--TCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTACCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGGTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGATTATT--ATTGTATGTAAGTG-----GTGAACACATTATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=2689 s mm7.chrY_random 17173716 100 + 30114534 TTGTAGGAATTATTAAAGATATGAAATGATAAAATGGGAATTTGACCTCAGATGTAC-----------------CTCATACTTTAATAACACTATAATTAT-CCTGCTTTATTAAACA s bosTau2.scaffold10439 16861 117 - 23754 TTGTGGGAGTCACTTAAAATGGGGAACTGCAAACTGGGAATTTAATCT-AGATGTATACACATGGTGAAGAAAACTGATACTTGATTAACCCTTTAATCCTAACTATTTTGTTCAGCA a score=8010 s mm7.chrY_random 17173928 422 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGAAAAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAATGTCTATGTTTAAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAA----------AACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTATTCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTCAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTAAAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT---TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3642 s mm7.chrY_random 17175777 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATTGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 17176178 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=5830 s mm7.chrY_random 17177459 396 + 30114534 GAGTGGGCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGAT---------------TGGAAAGGGCACTATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTATTTATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957523 435 + 62721844 GAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACCCAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 17178701 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATaaaaaa s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=4517 s mm7.chrY_random 17179623 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATCCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-TTTAAATACTTATTAGTATAATATTATTTTGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=3950 s mm7.chrY_random 17190344 269 + 30114534 AAAAACTTTAT-TAAAGAATATTAATTACTGTGTTAAATGCT-ACAAACC----TATTCAGTTATTTTCATTA----TTACATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTATTTGAACAACATTAC-------AATGCTGTTATTAATAATGATATGTTTAAAAAACATATCCAA-TATTTAGAAAAATT-CACAGAAAACTTTTCAAAACATAAGTCAAGTAATCACCTTCATAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGAAATTTCTTTTCAATATCACCATGCTTAAATC s bosTau2.scaffold2750 81941 282 + 102126 AAAAATTGTACATCAAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAAAATTTCTGGATTAGGTCTTCTCATTTAAAATGGGAGG----------ATCTCCAGGTATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGAGCC a score=16043 s mm7.chrY_random 17190624 962 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAAAGAAACATAGTAACAGTAACTTAA----ATCCAGAAAGCTTTTTTGT---TCTGACTTTAAGATTGCACAGCTAATTCTCAAAAGGTGTATATT-ATCTGAATCGATACATATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGCCTAGCAGGAT--TGTTCTG-TTACTT---------AAATTCAATGTTT-------------TCAGAGATAGCAAAAGACCAACTAGAAATTCAGGTAA----------------------------------------GCATAGTTAATACAGAATTAGCCAGGAATACAAGTTACCCCAGA--TTGTAGGAGAAGAGTGGATATTCTGACAGCAAATAGCTTTTAAATATAAACTCCTGAGATAAGTTGGAGTTAAAAAAAAGAGAGGGGGTGGTAA--AGCATTCAAGAATTCCAAGAAGAA----------CTTATG------GCATAGCACT-GAGGCAATGGCACAAGGAAATAACTGG-TTGATAGAAAGTGTCCCTG-AGTTTCTGAATGA-TGCAAGCCTTTATTGCTGCATAGCCAAAGGGAAACAGAAATCCTTCACAAAAATCAAAGAGAG----GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAATATCAAAAACTGCTCTTTGAAAA-CTGGCAAAGTGTACAAAACAGGCAAAACAAGTTTCGGTGTCAGTAAAGTAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTCAGTGTACCAATTTCTATA-AAACATGACCTTTCAAAGAATCAGCTTGACTAAGTGTTTAATAAATAATCCTGAGCAACTATATTCCAGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTATCC-TGTTGTG-CTTCAGGAGATTTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAATG-AATAAGAACCCAACTTGCTAACTGTGACAGACAAAACAATTCTTTAAGGCCACTAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGG---TAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaaggagctcaaagg-ccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataa-gcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaag-gaaaatgggtggaaaggagctttcaag--ttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCTGACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGT--TAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=19727 s mm7.chrY_random 17205302 954 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATCAAG--AAAGCTATTTTGTGCGGACAT--TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATCGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT------------TCAAAGAAGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCAC------AGTGAATACAGAATTA--------GCCAGAATACAAGT----------------------TACCCCCTA------TTGTAGGAAAAGAGTGGATATTCTGACAGTAAATAGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAGGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGCCTTTATTGCTGTGTATCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGTTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACAAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTGAAAGTGAATGGCCCATGTGTTGCCACTGATGCGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCCAACTCGCTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTTAGGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1041 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaaggagctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGC a score=11395 s mm7.chrY_random 17227103 383 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TTTTTTATCATTA-CTTTTCTTTTCTCAGAGGTTAGGGTTATTTGCACAAAAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAACCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTGCT--TGAATAATCACATTGGCATTATTTATTTGTATGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGGCCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTGATAATGGGACAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAATAAAACG-------TTATAAATATGATTTTAACAAAAGCCTAA--AATTGTGAAAAAGCTTTGTTTTCACATTTTCA s bosTau2.chr17 25742254 390 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTA a score=690 s mm7.chrY_random 17233057 139 + 30114534 TTTCTATGATTTCTGAGTCTATTTCAATCAGTTTTCTGTGTTTCACTTTGTGTAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCTCTTTCCCCAACTTTTT-----GTTTCTCCTTCAGTGTTCACATCAGAGTTTCT---------------ACCTATGA s bosTau2.chrX 28021518 148 + 48857030 TCCCTGTTATTCTTCACCCTCTTCCAGTTGG----CTGCCTCCCACTCTT-------AGGTCACCCTCCCCTTAGGAGCCTCTCCATTCCCAGCCCCTTCCCACATCCTTTCTTAAGCAGCCACCTTCCCTTTTCCTTTCCCCCACAGCCCATCTCTAG a score=37702 s mm7.chrY_random 17233196 1196 + 30114534 TCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTCCTGCTATCTCTGTTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCT-------------ACATGCAGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGTCTGAAAAGAAACTTTCTTCTTCCTTTGATATTCCTTTCACTGTAGGCC----ATCTCTTC----TAGCAAATTGTTAACTCACAGAATATTATGTC-----ACACTTTTAAATTTTTAGAGCAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAATACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAAAAAACAGAAAAACTTTTTTTTTCTTCCAGTCTTATATATTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TTAAGAATCTTTGGCACCAGAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAATCTTGATAAAGTACACAGAAGGATTGTCTAGAATTTGGGAAACAACCATTCTAAACTATTTGGAACCACCTTTTCTGGTGTACTGCACCCATTTACCTATCAACACATCACTGCCATCTCCTGA---TCTCTCTTCAGCAGGAGGAGTG------TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTTCTTGTGGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGAACCTGGGCTAGCACAACCCCCCTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTCACCCTTAAATTTGTGTGGTACTGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACATCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAAGACATTGGAAGAAGACATCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGTTAAGCCTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTATCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20326788 1204 - 48857030 TCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT--------TCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACA---AGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATA----TTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=11686 s mm7.chrY_random 17237323 510 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATGCCACTTCTTGGAATATTCTATAACATTA--CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGCGTGGGAACTGTCGATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAATCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTGCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG---GTCGTTCTGTGCCATATAAAGGAAGGTAGAGAAGAAAAGCTGT-TTTGGAGTCACTGACACACATTTAACTGAGGTCTCTTTGCTTAGTACAAGATAT s bosTau2.chr17 25742211 542 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGC--TACAAAACAACCTAGTCAACAAAGAATGCAATTGGAGTTTCTTCTGCCCTTTTAGCTGA-ATGTCTGAACTTGGCAAAATAGAT a score=13943 s mm7.chrY_random 17247110 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCATGGTT-ACCTCTCTGTCTCTTCATCATTCTAAAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGAGCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTACATAGCAGCTAGTTGGCTATTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATACAATTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCACACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=10042 s mm7.chrY_random 17251516 312 + 30114534 caAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGAAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACTTGTTCTGTGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTGGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGTTTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGCTCTGTGCATGCAGT s bosTau2.chr3 40229733 309 + 85360813 CAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=2775 s mm7.chrY_random 17252182 118 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATATATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAG s bosTau2.chr3 40230044 99 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTTTT-AAGAAGTGGGGTGGG a score=5472 s mm7.chrY_random 17252356 105 + 30114534 atatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGAAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGATTTATTA s bosTau2.chr3 40230167 105 + 85360813 ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCA a score=10252 s mm7.chrY_random 17264037 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTCATAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGCTCACAATGGAGCAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTTA--AATCACAAAAAAGCTTTG-CGTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=38537 s mm7.chrY_random 17270050 1287 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTAATTTTAAATGTCCCACTTTCCCCAACTTTTTGTTTCTCTTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTACTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCAAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTTTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTGGAAGTTCTTTCCACTGTA-------GGCCATCTCGTC-CAGCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTATCAAAGACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAAAAAAC----TTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTGGCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTACTCCACCCAGTTACCAATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAAGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCAATCCGTAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGCGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGATCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACTGTGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCACACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAAT-----------------------CTTTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=11436 s mm7.chrY_random 17274374 518 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTCCCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCGTAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATAACATTGGCATTTCTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCGTCCCGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATTTTT-TTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTCTATTGCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA-AAAGCGTT--GTTTTCATATTTTAATTATTTACAG---GTCGTTCTGTGCCATATAAAGGAAGGTAGAGAAGGAAAGGTGT-TTTGGAGTCACTGACACACATTTAACTGAGGTATCTTTGCATAGTACAAAATA s bosTau2.chr17 25742211 539 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCT-ATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGC--TACAAAACAACCTAGTCAACAAAGAATGCAATTGGAGTTTCTTCTGCCCTTTTAGCTGA---ATGTCTGAACTTGGCAAAATA a score=10942 s mm7.chrY_random 17383414 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTCATAGTATA-TTTTATATCATTG-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTACTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGGCAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGC-TATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=13676 s mm7.chrY_random 17543193 559 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCGGAGTCTCAGCATAAATGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAACACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTTAAATCACAAAGCCCTCACACAACATTTTAAAAATTCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTAATCCATAGATGAAACATGTATATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATTAAAACACATGGC------ACAGCATGGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGCTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCC------ACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=15081 s mm7.chrY_random 17548711 376 + 30114534 AATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAGGGCTTGGGCATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCTGCATCAACTATGTGGAGATCTACCCTGACTTCCTGGCCCAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGAAGTGATTGTGCTGGGAGCAGACACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGATGAAACGTTTTTGAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAATGCTCAGAATCTGGACATCTCTTCCCTTTAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATGAGGATACAGAGATATAAACT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4707 s mm7.chrY_random 17552217 599 + 30114534 AGAAGTATCTTT---TCCATTTTCTAAACAACAGACAGTAGTAGTTTCCTTCCTAATACAAATGTCTCTGGTTTAGATAAATAGGTTTATT--------AGATTCAAATCAGACAATACCATGAAAATTCATTTTCAGAAGGGTTAAGTGGAATTGAATTTGTGTTGTGTA-TTACTAACTGAGAGG--------------CCAATTTATAACCACAGAGCACTTTGAGGTGAGTGGAAAAAAATTTTTTACAATTATAAAATGCATAAAATTCCTTACCAAATTTTTATCAAACTTGCTTTATATGT------------AAGATCAACCAA------AAATTA-------ACAGACAA-------------------------------------------CTAACAAACAG-TTAAA------------------------GCATACAACATGCCA---------------ATAAATTAAAAGA----AAATGCTTATTTAGAAGTG-----GGAAAAGATAAG------CTTTTATGGAAT---CTGCTTAATTGTATAAGAAAGAGAAACATCACTTTTCTTCACAT--GCTCAGAATTTAAGA--GGGGGAAACGATCCATGCGATAATCCAGTTCTGTGTACACAAAATTAAGCAAGATCCTCATAATTAATGTGTGAGTACACAATGCCTGACTCAAATTCTATCATAGATGCTAAAGTCCTGTCAC---TGCAGGCTCATCAGTCTCACT s bosTau2.chr3 46353062 704 - 85360813 aaaaatttttttaaCTTTATCTTTTAAACTACAG---GGAGTAGCTTCTTTTCTGAAAAATGTTAAGTAGGTTCAGTTAAAGAAATGTACCTACTATGCATTTTCAAGTCAGAGAATAAATTCAAAATCAATTCCCTACAAAGGTGATTACAACAGATGTTACATTATATAATTGTTTACTTTAAAAATATCTCTTTAGTTTCATTCCATGTCCATTTATCATTTTGAGTTAAATGACAAAAA--TTTGTGAATTCATATTTTACAGGAAATTCTGCA---------TGACAGACTTGCTTTTCATGCTTAAGTTGGATAAAAATCAATCAAGTAAAAAAATTATCACTAAGCAGATAATATGTATAAGGCATTATACTATGTCACACCAGTAACATTTTGCCCAACAGAAAGATTAAACTGAGTGTTATAATTTAGAGGTTAGCACTTAATCTGCTGTGTAGATTTCACCTTCCAAATTGAAATATTTAAGACCCTCATTTAGAAAGGTGAGAGAAAAAGATAAATATTTCCTTCTATGTGATGAAATGTTTACCAAAACTAGGAGTATAGATATCACTTTTCCTCATATATGTTTAAAATTCAAGGAGGGGGGGAAAGCTACATATAAAAAC------------ATACAGA----------------------------TGAACAGTGAATGTATGACCCAATTTCTGTCATAAAAGGTAAAGTCCAGTCTCTGTTGCTAGTTCATTATTCTCACT a score=4670 s mm7.chrY_random 17553104 84 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGTCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAG s bosTau2.chr3 46354234 84 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAG a score=12862 s mm7.chrY_random 17554810 1050 + 30114534 ACAAGTTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTAGTATGTAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAAGTTTCTTAGGTTTGTGTTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGATGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----TTTCAAGGGCCCT----AATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAA-AGTGTGCATAGT--------CCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCAAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAT--------------------GTGTGGATAATACAGATAATGAAAGACAGTGGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTTTTATGATATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACCTTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGGCAATTCTG---------------TCT----GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGGTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTTAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCACCAGGAACACTGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTG-------------CTTAATG------CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATG-TAGATAGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAA-GCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTTTAGAT-----TCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3108 s mm7.chrY_random 17583306 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=20763 s mm7.chrY_random 17590380 1279 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACCCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAATGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAGAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAATTA-TATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTTGTCTAAAA--AGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAATGA------------------------------------------------------ATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAA-AAACCACATTGAAATATAATTAAATTTtgtacatgtatatatatatatatgtgtgtgtgtgttacatgtgtgttgtgtgtgtttatatTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAAACGTAAA---------TGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGAGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGAAATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTTTGAGTGTTCTTTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTCGTTACTGTACTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAAT-TTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagataaatcagtggttggtaccataaaaa-------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttacattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat---tgcatactctatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895153 1369 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCCTT--ACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA--------------------------------ATAAAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGT--TGTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATATATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=5897 s mm7.chrY_random 17593226 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATTTTATTTCATGTTATTGTAAAAATATACACAT-ATTTAG--TCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTACCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGGTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGATTATT--ATTGTATGTAAGTG-----GTGAACACATTATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=2689 s mm7.chrY_random 17593728 100 + 30114534 TTGTAGGAATTATTAAAGATATGAAATGATAAAATGGGAATTTGACCTCAGATGTAC-----------------CTCATACTTTAATAACACTATAATTAT-CCTGCTTTATTAAACA s bosTau2.scaffold10439 16861 117 - 23754 TTGTGGGAGTCACTTAAAATGGGGAACTGCAAACTGGGAATTTAATCT-AGATGTATACACATGGTGAAGAAAACTGATACTTGATTAACCCTTTAATCCTAACTATTTTGTTCAGCA a score=7702 s mm7.chrY_random 17593940 423 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGAAAAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAATGTCTATGTTTAAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAA----------AACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTATTCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTCAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA-AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT---TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3642 s mm7.chrY_random 17595790 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATTGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 17596191 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=6035 s mm7.chrY_random 17597490 396 + 30114534 GAGTGGGCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGAAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGAT---------------TGGAAAGGGCACTATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTATTTATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957523 435 + 62721844 GAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACCCAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 17598733 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATaaaaaa s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=4517 s mm7.chrY_random 17599668 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATCCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-TTTAAATACTTATTAGTATAATATTATTTTGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=3950 s mm7.chrY_random 17610904 269 + 30114534 AAAAACTTTAT-TAAAGAATATTAATTACTGTGTTAAATGCT-ACAAACC----TATTCAGTTATTTTCATTA----TTACATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTATTTGAACAACATTAC-------AATGCTGTTATTAATAATGATATGTTTAAAAAACATATCCAA-TATTTAGAAAAATT-CACAGAAAACTTTTCAAAACATAAGTCAAGTAATCACCTTCATAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGAAATTTCTTTTCAATATCACCATGCTTAAATC s bosTau2.scaffold2750 81941 282 + 102126 AAAAATTGTACATCAAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAAAATTTCTGGATTAGGTCTTCTCATTTAAAATGGGAGG----------ATCTCCAGGTATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGAGCC a score=16043 s mm7.chrY_random 17611184 962 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAAAGAAACATAGTAACAGTAACTTAA----ATCCAGAAAGCTTTTTTGT---TCTGACTTTAAGATTGCACAGCTAATTCTCAAAAGGTGTATATT-ATCTGAATCGATACATATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGCCTAGCAGGAT--TGTTCTG-TTACTT---------AAATTCAATGTTT-------------TCAGAGATAGCAAAAGACCAACTAGAAATTCAGGTAA----------------------------------------GCATAGTTAATACAGAATTAGCCAGGAATACAAGTTACCCCAGA--TTGTAGGAGAAGAGTGGATATTCTGACAGCAAATAGCTTTTAAATATAAACTCCTGAGATAAGTTGGAGTTAAAAAAAAGAGAGGGGGTGGTAA--AGCATTCAAGAATTCCAAGAAGAA----------CTTATG------GCATAGCACT-GAGGCAATGGCACAAGGAAATAACTGG-TTGATAGAAAGTGTCCCTG-AGTTTCTGAATGATGCAAACCTTTATTG-CTGCATAGCCAAAGGGAAACAGAAATCCTTCACAAAAATCAAAGAGAG----GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAATATCAAAAACTGCTCTTTGAAAA-CTGGCAAAGTGTACAAAACAGGCAAAACAAGTTTCGGTGTCAGTAAAGTAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTCAGTGTACCAATTTCTATA-AAACATGACCTTTCAAAGAATCAGCTTGACTAAGTGTTTAATAAATAATCCTGAGCAACTATATTCCAGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTATCC-TGTTGTG-CTTCAGGAGATTTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAATG-AATAAGAACCCAACTTGCTAACTGTGACAGACAAAACAATTCTTTAAGGCCACTAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGG---TAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaaggagctcaaagg-ccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataa-gcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaag-gaaaatgggtggaaaggagctttcaag--ttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCTGACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGT--TAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=3650 s mm7.chrY_random 17625865 266 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATCAAG--AAAGCTATTTTGTGCGGACAT--TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATCGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT------------TCAAAGAAGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCAC s bosTau2.scaffold2750 82839 294 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaaggagctcaaaggccaacaagacattcagacaaataa a score=17785 s mm7.chrY_random 17626170 649 + 30114534 TTGTAGGAAAAGAGTGGATATTCTGACAGTAAATAGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAGGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGCCTCTATTGCTGTGTATCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACAAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTGAAAGTGAATGGCCCATGTGTTGCCACTGATGCGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCCAACTCGCTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTTAGGC s bosTau2.scaffold2750 83214 666 + 102126 ttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGC a score=3919 s mm7.chrY_random 17742063 234 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTTTTAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCATTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA---CTTTATACTG----CTGTTATTAATAATGA-------------TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTATGTAATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGAAATTTCTTTTCAATATTACCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 81955 265 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAAAATTTCTGGATTAGGTCTTCTCATTTAAAATGGGAGGATCTCCAGGTATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=19338 s mm7.chrY_random 17742311 963 + 30114534 CATTTATAATCCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAATGAAATATAGC-----AAATGTAACTTAAATCAAGAAAGCTATTTTGTGCGGACATTAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTGTATATT-ATCTGAATCGACACTTATAATTTCCTACACATTTTACAACACAGCAAGTTCT---TCATGCCTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGACAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAA----------------------------------------GCACAGTGAATTCAGAATTATCCAGAATACAAGCTACCCCCTA--TTGTAGGAAAAGAATGGATATTCTGACAGTAAATAGCTTTTAAATATAAACTATTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAGGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGTCACAAGTAAATAATTAGATTT-TAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGCCTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACAGAAATTCTTCACATAAATCAAAGAGAGGA-----GCGAAATAAAC-ACCTTCCACCCAGCAAGATCAAAAATTGCTCATAGAAAAA-TGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACGAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGTAGGATCTTCAATTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTCAGTGTATCAATTTCTATA-AAATATGACCTCTCAAATAATCAGTTTGACTAAGGATTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATTCCAGCTGCATCATTGGACTGAACGTGAATGGCCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCT-TGTTGTG-CTTCAGTAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCTAAATATGAAAAATTAATAGGAACCCAAATCGCTAACTATGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACT-TTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaacagtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACG--GATAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCTGACA---ACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAAAACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=14049 s mm7.chrY_random 17819548 559 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTTAAATCACAAAGCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCTGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGAAATACTATATTTATAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14016 s mm7.chrY_random 17825120 363 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT s bosTau2.scaffold6942 16777 358 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACT a score=4623 s mm7.chrY_random 17829610 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCAAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=856 s mm7.chrY_random 17832031 211 + 30114534 TCCCTGCA-ATATGATAATTTTCCTTAGCTTGGCAATTCTGTCTGAGTTTTCTGACTAAGTGAGGGTGCATGTGTGTGTGtctct--------ctctctctctctctctgtgtttgtgtg----------tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt-gtgtgATATGTATTCAGGGTCCAAAGAGACCAGAAGACCTAGATATAC-AAGTAAGTTTTTATTCTTGTTTTCTGACACG s bosTau2.chr18 50048693 200 + 56508949 TCCCTGCATATATAA-GATTTCCCTC------------CTGTCTGAATTTTCTGATCCAGAAAGAGC-------TGTGATTTTCTGGAGAAAGCTTTTCCACACTCACTGCATACATGGGGTTTTTCTCCTGTTTTGTTTTGTTGGTGTATAGTGAGCTCTGCCTTC-----CTAAAGA-------AGGCTTTTCCACATTCAGTACATTTGTAGGCTTTCTCTCCTGTATG a score=11158 s mm7.chrY_random 17832242 277 + 30114534 TTCTGGTGTCTTAGAAGTCTTGATTGTCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTTACATTTCTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGAATTCTCTCCTATATAAAATCATTGATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTCT-GGCACCAGGAACACTGATGTAGTTTTATTTCTTTGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 51228 277 - 52585 TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=34635 s mm7.chrY_random 17881100 1136 + 30114534 TCTATCACTCTTT-----CCCCCAAATTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATTCC-------AGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCCTTC--TTCCTAAAAATCCATCTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTGCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAATGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACCGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCAACACA-GGAAAATAAACATTTTTT-------TCAAACCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTTAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATTCATAGGTAGGTCACTAAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGAGCTTTGTAAACAACCTTTCCGAAATTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGTACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTTTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCCCTTG-GCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCCCACAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCAAACCAGGGCGCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGAAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGAT s bosTau2.chrX 20326712 1181 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATAC---GTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTT--CACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAAT a score=20192 s mm7.chrY_random 17899764 666 + 30114534 tactcatgtcactcatgttccattttctcatgctccttttTCTTCATTGGTCTTCCTAACAGAAAAAAATGTAGCCTTACTACAAATCACTTTTGAAATTGTATTCATGGTGTCTGTTTCCACATTGCTTGCCAAAACAATCATTGTAGT-TTGGCTTTCATAATCACAGAACTTGTAAGAGGTTTAAGGAACCTCCTTTTATCAGGTTCAATGAAATACATCCTTCTGATATGTTCCAT-ATCAATGTATTC-TGTGGGCAATCTGGCTCTCAGTTTCTCCTCCCTTTGTTGATATTGATATTTGTTGATATTGATGATAATGA--TAATCATTTTGTGCAACAAGGGTTCAGTTACTGCATTCTACTGAATTTTGGGATACTTGACCTGCCTTGCCCTTGGAAGCTTCACTGTGGATTTCGAGGCAAAGAATTTTCCTGAAACATTTAATGAAGCCAAGTTCCTGACCTTTGTCGTGCTAGGATTCTGCAGTGTTTATGTCACCTTCCTCCATGACTCACATAGGACTAAGGGCATGGTCATGGCTGCTGTAGAGGTCTTCTCAATCTTGGCATCCAGTGCAGTGATGCTTGGATGCAT-TTTACACCCAAGATCTACATCATTGAAATAAGACCAGACTTAAATTCTATACAAGGTGTCAGATAGAAGT s bosTau2.chr7 14417433 662 + 69141744 TGTTCATCTCCCTCCTCCCGTGCTTCCTC-TGCTCCTTACTCTTTATCAGTCGTCCCCACACAGCCACCTCCATCCTC-CAACAGACCACATTTGGAGCTGTGTTCACTGTGGCTGTGGTCACTGTTTTGGCCAAAATCGTCCCTGTGATCTTGGCATTCAAGGCCAGGAAACCAGGAAGAACCATGAGGCGATTGCTCTTAACAGGACCTGC----TATGTCTTTCCCATGTACTCCATGATCCAGGTGATCATCTGTGGAGTCTGGCTGGGAGCCTCTCCCCCTTTCCTTGAGATGGACACTCATT----CTGAGCCCAAGGAGCTCCTCATCGTGTGCAACAAGGGCTCGGTCACTGCCTTCTACTGTGTCCTGGGCTACCTGGGCTCCTTAGCCCTGGGGACCTTCTCCTTGGCTTTCCTGGCCAGGAACCTGCCTGACACCTTCAGTGAAGCCAAGTTCCTGACCTTCAGCAGGCTGGTGCTCCTCAGTGTCTGGGTCACCTTCCTCCCTATCTGCCACAGCACCAAGGGCAAGGTCATGGTGGCCGTGGAGATCATCTCCATCTTGGCCTCCAGTGCTGGGCTCCTAGGCTGCATCTTTGCCCCAAAGTACTACATTGTTCTTATAAGAACTGATAAAAACTCTTTGAAAAGTTTAAAGAATAAGT a score=7787 s mm7.chrY_random 17903307 317 + 30114534 atCCTTTATGCAATTAGGCTGCAAATTTTCTTTCTCTTTGTTGTTATTGATCTACACTTAGAAC---AGGCCCATATCCTAGAGTGCACCAATG------TTACTGCCCTTTACTGTCTCTTGCAATACCAGGTCTACCTTGTGCTAGAGATATACACAGTGACATTT-TGGTTAGAAATCTCCCTGGCATATTCAAGTAAGCCATTTTCTTGACTTTCAGCATGCTGGTGTTCTGCATTGGCTAGGGTATATT--TTTTTTTCCAAGATGGCACATAGGGTAAGGACATGGAGGCTAATAAGGTCTTCAACATATTGTCATTCCATGC s bosTau2.chr7 11595422 329 + 69141744 ATCATCTGTGGAGTCTGGCTGGGAGCCTCTCCCCTTTTCCTTGAGATGGACACTCACTCTGAGCCCAAGGAGCTCCTCATCGTGTGCAACAAGGGCTCGGTCACTGCCTTCTACTGTGTCCTGGACTACCTGGGCTCCTTAGCCCTGGGGACCTTCTCCTTGGCTTTCCTGGCCAGGAAGCTGCCTGACACCTTCAGTGAAGCCAATTTCCTGACCTTCAGCATGCTGGTGCTCCTCAGTGTCTGGGTCACCTTCCTCCCTATCTGCCACAGCACCAAGGGCAAGGTCATGGTGGCCGTGGAGATCATCTCCATCTTGGCCTCTAGTGC a score=9239 s mm7.chrY_random 17933339 407 + 30114534 AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCTCAGGTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCAGCCATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCACCCCCCCCACACACGCACATTTCTACTTGATTAACGAT---ATTGGCATTACTTATTTTTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGGGAAATGTTGATGTATAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAATACAGAAGTCAACAGTATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAGATTTTCCATCGATTTAGT-----AAACTA--TTATAAATATGATTTTAAAAGAAGGC--AACACCCTGAAAAAGTCTT--ATTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC--------------------TTTCTGCT-AATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=19652 s mm7.chrY_random 17939176 833 + 30114534 TCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTC-------AGACTTCACACCAGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCGCTTC--TTCCTAAAAATCCATTTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCTTTGCTCACTATGC-----AGACCACATAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGCGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACTTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCA--ACACAGGAAAACAA-ACATTTT----TTTTCAATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTTCAATTTAAGTGATATTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGGAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTAAACAGTAGGATTGGCTAGAGCTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGG---------GTCTCTGGAACGATGTAGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTTTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCCCTTG-GCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCCCACAAATTTATATACCAG s bosTau2.chrX 20326712 880 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAG a score=8941 s mm7.chrY_random 17941714 522 + 30114534 TTTCTGACTTGACAACATCCATGGTGGTTATTTTTCATGTTCCAACCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTCTTTTCATAAATATTGCCAGACTCTTTGAGGCAGCACACTGGATAGCACACCAATTTTTACTTTATGAAAACCCACAGTTAGAGGAGGACTATTT-TTATGCAAACAAACCTGGAATTTGACTGGGTTAAATGACATGTATTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAAATTAAAAAAAAAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAAT-TTACCAGCACTTCTGATTATAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATGT--GTAGACAGAATACTGGACACAGGTATGTATAAAATTTACTTA---------------CAAATTA-GAGGACACTTTAAA-TGTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750424 495 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAGTGTTGCC------CATATAGAATGTTGGCT-------GGCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAATA-GTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAACTTGGA-CTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAA---TTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=10520 s mm7.chrY_random 17978898 422 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGATTGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGTGGCAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACATTTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGATTAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGAAATGCCAATTTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGATGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTATTACTTAA--------------TTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=36624 s mm7.chrY_random 17982291 1283 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGATATCTGCCCAGGTTTGGTGTGGTATACCACAGCAAGGCAACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGGCATCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAAAATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACAGTTGGAAGGAAGGTCATGAGCCTGTCACACAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTACGGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCTCCTTGCTAGTGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACTTACAAGAAGGATCCAGCACTCTATGCTCATCAGCTCCTGGATTACTACAAGGAAGGTAACTTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGCCAATCCTTCCGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCAATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTCGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAGTTTTGTGTTTTTTTTCCTGTGT----------TGGCAATCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATTTAAAAGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGGAGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACATGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAAGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAA-AAGTTGGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGTAATGTGGCCTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAAAG-----------------------ATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGA-GGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATG---TTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGA--AAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGA-AGGGGTCAGAAATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGTTGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10756 s mm7.chrY_random 17989227 393 + 30114534 CTGTAAATAAT-GAACATATGAAAACAAAGTTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATAAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTCTTATGCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAAA-TATACTACGAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=12032 s mm7.chrY_random 18016579 413 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATTGACAATTCCCATGCTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATAGGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAGTAATGATTTAGAA--TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38760 s mm7.chrY_random 18020236 1315 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTGTGGTATACCACAGCAAGGCGACAGCCATGTAGAATAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCATCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGGCTTCTTCCAACACCCTGAGAAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCATTGTTGGAACGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAAGAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTATGGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTCACCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAAATGGAGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTGTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAATTTCTAGCCAATCCTCCCGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCAAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAA----GTTTTTTTTTCCTGTGTTAGCTACATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTGGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACATCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTGGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA-ATAGACTCAAAAA----TCAGAGAAAATCAGG s bosTau2.chrX 28529056 1341 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAAAG-----------------------ATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAG--TCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAAGAGGGACACAAATACATTTAGAAGAAGTTCAGG a score=10300 s mm7.chrY_random 18027159 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATATCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGGCAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATTGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=7036 s mm7.chrY_random 18042215 308 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAatatatatatatatatatatatatatatatatatCATAACAAAGCTCTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATATATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130465 304 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT-----------TATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAA---CCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9824 s mm7.chrY_random 18042877 314 + 30114534 ACTGCATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACGGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTAGTGGAATACTATATTTACATTCTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14319 s mm7.chrY_random 18047176 390 + 30114534 CAAGAACTCCAATGTGACA---GTGTGAAACTGCTAATCTACAACCTGCTAAACTCACATGTGTGGGGTGTGGG--CATGCAGGTGTTCTGTCTGAGCCTGCA-GGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCAACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATAT----GCTGTAGAATGATGAGGAGAG s bosTau2.scaffold2757 13736 387 + 101657 CAAGAGC----ATGTAACATAAACATGAAGCTGCTCACCCACAATCTGCTGAGCTTGCATGTGTGGGGAGTGAGGCCCTGTGGCTTCCCT--------CTGCATGGCCACTGAGGTCCATACCAACCCTGTGGAGTTCAACCCCAACTTCATAGCATGTATGATACTCAAAGTGGAGTGGGAAGTGCTTCTGGAGGCTGCCAACAGCCTGCATCTGATCAAGGTGCCCAAAGAGACGATTCAGGGATATAAGCATGACAAGAAATTTCTGAGAAAGAGGCACC-ATATACTGCTGGAGGTGGATATGTTGGAGGGCATCCTGCAATGCCCAGAGTCAGGATGTCTATTCCCCATCAGCCATGGGATCCCCAACATGTTGGTTGCTGAGTGGTGAGGAAAg a score=26504 s mm7.chrY_random 18056888 730 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGGGGTCTAACACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGGCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTGCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATAGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCA-GAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGAGGGTTGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCAGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTTTTTACCAAATTCTAGCCAAACCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=505 s mm7.chrY_random 18057619 90 + 30114534 CATTCAATT--TTACATTTGTAAAGTGTCACAGAAATGCTGCTTATGACCAGAGTGCTTAAACTTCCT---TATTCTCATGAAGTTTGTCACATT s bosTau2.chr9 21199207 92 - 64650424 CATCTGCTTCATCAAATTTGATGATGATTTCTATATTTATGTCTACGATTTG---GTGAAAGCATTCTAGATGTCTTCATGAATTTTGTCAAATT a score=36064 s mm7.chrY_random 18088991 1169 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTAACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCACCAGCGCCCTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCGTTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGCTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGCTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATTAAATTTCTTGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAAATCACA---AAGTACAGAAATATAAACTTATAGGATTGAAAAAAAATGTTTGTTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGTTGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCCAAGGAAGATGAAAGTTGCAATGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGG-TTAGATTCTGTAGTCTGCATAG------TGAGCAAAAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAAATGGATTTTTAGGAAGAAGCGGAGAAAGACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=10300 s mm7.chrY_random 18097423 461 + 30114534 CTGAAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCAGGTCCAAGGAACAATGGATTCAATCATGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAATAATTAATTATACATCAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATAAAAATAAGTAATGCCAAT---ATCGTTAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGTGGGGGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGTTGATAT-------CATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCgtttgaataattgtgt s bosTau2.chr17 20172806 480 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATT-AGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACTTTAT a score=11149 s mm7.chrY_random 18161799 412 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCATT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGG-AAGGGAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAGTAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCATTTTCTATTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=3847 s mm7.chrY_random 18162799 109 + 30114534 AATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCAGTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATA s bosTau2.chr17 20172937 110 - 45915461 AATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA a score=5158 s mm7.chrY_random 18162945 155 + 30114534 AGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20173079 171 - 45915461 GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38558 s mm7.chrY_random 18166314 1289 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTGTGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCATCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCATTGTTGGAACGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAAGAAACACTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTATGGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCTTCAGGTGAGGGATGTCTACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACATCACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGAAGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA------CACTCCTCCGCCTGAGGAGAGA---TCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGATAAGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAATTTCTAGCCAATCCTTCCGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTT-----TAAGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAA--AAAAAATAAGTTTTTTTTTCCTGTGTTAGCTACATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTCC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTGGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAAAG-----------------------ATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10850 s mm7.chrY_random 18173192 393 + 30114534 CTGTAAATAAT-AAAAATATGAAAACAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=5462 s mm7.chrY_random 18185112 152 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAatatatat s bosTau2.chr3 45130465 181 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT a score=2775 s mm7.chrY_random 18185322 118 + 30114534 CTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATGTATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130670 99 - 85360813 CCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=10038 s mm7.chrY_random 18185794 314 + 30114534 ACTGCATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13595 s mm7.chrY_random 18190164 388 + 30114534 CAAGAACTCCAATGTGACA---GTGTGAAACTGCTAATCTACAACCTGCTAAACTCACATGTGTGGGGTGTGGG--CATGCAGGTGTTCTGTCTGAGCCTGCA-GGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATCAACA-GACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCACTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATAT----GCTGTAGAATGATGAGGAGA s bosTau2.scaffold2757 13736 386 + 101657 CAAGAGC----ATGTAACATAAACATGAAGCTGCTCACCCACAATCTGCTGAGCTTGCATGTGTGGGGAGTGAGGCCCTGTGGCTTCCCT--------CTGCATGGCCACTGAGGTCCATACCAACCCTGTGGAGTTCAACCCCAACTTCATAGCATGTATGATACTCAAAGTGGAGTGGGAAGTGCTTCTGGAGGCTGCCAACAGCCTGCATCTGATCAAGGTGCCCAAAGAGACGATTCAGGGATATAAGCATGACAAGAAATTTCTGAGAAAGAGGCA-CCATATACTGCTGGAGGTGGATATGTTGGAGGGCATCCTGCAATGCCCAGAGTCAGGATGTCTATTCCCCATCAGCCATGGGATCCCCAACATGTTGGTTGCTGAGTGGTGAGGAAA a score=11975 s mm7.chrY_random 18199857 413 + 30114534 CTGTAAATAATTAAA-ATAGGAAAACAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGTACATCGACAGTTCCCACGCTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGATTAATCAAGTAGAAATATGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCC-TCAATTAGCAGAAAGG---GGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=26979 s mm7.chrY_random 18203197 731 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAAAGGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGGAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGAAGGGTTGTGGTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTTAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGTCAATCCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=8947 s mm7.chrY_random 18231652 494 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTACTTATAATCAGAAGTGCTGGTAA-ATTTTAAAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTTTTTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATACATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTAAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAAACACCATGAATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAA--TTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAAC-TATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35406 s mm7.chrY_random 18234003 1173 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTTGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAGCAAACACTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTTTACGTACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCGTACCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGCTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACATCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGCTCTAGCCAATCCTACTGATTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTACTTATAGGATT----GAAAAAAAAAATGT-TTGTTTTCCTGTGT--TGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAAGAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAAAATGGATTTTTAGGAAGAAGCGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCTGGTGTGAAGTCT-------GAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGT----AAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATAT------------GGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=9597 s mm7.chrY_random 18240598 464 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATACTGTTGACTTCTGTATTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATAAAAATAAGTAATGCCAAT---ATCGTTAATCAAGTAGAAATGTGCGTGTGTGTGGGGGGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGAGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGTTGATAT-------CATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCgtttgaataattgtgt s bosTau2.chr17 20172806 480 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATT-AGCAGAAA-----------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACTTTAT a score=6959 s mm7.chrY_random 18242445 438 + 30114534 CTCTTTCTTTTAGGAGTTATGTGGACAAAATCTGCACA-----------CTCACTTCAT--TCCTCTTCAACATCAGAAATCTCAATTTA---AAGAAAGTGA-GATAATGAGAAGTAGTTTTAGATACCTCTCTATTTTTTCCTG---TGAGTAGCTTCCACTTCAAGTCACCAAGGAAAAATAAACATAAC-----AGGAAAGAAATTCATATTCAAATGCTCTTGACAAGCTCATAATACATTCTCCATAATGAATATAAACTTTTAT--TTAGAATTCCCAAGGAAATGAGACTTTTGAAAAATCCTTACTTTCAGA---TAGGCTTTGGTATTTCATTTCCCTGCAAAAGAA-CACCAATGTA-AAAAGACAAAATCTAGATTGCTTT-GTGCACAAGTTGAATCAGAAACTTTTGATAAT----GTGCATACAGGGA--CTCACCACATTTTTACAAACatatatatatat s bosTau2.chr17 20180082 462 - 45915461 CTCCTTTTTCTAAGAAGCATG--AACAGTGCCTACGTAATTATTCTTGTTTTACTTCATGCTCTTTTTCATCTTTAGAAATCTCAATTGATATAAGAACTAGATGCTAGGGAGAAATA-TTTTAAATA-------ATTTCTTTCTACATTGATTA-TTTGCACCTCCAGTCTCAAAGGAAAAAAAAATCAGACTATAAAGTACAGGAACA---ATCCAAGGACCCAATGCAAAACCCTATT-CATTTTCTTTAATAAATAGCAGTTTTGAAAACTAGAATTTATAAGGAGATAATATATTTTTGCAAGCTTTAATATTTGAATGCAGGGTTTGATATTTCCAGCCTCAAGAAATGAAATTCTAATAGATAAAAGACAAAAGCTAGAATCCTTTTGTGGAAATATATAATCAGAAGCTTTTGATAATAATAGGGCTTATTGAGATGCTTACTCTATACATACAAAAGGATAGATTTAT a score=13563 s mm7.chrY_random 18392041 559 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCGGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCCACACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTTAAATCACAAAGCCCTCACACAACATTTTAAAAATTCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTAATCCATAGATGAAACATGTATATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGCTAATAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTTGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14934 s mm7.chrY_random 18397548 376 + 30114534 AATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAGGGCTTGGGCATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCTGCATCAACTATGTGGAGATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGAAGTGATTGTGCTGGGAGCAGACACCTCAATTTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGATGAAACATTTTTGAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACAATGCAATGCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATAATGAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4644 s mm7.chrY_random 18401171 598 + 30114534 AGAAGTATCTTT---TCCATTTTCTAAACAACAGACAGTAGTAGTTTCCTTCCTAATACAAATGTCTCTGGTTTAGATAAATAGTTTTATTAGCT--------TCAAATCAGACAATACCATGAAAGTTCATTTTCAGAAGGGTTAAGTGGAATTGAATTTGTGTTGTGTA-TTACTAACTGAGAGG--------------CCAATTTATAACCACAGAGCACTTTGAGGTGAGTGGAAAAAAATTTTTACAATTATAAAATGCATAAAATTCCTTACCAAATTTTTATCAAACTTGCTTTATATGT------------AAGATCAACCAAAAATTAACAGACAACTACCAAACAGTTAAAGCATACAA---------------CATGCCA--------------------------------------ATAAATTAAAAGAAAGTGCTTA-------------------------------------------------TTTAGAAGTG-----GGAAAAGATAAG------CTTTTATGGAAT---CTGCTTAATTGTATAAGAAAAAGAAACATCACTTTTCTTCACAT--GCTCAGAATTTAAGA--GGGGGAAACGATCCATGCGATAATCCAGTTCTGTGTACACAAATTTAAGCAAGATCCTCATAATTAATGTGTGAGTACACAAGGCCTGACTCAAATTCTATCATAGATGCTAAAGTCCTGTCAC---TGCAGGCTCATCAGTCTCACT s bosTau2.chr3 46353062 704 - 85360813 aaaaatttttttaaCTTTATCTTTTAAACTACAG---GGAGTAGCTTCTTTTCTGAAAAATGTTAAGTAGGTTCAGTTAAAGAAATGTACCTACTATGCATTTTCAAGTCAGAGAATAAATTCAAAATCAATTCCCTACAAAGGTGATTACAACAGATGTTACATTATATAATTGTTTACTTTAAAAATATCTCTTTAGTTTCATTCCATGTCCATTTATCATTTTGAGTTAAATG-ACAAAAATTTGTGAATTCATATTTTACAGGAAATTCTGCA---------TGACAGACTTGCTTTTCATGCTTAAGTTGGATAAAAATCAATCAAGTA--AAAAAATTATCACTAAGCAGATAATATGTATAAGGCATTATACTATGTCACACCAGTAACATTTTGCCCAACAGAAAGATTAAACTGAGTGTTATAATTTAGAGGTTAGCACTTAATCTGCTGTGTAGATTTCACCTTCCAAATTGAAATATTTAAGACCCTCATTTAGAAAGGTGAGAGAAAAAGATAAATATTTCCTTCTATGTGATGAAATGTTTACCAAAACTAGGAGTATAGATATCACTTTTCCTCATATATGTTTAAAATTCAAGGAGGGGGGGAAAGCTACATATAAAAAC------------ATACAGAT--------GA-----ACAGTGAATGTATGA---------------CCCAATTTCTGTCATAAAAGGTAAAGTCCAGTCTCTGTTGCTAGTTCATTATTCTCACT a score=4670 s mm7.chrY_random 18402042 84 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGTCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAG s bosTau2.chr3 46354234 84 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAG a score=13226 s mm7.chrY_random 18403748 1050 + 30114534 ACAAGTTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTAGTATGTAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAAGTTTCTTAGGTTTGTGTTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGATGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----TTTCAAGGGCCCT----AATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAA-AGTGTGCATAGT--------CCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCAAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAATGTGTGGATAATACAGATAA------------------TGAAAGACAGTGGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTTTATGATATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACCTTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGGCAATTCTG---------------TCT----GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGGTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTTAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCACCAGGAACACTGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTG-------------CTTAATG------CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATG-TAGATAGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3112 s mm7.chrY_random 18432740 154 + 30114534 aaGAAGGTTCTGTGTAAAGTTTTG--TGTGTGGTA---------AAAAAAAAAATGGCCTACCAGTCTACTATATTTCT-TGCTTTAATTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893437 152 + 76426644 AAGAGTATTGCATGTAAAATACTGGGTATGTGATATTCCTTCCAAAACAATAAATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTT-------------CATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=18892 s mm7.chrY_random 18439849 1318 + 30114534 ATAAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTCTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTATTTGAATACATGG-----AATCACCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACCCTTTATTTTTAATATACATGACATATATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGGAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAATGAATGAACGAGAGAGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATT--TTAAAAATTATATGAGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATGTCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAAGACCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCTTAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGG-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAA-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATATGTTATGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGaaaataataaaaaa-aaaacacattgaaatataattaaattttGtacatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttacgtgtgtgttgtgtgtgtgtATATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAAACGTAAA---------TGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGGGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGAAATTTTATACTGCTATTTTTCTTTCTATAGTATGAAATGTTCAATTGAATTT--TTTTGAGTGTTCTTTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTCGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaa-------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccactatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatattatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895153 1369 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATAT------TTATTTGAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAATCCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCCTTACTACTCAT----GGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGA--------ATTAACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA-ATA-------------------------------------------------------------------AAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGT--TGTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6183 s mm7.chrY_random 18442735 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCAACAATTGGTAGCATAATTTTATTTCATGTTATTG-TAAAAATATACATATATTTAGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATGGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTGTTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTACCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGATCCTGGAATCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAAGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATAACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGATTATT--ATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=7184 s mm7.chrY_random 18443450 429 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAATGTCTATGTTTAAAAGAGCCATAATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGtatatatatatataaaacaaataaaaaaa-------aatCTCTAACTTTTTTGTCTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGAAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTCAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTTAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA-AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTAT---TAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT---TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3642 s mm7.chrY_random 18445307 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATTGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=6257 s mm7.chrY_random 18447000 396 + 30114534 GAGTGGGCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATTTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCCGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTATATTTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTTATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957523 435 + 62721844 GAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=4019 s mm7.chrY_random 18448242 97 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTCTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGGCCTGGAGAGATAAAAAAA s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=3719 s mm7.chrY_random 18448562 392 + 30114534 aacaaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACCTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACCTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAAACTTCT-GCTGGAAGCCCCACATGCCTGGGCCAAACATCCTTTAAGGCAGTCACTTAGGAAATTCAA---------TGGTGTGAATTCCCAAACCACTTTGTACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCTCTGAAAGGACCAAAAAAAATG------TCAATGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTACACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTGTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958097 398 + 62721844 AAGAAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataata-------ttataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTT----AAAGACCTGATGGGATGACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4358 s mm7.chrY_random 18449208 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAACGGCAATCTGAGTGTAAAATTCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAGTTTAAACAATTATTAGTATAATATTATTTTGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGA--AATCATTACTAATGAAATGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=17480 s mm7.chrY_random 18460391 710 + 30114534 AGATAAGCATAGTTAAT--ACAGAATTAGCCAGGAATACAAGTTACCCCAGATT-GTAGGAGAAGAGTGGATATTCTGACAGCAAATAGCTTTTAAATATAAACTCGTGAGATAAGTTGGAGTTAAAAAAAAGAGAGGGGGTGGTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCACT-GAGGCAATGGCACAAGGAAATAACTGG-TTGATAGAAAGTGTCCCTG-AGTTTCTGAATGA-TGCAAGCCTTTATTGCTACATAGCCAAAGGGAAACAGAAATCTTTCACAAAAATCAAAGAGAG----GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCATAGAAAA-CTGGCAAAGTGTACAAAACAGGCAAAACAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGTAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTCAGTGTACCAATTTCTATA-AAACATGACCTTTCAAAGAATCAGCTTGACTAAGTGTTTAATAAATAATCCTGTGCAACTATATTCCAGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTAACC-TGTTGTG-CTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAATG-AATAAGAACCCAACTTGCTAACTGTGACAGACAAAACAATTCTTTAAGGCCACTAGTGC s bosTau2.scaffold2750 83173 716 + 102126 agataagcatggttgatctatgacattatc------------ttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaag-gaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCTGACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGT--TAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=18662 s mm7.chrY_random 18478746 962 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATCAAG--AAAGCTATTTTGTGCGGACAT--TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATCGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGCCTAGCAGGATTATTCTGGTACTTAATTTA--------------------ATGT-------TTTCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCAC------AGTGAATACAGAATTA--------GCCAGAATA----------------------GAAGTTACCCCCTA------TTGTAGGAAAAGAGTGGATATTCTGACAGTAAATAGATTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAGGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTTCAAGAAG------TAAGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATG-TTGCAAGCCTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAATCGAAATCCTTCAGAGAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAAATCAAAAACTGCTCTTCGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACGAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTCTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTGAAAATGAATGGCCCATGTGATGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCCAACTCGCTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTTAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgac-actgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=11277 s mm7.chrY_random 18501330 393 + 30114534 AGTGTCCATATCACTTCTTATTATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTCAGAGGTTAGGGTTATTTGCACAAAAAGAGGCTAATCAGTCATCACTATTACATAAACCAAAGGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTGCT--TGAATAATCACATTGGCATTATTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCTTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTGATAATGGGACAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATAAAATGTTATAAAT-ATCATTT------TAACACAAGCCTAA--AATTGTGAAAAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=35495 s mm7.chrY_random 18507464 1191 + 30114534 TCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATTTTTTTGCTGCTATCTCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCCTATTCT-------------ACATGCAGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAAGTTTCATCTTCCTTTGATATTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTAACTCACAGAATATCATGTC-----ACACATTTAAATTTTTAGAGCAAAACA-CA--TTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAATACCCTTATGTAGCCA--ACACAGGAAAAAAAAAAACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATACGTTTACGTTTCTGTACTTTAAGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATATACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACAGAAGGATTGGCTAGAAATTGGTAAACAACCTTTCTGAACTACTTGGAACCTCCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAAAGAGCTGGATGCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGAACCTGGGCCAGCACAACCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCAATCTTTACTCTTAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAATCCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTCTTGGCATGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCATCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCCTCTACTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGCCTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGGGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTGTCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20326788 1204 - 48857030 TCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT---------TCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACA---AGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATA--TTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCAC-CTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=8903 s mm7.chrY_random 18510625 364 + 30114534 TTAGAGCAATAAATATTTTATTCAAACAAAGCAGGAATTTTACAGGGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCTATTTGCAACCGTGAATCATGGATTCTTTGCAAAATGAGAAGGCAATCTAGCTCTTGGTCCTGCTTACAAAGTTGTGATGAAGTTA-AACAAACCCAATATCAAACAGTCATGTTTTAAAGGCCTT-TAAAATTTATTAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTAATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATAGATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAGACAAAATATTGAATGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTAT-CAGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCA-------CTTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11518 s mm7.chrY_random 18511578 382 + 30114534 TGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACGTGATT---AATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGCGTGGGAACTGTCGATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT----ATTTT---TTTAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742256 399 + 45915461 TGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGC-TAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=13709 s mm7.chrY_random 18521220 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGAGCATTGCAGAGTATCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAAAACTTCATACTACACTTTGGGGATCATCTCTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGCAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCACACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9237 s mm7.chrY_random 18525659 313 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---ACAAAGTTAACGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCAAT-AAGACTTACTAACTCTGATTTCTGTACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTATTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGATTTATTCATGGAGTTAC-AGTACTAATGCTCTGTGCATGCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=2775 s mm7.chrY_random 18526326 118 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATATATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAG s bosTau2.chr3 40230044 99 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTTTT-AAGAAGTGGGGTGGG a score=5592 s mm7.chrY_random 18526480 105 + 30114534 atatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTA s bosTau2.chr3 40230167 105 + 85360813 ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCA a score=10933 s mm7.chrY_random 18538121 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTCATAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCGGAGGTAAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTATGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGGCAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=39720 s mm7.chrY_random 18544113 1287 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTAATTTTAAATGTCCCACTTTCCCCAACTTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTACTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGAAGTTCTTTCCACTGTA-------GGCCATCTCGTC-CAGCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTATCAAAGACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAAAAAAC----TTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACTTTAA-----AAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTGGCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTATTCCACCCAGTTACCAATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCAGTCCGTAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGATCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACTGTGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGCGGTATACCACACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTT--ACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAAT-----------------------CTTTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=11336 s mm7.chrY_random 18548445 511 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTCCCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATAACATTGACATTTCTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCGTCCCGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTGCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA-AAAGCATT--GTTTTCATATTTTAATTATTTACAG---GTCGTTCTGTGCCATATAAAGGAAGGTAGAGAAGGAAAGGTGT-TTTGGAGTCACTGACACACATTTAACTGAG-GTCT---CTTTGCATAGTA s bosTau2.chr17 25742211 539 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGC--TACAAAACAACCTAGTCAACAAAGAATGCAATTGGAGTTTCTTCTGCCCTTTTAGCTGAATGTCTGAACTTGGCAAAATA a score=5814 s mm7.chrY_random 18675776 290 + 30114534 TTTGACAGGGTTAAATG------ACATGTGTTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATAGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAACTTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAATTTACCAGCACTTCTGATTATAAGGAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAG-GATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATGTGTAGACAGAATAT-TGGAAACAGGTACGTATAAAATT s bosTau2.scaffold1094 48464 286 - 285174 TTTTACAGAATCAAATACCTGTCACATGTGAAGGAAACA---GTAATTATGAATTATGGATCATTTGCAAGAAGTGATACCAAATTAGTTTCTGGGCCTGTTTCCAACGTTGGAGTGAATTTATGACAAACTGGATATTGATGAAT--GGTTTCTAAAGTCTGTTGAATTTGTCAGCCTTGCCTATGAATGAGGATTTGTTAGGTCAAATA-AATGAAACGGTAATGAAATAGATTG------TTTCTTTATGAAAAATGAAAATGCATGAGATCTGGTAATTGTTAAGTCTAGATTT a score=13579 s mm7.chrY_random 18757472 555 + 30114534 TACTGATAAGCCTGACTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAACACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTAATCACAAAG------CCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGTATCT--ACTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAGTAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGATCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGCAAA------GCATGGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAAT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC---TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14996 s mm7.chrY_random 18763003 376 + 30114534 AATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAGGGCTTGGGCATGCATGACTTTCATCTGTGCCTGCAGGCTACTGAAATCTGCATCAACTATGTGGAGATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGAAGTGATTGTGCTGGGAGCAGACACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGATGAAACGTTTTTGAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAATACTCAGAATCTGGACATCTCTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATGAGGATACAGAGATATAAACT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=5767 s mm7.chrY_random 18766550 605 + 30114534 AAAAGTATCTTT---TCCATTTTCTAAACAACAGACAGTAGTAGTTTCCTTCCTAATACAAATGTCTCTGGTTTAGTTAAATAGATTTATTAGCT--------TCAAATCAGACAATACAATGAAAGTTCATTTTCAGAAGGTTTAAGTGGAATTGAATTTGTGTTGTGTA-TTACTAACTGAGAGA--------------CCAATTTATAACCACAGAGCACTTTGAGGTGAGTGGAAAAAATTTTTACAATTATAAAATGCATAAAATTCCTTACCAAATTTTTATCAAACTTGCTTTATATGT------------AAGATCAACCAAAAATTAACAGACAACTACCAAACAGTTAAAGCATACAA---------------CATGCCAATAA-----------------------------------------------------------------------------------ATTAAAAGA----AAATGCTTATTTAGAAGTGGGAAAAGATAAGAT-----------------TTATGGAATCTGCTTAATTGTATAAGAAAGAGAAACATCACTTTTCTTCACAT--GCTCAGAATTTAAGA--GGGGGAAATGATCCATGCGATAATCCAGTTCTATGTACACAAAATTAAGCAAGATCCTCATAATTAATGTGTGAGTACACAATGCCTGACTCAAATTCTATCATAGACGCTAAAGTCCTGTCAC---TGCAGGCTCATCAGTCTCACTGtattatta s bosTau2.chr3 46353062 713 - 85360813 aaaaatttttttaaCTTTATCTTTTAAACTACAG---GGAGTAGCTTCTTTTCTGAAAAATGTTAAGTAGGTTCAGTTAAAGAAATGTACCTACTATGCATTTTCAAGTCAGAGAATAAATTCAAAATCAATTCCCTACAAAGGTGATTACAACAGATGTTACATTATATAATTGTTTACTTTAAAAATATCTCTTTAGTTTCATTCCATGTCCATTTATCATTTTGAGTTAAATGACAAAAATTTGTGAATTCATATTTTACAGGAAATTCTGCA---------TGACAGACTTGCTTTTCATGCTTAAGTTGGATAAAAATCAATCAAGTA--AAAAAATTATCACTAAGCAGATAATATGTATAAGGCATTATACTATGTCACACCAGTAACATTTTGCCCAACAGAAAGATTAAACTGAGTGTTATAATTTAGAGGTTAGCACTTAATCTGCTGTGTAGATTTCACCTTCCAAATTGAAATATTTAAGACCCTCATTTAGAAAGGTGAGAGAAAAAGATAAATATTTCCTTCTATGTGATGAAAT--GTTTACCAAAACTAGGAGTATAGATATCACTTTTCCTCATATATGTTTAAAATTCAAGGAGGGGGGGAAAGCTACATATAAAAAC------------ATACAGA----------------------------TGAACAGTGAATGTATGACCCAATTTCTGTCATAAAAGGTAAAGTCCAGTCTCTGTTGCTAGTTCATTATTCTCACTCGGCTATTA a score=4513 s mm7.chrY_random 18767376 84 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCGGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCAAAGAATCTGCATAG s bosTau2.chr3 46354234 84 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAG a score=13345 s mm7.chrY_random 18775532 1057 + 30114534 ACAAGTTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTAGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAAGTTTCTTAGGTTTGTGCTGGCTTTCAGGTCTTCTAGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTATTTT-GGTATTCTATGACAGTCAACATTATAGCCACTGGAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGG----TCCCTAATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTTAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAATGTGTGGATAACACAGATAA------------------TGAAAGACAGTGGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCT---TCAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGG-----------------CCATTCTGTCT--GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGGGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGAGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCACCAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCT---------------TAATG----CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATG-TAGATAGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=2977 s mm7.chrY_random 18798151 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAAAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=20460 s mm7.chrY_random 18805250 1308 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATTATCTATTTTTTTCTTCAA---AATGACCCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTGAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTTTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAAAAAAACCACACTGAAATATAATTAAATTTT----GTACAtgtatatatatgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttacgtgtgtgttgtgtgtgtTTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAAACGTAAA---------TGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGGGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTTTGAGTGTTCTTTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaa-------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttcagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat---tgcatactctatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895153 1369 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTC--CTTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAA---TTATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATG-AAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATA------------------------------------------------------------TAATAAAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGT--TGTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATATATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=5760 s mm7.chrY_random 18808136 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATTTTATTTCATGTTATTG-TAAAAATATACATATATTTAGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTACCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATAGTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGGTAAAGAAATGCATGAGAAGTCGATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGATTATT--ATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=7403 s mm7.chrY_random 18808851 423 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAATGTCTATTTTTAAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAA----------AACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTCAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA-AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT---TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3335 s mm7.chrY_random 18810704 70 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATTGAAAGTA---TA---TTTCTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 18811105 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=3159 s mm7.chrY_random 18839242 237 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTGCCAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCGTTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAACCTTATACTGCTGA------------TATTAATAATGA-------------TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGTAATTTCTTTTCAATATTATCAAGCTTAAACC s bosTau2.scaffold2750 81955 268 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAAA-----ATTTCTGGATTAGGTCTTCTCATTTAAAATGGGAGGATCTCCAGGTATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGAGCC a score=20251 s mm7.chrY_random 18839490 963 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATCAA------GAAACCTATTTTGTGTGGACATTAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGTTATATATT-ATCTGAATCGATACTTATAATTTCCTACACATTTTACCATGCAGCATGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT------------TCAAAGAAGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCAC------AGTGAATAC-AGAATTAGCCAGG-----------ATACAAG------------------TTACCCCCTA------TTGTAGGAAAAGAGTGGATATTCTGACAGTAAATAGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAGGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGCCTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTCCATCCAGCAAGATCAAAAACTGATCTTCGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACGAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTGAAAGTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCCAACTCACTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTT--TTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaaggagctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=13526 s mm7.chrY_random 18908749 556 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCGGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAACACTATTGAGAACACTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCATTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCACAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGAACACTGAAAGTGTGCTT-CAAAGAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATTAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGAAGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTTTATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC-------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA--CCA----TGTATTAGTCTTATAAGGATACACTGGAAATTTT--------------AAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=4944 s mm7.chrY_random 18914920 608 + 30114534 AGAAGTATCTTT---TTCATTTTCTAAAAAACAGACAGTAGTAGTTTCCTTCCTAACACAAATGTCTCTGGTTTAGTTAAATAGATTTATTAGCT--------TCAAATCAGATAATACCATGCAAGGTAATTTTCAGAAGGGTTAAGTGGAATTGAATTTGTGTTGTGTA-TTACTAACTGAGAGG--------------CCAATTTATAACCACAGAGCACTTTGAGGTGAGTGGACATAATATTTTTACAATTATAAAATGCATAAAATTCCATACCAAATTTTTATCAAACTTGCTTTATATGT------------AAGATCAACCAAAAATTAACAGACAACTACCAAACAGTTAAAGCATACAA---------------CATGGCAATAA-------------------ATTAAACG--------------------------------------------------------------------AAAATGCTTATTTAGAAGTGGGAGAAGATAAGAT-----------TTTATGGAAT---CTGCTTAATTTTATAAGAAAGAGAAACATCACTTTTCTTCACAT--GCTCAGAATTTAAGA--GGGGGAAAAGATCCATGAGATATTCCAGTTCTATGAACACAAAATTAAGCAAGATCCTCATAGTTAATGTGTGAGTACACAATGCCTGACTCAAATTCTATCATAGACGCTAAAGTCCTGTCAC---TGCAGGCTCATCAGTCTCACTGtattatta s bosTau2.chr3 46353062 713 - 85360813 aaaaatttttttaaCTTTATCTTTTAAACTACAG---GGAGTAGCTTCTTTTCTGAAAAATGTTAAGTAGGTTCAGTTAAAGAAATGTACCTACTATGCATTTTCAAGTCAGAGAATAAATTCAAAATCAATTCCCTACAAAGGTGATTACAACAGATGTTACATTATATAATTGTTTACTTTAAAAATATCTCTTTAGTTTCATTCCATGTCCATTTATCATTTTGAGTTAAATG-ACAAAA-ATTTGTGAATTCATATTTTACAGGAAATTCTGCA---------TGACAGACTTGCTTTTCATGCTTAAGTTGGATAAAAATCAATCAAGTA--AAAAAATTATCACTAAGCAGATAATATGTATAAGGCATTATACTATGTCACACCAGTAACATTTTGCCCAACAGAAAGATTAAACTGAGTGTTATAATTTAGAGGTTAGCACTTAATCTGCTGTGTAGATTTCACCTTCCAAATTGAAATATTTAAGACCCTCATTTAGAAAGGTGAGAGAAAAAGATAAATATTTCCTTCTATGTGATGAAATGTTTACCAAAACTAGGAGTATAGATATCACTTTTCCTCATATATGTTTAAAATTCAAGGAGGGGGGGAAAGCTACATA--------------TAAAAACATACAGATGAACA-------------------GTGA-------ATGTATGACCCAATTTCTGTCATAAAAGGTAAAGTCCAGTCTCTGTTGCTAGTTCATTATTCTCACTCGGCTATTA a score=4837 s mm7.chrY_random 18915771 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=12613 s mm7.chrY_random 18917230 1302 + 30114534 CCTGGCCAAGCAGTTATTATTTCAACATAAACCTA--GGATTCAATCTACCCTGCTTCTAATTGGGACCAAAAGTATAAGTCACATGTGTTTCTCTGC-CAGACTACTAGTGGATGAGACCTTCGAGTATCAGATGCATACCATGTTGGAGAGGGTACATAAGCTCTCATGCACTGACCTTATCA------ATAAATTA--------AATGCTCAAACTTTTCTATAGAGAAAACTGCTATACTCATTTAAAATTATG---AAAT-----CACAAATTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATTATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTTTTATGGA--------------------------CAGT-GAGATCTTTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAAGTTTCTTAGGTTTGTGTTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTTCCCAAACTTCCGTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGGTAACACTG-----AAGGAAGACA--GAGTCTTATCATCGTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTGTATGGCAGTCAACATTATAGCCATTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGCCCT----AATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCAAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTCCTAATACACAAAAAATTGTGTGGATAACACAGATAATGAAAGACAGTGGGAAGC---AACTTATTATTGTA-----------TTGTATTTTTTTATGATATGAAACAT-------AACTCTGCCAAA--------------TTTTCTAGACTTTAAATATTCT--TTACATTCTGTACCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGATTGACAATTCTG---------------TCT----GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCGTCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGACGTGACATTTCTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCACCAGGAACACTGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTGTAA-ATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50039 1466 - 52585 cctggtccgggaactaaaatcccaacatgAACAAACCAGTTTCTGTCTGACCTGGCTTTCACT-----------TTTAAGTCACAGGCCTTACCCTGCTCTGACTGC------ACATTCCCTCCTAGCATCCAATGTTCACTGAGTCTACAAGA--CCATGAGGCCACAGG-GCTCTCCTTACCATTCTGAATAAATCAGTTTGCAAAATCTCCAGATCTTCCTGCAAAGCA------TCCATACATATGAAGCAATGCCTGAACAGCCATACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTA-CTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTG-------------CTTAATG------CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATG-TAGATAGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATTT-------ATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTTTAGATTCCTTTTTG---TGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3962 s mm7.chrY_random 18934085 73 + 30114534 GATTATGTGTATAAGCTTGTGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCTGCACACACATGCACATGCACACACGTGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=19890 s mm7.chrY_random 19087671 963 + 30114534 GCACTTGTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTAGTGAGTTGGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGGCTCACATCAGTGGCAACATATGGACCATTCACTTTCAGTCCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTGAGAGGTCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTCGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCGAAGATCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGGAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGAAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGGCTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGGGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTAGCACCCCCTTTCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCTATTTACTGTCAGAATATCCACTCTTTTCCTACAA------TAGGGGGTA----------------------ACTTGTATTCTGGC--------TAATTCTGTATTCACT------GTGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACTTCTTTGA------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACATGCTGCATGGTAAAATGTGTAGGAAATTATAAGTATCGATTCAGAT-AATATATAACTTTTGAGAATTAGCTTCACATTTCTA--ATGTCCACACAAAATAGCTTT--CTTGATTTAAGTTACAGTTGCTATGTTTCACTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTC--AGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagctccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=3159 s mm7.chrY_random 19088645 237 + 30114534 GGTTTAAGCTTGATAATATTGAAAAGAAATTACAATT--TTTCACTTTGAAATTAAATCTCTGAAGATGATAACTTAACTTGTGTTTGGAAAAGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA-------------TCATTATTAATA------------TCAGCAGTATAAGGTTGTTCAAACAAAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAACGAAAATAACTGAATAGTA-GGTTTGT-AGCATTTGGCACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 19903 268 - 102126 GGCTCAAACACTCTAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATACCTGGAGATCCTCCCATTTTAAATGAGAAGACCTAATCCAGAAAT-----TTTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=3854 s mm7.chrY_random 19117609 107 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCCATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGCTTTTAA s bosTau2.chr5 36527708 112 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGTTTGGTTTTTTAAA a score=3335 s mm7.chrY_random 19118047 70 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAGAAA---TA---TACTTTCAATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=7403 s mm7.chrY_random 19119548 423 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTACACTTAAACAAGAAAATGATTAAAGATATTTAAAAAT---AAAGAAGTTCTATTTTGACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGATTTTTTTATTTGTT----------TTATATATATACCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTTAAAAATAGACATTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGA---AGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTT-TAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=2572 s mm7.chrY_random 19120083 106 + 30114534 TGTTTAATAAAGCAGG-ATAATTATAGTGTTATTAAAGTATGAG-----------------GTACATCTGAGGTCAAATTCCCATTTTATCATTTCATATCTTTAATAATTCATACAAAGCCAT s bosTau2.scaffold10439 6776 123 + 23754 TGCTGAACAAAATAGTTAGGATTAAAGGGTTAATCAAGTATCAGTTTTCTTCACCATGTGTATACATCT-AGATTAAATTCCCAGTTTGCAGTTCCCCATTTTAAGTGACTCCCACAATACTAT a score=5985 s mm7.chrY_random 19120266 420 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTACCTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTACTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACTAAATATATGTATATTTTTA-CAATAACATGAAATAAAATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA---ATGTGTTCACCACTTACATACAAT--AATAATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=20913 s mm7.chrY_random 19122260 1309 + 30114534 aaatgcctagtcgttttcattgatagagtatgca---atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagataatggaacttaatttagtttcatatgctgaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt-------tttttatggtaccaaccactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAAAGAACACTCAAAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCCCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCA---------TTTACGTTTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacgtaacacacacacacacacacacacacacacacacatacacacacacatatatatacaTGTAC----AAAATTTAATTATATTTCAGTGTGGTTTTTTTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAACTAAAATATACAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCAAACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATATAATTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGGGTCATT---TTGAAGAAAAAAATAGATAATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530122 1369 - 76426644 AAATACC-AACAGCTTTTATATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAACA--ACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTTTATTA--------------------------------------------------------------TATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATAA---TTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=2823 s mm7.chrY_random 19130573 91 + 30114534 ATATTTTTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGCCAGAACAATAAAAAATTAAAGCAAGAAA s bosTau2.chr5 36533055 77 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATG-------------AAAAAATTATATCAGAAAA a score=13111 s mm7.chrY_random 19152231 1057 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCTGTGTTCCTGGTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACTCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGATGATCAAGGCTTCCCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC--AGACAGAATGG-----------------CCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGTTTCCCACTGTCTTTCA------------------TTATCTGTGTTATCCACACATTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTAACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTAGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATTAGGGA----CCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTCCAGTGGCTATAATGTTGACTGTCATAGAATACC-AAAATAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGACT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCC-----AGCAC--------------------AAACCTAAGAAACTTGTAAGTATTTGAAGTCCACTTACAGA---------------TCTCACTGTCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGGAA---TTTTTAAATGATTGCATACTACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAACTTGT s bosTau2.scaffold5600 1080 1221 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-----AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCTATCTA-CATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAA-TTCTAGCATTAAGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACT--TAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCAT--------CTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=4206 s mm7.chrY_random 19161363 83 + 30114534 CTATGCAGATTCTTTGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACCGATGCTGATGTGAGC-AAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006495 84 + 85360813 CTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=5645 s mm7.chrY_random 19161682 605 + 30114534 taataataCAGTGAGACTGATGAGCCTGCA---GTGACAGGACTTTAGCGTCTATGATAGAATTTGAGTCAGGCATTGTGTACTCACACATTAATTATGAGGATCTTGCTTAATTTTGTGTACATAGAACTGGATTATCGCATGGATCATTTCCCCC--TCTTAAATTCTGAGC--ATGTGAAGAAAAGTGATGTTTCTCTTTCTTATACAATTAAGCAGATTCCATAA-----------------ATCTTATCTTTTCCCACTTCTAAATAAGCATTT----TCTTTTAAT-----------------------------------------------------------------------------------TTATTGGCATG---------------TTGTATGCTTTAACTGTTTGGTAGTTGTCTGTTAATTTTTGGTTGATCTT------------ACATATAAAGCAAGTTTGATAAAAATTTGGTAAGGAATTTTATGCATTTTATAATTGTAAAAATTTTTTCCACTCACCTCAAAGTGCTCTGTGGTTATAAATTGG--------------TCTCTCAGTTAGTAA-TACACAACACAAATTCAATTCCACTTAAACCTTCTGAAAATGAACTTTCATTGTATTGTCTGATTTGA--------AGCTAATAAATCTATTTAACTAAACCAGAGACATTTGTATTAGGAAGGAAACTACTACTGTCTGTTGTTTAGAAAATGGA---AAAGATACTTCT s bosTau2.chr3 39007038 713 + 85360813 TAATAGCCGAGTGAGAATAATGAACTAGCAACAGAGACTGGACTTTACCTTTTATGACAGAAATTGGGTCATACATTCACTGTTCA----------------------------TCTGTAT------------GTTTTTATATGTAGCTTTCCCCCCCTCCTTGAATTTTAAACATATATGAGGAAAAGTGATATCTATACTCCTAGTTTTGGTAAAC--ATTTCATCACATAGAAGGAAATATTTATCTTTTTCTCTCACCTTTCTAAATGAGGGTCTTAAATATTTCAATTTGGAAGGTGAAATCTACACAGCAGATTAAGTGCTAACCTCTAAATTATAACACTCAGTTTAATCTTTCTGTTGGGCAAAATGTTACTGGTGTGACATAGTATAATGCCTTATACATATTATCTGCTTAGTGATAATTTTTT--TACTTGATTGATTTTTATCCAACTTAAGCATGAAAAGCAAGTCTGTCA---------TGCAGAATTTCCTGTAAAATATGAATTCACAAATTTTTGTCATTTAACTCAAAATGATAAATGGACATGGAATGAAACTAAAGAGATATTTTTAAAGTAAACAATTATATAATGTAACATCTGTTGTAATCACCTTTGTAGGGAATTGATTTTGAATTTATTCTCTGACTTGAAAATGCATAGTAGGTACATTTCTTTAACTGAACCTACTTAACATTTTTCAGAAAAGAAGCTACTCC---CTGTAGTTTAAAAGATAAAGttaaaaaaattttt a score=14996 s mm7.chrY_random 19165455 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGTTTATATCTCTGTATCCTCATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAGAGATGTCCAGATTCTGAGTATTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTCAAAAACGTTTCATCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTCCCAGCACAATCACTTCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATCTCCACATAGTTGATGCAGATTTCAGTAGCCTGCAGGCACAGATGAAAGTCATGCATGCCCAAGCCCTACACATTTGAGCTTAGGAGATT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=13568 s mm7.chrY_random 19170809 555 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ATTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCCATGC------TTTGCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGATCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTACTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAGT--AGATACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGG------CTTTGTGATTAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTGTTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCCGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA---GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=3962 s mm7.chrY_random 19362647 73 + 30114534 GATTATGTGTATAAGCTTGTGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCTGCACACACATGCACATGCACACACGTGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=11251 s mm7.chrY_random 19434523 511 + 30114534 TACTATGCAAAG---AGAC-CTCAGTTAAATGTGTGTCAGTGACTCCAAA-ACACCTTTCCTTCTCTACCTTCCTTTATATGGCACAGAACGAC---CTGTAAATAATTAAAATATGAAAAC--AACGCTTT-TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGGAGCAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-ATTTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCGGGACGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGAAATGCCAATGTTAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGCTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTACGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGGGAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172711 539 - 45915461 TATTTTGCCAAGTTCAGACATTCAGCTAAAAGGGCAGAAGAAACTCCAATTGCATTCTTTGTTGACTAGGTTGTTTTGTA--GCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=39086 s mm7.chrY_random 19438064 1288 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTGTGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCATCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCACAGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGATCAACTGCCAACAAACCCTTCGCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTACGGATTGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATTGGTAACTGGGTGGAGTACACCAGAAAAGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGCCAATCCTTCCGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGT---TTTTTTTTTCCTGTGTTGGCTACATAAGGGTCTTTGATAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGCTG-GACGAGATGGCC-------TACAGTGGAAAGAACTTCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTTGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGTAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAAGTTGGGGAAAGTGGGACATTTAAAATTAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAAAG-----------------------ATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10811 s mm7.chrY_random 19450054 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATCCTATAGGCTTCTGTTTTGCCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-CAATGATATAAAA-TATACTATGAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=11436 s mm7.chrY_random 19558968 518 + 30114534 TATTTTGTACTATGCAAAGATACCTCAGTTAAATGTGTGTCAGTGACTCCAAA-ACACCTTTCCTTCTCTACCTTCCTTTATATGGCACAGAACGAC---CTGTAAATAATTAAAATATGAAAAC--AACGCTTT-TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGGAGCAATAGAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCGGGACGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGAAATGCCAATGTTAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTACGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGGGAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172711 539 - 45915461 TATTTTGCCAAGTTCAGACAT---TCAGCTAAAAGGGCAGAAGAAACTCCAATTGCATTCTTTGTTGACTAGGTTGTTTTGTA--GCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=39004 s mm7.chrY_random 19562549 1289 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTGTGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCATCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCACAGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGATCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTACGGATTGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACTTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATTGGTAACTGGGTGGAGTACACCAGAAAAGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGCCAATCCTTCCGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGTCTTTTTTTTTCCTGTGT--TGGCTACATAAGGGTCTTTGATAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGCTG-GACGAGATGGCC-------TACAGTGGAAAGAACTTCCAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTTGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGTAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAAGAGAAACAAAAAGTTGGGGAAAGTGGGACATTTAAAATTAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAAAG-----------------------ATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10466 s mm7.chrY_random 19569467 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAACG-CAAAGCTTTTTTGTGATT--TTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATCCTATAGGCTTCTGTTTTGCTCCATTGTGAGCAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAAA-TATACTATGAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=5472 s mm7.chrY_random 19581452 105 + 30114534 TAATAAATCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTTCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatat s bosTau2.chr3 45130541 105 - 85360813 TGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT a score=2775 s mm7.chrY_random 19581635 118 + 30114534 CTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATATATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130670 99 - 85360813 CCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=10042 s mm7.chrY_random 19582107 312 + 30114534 ACTGCATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAAACATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCCAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCACAGAACAAGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTTCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTtg s bosTau2.chr3 45130771 309 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTG a score=13729 s mm7.chrY_random 19586445 376 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGTGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTGAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAATTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATGTACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGCTCAGAATACAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTTTAGAATGATGAAGAGACAGAGAGGT-AACCATGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11433 s mm7.chrY_random 19596084 510 + 30114534 ATATCTTGTACTAAGCAAAGAGACCTCAGTTAAATGTGTGTCAGTGACTCCAAA-ACAGCTTTTCTTCTCTACCTTCCTTTATATGGCACAGAACGAC---CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGCAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGACTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATCGACAGTTCCCACGCTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATACAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG--TAATGTTATAGAATATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172708 542 - 45915461 ATCTATTTTGCCAAGTTCAGACAT-TCAGCTAAAAGGGCAGAAGAAACTCCAATTGCATTCTTTGTTGACTAGGTTGTTTTGTA--GCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=37603 s mm7.chrY_random 19599557 1199 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGGCTTAACATGACATCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGATGTCTTCTTCCAATGTCTTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGATGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCAGTACCACACAAATTTAAGGGTGAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGGGGGTTGTGCTAGCCCAGGTTCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACCACAAGAAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA------CACTCCTCCTGCTGAAGAGAGA---TCAGGAGATGGCAGTGATGTGTTGATAGGTAAATGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTTAGAATGGTTGTTTCCCAAATTCTAGACAATCCTTCTGTGTACTTTATCAAGATTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGCCAAAGATTCTTAA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAATATATAAGACTGGAAGAAAAAAAAAAGTTTTTCTGTTTTTTTTTTTCCTGTGTTGGCTACATAAGGGTATTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGCTCTAAAAATTTAAAAGTGT-----GACATAATATTCTGTGAGTTAACAATTTGCTA----GAAGAGAT----GGCCTACAGTGAAAGGAATATCAAAGGAAGAAGAAAGTTTCTTTTCAGACGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAA--GGAACAG--CTTCTCTGGTCTGCATGT-------------AGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAACAGAGATAGCAGGAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGA s bosTau2.chrX 28529038 1204 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAA-------TATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCAT-CTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCT---TGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGA--------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGA a score=690 s mm7.chrY_random 19600756 139 + 30114534 TCATAGGT---------------AGAAACTCTGATGTGAACACTGAAGGAGAAAC-----AAAAAGTTGGGGAAAGAGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTACACAAAGTGAAACACAGAAAACTGATTGAAATAGACTCAGAAATCATAGAAA s bosTau2.chrX 20835364 148 - 48857030 CTAGAGATGGGCTGTGGGGGAAAGGAAAAGGGAAGGTGGCTGCTTAAGAAAGGATGTGGGAAGGGGCTGGGAATGGAGAGGCTCCTAAGGGGAGGGTGACCT-------AAGAGTGGGAGGCAG----CCAACTGGAAGAGGGTGAAGAATAACAGGGA a score=11824 s mm7.chrY_random 19669855 278 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTCCCTGGTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGAGAGACCATTCCTTCAAATATTTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=3259 s mm7.chrY_random 19670151 758 + 30114534 CAGAATTGCCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGCTTCCCACTGTCTTT--------CATTATCTGTGTTATCCA--CACACTT------TTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTCTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTTGACATCTGTGTTCACAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATACTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAAATCTTCACTTATCTCAGAAGAGATG---TAAAATGCTATTAGGGCTCT-TGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGGCTATAATGTTCACCGCCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAACATGATAAGATT--GTGTCTTCCTTCAGTGTAAGCA----------AGGTAGTTGTCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCC-----AACAC--------------------AAACCTTAGAAACTTGTAAGCATTTGAAGTCCACTTACAGA---------------TCTCACTGTCCATACTAGTTATCCATCTCTCTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACT---GGACTTTTTAAATGATTGAATACTACTCCTGTGCCTAAAGGGTTGTACAATTTGT s bosTau2.scaffold5600 1450 851 + 52585 CAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-----AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCT-ATCTACATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAG-AAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAA-TTCTAGCATTAAGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACT--TAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCAT--------CTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=4587 s mm7.chrY_random 19672533 84 + 30114534 CTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACATATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006495 84 + 85360813 CTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=4566 s mm7.chrY_random 19672896 597 + 30114534 AGTGAGACTGATGAGCCTGCATTA---ACAGGACTTTAGCGTCTTTGATAGAATTTGAGTCAGACATTGTGTACTCACACATTAATTATGAGGATCTTGCTTAATTTTGTGTACATAGAACTGGATTATCGCGTGGAATCGTTTCCCCCTCTTAAATTCTGAGC--ATGTGAAGAAAAGTGATGTTTCTCTTTCT--------TATACAATTAAGCAGATTCGATAAAA-GCTTATCTTTTCC-----CACTTCTAAATAAGCATTTT-------------------------------------------------CTTTTAATTTAT-------------------------------------------TGGCATTGT-----------TATGCTTTAACTGTTTGGTAGTTGTCTGTTAATTTTTGGTTGATCTT------------ACGTATAAAGCAAGTTTGATAAAAATTTGGTAAGGAATTTTATGCATTTTATAATTGTAAATTTTTTTCCCACTCACCTCAAAGTGCTCTGTGGTTATAAATTGG--------------CCTCTCAGTTAGTAA-TACACAACACAAATTCAATTCCACTTAACCCTCCTGAAAATGAACTTTCATGGTATTGTCTGATTTGA--------AGCTAGTAAATCTATTTAACTAAACCAGAGACATTTGTATTAGGAAGGAAACTACTACTGTCTGTTGTTTACAAAATGGA---AAAGATACTTCT s bosTau2.chr3 39007047 704 + 85360813 AGTGAGAATAATGAACTAGCAACAGAGACTGGACTTTACCTTTTATGACAGAAATTGGGTCATACAT-------TCAC-------------------TGTTCATCTGTATGTTTTTATATGTAGCTTTCC-------------CCCCCTCCTTGAATTTTAAACATATATGAGGAAAAGTGATATCTATACTCCTAGTTTTGGTAAACATTTCATCACATAGAAGGAAATATTTATCTTTTTCTCTCACCTTTCTAAATGAGGGTCTTAAATATTTCAATTTGGAAGGTGAAATCTACACAGCAGATTAAGTGCTAACCTCTAAATTATAACACTCAGTTTAATCTTTCTGTTGGGCAAAATGTTACTGGTGTGACATAGTATAATGCCTTATACATATTATCTGCTTAGTGATAATTTTTT--TACTTGATTGATTTTTATCCAACTTAAGCATGAAAAGCAAGTCTGTCA---------TGCAGAATTTCCTGTAAAATATGAATTCACAAATTTTTGTCATTTAACTCAAAATGATAAATGGACATGGAATGAAACTAAAGAGATATTTTTAAAGTAAACAATTATATAATGTAACATCTGTTGTAATCACCTTTGTAGGGAATTGATTTTGAATTTATTCTCTGACTTGAAAATGCATAGTAGGTACATTTCTTTAACTGAACCTACTTAACATTTTTCAGAAAAGAAGCTACTCC---CTGTAGTTTAAAAGATAAAGttaaaaaaattttt a score=14029 s mm7.chrY_random 19676746 369 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTCATCATTCAACACCATAATGGGTATCCTGCAGCTTATAGGGAAGAGATGTCCAGATTCTGAGCATTGCAGGGTACCATCCAATTC----TCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTCAAAAACGTTTCATCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAATATTGAGGAGTCTGCTCCCAGCACAATCACTTCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATCTCCACATAGTTGATGCAGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGCCCAAGCCCTACACATTTGAGCTTAGGAGATT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATA-TGGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCCCAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=14135 s mm7.chrY_random 19682064 557 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATACAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAAT--CTTCGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATATATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGTG------CTTTGTGATTAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGCGTTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGTCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA----GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=4167 s mm7.chrY_random 19839449 73 + 30114534 GATTATGTTTATAAGCTTGTGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCTGCACACACATGCACATGCACACACGTGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=3597 s mm7.chrY_random 19956298 242 + 30114534 ATCTGCACCGTAGAATTTGTAAGAGAAA-----GAAGAATAAACTATTAATAAATTAGAATATGTTTAAAATATTCAGTTTTGTTGCTCATTTCCTGAAAAGAAAAAAAAATCATGACTTATATATACCATAT---ATCCAGGATTATGTG----TATAAGCTTG---------TGTGTATTTGTGTGTGTGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACGTGTGCA--CGTACCTAACTTATTT--------CTAAACATATAGCTTACTA s bosTau2.chr20 12004826 262 - 42952723 ATGTACTCAGTAGAATT----AGATAAATATTTGGAGGTTAAAA----AATAATTTCAAATTTAATTCATATCTTCCATCTACATAATATATCCCTGGAAGAAGAGTAAATATATAAAATGTA-GTACTACACTTCATTGAGTATTATATGACAGTATGAAGCAGCATTTTAAATGTGTATCTGCGTGTGTGTGTACACGCACATCCACACATGCACACACGTGCtcagtcatgtctga-ttatttgtggccccataaacg-atagcctacca a score=3962 s mm7.chrY_random 20061001 73 + 30114534 TGCACACGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCAGACACACACACACAA----ATACACACAAGCTTATACACATAATC s bosTau2.chr14 47301233 77 + 50711261 TGCACATGTGTGTACATGTGCATGCCTGCATGCACACACACACACAAATTTATATACAAAAGCATACAAACATTATC a score=9531 s mm7.chrY_random 20095000 407 + 30114534 AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTCACAGGTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCACCCATCATTTACAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCTCCCCACACACACACACACATTTCTACTTGATTAACCATATTGGCATTACTTATTTTTATGGAAACATATCCCTCATTCCTGATTTAGTTGAAATCGTGGAAAATGTTGATGTACAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAAAACAGAAGTCAACAGGAATGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAAATTTCCCATCGATTTAGTAAAATG-------TTATAAATATGATTTTAAAAGAAGGCAACACACTGAAA--AAGTCTT--ATTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCCTTTC-----------------TGCTAATTGAG-GATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=27490 s mm7.chrY_random 20100862 1026 + 30114534 GGCCACATTCCTTTTATCTATCACTCTTTCCCCAAATTGATGTTTTTCC--CTCAGACTTCATACCAGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCCTTCTTCCTAAAAATCCATTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCCTTGCTCACTATGCAGACCACAGAAGCTAAGCCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGTTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCAACACA-GGAAAATAAACATTTTTT---TTTC----AATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGTAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTAAACAGTAGGATTGGCTAGAGCTTTGTAAACAAACTTTCTGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTTGTGTACTGCACCCAGGTACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCACCTCAGCCAGAGGAGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTTATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGAAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCCCCATCCCACTCCATTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTTAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGGGCGCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAATATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTCCGTAGT----GTCCGTAGACACTGTCAATTCCTTCATACTTCACCAAATAAAGAAAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCAAGA s bosTau2.chrX 20326739 1032 - 48857030 GGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTA---GAAGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCTTCCTTTCCCCC--ACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCT-----------------CCTT-----------AGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGGTT-ATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATA--TTTGCCTACATATAC---GTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGT--GAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGA a score=13335 s mm7.chrY_random 20272575 556 + 30114534 TACTGATAAGCCTGACTCCCTGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAACACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTAATCACAAAG------CCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGTATCT--ACTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAGTAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGCAAA------GCATGGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAATGACAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC----TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=15258 s mm7.chrY_random 20278090 376 + 30114534 AATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAGGGCTTGGGCATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCTGCATCAACTATGTGGAGATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGAAGTGATTGTGCTGGGAGCAGACACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGATGAAACGTTTTTGAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAATACTCAGAATCTGGACATCTCTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATGAGGATACAGAGATATAAACT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=5926 s mm7.chrY_random 20281733 597 + 30114534 AGAAGTATCTTT---TCCATTTTCTAAACAACAGATAGTAGTAGTTTCCTTCCTAATACAAATGTCTCTGGTTTAGTTAAATAGATTTATTAGCT--------TCAAATCAGACAATACAATGAAAGTTCATTTTCAGAAGGGTTAAGTGGAATTGAATTTGTGTTGTGTA-TTACTAACTGAGAGA--------------CCAATTTATAACCACAGAGCACTTTGAGGTGAGTGGAAAAAATTTTTACAATTATAAAATGCATAAAATTCCTTACCAAATTTTTATCAAACTTGCTTTATATGT------------AAGATCAACCAAAAATTAACAGACAACTACCAAACAGTTAAAGCATACAA---------------CATGCCAATAA-----------------------------------------------------------------------------------ATTAAAAGA----AAATGCTTATTTAGAAGTG-----GGAAAAGATAAG------CTTTTATGGAAT---CTGCTTAATTGTATAAGAAAGAGAAACATCACTTTTCTTCACAT--GCTCAGAATTTAAGAGGGGGAAATGATCCATGCGATAATCCAGTTCTATGTACACAAAATTAAGCAAGATCCTCATAATTAATGTGTTAGTACACAATGCCTGACTCAAATTCTATCATAGACGCTAAAGTCCTGTCAC---TGCAGGCTCATCAGTCTCACT s bosTau2.chr3 46353062 704 - 85360813 aaaaatttttttaaCTTTATCTTTTAAACTACAG---GGAGTAGCTTCTTTTCTGAAAAATGTTAAGTAGGTTCAGTTAAAGAAATGTACCTACTATGCATTTTCAAGTCAGAGAATAAATTCAAAATCAATTCCCTACAAAGGTGATTACAACAGATGTTACATTATATAATTGTTTACTTTAAAAATATCTCTTTAGTTTCATTCCATGTCCATTTATCATTTTGAGTTAAATGACAAAAATTTGTGAATTCATATTTTACAGGAAATTCTGCA---------TGACAGACTTGCTTTTCATGCTTAAGTTGGATAAAAATCAATCAAGTA--AAAAAATTATCACTAAGCAGATAATATGTATAAGGCATTATACTATGTCACACCAGTAACATTTTGCCCAACAGAAAGATTAAACTGAGTGTTATAATTTAGAGGTTAGCACTTAATCTGCTGTGTAGATTTCACCTTCCAAATTGAAATATTTAAGACCCTCATTTAGAAAGGTGAGAGAAAAAGATAAATATTTCCTTCTATGTGATGAAATGTTTACCAAAACTAGGAGTATAGATATCACTTTTCCTCATATATGTTTAAAATTCAAGGAGGGGGGGAAAGCTAC--------------------ATATAAAAACATACAG-------ATGAACAGTG-----------AATGTATGACCCAATTTCTGTCATAAAAGGTAAAGTCCAGTCTCTGTTGCTAGTTCATTATTCTCACT a score=4718 s mm7.chrY_random 20282576 84 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCAAAGAATCTGCATAG s bosTau2.chr3 46354234 84 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAG a score=13528 s mm7.chrY_random 20284282 1057 + 30114534 ACAAGTTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTAGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAAGTTTCTTAGGTTTGTGCTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGACAGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGCCCT----AATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTTAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAATGTGTGGATAACACAGATAA------------------TGAAAGACAGTTGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGGCAATTCTG---------------TCT----GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCACCAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCT---------------TAATG----CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATG-TAGATAGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=2968 s mm7.chrY_random 20306821 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTTTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAAAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=20475 s mm7.chrY_random 20313938 1318 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTATTTTTTCTTCAAA----ATGACCCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGTAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATT--TTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTTTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAAAAAAACACATTGAAATATAATTAAATTTTGtacatgtatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgggtgtgtgtgtgtgtgtgtgttaggtgtgtgttgtgtgtgtTTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAAACGTAAA---------TGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGGGGAA-------------AATC--TATAA-----------TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTTTGAGTGTTCTTTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaa-------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttcagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat---tgcatactctatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895153 1369 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCCTTACTACTCATG---GGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAA---TTATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA-ATA---------------------------------------------------------------------AAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGT--TGTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATATATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=5893 s mm7.chrY_random 20316833 418 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATTTTATTTCATGTTATTG-TAAAAATATACATATATTTAGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTACCATGCATGTTGCATGGCAATAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAGGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGA--TGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGATTATT--ATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=7587 s mm7.chrY_random 20317546 429 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGAGAACTGAGAAAAAAAATGTCTATGTTTAAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAAATTTCACTTGCTG-Gttatatat--atatatataaaacaaataaaaaaatCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGCTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTCAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTAAAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT---TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3335 s mm7.chrY_random 20319405 70 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATTGAAAGTA---TA---TTTCTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=35811 s mm7.chrY_random 20410297 1169 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGATAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTAACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCACCAGCGCCCTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCGTTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGCTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGCTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATTAAATTTCTTGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAAATCACA---AAGTACAGAAATATAAACTTATAGGATTGAAAAAAAATGTTTGTTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGTTGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCCAAGGAAGATGAAAGTTGCAACGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGG-TTAGATTCTGTAGTCTGCATAG------TGAGCAAAAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAAATGGATTTTTAGGAAGAAGCGGAGAAAGACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=10525 s mm7.chrY_random 20418726 461 + 30114534 CTGAAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCATGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAATAATTAATTATACATCAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATAAAAATAAGTAATGCCAAT---ATCGTTAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGTGTGGGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGTTGATAT-------CATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCgtttgaataattgtgt s bosTau2.chr17 20172806 480 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATT-AGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACTTTAT a score=3890 s mm7.chrY_random 20446840 76 + 30114534 GATTATGTGCATAAGCTTATGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCTGCACACACATGCACATGCACACACTTGTGCAAGT s bosTau2.chr14 3409951 80 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCAAAT a score=8412 s mm7.chrY_random 20460085 318 + 30114534 TATTTTTTTCATTAAACCTTGAACAGAATTTTTCTCTGATCTTAACAAAAT--TGCAAAGTACATGGGGGATAAAGGTGCACACTCTCAGGTGTGCATGGAATGACAATATGTTGAAGACCTTATTAGCCTCCATGTCCTTACCCTATGTGCCATCTTGGA---AAACAAATATACCCTAGCCAATGCAGAACACCAGCGTGCTGAAAGTCAAGAAAATGGCTTACTTGAATATGCCAGGGAGATTTCTAACCAAAATGTC-------ACTGTGTATATCTTTAACACGCGGTAGACCTGGTATTGCAAGAGACAGTAAAGGGCAGTAAC s bosTau2.scaffold865 134943 323 + 330098 TATTTTATTCCTGAAACTTTTCAAAGAGTTCTTCTCATGTCTTATAAGGATAATGTGTAGCACTTTGGGG-CAAAGATACAGCCTAGAAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGAAGATCTTCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGTAGACCGGGAGGAAGGTGACCTGGACATTGCAGAACACTAGCATGCTGAAAGTCAGGAACTTGGCTTCATTGAAGATGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGATAGCTAAGAAGAAGGTGCCCAGGGCTAAAAAGC------CCAAGTATCCCAAGACATGGTAGAAGGCAGTGAC a score=21440 s mm7.chrY_random 20463341 667 + 30114534 ACTTCTATCTGACACCTTGGATAGAATTTAAGTCTGGTCTTATTTCAATGATGTAGATCTTGGGTGTAAAGATGCATCCAAGCATCCCTGCACTGGATGCCAAGATTGAGAAGACCTCTACAGCAGCCATGACCATGCCCTTAGTCCTATGTGAGTCATGGAGGAAGGTGACATAAACACTGCAGAATCCTAGCACGACAAAGGTCAGGAACTTGGCTTCATTAAATGTTTCAGGAAAATTCTTTGCCACGAAATCCACAGTGAAGCTTCCAAGGGCAAGGCAGGTCAAGTATCCCAAAATTCAGTAGAATGCAGTAACTGAACCCTTGATGCACAAAATGATTA--TCATTATCATCAATATCAACAAATATCAATATCAACAAAAGGAGGAGAAACTGAGAGCCAGATTGCCCACA-GAATACATTGAT-ATGGAACATATCAGAAGGATGTATTTCATTGAACCTGATAAAAGGAGGTTCCTTAAACCTCTTCCAGGTTCTGTGATTATGAAAGCCAA-ACTACAATGATTGTTTTGGCAAGCAATGTGGAAACAGACACCATGAATACAATTCAAAAAGTGATTTGTTGTAAGGCTACATTTTTTTCTGTTAGGAAGACCAATGAAGAaaaaggagcatgagaaaatggaacatgagtgacatgagta s bosTau2.chr7 54723649 662 - 69141744 ACTTATTCTTTAAACTTTTCAAAGAGTTTTTATCAGTTCTTATAAGAACAATGTAGTACTTTGGGGCAAAGATGCAGCCTAGGAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGATGATCTCCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGCAGATAGGGAGGAAGGTGACCCAGACACTGAGGAGCACCAGCCTGCTGAAGGTCAGGAACTTGGCTTCACTGAAGGTGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGAAAGCCAAGGAGAAGGTCCCCAGGGCTAAGGAGCCCAGGTAGCCCAGGACACAGTAGAAGGCAGTGACCGAGCCCTTGTTGCACACGATGAGGAGCTCCTTGGGCTCAG----AATGAGTGTCCATCTCAAGGAAAGGGGGAGAGGCTCCCAGCCAGACTCCACAGATGATCACCTGGATCATGGAGTACATGGGAAAGACATA----GCAGGTCCTGTTAAGAGCAATCGCCTCATGGTTCTTCCTGGTTTCCTGGCCTTGAATGCCAAGATCACAGGGACGATTTTGGCCAAAACAGTGACCACAGCCACAGTGAACACAGCTCCAAATGTGGTCTGTTG-GAGGATGGAGGTGGCTGTGTGGGGACGACTGATAAAGAGTAAGGAGCA-GAGGAAGCACGGGAGGAGGGAGATGAACA a score=34503 s mm7.chrY_random 20481534 1170 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAAAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGTCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTAGGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTT-CCAGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGATACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGTCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCTTTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAATGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAATGTTCCGAAAGGTTGTTTACAAAGCTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAATCACA---AAGTACAGAAATGTA-AACTTATAGGATTGAAAAAAATGTTTATTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCAACTCAAGCTATGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGCGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAAGAAGGGGAGAAAGACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAATTTGGGGG-----AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCAA-GTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=3378 s mm7.chrY_random 20513913 55 + 30114534 CTTAAGATGGCCATGAAGTCAGAGAAGTGAATCCTGGCTTGTGAGTTCATGAAAG s bosTau2.chr3 46304496 55 - 85360813 CTTAAGATGGCAGCGGAGTCAGGGGAACTAATCGGGGCTTGCGAGTTCATGAAAG a score=4706 s mm7.chrY_random 20515275 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGTAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=5653 s mm7.chrY_random 20515613 607 + 30114534 aataataCAGTGAGACTGATAAGCCTGCA---GAGACAGGACTTGAGCGTCTATGATAGAATTTGAGTCAGGCATTGTGTACTCACACATTAATTATGAGGATCTTGCATAATTTTGTGTACATAGAACTGGATTATCACATGGATCTTTTCCCCCTCTTAAATTCTGAGC--ATGTGAAGAAAAGTGATATTTCTCTTTCTTATACAATTAAACAG---ATTCCATAAAAG-----------CTTATCTTCTCCCACTTCTAAATAAGCATTTTCA--------------------------------------------------------------------TTTAAT-------------------TTATTGCCATG---------------TTGTATGCTTTAACTGTT---TGGTAGTTTTCT------GTTAATTTTTGGTTTATCTTA--CATATAAAGCAAGTTTGATAAAAATTTGGTACGGAATTTTATGCATTTTATAATTGTAAAAATATTATTTCCACTCAACTCAAAGTGCTCTGTGGTTATAAATTGG--------------CCTCTCAGTTAGTAA-TACACAACACAAATTCAATTCCACTTAACCCTTCTGAAAATGAACTTGCATGGTATTGTCTGATTTGA--------AGTTAATAAATCTATTTAACTAAACCAGAGACATTTGTGTTAGGAAGGAAACTACTACTGTCTGTTGTTTAGAAAATGGA---AAAGATACTTCT s bosTau2.chr3 39007039 712 + 85360813 AATAGCCGAGTGAGAATAATGAACTAGCAACAGAGACTGGACTTTACCTTTTATGACAGAAATTGGGTCATACATT-----------CACTGTTCAT-------CTGTATGTTTTTAT--------------------ATGTAGCTTTCCCCCCCTCCTTGAATTTTAAACATATATGAGGAAAAGTGATATCTATACTCCTAGTTTTGGTAAACATTTCATCACATAGAAGGAAATATTTATCTTTTTCTCTCACCTTTCTAAATGAGGGTCTTAAATATTTCAATTTGGAAGGTGAAATCTACACAGCAGATTAAGTGCTAACCTCTAAATTATAACACTCAGTTTAATCTTTCTGTTGGGCAAAATGTTACTGGTGTGACATAGTATAATGCCTTATACATATTATCTGCTTAGTGATAATTTTTTTACTTGATTGATTTTT-ATCCAACTTAAGCATGAAAAGCAAGTCTGTCA---------TGCAGAATTTCCTGTAAAATATGAATTCACAA--ATTTTTGTCATTTAACTCAAAATGATAAATGGACATGGAATGAAACTAAAGAGATATTTTTAAAGTAAACAATTATATAATGTAACATCTGTTGTAATCACCTTTGTAGGGAATTGATTTTGAATTTATTCTCTGACTTGAAAATGCATAGTAGGTACATTTCTTTAACTGAACCTACTTAACATTTTTCAGAAAAGAAGCTACTCC---CTGTAGTTTAAAAGATAAAGttaaaaaaattttt a score=13573 s mm7.chrY_random 20519606 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTTCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCAAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGTTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCAAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCCC---AACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13368 s mm7.chrY_random 20524967 559 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATTTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTGTTTCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTTCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTACTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTATGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGCTTTGTGATTTAAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCAGAGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=13901 s mm7.chrY_random 20774940 556 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCGGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAACACTATTGAGAACACTTTTTTTTAAAATC---ACAAAGCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCATTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCACAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGAACACTGAAAGTGTGCTT-CAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGAAGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACA-----AACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA--CCA----TGTATTAGTCTTATAAGGATACACTGGAAATTTT--------------AAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=5053 s mm7.chrY_random 20781086 603 + 30114534 TAACTTTTCCATTTTCTAAACTACAGACAGTAGTAGTTTCCTTCCTAACACAAATGTCTCTGGTTTAGTTAAATAGATTTATTAGCT--------TCAAATCAGACAATACCATGCAAGTTCATTTTCAGAAGGGTTAAGTGGAATTGAATTTGTGTTGTGTA-TTACTAACTGAGAGG--------------CCAATTTATAACCACAGAGCACTTTGAGGTGAGTGGACATAATATTTTTACAATTATAAAATGCATAAAATTCCATACCAAATTTTTATCAAACTTGCTTTATATGT------------AAGATCAACCAA------AAATTA-------ACAGACAA-------------------------------------------CTAACAAACAG-------------TTAAAGCATACAACATGGCAATAAATT----------------------AAACGAAAATG---------CTTATTTAGAAGTGGGAGAAGATAAG-----------CTTTTATGGAAT---CTGCTTAATTTTATAAGCAAGAGAAACATCACTTTTCTTCACAT--GCTCAGAATTTAAGA--GGGGGAAAAGATCCATGAGATGTTCCAGTTCTATGAACACAAAATTAAGCAAGATCCTCATAGTTAATGTGTGAGTACACAATGCCTGACTCAAATTCTATCATAGACGCTAAAGTCCTGTCAC---TGCAGGCTCATCAGTCTCACTGtattatta s bosTau2.chr3 46353073 702 - 85360813 taaCTTT---ATCTTTTAAACTACAG---GGAGTAGCTTCTTTTCTGAAAAATGTTAAGTAGGTTCAGTTAAAGAAATGTACCTACTATGCATTTTCAAGTCAGAGAATAAATTCAAAATCAATTCCCTACAAAGGTGATTACAACAGATGTTACATTATATAATTGTTTACTTTAAAAATATCTCTTTAGTTTCATTCCATGTCCATTTATCATTTTGAGTTAAATG-ACAAAA-ATTTGTGAATTCATATTTTACAGGAAATTCTGCA---------TGACAGACTTGCTTTTCATGCTTAAGTTGGATAAAAATCAATCAAGTAAAAAAATTATCACTAAGCAGATAATATGTATAAGGCATTATACTATGTCACACCAGTAACATTTTGCCCAACAGAAAGATTAAACTGAGTGTTATAATTTAGAGGTTAGCACTTAATCTGCTGTGTAGATTTCACCTTCCAAATTGAAATATTTAAGACCCTCATTTAGAAAGGTGAGAGAAAAAGATAAATATTTCCTTCTATGTGATGAAATGTTTACCAAAACTAGGAGTATAGATATCACTTTTCCTCATATATGTTTAAAATTCAAGGAGGGGGGGAAAGCTACATA--------------TAAAAACATACAGATGAACA-------------------GTGA-------ATGTATGACCCAATTTCTGTCATAAAAGGTAAAGTCCAGTCTCTGTTGCTAGTTCATTATTCTCACTCGGCTATTA a score=4837 s mm7.chrY_random 20781917 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=12825 s mm7.chrY_random 20783376 1303 + 30114534 CCTGGCCAAGCAGTTATTATTTCAACATAAACCTA--GGATTCAATCTACCCTGCTTCTAATTGGGACCAAAAGTATAAGCCACATGTGTTTCTCTGC-CAGACTACTAGTGGATGAGACCCTCGAGTATCAGATGCATACCATGTTGGAGAGGGTACATAAGCTCTCATGCACTGACCTTATCA------ATAAATTA--------AATGCTCAAACTTTTCTATAGAGAAAACTGCTATACTCATTTAAAATTATG---AAAT-----CACAAATTGTACTTCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTTTTATGGA--------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAAGTTTCTTAGGTTTGTGTTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTTCCCAAGCTTCCGTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGGTAACACTG-----AAGGAAGACA--GAGTCTTATCATCGTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTGTATGGCAGTCAACATTATAGCCATTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGCCCT----AATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCAAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTCCTAATACACAAAAAATTGTGTGGATAACACAGATAATGAAAGACAGTGGGAAGC---AACTTATTATTGTA-----------TTGTATTTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTGCCAAA--------------TTTTCTAGACTTTAAATATTCT--TTACATTCTGTACCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGATTGACAATTCTGG--------------------TGAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCGTCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATTTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTTTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCACCAGGAACACTGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAA-ATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50039 1466 - 52585 cctggtccgggaactaaaatcccaacatgAACAAACCAGTTTCTGTCTGACCTGGCTTTCACT-----------TTTAAGTCACAGGCCTTACCCTGCTCTGACTGC------ACATTCCCTCCTAGCATCCAATGTTCACTGAGTCTACAAGA--CCATGAGGCCACAGG-GCTCTCCTTACCATTCTGAATAAATCAGTTTGCAAAATCTCCAGATCTTCCTGCAAAGCA------TCCATACATATGAAGCAATGCCTGAACAGCCATACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTA-CTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTG-------------CTTAATG------CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATG-TAGATAGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATTT-------ATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTTTAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3368 s mm7.chrY_random 20800840 116 + 30114534 ATCCAGGATT-----AAGTGTATAAGCTTGTGTGTATTTGTGTGTATGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACATGTTTTAGGTTGGAAACCTAG---ATGTCAGAAAAGTTAGTATTTT s bosTau2.scaffold1279 260563 112 - 261576 ATCTAGGTTTCTTGGAAGTGTGT------GTGTGTATGTGTGTGCACATGTGCACACTCATATGCGCAGGCACACACA---TTTAATTAGAAAAACCAGTTTGTGTCATCA---TAAGTATTTT a score=18416 s mm7.chrY_random 20901733 957 + 30114534 GTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTAGTGAGTTGGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGATCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGTGTCACATCAGTGGCAACACATGGGCCATTCACTTTCAGTTCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTAAGAAATCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTCGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCTAAGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGGAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGACTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGTGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTTT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGTTTTAGCACCCCCTTCCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCTATTTACTGTCAGAATATCCACTCTTTTCCTACAA--TAGGGGGTAGCTTGTATTCTGGCTAA-------TTCTGTATTCACTG---------------------------------TGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACATCTTTGA-------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATAAGTATCGATTCAGAT-AATATATACCTTTTGAGAATTATCTTCACATTTCTAATGTCTGCACAAAAAAGCTTTC------TTGATTTAAGTTACAGTTGCTATGCTTCACTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18243 1044 - 102126 GTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTCAG--GGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAG--TTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=2827 s mm7.chrY_random 20902704 112 + 30114534 TTAAGCATGATAATATTGAAAAGAAATTAAAATT--TTTCACTTTGAAATTAAAACTCTGAAGATGATTACTTAACTTGTGTTTGGAAAAGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA s bosTau2.scaffold2750 19906 115 - 102126 TCAAACACTCTAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATA a score=1895 s mm7.chrY_random 20902842 96 + 30114534 TTGTTCAAACACAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAACGAAAATAACTGAATAGTA-GGTTTGT-ATCATTTGACACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 20067 104 - 102126 TTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=16980 s mm7.chrY_random 20920576 968 + 30114534 GCACTAGTGGCCTTAAAGAATTGTTTTGTCTGTCACAGTTAGCAAGTTGGGTTCTTATT-CATTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAG-CACAACA-GGATAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATACAGTTTGAGTCCAATGATGCAGCTGGAATATAGTTGCACAGGATTATTTATTAAACACTTAGTCAAGCTGA-TATTTGAGAGATCATGTTT-TATAGAAATTGGTACACTGAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTACTTTACTGACACAGAAACTTGTTTTGCCTGTTTTGTACACTTTGCCAG-TTTTCTATGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC----CTCTCTTTGAGTTTTGTGAAGGATTTCTGTTTCCCTTTGGCTATGCAGCAATAAAGGCTTGCA-TCATTCAGAAACT-CAGGGACACTTTCTATCAA-CCAGTTATTTCCTTGTGCCATTGCCTC-ATTGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTTCCACCCCCTCTCTTTTTTTTTTTAACTCCAACTTATCTCAGGAGTTTATATTTAAAAGCTATTTGCTGTCAGAATATCCACTCTTCTCCTACAA--TCTGGGGTAACTTGTATTCCTGGCTAATTCTGTATTAACTATGC----------------------------------------TTATCTGAATTTCTAGTTGGTCTTTTGCCATCTCTGA-------------AAACATTGAATTT---------AAGTAA-CAGAACA--ATCATGCTAGGCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATATGTATCGTTTCAGAT-AATATACACCTTTTGAGAATTAGCTGTGCAATCTTAATGTCAGAACAAAATAGCTTTCTGGAT----TTAAGTTACTGTACCTATGTTTCTTTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTA--ACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTCAGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttc----cttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgc-ttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=4496 s mm7.chrY_random 20932308 165 + 30114534 attatactaataattatttaaa-CTGTGTCTTATACTG-CTAATATGGTTTCACATATACATGGGAGTTTGGTAGCCTCAGGAC------TCTGTCCAGGTAGCTGGATCATGTTAATGGATTTTTACACTCAGATTGCCATTCATTTTCTTTTTAGTTGCCAATTTCAAGGG s bosTau2.chr13 22763137 172 - 62721844 ATTTCATTAGTAATGATTTCAATCCCTGCCTGGAGCTGGATAATTCTGTTAAGCGTGTAAATTGGGGTTTGGTAGCCCCAGGACCCATCTTCTGCCCATGTAGCTAGCCTGTAGTATTGGA-TTATGCGTTCAGGAGACCACTCATCATCTTTCCAGTCTCCAGTCTGTAGAG a score=3787 s mm7.chrY_random 20932721 389 + 30114534 GATTTCTAAATGGTCCCCTCTGGTAAGTTGGAACAGGAAGAAAATTGTACAGCTAGTCCCCAAAACACACAATCCTGAT---TAGGTGAGAAAAAGTATAATCGAGGCTGTGTACCCAACATATCCAGTATAGCCC------ACAAAGGGCATGGTACCTGATACCTGCATTGA------CATTTTTTTCGGTCCTGTCAGAGATTAGAGAAACTAGACAAGGAATAGATGTTTTGTTCAAAGTGGTTTGGGAATCCACACCA--TTGAATTTCCCAAGTGACTGCATTAAAGAATGATTGGCCCAGGCATGTGGGGCTTCCAGC-AGAAGTTTAAATCACC-CTTCCATTAGGTAGGTCAGTTTTCCCCAA--AAA------CTTAAGTACTAGTTCAATTTTGGTtttggtttt s bosTau2.chr13 22763349 395 - 62721844 GACTCCCAATGATTCACCTTAGGCTAGGGAGAGTAGGAAAAAGGAAGGACAGATAGTCCCCAATACACATGCTCCTGACCTGTTGGCTGGTAAAATTGTATGTGCGTTAGT----CCCACAAATCCAATATGATCCTTCTGGACGAGGCCAATGG---------CCTTCAGTGGACAAGTCATCCCATCAGGTCTT----TAAATGGGGGATGCTTGTTAGAGGGTGAGGATTAGGCTCTGTATAGTTTGGGCATCCCCACCAACCAGAAGTATGaatattataatattataatatttttGGCCAAGACAAGTGAGTTTTCCTACTGGAACATTGAATAATTGGCCCCACCATGCCAGACAGTTTTTGTCAATTAAAGAAGTCTTTAAATGCCA----AATTCTGACCCTGGTCTT a score=3781 s mm7.chrY_random 20933358 96 + 30114534 ttttttATCTATCCAGG-CCATAGTTCTTCCATGTTAGTTTTTTCACATGCATGGCCAAAATAGACCCTTAGCTACTGGACTCTTGTGTCTACCAGG s bosTau2.chr13 22763786 97 - 62721844 TTCTTTGGCTTCCCAGGGCCATTGGTCTCCCATGTTAGTTCCCCCACACACATAGCAAGAAGTAACCATTAATATCTGGGCTATGGTCTCTGCCAGG a score=6307 s mm7.chrY_random 20936759 334 + 30114534 TGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAAAAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAGACAAAAAAAGGTAGatatttttttctttgttttatatatatatatataaCCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGACGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGTTGGCTCTTTTAAACATAGACATTTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528299 362 - 76426644 TATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGAAGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATT-TCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTTCTGAA-------TAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTTTA--AGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=5672 s mm7.chrY_random 20937387 420 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACGTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTACCTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTATTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGA--CTAAAT-ATGTGTATATTTTTACAATAACATGAAATAAAATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATAATGTGTTCAC-----CACTTACATACAAT--AATAATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=20961 s mm7.chrY_random 20939389 1263 + 30114534 atatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagatagtggaacttaatttagtttcatatgctcaacccaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt-------tttttatggtaccaaccactgatttttctttttcctcattgaatttctGTACATCCATATAAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAAAGAACACTCAAAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCCCTATCATATTATCAGAGAGGTTTTCA-------TTTATGT--TTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacgtaacacacacacacacacacacatatatatacaTGTAC----AAAATTTAATTATATTTCAATGTGTTTTTTTTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAAT-----------------------------------------------------TTATTTTTCATGCATTGCCTTAGTAAAGACA----GTGCAAAACA-----TATGTCAACTAAAATATTCAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAGTGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGGAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTAAGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGTCACACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGAAATGATATATTTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCATTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTCCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGGGTCAT----TTTGAAGAAAAATTAGGTGATTCCATGTCTACA-AGTAAAATAGATATAGATAAATTTCTTTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530141 1350 - 76426644 ATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAACA--ACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTTTATTA--------------------------------------TATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATT---TTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGTTAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATT-TATTCCCACATATTCAAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=3099 s mm7.chrY_random 20947621 94 + 30114534 ATATTTCTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAAAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=18416 s mm7.chrY_random 21035578 957 + 30114534 GTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTAGTGAGTTGGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGATCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGTGTCACATCAGTGGCAACACATGGGCCATTCACTTTCAGTTCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTAAGAAATCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTCGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCTAAGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGGAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGACTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGTGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTTT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGTTTTAGCACCCCCTTCCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCTATTTACTGTCAGAATATCCACTCTTTTCCTACAA--TAGGGGGTAGCTTGTATTCTGGCTAA-------TTCTGTATTCACTG---------------------------------TGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACATCTTTGA-------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATAAGTATCGATTCAGAT-AATATATACCTTTTGAGAATTATCTTCACATTTCTAATGTCTGCACAAAAAAGCTTTC------TTGATTTAAGTTACAGTTGCTATGCTTCACTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18243 1044 - 102126 GTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTCAG--GGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAG--TTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=2827 s mm7.chrY_random 21036549 112 + 30114534 TTAAGCATGATAATATTGAAAAGAAATTAAAATT--TTTCACTTTGAAATTAAAACTCTGAAGATGATTACTTAACTTGTGTTTGGAAAAGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA s bosTau2.scaffold2750 19906 115 - 102126 TCAAACACTCTAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATA a score=1895 s mm7.chrY_random 21036687 96 + 30114534 TTGTTCAAACACAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAACGAAAATAACTGAATAGTA-GGTTTGT-ATCATTTGACACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 20067 104 - 102126 TTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=16980 s mm7.chrY_random 21054421 968 + 30114534 GCACTAGTGGCCTTAAAGAATTGTTTTGTCTGTCACAGTTAGCAAGTTGGGTTCTTATT-CATTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAG-CACAACA-GGATAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATACAGTTTGAGTCCAATGATGCAGCTGGAATATAGTTGCACAGGATTATTTATTAAACACTTAGTCAAGCTGA-TATTTGAGAGATCATGTTT-TATAGAAATTGGTACACTGAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTACTTTACTGACACAGAAACTTGTTTTGCCTGTTTTGTACACTTTGCCAG-TTTTCTATGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC----CTCTCTTTGAGTTTTGTGAAGGATTTCTGTTTCCCTTTGGCTATGCAGCAATAAAGGCTTGCA-TCATTCAGAAACT-CAGGGACACTTTCTATCAA-CCAGTTATTTCCTTGTGCCATTGCCTC-ATTGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTTCCACCCCCTCTCTTTTTTTTTTTAACTCCAACTTATCTCAGGAGTTTATATTTAAAAGCTATTTGCTGTCAGAATATCCACTCTTCTCCTACAA--TCTGGGGTAACTTGTATTCCTGGCTAATTCTGTATTAACTATGC----------------------------------------TTATCTGAATTTCTAGTTGGTCTTTTGCCATCTCTGA-------------AAACATTGAATTT---------AAGTAA-CAGAACA--ATCATGCTAGGCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATATGTATCGTTTCAGAT-AATATACACCTTTTGAGAATTAGCTGTGCAATCTTAATGTCAGAACAAAATAGCTTTCTGGAT----TTAAGTTACTGTACCTATGTTTCTTTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTA--ACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTCAGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttc----cttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgc-ttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=4496 s mm7.chrY_random 21066151 165 + 30114534 attatactaataattatttaaa-CTGTGTCTTATACTG-CTAATATGGTTTCACATATACATGGGAGTTTGGTAGCCTCAGGAC------TCTGTCCAGGTAGCTGGATCATGTTAATGGATTTTTACACTCAGATTGCCATTCATTTTCTTTTTAGTTGCCAATTTCAAGGG s bosTau2.chr13 22763137 172 - 62721844 ATTTCATTAGTAATGATTTCAATCCCTGCCTGGAGCTGGATAATTCTGTTAAGCGTGTAAATTGGGGTTTGGTAGCCCCAGGACCCATCTTCTGCCCATGTAGCTAGCCTGTAGTATTGGA-TTATGCGTTCAGGAGACCACTCATCATCTTTCCAGTCTCCAGTCTGTAGAG a score=3787 s mm7.chrY_random 21066564 389 + 30114534 GATTTCTAAATGGTCCCCTCTGGTAAGTTGGAACAGGAAGAAAATTGTACAGCTAGTCCCCAAAACACACAATCCTGAT---TAGGTGAGAAAAAGTATAATCGAGGCTGTGTACCCAACATATCCAGTATAGCCC------ACAAAGGGCATGGTACCTGATACCTGCATTGA------CATTTTTTTCGGTCCTGTCAGAGATTAGAGAAACTAGACAAGGAATAGATGTTTTGTTCAAAGTGGTTTGGGAATCCACACCA--TTGAATTTCCCAAGTGACTGCATTAAAGAATGATTGGCCCAGGCATGTGGGGCTTCCAGC-AGAAGTTTAAATCACC-CTTCCATTAGGTAGGTCAGTTTTCCCCAA--AAA------CTTAAGTACTAGTTCAATTTTGGTtttggtttt s bosTau2.chr13 22763349 395 - 62721844 GACTCCCAATGATTCACCTTAGGCTAGGGAGAGTAGGAAAAAGGAAGGACAGATAGTCCCCAATACACATGCTCCTGACCTGTTGGCTGGTAAAATTGTATGTGCGTTAGT----CCCACAAATCCAATATGATCCTTCTGGACGAGGCCAATGG---------CCTTCAGTGGACAAGTCATCCCATCAGGTCTT----TAAATGGGGGATGCTTGTTAGAGGGTGAGGATTAGGCTCTGTATAGTTTGGGCATCCCCACCAACCAGAAGTATGaatattataatattataatatttttGGCCAAGACAAGTGAGTTTTCCTACTGGAACATTGAATAATTGGCCCCACCATGCCAGACAGTTTTTGTCAATTAAAGAAGTCTTTAAATGCCA----AATTCTGACCCTGGTCTT a score=3781 s mm7.chrY_random 21067201 96 + 30114534 ttttttATCTATCCAGG-CCATAGTTCTTCCATGTTAGTTTTTTCACATGCATGGCCAAAATAGACCCTTAGCTACTGGACTCTTGTGTCTACCAGG s bosTau2.chr13 22763786 97 - 62721844 TTCTTTGGCTTCCCAGGGCCATTGGTCTCCCATGTTAGTTCCCCCACACACATAGCAAGAAGTAACCATTAATATCTGGGCTATGGTCTCTGCCAGG a score=6307 s mm7.chrY_random 21070602 334 + 30114534 TGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAAAAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAGACAAAAAAAGGTAGatatttttttctttgttttatatatatatatataaCCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGACGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGTTGGCTCTTTTAAACATAGACATTTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528299 362 - 76426644 TATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGAAGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATT-TCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTTCTGAA-------TAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTTTA--AGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=5672 s mm7.chrY_random 21071230 420 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACGTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTACCTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTATTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGA--CTAAAT-ATGTGTATATTTTTACAATAACATGAAATAAAATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATAATGTGTTCAC-----CACTTACATACAAT--AATAATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=20961 s mm7.chrY_random 21073232 1263 + 30114534 atatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagatagtggaacttaatttagtttcatatgctcaacccaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt-------tttttatggtaccaaccactgatttttctttttcctcattgaatttctGTACATCCATATAAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAAAGAACACTCAAAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCCCTATCATATTATCAGAGAGGTTTTCA-------TTTATGT--TTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacgtaacacacacacacacacacacatatatatacaTGTAC----AAAATTTAATTATATTTCAATGTGTTTTTTTTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAAT-----------------------------------------------------TTATTTTTCATGCATTGCCTTAGTAAAGACA----GTGCAAAACA-----TATGTCAACTAAAATATTCAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAGTGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGGAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTAAGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGTCACACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGAAATGATATATTTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCATTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTCCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGGGTCAT----TTTGAAGAAAAATTAGGTGATTCCATGTCTACA-AGTAAAATAGATATAGATAAATTTCTTTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530141 1350 - 76426644 ATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAACA--ACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTTTATTA--------------------------------------TATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATT---TTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGTTAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATT-TATTCCCACATATTCAAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=3099 s mm7.chrY_random 21081464 94 + 30114534 ATATTTCTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAAAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=12513 s mm7.chrY_random 21109483 1057 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGCCCCTGGTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAAcatcaatgattttatacaggagagaatcctgtttaactgtattgaatgtgaGAGACCATTCCTTCAAATATTTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC----AGA---------------CAGAATTGCCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGCTTCCCACTGTCTTT--------CATTATCTGTGTTATCCA--CACACT-------TTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTCTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTTGACATCTGTGTTCACAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATACTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAAATCTTCACTTATCTCAGAAGAGATG---TAAAATGCTATTAGGGCTCT-TGAAG-----TCAGAAAGGATTAATATTCATGGCACAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACCGCCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAACATGATAAGATT--GTGTCTTCCTTCAGTGTAAGCA----------AGGTAGTTGTCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCC-----AACAC--------------------AAACCTTAGAAACTTGTAAGCATTTGAAGTTCACTTACAGA---------------TCTCACTGTCCATACTAGTTATCCATCTCTCTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACT---GGACTTTTTAAATGATTGAATACTACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAATTTGT s bosTau2.scaffold5600 1080 1221 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA---AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-----AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCT-ATCTACATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAG-AAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAA-TTCTAGCATTAAGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACT--TAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCAT--------CTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=3511 s mm7.chrY_random 21110783 69 + 30114534 CCAGGAGGATTCTTCTTAAGATGGCCATGGAGTCAGAGAAGTGAATCCTGGCTTGTGAGTTCATGAAAG s bosTau2.chr3 46304482 69 - 85360813 CCGTGCGTATCTCGCTTAAGATGGCAGCGGAGTCAGGGGAACTAATCGGGGCTTGCGAGTTCATGAAAG a score=4587 s mm7.chrY_random 21112165 84 + 30114534 CTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACATATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006495 84 + 85360813 CTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=3999 s mm7.chrY_random 21112480 597 + 30114534 AGTGAGACTGATGAGCCTGCATTA---ACAGGACTTTAGCGTCTTTGATAGAATTTGAGTCAGGCATTGTGTACTCACACATTAATTATGAGGATCTTGCTTAATTTTGTGTACATAGAACTGGATTATCGAGTGGAATCGTTTCCCCCTCTTAAATTCTGAGC--ATGTGAAGAAAAGTGATGTTTCTCTTTCT--------TATACAATTAAGCAGATTCGATAAAA-GCTTATCTTTTCC-----CACTTCTAAATAAGCATTTT-------------------------------------------------CTTTTAATTTAT-------------------------------------------TGGCATTGT-----------TATGCTTTAACTGTTTGGTAGTTGTCTGTTAATTTTTGGTTGATCTT------------ACGTATAAAGCAAGTTTGATAAAAATTTGGTAAGGAATTTTATGCATTTTATAATTGTAATTTTTTTTTCCACTCACCTCAAAGTGCTCTGTGGTTATAAATTGG--------------CCTCTCAGTTAGTAA-TACACAACACAAATTCAATTCCACTTAACCCTTCTGAAAATGAACTTTCATGGTATTGTCTGATTTGA--------AGCTAATAAATCTATTTAACTAAACCAGAGACATTTGTATTAGGAGGGAAACTACTACTGTCTGTTGTTTACAAAATGGA---AAAGATACTTCT s bosTau2.chr3 39007047 704 + 85360813 AGTGAGAATAATGAACTAGCAACAGAGACTGGACTTTACCTTTTATGACAGAAATTGGGTCATACAT-------TCAC-------------------TGTTCATCTGTATGTTTTTATATGTAGCTTTCC-------------CCCCCTCCTTGAATTTTAAACATATATGAGGAAAAGTGATATCTATACTCCTAGTTTTGGTAAACATTTCATCACATAGAAGGAAATATTTATCTTTTTCTCTCACCTTTCTAAATGAGGGTCTTAAATATTTCAATTTGGAAGGTGAAATCTACACAGCAGATTAAGTGCTAACCTCTAAATTATAACACTCAGTTTAATCTTTCTGTTGGGCAAAATGTTACTGGTGTGACATAGTATAATGCCTTATACATATTATCTGCTTAGTGATAATTTTTT--TACTTGATTGATTTTTATCCAACTTAAGCATGAAAAGCAAGTCTGTCA---------TGCAGAATTTCCTGTAAAATATGAATTCACAAATTTTTGTCATTTAACTCAAAATGATAAATGGACATGGAATGAAACTAAAGAGATATTTTTAAAGTAAACAATTATATAATGTAACATCTGTTGTAATCACCTTTGTAGGGAATTGATTTTGAATTTATTCTCTGACTTGAAAATGCATAGTAGGTACATTTCTTTAACTGAACCTACTTAACATTTTTCAGAAAAGAAGCTACTCC---CTGTAGTTTAAAAGATAAAGttaaaaaaattttt a score=14335 s mm7.chrY_random 21116252 369 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTCATCATTCAACACCATAATGGGTATCCTGCAGCTTATAGGGAAGAGATGTCCAGATTCTGAGCATTGCAGGGTACCATCCAATTC----TCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTCAAAAACGTTTCATCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTCCCAGCACAATCACTTCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATCTCCACATAGTTGATGCAGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGCCCAAGCCCTACACATTTGAGCTTAGGAGATT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATA-TGGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCCCAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=13827 s mm7.chrY_random 21121560 556 + 30114534 TACTAGCTTTGATGCTCGATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAAT--CTTCGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATATACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGTG------CTTTGTGATTAAAAAAAAAAATGTTCTCAATAGCGTTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCCGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA---GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=3962 s mm7.chrY_random 21426433 73 + 30114534 TGCACACGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCAGACACACACACACAA----ATACACACAAGCTTATACACATAATC s bosTau2.chr14 47301233 77 + 50711261 TGCACATGTGTGTACATGTGCATGCCTGCATGCACACACACACACAAATTTATATACAAAAGCATACAAACATTATC a score=9216 s mm7.chrY_random 21460356 407 + 30114534 AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTCACAGGTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCACCCATCATTTACAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCTACCCACACACACACACACATTTCTACTTGATTAACCATATTGTCATTACTTATTTTTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTGAAATCGTGGAAAATGTTGATGTACAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAAAACAGAAGTCAACAGGAATGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAAATTTCCCATCGATTTAGTAAAATG-------TTATAAATATGATTTTAAAAGAAGGCAACACACTGAAA--AAGTCTT--ATTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCCTTTC-----------------TGCTAATTGAG-GATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=27816 s mm7.chrY_random 21466198 1025 + 30114534 GGCCACATTCCTTTTATCTATCACTCTTTCCCCAAATTGATGTTTTTCC--CTCAGACTTCATACCAGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCCTTCTTCCTAAAAATCCATTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCCTTGCTCACTATGCAGACCACAGAAGCTAAGCCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTTATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGTTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCAACACA-GGAAAATAAACATTTTTTTTCAATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTT---TGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGTAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTAAACAGTAGGATTGGCTAGAGCTTTGTAAACAAACTTTCTGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGTACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCACCTCAGCCAGAGGAGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTTATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTTAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGGGCGCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAATATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTCCGTAGT----GTCCGTAGACACTGTCAATTCCTTCATACTTCACCAAATAAAGAAAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGA s bosTau2.chrX 20326739 1032 - 48857030 GGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTA---GAAGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCTTCCTTTCCCCC--ACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCT-----------------CCTT-----------AGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGGTT-ATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGT--GAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGA a score=3481 s mm7.chrY_random 21559301 149 + 30114534 AGGGTATATAACTATCTTCATAATATAAAAAAAAAAATACTAACTTTTCTGACAT---CTAGGTTTCCAACCTAAAACATGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCGGACACATACACACAAATACACACAAGCTTATACACTT-----AATCCTGGAT s bosTau2.scaffold1279 869 144 + 261576 AGATTATACAAATGTCAATATT-TATCAATTATAAAATACTTA---TGATGACACAAACTGGTTTTTCTAATTAAA---TGTGTGTGCCTGCGCATATGAGTGTGCACATGTGCACACACATACACAC------ACACACTTCCAAGAAACCTAGAT a score=8344 s mm7.chrY_random 21644940 483 + 30114534 TTTAAACGTACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ATATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATGTATTTCATCCTGTTGTACTGCATTTAATCCATGAAATTCCTTATAATCAGAAGTGCTGGTAA-ATTTTAAAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGtttttttttttttaattttatCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTACGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGCTTTCAATACATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGCTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTTGTGTGCTATCCAGCGTGCT-GCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164600 437 - 45915461 TTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAA-----TTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAGTCCAAG-TTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAA---ACTATTTCAGTG-----CATCGTCCTGGTCTT-----GCCAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=393 s mm7.chrY_random 21647216 82 + 30114534 GGAAGCCACAAGACAGTGTGATCTACCAAAACAGGTCTACAGCCAGGTAGAAGACAATACCTCTGAAGACTCTGAGCATGAC s bosTau2.chrX 20848372 72 - 48857030 GGAGGCCGAAGGGCAG----------CAAACCAGGGCTGTTGCAGGAAAGGCCACTGGGTCTGCAAACATGATGAAGAAAAA a score=35412 s mm7.chrY_random 21647298 1136 + 30114534 ATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGGGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGGCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACAGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCACTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACACCTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGTGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTACCTGGGTGCAGTACACAAGAGATGATGGATCCAAAATTTC-GGAAAAGTTGTTTACAAAGCTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTACATATCTATGTCTATATTCTGGTGTCAAATATCACTTAA--ATTGAAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATTGAAAAA---AAAATGT-TTGTTTTCCTTTGT--TGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAA---TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACAGGACAAGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAGAATGG-ACAGGACTTAGCTACTGTCGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAA--GAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529137 1181 + 48857030 ATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAG---TCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=9681 s mm7.chrY_random 21653825 409 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTT--TTTCAGCGTGTTGCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTGTACATCAACATTTTCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATAAAAATAAGGAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTATGTGTGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTCAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGTGAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA----------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=4075 s mm7.chrY_random 21682530 73 + 30114534 GATTATGTGTATAAGCTTATGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCTGCACACACATGCACATGCACACACATGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=3870 s mm7.chrY_random 21815715 73 + 30114534 TGCACAAGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCGGACACACACACACAA----ATACACATAAGCTTATGCACATAATC s bosTau2.chr14 47301233 77 + 50711261 TGCACATGTGTGTACATGTGCATGCCTGCATGCACACACACACACAAATTTATATACAAAAGCATACAAACATTATC a score=8469 s mm7.chrY_random 21841588 469 + 30114534 acacaattattcaaacGAATAAAGGA-----------ATGAAAAAGAAAATG-------ATGTCAACTAATA-------AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCTCAGGTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTGATCAGCCATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCACCCcacacacacacacacacacacaTATTTCTACTTGATTAACGAT---ATTGGCATTACTTATTTTTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGGGAAATGTTGATGTATAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAATACAGAAGTCAACAGTATTGAATCTATTTTTCCTTGGAGGTTAAGATTTCCCATCGATTTAGTAAAATA-------TTATAAATATGATTTTAAAAGAAGGCAAAAC--CCTGAAAAAGTCTT--ATTTTCATATTTTCATTCTTTACAG s bosTau2.chr17 25742175 480 + 45915461 ATAAAGTCATCCAATTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC----------------------------TTTCTGCT-AATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=36185 s mm7.chrY_random 21847462 1174 + 30114534 TCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATACC----------AGAGATTTTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCTCTTCTTCCTAAAAATCCATTTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATA-----TCTCCAATTCTTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGCGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCCACCGTA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-------ACCCGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATAGATATCCA--ACAGGGGAAAACAA-ACATTTT---TTTTTCAATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTTTCAAT--TTAAGTGATATTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGGAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGAGCTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGATCTCGCCTCAGCCAGAGGGGTCT---------CTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCTAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGGTAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGGGCGCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGATGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAAAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGA----TGTCATGCTCAGACTCTTAA--GAGGTGTTGTGTTCTAC s bosTau2.chrX 20326712 1223 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGCCTCTCCATTTCTGACC---CCTTCCCATATCCTTTCTTAA------------GCAGCCATCTCTCTTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATT--TTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGA---CTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAATCTTTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAAC a score=3129 s mm7.chrY_random 21849939 314 + 30114534 AGAAAATTTTTAGCTTTCTGTAGCTATGAGGGTTCCAATTACTTCATAAATGTACTTACCCATAGAAAAATATCCTAG-TCGTCAAGATTCTATCTCCTGATACAGACCA--------GGCACCAAA---------AGCCTGTGGGAAAAAAATGACC-----TGGCTTTGACACACCACTGTGAAGATA-GTGAACTCACCTTGAATGGATTCTAGCGCCTCCAAGTGGAAT-AGATGCGCAACCTCCAGCCAGTGCTCTGTGACATCACCCTAGTTCA--GCTTACATCATAGAACCCCTCTCAGGCTGGTTCCTTCCCTAGTTACACTCAGAAACGTT s bosTau2.chr17 25749564 322 + 45915461 AGAAAATCATT--CTGCTTGGGACTATAGAACCTTCAATCACTTAATAAATGGATCGCCCCACA-CAGAATGTCCTAGCTAGCCCAGATACTTTCTTCTGAAGGGGAACATTGGTTTTGGTAATAAATCTTGTTATATTCTCTATGGCTTAAATGAACAGAAATGGAATCTACA---TATTTTAAAGTTACATTCATTGATGTGCAAGAAAGTGCAGCGTCCCCTAGTGGACTCCTGTGTACCACCTCCA-TCAGCGC---------TTACCCTGCGCCAGGGCTTG---AATGGAAATCCTTACACCATGGTTTCTTCCAAGGTCACACCCAGAAATGTT a score=9068 s mm7.chrY_random 21850465 494 + 30114534 TTTCTGACTTGACAACATCCATGGTGGTTATTTTTCATGTTCCAACCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTCTTATCATAAATATTGCCAGACTCTTTGAGGCACCACACTGGATAGCACACCAATTTTCACTTTATGAAAACCCACAGTTAGAGGAGGACTATTT-TTATGCAAACAAACCTGGAATTTGACAGGGTTAAATGACATGTATTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCATGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAAATTAAAAAAAAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAAT-TTACCAGCACTTCTGATTATAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATGT--GTAGACAGAATACTGGACACAGGTATGTATAAAATTTACTTACAAAT s bosTau2.chr17 25750424 451 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAG---TGTTGCCCATATAGAATGTTGGCTGGC-----AAGAC------CAGGACGATGCACTGAAAT-AGTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAACTTGGA-CTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAA--TTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCAT a score=531 s mm7.chrY_random 21879611 90 + 30114534 AATGTGACAAACTTCAT---GAGAATAAGGAAGTTTAAGCACTCTGGTCATAAGCAGCATTTCTGTGACACTTTTCAAATGTGA--AATTGAATG s bosTau2.chrX 28007876 92 + 48857030 AATGTGGCAAAGTTTATCCTGACAGTTAGGACTTTTTCAC---CAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTGATGAAATAAACA a score=26544 s mm7.chrY_random 21879702 731 + 30114534 GAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAACCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACAACCCTCCTTTAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGATCTGGTGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATAATTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCAAACAATATTCCTCAAGACATTGGAAGAAGACATCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTATCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20327276 716 - 48857030 GAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=11533 s mm7.chrY_random 21883437 470 + 30114534 TGTCCATGCCACTTTTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCA-ATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACACTGGCATTAATTATTTGTATGGAAACATATCCCTTTATCCTGATTTAGTTAAAAGCGTGGGAATTGTCAATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG---GTCGTTCTGTGCCATATAAAGGAAGGTAGAGAAGGAAAGCTGT-TTTGGAGTCACTGACACACATTTAACTGAG-GTCT---CTTTGCATAGTA s bosTau2.chr17 25742256 494 + 45915461 TGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATT-ACTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGC--TACAAAACAACCTAGTCAACAAAGAATGCAATTGGAGTTTCTTCTGCCCTTTTAGCTGAATGTCTGAACTTGGCAAAATA a score=13664 s mm7.chrY_random 21893191 375 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCGTCATTCTACAGCATATTGTTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTC-TGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGCAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCACACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9852 s mm7.chrY_random 21897665 310 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTATAATGTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGCTCTTTGCATGCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTA----------GCTTCTTACTGCA------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=2668 s mm7.chrY_random 21898328 118 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGATATTCCTATTTAGTAGTTTATGATATACTAAATATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAG s bosTau2.chr3 40230044 99 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGT-------TGAAGCTGTTTA--ATATTTTAAA----ATTTCCAGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTTTT-AAGAAGTGGGGTGGG a score=5274 s mm7.chrY_random 21898484 157 + 30114534 atatatatatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGG-AGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230162 186 + 85360813 GTATA-ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10152 s mm7.chrY_random 21910214 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGATTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACACATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACT---TATTTGTACGGTAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTTTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTTATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTATATATA----AATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=39089 s mm7.chrY_random 21916127 1316 + 30114534 CCTGATTTTCTCTGATTTCTGAATCTATTT-----------CAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCTACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCCAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCCTTTTCTGCCATCCCTGCTCCACCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGCATGC----------AGACCAG--AGATGCTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCTAACACAGGAAAAAAAAA---ACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTGGCTAGAAATTGGTAAACAACCTTTCTGAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCTCCCAGTTAACTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCACCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTTGCGAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGTTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCACACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326633 1341 - 48857030 CCTGAACTTCT------TCTAAATGTATTTGTGTCCCTCTTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAAT-----------------------CTTTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=2676 s mm7.chrY_random 21918916 99 + 30114534 GGAAAACTTTCAGCTTTCTATAGCTATGAAGGTCCCAGTTACTTCATAAATGTACTTACCCAAAGAAAATGTCTTAG-TCGTCAAGATTCTGTCTTTTGA s bosTau2.chr17 25749565 97 + 45915461 GAAAATCATTCTGCTT---GGGACTATAGAACCTTCAATCACTTAATAAATGGATCGCCCCACACAGAATGTCCTAGCTAGCCCAGATACTTTCTTCTGA a score=8534 s mm7.chrY_random 21919482 454 + 30114534 TTTCCCTGTTCCAAAC-----TTTCCCTGGTTATCTTTCAA---------CTGTTCTTAGTGT-CAGAAATGGTGCC-----AGACTCTTTGA-GGCAGCACACTGGATAGCACATCAAAATTCTGTTTATAAAAACCCAAAGTT-AGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGTGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGGTCCTGCCTTCAAAGTTGTGATAAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTTTAAAAT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATATATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAGACAAAATATTGAACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA s bosTau2.chr17 25750424 446 + 45915461 TTTCTGTGCTTCCAACACACATTTCT---GTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGTGTATTGAAGTGTTGCCCATATAGAATGTTGGCTGGCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAATAGT-TTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTA a score=11270 s mm7.chrY_random 21920669 424 + 30114534 CTATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGCCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACTTTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATAATTTTTTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTTCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTGAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742210 445 + 45915461 CTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCT-ATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=13781 s mm7.chrY_random 22097697 556 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCTGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAACGCTATTGAGAACACTTTTTTTTTTAATCACAAAG------CCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATATATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGATCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCTTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATCGAGCGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC---TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14851 s mm7.chrY_random 22103224 376 + 30114534 AATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAGGGCTTGGGCATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCTGTATCAACTATGTGGAGATCTACCCTGACTTCCTGGAACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGAAGTGATTGTGCTGGGAGCAGACACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGATGAAACGTTTTTGAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATAGGATGGTACCCTGCAATGCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATACCCATTATGGTGTTGAATGATGAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCCA-TATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4587 s mm7.chrY_random 22107628 84 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATATGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAG s bosTau2.chr3 46354234 84 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAG a score=1650 s mm7.chrY_random 22109950 166 + 30114534 AAAGACAGTGGGAAG--CAACTTATTATTC-TGTTGTATCT---------------TTTTTTTATGATATGAAACATAACTCT------GCCAAATTTTCTAGATTTTAAACATTCTTTA--CTTTCTGTCCCTGCAATATGCTA---ATTTTACTTAGCTTGGCAATTCTGTCTG----AGTTTTCTGACTAAGAACG s bosTau2.scaffold997 63106 191 + 300671 AAAAACAGTAAGTAATACAACTAACTACTCCTGTTTCCTCTCACAGTCAACTCTAATTTCTTTCTG---TGAGACATGATGTTTACATCACCAAATTTTCCACTGGTAAAAAATTCTTCATGCTTCTTAATTTTGAAATTTTTCATAAACTTTA---AGGTTA--AACTCTGGTTGGTAAATTTTTTAGACTAAGAACA a score=12114 s mm7.chrY_random 22110116 278 + 30114534 TTCTGGTGTCTTAGAAGCCTTGATCGTCTGTTAAACGTTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTCTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCACCAGGAACACTGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATTTGAAC s bosTau2.scaffold5600 51228 277 - 52585 TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3099 s mm7.chrY_random 22125116 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGAATAAATTTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=21374 s mm7.chrY_random 22132228 1284 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATTTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCACCTAATTTTTCTTGAAA----ATAACCCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTGTAAGATGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATATCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAATGAACAAACTAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATATGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------CCTTTAGTAAAAATGTGTGTCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCTTAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTATGCTTTAAGTCACTGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTACCAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATA-----TGTTTTGCACTAAGTCTTT------------------ACTAAGGCAA-------TATATGAAAA------ATAA---------------------ATTAGAAATTATATTTGGTAGAAAATAATGAAA---AAAACACATTGAAATATAATTAAATTTTGTACATATATAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgcgtgtgtgttctgtgtgtTTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAAACGTAAA---------TGAAGACCTCTCTAATAATATGTTAGGGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGATGTTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTTTGAGTGTTCTTTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTCATTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataa--------aaaacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggagcaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895153 1369 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAATAA---TGATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTAACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATA----------------------------------TATATAATAAAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGT--TGTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=5420 s mm7.chrY_random 22135069 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATTTTATTTCATGTTATTG-TAAAAATATACATATATTTTGTCAAAATAGTTGTTAA------ATTTTTAAATCA---GTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTAATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGGTTTATTGTTAGACTACCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTTTAGAATAATTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTAAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTAGAAGCAGTTAAAGATATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGATTATT--ATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=6875 s mm7.chrY_random 22135760 544 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGGTTTGATTAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTAAGAAAAAAAAATGTCTATGTTTAAAAGAGCCATCATAGAGAATTCTCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAATAATTTTCACTTGCTGGtatatatatatatatatatatatatatatatatataaataaataAAAATCTCTAACTTTTTTGTCTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAATTTCTTTAATCGTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAAGCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTCAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAAGA-AAATCTAAATG---------AATATGTGAATGGTATATAGTCCTTTGGACTGAAGTTCCACA----------CACTAATATAGT-----TGAATTATT-TAAAATTTATTCTTATACtttt s bosTau2.chr5 39897983 569 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA-AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAAT-------TAAACCAGTG------TTTAATATCT---TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAATATGAACTTGTGTGAGGAGCAGCAATCCCTAAATTATATGTACCACTTTG--CTTCAGCTCTTTAATAGTGCTAGTGATAATATAGCAATAGTGAATTTTTCTAACATTTGTCATTTAACTTTT a score=3511 s mm7.chrY_random 22137640 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATTGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAATTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=5599 s mm7.chrY_random 22138043 228 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATGAATATTAGTTTGAGACATGGGTTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGTCCTTCATATAAATTACACCTAACCT-----------------------------TACCTAATCATTAA------GAATACTTTAAATGTGTATTCAAACATAAATGATCAAGAATGCCTTAT------ATTTTGATGTTCAGCAAATATGTAGAAATTTGTTTTTTAGATTCATT s bosTau2.chr5 39898824 269 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAATGACATATGCCCTTAGTAAGGATTAAGAGCATTTCATTAACATACCTAATTACTTATGGTTTAAGTACTTCACATCGGTCTTTAACTATAAATTACATAGAATGTTTTGTTTTCCAGTTTCAATATTCAGTAAATATATGGAAG-----TTTTTACATTTATT a score=4555 s mm7.chrY_random 22153423 291 + 30114534 CAAAGAAAAGGAATAGATTTTAAAAGCTTTATTAAAGAATATTAATTACTGTGATAAATGCT-ACAAACC----TATTCAGTTACTTTCATTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTATTTGAACAACATTAT-------AATGCTGTTATTAATAATGATATGTTTAAAAAACATACCCAAGTATTTAGAAAAATTA-ACAGAAATCTTTTCCAAACATAAGTCAAGTAATCATCTTCATAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGAAATTTCTTTTCAATATCACCATGCTTAAATC s bosTau2.scaffold2750 81929 294 + 102126 CAATTAAGGAGAAAAAATTGTACA--------TCAAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAAAATTTCTGGATTAGGTCTTCTCATTTAAAATGGGAGG----------ATCTCCAGGTATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGAGCC a score=19396 s mm7.chrY_random 22153725 964 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAAAGAAACATAGTAACTGTAACTTAA----ATCCAGAAAGCTATTTTGTGCTGACATTAAGATTGCACAGCTAATTCTCAAAATGTGTATATT-ATCTGAATCGATACATATAATTTCCTGCCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGCCTAGTAGGAT--TGTTCT----------GGTACTTAAATTCAATGTTT-------------TCAGAGATGGCAAAAGACCAACTGAAAATTCAGATAA-------------GCATA----------------GTTAATACAGAATTAGCCAGGAATAC------AAGTTACCCCCTA------TTGTAGGAAAAGAGTGGATATTCTGACAGTAAATAGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAGGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGTCACAAAGAAATAATTAGAT-GTTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TGTGAATGA-TGCAAGCCTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACAGAAATCCTTCACAAAAATCAAAGAGAG----GAGTCAAATAAACACCTTCCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCATAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACGAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGTAGGATCTTCAATTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTCAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCTTTGGACTGAAAGTGAATGGCCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGTGC-TCCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCCAACTCGCTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAAGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCTGACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=10237 s mm7.chrY_random 22176183 414 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTCATAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTCAGAGGTTAGGTTTATTTGCACAAAAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAACACAAAGGCATCCTAACCCTGTCAGATTTCTGCT--TGAATAATTACATTGGAATTATTTATTTGTAAGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTGATAATGGGACAAAACAGAAGCCTATAGGATTAACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATAAAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAACCTAAAATTGTGAA---AAATCTTTGTTTTCATATTTTCAA-TATTTACAG-ATCA--TTCTGTGCTATAAAATGA s bosTau2.chr17 25742254 426 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGCTACAAAACAA a score=38198 s mm7.chrY_random 22183465 1188 + 30114534 TCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTGCTGCTATTCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTAT---------TCCGCATGCA-GACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCCTTTGATATTCCTTCCATTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTAAATTTTTAGAGCAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGGTTGTCAAAGACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAAAAAA---ACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATACGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCAGAGTATAGATATAGATATGGATGTTACCATGAAACTTGATAAAGTACACAGAAGGATTGGCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTATTTGGAACCACCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTGCCTTCCTTGTAGTCATCTAGGACCTGATAGACGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCAACCCCCTCCAGTTTTCCTCATAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCACTCTGCCAACCAGAGCTCTGGTGAGATGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCTTGTCATCAATGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTAGGCAGTTGACCTAGAACTATGTC-TTCCATTGGGTGACAGGATCATTACCTTCCTTCCAACCGTGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCATGGAGTTGGAATAAGACATCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGCCTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTATCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20326788 1204 - 48857030 TCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCT-------CTCTTCCT-TTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATA--TTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=7107 s mm7.chrY_random 22187646 231 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACT--TTATTAATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGtt s bosTau2.chr17 25742211 242 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTT a score=15411 s mm7.chrY_random 22192924 389 + 30114534 TCTCCTCATCATTCTACAGC----ATATTGAGGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGAGCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAATATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCCAGTTGGCTCTTTGTGTACCTTGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCACTACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGCAGGCTCAGACAGAAGACTTGCATGCCCACACCCCACACATGTGAGTTTAGCAGGTTGTAGATTAGCAGTTTCACAC---TGTCACATTGGAGTTCTTG s bosTau2.scaffold2757 87535 386 - 101657 TTTCCTCACCACTCAGCAACCAACATGTTGGGGATCCCATGGCTGATGGGGAATAGACATCCTGACTCTGGGCATTGCAGGATGCCCTCCAACATATCCACCTCCAGCAGTATATGG-TGCCTCTTTCTCAGAAATTTCTTGTCATGCTTATATCCCTGAATCGTCTCTTTGGGCACCTTGATCAGATGCAGGCTGTTGGCAGCCTCCAGAAGCACTTCCCACTCCACTTTGAGTATCATACATGCTATGAAGTTGGGGTTGAACTCCACAGGGTTGGTATGGACCTCAGTGGCC-----ATGCAGAGGGAAGCCACAGGGCCTCACTCCCCACACATGCAAGCTCAGCAGATTGTGGGTGAGCAGCTTCATGTTTATGTTACAT----GCTCTTG a score=10639 s mm7.chrY_random 22201800 373 + 30114534 TGTCCATGTCACTTCGTGGTATA-TTTTATATCATTA-CTTTCCTTTTCTCAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTATCACATAAGCCAAAGGCATCCTAAACCTGTCAGATTTCTACT--TGAATAATCACAGTAGCATTACT---TATATGTGTGGAAACAAAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCatttaataaaata-------ttataaatatgattttaaCACGAGCCTAAAATCGCAAAAAAAAGCTTTGTTTT s bosTau2.chr17 25742256 378 + 45915461 TGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTATATAT----AAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTT a score=9280 s mm7.chrY_random 22220447 170 + 30114534 ttaaaaaaaaacataaaGAGTATATGCATGCACACATGCTGATGTTTCTGAAGGGCATTTTGATGAAAGATTGGAATGACTTTTTTGTCTTCTTGATCAAATAGTGTGTCTTTGGGGGC--------ATTTATTCTTGTGTCA-CAAAAAGAACAAAGTCTGTTGATATTGTTACTGAT s bosTau2.scaffold15138 2377 173 - 9017 TCAAAAGATAACA------GCATATGTACACACACACGCTGATGTTTCTGAAGGGCACTGTGGTGAAAGATTAGAGTGATTTTGCTTTCTTCCTGATCAAACAATGTGTCTTGGAGAGCACGGGTGAATTTAGTTTTGTGTCACCAGAAAGAATAAAACCTGTTGACATTGTTACTTAT a score=35869 s mm7.chrY_random 22234746 1268 + 30114534 CAAGACCACATTC-CTTTTATCTGTCACTCTTTCCCAACTTTATGTTTCTCCCT-----GTGACTTCACACCAGAGATTCCACCTATGTTTTGTTCTTCTCCCCTACC---TCCTAAACTTCCATCTTTTGCTGTCATCCCTGCTTCTCCAAGTCCCATCTACAATTGCTTC-------CTCTCCATGAACACCAGAAAATCTAAGTCCTGTTC-ACTTTATCATG------TTTGATATTAGATGTATGTACTATTCACAGCCTAAATTGAAACTTGT--CTTCCTTTGATGTTTCTTCCACAATA---GCCTGTCTCTTCCACCA-----AAGTGTTCACTCTCAATATGTCATGTCA---------TATGTTTCAATTTTAGAGAAAAACAA--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGT-GTCAAAGACGCTTAAGTTGCCAACACA-GGAAAACAAACATTTTTT-------TCCAAACCTATAAGTTTACATCCCTGCACTTTTGTGAT--TTTTCACCTTAAGGAAT----CTCTGGCACCAGATTATAGACATAGATATGGAGGTCACCATCAAACTTGATAAAGTCCACAGAAGAATTAGCTAGAATCTGGTAAACAACCTCTCAAATCTTTTTGGAATTATCGTGTCTGGTGTACTGCACCTAGTTACCTATGAAGTTGTCACTGTTATCATGTGATCTCACCTCAGCCCGGGGAGTCT---------CTGGAATGACGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTTATAGACTTAGAAGACCAGAACTTTCTTGTAGGTAATATAAAACCCGTCCTTCATGATTGTCACCTGGTCTACAACCACCCGCTTCAAGTTTTCCTTAGAGCCATGTTTTCCCTCAAATTTGTATTGTACCACTCTGCCAATCAGGGTACTGGCGAGGTGGATGTCCTTCACCTGAGGAAACACTAGATTGTGAGGCAAGTATTTAATATTTAAAATCTTCTCAACACTGTGGAGCTCCTTTTCATAGATGTTGTCAATTCTGTCATGCTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACAGTGGTCTTCCAATGGGTGACTGGCTCATTACCTTCCTTCCAACTGTGAGAATTTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAGGGCTTGGAAAGAAGGCTTCCTCCTCCTTTTGTTTTTGAGGGATGTTATGCTCAGCCTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCAGTAGAACTGGTGTGATAGGCCACAG-TAACCTGGTCCACTATCTTGTGGCTTTCATTCTGTGTTCAAGTA---CCATACCTGC s bosTau2.chrX 20326699 1293 - 48857030 CAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACA--AGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTT---TTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGGTTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC-ATATATTTGC----CTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTT-CTTTTGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG---AGGTGTCTTCATACCTGC a score=13124 s mm7.chrY_random 22255117 363 + 30114534 TCCTCAACATTCTACAGC----ATCTTGGGGATGCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTAGATTCTGAGCATTGCAGAGTACCCTCCAGTACATAAACCTCAAGCCAAATGTGGGTACAACTTCCTCAAAAATATCTTGTCCGGTTCATAGCAGCCAGTTGGCTCTTTGTGTACTTTGGACAAGATTGAGGTATCTGCTGCCTGCACAAGCTCTTCACAGTACAC------TATCATCTGTGCTTGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGAGTTGGTGAGGATTTAAGTTGCC-TGCAG-GCTCAGACAGAAGACTTGCTTGCACACACCCCACACATGTGAGTTTAGCAGATTGTAGGTTAGCAATTTCATACT s bosTau2.scaffold2757 87537 367 - 101657 TCCTCACCACTCAGCAACCAACATGTTGGGGATCCCATGGCTGATGGGGAATAGACATCCTGACTCTGGGCATTGCAGGATGCCCTCCAACATATCCACCTCCAGCAGTATAT-GGTGCCTCTTTCTCAGAAATTTCTTGTCATGCTTATATCCCTGAATCGTCTCTTTGGGCACCTTGATCAGATGCAGGCTGTTGGCAGCCTCCAGAAGCACTTCCCACTCCACTTTGAGTATCATACATGCTATGAAGTTGGGGTTGAACTCCACAGGGTTGGTATGGACCTCAGTGGCCATGCAGAGGGAAGCCACAGGGCCT-------CACTCCCCACACATGCAAGCTCAGCAGATTGTGGGTGAGCAGCTTCATGTT a score=35939 s mm7.chrY_random 22288854 1134 + 30114534 TCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTTTCCCTCAGACTTCATACC-------AGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAAGCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAAATTTCATCTTCCTTTGATGTTCTTTCCACCATAGTC------CATCTCTACCA--ACAAAGTCTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACAA--ATATTATTGGCAAAGATACTGGGGTTGTCAAAGACCCATAAGTAGCCA--ACATAGGAAAACAA-ACATTTT----TTTTCAATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACGTAGATATGTAGGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGAAATTTTTACACAACTTTTCCGAAATTTTTGGAACCATCATCTCTGGTGTCTGC-ACCCAGGTACCTATTAAGATGTCACTGTCATCATCTGACCTCTCCTCAGCCAGAGGGG-------TG--TCTGGAATGATGTGGATGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGAAGCGGGTAGACATAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAACCAGTCCTTTAAGAATGACACCTGGGCTAGCACCATCCCACTCCAGTTTTTCTCAGAGCCATGTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCTAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGCAAGACCTAAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCTTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGATTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCATCCAACAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTTCCTCCTACTCTTCTTCTTGAGTGAT s bosTau2.chrX 20326712 1181 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATAC---GTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCT-CTGTTTCTTTTGAGAAAT a score=5214 s mm7.chrY_random 22292058 228 + 30114534 TTTGACAGGGTTAAATG------ACATGTATTGAAACCAATGGCAATCGTGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAACTTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATACTTTAAATGTTTTTAATATTTCCCAGCACTTCTGATTACAAGGAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAG-GATGAAATAGAT s bosTau2.scaffold1094 48464 229 - 285174 TTTTACAGAATCAAATACCTGTCACATGT---GAAGGAAACAGTAATTATGAATTATGGATCATTTGCAAGAAGTGATACCAAATTAGTTTCTGGGCCTGTTTCCAACGTTGGAGTGAATTTATGACAAACTGGATATTGATGAATGGT--TTCTAAAGTCTGTTGAATTTGTCAGCCTTGCCTATGAATGAGGATTTGTTAGGTCAAATA-AATGAAACGGTAATGAAATAGAT a score=3776 s mm7.chrY_random 22385921 266 + 30114534 TATAGGTTTAGAAATAAGTTAGATACG--TGCACACGTGTGTGCATGGGCATGTGTGTGCGGACACACACACACAAATACACA---------CAAGCTTATA----CACATAATCCTGGATATATGGTA----TATAAATCATGATTTTTTTTTCTGTCCAGG------------AAATGAGCAACAAAACTGaatttttttaacatattctaatttattaatattttattCTTCTTTCTCTTAGAAAATCTACGGTGCAGATACCTATATCCCAGCTAATAGTTTTCTTGTAAATA s bosTau2.chr20 30947650 292 + 42952723 tatggggccacaaataa-tcagacatgactgaGCACGTGTGTGCATGTGTGGATGTGCGTGTACACACACACGCAGATACACATTTAAAATGCTGCTTCATACTGTCATATAATACTCAATGAAGTGTAGTACTACATTTTATATATTTACTCTTCTTCCAGGGATATATTATGTAGATGGAAGATATGAATTAAATTTGAAATTATTTTTTAACCTCCAAATATTT--ATCTAATTCTACTGAGTACATCTAGTTTATAAATATGGATGT-ACAACTAGTA-TCCTCTTAAGAATA a score=10185 s mm7.chrY_random 22422133 459 + 30114534 aattattcaaaTGAATAAAGGA-----------ATGAAAAAGAAAATGAAATCA-------ACTAATA-------AGTGTCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTACCTTT-CATTTCTCACAGGTTAGGGTTATTTGCATAACACATTTCTGATCAGCCATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCACCCCCCACCCCCCCACACACATTTCTACTTGATTA--ACCATATTGGCATTACATATTTTTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTAGTTCAAATCGTGGAAAATGTTGATGTACAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAAAACAGAAGTCAACAGGATTGAATACATTGTTCCTTGGAGCTGAAGATTTCCCATCGATTTAGTAAAATA-------TTATAAATATGATTTTAAAAGAAGGC--AACACCCTGAAAAAGTCTT--ATTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742179 476 + 45915461 AGTCATCCAATTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC----------------------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=35959 s mm7.chrY_random 22428050 1169 + 30114534 TCTATCACTCTTT------CCCCAACTTGTTGTTTCTCCCTCAAACTTCATACCAGAGATTCTATCTATG-TCCTGTCTTTCTCTGCTTCTTCCTAAAAATCCATTTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATA-----TCTCCAATTCCTTGCTCACTATGC-----AGACCACAGAAGCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTCCTTTGATGATCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCA-----ACAAAGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATCTTTAGAACTAAACAA--ATTTTATTGACAAAGATACTGGGGTTGTCAAAGACCCATAGGTACCCAACACA-GGAAAACAAACATTTTTT-------TTTAAATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTCAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGTAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGATCTTTGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGAATCCATAATCTCTGGTGTACTGCACCCATGTACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGA---TCTCGCCT------AAGCCAGAGGGGTCTCTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAATGTAGAGGACCGGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGCTAGCACCATCCCACTTCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGGGCGCTGGCGAGGTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACTTTGTGAGGTAAGACCTTAATATTTAACATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCATCGTACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAATAATATTCCCCAGGGCCTGGGAAGAAGGCTT--CCTCCTACTCTTCTTGAGTGA----TGTCATGCTCAGACTCTTCAG---AGGTATTGTCTTCTAC s bosTau2.chrX 20326712 1223 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCC------TCCCCCTAGAAGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCTTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATA--TTTGCCTACATATAC---GTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTTTGAGAAATCTTTTTCTTCCTCATACT-TGCAGACAAGGTGTGGTCATCAAC a score=3150 s mm7.chrY_random 22430528 313 + 30114534 AGAAAATTTTTTGCTTTCTGTAGCTATGAGGGTCCCAATTACTTCATAAATGTACTTACCCATAGAAAAATATCCTAG-TAGTCAAGATTCTATCTCCTGATACAGACCA--GGTACCAAAAGCCTGTGGGAAAAAATGACT--------------TGGCTTTGACACACCACTGTGAAG-------ATAGTGAACTCACCTTCAATG----------GATTCTAGCGCCTCCAAGTGGAAT-AGATGTGCAACCTCCAGCCAGTGCTCTGAGACATCACCCTAGTTAAGCTTACATCATAGAACCACTCTCAGGCTGGTTCCTTCCCTAGTTACACTCAGAAACGTT s bosTau2.chr17 25749564 322 + 45915461 AGAAAATCATT--CTGCTTGGGACTATAGAACCTTCAATCACTTAATAAATGGATCGCCCCACA-CAGAATGTCCTAGCTAGCCCAGATACTTTCTTCTGAAGGGGAACATTGGT----------TTTGGTAATAAAT--CTTGTTATATTCTCTATGGCTTAAATGAACAGAAATGGAATCTACATATTTTAAAGTTACATTCATTGATGTGCAAGAAAGTGCAGCGTCCCCTAGTGGACTCCTGTGTACCACCTCCA-TCAGCGCTT----ACCCTGCGCCAG---GGCTTG---AATGGAAATCCTTACACCATGGTTTCTTCCAAGGTCACACCCAGAAATGTT a score=9191 s mm7.chrY_random 22431043 491 + 30114534 TTCTGACTTGACAACATCCATGGTGGTTATTTTTCATGTTCCAACCTTTCCCTTGGTTATCTTTAAGCTGTGCTTCTTATCATAAATATTGCCAGACTCTTTGAGGCAGCACACTGGATAGCACACCAATTTTCACTTTATGAAAACCCACAGTTAGAGGAGGACTATTT-TTATGCAAACAAAGCTGGAATTTGACAAGGTTAAATGACAAGTATTGAAACCAATGGCAATCGTGAATTATGGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAACTTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATACTTTAAATGTTTT-TAATATTTCCCAGCACTTCTGATTACAAGGAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATGT--GTAGACAGAATACTGGACACAGGTACGTATAAAATTTACTTACAAAT s bosTau2.chr17 25750425 450 + 45915461 TTCTGTGCTTCCAACACACATTTCTGTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGT-GTATTGAAG---TGTTGCCCATATAGAATGTTGGCTG----------GCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAAT-AGTTTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCAT a score=10767 s mm7.chrY_random 22521618 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=38551 s mm7.chrY_random 22527587 1287 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCAAAAATTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCATTTCCTTATTCTTCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTTTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGACGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAATAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATATAGCTAACACAGGAAAAAAAAAC----TTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACATTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTGTCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTAGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCACCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGTTAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGGTTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTTTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCAAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCCGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGAGGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCATACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAG------------AAATCT-----------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=7952 s mm7.chrY_random 22531025 363 + 30114534 TTAGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGTGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGGTCCTGCCTTCAAAGTTGTGATAAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTTTAAATT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATATATTCGATAATTTTACTTTTGAATTA--TGGGTAGACAAAATATTGTACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTA-GCGGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCA------CTT------------GAAAAATTAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11126 s mm7.chrY_random 22531992 422 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGTAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATACCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACTTTGGCATTACTTACTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTACTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTTCTTCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATAATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGC-TATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14024 s mm7.chrY_random 22613896 558 + 30114534 TACTGATAAGCTTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAATA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC---------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13918 s mm7.chrY_random 22619448 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTTGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCTCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 22624003 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=12328 s mm7.chrY_random 22625706 1057 + 30114534 ACAAATTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAATTTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAACTTTCTTAGGTTTGTGCTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGACGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGC----CATAATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAATGTGTGGATAACACAGATAA------------------TGAAAGACAGTGGGAAACAATGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTCAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGG-----------------CCATTCTGTCT--GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTCATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCAACAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCT---------------TAATG----CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3072 s mm7.chrY_random 22648416 78 + 30114534 TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893512 77 + 76426644 TTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=13281 s mm7.chrY_random 22655487 754 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGCAGTTTAAAAAAATTA-TATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAAAAAACCACATTGAAATATAATTAAATTTTGtacatgtatatatatatata s bosTau2.chr5 39895153 839 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA a score=10009 s mm7.chrY_random 22656407 418 + 30114534 TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaa------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39896104 418 + 76426644 TGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6234 s mm7.chrY_random 22658403 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCatattattg-taaatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTGCCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=7711 s mm7.chrY_random 22659118 422 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGAGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAA----------AACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTAAAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT---TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 22660969 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 22661370 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=6271 s mm7.chrY_random 22662357 707 + 30114534 TATCTACTGTATTTGTCTGACTCATTTGGGATAAGGATTTACTTGGACCCAGCTTCATTTGTCACATCCACTTTTC-----------------------AAGTATAAAAAAAAATCACATACTCCATCTACCAACA----TGGGAGACATTATTTTTTGATATGCAGTTTTCCCCAACAGTGGAATGACAAGAC-GACCAGAG--CCATCCCTTAGGACAGGGAC---AAATGATCCAAAAGTTACTATTCTCTAACCTAGGACAACCAGTGTCAATAATTTTATAT---------GTCTCTG-------CAAACCTAGATTATG-----------------GCTGATCAACTTCATTGAG-------------------TCAGTGGT---AGCACTCAGAGTGG----------------------GCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCACTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957119 839 + 62721844 TATTTCATGCATTCGCATGACTAGATCAGGTCAGGGGGTCGCTTGGACCTTGCTTTAC----CATACTCACTTCTCTTGCCAAGGAGATGTCGAAACTTGTGTACTTAACAAAACAACCTATTCTATTTGTCAACACTAATGCCAGACATC-CGTTTTGACCC-CAGTTCCCCTCC-CAGTG-------AAGACTGGTTAGAGGTTCACCACTTAGAAGGAGGGCTCTGGATGAACCAGA---CACAAATTACGAATTTAGAAAGCCCATGGTTAGAGGTTCGCCACTCAGACGGAGGCTCTGGGTCAGCCCGACATAGATTACGAATTTAGAAAGCCCAGTGATGGTGCACTTTGATGAGAGTGCTGCTCACAAAAACCCCAGTAACCCCAGTACTCTGAATGGTGGAGGCTTGTCATGGGAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 22663911 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATaaaaaa s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=3732 s mm7.chrY_random 22664238 388 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACTTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGTCCAAACATTCTTTAGCAGTCACTTGGGAAATTCAA---------TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAAAAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataata-----ttataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4591 s mm7.chrY_random 22664822 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=27457 s mm7.chrY_random 22751648 731 + 30114534 GAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTACTGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACAACCTTCCTCCAGTTGTCCTCAGAGCCAACTTCACCCTTAAATTTGTGTTTTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCTTTTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGTTATCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20327276 716 - 48857030 GAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=12149 s mm7.chrY_random 22755271 502 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAACCGTGGGAATTGTCAATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG---GTCGTTCTGTGCCATATAAAGAAAGGTAGAGAAGAAAAGCTGT-TTTGGAGTCACTGACATACATTTAACTGAG-GTCT---CTTTGCATAGTA s bosTau2.chr17 25742211 539 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGC--TACAAAACAACCTAGTCAACAAAGAATGCAATTGGAGTTTCTTCTGCCCTTTTAGCTGAATGTCTGAACTTGGCAAAATA a score=14447 s mm7.chrY_random 22765000 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGCAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCGCACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9378 s mm7.chrY_random 22769463 314 + 30114534 TACAAGTTTTGAAAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGTCTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTACTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGCTTTGTGCATTCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=7244 s mm7.chrY_random 22770131 286 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATACATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAGAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAGAGCTTTGT-------GATAATATA-TATATCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAAGCAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230044 304 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACA-TGG-----TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10767 s mm7.chrY_random 22781864 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=38551 s mm7.chrY_random 22787833 1287 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCAAAAATTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCATTTCCTTATTCTTCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTTTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGACGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAATAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATATAGCTAACACAGGAAAAAAAAAC----TTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACATTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTGTCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTAGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCACCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGTTAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGGTTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTTTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCAAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCCGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGAGGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCATACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAG------------AAATCT-----------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=7952 s mm7.chrY_random 22791271 363 + 30114534 TTAGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGTGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGGTCCTGCCTTCAAAGTTGTGATAAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTTTAAATT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATATATTCGATAATTTTACTTTTGAATTA--TGGGTAGACAAAATATTGTACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTA-GCGGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCA------CTT------------GAAAAATTAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11126 s mm7.chrY_random 22792238 422 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGTAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATACCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACTTTGGCATTACTTACTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTACTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTTCTTCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATAATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGC-TATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14024 s mm7.chrY_random 22874154 558 + 30114534 TACTGATAAGCTTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAATA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC---------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13918 s mm7.chrY_random 22879706 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTTGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCTCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 22884261 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=12328 s mm7.chrY_random 22885964 1057 + 30114534 ACAAATTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAATTTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAACTTTCTTAGGTTTGTGCTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGACGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGC----CATAATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAATGTGTGGATAACACAGATAA------------------TGAAAGACAGTGGGAAACAATGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTCAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGG-----------------CCATTCTGTCT--GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTCATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCAACAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCT---------------TAATG----CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=4761 s mm7.chrY_random 22888701 343 + 30114534 ACAGTCCAGGTTACACAATGTATACACAAAGGAAAGGAGTTATAGTTAACCAGTTAAACTAGTCAGGTGGTTAGCTTGTAGATGGCCAGCATTACAACACTGTAGAGTGTCTTCTTCCATGGGTT--AGCATAGCCCATTCTACCTCAGATAAATAAATTTGTATATCGTCAAATATTAACATTC-CTGAAGAAGAGAAAGGACTTGAATTTAATACT----GAGTCAGAAGCAGTTGTTGTACCTGTCTG-----TGAAT--CATGGCAGGCTGCATACTGAGGAAATTATCAGTA-ACGAATTTAGGTGGAGAAACTGGGATAACCAGAGGTAGGCAAGT---GGACCAGATAATTGGT s bosTau2.chr25 41072650 348 - 41414979 ACAGGACAGATTAGTCCACTGCTGTGCAAAGGGAAGGGGAAAAAG--AAAC--TTTACCTAGAGAGATGACAGTCTCATAGTTTTCTTGCATTACATCATTGTAGAGGGCCTTCTG-AGTGGGATCCAGTAACTCCCATTCTTCCTGGGAAAAATACATGGCCACTTCTTCAAATGTCAATAAGCTCTAAAGAAGAGAATGGGCTTCAGCCAAGTACTTGCCACTTCAAAAGTGGCC----CAACCTTCTGAGCCATGAACTGCATGGTAAGCCAGTCACTAAAGGAACTAACAGCACATAAATTAATTTTAAG----TGAGATAGTAGAAAGGAAGTAAGCACGGGATCAGCAAACAGGT a score=3072 s mm7.chrY_random 22908678 78 + 30114534 TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893512 77 + 76426644 TTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=13281 s mm7.chrY_random 22915750 754 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGCAGTTTAAAAAAATTA-TATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAAAAAACCACATTGAAATATAATTAAATTTTGtacatgtatatatatatata s bosTau2.chr5 39895153 839 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA a score=10009 s mm7.chrY_random 22916670 418 + 30114534 TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaa------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39896104 418 + 76426644 TGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6234 s mm7.chrY_random 22918666 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCatattattg-taaatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTGCCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=7711 s mm7.chrY_random 22919381 422 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGAGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAA----------AACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTAAAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT---TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 22921232 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 22921633 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=6271 s mm7.chrY_random 22922620 707 + 30114534 TATCTACTGTATTTGTCTGACTCATTTGGGATAAGGATTTACTTGGACCCAGCTTCATTTGTCACATCCACTTTTC-----------------------AAGTATAAAAAAAAATCACATACTCCATCTACCAACA----TGGGAGACATTATTTTTTGATATGCAGTTTTCCCCAACAGTGGAATGACAAGAC-GACCAGAG--CCATCCCTTAGGACAGGGAC---AAATGATCCAAAAGTTACTATTCTCTAACCTAGGACAACCAGTGTCAATAATTTTATAT---------GTCTCTG-------CAAACCTAGATTATG-----------------GCTGATCAACTTCATTGAG-------------------TCAGTGGT---AGCACTCAGAGTGG----------------------GCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCACTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957119 839 + 62721844 TATTTCATGCATTCGCATGACTAGATCAGGTCAGGGGGTCGCTTGGACCTTGCTTTAC----CATACTCACTTCTCTTGCCAAGGAGATGTCGAAACTTGTGTACTTAACAAAACAACCTATTCTATTTGTCAACACTAATGCCAGACATC-CGTTTTGACCC-CAGTTCCCCTCC-CAGTG-------AAGACTGGTTAGAGGTTCACCACTTAGAAGGAGGGCTCTGGATGAACCAGA---CACAAATTACGAATTTAGAAAGCCCATGGTTAGAGGTTCGCCACTCAGACGGAGGCTCTGGGTCAGCCCGACATAGATTACGAATTTAGAAAGCCCAGTGATGGTGCACTTTGATGAGAGTGCTGCTCACAAAAACCCCAGTAACCCCAGTACTCTGAATGGTGGAGGCTTGTCATGGGAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 22924174 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATaaaaaa s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=3732 s mm7.chrY_random 22924501 388 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACTTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGTCCAAACATTCTTTAGCAGTCACTTGGGAAATTCAA---------TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAAAAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataata-----ttataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4591 s mm7.chrY_random 22925085 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=2192 s mm7.chrY_random 22951712 96 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTGTCAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCGTTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA s bosTau2.scaffold2750 81955 104 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAA a score=2622 s mm7.chrY_random 22951834 112 + 30114534 TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGTAATTTCTTTTCAATATTATCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 82105 115 + 102126 TATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=19272 s mm7.chrY_random 22951960 963 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATCGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATTAAGAAAGCTATTTTGTTCGGACAT----TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATTGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATACAAGTTACCCCCTA--TTGTAGGAAATGAGTGGATATTCTGACAGTAAATGGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAAGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGACTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACAAACTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCTAACTCACTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=9984 s mm7.chrY_random 23013501 492 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAACTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTCTGAAATTCCTTGTAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35432 s mm7.chrY_random 23015821 1238 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCCCAAAGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTACATATCTATGTCTATATTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAAATCACA---AAGTACAGAAATGTA-AACTTATAGGATTGAAAAAAATGTTTATTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGGCATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATTACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGAT-------TCTGAGGTCTGCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAATAGATGGATTTTTAGGAA--GAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGGG-----AAAGAGTGATAGATAAAAGGAATGTGACCTTGTTACACAAAGTGCAACCCAGAAAACTGATCCAAAGAGACTCAGAAAT s bosTau2.chrX 28529095 1282 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGT-AAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGG--AGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA------GAGTGAAATCTTGGGGTTGAGAG-GAAACCAGGATAAATTGAGTAAAGAGGGACACAAAT a score=9823 s mm7.chrY_random 23022414 458 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCTGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATGAAAATAAGTAATGCTAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTGTTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-------TCCTTTATTCTTTTGAATAAATG s bosTau2.chr17 20172806 473 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATG a score=4604 s mm7.chrY_random 23069003 235 + 30114534 AGTATTAAATTCAAGTCCTTTCTCTTCTTCAG-GAATGTTAATATTTGACTATATACAAATGCATTTATCTGAGAAAGAATGGCCTATGCTA-ACCCATCGAAGAAGACACTCTACAGTGTTGTAATTCTCGTCATCTACAAGCTAACCACCTGTCTAGGTTAACTGATTAACTATAACTCATTTCCTTTGTGTATACATTGTGTAACCTGGACTGTAATGGTG------AAAAATACACCCT s bosTau2.chr25 342116 239 + 41414979 AGTACTTGGCTGAAGCCCATTCTCTTCTTTAGAGCTTATTGACATTTGAAGAAGTGGCCATGTATTTTTCCCAGGAAGAATGGGAGTTACTGGATCCCACTCAGAAGGCCCTCTACAATGATGTAATGCAAGAAAACTATGAGACTGTCATCTCTCTAGGTAAA--GTTT--CTTTTTCCCCTTCCCTTTGCACAGCAGTGGACTAATCTGTCCTGTTTTGGGGGGTACTGAGAATGCACCCT a score=11370 s mm7.chrY_random 23070960 277 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATTTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4837 s mm7.chrY_random 23073770 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=13835 s mm7.chrY_random 23078036 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCATCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGAAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13218 s mm7.chrY_random 23083402 555 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTTCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCACTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGG------CTTTGTGATTAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA---GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=3108 s mm7.chrY_random 23167305 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=20336 s mm7.chrY_random 23174418 1322 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAATGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTATTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAA-AAAACACATTGAAATATAATTAAATTTTGtacatgtatatatatatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttacgtgtgtgttgtgtgtgtTTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAAACGTAAA---------TGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGGGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCTTTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaa------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895153 1369 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA-ATA-----------------------------------------------------------------------AAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGT--TGTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6215 s mm7.chrY_random 23177329 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCatattattg-taaatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTAACATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTAT-ACTAAGGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTAT----------------------------------------------CCAAATAGTTATTACATAATTTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=7568 s mm7.chrY_random 23178044 425 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGTACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTTCTCGTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGtatatata--------tataaaacaaataaaaaaatCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTATAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA-AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGT-AAGTTGTTA------TTCAGAACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT---TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 23179899 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=6066 s mm7.chrY_random 23181286 707 + 30114534 TATCTACTGTATTTGTCTGACTCATTTGGGATAAGGATTTACTTGGACCCAGCTTCATTTGTCACATCCACTTTTC-----------------------AAGTATAAAAAAAAATCACATACTCCATCTACCAACA----TGGGAGACATTATTTTTTGATATGCAGTTTTCCCCAACAGTGGAATGACAAGAC-GACCAGAG--CCATCCCTTAGGACAGGGAC---AAATGATCCAAAAGTTACTATTCTCTAACCTAGGACAACCAGTGTCAATAATTTTATAT---------GTCTCTG-------CAAACCTAGATTATG-----------------GCTGATCAACTTCATTGAG-------------------TCAGTGGT---AGCACTCAGAGTGG----------------------GCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957119 839 + 62721844 TATTTCATGCATTCGCATGACTAGATCAGGTCAGGGGGTCGCTTGGACCTTGCTTTAC----CATACTCACTTCTCTTGCCAAGGAGATGTCGAAACTTGTGTACTTAACAAAACAACCTATTCTATTTGTCAACACTAATGCCAGACATC-CGTTTTGACCC-CAGTTCCCCTCC-CAGTG-------AAGACTGGTTAGAGGTTCACCACTTAGAAGGAGGGCTCTGGATGAACCAGA---CACAAATTACGAATTTAGAAAGCCCATGGTTAGAGGTTCGCCACTCAGACGGAGGCTCTGGGTCAGCCCGACATAGATTACGAATTTAGAAAGCCCAGTGATGGTGCACTTTGATGAGAGTGCTGCTCACAAAAACCCCAGTAACCCCAGTACTCTGAATGGTGGAGGCTTGTCATGGGAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 23182840 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATAAAAAA s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=4160 s mm7.chrY_random 23183165 388 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACTTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGGCCAAACATTCTTTAGCAGTCACTTGGGAAATTCAA---------TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataata-----ttataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4591 s mm7.chrY_random 23183750 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=2192 s mm7.chrY_random 23210120 96 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTGTCAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCGTTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA s bosTau2.scaffold2750 81955 104 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAA a score=2622 s mm7.chrY_random 23210242 112 + 30114534 TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGTAATTTCTTTTCAATATTATCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 82105 115 + 102126 TATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=19356 s mm7.chrY_random 23210368 962 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATTAAGAAAGCTATTTTGTTCGGACAT----TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATTGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATACAAGTTACCCCCTA--TTGTAGGAAATGAGTGGATATTCTGACAGTAAATGGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAAGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGACTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACAAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTG--CCTGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCCAACTCACTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=11281 s mm7.chrY_random 23232914 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTCAGAGGTTAGGGTTATTTGCACAAAAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAACCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTGCT--TGAATAATCACATTGGCATTATTTATTTGTATGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCAGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTGATAATGGGACAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATAAAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAA--AATTGTGAAAAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=3855 s mm7.chrY_random 23317041 150 + 30114534 TAATTTAGCATTCTTAGTCATTAGGTAAGGTTAGGTTATCTG-AATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCCATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGCTTTTAA s bosTau2.chr5 36527670 150 - 76426644 TAATGAAATGCTCTTAATCCTTAC------TAAGGGCATATGTCATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGTTTGGTTTTTTAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 23317519 71 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAAGAAATATA-----CTTTCTATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=7562 s mm7.chrY_random 23319019 425 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTACACTTAAACAAGAAAATGATTAAAGATATTTAAAAAT---AAAGAAGTTCTATTTTAACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGatttttttatttgttttat--------atatatataCCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTCAAACATAGACATTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAAACTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGA---GAAGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTT-TAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=6234 s mm7.chrY_random 23319739 420 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGCAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACtaaatatatatatatattta-caataatatGAAATAACATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA---ATGTGTTCACCACTTACATACAATAATA--ATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=10009 s mm7.chrY_random 23321747 418 + 30114534 aaatgcctagtcgttttcattgatatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagataatggaacttaatttagtttcatatgctcaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt------ttttttatggtaccaaccactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAATGAACACTCAGAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA s bosTau2.chr5 36530122 418 - 76426644 AAATACC-AACAGCTTTTAT--ATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAAC--AACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCA a score=12907 s mm7.chrY_random 23322359 755 + 30114534 tatatatatatatacatgtaCAAAATTTAATTATATTTCAATGTGGTTTTTTTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAATTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAACTAAAATATACTAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCACACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACAGGATATAATTTTTTTTAAACTGCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGAGTCAT----TTTGAAGAAAAATTAGATGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530652 839 - 76426644 TATATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=3108 s mm7.chrY_random 23330157 94 + 30114534 ATATTTCTAAAATACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=12109 s mm7.chrY_random 23351900 1058 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCTGTGTTCCTGTTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATGAATGATTTTATACAGGAGAGAATCGTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGATGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC--AGACAGAATGG-----------------CCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGTTTCCCACTGTCTTT--------CATTATCTGTGTTATCCACACAT---------TTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTAGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATTATG----GCCCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACCGTCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGACT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCCAGCACAAACCTAAGAAAGTTGTAAGCATTTGAAGTC----------------------CACTTACAGATCTC-ACTG-------------------------TCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGGAA---TTTTTAAATGATTGCATACCACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAATTTGT s bosTau2.scaffold5600 1080 1221 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-----AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCT-ATCTACATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAG----CATTA---------------AGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACTTAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCATCTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=3426 s mm7.chrY_random 23353212 55 + 30114534 CTTAAGATGGCCGTGTAGTCAGAGAAGTGAATCCTGGCTTGTGAGTTCATGAAAG s bosTau2.chr3 46304496 55 - 85360813 CTTAAGATGGCAGCGGAGTCAGGGGAACTAATCGGGGCTTGCGAGTTCATGAAAG a score=4837 s mm7.chrY_random 23354572 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14263 s mm7.chrY_random 23358909 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=14774 s mm7.chrY_random 23364278 559 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GTAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGCTTTGTGATTTTTTAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAAGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=6008 s mm7.chrY_random 23428213 346 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataATCACAAAG-CTCTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATGTATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130465 304 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT-----------------------------------------------------TATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9815 s mm7.chrY_random 23428915 314 + 30114534 ACTGAATGCACAGAGCATTAGTACT-ATAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14327 s mm7.chrY_random 23433332 376 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGTGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTACAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11627 s mm7.chrY_random 23445062 412 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT----------TAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATTGACAATTCCCACGGTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGATAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=26654 s mm7.chrY_random 23448406 731 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAAGAGGAGGATGTCTTCTTCAAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGTTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAAACTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCACCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGAGGGTTGTGCTAGCCCAGGTGTCAATCATGAAGGATTTGTTTTACAGTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=9383 s mm7.chrY_random 23475708 494 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTACTTATAATCAGAAGTGCTGGTAA-ATTTTAAAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTTTTTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATACATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCAAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAACAATCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGGCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAA--TTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGCC-------AGCCAACATTCTATATG------GGCAACACTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=36927 s mm7.chrY_random 23477987 1220 + 30114534 AATGGAAGCCACAAGACAG--------------TGTGAACTACCACAACAGGTCTACAGCCAGGTAGAAGACAATACATCTGAAGAGTCTGAGCATGACATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTTCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCAGGCGCACTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCAATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGAAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATTGAAAA----AAAATGT-TTGTTTTCCTGTGT--TGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTAGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAAATGGATTTTTAGGAAGAATCAGAGAAAGACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529061 1257 + 48857030 AAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=9893 s mm7.chrY_random 23484631 461 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCTGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATGAAAATAAGTAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCTtttgaataactgtgt s bosTau2.chr17 20172806 480 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACTTTAT a score=5742 s mm7.chrY_random 23567942 253 + 30114534 TTTGACAGGGTTAAATG------ACATGTGTTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATAGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAACTTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAATTTACCAGCACTTCTGATTATAAGGAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAG-GATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATG s bosTau2.scaffold1094 48464 248 - 285174 TTTTACAGAATCAAATACCTGTCACATGTGAAGGAAACA---GTAATTATGAATTATGGATCATTTGCAAGAAGTGATACCAAATTAGTTTCTGGGCCTGTTTCCAACGTTGGAGTGAATTTATGACAAACTGGATATTGATGAAT--GGTTTCTAAAGTCTGTTGAATTTGTCAGCCTTGCCTATGAATGAGGATTTGTTAGGTCAAATA-AATGAAACGGTAATGAAATAGATTG------TTTCTTTATGAAAAATG a score=5742 s mm7.chrY_random 23630397 253 + 30114534 TTTGACAGGGTTAAATG------ACATGTGTTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATAGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAACTTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAATTTACCAGCACTTCTGATTATAAGGAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAG-GATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATG s bosTau2.scaffold1094 48464 248 - 285174 TTTTACAGAATCAAATACCTGTCACATGTGAAGGAAACA---GTAATTATGAATTATGGATCATTTGCAAGAAGTGATACCAAATTAGTTTCTGGGCCTGTTTCCAACGTTGGAGTGAATTTATGACAAACTGGATATTGATGAAT--GGTTTCTAAAGTCTGTTGAATTTGTCAGCCTTGCCTATGAATGAGGATTTGTTAGGTCAAATA-AATGAAACGGTAATGAAATAGATTG------TTTCTTTATGAAAAATG a score=5445 s mm7.chrY_random 23695153 253 + 30114534 TTTGACAGGGTTAAATG------ACATGTGTTGATACCAATGGCAATCATGAATTATAGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAACTTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAATTTACCAGCACTTCTGATTATAAGGAATTTCATAGATTAAATCCAGTAAAACAG-GATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATG s bosTau2.scaffold1094 48464 248 - 285174 TTTTACAGAATCAAATACCTGTCACATGTGAAGGAAACA---GTAATTATGAATTATGGATCATTTGCAAGAAGTGATACCAAATTAGTTTCTGGGCCTGTTTCCAACGTTGGAGTGAATTTATGACAAACTGGATATTGATGAAT--GGTTTCTAAAGTCTGTTGAATTTGTCAGCCTTGCCTATGAATGAGGATTTGTTAGGTCAAAT-AAATGAAACGGTAATGAAATAGATTG------TTTCTTTATGAAAAATG a score=27064 s mm7.chrY_random 23806100 731 + 30114534 GAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGA---TCTCTCCTCAGCCAGAGGAGTT-------TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGTTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTACTGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACAACCCTCCTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGTTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAAGTTTAAAGTCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCTTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTATCATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20327276 716 - 48857030 GAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGG-AGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=11544 s mm7.chrY_random 23809723 412 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTCTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCTCTTCATCCTGATTTAGTTAAAACCGTGGGAATTGTCAATGTGCAATTATTT--TGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14541 s mm7.chrY_random 23819459 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGAAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCGCACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9815 s mm7.chrY_random 23823923 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTACTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGCTCTGTGCATTCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=2570 s mm7.chrY_random 23824591 118 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATACATAACATACAGGGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAG s bosTau2.chr3 40230044 99 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTTTT-AAGAAGTGGGGTGGG a score=5676 s mm7.chrY_random 23824751 152 + 30114534 atatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230167 181 + 85360813 ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10542 s mm7.chrY_random 23836439 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTCAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=38378 s mm7.chrY_random 23842420 1296 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATCTCCCACTTTCCCCAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTAACTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCCTCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTTACAGCATATCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAT--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCTAACACAGtaaaaaaaaaaaaaaaaaacttttttttttCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACATGGAAGGATTGTCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCGGAACTTTTTAGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCACCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTTTGTTGTACCACTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCAAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTC-TCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCTGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCAGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGAGGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCATACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATA------TTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAG------------AAATCT-----------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=8415 s mm7.chrY_random 23845869 364 + 30114534 TTAGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGTGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAAATGGGAAGACAATCTAGCTCTTGGTCCTGCCTTCAAAGTTGTGATAAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTTTAAATT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATATATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAGACAAAATATTGAACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTA-GCGGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCAC-------TTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11079 s mm7.chrY_random 23846859 422 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGTAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACTTTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGAACTGTTGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTTCTCCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGA---AAAAGTTTTGTTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14185 s mm7.chrY_random 23935499 557 + 30114534 TACTGATAAGCTTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC--------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14263 s mm7.chrY_random 23941058 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 23945637 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=3151 s mm7.chrY_random 23945726 68 + 30114534 TTCACAGACCAAGTCCTCATCGATGACAGAAACTGTGGCTACGTACTGTG-TTTATACTTTATTCCTCA s bosTau2.chr3 39055378 68 + 85360813 TTCATAGACCAGCTCCTCATCGATGG-AGAAATAGTGGGTATTTACTGTGCTTTTTGGTCTATTCCTTA a score=3426 s mm7.chrY_random 23947032 55 + 30114534 CTTTCATGAACTCACAAGCCAGGATTCACTTCTCTGACTACACGGCCATCTTAAG s bosTau2.chr3 39056262 55 + 85360813 CTTTCATGAACTCGCAAGCCCCGATTAGTTCCCCTGACTCCGCTGCCATCTTAAG a score=11505 s mm7.chrY_random 23947341 1059 + 30114534 ACAAATTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAACTTTCTTAGGTTTGTGCTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGACGGTCAACATTATAGCCAGTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTACAAGGGC----CATAATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAAAATGTGTGGATAACACAGATAA------------------TGAAAGACAGTGGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAA-------TTA---------TCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTATTTTTCCTTAGCTTGG-----------------CCATTCTGTCT--GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTCCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTCATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCAACAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCT---------------TAATG----CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-------TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=2977 s mm7.chrY_random 23970050 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTAGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=12908 s mm7.chrY_random 23977150 749 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAA--AAAACACATTGAAATATAATTAAATTTT----Gtacatgtatatatata s bosTau2.chr5 39895153 839 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA a score=8645 s mm7.chrY_random 23977955 531 + 30114534 tgtgtgtgtgtgtgttacgtgtgtgttgtgtgtgttTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGC-TAAATCATAAATGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGCGGAAAAATCTATAATGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATATCTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaaa-----aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39896038 484 + 76426644 TGAGGGTTTTTCTGTTA---GTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATC------AGCATAAGTCAT--------ACTTCT------------------------------TGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6305 s mm7.chrY_random 23980073 422 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCATGTTATTG-taaatatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTACCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT-----TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=2572 s mm7.chrY_random 23980572 106 + 30114534 ATGGCTTTGTATGAATTATTAAAGATATGAAATGATAAAATGGGAATTTGACCTCAGATGTAC-----------------CTCATACTTTAATAACACTATAATTAT-CCTGCTTTATTAAACA s bosTau2.scaffold10439 16855 123 - 23754 ATAGTATTGTGGGAGTCACTTAAAATGGGGAACTGCAAACTGGGAATTTAATCT-AGATGTATACACATGGTGAAGAAAACTGATACTTGATTAACCCTTTAATCCTAACTATTTTGTTCAGCA a score=7587 s mm7.chrY_random 23980790 424 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAAA----------ACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA--AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCTTC---TCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=2823 s mm7.chrY_random 23982289 140 + 30114534 TAGTGA-TTTTTTTAACCTTCTTAACATTTAAAATTGTTTTCATTCATACAGATAATTGAAATTTATTTATTTTTTGATTCAT-TATCT-TATTAGTTTCCAAAGGTAAGAGATACAAATAAAGAAGGTACATGGGTTGATTT s bosTau2.chr5 39898517 133 + 76426644 TAGTGAATTTTTCTAACATTTGT--CATTTAA-----CTTTTAGCAATAAAAATGATTTAATTGCA---AGTTTTGGCTTCGTGTATTTGTATCACTTCCAAAAGGTAGAAAACACAAGTATAGATGGTTAATGTTCTTATTT a score=3428 s mm7.chrY_random 23982642 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 23983043 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=5847 s mm7.chrY_random 23984344 396 + 30114534 GAGTGGGCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957523 435 + 62721844 GAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 23985587 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATAAAAAA s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=4100 s mm7.chrY_random 23985910 390 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACCTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGGCCAAACATTCTTTAATGCAGTCCCTTGGGAAATTCAA---------TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataata-------ttataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4460 s mm7.chrY_random 23986498 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-TAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=14447 s mm7.chrY_random 24043785 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGCAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCGCACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9378 s mm7.chrY_random 24048239 314 + 30114534 TACAAGTTTTGAAAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGTCTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTACTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGCTTTGTGCATTCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=7122 s mm7.chrY_random 24048907 286 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATACATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAGAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAGAGCTTTGT-------GATAATATA-TATATCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCACTTATGTGTTCTTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAAGCAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230044 304 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACA-TGG-----TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10470 s mm7.chrY_random 24060647 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACATTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGAATTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=38634 s mm7.chrY_random 24066621 1287 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCACTTTCCCAAAAATTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTACCTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCATTTCCTTATTCTTCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTC-ATTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTTTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGACGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTCACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAATAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATATAGCTAACACAGGAAAAAAAAAC----TTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACATTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACGGAAGGATTGTCTAGAACTTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTAGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCACCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGGTTGGCACCTGGGCTAGCACCACCCCCCTCCAGTTGACCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTTTGTTGTACCGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCAAGGTGGGCATCCCTCACCTGAGGAAATACTACTATGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCACTGTAGAGCTCCTGTCCATAGATGCCGTCAATTCCATCATACTTCACCAAGTAAAGAGAAGGGTTTGTTGGCAGTTGACCTAGAACTATGGCCTTCCATTGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACAATGAGAAATTCTGCAGCCGACAATATTCCTCAGGGTGTTGGAAGAAGACTTCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGAGGACATGCTAAGCCTCTTCAAAGGTATTTTCTTCTACATGGCTGTAGCCTTGCTGTGGTATACCATACCAAACCCAGGCAGATGTCTTGTGGCTATCATTCTGTG s bosTau2.chrX 20326666 1308 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAG------------AAATCT-----------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=7952 s mm7.chrY_random 24070062 363 + 30114534 TTAGAGCAATTACTATTTTATTCAAACAAAGCAGAAATTTTACAGTGTTAAGTACCTTGTATTGAAGCCAGTTGCAACCTTGAATCATGGATTCTTTGTAAATGAGAAGACAATCTAGCTCTTGGTCCTGCCTTCAAAGTTGTGATAAAGTTA-AACAAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTTTAAATT-TTTTCAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATATATTCGATAATTTTACTTTTGAATTA--TGGGTAGACAAAATATTGTACGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTA-GCGGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCA------CTT------------GAAAAATTAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11126 s mm7.chrY_random 24071033 422 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGTAAT----------CAAGTA----ATAATTTTCCATACCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACTTTGGCATTACTTACTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTACTTAAAAGTGTGGGAACTGTCGATTTGCAATTAATT-TTTTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGGATTCACTGTATTTCTTCTGGGAGCTGAAGATTTCTGTTCCATTCAATAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATAATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGC-TATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=14024 s mm7.chrY_random 24154769 558 + 30114534 TACTGATAAGCTTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAATA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC---------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13918 s mm7.chrY_random 24160320 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTTGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCTCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 24164839 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=12450 s mm7.chrY_random 24166542 1057 + 30114534 ACAAATTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTGGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAATTTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAACTTTCTTAGGTTTGTGCTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGACGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGC----CATAATAGCATTTTACATCTCTTCTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAATGTGTGGATAACACAGATAA------------------TGAAAGACAGTGGGAAACAATGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAT----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTGG-----------------CCATTCTGTCT--GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTCATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCAACAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCT---------------TAATG----CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-----TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3108 s mm7.chrY_random 24189114 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=20795 s mm7.chrY_random 24196212 1323 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGCAGTTTAAAAAAATTA-TATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAAAAAACCACATTGAAATATAATTAAATTTTGtacatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttacgtgtgtgttgtgtgtgtTTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAAACGTAAA---------TGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGCGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaa-------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895153 1369 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA-ATA-------------------------------------------------------------------------AAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6234 s mm7.chrY_random 24199108 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCatattattg-taaatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTGCCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=7925 s mm7.chrY_random 24199823 422 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAA----------AACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTAAAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT---TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 24201674 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 24202075 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=6226 s mm7.chrY_random 24203064 706 + 30114534 TATCTACTGTATTTGTCTGACTCATTTGGGATAAGGATTTACTTGGACCCAGCTTCATTTGTCACATCCACTTTTC-----AAGTATA-------------------AAAAAAATCACATACTCCATCTACCAACA----TGGGAGACATTATTTTTTGATATGCAGTTTTCCCCAACAGTGGAATGACAAGAC-GACCAGAG--CCATCCCTTAGGACAGGGAC---AAATGATCCAAAAGTTACTATTCTCTAACCTAGGACAACCAGTGTCAATAATTTTATAT---------GTCTCTG-------CAAACCTAGATTATG-----------------GCTGATCAACTTCATTGAG-------------------TCAGTGGT---AGCACTCAGAGTGG----------------------GCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCACTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957119 839 + 62721844 TATTTCATGCATTCGCATGACTAGATCAGGTCAGGGGGTCGCTTGGACCTTGCTTTAC----CATACTCACTTCTCTTGCCAAGGAGATGTCGAAACTTGTGTACTTAACAAAACAACCTATTCTATTTGTCAACACTAATGCCAGACATC-CGTTTTGACCC-CAGTTCCCCTCC-CAGTG-------AAGACTGGTTAGAGGTTCACCACTTAGAAGGAGGGCTCTGGATGAACCAGA---CACAAATTACGAATTTAGAAAGCCCATGGTTAGAGGTTCGCCACTCAGACGGAGGCTCTGGGTCAGCCCGACATAGATTACGAATTTAGAAAGCCCAGTGATGGTGCACTTTGATGAGAGTGCTGCTCACAAAAACCCCAGTAACCCCAGTACTCTGAATGGTGGAGGCTTGTCATGGGAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 24204617 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATAAAAAA s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=4282 s mm7.chrY_random 24204939 388 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACTTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGGCCAAACATTCTTTAGCAGTCACTTAGGAAATTCAA---------TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataata-----ttataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4591 s mm7.chrY_random 24205523 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=3854 s mm7.chrY_random 24276293 107 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCCATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGCTTTTAA s bosTau2.chr5 36527708 112 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGTTTGGTTTTTTAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 24276730 71 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAAGAAATATA-----CTTTCTATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=7738 s mm7.chrY_random 24278230 424 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTACACTTAAACAAGAAAATGATTAAAGATATTTAAAAAT---AAAGAAGTTCTATTTTAACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGATTTTTTTTATTTGT---------TTTATATATATACCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTCAAACATAGACATTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGA---GAAGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTT-TAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=6234 s mm7.chrY_random 24278949 420 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACtaaatatatatatatattta-caataatatGAAATAACATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA---ATGTGTTCACCACTTACATACAATAATA--ATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=20633 s mm7.chrY_random 24280950 1313 + 30114534 aaatgcctagtcgttttcattgatatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagataatggaacttaatttagtttcatatgctcaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt------ttttttatggtaccaaccactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAATGAACACTCAGAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCGCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCA---------TTTACGTTTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacgtaacacacacacacacacacacacacacacacacacacatatatatatatatatatatatatgtaCAAAATTTAATTATATTTCAATGTGGTTTTTTTTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAACTAAAATATACAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCACACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATATAATTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAA--AATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGAGTCAT----TTTGAAGAAAAATTAGATGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530122 1369 - 76426644 AAATACC-AACAGCTTTTAT--ATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAAC--AACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTT-------------------------------------------------------------TAT-TATATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTT-CATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACC---CATGAGTAGTAAGGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=3108 s mm7.chrY_random 24289292 94 + 30114534 ATATTTCTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=12219 s mm7.chrY_random 24311067 1303 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCTGTGTTCCTGTTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATGAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGATGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC--AGACAGAATGG-----------------CCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAATGATACAATAGAATTCTACGTT------------------GTTTCCCACTGTCATTCATTATCTGTGTTATCCACACATTTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTAGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATTATG----GCCCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACCGTCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGACT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCCAGCACAAACCTAAGAAAGTTGTAAGCATTTGAAGTC----------------------CACTTACAGATCTC-ACTG-------------------------TCCATACTAGATATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGGAA---TTTTTAAATGATTACATACCACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAATTTGTG-------------ATTTCTTAATTTTAAATGAGTATAGCAGTTTTCTCTATAGA-----AAAGTTTGAGCATTAATTTAT------TGATAAGGTCAGTGCATGGGAGCTTCTGTACCCTTTCCAACATGGTATGCATCTGATACTCGAGGGTCTCATCCACTAGTAGTCTG-GCAGAGAAACACATGTGGCTTATACATTTGGTCCCAATTAGAAGCAGGGTAGATTGAATCC--CAGGTTTATGTTGAAATAACAACTGCTTGGTCAGG s bosTau2.scaffold5600 1080 1466 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCT------TTATAAATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCT-ATCTACATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAG----CATTA---------------AGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACTTAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCATCTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGTATGGCTGTTCAGGCATTGCTTCATAT-------GTATGGATGCTTTGCAGGAAGATCTGGAGATTTTGCAAACTGATTTATTCAGAATGGTAAGG--AGAGCCCTGTGGCCTC-ATGGTCTTGTAGACTCAGTGAACATTGGATGCTAGGAGGGAATGT------GCAGTCAGAGCAGGGTAAGGCCTGTGACTTAAA-----------AGTGAAAGCCAGGTCAGACAGAAACTGGTTTGTTcatgttgggattttagttcccggaccagg a score=3426 s mm7.chrY_random 24312379 55 + 30114534 CTTAAGATGGCCGTGTAGTCAGAGAAGTGAATCCTGGCTTGTGAGTTCATGAAAG s bosTau2.chr3 46304496 55 - 85360813 CTTAAGATGGCAGCGGAGTCAGGGGAACTAATCGGGGCTTGCGAGTTCATGAAAG a score=4837 s mm7.chrY_random 24313739 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14263 s mm7.chrY_random 24317999 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13847 s mm7.chrY_random 24323378 558 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTGACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAAGCTTTTCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA---------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=10996 s mm7.chrY_random 24409934 422 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAACAAAACTTTT---TCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGGAGAAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAAAAAT-AATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAAAGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTAT----TACTTG----------ATTACAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38474 s mm7.chrY_random 24413472 1288 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTATGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCCTCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCATTGTTGGAAGGAATGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTATGGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCGTGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACAAAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGG-TGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGGTGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCTAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGACAATCCTTCCGTGTTCTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAATGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAAGTTTTTTTTTTCCTGTGT--TAGCTATATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTATTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGAAGAATAAGGAAATGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTTGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------AGATTT------------CTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10656 s mm7.chrY_random 24420360 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATGTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACA-CAATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCTTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=5893 s mm7.chrY_random 24476942 301 + 30114534 TAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatatatatatatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatacatatTATCAAAAAGCTCTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATATATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130541 228 - 85360813 TGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT-----------------------------------------------------TATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAA-CCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9368 s mm7.chrY_random 24477597 313 + 30114534 ACTGCATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGAATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAATACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTACAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTT-ATTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCGTTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13840 s mm7.chrY_random 24481980 376 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGTGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCAGAGATGATCCCCAAAGTGTAGTATGAAGTTTTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGCTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11640 s mm7.chrY_random 24491658 382 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATCGACAGTTCCCACGCTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGATT---AATCACGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACA s bosTau2.chr17 20172806 399 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTA-GCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACA a score=38213 s mm7.chrY_random 24495239 1289 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTGTGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCATCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGAAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCATTGTTGGAACGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAAGAAACACTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTATGGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCTTCAGGTGAGGGATGTCTACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACATCACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGAAGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA------CACTCCTCCGCCTGAGGAGAGA---TCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGATAAGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAATTTCTAGCCAATCCTTCCGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTT-----TAAGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAA--AAAAAATAAGTTTTTTTTTCCTGTGTTAGCTACATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTCC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTGGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCATGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAAAG-----------------------ATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10728 s mm7.chrY_random 24502111 393 + 30114534 CTGTAAATAAT-AAAAATATGAAAACAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGGCAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=5584 s mm7.chrY_random 24514021 152 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAATCTATTAatatatat s bosTau2.chr3 45130465 181 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT a score=9813 s mm7.chrY_random 24514753 314 + 30114534 ACTGCATGCACAGACCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13381 s mm7.chrY_random 24519107 388 + 30114534 CAAGAACTCCAATGTGACA---GTGTGAAACTGCTAATCTACAACCTGCTAAACTCACATGTGTGGTGTGTGGG--CATGCAGGTGTTCTGTCTGAGCCTGCA-GGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATCAACA-GACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCACTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATAT----GCTGTAGAATGATGAGGAGA s bosTau2.scaffold2757 13736 386 + 101657 CAAGAGC----ATGTAACATAAACATGAAGCTGCTCACCCACAATCTGCTGAGCTTGCATGTGTGGGGAGTGAGGCCCTGTGGCTTCCCT--------CTGCATGGCCACTGAGGTCCATACCAACCCTGTGGAGTTCAACCCCAACTTCATAGCATGTATGATACTCAAAGTGGAGTGGGAAGTGCTTCTGGAGGCTGCCAACAGCCTGCATCTGATCAAGGTGCCCAAAGAGACGATTCAGGGATATAAGCATGACAAGAAATTTCTGAGAAAGAGGCA-CCATATACTGCTGGAGGTGGATATGTTGGAGGGCATCCTGCAATGCCCAGAGTCAGGATGTCTATTCCCCATCAGCCATGGGATCCCCAACATGTTGGTTGCTGAGTGGTGAGGAAA a score=11975 s mm7.chrY_random 24528845 413 + 30114534 CTGTAAATAATTAAA-ATAGGAAAACAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGTACATCGACAGTTCCCACGCTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGATTAATCAAGTAGAAATATGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCC-TCAATTAGCAGAAAGG---GGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=27232 s mm7.chrY_random 24532148 731 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCTCTCATGAAGAAAAGGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGGAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGAGGGTTGTGGTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTTAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGTCAATCCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=18793 s mm7.chrY_random 24570882 962 + 30114534 GCACTTGTGGCCTAAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTAGCGAGTTGGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGGCTCACATCAGTGGCATCACATGGGCCATTCATTTTCAGTCCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTGAGAGGTCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAGAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTCGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCGAAGAGCAGTTTTTGATTTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTCTCTGAAGGATTTCGATTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGGCTTGCAA-CATTCAGA-AACACAGGGGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTCTTA------CTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTAGCACCCCCTTTCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAATCTATTTACTGTCAGAATATCCACTCTTTTCCTACAA------TAGGGGGTAACTTC----------------------TATTCTGGC--------TAATTCTGTATTCACT------GTGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACATCTTTGAAA-------ACAT--------------------TAAATTAAGTACCAGAATAATCCTGCTAGGCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATAAGTATCGATTCAGAT-AATATATACCTTTTGAGAATTAGCTTCACATTTCTA--ATGTCCGCACAAAATAGCTTT--CTTGATTTAAGTTACAGTTGCTATGTTTCACTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTC--AGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagt-gtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=8191 s mm7.chrY_random 24622241 427 + 30114534 AGTGGCCATGACACTTGGTAGTAGA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCACAGGTTAGGGTTATTTGCATAAGAAGTTTCTGATCAGCCATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCCCcatacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaTTTCTACTTGATTA--ACCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTATTCCTGATTTATTTCAAATCGTGGGAAATGTTGATGTACAATTAATTCCTATTCATAACGGGATAAAACAGAAGTCAACAGGATTGAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAGACTTCCCATCGatttaataaaatattataaat-atgattttaaaaCATGCCCTGAAAAAGTCTTA s bosTau2.chr17 25742254 355 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC----------------------------------------------------------------------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCT-ATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAA------CCTAATAAAAGCCTA a score=9579 s mm7.chrY_random 24680432 458 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAAGATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATATATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCTGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATGAAAATAAGTAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATATGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGACGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-------TCCTTTATTCTtttgaataaatg s bosTau2.chr17 20172806 473 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATG a score=11584 s mm7.chrY_random 24728800 277 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4806 s mm7.chrY_random 24731582 79 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGG s bosTau2.chr3 39006490 79 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAG a score=14263 s mm7.chrY_random 24735948 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13206 s mm7.chrY_random 24741313 556 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGCGTGCATAAGTAGAT-ACTCCACTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA--------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=11210 s mm7.chrY_random 24822904 422 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAACAAAACTTTT---TCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGGAGAAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAAAGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTAT----TACTTG----------ATTACAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38368 s mm7.chrY_random 24826444 1288 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTATGGTATACAACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCCTCCGTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCATTGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTATGGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGCTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTTGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACAAAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA------CACTCCTTCGGCTGAGGAGAGA---TCAGGAGGTGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCTATAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGACAATCCTTCCGTGTTCTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAATGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGT---TTTTTTTTTCCTGTGTTAGCTATATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTATTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGACCATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGAAGAATAAGGAAATGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTAAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTTGGGAAAGTGGGAAATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------AGATTTCTCA-------------AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10767 s mm7.chrY_random 24833325 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=5676 s mm7.chrY_random 24845226 152 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatat s bosTau2.chr3 45130465 181 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT a score=2775 s mm7.chrY_random 24845420 118 + 30114534 CTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATGTATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130670 99 - 85360813 CCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9732 s mm7.chrY_random 24845894 314 + 30114534 ACTGAATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGAATGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTAATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC---------TATGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14735 s mm7.chrY_random 24850289 376 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGTGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTAGTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACATGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11888 s mm7.chrY_random 24859993 413 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATTGACAATTCCCACGGTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=26802 s mm7.chrY_random 24863317 731 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACAGAGAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAAGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGAGGGTTGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACAGTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAATGTTGTTTACCAAATTCTAGTCAATCCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=9240 s mm7.chrY_random 24890605 496 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTACTTATAATCAGAAGTGCTGGTAA-ATTTTAAAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATACATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAATCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGGCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAA----TTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGCC-------AGCCAACATTCTATATG------GGCAACACTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=36343 s mm7.chrY_random 24892964 1135 + 30114534 ATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCAGGCGCACTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTCAATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTTAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATTGAAAA----AAAATGT-TTGTTTTCCTGTGT--TGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTAGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATTACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAAATGGATTTTTAGGAAGAAGCAGAGAAAGACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529137 1181 + 48857030 ATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=8856 s mm7.chrY_random 24899520 472 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAAGATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATA----------TTTTACTAAATCGATGGAAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATATTGTTGACTTCTGTATTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATAAAAATAAGTAATGCCAAT---ATCGTTAATCAAGTAGAAAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATTGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGAGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGTTGATAT-------CATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCgtttgaataattgtgt s bosTau2.chr17 20172806 480 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATT-AGCAGAAA----------------------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACTTTAT a score=3870 s mm7.chrY_random 24933133 73 + 30114534 GATTATGTGCATAAGCTTATGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACTTGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=20620 s mm7.chrY_random 24949693 666 + 30114534 ACTTCTATCTGACACCTTGGATAGAATTCAAGTCTGGTCTTATTTCAATGATGTAGATCTTGGGTGTAAAGATGCATCCAAGCATCACTGTACTGGATGCCAAGATTGAGAAGACCTCTACAGCAGCCATGACCATGCCCTTAGTCCTATGTGAGTCATGGAGGAAGGTGACATAAACACTGCAGAATCCTAGCACGACAAAGGTCAGGAACTTGGCTTAATTAAATGTTTCAGGAAAATTCTTTGCCACGAAATCCACAGTGAAGCTTCCAAGGGCAAGGCAGGTCAAGTATCCCAAAATTCAGTAGAATGTAGTAACTGAACCCTTGTTGCACAAAATGATTA--TCATTATCATCAATATCAACAAATATCAATATCAA-AAAAGGAGGAGAAACTGAGAGCCAGATTACCGACA-GAATACATTGAT-ATGGAACATATCAGAAGGATGTATTTCATTGAACCTGATAAAAGGAGGTTCCTTAAACCTCTTCCAGGTTCTGTGATTATGAAAGCCAA-ACTACAATGATTGTTTTGGCAAGCAATGTGGAAACAGACACCATGAATACAATTCCAAAAGTGATTTGTTGTAAGGCTACATATTTTTCTGTTAGGAAGACCAATGAAGAAAAAGGAGCATGAGAAAATGGAACATGAGTGACATGAGTA s bosTau2.chr7 54723649 662 - 69141744 ACTTATTCTTTAAACTTTTCAAAGAGTTTTTATCAGTTCTTATAAGAACAATGTAGTACTTTGGGGCAAAGATGCAGCCTAGGAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGATGATCTCCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGCAGATAGGGAGGAAGGTGACCCAGACACTGAGGAGCACCAGCCTGCTGAAGGTCAGGAACTTGGCTTCACTGAAGGTGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGAAAGCCAAGGAGAAGGTCCCCAGGGCTAAGGAGCCCAGGTAGCCCAGGACACAGTAGAAGGCAGTGACCGAGCCCTTGTTGCACACGATGAGGAGCTCCTTGGGCTCAG----AATGAGTGTCCATCTCAAGGAAAGGGGGAGAGGCTCCCAGCCAGACTCCACAGATGATCACCTGGATCATGGAGTACATGGGAAAGACATA----GCAGGTCCTGTTAAGAGCAATCGCCTCATGGTTCTTCCTGGTTTCCTGGCCTTGAATGCCAAGATCACAGGGACGATTTTGGCCAAAACAGTGACCACAGCCACAGTGAACACAGCTCCAAATGTGGTCTGTTG-GAGGATGGAGGTGGCTGTGTGGGGACGACTGATAAAGAGTAAGGAGCA-GAGGAAGCACGGGAGGAGGGAGATGAACA a score=9625 s mm7.chrY_random 24965291 492 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAACTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTCTGAAATTCCTTGTAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTTTTTTGCATAAAAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAGTCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCT-GAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATACACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=36058 s mm7.chrY_random 24967619 1171 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCAACCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAAAGTAAACTTAT-------AGGATTGAAAAAAATGTTTATTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATTACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTA--AAAAGAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGGG-----AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=11584 s mm7.chrY_random 25027054 277 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4837 s mm7.chrY_random 25029830 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14001 s mm7.chrY_random 25034082 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTAAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTTGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=12983 s mm7.chrY_random 25039425 556 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGAGACCT----------CATATGAAATGAAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCACTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA--------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=10170 s mm7.chrY_random 25127622 398 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAC--AAAGCTTTTTTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATGTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAACGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCTATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACGATGTGACATGGACACTTACT s bosTau2.chr17 20172806 405 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCT a score=5770 s mm7.chrY_random 25139540 152 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAATAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatat s bosTau2.chr3 45130465 181 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT a score=2595 s mm7.chrY_random 25139734 124 + 30114534 CTCACACAACTTTTTAAAAATCCTAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATATATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130670 99 - 85360813 CCCACCCCACTTCTTAA-------AACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9682 s mm7.chrY_random 25140212 314 + 30114534 ACTGCATGCACAGACCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTACATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=4591 s mm7.chrY_random 25211051 200 + 30114534 TATTGTACAGTTAATAATTTTATGTCACaaaataatattatactaataattatttaaa-CTGTGTCTTATACTG-CTAATATGGTTTCACATATACATGGGAGTTTGGTAGCCTCAGGAC------TCTGTCCAGGTAGCTGGATCATGTTAATGAATTTTACACTCAGATTGCCATTCATTTTATTTTTAGTTGCCAATTTCAAGGG s bosTau2.chr13 22763104 205 - 62721844 TGTTGTTCTGCCAATAAATTAAGATCCTTAGCCA---TTTCATTAGTAATGATTTCAATCCCTGCCTGGAGCTGGATAATTCTGTTAAGCGTGTAAATTGGGGTTTGGTAGCCCCAGGACCCATCTTCTGCCCATGTAGCTAGCCTGTAGTATTGGATTATGCGTTCAGGAGACCACTCATCATCTTTCCAGTCTCCAGTCTGTAGAG a score=4137 s mm7.chrY_random 25211449 390 + 30114534 GATTTCTAAATGGTCCCCTCTGGTAAGTTGGAACAGGAAGAAAATTGTACAGCTAGTCCCCAAAACACACAATCCTGAT---TAGGTGAGAAAAAGTATAATCGAGGCTGTGTACCCAACATATCCAGTATAGCCC------ACAAAGGGCATGGTACCTGATACCTGCA-TTGACATTTTTTTTCGGTCCTGTCAG------AGATTAGAGAAACTAGACAAGGAATAGATGTTTTGTTCAAAGTGGTTTGGGAATCCACACCA--TTGAATTTCCCAAGTGACTGCATTAAAGAATGTTTGGCCCAGGCATGTGGGGCTTCCAGCTGAAGT-TTAAATCACC-CTTCCATTAGGTAGGTCAGTTTTCCCCAACAACTTAAGTATT----AGTTCAATTTTGGTtttggtttt s bosTau2.chr13 22763349 395 - 62721844 GACTCCCAATGATTCACCTTAGGCTAGGGAGAGTAGGAAAAAGGAAGGACAGATAGTCCCCAATACACATGCTCCTGACCTGTTGGCTGGTAAAATTGTATGTGCGTTAGT----CCCACAAATCCAATATGATCCTTCTGGACGAGGCCAATGG---------CCTTCAGTGGACAAGTC------ATCCCATCAGGTCTTTAAATGGGGGATGCTTGTTAGAGGGTGAGGATTAGGCTCTGTATAGTTTGGGCATCCCCACCAACCAGAAGTATGaatattataatattataatatttttGGCCAAGACAAGTGAGTTTTCCTACTGGAACATTGAATAATTGGCCCCACCATGCCAGACAGTTTTTGTCAATTAAAGAAGTCTTTAAATGCCAAATTCTGACCCTGGTCTT a score=3781 s mm7.chrY_random 25212066 96 + 30114534 TTTTTTATCTATCCAGG-CCATAGTTCTTCCATGTTAGTTTTTTCACATGCATGGCCAAAATACACCCTTAGCTACTGGACTCTAGTGTCTACCAGG s bosTau2.chr13 22763786 97 - 62721844 TTCTTTGGCTTCCCAGGGCCATTGGTCTCCCATGTTAGTTCCCCCACACACATAGCAAGAAGTAACCATTAATATCTGGGCTATGGTCTCTGCCAGG a score=6066 s mm7.chrY_random 25213009 707 + 30114534 AAACAGATTTCTTGCTATGGGAGCAATGAGAAATGGGCTAATTTTTATTTCCTCATGAAAAGAATGGAAGA-TCTGGATGT---CACTTAATGCATGATAGAAACTCTCTTGACATTTAACACAGACCCTGTGATCGTGCCCTTTCC----------------AATCTGCCAGCCAGTATTCTGTCAGGGGTTTCTTAAGTTAGTGATATTGAAATTAGAATGTTTCCAGGTCCCTAGTTGACAGTCTGATGCAGAAGGCTCCTTTTGAAGGAGCACCATTTTTGCACT--------------------TGTAGTGCCAGGTTGTTCATAAGATGTGCTTCCAGTAGGAAATGT--AAAAATGGGCTTTAGGGGTACATCTGGCCAGAGTTGAAGGAT----GTTCACATATATAGTTATCATTTAGCCTGTATGC----------------------CCACTCTGAGTGCT---ACCACTGA-------------------CTCAATGAAGTTGATCAGC-----------------CATAATCTAGGTTTG-------CAGAGAC---------ATATAAAATTATTGACACTGGTTGTCCTAGGTTAGAGAATAGTAACTTTTGGATCATTT---GTCCCTGTCCTAAGGGATGG--CTCTGGTC-GTCTTGTCATTCCACTGTTGGGGAAAACTGCATATCAAAAAATAATGTCTCCCA----TGTTGGTAGATGGAGTATGTGATTTTTTTTTATACTT-----------------------GAAAAGTGGATGTGACAAATGAAGCTGGGTCCAAGTAAATCCTTATCCCAAATGAGTCAGACAAATACAGTAGATA s bosTau2.chr13 22763886 839 - 62721844 AAAGACATTTTTAGTTTTGGCTGGAATAGGAAGAGGACCACTTTCAGTCTCTTCATAAAAAGAATGGAAGAGCCTGTGTGTGGAAATCCAGAGAGGAATAGAAATGCTCTGGAATAGCAATGCAGTTCCTG-GGTCAGGACCTCTCCTATTAATATAGATGCTGATCTGGTGACCCTCTTCCCATCTTGAGTCCCCAGGGTTGAAGACAGTGAAATTGACTGGGTTACACGTCCCCAGCTTACATTTGGGATCAACAGTTCCCTTTTGGAGGAGTGTTACTTTGTCCTTATTCTCCCAGGTCACCTCTATATTTTCCCAGGTTGCTCATCTGACACAGGCCCAGGTCAATCTGTGAAGAAAGGGGCCTTCATATCAC------CCAGTGTTATGGGATACTGGCTTACACATGTATTTGTCATTGAATGTGCATTCTTGTTCCCATGACAAGCCTCCACCATTCAGAGTACTGGGGTTACTGGGGTTTTTGTGAGCAGCACTCTCATCAAAGTGCACCATCACTGGGCTTTCTAAATTCGTAATCTATGTCGGGCTGACCCAGAGCCTCCGTCTGAGTGGCGAACCTCTAACCATGGGCTTTCTAAATTCGTAATTTGTG---TCTGGTTCATCCAGAGCCCTCCTTCTAAGTGGTGAACCTCTAACCAGTCTT-------CACTG-GGAGGGGAACTG-GGGTCAAAACG-GATGTCTGGCATTAGTGTTGACAAATAGAATAGGTTGTTTTGTTAAGTACACAAGTTTCGACATCTCCTTGGCAAGAGAAGTGAGTATG----GTAAAGCAAGGTCCAAGCGACCCCCTGACCTGATCTAGTCATGCGAATGCATGAAATA a score=3869 s mm7.chrY_random 25214596 105 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCCATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGATTTT s bosTau2.chr5 36527708 107 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGT---TTGGTTTT a score=3428 s mm7.chrY_random 25215033 71 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAAGAAATATA-----CTTTCTATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=7617 s mm7.chrY_random 25216533 423 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTACACTTAAACAAGAAAATGATTAAAGATATTTAAAAAT---AAAGAAGTTCTATTTTAACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGATTTTTTTATTTGT----------TTTATATATATACCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTCAAACATAGACATTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGA---GAAGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTT-TAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=2572 s mm7.chrY_random 25217068 106 + 30114534 TGTTTAATAAAGCAGG-ATAATTATAGTGTTATTAAAGTATGAG-----------------GTACATCTGAGGTCAAATTCCCATTTTATCATTTCATATCTTTAATAATTCATACAAAGCCAT s bosTau2.scaffold10439 6776 123 + 23754 TGCTGAACAAAATAGTTAGGATTAAAGGGTTAATCAAGTATCAGTTTTCTTCACCATGTGTATACATCT-AGATTAAATTCCCAGTTTGCAGTTCCCCATTTTAAGTGACTCCCACAATACTAT a score=6234 s mm7.chrY_random 25217251 420 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACtaaatatatatatatattta-caataatatGAAATAACATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA---ATGTGTTCACCACTTACATACAATAATA--ATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=20991 s mm7.chrY_random 25219249 1310 + 30114534 aaatgcctagtcgttttcattgatatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagataatggaacttaatttagtttcatatgctcaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt------ttttttatggtaccaaccactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAATGAACACTCAGAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCTGCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCA---------TTTACGTTTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacacgtaacacacacacacacacacacacacacacacacatatatatatatatatatatatacatgtaCAAAATTTAATTATATTTCAATGTGGTTT-TTTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAACTAAAATATACAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCACACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATATAATTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGAGTCAT----TTTGAAGAAAAATTAGATGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530122 1369 - 76426644 AAATACC-AACAGCTTTTAT--ATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAAC--AACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTT-----------------------------------------------------------TAT-TATATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=3108 s mm7.chrY_random 25227561 94 + 30114534 ATATTTCTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=4891 s mm7.chrY_random 25247275 343 + 30114534 ACCAATTATCTGGTCC---ACTTGCCTACCTCTGGTTATCCCAGTTTCTCCACCTAAATTCGATACTGATAATTTCCTCAGTATGCAGCCTGCCATG--ATTCA-----CAGACAGGTACAACAACTGCTTCTGACTC----AGTATTAAATTCAAGTCCTTTCTCTTCTTCAG-GAATGTTAATATTTGACGATATACAAATGCATTTATCTGAGGTAGAATGGGCTATGCT--AACCCATGGAAGAAGACACTCTACAGTGTTGTAATGCTGGCCATCTACAAGCTAACCACCTGACTAGTTTAACTGGTTAACTATAACTCCTTTCCTTTGTGTATACATTGTGTAACCTGGACTGT s bosTau2.chr25 341981 348 + 41414979 ACCTGTTTGCTGATCCCGTGCTTACTTCCTTTCTACTATCTCACTT---AAAATTAATTTATGTGCTGTTAGTTCCTTTAGTGACTGGCTTACCATGCAGTTCATGGCTCAGAAGGTTG----GGCCACTTTTGAAGTGGCAAGTACTTGGCTGAAGCCCATTCTCTTCTTTAGAGCTTATTGACATTTGAAGAAGTGGCCATGTATTTTTCCCAGGAAGAATGGGAGTTACTGGATCCCACT-CAGAAGGCCCTCTACAATGATGTAATGCAAGAAAACTATGAGACTGTCATCTCTCTAGGTAAA--GTTT--CTTTTTCCCCTTCCCTTTGCACAGCAGTGGACTAATCTGTCCTGT a score=12502 s mm7.chrY_random 25249297 1057 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCTGTGTTCCTGTTGCCAGAAAATCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATGAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGATGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC--AGACAGAATGG-----------------CCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGTTTCCCACTGTCTTT--------CATTATCTGTGTTATCCACACAT---------TTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTAGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATTATG----GCCCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACCGTCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGACT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCC-----AGCAC--------------------AAACCTAAGAAAGTTGTAAGCATTTGAAGTCCACTTACAGA---------------TCTCACTGTCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGGAA---TTTTTAAATGATTGCATACCACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAATTTGT s bosTau2.scaffold5600 1080 1221 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-----AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCT-ATCTACATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAGCATTAAGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACT--TAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCAT--------CTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=4837 s mm7.chrY_random 25251968 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14263 s mm7.chrY_random 25256159 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13939 s mm7.chrY_random 25261542 558 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTGACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAACGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAAGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA---------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=11210 s mm7.chrY_random 25342791 422 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAACAAAACTTTT---TCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGGAGAAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTTACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTAT----TACTTG----------ATTACAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38411 s mm7.chrY_random 25346333 1288 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTATGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTTCTCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCATTGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTATGGACAGGAGCCCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTTGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACAAAAATTTGAGAGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA------CACTCCTCCCGCTGAGGAGAGA---TCAGGAGGTGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGATGTACACCAGAAAAGATGGTTCTAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGACAATCCTTCCGTGTTCTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAATGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGT---TTTTTTTTTCCTGTGTTAGCTATATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTATTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAAGATCAAATAAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGAAGAATAAGGAAATGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTTGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------AGATTT------------CTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10682 s mm7.chrY_random 25353202 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAACATCGT-------ATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=7323 s mm7.chrY_random 25365103 296 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatatatatatatatatatTATCACAAAGCTCTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATGTATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130465 304 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT-TATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAA-CCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9946 s mm7.chrY_random 25365753 314 + 30114534 ACTGAATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14185 s mm7.chrY_random 25370134 376 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGCGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTTCTGGCACAGTTGATCCCCAAAGTGTAGTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATAAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11663 s mm7.chrY_random 25379861 413 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATTGACAATTCCCACGGTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGCCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=27169 s mm7.chrY_random 25383189 731 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAAGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTTCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGAGGGTTGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACAGTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAATGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=8942 s mm7.chrY_random 25410511 496 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATATATGAAATTACTTATAATCAGAAGTGCTGGTAA-ATTTTAAAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATACATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGATTGTTTGCATAAAAA--TATTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAATCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGGCGGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAATA-----AATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAA----TTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCT-GAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGCC-------AGCCAACATTCTATATG------GGCAACACTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=36542 s mm7.chrY_random 25412806 1193 + 30114534 ACCACAACAGGTCTACAGCCAGGTAGAAGACAATACATCTGAAGAGTCTGAGCATGACATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACAGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCAGGCGCACTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATTGAAAA----AAAATGT-TTGTTTTCCTGTGT--TGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGTTG----GAAGAGATTGACTA----TGGTAGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAAATGGATTTTTAGGAAGAAGCAGCGAAAGACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529102 1216 + 48857030 ACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=8523 s mm7.chrY_random 25419420 474 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAAGATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATA----------TTTTACTAAATCGATGGAAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATATTGTTGACTTCTGTATTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATAAAAATAAGAAATGCCAAT---ATCGTTAATCAAGTAGAAAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATTGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGAGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCgtttgaataattgtgt s bosTau2.chr17 20172806 480 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATT-AGCAGAAA------------------------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACTTTAT a score=3870 s mm7.chrY_random 25452970 73 + 30114534 GATTATGTGCATAAGCTTATGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACTTGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=21534 s mm7.chrY_random 25469573 667 + 30114534 ACTTCTATCTGACACCTTGGATAGAATTCAAGTCTGGTCTTATTTCAATGATGTAGATCTTGGGTGTAAAGATGCATCCAAGCATCACTGTACTGGATGCCAAGATTGAGAAGATCTCTACAGCAGCCATGACCATGCCCTTAGTCCTATGTGAGTCATGGAGGAAGGTGACATAAACACTGCAGAATCCTAGCACGACAAAGGTCAGGAACTTGGCTTCATTAAATGTTTCAGGAAAATTCTTTGCCACGAAATCCACAGTGAAGCTTCCAAGGGCAAGGCAGGTCAAGTATCCCAAAATTCAGTAGAATGCAGTAACTGAACCCTTGTTGCACAAAATGATTA--TCATTATCATCAATATCAACAAATATCAATATCAACAAAAGGAGGAGAAACTGAGAGCCAGATTACCCACA-GAATACATTGAT-ATGGAACATATCAGAAGGATGTATTTCATTGAACCTGATAAAAGGAGGTTCCTTAAACCTCTTCCAGGTTCTGTGATTATGAAAGCCAA-ACTACAATGATTGTTTTGGCAAGCAATGTGGAAACAGACACCATGAATACAATTCCAAAAGTGATTTGTTGTAAGGCTACATTTTTTTCTGTTAGGAAGACCAATGAAGAaaaaggagcatgagaaaatggaacatgagtgacatgagta s bosTau2.chr7 54723649 662 - 69141744 ACTTATTCTTTAAACTTTTCAAAGAGTTTTTATCAGTTCTTATAAGAACAATGTAGTACTTTGGGGCAAAGATGCAGCCTAGGAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGATGATCTCCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGCAGATAGGGAGGAAGGTGACCCAGACACTGAGGAGCACCAGCCTGCTGAAGGTCAGGAACTTGGCTTCACTGAAGGTGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGAAAGCCAAGGAGAAGGTCCCCAGGGCTAAGGAGCCCAGGTAGCCCAGGACACAGTAGAAGGCAGTGACCGAGCCCTTGTTGCACACGATGAGGAGCTCCTTGGGCTCAG----AATGAGTGTCCATCTCAAGGAAAGGGGGAGAGGCTCCCAGCCAGACTCCACAGATGATCACCTGGATCATGGAGTACATGGGAAAGACATA----GCAGGTCCTGTTAAGAGCAATCGCCTCATGGTTCTTCCTGGTTTCCTGGCCTTGAATGCCAAGATCACAGGGACGATTTTGGCCAAAACAGTGACCACAGCCACAGTGAACACAGCTCCAAATGTGGTCTGTTG-GAGGATGGAGGTGGCTGTGTGGGGACGACTGATAAAGAGTAAGGAGCA-GAGGAAGCACGGGAGGAGGGAGATGAACA a score=9742 s mm7.chrY_random 25485177 492 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAACTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTCTGAAATTCCTTGTGATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCCTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTTTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGTCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35729 s mm7.chrY_random 25487464 1206 + 30114534 GACAGTGTGATTTAGCACAACAGGTCTACAGCCTTGAAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTGAGCATGACATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAAAGTAAACTTAT-------AGGATTGAAAAAAATGTTTATTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCATCGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATTACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAA--GAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGGG-----AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529089 1229 + 48857030 GAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=9701 s mm7.chrY_random 25493964 458 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATACGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCTGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATGAAAATAAGTAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-------TCCTTTATTCTtttgaataaatg s bosTau2.chr17 20172806 473 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATG a score=48884 s mm7.chrY_random 25548251 2564 + 30114534 GCAGTCAGTGGATACAGGCCCTTTTA--CAGGCTGTGTCCC-----------TGGCGGCTCTGTGTGCATTTGTG---------------GTTGCGGGC-------TGTGGAGCACCAGGCTCTGCATCTG-TTCAAAGATGCAGCAGGTGTGGCTGCCACTCAACCCTCTTCAGAGTTTTCCAGAGATGAGAGTGGGAATGGGAAGGACAGACTTGCTGACTGCTTTCAACCTGTTCCAAACTTCAGTTTCTTCAAAATGAGCCTGGAAGTGGGAATGTGCATGTTTGCAGGGTGGTACCGTAAAGTCGCAGCTGTTCCTCATTTAGAGAAACCCACGAGCTTTCGGTGGGAGCCATCATTCTGAAGGTAACTCAATTATCTGTGTTTGCTGGTTCAATATGGTGCTCTTAGATATAGTGGCCCATCACTTGAGCTTTCTGAAACCATGCATGGCTTCATATGCC-AGCCTTCATCCAAAGAAGGGAGAGAGAGAGAGAACAGACGAGATCAAGGTGTGGGGTTGAATTCAGAAGTCCTTTTCCAAATCAATACACAGGATATGAGAGATGGCAGATG---TGGCTGAGCCCCAACCCCTGCTATCTCTTCTCATGCCATCTCTAATCCCCCAAGG-ATGCAGACATTCAAATGACTTGCAGCAGTTCAGAGGCATCTATTCCATGCCAGGTAAAATAGCTTGTAAAATTATAAAAATTGACTATCATACCTTTGACTCAAATTCAAAATTTCTAATTAGCCAAATTCATATAGTCATCT--CAGAAAATGGCCCAAACTAATTA-TTTGGACATCATTTCATTTAAGGGGGGCGGAGGAAGGGCTACAGAGAACTCCAGTTTACTgagatgatgcagtgagtaaaggggcttgctgccgagcctgaggacctaaggtcagtccctgtatttcatgtttgaagacgagacccaactcATGTACCACCCCTCCCCCATATACCTCAGTTTTAAATATAGTGTACGTTGGGTAACCCATGTTTTCAGAGCCTCAATGACCTTCCGTGCAGTTTCTGCTTCCCAACATGCCCTTCCATGTATCTGCACTCCCATCCAATCCTCTGAGTCCTAGTTTTACTCCTTCAGATCTTTGGGGCTGT-----------GCATAAATAAGCAGAACAGAGGAG-------GACAAAGTGTGGGGCTGAATTGGGATCACTAAGGGAGCAGGTTTAGACCTAAGACTCTGGTATGCGGGCACTCTGAACAGAGACATCATCAACCCTTGTTTATCCCAAATTAGACTCAAAAGCTCCTTTTGAGTATCTCTGCACTGCCAGC-------------------TTCTCAGCCAGTGGCTTTACCTCTGAGTACCTCAGGATATTTGCCA--ATAGACTGAAGCGATAATGACTTTGAAGTTGGCTGTGAGGGTTAGGGGT-ATGGATCTGGAATGAAATGGGCACAGCGTTGGGTAGGCGTTCCAGGATCTAGGAGGGTGTTTACTATTGACACCCCACTGGGGAACTCACACCCCTAACCGTGTGGAGTTAACTTCTCTCAGCTGACACCTAAGCTCACTGCGCTATCC--------------------TTCTCTTCTAATAGACAGATAGTGAATTCTAAAAGAATATCTTCCTT---TTATTTTTCACAAAGTTTCTCTCCCAGGAGGGGTTTCACAGCTCAACTGAAGTTTTTATTTTATTTTCAGAGTAGGAACTTGGATTCTCTTCTCTCCTAAGAAT--TGTACACATTTCTAAAGGAATTTTTGTTTTTTCTTGATGGTTCTTTCACAAAATACCAGTGACTGAAAC------CTTGAGCAATATCTCCTACTGGCTC----------------------ACCCTCAACAATAACA-AAAAGTGTTTAGCTTTTGAGTGTTTCATTCTTAAACAAGAGAGACTAAGTCATTCCTA------GTAACCTGGGCACTGAGTTGAAGTCCCTGAGCAGGTTTTTCAGGGATGCTGGAACTTGAGGCCATTGTGGGGTTGTGTCATAGCCATTTAGAAAGTGATGCTTCCAATGGCATCCTGGGGTGCTCCAGTCGTTTTCCTGGAAGCTTGAGCT---GAGCCGGCGATGATGAGCCACCTGCTATGGACATATTAGCTCCCCATGACTCTGCTGGGGTTTAAGAGGCAAACATCTGATTCATCATTAAAGCAC-AGCCTATACCATTTCCTCTTTGCTAAGCATGGCTGGATTTGTGTGGAGCAAACACCTTGGTTTCTTGGTTCCTTGGATTCTTTCCCTTCTAGGAGCAACAGAAAG--AGCTATCACAGCACACACACTCCCTTGATCTCCACATAAATCATTCTTT-TTCGAATTCTGAAGGGTGGTTGCTAATGGGCCATCTTTTCCCTCATTTCTCTCTCATGAATTTTCACCAAATACAAGTAGATGTACTCTACGT---GTAAAGTACAGTCTCCTGAGCTTCCT-TCCATCCAGAAAAGGCAAGGAGA-AGAACCTCTCAAGTGTGTTAGGTGTGGAAGCTGCTCTGGGTTCTTGTCCAAG-AAAGAGACATGTATTTCAAACCCAAGAGCCATGTTCGAGCAATTAATCCTATTAGCCTTGAAAGGTAAG------AAACTCTGCAGCTTCCTGTAACCTTCATTGGAGGGATTCACTGATGAATTAACATGGCCTGTCACTT s bosTau2.scaffold5216 30363 2438 - 56257 GCATTGGGTAGATACAGGCTGTTTTATGCAGGATCTGTCATCGATTTGCCATTGATGTTCCTGTGTTGATTTTTGTTGTTGTTGGTAAAGGTTGTGGGGCTGGGAGTGTGGAGCAGAAGGCTGTGCATGTGGTTAAAAGCAGTAACATATGTGACCACCGCTCATCTCTGTTTGGAACTTTCCAGAGGCAGTAAGGAGGGTGAAGGGGACAGACTTACAGGCT--TTGAAGCCT--------CTTCAACTTCTTCAGAATGAGGTTGGAAATGGGAATCT--CTGTTTCCCAGGTGGTGCTTTAAAGTCACAGCTGTTCTTCATTTAAAGAAATCCAAAGTCTTTCACTGTGAATGATCAATTTGAAGGTAACTCCATTATCTGCATTTGCCGGTTCAATATGGTGCTCTTAGATGTAATAACCCATCATCTCAGCTTTCTGAAGCAATGCATGGCTTCCCAGGCTGGGTCTTCATCCAAAGAAGTGAGTGG----------AGAC---------------------ATTCAAAAG-CCTCTTCCAAATCAATACACAGAATACGAGTGAT--CAGAGGGAATGACAGAGCCCCAAACCCTGCCACCTCTTCTTGTGTCACTTTTCATCCCCCTAGGCCTGCAAATGTTCATATGAGTCTCACCATCTCAAAGATGTTTTTCCCATGCCAGTTGAATTGCCATG-AAATTCATCAGA--CAGATATTGCATTGTTTTTTCAAGTTTATAATGTCTTGGTAGCCAAGTCCATGCAGCTACCCTGCATATGATGGCCCAAACAAGTTCTTTTGGGTAT--TCTTATTTA----------GCAACAGTCCTCAGGGAGCTA-----TTCTAAGA--ACATAGGGGATAGAGG-------TACAGGGCCT----------GTCTGGCACCTTCATCTCATTTTCA-----GTGACCCACTCTGCTCATTGCTCCTGTTCGACTCACTC---------------------------------TGTATCCACAGCC-----------CTGGGCTG----TGCTT-------------------TACCTGCCCACCT---------------TCCCAGTTCTGCCCATTCAGATTTTCTGGGCAGCATCCCCTGCTAGTCCAAGGGCATTGCACAGAGAAGTTACTCAAAAAACGTGTAGGATTGAATTATGAGAATT----GAGTACATTTAGGAACAAAAGTCCAATATGCAGAAACTCTGAACTGAGCTGTTTTCAATCC-TATTTATCTAAAATTGAGGTTGAAAACTC--TTTGAATCTGTTTGTATAGTCAGCCTTTCACTTTCTTTAATGACTCTTAGCCACTGACTTTATCCTCCAGCATTTTACAGTACTCACCAGCAAAAAGTGGGAGAATGACAACCTTCATTCTGGCTGTGAGGATTATGGGTAATAGATAGAGAGTGAAATGCATGCGACCCTCATTATATTATCTGGAATCTGAAATAAAGGTTAGAATTATCTATCTAC---------CAATCCACTGAACGTG-------------CCTCAGCTAATATCAGACTTCCTTGTACTAGTCCCTAGGTTATCATATTTTTATTTTCTTGTAATACATAAATAGTAAACACTGAAAGAATATCTTTTATAACATTTTTTTTATAACTTTTCTCTCCTGAGAGAGATTTCACAGCTTTACCAAAG-TTTTGCTTTATTTTCTTTCAAGGGGCCCAGATTCTGTTTTCTTCTGAGAATGACACACACATTTTGAACAGAGT-----CATTTTCTTGATGCTTTTCTCACAAAGTACCATTGAGTAAAATGTGTTACTTGAA----GTCTCCCAATAGACCAAAAAAAAAAAAAAACAAACAAACCTAAAATAAACACACAAAAATATTTTGCTTTTGAACTTGTCCTTGTTGAACAGGAGAGATTGAATCATTACAATGACATGAAATCTGAG---TGAGCTGGAGATCCCAGGCAGGTTT--------CGCTTAATCTTGAGTCCACTGTGGCTTTGTTCAGTAGATATTTACAGGATGGTACCACGGAGCCTACCATGTTGGTGACCTGGCATTTTTCTGCTGTCCTGAATCAGAGAGTAAACAAAGGTGAGTCACTTGT----------------------------------------GAAGCAAACATCTGATTAATCACTAAAACACTAGACTACAGCACTTCTTTATTGCT-----------GCTCTGTGTAGATAAGAT---------------CTCCATGAATCATTTCTTCTCTCAAAGCAAGAGAGAGTTAGCAGTCATAGCACATATACTTTTATGATCTCCAGGTAATGCTTCCTTCAATCTGCCTCTCAGCAATCGTTAGTAAAAGGGTCAGTGGCGTGTGCTTGTTTTCATATGAGTTTTTATTAAATGCTCATAGACCTACTGCATATCTACTAAGGTGCTCTCTCCTGAATTGCTTCTTCAGGGAAAAATAGCATAGAGATGGAAACTTTGGAGAATG-TATATGTAGAATCTCTTCATTGCACTTGATGGAGAAAAAAAATATTAGATTTTGACCCTAGAGCCCAGTCCCATCAACTAATCCTGGCAGCACAAAGAGGTGGGTTGAGAAGGATCTGATGCTTAATATTGACTCAGTACAGAGAATACTACAATGAATTGGGATTGACTGTCACTT a score=6357 s mm7.chrY_random 25550840 509 + 30114534 TCTCCTAGGCTTCTGAAAATGACCAGCTCTCTTCAACTTACAGAGCTCTAAATCTTAGAAATCTTCTCCCACGTCTTCAAAATGGCTGTGTTTTCAAGATGAAGGTGCAACACTACTGTTTTGACTAGAAACATTTACTTACACTAGAAAGCAGGTGGTTTGGTCTAGTCCTAGGAGTGCAGATGAGCCTAATGCCATGGTTTCATTTCTTCTATGTAG---------TAGGGCTCCAAGCCAGATTTCTAAATGTCCAAAAGG---------------------------------GGCTTTCTCT-----------------TGCTCTAGTCCAGGACCAGTTAGCGAAGATTTCCTTCAGTTGCAT-GCATTCTCCTTCCTTTGTGTGTG---CCCAG---GGCAGGAGACTTGTGC--CCTCCTCTGCATCAGCACCATTCTGCCCTCCAGAATGATGGTGGTGTTAGTGCCCAGAATCTCAGCCTGAGCTTTGTTCGTGCTTTTTATCTTCACTCAAAGGAT-TGGCTTAAAATTATTCTTAGAATTGAATGATTTCCCCTTGTTACAGGAAG s bosTau2.scaffold5216 33361 537 - 56257 TCTCTTAGACTTGCAAACCTAGCCAGTTGTGGTCAAGTTCACAAGCTTTGGCCCCTGGAAAATTTCCTC-------TTGAAATGGTTGTAAC--CAAGATGG-GATGTGACTGTAATTCTTTGGCTTCAAACTCTCA-----GATAGAAACTAATTCATTCAGTCTTATCCCACCAGCCTGGACAGGCTGAA----------------CTTCTGAATGAAATGAACCCTGGTGCCCCAAACCAAGTTTTTTAACTCTTAAAATTAAATTTAAATCCGTTTCAAGTTATAAAGACATTGTCTTTCTCTGACCGCCTTTGTATCCATGCCCCAACATAGGGTCAATCAGTGAAGACCGTCT-CACTTGCCTTGCGTTCTCACTTTGCTGTGTCTGGGTCCCTGTCAGCCAGGGCACTTTTCCTGCCAACCAGGCTTCAGCACCAGTCTGCTCTCAAGAAAGGATGTGCTGTTAGTCATTTACATCTCAGCTTGAGTTTCACT-----GTTTTTCTTTCTCTCGGAAAATAAAGTCTGAAATTTCTGTAAGGAATGAAAGA----CCCTTATTACAGGAAG a score=15295 s mm7.chrY_random 25551729 542 + 30114534 TTTTCTTCTCTCACAGGGATCTGGAAAGTACATATAGGTGGGGGGTAGCAAGCATATACCTGTTTTTCTCTCCGTTTGTCTTCAC----AGTTGACTTCTAAACAG--GACAAGCATTGTCTGACATCATGACATTTCTCGCCAAGACCTTCTCTGACTTTCCT-GTGTCTCATATCGTTGCTATCTCACATAGA-CTAAAGGCATCACTTGGATGACAGTCTCTCATACTTTGTCTGAAGTCCAGAGAGAAGAGCCTGGAGTCAGGTAGAGGCTGAGAGCTAATGACCTCTTTTGAATATACAAGATGCCCTGCAGTCCCCAAGAAAAATAAGCTGTCTGTGACAGCAAATGGGAGTCTGCTTCTTTCCCTGCTGGCAGGTGAGAGTGGATGTGGGCAGGAAGAAAGATAATAACTCTGAAAGGCTG-AAGGAGCTCATTCCAG-AAAGCAAAGC-CTCTTTAATGATGCCAAGAATGTGCCGACCTGAAATCCATACTAATTCCTGAAGACAATAACAACCCCACGATTGTCGCTGAGACAAAACCAGTTT s bosTau2.scaffold5216 33939 518 - 56257 TTTCTCTCTCTAGCAAGACTCT---AAAGATACATAGATTCGGGGGAATGAGCAGCCACATGTATCCCTATCTATCACTCTGCACCGCTGGCTGGCTTGCAAACAGAGGACAAGCATTCT---GCATCCCAGGATCTCTCTCCAAAGCTTTCTCTTACTCTCCCCGCCTCTCGCTTTCCTGACATTTCCCATAAAACTGAGGGGTTCGTTTTGATGACAGTTTTTGAAACTTTGCCAGAAGTATGGGAAGGAGAGCCAAGAGTCAGGCAGTGGCTGAGGGCTAATGAACCTCTTTCTGCACAC-AGGCACCCTGCCATCCCCGGGGGAAATGAGCTGGCTGCAGAGGCAAGTTAGGTCCTTCCTCTTGGCTTGGCGGCAGCT---------------TAAGAAAAAAGATAATAACTTTGGAAAGCTGAAAGGAGCACATCCAAGAAAAGCAAATCTTTCTTAAATAATGCCAAGAAC-------------ACTCACATTAATCTCAGAAGGTAATAATAGGTAGAGAAGTGTCACTCATGTAAAATGAATTT a score=5532 s mm7.chrY_random 25552327 660 + 30114534 CTTGCTTCACTC--------AAAGACTCAGTTCAAGTGCAGGGAAGGGTTCTCAGAATG-TTCAGGAACATATCGAGGCCAGGAAGCATGGAAGCAGGACAGGATGAAGGTCGGTCATGGGGTTGGAAACGGGGGAAAGGGCACCAGAGAAGGGAACAAAGGAGCCAAGTATTGAAGAGAAATTGAACATGGTAGGAGGAACTTGTCAAAATAAAATTCTAAAATtctctctctctctctctctctctccctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaAAATGTATGTGTGAGAGAGAACATATGCTAAAACTCACAAAAATCAGCATTGTATTTACCTGTTT-AATCTGCAGCCACTAGGATGGCAAAAACTTTCAAGAGGGAATGTGGGTGTGGTGATGTTGGATAGTCTG---AAGCAAAAGGGCCACTGAGAGCAGATAGCTAAGGCTGATACAGAGCGGGTGAACTCC--CAGGGTGAT-AAAGTGTAGC------TTTAAGATTCGTTCCTAACAGCATCTCT---TTGTCAGA-------------CTGCAAGCTCACCATTAACTTTAACAGAGTAGAAAGTACCTAGACCCCAATCAATAGTAAATAATAT----ATCAGAGTCAGATCCCCCTTAAGGAGGGGT s bosTau2.scaffold5216 35174 546 - 56257 CTTGTTTTACCCCTAACCTAAGAGAATTAGTGCTGGTGGAAA-AAGGGTTCGCAGGGTGCTTCAGGGGCAGAGAGAGG------GGCCAGTAACCAGGATAAG-----------------------------GAAAAACTGC-CCAGAGAGTGGGGCAACATAGATAAGTATGAAAATATGATTAGAAGAGGCTAGATAAGCTTGTCAAAAAGCATTTCTCAA------------------------------------------------------TATGAGGGGTGGAAAGAGAGAG----------------------------Aatgt------------------------------------atcagagttttatttaacttttcaaagagggaaccagcaagatgagaaaatcagtacaaaagaaaaatgagaactgggattttatataacttgtgaaataaaaaggaatgctgaaaagagatagataaattagatgcaaagccagataattcctgcatggcaatgaaactataacataatttttcagtttcttttctacCAGCCTCTCTACCTTATCAGAAAACTAATGTTTTTTATATGTTAACCTTTATCCTTTGTAGAATACAAAATACTCTG-TCCAAATCAATAGTAACCAGTATGAAAAACACAGCCAAATCCTCCTAGAGCAAAGGT a score=19056 s mm7.chrY_random 25553371 766 + 30114534 GAAGAGAGCCACCATCATTCC-----------TAAGTGT--CTGCCTGGAATGCCAGGGCAGGACACGGAGGCAGAACTGATTCTGACTGGCTGGGTAGGTTGAGAGGACTGGGTTAATCTT-CTCCGCCTTAGTTGTCCTAAT--AGGAATAGGGAGAGTGTT---TCCACCTGCAGGAGCAGTCCTGATTGATGGAGACAATCCATTCCCTAGTTCTCATCAAATGGTGGCTCTCAACTCCAAAATAACCCTTACCATTTAGAATCAATCAAAGCCAAACTGAAGTCCCAGGGTTCCAGACGAACCCACATAGTTGGTTGGAAAGGGTCTATGATGAGACCCAGAAG----CATGCTGAGTAGTCTTGATCAGCCCCTTACCAGCTGAGGTCTGCAGCCCTTGAAGCTTGGTTCGGAAACCC-CTCAGTCTTTTCCTCCATCTCCAGGTGGACTTAGGTTCCTGCAGTTCCTATTAAGAATCTCCT--CACCCTTATCCTA------GTGGCAATTAATAAACAAGAAGAGTTCTGGGGACAACTGCCTTGTAAACTAGGACACAGGGAATGTACTTAGGGGAA-GCTGCTGGAGTGAGCAGCCTCATCTGCATTTCAACAATGGATGTGCTAATTAACAAGGATCCTTACCTATTCATTAAAGTGCTAAGA--TTCTCCAAGAAGCATCGCAGTTCTATTCACTGGTGCCCAGGTCAGCATTGCCCAGTGCTCACTCAGAGCAACTATCTCAGATGCTAGCTATTATTGG-------------------ACTTTTCTCCTAATTGGAACAAGTTATC s bosTau2.scaffold5216 37567 798 - 56257 GAAAAAATCAGCTATCATTTTACCTGTAGTTATAAGTGTACCTGAGTAATACACCTGGGCAAGGAAGAGAGCCAGACCTGTTCTAATCCCAAtgagtgacctgtgaatgttgagtgaatcttactaaacctcagttttcctgcttcaaaaataaggataatattgggcccaccagaggttgctgtgacagttaaaagaagcaatgcatgtCCTAATACTCAACAAATGATAGGTCTTAATGATAAAATCATTATTGATATTCTTTATTAATCAAAGCCAAAGGGATGTCCTAGGGCTACAGTTGAATC------ATTTGTTGAAAAGGATAGGGGCTGGGCTCATGAAGGAGGAATGGAAAGTCCTATTGCTCCCTTCCTTGCTATTTAAGGTCTATGGTGTTTGAGGCTTTGTCCTAAGACCAACTCAGTCTCTCCCTTCAATACC-------CCT---TTCCTGGAATTCCTATAAAGAATCTCTTTACACCCCCTCCCCACCCTTTTTAGCAATTCATAAGCAA-CAGCGCTCTGGGGACAATAACTTTATAAACAAG--CACAGTGAGTATACTTTGAGCAACGCTGCTGGATT-AGCAGCTGTATTTGCATTCAGACAATGGATGTGCTAATTAAAAATGATTCCAACCCATTTGTTAAAGCCCGGAGAGATTCTGTTAGAAATATAGCAGCCATTTTTGCTCCTGGCCCTGTCAACAGTGTCCTGCACTTACTCAAAGCCACTCTTTAAAA--CTACATATTATTAgtttgtttgtttgtctgtttgtttgtttgGTAATTGGGACCAGTTATC a score=5098 s mm7.chrY_random 25554137 261 + 30114534 TCCTTCAGAGCAAGGGAATCCAT--CTTTCTACCCAGC-TCCTAGCAACATCAACCAAGCTCCATAGTTCCAAGAAGCAGTCTCTGTCTTGCTCTGTTTGCAAGAGAGGCAGGGAGAGGTCACTATAATCTGGAATATTCCCACCTGTCCCTATCCCAGCAGCTCTAAAGGTGACTCACACTGCC--CAATAAGACAATAATAATACACAATGTTAA--TATTTACACTAGGCCAATTATGTATCTCTCTGTCGTTTCCAGACA-TAAT s bosTau2.scaffold5216 38466 230 - 56257 tccttcaaagcagaggagttcatgtctccccacccaacctcctggcaacctcacccccaccccatcttttcaggGAACTACCTCTGTCTTG-------------------------AGGTTGATA------GTAATAT------CTG-CCCTCTGTTTACAGCTCTAATGCTTACTCAGA-TGCCTACAATGAAATATTAACAAAAAATGATGATGAAGTATTTGCTGCAGACCAGTTATGTATTTCTTTGAAATGTCTAAGTAGTAAT a score=3912 s mm7.chrY_random 25554398 311 + 30114534 ACCCAG-----------------------------------------------------------------------------------AGAATAATGATGCAGACAATATGAACTGCTCTCTGTCTCTGCCCAGAATCAGTCAAGAACCACTGTTTTGTGATCCTGAATA----ACAAATAGCATTACCATGTTTGATACATCAGCCTGTAGAGATGCTGAACAA--GAGTGGAGTTAGGGCAGATCTGAAGGCTAAGCCAAGTGGAAACTTAGGCTTAGCCTAAGAAGTTGGCTTC---------------------------AGGAACCTGCTGGCTTATTTTGCAATGTCTCCTGGCATTTGGAAAGTACCTGGGCACAAGGCTTTGGTCTTCCAAAGAGGGAAGGGATGGAGGtattgatgc s bosTau2.scaffold5216 38827 416 - 56257 acccagggattgaactgtcatctcctgtgtctcctgcatcggcaggtgggttctttacaactagtgccacctgggaagcccCCACTGTTAGACTAATGATACAAATGCCACACAGGGCTGTCCATCTTTGCCTGGGTTCAAACCAAAG--GCTGCCTAGTGATCCAGGGCAGAGGACCAGCCCCAGTGCTGAGTCC---ATATCAGACTGCAGA--CTCTGAGCCACAGAGTGGCCCTAAGGCAGTTCT-AAGGATGAGCCCACCAGAGAAT---GGTCAGCCTGGGCCACCAGCCTCCTATTCATCTACCACACTTGACCACTCAGGAGTGTGCTGGCTTGTTTTGAAATGGCTCCTTGTATTTGGAGAATAGCTGGGCACATAGCCTTGCTATCTAGGAGCGAGGGGAGGTGGAGAGGGTGAGGC a score=6775 s mm7.chrY_random 25555680 827 + 30114534 ctttatga---taagTTGTAAATAAACTCTGTATCCATGACATATAAATCAGTAGTAGCAGTCATTTGTGTACCCTTGTGACAGCCATGTGAATTTCTGTGCCGTGCCATCATGT------TTACACTCATGGTAGCTTTAGGCACACCTTGATAAGGTCTCTAGAACTCTGGGCAGCTCCTTTGGTGAGTGA--------------------CCCTCTTCCAGTCCCACAGTCTTCCCTGACCCCTT--------CCTGAGATATCTCTCAAGGCCC---TTCAAGG-----AGCCCTG-CCTGTGGGATGGCTTCAGGCACATCTAAGGATTTAGGATAGAAGAGGAAAGCCAGGGGTGGGCTTGACTTGTGTTTGATGGGAATAAAGTGTCCCAC-----CCCATTGTAACTGCCTGCCGTGTGAGAGAGAATTGAAGAGAGATGTCACTTTGTCCTTTTCCTACATTACCATCACTGTCACTGTGGCCTCCAGGTAAACAGGTGTCTTTTCAAGGCTGTATATC---TAAAAAGTCATCCTTATAGCACATCTATCTGGCCTTATCTGGCCTCCTGCTAGTTGGCAGATAACTGAAAGATGAGGGACGCCACCAGCATCTT--------CTGTTGC--------TCTGATCTGATTGCTGTAATCAGGGACAGAAGGAGGAAGAGGCCTTGCTCCACAG--------ATGAAGTCAAGAACTGGATGTCTGGGGTCGAGCTATCTGTTTCTCACTGAGTTATCAGAAGCCCAGATAAACAACTGTGTG-ATTCAAGATGTTTCAGGGAAAGGAA--GCCTTGCTGTTATTCAGTTGTATGTAAATAAGAGATTTGCATTTCTCAGAAAGAATTTTTTTTCCTGAAGAAGATGTACCATATGTGC s bosTau2.scaffold5216 39464 824 - 56257 CTTTATGCCCTTTAATTGTACGGAAACTTTATAGCCTTTGTA-----GTCAATGGTACCCACCACAGTGCCATCTTTGTAACAAC-ATGTAAACTTCATTTTCACGTCATCCTATGTGTGATTGCCCCCACATCAGCC-------CACCCTGCCCAGTGTTCTAGCACTTTGGATGGTGCTGTTGAGGGAAGAGGATTTCTGCCTGCTTTGCATCCTCCCCGAGTCCCCCACCATCCCCCAGCCCCTTGGGCATCTCCTGAGAT-TCTGTGAGGGTCCACTTTCAAAGCAAGCAGCCATGGCCTGCGTTATAGCTCCAGGTG--TTTAGTGTTTTAACATGGATGGGGTGAATCTGGAGTGG------CCCATGGTTGGGAGGAATCAAGTA-CATACAGTTACCCCTTTTAACTTTCTTC--TGCAAGAGAGTCTTGAAGAGAGACTTTGCTTTCTCACCCACTTCCCCTTGCATGTCTTCC-------TCTCCATCTTCACATTTACCTTTGCTAGGCTGCACCTCAGGTTGGAGGCTGCCC--ACTGCACA-----------------GGTGTACTGCTTATGGACAGATGCTCTTCAG-----------CATGGGCATCTCTTTAAACCCTGTTACATACTCACTCTGA---GGTGTCTGAGGTTATATACA---------------CCTGGTCCCCAGCAATCCTGGTGAGGTCCAGAG-TGAGTTAGTAAGGAGAGGCCACACACCTCTCACTGTGTTATCAGAAGAACACCTAAGCTAACATGTATGTCTGAGGTATTTTACAGAAAGAAGTGGCTTCACT---ACCCAATTGTGTGTGGACATAAGACCTACCCATCTTAGAATGGCATTTTTTATTTCAAAATGGCACCTCTTATTTTC a score=3028 s mm7.chrY_random 25556862 361 + 30114534 AGAAGATGGCATGCACACAGTCACTCCACTATCCTACCTTCAGCAAACCTGAGAAGTCCAGGTCACCCTGCCCCAGAGCCTGGCTGCCAGGTTGGATGGTACCACTTTTCCTATGTCTCCCAAAAACAAAAATGGAAGTCAGAGACAGCACATGGAGCAGGAAGAAGC---CCCAGTTTCAGGGCTATTGCACAGCGAAGTCACCCTCCACTCCCCTGCCTTGCCTCACAGAGTGCCTACTGTATGCCTCTCCCATGCTTCTGCTCAGACACCTCCTCCAGGCAGTCTCTTCTACCTTAGCCTGTGCTGGGTGTCCCAGGAATATGTCAACTCAACAGTGAGACTTAGGTAATAGTTGCTACTT s bosTau2.scaffold5216 40553 270 - 56257 aggaaatggca-------agccactccagtattcttgcctggggaatcccaggaa---caggggagcct-----agag---ggctac-------------------------------------------------agtccatggggtcacatagagtcggacacaactgactgactTTCA---CTTTCACACA-------------------TCCCACCAGTGCTCATGGAGTACCAGTTGTGTGTTCCTCC-----TGCTGCTTGGACACCTCCTCCAGGAAGCCTTCCAGGCCTCAAGCTAGGCTGGGAGCCTTGAGTATGTGGCTCTTTAGCACAGAGATTTTTATTAGTGTTGTCACTT a score=61102 s mm7.chrY_random 25557385 2495 + 30114534 CACTTGACTCATTAACCCATCATCATCC--TCATGCAAGG-----AGAAGCAGAGAGGATCACTGTgctggggctg-----gggctggggttggggctgCTTGCAGGTGTGAGACCCTAGCTGA--CTCTATCACACTTCCTCAGCATG------------GTACCCAGAGAATGAGGGTTAGGAACTGGGATATTTGAGACCCTGGTTGTATCGTGCAGAGCCCAGAGGACTGAGATT-----------------------------------TGAACATAACCAGGGTCACTCTGGAGGCTCAGACTTCTCCATTTAAGCTGGTAAACCCAGAGCTGAGCTGATCAGCCTCAACAACTTAATACTTAGGAGGAAAGGATGTATTTCCAGATTACATGGCGGAAAGGCAGTCCTGT---ATGAGTTCTGACAGCCCATTAGCCAACAGCAAGGGGTTAAGTGTGAAGTGCCCTGGCAAGAGTGTCTCCCCTTGTTATGGCATGCGCCAGGCTGATGCTGAGGGAAGCTGTTCATGTCACATCC-----GGGTTAAGCTGTCTTTGATCCCCCTTCAGAGCTGACAGCTGGCAGAATGTGCCTGCTGGGCAGGCTGGGACTTTTCCTGCTCTCTGTGTCAGAGGTGGCCAGCTGATAGGTCTTCTTTGCCTGGAATT-TGTGAAACCTGGCTCTGAGGTCTATCATAATATCTGAGGGATGTAACCTATTTCCTAT-ATCTCTCTTTGGAGAA-CTTTCTGGAAGCTGCATGGATTTAGGGAACAG----------------------------AACAGTTAGAATCCTGG---------------AG---GTGGCTAAATGGATGGTAACATTGAGGGAAAAGACTATGAAGCATTCTTTTTGGAAGAATTACTCAT---TTAGAATTTTTTTCATGAAAAAATTGCCTCAAATA-TCTCCCTCACTGTGATCGTAGTATTTAAAGATCAGTCCCTTGATGAATATAAAA-----------ATCACAAGGCATTATCAAAGCAAAATTGGCCAGA-TACCTTTCAGCCATGGGAGTGTGATGTGCAACCATGACCCTTTCTTTGTGGGTCATGTCTTGCTTCTTTGAATCTCTGTACAGAGCTGGAAGGGACCCAGAAGCTTTTTCAAGATTTCATATTACTCTTGTTCTCAACCCTGGCAGGTCCTTATCATCACTAGGGAGCGTCTACAGAAGT-CTGTTCT-------CTGTTGTCCATCC---------------------------------------------AGGGTGGGATAACAGCCAGGGTGGTTTTGAATTAAtgctgccgccaccgctgctgctgctgctgctgctgctgctgctgTGTCCTGGGAATAAAAGGCTGATT--GTTCAGCTGCTTGTTTTGTAGATGAGGATACAGTGGAGGCCTGAGAACAGCAGGGTTTCTGTATGGTACACGCCAAGGTATGGGGACCACAGG-----GACAGATGGAGGCCATTGTCCAGCA--------CTCTCTTGAGCAGATTTAGTATCCAGTTCTCTTCTGATATCCAGACATCCACACCAAG----------------AGTAAAGTGT-------------CTACTGTCCTGCCCGCCCACCATC-------------TCTGCCCAGTAAACTATAGTCTGG-------------AGTAGGCGGTGGTACTTGACTTGCTGACATTTGTGGTCGCATGAAGAAGCTAGCTTTGGCCTTCTCTTTAGGCTCTGGGCTTAGAGC----GGACTGCAGTTAAGTCTTCTTACCTCTGCAGTTT--GATTGACAAAATCAAAACAGAAAAAATA-----------AATAAATAAAAGCTGTCTGAGTGAGTGAAGAAAAACACTTGAAGAGCTTATGCGC-AGGCTTAAGCTTCAGCCATGTATGTCATATAATGAGATCATTTCTATGCCTAACTAGCTCATCTGCCCTACATTTTAATTGAGTCAGCACAAAAAAAAATAATTTTGATAGCTAGCCAAGGCTTCACTGATGCTAAACATTATGTGTATTCACATTAAGAAAAGAAAAAGAGGAGGAAATGGGGCTTTTGATTCTCTTCCTAATTCACAATAAGCCATCTACGGTGTTAATTGTTTATAATAATCTAACAGCATAATTACTCCCATGTAAGCTTCCA-GAACAGCAGAATCACAGAAGAGTCTCAAATCTTTTGAG--GTGTGTGAAAGGAAGGCTGGCTCCACCTCTGGTCAGATGGATGAGCGCTGTTACAGTGC---ATAGCCTCAGACACT----AGCCTTGCCTTTCAAGGGGGACAATATCTTATGTTGCTGAGTTATGAGAGAGGAAGCACAAT-GTTTCATCTCTAATTACATCTT-------CTTGGCCAAACCCTAACTAACTCTAAGGGAGGGATGGCCGTGGATGCTAGCTGCCCTC-AGCTCCTGTGGGCACTGAA--TCCA--CATCCTCCTCTCTCCTGATTGCCTCCCTGCCACCCTGTCCT------GGAAATATGCCCGGGGTTTTAGAAATGCGT---GTTGGAAATTAGCTTATGAGGATTTATCTCCTTCCTCAATCCTTCCTTCCTGCTTTTCATTTCCTTCTTCCTTCAATTACTCATTCACCAT-ACATAAGGACCACATCCTTTTCTCTACC------------ATAAGCCCGAGGATAGCCTCTGTCTTCCTGGTTTTGGCATCCTGGTGGGCAGG-TCAGTGTGAGCATGGGATGCAAGCAGATGACGAA s bosTau2.scaffold5216 40825 2656 - 56257 CATTTGCCTAGTTGTCCCAGGATGGTCCCTTCATGTGAGGGAGGCAGGCACAGACAGGGACGCGGAGCCTGAGCAGTGAAGAGGCAGCAGGAGATGCTGCTTGCAGGGGTCATAGCTCACCTGAGATTCGATGGT-CCACCTCATCCTGTCCTTTCTTCACGTGCCTTTAGGATGAGATTCTGGGAAGGGGATATTTGGGACTCAGACTGTCTTACTCAGGACACAGAGGACTGTGGTTCAGGGACATCTAGGTGCCATCATTTCCAGCCCAGCTAAGGATCACCAGGGT-GCTCTGGGGGATCAGACTTCTCCATCTGAGCTGTTAAATCCAGTGCTGAGCCAACTAGTCTTGTCAACCTAATACGGAGGAAAGTATGATGCGTTTCTGGATTGCATGGCAGAAATGCAGGCTTTTTTAATGGATTCTGACAGTCCATTAGCCGATAGCGAGGGGTGAAGTATGAAGTGCCCTCGAGAGAATGTCTCTTCCTGTTACAGCATGAGCTGGGCTGATGCTGAGGGGGCCTGCTCTCACCACACCCACATGGGGCTAAGATGTCTTTGATCCTCCAGCAGACCAA-----------------------GGGCAGGCTAGGGCTCCCCATGCTGTGTGT-TAGGAGGTGGCCCATCAGTGGGTCTCCTCTGCTGAGTATTCTGTGAAGCCTGGGTCCTTGGTCTCTCACAGCATCAAGGAGACATGGCCAACCCCATACCACCTCCCCTTGGAAAAACTTCCCAGAAGTTTCCTGGCTTTAGGAAGCAGTGAGAGCTCCTGGAAGGGGCTCTGGGCTGAAAGTCCACAGCCTGGCTGGACTCTGGCCCCAGTTTGTGGCTGAATAGTTGGTGACCTTGAGAGA---GACTCTGGATTGTCCTTTTGAGGAGGATTTTTCATCTATTAAAAATTGTCACCTATAAAA--TGGTGAAAATAGCCTATCTTGCTGTAATATTAGTATTTAAAGATGATTCCCTTAATGAATATGAAAGCACTTAGAAAAGCATAAGCCAATATCAAAAGTAAGGCATTAAGAATGCCTTTTGGCCATGGAAATG--ATTCGAGACTGTGACCCTTTCTT---GGATCATGTGTTGCATATTTGAACCTCTGCACAGAGCTGGAAGGTACTCAGAATATTATTTTAGATT-AATGTTATTCTAGTTCCCAACCCTGGCAGCTCTT-----------GGGAGCTTTTTAAAAAGTACCATTCTTCTACCACCACCTCCCATCCCATCACTCCAACCCTCCAACTCTCACATTTGGTCCTATTAGTCTGGAGGTGGGATAACAGCATGAGTGGTTTTTAAAT---------GCCACAGATGTTG----------------------TGCACCTGGAGAGGGAAAGCCTGGCTTGGTTCAGCCCCTGGTTTTGGAGGTACTGATGCAGTGAA--TCTGGGAGCGGTGGGACCCCC------TACAC----AGGTA-------CACAGGAGGCAGTCACCAGGAGGCCAAAAAATAGAAAATACAAGCCCTCCCAGGCAGGCCAGAAACCAAACCCTCT---GACATCCGGGCATCTACACCTAGCAGCAGAAATCCTGCCAATCAAATGTATCATCTTCAAGTCTACAGTC--ACCCTACCACCACCCACTTCAACAACATCTGCC--ACAAATATTGCTCTGGGAATTACTGCCAAAGCAGGAGATGGTGGTTTATTTGCTGGTGTTTGTGG------GTAAAAGCCTG--TTGTCCTGTTCTCC---CCCTGGACTCAGCTCTTCAGGGCAGGGGCTGAATGTCCTCATCTCTGCATCCCCCAGCAGAGGAAATCAAACCAGAAAAAATATTTGGTGGGCGAGTGAGTGAGAGAT---TAAGTGGATGAATAAAAGCATCTGAAGTGCTCAAAAACGAGGTTTAAATTTAAACCTTGAACATCATATAATGAAACCATTTCCACACTCAACTAGCTCTTCTGTCCTAAATTTTAATTAAGTCAGCATAAAAA----TCATTTTGATAGTTAGCCAGGGATGCACTGATGCTAAACATTATGTGTACTCATATTAAGAAAAGCAAAGGAAAAAGAAATGGTGTTTTTGATTCCCTGCCTAACTTGCAATAAACCATTTATGGTGTTAATTGTTTGTAATAACTTAATGGCATAATTACTCCCATGTAGATTGCCAGGAATAATGAAAACACAGAAAGATCACAAATCTTCTGAATCAGGTTTAAAAAGAAGGCTAGCTTCACCTTTTATCAGTTGGGTGAGATTGGTCATCTTGCTTATTAACCTCTGACCCTCAGCAGCCTCATCTCT----------AATTATCTATCTTGCTGAATTAGGACAGTCAAGACATAATAGGCTTACTTTGGGTTAAATTCTAcagtcacttggccccatcctaacag----caagggaggcttagaaatgtGCAGTAAATGTCTACTACCACCTTTGGGCAGTACAGCTCCATGTATATTAGTTTTCCCTCATTGTGCTTCTGGAACACATTTATAATTTAGAAAGGAGGAACAGAGGGTGGGAAAACCACTAATCTGGAAATCA-------AGGCCTCA-CTCCTCCTATAACCCTTCC-------------CTTCTTTTTTCCTCCATTCCCtcattcttcagaaaatatttatctggcccttcaaggtaccaggcagctgtagatagagttgaaggcagcccctgccttcatggcactaatattctggcagagaggcttaagggaggcatgga--gcaagaaacagacaaa a score=4529 s mm7.chrY_random 25559929 430 + 30114534 ATAATAAAACTGGCTGATGTCAC----AGCTCCTAGGGAAAAGGAC---AGGCATTGGAGGATGAGGCAGGCCAAGAGGAGC-TCTCTAAGAAGATGGC---TGAA--GGAATCC-----------------TTCATACAGTCTTCCCTACTAAGAAGCGATAATGTGGTATCAAAGCTGAAGAAAA------TGGCATCCTGTCT------GTGAAGAGATCAACAACCACACCTACCCCTGCC----------------------------------CCCAATTAAAAAAG-----------------------GAGAATACAGCCAAAAGAACTCATCAGAACCAAACACTCCATGACTCTGGAATCAGACCGACAGCATATACACATAAAGGGCAAGTCATTGatgagcag-ctctctgtcaacaaatta--------cagtgctgatgaagtcgaacttttaggaagacacggatgctttgaactgataattcaaaagaaaaagaaaacttgaatagacgt-tggtgaacaaat s bosTau2.scaffold5216 44245 525 - 56257 ACATTACAATTGACTGATGTGATCATAAGTACCTGGAAAGAAAGAAGTGAGGCTTTTGAG-AGGagagtgaccaagaaatgcctctcagaggagttgtcatttgaacagaaacccaaaCATCTGACTAGTCATCCACACTAAATACTTCACTGAGAAATGAAGATATGGTATCAGAGCCAGAAAATAAGGGTGTGACTTTTGGACTGGTGGAGTGAGGAGCTTGGCAAATACCCTCACTCTTCTCAAAAAGGAGTATAAGaaaaataataataaaaagttttaatttaaaaagtaaaaatgattaaaaatgttaaagacaataaaactaaaaaaa-ttataaataaCAACCATTTCTGGACTCTAGAAATTGACCAAAGGCAAACA-----AAAGGCTGgggaactatcacgaagaatttatgtcaataagttagataacttcagtgatggaaaaatc-----tctaaaaagacacaaataattaaaacggac--tcaaaaagaaatataaaatcttaataaacctctagcaagcaaat a score=9620 s mm7.chrY_random 25570237 588 + 30114534 GTTAGCTAGTCTTCCTTGCTGTGTATAATAGCAGCATTTTAGCTTACTGTTAACTCTTCTCTGTGGTAGTGGACTCTCATGGTAGGGCTTACTGTTTCTTCTGTGCTGAAGTGTGC--------------ACGGCAAGCAGAGGTTCAGAAGTTGTTTTT---TAAACAAATGAATTTTTGGCTACAGAGTAGATGTGCTGTGACTAAGGCACATCTAGGACCTTTTGTTCCCGTCAGGAA---TAATTTGTCACTTTGTGATCTACATTTTGGGTACTTCACTTGTTTTAGCTTACCGTCTAATTGTCTTGGGTGCCATTCATCAACGGCCACCTTAAACCCAGACTCAAG-AACGGAAGAGAATTTCATGTCACAGGTCGTGATGAACTTTGTTCCTTACCATGCATAGCAAGCAACTGAGGAACATCAGCT---------TCCTGACCTCA-----------------CTGGGAATCGGGGAGTGGCTTCAGCTAATTATCACACATCCCAGGA------TGTGTAGACTGAGCCCTTCCTAGGCCATGCGCTTACTGTCCTCTGAGCTCTCAAGTGGAACATGAGCACTTGACATGTCTAACTTGCATGATACA---------------------------------------TTTGCCTTCACTTTGACTTAATG s bosTau2.scaffold1191 182579 665 + 271640 GTTAGCCTGCCCCTCTCACAGC--ACGATTGAGACATTTTGATTGACAATTGTCTCTTCTCCTC--TAGGAGAGT------GTTGACCTTGCCATCCCATCTGGGTCAGAGTACCCCCCCAACCCCCGCCACCTTAAGCAGAGGTTCAGTAGTAGTTTTTCAATAAATGAAAGAATTTCTGGCTAGATTGTGACTCCAGAGTTACCCAGCAACACTTAAGACCCATCACTGAGATGAGAAGCAGTAATTACCAAATTCATCAATTGGATTCTAGGCACTTCCATTGTTACAGCTTCCTATTTAATTGTCTTGTGTAAAATTCATCAGTAACCATTGTAAGTCAATACTGAGTCAGTGAGAGAGATTTCCATGTCATAGATCTTTATGAACTTCAT-ACTTGCATTTCGCATCAGGCAGCAGAGGAATGCCAGCTATGGGTCTTTCCTGCCTCTAACATCAATTAATTAACCCTAGGATCCAGCAGAAGTCACCAGC-AATGATC---CATCATGGAAGATCTGTACATAGTTAGAACCCTGCCTGACCAATGTACTTTCCATCCTTTTGGTCCAGAACTTGAATCAGATCAGTTGACATGTCTGATTTGCATTGCTCAGTGTGTTTTTTGCTTTTTTGTTTTAAAAAACtaattaattttggctgcactgtgtcttcatt a score=1310 s mm7.chrY_random 25570825 461 + 30114534 TCTTAAGT---TTTTATTGCTTTTCAACATTTAGAATAT------------------------------AGGAAA-----------------------------------------------TTTCACATCTACAAA------------------AAACAAACAAAACACCTCTGAAGATTTGC-----CAGTGTATACCT---------TTTGGCTA-CATCTCTTGAAGCTAAATCGTACCCTTTCTATTTCGAAGCCAGCACTGGTGTTGCTGTGATCATAGCCCTCTCCCCTCAGCTGGCATCTTTCACTCGACC-ACTTCACTTACT---GCTACCTGGTCCTGAATTAC--CCACCAGGAACTAA----------TACAGATAGAAGAATATTAGGTTTGCAAAGGTACACACATGGCC---CCATGAGTAGCCCTATGCAGGGCAAAGAATAGGTCCTCCAG-GAGTTATTTCTGAGTTTCATTCTGTGTTATATACCTGTACTTCATGGGTAGCAAAATGTGAAAGCACATATATGTTCTGGGAATGACTAAGAATTAATTTCATGGA-----------------------------------------------------------GTGTTG----------------------------------------------------------AGGTCACGTGTT s bosTau2.scaffold1191 183412 696 + 271640 TCTTAGGTCTTTTTTTTTTTTTTTTAAC-TTTACAATATTGTATTGGTTTTGCCATATATTGACCAGCAAGGAAGCCCCTGCTTGTTTGtttttaatttttttttttaaaaaatGATTGGTGTTTAATGTCTGAAAATCAGGAGATGTCTTATAAAAATCTGCAAAGCATCTGTAGATGTCAACATCTACAGTTGACATCTCAGTTTTTGTTTGACCAGAACCAATGGGAGCTAAAT-ACAGTCCAACCACTTTGGACCCAGTGTCAGCACTCCTATGGCCAA--------CCCTCCAGTAGTTATCCTTAACTCAGCCTGCCTCACTCACTTCTGTTACCCAGCCTTGTATTACTACCAGCAGGAGTTGAAATCCCTAATTGCAGATGGTTGAGGATTGAGGCTGGAGATGGACACACA-GGCCTCACCATGGGAAGCACCACAGGGAGCTACAAGTAGGGCCCCATGTAAGTTGTTTCTAGGGGTTGCTTTTTGTTACAGACATATAGGGCATGT----TAAAAGCTGAAACTACATATTTATCCTGGAAGTGAATAAGGACCACTGCCATAGGATTGTGAGAACGTGTCTTCAGTCTGAGAGTCCCCTACTCCAGGGAAGGTTGATTTCCATGTGTTGTCTAGAAACACCCCATCAATCATGAGAACTAACCAGGGTGACTGAACTAACAGGGGAAAGGACATGTGTT a score=26610 s mm7.chrY_random 25571286 1242 + 30114534 CACTGTGATTCTTATGTTCAGCCAATGGGGAGGATTTCG------AAGAAGCTTCGTCTTCTGAAGAGCAGTAATCGTGGGCTTAGAGTGTAGTCCAAGATCAAAAGCCCG--GGCTCTGCCTGTACCACCAGGGCAAAGGTTCACGACGGCTTTATATT-CAGCCCTTACCCTTCCCCCAACTCTGTGTTCTACCTGTCTGGCAATAACTC-GTGAATACACATGAAAAGGACAGGGATA----------------ATTACTGTGGAAAGCTTACAACCTA--TTGACACTGCTTTGGTAGTTTTAGGATATGGTTATGGTGTCATGATGGAGGTGGGGAGGAAAAAACCTTAGTGTAATTCCACTGGCCAGAGAGAACT----TTACCCAGCATGCCTTCAGGC-AGGTGGTCCAGATTTTATCATAAGTGAGAAATACACACAGCTGCAAAACAGACAGCCATCCTGCCTGTA--AGAACAAATACACATTTCAAGGTTGAATTGTCTTCTGGGTACTAAGCAGCTATTTCTGCAGGCCAGCTCTTAGCAGGGTCCATGCTGGGCCCAGAAGCAGACA-----TCTTCAATCAGAAC------CCCAGAACATGCTCTGACTTAGCCAAACAAA-ACATACTACAC-CCACCTCCAGAGATATTG-TGGGAGAGTATGGTGACTCTGTCTATCAAACACCCATCTGAAGGCCTGTGGTTTCCATGAAGTTTGTG--TCTCATAAAAATTTAAACACCTGCTAAGTGGAAACAACACCTTTTTGCTGTCTATGTGGCAAACACCTTCTGCAGGAATTTTCTCACTTCTCAGAGGCGACATATTTCA-CAGGCAATTCCCCTGGCACAGACACTGCTAAAACATAACAGAAGCCAGGTGAGAGGTTGGATGCCCTCCAGGAGCCCTGAGAGTGAACTCCGGGAGTTGTGGCAGGCACCTTCAGGGGTCTGAG-------GGGCTTCA-------GAAGCAAGGGGTTTGGTGGCTGGAAGTAGACGATCCTGAGTTTAAGGGTGATGGCTAGGCCGAGGCGACATGGTTTCCAAGGATGG------GACAAAAAGCCTGCCAAGGG----CCAGAGGGAACACTGCTCAGATGGAACAC--GAGACTGGGGAGAGCCTGTTGTGAGCTACAATAGAGACTAGTCAGTCCTGTGTTAAGAAGTAGCCACACATCGGGCATTTTTCTACACCAACTGGCTTCTCCAGGGCTTGTTAATCTTCAGTATCAATAGGACCCCTATAATAGAAATTAGGAATATACCACATGTCTACCACC----------------CTCA s bosTau2.scaffold1191 184240 1236 + 271640 cccagtgattcttataggcagtcatggtagagaatctctgATCCCAAGCAAGTTTATCTTCTTAAGGTCAGTAAGCATGGGACTGAAACACAGTCCTTGGTTGAAAGCTTGAGGGTTTTGCCTGCCCCACCAGACCAAAGACCCAAGATGGCTTGGTGTTACAGCC-------TTCTcctagcacagtgcctggcatat--ggtagatactcagtttatacatatggaaagaagaaaGAAAGGGAGGGAAACAAGGCATCATCATGGGAAGCTTATGATCCAGCTTTGCTCTGATTTTGTGGTTCTAGAATATGGTTGTCATGTCAGGTTTGAGG-AGGAAGGAGGAGACCCCGATATGACTACACTAGCTTGAGAGAACTGTGTTTACTCCTCATGCTCTCTCCCTGGGCAGTCTGGAGTCAAGCTTACGTGGGAAGGACATGTAGTTGAAAAAAGAGAATCCTTCATATTTACAGAAGAATAAATGCAAGTTTTAGAGATGAGCTGACTTCT------------------TCTGATACCCAGCTCC--ACGGGGACCATGCTGGATCCATGAGCACACGATGTTTCTTCCATGAGAAGAAGCAGCCTAGAACCACCT-----TTCCCCAAGCAAACACACAGCCCACACCACCTCCAGGGACTTGGCTGGGGAACCACGGTGACTCTG-ATACCAAACACCCAGCTGAAAGTCTGCAATTTCCAC-AAGTTTGTGCATCTCATAAAAATTTAAACACCTGCTAAGTGCA--------------GCAGCAAGCGAAAACAACACCTTTTGCAGGAATTTTCTCACTTCTCAGAGGTGACATGTTTCACCCAGCAATTCCCCTGGCGCCGAGGCTGCTAAAAGACAAAAGGGG-CGGGTACGACG-----TGCCCTCTACAAGTCCTGGCAGGGACCTCTGGAGCCAGGGGTCGGC-----CAGTGCTTTGGGAAGAAGAGAGCCTCAGCCACAGGAAACATGTAGGTTGATCTTTGAAGTCAGA-------------------AATGGCTGGGCCTGGAAGACATGGCCCTGGAAAATGGTGGCAAAAAAAGAAAATTGACAAGAGGATTAAGGAGAGAACA-TGCTCAGCTGGAACATAGGGGGTTAGGGGGTGGCTG---------ACAA-GGAG------CTGTCGCAGACTAAAGACCAGATACATGCTAGACATTCTGC-GCACAAGCTAGTTTCG-CAGACTGCACCAGTCTTTGGTGCCAGTGGAGCCTCCAGACCAGTGACGAATAATATACTGCCAACATAccatctgatgtgaagagccaactca a score=10436 s mm7.chrY_random 25572528 763 + 30114534 AAGCTGTCCTTACCACTGGCATGATGTGGACTACAAACCACTGAAGGTTCTGTGTTCACAGTTCACAGAGTGTCTCATGT---TCTCCTAGGAACTATGTCATCTTCCCCC----------------TGTGActcct-aaaacccaagtaccaaagtcctagctttaaggatctctgaaaatggcctccatctggagtaacaatctcatttcaagtgtcattggtcaagatgaagtcatcctagcactgactgggcttctaatccaacatgctgggtgtccttataaaatagggaaccatgaacacagttgtgctcaggaaagggatcatgggaagatgagagcagagacccagacattgtgagaaaccacaagaaact--tcaagaaaggcatagaatgctttttttctacagctctaaggaggggtcaaccttgccaatatctttctctt--tcctcaagcctctagaaacacgagaca------ttttgttgtttaaaccacttggattgcagtagtttgtcatagcagctctggaaaagcaatCAAACAAACAAACAAATTAAAAACCACCTCCACAATGACTTCCTTTAGG------AAGTA--TGCCTCTGGGGTCCTCTGCAAATGAGCCCA----CAGTTTCCTGGGTGGCCACTTGTGTCTGGGCACATGG-----TGTATCAGTTTAG------GCTCAAATACCCATCACCCCATGCAATCT-TTCTGAAGTGAGCCCAAGAGAGAAATTAAATTAAATCCCTAATGTCTGTTGAACAGTCACAACTCAGGGAGATTATAGAACTA s bosTau2.scaffold1191 185596 748 + 271640 AGGCTGTTCAAGACACTGGCACGATGCAGGCTTCAGACCATGCAAAGTCCTG------CAGTTTCCAG---GTCTCATATGAACTTCCTGGG--TCATCCCACATTCCTCCCtgatgtgggttgaattgtgtcccttcaaaattctttcactgaagtcctatgccccagtacctcagactgtgacct-tatgtgggaggaggatat--ttgccagtatgattaagtacgatgaggtcatcctggggtagg-taggcccctagtccaatgtgactgctgtcctgataaaaaaggggaatttggaca----tggacacacagaagtga--aagtggagattggagtgaag--ccagcagtt---------cacagaaagctgagaaagagagatgtggatagattctccctcacagccctcagaaagaaacaactctgccaacaccttactctcagacttccagcttccagatctgcgaggcaatgaatttttgttgttgaagccacccagtttgtgg-----------AGCAACTTGG---------------------CCCAATGAATACACTCTCCAACCCTTGCTTTCATCAGGGACATCAAGTGGTTGCCCTGGAACCTTCCTGTAAATCATCCTGATGCCTGCCCTCCAGTGAGTCACCTATGTCCAGGTATATTGAGTCCAGTCTCAGCTTGGACTAGAGCCTCAATGTCCATCATCCAATATAATCCATCCTAAAGAAAGCCTGAGAAAG-----AACTTGTATCTTTACTTTCAGCTGAGTAACTGCACATCAGCTAAGTAACGggacca a score=8341 s mm7.chrY_random 25574409 402 + 30114534 TTTAGAACATGGGTTctcttgaaaatgtacaataccacttagcatgttaaaatctt------gtc----attaagaaacctgatttttaatttggcatttcccaaaTGGATGCAGTA--ATTAAAAGAGCAGCAAGCTTACATATCACCCACCCTAAAGAG-CAGTGCATAC-CTTGCAAACATGGTCATAGTGGCATTCCAATGTGGAAAATGGGAGGAAAGACCATGCTGGAGCTCTGAGCTCTGTCATTCTTTATTCTTGAGATAACCGGTAACCAGGCATTAGGGAAAGATGACCTCTTCATC-ATGCATG-TCTCTGAGTGATCTCAAGAAGCAGAAACACACTCAAAATTTACCATTCCATTTCCAAACAAAAAGTGATCAGATTTGTACATCATTGCATGCCCACGACAGG s bosTau2.scaffold1191 187356 406 + 271640 TTGGGAACACCATTTctcttggaaatccccagtacaaattagcatattaaagtctctgagaagccttggagtgaagaacctg--ttttaacccaacaatttccaaCCATAGGTCGTAGCATAAAGGAAACTATAAGTGTGTGTAATATCCGTTTTAAAAAGGCAGAATATATTCTAGCAAACATGATCATAAGACTACTTTAATATTGATAATATGAGAGAGAATTTCACTGAAACGTTGAGGACTGT---TTTTCATTCTTGGGAGAAGCTCAGCTCAGTCAT-AGGGAAATATGACCTCTTCCCCTGCGACTGCTCTGTGAGTGCCCACCAGGCATTAAAACATGCCCAATGTGAGCAGCTACACTT------GGAAAGTGATCAGCTTTCTGCTTCACTGCGCTCCCACATAAGG a score=12054 s mm7.chrY_random 25574888 1350 + 30114534 AGAGACCTCCCTTGCTTCC---------AGATGTAGGGCTAGCCATCCAGAAC-----ACTGTCTTTACAGGAAATAGTCCTCTAAATATAAGGGACACTGACAATCAGTCCCACTGGCCCA---------------------------------AGGATCACTCACATAGACCTACATACACATTCTGTATGAGGCCCTGTCAGCTCTGTCAGGAA-------GTTACAACAGCTTCTTGGAAGAGCAGAGTAGAGCTCACCTTCCCAGTCCACAGGAGGGAAAGGGATCAGTGCAAGGAGGAAGGGCCCTTCTGCCAGCATAGAAGTGCTAAATGAGTCATTCATACCTTCCAGAATTCTCCACAGCCCTTCCTAGCAGACTGAGGAACCATGTTCCTTCTGTTG--------------------GGCTCCAGTCCCTTCTCTTCAACTGTACTGT--GTTATCTG-------------TCCCTGAACCCAGATAGCTTCTAG---CACTTTCTTCCTCCCCGTGTCCCAGCCTGATTTCCATCTGCTTC-CAGCATAAAGGTCTACCTACAAAACAGCATCCCCAGAGCTATCAG--------AAACTCCACTGGCTTTGGAATG---TGCACCCCCCACCTACCCACCCCACCGCTCACCCCCGGTTTCACATCATAGCCTTTGATTGTCTGGTCCTTTCTTATGGTTGACTTCTG-GCTTTCAATCTGATGGCAGACAATAAGGCAATAAACCCCAGTGTCTAGTGACTT----GGCTCAAAAGTCACCTCTCACCC-----CCTCCCCAATCC---------------------------------CCTATGCTGC--------------AAA------------------TGGCTCTTCACAGAAAACCCAGACAGAACTAACTGCTAACAGGTCATGCATGGCGTT-GCCATGCTCTCC-TGTTGCTAGCTAATATGCATGGGCATTTT------AATTTTTTCTGCCCT-AATAGG--TCTCTAGTATATGTTTCTTTGCTATTTTATTATTTTTTACTCCCTGGGCTTTCTG-----------------------TTAATAAACTTATATTTATAA-GAGCACAAAGGTGGTGAACAATATAACCTAATCTAAGCTCTCTATTCTGCATGGCAAGAATGAGGAAGGTGGAAATCAGGTGTTATGTAATAATAAGGTGTGGTGCAAAGACTTATGACACTAAATTTGGAGACCGG--TGACAGGAGAAATTTTCCATAAGTTAAATG--TGTCAAAATTGACATAAGAAGTAGAAAGGCTAAGTAATTCTATTCTCTTGTATACGTGAAATGATAGTTTTCCATGGGTGTGTGTCTGCTCTTTCTGAGCATGA------------TGGGAATTCCTTACGTGGAT----ATGCATCTTCTTGTTGCCTACTTACTGCTAGTCA-CCAGGCCTTCATGGCCATCTTGGTAAGGATGGAGACAAGGAAG---------------------ACCTCGGTCATTTCCTATAGCCG-TGCAGGTGACTTCTAAACCTCTGTGCATACCACAGACTTCcaaaca s bosTau2.scaffold1191 187831 1524 + 271640 GGGAATCTCTCCAGCTTTTTCTCTTTTGAGCCATGGGGCTGCTCATCCAGGGTGTGTAACCATCTTTAGTGGGAAGAGCTCTCTGAGTGTGTGGTGTGCTGGCAGTCAGGACTGTTGGCTCAGGAAGGAGCCAACTGTTGCCTATTTAGGGCAATAGGAGCAGTCGCTCTGACCTACACACACTGTCATGAGTGGTCTCTGACAGT------AGGAAAGGTAGGGGTGTGATCGTGTCTTTGAAGAGTGAAGTGGAGCCTCACTCCCCAATCTGCCCAAGGGAAAGGGGTCAAATTGAAGAGGCTGAG-GCTCCTGTCAGCACTGGGGCACTAAATGGGCC----------------ACTCTCTGGAGCCCTCCCTCTGGACCTGACATCTCACATGCCCCCAGCTGTTTTCCTTCCCAATTGCTCAGGCTCGAGACCCTTCTCTCCATCTTCGCTGCAGGCTTCCTGCAGCTGGACCCCATCCCTGGGCCCGGACAGCCTTCAGTGCCACTGGCAACCTCCCTGT---CCAGCTGCTTGCCCCTCCACTCCTCTGCAAAGAGGT---CCTTCAGGGCAACATCCTTC-ATCCATCAGACTCCTTCAAGGCCCGCTAACTGTAGGATGTGCTGCAGCCCCTGCCCACTGGCTC------------------TCACATCGCAGCCCTTTGTGACCTGGCTTTTAGTTGCTGTGTAATTCTGTGCCTTAAATCCTAGCAGAGGAACCAGGTCAGTCAACTTATCTGTACTATGccttcccctgctccccctcctcctcttcctcttcatcctcccccacccctcctcttcctcctcctcTCAGACTGTGCACATCCTATTCTTCTCCACAGCCCACCTAAAGTTCCACATCCTGCCTGGTGTGTCTTTAGAGTGAACTCTTATAGGACCCATTACTAAACACTCAT--ATAGCATTCGCCTTCCTCTCCGTGTTGTTAACTGTGCTTTATAGATCTCCTCCCCCGCATCCCCCCCCCCCTAAATAAGCCTCTCTATTGTAAGTTTCTTTGCTGTTTCCTTTATTCCTATTCTTTGGATTTgctggttctttgaaaacactgattaaatggataaacctctgataatgatgagca-------ggttaaaaagaagacataacct----------------atagcaagaa-gataagagggaacagcagacagtacatgataatccaatgtattaaaaatgactatgacaataaatttgaaaatataaccaacataaacaaatttcta------atatggcttttctaattgataaaaaa---ataaatggaaaataatcatatactcttaaataagtggagccaataattTTCATAGTCAGATGCCTGTTTCCTACCAGCTTTGCTGTCAGCTCCCTGGTAACTTCTTGATTGCATCAGAATGTATATTGATATCACCTGACTGAGGTTGGCCGTCCTATCCTTCCCAGTATTCCGGGGGGGGATGGGAGAAGGCCAGCTGCTTCCAGACAACTCTGTTGCTCTGATGGTTTCCTCTGGCCACCCCAGCCCAATGTAAAGCTTCTGTGTCTTTTGCAGAATTTCAGATA a score=25567 s mm7.chrY_random 25576274 1134 + 30114534 gatagGATCCTCAGCCTTTCCTCTCGCCTCCTCATCTAGGATGACAGCTTTGAATCTTAATTCTTGGACT------CGCACAGACTATATGCACATTGCCCGGCACTTTTCCTTATTGCTCACGAAGTGTAGCTAAGGAGCTGAAAGGGACCAGATGGTCTGGCTCAGTTTCCACCTGAAACGTGAGGCAGATTTCTATACTAACAAAGCTAGGATGGGGAG-AGACACCCACTAAAGGAGAGAGCCCA---------AAGGAGAAGCCTGAGTGGCCTGCTGTCTGACCCTTGGAGATT---GTCACACA----TTCTTAGGATCTCAT-GCCTTGGGAAAACCGAGCAAGAAGTCTGTGCAACAGCAATGACCAACTCGGCTGCTGAGGCCATGGTA-----TGCTCCTGGA-ACTCAG---------------CCTCGTGCCACATGAGCTCTGGCATTTT--CCATTTTGTTCTGTTGCCTGTCTCTGCTAGCTTTAGAGTTTGTAGATTATGTTCCTCTAGCGCTCATTCTGCCCCCCTCAGTTTCCCGTTTTGTAACTGTGCTCTGCTGACTTAAAGCTTTTCAAGCCTCCTTTGTCTCACTTCGATCCTTATGCCCGGGTCATACTTTATCCACC---TCTCCTGCTGTGTTCAACATTTGTTTTGAGCTTTATTTTTATCTCACCAGTTTTGATTTTGGATTTGTTATTTGCCTTTTATGCTGTTTT-AAATGACTTTTGCC-TGATTCATCTC-TTTGCCAAGAGC--ACAGTTACATTACTGTCTCTTATGCTGTTTAATTACCAGAAGGAAAGTCTGGGACA--------ACAAGCTAGCTGTG-TGACTTACCCAGTATCTCAGCA---GTATTTTAACTGG-CAGTA--AGGAAGTTACCCAGACCAACACCA-TACACTGAAGGCTTCTGGAAGGGAC----TTTCA---CAAATATGAGAATGGTGTCATGACTACCCAGGCCTCATTAGAAAGGGACAATTTTTATCCA-AAATACCATCTCTCTCTGCGTGTCAGCATGGCCT------------TCTCTCTGCTGGTGTC-TCAGTGTGT-CTCTCCAGAAAGCCCAGGGC-ACTCTGCC-AAGGCTTCACTTGAAAACTAAACTCC--TTCGCAGGTCTTAATGTCCAGAGTCTTCTACCTCA----TCTATTTGTAACTCTTAGCAAGTTACAAATATCAGGAAG s bosTau2.scaffold1191 190156 1193 + 271640 gacatgaccaccaaccgtTCCCTTTCCCCTGTCTC------TGGTGGTTCTGAATCTTGATAGCTGGACTATGTAGTGAACTGAATGAATGAGCTTAG-----------TCCTTACTGCTCACAA--TGCAGCTGAGGGACCGATGGACAGCAGCTGTTCTGGTACAGGTTTCACC------ATGGTGCA----------TTAAAGAAGCCAGCCTGGGGAGGAGGCACAAATTGAGGGAGAGAGGAAAGAAAGGGGAAAGGGGAGGACAGAG--GCCTGCTGTCTGATCCTGGGGTGCTCTAGTCAGAGAAATTTGCTTGGGAGCTGGTTGCCGTGGGGGAACAGTCTTGGGAACCTGTGCCGCAGCAGTGACTAATGTGGCTGGAGAGGCCCTGATGGTCTTTGTTCTTAGAGACTCAAGACTTTGGCATATGCACTGGAGACAAATGAGCTCTATCTTCTTATCCATTTTGTTTTATTGCCTGATTATCCTAGTTTTATAGTTTGTAGATTATATTCTTC--GTCTTCACTTTGCTCT--TCAGTTTCTTATATTTTAATTGTTCTCAACTGATGTAGGATTTAATGACTTTCTTTTATCTTGCTTATACTTTTATCCCTGGCTTATATTTTATCTACCAGTTCTCTCATCATATTCAACTTTTATTTTGAGTTTTATCTTTATGTTGTTCATTTTTATTTTAGCCTTGTTATTTGCCTTTCACGCTGTTTTAAAATGGCTTTTGCCTTGATTCATCTCTTTTGTTGATAGCCTACTGTTACTTTAC-GTCTTGTATGCTCTTTAATTACCAAACGGTAAGTTTGAGAAAAGTCTTGGAGGAACCAGATGTGAGGGTTTGTGCGGTGTCTCAGAAAGGACACCTTGAGTGGTCAGAAACAACAAGCCACTCATGCTGCCTCCAGTACAAAGAAGGCTTATTGAAAGGATACAGGCTCATATCAAAGAAACAAAGTGCAGCAAGGATATTCAAGCCTTATTAGAAATGGAAAATTATCATCAACAGCTATCTTCTCCGTCTGGCTCTCATTCTGGACTCCCTTGTTCCTCCCTCTCTGCTCCTCTCTTTCATGTGTCCTCTTCAAACAGTTCAGATCTGCTTTCCCAAAGGCCCAACCCCAGCCCCCAGCTCAAGTCTGCATGCCTTATAGTCCAGAACCTATTACCATAGAACTGACTCAGTCACTGTCAATCAATTCCAAAAACCCGGAAG a score=5318 s mm7.chrY_random 25580697 621 + 30114534 GAGACAGTCCACAATAACATAATAATAATGAACTTATTGATAGCCAGCCTGCTTATTAGTAAGTTTAATACTATATTTTTTCTTTTCTTTCTTTATTTTTTTGAAATAAGTATTTTTCATGAAATAAATATTTTTCCTTGGAACACAGACAAAAATTTGTTCCATTTCCTATTGAGA-AAATCTGGTCTAAGTCCTGAAACCTATTCAATTACCTTTAGCAAAC----------------------------------------------CAGGACCCTCCCTGCTTTGAAGCACCCTCTCCTATGCCTCTTGGGCCATGCTCCACAACTCTAATAATTACTCCCCACTGTCATAACAAGCATACCCCAAGCAACACAGTCCTGTGGAAGCC----------------------ACCATAGGACAGAGAGGACACAGCCCATTCTGTGTCTGAACCATGACTTTCTCCTAGGGAC-TCCTCCCTCTTTGCTTCTTCCATGGAACCCA-GATGGGCCTAACATACATATACTGAAGGG----------GACATATAGCTGTGGCTTTACCAGC-CGGAAAGCAGGATG----AGTTCTCTGGACTGAAGTCTGTATGAGACTGCTAAATGCTATCATAAAAAATAATAGCAGAGTTTAAGTGACTTGGTATAATGGGAATGGGTTATCCCATAGTTCTTGAGTCAGGA s bosTau2.scaffold1191 191885 647 + 271640 GAGACAGCATGTAACAATGAAGTAATAATGGTTTTATGTATAGTC------CTTTTATGGAGGTT----------------CTTGACAATTTATATTTTT---AAGTCAGCAATTCCTCCAAA-----------TCTTGGAAACATGGACAAGGATTATTTTCATTTCCTCTTGAAAGAAATCTAGTCAGAGGCACAAAACCTAGTTAAGCACCTTCAACCGACTCTGGAGGGCTGTTTATGGTGAGCCTAGCCTCCTGCCTGGCCCCGTCAAGACACCCCCTGGCTGG--GCTCCCCTGCCTGGGCCTCTTCAGCCAC---------CCCTGTAGCTGACTCTTCATCTATTTAGCAAACTTACTCTGAGC-ACACTGTGTGCTGGATTCCCATCTGCTCACACGGGGCTTGTGACACTGAACAGGATACGTACATGACAGTC-ATGGCTGGAC--TGCATGTCCTTTAAGGACGTTCTCTCCCTCTGCCTCCT-CAGGGCCCCCACAAAGGACCAAGTGGAC-----CTGAAGGGCAGCCGAGCAAAAGTGTGTTTGTGGGCTTTGCAGCTCAGAAAGCAGAGAGTTTCAGCCTCCTGGTTTGATTTCtatatcag-tttccaaggactgctatagcaa--aatgccatgggctgggtggcttaaaccaagagaaacttactgtctcagggttctggaagctgga a score=5728 s mm7.chrY_random 25581953 190 + 30114534 GATCACCCAGGGGAGAGGAGTGATC--TACCCTCTGCTTCTGACTGAGTTGTATTTCAATCAGTGTGATTTATCAAGGAAGTTGGTTTCCTTTCTAGGCAGTTGATGAGTGCTCCTTCGGGCTGCACCCACATTTTGTC------TTCTGGCTGTGCTCTGTCTCATTTCTCCGGGGACTTACATTAATGAGGCAGTC s bosTau2.scaffold1191 195643 193 + 271640 GATCATCCAGGGAAAATGAGTAACTCATAGTCTCTACTTTCAACTGAGTGAT---TCAATCAATATGATTTGCCAAGGAAGTCTGCTTGTTTTCATGGAAGTTAACAAGCACCCCTGCAACCAGCACCATC--TTCGTCAATATACATGGACTATGCTCTACTTCATTTCTTTTGGGGCCCAATTTACTAGGATAACC a score=12353 s mm7.chrY_random 25582684 326 + 30114534 TGGGAATTCAGCTCTTCTTCCTTAAGGAAGTGTCAGCTTGGAGGACAGGGTGGAAACATTTCCTTTGCCTCCTCTGCAGAGTTCAGTACATGA-AGGCACTGAGTAATTACCCCTAACATCCTGAGCATG-GTGCGGTTGGCTATGAGAAAAACCA---ACAAATGGTGTATGTGACTGCATTCTACGCTCATCCTGGAAAGTTTGAGCCAGATAT-ATCTTCCTAGCAGGAGTAGGATGAAAACCTACTGCTGATAGAAATGTGCAGAAACGTGCAATGCAGGCTTCCCAATCGATAAAA-CATAGGCATTTCGGAAGAAGTAAAAAAAAAA s bosTau2.scaffold1191 197411 321 + 271640 TGTGCATACAGCTCCTCTTCCT-AAGAAGATGTCAGCT-----GGCACTCT------ATTTCTTTTGCCTCTTCTGCAGTGTCTGGAATATAACAGGTGCTTGTTAATTATTCCTAATATCCCATGCATGAGTGTGATTGGCTAGGAGAATAACAAGTGACAAAAGATGTAAGTAGTTGTACCCTAAGCTTATCCCAAAAGTTCTAAGCCAAATGCCATTCACCAAGCAGGAGGAGGATGAAAAACTAGGGCTGATAATTTTGTGCAGAAATGTGCAATGCAGACTTCCTAATCGATAAAAACAAAGGTAATTCTGAGAAGCTGCAGAAATGA a score=62622 s mm7.chrY_random 25583027 2384 + 30114534 TTTATTTTTCTGGGCTATGTGGGAGTTTGGATCTCAGTGGGGGAGATATAGTCATGGGATCTTCCCTGCTGGGGGC----------------TCTGGATCATCTGTAAAGACTTCCT--TTAGGGAAGGAGGAATTCTAGCTCTC-----ATTTCTAGGT-GCTTAAAAGAGTGAACTGGGT--GCAGCCCTTATGCACGGAAAGTTAGAGGTGGCCAAGAAGTGTTTGCA--ACAGCGAGATGAATCACAAGGCTACTAATCGGTCTTGC-TTAGTGCAGCTAGGGAACGAAGCCTCCCAACCACATTGCCAGGTCTTTGTGAGTCACAATAGGCAGCTTAGCGTATGATCACAGAACCTCTAATACAAATCCCCACGTTCAGTGTAGGAAACTATCAAACCAGGAGTTTGAGCCTACTGCAGTGGGTTCCTGTTTAGACGGCATTAGCTCCCAGACACCATAACGCC---ATAATTCACAGCTCTTTTGAGTTATTTCCTGTAAACTTGGACACAACCAGTTTATTTAAATTTGTATTGGCTTTCTATTGCCAGGAGTTTTATTTTTAAAAAGGCACAAGA-----------------GAGATTGGGAGTCGGTGTGTTG-----GTGCACTGATAGGCTAACTTGCCGCAAGAGCA-----TGGCCCTGAACTGGCAGAGCCTGGGCAC--GTGGCTCTCAGCCA----------------------TTTCATCCCTGAGCTAGCTACAGTTTTTTAGAAAACAATTGTTTTATTTTGCTCTCTCAAATTAAAAAAAAAATGAAGCAGCTGAAGGTGGGAGGCATTCAGTCTTCATTATCCTCCCTGGCCTTTTCTGCAGGAATCTGAAATTGATTTCCAAATTTCTCTTCCGAGTTTGATTTAACATTTTAATCTGCAGGCCTTCGGTGGGTGCTATGCGGACTGTATTGCTGACGGGGAAATGAAGAATTAGCCAGCCACCT---AGGCTCTTGTTATCAGTCCAGCCGTTCTGGCTGTGACTGGATGGAGCTA-GAGGTCTCCTGGCCTCTGTGAAGAAAG---CCTTAAGTTCCACTCGGCTGGGT--GGAAGAAAGCAGAAATGATGCCCAGCGGACAGCAGACCTCCACATTTTTGTTTTAGAGTTTGAGGCTGTCCCCTGAGATGG-TGACTTATTACTTCTAGCCATTGATGGAACAGTAAAA-GAGTCCATATACCTCTGTAGTATTGATCAGGCTGCCATTTCTCTTTCTTTTGCAGCTCAAAATATGGATTTTCCAGGCACTTGCCTTGACTTAAATTAAACATTTTAAATATACCTCTGCCCCTTTGGAG-TCCTTGCCCAAACACTTGAGAACTTCAGTACAACATACAGAACATG----GGACCTGTCAGAGCATAGAAATATAAAGTCTCTTTTACTGGCAGCTGTACATGGATTTCAGGGGCTCTAACACACAAAGATGCAG-TCAGCGCTGTGCAAGCCCCAGAGGCAGGA--CAAGGGG---AGGATCTCAGAGTATTTTGAGCTCACCATCC------------------------CATCTGTCAAATGGCTGAAGGCTAACTCAGCTGCCAA-GCTGTTGCTAGAGAGAGGATCGGAACGGGTCACATCAGGCGCAGTGACCCTCAATGAGTCTGGGAGGGACTTGGAAGCCATGTGTTCAGCAGTTTTACTGGTGTGCAAGAATCAAGCCAGCTAGCCAGAGCTCAGGGGTGGCATTATGCATGAGCAGGCCCTAAAATCTGG-----CAGCCAGG------------------AGACATTGGTTTCTGCACAAGGCTTTAAGAGCAAACTAGGACCCG-GGCAGTGGTCACACAGGCCTTGAAGTGAAGCTGATTAAAGGGGGTGGTGATGGACAGATGTGTGACTGACAGCTGGGGGAGAAGAGCAAGGAGGTGGGGCTCTAGTGA------GGCTAGGATATTTTGAACACAGAATGGTGAGCCCTTAGGAGACTCTTTTTGCCTTGAGATGTC-AAACCAGAAGAAAGTCAGTTTCAAGGCCCC--TGGGAAGTTGTTTTCATTGACATCAGTGATGACCAACAC--------TGCTAATTTTCCTCCccagaattttgcaaagcgcactaggcagttcccctttttaaccttcacagt------agcttggcacggcacacttcggta-tgcttccatcttatgggtgaagagatggaggctgcagtggag-----attctttggccagggtcac--agttagtaaTGACTTG----------TTGGAGTTGAAACATTCTGATTCCGTAAACTCCCATCTTAGCAATGATGCCAAGCTCCCTCTGACTACATTGAGATGTGCTTTCTTTGACGCTCAGCCTACATTTCTGGAGCATTTGGGATTAAGTTAGGTCTCTCCTTAAGCTGTGCAGGAAAGTCAGGGAGATGAGTACGTGTAGACTCTAGCTGCAGAGAATTCTAAGAAGATAA---------------CAATGGGCAATGCGGGA-----AAGGAGA--AGGAAGGACAGGGC-----TGGGGAGAGCCGAGGAGGTGA s bosTau2.scaffold1191 197745 2508 + 271640 TTTATTTTACTGGGGTGTGCAGAATTTTGGATCTCATTGGACATAGTATAATTATGTGACCTTTGCTGCTGGCAGCAAGGGAATTAAATTCTCCTGGGTGTTCTATAAATAACTCCTACCTAGAGAAGGGGGAATTCCATTTCTCTTTCCATTTCTCTGTAGCTTAAAAAAGTGAACTACATCCACATATGTTTTGCATGGAAAGCATGAAGAAGCAAAGGGGTATTTACTGTACAATGAGATGGATCATGAAGCTGC-AATTTATCTTGCATTGGCCCAAGGGGGAAATGAAGCATCCTATTAACATTGCT-GGTCTGTGTGAATCACAATTGGCAAATTAGAGCCAGAGCAAAGCACCAATAATACAAATATCTGTGTGCAGCAAAGGAAAATGTCAAAGCAG-AGTTTGGCTCTGCTGGAAATGGGTTACATTTAGAATGCATTAGCTCCT-GACACC-TAGGGTCCGGGCAATCTACAACTCTCTCAAGTTATTTACTGTAAACTTGGAAGCAGCCAACCT-TTCACATTTGCATTGGCTTTCTGTTGCCAGGA-----------AAAAGGGAAAAAAAAAAACAGTACATGCAAAGAAAATGAGAG-AGATGTTTTGAGTCAGTTCGCTGAAAGGCTGGTTTACTG-GAGTGCACGTCCTGTCCATGAACTTGGAATGCCTTGGCCATGGTGGCTGCCAGCCTGCAAGCATGCTCAGACCTGCCTTTGCATCCCTG--CTCCCTCTGATTCCTAGGGGAGTGATGGTTTTATTTTGCTCCA--GAATTAGAAAA----TGAAGCAGCTGAAGCTGGGAGTTAC-AAGCCTTAATTATCTTCCCTGGCCTTTTCTTCAGGAACCTCAAATTGATTTTCAAATTTTTCTTCTGAGTTTGATTTAACATTTTAATCTGCCTGCCTTCTGTGGGGGCTTTGTCAGCACTATTGATGACAAGGAAATAAAGAATTAGCCAACCACACTGGAGGTGCTTGTTACCAGCCAGGCAGCCCTGGTCTTGATGAGCAGTGTCCATGGGGTCATCGGGTCCTTGTGTAAGAAGGTCCTTCATCTCCCAGCCACCTTGATCAGAATGAAAGCTGGAGTCATGCCTGACAGGCAGCGG-CCTCTGAACTTTGGTTTTAAACTGTGAAGCTGTCCCCTGGGGAGGCTGACTTATTAGCTCCCAGAATTGATAGAACAGTAAAAAGAGTCCATATACTTCTGTAATATTGATTGGGCTGCCATTTCTCTTTCTTCTGCAGCTGGAAATATGGATTTTCCTGACACTTGCCTTAACTTGAATTAAACATTTAAAATATACCTCTGCCCCTTTGGGGTTCCCCACCTGAACACTTGGGAACTTCAGTACCAGATATGGATTATGAGCAGAACTTGTCAAGAAGTGAAAATGTGAGGTCTTGTACACCTGCAGTAGTTTGTCAGTTTCAGAGGCCTTGCTGTACAAGGAAGAAGCTTGATCTTGAGACAGCACCGGAGCTAGGAATCACATGGCATCAGATCCCACAgtgacttgaacaggtcatccagttgctctgtgtctcagttgactcatccattaagtgg--gatgaatacct--actgacagtggggttgctggtaaggTGATAGTTCCTACTGGCAGTGCGCCCATTGACTGGAACTGAATTTGGAAAGGAT---GCAACGGTGTATCCAGC------------TCAGAAGAAGCAAACCATGGGGC--AAGCTTATTGATAGCATCAGGCGTTAGAGGAGCCTGGCACCTGGAATAACAGCCCAGGtgtaacagagatgtaacagagatgtGTTACAGGGCAGAGCCCCAGACACAAACTGGGATCTGAGGTAGGGGCTAAACAGACTTTGAAATGAC-CAGGTAAAAGAGAAAGGGGCT---------------TGGTAACTGGCAAAGAGAAACCTGGAGGCAGGGTCCTAGTGATGACCTTGCTGAGATCTTTCTGACACCAGATGGTAA---CTTCTGAGGCTCTTTCTCTCCTGGGAGGACAAAATCCGAAGAAAATGATTTTCCCAGCTTTAGTACAAAGGGGCCACCACTGATGCGAGCaattgccaacacctactgtatact--ttttccatgccagcatcctgtaaagtgcttcctgcactttgctttgttga--tttatagtttacaaagcccaatatagtaggttctgttattattcccaatgtatagatgaaaagattgagg-tgtagaaaagtccatgcattttggccatgttcacagagttaggaatg--ttggagctggtacttgaagccaagtcattctgattccaaatgat----tcttaaccatcatcccatTTTTCCTATGAGTTGATCAAGA--------CTTTGAcatccaatagatattccctgaacacct-atattaagccgggt-----cttaagctaggcagtaaagtcaggaagataagta----tagattcttacttccagaagctccaaagggaaaaaaagatgtgtggaagcgattcataatgcagaaagtgcagggagcctgggaagcatggggcatggattaggggcaccaaggaggtga a score=4426 s mm7.chrY_random 25585790 131 + 30114534 GCACATCTCAGTTTGAGAAGCCTCAGCAGGCTCTTGGGAGGAGAACTTTCTTACACCAAGGGCTGAATCTTTCATAGGAGTTCTACAGATAGATA--TAAAAGGGA---TTTTCTGTTACATGACCAAGAGAAGGT s bosTau2.scaffold1191 200254 128 + 271640 gcccatctcagcttgagaagtcagagcaggctcctcaaaggagatg--------actgggttttgaagcttgtgtaggagttatccCAGCAGATACTTAAAAGGGAGAGTTCTCTGTTAGTTGACCAAGAGCAACT a score=3689 s mm7.chrY_random 25586234 170 + 30114534 TGAATGGCTCATGCCTTTGGCAACAAAAGCTGTTGAGGGCTTTAGCAACTTTAACAACTGTTTGACCTCTC------GTAATTTTTGCAAGCCTTGG-ATTTCCACAGTCTCCTGTTTGCTGATAAAGTGACAAAGCTGGCTTGATTGTTAGTAGTTTTTGTTTTTCTTAATTTCCA s bosTau2.scaffold1191 200382 164 + 271640 TGGATGGCCCTTTTTCTTAGGAATAAAGGCTGCTGA------TGGTAATATCAGCTGCTTACTAACCTCTCAAATGGGCAACTT--GCAAGCCTTTTTCTTTCCACAGGTTTCTCTTTGCAAATAATCTGCAAAAGCCTGCTTG-----TTGGGATATTTTTGCTCCTTGATTCCCA a score=16916 s mm7.chrY_random 25586728 639 + 30114534 TCCTTTATTAGGAGATAACGAAGTGACAGCATGAGTCTAGGGCTCAG------ACTTCCTT-------CAAGGTTGTGGTCAAGCTGGTTCACACACACAAAAGGGAAGATCTTTTTCCTGTGGAAGGGA--AAGAATCCAACCCCTGC---------CAAGGGAGACTGGTCTTCTGTAAAACAACAGCAACATGGATGTGCCCC----CTCTCCAGCC---TCTGAAGCCTCACAG-GCTTTAATGCCTTGTTCGGAGTTAAAGTAATGGGAAATGTGGTCTTAAGAAACCCACTTCAGGCCCCGTCAGGCCTTAACATGGCAATAGTGTGAAAGCCCGGAGGTGATCCGTCGTAAGGAGTGACA--------TGAGGTAGAGAAATAAATATCTGCTGGGTTTTTTTAATTAACTGCCTCTAAATAATGAAAATGAGCAAATTAGGCTCACTTTTAGTAGCAAAATGCCATTGTGACCTGAATGTTTCTGTTGATAGATGGCACAGTG-CTTAGACGGAGAGGCGTAAATCTGGCTTAGGCTGT---------------GGAA----GTGCCTTG-AGCCTGGGTCTGCCTCTTCCCCAGTGAATAG----CAGCAGGGGTTACTTTTTGCCTCTGGGTC---TGTGGGAGGGGAAAGTGTGAGGAAAAAGCCAAACATGGAGGCTTGCTCCGGGCCTTAGATT s bosTau2.scaffold1191 201393 679 + 271640 TCCATCATTAGGTGATAGTGAAATGGCTGGATGGGATTAGGATTAAGTTTGCCAGTTTCTTGCCCGTATAATCTTGTAGTCAATCC--TTTACTAGTCCCAAAG--CCTCCCTTCTCCTTGTAGAAAGGATGAGGTGTCCATTCCCTACTGTAAAACCCAGTAGGGCCTGCTCTTTCATTAAG-ATGAACACCATGGTTGTTCCTCATGCTTCACCAGCAATGGCTGAATTCTTACAGCAGTTTAATGTCTTGCTTGAAATTAAAATAATGGGAGACAAAACCATAAGAAACCCACGATAGGCTGCGTCAAGTCATAAAACTGTAATGCTGCAAAAGCACAGCAGC----------AAGAAATGACTGGTGATGTTAAGGGAGCAAAATAAATATCAGCTGAGTTTTT--AATTAACTGCCTCTAAATAATGAAAATGAGCAAATTAGACTCACTTTGAATAGCAAAATACCACTGTAATGTGAAAATTGCT-TTGATGGAGAGCATGGCGTCTTTGATGGAGAGGTGTAAATCAGGCAGCAGCTCTCACTAGCATCTCCTAAGAACCATGTACCTTTCAGCCTATGTCAGCTTTGTCCACAGTGGACAAGTGTCAGCAGGCA----TTTTTGC--CTGGGCCTCTTGTGGGGAGGGGAAGC----AGAAGGAGCTGGATACAGAGGATTTTCCCAACCTCTAGGTT a score=19124 s mm7.chrY_random 25590478 638 + 30114534 TTGATCTGCAAAAATATTTATTTTAGTAGCAAACCAATTCTACTGTAATAGCATTAGATTT----------------ATTGGTTTTAGGAAGAAGTTTA--GTTTCAGTTCTGTTGACCCTATGTGAATTATAAGCTAGGCTCTC-TGGCTAAAAGACTTGCACCTTATCTGGGAAT-GGTA--AAAGCCATTTCTCAACATAGACATCC-AGTGGTTACAAGTGACCAATAAGCTGTTACTTTAATCTTTTAAATAGTTTTAAAATGTTA------TTTTATCCTATAACAGTTCTATGAAAACAGTCATAAAGAGGCAGTGCTAAATCAAGGCCTGACAATGAGCACTTTGGGAACTGCAGTTCAATGTGATTTTTCCCTCTGAAGAAGGTCAAATGGGCCA-TTATTCTAAGAGGCAGCATTATCCTAAATGCTATGAATAATGCCAGGAAACTAATAATCAA---CAAAAAAGAATAATTTTATAGTTATTGTAGGATGCATCCTCTCTGAGTTTAATTAATTTCTATGGAAAACTTGCCCTTTGATGATATGAACTATTAATTATATATCATAGAGCTGTCCAACTGAATCCTCAGCCAAGTCACAAACATAGTTGTACATTTTCTACCAACTACATCACAG----AAAAGGAAAAAGAAGAAGTAGATt s bosTau2.scaffold1191 242541 655 + 271640 ttattttataaaaatattt--tttagtattaatgtaa--acagtgtaata---ttaaatttgttttataaaaataaaattttctttataaaGAGCTATACATTTTGAATTCTAGTGAT--TAAGTGAATTGTAAACTAGAACCTTATTGTCAAAAGACTTCTACCTTAGCTGGTAATTAGTATTAAAACCATTTGTCAGTACATACATCTGAATTTATAAAAGTGACCAGTGTGCTATTATTTAAATTTTT--ACTGTCATTAAAATATCAAATAGTTTTTGTCCTATAACAATGCCATCCAAGCAGTCATTAAGATGCAATGCTAATGCAAAGCCTGACAATGAACATTTTGGGAACTTGAGCTAAATTTAGATTTATCATCTGAAGAAGGCCAAATGGGCTGTTTTTTTTAAGAGGAAGCATTCTCCTAAATGTTAGGAATCATGCTAAGAAA-TAAAAATCAGTGTTAAAGCAGAACAGTTCTACAGTTACTGTAGAGTGAAT-CTCTCTACATTT-----ATTTTTATGGGAAAATTAGCCTTTAATGGTGTATATTATGAATAACGTAGAGcagcattgtccaacataaacataattcaag-cagatacat-gatatatgttttctcatagcctcactaaaacagtaaagagaaatgggtgaaattggtt a score=8068 s mm7.chrY_random 25592919 322 + 30114534 ctcaggatgatacTTCTAAGCACAATTCTGAACAGGCTCGGCCTATACCATAAGTCTTCCT-----------------CTGTAATTGTCAGTCCTGGAGTCTTGAGGTCTCCCTGGTGTTCCTTAGCTCCAAACACCTCTAGTGATCTGGCTTTATGTTTAGCTTCTCTTTCAAAAACCCAATTATCAGTCCCTGAGAGGCAAGATCAGAGTCCTAGGCTTCTGGGAGCCTCTGCAACTGCTACAATTCCTACTCTGTAGGAGGAAGAAACTACTCAAAAGGG-------AAGGAAGATAATCCAGGAATGATTAAGAACCTTTATATTTGCATGTGACCTTTCCA s bosTau2.scaffold1191 243529 341 + 271640 CTAAAGATTTTAGCTGTCAGCATGATTCT--ACCAATTCTATTTGAATATTAGGTCTTCCCGTGATTAATTGATGAGGCTGCAATATTCAGCCCTTATATCTTGAGAACTCATTAGCACTTATTAACCTCAAACATCTTTAATTATTTGATCTGATATACAACTTCTATTTCTGAAACTCAGTTGGGAGACCCAGGAGAGCAAGGACAGAGTCTTGGGGTTCTGGGGACCTCAGCACCTAGTAAGATTC--ACT-TCTGACAGCAAGTAGGTGCTTACAAAAATTTTGCTGATGGAGATAATTGGACAGTAGTTAAAGGCCATTATATGTGTATGTGATTTTTTCA a score=6892 s mm7.chrY_random 25593488 732 + 30114534 AATTAAAA---TTTTTGGCAGGTATTAAAAATGTAGTCATTACAAATGCAGTCACTGTCCCGTTCA-------------GCACATTTTGATGGTTTCTTCTGTTGTGTGTGCTCCATGGCACCTGACTCTATTGGTCAACCCTTGAGATTC---CAGGGAAGCTGCCAGAAGCA-----------GAACACCTGTGACAT---------------GGAAAGAGT-------ACATGGTC------------------------------AACTG-GAGAAGGATCCTGCCGA---------------------TACTCATTAGTTCCCGGTTTAAACTC-------------AACAAGAGT-----TGTAATGATAATGTGGTTTTGGACA--GGAGGATGGCAATTTTATTTCCATTACTCAGACGGGGTAATGAAGGG---------------------------CTAAAGATGGCAAGTGGATAGCCAGAGC--------AGGCTTCCCTGCCTC---AGCAA--------CTCCTTGGAATAGAAGCCCCGAAGCAT-----AGTATAGAGACATGTCCATGGTCATAGGGCAGGATCTTGTGTCCAAAGCTGTTCAGGCTGAAA---CTCCTTTTCTGTAGTCACAGCATCCTCTGAGATGGATGGTGCCATGACACAAGGCAGGCAAGTCTGGAGGTATTTGAGA-AAAGATGGGCT----CATCGTCACCTATGTTCCAGGGGCA--GGGAGCAGATTTCAGAGTTCAGAGCTTTAGCAGTGGGCACTGCAGGGATCCTT--------TGCGTACCTCCCTCCTCTGTCTGCAGAGACAGGGCTGACTTCTATGTCTTCCAAGCCTCCCTTCTCCAGCCAGGCATGTCA--ATGCAGAGAAATGCAAGC----TGTTCCCACTG s bosTau2.scaffold1191 247622 880 + 271640 AATTAAACACTCTCTTGTCAAATATTAAAAATCCAGCCACTATAAA--CAGTCACTGTCCTGGTCAATGAGGTATTCTTGCTCATTCC-----CTCCTTCTGCCATGTGTCC------ACACCTTATCTGAATTGTGGACACCTCAGGATCAACCAGTGAGGTCAGCAGAAGGACTGGGAGTTATTAACATTGGTAAGATCACACAGTGGAACTAGGAAGGAGCCCATCTGATATGGCCTGCCATCCTTTTCTGTTGCCTCCCTCATACAGCTGTGATGAGAATTCCATTGTATAGCTTTTCACAAATCACTTTACCCAGTAGATGCCATTATAAATTCTCAGCTTCAGAAAGAAAAAAGTACTATTCTGATTATAATATGGT---GGCCATTGGAAGGAGATTGCTGTattcccatttcataaatggagagatggaggtgtaggaaagtttaactttttataaattttagagaagacaagtgaagagtcagggtttgaatctaggtttgccttactcttaggcactgatccttctgctgggAAAAGCAGCACCAAAACCTTTGCAAAGAGAAAGACATGGCCGTGTCCACAGAACAGGGTCTTGTCTCAGCAG------AGGCTGAAAGGTTTTCCTTCTTGCAGTTATGGT-------------GGTGGCCGCATGACA-ACCACCAGTAATTCTAGAAGTATTTAGGAGAGAGATTGACTGATCCATCATCATTTATGTTCTCACAACACCCAGAACAGACACCTA---CTGCAGCCTCAACAGT--ACACTGTTGCACTCATCTCCTTGTATGTCTGCCTCCTTCTCCTGTCCTCAAAGACAGAGCTAG--TCTGTG--------GTTCACCATTCCTGGCCAGGCTGGTCAGCACACAGAGAGAATCGAGCTACTTGTTTTCACTG a score=24969 s mm7.chrY_random 25594231 1348 + 30114534 CCCTGAACAACACTAAACACCCAATAGATGTGAGCAGTCATGATCTCTAAAACTCAT-GCCATTTGTTTGTGTCCTACTGTATCCTCTATCACCAAGGGATGGCTTCTTTAA--GACTGTGTCCA--GTATGCTTTCATGCT-GGAAGCCCTCC-----CAGAACAGATGCACTGGTCACGAGGCAGACCAAATGGCCACTCAACCCCTGGTCAGGTTTTGCTTGACCTAATAATGGCTGTCGGGGCTCTGGG-ACCTTTCCACGTCTCC-AGCATCTATATAAGCTGTTGCATCATTTATTTATTCAACAGACACTGCCAAGGAGGGGGAAAAAAAAAAACGCCTTGTCTTCA---GTTTCTCAG-AAAAGGATAGC---TGTG-----CTTCCAAAAAGAGAAAAAAGGAGAGTGGAGGTTGTGGGTGGGTTTGGTTTCAGCACAGA-CTTTAGAAACATGG------CTTCTCAGATTAAAGAGCATGCTCTTGCTTTGCTCAGTCCTAAGCAGAAAGAAAGCTCTAGGCAGTAACAGACAGCCACC----CGCTCTGGTTCTATTGGGAATTGAGACAAGGTGACAATATAGCATCTAAGTGCTTGCAGGCCAGAAGGCAGGATTTACTATGATCATAATAA----AAACGGAGTGGCCTTCATTCTTCCCCAGTTGCAC---AGAGTAT-GGCATAGCCTCGTGGTACTTCCAGGATTAGACATGGCTAGTACTCCCCTGTCTGAAATAAAAAGGAACCTAGGAAAtacccaaggtcatacagctaaggagagcatagcaagcactcgaagc-----------------ctggtctgtctgaACCGTTCCCCATTCCCAGATCTCAGAGGGGG-ACCCA----CAGTGACAATCCCCAACACCTTTCCCCTTAATTTTCTACTGCTGGGTGATTATAAATTTTTAATCTGAAGTAGGAGGGCTTAAAGTCAATTTGTTTGAGTATAAATTTATTTCTAAGTTCAGCTCTTATTTGATATTCTGAGCATGATTACCCCAGGATGTAATTAGCATTTGTCCTTTCC-TGTTGTATCATACTTACAGTGACTGCAAATGACTTCATGTAGAGGTGTACTGTACAC---ACGAAAGC------TCCAACCCTAGGACTATGCGCTCATTGCTATCTAATTGTTA--TGTGGGAACTAGCAAGGACAGTGCATATAGC----------TGGCATCAAACTCTAG----AGGGACCTCCCCAGCTTGGAGGAGTGG--TTCCCAAGACCTGTCTTTTTCTCTA---TCAGATGTATGGACCTGGATAGTAGAATGTTTTCATGATTGT-------TGTTTGG--TGCAG---TTCTCAAGGGGACAGTA-AGCCA-TCAGAATGAAATGGCTCTCAGAGACATAGGAGTGGTCTACTCTCAG----TGACATTCAGTGCCCCTA s bosTau2.scaffold1191 248804 1394 + 271640 CCCTAAAAAATGTCTGGCTCACTATAAATGTGAGCTAGAGTAAACtttataaattattattatttattttcttcttattatattttGTTATGCCTGGGGAAGATGTGATGAGTGAATGATAACCATAGCATGTTTTTGTACTTGGGAGTCCTTCACCTCCAGACCATGGGCTCCA------------ACCAAATGGTTGCCTGTCATCTCTCCAAGCTCTTTGTGACCCAGTTGTGACTCACTGAACCCTGGGGATGACTCCAAATCTCTTAGCATAAATGTTGGTTGCTACACCATCTATTCTTTCAATA-ATATTGTTGAAGAAGG-------AAAAAATGCATTAACTTCATTGGTTTTTCAGCAAAAACATAACCACTGTGTTAATCTTCCAAAAGGAG------------------------GGGGACTTTTATTTAGCACAAAGCTTTAGGAAAATGAAAATGACTTTTGAAATAAGAGAGTATATTTTATTTTTGCTCAATACTGAGTAGATAA----CTGTAAATGGTGACATTCCCCCACCGCCACCTTTGGTTTCTAATAGAAACAAAG-TAAGTTGCCAATAT-GCTTCTAGCTGCT-GCAGGTCTTCAGGCAGGATTTATTATAATTGTAATAATAAAAAGTAGATAGACTTTTATGCTTTCCAAAGTTCATTTTAAGGTGTCAGTGCAGCCTCACTGAACGTTCAGGATTAGGCATGGCTA-TA-TCCTCAGTT----GTGAATAGGAACTTGGGATACACTCAAGGTCTTACAGATAAGAAGAGCAGGGCTGGGGCTCAGTGCAAGGCCAGCTGCCTGTGTTGGTTGATCTGAAATCTTCCTGCCACCTAGATACATGAGGGGGCAGCCAAGTTCAGGGATACTCCATTGAATCTTTCCCTTCAACTTTTCACTTTTGGA-AATTTCAAGTTTTTA-TTTGAAGTGGGAGGGCTTAAAATCAACCTTTTTTTTTA-AAGTATAT------GTTCAGCCTTGATTTGATGTTCTGTGCATGATTACCACTTGGTGTGATTAGCATTTGTCCTGTCCTTTTTTTATTACACCTTATGTGACTACAGGTGGCTCCACATAGAGGTGTGGAGCACACTTTAAGAAACCCTTCTGCCCAGCCCCCAGGTGGTGTGGTCAGTATTCCCTGCCTGCCAAGTGTGTGTACTGG-GAGGACAGAGGATACAGCTCAGAGCAGATGGTTCCATCCTCCATTGGCAGGGACCTCACCAATCTGAAGCAGAAGCCTTGACAGTATCTATCATTTTCCTCAAACCTGGGGTCATAAACCTGGCCTGATGTTTGTTCCAACAATTCTATCTGCGCGCTTGGGATGcagtgtttgtcaaggtgatgctatggccattttgggtgagactgttctcagtggtataagactggcc--cgctcaggacacaacgtttagcaccctta a score=17107 s mm7.chrY_random 25595804 991 + 30114534 TTTGATGACATGCATGACATGAACTGGAATTATCTCTGATGGCTAAATGATCTATCTGCCCATTCACTCTCTTTGGTTCTCAAGCAGGAAGAGGGACTTGGCCAAAGTACTGTTACTGTG-TTTAATAGAATGACAGAGATCAGAGAGAGCA---ATTCAGTGA-CACTCTAGGTCAGACA---TAaaatgctctacatatatcaaaccacttaaccct--------ccaacaagtctatgagctaaccactattaatagagcctcacactagt-----gatgcataagcaggcagacagg---aagcgactcgagcaagaccacaaagacagtC-------TGCCACAACCTAGCCTGTCTGGCCCTAGGTCCA------------------------AAGGAAACAAAAGTGATGTCCCCCCATCACACCACTCTACTGCACAGATAGAAAATTCTGCTTGAACACTTTCTCC--------AGCGACTCTCTTGTGAGACCCAGC--AAACTGAGTCTGT----------GAGTTCTCTGCAGGGCTTGGGGTCATAGTTGCA--CACCAGGAAGAGGATATGACCCCCGGAAGTGTGTGACAGCTACATCTGGGAAATGA--CAAGAAGagcagttcccaagaattttgttctcatgacctctttatgttcacaaacaccagtaaggtccctcaagcgcttttctttaagcgggtcatccatcagtatttattcaattagaaacaaaatgagagacacttgcaaatgcatagtcatttattta------aaatagcaataataaactcatcccgtgttggcataagtaacataatttgac-----aaatatattttccaaagcaattttataataaagagcattgcca---acatttttgcggtctctctaatatctagcttcacagaag-tatccagagcctcaaatctggttgtgcctccc----atgtgcattattgggttttttaggttagattatgtgaagaacataataa-----tagtaaaggaattatgcagtaagaaaaggaaggagtacttcaataatcttctctgataattgcagacatt s bosTau2.scaffold1191 250987 1037 + 271640 TTTAATGACACATGTGACACACATTGAAAATATTTCTGATGGTGAAATGAACTC----CACATTTGGCCTCTTCCATTCTCAAACATGAACAGGGACTTTGCCAGAAGTGTGTGGCTTTTCTTCAATATAATAACaatagtaagcactaacatatatatagtacttacctcatggcaagcactgttaagtgctttgcatgtattaactcatttaatccttccaacaaccaagaacgctatgaa-taactgttactaata-----tcatgccagttcatagatgagaaagcagtcacagagagataactgatttgcccaaggtcacacatgtagataatggaggattccagtccagcctgtctggctgcagagccagaagttaaccatccatgctTGAATGAAGATGTGGAAATGAAGCCCCACC--CCCAGCACCTTGTT-----GATATCAAGCTCTGCCTGG-----TTCTTCTTATTACAAATGCCTCAGCTGTGCAATGCAGTGGAAACTGAGTTGCTCTGAGATCAGGAGTTTTCTGACAGGTGGTGGGTCAT-GTTGCAAGTACTAGGAATAGAATATGGAATCATGATCTGGCTGGCAAAT---CATGGTAAATGATTTATGGTTGGTAAATGATaaacgtttttgtttcatgaccactttaaacatttcattgctaatga-----------cactttgggtta-------tatctactgatatttactgtattcgaaacaaaaattgagaagattccaaatgctaatttattaacttatttttttaatcacaataataaactcattacaggttaacatatataac-tgatttgacccaaaaaatagattttccaaaacaaaattagtgtgaagagtggtgccgtgcacatttttgcagtctcttcaatgtctgcttcaatagaggacagctagaccctcataact-----tccctcccttcaatctgttgtgatatgctgcataggttaaagtatgtgaagaaaaaaatagggcctcactcagg----tatatagttggaaaagagaggagtattt---taatcttttcagataatcgtagctatt a score=12088 s mm7.chrY_random 25599664 599 + 30114534 tttaactgtagttcagtgcctttctgaccacagggccc-tgcgtgactctcacatcacacacccaagaagctggtccCCTGCTCTAGCAGTTTCTTTTCCTGCCACACTGGACCCTGAAGTGTTTGACTTGCCCTATCGCT---------TTCCAAGGTATATTCTCCCCTCTACTTGAAAC-AAGATGTCATTCCGGTGGCCCGGGTATCTCC-TTTATCTCCTCCTCCAGCCTCTGCAAAGCCTTCACATC---CTTAGGCAAGCACACAACGCACGTCCCTCCAGATCTGAACTCTGTATCTCTTCTTCAGTGTGTATGTGGCTCTCCCTTTTCCTCCTCTAGGGATGTGGCTCTCTGACTACTGATCTCCCCAGACAGCACATAGTTTCTGTGGACTGTAGCTGGGGCTGGTCCTGCTCATCACTG--------ATGCCCAGCACTTAGTCCCTGATAAATATTTCCTGCCTGAATGGATGGATTATCTATTAAGAAAATGTCTGTGCAACAGGAGCACAAGTATTCAGTATGCCCAG-------TAATGAGTGTGATAT-------------GAGTTCTTGGTTATATTCAAAAGGGACTAAATTCTGTGTCAGTCTGAGTTGGTGAACACTAAGTG s bosTau2.scaffold1191 256381 621 + 271640 ttcaaccat-gcttagggccctcttgagcacacggcccctgagtgcctctccggttgcaaatccatgacgctgg--ccctgccccatt-gcctctactcctgccacacgggtctctgcagtccct--cgtcccttcctgctgaagggcactccca---tgtgttaccccccctgcttgaaactcagtttactctcctgtggcctgagtgtctccctttttctcttcctgtgatctcagctcagccatcacatctatcttagac---ctccctgccca-gtctccccaggtcaggactcagcacctc--cttcaatgcacatatcaccatcaccatccttcctgacagcaggtgattatataattccttaacttcctc--ctacactggactgctatcaccccaggactgggtggggtttgatcatcactatttcatcagtgctgggagcatagttcctaataaatatttatgagatggatgaatgggtgaataaatgaatGAACGTTTG--CAGCCAGAACACAAG-AGTCAG-ATGAAGAGGTGGGATCAATGAGGGTGATGTATTTCACTAGGGTGAATTCTAGTTTTTGTTCAAAGGAGGCTAAGTCCCATCTCAGTCTGAGCTGGTGCAGACTAGGTG a score=45736 s mm7.chrY_random 25600933 2011 + 30114534 AAAATGCTAGTTCCACTGAAATACAGTGAGATA-----GGCAAGATGGAAATATGCAAGCCCAAAGTTTACTTCTCTTGCCTGCCCCTG-------GTCTCCTCTGTGTCCTTCCCCCACCCCACCCCCACCCCCTTGCTTCT---TAAGGACTGCTGAGTCTGGTGAACTACTTTGCTTGTGCTCAAATGTTTCCAGCAGAAAATTACCCTCATCTATTTTAGGTTTAACTTGGCTCTTCAGAATGAAATGGTCTGATTAGCCTTATAATCATGGTGATGGTGGTGGTTGGGCACTCCAGAGAATCCTCCGGAACCAGTTTGAATACA----CTGGTAACACTGTCAGAGA-GGCACTGATCTTGGGATAAAATCACAGGGCA---------------CATT-----------AGCTGATTCAGAGCAGGAATTAAACCCAAGGATCAGCTAAAACCTATTCTTGTGTCCTAAAAGCTACAGAGATATGCTTATCAGAATGAGCAATGCTGAGATGCCCAGCAAAAACCTTGGGCAGTGGCAGCAAACGGGAGCCTGGGTTCCTGTTAGAACTTGGCCTACAA----CCCATTTTATTCACTGTAGTATATCTATATTTGAGAAACAACCTGGAAGGGAGGTAGTGAAAGTAGAATGTTCATAATGAAATTGAAGATAAAAGAAATAATAAGAAAAGCAAAAGCCCACGGGGAACATTAGTATTGATTGAACATCTTAGAACACATTGTT-TTAAGAGATTTGGGCATGCTTCCTATATGGAAAGTGAGGGA---CTCAGCTCAGCCACACATGAATTAGAGTCTGAATATGAATCATGGCCACAGGCA-TCCCTGGGGTGTGGGGGGGGACTCTTTAGACATCTTGAGACTCTTTGGAGATACAGTAATAGATTAGAACATATGGGGGCTTACAAGTCAGCCATACCTGAGTTTAATGCTCAAGTTTACCTCAATGACATTGAGCAAATATGTTCATAGTTTtcctcctcctcctccttctcctcctccttctTTTTCTAATTTGTATAAGTTTGAGTCATGAAGgcctataatcttagtatttaagaggccaaggttggaggatttcgaggtccagactgtcctgaactaaatagtaggatccagtctcaacaacaaaaGAACAACAGTGATTTGTATAAGCTTGTATAGAAGAGATGCCTTGTATATTTGCTATGAAGGTCAACTAAGATTGCCTGGAA------ACAAAGATCATTGCC----CAAAGCAGGCATGCAATCAATCCCATTATTCCTTTGCTTCCAATTGTCTGCTCTTATCAACAGCTGGACAGGATCTGGGCTAGGGAGAAACAAGCCAGCGCCTCTGTCACGCTGAGAGCAAATTCTCCTAGGAAGT---CACA---------------TGGTCCAGGCAGTATAGCTGAAGCAATGTCAGACCGAGGGTGAAACATCTCAGAGTAGATGTCCCTCTCCCT--AACTTCATCCCCTGGATCACCTTAGCAATGACACACCTAAAACCAAAAAAGCACTGTCAATTCATTTAAACCTATTACTTCATCTA-----TAGCACACTTGGAATTTGAACCCAGATATCTTGGCTC-----TGTACTTCAGTAGCCTACAGATCGGCTTCCCTG---CCCATCTCAGA--GTGCTCACATATCCCCCTGTACTGTAAGTGGCC--TCTGGACAGCTGAGCATCCTTGCCT---GAGGTCTACAAGTGCTCTCAAAACCACAAGAGGACATGTCTCAAATTTTCAGCACATTTCAAAACATTTACTATAGGACTTACTTTACAGTCAGAGTTCAAGAAATAAATATTCACGAGTAGAGGGGGGAAAAAAGAAGATTCTTGTGGCCTTGTAAATTTAATGCAGAGAAACAGTCATAATAA-ACATTAACCCAGCAGAACTGGCTAAATGCATTAATTTCACAACATGTTCTGCTCTTTAAGAAGTTAGCTGTTTAAGCTCCATGGGGAATCTTGAACTCACAGAGACTCACTCCCACTGTTTCAGAAGAGAAAATTGC----------------------CTGCCTCCACTGTGAGGGGAGGGTAGGTAGAGAGATATAATGGAGGCTG s bosTau2.scaffold1191 257335 1866 + 271640 AAAATACTGGCTCTGTGGAGTTGAACTGAGCTGCATTTAGTTTCATGAAAATATGTGGCCCTGAGGTTTACTTTTCTCAGCCTCCCCTGTGTCTGGATCTCCCCTTCCTCCTTTGCCTTTTCCTCCTTCCTCTCCTTTCTTCTGGTTCAGGATTTCTGAGCCTTGAGGACTACTCTAGATGAGATCGAGTGTCTCTAACAGAGAATTGCCCTCATTCACGTTCAGTTTAATTGGACTTTTCAAAGAGAAAGGATCCAATGAGTCTTAGAATTGTGGCAATAGT------TGGGAACTTCAGAGAATACCCTAGAACTAATCTGGGCACATTTACTGCTAGTATTCCCGTAACTGGCATTCATCTTGAGATAGAATCTCAAGGCAGGCATGTCAGAAGTCCATCTCTTCAAGCCCAGCCAATTCAGAGCAGAAATGAAACTTGAGGGTGGGATGAAACCCCTTCTCCCACCTTGAAGGCTGTAGACCTGGTCTTGTCCAAGAG-GCAGTGC--------------------------AGTGACAGAAA--GGGAAGCAACCTTCTTGTTAGAGCCTGGCCCACAAACTGTCTGTCTTGTTCATTATTCCATGACTACATTTGAGAAATGGCCAGGAGGGAATGTAGTGAAAATGGAGTGTTCATAATGAAATTGAGGATCGATGAAATAATAAAAAA--CAAAAGCCTAAAGGTAAAATTGGTATTGATTGGCCATCTCAGAAAACATTGTTAGTAAGAGATCAGCGCATGCTTCCTCTATGTAAAATGGGGGCTTTCTCTCCTGAGCGAGGCTTGAAC-AGGGTTTTAGAATG-----TTACCAGAAGCAATTCCTGTGGTG--------GTCCTCTGAGA-------AGGCTGCTTGgagatggtgcagtgaagcagaaagggtgtggagttaggactcagccatatccagggtttatac-caactttcactctgtgaccttgagcaagca-----ataacttctctgatcct-----------------ttttgttgttaatttgtactaatt---------------------------------------------------------ggtataaaatgtc--------------------------------------------------------------------------tgccttgcaggtttattgggatgattaaagcagatCACCTGGGTGGGGGTACAAAGCTGGATGCCTGGGCAGAGCAGACATGCAATCA----TGTTATCCCTTCTTCTCATGGTGTCTGTTCTTTGGAGCAGCTGGGCAGG--------------------------TGCCT-GGTCACTCTGAATGTGAGGACCCCATTAAAATATATACAGTAGGCACCTCACCCTGGTCCCAGCAGTGCAGCTGGGACAATGTCAGACCGGGATTGGGGCATGCCAG-GTAGATG---CTCTCCCTGCAACATCATCTCCTGGTGC-TGttactgatgacacagttgaaacccagcgag-----tcaacataatttgac----taaatcagctagaaagtagcaaacctggaacatga-ctcaggcccttgggctcaagcctacattttattcaccagCAGCCTGGACCCCTTGATGCCCATGTCACATGATGCTCACCCAGCTCTTTGTACTATGAATGGTCCTTCTGGATATCTACATATTGTCTCCCCAAGAAGTCTATAAGTTCCCTCAACACAGGAAGAGAATGTGTCTCAAACCTTTAGTACTTTCCAGAACACTTACTACAGGGCTCAG-----AGTCAGGGTTCAAGAAGTCAATATTTGCCAGTTGAGGT----AAAGAAGATATTTTCGTTGCTTTATCGTTTTAATGCAGAGAAAAAGGTATAATAACACATGAACCCAGCTGGGGGAGAGAAATGCATTCATTTTACAGCATAGTCAGTTCTTTAAGAAGGTGGTTTCTCAGGCTCCATGGGAATTCTGAAATTCACATAGACTCACCTCCACTGTTT--GGAGAGAAGATGGCAAGCTCAGAGTGGTGTCCGTCCCAGTCCCCACAGAGAAGTA---GTGGGT-GAGAGACGTGAAGGGGGTTG a score=25806 s mm7.chrY_random 25603022 705 + 30114534 TCAGATGAGTGAAGGCTCTGGCACAGGTCTGGCAGGACCTGGATCACAGTG---------TCTACCCATCTCCT-GGTCAAGCCAATGTGGCCAGCCCATGCAACACACTTTCAAGCACTGAAAATGTCATAATAAGACAATAGACTGGGCAAAGCTTTGGCCTTTGTGTCTTTCCATCAGCAGTCCTTTGTCTTTTGATTGTTTGCAAGTTCCTTAATCCCAGACTGGATAAATGACAAG-GGGAAGTCTGCTAGGAAGA---AGAAACTGAAGAAAGTCGCCA-----CCCATGTAAAGAATACCC----AAGCCCCT-----------------------GATGGGTAACATCCGCATGCATGAGACACTTCCACCTTCTCTCTAGGAAATGAGCATCAGAGGCCAAGTCTAG-TTGAGCATGGTGAATATACGGAGGAAATTATGTAGAAGTTTTGGGCTTGTAGATCCAGCTCTGTCGAGGCACTGTGTTGAGCCCAGAGGCTCCCAGCACTCACCCTCACTGCT-CTTTTCTCCTGCAGGGGAAATCTGTGCATTCAAGATCCATGGACAGGAGCTGCCCTTTGAGGCTGTGGTGCTCAATAAGACATCTGGAGAGGGCCGGCTCCGCGCCAAGAGTCCCATCGACTGTGAGCTGCAGAAGGAGTACACGTTCATCATCCAGGCCTATGACTGTGGTGCGGGGCCTCGGGAAGCAGCCTGGAAGAAGTCACACAAGTGAGCTCCCTG s bosTau2.scaffold1191 259541 728 + 271640 TAAAAaagatgtagctcctgactcaagaggtccagggtccagatcctaggagcctgtaattctaacaagctccccagggatgcccaggtcactgcttcacagagcacactttCAAGAATCGAGGATGTTGTCACAGAACAAAAGACAGTG-AAAGCTTTGGCCTTTTTCTCCTTTCCTCTGTAGTCATTTGTCTTTTGACTGTGGTCAAATTCCTTAATCTCATTCTGGGCAGAGGGCAGGCGAGAAACCTGCCAGGAAAACTGGCAAACTGGGATGAACAGCCAGCTCCCCTGCGTGATGACCGCCCTCCCCACCCCCTTGCTTTTTCTGCCAGCTGCACTGGATGGGGGACATTCCGGTGT---------TACCACTGGCTCCCTAA--------------AGGCTGCTTCCAGCTTGACAATTATCTGTGTG-GAGGGAAATGGCCTAGGGCTTTTGGGTTTGCAAGTCTGGTCCAGTCGAAGCTCTGTGTGCAGTCTGGCTGTTCTTAAGACGCTTTCTGTCTCCTTCTGTCCTCCTGCAGGAGAAATCTGTGCATTCAAGATACATGGCCAGGAGTTGCCCTTTGAGGCTGTGGTACTCAACAAGACATCTGGAGAAGGCCGGCTCCGTGCCAAGAGCCCCATTGACTGTGAGCTGCAGAAGGAGTACACGTTCATCATCCAGGCCTATGACTGTGGCACGGGGCCCCGGGAGACAGCCTGGAAGAAATCTCACAAGTGAGTGACCTG a score=22390 s mm7.chrY_random 25604397 546 + 30114534 CCCAGAGGGAGGGGAAACAGAGCACTCAGGTAACCATTGTCCTGAGCATGTTGAGGCCTCTTCACTAACATGGCCTTGGG--CTAGATCAATGCCCAC---AAATACA------TGGTGTTATTCCTTTTTTACCATTCATTCTTCTTT--CTGATTGGTGCTCCAGGGCTGTGGTCCACATCCAGGTGAAGGATGTCAATGAGTTTGCACCCACCTTCAAAGAGCCAGCCTACAAGGCCATCGTCACGGAGGGCAAGATCTATGACAGCATCCTGCAGGTAGAAGCCATTGATGAGGACTGCTCCCCGCAGTACAGCCAGATTTGCAACTATGAAATTGTCACAACGGATGTGCCTTTTGCCATTGACAGAAATGGTAAGTGTCCTGAAAAGATCCCAGT--ACTGTCG-AGGAGACAAATTCACTGTCCCTGCTCTC---AAGACCAA-----------GAAGGGCC----CCAAATGGTACATTCCTAGAGACCCT-ATCTCCTGAGACACTATGACCCAA-------------TTCTGCACTTGAGTTGATGGCTCATTTATAATTAGAACCTTTTTTATGTCTAAACTA s bosTau2.scaffold1191 261472 586 + 271640 CTCAGTGGACGGGGGGACAGGGCCCTCAGACAACAGCCAACCCAGT--TGTCATGATTTCTCCATTCTCGTGGCCTTGGGGCCTGAATCAGTGCCCATGGGAAGTGCAGGAGTCTGGTGCAATTCTTTCATTACTGGCCTCTCTTCCTTTCCTGTGTATTGTCCTAGGGCCGTGGTCCATATCCAGGTGAAGGACGTCAATGAGTTTGCTCCCACCTTCAAAGAGCCGGCCTACAAGGCTATCGTGACGGAGGGCAAGATCTATGACAGCATCCTGCAAGTGGAGGCCATCGACGAAGACTGCTCCCCCCAGTACAGCCAGATTTGCAACTATGAAATCGTCACAACTGATGTGCCTTTTGCCATCGACAGGAATGGTGAGTGTCCTTAGAGAACCCCGGTGGATGGGAGCAGGGAACAGCTCCACC-CCCCACCCCTCTGAAAGGTCAAGTTCAGGCTCTGAATGTTCTTGGCCAAGTGATGCCTCCCTGCCACCCCTGATCT----AGGCTCTGTACCCAGAACTTGAGTACATTCCCTGCACTAGAAGGGATGACTT-CACATAATTAGCAGCCCAGTCAGGTCTAAAGTA a score=41208 s mm7.chrY_random 25605316 2158 + 30114534 ACTCTTGCCAACTTTCCCTTTGAGAATTTC------AACTGTAGCAGGGCCT-------TCCTCCCAGTTTGAATTGAACTGAAAATAGACCCATAAAACTATTTGGATATTTCTC-ATCACCATTAATAT-GAGTCTTATTATAGTCTACACAT---GGCCAAAGGTCCAATCAACTCAGCCCACTTGGCCT----ATAACTTGATTGTAATGAAGTAATA-CTATTTGCTGAGTACTTTGCT-CACCATCAGTGTGAGT-TGTGTGTGTCTGTATATTATCCCCACTTCATTTCAGATAACATTTGAGTAGCACAGAAGGCTGCAAAAGTTGCAA-----GAAG------CATTCTGTAA-------CCAAGTGTTAGGTTTAG-CAATGGGCTCAGAGTGGAACTAGAATGGAACTCAAGAGAGACACAAGCTCACTTTCATGGAGATTACCAAACATCAagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagTATTAAGAGAAAATGAAGAATAAAACCATGTACAAAACATGCTGGGAACTGGATTTAGACTGAAAATTAGAGATT------TGAGAATCTTTCTAGCCAACATCTACAGGATAAA---------CAAATACTCCCAAGTCTTCAGGAATCT------TTCATAATATTGAGATTAAAAGGAAGCTTACTAGCTGATATAATCTTCTGCATTCTCAAAACAATGGTCCATAGAGGCAGGGAACACCTCCACCCCTAACTTCAAGTAGCTTCCTTTATGATCTGCCT-------------------------AACTGTTAG----------------------TACAAAAGGCTAAAAGGCATGGGACTAAGAATTAACCTGTCTGGACATTATTATTC-----CTAATTATACAGAGCAGGAGATCTGTGCACAGGAAAGAGAAGATAGGAATATTGAAGTG-----------------------AAGATG-----AGTTCTATTTATAGAACCATCCAGACCCTC-----ACAGCTTCTC-TATTAAGCCAAGCCTACAGGCTGGCATATACCCACcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac----------------------------------------------------acTTGGGAATTTGGGCTATGACAAGTACATGGTAAATAGCAAG-CCATCTGAGTAGAGA-CATCTGTGACTGGTGGTCAAGTTCCACTTAGCCTCTGGTGCTTGTTCTCAAGAGCT----CCCAGGGAAAGATAAGATGCAAATTCTTCCATCTGAGGGTAAACTGCCCCAGTCACGAAGATAATTACTCACCTTGATGAGCCATTCCACTAACATATGCCAATTTATTTCCCTGGCTGTCTCATTAAAAGTGAGTAATGGGCCTTTGCCAGGCCTCTGCCTCCAACTTTGGTTTACAATGTAAAGATGGTGAGGAGAGTTGGCTCTCATAGAGAGTGTGGGTCCCCAGCAGAGAAGTTTACAAAAGCAGCTATCCAAGTAATGAAGACAGGACCT--------------GGGCAGCTCCCAGTCTAATGAGCTTCCCAGCAGGCCCTTATCCATCACTTCG-GTGGCGACCTTCTCAGCTCCTT---GAACTTCTTTGCATGTGAACAAATCATAGAAAGTGTGACTGAATGTTAGGTATCTCCCTT--GGCCACAGGTTCTCCACATTCTTTATCCCACAGCTAATTAGATGCCCCCAGGCTCTTTGCTTTAGGGGAGAAAGAAAGACACAGA--AGCAGGAAGGGTGAAAGACATTGGGTAGAGTCAGAATGACCTCCTATACCAACAGACCCAACCTCTTTCATCTCTAGACCCTTGTCCTCCTTCCTGGTCAAGCCATGGC---AGTTATCAACCCAAAGTCATTGTGGGGTTCTGAAG-----------CCGTGGATGGGGTCTATTCAGAGTACTCCCCAGATAAGCAGTGCTGAGTAAGGCTGCTATCTATAGTCCTTAGATATTTCTTCCTGTGACTGGGGCATGAGGG----CCACCCTCCATGCAATCT-GGGCTGAGATGATGGGCATATAACTATAACGTGAGGATTTTTCCACAATCTTGGAAAGTTCTAGATTCA--------GGCTCC------------TCCTGCTGGCTCTAGGCCAGCCTCTTTTTGATAAGCAGAACCTGGATCCCTGTTTTCATTAGACAAGTGGAGAAACTGAACCCTAAGGCAAGAAGAATT---------------------------------------TCCTA-------------------ATTACTGTTGGCCCTTG-GGTCTTACCACTACAAACCTCTTCCTCGATGATAATTGAAAGGAACAGAT-----TGGAGTTTAGGTCCATAAACATAGTGT s bosTau2.scaffold1191 262991 2389 + 271640 attcTTGCCAATGTTT--TTTTAGAATTTCTCCCCTAATTGGAATGAGGAATGAAAGACCCGTCCCACTATACCCCAATCTCAAACTAAACTTAGAAAGCCATT-GGATATTTCCCCATCAGCATTATTTTTAAAACTCATTCCGGTATAAACACCAAAAGCAGAGGCCCAGGCAGCTCAGCCCATTTCAACTCTCAATAATTTGATATTAATCAAATGATAATTATTTGCCAACTACGTTGTTTCATTACTAGCATGAGTGTGTGGTCATATGTATATTATCCTTATTTTATTTTAAACAAGATTTAACTG---CTCAAAGACGTAAACTTTGTATAACCTGAGGTtcatccactctgtcaatgtttattaagtgccaggcacagtctggaaactgggaatagagagagaagggaagtcatagcataagcgggcctatccacatggagcttaccatctAGCAAAAT-----------------------------TaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaCTAGAAAGGCAGCATCAAGG----ATGAAGG------TGGTGCACAAAGCGTGCCCTGAACCAGACCCAGG--GGTGGGCAGTGactcagccatgagcctcctggtagccagtgcctagagggaaataccatcagtcacCTGCTTGCAAATCTTCAGCGCTTCCCAGACTTCCTGATGTTGAGACCAGGGAGAAACATACCCTGCAACAGAGTGCTCTGCATCCTGGGAAT--TGTTACA-----------GATTCCCTCATCCTTGGCATCCAGGAG-----TTTATCATCTGTCTCAAAAGATGAAACCAATATTCATAAAGCAGATAACGTGATAATAGAGACATTTCCTTATAAGATGCTCAAACACATGGCGAGTGTCAGTCACACACCTGGGCATCACTCACTAGAGGTTAATTCTGTGGGACACAAAATCAGTGCATGAGGAAGTAAAGGATAAAATACTGTACTGTAATTAAAGTTTGGCTCAGGATTAAGAAGCAGGTAATTTCATTTGTAGAGCCTGCCAGAACTGCTCTGGATAGCTTTTCCTACAAGGCCCTGTGACGTAGCTGATCTGTCCCCACCACACACACACACACAGGCACTCACACCCGACTGTATAAA-ATATAGAGTAATGCTTTGTATTTTTCCAGTCTCCAATGGTCAGCTGTGAAGTCTATGACTCTGAGAGCTCTGGAACTGGGGGAGTGACAAGTCCTTGCTATAGAGCTGGACTGGATGGGGGGAGGGCATCCAGAACTAGTGGTCAAACTGCCCTTGGCCTCCTGCCTTAGTTCTGGAGAGCCACAGCCCTGGGAGAGAGGAGATGCTAATTCCTTTATCAGAGGGTAAACTGCCCCAGCCATGAAGATAATTACTCACCTTGATGAGCCATTTTACTAACATATGCCAATTTATTTCCCTGGCTGTCTCATTAAAAGTGAGTAATGGTCCTTCGCCAGGCCTCTGCCTCCAACGTTGGTTTACAGCCT-GAGATATAGAGGAGAGCGGGCACTCCCAGGGATTGTGGGCCCTTGACGGCAAGGTTTACAAAAGCAGTTCTCC-AGTAATGAAGACAGGACCTCAGGGCAGACACAGAAGCAGCTCCCATTCTAATGAGCTTTCCAGTTGGCCCTTATCCATCACTTCTCCCAGCGACCTTCCCAGCTCCTTGAAGAAGTTCTTCACATG----CACATTAGAAAAAGTACTGCTGAGT-TGAGGTCCACTCATTCAGGCCCCAGGCCTTTAGGGAGATTGGCTCCAAGGCCCTTCCAC--CTGCCAGACTCTTTGCTTGTGGGGGAAAGAAGGGAAACAGGGCATCAGGGAGGATAGATGACATGGAAGTGATT-----TGACCTGTCTGAACGCAAGAATCAACCTCTTCCAACCAGGGGTCCTTGGCCTCCCTTCCCTTGAATTCCTCCCCTGAGATATCATGGC--GGTAGCAGTGAGGCCTCGAGGAGAGGCAGTGCCTGTGGATGAAG----TTAACAGCTTACCCGGCATAGAGTGTTCCATTCATGAC-----ACCATGATTATCAGATACTTGCCTGGGTGACTAGGACATGAAGGTTACTCACTCCCCATGGATTTTCAAGCTGAAATTATGAGCATGTAACTA-AGTTTGTGG-CATTGCCAC-CTCTTGGGATATTCTGGATCCATTTCAGATGGCTTCCAGTCCCCTGTATCTTTCTAGCACTTGGCTAGTCTCTCTCAGATTGCTAGGTTGTAGATCCTCACTTTCGTTGAACTGATGGAAAAACTGATTCCTAAAGAGTAAAGAGTTGGCAGAGTGGGGACTGGAGCCAGGTCCCCTGAATGTTTATCCCAAAGCTTTTTCACcagtgatattaccactgtcctcagtgatattaccactg---------tcctcagtgatattTGACAGGAATGTATGACAATGGTATTTAAGTTCAAAAATACAAAGT a score=18906 s mm7.chrY_random 25614310 505 + 30114534 TCTCTGAGCTTTCAAAGCA---TTTTTAAATGTGTGTCTTCTCCCCAAACAACCCTCTCCCATGCAACAATGGGCCACATTATTATACCCTCATTTGTGACCTAATGTTTCAAGTTCTTTGCTTTGAAAGTCATTTGCGCATGCATGGAGGTGGCTGTTGGTGGGGAAAGTGAATTAGTCTCCCAGACAGTTTCATTAAGACTTGTTCCGGAAGTAGAGCTGCAACAAATTGAGCTAAAGATTCTG--TTTGTGTGTTTATTTTTCTGCTACAATCGATAGTGCTTTGTCAGCTTAATGCTGCACCAATTGTCAACCCCCAGCCTTCTTCCTCTTTTAAGTGGCGTGCATTTCTGGAGTCATTTCATTCTAAGGAAAGACAAACACTTCTGTTCAGAATTCAATCTGATGCTGCAGAAACAT-TTCTTGTGATGAATTGAAGGTACTTCTTCTTGGCAGAGTCCCTCCC-TGTGTTGAGGACAGCCACAGACCAGTTCGT----AGAGTCCATAGA s bosTau2.scaffold1191 266952 509 + 271640 TTTGTGATCTTTAAAAAAAATGTTTTTTAAAGTGTGACTTAGCCAAATACAACCCT-TCCCCCACAACCATCAGCAACATTATTATACTCTCATGTTT-ACCTAGTGCTCCAAATCCTATCCTCTGAAACCCATTCTCCCTTGTGTGAAACTGG-TGGTGGTGGAGAAAGCAAGTTAGTTTCTCAGACAGTTTCATTAAGACTTCTTACTCAAGTGGAGCTGTGGTAAATTGAGCCAAAGATTGCGGTCTTGAGTGTTTCTTTTTCTCCCACAATCAATAGTG-TTGCTCTGCTGAATGTCACACGGCCTGTAAACCCTGAGC---CTTCCCCTTCTACGAGGTGTATCTTTTGAGAGCCATTTAACTTTAGAGAAAGATAAAACTTTTTGTTCAAAATTCAATTTGATATTGCTGAAGCATATTCTCATGGTCCTATTACAGCGCTTCCACCTGGCAGAAGGACTCCCTTGTGATGGCTATAACCATGAACTAGTTTGTTAACAGAAGCCACAGA a score=46623 s mm7.chrY_random 25615503 1616 + 30114534 GTCTGTGTTTGTTGATTTGTTTTCTTGTTTCTGTTTTCATAATTTCACTATGGGGTAAGAA--AAGATAACATCTGAGCTTGTATTTGCTGTCAATGCCAAAAATCAAAAGgagagagagggagagagagagagagagagagagaaagagagagagaaagaATATGAATATAGGGAAGGAAATGGTTCCCAGAAATTGAAGATCTTAGTGTCTAGCACTAAACACTTAAAAGTATTGAGTTT------GGCCTTTATTCACACACACACACACAACCGGGAACAAAATAACATTCCACCAAAA---GCCAAAAAAAAGCAAATGAACAAAAACACAGCCAGTCTAAGTTTTGCTCATTAATGACCAAATATTTATTTCTGATCATAATATTAAATTCCTCAAAGCAAATGCCCATGAACGGCTCTGGATGCATTGTTTGGTCTCTCTTGGAGAAGAAAAATGTCTCTTTCCTCGGGGCGAGGAATCTGTTATTCTGTGCAGCTTTCAGAAGAGAGGTCACACATTTTCT--TATTGATTTTACTTCCTATTTGGTAGCAAAATAATGTGAGAAGAAGCAGTGAGCGTTCCTGGCGACAAGCCCAGATGCTAAAAATGA--CGGGCCAGGCTGTTGTCTGGATTCCATCTCTTTCCCAGAATCCTCATGGTAGATGGGTACTC--TGCCCCTCATCAGAGGCA----CACGTGTGCAC-TTTCAGGGTAGTTCTCTGGCAACCCACTACTTGGAAGCACAGACCGGTTGGACTCCAGATGT-TGCTTGGAATTCTCTAGCTGCCCCATTGCACAA--AGAGATGCTCCACCCAGTGGTCCCCTGGAACCTACTGTCAAAGCACAAGGGGATTATGGGTGGCAGCTGTG-TGTCTGTTTACCTTAGGTTTCACAAAGAGGT-------GGGGGCCATCATTTCATTCTTTCTGAAGGCTGATGGGATGAGAGGGAGAACTAGAGTAAGTGCAGCCTACTCTACATGGTCAGAAATGAATGTGTGCATTCCTGT-TCTTCAGGCAACATCAGGAACACTGAGAAGCTGAGCTATGACAAGCAACACCAGTATGAGATCCTGGTAACCGCTTATGACTGTGGACAGAAACCCGCCGCTCAGGACACCCTGGTGCAGGTGGACGTGAAACCAGTGTGCAAGCCCGGCTGGCAAGGTGAGCCTGAGTTTTGTTAGTCCTGCTATGTGAAGGCAACTTGGCCTGGGGCACAGGGGGTACCGGGTGTGCCCACAAATC-TCACAGCACTTGTCTAAGGGGAGTTTTAAAGTATAG---------------------------TTATGTATTCTCATAACTTTTCCGTGGTATAAT--CTGCACTTTACAGTTAAGAATATCAGAGACAACTCAACTCTAAC-------CACAGATATTGTGAGGAGATATTGTCAGAGTCTGTTGAC------------------TTTACCCAGGAGTGCT-----------------GAGCCTGC------CCGATGCACATCAAGTTCTGCATCGCTGCTCAGCACATAGGGATTGTCTGCTGATCCTCATGCATAC------------CACCCAGGGGTGGGAGAG-AAGGATGGAGCCTCTGTTTGAGGGGGTTTCTGGA-----AGCCCTGTGCAGGGAAGGGAAACAGTGGCCCTCAGTGGAGCTTCGGTTTGTGTCAGTTTAGATCTTTCGGGAAGCAAAGACAGGA s bosTau2.scaffold1191 267875 1627 + 271640 GTATTTGCTTGTTGATTTGTTTTTTAATTTCCATCTTCTTGATTTTGCTTCTAGCAAAGGATGATGATATCATTTGAGTTCTAATTTGCTGTCAACTCTAATTTTCACTGGAAAAGAAA-----------------------------------AGCCAGAAT---------------GAAATTATTCTTCTGAAAGGAAGACTTTAATCT-TGGAATCAAACAGTTAAAATAATTAAATGCACATCAGGCCTTGATTCATTT------------TTGAAACCAAAATTGTATTTCAGCAAAAATAGTCAAATAAAAG------------------------------TTTGCTCATTAATTGTCAAATATTTCTG---AACCATTGTATCAAACCCACGGGAACAAAAACACACAAATGGCTCAGAA-ACAATATCTGATCTCTCTTGGAGAAGAAAAATGTCTTTGCCACCGGGGCAAGGAATCTATTATTCTGTGTCGCTTTCAGAAGAGAGGTCACACGTCTTCTCTTATTGATTTTACTTCTTATTTGGTAGCAAAATAATGTGAGAAGAGGCAGTGCATGTTCCTGGCGAAGAGCCCAGATGTTAAAAAAAATACATGTTGAGAAGTT-TCTGAATTCCATCTTTTTCCCAGAGATTTCCTGTAACGTGAGCACACAACACCCTGTATCAGGGACATAGCCACATGGGCGCAGTTTAGGGTGGTATTCTGACAACCCCGAACTT---AATACA-ACCACTTGGATTCCAGACGTGTGCACAGAATTCCCTGCCAGTTCTGTCCCACAGCTGGAGTGGCTCCAGCCAGCTGTTCCTAGGACTCTGCCACTAAGGATCAAGCAGGCCACATGTGGAAGCCACGCTCCCTACGTGCCCTAGCTTTTATAAAGAGATAAGAAAAGGGGAC----ATTTTATTCTGG-TGAAGGCTGGAGGAGGGCAGAAGGGATTTTGAAGAACTGCAACTTGGTTCACTTGATCTGAAATTATTTTCAATGTCCCTGTGTCCTCAGGCAACGTCAGAAACACGGAGAAGCTGAGCTATGACAAGCAGCACCAGTATGAGATCCTGGTAACCGCCTATGACTGTGGACAGAAGCCCGCAGCCCAGGACACCCTGGTGCAGGTGGACGTGAAGCCAGTTTGCAAGCCTGGCTGGCAAGGTGGGCCTGC-TCTTGTCAGACTTGTCGGCTGAAGGCAGCTGGGCTGTGTGTCTCGGAGGGGCTGCACCTGCCTTCTGATCATCACAATGTATCACTAGAGGAGTTTGTAAAGCACAGGCACTCTGCTGTGAGAAATGGAGTAGCCTATTTGTTCTCACAACTCCTGGGTGATATATTGCCCCCACTGTACAGCTCAGAATGTCCAAGGCAACTCA--TCTAACTCATGTGCCCCGTTTGTCCAGGGTGCCCTTTCTCAAGTCTTATGACATCTTCCAATCAATAGTAATTATCCCACAGTGCTCAGGAGAAAGTGCCAGAAAGCCTACATGCTGCTAGTGCGTTTCAAGTTTTG-ATCATTGCTCAGCACCCGGGGAAGGTTGTGTGTTCCTTGGGCTTGCACGGAGGGCATACAGGCAGAGGTTGGAGAGCCAGAATACAGCCTCTGCGTTAGCAGGTTTCTAAACTATTGGCTCTG---ACAGTGGAGAAACAATGGCCTTAGATGGA--TGTGGATT---TTTGTTTACCTCTTTTAGGATGCAAAGATAGAA a score=3020 s mm7.chrY_random 25617462 267 + 30114534 CTCTGTTAGTCACTCACACCTCTATCAAGCACACTGATGCCAAACCA--------------------TGCTGTAGTATCAGCCACTCATTCTTAGTGCAACCCAGCACAGCTCATAATGCATAGACACCTGTGGCTGAGACACTGCCTGGGCTGGCTCTGCTCAGAAGACAGCTCACCATAAGCTTCCACAGCATAGCCTGAGCTCCCATAAACTTAGAGGAAGAGAGCTGGGAG-----ATCAGGTGCTCGTCTCTGAGAGAGCTGGTATTGTGTGGACTTGAACAAAGTT s bosTau2.scaffold4168 1176 239 + 69598 CTGTGTTTTTTGCTCGTGTCCCTATCAGGCAGGCTGATGCCAGACCACTGGCCAGATTTTGAATGGCTGCCTTTTAGCCAGGCATTCAGTCCTAAAACAGTTCAGCA-------------------------GGCC---AGACTGGCAGGGC--------CTCAG----------------ATTGTCCCCTGCACAACTTTGTCTCCCTTAATCTTGAAGCTAGAAAGATGGGAGTTGTAATTAAATCCAC-CCTTGGACAAAGCCAGAATCATTAGCTCTTGAACAAAGTT a score=3701 s mm7.chrY_random 25618072 139 + 30114534 CAGACTGGAATAGGAAATTTTTTGTAACTTCAggag-tctgagctct--------------------------aggatatgggaggcaggattctgcct----ggtttactaatgtacttttcaggcttagcacagtgcctgatgctcatagaagatacttaagagatgG s bosTau2.scaffold4168 2050 169 + 69598 CAAACCAGAGTGGGAAACTGTTCCCAACCTTGGGAGGCCTGAGCTCTGGTTGAGTGTAATTCACTGGACCCTtaggatcctgaggacaggattctgtccctcctgttcacagtagaatttctcaggcttaacaca-tgtctggccccagtggtaggtgctcaagaaatag a score=18093 s mm7.chrY_random 25618227 888 + 30114534 tgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatAACTGAGTAAGGAGT---CACTGTTTTATTTTAACTTGTAAAGAT---CACCAGTGAAGGACTAGCCTTTCAAAAGAAAGCCCAGGGGAAAAAAAGTAaaataaataaataaataaataTTTTTTAAGTACAGAGCATGATCACAATGGAGTTTTAAGTGGGGGAAAAGCAAAACATGAGGTTGTATCTTTAAAAAAAAATGATCCCAGTACTTTTTGACTTTGACAAATGAGGTACCTACAGACTTTGGAATAAGTGCTCATGCCTATATTTAAACATTATTT----ATAGAGTTTTGTACTTGTTAAATCTATGCAAATTTAGCATAAAGTATATGATTAAAAAAACTTGTCATCGTGTTTAATTTTGTGTGTGAAGGGTGTAGCAGGCACCTACCTGTAGTGTGTAATGCTGCTGACAACGTGTGTAAATGA-TCTTGGGCAGCCAGGGTGGAGCCTGCTGCCTGTGCTGTCTCCAGC-CCCATCAGAGGCTCAGGCATGATGTGGATCCTCA--CAGTGTT-AGAGGATTAATGAATAGGCGGTGAAACCTCAGTTTTAAAAAAAAAATGTCTTT-CCTGGAACAAAGAGAAGAGGAAAGAATCGGTTCCCTGAATCAG-CCATCATGTCAGGC--AGTGATTTACA-GTGTGTAGTCTTAGAATCCACTGTTTCCTTGTGGCTCCTTGACTACAT-TGGTGCCTTGGGGTGGCAGATACTGTGTTGGTTAAAATATTGAGAGCCTC-TCCCTCCAGTTTACCTACTACATATTCTAGCAAATCCTTCTCACTC-TTACTACCCCAGTAGCCTTTCAGATTATAGCTGGACTCTCTAGGATATCTGTTGTGTGCAGGAGTAG------TTATAGTACCTTTCTG s bosTau2.scaffold4168 2223 848 + 69598 tgaatgaatgaatGAGTGAATGGAAAGCTATCTGAGTAAAGAACTTGCCTTGTCTTGTTTTGACATGTAACAACTGGCCCCAGTGAAAGTCGTGCTTTTGAAAAGAAAGCCTAGAGAGAATA--------------------TAAAAGTTTTCTAAGCCTGGACCACATTCCCAATGGGATTTTAAGTGAGG--AAAGCAAAACCCAAAGCCATATCT-----GGAGAATGATCCCAATCTGTTTTGTCTTTGATAAATGAGATACCTACAAATTTGGAATCACATTTTTGTACTTAAATTTAAATGTAATTTCCAAACAGAG-TTTGTACTTAT--------------TTCAGTGTTCAATGTATGCAAAGTAAAACATGTTGATAATGTTAGTTCTGTATATGAAAAATGTATGGGGCCGCTACCT-TGGGGCAcaaggctattttccactcttgacaatgaggccaagaaggcaaggatgctgtccattttttggtgtgtctgtagcgcccagcacagggccaggcacaaggcaggttattgacaagtgttgagtggacgaatgaatG--------------------ATGGAAAATATAACTTTGTGTGGAACAAAGACAAGAAGGAAGCAGCACCTTCCTGTATCAGTTCACCATGCCAGGCAAAGTGATGTAAACAGGGGTAACATTAGGACCAATGACTTGATGATGGCTCCCTGCCCGAGTCTGCCAGCTTTGGGTGGCTGATGCTGATTCTG------CATCACTCCCCTCTTCCCTCAAGCTTACTCGCTGTAGACAGCATTAAGTCTGTCTCCCCAGCCATCACCCCAACAGGCTAACAGATCACAGACAGGCATTCCTGGTTCTCTGATATGTGTGGCAGTGGTCAAAATCAAAATGCTTTCCTG a score=3949 s mm7.chrY_random 25619203 218 + 30114534 TCTCTCATCCACCTAACATCTTGGTCC--------------CAGATGTGTAAGCCCCTCTTACCTCTAGCCCTCCCACTTTATTTTCTCTTCTACTATTGGTCAAGACTACAAGCTATCATCTATACGGGCATCTTTCTCCAAGGAAAAACTGTACACAGATGGCTCCAGATG---GTTTCTTGCCT-GCTCCATTTTCCCGGCTTTACAGGTCAACTTAGAGTGAGCTGTATCCT s bosTau2.scaffold4168 3106 220 + 69598 TCTTCCCTCCTTCCACCATACTGGCCCACTTTACTCCTCCACAGAGGCAAACTCCGCCCTCCCCTTGGGGCC--------AGTTCTCTCTTCTAC---TGGCTAGGGCTGC---CTGGGAACTGGAAGTGCTCCTTTCTCCAGGGAAGAGCAT--CACCACTAGTCCCAGATATATGTCTCCTGTCTAGCCCCCTTCTCCCAGCTTTGTAGAGCAAACTGGAGTGAGCCATGTTTT a score=11213 s mm7.chrY_random 25619601 596 + 30114534 AGGGTGAGGTAAATAGCTGAGACCTTGAA-GTCAGAATGAGGAGCCTGGATGAGCCGAAATCCCTCAGACCCTATC---------AGGACCCCCATGCTTGTGCCCAGTGAGATTCCCTTCAGTCCTGTGGGAGAGCATGGGCCCCTCCCCAG-CTCACTTCCTACTAGCAGC----TCCAGGCAGCAGTCACAGCCTGGCAGTTAGAATTCTTGTACCTGTTCTAAGCCATTTCCCTGCAGGCAAGAGAGAATTGC-----AGTGAAAACAATCCATCATGTTCTGGAGCC--CTGCCTTCTGGAGAGCA----GTCCCAATCTGCACCCTACCCCCCCCCCCTTGTGGAGGAGCCTTCTCTGCAGCCAACATCTCCCAGGGAGTTGTCACAGCTGAGCAAGAGGACCCCACCTAGGTGAAGCCTCCCCAAGCTCACAAGAATTTGCTCCCAGACTCCAGTGACAGCCTGGAGCAGTCTCCTGACT-TCTGTCACAATAAGTGCCCCCCCCCACACACACACACACACTGCCTTGCTC---TGTCCCCAGCCTTAC----CTGTGTAT-----------CAGACATTGGCTTTGCCGCCAACTTTATTTCACACTCCAGCCAAGGTGTGGTCT-CCTGAGA s bosTau2.scaffold4168 5609 590 + 69598 AGGGGAGGGTTGACAGTTAAGATTTTGGATGCCAGGGTGAGGAGCTGCAATGATCCCCAAGCCCCTGGAACCCAGTTCTGAGTGAGGGATCTGCAGATATGTGCCAGGCATAACTGCC--CAGT----------AGAACAGGCTCCTCCCTGGGCTGGCTTCTAGCAAGCAGCAAGAGCCACCAAGCAAACACATTTTGGCAGTTCAAATTCTTGTACCTGTTCTAAGTCATTTCCCTCCAGGCAGGAGGCGACTGCAGCATAGTGAAAGCAATCCATCATGCTC-AGAGCCCTCTGTCTCCCTTGGACCACTCTCTCCCAATCAGCTCTT--------------------GAAGCCTT-GCTGTACTTAGCTTCTCCCTGGGAGCTATCCTGGGGAAGCCAGGGACCTGCTCACAGTTAGAGCCCTCCC--------------TTCCTCCCAGACCCCAGTGATGCCCTAGGGCACTGGACAATTTATCTGTTACCATAA----CCCCTTCTGGGAATGTAGTGCTGAGGCTTTCCCCAGGTGATGCTGGCCTTACCCAGCTGTATATGAAGGACTTCCCACCCCCTGGCTTTGCTGCCACCTACCTTTTAGACTTTGGCTGAGGCATCATCTGCCTCAGA a score=9125 s mm7.chrY_random 25621730 486 + 30114534 CCTGGACTTGTAATTGACCAGACAACCTTACAA-ATGGATCTAGGCTTCCCAGGTTGCAGAGTCAGCTCTCCA-------------ATCCCCAAGAT---ACTCCCCCATCCCAGAGCAGAAGACTCCAGGACAGT-AAGCATGTCTCACTCAG---CAATTCACCCAGC-TTGACTG-----AGAGTTTCTCCATGGACCCAAACAATACCTTTTCTTCAAACCTCCATGATGATGGATCCTATTCAG-ATAAAAGGAAGAGGA-ATGAAGCCATGCAGTTGAATACAGCCCCTGTGTTCTCTAGGGTTTGGAGGACTCTGCAGGTGCATCAAATCACCTCAAATGTTCCAGTGTTTCCGCAGGCCAGGTTTCAA--AGGAAGAAAGTGTGACATTTGCGAAGGGGtgcttttcaaacctgaatgtccccacagatcatgcagggacctggataaaaatgcaggtccagacttagtaagattggggtaggtctgagTACTACAGGTGGATAACgtt s bosTau2.scaffold4168 7798 504 + 69598 CCCAGGCATGTTGCTGACCAGACATCCAGCCATTCTGTATCTGGAGTTCCCACATCA---AATCAGCTTTCCAGACTCCAGCCCCCACCCCCAGGATTTGCCTGCTTCATACCTGAGCACCA--TCCCATGGCAGCCAATTACACCTCGCCCAGTATCAGTTCACCCAGCGCTGGCGGTTCCTAGAGCTTCTCCCTCAGGCCCAATTCTGGCTCCTTTT---ACCTTCACAGTAAGGCGTCCTATCTAATACAGAAAGAAAAGGAGATGCAACCATGTAAT-GGCCATCTCTTCTCTGTTCTTTTGGGATTGACTAATTCTCCAGGTGCATCAAACTATC-AAGGTGTTTCTACCATTCCACAAATCAGGCCTTCGTTAGGCAGGAGATGGATGTCTTTTAGAGAAGtgcttctcatgtctgagtgtgcacat-gagcacctgggggctggg--aacaatccagattctgactcagtaagtctggggtagACCTGGATGTTCCTGGTCCATGGCTTT a score=5444 s mm7.chrY_random 25623055 342 + 30114534 ATATGAGCAACAGAACTCCTAGCCTT-GCGGAACA-ATGGCACAGTGAGGATGACGGGTG----TGGTGTGGGACCTGTGCAAGTGCAAATGAGACAGTGAATTTGATACACGCACGCAGGCAGGGGCCCTGGGGAATCCATGTCTGGTTCAAATCTAGATCACTACATGGCTTTGAGCACAGAAGAGAAGGTTGTTACAGATCCCA--CCAGTTGTTGGGAAAGTGGGAGGGACCACAGTGTGGCCAGGCTCAGAGGAGGAAGACTAGACTGACCAAGGAGGGGGAGATCATGGAAGGAAGACTTCATTGTCATTCTGAGGTCAAGAAGAAGTCCTGGAGACTTTCCTG s bosTau2.scaffold4168 8957 332 + 69598 ATAGAGGAAAGAGACCTACTAGGATTCATAGAATAGAAGGCAATAAGAGGGTCACAAGTTCTGCTGGAGGGAGCACTGGGTACATGAAGGAGAGACATTTAACTTT--------------GTAGAGGCCATGGAGGGGATGTACCTGGGGTAGATCTTGAAGGATA-ATAG-TTTCAACACAGAGAAGAAGAGTGTTCTAGACTAGGGGTCAGGTGTCAGGAAGGTGGGGGAGAGCACGATATGGCCTGGGCATGGAGGAGAAGACTGGACAGGCCAGTGGGGACCAGATC-CGGAGGGGGACCTCCTATATTACCCCAAGGGCAATGGGAAG-CCTAGAGGCTCCACCA a score=6637 s mm7.chrY_random 25623425 456 + 30114534 GAGGAATGGTTTCACTGACCAT-----TCCTCCCTGAGACCCATGAGAAGATAAACCAAGGTAAAGGTTGAGTGCACAGGGCCCAGCTAAAACGGATGATTATCTATGAGTGTACTTTG----------------------CTAAAGCCAAGTATTTATTCCAAGACAGATTTAAAGTGCTTGGCAGGAAAGGAGGTTAGATTTGTAGTTTTATCC--TAAGACCTCATAACTGAGAAGACAAAGTT-GCACTTGAGTG-GTCTG--------------------AAGCCTTGTCAAGGATACACCTCACGCTCCTGTCATGCGTCTGTTGCTAGAGTTTCCCCCACAGG---CCCAAACATAAGAGAATAAAGCCCAG---CCAGGGACCAGCTGGTCTCTGCC----CCTCCTAAATCTCAGATCA--------------ATAGTGAAGAGCTTGCTAAAGTTTTACCTTCTGAAGGAAACTGATTCAGCA-CAGTGGGTGATGGGCCCAGTGAGGTGTCCAGATCTGCT s bosTau2.scaffold4168 9315 495 + 69598 GAAGCACTGCTTGGCCGACCATGTAGATGGTGGCTGGGAT--------------------GCAGAAACTGGG-GCAGGGAGACCAGCCAAAA-AGATGATTATTCCTAAGTATACTAAGTGGAACACTTCTAGAAAAATATCTAAAGACATGCATTTATTCCAAAACCAGTTCAAAGTACTGAGAAGCAAAGAAGGTTTGATTTTCAGGCAAATCCCATGAGACTCCATAGGCAGGGGGTCAAGGCTGGCAGTCAGGCATGTCTAGGGTAGAAAAGACACCTGCTAAGCTTTGTCAAGTATATA--------TTCTGTCC--CCTCTGCAGCTG----TCCACTTACCTGCCACCCTGCCAT-GTAGAAAAATACCCAGGTCCCAGGGGTCAGCTGGCTTCACCCTCTGCCTTGCAAAAGTCAAATCAGTTATTGATCAAGTATAGCAAAGAGCTGACTTAGATTTTACCAGTTGAGAGGCATTGATTTTGAATCATAAAATGATAAGCTCACAAAGGTACCCAGATTTGCT a score=31796 s mm7.chrY_random 25624052 2309 + 30114534 TTTTTTAAAGGAATAGTCCCCTCTTAAAATGCAAGTGCCTCCT-TCAGTAATAATGGATTAAGCTGGGGTTCCAAaaactgtagcctataggtaagtctagggaatcactcatttctatagacccatgagctaaagtattgttatttttatatttttaaatggttatcaaaaatcaaaaga---ataatattttatagcaca------------gaaattcaaatctgggtgccaa-----aaggttcccagggacacag-acccccctccttgcaggttgcat---atgga------tgccctgaaacagtggagctgaTGA------TGGAGGCCACCTGCCTCTCAAAATCTAAATAGTCACTTTCTAGCCC-----ATGGGGAGGTAAGGGGAGGAAGAAAGCTACTTGAGCCCTCCATGAAGCTTTGATTGTCCATTGTCACCGTAGGAAGAAGGGGTTTATTGTGTTAAGTAGCACAGCCTACATAGAC-CAGGATACCAAAGGGCCATCTTTGTACAAAGGCAAAATATCATAAATAAGACGGTTGAT-----GTGTCATCAAACAGGaacaaccctgtgatatgagcaattcgattacaatttctataagcaatttctagataggaaaat---gagctaaagagagactaagggatttattc----------------tacatctgttaaatagcaaggatggaattcaaatccTTATCAATTTGAAC---ACATAGTGAAGTTCAGGAAGTACGAAGGAGGCTGGGGAAAGAGGTTGAGAATTCCCAAGGGGAGTGCATATTATCAGCTTTA--CAAAAGCTGTTT-AGAAAGCT---CAGAAGACAGACATGACCCCAGCATCCTTGGCCAGCAGGT-TAGCCTCCCAGTTAC----TCTACAAAATGGTGGTGAGGCTTA---TGCAGGAAGGTAGCTAGACTTCAATGGAATGATACCCATTAGGCCACCTGAGTG---------ACTCTGGCTCCTCCCTCTGCTGCACCCAAC------TCACTTTTCCT--------CCCTACAGCAGTCCCAGT--------------AGCTCATTAAAAAAACAAACCTATGCTTGTAGACTGCCTGTCTCTCAGCTATTGTCTCCCTAAACCAAAAGTGGCCCCAGGTTATCTCACAGGCCAGAGGACACAAGTG--AACCTAGAACTTTGATAGTAAGCTTCAAATACAAAGATGCTAACCTTTAGTATGGCCCCTTATCATGGGTCAAGAAGATGCTGTCTTCCCCTCAATGAAAATGCAACTTGAAAATCCCCTACCGTC---CTTTCCTTTCATCAGGGTGGCACCCAGCTT-ATTTGAGGCTCATCTCCAGGGAATCAGGTCCTTTATCTTCCAGCCCCAGTTTCTGTCCCTTCTGCCCTCGGGCTTCCCCCTGCCCTGTCACTCTCCTCTTTGGGCCCATATTCTTCTCTCTATCCATCTGTGTCTGACCTTCAGTCTTTCTACAATCTTCC-TCCAATACCATTCCTGTTCCTCTCTTTCCCACACAATGCACCCTAACCCCCACAAGGAAAAGCCCTGGAGCCCTGGAAGGTAGAGGGGCACAGGGGTCAAGCACA-AGCCATTGATTACTG--AGCTGGGCATGGAATGTGGTCTGGACTCAAAGATTAGCTTCACTCCCATCTGGCCACGGGAATTGTTTCAGCCATTTCTCTGCCCTAGATTTGCTCTCCTCAACAATAAATTTTGAATCATAATTCTTGGCCAAACTATTTTTTTATCAGATTT-TTAGGACCAAAAGAGATTGT-TGTGTGGAAATACTTTGCAATATTTAAATCATTGTGCAGACAATGCTGTGATTAAA--AT----TGAGCAAATAAGGG-------------ATGCT-------------GTACAGATGAACACACCCTGTAGAACACACC---------AAGACTGTGTGGATTGATCAGCATACCCCACATGATGGTGCTAAAGACTAGAACCAA-GGGAGGCAGTGTCCCGGGGGTGGGGGG-------ATGGGATGGAGACAC--------AGTCCCAGCTTAGATGTCACTA---CTCTAAACT--GGAAGATTACTCCCATCTGGCCTTGGCTTCCTTCA-GTGTAAA-----------------CTCTCCaggattaaatagaaggcacc-tatgaagggccttgcacagaacca---ggtaggaggctcagcaaacagtagctctttt-----------GCTCTGATTTTTAAAACCGCAATGAGCAATTTTGTCCCACATAACTAGCAAAGGCCTGAGCATTGCTGGCTGCTAGAGGGTG----------ACCCTGAGCATTGCCTTTGCTGAGAGCTGCCAGGCGAGCAGCT-TGCTCTGGCTGCAGGCCTCATGGGAGACTCA---GCTATGAATAACGACCTGTTTTGACATCTCTGACATAGCCGATCATTAAGGTGCAACAAATGGCTCTGTAAGGGATGCTGGTTTACCTACTCAGTGGCATCCTAATGTG s bosTau2.scaffold4168 15579 2270 + 69598 TCTTTTAACAGGATAATCCCCACTTAAATTGTAAATGTCAAATGTCACTA--------TTAAGCCAGGATTC------------------ACCAAATCTAGTTGATc---tgattttgtgaaacggtgagttacaaaatggtagc----acatctt-aaatggttgaaaaaaatcaaaagatgaataatattttgtggcacatgaaaattacatgaaattcaaattttagtgcccataaataaagttttt-ggcatacagtacactcattcatttatgtattatctcatggcagcttttgcactatgacagcagggctgaggagtttcatggggaccagatggccctcaaagccaaaatatttactatctggccctttccat------------------aaaatgtttgctgacacttgCATGAAGCTATTATTGCCTGTTGACACCTTAGTGAGTAGTAGTTTATCAGAGTATCTAGGGCAGCCTAAAAAAAAACAGAACGACAAATGAACACATTTAGACAGAGGCAAAGAAGTATTGATACAAAAGTCCAAAGCAAGATTCACCACACAGAA--------GACAGAGAAACAATTCTAGTccattttacagatg------------aggaaaacttggggc--aagagggattgagtgacttgcccagaacctcacagctgatagatctgacagatcgcagagatggaattcacattcatgtcagtctatcccagaCAGACTAAGGTGTCAAGAGGAAGGAGGAGAATAGATTAGAAAGTTGGGAATTTCCAACGAGG-----------CAGCTTTATACAAAAGGCATCTGAGAAAGCTGTTCAAGAGACACAtatg---------tcctttgggaatatatgtaatctctttatcaccttatctacaaaatggtgatgagacttaccttgaagga--gcagctagtgttcaatgaagcaatatatAGTTTGC-ATCTCAGTGGTGCCCAGTATTCTT-TTCCTCCCTTCTCCATGCCTGACCCTTTTTCACATTTCCTTAACTGAGCCTCATCCTATGCCCTGTTCCCTTGAGATTACAGTTCATTTGAGAA-TAAACCCA-------AAAAT-----------AGATACCATTTGTCTGAGCCTCAGGTTACCTCTGGTGATCTCATGGGCCAGATAAACCCAGTGTGAGCCTAAGACCTGGGTGTTAAGTTTCAAACCAAAAGATGCC-------------GCCCC---------------AAGCTCAGCTTCTCCTGTCAG---AGACATAGCCTGAAGATTATCCACCATCTACCCTTCTGCTCAACAGGACGGAACTTGGCTTTATTTGAGGTTCATC-CCAGGGGCTCAGCTCCTTCATC---------------------CCTATGCCCTC---------------CCTTCATTGTCCTACTG--------ACTCTCCTCTTTATCAG-----------------GATTCTCTACCACCCCCCATCCCATATC------------------CCCGCAGAGGG---------------ATGGGGGGGTGATGGGGCCC----------AGGGATGCAGCAGTCAGGTACAGAAACAGTGCAGACAGTTAGATGGCGGTGGGAAGGGCTTCA---TCAACA--CAGCTCCATCATAATTTT----CAGGCTTTGCTGAAGCCCCTTCCCTGGC-TAGCTTGGGTTTCCTCAACTATAAATTAAGAATCATGACCCTTGGCTCAATTATTCT---GTATGATTTAGGAAGACCACAAGAGGCTCTATGTGTGGAAGTGCTA------ATTTAAATCATCAGGcaaataatgttgtgatcaaataatgttgtgatcaaataatgttgtgataaaataTATACTATCATAAAAATGGGCACAGATACATACACACACTGAAATCCATCGAGTTGGGTAAGGCTGTGTGGCTTAAGCACCAAGTCCTTGATTTTGGAGGCTAAGACTTGGACCAAagggagacagtgaggtggggtgggaagagcagtctagggggctgagaaaccaggtctcagtcccagctcagctccaacccagccttcagccttgagaaagtcactcctgcctggc-tgggcttcccccaagtgtaaagggctcaacaatgccttcttgtgaggatgagatgaaaggtaatgtgtgtagtaccatgttcagaaccacacgtgatggggcttaatgaacagcagctcttttTAGTTTCCTTTATTTCAATTCTTAAGATCACAGTGGAACATTTTGTCCCAATT--CCAGTAA---TTAGAATCCCACTAACT-CCAGTGGGTGTGACCCCAGGACTGTGGTTGTTGAGTCAGCTCAGATCTGCCAGGTGCGCCTCTGTGCTCCCAGAG-AGGCTTCATGGGGCTCTCCTGCGCTGTGAATAATGACCTGTTGGGACACTGTGGACACAGTCGGTCCTTAAGGTGCAACAGATGGTTCTGAACAGGATGTTGATTTACCTACTCAGTGAtttctttatttg a score=15507 s mm7.chrY_random 25626361 1129 + 30114534 CTTAAAGACCTGCTGGATCAAAGT------------AGCATGCTCCACCTGGCCCCCTGTG---TTTGGAAGAAA----------------TGGGCCGATAATCTCAGCTCTG-GGGAGAGGGATGGATGG-CCACAATC----CACACAGTATTAAAGACAATAACAATCGCCACTGTTGTCTGAGTAATCACCATTTGCCA---------AGTGGCT----------CCTAAGGGCCCAGT-ACTCTTTAACACATCCTAAAAGATG---CTTACACATTTTATAGATGAGGACACGGAGGTTAAGATTTT--CCACGGGGTTCAGGATACCCAGA---------CCACTGCCATCTTGGATACTTAGACT-CCCCAGCATGGTCATCTGTGATGCTTCCAAAGAAAATGCAGGGCACCATTATCTTT---AGAGCACTGCAGCCAAGCTGTGCAAATGAACAATGCATACTCTGCGCCAT---CCCATG-------------GTATCACTGCAC--TAGGCAGCTTTGAGGAAATGCCATAGCCTCCAGGATGGTGGGAGGGGGGCGGTTGTCACTCAT-CCCTACAAGCCTACCACTGGGATCTGCCTTGATTCAAGGTTATAGGTGCAGATAGTTATCAGCCTCCTTGGATGACCTCTTGGGAATCACAAAGGGGAAAGGCTTAGACAAGGACACACATGTGAGATGCTGAGAGGGGAAACCATGACCAGAATCAGATCCATCATTAGAATTCATGTGCCCTGCCCTGCCT---TATCGGTTTGTGAAACTGG---------CTGAGCCAC--AGAGTCAGCAGACTGTGGTTTCAACTGACATAGCTTATAAGTTCTTTCATATAGTTATAGTCCACGGGATGTTACTCCAT--AGGAAGTTGgcag-gaatagagtt--------ctgcctcttacatcagaaaaacctgagtttgagttcagggcctaccacaccttgactccagaacactggactagccagttagtcactctcaacccttaagtgtggtatctgcaaaatgaggctaatatcagccctta--ccaggaggctgtcacaa---agaACTGT-----GCATGCAAGAACGACTAAGCTAATACTACTAGTAATGGAAAGCAATGCCTGGAGTGAACAGAAGCCACTAATGT-TTCTGGGGAGTCTGGCTAGCCTCTTGGTCTAGCTTCTCGGTCTGGCTGTGCTACC----------TTGGACATCTCAGCCTTAAGTGTGT s bosTau2.scaffold4168 17978 1216 + 69598 CTTAAAGACTAGCTGGATAAATGTGCCCACCCGAAAACCCGGCTCCCCCAGGCTCCATGTGAGCCTGGGGGGAAATGAGCCCCAAGGTTTCTGGGTCCATAATCTCAGTCCTGAGGGGGAGGGGGGAGTGGACTGCACTCACCGCAAGCAGCACTCA--GCCACATtaatagtcactgctgaccgagcacttcctgtgtgccatgccctgtgtgtggctgaggcaggtactcatgtacccagtcactcttcatcacaccctgaaagctgtgttcttcccgttttgcagacgaggacttggtggttgagactcttgccagccagctactaatatccaggaccagccttcaaatccagtcctgtctgcctgcaggaccactgctcattcagctgcaGTGTCTCAAAGCAAA--GGAGGACACTGGCCTCCTTGGGAGACCTTTGAAAGAAAGGTGTCTTGGGGACAGTCCCACAGTTGGAACCCTTTCCTCATGTTATAAAGAAAACGTGTTGTTGAACAGTAAGGAACCATGAGAGAGGATGGTGGCTTGCCAGATAGTG---GTGGGGAGAGTACCACTCCTGCCATACAAGCCCACAGGTGATGCCTGCCTTTGTTCAGGACAGCAG-----GGCATCTATAGGCCTTCTTGGATGACCCCTtgaaccctgggaaggggatggacttgccagaggacatcc-----agatgctgagaggtggaaccagagctggtataggtctcct------gactca-gtgccccagcccacctgcccatctctccatggacctgggtctgcccccagagccgcttgtagtcagccaactccctcttccatggac----------agttcttttaaatacttgcaggcaacttga-attcctccctgaagGGAGTCAACAGAGagtggggcttgggaggactg-ctccaaagccagaaagatctggattcacatccaggttccatcacatcttggctcagggacattgggcaggtcactta-cctctttgagccctcagatatggtgtctgcaagaagagactaagaatagcatttgtctcagagggtcgtCCCAAGACAGAACTGTGCTGAGCTCACAGGAGCATCTCCGTTTGAACCAT--------GAAGGAGAT-----GAAGAAACAGAGGCCTCTAAAGTgggcttaggagtcaggccagctagttggt---gccatttgctggggaggtgctctcaggcaggtcatttcacatctcagcctcggttATAT a score=11075 s mm7.chrY_random 25627493 981 + 30114534 GATGAAATGAGCCTCTTGCCAGTG------------CCTTCCTCAGATGGATAGCATATGCTCTGATGGCGTGTGTAAGAGACCCAGCAAAGG--------GCCTTTGCTCCCTCCTTGCTCTCTGTTGTC--AAGTTGTAGATAGCCCAGCCAGTTTTGACGCCATGTTGTCTGTAAATCAGCCAGAC-------TGTTCTGATGAACATGGCCCAAGTAGCAGGCAGGCCAGCCTTCTTCTTCCTATGCT-GTCTTCATCTGAAGTA--GGTAGAATAAGTGCTA---------------ATATCTACCATGTGGGCTCTTGGTAGAAGGAGAAA---------------------AACCCTGGATTTGCATTGATGGGTGGTGATGTGACCTTTG---------------------GGGCTCTGATGCCAC-CTTACCATGCAGAGGATCAGCTGTGGTCCTGGATCAATTAGAAAGTTCTCAAGGCT-----------CAAGAAAATGTCCCCAGAGCTTGCCTACTGTCTGGCCAATAATGAGACCCTGGGCACCATGACCTGCAGTGGTGAGGTGGAGGCAGGCAAGTGATTAGACTGTGA-----------CAACACAGAGTATCCAGGGTACTAACAAGTGCATCCAGG--CTGTGATAGTTGAAATCAAAGGTACTTGTCCCCATGCTCAGCTGTCCAGAGGAGGTGATCAGCATTAgaaaggcttctcacaggagacagcactagaattgagctctaaatgtgagtgaagttagctaggtgccctgaggggatggggaagg-CACCGTGATGGGAAGTGGTAGGAAGTAGGCAACCCACAGGAGAGCTTGCCAATTAGTTTCTGTGCCTTCTAGATGGGAATC------------TGTTCCCATCTACCCACAATGCG-----TCTTGCTTTATGA-CAGAAGGGGCCAGACATCCACAGTGTGGTTGAAGATTTTGTAAAAA-------------GATG-------------TTGCCTATTAGTTTT-----------CAATGGGGCTTCTGAGGTAGACAGTTAATAAGAGTAGA---ACCCTTTCAGAAAGATTCTGTGAGACAGTAGATGTGATAACAAAGTTCTCCTGCCTCCCTAAGG s bosTau2.scaffold4168 19596 1090 + 69598 GGTGAAATGGCCCTCCTACTTTTGGAGGGCCTGCTCCCTTTCTCAGTTGGATGCCATGCAGACTGATAGCACATACAAAAGGCCCAGCAAGAGTTTACTAAGTGGTGGTTTCCTTCTTGCTCTGCGTTACTGAAAGGCATCATCAGCCTAGACA---CTGATATT-TATCATCTGAACATCAACCAGACACTTGATTCTCATGATGAATGTGACC---ACAGCCAGCCACTCA--CCTCTCCTTGCCAAGCTCATCCTCATCTCTAACAGGGGCAGAATAA-TGCCAGCAACCCCTCTCTGCATCCTCATCATGT-GGCTCTTGGTGGACTGAGCAACAGACTGCAGAGCTAGGAGTCCACCCTGGACTCACAGAGCGAAGC-ATGTAGTGACCCTGGAGATGCCAGGACGGTGGCCGAGAGCACTAACTCCGCTCTAACCATGCAGAGGGGTGGCTGAGGTCCCAGCACATAAGAGATGCTCTCAATGCTTCCATTCAACACAGGGAACTTCCCCCAGGGCCCGGCCTGAGCCAGGTGAGTAG-GGCACCCTGGG-GTCAGGAGCTGGAAGAGGGAAGAG--AGCAAGCAGGTGACCAGATCCTGAATATATGATTCCAATCCGAGGAAGTCAGAGCAGGGACAGG---GCCCAGGGCCTGGAAGAGCAGAGAGCAGGGGTGC-----------CTAAGCCTTTGGAAAGGGATGA--AGGGGCACTGAGGCTTATTG-AGGGGCCAGTAC--------------------------AATTTGCCAGGTGCCCTGAGAAGGTAGGGATGGACGCTGTGATGGGAAGAGGCAGGGAGGAGT---GCTCCAGCAGAGCCTAGTCCTTCAGTTCTGCACCTTC-AGTTCAGAATCATGCCAGCCATGGGTTCTTGTCCATGTCCAACTCAGCATTTCTTGTTCTATGAGCAAGGAGAGACAAGAGTTCAAGTTGCAGATAAGAGTGTGGAGAAAACTCGGCACGAGTGGATGAACCAGTATGCATTTCCCTGTTTGTTCTCATGACAGATGCAGTCAGATTTCCAAAGTGGACAGTGAATGA-AGTAGACAGAACTTTCCAGAGAGATTCTGTTCAGCTGTGGGTGTACCAGCCAGACTTCACTGGAGCCCAAAGG a score=6474 s mm7.chrY_random 25630202 538 + 30114534 CCCAATGCCAGTGTCTGTCTCTGGCCCGAGACTCTGAATCCCTGGGTCATAGTAACCAGGTTTTCATAGGTAGGTC---TGGCACTGTGAGGAGCCTGAGCCTTTTAATCCCTGCTAGGAGGCTTTATTAATGGCAACAGTGTTCCCCACTTGCCATGAGCCTCTTGGGCAAACCAGCCT---TTCTTCAGGGCTACAAGCC-AGAAGCAAATGCTGACACTATATTGTTCCTCATCAGCCTATAAGGCTTTTGGACTTCAG-------CCCCACTACAGCTTGGATACTTCAGTTATCCAAACTGAGTATAAAACCCACAATATCAAATCCCAAAGTGTTCTGTGTGAGAAACATCAGAGGCAGTCACATATGCCAGTGGGG--TCTGTGACAAAGACGGGCAG--------------GCACCCCTGAGCTTAGGAGAGGGATGTTTCCCAGGTGACTGTTACATGCTCTGCATTCTGGGGGAAACTTTAAGGGAAGTGGCATTTGGGCCACCATAAC-TTTTAATGCTACTATCTTT--ACTTGCAGAG---TTTATAATCATTTTTAAAGA s bosTau2.scaffold4168 21113 500 + 69598 CCCAGTGCCGG-GTCTGTCTCTGACC--------TGCATCCCTAGGTGACAGCAGCCAGTGATACTCAGCAGCACCCATTGGCAAGGAGTACAGCAGGGCCCATCTACCCACTG-----AGGTCTGGTGAATGGCAGC---------CACATG------------TGGACTGACTCGCCCACCTTCTTCCCGGCTACAGGCCCAGAAGCACAG--TGACAGCATGCCACTCCCTGCCAACCTCCAAGGCTTTTGCTCTTCAGGCTCTCAGCCCACCATGGATTTGTAACACCCTTCAT---GACTGAATGCAA-------GATAAAGCATCCCA---TGCCTAGTGTGTG-------GGCGGCGCTCAGACCCGCCAACAGGAGCTCTGTGGCAAAGGGAAGCGGCAGGTTGTCTGTCTGCCCAAGTGGCCAAGGGAGAGGGATGGTTTTCAAGCAGCATTTACAAGTTCTGTAT-----------------GATAAGTAGCAATTGGACCACAGCAACtttttaatataaatatattttaaattataaaGTGTTTCCTGCTCATTTGCAAAGA a score=36888 s mm7.chrY_random 25631201 1684 + 30114534 taataataacaataataataatTTTAAAATACCCATAATTTAAT-AATACAGCATCACCATCATG---------CTTTCTCCTTTTATCCA--GCCATGTGCACCTTA---GGTTCCTTCTTACTTCATGGCCACACATATC-TCCGACATCATAAAACC-----------TCACCAGATGCGTA-TGCTCCTTAACAGAGGAATATGCAAATGTGCTTGGCCGAGT-CCTGTAGGCTAGTGG----------TTGTCAGGTACTGGCATGATTCTAGTTTTCTTTTCAAAGCATTCATGAATATTCATG--AATATTGCTTTCCAGTCTTTCAATCCTTACTTTCTCAGGGGTGG-ATGGACTTGCCCAAAGTCTAAGGC---TTTGAAGTCTGAGACAGGTTC--CCAAGCACCTACCTGACC-TTTTTGATGGCTCAGCACTGCCCCTGGCCGTGAGAAG-ACGCTGCCTTCCCCAGCATCAGACATGTGCACACTGGAGTCTTGGTCTATTCTATAGACCA---GGGCTTGGGACATGTTTTTCTAAGATATGAGAATTCGATTCTAACTTGAGAATGCTGTCCAGTGAAATGTTAAGCTTCA---TGCTCTTGAGCCACTTAGAGTCAAAGTCCTTTTATGTAAAG---TTAAGTTTTTGAAGTCGTGTGCAACTGGTA----AACTAATAATACTTACAAGGTTAGAATGTGACAAAACCTACGGAAGCCACCTTTTCAAAAGGCCTGAAAATGCACGCACGAAAAACCATACTCTTCCATTGTAAATGCTATTCTGAGACATAAAAGTAAATACTCTCAAAGAACAGATGCTCCATCTTACACAAATAATACATTTTTCCCAAGATAAGAAAATTGCCTGG-AAATGCTCATGCTTATTGGGCATGAGAGAGAAGCATTTCTATAAATCCACAAGAAAGTACCCTGGCTGGCTGAGTTAATGATCTCCCCTTTGGGAGAAGTATCTTTCATGATTGCTGCTC-TGATCTGCCTGTAT-------CTCTTCAGCATTGAGCCTG----------TTCTGTCCAAGAACCATGAA--GGTGGAGGTGAATGGATTAGACAAAGGATGAGGCGAAGGCAGAAGCTCAAGGCCCTGGTTTCTGAACTGCACATGGGTCTCTTCTGTGTTGGCTGCCGCTGTTCTTGCCCTCCAAAGGGTGTAGAACCAGAGAGAAAGGAAGGAAAGAGCTGTCATGGGCTGAAACAAGGTGGTATGCACATTCACAAG---AGTACACTCTTGGAGAACTGAAACACTCATCTCAGCCTGACAGATCTGTGCAGAATAGAAGGGTTTCCCTTGTGCAACACATGGAAGGCCAGTGGCTGCTGGGACTGGGATGCAGTAGCTCGGGTACCTGAGCCAGG-ACGTCCACTGAAGA-ACCTGCCTAAGGTCTGGGCATAGATGCGTGGACTCCAGAGAGACAGCATGCTGAATAAAGAC-AAAACCAGTCAAACAGAA---TGGCCTCATTTTCGATTTGGAAGGACTGGAATGAGCGAGGGAGACTAC-AGCGAGCACAGAGTGAGGAAAGACTGACTACTGCACGCAAGCCAGGGAACTCT-------------TGCAGGCGCTGGCACCTTTTCTAATGTGCGGTATCCCTGCcattcatttctgaaccatttagtgagaacctactgtgttctagaaattggtccggtc-ttagagatttgaaagatcacaaaatagacacagcccatgctcttctgggacttttgat--tggatgtag s bosTau2.scaffold4168 21938 1724 + 69598 TAAAGATAATAATTACAATAA----AAGTTCCCCATGATCCAATGAACGCAGTATTATCAATGTTACAGTATACTTTTCTCCCTTCATACACAGTCATTTGAACTTTGCGTGTTTCCCACTTAACTTGGTGCCACATGTATTATCCCACTTCATGAAACCATACCGCCCTCTCATCAGCTGCCTAACATTCTTTCAAAGAAGG----TCAAGTGTGCCTGATGGGGTTCCTGAAGTCAAATGGGACAAAGTGATTGTCCAGCTTTAGCTTGGTTCTGCTTTTCTGT-----GTATcagtgaatatctgtgcaaaaatctttgtctgcattttggag---tactttctcaggagtattatcacctgggccaaagcatatggtcattttgaggcccaagatatgttttgccaaGCATCAGTCTAATCATCTGTGATGACTCC-CACTGCCCAT--CCATGTGAAGGACAC--CTCTCCCCAGTCCTGGGCGCTTGGACTCTG-ATTTCCAATGTATTTGATGGACTCTGCAGCTTTGTGCCATATTTTCCAAAGAGATGATAATTTGGTCCCAATTTTAGAAAGTCAGTCAGTGAAATGAAAAACCCTGCAGTCCTCTAATATCACCTGGAGTTGTGGTCCTTTTGTTTAAAAAAATTAA--TTCTGCAACCATGTGCCACTGATCTATCGATTAAAAAGATTTACGTGACTGGAGTCTGA-AAAGTTTACATAAGCCATCTTTACAAAAAGACTAAAAGTGTGTGTTTGAAAAACCATATGCTTGCATTGTAAATGCTTTTCAAGGCTATAAAAGTAAAGATTCTTGAAGAATAGCTACTCCATCTTGTACCAATAATGCATTCGTCCCAAGATAAGAAAATTGCCTGGAAAATGCTCATGTTTATTGGACATAAGAAAGAAAAGCTTCTATAAATCCAAGAGAAAGTACCCTGATTGGTTGAGTTAATGATTTCCCCCTTGGGAGACTTGTCTTCCAGAATGGCTGCTCTTAAATTGCCTGGTTTCTGCCCCTTTCCAGCATCAACTCTGCTGGACATGTTTCTGCATGTGAGCTGAGAATCTCTGGGAATGAAAAGGGTGGGGAGTAAAAGTAGCCAAATTTG--GCATGGGGCCCTGGTTTTTGAACACCATGTGGTTCACTTCGGTGGCAGCACTGACAGT--------CCCGGAGAGTGTGGAGCCAGGGCGAAAGG--GGGAGGACCCA----AGCTTTAGAGAAGGT-GTGCCTACATCAGCAAGTTCAGAGGCTTGTTGGAAAACTAAGGTGCTC-------CCAAGGGCATCAGAGGACCAGTGAATGGATTCCCTCCT--AGCATGCAAACAGCCAGGGGCTGACCAGATTGGGGTGCAGTGCCAAGGGGGCCTGTGTCAGGCATGGGAGCAGAACAGACCTCACCCCCGGCTGAGGGCAGA---------TCTGGAGACACAGTGCATGGAGTGAACCCTAAACCCAGCCCAGCAGAACAGCAGCAGCATCCTCAGTTCAGAGAAGCTGGAAGGAGCAGGAGAATCCAAGAATAAAGACAACAGGAAGAAAGGCTGACCAGAGCA-ACGGGCCAGGAAGATTCCCAGAACCCAGAACATGAGCACAGACACCTTC-----CACGAAGCAGCCATAtcattcattccccagatatgtagtgagaaccagccatgttccaggaactgcaccaaccactggagatttcaaatctaagcaaa-ggaggcaaccc--gctcttgtggaactCGTGATGGTAGATGAAG a score=4850 s mm7.chrY_random 25636025 296 + 30114534 GTTCTCCTGTTTAACAGCGATAAGCTAGGGAAGAGGGTCTAAGAAAAGCCT---------------GGCTGTTGGGCAAGAAGCTGCCTGAAGCTTCCCGG-TGCTACTGGGATGA-GCCTGGGAGCAGCTG-CTGCTAGTGTGACTCCGAGGTCT--------GTGGTGTG-----------AGATGGAGGAACCAGGAGTCACAGTGTTGATCAGGGACAAGAGGAAATCTCTGC--TCCCCAGAAA-----------------------GACAGA-------------------GTTACTTCATCTGGCATTTATTGACAATAAATAAGGAAACTAAGTATGGTGAGGA-ATATGAGGATATTCCCAACATTAAA s bosTau2.scaffold4168 27188 375 + 69598 GTTCTCCTGACTGACAATAATAGGCCAGGGAAGAGGGTATGATAGAAGCCCCTGATTTTGTCAGGGAGCTATTGGGCAGGAAACTATCCGCAGTTGCCTGGATGCTTCCAGAATAAGGCCCGAAAGTGTCCACCCACATGCCTGACTTTGAAATCCCCCAGGTGACGATGTGAGGGTTTTCTCAGACCAAGGATTTGGTAATCAAGATGGTGACTTGGGATGAAATTAAACCCCTTCTATCATCAGGAAATTAAAGAGAACTTCACAGGCAGGACAAAATTTGAGGACAAATTACTGGTTGTCTCATTTGACATTTATTGA-GACATCTTGGGGGACTAAAAAGGTTGCAAATACATGAGG--GTTTCCAAAATTGGA a score=47252 s mm7.chrY_random 25636553 3945 + 30114534 tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtATACC---------ACTTACCTTATGGGTAATTATTGAATGTTTCCTCAGTGTGTGATATACTGGTCTGACTCTAGAATGAG-------------TCTAGGACATAAGCAAATAG---GTAAATAACTATTTCTCAGGAGTCAGGACTAAATGAAAGT-----AGGGGCAGA-CTCTCCACCAAGGCA-GACCTGAGAAATCTCCATTCCAGAGCCAC------CTCGCAGCTGAGAGTAGTAGAATGGCCAGA-ACCCCAGAGAAAGGGACCA--------GCAAGAGTGTGGTCTGAGGCTTAACCAAAGATCTAGGTCCAGAGATCCATGCCACCCCCCTTCTCTGCTCCTTGTAGTTAATTA-----TCTCTTTT-AGTAGGAATTAAAAGGTAGTAAAAATGCTGTTGCTAAAATAAAATATAGCAAATGGCAGAGGGGTCAGTCGTTAAAAAAAAGGGAGGGGAGACCTTACACTTGTAATTGAGTTCACAGAGTTTCTGTTGTGTTTCTTTTTAAATGGCTCCTGTGCGTAATTGTTTTTAATTGGAAAAAGAGAAAGGCAAATAATTTAACACTCAGACACTTGGAATGTATgtgcctatgcatatcaggcgcagggctaagtgcttggcatttattatctcatataaacactataattgactctgaactaggta---------------tctgcgtgagtaaattcacatagagagaaggaaatgacttgcccctgagagta-------aacaaacagagctggga-tcacatcagagctggcttcaaagccctagtcctggtagctatgccatggtgcctccctTTgggacc----attagtgctcccattctacagataaagaaactgaggcttagaaaggttaaagagcatgaccaaTGAAAACTGGC--AAAGAGTACCTGTCATGTCATTTGTGGGTTCTGGTGTTTTGAAATCATTGGGAATTTAAGACAGTGACAGCTAACCAATCAACCAGTC------CTCTTCCAAGCAGTAAGTCACTC---------AGACTGCATGCCCTGTCACACACACACATACCCACTCTTCAGTGACTTCAACTCCTCCCTCCCTCCCTCCAACAGAGGAAGAACCTGGACTGTGGCTGACAAGGTGGGGAAAGGAAAGCAAGTCAGAGAGGCAAAGGATGCTTTTGGAAGTTTAGGGCTCAGGTCAACCAAGTACAACAGCTGTGTCAGCCTCTGGCCATCAGAGTCCCAGGAAGTCATACACTGTCTGTCCAGCCCAGCTTCCTCTCCCTCCCCAGGAGAAGAGAGTAGCACTTCCCCTTCATCGGGCTTGAAGGACCCAGCCTGAGAACAGTGCTCCTCACCTCTCTAGAGGGCTGGTTGCAAGGATAGCAGAGCCTACATTCAGATTCCCAGGCACTCATGGGAAGAAGCCAGCATTCAGAAGCCTACTAAAGACAGCGCATATTTCCTGAGCTCTGCTAGGCTTCTAAC------TGGTATCATCTCAGTACATGAAAGCCTCATGAGATAACAGCCACACTCCCCCAACCCAccccacttctaccctcacccccactcccacccca-----------------atcccc-CATTTTGTATG-AAGGTGTCATAGCCTGCCAGTGGTGCAGCAGCTGGTAG-CAGGGGAGACAG-----TGTCTGCACATAGGTGCTCA-GTCTGTACCATACCATCTA--CCACCCCCTGGCCCTGCCCAAAGTGGATCCCAGATGCTGAGAGGAGAGCTCACCTTGAGGATCCATGAAGGGACAGAATCCTGAG------------AGCTCACTCTTTCCACTCAGGCCTTGGGGTACTGTTTTGTATATACCAAAGAACTCTCT---------------CATGGTCCTGGCCATCTGCCGCCAACACTCCTTTCTAGCCTGTGCTCAGAGCAAA-------------CACCAGTAGCCTCTACCTTGCCCAAACTCTTTGAGTCATGCCAGGCTGCTAGGGTGTTCAAGCTGAGATTGGGTGAACA----TCGCATC-TTCTCTACCTACATCACATCACTTGAACTTACAC---AGCTCTGGGGGAGTCGTGTTGGAGTTGTCTTCTATCCCTGTGACTTTGTGCTG---ACTCCACAGTGGGGTACAAACTCTATCTTATATTTTCCAAGTTTGGTAGCATTGATATTTAGAGCTTTACTTACcctgta--------------------------------------------------------------agatgtgaaccaatcaatcca-----tacagctcactgtaaaccttctacagctgcctctcacactactgcccactggatgactgccccagtcaccc-agacatggctaccatacccctaagcacagctctggtgccctagagacctctgaaattcc-caaactgg------ccaaggctagcctgcattactagtatccttactaatcctttctgtgaaagacacagtagagcaagcatcttgtccatggattctgccat--cctctgcctcttgagtgtc------agctct----------------------gctcacttctctgagaagcctgtgagaactacaacatctc----cggcagcaactgtatcctgatgtgttggcctta-cacacatagcaacaacaatggttaaaacctgtattaaaacaAACACCCTAGCCACTCCCTCCAGAAAGCCC---TGGGGTGCCCTCAGTGCTATAAATTACCCCTCTATT--------------------------CCTGTC--------AGCTGG-TGTGTgactgtggctttcctaa-------------------aaataagaggtaag----------tctctgcctcccatcccccaggttctgcctggtacatagtaggaacttagtaagtTCCTATCATGTGGAGTGACGACAAGAAAGGAACA------CACACATGAATGATTGTAACAGTAACAG------------------------------------------------------------------------------------------CCTCTGGCCCTGGGCTTT------------------------------------------------------------------------GAAGCACTT--------------------------------CCAGAGAAGCAATGT-------------------------------------------------TTGAGTGATCCTCG-------------TACAGTGAAAGAAATGAAATTCAGAGGAACCCAGTGAGTGA-----GACCTCACATCCAAGAACTCAAGGTGGCAGAGCCA-GAGTCAAGCATCTGTCTGTCTAGATACAGAGAAGACACTTGGAGAGCTGACTGAATTTGCTGGATGGGGGTCCCTACCCCT-TTGTATGCCCCTAGCAGAG-------CATATAGTGATTGATCTTGAGTTAGC---CAGGAGTTCTCTACTCTTCTGAAAGTGAATACTAGGGCTCAGCCTAACTCTCGAGTGAGTATTT---AAACCCACTCTGGGCATTTCATGTCCTCTCTAAACACATATGCATGGCTCTTCTTTGGCCCTGAAATTAAATCTAAATCTCTTA--CATAGTCCACCCTTTGACTTCCACTTGACCTCTGCAGCCTACGCCT---TCCTTACCCACTGTCCCAGTTTGATTGCGC------------------AAGGTGGCCACTGCTTAGCCAATGTACCATGGTAGCTTCTCTTGGTAGCAGGGCTAGACCTTTGGCACCCAAATCCAAGTTACC-ATATCTTAGAGAAAGCACTGAATGAATCC----TGTTGAAACCT----------------------GTTCACTGAAC-------------------TACTTTCTTATCCTCCCACCGCCCAACCCAGTATCCCAGCATCCAGCAACCCAGCTTATGGGAATCCAGCAACTTCCTAGGAGACCTGATGTTCCTTCAGCTCCTGAGAGCTGAGGCTGCAATGAGCTGGAGATACGCAGGCATGCACAATTAGGGAAAGAAAGGAAATTGTCCAGGCCAAGCCCACGTCTGTCCCTTCCATCCTCCTGTGACATTCCCAGAAGCCAGAG-TGGGACAATG----AAATGACTTGAATTTCTTGGTATAAAGTCTACAAAGCCTGTGCTTTTCTGGAAACCTCTGACTTGCTTCTTCTCAACTCTAGGCATTTAATGTGAAGCTTCTGGGTGGTTTCTAGTCTCCCAATAAGAAAACGTGGGAATCCCTAAAATTAGCAGaaattttaataaaattataatGTTTCCAAATCCTTAATCCAC-AACAAGGAGTTTAAATCTCAATGCCATTGCACTCTTGGCATCCTTAGTTTCCTAAGGAAACTGGCAGGGTAATTTAGGCCTTGTTGTTAAAACAGCAGGCAGGCAGTGTCTTTCTGTTCACTTTAGAAAAAAAAATGAGT--CAGTTTATAAACCAGCATCTAGACCTTT s bosTau2.scaffold4168 28041 4174 + 69598 tgtgtgagtgtgtgtgtgtctgtgtgtgagtgtgtgtgtTTTGATTTTCATATACCTAATCattcactcatttcttagatatttattgaatacca---------gttatgcaccaggcc--ctgCAGAGTGATGTACAAGTTATGCTCCGGTACATGAATAGATGGTACATGAGTCAATAATTCTCAGTGGGGAAGGCCAGGCAGGAGTTGGGTAGAGGTAGGGCGCATCACCAAAACAAGACCCAgacaacctcctttacaaagtcacatgcgatttgggacctggaggaagagaaggaccagccaccggggtgtcagggactgagcaccaggcaaagggCTGCTTTGAGTTGTACCTCCTGATCTGAACTGTGGGTATTTTTTCTCTTCCCTCCTTCTTTTTTTGTAGTTAATTAAGATCTCTCTTTTTAGTGAGAATTAAAAGGTAATAAAA-TGCTCTTGTGAAGATAAG-TATAGTAAATGG-AAAGGGGTCAGTAAT--GATGGAAGGGAGAGGACTCCTTATATTTGTAATTGAGTTCAGAGAGTTTGTGTTTTCTTTCTTTTGAAAGTGTGCCTGCGTGTAATTGTTTTTAATTGGGGAAGG-GAAAATCGCATAATTTAATGCTTAAAAA---GTGATGTATGT-CTtatg--tattgggcccagg-ctaagtagtttgcatgtatcatctgatataaaccctttcaaaagctctgaaataggtgataatatcaccagtgtttgcatgagtaaacttaggcaggaa--aggagctgactggccccccagcacatggtaccaataggtagacctaggacttacacctagtctgaccccaaagccta--------------------ggctcctctctctgggatagttaattaatattcccattctacaggtgaagaaactgaggctcagaaacatgaagggacatgcccaaggttattcagctggaaaggcagctat-----------tggggtc---------aaaaTgatt-----ttcaagacagtgacaggagagtgttacaccaagcatggggcccttctgtacatgaagcTGGTCTTGGAGCCAGGACTGGATGCC------------------------------TGGCTCTGACTCCTTCCAGCT--------------------------------CTGAC--------------------------------------------TGGAAgtctcagtctctg----actgagttt-----ctgactcagtctctgtc----------------------------tcCTTCCAGCTAAATGTCC--------------------------CATCTGCTGCTTAT----------AGACCCA---CAACAGCAGT---------------AGAGAAAATGTTAAAAGGAAA--------TGAACTCAGA--------------------AAAGCCAGGATTC------CTTTTAGAGGTTGAG------TCTTGGAGTCctataggcctggcacaagtcctggccttaccac-gtatatga--------------------------------------------tctaaccttatctccacaccagttccatgagctatagttgtaatatctccgcattttacagacaaggagt---gtcttgcgcaaggtgcagtagctggcaggcagaggaggcaggcatctgattccTCCTCCTCCCTCATGTCTCTACTTCGTTGTCTAAGCATCACCATGGCTCTAACCAAAGTCAGACTGGGATTCTGAGGA-----CTCCACTCCAGGAGCCCTGGGGGAGAGGAGACATGAGGAGGGTCTCAGAAGCTGGCTCTTGTCACTC-----------------TTT-----TACCAAAAAGCTCACTTCCTGGCCCAGCACTCAAGTCCTTGCCAATCTGGCCCCAAAGTTGCTTTCTGGCCCAT-CTCACACCAGGTCTCCTAGATGCCCACTCCTGGCCTTACATTTGTCTACACTTGCTGAGTCCCACCAGGCCACT---GCGT--------------GGGGAGCACCATTCATATCATTTTCCATCTAAGTAGCACTGCTTATTGTTGTACCAAGGCCATGGTGGTGACACCCTCCAATTCTCT-CTGCCC-----ACCGTGTGCCCCACATCCTGCAGTGCtgtgttaaccgtgccttctgcctgc--atcctgat-gcttggacaaccagggcctggctgagcctggagagactgccccctcaatcagcgaattcctagagagaacaaacaacttacccttttgcttttcaggcactgaccaaccaacccagaacctacatcccacc---cacctcttttatcaggggctcacactccagccaac-atttacctgcactaatcaccctagggccaggtaccagacagctagggatagctcca-tgccccagagcccactgaaattatacaaactaggtgattttaaggct-gcttaccttgc-------ctgacctcttccttccgtgcaaaccatagca---caggc-tcttgcccatggttttttcctctccctctacctcttaactatccctggtgattctccatgcatccccagtggtgggggaccccctctattggagacttgtgagtataacaaactctcttttcaatggcaattatatcctgatctgttggccttatcacactta--aataataat----acaacctatgctaaaacGAA-GTCCAGgtcacttcctccaggaagcctcctttgttcactctagtcagtataacttacctcttctttgttctctggggtctgctttttgtccctctgtctgccttaaagctggctgtgtgcctgtcactgcccttacctgactgtcagtgcctctgagtcagggctcatgagttacacttttctgtcactcatgcctggggctctgcctggcccatagtaggtgctcagtaaatgcatagcAT-CAGAATAATGATAAGAATGATACAAGACTGCTGACAGGAGTA---GTAGCAGTAGCTGTCTGTTCCTGGTGCTTTGCATTTGTTATTGTTGTTTTgttgctaagtcatgtcagactctgcaactctatggactgtagcccgccaggctcctctgtccatgggatttcccaggcaagaatactggagttggttgccatgccctcctccaggggatcttcctgacccagggatagaatctgaatctcctgctgggctggcaaattctttaccactgagccaccagggaagccctgtgctttgcaaaccttttctccaattcccaaagcaactcttcaaggtagatttatgtaatcataaattttaattcattttcagatgtgaaaatgaagctcagagaggttcagtgatttacccagggccacacagccaaaaa------gtagcaaagtcatgattcagacctgagtctgtccaactgcagaattaacactcttGAATTTGGCTGAATT----GAACTGAAGTTAATTTCCCTATTGTGTGACCCTGTCAGTGGTGACCCTCTGTGTGGCTTGATTATGAGGTGGCAATCGGAGATATTTTAGTGTTCTGGA------CACCAGACCT-AATCTAGCTGCTAAGTGA-CATTTCCAAAGCACAGTCTGCATTCTTCATACCCTCACTAAACACCCATTTATAGCTCTTCACTGGTCCTAAGATGAAACCCAAACCTCTTAGCCAGCATTTATCATCTGACCTCCACTT-ACCTCTCCAGCCCATCTCTACCTCCTCACTCACC--CCCAGCTCAGGTGCACTGGATGCCAGTGAAGATAAAGATGCTCCCTGTTGAGCATGTCCACCTCCCGAGCTTCTCCCAGTAGGAAAGGAAGTCCCTGGGTACC-AAATCAAAGTCACCCATCCCTGGAAGAAAGACTTGAAAGATGCCAGGTGGTTGACACCTACAGAGTCTAGTTAGAATATCAGCTAACTGAACAGTCCCTGATCAGGACAACCCCTTTCCTATCCCTCCCCCTCCC----CAGCATCCCCACATCGAGCCATTTATTTTGTATGAATGCAGCAATTTCCTGGACAACCTGATGCTTCTTCCTCTGCTAGGAGCTGAGACTAGGAAGAGCTGGAGGCCCTTGAACATGCGCAGTTAAGGAAAAAAAAGCA-----TCAGA-CACACCTGTGTCTTTCCCTTCCCTCCTTCGGTGTCACTTCT-GAGTATAGAGTTGGAACGATTTACCGAGTGTCTTGAATTAC------AAGAGCCCATAAAGCCTGTGC-TTTCCAGAAGTCTCAGCTTAGCTTTTTTCCACCTCCAGGCATCTAATAAGAGAGTTCTAAGTAGTTAATCTTTTCCTAATGAGAAAATATATG-TTCCCCAAATTCAGCAGGAGTTATAATACATTCATCCCATTTCTAAATCTTTAATCCCCTGAGAGGGAATTTAATTCCTGAAGGCATTCCA----GGGTAACC-----TTTCCAAGAATGTTTATGATGCCATTGAGCCCGAG-TATTAAAACAATAGGTGGTCTACTTCTTTTCTCTTTATTTAGGGAAAAAAATGAACAACAGTTCATTAACTAGTCTCTAGATCTTT a score=24158 s mm7.chrY_random 25641345 915 + 30114534 CCTCAAGGTAAGG-----ATGAAGCCAACCACACCCCTCCATTCTTTGTCAATAATGGAG-TTATCCCTTTAAGAAAC----CAGTGCAAGT-AAGTCTTTAAAAATGAATCTGTTTAAAAAAAATGGCTGTTGTCCCCAGTTCTGGTGAATTCTCAGGCCCAGTGGGGAACTTTTGCAAAAGagttgtgtggccctgggcaagtcacaccaattttcagctgtcgcttcctcatttgtgcaattagggcagtaacatccctaccctgggtcccagtgaggattaaataaaaaggcagttgtaaaagtgcttGA-----TGGATAAACTGACCAATCGTCT---------CTTCCTG----ACACATTGTTTAAGAAGTGATAACTTAACAGCTAAC----TATCTTTTGAACATGTCC-CTGTGTTTGATGGTGACATAGCCCTGTTTTTAATTCCCTCTCCCACAATTCTGA--ATAGCTGTTACAAATTCATAGAAACTGGACTCTTGGGAGGGCAGATGATCT---------CCAAGCAGG---TGGCAGGGCTGGGGT-TGATGCTAAGAGGGCTGGACTGAGGGGCTGTCCTTTTAAACACTACACTCTCTCACCCTTCAGAAAATGAAGAGGAATAGATATGTCACGTGGTGTAGGCTGGATGTGATGACTT-CCTTTGGCTCTCTCTCTCGCCCTCCTCAGCCTCCTTTTGTAAGACTTTAGAGATGTTTGTGTAAGCTTTCTAGTCTCTCAAGGATGTTATGCTCTGAAAGCGTCATCGATTTCTTTTACTGGATAGTGGCAATGTTGCCTGCTCCTCGT-AACCCTCAAAAACAAGCTGTGGGAGGTCGCCAGAGCGACCGGCA-GTTTGCTGCATTTAAAGCTCTTTTGTACCTGACTTCCATGATGGCCAGAGAGAGTCCAGCCCTCCCAAGCAAATGGGTGGCCAGGGGACAGA s bosTau2.scaffold4168 32541 928 + 69598 CCCCAAGGTCAAGCATTGATGAAACTGACAATATTCCTTGATCCTTTACCATCATCAGAAATTATCATTAAAAAAAATTTATCAGTGTAAATTGAATATTCAAAGATGAATCTGT-----AAAAATTGCCATT---CTCAGTCCCAGCAAATCCTCGGAATCATAGAGGAGTTATTGTAAAAGAACTAGACAGccttgagcaagtcacaccaactctcagccacagttttgccatgtgcactattaagatagtaacacccactcactgggtcgctgggaggattaaatgaaagaaccgatgtcaaagcacctagcaTCTTGTAGATGCT-ATTAATTGTATGTCCTCTTATTTCCTGCAATAAATGTTATTGAATACATGATCAATTAACA-TTAATACCATATCTGATGAatgtgtccattgtgtttgaggctgaaatgattcagcatttaat-----ctccccagatcctggtggtaggtgctact--tttattcaggctcaa------ggtgggtaagtggtttactcggagtccacgcaggaagtgagaaggctggaatctgaatccaggcaccctgaatttggaggtcatacttttagacatcttgccattctACCCTCCAGAAAATGAGAATGAATAGATATTTCATGTGGCAAACACTGAGTTTGATGACTTGCCTTTTGCTCTCTTAAACCCCCGCC--------CTTTCTTGAAAAATGAAAGATGTTTGTGTGAGCTTCCCACTACGTCAAGGATGCTACACTCAGAAAGCTTCATTGATTTCTTTTACGATATGGTTGCAGT-TTGTCTGCTCTCCATAAACCCTCAAAAACACGCCTCATGAGATCACAAAAGCTACTGGCAGGTGTGATGTTCTTCAAGATCTTTTCTCCCTGATTTC-----TCCTTGGAAAGGGCCTTGCCCCCTTAACCAAA--GGCAGCAAAAGGACTGA a score=20060 s mm7.chrY_random 25642325 1859 + 30114534 ATTTCTCATCAGAAATAACCAAGCAGATATATAGATGGGAAAGATGGCAGCAAAGCCCACAGGGAACAT--------GGGATCCATTCTGTGACCAGAGTCCAATGTAATGGAGGATTCTT----------------ATACTTGAGGGCCCAC----TGGGCTCACACCAAATTC-CCCTTCACAAAACCATTT------------------GCAGCTT--ACTAAAAGGATCC----------CGGGAGGGAGGGAAGAAAGCAG----GCCATCTCCCTGATTCCGTATCTTGTTCAGAAGGAAACAGATTCTTCCATTGTCAGCTATGGGCCAAATGCCTTGCCAAGAATAGAGAAG--------------------TGGGGAGGGGTGGTTCAGAGGAGCTGAAGATAGGGCCAATAGG-ACAGCAACAGG-AAGTTATAGACAGACTCTGGATTCTGTCTGGAACTCAGGATGGGCTCCCATTGCTGCAGT------GAGGTCTCCAGCCTGTTCCAGATCCTCCTGCTAAATATTTCCGACACTAGGACCATAGTGTAGAAGCTAAGCGCTAGGTGTGGAAG------------ATTCAAACTCCCTGCATTTAAGGGCTTCATAGCTATT-GAGGGAAACTAGCCACAGGTAGATAGTTTCAATGTGCTAAGTTAGGGGACTCAG-AGCACTTTTCTCTGCTAGCTAATAAGAACCTACTCTGGACCAGGCACCTACTACCTGATGGAGATTCAGTCATCTCTGAAACTTGGGACCTAATGCTGCACACTGACGTGTCGAGCACCACGGAGACATGGCATAGGCCTCTACCTAGAC--AAGAAACCACAGAAG----------GATGCATGAGAGATATGGCAAGAGGGGAGGAGATGCCAGGTAGAAGAAATAGCATGATCAA--GCACAGCGACATGAAACATTTTGTACCTGGG---ACACGTTCCTCTCTAGTTGTGGGTCGCTTCTTAGAATACTGTGGCTCTCAGACAACGTTCTGACAAAAAGCCTTCCTTTCCTTTGTTCTATGGTTTATTCTTAGGATTGAACTGGGGAAAT-TGGGCCATGAGGGGCTTCATGG-----------ATGAGATAAAATGG-----TTTAGTCTCAGCTCCTGGAGACT--------------GTAATTGGGTATATTTTTCTCTGTGGATTTAGTTGTACTTACCAGAACATCTTCCCA------------------------------------------TTGCCCACTC-----------------------------------------------------------------------------------------CCTGGGATCAAACCTCACAACCATGATATACAACTTCTGCTCCTGGCATGCTTTTAATAACCCCTGACAAATGCCACCAATGAACATGGAAGCTCTGAGCTAGGCCCATATTGTGCAGTTATCTAGAGCATGGGTGGGATTTATTACAAGCAGGGATTGGCCCTCCCTCACCAG-------AAAACCTCGATCAGAACCCCATTTTATGCAGGAatccattgacacacttgacccttatcccagctccgtaaggcccatattaatgtcctggctatactgatgaggtgcctgcagcttggaTGTTCTTAG-AGCCTGCTTGTGACCTTAC-----------AGCCAAACCAAGATCTCAGCTGCTACTACGCCAAGCAGA----------GCACACCA---------GTTCTTGAC-------CTTGAGTTCAAAGAAGAACTGTC--AATCT--AGATGTGCCTT----------GCCATCCTCCTTCTGATTGGTCAGCACAAACCTTGCTC-----------ATCACctctctctctctctctctctctctctctctctct---------ctttctc----tctctctctcCTGCATCCATGGTGCTCAAGGCAGGGTGTGGCACATAGAAATACCAAACAAAATAGCTGCTCAGTAAAGGCAGCCATCTGACTGGTCCCTTAGGCTAACTTTCTCCAT------GTATCTCTTTGACCGATGCCAGTGTCCCACTAG-AGACTCATGTA-CCTCTTGACTGCACACTGACATAAAGTCCCACAAATATAGGAATTCCTAATGCTCTCACAGGTGAGGTCAGGCATTTCCTAGATCTCCATTTCTAGTTGGATAT s bosTau2.scaffold4168 34706 2101 + 69598 ATTTCTCATCAAAGATAACCACTAACATATCTGGATGAGAAAGAGATGCCCACGGCCCCCACAGAACACCAATACCAGGGATGTCTTGGGCTTCCAGAAGTAGATATTATGAGGAATCTCTCACCCACTAGCAGGAGAGACTCAAGAACTGGTGATATAGGGCCATACCATGGGCACCCTCCACAGAACCATTTCTCTGATCTTTTTAAATTGCATCTCTAAAGAGAAGGATGATACAGAGAGACAGGAGTGAGGAAGGGAAGGAGAGCAGCCTCTTCCTTGATACCATGTCTTGTTACTGGGGAAATA--TTCTTCCAT-ATCATTTCTGGACCAAGTGCCTTTGAGAACAAAGAGAAGCAAACATGTGATGGCTTCTGTTGGAATGGTTGTTTCTGTAGAACGAGAGTAGGGGCAGACAGGGAAAGTACCAGATAAGCTACAAATAGGCTATGGGTTCTGTCTGTGGCTCAAGAAAGGCTGCCAGGGCTGAAGTCAAGGTTAGGTTTCTGGGGCCCCCCAGATCCACCTGGAAAATATTTCC-----TGGGCTTACAGTTT---------------GGTGTGGAGGGATCAAAAGTAAACTCACAATTCCTGCCTTTAAAGAGTTCCTAGTTACAAGAAGGGGAAGGCACACAAATGGGTCATTCCAATG--ACATCCTACAGGATCCATTCATGCTTTCTCCCACTGTCTAGTGAGTATCTGCCCTGTGCAGGGCATCGTGCA-------GGGATTCAGAGTTACCATCAGCTTGGACTCTACTGTTG-AGAATGCTGTG-AGGGCACAGAGGA----------AGGTTTCTATCCAGACTGGAGATATCCTGAAAGTTATGTGGTAGAGGTAACAGACAGACAGGAACAGGAAAGGAGCT-CCATGCAGAAGAAATCGCATGACTGAACGCACAATGGTATGCGATATTTTGAACCTAGGTTGAGACGAGCCTGGTCATGTGTGGACTGCTGCTTACAGCACGGTGACTTTCAGATATA--TCAGACAAAAAGCCCTCCTGTCTGC----CAGTGATTTGTCCTTTAGATTGACCTGGGGCCACATGGGCTAT-AGCAACTCCATGGTCTTATCCTCCAGGAGGTAA--TGGGCCATTCCAGACACAGCTCCTGGGGGCTCTGAGAGAAGACATATAATTGGGTAGATTCTCTTTTAC--CTATAGTCATTGTCATCTAAACATCCTTTCAAtgggaagaaaatccaaaaaggagtgaatatatgtatatgtatggctcattcactttgctgtacagtggaaacattgttaagcaagtatacgccaataaaatttcatttaaaaacaaacaaaaatcatcCCATAGCAAGTTCCTGGTGAGAAACCTCACAAC-GTGGTGTTAAATCTTTGCTCATGAC----TCCAAAAAATACATTAAAGGTG--GTTGGTTATCATGGGGGTTCAGAGCTAAACCCAGATTGCCGGGTTATGTGGAATGTGCAGGGGGTGTG-----AGCA-----TCTCCTTTCCTCTCTGGGGAAGGAATAACAAGGATTGGAGCCCTACTGCATGCC----------------------------------------AGGCCCACATGGTTGcccca-cttcactgataaggtgcctgaggcttggagaccttcaataacctgcccaagAACTTCCTGACCTGATGGAGTCAAGCCAAGATCGTTGCTGCCTTTACTTCAAACAAGTTTCTCTGAGGCTCCCCATGGGCTTTCATCCTTGACATTCAGGCGTCAGCTCAGGCAGGAACTCTCTCCATCTGAAGAAGTTCCTCTCTAGAGGTCACCacttttcctttcat-----agcacttaccctccgcgataggacagcatggcgtatccattgct-tgtctctctctcagctccacaaggcagggaccttttcagattccttcattgctgtatctgtgatgctcaaagcaaagctgggggcataagaagctcaaacata-cgtttgctcactgaacaaaGCCCTCTG-----TCCCTAAGCTCAGCCCTTTCACTCTGCTGGTTTCCTCAAGATGGCAGCCAATGGCCAATGGGTATTTTCAGGAAGCCCCTTGGTGGC----TGATGAATGATCCTA--AATGCAAGACTTTCTGAGTTTCCCAAGGGTGAGG-CAGGCAATCCATAGATTTTCATTTTTACCTTGGCAT a score=7757 s mm7.chrY_random 25644318 457 + 30114534 ATGTATCTTTACAGTGTGGAATTGTGCCTG--------------------------TTTTCAGGGACCATGAATTAT-------------------CAGTCTTTGGGAGC-TTGCTTTGTCTTAAGTGAGTGGCCCTGAAGTTCGATTGCTGCTATTATGTATCAATCAATTCCAGCG------CAAACCCAGCGTTTGTTCCCGTTGATTGCTCTGTTCTTCAGTGTTGCCATTTTGATTGTGCTTTTTGCTTCTCTTCAATGCTTTATCACCTCGCAATTATTTTTCCACTGAAAAGCAGTGACAGAATGATCAGCCTTTCTTGAGTGGCAGTTTTGAATGTTTGAGAATCCCTGCGTTCTCCTCTGAAACCTCACATGTACTGTGGAGGGA----GGACTATGCTTCCTTTTGTT-------TTGAATAAAGACACATGCATTCCCCAAAATCATCATACAAGATAAATTGGGGTCAGGGGATGGGGAAAGTCACAACTCTCCAAAATGTCTCCGGT s bosTau2.scaffold4168 37099 490 + 69598 ATGTTCCTTGATGATTCAGACTTCTACCCACAAGTCTGGCTCAGGCCTACGTAGACTTCTCAGG---CAGGCATCATTGTCAGCAAGTGCTGTTGCCAGTCACCGTGAGCATGGCCTTGCCTA--------GACTCTGACTCTCCACTCTTGTTGTT-----TCAATCAGTTCTTGTGTACGCTCACTCTCAGTGTTTATTTTTGTTGATTGCTCTTTTTTTGTGTAGTGTCATTTTGATTGTGATTTT-GTTCCTCTCCCACACTTTGATGTCTCCAAGTTATTTTTCCACTAAAATGCAGGGATAAGACCATCAGCCCTACTTAAGTCACAGTCCTGAAAGGGAAGGAATCATTGTGCCTAACCCCATGGCTT--CATGGAGTCCTGAATTATCTTGGCCTCTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGCTTGTGGCAAGGTGTATGCGTTCCTGAAAATCAACTTGCTGGGAAAAATGGGACAAGGGA-----------CTCAACAATCAAAAACATCATCAGT a score=4148 s mm7.chrY_random 25644999 209 + 30114534 TATGGCTCACTCCATTTCGCCCACAATAGTAAAGTGAGAATCAGGTAGATGACC-AAGGTGCATATGTATTTGTGTTCTGTATAATCTTCTGTGGCTCAATGCCCAGCC----------TTCTGG-TTCACCTGGTATTTTCTTAAGGTGAGGTGGGAGCTTTAATCCTGCA------GATGTAAAATCCCCATTATCCTCAAACTGTTTCACTAATCTATCCGTTG s bosTau2.scaffold4168 38169 202 + 69598 TGTGGCTCATTACAC----------ATGGCGAGTGGAGTAGCTGGTAGATGTTTTGAGGTCTGTACGTGGGCCTGTTTTGTGCCTTCCTATGTGGCTTA--GCTCAGCCAGGTGTGGATTTCTGAATTCATCTAGTGTTTCTTGGGGACAA------------AATCTTGCATAAGTAAATGTGAAATCCCCGTTATCCTCGAATCATTTC-CTAATATATCGATTG a score=19897 s mm7.chrY_random 25645220 392 + 30114534 TATTGGAAGGAACTCAGCTTTTCAAAACAAGTGGTCTAGCAGGGCTGACT----CTGAATGATT----TTATCTTCTTGTTTATTCAGATTGGACCAAAAGGATTGAGTACCAGCCTGGCTCGGGGAGTATGCCCTTGTTCCCCAGCATCCACCTGGAGACATGCGATGGAGCTGTGTCCTCCCTCCAGGTCACTGCGGAGCTGCAGACTAATTACATCGGCAAGGGCTGTGACCGAGAGACCTACTCTGAGAAATCCCTTCAGAAATTATGTGGTAAGCTTTTCC-TTTGAGACTCCGTTCAATTAATAGCTTTCAAGTGCTACATGCAAATGAAGTTTATCTAATTATAGCA--AAAAGGCCAGCC-TTCCCCAC----CTGCCACAGTC--CTCCTGAATGGATATT s bosTau2.scaffold4168 38510 405 + 69598 TGTTGGAACAAATGTACATTTTCAAAGCACATGTTACAGCAGAACTGTCTGCACCTGACTGACGGTCACTCTTTCCTTGTTTACTCAGACTGGACCAAGAGGATTGAGTACCAGCCTGGCTCAGGGAGCGTGCCCCTGTTCCCCAGCATCCACCTGGAGACGTGCGATGGGGCCGTGTCCTCCATCCAGATCACCACGGAGCTGCAGACCAACTACATTGGGAAGGGCTGTGACCGGGAGACCTACTCTGAGAAGTCCCTTCAGAAATTATGTGGTAGGCTTCCCTGTTTGGGTTATTTTTTAATTCATTG-TTTTAAACAATATATACA----AAGCGTATCTTACTATATTATGAAAGAATCAGCCGCTCCCCACTGCACTGGCACATGTGACCCCTGGATGAATATT a score=3098 s mm7.chrY_random 25645618 134 + 30114534 GGGCTGAAGGGTGAGAAAACTCAGCTTTTTGGCCTCAGATACAACTGGTTCAGAGTCGG---TTTGCCAGACTCGTGTGGCTTTAGGCAAGTAGTGTGTGACAGAGC----ATTCTTCACTGGTAAGACAGGGACTGAATG s bosTau2.scaffold4168 39993 135 + 69598 GGGTTAAAGGGTTGGAAAGCTCAGCTTTC-AGCACCAACCACACCTGAT-CAGACCCCACCATGTACCA-ACTC-TAAGGCTGTGGGCAAGTGCTGCG--ACAAAGCCTCTATTCTTCATCAATAACATAGGGACATTATG a score=9969 s mm7.chrY_random 25645823 850 + 30114534 AGAGAGCTGCTTTCCC-GGGTCCATTATGAAAAATGGTGATAGACAACCTGCAAAAGGGTTTGACCCACCTCCACC--AAGcagcta---cacaatttccaaggcccggtgcaaatgaaatggtt----------------------aagaattttactatgggaacagcagagcagtaaagcaag-----ggcCTGCAGCTAAACAACTGCTCAGGGTACA-----GTGGAGCTGAGCCCAGCTGTCCATAGCGGAGCAGCTTCAGAGAGGATGGA--GGTGGGCAA-ATGAAGATATTCATATGTGGAGGTGAAAGGGGAAGGAATTATTAATGGAGAGTGAGAGTGGGCTGCAAGAAAGGAGAAAGGCCAGGAATTACTAGTAGGAAGTGGAGCTGATTAAAGGATACCAGAGAGGATGGCTTGGAAGAGGCCtttattgaatacccactgtgtgcatc---------------------------------------ctgtgacacccca-----------------------------catgggatgttcca----------------------------------tctagtgc---tcacgtgt-------------atatgggaaagaatatatatccacaccgctttgcagatggaaacttggagactcaaagtgtgaccatc--gttgaagtttgcacagacaggaaatatccgagattggctttgaaaacaggtctatctgaAAGGTAGGCTCATAGGTTGACAATTTATCAAAGCCAACCAGGCTCCTAGAGCTGGCGTGTATCTCCCCAGTGACCTGTGAAGGAGAGGCTAAGTACCCTGTGTGGTGGGACCGG-CCCACATGCTCCAGCAGCT-GACTACTACTGTGTTGGCGACCTCTTCATCTCCCTCAAACGTGCAGT--ACTTCTCATTTGTTCTCTACAAGAATATCCAGGGACTCACATGCAG-CTCTCCAGCTTCACTGTGGG-AGCTTAGGAAAAG s bosTau2.scaffold4168 40235 970 + 69598 AGAGAAGTGCCTTCCCAGGGGCCAGTGTGAAGGGTGGTGCCAGCCTCTCAGGGAGAGG---TGGGTCTCCTCCTCCGGAACCAGCTATGGCACA----CGAgggcttactgcaaatgaaagtgcttgacctttgttccaaaattatgaagaattttaaggcagaaacagcaaagcatgaaaccaagctgggggcc-----ccatgtgactgttcaggtcacatgctgatgaagccgggcctgGATGGCCACGCTGGAGAAGAGCTAGGCTGGGAGGAAAGATGGGGAATGTGAAGG-ATCCAAGTGTAGGGGACAGAGGGCCGG---CTGTCAGTGTGCTGAGACATGGTGCCCCAAGAAGGAAGCAGG--CCGGAACTGGGAGCCAGG-GTGATGCAGGTTC-----TACCCGAGGAA---GCTTAG-------CTTTATTGAGCACCTGCTGTGTGCACCTCACGCGTGtgtgtgttagtcatccagtcttgtccgactctttgcgaccctatggactatagcccaccaggctcctctgtccatgtgattctccaggtaagaaatctggggtgggttgccattcccttctccagTgtgcttcacatgccctaccctaattcacactgaggagggtct-cattcatccagttttaaacatggacaattagacgcccagagaggaaaaattatgtttaaggt----cacacagggagtgacagaggcaggctttgaaagtaggtctATGGGAGGGAAGGGCTCTTTGGCTCTGGATCTGTGACGCTGGGCCAGGCCTCTGGAGCTGGAATGTAAATCTCTCAAGTCAAGTGCAGAATAAG------ACACAGTACGGTGGGAACGGTCCCATGTGCTTGGTAAACCAGACCGTGGGTGTGTTGATGGGCCTCTTTCCTCCCCACCATGTATATTTCATTTCTTTCTTGTTCTCTCAGAGACTATTCAGGCCCTCACA--CAGCCTCTCTAGCCAGACTGTGGGCAGCTCAGAAAGAG a score=23904 s mm7.chrY_random 25646809 1175 + 30114534 TCTCACCTGAGGAACCAAGTGAAAATTTCAGAACCAAA------ATAAACTCCTATTAATCAGCATATT---CTGTTCATCATATCATCAGGCTTTCGGGGAAGATCTGTGGGGATGCCTGCTCTTCTGGAACAAGTCAGTAGACTGGGGGGAAACG----------GTGTTATGAACAACTATTTCAAAAGAGGATATATAGGGATTTACAATGCTCATAGA-CTGCTCAATTCC--TGTCCTTTCCTCTACTTGGTTCACAGAAGTCATCTAAGGTGACATCTTACTTGGAATAAATATCCCTTTCCATTCTCCCTATACTTGGAGTGTCAGCAAACTCAACCTCACATGGCCTCCATGGCTTATATAGTCATTTCCCCGAA--CTCTGGGTTAGAAGGAAATGATGAATCTGCTTGCTAAAGATCAGA-GGGCCCAAGGGCACATGC-TGTGACTTGATTTTCAATGTTGCTGGAGAGAGA-TGGGAGATAGAGAAGGCGCAAAGTGTGTTTTAAGAGAAGAAACAGCAAAGCCAAATTGCATGTGGCATACTAACA--GCTCACTCCATCTGGACTGCCAGCCTC-------------GTGGGCTAACTCAGCTGGGGAAGACAGCTTCCCCAGGTGTGCA---TCATCTGCTTCTGGAAGCTGCCCT-GTGAA-------TGAGACAAGCCTGCTT-----------------------CTCTCTAG------------------------------CCACCCAC-CCAGTA---------------------GCACTG-------CCCACT---------------ACTCTTATGGGATCCCTGC-----CCAGTAGCCAAGGTGGACAGATGAGTCAGGTCTCATGTCAGAAGCC--------GTATTTATGGAGTAGAGTACTGATAAACAGAGCAGAAGCAAAGGGGAGGA-------------CATCAGAAGTCAGGCCCCCTGGCATCTA------------------AGGAAAAGGTAGGGTCTGGGTCGT-------ACATAGGCTGTGTGGTGCTGTCTGACTCTTGTAGGCATCCT-GGCTCCTGTTGACAGACATTTATCTATGTTTTCAGTAGACGGTAGGCAGGCTTCTTGCTGTATCTCCCAACCAGAGAGCTGCTGTGACACTTTAAACTTGG-----CATGC-ACGCATTTTTTTT------------------TTCATCCTACAAATCTTTATTAACTTTAAAGggaaacagggagagcaattaggatgttattaccatagtctaagcaacagataatgagttctgaaccaggggagtggctgttgggatgaatttaggacag--ttaagaggcaaaatcagcaagatttaa-------------------------------------tgagtggta s bosTau2.scaffold4168 41656 1404 + 69598 TCTTGCCCAAGGA-CCAAGTGACAATTTGAGAACTGGATGTGCAGTATGCCCTGCTTGGGTAGCACAGTGCCCCATTTATCATGTTGCCAGGCTGG-AAGGAGGGCCCATGGGAAGGCAGGTTTTTCTAGAATGATGCAGGAGATTGGGGAAAACAGCACAGCCTAAGTATTCCAAACAGCTCTTGTAAAAATGCCCAT-CAGCAGCCCGCAGTACTGAGAAAGCTGCC----TCCGGTGCTCTTTACTCCAC---GCACAGAGAAGCCGTCTCCGCCAACATCTCATTTCGAATGAATATCCCATCTTGCTCCCTGTGCACCTGAATTATAAGTCAGCTCAACCCCAC---GCCACCGCAGGTTACA--GTCATTTCCTCAACTCCTCCAGGTTAGGAGATGATG--GAGTCAACTTGTTAAAGATCAGATGAGCCCAAGGGCACGCACAGGTGATTTGATTCTGAATGTTGCTGGGGGGAGAACAGGAGATGGAGA-GAAGGAGAGGATTTTTCAAGGGAAGAAACTTTAGAGCAAAATTGCATCTGGT-TGTTAATATAGCTCACTCC-TCTGGGCTGCCAGCCTCACCTGGCAGGAAGGCAGGTTCAATCAGACAGGAAAG-CACTTTACCCTGAGATGCAAGCTTATCTAGTACTGGGAGCGACCTTTGTCAAgctcagctggaaagaatctgcctgccatgtgggagacctgggttcgatccctggattgggaagatcccctggcgaagggataggctacccactccagtattctggcctggagagttccatggacTGTATAGTCCTCACTTACACTTCCTGGTGTGCACTTCTGGGAACCCCGAGTAAGCCTGTTGGCGGGGGGGGGGGGCATTCCTGCCTCCAGATCAGGAATCTGCCTCTTGAATCTACAGAGGAGAA-----------AAGACAGAAGCAAATGAGTGAGACACATGCCCATCCATGTTAGGTCTGCTTCCTTGGGCCCCACGCTCTCTCCAGACTGTGAGGGAAAGGTAGA--CCAGATCTCTTCTAAAGCGGAGCCTGGGTTGTGATTCCTGACTTAAGTGGGGCTCCTTAGGTTCTGAAGACAAGC--TTCTTTGCATTTTCCCTGGCTTGTCAACAAGCTGCTGGCAGGGTTTCCCAGCCAGAGGGCTACCGtgacactttaagccccagtgttcattctacatatcttcattgacactttaagccccagtttcattctacatatcttcattgacTTTggatagtaacagggagaccaattaggatgttatggccatagtctaagcaagagataatgatttctgaactgggggagtggcagtagggatgaacctaagacaggtttaggaggcaaaatcggtaagggtcaaccattgattgagaactggatgtgcagtatgCCCTGCTTGGGTAGCA a score=16957 s mm7.chrY_random 25647984 1225 + 30114534 agctgttggaagga------------------agagagaaggaaccctaaagtATC--AGCGCCAGTGTCTAACTTGATGAACAGGGCAC-ACCCACAACCAGAAACCCAGGAGCAAGGGTACATTTATGGGACATCACTGGCAGGCCCCTGGGCGACATC---------------------------ACCTTCCAGCCTCCTCTCAGTTCTCCTGGGGATCTGCCTTAACCAT-------------------GGCTCACCTC--------ATGCTGGTCCTTTTG----------TTCCTTTCCTTGC-------------TTCTCATTCCCAAGCCTTTG-------------------------------------CTTTCCTCTCCCAAGCCCCTTCCCTTGGTCACTGG--GCCATCTGTCCCTTTGATCAG--------TTGGA-----------------TCAAGTCTCATGTTGCTTCTATG----------------GGAGCTGGAGCTCTGCTGCATCC---TCTGCGTTCGTGTGGCCGGACAGGGACCCAACC-CGACTGGCTTCCAAAGCATGA-----AAGGGAGTGTG-------TCCCATTTAAGGGGAAAGTGGGCAGTAGCTGATGCTGGATGGTGTCAGAAGTCACCCGAGCAGACGTGGCAGCACAAGAGACAGACACTGCTTGGC---------------------AGACATTTTACTTCCTGAGATTTAAGCATGGAGATGTTTCCTTTATGCCTTGAGACAATATAGTGGAGTCCTCTGGACCTGTGTCTCCTCCAGACTGTAT-ACCAGATACAGGGTAAGCTGATCC-------ATCTTCCAGACTCCACATGAAGCCTGGCTTCTCAGAGGAGATGGCCG-GCTGCCCATTACCTTTTCCAACTTCAGGAGTTCAGG----GAACAATCTTGTCTCAGGACCAGGCTTTCCAGATGTGAAAAGCCACAGCAGTGTATTGAGGACAAAATGCAAGAGGAAACCCTCAGGGAGACCTCTCAGCCAAATCAAATTTGACATTAACGACAGCCCAAGAAAAGGTTCCCTTCCTTGACCCTATGTCACTACATATTATACGGAATAGAAAAGTACTTTGTGCTGCCTATGCCCTTTGTACAACACAGAGGCCAGG-CTGTTCCGG--GGGGATCATACGGTTTCTGGCAGCTGGCCACTACTTCCTGA----ACACAATGCCAAGGGCAGCTGTTTTGTTTGTAAGTTAAGAGTTCCCAGGACAGGTCCTGCTGAAGGAAAGGCCACCGGTGTGTGAGCATGCTTCTAAAATCAAGTGCTTTCCAAGCCAGAGCTGAGTGGATAACCCAACCCTATGTTCTTCTCCAAATTTTTATACTGCTGAGCTGGGGA------------------ATTCATTCATACATTAATGACTTCAACAAATGTTTTTGTTTGCGTAA s bosTau2.scaffold4168 43172 1436 + 69598 AGCTCTTGTAAAAATGCCCTTTACAAGCAGTGAAAAACAAGGAATCTTAGAAGATTCTAATGTGAGCATCTAACTGGATGAGAGTGCCACCAACCAGAACTAGAAATTCCAG-GCAAGGGTGGATTTAGGGGACAGTGATGATAAATATCTGTGAAACAGCCAGGTGTGGGTGCCCAACTCTAGAATGACTCCCCACCCTCCC----GAGCTCCCGAGGACCTGCC---ACCATCCCACTGGTCCATTGTTAGAGCCCATTTCTTCCCAGTGTGCTGCCTCTTCTGGGCCAGAGTATTCCATTTGTCACCATCCCCAGCTCATTCCCATCCCTATGCCTTTGTTCATGATTTTTTTTTTCCTGCTAGAACCTCTCTCTCCTTTACCATTCCAAACCCTTTCCTTAAGTCAATATTTGCCTGCCATCTCTGCTATCAGAAGCAGTGCTGGAGGGCTCCCGGGTGCTTTTAAATTCTGACATTGCTTCTGTGACACTGTCCTTGTGCAGTAGCCCAGGCAAGGCTGTCTCCCACTCTGAGA----GAGGTCTGATCAGTGCCCACCTGCTTCCTCTTTCTGCAGCATCATTCACAAGGAGCAGTGATGGCATCCCTGAATAAGGAGCCATCAGACAGCAGCCAGGCAGAGCCACTGTCAGGAAGTACCTG-GCAGGTGCAAAAGCACCAGAAAAAAGC-CTCTTTGTTTCCAAGGGAGCACCAGACATAAGCCATATTGCTGCCTGAGGTTTGCGCGCTGAGA------CTTTGT--------AAAACATGATACAAGCTCCTGCGCCTGTGTCCCTTTCCACTTGCAGGAACAAATTTAGCCTAACACGGTCCCCCAGTGACCTTCCTG----TATGTGAAGCCAGGCCTCGTGGGGAAGCTGGACAAGCTGCTTATAACTTCCTCTGGATTCAGAAAGTCAAGATAAGAACTCTGCCATCTCAGTCCCAGGTTTTCCCAAGGTGAAGTGTCATACAACTGCCTTGAGAATGAAATGTACAATGAGGCCC-CAGTGAGGCTTCCTGACCAAATTCAATTTGACGTTAGCCCAAGCCTAAGAAAAGGCCTGCTTCCATGGCCCTGAGTCACTGCATATTACAATAAGCAGCAAAGCAGTTTGTGACACACACGTCTCTTGG--AGCCCTGAGGCCAGGACTGCTCCTTCCTGAAACCACA-GGCTCCTGGCATCTGTCCAGCATCTCCCCATATGACAC----TCGGGGTCAGCTGCTCTGGTGTGCAGTCAAGAGCTCTGAGGACATGTCCTGTTGAAGGAAAGGCTG-CAGTGTGAGAGCCTGCTGTT-AAATCAAGAAATGGATCCATCAGACCAGCTCATATCATCAGACAGTGAGCTGTTCTCAGAATTCATACACTTGTGAGCACAGGAGATTTTCATAGAGAATCTATTCATTCATTCATTAATTTTTTTAAAGGAAAGTTCAGCTTTCTTGC a score=12021 s mm7.chrY_random 25649763 498 + 30114534 ACCTAGAAATCCAATTTTCCATTTTCAAGGCCTTCAGATCTCAAGCATATAGATGGAAAAAAATGGAAACCATAGTTGCCTACGTCATTTACTTCTATGAATCATTTGGAAGTATGGCCaggcaggttatgctacagtaacaaatgatctcataatct--------------cattggcttaaaatacccaaggt--ttatcattcctaccatgtatccttcttggattg-----------------------------gacaagaccccagctaatggggtagcctttatctagaatatcgttcatcccaggaaaggtagaaaaggttca--tggtgaactatgaactatcacttaagatttcgttcctaatatgacacatgttccttgaaaccacatttctctggtcagagcagg------acttatggtcaagctaatatca-tgggTCAGAGCTGTATGTCGTGCATA----CATACATTCTTCTAGCACCCAGGCCCTATGGTCCA--CCAGGCACTTG--AAGAGTGCCTTTCTGGATTCTGCCAAGAATCTCT s bosTau2.scaffold4168 45067 540 + 69598 ATCAAGAAGTCC-----TCCACCTCCA-----TGCAGA----AGGTATGCAGATAG--AAAAGTGGTTATGGTAGCCACTGATGTCAGTCATTTATGCACATtatcagtcag---gacagggcaagttaggctgtggtaacaaatgatgccaaagtctataggcttaaagtctataggcttaaaataacaaagttaatttccattcctatcacatgtccttcttgggttgactgtcgctctgttccatgttggtttcccaccacgatccaggctaacagaatagtctctatctagaatattgttgatctcatggcagatggaaaaaatatatgtggtgaaccttggactggctcataaattttctgccctaaagtgacacatgtcatttgcattcacattttcttggtcagagcaagtgacacacacACAGCCAAG-TGTGATCAGTGGGTCATTGAAGCATGTTAAGAACAGAAGAATGCTTTCTACCATCATGCAGTTCATGCAGTTCAAGTATGGCCTTTGTCAAGAGGGCCTCCCTGGCTTCCCCCAAGACTCTCT a score=4196 s mm7.chrY_random 25650272 371 + 30114534 TTCTACCTAGTTAACTGTTCC-CTTGGGAAAATTAAAAGGCTT---ATTAGGTCCCTAAAAGT-GGGACCACTTTCATGTGATTAAAAGTTGTGCTCTCATGGCAGTGCTTGGCATGGCTTGGCCATTGCATACACATTTATTGAGATAAAATAAAATCTTCCATGCATCTGCTTAGTACTCACCATGTGTCTCTCTGAGAATACTGAAGAATGAGCCTTGATCTTAGATGATCTTACATGAAGCAGTTCCTCT--CTCAAGATTCTCCCACTGATCTCCACCCCACCTATGCCACCCAACTCTGG--------------------AGTCTCCGTGCACATCACTCCTGCCACAGTTCCACTTTGGAATACTAGGGGGCACT-------------GCCTATCCA----------------------------------------TACCTGG s bosTau2.scaffold4168 45863 414 + 69598 TTCTACC-AATGAACTATTCCACCCACCAAAAATAAAAGACTTTCCATTGGGtctctagaggtagggcccattgctgcatggttcattgctgtattcccaccacagtgcctggcataACTAAGACATAATATAAGCATGTAATGAAATAATATGGAGTTG---ATGC----------TGCTAATCATG---------GAAGGTGCTACAAAATGAGGCCTG--------TGTCCTCGATTACAATGGTTCCTCTTCCCTGAGATCCT-CCACTTCTCCCATCCCTTTCTG---CATCCCATTGTGGACCATAAGGAGGCATGACTAAGGCTCCACGTCTGTCACCATGGCTGCAGGCCCAC-TTGAAATGCT-GAGGGCACTCTGCCTTCACCAAGGCTATCCAGAACAGCACACAAACCCTACAGTTAAGAGGTCCAGggacttccctgg a score=11740 s mm7.chrY_random 25650643 439 + 30114534 GCCAG------------GTACAGCAGAATAAATACCTAA--------------------------GTGACCACCA-TTCCATTTACCTTTTGACCTCTTACATTCTCCTGTGCCCATAAAGCTCTCTCATTCTGTCCTGTCTCTATGTGCT-----GCTCAGAACAGCTTCATCACCCTAATAGAACCCAGGGACTTGAAATCAAATGGCGTTGCTAGTTTGGAGTACCTAACACTGAGGCAACAGCTGCAATGTACCAGAAGAACAGGAATTCTTAGCA-TCTAGTGGCT-CCAGGGACTGTCACAGAGAACTCCAAAGAAGCAGCGTAAGCATACTTGGATGTGCAAATGCTGCCATACCATGTCTACAAGTGACATGTCTTGTTTTCCCACAGCTTTCCCATGGGATCCTTTAGGAAGAAGAGATGAGAGAACTTTGGGTGGAAGTGAATCCTCCTCAGATTGTTTAAGTGTGACAAGAAAT s bosTau2.scaffold4168 46378 461 + 69598 gccagaactaagacccagtacagctaaataaataagtaaataTTAAAAAAGAAAAGACCCAGATGGTGACCCCTGCCCCCAGGCCCCTTGTGGGCTCTCACTCCACTGTGTGTCCTGAAATCTGCCTAACTC--ACCCGTCTTTATCTACTTGCTGGCTCGGCAAGGCTTCTCCACCTTGATAGGGTTCAGAGACCTCAAAGCAGACTTCATTTCTGGTTACAAGCCCCTTACACTCAGGCCACAGTTTCTGTGCACCAGACTAGTATGAGCTCTCAGTAGCCCAGTGGGTCCCAGGGACTTTT------------------GCATCTTAAATACACCCTGACATGCAGACAGTGCCACACTATCTTTGCAAGTTATGCATCCTGTTTACCCACTGCTTT-CCATGGGATACCTTGGGGAGAGGA---GAGAGAACTTTAGGAGAAAGGAAATCCCTCTCATTTTATTTAAGTGCACCAGAAAAT a score=5291 s mm7.chrY_random 25651084 172 + 30114534 ATTCAATCTGTTAAGTCCGTGAAAGTCTGTACCATCTGGTTATAT---GTCTCGTGTTCTCCAGCA-GCAACATCTGCAGGACAGGGAAGAGGGGC-TGCCATTTCCCTC--CACAGAAGATACTGGCG----TGCCAAGCGGCCTCAGTGTGCCTCTCTGGGAGCAGACACATGTATAGAGA s bosTau2.scaffold4168 47058 176 + 69598 ATATAATCAGTTAAGTCTGTGGAAGTCTGCACCATCTAGTGAAACACAGTGTCATGCTTTCCTGGAGGCAACATCTGT-GGGCTGGGCAGAGTGACATGCTATTTCCCTCATCAAGGATGACATCGGTGGCCTTGCCAGGGCAC------ATGCCGTTCTGTGGACAGCCACCTGTACAGGGA a score=7207 s mm7.chrY_random 25651596 855 + 30114534 TGCAACCAGTT-TTCTTCCCAAACACCTTTCATGCCAACCCCACTTTCATGCCATAG---------TAGTCTTTGCTCTA--------TGCTTCTCTCCAAATCTGTTTTGGAAAAACTTGTCACTTAACATCTCCACTTGTCTAAATTATTAAGTTCAATTCTCCAGGCACA-----------------GTAAGACTCTTAACCAATAGAGGGAGCCTTGTATGATAATTCCCAGCCCTCCCAAGCCTTTCTCTGGGTCTTGTGTGTGCCA--CCCTGGCT-------------------ACTCCGTTGATGGCATAAGACAC-----CATATGTGTCCCT-CTGCACTGTTCTTGGATAAACCTTATTGACTTC----TCCGGGATTCTAAATGGTCAGCCTGTATTTTTGCAGATAACACAAGTTTCAATAGCCAAGAA-------TGTGTGCCTTAGTCATTGGTTGTCTTCATGCTGCACAAATCC------CAGATCTAATGCCATTATCAGTAAAAGAAACTGTTG-----TGATAGGATTCTGTGAGTGATGGAAAAAATGAACTT-TTTGATATTCCACAAATCTCTCATTCCCAAATGACCCACTAATCTCTCCCTGATACCACCTTGACTGATGTCTTTTTAACCAATATATATGGAGACTGCAGTCCAAGGAAGG-------------TAAAATAGTAGTGTAAACTTGTTTTTTTAGATAAGTGGTATATTCAGGGGGGAGAGGCATTGTGGTGTGAGAATAACTAAAAACTGTGAGGCATGGCCAAGAGGCAGGATGGTCACCTGAGCACTGAAAATTTCCAGAGCCACCTGCTGTCTGTCCTTTCTTCCTCCTTTCCTCCATTTTTTACATTGTTCCTTTATTCTGTTATATGTATGTTGTATTGTATGTATGTTGTGTTATGTGTATGTGTGGTGTA s bosTau2.scaffold4168 48451 846 + 69598 TGTAACCAGTTGTTCCTCCTAACCTTCTCTT--------TCTGTTTTCTCTCCATCACCCTCCACCTCATCCTTGCTCTAAACCTCCCTCCCTCTATCCAACCTTGCTTTGGGGAAAATTAGCAATCAGCTCCTTCAGTAACCTAAATGACTAA--TGAATTCTGCAGGAACATTGGCTCCTTAACAAAAGCAAGGTCCTCGATCAAAAGGGAAGCTCAAGAAGTGGAGTTTTAAGTCATGTCAATGTCATC-CTGGTTCCCTGGTGTGCAAGTCTCTGGCTCTGTGTGGTGGCAAAGCTGACCTTGGTAACGGCCGAACACACATCCCTGTATTGGGCCCTGCCAGATTGTGCTGGGGGGCACTGGCTTGAGCTAGAAGTCAGGAGCCCTGCATGGTCAGCCTGCATCTCCCTGGCCACCTGAAATTTCAAGAACGACACACATTCATTGTGAGCCCTAGTCACCAGCTGTTATC---CTGGACAAATCCTGGTGTCCGAACCAACTCACTTATGAGACCGAGAAGCTGTTACCAGCTGGCATTATTCTGGGAGATTCTAGGAAAATGAACTTATTCCAAAAACCACATATGTCCCACCCTCCAACTACCCCCAAATCTTTATCTACCACTACCTTGGTAGATTTCTTTCTTTCAAATACCTAGGGAGGTT-CATAGCGCTGAAGGCTTTGCTAGTCATTAAAATGTTAGTGTGAACTAGCTTATC-GGATAAGTAAAATG--------------------------GACATCAAATAAGACTCTAGGAGTATGGATGAGAA------------------CAAGTAAAATTTC--------------------------------------------TTTTTTAGTATTTATTTACTTGGCTgggtcttagttgtgtc--atgcaagtttagttgtg-gcatatgggatcta a score=48743 s mm7.chrY_random 25652611 2003 + 30114534 CCAGAGCATCTTAGGAGGGACACTGGAAAAGAGGAAGGGCAGCTGTAAATAGGAACTGAGTACCAATTATGTGTCAAGTGCAATAACAGGCAACATCCCTAGAAAACCCCCATGTGACTCATGCCATCAATTCTGCGCACAGCTCCC----------------ACAGAG-AATAATGAATGGAAAGCCTA-------CATCCCCCAC----CAGAAGGATGGGCCTTCTGGAGGCCCTTTC-AGGATGAACTTAATGCAGTGCTAAGCGGAGCATCTGTGCTCAAAGGAATCACATGTTCCCTGTCTATTCTAGTCTTTCACTCCAAACCAATGAACATGTGCCTGACAGTCCTTTCCAAAGCCAAAGGGAAGTCTGGCAAGGATGAACATTATAAAGAAGTGTATTGGTTTCCAGCATGGTACCTTTCTGAGGACTTTTCA---------------CTGAAGGATACTTTTTGTGACAGCTGACCTTGAAGCCCAAACCCTAGATGAGATGACTTTGTGCTCTACAGATGGCCAAAGGCCAATGACCCAATGAACATGAGACAGTGCACATGCCCCGCCATCCTTTAGAGCATCAGCTCTGTACCACCATCACAACATTTACATGACTGGTGAGTGTCCTGCCAGGAGATAGCCCCATGCGC----------AGCCCTGGCAAAGCTTGCATTCCCCAATCCTTTAAATGTGAACATTGCAGGAGGCTCCCAACCT-------------AATGGATAGGAT--GCTGCTCAATAAAATGAATGAGGGC-CCAAGAGTCCTCCCAG----------------------------AAGCAGTCTAG--ATTTTCCTGAC------------------AAACCAGCTGTTTCCTCTC-CTCAACCCA-CCTTCCACAAAGATATCC-TGTGACTGTCTCAAAATACTAACCTTCCCTTATAGGTCTAGTCTTGATGTTTTGGGGAAAGCCCTCCTGTTCTACCCTGGAATGGTAGTGATAGCAAAACAAAAAAAAAATTACAATAATGGTAATGATAAAATTATAGCACACACCAAGTGAGCAC--TCAATATTGCATGAAGC------TGTAAGTTTGAATACATGATCTCATCCCGCCCCCCCCCCACACTGAG---------------GAagggaatccag--tcagagagattga---tgtgttcccagtcacagagctgccgagtcaagctgcca---ggtgtcaaattcaagtggtgccaacttcagagcccctgttctcaagcactgtgccatTTGGCTTCAGCAAATGGTTGTGGGAAAATGTCATGTATACAAAGTGGCTTACACACCTTCT--------------------------------------------------------------------------------CTCTAGATGAGAGCCTAGAATTTTCCTCAGTCTTAACCCTGATCATACTGTATT-----GTCTCAT----------------AGATTCTTTACGGCAATGAGTAT-CTTATTTGTCTTCATGTGGCCAGAACTCAGAAAGGGTCATGGCATAGGGTTGATGCTCCCTAAATGACTGGCAGGTTAGTTGATTGATGGGTACATGAAGGAATCCATTCACCCAAACAAAGCCCTGGCTGTCTGCAGGAAAC---CAAGCTACTAAAAGCCCCAGTGGTTCTCCCAACTCTTGAGGCTCCTCTCACACCTTTCC-CTTGTGT----GGTAGTTGTACCTGCCTGGACATATGTGTCACTTTTATCTGCA---TACCAATGTATGTCTGAACAGACCAGGATCAAGTCAGAGGTTTGAATGATATTGGACTCTTT----CCTGAGCCACCTAGGTCAGGAGTAGGCAC--AGACCTCAGTAAGTACAC---TCTCTCCACTCTGACACACAAAG-AGAAGTCAGAAGGTGAACCCACTGCCATCCTTG-AGGAATAACCACTGTGCT---TCCATCTCTTCCCCTTGCAGGCGCATCCTCGGGTATCATCGATCTCTTGCCGTCCCCTAGCGCAGCTACCAACTGGACTGCGGGGCTGCTGGTGGACAGCAGTGAGATGATCTTCAAGTTTGACGGCAGGCAGGGTGCCAAGATCCCTGATGGGATCGTGCCCAAGAACCTGACGGACCAGTTCACCATCACCATGTGGATGAAACATGGCCCCAGCCCCGGCGTGAGAGCCGAGAAGGAAACTATCCTCTGTAACTCAGATAAAACTGGTGAGtct s bosTau2.scaffold4168 49431 2178 + 69598 CAGAAGCATCTCAC-AGAGGTATTTTACAGAAGAAAAGGCAGTTataaacattaatggagcacctactatgtgtcaggcaTGCGACCATGCAAAATCCCTAAGAAATATGCTTGTTAATAATGCAGTCAACGCTGCCCACATTTCCCCTTGATAAGCATAGCTACAGGGTGATTGTGAATTAAGAGACCAGAATCTCCACCCCCTACATCTCAGACACTGCAGTTCCCCGGAGGCCTTTCCCAGGGTGAGCTTCTCACCA-GCTAAGCAGAGCAGCTG-GCTCTAAGGATACAAATGTTTCACGCAG---CCAACCTTCAATTGCAAACCAATAGGTATCTG------------TTCCAAGGCTACAGGGAAAAGTGGCTGGGTGAAACATTTTCAA--AGTACATTAGTTTCTAATATTGCACCTTTCTGAGGAATTTTCAAGGGTCATTTCAACTCTAGGGGATGTTTGTGGTGGCAGT-----------------CCCCAGGTGAGATGAGTCTCTGATACACAGAATTCAGAAGTCCAGCGATCCCTGACAAATG-------------GCACCACTGTCCATTAAACC--CATTTATG-ACCACC-------------------TGGTTGGTACTGTGCCAGGAAGGAGCCCCACACACCTGGTCCCCTGCCCTTGGCATACCTTGGACTCCCTGGTTCTTGTTCCCTGGA-ATT--AGGAAGCCCTCCACCTTCCTCATCCCCTGAGTAGCTGAGCTCTGCTCCTCTACAGA--GCATAAAGATGCCAAGAGCACTGCTGGCACCACCTGAGCTTCAGTGAAAAGGCCAAGGCAGCCCAGTTACCCTCCTGGCTGTGCCATCCTACTTTCTGGGTCAGCTCCTCTGGCTCACTCAGCCCCTCCCTCCACAAAGCTGTTGGTGTAATTATTCTAAAACACAAATCTGCC--TATGG---CACTCCCACTGCCTCGGGTTA-----TCCT----TAGACTAGAATCATAGTGGTAGCAAAAATCATAGCAACTC----TAATAATAACGGCAGAGTtacagctaatgtagagtgagctccattcatggtgcgccaagcacactgtccaagccaggatgcagtctctcatccagtccccacaacac-ctgggagggctggtggcagagaagggggtggaggatcagaaaagtgaagtctctgctcacagtcacgaggctagaaagtcaggccaccaccaggcgtcagatttaagttctgccaacttcagaacccatgttctcaaccactgtaccaTTTGGCCTAAACAAATGATTGGAAAAAAGTATGATGAGTGCAGAGTGATTCACACTCCTCTTGGAATCAGGCTGTGTGTCCTCTATCACAACCCTGGTCTCACTGCATTCCAGATATCCATCAATTTGTGGGGACCGAGCTCTTCCAGGTCAGGAGCTAGAACTTTCCCCA-TCACAGCCCTGGTCTCACTGCACCCCAGGGGTCCATCAATTTGTGGGGACCAagctcctccagatcaaggactgcgctgattcacttttactttgccagcacctaggaggggtcttggcacctgctgggtgctcgataaatGGCTGACAGGTTAATGCATGGATAAGTGCATGAATGAATCCATCGGTTGGAATCAAGCCCTGGCCTTCTCCAGGAACCTTGCCTGCTTTTCGAAGCCCCCAGGGTAATCTCGTTTCTCTAAATTCCTTCAGCACTTTTTTTCTTGTATAATGGTTAATTGCAC-TGTTTTCCCACATGCAATACTTTTGTCTGTAAGTTACCGATGCCTCCCCAAGCCG-CCATGGGCAACTTGG--GCAAGAATGACATTTAACCCTTCTTTCCCCAAGTCACCCAGCTCAGGACAGAGCTCTTAGCTCTGGGTGAGTACGCATATTAGTTCACTGTGGCCCTGAGAGCAGAAAACAGAACATGAGGACAC--CCGGCCTGGGAGGAATGACC-CTTTGTTCTTTCTGTCCCCGCCCCCTGTAGGAGCTTCCTCTGGCATCATTGACCTCTTGCCATCCCCCAGTGCTGCCACCAACTGGACCATAGGACTGCTGGTGGATAGCAGTGAAATGATCTTCAAGTTCGATGGCAGGCAGGGTGCCAAGATCCCTGATGGAGTTGTGCCCAAGAACCTGACCGACCAGTTCACCATCACCATGTGGATGAAGCATGGCCCCAGCCCTGGCGTGAGAGCTGAGAAGGAAACCATCCTCTGCAACTCAGATAAAACCGGTGAGCCT a score=12663 s mm7.chrY_random 25654654 1164 + 30114534 agagttgccatgctcatgg----------------------catcttttcat--ggcaataaaaccctaactaagacaTTGTCTAAT---------TATTTTCA-AAAGCTGTCTTTGAATAAAAGGATCTTGTCATCTTAGAGATGTATTGCTGTATTTTGAAAA------------GGGAGAGTGGAAGCTAACAGGTGCTGCACGTTTCTC-TCATGCCAGGCCTGCACA--AGGATC-----TTTGGGGATTGACCAAAC-CCGTCACTTAC-AGCTGGGTGGCCTTG-----------------------------------------------------------TTatagtattctcttcctta-gagttgtttttgctgattaagtaacttaa---acatacaggaagctctcaaaatagcgctgggcacgtagAATGCATCGTTGGTATCTGCTACACCTTTTCTGA-ACCTTTATAAGGAATTTTATGAGTACACAGTTGT--------------------GAGAACATCCACTGAGAGGCCACGCATCT--TCCCAAGTAGCTACGCAACCAATAAACAGCAGAACATAAAGGTCAGTTTATGTACTACTGAGTCACATCTTATGCATTTATCACTGTGCCTCCGTGAacacacatacacacacacacacatacaaacaGGTGTCTTGAAATCTTTTGCAAAATTTTCAACTCTACCTTTAATTGTGATTCCAGTCTCCCATTGCAAATGTAACTTTTGTTAAAATA-TTCAAATAAGTCAGTGTTGCTAACTGTAAGACAGTGCAGAGGGTACCAGCGGCTCAGTGCctggtgtcagacagcccgagtcctcagctcaacgagatggctgctt------------acgtgtgacccttgaggagttatta---agctccatgggcctcaatttccccatatgccaaatggaggaagtaaGCATGAAATAGCATACGAAATCATTTAAATCAGAT----ACAGATCATCAGTTGGGGTGGTATCATTGGCACCGTCATTGCTATTACTGTTTCTGGGTTTATTCCATTTCATGCCATTTTCATGCCACATGTCCTCCATATTTTCCATCCCACTTGATCCCTGTAGAGTATGTTAATTACTTTTCTTCTAGACAGACACTAAGCCA----GGGTTGTCTGGCTTTCACCTACTCACATGACTGGTCTTATGTAGAAGGAGGCAGCACTAGAAATAGCTTTTCTCCAGACCTTCATGCAGGGAGGATGTTATGGACATG----AGGTGACACAGAGCTTGGGGCTTGGCTTCATGGCCTGGTCC s bosTau2.scaffold4168 51877 1201 + 69598 AGGGCTGCTATACCAGGGGCTGGGGGTGAGGGAGGAGATTTCATCTTTACTTCAAGCAAAGCAGCTCCACCT---TCACTGTATTATATATAGGCACATTTCCATTAAGATCATTTTCAATGAAAGGGTCCTGCTAACTTACA--------ACAGTAGTTTGAAAATCACTGCTGTGCATAATAATGGTAGCTAAGTCTTGTTAGCTATTTTTCAGCATGCTAAGTGTGTGCAGCAGGGTTCACAGCTTGGTGGTTAAAAATgctccaccacttactagctgtgtaatcttgagcaagttgtttaacttctctgtgcctcaatttcccagtctataaaacatgcattttattaatagtattatctacctcataaggtttttatcagaattaagtgatttgatgtacatatag--agct-ttagaacagtagctggcacacaagaagtgcAATCTTCCTGTTCCAAACGGtgtctcacatctctacaattgattttataaaagcaatattgtgttttctgttttaaggatgaggaaacatcc-ctgagaggttaagtagcttgtcccaaat---tatacagccagtaggtatcaaaactggaaggtaagcttagctccagctaactccaaccccgtgttctgctcatcacaccc---------cacATGTAAAGATACACACACACAAA----TACTCTGGTATCTTATG-AAAATT-----------------TGATGCCCACAGTTTTCCATTTCAAATGCTACTCTTGTTAAAATATTTCAAATAAAT--------------------------AACAGGAGCCTGTGGTGCAGT------------------------CACAGTTCAC----ATGGAagctttcccactatttaacacatgacctttgagggcttgctacacagcttcag----ttcagtttccccatatgtaaaatgggggagataaacatgagataatatatgaaatcacttAG--CAGATCCACACATAAAATCAATGCCAATTTACTCAATGTGGTTGTCATTGTCATTGCTATTTCTGGTTTTATTCCATATTCTATCATTATCA--------GGACCCCACATTTCCTATTTCACCTAATCTTTGCAATACATGTT-ATAGTGTTTTTTGGATGTAGAAACTGAGACAAAGGAAGTTGCCCATTTTT---------------CTAGGCATATGGTGTCAGAGCCAGGGCCAAGGATTGGTTTTCCTGGGATCTTCCTCTAGGAAGTGCCCCGCAAACCTGCTTAAGGTGCCACTGGGGATTGGGACTGGGTTCAGAGCTCAGCCC a score=11696 s mm7.chrY_random 25657739 1001 + 30114534 taaatatt-GAGAATTTTTAAGTGAAAATGATGAAATTGGCCTTCATGGGCATCACATTGCTTTCTGTTTGGTGCACTGAACAACAAAACACAGTAATGGTGGTCCATTATGAAGTCCTCTATAAATAGTTGGAGATCTCCTCTGTTTAGTCAGCAAAGGCTCACTGAGG----AAAAAAGAGAGACGCTTAAGCCACCATTGCCGTTATCACCAGTAAAGCTCTTGGTGGCTGCCACTCTCTTGTGGGTCTCCTCAT---TCATTGTCTAGTGG-------TGAGTGTGGAGGAAAAAGCTCTGTCTGGTCCAGATATGCTGAGACAAGA-ATCCTTGCATTGTTTA-----------CTTAGCCATCaaagagaaag-----aaccagtgttgagtgcag-aggcttttattgacaaaaccagcaggttgtgtgtgtcgcctctaatcactaccttccacttgctg----aaacttggtcacagggccttcacccagccccg-gagaggctgtgaaatgcaattaactata-tactgggagcaaaggaagcaggacttggtgcacatggagcaatgactctgccaca----------AGGGACGCATGGCCTTTGCTGGCCTTTGTCTCTATTCTCTCTGCTGGCCTCATTCTCTATGAGAATCATGCTATTGCCTGTTACCACCCACAA--TTCCTTCCCAGCTCCTGCCAGCTCCTTATAATCCCTTCATACTCACAAGATCCCTTCCTTTTCGAGTACAGTTGCCCTTCTCATTTTGAGTTCAGCTTGAAAGAGTGAATGATAAGTAGACATACATTGCATTTGACATTTCCTGCAGGGAATTCTAAGATGGGGTTGGGGGGCAACCTGGCC-------------TAGCCCTGACAGA-GCATCAGCCTGATAGTGAGTACTACAATGGCTCTCCAGCCTATGGGAAAA--CAAGGATGTGTCCACAGCTCTGGAG-TGACTAG-AAATTGCTCAGAAGGATTGCAACTGT--------AAGAACAGGAGGGAACCCTGCTCCCTGCTGCCCGTTGGCTGACCAGGAGATGCT s bosTau2.scaffold4168 56434 1018 + 69598 TAAATGTTAGAAAGGCTGTTGATATAAATTACAAAATCACCCTTCATGAAAATTGCACTAGTTTCTGTCTTACCCACTA---AGTAAAACTCACCAATGCTAGCCTATGATGAAGTAGTTTAT---TTTTTGGATAACAGAACTGATTAGTCATCAAGGGTTAGTTGCAGTTTTATAAAAGAAAGG-----AAACCACTCTCAGCACAACCACCAAGAAGCCTCACGATAACTAACACCTTTTCATTCGTTTTCCCTCCTGTCACTGTCCAGCAGCCCGAGCTGGAGCTGCggggtgaggctcagctttgcccagacattcagggactcgagatccttccatcatttgtcactgccattttcaaccgtggaacagaaagttagaatagagggttaaacacagaagggttttattagctagaccagcaagccacatg------------------ctctcagttttctggtgagaatttgatctcagtg-ttccatctgaccatgagagaagcagcgagatgactgaggctatgtttctaagagc-aaggatacaaggttaggtgaatacatagcaatggctctaccacaTGGCATTGTGAGGGGCACTTGTGCTCCCTCCAACCCCACCTTTCTTGGCCCTA-TCTCTCCATTCCTGGTGTGAGCAATGTCCTTTCCTGGCCTCTCTTAGAAACTCCTCTCCCCCTACACACCCGCTCCT---------------CCCGTGGGACCCTTTCTTCCTGGCAT-CAGCCCTCTCGCTGCCTCTGAGTTTCATTTGAA------TACGATGTGCC-ACTTGCAGTGCCAGCTAC-TTTCATACGGTGCTTTCCAAGACAG----AGGGACCAACCAGTCCAGAAATCACCAAGTGATGGGGACAGAGGTGCCAGCATGGTAGAGAGTCCTAGGATGGTCCCTCAGGCTGCTGGACAAGGAAGGGGTGCTCTCACACATCCAGAGATGCCCAGAAAACCTCTCAGAGGGACCAAGGTTGTCTAAAGTAGAGAGAAGGTGGGAATCTCATTCCCACCTCCCTGTTGGCTGAGCTGAAAACACT a score=52436 s mm7.chrY_random 25658819 2711 + 30114534 GAAGTCTGTTCTTCCACTCTTCTTGGTCCACCTCTTCACCCTAGT------TGATTATAAATAAGGCTAATA-----AAGTCTTCCTTCCTTCCTTTTCCTAACACTTCTTAACAGAAACC-TAGAAAATTACTTACACAATCATGAAGGGG-CAAGAAGTATTTAGCAGAGGCCATGTGGGCAAAAGAATGACCCCCTCTGTTGACCTTGAACCAATTCCTGTGTTGGAAGAATTGGCAGTAATCTATTTAGTCAGAGCCAATCAAGGTTTATCTTTAGAGATGAAGCCAGTATTGACCTCATAGCAAGGTCATAACCGGGCCAGAAGAGTTTTGCCAGTCCAGAGGCTAAGAGTGGCCATCCACACACTGGGCACATGGAGTGACTGCCCATCCTCTCCCTTGCCATTTTTGCATTGGGTTCTGGAGAATGCTGGTGCTTGGGTGGAACCAGCCTCTGACATGGCTGT-CTGTGATGCTGTAGTCCCCAGGCACAGCAATGGCCTTTATAATAACCGACAGCCACTGAGCATCTGTTCCAGCCAGCTGCTTTGCACACATTTCCTCATTGTGGCAATTAAGATTCTATCCATTACAGAGA-TGGAAAGTCCAGATCAAA-TGGTATCAGATAACTAAAAAAGAAATCAAATGAATGCAGAGAATATAGACTTCCTTGTACCAGAAAACTCCTAGATCTATGATGGCTTTGTGGTCATCTTACAGGTAAAGTGTGATCAAGATCCACGTCCCTGTTCTCTGCATTTTCTCAGATCTGTGTCTATGCATGTATCAGTTTAAGATGAGCAGATAAGGGTGCAGCTGCTGCAGACCTCTGGTTATACACTGCACTGCCCCAAAGGAAAGAAGGCATCCCACAGGTTCATGTTCTGCTGGCACCTA------------------TCCCAGGACTGCTTAGGAAACTACTA--ACCATTGGCCTAGACCAAGTC--TTCCCTG--------CCAGTTCTCAGCAGAGACCATGTTCT------CTGACCTTGGGCAGGCATCTTGAACCAATTCCTGTGTTGGAAGAGTTGGCAGGAGTCTATTTAGTCAGAGCCAGC-CAAGGCTCAT-CTTTAGAGATGAGGCCAATGTTGA----------------CCTCATA-GCAAGGTTAATAT-GAAGGTATAGGA---ATCAGGCACAGTATTCCAGCCCTAGGTTACCTTAAGCTAGCCCA--CTCCCTGCCCTAATGCAG----------------------------------------------GTCTCAATGGATGGCTATGCT-------TATCCCCGTGCATGGCC-----------------ATGAACTCATTTACCCA---CCTATAACACACATGCCTCCTAGTAAATTTCTCTGGAGTTCTACAGCCAAGTCCAGCATGACTTCTCTATGTGCTGGT-ACAGAACAGCTCCTTTCTTGCCAGTTGGTATTGTCCTGTGGCTCTAAG-TGTCATGGCTAAAACCATGTCA---TACGATTTCCTAAGCAAGTAAGAAAGCCTTTCTATCAGAGGAAGAAAAGGTTCCGTTGATTGATGGCCGTGCCTGGGGAGGGGGTTATT-ATTCATCGCTTTGAAGAGCCACACAGTTATGTCTAATGTTGGAAAATCAATTTGTCTCCTCCT---AGCAGCTAAAAGCAAGGCTTCCCCTCTTA---GCATAGATTAAGGAGACAAAAGAGATGTGTTTTGTGGTCACTGT-GTCAAGACTGACAAAATAAAACAA-ATCCCAGAACTCCAGGAGAAAGCAGCCATGCTGTAG-AGCCCAGAGATGCTGATGTGATTGGCAGAGAGCCCCGTAAGTACACACA------------------------------------------ACGAAGCTTTCACTGGGCTCTGATGGAGTATGACTTGGC--CCAGGGTTTAAA-GGCAAGGTCTCAGAAGTTTTGC--------TATGGGGCCTACCAGAGGTTGTTCTACTGCAGTGTCTTCCCCCAAATATGTTCTAGAAA-ATTCATCAGAACCACTTATAGATGGGAAAATAAGAGAGACTATTTCTTTGTTTTTCTGAACTGTACCTAGCAAC--------------TCTTTGGTGGAACCAGACAGAAAGATTCTCTTGTGCTTCAA-TCCCATTTCTGCCTTTCAGAAATGAACCGGCATCACTATGCCCTGTATGTGCACAACTGCCGCCTCGTCTTCCTCCTGCGGAAGGACTTTGACCAGGCAGACACCTTTCGCCCTGCAGAGTTTCACTGGAAGCTGGACCAGGTAAGGCTCTCAGGGGCATGCCTTCTC-----------CTTTGCAGAGACCACCAGTTTGCTCTCAGGGGAGTGGCAGTGGGTTGGCTCTCCAGGA--CTGCTCAGTTTCTTGGTTTTAGAAAATTCAGTTCAAGAAGGCAGATAG---------GTCAGGGTAAAAACTG--------AAAGCCAGT----AGTGGGGGAAAGTG----TGCTAGCTGAGATGCCACAGGATCAGAGGACCTGTGGACCATTGTACCTGCATATGCTATG----CTCACTCCTTGTTGAGCCCACGGGAAGATGTTTATCCTGCCCCCCCCCTCTCCCGACCTGCTGAAGATCTTTGTTGATAGATATATCTTTGGTCTTTGTGTCAGTGA-GCATCATGTCTGCCCTTTGATGCTTTCCTCCTTTGGGTGCCAGTAT-GACTTGCTTTTGGTGACAGGCAATTGAGAACAGGGACAAGAGGACTTTGAAAAAAAAAAAAAAGCCATGACAGAGCATTGTTAACAGTGTCTG--CATTTCTGAAGTGGAAAA---CCTGACTCATCGGAGCTTTATGGCT--TGATCACAGGGGCTGGTACATCACACTTCTCCATGACAAA-----GCTGTGTCTGGGTTGAGTCCAGAGCTTTGTAGTGTGTGTTCCTGAGGGTGGTAC s bosTau2.scaffold4168 58825 2759 + 69598 GAGGTCTATCTTTTCATTCTTCTTTA---ACCTCTTCACCACAGCCTCTCCTGATGCCAAATGAAGCCAAAGGGGAGAAATCTTTCTGTATCC----TCCTGACAGTTATCTATAGAAACTACAGGAAATCAGTTAGGCAATAGTGTGGGAGACAAGAACTGGTTAGTAAAATTCCTATAAGCAGG---------------------------------CCTGGGT---------------------ATTTCATCAATG------------------TAAAGAT----CAAGTAGTCACCTGA-ATATTGGTCTTGACC----------AATGCTGCCA----------------------------CACTTGGCA---------ACTGACCATTCTCCCTCTGTCCATCTTTTGGTTGCATTTTGAAGAATGGTAATGCTTTTGTGAAAACAGCATCTGACACTACTCTGTTGTGTTGTCATGGTCACGAGGCAGTGTAGTAGTCCTTATAATAACCAACAGCCATTGAACATCTGTTCTGGGCAGATGGTTTATACACATTTCCTCATTGTATCAATTAAGATGCTTTCAGTTACAAGGAATGGGAAATACAGAGCAAACTGATATAGAATGATTAAAAA-----TCAAAATTATTAAGGGAATGTGGGGTTC-TTGTAACTAAAAGTGGCTAGAGCTAAGACAGAT--------AGCTT-CTGATAAAGTGTGATCAAGGTCCTGGCTCCTATTCTCTACAATTTTTCAGATCTGCCACCTTATATGTATCAATTTCATGTTAGTAAACATGTCTGCAGCAGCTCCAAACCTCCCAGTATATACTGCAACTTCTTGAAAGAGATGGGG-----------TTCTCTTCTTGCTAGCTGCTAAAAGAGGGAGACAGTTCTTTCCTAGACTGCTTATAACAGCTCCAGAATCACTGGCCTGACTCGAGTCACTTTCCTGACTGAAGCCCCATGGCCAGAAGA----ATGGTCTGCAATGCTGGACGTGGACCTGGGTTCTGAACCAAACACTGTGGTGGGGGTTGTTTCACGAGCCTTTTTGGCTTAAACCAATGTGGAGCCCATGCCTTGAAGTGGGAATTGATGTTGATTCTTCCCACTTATACCTCCATAAGCAAGGTGTGTACAGGATGTGCAAAATTAGTCAATCACAACAT-CTATTCTCGTGACacattaggataatccagcatccctgtcatgatacagctaaggaaatcaagcctctaagaggttgaattacttctccagcatcatccagaggtatggcttcactccaagtctatctgaatccagggcccatgtccttcttgctgtatctgctcatttgCCCAATACTTACAGAACATGTGCACCATACTTGCCTTCT-GAGTGTGATACTTTGTAGTATAGTGTGAGTTCTCTGCGTATTGGTCAAAGAACAGCTCCCCGCTTCCCAATGGCTGTTATATTGTGACTACAGGATATCATGGCTAGGACCCAGTTGATTTTTTTTTTTTTAATCAGAAAAGGAAG---TTTTAGCAG--GAAGAGAAAGTCCCATC---TGTTGTCTGTGTATGGGGAAAGAGGTATTTATTCATTGCTTTGGAAATTCAGGGAACTGTGTCTAGTGCTGGAAAGTTGACCTGCCACCTCCTCTCAGCAGCCAGAAGAGAGGCAGATCTCCTTAACTGCACACAGAAATGA--------AGGTGTGCTCTGTGGTTGCTGTTGTCAAACCTGATGAAATAAAATAAGAGCCCAGAGCTCTGGGAGCATCCAGCTGTGTTAAAGGAACCTAGAGTGGCCGATGTGATTGTCAGAGAATGCCCTTGGCACTCCCAGAAGTCTATGTACAAAAAAAAAAAAAAAGAGCTTGAGAACATATGTAATTTTATCCAGGCGCTAATGCAGTAAATGTTGGTATTTAAGGCCCAAATGGCTTCTTGGCAGAAGTTTTTTGTGGGCTTTCTGGAATCTACC------TCTTCCATTTCAGAGAGCTCCAC-ACGTGTGTTCTAGAACTATTCATTAGA-TCAGTTGGAAAAGAAAAAACTAGAATGCCCATTTCTTTGTTTTT-GGGGTTGTGCTAAGTGATGAACTGGGAAGACTCCTCTAGGGATGATGGGCTTAGGGATTCTGGCCCCCCTCAAATCTTCTTTCTGCTTTTCAGAAATGAACCGGCATCACTACGCCCTGTATGTGCACAACTGCCGCCTCGTCTTCCTCTTGCGCAAGGATTTTGACCAGGCAGACACCTTCCGCCCAGCAGAGTTCCACTGGAAGCTGGACCAGGTATGGGGCTCA-CCTCGCACCTTCCCACCCCCCGCCTCTCTGCCGGGATGGTTGATGTGGTTCAGGGATGATGGCAATGGGTAGGTACTTCACGGTTCTGGTCACTTGCTGATTTGGAGGAAAATCAACTCTGGGAGACACACAGCATCTTGAAGTCAGGATGGAAACTGCCGCCTTAAAGACCAGTAGGAAGTGGGGAGGACCACCCTTCCTGGCTGGACCGTCACC-CATCAGTGGACTTG------------CCCGTGTGTAGCTTGTCGACTTGCTCTGTGTGGAGCTCCTGGGAAGCTGATCCTCTTGATCCC-------CAGGCCCAGTTTCTGATCTTTGTTAGCACA-----------TCTTTTTGTCATAAATGCTCTGTGTCTCCTCTTTGATGCTG---TCCTTTGGGTGACGGTGCAGCCTCGCCTTTGGTGACACA-GGTTGGGAGCAGGGAC-TGAGGACTTTGAAATCATCAGTGAC------ACAGTGCCCTGTGAGCAGTGCATGTTCTCTTCTGAAGCAGGAAAATCTCTGACTC-----------CTGACTTGTGATCACAAGGGCCGCTGTGTCGGACTTGTCAGTGACAAATGAATTAAGTGTCTAGTTGGAATGAAATGCTTTGAAGTGACTGTTTCTGAGGGCTGTGC a score=26939 s mm7.chrY_random 25661573 1732 + 30114534 AGCAAGACT-GATATGGCCTTCACTTAGA--------------GATGAAACTGGGCAGAGTTTCCTTTTTTAAAAAAAAATAGTATTAATTCAGCAAAAGAGAGAATGCCAATAGGCAGGAATAA-------------GACGTCACCT--------------AACAATGCTCGTTTTATAG--TCCCCAATGAGTTAGGTCTCAAC----CTCTTATTTT--GTTCTTCTGTGACCTACAGACCTATTTTCTCTCTTGTGTGCCCACTGTATGTAATGCTACCTTGTCCTTTCTGATGCTGAGTGTTTCATAATCCTGCGTTTTCTGTCTCC-TATTAC-----TCTGCCTCTTCCCCATCC----TCTCCTGAACACCCCTACCCTTCAGCTCCCAGTAGGACTGACCT-------------------------CAGCAAGAACTTACTCATATGGAAACGTTAGTGATGGCTGCCCCT-TCCATCCTCACAAACGCTCACATGTATGTTCGGTGTAACCCAGGTATCTCAACCCAAGGACTCTCCTC--TTATGGAATCT-GTGCAGTGTGTGAAAAGCAAAGATGTTGTGCTCAGGAGACAGA-----GTGGGGAGCCAGTGCCAACTGTCTGGCCTGATCCTAGGAAATGCAAACCCTGCTGGATCCTGGGTGGCTGAAAAGACAGCATATGTGTTCATCTGCATTTCTTTGTGTTAGGAATTCTGGGGCATGTAGGAGTGGTAAAACGTTGACATTGTTTATATGATTTCTCAGCAACCTCCCAGCTATGTCCTGAAGTGCCAGATGGCTTTTATGGGATATTTT--AAAATATATAATACAAATTGAAGTGAATTAAAATAAATTCCATATTGTGAGGGGTTCTTTAATAAGAACTTCGCCATACTGGTGGAGATAATTATAGATACCCAGAGGCATTTTCTGAGATGGGATTGAGAAGGAAGGATACAAGCAAATG-AAGTTGCAGGGTTTGAAATTAAAAATAGACAAGGAAGGAATCCTGG----------------------------------------------------------------------------TCGTATAGATAAAT----------------------------ATATAGTGCATGTAGCAATTCTGAGAGCC------------ATGCATTTAAAGAGGAACT--GAGTCACTGAGCAATGCCCTGGTCCCAGGGATGTTCCTTTGGTTATttttgttttgttttgttttgttGAGCCTGCTCTGTAGCAGGCAGGCTGCATATATGAGACCATTCCCAGCCCTGCCACAGGCTTTC--CATGGGGCCTTCCCGGCAGGAGACTCCAGCCCCAGTGACTTGCCTATGGCC-CACAGCAAGCCATGGCCAGCACCTATCCTTT-------CTCTCATGCTACTCCTTTGGTGAGCATGCTGACTTAAAATGTAAAATCTATTCATTCATAGACAG-AAATTACATCTATT---------------------ATACAAAATATTTGTAGCTTTTATAGAACCCTAC-AAGCTAACAGCTCTTTAATTGTAGTAAGCTCTGTATTCGTCTGtgtctaaccttgtgcaggctaccttaacaaaataccctgggctgcatggcttaagggaaagatgtttactttcacatagccaataaggttgggaaatgcaaggtcaaagcgcttgttaatacatgatctaatgagatctgttttcctggatacagagggcttcctttacctgctttgtcctcaATTCCAGAAATAGAAAGAT--GGTACCCTCATGTCTGCTCCTCCTT------------CCCTGCTAGATGAAGTCCCAAGTCTCACTCCCTCATTTTATTTCTGTTG-------------------------------------CCTGCCCTGGGTCATAACTTCAA-ATATA-----------------------------------CCTGG-GATTTAGT----------------------------------ATTTCATACTGTGAGCTTGGGGAGGAC------AGAAGTCAGT---------CTGCAGCATTTCT s bosTau2.scaffold4168 61647 2036 + 69598 AGCAAACCTAGAGTTGTCCTCTGCTTAGATTTGGTGGGGGGTGGGTGGG---GGGCATAAATTTTTGTTC--------AATGGTTTTACATTGTCAAGAGGGAGCGTGGTGGTCGGCAGAGAAGAGGGTCATAGCATGGGTGCTGCTTAATAAAGCAGATGAAATAATGCTCATTCTACTGCATCTCTTGTTTGCTTTCTTTCTGCCCAACCCATATTCTGAGAGCTTCTAGGGCCCTCAACCTTCTTTTCTCCCT------CCAGGTGGATGCCAC-CTGCCTCACCGTGCTTGGGGCTGAATGTTTCATAATCCTCTCCTTTCTCTTTCCTTACTACCTGTGTCTACCACTCCCCACTCCCTTTTCTGCTGAAGCCCC--------AGGCACCCAGTGGGGCTGATCTCAGAGTGTGTCACTGGAAAGCATACCAGAAGGAATTCATTTCCACCAAGATGAGAATGATTGCTACCACTCTTCCTCTATATGAAAGTACTGACATATGCTCTTTAGGAGAGAGATTCATTAATCTGAGGGAATGTCTCAATGGTGGGACATCAGGCAGCGTGACAAGGTCAAGGATGCCAGGCTGATGGGAAAGATGTTTGAGGGAGTCCTGGGGCAACTGCCTGATCCATTCTCAATAAAT-CCCATCCTGCTGGACCCTAGGGTTTTGGAAATATGGCATTTGGATTAATATACGTTCTTCTGAATTAGAAATTCTGGGCCTTACAAAAATTACACTATCTTGACATTGTTTATCTGATTTCCCAGCAACCTCTTGGCTACCTTCTAAAATACCATATGGTTTATATGGGATGTTTTTATAAATACATAATATGAATTGAGGTAAATTAGAATAAATTCCATATTGTGAGGGGT--TTTAGTAAAAACATTTCTATACTGGCTGAGATCATTATAGATGCCCTTCAGTATTTCCTAAGATGGGATTGAAAGGCACTATTATAGGCAAATGAAAGTCACAGGCTTTGGAATTTAAACTAGGTGAGGAAggaattctggcaagaatactgtagtgtgtagccattcccttctccaagggatcttcccgacccacggattgaacccaggtctcctctattacaggtggattccttatcatctgagtcacaaggaaaccttatAGTGAATCTAGGAATTCTGAAATCTGCTCCCAAACTGATGACTTTAAGGAGGAGCTGAGAGCCACTGAATATCTTCC-----------AAACTTCTCTAG----TCTCATTTActaccattcatgtgtgcctgctctgtgccaggtactctgtgca---gagctcaatctcatctctccccaagccctgctgcgtggataatatggagcaggagac-catgatccagcaacttggccaaggtcacacaATAAA-CATGGCTAGGACCTGCTTTTTCCATATGCTCTAGTGCT----CTTTGGTGAGCGTGCTAA-TCAAAATGCAAAATGTTTACatttttaaatttcaaataatttttatttGGAGATCGGAATTATGCAAAGTGCAAAATGTTTAT---CCTGATGAAACCCTATGAAACTGTCAAATCTTCACTTTGTTCAAGCTCTGTCTTCCT---tgtcttagcttg----ggttgccgtaaccgaataccacagcctgggtggcctgaacaacagagattta-tttctcacagttcttgaggctgaaaagtccaagttcaaggtgctagc-----cattcccccatgaggaccctcctcctggctatatacagcagccttt-ctcactgtgttctca---catggtggagagagcttaggtacc------tttccttttccttatcaggcaggagccctattggactagggtcccacccttatgacctcatttaaccttcattagtcctaatgaaaattagaccctttcttccaacacagccatgttttgggttagagcttcaacatatgaatttacaaggatgcagttcaGCTTacagggcttccctggtggctcagtggtaaggaatccacctgccaatgcaggaaacgtggtttcaatctctggg-ttgggaagatcccctggagaaggaaatggcaacctactccagtattctt a score=19458 s mm7.chrY_random 25663340 1150 + 30114534 GAAAGTCAGAGGACTTCTTGCT----ATCAGACATCCTAGCTCATAGGGATAGTTGGCAGGGGAAGGAAGGAGGCTGTAGTGAGGAGGGCACAGGAACTCTCCACAGTGCTCACACTGCCAACCCAGTAGTGTGTATAGGCCAGCCCACGGAACCACCT------TCTTTTTGTCCTCAGCTCCCTGTTATAGG-AGAACCTTACCTGAAGTTTCTCTCATGTAAACTAAATGATGCTCAAAACATACAGACCTGATGAAG-CTTCTCGACCAGGAA-CTACCCTGG--CACAT-------------CTCCTGCCCCTTGTTTGTCAGACT------------CGTCATGACTCTTTCTGCACTGCCAT-------CACATGGTTATCCCTCCCATCTGCTTCCTTAGTGCCAAGCTCCTGGAAGA-AGGGTGGTGTCTTCCTCAGGCCCAGCTATACAGAGTATGGCATAGCTCCAAGTACATAAGATAGTCCAGATAAAATGTCTGCATAACAGTGAAGGGATGTGGAGG--GAGAGACAGTAAGGCCAGAAGAAGGGGAAGAAAGAGAGAGATGGAGAGAAGAAAAATCAAGATATCTAaaaacaaacaaacaaaacaaaacaaaacaaaacaaaacTTCTGGTGATGAATTGAAAATTTTGTTCACTTCACTGG--TCATTAAAAATTGTTTAATTTTGCCATTGTTTTCTTTACTCTCTGATTCTTAAATCAGTGTTTATCTCTTATCTTTTTAGCT----TATTTCAAATATCCAGTTGGATTAGCCACTAGTGAGTCTATAG---------------ATGGCCTTTGCCAAAACGTATTCAAACTGGTCTAATATGGTGTGTGTAACTAAACTCCTGGCCTA---------------------AATATTGATTCTAATGCCTACTGGGCCTTTTTTATTTCTGCTCTAAGTGGCTTATTCTGTGAGTTAGACTCTGTGCTTCATCCCC-AGATCAGTGTAGAACTAGAAGCTTTGGCTATCTAGAAGTTTCCATGATCATGGGTCAAAA--------AAACTGTTTATAGTCTCATGTAGGCAGTGCTTGGGCAGATAGCAGGGCACAACCCTAGTAGGGAGAG--CAGGCAGGGCTATCTGATG----------TAGTCCTGTGGATAAGAGTCTAAGAAAGCATCCAGAAGGAACCCTGGAATGGAAAGGTACA---TGTGCAGAGGCAGGCATCCAAGATGGTAGACAGTGAATAG s bosTau2.scaffold4168 63825 1185 + 69598 AAAAATGTGAAGCCTGCCTATTGATGATCAGAAGCCCCAGCTCACTTGAATAGTTGCCCACACCCTGAGAGGAGCTACAGTG-GGTGGGAATAGGGAACCTCCACCATACTCATACTAGCAATCCAGTGGAATATACAGACCAACCCA--GATTCCTCTGTCCACTATTTAGCTCTCTAGCTTCTTTCTGTAGACAGAAACATATCAGAAGTTTCTTGGATGTAAATCATTTGATGC-CAAGCTGTGTGTATCTGATAAAgtcacctccctcaggaagccattctgggtcacatgttgtatagcttgcctcttcccagtgctccccagactccatgcagaatccgtcccaatacttact---ctgccttagttacccatttatttgtcctgcctttcttcccactttgtgctgagatcctggagggcatgtctgtgtcttactctctccaaattct-cagtgcagattgtagccctgagcacac-agttggtgtccagtaaatgtttgcataaaaatgaatggatGTTGAGATCAAAAGAAAGGAGAGACAAAATGAGGG--AGGAAGAGAGGGAAGTAGAGAAGAAAAATCGAGATCTTTTAAAAC--------------------------------CTCCTGGTGATTAATTGATCTTTTGATCCATTTTTATGGAACATTTTAAAATTCTAAAATTTTGCC-----CTTTTTCACTCTCTGAATCTCAAA----GGTTCAGCTTTGATCTTGATAATTTTACTCTTTCAAAGATCTCACTGATTTTACCCCCAGTGGTTCTGTAACTGTTATAAAACTTTCTGGCCTTGAGTGGAAAACGCTCAAGCCAGTCTAATGTGCTGTGTGTACTCAAATTGCGGACCCACCTTAGGGGTTCTAAAAGCATAATAAATGTCCTACTGCCTGATGAGACCTcatttattctg--------agcataaactttgtgccaaactctttgttaggtaccagagatcaac-taaaat--aaagcttctgctctctggaagtatccatgacaacggggcagacaaacacataaacagtgtacaatcctatgtg------atatgtgaagaaggcaggg----aaccaggtagggggcatccatggggaccaatctgaaggatcctgccatgtccctgggtatgagggcctgggaaagcttctggga--------ggggtgGGAGGGTTCAGAGGAGGTAGAGCCAGGTAGCCAAGCCGGGAGGGAATGAGAAG a score=20656 s mm7.chrY_random 25664516 1001 + 30114534 GGACCAGGTAGGAATTAAGT-CCAAGTAGATTTTTATGTCCTGTCACC-------------CTCCTAGGCAAACAGGTCATAATCAAATTACCCCTTATTTCCACTACTCAATATAAGACCATAAATTTTATGGATGGTCAAACTCAGAGAGT-CTTGTATGTTATC------ACAACACATTCCAGCAAATGTAACTCTGCCTAGAACAATACCTGAGACCAGTGGTAGGGACTA-------ATC----TCTCCTGTCTCCCAGCCACTGTACCCAAGTCCAGATCAGTGCATTTGATCAACTG--GCCTGTAATTACCACTGAAACTAGACAATAATGTTT---------TCCACGTAGCTCTTCAGG-----GTGGCCATG-AGTGAAACAGTTGCTCACGACCCAGAGGCATCATGTGTCTCCA---------CCCTTTTTCCCTACACTGATACCCCAGAAGGCCTTTGCCAAGGCACATGAATTGCCTG-TAGGT--GTAATGAGGCAGCCCCAGGAAATGCCTCTGAGAATCCAGGGCATCTCACTGAAGTGATGCTAACAGCAAGGGAAATGTCATTTTAATAGGATTTTTTGCCCACAGTCTACTAATGCAAATCCCTCAAGCCAGCAGTCAGTCATGAACAAACTCAGACAAGAGC----------------TCCCAG--CACATACAGGGAAAGGTTTATCAATCCATGAGCCCTCTTGACTTTAGTATTATTTGGATAAGGTTGATTCAGTGGTGTGAATTCTGATCGTCTTCCCTTTAGAACTGTTGGTATTTGAATGGTATTTCCTGGGACTCCCATTGGAGGAGATAGCTTGAGTGACAGACTCAGTGAGACAGAAAGAGCACAGGTGTCCCAGTTCC---TATGAGGAAAACAAA-GTATCTGTGGAGAGCATAGAGCCCAGAAGAGGCAGAAATTGGTCACGTTTGGCCAGCCATTTTCTTATCTG----------TGCATCAGGGACAGGGACA-AGAGGGGT---ATGGCTCACGCTGAGGGAGCTCA---------CTGGTTCATGGC--AGTTAATGTTCCCCAGTAGCGTTCTCCTGCAGGGGCCTC s bosTau2.scaffold4168 65957 1057 + 69598 GGAGCAGGTGGGAATTAAACATCAAGAGGCTTTTTATAGCGTGTTATTGAGCTGGTAATTTATCCCCAAAGAATGGGCCACAATCAAAGCA--------TTTTGTTATTCAAAAGAAGACTAATAATTTGGGGGATA--CAACTGTGAGGAATGCTAGTATGACATTCATAAAATATCACATTCAAGCAAATGTAACTCAGGCCAGGTTATTCACTGGGGTCAGTAGCAGGGGGTATGATAGAATCAGGGTCTCCC-TCTTCCTTTCTCTGCAGCCAGG---AGACTAA-GTGTGTGA-CAGATGCTGCTTGTGGGCA----TAAAATGAGGGCATGATGGGTGGGCTAGGTTCTACATAGCTTTTCAAGTGTGTGTGCCCAGGGAGTGTAGTAGTTGT------CACAGAGGAGCTACGTGCTTCCAAAAAGCCCATCCCTTTCCCCTGCAC------CTCAGAAGGCCTTTGCCAGGGTATATAGGCTGCCAGATAAATCCATTACAAGGCAACCCCAAGAAATGCCCC-AACTACCCAGTGTACCTCTTGAAAATGAATCCA-TGATGAGGAGACTGTCATTTTAATTAGATTTTT-ACTTATGATCTGCTAATGGAAATCCCTCAAGCCTGCACTTAGTCATGTGCAAACCCAGATAAGAGCAGAGGAGAAGGCCAGTTGCCAGTTCACATGCA---AAAGGTTTATGAACTTAC-AGCCCTCCCAGCTTTCGTGTTATTTGGATATGGTTGACTCAGCATCACAAATTCTAATGATCTTCCCTGTGAACTTACTGGTACTTGGAGGGAGACAGCACACTCACTTATTGGAAGACACAGCTTGAGTGACAGCCTTAATGAACCAATAAGAGGACAGGCGCCCCAGGCTCAGACAAGGGGAAAAAAAATGCATCTCTGAAAAA--------TCGCAAGGAAGTGAAATC-----CATTCTGTTGGCCCTcaccttctctgtgccagaaattgcagcaagcaccgggggagagaaggacacgatggatcctgccttaggagcccacagccctgcctagattatgcccaattttacagacctgaggaTTATTCTCCTGCAAGCGTCCC a score=15914 s mm7.chrY_random 25666284 343 + 30114534 GGTCTTCCT-CTTTCTACATAAAGGAGACAGTTAGTCACAGGCCTGGATTTTCC-------------CACAATGGGGATTT---------ACACACATTTGTCTTAAGCCAAGGCCTTTGCCTCTCAAGTCCATTGTTCTTACATAGAATGTGAAAGCTCCTAGAGGAAGATTTTAAAAGATCTCATCCTTTATTCTTGAAGAAGGGGGTAGG----AATGATGCAAAGGCAGTTTCCTTGCATTTGCCCATTCAGCCACACTGGGAGTCAAATGGGTTAGTTCAATCATTATTATAGCCA-GTGCCAAGGAGTTAATTAGAGAATGGTCAGTCCAGTCCAGACCAGTCATCTTAATGAGCAAAATAATTG s bosTau2.scaffold83912 355 357 - 714 GGTCTTCTTTCTTCCCACATAAAGGAGAGAAGAAG-CACAGGCCCAAGTTACTCTGGAAAAAAATGACAGAGCCAGGATTTGAGTCAAATACTCACATTTGTC--AGACCATCGCCTTTGCCCATTAAGTCTATTCTACTTGCTTAGAAATCCAAAGCTCCTGGGAGAGGA------GAAATCT-----TTTATTCTTGGTGAGGAAAGTGTGTTTGAATGATGTAAAATGAGTTTACTCGCATCTGCTTTTTCAGCCACCCTAGGAGTCAAATGAGTTAGTTCAATCATTATTATAGCCAAGTGCCAAGGAGTTAATTGGAGAATGGTCAATCCAGTCCAGACCAGTCGTCTTAATGAGCAAAATAATTG a score=6050 s mm7.chrY_random 25666810 465 + 30114534 TTTCTCATGCAGGTAGACTGCAAAGCAGATTTTTTTTTCAAAGAAACCAATCTGCGTGGTTATTATGTGTCAATAGTGGATACACAGAGGGTCCCAACCACAATGGCTCTCACTATCATATATAAAGAGAACCTAGAGAGTCTTTCAATGTGTAGGAATACCACCACGCCCCTGCTCCTCTTAGAACCCACCCCTCTCCA-GCTTCTTTCCATCTTCAGCAAAGCTTCTAG-----TTCTGGGGGGAGAAGTAGCTACATGGTTTCATGGTGCTGGCAGAGAATGGTCTCCAGGCCCCCAAGGCATAATCAGGCCGCTGAGGTCAGTAC--TGCAGTG-TTGAGTGGCCTGATCACTGAGAAGGTAATAAGAGGCATGCTTGCCCTG-----TTTGCTCTCTTTGTGAGATGGTAGCA--------------TGCAACTCATTG-CTAAGCCACACCCCCTTCATC----AG--CCTTTCATGGGCCCCTTGGTCCCTGC s bosTau2.scaffold4168 67901 457 + 69598 TCTCTCCTTTAGGCAGAATCCCAAATGACTTCCCTT----AAGATGCCAACTTGCAGGGTTGTTCAGAATGGATAA-GGAGTTGGGGAGAGTCACAAACACAGTGAGTCTTACTTCTTTATTTTTCTGTAGTACATAAGGTCCCTTTAT----------------AAGCCCTCACTTTTTTTCAG---TGTCCCTCTCCCTGCCTCTTCTCATCTCCA--AGAACTTCTAGAAACATTTCGGGAGAGGGGGCATCTG--TGATTTCATGGTGTTGGCAGAGAACAGTCCTCAGACGGCC---------TTGGTCCTCTTGGGTCAGGACTGTGCAGTGATCGCATTTCCTGCTCTCTG-GAAAGTGCT----GGCATGGTTATCCCAGTCATTCCGTTTTCTTTA-GAGATGGTACCAACATCCTAGAAATCCATCACCCACTGCCTGAGCCATGTTCTCTCCACCTCGAAGCTCCTTTCCTGGCAGCCTTTCATCCTGC a score=13191 s mm7.chrY_random 25667288 863 + 30114534 Ctgtggcagacagaaaactccctccctcaagcgtttattcttccatatacc------atgtgaatatatcctcttgtgtggcaaaaaaagtgtttgcatctgtgagcagctaatgagcttgagat---gagatagttctgtattacttttatgggtccaatagag-acaaggctctaagtgggagggaggcaacagg---agaaacaggaaatataaagatggaaggagaggtccaacatgatgcactagagtatgggaggccataagccaaggagtttcaaaacctttacaaagtgg------------------aaaagtttctcctccagagccctcagaagggatttggccatgctgacaccatgattttagtctactgaaacttatttca--tcctctgacctccaaaaccgtaagatcataaatctatgttgttttaagccacaaagttggaggtgatttgtt---------------------------atagcagcaaaaggaaactaatacaTCAC-CGTGCGCCTTGGGGAGGTCTTGGAATCATAAATCAAGCCATGTGTCCCATCCCCTTGCATCTTACCGAGGTGACCCTGAGCCATGTTTTCAGAACAGGCCTATAGTCTCCTCTGCA-CATCAGTGCAGGCACCTCAGCCGCAGGTTTCCTGAGACCCGCCATTTCTAGA---AAGGCCCTAGGAGGGAGGGAGGAGGAG--GCTGCCCAACAATGACCTTCAGTGCTTATGCCTGGCTTCCCACCTAGCTTGGTTTCTC-ACTGGCCCCTGGATGAGGCTATGCAAGCGACAGATTTGGGGCTCTCTTTCCCCTCTGAGATGCAT-TATACTTTTGCCTAAGGGACCAGCAA-----------AGGGGAAAAGGGAAAGAT-----TCTGCCTTCATTGAAAGAAAGATTGCATACTCTGTG s bosTau2.scaffold4168 68725 871 + 69598 CTTtggtagacagaataatggctcc---gaaggtgtccacctcctaatccctgaaatctgtaaatactttaccttacatggcaaaag--gtctttatagatgtga----ttaaagatcctgagctagggagattatcttgggttagtcaagtggatccaatgtaatccaaggattcttacaggagggaggcaggagggttagagtgagacaagacatgacaggaagcagaggtc--------------agagt-------gatgtgagccaaggaatgcacccacctctatgagctggtggttaaaaaaacaaaaaaacagattgtctcttacagtctccaaaagg----------------caccttgattgaagccaagcgagattcatttcagatttttttactgccaaagctataatagaattaatctgtgttgttttaa-CAGAAAGGCTGAGGttgttttgttttttgtttttgtttttgtttttttttAATAGCAGCAATAGGAAATACATACATTGTTCGTGAGCCTTTGGGAGATC----------------------ACCTCCCATCTTCCCACACTTTACTGAGGTGACCCTGGGCCCAGCTTTCCAGGCAGGTTCACAGACTCTTCTGTACCCCCAGTGTGGG-GCCTCTGTCCAGGGTCTCTATAGAACCCCTCCCCTTGGAGGCATGGCCCTAGCAGGGAGGGATGAAGAGCCACTGCCT----TTAACATCCCCCACTTACTGCCTGCTGTTCACCAAGCCTGCTGCCTCAACAAGCCTCCGGACTAGGATCCCCATGGGGCACA-TTGAGCCTTTCCTTCTGCCCTAAGCCATATCTTTCCTCTAGCCCAAGGTGCCGGTCACCTCACCAGCCATGATCAGTGGGAAAGGTACCTCTCTGCCTTTA--GGGAAGAAGCGTGAGTCCTTTATG a score=15405 s mm7.chrY_random 25669634 755 + 30114534 ACCACTCGGAGTTGCTACCTGATCTACAGTCTCCTCCTGGG-TGACAAATCCTACCCTTCTCAGGTCCCCTTTCCCTAAGTG-GCACCTGCTCAGCAAAGCTTCTCTCTCCCATGAAATCATTATTTGTGTTTTAGCATGTACATCTGCCCAGAGGCAATGATTGCATGTT---TTCAACAAACAGCCCTTAATACATATTTAAAAGCAATTCGAAAAAGAAGGCAATAAACCAGCATTAAAAAGAATATTGTTTTATTGTTAAATGA--GGAAATGGTGTCAACACAGTTAAAGATGCTCAGTAAGTGAAAT-ACCCTCTCAGATAATGAATTAAGCTGC-CATCCCCTCGGGTGGTCCTGAGGGAGGCAGC-TTGGCTGAGTCAC-----------------ACTCCTGCCTT---TCCAGTTTCTTTCAAGCACCAGA-GCCAGTGGGAAAGACGGGAGCTGGTACCTTGGCAGAGAACCCAAATGTTTGCTTCAGTCAGTATCACTGATTTTTTCCCCTCAGAA--------AAAGAGAAAGAAAAAGAAAGAAAGAACTTAACAAAGTTGAGTCTTATTGTAAAATGTTCACTTCTGATGATAATGCTTTACCTCAGGGGAAGTGTGTCCAACAATCAGTAGCATTG------------TCCCTATACATTGAGC---AGCCTTGGAGCCAACGTTACTTTGACTCTTACTTCATGGTTTGCACTTTCTTTT------------AACTCTTGGGGTTTAGGCAG------------AGGGATGAAGACTTAGA-----CATAGCTAGGCTTCCATAGTTCTAACCTGACCAAT s bosTau2.scaffold6778 9 779 + 43138 ACAAATCAAAGATGCTAATTATCCTATACCTTCTCCCTCTGCTGGCAGACGTGGCTCCTCTCTGGCCTCTTTTCCCCAGATGAGCATCTGCTCAGTAATTCTTTTTGCTCCTGTGAAATCATTATTTGTGTCTTAGCCTGTACCTCTGCCCAGAGGCAACAAATGCATTTTCTGTTCAGTAGACATCCTGTAATACATATTTAAAATCAGTC-------------------------------------TCATTTTACTGTTAAAAAGACAAAAACAATGTCAACATAATTACAAACGCTTAGTAAATCAAATCACCATTTCAG-TAA-----TAAGATGCTCAGGCCTTGGGGTGGTCCCAGTGGAAGCAGCTTTGACTCAGTCACCACACTGACTGTAACTTGCTCCTATCTTTTCTCTAGACTGCTTTGGGGATTAGGTACCAGGGAGAGGGGAGAGAGACTCCTCCTTGCCATCAAACCCAAGCATCTACATTTGTC-GTATGAAAGGTATTTTTCTCTCTGTGTCATTTCCACAGTG-------TAGAAAATAAGAAATTGGCATAACTGAAACTTAATATAAAACAGCACATTCTAATGCTAACACCCTCATTTAGGAGA--------CATAAGGCAGAGGCACTGATGACCACGAAATTGCTGTATAGTGAGAAGGAGAATTGGATTGAACATTATTTCTATTCTTACTTTGCTCCAGACACTTTCTTTTTTATTCTAACAAGAATCTTGCAATTTAGGCAAAACACCCAGGTTAAGGATGAAGAATGGGAGACATAATAGGTTGCTTTCCACATCTCTTATCTAGTAAAT a score=42780 s mm7.chrY_random 25673864 1557 + 30114534 ATGACCTTACATCTGGGGATTAGTAATGAGACAGTCATTCATGCCCTAAAACAAGAGGAGACCATAGAGCCAACTTCCCAAAGAAGACCTCTCCTTTGAGGAAGTCTTGAAAAGCAATAACCCTGGAGGCCC--AGCGGTGAGATTAATTTGTTCTACCTTCCCTGCTTCCTCCTAATCTCCTCCGAGTCATCTGTTTCCATCCTTAATGTCTAAACATGCAAATATTGCTGCACTTACTGCTCATTAGTTTAGCTAAAGGAAGTGCCCTTTAATTATGCCTCTAAATAATGAACCTCCTCCATCACCTTGACAATCAGTGCATATTTAGAAAGAAGCAAAGCCTCATTATAAAGCAGCAACTGCATCCCCTGGCTTCTTAGAAGATGGTAGCTTTCTTGAGGCCACAGAAATGGGAATCACAAGACCACCAATTC-----------TTAGCTCTTCAT-GACCTTAGAGGCAAGAATGGCAAATAACTGCTTAGTAAGACATTACATTTAAGAAATAGAAGGAGAATTAGCATTTGCCAAAGCACTCTTGTATTCCACTTC---------TTGATCTCTAAGTATGAGGTCTAAGCT-CACAGTTAGTTTTACAGTCCAGTCTTGACTATTTGTTCTGCAC--------TAAGTCTGTGGAAATGAAAGTAATTTGACTAATGTGTTAGACCAAGCCCACCATTCTGCAAAGCTCCAC--GTTGCTTACCATTACGCTTTTATTTTGTTGAG----ATTTATGTAGCTTGGCAGAA-----------CTCAACCTTGACCATATTTCTCCATTTGTTGATCTAAGGAGAAAACCACAGAAATTGTTTGTTGACATTCCATTGGCGATAGCAAAGGCAGACTGGACAGCTCTAT-TGTGAACCTGTCTGCCTTGCCTGGATGAATGAAGC------TCATGTTGTGGAAACAAGACATCCCTGCTATCTGGCATGCCACATTCTTGGTTCATCTGTCAG--------TCCTAGATTCATGAGCCACATCCCTGGTGGACCTC-----TAAATCCCACAACAATAGAGAACTGACTTTACATCCATTATGAGGAGAGATTACAAAGATTCATTCCAACTTTTTCTTGCAACTTTTGTTGCATTGACTTTTCCACTGGTTTAGTTCCTTCACTACCCTGGGATAG-ATG---------ACCCTCTAATCTTTAACTCTGCTTCTAGTCTAAAAATATGCTCGGAAAATATATATTAATCTCCAAA----------TTATCTGCATGGCAGAACCTGA---TCCACGCTGTGGTTCCTGA----------AGAGACATGCAAGT-CCACTTTAACCACGTACATATCATCCAAGGGACACTGAAAAGAGCCTCC----AGTGAGTC----CCAAACACATCCAGCTTTT-------------------------TTATATATTTATTCTCTGAATGGTATTTAG----------------AATATT---------------------TTTTAAACAGACAA---------CTGAAAGGACTAAAACATGAAGCAGGCATTCTTCATGACTTTTTGTATAGGAAACGTCCATAAAGACAAGTCTATAGATGGAGAACAC-----AGTACTGTTCTGCCTAGGGCTTGGGTTCAGGGTAAAACCAGACAAT-----------TTTATTATAgggtgct---gatgttctaaaactggattctg-tgattgcccaacaaaattaa s bosTau2.scaffold6778 1142 1723 + 43138 ATCAGCTTTCTCCTGAGGTCCGCGGGTGAGAGTTCTGTTCAGCCAATAAAACAAGAAAAGCCAGTGAAGCTGACT-CTTAGGGAATATCACTCCTCCAGGGATGTCCTGCAATGCAATAACCCTGGAGGTCCTAGGCAGTGAGATTAATTTGCCCTACCTTCCCTGCTTCCTCCCATTCTCCTATGAGTCATCTGTTTCCATCCTTAATGTCTAAACATGCAAATATTGCTGCACTTTCTGCTCATTAGTTTAGCTAAAGGAAGTGCCCTTTAATTATGCTTTTAAATAATGAACCTCCTCCATCACCTTGACAATTAGTGCATATTTAGAAGGAAGCAAGGCCTCATTATGAAACTGCTATTGCACCCCTTGGTTACTAGGAAGAAGGTACTGTTCTTTAGACAACATACATAGGAATCAAAAGACAAATAAGCCTTGTGATTGCATTAGCTTCTTGTAGCCCTTATGTGCAAGAATGGCAAACAGCCA--------------ATGTGTGAGGGAGAGAAGGaaaactggcattttttgagaggctgttatgtgccaatccctaaatacattgatttgcatacattaagtctaatctgctcagttacttttgaagctatttcttaattcagttttttagatgttgaaaatgaggctctgaaagattaagcaatttgcctaaggtATCAGACCATGTCCACCGTTCTCCAAAAGAACATGGGTTATTTTCCATTATGTGTTTATCTTGTTGAGAACTATTTACATAGCTTGGCATAATGGGGTATCTGCCAAGTTTTCACCATATTTCTCCATCCATTGATCTCAGCAGACACTCACAGGAATAATTTGTTTCCATAAAATT--CCAAGGAAAAGACAGTTTGGACAATATTATGTTTACACCTATCTGCATAGCTTTTAAAAATAAAACAATTTGTCATGAT---AAAGCAAGTTATTTCTAC--TCTTACTGACCA-ATTACTTGTTCATCTTTTAAGACTATCTTTCAAGACTCGAGGATCACGTCCTTTATAAGACTTTTCTGTAATTCTCTCTCCCATAAAGAATTAGCCTTAACTCCATGA-------GGGCTCCAGAATTTTATCACACCATTCTT---CACACTTCATTACACTTCTTTGTTTGTTGGTTCATTTCTTCCACAGTGCTGGGATATCATGTCTTATTCACCTTTTTAACTTTTAACATAGCATCTAACACAAATATGTGTCCAAAATATGCTTCTTAAATTTAAAAAGATGAGTCCTTATCTGAATGTCATAATTTGATTTTCTACACCATGATTCCCAAACACTGGTCCATAGACCTATAAGTACCAGTTGGGCTATATAAATATTATCTGAGGAACATTGAAAAAAAGCTTCCAAAAGCaaaacaaaacaaaaccaatatatcctttaacaggtgaataaataaatagcctattgtatatccatacgtggaatgttgttcagcaataaaaaggaacaacatattgacttacacaacatagatcaatttcaaaaacattatgctaagtgttgaaa--actagacaacaaagactagatagtccatgacttcatttatatgaaatgtccacaaaacacagttttaagatggaaaatattatagatcactggt-tgcttgggactcaaagtcagaggaggagtaaactataaatgagcacagtcatctttaggtgacagaaatgttataaaactagcttgtgatggttgttgcacaaggtgaa a score=7163 s mm7.chrY_random 25675624 584 + 30114534 AATACCAGAAATGATAGGGAGGCAGGAAAGGAACTGAAAATCTGAACACAGGGTCTCCTAGAATCCTTCAAACTGTCAACCGCCCTGTGAACTGTGTCCATAGGGGAAAGCACAAGAGCCTGGGAAACA--------------AGCAAGAAATAGGAAAAGCAGCAGCAAAGATATCAGAGCCACTGTGCACTGATCAAGAGACACATTTTGGAATTCTTCTAAGTAAGAAAGGCTGAGGACACATCTAGAGTTTTCCAGTGGAATTCCAGAAGAGAGAC-TCTTGGAGATGAATGGGCATGTGTCAGGATTTAAAGGGCTGGCCTAGAGCTAAGGATAAGCAAAAACAACAAAGAATCCTCAATAAAACAGAAAGCCAAACCTCAGCAAGTGCCAAGTGCCAGGGCTCATCTGGCCATTCAGTTAAAGTCAGCAATCTTACAGAGCAAG---GGCAGAAGCCAGAGCATCAAC----CCCAAGGTTCAG----------AGGAACAAAATTGTCAGATGCATGAAGCAACA--ATGGAATGCAAATGACTGTCCAGAGTAATATTGTGAAGCAGAGTTTGTTGTGGCCAATGGATTGAA-----CAGATGAATGGGAAAATA s bosTau2.scaffold6778 17029 572 + 43138 AACAccagaaaagagggatatataggaagagatct-caactctgaaagcaaa----ccta-----ctttagatccttgactgacccctggactgtggacatacagaagag-------actttggaaacccagtgaaaagagatagcacaaaagatgaaaataatgatcagagattttag--ttaccatctaTTTCAAATGAGACAAATTTTAGAATTCCTCCAAGTTATAAGGGCTAAATAAACACTTTGAGTTTTATAATAAAATGACAGGATAAACATATATTAGAAGTAAA-GTTCATATGTCAGGAT-----------GTTCAAGATTAAGAGTAAACCTAAAC-ACTAATAGCCTT--ATATAGTATAAAATCAAA-GTCTACAGGTACAAAGT------GATCTTTAAATAATTTAATaaaaatcaacagtct--cagagaaagataaaaagaatccagagtttctactatgtacaattctcagttcccagtatgagagacaaattattagacatgtgaggagacaggaaaaaATGTGACCTAAGGTTCAGAGt-------tggaaaagaccctgatgctgggaa-agattgaaagaggaagaagaaggggacaaca a score=14036 s mm7.chrY_random 25676308 977 + 30114534 ATGGTCCAACTCATTTTTAAATGTGTTA-GAAGCATTATTTTAAAAGCTGGA---GATCAGCAAGATCCAAACTTAATGA-TACTAAGGAAACAA-ATCTGATCACATTGTCTACAACCTGTTGAATCATAAAAATGAAGCAGACATCTTGGGGG--------------GAAAA----------------------TGTGTCATACACAGGGAAAAAGCAATATAAAGTAACAAGCAATATTTTA-TGAAAATTTGCAATAGCAAAAGATGAAAGGAATGGCCAGGAAAGCCCTTCCAGTAAAAAAGAA--------CTGATATTGAAACAGAACTACCCATGTGGAAGGAAGGACAAGCTCTGAAAATGATGGCTTTGTGTGTTAGGACCAAGT----------CTTCCTTCTCAGCCTCTCTGAAT----ACTT----------AGCTATAAGTCAGCGGCTTTGGCAGAGAAC-CGCATAGCATACAAGGCAGGAAGGTGTAATGAACGGAACCATGGAGATGTTAAATA-AGTCATAATGATCCAAGGTTCACACATTTTCTGTGAAGTTTTGTAATGTTAATCATAAATACACTGTGATATGCTAAAGATTCATATTAAAGAAAGCCTGCTTGAGGTTAGACACAAGAAGATGAAAGGG-----CTATGCAGGCTAAAATGTCCACGTTCAGAGGATTATAGGCTTCTTAAAGCAGATAGACAGAAAGGCCAA--GTGCTGGCTATTAAAAGTCACTGTTTGTATAGTTGGTGTGGGCCACTCTACAGAAGGGAGGAGTCAAACTTGGACTGTCCTGACAATGCC-----------CTCAA------------------------------------CCCCCTGGCCTGTAC-----ATCACACATCATACTTAAGAAAACAGAGTTGCTTAGTTACCATGAAGCAGA--------GTTCAAGAGCACCTAGACAGGAAATCCTGAGGGTTGCATTTGAGAGAATAGACAAAAACACTAATTGG-ATGAG--TGAGGAAGATGGAGAGTGCCCAAG-------------------AGGGCAGAGTGTGCTGCTCTTGGGGCTGCAGGCATCGGCACCGGCATTGTCTGGATGTGGACC s bosTau2.scaffold6778 18202 1118 + 43138 atggttgaaaagttttccaaacttggtacaaaacatcattttaaaatttaaataaggtaagcatgctccaaactggataaatacaaagaagaccacacctaaacacattatcctcaacaagttgaaaacccaaaataaagacaaaattttgaaagcactcagagaaagagaaaacaaaaaaacaaaaaaaaactttttttttccatgtgggagaacactaatatgaatta-cagctgacatttcactagaaatgatggaaaccaaaagacgatggga-tgac-----aaaatcttcaagaaagaaaggcagtggtgtcagatggaaaaacaaatctata-----ggaaggaaagaagagaactggaaatggtaa-tatgtgagtgaacataaaagactatctttacttctctcctaatttatttaaatgacaacttttactgcaacagttacaagttggctg--tgggcataaaatgtacatag-atttaaaatacataaatgcagcagaccaaatgatgcgtgtgggaaatggagttatactgttgcacgcttcttacattttatgtaaagtagtttaatgttagctttaagtattctatgataagctaacgatgcatGTGAAAGAAGGCCTACTTTAGAGTAGAGACCATGAAATTAAAGGGATGCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACTCAGAATGTAGTAGATTTCTTAAAACAGACAAA---ATTGGGTGATGGTGGTGACAATGGAAAAGAACCATTGGTGT-----GCATGGGTCACAA-AAGGAGTGGAAAAATTGAGCCTGGGATTTTTAAATAATGCTTAAAAAGAGTGCTCAAGGGGTGGTATGAATGATGAAGGAGGGCCTGATTTTACCTCCCAATCTTTAATTGGAATTGGCCACAATATTTAAGAATGTATGGTTGTCTGTTTGCCATGAAACAGAGTTGTCATGTTTTAGAGGGCCTAGCGAGAAAATTCTGAGGTTTGGGTTTCAGAAAATAAGCAAGAAAAGCAACAGGTATAAGTTTAAGGGATTTGGAAAATGGCCTAGAAGTGTAGGAATAGAAAGAAAGGTGGAATTTGCTGCTTTTATGGCTGCAAGCAGCTGTGTCAACCTTGTCCCTTTGtgtatc a score=17432 s mm7.chrY_random 25677796 715 + 30114534 CTAGTTTCTGCCTCCCTGGTACTGCATGCACTGTTGGTTGTTGAGCAGCCCACATCCTCCT--TTAGGTTGCCCTGGAAACTGAGACCTTCCCAGCAACCTCTGTCCTTTCCTGtttttttttttttgttttttttttttttAAG--CTACAAGGACTCCCATGAACTGCCACCTTGTCAAA-GGTTTTATTACTGTCATAAATACAGGGAGATGATGAAGTTATAGCTATTTGAACACAAAGCTAAGATAAACTCATAT--CTATTATCTAGACTCCAA----AAATGACCCCACAGTTGGAACATAAATGTGATTTGAGACTTGAATTGCTTGGAGA-ATCTTCTGATAACCAACCATGGTGCTTTTCTGTCTGTAAGCATATGAATAAAATGAGTCTCATAAGCCACCAGTGAAAATATGCCTTCGGGTTTATTCTAGAATACTAAAAATATTTCTTTTTCATGTCTAGCTAAAATAGAAATATATGGTGCTGGGAATCCAAAAGAAG---------------------TGGGAGCCAAATGCTATG-TTGTCTTTACGCACT--GCCCATTGAGTCACATACTTACTCAGTCACTCACTCA--------------------TCAGCTTTTAAAAAAACAAACTGA--ATTTTAGGAACAAATAGTCATTAAGGCCC------------ACATGCCCAGTAACCTCTCAGAC---------CAACTCATTTCTGTCCCATATCACCAGTGTAACTTTGGTGAGGCATCTCATCTCTGTgagcct--gtttctt s bosTau2.scaffold6778 20660 755 + 43138 CTAATATCTGCCTTCGTGACATTACATGAAATGTTAGACACCGAGTACCCCTTATCATTCTATTTAGGTTTCCCAGGAAACAGAG--CTTTGTATCAGC-----------------TTTGTAATGTGGTCTGCTTCTATTAGAAGGGTCACACACCCTTCCATCAA--ACAACCTTCTCAAAAGGTTCCATTACCATCACAAATATAAGGGGACAGTGAGGCTTTGGCTATGGGGTCACAAAGCAAAAAGAACCTCTTATAACTATTATTTAGACTCAAATAAAAAGAGAACTCATAAATAGTGCATACATGAGAATTGAGACATGAATGACTTAAAGATATCATTCACT------------TATTTTTATATCTGTAAACATATGAATAAAATGAGCCTTACAAGCCAAGAGTGAAAATATACCTTCAGGTTTATTCCAGAATACTAAAAATATCCCTCTGCCATATCTGGCCA------AAATATGTCACAATGGGAACTAAAAATAAAATAAGGAAGGAAAGATTCTTTCATGGGCCGAGTGCAAAGCTTGACTGCCTGTACTCGGCCCCATGAATT-TAGGCTTATTCAATCACTCATTTATAACAAATTTAAATTGAGATTAAATTTTCAAATGAACATACAAAATATTTCAGGGGCAAATGCTCATGAAGGAACCgtggaaagcaggcaggctttggagtctatcagatttgagtttgtggttgagctctg-ctcttattagctgtgagatctgaatgaggcacttcaccactctgagccttagtttcct a score=8807 s mm7.chrY_random 25679463 589 + 30114534 GGAAGCAGTATGCACTG----AGGGCCACTGTGT---GAAGGCCTT----TGTCCCATGACAATGAATGAAGCTCAACCTTGGCCCT---GGAGCTAAGAGTTGAGTAGGAGAGAAAAAGAATTACAGTACCATGATTGGAAGTAGAATGGAGAGAAGGGCAGAAAATTAACTGGCAGGGGTCACCTCATCTGCCCTAGG----AACTGTG------------CAGT-AGGGCAGGACCTGACAAGTCTGAAATACCTACTGCAAGCTGGCCTTCTCTGAGGATACAGGGTGTAACTGACCCTCTCTGGGCTCTGAA-GAGCACAATTCAGG-CTGACTACTTTCATGGAGAGGAAC------TTCACAGGCAGGA----CTCACTTGACCTTCGCCTTACTG---TCCTGGCTTGCT-----CTGCCAGGTA--------CCATTATCCAGAATGCACATTTGGACCATGGCTTAG---AGAGATTGACTAG-------------AGCTGGATAGAAAATATAA-ACCTGATATTTGAA-TCAAGACTATACTTTTG--------------CCAGGGAGGTAGTTAGTCTGGGGTCCCTGAGAAATATACATAGCCAGAC--TGGAAGAATTCAAGTCAGCAGTGGAAGACATTTACAACAGAAAAGCATACATCACAAAA s bosTau2.scaffold6778 24996 667 + 43138 GGATGCAGCATGTGTTGGGGCAGGGCTGCTGTGTACTGGAGACTCTGCCATGTGCTCTGGCAATGAGGGGAGCTCTAGCCTGGCCCTGAAGGAGGTTAGAGTTGAGTGAGAGAG-AAAGTAGTTGGATTACCATGATCAGAGCTAGGAGAGAGGGAGAGGTGG-------ACAGGGAGGGG-CGCCTAGCCAGCCCCAAGGGGCAGCTGAGGCTTGTCAGGAACAGCAAGGACAGGACCTAACAACTGTG-AATCCCGACCACACACTGGTCCGGTGTGAGCACACAGGGCGATGGTGAGTCTGTCTTGGCTCTAAAGGAGCTTGAGTATGGTCTTACTGTGGTGATGTGGGCAGACAGTCTACTCACAGACAGGGAACCCTGCCCTGAAATTCACACCACTTCTCCTCTGTCTCGTTAATTCCTGCCagacattattgccccattactcagatggcaggt---aactgggggttagacaagatatagaacaatttgccctcgatcaactggtcaatgactagaagggctgagagttgaacccaaacctacACTCTTGAACCAATGACATTACCAGGGAAG--GCTGAGACAGGTTCCCTGACAGGTCCAGCTGGTGTGTCTGTGGGAGTAGGCTGACCAGGACCTGAAGGGGTTGGCAACAGAAAAGCACAAATGATAAAA a score=3796 s mm7.chrY_random 25681987 780 + 30114534 ATGAACA----CTACATACAAACAAAGCATTTAATTCCTGCTAGATGGTCACTAAATAGAGACGGTCACTGTATTAACATTAACATTATTTTTTTTACATTGTTTTACCCCATATC----AGATGAGGATTCTGGCTGAATCAGATCAGCCCTGCCCAAGGGGATTCTAGCATTCAGGGCTTCTGGGAAACAG-------TGAACTTAGTTGTAAGTGGCAC---------CCCAGCTCATTGAAATgtataaattctagaacctgatttcatgggttcgagccctagctctgacac-tacagggttcgtggcctgaggATTGGATGCCTTGGTTTCTCAACCT--------------------GTTAAACTTCATCTCCCACACAGTGCTTTTTGTATAACATAGTACCAAATGTAACTTTCTGACTTGGGGCCCTTGCATTAAGGGACTGGTGATGACCCTTTCTCTTGTGCCCAGCAGAGAGATCCTTGCCAGTCTGGTTGAAGCCACCC---AGTATCACCGGTTATTCTCACCTCTGTGGCCTCTGAGTTTCTGCCTTGAGATACTCTTTATGATTTACGTGGGTTCTGGCCCTTGCTTAGT----------------CCAAAGATATCGAGTGTTTAAGTCTTTCCCTAGGCACTGCTTCTGCCTGCTGCTTGGCTC--TACAC-----TGGAAGCCTGGCAGTCTGTGCTCTGACAGGATGCTCCGTGATGCACTCCACACCCATCACTGCATCTCCA--CACTTCCCTCACCGCATGCAGACAGGAAGGGGC---------------------------------------TTTCA----------AGCCT-------------------------------------------------------------------TAAGGAGAAAGAGCCCCTTACTACTA-AGACAAGGCTGAGTATA s bosTau2.scaffold6778 26064 849 + 43138 atgagcattagctgtatgCATATAAAGCACCTGATTCATGCTGGATGGTAATAAATTA--------CATTGCTTGATCTTTGTCCTTGTTTTT---ACTTAGTCTTGTCC---ATCCTAGAGATCAAAGTCTTGGCTTAGCCAGTTTGAATCTGTTCTGGAGAATTCTAGAATTCTGGGCTTAATAGAAACAAGAAGTCATGCCCTCTGGTGTGCCTGGCAAGTGGATGAGCCtggct----gaagtgcacagatttctgaacctgattttctgggcttgaatctgtgctcttccatatgtaaagttgagaaagtaagttcactgtatctccgtttcccaatttcaccccataggattgggaggattaaacatggta----atacaGTGCATT------------GTACGCTCTGTAGGTTTCTGACTCCAGGCT-------------------------------TCCTGC-------------ATCCCTGTCAATCTGACTGGCACCTTCCCTGGGCATCTCTGGCT-------CCTCTGGGGCTTCTCAACTCCTGTTTCCATA---------------GCAGAGGTTCTGACT-TTGCTAAGCAGTGACTCAGTGAAGGCTGAAGACATGAAAGACTTGAGTCTTT-----------GCTTCCTTCTATTGCTCAGCCCATTGGACAAGCATGGAAGCCTAG--GTCTCTACTCTGT--GGATCC-----GGGGGCCTCCACACCAATCACTTCTTCTCTGTGCATGTTTACAGCCCTATTGAGGTGGGAAAgggaagggaatggcaacccactccagtattcttgcctggagaatttcatggacagaggagcctgacctgctacagaccatggggtcacaatgaattggacaccactgagcaactaacaGTAACTAACTAACATGAAGGAAGGATACCTTCCTACTGGAGGCAGGGCTGTTCCTA a score=15912 s mm7.chrY_random 25682798 749 + 30114534 TGCTGGGGACTCATCTGCTGACCACAGGAGGGCATCCC---ACTTATGCCTCATAAAAGTGAGGCTGAGCCACAGACAGGGCTCTCAGGC--TTTGCTGGAGGATGCCCAGGTCCAGGTTGGGATGTGGTACCTCCAGGAGAACTATGTTCTGAGCAGTCA-----TTGTAACTTCCCACCTCTCAGTAATGGGCAGGCTGTTCACCAACCTGCCTGGCAT-CTGGGCATTGACA-----AGCCGTTCTGGTGCC-TGACCTAAGAGAGACCACGTATCTCACAGAGGTCACATGGCCTACTCTGCCCAGCTGTGATGCCCTATACAGGCTCTTGTGGAGCCAGGGAGCATTCATGATAATGGCCAAGCCAGCAAGAACCCTCATTACCGTTTATTACTCTAGGCTGCAGCATTTCTGCATTTCATCTCACAAA-GCTTAGCCAAGGAGAGTCAGG----ACATGAAAAGAC-GCTCATTTAATATGACTTT-ACACAGTCTTAA-CCCCTGCGACTCATTTGTCCCTAATACGCTTAAAGTTTTTTTTTTTAATCTGTAAGAGCAAAGTACAATTGGTCACTTAAAATCTTGAAATGAAGATTT--CAATACTAACTCAA--ATACTATTTGCCTTCCCCATGACTCCATAGG------CCCCTCTCCCCTGACACCCCTGTCCCCTGCTCTATGTCCACTCTGCTGCCTGGCCTCTGTAATCGTCTCAGTCACATGGCCTGGTTGGGAACATTGCTACTTTGC-TAGATGTATTTCATGAGTC s bosTau2.scaffold6778 26994 755 + 43138 CACTGAAGAATCACTTGCC-CCCAGAGTAGGGGCTCCACTGACTTTCATTCTAGAACCCTAAGCCTGAGCCACAGAGAAGGCTTTTATCCAGTCTGCCTGAA-CTGCCCTGGACCACTTCAGAATGTGGCCCATCCCCTGGGAGTATGTTCTGAACAGACAGGATTCTGTGGCTCACCACCTTTCAGCTATGGGCAGTCTGCTCACCTGGCAGTGTCGTAGGCTGAACGCTGACCCCATCATCGGCTCAGTCACCATGTTC------AGACCCCACACCTTGCAAAGGTCCCACAGACCAGCCTTCCTGGCTGTGATGTCAGG-GCAGGTTCACATGTGGTCA------ATTAAAGA--------AGCCTAGGAGGCTTCCTCATTACACTTTATTACTGGAGACTGCTCCATTTCTGCATTTCATCTAACAGCTGCTTATCTAGGGAGAGAGAGGCTGAACATTTAAAGGCTGTTCATTTAATAAGATTTTCGCATAGTTTCAATCCCCTGCAAGTCATTTGTCTCTAACAGATTTCGGGCTTTTTATCCTGG-------GAGGAAGCCACGATTGGTCACTTAAAATCTTGGAAAACATATTTTACATCACAAGCATAGTCATGTTAATTTGTCTTCCCATGTCTCCATGTGGCTCACCCGCCCACCCCCACCCCCGCTGCCCCCAGCCTTTTGTCCACTTGGCTACTTCGCTTTGACGATTTTTCTAAAGATGTTGCAGGGGCTGCAGCACCACTGTCTGACCTATACATGTTTCCTGAGCC a score=11884 s mm7.chrY_random 25683605 252 + 30114534 CAGGAACACTTAAATGTTTCAAGGGAAACAAGTCACTTAATTTGGGAGATATTAATATATCACCAATGACATTAAGGGAGAGATATTAGAAATACATGAATGGACTTTAAAAAATGTTTAA-TAGTCACCCATTTATTTTAATGAGTATAAGAAAATGTGTAACTTGCACATTAGAA-CATGATTTCACAGCTATGAAATGATATAAAATTATTTTGTCAGTTTAAGTGAGTTAATTCAGAGAAAAAATGTTAA s bosTau2.scaffold6778 28039 242 + 43138 TAAGAGCACTTATATGTT-CATGGGGATCAAATCACTTAATTTGGGCGATATTAGTCTATCAACAGTGGCTTTAAGGGAGAGAAATTAGAAATACATGTGTGGATTTT-----TTTTTTAATTTGTTGCCCATTTATTTTAATGTGTAAGAGGAAAAGTGTAACTTTTATATTACAGCCATGATTTCAGAGCTATGAAATGATATTAAATTACTT------TTTAAGTCAGTTATTTAAGTAAAAGTGAGTTGA a score=16468 s mm7.chrY_random 25684010 900 + 30114534 gggaaatgtcaattttaaatccataatgagctacccta--catctatcagaacttccaaaaata-----------aatttcagatggctaacacaggtatctggcagagatgtagaacaaacagaaaccttgaatattgctcgtggtggtagaagctgatgtagatgttgtggaaaaactctt------------tggccatacccaaaatgggtccagcaggtcca-gcttagtcatctacccagaggaagca--tacacgtgttcactcaaagacatgaacgatgttcaAGACATGAATACGGTTTAGAGAACGCTATTTGGAGGAATTACTGTTCTGTAGTGCTCTGTGAAGAGGTGTATAAGTCACTGCTCCCATCCTTGAGAGG-----------------------GAGCAGTCTTCCAGATTGCAT-----TCTGGATTTCAAGCTGAATGCCTGGAATACCATCACCACATCTAAA--------GTGCCCCACCATGTCAGGCAAA--CAGCCACTTACCTCAGTAATGTGGAG--CACGGTCATTTGACACTTTGCTCAAGGAAATTTGGTTGAGTGGATATCCGTATGGATAGCAATGCTTTTCATCCTGGGTCTGTTTCTCTGTGGAAGTCAGCCTTGTCTCTCTGTGAGAGGAAGACTCTTGTCTGTCTTCCTAATTTACTGTTCAGTAGCAATCAGGGACTTATTGTAACACCTGTTTCATTTTCACACCCTGTGAGTATATGCTAGA-----------------------------------TGGCTAGGGAGGTGGAAGGAT-----TGACAGGGACATAGGATAGAAATAAACAAATGAGGAAGGCTGGGAGTGGTCTGTAGTTAAACTATCCCTCTCCCCATGAAAGGCAGAACCTCCCACCATATAAGGGATATTCCATAAAGAGTGTAGCAAGCCTTAGCTATCTCTGCCAAGGGCATACCCTGGCAGTTAGAATTATTACTAT-----TGGAC s bosTau2.scaffold6778 30010 986 + 43138 gggaaatgcaaactt--agtccacaatgaggtgctctaaacagccaccagaatggttaaggaaaggaggagagaaaagaacaaaagac-agtactaagacttggcaggagtgcagaacaactagaactcttgtatatggcttatgggaatgtcaattggtacaaccactttgcaaaactgcttggcagaatctcctagtaattctcctagtagtcccagaagtttcactcccagtagtctacccagcaaaagcacatacatatgttcactgaacaacatgtacaaTATTTGGGAAATGAACGGGTCTCACGAAAAGCTAGTAGAATTAAAACCTAT-CTGCACTGCTTTGTGCAGAGGTAAATAAGACAGTATCCTGGTCCTTGAGTAGCCCCAGAGTAGATTCTCTTCACTAAACACTTTTTCTGAGTGTGTACTGTCCTGGGTCTCATGCTAGGCACTAGTAATGC-------ACAGCTAAATCAGAGATGGGCTGTACTCTCTTGGGAAAAGACAGTCACCT-CCTCAACAACCAGGATATCTTGGCCTTTTG-CATTTAGCTCAAGGAGATTTGGTTGCATGGGTGTCAGTATGGACAATCCTGGTTTATATTCTGCAACTATTTGTTTATGCAGTTATGTCGTCTCTctccatgagagcaggaaccccaccagtcttt----tttcctgttgtgtccc---cctggactt-tagcagtgcctggctcacagcagggactcaTGGGCACATGCTAGAGGCAGCatggatggatggatggatgagtgggtagatggGTAGGGAGGCAGATGGACGGAAGTGAGTGGGTGGGTGAGTGAAAATGACCACATATGGTAAGAGGTTAGTAGTCTGTA-TTAA----TTCTGCTCCCACTGGAGGTAGAAATCTCTCACCATGTAAGGAATATTCCACAAAGGATTTGATAAAC-TCACTCATCTCTACCAAGAACACTCATCAGTAGTTTGAATTGTTACAATCAACGTGGAC a score=25758 s mm7.chrY_random 25685111 739 + 30114534 GATTAGTGTTTCAGGAAAACAAGGTTCTAATTTATAACCAAGACCTGTGGTTTAATCAGCCAAAGAAAGCATG------AACAGCTCTGCCTTTCTCCTGTTCTCCCGCCACCTTCAGAGCCCAGGTTTACCTCTTTGGCCTTTAATTATTCTGTTCTCTCACGTAGCTTTATCTCTGACACTTGAGGATGAAAATTTGATTTGCCATTCAGAGGTTTCAGCAAAAATTCCCATTCAAGTCACTAAATTGAGAGTTAGA-AAAGGAACCGAGGATGGAGACCAGACTTTGAAAGGATGCTTTAGCGGTGTTTGTAATTAAATCTGTGTTATTACTTAGGATGGGGGAGAGTCATTTACATGCAGCACAGGG-GTGTTTGCAAACTCAGCCATGCGGTTCTAAAAACTGCAGCGTTAGTCATGCAGC---AGG-------AACAGGTCTGCTCCCTTGTACTAACA--CTGTGAGC-------------CATGCCTACTTTACCCTAGACAGCAAGCTGGGTCCTGTGGGGT---CAGAGGAATACTTGGCAGAACCCCTACTCTATCAAATCAGGGTCTGAGTAATAAT--CAGCTA---------ATGAAGGGGGAAGCCAGAGGGACAAATGTTA-----AGTTCCCCCTCCCCAACC------AGG-----------------GTCTTGTGACCATCACAGCGATGTGTAAAGAACAG-----------ATGTCACAT-CAGGGCACTCGGGGCCAGAGAATTGAAGTAGCTTGTTTT-AGCCACAGAGCTCTTAACT---ACTCTCT-AATACCTCTGCTCTTTGAA s bosTau2.scaffold6778 31015 826 + 43138 GATTAATATTTCTGGAGAACACTATTCTAATTTACAGTAAAGAACTTTGGTTTAATCAGCAAAAGAAAAAATGTTTGTGAAGATCATTGGCCTACTTATGTTTTCCCATTGCACTCCTAGCT-GGGTTTACCTCTTTGGCCTTTAATTATTTTATTCTGTTGTATGACTTTATCTCTGACACTTCGGGATGAAAATGTGATTTGCCATACAGAGGTTTCAGCAAAAA-TCACACTCTAGTCAGCAAACTGAGAGGTTGATAAAGGAACAGAGGGATGGACTGAGGCTTTGAAAGGATGTCTTTAAAGTGTTTTTAATTAAATCTGTGTTATTATTTAGAATGGTGGAAAATCATTTGCATGCATTACAGGGTTTGTTTAGAATCTCAGTCATGCTGTTCTTATAACTGTAGCATTAGTCATGGAACCTAAGGGCAATGTGACAAGTTTGCTTCTTCAGTCGGATATGTTGTGAGCAGCACCTCCTGTGCATGCCTGCTGTATACTAGTCATTAAGCTAGGTTCTGAGGGGGTCACAAAGAAATTCTTGGCAAAACTGCTGC-CTAGCATACCAGGAGCTGGATGACATTGCCAGATATAATTCAGCAGAAGGGAGGAGGATGAAGGACTGAACACTACCGAGATTTCCCATACGGTAATCTGCTGtaggcacttcgcctgcattctttcttttagtcatcacagcagtctgcacaggagaaccattacccccatttcacagacagaagactt--gctcagagcattgaagcagctggtcttaagccacacagctCTGTAGTTGAGCTCTCTAAAAACCTGTGTTCTTTCAG a score=10868 s mm7.chrY_random 25686600 486 + 30114534 CTTGATGTTAACCTTTT-GACCACATTGAAGAAAATTAGGAAAACTAGCCCACAAGACTCAAT---AGA---TAGATGAGAGTTTTGAGAACAATGGTTTCCACATTATAGTGGTCCCTTTGTATGA----CACATAGACAGATTTCTGTCTAGGCTCTATAGAAGAAAGGGCTGTCTTCAGTTTTAACAGGAGGTATCTGTTCCTTCTCTGGGC----CTAAGATGTGTGGTGCATCAGGTTTCTTCTTTGGGCTGGCAGCTGGAAAGCTTCCATTATC------TGTTCCCTCCATGAAAGTGTGTCAATTCTTTCAATATCCATTTAGCGCAGAAGCCACGTACGCGTTCTCCAAAGGTTCTTCTCAGCTTTGTGCCTTGTCCTAAGTCCTATTAAGGCAAGGCCTGAGGTAGAATTTGGGGAGCATCTGCTTTACACTGCAGAAACCAAATGTAGGAAGCTGAAAAGGAGGGGCATAGAAA-GAGGCAAAGGATGAAAGGAGAT s bosTau2.scaffold6778 32424 503 + 43138 cttgatattaaactttcagaccacactgaagtgtgttaaaagaaccagtccccaaaactcattatcagattttaaagggtgatgttgaatatagtggtgtctacatcat-gcagtatctctttttgagaaccaca-agagagagctttgtctgaactcagtacaaggaagagctctgcttctcttTGACAAAAGCTGCCTCTTCATTGCATGGGTGTGGCTCAGTAATAGCACTCAGCAGGTTTCCTCTGTGCATTGGCTTCTTT--AGCTTGCAGAACAAACTGGTGGCCCCTTTGCTAAAGAATGTAGACCCTTTCAGCACACGTTTAG-GGGCAAACCACACATACTCCCTCCGAAGCTTCATCTCAACTTTCTATTTTCATCCGAGTCCCTGGAAAGCAAAGTCCAAAGTGAAAATGTATGAGTTTCTCCTTTACAATAAGGAGAATAAGTTCAGGGAGATGAGAGTGAGGGGAAAAGGAGTGAGGCACAAATAAAAAGGAAAT a score=19603 s mm7.chrY_random 25687117 1453 + 30114534 AGATTAGAGTTCTTCCAAAACAGTCTATAAGCAGCAACAATTAATGAGCATGCCTTATGTGAGAGGAGAAAGGGGGAAATC-----------------------------AAGACTATTATACACTGTACAGGACGTGGATAG---AAGTTCCATCATGCCT---------------------GAGACCAACGTTGGTGCAAGATGCTGCTGAATTTTGCCTCTGAGATGCCCATCCCTGGCCATC----TGGTAGACCTTACAGGACTGTTTTCCATAAAGACATGAGACATCAAGGAACAGCCATGCCCCAACCCTTTTTTGCTCC-------AAATGGTGCCAAGACCTGAGG-GGGTCTCAGACAACAAGATTTTCCAATCCACATTTTCTTTTTCACAGCTTCC----ACTTCCCAACTTAA------AAACTATGTGTATCTTATATTGGTATTCCA-ATATA------TTTCAGGTATGTCAACATATAAATAAGTGCCACAACTCCTTCCTCATTGCTCATCTGCTCTCTCCAGTAAGAACGGCA-CTACAAGGCCCCCTTTCTGTCTTCTCTCCCTGAGTGCTCCCAGGAGTGGTGAAATGAGCGCTTGAA-------------AACCAGTTCTCACCATCACTGCCTCAAAGCCAGGAAACCTGGAGTGCAACAATGC--AGTCCATGTATAATTTTTTCATTTTGAGGATATTTCCTTTTAGCCTTGGTTACATTTGTCAAAAAGAagggagagagagagggagagagagagaACAAACAATAACAACACAGACCCTTCAAGATTGTTCAAAGATAGCAAGTCTTTAAAATTCCCAATACC-AGCATTTTTCCTGAATTTTGAACATAGACTCAATTTTCATACTAACCTTTCTAATTAACAATAGTTCTGTCAAAATAAAAAC----TGTTCAGTAT--------------------------AACTGAGTTACCTGGTTTCATTTG------------TCTCACCAGCTG-GGCTTAGTTATATAATTGGCTGAGGAAACCTGATTCATGTGATTATGGGGTTTTGCTAAAAAACAAAACAAACAAACAAAAATGTTCACATACACACACACACCTGACTCTGATACC-----TGCT-------GTCCTTGGGGGCTT-------------------CTTCCCCTGATT-CTGTGACATCCATGTTTGCTTTTTCAACTGTATAACTCACAGCCCCACCTACTGACAGCAGCAA--------TACCTTTCTGGAACTCGGTGTACAAGTGGCCTTTAATTTCCTAATGTCTTCAAGGTCCCTGATGTGCAATTACTTTAATTGGACCTCATAATTAGATGGTCAGCCAAGGGCATGGGAGGATATATTGGAGTTGGGCAtttcttttcttttcttttcttttttttctttttctGGA--------CTGAGCACTGTAACCCAAGCATCAAAGACGCAG-CTGGTTCCAGTC------ATGGCACCGGATGCTGAGAGAACAAGTGAAGATGGCAGAAACTGATCTTCATGCCAGGCAGCTCAACTCACTGGCACAGTCACCCTTAGTGTGGGGATGGATAATAGAGTCT-----------AATATTTCT--CTGAGTGTCTCTCACTGAC s bosTau2.scaffold6778 33889 1512 + 43138 AGGTGATGGCTCTTCCAAAG-AGTTATTAACTTTGAATAATAACCTACGGTGTCTTAGGTGAGGAGAGAAAGGACGAATTCGTCCACAGGCACGTGCCTCCTGTTGGCCCAGGAGTGTTCACCCCTCTGTATGTC-TGGGTAGCATGAGTCCTGCTGTGTCTCATGGCTCAGAGATGGCTGGGGAGCCTATAGCAGGGGCAGG--GCTG-TGGGTTGTGCCCTTGAGAAGCTCAGCACTGGTCAGCAGCTGGGCGGACCATGCAGAGATATTTGCCACATAGCT----GGAGCCAACGTGTGGCCATGCCCCTCCCCAC-----CACCCACAGAGAAGTGGTACCGAGACCCAAGGTGGGTCT--GACGAACTGTTCTTCC----CACATCTTCCCTTCCATGGCTTCTTCCTATTTTCTAACCTGCTTTCTTAACCTGTATTTATTTTATCCTTGTAAGCCACATGCAATCTGCTTTTGGATGGGCTGAGGTATAAATAAATCCCAAAA-TCTTTGCTGTGTGCTAATCCAGACTCTCCAGTGAGAGTCATATCCTCAAGACAGCCCTTCT--CTTTCATCCTTGA--------AGGTG-GATAAAGTTGGTGCTTGAGGCTAAATTGATGCAACCACTAGCCACTGTCATTACCTC---TCTACACAACTTGGTAGCCTTTAACTCTTATGCCAAGTGTAAGGCTTGGTTTCCTCAAGTGTTTCCTCTAAACCTTGGTTACATCTGTTAT------------------TGGAAACCCCAAGAACCTGCAAGAACAATAT-------------------------------TCCTTGGAGTCCCCAACACTGAGCACTTG--ATGAAT----------------GTTTTTGCATTAACTCAAATAAGTAACAATAATTATGTACtaataaggaccatttattgagcatttactatatgcccaaccctgccctggaacaggtttatgtcattgaatttcatAGAACTCAGCTCCTACCATCTGTGGCTCAGCCATATAACCTGATGGCAAAACCAGATTTCTATGATGATGGA-TTTTGCTAGAAAAAAA------------------TTTATATAC---TACCTCCCTGACTCTGAAAATGTCAATGCAATATTGAGTCCTTGGAGAGTTTGTCGTCTCGGATGCTTCTCTTTCTCTGGTTGCCTTGGTCTCTAGGTTTCCTTTTC--ACTTCGTGACTTACAGCCCCACCTACCACCTGCACTAAAAACCATCTACCTTT-TAGAATTCAGCAGTGAGGCAGCCTTTAATTACCTAATCTCTTCAGTGTCCCGAAAGTGTAATTAGTTTGACTGGACCTTGTAATTAAATGGTCAGACAAACATGTGGGAGGACACCATTCACTTGGGA-----------------TTCTTTTCTGTCTTTTTCTGGGCTGAGGCTCTGAGAACTGCAGCCCCACAAACAAAGACCCAGCCCGGTGCCAAGCTGCCCTAAGGC-CTGGATGCCAGGGCAGCATTTAGAGATGG-AGGGGCTGGTCTTTGTGCCAGACAGCT-GGGTTACTGGCAGAAGTGCCCTTGGTGGAGTGGTGG----TACAATTCCTCCATCTCTAAATATTTCTTGTGGATTGCCTCTCACTGGC a score=4285 s mm7.chrY_random 25688627 253 + 30114534 GTACATCATGGGAGGTCAGGAAAGCTCATGCCAGGGGTTCCCAAGCCTGAGCACAAAGATTTAGAGTCAA-TAGTCAGCATCAGGGATGCTGAACCCAGAATGTCTTCTTAGTCACCCAAAAGAGCTAATATG--GGCATT--TCATCTAACTGAACAGAAGCTGGTCCAAACAGGAGCTTTGCTGGCTACTG--------GGCA------ACCATGGAAACAAGCGATAGATACAGTATACACAGCTATA--TATGACCACTGAAGAAGTGCA s bosTau2.scaffold6778 36839 269 + 43138 gtgccacctgggaagccAT--AGGTCCGGGTTAGGGGTCCCCAAGGCTAGGCTCAGGAATTCAGAGTCAGCTTATGACCCTTGAGGATTCTGAACGTA-AATATCTCCTCTTTCATCCACTTAGCATAAGAGGAAGGCATTTATCATTAAAT--ATCAGAGGCTGGTCCCCAAACCAGTCTTGCTGATCAGTGTTTAAGGAGACAGAAAATATCTGGGAAATGAGCAGACCAAGCAGCACATACATATATAGGGATGACCACAGACGAAAAGCA a score=13703 s mm7.chrY_random 25689271 634 + 30114534 TGTTTGCTTTGCATT-ATAGAATACCTGTAACACTCAC----TCATCCTTCCTGGG-----GAGAAGA-----GGGTAGCATT-GTGGAACACTGAAATTAATAAAGCATTC-TTCACTAATGGAAAAACGATTAGTTCTGTGGCCATTAATGATGGCTGTTAAGGATCTATTATTAATGCAAATTAATGTTAAATCTGATGAGGAATGAAGTGAATGTAAATACATAAATAACATCTAAATGAATGGGTTC-GGAGGCAGTCATTATAATAATTGAGTACCGAGCTTCCTGCTCTTG-CTCCGGGTCCCCAGTGAAGGGAGGAA------TCCCGACAC------TGGATGATGAATGCTG-------CTGCTTTTTCTTCCACACTTTGACT--CCGGGCACCCCAGCTCTGGTCAAACCATCTCTCTCCATCTTTAGCCTGGCTTCTGTTCTCTCAGGCTCTCCTGAGTACCTGATGGCTTGCACTAATGCAATGCCTTCTATCCACGGCTCAGGCTGAGAG--TTCAGGGGCAATC-----AGGGACTATTGCAGGAGCAGGTCTAGTCACTCTGATATT--------CTCTGGAGACTGCTGATTCCCATGGCCACCACATAAGGATTCAAACTCA-----GTGTCAGTCCTCTAGCA------TAGAAACTACTCTCCCCTGCCTAGACTAAGG s bosTau2.scaffold6778 37989 680 + 43138 TGTATGATTCTCATTTGTAGAACACATAGAACACTCACCCTTTCATCCTCCCCGGGACTCTGAGGAGAATGTTGGATAACATGAGGGGTACTTTGAAAATAATAAGGTGTTAGTTCATTAATGGAAAA-TGATGAGCGCTGTTGCCATTAATGATGGTTATTAAGTATCCATTATAAATACAAATTAATCCTAAATCTGATGAGGAAGGAGGTGGGTATAAAAAAGTAAGAGAGATCTAAGTGAATGGATTTAAAAGGCAGTAATGATAGCAATTGAGAACCAGCCTGGCTCCTCTAATCTCTAGGTGAGTGTTGTGGGGAGGGGAGACCTCCCTGACCCGCTTAATGGAGGGAGTCTGTTGAGAGAGCCAGCCCTGCACTCAACTCTGTGGTGAACGAGGCATC----TTCTTTACAAAGCGACCCATCCCCTCCCCTGACCTACTCCTATTCTCC----CTCTCCT---TACTAGCTAGCTTGCCTGAATTTGCATCCCTTTCTC-----CTTAGACTAAGGGACTGAAGGTGCGGTCTGGATAGGGGTGTTTGCAAGGGCACTCGCTATCACTCTGACACTCTAACACCCTTTGCAGGTCATCTA--CCTGCAGCCACCCCACAAGTACCAATAGCCAGTATGGTGTCAGTCCTCCAGCAAACCTGTAGGAGCGGC-CTCCCCTGCCCGGCCTGAGG a score=23811 s mm7.chrY_random 25691793 1192 + 30114534 GAGATCTCCCCAGTCTTGCACACAGAGTTCATACAAATCTGCTTTCTAACCAGTATGGCTTGGTTGTGAGCCAAGATGTATGAGCCACTTATTTCTGT--GGAAGCAGAGATGCATTTAGTTCTGCACATCTTGACATCCACAACCAGACGGAAACTTGGAACCAGCCTGAGCTTTGCCTGTAATGGG-----CACTGATG-----GAGTCTATGCTAGGTGGTCCATGGGAAGCAGAGCACAGAAGTGAATGGACCATCTCACCT---CTCCAAAGCCAAAAA--GTTGCGTCTGGTCATGCTGTAATTTGTTCCACTTTCTATTTTCTTTTGTTTTTGTTTCAGTGG----------------------------TAGCAATGGCTAGATTTTAAGCAGTTTTTTCAGAGCTTTTTA-GAGCTCAAAGCCCAGGTGTGAAAATTCCACTTGGTAAATATTCATAATACTGGAAGGAGCCTGTGCCCAAGATTTTGAACGTTATCATGGATTTTAAACTACAACAGTTCCCTAAAGAGTCCTACAGATCCCCCCCAAAGATAATGGCCTAATTTGTTCTTTGGAGTAAATACCCAATTTCTTTGCTGTGGATTGTCAAACAGAGGCAACCTGTTGGCAAGCCTGGTAGGGAAACCAGCTGTAAAATGTAG------CTCCCCCTCCCAGGGA-----------GATGGTGTTCCAGGG--GAGCCCGTGATCCGGCTGCGGC-AGCATGACTCTGCTTGTCTTGGGTGTGGATGTGAAGACCACAGCCTA-GCCTGCTGACAGCC-----------------------CCAAGCCCCACCAGAGCAAGATCAGCTTAGG----------GGTG----CTCTGTGCTAGAACCCACAGCACTTCTTCTGT---GCATGTTCTGGTCTCTGCTGCTC----------CTCACAAA-------------------------------------------CCCCTGTCACCAG-----------------CCAGGAAGTCCCCTGTGAGCTCCGATATGCGGACCATGCTCTCTGCC--AATGGGTACCATGTCTTTCAAAGTGGAAACTCTTAAACCTTTCAGTTCTAGATCA-CTCCACTTTCTCTGGGCACAGGATTTATTATTTGAGTTATTCAGTGGATTTTTTTTTATCTCAGTAGACTGAGATATGAG-ATATGTCAACAAAATTACAATTATGTTTCTCTATAGATAGCCACTGAGATTCTCCCTTTTATTTTTAACTTG-GCGAGGATTCCAGCCTGCATCACTTACAGATAGACTATATTGATGGAGAGCCAACCTCAGTACTTAAGAGTAGCAAAATGAAAATTTA s bosTau2.chr1 24927299 1299 - 102834029 GAGACCTCCCCGGTCTTGTTTGAAGGCT--ATACAG-CCTGGTCCCCACACAGTGTAGCTTGGATAGAGGCCAGGGTAGATGAACCACACATCTCTCTCTTAATGTAGCAGCCCATTTA------TATTTCCTGACATCTACAGTCAGACCCAAGGTTGAAACCAGCAGGTGCTTTGCACCTGATCAGTGCTTCATTGGTGCCCCAGAATCCATGCTGAGTGACTATT------CTGGGCATGGGGCTAGTCAGAGCATACCACCTTGTCTCCAAAACAAGAGAAGGTTGGTGCTGG-----------------CAGGTTCCTATGTTTCTTTGGGT--GTTCCAGTGGAGAAGGAAGAGGAAGTGGGGAGGGAGAAGAGATATTGCTAGATCTTAAAAACTGTTCCCAAAGCTTTGTGTGAGACTAAAACCCAAGAGTGAAAATTCCAAGTGGCGAATCTCCCTAACA---------GACCAATCTTAAGATCTTGGATGTGCTAATGGATTTAAAACTCTGGCTGTTCCCTAAAGATTTCTACACAGTCTGCC-AAACTTAACTGGCTGACTTGTAGTTCAGACAAAGCACC-AATTTCTTTGCTGTGGAATTCCTAGCAGAGGCAACCTATTCACAGTCCTTCCCTGGAGGCCC-CTGTAAAATGCAGATCGGCCCCTCCCTCTCCAGAAATCACTCTGCGGATGGGGGAGCAGGGAGGAGCAGGTGATCCATGTGTGGCCAGGATGGATCT---TTTCTGGAGCAGCCATGTGAAGTTTACAGCCAAAGCGCACTGACAGTCGTCTGTTATTATAATCAGGCAATCCAGAGGCCACCAGGGCAAAATCAGAGTGGGAAGCCCATGTGGTGGAGTATCTGTGCTAGAAGTTCAGCCACTCTGTTTGGAAGGCATG--CTTGTCTCAGCCACTCTACTGAAGAGCTAACAAATACACACCAGGTGGGCATGTGACCAAAGGTGAGACAGGTTAGCCACGTGGCACCTGGTTTGCAGAGCCAAAACCTAAGGAGATCCCAGTGAGATTTGAGATGCGGGAGGCACTGGCTGACTTGGCATGTGCTATGTCTTTGGAGATGGAAATACTTAAACAATTCCATTAAAGATCAGCTCAATTTTCCAAGGGGGCAGAATTTATTATTTGAATTATTCAAGGGAATTTTATTCATCT----ACACCAAGATATTAATAAATGTCAACTAAATTATAATTATGTTTCGCTAAAGATATCTGCTGAGATGCCTCCTCTT-TTTTTAACTTGCAAGGAGAAGTCAAACTG------------------TGTGTTTATAGACAGCCGGCCTTAATA-TTCTGAGTGGCAGGATGAAAAATTA a score=8914 s mm7.chrY_random 25694264 373 + 30114534 ATCCTAAAATGT---------CTTTCTCTCAACACTGATCCTGATTGGAGGCAAAGGCAGCTTTGAGTTTGTGCAGTTGCTACTGCTCAGTATAAGAACACCCAGGGGAAAAAGAGATCCTTTCCCCCAATCTCAAGTTTAAAACATATGCTTCCTGACCAGGTAAAAGATGGAATTTGCTTGGTATATTTAAGCTTACGAGCTACAGCAGGCATACAGGCCCCCTGCAGCTCTGAATCTGTGCCTCAGGGCCCTGACAGATGTCACCTGGCTCTGGATATTCATGAAGAGACATCCTG--GGGGCAGTCAGTGGC-TCTGCTAGAAGCAAAGTCT--GAAAGAGGAAGAAAGTGTGACCCACCAAGGACAGGC-ATTTGTCTTAGGG s bosTau2.chr1 24932057 375 - 102834029 ATCCTAAAGTGATGGGGTTCACTCACTTTCAAGACAATTCCTTTCTGGAACCA--TGCAA-TCTGTCTTTGTGCAGTCAATTGTGATCAGGGAAAGAAC-CCTAGAGGAGGAATAG-TCTCTTTCCTGACTGTCAAGTTGAAAACACATGCTTCCTGGCCTGTTAAAATATTAAACTTTCTCTGTACACAGTCGCTTACAACCCGCAACAGGCAGACCATGCCTCCAAGGCTCC-AATCTGAGCCCCAAGGCCCTGACAGATGTTAGCT-GTTGGGGAAATTCAGGATGAGAATACCTGTAGATGAATTCCATGGCATGTCCTGGAAACAAAAACCAGGGAGGAGGGGGAAAGCTGGGCTT------GAGAGGCTTTTTGTTTTGGGG a score=4680 s mm7.chrY_random 25695695 138 + 30114534 GCTCTGACCTTTGACTCCTACCC-AACTCCACTAACCCTTCCTTCATGGGGTTCTGAAGACTTTATAGGCAAGCCCCAAGGTGGGTGAGGGAAAAGTCTTTTAATTAATGGAGTGACTAATTGCACTGGGCTCTTTAAT s bosTau2.chr1 24933540 136 - 102834029 GCCCTAACCTCTGACTCTCACATGAACTCAGCCAACCCTACCTCTGTGGGGCTTTGCAGAATTTGCCAATCAGCCCCAGGCTGGGCAAGAGAAG---CTTTGTCCTGGTTGAGGGACTAATTGAAATGCACCTTTTCAT a score=13040 s mm7.chrY_random 25696134 384 + 30114534 GGTGTCAGGGTACCCAGCACACCACCAGTGTCTAAGAAAGGACTAGTGTGTTTTTCGGTCCCTGTGGAGTAACTGAAATCCTGCATATTGAGCAATTCTTTATTTATGTGCTCCAAATACAAGTTGCAAGGGCAGT-TTTCAGGATTGTTTTGGCAATTTGCCCAAATGTTGCTCAAACAAATTTCAAACACGGATAGTCTCTTGGACACAGGCCATCCACTATAT---CCCTGTCCCTGAGCTCCTGTGGTCCTGAGTCA------GCTTTCTGACAGAAGGCCCAGTGGATACTATCTGACCTGTCACAGTCCAGCTCCACAGGAAGCACACTGG-----------------CAGAAGTGCAGGTGAGCCCCTGGGAGCATCTTAAGTGGATTGGC-AACAAGAGAGGCA s bosTau2.chr1 24933794 401 - 102834029 GGTGCCAGGGCAC--GTCTTATCATTGCTGCATAATAAAGG-------TGTTCCTCTCTCCCCATGGATAAATTTAAATCCTGGGTGCT-AGCAATTCTTGATTTATACTCTCTGAGCACAAATTATGAGGACGGCATTTGGGGATAGTTTTGAGGATTTGCCCAAATGTTCCTCAACCAAATTGCAAATGGGAGAAGTCGCTTTGACACAGGCCACCTTTTATGTTTCCCGCTCCCCTGGGCTCCACT-GCCCTGAGTCAGCAATTGCTTTTTGACAGAAGACCCAGCAGGTGCTTTCTGAGCTGTCATAAACACCTGCTGCTGAAAAACCACTGAACTTTTCCCTGCCAATTCGGAAGTGCAGGCGACCTCCTGGGGAGATCTCAAATTGATTTGCAAATAAGAGTGGCA a score=7024 s mm7.chrY_random 25696597 516 + 30114534 TTTGAATTTGTCTTTCTAAGGGCTCTATGGACTTTACAGAGGTGTTTT-AAGTTAGTGTCTGAGCTCAGGGCTTCCATCCTGTGTCAGCTGTCTGCACCTGGACCTGATGCCCAGGCATAGAGCAAGCCTAGGAGA-------------------------CAAAGTCCTTGGCTGGCTTCCACCCTTCAGCCCTACATCAGCAGCAGTATTTGTCCTGGGATCCAGGCTTCAAGCTGCCCCCTCACAGTACAAACTTCATGCAAGTATCCGAGCACACGTCTTCTTTCTGCCAAGGTCTAAGGACCTAAATGTCCATTCTC---TTCAAGGATCTTTGAGACTCCTACAGACAAGGTAGGGGGCACAGCCTTCAGCAGTTGTCAGTTTCAATTCTCATCTCTAGTTTCTTTGTGTTTGATGTCTGAAGAGCTCTCTTCCCAGATAGCTTAGTCTTGTTTATTTTACTACTAGCATTATATTTTACCCAGCATCTCAGTGTATTTTAGATGAGGAAAGAATCCATGGTTTGATCTTCTTTCAGGT s bosTau2.chr1 24934978 438 - 102834029 tttgaatatgtctttcctaaaggcctaaagacttcaaagatgcatttttaaagtagagtctaagctctgaatttccacatcaagtgggctgtttacacttgaagcgaatgtgcatgctcaggaatggcttggaggggtaacatctcagaagagaTGCTTACCAGAGTGATTGGCTGGCTTCC-----CCAGCCA---ATCAATGTTGGCAGTTGTCCCAAGACCCAGACTTCAGACAGTCCC----------AGACTTTATGCAGACatgccaactcgagttttcttt-------gcacagaagacctgagt---cattcctgattcctGTGGGCTTTGAAACCACAGCTGATA--------GGCTGAGCCTT-------------------------TCTCT--CTTATTTTTGTTTTATAT--------------------------------------TGTTGCTGTTGTTGTTATAGTTTATGCAGCATCTCAATGTGTTTGGAAAAGGGAAGGAGT------TTCCATATCTGTTCAGGT a score=7061 s mm7.chrY_random 25698499 250 + 30114534 AGGGAG--TTGAGTAGCCTAAGCAAGAATATGGAAAGCTGCTTATAGATGGAA-AGCATGTTCCAAGATTGATTGTTGGTATGACTGCCATCCACTCCCC---TACCCAGAGA-------CCCCTGTTGCCTACAG----------AATAAAGGCAACACGGGTCCTCAGTCCTCCAGTTCCAAAGGATGCTTGCAGACTCAGCTCACGCTCCTCACCTCTCTCAAACATTCTCTTACCACAATCTGCATCTGTGTGTGCTGCCTTCATCTCC s bosTau2.chr1 24936663 255 - 102834029 AGGGAGGATTAAATGGTACAAGGAAGAG---GAAAAGCTGCTTTGACACTGAGTAGCATGTTCCAAGATTGATTGTTGCTATGACTACCATC--TTCCTCAGGTCCTCAAAGATTGGTACCTCGTACTGCCTATAGAAAGAAAAAAAAAAAAAGCTATCCAAGTCCTAGGACCT-CAGTTCCAAGCTGTCCTTGTAGCCTCATCTGCCACTCCTCACCTTTCCCAAAC------------CAATGTGACTGTGTCTGTGCTCCTTCCCTCCTC a score=9716 s mm7.chrY_random 25699249 601 + 30114534 TGTTAGAAGCCTTTT-ATCGATACCTCAGTCGGACTGGAAGCACTA----GCTAGGT--TTTCGGGTTGTTTTTTACAAAGTAGGCTATGCTTTTTGCAAGTCTCTATAGAAATGACTGAAAGAATTAGACTCCATATGCTGCCAAACTGGTGCCTCC-------------AACAGTGGGAGGGGAAAAAAGAGACTGATTAAAGGAATAAGAGGTTTCTGCGTCATTTGCTTGAAATTTATTCATACCTTCTATGCCCAATGAAATCTTAACATTGCTATGGTATTCACCCGGAATTCTACTTTCTCCCAGCTGGAAAGATCTCTCCATTCTCTGGAACCTTGAAGTGCTCCTCACCTGAGTTACAACACTTGATTCAATCCATATTATATTGGAATATTTT-CATAGGTGGGCCCTTAGCTCCCTCTCCCCCCTCTCTCTCCCTCCCTGTTAGGTTGAAAACCCTGAAGGCAAAGAATCTATTCCATAAGGCTCTTTCACCTCA-ATAGAC------ATAGTAATTGATACAGAAGTTGGCAAATCAGTGTGTCACATACTGAATAGCTGCATTAAAAAATACCTGATTTAATGGAGAAACTAAGCCAGAGCTTCCAACTTGGCCCT s bosTau2.chr1 24936995 576 - 102834029 TGTTGCAAGCCtttttgtcaattctatgtctgaactggaagctccatgagggcaggtgctttc----tttCCTTCACAAAGCAGGATATGCATTTAGTAAATGTCCACAGGACTGAATGAATGAGTGAATCTCCATTCATCCCAAACCTATTATCTTTTTTTTTTTTTTTTGGCAATAGGATTGA-----------TGAATGAAGGATTAAAAGATTGTTGCTCCATTTGCCTGAATGTTTTCCTTACCATCTATTGTTAATGGAGCCTTAGTAGTTCTAG-----TCACCCTACTTGCCACTTT-TCCCAGCCAGAAG--------------TTTGGATCTCACAGTGCATTGTGTCTTGTCTGTAAGACTAATCTCAGTTCCCATTTCATTCGAGTCTCTTGTGTATTTGATACCTAACCACCACCACCCCTGCCCC--------------AAATTGAAAATCTAGA--GTAAAGCACATACCTGACAAG--TTCTGCATTCCACACAGCCTCTAGTACACTCCCTCACACATTGGTTTGTAGGTAAATGCATCACACATTGAATAACTATGTTCAAAAATACCTGATTTCCTGAGAAAACCAACTCGGAACTTCCCATGTGGCCTT a score=5511 s mm7.chrY_random 25701556 221 + 30114534 CCCTGGACCCAGCCAGCAGCTTCCTGATACCTCTTGGACGATCCTCAGGATGTAAACCATTTTCCAGGTAGCTTTTGATGCCTGAGTATCTTAGACTCCAGCTCTGAACAAAGGTGCACTGAGATCCCTTGGGTGGA------CTTCATGTAAATACTCCCTTGGTTCCCCACTCTTCCAGCATCCCTAGACTCTGTCTTTAAGTTCTCCTGTGTACAGCCCCTATA s bosTau2.chr1 24937968 217 - 102834029 CCCTGGACT-AGTCAGAGGTTTCCTGATGCCTCAGAGAATATCCTGGGGATGGGG---GTATTCTGACTAGCCATCCTTGACTT-GCATCCTGGACTGCAAGTCC-----AGGATACATTGGGCCTCCTTGGATTGGAAGCTTCCTCATTCGGAACTCTCCCTAGTTTCTCATTCTTCTGTTGCCCCCAGGCCCTGTCTCCAGGTTTTCCTTTGTACCACACCTATA a score=22667 s mm7.chrY_random 25701823 568 + 30114534 CAGGGTCTGATCCAAGACATCAATAAAGTGCGGAGTGTAAACCGAGTTGAGGACTCT----------------CACTGAATT----------------CAACAAGACATTGGAGTGAACTGCCTGAACCCTTCCTGTTTGCCTACTGA-AGACCCTAAAATAGTCTTCAGGCTTTATCAGACTAACAGGCATCAAAGGGAGTAATTTTCTGAGGCATGAGATGGGACAATATAAAAAAGAACATTAAGGGGAAATT-TCTTATTCCAAAATGAAAGGGAAAAGATCATTTAGCAACCCTGTTGGTGTTATCTATTCATGGGAAACAGCACATTTAATCCAGTGCAGGATGGAGGGGGGGGCTTTGAAGCCCTCACCTTGGGGTCACCTTCATGGAGAACTCATCAGCCTCCCCTGCCATCTGCAGCAGGGGTGGTGGAGAGCGGATGATACAGATGACACACACTTCAGAGGATCCCATGTGATGCAGAGGGAACGGAGGACA-CTAAACACAAAGGAGA-----AAGCCCGGGGCCTGCACAGAGAGAGGGGAGCACTGTTCACTAGTCCCGCTGCCTTTTCTGGTTCCTGCCTCCCTGCCCATGGT s bosTau2.chr1 24938523 585 - 102834029 CAGTGTCTGATCACAGGCATCAAGTAGGAGGGGAGTATAAATCGGGTTAGGACCTCTAGTGGGATATACGCAGTACTGAACTGTATACTTATGAAGCGTAACAGGATTTTGGAAGTGTCTGCCTGGAACCCTCCTGCTTACCTTTCAAGAGTCCCTAAAATATTCATCAGCCTTTATCAGGTTAATGGACTTCAAAAG-AGTAATTTTCTGAGACATGAGACAAGACAGTATAAAAA-GAACATTAAGGGGAAAAAATCTTACTCTAAAATGAAAGGGAAAAGATCATTTAGCATCCCTGTTGGTGTTATCTATTCATGAGAAACAGCACATTTAATCCAGAGTGGGGTGTAGGGAGGA-CTTCGATGCCCTCACTTGGGGGTCACCTTCCTGCAGAACTCATCTGTCTCTGCTGCCACAGATGACAGGGGCGATGAAGACAAGAGGATGCAGA---------------AGGATC-----TGAGGGGGAGGGAGTGGGGAAGAGATGGAGTCTAATGTGACTTCTAAGGCACTTGCTTGGATTGGAGGAAGGGGGTGCCATTCCCCAGCCTTGCCACCTTTTATTCTTCCTAGCTCCTTTCCCAAGAC a score=7283 s mm7.chrY_random 25702878 500 + 30114534 TCACATCACCCATCTCCCCTGAGATTCTACCAGTCCATTAATGCT-------GGTCCCCAATCCTGGAAAAAGACAGGACTCCTGAGCATGGCTGGTTGTGAAAGGACATATCT-TAAGAGTAGCCAGTTCCCAGTGCAGGCCAGAAGGTTCCATCTGTGGCCCGTCTCTGCCTCCCTAGATACACCAAGATAGAGGAGGGTGGAGTTCTCCTAGGAAATCTGTCTCTCTTGGAGTTAACCTTCCTAGAATTGAAAGGGCTACG---CTACATTGGCTTCTCAGATGC---TTAACATAGAAACATCGGTATTTGAGGCTCT-GATTCCTTGGGGGTTCCTGTTTCTTC---CTTTTTCCTCATCTGCCTCTCTAACTCTGAATTCGAACTGCTCTGCTGCTTTCTTCTTTCACTGTCCTTTCTCCT----CTTCTC-------ATCT--ATCTTTACTTTCATTGTGGCACTATTCTTTGTACAGCTCCATGTAACCCAAGACTTAGAAAAAAATGTTTTAAATTACACT s bosTau2.chr1 24939477 519 - 102834029 TGACTTTATCCTGGCTCCAAATGTCTCTACCCACCCATTAAGGTTAGGTTTTGGTTCCCAGGTCT----AAGACCAAAAGTCTTAGGTACTAA-AATTATGAGCAGACATGAATGTGAGTGTGCTCTGTACCAAGTTCAG-CCAGGAGGACTCAT-TGTCATCCTTCTTTGGCTTCCCAGGGACTCTAAGGAAGGATGAAGCTGAATCTTCTTGGGAAGACT--CTGTCTCAGAATTTATTTTGCTTCAGTTGAAGGGAGCATGAGACTACAACAGCTCCTTGGGCAAGCATTAATATAGAGACAAAGGAATTGAAGGTTTTCTGTTCTTATGAAACTCCTTCTTCCTTTGTCTGTTGCTTTGTCCTTGCTCATAACTCCTAATtt--cttcctcttctattttgttctttctttttcccttcctctgcaccttctctatcttcatcttcatttctacttcCAGTCTAGCATCTTGCTTTTTGTAGCACCATCCATCCTCAAGCTTCGAAAAACAT-TTTTGggcttccct a score=1092 s mm7.chrY_random 25703519 25 + 30114534 GTAGTCCACCCTA-----CTTGCCTGAAGG s bosTau2.chr1 24940084 30 - 102834029 gtaacccactccagtattcttgcctggaga a score=27346 s mm7.chrY_random 25703740 1342 + 30114534 ttttatagaagaaacttaag----------catctg-----cagatttta--aactcagattggttcctggagccagtcctgtaaacactgacggacagctgGATTCAGCCGATGATTAGACCTATAGATTCTTCTCATTGTGTCTGAT------------AACCTCGATGTGTAATATAGTCAAAACTATGTTCTTTGAGT-CTTTGAGCTAATAATTGTTGGCCCCAAAACATCTTTCTCTCCTTTCAGAATGAGATTTTAAAGGGCTGTTTAGTGATGCATTGTAGATTTAATTTTAAGTGTTGCTTCTCTCTGTGTGTTCTTTTTCCCCCATTAGATTTGTGACAAAGAGTGGCATTACTATGTCATCAATGTGGAGTTCCCTGTGGTTACCCTGTACATGGATGGAGCAACATATGAACCATACCTGGTGACTAATGACTGGCCCATTCATCCATCTCACATAGCCATGCAACTTACTGTCGGCGCCTGTTGGCAAGGTAACCCTGA-GTAGAGCCCTCTTT-----CAACTCTGTGTGCTATCCATGGGAGAGATTGATATAGAAAAAAAAAGGAAGAATGGGTAACATAAAAGCTAGCCAGAAAAAAAAAGTTGCTAGCCCTTCATTAATAAAACTGTACTTAAAATA-TAAGCATTGATCAAGACACCAGCCCTA---AGTAATGGAGCACCGAGCTTGAGAATGGGTTTTTCTTTTACATCAACCTAGACAAATTCG----------TGTGTTACCAAGGCCATGTATTATTTTGGAATCTTAACTCATTCCAATCTGTAGCTGCATGTAGGAAGGGTGGAACACACAATCT------------------TTGACTGAAATTGTCTCAAGGTTGCTTAGAAACCAAGGATCTC-----ATTATCACTCAAA-TGTCTAAGCCCCTGGCATCCACATGACCAGAGCTATGCGAAGCAAATTGTCTACAGGCCATGGGGTCATCGCGGCCACTCTCGGGGTATGCTCAGCACTCAGTCCTGAGCCTTGCTTCAGCCCTGTCCCTCACCTCTTAAGACAGAGGCCCTTGGTTGACATCACCCATAATGAAGTCTGTTTCTTCCACTCTCCCTTAATCACGCCTCTCTTCTAACCCCCAAATTCAACCCCATTTCCATTTTGGAAATGGGCAAAGGGGTTTTC----AGTGCACACAGCCT---TGTATCTCACTCAGCTCAGATGGATTCTGTTTCTT--CTTCCCTAAGTACTGAGGGTTCTTTAAAGC-CCAGTGAGTGTGACTAGCAGATAAGGAGGATGCT-CTCAAGTAGGCATAACAG-ACTCTGAGGTAAGACC-CAGCCTTGTACTGATGGATCCTATGAAGGCTTGAAAGATTTGTAACTTCAGCCGTTCACCACAGGACAGTGAGAAGAGAGG s bosTau2.chr1 24940209 1235 - 102834029 TCACACAGAGCAAATTTAAGTTGACACCCCCACCTGTCCACCAGAACTTGCCAACCAAGAT-AATCTCCATAGTCAGATATTTACCCAATGATAAGTTTCC-----CAGGTGTTCCTCAATTCCATGGTTTGCTC-CATCATATCTGATGTGCGTTTCTATAACCTCAGTGCATATCA--GCCA---TTATGTTCACTGAGTTCTTTGCAATAAACATTGTTAACCTAAAGGTCTCTTCTCCCTCTTTCATAATTGGAAT--AAAAGTCCATTGGATGTTTTATTGCATATTCAATTTTAAGTGTTGCTTCTCT-------TTCTTTT-----CACTAGATTTGTGACAAAGAATGGCATTACTATGTCATCAATGTGGAGTTTCCTGTGGTCACCTTATACATGGATGGAGCAACGTATGAACCATACCTGGTGACTAACGATTGGCCCATTCATCCATCTCACATTGCCATGCAACTGACAGTCGGCGCTTGTTGGCAAGGTAACCCTTAGGTCCAGCCCTTCTCCCTGGCCTATCTGTGTACAGTCCATCAAAGGTACAGGCAGAG----AAAAGGGCAAAGCAAGTGGTATGAGCTTCAGCCAGGAAAATATAGT-----ATCCCCTACTAATAAAACAGGACTTAAAAAGTTAAGGATGAATCCAAGCACTAACCTTGTGTAATAATAAAGCACTTGGCTTGAGACCAGATTTTGACTTTAGATCAACAGGAGCAATTTCAGAATTGCCTCTGAGTTGCTAATGCATTTTATTATTCTGGAACCTTATCTGGTTTCAAACTGGGGCTGTGTAAAGAAAAGCCTGCAAGTGGAATCTGGTATAAAAAATTGCCAGTTGGCTCTGTTGCTCTCTCCACTGGTCAGGAGCCAAGGATCTCTCTTTATTCCCACTCAAATTGTCTAAGATCC--------------------------------------------------------------------------------CGACTCTCTGTTCTGG----------------------------------------------------------------GAAGTC-ACTTCCTCTGCTGC----------TGCTTCTCCTCCAGTCCCC-AGCCCAGACTCATCACCTCTTTGGAAGTAGGAGAGCCAGCTCTCTGAGCGTGCATCTAGCCTTTCTGTTCCCCACTCAGATTTGTGAGCATCTTTGTCTTTGCTCCCTTTAACAGCTGGGGTTCTTTGAAGTATCAGTGA--GAGACCAGAGGGGAAGTAAAATGCTCCTCAAATAAGCAGATCAGTACTTGGAGATGACTCCTCAAACTCCTGATGATGCCTTCTTTGAGGGTTACTAAGATTTGAGACCTTGACCATTTGCTGTGGGGGCG-GAGGAAAAAGG a score=5237 s mm7.chrY_random 25705602 320 + 30114534 TGTTCCTGTGCCAAGACTGCCCACATCATGTATGACATGTTTCACCCAAGGGTTTAAGCCCTGTTAA-CATTTTACAGGACTTGGGCACAAGAGTCTTTTCAGAATCATAGGTTCCCCCAGGCTACCAGGA---GAAGACTGTGCCATATGACAGGGAACCATGAAACCAAAAAAGAGAGAGAAAGGCAC----TTTGAGGTT-----GAAAACATTAACCACTGGACATAGCTGTGGTGAAGTGGGAACC--ATGGTGTGACTCAGTGCCCCAGCCAGATTCCAACAG---------AGGTATTCTGAG-CACACCCTGGGGAAACCCTATAAGAAAAGACATT s bosTau2.chr1 24942463 336 - 102834029 TATTTTTGAGTAGAAGTCACCTACTTGAAGTCTGATGTACATCACATGACAGTAAAAATCTTCTCAAATGTTTCATAGAATGTG---ATAAGAGCTCCCTCAGTATTGCAGAATTCCCCAGGATATGAGGAGAGGAAGACTGTGTCATTTGACGCGAGCCCATGCAACTAGTTA--GTATAGCAAGGCACTAATTCAGAGGTTGCCCAGGAATCATTAGTCACTGAACACA---GTGTTAGACCAACAGCCCTCTCATGTGGTTGCATGCCCCAGCTAGACGCC-ACAGCCAGGCCGCAGATATTTTGGGACATAGATTGGATGCTGCCCATAAGAAAGAGCGCT a score=8312 s mm7.chrY_random 25707822 626 + 30114534 GTGTGCGTGGCATGTTTTGTGTGAATGGATGTGTCACCTT-AACATATTTTCCAGT--CTTCCTCCATTTTCCTTTTCTTTTCTTTCATCTAAATCTGACACAATAGGAAATCTACCAGAGACAGGCCTACTCTAACA-CTGTGGCCCCAAGTCTCCTACGGGTCTCTCCATTCCCTTACTTCCCTCACCTCCCCTAGGACCAGCCCTTATACACAGACTCTGCCTTCCCAAGGCCCATGTATAAGTCAAAAAGAAGAACAG-----CTGAAGAACAGTTTATCAGGAGA--ATTTGTGGAAGACAGGG--------ATAGAAAAGCATTCATGAAGTTTGGG----GGAACATGGAGAATACTTGAGTACTTTCCCTATGAGAAATGGCAACGCAATAGTACATTTCCCCCA---------AATCTCC----ATCTTTAGAA--TACC------GAATGAGTTAGACCACACAAAGAAGGGATGAGAGTAGGA---------------------------GGCGTGAGGATGCTCAGCTCTCCCCTAGCACTGTAGTGTACATGGCCCAGGAAGGATGGAGGAGAGGATGAAGAAAGAAGTTGAAATTAAGTCTCAGGACACTCTACTGGCGTGTTAAGGAATTTGGATTTCTATGAATTCCTACATTCTTCTGGGAGCCACGTTTCTGTGT--------------------------------------------------------------------------------GCAT s bosTau2.chr1 24943500 764 - 102834029 GTGTGCTTGGCATGTTTCAGTTGAATGAATGTGTAAATTTGAAAACATCTTCTGGTTGCCTCCTCTACCTCCTCCACTGCTCCTTGCACCTAAACCCTATATGGTAGATTTTCCACAAGACCTTGGTACACTTTGGCTTCTGTGATTCCAGCTTCCCCACAGCTCCCTGAACGTACTGACCTTC-TCCCCTTCCCCAGGACTAATCCTCACAGACAGGCCCTGGCCAGCCA-GGTCCATCTCTAGGTCAGAAAGAAGGTCACTGAGCCTGGGAAAGAGTCAGTCAGAAGACAAGCACGGGAAGATGGGGCTGATGTTGTAGGAGAGAACTCATCA--TCCAGGCTTCTGAGCGCGGAGAAGATTTAGGTATCTTTTCTGAAAGGAAAGATAAT-CTTTGGTGAATTTTCAGCATGGAAGAAAAATACCTTAAAGTCTTTAAAACTTAGCTTTTGGGGATGAGTATGAGTTCACTAGGC--TGATAAAGGTAGCAACAGCATATGCCATGGCAGAGCAGCTTGATGTTGGCGTGCCCAGGGTGCC--TATCACTGGAATGTGCATGGATCAGAATGAGTGGAAAGGAGGAAGAGATAG--AGTTGAGAGCAGACCATAGGGTGC-ATCTTGCCTTGTTA-GGAGCTTGGATTCTCATGAATATTTACATGCTCCCTGGAGCCATGTTTTTGTCTTGGGTGGTGGTttagtcgttaagtcgtgtccaactattgtgaccccatggactctagcctgccaggctcctctgtccatagcat a score=18523 s mm7.chrY_random 25708448 500 + 30114534 AGGACATATCAAAAGCTCTTCCAATGAGATGCAGTGCTGTGAAATTAATGGCCTGTGGAGCAGGCCTCATCTT--CATAGTTCTCATCCT-CGGCTGTCTGCTTACCTACATAGCACAAAGC-----TCTGCATAGGCCCCTCTAATTGCCTTGGGCTTGCAAACCTGGGGAGCTTTTCTGGTGCTTCTGAGGTTGGCTAGGGGACTTGTTCTCATTTGTGAAATTTCTGGTT-GGGCTTGGACAAAGTGAATAGAAAAGGACTGGATTGACTCTGCGTGTCGGTTTCTCCTGGGAGCT-----------------GGCAACAGCGCCATTGCTGGTCTGTGTTCTGCAGACCCAATTAGCCTCCAGTGTCCTGTTAGTGAATTTGAAAGCCAT-GCAATCAGTGGGACTTCATTTTCGCTGGGATTTTTAAAAGTAATTAAAAAAA-TGAGACTTCATTTACACTCAAGAAACATTGCCAGTGAGGCCTAGTCCATGCAGCATCGCATAATTGCAAGGAAAGCCTTT s bosTau2.chr1 24944405 518 - 102834029 AGGAGACATCAAAAGGTCTTTCAATAGGACACAGTGCTGTGAAATTGATAGTCAGTAATACAGCCCTTGCCTCGGCATGTTTCTAAGCCTTCCAAACTCCACTTATACACACATTATAAGCCCGCTGTGTGAACAGGCCCCT---------TTGGGACTGTAATTGTGGGGAGTTTTTCTGGTACTTTTGAGGTTGGCAAGGGAACCAGTTCCCATTTGTGAAATTTCCATTCAGGGGGTTAACAATGGGGATAGAAAATAATGTGCTAGCAGCTGCTTGCTGGGTGCTCCTGGGAACTCAGAGCTGGAACTCAGAGGCTCCAGCTCAGAGGCTGGGCAGGACTCTGCTGCCCCAATTAGTCTACTGTGTCCTGTGATTGAATTGGAAAGCCAGAGTAATCAGTGGAACTTCATTTTCATGGGTATTTTTCCA-GTAATTAAAAAAAATGAGATTTCATTTACACTTAGTAAATATTGCCAGGATGGCCTCAAGCAGGCAGCATATCTTAATTCTAGGGAAGGGCTTT a score=20086 s mm7.chrY_random 25709241 1189 + 30114534 GGTAGATCACTTAAAGACCAAGTCAAC---TCCTTTTCCTTAG-GTTTTTACTCG--------TAAGGATAAAACTTAGAGTCAATTGAGGTCAAGTACACAGACTATG----AAAAATCAGATAGCCACAC-----CCTGGACATCTA--CTACTACTGATTAACCAGGTCCTGTAGGCTGCTTGTACAGGGAGGTAAGTCA-GATGGCTACCAATTCATAACAGTGTCTTAAAGAGTCTTGAGGTTTCTAGAAGATTCTACAGGGTGCGGCAGGCCAGGTCATCTATCC---------TGTGCTAGACTGTCTCTGACTTCCCTTTTGTGAGTTAGGCATCTGGGGTGGCAGGTGATCTTTTTTTTATCAGGTGGCT--GCATGTGTGAAG------AGCTATAGAGGCAAACTCAAGCATGTCTCACCCTGTTCCACATCTGATTCCCATTCTCT-TTGATGTGTTTCAGCATAGGGGTCCCCACCTGTGGCTCTCTTCTTTGTAACCACTAACCACTAACCCCATCTCTGC-----CAAGATGTTCTCTTCCAGTGCAGGAAATCCTGGCCTTTCTAGAATATGCAGCCCGATCCCCCATCCCTAAGAATG----CTATTGATCTGAGATAGGAAGCCGACTCCTACTCCATCCTGAACCCTGTCCTTGCTGAGTCCTATCCTTCACTT----AACAAAACAATGGGAAACAAAGAAGAA--TGTTTTCTAAAAATACAGGCTGAATGGGGACAGATACAAGACCCTCAT------TGGCACTTTGAAGTG---AAGACAAAGAA-AAGAATGGCCTCCAAGGG--ATCAAAAGGCAGACATA--GCCCAAGG--GCTGTAAGCAATGGCTTATGAGCCTCAAAT-----GCCCCTGGAGCCCCGTGCAG-CCTGAGATTTGTTATTCATTTTCAGGTCTTCCCTCCCCCCACCCCATCCCCTTGCTAGAGTCTAGAATCAGTGCAGACAATTGGACTACATCCCTCCAGTTAATGAGCTTGGTCTAATTTAATACAAATTTCTGTTAATAAAGTCTGTGTTCAAGTTATTCGGTATCCCTCG-GGTCTCTCCAATTCTGAAAAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAAGGTACACACTAGCATAGACTGCTTTCTATCCAGGCAGCGTTCCTTCCCTAAGGAATCCGCATGGAACTTCATTCTCACAAGATGCCCCTTCTACAAGGAGGCCAAGGTAAGATTTAGGAAGCAGCACAAACCACTCTGAC s bosTau2.chr1 24945136 1148 - 102834029 GGAAGATTGTTTAAAAGACTAATTAATTTGTCCTTTTCCTTAGAGTCCCTATTCATCCATTTCTAACAACAAAAATTCAAGTTC------------TACTCA---TATGTGATAAAAATTATATAATCTCCTTTGTGTCTGGACCTCTACCCTGGGTCCAGCCACCCAGGCCCTATAACTCAGTTGT-CATGGGAGTGAGTCAGGAAGGCTACTGATGCGCCA----GCCACAGAGAT-----------------GACCCAGCAG---GTGACACTCCAGAGCACCTCTCCCCCATCACGTCAACCGGAGAAGCTCTGACTTACTAATTTTATAT--GATATCAGAGCTAGAG-------TTGTTTTAATGAAATGGCTAAACGTGTTTGAAGAAGCATAGCTGTAAACACACATTTAAGAAGGTACCACCCTGCCCCCTGCCTGAGCCTTATCTGCTCTTGGCAGAGCTCATCACTGTCGTCCCTGCTTGTGGCTCTGTCCCCAGCGACC-----------ACCTCATCTCTGCCTCTGCTGGGGACTCTCCTCCACTGCTCTGGACCTTGGCCTTCCTAGAGCGTCCAGCT---TTGCCTCTTCCTAACGATAGCACCCCCTGGTGTTGGATGAGGAG-GGCCTTCTAC-----CCTAGCTCCTGGTCTGGCTGAGTCCTACCCGCTACTTAACAAACAAAGCAGCAGGAGATAGAGAAGGGGCTAGTTCTAAAAATTAGACTCTGTTAAGGAAAAGACACAGAACCCCACTTACTTGTGGCTTTTGGGAGGGGCTGAGGCAAAGAATACGAATGGCCAAAAAAAGTAATAAAAAGGCAGAAATGATGCTGAAAGTTGCAGTAATCAATAGCATCTGTTCCTCAGACAGAGGGGAATTGGAGCCACATGTGGTCCTGAGATCTGGTGTACATTTTCAGGTCAT----------------TATTTTTGCCAGACACTAAAATTAGTACATAC--CTGGAGCGCATGTCATCACTTAATAAACTTGGTCTAATTTAATACAAA-TTCTCTTAATAAAGTCTGTGTTGAAATTATTCTGCATCCCTGGAGGTCTCTGCTGCT-------GAGAGAG-------------AGGCACGTGCTAGCATAGTCTGCCTTACATTCAAGTGGAAT---TTCCCCAGGG---CTTCATGAAGCTTGGGTCCCCCAGG-------TTCCACAAGGAGGCCAAGGTCTAGTTTGGGAAAACATATAAGCCATCCCCAC a score=27429 s mm7.chrY_random 25710600 1134 + 30114534 TATGGAGAAGTACTACCAGA----ACTAGATAACCACCGTCAAAGAAGACTCTAGAGGCTGCTAGAATCTG-GGGCAAATCAGTTCCCAG-ATGTGCCTGACATTATCTCAGAGTCCTGATGAGGTCCAGCTGAGACCTAAAGATGACTTCAGAGCCATCGGGCATCAGGCTGTCACAGGAAAAGGCGAGGCTCCAGTGAGTGGAAGGGAACTCTACACCCTTGCCACCACTGACATTTCT------------GCCACTCGAGACTCTCAATT-TCTTTGT----CTGGAGAGTGAAATCAATATTGTGGATGACACATGAGCAACCTTGTGACTCCATCAATTTAGGTCCTCGGTTTCAGGGGTCTGACTTTTGGTGTCAATAC-TAAGTCATATATTTTATTCTCTATGG----------TGTCATTTAAATGTTTACTGTGAAAGC---AAGTGAAGAGTACACTTCAGGTTTGTTTTTTTTTTTTTTCCGTTTAGAAAAAAAAGGTTTAAAAAAAGCTTGATGAGAATGTGTCATGGCCAGCTCTGATGACAGATCATTTTTCTTTGCAAGTCACCTGCAACTTATAGCTCTGTGAACCCCCTTTGGGGTTATATGCACATAGCTTGAAAGCTGCAGCTTGTGAGGGTCTATTACACACTTCACTTAGTCTTTGCATTCCATGGGTGTCTCCATCACTGAAATGAGGAAAAAGGGAGAAAGCAAGATTTCAGACAGTCTGGCCATTTGCATTGCTCAAAATTGATAGTTGACCATCCGTGAAATTGCGTTCATTGAGGGGCATCCCCATCCACAAGCCTTGCAAAGAGCAGTGTTCGATTCAAGCAAAAGAAAGCACGGCCT--TCTCTCTTCCCCATGTATTTCTTAGACTAAACAGCAGAGGGAAAGACGAAAGGATAGG-------------CAGTAGCTTCCTGAATAC-CTTTGTATAAGATGGAGACTTGGACGTGGTGCCTTCACCTTACATAGCTCGTCTATCTTCAG--------------TTTCTCTTACAGCTGTATTTACAGCGAATAGACCCCACCTCTCA--AAAGACAAAGCTGGGACAATGGGTGGTGGATATTCAGCTCTTCGTTCACATTAAATTAAATGCTCTGTTTCAGAATAGGACTGGCTGCATCAGATCATGGATCCCAAATAACACTgcccttca s bosTau2.chr1 24947269 1089 - 102834029 TAGAGATATGTAGAACCAGATGGCATTTAATAGCCA--AGCAAGGAAGGCC--AGAAGATTCTGGAATCTACAGGCAAACCATTTGCCAGGACTCCCCGGGCTTTCTTCCCCAGATCAGACAAAGTCAAGCTGAGGCC-AAAGATAATGACTGGCCCACTGGGCATCTtggtttaacaggagg-gctgaatctagagtcag---aaaagaattctaaacccttactgctactgctgctgcttacttgctctgggtctttgaagactgtgtcttgcctctgtgctcctggagaatggcggagccattctgtttgatatataagggccattccagctttgtgaatctaGGTGCCTAACGCCAGAGTACTGACTTTTGGGGTCATCCCATAAGTCATATGTTTC-----TTATGAACTTAGAACCCACCATGTAAATGTTCACTGAAAATGCTGGAAGGACAGAG-ACA------------------------------TAACAACCAAAGGATCGAGAAA-GCCTGCTGAGACTGTGTCATGGCCAGCCCTGAGGGCAGAGCATCCCTGACCACCAGTC-CTTACAACT-ACAGTTCTA--AACCC----TGGGATTGTGCACA---GGTTTTAAAGCCACAGTTTATGGGAGTCTATTACACACTTCACTTAGTCTTTGCATTCAGTGGGTATCTCCATCACTGAAATGAG---------AGAAAGCAAGATTTCCAATGGTCTCACCATTTGCATTGCTCAAAATTGATAGCTAACCATCTGTGAAATTGTGTTCATTGAGGGGCATCCCCATCAACAAGCCATGCACAGAGCAGCATCCAACCCAAGCAGGAGGGAATATGCCCCCACCCCTCCTTTCTATGTGCTTCTCAGACTAAATAGCTGTGGGAATGACAGCAAGAAAAAAAAAAAAAAAGACCAGCAGCATCCCACACATACTTTGT---AAAGGGAAGCT---ACTTTGTCCATTCACACAACACAGGTCTTTTACTCAGAGGAAAGTGAATATTACTGATTCTAAAGCTATGTGTATAGTTGGTGGG-CCCACCTCTCAGTGGAAAGAAAGCTG-----------------------------------------AATGAAAACTCTGGCTCAGAATAACACAAGCTATGTTAAATCACTTTTGCCAAAGACCATTATTTTTCA a score=4319 s mm7.chrY_random 25712059 160 + 30114534 AACTGGCTTTCCCAGAACTCTTCATCCCAGCC-CTGGGAATTGCTCCTGAAGCTAGTTAGTGTCTGCAGAAGCCAGCATAACTGTGTACTCGGTGCCAGCACCGTATCGGTCTCAAACTGC------------------------------GCCCCTCCGGTAAGTCTTCCTTGGACCTTTTCAGCCACAT s bosTau2.chr1 24948362 191 - 102834029 AACTGTGTTTCCCAGTAAACTTGACACAAATCATTGGGAGTTGGTGCTGAAATCATTCAGTGTCTACAGAACTCCGTGTAATTGGACATTCACCCTCAGCCTTGTATCAATCCCAACCTGTCCTCATCTTTCTGAAGCAGCCCAATTATGAGATCCTCCAAGAAATTCTGCTTGAACCCTCCCAGCCATAT a score=10926 s mm7.chrY_random 25713151 532 + 30114534 TTTTTTTCCTCTCTGACCTAGTAGACATGTT-------------GTTTAGAAATTGATCATATGCTGACTTAAAATTACAGATTATCTTAG--AACATCTAATTCTTATATTTTAA----ATTATCCTGGTATTTCTACTCAATATAAATTCTAAAT--ATCTCAGCCC-------ACAATGTACAATTATAT-------------AAACCTAAAACTAGGCAGGCAGGAAATGTTTTAGAAATGCTTATCCAAAATCATGGATAGGAATCCAAAGTCATATCTGGAAACAAAGATTTG----AGGTTTTTTGT----------------TGTTGTTATCTTAAAATGATTCATGACCGTGTTTAT-TCTAAATTTTGACAGAGGAGCTGTGCGATCCATGTGGACATCTTCAATATTAAGAAGAGAAACTTTTCAGTGTGTCTATTA-----TTTTTAATATCTAGTA------------CTGGGTA-AAATGTATTTCAAATTTT------CTTCATGTCTCCCATTGCTCACTAAAGCTATTTCCTAGAAACTTCTGACTCATAAACAGTGTATATCTCAGATCTTGGATTCTTAAGTTGAAAATATAGAACGTG s bosTau2.chr1 24949378 596 - 102834029 TTATTTTCCCCCCTGATCTGTTGGATGTATTTTCTATATCATGTGTTTGGAAATTAATCATGCACTGCCTTAGGA-----AATGAACTGAACTGGCAATTTACTCTTACATTTTTATTTTACTTTTCCAGTGTCTATActgtattc---ttccaactgaatgtgagctcctggaaaacacagtcctatcttatcatcagctgaatcaaacagaatgctaggcaaacagcaaacactttaaaaatg--tgtgCAGATCTAGCCTTAGGAATCTG------TGTTTG----CAAATATTTGGAGAAGGTTCTTTGTATTGGAAATCAGGTTATTTTCTTTTCTTACGATAATTCATGAGCATATGTATGTCTAAATGTTAGCAGAGAAGCCATGTGGTGTGTGCAGACACCCTAGATATTAAACAGAAAGATTTTTCAGTATATGTATCCACTCTTTTTTTAAATCCCGCATCACAACCACCTCTGAGTGCAAGTATATTTCTAGTTTTTGCTAGCCTCCTATTGCACAATGCTAATTGAATTGCTTTCCTGGAGTCGTGTCATTAATAAAGAGTG--CATCGCAGGTCTAGGATTCTTAAGTCAAAAATAGAAAACATG a score=9250 s mm7.chrY_random 25714878 633 + 30114534 CACTAGGGCATGAACATGTAAGTGTTATGGAAGAGCACTTTATCCACAAGGAATC-----GTCTAGATCAGAAAAC-AACAAATTGTCCTCCCATGGCCAGGGCTAC---------------TTCAGGCCATTCCTCAAAGCCACAGTTATTTTGGAATTCCCTGTGAACCCAGCAGTAAACAAAAGACTTGTC---TTAGATTCAAAGCAAAGAATCCTTACATGACAAGAAAACCACCCATGGGGTAAAATGGTTTAA-CACATAAAGACAGATT----GTTTCTGAAGCCGAGGATATCCCGAAGCACAGCCATG--GAGATACATCTGGGTCCTACTTGATCCCAAAGTAGCTCTTCTAGCTCTGCCCC-ACATTTTGCATTGTCCTTACCATCCC-AATCTAATGG------GGCTTATGCAGCTGTGACTTCTCTAT--------------------AAAAAGACAACAAGAGTTCATT--GAAAACCTTCTGGGAGAAAAAAAATAGAAGCTTTTATGT-GTAAGCCACCAGTCATCATCTCT---CATGATGGTAGCCTAAATTTGGGTCCATGCGTATTC-TGGAACCATAATTATAGCTTTTTGAATGCCAGGTACTGATTGGCTTCATTTTGGTAC--TTGGCCCCAGACCCATCCCTGAATCCATCACTGGAGCAACGATGGTATAATA s bosTau2.chr1 24951284 667 - 102834029 CAGTAGGGCAGGAGCATGCTGATGGCTGTGAGGGGCACCTTAACCATGAGGGCCTTGGGAGCCTAAACCCAATGACTCCCAGATTGGCTCCCCATACCCAAAGCCATGGCCTGAGAGATCATCTCAGGTCATCTCTCAAAGTCAAA---------------CCTGTGGATGGAGCACTTTGATAGAGCCTTGTCCATTCATTTCCAATGTGAAGATGTTCTGGGTAGCG-------------TGAGTCAAAACAGATTAAACCCTTAAAGATGGATGCCCAGCTCCCACAGCTGAAGACATCCTGCAGTAAAGCAGTGAGGAGGTCTACTCAGGATTCGCTC-AGCCTGCTGTA-CCCTCCTGGCTCTGCCCCTGCTCCAGGCATTGCCTTAGttgtccctggtctgcttgcaggatggctgcagccactctcagccttctatctttacagaatgatccccagggaaagagagaaagagtaggttccagaaaccttct---agagagaagatggaagcccttgtcccagaggctgccagccagcttctctgctcatctcattgggttaaacttgatctcctgattatccctagaccaacactTGTGGCTTTTTGGATGCCAAGTGCTGATTGGCTTCA-CCTGGTATGGCTAATCCCAAGTCCATGCCTGGTTCAGTCACTGGAGCAATGGAGACAAAACA a score=14168 s mm7.chrY_random 25715520 495 + 30114534 TAGACTCTATCCCTGAAGTC--AATCCATGCCCAAGGCCTCAGGGCTGCCTTAGCAAGAAGAAAAGGGTGAG-----------AGAGA-GCCAGAGTGCCCATGATGACTCTGATGGGATGCAGCGTCTCCTCCAattcaacaggcaattataaagtgtctgctgtgtgccaggcaGAGTATAGCATGCCAAGAGGACACGAG---AGGCCAAGTGTTCTTGAGAAGAATAAATGAGTCAACTTATGCACAGTGTCTGGTGCA-CCCTCAG--CCCCTAATACTTACTTGCTCAGTATTGTCTTCATTAAAATGAATAATGCATGAGTGATCCTTGCTATCCAGGAAAGAGAAGCTTAAACTAATAAATTATAGCAGCTTGCA---------AAGAGCAAGCCTGCGGGTAGCATCAAGGAGAGAGATTGCATAAGGAGTATGCAAAAGGACCAATGTGGAGAAGCTCGCTGCTCAGTGCTGCTcagtgcttcttaaccttgccttcccatctgctttacccaa s bosTau2.chr1 24952259 490 - 102834029 TAGAGTCCATCCCTGGAACTCGAGTCAACCCCCCAAACTTCAGTGCTGCCATTGCAAGAGGGCAGGAGTGAGGTGGCTGCTGGAGAGATGCCACAGTTGCTA------CTCTGCTGG-----AGCATCTCCTTCAATCCAGCCAACAATTAGGAAGTGTCCACTGTGTGCCAGACAGCATGTAGGAGGCCCAGTGACACCGGGTCAGGGGCTCGTGCTGTTGAAAGGGATAAATGAGTGCATGT-TGCAAAGTGCCTGCAACAGTCCTCCGTTCCCCTA----CTACCTGCCCATTATTGTCTTCATTACAATGAATCATGCATGACTGCTCCCTTCCAACCAGGAGACAGA--CTTA----AATAAATTCTAGAAATGTGTGAGGATGGGCAAGAGTAAGCCACCAGGTGGCACAGAGCAGAGAGATCAC-TTAGGAGTAGGCAGAA-GCCTGGCTTTAAGAAGCT----------TATAGCCcagtggttctgaaccttgacttcatgtttgattcacttaa a score=30546 s mm7.chrY_random 25717237 1224 + 30114534 cGGTCCTGCCTACCTAGAATCCTCAAGGCAGATGACAATATTTCTTGTTCTTACAGGAGGCGAAGTGGCCAAACCACGGTTTGCACAATTTTTCCATGGCAGCCTTGCCAGTCTCACAATCCGTCCTGGCAAAATGGAAAGCCAGAAGGTGATTTCTTGTTTGCAGGCCTGCAAAGAAGGGCTGGATATTAATTCCTTGGAAAGCCTTGGGCGAGGGATAAAGGTAAGGAAGGCACCAGTACTCTCTCTCACCA----CTGACTTACGAGTTGAAGGCTAACCAAGACCTAAGCATGCCAGGAAAT--AGTTATTCCCAGAGAAGCCTCACAGAATTGGTGCCTCAGTTTAGGTGTGGCCACACTTTAACAGGGAACTGGTAGTGACCATGACTTCCAGAACGGGCTTCTGATGTCAGCTCCTGAGACTTCTAGATCGGGTGCTTTGGAATAGACAATTGAAGCCA----------------TCCCATGTCTGCCTGGAGGGAGGTATGAAGCTTCATTTGTCTGTAGATTGGTTGGTTGCTTTGCTATTCATTTGCCTAAAGGCACTAAAGTGGCACGCAAGAATACATCCCAGAAACATAAAAAGTAAACAAAAACATTACGACTCCAA---------------------AATGAGGAAAGAAAGAGAAGACAGACATGAGGTAGAATTGGAAAACAGATATGACAGCCACCAGGTCTTACATTGTTAAAGTGAAA-CCAATTCCCCCTCCAAGCAATATCTGGAAGTCAGGAGAAACATGAAAAGATTTGTGATTTTTATTGCTTGTGTGAAACAAAAATATACAAGTGA-CTTGGGAAATCAGAGCTGTGTCCTTAGGAAAATATCTCCTG-GGAGGCAGGAGGAGAGGCAGCTA--TGGCCCCAGCAAGCTTCTCTGCCCCA---GGCACAGTTACCCTCTGTCCTCACGGGGCTATAAGAAGCTCTTGCTGGTCCTATACC-------CCTGAATAAAGAAAG-------CATCA--------------GTCCCATATAAGGCCCCCATGTGAGAAGGGAAGTCCCAAATCACTT-TATGGAAGTCAGGATGTCCCACCCTCTGTATCCTGAAGACCAGGACAGCTCCTCGGGTCCCCAGAATCCATAGTTGTTTCTCCCTTGGCCATTTCCCAAAG-GACAGTAACGACATCAGAGGACTGTCACCTGATGCCCATCTGTACCCAGTCTG------CCATGGCTCTGCCTTGCCATCCTACCATGGGGTTGCATTTCCTAGCCAGCAGC-------TCAC-TTTCCAGCAGA s bosTau2.chr1 24955698 1223 - 102834029 CAGTGTTGCCTGCCCAATCTCCACAGGGCAGATAATGGTGCTTCTTTATCTTTTAGGAGGAGAAGTCACCAAGCCACGATTTGCTCAATTCTTCCACGGCAGCCTGGCCAGTCTCACCATTCGCCCTGGCAAAATGGACAGTCAGAAGGTGATTTCCTGCCTGCAGGCCTGCAAGGAAGGGCTGGATATCAATTCCCTGGAAAGCCTGGGCCAAGGAATAAAGGTAAGAAAGGAGCCAGCCTAGCCCCCGGTCAGATGGTGCTTTGTGAGGGGGAGGC-ACCCAGCACCAGTGCACTCCTGGAAGCCGAGTTGTTCCTTGCCACGTGACACAGAGACGGTGCCT-GGTGAACGTGTGGCCACAGT-----GGGGAG--AATCATGACCATGAC-TACACAACAGACTTT--GTGCCATCTCCTGAAATTCCTTGAT--GAAGCCTGAGGATAAGCAGTTTGATGCACAAAAGCAGGCACATGTTCAATGTCTACCTGAAGGGAATTGTCATATTTCACTGTTTACCTGAGTGGTGGGCTGCTTTGTTGTTTATTTGCCCAAAGGAACTGAGGGATCATGCAATCATACCTTTCAGAAATACAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGAATTAAAAGTTTGGACCATGGACAATATGAATTAGCACAGAAAG-TCATCCTGGTGTGGGGTGGGATTAGAAAGCAGATGCTGAGGTCATTGGGTCCTCCATTATTAAGTTGAAGCCCAGATTGGGCTCCAGGCAATGTCTCCCA-TCAGAGAGAATACTAGCAGATTTACGATTTTTGTCATCCATACACGATATAACTA---AAGTGATCCCAGGGAATCCCAGCTACATTTTGAGAAAAGCTCCTCCTGAGGGGGCAGGATATG-----GCTGACTGTCCTCATCAAGCCCCTCAGCCCCAATGGGCAGGGATA-GCTCTGGCCTCACCTGGAT-CAGGGAGCACATGCCAGCCTCAGGCCTCAGGGTCCTGAGCAAATAGAGGGGTAAACATCATCACAGCCTGTGCTGTATCATAGCAGATCCCAGTGGAAGCAGGCAGTCCCTTGGCCTCTTCTCTAGGAGTCAGGGTGGC--------------------------------CCTCGAGCCCTAAGAAGT-----------------------TTTCCCAAGGAGGCAGTGACCAGAGCAGAGGTTTTCCA-CTGCTTCCCATCTGTCCCCACTCAGCATTGTCCATGGAGCTGCCCTGCCTTTCTGTC--------------CCTAGCCAGAGGCCAAGGAGTCACACCTCCAACAGA a score=6452 s mm7.chrY_random 25772323 289 + 30114534 TTTTTTTCATTAAACCTTGAACAGAATTTTTCTCTGATCTTA--ACAAAACTGCAAAGTACATGGGGGATAAAGGTGCACACTCTCAGGTGTGCATGGAATGACAATATGTTGAAGACCTTATTAGCCTCCATGTTCTTACCCTATGTGC------------------------------CATCTTGGAAAAAAAATATGCTGAAAGTCAAGAAAATGGCTTAATTGAATATGCCAGGGAGATTTCTAACCAAAAT-GTCACTGTGTATATCTCTAACACAAGGTAGACCTGGTATTGCAAGAGACAGTAAATGGCAGTAAC s bosTau2.scaffold865 134945 321 + 330098 TTTTATTCCTGAAACTTTTCAAAGAGTTCTTCTCATGTCTTATAAGGATAATGTGTAGCACTTTGGGG-CAAAGATACAGCCTAGAAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGAAGATCTTCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGTAGACCGGGAGGAAGGTGACCTGGACATTGCAGAACACTAGCATGCTGAAAGTCAGGAACTTGGCTTCATTGAAGATGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGATAGCTAAGAAGAAGGTGCCCAGGGCTAAAAAGCCCAAGTATCCCAAGACATGGTAGAAGGCAGTGAC a score=21067 s mm7.chrY_random 25775585 667 + 30114534 ACTTCTATCTGACACCTTGGATAGAATTCAAGTCTGGTCTTATTTCAATGATGTAGATCTTGGGTGTAAAGATGCATCCAAGCATCACTGTACTGGATGCCAAGATTGAGAAGACCTCTACAGCAGCCATGACCATGCCCTTAGTCCTATGTGAGTCATGGAGGAAGGTGACATAAACACTGCAGAATCCTAGCACGACAAAGGTCAGGAACTTGGCTTCATTAAATGTTTCAGGAAAATTCTTTGCCACGAAATCCACAGTGAAGCTTCCAAGGGCAAGGCAGGTCAAGTATCCCAAAATTCAGTAGAATGCAGTAACTGAACCCTTGTTGCACAAAATGATTA--TCATTATCATCAATATCAACAAATATCAATATCAACAAAAGGAGGAGAAACTGAGAGCCAGATTACCCACA-GAATACATTGAT-ATGGAACATATCAGAAGGATGTATTTCATTGAACCTGATTAAAGGAGGTTCCTTAAACCTCTTCCAGGTTCTGTGATTATGAAAGCCAA-ACTACAATGATTGTTTTGGCAAGCAATGTGGAAACAGACACCATGAATACAATTCCAAAAGTGATTTGTTGTAAGGCTACATTTTTTTCTGTTAGAAAGACCAATGAAGAAAAAGGAGCATGAGAAAATGGAACATGAGTGACATGAGTA s bosTau2.chr7 54723649 662 - 69141744 ACTTATTCTTTAAACTTTTCAAAGAGTTTTTATCAGTTCTTATAAGAACAATGTAGTACTTTGGGGCAAAGATGCAGCCTAGGAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGATGATCTCCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGCAGATAGGGAGGAAGGTGACCCAGACACTGAGGAGCACCAGCCTGCTGAAGGTCAGGAACTTGGCTTCACTGAAGGTGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGAAAGCCAAGGAGAAGGTCCCCAGGGCTAAGGAGCCCAGGTAGCCCAGGACACAGTAGAAGGCAGTGACCGAGCCCTTGTTGCACACGATGAGGAGCTCCTTGGGCTCAG----AATGAGTGTCCATCTCAAGGAAAGGGGGAGAGGCTCCCAGCCAGACTCCACAGATGATCACCTGGATCATGGAGTACATGGGAAAGACATA----GCAGGTCCTGTTAAGAGCAATCGCCTCATGGTTCTTCCTGGTTTCCTGGCCTTGAATGCCAAGATCACAGGGACGATTTTGGCCAAAACAGTGACCACAGCCACAGTGAACACAGCTCCAAATGTGGTCTGTTG-GAGGATGGAGGTGGCTGTGTGGGGACGACTGATAAAGAGTAAGGAGCA-GAGGAAGCACGGGAGGAGGGAGATGAACA a score=9711 s mm7.chrY_random 25791177 492 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTCTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTCTGAAATTCCTTGTAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTTTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGCTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35739 s mm7.chrY_random 25793497 1172 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCTTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAAATCACA---AAGTACAGAAATGTA-AACTTATAGGATTGAAAAAAATGTTTATTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGGCATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAA--GAAGGGGCGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGGG-----AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGT-AAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=9692 s mm7.chrY_random 25800095 458 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCTGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTTTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATGAAAATAAGTAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-------TCCTTTATTCTtttgaataaatg s bosTau2.chr17 20172806 473 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATG a score=11584 s mm7.chrY_random 25848612 277 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4837 s mm7.chrY_random 25851388 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14049 s mm7.chrY_random 25855606 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGTTGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13328 s mm7.chrY_random 25860951 556 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCACTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA--------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=11443 s mm7.chrY_random 25941855 422 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGAAGAAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAAAGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTAT----TACTTG----------ATTACAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38730 s mm7.chrY_random 25945420 1288 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTATGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCCTCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCATTGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACGGCATCTATGGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTTGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACAAAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGATTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGGTGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCTAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGACAATCCTTCCGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAGAGTACAGAAATGTAAACATATAGAACTGGAAGAAAAAAAAA---GTTTTTTTTTCCTGTGTTAGCTATATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTATTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGTCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGAAGAATAAGGAAATGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGTACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTTGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------AGATTT------------CTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGA-TGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT-GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAG-AAATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10553 s mm7.chrY_random 25952261 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTAAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=5470 s mm7.chrY_random 25964223 105 + 30114534 TAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTACTAAGatatat s bosTau2.chr3 45130541 105 - 85360813 TGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT a score=2775 s mm7.chrY_random 25964390 118 + 30114534 CTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATGTATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130670 99 - 85360813 CCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9601 s mm7.chrY_random 25964862 314 + 30114534 ACTGAATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGTAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGACTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14316 s mm7.chrY_random 25969255 376 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGCGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATAAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11967 s mm7.chrY_random 25978272 502 + 30114534 TACTATGCAAAG---AGAC-CTCAGTTAAATGTATGTCAGTGACTCCAAA-ACAGCTTTTCTTCTCTACCTTTCTTTATATGGCACAGAACGAC---CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTTTTCATGAAT--TTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATTGACAATTCCCACAGTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATCTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAGAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172711 539 - 45915461 TATTTTGCCAAGTTCAGACATTCAGCTAAAAGGGCAGAAGAAACTCCAATTGCATTCTTTGTTGACTAGGTTGTTTTGTA--GCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=26366 s mm7.chrY_random 25981686 730 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGATACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTACAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGACATCCCTCATGAAGAAGAAGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGTGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGGAGGGTTATGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACAGTA-CTACAAGAAGAATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAAAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAGAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTC s bosTau2.chrX 28529038 716 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------------------AGATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTC a score=6486 s mm7.chrY_random 26009101 270 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTACTTATAATCAGAAGTGCTGGTAA-ATTTTAAAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTTTTTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCAT s bosTau2.chr17 20164586 243 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAA--TTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCAT a score=18052 s mm7.chrY_random 26009371 780 + 30114534 TGGTTTCAATACATGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAGAGAC---------CCCTCTGGCTGGGGTGAGTTCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTCGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATTGAAAAA---AAAATGT-TTGTTTTCCTGTGT--TGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTAGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAATGCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAAATGGATTTTTAGGAAGAAGCGGAGAAAGACAGGA-CATAGATAGAATCTCTGGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529492 826 + 48857030 TGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGA------GGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=8796 s mm7.chrY_random 26015577 474 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAAGATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATA----------TTTTACTAAATCGATGGAAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATATTGTTGACTTCTGTATTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATAAAAATAAGTAATGCCAAT---ATCGTTAATCAAGTAGAAAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATTGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGAGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGTTGATAT-------CATTTTCTTTTTCAT-----------TCCTTTATTCgtttgaataattgtgt s bosTau2.chr17 20172806 480 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATT-AGCAGAAA------------------------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATGACTTTAT a score=3870 s mm7.chrY_random 26049209 73 + 30114534 GATTATGTGCATAAGCTTATGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACTTGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=21318 s mm7.chrY_random 26065741 667 + 30114534 ACTTCTATCTGACACCTTGGATAGAATTCAAGTCTGGTCTTATTTCAATGATGTAGATCTTGGGTGTAAAGATGCATCCAAGCATCACTGTACTGGATGCCAAGATTGAGAAGACCTCTACAGCAGCCATGACCATGCCCTTAGTCCTATGTGAGTCATGGAGGAAGGTGACATAAACACTGCAGAATCCTAGCACGACAAAGGTCAGGAACTTGGCTTCATTAAATGTTTCAGGAAAATTCTTTGCCACGAAATCCACAGTGAAGCTTCCAAGGGCAAGGCAGGTCAAGTATCCCAAAATTCAGTAGAATGCAGTAACTGAACCCTTGTTGCACAAAATGATTA--TCATTATCATCAATATCAACAAATATCAATATCAACAAAAGGAGGAGAACCTGAGAGCCAGATTACCCACA-GAATACATTGAT-ATGGAACATATCAGAAGGATGTATTTCATTGAACCTGATAAAAGGAGGTTCCTTAAACCTCTTCCAGGTTCTGTGATTATGAAAGCCAA-ACTACAATGATTGTTTTGGCAAGCAATGTGGAAACAGACACCATGAATACAATTCCAAAAGTGATTTGTTGTAAGGCTACATTTTTTTCTGTTAGGAAGACCAATGAAGAAAAAGGAGCATGAGAAAATGGAACATGAGTGACATGAGTA s bosTau2.chr7 54723649 662 - 69141744 ACTTATTCTTTAAACTTTTCAAAGAGTTTTTATCAGTTCTTATAAGAACAATGTAGTACTTTGGGGCAAAGATGCAGCCTAGGAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGATGATCTCCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGCAGATAGGGAGGAAGGTGACCCAGACACTGAGGAGCACCAGCCTGCTGAAGGTCAGGAACTTGGCTTCACTGAAGGTGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGAAAGCCAAGGAGAAGGTCCCCAGGGCTAAGGAGCCCAGGTAGCCCAGGACACAGTAGAAGGCAGTGACCGAGCCCTTGTTGCACACGATGAGGAGCTCCTTGGGCTCAG----AATGAGTGTCCATCTCAAGGAAAGGGGGAGAGGCTCCCAGCCAGACTCCACAGATGATCACCTGGATCATGGAGTACATGGGAAAGACATA----GCAGGTCCTGTTAAGAGCAATCGCCTCATGGTTCTTCCTGGTTTCCTGGCCTTGAATGCCAAGATCACAGGGACGATTTTGGCCAAAACAGTGACCACAGCCACAGTGAACACAGCTCCAAATGTGGTCTGTTG-GAGGATGGAGGTGGCTGTGTGGGGACGACTGATAAAGAGTAAGGAGCA-GAGGAAGCACGGGAGGAGGGAGATGAACA a score=9648 s mm7.chrY_random 26081373 492 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAACTAAAATTACCTCACCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTCTGAAATTCCTTGTAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTTTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35516 s mm7.chrY_random 26083693 1170 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTAAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGAAAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTGTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAAAGTAAACTTATAGGATT----GAA----AAAATAT-TTATTTTCCTGTGT--TGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATTACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAAGAAGGGGAGAAAAACAGGACATAGATAGAATCTCT----------GGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTTGGGG-----AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAA--TATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGA--AAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=9448 s mm7.chrY_random 26090283 458 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAAGATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCTATGGGAAATCTTCTGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATTCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATGAAAATAAGTAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGACGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT-------TATTAGT-------TGATTTCATTTTCTTTTTCAT-------TCCTTTATTCTtttgaataaatg s bosTau2.chr17 20172806 473 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTTCTTTCAATTGGATG a score=3870 s mm7.chrY_random 26181117 73 + 30114534 GATTATGTGCATAAGCTTATGTGTAT----TTGTGTGTGTGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACTTGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=20810 s mm7.chrY_random 26197693 732 + 30114534 ACTTCTATCTGACACCTTGGATAGAATTCAAGTCTGGTCTTATTTCAATGATGTAGATCTTGGGTGTAAAGATGCATCCAAGCATCACTGCACTGGATGCCAAGATTGAGAAGACCTCTACAGCAGCCATGACCATGCCCTTAGTCCTATGTGAGTCATGGAGGAAGGTGACATAAACACTGCAGAATCCTAGCACGACAAAGGTCAGGAACTTGGCTTCATTAAATGTTTCAGGAAAATTCTTTGCCACGAAATCCACAGTGAAGCTTCCAAGGGCAAGGCAGGTCAAGTATCCCAAAATTCAGTAGAATGCAGTAACTGAACCCTTGTTGCACAAAATGATTA--TCATTATCATCAATATCAACAAATATCAATATCAACAAAAGGAGGAGAAACTGAGAGCCAGATTGCCCACA-GAATACATTGAT-ATGGAACATATCAGAAGGATGTATTTCATTGAACCTGATAAAAGGAGGTTCCTTAAACCTCTTCCAGGTTCTGTGATTATGAAAGCCAA-ACTACAATATTTGTTTTGGCAAGCAATGTGGAAACAGACACCATGAATACAATTCCAAAAGTGATTTGTTGTAAGGCTACATTTTTTTTTCTGTTAGGAAGACCAATGAAGAAAAAGGAGCATGAGAAAATGGAACATGAGTGACATGAGT-AGCTGATGAAAAATGTGGAAAGACATAGAAGGAAGGACAGGAAGAAAGTTAGAGAGTAAGAAAG s bosTau2.chr7 54723649 726 - 69141744 ACTTATTCTTTAAACTTTTCAAAGAGTTTTTATCAGTTCTTATAAGAACAATGTAGTACTTTGGGGCAAAGATGCAGCCTAGGAGCCCAGCACTGGAGGCCAAGATGGAGATGATCTCCACGGCCACCATGACCTTGCCCTTGGTGCTGTGGCAGATAGGGAGGAAGGTGACCCAGACACTGAGGAGCACCAGCCTGCTGAAGGTCAGGAACTTGGCTTCACTGAAGGTGTCAGGCAGGTTCCTGGCCAGGAAAGCCAAGGAGAAGGTCCCCAGGGCTAAGGAGCCCAGGTAGCCCAGGACACAGTAGAAGGCAGTGACCGAGCCCTTGTTGCACACGATGAGGAGCTCCTTGGGCTCAG----AATGAGTGTCCATCTCAAGGAAAGGGGGAGAGGCTCCCAGCCAGACTCCACAGATGATCACCTGGATCATGGAGTACATGGGAAAGACATA----GCAGGTCCTGTTAAGAGCAATCGCCTCATGGTTCTTCCTGGTTTCCTGGCCTTGAATGCCAAGATCACAGGGACGATTTTGGCCAAAACAGTGACCACAGCCACAGTGAACACAGCTCCAAATGTGGTCTGTTGGAGG---ATGGAGGTGGCTGTGTGGGGACGACTGATAAAGAGTAAGGAGCA-GAGGAAGCACGGGAGGAGGGAGATGAACAAGTCGGTGACATCCCCAGAGAATCATCAAATTCAGGATGGTCAAGTCCTTGGGGAGGGAGGCAG a score=9984 s mm7.chrY_random 26213209 492 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAACTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTCTGAAATTCCTTGTAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35180 s mm7.chrY_random 26215527 1238 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGCAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCCCAATGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTACATATCTATGTCTATATTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAAATCACA---AAGTACAGAAATGTA-AACTTATAGGATTGAAAAAAATGTTTATTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGGCATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATTACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAATAGATGGATTTTTAGGAA--GAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGGG-----AAAGAGTGATAGATAAAAGGAATGTGACCTTGTTACACAAAGTGCAACCCAGAAAACTGATCCAAAGAGACTCAGAAAT s bosTau2.chrX 28529095 1282 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGT-AAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA------GAGTGAAATCTTGGGGTTGAGAG-GAAACCAGGATAAATTGAGTAAAGAGGGACACAAAT a score=9773 s mm7.chrY_random 26222122 407 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCTGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATGAAAATAAGTAATGCTAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTGTTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=4604 s mm7.chrY_random 26268671 235 + 30114534 AGTATTAAATTCAAGTCCTTTCTCTTCTTCAG-GAATGTTAATATTTGACTATATACAAATGCATTTATCTGAGAAAGAATGGCCTATGCTA-ACCCATCGAAGAAGACACTCTACAGTGTTGTAATTCTCGTCATCTACAAGCTAACCACCTGTCTAGGTTAACTGATTAACTATAACTCATTTCCTTTGTGTATACATTGTGTAACCTGGACTGTAATGGTG------AAAAATACACCCT s bosTau2.chr25 342116 239 + 41414979 AGTACTTGGCTGAAGCCCATTCTCTTCTTTAGAGCTTATTGACATTTGAAGAAGTGGCCATGTATTTTTCCCAGGAAGAATGGGAGTTACTGGATCCCACTCAGAAGGCCCTCTACAATGATGTAATGCAAGAAAACTATGAGACTGTCATCTCTCTAGGTAAA--GTTT--CTTTTTCCCCTTCCCTTTGCACAGCAGTGGACTAATCTGTCCTGTTTTGGGGGGTACTGAGAATGCACCCT a score=11379 s mm7.chrY_random 26270639 277 + 30114534 GTGCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4837 s mm7.chrY_random 26273463 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=13835 s mm7.chrY_random 26277750 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCATCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGAAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13209 s mm7.chrY_random 26283125 555 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTTCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCACTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATTCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGG------CTTTGTGATTAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA---GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=21380 s mm7.chrY_random 26363661 837 + 30114534 ATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGATGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAATTTCTAGCCAATCCTTCCATGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGTTTTTT--TTTTTACTGTGTTAGCTACATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTAAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAA--GGAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGTTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTGGGGAAAGTGGGAGATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA-ATAGACTCAGAAA----TAAGAGAAAATCAGG s bosTau2.chrX 28529512 885 + 48857030 ATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCAT-CTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAAGAGGGACACAAATACATTTAGAAGAAGTTCAGG a score=10926 s mm7.chrY_random 26370064 400 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAACAAAGCTTTTTTTTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATGTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACTTACT s bosTau2.chr17 20172806 405 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCT a score=5676 s mm7.chrY_random 26381994 152 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatat s bosTau2.chr3 45130465 181 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT a score=2595 s mm7.chrY_random 26382226 124 + 30114534 CTCACACAACTTTTTAAAAATCCTAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATATATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130670 99 - 85360813 CCCACCCCACTTCTTAA-------AACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9608 s mm7.chrY_random 26382704 314 + 30114534 ACTGCATGCACAGACCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTGGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13580 s mm7.chrY_random 26387049 377 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGTGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTACAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACGCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAAATATCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGC-CTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11991 s mm7.chrY_random 26396712 413 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGTTCCCACGCTTTTAACTAAATCGGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=9242 s mm7.chrY_random 26399398 297 + 30114534 ttttGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATCCTATAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATCAACAA-AATTAATTGCACATCAACTGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCATACAAATAAATAATGCCAATGTGATTATTCA--AGCAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGGTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTTTTGTGCAAATAACCCTAACCTCTGAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATACTACGAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172912 295 - 45915461 TTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCAG-TAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=19608 s mm7.chrY_random 26421277 963 + 30114534 GCACTTGTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTAGTGAGTTGGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATTCAGTTTGAGTCCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTGAGAGGTCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTTGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCTAAGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGAAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGTCTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGGGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTAGCACCCCTTTTCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCCATTTACTGTCAGAATATCCACTCATTTCCTACAA--TAGGGGGTAACTTGTATTCTGGATAA-------TTCTGTATTCACTG---------------------------------TGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACATCTTTGA-------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATAAGTATCAATTCAGAT-AATATATACCTTTTGAGAATTAGCTTCACATTTCTA----ATGTCCGAACAAAATAGCTTTCTTAATTTAAGTTACAGTTGCTATGTTTCACTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTC--AGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=2622 s mm7.chrY_random 26422254 112 + 30114534 TTAAGCATGATAATATTGAAAAGAAATTACAATT--TTTCACTTTGAAATTAAATCTCTGAAGATGATAACTTAACTTGTGTTTGGAAAAGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA s bosTau2.scaffold2750 19906 115 - 102126 TCAAACACTCTAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATA a score=2192 s mm7.chrY_random 26422392 96 + 30114534 TTGTTCAAACAAAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAACGAAAATAACTGAATAGTA-GGTTTGT-AGCATTTGACACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 20067 104 - 102126 TTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=4366 s mm7.chrY_random 26448562 200 + 30114534 TATTGTACAGTTAATAATTTTATGTCACaaaataatattatactaataattatttaaa-CTGTGTCTTATACTG-CTAATATGGTTTCACATATACATGGGAGTTTGGTAGCCTCAGGAC------TCTGTCCAGGTAGCTGGATCATGTTAATCAATTTTACACTCAGATTGCCATTCATTTTATTTTTAGTTGCCAATTTCAAGGG s bosTau2.chr13 22763104 205 - 62721844 TGTTGTTCTGCCAATAAATTAAGATCCTTAGCCA---TTTCATTAGTAATGATTTCAATCCCTGCCTGGAGCTGGATAATTCTGTTAAGCGTGTAAATTGGGGTTTGGTAGCCCCAGGACCCATCTTCTGCCCATGTAGCTAGCCTGTAGTATTGGATTATGCGTTCAGGAGACCACTCATCATCTTTCCAGTCTCCAGTCTGTAGAG a score=4137 s mm7.chrY_random 26448956 390 + 30114534 GATTTCTAAATGGTCCCCTCTGGTAAGTTGGAACAGGAAGAAAATTGTACAGCTAGTCCCCAAAACACACAATCCTGAT---TAGGTGAGAAAAAGTATAATCGAGGCTGTGTACCCAACATATCCAGTATAGCCC------ACAAAGGGCATGGTACCTGATACCTGCA-TTGACATTTTTTTTCGGTCCTGTCAG------AGATTAGAGAAACTAGACAAGGAATAGATGTTTTGTTCAAAGTGGTTTGGGAATCCACACCA--TTGAATTTCCCAAGTGACTGCATTAAAGAATGTTTGGCCCAGGCATGTGGGGCTTCCAGCTGAAGT-TTAAATCACC-CTTCCATTAGGTAGGTCAGTTTTCCCCAACAACTTAAGTATT----AGTTCAATTTTGGTtttggtttt s bosTau2.chr13 22763349 395 - 62721844 GACTCCCAATGATTCACCTTAGGCTAGGGAGAGTAGGAAAAAGGAAGGACAGATAGTCCCCAATACACATGCTCCTGACCTGTTGGCTGGTAAAATTGTATGTGCGTTAGT----CCCACAAATCCAATATGATCCTTCTGGACGAGGCCAATGG---------CCTTCAGTGGACAAGTC------ATCCCATCAGGTCTTTAAATGGGGGATGCTTGTTAGAGGGTGAGGATTAGGCTCTGTATAGTTTGGGCATCCCCACCAACCAGAAGTATGaatattataatattataatatttttGGCCAAGACAAGTGAGTTTTCCTACTGGAACATTGAATAATTGGCCCCACCATGCCAGACAGTTTTTGTCAATTAAAGAAGTCTTTAAATGCCAAATTCTGACCCTGGTCTT a score=3781 s mm7.chrY_random 26449572 96 + 30114534 TTTTTTATCTATCCAGG-CCATAGTTCTTCCATGTTAGTTTTTTCACATGCATGGCCAAAATACACCCTTAGCTACTGGACTCTAGTGTCTACCAGG s bosTau2.chr13 22763786 97 - 62721844 TTCTTTGGCTTCCCAGGGCCATTGGTCTCCCATGTTAGTTCCCCCACACACATAGCAAGAAGTAACCATTAATATCTGGGCTATGGTCTCTGCCAGG a score=6066 s mm7.chrY_random 26450515 707 + 30114534 AAACAGATTTCTTGCTATGGGAGCAATGAGAAATGGGCTAATTTTTATTTCCTCATGAAAAGAATGGAAGA-TCTGGATGT---CACTTAATGCATGATAGAAACTCTCTTGACATTTAACACAGACCCTGTGATCGTGCCCTTTCC----------------AATCTGCCAGCCAGTATTCTGTCAGGGGTTTCTTAAGTTAGTGATATTGAAATTAGAATGTTTCCAGGTCCCTAGTTGACAGTCTGATGCAGAAGGCTCCTTTTGAAGGAGCACCATTTTTGCACT--------------------TGTAGTGCCAGGTTGTTCATAAGATGTGCTTCCAGTAGGAAATGT--AAAAATGGGCTTTAGGGGTACATCTGGCCAGAGTTGAAGGAT----GTTCACATATATAGTTATCATTTAGCCTGTATGC----------------------CCACTCTGAGTGCT---ACCACTGA-------------------CTCAATGAAGTTGATCAGC-----------------CATAATCTAGGTTTG-------CAGAGAC---------ATATAAAATTATTGACACTGGTTGTCCTAGGTTAGAGAATAGTAACTTTTGGATCATTT---GTCCCTGTCCTAAGGGATGG--CTCTGGTC-GTCTTGTCATTCCACTGTTGGGGAAAACTGCATATCAAAAAATAATGTCTCCCA----TGTTGGTAGATGGAGTATGTGATTTTTTTTTATACTT-----------------------GAAAAGTGGATGTGACAAATGAAGCTGGGTCCAAGTAAATCCTTATCCCAAATGAGTCAGACAAATACAGTAGATA s bosTau2.chr13 22763886 839 - 62721844 AAAGACATTTTTAGTTTTGGCTGGAATAGGAAGAGGACCACTTTCAGTCTCTTCATAAAAAGAATGGAAGAGCCTGTGTGTGGAAATCCAGAGAGGAATAGAAATGCTCTGGAATAGCAATGCAGTTCCTG-GGTCAGGACCTCTCCTATTAATATAGATGCTGATCTGGTGACCCTCTTCCCATCTTGAGTCCCCAGGGTTGAAGACAGTGAAATTGACTGGGTTACACGTCCCCAGCTTACATTTGGGATCAACAGTTCCCTTTTGGAGGAGTGTTACTTTGTCCTTATTCTCCCAGGTCACCTCTATATTTTCCCAGGTTGCTCATCTGACACAGGCCCAGGTCAATCTGTGAAGAAAGGGGCCTTCATATCAC------CCAGTGTTATGGGATACTGGCTTACACATGTATTTGTCATTGAATGTGCATTCTTGTTCCCATGACAAGCCTCCACCATTCAGAGTACTGGGGTTACTGGGGTTTTTGTGAGCAGCACTCTCATCAAAGTGCACCATCACTGGGCTTTCTAAATTCGTAATCTATGTCGGGCTGACCCAGAGCCTCCGTCTGAGTGGCGAACCTCTAACCATGGGCTTTCTAAATTCGTAATTTGTG---TCTGGTTCATCCAGAGCCCTCCTTCTAAGTGGTGAACCTCTAACCAGTCTT-------CACTG-GGAGGGGAACTG-GGGTCAAAACG-GATGTCTGGCATTAGTGTTGACAAATAGAATAGGTTGTTTTGTTAAGTACACAAGTTTCGACATCTCCTTGGCAAGAGAAGTGAGTATG----GTAAAGCAAGGTCCAAGCGACCCCCTGACCTGATCTAGTCATGCGAATGCATGAAATA a score=3640 s mm7.chrY_random 26452104 107 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCAATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGCTTTTAA s bosTau2.chr5 36527708 112 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGTTTGGTTTTTTAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 26452541 71 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAAGAAATATA-----CTTTCTATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=7486 s mm7.chrY_random 26454041 423 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTATACTTAAACAAGAAAATGATTAAAGATATTTAAAAAT---AAAGAAGTTCTATTTTAACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGATTTTTTTATTTGTT----------TTATATATATACCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGAACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTCAAACATAGACATTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTACTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGA---AGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTT-TAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=6234 s mm7.chrY_random 26454759 420 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACtaaatatatatatatattta-caataatatGAAATAACATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA---ATGTGTTCACCACTTACATACAATAATA--ATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=20661 s mm7.chrY_random 26456761 1318 + 30114534 aaatgcctagtcgttttcattgatatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagataatggaacttaatttagtttcatatgctcaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt------ttttttatggtaccaacaactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAAAGAACACTCAGAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCCCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCA---------TTTACGTTTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacaaacaacacacacgtaacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacatatatatatatatatatatacatgtaCAAAATTTAATTATATTTCAATGTGTTTT-TTTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAAATAAAATATACAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCACACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATATAATTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCATTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGAGTCAT----TTTGAAGAAAAATTAGATGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530122 1369 - 76426644 AAATACC-AACAGCTTTTAT--ATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAACA--ACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTT-------------------------------------------------------------------TAT-TATATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=3144 s mm7.chrY_random 26465106 86 + 30114534 ATATTTCTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA--TTAAAGGA s bosTau2.chr5 36533055 87 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGA a score=12252 s mm7.chrY_random 26486894 1059 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCTGTGTTCCTGTTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATGAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGATGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC--AGACAGAATGG-----------------CCAAGCTAAGGAAAAATAGCATATTG---CAGAGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGTTTCCCACTGTCTTTCA------------------TTATCTGTGTTATCCACACATTTTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTAGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATTATG----GCCCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACCGTCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGACT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCCAGCACAAACCTAAGAAAGTTGTAAGCATTTGAAGTC----------------------CACTTACAGATCTC-ACTG-------------------------TCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGGAA---TTTTTAAATGATTGCATACCACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAATTTGT s bosTau2.scaffold5600 1080 1221 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-------AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCT-ATCTACATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAG----CATTA---------------AGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACTTAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCATCTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=4632 s mm7.chrY_random 26489567 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAACTGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=5475 s mm7.chrY_random 26489897 602 + 30114534 aataataCAGTGAGACTGATGAGC---CTTCAGTGACAGGACTTGAGTGTTTATGATAGAATTTGAGTCAGACATTGTGTACTCACACATTAATTATGAGGATCTTGCTTAATTTTGTGTACATAGAACTGGATTATCACATGGATCTTTTCCCCC--TCTTATATTCTGAGC--ATGTGAAGAAAAGTGATGTTTCTCTTTCTTATACAATTAAACAG---ATTCCATAAAAG-----------CTTATCTTCTCCCACTTCTAAATAAGCATTTTCA--------------------------------------------------------------------TTTAAT-------------------TTATTGGCATG---------------TTGTATGCTTTAACTGTTTGGTAGTTGTCTGTTAATTT--TTGGTTT------ATCTTA--CATATAAAGCAAGTTTGATAAAAATTTGGTACGGAATTTTATGCATTTTATAATTGTAAAAATATTATTTTCACTCAACTCAAAGTGCTCTGTGGTTATAAATTGG--------------CCTCTCAGTTAGTAA-TACACAAAACAAATTCAATTCCACTTAACCCTTCTGAAAATGAACTTGCATGGTATTGTCTGATTTGA--------AGCTAATAAATCTATTTAACTAAACCAGAGACATTTGTGTTAGGAAGGAAACTACTACTGTCTGTTGTTTAGAAAATGGAAAAGTTA s bosTau2.chr3 39007039 701 + 85360813 AATAGCCGAGTGAGAATAATGAACTAGCAACAGAGACTGGACTTTACCTTTTATGACAGAAATTGGGTCATACATTCACTGTTCA----------------------------TCTGTAT------------GTTTTTATATGTAGCTTTCCCCCCCTCCTTGAATTTTAAACATATATGAGGAAAAGTGATATCTATACTCCTAGTTTTGGTAAACATTTCATCACATAGAAGGAAATATTTATCTTTTTCTCTCACCTTTCTAAATGAGGGTCTTAAATATTTCAATTTGGAAGGTGAAATCTACACAGCAGATTAAGTGCTAACCTCTAAATTATAACACTCAGTTTAATCTTTCTGTTGGGCAAAATGTTACTGGTGTGACATAGTATAATGCCTTATACATATTATCTGCTTAGTGATAATTTTTTTACTTGATTGATTTTTATCCAACTTAAGCATGAAAAGCAAGTCTGTCA---------TGCAGAATTTCCTGTAAAATATGAATTCACAA--ATTTTTGTCATTTAACTCAAAATGATAAATGGACATGGAATGAAACTAAAGAGATATTTTTAAAGTAAACAATTATATAATGTAACATCTGTTGTAATCACCTTTGTAGGGAATTGATTTTGAATTTATTCTCTGACTTGAAAATGCATAGTAGGTACATTTCTTTAACTGAACCTACTTAACATTTTTCAGAAAAGAAGCTACTCC---CTGTAGTTTAAAAGAT---AAAGtta a score=14263 s mm7.chrY_random 26493826 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCACCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=14141 s mm7.chrY_random 26499178 559 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGCTTTGTGATTTAAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAAGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=9608 s mm7.chrY_random 26568003 314 + 30114534 TACCAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGGTCTGTGCATGCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=2595 s mm7.chrY_random 26568671 124 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATATATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAG s bosTau2.chr3 40230044 99 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTT-------TTAAGAAGTGGGGTGGG a score=5770 s mm7.chrY_random 26568849 152 + 30114534 atatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTATTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230167 181 + 85360813 ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=11059 s mm7.chrY_random 26580534 398 + 30114534 AGTAAGTGTCCATGTCACTTTGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATACATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAAAAAAGCTTT--GTTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742250 405 + 45915461 AGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=21279 s mm7.chrY_random 26586526 810 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATCTCCCACTTTCCCCAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTAACTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTTACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCTAACACAGTAAAAAAAAAAAACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACATGGAAGGATTGGCTAGAAATTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATACAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGAT s bosTau2.chrX 20326666 852 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC-ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGAT a score=3108 s mm7.chrY_random 26640018 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=20451 s mm7.chrY_random 26647124 1320 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTAAT-ATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAAAAAACCACATTGAAATATAATTAAATTT--TGtacatatgtatatatat-atatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatg-------tgtgtgtgtgtgtgtgttacgtgtgtgttgtgtgtgtTTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAAACATAAATGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGCGGAAAAATCTATAATGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaa------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895153 1369 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATAATAAAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTA---GTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATC------------AGCATAAGT-CATACTTCT------------------------------TGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6427 s mm7.chrY_random 26650028 422 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCATGTTATTG-taaatatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTACCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTATTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT-----TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=2572 s mm7.chrY_random 26650527 106 + 30114534 ATGGCTTTGTATGAATTATTAAAGATATGAAATGATAAAATGGGAATTTGACCTCAGATGTAC-----------------CTCATACTTTAATAACACTATAATTAT-CCTGCTTTATTAAACA s bosTau2.scaffold10439 16855 123 - 23754 ATAGTATTGTGGGAGTCACTTAAAATGGGGAACTGCAAACTGGGAATTTAATCT-AGATGTATACACATGGTGAAGAAAACTGATACTTGATTAACCCTTTAATCCTAACTATTTTGTTCAGCA a score=7617 s mm7.chrY_random 26650745 423 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAAA----------ACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA-AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCTTC---TCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 26652597 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 26652998 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=5847 s mm7.chrY_random 26654294 396 + 30114534 GAGTGGGCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957523 435 + 62721844 GAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 26655537 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGataaaaaa s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=4070 s mm7.chrY_random 26655863 391 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACCTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGGCCAAACATTCTTTAATGCAGTCCCTTGGGAAATTCAA---------TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataata-------ttataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT-------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4460 s mm7.chrY_random 26656450 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-TAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=2192 s mm7.chrY_random 26681812 96 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTGTCAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCGTTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA s bosTau2.scaffold2750 81955 104 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAA a score=2622 s mm7.chrY_random 26681934 112 + 30114534 TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGTAATTTCTTTTCAATATTATCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 82105 115 + 102126 TATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=19141 s mm7.chrY_random 26682060 963 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATTAAGAAAGCTATTTTGTTCGGACAT----TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATTGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATACAAGTTACCCCCTA--TTGTAGGAAATGAGTGGATATTCTGACAGTAAATGGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAAGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGACTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACAAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTACCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGTATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCTAACTCACTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=10790 s mm7.chrY_random 26704648 437 + 30114534 TTCAAAGAACGAAAGC-------ATGTAAAAGAAAATGAAA---TCTAGTAATAAGT-----------GTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTCAGAGGTTAGGGTTATTTGCACAAAAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCAAATAACCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTGCT--TGAATAATCACATTGGCATTATTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGACTTAGTTAAAAGTTTGGGACCAGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTGATAATGGGACAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATAAAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAA--AATTGTGAAAAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742189 466 + 45915461 TTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=605 s mm7.chrY_random 26710661 148 + 30114534 AAACCTGATTTTCTCTG--ATTTCTGAGTCTATTTCAATCAGTTTTCTGCGTTTCACCTTGTGTAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATGTCCCTCTTTCCCCAACTTTTT-----GTTTCTCCTTCAGTGTTCACATCAGAGTTTCT---------------ACCTATGC s bosTau2.chrX 28021507 159 + 48857030 AGATTTCACTCTCCCTGTTATTCTTCACCCTCTTCCAGTTGG----CTGCCTCCCACTCTT-------AGGTCACCCTCCCCTTAGGAGCCTCTCCATTCCCAGCCCCTTCCCACATCCTTTCTTAAGCAGCCACCTTCCCTTTTCCTTTCCCCCACAGCCCATCTCTAG a score=37180 s mm7.chrY_random 26710809 1195 + 30114534 TTTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTGCTGCTATCTCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCT-------------ACATGCAGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCACCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATATTCCTTCCACTGTAGGC---CATCACTTCCA-----GCAAATTGTTAACTCACAGAATATCATGTC-----ACACTTTTAAATTTTTAGAGCAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAAAAAAACAAAAAACTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATACGTTTACGTTTCTGTACTTTATGAT-TTTAC----AACTTCAAGAATCTTTGGCACCAGAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACAGAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTTTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCTTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGAACCTGGGCTAGCACAACCCCCCTTCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACTGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGGAGTTGACCTAGCACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCTTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACCCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAAACCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTAACATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20326788 1204 - 48857030 TCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTC--------TTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACA---AGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACA----CTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC-ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=2545 s mm7.chrY_random 26713271 99 + 30114534 GGAAAACTTTCAGCTTTCTATAGCTATGAGGGTCCCATTCACTTCATAAATGTACTTACCCAAAGAAAATGTCTTAGTCA-TCAAGATTCTGTCTTTTGA s bosTau2.chr17 25749565 97 + 45915461 GAAAATCATTCTGCTT---GGGACTATAGAACCTTCAATCACTTAATAAATGGATCGCCCCACACAGAATGTCCTAGCTAGCCCAGATACTTTCTTCTGA a score=8356 s mm7.chrY_random 26713859 458 + 30114534 GTTATCTTTCAA---------CTGTTCTTAGTGT-CAGAAATGGTGCC-----AGACTCTTTGA-GGCAGCACACTGGATAGCACATCAAAATTCTGTTTATGAAAACCCAAAGTT-AGAGCAATAAATATTTTATTCAAACAAAGCAGGAATTTTACAGGGTTAAGTACCTTGTATTGAAGTTATTTGCAACCGTGAATCATTGATTCTTTGCAAAATGAGAAGGCAATCTAGCTCTTGTTCCTGCTTACAAAGTTGTGATGAAGTT-----AAACCCAATATCAACCAGTCATGTTTTAAAGGCCTT-TAAAATTTATTAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTAGTAGAATAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATAGATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAAACAAAATATTGAATGCTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTAT-CAGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750450 469 + 45915461 GTTATTTTTCTAACTCTGCTGCTTCCCTTAGTGTATTGAAGTGTTGCCCATATAGAATGTTGGCTGGCAAGAC-CAGGACGATGCACTGAAATAGT-TTAATCAACACTTGTCGTTCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCA-------CTTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTTAT-----TAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11543 s mm7.chrY_random 26714953 413 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGCGTGGGAACTTTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGGCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=9892 s mm7.chrY_random 26777779 492 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACATACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAACTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCATTTAATCTCTGAAATTCCTTGTAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACTTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAATTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTTTCCTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGGTTTTTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAG-TCCAAGTTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35814 s mm7.chrY_random 26780102 1171 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGGTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATAGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAGCCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCTTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTTGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTACAGGACTATTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTTCCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGTATCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCTTGGTGACCTCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTAAAAAAAATCACAAAGTACAGAAAAGTAAACTTAT-------AGGATTGAAAAAAATGTTTATTTTCC-TATGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACATTGT-----TGGAAGAGATGGAC---TATGGTGGAAAGAACATCAAAGCAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATTACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGATTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAA--GAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGAATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGGG-----AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCAC---GTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=9559 s mm7.chrY_random 26786696 407 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AATACTTTTTCAGGGTGTT--GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGATGGGAAATCTTCTGCTCCAAGGAACAATGGATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTATACATCAACATTTCTCACGATTTGAACTAAATCAGGAATAAGGGATATGTTTCCATGAAAATAAGTAATGCCAATATGGT--TAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGGGTGTGGGGTGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAAACTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGATATAAAC-TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATAT-ATAGCCAGTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA--------------------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=11678 s mm7.chrY_random 26835288 277 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCC-AGAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGGCCATTCCTTCAGAAATTTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACAGACAATCAAGGCTTCTAAGACACCAGAA s bosTau2.scaffold5600 1080 277 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA a score=4837 s mm7.chrY_random 26838101 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14274 s mm7.chrY_random 26842308 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGTGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=13239 s mm7.chrY_random 26847702 558 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGATACTCCACATTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGCTTTGTGATTTAAAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGT---------TGAAGCTGTTTAATATTTTAAA----ATTTCCAGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=20339 s mm7.chrY_random 26927276 809 + 30114534 ATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAACTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAATGTAACCTCCACATGATTCCAGA--CA-------CTCCTCCGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGATGCAGTACACCAGAAAAGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAATTTCTAGCCAATCCTTCCATGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAATATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGTTTTTT--TTTTTACTGTGTTAGCTACATAAGGGTCTTTGAAAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTAAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAACATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAA--GGAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACATGACATAGTTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGCAGAAACAAAAATTTGGGGAAAGTGGGAGATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529512 852 + 48857030 ATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCAT-CTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCA-GAAATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10701 s mm7.chrY_random 26933666 398 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAAC--AAAGCTTTTTTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATGTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAGGA-TATACTACGAAGTGACATGGACACTTACT s bosTau2.chr17 20172806 405 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCT a score=5770 s mm7.chrY_random 26945609 152 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAATAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatat s bosTau2.chr3 45130465 181 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT a score=2464 s mm7.chrY_random 26945819 124 + 30114534 CTCACATAACTTTTTAAAAATCCTAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATATATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130670 99 - 85360813 CCCACCCCACTTCTTAA-------AACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9813 s mm7.chrY_random 26946297 314 + 30114534 ACTGCATGCACAGACCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14224 s mm7.chrY_random 26950646 377 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGTGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTACAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACCCTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTAGTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAGGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGGTCAGAATCTAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTGTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGC-CTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=11768 s mm7.chrY_random 26960330 413 + 30114534 CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTACTAAATGGAAGGGAAATCTTCAGCTCCCAGGAACAATCCT---------GTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCACATCAACAGTTCCCACGCTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGACAATTAT----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=36788 s mm7.chrY_random 26963743 1192 + 30114534 GCAAGTATGATATTTGAACACAGAATGTTACCCACAAGACATCTGCCCAGGGTTGGTGTGGTCTACCACACCAGGGCTAGAGCCATGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTCTTAGCATGGCATCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGATGTCTTCTTCCAACGTCTTGAGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCAAGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACTCAATGGAAGACCATAGTGCTAGGTCAACTCCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGATGGAAATGACAGCGTCTATGGACAGGAGCTCTACAATGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCAAAGTAAGATTTCCTCAGGTAAGGGATGCCCACCTCACCAGAGCCCTGTTTGGCAGAGCAGTACAACACAAATTTAAGGGTAAAGATGGCTCTGAGGACAACTGAAGGGGGGTTGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTACTTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGAAAGGGAACCTCCACATCATTCCAGA--CA-------CTCCTCTGGCTGAGGAGAGATCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGCAGTACACCAAAAAAGGTGGTTCCAAATAGTTCAGAAAGGTTGTTTACCAAATTCTAGCCAATCCTTCTGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTCTGGTGCCAAAGATTCTTGAAGTT----GTAAA-ATCATAAAATATAGAAACGTAAACGTATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGTTTTTTGTTTTTTTTTTCCTGTGTTGGCTACATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGCTCTAAAAATTTAAAAG----------TGTGACATGATTGTGAGTTAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAATATCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGTGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAA--GGATCAG--CTTCTCTGGTCTGCATGT-------------AGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGAGATAGCAGCAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGA s bosTau2.chrX 28529038 1204 + 48857030 GCAGGTATGAAGACACCTCACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGA-----------AAAAG------------ATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAA--TATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAG----TGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATG-CTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCAT-CTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCT---TGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAA--------GAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGA a score=594 s mm7.chrY_random 26964935 148 + 30114534 GCACAGGT---------------AGAAACTCTGATGTGAACACTGAAGGAGAAAC-----AAAAAGTTGGGGAAAGAGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTACACAAGGTGAAACGCAGAAAACTGATTGAAATAGACTCAGAAAT--CAGAGAAAATCAGGTTT s bosTau2.chrX 20835364 159 - 48857030 CTAGAGATGGGCTGTGGGGGAAAGGAAAAGGGAAGGTGGCTGCTTAAGAAAGGATGTGGGAAGGGGCTGGGAATGGAGAGGCTCCTAAGGGGAGGGTGACCT-------AAGAGTGGGAGGCAG----CCAACTGGAAGAGGGTGAAGAATAACAGGGAGAGTGAAATCT a score=11120 s mm7.chrY_random 26970653 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTTTTCACAATT--TTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTTTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATCCTATAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATCAACAA-AATTAATTGCACATCAACTGGTCCCACACTTTCAACTAAGTCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAATAATGCCAATGTGATTATTCA--AGCAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGGTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTTTTGTGCAAATAACACTAACCTCTGAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATACTACGAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCAG-TAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=19385 s mm7.chrY_random 26992787 963 + 30114534 GCACTTGTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTAGTGAGTTAGGTTCCTATTACTTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATTCAGTTTGAGTCCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTGAGAGGTCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTTGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCTAAGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGAAGGATTTCGGTTTCCTTTTGGCTACACAGCAATAAAGTCTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGGGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTAGCACCCCTTTTCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCCATTTACTGTCAGAATATCCACTCATTTCCTACAA--TAGGGGGTAACTTGTATTCTGGATAA-------TTCTGTATTCACTG---------------------------------TGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACATCTTTGA-------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATAAGTATCAATTCAGAT-AATATATACCTTTTGAGAATTAGCTTCACATTTCTA----ATGTCCGAACAAAATAGCTTTCTTAATTTAAGTTACAGTTGCTATGTTTCACTCAGATAATCAATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTC--AGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=2622 s mm7.chrY_random 26993764 112 + 30114534 TTAAGCATGATAATATTGAAAAGAAATTACAATT--TTTCACTTTGAAATTAAATCTCTGAAGATGATAACTTAACTTGTGTTTGGAAAAGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA s bosTau2.scaffold2750 19906 115 - 102126 TCAAACACTCTAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATA a score=2314 s mm7.chrY_random 26993902 96 + 30114534 TTGTTCAAACAAAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAATGAAAATAACTGAATAGTA-GGTTTGT-AGCATTTGACACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 20067 104 - 102126 TTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=4591 s mm7.chrY_random 27019078 200 + 30114534 TATTGTACAGTTAATAATTTTATGTCACaaaataatattatactaataattatttaaa-CTGTGTCTTATACTG-CTAATATGGTTTCACATATACATGGGAGTTTGGTAGCCTCAGGAC------TCTGTCCAGGTAGCTGGATCATGTTAATGAATTTTACACTCAGATTGCCATTCATTTTATTTTTAGTTGCCAATTTCAAGGG s bosTau2.chr13 22763104 205 - 62721844 TGTTGTTCTGCCAATAAATTAAGATCCTTAGCCA---TTTCATTAGTAATGATTTCAATCCCTGCCTGGAGCTGGATAATTCTGTTAAGCGTGTAAATTGGGGTTTGGTAGCCCCAGGACCCATCTTCTGCCCATGTAGCTAGCCTGTAGTATTGGATTATGCGTTCAGGAGACCACTCATCATCTTTCCAGTCTCCAGTCTGTAGAG a score=4259 s mm7.chrY_random 27019475 390 + 30114534 GATTTCTAAATGGTCCCCTCTGGTAAGTTGGAACAGGAAGAAAATTGTACAGCTAGTCCCCAAAACACACAATCCTGAT---TAGGTGAGAAAAAGTATAATTGAGGCTGTGTACCCAACATATCCAGTATAGCCC------ACAAAGGGCATGGTACCTGATACCTGCA-TTGACATTTTTTTTCGGTCCTGTCAG------AGATTAGAGAAACTAGACAAGGAATAGATGTTTTGTTCAAAGTGGTTTGGGAATCCACACCA--TTGAATTTCCCAAGTGACTGCATTAAAGAATGTTTGGCCCAGGCATGTGGGGCTTCCAGCTGAAGT-TTAAATCACC-CTTCCATTAGGTAGGTCAGTTTTCCCCAACAACTTAAGTATT----AGTTCAATTTTGGTtttggtttt s bosTau2.chr13 22763349 395 - 62721844 GACTCCCAATGATTCACCTTAGGCTAGGGAGAGTAGGAAAAAGGAAGGACAGATAGTCCCCAATACACATGCTCCTGACCTGTTGGCTGGTAAAATTGTATGTGCGTTAGT----CCCACAAATCCAATATGATCCTTCTGGACGAGGCCAATGG---------CCTTCAGTGGACAAGTC------ATCCCATCAGGTCTTTAAATGGGGGATGCTTGTTAGAGGGTGAGGATTAGGCTCTGTATAGTTTGGGCATCCCCACCAACCAGAAGTATGaatattataatattataatatttttGGCCAAGACAAGTGAGTTTTCCTACTGGAACATTGAATAATTGGCCCCACCATGCCAGACAGTTTTTGTCAATTAAAGAAGTCTTTAAATGCCAAATTCTGACCCTGGTCTT a score=3781 s mm7.chrY_random 27020092 96 + 30114534 TTTTTTATCTATCCAGG-CCATAGTTCTTCCATGTTAGTTTTTTCACATGCATGGCCAAAATACACCCTTAGCTACTGGACTCTAGTGTCTACCAGG s bosTau2.chr13 22763786 97 - 62721844 TTCTTTGGCTTCCCAGGGCCATTGGTCTCCCATGTTAGTTCCCCCACACACATAGCAAGAAGTAACCATTAATATCTGGGCTATGGTCTCTGCCAGG a score=6066 s mm7.chrY_random 27021035 707 + 30114534 AAACAGATTTCTTGCTATGGGAGCAATGAGAAATGGGCTAATTTTTATTTCCTCATGAAAAGAATGGAAGA-TCTGGATGT---CACTTAATGCATGATAGAAACTCTCTTGACATTTAACACAGACCCTGTGATCGTGCCCTTTCC----------------AATCTGCCAGCCAGTATTCTGTCAGGGGTTTCTTAAGTTAGTGATATTGAAATTAGAATGTTTCCAGGTCCCTAGTTGACAGTCTGATGCAGAAGGCTCCTTTTGAAGGAGCACCATTTTTGCACT--------------------TGTAGTGCCAGGTTGTTCATAAGATGTGCTTCCAGTAGGAAATGT--AAAAATGGGCTTTAGGGGTACATCTGGCCAGAGTTGAAGGAT----GTTCACATATATAGTTATCATTTAGCCTGTATGC----------------------CCACTCTGAGTGCT---ACCACTGA-------------------CTCAATGAAGTTGATCAGC-----------------CATAATCTAGGTTTG-------CAGAGAC---------ATATAAAATTATTGACACTGGTTGTCCTAGGTTAGAGAATAGTAACTTTTGGATCATTT---GTCCCTGTCCTAAGGGATGG--CTCTGGTC-GTCTTGTCATTCCACTGTTGGGGAAAACTGCATATCAAAAAATAATGTCTCCCA----TGTTGGTAGATGGAGTATGTGATTTTTTTTTATACTT-----------------------GAAAAGTGGATGTGACAAATGAAGCTGGGTCCAAGTAAATCCTTATCCCAAATGAGTCAGACAAATACAGTAGATA s bosTau2.chr13 22763886 839 - 62721844 AAAGACATTTTTAGTTTTGGCTGGAATAGGAAGAGGACCACTTTCAGTCTCTTCATAAAAAGAATGGAAGAGCCTGTGTGTGGAAATCCAGAGAGGAATAGAAATGCTCTGGAATAGCAATGCAGTTCCTG-GGTCAGGACCTCTCCTATTAATATAGATGCTGATCTGGTGACCCTCTTCCCATCTTGAGTCCCCAGGGTTGAAGACAGTGAAATTGACTGGGTTACACGTCCCCAGCTTACATTTGGGATCAACAGTTCCCTTTTGGAGGAGTGTTACTTTGTCCTTATTCTCCCAGGTCACCTCTATATTTTCCCAGGTTGCTCATCTGACACAGGCCCAGGTCAATCTGTGAAGAAAGGGGCCTTCATATCAC------CCAGTGTTATGGGATACTGGCTTACACATGTATTTGTCATTGAATGTGCATTCTTGTTCCCATGACAAGCCTCCACCATTCAGAGTACTGGGGTTACTGGGGTTTTTGTGAGCAGCACTCTCATCAAAGTGCACCATCACTGGGCTTTCTAAATTCGTAATCTATGTCGGGCTGACCCAGAGCCTCCGTCTGAGTGGCGAACCTCTAACCATGGGCTTTCTAAATTCGTAATTTGTG---TCTGGTTCATCCAGAGCCCTCCTTCTAAGTGGTGAACCTCTAACCAGTCTT-------CACTG-GGAGGGGAACTG-GGGTCAAAACG-GATGTCTGGCATTAGTGTTGACAAATAGAATAGGTTGTTTTGTTAAGTACACAAGTTTCGACATCTCCTTGGCAAGAGAAGTGAGTATG----GTAAAGCAAGGTCCAAGCGACCCCCTGACCTGATCTAGTCATGCGAATGCATGAAATA a score=3869 s mm7.chrY_random 27022622 105 + 30114534 ATTTATCTGAAGGCCAAGCCAAATGAAATGTTGTTTTGATTCCTTTTTGGGAATA-----CAAAAATCCATGTCTCAAACTAATATTTATAGATTTTGTCAGTTGATTTT s bosTau2.chr5 36527708 107 - 76426644 ATTTAATTATGGACTGAGCCCAGTTAAATGGCATTTTGATGTCATTGTAGAAATGACATTCAAAAATCCATGCCTTAAAACAGTATTTATATATCCTGT---TTGGTTTT a score=3428 s mm7.chrY_random 27023059 71 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAAGAAATATA-----CTTTCTATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTT s bosTau2.chr5 36527827 76 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTT a score=7970 s mm7.chrY_random 27024559 422 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTACACTTAAACAAGAAAATGATTAAAGATATTTAAAAAT---AAAGAAGTTCTATTTTAACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAAACAAAAAAGTTAGAGATTTTTTTATTTGTT----------TTATATATATACCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAGTACTTCAGATTATCCTCCATGATGGCTCTTTCAAACATAGACATTTTTTTTTTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCA---TTTCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGA---AGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTTTAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCT---TCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=6385 s mm7.chrY_random 27025276 420 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTACCATGCAACATGCATGGCAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACtaaatatatatatatattta-caataatatGAAATAACATTATGCTACCAATTGTGGAGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-------------------------------------ATTATGTAATA------------------------ACTATTTGGAT------------AAAATTTA----GGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA---ATGTGTTCACCACTTACATACAATAATA--ATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=21128 s mm7.chrY_random 27027268 1303 + 30114534 aaatgcctagtcgttttcattgatatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggataaatagataatggaacttaatttagtttcatatgctcaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt-------tttttatggtaccaaccactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACATCCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGCACATTTCATACCAATATGAAAATGAACACTCAGAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGAAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCGCTAACATATTATCAGAGAGGTTTTCA---------TTTACGTTTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAATTATAAacacacacaacacacacgtaacacacacacacacacacacacacacacacatatatatatatatatatatacatTTAC----AAAATTTAATTATATTTCAATGTGGTTTTTTTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTA----AAGACAGTGCAAAACATGTCAACTAAAATATACAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTATGAATTAGATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCACACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATATAATTTTTTTTTAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCGTTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGAGTCAT----TTTGAAGAAAAATTAGATGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAATTGATAGA-TATCACAAA-CATGCTT s bosTau2.chr5 36530122 1370 - 76426644 AAATACC-AACAGCTTTTAT--ATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAG---CAATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAAC--AACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTT-----------------------------------------------------------TAT-TATATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGT------TAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAAAAAATACACATACTATCAAAAAGCATGATT a score=3108 s mm7.chrY_random 27035587 94 + 30114534 ATATTTCTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=4761 s mm7.chrY_random 27055252 343 + 30114534 ACCAATTATCTGGTCC---ACTTGCCTACCTCTGGTTATCCCAGTTTCTCCACCTAAATTCGT-TACTGATAATTTCCTCAGTATGCAGCCTGCCATG--ATTCA-----CAGACAGGTACAACAACTGCTTCTGACTC----AGTATTAAATTCAAGTCCTTTCTCTTCTTCAG-GAATGTTAATATTTGACGATATACAAATTTATTTATCTGAGGTAGAATGGGCTATGCT--AACCCATGGAAGAAGACACTCTACAGTGTTGTAATGCTGGCCATCTACAAGCTAACCACCTGACTAGTTTAACTGGTTAACTATAACTCCTTTCCTTTGTGTATACATTGTGTAACCTGGACTGT s bosTau2.chr25 341981 348 + 41414979 ACCTGTTTGCTGATCCCGTGCTTACTTCCTTTCTACTATCTCA----CTTAAAATTAATTTATGTGCTGTTAGTTCCTTTAGTGACTGGCTTACCATGCAGTTCATGGCTCAGAAGGTTG----GGCCACTTTTGAAGTGGCAAGTACTTGGCTGAAGCCCATTCTCTTCTTTAGAGCTTATTGACATTTGAAGAAGTGGCCATGTATTTTTCCCAGGAAGAATGGGAGTTACTGGATCCCACT-CAGAAGGCCCTCTACAATGATGTAATGCAAGAAAACTATGAGACTGTCATCTCTCTAGGTAAA--GTTT--CTTTTTCCCCTTCCCTTTGCACAGCAGTGGACTAATCTGTCCTGT a score=11884 s mm7.chrY_random 27057283 1058 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACTCACTAAGAAATAAAACTACATCTGTGTTCCTCTTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATGAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTGTGTGAGAAAATGTTTAACACATGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC--AGACAGAATGG-----------------CCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAATGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATA--TCATAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGTTTCCCACTGTCTTT--------CATTATCTGTGTTATCCACACAT---------TTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTAGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATTATG----GCCCTTGAAG-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACCGTCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGACT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCCAGCACAAACCTAAGAAAGTTGTAAGCATTTGAAGTC----------------------CACTTACAGATCTC-ACTG-------------------------TCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGGAA---TTTTTAAATGATTGCATACCACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAATTTGT s bosTau2.scaffold5600 1080 1221 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-----AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCT-ATCTACATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAATTCTAG----CATTA---------------AGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACTTAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCATCTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=3426 s mm7.chrY_random 27058595 55 + 30114534 CTTAAGATGGCCGTGTAGTCAGAGAAGTGAATCCTGGCTTGTGAGTTCATGAAAG s bosTau2.chr3 46304496 55 - 85360813 CTTAAGATGGCAGCGGAGTCAGGGGAACTAATCGGGGCTTGCGAGTTCATGAAAG a score=4837 s mm7.chrY_random 27059955 89 + 30114534 AGATACTATGCAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATGGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006490 89 + 85360813 AGTTTCTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14263 s mm7.chrY_random 27064230 375 + 30114534 TGGTGGCTAACA-AGTTTATATCTCTGTATCCTTATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAAAGATGTCCAGATTCTGAGAACTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTAAAAAACGTGTCGTCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGACTGCTCCCTGCATAATCACTGCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTAGATATCCACATAGTTGATGCGGATTTCAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGTCCAAGCCTTACACATTTGAGCTTAGGAGAT s bosTau2.scaffold6942 24684 371 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGT a score=14185 s mm7.chrY_random 27069596 557 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCTCTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAAGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA--------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=11229 s mm7.chrY_random 27150408 422 + 30114534 CTGTAAATTATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTCACGAATTTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGAAGAAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGATGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAAAGTGAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTCCAAGAAGTGGCATGGAAAATTAT----TACTTG----------ATTACAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172806 444 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=38449 s mm7.chrY_random 27153971 1287 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTATGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCCTCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCATTGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTACTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACGGCATCTATGGACAGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTTGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACAAAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA------CACTCCTCTTGCTGAGGAGAGA---TCAGGAGGTGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGATGCAGTAAACCAGAAAAGATGGTTCTAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGACAATCCTTCCCTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCAAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAATGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAA----GTTTTTTTTTCCTGTGTTAGCTATATAAGGGTCTTTGACAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTATTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGC-----TGGAAGAGATG---GCCTACAGTGGAAGGAATGTCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGAAGAATAAGGAAATGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACAAAAATTTTGGGAAAGTGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAACCCAGA-AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAA-----------AGATTT------------CTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTG--AAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT--GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGT-TGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10767 s mm7.chrY_random 27160854 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATGCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATTCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAGA-TATACTACAAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=5676 s mm7.chrY_random 27172788 152 + 30114534 GAATACTTATAATAGGAGAGATCCCAGGCTAATGGTTTTCTTTCTT----------------------------------ATAATAAGTCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTCCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGatatat s bosTau2.chr3 45130465 181 - 85360813 GAATACTTATTATCT-----ACTCCAGTCTCATGGCTCACTTTCTTCTTGACGCCCTCAATTTGCTCAGACTTAGTAGTAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT a score=2683 s mm7.chrY_random 27172986 118 + 30114534 CTCACACAACTTTTTAAAAATCCTCTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATGTATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130670 99 - 85360813 CCCACCCCACTTCTTAAAA-----CCA-TGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9601 s mm7.chrY_random 27173458 314 + 30114534 ACTGAATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAATCATGTTCATGAAGTAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCCCGAGATGAAAATTATTTTCATCAACACACATGGCACTGCATAGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGACTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=9644 s mm7.chrY_random 27276936 407 + 30114534 AGTGGCCATGACACTTGGTAGTATA-GTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCACAGGTTAGGGTTATTTGCATAACATATTTCTCATCAGCCATCATTCTCAAATAATCCAAAGGCATCCTAACCCCACCCCCCCCACACACACACATTTCTACTTGATTA--ACCATATTGGCATTATTTATTTTTATGGAAACATATCCCTTATTCTTGATTTAGTTCAAATCGTGGAAAATGTTGATGTACAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAAAATAGAAGTCAAAAAGATTAAATCCATTGTTCCTTGGAGCTGAAGATTTCCCATCAATTTAGTAAA-------ATTTTATAAATATGATTTTAAAAGAAGGC--AACACCCTGAAAAAGTCTT--ATTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC--------------------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTACTGGCTAT-ATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=6732 s mm7.chrY_random 27282752 379 + 30114534 TCTATCACTCTTT-----CCCCCAAATTGTTGTTTCTCCCTCAGACTTCATTCC-------AGAGATTCTATCTATGTCCTGTCTTTCTCCCCTTC--TTCCTAAAAATCCATCTTTTGCTGCCATCCCTGCTCCTCTAAGTCATATCTCCAATTCCTTGCTCCCTATGC-----AGACCACAGAATCTAAGTCCTGT-CCATTTTAGCCTG------TGTGATATTAGATGTATGCACTGTTCACAGCCTGAGTTGCAACTTTCATCTTGCTTTGATGTTCTTTCCACCATA---GTCCATCTCTTCCAT-----CAATGTGTTCACTAAAAGCATGTCATGTC-----ACACGTATTAATTTTTAGAACAAAACA--AATTTTATTGACCAAGATACTGAGGTTGTCAAAGACCCATA s bosTau2.chrX 20326712 408 - 48857030 TCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGA-AGCCTCTCCATTTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT------CTTCCTTTCCCCCACAATCCAT--CTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAGATGACTGATTATGATACTAGCTGAA--CTTTATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATG-GGTTATTAGGGACCCCTA a score=29057 s mm7.chrY_random 27286519 806 + 30114534 ACACAGGAAAACAA-ACATTTT----TTTTCAATCCTATAAGTTTACATTTCTGTACTTTGTGATTTTTTTTTAATTTAAGTGATA----TTTGACACCAGAGTATAGACATAGATATGTAGGTCACCAAGAAATTTGATAAAGTACACAGTAGGATTGGCTAGAGCTTTGTAAACAACCTTTCCAAACTTTTTGGATCCATCATCTCTGGTGTACTGCACCCAGGAACCTATTAAGAAGTCATTGTCATCACCTGA---TCTCGCCTTAGCCAGAGG------GGTCTCTGGAATGATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGACGTAGAGGACCAGATCCTTCTTGTAGGAAATGTAAAAATAGTCCTGTAAGAATGGCACCTGGGATAGCACCATCCCACTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTCCCCTCAAATTTGTGTTGTACCTCTCTGCCAACCAGGGCGCTGGAGAGTTGGACATCCCTCACCTGAGGAAAAACTACATTGTGAGGCAAGACCTTAAGATTTAAAATCCTCTCATCGCTGTGGAGCTCCTGTCCGTAGACACTGTCAATTCCGTCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTTGCAGTTGACCTAGAATGATGGCCTTCCAATGGGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCACCCGTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCCCAGTGCCTGGGAAGAAGGCTTCCCCCTATTCTTCTTCTTGAGTGA----TGTCATGCTCAGACTCTTCAG---AGGTATTGTC-------------------TTCTACCTGGCTGTAGACCTTTTGTG s bosTau2.chrX 20327130 844 - 48857030 ACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTT----ACCCTAACCATTAAGACTTTTTCACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTT-TTGAGAAATCTTTTTCTTCCTCATACT-TGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTG a score=5085 s mm7.chrY_random 27315767 203 + 30114534 TTACTCATGTCACTCATGTTCCATTTTCTCATGCTCCTTTTTCTTCATTGGTCTTCCTAACAGAAAAAAATTGTAGCCTTACAACAAATCACTTTTGGAATTGTATTCATGGTGTCTGTTTCCACACTGCTTGCCAAAACAATCATTGTAGT-TTGGCTTTCAAAATCACAGAACCTGGAAGAGGTTTAAGGAACCTCCTTTTA s bosTau2.chr7 14417432 201 + 69141744 TTGTTCATCTCCCTCCTCCCGTGCTTCCTC-TGCTCCTTACTCTTTATCAGTCGTCCCCACACAGCCACCTC--CATCCTCCAACAGACCACATTTGGAGCTGTGTTCACTGTGGCTGTGGTCACTGTTTTGGCCAAAATCGTCCCTGTGATCTTGGCATTCAAGGCCAGGAAACCAGGAAGAACCATGAGGCGATTGCTCTTA a score=16342 s mm7.chrY_random 27316176 467 + 30114534 TACATCCTTCTGATATGTTCCAT-ATCAATGTACAC-TGTGGGCAATCTGGCTCTCAGTTTCTCCTCCTTTTGTTGATATTGATATTTGTTGATATTGATATTTGTTGATATTGATGATATTGATAATCATTTTGTGCAACAAGGGTTCACTTACTGCATTCTACTGAATTTTGGGATACTTGACCTGCCTTGCCCTTGGAAGCTTCACTGTGGATTTCGTGGCAAAGAATTTTCCTGAAACATTCAATGAAGCCAAGTTCTTGACCTTTGTCGTGCTAGGATTCTGCAGTGTTCATGTCACCTTCCTCCATGACTCACATAGGACTAAGGGCATGGTCATGGCTGCTGTAGAGGTCTTCTCAATCTTGGCATCCAGTGCAGGGATGCTTGGATGCATCTTTACACCCAAGATCTACATCATTGAAATAAGACCAGACTTAAATTCTATCCAAGGTGTCAGATAGAAGT s bosTau2.chr7 14417644 451 + 69141744 TATGTCTTTCCCATGTACTCCATGATCCAGGTGATCATCTGTGGAGTCTGGCTGGGAGCCTCTCCCCCTTTCCTTGAGATGGACACTCATT--------------CTGAGCCCAAGGA----GCTCCTCATCGTGTGCAACAAGGGCTCGGTCACTGCCTTCTACTGTGTCCTGGGCTACCTGGGCTCCTTAGCCCTGGGGACCTTCTCCTTGGCTTTCCTGGCCAGGAACCTGCCTGACACCTTCAGTGAAGCCAAGTTCCTGACCTTCAGCAGGCTGGTGCTCCTCAGTGTCTGGGTCACCTTCCTCCCTATCTGCCACAGCACCAAGGGCAAGGTCATGGTGGCCGTGGAGATCATCTCCATCTTGGCCTCCAGTGCTGGGCTCCTAGGCTGCATCTTTGCCCCAAAGTACTACATTGTTCTTATAAGAACTGATAAAAACTCTTTGAAAAGTTTAAAGAATAAGT a score=7897 s mm7.chrY_random 27319577 397 + 30114534 atCCTTTATGCAATCAGGCTGCAAATTTTCATTCTCTTTGTTGTTATTGATGTCCACTTAGAAC------AGGCCCATATCCTATAGTGCACCAATG------TTACTGCCCTTTACTGTCTCTTGCAATACCAGGTCTACCTTGTGTTAGAGATATACACAGTGACATTT-TGGTTAGAAATCTCCCTGGCATATTCAAGTAAGCCATTTTCTTGACTTTGAGCATGCTGGTGTTCTGCATTGGCTAGGGTATATT-TTTTTTATTTTCCAAGATGGCACATAGGGTAAGGACATGGAGGCTAATAAGGTCTTCAACATATTGTCATTCCATGC---ACACCTGAGA-GTA-------CCCGATGTACTTTGCAATTTTGTTAAGATCAGAGAAAAATTCTGTTCAAGGTTTAATGAAAAA s bosTau2.chr7 14417677 416 + 69141744 ATCATCTGTGGAGTCTGGCTGGGAGCCTCTCCCCCTTTCCTTGAGATGGACACTCATTCTGAGCCCAAGGAGCTCCTCATCGT---GTGCAACAAGGGCTCGGTCACTGCCTTCTACTGTGTCCTGGGCTACCTGGGCTCCTTAGCCCTGGGGACCTTCTCCTTGGCTTTCCTGGCCAGGAACCTGCCTGACACCTTCAGTGAAGCCAAGTTCCTGACCTTCAGCAGGCTGGTGCTCCTCAGTGTCTGGGTCACCTTCCTCCCTATCTGCC---ACAGCACCAAGGGCAAGGTCATGGTGGCCGTGGAGATCATCTCCATCTTGGCCTCCAGTGCTGGGCTCCTAGGCTGCATCTTTGCCCCAAAGTACTACATTGTTCTTATAAGAACTGATAAAAACTCTTTGAAAAGTTTAAAGAATAA a score=3382 s mm7.chrY_random 27335535 54 + 30114534 TGCACAAGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCAGACACACACACACAAATACACA s bosTau2.chr17 11845060 54 - 45915461 TACACATATGTGTACATGTGCATGTGTGCGTGCAAACACACACACATACACACA a score=13252 s mm7.chrY_random 27354079 556 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAACACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTAATCACAAAG------CCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGAGGAGTATCT--ACAATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAAAATTAGTAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAACAGGTATGACTAATATTAAAATAGTAAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTAGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC----TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14819 s mm7.chrY_random 27359613 376 + 30114534 AATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAGGGCTTGGGCATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCTGCATCAACTATGTGGAGATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGAAGTGATTGTGCTGGGAGCCGACACCTCAATCTTGGCTGAGGTATTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGATGAAACGTTTTTGAGGAAGATGTACCCACATTTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAATGCTCAGAATCTGGACATCTCTTCCCTATAAGCTGCAAGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATGAGGATACAGAGATATAAACT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=5806 s mm7.chrY_random 27363182 597 + 30114534 AGAAGTATCTTT---TCCATTTTCTAAACAACAGACAGTAGTAGTTTCCTTCCTAATACAAATGTCTCTGGTTTAGTTAAATAGATTTATTAGCT--------TCAAATCAGACAATACAATGAAAGTTCATTTTCAGAAGGGTTAAGTGGAATTGAATTTGTGTTGTGTA-TTACTAACTGAGAGG--------------CCAATTTATAACCACAGAGCACTTTGAGGTGAGTGGAAAAAATTTTTACAATTATAAAATGCATAAAATTCCTTACCAAATTTTTATCAAACTTGCTTTATATGT------------AAGATCAACCAAAAATTAACAGACAACTACCAAACAGTTAAAGCATACAA---------------CATGCCAATAA-----------------------------------------------------------------------------------ATTAAAAGA----AAATGCTTATTTAGAAGTG-----GGAAAAGATAAG------CTTTTATGGAAT---CTGCTTAATTGTATAAGAAAGAGAAACATCACTTTTCTTCACAT--GCTCAGAATTTAAGAGGGGGAAATGATCCATGCGATAATCCAGTTGTATGTACACAAAATTAAGCAAGATCCTCATAATTAATGTGTTAGTACACAATGCCTGACTCAAATTCTATCATAGACGCTAAAGTCCTGTCAC---TGCAGGCTCATCAGTCTCACT s bosTau2.chr3 46353062 704 - 85360813 aaaaatttttttaaCTTTATCTTTTAAACTACAG---GGAGTAGCTTCTTTTCTGAAAAATGTTAAGTAGGTTCAGTTAAAGAAATGTACCTACTATGCATTTTCAAGTCAGAGAATAAATTCAAAATCAATTCCCTACAAAGGTGATTACAACAGATGTTACATTATATAATTGTTTACTTTAAAAATATCTCTTTAGTTTCATTCCATGTCCATTTATCATTTTGAGTTAAATGACAAAAATTTGTGAATTCATATTTTACAGGAAATTCTGCA---------TGACAGACTTGCTTTTCATGCTTAAGTTGGATAAAAATCAATCAAGTA--AAAAAATTATCACTAAGCAGATAATATGTATAAGGCATTATACTATGTCACACCAGTAACATTTTGCCCAACAGAAAGATTAAACTGAGTGTTATAATTTAGAGGTTAGCACTTAATCTGCTGTGTAGATTTCACCTTCCAAATTGAAATATTTAAGACCCTCATTTAGAAAGGTGAGAGAAAAAGATAAATATTTCCTTCTATGTGATGAAATGTTTACCAAAACTAGGAGTATAGATATCACTTTTCCTCATATATGTTTAAAATTCAAGGAGGGGG------------GGAAAGCTACATATAAAAACATACAGATGAACA-----------------GTG---------AATGTATGACCCAATTTCTGTCATAAAAGGTAAAGTCCAGTCTCTGTTGCTAGTTCATTATTCTCACT a score=4504 s mm7.chrY_random 27364025 84 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCAGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCAAAGAATCTGCATAG s bosTau2.chr3 46354234 84 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAG a score=12750 s mm7.chrY_random 27365732 1059 + 30114534 ACAAGTTGTACATCCCTTTAGGCACAGGAGTAGTATGCAATCATTTAAAAA---TTCCAGTGTGTGTAATAAAAGCCA-AAATAATCAAAGTCACTTTACTGCTCTCTTTTACTTCCACAGAGATGGATAACTAGTATGGA-------------------------CAGT-GAGATCTGTAAGTG----------------------GACTTCAAATGCTTACAAGTTTCTTAGGTTTGTGCTGGCTTTCAGGTCTTCTTGTGTTCCCCAAGCTTCCTTGAAAATAGACAATGTCAAGGGAGAAACTGAGGTGA----CAACTACCATGCTTACACTG-----AAGGAAGACAC--AGTCTTATCATCTTGTTC----ATAAATTTACCTGAATCTTTGTTTT-GGTATTCTATGACGGTCAACATTATAGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGCCCT----AATAGCATTTTACATCTCTTTTGAGAAAAGTGAAGAATTAAATCATAGTCCATGGTACCTGAAACCAGAGGATAGTGTCTAAGAAA---ACATTGCTATGGACACAGATGTCTAACAAAAACATAGGTATGGATA--------CAAATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATTACTAATACAAAAAAAAATGTGTGGATAACACAGATAA------------------TGAAAGACAGTGGGAAACAACGTAGAATTCTATTGTATCTTTTTTTATGA--TATGAAACATAACTCTCCCAAAA----------------TTTCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTG---CAATATGCTAATTTTCCTTAGCTTTG-----------------CCATTCTGTCT--GAGTTT------------------------------------------------------TCTGACTAAGTACATTCTGGTGTCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTTATGAGGTGACATTTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTAAAAAATCATTGATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTTCTGGCACCAGGAACACAGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTTTAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 50284 1221 - 52585 ACAAGTTG-GCCTCCTGTTAGGTCCTGGAGCAGGGTGGCATCAACGTGAAAGTCTTCTAGTCCATATAATGAAAGTTTTAAAAAAAAAAGGCCACTCACATGCCCTATGC--CTTCTACAGAGATAAGTACTCAGATGAGAGCCCAGGCTGCCTCCTTCATCATTTCAGTCTAAATACCTAAGTGTCGAAGGCTCAGCAGGAAGAAAGGTACCAAGTGCTTCCAAGGCCCCTAGGCCTTTGCT---------------TAATG----CTAGAATTCCTTGACAGAAAACACTGCAGTAGTGGGTGCTCAGGGGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTATT-------TATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGTT----TAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGT---TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=2977 s mm7.chrY_random 27388483 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAAAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=13304 s mm7.chrY_random 27395618 751 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTATTTTTTCTTCAAA----ATGACCCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTTTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATACAGAAGTCTTGCACATA---GTCTTAGGAAT--GTAATTTACTGATTATTA--TGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAAAAAACCACATTGAAATATAATTAAATTTT----Gtacatgtatatatata s bosTau2.chr5 39895153 839 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAA---TTATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAG--CTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTATTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA a score=10009 s mm7.chrY_random 27396537 418 + 30114534 TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCTTTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaa------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39896104 418 + 76426644 TGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGT--TGTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6243 s mm7.chrY_random 27398547 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCATATCATTG-TAAATATATATATATATTTAGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTACCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=2428 s mm7.chrY_random 27399044 115 + 30114534 ATGGCTTTGTATGAATTATTAAAGATATGAAATGATAAAATGGGAATTTGACCTCAGATGTAC-CTCATATTTAATAACACTATAATTATCCTGCTTTATTAAACA--taaccctaac s bosTau2.scaffold10439 16855 109 - 23754 ATAGTATTGTGGGAGTCACTTAAAATGGGGAACTGCAAACTGGGAATTTAATCT-AGATGTATACACATGGTGAAGAAAACTG--------ATACTTGATTAACCCTTTAATCCTAAC a score=7709 s mm7.chrY_random 27399261 423 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTGTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAA----------AACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA-AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT---TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 27401113 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 27401514 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=5764 s mm7.chrY_random 27402815 396 + 30114534 GAGTGGGCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACTGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957523 435 + 62721844 GAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 27404058 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATAAAAAA s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=4137 s mm7.chrY_random 27404380 390 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACCTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGGCCAAACATTCTTTAATGCAGTCACTTGGGAAATTCAA--TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataatattataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4356 s mm7.chrY_random 27404969 164 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTGATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataat s bosTau2.chr13 39958535 172 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAAT a score=2192 s mm7.chrY_random 27430363 96 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTGTCAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCGTTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA s bosTau2.scaffold2750 81955 104 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAA a score=2622 s mm7.chrY_random 27430485 112 + 30114534 TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGTAATTTCTTTTCAATATTATCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 82105 115 + 102126 TATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=18717 s mm7.chrY_random 27430611 954 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATTAAGAAAGCTATTTTATTCGGACAT----TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATTGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GAATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATACAAGTTACCCCCTA--TTGTAGGAAATGAGTGGATATTCTGACAGTAAATAGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAAGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAGATATTAGAAAG---TGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGACTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTCGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACAAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCCAACTCACTAACTG----TGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaacagt-agtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGATAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=11281 s mm7.chrY_random 27453181 393 + 30114534 AGTGTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTCAGAGGTTAGGGTTATTTGCACAAAAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAACCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTGCT--TGAATAATCACATTGGCATTATTTATTTGTATGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCAGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTGATAATGGGACAAAACAGAAGCCTATAGGATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATAAAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAA--AATTGTGAAAAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742254 401 + 45915461 AATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=308 s mm7.chrY_random 27459208 116 + 30114534 TCAATCAGTTTTCTGCGTTTCACCTTGT-GTAACAAGGC--CACATTTCTTTTAAATGTCCCTCTTTCCCCAACTTTTTGTTTCTCCTTCAGTGTTCACA-------TCAGAGTTTCTACCTATGC s bosTau2.chrX 28007355 124 + 48857030 TCAATTTATCCTGTCCGTTTTTCCTCTTAGCCCCAAGATTTCACTCTCCCTGTTATTCTTCACCCTCTTCCAGTTGGCTGCCTCCCACTCTTAGGTCACCCTCCCCTTAGGAGCCTCT--CCATTC a score=37973 s mm7.chrY_random 27459324 1195 + 30114534 TCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTGCTGCTATCTCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCT-------------ACATGCAGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCACCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATATTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTAACTCACAGAATATCATGTC-----ACACTTTTAAATTTTTAGAGCAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAAAAAACAAAAAACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATACGTTTACGTTTCTGTACTTTATGAT-TTTAC----AACTTCAAGAATCTTTGGCACCAGAGTATAGACATAGATATGGACGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACAGAAGGATTGGCTAGAATTTGATAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTTTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGAACCTGGGCTAGCACAACCCCCCTCCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACTGCTCTGCCAACCAGGGCTCTGGCGAGGTGGGCATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAACCTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATCATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGGAGTTGACCTAGCACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACAACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTAACATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20326788 1204 - 48857030 TCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTC--------TTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACA---AGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACA---CTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATCATATA--TTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=8217 s mm7.chrY_random 27462473 360 + 30114534 TTAGAGCAATAAATATTTTATTCAAACAAAGCAGGAATTTTACAGGGTTAAGTACCTTGTATTGAAGTTATTTGCAACCTTGAATCATTGATTCTTTGCAAAATGAGAAGGCAATCTAGCTCTTGTTCCTGCTTACAAAGTTGTGATGAAGTT-----AAACCCAATATCAACCAGTCAGGTTTTAAAGGCCTT-TAAAATTTATTAGTATTTCTGGTTACAAGTAATTTAGTAGATTAAATGCAGTAAAACAGGGTGAAATAGATTTGATAATTTTACTTTTGAAATA--TGGGTAAACAAAATATTGAATGTTGGTAAGTATGGAATTTACTTA---------------CAAATTAT-CAGGCACTTT-AATTTTTCATGCCA s bosTau2.chr17 25750563 356 + 45915461 TCAGGGGAAATAATTTCTTACTCAAACAAA-CTTGGACTTAACAGGATTTAACACCTTGTATTTAAATTGATGATAACTATGAGTCA-------CTTGAAAAAT------------TAGCTACTGGGCTTGTTTCCAAAGTTAGGGAAAATTTATGACAAATTTAATATTGACCAATAATATTTTAAAAGTGTTAAAAAAATTTTCAGCACTGCTGGTTACAAGGAATTT-----ATTAAAGACTGTAAAATGTTATGAAGTAGAC----TAGTTCTCTTTTTGAAATATTTTAGTAGATGATATACCAGGTAACAGTAAATGTAAAACTCCTTTATGCATAATCCTACTTCAAATTATGGATGTGCTTTAAAGTTTTCATGCTA a score=11860 s mm7.chrY_random 27463500 413 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGCGTGGGAACTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTAATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=13704 s mm7.chrY_random 27473210 377 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTATGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGATATTTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTATCTGCACAAGCACTTCCCAATACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGTTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGTAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCACACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAG-GCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9813 s mm7.chrY_random 27477620 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGGTCTGTGCATGCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=2473 s mm7.chrY_random 27478288 124 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTGTTTTATGATATACTATATATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAG s bosTau2.chr3 40230044 99 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTT-------TTAAGAAGTGGGGTGGG a score=5770 s mm7.chrY_random 27478472 152 + 30114534 atatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTATTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230167 181 + 85360813 ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=20455 s mm7.chrY_random 27496115 808 + 30114534 TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTAAAATGTCCCACTTTCCCCAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTAACTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTTACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCTAACACAGTAAAAAAAAA---ACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTGCATGGAAGGATTGGCTAGAAATTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTTATGAT s bosTau2.chrX 20326666 852 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGAT a score=9478 s mm7.chrY_random 27623726 499 + 30114534 ATTTGTAAGTAAATTTTATACTTACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTTTTTTCCTGCATTTAATCTATGAAATTCCTTATAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAAGTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAATAATCCATAATTCACGATTGCCATTGGTTTCAATACGTCAATACATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGCTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGCGAAAATTGGTGTACTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGTGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGGATGTTGTCAAGTCAGAA s bosTau2.chr17 20164586 450 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAAGTGACTCATA-------GTTATCATCAATT--------TAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAGTCCAAG-TTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG------GTCT-----TGCCAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAA a score=35016 s mm7.chrY_random 27626063 1242 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGTTGGAAGGAAGGTAACGAATGACCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATCATTTTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTTTTTATTTGGTGAAGTATGAAGGAATTGACAGTGTCTACGCACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTTAGGTGAGGGATGTCCACCTCATCAGTGCCCTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAACATGGCTCTGAGGAAAAAAGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTAAATGACTGGTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTATGTCTACTCGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACGTCCACATCATTCCAGA------CACCCCTCTGTCTGAGGCGAGA---TCAGTTGATGACAGTGACTTCTTAATAGGTACCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGTTCCAAAATGTTCGGAAAATTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAATATCACTTAAATTGAAAAAAAAAACAC---------GAAGTACAGAAATGTA-AACTTATAGGAATGAAAAAAATGTTTTTTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATTTTTGTTAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAA----ATTAATATTTGTGAC-ATGACATGCTTTTAGTTAACACTTTGT-----TGAAAGAGATGGAC---TATGGTGTAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAAGTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGCTGCTGTGGTCT-----GCATATTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTCCAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATGTGTAGGAA---GTAAGGGAGAAAGACAGGACATAGGTAGAATCTCT--------GGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAA--AACTTTGGGG----AAAGAGTGATAGATAAAAGGAATGTGGCCTTGTTACACAAAGTGCAACCCAGAAAACTGATCCAAAGAGACTCACAAAT s bosTau2.chrX 28529095 1282 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGA----TGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAA----GTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA---ATGGAGAGGCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA------GAGTGAAATCTTGGGGTTGAGAG-GAAACCAGGATAAATTGAGTAAAGAGGGACACAAAT a score=10905 s mm7.chrY_random 27631409 405 + 30114534 CTATAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGACTTTTTCAGGGTG-------TTTTGCTTGTTTTAAAATCAT-ATTTATAGTATTTTACTAAATCGAGAGGAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGGACTCAATCCTGTTGACTTCTTTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTGTACATCAACATTTCCCACCATTTGAACTAAATCAGTAATAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGGTTAATCAAGTAGAAATGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAACTTGTTATGCAAATAACCCTAACCTGTGAGAAATGAAAAGTAATGATATCAAC----TATACTACCAAGTGTCATGGCCACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATAT-AGCCAGTAATGCCAGTGCGATC-CTCAATTAGCA--------------GAAAGGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAG--ATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=3870 s mm7.chrY_random 27659024 73 + 30114534 GATTAAGTGTATAAGCTTGTGTGTAT----TTGTGTGTATGTGTCCGCACACACATGCACATGCACACACATGTGCA s bosTau2.chr14 3409951 77 - 50711261 GATAATGTTTGTATGCTTTTGTATATAAATTTGTGTGTGTGTGTGCATGCAGGCATGCACATGTACACACATGTGCA a score=9591 s mm7.chrY_random 27734984 492 + 30114534 ATTTGTAAGAAAATTTTATACTTACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTGTACTGCATTTAATCTATGATATTCCTTATAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATTACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAAGTTTATCACAACTTTATAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTACTTTCCAAATAACCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATACATGTCATTTAACCCAGTCAAATTCCAGCTTTGTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACTACCATGGATGATGTCAAGTCAGAAA s bosTau2.chr17 20164586 451 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAAGTGAC-------TCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAGTCCAAG-TTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAA a score=35859 s mm7.chrY_random 27736953 1115 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCTCTGGGGAATAAGGTTGGCTGCAGAATTACTCACGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGCCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCATCAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACAGAATTGACAGTGTCTATGGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCAACTCGCCAGCGCCCTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGAGGAAACATGGCTCTGAGGAAAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTAAAGGACTGGTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACATCTATCAGCTCCTGGATAACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACAATGACTTCTTAATAGGTACCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGTTCCAAAATGTTCGGAAATGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAATTTCATGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTGAATTGAAAAAAATCACA---AAGTACAGAAATGTA-AACTTATAGGATTGAAAAAAATGTTTGTTTTCC-TGTGTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT--TGGTAGAGATG------GACTATGGTGGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATTTAATATCATA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGAATTAGCTTCTGTGGTCTGCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGAATTGACTTAGAAGAGCAGGGATGTCAGCAAAAGATGGATTTTTAGGAAGAAGGGGAGA-----------AAGACAGGACATAGATAG s bosTau2.chrX 28529095 1139 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCT-----------AAGGA----GAGG--------AGAGGAGAAGG------AACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAG a score=9845 s mm7.chrY_random 27743639 527 + 30114534 GAAACTCAGTTAAGTGTGTGTGTCAGTGACTCTAA--ACATCTTTCTTGCACTAGATTCCTATTTATAACACAGAAT---GGTCTGTAAATAATGAAAATATGAAAAT--AAGAATTTTTCAGGGTGTTT-GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGAGGTGAAATCTTCAGCTCCAAGGATCAATGTATTCAATCCTGTTGACTTCTGTTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTGTACATCAACATTTCCCATGATTTGAACTAAATCAAGAATAAGAGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGGTTAATCAAGTAGAAATGTGTGTGGGGTGGGGGCGGGGTTAGGAAGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAATATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGTGATAAATGAAAAG-TAATGAT-ATAAATTATACTACCAAGTGTCATGGCCATTTAT----TACTTG----------ATTTCATTTTCTTTTTCAT-TACATTAGTCTTTCT s bosTau2.chr17 20172727 538 - 45915461 GACATTCAGCTAAAAGGGCAGA--AGAAACTCCAATTGCATTCTTTGTTGACTAGGTTGTT--TTGTAGCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATAT-AGCCAGTAATGCCAGTGCGATC-CTCAATTAGCA---------------GAAAGGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATAGACATCACCCTCTTT a score=625 s mm7.chrY_random 27761407 154 + 30114534 TCTCTCTACCTCTCTGTTGGCATATTTTTCTGACATATTTTCATTTTGATTGTTGCATTTTTTCTACCATTTACTCTCC----GCAATG------------------TTGTCTAATCTCTGTT---TCTTTACCCTCTACTTCATCTGTATAAGTTATGTGACAGATACTAAATCACCC s bosTau2.chr25 41074719 163 - 41414979 TCTCTCAGCTACTCTGCTGGGATTT--------CAAATCTTTCTTTCT----CTGTGTTCTTTCTACTTTTTCCCCTTCCTGGGCAGTTGTCCCCTAGTCGTTTGGTTTGTTCCTTCTCTGTCGTATCTTCGCTCTCT-TTTGGTCTCTCAGAGATCTTTCAT---TTCTGATCTGTCC a score=5003 s mm7.chrY_random 27761564 180 + 30114534 TCCTTCCCTTTCTTGCTTTTCA----ATTTTGTTTCTGAGGTCTTAAGGCTTGTATTCTTAAATGTGCTAGAGCAGGTCCAGCACTGTCAATT---CCTGGCCTTAAAAGAAGACAAAAAATACACACCTCCCTCTTTAAGGCCATG-AAAGACTTTGCTAGGTACT-CTCAGCCTAATGAAGTtgcca s bosTau2.scaffold17916 2 181 + 4668 TTCCTCCCTTCCTAGCATTTTCTTGCCTTTTATTTCTTGGCTGCTAAGTCCTGTCTCCTTGGCCATGCTAGGCCAGGCCCACCACCTTCAATTCACCCTGGCCCT-AAAGAGGGCAAA----GTGCATTTCTTTTTCTAAGGCCAGGAAAAGACTCT--CAGGAACTCCCCAACCTGA-GAAGCTGTCA a score=10936 s mm7.chrY_random 27762672 681 + 30114534 GTGATTTTGGATTTTGCCTAGCCATTCTAAGGGAATGAGAG--------------CTGTCCCAGTATTTGATTACTGTCAAACAAGACATATTTTCTTGGGTTTTATGTCATTGTAGAT-TATAAGAAATCTTTGGTCTCACCTCATGTGGCTGTGTCTCCA-------------AGGAGCTGAACAGAGCCCCAGCCTGTCTGACATCTTTTGGATCATGCTTTTTCACTCAATTACTCATTCCCTGTGGGAGAATTGTTAGGAAATGCTATATTTCCAGAGATTCTAAGATCAGTACTTTTGAGCTGGTCTCTGGCATCAGCCACTGATCACATAATTCCTAAAGCTGGTTTGAAGCCTCTAGTTGTTTTAGTCCTTTCAT-GTAAGATAAGTTCCAGAACTGCTGCTGAGAACACTAGAGAAAGTGACATTTTGTCTGATAGCTGTCATTACTGCTCTGGTTTGAATCATCTTGCACAGCTGCATTATTTTTCAGCACAACTC---------------GTCTCTTAGTTAACTTCA-----CTCATTGTCTTGTGCTATAGGAACCATTTTAC---------TGTAATCTTCTTGGTACCACCATTCACAACTGAAGC--------------------ACCAGTGGATTGAAGTTTCTTCCTAAGAGAAGAAAGCAGTGAGgaaagcaagacagaagggtgaggcaaggggagactgacagagagagagtcagacagacacatacatacatacata s bosTau2.scaffold17916 193 722 + 4668 GTGATTTCAGATTGCACTTAGTTATTCTAAAGGAACAACAGAAGAGTGACTTAATCCATCTCATTCTCCAGTTATTGAC------------CCCTCTTTCACCCTCTTTCACAGTGTACATATAAGGAATCTTTCTGCTCACCTCAT-TGCTTATTCCACCACATTCTCTGTGAAAGCGGTCTACCAGGGCCACAGCCTCTTTGACGTTCTGTGGATGATACTTCTGCACCCAGTTCTGGATATGACTGGGCAGAACGTCCAGGAACTGCTCCAGCACCAGCAACTCCAAGATTTGCTCTTTTGAGTGGATCTCTGGCCTCAGCCACTGAGAGCATAATTCCTGCAGGTGGCTGACAGCCTC-ATACGGTCCAGGTGTGTCATGGTAACAGAAGCTCCGGAAGTGCTGGCGAGCACTCTCAGGATGAAGACTGCCCATCTGTGGGCTGGATTTCTTACTCTTATTGGAACTCTCTTTCACAGACCTCTTAGTCCCCTGTAAAACCTCCACATGTGGGTACAAGCATGCAGGCGCCTTCACAGGGCTCATCATTATTTGCTCTGGGAACAGCTTTTCTTCTATTTGTGACATCCTCCTGG-GCCACC--TGATAACTGAGGCCTTGTCAGCTTTGGTACAAAACCAAT-GAGTGGATCTTCTCCCCAAG-------GGCACTGAG-----------AGAGGGGAGGGAAAAAAAGTACACGTCAAGAAGAAAGCCACAT-GACGCACATTTACTTACTTA a score=3226 s mm7.chrY_random 27764163 162 + 30114534 AAGAACTAATCATTACCCTGGCTTCACACTTCCTCAG----ACTATGATTCTGTACCCTCCATGCTAAGGATAGCCTTGATGGCTCGATTTTCCCAGAAATAAGTCATCCAGCAGAAAAGTACCACAAA---CTTCTGAGGATGCAAAAAGTAGACTAAGACATGTTTC s bosTau2.scaffold17916 1828 161 + 4668 AAAAGGTAACCCTTGTCTTGACTTGACATTTCCTCAGGGTCATAGAGATTTTTAA---GCAAGGCTGACGATGGCCTTGAGAGTCTGATTTTCTCAG----AGGTGACCCAAGAGAAACA-ACAACAAGGCTCTTTCAAGGAAGCCACAGGTGTTCAAAGGAATGGCTC a score=8924 s mm7.chrY_random 27771033 777 + 30114534 GGGGTGACATCTACAATGATAACAAT-----CAAGGAAGACAT--AGTCTACTCATGTTGTTC----ATAAAGTTACCC-AATTCTTTGTTTTGGTCTTCTATGGCGATCAAAATTATGGCCACTGAAACTATGCCATGAATATTAATTCTTTCTGA-----CTTCAAGGGCCCTAATAGCTTTT----TCTATTTCTTCTGAGAAAGAGT-GAAGAATGA--------AATCATA----------GTTCGTGTTACC---AGACACCAGAGCATAGGGTCTGAG----------AAAAACATAGCTATGGAC--------TAAGATGTCAAACAAATACTCATTTCTTTTATCCCTTAAATCACAAACAA------AAATTTTG-TGGTTAAAACTGAAAATGGAAGGC-----------AGTGGGAAGCAGTGTATACCTTCTAACATTTCGTTTTGTGAAATGAAACATA----------------ACTCTTCCAAGTTTTCT--ACACTTTTAACCTTTATTACATTCTGCCCCTG---CAATATGCTAATTTCTCTTAGCCTGGGAATTCAG-------TCTGCTTTTCCTG---------------------------------------------------------------ATTATGTATTTTATGGGTTCTGAGAAGGTTCCATCGTCTGTTAAATGTTTACTCACACAGTTGTCATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGTTTAATGAGCTAACATTTCTGAAGTAATAGTCTCCCAAATTC--AATAGTTAAAGGGCTTCTGACCTAAATGAAATCTTTGGTGTTTAACATAGTTTGTATTATTACAATTAAGGTTTATT--GGACCAACAACATTGATGTAGTTTTATTTATTGGTGAGTCAGAAAATGCATTTTAAAATCTAAACT s bosTau2.scaffold5600 50573 933 - 52585 GGAGAGGCAACTAGAATGGGGGTACTTCTCCCAAGGCAAACACTGAAACTTCTCTTCCTGTTTCAGGATACAGTTCTCTGAACCCTGGGCTTAGGTAGTTCATGTAGAT-AGGGTGATAGCCACAGATACTGCCTCAAACTTAGTAATTCATTCTGAGCTCCCTTCAGAGAAACTGTATACTCTTATGATCCATCTCTCATGAGAAAGAATAGGAGTAGGATTCCTCACCATCATATATTTACTGAGTATTTGATACCTGAAGAATTTAGATCATGGAGGATGGGGAGGCTGAGTAAGCAGACAGATACAAACAGGTAACTTCAGATATAAAAGAATGATTCCACTCTTTTAT--------TTATAAAGAATTTTCCAGGTATTGCTGGTAGGCACTGAAAATACAAAGCTAAAAGATACAAGCATAAAACAGAGAGT------TTAGATTCCTTTTTGTGAAACATCCCATGTGCCCCTCCTAAAAACACTATTACTGGCCATCTCAACATTATGCACTCTCATCACATCCAGGATCTAGCTCTAAATGGTGACTTTCCTCAGACTGGAGACACTGGACATGATTCCCTTCTCTTGTGGAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTCTTGTGGAGTTTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAAGGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGAC---TAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAACT a score=5615 s mm7.chrY_random 27780891 290 + 30114534 AATTTTATACTTACCTGTGTCCAG-TATTCTGTCTACACTTTTTTCAAAAGTAAAATTACCTTATCTATTTCATC-CTGTTTTACTGCATTTAATCTATGAAATTACTTGTAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTAAAAACATTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAAGTTTATCACAACTTTGTAAGCATGACCAAGATCTATGTTGTCCTCTCACTTTCCAAATAATCCATAATTCACGATTGCCATTGGTTTCAATACATGT------CATTTAACCCTGTCAAA s bosTau2.scaffold1094 236424 286 + 285174 AAATCTAGACTTAACAATTACCAGATCTCATGCATTTTCATTTTTCATAAAGAAA------CAATCTATTTCATTACCGTTTCATT-TATTTGACCTAACAAATCCTCATTCATAGGCAAGGCTGACAAATTCAACAGAC-TTTAGAA-ACCATTCATCAATATCCAGTTTGTCATAAATTCACTCCAACGTTGGAAACAGGCCCAGAAACTAATTTGGTATCACTTCTTGCAAATGATCCATAATTCATAATTACTGTTTCCTTC---ACATGTGACAGGTATTTGATTCTGTAAAA a score=179 s mm7.chrY_random 27783182 82 + 30114534 GGAAGCCACAAGACAGTGTGATCTACCAAAACAGGTCTACAGCCAGGTAGAAGACAATACCTCTGAAGAGTTTGAGCATGGC s bosTau2.chrX 20848372 72 - 48857030 GGAGGCCGAAGGGCAG----------CAAACCAGGGCTGTTGCAGGAAAGGCCACTGGGTCTGCAAACATGATGAAGAAAAA a score=35390 s mm7.chrY_random 27783264 1132 + 30114534 ATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTACAGAATTTCTCACGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCAATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTTTTTATTTGGTGAAGTATGAAGGAATTGACAGTGTCTACAGACAGGAGCTCCACAGCGATGAGAGGATTT-AAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGCGCCCTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAACGGAAACATGGCTCTGAGGAAAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGTCATTCTTAAACGACTGGTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACATCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGATGATGACAGTGACATCTTAATAGGTACCTGGGT-GAAGACACCAGAGATGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTGTAAAAATTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACCTACATATCTACGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATTGAAAA----AAAATGT-TTGTTTTCCTATGT--TGGCTATTTATGGGTCTTTAACAACCCCAGTATCTTTGCCAATAATAT--TTGTTTTGTTCTAAAA----ATTAATATGTGTGAC-ATGACATGCTATTAGTGAACACTTTGT--TGGTAGAGATG------GACTATGGTGGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACTCACGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGCTTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATTGCAGCAAAAGATGGATGTTTAGGAATTAGGGGAGAAAGACAGGACACAGATAGAATCTCT----------GGTATGAAGTCTGAGAGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529137 1181 + 48857030 ATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGG--GTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATG-GATTGTGGGGGAAAGGAA-------GAGAGATGGCTGCTTAAGAA--AGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=3679 s mm7.chrY_random 27880874 54 + 30114534 TGTGTATTTGTGTGTGTGTTTCCGCACATACATGCACATGCACACACGTGTGCA s bosTau2.chr17 34070347 54 + 45915461 TGTGTGTATGTGTGTGTGTTTGCACGCACACATGCACATGTACACATATGTGTA a score=3420 s mm7.chrY_random 27942728 243 + 30114534 ATCTGCACCGTAGAATTTGTAAGAGAAA-----GAAGAATAAACTATTAATAAATTAGAATATGTTTAAAATATTCAGTTTTGTTGCTCATTTCCTGAAAAGAAAAAAAAAATCATGACTTATATGTACCATAT---ATCCAGGATTATGTG----TATAAGCTTG---------TGTGTATTTGTGTGTGTGTTTCCGCACACACATGCACATGCACACACGTGTGCA--CGTACCTAACTTATTT--------CTAAACATATAGCTTACTA s bosTau2.chr20 12004826 262 - 42952723 ATGTACTCAGTAGAATT----AGATAAATATTTGGAGGTTAAAA----AATAATTTCAAATTTAATTCATATCTTCCATCTACATAATATATCCCTGGAAGAAGAGTAAATAT-ATAAAATGTA-GTACTACACTTCATTGAGTATTATATGACAGTATGAAGCAGCATTTTAAATGTGTATCTGCGTGTGTGTGTACACGCACATCCACACATGCACACACGTGCtcagtcatgtctga-ttatttgtggccccataaacg-atagcctacca a score=3962 s mm7.chrY_random 28076976 73 + 30114534 TGCACACGTGTGTGCATGTGCATGTGTGTGCAGACACACACACACAA----ATACACACAAGCTTATACACATAATC s bosTau2.chr14 47301233 77 + 50711261 TGCACATGTGTGTACATGTGCATGCCTGCATGCACACACACACACAAATTTATATACAAAAGCATACAAACATTATC a score=5742 s mm7.chrY_random 28133812 253 + 30114534 TTTGACAGGGTTAAATG------ACATGTGTTGAAACCAATGGCAATCATGAATTATAGATTCTTTGGAAAGTAAGAGGACAACATAGATCTTGGGCATGCTTACAAAGTTGTGATAAACTTAAAACAAACCTGATATCTCCCAGTCATATTTTAAAGGTTTTTAAAATTTACCAGCACTTCTGATTATAAGGAATTTCATAGATTAAATGCAGTAAAACAG-GATGAAATAGATGAGGTAATTTTACTTTTGAAATATG s bosTau2.scaffold1094 48464 248 - 285174 TTTTACAGAATCAAATACCTGTCACATGTGAAGGAAACA---GTAATTATGAATTATGGATCATTTGCAAGAAGTGATACCAAATTAGTTTCTGGGCCTGTTTCCAACGTTGGAGTGAATTTATGACAAACTGGATATTGATGAAT--GGTTTCTAAAGTCTGTTGAATTTGTCAGCCTTGCCTATGAATGAGGATTTGTTAGGTCAAATA-AATGAAACGGTAATGAAATAGATTG------TTTCTTTATGAAAAATG a score=3016 s mm7.chrY_random 28235038 94 + 30114534 ATATTTCTTG---CTTTAA---TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGTCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893490 99 + 76426644 ATATTTTATGGATCCTTAAAACTTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=20593 s mm7.chrY_random 28242173 1320 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTCA-AACG--TGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGAAGTTTAAAAAAAATTATATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAAAAAACCACATTGAAATATAATTAAATTTtgtacatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttacgtgtgtgttgtgtgtgtTTATATTTCTTTAATTTTGAAAAGCTAAA--ACATAAA-------TGAAAACCTCTCTGATAATATGTTAGCGGAAAAA-----TCTATAA--------------------TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTTTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATATCTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaaa-----aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39895153 1369 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA-ATA-------------------------------------------------------------------AAACTCCACTAGTTTTCAAGAGCTAAAGTGCATGAGAGGATTTTGAGGGTTTTTCTGTTAGTTGGTTAGGAAAATAAATATTTCTGGAATCAGCATAAGTCATACTTCTTGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6103 s mm7.chrY_random 28245073 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCatattattg-taaatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTGCCATGCATGTTGCATGTCAGTATCAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAATCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=7617 s mm7.chrY_random 28245788 423 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGTGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAAA----------ACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTA-AAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCTTC---TCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 28247640 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3808 s mm7.chrY_random 28248037 111 + 30114534 CAAATTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898820 116 + 76426644 CCATTTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=5930 s mm7.chrY_random 28249028 706 + 30114534 TATCTACTGTATTTGTCTGACTCATTTGGGATAAGGATTTACTTGGACCCAGCTTCATTTGTCACATCCACTTTTC-----AAGTATA-------------------AAAAAAATCACATACTCCATCTACCAACA----TGGGAGACATTATTTTTTGATATGCAGTTTTCCCCAACAGTG--GAATGACAAGACGACCAGAACCATCCCTTAGGACAGGGAC---AAATGATCCAAAAGTTACTATTCTCTAACCTAGGACAACCAGTGTCAATAATTTTATAT---------GTCTCTG-------CAAACCTAGATTATG-----------------GCTGATCAACTTCATTGAG-------------------TCAGTGGT---AGCACTCAGAGTGG----------------------GCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCCCTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957119 839 + 62721844 TATTTCATGCATTCGCATGACTAGATCAGGTCAGGGGGTCGCTTGGACCTTGCTTTAC----CATACTCACTTCTCTTGCCAAGGAGATGTCGAAACTTGTGTACTTAACAAAACAACCTATTCTATTTGTCAACACTAATGCCAGACATC-CGTTTTGACCC-CAGTTCCCCTCC-CAGTGAAGACTGGTTAGA------GGTTCACCACTTAGAAGGAGGGCTCTGGATGAACCAGA---CACAAATTACGAATTTAGAAAGCCCATGGTTAGAGGTTCGCCACTCAGACGGAGGCTCTGGGTCAGCCCGACATAGATTACGAATTTAGAAAGCCCAGTGATGGTGCACTTTGATGAGAGTGCTGCTCACAAAAACCCCAGTAACCCCAGTACTCTGAATGGTGGAGGCTTGTCATGGGAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 28250581 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATAAAAAA s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=4137 s mm7.chrY_random 28250904 390 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACCTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGGCCAAACATTCTTTAATGCAGTCACTTGGGAAATTCAA--TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAACAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataatattataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4591 s mm7.chrY_random 28251492 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=2716 s mm7.chrY_random 28276922 224 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTGCCAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCATTTATTTTTGTTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAACCTTATACTGCTGA------------TATTAATAATGA-------------TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGTAATTTCTTTTCAATATTA s bosTau2.scaffold2750 81955 255 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAAA-----ATTTCTGGATTAGGTCTTCTCATTTAAAATGGGAGGATCTCCAGGTATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTA a score=20226 s mm7.chrY_random 28277170 963 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATAGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATCAAG--AAAGCTATTTTGTGTGGACAT--TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGTTATATATT-ATCTGAATCGATACTTATAATTTCCTACACATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT------------TCAAAGAAGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCAC------AGTGAATACAGAATTA--------GCCAGAATACAAGT----------------------TACCCCCTA------TTGTAGGAAAAGAGTGGATATTCTGACAGTAAATAGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAGGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGCCTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACGAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTGAAAGTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCCAACTCACTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaaggagctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=18871 s mm7.chrY_random 28386608 957 + 30114534 GTGGCCTTAAACAATTGCTTTGTCTGTCACAGTTCGTGAGTTGGGTTCCTATTAATTTTTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGATCATATAATTCTCCTGAAGG-ACAACA-GGCAAATGTCTCACATCAGTGGCAACACATGGGTCATTCACTTTCAGTCCAATGATGCAGCCGGTATATAGTTGCACAGAATGATTTATTAAACCCTTAGTTAAACTGATTCTTTGAGAGGTCATGTTT-TATAGAAATTGATACACTAAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTTCTTTACTGACACAGAAACTTCGTTTGCCTGTTGCATACCTTGCCAG-TTTTCTAAGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC------CTCTCTTTGATTTTTCTGGAGGATTTCGGTTTCCCTTTGGCTACACAGCAATAAAGGCTTGCA-TCATTCAGA-AACACAGGTGCACTTTCTAAT-ATCTAATTATTTCCTTGTGTCATTGCCTC-AATGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGTTTTAGCACCCCCTTCCTTTGTTTAACTCTAATTTATCTCAGTAGTTTATATTTAAAAGCTATTTACTGTCAGAATATCCACTCTTTTCCTACAA--TAGGGGGTAGCTTGTATTCTGGCTAA-------TTCTGTATTCACTG---------------------------------TGCTTTTCTGAATTTCCAGTTGGTCTTTTTACATCTTTGA-------------AAACATTAAATTTAAGTA-CCAGAATAATCC------TGCTAG-----GCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATAAGTATCGATTCAGAT-GATATATACCTTTTGAGAATTATCTTCACATTTCTA--ATGTCTGCACAAAATAGCTTT--CTTGATTTAAGTTACAGTTGCTATGCTTCACTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18243 1044 - 102126 GTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTAACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTCAG--GGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccacccattttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=2827 s mm7.chrY_random 28387579 112 + 30114534 TTAAGCATGATAATATTGAAAAGAAATTAAAATT--TTTCACTTTGAAATTAAAACTCTGAAGATGATTACTTAACTTGTGTTTGGAAAAGATTTCTGTG-AATTTTTAAAAATA s bosTau2.scaffold2750 19906 115 - 102126 TCAAACACTCTAAATTTTAAAGGAATTTTAAAGTAATTTTGCTTTGAACTTATTTGTGTGCAAATAACTGATTGATTTGTGATTGACAGTGATTTCTGTGCAGTCATTATACATA a score=2100 s mm7.chrY_random 28387717 96 + 30114534 TTGTTCAAACAAAAT--GACTTTTATTCATTGTAAATTTAA----TAACGAAAATAACTGAATAGTA-GGTTTGT-ATCATTTGACACAGTAATTAATATTCTT s bosTau2.scaffold2750 20067 104 - 102126 TTTTTCAAATGAAACTAAAATTTTATGAGTACTAAATTTAACAATTAATGAAGTTGACTTAATGCTACATTTTGTGAACATTTAATTAAGCATTTAATGATCTT a score=18163 s mm7.chrY_random 28405412 970 + 30114534 GCACTAGTGGCCTTAAAGAATTGTTTTGTCTGTCACAGTTAGCAAGTTGGGTTCTTATT-CATTGTCATATTTGGATTGCTTGTTGAAGGTCATATAATTCTCCTGAAG-CACAACA-GGATAATGGCTCACATCAGTGGCAACACATGGACCATTCAGTTTGAGTCCAATGATGCAGCTGGAATATAGTTGCACAGGATTATTTATTAAATACTTAGTCAAGCTGATTATTTGAGAGATCATGTTT-TATAGAAATTGGTACACTGAGAAAGTGTAAAATTGAGGCTATAAGTGAAGATCCTACTTTACTGACACAGAAACTTGTTTTGCCTGTTTTGTACACTTTGCCAG-TTTTCTATGAGCAGTTTTTGATCTTGCTGGATGAAAGGTGTTTATTTGGCTC----CTCTCTTTGAGTTTTGTGAAGGATTTCTGTTTCCCTTTGGCTATGCAGCAATAAAGGCTTGCA-TCATTCAGAAACT-CAGGGACACTTTCTATCAA-CCAGTTATTTCCTTGTGCCATTGCCTC-ATTGCTATGC------CATAAGTTCT------TTCTTCTTGGAATTCCTGAATGCTTTTCCACCCCCTCTCTTTTTTTTTTTTAACTCCAACTTATCTCAGGAGTTTATATTTAAAAGCTATTTGCTGTCAGAATATCCACTCTTCTCCTACAA--TCTGGGGTAACTTGTAT----------TCCTGGCTAATTCTGTATTAAC-----------------------------TGTGCTTATCTGAATTTCTAGTTGGTCTTTTGCCATCTCTGA-------------AAACATTGAATTT---------AAGTAA-CAGAACA--ATCATGCTAGGCATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATATGTATCGATTCAGAT-AATATACACCTTTTGAGAATTAGCTGTGCAATCTTAATGTCAGAACAAAATAGCTTTCTGGAT----TTAAGTTACTGTTACTATGTTTCTTTCAGATAATCTATA-AAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATG s bosTau2.scaffold2750 18237 1050 - 102126 GCCCCAGTTGCCTTAGACAAGCTGTTTGTCAGTTACACTTTACATGATGGGTCCCTAGAATATTGAAACACTTGGATTGCCTTTGGAAGGTCATCTAATTCTCCTGAAGGCACAATATGGCTAATGGCTTATATTAGTGGCTCTGCATGGACCATTCACTTTCTTTCTGATGCTGCAGCTGTACTCATGTTTCACTGAATGATTTG--AAATCATTAGTCAAATTGCTTCTTTCAAAGGTCATGTTTACACAACAGCTGACATTTTGAGAAGGCATAAATTTGGAGATATGGGTGGGGATGTTAGCTTCTTGATATAGAAA-TCGGTTTGTCTA--ACGCACATTTTGACAGCTTTTCTTTTAACAG-GCTTGATTCTGTTGGATCAAAGGCAGTT-TTTGATGCAAAAATCTTTTGATGGGTTGTCAGGGATTTCTGTCTGCTTTTGGCCACATGGTCAGTACTCCTTGGACTTACTCAGAGGATACAGAACCACATCTTATTAATTTAATTA--TCCGTGTgccattttctctcttgccctgtgactggcatatgctcttcctccttcttcctggaacttgaaagctcctttccaccc-----attttccttgactaccttcaatttatcctactaattttgattttagaagtatcttcctccataaaaccgattttattcctccaaatccagaagaagataatgtcatagatcaaccatgcttatctatacattagcacttatcacattctcatatacattttttacttatttgtctgaatgtcttgttggcctttgagc-tccttgagaggagggtacataaccatcttatttctgtacccaaagtaattagcacagtgtcagacacagcatagataatacactac--tgttgaatATAAAAGAAATTACAAAGATCAATGTAGGTCAATGTATACACTTTGAGACCTTGTTCAGCAGTCCTACCAGGTATTCAAAAAGTTTCattgaattgaattgaattgaaGCAGCTACAATCAGTTTAGATAATCTATGCAAGGTATCTAGAACAGAGGCTTGCACGTG a score=4506 s mm7.chrY_random 28417198 201 + 30114534 TATTGTACAGTTAATAATTTTATGTCACaaaataatattatactaataattatttaaa-CTGTGTCTTATACTG-CTAATATGGTTTCACATATACATGGGAGTTTGGTAGCCTCAGGAC------TCTGTCCAGGTAGCTGGATCATGTTAATGGATTTTTACACTCAGATTGCCATTCATTTTCTTTTTAGTTGCCAATTTCAAGGG s bosTau2.chr13 22763104 205 - 62721844 TGTTGTTCTGCCAATAAATTAAGATCCTTAGCCA---TTTCATTAGTAATGATTTCAATCCCTGCCTGGAGCTGGATAATTCTGTTAAGCGTGTAAATTGGGGTTTGGTAGCCCCAGGACCCATCTTCTGCCCATGTAGCTAGCCTGTAGTATTGGA-TTATGCGTTCAGGAGACCACTCATCATCTTTCCAGTCTCCAGTCTGTAGAG a score=3750 s mm7.chrY_random 28417641 389 + 30114534 GATTTCTAAATGGTCCCCTCTGGTAAGTTGGAACAGGAAGAAAATTGTACAGTTAGTCCCCAACACACACAATCCTGAT---TAGGTGAGAAAAAGTATAATCGAGGCTGTGTACCCAACATATCCAGTATAGCCC------ACAAAGGGCATGGTACCTGATACCTGCATTGA------CATTTTTTTCGGTCCTGTCAGAGATTAGAGAAACTAGACAAGGAATAGATGTTTTGTTCAAAGTGGTTTGGGAATCCACACCA---------TTGAATTTCCTAAGTGACTGCATTAAAGAATGATTGGCCCAGGCCTGTGGGGCTTCCAGC-AGAAGTTTAAATCACC-CTTCCATTAGGTAGGTCAGTTTTCCCCAA--AAA------CTTAAGTACTAGTTCAATTTTGGTtttggtttt s bosTau2.chr13 22763349 395 - 62721844 GACTCCCAATGATTCACCTTAGGCTAGGGAGAGTAGGAAAAAGGAAGGACAGATAGTCCCCAATACACATGCTCCTGACCTGTTGGCTGGTAAAATTGTATGTGCGTTAGT----CCCACAAATCCAATATGATCCTTCTGGACGAGGCCAATGG---------CCTTCAGTGGACAAGTCATCCCATCAGGTCTT----TAAATGGGGGATGCTTGTTAGAGGGTGAGGATTAGGCTCTGTATAGTTTGGGCATCCCCACCAACCAGAAGTATGaatattataa-------tattataatatttttGGCCAAGACAAGTGAGTTTTCCTACTGGAACATTGAATAATTGGCCCCACCATGCCAGACAGTTTTTGTCAATTAAAGAAGTCTTTAAATGCCA----AATTCTGACCCTGGTCTT a score=3781 s mm7.chrY_random 28418277 96 + 30114534 ttttttATCTATCCAGG-CCATAGTTCTTCCATGTTAGTTTTTTCACATGCATGGCCAAAATAGACCCTTAGCTACTGGACTCTTGTGTCTACCAGG s bosTau2.chr13 22763786 97 - 62721844 TTCTTTGGCTTCCCAGGGCCATTGGTCTCCCATGTTAGTTCCCCCACACACATAGCAAGAAGTAACCATTAATATCTGGGCTATGGTCTCTGCCAGG a score=6409 s mm7.chrY_random 28419221 710 + 30114534 AAACAGATTTCTTGCTATGGGAGCAATGAGAAATGGGCTAATTTTTATTTCCTCATAAAAAGAATGGAAGA-TCTGGATGT---CACTTAATGCATGATAGAAACTCTCTTGAAATATAACACAGACCCTGTGATCGTGCCCTTTCC----------------AATCTGCCAGCCAGTATTCTGTCAGGGGTTTCTTAAGTTAGTGATATTGAAATTAGAATGTTTCCAGGTCCCTAGTTGACAGTCTGATGCAGAAGGCTCCTTTTGAAGGAGCACCATTTTTGCACT--------------------TGTAGTGCCAGGTTGTTCATAAGATGTGCTTCCAGTAGGAAATGT--AAAAATGGGCTTTAGGGATACATCTGGCCAGAGTTGAAGGAT----GTTCACATATATAGTTATCATTTAGCCTGTATGC----------------------CCACTCTGAGTGCT---GCCAATGA-------------------CTCAATGAAGTTGATCAGC-----------------CATAATCTAGGTTTG-------CAGAGAC---------ATATAAAATTATTGACATTGGTTGTCCTAGGTTAGAGAATAGTAACTTTTGGATCATTT---GTCCCTGTCCTAAGGGATGGCTCTGGTCTTCTTGTCATTC--CACTGTTGGGGAAAACTGCATATCAAAAAATAATGTCTCCCA----TGTTGGTAGATGGAGTATGTGATTTTTTT-----------TTTTTATACTT---------GAAAAGTGGATGTGACAAATGAAGCTGGGTCCAAGTAAATCCTTATCCCAACTGAGTTAGACAAATACAGTAGATA s bosTau2.chr13 22763886 839 - 62721844 AAAGACATTTTTAGTTTTGGCTGGAATAGGAAGAGGACCACTTTCAGTCTCTTCATAAAAAGAATGGAAGAGCCTGTGTGTGGAAATCCAGAGAGGAATAGAAATGCTCTGGAATAGCAATGCAGTTCCTG-GGTCAGGACCTCTCCTATTAATATAGATGCTGATCTGGTGACCCTCTTCCCATCTTGAGTCCCCAGGGTTGAAGACAGTGAAATTGACTGGGTTACACGTCCCCAGCTTACATTTGGGATCAACAGTTCCCTTTTGGAGGAGTGTTACTTTGTCCTTATTCTCCCAGGTCACCTCTATATTTTCCCAGGTTGCTCATCTGACACAGGCCCAGGTCAATCTGTGAAGAAAGGGGCCTT-----CATATC-ACCCAGTGTTATGGGATACTGGCTTACACATGTATTTGTCATTGAATGTGCATTCTTGTTCCCATGACAAGCCTCCACCATTCAGAGTACTGGGGTTACTGGGGTTTTTGTGAGCAGCACTCTCATCAAAGTGCACCATCACTGGGCTTTCTAAATTCGTAATCTATGTCGGGCTGACCCAGAGCCTCCGTCTGAGTGGCGAACCTCTAACCATGGGCTTTCTAAATTCGTAATTTGTG---TCTGGTTCATCCAGAGCCCTCCTTCTAAGTGGTGAA------CCTCTAACCAGTCTTCACTG-GGAGGGGAACTG-GGGTCAAAACG-GATGTCTGGCATTAGTGTTGACAAATAGAATAGGTTGTTTTGTTAAGTACACAAGTTTCGACATCTCCTTGGCAAGAGAAGTGAGTATG----GTAAAGCAAGGTCCAAGCGACCCCCTGACCTGATCTAGTCATGCGAATGCATGAAATA a score=6326 s mm7.chrY_random 28429146 333 + 30114534 TGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAAAAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------------------TCTGTTTCATAGGAGACAAAAAAAGGTAGatatttttttctttgttttatatatat--atatataaCT-AGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT---------CATTTTTCTGAAGATGGGAAAGTAAACGAGTACTTCAGATTATTCTCCATGTTGGCTCTTTTAAACATAGACATTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTAGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528299 362 - 76426644 TATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGA----AGATATTAAACACTGGTTTAATTTTTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTTCTGAATAACAAC-------TTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTT-TAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=2349 s mm7.chrY_random 28429591 106 + 30114534 TGTTTAATAAAGCAGG-ATAATTATAGTGTTATTAATGTATGAG-----------------GTACATCTGAGGTCAAATTCCCATTTTATTATTTCATAACTTTAATAATTCCTACAAAGCCAT s bosTau2.scaffold10439 6776 123 + 23754 TGCTGAACAAAATAGTTAGGATTAAAGGGTTAATCAAGTATCAGTTTTCTTCACCATGTGTATACATCT-AGATTAAATTCCCAGTTTGCAGTTCCCCATTTTAAGTGACTCCCACAATACTAT a score=5897 s mm7.chrY_random 28429773 420 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGCAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTACCTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGATACTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTGAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATAGTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGA--CTAAAT-ATGTGTATATTTTTACAATAACATGAAATAAAATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAA--CTATTTG-----------------------------------------GATAAA--------------------------------ATTTAGGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATAATGTGTTCAC-----CACTTACATACAAT--AATAATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=20339 s mm7.chrY_random 28431770 1268 + 30114534 atatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagatagtggaacttaatttagtttcatatgctcaacccaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtt-------tttttatggtaccaaccactgatttttctttttcctcattgaatttctGTACATCCATATAAGACTTCTGAAATGTAGTTATATACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACAAAAGCAGGTACATTTCATACCAATATGAAAAAGAACACCCAAAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGGGAAATCA--------------------TTATAGA-----TTTTTCCCCTATCATATTATCAGAGAGGTTTTCA-------TTTATGT--TTTAGCTTTTCAAAATTAAAGAAATATAAacacacacaacacacaagtaacgcacacatacacacacacacacacatatatatatacaTGTAC----AAAATTTAATTATATTTCAATGTGTTTT--TTTTCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAAT-----------------------------------------------------TTATTTTTCATGCATTGCCTTAGTAAAGACA----GTGCAAAACA-----TATGTCACCTAAAATATTCAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTGTTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAGTGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTAACATTGACTTAAAGGAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTAAGAATTACATTT--AGTTTGCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGTCACACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATA-TATTTTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAAAATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCATTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTCCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCCATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTATTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGGGTCAT----TTTGAAGAAAAATTAGGTGATTCCATGTCTACA-AGTAAAATAGATATAGATAAATTTCTTTCAATAATGCTATGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530141 1350 - 76426644 ATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAACA--ACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCAAGAAGTATGACTTATGCTGATTCCAGAAATATTTATTTTCCTAACCAACTAACAGAAAAACCCTCAAAATCCTCTCATGCACTTTAGCTCTTGAAAACTAGTGGAGTTTTAT----------------------------------------------TATATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATT---TTGGTACAATGATTTTGTACAAAAGAACAGTTAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCAAT--CATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTG--TGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTGTACCCATGAGTAGTAA--GGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATT-TATTCCCACATATTCAAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=2855 s mm7.chrY_random 28440015 94 + 30114534 ATGTTTCTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTATTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=3072 s mm7.chrY_random 28512705 78 + 30114534 TTTTTTATTGTTCTGTCTTCACAGACATGAAGTAGGCAGTATGTTGGATAAATCTGGAGGTATGTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.chr5 39893512 77 + 76426644 TTTTCTGATATAATTTTTTCATAGGGGTGAAGTACAGAATATGCTGGAAAGATTTGGAGGTATGT-TTTAGGAGATAT a score=13281 s mm7.chrY_random 28519775 754 + 30114534 ATGAAGCATGTTTGTGATATCTATCATTTAATTTTAAGTTTCCATAGCATTATTGAATGAAATTTATCTATATCTATTTTTACTTGAATACATGG-----AATCATCTAATTTTTCTTCAAA----ATGACTCTTTATTTTTAATATAGATGACATTTATAAGACGCTTCACATAAAGAGAAAATGGATGGAAACTTATGTCAAAGAATCTTTCAAAGGCAGCAACCAGAAATTAGAAAGATTTTGCAAAACGAACGAACGAGAG---AGGTAGAGTTGTTA--TATTTGTAGGGTC---AAATGTGTATCATTTTAAAAATTATATGTGGCTGCAGTTTAAAAAAATTA-TATCATGTCTGAT---------TCTTTAGTAAAAATGTGTGGCTTTGATTTT-GTCTAAA-CAGTTAACCCTATAACATCATGCCTTCAAGCAAACT--AAATCTAATTCATAGAAATCTATGAAAAT--TTTATTTTCTGCTTTAAGTCAATGTTAATGAGA-----TTTAAAT------TTTAATTTACATTCATTGTGGAAATAC-----------AGAAGTCTTGCACA------TAGTCTTAGGAATGTAATTTATGGATTATTATGTTTAACAATATTCAAAAGGAACAACTACAATTACATA-TGCAGACAATTTGTATATTTTAGTTGACATGTTTTGCACTGTCTT----TACTAAGGCAATGTAT---------GAAAAAT------------------------------------------------------AAATTAGAACTTATATTTGGTAGAAAATAATGAAAAAAAAACCACATTGAAATATAATTAAATTTTGtacatgtatatatatatata s bosTau2.chr5 39895153 839 + 76426644 ATCATGCTTTTTGATAGTATGTGTATTTT--TTTTTAATATCTTCAAAATTCTTGAACCAGCTTTATCCATATTTATTT------GAATATGTGGGAATAAATAACATACTTTCACATTAAATTTAATGAATATCTATTTTCATTATAGCTGATATTAACAAGTCTCTTCTTGCCAAGAGAAAGAGACTAGAAATGTATACCAAGGCTTCTCTCAAAACCAGTAACCAGAAACTTGAAAATGTTTGGAAAAT---CCAACAAGAGCAAAGGTAAAGTTGTTGGTTTTTTTCACTGCCACAACATTTGTATCATTCC--TTACTACTCATGGGTACAAATTATGAGAAGTATTATCATCTTCAATTTATTGGGATCTCTAGTAAAAAT---TATATTTGATTTTCCTCTAAGTCTTTTAGTCCTATAACTTTATTTCTTCA--CAGACTTGAAATACATTTCCTAGAAATCAATAAAGGTGACCTCTTTCCCCTTTTAAAT-AATG--ATTGAGACtttttttaaacaataaaagtaatttattttcattttaaaaataCGCTAGCTGAATAAAAGTGTCATATAAACCATTGATCTTATAACAGTTAACTA------------TTTAACAATATATAAAATGATCACC-----TTATATATTATAAACAATTTGTATATTTTAGCTGAATTA------ACTGTTCTTTTGTACAAAATCATTGTACCAAAATGGGGAAAAATTAAGTGAAATATTTCTATTTGAAAATCTTCTATAGTAACTTCAGTGAATCTATCATATCATAACCTGTATTCAGTAGGAGAAAATGAAAAGTAAATTGCTTGGAGATAAAATGGACTTTTCTGGGAAAATGTATATATATA a score=10009 s mm7.chrY_random 28520695 418 + 30114534 TGATTTCCCAT-TAGATATTTTATACTGCTATTTTTCTTTTTATAGTATGA-AATGTTCAATTGAATTTGTTCTGAGTGTTCATTTTCATATTGGTATGAAATGTGCCTGCTTTTGTTACTGTGCTTTACAGGAAGAACATCAACAACAAATTTTGTGAGCAGTATATAACTACATTTCAGAAGTCTGATATGGATGTACagaaattcaatgaagaaaaagaaaaatcagtggttggtaccataaaaaa------aacttaatatttaacctagtattac-------taagtaggaatggaacaactagccttgagttgagcatatgaaactaaattaagttccattatctatctatccttgcttctgttctagtcttactgagatataaactattgat-----tgcatactatatcaatgaaaacgactaggcattt s bosTau2.chr5 39896104 418 + 76426644 TGATTTCACATCTGGAAATTTGATACTT---TCTCTTTTATTATAGAATAATTACGTCAAATCAATTTTGTTTTGATAGTT--GTTCCACGTTGATATGAAATATA---------ATAATATTGTTTTACAGGCAGAAGCTTAACCAAGAATATTCTCAGCAGTTTCTGACTTTGTTCCAGCAGTGGGATATGGATATGCAGAAAGCTGAGGAACAAGAAGAAAAACTTGCTGTTAGTATTATGCTTAGCTTTGTAGCTTTATAATTAATCTATTATAACCAAGTTTCAAGTAGAAGTGGAGAGCCTGGCCTTGTAGTACACTCATGGAACTCAGTCAGGTTCCATTACCTAT---TGCTGGCTGTGAGTTTGGTTCTGCTGAATGGTAAACCATAAGTACAGGCACATACCATAT--ATAAAAGCTGTT-GGTATTT a score=6234 s mm7.chrY_random 28522691 420 + 30114534 AAAATTCCTACCCCACAATTGGTAGCATAATGTTATTTCatattattg-taaatatatatatatatttaGTCAAAATAGTTGTTAA-----AATTTTAAA----TCAGTTGGAAAACTATTCCTTTTAACTTTCATATAGAATTATTTTTGCTCACATAAATGTTTTAGTATTAGATATACATTTAGTGTTTTATTGTTAGACTGCCATGCATGTTGCATGGCAGTAACAACAAAAATAAACAGAATTGTTATACTAATGTTTTCCTTTTACATTTGTAGAATAGTTGTCAAAAAGAACAACAAGCATTGAAACTGTCCAAATGTAGTCAGAACCAGACCCTGGAAGCAGTTAAAGAAATGCATGAGAAGTCCATGGAGGTATGTTGCACATGGT-CCATAAAATGACCTTAGGAATCTAAATATGTTTTA s bosTau2.chr5 39896760 344 + 76426644 AGATTTCCTATTCAGTGACTAGCTGGAT--TATTATTGTATGTAAGTGGTGAACACAT---TATCTAAACTCATAGTAAATGTTAAGATAAAATCTGAAAAATACTGATTTAAAAACTATTCCTTTTAAGTTTAACATAGAATTATTTTTTCCTAAAT--------------------------------TTTATC-----------------------------------------CAAATAG--TTATTACA-TAAT-TTTTTCTTTTACATTTGCAGAATCTGTTTCGACAGCAACAAAAGGTTTTTCAACAATCTAGAATTGTTCAGAGCCAGAGACTGAAAACAATTAGACAATTATATGAGCAGTTCATAAAGGTTTGTTGTATTTGTTAACATAATACATTCTTATA-----AAATATAGTTTA a score=7711 s mm7.chrY_random 28523406 422 + 30114534 TTTTCTGTTTTAGGTTTTGATGAACTTGGGGACCAAGAACTAAGATATGCTTTTTGGAGTAGATGGTGAACTGAGAAAAAAAATGTCTATGTTTGAAAGAGCCATCATGGAGAATAATCTGAAGTACTCTTCTACTTTCCCATCTTCAGAAAAATG---------AAGCATGAAAAATTTTCACTTGCTGGTATATATATAA----------AACAAATAAAAAAATCTCTAACTTTTTTGTTTCCTATGAAACAGA--------------------GTTTTAAAGTTTCTTTAATCCTTGTTATTCTGATGATTCT---GAGAAGGAAGTTAATCCCA------GTGATGTGATTACAAAGTTAACTAGCAGTTATACCTTTAGAGTTAAAATAGAACTTCTTT---ATTTTTAAATATCTTTAATCATTTTCTTGTTTAAGTGTAAGTGCA-TCTTTATATTAACTTCCAAA s bosTau2.chr5 39897983 447 + 76426644 TTTTGTGTTTTAGAGTATGGAGGACTTGGAGAAGAATCATGAAAATCTACTTACTGGTGCACAAAATGAACTTAAAAAAGAAATGGCTTTGTTGCAAAAAAAAATTATGATGGAAACTGTAAGTTGTTATTCAG-------AACTGTAAAAGAAAGTATTAATGTAAGCATTGAAATATTTTATTTGCTGAAATATGTATTAACACTTATCTAAAAATTAAACCAGTGTTTAATATCT---TCTCTCATGTAACAGCAGCAGCAAGAGATGGCAAGTGTCCGAAAGTCTCTTCAATCCATGTTATTCTGATGACTCTTTGGAGGAAGAACTTGAACCTAAGTAACATGATACAATTATAACATTAGCTAATAAGT----CGTTAGAGTGATTTAAGATTCTGGTTTAAAATATTATATAGTATTAATCAT-------------TGCAAGACCATTCTTTTTGTTCACCTCCAAA a score=3428 s mm7.chrY_random 28525257 71 + 30114534 AAAATATTTCCTGTTAACTTACAAAATTCATAGAAAG-----TATATTTCTTTCTTGAAAGAAACTAAACTGCTAA s bosTau2.chr5 39898741 76 + 76426644 AAAATATATTCTATTGACTTATAAAACTTATTAAAAGCAACTTAAGTTTCCCTTCTGGAATAAATTAAACTGCTAA a score=3854 s mm7.chrY_random 28525658 107 + 30114534 TTAAAAGCAACTGACAAAATCTATAAATATTAGTTTGAGACATGGATTTTTG-----TATTCCCAAAAAGGAATCAAAACAACATTTCATTTGGCTTGGCCTTCAGATAAAT s bosTau2.chr5 39898824 112 + 76426644 TTTAAAAAACCAAACAGGATATATAAATACTGTTTTAAGGCATGGATTTTTGAATGTCATTTCTACAATGACATCAAAATGCCATTTAACTGGGCTCAGTCCATAATTAAAT a score=6271 s mm7.chrY_random 28526645 707 + 30114534 TATCTACTGTATTTGTCTGACTCATTTGGGATAAGGATTTACTTGGACCCAGCTTCATTTGTCACATCCACTTTTC-----------------------AAGTATAAAAAAAAATCACATACTCCATCTACCAACA----TGGGAGACATTATTTTTTGATATGCAGTTTTCCCCAACAGTGGAATGACAAGAC-GACCAGAG--CCATCCCTTAGGACAGGGAC---AAATGATCCAAAAGTTACTATTCTCTAACCTAGGACAACCAGTGTCAATAATTTTATAT---------GTCTCTG-------CAAACCTAGATTATG-----------------GCTGATCAACTTCATTGAG-------------------TCAGTGGT---AGCACTCAGAGTGG----------------------GCATACAGGCTAAATGATAACTATATATGTGAAC----ATCCTTCAACTCTGGCCAGATGTACCACTAAAGCCCATTTTT--ACATTTCCTACTGGAAGCACATCTTATGAACAACCTGGCACTACA--------------------AGTGCAAAAATGGTGCTCCTTCAAAAGGAGCCTTCTGCATCAGACTGTCAACTAGGGACCTGGAAACATTCTAATTTCAATATCACTAACTTAAGAAACCCCTGACAGAATACTGGCTGGCAGATT----------------GGAAAGGGCACGATCACAGGGTCTGTGTTAAATGTCAAGAGAGTTTCTATCATGCATTAAGTG---ACATCCAGA-TCTTCCATTCTTTTCATGAGGAAATAAAAATTAGCCCATTTCTCATTGCTCCCATAGCAAGAAATCTGTTT s bosTau2.chr13 39957119 839 + 62721844 TATTTCATGCATTCGCATGACTAGATCAGGTCAGGGGGTCGCTTGGACCTTGCTTTAC----CATACTCACTTCTCTTGCCAAGGAGATGTCGAAACTTGTGTACTTAACAAAACAACCTATTCTATTTGTCAACACTAATGCCAGACATC-CGTTTTGACCC-CAGTTCCCCTCC-CAGTG-------AAGACTGGTTAGAGGTTCACCACTTAGAAGGAGGGCTCTGGATGAACCAGA---CACAAATTACGAATTTAGAAAGCCCATGGTTAGAGGTTCGCCACTCAGACGGAGGCTCTGGGTCAGCCCGACATAGATTACGAATTTAGAAAGCCCAGTGATGGTGCACTTTGATGAGAGTGCTGCTCACAAAAACCCCAGTAACCCCAGTACTCTGAATGGTGGAGGCTTGTCATGGGAACAAGAATGCACATTCAATGACAAATACATGTGTAAGCCAGTATCCCATAACACTGG------GTGATATGAAGGCCCCTTTCTTCACAGATTGACCTGGGCCTGTGTCAGATGAGCAACCTGGGAAAATATAGAGGTGACCTGGGAGAATAAGGACAAAGTAACACTCCTCCAAAAGGGAACTGTTGATCCCAAATGTAAGCTGGGGACGTGTAACCCAGTCAATTTCACTGTCTTCAACCCTGGGGACTCAAGATGGGAAGAGGGTCACCAGATCAGCATCTATATTAATAGGAGAGGTCCTGACC-CAGGAACTGCATTGCTATTCCAGAGCATTTCTATTCCTCTCTGGATTTCCACACACAGGCTCTTCCATTCTTTTTATGAAGAGACTGAAAGTGGTCCTCTTCCTATTCCAGCCAAAACTAAAAATGTCTTT a score=3781 s mm7.chrY_random 28528199 96 + 30114534 CCTGGTAGACACTAGAGTCCAGTAGCTAAGGGTGTATTTTGGCCATGCATGTGAAAAAACTAACATGGAAGAACTATGG-CCTGGATAGATaaaaaa s bosTau2.chr13 39957961 97 + 62721844 CCTGGCAGAGACCATAGCCCAGATATTAATGGTTACTTCTTGCTATGTGTGTGGGGGAACTAACATGGGAGACCAATGGCCCTGGGAAGCCAAAGAA a score=3732 s mm7.chrY_random 28528526 388 + 30114534 aaaaccaaaACCAAAATTGAACT----AATACTTAAGTTGTTGGGGAAAACTGACTTACCTAATGGAAG-GGTGATTTAA-ACTTCAGCTGGAAGCCCCACATGCCTGGTCCAAACATTCTTTAGCAGTCACTTGGGAAATTCAA---------TGGTGTGGATTCCCAAACCACTTTGAAAAAAACATCTATTCCTTGTCTAGTTTCTCTAATCT------CTGACAGGACCGAAAAAAAATGTCAA-TGCAGGTATCAGGTACCATGCCCTTTGT------GGGCTATACTGGATATGTTGGGTACACAGCCTCGATTATACTTTTTCTCACCTA---ATCAGGATTGTGTGTTTTGGGGACTAGCTGTACAATTTTCTTCCTGTTCCAACTTACCAGAGGGGACCATTTAGAAATC s bosTau2.chr13 39958100 395 + 62721844 AAGACCAGGGTCAGAATTTGGCATTTAAAGACTTCTTTAATTGACAAAAACTGTCTGGCATGGTGGGGCCAATTATTCAATGTTCCAGTAGGAAAACTCACTTGTCTTGGCCaaaaatattataata-----ttataatattCATACTTCTGGTTGGTGGGGATGCCCAAACTATACAGAGCCTAATCCTCACCCTCTAACAAGCATCCCCCATTTAAAGACCTGATGGGAT------GACTTGTCCACTGAAGG---------CCATTGGCCTCGTCCAGAAGGATCATATTGGATTTGTGGG----ACTAACGCACATACAATTTTACCAGCCAACAGGTCAGGAGCATGTGTATTGGGGACTATCTGTCCTTCCTTTTTCCTACTCTCCCTAGCCTAAGGTGAATCATTGGGAGTC a score=4591 s mm7.chrY_random 28529110 200 + 30114534 CCCTTGAAATTGGCAACTAAAAATAAAATGAATGGCAATCTGAGTGTAAAATTCATTAACATGATCCAGCTACCTGGACAGA------GTCCTGAGGCTACCAAACTCCCATGTATATGTGAAACCATATTAG-CAGTATAAGACACAG-tttaaataattattagtataatattattttGTGACATAAAATTATTAACTGTACAATA s bosTau2.chr13 39958535 205 + 62721844 CTCTACAGACTGGAGACTGGAAAGATGATGAGTGGTCTCCTGAACGCATAATCCAATACTACAGGCTAGCTACATGGGCAGAAGATGGGTCCTGGGGCTACCAAACCCCAATTTACACGCTTAACAGAATTATCCAGCTCCAGGCAGGGATTGAAATCATTACTAATGAAA---TGGCTAAGGATCTTAATTTATTGGCAGAACAACA a score=2192 s mm7.chrY_random 28555743 96 + 30114534 AAGAATATTAATTACTGTGTCAAATGCT-ACAAACC-TACTATTCAGTTATTTTCGTTA----TTAAATTTACAATGAATAAAAGTC--ATTTTGTTTGAACAA s bosTau2.scaffold2750 81955 104 + 102126 AAGATCATTAAATGCTTAATTAAATGTTCACAAAATGTAGCATTAAGTCAACTTCATTAATTGTTAAATTTAGTACTCATAAAATTTTAGTTTCATTTGAAAAA a score=2622 s mm7.chrY_random 28555865 112 + 30114534 TATTTTTAAAAATT-CACAGAAATCTTTTCCAAACACAAGTTAAGTTATCATCTTCAGAGATTTAATTTCAAAGTGAAA--AATTGTAATTTCTTTTCAATATTATCATGCTTAA s bosTau2.scaffold2750 82105 115 + 102126 TATGTATAATGACTGCACAGAAATCACTGTCAATCACAAATCAATCAGTTATTTGCACACAAATAAGTTCAAAGCAAAATTACTTTAAAATTCCTTTAAAATTTAGAGTGTTTGA a score=19272 s mm7.chrY_random 28555991 963 + 30114534 CATTTATAAACCACTACTCATTTTGCCTT-TATCGATTATCTGAGTGAAACATAGCAACTGTAACTTAAATTAAGAAAGCTATTTTGTTCGGACAT----TAGAAATGTGAAGCTAATTCTCAAAAGGTATATATT-ATCTGAATTGATACTTATAATTTCCTACCCATTTTACCATGCAGCAAGTTCTTCATGC-----CTAGCA------GGATTATTCTGG-TACTTAAATTTAATGTTT-------------TCAAAGATGTAAAAAGACCAACTGGAAATTCAGAAAAGCA---------------------------------CAGTGAATACAGAA-------TTATCCAGAATACAAGTTACCCCCTA--TTGTAGGAAATGAGTGGATATTCTGACAGTAAATGGCTTTTAAATATAAACTACTGAGATAAATTAGAGTTAAACAAAGAAAAGGGGTGCTAAAGCATTCAGGAATTCCAAGAAGAA------AGAACTTATG------GCATAGCATT-GAGGCAATGACACAAGGAAATAATTAGAT-ATTAGAAAGTGCCCCTGTGTT-TCTGAATGA-TGCAAGACTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAACCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAG------GAGCCAAATAAACACCTTTCATCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAA-CTGGCAAGGTATGCAACAGGCAAACAAACTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCAATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATA-AAACATGACCTCTCAAAGAATCAGTTTAACTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACCGGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGTGAGCCATTTGCC-TGTTGT-CCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGCAATCCAAATATGAAAAAGTAATAGGAACCTAACTCACTAACTGTGACAGACAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGC s bosTau2.scaffold2750 82839 1050 + 102126 CACGTGCAAGCCTCTGTTCTAGATACCTTGCATAGATTATCTAAACTGATTGTAGCTGCttcaattcaattcaattcaatGAAACTTTTTGAATACCTGGTAGGACTGCTGAACAAGGTCTCAAAGTGTATACATTGACCTACATTGATCTTTGTAATTTCTTTTATattcaaca--gtagtgtattatctatgctgtgtctgacactgtgctaattactttgggtacagaaataagatggttatgtaccctcctctcaagga-gctcaaaggccaacaagacattcagacaaataagtaaaaaatgtatatgagaatgtgataagtgctaatgtatagataagcatggttgatctatgacattatcttcttctggatttggaggaataaaatcggttttatggaggaagatacttctaaaatcaaaattagtaggataaattgaaggtagtcaaggaaaatgggtggaaaggagctttcaagttccaggaagaaggaggaagagcatatgccagtcacagggcaagagagaaaatggcACACGGA--TAATTAAATTAATAAGATGTGGTTCTGTATCCTCTGAGTAAGTCCAAGGAGTACTGACCATGTGGCCAAAAGCAGACAGAAATCCCT--GACAACCCATCAAAAGATTTTTGCATCAAA-AACTGCCTTTGATCCAACAGAATCAAGC-CTGTTAAAAGAAAAGCTGTCAAAATGTGCGTTAGACAAACCGA-TTTCTATATCAAGAAGCTAACATCCCCACCCATATCTCCAAATTTATGCCTTCTCAAAATGTCAGCTGTTGTGTAAACATGACCTTTGAAAGAAGCAATTTGACTAATGATTT--CAAATCATTCAGTGAAACATGAGTACAGCTGCAGCATCAGAAAGAAAGTGAATGGTCCATGCAGAGCCACTAATATAAGCCATTAGCCATATTGTGCCTTCAGGAGAATTAGATGACCTTCCAAAGGCAATCCAAGTGTTTCAATATTCTAGGGACCCATCATGTAAAGTGTAACTGACAAACAGCTTGTCTAAGGCAACTGGGGC a score=10666 s mm7.chrY_random 28578485 437 + 30114534 TTCAAAGAACGAAAGC-------ATGTAAAAGAAAATGAAA---TCTAGTAATAAGT-----------GTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTCAGAGGTTAGGGTTATTTGCACAAAAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAACCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTGC--ATGAATAATCACATTGGCATTATTTATTTGTACTGAAACATAGCCCTTCTCCCTGACTTAGTTAAAAGTGTGGGACCAGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTGATAATGGGACAAAACAGAAGCCTGGAGGATTGACTGTACTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATAAAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAA--AATTGTGAAAAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742189 466 + 45915461 TTGAAAGAAAGAGGGTGATGTCTATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=308 s mm7.chrY_random 28584523 116 + 30114534 TCAATCAGTTTTCTGCGTTTCACCTTGT-GTAACAAGGC--CACATTTCTTTTAAATGTCCCTCTTTCCCCAACTTTTTGTTTCTCCTTCAGTGTTCACA-------TCAGAGTTTCTACCTATGC s bosTau2.chrX 28007355 124 + 48857030 TCAATTTATCCTGTCCGTTTTTCCTCTTAGCCCCAAGATTTCACTCTCCCTGTTATTCTTCACCCTCTTCCAGTTGGCTGCCTCCCACTCTTAGGTCACCCTCCCCTTAGGAGCCTCT--CCATTC a score=36883 s mm7.chrY_random 28584639 1195 + 30114534 TCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTGCTGCTATCTCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCT-------------ACATGCAGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTACGTAGTGTTCACCACCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATATTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTAACTCACAGAATATCATGTC-----ACACTTTTAAATTTTTAGAGCAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCCAACACAGGAAAAAAAAAACAAAAAACTGTTTTTTCTTCCAGTCCTATACATTTACGTTTCTGTACTTTATGAT-TTTAC----AACTTCAAGAATCTTTGGCACCAGAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACACAGAAGGATTGGCTAGAATTTGGTAAACAACCTTTCTGAACTATTTGGAACCACCTTTTTTGGTGTACTGCACCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCAGAGGAG-------TG--TCTGGAATGATGTGGAGGTTCCCTTTCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAGAAGTAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGATTGGAACCTGGGCTAGCACAACCCCCCTTCAGTTGTCCTCAGAGCCATCTTTACCCTTAAATTTGTGTTGTACTGCTCTGCCAACCAGGTCTCTGGTGAGGTGGGAATCCCTTACCTGAGGAAATCTTACTTTGGGAGGCAAAAACTTAAGGTTTAAAATCCTGTCATTATTGTAGAGCTCCTGTCCATAGACGCTGTCATTTCCATCATACTTCACCAAATAAAGAGAAGGGTTTGTTGGGAGTTGACCTAGCACTATGGTCTTCCATTGAGTGACAGGCTCATTACCTTCCTTCCAACCTTGAGAAATTCTGCAGCCAACAATATTCCTCAAGACGTTGGAAGAAGACATCCTCCTCCTCTTCTTCATGAGGGATGTCATGCTAAGACTCTTCAGAGGTATTGTCTTCTACATGGCTGTAGCCCTGGTGTGGTAGACCACACCAACCCTGGGCAGATGTCTTGTGGGTAACATTCTGTGTTCAAATATCATACTTGC s bosTau2.chrX 20326788 1204 - 48857030 TCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTC--------TTCCTTTCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACA---AGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACA----CTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC-ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGATGGGTGCTTGAGCTAAGACCATCCCCCTCCATCCATCCTTAGAACCATGTTCACCCTCAAACATATGTTCAACAGCTTTACCAATTATGGTATTTGCAAGGTGCACATCTCTGACTCGAGAAAATGGCACTTTATCAGGAAGGATTTTAAGCTTTAAAATCCTTTTATCTCTGTGAAGTTCCAGTCCATAGACACAGTCAATTCCATCATATTTCACCAGATAAAGAGAGGGATTTATAGGCACCTGATCCAGAACGGTTCCTTTCCACTGGGTGATGGGCTCATCACCTTCCTTCCATCCATGTGAAATTCTGCAGCCCACGATGTTCCTGCGCGTCTGGGAGGAAGGTCTGCCCCTCTGTTTCTTT-TGAGAAATCT-----------------------TTTTCTTCCTCATACTTGCAGACAAGGTGTGGTCATCAACAATTTCCCTGGTTTGCTGCCTTGCAGTTGCCTTTTTGTGAGGTGTCTTCATACCTGC a score=12145 s mm7.chrY_random 28588826 432 + 30114534 TATGTAAAAGAAATTGAAAT----------CAAGTA----ATAATTGTCCATGCCACTTCTTGGAATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCTTTTCTTAGAGGTTAGGGTTATTTGCATAACAAGAGACTAATCAGTCATCATTGTCACATCAGCCAAAGGCATCCTAACCCTGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTACTTATTTGTATGGAAACATATCCCTTCATCCTGATTTAGTTAAAAGCGTGGGAACTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCATAATGGGACAAAACAGAAGCCTAC---------AGGATTGTTCCTGGGAGCTGAAGATTTCCCTTCCATTTAGTAAAATGTTATAAAT-ATTATTT------TAACACAAGCCTAAATTCGTGAA-AAAGCTTT--TTTTTCATATTTTAATTATTTACAG---GTCGTTCTCTGCCATATAA s bosTau2.chr17 25742211 466 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAGCATGAGGTTTCCTGCTACAAAA a score=14139 s mm7.chrY_random 28598550 377 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAAAAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCATCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCAATACACTTTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGCAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCGCACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAG-GCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9599 s mm7.chrY_random 28602958 314 + 30114534 TACAAGTTTTGACAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGAAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATCTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGGTCTGTGCATGCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=5770 s mm7.chrY_random 28603875 152 + 30114534 atatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTCTGGAGCCATTTATGTGTTATTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTAT----------------------------------AAGAAAGAAAACCATTAGCCTGGGATCTCTCCTATTATAAGTATTC s bosTau2.chr3 40230167 181 + 85360813 ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTACTACTAAGTCTGAGCAAATTGAGGGCGTCAAGAAGAAAGTGAGCCATGAGACTGGAGT-----AGATAATAAGTATTC a score=10690 s mm7.chrY_random 28615563 400 + 30114534 AGTAAGTGTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATACATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAAAAAAAAGCTTTGTTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742250 405 + 45915461 AGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=21442 s mm7.chrY_random 28621515 841 + 30114534 CCTGATTTTCTCTTA----TTTCTGAGTCTAT-TTCAATCAGTTT-TCTGGGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATCTCCGACTTTCCCCAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTAACTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCCCTGCTCCTCCAAGTTCCATCTCCAATTCCTTATTCTGCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGATGTATGTACTGTTCACCGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAATTGTTCACTTACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAACAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCTAACACAGTAAAAAAAAAAAAAACTTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACATGGAAGGATTGGCTAGAAATTGGTAAACAACCTTTCCAAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTGTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGAGCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGAT s bosTau2.chrX 20326633 885 - 48857030 CCTGAACTTCTTCTAAATGTATTTGTGTCCCTCTTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCA-ACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCTCT------TCCTTTCCCCCACAA--TCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATA--TTTTGTGTTTCTCCAAATC--ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGAT a score=13429 s mm7.chrY_random 28702381 557 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGTGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCGTTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATT-ACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC---------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14254 s mm7.chrY_random 28707950 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACATTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TATTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=13429 s mm7.chrY_random 28721898 557 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCATAAAATACTAAAGTGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCGTTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATT-ACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC---------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA------CCATGTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=14254 s mm7.chrY_random 28727463 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCAGTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTAAAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACATTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TATTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4837 s mm7.chrY_random 28731989 89 + 30114534 ACAAAGTTGTCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=11370 s mm7.chrY_random 28734607 277 + 30114534 TTCTGGTGTCTTAGAAGCCTTGATTGTCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACATTTCTGAAGGAATGGCCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTCCTGTATAAAATCATTGATGTTCAACTAAATTTGTATTATGATTAAAGGTTTCT-GGCACCAGGAACACTGATGTAGTTTTATTTCTTAGTGAGTCAGATAATGTATTATAAAATCTGAAC s bosTau2.scaffold5600 51228 277 - 52585 TTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAA-GGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGACTAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAAC a score=3724 s mm7.chrY_random 28831526 72 + 30114534 TTAGCAGTTTAGTTTCTTTCAAGAAAGAAATATAA-----TTTCAATGAATTTTGTAAGTTAACAGGAAATATTTTT s bosTau2.chr5 36527827 77 - 76426644 TTAGCAGTTTAATTTATTCCAGAAGGGAAACTTAAGTTGCTTTTAATAAGTTTTATAAGTCAATAGAATATATTTTT a score=8111 s mm7.chrY_random 28833028 428 + 30114534 TTTGGAAGTTAATATAAAGA-TGCACTTACACTTAAACAAGAAAATGattaaaaatatttaaaaat---aaaGAAGTTCTATTTTGACTCTAAAGGTATAACTGCTAGTTAACTTTGTAATCACATCAC------TGGGATTAACTTCCTTCTC---AGAATCATCAGAATAACAAGGATTAAAGAAACTTTAAAAC--------TCTGTT----------TCATAGGAGACAAAAAGTTAGAGattttttttatttgttttatatat------atatatataCCAGCAAGTGAAAATTTTTCATGCTT-CATT---------TTCTGAAGATGGGAAAGTAGAAGAATACTTCAGATTATTCTCCATGATGGCTCTTTTAAACATAGACATTTTTTTTTCTCAGTTCACCATCTACACCAAAAAGCATATCTTCGTTCTTGGTCCCCAAGTTCATCAAAACCTAAAACAGAAAA s bosTau2.chr5 36528214 447 - 76426644 TTTGGAGGTGAACAAAAAGAATGGTCTTGCA-------------ATGATTAATACTATATAATATTTTAAACCAGAATCTTAAATCACTCTAACG----ACTTATTAGCTAATGTTATAATTGTATCATGTTACTTAGGTTCAAGTTCTTCCTCCAAAGAGTCATCAGAATAACATGGATTGAAGAGACTTTCGGACACTTGCCATCTCTTGCTGCTGCTGTTACATGAGAGAAGATATTAAACACTGGTTTAATTT---TTAGATAAGTGTTAATACATATTTCAGCAAATAAAATATTTCAATGCTTACATTAATACTTTCTTTTACAGTT-------CTGAATAACAACTTACAGTTTCCATCATAATTTTTTTTTGCAACAAAGCCATTTCTTTTT-TAAGTTCATTTTGTGCACCAGTAAGTAGATTTTCATGATTCTTCTCCAAGTCCTCCATACTCTAAAACACAAAA a score=5677 s mm7.chrY_random 28833751 420 + 30114534 TAAAACATATTTAGATTCCTAAGGTCATTTTATGG-ACCATGTGGAACATACCTCCATGGACTTCTCATGCATTTCTTTAACTGCTTCCAGGGTCTGGTTCTGACTACATTTGGACAGTTTCAATGCTTGTTGTTCTTTTTGACAACTATTCTACAAATGTAAAAGGAAAACATTAGTATAACAATTCTGTTTATTTTTGTTGTTACTGCCATGCAACATGCATGGTAGTCTAACAATAAAACACTAAATGTATATCTAATACTAAAACATTTATGTTAGCAAAAATAATTCTATATGAAAGTTAAAAGGAATACTTTTCCAACTGA----TTTAAAATT-----TTAACAACTATTTTGACTAAATATATGTATATTTTTA-CAATAACATGAAATAAAATTATGCTACCAATTGTGGGGTAGGAATTTT s bosTau2.chr5 36529540 344 - 76426644 TAAACTATATTT-----TATAAGAATGTATTATGTTAACAAATACAACAAACCTTTATGAACTGCTCATATAATTGTCTAATTGTTTTCAGTCTCTGGCTCTGAACAATTCTAGATTGTTGAAAAACCTTTTGTTGCTGTCGAAACAGATTCTGCAAATGTAAAAGAAAAA-ATTA-TGTAATAACTATTTGGAT-----------------------------------------------------------------------AAAATTTA----GGAAAAAATAATTCTATGTTAAACTTAAAAGGAATAGTTTTTAAATCAGTATTTTTCAGATTTTATCTTAACATTTACTATGAGTTTAGATA---ATGTGTTCACCACTTACATACAAT--AATAATCCAGCTAGTCACTGAATAGGAAATCT a score=9468 s mm7.chrY_random 28835753 400 + 30114534 tctttgatatagtatgca-----atcaatagtttatatctcagtaagactagaacagaagcaaggatagatagacagtggaacttaatttagtttcatatgctcaactcaaggctagttgttccattcctactta-------gtaatactaggttaaatattaagtttt--------ttatggtaccaaccactgatttttctttttcttcattgaatttctGTACAACCATATCAGACTTCTGAAATGTAGTTATGTACTGCTCACAAAATTTGTTGTTGATGTTCTTCCTGTAAAGCACAGTAACGAAAGCAAGCACATTTCATACCAATATGAAAAAGAACACTCAAAACAAATTCAATTGAACATT-TCATACTATAAAAAGAAAAATAGCAGTATAAAATATCTA-ATGAGAAATCA s bosTau2.chr5 36530135 405 - 76426644 TTTTATATATGGTATGTGCCTGTACTTATGGTTTACCATTCAGCAGAACCAAACTCACAGCCAGCA---ATAGGTAATGGAACCTGACTGAGTTCCATGAGTGTACTACAAGGCCAGGCTCTCCACTTCTACTTGAAACTTGGTTATAATAGATTAATTATAAAGCTACAAAGCTAAGCATAATACTAACAGCAAGTTTTTCTTCTTGTTCCTCAGCTTTCTGCATATCCATATCCCACTGCTGGAACAAAGTCAGAAACTGCTGAGAATATTCTTGGTTAAGCTTCTGCCTGTAAAACAATATTAT---------TATATTTCATATCAACGTGGAACA--ACTATCAAAACAAAATTGATTTGACGTAATTATTCTATAATAAAAGAGA---AAGTATCAAATTTCCAGATGTGAAATCA a score=13110 s mm7.chrY_random 28836285 749 + 30114534 tatatatatacatatac----aAAATTTAATTATATTTCAATGTGTTTT--TTTCCATTATTTTCTACCAAATATAAGTTCTAATTT------------------------------------------------------ATTTTTC---------ATACATTGCCTTAGTAAAGACAGTGCAAAACA--TATGTCAACTAAAATATACAAATTGTCTGCA-TATGTAATTGTAGTTATTCCTTTTGAATATTGTTAAACATAATAATCCATAAATTACATTCCTAAGACTA------TGTGCAAGACTTCT-----------GTATTTCCACAATGAATGTAAATTAAA------ATTTAAA-----TCTCATTATCATTGACTTAAAGCAGAAAATAAA--ATTTTCATAGATTTCTAAGAATTAGATTTAGTTTTCTTGAAGGCATGATGTTATAGGGTTAACTG-TTTAGAC-AAAATCAAAGCCACACATTTTTACTAAAGA---------ATCAGACATGATATAATTTTTTAAACTTCAGCCACATATAATTTTTAA--AATGATACACATTT---GACCCTACAAATA--TAACAACTCTACCT---CTCTCGTTCGTTCATTTTGCAAAATCTTTCTAATTTCTGGTTGCTGCCTTTGAAAGATTCTTTGACATAAGTTTCCATCAATTTTCTCTTTATGTGAAGCGTCTTATAAATGTCATCTATATTAAAAATAAAGGGTCAT----TTTGAAGAAAAATTAGGTGATT-----CCATGTATTCAAGTAAAAATAGATATAGATAAATTTCATTCAATAATGCTGTGGAAACTTAAAATTAAATGATAGATATCACAAACATGCTTCAT s bosTau2.chr5 36530652 839 - 76426644 TATATATATACATTTTCCCAGAAAAGTCCATTTTATCTCCAAGCAATTTACTTTTCATTTTCTCCTACTGAATACAGGTTATGATATGATAGATTCACTGAAGTTACTATAGAAGATTTTCAAATAGAAATATTTCACTTAATTTTTCCCCATTTTGGTACAATGATTTTGTACAAA------AGAACAGTTAATTCAGCTAAAATATACAAATTGTTTATAATATATAA-----GGTGATCATTTTATATATTGTTAAA------------TAGTTAACTGTTATAAGATCAATGGTTTATATGACACTTTTATTCAGCTAGCGtatttttaaaatgaaaataaattacttttattgtttaaaaaaaGTCTCA--ATCATT-ATTTAAAAGGGGAAAGAGGTCACCTTTATTGATTTCTAGGAAATGTATTTCAAGTCTGTGAAGAAATAAAGTTATAGGACTAAAAGACTTAGAGGAAAATCAAATATA---ATTTTTACTAGAGATCCCAATAAATTGAAGATGATAATACTTCTCATAATTTG--TACCCATGAGTAGTAAGGAATGATACAAATGTTGTGGCAGTGAAAAAAACCAACAACTTTACCTTTGCTCTTGTTGG---ATTTTCCAAACATTTTCAAGTTTCTGGTTACTGGTTTTGAGAGAAGCCTTGGTATACATTTCTAGTCTCTTTCTCTTGGCAAGAAGAGACTTGTTAATATCAGCTATAATGAAAATAGATATTCATTAAATTTAATGTGAAAGTATGTTATTTATTCCCACATATTC------AAATAAATATGGATAAAGCTGGTTCAAGAATTTTGAAGATATTAAAAA--AAAATACACATACTATCAAAAAGCATGAT a score=3108 s mm7.chrY_random 28844018 94 + 30114534 ATATTTCTAAAACACATACCTCCAGATTTATCCAACATACTGCCTACTTCATGTCTGTGAAGACAGAACAATAAAAAA---TTAAAG---CAAGAAATAT s bosTau2.chr5 36533055 99 - 76426644 ATATCTCCTAAA-ACATACCTCCAAATCTTTCCAGCATATTCTGTACTTCACCCCTATGAAAAAATTATATCAGAAAAGTTTTAAGGATCCATAAAATAT a score=13093 s mm7.chrY_random 28871626 1061 + 30114534 GTTCAGATTTTAAAATACATTATCTGACCCACTACGAAATAAAACTACATCAGTGTTCCTGGTGCCAGAAAACCTTTAATCATAATACAAATTTAGTTGAACATCAATGATTTTATACAGGAGAGAATCCTGTTTAACTGTATTGAATGTGGGAGACCATTCCTTCAAAAATGTCACCTCATTAAGCACCAGCTGACCCACATTGCTGACCATCCCTATACATGTAACCTTTGTGAGAAAATGTTTAACAGATGATCAAGGCTTCTCAGACACCAGAATGTACTTAGTCAGA------------------------------------------------------AAACTC----AGA---------------CAGAATTGCCAAGCTAAGGAAAATTAGCATATTG---CAGGGACAGAAGGTAAAGAAGGTTTAAAATCTAGAAA----------------ATTTGGGAGAGTTATGTTTCATATCATAAAAAAAAAGATACAATAGAATTCTACGTTGTTTCCCACTGTCTTTCA------------------TTATCTGTATTATCCACACATTTTTTTTTGTATTAGTAATAAAAGAAATGAGTATTTGTTTGACATTTG--------TATCCATACCTATGTTTTTGTTTGACATCTGTGTCCATAGCAATGT---TTTCTTAGACACTATCCTCTGGTTTCAGGTACCATGGACTATGATTTAATTCTTCACTTTTCTCAGAAGAGATGTAAAATGCTATT----AGGGCCCTTGAAA-----TCAGAAAGAATTAATATTCATGGCATAGTTTCAGTGGCTATAATGTTGACCGTCATAGAATACC-AAAACAAAGATTCAGGTAAATTTAT----GAACAAGATGATAAGATT--GTGTCTTCCTT-----CAGTGTAAGCATGGTAGTTG----TCACCTCAGTTTCTCCCTTGACATTGTCTATTTTCAAGGAAGCTTGGGGAACACAAGAAGACCTGAAAGCC-----AACAC--------------------AAACCTAAGAAACTTGTAAGCATTTGAATTCCACTTACAGA---------------TCTCACTGTCCATACTAGTTATCCATCTCTGTGGAAGTAAAAGAGAGCAGTAAAGTGACTTTGATTATTT-TGGCTTTTATTACACACACTGGAA---TTTTTAAATGATTGCATACTACTCCTGTGCCTAAAGGGATGTACAACTTGT s bosTau2.scaffold5600 1080 1221 + 52585 GTTCAGATCTTAATAAGCACTTAATGGCACACCAAGGAATTAAACCATATAGATGCTCATGGTGTGGAAAAAGCTTTAGTCATAACACAAATCTACACACACACCTAAGAATTCACACTGGAGAGAAGCCC-TTTAAATGTTATGAATGTGGGAAAAGATTCATTCAGAACTCCCACCTTATTAAACACCAGAGAACCCACACAGGTGAGCAGCCTTATACCTGTAGCATATGCAACAGAAATTTTAGCAGGCGTTCAAGCCTTCTTAGACACCAGAA---ACTCCACAAGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAACTCCACAAGAGAAGGGAATCATGTCCAGTGTCTCCAGTCTGAGGAAAGTCACCATTTAGAGCTAGATCCTGGATGTGATGAGAGTGCATAATGTTGAGATGGCCAGTAATAGTGTTTTTAGGAGGGGCACATGGGATGTTTCACAAAAAGGAATCTA----AACTCTCTGTTTTATGCTTGTATCTTTTAGCTTTGTATTTTCAGTGCCTACCAGCAATACCTGGAAAATTCTTTATA-------AATAAAAGAGTGGAATCATTCTTTTATATCTGAAGTTACCTGTTTGTATCTGTCTGCTTACTCAGCCTCCCCATCCTCCATGATCTAAATTCTTCAGGTATCAAATACTCAGTAAATATATGATGGTGAGGAATCCTACTCCTATTCTTTCTCATGAGAGATGGATCATAAGAGTATACAGTTTCTCTGAAGGGAGCTCAGAATGAATTACTAAGTTTGAGGCAGTATCTGTGGCTATCACCCT-ATCTACATGAACTACCTAAGCCCAGGGTTCAGAGAACTGTATCCTGAAACAGGAAGAGAAGTTTCAGTGTTTGCCTTGGGAGAAGTACCCCCATTCTAGTTGCCTCTCCCCTGAGCACCCACTACTGCAGTGTTTTCTGTCAAGGAA-TTCTAGCATTAAGCAAAGGCCTAGGGGCCTTGGAAGCACTTGGTACCTTTCTTCCTGCTGAGCCTTCGACACT--TAGGTATTTAGACTGAAATGATGAAGGAGGCAGCCTGGGCTCTCAT--------CTGAGTACTTATCTCTGTAGAAG--GCATAGGGCATGTGAGTGGCCTTTTTTTTTTAAAACTTTCATTATATGGACTAGAAGACTTTCACGTTGATGCCACCCTGCTCCAGGACCTAACAGGAGGC-CAACTTGT a score=4373 s mm7.chrY_random 28874306 84 + 30114534 CTATGAAGATTCTTAGCCTCTGAACTTGGCAATTGTTTACAGATGCTGATGTGAGCAAAATGAGGAACTAAAGGACAACTTTGT s bosTau2.chr3 39006495 84 + 85360813 CTATGCAGATTTTGGACCTCTGAACTTGGCAATGGTGTACAGATACTGCTGTAAACTAAACAAGAAGCTAAAAGTGAGTATTGT a score=14605 s mm7.chrY_random 28878461 376 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGTTTATATCTCTGTATCCTCATCATTCAACACCATATTGGGGATCCTGCAGCTTATAGGGAAGAGATGTCCAGATTCTGAGCATTGCAGGGTACCATCCAATACATCAATCTCAAGCCACATGTGGGTACATCTTCCTCAAAAACGTTTCATCCTGTTAATAGCTTTCAGTTGGATCTTTAAGTACCTCAGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTCCCAGCACAATCACTTCCCACTTCATTTTGGGGAGCATCTGTGCCAGGAAGTCAGAGTAGATCTCCACATAGTTGATGCAAATTTAAGTGGCCTGCAGGCACAGATGGAAGTCATGCATGCCCAAGCCCTACACATTTGAGCTGTGGAGATT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATAT-GGGGATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAGGCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=12974 s mm7.chrY_random 28883813 555 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTTT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAAGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCCCTTA-GTGTTACTTCATTAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCGTAAGTAGAT-ACTCCTCTTCAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGG------CTTTGTGATTAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTGTTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAATGTTTATGCTGAGACTCG-GGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA---GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=9088 s mm7.chrY_random 28952419 502 + 30114534 ATTTGTAAGAAAATTTTATACGTACCTGTGTCCAGTATTCTGTCTAC--ACATATTTCAAAAGTAAAATTACCTCATCTATTTCATCCTGTTTTACTGCACTTTATCTATGAAATTCCTTATAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTA-AAAACCTTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAAGTTTATCACAACTTTGTAATCATGCCCAAGATCTATGTTGTCTTCTTACTTTCCAAAGAATCCATAATTCATGATTGCCATTGGTTTCAATATATGTCATTTAACCCTGTCAAATTCCAGCTTTCTTTGCATAA-AAATAGTCCTCCTCTAACTGTGGGTTTTCATAAAGTGAAAATTGGTGTGCTATCCAGTGTGCTGCCTCAAAGAGTCTGGCAATATTTATGATAAGAAGCACAGCTTAAAGATAACCAAGGGAAAGGTTGGAACATGAAAAATAACCACCATGAATGATGTCAAGTCAGAAA--CAGAAGACTT s bosTau2.chr17 20164586 463 - 45915461 ATGCATAAAGGAGTTTTACATTTACTGTTACCTGGTATATCATCTACTAAAATATTTCAAAAAGAGAACTA----GTCTACTTCATAACATTTTACAGTCTTTAAT-----AAATTCCTTGTAACCAGCAGTGCTGAAAATTTTTTTAACACTTTTAAAATATTATTGGTCAATATTAAATTTGTCATAAATTTTCCCTAACTTTGGAAACAAGCCCAGTAGCTA------------ATTTTTCAA-------GTGACTCATAGTTATCATCAATTTAAATACAAGGTGTTAAATCCTGTTAAGTCCAAG-TTTGTTTGAGTAAGAAATTATTTCCCCTGAACGACAAGTGTTGATTAAACT-ATTTCAGTGCATCGTCCTG-GTCTTGC----------CAGCCAACATTCTATATGGGCAACA---CTTCAATAC-ACTAAGGGAAGCAGCAGAGTTAGAAAAATAACAGAAATGTGTGTTGGAAGCACAGAAAGCCATAAGAATT a score=35034 s mm7.chrY_random 28954378 1165 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGGCTTCTTCTCAGGCTCTGGGGAATAAGGATGGCTGCAGAATTTCTCACGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGCCACCCATTGGAAGGCCATTATTCTAGGTCACCTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGACGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGTGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAATAGTTTTTCCTCGGGTGAGGGATGTCCACCTCGCCAGTGCCCTGGTTGGCAGAGAGGTAAAACACAAATTTGAGAGGAAACATGGCTCTGAGAAAAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTAAAGGACTTGTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCTGGTCCTCTACGTCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCTAGATCAGGTGATGACAGTGACTTCTTAATAGGTACCAGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAGAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAATTTCTAGCCAAATCTAATGTGTACTTTACCAAATTTCATGGTGACCTACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAATCGCAAAGTACAGAAATGTAAACTTAT-------AGGATTGAAAAAAATGTTTGTTTTCC-TATATTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAA----ATTAATACATGTGAC-ATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT--TGGTAGAGATG------GACTATGGTGGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAG-----CTTCTGTGTGCTGCATAGTGAGTAAGGAATTAGAGA-----TATGACTTAGAGGAGCAGGGATGTCAGC-AAAATATGGATTTGTAGGAAGAAGGGGAGAAAGACAGGACATAGAATCTCT--------GGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529095 1223 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGG--GTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATG-----GGAAGGGGTCAGAAATGG-----AGAGGCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=10284 s mm7.chrY_random 28961013 481 + 30114534 AGTGACTCTAA--ACATTTTTCTTCCTCTAGATTCCTATTTATACCACAAAAT---GGTCTGTAAAAAATGAAAATATGAAAATAAGATTTTTCA---GGGTGTTT-GCCTTCTTTTAAAATCATATTTATAA-------TATTTTACTAAATCGAGGTGAAATCTTCAGCTCCAAGGAACAATGTATTCAATCCTGTTGACTTCTATTTTATCCCATTATGAATAGGAATTAATTGTACATCAACATTTCCCACGATTTGAACTAAATCAAGAATAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGTAATGCCAATGTGGTTAATCAAGTAGAAATGTGGGGGGGGGCGGGGTTAGGATGCCTTTGGATTATTTGAGAATGATGGCTGATCAGAAACATGTTATGCAAATAACCCTAACCTGTGAGAAATGAAAAG-TAATGAT-ATAAATTATACTACCAAGTGTCATGGCCACTTAT----TACTTGATTTTATTTTCCTTTTCA s bosTau2.chr17 20172749 487 - 45915461 AGAAACTCCAATTGCATTCTTTGTTGACTAGGTTGTT--TTGTAGCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATAT-AGCCAGTAATGCCAGTGCGATC-CTCAATTAGCA----------GAAAGGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTA--TGCCTTTCCA a score=667 s mm7.chrY_random 28978534 154 + 30114534 TCTCTCTACCTCTCTGTTGGCATATTTTTCTGACATATTTTCATTTTGATTGTTGCATTTTTTCTACCATTTACTCTCCCCAA-----TGTTGTCTAATC-----------------TCTGTT---TCTTTACCCTCTACTTCATCTGTATAAGTTATGTGACAGATACTAAATCACCC s bosTau2.chr25 41074719 163 - 41414979 TCTCTCAGCTACTCTGCTGGGATTT--------CAAATCTTTCTTTCT----CTGTGTTCTTTCTACTTTTTCCCCTTCCTGGGCAGTTGTCCCCTAGTCGTTTGGTTTGTTCCTTCTCTGTCGTATCTTCGCTCTCT-TTTGGTCTCTCAGAGATCTTTCAT---TTCTGATCTGTCC a score=5005 s mm7.chrY_random 28978691 180 + 30114534 TCCTTCCCTTTCTTGCTTTTCA----ATTTTGTTTCTGAGGTCTTAAGGCTTGTATTCTTAAATGTGCTAGAGCAGGTCCATCACTGTCAATT---CCTGGCCTTAAAAGAAGACAAAAAATACACACCTCCCTCTTTAAGGCCATG-AAAGACTTTGCTAGGTACT-CTCAGCCTAATGAAGTtgaca s bosTau2.scaffold17916 2 181 + 4668 TTCCTCCCTTCCTAGCATTTTCTTGCCTTTTATTTCTTGGCTGCTAAGTCCTGTCTCCTTGGCCATGCTAGGCCAGGCCCACCACCTTCAATTCACCCTGGCCCT-AAAGAGGGCAAA----GTGCATTTCTTTTTCTAAGGCCAGGAAAAGACTCT--CAGGAACTCCCCAACCTGA-GAAGCTGTCA a score=11876 s mm7.chrY_random 28979796 645 + 30114534 GTGATTTTGGATTTTGCCTAGCCATTCTAAGGGAATGAGAGCTGTCCCAGT-ATTTGATTACTCTCAAACAAGACATATT-----TTCTTGGGTTTTATGTCATTGTAGAT-TATAAGAAATCTTTGGTCTCACCTCATGTGGCTGTGTCTCCA-------------AGGAGCTGAACAGAGCCCCAGCCTGTCTGACATCTTTTGGATCATGCTTTTTCACTCAATTACTCATTCCCTGTGGCAGAATGGTTAGGAAATGCTATATTTCCAGAGATTCTAAGATCAGTACTTTTGAGCTGGTCTCTGGCATCAGCCACTGATCACATAATTCCTAAAGCTGGTTTGAAGCCTCTAGTTGTTTTAGTCCTTTCAT-GTAAGATAAGGTCCAGAAGTGCTGCTGAGAACGCTAGAGAATGTGACATTTTGTCTGGTAGCTGTCATTACTGCTCTAGTTTGAATCATCTTGCACAGCTGCATTATTTTTCAGCACAAC--TCGCCTCTTAGTTCA-------------CTTCA-----CTCATTGTCTTGTGCTATAGGAACCATTTTACTTT---------AATCTTCTTGGTACCACCATTCACAACTGAAGC--------------------ACCAGTGGATTGAAGTTTCTTCCTAAGAGAA--GAAAGCAGTGAGGGAAGCACGACAGAAGGGTGAGGCAagaggagactgaca s bosTau2.scaffold17916 193 701 + 4668 GTGATTTCAGATTGCACTTAGTTATTCTAAAGGAACAACAGAAG----AGTGACTTAATCCATCTCATTCTCCAGTTATTGACCCCTCTTTCACCCTCTTTCACAGTGTACATATAAGGAATCTTTCTGCTCACCTCAT-TGCTTATTCCACCACATTCTCTGTGAAAGCGGTCTACCAGGGCCACAGCCTCTTTGACGTTCTGTGGATGATACTTCTGCACCCAGTTCTGGATATGACTGGGCAGAACGTCCAGGAACTGCTCCAGCACCAGCAACTCCAAGATTTGCTCTTTTGAGTGGATCTCTGGCCTCAGCCACTGAGAGCATAATTCCTGCAGGTGGCTGACAGCCTC-ATACGGTCCAGGTGTGTCATGGTAACAGAAGCTCCGGAAGTGCTGGCGAGCACTCTCAGGATGAAGACTGCCCATCTGTGGGCTGGATTTCTTACTCTTATTGGAACTCTCTTTCACAGACCTCTTAGTCCCCTGTAAAACCTCCACATGTGGGTACAAGCATGCAGGCGCCTTCACAGGGCTCATCATTATTTGCTCTGGGAACAGCTTTTCTTCTATTTGTGACATCCTCCTGG-GCCACC--TGATAACTGAGGCCTTGTCAGCTTTGGTACAAAACCAAT-GAGTGGATCTTCTCCCCAAGGGCACTGAGAGAGGGGAGGGAAA------AAAAGTACACGTCAAGAAGAAAGCCACA a score=5569 s mm7.chrY_random 28997033 228 + 30114534 ATCTATTTCATCCTGTTTTTCTGCATTTAATCTATGAAATTCCTTGTAATCAGAAGTGCTGGTAAATTTTAAAAACATTTAAAATATGACTGGGAGATATCAGGTTTGTTTTAAGTTTATCACAACTTTGTAAGCATGCCCAAGATCTATGTTGTCCTCTTCTTTTCCACAGAATCTATAATTCACAATTGCCATTGGTTTCAATACATGT------CATTTAACCCTGTCAAA s bosTau2.scaffold1094 236481 229 + 285174 ATCTATTTCATTACCGTTTCATTTATTTGACCTAACAAATCCTCATTCATAGGCAAGGCTGACAAATTCAACAGAC-TTTAGAA-ACCATTCATCAATATCCAGTTTGTCATAAATTCACTCCAACGTTGGAAACAGGCCCAGAAACTAATTTGGTATCACTTCTTGCAAATGATCCATAATTCATAATTACTGTTTCCTTC---ACATGTGACAGGTATTTGATTCTGTAAAA a score=34694 s mm7.chrY_random 28999362 1140 + 30114534 ATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCCTGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCATTGGAAGGCCATTATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTATTTGGTGAAGTATGAAAGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCACAGTGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGTGGGATGTCCACCTAGCCAGCGCCCTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAACATGGCTCTGAGGAAAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGTCATTCTTACAGGACTGGTTTTACATTTCCTTCAAGAAGGATCCGGTCCTCTACATCGGTCAGCTCCTGGGTGACTACTAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGATGTGACAGT-GACATCTTAATAGGTACCTGGGT-GCAGACACCAGAGATGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTGTAAAAATTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACCTACATATCTACGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAATCATAAAGTACAGTAATGTAAACTTATAGGATTGAAAAAAA--------ATGTTTCTTTTCC-TATGTTGGCTATTTATGGGTCTTTGACAACCCCAGTATATTTGCCAATGAAAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT--TGGTAGAGATG------GACTATGGTGGAAAAAACATCAAAGGCAGATGAAAGTTGCAAGTCAGGCTGTGCATA-----CATCTAATATCACATACATCTAATATCACACAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGCTTCTATGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTCAGAGGTTCAGGGATGGCAGCAAAGATGGATGTTTAGGAA---ATAGGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529137 1181 + 48857030 ATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGG--GTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAA--TATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAGTTCAGCTAGTATCATA----------ATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGAT-------GGATTGTGGGGGAAAGGAAGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=13217 s mm7.chrY_random 29036511 556 + 30114534 TACTAGCTTTGACACTCAATCTTGT---GCAAAGT-AATGCAGCAGGAGTTTTTCACTAATGTATGTTGT-----ATGTAAATATAGTATTCCACCAA--ACTTAGTAACTCTGTATTCCATACTTCCTGCATTCAGCTGTTCACTATTTTAATATTAGTCATACCTATTCCATGCTGT------GCCATGTGTTTTGATGCAATTAGGTTTCATCTGGGGACCT----------CATATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTTCCTTA-GTGTTACTTCATAAACATGTTTCATCTATGGAGTAACA-GTATTAATGCTTTCTGTTTGAAGTA-CACTTTCAGTGTGCATAAGTAGAT-ACTCCACTTTAGTATTTTATGATACACTAAATATAACATATAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTAAAGGATTTTTAAAATGTTGTGTGAGGGC----------TTTGTGATTTAAAAAAAAAAGTGTTCTCAATAGTATTGGCTGAGATTCTGCAGTCTTGTGTGTGCTCTTTTCTAATGAATCATAATTAACGTTTATGCTGAGACTCGGGGAGGCAGGCTTATCAGTA s bosTau2.chr3 40229731 544 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTTCTTACTGCATA--------------------GCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATG------GGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAATGGTATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGACTAATACATGG------TTTTAAGAAGTGGGGTGGGTTTCTTTTCTCTTTTTTTGGTATAATA--------GTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCACTA a score=11806 s mm7.chrY_random 29128555 511 + 30114534 TACTATGCAAAG---AGAC-CTCAGTTAAATGTGTGTCAGTGACTCCAAA-ACAACTTTCCTTCTCTACCTTCCTTTATATGGCACAGAACCAC---CTGTAAATAATTAAAATATGAAAA-CAAAGCTTTTTCTCGAAT--TTAGGCTTGTGTTA------AAATAAT-ATTTATAACATTTTATTGAATGGAACAGAAATCTTCAGCTCCCAGGAGCAATACAGTGAATCCTGTAGGCTTCTGTTTTGTCCCATTATGAAAAA-AATTAATTGCAAATCGACAGTTCCCACACTTTTAACTAAATCGGGACGAAGGGATATGTTTCCATACAAATAAGAAATGCCAATGTTAT--TAATCAAGTAGAAATGTGGCAGGGTTAGGATGCCTTTGGCTGATGTGACAATGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTAACCCCTAAGAAAAGAAAAG-TAATGATATAAAA-TATTTCAAGAAGTGGCATGGGAAATTAT-----TACTTG----------ATTTCAATTTCTTTTACATA s bosTau2.chr17 20172711 539 - 45915461 TATTTTGCCAAGTTCAGACATTCAGCTAAAAGGGCAGAAGAAACTCCAATTGCATTCTTTGTTGACTAGGTTGTTTTGTA--GCAGGAAACCTCATGCTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGT-GGACATTCTCTGTGTACTTGTGTCTATGCCTTTCCAGTTTCTCTTCCATA a score=39452 s mm7.chrY_random 29132092 1288 + 30114534 CACAGAATGATAGCCACAAGACATCTGCCTGGGTTTGGTGTGGTATACCACAGCAAGGCTACAGCCATGTAGAAGAAAATACCTTTGAAGAGGCTTAGCATGTCATCCCTCATGAAGAAGAGGAGGAGGAAGTCTTCTTCCAACACCCTGAGGAATATTGTCGGCTGCAGAATTTCTCACAGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCAATGGAAGGCCATAGTTCTAGATCAACTGCCAACAAACCCTTCTCTTTACTTGGTGAAGTATGATGGAATTGACAGCATCTACGGACTGGAGCTCTACAGTGATGACAGGATTTTAAACCTTAAGGTTTTGCCTCCCATAGTAGTATTTCCTCAGGTGAGGGATGCCCACCTTGCCAGAGCCCTGGTTGGCAGAGCGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAAGATGGCTCTGAGGTCAACTGGAGGGGGGTGGTGCTAGCCCAGGTGCCAATCATGAAGGATTTGTTTTACATTACCTACAAGAAGGATCCAGCTCTCTATGCTTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATGATTCCAGA------CACTCCTCCGCCTGAGGAGAGA---TCAGGAGATGACAGTGATGTGTTGATAGGTAACTGGGTGGAGTACACCAGAAAAGATGGTTCCAAAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACCAAGTTCTAGCCAATCCTTCCGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACATCCATATCTATGTCTATACTATGGTGCCTAAGATTCTTGA-----AGTTGAAAAATCATAAAGTACAGAAACGTAAACATATAGGACTGGAAGAAAAAAAAAGATTTTTTTTTCCTGTGT--TGGCTACATAAGGGTCTTTGATAATCCCAGTATCTTTGCCAATAAAAT--GTGTTTTGTTCTAAAAATGTAAATGTGT-----GACATGACATGCTGTGAGTGAACAATTTGCTG-GACGAGATGGCC-------TACAGTGGAAATAACTTCAAATGAAGATGAAAGTTTCATTTCAGGCGGTGAACAGTACATACACCTAAAATCATA------CATGCTAAAAT-GAACAG--CTTCTCTGGTCT----------GCATGCAGAATAAGGAATTGGAGATGGAACTTGGAGGAGCAGGGATGGCAGAAAAAGATGGATGTTTAGTAA---GTAGGGGAGAAGGACAGGACATAGGTAGAACCTCTGATGTGAAGACT-------GAAGGAGAAACCAAAAGTTGGGGAAAATGGGACATTTAAAAGAAATGTGGCCTTGTTGCACAAGGTGAAAACCAGA--AAACTGATTGAA s bosTau2.chrX 28529056 1308 + 48857030 CACAAAAAGGCAACTGCAAGGCAGCAAACCAGGGAAATTGTTGATGACCACACCTTGTCTGCAAGTATGAGGAAGAAAAAG-----------------------ATTTCTCA-AAAGAAACAGAGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGA--AAAAGTCTTAATGGTTAGGGTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAATATAT-GATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAA-CCCATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATA--AAGTTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAGATGGA--TTGTGGGGGAAAGGA------AGAGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAG-GCTTCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTG--GGGTTGAGAGGAAACCAGGATAAATTGAGTAAA a score=10933 s mm7.chrY_random 29139040 393 + 30114534 CTGTAAATAATGAAAATATGAAAA-CAAAGCTTT--TTTGAGATTTTAGGCTTGTGTTAAAATCATATTTATAA-------CATTGTATTAAATGGAAGTGAAATCTTCAGCTCTCAGGAACAATACAGTCAATCCTATAGGCTTCTGTTTTGCCCCATTGTGAACAA-AATTAATTGCACATCAACAGGTCCCACACTTTTAACTAAATCAGGGAGAAGGGCTATGTTTCCGTACAAATAAGTAATGTCAATGTGATTATTCA--AGTAGAAATCTGGCAGGGTTAGGATGCGTTTGGCTTATGTGATAGTGATGACTGATTAGTCTCTTGTTATGCAAATAACCCTTACCTCTGAGAAAAGACAAG-TAATGATATAAAA-TATACTATGAAGTGACATGGACACT s bosTau2.chr17 20172806 401 - 45915461 CTGCAAATACTTAAAGATTGAAAAATAAAGGCTTAATTTGGTTGCTTAGGCTTTTATTAGGTTCAAAATGATCAGTTAGTTTTTTTTATTAAATGGTAAAGGAGTGTTCAGCTCCTGCAAACAATCATCTCAATCATGTTGGTTTCTATTTAATCCCATAATGAATAGTAATTAATTACACGTTGATCATTTTCATCCTTAGAACCACATCGAGATGTAGGAATACATTTATATATAGCCA-GTAATGCCAGTGCGATCCTCAATTAGCAGAAA------GGGGCTGAAATGCCTTTGGTTTGTGCAACATTGATGGTTGATTGGCTTCTTGTTATGCAAATAAAGCTCCCCACTGAGAGAGGAAAAGATGAGAATAAAAAAGTGTTCTACCCAGTGAAGTGGACATT a score=7317 s mm7.chrY_random 29151072 245 + 30114534 TAATAAATCTGTCTCTCCCAGTCACAGAATAAAAGGAAATTATGATTCATTGGAAAAGAACACATAAATGGCTTCAGAAACTCAGCCAAGTCTATTAAGATATATATATATATATTAACACAAAGT-------TCTCACACAACTTTTTAAAAATCCTGTACTGGATTCATCTTCTAAGTATACACTGTATGTTATATATAGTATATCATAAAATACTAAATAGGAAT-ATCTAGCTATGTACACTGAATGTA s bosTau2.chr3 45130541 228 - 85360813 TGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAACTAT-----TATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTT-AAAACCATGTATTAG-----TCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATA a score=9130 s mm7.chrY_random 29151671 294 + 30114534 ATTGCATGCACAGAGCATTAGTACT-GTAACTCCATGGATAAAACATGTTCATGAAGCAACACT-AACAGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATTTGT----------GTTCATCAA--------------CACACATGGCA------CTGCACAGAACAAGTATGACTAATATTAAAATAGTAAATAGCTGACTGCAAGAAGTATAGAAATCAGAGTTAGTAAGTCTTTGGTGGAATACTATATTTACATACTC-ACAACATCCATTAGTGAAGAACTTCTGCTGCATTAACTTTGC---ACAAGATTTATTGTCAAAACTTGTA s bosTau2.chr3 45130771 311 - 85360813 ATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACCCATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGCTA---------TGCAGTAAG-----------AAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13982 s mm7.chrY_random 29155989 376 + 30114534 AACCTGCTAAACTCACATGTGTGGGGTGTGGGCATGCAAGTGTTCTGTCTGAGCCTGCAGGCCACTTAAATCCTCAAAAACACTGTGGAGTTCAACCCTGACTTCCTGGCACAGATGATCCCCAAAGTGTATTGGGAAGTGCTTGTGCAGGTAGCAGACACCTCAATCTTGGCCCAGGTACACAAATAGCCAACTAGCTGCTATGAACAGGACAAGATACTTTTGAAGAAGATGTACCCACGTGTGGCTTGAGATTGATGTACTGGATGGTACTCTGCAATGCTCAGAATCCAGTGTTCTTTTCCCCATCATCCACAGGATCACCAATATGCTTTAGAATGATGAGGAGACAGAGAGGTAACCT-TGCTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16776 372 + 41832 AACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATC-CCCATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4213 s mm7.chrY_random 29171516 353 + 30114534 TCTCTCTACCTCTCTGTTGGCATATTTTTCTGACATATTTTCATTTTGATTGTTGCATTTTTTCTACCATTTACTCTCCCCAA-----TGTTGTCTAATC-----------------TCTGTT---TCTTTACCCTCTACTTCATCTGTATAAGTTATGTGACAGATACTAAATCACCCT----TTTCCTTCCCTTTCTTGCTTTTCAATTTTGTTTCTGAGGTCTTAAGGCTTGTATTCTTAAATGTGCTAGAGCAGGTCCAGCACTGTCAAT---TTCTGGCCTTAAAAGAAGACAAAAAATACACACCTCCCTCTTTAAGGCCATGAAAGACTTTGCTAGGTACTCTCAGCCTAATGAAGTtgccacagaccctctgggtct s bosTau2.chr25 41074719 359 - 41414979 TCTCTCAGCTACTCTGCTGGGATTT--------CAAATCTTTCTTTCT----CTGTGTTCTTTCTACTTTTTCCCCTTCCTGGGCAGTTGTCCCCTAGTCGTTTGGTTTGTTCCTTCTCTGTCGTATCTTCGCTCTCT-TTTGGTCTCTCAGAGATCTTTCAT---TTCTGATCTGTCCTGAACTCTCCAGCTCCTTAGTGCTTTTTG--TATGTTTCTAAGAATTTGAGGTCCATCTCCTTGGCCAAGCCAGACTAGGCTCATTACCCTCAACACACCCTGGC-TCCAAAGAGAGCAAAA----CTCAACTCTGTCCCTAAGGCCAGGGAAGTCTCTACCAGGATCTCTGAATCCTATGGGCTGACTAAGG---CTGCGGGTCT a score=11615 s mm7.chrY_random 29172779 616 + 30114534 GTGATTTTGGATTTTGACTAGCTATTCTAAGGGAATGAGAG--------------CTGTCCCAGTATTTGATTACTGTCAAAGAAGACATATTTTCTTGGGTTTTATGTCATTGTAGAT-TATAAGAAATCTTTGGTCTCACCTCATGTGGCTGTGTCTCCA-------------AGGAGCTGAACAGAGCCCCAGCCTGTCTGACATCTTTTGGATCATGCTTTTTCACTCAATTACTCATTCCCTGTGGCAGAATGGTTAGGAAATGCTATATTTCCAGAGATTCTAAGATCAGTACTTTTGAGCTGGTATCTGGCTTCAGCCACTGATCACATAATTCCTAAAGCTGGTTTGAAGCCTCTAGTTGTTTTAGTCCTTTCAT-GTAAGATAAGGTCCAGAACTGCTGTTGAGAACGCTAGAGAAAGTGACATTTTGTCTGGTAGCTGTCATTACTGCTCTGGTTTGAATCATCTTGCACAGCTGCATTATTTTTCAGCACAAC--TCGCCTCTTAGTTCA-------------CTTCA-----CTCATTGTCTTGTGCTATAGGAACCATTTTAC---------TGTAATCTTCTTGGCACCACCATTCACAACTGAAGC--------------------ACCAGTGGATTGAAGTTTCTTCCTAAGAGAA--GAAAGCagtgagggaagcaaga s bosTau2.scaffold16262 1477 678 + 6750 GTGATTTCAGATTGCACTTAGTTATTCTAAAGGAACAACAGAAGAGTGACTTAATCCATCTCATTCTCCAATTATTGAC------------CCCTCTTTCACCCTCTTTCACAGTGTACATATAAGGAATCTTTCTGCTCACCTCAT-TGCTTATTCCACCACATTCTCTCTGAAAGCGGTCTACCAGGGCCACAGCCTCTTTGACGTTCTGTGGATGATACTTCTGCACCCAGTTCTGGATATGACTGGGCAGAACGTCCAGGAACTGCTCCAGCACCAGCAATTCCAAGATTTGCTCTTTTGAGTGGATCTCTGGCCTCAGCCACTGAGAGCATAATTCCTGCAGTTGGCTGACAGCCTC-ATACGGTCCAGGTGTGTCATGGTAACAGAATCTCCGGAAGTGCTGGCGAGCACTCTCAGGATGAAGACTGCCCATCTGTGGGCTGGATTTCTTACTCTTATTGGAACTCTCTTTCACAGACCTCTTAGTCCCCTGTAAAACCTCCACATGTGGGTACAAGCATGCAGGCGCCTTCACAGGGCTCATCATTATTTGCTCTGGGAACAGCTTTTCTTCTATTTGTGACATCCTCCTGG-GCCACC--TGATAACTGAGGCCTTGTCAGCTTTGGTACAAAACCAAT-GAGTGGATCTTCTCCCCAAGGGCACTGAGAGAGGGGAGGGAAAAAAAA a score=9084 s mm7.chrY_random 29181582 286 + 30114534 TTATGTATTTTATGGGTTCTGAGATGGTTCCATCGTCTGTTAAACATTTACTCACACAGGTGTCATGTATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGTTTAATGAGCTAACATTTCTGAAGTAATAGTCTCCCAAATTC--AATAGTTAAAGGGCTTCTGACCTGAATGAAATCTTTGGTGTTTAACATAGTTTGTATTATTACAATTAAGGTTTATT--GGACCAACAACATTGATGTAGTTTTATTTATTGGTGAGTCAGAAAATGCATTTTAAAATCTGAACT s bosTau2.scaffold5600 51219 287 - 52585 TTGTGGAGTTTCTGGTGTCTAAGAAGGCTTGAACGCCTGCTAAAATTTCTGTTGCATATGCTACAGGTATAAGGCTGCTCACCTGTGTGGGTTCTCTGGTGTTTAATAAGGTGGGAGTTCTGAATGAATCTTTTCCCACATTCATAACATTTAAAGGGCTTCTCTCCAGTGTGAATTCTTAGGTGTGTGTGTAGATTTGTGTTATGAC---TAAAGCTTTTTCCACACCATGAGCATCTATATGGTTTAATTCCTTGGTGTGCCATTAAGTGCTTATTAAGATCTGAACT a score=34670 s mm7.chrY_random 29192141 1130 + 30114534 ATCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAGGCCATGGGGAATATTGTTGGCTGCAGAATTTCTCACGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGTCACCCGTTGGAAGGCCATCATTCTATGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTTTTTATTTGGTGAAGTATGAAGGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGTTCCACAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAGTAGTTTTTCCTCAGGTGTGGGATGTCCACCTAGCCAGCGCCCTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGGGGAAACATGGCTCTGAGGAAAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGTCATTCTTAAAGGACTGGTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCCGGTCCTCTACATCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGATGATGACAGTGACATCTTAATAGGTACCTGGGTTCAG-ACACCAGAGATGATGGTTCCAAAATTTCGG--AAAGGTTTGTAAAAATTTCTAGCCAATCCTACTGTGTACTTTATCAAGTTTCATGGTGACCTACATATCTACGTCTATATTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAATCACAAAGTACAGAAATGTAAACTTATAGGATT----GAAA---AAAATAT-TTGTTTTCCTATGT--TGGCTACTTATGGGTCTTTGACAACCCAAGTATCTTTGTCAATAATAT--TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTTAGTGAACACTTTGT--TGGTAGAGATG------GACTATGGTGGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGCTTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGGCAGCAAAAGATGGATGTTTAGGAA---GTAGGGGAGAAAGACAGGACACAGATAGAATCTCT-------GGTATGAAGTCTGAGGGAGAAACAACAATTTGGGG------AAAGAGTGATAGA s bosTau2.chrX 28529137 1181 + 48857030 ATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGG--GTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAA--TATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACCC-ATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAA-ATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGA a score=35881 s mm7.chrY_random 29211238 1238 + 30114534 GTAGAAGACAATACCT---CTGAAGAGTCTGAGCATGACA----TCACTCAAGAAGAAGAGTAGGAGGAAGCCTTCTTCCCAAGCTCTTGGGAATAAGGTTGGCTGCAGAATGTCTCACGGTTGGAAGGAAGGTAATGAGCCTGCCACCCATTGGAAGGCCATCATTCTAGGTCAACTGCCAACAAACCCTTCTTTTTATTTGGTGAAGTATGACAGAATTGACAGTGTCTACGGACAGGAGCTCCATAGCGATGAGAGGATTTTAAATCTTAAGGTCTTGCCTCACAAAATAGTTTTTCCTCAGGTGAGGGATGTCTACCTCGCCAGTGCCCTGGTTGGCAGAGAGGTACAACACAAATTTGAGAGGAAACATGGCTCTGAGGAAAACTGGAGTGGGATGGTGCTAGCCCAGGTGCCATTCTTAAAGGACTGGTTTTACATTTCCTACAAGAAGGATCTGGTCCTCTACATCTATCAGCTCCTGGATGACTACAAGGAAGGTAACCTCCACATCATTCCAG---------AGACCCCTCTGGCTGAGGCGAGATCAGGTGATGACTGTGACGTCTTAATAGGTACCTGGGTGCAGTACACCAGAGATGATGGATCCAGAAAGTTCGGAAAGGTTGTTTACAAAGTTCTAGCCAATTCTGATGTGTACTTTATCAAATTTCATGGTGACCAACATATCTATGTCTATACTCTGGTGTCAAA----TATCACTTAAATTGAAAAAATCACAAATTACAGGAATGTAAACTTATAGGATT----GAAA---AAAAAATGTTTGTTTTC-TTGTTTTGGGTACCTATGGGTCTTTGACAACCTCAGTATCTTTGTCAATAAAATT-TTGTTTTGTTCTAAAAATTAATACGTGT-----GACATGACATGCTTTAAGTGAACACTTTGT--TGGTAGAGATG------GACTATGGTGGAAAGAACATCAAAGGAAGATGAAAGTTGCAACTCAGGCTGTGAACAGTGCATACATCTAATATCACA------CAGGCTAAAATGG-ACAGGACTTAGCTTCTGTGGTCT-----GCATAGTGAGCAAGGAATTGGAGATATGACTTAGAGGAGCAGGGATGTCATCAAAAGATGGATTTTTAGGAA--GAAAGGGAGAAAGACAGGACATAGATAGAATCTCT-------GGTATGAAGTCTGAGGGATAAACAACAAGTTGGGG------AAAGAGTGATAGATAAAAGGGATGTGGCCTTGTTACACAAAGTGGAACCCAGA--AAACTGATCCAAAGAGACTCAGAAAT s bosTau2.chrX 28529095 1282 + 48857030 GTTGATGACCACACCTTGTCTGCA-AGTATGAGGAAGAAAAAGATTTCTCAAAAGAAACAG-AGGGGCAGACCTTCCTCCCAGACGCGCAGGAACATCGTGGGCTGCAGAATTTCACATGGATGGAAGGAAGGTGATGAGCCCATCACCCAGTGGAAAGGAACCGTTCTGGATCAGGTGCCTATAAATCCCTCTCTTTATCTGGTGAAATATGATGGAATTGACTGTGTCTATGGACTGGAACTTCACAGAGATAAAAGGATTTTAAAGCTTAAAATCCTTCCTGATAAAGTGCCATTTTCTCGAGTCAGAGATGTGCACCTTGCAAATACCATAATTGGTAAAGCTGTTGAACATATGTTTGAGGGTGAACATGGTTCTAAGGATGGATGGAGGGGGATGGTCTTAGCTCAAGCACCCATCATGAAAGCGTGGTTTTATATTACCTATGAGAAAGATCCTGTTTTGTACATGTACCAGCTTTTAGATGATTATAAAGAAGGTGACCTCCATATCATGCCAGAGTCAAGTAAGTCTTCTCCAAAAGAGAGAGAGCCAGAAGGAGTTATAGATGGCCTCATAGGTAAACATGTAGAATATACCAAAGAAGATGGCTCCAAAAGGACAGGCAAAGTCATTCACCAAGTTAAAGCCAAACCTTCTGTGTACTTCATTAAGTTTGATGATGATTTCCATATCTATGTCTATGATTTGGTGAAAAAGTCTTAATGGTTAGG--GTAAACATTGTCACGTATATGTAGGCAAA--TATATGATTTGGAGAAACACAAAATATGTTGCTTTTCAGTGTACTGAAAGTATAGGGGTCCCTAATAACC-CATCATCATTGCCAGCAAAACTGTTGTTTTGTTCTAAAAAAATATAAGTTTATGTAGCTATGACATGCTGTGTGTAAGGAATTTGTCATGGTGAAAAGGTTGGGTGTGTTTGGTTGAGGGGACATGAAAGGAAGGAACAAGTGTAAATTCAGGCTGTGAATAAAG--TTCAGCTAGTATCATAATCAGTCATCTAAAAATGGAACAGGACTTAGCTGGTCTTGTCTAAGGAGAGGAGAGGAGAAGGAACTAGAG--ATGGATTGTGGGGGAAAGGAAG------AGAGATGGCTGCTTAAGAAAGGATATGGGAAGGGGTCAGAAATGGAGAGGCT-TCTAGGGGGAGGGATAACCTAAGAGGGGGAGGCAGCCAACTGGGGGGTGTTGAAGAATAACAGAGAGTGAAATCTTGGGGTTG--------AGAGGAAACCAGGATAAATTGAG-TAAAGAGGGACACAAAT a score=14203 s mm7.chrY_random 29270687 377 + 30114534 TGGTGGCTAGCA-AGGTTACCTCTCTGTCTCCTCATCATTCTACAGCATATTGGTGATCCTGTGGATGATGGGGAACAGAACACTGGATTCTGACCATTGCAGAGTACCGTCCAGTACATCAATCTCAAGCCACACGTGGGTACATCTTCCTCAAAAGTATCTTGTCCTGTTCATAGCAGCTAGTTGGCTATTTTGTGTACCTGGGCCAAGATTGAGGTGTCTGCTACCTGCACAAGCACTTCCCACTACACTCTGGGGATCATCTGTGCCAGGAAGTCAGGGTTGAACTCCACAGGGTTTTTGAGGATTTAAGTGGCCTGTAGGCTCAGACAGAACACTTGCATGCCCACACCCCACACATGTGAGTTTAGCAGGTT s bosTau2.scaffold6942 24684 372 - 41832 TGGTGCCTGGCACAGTTTAAGTCTCAGTTTCCTCATCGCTCAGCAGCATATGGG-GATCCCACGGCTGATGGGGAATAGACGTCCTGACTTTGGGCATTGCAGGGTGCC---CAACACCTCCACCTCCAGCAGCACGTGG-TGCATCTTTCTCAGAAATTCCTCGTTATGCTCATATCCCTGAATCGGCTCTTTAG-GCACCTCGGTCAGATGCAGGGTGTCCACAACTTCCAGAAGCGCCGCCCACTCCACTTTGGGTATCATACGCACTGTGAAGTCAGGGTTGAATTCCACAGGATTGATAGAGACCTCAGTGGCCTGGAGACGCAGGGGGAAGCCACGGGGCCCCACCCCCTGCACGTACAAGCTCAGCAGGTT a score=9721 s mm7.chrY_random 29275103 314 + 30114534 TACAAGTTTTGAAAATAAATCTTGT---GCAAAGTTAATGCAGCAGGAGTTCTTCACTAATGGATGTTGT-GAGTATGTAAATATAGTATTCCACCAAAGACTTACTAACTCTGATTTCTATACTTCTTGCAGTCAGCTGTTTACTATTTTAATATTAGTCATACCTGTTCTATGCAGTGCCATGTGTGTTGATGAAAATAATTTTCATTTCGGGAAC----------ACAAATGAAATGCAAATATTGTGTG-TAAATCTCTGTT-AGTGTTGCTTCATGAACATGATTTATCCATGGAGTTAC-AGTACTAATGGTCTGTGCATGCAGT s bosTau2.chr3 40229731 311 + 85360813 TACAAGCTCTGACAATAAATCTTGTTGTGAAAAGTTACTGTGACTGGAATTCTTCACTAAAGTGTACTGTTAAGCATATGAATATAGTATTTCACCCAGGACTTCGTAGCTT-----------CTTACTGCA---------TAGCTCTTTTAAAATTAGTCATACCTGTTACTTGCAGTCAGCTTGACATGGGTGGAAGTAAGTTTGATTTGGGGAACCGTATAAAAGGCATACGAAATGCAAGTATTTTGTGCTACATCTGTTTCAAGTGTTGCTTTGTAGACACATTTTATACATAGTGTCACAAGTGTTAACACTACATTTATACAAT a score=2595 s mm7.chrY_random 29275771 124 + 30114534 TACATTCAGTGTACATAGCTAGAT-ATTCCTATTTAGTATTTTATGATATACTATATATAACATACAGTGTATACTTAGAAGATGAATCCAGTACAGGATTAGGATTTTTAAAAAGTTGTGTGAG s bosTau2.chr3 40230044 99 + 85360813 TATCTCTAGTGTACATAGCTAGGTTGAAGCTGTTTAATATTTTAAAATTTCC--------------AGTGTATCCTTATAAGA-----CTAATACATGGTT-------TTAAGAAGTGGGGTGGG a score=5555 s mm7.chrY_random 29275957 105 + 30114534 atatatCTTAATAGACTTGGCTGAGTTTTTGGAGCCATTTATGTGTTATTTTCCAATGAATCATAATTTCCTTTTATTCTGTGACTGGGAGAGACAGACTTATTA s bosTau2.chr3 40230167 105 + 85360813 ATAGTTCTTAATAGATTTGGCTGAGGTTCTGCTGTCTTGTATGTTTTGTTTTGCTATGAGTCATAATTTCCTTTTATTCAGTGAATAGCAGAGGTAAGCTTGTCA a score=10793 s mm7.chrY_random 29287629 397 + 30114534 AGTAAGTGTCCATGTCACTTCGTAGTATA-TCTTATATCATTA-CTTGTCTTTTCTCAGAGGTAAGGGTTATTTGAATAACAAGAGACTAATCAGTCATCACTATCACATAAGCCAAACGCATCCTAACCCTGCCAGATTTCTACT--TGAATAATCACATTGACATTACTTATTTGTACGGAAACATAGCCCTTCTCCCTGATTTAGTTAAAAGTGTGGGACCTGTTGATGTGCAATTAATT-TTGTTCACAATGGGACAAAACAGAAGCCTACAGCATTGACTGTATTGTTCCTGAGAGCTGAAGATTTCACTTCCATTTAATACAATG-------TTATAAATATGATTTTAACACAAGCCTAAAATCTCAAA--AAAGCTTTG-TTTTCATATTTTCATTATTTACAG s bosTau2.chr17 25742250 405 + 45915461 AGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTAC-TGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCAAATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=20115 s mm7.chrY_random 29293606 809 + 30114534 TTCAATCAGTTTTCTGTGTTTCACCTTGTGCAACAAGGCCACATTTCTTTTAAATCTCCCACTTTCCCCAAATTTTTGTTTCTCCTTC-------AGTCTTCACATCAGAGGTTCTAACTATGTCCTGTCCTTCTCCCCTAC---TTCCTAAACATCCATCTTTTTCTGCCATCATGCTCCTCCAAGTTCCATCTACAATTCCTTATTCTGCATGC----------AGACCAGAGAAG--CTGTTCC--TTTTAGCATG------TATGATTTTAGGTGTATGTACTGTTCACTGCCTGAAATGAAACTTTCATCTTCATTTGATGTTCCTTCCACTGTAGGC---CATCTCTTCCA-----GCAAAGTGTTCACTTACAGCATGTCATGTC-----ACACATTTACATTTTTAGAGCAAAACAC--ATTTTATTGGCAAAGATACTGGGATTGTCAAAGACCCTTATGTAGCTAACACAGTAAAAAAAAAAAACTTTTTTTTTCTTCCAGTCCTATATGTTTACGTTTCTGTACTTTATGATTTTTCAACT-----TCAAGAATCTTTGGCACCATAGTATAGACATAGATATGGATGTCACCATGAAACTTGATAAAGTACATGGAAGGATTGGCTAGAAATTGGTAAACAACCTTTCCGAACTTTTTGGAACCATCTTTTCTGGTTTACTGCATCCAGTTACCTATCAACACATCACTGTCATCTCCTGATCTCTCCTCAGCCGGAGGAG-------TG--TCTGGAATCATGTGGAGGTTACCTTCCTTGTAGTCATCCAGGACCTGATAAGCATAGAGAGCTGGATCCTTCTTGTAGGTAATGTAAAACAAATCCTTCATGAT s bosTau2.chrX 20326666 852 - 48857030 TTTACTCAATTTATCCTGGTTTCCTCTCAACCCCAAGATTTCACTCTCTGTTATTCTTCAACACCCCCCAGTTGGCTGCCTCCCCCTCTTAGGTTATCCCTCCCCCTAGAAGC-CTCTCCAT-TTCTGACCCCTTCCCATATCCTTTCTTAAGCAGCCATCTCT--CTTCCTT-----TCCCCCACAATCCATCTCTAGTTCCTTCTCCTCTCCTCTCCTTAGACAAGACCAGCTAAGTCCTGTTCCATTTTTAG-ATGACTGATTATGATACTAGCTGAACTT--TATTCACAGCCTGAATTTACACTTGTTCCTTCCTTTCATGTCCCCTCAACCAAACACACCCAACCTTTTCACCATGACAAATTCCTTACACACAGCATGTCATAGCTACATAAACTTATATTTTTTTAGAACAAAACAACAGTTTTGCTGGCAATGATGATGGG-TTATTAGGGACCCCTATACTTTCAGTACACTGAAAAGCAACATATTTTGTGTTTCTCCAAATC-ATATATTTGCCTACATATACGTGACAATGTTTACCCTAACCATTAAGACTTTTT--CACCAAATCATAGACATAGATATGGAAATCATCATCAAACTTAATGAAGTACACAGAAGGTTTGGCTTTAACTTGGTGAATGACTTTGCCTGTCCTTTTGGAGCCATCTTCTTTGGTATATTCTACATGTTTACCTATGAGGCCATCTATAACTCCTTCTGGCTCTCTCTCTTTTGGAGAAGACTTACTTGACTCTGGCATGATATGGAGGTCACCTTCTTTATAATCATCTAAAAGCTGGTACATGTACAAAACAGGATCTTTCTCATAGGTAATATAAAACCACGCTTTCATGAT a score=13243 s mm7.chrY_random 29363219 557 + 30114534 TACTGATAAGCCTGCCTCCCCGAGTCTCAGCATAAACGTTAATTATGATTCATTAGAAAAGAGCACACACAAGACTGCAGAATCTCAGCCAATACTATTGAGAACACTTTTTTTTTTTAAATCACAAA----------GCCCTCACACAACATTTTAAAAATCCTTTACCGGATTCATCTTCTAAGTATACACTATATGTTATATTTAGTGTATCGTAAAATACTAAAGTGGAGT-ATCTACTTATGCACACTGAAAGTG-TACTTCAAACAGAAAGCATTAATAC-TGTTACTCCATAGATGAAACATGTTTATGAAGTAACAC-TAAGGGAGATTTA-CACACAATATTTGCATTTCATATG----------AGGTCCCCAGATGAAACTTAATTGCATCAAAACACATGGC------ACAGCATGGAATAGGTATGACTAATATTAAAATAGTGAACAGCTGAATGCAGGAAGTATGGAATACAGAGTTACTAAGT--TTGGTGGAATACTATATTTACAT-----ACAACATACATTAGTGAAAAACTCCTGCTGCATT-ACTTTGC---ACAAGATTGAGTGTCAAAGCTAGTA s bosTau2.chr3 45130538 544 - 85360813 TAGTGACAAGCTTACCTCTGCTATTCACTGAATAAAAGGAAATTATGACTCATAGCAAAACAAAACATACAAGACAGCAGAACCTCAGCCAAATCTATTAAGAAC---------TATTATACCAAAAAAAGAGAAAAGAAACCCACCCCACTTCTTAAAA--CCAT----GTATTAGTCTTATAAGGATACACT--------------GGAAATTTTAAAATATTAAACAGCTTCAACCTAGCTATGTACACTAGAGATACCATTGTATAAATGTAGTGTTAACACTTGTGACACTATGTATAAAATGTGTCTACAAAGCAACACTTGAAACAGATGTAGCACAAAATACTTGCATTTCGTATGCCTTTTATACGGTTCCCCAAATCAAACTTACTTCCACC------CATGTCAAGCTGACTGCAAGTAACAGGTATGACTAATTTTAAAAGAGC--------------------TATGCAGTAAGAAGCTACGAAGTCCTGGGTGAAATACTATATTCATATGCTTAACAGTACACTTTAGTGAAGAATTCCAGTCACAGTAACTTTTCACAACAAGATTTATTGTCAGAGCTTGTA a score=13835 s mm7.chrY_random 29368771 375 + 30114534 ATCTCCTAAGCTCAAATGTGTAAGGCTTGGACATGCATGACTTCCATCTGTGCCTGCAGGCCACTGAAATCCGCATCAACTATGTGGATATCTACCCTGACTTCCTGGCACAGATGCTCCCCAAAATGAAGTGGGCATTGATTATGCAGGGAGCAGTCACCTCAATCTTGGCTGAGGTACTTATAGATCCAACTGAAAGCTATTAACAGGACGACACGTTTTTTAGGAAGATGTACCCACATGTGGCTTGAGATTGATGTATTGGATGGTACCCTGCAGTTCTCAGAATCTGGACATCTTTTCCCTATAAGCTGCAGGATCCCCAATATGGTGTTGAATGATAAGGATACAGAGATATAAACT-TGTTAGCCACCA s bosTau2.scaffold6942 16777 371 + 41832 ACCTGCTGAGCTTGTACGTGCAGGGGGTGGGGCCCCGTGGCTTCCCCCTGCGTCTCCAGGCCACTGAGGTCTCTATCAATCCTGTGGAATTCAACCCTGACTTCACAGTGCGTATGATACCCAAAGTGGAGTGGGCGGCGCTTCTGGAAGTTGTGGACACCCTGCATCTGACCGAGGTGCCTAAAGAGCCGATTCAGGGATATGAGCATAACGAGGAATTTCTGAGAAAGATGCA-CCACGTGCTGCTGGAGGTGGAGGTGTTG---GGCACCCTGCAATGCCCAAAGTCAGGACGTCTATTCCCCATCAGCCGTGGGATCCCC-ATATGCTGCTGAGCGATGAGGAAACTGAGACTTAAACTGTGCCAGGCACCA a score=4848 s mm7.chrY_random 29373316 89 + 30114534 ACAAAGTTATCCTTTAGTTCCTCATTTTGCTCACATCAGCATCTGTAAACCATTGCCAAGTTCAGAGGCTAAGAATCTGCATAGTATCT s bosTau2.chr3 46354234 89 - 85360813 ACAATACTCACTTTTAGCTTCTTGTTTAGTTTACAGCAGTATCTGTACACCATTGCCAAGTTCAGAGGTCCAAAATCTGCATAGAAACT a score=9684 s mm7.chrY_random 29436460 187 + 30114534 AATATTCAGTATTTAATTTCTCTTTAAAATTCACC--------CATTATAGATATTGTCTCCTCAAGATTCTAAAGCATTGTCAGACTTTGAGAGAAGCTCTTGTTGCAGCAGGGAAAGAGGTTTTGTGGCATGGGAGGATAAATGATGAACCAGCTCCTTACTGTAGCATCTGTGAGGTAAGTATCCTTTCTTA s bosTau2.scaffold2508 12535 195 + 112310 AATATTCAACATTCAGTTGCTGGTCACAAATAACTTTCCCCCACACTCTAGGTATTGTCTTCTGAGAACTCTGAAGCAGTGTCAGACATTGAGGGAAGCTCTCATTGCTGCGGGAAAAGAGATTATATGGCATGGGCGAACAAAAGAAGAACCAGCACATTACTGTAGCATTTGTGAGGTAAATAATTGTTCTTA a score=2419 s mm7.chrY_random 29437242 98 + 30114534 ATCTCAGAATTTCAAGATATCAGTACACAATAAAAGTACAGATGGTGACAAAATAGATTTAGTGTAGTGCAAGTCCAGGCAGGTAGTTACTGAACCCT s bosTau2.scaffold2508 13288 98 + 112310 ATCTTGAAATTTTAAACTGGGAACACTCCAGGTGTAGACAGATGCCAGTAAACTGGATATAGTTCAGTACAGTTTCAGGCAGATCATTGTTCAGTTCT a score=14699 s mm7.chrY_random 29439619 509 + 30114534 CCCTTTCTCTTGTGTTAAAATAGGTGGAAGTTTTTAATTTACTTTTTGTCACTAATGAAAGCAATTCTCAAAAGACATATATAGTACATTGTCAGAACTGTGCACGAAAAACAAGTGGAAATTTGGAAAATTTTGTAGTGCTAGAACAATACAAAATGGAGGACCTGATTCAAGTCTATGACCAATTTACATTAGTAAGTG-ATTTAAAATGTCACTATATACTTAACTGGGTTATAAAGGAGCAGTGtatat----------------------------atatatatatat--------------ataggtgtgtgtgtatgtgtgtgtatacatat----------------------atatatatatatat----------------------------------------------CACAGAATGGTATCACAGT---TAAATTTTAAAAATTTCTCCTGCTTTTTATAATAT----ACATGTATGTTG----TTGACCCTAGTTGATAGAATTAACTCATTTTTCTGTAGTAATTAT---------CCAAATGGA--AGTA---ATACTTTTA------------------ATCTAATTG-ATTTATTTAAAATGTAATACTTCCTAATGCTATTATTTTCATGGAAATAGTCTGTGA s bosTau2.scaffold2508 14948 653 + 112310 CTTTTTCTCTTGTAT-GAACTAGGTGGAGGTTTTTAATCTGCTTTTTGTCACTAATGAGAGCAATTCTCGAAAGACCTACATAGTACATTGCCAAGATTGTGCAAGAAAAACAAGTGGAAACCTGGAAAATTTTGTGGTGCTAGAACAGTACAAAATGGAGGACCTGATGCAAGTCTATGACCAATTTACATTAGTAAGTGAAACCAACATGTGAGTACATAGTTAGCTGGATAGGGAAGCACCAGGATTTGTTCTGCCACCTGATGAGTAGGAGGTAATGAAATATTTAAATTTTCCTTTGACTCATTAGATAT---TTCATGAGGAAATACTCATATTCCCTCCCTCCTCCACTTCCAGGTATTTATTTCTATGAAATTGGCATATTTTATTTTTACTTTTCTTCCTGGGTGAGACCAGCCCTAAATAATGTCACAGTAACTACATTTTAAAATCTTTGTGTAC-TTTTAGAACATTGCCACATCCTTTGTGTCATTTGATCTCAGTTGATAAAAT------GTTTGTGTACATAGGTTATTAGTGTCCACAAAATGAGTCAGTATGTATGCTTTTAAATAACTTCTGCTTTTAGAGCTAATTGTATTTATTTAAAACCTTGTCCTTGCCAGAAGTAGTAACTTTACAGGAATATTCAATGG a score=35721 s mm7.chrY_random 29440314 2173 + 30114534 AGATAGCATTTATTCCTACTTCCAGGAGTTGT--GTCTCTAGAAATACAATTTCAGCTATAGATATTATTTTAGGAACTTTATTTCTACATTGGAAATTTATTTTTAGATTTTTGTTGTTGAA-AGTCATT----TTGGATGAGGAAATTAAAGAACAAATGGAGTTTTTAAAATAAATTACAGAATAGAAACACAAATTATGTTTCTATATAATCATGCCAGTAAGTAGCTGATAGAATGTTTATTAAATTTCACATTGTACA----------------TTCAG-AATTTTAAAAAC---TTAACTAAATAATACTTAAAAAG-TTTTGATTAAGTGGTAAACTACAGAAAAAATGATGGA------AATTTTGGTAGTG------GAATCTTGGGAA------------------------------CTATATTCAGTA----------------TGAATTCTCATTTGACTGATCATTAAGATTACTTTTCAACTCAAGCATAAACAGGCTGTTAGTATTCATTTATGGCTTTGAGCTACAGAATAC--TTACAAGCTTATGTAACAAAACAATA---TTTTTTTTTATTTGTAGGCTCCTTCGTT---ATCTTCTGCATCTTAATATTGTTCCAGAAATACT----GAGGCGTT---TGTTCTTCTTGAAATA-----------TACTACTTATTTTCTTGTTATTCTCATAAGACTGCTATCTCAAAGCTAAATTTATGCAACCTTTCAAGAGTAGAGAATCAGGAGACTAAAC-----AGAGCATTACTTCTATTCCAAGA--TTTACAAAGTTGACCCAAATGTATTTCATAATTAAAAGTTAATAGTAATAGTCACATGATTTGTATATATCTGCCAGAAATAACATTTTGACACAAACAAATACCTGGAAAACAAC----TTTTTATATCTCCATTTCCTGGATGACAGATTTCTTTATGCTTGTAAGTTACCC----CAAATTTTTTGTTTAGAATCAAATAGTATCTTATTTGGCTACTTCTTTTTAAGATAACTAACAAATTGAAAAAAAATTTTTTCTTTTACCAATTTTTTGCTAAAGTCAAAA-TAATATGAAAAAGGTTTATATTGC-------TCTGTCACTATTGTTTTGAAGTCTTG------ATTTCA--TGTGATTACAAAA---------TAAAAATATTAACAGACTGGT-AAAAAGATTATAGGTTGCATATAAAT---------AATTTCAAAGTGATGGTTTTTTGTTTTGTTTTGAATCTTGACACAAACTCAAACTAttcataaatacatatatatatgtgtatatatgtatgtatacatatatgtacatatatatatatatacacatacatacatatatacatatatatgtatattgctggaAAATCCTTGTGAATTGAATGTTAT--TTTTTTCTAGATTTACTTGCCATT-AAATACTAAGGAGTTGTATAATTTTAAATGCCA---CAATTAATTTTTATATGTGTAAATAAAGCTACTTAGTATTGTACATAAACTCTTATTAAAATTATTTAGTGTATAAAGAATTTTTCAATGTTTGAGTTTTGAAGAT------TATATAGT-TCCAATCTTTGTTCCTTTTCAAAGTTAATGAATATATGTA-TTTAAGTCTGCCAACACATGT-------ATGTATGTAGAGATCTCAGTATTTCACTCAACAAG----AAAATCACAATTTTTC--------AATTTTTTATGGCTGAAAGTTTTTGAAGGTAT-------------TTGCTTACAAAATAGGTATGCTTATTTTTAAAG-----------------ACCATCAGTGTC-----TTTTAGTCTG-------ATTAGGTTACACCTTATGAAATGAC--------AAGTAGTTGCTGTCAGAAATATTTTTTAAGGGTAGAAAATAAAGGTAAATTAAGATT---TTTTTATAAGAA-----ACATAGATTTGACAAGTGCT---TATCATTTA-GAGTTTTGCTTTAATGGAAAAGTTCATTGCAATGATGATCTCTATTTTAGAGTTTAATATTCCTAGGA-----ACTTTTAAA--ACAGATAATTTTGAAATTCCATGTATTCCTGCTTGTTCAATCTGGTGTGTGTTGGGAGACTTACGCATTAAAATTTAT--TATTAGTAAATCTTAACAAGGTCTATGAAGGCTTTATTTCAT-ATTTTTACTTAAAAGCTTAGTTTAGCAAAGACATCCCTATTTTCTTCTGTTTTTTGAGGTATTTGCCTTACATTCTCATTTTATTAT-TTGTTCTTTCCAACATGTTTTTAAAAATCTTTTGTGAAGA---ATGGATGAAGATTCTAAATGAAATCGCATAAATTACAAAACAAAATTTTTAGTTAT---TGGTAGTAAACTAGCTTGATTGCATTA s bosTau2.scaffold2508 15742 2258 + 112310 AGACATAATTTAT------------GAATTGTTGAATTCCTTCAATACTTTTTCTCTTACATATGTGG--TCAGAAACTGAATTTTT------GAAGTTTAGCTTCTGGTATTTTCATTTGAATAGTCTTCAAGATTGCTTGAAGAAGATGAAAATTACCTG-------TTAAATAAATTATCATCTAG----TTGAATTAGGTTCT----GAAGCAAGTCACCAAGGAAGTCATAGTTGATTTGTTATATT--ATTTTTTACAAGCCGCCTTTTAATTTTTAAGCAATTTCAAAAAATGGTCAACCTAATAACATTTTAAGAGTTTTTGACTAATTGGTGGAGAAGTACCAAAATGTAGGGTACACTAAGTAGGGTAATGGTCTCAGACTCTTAGGAAAATTGGCCAGGTGGGGGACAGTAACAGAGGTTATACTGGACAGAGTGTGACAGGCAGCTGAACTTTCTTGAGAATTGTTCTTTCCCCTACCTTT----------ATACACAGACCAT--------GTTTGTAGCCTTGAGCTAGGAAACACTATTAACAATTTATATACCAAAGTAACATACTTTACTTTCATTTTCAGGCTCCTCCATTACCATCCTCCTCATCTTGATATTGTTCCACGGACATTAAACGAGACCTTTTCTGCTATTCAGGAAGTAACCCAGTTCTGCACCACTGGTTTTTGTAGCTATCTCGTAAGGCTGCTGGCTGAAAACTGTGTCTATGCAACCTTCCAAGTGCGGAGTGTCAACCAACTGGACAGGGGAGAGCTTTGCTCCTACTCCAGGACTCTCACAAAGCTGA-TCAGCTGTTCTTCAGAAACAAAA--TAATAAT-----TTCCATGTTTTGTATATATCTGACAAAACTGGCAACATAATACAGACTACTGACTTGAAGACAACCTCTTTTATATTTCTCTATTTCTGGGCTGACGAATTGGTTTTCATCTGTCTTTTCCCCTCTTCAGAATTTTCCTTGGGAA-AAAATACTAGCCTAGCTGGTCATTTCTTTGTAAGGTAGTTAGAAATTTTAAG------TCTTTATTTGGTCAACTTTTTTTTAATGTGAAAAGTTAGGTAAGGAACTTTTTTACTGCTTTTATGTTTTTCTGTCTTGTTTTGAAACCATGACGGTTATTACACTTCTGGTTCCTAAATAAAATGTTTAAAAAATTTAACAGCCAAGTCACAAAGATAATGGATTGCACATAGACTAAGGAATAAACTTCAGATTTGTGAT------TTTTGTTTCTAATCCTGATGTAAATTTACACTATTTATAAATACGTA--------------------------------------------------------------------------------TTTATTGCTTGAAGATATTTGTGAATGGAATGCTGTTATTTTTTCCAGATTTACCTGCCATTGAAATTTTAAGGAGTTCTGTAATTTCAAACACTACTCCTATTACATTTTCTATGTGTAAATAAAACTGCTTAGCATTGTACAGAAACTTTTATTAAAATTGTTTAATGTTTAAAGAGTTTTCTATTGTTTGAGTTTTAAAAAGACTTTATGTACAGTGCCCAGTTTTTGTTCATTTTTCAAATC--TGATtatatatattttatatatacttgtgtatgtatatataatatatatagaaatctggatatat-atgtataAAGATTTAGAACTTAAATTTTTCTCATTTTAAGTTTCCCATCTATGGTAGATTTTTGAGGTGTCTACTGTAAAGTATTGCTTACAAAA---GTATGATTATTTTTAAAGAAATATATATGGTATGTAACTTCAAGACCTAAAATGTCAGACTGGTTTATTGTTAAGTTGCA-ATTCTGCAATGACAGATCAATAAACAGATGCTGCCA-AAATGTAGTATAATAGTAGAAAACAAATAGTGATTGAACTTAAAGTTTTAAAGGGCATGTTATATGGGCTTGACAAATCCTGTACATTATTTATTAGTGTT--TTCTATGGAAAAAAAGATTCAGATGAAGGGCTCTATTTTAGAATGCAAATAAATTAAGAGGCTTATTTTTTAATGTTAGGCAGTTTTGACATTTCATGCTTTCCTGCTTGCATGACATGATATGGGCAGGG-GAGGGAGTCTTTCAATTCTATAGCAGTAGTAAAATAGAGTAAGCTATATTA--GCCTTATGGAATCACTTCTAATTAACAA--TAGTAT----------TTCATATTATAATGTACCTT-----GCATTTGACACACATTCTCATTTTATCATGCTGCTCTTTCTAAGGTTTTTCCAGGAATATTTAGTGAAGAAGCATAGA-GAATGCTCTAAGTAAAGT--TATATATAACTAAAGAGAATTTATAATCCTATCTGGTGAAATGCTGTGCTGACTGGATTA a score=5746 s mm7.chrY_random 29462596 356 + 30114534 ATTTTGTAATTTAGAT-------GTCTGATGAGCTCACTGTACAATAGTATAATACCCCCTGTGAATTAAAGGTGATGTCAGTGA------------GAAACTAAGAGTCAGTCAAACACCAATTTTTCAGGGCTTTTTAAGTTTAGGCAAAGGCATTGTCTGATTTTTAAGCCCTTGGTAT---------TATAAACTAATGAAACAAATACTGTATCATATCTTTGATACAGTAAAAGTTTTCCCAAGTTAGGAAAAGACATAAATAGCAATGAGAATTAAGTGTACATACCTACAGGAGTAAACGCTAACTTTCCAAAAGACAGGACATATGTAACATTTGTCTG--------TTTTAAATCACAAGGCTCATCAGGGGTTAATTCTCA s bosTau2.scaffold8615 17887 366 + 32119 ATTTTTGAATTTAGATTTTTAATGCTTGATGTGCTCTTTCTACTATAGCTTG----TCCCTGTGGATTATAGGGGATGCCTGTGTTATGTTTTATATGAAACT---------TTATACAAAACTCTTGGAAAGACTTAGAAGTGTAAGTAGGGGCATTATCAGTTTTTAAAGCTTTTGGTAGGCCTAAATATGAAAAACAAGTAAAGAGATGTTGTACTACATCCTT--------ATATGCCTCTCCAGTGCGAGCAGTTGCAATAATGACA-TGAGAAA-AAGTATCTACAGTTACATGAACAAAAGACAGTTTTCCAAATGAAGAGACATGAGTTACATCCATCTGCCAAAGTATATTAGGTC-TGAGACT--GTGGGGGTTAACTCCCA a score=3349 s mm7.chrY_random 29464086 313 + 30114534 AGGGATCTTAAAAGTTAAGATAAACTGCTGTTTGAGTCGAAGTCGTGAGTAAATATTTTGTGGAA--GAGGTACAGTCCTGTGCTACCTGCAGCTGTTGGA--GAGTCTTTCTTTG-----------ATAAATGGCTTGGTCACCTGAGGCTGTTGAATTACCTCTATTGTTTGAGGGACCAGAGGTAGGTCCCTCA--CAGTTTCCCTGGTTTGATAAAATTTCTGTATTATTAAGGATTATAGTAGCACCAGATAAAGCA--GTACCATTTTTATGAAAGTTAGTTTGACATTCCTTATGCCAGTGGTAGTCTTTCAGACAACTATGTCA s bosTau2.scaffold2492 16160 275 + 113221 AGGGATTTTTATAGT-AGGACTATCTGGTGTTAATATTGTTGAGGTG------------GTGGAACGGAGGTCCAGCCCTGCGCTGCCTGGGGTTGCTCTAATGAGCTCTGTGATGGGATGAAGGGTATGAATGGGTT-------CAAAGATGTTG-----CCCCAATTGCTGTCAGGGCCTGAGGCTGGCCCCTCAACCCGTTTCCC-----------GACTGCTG----GTCAGGAACTA-----------------GCAAGGTTCCATTTTTATGGAATTTTGATCTACAGTCTTTTACCCAGTGATATCCCTTCTGACAACGAGGACA a score=4084 s mm7.chrY_random 29464647 130 + 30114534 TACATTTCCAGATTTTTTTAATTGACTTTAGAAGAGATAGAAAAGTAGGTGCAGCACTCTCAAAGGCCAGTTGTTTTAAAACAATATCTTTTGCTTCAGAGCTAAGAACTATCCTCTCTACTGCTTCCAT s bosTau2.scaffold2492 16732 130 + 113221 TACTTCCCCAGATTTTTTTTATAGGACGTAGGATAGCCTGGCAGGTAGAATTAGCATTTTCAAATGCTAGTTGTTTTATCAGTATTTCAGATGCCTCAGTACTAGAAATTACTCTGTTGATTCCCTCTAT a score=10199 s mm7.chrY_random 29464791 709 + 30114534 CCTTTGTCAGAGAATCAACCAA--CAGTTACACTCATGAATAGGACCAGGAAGCATTGTATAAACTCGAACATGACCTACAAAAAAAGGACACTCTCTAGATTGAGTTAACACCTGTAGTTTTGAAAGTAGAGCTAAGATTGTGGAGTGGCTAGATGGCAGTGGAGCTGCCTCAATATAAGGAAATAATCTGACAATATACTGAGAGTCTGTATATAAGTTAATGGACTTGTTTATAAGTATTTTAAAGGCAATGATTATTGCTATTAATTGCACTTGCTCAGCATAAGTTTCTAGGGTTGGGAAA----------GATTCTTTGTTGCCATCAAAGCAGCCTGCCCTGAAGCTGAGCCTTCAGTAAACACCAGT--GCTGCTTGGGAAAGGCAAGGGAGTTGACTTAGTTCTGAGAGGAAAGATGACTTGATGTCCTATAATGAAATATAATAAGGGGTGATTAGGCAAGTGATA------------AGAATAGGTCCCTGTATATCCTAATTGTGCAATCTGCCATTGCTCAGATTCA-----TAAGAAAATGTTATGTTGGTCTGCAGTATAAGGAGTAACCATATCT-----CTCTTTACC----------------CCTTTTCTCCCTTTACCTAATAATTTGGCTACCAGGGAGGAATAAGCAATGACTATTCCTTT---TTGTGCCACTggcaaatgtaaccattctaatataccctactgccataaaca-tgctgtaggagtatgtacagtagcaag s bosTau2.scaffold8615 18412 737 + 32119 CCTTGGTTAGCGAATCTGCCAGATCACTTA-AGGCATTTAATGGTCCAGGCAGTCCAGAATGAGCTTGAATGTGGCCAATAAAATATGCTCGGTTTCGTTTCCAAATTTGCTGCTGTAGTTTAGTTAATACGTGAAATATTGTAGTTTTGTTTTAGGGCAGAACTGCAGTCTCAATGTACGGAAACAGCCTGACCACATATTGAGAGTCAGAGTAAAGGTTAAATTCCTCCTCTGCAAACATAATGAAATCCTCTATAACAGCTGTGAGTTCAGCTCTTTGAGCTGAAGTTTCCTGCGTTTGTAAAACCTTATGCTGATTTCTTGTAACTAT---AGAAGCTTTGCCATTAGCTGACCCGTCAGTAAAGGCCATTTGAGTGTCTGGAATGGGGAAGTG------TTTGCACCTAACAGGGAAAATAACTGGGTGTTTAGATATAAAATTTAACAAAGCATGTGAGGGTAAATGATGCAGAATTTGACCAAAATAGTTTCCTATA------------GCAATCTGCCAATTTTCA---TCAAACATTAGAAAAGCATCAAGCTATTCTTTTTTATATGGAATTACAATTTCTGATGGGTCTTTGCCAAATAAGTCAATGCTTCGCTTTCTGCCTTTTGATATTAACGTAGCTATCAGCCCTGGATAAGAAGCCACTACCTTTTTAGCTTGAGCGA---GAAGATGGACCCACTCTAAGGGGCTGTTTTGCCATAAAAACCCCTGTAGGTGCAGTTGGGGTACCCAG a score=4223 s mm7.chrY_random 29481036 152 + 30114534 TGGAGAAGCTGGAACTTCTTCAACAGGAGCTCAGCTTTGTGAACGGCCGCTGTAGTGGAGCTTTTGCCTGGATTAAA-GCAAAGGTGGCCAAAATGCGCAAATCTCACTTTAAGTGCAGAAAGACCATAATCCAGGGCATCCCAGGCTTCTGG s bosTau2.chr12 24554721 152 - 48608624 TGGAGGCACTGGAAGCCCTGAAGTTAGAGCTGGGCACTGTCATTGCCCGAGTTAGTGGGACCTACACACGGCTCAAACGCAAGATCTGTCAGAGAGGGAAAA-CTCACTTGGATCATAGAAGGACCATCATCCATGGCATCCCTGACTTTTGG a score=3653 s mm7.chrY_random 29482163 99 + 30114534 ATGTTCCATCCACAGATGTCGTCCATCATCAGCAACCAAGATGAAGACTTACTGAACTACATGTTGAGCTTGAGGTGAGTTGGAATTGTGTCTGGGCAG s bosTau2.chr12 24554889 98 - 48608624 ATGAACCACCCGCATATGTTAGCCATGATCAGTGACTGAGATAAAGACATCCTTAACTACATGATCAATTTGGAG-GTGCAGGAACTGGGCCAGCGCAG a score=4701 s mm7.chrY_random 29482409 316 + 30114534 TGCAGGATAATGTTTTTCTTTAGTGAAAACCCATACTTCCAGAATGATATTGTCACGAAGGACTATCAGCTCAGCATGGTTGGAATGTATGGTCATAGGTTATGGGGTGTTGCATGGGCAGGGGTATGGTGATCCCTGTGCTATTCCACACTCCTTTTCTGCAGTATACAAAGAGTCAGATTCCAGTATAATAGAGTTGATTGGACAGGCAGAGCATGGTTATGCTAACTGCATGCAAGAAACTACTAGACTCACTTTCTTCAACTGGTTGTGTGCACACAAATTCCCTGGCTCCAACAGGATTGCTGAGGTTGGC s bosTau2.chr12 24554994 235 - 48608624 TGCAAGTTGATGTTTTTCTTTTAGACCAACTCCTACTTCTGGAAGGAAGTGATTGTTAAGGAGTATCACCTTAGCATCATTGGA-TGTATGGT-------------------------------------------------GTCTCACTTGACTCTAGCCCAGT-------------GGTTCTGGGATTAT----------GAACAGG--------GGAGGTCCCAGCTATAGCCAGGACAACACCAGCCTTAATTTCCTCAACTGGATGTTTGAACACAACTGCCCAAGGTTTAACCGGATTGTTGAGGTCAGC a score=8819 s mm7.chrY_random 29550495 347 + 30114534 AAATTTGGCCAGACACTAAGGTAAGTTTGTATGAAATGATATGAAA---TCTGACAACACATTTTGTTGAAA--TAACTCTAAATCTAGTAGGTAAGAATGAGAATAATCAAGAAATATTATACCTATTCCATCAAATAACGACTTTTCTTCTTCTGGGGTCAATTCAATTTCATCTTCATCCATGGCCTTTAGTTCTTACTAAGT-CAGCTCCTAAACCAGGGAACAACAAATACtaa-----------tttatattaaatatt-aaaatGTC--ATCATATTTGCATCTCTGAGGCACTC-ATTTCCCATAACCTATCAATTTCAAT-AAGAAGGAATAGATAGGAAACACTATAATTAAAAGTGAA s bosTau2.scaffold4269 20069 368 + 68191 AGGTTTGACAGGATAATAAGATACCTAAATGTGAATATCAATGAGAGCATCTAGCAATTTGTCCATCTGACAACCAACTCCAAATCTGGTAGTTGGGAAGCGGAACAATCCAAATA-GTTATACCTGTTGTATCAAAAAATGAGTTTGGTTCTTGTGGTTGTAATTCAAGTCCATCTTCATCCATGGCCTTTAATTTTCATCAGTCACAGCTCCTAAATTAGGGGAGAAAGTAAACCAAGCATTAGGTGTTTTATATCATGTATTAAAAATATCATATAATATTTACACTTCTGAAACACTCAAAATTATGTGACAAATGAATATCTATCAAAAATGTATCTAGGTGAAATAAAAAAGTTAAAATTAAA a score=2264 s mm7.chrY_random 29605665 55 + 30114534 TAAAAAGAACATTAGGGAGGAAATTGTAACAAAAACATTATCTCAAAAATAACAT s bosTau2.chrX 41161346 55 + 48857030 TAAAAAGAACATTATGGCTGGAATCATGGTCAGTATTTTATCTTTGAAATAGCAT a score=18721 s mm7.chrY_random 29606192 622 + 30114534 TCCCTAGATGCTAAGAAACAAGAATTACCCAGATGTTCCCTTATTCTATATGAAATTTTTATGACAATTAAAACACCAGCCCAAG-AGGGTCTTTTGACACACTGTCACATATTTTTAGGCTAGTATAGGCTAACAAATTAGAATAAAATTATGCAACAAACTTTATACTTAAGACATTAATTTAT---GTTTATGGCTATACTCA--AAAAATATTGGGCTTGGTTGCCAATGAAACATAATTAAGCACACTGGTCTTTAATATGTG------ATTTTAACTTTTCCTTAATTATTTCTTTCTTTAAGACATGGTGAACAAGATTTATTTTCTGCAGGATAGTGAGAATTTTAATGGCAACT-GAACTCATTTTATATGCTTTGGTCTGACTCTGGTAATATTTGTACATAAATAAACCTAGTCCTACCCAAAAACAA--------------------------GGAAA----------------------------------CTTTGAGCTATGGACATGCACAGACATGAGGTC-AATAACTAAACCTGTAACACTATGAATTTAAACAAGTTTCTTACATTTTAGATGCATTCATTTACTCATTTTAT-AAACCGAATAAATAAGCAAGTGTAATGGATTGATCTAAATAAAGCATGTATCCTAGTAGCTCACTCATGGCAAATACTGAAGAA s bosTau2.chrX 41161422 694 + 48857030 TCTCTAGTCCCCGAGAAACTGTAAGGGCTCAGCTGGCCCCTTAATCTATATGACATTTTTATGACAATTAAAATATCACCCCAAGGAGAGTCTTTCGTTCCATTGTCAGATTTTATTGGGCTAACATAAGCTAACAAAGCAGAATAAAATTATACAGCTAATATTATATTTAAAACATCAATTTATTACATTTAAGGTTATTCCAAGGAAAAACACTGGCCTCTGGTGTTAACCAAACAAAATTAATCACACAGATGTTTAATATCTATGTGATATTATAATTCTTCCCTAA--GTTTCTTTGTTTGGACCACACTTAACAAGATTCATCCTCTCAAACATAATGAG-ACTTTAACGGCAACTAAAAATTATCTGATGTCCTTTTGTCAGTTCCTTGCAGTAGTTGTATGTAAATTCGCTCAAATCTTTCCAAAGAAAAACTGTCTTTTCTGGGGGTGGGATGGGGGAGAATACAACTTTGTCTCTTTTCCTCCCCTTTGTgggctttgaactgcagagtcatacaggcttgagttcaaaccaccaccccagcacttgtatgtcttgggccaaattgcctaagctttttaagtgtcagtttcctcatttgctaaaaatgaatacatatataaatgcaaaagattaatctctataaagcttttagcatggtggttgatccacagaaagtattcaagaa a score=10484 s mm7.chrY_random 29607903 722 + 30114534 ATATAACTGTGCTGCTGAATACAACCCCCACCACAAACTTTAGAATGTAATCTGAGACCCATCCCTAGTCACACTGAGGTATAATCTTCAAGGTCAGAAACCTAGGACCTATACTTTTTAATAGTTTCCCAGGCAGTTATTATAAAGATGGTCCATTATCAGTTGACTCCAATAGTAAACAAGGTTTACTTAGACAAGTAGTATTTAAGCCAATAGTAAGCAAAGGTTAT---CAGTGTGTTGTTCTACTTCCCTACTTGAAAAATGCAGAAATGCTTCACATACTTCTCTCATTCATCTCAACTTCACATTTTCAGAGGGATATGTCTAATAAATACACAAACCCAAGAAAATACAAAAAAGACAC----CCTCCAC------ATATTTTAATGTAC---TACATCCAATTTTATTAATCTTCAGTCTAACATCATGCTTTCTTGCCATTACTATTTTCAGGTACAGTGTAAGTTTTAAAGTCAGT-TAAGCTGG--------AATAGATCAAACAACAGAGGCTGCTCAGATGTC-----TCTTCAGTAATACTGGTAGCCACTGATGTGACAGGGTTTGGGAGGCCTCCTCACA-TTTATAATACCTCTTCAA-TACCGACATTTCCATATATAT---TTCCAAATCAATAACCCACATGTAAGTAGCAATTTTCCAAGCAATGTGAAGTTTCATATTTTCTTTTTTTCCTCAGAAAGTTCTTTTCTTCCTAGCGGGCACACTGACATTAAAAA s bosTau2.chrX 41162497 676 + 48857030 ATCTAGCTGAGCTG-----TACAACCAACAGGAGAGCTTTTAAAATACAATTT---------CCCTGATCCAGCTGGGTTGTCAGCCTCAAGGACAGCACCCTGGAATCTACATTTTTAACCAAGACCCCAGGCAGCTCTT--------------TGGCCAGTGGCCTGGAATCATCCATACATCTCGCTTGG----------TTGTCACCTATA--CAGCAGGGCTTATGGTCAGCATCAAGATCCATTTCCTCACCC--ACAATCCCTGGGTGCTCCTCACAGCTCTTCAAT--ATCCAAACTTCAACTTTTCATA------------------ACCCAAACTCAAGAAA-TGCAAGAAAAATATGAGAACTGCACCAAACAATGTTTTTGTAAACAGCTGCTTTCAATGTTATC-----CTAGGCTAATGTCATGCTGTCTTGCCAGTGCTATTTTCAGATGTAGGGCAGACTGTAAAGACAACGTAAACTGGGGGGAAAAAAACAATCCACCAGCATAGCCTCTCCAAAAGGCATTGATATTGAGCA----TGGTGGCCACTGACATTACAGGCTTCAGT-GTTTTAGTCATGTTTTATTATTTCTCTTTAATTATCAACTTTTCTCTAGCCATTCCTTCTGAATAAATG--CCATCTCTAGGTGACGATTCTTCAAGCTATGTGAGTTTTAATTTTTGCTTT------TCATAAAGTCACATTGTCCCAAGCAGACACACCAGCAAGAGAAA a score=3191 s mm7.chrY_random 29609734 124 + 30114534 ACTGTCTTGTACTGGGC--TGTTTCAAAACCAGTAAATTTGGAGACATAAACTCTGTCTGCATTCTCATTG-CCCAGATACAAGAATTAATCATTCTAATATACTTACAATAATTAGTGGTTGGGAG s bosTau2.chrX 41163293 126 + 48857030 ACCTCCTTCCACTCAGCCATGGTGCAAAACT-GTAAAGTTGGCAACCTTGACTTTGCTTTCCTTTTCGTTGATCCAGCTTCAAGAGCTAAACATTCTAAAACATTTGTACTAGACTGGGGTAGTGAG a score=11818 s mm7.chrY_random 29647743 626 + 30114534 TTCTGCTTAATGAAAATCTATTTTTGTTGTTGTTGTTGAATGTTATTTCTTGACTTCAGGAATTTTTTAATACTAATAAGAGGATGACTGTTCTCCAGATGTCTCCTTTCTCCCACCCACAATATAATTTTTTTTCCTGTAAAAATGGGGTGA--ATCCCTTTATGCAC----ATTATCAAATGTTTCTGATTCAACTTGTGGACAAA-----TCTAGCTACTGACTTTT-TCCATAGATGTTCCTTTCCATGGAAATGTAAATACCAAAGCCTGCCT---GAGAGTAAGGATTTTCCAAAAGTCTCATCTCCTTGGGAATTCTAATATCCAAAGTTAACATTCATTAAGGGGAATGGATTATGAGCTTGTGAAGGGCATTTGGATGTGAATTTTCCT---TCTTATTGT---ATTTATTTTCCCTTTGTGACTTGA-ATGCAAGCTACCCACAGACAAAAAGATGTATCTAAAACTAGTTCTC---ATTATCTCCCTCTC-TGTAAATTGGGATTTCTAAAGTTGAATAGGA--ATGA-----------AATGAGTCTGCAGATTTTGTCCATATACTTCCTAAAAGAAGGAGCAATAGTCATGTTCCACAAACACATTTATCAGACATACCAA-TGAAATTGCAGGG-GTTCTGGCTAAATCTAA s bosTau2.chr17 25734804 645 + 45915461 TTTTATCTATTACAAATCTAATTATTTCTTTGGGGC--AATATAATCTTATAACTTTAGGGATCTTTTAAAACTATTAAGCCACTGAAAATCCCCCAAATGTTCCCTT------GACCTCCATA-AATCTATCCTTTTGTATGTATAGAGTAAGCATCTCAATAAGCCCTATTATTATCAAAAGCTTCTGATTATATATTTCCACAAAAGGATTCTAGCTTTTGTCTTTTATCTATTAGAATTTCATTTCTTGAGGCTGGAAATATCAAACCCTGCATTCAAATATTAAAGCTTGCAAAAATATATTATCTCCTTATAAATTCTAGTTTTCAAAACTGCTATTTATTAAAGAAAATGAA-TAGGGTTTTGCATTGGGTCCTTGGAT-----TGTTCCTGTACTTTATAGTCTGATTTTTTTTTCCTTTGAGACTGGAGGTGCAAATAATCAATGTAGAAAGAAAT-TATTTAAAA-TATTTCTCCCTAGCATCTAGTTCTTATATCAATTGAGATTTCTAAAGATGAAAAAGAGCATGAAGTAAAACAAGAATAATTACGTAGGCACTGTTC--ATGCTTCTTAGAAAAAGGAGGAGGAAG-ATGTT--ATGAGAAGAATGATTagatttaccaagtaaaattgccggataccccagttaaattaaa a score=12942 s mm7.chrY_random 29649719 423 + 30114534 TATGTAAAAGAAA----------ATAAAATCAAGTA----ATAAATGTCCATGCCACCTGGTAGTATA-TTTTATATCATTA-CTTTTCATTTCTCAGAGGTTAAGGTTATTTGCATAACAAGTTTCTAATCAGCCATCACTCTCACATAAGCCAAAGGCATCCTAACCCCGCCACATTTCTACTTGATTA--ATCACATTGGCATTAGTTATTTGTACGGAAACATATCCTTTCATCCTGATTTAGTTCATAGCATGGGGACTGTTGATGTGTAATTAATTCCTATTCATAATGGGATAAAACAGAAGCCACCACAATTGACTCCATTGTACCTGGGAGCTGAAGATTTTCCTTCCATTTATTAAAACAATATAAATA-------TGATTTTAACACAAGCCTAA--AACCATGAAAAAGCCTTGATTTTATA--TTTTCATTATTAACAG s bosTau2.chr17 25742211 444 + 45915461 TATGGAAGAGAAACTGGAAAGGCATAGACACAAGTACACAGAGAATGTCCACTTCACTGGGTAGAACACTTTTTTATTCTCATCTTTTCCTCTCTCAGTGGGGAGCTTTATTTGCATAACAAGAAGCCAATCAACCATCAATGTTGCACAAACCAAAGGCATTTCAGCCCC------TTTCTGCTAATTGAGGATCGCACTGGCATTA-CTGGCTATATATAAATGTATTCCTACATCTCGATGTGGTTCTAAGGATGAAAATGATCAACGTGTAATTAATTACTATTCATTATGGGATTAAATAGAAACCAACATGATTGAGATGATTGTTTGCAGGAGCTGAACACTCCTTTACCATTTAATAAAAAAAACTAACTGATCATTTTGAACCTAATAAAAGCCTAAGCAACCA-AATTAAGCCTTTATTTTTCAATCTTTAAGTATTTGCAG a score=27875 s mm7.chrY_random 29681444 877 + 30114534 TGCCACAGAGCCTCAGCTGTGATGCTCCCTAT-TTCTTCAGATGTTCAGCTCAGTCCTGTCCAAGAAATGCAAAGTGTCTGGACCTGACTCTAGTCTGGATTCTAGTTGGTCTCCTACCTATTCTGTGATGTTTGGCATGCCCCCAGGGCCAACCAACG-GAGTATGACGTTTGTAAGGATGGAAACAATCAGTGGGGGTGATGAA---------------GTACCTCTGTCTTTCCAAATGTCTCAGTCTCATTTCTATTTATCTCCC-----CTGGAACTCTCTGCTCATCTTTAGGAAATGTCAAAAACAAAATAAGGAAATGGACATAGATGAAAGCCTTTACTCTCACCAGCCAGCTGTGAATGGTATCCACATCGGGAGATGAAGATTGGGAGAAGGCACAGAGTGG-------------GGCA-GACACTAACCTAGAGT--TCTTTAAT--GACAGGTATGTACTCGGCCATGAGTCAGCGAAGCATCTCCAGGCTTCCAGAGTACTGATATCAGGCCTGCAGGGTTTGCATGTTGAATTTGCCAAGAATATCATCCTTGGTGGGGTCAAGGCTGTCACTTTCCATGATCAGGGCACTGCCCAGTGGGCTGATCTGTCTTCCCAGGTATCATCTCTTTTTGGCTTCTCCTTGCTTAGGCTCCAGC---ATGTGCACTGCATGTGTTTCAGTGCTATCTTCCTACCCCCT-TTTCATAGTTCTACCTATGTGAGGAAGATACTGGTAAAAACCAAGCTGAGCTATCCCAACCAAGCCTTGCTGAAGTAAACAGTTACGTTCCTGTGTTTGCCTACACTGGACCTCTAATTGAGGAGTTCCTTAGTGGTTTTCAGGTACCCTGGAGTAACCCCATGCC-------------------TCCTGTCTTATTCTT-------------------------------CCAGGTTTGTTGCCA----------------------------TTTAGGC s bosTau2.chr27 15969478 971 + 31566707 TGCCCCAGG--CTCACTTCTGATTTCTTTTATGCTCTCCAGATGTCCAGCTCGCCGCTGTCCAAGAAACGTCGCGTGTCCGGGCCTGATCCAAAGCCGGGTTCTAACTGTTCCCCTGCCCACTCCGTATTGTCCGAAGTGCCCTCGGTGCCAGCTAACGTGAGTGTGTTCTTCCTA------GAGACTGGCAGGTGGGGTGGTGGGTGGGAAACATCTTCTGTATCCCTGTCCTGTC---TGTCCCGTCCCTCCTCCTGCACATCTCCCTGAACCTAGTGTTCCCCTC-CATTTCTAGGGAATGGCGAAAA-ATGTCAGTGACGCAGACATAGATGAAGGCCTTTACTCCC----GGCAGCTGTGAGTGGGGCCGAAGTTGGACTGTGAGG--TGGGAGGGGGCTCTGAATGGATAGGGTCAGGAGGGCGTGACTCTGACCTGTGACACCCTCTAACCCGGCAGGTATGTGTTGGGCCATGAGGCAATGAAGCGGCTCCAGACCTCCAGCGTACTGGTATCAGGCCTTCGGGGCCTGGGCGTGGAGATTGCCAAGAACATCATCCTCGGTGGGGTCAAGGCTGTCACACTGCATGACCAGGGCACTGCCCAGTGGGCCGACCTCTCCTCCCAGGT-TCCTCTTTCCATCCCCCTTCTTTGCCAAGGCCCCAGCCCTCTGGGCTACACAGCCAGTTCACT----TCTTCCTACACTCTCCTTTGCAGTTCTACCTGCGGGAAGAAGACATAGGAAAAAACCGAGCTGAGGTCTCCCAGCCCCGTCTCGCTGAGCTCAACAGCTATGTGCCTGTCAGTGCCTACACCGGGCCCCTTGTGGAGGACTTTCTCAGTGACTTCCAGGTACCATAG----GCCTCATGCCCAGTTCTCTCAGAGCCTAGCTCTGGTTTATTCTTTTGATAAACATTTAATGGGCTAGCCTGTGAGTCAGGTTTCCCGCTAACGCTGCAGCAAGGAAATGCGAGCAGGCTTTAGGC a score=2044 s mm7.chrY_random 29682482 131 + 30114534 GAGTATAATGAGAGGAAACCCAGACTAGTTGGGTAG----------TTACTCTTG-------ATGGGTATAACCTGGCTGTAGGTAGCCAGCTGTCTATTTTTACCAGATAAATGAACTTAGGTGGTCTCCAGACCTTGTTTGTCTAG s bosTau2.chr27 15970872 144 + 31566707 GGGTGTGGTAGGAGTGAGCTCAGACT--TTGGCTAAGGACAAAGTTTTACTTCTGTGTCTCCCAGGGCATGGCAGGGCTGTAAACAGGCAGCAGT-GGGTGTTGGCAAATGAAGGAG-TCAGCTGTTATCCAGACTCTGTCCTCCCAG a score=15559 s mm7.chrY_random 29682703 614 + 30114534 TGGGACAAAAGGCTGTGCCAGCTGAGCCTGGGTG-----TTGGATTCTTCT-----CCCTTCTCCCTAACTTCTGTCAACGTTTTTATTCTCTCACTCC-------ACCCCAAACCTGGGCTTATTGTTCTTTACATGTATTGGATCTTACCAACACTCCTTTGGAATATCAGCTGCATGTGGGTGTATTCAGCCATAGCCACAGAATCGAGCTGGTAGTAGCAGACACTCGGGGCTTAGTTGGGTGAGTG--CTTGCATTTGTCTAACTT----CAAACATAGGCCAAG---AGACTCCCAAACCTTCA-TGTCCTCCTCCACCATCCAGTTTTGAAGT----GATTTTTCTTTTT----TTTTCCGGTGTGGTATGAACATCACCCGATCTGTCCCAG--------------TTCCTTGAGTA--------------CTTGAAGGCCCTGTGC--------------TTGGTTCAAAGCATCACTCCCTTTGCCTCCTTCTCTAGACAACTCTTCCGTGACTTTGGAGAGGAAATGATTCTCACTGATTCAAATGGGGAACAGCCACTCAGTACCATGGTTTTAATGATCACTAAGTTAAGGAGGCCAGCCCCATACGTTCTCATGCAGAGAAGGTAGGCAGTAATTGTTTTGGTTTGATtttcctttccttttcctgttctctgaacc s bosTau2.chr27 15971114 666 + 31566707 TGTGATAGAGAGCTGAACCAGCAAAGCCTTAAGGACCCCGTGAGCCCTCCTATCAGCCCTCCTCTATGATTGCTCCC------TTTACCCT-TCACCCTGGTGCTGGGCCCTTGCCTGAGCTTCCACCTCTCCACAGGTGGTGGTCCTCACTAACAGCCCCCTGGAGGACCAGCTGCGGGTAGGTGAGTTCTGTCACAGCCATGGCATCAAGCTGGTGGTGGCAGACACCCGGGGCCTGTTCGGGTGAGTGCCCCTGCTCTTTTCCACCCTGACCCCTGCCTTGTCCAAGAAAAAACCCCCAAGCTCTGACTGCCCTCAGCCCCCCTTAGGCCTTTGGGTTTTGGATGCTGCGTGTTTACCTTGCCTCACGTAGCATGAGCACAGTCTGAT---TCCCAGCAGTGATGGGCTGATTTGCTCAGCAAATACTCACTGCATCTTGAGGGACACGTGCAGTCTCAATGTGCGTGGGACTTGGGCATCAGCCCTGTTGCCTCCCTCTACAGGCAGCTCTTCTGTGATTTTGGAGAGGAAATGATCCTCACTGATTCCAATGGGGAGCAGCCGCTCAGTGCTATGGTTTCTATGGTCACCAAGGTGAGGAGGCCAGCCTTGGGTCCTGGCAGGCGGA-----TGGGCGGTCA----------CAGGCCTTCCTGTCTACTCCCAGTACCCTGAGCC a score=7650 s mm7.chrY_random 29684752 182 + 30114534 CTTTTTCCCCAACCAGGAGAATCCAGGGATTGTCACCTGATTGGAGGACTCCTGGCATGTATTTGAAAGTGGTGACTTTGTCTCTTTCACAGAATTTCAGGGCATAAGTAAACTCAATGGCATTGGTCCCATATAGATCAATGTTCTGAGT--ACTGAAGCCTGGGG------AAGGAGGGTGAGAAGTG s bosTau2.chr27 15971793 190 + 31566707 CTCCTCCTTCAACCAGGACAACCCCGGTGTTGTTACTTGTCTGGATGAGGCCCGACATGGCTTTGAGAGTGGTGACTTCGTCTCCTTTTCGGAAGTACAGGGCATGATTGAACTCAATGGAAGTCAGCCCATGGAAATCAAAGTTCTGGGTGAGCTAGGGCCAGGGGGGAACCAGGGGAGATAGGAGGCG a score=47993 s mm7.chrY_random 29687191 1473 + 30114534 TTCCAGGTCCCTATACATTTAGTATCTGTGATACCTCCAGCTTCTCTGAGTATATCCATGGAGGCATTGTCAGTCAAGTAATATTACCTTGGAAGATCAGTTTTATGAGTATGTGGTGAGGGGGTATGAGTAGAAGG--------------------------------AGTCCTGCTTTTGAGATTTATAAGTTGTTTATATCTGGCCTCACAATGCTCCATTACCCATAGAAACCCCTATTCACCTCCCTGCCAGAGCCAGAATTTGTGGTCACGGGTTTTGCTAAGTGCTGTAGTCCTGCTTAGCTCCACATTGGCTCCCAGGCCCTGCATCAGTTCTGTACTTAGCACAGCAGGCCTCATCGGCACCATAATGAGGTAAGTGAGTGGGAAGCCAGCCAGGA------ACCT-------------CTGATTTGTCTGTTT-CCTATACCTGTT-CTTCCTCCAGTAGGGCCTGATAGGCTCTATCCCAGTTCCTTTTGTCCAACCAGGAGGATGCTGATGAATTGGTGACCTTAGCCCAAGCTGTGAATGATCAAGCTTTGCCAGCAGTTCAGCAAGACTGCCTGGACATCGACCTTATCTGGAAGTTGGCCTATGTAGCAGCTGGGGATCTGGCACCCATGAATGCCTTCTTTGGTAGTTTGGCTGCACAGGAGGTCATGAAGGTTAGCCCTAGTGGGAAAGGTTGTGACTG---------------CTCTGTGTTTCTG----ATGTCATCACTGCCTTTTAGTTCAGTTAGGCTACTGCTACTGACAACCTCCT-----TTCCCCAGGCTTCTTCTAGAAAGTTTATGCC-------CAGTGGCTGTACTTTGATGCCTTTGAATGTCTCCGGGAGCATGGAGTGACCTTTATGGAAGATAATTGCCTGCTG--------CTAGATCCCTGTGAACAGTAGGAAACTTTGGGAACA-TCATGAGGAGATTGTAACTTTAACCTGTCT--GTAAGCATTCACATAAATCCAGTGTCAGAACTGATTCAATGGGCAAGTGGCTGCATTTGGATCAGACCTACAAGAGAAGCTTGGCAAGCCAAAATACTTCGTGGTGATTGACACTAATGG-------CCTCTGTTCACCCTTTCTGGAAGGACCTCTCTTTCCCT--------GATCCCTT------TGGGGAGGTGTCTTTTGGTTTTTCATGTCCTGATCACATCACCTATTC-----TGTTTTGTGGTTGGTTGAGGAAAGGCTTCAGGTATCTCTTTTTCTTTCTCTCCTCTCAGT-----CACCCATAGGATTGTG---------CATCCCTGTGAATGGAATATTTGTTACTACACAGTCTTGTATTTGGTTGATGTTTTCTT----TTGGGAGTAT------------------ATGCCATCCCTGTTTACTCTGA-TCAGA-----------------TGGTTTACCAACTTCTAGGTAGGTGCAGGTGCCGCTGGCTGTGAGCTGCTCAATAACATTGCCATGATTGGCCTTGACTGTGGATAGGATGGAGAAATGACAGTTACAGACTTAGACACCATTGGGAAGTCAAACCTGAACAGACAGTTTCTCTTCCATCCCTGGAACATCACAATGAGTAGGATGG s bosTau2.chr27 15972431 1607 + 31566707 TCCTAGGTCCTTACACCTTTAGCATCTGTGACACCTCCAACTTCTCTGACTACATCCGCGGAGGCATCGTCAGCCAGGTCAAAGTACCCAAGAAGATCAGCTTTGTGAGTGTGAGGGGCGGTGGGCTGTGGGGGATGTGGGGGCTGGGGCTGGGTATCTCACGGTTCTCAATTCTTCTCTTCTGATTCTTTTTTTTTTTTTTCCTG--------ATGCCCTGCTTCCCACAGAAATCCTTGCCAGCCTCCCTAGCAGAGCCTGACTTTGTGATGACAGACTTCGCCAAGTATTCCCGCCCTGCCCAGCTACACATTGGCTTCCAGGCCCTGCACCATTTCTGTGCTCAGCATGGCCGGTCCCCTCGGCCCCACAATGAGGTGCGTGTGGGTGAGCCAAGCCAGGGCAGATGACCTTAGCACTGCAGGCCTGTTCTGCCCCTCTGTCTACACCTCTCACCCCCGACACAGTGACCTAACAAGCGTGCTCTTGGTTCCTTTGGCCCCACTAGGAGGATGCAGCAGAGCTGGTGACCATAGCCCAGGCTGTGAACGCTCGATCCCTGCCCGCAGTGCAGCAGGGCAGCCTGGATGAGGACCTCATCCGGAAGCTAGCATATGTGGCTGCTGGGGACCTGGCTCCCATAAATGCCTTCATTGGGGGCCTTGCTGCCCAGGAGGTCATGAAGGTCAGCGTAGGTGGAAAAGGGCAGGGTTGGGGTAGGCCAGGCGCCTACCTGCCTCTATCACTTGTCCCATCTGCATGAGGCCCCAGGTAAGCACTGACTACTTCCCCTCTCCTGTCCATTCTCCAGGCTTGCTCTGGGAAGTTTATGCCCATCATGCAGTGGCTGTACTTTGATGCCCTTGAGTGTCTCCCTGAGGACAAAGAGGCCCTCACAGAGGACAAGTGCCTCCCGGTATGTGAGTAGGGCCCTGGG----GGAGGTGACATAGGTGGCATTTCTGGTGAGGCTGC-TCTCTGACCTTTCTCCCTTTGCATTC-------CTCAGCGCCAGAACCGTTATGATGGGCAGGTAGCTGTATTTGGCTCAGACCTGCAGGAGAGGTTGGGCAAGCAGAAGTACTTCCTGGTGAGTGAT-CTGCTGGGACACCTGCTTCCTTCATATCCCCTGG-----CCTCTGGCTACCTGTTTATGGGGTCTCTTGCCACCTGAGGGAGTGTCTTTTGGTTCTT-GTATCTGTATCACATGACTTGTGCCCCCTTTTTTTTTTTTTATCTTGGGAAAGCCT---AGTATGTCCTTCTGTTTCCCCCATCTGTGCCTCTGCCCTCAGATGACTAGGTTATTTTCACAGTCGTGGCACTTAAAGATGTGGCACTAGACACCCCT-------CTTGCTGTTTTCTGGGGAGTGAGAGTATAGAGTGATGAGTGACTTCATGCTGACCTGCATCACCCTGACCCAGACTCTCTGTGTCTTTTCTTGGTT----GTCTTCTAGGTGGGCGCAGGGGCCATTGGCTGTGAACTGCTCAAGAACTTTGCCATGATTGGGCTGGGCTGTGCAGAAGATGGAGAAATTGTTGTCACAGACATGGACACCATTGAGAAGTCAAATTTGAACAGACAGTTTCTGTTCCGGCCCTGGGATGTCACTGTGAGTGTGATGG a score=23735 s mm7.chrY_random 29690467 705 + 30114534 GAGCCTGGTTGACTTTGAGCCTTGTTCTGCCCCTTATGAGATAAATA---CTGCA-----ATATCTCTGTAGACTTTTTTTGCATCAGTGCATGGA-AGC--AGCTCTGTTTTTCATATTCCCACAC-----------AGAAATTAAAGTCTGAGACTGCTGCTG---------GTGAAATAAATCTACACATCAGGGTATTCAGCCACCAGAATGGTGTAGGCCTGGAGACAGAACACATCTATGATGATGAC---TTCTTCCAAAAGCTGGATGGTGTGGCCAATTCTCTAGTCAATGTGGATGCTCGTAAGTTTGGAGTTGAGTGAGGAGGGCAAGATCAGGGTAGAGTGTATGAGGTTCTTGTGCTCCTGTCTTGCCttggtttttcgagacaggatttctctgtgtactctcggttgtcctgtaactcactctgtagaccaagctgacctGTGTTCCTGTCTTATG-TAAGCTTGCATGATACTCATCTGCCATT-TCTTCCCATCTCCCTGAAGGATTATATGTGGACCTCCATTGTGTTTACTATCATAAGCCTCTGCTGGAATCAGGCATGCTGGGCACCAAGGGCAACGTGCAGGTGGTTGTTCCCTTCTTGACAGAATCTTACAGCTCAAGCCAAGACCCACCTGAGAAATCCATCCCCATCTACACACTGAAGAACTTCCCTAATACCACTGAGCACACCCAGCAGATGATCAACCTTGGGAGGTGGAAG s bosTau2.chr27 15975526 666 + 31566707 GAGCTTCCTGAACTCAGGGCCTAGTTCTTCGCAGCATTAAATATGTCAACCTTCAGGAGGACAGCTCTGTAGGGGTTCTCTGGCTGCACACATGAATAACTGAGTTTTGTTCCCCCATTCCCCACTCTCACCTCCCCTAGAAATTAAAGTCTGACACAGCTGCTGCAGCTGTGCGCCAGATGAATCCTCATATCCGAGTGACAAGCCACCAGAACCGTGTAGGTCCTGACACTGAGCGCATCTATGATGATGATGATTTCTTCCAAAACCTGGATGGTGTAACCAATGCCCTGGATAATGTGGATGCCCGTGAGTTTGGAGGCGGGTGAGGAGG------TCAGGGGCCAATG---------CGTGCGCACGTGTGT------------------------------GTGTA--------TGTTTTGGAGGT-------------------GTCTGTCTTCCTGCCTCCTAATGTTCTGTCTTGCCACTCATGTTATGTTGTGACCCCACCCCCC---AGGCATGTACATGGACCGCCGCTGCGTGTACTACCGTAAGCCACTGCTGGAGTCGGGCACACTGGGCACCAAGGGCAACGTGCAGGTGGTGATCCCCTTCCTAACAGAATCTTACAGCTCCAGCCAGGACCCGCCTGAAAAGTCCATCCCCATCTGCACACTGAAGAACTTCCCCAATGCCATCGAGCACACCCTGCAGGTGATCAGCATTGGTGGGAGAGAG a score=5934 s mm7.chrY_random 29693092 110 + 30114534 ACCATTGCTGACATGCATTTGTTTGCTCTGTCTGTAGTGGGCTC-AGATGAGTTTGAAGGGCTCTTCAAACAGTCAGCTGAAAATATTAACCAATACCTCACGTAAGTAAC s bosTau2.chr27 15978417 106 + 31566707 ACCATTGCCCCCTGTAATCTGTTTG-----TCTGTAGTGGGCTAGAGATGAGTTCGAAGGCCTCTTCAAGCAGCCGGCAGAAAACGTCAACCAATACCTCACGTAAGTAAC a score=29418 s mm7.chrY_random 29693229 1582 + 30114534 GTCAACAAAGACGTCCTTGTCTGCTCTCCTCA--------------------GGCACA-TCCTCGGTGGATGCTTTGGATAATTAATGGTTGATTGAGCCTTATGCTGGTGGAGGTTGATAGGAAATGGTCAGGATTGACATTTTTGCTGGAGAAAGAAGGCTTGCCCAGAAACCTTACTTCT-AGGCCTCTGAAGTAATCCAGGTCTTTGTATT-----------TGATAGAGATCCCACGTTCATGGAACAGACACAGCAGGTAGCTGGCACCCAGCCTTTGGAAATACTGGAGGCCATACACTGTAGTCTGGTCCTGCAGAGGCCACAGACTAGGGCCAACTGTGTGTCTTGGGCCTACCAGCACTGGCACACCCAGTATTCTCACAACATCCAGCCGTCGCTGCACAGCTTCCCTCCAGCTCAGGTGTTACATACTTGGTGGATGTATTTGGCTGAGCACATTTCCAGAAAATTGGAGACTTACT----GTCCTCTG--TCCTTCTGCCAGGCAGCCTACCTGC--CACAGGTACCAGAATGCAAGGTGT---AGGCTAGTACTTGGTGCAAGCTT----TTGTGTTTTCTTCCTCCTGTCAGCCAGGGAAGGGGTTTAGTTTCCTTCCCAGCTGCACTTGTGGGCTGAGTCATAGCTGAGTTCTCTTTGAGGGCTGTAGTTGT-------GAGAAATTTTATAGTTAAGCA-TAGAGTGATC--TGTGTGTTCAAGTCCCAGCTGTGTTTGACACTGGGTCGTGTCATGCCTAATGTCTTGCTAAGCCA-------TATCTGGGAAGTAGGTATGACAATGGCTGT------GGGCATTTAGAAAGGACTAACTTTCATTTCTTAATTTTGCC--------------------TCATATGAA-TTGGTAAGTTGAACT--------------TGCCATGTGTT----------------TGGCTCATCAT-------GAATTTC----------------------------------------------------CCAAGAATGGTGAACCTAGGCTTCT-----TGGCATG----------------------AGGGTTTCCTGAGAGTGCTTCTCCCTCGGTCCTCTTCAT-----ATCTTTGCATTCTCCTGGCTTACTAGCTCTGAAGCACTGTTTTGATCAGGACCAAAACACTGTCCACATCCACTCACCTTTGACATAAACAATGTAAGT---GTCCTTGGGATCTCCTAG-------------GTGGTTGTGTGGGAATTAGGTCTCTCTACTCTTAACCTGTGGTTGTTAAGCTGACTTTCCTTTGCCATGCCATTCTTTCAGTCCCTGCATCTGGATTATGTGATGGCTGCTGCCAACCTGTTTGCTCAGACATATGGATTAGGAGGGTCCCAGGACTGTGCTGTGGTGGCCAAACTCCTTCAGTCTCTGCCGGTCCCCAAGTTTGCTCCAAAGTCTGGCATCAGGATCCATGTTTCTGATCAAGAGCTGCAAAGTACCAGTGCCACAACTGTCTTTAAGAATGCTTCACCATTCGTTTAGAGATCA----TCTATTTGTGTTCGGTTCCCTCTCAGCCTTCCCTCTGGTGTTTGCCACTAGCCAGGATTTTCACTATATTTCTGAGACTTAC---CTAGTCTGTGCTTAAGGGTTGAAGGATGGAAAAACAAAAGCTCTGTATCTCATTTCTCTGCAATATAGACTTATGGAAATGGTTCATCCCC---TTCCT-----TGTGTTT--------------------ATAGACTTCTCCTTGT-TTCTTCTTGATTTATTTACTTTCATGC s bosTau2.chr27 15978552 1776 + 31566707 GCCAGTCAAGGCATCCTGG-CTGCTTTCCTCATTGCTGTGACACCCAGCACAGGCACACTTCTCAAATGAATCTGTGAATGAA--------GCTTGAGCCTCATTCCATTGG--------------CGGTCAGGATTAGC--TTTCTCTGGAGAAAGTGAGGTTGCCCTGGAGCCC-ACTCCTGAGGCCGCTGT-GTAATCCTGCCCCTTTGACTCCCCCAATTCCTGATAGAGACCCCAAGTTTGTGGAGCGGACCTTGCGACTGGCGGGCACTCAACCCCTGGAGGTGCTGGAGGCCGTGCAGCGTAGTCTCGTGCTGCAGCGGCCACAGACCTGGGCTGACTGTGTGACCTGGGCCTGCCACCACTGGCACACGCAGTACTCTAACAATATCCGGCAGCTGCTACACAACTTCCCTCCTGATCAGGTAATGCCCACTTGCCAGGTCCACTTGGCAGAATGCTTTTTTTCCGTAATGGGAGCCTGCTGTGAGTTCTCTGGCTCCTCCTGGGGATTATTCCAGCTGTGGCACATGCCCCAAGGTGTGGGGAGTCTCAGAAAAATGATT-----AAACTTGACCTTTTTTTGCCATCCCCTTTCCTTCTAGCAAGAGACTTTCATTTTTATTTC--CCTTACCTGTGAGGTGGGC--TGACTCATCCACCTCCTAGGACTGTAGCGATCATAGAGGAGAAATCTTcgagttaagagctcaggaaatcagtgggggttcaactccaagcaccatttg-cacttgggcaagtca--catagcttctctctacttcagtttccttgtcagtaaagtagaggtggtaataattacctcatgagggttcttgtgaggatttcttggtatttgttaatattaactcagtacagtacctggcaggtcataagagtttgttaaGCTGTGTCTTGCACAGAGTGAGTGCCAGGAGTTCTTTCAGTAACACCCCTAGTTCACCCTGGCATCAGAACTTCCATTCACAGGACCCTTACAGTCTGGGTTATTCATGATTGACTCTATCCCCTGCCATGCATGCCCAGCCAGGGCTAGTGAATAGGGCATACCCAAGGCCCAGGTGAGAAGTTAGGATTGCTGGAGAGGCTCCAGTTTTAGATCCTGCTCCTCAAAAATCTCTCCACTTCTTTAGCTCACAAGCTCAGGAGCTCCATTCTGGTCTGGGCCCAAACGCTGTCCACACCCACTCACCTTTGATGTCAGCAATGTAAGTCTCCTCCTTGGGGTCTCCTAGGGTCAAGTGGAGAGTGGGTGGGAGGGAAGGAGGCCGAGACGC-CCCAGGTGAGGGCAGACGTGCTCACCCTTCTGGGCCCTGCC-TTCTCCCAGCCCCTCCATCTGGACTACGTGATAGCTGCTGCCAACCTGTTCGCCCAGACCTACGGGCTGACAGGCTCTCAGGACCGAGCTGCTGTGGCCACACTCCTACAGTCTGTGCAGGTCCCCGAGTTCACCCCCAAGTCTGGAGTCAAGATCCATGTCTCTGACCAGGAGCTGCAGAGCGCCAATGCC---TCTGTGGGTGAGGATGTTTGGCCCCTCTGCCAGGAGTTACTGCCCCACTGGTCCTCTG-CCCAGTGCAGCCTCCTCACCAGTTCTCTGCCCCAGCACTGCTGTGCGACTCTGTCCTGAGACTTCCTTTTTGATCTGTTTAT-----CCGGAGGGTGTG----------------GTCTTGCTCCTTTGGTATCTGCCCCTAT-----CTTCTCACCCCCATGTTCCTCCATGTGTGTCTTCACCGTGATATTACCCTCCACATAGTTTTCCTCATCCCCCTCTTCATATTTTTACCCCAGTTC a score=906 s mm7.chrY_random 29695015 97 + 30114534 TCCCAAGTCGATACAGTTCCTCAGTTTCCCTTTCAGAGTA-AAGTTGTCTCCTTGTGAGTGAGATTTGACCAACAATATTCCTTTCAGACTTTCCCTT s bosTau2.chr27 15980502 84 + 31566707 TCCCAAATATCTAC---CCCTCATGTTCC---TCTATGTATATTTTTTCTACTTCTGC-----ATTT---CACCCATATTTCCTTCATTTTTTCCCTC a score=1531 s mm7.chrY_random 29695283 47 + 30114534 TTCTCTACCACCTCACCATCCTTGAAAACCT---TTCTCTACATTTTTGT s bosTau2.chr27 15980716 50 + 31566707 TTCTCACCTATCTCACTCTCTCTATATGTCCCTATTCTCTACTTTTTTGT a score=10297 s mm7.chrY_random 29695690 232 + 30114534 TCCCTTACAGCTTCCAGGATGTCTCTCCTTTTCAAATACT---TTTACATAAACACCACTTTCCAGTCCAGATTTCACCTTGGGCAGT-ACAATGGGTTCACCACACATCATGGTGTCCTTTGCTTTCTGCAGATGACAGCCACCTGGAGGAACTCAAGACTGCACTTCCTACTCCAGACAAGCTGCTTGGATTCAAGATGTACCCCATTGACTTTGAGAAGGTATTTGGTGTGGG s bosTau2.chr27 15981069 235 + 31566707 TCCCTCGTCTCTCCCAGGATGTCTTTCCTTTTCAAATCCTTTGTTTCCCTAAACACCTTTTGCCCCACTTGTTTCTACCTCAGACCCTGGCCTTGGGTCTAAAGCGT-TGATGGTGTCCCTCTCTCCCTGCAGATGACAGCCGTCTGGAAGAGCTCAAGGCTACACTGCCCAGTCCCGAAAAGCTCCCTGGGTTCAAGATGTACCCTATCGACTTTGAGAAGGTGCTGGCTGGGGG a score=3152 s mm7.chrY_random 29813522 128 + 30114534 cacaGGCAAATTGTTAGAAGGTAGTTCCAGGACTATTTTAAGCATGTGGTGATGCAGGATAGGAAGGGAGGGT-CCTCCTCAGGATGCTCCAGCTTGGAGTTGATGCCTATAGACAGCTC--AGGAAAACA s bosTau2.chr1 118419 124 + 102834029 CACAGA-AACTTGCTGGCGGGCAGCTCCAGGGCCACCTTGAGAATGTGGTGCTGCA------GAAGCGGGGGCACCTCCTCCCGCAGGCCCTCTTCTGAGATGACCCCTGCGGGCGGACAAGAGGAAAACA a score=6142 s mm7.chrY_random 29821280 482 + 30114534 CACACAGCATGGGTAGT-CAAGTATTCAGAAAGA----CATGATGTTAGCATAAAGACTGAATGTATATCTTATGGATAATAAAATCCAATTTAAAAT----------TCCATGTCACCGAG-CAAAAATGATAAAAGAT--CTTCATGAGTAGAGGGAACTTAACATAGAACTCTTTGAGGATACGTTAAGGAGCCATCTCAGATGACTGACTTATCTGTCCAAGTAAAGGTAGTTGAAGCCCTCACAGTCCCAGAAAGCTTTGGAAGAAGCAAT-ATCCTGCT-GCTGATTTACTCACTTTCCTGTGACACAGCttaattttttaatttttaaatGCCTACCAGAACCAACAAACAGTGTTCAAATCAGGCAAATTCTAAGTAAGATTGAAGCAAAGAAT-AAAAATCAGTCATACGAAACATGTAGATTAATAATGAAATTGAACATACTAACAGGTGAAAAAATCAAAACAAAACAGTACCAGAGAGGAGGAACAAGTA s bosTau2.chr1 120454 468 + 102834029 CACATGGCATCCATCATGCAAGGGTTGAGAGAGATGTGCGTGGTGCTTGCATAAAGCTTGAGTACATTTCTAACAGATGTTGAAACCCAAAGTACGATGCTAGGCTCCTCCTTCTCACTAAGCCAAAAAGGACACAGGATTCTTTCAGAGTCAGAGAGGCCTTCACA---AGCTCCCTGGGA-------GAGGAGGCTCCCAGGCTGCCTGGGCCAGTGGTGTGTGCAAA--------CAGCCCTCACCACTCTCGGGAGCCATGCAGGGAGCAGCGGTCTTGCTGGCCTTTTTCTTTCCTTTCTCGTCATCGTGTTCTGAGTCTTGCTTCCTGAGAGACTGCCAGACCCAGATGATGGCATTCAGGTCTGGTAAAATCTGAAAGGAAACAAACAAAAAAACAAAAAATCAGTCACACTGAG-----AGGAAGAGAAACAAACTGATCCCACTAAT-GATGAGAAG--CAAAG---------AACAGGGAAGAGGGGCCAGCA a score=8778 s mm7.chrY_random 29822318 579 + 30114534 CCTCATGCTCTATGCTCTCAGGACAAACTTGACTTTCTGCTGTGTTTACTGAATGAGTAGTCAGAAAAAACTCAAATGTGAACTTGTAATTACCGTTCTCAAGGATTCTTTGAAGATCTGAA-AAATTCTTCCTTTATCTCAGC-ATGTATAATCCTGAACCTCACCATGCCTCTTTGTCCAGACAGTTGTCAATTTTTTATAATACTCTCTTCAAAATGAATGAAATAAGGAATAATGCCTAGTGTTTAATGGTTATGCTGTTCAAATGGGAGAAAGAATTAAAAGCACAATGACTCTCAGTGGACAAATCTTCTTGGAAGCTTCTGAC-TCCTCAGGTTACTATTAGGGAAAATCATAAGAGATGGTTGGACTCTACACTGAGAATAGGTGACCTTGGGACTTTCCCCAATCGATGCTTATTATAAATGACTATAGCAGTTGTCAGGAATGTAGCTCCTGAAGTTA--GAGTCTCAAGGTGGTTTTTGTTTTGTA--------TGTACTTCCGTGTAAGCCTTCTTTGAGAGCTACTCAGCTAGTAAAGATTATCTGC---------ACTGAAGCCCCAGGAGATCTCCAGCAGCCACT s bosTau2.chr1 121434 547 + 102834029 CCCCACCCTCTGCGCCCCCAAGCTCGTCTCTCCCAGCTGCTGTGCTACCTGTAAGGAGAGGC----------CACACCTGGCTCCGGGCCTACCTTGCTCAAAGCTTCTCTGAAGAGCCGCACGAAGTCTTCCATCATGGCGGCCGTGTAGACGCCTGACTCCTGCCAGGCCTCTTTATTCAGGCAGTGCTCGATGGTCTTTAAGGCTCTCTTCAAAATGACGGCAACAAGGGATAAAGCTGTGTGTTTCACGGATACGCTGTCCAACTGGGAAGAAA----------ACAAAGAGT-TGAGTCCACAAACGTCTTCGGATGGCCCTGGTGGGCCCAGGGCAC------------------------GCTGGCCTTTCC--------TGGGGGCCTGCCGGCCTCTGCCCGCTTGACCTCCTGCAGACCTGACAGCAGCAGATGCCGGGAGGCTGGTCACTAAAGGAAAGGAGTCTGATGGTTATTCCTGATTTTTACTCCACCGTCTGTTTTTG-ATAAGTCTTCTCTGACAACCGCCGGGCTCACACGGATAATCCGTGTCAGTGCAGCCGACGCCCCACCAGGACCCGACCAGCCCCT a score=904 s mm7.chrY_random 29865408 82 + 30114534 gtatttaacatatatctgca-aaacatttggtc---ctaaaacaaaag--gatatgccttgttctcagcacctcagggtaccttcttc s bosTau2.scaffold758 347171 88 - 354501 GTACCCAAAATGTGTCTCAACAAACACTTAGTCTGTCTGACACAGAAGAAGAGATGCTGGGGTAAGATTAGTTTAGAATAACCCCTGT a score=27275 s mm7.chrY_random 29865490 727 + 30114534 aaaatATCTAACATTCAGAGATACTGACAACAGGCAGAAGGGGATTTTTTTTTTT---GAGAATGAAATGTTTCTCCTCATAGTGGACTCTTAAGCACATTCTCCAT-TATGCGATGT--TAGCTAGAAACCTAT-GACATAATTATTACACATTTGGCATGGACAGCACACAGGTTGTTATCTTCAAAAAGGTCAACTAGACAGGCCTCACTTATCTCCTTTAAATCACCAATAGATGTACCCTGGAAGCAGAGATCTGTTTTGA-GTTATGAGCAATTTCTTGAACCAGACGCTTACAAATCAAATCAAAAGTTCAGTGGACTCTTTTTTTTTTCCTTGGAttttttgagacagggtttctttggctgtcctggaactcactctgtagaacaggatggcctcaaactcagaaatcttcctgcctctgtctccACTGCCCAGTTTCTTGtgtttgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtctgtctgtctgtctgtctgtTTTGGTCAGTGGACTTCTGATAGCACCTGATTTCAAAGACTGCCACAGTACCAGGCCTGTAACAATAAGGTTTCTTCATCCCTCCAGAAGAAAGCGCACTCTTGTGAGCAACTTTTGTAGCTAGCTGTTTCCTGGGTGTTTTACCACAGGTGAATTTTCTGGCAGGGCAGTCTGCTTTGTAAGAGCCATGGTATGGGCACCTTCTTACTTACCTCCCCTTCTCCTTTAGCTGGA s bosTau2.chr11 1692258 545 + 87172399 AAAATATCTAACGTTCAGAACTACCAATAACAGGAAGAAGATAATTTTTTTTTTTTCAAAGAATGAAATGCTTCCCATCATAGTGGATTCTTAAGCACGTTCTCCACGTATGCGGCGTGCTAGCTGGATGTCTTTTGGCATAATTGTTACACGTTTGGCATGGATAGCACACAGGTTGGTGTTTTCAAAAAGGCCAACCAGATAAGCCTCACTTGCCTCCTGCAAAGCACCAATAGCTGCACTCTGGAAGCACAGATCTGTTTTGAAGTCCTGAGCAATTTCCCGCACCAGACGCT---------------------------------------------------------------------------------------------GGAAGGGAAGTTTGCGAA-TCAGAAGT------------------------------------------------------------------------------------------TCAGTGGACTTCTGATAACATCTAATTTCATGGAGTGCCACAGTACCAGGCCTGTAACGATGAGGTTTCTTCACCCCTCCAGTAGAGGGCGCACTCTTGCGAGTGGCTTTTGTAGCTGCTTGCTTCCTCGGTGCTTTACCACCGGTCGATTTTC-----GGGCAGTCTGCTTTGTACGAGCCATGGTATAGAGACCTCCTTACTTACC-CCCCTTCTCCTTCGGCTGGA a score=4296 s mm7.chrY_random 29876861 229 + 30114534 CACTTACTTGGTATAGATATAATTGCTAAGTCTTACATGAACATATATCAGTAAGTTATGTATTCTCATAGGAAAAAA---TTTTGCCCTT-AGTGACTAAATTCCTAATA--AGTGTCTCAAAACTCATTATTTTACTAACTTATATACAATACAAAAATGGC-ATTTTTGCACATACTTTTCTGTACTCCCAGTTATAAAGTTAATCTTACTAAGCAAACGttttttaattagg s bosTau2.chr1 118954 234 + 102834029 CATTTACTTGGGAAGGATGCGGTGAGTAAACATTCAGTGGCCACATTCTAGCAAATCTCGTCTTCTCACGGCAAGAGAACTTTCTGCCTTCGAACCATCAAAAACTTAACTGTAGCTTTTTGAACAGGACTATTTAAACAGCTTAGATAAATTCCAAGACTGATTATTTCTGCAAGTCTTCCTCCGTTGGCCCAGTTATGAAGTCAGTGTTAGTAGACAAA--TTCTTCCATCAAG a score=8185 s mm7.chrY_random 29883763 338 + 30114534 CTTTCTGATCTTCAGTCCCTAGAATTTGATGTAATTTATTACAGTATCTGTTATCCCCAGTAACAAA---AACAGAGA-----TTGCCTATAGTTTAAAACGCAACCTTTGAGGAGCTTACTAAAGTCAAAGTTTTACTGAGTGACCACATATTAAACAACCTGTTGGGAGAGGCATATGACCTAGAACTGAAAGGCTTTCAGAATATTGGTTTCTGCATCGTGTGCACTAAATGGAGACAGCTTGCATTAGAACAAATAATAGCCCTTTGTCACTGTTCAGATGAGCATTCATACTAGAGTCATGACCAACTTCTTGCTCTCCACTCAGTTCATAGA-AGATTCCC s bosTau2.chr1 119778 333 + 102834029 CTTCCCGGTCCTCTGCCCTGGGGACCCGGTTTATCT----GCAGCCCCT-TCACCCCCACGGGCAGGCCCAGCAGAGGGGCACCTGCC-ATCACTCAGGACGTA-CCTTTCAGGAGCTTGCTGAAGTCAAAGTTGTACTGCATGACCACGTGCGGGACCACCTTCTGGTAGAGGCAGATGACCTGGAGCAGCACGGCTTTCAGAAGAATGGTTTCTGCATCATCTGAATCAGAATCGAACAGTGTGAATCAGGAAACACCCTCGTTCTCTGTCCTCAATCAG-TAAGCAATCCCA------TCACGGTCAACTGCACGCAGAACACTGAGGCTGCAGACAGATGCCC a score=21533 s mm7.chrY_random 29886266 518 + 30114534 ATCAGTATTTACTCAGTATTGCTGCTCCATGTTTCC-TAGTGTACCTTTCATGCCAGGCCAATGGCTGTGTCCAAGCCATGGGAGAGGC-TTCCCGCTCGTTTTATACATATTTTTACAAACCAAATGACCACAGATGACTATATAGTGTA------GTGTTAAACCAGCAGAACCCTAGTCGCG----------------TATATATGAGGGAGGGAGAGAG--TAGAAATATAGATTTACACCCAGACATGGTGGGTGATAGCCCATCAGTTTATCTCTCTGTCC------CTTCACTGACCTAGA-AGGATTTGAGCTGCTGCAGCTTTAGACAGAAAACAGCCACATTTCCTAATTGTGGGCC-ATAAATTCACTTTTAGGACGGCTTTGCTGATGCATAAATAAGCAATCTGTCATATGTACTATATATAATTA----TTTTCTTTTTACT-TTATTTCAAAATGTATATTTTCTG---ACTATCATGAGCTATAAAGCAAAAAGATCAATAACTAATATTCT-CCAAAATAATAAATTTTCAAGATTCATTGGGG s bosTau2.scaffold7812 25036 554 - 36450 ATCACTATTGATTCAGTATTGCTGCTTTACGTTTCCAGAATAAGCTTTCGATGCCAGGACAGTGACTGCTTGAAAGCTGCAGGAGCTCTATTCCAATGCATTTTATA--TATTTTTAGAAACCAAATAAATGCAGATAACTATTTAGTATACTAATTATATTAAACCAGCAGAAATATAAAGGCAATAAAGTATATACATATATATATGGGGGGAGGGGAAAGGTTAAAAAAATAGGTTTACAGCCAGACGCAGTG----ATAAGCCCTAAATGTATTTCTCAATCTGTCTTTCTTTATTGACCCGAAGAGGATTTGAGTTGCTGCAGCTTTAAACAGAAAATTGCCATGTTCACCTACTATGAACCCATAAGTATGCTTTTAGTACTGCTTTGCTTATGTACAAGTAAAATACCTGTAATCTGTATTATATGTAATTATTTCTTTTCTTTTGACTGTCATTTCAAAATGTATATTTTCTGATAATTATCATGAGCTGTAAAAC-AAAGGATCAATATCTGATATTCTCCCCAAATAATAAATTCTCAGGATTCACTGGGG a score=3328 s mm7.chrY_random 29894929 46 + 30114534 TTAGTTCTTCCAGATAAGCTTGGAGCCAGGTCTGTATTGAGAGGAT s bosTau2.chr4 35216374 46 + 69556449 TTAGTCCTTCCAGATGGGCTTGGAGCCAGGTAGACATTGAGAGGAT a score=42436 s mm7.chrY_random 29909290 756 + 30114534 TAAACAACTTAATATGGTACA---------TATTATGGCTT-TTATGCAGATTTTAACATCCTAAATGAAATTGTATTT----TTTT------AATGATGTATAGTTAATAAAAGCATGGTAATATATTGCCT--GTGATAGATGTTGACTCT----TCCAACACCAGCAGTATTGAAGAAGGTCCT-------------------TGGAAAATGACAATCATGACATTTTAACCAAACTTATAAT---TTCCCCATAAGCAGGAAAAAGACAATAAATCTGTTCTCTTTGGGACTCAGATATCATCGAGAAGAATGAAAATGAAACAAGCCTGGTTCTTTACTTGTAGAAGAAAACCACAATGTCAAAAGAAATGAGAAATAAGGACTCTTTTATGTGGTTCTTAAATATTAGCTCTGAATGTGTTTCCCTGCAAAGAGAAGAGTCT--------CAAAACATTGGGGATTGGGCTGCAGATGGAAGGTGGGATAAAAGGGAATTAACCTGTATTATAGTATGCCCCTTGAATGCTAGCAAAAGTGAAGCTAATAGCTTATAAAAAAACACATAAAATACATAAAGTAAAATGATTT-CATATACACTTTAATTTAAAATAATCAATGAATCAAATTGCTGTTTAAGACTTTAAACTGAATATCAAATTTAAGAGTC-AGACTAGCTCCTGTTACTGTGGTTCTTCACCACATGTAACACACACACTATCAAAAATAACTTTAAAGCCTTGACATTTTTAAATCTAAATTAGTGAGATATTTCTCCAGAAAAATTCCAAATAAATAGCTTTTT s bosTau2.chr4 57184628 805 + 69556449 TATACAACTTAATATAGTATAGTCTTATTATATTACGGCTTATTATGCAGATTTGAATATTCTAAGTCAAACCATATTTCATATTTTCCAACAGATTAGGTATACAGAATAAAAGCATCATAAAATATAACCTCTGTGGCAGGTGCTGGCCCTGCCCTCCAACACCAGCAGTAT-GAAGAAGGCCCTCTGGAGTTATAAATGTATTTGGAAAACTACAAACATGACAATTTAACCAAACTTATAATACTTTTCCCACAAGTAGGGAAAAGATATTAAAGCTGTACTCTTTGGGACCCAGATATCATCAGCAAAAGTGAAAATGCAAGAAGCCTATTTTTCTATTT--AGAAGAAAACTGCAATGTCAAACGAAATGAGAAATGTGGGGTCTTGAATGTAGTTCTTACACACTGGCTATGAAAGTGTTTCCCTGCAAAGAGAAGAGTCTTGTGTCGTCACAAAATGAGGG---GGAGTGCAGAGGGAAGGTGGGACATA-GGTAATCGACCTGGATAACAGTATGCACCTTGGATGTTAGCAAAAGCGAAGCTAATAGCTTATAAAAAA-CACATGaaatatataaaataaaatgattttcatatacatcttaatttaaaataattaatGCATCAAATCCCTGTTTAAGACTTTAACCTGAATAGCAAATTTAAGAGTCCAGACTAGTTACTGTTACCGTGGCTCTTCCCCACGTGTAACACACACACTATCAAAAATAATTTAAAAACCTTCACATTCTTAAATCTAAATTAGTGAGATATTTCTCCAGAAATCTTCCAAATAAATAGC-TTTA a score=17055 s mm7.chrY_random 29912223 277 + 30114534 aaaaaGAAAGAATTTAAAAGGTGTTAACTTTAAGAAAA--TCTGttaaataaattattgataattttttattCTACTACTGAAAAAAATGAAATCAAGACACTACCAACCACAAAATTAAATTCAAGCCCTGACAAAA-ACCCTTTTCAATTCAAGGTTT--TTTTAAGGTTCTACTACCCTCCTTCTCCCTGTCCCCCACAAGTCCCAAG-GGTTATCACTGAGTGCTTATGGCACAATAAAAATGCAGCAACAGGTTTATTTTGTTCTTTAGGCAGATTTC s bosTau2.chr4 57185433 276 + 69556449 AAAAAGAAAGAATTTAAAAGCTGTTAACTTTAAAAAAAAATCTGTTAAATAAATTACTGATAATTCTTTACCCTATCACTGAAAA----TAAATCAAAACACTACCAACAACAAAATGAAATTCAAGCCCTGACAAGAGACCCTTTCCAGTTCAAGGTCTCTTTTTAAGGTTCTAC---CCTCCTTCTTCCTCTCCCCACCAGGTCCAAAATGGTTATTGCTGAGTGGGTGTGGCACAGTGAAAATGCAGCATCAGGTTCATTTTGTTCTTCAGGCAGTGTTC a score=9205 s mm7.chrY_random 29917198 203 + 30114534 CTTAACGTACACACAAACTGCTTTAAGCAGTAGATGGGG------GAACCTCCAGGCTTTGAAACCCCAAGATTGGCATTCAAAAAGAAGAGTGACTGCAATAGCAGCTCTGTCACATTAAGAAGTGAGTATGGTCATTTCTGTTCAATTTCTGAATCTTCCCAAGACATTGTTTGGCTGTTTCCATTTCTTTTTTTTTTTAAGGACAT s bosTau2.chr4 57185709 195 + 69556449 CCTACTGTACATGCAAACTGCTTCAG--------TGGGGCACGTGGAAGCTCCAGGCTCCCGCACCCCAAGACCAGTCTCCGAAGGGAATAGTGGCCACAGCCGCAGCTCCGTCACACAAAGAAACGTGCGTGGCCATTTCTGTTCAGTTTAAGGATCTTCCCGAGACGTTGTTTGGCTGTTGCCATTCCTTTTTTT------GGACGT a score=16033 s mm7.chrY_random 29917401 282 + 30114534 TTACCTTTTGTTGCCTGGTTGCTGATAGGCAATGGGTTTGCTGCAGGTCTCTTGGTGGTTTGAAGGAGCACTGAAAAAGAAGTTTCACCAATAGGTCTTTCTCTTTCTGGGTTTAGATTGCCATTACTTATCTGGCA------TGAAACCAAGCTGAGATTCAGTGTGTACTTTCAACTCTGAATACTCAAGTTATTCTTG-CCACATAATGTCTGCTTTGTGCCTTCTGACTGATTTCTGGAGAACTTTCCTTTTTGATATATTTCTGGCTTCTACTTAAGTCCTGAG s bosTau2.chr4 57186499 283 + 69556449 TTACCTTTTGTTGCCTGGTTGCTGATAGGTGGTGGATTTGACGCAGGTCTCTTGGTGGGGTGAAGGGGCACTGAAAAGGAAGTTTCACCAACAGG------CCTTTCTGGGCTTATACTGCCGTTACTTAGCTGGCACGCCCCTGATATCAAGCTTGAACTCTGCGTATACTTTGCATTCTGAAGGCTTGAGCCACTGCTGTCCACAGAATTCCTACTTTGTACTTTGTGACTGATTTCTGATGAAACTTCCTTTTTGATGCATTTCTGGCCTCTATTTAGATCCTAAG a score=5101 s mm7.chrY_random 29917697 80 + 30114534 AGTTCAGAAGTTCAATCAAACTGTTTAGTCCAGGAAGAAGTCATCAAATCCTGATCTTCAGTCTTGTCATGGTATCCAAA s bosTau2.chr4 57188630 80 + 69556449 AATCTGGAAGTTGTATCAAATTGTTTAATCCAGGAAGAACTCCTCAAGTCTTGATCTTCAGTCTTGACATGATATCCTAA a score=10658 s mm7.chrY_random 29917798 148 + 30114534 AGCTGCTGGAATCCTAGAGAGAGTTCTTCTCACCACTGCAGTCTGTGATTTTCATCTTCCTTTGTAAACACATGGAATAGTGCAACCCTGACATGGACAGCTTGCCCTGAATAGCTTCTTTCTCTGTGCTCCTTGAGGTAGGACATTC s bosTau2.chr4 57190099 148 + 69556449 AGCCGCTGGGGTCCTGGAGAGAGGGTCTTTCACCACCGCAGTCTGTGCTTTGTATCTGCCTTTGTAAACACGTGGAATAATGCAACCCTGCCATAGACAGCATGCCCTGAATAGCTTCTTCCTCTGTGCTCGTCGAGGTAGGACATTC a score=9432 s mm7.chrY_random 29917946 153 + 30114534 CCTTTTAACTGG-ATTTCATTTCTAGATGGGTTCTGGCTCTTTTGAAGGAGATTGCTCACTATATCAGATTCCTCTTTAACGTTTATTTCATGTTATTTCATGTTTCTTTTTATCACCTGAACTTTCAAAATCTTCAGTGGaaaaattaatttt s bosTau2.chr4 57190441 150 + 69556449 CCTTTTAACTGGAATTTCACTTCGAGATGGCTTTTGGCTCTTTTGAAGGAAGTTCCTCATCACATTAGATTCTTCCTTAAAGTTTG----ATGTTACCTCTTGTTTCTTTTCATCACCTGAACTTTCAGACTCTTCAGTGGTAAAATTATTTTT a score=6001 s mm7.chrY_random 29918110 83 + 30114534 aatCAGGTCCAGAGTCTTCTGAATAAGAAACATCAGAATATTCTGATGGTCTACTCCTGAGTTCCAATTTCACACTTG-TAAAG s bosTau2.chr4 57191742 84 + 69556449 AATCAGGTCCAGAGTCTTCTGAATCAGAAATATCAGAATATTCAGATGATCGATTCCTGAGTTCTGATTTCACACTTGTTAAAA a score=7112 s mm7.chrY_random 29918193 150 + 30114534 ATTCTGTTAAGTGGTTTTGGAGATCTTTTACTTACTGCATCCTCTCTTCCTGTGCTCTATTCTGTCTTCATGTTTGCCTTCTTCGT---TGGCTTATCTTCTTCACTT-AACTATCTGCTGTATAAAGACTCCAATATGCAAACATCTGCCTCT s bosTau2.chr4 57193031 154 + 69556449 ATACTGTTAAGTGGTTTTTGAGACTCTTCGTTCTCCACTCCCTCTATTCCTGAACTCTCTTCCATCTTCACTTTTGCCTTTTTTGTCCTTCTCTTATCCTCTTCATTTTCACTATCTGCTGTATAAAGACTCTGATCTGTGAAGGGTTGTCTCT a score=8363 s mm7.chrY_random 29918343 125 + 30114534 TTAGTTATTCTTCCATTTGTCAGCAATTATTATTATATCATTATCTTTTGCTCTCCATTCAGGTACCAAGGGAGATGGCTGGAGATGTTTATTGAATTTTCCATTCAGTTTAGAGCTCAACAGGT s bosTau2.chr4 57193403 124 + 69556449 TTAATTATCCTTCCATTTGTCAGCAGTAATCGA-AGATCATTATCTTTCACTCTCCATTCAGGTACTGTGGAAGATGGCTGGAGATGTTTGTTGAATTTTCCATTCAGTTTTGAGCTCAAGATGT a score=4905 s mm7.chrY_random 29918468 90 + 30114534 CCTCCTCCCATTGACACATCTCTAATCTTTTGAGGACTTCCCTTTTATGGATCTCAAGAATATTGAAGTTATAAGAGGTTCAGACTTGGt s bosTau2.chr4 57195010 90 + 69556449 CCTCTTCCCAGGGACACATCTCCAATCTTCTGAGCACCTCCCTCGTGTGGAGCTCCAGGATGTCGAGGTTGGAAGGAGTTCGGACGTTGT a score=7450 s mm7.chrY_random 29993778 274 + 30114534 TCCTTTGTGATATGGTAGCATAATAATCTCTATGCAGGTCTGCTGTTA------------TACTGCT----TGCTTTAAAAAGAATTAGATTTTATAGAAACAAAATCTTCTCCATTCAAAGTAAGCCATGTACTTACCAGTATCTTCTTCTTCCTTTTGAGAATCACTGGCTGACATATAAA---TGTTGACTCTGGGAACACGAATGCTAGTGCTCTGATCTGTGACTTCAGCTTCATTGCCATTTTTGGTCTCACTCTCTACTGCGTGTATAGTTTCTCCTAAAAGAAAA s bosTau2.scaffold4269 4264 286 + 68191 TCTCTTGGAATACAGCAGAATCATAGTCTCTAT--AATACTGCTACTTGTTTCCTCCAGTTACTGGTCATATTTTTTAAAAAAAA---GAGCTACAAGAACAAAAATTCTCTCCCACAAAA--AGGCCACCTACTTACTTAAATCTTCATCTTCTTGCTGAGAGTCGTTGACAGTCATATAAACCATCTTTTCTCTTGGCACACGAATACTGTTATTCTGATCAAGTAGTTCAACTCCATGATCATTCTCAGGCTCACTCTCCACAATGTCTACAGTCCCACCTATCAGGGAA a score=10089 s mm7.chrY_random 29995982 208 + 30114534 TTTCCTTACCTAATTCATCCACTTCTGAGTCAGCTTTAAGAATGCACACCTTGATAACTTCTGGAGATGCTTCATCCAATTTAGAAGAATCAGTTCCTGACTCTGCATTCATGGTAACTTCAGAGGAACCTTCAAGATCTGCTTTGCTAGGTTCATCCACTAAA-----TAGGAAATGTATTATAAACCTTTACATTAGATA-TAAAACAAAAT s bosTau2.scaffold4269 4748 207 + 68191 TTCTCTTACCTAAGTCATCCTCTCCAGGATCAGCTTTAAAAATGTACACCTTGATAACTTCAGGGCAAGTGCCATCTACTTTACAAGGATCGATCTCTGACTCTGCATCCATGGTCATTCCAGAGGAACCATCGTGTTCTATTTTGCCAGCATCATCCACTAAAAAGGGCAGGAAATATATAATA-------ACAGCAGATATTTAAATAAAAT a score=43193 s mm7.chrY_random 29999505 1501 + 30114534 CAAAATAAAACAGTAAAAACAA-----AAACATACTTTTGATAACCA-TGTGGCTCAAGACTTACAAGACATCATCAGATAATCCTCACAGTTGATTTTGTCATTATCTTGCTGCTCCAGAGGCATCCCACTGGAATCTAAGACTGCTTCAGAAACACAATCTGCTACCAGTATATCTGAAG------TGTCAGCTGTTATAGGATCAGTGATGACTTCTGTTTCTACAAGGCTATCATGAATCACTTGTTCAAAATGTCCTACATCAGACACATGTATAGCTTCACTCATCAAGACATGTTCAGGCATAGTCAATGAGGTTGACGTAATACCAGATGTTAAAATGTC---TGGAATTAAGAACTGTGCTAAAGACACTTCTTCTGCTGTACCTAAATTGAGAACTTGCTCAGGAATAATGACATTGTCAGATATATCTGTTTCTTCTAAAATATGTGAACAGTGAACATCTTCAATAAGAACATTTTCAATAACATCTTGAATTATAACTGAGCCTGGATTATCAGGAACAAAATTATGCACAGTTACATCTGAAT------TAGCTAA---AAAAACAGTTTCTTGTACTTCCACAACAATCTGGTCACTATCCATGTGTACTGCATCAGCTCCTTAAAAGATAAAAAG----------AATTTCAAGGTAAG--TACATG--TATCTCAAATAAAGTAAATGCTTTTAAATTTCTATAAGAAAAGCAGACTA-----------TTACcacacacacacacacacacacacacacacacaATGAGTGTCTACTTTTAGGTTATGTAACAA---------------------------------------AAATTAACTAACAAAACTTAAAAAGAAAAACCTTAGCTTTGGGATAGTCATAGGAAAA---ATATTTAGGAAAGAATTTTAATGTATCAGCATATATTTCTTATTGTGTTaaaatcttaaatgaaatcttaagtgaaaatcttaaat---aaaaCAAGCAAGCAATGCAATTTAGAAA-----------CATTTCTCATATTACA-------------ATTCCCTT---------------TACCATATTTTATCACTCTAAGAACACTTAT-TGTTTACTCTGACT--------------------------TGTTCTTATT-----CAGTAACTTACTTATATCCTTGTCAGTGATAGCAGCCAACA-----AAAATATCATCCTTAGTGAAACTAAAAT---AAAACACTCATGGCATAAATGAAAAGTATACTGGTAAAGGTACACAGTTAATGACAAAAGACAATTGACTGAAAAAGGTATCTGACTGGAGAGTAAAAATGAATGAAACTTCAGTTGCCTTTTAAGAAATTTGATGTTAAGGACTGCAGAAGTGGGACCTAGACTAAAT--AACA-AGTATGCAGCTCCCCTTCAGCTCTTCCTTTCAAGACCCAATTTTCCAAATTTCACTGAAGTTTCTCAGAATATTAAATACC-------AATCTACATTGAGGGTACAGTTAAGAAATGAAGTAAAAAGGGTGAATCCTTGAAAACCCATTGAGATGAAATGATTTAATT-GTATCACAAACCTGGCACATTATATGGTATTCAACAAATTTTATTCAGATTAAAAGCCacaaaatgggatccacacaaatcag s bosTau2.scaffold4269 16366 1634 + 68191 CAACCTAAGTTAGGAAAGACAACCTTTGAAAACACCTTTGACAATCACTGTACCACAAGACTTACAGGAAATCATAAGGTAGTCCTCACAGTTGCCTTTGTCATCCTCCTGCTGGTCCACAGGGATCCCGTTGGCATCTATGACTGCTTCTGAGGCACAATCTGCTACCAATACTTCTTCTGACACTACATCGGCTGTCAGAGGATCAGTGACGATTTCTGCCTCTACTACGCTATCATGAACAACGTGTTCAACGTGTCCAATGTCAGACACGTGTATGGACTCACTCGTCAAGACGTGTTCTGGCATAGACATTGAGGCTGAAGTAATATCAGAAGCTAAGACGTCATCTGGGACTGTACAATGTGCTAAAGACACTTCTTCTGTTACATCTGAGTCCAGCACTTGCTCAGGAATGATGACTGTTTCAGATACATCTGCTTCTTCCATGATATCTGGACACTGAACATCTTCTATAACAACGTCCTCGATAACATCTTGGATTACAACTGAGTCTGGGTCATCGGGAACAAAGTTATGCACAGTTATGTCTGAATCCACAACATCTGAAACAAAAACAGTTTCTTGTACTTCCACAACAATTTGATCACCATCCATGTGTGTAGCATCAGCTCCTTAAAAAAACAAAAATTAAAATCACAAATTTCAGGTAGACCTGCATGACTACCTCAATTAATACAAATGTTACTTAAGTTCTACCAGGAAAACAGTCTAGAGCGCCTCAGTTGTCTCAAACATTAAGACAGAT-TAAAGAAATAAAGAGGAACTCTATTTTTGAATCATATCAGAAATTAGAAATTCTTAACACAAGAATTTTTATACTCATCCCAAATCAACTGATAAGGAAATAATAGAAAAA--------TTGAGACAGTCACACAAAAAAATATATTCATGAAAGTAATTTCCTAGACTAAGATTAAACCCACA--------------TGTATAGATACTTGAGGGATGATTATGATTATAAAAATTAGTAAGTAAAGCAACTTCAGGAGGTAAATATACCATTTCCCTCATTGTATGTttttcacttctttcccttcttgctccatgtctctctcatgttttttcttcttttcatctctcccatgttttcttttacttcccttccattttttcccctttctcctgttttgtttGAGGACAATATCCCACCAATATCCT--CCATTTATGACTATGGAAATTCAGAAACTATCTTC-----TGAATCTAGAATATAAAAAGGATTGGGCCATAAATAAAA---CCAGGGCTAGAAGGCCACAGTTATAGAGGAAAGACAATTGGTT--AAGGAGCCTCTG--TGGAAAGGTAAGATGAATAGAAGTGTAGCTGCTCTGCAGCAG--TGGAGGGTAAAGTTAGTTGGAGCAGGGCCTGATCCAACTTCACCAGGGTAGTCTGCCTCCATCCAG--CTTCCTCCCATCTTCCCATATCCCAATCCCCCAGGGAGTTCTTAAGAATATAAGAAACCCTATTCTAGTCCACTCTG------CAGTTAACGAATGAAGGTAGAGGGTTGAATCATTtgaagcccagtgagattaaatgacttcaccaagatcacacagtttgcacagattatggtgctcagtaaatattactctgaatgaatgCCAC-AAATGAGAATCA---AAATCAG a score=14228 s mm7.chrY_random 30003602 919 + 30114534 ACCAGGTAAAACAACTCAAATTTAAAGATCAGG--TTGTATGCTTA---AGTTtgcaatcttggaca-----tttaacctttgaacttcagtttcctttttc----aatgaggatagtagtaactgacatgcatg--tcataggagtgtgatgatgttcaaatgtgaatgtatgaaaggcATCCTGAAAAACTGTAAGGAGAATTTTTATTATTATAATGACGGTAAAGAAAACATAGGCCCT-----ATTA-----------------TAGAGAAATAGCA---GTATTAATTATCTCTACTCAAATGT------CCTCCAATCTGCTACTTAGCCCAAGTTCTAAGATTACTTATGGTAAAACAAAAAACACTAATAGTTCTAAGTTTTCCCTTCAAAGAATCTA-TCTCCATTTTTGTAGTATTAATTGTATTTCAGTATGTTCTAAAGAAT---TAATTATAATTTTACATTAGCTATCA-CAAACTAAAACCACCAAAATGAGAATCAAAGGACCATGACAAATT---------AAGACACA---------------TAGAAAATAAAGAAAGGTTAA-------------TAAAATTAAATT-----------------------CATAA-----------AATCATTACAAACT------------------TACTTTACCTACAAGAATTCTTAAGTATTTTCTTATAAAGCATTTCATTATATTGCAA---------------------------ATGTAACAAGAGT----AGTAATTGGAAA------------------CCCCACTGCTAGAACTTCATAAG--TAATTTTTCATATGCAATTTTGGGACTGAGGATCAACT--ATATTCCTGATGCTA-----TCTCTTTTATAGGGGTGCATATGCATGAAAAGGTTGCAAAATTAATATGGGAT--AAACACAAAAGGACTTTAAAAATAT----------CTAAACTATGGAAGGGAATAGTAGGAGAATGACAAAATC-------------ATGATACATGATCT----------------AAGATTAAGACTGTGTAAAAGATTTT----GTTATTGTACATCCATAATGAGGTA--AGTACTGAGCTATTTGT-TGACAATGAAATGAGGAAATTTA s bosTau2.scaffold4269 18471 1141 + 68191 accggttaaaaaatctaaa--ccacagggcaggatttggacacttattagttttgtgaccttgggcaagtcatttaacctctgagtttaggtttcctcatcagtaaaatgaggacagtagtatctgccatgcatacctcacaggactgttgtgatgatcaaatgggaatatatgggaagtgttCTGAAAAACTGTAATGAAAGGTTTCATTATTATTAGGACAT--ATggaaatggaggccctggcagattaagtgacttgctcaaagataaacaaacaccataagtgttaacaatcagggctaaaatgcaacagcccttcaatttacccctcagcccatgatctAGGCTTGCATGCAGCAAGATTAAGCTAGTAAATAGCG-TGCGTTTTTC--TCAAAGAGCTTAGTCTCTCCTTCAAGCACATTAATTATACTTCA---TGTTCTAAAGAAGAAAGAATCATAACTTTGCATTTATCATTATCAAGCTGAAATTACCAAAG-GTGAATCAAAAGACTATCCCATATTGTTAAGAAAAATACACAAACCCCCATTAGATTTAGAGATTAAAGAAAAGttaaaattaaatatcattaatatttaatttCCTGATAGTTAATTACTATTTCCTTAATATACTGTAATAGTCATTTCAAGTCCAATGGAAAACTCATTAACATTTTATTTATAAGGATTCCTAGTTAATGTTATATAAAACCATT--TTACATTACAAAACCTAGCATAATAACTTCACTATGTTATATAATGGGAACCATGAGTAATTAAAAATTGTGAATACTTTTTTTCTTCTATTTTTAGAAATTCATAAATTTAATTTTTCTTGAACAGTTTGGGGAGTGAGGTAAGACTCCATCTTCCTGAAGCAAATGGCTCCTTTTGTTA-----CCTTGTGAGAGAGAGGATTTTAAAAGTAGGATGGTGTCAGAAAACAGACTG-CCTTAGGTTTATACTTTACCTGCTGGATAATGGGA------AACAGAGAAATGACAAGATCCACATGTTATTTTATGATGAGTACTCTGCTGGGCTAGGCAAAAAAGACTAATGGGAAGGAAAAGAATTTAAAAGTTACTGAAGACTAAGAATGAGATGATAGAGTTCGTCTATGTGGAAGAAAGTAGAATGAAGAGATGTA a score=8807 s mm7.chrY_random 30020749 298 + 30114534 ATCTGACAAACATTTTGTTGAAATAACTCTAAATCTAGTAGGTAAGAATGAGAATAATCAAGAAATATTATACCTATTCCATCAAAGAATGACTTTTCTTCTTCTGGGGTCAATTCAATTTCATCTTCATCCATGGCCTTCAGTTCTTACTAAGT-CAGCTCCTAAACCAGGGAACAACAAATAC-----------TGatttatattaaatattaaa------atGTCATATTTGCATCTCTGAGGCACTCATTTCCA-ATAACCTATCAATTTCAAT-AAAAAGGAATACATAGAAAACACTATAATTAAAAGTGAA s bosTau2.scaffold4269 20133 304 + 68191 ATCTGACAACCA-------------ACTCCAAATCTGGTAGTTGGGAAGCGGAACAATCCAAATA-GTTATACCTGTTGTATCAAAAAATGAGTTTGGTTCTTGTGGTTGTAATTCAAGTCCATCTTCATCCATGGCCTTTAATTTTCATCAGTCACAGCTCCTAAATTAGGGGAGAAAGTAAACCAAGCATTAGGTGTTTTATATCATGTATTAAAAATATCATATAATATTTACACTTCTGAAACACTCAAAATTATGTGACAAATGAATATCTATCAAAAATGTATCTAGGTGAAATAAAAAAGTTAAAATTAAA a score=7895 s mm7.chrY_random 30075169 530 + 30114534 agcattttacctttggtttaccttcacccaacctccaaaggctatgccagaggtaccagtggaaagtgctcccccaaggtatgaaaaatagtcccactctttgtcagaaattcgtggatattgctatcc-------tgcaggaccata---aagtctattctaacatttatcttggtatatggacaatattctactttcttataaagatagagcatatttacatgaggcactacaatttttggttgagcagtt------------aaactcatatggacttcaaa--tggttccagaaaaggttcagagatagccccattctcatacctgggtcctgt------tattcagacagaacttgtttctcctcagcccattcagctaagggttgatcatctagagactttaaatgactttcaaaaacttcttggagatatcaattggattcatcctttct-----caaaaataactactggg---aacctgaagcttttatttgatatcctccatggagatgctattccaaaatcatcacaaaactaacccctgaggcTAAAGCCTCACTA s bosTau2.scaffold8491 3211 521 - 32792 AACGGTTTGCCTTGAGTCTACCTTCAGCTAATTTTAAACGGCCCTATAAAAGGTTTCAATGGAAGGTTTTGCCTCAGTGAATAAAAAATAGCCCCATCTTGTGTCAGAAATTTGTAGACCAAGCTGTACAAAATGTTAGAGGAAAATATAAAGATCTAT------ATTTGATACATTATATAGATGATATTTTGGCAGCTCATAAGGACAGAGCCTTGTTGCA---------ACAAATTTTGTCTGAATTGATTGAGGCTTTGGAAAACT-----GGGGTTTAAAGATAGCTCCAAATAAGATACAAGTAAGTCCTCCTTTTCTTATTTAGGGAGGGTATTAAATATCCATAC------TGTGAGTCATCCCCTTTTGCAGCTGTGGAGAGATGGTTTACTAACTTTAAATGATTTCCAAAAATTATTAGGAGATATTAATTAGATACGCCCActtggactgcaagaagatccaaccagtccattctgaag---------gagatcagccctg-agat-ttatttggaaggaatgatg----------ctaaagctgaaactccagta a score=1373 s mm7.chrY_random 30075879 47 + 30114534 caggagctgatg-----cagag-gccatggagtggtgttatttactggcttgc s bosTau2.scaffold8491 3876 53 - 32792 cgggagttggtgatggacagggagtcctggtgtgctgtgattcatgggattgc a score=6042 s mm7.chrY_random 30076153 311 + 30114534 TCCTGCTTGCTACTGTACATACTCCTACAGCATGTTTATGGCAGTAGGGTATATTAGAATGGTTACATTTGCCAGTGGCACAAAAAGGAATAGTCATTGCTTATTCCTCCCTGGTAGCCAAATTATTAGGTAAAGGGAGAAAAG----------------GGATAAAGAG----AGATATGGTTACTCCTTATACTGCAGACCAACATAACATTTTCTTATGAATC--TGAGCAATGGCAGATTGCACAATTAGGATATACAGGGACCTATTCT-TATCACTTGCCTAATCACCCCTTATTATATTTCATT---------ATAGGACATCAAATCATCTTTCC s bosTau2.scaffold8491 4148 342 - 32792 TTATTCTCACCATAGAACATACACCTACAGGATACTTGTGGCAAAAAGGCCCATTGAAATGGCTCCATCTACCAGTGACCCCTAGAAAAATAGTTTTATCTTATCCCAGCTTGGTGACACAATTAATTATAAAAGGTAAAAAAAAAGTGTGAAACTTTTTGGAAAAAAAGTAACAAATATAGTGATTCCATTCAATAAAGATCAACTGCAATTTCTTTTACAAAATAGTGATGATTGGCAAGTTGCCCTGATA-GATTTCTGGGGTCAAATTTTCTTTCATTTGTCCTCAAGCCCCTTTTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACACATCCAGTAATTTTTCC a score=4262 s mm7.chrY_random 30076500 405 + 30114534 CAGCACTGGTGTTTACTGAAGGCTCAGCTTCAGGGCAGGCTGCTTTGATTATTGATAGCAACAAAGAATCTCTCCCT------ACCCAAGAAATTTCTGCTGAGCAAGTGCAATTAATAGCAATAATCATTGCTTTTAAAATACTTTA-AACCAAGTCCTTTAACTTATATACAGACTCTCAGCATATTGTCAGATTATTTCCTTATATAAAGACAGCTCCACTGCCATCTAGCTACTCCACAATCTTAGCTCTACTTTCAAAACTACAGGTGTTAATTCAATCTAGAGAGTGTCCTCttttttttttttttttttttttttGGTAGGACATGTTAGAGTTTATACAATGCTTCCTGGTCCTATTCATGAGGGTAACTGTATGGTTCATTCTCTGAAAAAGGTTTTTGCTCT s bosTau2.scaffold8491 4522 384 - 32792 CAATTTTAGTTTTCACAGATGATTCCTCTAATGGTAAAGCAGTCACAATTATTGAT------AAAATATCCCATGTTCAGGTAACTGAAGAGACATCTGCCCAGAAGGCTGAGTTACGAGCAGTTATT-TGGGTTTTTCAACATTTAAGAGACCACACCTTCAATCTTTTGACTGACTCCCAATATATTGTAGGGTTGTGTCCTCATATAGAGACTGCTAATATTCCAGA-AAATAAACTATTATCTTCTCCTTGTTATCTGATTTACAGAAAGAGATTAAACACAGAGA--------------------TAAAAAATATTTTGTGGGACATATTAGACCCCATTCTGGCTTGCCTGGCCCTTTACATGAAGGAAATGCTTTGGCAGATGCATTAACTAAAGTAATTGCTTT a score=5295 s mm7.chrY_random 30078315 662 + 30114534 AGAAATTGTCTTTTCTCTATTGGACATGTTCAAGTTCATTCTATGCTTCCTGATCCTATAAATGGAGGGAAGGATTAACTTAATTTCTTAA-CAAAAGC----TTGTTGCTTTTCCTAAGAAGG----------TAACTTA--GCATGATCTTAACATTAC------AAATCACCATT-----GAGCTCAGAGAAACT--------GGTCCTGCATTCCTGCAGA-GCTGTC--------------AGTTAAGCT-TGAGAATTATCCCCTGATTAGCCTATGTCCTTGTGATTTAAAACAGACAAATGTTACTTATGTCCTGTC-TTTTGAAAGTTAGCCTTTACTCCGGTAGGTATGTACACTTAATTCTCATTGCTATTTATGTCTTTTCCTAACTTGGGAAAACTTTTACTGTATCAAAGTTGTATGATACA---GTATTTGTTTCATTAGTCTATA-ATACCAAGGGCTTAAATTTCAGGCAATGTCCTTGCCTAAACTTAAAAAGCCCTTAAAAATTGGTGTTTGACTCTTAGTTTC------------TCACTGACATCAACTATAGTTTACAGGGACAGACTATTGTACAGTGAGCTCATCAGACCTTAAAAGATATAGACATCtaaattacaa-aataaaattataattaatCATCTCCTTATGATACTTTATAGAA-----------CAATAAATA-AGTATATTTTTTC----------AACTTCCCTAGCCTCTATAAAATA s bosTau2.scaffold8684 15276 739 + 31727 AGAAATAAAATATTTTTCATTGGACACATTCAGGCTCATTCTGGATTGCCCGGCCCTTTAAATGCCTTTAATGACTTGGCTGACTTGTTAATCAGAAATACAGTGGCTACGGTGATTAAGGAAGCCAGAGCCTCTCACTTACTTCATCATCAAAATGCTACTGCTTTAAGATATCATTTCCAAATTCCCAGAGAAACTGCTAGGGAGATTGTGTGCTCTTGCTTACACTGCCCCACTGTTTATAATAGTCTACCTATGGGAGTTAACCTTTG--CAGTCTCAAACCTAACATACTCTGGCAAATGGACGTAACTCATATCTCTTCATTTGGAAAACTTTCCTTTGTTCAAGTAACTGTAGATACCT-TTTCTCA-TGTCATTATTGCAACTGCTCATACCGGAGAGGCAGTTAAAG-----ATGTTATACAACATATCTTTACTTGTTTTTCATATCTAGGTCTGCCAAAGGCTTTGAAAACTGATAATGCCCCTGCTTATACTTCTAAGTCTTTTCAGGAATTTTGTTTA-----CAGTTTCAAATTAAACACAATACAGGCATCCCTTATACTCCCCAGGGACAAGCCATTGTGGAAAGAGCACATCAAATATT-AAAGGTTCAAATTCAAAAATTAAAAGAAGGGAAGTTTAAGTATAGCTCTCCCCATCAAATCTTGCAACATGCTCTTTTTGTAATAAATATTGTATTTTTTTTTTCAAATCAAGAGTTTTTATTGTCTCTTTAAAATA a score=32119 s mm7.chrY_random 30081752 975 + 30114534 TGCCACAGAGCCTCAGCTGTGGTGCTCCCTAT-TTCTTCAGATGTCCAGCTCAGTCCTGTCCAAGAAACGCAAAGTGTCTGGACCTGACTCTAGTCTGGATTCTAGTTGGTCTCCTACCTATTCTGTGATGTTTGGCGTGCCCCCAGGGCCAACCAACGTGAGTATGACGTTTGTAAGGATGGAAACAATCAGTGGGGGTGGTA------AAGTACTTTCCAAAT----GTCTTA---GTCTCATTACTATTTTTTC----TTCCCTGGAACT-----CTCTGCTCATCTTTAGGAAATGTCAAAAAAT---AAGGAAATGGACATAGATGAAAGCCTTTACTCCCGCCAGCTGTGAGTAGTACCCAGGACGGGAAATGGAGATTGAGAGAAGGCACAGAGTGG-------------GGCA-GACCCTAACCTAGAGT----TCTTTGCTGACAGGTATGTACTCGGCCATGAGGCAATGAAGCATCTCCAGGCTTCCAGTGTACTGATATCAGGCCTGCAGGGTCTGGGTGTGGAAATTGCCAAGAATATCATCCTTGGTGGGGTCAAGGCTGTCACTCTCCATGATCAGGGCATTGCCCAGTGGGCTGATCTGTCTTCCCAGGTATTATCTCTTTTTGGCTTCTCCTTGCTTAGGTCCCAGC---GTGTGCACTGCATGTGTTTCAGTGTTATCTTCCTACCCCCT-TTTCATAGTTCTGCCTACGTGAGGAAGATATTGGTAAAAACCGAGCTGAGATATCCCAACCACGCCTTGCTGAACTCAACAGTTACGTTCCTGTGTTTGCCTACACTGGACCTCTAATTGAGGAGTTCCTTAGTGGTTTTCAGGTACCCTGGAGTATCCCCATGCC---TCCTCT-----CTTATTCCAGGTTTGTT---------GCCATTTA---GGTTGGCACCTTGTGTCAGATCTGGTTCTGG----AAAACTAGGAGATGTAGGTAGCAGGTAGA----------GCTCCCCAGAGGGGCAGATTCT-------CTTATAGAAAGGTGTTGTGTTATAGT---GAGACTGAA s bosTau2.chr27 15969478 1047 + 31566707 TGCCCCAGG--CTCACTTCTGATTTCTTTTATGCTCTCCAGATGTCCAGCTCGCCGCTGTCCAAGAAACGTCGCGTGTCCGGGCCTGATCCAAAGCCGGGTTCTAACTGTTCCCCTGCCCACTCCGTATTGTCCGAAGTGCCCTCGGTGCCAGCTAACGTGAGTGTGTTCTTCCTA------GAGACTGGCAGGTGGGGTGGTGGGTGGGAAACATCTTCTGTATCCCTGTCCTGTCTGTCCCGTCCCTCCTCCTGCACATCTCCCTGAACCTAGTGTTCCCCTCCATTTCTAGGGAATGGCGAAAAATGTCAGTGACGCAGACATAGATGAAGGCCTTTACTCCCGGCAGCTGTGAGTGGGGCCGAAGTTGGACTGTGAGG--TGGGAGGGGGCTCTGAATGGATAGGGTCAGGAGGGCGTGACTCTGACCTGTGACACCCTCTAACCCGGCAGGTATGTGTTGGGCCATGAGGCAATGAAGCGGCTCCAGACCTCCAGCGTACTGGTATCAGGCCTTCGGGGCCTGGGCGTGGAGATTGCCAAGAACATCATCCTCGGTGGGGTCAAGGCTGTCACACTGCATGACCAGGGCACTGCCCAGTGGGCCGACCTCTCCTCCCAGGT-TCCTCTTTCCATCCCCCTTCTTTGCCAAGGCCCCAGCCCTCTGGGCTACACAGCCAGTTCACT----TCTTCCTACACTCTCCTTTGCAGTTCTACCTGCGGGAAGAAGACATAGGAAAAAACCGAGCTGAGGTCTCCCAGCCCCGTCTCGCTGAGCTCAACAGCTATGTGCCTGTCAGTGCCTACACCGGGCCCCTTGTGGAGGACTTTCTCAGTGACTTCCAGGTACCATAGG----CCTCATGCCCAGTTCTCTCAGAGCCTAGCTCTGGTTTATTCTTTTGATAAACATTTAATGGGCTAGC-CTGTGAGTCAGGTTTCCCGCTAACGCTGCAGCAAGGAAATGCGAGCAGGCTTTAGGCCCTGGGCCTGCCTCTTTAGGAGGAATATTGTAAGCCAACAGGTGGGAAGgcatagtggttatgtgcagagactgaa a score=15881 s mm7.chrY_random 30082944 592 + 30114534 AACTGTTCTCTGACCCTTGTTATACCTGATGCC-------------------------------------------CATTGAGACTTGTGTG----------------------------TCCAT--GTGACAAAAGGCTATGCCAGCTGAGCCTGGGTGTTGGATTC--TTCACCCTTCT-----CCCTCACTTCTGTCAGCTTTTTTATTCTCTCACTCC-------ACCCCAAACCTGGGCCTATTATTCTTTACAGGTAGTGGTTCTTACCAACACTCCTTTGGAATATCAGCTGCAGGTGGGTGAATTCTGCCATAGCCACGGAATCAAGCTGGTAGTAGCAGACACTCGGGGCCTAGTTGGGTGAGTG--CTTGCCTTTGTCTAACTTCTACCAAACATAGGCCAAG---AGACTCCCAAGCCTTCAT--------GTCCTCCTCCACCAACCAGTTTTGAAATGATTTTTCATTATTTT--CCTGTGTGGTGTGAACGTCACCTGAT----------------CTG-----------------TCCCAGTACCTTGAGTG---CTGGAAGGCCC--TGTGCTTGGT-CCAAAGCATCACTCCTTTTGCCTCCTTCCCTAGACAACTCTTCTGTGACTTTGGAGAGGAAATGATTCTCACTGATTCAAATGGAGAACAGCCACTCAGTGCCATGGTTTCAATGATCACTAAGGTAAGGAGGTGAGCC s bosTau2.chr27 15970988 729 + 31566707 AGCTGTTATCCAGACTCTGTCCTCCCAGTTGCCTCTTTACCTTGCCTGCCATAGTCTAGGGATTCACATTTCCTTTCATTGAGTTTTGCTTGGGCTGAATCTGATACGTGGTAGATACTTTCTGTTTGTGATAGAGAGCTGAACCAGCAAAGCCTTAA----GGACCCCGTGAGCCCTCCTATCAGCCCTCCTCTATGATTGCTCCCTTTACCCTTCACCCTGGTGCTGGGCCCTTGCCTGAGCTTCCACCTCTCCACAGGTGGTGGTCCTCACTAACAGCCCCCTGGAGGACCAGCTGCGGGTAGGTGAGTTCTGTCACAGCCATGGCATCAAGCTGGTGGTGGCAGACACCCGGGGCCTGTTCGGGTGAGTGCCCCTGCTCTTTTCCACCCTGACCCCTGCCTTGTCCAAGAAAAAACCCCCAAGCTCTGACTGCCCTCAGCCCCCCTTAGGCCTTTGGGTTTTGGATGCTGCGTGTTTACCTTGCCTCACGTAGCATGAGCACAGTCTGATTCCCAGCAGTGATGGGCTGATTTGCTCAGCAAATACTCACTGCATCTTGAGGGACACGTGCAGTCTCAATGTGCGTGGGACTTGGGCATCAGCCCTGTTGCCTCCCTCTACAGGCAGCTCTTCTGTGATTTTGGAGAGGAAATGATCCTCACTGATTCCAATGGGGAGCAGCCGCTCAGTGCTATGGTTTCTATGGTCACCAAGGTGAGGAGGCCAGCC a score=9296 s mm7.chrY_random 30084080 190 + 30114534 ACTCTTAATCTTCTTTT----TTCTTTTTCCCCAACCAGGAGAATCCAGGGATTGTCACCTGCCTGGAGGACTCCCGGCATGGATTTGAAAGTGGTGACTTTATCTCTTTCACAGAAGTTCAGGGCATGAGTGAACTCAATGGCATTGGTCCCATAGAGATCAAAGTTCTGGGTAAGGGAAGCCTGGGGAAGGA s bosTau2.chr27 15971770 194 + 31566707 ACCCTGAGCCTGCCTCTGAGGTACTCCTCCTTCAACCAGGACAACCCCGGTGTTGTTACTTGTCTGGATGAGGCCCGACATGGCTTTGAGAGTGGTGACTTCGTCTCCTTTTCGGAAGTACAGGGCATGATTGAACTCAATGGAAGTCAGCCCATGGAAATCAAAGTTCTGGGTGAGCTAGGGCCAGGGGGGAA a score=58456 s mm7.chrY_random 30086400 1639 + 30114534 CATCTTTTTCATCT--TCCAGGTCCCTATACCTTTAGTATCTGTGATACCTCCAGCTTCTCTGAGTACATCCGTGGAGGCATTGTCAGTCAAGTGAAAGTACCTCGGAAGATCAATTTTGTGAGTA--GGTGGTGAGGGGCTGTGA---ATAGAAGGACTCCTGCT-----TTTGAGATTTATAGGTTGTTCATATCTGGTC--------------TCGCGATGCTCCATTATCCACAGAAACCCCTACTTGCCTCGCTGGCAGAGCCAGAGTTTGTGGTCACAGATTTTGCTAAGTGCTGTCATCCTGCTCAGCTCCACATTGGCTTCCAGGCCCTGCATCAGTTCTGTACTCAGCACAGCAGGCCTCCTCGGCCCCATAATGAGGTAAATGAGTGGGAAGCCAGCCAGGG------ACCT-------------CTGATTTGTCTGTTT-CCTGTACCTGTT-CTTCCTCCAGTAGGGCCTGATAGGCTCTATCCCGGTTCCTTTTGTCCAACCAGGAGGATGCTGAGGAATTGGTGACCTTAGCCCAATCTGTGAATGCTCAAGCTTTGCCAGCAGTTCAGCAGGATTGCCTGGACATCGACCTTATCCGGAAGTTGGCCTATGTAGCAGCTGGGGACCTGGCACCCATGAATGCCTTTTTTGGTGGTTTGGCTGCCCAGGAGGTCATGAAGGTCAGCCCTAGTGGGAAAGGGTGTGGCTGGTGTGTGCT---------TCTGATGCCATCAC-TGTCTTTT---------AGTCCAGTTAGGCTCCTGCTACTGACAACCTTCT-----TTCCCCAGGCTTGTTCTGGAAAGTTTATGCCCATTAGGCAGTGGCTGTACTTTGATGCCCTTGAATGTCTCCCAGAGCACAGAGTGGCCTTCATGGAAGATAAGTGCCTGCCAGTAAGTCTGTGGGGACAGTGGGAA----ACTTTGGGAATGTCTTGAGGAAAGTGTCACTCTAACCTATCTGTACTCACTCACATAAATCCAGCACCAGAACCGTTATGATGGGCAAGTGGCTGTATTTGGATCAGACCTACAAGAGAAGCTTGGCAAGCAGAAATACTTCCTGGTGATT----------GACACTAA----------------TGGCCTCTGTTCACCCTTTCTGAAAGGATCTTTCTTTCCCTGATCCCTTTGGGGAGGTGTCTTTTGGTTTTTCATGTCCTCATCACATCACCT----CTTCTGTTTTGTGGTGGGTTGAGGAAAGGCTTCAGGTATCTCTTTTTCTTTCCCTCCTCTCAGTC---ACCCATAGGAG-----------TGTGCATCCCTGTGAACGGAATGTTTGTTACTACTCAGTCTTGTGTTCAGTTGGTGTTTTCTTTTGGGTGTAAAGTTAGCAT-------------ATGCCATCCCTGTTCACTCTGA-CCAGA-----------------TGGTTTACCAACTTCTAGGTAGGTGCAGGTGCCATTGGCTGTGAGCTGCTCAAGAACTTTGCCATGATTGGCCTCGGCTGTGGGGAGGATGGAGAAATCACAGTTACAGACATGGACACCATTGAGAAGTCAAACCTGAACAGGCAGTTTCTCTTCCGTCCCTGGGACATCACAGTGAGTAACATGG------------------------CATAGCTTTCTT---TCTCCTATTTGATTCTTTCCTAAA----TGGCTTAGATGTTTGtcccctcctctccactct-cctcacctcccattcccctctcct-------------cccttccTTTTTTTTTCCCTTTACTTCCCTCCTTTTTTTTTTTC s bosTau2.chr27 15972416 1804 + 31566707 CATTTTCCCTGTCTATCCTAGGTCCTTACACCTTTAGCATCTGTGACACCTCCAACTTCTCTGACTACATCCGCGGAGGCATCGTCAGCCAGGTCAAAGTACCCAAGAAGATCAGCTTTGTGAGTGTGAGGGGCGGTGGGCTGTGGGGGATGTGGGGGCTGGGGCTGGGTATCTCACGGTTCTCAATTCTTCTCTTCTGATTCTTTTTTTTTTTTTTCCTGATGCCCTGCTTCCCACAGAAATCCTTGCCAGCCTCCCTAGCAGAGCCTGACTTTGTGATGACAGACTTCGCCAAGTATTCCCGCCCTGCCCAGCTACACATTGGCTTCCAGGCCCTGCACCATTTCTGTGCTCAGCATGGCCGGTCCCCTCGGCCCCACAATGAGGTGCGTGTGGGTGAGCCAAGCCAGGGCAGATGACCTTAGCACTGCAGGCCTGTTCTGCCCCTCTGTCTACACCTCTCACCCCCGACACAGTGACCTAACAAGCGTGCTCTTGGTTCCTTTGGCCCCACTAGGAGGATGCAGCAGAGCTGGTGACCATAGCCCAGGCTGTGAACGCTCGATCCCTGCCCGCAGTGCAGCAGGGCAGCCTGGATGAGGACCTCATCCGGAAGCTAGCATATGTGGCTGCTGGGGACCTGGCTCCCATAAATGCCTTCATTGGGGGCCTTGCTGCCCAGGAGGTCATGAAGGTCAGCGTAGGTGGAAAAGGGCAGGGTTGGGGTAGGCCAGGCGCCTACCTGCCTCTATCACTTGTCCCATCTGCATGAGGCCCCAGGTAAGCACTGACTACTTCCCCTCTCCTGTCCATTCTCCAGGCTTGCTCTGGGAAGTTTATGCCCATCATGCAGTGGCTGTACTTTGATGCCCTTGAGTGTCTCCCTGAGGACAAAGAGGCCCTCACAGAGGACAAGTGCCTCCCGGTATGTGAGTAGGGCCCTGGGGGAGGTGACATAGGTGGCATTTCTGGTGAGGCTGCTCTCTGACCTTTCTCCCTTTGCATTCCT-----CAGCGCCAGAACCGTTATGATGGGCAGGTAGCTGTATTTGGCTCAGACCTGCAGGAGAGGTTGGGCAAGCAGAAGTACTTCCTGGTGAGTGATCTGCTGGGACACCTGCTTCCTTCATATCCCCTGGCCTCTGGCTACCTGTTT--ATGGGGTCTCTTGCCACCTGA---------GGGAGTGTCTTTTGGTTCTT-GTATCTGTATCACATGACTTGTGCCCCCTTTTTTTTTTTTTATCTTGGGAAAGCCT--AGTATGTCCTTCTGTTTCCCCCATCTGTGCCTCTGCCCTCAGATGACTAGGTTATTTTCACAGTCGTGGCACTTAAAGATGTGGCACTAGACACCCCT-------CTTGCTGTTTTCTGGGGAGTGAGAGTATAGAGTGATGAGTGACTTCATGCTGACCTGCATCACCCTGACCCAGACTCTCTGTGTCTTTTCTTGGTT----GTCTTCTAGGTGGGCGCAGGGGCCATTGGCTGTGAACTGCTCAAGAACTTTGCCATGATTGGGCTGGGCTGTGCAGAAGATGGAGAAATTGTTGTCACAGACATGGACACCATTGAGAAGTCAAATTTGAACAGACAGTTTCTGTTCCGGCCCTGGGATGTCACTGTGAGTGTGATGGGGGATGGAGGTGGTACTTTGTCATCTTGTTTTTCTCTTGTCTTTTGTTCCCATTCTTCCTAGAAAGGGGGCTTTACTGCCTTTTTCTTTGCTTCAGCTCTCCCTCAGTTTCTGTCACTCGTTCACTGAACGCTGAGTACCCTTCCATTGAATCCACCGTTTTTCATCTCCTGTTTTCTTTTC a score=2097 s mm7.chrY_random 30089169 71 + 30114534 GACTCAATCT----GTCTGTG----------GTTTTATTCGGG-----------TTACTCTGGATGTCATTAATTGAAAGTAGAGTAGTTGTTGGG s bosTau2.chr27 15975294 96 + 31566707 gactcaAACTTCTTGTCTGTATGCTAAGATTGTTTTGTTTGGGGGAAATGTTCCCCAGCCTAGGTGCCATTACCTGAAAGAACAGTGGATGTTGGG a score=27399 s mm7.chrY_random 30089619 725 + 30114534 GAGCCTGGTTGACTTTGAGCCTTGTTCTGCCCTTTATGAGATAAATC--------GTGGGATATCTCTACAGACTTT-----GTTGCATCAGTATGTGGGAAAC--AGCTCTGTT------TTTCATATTCCCACCC-----AGAAATTAAAGTCTGAGACTGCTGCTGCAGCAGTGCGTGACATAAATCCACACATCAGGATATTCAGCCACCAGAATCGAGTAGGCCCAGAGACAGAACACGTCTATGATGATGAC---TTCTTCCAAAAGCTGGATGGTGTGGCCAATGCCCTAGACAATGTGGATGCTCGTAAGTTTGGAGTTGAGTGAGGAGGGCAAGATCAGGGTAGAGTGTATGAGGTTCTTGTGTTCCTGTCTTGCCttggtttttcgagacagggtttctctgtgtactctcggctgtcctgtaactcactctgtagaccaagctgacctGTGTTCCTGTCTTATGTAAGCTTGCGTGCTACTCATCTGCCATT-TCTTCCCATCTCCCTGAAGGATTATACGTGGACCGCCGTTGTGTTTACTATCGTAAGCCTCTGCTGGAATCAGGCACGCTGGGCACCAAGGGCAACGTGCAGGTGGTTGTTCCCTTCTTGACAGAATCTTACAGCTCAAGCCAGGACCCACCTGAGAAATCCATCCCCATCTGCACACTGAAGAACTTCCCTAATGCCATTGAGCACACCGTGCAGGTGATCAACCTTGGGAGGAATGGGAGGTGGAAGGG s bosTau2.chr27 15975526 677 + 31566707 GAGCTTCCTGAACTCAGGGCCTAGTTCTTCGCAGCATTAAATATGTCAACCTTCAGGAGGACAGCTCTGTAGGGGTTCTCTGGCTGCAC----ACATGAATAACTGAGTTTTGTTCCCCCATTCCCCACTCTCACCTCCCCTAGAAATTAAAGTCTGACACAGCTGCTGCAGCTGTGCGCCAGATGAATCCTCATATCCGAGTGACAAGCCACCAGAACCGTGTAGGTCCTGACACTGAGCGCATCTATGATGATGATGATTTCTTCCAAAACCTGGATGGTGTAACCAATGCCCTGGATAATGTGGATGCCCGTGAGTTTGGAGGCGGGTGAGGAGG------TCAGGGGCCAATGCGTGCG---CACGTGTGTGTGTATG--------TTTTGGAG---GTGTCTGTCTTCCTGCCTCCTAATGTTCTGT---------------------------------------------------CTTGCCACTCATGTTATGTTGTGACCCCACCCCCC---AGGCATGTACATGGACCGCCGCTGCGTGTACTACCGTAAGCCACTGCTGGAGTCGGGCACACTGGGCACCAAGGGCAACGTGCAGGTGGTGATCCCCTTCCTAACAGAATCTTACAGCTCCAGCCAGGACCCGCCTGAAAAGTCCATCCCCATCTGCACACTGAAGAACTTCCCCAATGCCATCGAGCACACCCTGCAGGTGATCAGCATTGGTGGGAGAGAGCAGGGAACAGG a score=24427 s mm7.chrY_random 30092124 1098 + 30114534 CTTCACCCAGAACAG-----TCTTTACTAAAGGGTTGTCTCACTAAGAACTTTTTTTGTGT--------GTTTGTTTGTTTGGCCTTTGCTGACATGCATTTGTTTGCTCTGTCTGTAGTGGGCTCGGGATGAGTTTGAAGGGCTCTTCAAGCAGTCAGCTGAAAATGTTAACCAATACCTCACGTAAGTAAC-AGACAAACCAACAGCCAACAGAA-ACCAATCAACAAAGGCGTCCT-------TCTCTGCTCGCTTCAATGCACATCCTCGGTAGATGCTTTGGAT-AATTAATGGTTGA---TTGAGCCTCATGCTGGTGGTAgatgatgatgatgatgatgatgGGAAGTGGTCAGCATTGACATTTTCCCTGGAGAAAGAAGGCTTGCCCAGAAACCTTACTTCT-AGGCCTCTGAAGTAATCCAGGTCTTTGTATT-----------GGATAGGGACCCCAAGTTCATGGAGCGGACACTGCAGCTAGCCGGCACCCAGCCTTTGGAAGTACTGGAGGCCATACACTGCAGCCTGGTCCTGCAGAGGCCACAGACTTGGGCCGACTGTGTGACTTGGGCCTACCAGCACTGGCACACCCAGTATTCTCACAACATCCAGCAGTTGCTGCACAACTTCCCTCCAGCACAGGTATTACATACTTTGTGGATGTATTTGGCTGA--GCAGATTTCCAGGAAATTGGAATCTTACTGTCCTCTGTCTAGACATGGCTTCGTCCAGG---CAGTCTAGCTGCCACAGGCACCACAAGGCAAGCTGTAGGCCAGTACTTGGTGCAAGC---ATTTGTGTTTTCCTTCTTCTGTCAGCCAGGCAAG--------TTTCTTAGTTTCCTTCCCAGCTGCACCTGTGGGCTGAGTCACAGCTGAGTTCCCTTTGAGGGCTGTAG---TTGCAAGTGAGAAATTTTATAGTTAAGCATACAGTGATCCA--AGTGGTTCAAGTCCCAGCTGTGTTTGACACTGGGTCCTGT--CATGCCTAATGTCTTGGTAAG---CCATATTTGTGAAGTAGGTATGATAATGG----CTTATGGGCATT-TAGAAAGGACTAACTTGCATTTCTTATTATTGACTCATATACA----TTGGTAAGTT----GAACTTGCCG---TGTGTTTGGCTCATTGTGAATTTC s bosTau2.chr27 15978335 1119 + 31566707 CTTCTCCCAGAGCAGCTATGTTCTTCCCATTGGATTTGTTCACTGATGGTGTTTCTAACGCTTCCAGAAGTCCGTTTTGTCCACCATTGCCCCCTGTAATCTGTTTG-----TCTGTAGTGGGCTAGAGATGAGTTCGAAGGCCTCTTCAAGCAGCCGGCAGAAAACGTCAACCAATACCTCACGTAAGTAACCAAATGTCCCCTCAGCCCACCCCCTGCCTGCCAGTCAAGGCATCCTGGCTGCTTTCCTCATTGCTGTGACACCCAGCACAGGCACACTTCTCAAATGAATCTGTGAATGAAGCTTGAGCCTCATTCCATTGGC-----------------------------GGTCAGGATTAGC--TTTCTCTGGAGAAAGTGAGGTTGCCCTGGAGCCC-ACTCCTGAGGCCGCTGT-GTAATCCTGCCCCTTTGACTCCCCCAATTCCTGATAGAGACCCCAAGTTTGTGGAGCGGACCTTGCGACTGGCGGGCACTCAACCCCTGGAGGTGCTGGAGGCCGTGCAGCGTAGTCTCGTGCTGCAGCGGCCACAGACCTGGGCTGACTGTGTGACCTGGGCCTGCCACCACTGGCACACGCAGTACTCTAACAATATCCGGCAGCTGCTACACAACTTCCCTCCTGATCAGGTAATGCCCACTTGCCAGGTCCACTTGGCAGAATGCTTTTTTTCCGTAA--TGGGAGCCTGCTGTGAGTTCTC------TGGCTCCTCCTGGGGATTATTCCAGCTGTGGCACATGCCCCAAGGTGTGGGGAGTCTCAGAAAAATGATTAAACTTGACCTTTTTTTGCCATCCCCTTTCCTTCTAGCAAGAGACTTTCATTTTTATTTCCCTT---------ACCTGTGAGGTGGGC--TGACTCATCCACCTCCTAGGACTGTAGCGATCATAGAGGAGAAATCTTcgagttaagagctcaggaaatcagtgggggttcaactccaagcaccatttg-cacttgggcaagtcacatagcttctctctacttcagtttccttgtcagtaaagtagaggtggtaataattacctcatgagggttcttgtgaggatttcttggtatttgttaatattaactca-gtacagtacctggcaggtcataagagtttgttaaGCTGTGTCTTGCACAGAGTGAGTGCC a score=18373 s mm7.chrY_random 30093222 508 + 30114534 CCAAGAATGGTGAA----------CCTAGGCTTCT--------------TGGCCTGAGAGTGCTTCTCCCTCGG----TGCTGTTCATATCTTTCTC-------TTAGCTTACGAGCTCTGGAGCACTTTTTTGGTCAGGACCAAAACGCTGTCCACATCCTCTCACCTTTGACATAAACAATGTAAGT---GTCCTTGGGATCTCCCAG-------------GTTGGTGTGTGGGGAGTGGGTCTCTCTACTCTTAACCTGTGGTTGTTAAGCTGACTTTCCTTTGCCATGCCATTCTTTCAGCCCCTGCATCTGGATTATGTGATGGCTGCTGCCAACCTGTTTGCTCAGACATACGGACTAGGAGGGTCCCAGGACTGTGCTGTGGTGGCCAAACTCCTGCAGTCTCTGCCAGTCCCCAAGTTTGCTCCCAAGTCTGGCATCAGGATCCATGTTTCTGAGCAGGAGCTGCAGAGTACCAGTGCCACCACCATTGGTGAGAATGCTTCACCATTCGTTCAGGGATCATCTGTGTTCTTTCCCACTCTGCCTTTCCTC s bosTau2.chr27 15979568 545 + 31566707 CCAGGGCTAGTGAATAGGGCATACCCAAGGCCCAGGTGAGAAGTTAGGATTGCTGGAGAG-GCTCCAGTTTTAGATCCTGCTCCTCAAAAATCTCTCCACTTCTTTAGCTCACAAGCTCAGGAGCTCCATTCTGGTCTGGGCCCAAACGCTGTCCACACCCACTCACCTTTGATGTCAGCAATGTAAGTCTCCTCCTTGGGGTCTCCTAGGGTCAAGTGGAGAGTGGGTGGGAGGGAAGGAGGCCGAGACGC-CCCAGGTGAGGGCAGACGTGCTCACCCTTCTGGGCCCTGCC-TTCTCCCAGCCCCTCCATCTGGACTACGTGATAGCTGCTGCCAACCTGTTCGCCCAGACCTACGGGCTGACAGGCTCTCAGGACCGAGCTGCTGTGGCCACACTCCTACAGTCTGTGCAGGTCCCCGAGTTCACCCCCAAGTCTGGAGTCAAGATCCATGTCTCTGACCAGGAGCTGCAGAGCGCCAATG---CCTCTGTGGGTGAGGATGTTTGGCCCCTCTGCCAGGAGTTA--------CTGCCCCACTGGTCCTCTGCCC a score=9157 s mm7.chrY_random 30095034 266 + 30114534 ggcGCCTCTCCCTTTCAAATGCTTT---TACATAAACTCCACTTCCCAGTCCAGATTTCACCTTGGGCAGTACAATGGGTTCACCAGAGACCATGGTGTCCTTTGCTTTCTGCAGATGACAGCCACCTGGAGGAACTCAAGACTGCACTTCCTACTCCAGACAAGCTGCTTGGATTCAAGATGTACCCCATTGACTTTGAGAAGGTATTTGGTGTGGG-----GAAGCTGGGGTGGTTAGGATG---GCAGGCGCAGGTGCCTAGCATAGGCTTTTG s bosTau2.chr27 15981086 276 + 31566707 GATGTCTTTCCTTTTCAAATCCTTTGTTTCCCTAAACACCTTTTGCCCCACTTGTTTCTACCTCAGACCCTGGCCTTGGGTCTAAAGCGTTGATGGTGTCCCTCTCTCCCTGCAGATGACAGCCGTCTGGAAGAGCTCAAGGCTACACTGCCCAGTCCCGAAAAGCTCCCTGGGTTCAAGATGTACCCTATCGACTTTGAGAAGGTGCTGGCTGGGGGCCCCAGCAGGCAGTGGGGATGGGATAAACATAGGTG-GGATGGACAGAACAGGCTTCTG a score=5208 s mm7.chrY_random 30097384 115 + 30114534 GTAGGTCTTGGTAATTGCATTAGATTGGCCTTGGTGACATTGCCCAAGATGGTAGTGCAGCCTGTGGTGCTATGTTACC---TCTCAGTGCTGGTCATCAAAAGGAGCTTCTTGGGTA s bosTau2.chr21 25551956 118 - 49724630 GTAGATCTTGGAAATGGCATCGAAGTGGCTTCGGTGAAGTTGCCCAGGGTGGTGGTGCAGCCCTCAGCAGAAGGGTAGCAGTTTTCAATTCTGGCCATCAGCAGTAGCTTCTTGGGCA a score=19782 s mm7.chrY_random 30102887 483 + 30114534 CTCTCTTAATTCTCCACTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAAACAAAACAGGATGACGACAGCAACTTTCACATGGATTTCATTGTGGCAGCATCCAACCTCCGAGCAGAAAACTATGGCATTTCCCCAGCAGACCGGCATAAGGTAATAGGAGTCTGTGATGTACGACTGACCCTTGCCCAAACTG-ATTTTCCTTCATTTGGGCC-TTCTGTAGACCC--------CTACTTCC-----TCCTATACAGTAATCCCTGGTGGTCACTGTCTTACAGAGCAAACTGATTGCAGGCAAGATCATCCCAGCCATTGCAACCACCACATCTGCTATAGTTGGCCTTGTGTGTCTGGAGCTGTACAAGGTGGTTCAGGGCCACCAACAACTGGAGTCTTATAAAAACAGTTTTATCAACTTGGCTCTGCCTTTGTTTAGCTTTTCTGCACCTCTGGCTCCAGAGTGTCATCAGGTATGGGACCTGCAAGAATAGGAAATG s bosTau2.chr27 15981552 462 + 31566707 CTCCCTTAACCTCTCACTCCTAAAA--------------------------GGATGATGACACCAACTTCCATATGGATTTCATCGTGGCCGCATCCAACCTCCGGGCAGAGAACTATGACATTCCCCCTGCAGACCGGCACAAGGTGAGGCAAACCCAGACCCAACGTTCCACCCCCTCCCGGGCTGGATTTGCCCACATTTCATCCCTTCTTTAGACTCAGCCTCTTCTACTCTCAACTTCCATCTTCCTTGATCCTTTG------CTGCCTCACAGAGCAAGCTGATTGCAGGAAAGATCATCCCAGCCATTGCCACAACCACAGCAGCCGTGGTTGGCCTTGTGTGTTTAGAGCTGTACAAGGTGGTGCAGGGGCACCGACAGCTCAACTCCTACAAGAATGGTTTCCTTAACTTGGCCCTGCCCTTTTTTGGCTTCTCCGAGCCCCTCGCAGCACCTCGTCACCAGGTGAGGGTCT----ATATTAGGAAGTG a score=24310 s mm7.chrY_random 30103893 757 + 30114534 AGTACTATGATCAAGAGTGGACACTGTGGGATCGCTTTGATGTGCAAGGACTGCAACCTAGCGGTGAGGAGATGACCTTGAAGCAGTTTCTAGACTACTTTAAGGT-AGGGCTCCTTCGTCTGTGAACTTCGCCT----TTGTGGGGTCTTGCCCACTTGATTTAGCAGCAATGTCCATCTCACAGTCATCACTCCTGTCTCTTCTAACCTCTGCAGACAGAGCACAAGCTGGAAGTCATCATGCTGTCCCAGGGTGTGTCCATGCTCTATTCTGTCTTTATGCCAGCCAGCAAGCTCAAAGAACGGTTGGATCAGCCGTGAGTTAGCCTCTGGGCTGATGGGAGTGGAAGCCTTGGATGGGATTCTCAACAACCCAGTGTGGTTCCCCATTCTTTTTCTACAATCTGCTGCCACCTTTAATTCTATGTTTGTTTGCTTCCTTCTTAAGTCTCCTGCTCTTTGATTTCAGGATGACAGAGATTGTGAGCTGTGTGTCAAAGCAAAAACTGGGCCATCATGTGAAGTCACTTGTGTTTGAGCTGTGCTGCAACAGTGACAGTGGAGACGACATAGAGGTTCCTTATGTACGATACATCATCCGCTGATC----TCTT---------ACTGACTCCG-----TTCTTTCAGATCTCTCAGTCTATATCAAAACC---------TTTCTAGTTATG--------AGGAAACCTCAGTTTGAACCTCCTTGTTCCTAAGAACTTTTTAGTGCTG-TTTTTACATTGTTAAGAACTGAAATTCATAATAATAAATTTTCAGCC s bosTau2.chr27 15982904 751 + 31566707 AGTACTATAACCAAGAGTGGACGTTGTGGGATCGCTTTGAGGTACAGGGTTTGCAGCCTAACGGTGAGGAGATGACCCTCAAACAGTTCCTCGACTACTTCAAGGTGAGAGCCCTTTC-----TGACTCTCACCCCACCTGGGGGTGGCATGTGCAGGTGACTGACTGGCC-TGTCCACCCC---TGTAACACTGCTGTCCTCCCCCTCTTC--CAGACAGAACATAAGTTGGAGATCACTATGCTGTCCCAGGGCGTGTCTATGCTCTACTCTTTCTTCATGCCAGCCGCCAAGCTCAAGGAACGATTGGATCAGCCGTGAGTT--------GGGTGGTGGG------------------GAGCCTCAACTTGCAGCTGT-----CCCACTGCTGCTC-ACTGCCCCCAGCTACCTGCCTCTTCTCACTTACCTTTTGCCTTCCTGACCCTCTGCTCCCTTGTCCCCAGGATGACCGAGATTGTAAGCCGTGTGTCGAAACGAAAGCTTGGCCGCCATGTGCGAGCACTGGTGCTTGAGCTGTGCTGTAACGATGAGAGCGGCGAGGATGTTGAGGTCCCCTATGTACGATACACCATCCGCTGATCCGTGTCCTCTCCTGTAGACTGACCCCAGATCCCCTCTCCAGATCCCT---TCCATCCCAGGGCTCCCATTTGACCTCTGGCAGTGGCCCAGCTAGCCAGGCTTGGTGTTCTCATCCCCCTACCTGAACTCCTCTTGCCGCTGCTTTCTACCTTGTTCGGAACCT-GACTCCTAATAAAGAATTGTTAACC