##maf version=1 a score=92939 s mm7.chr5_random 1989 1642 + 11523536 ACAATGATGTCCTTCACTTTCTATCAGTACAATGGGAAGGTCTACCTTTAAAAAAAAA---AAAAAAGCTG----TGTGTAGCAAAGAAATAAAATTTGCAATGTGCTGTAGTGAAATGATACT-----GGAGTCGAAAGTGCAGGAATGAAACGAAAATCATTGTT---TGCTACAAAAAT-TAAGATTTTTCCCCAAAGATGGCAGCAGGTTCTC----------------------------------------------------------------------------------------------ACAGCTTG----------GCTATTTTAAGGCCACCTGCATTTCCACAGCGGCCTCCTCAATCTAAGATCTCAATTCAGCACCCCAC------GCCCTGGCTGTTGACGGTAGTGCATCACCAGAGAGTGAGCAAAAACAAAGAAAG----------TGAGCTCAAGATGAACTCCTTGCCGGGTTCCCCACTCACACTCTTCCTT-TCTCTTTTGCAGGTTTCCACCAGCTGTGGATGCCTTTGACATTATGACTGCTGAAGATTCCGCCACAGCCATGAACAGCGATCCAACAGTGGGGTCCTCCACCAAGGTACCGGAGGGTGTGGCGGGCGCGCCCAATGAGGCTGCACTGTTGGCACTGATAGAGCGCACCGGCTACACCATGGTACAAGAGAACGGGCAGCGCAAGTACGGTGGACCCCCGCCCGGCTGGGAGGGCCCGCATCCCCAGCGTGGCTGTGAGGTCTTCGTGGGCAAGATCCCACGTGACGTGTATGAAGATGAGCTGGTGCCTGTGTTTGAGACCGTAGGTCGCATCTATGAGCTGCGACTCATGATGGATTTCGATGGCAAGAACCGCGGCTATGCCTTCGTGATGTACTGCCACAAGCATGAGGCCAAGCGAGCCGTTCGGGAACTCAACAACTACGAGATCCGCCCCGGCCGTCTGCTGGGTGTGTGCTGTAGTGTGGACAACTGCCGCCTCTTCATTGGTGGCATCCCCAAGATGAAGAAGCGCGGGGAGATCCTGGAGGAGATCGCCAAGGTCACCGAGGGCGTACTCAACGTGATTGTGTATGCCAGTGCGGCAGACAAGATGAAAAACCGAGGCTTCGCCTTTGTGGAGTATGAGAGCCATCGTGCTGCAGCCATGGCACGCCGCAAGCTCATGCCGGGTCGGATCCAACTGTGGGGCCACCAGATTGCTGTGGACTGGGCCGAGCCAGAGATTGACGTGGACGAAGATGTGATGCAGACAGTGAAGATCCTCTACGTGCGCAACCTCATGATCGAGACCACCGAGGAGACCATCAAGAAGAGCTTTGGCCAGTTCAACCCAGGCTGCGTGGAAAGGGTCAAGAAGATCCGTGACTACGCCTTCGTGCACTTCACTAGCCGTGAGGATGCTGTGCATGCTATGAACAACCTCAACGGCACAGAGCTGGAGGGATCCTGCTTAGAAGTCACGCTGGCCAAGCCCGTGGACAAGGAACAGTACTCCCGCTACCAGAAGGCAGCCAAGGGTGGTGGTGGCTCGGCTGAG---GCCGTAGCGCAGCAACCCAGCTACGTGTACTCCTGTGACCCCTACACGTTGGCCTACTACGGCTACCCCTACAACGCTCTCATCGGGCCCAACCGGGACTACTTCGTGAAAAGTTAGTGGAGAGTCTTCTCTTGAGGCCCCCGTGGGTGTCCAGCCCCCTAGACAAGGGTGTTAGATTGA-GC-------------GTGGCTACAATTTATTAAGC s bosTau2.chr6 38370823 1770 - 69624268 ACACTGCCCTCTTTCCATTCCTA-------AATGAAAAAGCGT--CTTTAAAAAGAAAGCAAAGAAAGCAGACTTTGTCTGCCAAAGAAATAAAGGGGGTAAAATACTATAACTAAAAGGAAATCAATCTGAGTTGACAGTGCAGGAATTAAGCAAAAGATGTTGCCAACTGCCTCAGGAACGTGAGATTTGCACCCACAG-TGACAGCAGGTTCTCTATGCTTCAAAGCTGTTGGGGGTACTGATTAGGCGGAAGTACCTGCTCCTTCTGATTTTTTTTTTCCTGAGTCACTTCTGGTTTTTCCTGCAAAACAACTTGCCTAATTTAGACTATTTTAGAGCTGCC-GCTCATCCAGAGAAGTCCCC---ATCTTATTTCTCATTTAACCACCCAATAATTAAGCGTGAGTCTTGGATGGCTTTAAGAAAAAAAAAAGAGGAGAAAAAGAAGGAAAAAAATTGTAGTTAAGTTGTGGCTCAACTTGGTGT-AGATTCTAGGCTCATCCTCTCTCTCCTGCCTTCCCCAGGTCTCCACCGGCCGTGGATGCCTTTGACATTATGACCGCAGAGGATTCCACCGCAGCCATGAGCAGCGACTCCGCCACAGGGTCCTCTGCCAAGGTGCCCGAGGGCGTGGCGGGCGCGCCCAATGAGGCGGCGCTGCTGGCGCTGATGGAGCGCACGGGCTACAGCATGGTGCAGGAGAATGGGCAGCGCAAGTACGGTGGCCCGCCGCCCGGCTGGGAGGGCCCACACCCGCAGCGCGGCTGCGAGGTCTTCGTGGGCAAGATCCCCCGCGATGTGTACGAGGACGAGCTGGTGCCAGTGTTCGAGACGGTGGGCCGCATCTACGAGCTGCGCCTCATGATGGACTTCGATGGCAAGAACCGCGGCTACGCCTTCGTCATGTACTGCCACAAGAACGAGGCCAAGCGCGCCGTGCGCGAGCTCAACAACTATGAGATCCGCCCCGGACGCCTGCTGGGCGTGTGCTGCAGCGTCGACAACTGCCGCCTCTTCATCGGGGGCATCCCCAAGATGAAGAAGCGCGAGGAGATCCTGGAGGAGATCGCCAAGGTCACAGAGGGCGTGCTCGACGTGATCGTCTACGCCAGCGCGGCCGACAAGATGAAGAATCGCGGCTTCGCCTTCGTGGAGTACGAGAGCCACCGCGCCGCCGCCATGGCGCGCCGCAAGCTCATGCCCGGCCGCATCCAGCTGTGGGGCCACCAGATCGCTGTGGACTGGGCCGAGCCCGAGATCGACGTGGACGAGGATGTGATGGAGACCGTGAAGATCCTCTACGTGCGGAACCTCATGATCGAGACCACCGAGGACACCATCAAGAAGAGCTTCGGCCAGTTCAACCCGGGCTGCGTGGAGCGCGTCAAGAAGATCCGCGACTACGCCTTCGTGCACTTCGCCAGCCGCGAGGACGCCGTGCACGCCATGAACAACCTCAACGGCACCGAGCTGGAGGGCTCGTGCCTCGAGGTGACGCTGGCCAAGCCCGTGGACAAGGAGCAGTACTCCCGCTACCAGAAGGCAGCCAAGGGTGGCGGCG---CAGCCGAGGCAGCAGTGGTGCAGCAGCCCAGCTACGTGTATTCCTGTGACCCCTACACGCTAGCCTACTATGGCTACCCCTACAACGCGCTCATCGGGCCCAACAGGGACTACTTCGTGAAAGGTTAGTGGGGGTTCCTCGCCTG-------CGTGGGTGG-GAGTCGGGGAGACGCATCTGCCAGATGGATGCCATTTGGGAGGTGGTGGCTGTCATTTACTGAGC a score=1118 s mm7.chr5_random 3755 165 + 11523536 CATGTAGAGCAGGCCTGCTTATCCCTTGGAGGTTATGTTATAATCCAATTCTCAGCcatgcctgcaatcccag---cattctaaagggtgaggctag-----aggattcctaatttgaggccagcctgggttacCACTTCTGAAGTTATA-TTTTAAGGTGTTGGTTAGCAAAG s bosTau2.chr6 38372703 133 - 69624268 CATGTGAAGCATGCAAGCTC------------TTGCGTTTTCTTGCGTTT-----------------TCCCAGGGCCTTTATCCAACGTGGGGCTAGACGGCAAGGTTCTTAGGTTAAAGCCTGCTTG------------TGAAATTAAACCTTTAGAATGTTGGGGAGTAGGG a score=31284 s mm7.chr5_random 4088 1437 + 11523536 gacagccagggctacacagagaaaccttgtgttgaaaaaccaaaaAAAAAAAAAAAAAAAACCCAAAAAAATAACATAGGTTCAAGGGCCCACGGTCCCTGTTCACTGGGTCTGCGTTAACATACTCTGCCTTTT-------------TTTTTCTTTTTAAGCATAAAATGAGGAAGGAAGATGGGCACCTCCTTTTCCAGATCTAACTTT---------TTTTAAACTCTAAA---ATTGAAGTTACAATTACAATCCTTGGAACTCACCT---------------TGAATGAAGTTGGCAGATTAGAATGTTAAAGAAGACCAAAATAGGTCGTCCGAAGCATCTTATGAGCCCACTAAAGGCCAGAATGGTGGCCACCTGCCACTTAGA--CAGAAGGCAAACTGAAG---------------------------CCCCTGGACTATCCCTGTCGCTGGCTCACCCTTTTGTGTGTTGTTATTTTAAAGCAGGCAGCATAAGAGGCCGAGGGAGAGGCGCAGCTGGAAACAGGACCCCAGGGCCCAGGGGTTCCTACCTCGGAGGATATTCCGCTGGCCGTGGTATATATAGCCGATATCACGAAGGCAAAGGCAAACAGCAGGAGAAAGGATATGAACTTGTGCCGAATTTGGAGATCTCTCCTGTCAATCCAGTTGCCATTAAACCTGGCACAGGTCAGTACAAACCAGAAC--AAACGCATCATTTGGTCTTAAACCCCA--CCCATCTCTTTCAAGTGAGTCCCAGTCTTCATGGCTCTTGGATCT-TATGTGGATTCATCTGCACTTGTG-----------TAAAAAAGAATCCCCACCCCCATCATGGCCTCATCTCTCTAGAATTTAGGGGAACAGTCTAGTTGGGCCCA-GGTCATGTTAGACTGTC----AGGGCGTCTTTCAGACGG-TGTCACCCGCCCGTCACTGGGCTATGTCTC-----TGTCTGTGACCTAGTAGGGAGA--GACGAGAGTGGGAAATAGTTAGAGAGGTATGAGACTC-TCTGACTCCCCTGTCATCTAGGACCTGCCTTTTCCTTTCGAGTGTAGATAAACGCCCATCACTGAGCTACAACCCAGCTGTGTGCCAGCCAGCAGAAAGCAGAGGGCACAGGGATTACCCATTTG-GAGAGAAAGT-AGAAACTTCTTTTCCAGAGCAAACAGTGC---------------CAGTTTT------CCAGA-----------TGAGACAACGGTGAAGGTATTTACAGCTGG----------------------ATTGTACAGTCCATAGATTTAGAATAGAGATGCTCGATCCTTTG-AGCCAAGGACCTTGAACTTTGATTTTACCACCAGCTTCCCACAAACTTATCTGTCAGCATTGTCG--GGTGGATTGTCACCTGGA--------------TGGTCACCCGCTGTGAGGAAGGATGAGAATCTGTAACTGGGTTTGAGTTTGG--CAAACCCATTGTCTGCGGATTCTCCAGGCGCTAACCTCTGAACCCATGGCGAATTCCTCCTGTGGATAACCAGAATGATTCTCTCCCTGGC---GTCTTGGCCTCACTCAGGGTAG s bosTau2.chr6 38372900 1501 - 69624268 gaaagcaggcattacactggaaaac------------------------------------------aaaat-acttgggttctgggtcctgccat-ctgattaactggctctgtg--actttagtcagccccttaaagctcccgaagcctgttttctcacgcctaaaatgaggaagatgaactagCAGTTCCCCTTCTACATCTAGTTTTGTGACCGTCTTAGAAAATTTTTATTTATTGGAGTGGCAGTTACAATCCTAGGAACTCACCCTTCAAGTTCATCTTGTGTACTAAGCAGACATCTTAGGATG-CATCTAGGCTGGAGCCAGAAAGTCTGAAGCATCTTCCGAGCTCACTAAAGAGCAGAGGTGTAGCCACCTGCAGCTTAGAGCCAGGACAGATACCGAAGTGCCAAGAACCTTGGGTTAAGATCCACCTCTTGTACTGTTGCTGTTGGTAGCTCATCATTTTTTGTGTTGTTATTAT-AAGCAGGCAGCATAAGAGGCCGGGGTCGAGGTGCAGCTGGCAACAGAGCCCCGGGCCCCAGGGGTTCCTACCTTGGGGGATATTCTGCTGGCCGTGGTATATATAGCCGATATCATGAAGGAAAAGGAAAACAGCAAGAAAAAGGATATGAACTTGTACCGAATTTGGAAATCTCTGCCGTCAATCCAGTTGCCATTAAGCCTGGTACAGGTCAGTATAAACCAGAGTGAGAATGCATTTATTCAGCCTGAACCCCAACTCTCTCTCTTTGAAGTGACTTC-------CTCGGCACTTTCATCTGTACATGGGTTCCTCTTCTCAAAGGCAGGCGGAGATTAGGCAAGGATTGTGGCCTCC----TGGGCCTTCTTATCTAGAACTT-GGGGGATGGTCTAATTTTGACCATGTTCAAGTCAAACTTTCTTATAGTGGGTTTCCCAAATGGCTGTCA----CCAGTTGTTAGACTTTttctcaattaggtaggttctcaattagggaggttGGGGCGAGGGGTGCGGGGGTAGAAAAATGTGAGGCTCTTCTATATCTTCTACCAGCTAACAGCTTTCTGTTCCTT----------------------------ACTCAAGCCTATTTTGACCCCAGTCATCAGAAGCCAGAAGGTGCAACTCTTTGCCAGTTGTGAGAGTTGTTGGGAAATTCCCCTTCAGGAGCAAATAACGCTGCTGTGCCTTGTCGTGGTCTTAACCAACCAGAACACCTGGGAGTAAGGCAGCAGAGAAACTTTCTGCAGCTAATTCCCAGCTCTCATTTCCGCCTCTTGCTGGATCAGTAGCTTGAGGGTAGGGGCACTCAAGTAGTTGAAGCCAAGGACCTTGAACTTTGCTTCCACCCTCCAGGCCCCACAAACCAGTTTTCCAACATTGTTAATGCTCGTCAGTCATCTGAGACAGGTCTTCTTTCTAATCCTAAGCTGCAGGGAGCTTTATTGAACTGCAC---AGTGTGAGCACGGCACAAACTCCTTATGTGCGCACACCACA----CAAGCACCCAAACACATGGGAAATTCCATC--------------ATGATACTCCTCCAGACCTTCTCCCAGTCTCATGGAGGGTAG a score=5303 s mm7.chr5_random 6095 220 + 11523536 TTTCTTCACCTTTGATCACATCCATCTTCGT-AGAAGAAATGTGCTTACAGTTGGAGAGAAAACACAAACGAAAGGACTCTTGGT-GTGTACGTTTCATGATCCGGCTTATCCTCTCAGCACACACAGCATGCACACACACAAGCTCCCCCAAACCGGGTCTAGCACCTCTT------------CCTTTGATCTCTTGATATCGCACATGGACGTTGGGTAACTCTATCTGTTT s bosTau2.chr6 38375548 227 - 69624268 TCTCTTTAACTTATATCAAATCAGCTTTTATTCGAAGAAAT-TACCTACAGTTGGAAAATAAAAATAAGTGAAAGTATACTTTGTTGTATGCATTTCAGTATTCTTACCATCCTCAAAACATGCA------GCACACACACAAACTCCCCCAAATCAGGGCTATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTCTttttacctctccttatcatacattggagaagggcatggcaacccactc a score=15726 s mm7.chr5_random 6423 754 + 11523536 CTACACACACACACACACACCCTGCTGCATCAGTAATACTAACATGACATACAAGGCAGGGATGATACACTCACATCTCTAAGCTGTCAGAATGATAC-CTCATTCA-ACCTGCTTCGTAATACATTGTGAACACGCAAA-GGGCATCGGTG---GTGGTGAGTAATGTCAGTGAGAATAAACAGA-----------------------------------GCTCACACT----------------------CACACGTGTGAGG--------------------------------------AAACGTCAGT---------------------GCAG---------------ACGCCTCACTGGAAATGCTCCTGCCGCAGGGCGCTGTGGAGAAACTCCATCCGATG------TGGCGCCGC---AGAGCCAAGCAGA----------------------------------------------GCAGTGGGAGTG--------TGCAGG---AGTGTAGGGCTGCTAACCTGGACTTTAAAACATAAGCAGCAAGCGAAGGAACCTCCTCAGG-----GGTAGTGATTAATGCGCCTGTCTCACGTGCTTCTCTTACAGTGGCCATCCCTGCCATCGGTGCTCAGTACTCCATGTTCCAGGCAGCCCCAGCCCCGAAAATAATCGAAGATGGCAAGATCCACACAATGGAACACATGATCAGCCCCATTGCGGTGCAGCCTGACCCCGCCActgctgctgccgctgcagccgctgcagccgctgctgccgTCATTCCTGCGGTATCCACACCGCCACCTTTCCAGGTAAAGTTCTTGGCATGGCGGGGAATTTATATTTGGAGCCCCCTCAGAGGTCTTTCTGTGGCTGCTATCATTTATCTATGGAGCCTCTCTCAATCATAGACTCAATTAGTATTC------AACACTGAGACTATACTTGG s bosTau2.chr6 38375940 888 - 69624268 CTTTATTCACAGAAACATGTCTT--TGCATTGG------------------CAGGTCGGGGAGGATATACACTGACCTCTGAGTTCTCAGAATGAAACTCTCAATAGCACCTGCTCTTTAAAACGTGGTGAAAGTGAAAAAGGGCAGTGGGGCAGGTACTGAGTAAGATAGGTAATAAGGAACTGGCAGGCTCTTCTCACACTCTTGGGCCTCAACCCTCTGCTCTCACTTCTTATTCTGATCCTGTTTTCTCAAAATTGCAAGGCCCTTTCTTGCTTTGTAGGACCTCAAGAATACGAGTCTAAACGCTATTCTGTTCTAAATTCTGTTAGCAGCAGTAGAAAATGTGGGCAAAACTTAACTGTAGGCTTGCGTACCCTGAGGATCCGTGGGGAGATCCCACCCATTGCCCACATGGTTCCTTTTGAAAGTCCAGCGGGATATAGGGTACCTCCACCTCCCCTCTCTTCCTCTTGGGTAGCACCTGTAGTGAGAGAGCATTCGTTTGCAGGCAGAGCCCCTGGCTGCTAAACTTGTTTTTAAAA-GTATTGAGGAAGTGATGGCGCTTCCCTCAGTGCCTGGAAGTGACTGACCTGTGTTTCCCTTTTCCTTCTTTTGCAGTGGCCATCCCTGCCATCGGCGCCCAATATTCCATGTTTCAGGCAGCTCCGGCCCCTAAAATGATTGAAGATGGTAAAATCCACACAATGGAGCACATGATCAGCCCCATCGCTGTGCAGCCCGACCCAgccagtgct------gctgcggccgccgcagccgccgctgccgtcatccctgccgtgtccacgccaccgccTTTCCAGGTAGGCTTCTTGCTGCGGTG-----TTTGTGT--------------GAGGTC---------------TCATGT-------------------ATCACAGATTCACTTAATACTCTGCAGGAGCACTGACACTGTGCCTGG a score=2419 s mm7.chr5_random 8921 45 + 11523536 GAAGTTCTTTTGAACATAGTTTCGGGAGTCCAGTTTATAGATTTT s bosTau2.chr6 38379507 44 - 69624268 GAAGTTCTTT-GAACATAATTTTGTGACTCTAATTTGGAGATTTT a score=2395 s mm7.chr5_random 9561 321 + 11523536 ataaataaatcttttttaaaaaagaaagaaaGGAAAGGAAAAACATCCTATGAAAACCTTGCCTTTTAAATGTAGTTTTCCATTTTGTATATTCTAAGTTACTTATTCTGAAG----TT------AGAGTAAGGTGCAGAAAAGATAGCAGCATTTAGTTGCAATACTTTTATTCCTTATGTGGTGTTTTA----------TTTTTGCCCCAAAAC------CAAAACTAAATTCGTGGT-----TCTTAGAGATATGTTGACCCTTACAGTCTTGCCCTGTCCCTTTCTCTCCCCCCCCCCCCGCACCGCGCCCCAACTTGGTATGCTTCACTTTCAAACAGAAAGGGGGA s bosTau2.chr6 38379563 288 - 69624268 ATAAGTAATTCCTTTATAAAACCCA-------GGAAGAAATAATTTC-----------------TTTAAATCTACTTCTCCCTTTTGCATATCCTGAACTATTTGTACCATAGGGCATTCTATGAAACATAAGGTACACAAGA--------TGTTTTGTTA-AATAAAT-------GTATGTTTTGTTTTACCAAAAATCTCCTTTTCCCTTAAGCAGTCCACAGAATGAACTCCGTAGCAAACATTTTGGAAA-ATACTGAACC--ACAGTCTT-CCTTGTCTACTTGT-----------TCTGAA---------AATGTAGTATATTTCACTCTCAAGTGGAGGGAAGGA a score=2113 s mm7.chr5_random 9927 68 + 11523536 CCCCTCATTACCTCTCTTTGTGGCTTTAACTAACCGAATAGAATGGCCAATCAAAGATTCCACTGTAT s bosTau2.chr6 38380553 68 - 69624268 CCCATCTCTAGCTCGCTCTGGTACATAGGCTGATTGAGTAGAATGGTGGGCAGAAGATTCCAGAGTAT a score=109776 s mm7.chr5_random 10227 3218 + 11523536 CTCTCAGGGCCGTCCAATAACTCCTGTGTACACCGTGGCACCAAATGTTCAGAGAATCCCCACCGCCGGCATCTACGGGGCCAGCTACGTCCCCTTTGCTGCTCCCGCCACTGCCACAATCGCCACACTACAGAAGAACGCCGCGGCTGCCG------TGTATGGGGGCTACGCCGGCTACATACCTCAGGCCTTCC---CCGCTGCTCTCCAGGTGCCCATCCACGACGTCTACCAGACTTACTGAGAACGGGGGACCGGAGCCAAGGCAAGCCACCAAACCCCGCTGAAGGAACACTTTATTATTTATGAAGAAAGAACGTGTCGGGTTGGTACACGTGCAAAACCTGCAGGTGAAGAAGAATGTTATCAAATAGCACACTGAAATATTTTATTATATCCATGAAGTTTTCACTCGCtttttttttttttttttttttttttGAAAATGACTTTTCAACTTAGCAGGCCCGCGTTCATACATTTCTAAAAGACTTGCGACGCCTCACGCCTT-AATGCCATCTCTT-AAAGTTTGTATGCTCTTCTGCTTTTGTACAGAGGTTTGGTTTTTTGT-TTTTTAAGGATATATTTTCAG-TATGAAGGTTATTTTCTTAACTTCTGCACTCCAGAGTTTTCTATTTTGTAGAACCTTTCAAAGTATATCAGCTATATGTATGTATATCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGCACACCCGCGCATCTAGGGAACTATTTTGAAAACTATATTCAATATTTAAAGACACAAACTGTAGTGCTCT-GAAATACTACATAAAACATTATTTTATTTTTTAAAGTGATGCTGGAAAGTGCAATTTTAAAATGAGGAAAAAAAAAGTCTCTACTGTATTTCCACTGGCATTAAGGGTTGACGATAATGCCATTTATTCTTGTCATGTTTTCTGGGTTTATGGGGTTTTGGTTTGGTTTGGGGTttttgttgttgttgttgttttgttttgttttTAATAACACT----CTGTTCTTAA-GCCAACATGGAAAAGACTCCTCACA-TCCAGAGTCCCAACACTGGAAAGCTCTG--ACCTGCCCTCACTACCTTGGGCTCTCTCTCCT-------GAGTCCTTA---GTAACTGTgccccgcccccgccccgccgtgccccgc------------cccgcccTTCTCCTTCCCTAGCTCCA-GTGCAACTTTGGCATATCTAAGAAAAATGGATAATTCCAATAGAGAAGACAACTGATGCCTTTTATACTTCTTCCTGGGATTGTGTTGGGGTCTTTTTAATTATTTTTGG---TTTGTTTAGGGCGTCTTTTTAATTATCTTTGTTAATTATATTTGGTTTGTTCTATGTG-TATCTTCAGTAGCAGAATACACATTAAGGACAAGATTTTACCATCTTTGCCTAAGGCATCTCTGCATAGCTATTTAATTGTTCAGTATGAAACCT----GACCTTTCTAATTCTTTGACT-TTTTTTTTTTGAAGTCTGGGTTTTTAGAGACCAAGAATGTATGTGATTATAGACAAGA-----------CTTGTCAGTGGGAAGTTAAGCTTCTCGCTGCCTTTCTTTCTCCTGTGTTTCCTACAGAATGCCTGGTGCCATCAGGGATGTCGGAAGCCCTGTGTTTGTTTAGCAGGGCTTCCCGCC---GTTGCTCTGCATTTGGTAGGTGAACACGGGCAGGTGAACACGGGCATACACATCCAGGAGAAG-------TCTCTGTAGGAGTTTAAGGGTAGATTGTAAATAACTTCTGACGCTTGCTCGCCAAAGTTGCC-----------AAGTTCATGGCCTGTAGTGTAATGCGAAATGCAGCCATTTTATTTCAATGTTATTCAAAGTGTTTGCCttttttttttttttttcttttttGGAAGTAAATGCACAGATGCTGGGTTTTGTGCCTGTTTTAAGGCTTTTCTTTGGCAGAGTGAATGTAAAATACAGTAGAAAAGATAATATCGTCATCTCTTTTATGAATTATATCAACTT-ACATCTTTTTAAGAAGGCTCAGTCCAGGATGTGAGGTGTGCAATAAGGGTAGCAGATGCACAGTTGTG-TTTCATGGCATGACAGAG--TCCATCCAATCTCCCTTCCCATCAGAGTTTTGCTAATAGGCTTAACTCTTATTTGTGGACTAATAGTAGGATCTTGCCCTCAGCAAACGCT----TTCTGC------TTTTAAATTAAGAGAGTCCCAATTGTCTTTTTTTTTTCTGCCTCCCCCCCACTTTATCTTGACGGGATGGattttatatatataagaaatatttatttaaCTATTCTATAGAATTATCGAGTGCCTGCTAAGACCTTTAAGCATCCCT--CCTTCC---------TTATTGCGTGGTATAGAGCAGCTGGGAGA----GTGAGAGGCGTCACTCGGGAAGCTGCAGCC--ACACGGGCCTGTTGGAATGAGTGACCTCCTTAAAGGTA-------TCAGGTCCTCATCCCTTGAC-TGGTGAGGAAAAAGTG--------CCTTCCTGCCGGCCACGG----ACTGACATGGAGG-TCTTCGGATGAGCCCGGATGCCCATGTTCTTACTGTATTTTACAAGTGCCTGGGGaaatattttcaaaaataatattaataatttaaaaaaaaGGAAAAACTATGCACTAACTTAACGTGGC--------GACTACCTTAACGGCAGGCGTTGGTGGC--AGCCAGTTAAGCACCAGTG----TCTCTGCAGTCTGTGGCCTTAGCTGTCCCTCTTGTTTCTCAACCATTTCAC----GTACACTACTGAGGTAAGTTTATAACTTGAAATGTGAACTTTTTTTTTTTTTTAGGATTAAGAACAAACTAATATAAATGTTTTTAAAAG---------TTTTAGTGTTTGGGTTTTAGTCATGCTACTAGTTTAGTTTTTA--------GCTTCGTATTTGAAAAGCTT---------TTTAGATCTCGCTGCATTTACATACAGTACATTCTTAAGATGTATGTGGTAAATAAAGCTTTCTTTAAAGCAGTTTCAAGACTTTCT-----------TTTCCTTTAAAA-----------------AATAAAATCAGGAAGTTTTTGCAACAGTGGGGGGATGGCACAAATTCAGTCTTTGCAGTTGG-GAAAATGGCC------ATGTGGAA---------ATGCAGAGGAAGGCAGTTGCAATGTTGAATTATCGTTCAGTATCCTCAG---------------------------------AACTTCAGCCCAGCATTTGGATGCAAGTGGGACGTGACAGAGCCTGTCACTGCTTCCAATAGTGACACGTGAT-------------GCTTCCCAGTCAGAAGGAGACCTGAAGGCAGCTGTGATGTCATTG------CCAGTGAGTTCACAAAATCACTGGC-TGACCTCCATGTTGGGCACAGTATCTAaagc s bosTau2.chr6 38381658 3211 - 69624268 CCCTCAGGGTCGCCCAATAACTCCAGTGTACACGGTGGCTCCAAATGTTCAGAGAATTCCCACTGCCGGGATCTACGGAGCCAGTTATGTGCCATTTGCTGCTCCAGCCACAGCCACGATCGCCACACTACAGAAGAATGCAGCGGCCGCCGCTGCCATGTACGGCGGATACGCAGGCTACATACCTCAGGCCTTCCCCGCCGCTGCTATCCAGGTGCCCATCCACGACGTGTACCAGACCTACTGAGA--------------------CCCGCCGCCG----CCACTGAAGGAACACTTTACTATTTATGAAGAAAGACCGTGTTCGGTTAGCACAC--ACGAAACCTGAACGC---AAAGAATGTTATCAAATACCATACTGGAATATTTTATATTA--CATGAAGTTTTCACTAG--------------------TTTTTTAAGACTG--TTTTCAATTTAGCAGACCTGTGTTCATACATTTCTAAGAGACTTGCAATGGTTTGTGCCTTAAACACCATCTCTTAAAAATTTGTATGTGGTAGTACATTTGTATAGAGGTTTTTGTTTTTGTATTTTTAAGGATATATTTTCAGTTATGAAGGTTATTTTCTTAACTTCTGCACTCCAGAGATTTCTATTTTGTAGTACCTTCAATAATATATCAAGTATATAT----------------------TAAAAAAGCACACTTGAGCAGCTAGGGAACTATTTTGAAAAATATATTCAATATTTAAAGATACAAACAATAGTGCTTTAAAAATACTACAGAAAACATTATTTTA------AAAGTTATACTGGAAAGTGCAATTATAAAATGAGTGAAA------CCTCTA------TTCTGCTGGAATTAAGGGTTGAC----------------------------------------GGGTGTTAACCACG-----------TGTTATTCATGATG----GTTCTGTTCTTTA-AACGCTCGACCTCTCCTTAAGGCCAATGTTGAAAAGACTTGTCACACTTCTGAGTCCAAACACTGGAAGGCGCTGTCACCTGCTGCCCTCGTCCTGGGCCCCTACTCATTGTCCACGAGCCTTTGCTCTTAGATGTGTCCCCTCCGCCGCCCACCACTACCCTCCACTCACCCTCGCCCGCCCCCAACCTTCCCCAGACCCACCTTCATATTTGGCAAGTCAAGGACAAATTAATTACTCTGACAGAGAA---CATTGATGGCTTTTATACTTCT--------TTTTGTTAGGGTTTTTT--GTTTTGTATGGGTTTTTGTTTAGGGAGGGT------------------------TGTGGTTTGGTTGGGGAGCTATTTTCAATAGCAGAGTATGTG-TAAGCACAAGATTTTAATAG-TTTGCATAAGGCATCTTTGCATAGCTATTTAATTGTCCAATATGAAACCTTCACTCCTTTCTTAATGCTTTTATTATATTTGTTTTGAAGTCTAAGTTTGTACAGACAGAGA----ATGTTATTATAGACAAGACCCCAAAGGCTCTTGTTAGCAGACGGTTATGCTTCTAGTTGCCT-------TATCATGTTTCATGCACAACGTCTGTGGTTGTCAGGGGTGTTGGAAA---TATGTTTATTGAACAGGGCCTCCCTCCGTTGTTGCTGTGCATGTGGCAAGTGAAC---------TGAATTGGGGCGTGCACAGCCAGGAGGAGGAGGAGAGACCTGTAGGAG-TAAAAGATAGTTTGTAAATATCTCCTAATGCTCATTTTT---AGTTGTTTTATGTTGCAGAAATTCATGGTATATAGTTGAATGCAAAACAAAACCATTTTATTTCAATGTTATTAAACAGTTTTG-----------------TTTTATTAGGAAGTAAATGTATTGTTGCAGTGTTTTGTGCCTGTTTAAAGGCTTTTGTTTAGCAGAGTGAATGTAAAATACAGTA-AAATGTTAAGATTGTCATCTACGTTATGAAATACATCAACTTGGAATTTTTTTTTTAAGGTTCTAACAAGGAAGTGAGGTGTGCAATA--GATGGCAAGGACATAGTTGTGTTTTTATGTCATATTAGAGATTCCATCAAATGTTTCCACTCA-CTGAATTTTGCTGAT-GGCTGAATTCTTA-TTGTGGATTGATAATAGGATCATGCCCTTAGCAGATGTTTTAGTTCTGTTTTACATTTTAAATTAAGAGATTCCCAGATGCTCTCTTTT-----------CCCTCATCTTA---GGGTGGGATGAATTTTTTATATATAAGCAATATTTATTTAACTATTCTATAAGATTATTGAGTGCCTGCAAAGGCCTTTAAACATTCCTAGCCTTCCTTTCCATCATTGTTAAATGACAGAAAGTAATTGTGCAATGTTTTCTGATGATGCACCCAGCGAGCTGCATCCAAACTCAAATCCGTCGTAATGAGTAATCCAACCAAATGCAGTTCGCGTTCAGCCCCCATCCCTTGACTTTGTATGAAAGAAGTGCTCTCTTACTCTCCTTCCAGTGAAGGGTTAATTAGCACAGAGGTTCACTGGATGAGACTGAC--CCAGGGATCTTACTGTATTTTACATGTGCCT-GTAAGTTATTTGCAAAAATGGAAAAAA------AAAAAAAAAGGAAAAAAATG--GTGTCTTAACATGGCAACTACCAAACTACCTTAAAAATAAATGTTGGTGACATAGCCAGTTAAGTATCAGTGAGCCTCCCACCTACCTATGGTC-TGCCTGTTCCTGTTGTTTCAAAACCATTTCACATATATACACTACTGAGGTAAGTTTGTAACTTGAAATGTGAAC------TTTTTTTTAGGGTTAAGAACAAAGT-ATAAAAATGTTTAAAAAAAAAAAAAGCTTTCGAGTTCTCTGTTTTCAAACATGCTGGCAGTTTAGTTGTTATCTTTAGTGCTTTGTATTTGAAAAGCTTTTAAGTTTATTTAGATCTTGCTTCATT----TACAATACATTCTTAGGATGTATGCAGTAAATAAAACTTTC-TTAAAGCAATTTCAGTACCTTATTTTAAATTGTGTTTTCTTTATACACTTTTTTTTTTCCCCTAACAAAATTAGAAAAAAAACCCTATAGC------ATAGAAGGAATTGACTGTTTCTGGCTGGAGAAAATCATATCTTTGATTTGGAATTATTAATGAAGTTGAGGTACATAGTAAAAATTGTGAATTA----TCAGTGTTTTCAGCCTTGGGTCCAGGTGGTAGAAAGTTGAGCGTTCAACTACTACTTAGCATCTGGATCAGAGTAGGATGTGGCAAAGCCTGTCACTGTTCTCAGTGCTGAAGTTTGTTTATGATCCCAAGGGTTTTACACTTAGATATATACATGGACTCAGTTGATGTGACATTGAGTTGTTCGATGGTCTCATGAAAGTACTGGTGTGACCTGTATGTTGGTCACCGCACTGGAAAC a score=2814 s mm7.chr5_random 14431 215 + 11523536 CTTGAGAGCTTTAGTGGTGTTGCCTCTGAGGA----AGAACAGGAGTGAGGCCTACCCTCTTCCTCA--AACACTGACCAGAGATTTCA---TCTTGTTCACTGTAGGAGGAAGC--TCTGACAACTATCACAAGGAGGTTGGGGGGCCCAGTAATAAAGTGGGAAGAACTCTAAGTTATTCCTTCTGCTTCAGGATTTCAGTTTTGTTTGTTTGTTTTAGAggat s bosTau2.chr6 38387329 193 - 69624268 ctgaacaacgttagtgtggcagcctcaaaagagaggagaaagggtgtggGGACAACCTTTGTCCCCACCAACGCTAAACGTGGTTGATAGGCCCGTGTAAATTCTGGAAGGAAGAGATTTGGCCCGGATAACAAGGA---------------------AGTAGGAAGAACCCTAAATCATTCC----AATTTAGGACTTTGA--------GTTTCTTTTAGAAAAT a score=25708 s mm7.chr5_random 14889 1169 + 11523536 TATCCACATGGATGAACTTGCAAGAGTGTCTTGTTA-------CATGGTACACCTAGCTACTCTCCTTGGAAGGCTG--TGCCCCACTGGATGCTTTCAGGCCTCAGTGGAACATTAGCCAACCCTGACCTTGCAGAAACTCCTTGTGGAGTTTTCAAGCATGACCAAGGCTCTGGGAGATCGC------TTTGTGTTC-----CAGACTCCAGGCTCTGGGATCTTCCATCCTCCTCTCTCTGGGGTCTACAGCAGTTGCTTGCACTTGCCAGAGCATCCCCCACTGCACTTGGATAGGCATGGCACAGGGATGCAGGC--CTTTGCAGAGGTTCCAAGACATGACTTAAACGAAGAGGACAAGGAGGATGAGGAGGAGAGTTCTGAGGAGAA---CCTTGAGACCCCCAGGTTTCCTCGGAACCATTTCATGAGTT-----CTCCAT--CACACACTTATGCTCACACCTGGAAGTAGTACCAGATCCTGTATTTGCAAGAAATACCACCTTCCC-AAGCTAATCTTTAGCCACCCTTACTTCTTGGCTTGCCCTACTTTGTCAAAAGAAAAAAAAAAAAATCCTTACTGATTAACCAGCCCTGAGGTTTAAATAGGCCTTAGTCATTCTGAGGCAGGAAGGACGTGT--CTCAAGCCTAATGGTTCCTGAAAGGACAGTACTGGAGTTTGCCGGGGTCAGGACATGTTGAACTC-TGGGATTATGATAACATAAGGTCTTGCCAGTTTGCTCTGGCTGGGACTTTTCTTCTCCTCTTTCCTGGGACTTGTATTCAAACTCTGGTggtaactaggaaaggagatggggtttgaaatgtaaatgaagaaaatatctaataaaaagaaaaCTGGTGGTACCATGAGACAAAGCTACCATTCCCATTGACTTCACCACCCTCATCTCTAACCCAGTTCAAATCTGGCCATTTGACACCTCCTTAATTGTATATAAAGTGCTATGCTGACGTAATATACAGAGAG--------------------AGAGAAAGGG---------AGAGAGGGATTTTGGAGATGAAATTTAATTCTAAACATGGTCCAGCCTTTACAGAAGAGGGACATTGTCTGAAAGTAAGATATATGGACAAAAATAAACTATTTAGCATACCTTCCCACCCCTTCAGGACAATTACTCAAAGGATCA---GGAGGCTTAGTCAAGGCCTCCCCCCGAACATTTCTTTTTCTTGTT s bosTau2.chr6 38387535 1123 - 69624268 TATCTAAACTGAAGGGCT-GAAGGATTGTCTAGCGATCAATAGCATGATGCATCTGAGCGCTCCCCCTAGT-GGCTAACTGCCTCTCTTCGGCCTTCCTAGCACCAG-GTGATGCCCACCAACGCTGATTTT-------TTCCATG-AGATTTTGTAGGGCTAGCCGAGGCTCTCAGAGTTCTCACCCCTTCTTTCTTTAGAGGCAGGTTCCACCCTCTGGGACCTTCCATCCTTC-CTGTCTGGAGTCACATGCAGCTGCAAGGATTGGCCAAA---CTCCCCACT-CTCTTGGGAAGCCCT---ACAGGAATGCAGCCTTCTTGGGAAAGGTGATGGAGGCCCATTGTCCTGCAGATCAATGTGAGGATG--GAGAAAAGTCCTAAGTAAAATCTCCTAAAGACACACTGGCTTCCTCAGCAGGGTTATATATCCTTGTGACTCCATTCCACACAATTATACTCACAATCAAAAACACCACCAAACCTTTCATTTGCAAGAAATATGACCTTTTCTAAGCTAATTTTTAGCCACCCTTCTTTCTTGGCTTGTTCTACTTTGTTTGTC------AAAAATCTTCATTAATGATTAACCAACCATGAGGCTTAAATAGGCCTTAGTCATTCTGAGGCAGCTGAGACAAGTTGCTGAAGCCCAGTAGTTTCTGAGATGACCTTGCTGGGGGCG--CTGGGTCAAGACATTTTGAGCTCATGGTGTCATGACAGCATTGGGCCTTGCCAGTTCCCTCT-GCTGGGACTCTTCCTCTCCTTTTTC--AGAATTTGTATTC--------------------------------------------------------------TAAGAAG-----TGGTGGCACCAGAGAACGG------TATTTCTATCAGCTTCACTGGCTTCACACCCACCCCAATTCAAATATGTCCATTTGACATTTTCTTAAT--CACACAAAATGATATGCAAACTCAGCTTCCCAAAAGGCACCTTCTCTCCTCTTTCCAAATAAGATGCTCTCATAAGAGGAGAAATTCTGGAAGTGTAA-CTATTTCTAAATGTGCTCTAACATCTATAGAAG-GAAGCAT--TCTGAGCATGAGGTA-ATAG-CAAAAATAACCTATTTTGCATAATTTCCCAACTCCTAAGTACAAATATCTAATTAAACCATTGAGTGCCCAGTCAAGGCCTGCCCTCT-GTACTTCTTTTTCTTATT a score=4544 s mm7.chr5_random 19478 375 + 11523536 ACTCTGAAA-CAAAGGAGCTTTGTGAAGACTGAGGACCGGTTCTTCAGACAGGGTTTAACTACTTGCTGCAAGCCAGTTGGATCTGGAGTGGCTTAAGTCACATTTGTATGCTCACAGAAGGG----GGTGCTAGGAGTTGGGGGACAATGACTATGTGAGCAAGGGAGGGAACTTCTGGGTTGTTTTTTGTTTTCCTGGGGGTTTTTTGGTTGGTTGGTTGGTtttgtttgtttgtttgtttgtttgtttTTT---------------ATTGTT--------TGAGTTTATTAAGGCCAACTTTGTTCAAAGCCACAGCATGAAGATTTCACTTATTTTCATGTTGAAGGCAGGCTATAATTGCCATCATAATTACTGCTTTTAAGTCTTGTGTGAAAAGCT s bosTau2.chr6 38338996 365 - 69624268 ACTCTAAAAACAAAGTGGCCTTGTTAAGACAAAGGAT--GCTCCTC---CAGGGATGACGTACGCACGCCAGAGCTGTCAGAAGTTAGGCAGCAAGTGTAGCATGTGTCTGCCTTCACCAAGGCTTAGGTAATAGCAAT-------CAGTGTCCCTACCAGTA-------GAACGGCTGA----CTTTTACTTTTCTTGTGTACTTGTCTATTGTGTGCAT--TTATGATAACTTGTGTGCCT---TGTTTTTTGCCAAGACCATAGATAGTGGTAGGCCACGTGTGTTT-TTAAAATTAACTCTGTTCAAAGCAAAAGCAGGCAGAAGTTGCTCATTTT--TGTTTAGAGTAGGCTGTAATTG------TAATTA-TGCCTTTAGATATTCAGTGAAAAGCT a score=6850 s mm7.chr5_random 20663 237 + 11523536 tttttaaaataCTGGCTTA----CACACTATGGATTCTTTAGTTTTGCTTCAATTAG--CCTAAGAGTTTGGTTTCATGTAATATTTAACA-ATTTACAATCTTAGATTTTTTTTTTATTTCTAGTCTTTATTAAGTCAC-------TAATATT--TCTCAGTATTGAT----------CATTTTATTTAGAAGCAATAAAAC--CTTCCTTTATAAAATATGGATAGA-----AGACTGGAAACACATTTGCCCCTCTGGTCTTTTGAC s bosTau2.chr6 38339697 266 - 69624268 TTTTGGAAACACTGCCTTAGTATCATTGCAAGATTGCTTCCATTTTCCTTTAATCAGAACTTAGCAATTTAGTTTTATATAATATTTAATGTGATTATAATCTTAGACTTGTTCTGGATTTTGACCCTTTACTAAGTAACCTGTTGATAATTTTCTTGTCACTATTGATAGCTTTAGATTATTTCATTTGGGAGTAATAAAACTGTCTCTCTTAAAAAATATAAGTAGATAAGTAGATTTAAAAC----TTGTCACTCTGGCCTTTTTAC a score=3674 s mm7.chr5_random 21413 142 + 11523536 GGAGTGTGTTTACCCCA---AAGTGCTATGGATCTTCC---------------------TTGTCTTTAGTA-CCATGATGCTCGTTTTACCAAACTCTCTGCCTGTGCCGCCCACTGCTTGTCCCAGCTTCTAACAGGTGAATCTATT-TCAGCTTCAAATGAATAAA s bosTau2.chr6 38340443 168 - 69624268 GGAATATATTTACTCTGCTTAAGTGCTTCTGGTCCTCCGAACCCGTTGTTATGTACGGACTGTTTTTATTATCCATGAATCATGTTTTACTGCTCCTTTTTCCTTCTACCCCTTCTATTTGCCCCTGCCTCTTACCAATAAATCCATTGCCAGCTCCAAATGGATAAA a score=16589 s mm7.chr5_random 22072 620 + 11523536 TCACAGTGTCACTTTTT-AGTATTTTCTATTTGCCAGAAGACTTT----GGGCTCACTTAAATGTGTTTATTTAACCCCCACAACATCTCACATGAAGTAGGAATTACTACATTTCTTATTTATATTAAGCAGTGGTTCAATAGCAGTGGGCACCCACATGATTCTCTGAGATGATTGGTA-AGAAAATCATTCATTTAATTTTAGCCA-----------CGATTAAAATATTTCTGTCAAATTTCCTT-TCTATGCAATG-CAG------TGTCTTCTTGGGGCTTCCCCAG--TCATCTATTAGAATAGGTTTTGCACTAAAATCTTTGTAAGGCTAC---AAAGCATTTC-CCCAGGACAGCTATGGCCCCTCCCTGCTTTCTGAGCCACGCCTTCAAATTCATTCCAGGTGTCCTTAGCAAATGACTCCCAAGGC----------TCAAAGC-CATTGGCCAATGCCGAGCCAGGAGCCACGTAGGGCAGAGTCACGCTGTTCCTGGGGTTAGGGGCAAAGGTTGCTGAAGCCAAGCCGGGCTGTGGTCGCAATTAGCCTG-CACATCCAGATCG-AAGCCTGGAAAGGTAGGGAA-ATCTTATTTATTCTTATTTATCCTCATTGAGGTGTGGAGAA--TGGTTGTGTTTGGTTAAGGCATT s bosTau2.chr6 38340821 627 - 69624268 TCACGGTAACATTTTTTGAGTACTTTCTATTTT---GGAAATTTTCTAAGTACTTCCTGAAATGC------TTAAAACTCA--ACAACTCAGGTGAAGTAAGAATTG-----TTTTTATTTTGTAGCAAGCAGAA---CAAT-GTAATCGGCACCCACCTTATT-TCTAGGAAGGTGAATTTAAAAAAAAATTTGTTTCCTTTTCGTTAGTTTTGGTGTTAGAATAAAATACTTCAGGTACATTTCCTTCTCTATGAAATGTCAGAACTTTTGTCTTCTTGGGTCTTCCCCAGATCCATTTGCTACCGTAAGTTTGCTATTAAA----TTGTCAGGCTGCTGTGGAGCTTTTTGTATCTGGTGGTTTAAACACCTCCCTTCTTTCTGTACCACCCACTCAAGTTCATTCCAGGTGCCCTTAGCAAATGACTCCCAAGGCATTTAAGTGGCCAAAGCTCATTGACCAATGAGGAGAAGAGTGTCATGTATAATAGAGTTACGCAGTTCCTGGA-TCAGGAGCAAAGTTTGCTTAAGCAAAGC-----TTTTGTTACCATTAGCCTGTCGCATCCAGATTTCAAGACTGGAAAGGTAGGGGACACCTTATTTGTTGTAATTG---------GAAGAGAGGAGGAGATGGTTTTGTTTAGTTAAAGTAAT a score=2412 s mm7.chr5_random 22717 531 + 11523536 TTTTGTTTTAATTAAAAGTGGTGTATACGTCTATAAGTTCTTGAGAATTTTAAACACTTCTCTACTTACCTTGCCTCCTGTTCTCTAGTGATGGGTGGGCTTTTT-------TTTTAAAGATGT---------TGCTTAGTCTTACAGCTTTCCACTGCG-CTTACTTAAAAAA-------------------------TTCTTACATTTAAGCGATAC----------AGTATAAGCAAGGATTTGTCGATGGTGTC-----------------------GCAAAAGCAGTCTTTAGAGGAGAAA---ATGTGATAACTAAAATAAGTTAGGAATCAGCAGTCTGATGATACGTGAAACTGGAGCCTTGGTATTTCCTCTTGGGTACT-CTACTT-------------------TGAGACA--TTC-----------------------------------TTTTTCAAACCGACGATAG-TTTTAAGAAATGGATCTA-------------------ACCACAGGCACTATGC------TCTTGACTATAACTATAATACTT--TTTAGGACAACTTTCCACGCT------CTGTTCTAATATTAACCACAACAACCAGAAAGCAGAGTGTCTTTCT---CACCTATCTACTTAAAAATGAAGCGATTTGCATAGCAGTAGAAGCTGAACATCAAGCGGAG s bosTau2.chr6 38341478 671 - 69624268 TTTCGTTTTCAACTGAGGGCAAAAAAAAATTTAGAAGTTTGTGAGAATTTCAAATGCTGCACAGTTTGCCTTACCAGCAGC---------AAAGCCAAACTTCTTAAGAACATTTAAAAAACAAAAAACAAAACAGTTCGTCTAGCATCTCTTCTCTTTATCACACTTGAAAAAACTAGGTGGAAAAAAAAGTCATGTTTTCATAGATTGCAGCTATTTTCATTCTGGGATTAAAAGCAGGAATTTATCAGTAATATCCACATTTGTTTTCCAAAGTCATTTCAGACTCAGTCGTTATAGAAGAATTTTGTGTAATTATTTAAATGAGATAAGGA-------------AAAATGTGAAATTAA-----TAGAATTAGCTCTTAAGAGCTACTACTTAAAGGTTACTGATAATGACTGAGAAAAGTTCAGGTGTAAAAAGACTCTCATATCAATCATACTGCTTTTTTCAAGCCAACAGTAAAGTTTATGAAATGGAATTAGTTAAGTGTAGGTTTATATACTTTAAGCACTATATAAATTAGTTTCACTTTTATTAGAAGGAATAATTTAGTTATATTTTATGTGCTGTTTAGATGTTCTAATATTAA----AGAAGCCAGAGA-TAAAGAATCTTTATTTGCTTTTTTCTACCTGGAAATGGAGTGATCTGGATAGCATTTGAAGCTAATCCTAAAAAGAAA a score=3756 s mm7.chr5_random 23407 217 + 11523536 TCAGTGTCAAAGGTAAACGTGCCTGTAATGTCTGTAACTAGTTTGCT------GCTTTGTTCCGAAAATGGCTCAGCATGGGTTTGTATTCTGTAACAGAATAGACTGGACATTTATTTAAGGGC--------TGAGAGATGGTAGTGTTGGATAAAAATATTACATCAAAAGCATTTAGTATTTGGT---------ATTTTTATCTGATTTGTAAAGAGAATGTTACTGTGGTTATCAC s bosTau2.chr6 38342276 209 - 69624268 TCAGGTTCAAAGAAAA--------GTAA-------AACTGGTTTCCCAAGATGGCTTTTTCATAGAGCTGACTTAATATGAGTTTGTATTTTATA-CAGAA---ATTAGATAATTGTTTAAAAATACAACATATGAGAGATTGTATCATTTGATTAAAATTTTTTA----AAGT-TTTAATGTATAGTCAAAACTCTATTTTTGCCTAATTTATAAAGAAAAT-------TGTTTAGCAC a score=27907 s mm7.chr5_random 23864 822 + 11523536 AGTTTTCATCCTGAAATATCCTGCTTTTACTAGATGTGTC-CAAACTGTCTTTTTTTCTTCCTGAAGCTCGCTCTCAATGGCACCTTCAATGACTGGTCTCTCGATCTGCGGATTGTGCTTTCGGGCGGAGCAACGG--CCACGGTGTTAACTATTTACCTGGCCTGGGAGAATAATTACTAACCACCATCTCGA--------------TGTTTCTCAACTCCAAGCTGAGGTTCAAAGGTTCACA-TGAACCTTGCGGATCAGAGGTCAGACTCAAATTGCTGCAATTTGTTGCTGAATTCTGCCGATATGACAGAAATTCACAGCTATGAGGATTGCTGGATCCACTCCTGCACACAGACCAGGCGGGGCAGTTAATACTGTCATTTGTACAAGTCAGCCTTTGGCACCCAAGTTTAATAAGTAACCAGCTGGTGCCTTAGGTTTCACTGGTACAAGGTGCACGTTATAAAAAGGGTCAGATGTCACTGGGCAAAGATGAAGGCAGTGAGGAGTGGCCATCTCATGGCTACCACCCATGAACTAACTATACACAAAGATCCAGTAGTCTGTTTAGTTCAT----------ATTTCTACGGTGTAAATTTCAACATACATTCATTTTCTTGGTCTT----------AAAGAGATGTGTCCTTTTGTAAAAATGTTAGTAAGAAAGAGCTATCTGATTAGGGATCGTTAGCCAAGAAGTAGACTCCAAAGCTGCACGCT-TCACTAATCATTTCACGGGGTCTTTGATTTCTCAAAAACTTTCCAAAATTAGATGGCTTTTTAAGAATGTAGGGgctaagc--ggcagtgactcagaccatgtgattccagcctcagaaaact s bosTau2.chr6 38342573 802 - 69624268 AAGTTACACCCTGAAACTTTCTACTTTTATTAGATTTTTTTCATAATGCCACTTTATGA----GAAGTTTACCCTCCAGATCTCCCTC------TTGACTCTTCAG-GGCAGGTGGAGA---CAGATGGAGCACCAGGCACACAGGGTTAACTATTCAC-------------------AGCAGCCATCTTCTTGGGTACAAGTAAATACTATTTCTCAACTCCAAGCTGAGGTTCAAAGGTTTAGACTTAACTTCACAGATCAGAGGTCAGGCACGAATTGCTGCAATTTGTAGTTCAATTCTGCCGATATGACAGAATTTCACAGCTATGATGATTGCTTTTTCCACTTCTGCACACAGGCCAGGCCGGGCAGTTAACAGCATAATTTGTACAAGTCAGCCCTTGGCACCCAGGTTTAATGAGTAACTAGCTGGTGCCTTAGGTTTCACTGGTACAAGGTGCACATTATAAAAAGGGTCAAATGTCACACACAAGAAATGGAGGGAGTGGGTAGTGAGATTGCAGTAACCACCATTTATG----AATCATACATAAAGAGTTGGTAATTTGC---GTTCATTTTAAAAGTAATTTCTGTGATGTTAGTGTTA--CTGTGTTAATTTTCTTTGCTATGAAAAGACAAAAAGACATAGATAATTTTGT-TAAATGTTAGCAAGAAAGAACGATCTGATTAGAGATTATTGAC--ACCCATAGACAGTGAAATTGCAGGCTCTGATTATGCCTTTCATAGGG-------TTTCTCGAAAACTTCCCCAAGCATGCCAGTTTTTCAAGAATCTAGGGAACAAGTTGGGTA---------ACCACGTATTTCTGAGCCCATAATATT a score=3382 s mm7.chr5_random 25164 601 + 11523536 TAATTAATAGACCTTAGTCTCTGGtcagcctctctgtgct---gttccccatctgtcacgtgagtagaattatagttcttgtttcctgtgattgtagcagcgattaagtggatg-atgtcactcattgatgctcagcgcaatgtctaatgtacagtggggattc----------------aaGCAA-------GGCCCAAGCTGCCGCTG--CTGTCACTGGCTCCAAGCTGGTGACT----------------TAGCCTTGCCTGTTCCACATCTCA-----------------------------------------------CCCC------------------------------------------AAGTGGCTTCC------------------CCTTGGTCTCTTCCTTTCAGGAGGGGGGGTAGACACAGAAGTACAGAGTTGGATGAGATGATGTGGGGG-ATTTCAGGAGTTATTCTATTAAACATCGGGCAGAAGCATGCTTTAAAA--CGTCCATTTCAGGTCAACCACTCCAAAGAAGTCCTATCTTTCCTTAGCAGA-TTGCTGTCACATGGGAAAAGCCAT--AAAATG-----------AAATAACTCCAAATTATCTTG------------------------CTGCCAAGCAGTGAGACACACTTGAGATTTAAAATAAGCCCATGTATGATGTCTTACGGATAAGCCGAGTCCTACACTTGGGGATATACATTACGGAGTTATATTTACTGATTTCAAAATGAAGTTCTCATTTC s bosTau2.chr6 38343742 755 - 69624268 caattaaggaacctgaacaaatgagcagtcttcctctgtttaattccctcatgttcaggatgagtataa--acagaatttgcttcgtggagttgtaataacaattaaataagtgtacatga------aatgctcagcacaatgcctggcacctattaagcactccgtgaatatttgttatAATCAGTACTATTGGGACTAGCCTCCTCTACCCTGTAAATCATCCCAATTTGTTTATTATTTTTTCAATATTTATTGAtttggctgtgccaggtcttagctggggcatgtgatacatagttccctgaccagggattgaacccaggccccctacattgggagctctgagtcttaaccactggaccaccagggaagtccATTCCAGCTTGTTTGGACGTGGTCTTTGCTCTGTTCATTTCAGGAGAGACGTAAGATA---AGGTATA---CTTGGCAAGGTGATCTGAGGATGTTTTAGGTG-TATTTT-TTTAATATCATGAGGAAGTGTGTTTTTAAATTCCTCAGTTTCAAGTCCAGCATTCTTTTGTATGCTAGTTTTCCCCCAACTGCTTTGCTGTCATATGGCAAAAGCTGTTAAaaataaataaataaataaataaatCCAAATCATCTGGTTTCCTTTGAGAGTTGTTTTCATTCTGCCCTTTGGTAAGAAACATTTGAGTTGAAAAAGAAAAAAATCCA-----CCTTATCAGTGGGCTAAATTCTATTCCTGATGATAT--------GTGTTATACTTACTAA----------AAGTCATGGTTTC a score=2554 s mm7.chr5_random 25765 31 + 11523536 TGTCACAGGTCAGGACTTGGTCTTTTGCAAA s bosTau2.chr6 21459233 31 + 69624268 TGTCATAGGTCAGGACTTGGTCTTTTATAAA a score=7725 s mm7.chr5_random 25810 591 + 11523536 CAAAAATGTCAGCTATGAAACTATTACCTTG-GATTTATTC---------------ATTTCGTTTCTTTACCCTTTTCTAATTCAGTGCCTCTTGGATAAAGATAGGATTTGAATGACCAGAGACATTAAAGC---TCAGTACTTGGTATTGAGAAAAGTCACAATGACATCTCAGATTAATTAA--AGCTAAGTACTGGCTCTGGGCCAGCACTGAGTGGAGG--ACTGGGGTT-TCGATGTGAATCAGA-CCAGATTCTGCCCTAGTAAAGTTTTAATTTGGCTGATAATGAACCCAGTTACTAACAGTTATTGTAAGCTTGGGCCATA------TGCCAAAATTCTACCCCGTTTGTCCTTCAATGTGCCAATTTCCTGGGGTTCGACCTAGTGTCACGAAGAGTGCTAGAAGACACTGTGGGCACATGTTTCGGGGTCTCTTCATACTGCTTCAGGGAGGAGTGAGATTTACAGCTGAGCTCGGGCTGGCCATGTAGGGGATC--------TCTGATGCCCCATGAATGACCTGTA-AGGGAAACCGTGTTGGGAGATAAAGCTGGATGAGGACTAAGACTCTTCAGGTCTTATG----------AGGATACTGACT---TTCTAAAAACAGCGGCAAGG s bosTau2.chr6 38344497 585 - 69624268 CAGAAATGTCAG----GAAAGTCTTAAAAGGTGATTTTTTTGGGGGGGGGGGGCTAATTTTATTTC----------TATGGAACAGTAGCATTTGAACAAAAACATGAT----ACTACCAATGACAATATATCAATTATGTGCTTAGTATTGA-AAAGGTAGTAACAATCCCTCTCCCTAATTAAACAGTGAagcacctactgtgtgctaggattgtgtgtgggacactgggactatagctgtg-atcagatctggatcctgccctggtcaagtctataactgattggagaagacTGCCATTA-TACCAACTACTGTAAGATTAAACCAAGTAAAACTGCCAGTATTGTACTGTTTTTGTCCCCTCAGGGGGCAATTTCATTGGATTCAAGCCAGTGTTATGAA--------------------------------AGGGTCTCCAGAGATGACCTC--TGAGGAGTGAAGTGTAAGGATGAGAACAAGCTAGCTAGGCAGGGCATTGGTGAAGATTTGAAGCTCTAggagtagcaagtgttggggaaaagtgacacaacatgaggctggggaaggagccaaagtcttc----cttacgtcccttactaaggacattgactttcttctaagggcagtggaagag a score=20492 s mm7.chr5_random 28575 2647 + 11523536 TTTTGAGAACAATCAGAATAGCA-AATAGTGAAGTTCCTATGAAATAAATCCTATTTAGATTTCTTGTAGGAAGTCAGTCAGAATTTCCTGGAGATGTATATTTAGCCC---ATATGTTATACTTGAAGGAG---TTTTGTTACTTACATAGTTATGAGTAACCCTCTCAGTGAACCTT-CTTTCCCTACAGTATAGCATAAAACTG-----GACCCTGCGTTTCATT-ATATATTAGTGATTTGCTTTCAGATTACAGAGTTTACGTGACCGCTGCCGAGATACTGCATTTGCTGAGGGGAACATTTACTAACACACACAGCGGGAAACCTCAAAGTTCTGTGCAAACACTA----CCAAG--------TTCATA----------CTATTTCCTGTG-----------------------------------GGAGACCTCCCCTCAAGAAAGCT---------------GGGCACACCT-------------------------------------------GCCGTGATGCTGCA--ATTGATTTCAAGACACAGCTTATAATTTGCAC-TTTAATGTCCAAGGTTTTATCAAAC-TGTGGCACGGGG----TTGGTTGTTATCCAGCAGGTGACACACAGAGCTATTTTTTCAGGTTGGGTAAAGACTATATGCATCATGAGCTCATGTGTTTAGTGGCTGCAGCTCTCTAAGGCTTTGGCCCTTTTTTGGAGGGGGGAGGGGATACCtttgttttcttttcttttttttcttttttctttctttctttctttttttttttttttttAATACATGATTAGGATTTGACCCAGGGCCTGGCTGGGGTT-ATCCCCTGTGTTCTGGTGAAGACATGGATCCTGCAGAACACC-----AGCCATTCTAACATGGA------TGTGGTTAAACGATTTCATGG--------GGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGGTTGGTTG----GTttttggtttttcgagaca-------------------aggtttctctgtatagccctgga-tgtcctggaactcagtctgtag------accaggccggcctcaa-------------actcagaaatc-------cgccgcctctgcctcccaagtgctgggattaaaggtgtgcgccaccacgcccggctACGATTTCGTGTTTTAACTGGCTTCAGAGGCCACTTGATCCAGAAGATTCCAAAGCATGCCCTATAGAGTCCTAAAGGTCCTCCCATGTCCCCATGAAGCCACTGGCTCTTGTGTTTGTTttggttggttggtt-agttggttggttgg--------------------------------ttagttggtt---ggttggttggttggttg--gttggttggttggttTTTGGTG----------------------------AAGAATATATGAAGCAAACCAAAAAT--------------GTACAACAGTGGCAAACCCAGCTATTTAACTAGCCAT------TCAGCTAGTACTTCAAACAAGTGAAGGGATTTCTATAAAGTCAGAGACCAAAGGTAAAggcatggtgggatatgcctatggtccctagcacttaagaggcagaggcaggagaattgcaccttctaggccattctgagatatatagcctgtctctgtctcacagaagacaCCAGGGCCAGGATATGGACACAAAGGTGTTGAAAGTCTAATCTCCAAGCCCTCACTCGAGTCCTACATACTGGCGCCATACTGGAGTTGAGAAATATGGACGCACAGACATTTGGATTGTCAGGTAGCTTGGTCAGGTCTCTTGATAGTT--GTAA-----------CAGCTGGGTAGAGTGTGTC------TCCACATATGAAGTGAAGG-AAGGATATTCTGT----AATACTTTTACTTTGTCTGTGTGTCTTGAACA--TTTTAATTTGAACTTTACAGTCCCTTCATTTGAATATTTTGTACCATTAGGATTTCTAACATGAACTTAAGACCTGAATTGATACTTCCCATTTTTT-TCATAACCCACTCTTTTGAAAAAAAAAAAAAATCCTCAAGAAATCTTGACTGTGATTTTAGGGCAG-----TTAGTCACTCTCAAGTCACCTCTGACTAATTGCAGATGGATCACTAAGC--CTTGTTCCTGTGGTCCTGGGGACAGGCTCTGGATGCGGTCAGGCACTA--GTAATGATTTGTTAGTGATGTGTAACATAACTCCACA----GCCATGTGGGAGGCCTCAAGCTAGATATTTTTATCTCTGTATAAGGAGGTAG----GTCTCTTTGCGAGTCTCTGGGC-------------TGCATCTGTGTTC-TTCCTAA--GCTGAAT-GTGTATCAGGCAAGTCATGGCTG-----------CTC---------CAAAGGTCAAAACACACCACAGGAAAGGAATTGCTCATGTTCCTGACGCAATTCCCCATCTCTTCAAGGATAAGATAATGA-------GTTACATTTCTTGGTTTCTAGAGGACATAAGAGTAATAAAGGTTTCTTGACTAATCGGAGTCATGATAGTTCA-TTTTAGAACGAAAACCTCCTCAGTTTCTAGGCCCATGTA--AAACTTACATTGAAATAAAGCAAAGCAAAACATCTCTACCA----TTTTCTTCAATGCTTTAGGGTTTGCCTCAGAGGACACGTCAAGAACTGATCAGAGAAATCCCAAGCGAGCTGCCTGAACCTTCGAGAATTCTCTTGTTCTACCTTCCATATAAAGAACCAGGACCAATCGCATTGGTGACCTTTGGTGAGTGCACCTCCCAGAATCCTTTTCTTCCCTACTTAAGTAAGAACATAATTCCCCTCCCTATCAAACAGGACATGTGT------GAGATGACGCATCCCTGGTGTGTTT-------------------ACATGGTAAACTAGTGGGATGTCACACGGAATGATGAGCCCACACTACAGAGCCTTATTTCTCTGTACATGTCACGTCTTTGTGGCTTGAAAGGACATGTCA s bosTau2.chr6 38346682 2697 - 69624268 TCTTGAAGATTTTCATGATAAAATAGTATTAAAATATTTATGAAATGACTTGTGTTTAGAGTCATTCTGGAAAATCAG-----ATTTTTTGGTAA---ATAAATAGTCCTAAGTATTTTTCCCCCCCGGGAAATTTTCTGTTACTTAAATTGCCACGAGAGGCACT-TCAGTAATCCTTTCCATCATTAAGATTCAGCACAAAACTATGTAAAATCtataatttcatttatatattaataatttGCTTCTACTTCATAGAGTTTACATCTCCATTACCATGATATTAT-TTTTCAAAGGGAAACATTTGCCATTATA----GAGAGAAAGCTTACAATTTTGCACCAAtattatgtgccaggaatagtgttttataagtattttctctattctccatacagtcccacaagaaattagctccacttatggatatggagactgaggcccagaaaagtttagttaagtttgtcaggattcacttaaatagtaaatgaatagtgcaggaGTTTACATTTTATTCTGTTGTCTTGACAGGGCAGAATTAATTTCAGGACACACCTTGTAATTTCCACATTTATTGTTC-----TTTATCAAACATGTG--ATGGTGATCATTAGGAATTATCTAGAATGCAGCA--------------TTTAAGAAAGGTGAGGGTTATATGCTTTGAGATGTACAGAGTTTAACAACAATTATTCTATGA-----------TTTATTTGAGGGTGTAG-------------------------------------------------CTTTATTTTTAGTAGATCATTA-ATAATTAGGATTAAACCCAGTTCATGGCTTAGTTTTATTGCTTGTGTTGCTATAATGTTATGGATCCCATTGAATGCCTTGCCAGTCACTGCAATATAAAGATAGTTATGGTGGAATAATTTTGGAGCTGTAACTGACTATGtacgtacatgttaagtcacttcagtcgtgtccaactctttgtgaccccatggactgcagcacaccaggctcctctat----ccatagagtctccagggaagaatactggagtgggttgccatgccctcctccaggggatcttcccaacctagggattgaacccatgtctcttttgtctcct--gcattggcaggcgggttctttgccacctggaaagccTGTAACT---------AACTGACTTAAAAGGCTGTTTCATT-GGCAGGTTCTAAATTGTGCTCTGTGG--TTCTAAAGAACCTAT-GTGTTCCCACACAGCC--------------------TGGATGGACGATGGAGCAGAATGGGTGGAGATGTTTCCCCATATCATCCCCTACTTCAGCTTAGCCAGCTCCTGTTTTATCAGTTTGTTTCTGTATCTAGGTAAATTTTTGGTGGAAGAAAGGATGCTACACCTTTAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGCAAAACAAATATTAAAAAACCAGTTTGAAAACTACTGGtaatccaacttttttatttttctacaggggagcaaactttagctcagccaggtaaaacaatttgcctaagaacatagaacaaag-------catggcagag--------------ctagaattaaaatcccag----------------ccttctagg--------------------------------------------------------------------tgctccaagtctggcgttgcagcc------------------actg-caccaTATTGGATT--------GTGG-----CAGTCATCCTGGTCTTCTGATGGCTTCATGAGGGCCCTCTGTATTTAGGTGAGAATATTCCTGAAGTTTGGCAGATTATATTAATATTTCCAGGTGTGAAATAAAGGTAAAAGTTTTATGCTCAGGATACATATTTTTCACATACCCTTTTAAAATAACCTTTCTCTTGAACTTAAG-----TTTCTTTTGAATGCTTTCTAT-ATTATGACTTTCAAGATTATCCTAGGACTCTAAAT-------CCTATTTTTTATAGTACTCCATGC-----------AAACAACATCCTCCAAAGTGTCTTACAC--ATTTTAGGGCAGAATaacaagtttattttataccagctctgatcggttggtggtggttggccaaagtgcttgtttcactggtttttgagacc--ctctggatctag-caggaaagaatgtgatgatccat-agtgatgtgtgacataagcCCCCAAATGGGGATGGGGGAGTCCATGAGCTAGATAGTATCATCTCTTTAAAGGGGTACCGCCGCTTCTTCTTGTGGATTTATAAGCATAAAATATAAGCTACATCTGTATTCATTCCTAAACGCTGTGTTGTTCATCTTG-GAGTCAGGGGTGGGGAGGCAGGGTTCTAAATAAGACAGAGGGGAAAATACAACAAATGGAAGAAATTGGTCATTTTCTTATGGCCATTCCCTGTTTCTTCAAGGATAGAAGGAGGAACAAAAGGTTGCGTTTCTTGATCTGAAGAGAATATGA---------------------TAATTAGAATGACAGTAGTTTAGTTTTTTGAAGAAAATGGCCCCAAATTCATATTGCATGTATGAAAATTTTATTGAAATAGA--------AAACATTCCTAGCAGGTTTTTTTTTTAACTCCTTAGGATTTGTCTCACGGGGCACTCCAAAAACTGAACTGAGAAATCCCAAGAAAGCTACCTGAATCTTCCTGTGTATTCTTATTCTACATCC--TGTAGAGGATCA-GACTAATCAAATTGGTGGTTTTTGGTAAGTACACCT---------------TGCCCAAGTTTGATAAG-------TTTTCATTCTTATCAACCAGTACATCTGCTGTATAGAGAGTGTGTACCAGATGTATGTTTATTGACATTAGTACATATGACATGATAAGTCATTTGG------TAAGTCATTTTGAACCAACAATATAAATCCTCATTTCTTTGCTCAGTTTACATCTTTGAGGCCCAAGACGAGACGCTA a score=14194 s mm7.chr5_random 32447 603 + 11523536 TAGGCTTTAGT--TTGTCCCACAGATAGACAAGAGAAAG-------GGTTTGGGGAGACAGAGAGCTC--------------CTGTAACTAGCAAACTATAGTGAGATCAGTGAG----TGG----------------TTTT----------TGCTTGATAAAATTCCCAACACAAGAACAACAGAAGCTGACAGTATTTTAAG---------------------CATGCCGTGCCCGTCTCTGCGTGTGTGTTATGAGGATATTCCTTTGGAAACGGAGGGAGCAAGAGAGGCCAC------------ACTTGATGTGGTTGGGAGTGGAGAGTGTTAGGTGGATGCCTGCACCATTTACACAAAAAAATCAGTTGTTCCTCATGCTGCATCGGAGAAATTAAACCAGCCTACCCACAATACTGTGGGCAAGCTGT---TTCCAGA-AGTTTCCCTAGCCATGTTTTATTGTGGACAGAACCTACATATGCTTCCAATATAAAATGTGAA-ATCTTTTCAGCACCTTTCCTGGTAGAATTTTGAGAAGAAGGAAGCAAC-ACCCGACTGTGTACACTGCCCCTCCTAGTCT---------CAAAGGTCTCCA-GGAGCTGACTGCTCTCTGTTGGGC-CGCAGATAACAGCAGGCTTGCATTTATGCAACCCATAGTTACAGGATTTTCTGATTCGGTTAGACTT s bosTau2.chr6 38353917 694 - 69624268 TAGGCTTCGGTGGTTTCCCAGTAGACAAGTGAGAGAAAGCTGAAGTGGTT--GGAAAACTAACAGCTCAGCTGGCTTACCTCCCGTAACCAGGATACAGTGGTGAGAGCACTGAGGCAGTGGCCAGGATCAGCAAGCATTTTGATGTAAACATGCTTGATGAAATCCCCAAAA-AAGAACAGCAGAAGTAGGTAAAGTTTTAGGAGAAGAAGGAAAAAGGGAGTGTGTGTTATGTGTGTGCATGTGTGTGTTATATATGCACACATATATGGCAGCAGAGGGCAAGAGTGAGGTCACTCCACACTGGATACTGGATGTGGCTGTGAACTGTAGGTTACAG-CAAATTTTTAT-TTATGTTCATACAAAAATAAATTTCTCTCTGTGCTGCTTTAGAAAAATCAAACTAGATTAACCACGGTTATGTGGGCAAACTGTGTTTTCCAAACAATCCTCCTAGTTCTGTTTTACAGTGGAAAGAACCTAAAAGTGCTTACAGTGTAAAATGTGAAGGTCTGCTTAG--CCTTCACTTGCAGAATCTTGAGAAGTAAGAAGAAACTACCAGGCCATGTAATCTGCCTCACCCAGTATCACCAGGACCAAAGGTCTTCACTGGGCGGGCTG--CTCTGATGGGCTTGGAGATAACAGCACCCCT---CTCACATAACTCATAGTTGCAGGAATCTACAGATGAATTgggctt a score=13167 s mm7.chr5_random 33050 1292 + 11523536 TCAACATCAGAACACTTGGCCTGGGGAGTCAGTGTCCAAATTCCAACCCAGTTAGTGCTAAATCTGTTAGCCTAATCTTCAGGAC--------AGAGTTTACCAGGCCCACCCCTCTTCTGGTTTACATTGGGGTTGGTTTATAAGGAGCAACTCTGTTGGCCATTTGTGGGCCATTCTCATTCTTGCTCTACTATAAATGGGGATTTGGAAAAAGGAGAAATAACTAAGGGAATTACATTTTCTGATTTTGGATGGCACCCGATAGCCTATGCTTTTCTGAGGCCAG-------------TGCAGTGCGTTTCCTTTG-------AAAGTCTCTTCACATGTGATTAACTCAGAG--CTCCCACTCTGTCTATATGAACTTGAGAATAAGTGATTTGCTCGCATCGGGGCTGTTTTTATT--CATTAGGG---CTCAACTAAAATATTAACTCCAAATGTGCATGCTGAAAGCAGAGAACATGTGAGAAATGATGCATCAATT-CAACTCCACCACCATTTCCAGAGTTTAAGAGATGTTAATCTCTGACAGACCACACATTTCTTGACAGTGTACCGT-----------------------------------------ATTTTCTGTTTATTTCCACCAAT-ACACTAAGAGCATATTTC---CTGAAA--------------TTCTTTAATATTGTTTTGCTTCCTA-GAACCATTCATATAGTCAGT--------CGTCAA--CCCGAGCAACTCTGACTGCCTAGGCAGGTTGTAGATAGAGGCTGGAAAATGGCTCTCCTTC-----------TCTTCCCTTTCCTCAGAAGTA-------------AACAAAGCAAGT--CATTTGTTCCTAATATCATGCTCATTTCACCTTCAAGACTTGTTTGTAGATAAATGAACATTTCAGTTTTTCATAA---CCAGGCTCCCCACCCCCACCCCCTTCCCGATCATGAGCCCTATATAGCCGCACT---------------------GGAGGAAA------------------TTATTTAAACAAGCTCTAAGAGCAAGTAGC----AATCAGATTGTCACATAGCTTGACTCCCATTTCTTACTGTGG-GTAATCATTAACCAAGGCGATTACAGTTGGGAGTCGGAGAGAGAGGATGA-----------GAGGAAAGTGCATTAACAAGGAAAGGAAAGCAGGGACGA---ATGAGGAAGGAAGACAGTGGGCCTCGGAAGGAACTGGCTCTTCCAGCCTGTGTTCCCTCAGCTTAGCCCTG------AGTGTTGTCTC-----------CTGTATGGACCGAAGGCCATG--TGACT---------GATGGGTGGC----CAGGGACTTGGGGTTTGTGTGCTCGAACACAGAGACCTATGTGAGCGTCTGAGTCACGTGATTGGTATCAGACCTGATAGTGTGAGAGCTCCTTTAGG----CAGGATCCCCCACCATGTGGCAGAGACCTCCCCAGGAGCAG s bosTau2.chr6 38354840 1447 - 69624268 TCTACATCAGAAC-CCAGGACTGGCAATAGGGCATCCAAATCTCAAATAAATTAGTGTTAAGTCTACTAAGGCTGGCTTCAGGACCTATGAGAAACACTGACCCAGTCTGTCCC-CTCTTGTTCTTCATGGCGACTGGTTTACAGAGATAAA--CTGTTTGC----TGTAGGTC---CTCACCTTCTCTATGCCATAAAAGGCTATTTGGAGAAAAAAGAAATAACTAAGCCTATTAAATTTTCGGGTT-----TGAC------TAAGCCGTGC-TTTCTAAAAACAGTTTGCAAGAATGATATAGTATATTTCCCCTGAAGCATTAAAGTCGTTTCACACTTTATTAACTCAGAGAATATCCAGTCTTTTCCTCTGAGACTGGGAATAAATGACTAGCTTAAATCAGAGACGTTTTTCCTGGTATTCTAGTTTTTCAATTGAAATATTAACTCCAAGTACACACAAGGAAAGTACAGA--CTGTGAGGCGTGA-ATAGCAATTATGTCTCAAACAACAGTCCCAGAAGTTTA-------TTATACCTGAAAAATCATAAACTTCTTGACACTTGACCATTTCATTCTAAACACCCTAAGTTCAGGAAAACTCTGGATATAAGTTTCTGCACATTTCCTTTCTTAACTTTCAGTCTGTATTTCAGACTGAAATACAGTATATTCGTTTAACTAATATAGTTTTGATTTCTGTGCAGCATTTGTAGTCTTTGTAACTTTTATGTAAATTTCCAACTAACTTTAACTGCCTAGTTAAATTATAGACACTGG--GAAAACTGGTTCTCCTCCATCCGCCCCCAACTTTTCCTTCTTCTAAAATATATCTTTCCTCAGAATAGAACAACTTCCCTCTCCTCCCCCAAACCTGCAGATTCTACCTTGGAAAAAAAATTAGACAT---TTAGTATTTAAATAATTCATAAATGACAAACTCTTC-------TCCTTTCCCTAGTTTAAAACCATATGTTACCTCATTTTGTTCAAATGGTGAATTCTCGGTAAAAAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTTATTTAAACAAGGATTAA-AGCAAACAGCTACTAATCAGACAGTAGCATCAGTCTAGTCCTATACGATCATCTGGAGTACTTATTAACC-ATGTATTTACATTTGAAAACCAGGAATATAAAGTGACAATTTAAGATGAGAAAGAGAAAAAAATAAGAAAAAGAAAAGATGAAAGAAGTATGAATAAACAGGAAAAATGGCAGCAG--------TGCTTTT-----TTTTTTCCCCTCCCCAAAGACCAGAGATCCAGTGCTGCTTCCCCGTTTCTTACCCCCTGAACAAGAGGCTGTGCCTGCCTGTGTGGCAAGATAAGTGACACTACTGGGTCGTGGAGGTTTCCTGTATGGACA--------TTTATGAACTTCTGTATTATAT--CCAGCGTCAGATTAGTT--TGTGATTTCTCTTCCAAGTCATCAGGACTCACTAC--TGCATTGGAGAACTGCCCAGGAGCAG a score=2642 s mm7.chr5_random 35163 45 + 11523536 GAAAATATTTTTAATTTCAAAAATACCTGTTAATCAGTTTAAGCA s bosTau2.chr6 38357846 45 - 69624268 GAAAATATTTTTAACTTCAAAAATACCCCACATTCAACTTAAATA a score=15599 s mm7.chr5_random 35827 611 + 11523536 TATCCCTGGCTTATTTCCCTTCCTGGGGGATACTCTTTCACTGGGACACTTGTCTTCAGGTCGTTGAAAAGCAAGGGCATCCACCTTGCACAGGATCTGTGTCACCCCTGCTCCAACGGGAGCAGATCTTGTTTCGTAGTTATAACTGGGATGACTAATGTTAACCAAACAAAATCAG---GTCACACCTAAAACTGAAGCTAATGTTTGACTGTGTCGATCCAGTCCAGAGCCTTTGTTTCAGGACAGGCAACTGGTCATGTTCCTTCCAGAGAGACCTGTGAGATTCTTGTAAATGACTGTTTCACATGTCCCACCACAAGGTCACACTAGGGCAAGCCCCAGTGAGCATGCATTCATGGAC--CATGGGACACTAGCGGTGTTCCATGTTTTCACAGTGTAACTGCTTTTTGCAGCCTAGTA-------AAGCGGGAGGGCAGGACACCCCT---CATGCACATCACAGCAACTGTGCCACCTTATATTAGAGGAAGTCCTCGTTTTCATCTTCATTCATatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagaGAGTATTCTTTCTTGAAATACATTTTGTACACCAGTT----------TGTACACCATTTTTGTGTTCT s bosTau2.chr6 38357933 579 - 69624268 TATTTCTGGCCAACTTCTATTTCACTGTGA--CTAGTGCCTTGGGATACTTGTCT--AGG------AAATACAAGAACATCAACATTAAACAGGATCTGATTTTTTTCTGTGCTG------GCAGATACTGTTCCCTGGTCAGAACTGAGATGACTAATGTTAACCAAACAAAATCAGAAGGTCACACCTAAAACTGAAACTAATGTTTGTCTATGTCACTCCATCGTAGAGTCTTTGTTTCAGAACAGGCAATTTGTCATTTTTCTTATAAGGAGACCTGTGATATTCTTGTATACTATGATTTGACATA--CCACCAGAAGGTAATAAAAGAACATAATCCATAGAGCATGTACTCATGTATAATATGGCACAATAATAATA-GCCATATTATTACCATATAACTACCACTTG----CTAATATACTTTGAAACTGGGGGAAAGGAAAAGCATTTACATAC-CATCATAA-AGCTACATATGCTTATGTTTGGGAAAGTTCACCTTCTAA-----ATCTATTTTGGTATAAATTCAAGAAACTAAATGAATGAA---------------------------AAATACTCTTTATACACAAGTTTTAGAatatatatataacatatatatattct a score=5268 s mm7.chr5_random 37607 606 + 11523536 AGATTTTGAACTACTCCTCACAGAAATGTCATAAGAATTGAGGAATTCCCATGAGATGTCTTGTACTCAAGTGCTGTAAGTTTACTAGCCAGCGTGCTTAGTCGATTTGCTATTAAGATAATTGTTCAAGAAATTCTTTCCAGTCCATCTCCTTTCCTGAAAAGA----------------------GGATTATTTATAAGCCATCTCTTCTCTTTATTGCTGCCCTGTCCTCTGCACATG-GGCTAACCACACCATACAGCCACTTCTCCAGAAACGC--GAGCCGC-ATGGAAGGAAGCGCCGCCCCCTAAGGGTTCTTCACAGGGCTAAATG-----------------------------GTTTGGCC--------------ATAAAATGGGAGTTGCTTTTCATGAGTTTAATGAATT-------GTATAAAGTCCTTACA-AAGACATTTATAGTAATATAATC----TATGATAACATAGTTCTGAGGATAACAAGATAAGGAAGG------------------CGTCTGTCTCT--CCATAATCAGTCAGAGGTTTGGAAAGTTCTAGGCCTTTCTGGATGTTTATAGCAGCATTATTCCTTGGG------TTTGACGTGTTGCCCACTGTTGGTTATCTACAT--------TTTGAGCTAGCCTTAGCTTCAACGCAATAAATGCTTACTCGGTGGGTGTATGTGACCTCCT s bosTau2.chr6 38360604 615 - 69624268 AGTTTTTAAACCATACATTACAGAAATTTCAT-----------------------------------------------------------------------------------------------AAGAGATTATTTCTCGTCCATCTCCTTCCCTCCAGGGAATTTATGTCATCTATTGCATTTAAGTTGCATTTGAGTCATCTATTCTCTTTTATGCCACTCTCTTCTTAGCATATGAAGGAAATAACACTCTCCAACCATTTTCCCAGGAATGCTGGAGATGCTGTGGAATACA--GTCCTCCTCTGAAATTATCCCACTGCGGTAAATTGATAATAATATGATAGCAGTGAGCAAAGCGTCTGGCTTATAAAGATGCTCGATAAAATTGATTTTGATCTTAATGATTTTAATTAATTCATTCTATTACAACATCATTGGGTATTATATTTGTAGTTATGCAATCAATATATGATAATGTAGTTTTAGGTGTAGATGGAAAAGGTGGATTACCCTTGCAGAATTTCCATCTGTCTCTAAATATaattagccagatg--tgcagattttcagtcctcacccacctgttaaagctggatcactctttgggtTCTGTTTTGACCCACAGTCCATTGTTGCTTGTAAACTTTACAAAGCTATGATCATGCCTTTG-------GCACTCAATGTTTGTTGAAAGACCATATGTGATCTCCT a score=11029 s mm7.chr5_random 38886 638 + 11523536 TCTGGCATCCTTCTGTTCTTTCCGCTTTC--------TTGCTAGATTATGAACAC-AAAGACTGAGCAG------TGGTCGCACGTTGGAGCACTTAGCACAGCCCAGTCCTCAG-AAGTGCCC-----AGTGGGT---TAAGTGAGAGAATGAATGTGCGAATATTGTTTCCTTGTCTACATCACCATAGCATCGCCTTT-------GGAGGACAGAAGATGACTTCAGTACCAGTGAACTGACT-GTGTTCTAAGACCACATTGTCAGGGAATGTCCATAGGATGCCTTAAGCAACACGTGACTCTGA---CGAGATGAGGCTTATTATGCTATCACAGAAGTCAGTAGTAGAATTTTAAAATGACCCATGTCTTGAAAACCAGATTGTCAGCAGTTCTCATGTATCTCGGAAG---AGGTGCTCCATTTAAATGAGACACTGTGATAGCTGGCCAGGTCATTAGCCTGATTTCAGAAGTCTTATTTGT--------GGTCTGTCAATCAGCCTGTGGTGGCAGATTGGGAATCAGATCACAAAATGTGATAGTAG---TATATGATGGCAATT-GTTGCACGAAAAATAAAATTGATAACACTTCTGCCACATTG--TTAAATAGGGTGTCTGGTATCTCAGACACTAACCTGTCTGTCCCCTTGAACAACACTGCACGTGTCTCAG s bosTau2.chr6 38361411 661 - 69624268 TCTGCCCTCTCTTTTCTCCCTCCTTCTTCATCTAcccttgcttggctgggaaccccaaggactatgctgcattcatgactgcatcaccaagcacccagcatggcctggcaatcagtaagtgttcgaatgaatgaataaatgagtgactgaatgaatgcatgCACAAACATTGAGCATCTATTTTATCACGTCATTGCCTTCTGCCTAAGGGGTACAGAGGTTGGTTCTAATATCAGTGAATTGACTTGTGTTCCAGGGGCA-ATAGT-------TGTTCATAGCGTGTC----AAAAAACAAAATTCTGAATCCTAAGTGAAGCTTTTGACATAATTA--GAAACCAGCAGTGACACCAGAAAAAGGTCTAAGTCTTAAAAACCAGATGGTCAGCAGTTTTCACATGTCCGTGAAGCCAAGGGGTCTGAATTGAATAAGGCATTTCTATAGCTCGGCAGATCCTTAGCCTGATCGCAAAAGTGCTATTTGGGTGACGTAGGCCTGTCAGTTTGCC--GGATGGCAAGTCAG---TCTAACGACAGAATCAGTGTGTAGGGCTTTATGGTGGTAGTTCTTTGCTTTGA----AAAATTAATAGATTTCCAACCAAATTAATTTGAGTA----GTTTTGTATCAAAGAGAC--ATTGCTTTGGATCTTTGAAATCTCTTGCACATGTCTCAG a score=8233 s mm7.chr5_random 39750 596 + 11523536 ATTGCATACAGTCTTGGCAACTCCA--GTAGATTCCATCAGCCGTTCTCCACAAAGAGCCACTCTGCATATTTCCCACCCCACAAACTGCACAgtctgaagccatctctggttgtcacacattgtcaggtcgtgtgtttgtgcatctcctgggtagacggcagggatgcttccaaacttcctactacacccagggcatcccct---cacaCAGCCAGAATGCTGACAGACCTACAGAAG---------GTTCA-AAATCCTGCGATAAATGGTACCTCGGGTGCCTGCGCAGCTCAGAGTCTGGGAC-TGGGAAATGAGATCATGTGCGTGGAAACAAACAAACAAACAAAAATCTTCCAAAC-------CACCGCATCTCTTCAAGCTACAGCATCTGATAGACTGCAGCA----GCTTCTTTCTCTATTCAGGCATCTGCCTGCCTTCCTGTCAGACTTTTCTGTCCTTC-CCAGATCTCTCAATGGCTCAGGCCAGCAGAGCCAGAATAAGGAGGGAAACGATAAACCCCCTCCTACTGTATGCCAGTGGCTTG------------TTTAGG----------------------------CGTTTGTTTCCTCCAGCATCA---GTGAACTCGTTAAGAATGAGTGTTAAGTGTTGTAATGCTT s bosTau2.chr6 38362389 601 - 69624268 AGTGTATAATCTGTTTATAACTCCAAGGTAGACTCGATcagtaattctcaacagggagcagttttg------------------------gctctctggagatgtttttggttgttacatgtag-------aggggattgggaat-------gtagagggcagagatcctatgagacatgctacagtctacaggagaccccctccacccaaacccagaat--tatcacacccacaatggcagtagccaattcagaaactttgGGTTAAATGACACTCAAGGTTCCTTTGCAGCTCAAATTCTGGATTATAGGAAATT----------------AACTTACATACATCAAAGAATTTTCTAAATTGCCAAACACTATATACATTCAAGCTACTAT-TATGATACAAGCCATCACTGCTTTTCCTTCTCCTCTCTGGTATTTGTGGG----CCTGTCA-ACCTTTCTGTTCTGAGCCAGATCCCTCAAATATTTAGGTCAGAAGAGCCAAGAT-AGGGGTGAGACTAGAAG-TCCCTTCTACTGCTTGTTCACGGCTTGGGAGAACATTAATTCAGGAAGTAGATGTGTCCGAATTTGCCAGTTTCATTT-TTTTTTTCAGCATTACCCATCAACCTGTTGAGAAAGAAGTGTATGTG-TGTAATGCTT a score=13783 s mm7.chr5_random 40361 700 + 11523536 ATAATGGATTCCTAGCAGATATTTAGGTACTGTCAAACTCCGGGGCAGAAAATCCCTCTGCTTTGCCCACTTTCTGGAAAGTAG--CCACCCCTCCTGAGCCATACAGCTGGTGTCCCTGGGAACCCACAGCAAAGT-CTCCTTTTCAGGACTGTGTTGATAGAAGTGCCTGGGAAAA--GAGCCTCTTGGCTTTGCTTCTGTTTATCAAACAGAGCCATGCATTGAGTGATGTTCTTTGCCACAACAGACTGTGTTAAGAGCATCAACATAACCT-GGCCCTCCTATGGG-GAGCTGTTCC-----TTAGTCGGGGGCTT-CTAAAGGTAGAGGCTAGGAC-------TTCGTGATCTCCTGTCTCTTT--AAGACTTTGCTTACAGCAAGGAGACTCACAGAAGGCAGTTAGTGT--------------------AGACGGGTGAGGGGTGCAGGGTGAGCCAGA----GCTCCCAT-CCCCTGCTTATTGTTTGGGGCCCCTAGGTGAATTCCTGGTCCTATAGCCTGACTTCCAGTGGGAACCCTCTTATTCTTTCAGTCTTGGGATGGACGGA------------CTGACAGACCTGCCCTGGTG---------CCAGAG----CTCCAAGAGTGGGAGCAGCCTTCCTGATGTTTATTTGAGTGGGTGGGTGGTGACTTGGTACTGGACAAAAAGCTAA------------ATGCCACATGTTAAAAACCCTCTGCCGAGGCTAATCTTTCTCTCCTGGTTTCTTCCTGATTTGTGGT s bosTau2.chr6 38363492 766 - 69624268 ATAGCAGATTCTTAACTGGTATTTATGTGCTGCCAAAACCCCA--CAGAAAGTTCCCCCACGCCACCC-CTCTGGGGCAGGTGGTTCTACCCCTCCCCTGGTACACAGCCAATGTCCCTGGGAACCCACAGCCAAGTGCCTCATTTCAGGGATATGTTGATAGAAATGCCTGGGAAAAATGAACCTCTCGGCTTT--CACTGTTTATC------GGTCATTCACCGAATGATGTGCTTTACCGTAACAAACTCTG-TACCAGCATCAGTGCAGTTGAAGACCCATTATGAATTAACTCTTCTCAGAATTAGCCAAGAGCTGACAGAAGGTATGGCCCAGAGTGCCTCTATTCTAGGGCCCCTTTATCCTTCCAGGATTTTCCCTAAATAAAAGAGAATCATGGGAGGATTTTTGTGTGTCCCACGGGCCATGCCTTCAAATAGCACAAGGTTACTGGCTGAGGTAGAAAAGGTTGCTGTGCTTCAGCTTTCTGTTT-GGGCCCCCAGGTAATTTCCAAGTATCCTGCCTCCATTTTGAGC-AGAACTGCTGTAAACGTTCAACCTCTGGGGTAACAGAAATGTCCCTATCCCCAGAGGCCTGCCCACCTGTCCTCAAGCCCAGAGGCCTGCCCGGTGGTGGGAGTGTCTGCTCTGCTGTTGACTCTAATGGGT-GGTGGTAACTTGGCACAGAGCAGTAAGATAACCGCTCAGCGTGAGGCCAAATCTTCGAAACTTTTTGTAGAAGTTGGTCTTCAATTCT---TTTCCCCCTCATGTGTGAt a score=2165 s mm7.chr5_random 91855 48 + 11523536 GATCCTGAGTGGGCCCAGGATCAAACCCTATGTGAATTACTCTTCTAA s bosTau2.scaffold2146 113688 48 - 133620 GGTCTAAAATGGGCCCAGGATCAGAGCCTAGGGAAAATAATGTTTTAA a score=9019 s mm7.chr5_random 92229 284 + 11523536 taAAAGCAAAATAGAAGACAGGGCAAGATTTGGGGGTGGGGGTAAATGCATCCAAGTTACTGTCATTGTTCAATGTGTACCTCACAGCTGTTGATCCAGAAACATGGCCTACTTTTAGAAGTCCAGTCAGACTTAAGACTGATGGCTTAGTTTTCTTAATAGTATACAGAACTGAATTGAACTAGGAATATAAAAGGCGTGGTAACATGGCTACCTAATTAGCATCATGATTAGGTACTTTCTCCCCCTGAAGCACAGTTTTACACATGAGTAGTCAGAAGAGC s bosTau2.scaffold2146 113737 259 - 133620 TAAGGACGCCATAGAGGACAGGATGAAAGCTT----TGGGGCTAAATGTGCCCAAGGCATTGTCATTGTTCAGTGTCACCCTCACAGCTGCTGACCCAGAAATATGGATTATTTTTAGAAGTTTGGACAAGCCCAG-------AGCCTGACTTATCTCATAGTACATAGAACTGAATTCAACTGAGAACGCTGAA----TGGCA--GTGATCACCGAAGTAGGGCCATGATGAGATGCTTTTT----CTATAGGGCAG-TCTATAC---AGCAGTCAGAAGAGC a score=22180 s mm7.chr5_random 94265 579 + 11523536 CACACAAAATGAAGACCCACACTCCATGTATTTTTGCCAGAAATCATAACCATGAGATCAGCTCGAACAAACT--AATTTC---GAACTGGT----CTGTATTAAGACCGTCAATGCCAAGTCAACCAGAAGACTTTTCAAT-----AGCCTTGAGCCTATCTGTACCTCTAATGGGCTAGCCATAAATAAGAGACATAAAG-TAGCAACAATGAGCTTGTGTGTGTGTGTGGGGACGGGGGGGGAACCTAGCTAATTTACACCATAATCAAAATACCCAGGAATCTTCAACAATTGAAGAACTGATGCCAGTCTCTGTCGTAAGCACACCCGACTGTATTATTTCACATGTGAATGTAATTTCTAAATTGCAGTGTATAATGTGGAAGGGTGTGCGATTTCTGAAAAGCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGTATTTA---------TGTTTCTCTGTGGCATCGCTCCCTGATGAGAGAAATCAAAGGGATTATTGGAACAGTGTATTAC--AGGGCTCGGGAGCGGAACAGTTGAGAAAACGACTATCATTAATCTTCACGCAGCTGAACAGAGAGAGCAGAGGCGGGAGCCTCGTG s bosTau2.scaffold2146 116298 563 - 133620 CAAAAAGAAAGAAGACACACTCTCTATGTGTTTGTGCTATGAACCATCACCATCAAATCAACTTGAAAGAATTTTGATCCCACAGAAATTGTGCTGCTGGGCTAAGCCCTTCAATGCCAAGTTAACCAGAAGGCATTTCTCTTGTAAGGCCATGAACCTGGGTGTACCTGTAATACCTTATAAATAAATAATGGACGTAAAAACAGCAATCATGAACTCA--------------------GAAAAATACTAGCTAATTTACACCATAATAGAAATACCCAGGGATCTTTAACAGCTGAAGGACGGATGCCAGCCTCCCTAATAAGTATACCAAACCATATTATTCCACATGTGAGTGTAATTTCTAAATTGCAGTGTGTAATTCAGAAGGGTGTATGTTCTCTGAAAGGC----------------------AAAAAGTATTTATATGAATGCTATTACTCAGCTGCATCATCCCCTGATGAGAAAAATCAAAGAAATTATTGGAACAATGTATTCCTTGAGACCCAGGAGCAAAATGTTTCAGAAAAAGGCTGTCATTAACCTTTATGCGATTGTGGAGATAAACCACTGCTCTGTGCCACGTG a score=20172 s mm7.chr5_random 99152 564 + 11523536 TTCCGAGGGTTTCGGTTACAAGTGATTCCA-GTGCCGTTTTCTTCGAAAGAATTTGTTAAGCGT-GGGGCTCTAGAGCCTGCAAGGACTTCTGGAACTGGTTGAATTTTAT-------GTTGCCA-----------TGAGAATGATA-----AGACAG-TTAAGGCTCAGGTTGAGGGAAGGTGCTGAAGAAATAGTGACATTTGATTTTCTGCACA------GTAGAATCTCAGAATCCACCTGCTTGCTCAGTAGATTTGAGGCAAAGGAGGGCAGGAAGTGGAAGTTTGT----AGGCCTCTCTTCTGGGCAAGGCTATTACATTATTTTTTATTGGGAAGACTTAATTAGAAGTGGAACTTACATCTGTTCCAGCCTTTCATAGCATTCAGGGAAATTGGGTACTGATGAATACCTCTGCAAACCTGAATAGAGGGGCTGCCTGAAAGGTGATGTTTTGAGTCAGTCAGTCCAGTGGATAATG-GGAAGAAAACAGAAAGTTAGTGGGAGTAAATTAGTGAAAAA-AATTCTTAAAGCTTTTGACTTAAATGTAAGAAAT-AGACAGCAATTGATAGAATTTTCTTTCTGGACCTTCAT s bosTau2.chr25 13958399 584 - 41414979 TTCTTAGGATTTTGATTACAAATGCTTTCATGAATGGATTTCTTCCGGGAAGTTT---AAGCATTGGGGCAGTAAAGTTTGCAGGGAGTTTTGGAATCGATTGAATTTTCTCTTATTAGTTACCAGCTTAACATGATGGGAACGAAATAGATGTACAGCTTAAGGTTCAAGCTTAGTGAAGATGCTGGAGAAATAATGATACTTGATTTTCTTTCTGCTTCAGGAAGAATCTCCTAATCCACCCGTGTGCTCA-TAAATTTGAGGGAAAGGAAAGCAGAAAGGGAAAGTTTATTTCTAGGGCTCTATAGTGGGCCAGGCTATCTC------------TGGGAAGACTTAATCAGAGGTGAAGCTTAAATCTGTCACAGTCTT-CACAGCAGTCAAGGAA--TTGACACTGATGAATACCACTGGATCCCCGAAAGGAGGGGATGCACCAGAGATTAGGTTTGGAGTCAGTCAGTAAAATGGATCGTGAGAAAGAAAATGTCAAGTTTGAGTGAAAAAAGTACTGAAAAAGAAGTCCTACAGCTTTTGGGTTACACGGAAGGAAGAAAACAGTGGTTGATATGATTTCCTTGCTGGATCATCAT a score=30066 s mm7.chr5_random 100873 1380 + 11523536 CTTTCCCCACATTCTCTGGAT----TTAAAGGTGGTG-------ATACACTTCGGATTGGCACTGTGTTGTAGACAAGAAAACA--TCTAAGA--------------------GTTGTGGGTGACCTAGTGAGCTAATGGTAGAGGTAGGGCAGAGCTGCAGAGGCCAGTCCTCCTAATATATAGGCCATGGCGTTTCCCACTGGGCTGCACTGCTGCCATTTAAAAATATTTCAGACTTATAACTGAAGCTTAATTTTATAAACCTAATTTGTGTCACTTGTACCCTTGTGGATGCCCTAGATTAAAGTAGCCAAGTTGTGCTTGCTCGCTCTccctccccccccccccccccccccccccGCCATAGGGAGGA-------AGAGGTGCTAGAAA------TGTGCTGGTTTGATTTCCCGA------------GGTGTCTTTCTAGTCTTTGATAGGATTTTTAAAAAGTAGG-------TAAAATAAAGGACTCACCTCAGGATTGAATTTTGCATGGGCT---CATCCCAGGCA---------------------TTCCAATGTTATTTTTAACTTGAACCTTCGTCAGGATATAAT--GAGTTTAAAT------------------------------GGAAAAGAGTACAGAGGCAGCTGTTTGTAAACTCCAGTTCGGATCCACCTTCTAGTAAGACTGAAAAGA----GGAAGGGACTGGGAAAAGTGTCTCCATTTCTGGGGTGTTTTAGAATTTCCCACAttctatgttttttttttttgtttgtttgtttttgttt-------tgattccttttgttgtggcctcttttcttggctaatgttttgtttAAAAACAAGTGCTTTGGTATTGTAAAACAAATTATC---CTGGTTTAGGGATTGTGCTCTCAGATAAAAGGCCCCAGGGTAGGGCTTTTTTTTTCTGCCTTTGAATCCTAGTCCCCTAGGTCTGCCTGAGAGCAAAATCCAGTTTATCACGCCGCTTCCTATCTAGCCTAGTGTGGTTCTCTAA-AGCAAAGAGTCTGAATCTGAAAGGGAGAGCCGGGGACTGGATTTAACTCTACCTGGGGGCCTTAGTGGGG-TCTGCGGAGGATTGTGGAT--TGGAGTTTCGTCTCTGGTTAGAAAGAACCATCCGCAGTTTCTTTCTGAGTTTCGTCACCA------------------------GTCTGGAAAATCAAAATTCTCCACAATACAGTG-TGATAGTGAAAACAG-GACCAGGCTTTCAGGCTGTGTTGTATGTGAGCACATGCTCGGGGTTCTGCCAATGACCCAGAATCCCATGTGGCCACA-ACACGTAATTCGATTTCACAGTTTCTATTCTTAAATTTGCAGGAGGGGGTTTCT-GCAGGAGTTACATAGTGATTATAACTTAGCAGCTTCCTTTTAGGGTAGA---TGTAATTGTGAGACAAATATTTCCTGAAAGCCGTAGCCGGGCATTTTGTATTTG-GT-----------------GGGAGAATACCCTTTCAGTTGTTAAAGCTGCTGGAAAA s bosTau2.chr25 13959466 1475 - 41414979 CCCTCCTCAC-TTCTGTGCATGTTTTCAGAGATGATATATTAATATATTCCTTAGGctttcaccttattggagatgagaaaacagatctagaaaaatttcatgttatgtaactgctctgtacgacctacagggttagtggtag------gacagctatgtggaaccccggtttcctaatatataggtcactgcttttcccactgctccatattgGTTCCATT----AATTTTTTAAAA----AACTGAACTAAAATTTTTGATA---AATTTGTGTCATT------CTTGCAGAAGAACTAAGTTAATATAGCTAGGGACTGTGTGATT-------------------------------TTGCCCTAGGGAGGAGGGTAGTAGGCATTTTAGAAGCTAACGTTTGCCTGTGGGGTTATCTGACCTACTCTGGAGGACATCTTTCTATTTTTTGGAAGGTTTTCTTAAAAGTGGAAAGTATCTGGAGTGTAAGAATC--CTAAGACTTTGGTTTTGCATGATTTGAATATTCCTGGAAGGGCAAGAATTTTTTGTTTTGTTTTACTCTTTTTTTTAGGTTTAAATTGGTTGAGTATCCCATTGGAGGTTAAAGTTAAAAAGACATGAATAAGAAGAAAGGAAAAAAAAAAAAAATGGGAAGAGCTCAGTGCAAGC-CTTCTTTACCTACATTTCCAAGTCTGGCAAATAAGACTTTAAAAGAGGGTGGAAAGAA-----CCACCTT-------------GATTCTCAGtgtttggctttttgtttgtttgtttgtttgtttttttTTGGTCTTGTGCTTCCTTTTGCTGTAACCTCTTTCCTTGGCTAATGCTTTGTTTAAAAACAAGTGCTCTGGTATTCTAAAACAAATGATCTAGCAGGCTCCCTGATTGTGCTCTCAGATAAA-GACCCCGGGGTAGTGCT--------CTATCTTTGGATTGCTGTTGCCTATGCATGCCCAAAAGCAAAATTCAGTTTACTGCGGAGCTTCCAACTCCTGTGAATGTTGTTATCTAAGAGTAGAGAATATAAATTTGAAAGGGGAAATGTGGATTGGGGCTTAACCCT-TCAAAGGCCTCTGGTGGAAAGCTGCT----ATAATGGGTGATAGAGTTGTGTCTGAGATGAGAAACTGTGGGCTCCAGTGTGTCTTTGAGTCTTTTTGCTAAATGACTTTGGTTGTGTTATTAATGTCTGGAAA-TCTAAACTCTCAACAGCACATTAATGATAATGAGAATGGCGGGCAGGCTCCCAGACTGTGCTGTGGAAAAGCACATGTTCAGA-TTTTGCCAATGACCCCGAATCCCATGTGGCCACAGACTAGTAATTTGATTTCACAGTTTCTACTCTTAAATTTGTAGGATGAGGTTCCCAGTAGGAGTAACTTAGTGATTATAACATATCAAATTCCTTTTAGGGGAAATATTATAATTGTGAGAAAAATA-TCCATGAAAGCCTTTGCCAAGTtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtTTGGGTAGACCATCCTTGGAGTTATCAAAGCTTCTGCAGAA a score=3479 s mm7.chr5_random 102499 89 + 11523536 TTTTGTAATCATTATTGTAGAAAACAGTTTTGAGT-ATTTCTTAGGACAGTGGTAATGGTAGTGTTTTAAAATAACTTCTTTTGTGTGTT s bosTau2.chr25 13961181 84 - 41414979 ttttggaatc-----TCTAGAAAATATTCTTGAGTCACTTCTTGGGGTGGTAGTAATGGTGGTGGTTTAAAATGA-TTAATTTCTGTGCT a score=35614 s mm7.chr5_random 103467 1092 + 11523536 TTTCCTCTTCTGCTC---CTTACGCTCCAAGAAACTAGGACTATATTTAATGGCTGATAATGCAGTAAAGTACAGTAAAGCACAGATGACAGAAACATTTCTTTTTCTGCACT---TGGTACTTAATCACTCTTGT-------GGGTTGGGGTGAT---------AGGCAGTGTCTATTGTTTATGTTTTTCTTCAGCCTTCAATTTGATCTCGACAGTGACTTGTCTATTAATGCTCAGAGCATATATCAAAATTTTACTCTGTGATCTGTCCTTTTAGAAATCTAATTCAG--TGAAAATATCCACATAATAGCTTTGAGAAATATGTAAAGACAGACAACCAGCCATGGCAGCTGTGGCTCTATTAAGTAAATGAATCTTATCTTTGCTGCCTGGGTAACTTAGTAAACATGTCTCATCAGTCAAG-TGTCTTTATCT-GCTACACGATGAAAGGTAGATTCTTGACTAACAAAAATGA-------AAGAATTTCCTCCTCTTCTCTGTCCATCCCTGAATAGTCTCCTTCATTCAATTCCACTTTGAGCACTTAAAGCCAAAGGTAATGGAATTTGCCTGGA----TTTCCTTCCTAATT-TGTTTTTTTCTTCCCCTGAC--TGAAGAATCATTGGGTTCTCAGGGGAAGAAGTTGTAGCTGTTATTAAATAGCAGGGTTGCTTGTTTGTTTTCTTTGGAGAGGGCTGCTTTCCATAAAGGTATCAGAACTAGACACTGCACTTGAGCTGTGTGCAAGTTCAGGGAGAGTACTGGCTGCTGCTGCTGGCTGTGGTGACATGGTACTTGCTGGCAGGCAGGTGAGCCCTCTGTCAGTGT---GAAGAGCTGTCCCCGCTCCCTCCCCCCCATACCCCCAATGTGGTAATAGCCACTATTCACTAAACAGGTGACACTCCTCCAGTCACCCCTGTTCAGAATGGCTTTCTGTCTTTCCAAAAGTACACTGGAGGCTTGTTTTGTTGCAGTTCATTGATTAAATAAATATCTCTGTGTTCACAAAGGAACTGAAATCAGTTATAGCACTGGGCAGTTAGCTAGCTGTCCATTAGTATCAGAGCAAGTACTGTCTGTACCCCGACCC--------CCATTCTTTTCTCTCCAACACGAAGGT s bosTau2.chr25 13961453 1072 - 41414979 TTGCCTCTTCTACTCGTTCTCAAATCCCAAGAAACTAGGAATGTAAGTAAAAGTTGATTAAACAGT----TACAGTAAGGTGCAAGTGTAAAACGCATTCTGCTTTCTGTACTAGATGCTTCTTAATCATTATTGTTTCTGTAAGGCTTTGGTGATGTTAAATTAAGTTGGTGTTATTTATCTGTGTTTTGATTCAGACTTTAATTAGTTCCTGACGATG-CCTGTGTATTAATGTTCACAGCATACATCAAGATTAAACTCAAAGATTTGTCCTTTCTGAAATCTGATTCACACTGAAAATATTCTCATGATAGTTTTGAAAAATGTGTAAGGACAGATTACCAGCCCTGGCAGTTATGACTTCGGTAAACAAATGAGCCTTGTCATTACTGCCAGGGTAGACTAGTAAACGTGTCTCCGTAGCCAAACTGTCTTTATCTTGGTACATGAGGAAAGATAGCTTCTTGGTTAACAACAACAACAACAAAAAAAGTTCTGCCCTGCTGGCTGTCCAT------------GCCTCTGATCAATTCCATTCACAGCATTTAAAGCCAAAGGTAATAAAGTTTCCCTGAGGGTTTTTCTTTCTTTCTTCTGTTTTCCTTTTCTTTTGACACTGAAGAATCATTCGATTCTTAGTGGGAGAAGTCCTGTCTGT-GTTAAACAGGAGG----CTTGCTTATTTTCTTTGGAAGGAGATGCTCATGGTAAGGG-ACTGCAGCGAGCC-CCGCACAGGAGTTGTGC-TGAGT----GGAGAGAGCGAGCCGCAGCGGCTCAC-------GTCTGGGCCTCCCTGGCGGGCAGCGGG---CTCTGTGGACCTACAGCAGCCCCTTCCCCGC-CCCTGCCTCACACACCCCTTCT-TGGCTATCTCCAGCATCAACTGAGCAGGTGACAAGACTCCAATCACC--TGTTCTGGGTGGCTTTCCATCTTTTCAAAAGTACATCAGAGGCTTGTTTTGATACAGTACACTGATTAAATAAATATTCCTGT------------------------TATGGCACTCTGCAGTTATCT----GTCCGTTAGTAGCAAAGGAACTACTGCCCGTTTTTCTTCCCTCCCTGCTCCTTTTTATTCTCTTCACCACCAAGAT a score=59400 s mm7.chr5_random 105043 1284 + 11523536 TTTCTGTTTTCAGTTGAGGGTGGCGGAGGGCTGGTTGTAGTGTTAGATTAAAAAAAAAAAGGATG-ATTTACAGAGTGTT-CCTGTAATTCTTCACATGTTAGCTACTAAGTATGTCAGCATTAATGGCTGATTTATGCATCAAGTGTGAAGTGAGCAAAATTCTCCTTTTCCTACAGGATGTTA---AAGGGGTGCCGAGTGGGAAGTGGGGAGGGGAGAGAGGGAGAATGAGAGAGAGCA--TCAGTGTGGCGGGAAGGATGCTTA-GTAGCATTTTCCTGTGAAGGGAG---CAGCTTGTTTGGAAGTGTGAGCAAGG-GAGGTGTTGAGGTCTTAGTCACGCCTAACATTGTCCCCTGCTCAAGAGAGGGGGACCCTTTTGA-------------------------------TGACTTGAAAAACAGAATCCTGGGAACCTTGTGGCTGTGAGGACAGCA-----GCCCCAGGAGAACGG--CTGTAGTAGT-----AAAGAGAATCTCTTAGTGCGTGTCTCTTCCAACTGACTGTGGGTAATTAGTTGGAAATGACATTAACCTGAGCTTAATTGTAATTTTGCATCGTAACAACATACCAGCTGTTCACTGTATTCTTTCCTGGCGGTGTGATTTAATTATTTTTTTTCCATGCTATCTCTTAAGCTCTAATGTTCAGTTGTGTTTCCTTTTAACCCTTCCTTGTGGCTGTGTGTCCACGGCCCACACAGTTTGGCAGGCATGTCATTTCT----------------TTCTGTGATGAGGGTT--GGTTGCTGTTGGGTTTGTGAATGACTCCCCTATTTAAATGAGGCCACTTTGGAAAGGCACTGAGAT-ACGCCTGGATGACTGGAAACCTTGCTGTATTTAGGGCTCCTCCACCAGGTTTTAGCTTATTATATAAATAATATGGGCAATCGTAGGCCTATCAAAGGTGCTGAAAATATCAACTGAACAAGCC-AAAAGAGAAGTTAATTACTGAACAGTGATTGCTCTGATATAACCAATTATTGGATCATTAAATGTTTATTACCTTTTATATGCTCTTT-CCCCCATAAGAGCAGTTTCTTTTTTAAGTCATTAAAATAGAAATGGGATCTTAAAAAAAAATTCTGCTTAAAAA-TTTCCACAAGACTGAAGTATTAAAAAGGTCTTGTGTGATCTGACAGCTGAATAGCCTATTTTTCTTTGGTCTGTTGAATTAGTAATTAATGAAATGTATTGGTTGAGCAGAGAAAATAAGATTAATTTTGCTTAGGAAATAAACAGAAGCAAAGCTTTACTCTCCACCCAATGCAGGTGAACGTTAAAGAGCAGTATAAGAAGTATATAAAG s bosTau2.chr25 13962839 1323 - 41414979 TTTCCTTTT---ATTTGGGGTGTGGGGGTGCAGCTGGTTAGGATGAATTAAAAACAAGACTGATTTATTGATAGAAAGTTATTTGTAAACTTTTAAGTATAAGCTCC--AGTACCTCCATTATAATAA-TGGTTTGTGTACTAAGTATGAAATGATGAATAATTTCCTTTTCATACAGGGCCTTAGAAAAAGGGTCTGGGATGGGGAA---GGAGGAGGAAGACTGAGGATGGAATATAGGAGATTAAGCTTGTGGAGAAAACACTGGCACATTCTTTTGGTGTGAAGGAAGTGTCAGCAGGC---AGAGTGTGACCAAAGCGAGGTGTTGAAATGTTAGCAGCTCCTAACAT------CTGCTGCTAATAGGGGGACCCCTTTGACAGGAATGAGATGGGTGCGCTTGTGTAGCTGTGACTTCAAAAA--AAATATGAGGAGCCTTGTATCTGTGCTGATGGCACAGACACCTAAGCAGGAAAGACTTGTTGGGGTGGGCAAAGTGAAATCTCTGAGTG--TGTCTCTTCCAACTGACTGTGGGTAATTAGTTGGAAATGACATTAACCTGAGCTTAATTGTAATTTTGCATAGTAACAACATACCAGCTGTTCGCTGTATTCTTTCCTGGTGGTGCGATTTAATTATTTTTT------GCTGTCTTTTAAGCTCTAATTTTCTGTTGTGTTTTCCTTTAACCCCTCCTTGCTGCCATGT--CCACAACCCCCACAGTTTAGCTGTGGTGTCATTACTGCTGCGTTGGTGCCCACTCCACGCTGAGGACTTGGGATGATCTTGGTTTTGCTAATCAGCTGGATTTATAAAGGGGG--ACGTTGGAAAGTTACCAAGATGAAACACGCGTGATTGCAAACCTTGTTGTGTTTTGGACTCCTCCAA-AGATTTTAGCTTATGATATAAATAACATGGATAATTCCAGGCCTATCAAAGGTGCTCAAAATATCAAGTGAACAAGCCCGAAAGAGAAGTTAATTACTGAACAGTGATTGCTCTGATATAACCAATTATTGGATCATTAAATGTTTATTACCTTTTATATGCTCTTTTCCCCCATAAGGGCAGTTTCTTTTTTAAGTCATTAAAACAGAAATGGGAT--TAAAAAAAAATTCTGCTTAAAAAATTTCCACAAGACTGAAGTATTAAAAAGGTCTTGTGTGATCTGACAGCTGAATAGCCTGTTTTTCTTTGGTCTGTTGAATTAGTAATTAATGAAATGTATTGCCTGAGCAGAGAAAATAAGATTAGTTTTGCTTAGAAAGAAAACAAAAGCAGAACATTAACACTTA---AACGCAGGTTAATATTAAAGTGCAGTATACGAAGTGTAAAAAG a score=11545 s mm7.chr5_random 106853 1313 + 11523536 TTAAACGAATTCATTCATCG-TTTCCTTGAGTATCAGCATTAACTCTAGGAAGACT----TCATGTC--CTCTAAGAAA-----------------------------CTGCATTTGAAGAGCAGAGCTATGCCAGCTGAAAGTTTTAGTAGCCACTGATAAAATGTAGGA-----AGTG---ATAGTCCTGGTGCTGACTGAGTCTCTGTAAGGAGGGTG-----GCTCTGAAGAATGAAGGTATAGTTGGGCATGGTGGTGCTCCAgaggctggtccagtccataccttcagttccaggctaattaggactccatggtgagactctctttcaaagaCCACAACCAAAAGCAAGGTATCCCGAGGATTTAAGATTTACTGCAGAGTGAGTGTTGTGATAAAGAAAAGTTCTCCTTTTGGAGGTCACTGTGACattccttggggtcacagcccagctttgccacttgttggctgtgtgacatgttaaagtcattgtttccctgtgtataaaatagtagtctactcttcttaggct--tgtgaggacta-atgatttattaaactgctatgacagtgcatagca----tgcagcaaactgtgtaatag----gttgttcatttttTGAGAGCTAATGTAACAGA--ATTCTTCCTTAGGGAAGACAGTG-TTTGATTGGGTATGGAGAGTTAGAGACTTGTTTCTGATATTAAAAAAAAAAAAAGATTTCTAAGAAATCTCCCCCCTCCTGACCGATTCTGTTTGTGTGATGAAgaggacagaaaagggtcccctggaactagagttagagaaggttgtgagccCACAGGACTAACAAGACCTCTTAGCTGCTGAGCTATCTCTCCAGGCCCATTTCTGGCATTTCATGACACCCTTTGGTGGAATCGCTTAATTTATAATGCCTACAGTGGTGTGTGCTTCTGCAGC-CCATTGCCAATCGATTGCAAAGGGTGT--------GCCT-TCCTCAGAACAGCCTTTTGAAGCAAGAATACTGTTTATGCACATCCTGTGGTTGTGGGAAGGGCTTTGGAGAG--AGGTTTGTCTGCTGCGAGTTACTG--CGTTCATTGATGTGTGCTTGGGGTCTGAGTTTCTCGAGGGTAAATTACACTAGTGAGGGAAAATAACTTTTTA--------------------------------------------------------ATGTTGTAAATTCTATTTTTAAGTCTTAGT------------------------------------GAAAAAAAAAT---------TACAATCACCCACATATGTGGTACA----TTTTAAAGTTGTTTTCTCCAGTTCCT-AGCAGTAATGGGGC-TTGTTTATTTTAAGGTAGATACCAGGTCTCAGACAACTGGATTTATAGGCACTTTAGAAGGAATATAATAGTGATGAGCATTTCTTGAGCACTT--------------GCTGTGAGTAGTCACAACTCTGCGGTTG s bosTau2.chr25 13964205 1247 - 41414979 TTTAATTAATTCATTCATTACTTTTCTTGAGCACCAACATTATGTTTAGAAGGACTGGGATTATGTAAATACAGAGAAAGCGAGCTGGTGAAGGGGCCTAGGGAGACCCTGGGTTTGCAGAGCAG--TTACACCA----AATCCTTTAGTGACCAGTATTGAAACGTCAGAGCAGCAGTGTTAACAGCACAGGTAC-------ATTTCTGTGGGGCGGGTGTGGTGGTTATGAAGAGAGGATTTACTTTTGGAGGCTGAGGTATCCTGTGGGTTAAGC------------TCAGGGGGAGGGTGATTATGAAGTCA--GCAAGTCTTGCTCTTGGAGGTCGCC------------GTGTCCTGTGAAtt------------------------------aacagcaggttct----ttggagccc-------cattacttgggttgacatcccagttttaccattcgcgagctccctgccctttta---cctcggtttcctcgtctataaaatggaaaatgaacaatgaaggattgttgtgaggtgtacatga---gttaagtgcttacgacagggtctcgcacatGTGGAACATCTTAGGTGGTAGTGTCATTTTTC-TTTTTGGTGGGATAATGCAACAGAGAATTCTTTCTTAGGGGAAATGGTAATTTAATTGG---------------------------ATGCTGAGGAAGGGAAAGGATGTTTCAGGCATTT---------------------TTCGTATTGTCA-------------------------------------------TGTGTAACCACA------------------------------------------------------------------------------TACTTAATTTATAATGCCTAGAGTAATGTGTGCTTATGTAGCACCATTGTCAAAAGATTTCAAAGGGCATTTACAACCGTTTATTCTCAGAACAGCTCTCTGAAGCAAGAAGATTGTTTGTGCACATTCTGCTGAGGTGTGAAAGGCTGCAGAGAGCACGG------CACTGCCAGCGACTGTTCTTTAATTGCGGTGTGCGTGGAGCCTGGATTTATTGCGGGTAAATTAGACCAGTGGTGAGAGGAAACGTCTTAGACGTTTTTTGTTTAGCAacttccctggcggtccagtggttgagtggaccccttccactttgggggtccttggtttgatccctggttggggaactagatcccatatgccacgaggcaggaccaaaaagaaaaTGTTTTCGGGGACAGCTATGCTCTGTTGTGGTAAATAAGTTACCAAGATGTTTTCTGTAGTCTTTAAGCAATGGTGAGACTTTGTTTATTCCTAA--CAGTACCAGATTGCAGACAGTTGAATTCAGAGGAAGTTTATACATATGATGatcataatgaatatttgttgagtacttattgtagtccaggcactgttaattgtcataactctgaggtcg a score=44080 s mm7.chr5_random 109011 1771 + 11523536 TTTACTGTGATGAAACATTTTATTCAGGTCAAGAATTTCTTCCACGTTAAGAGTATATATATATACCCATTTCTGTTTGGTGACT-GAGTCTGTGGAGGGAGCATTGGTCAGGAAGTT---GTGAAGCTGAGTTTCTGACAGCGTAGAGTTCTCACAGACTGCTATGCTAAAACAAGCACCTTGCTGTAGATG---------------TCTGGTTATGC-TCATTG--TGACCTTTCGGGGGAATTAAAATAAGCAAACTACGGAATGCTTGGATAAGACTTGCTTC--------------ACTATCGGAACTGTAAACTCCAGTACTTAGCGATTTCTCAAGCCCGTGTGAAAGCCAGTGAGATAGATCACTTTCCCTGCTTCTGTTGGAGCAGCTGAAC-CTGT-TGTTTCCTCTCTCAGCAGCACATCAGGAGAGGAGTTTTGAAG-TTGTCATCCTCTCAGTTAATCT-TGCCTTTTGTCCTAATCTTGAGGGAGCTTGATTTTAAAAAAGTAGGGGTAAGAAAGtgggaagacagctcagttgagcaagcatggagaccca----agttaaatctatcagaacccatgtaaaaaaaaaatcagggtgtgtatgactttaattacagtgctggaagggattcccagg-gctcactggacaggccagctcgtctgtccagactggtgagttagttccaggttcagcgaaacatcctgctttaaaaagaaagggaagagctattgaggaagacactacatgctgacctttggcctctacaTGTAAACTATATGCTCATAGaggaacacaacttcttggatacaactca-tgactttactaaatagagatctcttggaggtgatacccagaaatcgattctaaggagcacctcaaattttatgattgtgttgatttggaaaccagtgGAAGGCGGGAGATTGTTCTCCATCCCATCATTTATTTTCCTTCCATGGCTAAACCGTGCCATGAACAGATTAGAATTGGTTGTCCATCGTGCAATGGTCATTTACGAACTGGCTGGAGAAACAAGGAT--GAATACAACCCATGGTCTGTGGGGGTTCACAGGCAGGCTGAAACGACTTTAACTTTGTGTTGGGTTTTAAAGGATTCACAAGCCGTGTTCCAGACTTCATGGGAAGA----TTTGTGCATGCAGGTTTTTCTAGCTTTCATCAGATTCTCTTAGGGG-TCAGTGACCCATAAAAGGTTAAGAAGCGAGGTCTCAGGCGTGCACAGCTGTT--------------AGAGGAAATGTGTTTCTGTTGCCACTTAGCATGCTTTTTGACCTTCTGAGAGCCTGTAGCGGTTTGAGGCTCTCATCTGTTTTCTGACCCACTTAACATATTTTTAAAAGAAGGAAAAACAGTTTAACAC-TGGGTTACGGTCTGAAT--------AAAACACCTGTTTGGAGAATTGCATCAGATATAATGTTAAAGAGCTGCCTG-TAGTGAAACAGCCCAGTGGTCAGTCTGATG----------CGTAAGCAGGGCGGCACAGGCAAGGTTCACTCCAGCTTTCTTACAGTATATAATTAGCCAAATTGTGGATAATAGTTTTCTCTCCATGGATATACATAAAGACTAATTGTCTTATTTTTGTTGCATTCCAGCCCCAGCATGTCTGTTGAATTACTTAATTCCAAAATAACTTTGCCAGCTGTACTGCTGCTATGTTCTTCCTTATCTCCTAAAATCCTCAAATAACACCATTCATCACAAGACAGAATTGAGTATTGGGGAAGTCCGTCTTTAACCGTTACCAAGAATTCACTTAGT--AATGCTAGAGCCTGGTATATATATTATTGTT s bosTau2.chr25 13966646 1595 - 41414979 TTTATGGTGGAACAACATTTTATTCAGGTCAAGAGTTTCTTCTAAATTACAG---------CATATTCATTCCTATTTTGTGGTTTGAGTCTGTGGAGTCGAAACTTGTCAGGAAGGTTTAGCAAAGCCGTGCTTCTAACGATGTGGAGATCTCACTGGCAGCTGTGCTAAACC-----TCCTGCTGTAAACCAGCCACGAGTCATCCTCTGGTTGTGCATCATAGCATGACCTTTCAGGGAAAACAAAACAAACAAACCACCAAACACGCTAATCAGGttttttttttttttttttttttAGTATCAGGATTGTAAACTCTGACACTTAACAGTTTGTCAGGTCCACTTGGAG--CAGTTAGATAACTTCCTTTCTCTATTTCTGTTTGTGCAACACAATGATGTGTATATCTTTCTTTAACAGCGTATTAAAATTT---TTTTAAAGCTTTTCTTCCCCTGAGTTAAGGTACATCTACGGGTTTACTAATCAggg-----gactctatacaaatg--------------------cagatca-ccgactatcactgaagacctactgaatctgaatctctcaga-------------------------------------------------gggcggga--cccagGAGCACCCTGAAT-------------------GATTGTATGGTTAAT--CAGATTT---------------------------GGAAATGACTAacggaggagcc------tggtaggcttcagtcc-------------atggggtcactgag------------tcggacatgactgagcgacttcactcact-------------------------------------------CACAACAGAGCT----ACTATGTAG----------------------------TTTTCACCCATCCATCTATTCTTATCCATTTAT-------CCATGTCTTGAGTATATGAGAATTGGTTACTCTTGGGACAATGGTTATCTTAGAAGTGGgcatggaaaccagcattagaacataatctctgccccatgggg-ttcacagtctGGTTTACAAGTTTTTAACTCTGAGTTGAGCTTTAAAGGATTTGCAAA---TGTCCCAAAAGTCACGGGCAGAAGATTTTGTGTACACACGTTTCTCtagctttcatcagattctctaagggggtcagtgacccataaaaggttaagaaccGAGGTCTAGCGCTCGTACAGCTGTTCTGAAAACAGGGGCAGAGGGCA-GTGTTTCTGTTGCCACCTACAATG-TTTCTGACCTTTTGAGAGGCAGCAGCAGTTTGTGAATTGCACCTGTTTTCTGCCCCATTTAAAATATTTA-AAAAGAAAAGAATATAGTGTAACACCTGGGTCGCGGTCAGAAGTGATATAGAAAGGAACTATTTGGTGAACTGCTTCAAATTTAATGTCAAGTTGCTGCTTACTGAAAAAATAGCCCAGTGGTCAGTCTGATGGAAGAACCTTTTAAACCAGGATAACACAGGCAAGGTCCACTCCAGTTTCCTTACAGTATGTAATTAGCTGAATTACA-ATGACAATTTTCACCCCATGGATATACATAAAGACTAATTGTCTTATTTTTGTTACGTTCAGTCCCCAGCATGTCCATTGAATTGCTTAATTCCAAAATAACATTACCAGCTGTACTTCTGGCTCATCTTTCCTTAGGTCCTAAAATCTCCAAGTAACACTGTTTATCATGGAACAAAATTAGATATTAGAGAGGTTTGTCTTGAACTGCTGCAGAAGTTTTACTTAGCAAAATAATAGAACCCATTGTGTGTAATATTCTT a score=6480 s mm7.chr5_random 112184 389 + 11523536 GTTTAAAATGATCCATACTGGTAATTTCAGATTATTTACAGAATTGATTTAAGAAAGTGA---TGAGACCCAACTTGGCTCTTCTATGCCTGTTGAGGACACAGTTTAT--TGCAGTAAAAAGAGCATAGTTTTCCAGTAGTGCTGTCTCAGGGTCTAGACTTTCAATTC-------CAATCAAACCCACTGATCATACTCCTGGGTTACTGTTATCTGGGCAAATAACACCACTGATAGTGAGTGACCTCTGGTTACTCTGCATCCTGAAGAGAGAGTGCTTACGTGGGTTTTCAGGGGAGAGGGTTTTGAGTGATGTCTA--TACAGTTCAAAGTTCAGAGCTGCTTCTTGTAAATTTATCTTTATCTTTTTAACTACTCAGTTGTGGGTGTTGTTTAGTT s bosTau2.chr25 13969578 378 - 41414979 gctcaggatgatacatggtggctgccttaaagtagtttcagagcagatttcaggaagagggattTAGATCCAA----GCAGTTCCAC------TGGAGGAACATTTTGACATTCTGTGTGAATAGAGTAGATTTCTAGTAGTGCTTTCT-GGAGTCTTtgagttcagttgttgaaggcattcaaactgactcacttgtcacctggattatcggagtggggg----ttttagcaccaggaattagtgacctttgaggtctccccatcccaaagatactgtTAATTAAATGATTTTCTAGCTAGAGTGTTCTGAGTAA-ATCTAGTCATGGTTCAAAGTCCAGGTCTGCTCCCCGTAGAT---------TCTTTTTAAAGAGCTGGTCTTGGATGTTGTTTACTT a score=7387 s mm7.chr5_random 112986 260 + 11523536 CACTTGTGTTGGA---AAGGGATACCC---TTGTATAGTCTTCC-AGGTCTCCTTT-------GATTGACCTCTCAGAGTTCAGGTGAATTACTGGCAGTACCTTGCCATTTTCCGTGGAGTTTGCCCATGTGTCTGCAGCTCCAAATGGGAACTCAGCTCAGTTATTTGGAACATACAGATTTTTGTTTGAAGTCGCTTAAGTGATACCCATA-GTGATATTTTCGTGTTTTATATACTT--GGGCCTTTGCAAATCTTTTTACTTAAAAATAAAA s bosTau2.chr25 13969977 273 - 41414979 CATGTGTATTGAACTGAAACAATACCAAGATTATCTAGTCCTCCTGGGTCTCTTCTCGTGGTAGTCTGAGCTCTTAAAGGTGAGGCCATTTAAAAGTATCATCTTGGCATTTTTCTTA----TTGCCTGTGTGTTTGCAAATCAAAATGTGAATTAAGTTCAGTCATTTGCAATATATCGGTTTTCATTTCAAGTCACTTAAGTGATGTTTTTAAGAGAGATAGCCATGCTTTACTTACCTTAGGGCTATCCCATCTCTTTTCTTTAAAAAAAAAAA a score=38580 s mm7.chr5_random 113396 881 + 11523536 GAAAAATAAGCAAAACCTTAAATAACTTGTTCATCTTAAGAGTCTGAAAAAGGTGTTTTGAGATAGTTGGAAATACGTGTGAGACTAATGACAAACTCTCCAGTTAAACAGAATTACAC-TAGATTAATCATGTCTCATTATAGTAA----ATATTTTATAAGAAGA----------------------------TTTTGGAGGTAGAAATAG----GGGGTGGAGATGTTGTATATGTTGGGGTCCTTGGTACTGGAA----TGAAAATTTAATCCTCTAGCCCTCTATCTAGTACCAGAGGACATTGTGGATTAATGTTCCTGGTTTTAACTCAGTGTCTTGTCTA---AGACACTTGGTACTGATTCGTTCATC-----GCTGAAGTCTTGAGGATTAGGAGGAGAGAGAGAATGGAAATGTATCATGTTCTCTGCCAGAGGAGGTACTTAAACC---AGAAGGAGGAGGGGATGTTAACAAATCAGGCCTTGGCAGGGAAATCTGTCGTGAATCAGCAATGACTTGGAAAGTCTCTGTCGCTGTATTTTTACAAAATGAAACATTTGCTGCCGCTGCCGAGGCTTCT-TCTTGCTTACTTTTCGGATCAGCTTCAGGTTGCGCTATAAAAGGAATGACCCCCTC------------------CCCATTTTGACAACATTAGGTAATTAATTTACAAGTAGCTTAATTAGACTCTAGCCCATACAGTGTGTGCAGGGCCTTTTGAAGAGCCTTTGTTTTGATGCTAATTGAACTGGTTGTAGTAGCGGAGACAGCCAAAGCATTGACATTCATCTTTGGCAGGAC-AGAGGGCTCTCCCTTGGTATGGATGACCCGGTTTTCTTTTCCTTATACCGAGCATAGCATTTAAAATGCCTTGTGCTGTTTTAAACTGTGTAATATGAGAACTTCGAAAAGTGACAGAAGTCAC s bosTau2.chr25 13970250 907 - 41414979 GAAAAAAAAGC-------------------TCCAGTTTTGAGACTGAAAAAG-TACTTTGTGATGGCTAAAAATATGTTTGAGAGTAGTAACATGGTTTCTAGTTAAACACAATTAGACCTGGATTGGTGAGGCATCATTACAGTAAGAAGATATTTTGTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaTTTTTTTTTTTCTTTGAGTTAAAAAAAGCAGCAGGGTGGGGG-GATGTGCGGGT-GGGGTCAGTCTTACCAGGAAAGCTGAAA--TGAATTCTTCAGCCTTGCA----GTACCAGAGGGCACTGTGGATTAATGTTC-TGGCCCTAATTCAGCATCCCGTCTCTTCAGACACTTGGCTCTGATTCTTTCGTCTCAGAACTGAAGTCTTAAGGATTAAGAGGAGAGAGA--ATGGAAATGCATCATTTTCTCTGCCAAAGGAGGTACTTAAACTGGGAGAGGAGGAGGGGGACGTTAACAAATCAAGCCTTGGCAAGGAAATCTGTCGTGAATCAGCAATGACTTGAAAAGCCTCTGTCGCTGTGTTTT-ACAAAACTAAACATTTGC---CACTACCAACATTTGTCTCTTGCTTACCTTCAGGATCAGCTTCAGGTTGCTCTATGGAGGGAATGAATTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCCCATTTTGACAACATTAGGTAATTAATTTACAACTAGCTCAATTAGACTCCGGCCCATAGAGTTTGTGCGTGGCCTTTTAAAGAGCCTTTGTTTTGACGCTAATTGAACTGGTT---GTAGCAGAGACAGCCAAACAATTTACATTTATCTTTGGCAGGACTCAAGAGCTTTCCCTTGGTATGGACAGCTGCACATTCTGTT-CTTCTACCAAGTGTGGTACTTA------CGTGCTTTATTTTAAATTTCTAGTTAAGAGACCTTTGCAAA-TGACAGAAACCAC a score=4205 s mm7.chr5_random 114741 104 + 11523536 tttgtttgtttTT--TCAGAAA------TGTAGC----TTCTCAAACGAATATGGATCAACCTAAAGAAATAGACTGAAATGAAAGCAAGAAGTGTATATTTTTGCCTCTTGTATG s bosTau2.chr25 13971974 116 - 41414979 TTGGTTTGTTTTTCCTCAGGGAAGATTCTGAAACAATATTTTCATATGAATAAAGACCAACCTAAAGAAATTGACTACAATCAAAATAAGAAGTGGATAGCTTTGCTTAGTATATG a score=37933 s mm7.chr5_random 114975 1679 + 11523536 CCACTTTGTTCTATAATTCTCTTTACCTGCTAAAAC-ACTTGTCTAGAAGTCTGAAATGCAGCTGTTTTATCTCTTCTGTCTGCCGTGTCGGAATGTTCATGTATATTCAG---ACTAAAAGCAAGTTCTCGTGGTTGACTGAAGGAACGGATTGCACAGGCGTGCTTGCTCCAGAATGAGATAGAGAG-AAGGTCTCCCAGGTCAAGTAGGATCCACCCAccaatatcct---tcttagagctaaggaaattgaagtttagaaagatgaagtgacATCTTTCTCTAGAGCAAATTAATTAGTCTCAGCATATGTTGAACTTCTCCTTATCGATGTGTTTTGTTTGGGCGATTCTTGTAGAAAGAAGAG-AGTGTGTTTTCTTTCCAAG-----------------TACACTTGAAAGCACAAAAGAGCCTCTC-TTTCATAAGCAGC--AGTTTCCTGATGTCTCTTTTTCCCTTTTATGTTTGTATTGAAAATAGCCTCAGCTTTTGT--TACAATTCAGCA-------AGCTCACCTTT--CTTTTATTCTTTCTCTTTCTACAGTATTTTTACCTATCTAGTTTGTTTTCTGTCAGTGGAGGTTTGGGTTTGCCCAGGTAGCATTGCCATATGCATGTGTGAATATGTTGAATTGACTTCTAATCTGAAGATTTAAATCAAGGGGTCCCCAGCCCAGGAAGCAGGGATT-------GAGCGGAGGCAGGCAACACAGAGGCCCCCGGGAAGGCCCAGGTGCCGA--GGTCTCCTGATTGA-GAGTAGGGTGCAGATTTCCTC------------CAGAGGCTCGTTTCTGGGTACAGTTTCTGTTTGGGACGGTTCCGTTTGCCAGTACTGCATTAAGTTAGCAGTGAAAATATGTTTGGGGTAAACACGGAG-----------GAAGGGGGTGTTAATGTGTAGTTTTAACAGTTCTGTGTTTTAATTTTT---CATGTGATTTTTAGCCTTTTCCCCTTTCTTACTGAATTATTGAAGGGTTTTATTGAAGT-GTAAGTTCTGGAGTGTAGACACCATGGTAGTTAGAAAAACATGGGGTACTGTACTTGTAGGTTCCATAATATTTCATACTCCTGCTCTTTACTGTATGTGAAATGATAGGGAAGTGTCATAAAATATGCCTAGAGAGCACTTACCTATTTTATGCCCTGTAACATTCAGTGCTTGATACAAGTCTAGCAGATCTGCAATCCAGACAGCAACAAAAGTGGTTTTGTCCCAGGAGAAAGGACTTAGGCTCATCCATGGAAAGTTCCCTGTTGGCAGCGTGTGTTCAACAAAATCACAGAATATGAAACTTTCC-AGCTGTTCATAGGACCTCCACCAATCTTTTCTTTTACACATGG-GAAAGAACTAGTCACTGGTCCAGGATCATTGAGCAGGGTAGGGATTGAACTTTGGGTAGAACCTAGGATTTAACACTTGCTGGAATATGCCTTTTCATTCTGGACTCTTAGTTGGAGACTTAGACTTCGGTCTGATCCCCCTATAAAACGGTGTGCCGTGTGATGTTTGACTGGCTGGAAACCTGTGGATATGCCATGTGGCGGCACCTCAAGCCT--TCCTTTGGCTCACTTTTCCTTGTGAGTTCTGCGGTGCTTCTCTCGTTGCAGCGAGGTTGTGCATGGAGAGAA--AGCTGTCTTGTGACAGTGTTTAGAGAGAATTGCTTTTGATAACAGAACTCCTCTCATCACTAAGTCAG--GTAGAGA s bosTau2.chr25 13972541 1650 - 41414979 CTGCTTTGTTGTACAGT-CTCCTTATTTGTCGAAACTGCTAGGCTAGAATTCACAGCAGTTGATGTTGAATTTTCTGTGTTAACAATACCTGAATGTT---GTACACGCAGTCAACAAATAGCAGGTACTCATTGTTCACTGGATGAATAAATGA---AGAGATATTTAGGTGAGTTGAAGTTAAAGAATAAGATCTTTCGTCTGGAACTGCCCCCACTCCCC----tccccagttttatagcagaagaaactgaggcttagaaagattaagtgacatcttgctcaagagcaagttaatga-tgcaaacagaagttggaattcTC-TTATCAATGTGTTCCCC-----AGATTCTTATAGTGGTAGTAGGATTGTGCGTTTTGCCCAAGATGGTACTCTGTATGATTGTGTTTAAAATCAATAGTAAAATTCTCATTTCCTATATTGCTCAGCTTCCCCAGCTCTTTTTCTTCACT----------AGTGAGGTCACCCTCCATTTTTGTGTTGAAATTCAGCACACCCTTAGCTCACATTTATTTTTTCTTTTCTCTCTTTCTTTAATATTCTCACTTCTCCAATTTCATTC-------------TTTAATTTACTCCCGGCAGTATTGCCATCTGGATGTCAAAATGCATTGAGTTGACCTCTTATCTGGAGAACCAG-TGAAGGTCTCACCTGCCCCAGA----GGGATTTAACCAGGAACTGAAGCAGGTAAAACAAGG--CCCGGGTGCTGCTAGTGTGCCAGCCTGTGCTTTGATTCACGCATGGGGTGCACATGTACACATGGTGTAGTGTTAGAAAGCAGCTTCTGAGTACAGTTTCTTTTTGAAAATTTTCAGTTTTCCAGTACAACGAATTGTCTGCAGCAAAAGTTGATTTCAGAGTAAATCGGAACTAAAGAATTTGAGAGAGGTGTTTTTTTTT-TTTTAAACCTTTCTATGCTTTAATTTTTTCGCCTCTGACTTT-AGCCTTCTCCCCTT-CTTAGTTAATTATTATAGAGTTTTATTAAAATTATAAGTTCTAGAAATTAGACACCATGGTATTTAGACCAGCATGGGATACTATACTCTTAGGTTCAATAATATTTCAGAGAACATCTCTTTATTGTATATTAAATGATAGAGAAGTATAATAAAATGTACCTTGAGAGTACTTATCTACTTTATGTCCTGTAACGTTCAGTACTTGATGCAAATGTAGCAGATCT-CAACTCAAAAAGGAACAAAACTGGTTCTAGCCCAAGAGAAAGA---TGGGC-----------AGGTTCCTTGTTGATGGCCTAAGTTCAGC--AGTCTTAGAATTTGCAACCTTAAGGGATTTTTATAATATCTCATCCAACTTGTAGTTGTACATATGGAGAAAGATTTAGCCACTGGTCCGGGGTCATTCAGCAGGTTAGA----GAGCTGCGGCCTGAACCTGGGACTGAATGCCTGCTCTGCTGTG---TTTCAGTTTCCGATCATAGTTGA------AGCATTTAGTCTAATCTCGCTTGAAAAGAGCATACTTTTTGATGTTTAA--GACATTAAACCTGTTGTGATGCC---TACAGGCACCCAAAGACTGACCCTGTTGTTGATTTTTC----TGAG------GGTA----------------GACTTTGGGTGTGACTAGAATGAGATGTGTTGAGGCAGAGCTTAGAGAT--CTGTCTCTGATGAAATGACTTCTTATTTTTCTAAGAAAGCAGTGGAAA a score=26837 s mm7.chr5_random 116713 1027 + 11523536 TGGTTCCTAA--------TCAATTTCTGGGTTTACGGTGTTATCTTGGTCCAAAGCTTGACTTCTTCAGGACTCACTTTCTTCTTAGGAGCTTCAGAGGGTTACTAAATGAA-TGATTCCTAAGGTACTTACCTTCCAGGTCCTG------------------GATTGTTTATATAAAAGTTTTTCCATGTCATCGAATAACGGAGCATGGA-------------GTTTTACTACTGTTTTGATTGGTATGTGTGGGAATTTGGAAAATGCCTCCTGACTC--CTGTGAGCAAACTGCTAAGCGGTTTATTTACAGATC-TCCACCAGGTGCTAAAGGTCTGTAAAAGAAACAGTGTTCAGAGTCTCAGGGAGACCAGAAAGACTTCTTTATCTTCCCAGCAGAAGGTG--GGGCATTCTTCCCTTCCAAGGGA-TAAAGCACTCTGAGTGAAGGGGCtctgtctgtctgtctgtctgtccgtcACTCTCTCTCAGTGTTGGTTGTTAGAATGTAAGAGTGAATCTCCTTGTCAGCCTTGCTTAATAGTTAC---AGATGTACCACTGAAATTTCTTATTTTTGTCCATTGTTAAAAATGCCATGAACATGAATAAATTTCTCAGAAAGTAAGCATTCTTCACCTTCCATAGAAGAACGGAATGAA---------ACGTTTGGTGGGGAAAGCAAGGTCACTATGTTATTCCCTTCTGGGGAATTTACTTTGAAATTCTC--ATGATTCAAGATGTC--TGTTCAAATAATATGTTTTAACCC-ACATTTCCTAAACTTTTCCTGACCTCAGACTACTATCCGTTTCACTCTTTCATGGAATAGTTGTTCATATTGCTCAG-ACTTTGACTT----AAGAAATAATGGCCAGTAGAAAGAGTAGTAATACGGACTGC-ACAAAAGTACCAACAT---TAACCAACACGTAATTATATTTATCATTGAG-------GT--AGCATTGTTTCCTATTAACTCTGTATGAAATTGTGGTGGAC---------------------TTTTTTTCTCCCTAAAAATGACAGTTGGTTATTCTACATTTGAAAGGATGACCTGGCTGCTTTATTATTTTAGGGTATAATGGTATAT s bosTau2.chr25 13974547 1069 - 41414979 Tggttcttaatcttaacctctattcctatattcactgtatggtcttggtcaagcgcctcacctctcca-gccttattttcctcttaggagattgaagggg--gctaaagcagttgatttctaaggcact----gtccaagtctTGAATAGTTATTCTGAAAATGATTATCTTTGTAGAAGTTTATCCACGTGATTAAATAACCAAACATGTATTTCTCACAGTCTGCTTTCTTACTGTTTTGATTTGTTTTCATGAGAATTTGGAAAATGTCTACAGACTTTACTGTGATTAAGCTGTT-AGCAA-TTATTTATAGAACACCCACCAAGTGATCGAGGGCTATAAAAGAAATAGTGTCC--AGCCTCAAGGAGACCACAGAGATTTCTTTATCTTCCAAGCTGGGGATGGAGGGCATTCTtctcttccagtggatttaagctccatgagtgcagggcctttgtctttcttttatagtgcagg----gctcagcaaatattggttgcatgaatgaaACAGTGAATCCACTTGTCAGTCTTGCTT-CTGTTTACTGAAGATGTCCCACTGAGATTTTTTGTTTTCTTCAAC--CTGTAAGTGCTGTTAACTTGAGTAAATTTCCCAGGAAAT----ATTCTCTACCCTCCGTAGAAGAATGAGACCAAGATGCTCTGAGATTAAATGAAAAACATAAAAACCCGTGAATGCTGCATTCC----ACTTTACTCTCagcatattgaaagcattgagatgtctgtgttaaaataactttgttcaacccaacatttcccaaactcat-ttgaATTCAGAGTCCTATCCATTCCACTCACCCATGGAAGAGTTGTTAACATCTTGTAGAACTTTGACCTGTGAAAGAGATAGT--TTGGTATAGAGAGTAGTAATGGGAAATATAACAGAAGCAGCAACATTAGTAAAGAATAGTTAATTTAGTGTATGACAGAGTATATATGTTAAGCACTGCTTCC-GGCAGTCCTGTGTGATAGCGTGGTAGACTTGTAGGGTGttttttttttttttttttctttttAAAAATGAC-------TGTGCTTCATTGGAGA-----------------------TTTGAGGTTTGGTGGTAGAT a score=5153 s mm7.chr5_random 117881 184 + 11523536 TTTAGTGCTGCTCTGTTA-ATAATGCAAGGAAAGAGTGA--AAAGGGTGTTGGAGTCC-------AGAAGCTGGCTGTCCAGTGCAGGAGACAGACATGTAAGTAGATTATAGCAATGAAGTTC--TCAGATA---TGTAAAGAGCCAAAAGAGGACAAAGGAAGAACCATTATct----------gtgtagaccaggctggctttaca s bosTau2.chr25 13975685 209 - 41414979 tcaagggctgcgctgtcatgtacggcagggaaataatgatgaaaggactctgcgtttcctcctttaggagctggctgtcctttggaggaaacagacttgtaaacagaTTATAGCAGTAATGTGCTATAGGACATGTTGTAATGAACAGAAATAGGACAGAGGAGAGAATGGTATTTTTCCCCTCCAGTGTAGAACACGGTTGCTGTTCA a score=16742 s mm7.chr5_random 118802 1046 + 11523536 GTGTAGTTTGATTGCCTGGTTGAGCATGGGAACAAGGCATTGGAGCTTTGAAAGGTCTCTTTAGTAGGCAAATTCAGTAAATAAAATCACATTTTATGGAAAATATAGATAGGGAAGGAGGACGTATTG------ATAT-----------------TTTTTTTTCTCTTCATTGCTTAATCGTGGTTTACATTTCAAGATTTCAATGACAAgggctggaggaatagctcactggtaccatgcttgtctatgggcacagggctctctctgggttccatcctcagccctgaaaaaaaaaaTCAGTTGTTTTTTGGAAGGAAGTAAAAAATTCTATATCATGAGCTACATATTCATTTGTGTGAAACGCTGTATAACATATGCATTAGCTTTTATAGCTCCCCTTCCTCATATCTAACAATTCATTTGGAATACCGTAAGAACAGGGTAG------------TTCCCATTGACTTCTTGTGTCTGAGTTCATAGTT--AGGT----ACTGATGACATTTTC-TTTGATATATTTGTATCTATTTGCTACATGGG--CAGAACTGGTCTCTGGATGTTGTA--GGCAGTAACTAAACTGGAAAATAGTCTGACTTAGCATTATAATTAACTTCCATGGTGACCTTGGGCAACCACTTAACCGTCCAATAACCAAGGAGGTTGGGCTGGAATTACTGAAGTCCCTTGGAAGGTAAATGTTCCTCCATTCTATAAGGAGCATTCCCTTCAAGAGAGAGTTTAAAAGTGG-TATTTTCCTAGGTTAAATGGCATTGTTCACTAAGATGTTCTGCCCTCACCCCCAACCCTGTTTGGAGCAAAAAGTCTTGCTTATTATGGAGTAAAAACAACTCA------------GAAGGTTGCAGTTTGGCTATTTTTTTT--CATGCTTAAAGGAAGCAAAAAAAAAAAAAATTAAAAGGCAACAAAGCAAGCTTGCCTCTACCTGTGAACTGAGTAGAGCCATTCCCATTTATTT--GTATACTGTGTAAA-------ATTAGATTAAG------------TTAGCTGAAGAGGAAGTATTTGGTTTGGCTTACCATCCTGGATCTAGAGAAAGTTGT-TTTGGTGGACACATTTTCATTA s bosTau2.chr25 13976426 983 - 41414979 GTGCATATTGGCTGTTTTGTTTAGACTTGGGGTAAGGCACTGGGGCTT-----GCTCACTTT--TAAGTAAATTCAGGAAATAAAATAA-ATTTTATATGAAACATAGACTGGGAACATAGTAGTATTGTTGAGAGTATGATTCCTTCCCATAGCATTTTTTCCCCCCTCAATGTCTACATATGACTGAAATTTCAAGGATTCAGTAACA-------------------------------------------------------------------------------------------------TTTTTGTAGGAACTCAGTAATTCCACATCGTGAAGTG--TTTTTATTTCATGGGAGTGTTTTGTAG---------TCATTTTTGTAGGACTTTTCTCTTACATCCTGTACTTCATCTGAAGTATTTTAGGCTAAGTTCAGCTTGATATTCTATTCCCTGCTAGTGGTTGTGTTTGAGGCCCAAGGTCAAGGTGTTGATTGATGACATTTCCCTTTAAAGTATTTGTATCCATCTGCAATTTGGGGGAAGAGTGACTCCcagtatggtgcaatggaaataactgaa-tggaagtcagcctggtatggttttgaagttcactttctttgtaaccctgggcaggt---------tccaataactgaggagatttgaccagaatagc-acagtcccttttaatactgacattctgtgattctCCAGGGAGGATTCGCTTCCATTGAAGGGTTAAAAATGGATAAATTTTTAGGTTAAAAGGCTTTGCTCATT----TTTTTTTTTTTGTCCCTTTGCCCATATAGGAGCAATAAGACT-GCTTATCATGGAGTAAAACTGAATTACCTAGAATTCTCAAAGGCTGCAGTTCTGATCTTTTTTTTGTTTTGTTTTAAGGGA------AGGAAAAAAAT-----GACAGTAAAACAAGCTTGTCTGTATCCATGAATCAGGAAAAATTCATCCCATTTTCCTACATATACAGTATAGATAACCACATTCAGTGAAGTGCTGCAGAGTCTTAACTGAAAATGAAA---TTGGTTCTGTTTTTCATCCTAAATCTAGGAAGAACTATAGTTGATAGATGCATTTTGAGTA a score=6012 s mm7.chr5_random 121561 526 + 11523536 TTCATTGATTGGTTAACTCAGAATCAGTTGGT-------GGGCACAGTGATTTTTCTCC---TTGGGATTTTTCTACCCAACT---TTGTTGGACTCTTCACTAGCTTCTCTAATGATAAAACTGGGACGTGAATGATAATTTAAAAAGAATAGTGTAATTA----AAGCTCCTAA-------------CTCATTGAGTGGTTCCTTGTC-AGCTATAGACTCGCTGAGACTGACTCTCA-GCCACACCCACCT-------------------CAGCAGGGGCATGGTGTGTGTTCCTGAGGCTGAGAGTGGTGAAAAGGAACA----------ACAAGAACAACAGAGACCTTAGCCTTTCTTTCCCACCTGAAAGCACTCCTTGAATTCTTGAACAGGGTTTCAAAAAAATCTGC---TTTTAAAGATACATGTAATTTACTTTTAAAAACTGTAATCAGAATTTTTGAGAAATGTGGGCCTTCGGATTTAGTTGCTGTGGTAAATGCATATCACCCAG-------GGGCGGACGCACAAACCCAATATTGACAGGGGGAGGGGCGCTCACATTTGGGAA--TACATCGCTTTCATT s bosTau2.chr25 13979648 568 - 41414979 TTCATTCATGGGTTCATTCA---TCCGTGGAGACGCAAAGGGCTCAGTGTCCTTTCCCCAGTTTTATACCTTTCTGACTGGTTAACTTGCTTTATCTTTCTAGGTTTTCTCTCTTGGTAAAATTGGGATATTCACATCCATCTAAAAAGAATGAAATAATTAGGTAAAGCTCCAAGTATGTAATAGGTCCTCACTGAATGACAATTTGACTAACTATGG-------GGGAATGATTAACATGTTACATTTATTTATTGTTTCATTCATCATACCAGCAATGGCATGGTGTA-ATACATGAGA--GAGCTCAGTGAGAAAGAGAATTGGGGTGGGAAAGGAACCAAGAAAACCTCAGCATCTTCCTTCTGCTTGAAAATAGGTCTTGAATTCTTAAGCAGG------AAATTTTTTGCATATTTTTAAGCTATGTAACACTTGTTTTTAATAATTGTAGCCA-AATTATCAAGCAGGGAGAGtttttttttttttttttttttttAA---CATGGCACTTAGTCGTATCAGAAGGACACACAAG--------TGATTTAGAGGGAGGATCTTAGAATTTGAAAAGTCCACCTGTTTCATT a score=51697 s mm7.chr5_random 122163 1149 + 11523536 TGGAAGAGAGGAAACAGGGGTCATAAGTTTTAACTTTTATATGAAGTCATCGTTTT-AGTAACTACATTGGAAACAAACATTCCACATG---TTTAGAACTGTGAAACCCACTGCCCTGGCTG--CACATAGCCACGTGCCGTTTTAATACTAAGATGCC-----------CACGGAGATAGATGCCTTAGCTGTCCCAGAAGTCCCAGAGTGACACCTCCTCTCTCTGCCTTGGAAACTTGGTTCTTGAGGGAAAGGTGGATTAT-GTGGGGCTGGGAGTTGCAGGGGCTGGGGGAGGGGAGGAGCCGAAGAGAGGCTTCCAGC-------------TGGTCCCTTGGGGGATTTAGAGCCTGTAAAAACACATTTAGGTTCCTGAATGGCAACAGATAAATAGCCATGGCCCTTAATTGAAAGGGAGGAGACCACAAGGAGCAGAGGTCAGAGCTTCCCCA-GATGACTGGTGTCCTGGGGGGTGTCAGCTGAAAAGGTCTAAGGCTTTGCCTTCTTT---------CCTTCCTCCTCCCACTTTCCATGCTGGCGATCTAGCCGGGGTTGGTGGAGGGGCCATTAGCTAAGCAGTGTTGTTTGGATAGTTGATGAGGATGGCCCCTGGGTGGGCTGACATTTTAGGTTGGGGGAAGGGCCCTGAGTCTTTTCTTAACTGATATATTACAATCTGACTGTTACCTGCAGTTTGCCAATTACCCAATTATGACACAATTTTGTACATTTTTTTTTAAAAAGTAGGCTTGCTCCTATTCTTCCTTATACAAGGATTTTAGTCATTGTACATCTTGTGTCTTTAAATAATGTATTAGGAACATTTTCAAGTCTGTAAGTGCTTTTTTAATGAGAGTGTGAAGATTTTAATGGGACTAGATTGCTTTTCATGACATTTCAGAGTGACTTAATTGTAACAATGTTGGGAGGCTGTATTTTAAAGTTTGCTAAGTATGTCTG-TGTGGATTATAGTCAGACACTTAAAAGGATGGATGGTTGGATAGTGGATTCAGATAGCTCTCGCCTTAGTGATTCCCTCTAAATATTAGCTCTTTGTAAATATGGGTCCAGCAAATTAGATGCAGGTGAGGGTTCTCTTGAACCTTTTAATTTTCAAACAGGAACAGAAGGTAATAATTGA---------GGATAATTTGCAGGGCAAATTCTTCAAAAct s bosTau2.chr25 13980254 1166 - 41414979 TGGAAAAGAACCAGCAGGAGTCATACATCTTATCTTTTATACAGACTCAACATTTTCAGTGATTCTGTTG-AAACAAAC--TCTAAAAGAAATTTAGACCTGTGAAACCCATGGGTCAGCCTGACCACACTCCTCCCGGCCCCTGCAAGGCT----TGCTGCATCTCTCTGCACTGA-AGAGATTGAATAGCTGCATTAGGAGGC---AGGTGTCAGACTCCCTCATTGA--TCAAAATTCAGTTCT-GAGTTAAAGGTGGTTTTTTGGGGGGCGGGGGGAGGGTGTTGCTGGGGGAAGGGAGGAATGGAAAAGAGACTTACAGCCTGGGGCTCCTGCTGTTCGCTTAGGGGATTTAGGACCTGTAAGAACAAGCTGAGGTCTCCCAATGGCAACACATAAATAGCAGTGACCCTTAATTGAAAGGGAGGAGACCAAGTGAACCAGAGGCCAAGACTTTACAGTGAGGACTAGTGGCCTGGGGG-TGTCAGCTGAAATGGTCT--GGATTTTTTTTTTTTAATTCTAACTCTTGCCCATCCCCCTTCCTGGGCTTAGAA---ATCCAGGAAAGGAGAAGGGACCATTGACAAAACTAAGTAAGGTG------TGATGAGGATGGTCCCTGGGTGGACTGGAATTTCAGA--GAGGAAGGGCCCCCAAGCCTTTTTGAAACTAGTGTATAACAACCTGACTGCTACCTGCAGTTTGCCAATTACCCAATTATGACAAA--TTTGCACATTAAAAAAAAAAAAGTAGGCT-GCTACTATTCTTCCTTATACAAGGATTTTAGTCACTGTACATCTTGTGTCTTTAAATAATGTATTAGGAACATTTTCAAGTCTGTAAGTGCTTTTTTAATGAGAGTGTGAAGATTTTAATGGGACTAGATTGCTTTTCATGACATTTCAGAGTGACTTAATTGTAACAATGTTGAGAGGCTGTATTTTAAAGTTTGCTAAGTATGTCTGCTGTGGATTGTAGTCAGACACTTACAAGGACAGATGGATGGATAGTGGAACCAGATAGATTTTCCCTCACTGCTTTCCTCCAAATATTTGCTCTTTGGAAATATGGTCACAACAAAAAAGGTACAGGTCAGGGCTCTCTTGAATGTTGTAATTTT-AAATGGGAACAGAGGCCAATACCTGAGGCTGGCGGGGATAGTTTG--AGACCAGTTCTTTACAACT a score=21648 s mm7.chr5_random 125317 788 + 11523536 AACCCCCAGCTCAGCAAATGTGAGTGGGAAGGACTGACTGCTAGAAGAAGACTCGCTCATTTATTCCGACAGGAGTTCCAGCTTAAATGCTGATCCCACCTATGGATTTAACCATCTCGGAGAGATTAAAACCTTTTCCCAGTCA-CTGATTTAAATAGCAC-AAGTTCTTAATTAAAACGCACTATAAAAAAGTGATGAACAACCAAACTCAGTTGCTGCATAATTTATTTACACTTATGTAACGGCTTCCCTCAAGGAACTCAAGGCATTTTG-AAACTTAAAATTATCTAGTGGATGTTAATCTCTCCAAAATTCCCAGGAGAAAGACACAAATACAAGGTGTAAAATCAACAAT-GAGTCCCCTATCGTTACGTAGACACGTCTTCCTCCCACAGAACTGACTGTAGCACTCTAAATCTCCATGGACCGCAGATCTAAAACTACTTTAGAAAATCCTACCAAGTGTAGGGAGTTGTTTTCTCAAGGAGCCCTCTTA--TAGAAACAGAGCTAACAA-ATGCTTCACATGCTG---AGAAAGAAAAGTTAGCAAACCTTTCTTGTATTTTT---TTTTGTA--GTTAAAACAAAAATCCTACCCAATTTTCAACTAAAAAAATTTCAAAAGTTACTTTAAAAATGTACCTTGTTCAACATTTAATCAAATTAGAAAAATTTAA---ACTTAATTCTGATG--TGCATTGTTCGTTATATCT-----CTCAGTCTTCATTAAACCAATCTGC--TTTCAGCAATTCTCTG-GACTTTCCTGGGTCTTGGAAAT------GTTTTAGTTTTT---TTGGGTAGT s bosTau2.chr25 27431420 762 + 41414979 AACCCACAGCTCAACTCA--------GCAATGACGGATACCCAGAAGT---CCTGTTCAATTATTCCTTCTTGAGTTCCAGTCTAAATGCTGTTCCTACCTACTTATTTAACCATGTCTGAGTGCTTAAGGTCTTTCCCCACCCATCCAACTTAAATAGTGCTAAGTTCTTAATTAAA---CACACTGAAAAAATGATGAACAACCAAATTCAGGTGCTACATAATTTATTTACATTTATGTAAC-ACTTCCCCCAGGAAACTTAACTCACTTTGCAAACTTAAAATGATCTAGCAGATATTAATCTTCACAGATTTCCCAGGAGAAGGACAAGAATATGAGACACATAATCAATAATAGAACTCTTTACCTTCACACATACACACCTTCCTCCCAC--------------------AAACCTCTCTAAACCACAGATCT-AAACTAATTCAGAAAATTATA-----GGCGAGATTTTTTTTTTCCAAAAAACCATGCCAAGCAGAAGAGGAAGTAATGACATTCCCACCACACTGGAAAAAAAAAAAAATTACTAAATTTTCCTTCAGCTTTTCTATTCTGTAATATTAAAAAACAAAACCCATCCCACTCCAAAGT--TAAATTTTCTAGA---ACTT--AAAACACACCTTGT--------------GGTTAAAAAAAACCAAGTTACTGAATTCTAATACTTATATTGCTCAGAATGTCTCTGACCTCACCCCTCA-GAGGAGAATCTGCATTTTAAACAAACATCTGAGGCTTTCCAAggccttcaaaagtataaagttctattttttaagctgggtggt a score=10297 s mm7.chr5_random 127742 542 + 11523536 GGTCACCTTGCTCAGTGGTTAGTATCTTCAACCAGTTAGCCCTGGCTTGTTTGAACTGGTATTTTTCTGGATAGTTCTTAAAAGCTATATGTCTTCCACAGCAGGAG-CTGTGGTCCTGTAAACTAAGAGTTAGTCTTTTCTTGTTGCATGTAAAAGGTTTGGTTCCAGTGTACTTTTGCCGTGAGGTAAGTGGAGCTAGCTGTGAGTTGGGCACAGCAAGGTCTGTGAAACCTCTTTATCTCAG-GATGGATGCACAGCTAAATGTTAGGAAAAA--AGAAACCCGACT---GGCTACTTCAGATATCTAGTGACGGAA----------------TGACTGCCGTTCTT----AGGCTTGAGTAAGTAAATGTTTGTAGATGG----ATGATTCTT--------------CTGTCCTTAACCTGGTGGTGTTGA--GAGTGACATATGTAGGTGCCTTACTCT---------------GAACTAAAGTGGACAGGATCTCTAAAATACTGGTGCGGAATTGAAATGTGTCGGTCAGGCACGTATT-----TAAAGGTTTTTA---------------------AATGGATGAAATAGATTGTA-----CTAACCAATGTAGCAAAAATTTTAAA s bosTau2.chr25 13985864 604 - 41414979 GACTATTTTGCTCAGAGGCTACTATTTGAAACTAGACATTCCTGGATTGTTTGAGGTACTATGTT-CTGGAGAATTCCCCAAAGCTGGAGGCACTTGGTAAAGTGAGGTTGTGGCTCTGTAGGCAGAGAATCAGTCCTGC--TGCTACGCTTAACAGGACTGACT-------ATTCCTGCCTT-----AACCAGAGGTAGGCAT---TTGGGCAAG---AGGTCTGTGAaacctcttcatctcaaagatggacaagcaactagaagtttggaggaattagagagcatgttcaaggttgattcagatacttggtgcctgagctggcactggaatccgtgattcctgTTCCTCTTGAGGCCTCAGTAAATATTTGTTCAAAGATTGTTTTATTCTTCTTTTGAAGATTAGCATCTGGCCTTGACCTGATGGAGTTAATGGGATGAAATATGTA----CTTCTCTCTTGAAATTGTTTCAAGGAGTTAAAGTGAACAGATTGTCTGAAAcagtgctgtccgattgaaatatg------agtcacatattcaatttaaaagtctttagtagccacattaaaaagtaaaaagacatgaatttaactttaataacttaaccaatatatcaaaaatttttag a score=27449 s mm7.chr5_random 128428 865 + 11523536 CTTCTCTCCC----TAACTCTTTTATTAGGCAG-TAAAGGTCCAGAGTATGCCAGCCAAATTAtttcttttttttttttttcttttcctttTGAAGTTGCTTTAGAGCAT----GTTAGCATG-------GTGATTGGTGGGATGGTACAACATGGGAAATAGTGGGCATAGGGTCGGAGCTGGTTTCCTCCATTCAGTCTAACTGGCTTTAAGGGGTCAGGTGAGTTCAGATTCCTCCCTCAGAGAGGTGCTGTGGAAACCTGCTTCTGTGCTGAG--------------------------------------CATCTGA-------CTGCCAGTCAAGGAGAATTCCTCT--TGTTGAGTCAGCCTTGGCTTTGACCCTGTTTGTGTGGAGAGAGAGCTTGCTGCTGACTT-----AGATCCTTGTTCTTCCTAGAGTCAGTTTAGAAAGGAGGTGTGGGTTTTGAGGGAGATGATTAATCAATATGTGAGATATTCCTCGTGACATTTAATTACAATTTAAGTATCAAGTG-------CAGTCATTTATTAGCCTA-GTAGATCACAGAAACTAGCAGGGTAAGGCAGCCTTTCCTTC------TCCTCCCACAT--------TAATAGCCAGATCTGAACTAATTTGTAGATAAAGGCTGGTATATAT-----CTGC----------------------CTTTCCTTCATTTTTT-AGACCACTGCTCGGAGTCCCCTGACAGAATGCAAGGAGACAGCCTTGATTAGATTAGGCCAGATTACATTAAAGTGAATGGTTAAAGCCTTTGGAGTCTCTGGTTTGTAGGAGACACCATAATGGCCTTCCTAGAATCCCCAAATCCTATTAGGTGAGTTAATCTTATAGAAGATCTTAGGTCTCTATAAAG-AGCCTTGCCCTCCA---GGTGGTCTCTGGCTACCAAGGTAAGCTGATAGACCCAACTTTCTT------GGTTGGTTTTG s bosTau2.chr25 13986750 951 - 41414979 CTTTTTTCCCAGTGTAGCTACTGCACTGGACAGGTGTAGGTCTAAAGT-TACTAGCTGGTGCATTTAATTTTTATTTTTTC---TGACTTTTTAGGCTGCTTTAACCCATATTAGTTAGCCTGTGAGCTTATTACTGATGTGATAAAACAGCTTGGGAAAT-GAGGATCTGGGACATAAGCTAACTTATT--AGTTAGCATGCCAG--TTGTACTGGTCAGGTGAACTCAGAATGCTCCAACATGGATTTGCTGTATATCTCTATCTTTGTGCTGGGGAGAGTGCTTGCATTCTCTTAGGGGACAGAAACCACCTCATGTGGAGACCTGCTGTCAGTCAAGGAGAATCTCTCTGCTGCTGAG-CAGCCTC---------------TGTCTGCACAAAGAGCCTCCTGCTGAATTTTTGCAGATTTTTACTCCTCTTGGAGCTGGGAGGGAAAGTGGTT-----TTTTGAGTAAGATTGCTGATCAACATGTGAAATCTTCCTCAGGCCATATAATTAAAGTCTCTACATCAAATAGATCCTATAATCATTTCTTAGCCTAAGCAGATTATAGGAGCTAGCAAATTAAGGCA---------TCAAAAGATCCACACACAAGAGATCCACAAACATCAGGTTTGCCCTCATTTCTAGATAAAGGCTAATATGTATAAGGTCTGTAGGGTGTGATTTGAATGGAAGTTTTCCCTTCATTTTTTTAGATCACTGCTCAGAGTCTACTGACAGAATACAGGGAGACAGCCTTgattagattagaccagattggattaaatcaaatAGTTAAAGCCTTTGGAGCCTCTAGCTTGTAGGAGACACCATAATGGCCTTCATAGCGTCCCTAAATCCTATTAGGTAAGTTAATCTTATTGAAGAATTTAGGTCTGCATAAAGTAGCATTGCTCTTTATGGGGTGGTCTCTGGCTCTTAAGGTGAGCTGTTGG---TAACTTTCTTGGAATAGGTTGGTTATG a score=5576 s mm7.chr5_random 130193 397 + 11523536 ACTTTGAA-GTGTGCTT-ACTGCATCTACATTAAAGACT----TAAGAGTTGTGAAAAATAACGGTAAATTTGA--TAATTGGTCATTGTGGGAGGAAAATTTTGTTAGGTAGAGATACGAT---------GAAGTGACTCTTTGGTGCTGGCTTGTCTTTCCGAGATGAAAGG-GATTCCTTTCAGGGCATCCTTAAAAATTATGTTCCTTAGTGCCTTAACTAGGAG-TGAGTGTCCACCACTG---TCCTGTGAGTCACATGCTTGCCAGGGAAGAAAGGGAGCCATAC-CTGGAACAGCTGGTTACTC--------------TGAGGGCTTCTGCATCCAGGAGACCAGAATGGATGATGGAGGTGACATTTTACTAGATTTAAGACACTTTGACCTTGGGACTTTCAGTG-TCTGGTAGAGTGGAGGCCT s bosTau2.chr25 14157812 390 - 41414979 ACTCTGAGTGTGTGCTTTACTGCATC--CAGTGAGGACTATGGTGGGGGTGGGGGGAGA----AGTAAATTAGACTTACATCTTTGTTACAGGTTG----TCTAGTTAGACATAGACACCTTTAAGACCCAGAAGTGATTATTACATACTGAATTGGCCTTCAGAGATGCAGGACGATTTTTTACCAGGCATCTTTAAAAATAA-GTTGCATAGTGCTTCAGCTAGGAGCTGAGTGACCACTACTGAGATCCACTGAGTTAAGTGGTTTGCA-GGCAGAATGTGAGGCATCTGATGTTGCGTCTGGCTCCTCAGTGAATAACCATGAGAAGGTTCCTATATCCAAGG-------------GATTGAG-------------------AAGACACTCTGGCC-TGGGAATTTCGCTGCTGTCATGGAGTGTGGACTT a score=33813 s mm7.chr5_random 131367 892 + 11523536 CTCAGTTCTTTATTTAGCCTTTGTATTAGGG-CAGCCCTGGACCTGT--CCTGTCTCCAAAGATGAAAGAGCATTTCTGGTATGGGCCAGAC-TGGGAGC-ATGAACAGTTATGATTGATTAATAATGGCTTTAATTTGCTTTGAGGAAGAAAAGTGTAACTAGCCCACTGGATGAAGAGAGATAGTATCTCT----AGCACTCCTCTGTATCAAGTATTTGGTGTTCTGTGCCTGCATAGCACTTGTCTTTTCAAGAGCTGGGGTCATTGACAGCACGCTTCT------TGAGTTTCAGAACATAGTGGAGTGCATGTTTGAAGTCAGAAATGTAATTTTCCCTAAGTATAGTAAGATTCACCGTAGTTCTCCGTACA-TGCATGCACATGCTCACGCAATTGTGGGCTTTTATTCTGGCTCGGCTCCTTGAGGAGCTGAGGCCCTCCCTTTTGCTTCCATTGATTCTTGATTGCACACTTTTCAGAGTTACCTTTGTTAGGCAGCAGCTGTGGGAAGAATGTGTGCTTATTTTGTATCTGTGACCTTTACTCCTGCAGTCCCTCTGACCTGAGACTCACCCTGCCTGCCACCTCCTCTTCCTCAGCCCCAGCTTTGTTCTTCTGGGCCTCATGTGCACACTCCCATAAAAAGGACCTCCTTGCTTCTTTCTGTCTCAGCTTAGAAATGATTTCAGCTAAGGATGTTCCAGGCTTGTTGGAGGATAAGAAGTGAATTAGAATAAGGAGGAAGAAAGGGATTTATTTAGGAGGCAGTTAGACAACTTATGTCTT---CTCTTA-CAGTTTCAGGCACTTTGGAATTATA------TTTGATGTCAGCTTGTTGACCTCTG---ACTCCTCTTACCTGTTGTCTG---TGCTTTCTTGCTGCTCTTCCTTCTAGCCCCCGCCTCC s bosTau2.chr25 14158571 872 - 41414979 cTCATTTCTTTATTTAACCCCTCTGGTAGGGGTAACTCTGCATCTGTGTCCTATCCTAAAAGATTAAAAAGAATTTCAGGTGTGGACCAGACATGAGTGTGAAGAACAGTTATGATGGATGAAT---GGTTTTGATTTGCTTTTAGGGAGGAAAGTGCAACTAGCCCTTTGGATGAAGA-------TATCTCTCTTCAGCCATCCTCTGTATCGAGTGTATGGTGTTCTCTGCCTGTATAGTACTTGTATTTTCAAGAGCTGGGGTCATTGACAGAACACTTCTCACTCTTGAGTTTCAGAGCATAGCA---TGCGTGTCTGAAGCCAGAAATGTAATTTTCTCTAAGTGTACTAAGCGTTACTTTAATTCTCCTTATAGTGCATGCATGTGCTCATGCAGTTGCGGGCTTTT-------TCATGCTCCTTGAAGAG--GAATTGCCCCTTTTGTACTTTATTGGTTCTTGATTGCACACTTCTCAGGGTTACCTTTGTTAGGAAGCAGCCACTGGAAGAGTGTGTGCTCATTTTGTCCTTCTGGCCTTTACTCCTG-GGCTCCTCTGACCCCGGGCTCACCCTTCCTGCTCTCTCATC-------AGCTCAGCTTTGTTCTCCTGGGCTTCTTATTCTTACT-CTGTGAAGGGGACGTCCTTACTTCTCTCCATTTCAACTTAGTGTCCA-TTCTGTTGAGGCAGTTCTAGA--TGGGAAGAGGTTGGGAGGGGATTTGAACAAAGAT-------TGGATCTGGTTAGGAGAAGTTTATAAAACTTCTGTATTCAGCGCTAATCATTTTCAGATGCTTTGAGATCACAATATGCTTTGGTG-------GGAGACCTTTGAGAACAGTTTTTACCAGTCATTAGACAGACTTGTCTGCTTTTTTCCCCTGT----CCCATCTCC a score=42474 s mm7.chr5_random 132647 1261 + 11523536 ccTTTTAGAAGTCTTTTTGAT-TCGTTCTCATAACAGCAGCTCCTAATCATGGTTGTCTGCTTTGGGGCAGATGAAAACCCATCCTTTTTCCTGGTAGCACCCTGACATCCTGAAGGAAAAGGAGGGCTCAGATCCTTCTGCGTACCATACACATTCTGTTTACACTCACGTTTACAGGTGGCTATGGTAAGACCTGTAG--tactga-gtactcgaaatgtgctcaacactgtgacaagcactttacatagagtatttcttattccatcgct--ctcaataaagtttatgaactatcactgtctttagtctatagatgaggaagttgatactcagagagttttaataacatgccattatgtatgtagcttgaatcaaacagcagcaatcaagattcaaaccaggcagcctg-TGCCAGGGACCAGGTCCAATTGCTCAAGGAAAGGCTGTGAGCTTACAGCCAGAATAGCTGGCCTCATGGCAGCTTTCTAA---CTGGGAAAATTTCCCTCTTGCATCAACAGCCTAAAACACTTACTGTCTTCATATTTTCA----GCTCTCTAAGAGGAGTGTTTTGGGTTGTTTTCCAGTGATGGAAACTGCATGATTTAAAGCACTAAAAAGAAAAAAAAAGTTAGGATTGAGCTTTA--AGTTGCAACTCCCCTTTGACTGTA---CAGTGAAAGGAAT---------------AGGCCAGGAGTGCCCCGGCTTCAGGGGCATTGGTTAATTGGGAGAAGCTGTGTCTCTGAGGTTCATCTGTGTTCCAGTATTCGCAGTAGGTGAGTATCCAGAGGCAGCAAGCCTGTCTGTCCTCAGCAGTCCCATAGA-CAGGGCTCTCTCCAGCCCCCGCCCCGGTTGGCGCACCTGAGTAACAATGGGGAAGCTTGTTGACCATTTGGCATGCCACAGCCCAGTAATTAGAAACTGTAAAGCAGTAATACAGACATGAGGCAAATCCCCCAGTTCATGAAAATAAAAAAATCTGTGCTCCTGCTTTGTGGCTGAGTGGAAAATCACAACCGGCTGCTCAGACAGCAAAGCAAATACTTCAGGATTTTTGGCAGCTGTTTTGTACATATAAAAAGCTCTAGGCTCTATAGTCATTTAGAGGATGTCATATTTCCATAAAAACGGAAAA--CAATTGCCCCACTTCCTGGATGCATCCCCTCCCCAGTTTTCTGcagtgaatctcaaattatgaatcctagaccagcagtagtgtcagcatcatctgcaaactgtgttagaa------tttagattcttggtcgctacccaag s bosTau2.chr25 14159504 1228 - 41414979 CTCTTTCAAAGTCTTCTTGACCTCCTTCTCACATCAGCTGCTCCCAGTCTTGCTGAGTCCCTTCGGGAAGGAGGAGAAGCCATCCTGT------------CCATAATTTAC-------------------AGACCTTTC-----------CATGTCCTGC---CCCAGAGCTTCACAGAAAACAATAGTAATGCCTAGGGCTTACTTACATActtaaaatgtgcctagcactgtgacaagcactttacatggattatcgctgataatgaagtcagcccgatgaagtctgtgtgctgtcactgtcttcactttatatatg-ggaaatcgatgcctagagagttt-ggtgatatgccactgtgttcactgctggaatcaagtgatgg-aatcgagattcaaaccaggtagcccaattccagggctcatgtccAACTCCTCAGGGAAGGGCTGGGAGTTAACAGCCAAGAGAGCTATGCTCATGGCAGCTTTTTAAAATCTGAGGTA-TCTCCCTTTAACA----CAGACCTGACCACTCATGGTGTTTTTATTTTCATTTCATTCATTAAGTTGGGTATTCTCATTTGGTCTTTGAAGGTGGTAACTGTGTGTTTTAAAGAGCCAGAAAGAAAAAG---GTTAGAGGTGGACTTTCTCAGCTATAGCTCCCCTT-GACTGCAGTCAAATAACAGGACTTCTGATGAGGAAATAAGGCGCTAAGTGCTCTTGCTTTGAAAAGGTTAGTTAATTGGTAGAGGTTGTGTTTCTGTGGTTCATTTGTGTTCCTGTCTTAGCCACAGGTGAGTGTCCACAGGCAGTGGGTGTGTC-GTCC--AGCAGTCCCATAAAACAAGGCTCGCTTCAGCTGGTACCAC--TTGGTGCACCTGAAAGACAGTAGGAAAGCTTGTTGACCATTTGGCGCCTCACAGCCCGGTAATTAGAAAC-GTAAAACAATAATACAGATGTGAAGCAAATCCTCCAGTTAATGGAAAAAAAAAG---TACAATAGTGCTTTGTGGCTGAGTGCAAAATCACAACTGGCTGCTTATACAACAAAGCAAACACTTCAGGA-TTTTGGCATCTGTTTTATACATATAAAAAGCTCTAGGCTCTGTATTAATTTGGGGGCTGTCATATTTAAAAAAAAAAAGAACAGTCAGTCACCTGGCTTTCTTGTTA------TTTATAAATTCATAGTaatgattctcaaatcatagtccctaaactag--gaagtatcagccttacctgggaact-tgttagaaatgcagatttgttttttgggtcccaccccag a score=9805 s mm7.chr5_random 135336 798 + 11523536 TTTTGACAGAAGGCTCTTAGCCCCTTTTCCCTTCCTTGCCCCTTGCAGTGTGTACAG-AGTAGCATGGATCCATTACAGATCAATTATAGGTCCTCCCACTGCTGACCACAAGATCCCCTGGAAAGGGCTCTTGAGAAATAAGAGCTTGCCACCAGAGTACAATGAATCTTCAACCTGTGTTCTTTTAAAGGCTCAGGTTCCTTATAATCCTTACACAGATACAGTCTCTCTGAGGCAGATAGTCTCTGATGGGGCAGAGAACCTCATACAAACAGAAACACCTATTCTGTGGTTTCCTGGGTTTTATCCAGATTTGCTAATTTTTGCTTACATTCGAAAATGTATTTATTTTGTTC-CATGTTTCCTCCTGCCTTTATGAATGTCATGCTTTCCTGTGACCTTAAAAATAAGAGTGTgagctagggatgtagcccaggagagtgcttgccca-gagtgtgtaaagtcctgggttccatgcctagcactgcatctagatggca-tggtggtacatatctaatgtcccaacatttttgaagtagaagcaagaggttcaaaggttcaaagtcaccttcactacatagttttgagaccagcttgtctaaacaaaacaatctaaacaaaacaaaaAACCAAACCAGTAAACCCTGAACAAAACATAAAAAGCCTGGGCCATACTGGCTCACAAATGTAT------GTGGCACACTTTGTCTCCATC-----ACCTAGCGTAGCATGGCAAAGCTGCAGAGATTAGTAGGTAATGGGGACAAATCTGTGTCCTCCCTGACAAGAAAGGATCTGTATGG s bosTau2.chr25 14161772 674 - 41414979 TCCTGACAAACGGCTCCTCTGCCCCTTCCCA--------ACTGTGTGGTGACCGCAGCAGGGACACAGGGTCATTTCAGAGTCATTAGAAGTCCATGCACAGCTGACCTCTAGGTCTCTTGGAAAGGCCTCTTGGGAAATAAGAGCTTGTCACCAGCATGAAATGAGTTCTTGACTGGTGTTACCACAAAGGCTCAGGTTCCTCACACTCCTTCAATAGCTT--GGTTGACTGA------------CTGTTGAGG-ACAAAACCTGATACAAACAGAAACACCCAGCTTGCAGCTTCTTGGTTTTTGTCCAGATTT-TAAAACTTTGCTCATATTTTAAAATTTGTTTATTTTACTCACATTTTTCCT---GCCTTTTAGACCAGTGAGTTTTCTCATT-CCTTAAAAAAAGGGG-----------------GCACAGGAT--TGCTGGTCAGTGAGTGTGTTCTGTTCAG---TCAGTGTC-AGCACAG------GAAAGCAGCGAGGATAGA----------------------GGGGTGAATGCGAGAGG----------------AGCCCTGTCCCCCCAGCCTTCAGACTGACTTCTTGGGG---AGGAAACTGACCAAGA-AAAGAACCACGC------------------------AGATCCTGGGTTCACTTGACTCCC---TGTGTTCTCAGGTGGGAGAACTTGTTTGAATTCCTGAATTTGATGTTGGGTCACAAAGCCA---ACATCAGGATTTTTT----------TTTTTTCCTCTTGGGGGAGAAAAAATTTGTATTA a score=38946 s mm7.chr5_random 136268 1006 + 11523536 TTTAAGGGGTGTGGTTCCTCTTAGCT-TTAGGCAGCCGTAGCTACAGATTCTCTGTCCAAGTGACTCTCTGTGAGCTTGGAGAAGTGAGAGGCTCACTCAGGCTGCAGCATTCACCTGCTTGGG-TTTGGGAAAGATG-TCATT-----------GTATAGAAAGAGGAATCGG------------AGCCACCAGGATGTTCGTTTTTACCAGTGT--------TGTA-------------GCTGATCTGCTGTCTTCCCCAGCCCGCTT---------TGTGCTTTAATTAAATACACAGCTGATGGTATCAGCTTGGCTCCCTGCTCTTTCAGCTTCCCCTCAGAACAAAAACATCCGGACAGACAGCGGTGACATGAGGATTAAGTCTCAAGACCCAAGCTTTTGCTCATTC-GTGGTAATTAAACTAAATCTGCCTAAGCATCATCAAATGTAGATAAAACCTAGGGCTGATTAGAGATGACCCTCTAATAAACCCGATTTGATTAGGCAGAGCCAGAGGGGTGCAAGGAAACATTCAAGACTCTGGTCA--------------TTGGCCTTTAAATGGGGGAGGGGGA-------TTTTTGATTGTTTCAGTCACAG--TACTTTGAGAACTATTATCTGTGACAGCTAAGGAACCTGGTTGAAATAAACAGGGGAGACCTGTCGACTTGCCATGAAGAGTTTTGGTCAACCACCACCTGGGATGTGCTCACTTCCTGGCCAATCACTGGAGAATGGATTTTGCTGGAGGTCTTGGCCTGGCATGATCGTTCAAAAGGATGTTCCCAAACACACCCTGGCATGTTCCGATAAAGTTACAGCAGATGCAGATCTTGAAGACTATTTTCTTTTTTAGTGAAAAATCTTCATCTCTTTATTTATGAAAGTAACTTTTGACACTTT--------TAGAATAGCCCAAAGGAAACTCGATTCTTTTTTTTTTAATGAAGACTGTCTAGGCTATTTAAGAGAAATTTCTGTAATTGATCCATTT-CTGGATCCTGTAACCC-TAGGCACGCTTCTCTTAGCATTTATCACA-GGTGCCCACTGTACTTTTTAGTTTAT s bosTau2.chr25 14162672 1054 - 41414979 TTTAAGGAACTTGTGGCCTGTTGGCTGTTAGGAGTTGGTAGTTGTTGATTTTCCTTTCATGTGACTTTCAGGGCTCATGGAGAAGTCAAAAGCTCAC----ACTGGAGCATCTGCCTTCTTGGAAGTCAGAAAAGATGGTCCTTCTGCCAGATGAGTGGATGGGGTGGGATGGGGCAGAAGCCTTTAGCCACTTGGAT---TGTCTTGAGTGGTGTGGCCTTACTGTATTGGGACAGGAAGGCTGACCCACTGTCATCTGCAGCCTGCCTGCCCTTCATCTTGCTTTAATTAAATACACAGCTGATGATGTCAGCCTGCCTCCTGGCTCCCTCAGCTTCCCCCTTGGAAGAAAACATCCGGGCAGACAGTTGTGACA----ATTAAAGCCTCAAGACCCAAG-TTTTGTTTGTTCTGAGGTAGTTAAAATAAATCTGCCTAAATATCTCCAAATGCAGATAAAACCTAGTGCTGATTAGAGGTGACCCTCTAATAAACCTGATTTGATTAGGCAGAACCAGTGGGGTGCAGGCAAATATTTGAGACTCTGGCCAACTTGATTATTCCATTGACCTTTCCCTTGTGGGGGAAAAAAAAACCTGTTTGATTCTTTCTATCCCAGAGTACTT-GAAAACTATTACCTGTGACAACTAAAGGACTTTGGTGAAATAAACAGGCAAGACCTGTGGACTTGACCTTAAGAGTCTCAGTCAGCTACCACCTGGGACATGCTTGCTTCCTGGCACATCAATGGAGAATGGATTTTGCCGGAGGTCCTGGCCTGGAACACTAATTAAAAAGGACGTTCTAAAATGCACCCAGGCATGTTCTGATAAAGTCTTAGCAGATGTGAGTGGTGAAGGCTTTTTTTTTTTT------AAAGTC----ACAGTTTATTTATTAAGGTAACTTTTAACAATCTGTTTTGTATAGAAAAACCAACATAGAAC----TGCTTATGTGTTTATTG--------CCAG----TTTACGAGAAATTTCCATGATTGCTTTGTCTGCTGGCTTCTGTAATATGGGGGCACTCCTCTCTTCGTATTTATCACATTGTGCTC----TGATTGTTGGTTTAT a score=13037 s mm7.chr5_random 137669 484 + 11523536 Ggaagttgacaaagaataggccagaggccagaactaggtctttacctgtttttatacatttgtgagcctaagagcaattttgatattcttaaatagttgggaaaaaaattaa--aagactatttcatgacacatggaaattatatg-gatttaaattcaagtgttcataaataaggttttattggaatactgccatagttgttcatttatgttattgtctttggctacattttatgctaagacagcaaaattgagtccttgtaaccaagaccatctggccccaacagcctaaactatttactctcccgtccttttcaaaactggctctgcctatccctTTCCTCTTTTAGATTACACACGAAGTAAATACTTACTGTTTGAATTATTTCAAGTCTGAATTTGAGTTTTTGGATAGAGTGC---TGATCCTAAAAGTGATC----GTTAAGTAAACAAGTGAATGATAGATCTTTTTCTCTTGTTAGCCATTTGT s bosTau2.chr25 14163859 433 - 41414979 gggaatgaactaagaat----------------------------tttttttt------------------------tttttacgtttttaaatggttgaaaagaaatcaaaggaagagtatttcactacatgtgagaattatgtgaaattcacatttcagtgttcataaa----gtttta-tggaacacggaagtatccattcatttacattattgtctttggctac-tttggtggtacaacagcagaatcccatagttgcagcagagaccttatggcctgaaaagcttaaaatatttactatgtgattattttacaga---agtttgccaatccctTTCTTATTGTATATTGGGCATTTCATAAATTCTTATTGTTTGAATTGTTTCATATACAAGTCTGAGTTACCAGATAGGATTATTGTGATCCTAAAAGTGTTCAGTGACTAAGTGAATGAATGACTGATTGACCTATATCTCTTGTGATCCTTTTGT a score=3601 s mm7.chr5_random 138932 162 + 11523536 GGGAAGACTGTGGTTGCCGAGAGTCT-----CCTGCCACAGTTCAGGAACACTAGCCTATCTGGGAAGATTCCTGGATGTGCAGCCAGGTCTTTTTTTTCCCTGACCTCGGAAAATTGAG----------AGGAGT--AGGCTGAAAGCTGGAAAAGATTGATTGGTGAGCTACAAAAG s bosTau2.chr25 14167053 165 - 41414979 GAGGAGACTG-----GTTGAAACTCTGTTTCCCTGCCCAAAGTTAG---CACTTGTCTTTTTGCAGAGAATTCTGTGTATGCAGGCAGTGTTTCTGATTTCCAGA------AAAATTGAGGAGGCTGAACAGGAGTGAAGATTGCAGGTCTGGAAGGATTGATTGGTAAGGTACAAAGG a score=8340 s mm7.chr5_random 139098 447 + 11523536 AAAAGACATTTTCTTGAAGGTGAACTTGCCTTATCAAAATATTATGAAAATTCCAAAGAAAAG----CTGAGCTGGGTTACCAAGAAAATGCCAGGAGGGAAAAATCTTAATATATAGAATTTGAAAATGGAAGGCTAGTCTTTTT---GACAGTTTCCCATTTCACAAGTTGAGGATGTTACAGGATATGGGG--AAATGTTTGAAAGCTCCTCTGGCTGTAATTCCTGACTGTGGTCTCCTTCCC--------------------TCAGTCCTGT-----ACCTTGGTCACCTGGTATTGCTGGTAGCTCATCTCC-----------------TACAACCTGCCAGTACACATAAACCATTTATAACCCTGTCCATGATAGTGAATGGTCTGATAGCTTCGTCATAAACGTCTATGGCCTAGGGCTCATATGGAGGGAGAAGAGACATTTAAGAAAACCCAACACTCATGTTTTGGGGCTCTTTTTAAAATTTTTA s bosTau2.chr25 14167864 454 - 41414979 AAAAGACCGTTTCTTGAAGGTGAGCTTGTTTTATCAAAATATAAT-AAAATGCTAAAGAAAAAGAAATTGAGTCAAATTG--AAAGAAATTTTAAAAGGGGGAAATGTGAAAGGGTTTAATTTGAAAACGGAAAGCTTTTTCTTTTCCGTTTTGTTTCCTGTTCTATAAACT-AGGGTGTTTT-GGAGATGGAGCAAAATGTTTGAAACCTTTCCGTTCACCATCTTCTG---GTGATCAGTTTACTCTTGTAAACACAGGTACCGTTTAATACTGTTTAGAACCTCAGCCATCTGGT---GCTGGTAGTTTTTTCCCCCCCCCCCCCGATATTGTATGACCTACTTCTACAAATAAATTGTGAATTAACCTGATGAAGATAGCAACTGGTGTGATAACTTCTTAG--AATCTCTAGGCCCTAAGGTCCATGACCAAGACGAAGAGA-------------------------------AGCTGCTTTTAAAATCTTGA a score=10412 s mm7.chr5_random 139654 667 + 11523536 agtttccagagatcaaacttcagtccttatgcttagacaacaagctctttacacgctgagccatctcactggccccCTGTTTTGGATTTTCATAGTGTCATTAAGGCAACAACATTCTATAGTTTAAGACGGGTTAGGGTGTTG--------TAGAATTATGTGAGCAAGGATGCCTGTGGCATTAAAAAAAAGATGCTGTAGCTCTCTGTGTGATTTTTGTGTCTTCCATTGGGAAGCTGTTCTGGGCATGGTGTGCCTTTGCTAGTTAGTTACTTACTTATCACCTGCAATGGTTCTGTACA-CCTGTTTCCAGCTGTGCTGTGCCAATGTGGAATAGCAGGAGGGAATAGCCGGGAGAGCATAC-TCATGATCTTGAGGGGAGAGTCTCCTGGGTGTATGCAATTGCCGTGATTTGAAATGTTTTCACAGATTTGTCAGAGAAGGTACTTTTTCTTCTTT----GCTCCTAGTATCTTGTTTTAAGGCCAA-ACTGCCTCCACTTCTGCTGTCTGA-GTATACTTCTTATTTTAATCTACCAATTTCTCTTTTGTCTTTACTGGTTAAGCAGGAAGGTCTTGACCATGCCTAGATTGACCGCTAAGCAACTGAGCTCGATTCTTCTTGTTTCAGTTTGtttttttatttcttaaaaaaatttaaacaattaatttattgt s bosTau2.chr25 14168318 555 - 41414979 AGCGCCCA-------------------------------------------------------------------------TTGTGTTTTCATGGTTTCCCTAAAG--AGAGCGTTCACGA---TATGAAAGGTTAGGATTATAGCCTTGTCTAGAATTACG--GACAGTGCTGTCCTTGCGAATGACAGAAACATGCTGCCGTGCTCCACGC-ATGCTTGTGTCTTCCACGTGAAAGATGTTCTGGGTCACGTCTGCTTGTGCCA--------TTTACTTGTTCCCTTTAATGGTGCTGCCCAGCCACTCTGTGACAGTGTTATTTTAACTTGAAATAGCACAAGGG-----TTAGGAGAAAGTACCTTGTGTCTGTGGAGGGGGATTCTCCTGGGTACCTGTAATTGCAGTGATTTGAAATGCTTTCACAGATTTGTAGGAGAGGGTAATTTTTCTTCTTTATTTGCTCCTTTTATCTTGTTCTAAAGCCAGTATTACCTCTCCT--------CTGACATACACTTATTATTTCTTCCTTCCTATCTCTCTCTT-TTTTTCTTGGTTAAAGAA----------ACCCTTCCTATGAAGA------ATCAAAGGCACTTGGGGCTTCTT-------TTTATTTTTTTGTTAAT--AGTCGATTTGACTTTTTAATATGGTGT a score=5053 s mm7.chr5_random 140699 621 + 11523536 CCTGAGGGGTCTGCCATTT--------ATTACATG--GGTCAAGGATGCTCAAGGATGCTCTTAA----GCCTGACTTTTTATGTGTTCTCAGGGTCTCTGGTGGTAGTGATAACCTCTGAAGCAGGGTGCTCTGTCCCAAtggcatgccgagctggacaactggctgcgtgggatatactttgtgctgtagggatattgagcagcatcctggctcatttaacactgtagcagctcctactgtgtcaaccacaaatccatccagaccttgccgtgagggcaagattaccttggctgagaattattgCCGTAGACTGTAGGGGATGGTCTGAAATCAGAAGTCTGTCATGAATCCTAAGGGTCAGCGTCTGCATTCAGATGGTTTGACCCTTTAAAAACATCCCTCAAA-----GCAATGA--------------------CTAGAGCATATGTAGTTTGTTGAAATTCCTGTGCAATCTGTAAGTACCTTTTTAGCCTCAGCTCACA------------TTGAAAAGGAAGGTATGAGATTTTCTTATGTTAGAAATGAGG---TTAGTAGTAAAATGTAGAAATTTCCCATGTTTCTCCCAAGCCTCACATTTT-ATGATATTAGTTGTAACAGGCATCTTTATAGAATTATAGATCTTAAGAGCTGAAAGTTTA s bosTau2.chr25 14169272 545 - 41414979 ctggagtgggttgccatttccttctccaatgcatgaaggtgaaaagtgaaagggaagtcgctgagtcgtgcccgactctta--gcgaccccatggact------------gcagcct----accaggctcctctgtccatgggattttccaggcaagagtactgga---gtggggt-----------------gccattgc----cttctccGCTCATT-----------------------------------------------------------GTAACCCTACCTTATAAGAAAAGAAGTGCCCCAGAA-GCAGAGGATAGCCGCAGGGCTGGAG---------------------------CTTCATTTAGATGCTTTGGCATATTGAAAGTCCCTCTCAGATATTGGTGATAAGGTGAGAGGTGAAAGTCCCTCTTGAATATTGGTGGTA-GTTGAAATCCCTTTGTAATCTTTAAATGTCATTTTAGCTCTTGCCTTCAACTTCCTAGCACTAGAAGTGTGATACGTTATTtttccttattttcaaaacgagggagtttgtagtgaagtttagtaatctcacaggtctctcccaaccctcacatttttatgattttaGTTATAAAGCAAATCTT-ACTCAGTTATAGAACTTCAGAGCTGAAAGTTCA a score=111653 s mm7.chr5_random 141590 3064 + 11523536 TTAGTGGTTATTTAAGTTACTTTTTGTTTCATCCATTGA---TATTTCCACAGTGGATCAAGTCAGATAAAAAGATTTGCTTTTTTAGACATGGATGTTATTAAATGGCTCTATTTACAAAAATGTATGAGACCATACTTTTATAAGACTGTTTCCTTTGCTTCT---TGACTGGG-TTCAGGTGACAGTTGCTTGCACTCTAAGTGAGTCTGTT---TGGAATAAGGCTT----GTGTTAGTATTTATTTCAACATGTGCTTGCTGCT---ATGGGCGCTCCCATTGTCAAACATCTTCATGGTCTGCTACGTTAATTAGAGAAACTTTGACCTTTCAGAGTGCCTTGGTTGATATATTAGGGTTAAATTAGTAAG----CTATTTCAACTGGTTTTTAATCACAA-ATCAGTAGGGACTTATTATTCTTTTGGCCCGAGAAAGAGGTGGCTGAGAGAGAAATGTAATAACTTTTATGGGTTTATATGCTTTACATGTGATGTGCCCAACCAGAAATAACAAGATATATAGCAGATGTGAAGGGACCAGCTAATATAATTACACTAGGGATCATTTTCACCATTTGAGC-TGGAATTACATTGAACTTATTTCTTCAGCCCTAACAGGATTTGGTAGAGTTGCTTCAATTTGAATTGAAGGCTGAGATGAATTGCCCACACTTGTGTCTTTACT-GCAAGGCTAGGTTATCGGTACCTTCTGTATTTCAGA-GTTTGATAGACTGTCAGGCTCA---TATTCAGATTCATAACAAGGCTCAACCGGATGGGGGAAAGTGTACTTCATTAAATCTACCAGATTAGCATGCTTGGGAGTGATTATGGGCTCTTGTCTTGAAACCAGGTCTGAAGGTAGTCTGATTAGACACACTGCTAGTCTTAAGCCTTATTGGAAAA-ATCGGGCCTTCTAGCTTGAGCTCAAAAAGATAATTTTGCATGCATGAAAATATTTGACAGAGGGTGTGAACTGTGCTTATTTTGGCAAACAAGTAGATCCCAAGATGAATCAAACAGATTTCAGTGTGGGACAAATTGAAATACTGGAGAATTTGTGTTAGATACTTAAA-CTTATATGTTATCCT----GTCTTCTTAG-ACTTCTGGGGAGGGAAAGAGCCAGTGGCCATGCTGGTGTCAGAGCAGAAT---CTCACAC-ACAGTCGGGATGGTAGGCCTG---CCTGGCCTGTTTTTGCTTTTATACTCTGAGTCCTGTCACAGCAGAAAGGCTGTAGTGAAGGTGTTTACTTCATG---GAGGATCTGCATAAAGACCAGCTTTTAATGAAGCTCAGCACATGGCACCGTTATCGTTTCTAACACAGGGAGATCGTTTTCAATTTTGCTATCAAAGAAAAATGACAAATAGAGAATGCAAGAAAAACCCAGATGGACTCGCTGCATTAGGAGCTTGGTATGCATATTTTGTGTCACATATTAGCATTCATTAAGTCAAAAGGGGGAAAAAATGAGCTTTTCCTACATGCATTAAACCAATAAGGCTGGCGAAGTTCCAAGCTAACTCTTGTGGATTAATTGTTTTATAACTGTTTTAATTAAAATTGTTCAGTATATGATTAACCTAAAAGTTTTAATTTCTACAAAACTGTTGAGCAAACGAGACATTAATATTTTATATTAACTGTGGTGATACTGCTGTGGTTTTCAAAGCGAC-GCTCTTTCAAGTAAAACATGGCAAGTGGT-AGATAGGAAGCTCTCTG-CTCAGGACGCCACTAAAACTAC-------------------------------------CGAGGT--TCGGGAGCCCTG-----TCTGCAGGTCAGCATT-----GGTCGCCCTCTGTTTACACGTTCCATCTACCAAGGAGGTACCAGTTACCTGTAAT-GGTTGTCATGGT---GAGGTTAATAGTGTGTC---------AGGAATCTACT---------------------CCTTATGGTAATATTGGTAGAGCACATAGGATCCTGAGATCATCAGGGGCTGGCCAGGGTTGGGTGT------------------CTTTGTGGTATTGATTTATATGACAGGGACAGTTGTTAACTCTGGAATCAAAGGGGAGGATTAGGAAGGCTTGAATGGATGCTCACCTTTATTTGCCTGAGGTTCTCTAGGTAGGCACC--ACTAACTTTGGCAGAACCACAACCTATTTTGCAAAAGCCACAACTGACCCCAGGGAAGCTGTATTGTGAATAGTTGTGTGCAGCTATGGCTCC-CCAG-ACACAGATTTGAAT-----TCACTCTTCCCGTACCCCACTTCCTCTCCAAGATGCCTTTGTCCTAATCTTCT---------TTTTCTTCTTAACCGAGGAGAAAGTCTTTCCTTTAAAAA-ACTTTATTCTCACCTCGCTCTGAGGGGTTGTGTCACAGTACCATAGAAATTCAAGATAATGGTGTTATTCGAACCCCACAGGAGCGTGTTGGAGAAGATAAGATTAGCGTTGCTCAGTGGGAAGGATTATGATAGAGCTTAGGCTGTTCTAGCTGTCTAGATAATGATCAGCCCTGGATGGTACCAGGCTGAGATCACCTATTAGATCCTGGGACACTTGACACAGGGTCTTTGTTGCAGAGATATATCCGTGGAATCTGGGGTGTAGCTTCGGAACAGCAGCAGTGTGTCTGCCCTGCACTTG--TAGCCA-TGTCACGAGAGACTGTAATCTGTCCAGACGCCTAGCCACTGCCTGGTTCTGTCTCCTTCTCCCCCTGTCTAGTTGTTTTTATCTAGAGTCACAGATTCTT---TGCTAGCCTTTCTTTCTGTGC--TATACTCTTTCT-CCTCCCAAGTCCCTTCTGTTTATCATTTAAAGCACCAGATTCCTAATAAATGATTCATATATCCAGTATTTAC-AAGTCGTTGATAATCAGAGTATAATAATagatct-------------tagtcttgtacgggctgctgcatttgccagaaatctggctttgcacaagtgatttttgagataagtggtttatcaggtatgctgctatcctctcatttctttaaactctcttgagttctgtcttttttttttttttttttttttttGAGTTTGATCATTAGAAAAGCACACAGCTTGGATGGA---------------ACGGTATCCCTGTGATGGAGTTCGGAACGCTGTG-CCTTGGAAAATACAGAGGAAGAACACTCAGTTTAAAATTTCAGTATTGGAAGGTCA s bosTau2.chr25 14169817 3153 - 41414979 TTTGTTATCATTTA-GTCCATTCCTGTTAGTTCTATTGAGTGTGGTTTCATAG--GATCAGGCTAGA-AAAAATAGTTGCTTCTT-ACACATGGACATTATTAAACACTTATATTTA-GACAGTTTATCAGAACAGACTTTTATAAAAATGATTACTTTTTTACTGACTGACTGGAATTCAGGTGA---TTGTCTGAATTTTAAATATTTCTGTTGTTTGGGATTAGGCTTTTAAATGTTGATGTTTATTTTAGT-TAAGTTTCATATTCAGGTTGGTACTTATACTGCCAAACAGCTTTATGCTCTGCTACCTTCATGAGGGAAACT--AACTTCTCAGAACACCTTGGCTGACACATTGGACTTAAATTGGTAAGTCTTCTAGCCCAACTGCTTTTTAAGCATAATGAAAGTAGAGAACTTTT--TCTTTTGGACTGAATGAAAGGTGGTTAAGAGGGAAATCTAATACCTTTTATGGATTTATATGGCTCACATGAGAT-TGTCCAATCAGAAATAACAAGATACACACCAGATGTGAAGGTACCAGCTAATATAATTATGCTGGGGATCATTTTCACCATATGAGGGTTGAGGTACATTGAACTCATTTCTTCATCTCTAATAGGACTCAGTATAGTTGCTTACATTTGAATCAGGAGCCGAGATTAAGTACCTATGTCTGTGCTTTTACTAGAAGGGTTGAGTGGTATGTACCTTTTGTATTCCTGAAGCTTGATAAACTATAAATCCTAGAGTATTCAGGTTCATGGCAAGGCTTAGGGATGTAGTGGAAGGT----------------AATAGCTGAGTGCACTTCT------TTGAGGGCTCTTTCCTGGAAAACAAATCTGAAGGTGTCGTGA---GACACAGTG--------------TATCAGAAAATAACAGGTCTCTTAACTTGTGCT-AAAAAGATATTTCTGCATTCATTAAA-TATTTAACAAAGGGCGTGAACTGTGCTTACTTTGGCAAACAAATAGATCCCAAAATGAATCAAACAAATTGTAATGTGGAACAAATTGAAACACTTGAGAATTTGTCTTAGATGTTTAAAACTCATATTTTATCCTCCATGTCTTCATAATACCTTCAGAAAGCAAAGAATCTTTTGGAAATGGCAGTGAAAGGGCAGTATTATCTCAAACTGCAGTTGTGGTTCTGGACCTGGTCCATGGGCTGTCTTTCCTTTTA--CTCCTGGCCCTGTAACAGCCAGAAGAGAGTACTTAAG-TGTTTATTTCACGAGGGAAGATTTTTACAAAGAGCAGTTTTTAATGAAGCATGGCACATGGCATCATTATCATTTCTAACACAGAGAACTCATTTTCAATTTTGCTATCAAAGAAAAATGACAAATAGAGAATGTAAGAAAAACC-AGATGGACTAACTGTATTAGGAGCTTAGTATGCATATTTTGTGTCACATATTAGCATTCATTAAGTCAAAAGGGAAAAAAAATGAGTTTTGCCTACATGCATTAAACCAATAAGGCTGGCAAAGTTCCAAGCTAGCTCTTGTGGATTAATTGTTTTATAACTGTTTTAATTAAAATTGTTCAGTATATGATTAACCTAAAAGTTTTAATTTCCACAAAACTGTTGAACAAATGAGACATTAATATTTTACATTAACCATGGTGATATTGCTGCGGTTTCCAGAGCAACTGCTTGTTCGAGTAAACCAGGAAAAGTGGTCAGGTGGAAAGCGCTGTGTCTCGTGCTACAACCAAGAAAACCTGCAAACAGAGTAACTTAGCGAAAGCACCAGTGTGACAAGGTTGTTTGTTACCCTGAAAATTCTTCAGGGTGGCATTTATGAAGTCAGCCTC----CCCACTCCCTGACTGTCAGTTTAGAGCTGAGGCTCAGTAATAAATTGTCATGTTGAGGAGGTTAACAGTGTAACATGGCAAGAATGAGTTTATTTTGTCTTTTGCTTCCATTTGGCTTCATAATGGTGTTGGTGTACCACATGAGATGTTTGGTTTTGAAGGGTTTGGCCAGTAGGGGCTGTGAATTGATTGACATTAAGTTCCGTGGTTTTAGTTTAGGTGATAGGTACAAGTGTTGGTTTTGGAATCAAA-GGGAAGATAGGAAAGGTTTGGATGACTCACCTCTTTTATTTTCTTG-TGTTCTTAAGGTTGGTACCAGACTGACTGTGG-AAAAACACATCCCATTTTGCAAATGGTAAAACTGAGACC-------CTGTAAAATG--TCATTATATGTATCTGTGGCTCCTTCAGTGTACACATCTGCATTTCTCTTACTTGTTCTCCTCCTCACTTATGCTCCCATTTTACTGTGTTTTAGTTCATTAAAAGATGGCTTTCTTCT---------------CTTCTCCTCTAAGCATTTTTTACTCTGACTTCACTTTGTGGGTTAAGGTCATGGTACTATATAAATTCAGGGAGCTGGTGGTATTTGAACTCTATAGGAGCATATTTTAAAAGATAAGATGGATACTGC-CAGTGGAAATGGTGATGACAAAACTCAAGTTGTTCTGACTGTGCAGAAAGTGATAAATTCTTTGGAGTCCTAGGCTGAGTTCAGTTGTTAATTTCTATGACACCTGATACAGGATTGTCTTTGCAGCATTAGCTCTGCAGAGTTTGGGGTGCAGCATCTGAACAACAGAAATATATCTGCCTTGAACATACTTAGTCAGGGTCATGCGGCATT-TGATCTGTCCAGA-GTTCAGC-----CCTGATGTGATCTCTTGCGTTACCTTGCCCATCATTTCTTCCTAGAACCATAAAGTTCTCGGTGCTAGCCTTCCTCTCTGTCCCATATAATCACTCTCCCTCCCAAATTCCTTCTGTTTAGCCTTTTAAGCACCAGCTTTTGAAGAAATTATTCATATATTCAGTATTTTTGAAGTAGTTAATAATCAGAGTATAATCATACATTTAATGATTGTGTAATTGTC-TGTACAAGTTGCCATATTTGCCAGAAA-CCAGCTCCTCACaggtgattttcaagataaatggtttatcaggcttgctactatctgttcatttctttaggctgtcttgagttctatcactgcgtgat----------------gttagatcattagaaatgcacatacctggactgtattatattggtgcttcagaggattgccattatggaatt-agagtgcagtgtCTTTGGTAAATGGAGAGTAAGGACACTCAATTTAAGAGTCCTGTATTCTCAggaca a score=13490 s mm7.chr5_random 146254 461 + 11523536 CTCTGTAGTCTGGAGAGCATGTCTGTCTTTCCATAAAAACTGCTGGTAGTG------TTCACTGGTGAGGCAGCTGTCCTTTTCTCCTTTGTTTTTCTGATGTAGTATATTGCAAGCTTCTCAACATACCACCAATGTGCTATAAATCTTGTGTAGTTCAAGTCTTTTTTTTTGTCTGAGGTTTAGTTACTGTTGCAGTTGACTGCATGGCAGCCCATGGCAAGCAACAAACGAGTGTTTAAATGCTGTGTTTTCCAACAGATGTACCCATGCAGGTGGGC------ACAACAGCTGCTGCACATTGGGTGTA----------------GGGGCCAAATG----GTTCCAGATACGCTGTTG-TTTGGTCAGCTCCTTTTCTATGACTATAATCTGACTCATTTTGCTTCTGTTCAGATTTTGTGACTCTGTTTTATTTCTTTTTGAAAATGCTAGCTGTGTGACTTCCATTTGGGGGATGTTAAATTTGAGAT s bosTau2.chr25 14173841 468 - 41414979 CTCTGCAGCCTGCCTTCTACCTCTACCCATCCATAAAACATTGTGCTTGTGCTGCTCTTCATCAGTTACATGGCTACACTTCTCTCATTTGTTTTTCTCACGCAGCA----ACAGCCTTCCAAAAATACCAGCAAGG-ATAATAATCCTTTTGCTGTTCAATACATCTTTT--GTCTGAGATTTAGTTACTGTTGCAATTGATGGCGTGCCAGCTGATGGTAAGCAACAAATGAATGCTTAAATAGTGTGTATT-CAAAGGACGTGCCAATCCAGGTGATTTTTCCAATAGCAGCCACCACACACTGAGTGGAAAGAGAGCAGTAACCGAGGGTACAGTGGGTTGTTCCAGATGTTCTCTGGTTTTAGCTAGCTCATTCCTGGTGATTATAGATTGACTTATTTTCCCTCTGTTCAGTTTTTGTAACTCTAGCTACTTTATTT------------------TGGCTTCCACTTGGGGATGTTTAAGTTTCAAAT a score=5783 s mm7.chr5_random 264522 184 + 11523536 TCCTCAGAATGTGGCAGTATTATTTTATCTATCTGTATACAGAA-CAATGGCCTATTGAATAATAATATTTATCTCTT---CTAAAAGTATACTGAGCAGGA-gtagccagcagccacatgcaattatgtatcactttaaatgtacttagtccaaatagaaataagtgattgtaagttttaaagactca s bosTau2.scaffold1698 99918 184 + 200348 TCATCAGAATATGACAGTATTATTTTCTCTACCTGTATACATAAGCTTAGGCCCACTGAATAATAAGGTTTATCTTTtgtgctagagtttcactgtccaacctggaaccactaaccatatgtatctcttgagcacttgaaatgtgaccagtctaaattgacat-----gtTTTCAGGTGGAAAGACACA a score=2669 s mm7.chr5_random 266360 46 + 11523536 TAATTTGTGAAAGTGTAGTGGTGTCCAATCTAATTGGAACACTGTT s bosTau2.scaffold1698 103412 45 + 200348 TAATTTGTAAAA-TGTACTGTTGCCCAATCAAATTGCAACACTGTT a score=21845 s mm7.chr5_random 266650 558 + 11523536 ACATTTTTATTTAATTAC-TTTAATCAGAAGG-ACATGATAGTAATTTTATAAATAATTAGGTTTAATATTTT-TCCTGGAGTAATATTTTTTAGTTGTCATTCAAGCTGGATGTCGCTAGAATATGTTTCTTCAGTAATGTGA-TGACTGTGAAGTAGTGGGAGAA-GGGTAGAATGTAA-----------CAAAGGAGTTAGGAAAA-CATTTCAGGAATGAAGAGGACTAATTAACTCAGACATACGGTTCATCTCACTCTGGCAAGAGCTAATTG-CTTTTATGCACCCCAACT-TTAAAAGCACAGTGCTATGGCTGCTCATGTGGACATAAACAGAAAAAGTACTAGAAATCATTGATATTTATGATACATACTAGTTTTTACAAAATACAACTCCACTCCCTTTGGCTAACATAGTGTGGCAATATATTAATCTTTTCTGGTTTATTTTAAGTGATTATTTAAAGATATTTCTGATATATATCAGCCTTTATTTTATTTCAATGAAAATCCTGTAACAAATAAAATATATGGCAAAGATAATTAAAAATCATTCACTGTTTTAGAAATAT s bosTau2.scaffold1698 103458 557 + 200348 ATATTCTTCAGTGGTTACATCTAACCAAAAATTACATGATAGCAATTTTATAAACAA----GTTTATTATTTTATCCAGATGGAACATTTTAAATGTGGTATTTAAGCTCGATTTCATTAAAATAT--TTCTTCAGCTGTGTGAAGGGCTGTAAAGGAGTGGAGGAATGAGCAGAGTGTGAGAAAACCATGATAAAGGAGTTAGAAAAAACATTTCAGGAACAAAGAGAACTAATTAACTCAAACACATGGTTCATCTCACTCTGATAAGAGCTAATTGCCTTTTATGCACTTCAACTGTTTAAAGTACTACGATGTGGCTACTCATGTGAACATACATAGAAAAACTATTAGAAG-CATTGAAATTCATAATGCATACTATATTTTACATAATAAAAATCCTTTCCTT----CTTACATAAGACTCCAGTATATCAA-ATTTTCTTGTTAACTTGAAATATTTCTTTA---ATCTTCCTAAGGTAGATTAGACCTTATTTTGTCTTAATAAAAATGCTATGAT-----AAATATGTGCCAAAGATGAGTGGATTTCTTTTAGTGTTCCAGAAATAT a score=17716 s mm7.chr5_random 326076 594 + 11523536 ATTAATACCATATGGATCATAGATTCATAACTTTGATTTTGCAGCCAATCTCTGCAAACAATGCAAACATTCTCCTATAATTGACACGGAGATTGAAAGGAGATGACCCTGCAATTAAGAAAGTCTGATG-AACATGGAATTAAGCTAGGTGATATTAAATGTCTCAGTGTTCATCAGA---ACCCATAAAAAATGTTAC----TGTTTGCCTTCCATCATGATTATATTAAGAGACTAGACTGAGAGAACTAAACCAAAATAGAAGCTAAAAATGGGCCTATACATCAAAGTATTGATCAAAGGTTCATACCTGTTTTGCTTTGTTACAAAGCACATCTTGCATGCATCATGAAGTCATTGATTTCTTGCCATGTTTTATCCTTAACTCAGTGAC-TACTAATAGAGTTATAATTGTTAATATGCAAAGGTTGTCTTTA-------------------AGGAAAACTAGTAATACTTTTACCTATGAATAAAATGACCATTATTTCAAAATAAATTTCTAATTATGTTTCTTTTAG---AAGGATCTCTTTA------CAGTTTAA-------TTTTCACAGTGTATTTTATGGTAAAAATTGGCTTAACCTTCCCA-TTTGAAGACTAAAGTGCTAA s bosTau2.chr6 35676622 628 - 69624268 ATTAACACAATATGCATCATGGGTTCAAGAATTTCAATTTGCAGCTATCCTTAGCAAATAATGAGAACCATCTGGACTGATTGATGTGGAAATTGAGAGTAATTGATCCTGCAACTGAGAAGCTTTTATGAAACATGAAATCAAACAAGATGATATTAAGCATTCTAAAGTTCATCAGAATGACACATCAAATGTCTTACTAGTTGTTCATTTTCCTTC---CTTATATGAAGAGACTTGACTGGCAGACTGTAGCCAAAATAAAAGCTAAAAC---ATCTAAACATTGAAGTACTGATCAGAAGTCAACAGCTGGTTTACTTAATTGCAATAAACATTCTCTGTGGTACATAAAATCTTTGACTTCTTGCCAAATATCATTTGTAGGTAAAAAATATATTAGTAGAATTAT-ATTATTACCATGCATAGATCACCCTTAAAAAGAGCAGACTACATAGAAGGAAATTAGCAGTAACATTATCTTTGAATAAAGTTTACATTATTTCAGATTATA-TCCTTATTATCTCCTTTTTGGTAAAAAGAGTGCTTCACAAGCCCAGTTAAATAACTGGTTTCCACAGTAAA--CAATGGTAAACA-GAGCttattcttcccatttttaagaatagaaagataa a score=8539 s mm7.chr5_random 327972 449 + 11523536 TGTATTTTATCCCTTTTGCTTCCTCAAAGGTGTTAGAGAGATTTTGTGAATGAAGTAAAATGTTATAAACAATAATAAGGAAAACC-----TATCTCAAGTGGCTGTGGAAGAAAAAGCATATTTAGGAAAGAAAACACCATTTGAGTAGTATTCAGGGTCAAGAAGT-ATAGATTACTG-CTGGCACAA-TGAACCATTTAGGCA------TGTATTC-CATAGGTAGTGAGCCTTCCCTATTTTATTGTACCT--CCAGACAAATGATAGTAAAGGTCCACATGAATCCTT-----GTGAGACTTTTGCCAAATGTGAGTTCCATAGCAGGAGCTGAGGTCA---TAGCTGACAGAAGAGGCCCGGCCACCACTAACCAAGAAAGAGTGAATGAATGGGCATGCTTTCCT--ATTACTTTAACTAAGCTGAATTAACTAGACAGGCATGACTCTCAAACCATGGAGAAGAAAGT s bosTau2.chr6 35677995 466 - 69624268 TGTAACATGCCCCTTTTGTTTCTCTAAAC---CTAGATAAGTTTCATGGAGAAAATGAGATTTTATAAGAAATGCTAGGGAAAAAAAAGAAGACATCGAGAGATTGTGGGGAAAGGGGCATGTTACAGAAGTAAAACACAGCTTGAG-AGGGCTCAGGGGCAAGAAGCGATCCATCAGTGGCTGGTGTAAATGAACCGTTTAAGTAATAAGATGCATCCACCCAAGCAGCAAGTCAACACGACTCTGTTTTAACTGTCTAGCCAAGTAATGCCACAAACCCATGCAGAGCCATACAACGTTGGATGGTCCCCTGATGTGAGCATTCCTGCAGAAACTAGGATCAAGGTAACTGACTGAAGATGCCCATGAAGCAATGAGCAAATGAGAATAAATTGTCACACATCCTTACCCTCAATGCTTT------GCTGCATTAAGTAAACAAATCTCTCTCTCAAACCATGCGGGGAAATGT a score=17369 s mm7.chr5_random 395137 846 + 11523536 CTTTTATTTGAATG------------GAAAAATGTCTGCATGAAACATGCTACAGAAAAATAAAATAACTTAG---AAGTGGTCAGGAAATGCACGGCGACTTACAATGTGTTTGAAACAAAGATTTTATGAAGCTTAGCTTCAGGCTAATAAAAACATCTCTTCA--TTTGATAATGTCAGGAAAGATAGGCAGTCGCCACACACA---TAACT----GAATAGGGCTATA--AAAAGGAGATCCTCTAAATGCTTACTTAGCTGCAATCAGTGAACACTATGAATCAAGGAAACTTTCAAAAAATGCTTTCAATAAAAATCCC-AGTATT------------AATAT-------TGCCTCTTCTCTATTCCTAAGTCAGATCCTGCAATAGAACATTTTTAGACTTG-----------GTGATTGGTTGAAC--ATTTCTGTACTCTTGGTTAAGCTTTTTATTTTCTGGCATAATCAATACCCTGTCACATATTATTTGCCATTATTATCAGAGTGCCTAATCAATAAAGTTTAAGAGCTAATCCCTTA--------------TTTTTCTAATGCACTTAGAAACATTT-------------TAGCCCAAATCCGTTGGCCTACAATTCCAAGTTTGATATTAGAAAGAATTTGCTTCTT--------TTTGAATCTCAACATATTCTAAACTGCCATCTTTAATTGTGGTAAGATAATTCCAACTACATATAAAAGGTTA-TCAAGGTAAGCTGGCAAAGGCATATGTGGTACATAACACATCAAACT--ATATAATTCCTCTTCACACTTTCTAGCAATAAAATATTTTGGTTTACTTTTTTTATACATTTTCAGGTTTC-----AGTTCCAGATTCAGAAATTTTTTAAAAATATGTTTTAACATTCAGTAGCA-AAGTCTTCGGGCTTTAAAACTACTAGCA s bosTau2.scaffold3436 15219 908 + 82597 CTTTTGTTTGGATATATAGGACAGAAGATACATTTTTACACTGAACATGTCACCAAACAGTAAAATAGTTTAAGTTAAAAGTATAGGAAATGCATAGTGACTCACAATGTATCTGAAACAG----TTTATGAAGCTTAGCTTCTGGCAAAGAAAAACATTTCTTTACTTCTGATAATGTCAGACTAGATAGGCAGTTCTTGCACACACACTAACTACAAGAAT-GAACTATACCAAGTGAAAATCTTCTAAATGCTTACTTAACTATATATGATAAAAACTGTCAGGCAAGAAAAGTTGCCAAGAAAGTCTTGGAGGAAAGGCTTGAGTATTGGAGCACAGTGAAATCTAACTAAATGACTTGGTAACATTTCCAAGTCAGATAATGTAGCAGGACCTATACAGGACTGTTATGTTTCAAATGATCCCTTGAACTTACTCCTATATTTTTAA--------------TATTGAAATAATCAGTCCTCTTACATCTATAATTTGTTGACATAATTAAATGTCATAAT---TAAATCCAAACAGCACAACCTTTAGATGGATGTTTTCCCTTTTCTTATATACTTAGGAGTTTTTCACTTATGTTTAATAACCCAAGCC-----ACTTAGAATTCCCTGCTTGATATTGTAAATAATTTATATTTTGATTTGAGTTTAAGACTCAAACTGTTCCAAACTGTCAACTCTAATTATGGTAA--------CACGTTGGCATAACAGGATAGCCAAACTAACCTAGGTCTGATATAATCGTGCTGCAATATATCAAATTTGATATATTACCTCCT-GTACTTTATATT-ACAAAATAACTTTATTTCACTTTTTCATAAATTT---GGCTTCCTTTTCTTTCTAGATTCAGTAATACATAAATATCATGTTTTAAAATT-AGTGGCATAAGGTCTATGGATTTAAAAAAATTAACA a score=26494 s mm7.chr5_random 402043 971 + 11523536 TTACTTGTGTTGTTTAAAAGATAATGATAAGAAAAATAAATCT---CTCCATGTTTAGTAAAGATGCA-ATATATTTCAGTTTTTATTAGGAGCCAGATGACTAGTGCATG-GTAAATCCATAGGCATGGAGAGGTACCCATAACATATATGTATAATAATCTACACATTTACTTGCCACAAATCAAACATAAAAATTCAAATTTTTCTACCTTTCTA-----------ATAGTTGATGATGTTGATCTTTTTTTACA---------ACTTTTATATATAAGTTATCATATATTT-----TACAT--ATATGA-----TAATTCTAACCAGTTTAAGAATTTTGAATATTAGTTTAAATGTCTCAAAATCAGTCAAATTTAATAGTTATTCCA--CAAAAGTTACA---AATCTGAAGTTGTAAGCATGTCTAGGATGTACTTTCATGAATTTGAGTTTAGAAAAATCAATCCTGTCTGCCAAAAATAGAACGCTTCTTGCAAAGTAATTGAAAGAAGGAAATTCATTGTTCAAAACAGAGAAT-AACTGTTGATTAAGATAAAGTGATTGCTATGTGCATGAGTTAAGATACTTAAATGGGTCTATTTCCTATATTAGAACTAATTTC--------CTTTTCTTTTTGGCTATCATTCAGATGAGCCCCCTTGAATGACAAAGCCCTATTA---GGACCTGATTTAAAGTGACCAAAGGCATTTATAAACCTG-GCAAAACTGATTATACTTTGTAGAGATATGAAAGATCATTCTGTAATGTTCTTTCTAATTTCCCCTGTGGTTCCAATGTCACCTAAGGTATAATTAATCAGAACAACTATATTTTAGTAAAATTGAGTCAATGACCTAAGACTAACTTTAGCATATTTTAAGGAAATAA-GTCAGAGGAAAACAGTT-CTTGGTAAAGAAATAAAAAGAATTTTAA---GTGTCAG-----------GAGAAAGAGAAGACATTAAAAGATAAAAAGATGATATCTATAAAAAT-GTTTTGAAAAAATAATTTCCATA s bosTau2.scaffold3436 21012 996 + 82597 TTGCTTTCATCATGAAAAAGAAAAGGAGAATGAACATATATATATGCTACATATATA-TGAAAATGCACatatac-----------------------------gtacatacatatatgtatatgtatacatacatacacaatacatatatatgcatatatgtatacatatgcat------atacacatatatacatgtatatgtatctatctgtgtatatatgcatacatatacacatatgtatgtatgtgtttatacatatatatacatatatatGAGAATGGACATATACATATAGCTACATTTATATGAAAACTTAGTTTCTACCAGTTTAAAAACAACTAATGCTACTCTCAGT-TCCAATGTTCCCTCAAATT----AATGGCCCCATTCAAAAATTGTAGGTAGTTTTAAGTCTTAATCAACATTAGGATGTACATTTGTGAATTTTTCTTTAAGAAAATCAATATTTCATGCCCAAAATAGAAGGCTTCTTGTAGAATAATTGAAAGAAGGAAACTCATTGTGTAACACAGAAAATCAACAGCTGATTAAGACAGAGCAATTGTTACATGCATGGCTTAAAATACTTAATTGTGTTTGGATCCTATATCAGAACTAATTTCCTCCTTTTCTTTTTTTTTTGGTTTGCATTTGGGTGAG-CCCCTTGAATGATAAAGGCATATTATACATACTTGCTTTACAGTGACCAACAGCATTTATAAATTTATGTAAATCTGACTACATTTCATAGCATTATGAAGGATTTGTATGTAAGATTCTTATTAATTTGCTCAGGGCTCTTAATGTCAACTTAGGTAAGATTAATCAGAACAACCATATTTTAGAAAAATTGATTCAATGAAC-AAAACTACC----ACATATTTAAAGGAAGTAAGGGCAGATGAAAGCTGTTACCAAGGAATGGAGTAAGGAGAATTTGAGCCCGTGGCAGATGGAGGAGGAGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATAAAATTGTGACATCTGTTCAAACAGTTTTCAAAGAGTCATTTACACA a score=22571 s mm7.chr5_random 403841 815 + 11523536 AAATAATTTTAGTATATCCAAAATAAATTTTCAGG--CTAGTTTTAGACTAGATAGTTTTAGACATTA--GATAATAATCAAATTGGCATTAATCAA--AAATACTTTCCATATCTTTATTACAAAAA----AATCATAAAGATAGCACAGTTTAGAGTGTGATAAAGCCGAGATTTATGGTAGATTTAAAACCACCTACATTTTGTATT---CTTTTCCTTTTCTGGGCACTCTTTTTACAAGATATCG-CTAAGCTGCAGAGATAACACTCATAGATTATGTTATTAATATTCAATTACCCAACCTGAAATAGTTTGCTTATGCAACATACAGCAGGTGTAGCTTATAATTGAATTTCTGAACTTTGCTGTGGCTTGGGAAATGCATG-GGCTCATTTATCATTATCCAGACACCATCATTTTTAGTacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacgcacacacacacaAaattaatcaatcaatcaatcaatcaaAGCATTAATTATGGAAAAAGAATTCCAGGAAAGCTGATCACATTTAACTCTTGAATAAATATTTTACCATTTAGTTATAAAACTAGCATCCCTATTAGCCATGGTACTAGATTGTCATTATC--TTTATTCAGGAGGATATCAGAACAAAGTCCTTAGGCAAAGTCAATAGAAAAAAAATATTTAACACACAAGGTACTTCCTATGCGGCTATGAAGTTCAGTAACTTTCTAAATGAGGCACCTTAGCTTTGGGTCTTTATCATCTGAAGCTAATGTCAATAATGGTTTGTTTTTAATTTAACTAAATTCAGC s bosTau2.scaffold3436 25539 742 + 82597 AAATACTCTAAGTAT--CAAGAATATATTATTAGAGACTCGTTTT--------TATCTTTGAAAGCTATTAATATTAATTATATCAATAACCTCCaataaaatatctaaaagattttaattattaaaataaaaataCTAGTGATAATATAAGTAAAGTTGTAATGTACTTGAAGGCTGAAATAAACTTGAAACAG--TTCAGTTTCTACTTACCTTTTGATGCTTCAAGAACTACTTTTGCCAAAGAGTGACTAGGCTGCAGAGCTAACCCACATAGATAGGGTTATTAATATGCAGTCTGTCTACCTGAAGAAGTTTACATATGCAATATACAGCATCTGGACCTTGTAATTGAATTTTTGAAGTTCGCTGTGGTTTGGGAGCAGCATGTGGGTCAGTAATCATTATCAAGACACTATCGTTCATAGTACACATA------------------------------------------------------------------------TAATTAATCAACTCATTAATTATAGAAAAAGAGTCTCAGAGAAGTCTAGCACACCTATTTCTTAAACAAATATTTTATCCTCAAGCTGTAAAAGTAGCATCTACTTTCGCCATTGCCTTTGCTTACTATTAGCAATTTATTTAGGGAGATTTTAGTAAAAGGTCCGTAAGAAGAGTCAAT---ACAAAAATCTTTCAGACCCAGGACCCGTCACATATATCCACAGAATTTAATCACTTTCTGATTAAATCACT---GCTTTGGATCTTTATCTTCTGAAGCTAATGTCAATAATACTTTATTTTTAATTTAACTAAATTCAGC a score=14480 s mm7.chr5_random 404921 548 + 11523536 TTATTCTCTATTCTGAGAAATGTATCTTTACGTTGTAATGCCTTTCATCATGTCTTACAAAAATCCATGTGTAAAGAC--ACACATTAACAGAAAACAGAGACTAATTTCATCAGATAAGTGCCAA-AATAAAATAGTAATCAAATAAAATCAAATGTCCCCTGGATGTAGATGGAGGAAGGGTTGTTTAACAGAGAACCTGTTAGTCCCTTCAACGACAGGGTGAGTTTAAGAAAAATGGATAGCTACTTTCCCACCT---------------TAGCTTAGGATTGAATTGAGAGATAC-AAAAGGAGATTTCTGTCTGCAGAGTCCTAGTGCAGTACCCTTGTAGAGCATCGTAATGCAATACATAAGAATGTGGG--TTGTTCAATGTTGAGAAGTATGAGATAATTC----AGTTAAAAGAAAATGAGATAAAGTTATATTTT-AGGGTTTTCCTTTCACTGTCATCAAGTTTTTGAGAATAATTTGAGTCTCAGTTTTCTATCTCTCAAATACTCTAATTTGAAATTATATAATATAATGTATATCAAGACTAACACTTGTATCTGGTT s bosTau2.scaffold3436 26353 556 + 82597 TTTTTCTGTACTCCTAGCAATTCATCTTCATGTTGGACTAACTTACATTATGACCTACAAAACTCCTTGTAGAGAGACATACACGTTACTATGAAA-AGAGGTTAATAGTGTAAGATAAATGCTAATCCtaaaataataa-aaaatataatCGGATATCAGCTCCAGGTCGAGACaggaaggactgtgtaatagag---ctgttg------tgaaatatatggagagcttaaggaagatgaacagctgtttgctatcttcactgaagctagaaatatcttaggcttaaaatgaaagacatgaagaaGAGATTTCTGTCTGCAAATTTCTAACGAGATTTCTAGTCAGAGAACC---ATGCAGTCTATAGAATTTTATTTCTTGTTAGATGCAGAGAA-TATGAGATACTTTAAGGAGGTAGGAGGAA---AGATCAATTGATGTTTTAAGGGTTCCTCTTTTTCTAATACCACATTTTCCTGACTTTGCTGAGCCTCAGTTTTCTATTTCTGAGCCCTTCTGCTTTGAAATTATAAAATACCACACAGATCAAGACTTAAACTTCTAGCTATTT a score=6583 s mm7.chr5_random 406491 534 + 11523536 TACCTTATTATTTTTATTCTAAATCCTTCAAAATAAGGTTTAGAAATTTGTTTTCACT------ATCCATTGCTTTAGAAGATTCTCAGCTTTATCATCTCTAGAGTTTTACAATCTTACCTTTTCTTCAAGG--TTCTGCTTTTTATTATTCAAACTTCATAACTGAAAGTTTTTTTTTCCTCTTCTGTTTTTCCTTCAAGATTATACATTCAGTGAAGGGC--AGACCACAACTAACTGACATGTATCTCAGCTTGAATTA---------AGCTGATGTTGATGTACTAAAATA----------------AATAACA----------------------------------GCAACTTATATTTTTCACACTTATTGCCTCACCTTATTAAGTAAGAATTTGAAATGTGGTTTAAGCAATATTGTGTTTTGCACATT---GTACAAGTTTTTCTGTAATTTATTTTAA-----TTGTTCCATTGTAG--TCattttttttatttttttttttttaGAAAAACTTGCAAATTTTTGAAACTTGGAAGTATGATATGTCAATCTAGTTAATA----AAAGGTAATCTATTCTAAAATATTAGGTCAAATAAAAATTA s bosTau2.scaffold3436 27879 594 + 82597 TACCCTGTTACATCTATT--AAATCAAGGAAAATAAGTCTTA-AGATTTATTTTCATTTTCATGATCCCTTTCTTCTAGAAATACCTATCTTTATTATCTTTACTATCTTACTTTCATATTGTATATCCCTGTATTTTTTATTTTTATTATTCACTCTTTTTAACTTA-----TTTTTTTCCACATCTGTCTCTCCCTCAAGGTTAAAACACCCTTGAAGGATAAAGATCATAATTGAATAATATTTATACCTATGTTAACTAATAGGTAACAGTAGATATTAA-GTATGAACATAGCATGTAAGATTCTTTAATAGTGGAGACACTGCACACATCAGTCCAAAGAGGCACGTGCAACTTATA-CTTTCACAGCTAATGTCCCATTGGAATAAATAC-------ACATGGGTTTTTAATCATTTTGATTCTGAATCATTAAAATTATAGTTTTTCAGT-TTTCATTTTCAAAAGCTTATTTTTTGGGGGGTTGATTTTAATCATCTTTACTCCATCA-AAAAGCTCCCTGATACTAGGACTTTGGGAAT----TTTGTTAAATTAGTTGAGATAACAAAGGTCAGTAAGAATAAAACACCAGATCAAACGAAAACTA a score=18295 s mm7.chr5_random 407712 428 + 11523536 aTCTGTCACAGGATATTTTTATTACTCCGGTACATTTACATGCTAGAAAATAGACTAGCAAAGTTCTACTTATGGGGA--TACCTAACAACCAACTCTTTTTCAGTGGAAAGGCTAATGGGAATACAAAGCATTAAAAAGGTATCACATTCCAGGCCCTTCTTACATCAAACCCATCTGAGAACCATTCTTCAGCTACCTATTGAGTACATTGTTTATTGTTTGGGGCCTCTGTTGAAGAGGTGAGGAGCAATTGTAATTGGAGGTGTTTATC----------TTGGATGCTTGAGCAAGATGAGGTCCCACCACTGAGCCAGGGGGAATGGAACTCAGTACATACAAAGGAGCAGAGTGGAAAAGAAGATAGTGTTAAGGAAGCAAATCAAAAAGAAATATGGATCTGAAATTAGCTACAAACAATTGCTATGATAAAG s bosTau2.scaffold3436 32639 440 + 82597 ATATATCATGGTGTATATTTAATATAGCAGAACATTATTCTGCTAGATATCACACTGCTGAAATTACCCTTATGGGGAAATATTAAGCAGCCTAGTACTCTACCACGAGGAGACTAATGGGAGTTCACAGAATGAAAACCATATTACAACCTAGTTCTCTGTTACATTAAGCTCATCTGAGAATCACTCTTCAACTACCTATTGAGAAAGTTGTTTATTGTTAGGGGCCTCTGTTGGAGAGGTGAGGAGTGATTGTAATTGAAGGTGTTTATCTTGGAAAGTTTTGGAAATTTGGAGAAGAAGAGGTCCCAGTGCTGAGCCAGCGGGAATGGAATTCAGTGATTGCAATGTAGCATAATGGGGAATAAGTTAAAATGAAGGTGACAAAGCCAGCAAAAGTAGGGACATGGAACAAGCTTTGAACAATTGCTAGGAGAAAG a score=3643 s mm7.chr5_random 408508 120 + 11523536 AGATATCACAGGGATGTAAAGTGATAAGTATCAGAACCATGTTT-ATAAGGCAAAATGAATCACTTATGTTTTTTCCTTATAAC--ATATCAAGATTGATTTGGACATTAATTTTATAAGGTA s bosTau2.scaffold3436 33151 121 + 82597 AGATCACACAGGGACATCAAGTGATAAGTAGCAGAATTAAATTTGATAAAGCAAAGGTAAACAC-TGCATTTTATCC-TACAATTAGTTTCATGATTGAATCAGACACCTATCCTACAGAATA a score=4416 s mm7.chr5_random 415002 224 + 11523536 TGGAAATTTATCAGAGTATAAAACCAGTAGCATTGCATACTCAAAGTATAGTAGAGCTTACTCCCTGACAGTAGTAAAAGAAAGAAATCAGGACCAAACAAATTAAAAAAAAATGTAGTTCTAAACTCTTTATAACAAGCAAGCAAGCACATAAAATTCTTAAAGTCCAGAGAA----ACATCTACCATTTCTTGAAATGGTAAGTGT---TCCGTCACACTCAGAAGGTC s bosTau2.scaffold5871 19737 212 + 50199 TGGAACTTCATCGGAGAAGAGAACAATTAGTAGAACGTACTCGGAGAGAGGCACAACTTGCTGCCCTACAGTATGAGGAGGAGAAAATAAGGACCAAGCAGATT-CAGAGAGATGCTGTCCTGGACTTTGT----------------CAAGGTGAGTTCTTTGGGTTCATTGAATGGTACTCCTAAAGTTTCTTAGAAT--TAAGTGCATATTTGTTTCATTGAGACTGTC a score=3003 s mm7.chr5_random 415571 75 + 11523536 AATCATTAATTTGACTCTTGAGTTACCTGCGCACTAAATGATGCTCTTTT---CTCATGAAACCAGGTATAAAACTGT s bosTau2.scaffold5871 25697 78 + 50199 AATCATTAATTTGTTTTGTGAGTCACCTGTATGATTAATGGTTCCCTTATTACTTCATGATGCTAATTATACAACTGT a score=35422 s mm7.chr5_random 416108 1061 + 11523536 ATTGAATTTTCACATTCTTCACACAGTCCTTAAAATACTCATTTTATTCCATATTACTTT--TCATCACATTTGAATAACAGATCCTTGTAAATC-----CTCATGGTTTCTTCATGGAACAACAAATCCTCAGGATAACTAAAGTTATGCAACCCCTGAAAGGTCTAGAACAGCAAATTTGTAGGGTATCATTATAGGTGCCAAGCTGGACAGGGCTCCAGCTACATAATGTTCACTTAATGAATACCTGCACTAATAAATTAGCTAATGTGTGAATTGTCCTACTTCTCTGACCTTGCCTTGTTTCCTCCTCTCATCTCAATAAATCTTGTTTCACCCttttatatatatatatttgaaaatgtaatataataGGGAGATGTAAAGCA------------TTACAGAAAAGCATAGAGAACCTCATTGAAGTGTA-CAATAAACAGGATCGTGTTG-AATAATAATATGGATCGTTT---TAAAATCACACTGAGTTTA--------------TCTAACAGTAAATTCAAAGAAGCAGACATTCATATATATAT-----ATGAACTCATCTTTTC------------------TGAGTGAGATTATCCAAATTCTTTTGTTCAGTTCTAGGTACTGTGTTTGAAAACAGGTGTGTACAGAATTCCTGAATTGAATGGGCTGGACTCTATTTGCTCAGTGCCAATTGAGTTTGACAAGCAGGAAAGTAATGTTTGCAGAGCAGAGAAAGAATATTTGAAGTCCAGAAGAGTTGATTACATAGATGACCTCAGGAACTGGGGTGAATGAGCTGGTACATATGAGATGCACCTTTCCTTTGCACTTTGGAGTCTGGAATATTGCTTTGATTGTTCTTACAAAGCGCAATCATACCCAAAAGGCTTTAAAGATTCCTATTAGGATTCATAAGGTCTTGGAGGCTGGTAAGCAATTATTGGCATCTTATGATCATTTCCCTGACAATCCCACTACCCTGACTCACCTGCTGAGCCATTGAGTTCCCA-TCAAAGCCTCAACATTTTCCTCCCCATAATCTGTTACTAACCTGTATTTGGGTAT-------TTTTCAAACTGTCTCA------AATAATATTATTCATATTTCAAAGGCA s bosTau2.scaffold3436 42450 1112 + 82597 ACTGAGTCTTATCAATTTT------GTTTTCAAAATATTTATTTTATTCTATATTTCTTTCCTCATCCCTATTAAATTCTAGATCTCCAAGAAACTATTGCTCATATTTTATT---GAACTAATCACTATCGAGAATCTCCAA---TTTACAAAACCTAAAATGGCTGGAATCACAAATGGGGAttgcatcattttatctgcaatgtataacacaaccttagtcacataatagttgcctaatgaatacatgttTTAATAAATTAACACATCGGTCTATGGTACTACTTACTTGTTTTTGTTTTATTGTCTCTT---ACCTCTGAATATCTTCCCTTTTCTTTTCAAAT-TGAGTTTTTGGGT-TGGAAAAGAAAAGAGTGGGGTAGGGTAGACAGAACATAATTAAAAAAGGGTAGCGATAGCCCAGTTGAGGGGTAGCAATAAATAGAATCTTGCTGGAAAAACTACATAAAGCATTTCAGTAGAATCACAC--ACTACAAAAACAGAACAAACTCCAAAAGTAGTttaagagaagtagatattttcctaaatatgaaaaataaaataataatttcacttcactccactcagtcctaactagattatccag--tcttttgtttgtatctaggcaccgtatttgaagagaggcattgacaaaATTCCTAAATTGAATGGAGATGAATATATTTGCACAGTTCCAGTTGAGTTTGACAAGCAGGAAAGTGATGTTTGCAGAGCAGAAAAAGAATATTTGAAGTCCAGAGGAGTTGATTGCACAGGTGACCTCAAGAACCAAGGTGAAGGAGACTGTACATATGATATGCACCTTTCCTCTGCACTTCCAAAACAGCAATATTGCTTTGATTGTTCTGACAAAGTACAGTCATCTCCAACAGTCTTTAAAATGTTCCATTAGGACTCATAAAGTCTAGGAGGCTGATAAGCAATTATTGTCATCTTGTGATCATTTTTCTGACAATTCAACAACCCTGATTCACCTGCCCAGCTAT---GTTCCCATTCAAAGTCCCATACATCTCATCTGCATAAGCAGTTAATAACTTGCTCTCCTGCATACATTCATTGGTAAATTTCCTCATCTAATATTAGTATTATTTATAATACAGTGGTA a score=5578 s mm7.chr5_random 417195 542 + 11523536 TCTATTTAAATTAAGCTAGGTTTAGTAACATTATTTAAGGATGGAAC--ATTTTATAACATTT----TGACTGGACATTACCTA----AATACCCTTGGCATTTGGAACACAAA-----------------------TAGAGT-TTTCCAATAGGAAAAAAAGTATTAGCATAGAATGTCAAAGTGCCTAGAAGATAACATGCAAGGAAAATGAATTACTGAAACAAAAAACAAAAAATAGTTACCTTGGTAAAGCCTGTTCAACTATATAATAATA---------TATAAACATTTGAATGGTGAATGCAAAAAAGGTACAATGAATCTACTTTGCTTCTTCAAAGTACTTTATCCTAGAACAATTGATGAATGAATGTTTTAAAAGGAGATAACCTTTTGCTTCAGGAAGGGCAGGTTAAAAGCTATGGGTTTCCAGAAACAGC---------------ATTGAACATTAGC------AAGAAA-------ATTCAAATTTGGAGAATGTAGGCACTGATTAGATCAAATAATTCTATGAGCAATATTAGGATAAACAGAGTTTAAAACGGTGATAGGAGGGATTTGGGAATTTTACTTTTAGGA-ATTTTA s bosTau2.scaffold3436 43705 574 + 82597 TCTGGACAAGttaagagaattttagtaatattatcaaaggaagtaacaaatttgacaaattttctgatggttggacaatatgtgatacattaagtttgacatctgggatacaaattttaaaagacacattgacaaattagagtgtgtctcaggggaaaaaaatt-----caaaagatat-agaatgccttgaaaacaggacataaaaaaaa--aatgactgatat-----tttgggactattcatcttgaaaatggcca--cacttaagtgacattaatagaagttttcaaatatttgaatggctatctcataaaagg------gtacccattctgtcacttctaagtaatata-ctaagaaca----atggttgaaagttataaaaaaggtgaa---tttggctcataataaggaaat---aagctgt--atttttaaatacagctattattttctcaaaataaaacagtaacctactgaaggagtgagttcactAAAAATTCAAAATTTTAAAGACTGACCAGATTAG-----TATGTATGCGGTATTATGAGGAACATA-TTTCAAAGGCTTATAAAAGGGATATTGGAACacattttttaatatatttta a score=15261 s mm7.chr5_random 595916 491 + 11523536 GCATTATTATAAGCAG----CTACTTTGAAATGAATGCTATTTATCTAGTAAAG------TTCAGATGCTCCATATGGATCAGACCAGGAAAAATCCCCTCAGAATCTCCCACAATAACAAATGACTGCATTCTGAGAATACCATTCATCTCAGATGACTGACAGATGAAACACCTAGAATCAAAATATTATACGCAATCAATCCCTAATGAAGAGGCATCATGTACACTTAATTTCAACTTAATCTCATGATTTTATAATGTGGTTCACATGGGAGGTCTTCTGTATCTTCTACTTTGC-TGATTCTCCAAGCTGATTTGAGTTCAC-----TCCCCTGACAGTC-CTTGCCTTCGTCTCCACTTGACAGCATGAGTCAGTCTCAGATGTCAGCACAGGGTGCATGTGTTGATGTTTTAAATTTCCATTTTGACACCGTAATGATCTCTCCATAGATTTACACTGAGATAATATTACAATTTTATTTGCATCTTATGGTAG---TTTTTG s bosTau2.chr6 6891902 486 - 69624268 GCATTATTATAAATAGATAGCTACTTT-AGATGGGTGATATCTGACAGCTAAAGAAAAAGTTCAGAAGTCGAGCATGCATAAGACTGAGTCAAATTCCCTTAGCATCTTCT-------CAAAT---TTCAGTCTCAGGGTGCTGTTCATTTCAGATGAATGGCGTATGAAAT-TCTAGAATTATAATATTACACTGAATAAATTCCCAAGGGAGAGAAA-------CATTTGCTTTCATCTTAATTTCATAATTTTATAATGTCGTTCCTGCAGTGAG-ATTTTGTGCCCTCAGCTTGGCCTGTCTCACCAGTCTGATCT----TCACAAACATTCCTTGATAGTCTCTTATCCTCCT-TCAATTTGACAATATCAGTCAGTCTCAGATGTCAATACATTCATCATGGATTGACTTTTAAAATGTTCATGTTGGCATTCTAATGATTTCTCTATAGATTTACACTGAAATCATCCTGCCATTTTCTTGGCACATTGAAGTGGATATTTTTG a score=19502 s mm7.chr5_random 596497 975 + 11523536 AGATAGCCAAGTTAAATCAGTAG-------------TTTGTTATTTGCTACTACTGTCAATGATGGAGAAGTTTGAAGGATCTCTGTTCTTCCTTTGTAAACTCCCTAGCTTGAGCTTAAAAGAGTGCTTTCAGGAAGCAGGGCTATCTTGGGAACTTCTGTATTAGATATTCTGTAATGCAGACACCAAATAAAGAGATGATAGGCCCCACAGGCTGCCTCAGTGAGAGTAGGGAGATGGCAGAAAAGATGCTCACTTTT---GACTG-TGAGTAATTTATTACTCAAGTTTCTGGAAAACACTATCCGTTTCCTTTCTAAATCATTTCTACTCTTTATGTG----GTAGTAACACACTGAACCAAGTGAATGCTAACAAAAGATGAAGCAGCCACCATTTTAATCTGGCCTTAACTGCTGGCTGCATTTCACATGACTTAC--ATGGCTTTGAAGAAGAAAGAGCTATTTCCCATTTTATTTCAGGAGAGATGGAAAAAGAGACTCTTTGATTTGGTTATACAGAATGCATTAAATTATTCAGTAGGGAAGTTATATTTTGACTTCCAAAATAAATATTTTTGGTTAAACCTCTGGTTGAAGTTTTAACATTTACAATACTCTGTAAA--CGCTGCCCCATCCTCTTACCCTGTCTCAATGATTCTAGTCTCATCC---AAGCATCAATATTTAACATAGCATCTTGACTGG--CAGTAGGAGT---GCTT---CTGTATTCCTCTGCTGACTATCAGCAAGGAGTAGGCCTTAATCCCAGCAGAGCAAGAAGCTAGACTGGACTAGTGATA-----AAGCTTCCACAGTGTTTGGC---TCCTTCTCATTTGATAATCTCC---------AAAGTTTTCGCTACATATTAGACACGA----AGTCCCCTTGGACTT-------TTCTTTAGGCATTTCAGATGGGGTCCACCTTGAGGTCTTA-TCCTTGTTTCTTTCTATATATGCTGTGCACCTTTCCACTGAAACTCTCACAGC--CTGCACAATGTCTTCTATTT s bosTau2.chr6 62735857 993 + 69624268 AAATGCCTAAATGAAACCAATGGAGTAAGAAGCATCTTTGTTCTTTGGC-TTGCCTTCAGTGATGAAGAGAGTGGCAGTGGCAAGGCTTTTGCTTTCTGCCCTTCACAAGT--------GAAGGGCACTCCCAAGAGGCAGAGATGCCCTGGACATTTCTGAGTGTGGAACTCTGCCTCCAAGACACCCAGAGGTGACAGGATTAACCCCGGGTGCCGCCTCAGTCAAAGCAAGACAATCTGAAATGTGGTACTGGCATTTTGGGACTGCTCAGTAATTCATCATTCAAGTCCCTTGCAAATGCTATGCATTTCTTTTCCCAATCATCCCAATCCTTTTTCTGTCCAGTAGTCACGTTTAGAACAAAGCAAATGTTAACAGAGGAAAAGGCAGCCAATATTTTAATCCAGCTTTAATCATTGGCTGCATTTCAGATGATGCACAAAGAGCTTTGAAGAA-AAATATCTATCACCTGTATTATTTCAAGAGAGGGGGGAAAAAGCTTTACTTGA------------------GTTCAATTATTCAGTCGAGAAATCAGATTTTGATTTCCAAAACAAATATCTTGTTTAAAATCTCAAATAGAAGTGTGAACATTCATGGTACTATTTGAAGTTACTATTCCAT-Gtcctaacttgtctcgatggcttttatctcatcctcagagcatcagcacatagcacagcattcagactgatcctgttaaaatacagctcagactgaatccatcttctgctcaac----------------tcatcctaggagagtaagagcccaaatt---ctaacaacagccacaaggccctacaaaaccgggcccttccttctaaactgctgacctcttcttctttgaccactcccgcctcttggctgaaactactccagccaaattggcctcatcattgttccttggacctacctgatcagtcttcctctgggtccctagttctacctcttttctatgcttgttgtgt-tcttccccttgaaagtctcggagcttcctccccttatctTCCATCT a score=56231 s mm7.chr5_random 597727 2248 + 11523536 TTTGTAGGTGCCGTGGGACATGAGACAAGGATAAAGGGAAGGAGAAGGACGTGATGGAGCAGAGAGGGATGAAGAAAGAGTTCTGATAAGCACCTGCACTATAGTCAAATCCATGCCCCCTTCCATGCTATGAAGTAAGAACCTTGGCTCTTGTAATTGCTTCACCCTTGAAAGGTTTAAAGGTGAGAACTGTCGATGTTGTAGAACAATATGTGCTGATCAGTACAGCCTTTCCCTTTGATTGTGACTTCGCAGGACTCATAAATAACTACCCACCTGAGAACTTGCTTCTCTTGAGCTGAATTTCATTTTGATTTTT-CATCCTTCTTGATTCTTATCCCTTTGTGCCAAAATTGTATTTTTCCAAAGCTGTTTTCAAAAGTGGTTTTGTTCTGGTTTAATGGGCTCACTTTCCAATGTTTGGGCTAAAATTGCAGAGAAGC-TTTGTGAAAAGTGAATGCATTTGAATAGTGAAGTTTCCTGTGACCAGAAATGAAGTATTGTTTCCCTCTAAAGCT-----------GCCTCTGTTATTTTACTTGTGTGTTTCCTTCCATGTTCTTCTATAAAACTTTTAAAAATGACATCAAACAGCCTGGCTCCTCTTATGAAATAGAGAAAGTTCTTTTATCTATAGGCAGGCTTATGGAGAAAGGATTGTCAAGCAGAGGCAGCCACAACCATTGTTCttataaaatatattaaatatatttctatataaaaGAAAACTTTCTCTTTCTGTCTACTCACTGCAAAATATCTGTTCTATGTCTACAATCCATAAACCAAGATATGACCACACAAAGAAGTAAAGCATA-AATAACCACAGGAGAAGATCACCCATATGAACATGCATCACTCTAGTGGGTAGTCAATAATAACAAATGGAGAAAACAGAAAGCAGAATTTATTGATGAACTATTTT----------------------------------GTGCTCAGTAAAATACCATCTTGTGTACTTTAGATGTATCTGAAGTCGTTCATGGTTTTAAAAAGCCTCTAAGTAAAGGATTCTT-----CATTCCACGAGAGAACAAG-------TGAGAGAAGCTAAAGCAGTTTACTCAAA---ATGCTGAATAGCAAAGACAGCATTTGGATTTGGATATTCCTGAC-ATGGCAAAGAGCATCAAATTAGTATCTTTCCTTCAGCAC-------AAAAAAAAATAGTTATGAAAGTTTCTGTTTCTTACAGATGATAAGAGAGAAGAAACAAGAAGATCAG--ATGTTGTTCACAGTAAGGAATAATCAGTAGTTGATTATCAAACAAATATGAGTTGGATAGCTAATGTTCCCTGAACCTGAGCATTGCAGCACAGCTTAGTAGTATGAAACGTGGACTCTTTCCATCACAAAGCTTGCTCTGTAGGTCAAACACTGGCTTTTCATATATATA-TGGAT-TAGTATATAGTAGTCAACTGGGCTTC-ACTTTGTAACAGAGACAGTACCAAGTTCTGGTGTGGGAGTAGTGCTTTGGAATTTTCAA--CATTCTTCTGCGATG--TCATTCGGTCACCCTTTCTTCCCTGAGAT--GAGTT--TTGACTTATTGAAAGTTGACTGCGAAAGTGCACAGGAGCAGTTCAGCAGTGTAATGAAGACAGAACAGTTAATAGACTGTGAAGCCAGATCTAGAACCTA-TTCTTCAGCTACCAAGACATAATTTTTCAGGCCATGTTGGCTGGCGTCCTAATTGATCTCTGAATGGATGTAATGAAGATTTATTAAAGCAAAGAGTGAACAAGCTCTGGGGAAAAGTACAGCAAGCTTTGCCCCTCTCAGGGACTGTTCATCTTTAATCTTACAAAGAGGTTGCTAATGTCTCTCTTCATTGAGTAGTCTCTCACCTCTTATACTCCAGGTTGAAGAGCACACTTGGGAATTTATATCTATAGACATCCTAAAATTCACTGTTCTTTTCCCATT---TTTCAGTT-AGCTTTTATCTCTCCCTCCCTATTTTAGTTTGTT-------------ATATTTTTGGGGTGATTAATACTCGTCAGTAAGAATGTGACCTCTGAGAATCTAAGTGCTACATACCCAGGCAACTTT--GATCTCATCACAATAGTATAGAATATGAATAGTATAGTAAATGAAGACAGAGAGCACAAAAGGAGGCCCAG-GTGCACAAGAAACTGAAGTTGTATTTTGATGAATG-----AATGCAATATGGTAGGAGGAGGAGCAGAGAGTAAAAAGAGGAAACCTCGAAGGTAAGGGCAGAATGA---ACAGGTAGGCTTGA----------TGTATATTGGGAAAAGAAACAAAAACTAAAATGTTCCT-ATTAAA s bosTau2.chr6 62739236 2259 + 69624268 TTTATAGATACAGTAGGACATTCAAAGAGGATATAAAGAAGAGGGAGGGTTTGAGAGTGCAGAGAGGAGTGGAGAAAGCCTTTTGATAAATAGCTTAACTACAGTCCAATCTACGTCCTCC-CTTTTCTATAAAACAGGATCCTTGGCCCCTATAATTGCTCAACTTCTTATATGTTTGAAAGAGTGAATCAAGGGCACCACTGAACAATGTGTCCTGATGGGTGTAGCTTTCCCCTTTGATTGCTACTCTGCAAGTTTCACAAATAACTAACCACCTGAGAGCT-GTCTCTCTCATTCCGAATTCCATTTTGATTTTTTCATCCCTCTTGATTCTCATCTCTTTGTGCCAAAATTGTATTTTTCCAAAGATGTTTTCAAAAGTGTTTTTGTCCTGATTTAATAGGCTCAGTTTTCAATGTTTGGGCTGAAATTGAGGAGGTGCTTTTATGAAAAGTGAATGCATTTGAATGGTGAAGTTTCCCGTGAACAGAAATACGGTATTGTTCTACTCTGTAGTTCCTAAGAGTCAGCCTCTGTTATTTTATTTCTACATTCCCTTCCA---TCTTCTTTAAAAACTTTCAAAATGACATCAAACAGTCTTCCTTTGGCTATGAAATAGAGAAAGCCTTTTCATCTGTAGGTAGGCTGATGGCATGAGGATTA-CAAGGAGGGACAACCAGAGCTATTGTTCTTGTAAAATATATTAA--------CTTAAAAAAAGGAAACCTTC-CTTTCCAGATACTCTCTGTGAAATACTGTCTCTGCATCTCTAATCCTTAAAATAAGAGTTGGTCACAGAAAG--GGAAAGCCTATCAAAACCAAGGCAGTGGGCCATCT---TGTATAT---TTCCTTTAAGAATGCATCAATCCTGAAACAGAGAGAGAAAAGGAAGAAGCATTTCTTGATGATCTACTTTGAGAGAAGTAGATCTGAGAGATTTGAGATTTGTAGTGCTGAGAGAAGCACTGTGTTACATA------AGGTACCTTAAGTCACTgggtcttttgaaactcctctaagcaaacttctcttatctccattctacagatgagcaaactgagattcagaggaggt-aggcaacttagtcaaatgttttgtgagtgtcaacatcagacattgaattcagatATTTCTTGCAATGATAAGTCATAT-AATTTACCTTGTCAACTTTAGTGTTGTTCTGAGAAATGATTATTTATGGCAGTTTCTGCTTCTTATCAGAGATGTGA---AAGAAAC-AGAAGTTTAGTAAATTTGTGCAGAGGGAAAAATAATCACTTACTGA-CATC------ATACGTGTTGAATAACGTA---CCCCTAAACCTATACGTTAAAAAATCACTTAATAAAATGCTAAATGGAATCCTTCCCTAAAAAAATAGTGTATGTTG---AAAAACTAGCATTTCATATCTAGAGTGGAGATAGTAAGTAACATTTTATTGGTATTCAATTTTATATCACAGACAATACT---CTTTAGTGTTTCTTCAGCAGTTTTGAATTTTCAAACAGTTCTAATGCTTTGTCTCACTGAAATCCCCATCTTTCCATGAGATAGGAATTACTTGAGCTCCTATACTTTCATTAAACTATTG----GAAGCAATTCAGCCATGTGAGCGATATAATGCAGCTAATAAATTGTGAAGCCAGACCTGGAACATAGTTCTTCAGCTACCAGGGCATAATTCTTCAGGCAATGTCGATTAACATCCTAATTAATCTATGAATAGAAACAGTGAAT-CTTATAAATACAAAAAGAAGACAATCTCTGTAGGACAGCCTAGGGCAGTTTGACCA-ATAAGAAACATTTATTCTTCTAGCTTTATAAAATATTTTCTATGTCTTTCTTACTT---CAAACACATACCTT-------------------GACCCCTTCAGAATTGGTGGGTATAAA-------------------CCCTTTCCATTGTATTTCAGTTCAACTTTCTTCTACAGCTTTC-ACTTTGGTTTATGATTGACCATACCAATATCCCCTATATGGTTAGAATTTTCTGCCATGGACATGGACACCCGGATTCCAAACCACACATGCCTAGGCCAGTTTTGGATCCCATTGCAGAAACAAGTAGGACCGAAAG--CTGTGAATAAAGGAAGAAATCCTAAGGGGTGGCTTGGAGAAAAAAAGAAACAAGATATAGTCTATGAAAAATGCAGAAGATGCAGTGAGATGAGAGGAGCAACATGGTGAAGTTAAAAGAACCC---------AAAGCAAAATGAAAGAAATATAGGCTGGGGAGCACAGTCTGTATAT---GGAAAGAAATGAGAGGCCAAACATTATTCATTAAA a score=1844 s mm7.chr5_random 599982 643 + 11523536 AATCTTTAAAAAATAATTTTGTGTATATGATATGTGTGTGTGTGTGTATGCATCATAGATGTATGAATGAAGACACACATGTTCCAAAGTATGTGTGGTAAGAGGACAACCTCAAGGTGTCTGAGACAGCTTCTCTTGTTATTTAGCTGTCATATACCAGGATATGTGACCTACTATATCCTAGGGATTCTTCTGCCTCCTCATTCCATCTTGAGGTGGGATCACTTAGATTATAGATGCTTGCTATTGTCTCTTGATGTCATCTGTGGATGTGAAGTCATGTCCTCTCACTGCCAACCCAGCATGCCATATAGTCACTCAGCCATTTTCTCAGCTCACCTATTCTAACACTCTGAAGTTGTCTACAAACATCTTTCCCACCTCTCTTACTCCATGGCTTATTCACTTTTTAGTGCATATATAGCATAGTTATAGCTGTTATTAAAATGCCACAGAAT-TTTGCTTCCTAACTAGAA--ATATGAACAC-AATGTTTTGGAAGAATCTCA--AAGATGGAATAAAATGGAATGCACAGTTCTGCCAGTTTGG-TTTTATAATCAAAGTGTTGCAAAG-TTTCAAGGTGAATATACTTTTTGTGGCAT-GGAAAGCTCTGAAGACACTGTCTTAAA---TAAAGGAGTGACAGCTG s bosTau2.scaffold7754 4140 391 - 36782 AGTC-----------------TGTACATG-----------------------------------GAAAGAA--------------------------ATGAGAGGCCAA------------------------------------------------------ACATTATTCATTAAATCCCAAAGCTGATGCTACAAACCTATGTCAGTTTCAGTTCAG--CACCTGAATT-----------------------------ATTTGCAGATaca---------------------------------cacacacacacacacacactctctc---------------------------------------tctctctc-tctctcACACACCACAA----------------------------ACAGATATGGCTGTTACTTAAGGCTCACAGAATGTTCACTTTCTAGTTAGAAACACATGGACACAAAGGGTTTTGGAGAATTTTGTCAAGATGTAATTATTCCAAATGCACAGTTTTGTCCGTTTTTCTTTTATAATCAAAGTGCTGCAGGGATTTCAAAGTAAATACAATCTTTGTTATGTCAGAAAGCTCTGAAGTCACTGTCTTAAAAACTATAGTAGGGACTgctg a score=7575 s mm7.chr5_random 608421 511 + 11523536 TATCTCTTAAAAT---GAAAAGGTATTTATTTTA-CTTAAGGAATAAAAAACAAGA--GAACATAAATATTTGATTTTTGTATA----TTTTTAAGTTAAATGTATTTGCATG---------TTTA-ATTTTTAACCATTTTACAT-GTAATCTTCCACTTAGAATGTTC--CTGTAAATATTTTCCAGATAGATATATAAA-----ATTTTATTACTT-TTCTATTATT------AAACATGTAGATGATAATATTTTCTTTAGTCAAAATCATAAACCCACAGAAAGTTTGATCCTAATCTTTTGTTTACATC--AGAATATTTATTTATGATAAAGCCTTAAGTCTCAGA-------ACACTGGATTAATGGATTGACATTATTTCTTCTCTTTAGATGCAGGCAAATAATCATCTATAAACATTT-ACATCTTTGTTCTGCCTGGGTTTGTAGGAAATATCTACCCCAGATTGCTTGTGTTTCCTTGAAAAAATAATTCAGTCTCTCTAA-CATTAGTTTCTTTGTTGGTGACAGAGTGTCTAATAGCATCTC s bosTau2.scaffold7754 14896 528 - 36782 TATGTTTTGAAGTATGGGAAAATTATTTATTCTAACTTATAGAAGaaaatatatgataaaacattaatattttatttatatttaatCTTTTTTCCATTGCATATATATGTATACACATCtattttatatattttatacttttatataGTGACTTTCCAATT----TTTTCTGCTTCAAATATTTTCATCATATTTCTTTGATTGCATATGCCATTACTTACTTTAGTATTTTATAGATATATGACTGTGATAGAATTTTCACTATTACAAATAGCAATCCCATGAGCAGTTTGTACCTAAATATTTTTCTGAATCTCAAAATATTTCGTTATGGTAGACTCTC---TCTCAGACATAGGAATACTGAATTAATGGATGTAAGCTTTTACCCTTTATGAGATATAGCTAAATACCTGCCTATGACTGTTTTAAATTTTTATAATCTTTGCATTTGTGGTAGGC---------------------TCTGCTTCATACagtaactcaacttctctaagcttcagtttcttcatccataaggcag-gcctaatactgcctc a score=16139 s mm7.chr5_random 609003 505 + 11523536 GGAAGGATGTATATACAAGATTGAGCACAG---ACTGGGAAGATAGCATATGGACTAG----GATTCTCCTCTCTTCCTATCT--TACAAACTAACTCCTTCCGTGGAAATGCAACTCTCCTACTACAAG---ATGTTGCAGCTTGCTTTCTACTTAGCCATC-GAAATGCGCCTGCAATGGTGCT-TTCTGTAGGTCTGCCCTCCATTTCACGTTTCCCATCCTCAGTTATACTGCCAACATACCATCTATATTAGAG-GAGCTTATCTCATTTCTTCACACTATAAATAACAGACTTCTGATGAGAAAAATAATGAAAAGCCAGATTGCTGCAGAATATAAGCAGGA-AAAATAAAGGTAACATTGAGTGAATTTCTGTCATGAACAAAGGAAACATGGTGGATAAATGATTCAATACCCAGAGGGGATGGATGCTGCTAGGT-------------GGTAAATACACAAGTCTTAAaagcaagaaaggaaggaagaaaggaagaaaagaaagagagagagagagagagagag s bosTau2.scaffold7754 15674 526 - 36782 GAAGTGATTCACCCACAGGATTTCACACAGTGCACAGAGCAGA--------GGACCAGCAGTGATCATTTTCTCACCCTCTCCCCTGCAAGATAACTATGTCTGCTGAAATTTCACTTTTCTACCCCTAATGCCTTCTGCAATTCATTTTTCATCCAGCCATCAGCAACACCCCTCTAGCTCTGTTGTTTTGTAGCTCTGTCTTCCTTTTTACATTGCTTATTCCCAGCCACATTGCCTGTGTCCCATCTATATTAGAAAGAGCTTATCTTATTTCTGCACTCTATAAATAACAGACTGCTGATAAGAATAATAATGGAAAGTCAGACTGCAGTAGAGCAGAATCAGGAGAAAATAAGGGTAACATTGAGTGAACTGCAACAGGAAAGAAAGGATGCCTGGTGGATAAATGATTCTACACTCAGAGGTGATGAATGCCATCAAGCAACAACTATGCCAGGAAAACACAAAAAGGGTCAATGTGAATAAGGGGGAGTGAAAAGAAATCAAGGAGTATTGAGAAAGCCAAACAGGG a score=10186 s mm7.chr5_random 726069 234 + 11523536 TAACTATTCCCCCCACCCAAACCTGTAACTCCCAGGGGCCAATTAAGGCTCC-CGAGCTGCTGCTGTT-TTACCAGCAGCCGCTCTAATCCTCGAGGTAATTTGGAGGCCTCGTTCAGTTTGCTGATATTCGTAATTACGCCCATT----GGTGATTAAGAGGCCTCAGCTGGATAGTAAAACGCTAACTGTCTGCTGGTCGTTAGATCAAAAGATAATCCTTCATTTCAGCTGCGGGGC s bosTau2.chr17 35458389 237 + 45915461 TGGCCATTTCTTTCTCC---ACCTGGAACTCCCATGAGGCAATTAAGACTCTGTGAACTGTTCTAATTCTTACTAGGAGACCATCTAATCCCTAAGGTAATTTAGAAGCGTTACTCTGTTTACTGATATTCATAATTATACACATTCAGTAGTGATTAAGAGGCTGCAGTTGAATAATCAAAAGCTGACAGTCTTCTTGTCGTTACATGAAAAGATAGTCCCGCATTTCAGCCGTTGAGC a score=2040 s mm7.chr5_random 934019 178 + 11523536 ATGAAATAAAATTACATCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTTacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaTTTTCACCCAATTCTATAATAATTGCTCATGAACTAGGACAGC-AAAATGATC---------------------ATTAATTTGACTG---TTAGTTAATTTAGACTGCCTCTTCCAAACA s bosTau2.scaffold2336 41674 188 - 121186 ATAGAACAAAGCCACATATATCTGCATTTATTTCCTTTGCATTCACTT---------------CACCAAAGAAAACAATGTTTTATTTAGCCAGCTCTCTGATACTTCCTCAAAAAACAGGACAGCAAAAAAGATCAGCCCAGTAACATAAACACCAACTAATTCAAATGTAATCAATTGTTTAAAACCATACTTCCCAAaca a score=3568 s mm7.chr5_random 934197 123 + 11523536 CAGAAATTAGCCATTATATATAATTTAAACATCA---------GAATGTTTGAATTGTAATGG--CATTTAAATTTCAACTCTCATTGCTAAGGCTACCTTAAGTTCAGTCAATTTGAAGTATCCATATTTTTG s bosTau2.scaffold2336 42286 133 - 121186 cagaaatt-gacattgtaaaggaattatataccaataaaaaaAGAATGCTTGATTTATAAAAGGTAATTAAAATGTAAAATCTTATTGCTAGTTCTATCTTAAATTCATTGCATTTGAACAATTGGTTTTTTTA a score=10830 s mm7.chr5_random 934815 739 + 11523536 ttcatgtttacattgcaagcactttactgagggagctagctcctaagccccAGTATTCATATTTGTAGACCTGATCACTTAATACCAAGGGAAAATGCTGAGCAGATGTGCACAAACTCCCT----AGTAAGTATC--TTTTATGGAAACTATTCTTTAAACTTTCCTTGA--------CATTAGAACTTTCACTACATTTAAAAATACTATCAGTTTTCCAAGTCATTTTT-----TATTTTAAAAGCTTCCTCATTTCA-----ATTCTGCTAGCTCCA------------------------ACGTTTTGGCTCTTTTCTGTTAAAAACACAT---CTCACCATTTTTACAAGA---ACATGTTAGATTTTAAATAT--AAGAACATATGGGATGCTCATCAAGAGAGTTGTTCTCCATGAACTGAGTGGCCATAAACCCAGTA-CTATTTAG----AAACACAATCAACTCACACTAATACATGATAGCATCTAAATTAGAAACTTGCTGTGGAGAAGAAGAAAAAGTCAAGACTTGCCTGGAATTTTCAGTG--GCAGGGAACACAAAAC----ACACAGGTTAGGATCT---CTCTATGAAAGCTCA--GAGTCAGCCTACTTTGTCAAAATTCAGAATAAATGCTTTGGAGAAAGATCAAGGATTCTTTCAGTAGAGGA----------GAACAGTTTTATG-----TTAGTAACCATTTCCATAGACCTCTAAACCAGAGGCAAATGCTCCAACATC-TGATGGCATGCAAATCAGCTTTATGGAGATAACATCATTG-------TGCATACCTGCCTCTTGATGT s bosTau2.scaffold2336 42758 775 - 121186 ttca-gtttatcttAC-AGCACTT---------------------AATATCAGAAT--AAATTTCTAAACATG--------ATACCCAGG-----TACTGAGTTGGTCAATACAAACTCACTGTTCAGCAAATAACAAATTTGGGGAAATGTTTCTTTTACATTTATGGGGATATCTCTCATAAATTTTTTCATTAAA---AAAAATACTG-CAGTTTTAAAATTCTTCCTTGACTCTACTTAAAAAGACTCCTGATTTGATTTATACTGTGTTAACCTCAAGTGTAGTTTTGTTCTAACAAAACACAGTTTTGTTCCTGTGTAGTAAAAGCCTATCTACTCACCATTTTTATAAGAAGGAAATTTTAGAATTTAAATATCAAAGAAAATGCGAAATACTGCTAGAGAG-GTTGTTCTCAAGAAATTTGATGGGAATAAATATGACAGGTAAATAGCCTTAGAAACTATTAATTCACACTAGCACGTGATGGTATCTAAG-TAGAACCGTTGGGTAGAGAAGACAAAAATGCAAGAACCTA--TTACATTTACTGTGTAGCAGGGAATCATAGTCTTCATCAAAGGCTGCACCCTGAAATCTAGGAAAGCTTATTTAGCTGACCTCATCTGGTAAAATTCAGAACAAATAC-------------CAAGGATTCCTTCAGCAGAGGACCCTGTTTCCATATGGGTTCATAACTTTTTATTAGTTGTTTTTCTAGGCTTCCAAAACTAAGAGAAATGTGCCAATATCTTGATGATACATCAGTTAGCTTTGTGTAGATGATATCAATGCTGAAATCAAATATCTACTTCTGAATAT a score=14117 s mm7.chr5_random 936278 861 + 11523536 TCCATATCCAGCTATTTCATCTATATCTCCATTTACAGGCAGTTCAAATCCCTCCAC--TCTTTGCACAGTGTGGTAAA-GAGTCTATCATCCTGCAGGTATTTTACTTCCTGCCATGATGCTCAGATGAGCTCAACTGAAAACTCATGCCATGATTCTTCTTAAACTCAGCTGAAGAAATAGTGTGTTCTTGGACAGGAGC----ACAACTTACCTGA----------TAGATAA-GGGCCTTAAG-GCTTATATAACTCCAT-GGTCCAGTGGCAGGATAATTAAATTGTGATTTGGGAATGAAATGCATATATTTGTATTTTCACTCAAGTATGCAAGAAAATTCCA------TGGAAGATTATCTACGAGTAGTA--ACTTGATAACGGATAAATTATT-TTACAGAAAATATAGCTCTAGTactgagaggcaagaagacaacatagctatctgttttattgtctgtgtgcaaataacatagtttcaaaat--accagtagagtatcagggaaagaatgatgtta---------gacccttgtttg--tctgttttttatacagtggcttgtgaactgaaaagccag-----aacagtgtctttattctctgaaaacttctatcttctagtcactcacagcgagtatgcccaggaagcagacatttgagttatgtgttaagggcactggtgttatgtaactaaaatatggtgactgGAGTATAGTGTAAAATGAGAAATGATTT-ACTAATTCTAATAAGC-----------------------------------------TGCTCTCAGCTGCCTATCCTTCAGA----------------TTTGATCATGTGACATCATTTCACTTAGGTAGTCTTCAAAACACAAGTTGTTTTTATGCTAGTTACCTTATACTTCTCTGCACTCATAAGGAAAAGCAAAGGTGAGATGTGGCTTTCTT s bosTau2.scaffold2336 44552 920 - 121186 tccaccgtcacctatttcatcttaaactccatttatgtacgattcaaatCCTGCCACATTATTTGCACAGTGAAGTAAAAGTTTCCACTCTTCAGCACACATTTTACTTTTTACTATGATGCTTGCATGTTCTCAGTTGCATAGTTTACATATATTTTTTCCCAAACTCACCTGAAGAAATGGCATGATCTCCTGCTACAGCATTGATAACCCATCCAAAAGTCCATTTAAGATAATAGGCGTTAAGAGCTGAACTACCTTTTTCAGTCCAGGACTGGATTAACGATGTTGTG-TTGAATGGTAAAAAGCA--------TATTTTCACTAAAGTGTCCAAGGAAATTAGAGTGATCTGGAGAATTATCCACCAGTCATACTGCTTTGCAA--GTTAGATACTTGTTGCCTATAATATTTCtttaccactggaagataaggagatactgccactacgtgttttgttgtctgtgcccgaataacagatgtacatgaccaatcactgacagacttgggaataaatgacataatttgtcactgatcatgatatgcacctgctatttatgtagtgatttgtggattgaggagatggtagcagacagt-tctttacgc--------------------aatcattcacagctaatatacactgggaactaaaattcaaacagtgttattggagggctggtgttatttaattaaacttgaataactgaaaAAT-GTGAGGAAAAAGGACTACCTTGACTAAGTTTAACAAATTTGTCCAAGGCTTCTGTGTTTAATGTATCTCTTCCTGACAATGTGCTCAGCTGCTCATTTTTAAAAATGATAGCAGTAGGGTTTAGAATGTAAGAAATAATTTTAACTTGATGAACTTTAAAGAATAAACT------------ATTACTTTA-ACTTCCTTATGCCAATAAGGCAGCTGGTGGGTGGAATCTGGCTTCCCT a score=5578 s mm7.chr5_random 941430 551 + 11523536 TCAGTTCTTAGAGTAACCAGGGGTTCTTTGTTCT-----GTTCA------TTTGTGGGA-------GAAGTCACATATTCTACTTGTAGCTT-TGCTGCTGTACCAAAATCAGTCCCTGATTTCTAATGAGCACTGGTAGTAATTAGTATTCTTTATCGCTCACACTTTCTTACAGACTG-TCTGTGGTTTTC---CTCTTATTCCTACAGAG---ATGCTGATATCATATAGTCTTGAGTGTGTTGGCAGATTGCCTTT--CCTACTGTATTCTGTGATTTGTGGAAATAATTGCTCAGTAGTTTTTTCTTTTGTTTTTCTTTTTAATGGTGGCTTTATCTTGCTTTTACTTTTTCTTTGGTACGGGGTCTCATGTTGCCCAAATAAACCTTCCATTCTAACTAGATGATCCTGGTTTTGTTTGTTTTTAATCTAAATTATTTTTACT-----GTGGAAATATAGAAGGATTAAAAAACTACATCACCACTTCTACCTACATCCTAAAATCCTTTCTTTTCATGTGATCATTCAATATATACCATTAA------------TATAGAAT---CTCAGTCAATGC-TTTTAATATTCCGTG s bosTau2.scaffold2336 49119 502 - 121186 TCAGTTGTGGGAGTTAATAGACGTTCCCTGCTTCAGGTGGTTCAGTCCTGTTTGTGGGAAGGAGTTGCACTCACAAACTC--CTCACAGTTTCTGCTGCTTTTCCTGCCTTGGTCCTTGTTTTGCAAGGAATACCTGTTGGCAGTTTTATTGTTCTGTTCTCAAGCTCCTATG-ACACTGCTCTGTTGCTTTCTTTCTCTTCTCTCTGCAGAGGAGAAGCAGGTATCATGTAATTGTAAGGCTGTTGGTGATTTGTCTCTATCCCATT-TATTTTGGGGCTCATGGGGATAACTATTCA----------------------------------------TCTTGTTTTAA-----------------------ATGCTGCCC--------------------CTGGTTTAT--TGGTTTTGTT--------ATTTAAATGTTCTGTTCTTTTAGGTGGGAGTTTGATGAGATTAAAAAACTGCACGGCTGCCACTGCCATCTTCCCAGAATCTTCTCTCCTGTTCAGATT-TTCAACATGTGATTTTAATGGCATGGTGGCTATTGACTACCCTTAGTGAATACTTTTTAATATTCAATG a score=11591 s mm7.chr5_random 942520 430 + 11523536 TGATGTGAGATTTCCTTCATGATAAACAGTGAGGTTTTCCCCTTCTTTTTAGTGATACAGTAATACAGTGATACAGTTTTCAGCACCCTCTTTTTCTTGCAAGAAAATAATTTTATTGGAAAAACTCCTCTATCTGGACTGATTGAAAGTTCAGTTTTTCTTTTAAACAAGTTTGAAGTGATTTAAAGGGCAGTTTCACTAAGATGATGGATACATAATAAAG---AATAAAAAGAAAAACACTACAC-----TTGACATGATTTTTCTTTTCTACTGAGACGTTTCTTGTAAGA---AGCAGACTACTGGCT--TTCACAATATTAGTACAGCAGTGGGAACAGTTCTAGATAATGGCA--CTGGTAATGATAATCCTTAAAAGTCTATGCCATGATCCAAATAGGAGTTGGAGGAAATGCAAATATATGATTGCTTTAAAAAC s bosTau2.scaffold2336 49967 413 - 121186 TGATATGAATGTTTCCTCAGAGCAGGCAGAAAA---TTCTTTTTCTTTT---------------ATGGTGATAGAGCTTTCGAGTCATACTTCTCCCTGGTAGAAAATAATTCTGTTGGAAAAAA--CTCCATCTAGACTCATTGAAAGCTCAGGTTTCCCTTCAAACAA---TCAAGTGTTTTAAGGGCCAGTTTTACTCAGATGATAGGaatataaaaaagaataataaaaaaaaaaGCATTGCACGTATTTGGAAGTAATCTTTCCTTAGAAGTAGGGTGTTTGTTGTAGGCTATGGGAGACTGGTAGCCTATTCATGACATTGGT--GGCAGC-----CATTTCTGGACAAAGGAAGGTTCACACAGGTAACTCTTAGAGTGCTGTGAAATGATCCAAATTGGAAGGTGGAGAAATG-AAATGTGTG-TTGCTTGAAAGAC a score=9864 s mm7.chr5_random 943472 614 + 11523536 CCTACATTTCTCAAATGAATGACAGTGAGGAATAATCCTTATCATGGGGGCCAATATTTTGTACACTTTAGAATACAGAATTGAGAAAGAATGTTAGTTGTCATTATGA-------------CTTTGGAAAAAATACAAAGAATTTCCTTATAGAAATTGAATTCAGTTTTTTACAAACAAATAAGAATGTCTAAGCTTCACTGGGATAAGCTAGATAATGATGTGACAACTTTCATTCATCTGAAGCATAATGCATAGTTAGAGGCCTCTT----CTCAGGACACAGATGTATATCCAACAAAGAGCATCCTTCTTTTCTCAGGCTTGCTTCCTCTTCCCTTCTAGAGCAGAGGATGCACCC------AGAGGGAGGAGGTACATATCAAGCAGGGGAACCTTAAAGATG--CAATAGTAGAAGAAATGAAGATTGCTTTTTTCT-CCAGTGAT---TAGCACAAAGAACAAGCAAG---ATATCACAAAGATGTGGGTGATATCTGTTTAGCTCAAGAAAA--CTAGCAATTCCTTTTGAGACCT----TCCTGGAGGAAAAGCTATATGAACATAAAAAGTTAATCATAGGAGTGGGGTTATT-TTTCATAGATGCTTTCCTTGCTTATGTATGGGCAACACAAAAGTAA s bosTau2.scaffold2336 51678 624 - 121186 CTCACATTTCCCAAATGAATGATGCTGAGAAGTGACA---ATTATGAGAATCAGTATCTTTTTTATATTAAACAACAAAGTTGAGAAAGATTGCTATTTGATTTTATAAGAAAATCTGACTTCTTTGGGCAAG-TACAAAAACTTGCCTCA---AAACAAAGGTAAGGTGCAGATCAACAAAC--------TGAAGTTTTGCTGGGG---ATCAGAAAGAAGCTTGAGAAGCCTTTCTCATGTGAGCCTTAAAGC----TTGCAATTCGCTTTACCCACAAAACATAGTACTAGAACTAA--GTGAGTATCCTTCC---CTCCATCCTGCT--CTTTTCTGCTCTACATCAGAGGAGACATCTGAGCAGAAAAGTGGGGTGTGCACAACTGATGGATGTACCTTATTACTGGCCAAGGGAGAAAGAAATGACAACCACCTCTTCTTGCCAGTGACATATTGCAGGGACATGAAGCAAAGTAATATCACAGGGTAGTGGATACTTTCTGGTTTAGTCAGAAAAAAGTTAAGGATTCTGTCTAAAATATGAATTATTAGAGGTAAAACTATATGGGCACAGATAGTTAATGATAACGTTGAAATTATCCTTTAATAGGTGTTTTTCTAGCTTATATATTTGCAGTGAGGTAGTAA a score=28174 s mm7.chr5_random 944419 946 + 11523536 TTATAGTTAATTAAGATGATATATAGCAACACTGACCAAGCTTGGTATTTTCCTGATACATATATGGCATCATTTCAGCCAGAGTTCTTGATATTATTATCCAATCTCATACCATTTGCCTTATTTTAGGACTGTCATCCTTTAAAGATTTACAAAGGACATGAGAATCTGGTTATTACCTGGCTTTTACTCTCAAAGAGCTAACAAGCAAGACTCATTACTC--AACGGAATAATTTA----GTTTCAATTGTATGACAGACAGTGGGGCAGGGATCTGGACTCACTTAGCTATGAAACTGTTCTTTTTCTTATGGCA--CAGAGTGGAGG-AGAGACAGGTAAACAAATCATTGCCATAGATAGTGATGAATGCTATAATAAAGGTATGAGCAGATGCCACAAATACAGTAGAAGGGCTGCCTACAAGCTCCTAGATAAAAAGCTAAGCTCCCC--AGTAGCTGGCACTTGACTTTTAGCAACACTTTAGAAAGCTGAAAAGA--GAAGAGGCAAGCCAAATTCAAGGGATCCAGCTAGGCAAAGAAGTACCATGCTTGACTGAATAGATTTGTCTTCTGAAAA------TCCTAATGCTGTTAAGGAGCTTGAATGTTGTTCAAAAGAAAATAGATAACTTT----AGAGAAGATTGCAACAGAGATAACT------AATCTTTTTTAATAT---------ATACAATGTATGGCAGTCTGCCATGCGCTCT-------CTATGGGAAATGTTACAGTTAGAGTTAAAGTATTGAATGGTTTTAAAAGAAAAATGGGTGAGAGTGGGA------TGATAATAAAACATTAAA-TTGAATCAAGTAAAGGAA-AGTTATTCTGTCAGAGCAA-AAAGTGAGCGGGGCAACACTTGCAGGTTCGCTTGGGTCACTCACACTGTCCGGCCAAG-ACC-AGGATCTTTCCATATGCTAGCAGTTGCTTATAATTTTATTATCAAAACATGTTTT--------------------------CTTAGGTTC s bosTau2.scaffold2336 52350 1017 - 121186 TTGTAATTAATTAAGGTGATATATTAAAACATTGGCAAAGTTACGTGTTTTCA-AATGCATAAGTGGTGTGATTTCAGCCAGTGTTCTTGTTGTTATTATCTAATCTCCTAACATATGCTTT---TTAAGACTGTCATCTTTTTAGAATTTACAAAGGAAATAAAAACCAAGCTATTATCTGACTTTTGCTCCTGAGAAACTAATGAGCAAGAGTCAttactcataacagaataattaattgggtttccactctgtgccagacagt-gagctgggatctgggctcacttagataaggaacagttctccttttcatggcactcacagtgtaggaagagacaggtaaacaaatcattgccatataagctgataaatgctataataaaggtatgaacagatgccacgaacatagaggagggagGATTTAAGTGCCTCCAG-CAGAAAACAAGGGTTATCAGAGTAGCT-GTACATGACTTACAATGAGACTTCACAAAGCTAAAAGGAAGGGACAGGAAAAACAACTTAAAGGTATTTGCTTAGGCAAAGGTACGCAAAGTTAAGGACGGTAGGGTCAGCT--TGAACAATAGCCTTTCTATGATACCAAAGAGTCTGAATTTTTCCCTAAAGAAAACAGGAAAGTATTCCAGGAGATAAATAGAATCAAAATAATTTGCTCAAATTTCAGTAAATATTGATTGTTCATCTATTACATGCCAGGATACCATGTGCTTTTTAATTGCCATGTAATACATTATAGTTGAAGCCAAAGGATTAAATGATTTTGAGACTTAAATGAGTGAGAATTAAAAATAACCagtaatagaaagttaaaggtaggttaagaaaaagaatttttattcccacagaacaagaaaatcagcagattgctaatcacagcattgatttaggggctcatgctatc--atcaagtaccaaagatccttccactttGGATCTTTAAGCTATTTCTTTATTGTCAAAAAATGGTTCCCCggacttccctggtggtccaatggcttagattc a score=5362 s mm7.chr5_random 945365 159 + 11523536 TGCTTTTTTTTATTATAGTCAATCTATACATAGAAATTCATGAGGAGGAGGATT-GAGTTTTACTGTTTTATATATGTCTTTGTGAGGTAAGTCTTTCTAAGAAGCTCTTTAACAATTCTTCTTTC-CCTCACTATAGAAAACTAGCTATGC---catcaaaat s bosTau2.scaffold2336 53501 164 - 121186 TACTATTATTTTATATAGTAAGTCCATATATAGCAAGGAGTAAGAGAAAGGATGAGAGTTTTACTCTTTCATCTTTTTATTTGTGAGGAAAGTTTTTCTAGAAAGATCCTTGAAGAGTTTTCTTCCTTCTTATTGGAGAGAACTGACCAAACAGACATCAACAT a score=4021 s mm7.chr5_random 946061 206 + 11523536 GGTGTTTTGACAAAGGAATAGTGTTTCTTTTAAGCCTTTATAATAGCCAAAAGTTTTAGACAATGAGTGAAGGATATTAGGAAATAAAGTGTACAAC-----AGCTGTGATGTTGGTTTCCTCTTGGGTAAAATTAATATATAAGAGTTGAGAGAAAAGGGAG-------TGAAGAAGACTATGTAGAAAGAGGGAAAAGATTGGGAGATGGTGATAC s bosTau2.scaffold2336 53672 213 - 121186 GGAATTTGGGAAAGGGAATCAAACTCATTTTGAGCTTTTGTTACATGCAGTGGAATTTTTCAGTGAGGGATAGGGGATAGAAAATGGC-TGTTTAACTAGCCATCAGTGGTGTTGGACTCCTCTTAAGTAAAATTACTTTTGAAAGCTTGGAAGTAAAAGGAGGCAGCATTTAGGTAG---ATGTGGAGATAGGGAGAA-ACCAGAAGACAGTGTTGC a score=42448 s mm7.chr5_random 1000257 1280 + 11523536 CTCTTGCCTGAATC--TTAGCAAAATAAACTCCATTCTTATATATGTCTTTATT-GTTAACATTGATCACCGAGCACAC-AGTTATTTTATATTCAATGTTAGGACCTTCAAATATGG------TAA-----AGAATAGGGGTTATTACAAGATTCTGAGGCAACATCATCTAAGGTCAGAAGGATGAATATGGTAGTAACAGCAGAAAT---GGATGGAGTAGGG--AGCACATTGTAACTTAATTTGCAGTTAAGATAatcagcaacatctggaatctttctccaacaatatttctatatcaaacttgttgagtcagaatccttgggaaagggaccaaga--ctgtatttaaaatgagcttcctgaatgatttatattcacaatcagttggagaaGAGTTTAAAACTTT--CTATTGCATTTGAATCCTCTTTATTGAGTCTGCCAGTGTTTCAAATTATGCATTTCAATATTAGCAAAATTGAGCTGTGCAATTTAAATTTTTAATCCCCCAAACATTTAAAACCTTGCATTAATTTGCAGTTCATGCCCCCTTCCTTTGAATGTGACCATTATTTTAATTATAGTGAAACTTATAAAACTTGGTTCA------TAATTTACTGT-ATAGAGCTAAATCCTTTTTGGAAATGATTAGACTATAGGTCCATAGTAAATCCTTAACATGTACA--CAAGTAAAATTATTA-GTTCTCAAGAACTACCTAGGCAAAAATACAGATAATAGAAATACAA-TTCTGATCAAGCTTTTTGTTTTAATCACTCAACAGAGCTTGCCATCAACATTAAAAATGCAGGAACAGATAAA--------GAT--GAAACAGCAAAGCCATG-ATTTATGGACTCAGGTTAATTG-TATATACCTAATGGC-AATGAACAGTGTTTGAGATGCCATGTCTGAAGAGACTG----------GTTGTTTTGGCACAGAAGAGATGAAGCCTTGGGCTACTTAGAATGAATAACTGAGTGACTCCAGTATATACTTTGGACCAGAGTTTATTTTGTTCTTGTTCCATTTCACTTTTCAACATGGTAGGCATTGAAATGCAGTTGGGTTGTGATGAAGCCAAATGACACAACAAAATACTGGAATGTCTCTTGGGGACAATTTTAAATCCATAAAGTAGCTGCTCATATTTTCCAATATCCACTCCAAA-AATGTTTGTGATCACTGTGATATTTCTGAGTCTTGCT---AGAGAAGAT----AAAGACAATCATGAAATATAG---------------TGTGGACAGATATCTTCCCCTGCAAAAATGGAACATAGATATACAATCTCAATAAAAAGCATCAATT-TTTAAAGCA s bosTau2.scaffold1366 24153 1294 - 251677 CTCTTG--TAAATCCTTTTGAAAAATAGTCT---TTTTTATACAGGCTTGAATTCATTGGTATTTGACATCAAGCACATGAATTATTTGATGTTCAGTAATAGGAGCTACAAATATGAGACTTTTAATCCCCATAACTAAGGGCATTGCAAGATTGTGAGAGAG-----TCTCAAGTCCCAAG-ATATTACTGGAAACCACAACGGAGACCAGGGAGCGAGTCAGGTGAGTATGCAGTGATTTAATTT--------------------TACTTGTGACc---ctcagacag-attact----------------gaccaaatcttcaggataggaaccaggaatctgcattgttaaaggacttcccaagtgatttatattcacaatcagttgaAGGAAACTTTAAAACTTTGATGCCTTCATTTGAATCCTCTTTATTGAACCTGCCAGTGTTTCAAATTATGCATTTCAATATTAACAGAATTGAGCCATGCAATTTAAAATTTTAAT-CTCTAAACATTTAAATCCAAGCATTAATTTCCAGCTCACACCCCCCTTCTTTGAACATGACCTTTATTTCAATAGTAATGAAGTTTATGAAGCACACTTCATTTTCCTGATTTACTATAACATAGCTAAATCCATGTCACAAATGATTACACTGTGGCTACATATTAAATCTTTAACAAACACATGCAAGTGAAATTATTAGGTCCTCTTCAACCAACCAGTTAAAAACATAGATAATGGAAATAAAATTTCCTGTCAAATTTCTCCTTATTATGACTCAACAGAGTTTGTCATCTCCACAAAATATCCAGGCACATATAAAAGGAAGTTGATTAGGAAAGTGAAGGCTATGTCTTCATTGAATCAGGTTAATTGTTATATATCTGATGGCAAATGAAGAGATTGCCAGGTTTTCCTTCTGAATAGATAGTTTTGAATAAGTTGTTTTGGCACATTACAGGCACAGCCTCAGGCTACCTAAAATGAGTGA-TGA---ATTCCAGTATACGCTTTGGCCCTGGATATATTTTTTCCTTATTCCATATCATTTGCCAACACGGTAGGCAGTGAAATGCAATGGGAAAAT-ATGAGGCCAAATAACCCAACTAAATACTGGGACACCTCTCGGGGTCAATTTTGAATCCATAAAGTGGCGGTTAATATTTTCCAAAATTCACTCCAAAGAATGCTAGTAATCACTATAGTATTTCTAAA--TTGCTTTGAGAGTAGATGGAGAAGGACAAAAGTGAAAAACAAACAAACAAAAATGTTTGTGGAGACATATTTTCTCGTAAGTAGCTAAAGTCCAGAAATGCAACCTC---------CAACAATTATTCAGAGCA a score=11271 s mm7.chr5_random 1002226 466 + 11523536 AGCTTTAAGGATCGGGTGGAGAGCTAGGTGTGAAGAAGTCACTGTTAGCCAAGAGTGTGGTAGTAGTTGAATAGCAGCAAGGGCTATGTCTCATGTCTTCTAAAATGTGTTTTCTAAGGCAGGGTTTTACTGTTGGCA--CCATTGGATCT-CCCAGGACAGCTTTTTCAGTCTCTACACCAACCTGGGTGCTCTATCCATCACTCCTGTTGAC--AACCACACTGCCATCTTTTGACGAAAGGAGCTTGGCTATGTATTCTCCTTCA-ATCTGAGTTTAGCTTTTGGTTTTAAAGATTTCACCAAACATTGA-------------GAAAGGAAAACAAGAAAAGATAAAATATG-TCCATTACCCTGAAAGTA-TTTGAAACAAATATTCAATGCAAAAAAAGATAGAAAGACTAATTTAAGAAATTAATTTCAGAAGGATATTATCTAGAGCTTTGTATGCAAGGAGTCATTTCTAGCCAGTTAT s bosTau2.scaffold1366 26766 463 - 251677 AGGTTTGGAGACTGGGAGGGGAACCAGACTGGAAGAACCACCATTTAGCCAAGGGTGTAGTAGAAGCTGTGTCTTAACAAGGACG-------GTCTCTTCTGAATTGTTTTTTCTGAGGCAATGTTTTTCT-TTGACATGCCTTTGGACCTATCCATTATAGCTTCTCTATTTCATGTCATGACCTGGCTACTCTATCCATCACTTTTGTTGGCAGAGCAACACTGGCTTCTTCTGACAGGAAGAGCTTGGCACGGCTTTTGCCTTCATACCTGGCTGGGACTCTTAGCTTTGGATAACTTCTCaaatttttattttattttttttaaaaata----aaGGTTCAGTAAAGTATGTTCCATCACCATGCTAATATTTTGAACCAAATATTCAATGTAAA-------TGTGTTGCTTCTTTAACTGGTTAATTTGAAACGAATTTTATCCAAAATATTTTATGCAAGAAA-----TCTAGCTGTTTAT a score=9336 s mm7.chr5_random 1021487 569 + 11523536 TGTTTTGACATATCTCACTATTTTATTGTTAATGAGCTAGCTCATGCCTTTACTAT----AAATATTGACTTTAAAATCCTCACCTGCCACCTACACCCCTGAATACTCTTTAACAGATTAGTTTTCCTTCCACTAGGCCATTGCTACTGCATATGGTATCCCAGTTGTAGCAGTATCCATTTGAATTTTCTACAAAAGCATACTATAGATCTCCTACAAAATCTGTAGAACCAATATCTGTCCAGATAAGACTCAAAATCTGAAGTTCTGTTATTTCCTTTGGGTAACTGCATGGTATAGGAATATTTGTCAAGCACTACTCTAGTCTACCCTCAGTCTTTCTGTGAACTTGGTTTTATTTGCTTATGAATAAGAATAAAGAATGTGCAGGATGCTTGGAGCTC-AATAAAAGAGCAGACCCAGAGTTTAAGAAGACTAGGAAATAAGAAGAAAACAGGAGTGATTTAAGAATAATTCAGAAATTATAAATACACAA-TAGGCA-CAAATAAGCATTTAGTTAAAAAGGAGATAAAGTCACGTA----TCACATCGGAATAAATTGTCA----AACACTACCA s bosTau2.scaffold6913 6374 568 + 42053 TATTTTGTTTTATGCCACTACTTTATTATTAATAAGCCAACAAGAACCTCCACCAGCCAGGAAGGAGGAGTTGAGCCTCCTTACCCTCTGCCTAAATCCCTGATTAATCTTTAATGACTTATTCTTT------GTAGACCAACGACActcaagctgtggtcccaacagtatcagcacctatttagaactt-tagaaaagcaaattctcagccccattcaagacccactgagtcagaagtt-tggggatggagcccagtgctttgtgttttaacaagccctctgggtaactacaatgcacaggaagtttTGCCAAGTTCTGTTCTCAGCTTTCCACAAGCCTTTCATGAACCTCATTTTACCTGGCTATTAGCATTGTCAGAGTGTAAGAATGATGTATAATGTTCAAACAcagggacagatgaagggtttgaagagctgaaagattataactattgaggaaataattgaaaaagtatt-aaaaatgaggaatatgcaattaggtgttaaata-----ttaactagaa--ggaccaaaatcacataaatgtcacattttaataagctgacattttaatattacca a score=30513 s mm7.chr5_random 1028984 897 + 11523536 TATTGGGCCTCTGAGGTG-GGGACATTTGGTTTTACTTGTGAAGCATAATACCTATTTCTTT-AGAGACTGTGATGAATAACATGGGCTAAGA-TTTTAGACTTTTCATTTACAAAAGAAAATGAGTAGCTGAGACACGGGGACCGTGTGTTTACAATGAGTCCCAGGTGTCGGGAATGCTTATGTGCCCTATAAAACTCCCTGATGAGGCTTCCTTCCCTTGGCTTCTCACATAGTTCAGTTTGTATTTACGCAAATGAGAAAACAAATCAGTAGTTAACAGGAACACCGCTGTGCTAACACATTAACTCTCACTTTATAACCAGATGA-GGCAATAAGTGCAGGTTAGCCCAGTGGGGCCTCTGCCAGGCAGGGAAGTGTACAC---TTCCCCTCCGGCTCGCTCGGGTGGCAAAAATAGATTCATCTTTGTCAATCCCAAATCAAAAAAACCTGG-AGTGGATTTGCACATTTGAATGGATGCATGTGTGTAGGTGACAGGAGGTAGAGTTAAGTATAAGAAACCA-AGATTCTGGCTTTTGATTATCTATATGCATTTACAGT-----CAACATATGACCATGCATAGGA---GTTGATTTaacagaagtttattatgctataggaaacgaggccagaagtctgaaattg-------agtaggggtggcccttcctggaagttcagagagagagattgcaaaccatggtttt-------gaccttgcttctggtgatccctagcctcacttgacatactttggattgtggtagcattgctccaagccctccctgcttctgccaatgtattca--ttttgtttgagtctcctctcc-----------acttttctcatttttataaagacaccaattatttgattatgacctacttccaaccaatttaagttcat-ttgtgttgacttctgtatagtga s bosTau2.scaffold6913 9943 900 + 42053 TATTGGGCCCTAGAATTGCAGGGTAATTGGTTTTATTTTTAGTGCATAATGTGTATTTCCCTGAGGGATTCAGACGAATATCCTGTGCTAAGAATTTTGAACTTTTTGTTTACGAAAGAAAATAAGCAGCTCAGATGCAGGATTCG-GTATGTACAGCAAGGCCCAGGTGTCGGAAACACTTACACAACCTATAAAACTCCCTGATGAGGTTTCCTTCCCCTGGCTTCACGGATAGTTCAGTTCGTGTTTACGCAAATGAGAAAACAAATCAGTACTTAACGGGAACACCGCTGTGCTGGCGCGTTAACTTTCATTTTATAACCAGACGATGTCAATGCGTGCAGGTTACCCCAGTGGGGACTCTGCCAGGCAGGGGAGTGTGCACACTGTCCCCTCC----TGCTGGGATGGCAAAAATAGATCCATCTTTGTCAA-ACGAAATCAACAAGCAAGGGCAGTGG---------------CGTGTGCATATGGGTAGAT--------GCAGAGTTGTATGTGAGTTAGCACAGCTCCTAGCTTTACCCtatcaat---tacttaacgctgctgcaacaaattaacacaaacagggtgttttaaagtaacagaaatgtatgtccttacaatacagggggtctg-agtctgaaatcgaggcatcagcagggttggatcttacaggaaactcagggagaaa-----ctgtccatgcctctctccaagagcttctcttatggtggtttctggccgaccttggcattccttgtctcatagcaacgtaactccaa----tctttgcttttgccttcctttacaactttgatttgacttctctttgcaactgcgtctaaatttccctcttcttataaggacatcagccattggattaagatccacgctaatccaatatgacctcatattgaatcatttcttgtataaaga a score=2388 s mm7.chr5_random 1030611 103 + 11523536 TTTTCTATAGCACAAAAGACCAGGCATGGTTTGAAATACTTCAGCACAGATGAGAGTAATGTTCAAGCACATTAGGACTACTTTTCTTGTTACCCTGAGACCC s bosTau2.scaffold6913 11495 103 + 42053 TTTTCTAGGCCACAAGAGGCCAAGGAAGCTTTGACGCACTTTGGTTTAGACCAAAGCATAACTGGAGCACGTTCTGAGAGCAACACCTGTGCTCCTGAGAAAC a score=6114 s mm7.chr5_random 1030766 1069 + 11523536 GGCATAATAAATTGTCCTgtgtcttaaagcag---aaattgatgaagtcacagctctggaggtcagatgtctgaaatggacctggcagggttaaagtcaggtgccagcaggctactgtttctggatgatcagggggagaaGCATCT-------AGAATTTCTGTAAGAGAAGCTGAACCTTGAGTATTCTATCTTCTAGCAATAGCCCACATTCATTCACTCTGACTTGGGCTTCTATTGTCACAGATCCCC--------AGTTTTCACATTGTaggatacctgtgattacaaaggactcatcttgatattctaggatgataacctcatctcaaaatttttaatcaga-----------cattttctcatgtagtgatatatatttagagggtcagg--atgaaagcatgaacacttgagggggGGAAACATTATTGCACGAATCACCTCAAACTTAGGTTGTCATTAAT--AGAAGCCAAAGTTGCAAAGGCCCCAGGAGGAGAAAATACCAAGATTATCTGCTATCTAGCATAAGAACTCTCTGAGTGTTAGTCCTATTCACCCTAGAAAGTCTCTATTCATTTAGGTAAATATTGGTTTACCTGTAAAC---------------TTGTGCTCCTGTGTGTGTCAGTTCCAAGAATGTGAGGACAGTGACATTCATCTCCTATGCTC----------ATTCCAATATTAGGACA---------TTTTTTTTTCTGCATATACAA-----CCTATGTCCAGTTCAACTATAAAATTGTCAAAATCCCTGTGACATACTCACATGATATA-----AATAAACTATACATTATTTTATTGGTATATTATTAACATACCAAGTTAGCTATATCCAA-ATGGCTAGTAGATCTGCAGGATTAATGTCTTAATATAATCTATACAATGGATCATATAATATCATAATATGATCATATGTATAACATGAATATTATT---------TTCATAAGAATGTTAAC-------tattatttttataca------tataaaatacttttatataactatat-------------taaatGTGTATAT-------TACATGTGCA------------------------------------------------------------TTTATTGTATAAAAATATAA---------CTTTTCTGT-TATCAATGTTTAGTTCTTGGGGATTTTTATA--CTG-GGCACATAAAGTT-------------GTATTAAGCAAACAAGAG s bosTau2.scaffold6913 11636 1180 + 42053 gacacaaagaatgg--------cttaaaacagcgtacatttactatcttaaaatttccatggtcagatatctgtagtgggtctcacggggttaaaatca---------aggc---------------attaaggagaactgtgtcttttcttaaggatttaag--ggagagtctatgcctttccttttctaccttctagatactgtgcatgttccttgact-------ggagtccacgtgactctgattctcttcctttcctctttcac-ttataagaagccttctcatacattttgcccatctaaagaatccaggatagtcatcccatcccaggagtcttaatcacatctacaaaatccctttttccatgtaaggtagcatattcataggcattgggcattaagacatagacatctttggggaccatccatcatt---ctgtctaccaGAAGGGCCTGTAGTCATCACTGCAGAAATCTGGACCTCAGAGGCTCTACCAAAGCAAAGGGCCA-GATGAACTGTCATTTGGGCAGAGAAGGGTCTGGACCTT----CTGTTTAGACTAGGAAGCTTTTCTACATTCAAGTGACC-TTTCTTTACACATAAATACTAGTTTTTGGTGGTGGTGGTCGTGTGTGTGTA---CTTGGGAGTG-GTGGTGAGTGATGTTTCTATTCTTTCCCTTCAGCAATCAATTCCAGTGTTAGTGCAGTAGATGTGTTTATTTTTCTGCCTCTATAAAACCGTTTCTGTCCAATTC-----------TGCCAAAATAGCT-TGACAAGTATGCAGAATATATTGCTCATACAATACACAACAC-----------------AGTGTATCAAAATATTTATATCAAATATGCCTTGTACAGT--CATAATTCATATAT--ATATAATCTGCATCATAG--Caaattttataataatctta----atttacaatatgaatattattatatttatattGATACTAATGTGAATACTAATATGTAATCTATATACAAATGTATGTGAAATA-TTTCATGTAGCTATATATATAGTTatacatacatatatatatacacacacacacacaCAACACAACCTGTAACTATACACATTTTACTTCTTGGACAGTCCTTTCTTTGGTCTATCAAGTTCATAGCATAAAAAAACAATACTTTAGACTGTGCtgtgcttcgttgctcagttgtgtctgactcccatgggctgtagcccaccaagcccccgtgtccatgggtattccccaggcaagaa a score=21196 s mm7.chr5_random 1031835 1282 + 11523536 CAACACCACTAACATAGTAAGA-------------------------------------------------------ATTAATAGTAGACTACTGAGCAT------------------------------------------------AAACTTCCAGGGGAGAGAGACACCATACATTGAATTGTTGATTTATAGCTTCTAGTGCACAACTTTTGCTCCAACCATGTGCAGTTGCTGAATTGAAACTCTTCCTCTTTTGCACATCACAAACCTGAGACATAGAAAACA-----CTTTCTAAGATCAGGCAGTCAGTATGTGCTAGCACGTGAGCTGAATTTAAGATATTTC--ATGAGTCCAATTGTGT--TGGCTACATTCAAAACTTGGCATGTT-GTGTAGTTGTAAATGGCAGGTGAAAATT----TGCCTCATTCCCAGAC--TGGTAAGGGTCAAGTTCATGAGA-TGAAATACTGCATGTGAGATGAGTTCAGTAATAAAACATCACGATGGCATGTGTGACTTAAGATGACACAGATTGTGTTTAAGGGAAG----ATTAAAGGGAATTTTAACATTATTAAGGGAATGGGAACTGTTATCCTCTGGAGGGCACAGAGAAGGGTAAC-----AATATGG-GGGGGGGGCTGTAACCAAAGTAAAACAATCTACTTGAAATAGTAGTATTCAAATTTA--------------GTATTTACAACTTTCACAAGTCATTACCAAGTCCCCTGTATGGTTAAGTAAACAAAGATTCAGGGGAGATAAATATGC-CTCATGCTTCCTTGGTTCAAGATTAGATTACCTC-AGGAAGTCA---TCCTTTGACTACTCTCTCCTT--TCTTAAGCATGTGT-GTGCCCTTGGTAGTGAAAGACATGTTTGCATTTAGTAGAGCACTGGAATACTAATCTGCTCTTTGAAG----CACAGATATGTTTC------------------------TGTAAGAAAG----AATCAAAACAA--------CAACTTAAACTTTATGACACAGTTTTCTTC---CTCAAACTTAGCTGCA---TCTGTTTGTCCTTCCTTCTGTAAGTGCGGTCTGACTTCTCAGCATTCTAAGAGTGAATCTAGGGAAAACAGGAAATACTGAAAATAGAAGAAAGTTCTTTTCAGGCCTCAGGGCAAGCTCTGAGTTGCCTAGAAGGTTTTGATTAGCATCCCATAGTGAATCTTGT-TGCACATCAAAACCTCTCA---GCACAGCATGACTCCAGTTCCCTTTCAGACCCCAGCTCAGTGTTGGGTGTTTACCAACTGTAGTTCCCTTCTGC-TCTTTGCAACAAATCCAGATCTCTGACCTTTAAAACAGCAAATACAGCTTTGCAAATTGTCAATGTTTTTTCAAGTTTTACTTGAGACCAAAAGCATGAAATTTTAATGAATACATCCCAAGATTCAGCCTACTGCAAACAT s bosTau2.scaffold6913 12929 1446 + 42053 caagaacactgaagtaggtagcctatcccttcttcaggggaactttcctacccaggaatcgaactgggatctcctgcattgaaggtggattctttaccacctgagataccagggaagccTCCAGTAATTTAGACTATAAAATAAAATAAAGATTTTAGGAAAGATAATCAAGATGCCTTGAGCAATTAGtttatatcttatattgcttattcctttcaccgactgtatgagatagctaaatcataataatacccatttctaagatgaaaaaattgagactcaattaccagtgatttttctaagatcaggcag-cAGCTTTTATCAGAATACAGGCTGAATTGCGGGT-TTTCGGATTAATCCTACCCTGTCCTTATAATCATTATGACTTGGCATGTTTGTGCAATTGTGAATGG-ATGCGATGATGACAGCAACTTGTTCACAGAGAGCGGTGAGGGTCGAGGTCAAGAAAATAAGATAACGTATGCAAAATTCTGTCAATTGTTAAACACCATGAAATTCTTTGTTGGATGGCATGCCACTAAGCATATAAATGGCAAGTTAAATTAGATGGAGCT----------------------AAGTATTCTCTCCATAGGAGTTCAGAAAAAGATAATGTCCGAGTATCACTGAGGATATTGTTACCGATGTGGAGTATTCTGCTTTGATTAAT------CTAATTTACCACCCCTCCACACACACACATACATTTCTGATGTAGTTATTGGTTCCATTGTATAGTTGAGGAAATAATTTAACAGGGATGCCTCATCTTCTCTCACGGTGCCTGGGTTCAAAATTGGAGTGTCTTTAAAAAGCCAGATTCTTTTGAGAACTCTCCATTTATTCTCAACAATGTTTTAAGTCCTTGGTGCTGAAAAGATTCATTGGTGTTGGGGGCACTCTGAAGGACTCATCTGCTATTCAAATAGGTCAGTGAGTGGTCTTAAAGGTAAAAGGGAGACTGAGCAGTGCAAAAAAGTTTAACATAAAACAATAATTACTCAAATAAATCTTTACCACAATGACTTCCTTATACTCTCAACTGTCTGTAATTTTTTTTTTTTTTTCCTTCTCCAAATGCAGTCTGGCTTTTCACCATTCTGACAGTGGTCCCAGGGAAAGCAGGAGGTATTGAAAACAGGAGAAAGTTCTTTCAAGGCCTCAGGGCAAGCTCTGAGTTCTTTAGATGGATTTGGTTCACATTCCTTGGTGAAACCTCTATACATATCAAAACCTGTAAAATGCCATCTATCAACCCACCATCCCTTTAGATAC--GCT-AGTTAGGACTGCTTACCATCT----CTTCCTTATGCAAATTTGAGGCAACTCTGAATCTCTGACCTCTAAACTAGTAAATACAGTGTTGCCATTTTTCTA-GTTTTTGCAAGTTTTACTTGGGATAAAAAGTACGAGTTTTGAATTAATACCTCCCAAGAATCTGCCTACCACAAGTAT a score=4594 s mm7.chr5_random 1034626 150 + 11523536 atggACAATTATTTTTATTAATTATGGATGTTTGAAGATATTTGGATGATTATTTTTCTTA---ATTTATCAAGCTGTGTTTTCTTCCTTCAGCTATGAATGGTACATGCAAAACTATGCCTTGACATGTGTACATTTCAATAAAATGCAAGT s bosTau2.scaffold6913 16283 149 + 42053 ATAGATAATTATTCATACTCATTGAGGGTGATAGAAGGTATTTTGATAATTCTGCTTCTCCGGTATTTATCAAGACACATTTTCCTTCCTCATCTGTGAACA--CCATGTAGGAGTCTGTCTC--CAGGTGTACATACCATAACAACACAAAT a score=45747 s mm7.chr5_random 1037144 1134 + 11523536 CTTCTGCTAGAAGAGGTAACCAAGG------CCTCAGGCATGAATAGACATCATAGAGACCAATGATTCTAAACAATCCATGCAGTATTCTATC---CATAAATGGACGCCATCGAAGGGCTTGTCATCTTCTGCACTTTGAATTC------CAACTGTGGTGCTTATCTTCCTACAGAACAGGTGACAAGCAGCC---------------TGTATGGAGATCACAGTCATTGTTGTGGACCTGAAAGTGTTGCTTCACCTGTTTTACAATGAGATTTCTT------------ACATATTTCT-ACTTCTCTGTGGGGAAACTGAACCTCAACCTGGAGATCATTATTATCACTGAACAAATAATATGCTGTCAAACATTTCATAGACTCTTCAATCTGT----------TTACTGAATGTTCTGAATTACTATCTTCCCAGACACACCCATGAGAAGCATTTGTCTTCAAATTTCCTTGATT-CCTGAAGTAATGAATTCATACTGGTTTACTCTAACTACATAGTATACTCAATCTCACTTGTTGTCACTTAAGCCTGCTTCCTCAGTGGAAGCAGACAAACTTGAAGGATGTCTTAGCTCTCCTG--TTTCTCAGCACTTTGAACAATGTACTATTTACATAAGCCTGCTATTGACTCTGGGCTTAGCCTTCTTTATCCAGCTTGAACATGACAAAATCCTTAAGAGAAAACCAAGGGATATTTTCCCAGACTTTTAATCATTATTCTTTTTCTCCGTGGGAGTCT-TGCAAAATCTTAGCTCTGGGTCTGGCCTTAAATATCTGAAGGTATTTTC-CATTCTAGCCCCACTGTGGTCTCTTC-----ATGGATTTATCCCAGCTTTCTAAAAGCAA-CTAAAAATAAAAATTTTCAAGAGGGAAAAAAGGAGCTAGTTTTATGTCGTCCACTGTGTCTTCTTTTCCAGGCTTTTAAATATGCACAGATTACAATCAGCCTTTCTTGTTCTTGTCACTTGGCCAAGATTTGAAGTGCCTTTGAAATTCACCACCACCTTTAAGCATCACTGCTGTGAGTCTGTCTGTTTCTATCCCCCTGAACTTTTAATCTTGAAGC-ATTTGTTGAGCTCTTCCAATGAGCAAAGTTCAACACATCGCCGCTGCAGGTATGTATCTTGCAAGTGCAT-GGAGAAAAAGAAGCTTTCACATGGAAA s bosTau2.scaffold6913 20247 1169 + 42053 CTTCTCCTAAAAGAAGTTACCAAGGAGGAGACTT---GTATAGGTGAATGAGATCAAGATCAGTGA--CTATTTAAGCAAAATAATATGTTATAGTACACAGAACTTCAGCATCAAAA-------------CTGCCCTTCAAATTCAGAACCCAAGTAAAATGCTTAGTTTTCTGCAAAGCGGTTGACAAGCAACCAACTCGATAACAGCAGGATTAGAAAACAAGAACAACTCCACAGAGCTGAGCATGTTGCTTTGCCTTTTCTGCATGGAGATTTTTTTTTTTTTTTAATGTATATTTCCCACTTCACTGGGTAGAAATTGAATTTCAGCAAAATGATCATTATTATCCTTGAACAAATAATATGATGTCAAACATTATATATACCCTTGAATCTATGTTGATCTATTTGCTAAAGGTTTCCCATTCTCCTTTTCCCAGATACACCCGTGGGAAGCATTTACCTTCAAATTTCCCTGATTTCCCAGAGTAATGAATTCACACTAGTTTACTTGAACTGGGTATTATATTCAATCTCACTTTCCATCACTTAAACCTGTTCCCTTGGAGGAAACAGAATAACTTTCAGGATGTCTTAGCTGTTCTGCTTTTCTCACCCATGCCAACAGTGTACTATTTACATAAGCCTGCTATTGACTTAGGACTTAGCCTGCTTTATCCAGTTTGAACATGACAAAATCCTTAAGAGGAAACTGAAGGATACTTTCCCAGTCTTTGAAACATTATT-TTTTTCTCTGTGAGAAACTCTGCCAAATCTTAGCTCTGGGTCCAGCCCTAAATATCTAAAGGCATTTTCAAAGTCTAGTCCCTCTGTGGTCTCTTCCCTGGATTTATTTACCTTTGCTGCTTAAATGTAACCTaaaaaaaaaaaaaaagcaaaaataaaaaagaaaCTAATATTATACATTCCACTCCTTCTTCTTTTTCAAACTCTTAAATATGCACAGATTACAATCAG---GTCTTTTTCTTGTCACTCGGCCAAGATTTGAAATACCTTTGAAACT---CATTCCTTTTTAAAATTCCTGTTATGAATCAGTC--TTTCTACTCACCTGAACTGTTATTTTTGGAACTGTTTGTTGCATTCCTTCAGTGTTCAAAGTTTAATCCAT---CGTTGCAGGTGTA-GTCTTGCCAGGGCCTAAGTGGAAAAAACACTTTCATGTGGAAA a score=10542 s mm7.chr5_random 1039742 454 + 11523536 TAGCCACATCCACCTACACAGCTTTTAAAAGAAACACAGAAAATATTTTCATTTCCCTTGACCTTATGT-ATAATTCTATCACAGTTGGTTTCAAATTGAGACAGGAAAATACAAATTTTCCCTGAATTCTCT------TCAATGTAACAAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAGCCTTTTAAAATGATGTCCTAAGATGGACATTTTTTTATTGGTTATTTGGAAGGCCAAATGCCTATGAAATGGAACTTTGGACACATCCAGCATTCTTAGTACCATATTTCAGTTTATCTGAAAACCCCAT----CCATACTTCAGTGCTAGGGCCTCGCAGGATAA-ACTTGATTCTCACGTTGCTCCCATCCTGGCAATCGTGAGTAAATCCTGTGGGACTCTCCTCCCTCAGGGTCTGCTGATAACTCTTGGAGTAATTACTTCCCAGAGGTTTTGTGGTGATGATTTGCTTT s bosTau2.scaffold6913 21911 441 + 42053 TGGCCACATCCACCTAAAGAGTTTCTAATGGTAGCTGAGAAAG-ATTTTCATTTCCTTTGACCTTGTTTTCTGACTCTATTTCAGTTGGTTTTAAATTTAGATGGGAAAGCATTTATTTT-ATTGGCTTTTCTCATCAGTCATTGTCAAGAGT----------------GGCCTTTTAAAATGACACCAAAAGACAGGCATGTTTCT-TTGTCCATTTGGAAGGCCAAATAATTGTGAAAAGGTATTTTAGAAGAAGCCAGAGTTCTAAT-----TTGTTCAGATATGCTCAAGCCTTTGTTTTCCCATTTTTCTGTGCTACAGCTTTCAAGGGTAAGGCTAGGATCACAAATATCTCCAAGATCTGAGATTATTAGCAAATAATTTGAGGTTACTTAATTCCAGGCTCTTCTGATTACTCTC-TAGTGAGTGCTTGCCAAATTTCTTGGGATGGGAATTCATTTT a score=4302 s mm7.chr5_random 1040198 195 + 11523536 AACAAAATAAAAATTACATATCTTTCCTCTCCTGAGTGAGGACAGGCATGCAAAGGAAAGGAAATGAA---------CTACACTTATGTTATACA---------TATTTCACTTTTGATTTATATACTTATCTGTCCTTTCACTGTTGATTAAACTCC--TGCTGTGACTAAGACCTTGACAGCATTGATGATTTAGT----GGTAAGAACAAAGGATT s bosTau2.scaffold6913 22972 211 + 42053 AATCAACTAAAAGCCATGCATCTTTCATCTTCCAGGTGAAAAT-------TAAAAAAATAAAAGTGAGAACAAAATTTTGCATTTAGTTTATTTAAGTATCTTCTATTTCCTCATTCATTCATTTATTCCTCTATTCTTTCAATGTGTGGTAAACTCCCTTTCTTTGACT-AGACTTTATTAACACTGGTGATATAATAGTGGGTAAGCATAAGGGGTT a score=24566 s mm7.chr5_random 1055427 665 + 11523536 TTATTATTATATGTTTTCTCTTGGTTGCAGATGTGGCAGCTTTCTATCTTCAAAGCAACATGAATGGAGTTGCAGGCAGTGACAAAATTGGCAGGTTCAGATGTGTTCATTACTGTAA------------------------------TGAGGCAATCTCATAACCACTTAGACCATTGTTTTCCTTTTGTCTTTGTTTGTAAATTCAACACAACTTCATGCAATCTGCCAGAAAATGAGAAGAGTGTAGCAAAGTTACTCACAACTCACGGGACCAGGCAAAACCAAAATGTCATTGCCTCTTGCTTTAGCAATTTGAGAGGACCAAAGAGACAGTCAACTGCATGA-CTTTTATAAGGTCATAATAAGAGCAGTTTGGTACAC-----TCTCCCTAGCAATTACACCTTTAAAACCCCCATATCCTGAATTCCACAGCAGTTATTG---------------ACAAGCCTCTGTTGCCCAGAAAATCGCCTCTAAATGTTTGCTTTGTGAAAACTGCCTTCAATGAGAGTTTGATGACAGTAATGATTAGCACTAGGTTTTAAAA---CAAAACTCTCAACTCTCATTTTTATTAGTTGTATATTAGGACGCAa-gggggaaagaaaaggaagaaagaagaaaaagaaggagaaggaactgaga----attatgatcaagaggaagtgaagtgaagtaggcagag---ggagcaggagggagaaga s bosTau2.scaffold6913 26273 712 + 42053 ttttttttttttttttttGCTTAGTTGCACATGAGACAACTTTAT-CATCCCAAGCAATGTGAACAGCGTTTTAGATGGTGACTTCATTGTCAAGCTCAGATGTGTTCATTGCTATAAGCAGCAAGCTTCCGGCAGGCTGCAGTTTAATGAGGCCATCTCAAAGCAGCTTAGACCATTGTTTGCCGTTTGCCTTTGTTTGCAAATTCAGCACAACTTCATGAAAACTGCCAGAAAATGACAAGAGTCTAACAAAATTACTCATAACTCAAGGGACCGGGTGAAATCAAACCGTCATCGCGTCTTTCTGTGGCAATTTGAGATGGCCCAAGAGACAGGCACCTGCATGAGGGCTTACAAGGTCAGGATAACAACAGCTAGGCAGACACACTTTCCCCTAGTAATCCCACCTTTGAAA-CCCAGTATCCTGGATTCTACAGCAGTGACTGGGGGAAAAAAAAACCAGAACACTCTGTTGCCCAGAAGATTACCTGTAAAAG-TCACTTTGTAAAAATAGTCCTCA---AAAATATGGTCTCAATGAT---------TGCGTTTCCAAAAGCAAAAACACCCAACTTCTATTTTTATTACACAGGTATCTGGTTTCAATAGAAGAAaggagggcaaagaggaggagggggagggggaagggaataggagcagATGGTGATTATGGGAAAGCCCATTAAAAATGACAAAGTCCTGAACATGTGGAATAAGA a score=3389 s mm7.chr5_random 1057133 80 + 11523536 ACAACGAAGACTTCTAAGAGATGAAAAGATATGAGAACAAGATAGGAGAGTTTTTAGAAAATCCAAGCCAACATTTCTCA s bosTau2.scaffold6913 32297 80 + 42053 ATAAGGGAGCCTTCTGGAAAATGAGAGGACATAAAAACAGAATGTGTAGGCATTTAGACAATTTAAGCCAACAGTCCTTA a score=9384 s mm7.chr5_random 1061925 477 + 11523536 TTTTTAAATATAATT-AAGCATAGAAAC-TGAAAATGTGTCT-CAACCTTGTGTTAATGGAAAGAAAACTGATAAGAGAATTCTAGTCTCTAAAAAGAAACAAACAACAGTGGTCTTAAATTCCTATTTTCCCCATAATAACACCATGCAAATATTAC---TTCCTTGGCTTTCATTTCCTTTGTCAAGATCTCTCCTGTCAATCACTGAAAGGACAAAACAAATGAAAAGGGATAACTCTGGCCTTGATGCCTTTTGCACTTTACAGAAGGAACGACTGTTGCAAAGTATTCTGTCTCATAACATGTCAGAG-TGAGACCTTAAATGTGAATTTACAAGGTTATAAATATGTGAATTT-AAGATTTTAAATATGTGAATTTAATAAAATTGTAGGTCATAATCAAGTATTTTACAAGTTACAAAGCATCTGAGTCCATAAAATCATTGA-CTATGCATGCATATGC-TTATGTTCTTTCTGTATAT s bosTau2.scaffold6913 35812 461 + 42053 TTTTTAAAGATAACTGAAGGATAAAAGTGCAAAAAAGTTTCTTCAAGGTTGTATTGAT----AGGAAAGTAAGAAGAGAACTGGGTTCTCTCAATATTTTTGTTTCTCTGTATTTTTTTGTTTTTAACTCTACCTCCAAAGCA--ATCTAAACATTTTGTTTTCCTTGACTCTCATTTCATCTGACTAGAGCTATCTGGTCAACCACAGAAAGAACAAAATAAATAAGAAGCAATAACTGTGGTCTGGGTGCCATGTTTGTTTTATA-AATAAATGAATCTTTCAGAATATTCTATCTGATAAAATGACATAGCCAAGGCCCTAAATCTGAATTTATCAGACC-TTAATATATGGGTTTCAAGATTTTA---ATGAAAAGTGTTTAAACCTTTGATT----------TACTATAGAAGTTGAAAAACAGCTGACTATATA----TATGGAGATATGTGTGTATATACAATATGTG-TTCATGTATAT a score=5872 s mm7.chr5_random 1062442 364 + 11523536 CATATATGTTTGATACAACCTTTTGTGCAGACTTTTGTAAATAATTTTGAATAATATACTAAAACATAATCATTGTATCATGTCATTTGGCtatttattcatttatttttttattcatttattcattaa------ttACCTGAATCATTCATG--AGTCAATCTTTATGGACTCTCTTATCACATACCAGACAATATTCTTGTCAAGAAAACACACACAAATAAATAAGATAGATCTCATGGACTGTAGGAAGTGGCCTTTTTCCTG--AGGTAGACATATATAGACATAACTATAAAGGGAAGAGTGCAAGAGAGCAAATTATTCATATTAATGAAAAACACAAGATTACCATTTTAGGTTTAATGAAATAGG s bosTau2.scaffold6913 36717 361 + 42053 CACATATCTCTAGTACAAA-TTTTATTCATAAATTTCTATATGATTTGAAACAAGAGA--AGAAGGAAATCATTACTTCGT-TGACTCATCTTCTCATTCATTTACTAATTTGTTCTCTTAATTTTTACAGCCTTTCATCTCGATGTTACATGGCATTGCATCTTCATAGAGTATCT-GCCACATGTCAGATATTGGGCTAGGCAAGAGATTGCACAAAAATGAATTTTAGGGGTCCCCTGTACTGTAGAAATTAACCAACTCCTGGGAAAATAGAAAAATACAAAGGTAATTACAATTCAAACAGTCCA---GAGCA---TGATGATAAAAGTGGGAGACACAAAGTT--TATCTTCAATTTTATAAGGTATG a score=19797 s mm7.chr5_random 1062883 783 + 11523536 ATCAATTTAGCATAGGAATGT----GTAAGTATGACTCAA----CTTCCTCTAATCAGCAGGCTGCAGGCCTTT-----------------------CTTAGCAGTACAGCTTGTGGCCTGTAGATGGCATGAATAGCTCACGGATCTGATGACTCTCCCCAG--CACCTGTTGGCGGCAACCTTAAGCACTGTGCAGCAACAGTCGAGCTGTTTGCCTACCGCTGCTCCCAAGAGCAGAGCTACATATTTATTTTCTTGGTTCATCTTAAAA-----CCTTGTGATGCAACACATTTTTCATGTCATGGATTTTTAATGTTCCTGAGCATTTTGTCAGTGCAGCTCATAAATGTATGCGTAGGAAGGCCTTTAATGTGAATGACTTTTGATCTTGAGATGTAAATAAAGAATTATTCACaaaaaaaaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaaACCCGCAGTCGATACTGTGGACAAATCAGGTAAATTAAAAACAGAGGTCACCAACCCTACACACAAGTGTGCCTGCTAAGCACAGACAGTCTTTC-CAACATGTAACCACCCCTCTCAACTCT-AGAAGAGGGCAATCAGTTAGCACCTTAGTTCTAGGGCCAGAATTA-TACAAACCAATAAGTGCCTACTG-CTTTATACCATAGGCAAGCTGCTGCTCCAGGTGATAA-GGAATTCATACTTGAATAACCGTAAAACCTGGACTG-TGAACCACACGGTTTGGGGCAG------AATAATAATACAGGCAAA s bosTau2.scaffold6913 37169 723 + 42053 AACAATTTGACATAGAGTTGTCTCTTTGAGATCGAATCAATGAGCATTCCCTAA--GACTTGTTACAGGTTCTTGGACGCAAATCTACCAGCACCCATATGGTGATACACACTTTGGCCTGTAGATGGCAGGCTTCACTCGCCGTTCCAATCAATTTTATAAAAACACCTGTTG-------TGTTAAACCTTGGGCCACAGCAGTCTAACCTTACATCCAGGACTGCTCCACAAAT--GAGCTACGTATTTATTTACTTGGTCCATCTAAAAAAAACTTTGTGTGGTGCAACACATTTTTCATGTCAGGAATTTTTAATGTTCCTGAGCATTTTGTGAGCACAGCTCATAAATATGTGTGTAGGCAAGGATTCAGCTTGAAAGACTTTTGATCTTCGGATGTAAATAAGGAATTATTTAAGAAAAA--------------------------------------------------------------------------------------------------AGTCAATACTATAGAAAAATCAGGTAAATTAAAAATAGAGGCCACTAACCCTGGATATAAACATGCTTGCTAAGCACAGGAACTCTTTTGCAACACCTCCACACCTATGCTTTCTCTGAGATTATGGAAATCTGTGAGCA-TTTGGCCATGGGGCTGGAATTATTTCAatttagcaagcatttattgactttatagtgtgtgcaagacactgcattaggtgataacggaatatatagttgaataagcataaaaacagggccattgaggcttataattttggggaggaaacTAATAATAATGCAGTTAGA a score=2227 s mm7.chr5_random 1063985 70 + 11523536 GAAAAGTTGTGAGGAGGGAAGCCCTTCAAACAACTGAATTGGTTTGGACAAAGTTACGTTTTGTAAGCTC s bosTau2.scaffold6913 37970 67 + 42053 GGAAAACTGAGAGGAGA-AAGCATTCCGAACACTTGCATTA-TTTGGACAAAAG-ATACTTTGCAAGCTC a score=2837 s mm7.chr5_random 1064126 104 + 11523536 AATGGAAGT--AAATTTCCCAAGCAG-AAATCAATATAATACAAAATTAAATGAATCCTTATACTCTACACAATTTACTCTATTTT--------TAACTTACACTATAGTAAAAT s bosTau2.scaffold6913 38110 115 + 42053 AATGGAATTTTAGATTTCATTGTTAACAAATCCATATAATTCCCAAATAAATGAGTCTCTGTCTTCTATGCAATTTTCTGTATTTCATAAATAATCACATATGCCACATTAAAAT a score=11548 s mm7.chr5_random 1064304 979 + 11523536 TAGTAATAAAAATAACCCATAATTCCAATTTC-TGATGAAGTAACTAATAATATTTCAGTGTTTAAAAACGCCTAAGTGATTAAATAACTATTCCAATATCATGATGTCTATATTTATTAAAATGTGACTGAGATTGGACT-AAGTTATTGACATATAAAACCACTCATGAGGACTATGACA-TTTCGTGCCTTGTTAAAATTTATAGGCAATCAATGAAAATGATTTCCATTTTGAAACAAGAAAGGGGCTA------------------------CTTTCAACCTTGGGCTCTATAACTAATATATTTGTGTTAAAGTCAAAGCTAAAATGAGTTATC--------AGGTAGCCCTCTCTCTG-----------------------TTGGTG----------ACTTCCTTTTCTGTTGCTCTTGGT---------GAGTAGAAGACAATTAGT--TGCT-------------------------GGACCTTGGTCATGC-TGCACACTTAGCTTAATGTTTCCCCA----------------------------------------------------ATGAGA---------------------------------ATAGCAAGT-------------------------------------GAGTTCCTGTAATACTGTCATTTGAGAACCTC--AGAAA-----------TATAATAGTCTAAAATTTCCAACCATCAGATACAATGGTGGTTTGAGGTAAGCATCCTATTGTTTTGGAGG-TATAGAATGCTGTGGAATGTTCATTCACACCCCTGTTCTATACTC---AGGATATATCAGTGGCAACTCACCCAATTGT-GTAAGTAGAAATTGCTTTAAATATTGCTAAATATACTTTGGAATGTAAAAATCATCTTGA---------CACT----------GAATCGTTGCCCAGAATCTCTTTAGTAAT------------GATATAAAAGGATAGAAAATTTCTCAGTATATTTAGACTGACCACCATGAACTATAAAT--TTGAGAGCCCCTGCAGCATTACCTAGTTTTATTTCATCA-CAGA-ACCAGGATTCTGCTCTGTGCTTGTCAGAATTGTGTAGGTGCTG-GAAGTCATAGGTACAGCAGTTTGTACCCTAGTATC-TTTTACCCATGAAGCTCAGAGGAGTCAAGACCATCACTGTTTCCATTATATCTATTATGTGGTTTTCCACGAATCACTCCCTCA s bosTau2.scaffold6913 39102 1242 + 42053 TAGTTATAAAAGTAACCTTCAATTTTATTTCCCTGATAAAGCTAGTCCTGATATTTCAGTACTAAATGAATTTTAA-TGTTTAAATAAGCATTCTAATAGTACAATGTCTACATTTATTAAAA-GTTAGTAAAGTCAGACTAAAATTATTGACATAT-AATCCAGACATGAACACAATGACATTTTCCTGCTTTGTTAAAAATTATAAGTGATC-GTTAAAATGATTTCCATTTTTAAATTAGAAAAAACATAACTTTCACAGTTTTCCCCAGTAACATCTCAGCTTTGTGGTTTGTAAGTAAAAGATTAGGATTGAAGTTCCAGCTAAAATGAGTTATTTATTGAGGAGCTGTTCCTCTTTCTGAAACTGTATTTCCTTTCTATAAAGTGATGTCACATATCTACTTCCTTTGTTTTAACTTTTTATTTTGTATTAGAGT-GTAGCCAATTAGCAGTGTTGTGATAGTTTCAGGTAAATAGCAAAGGGACTCAGCCGTACATATACATGTATC----TGTTTCCCCACAAACTCCCCTGCCATCCATCCCAGCTGCCCCATAACATTGAGCGGAGTTCCATGTGAGGTTGAAGAGAAGTTGTGTGCTGGACCTGACACACAGCAGGTCCTCAAGATGTGTAAACCCCAACCCCCACCTGACGTCGAGTCCCTTTTCTCTTGTTCCCTGAGAATTTCTAAGAAACTTGTCAACATTGCCCTAGTCcaggatttctcagtctcagtgatattcacg--ttgtagtcagatacatttcgtcatgggggctgtaggatgctgtacaaagtttatcagtatcctggttctctactcaagaggagatgccagtggcaactt-ttcagttgtggcaatcaaaaacattttcagacgttggcaaatgt-cttctgggtggcagaatcatgctgaataggggatcactgctgaataggggatcactgcCCTAAGCCT-TTAAGGAATGCCTGCTCAGTGGATAC-AGAGAATGGGAAATGTCTCTCTA-ACTATGGCTGTACAGCTGCAACTCAGCCTGGTTGAGAGTCCTCAAGTCCTGACTTTGCCTGCTTTGTTAAGCAGATACTGTGACTTTA--CGGCCATTCTCTGCATCACTTACTTCATGAGAAGTTTTAGACACAACAGTCTATATCTCAGCGTTGTTTTTCCCAGTTAGCTCATAAGGTCTATAACTCTCTGTGTTGCCA-TAAGTTAGTTATCTGATTTGCCTCATATAAATGCTTCA a score=45251 s mm7.chr5_random 1069821 1446 + 11523536 AATCAACTATCAAAAGAATGTGACAGAtacattatcaccactgt--ttcatagtcatttcctgtgggttgttcatagagagagtgggcatggtacaaat-tagatatggatttaaaaacagagcagtttgggttctctttcaattacttctctgca---agagatctggcagttttattcttacagc-accacaGAAGCTAATGCGAAATGAACTAACAGGTGTACTTTTGGCACAGTGATTGGGTTTGCTCCAGCATGCTAGGGACTTCTGGAT-CTTTAGTGAGCCTACCTTAA-GTTTGTCTTGTTTTGCAGATGGCAACACAAAGAAACTTATGAACTAGGTGCCATGAAAAAAAGTACATGGCGTCTGCTCCCATGAGCATCAACTATTTAGCATCAACTATTTGGCACCATACTGCCTTACCCCACGTTCAGTCCGAGACAGCTC--AGGGAGACAACCAGAAGAGTTTACAACAGGAGGCCACTAGCACATATAGGAGAATAAGTTACAGAGGGATATAGGCAGAGAACCAGCAAAGGTGGGTACAATAAGTTAAGCAGAAAGAGAAAAAAAAACTGAATGCTAATTATTTCTTTTCCATCATCTGTAGGTTTCCCAGGATACAAGGTGGGGAGTGGGGTGGGGAGTCAAGTAGCATTTTCTCTGTGTTTATGATTTCCCTCTGAGACTATCAATGCTTTAGGCAAATGTATTAATGTGAAGAAT-ATTTTTTTTCATATCTGAGCCTGTAATAAATGTCAACCATTTTTTTGGCAGCTGCAGCTAGTACTGCAGACCGACCATTACTGaaatttaaattatatattttaGGAAGCTCAATCATGTTATTTCAAGGGACACCTAAGATATCTTTGGATACTCAATAAATTCTTTCTACCTCTTGAGCTCTGGGTTTCTGTCTAGAAGGCAAGAATGGGGTTGTATGTTTGA---------------ACATTTCCTCT--------GAAAATGTAGAAGAAATAAATATTAAAAATACTTTTGGCATTATTAATTCCCTACAAATCTGGCATTC--TCTATAACCCTTCCTAAAGCCAGACATTCAGTATACAAAATTTAAAGTCTTTAAGATCTGCTTAGTGGAGCCTCTGAGCCATTTAATAAATAGCCCTTACATTTGcataggaatcataggctcctggagcagaaagtaagcttaagaaaaaaaaatcacagaagatgcttcgttttataggtaagaaaaatgagagtcaggaggagaaagtgatttgcttcaagccatgcatgcagtttgtgctagagATAA---CAGATTTTCAAGTGC-TGAAACCTGCTCTAATA--TTTTGGTAGTGCTTAACAGTTATAAGTTTAATCATAATGAAATGAT---AATATGTGAAAT---TTATTATATGTTACATTCTGGTTTAAG---CCTTTGCCCATTGTCTC-AGTAAGGAAACCTTTAATGAGACAATGtttttttt s bosTau2.scaffold1322 6074 1433 - 257032 AGTAAATTATCAGAGTAATATTGAATctgccttaatgtccttgtatgtctcagtcattggctgaaagcagtccatgggaagcatggtcttggtgcaaatatggttttgggtttgaaaacaaagcagctggggctcacagtcaattatttctccacagtcagaaatctggcaggtatattctcaaagccactacaGAAGCCAACTCAAGGTACATTAGTGAGCATGCTAATGACATGGGCATTTGG---GCTCAGTCTTGCTCAGGACTTCTGGAGACTGTGAACAACCAGCGTCAAAGTCCCTTCTACCTGAGGGATAAGGAAGTTGAGATATTCATCCACTAGGTTCCA--GCAGGCATTGCCTGAGGTCTGTTCAGA-GAGCATCAACCAC-------------------------CTGGCCTGTCCCAAGTTCAACCAGAGAAAGCCCCCAGGGAGAAAATCGCAGGTACCTG-AACAAGAGGCCACTGGTACACACAAAATGGAAAGTACCAAGAGGATATGGGCAGAGCACCAGCAGAACCTGTGGCAATGAGCTAAGGAAAAAGAGAATTGC---CTGAACGCTAATTATTTGTTCTTCAGCCCTTCTAGGTTTTTCAAGATTTGAGG---------------ACAGTTAAGTAGCATTTTCCTTCTGTTTATGATTTCCCTCTGAGACTATCATTGCTTTAGGCAAATGTATTCATATGAAGAATCATTTTTCTCCATGTCTGAGCCTGTAATAAATGTCAACA-----CTTAGCAACTGCAACTAATGCTGCAGACATACCATTACTGAAATGGAAATTACATATGTTAGGACCCTAGATCAT-TTATTTCAAGGGGCATCCAAGATTGTTCTGGACAGGCAGTGAAATTTCTCCACCTCTGTGGCTCTGAGCCTCTTTCTGGACAATGAAAATGGGATTTTCTACTTGCTTTTCTTTTTCTGCTCCGTTTCTTCTCATTCTTACATAATGCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaG-----TTAGTTCTATTAATTCCACTCCAATCTAGCATCCTTTCTAAGATACTTAGTAATACCAGGTACTCGGGAAACACAGCTAAAGGCTTTAAAAGTATGTTTAGTGGATCTTTTAAGATTTTTCATAAATAGCCCTTAAATTTCCCTAagaatcataagatattgggagagaaagtatactc----agacaatatcacaagaagtgctttattttactggtgagaaaaatgagtgcca-gagaagtaagcaacttgcccagaaccacacatccctttagtggcagagctaagatcagaattaaggttgcttgacagccagtcTAATAATTGTCAATAGAATTTGATAATTATAAATTTAATAACAATGAAATAATAAGAATAAATGGCATGTATTATTATGTTCTAAGTTCTGGTATAAGATCTCCTTGTACATTGTCTCAAAAAAGGAAATCTTTAATAAAATGATGTGTTATTT a score=5831 s mm7.chr5_random 1072412 423 + 11523536 AGAGAAACTACTTGTCATTTTAGATCAATATGGTAGACACTATTTTGGTAGCCAC-------TTGATGTTTACAAATTGATGGTTTGATA-ATATGACAGAGAAGGCATAATTTGAATGCCAAAGAGACTGAAGTAGAAAAACACATGGCAGAATGGAAGGGCAGATGACTTAGAGATATTTATTTGCATGAAACAAACCTGAATCTCTGTTTGAGTAAATGATTAATGAAACATTTATATTCCAATGATATATTTGAAGCTTTGCTCGCATT---------------------------TGCAAATAACACGCTTAAATAGATGG-------------TGACATTTTC-TCCCCAGACTCAAGAGAAAGATGCTGCAGGTTACTACGGTTTTGGCATATTTCTGAATAGAGAGGATATGTGAACATCCTTCAAGAAATT-----AGCTCAGAGGAGACAGAGA-TGTTAATCATAGG s bosTau2.scaffold1322 10018 442 - 257032 AGAGAAGCCAAAGTTCTTATTAGGTAAATAC------------TTTGATAGTCACATTAGGGTTGATTTTAGAGGGTTGAAAATTTGATATATAAAATGAATAAGG----ATTTAAA----------ATTGAGAAAAAGAGAGCCATGTGAATATAGAGGGAGAAATGATTACATAATATTCAATAACATGGAAGGAAATTGAATCCTTATTTGG--------CCAAGGTAATTTTTGTATTCCAGTGATATATTAGAA--TTTGTTTGAGTGTTTTTTTTTTTTTTCTTCAGTTTTTCATGCAAATAGAAGGCTCATATAGATGGGTAAGTGTGTTATTGTTATTTTTGTTACTGGCCTTAAACGAAGATAGCTACATATCAGGTTTGTTTTGACATGAACTTGAATAGAGATACCATCTACATGATGACCCACAAATTTAATGAATTCAGAAGAAGCAGAAACTGCTAAACATAAG a score=4290 s mm7.chr5_random 1075171 211 + 11523536 TGCTTCCGAATCCTTATCTATGCCTTTGTGTTATGA----------TTATAAAAGGTTTTGAGAGAATTGGGTGACATTGAGAAATGGGCAAAG-AAATTCTGGGTACACTGTGTCTACTTTGGGCCATAGTACTTAAG--GACACTTAGT--------ACTTAAGGGCACTGAG---------------------GAGTTAGGAAGCAATTGTG----------CTGCAGGCATACACAGAAATAAGAATGTAAAAGCCCTA s bosTau2.scaffold1322 12697 262 - 257032 TACTCCCTAATCCTTGTGTAAGGCTTTGTGATATGAAATTTATCAATTATGAGATAATTTGAGAGAACTCAGTACCTTTGAGATACAGGCAGAGAAAAGTTAGAAAATTCTATATCTTTATTGGGCCAAGTTATTTAAGATAAGACTTCATTCTTGCagaattgagggaaatgagtcagcaagaattgagggaaatgagtcagcaag-aattgagggaaatgagtcagcaagaatAAGCTGGAACCAGGATGCAAAGGATTTA a score=4256 s mm7.chr5_random 1075678 229 + 11523536 CATCCTCACACCTCAAATTGAAAGATGAATGTAGAAAGATTCAGAGACACTAGAGTCAAGA-GATCTCTAGAATTCTAAACAAAACAAA------CACTGTGTTCTTT---------------------TCCTTTACATTTTT----CTGTGGTCTTTAGAAAACCAATCAATTTTCCATTGACCAAAATAAATGCTGTTGCCTGTGTACAAACCCAATATGTATACCCTTATAGATCTCTTAAAAAGCACCATCGATTCT s bosTau2.scaffold1322 13146 253 - 257032 catctgtatgtcttgaattgaaaaatgAATTTAGAAAGACTTA------CAAGAGACAGAATGACTTCTGGCATGTTAATAAAAGAAAATTGATGCTTTGCATTTTTTCTACTGTCTCTCATGTGTATATCCATTAGGTATTTACATCTGTAGTCTTAGGCAAAATGATCAGTTTTCCATCAATGAGAAGAAAT-CCGTTCCCCAGGTGTATATTATATGTGAGCGTGCTTGTAATTTTCTTGCTGA-CACCACAAATTCT a score=26705 s mm7.chr5_random 1082109 977 + 11523536 AAAGGATGAGATAATAAAGTTTCAGTAATTTTTA--TCAGTGGGATACCTAGAGAAATCAAATGAGAAAATGCATGTACACATGTTTTGTGAATTTGTATTCATTTATCCA--TTTGTTAATTGCT-ATTAAAT--TAGAAACTGAATCCCATAATGGAAATCCATGTT------AAATACAATAT------------AGCAGCATAAACTACTTTCACTGATTAAAATAT-TTGTGTCCATTGCTGTTGAGGATAGGCAAAGAATGAT-TCATAAACACTGTGAGGAGTAGTCCTAGGTTCACTGGGAAATGGAGTGTCATTGGAGAAGAAGGCCTTAAAGGAAGAGGATTGGCA---TTCAGGTTTGTATACATGCCAAAGTTTTAC-------------TTACTTATTAAAATTTAATTGCTATCATTATAACTCTGACTGAGTGTTGAAATGTATGATTATTGCTATT---ATTATCAAACATATGTAAGAATACTTCATACATGCTGGCTGGGGCTTTTTGAGCACTTGGGTATGGGGGCCATTTCTAGGGATTGAGTTTTCCTTCTTCTACACAGATGGTTCCCAGCAAGAGGGAAAAATCTCCTTCCACAGGGAACCAGCTTGCAGCAGCTGGCATTTCAGATCCTTGCATAGTTGTCGATTTTT-ACCTCGAATTGGCCTCATCTGTGTGCATGCTATAAATCATCGAGATTTTATTAGGAGGATATTATATTTCTCAACATGGTAGTGCCTTTGGGAGGTGAAACTGTTTGCTTTTCTTGTGGGTGAATGACATTTTAAAAAACGTGTTCTCTG---TGTTACTCTGGTAAGATCAAATGGGCTGAAGTACAGGGCAGCGAGCCCTGATCTCTCTTTTGAAACCAAAGCATGTCTTTGTGTGAC---CTGACTTACATTTCAGCTTTAGAAAAAACTCTAAACCTGAAAACACTGATGCTAGTAAGTAGCAATTACATCTTCCAGAGTGAAACTTTAGTCTG------tgtctttctctgtgtctct s bosTau2.scaffold1322 23445 994 - 257032 AAAGGGGGTGCTAATAAAATTTTCTATGCTTTCAGCTCAGCAGGATAATTATACTGATCAGATGAGAAATTGTGTGTGCAAGTGTTTTATGAattc--attcattcattaaaatttgttaagtgcttattatatgccaggaactaaaccacatattggggatatatattcaaatgagatgtaatctctaatcttgGTAAACAGAACAAAGGAAAGTAA-TAATTAGAAAACAGTGTGTTGGTTTTTATAAAGGTTAAGCTCAGGGTACTATGGTAGACACTATAAGGAGT---CTTTTGTCCACGGGGT--TGGGGTATGATCAGAGAGGATGGC-TTAAAGGAAG-GGATACTCAAACTTTGAGTATGTTCAATTCTCAATATTTTCAATTATTATTTGTGTTAGTTAATAAAA---AATTGGTAT---------------------TCAGAATGTATTATTAATCCTATTCTTATTATTAATCACATGAAAGAAGGTCATAAAAGAATTTGTTTAGATAATTTTAGCACACAGATATGAAGACGCTTCCT-GGAAATGTGTCTTCCCACTCCTATGCAGATGGTTCCCAGCAAGAGGGCAAATTC-CTTTCCAGAGGGAACCAAAATGCAGCAGCTGGCATTT--GATACTTGCATAACTGTCAATTTTTTGCCCCAAATCTGCTTCCTCTGTGTACATGCTATAAATCACCTGGATTTTATTAGGAAGACATTATGCTTCTTAACAAGGTAACACCTTCAGGAGGTGAGATTGCTTGCCTCTGCCATGAGTAAATGACG-TTAAAAAAAAAAGTCCTCTGAGCTGGTAGTATGCTAGGATCAAATGGATTGAAATGTAGGGCAGCAAACTCTTTTCTTCTTTTTTAAGCCAAATATTGTTTTTTTATGACCCTCTCGATTATATCTGGGCTCT--GAAGGATTCTAAAATTGACATTATTGAAGCTA-TATGTGGTATATTCTACTTTTAAAGGAAAGTATTAGCTTGTTTGCTTGACCTCCCCTATCTCTCT a score=6669 s mm7.chr5_random 1084189 447 + 11523536 TGAATACATGTATATGTGCAATATCTCTGATGATGAGAACATCTGCTT----GGTGCCCTGCATTTCATGAA---AACTATTTCCCCTC---AATATTTATCCTACATGAATATACTATAAAACCTTATAGACACTTTTGT---TCATATTGTGACAGAATTTGCAAGAATAGATACCAGCTAAATAAGGACAGAGGT------------TGCCAAGATAGAAGAATATAA----TGTGCTAACTACTGATAATTGAGCTGAGGATGTCAACGGTAAAAAATAAAAATATAAACACACATACCCCCAAAGCAGTGTAAGA--AATATCATATTAGAATTACTGAGAATATGGATAATATTAGCAAGCACATAAAAACATATTATTCA-CTTTAATTTCAAAAAAGCCAGAAAAAGGTGATGGTGATACACACCTTAGTCAACGTTAAACTTTAAGAA-GAACCTTTGATAAAGAGAGAAA s bosTau2.scaffold1322 29579 468 - 257032 TAAAAAAGTAAATATATATTAAACCTCTCATGA-----ATATGTGCTTTTCAAATAACATTTGTTTTATGAGTTGAATAAACCCCCCTCCCAAATATATATCCTAAGTACAATTTTTTGAAAATATTGCAGGCACTTGTATGTATCAAATTATAACAGGATTCACAAGATT-GACAGTAGCAAAATGTGGCTTGAAGTAGATATGAGTTATAGCAAGATTTCAGTACACAAAAATGATGGTCACTGTTGAAAATCAGGCTTAGAAAGCTACTGCTCTAAATTAGAATATTAAACTTGGAAACTGCAAATGAAGTATAGGATGGATCCCAAATTAGAATTACTAAGTAAGGAGAAAATATTAGCAAGAAGAAAAAGA---ATCACCTGTTTTTTCTTTCAACAATGCAAACAAGAAGTAAGTGGATTAAACAGTC---TTAAAGTCAGCCTTTAAGGATTAACCTTTGACAGAACAAAAAA a score=15903 s mm7.chr5_random 1086376 647 + 11523536 TCCAGTGCATTCTCTCTTCTTGACTTTTTTCCTCTGTGGTACTAAATTGCCTTAGGTA----------------TCCACCTGCAACCTTTTGAAATTAACCTACCCACATAG-------TTAAAACAATTGCAACAGTAGTGTTCTATTCTAGGACTGTGTCTGGAGACAATGTTAG--CTACAGGAAATAAGCCC-TTCAGTACCTCCAGGAATCCTGTGATTCAGATTTGAGGGGGGGGCGTTGTCAGACTCCCCCTGTCTCCCATGTTTAAGATGTTGGCTTTTATTATTTTATTGCTAGCAACCTAGAAATGGGAAAGAGAAAAAGAAAACTATGCCATTCTGAAAATAAGTGACCCAATTTTAGCCCCAGATGAAAGGGAAAGAAAAATCAGAAGAGAACAAGCCA-ATCTGTGGGAAGAGCAGCCATCTGT----GCTTTGAATTAATGTAAGTTAGCAAACTTC-CTCACGTCGGAAGCAGAAAGGG-------CATATTGGAGGACAATTCTGGCAAATGCAGCATGTAGGCAGTTCTGAGAAGGG-----------ACCCTCACCTTACTGTGTCTGCATCTTATAACTGGT----CTAGACAATTTTGGAGATGTTGGTGAAGGTATTTTGAGTATCTGAGTTCTAAACACAAGTCTTACCTTGGGGACTCTCCATCAGAATCACTGCCTC s bosTau2.scaffold1322 31155 673 - 257032 TCCTCTGCGTATTCCCTTCTTAGCGCTTTTCCTTTGTAATAATA--TCTCCTCAGGGACATGCAGTCAGACTAATTCATCTGAAGCCTTT-GAAAGCAACCTATCTACATTACCGTGTTTTTAAAAAATGCAAAAAGGAATGCTATTTTCTATGCCTGTGCCTGGAGACAATTTTAGAGTGAGAGAAAATCAGCTCAGTGAGAGCCTCCGGGGAGCCTCGATTTCTGATATTAAAAGGAAAC-----TGATTTCTCCGTATCTCCTGTGTTTCGGACTTCAGCTTTTATTATTTTATTGCTACCAACCTAGAAA---AAAAGAAAAGAATAACACCATGCCATTCTGGAAATAAGTGACCTAATTTCAACCTTAGAAGAAAAGGAGAAATAAGAAGGCAGAGGGCAAAAAATATCTGCAGGAAGAACAG--ATTGGTTCTGGTTCAGAATTAAGGTACATTAGCAAAATCCTCTTGTGGCAGGGTCTGAAAAGGCAAGGTACAGAATGGATGAC--TTTGGGTGCATGCAAGCTTTTGGTAGAGTCAGGAGGAGAATCGAAGTGCACGCTCAACTCACTGCACCTGTAGCTTGTGTCTGGTCAAACCATGCAATTCCAAA----TTCAGCAACGAATGCTGGAAGCTCTAGTTCTAAGTGC-AGTTTTAAACTTGGGACTCTC--------TCACTGCTTC a score=5478 s mm7.chr5_random 1087094 333 + 11523536 TGTCATTCTTTAGACATAAACACAAGGAGCACAGAAAG---------------CAAAGCGAGCTGCACAGATTTAGGAGAGGACAGCGATCTGCTATGTTAATAAATAA-----AGACACATGCAAGAAGTGCTATTTAAGATGATACATGGAATGTTCTTTATTGATGTGGCTGTAAGATGAACCAGTTTTGGTGAGAATGAACTCCTTTGAATTAATTGTGGCTCTTTTGGAAGAACAAACATAAGGCCAGTTCTGCAAGCAGAAGGAAAATACTATATGTACTGTTTTGTGGGCTAGTAGCAACATTGTTTTAGAATTAG-GAGGGCTGGAT-----TAATTAAGGACTTG-CACAG s bosTau2.scaffold1322 32125 343 - 257032 TGTCAGTCTACAATCACAAA-ACAATAAGCAAAGACAGGTTTCTCTTCCCTGGAGAAGCAAACT---CAAAGCTACAAGAGGAGAGCAATTTGCTATATTAATAAACAAAAGGGAAACACATTGAAGATTTTTCTTTAAAGCAGACACATAGGATTTTCTTTGTT-ATGCAG-TCTATTTTG----GGTCTTTGAGAGAAGGAGCTCCTTTGAGCT-----TTATCCCTGGGCAAGGTAGAGGGTAAGATCAGTTCTGTGGATATAAGTTGaat--ttcctcatctgtgatacaggataacagaacctttgttacagagtttgtgaggattgagtgaACCTAGTTAAGGTCCTGACACAG a score=6092 s mm7.chr5_random 1087676 257 + 11523536 AATTTCATGTTTAGTTGCTCCTAGGTTCTAAATCCCCTCAAAGTCCTTGGCCA---------CTTTAC---TAAATTCTTGCACAAGTTTTAGCTTTTTATTTGCTTGTGTCCCTGGGAGGTTTATTACACTGGCTTCATAAAGGGATGCCTAGCTA------------------TGTGTACCCTGGCATTGCTGTTTCTTCTCTTCTTGTTAAGCAGTCTAGTGGACAATAACATTAGTATTTCCAGCTTAT---AGAAGAAGCTTACATTTGAAAGAACATCACCACT s bosTau2.scaffold1322 33287 289 - 257032 AATCTTATGTTCAAATATTTCTGGTTTTCAATTTTCCCCTAGACTCTTGATCATTTGTTTGACTTTTCACTTAAGTTCCTGCATAA-CTTTAGCTCTTTACTTGCCTGTGACCTTGGGAAGTTTGTCTTTGTGACCTCTGGAAGGACAACTTACCAAATCAGGcaggtggtgtgctgcctaccttagtcccacagtctcttctcatcctctcaggaacccctcatatagacaacattataatccccattttacaaaagaagaaaATTTCATTTAAAAGAACATTGCTATT a score=12912 s mm7.chr5_random 1087933 680 + 11523536 GGAGTAAactttggagatgtcttgcctggctttaaatcctggtctcctgctcacctgctgtgtgcttttgagcaagtaggttgacctctttgtcactcagattcttcttctgcaaaatg-AACTAATATCTAAGCATTTTGCATGTGGAAGTAATAAAACTGAAGGAG--------CTGCTATGT------TGCA--------CCCAAAGAAAGCTTTCTATAAATATTAGCCATCCCCATTA-TACTAGAGGGGTTAAACATCTTTCTTTTATATGCCAGCATCTTCTGGAAAAGGTATGCTGGTCT-TGTCCAGAGCCAGTGGTCTCCTGATTTCCATCATCAGG-TGTGTAGGAATAACATTTTGTATTGTTTTATGAAAATAATTAAAGGCTGTGGAGTGTACCATCTTTAAGATTAAATTATCCCAGTCTAGAA-AGAATCTGAAAATTCATTTCAAAATTG-AAAGCTGTCAAATCATTA-----TAAACATTTGGTTGTTCCTGTAATTGACAATGAAAGGTAGGTATTCGTTATTTCCAAATAAAAACCAATGTTACACATAACAGCTCACTGTG----TCTTTCAGGATGGAAATGG-----------------------GAGTAGTAAATAGTTATCAAGTTAAATAAATAAAATCTGCCACTCAATATCTTTTC--CATAAACTGCTCAGGATA--------------------GGAGGAAATTCTTAGGGTTTGAACGAATTATTGACTA s bosTau2.scaffold1322 33775 721 - 257032 ggagtggactttgggcgtgccttgcctggctttggatcttggtcccctatttacttgatgtatgattttgagcaagttgtttgacctc----------agattc-----ctgtaaaatggaaataacatctgtacttcttgaatataattattttaagtctgaaagaaaataatgcttgttatgtgcttattgcagcacatttcactaagggaacttagaataaattttagctataattACTGCTATTAAAGATATTTAG-----------TAAATAGCAGAACCTCCTGTAAAAAGCATGCAAGCCTGTCTCCAGGGCCAAAATTCTCC--------ACCATTAGGGTGTCCACCCCTCAAGTCTTGTATTATTTTAT-AAACTGAAGACAAACTGC----TATAC--TCTTTGGGAGGCAATTATTAAAGCTTAAAATATGATCAGGAATTTTATTTGAGAAATGTCAAGGTGTCAGAACTTCAAGGTGTAAATATTTTATTCTTTCTATAATTGAAATTGAAGGTTGGATATATATGATTTGCAAATAAAATAAAAGTACACATAGAGTGATTTAACATGAGCATTTTCAATAATGAAAATGGCAAGAAAGTGTCCTTCCATGCAAGGATAATGAACAATTTACAGGAGAAGTAAATAAAAGTGGCTGCTCATTAAAGTCTTAGAATAAGCTGCCTGTGGTAaaaataaaataaaataaaataaaaGAACTTATTAGGGCTTGAATGTAGGATAGGCTA a score=8219 s mm7.chr5_random 1093958 625 + 11523536 TCTATAACTCCCTACACTGACCTATAGTTTTCCATAAGAACCTAAAAGAGAAAATGCCAAATGTTATTTGGGGAAGTAAGTAGCAGGCAAGCTCATACACTGTAATTCAATATAAGAACAAA-TCCTATGTATCTTCAAACTGTAGCTATT--------------CCAGAGTCTGTGAGTTTATTTTCAAGATAGCAATTTTCTTTAGAGCTCAGAGCCCAGAGAATC--------AAATGGCCTCCCTTGTCCTTCCTGTGTTTTCTATGTGCATGCATCTAAGACCTGGTTTTATTGTAATCACAAAACTGATGGATAT-ATTCAATTTTCACTAGGCAAGTTTAG-GAATTGTGCAAGTCATGA-TTCCAT--TTTCATTAACTGGAAGCACAGA-------------------TTACAC---TAATGAAGGCGTGGATCTACTAGATTGTGGACTGGGTACCTGGGACTATTGCTGTGGTTCT-GGGCTTGAATGGGTACTGGAGTGATTA-------CTCCTGTTTTCagtgtctgatgaaggaggtctagagggcatccaagattttacatgtctcacacatttcacatgttgctactagggtcatagatgtaaactcagagaactacAAGACTTCAGCATCTTGAAAATTTGTTCAGCAATTGCTACTAGCCAGAG s bosTau2.scaffold1322 35508 649 - 257032 tcccCAGTTCTCTGCATTTCTCTCTAATTTTCCATTAAGAATTTGGAAAGCAAATACCAGATATT--TTTGTAGAGTTTGTAGAGGACAGGTTCATTCACCAGAAATCAACATAAGAACAAGGTCTTTTGGGTCTTTAAAATGTACCTGCTGCATTTTGTTTGACTCAGAGTCCATAAGCTTAGTTTCTAGCCAACAATTTCCTTTACAGCCTAGTGTTCA---AATCCCACCCTTGGATGTGTTCCATTGCACCCCTT----CATACACAAGCACTTATCAAGGGACTGGTTTTATTGTAATCATTCAATTGAAGAACTTGATTTTTTTTTTCCAATGAGAGTTAATCTATTTTTGAAAGTTTTGCCTTTTATCATTTCACTAATTTGA-GCACAAGAAGATCCATTTTTGTGTTTTTACACAGCTAAACACTGTGTGGACATATCTGTGTGATGTCCACATTACTAG-ACTATCAcggtgattctctaacctagacatgcatcagaaacaccaaaaggtccccctttccagagtttctgatgcagggagtttggggtgggcctgagaatttgcatttctaacaagttcc-----------ctggaagttctgatg---atgctgAGAACAACCAGGGTTTAGCTTGTTGTGGTGCTAATCA---------ACTGGCAGGAG a score=16047 s mm7.chr5_random 1094812 928 + 11523536 AAAGAAAACAGTGAGTTCACCTGGATGCTCAGCA-AATATAAATGTAATATGGAAGG-GAACATCTGAGGAACTAAATATTGTGCCATAGATGATTCCAAACCACAAGGTTAAAAATGGACATCTGTAATACAAGGAGCTGTAAGCTGCAAGAGTCAGGAAGCACCTAACGGATGAAGGGGAAGCT--GTGGTTTTGATAGAACTTCAAGGTGACTTTATGAGGAAGAAGCAAAAGGAAGGATAAAGAGACCATACTTTGACATATGACAAACTTCGCTTAAAACCCAGTGTCTTCCAGTTACCCAAGTGGGTTGAATTTATTATGTGTATATTAAC--ATCTCTGATAAGTAGTTGCTTTATCTGTGAGAAACTGATAGT--------TGTGGTGTCCTCTTAAGTTTAAATG-ACAATTCCAGACACTGAACATATTGAGT--AAAGTTATTGAGTAAATTATT-AAATACTTCTATTCGTTATGGAGAGATGGTGGGAGAATTAGGGAATAATCA---GAATTTTGAAACTCTATATCATTTTTGATAGATGTTTCTGTCTAGGCAGAATTGATGATGATTGTTTTATTGTACTGAATTTTAGTCACAAGAGTGAGTGACGGACTGCAGAGAATCTGCAGCCCCAAGAACTCTGATATTAGAAATCAAGAAACAATAAAAGTGAACTGGACCAAAAAATTGCCAGCAGG--------AATATGTCCCAAATGCCTTGCAGA--GTTTAGGAAAATCCATAATCCATAATGAAGGATTTAGCCTTAGCTTCAAAAACATGTCATGTCAAATAAAGCGACAAGAAAACCAATAGTACTAAAAGTGATAATAGCAATAAATATTTATTGAATCATTCCTGAGCTT-TATGTGCCAAA-AGACACAGCTTTAAAacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaAGTAT s bosTau2.scaffold1322 36209 879 - 257032 AAAGAGGACA-------TATCAGAATATTCAGCAGAAGACAGAGACAAGAAAGGAGGTGAGCAACTGAGAAATTCAGAAATGTGCCTTCAATCCTTCCAAATCACAAGATTAAAGGCAGATAGCTTCAGGGGAAGGGATTG---------------GGCAAGCCTCTTGAGAATGCAGTGCAAAGTAGGAGGTACCGTGATGACTTGATGATAGAACTATgaggagacagcaggaagaagagtaaagagattgagctccaacaccaaacagccctggatttcaatccaagatttccaatttatccaagtgatttg-----attttgtataaattagttaacctctgacaattagttgtcacacctatgaagtaggggcaattagaataatgtgatg-------gagattaactgaactatgtcagacacttaatataCAGTTTTCAAAG-----aaataaattattaaaatatttCTATAAGTT--------ACAATAATAGAATCAGCTAATGATCATGGGAACACTGGAACCATGGATCACATTTGCTGTGTGTTTGTATCCAAGCAAGATTTACAATGATTA---AATTGTAGTCATTTTGAGAGATAAGAGAGAATTACAAACTGCAGAGA------AGCCACAATACTTC--ATTTCAGTTACTGGGATGT--------TTAACCAGAGCAAAAATTTGCCACTAATTATTTGTCCATATGTCCAAAGATCCTTGAAAGATGTTTAGGGACATTCAT----CAAGATTAAGGGTCTATTCCCAGACTC--TCATATGTCATTCCAAA------GTTAATAATAGCAATAACaataaa----acaatataaattaatatttattgaattatttctaaatttCTATGTGCCAGACCAACACCACTGTAATGTGAATACATATACACATTTGTGTGTGTGTACATGCATAGAaaaaaat a score=6569 s mm7.chr5_random 1096468 485 + 11523536 TGGCTTCGAAATCATCTGATAGAGATACTCAGATG-CAACTGATCCAGCCAGGCTCAAGGTAATGGGTTTTCAAATTCTATATA-ACAGCTGTTCA---TCCACCCTATTCATGAATTGG----CATTATTAGTAATCCTGTTTTTACCAGCATCTCCAGTTTTTATTTAT------TCCTCTTCTGTCTGGCCTACCT----CCACAGGTTA---AAGCCAGGGTAAGTGTGTTGCTCTGGAATGAAAAGATTTAGGCCCCAGATAATTCATGACTACTGAGGTTTGAGGGTAGGGTGGTGGACATTTTAATTGTAGTCAGGGTGTTGTCAAGGGGAAATAAGGACATTTTCATTGACCA-----------------ATCCATTTCACATGTTCCACCAGGATAGGGAGCAAGTATGATACTACATTTTCCCTA---AGAGGAAATAAATGGGGTAAGTCAGTCACACTCACAATGAGTTGTCAGGGAAGTGCCATAAAATGTAGGTCTGGTGTTG---CCACCTTAGT s bosTau2.scaffold1322 38915 520 - 257032 TGACTCCAGGAATATCTGATGTAAATCCTCAAATGTCAACT-----ATCCAGGGCCAGGTTAAAGAGTTTTTAAATTCTATGTGTATAATCTATCAATGTCCTTCCCATTCAGGGGATGGGGGTCATGATTAAGCAACCAACCTTTCACTTCTGCTATAACTTCAACCCATAGGCTCTCCTACATTGATTCACCCATATGATACTTTAAATTAAACAACTCAGGCTGGATCTGATATATAGGAATTAATAGATGTGTGTCTTGGATTCTCTA-GATGATTGGGATTTTGAGGAAAGAAGTTGG-CATTTTAGCTG--ATCAGAGTCAGGTCAA-GGTAGTTACAGACACTTTCATTGACTGGGAAGTCTCCATACATTACCTCTTCTATGAGCCTTATAAGCAGAGATGACAAGCATGACATTGGAAGTTCCTTAGATAGAAAAGAAAAAAAGAATAAGAGAACCATACCCACAGTGGGTGGGTGGGGAAGAGTCTTCAAAAATAAGACTAGGTCTGGATCCAGCTTAGT a score=12591 s mm7.chr5_random 1159575 456 + 11523536 AATTACACATTTCTATGCCACAAATTTCTGTACTGCAGTA-------TGGCTTTCCTTTGAGAGAATCAAGCATCTCAAGTTCCAGATTTCAGTCC----TTTGTACAGTTATTTATTTATCAATTAAAAAACAGT---TAAATATAAACAATGAGTGAAATAATCTGTGCAA---TTTTCAAAGCAGAACTTAAT----TAATACTTATTATCACATAATTCATAGT-------ATAAGGCACACATATAAACATAGAAACTTAACTCTTAAAGGGATATTGTTAAAAAAAGATTGTAAATAATAATTTAAAATAACAACTGTAACAACAAAGAAGATGG---AATATATTTGCTATTTCATGAAAAAACTGAATCTTCTATATCTCC----CTATCTAGTAGTTTTTATTTTATTTTATCTC---------CAGGCCCAGGTATTTCT------------CCTTTTTCAAAGTGATTCACCTTTGTAAAAGGGACCCCATTTCAACATCT s bosTau2.chr6 42856679 478 - 69624268 AATTATATATTTTCAAGCCACAAATTTAAGCACCACCACAATATTGTTAGGTTTCCTCTGAGAGATGCAAGCATCCCAAATTCCAGATTTGCGTCCTTTGTTTGTACATTTATGTattcatcttttaataagcattttctgaatatgcacaatgggtcaagca--ctgtgcaacatttttcaatgtagaattgaataaaacaatacttattatcatgtaacacatagtctagtggatgatacagaaatataaacatataa--tta----------------tGTTGAGATAAGttttaaaataata---taaaa-attaattGTGACAACACAGAGGAGGGAGCAATAAATATGCTGTTTTATGAGCA-----AATTTCAAATATCTTCACTACTATTTATCA-----TACCCTGCTTTTTCTCTCAATGTTTCAGTTACAGGTCTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTTCAAAATGATGTATATCCATAAAGGAGCATTCATTTCAACGTTT a score=11352 s mm7.chr5_random 1174452 377 + 11523536 TTCAACTCTCTAATATTTTTCTTGACTAAAG-CACACTAAGCCACTTGCAAGGTCAAAACATTCAACAACGATTGTCAAAGCTAAGTCTCCAGAAAGGTCCAATTGATTGTTATGACAAATATGACAAGGCTGCATTAATAAGTGAAAGCATTTTCTGCATTACTATATGGATCTATAAAGCAGAATAAACTGGAATAGAGACGGGCATCTCTGCTAATGGCAT-GTAATCCCAAAG----AGAGACATCAGTAGACATGCCAACTAGTATAGTAGGTGAATTATTTCAAAAATGAAATTATTAGTGATGTTAATTCAAAGATTTATATACCC--TGAAA-ATAACATATT--GAAATGTAAAATAATTTTTCAATCTCTAAAAATAA s bosTau2.scaffold2848 66283 386 + 98849 TTCAACCTCAGGATGTTTCCCTTGGCCAAAAACGCACTAAGTCGTCTGAGAGTTCAAAGCATTCAGCAAGCAGTGGCAAGGCAGATCCATCAAAAGCGGGCACCTGATTTCCATGACAAATATGGTAATGCTGTATTAGCTAGTGGAGCCACTTTCTGTGTTGCTGTATGGGTATATATGGCAACACAAATTGGAATAGAGTGGAACCCATCACCTGTTGGCAGAGTCACCCCAAAGGAATGGAGAGAACAGTAATCATCCCAGCTGATTTAATA-CTGAATTGTTTC-AAAATCAACTCATAATTAATTCCAAGTAAAAGTACTATGTACCCATTAAAATATAGCATGTTTGAAGAAATAAAGTATACTTGAAACCTTCaaaaaaaa a score=29355 s mm7.chr5_random 1175187 1823 + 11523536 CTAATGAAAGGAAATTCAACTTTCAGAAGCTCTGTTT------------GGGCACAGTCAGCTTGGATAAA-AGAACTTAGGTTCCTGTTACATCTCCTTATTGAAATAAGGAT-----TTTTTTCTGCATATAAAGTTAATTTTTATTTGCCTATGAATTAAGAAA-AGTATGTGCCTTGAATAAAAAAGGCTGACAGGTTAGCTAGTTTATTCTTTTTCTTTTCTTCTGTATTATAGCAGAACTGAAATGGTTCTTTTCACTATATACTTAGGGAATTGTAAATACATCTCCAGGATTTTA------TTGTTGTCTTTTCATTTTAAGCCTGGTAATAAGAAAAGGAAACTAAGTAGAGTTATTTCTTGATGATTTGGGGTTATTAAAATTTTTTCATTCTAGAATAGAAATATATTGTATGAAATGAAC---AGGTATCCATAGTTAAAACCCTTCTTTTTCTGAATTTGAACATATGTTTCTTCCATCTGACTCTGTCATGTGTTGCACTGTGCAATGGCTGTGTCATGGTCATCG-TTCTGCTCCATCCCTAAC---ACAGAATTCAGAATCATGAATTTATCCTTAATGATGTGCACAATCTTATTATATGGTTTGGTCAATATCCACCAATTGTAGATGCAATTCCTGGGCAATAAAATTCTCTTAGATGCTTCAGTG---CTTCCTGAGGTTAAATGTAGAACATG--------------AAGGGAGCTGGAATGAAAGAATATATCTAGGAATTCAGATGGGAA-TGAAAATTGTTAAAGTGCCAGCGTC------TAGCAAATTAATGAGTTATCCATTAGTTAATAATGTTT--TATTATTCCACCTAAATTTACAAGATGATCTGGACCAGTGACAAAATACACAATAGCAATAGTAATAGCCACAGACATGATTAAGAATGTAACTGCTTAGAGCATTACATCTCCCAG-GGAAAGAAATGTTCACACTGAGAAT-TAT-CCATAATGGCACCATTGGGGATACTTGAGAATACTCCAGTCAGAAGGTTTTAACT-TTGGATCAGGTTTGAATGATCCTCAGATGTAAGATGACAT-AGCGATAATAGCAA----CATGTTAGCCCAACTTCAAAGCTCAAGGAAAGCTTAAAGAAAG--------------CAGAGCTGGTGTAGTG--------AAATCACA-AGGAAATTATGCACTTCCCCAACTTCTAGCCT-AATCACTGGTGTGATGACAGCATCCACCTCCAGGATTCCATGTGGTCCAGCTTTTGTTTCTCATTATAAAGTACAA-------CCTCCCATTTCTTCATTATTTTCTCTTCTGCTGTTTTCTGACCACTTAAATGACCTTCTCATAAGTTCATGCTACTTTAAAATACCATGCTACAAA--CAAAT-----------CCATCCCCTTATTAATTTTTAGTACTTGGGCACAGACTGGTTTCATACAATCATTGACAGAAAAATAATAAACTTGTGAACTAATGAGCCAACCTTAGGTTTGTTTTTTTTTTTTACCCCCAGAGAACAGCCAGCTTCAGTAATCACATTACTTAACAAAAATTCAGGTATTAGTTTTCTGTGCCCAACACCATGGAGTACAAG------GTCATTGATTTGTTAAAATTAATGAATTAATTGCACTAAAGGTCCTTG-ATTTAATATT-GTAAATAGCAGGCTAGCTGAGCATAGGAATATACCACAAACATT---TGTCAAAGACATACAACTT---AACAATCGTAAA---ATGCTTCAGCAAGAATAATAACAACACATGGAAGGGTGGTGTAGGAAAATACAAATAATTTTATGCCTAAGATCTATATTTTCTTTTATATAC---------AAAATGTTTTTAGT-----GTAAG---CTTGAAATGCTATGGTGTAATTTTATTTTTGCATATTTATAGAAT---CTTGCGTGTTAA s bosTau2.chr6 42868414 1811 - 69624268 CTAATGGAAG---ATCAGACTTCCGCTGATTCTGCTTTCCTGTCACACCAGGCACAA----CTTGAACATGTGGAGTCTGGATTCCTGGTACAACTCTTCAGTCAGCCTATGATGCAGCTTTTGTGTGCGTGTGAAGT-ACTTTCTATTTGCTTTTAAACTCAGAAGCACCATGTCCCTTAAATGAAGGAGGCATGTAAATTTAC-AACTTCTAATTTTTGTTTTCATTT----TAAGGCAGAATTGAAATGATGCTTTACATTGTTTACTTTGA-------------ATCTTTGGTATTTCAATAAGTTTGAAGTTTTTGCA----------------------AGTGGATCATAGGGACTTATTTCTTGCTAATTTTAGGTCAT-GAAATTTTTTCATATTCTAATAGAAATAGATGGGATCAAAAGAACTAGGGAAAGACATGGTTAGA----CTCTATTTCTGAATATGTACATGTGTTTCTTCCATCTGACTCTGTCTTATGCTCAGCTCTGTGATGACACTGTTACAGTTATCATTTCTGCCTCCTCACTAACTGTGTAAAATCCAGAATCATGAATTTGGCTTTCACTGTATACAGAGCATCATGCTATTGTTAGGGCAAGCTTCAGCTAATGCAGATAAAATCCC----------AAGTATGTGAGAGGCTTCTGTGGTATTGCTTCAGGTTTAATGAAGCACATGTGGTTGAGCACACTGAGGGTTCTGGGTGGG--------CTCTGAGAATTCAGATGGGGACTGTAAAT--TTGAGGTGCTTTCCTCTTTTTTTTTTTAACAAATGAGTATTTTTTCAATTAAAAATATTTTGTATAATAAGATTTACATTCACAAGAAAAGCAAGGCCAATGGC-AGGTAGACAAAACCACAAGTAA-----ACAAGACTAATAAGGAAT-TATCAGTTTAGAGTGTTATATTTCTTTGCTGAGATTAAGGCCCATACTGTGAATGTATACTATAGT--CACCA----------GTGAGAATATTTCCATTGGATTGCTTTAACTGTGGGATCAGGTCTGAAGGAGTATCACATATTAGATGACATAAGCAACAACAGCTAACTCCATATAGACTAAGTTTGAAAGCTCAGTAGAACCATAAAGAAAAGCAGAGAAGAAAATCACAGCTTGTGTGGTGGCTTTATAAAATCACAGAGGAAAATATCAATCTTCCTGACTACTTGCTTCACTTACT--------------------CTTCAAAATTC--------------TTCATCTCCTGTTATAAAGATTAAGTACATTCCTCCCAGCTCCTCATTTTCCCCT----TATTGTTTTCTGACCATTCAAAAAACCCTGTCATCAGCCTGACCTATTTCAAAATACCTGGCTACAAAATTAAATCCATTCCATTCCCATCCCTTCATTAACTGCTATTTCCTCAGGATAGCTGGATCTCATGCAGTCCTTTG-AGAAAAGAAATA------TTAACAAATGAACTGGCTTTAA-----------TGTTTTATATACAGAGAAAG--CAGCTCTTAGAGTTACATTCCTTCCTAAGGA--CACTTTTTAGTTCTCTGTGTCTCAAGGTGTATAGAATAAGGTCCCTGTCACTGAGTGGTCAATATT------TTAATTTCACATGTGATGTTTGTGTTGTGTATCAATAAGTGGTGGAATTGCTGAAAATATTAGCAGACTAAACTGACTCAGTTTCAGAGAAGGACACCTTTAAAACACTGGCAAAATCATACCTCAGAACAAGTCATAATGGCCCTGGGATGGGT--TGAAAAACATGGCACATCCTCCTGGAGGAGAGAAAATTGCTTTCATTTATTTATTCAGACAAAGAAATATGATTAGTTTCTCATAAGGATTTTTGAGCTTCATTGTATACATTTGCTCTGACGTATTTATAGGGTGtgcatgcgtgctaa a score=21063 s mm7.chr5_random 1177380 1172 + 11523536 GTTCTGTGTGCTAGAATTTCTAATTTAATTTCTGCTTTTCCACAATTAATGCTTAGGCTTTGTG--TTACTA----GCACTTCATAGAAGAATGACAATTGCTCACATTATGAAAAGAGATAGGAGAATGGAAGAGGGAGAGGTGAGAGAAAGCGAGAAAGTAAAGAATTCATATTGGTAATTACAAAA-CTTAGTCTTTTACTTTGTGGTTCAGAACACCCAAGATTCTCCAACTGTTTGTCAATAGAATTGTGAATGTTATGATTAGTGAGTTGACCTCGTT---TAGATTTCCCCGATGATTTCCCCATTGCCATGGCCCCGTTTTCTTCTGTGCTATCTACCCAAGAGAAGTTGTATGAATTTTCCCA-------TTTTAATTACTCAGGGAAGAAGGAAG-AGGTAGTAAATTAAGAGTAGCTACTGCATAGGAAATGTTAGTACAAATTCATACAAACTGTTTTGGGGATAAAATTGCAAAACTGAAATTGTGAAG-CTCAAATATACATGGTCAGAATTATGTAAAAGCCATCTGCACCTTCATTATACTGTCTAATTATATCTTTTTAGACTTACTATTGACCTAAATGCTACTGCACTGTCAAGTGAAGCTTACTATTTTTATAAACACACTTCTGCATTGGAAGCAATTTCTATCTT-GCCAACATTTTT---------ACAGGGGCAGAGAGAAAAACTCTCTCCATTGTCTTTTGTTTTTGTAGACCCAGAGGTGTTACATACTAGTTTCCATGCATCTTCATGATTACG----------TGCAGT--------CATTCCTTCTACCTAACTTTAAGGC--ACTGGCCGTTCTTTTCAAAAGC-AAGCAATGAG---AACTGATAATCCTGACCTCTCTATTTTTTTATCTCAGTAATGGATTTGGCTTTTTGAAGAAACTAAGATATTAATTTCAATAAACAATAAATAAGCATTTGATTAAATTGTACAAGTTGTTTGAACTACAAGGTACTATTATCTTCAGGTTCCATGGAAAATTGGgtagggagaagctcttgtactctatggaaccattgcctgctaatataatgttgttggcctgttaacttaggcagcaaatagggaggagttccagtacagaacgaagaatcagggacaggagatttgctctgaactctgaggaggagacccatgcatgaacctagaaagaaagtaaccagccatgtagtatt s bosTau2.chr6 42870942 1042 - 69624268 GTTCCTAATGTAAGAA---CTAAATTGAATTCTGCT---CAACAAACTGTACTCAGTTTCTCTGATTTATCATGAAACATTTCACAGAAAAAAGCCAATTGCTCCAAAAATGACATGAGAGAGAAATGAGAGGGAAAGAGACATGA-AGGAAGAGAGAACAT----------TATTGACAGTCATAAAAACATAGCTATTGCCCATGTGTTTAATAACACCAAAGAATTTAAACTTACTC--CAGAAGAATGTT--ATTTTTTGATCAATAAGATGACCTATTTGAATAGACTGACCTGATACC----------------CTCTGAGGTCTCCTAGTGTAACTAATTGAGGGAAATTTCATGCATTCCTTCAAACCCAGTTATAAGTGA--AGGGAGGAAGGAAGGAGATGGCAAATTAAAGAAGGCTACCGCATAGTAAATGTTGGTACACATTCATACAAACTGTTTTGGGGAATAATTTGCAAGACTGGAATTGCAAAGGCTCAAATATATATGGTCCTAATTATGTAAAAGCCATCTGTCCTTTAGTTACTCTACCTTACTATAT-TTGTTAGACATACTGTTGACCTAGATGCTGGTATACTGTCATGAGTAACTTATAATCTTTATAAATATATTCCTGTTTCCAAAGAAATTACTACCTTTACCAAAACTTATGAGAGAGATACAAGGACAGAGAGAAAACCTGctttcctcacctctggtttc-atagacccaaagatagtgggcttaagcttatatgaataatcatgatttcaaggcatttcctgcaattctcctgacattccttctgcctgattttaatacctattgcttacctgtttcaaaaattaggcagtgagtaggaatgCTAATCCTGAACTCTTT--TTTTTCCCCTCTataatagattcagcatttttgagaaaataatacctttatgtcagtgac---tgaaaaggcctttcgagacatttca--------ttaaatcacaa----------------------------------------aacagcctgtg------acaaaactaccgggtactgttattatctt----------------------caatt---------------tgcagatggaaaagcgaggga----------------------------------------------tagaaagagtgtagttaccttcttagtagt a score=2114 s mm7.chr5_random 1178745 1336 + 11523536 TACTGCCTTTAGCTACCAGAAGGTGACTGTTAAATTGGCCTTATGCCTTGTTCATACCCTGCATATTATTATGGTAAAAAGGTTTTAAACATTTGGGTTGTAATGATAAAATCTTCTTTCATCAAGTAGTTTGTGCAT-----TTCCATCAGAGATAACTGGCTCATAATATTTCCTC--------------CTTCTAATCTCAAAATATTGGATACAAAATAAGATAAAATCTAATA----AAATTAAGACAGCTTGAATAAAAACCAATTGGCATT----GATACTAGGTA---GGCAATTTCTTTAAA----------------ATACTAACACCTCAGACTAAAATAATGTAGGCCTGGGCTGCATTCAAGATCGCTGGAAGTACTTAAT--ATAGTTTCCCTG--ATTTTTTTTTTTAGCAGTTCTTTTGATGCTATGGATTCTCAAAATATCCATTTGAAAATGTTTTTGTGAGAGGT----CCAAAACTATGTAGAAGCTTTAATTCAATGTAGACTGCAGGTTTAATTG-ATATACTTAATTATACTTATCGATGTCTTAAATAACATTTAAAGAGTACACTTTTTGATAGATTATTTAATAATAGTATCAAGTG----TGACTTTTGTGTCAGAAAATATTTGTGATGGATGCTTTTTCCTTTAAATTTTGTTTTCTTCTTCATCGTGTCATAATATGCTGTTTTCTTCG--AATTATTTATCTAAA-TCATCTGTTTATTTATACTCAAATTTTCTGTTTGAACCAATTCAGGCATCTATTGACTTATACGTGGAATTAA---ATAACAAATAACTAGAATAGCATATCATACATGTAAAAATGATTGCGTTACTCAATTGTGGTGAAAAGACATTTAATATTTAAAAAGCACAATCATGC-ACAAAGTACTGAGACATGCCTACAAGAGACTACAAAAGAA---AGACCACAAGTTCAAGGCTTTCTTTAGGTAGACAGCTTGAAAGCAGCATGTTTAACTGAGAAAGTACTTGCCTTTAAAAAAGCAAGAAAAAATATAAATTgaactggagttataactcaccaatagagtacttgtctag---------------catttgtgagacaaattgtactcaattcctaTTATAAGaaataattaataattaattgttaataatGAACAATTATTTACCCAGAAATAAGAAAA-----GGAAGTAGGGTAACAT----TAATTATT----TTCTAGGAATGTTTTATATAAGAAGG---------------------------ACATTATAATAAATATTAAGGT--ATTGTTTTCATGTGTATATCTGTCTCTAAGT----CAACTTTCTGCCA-TATCT-CTAGAGCACACA-GGATTTATAGTGAATAATGGCATGAGAAATTAAAACATGAATGCACAGGCAGTAAATTATGATCTACTCTGGGTCATTCTGTC s bosTau2.chr6 42872028 1361 - 69624268 tactctctctatacaccag-----gcctgcTTG------CATCTGCCTTTCCACTAAACTACACATCTCCATGTTGGAATCATACTTATTGTTTATATATTGCTGGCCAAGTACTTAGTCACCAAGTGCTTTGTGCATCACAATTTTAGCATGAGTGCTTGGCTCATG---TTTCCTCGAGTGACTATTTGTCATCCAGTCTGCTAGTGATGGGTA----ACTGAATAAAAACTCCTGGAGTAAGTTAAGCCAATCTGATTCTATCTCCATTAGTAATTTGAAACACAAAACAAAAGACACATCCATTAAACTTGTGTTGATTCCGAATGAGAGTGCCCCAGAGCAAAA-GATACACACTTCTACTGCAT---AGCACCTGGGGACAACCTGGTTTGTAGCCTTCTTGCAGTTTCATTGTTCAGCATTTCTATT-----TATAGGGTACAATAATTTCCACCC-ATTATTTTTCCTTAAGAAGTGTACATATAACCAAGAGAAAGTTATAATTCAATATAGTTTTTGGCTCTCTTTTTATAACAGCTATTTTATTTATTGACATCTTAAGTAATATTTTTACAAAAT-CATCTGAACAGATAATT-ACTAATATCACCAAGTGATATTTACTCTGCCATCACCAACTTTGTCACTTGCATACTTATTCACATAA-TTTAACTTTCTTCTTCTAAGAATTATGCTAT-CTTTCATCTAAGGTAACAATTCACTTAAAAGCACTTGTTCTACAAAGTTCA---TTTTAGCTTAAATCTATTCTTCTATTTATTGATTTATCACCAAAATTAACAAAAAAAAAATAGCTAGACAAATATAGCTACCAAATTTAAGTGG-----------ACTTTTGATGAAAGAAT-TTTAACACT--AAAAATACAGCAGTGTTAAAAATTACAAATTCAT--TTTCTAGATGTTAGAAAAAAATATAGGGCAAATAGTTATATTTTTTTCAAAAT-----GTTTAGCAACAGCATAAGTTAATGCAAAAG---------------------GATAAACAATGAATT---CAGTAGTCTTGATTCAGTATCTGAGTCTGTCACTAAGTCCCTTTATTGTCACTTTTCTGGGGTACA--------AATTCCTAT------AAAACAATGAGGATGAGAGGTTAAAAA-------------GCCTGGGGACAGGGTGACTGTGAGATCTAGATTAAATTCTTCTGACCATTGCATTCTTAAGAAAGTTTTAAAAGAGAAGGCATATATGAATCTAATCTTTGTATTTAACATAGTGACAGAATATAATGTTGATAAATATCTTATATGTAGCTAT-TATAATTATTGCAGCTTATTTTCACTATCTTCAAAAGCAGCTATGAAGTTTTGAGAAAAAATCATATAGGCAAATTGAGGAAAAGCatacatacaattgaaaaagtgaaagtgttagtcattcagtt a score=20120 s mm7.chr5_random 1180228 1286 + 11523536 CACAA-----AGCTAATAAAACTTATTGG--AAAAAGATAAAATGGGTACTGTGCA----TGTAAATATAAACATATAGATTCTGACACACTTGCTACTATATACTAGCAGCTAGAAAA--GTACAGATGAGACATTAAGACAATGAATCTTTCTAAGAACATTTCTACAGTGCCATTATTCCTTTCATCAACTCTGTTATGATGGAGATGGAAAATTGCAATAACTGGTATGTTAAAACCAATTACACTGTAATGCAGAGATTCAAATCACGTTGACAATGGTTTAGAAATCAGTCAAGTTTATGTCGAACCCAGGCACTCCGGAGGGGTAGTGTCTGTAGATGCAAGTTTCCTTCCTTCTGAAAGTAAGGAAAATAGTCTTATCACTTGGTTGTTGAAGGAATGAAATAAAGACATGATTAATAGCTAGGATTCATGGCATATGTGTTTCTCTTCTACCTGTTTGTggcagatgcgactgagtctctgtgagtttgtggtgagc-ctgcactatgaagaaattctaagcaagagctacacactgagactttgtcttaaaatatacaaaTAAATAAATAAATACATTAAGATAGCTCAATCTAAAATCATTGATTATTTTGTGATTAATTGTCAT----TACTTAATTGGAAAATACCCCTCTGAAACATCTAACTTAAAGTTTTGATATACTGGAGGAATACCCAGT-----------------CTGGATACT-ATCATATGCATTATGCCCTTATGTT---TATATAA----AAGGCTA--AACTCTAAATCATGCACAGTGGATTT-TCTAAGAATCAAAACAAAAAGAGAGTTTTTCCTCAAATCTTTGACTGAAATATAATGAAATTGCATGTAATTATAAAGCTACTTCACTGAAGTCTGGACTGTCACAGATGACTTAAGGTGCCTAAGAATAGC--TGATTATCCCATTCACAAAGCAGCAATATTATTGCTTGTCATGATAAAATATTTATATGAGTTAGAATTTGTAATAATAATTAGC--GAAAAATATAAAATATTCATTTTATTGCCATTGTTCTCTAGCAAGTAAAAAGAAACATTGCAGAGAGAACATGGGGAAATATTTCAATGATAAGTTATACGTTTTTATCAAAATGAATTCATTTCAAAAATCTATATTAAATACAATATTTCACCTTTAATAGCTAGTAACTTGAAGTTTATTTTCAGGTttttct--tttcttttcttttcttttAAAATTTGTCTGTGCTGAT--TACTTGTGACCACGTTTGTGACACCAGgacacaaatccttcatccactcaagataacagggaattagagaa s bosTau2.chr6 42873563 1132 - 69624268 cacAATTGCCAACCATTAAAAGTGATTAATCAAAAAGTTGTAACTGACACTATATACAGGTGTAAAAAAAAGCCCATA----CAGATATGCATG------TATACAAATAAATAGCACATGAGATACATGAGGCATTATGATCATGAATATTTTAAAAGATGTTTTCACATTGTCATTATTTTTCT-----ATTTTATTTGGATTGAGGGAGTAAAAT----TATTGGATAAGCTAAAATTAATTTTGTTGCAAGCCAGAgatgcagagggt-ttgacataagctttgaaatcagtcagattgagctcaaatgcaggctcggctgcttactgatgtccttattctcaaaatttcttcatttgtaaaagagagataataaccatgtcatagggctgctgtgaggaggaaataaaa----------------------------------------------------------------------------taagtatataatgggcacagcacaat---------------------------TTAAGCCTT-----------------------------ATTCATTA------------------TCATTAGTGTTTACATGAAAAATTGTTCTATAGCACCCAGTTTGAGGGT--------GAG-----TGAGTTAGATTTTTAGTATATGAGAGGAGGGACAAGTATTCCAGGCAAAGCCAACTAATTATTCATAATATTCAATGTGCCTTTGTGTTAACCATATGATTTTAAGGAAACTAACTCAAAATAGTGCATAGTGTGTTGATCTAAAAGTCAG--TGAGAAGAA---TCTTTCTAAAAACTTTGACTAAAATATAATGAAGTTACATATATTTTCACAGCTATTGCATTGAAGTATGAACTGTCACAAATGGCTTAAGTTGCCTAAGAATATCTGTGATTGTCCTATTTATTAAGCAGC---ATTATTGTTTTTCACAATAAAATATTCATATGACAAAGAATT----GTCATAATTAGTTGAAAAAACATAAAATATTCATTTTATTTTCAATGTCCTTTTGAAAGGAAAAAGAAATGTAAAGGGAAGAACATCATT-AATACTTAAATGATGaa-tatattattttattaaagtcagtttatataaaagaattttgataaataaaattttttacttttagtaatta-----ttcaaatatttcaataaaatattataGCTGTTTTTTTGGTCATTTAGTCTTCATCTATCTTGTTCCTACTTGAGTTCACGTTTGTCA-AGCAGGGTGTTACTGCTGCAG----TCAAGA-AAAAAGAAAATAGAGAA a score=17695 s mm7.chr5_random 1242046 291 + 11523536 CTTACTTCTGCTTTTCCATTTGCAGTTCCTCGTCCTGAGCTTGGCACAAGTCCTCTTTAAGACTAATGGCTTGGTCACAAGATAAAGGTGGAGAGATGTAAGTGCCATCGACTCGCAGGTCATCAAAGCACGGCTTTCTGAAGGCATAGGAGTCGTCGCAGCAGTGGCCCACTCCTGCATTGACAGGCTTCCCACCGTGTCTTCTGCACAGCTCTCCAAGAATCAGCTTTGTCTTGTCCGGAAGAGAATTAAAGGAAGAGGGGTAAG-GTTATGTTTGTTG-------TCTTTTTATCC s bosTau2.chr28 25439009 299 + 34887537 CTTACTTTTGCTTTTCGGTTTGTAATTCCTCCTCTTGAGCTTTGCACAAGTCCTCTTTAAGGTTGATGACTTGGTCACAGGATAAAGGTGAAGAAATGTAAGTTCCATCAACTTGCAGGTCATCAAAGCAAGGCTTTCTGAAGGCATACGAGTCATCACAGCAGTGACCCACAGCAGCATTGATGGGCTCTGCCTCGTGCCTTCTGCATAAAGCTCCAAGAATTAACTTTGCCTTCCCCAGAAAAGAATTAAAATAAGAGCCATAAGTTTTGTGGTCATTAGGATTATTTTTTTTATCC a score=14194 s mm7.chr5_random 1242424 789 + 11523536 TTACCAACATCAGTTTTGTCAACTTTAAAGCCCTTGTATGTAACCCAGGGGATGTGAACC---------------TAACCAGACATG-------TTTGAGAGGAGACAGTCCT-CCCTTGCGGCTAAGTAAAGACAGTTGGCATGAGATGCCTGGAAATATCCTCCTCTGAG-----AATTTTTA-ATTCCAATGGTAAGTCATAGATATAACCAA-GAAATGAGGTTGATTCCGGGGGACCAGAG---AGAGAT----------GGCAGACATGT---CATGCGTGTGCTTACCTGGTCCTCCACGCAAGCGGACTGCAGCTCATCCCTTAATGGGCAACATCTCCTGGCAACCGCTGCCATCTTCTTCACGAACACCACCAGCTCCTGGGCAGACAGCTGCGGAGCTTTCTTAGTATAAAGCACCGTGAGCCTAAAAGAATAAG---TTCTTATTCCTGGTAACGGGTACACACA-CAAACAAGCATCTTCG------GTTTCCCATGATAGCCAACA-TTATCGCTAATGTAGGAGGAACCAGGCAGGCATTAA-------GCAGATCTCTTCTGCCTTGTCCT-------------GATGGCTCCGTAATTGGA--CATAATTGCCGAAGCACCACACTCG-CGCCCTGCTCCAACCTA--TCCTTCTTTATTGGA------------------CTTATCGGGGATACTGTCAAA----GCTAAAATCAGACAGCTCCTCTGAACAGAGCCTAGATAAAGCTCCTGGGGACCATTTGCCAGGTGT------------GAAGTAGGAGC-ATAGTGGCTCCCAGG-AACTGTCCCTGTTCTCCAGGTACTCACACCCCAGCGAGCAGGGGCAGACAAGAA--------CAGTGTGTGG--------ACAGAGTGCTGTGG s bosTau2.chr28 25440255 906 + 34887537 TCAGCAAAATCACTTTTGTTGACTTGAAAAGCCAAGGA-ATAGATCTGGAGATATGATCCAGGCAAAGGTCTGATGAATCTGACATTCCCAGTTTTTGCAAAGTGACGGTCTTACCCCCGCTGTCAATCAAAGACAATTGACATGAACCAACCAGAAAGAAATTCTCCCAAGGACAGAATTATTAGAGTCCAGTGACAACTCACAGATGTGTCCACTGACATGAGATTGATGCTGGGG-CCTGGAGTTCAGAACTTCCCACGATAGGCAAACATGCAGCCAAGGGTGTGCTTACTGAGTCCTCCATGCAGACAAACTGGTGCTCTTGATTCAGTGGGCAGCACTTGGTGGCAGCAGCTGCCATGTTCTTTGTGAGTACAATCAACTCCTGAGCAGACAGTTGTGGGGCTTTCTTCGTATAAAGGACTATGAGCCTGAAAAAATAATGTCTTCTTATTCCTGGCAATGACTCTGTGCCTCAAATGAAGAATTCTACAAAGTGTTTGTCATCAT--CTGATATTTGTCTCTGATGTGGGATGAGC----AAGTTATTAAACTGGGCGTAAGTCTTTTCTTTTAGTTCCTATTTCAGTGGTTCGGTGGCTTCTTCAGTAGACCCAGAATTCTCTTTCCACATCACACATTGCTCTACTCTGAACCAGTTTTTTCTACATAGGATCAAGGATTGTATGATAGCTAATGTGGGTGACTGTAAAATCAGACTCAGAGTAAACAGCT--TCTGAAATAAATATATGCACAGGTCTTTAAGG-CATGTATTAGTTGTCTGTGATATGtaggaacagaagctacagcagcaatcaggaaacatttcctggtct-catggactcacaccctagt-----tggggagataaaagagtacactcagtgtgatgagaggaacacagaatgctatag a score=8966 s mm7.chr5_random 1244005 540 + 11523536 TTAAAGTAAAGGAGAATGG---CCTGAACTGGGA-AGTAGTGATGAGGGTGGAAAGAGAGGACATGGTTTAAAGAGAAAGACCATAGAGCCTCGTGTTGAAGACCACAGACAACTAGCACTAACTGCTGCCTTGCCAGTAGAAATGCGTGTGGAGAAGGAGGCAGTTTCCAGAGCAGCTAGGTGGACAGGCGACCTTAAGGGGGTTAACCAGCTATGgcagtttcggcctcctgaggtacttgttagaaat---------------ccaggactttccgctgacttcctgagttggaaacgctgaattcggggcctgggtcgtaatgtcttctggaaggttctg--tcacactaaagtttgagagccacAAATCTAATCCTTACAGTGAGCACTG-----CACACTACATAAAAGGAAA-GAAAGCACTAAGCTGAAAGCCCTCGCCTGAAAGACTCAGGGCA----CTCTGTGACCCATTACTTTGGACTTTTAATTTAAACTCGATATTATGAGATGCTATGTCAAACTCAACTTTCCTCTAATGCCATGCGTATAAATAGACCATTCT s bosTau2.chr28 25441493 527 + 34887537 ttcaagtgagagagggtggtgacctgaactaggatagtggtggggaatgaggAATTCAGGGAAAGATTTGAATGAGAAAGACTACAAAAC-TGGACTTGAGGTCAACAGAATATCAGAATCATTTACTGCATTTATGTTATAATGGAGTTAGGGAAAGAATGTATCtgct-----------------------tcttaaagtatgacccctggattggcagtatcagtatccttgggtacttgttagaaatattaatacatattctcgtgcaccatcc-cagatttactgactcagaaactctagaggagagctgtgtttcaacaaatcctccaggtagttttgatgcactctaaagtgtgagagccaTGGGTCTAATCCTTAAACTAGACATTAACAAACACAATAGTTAAAAGAAAATGAAAACA---------AATATTCTGTCTGAAA---TGAGAATAATTTCTCTG-GTTCCATTATTTCAGTC-----ATTTAAGTTCAACATTA-GGGACACTGTATCAAACTGAATTTTTCCCCAGTACTCTGCTTCTAAGTAGACTATACT a score=21009 s mm7.chr5_random 1244588 1417 + 11523536 ATGCAATCCTTGATA--AATAGGATTCACTGAGCTCTCTGGAACCACTGTGTTT----GCATTCCCT-TGACAAATAACTAAGCCATCCATCAAG-----CTCTTGGTGGTCAAAATATTA-------------ACCTCGCCTGAAAAAACAGACAGGTAAGTGGACCCTGGATTCTAATCTCAACCGCAGCTTTGATTCCAAGT------CACAGCTCCAGGTCACAGG----GATGAAGGTCATGGTGGCCC---------TGCAG------GGCCAG--CCTGCTTTTCTCTCTTACCTCAGGG---------GCATCTCAAGACTGCGTTGGGG-GCAGGATAGAAACTGCCAAACTTACCTAAATATCTGTTGAATCAGCACA--GAGGGCTGG-TTAAT-----ACTCAATTAAT---------------------GGGTGGATGAACACTCTGAGCCAATCTTAGCATCAGGGACTAACCAACAGTCTCTGATGAGGATGAGTCTGGG--GTGTCTGGCGAGCACACCTGTCCTGGAAGCTGCTACTGCCCAGCTGCTTCTGTAAGTCACAGTAAGTTTTAACTTGGTCACGGCTTTCAAGTATCACTTTTTGGAACATCTCTTTCTAAAAAAAAAAAAAA------------------------------------------------AAGATGATGT---------------TGTTAGTGTTT------ATCCAGGGT--------CACAGCAA------------------------------TATGCCAG----GGTCATG--------------------------GGCAAGATTAAGAATTCATTTTATCATGACGTAAACTCATCTTTGGGCCTAAATGTTGTATTCTATAACCACAAGGCAAATCATTCATCAAGCCAGAAAGAG------AAAGG----GTATAGACC------TAGTTAGCTGGTATATGTGTGTCTGTTCATTGGTT-CATTTAATAATTAGGC-TTTTTATATTAGCAGTGTGCacacatacacctaagcacaaatatgcaggtatacagatagtatgtgtgctaaggagtcacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatacacacacacacacacacacacacacacacacacacatatacaTATATCAGTCATGGTTATAAAG----CCACAAA-GTACACTGAGAGGAACCAAATGGGATTTTCAGAGCTCAAAGTAAATC-AAAGTGTTCTCCCACCATG--AACCAGGCTCCAGTAAGAAGAAGGCATTAGTAACCTTGCAAGCTCAGCTCTTAGACAGGAGCAC-----ACACCCCTTAGCAAGCCAGCACAGTGTACCTTAACCTAATAAGCAGTGTTTGGCACAGAGAAAATTCCCTCAGATTTGCAAGCTGTTGGCCTGGATTTTATTCTTATCCCTGTCTTTACTGCCGGTGTAACATGAGGCAAATCGCCT-ACCCACCCGAACTGCTATCTTCTTACCCGCAGAACGCATGCAGGAGCTGCAGTGTTGCCTGTCTTACCAGGCTACCGAGAGAGTCA--------ACTGGATGCCACGGTAAGGCCTTCCATGCAGTCTCTGCCCACCCATGCCTCTGCATGGGGCCGTAGTTGTA-----GATCACTGTGGAAGCT s bosTau2.chr28 25442496 1563 + 34887537 atacAATCTTTGACAGAAATGGGATTTGCCAGGCTCTCTGCACACAGAGTTTTTTTGTGCACTCCCTCTGACTAATAACTAAGGTATCCATTTATTTCCTCTCTTGATGGTGAAAATACTGTAGTGCTATGGTGACCTGACTTGAAA---CTGACA---AAGT-----CTAGATTA-GATCTCTGTTGCAGCCTTGACTCCAAATTGCAGGCAAAGCCCCAAGCTAAATGTACAGGTGAAAG--GTAGAGGCTCCTATGAGATTGCAGAAAGGGGGTCAGGGCCTGCTGG-CTCCCTAACCTCTGGGCATTGATTGGAATCTGGAAACTGGACCAAAAAGCAAAGTAAAAGCACACAAGGTTATGTAGTCAAGTATCTTATCAAGATAAGGATAGCTGGGTTAATTTGGAACTGAGTTTTTCCTTGGCCTCTGAGGCTTTAAGGTTGAATATAGACTCTTAGCAACTCTTAGCAGCAAAAGTTAACAAACA----CTAACAAGCATAA-TCTGGACAATATCTTAGAAGCATACCTGTCGTGAAAGTTACTATCTCCTAATTTCTTACGTAAATCACACTGATTTTTCACACGCTCATGGCTTTCACGAACCACTCTTTGAAACATCCCTTCCTGAAAAATAAAGATAATCAGTGTTTGCCTATTATTGCGACAATATATCTTGAGGTTAGATTGCAAAATCATCTTCTGTAATAGTTTAATGTAACTGTTTTACTAAACCCAGGGTTTTATTTACTCAGTGAGTTTGGAAATGTTGAGAAAACACATTTTGCTATGACAGGAATGGCCATGTACTTTGTGGAGAAAAAAAGTGGGACAACCAGATTGATATTTAGTTTTCTC-TGATGTGAACTCATTTGTGGGTTTAAATGGCATATTTTACAAGTATGAAGCTAGTCTTTCATCAAGCCAGAAAGAGGTCCTTAAAAGTAATTTATAGATCAAAGTTCAATTGATCAGAATATGTGTGTATAT--ATTGGTTATTTTTAATAACACAGCATTTTTATGTAAACAGT--------------------ACAGATATGGAG----------------------------------ATATGGATGTAGATATAGAAATGTAGATACATATTAAGAAGAACGGTTTAATAAAAACACGTGC----------------------------CGGATGTGAAGCACTCCACAAATACACATCGAAGGAAATCACATGGAATTCTCAGAACTAAATACAAATTGAAAAAGTTCTTGAACAATGCAAATAAAATCCCAGTGGGAAGATACAATTGG---CCTTGCAGACTTAGCTCTTTGCTAGGAACACTGGTTATCATCTTAAGTAATCAGACCCAGTCCACCTGATCCTAATAAGCAGTGTTCAATA-GTAAAAAATTTACCCA-ATTTGCAAACTGCTCATctggatttaacccttct------------tgcctgagtggcactggactagtcacttgaaccttctgaaacccaatactttcatctataaagtgtagctagtacttctgccattacctatcttaccaagctgccgtgagaataaaataggacactggttgtaacg-------cTACTTTGTAAACTCTAAACACCCATCCTCCTAGAAGGGGCTATTATCATAGTAAGGGTGATTGTGAAATCT a score=11643 s mm7.chr5_random 1246847 659 + 11523536 AAGTCATCATTTTATATAACCAAAGTCAGAACTACCTAGGCCATGGTAAATCCATGGATAAC-TCCCAAAGCTGGAG-CTTGTGTGCACTCTAGCGTCTCCTTA-AAAGTGCACATCAAGAGTTGCTACCTGCAGTCAGGCAGATTGCTCACCTGAAATAGAAGCATCTTCCACAC----------AACATGG------------CACCCAACCAGGCTCTACTACC-------CTACTACTGTGTCAAACCGCCTTCCGCATTCACTTCAAACAGA------CACTACAAGTGTCTCCAGAAACA----GTCTATAAGACAG--------ACA---AGTCTCTATGCTGTGATGATCC-AGCTTTGGATAAGGAAGGAATCTTGCTTCTGGCCTAATGCTATAATTAACCAAAAACATGGAAAACTCGTTTTACAAAAGGA-AGTGGTTCTAACAGCACTAGAGCGTTCACTGTTTGCAAGCACTC-------GTGAGGAACGTGTTTTTTAAAAGTAGGTAAGAAAGGAATTCACCCCAGGCTGGTGGCATTCCAAGGAGTTTTCTAGCTTGCAACATTTCTCCAATACACGTTTGTATGTTTCAAAGACTCTTAAGATCACGGGAACCGCCAACTCCAGGTGTCTTCTTGAGTATTCATAAAGAAACCTGTATT-GTACGAGACACAC----GAGGAGACAAAAGTTAGAACTCGGAGGCCAT s bosTau2.chr28 25444416 691 + 34887537 AAGCCACTCATTAGCATAACAAAAGCCAGACCCTCCTGGCTCCTGG-AAAGCTGTGAATGACATCACCTGGTCAGAGATTTGTAAGGTCACCTGCTTTTTCATGTCAACTGCACAACAGGAGCCACTGCCTGCAAACAGTGTGCTTTCTGGCTTGAAACAGGGACAGTGTCCAGGTCTGCTTGGTGGAAATGGTCAACCTTCCCTCACCCTAACAGGCTATGCTTTCATGCTACCTGCTACCAGGCCAAGCAA------------ACTGAAAGGAGAAAATTGCACAGAGAATGTTTCATAAAACACAGAATTTATAAGGCAGTGACTCACACAGAGAGTCGCTGCTGTGTAATGATGTGACCTTCGGTTTAGGCGGAAATCAGAGTTTGTGTGTAGTGCT----TGCAAGCAGAACGTGCATAA------TCATAAAAGCATGGCACTACTAGCAGCACTGGACTTTTCTCTATTTGTAATCACACCACAAATATGAGAAATAGGTTTCT-----------ATAAAAGGAATTTACCCCATGGCTACAGCATTCCAGAGGATTTTCTAATTTACAGCATTTTCCCAGTAAATTTTGATATACTGTATCCACTCTTAAAATGACTGGAAGTGCCAACTCTGGGTGTCTTCTTGAGTATTCATAAAGAAACCTGTTTCCACATGAAGCAAATTAGAGAGTAAACTAAAGTAAGT-TTCTGAAGTCAT a score=6474 s mm7.chr5_random 1247606 445 + 11523536 ACTTAGAAACCTTGGGAAGCTGTCAGGAG---CTTCATTATCATACACTGAGATAAAAAAAAAACAAATCAATAAGATCAGGTGATTTT-CCAAAGCCATGTGGTACCAGATGGCAGATTCAGAACCTGAACCTGAAACACACTGGCTGACTAGAAGGTTCTGGCTCAGA--CTCTAGAAACTTCCATGTGAGATCAGTGTCAAGTATTTGTATGGAAAATATATATTTTCCAATTACCTTTGGGACtaattttttttcttaaaaaaaaaaaaaaGACTTCCTAGGACTGTACTTTTG-AGGTATTAAATCACCATCCCCCCCTTCAAATAAGCCACTAAGTGCGAGTGGTCTAGTCATAATCTGTACACTCATCTGGCTCACCAAAAGAAATAAAATGggggcagcagagatggcccagtggttaagagcacacatcgcccttccagagga s bosTau2.chr28 25445165 363 + 34887537 ATTTGAAAATTTGGGGTGACTGGCAGGGAGGATTTTCTGGCTATGTTTTGagataaggaaac--caaatcaataaaattacgtgatttttccaaagtcacacagcagtgaggggcagattca-aatttgaacctaaaatattctga-taacctttagttcttggctcAGGGTATCTCCTTACTGTTACTAGAAATTCATTTCAAGTGTGTAGATGAGAA---TATTTTTCCTAATGACCTTTGAGGCTAGATTTTAT---------------AAATATTACA---------ATTTTTGTAAGTATTAAATCACCATCTTCCCCTT------------------------GTC----CATAATCTATTCCTTCTTCTGGGTTACAAGAAGGAG--AAATTTGGACTATAGAA----------------------------TACTTCTAAAGga a score=31217 s mm7.chr5_random 1248395 1222 + 11523536 TTTTCAATACCAAATGCAAGTCTAGGAATTTATGTGAGTGGGGTTCAGATAGTAGTAGAATTGGATTTTATTAGCTAGGATCAGACATAATTTGTAAAATATAAGTGAGGTCTTTTAAC-------TTTGAGGAAAACTCAA-TTCTCATG------------------GCTGCACAT-------------GTGACTCTGGAAGCAATTTAATTGCACAGTGTTATTGTCTTAATATTATGTTTTGAAATCACTTTGCTTTGATGCACAAACTAGCATCTACTTCTGAATGGCCACCAATGATGCTAATGTCCCAACTCCTCAATGGTTAAACACTACG---TGTATTTGATAGTGTATATTAAGTTAACTAGAATAGAAGTGCTAGCTAAGAATACTAATCTGGTCCTCTTATTTGTCTCTAACTCC----CTCATCCCAATGCCTGTA-GCACTGAACTACCAACACACTCT-TTTTTAAAAAGCCTT-------TTTTCAACATTTGAGAATAAAG-GACCCTCTAGCTTCCCTTTCACGCACTGTT--CCCAAGCACCTTAA-CCCATGGTCCCACACGGCATCCTGAGTGACCCTGAACAA-------CTTCAGACTCTGATTGGCCAGATGGTGCATCACAGCAACCGTTTA--------------------------------CATTCAAGTTTGCAACATCTCCCAAGTGAAGCCATAAGT-CACTGG---------AAGG--------AAAGCTGCCTTACTCCTGTAGAAAGCTGTCCTGGTTGCCGCTGAATTGTTGGCACACAGACCAGTCTTCTGTAAACCTTGTGAGCGGCAGGGGTGAAAGGTCAGGCTTGTCGTCATTTTCTGAGTTGACGATGCACTCCCCGCGGAATGGTTCTGGCTGTTCACAGCACTCAGCAAACTTGCTGGATAAGATGGCCTGGTTAGAGCAGGTGTAATTCATAAGCTGGCGCTG-GGGACAGGAGG----GAAGTCATTCTTTGATTACTTTATCCTCAACTTAGTTTGCTGTCATT-AGAATAGCAGAGGAACACTTGATACcacacacacacatacacacacccacacacacacacacacacacCGCTTTGCCCGAGGCAAGTTGAATCCCA--AAGGGACATTCATCATTAATTCCTTTTGGAAAGAAATACTTGTCTATTTGACCTTATGTAGTATCTCAAACTCTATCGAAAATATAGGAGGAGATGGATTGTGTCAATGGTTCCATGTTTAGCTCCA-AAACTATAAGCCGAGGTTCTCTTGTCTTCCTGCTGTGCTTACTGAAGGGTCCCACTCTGAGAAGCACTT s bosTau2.chr28 25445734 1266 + 34887537 ttttcagTACCAAATGCAAGTCTAGGGA--------AATTGAGTTCAGATAGTGACA---TTTACTTTTATAAGCCAATGTCAGATGTAATTGCAGAAATATAGCTAACGTCACTCAACAGAAAACTTTGAAGAAAACTCAAATTTTTATGCTTTGTTAGAATTTAGTTGCTCCAAATAATACTTTACACAGTAACTTTGGAAATATTTCAATCACACAATAATACTATCTTAATATTGTATCTTGAAATCAGTTTGCTTT-ATGACCCAAATAATTTGTACTTCTTCATGGGCACCAGAGATGTTAGTATTCCATCTCTTTAATCTTGAAATGTTATGCAATGGCTTTGATAGTAGGTATTAAAATAATCAGAAGAG-----CTGGCCA----TACTAATCTGAGGCCCTTACTTAAACATGACTCTAAGTCTCAAAGCAAAGCTTGCACACACTTGAC-----ACTCACTCTGTTTTTAAAAATTCCTATATTGGTTGTCTACATTTAGAACTCAAGAGACCCTCAA--CTCCCCTCCAAATGCAGTTgatccaaccacccaaagcttacattcccagatggc--cacaagtagctagagccaaatagtagctgccaccttggatt--ccacagagcatatcttctTGGCCATTTAACCATTGACTGATATTGACTAGCCTCTGCCATCATTCAAGTTTGCAACTTCTCCCAAA-GAATCCATAAATACAATATCCCTTTATTAAGGTTTTATAAAATGCTTTATTACCCTTGTAGGAAGAAATCTTGCTTGTCAGTGAATTGTTTGCATACAGACTAATCCTCTGTAAACCTGCGATGGGGCAGGGACGAGAGATCAGGTTTGTTGTCATTTTCCGAGTTGACAATGCATTCTCCTCGAAATGGTTCTGGCAGTTCACAGCATGGAGTGAATTTGCTAGATAGAATAGCCTGTTTAGAGCAGATGTAGTTCATAAGCTGACTCTATAAAACAGAAAGAGAAGCAGTTATT-TTTGATGACTTCATTCTTA------TTTATTTTTATTGAGAAAAGCAGAGAAAAACTTGGC--------------------------------------CTCGTATTGCTTTTTTCTTGGCAAACTGAAAAACAAGAAAGACCATTTAT-ACTGACTCTTTCTAATAAGAAA-GCTTCTCTACTTGACCTTATTCAA-GTCTCACAGCTCTCAAAGAACTTAAAGGAAGACAGATTGTATTACTGTTTTCAAGTTTAGCCCAACAAAATACAAATAAAGAGTTTTTTCACTTGCTATTGTTATTGTTTTAGGATACCAGTTGAGAAAACATTT a score=5360 s mm7.chr5_random 1249689 341 + 11523536 ATGCACAGATAATCGCTTATATGTGAGGATTAGCTAGTCTCTACGCTTAACAAATTCAT-GACCTACTCAAGGAGTC-AAATAACTAAACCCAAAAATCAT-------------AATATTTAGGAGCTCAATATG------ATTCTTCAGAATAAATCAGAGAAGCTTACAG-----GCAGGGTGGACCGTCACAGTGAAGGTCTTCAATGATTCAAGTCACGAAGGACAGATAGAAGTTAATTTGAAACAAGTGAAAGCATCTAAAAGT---CTAGAATTATTTTTTCTCATGAGTATATAA--AATCTTAGAGGTAAGAAAGCCATGG-----TTGGGAAA---------GGGTCATTTGAAAGTTGTTGAGAA-AATTAGTTAA s bosTau2.chr28 25448815 373 + 34887537 ACACACAAATTAGTACGTGTGTATATGAACAAACTAAACTCTACACTTAAGGAACTCACAGGTTTAGTTGGAGAGTTTAAATAATTAAACAACAAAATAATGCATTATAAAATAAATTGTTAGAGA---AATATGTGTATTATACTTTGGGTGAGAAAAGA-AAGATTGCAATCCCAACTGGATAAG--ATCAGAGTAAAGACCTTGTATGATTTCAGTCTTGAATGACAAATATAAGTTAGTTGGAAACAAATGGAGAGA--AAAAAGCATACTAGAACTA----TCCATATTGGTCTATAAAGAGTCTTAGACGT--GAAGACCATGACATACTTGGGACATGATATTTTAGGATATTTCGAACTTACTGGGAATATTTAGTTGA a score=2560 s mm7.chr5_random 1250278 243 + 11523536 GATAAAAATCTAGGAAT-------------GATCAACCCAAAAGTTGAAGACTGAGAGTGGTGAGTGGAAGC-AAATTGC-GAGTTAGTTTGAGACTCCCAAAGGACGCATGCGTGCTGGTTCACTGGGAAGCAGGGGTGCTCTC-------TGCTCGCA-CAAGCGCTTTCTATCTCCCTCCTGTCGGGGAGGAGAGC--TGAGTCTCCTCCAGGCAGCAGATCCAG-GAATGAAGC-----ACAGCCTTTTTACCGTCTACTTGTGGCTTCT s bosTau2.chr28 25449188 267 + 34887537 GATAAAGATCAAGGGATCAGGAGAGAAGGAGAATGTACCGAAAGCCTAGATCTGAGAATGGTAAGTGGAAGCTGCATTATGGGGTCAGGTTGAGATCAATAAGGAGAATGTCTACATTAGTTC----GGAGACAAGTCTGCCCTCAGTGGCTTACTAGGATCAAATCTGTTTCAATAAAGTCCTGTTGAAAGGGGAGGCATTGGG---CCTGCGGGCAGTAGTTCTGGCGAACAAGGCTGGCAAAGGCTCTGTCTTCATCCACCTATAGATTCT a score=9858 s mm7.chr5_random 1254191 475 + 11523536 AAATAATTATGAAGAAAAAAGAGCTGTCTTACCCTGCCCAGGGCACACACTAATGTGTTCCCCTCACAACAGGTCTCATGCAGATTTTTAACATCCATGGTCAATTTGGCGATTTCAGAAAAA--TTAGCTTTAGGTTGCTTTTTGGTGAGTAGAATCAACTCTCTGTAAAGAAAATTAAGTACATCAAAACATTATATTATTTTTAGAATAAGCATAGCATTCTGTTTTTAGTAATTAttttctttttgaaattataatataattagaacattttctctctccctttcttccATATTTTGAATTTCTACTTCAAGGA---ACCAAAAGTATCTAAATGCATTAGCAA--GTATTAGGAAG--------------TGTTTTCAACTGCTTTGGTGATGATGTGCAGACCCACACAAAGATC-AAGTCTCAA--------------------TAAT-GTG-AAATCCGGACATCTTCGTCATT------------TAAAGAAGCTGAGGCATTGAAACGTACACCTTGATAG s bosTau2.chr28 25455316 446 + 34887537 AGATGAGTTTTAAGAAAAGAGAAA-ATCTTACCCTGCCAAGTACACACACTACTGCATTTCCTTCACAGCATATCTGA-GCAAATTTTTAATATCCATGGACGGCTTGGCAATTTCAGAAAAAAATTAGCTTTAGGTAGCTTTTTAGTCAACAGAACCAATTCCCTGGGGGGAGAA--AAGTGCAT--------TTTTTTATTTTTTGGAT--------------------------TCAATTCTTTCTAAAATTAG-----------------------------------------------TTCTAGTTCAATGAGTAATCAAAAGAATAGAACTACATTTGCAAACGTAGGATGAAGATAGTTGCATATTATGTTTTCTATTTCTTCAGTGATAGAATCCAGAGCCATACAAAAATCTAAGTCACAAAATGAAAATTATTCAGTTCATAATCGTGTAAGTACGGTCATTGTCATTACTCAGATTATTGCTTAAAGAAGTTGAGTTGCTTGGACAAGTACTTTGGGAA a score=-1361 s mm7.chr5_random 1254733 224 + 11523536 TGTCAAGTCTCT--------GGAGTTTCTCTGGAAA------------------------------------------------------------------------------------------CAAAATATCCCTGCCCTTCAGGAACT------CCAG---------TGCTGTCACTCACTGGGGGTGATGGTGATA-AGAAAAAATACATGAATTCAAGGT------------------------------GGAGACGCTG-----CATTAAGGCCTCCTCC--------ATTCCTTAGTTCCTAGAGAAAAGAGGATATTT--ATTTCTCTGTTCTTTATTATAAAGGGAGATTCAGCTAATCTCTGcatcatcgtc s bosTau2.chr28 25455942 376 + 34887537 tgccaggtccttctgtccatgggatttcccaggcaagaatactggagtgggttgccattccttcctgacccagagatcgaacctcgtctcctacttggcaggaggattctttaccaatgaaccaTGAAAATTAGGCTTGCCTTATAAGAACTGAGCTTCCAGGCAATGCGATATTGTCCTAAAATGGGTAAGAAGGTAATATAAGGAAGACGCATGCATTCAGGGGTAAACAGAAACCAAATCTGGGCCAAGAAAGAGACACGTTGAGTGACATCAAATTCTCCTCCCACTCCACACTCCTCTATCCCCACCCCAAAAAACACCACTCAATTTTTCTGTTTTTTGTGACATTAG-------AGCCAAAATCTTTCTTATCTTC a score=13879 s mm7.chr5_random 1255089 619 + 11523536 tgccatgcccagcctttataagagttgcctaggttatagtgtttcttcatagcaatggaaacccaaactacggcaAAAGGGTTCCAGGCTTATATTGACAAACA---GTGTCCAAA-------TGACTTTTCAAAGTAGTTTAGCCAAAACAGATGACATAGCAGCAACAGAACACACGGATCCATGCGGGAAACTTACACTGCACTTGCTACTTTCTCGTTGAATTTGGTGCCAATTTCACATAAGTGATGATGTCTTGCAGATATTCCTCTAATGTATTTTCTGATGGGTTCTAGCTGCAAATGGAAAAACAACTCATTAAAGAAATGTGTTAGTAACGGATAACGTTAACAACATCATTGGGAAAAGATAGAAGATTAAAAATCATCA-ATGTGTCCTCACCATTTAAAAGTCTTCAACCCACTGACATAGGAGGGGATAACTATAAAGAAATAACATGACAAGGCTTTTGC-------------------------------------AAAAATAGCACCTCACACTCCCCAAAGATCATTTGTCTAAAAGCTTC--------------------------------ATAAACAAAGTAATTTCTACAGAGCAGCCAAA--GAGACTCAAAACTGCCCTACAGCTGCACTT-TCTTTTATCCAAGTCATTAACCATTTTATCCTGGGCGTGACTCCAA s bosTau2.chr28 25456476 668 + 34887537 TGCAATGTGCAGC----------ATAGCCCAGGGTGCCCTGTTGA---ATAGCCAAGTAGCCC--ACCTGTAGAGAAAGGAA-CCAGGTTTGTGCTGAGAGACATTAGTGAACAAAAGATAGATGATATTTCAATG-AGTTCAATTAATCCAAA----------GCAGCAAAGTCCACAAATCTAAGTAAGTAACTTACACAGCTGTTGCTACCTTGTGGTTGAATCTAATCCCAATTTCATATAAATGGTGATGCCTCAAAGATATTTCTCTAACATACTTTCTGATGGGTTCCAGCTGTAATTAGAAAAATGACTCATCAAAGAACTATGGTAATAACTGAAAAAGTTCACCTCATGGTTAGTAAAGAACAGAAAA--AAAAAAAATCATATATCTTCTCAAAATTAGAAAGT-TTTAATTGTCTTATCTATGA--GACCAAATGTAAAAGCATAATTTAGTGAAGGTTTTGTTTTCTTGTTGTTGTTTTTTGGGTTTGTTTGTTTTTTACAAAATAGCA-CTCAC-TTCTCCAGAGATCGCTTGTCCCTTAACTTTTAGACATTTGATGTATAAATGAGAACAAGACAGTGAACAAACAAGAATCCAGAGAGCCGATAGAATAAATTTCAATAATGTCTTACAGTTGTATTTAGGTTTTATTCAAGTTACTAACCCTGTCATCTTGAGCATGTCTTTAA a score=8706 s mm7.chr5_random 1256099 459 + 11523536 TTATTTTGAAATGCTAGACAATGAGACAGGGCATCAGTGTGTA--ACCATTGGCTTTCAG-GCTTTAATTAAAGTGAAACCAAGAGGA----AAGAAATATGACCA-CCTGCTCAGGAACTGAGAATCGGCTTCCGAAGGAACCAGAATC--------CCCCAGGATAATAATGGG---GATGTCAGAAATATAAACAAAT----------------------AACTTTAATGAAAAATAATGCAATCATGGAGTTCTTAGCCTGTGGCAAAATCTCTTCAGATACCCCCTTTGTTTTTTAATACACAAGGAAGAA---------CTAGGTAGGAGAAA----------GAGATAAAGTTATATGAATTTCAGAGGAAATGAGGTGGTTTCTTACTCAGAAAAATAACGACATCAAGACAAAACCAGTCATACTTAGCCTTGAGTTTTTCACCATAATGATTATCAAATTACCATTAGTTTTCAGCATGGCACGTAGAAAATCTGTTTGGTGGCACCTC s bosTau2.chr28 25460844 489 + 34887537 TTCTTCCAAAATGCCTGGTAATAAAACA-----TAAGTCTACACAATCACTTGTTTTTGTTGTTTTTAATAATATGAAACCAAAAGGAGGAAAAAAAAAAAAACTGTCCTGCTTAGGAATTCAGAATTTGCTTCTGAAGGAACTGGAGTTAACTCCAGTTCCAGGGGAAGAATGGAAGAGAGGTAAGAAATATACgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtAGCTTTAAAGAAAACTA---TGATTATTGCATACTTAGTATATGCTAGAGACTCTTTAGATACATTATTTAGTTTCTAA--CACAAGGTAGAAAATAAGGAGCTCAATAGGAGAAACATAGTTAAAGGAATAGAGAAATAAGGGTTGAGAGGATTATGAGAGAAATTCTCACTGAAGAGATCAAAGAAAACAGCAAGAAAACGGTGGTACT-------------------ACACTGATTATCAAACTACTATTTATTT-CAGCGTGACCTTCAAAAAATCCATCTGGTGTACCTTC a score=7324 s mm7.chr5_random 1256634 358 + 11523536 ATTTGTACACACACACAAATGCTTTTATCTTAAAATTAACCACTGGTTTGCATCTAT------------------CTATCCAATGATGATCAAAAG---------------------------ACTAAAACA----TCTATCCCGTGTTTTCCTGAAAAGGAATTGATCATTGTTAtcccagtaagaagtaaagtctacatacaggccctctccaactggtgaggtcttgcggtgctttaaacaggagaacctgatagaaatgaattaagaggctagattacaaatggcaacacagcctcatccttgtctactacaagattccttccagaagcttttggctatgcgtaagcaatccagttgccctctggccaccatgctgtgaaacagcccaaAGTAGCGAGGCAAG s bosTau2.chr28 25461558 375 + 34887537 ATGAGCATACATTAAAAAGTACTTTTATCATGGAACTAATCACTGATTTACGTCTATTCAACGAAGGAGAAAAGGCTATCTGGTTAAAATTAAATGtgtggctaacagtattttccagggttagctaaaatagtcttctatctcatgtttttcttacaatgagctt----ttgttac---------------agtgtatttactttctccttcaaa--------gttttgtggcatttcagccaatagagtataataagggtaaattttgagacttggtcattaaaggccatacaacttctgctttatccataagaatacgcattcttgagactct-ggccatatgttagcagtccagctaccctcgggctgccacgctgtgaggaagcccaa----gccaGACAAA a score=19383 s mm7.chr5_random 1257209 845 + 11523536 aattttgggttgtttggttacctagcaacagtgcctggaaTGCTTAAATGTTTATTTTCAAA----------ACTG--TCCTGCTTCTCACATTGCAAGACTGACTACATAGCT--------Ttcttttctaaaacggactct-atttactaggtccagagaagagcttgagattctgcatctctggcatgatgtggggccatgt-catgctgtttctctacaatccacaatttCCATCGCAAAGCCCTAA-CAACCGT-GCTACATACACAAT--ACCTTTGTCCGCAGGCACTCTGTTTCATTCTCTTCTTGACAACATGACTGAACAGCTGTATCATAGCAAGCAGACATGCTCAAGATAGTGGGTCCGTATAAGAATGGGTGTCTTCTAGATATTTCATAGCTGAACCTGTAATTTGACAATTGCAAAGTTGTGA-------------------------GCTCTGCCGTTGAGGCCCA---CCTGACAATGTCCTTTCAAACGCACAGCATTTGTTCATTCTGTGTCTGTCTGAAACTTCTGGAAATCC-CAGTGATTGAGATTTGGTAGAACTTGGCCTAAAATCATCAAATGTTCACTATGAACAAATCACC---AGAGTCACTCTCCAGGTGCAAATGAAGTG----ACTGCGTCAGGTGGGTTGAACATAATGAGAAACTAC-------ATCTCTCCACTTCCTTAGAGAGACAG-GCAGGTAGGAAGTTTAATAGTCTAAGCTGCAGTGATATGCAGGATTGTTCATGTGGGCCA--GGAACGGACTTTACAAGC--ATTGATGGTGGTCAGAAGTCTCTCCAGGTCATCCAGAAGTTCTTTCTAGACTATCACAGTCAATACCATTGCCCT--GAGTCCTGCCATTCAGTATGTTTGCTTGTTACTAAAT s bosTau2.chr28 25461984 903 + 34887537 GATGTTGGGGTGTTTTGCTATGCAGAAATAATAATTGAAGTA-TTAAATATGTATTATGAAGTGATATTTGTGCTGGATCAtgcttctcaaattttgag---gactatatgaatggcctgagtatcttgttaaaatgatgtcttattcagcaggtctggagaagagcttca--ttctgaatcttta-caagctgcaaggtgattcacatgctgccagtccacagtcctcacttagcataacaAGTTCCTAAATAACAGTTGACATATAAATAGTTTACCTTTGTCTGGAAGCATT--GTCTTATTTTCTTCATGGCAACATGACTGAACAGCTGTTTCATAGCAAACAGACATGGTTAAAATAGTGGGTCCATACAAGAATGGGTGCTTCCTAGAAGTTTCATAAATGTATCTATAATTTGACAAATGCAAAGTCATAATAATGGAATTATTATGGAATAATATAATTTGGAATTCAAGAACATGTTCTGACACTGT-TTCTTAAGAACTTATGATTCATTTAGTTT-TGTTGACCTGAAACTTCTAGAATTTCATGGTAACAGAAATGGGATACCACTACACTTAAATGTATCAAAGGTTCACAACAGACAGGTCATTGTGAGGTTAGAT-----AGCGCCCAAGAAGTAATCCACTGTATTTTTTGGGCCAGTGAGAAAAGGAAATCACCAATTAAAAGTGTTCATTT--TTATATAAGTAGTAAAAGTAGAAAGTTCAATAGTCTAAACTGATTGTAAATGGAGGATAGTACAGCTGGTAAAGGGGAACTAAATTTAGAAATTATTTGTGGGTGAAGAGGAATCTTTCAAGATCATCTGTAAGTTCTTTCTAGACTACAAAAGTTTATGCCATTGTCCTCCAAGATGTCTCACTCAATATTTGGGTTTATGACTAAAT a score=7562 s mm7.chr5_random 1259014 461 + 11523536 ATAATCAGGTCACCACCAGGCTCCCAGACTCCAGATCTAGCAATTGGATTTCTGCCTTAGTCCTCACGCCCATGTCTGACTCGAGTCATGTGGACACTGCCACATTCCATGAGAGCCACAGTCTCGTGTTCCTCTTGTCCTTG----------------------CCTGGCTCTAAACCCTAACCACCTGTTAGCACCTGACTCTCAACAGAGGCAACTTCATGCTAATTAGGGTTCCAGACTTGATCTTGATAATACC------------ATAGTCCTA-CCACT-TACCCCAGGATTACACGGTCCATTTTTTTTTTTTACCTGGAAATTCACCTCTGTTTAATCTACAATCATTGCTGTTTCTTGGCT--CAAATGACAGACGGTATGCCACACCTCTCAGAAGCTCTGCCTGCTATCTATGGATGCATCTCACTAGGACTGGGGC----------CTGTTACTGGC-CTCTATCCCCAGTGTGCTCTGCTTTTTGTGGATTTCCTA s bosTau2.chr28 25466877 481 + 34887537 ATAATAGGATCAGCACCATGCTTCCTG-CACTGTATCCAGCACTCAGATCCTTCCTTTATTCCTGGTGTC--TGTCTGTCTTGA-CCAAATGACCAGAACTGCATTCCTTGAGAACGGAAGCTTTGTACTTCTCCTGTCATTTTTGTCTCTCTCGGTATTGGTTTCCTGCCTCTGAACCCCAGATACTTTCTTGTAA--GTCTCTAAAGATAGACATCT--ATGCTAACTAAGACACCAAAATA-----TGAGCACACCTACCCATGGGCTATAACGCTATCCACTGTAGGCAAGAATTATAGAATCAGAGTT---------CTTGAAAACTGATCTCTGTCCAATCTACCCTTATTGTTTATTCCTAGGTTCCCAATGACAGAGTCTATG-----CCTGTCAGATATCCCTCCTGTTATACCTCGGTGAACCTCCCAGGTACTGGCCCCTTGCCTAAGCTGTTACCTGCGCTCTATTCCCA--ATACTCTGCCTATTATGCTTTGCCTA a score=16330 s mm7.chr5_random 1260151 626 + 11523536 AATATTGTTTCCTGCTGCCCTTTATAATC--------AAAGAGGCAAGCCCTTTGCAGGGTTTACTC-CTTTTAATCATCCACAGCAGACACTTCCAGGCCCTATAGGAT-------ATCAACTGGCATCCTTTCTAGAAGGATCAAAAAAGAATCATAGCTCAAGTTTCCATTTTAATTCCATACAAGAAAACATTGCTT--TCAGAGAATTGTATATGCGAAAGGGGCTGTCTTAAAAATTGGAACATATTCTTTGTAAAAGACCATGGCAAAGAGAAGAAGGCTTACCTCTCCTT-CAGGGACACATTATTCTCTGCAGCCACCTCACAGGTCAGTTCAGGCCTTGGAATCAGGGGTGTATCATGGCTGTCTGCGTCGTCTTTCTTGTAGGAGAGGAAGCACCTGAGTCTTGCTGCAGTTTTCATCTTACAACAGTCAGTGAACACGTGACTATCCACCAGGCCTTGGTTGTTGCAAATGTGTATAAGGAAGGCAGCCACCTATTGGAGGGAAGGGGGGCATACAGGGGAAGTGTGGGAGACG-ACATTCCTCACTATAGGTGAGTT-------------------AAACTAGGTACATCATATGCTGAGCTTTGGATCCAATAATATCTGGACGCAGAGACTTCAA---------TTTTATATGTTTATT s bosTau2.chr28 25467374 658 + 34887537 AACATCATTTGCTACTGGTCTGAGCAATCTAACCCTTAAGGAGGTGGGTCCTTTTCAGATCCTAGTCATTTTTAGTGTTTCATGACAGACATTTTCATGCCCTCCAGGGTTCGCTAAGGCCATTGTCATTCT-----GAAGGA-AAAAAATAAATTGTAGCTCaaatttttactttatttttatataataaaGCATTGTGTACTCAGAGG-TTTTATCT----AAAAATCTCTCTTCAAAATTAGAAAATACTCTTTTTCAAAGAC-GTGGCAAGGA-AAGGTGACTTACCTGTCTTTTCACTAGCACTTGACTCTCTTTGCCCATCTCACAGATCTGCTCAGGATTTGAAATCTGGAATATTTCACTGTAACCTGCATCATCCTTTTTGTGTAATAGGAAACACTTATGTCTTGCTGTCTTATTTATATTGCAACAGTCAGAAAACACACGCTTGTCAGCCATTCTTTCGTTATTGCAAATATGCTGTAGGAAGGTAGCCATCTGTAGAAGGAAATAATAACATG-AGGGTAGGCACGTATGGTTCACATTCCTAACCATAGAAAAGTTCAGGAATTATAAAGAAAGGCAACTGAATGTATAATCT--TATACTCCATATCCAGTAGTCCTTGGACATAGCTCTTTTGAGCAAAAGTCTTTTAAAAGGTTGTT a score=10967 s mm7.chr5_random 1261377 447 + 11523536 AATTCACACCTCCTCGTTGTCGACCACAGAGAATCCACCATT-TCCCCTTCCCTATGATGTTGCTTCATTCGCAAGCGATCGAAAGGCTTTTGAAAAAAAATAACTAGATATCATTCAGAATACCCAGGGC--------AGCAGGATATTTCTAAGGAGAACTATCCAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTGCTAATTTAGTTTATTTCCTACTCGTTTTTAGTTTTGTTTCCATGGGAACATATTTTAAGAATTGAACTTTGAGTCAGTGTGTGCTCACTGTCAGCTTTACAGCTGGAGATGTAACAATTCCCGTGTTTTCAAATGTTTTTAGGTGGCAGTCAACGTGTGGTGTTTGGTAAACCTCAGCTGGCAAGTGAGTTTTATATTTGAGAATAAATACAGAAAAAAAGGTCATCTTCTGCAATGGAAAAAAAAAGAGAG------------------------------------------------------AGAGATTGTTCTATAA s bosTau2.chr28 25468032 487 + 34887537 AAGTCTCATGTGCTAGACATTGGCCAAATAGAATTTATCATTCTCTCCCTACTTATATAAGTGTTTCATTTTCATACAGCTGAGAGGTATT------AAAATAA----GCATAAGCCAAAATGGCCAGGGCCTAAAGAAATCAAGGAATTTTTAATAAGAATTATCCACCAAGAAATATGTGATG--GCTTGCTTTCCTTGTTTCATGATGGCTTTTAGTTG-GTTTCCATGGGGACTTATTTTAAAAATTGAGCTCTAAGGCAATGTGTATTCAGTGTCAAATATTCTAACAGAAATGTAATGATTCA---GTTTTCAAATGCCTTTGGATGGCAGTAAATGTGTGGGATGCTATAAACCTCAAATGGCATTCCAGATTTA-----GGGGATAAAGTCAGAAAAA--GGTCATCTCTTGAAGTAGAACTAAGAAGAAATCACTGTACAATAAGTGCAGAAGTATTTCTTGTAAAGTGTGTTTCTAATAAGGCTAATGATTTTTCTATGA a score=22275 s mm7.chr5_random 1261875 1203 + 11523536 CCCTTCCCTAT------TCAGAATCTAGCACATGGTACACA-----CACACAGACAAGAGATGGAGCAGGAAACTCCACAAATAAAGGAGGAAAGCTACTCCTTATGTGTATGTTACATTATTTAGCATGAAAATAACTGATCCCGAAACTCCGCATTCTAAGA---GAATGATAGTGTTAATCAAGAGCTTCCCAGGGAGGGGTTATgagatggcccaatggctgaaggcacttg--ctgccaagtctgacaacctgagttcaatctctgggtcccacacagtcagaggagagaattaat-ttccacgagt-tgacctctgacacacacacacacacacacacacacacac-------acacacacacacacacaGTTTAAAAACTAAAAATATTTCTACTGAAATTGCTGAGCACAAGACACATACAGTTTTATAATGAAGCGATAATAATACCCCTAATATTCTAGTGACAGAGAAAGGGATCTGTAAAAATATGT---------CTCTTTGGCATATCCTTAAAGAAATTCTTTTTAATTAATTTAAATCTCAATTT----AGTCTCTTGGCGTGAAGATGCCAGACACCAGCATTTTGGTGGCTCTGGCAGAGAGACCAACATAAATAAGCTCGTTGCTCTTCAGGGCTGTGATTCATTGATTCATTCTCTCGAGTGCTTGGCCCTCAGAACCTGGGCTCTCAGAGA-AAATTTGGTTAAATATAGATTTAGAAGCCTACAAAGATTATATCTGGAGTGTGATTCATATGTATACTCTTGCTTTGCAATGTTCTGCCTACTTATTCAACCA------------------TCTTTTGTTTACCCTCTAGCTCAG---------------ACAGGAAAACAAAGCAGCGCACGAAACACATGATCCACCTACCAGTTGATGAGCACACTCTGAGGGTGACTCAGGT---TTGAGACGCTTACACTTTTCAGCAAGCTTCAGCAGCTCTTTAGCTATGGTTTGGACTTGGTCATAAGCTGCATCCTGAAGAAACTGAGCCACCATAATGCTGACACTGAAACATAAGTTGTGTGTGTTGAGCATGCAACAATGTTGCGTT------GCCCCCTTTCTTCTTTGTTGTATCATCACCA--CCACCACCATCATCACCCTTCTCCC---CAAAATATTTTCCTTTCAAATTAAAAACAAAAACAAAGAATATGGATAAACAAACTCACCTGACTCCTAAGTTCTCCTCCAGGTGATCCTGCCCACTGACATGCTGCCTGGCTGGGAAAA s bosTau2.chr28 25468734 1183 + 34887537 cccTTTCCTATGACTACTTAGATTCTAATAAAAAATAGACAGGTTTTAGCCCAAGAAGACAGAGTGGAAAAAAACCTACAAATAAAGAAGAAAA--------CTATTTGTAT-TTAAATTGTTGA-TATGAGAATAATTGATCAAAAATATGTAGATTATAAGACTTTTTTGATA-TGTTTATTAACAATTTTTCTGggac---ttctctggtagtccggtggttaaa---acttcaccttccaatgcatggggtgcaggttcaattcctggcc----------------agggagttaagattccatatgcctcacagccaaaaaaCCAGAACATAAACA-ACAAAAGCAATATTGCAACAAATTCA-ATAAAGAGTTTAACAAAAAAGAATTTTTATAAT------------CACAAAATACACAC---TTTATAA-AAGACAATAGTAATTTTCAAGATTTTCTATTAAGTGGGAAAAAAACCTATAATAATATTCACTTTCTTCTTCTTTTTTATATTCTCTTAGACACTTTTCTAAATCAGT----ATTTTAATTTCCCAGGAATCTTCATATGA-GATGTCAGACAATAGTACTCTAGTGACAGAGAAAGAGCAATAAACTTAGATGAATAAGCTGACATTCTAGGGTATAATTCATT--------CTCTCAAGCCTTTGGTTCTCAGAATGTGATCTCCTAGATATGAGCTTAATAAACTGTAGGTTCATAAACCTGCAAAGATTATATCTTGAGTGTGACTCACGTACATATT-TTGCTTTAAAATCGCTTGCTTGATTATTCAATCAACCCATCCCATAGCAACATCTTTTGTTTGCAATTTAGTTTCATTTTTTCTTTTTTTAATAGAGAGAAAAAG--------GCAGAACATGATTCACCTACCAACTGGTGACAGGATTCTGAAGGTAATTCATGTGACTTGAGGTTCTTGCACTTTTCTGCAAGATCCAGCAACTCTTGAACTGTGATTTGTACTTCTTCATAAGTCAGTTTCTGAAGAAACTGTGCAACCATAATGTTAGTACTGAAACAGAACACTTGTGTG-------------AATGTTGAAGCCAATCAAACCCCTTTCCTC-------------CACCAGTCTTGTAATATCACTGCCCTACGCCCCTACAAAATAACATGAGTGTAAATTTCAATTAAA-------ATTTTTGATAATAAAACTTACACAGCTCTTAAGTTCTTCTCTAGATAATTCTGGCTATTTGTTTGGTGCATGGCTGGGGGAA a score=4134 s mm7.chr5_random 1263436 134 + 11523536 aTTTGTATAATGGGAAATTTTCCAGCTTGAAAGCTCCCTTTAAATTCTATAACCTACACTTACTCAATCACAGA-TTCCGGATTTATTTTCATTAGCGGTAATGATAGGAACAA----TTTAGCGGTATATATCTTCTT s bosTau2.chr28 25469932 139 + 34887537 ATTTGCAAAAGAGGAAATTTTCCAAGTTGAAATCCCCTTTTTACAATTCAAATCTACATTTATTCACTCATAAATTTCCAGATCTGTTTTTGTTTACATCATAAATCAGGataaattttataaaaatatatatttGCTT a score=2112 s mm7.chr5_random 1263570 63 + 11523536 CTGAGTTTAAACTGTTCTCTGTGAATGATTTCTTTAATATTCGA------ACATTGCTGAACTCTATCA s bosTau2.chr28 25470296 69 + 34887537 TTGTATTTAAGCTGTATTCTGTGAATGATTTACTTCTAGTCCAAAACATCATGTAGTTGAAATCTGTCA a score=3551 s mm7.chr5_random 1264684 188 + 11523536 cacacacacacacacacacacacacacacatacacCTCGATGGAGCTGTGTCTTTCTTCTTACACTAACGGTTTCCAAAGAA------------------------CCAAGCAGCTT-----TCTTTTACGTAAGCA---------ACCATTAGCAATTACCATTGCTGCACAAAAGTAAAGGTTTTAAAGGCAACTCTTTAGATTTCAACTTCTATTTATAAAAC s bosTau2.chr28 25470608 215 + 34887537 CATTCTCACTCAC-CATGTACATATACACATGCTCTCTATTGAAAACATGTCTTCCTTCTTATACCAATAGCTTCTAAAGAGTTTGCTATTGTTCAGTCACTAACTCTAAAGAGTTTAGCCACTATCTATGTAATAAAGAAACCATATCATTAGCAAT----ATTa------acaaggaaaggctttggagacagttattctgagttcagcctctagctctgatac a score=4072 s mm7.chr5_random 1265326 174 + 11523536 ATTAAATGAAAAC--ACGTGTCAAGGGGTAAGCATATTGCCT-TGTAATAACAGGTA----ATAATGTAGCTTCCAGGATTATTCCCGAGTCGTTCCCATTTTTTGCTCTATTTGAATTCACTTTAGCCAGTTTCAAACATTGGCTTAAACGA-AGCAGTCTCTCATCTAGACTGGGGACAA s bosTau2.chr28 25470920 174 + 34887537 attaaatgaaagcctatgtgtgaagcaatgagcacagtgcctgcgacatagtaggtactgaataatgtagctcATGATATTAGTCTATAAACACTA-------TTGCTCAATCTAAAATAA-TTTATCCAATTTTAAATGCAAGTTAAAAATACATCATTCTCTCCTCTAGACTGGAAGTAA a score=17473 s mm7.chr5_random 1265662 666 + 11523536 CTGTCATGGTTCCTCATATAATCCTTACACATAGGCCACACAGGCAGCAGATGGGATTTCCTACCTGCATGTAGTAAACTTGTTTGGAGAGACTCACATTTACTGTAGCTGAAGAAAACAATGAAGGGTAGAGCTTTAAGAACCTCCATTGTTTCAGATGAA-------------GTTCCGCCGTTTGAGAG----GAATGATGGTGTTTATATTCTTTTCCAGCAATTATCATTAACCGTTAG--CTTTTCTAGTGAATATTAGTTTTTCTTAAGGCTCCCATGGACTGTCATGAAACCGGACAAACTCAGGACAGTGAAGAAATGTCCGTG----------TTTGTTAATGAATACAGGAATTTAAAGCAGATCATGTCGACCTA-TGATATGTTTGAGATTGCAACACACAGGCCTCGTGCT--AGCAAACGATGCACCTGTTTGGTAAATGCCAGTCTACAGTATCTCGTTTCATAGAAATGCCTGTTTACATGTGCAAAGTTCTAAAGAGGCA-AAGAGAAAGCAAACATGAACTGCCTTTGACTGGGCAAGTGGACTG-GACTCAGGTGTCAATGCCAACACTGG---CATTGCCAAGACCCTGGAGAGGGGAGAGGTGGAGGGCACAG-CCAAGCCAGCAAACACAAAGGACTCCTATCC------CTGAGTGCTGGTTGTCAATCAGGACCATCATGTGACT s bosTau2.chr28 25471172 675 + 34887537 TTGTCGTGACGTTTCACCT---CCTGGCACA-AGGATCTGTAGGTTATTAACAGAATTCCCTACCTGCATCTAGTAAACTTCTCTGAAGAGTCTGACATTTAATGTAGCTGAAGAAAATAAGAAGAGATATGGATCTAACAGTCTTCATTATTTCAGATAAACTTAATAGAAGGTGTTCTATCATTTGAGAGAATTGAATAATCCT-TTTATATTCTTTCCAAGTAATTACTATTAATAATTAAACTTCTTCTGGTGAATA-----TTTTCCCCAGGCCACTATAACCCTGAAAAAAATTATAGAAATTCATGATAATGAAGAAATATTTCTGATAGATAGCATTCATTAATGAATACTGGATTTTAAAATGAGTCATGTCAATCTAGTTGTTTTTTCAAGATTACATCACATAGGACTTGAAATAAAGTAATCAATAGACGTTTTTGGTAAATAC-------------CTCATTTCCTAGAAATGCCTGTTGACATGTACAAAGGTCTAAAATGGCAGGAGATCAGGTAAACACATACAATGCCAGATT---CAAATAAATTATGACT---ATCCTAATTCCAGTGCTGGACACATTTTTAGGTCCCTAGTGAG------AGTGGGGAGCACAGATTTGGGAAACAAACCCATGGGAATGCAACCTAATGTACTGAGTGTTCGCTGCAAGTCTAGCACTTTATATGACT a score=59159 s mm7.chr5_random 1266390 1810 + 11523536 GAAAATCTCAAATAAAAAGTTTAATTTTAGAATCCAAGCTCATCATTTATATAAATACACTAAAG--CATAGTCCTTGCAAACTCAGAA----------------ATTCAAAAAAAAACATTTTTTTTCTAAAAGGTCAGAGGCAAA-TGAGTGATTTGTTTCACCCA---TATTTAATTGATTTGAAATGAGGAAATGAAAAACCTTTTAGAGTTATAAGCAGAAACTTTAGAGTC-------CGGTAAAGAA----TCTGATAGCTGATACTTCATGTTGATATCTTTGGGATTCTATAAAGTCCCAATGATGGTTGGGGCTTCCCTATCATAGGAAAAACAAATCAAAATGCCTAAGGCTTTTCTCATGACTGCAATA-AACAAGCACTTTCCCTGTCAACAGGCGACCCCTTCAAAGTAGAA-TCTGAGCTATATCTGGTCAAACTGTGAGGGGTCAGTGCGTACTTCTTATGAGATGGCTTTATTGTATAGAGACACAAAAGTAAATCAGAGGCATGGAGGTTTGATCAACAGGCCATCTGTTGTCAACGTGTCATACCATGCACTGGCGAAGTCCTAAGCATGATGCTAAGA----CCCAGATCCAATTTCAAGGAGCTCATGAAAAACGGGGTATCTCTGAGTTAACTGGCCGTGGAAAACCTGAATGCATCATCTGACGCGGGAACCTTCTCATGACCCACACTCCGTGATATGCCCAAGTTCAGTTTTGCTTTCAGATGCCTGGTTCTGTAACGTGC-ACAGCT----TCCAGAATATTCT---CTCTTCGGCATACTGTGGAGCCTGTGGTTAAGAACTGTTCAGTCAGGATGGCTTAGCCGCCACCGCCTATTTGCAGGTTTCGTTTATCAGACACAGAAACTGTTTTGTTGCAATTGAA---ATATTTAATTAAAATACAGCACCTGATTTGTGGTTTTTACACAACTGAATAAAAAAAAACCCTACACAATAAAGTTGTTTATATCTTC-CTTCCATTCTAGTAAAACAGATTGCTATCCCCT--CTTAAAACAAAACAAAACTTTATAGTTTT------ATACCTGATCATCCTATTCCAATAATTGCCAAGA--GTTTGTTTCTAGTGGTCTTCTG----------------------GCCCAAAGGA-GGAGTAAGGCCCATGTGGATATTACAGTGAGAACTTGCAGGTAGCCCCAGATGC-----TTGCTCTG-GTGTCCTGCATGGCCCCGCCAGGCAGTGTCGGCTCTGGTA--CAACAGC----ACTGAAGCACATTTCCAGTCTGGTGGCTCCATCTCTGAGTTCCATACTGAAAGCCTACTAAGGGGAGATTTACGTTTAAAAAGATGAGCTTTTCAAAATGCTCCATCATGAGCCTGGGTTGGCCAAAGCTGCCAGAATCCATGGGTATGCTCAGCAGCTTTTCTGAGGGGACTGTACTTGGGGGACAGCCCAGAAATCGGACTGCTAAGGTAGACAGCCCAGGTCAAGATGACTACTTCAGCTTCCAGTAGGTAAGTGGGTCACAGCTGTGTTCCAGCATCTCTTCCTCCAAAGATGCAAGCACCATGTTTTCAGATAGCTT----CTCTCTCTCTGATCTCTCTATT--------GGTGCAAGTGACCACAGGCTCTTCTCTGTGCCAGT---GTCTTTAAGTGGAGACCCTGAGTCACAGCCGTTGGAGGTGGCCGTGTCCTCTGAGGTAGAATTCAGTATTTCTAGTTCCCTGATGAAGTCTTGCCTGTAGTGCTCTGCCTCTTCCTCTGTGAACAAGGAAGCTTTGTAGTGAGGGTCCAGCAGTGTGGCAAAGATGTGCCTGGGATCATGGAGGGTAGCAGACAGGCAGCTTGCCATGGCTTCCTTCAGGGACTTAAGCATGGTGTCCATGC s bosTau2.chr5 76305956 1848 + 76426644 GAAAATTGCAAATAAAAAGTTTAATTTCAGAAACTGAGTTCACCATTTATA--AATACACTAAAAAACATAGTCAATGCAAATTCAGATTAATAACAGATACAGTATTTTAACAAAACAATAACTTTTCTAAAAGGTCATAGGCAAAATCAGTGACTCGTTTCACCCAGAATATTTAACTGGTTTGAAGTAAGAAAATGAATTCTTTTCTAGACGCTGAGACAAAAACTTTGAAGACATATTATTGTTAAAAAAAACACCTGATGACTGATAATCCATTCTGATGTCCTTGGGATCCTAAAATACCCCACTGATGGCTGAATCCTCCCTATTTTATAAAAGA-AAATCTAAACGCCTAAGGCTATTCTTACAACCATAACATAGCAATCTTCTTCCCTGTTAATAAGCCACCTCTTCTAAAAAGAACTGTGTACATAATTGGATCAATTTG---GGGGTCAGTGCACAAATTTCA--AGACAGCTTCATGATGTAGAGCCAC-----TGAGTCAGAGGCTCAGAGATTC-ACCAACAGGA----GGCTGTAAGCGTGTCGCGCCGCGCGCTGGCCACACGGTGTACACCACACGTGGGGGTGTCCACACC--------AGCCGCCCACGCGGCACAGG---------------CAGGCCCTGAAA----CGGGCGCGTGCTCT-CTGCGGAAACCCT-GCGCGACCGACCCTTCGTCACATGTC--AGCTCGGGCTTGGTGCCCACGCCACGCCTCTGTCGTGGTCGACAGCTGCCCCCCAGAACGCTCCGTCCCCCTCAACGCCCTGCAGAGCC-GCAGTCAGGAACTGCTCGGCCAAGATGGCTTCAACTCCACCTCCTATTTACAGGTTTTATTTGACAGCCACAAAGGCTGTTCTGTTGCAATTAAAGCAATTTTTAACTAAAATACAGTACCTGATCTG--ATTTTTACATAATCGAATAAAAAG----CCTACGGAATAAAACTGCTCACCTCTCCTCTGCCATTCTACTGAGACAAACTACTGATCCCCAACTTGTAA------AAAACCTTACAGTTACGAATGAAAACCCAATCATCGTATTTCA-TCATTGACGAGACAAGCTGCTTCTAGTGGACTTCTGAAAACACACACCGTGGTACCTGGCCTGAAGGACTGGTTAAGGCACGTGTGGCCGCAACAGCGAGGGC---CGGGCGGCCCCTCCCGCGGCCGTGGACCTGAGCGCCCGGCCTG---CCGTCCTGCAGGGCCGGCTGTGGCGAGCGCCAGCCTGGGCAGACGC-CGGTGCTCGCCGGGTGGCTCCAGCGGGCTCTTCAGTACTGGAAGCATATTAAGGGAAGATTCACTTTCAGAAAGATGAGTTTCTCAAAATGCTCCATTAGGAGCCTGGATTGGCCGAAGCTGCCGTTCTCGGGGGGCGTGCTGAACAGCCGCTCGGAGGGGACGATGCTCGGGGGGCAGCCCAGGAAGCGCACAGCCAAGGCGGAGAGGCTGGGCCAGGCGGCCCTCTTGAGGCTCCAGTAGGCGAGCGGGTCGCAGCTGTGCTCCAGCACCTCCTCCTCCAGGTAGGCGAGCACCATGTCCTCGGGGACCTTGGGCCGCCCTCCGCGCTCGCTCTTCTTCAGCTTGGCCATGAGTGCCCAAAGGCTCTCCTC---GCCGGTGCAGTCCCGGGGCGGGGAGCCCGGCTCGCAGCCACTGGGGACGGGCGTGGGCTCTGAGGTAGGATCCAGCGTCTCCAGCTCCCTGATCAAGTCCTGCTTGCACTGCTCCGCCTCCTCCTCGGAGAACAGGGAGGCCTTGTAGCGCGGGTCCAGCAGGGTGGCCAGCACGTACCTGGGGTCGTGGAGCGTGGCGGACAGGCGGCTCACCATGGCCTCCCTGAGGGCGCGGAGCATGGTGTCGATGC a score=5478 s mm7.chr5_random 1268869 295 + 11523536 ATAAAAGAGTTTCAAAGGAGTACAGTCTATTAGCTGATTCTGCTACCCACAGGCTCCCTCCTCTGGCTTCCT--GAAGAGGAACCTGCCCATGTGGATGC---ACACACACTTGTCTCAAGGGAGAGAAACAGAACCT----GACTGGTTTTCACTTAGATCTGGGCTACACCAGTTTC------AGAATATGAATGACCATGTGAAATAGAAAGCCATGGTTAACAAGGGAAAGGTACCTTGACCTTTGACCAGTTGTCACCAT----CTTTTGGGGCCTTCTGAATGTTCTTAATGTTCATTGTCTCCTTTT s bosTau2.chr28 25472183 291 + 34887537 atcagataatcttcaaggCTGGAAGTCCATTGCTTGATTTTGCTACCCACATAATCTCATTTCTGGTTTCCTAGGCAAAAAAAAATATATATATAAGTGAGAGAGATACATTTGCCT-------GAAAAACATTATTATTTAGATTTGTCATTATTTAGATTTGGGACATGTTGGCTTATGGTAAAGAATATAGATGACC-TGTGTGGTAGAAAACCAC-----ACAAGGGAAGACTGTCTTG--------CCAG--GTTTCCATAGGCTTTCCAGGGTTCTCTAAACAGTCCTGATGCTCAGCATCTCTTTCT a score=2784 s mm7.chr5_random 1269305 89 + 11523536 GTCTCCTGAGGTGCACCCTCAGCAGCATTCCCTTGAGATCTTATTCTACAGCTCCTGAGTTGGCCAGAAAATGAGCTGTTACACTTGTG s bosTau2.chr28 25472474 82 + 34887537 GTCT-------TGCACCCTTAGAGTGGCTCCCTTGAGACCATACTCTAAGCTTCCTGGGGCTACCAGAAATGGACCTATTACTCTAGCG a score=8444 s mm7.chr5_random 1269884 435 + 11523536 AGACTGCCACCCCATGCAAACGTCACCAACTAATTCTGTGCTTTGCCCCTCAGCTCAGCCTTAGATTTACTCATAGTGC-------------AGCCAC-ATCAATAGATTGGGG---------GGAAGGGACCA--------GGACTAAACTAATCCTGCCTTTTAAAAAACACC---------CAAATTTTAGTCTCCAGAGGAGTTCTCCTCTCATAGATATTTGAATATTATAAGAGATTTTTGTAAACACAAGAAGAATCTATGTGTTTAATCAATGGCTAACGGTAGAATTC-AGTCAACAAGAAATACAGGTGGTGAGGATTTTTTAAACAGTGGCCAATGAATGGGATTTGTGATGTCATTC-----ATTCTGTATAATT--TTCTATGAAACCAACCACTTAAAAAACACTTTTATGCTGGCCTCTGAGATTAAGAAAAAGA----AAGGCACCCAAATATAAAACAAACTAATGATTT s bosTau2.chr28 25472583 448 + 34887537 AGACTGTCACCCGTTGTAGATATTACT--------------CTTTCTCTATGACTAAGCCTTAGAATCATTCACAGCACCACACCACAGGACAGCCACCATTAACTGATTGGAGCTGGCACTTAAAAAAAACTGTTCTGTGTATGCTAAACTAGTTTCTCttttaaaaaaaaattatttttGGACAAAATTAGCTTCTCATGAGCATCCTTCTCTCACAG--------------TAAGAGATTCTTTAAAACATA-GAAGGAGTTAAATTCTTTATTAGTGACTGATAGTGGAATTTTAGATCAGAGGAAAGACAGGTTGTGGGGATTATTTAAGCAAAGGCTAAGGAATGGGTTTTGTGATAGAATTCAAAAGATGGCACAGAATTTGTTCTCTAAGA----------GAGGAAGATCTCCACCCTGACCTTTAAGATAAAAAAAAAAAATAGAAGGTGTGCAAGTGTAAGACACAATGATGATTT a score=8906 s mm7.chr5_random 1270459 657 + 11523536 TCAATAAATACTGTCTTCACAGCAAATGGGACCACCTAATTCTTGCTCACATTGTAGAGACAAAGTTCAAAAGGAC-----AAAGACCAGGGCTGGATGCCATAACACC-------------------ACTGCCCAT----------TCCTGGTGAGCATGAT-TCACTGTGATG-------TACTTACAAGC------TGTAC----AGGGCTTGTGCATCA----AGCCCAAGTGTGCTCTACTCATTGATACAAGTCCTATGTGACACATACACAGTAAACTTGAAGCTCACTCACTCCAAATCCTCTGTCTGTCCTCCGAGCAAAGGGAAACTACAGTTCTAGAATAAACCACTTCCTACCTCCT---------------CTGGTCAGGTGATTTTT-TTAGTGTGTCCTCTGGCATGGCAGTGCACTCCATTGGTGTGGCAACATCCTTTGTGACCACAG---TCTGCAAGGTGGCTGCAGCTTCCAGAGCTCGAGTTTTATATGTGCTGCCCACAGCAGAGTCTTGAGCTCAAAGCA-ATTCAAATATTAGGTGTAGGGTCAGACTAGCCAATCGTG-TCTGCTCCACTCCTGTTCA-------------TAATTGTTTAAATAAA--------CCATTTCAT-CATGGCATTAA---------------TAAATAATCAAAGAACAAAAAAGCTTTATGAATGCATTTATAAATTCAGTGCTATAATCCAGAGGCCAATGTACTTGGCAAGCTAATATATTAAT s bosTau2.chr28 25473031 735 + 34887537 TTAATAAACAGTTTTACCACAA-----------ACCTAATTCTTGTCCAAGTCCTAGAAATAGAGTTTGAAGGAACCTTAGAAAAACCAAGGCTGGATCCCTAGACCCTACCGAAAGCCTGGGAAGTGACTGCTCATGCATGTGCAGTCCTGGCCCTCATTATAGCACCATGAGGCTGATGACATTTACAAACATCTCTAGTACTAGAAGTTTTCCTGCATCAACTGAGTCCAGTTATGTTCCAGTCATTGGTATGAGCTCTGTCTGAGCCATACAGAGTCAGTATGACTTGCTTTTGTTCCAAATCCTCT-----CCTTCCAGGCAAAACAAGAC------TTTTGAAAAACCCAGTTCTCTCCCTCTTTTATTTCCATCACACTGATTACCTATCTTTTATCACTGTGTTCTTTGGCACATCAGTATAGGGAGTT-GTATGGCAGTTTCCTCTATGATTATGGAGTCTTGTAA--CGGCAGAGGTCCCTGGGTCtttgctttcatgtctgtggctcttagcacagcactggacacataggagAATCCACTATCAGATGCAAAATTGAATTAGGAAACTGCACTCTGTTTCACTTCTGTTTGCTAAACTTATTATTCATTATTTCAATAAAATTGTCTTCCTTGTCATCCCTGACAATAAACAAGAGTGTTTGGGAAAATGGTAGAAAGAAAAATCagcttcatgaat-------taaacac----ctactttctgctggccattgtatttggatactttatatagtaat a score=6388 s mm7.chr5_random 1273451 357 + 11523536 cTCAGTTGATTAATTTTGTGATCATGTTGGTAGGTGGAATTAGTCT--GCGAAATAACTTTATCCTTTCATT--TTATTGCCTTTTGTAGGAACATGATTCAAGA-AAGGGTTACGGAAAAACCT-TCTATTCCATTCTTCTCAAAAGCTGAATTTCACCACACCACAGGGCGG--------AGGACGGTCCTGCAAACTGGCACTGG----CTGAAAAGAAAAAGGAAATTTTCCTGCAGTGAAAGAATCTGAACTCGGGGA-------ATCTGAACTCATATATT---TAAAAGATGTCACTAGTGTGGCCTGCGACTTGTACATGG-ACTTACAAACAAGCCCTCT--CCTGG----------------------GTCCAGGTCTATCTCTCCTGACCCTGGGCATC s bosTau2.chr28 25475071 409 + 34887537 CTCGGTTGTTTCATTTTGTTAACAAGTTGACACATGACATTAGTCTTTGAGAAATAACTTTATAATGTTGTTGTTTATTGCTTGCTGCAATAACATTATCTCAGACAATAGGTACAGAAGAATCTGTTTACTGTGTTCTTTTCAGAAAATGAAATTCACCACAGGACAGCTAGGAAATAGGTAAGTTGATCTTCCTCACTGTTCTCAGAAACCTGGAAAGAAAAAACAGTATCTTGTGCAGCAAAGGAATATGAAATGATAGAAAGCCATATATGTGCCTAGATATCCCATAAAAAAACTC-TTAGTGGTAACTATGTTTTTCCTTTTGCAGATCCAAACCTGCCCTCTGGCCAGGTGGCGGGGAGGCAGGGGGCGGTGTTGAGGTCTCTGTTTCCCGACATTGAACATC a score=5710 s mm7.chr5_random 1274071 468 + 11523536 acttgctcccatcttcctggtccagcaccctaagggctgtggttccagaaatatactaccCCAGGTTTACCTCTCTAGAGAGAAAATAT----CTCTCTTTACTGATTCAGACAAAAGAAC------ACAGAAGGGCAGAGAGATGTGGGTCCCTTTGTGTT------ACT----GAGAAATTAGACAGTCCTGACACAAATGCAG------CATTCCTGCCCTGCATATAATGACTGGCATCCAGAGGAACACACAAGGGTCTGAGCTGGGAACTCTGAGCTCCTAGGTGAATGGCTAAATCAGAAA---------------------------CAGACATC-----TGACACACAAGAAGGAAAAGGCCACGGAGACCAAGCA--TTCGCATGAAGTTTGGACATTTGATTGAGACAGAGATGTTTATTCACCTTTGGTCGGTTATCTTTG----TTTCTCTGTAGCTTGACTTTCGTCACCAGTTTTTGAACTCTGGAAGAGAAAAAAAAATCACAGGAA-----GGAAAGTTT s bosTau2.chr28 25475634 504 + 34887537 ACTGAGGCCTGTCTGCCCATCCCAGCCCCCT------------------------CCTCCCCCTGTGAACTTTCATATTAATAGATTCTTTGCCTTTCTTTTCTGGTCCAGACATCTGAGTGCAGTGGCAGGAAGGCAGAAGA--GTGGATGTCTTTATATTCAGAAAACTGTTAGGGCAGTAAGGCAGTGCTAACACAAACACAGTAGGGCCATCCCAGCCATCAAGAC--TGACTGACACCCAGAGACACATTACAGCACCAGTACTGGGGTTTGTTAGTGCAAGGCCAGGGGGATAAACCAGAAATGTTAGTGCAAGGCCTAGGTGATGAACTAGAAATCAACAGTGAAGCATGAGAGGGGAAAAGCAAAAATAACCAAAGAAGTTAACGATACATTTAG-CCTTTGATTGAGATAGAAGGCATT----ACCTTAGGTGGGTTTTACTTGATGTTTTTCAAGCAGCCTGACTTTTGGCTGCCAATTTTGGACTCTGAGAGAGAAAAAATAGAAATAAAAACATACAGAAAAttt a score=9578 s mm7.chr5_random 1275471 720 + 11523536 GGACATGTAGAAAAGAGGAAG----ATCCCACAGCGATTTCTATTGTGTTCTTATTTCCAGAGACAACAGTAGAATTTCCATGGGAA-AGCAAGAAATAACTACCTCTGGACTGAAACAGGACTCAGGCTCCTGCACTTCGCTGCACTCCTCCCTGGCAGCAGTGAACTTTGTGAACAAGCACAGCCACTCCTCATCCGTGATCCCTGGCATCCACTTCACCAAGTTGACCAGAAACCTGT-ACTCAAAGACACCCAACAGAATCGCTGAAT-GATCCTCCCTACAGCGCCCCTTCTTCCACGTGTTTGTCACAGACACACATGCT--AGGTTTCAAACTTGGTGAGTGTAAAATTTTAAA-TGTTCCACTTCTGCAAGGGTCTTACGAAACTTTCT----AATTCACTAAGTGGACT--------------TTTTGAGGACTATATAATCACAAACCAAAGTGGATCCTATT---GAACATA--GTAGGTCTTCTAAATGATTTGTTTCCCAAATCAATTCCCTTTCCT--------CAGTGGTTAAATG---CTGTTT--CTGTTACACTTGGTACAGACAAGGGTCTAAATCCATGACCGTGGG------TTCTTATTCTTGACATTTGAAACGTCACATGAGAGAATAAAA--GCAAAGTTCCTGCCCCTTTGTGTCTCTCCTGTTTTAAAACACTGAAAGTCTCAAGGCAAAAA------------------TCTGTATCATTggagatagtgagacagctcagcgggtgaaggtgcttgccaccat s bosTau2.chr28 25476631 738 + 34887537 gGAGACgttgcaaggaggaagcagggtcctgtggggagttccattttcttttttggaccaggaatactagttgaattccagagaaaagagctggaaatacCTCCTCCT----TGAAGCAGGCCTCAGGCTCCTGGGCTTTGCAGCACTTCTCCACCACATTCGTGAAATCCGCCAGCAACGACCACAGTTCCTCCCCTGCAAGTTCAGGCTTCAGTTTCACTAAGTTGACAAGAAACCTGTGACCCAATGATGTCAAACAGAATCAATTAACAGTTTCTTTCTGGAACCCCTCTTCTCCAAAAGGCTTGTTATAGAATTATATCTTTGAAATCTCCATTTAGGTGAATGTAAAAAGTTAAAATATTCTACTTTTGAAAGAGGTCCTGAAACCTTTCTGCTAAACACATGGGATGGATTCCATGATAACATTCTTTGGAGGCTTATGTAATTATGGACAAAATTGTATAAAATGTGggaacatatagtaagtct------------------cactccagtactcttgcctggaaaatcccatgggtggaggagcctgctgggctgcagtccatggggtcgcaaagagtcaga---cacgactgagcaacttcattttcacttttcactttca------tgcattggagaaggaaatggcaa----cccactccagtgt-tcttgcctg------------gagaatcccagggacaggggagtctggtgggctgctgtctgtggggtcgcacagagtcagaca------cgactgaagtgacttagcagcag a score=1891 s mm7.chr5_random 1276387 164 + 11523536 ATCCATATTATTCTCCCAG----------CTCATT-TGCACCTCTCCAGCAGCACTCTGGCTAACTGCCTGACCCATCCTTCCAAACCACAGACCAGTGAAT---AGACTCTACCAATAAGGAAAAG-----------------GATAAACTAGATGTTTGGTTATAAACAACAGCAATACATAAGCAATGTTGT s bosTau2.chr28 25477641 192 + 34887537 ATCTATGACATTCTCTCAAGAAAATCTGATTCATTATGAACCTC-CTATGAGCCTTTTTATGGCCTCCCTCACTCACGTTTCCAAATCACAGTCTGGACACTCCAAATCTCTAGCAA--AGGAAAAGACTGAGTTTTATAACTAGACAGACTGGACAGTTTGACAGAAGGAACAGGATTATAACATCAAGATCAC a score=16983 s mm7.chr5_random 1276650 871 + 11523536 GGGCTTCATACCTGTGTTTCTTATTCTGAAGGTCCTCCTTACGAGGCTGACACCAGTCTGTATGCAAAGCAGATACAAGTGCGGAGACTGATGGGAGCTCATACGTTGTATCAGCTTTCAGATGCTCAAAGCAGTGTCTTCTGAAGGCGAAGTCTGTTTTGCAGCAGTGATCCACAGCAGGATTGATAGTTCGATTTGTATTTACCCCACATAACTCTCCAAGAACTAAATCTGCCTATACCAATGAGAAGTGGGACACTGGTATGATTTTAAAATTCTAAGGGCACTTTAAAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtAAAATTAGATGAATAGCTAGTTG----TGAGATCACCAACAACCTTACTTAGGAAAATACAGGTATCCAGGATACTGTACTGTGT-----AGCAAGAATTGTAAAG--------GCTAACCAGCAGTATTGCAAAAATTCAATCTACAGCAA-TTAAGTGCCTATGAATTAATTTTTCATGTTATATACACAAAGTTTCTATTGTGTGCAGAGACTTGTGACC-----------------------TCAAAGTGACAATTGAACATGGGTTTCT----GGGTGTACCCCAGACGCTCCACCCCATTCCTAAA----------------AGACTAGGCAGAAAGTAGCATTTCTCTT-CTGAACTCTCCCTTTGGAGACAAAAAGCAAAATTGGTAACACTATTTAAAATGGTAGGGTTTACAATCTGAGATGTAGTACAGTAGAAGCCTTCCTACGATGTGTAAGAACTACAAAACAAATGGATAAGGCTTCCTAGGCTATTCTGGAACAATACTGTGATTCTTAAATCATTTGCCCTAACCAATCACCTCTGACGTTTAAAAAGAAGAGAACTTGAGAAATCCTTGAACATGACTG s bosTau2.chr28 25477906 758 + 34887537 AAGGTTGGTACCTGTCTTTTTTCCTCTGGAGTTCCTCGTTATGAGCCTGACACAAGTCTGCGTGAAAGGTAAATAACCCTTGAGAGGTAGATGGAGGTACGTATGTTTTATCAGCTTCCAAGCTCTCAAAGCAGGACCTTCTGAAGGCAAAATTTGTTTTACAACAGTGGTCCACAGCAGGGTTGATATTTCGATTTTCATTTATTCCACATAACTCTCCAAGAACTAAATCCACCTGTACCAATGAAAGTTG---CAATGG---AGTTTTGAAAT-------------------------------------------------------------ATGGTAGATGAATTGTTAGTTTGTTCTAATATCACTGTCA-----ACTCAGAAAAGCTTCTGCAATCATAATATGACGCTATGCACAAAAGAAAAAAAAATAGAGCCTGAGGTACTAAATGGCATTATAACAAAAATTCAAACCATAGTAATTTAAATTCATGTAGATTAAGCT----TAATGTATATACAAATTTGTGACTTTGAGCTGAGAGCTGCAAACAGCTAACCGAAAGCATCAGCAGGACACAGTGACCCTTAGATTTAGTCCCCTCCTGGGATCCCCCACATATGGGCCACCCCAGACCTAAAGAGATATGCCCAACCCAAACTGGACTGGAAGCAGCAATTCTCTTACTGA------CATGGTGGGACAAGGAG---AATTTATAGTGTTGTTTAAAAT------------------------------------------------------------------------TATGAAGTTTTCTCCGTCATCCTGAAACAATACTATGATTC-CAAGTCATTTGCTCTAACAAATTACTTCTAG----TATAAATAAGAAA-------------Tgggacttgactg a score=10381 s mm7.chr5_random 1278037 297 + 11523536 tcaacaataatgaacacagaaaaggaggtcatgaatttaagagggagtgaggggCAATGATATAATTGTATCTCACTTTTAAGAACCGGAGATTAGAATAAACAACAGCATAGTCTGGTACATAGACCATACTCACCAAGTTGTCAACGCAGGCGAACTCGTCACTGAGAGTGCAACAGGTTGTCAGAGCTGCCACCATTTCCTTACTAAGGGAGACCAGTTCTTCCATGGGGAGCTGAGGGGCTGCCTTGGTGAACTTGACAAGGAAACTGAGAGAACACACATCT-ATTTGAACAA s bosTau2.chr28 25479044 270 + 34887537 TTAAAAATAATGGAGAGAGGAAGACAGACAATCACTT----ATAAATCAATGAATGCAGGTATCCTTTTTTTTTTCTTTTTAGGA------------------------ACAGTCAGGTATGTGGGCCAGGCTCACCAAATTATCAACGCAGGCAAACTCTTCGCTCAGGGTACAGCAGGTGGTCAAAGCCATCACCATTTCCTTGCCAAGAAAGGTCAGTTCTTCAGTGGAGAGCTGGGGGGCTAGCTTCGTGAGATTGATGAGGTAGCTGAAAGAGCATATGTCTGATCTGAACAA a score=17563 s mm7.chr5_random 1278372 871 + 11523536 TGCCCAGTGTGACCCTCATGACATGATAGAAAATCCTTGGCAGAAATGACCTTGGCCAGTAAGT-------------TTTGAGATACGTTGTGTTGATGCTAAATTGTTTAAAAGGACCATTTGACAG--CCATGCTAGGAA---------TAAGATGAA------GAAAAGTAGGGTCCTTAGGCGGGCTGAGGTTGGCACTGCAGCTCACAGCAACACTGCAGGAATGATGAAGTCACA--TTGTAAACTGTGTTGTGTTTGAATCGAGGATGTTAAGCTTCAATAAACTCAGCTCTAGGATGGTCACTG--TTTACAAACTTA-AATTAACTGCACAGTATTCTAGAGTTCTCATAAAATCACGGAAGAGTAAATACTACAATGAGAAGCAGGCCCATTGACAATTCTGTAA-----TTATTACTGGCTTCACTCCTGAGCTACCCATTGGTTTCCCAGGAAACAGTCGACACCTGAAGTT-----CTTTCCATTCTCCTTACT-----CAGGACAGAATGCAAGAGTCCTGCTTTGGAGGCCAGAAACTCAAGTTC--ACAGACACTTAAACCTTACAGTAACAG--TGCCTCGAATCCCATCTTTCTTTCCGTTTGTGACCTCATTTCTTGTCAAAGAGTCCTGA---GAAGGCTCAGTGGGAATTCTTGACTTTTATGTCTTTGTTCTTTCCCAGAGT---TGAATTGGCATGACTGAAAGACCAGCCTACAATAATACAATGATAGTCTA----CATCTGAGAGATTATTTGAGCCAAGTT-------TTAGCCCAAGTTACGCAGATGACCTACTGGCGCTGCAGAGTGTCCTTCCCCAGCTCCTGGAACTGTTTGCACTCCTGCTGCACCATTGCAAGGCTTCGCTGAGTTGTCTCATTGAATTTATCCTCCTGAAAATTAAAAGCAATCATG s bosTau2.chr28 25479527 913 + 34887537 TGCCCATTGTGTGTCATCTGTGATGATAGGAGCATCTTGGCAGCAAGTATCTTGGCTAGCTAGTATGTAAAGTCCTACTTGAAATCCTTTGCATTGTGAATAAACATTTCAAAGGGAAAATTTAATAAATACATGTTGGAAAAAGATAATCTGAGATGAAAGAAGCAAGAAACAAAGATCTTTCATGGGCTGAGTT------CCCAGCTAACAACCCAAGTGCAGAAATAGTGAAAACATATTTTTTAAACTGTGTTTTGTT----TTGAAGATGTTTGGTTTCAATGTATAATACATTAGCATGGTAATTAATTTTAAAAATTCAGAAAAAATTTCATATTATTCATGAATATTCACAAAGTACTTAAAAAACAAATATTAAAGTGTTAAGCAAATCCAAAATTATTTCTTTAAACTCCATAAGATGGGCTTAAATCTTGGGAAGAGCATCTTTTCCTTGAGAAAATATAACAACCTGAAGTTTGCTGCATTTCATTCCCTATGCCTGAAATGGGGCAAAATCCAGCAATTCTGTGTTGAGAGTAAAAAAGATAAGTCTAAACAAAAACTAAAGCATTAGATAATCAATTTGTCCAAAATCCTATATTTC-TTCCATTTCTAGCCTGATTTCTGAT---AAAGTTTTAAAATGACAGCTCGATGTGAATTCTTAACTCTTGTGATATTATTCTTTCCCAGAATTTATGAATT--CATCACAAAAGGGCTGAGCTA-AATTTT----TGACACTTTGTGGCCATCT------TTATTTTATCCTGGTCACCAGGGTTAACCTGC-TTGTTTGAACAACTTACTGGTATTTCAAGTCATCCTTCCCCAAATTCTGAAAATGTTCACATTCTCGTTGTACTATCTTGAGGCTTTTCTCTGTTGTCTCATTGAATCTATTTTCCTGAAAA-TAAGAACAACCATG a score=9944 s mm7.chr5_random 1279310 659 + 11523536 AAATGAGAATTTTC---------------------TAGCGCTCTTATTCATCCACAGATGAGAACCACAGTAGCTTATTCAGGACAGTAACAACATAA-------------------------------------CTGT-AAGCCATG-----TTCCCAGGGCCACCCAGCTAATAAGCATTGCTGTAGAACA---TTGAAGACATATT-------------TATCTCTATTTGTATC--TTTTCCAATCATGTTGGTTTGCAACTTAAAACCTCCCAGAGTTGTCTTCAATTATTTGATGGACTTTTTTTTTTTTTAACAGCATAAA-CTGAACATTTTCCTAG-AGCTAT--GAGAGAGAACCACTCTGCAACACATGGGCATGGGGAGACAAA-TGTGCCTCCAAGAAA-ACAGAGAATTCCCTAGCACCATCTTTCATCCAAGGATGAGGGACACAGTGGCTTGTTAAGGACAGCACAAGAGCAGAAATGGGAAATAACAGTTTTCTTATTGCATTACTTAAATTTGCATGACTATAAACaaatttttataatatttaaaaGAAAAAGGTTAAACAAAGCAAAGGTAGCACATATAA--CAAAGGAGTTATGAA--AAAATTGTCAAATA------CTCCATAATCCATGAAGTCATAT-CTTATAAGGAGATAGAGAAAAAAACTATTAATTAGAACATGAAAACAAGAAACAAACATGAACACACtttttatagaaaatt--------------taaaataatata s bosTau2.chr28 25480649 747 + 34887537 AAATTTAAATTTTCATCATTACCTTGTATATTTTATAGAGCTTTAA--AGTCTACAAAGTGGAATTCAAAT--CTGATGC-TGACAATGATCATATAAATTTTCCCTTTAAAGTGGCCAGAGAAGTCATTTggtcctgtgaagtcaagggacttgcctagaattacccaataggcaagtgTTGCTACAGAACActtttaatcacatatcttttaatcacatatATCTTT-TTTATACCATCTTTTTAATCATTTAGAATTGGAATTTAAAACCTCCAGtaattgtcttcaaatatttgacaaactctcac--------atagcataaagttggacaccagctaagtggccaccagggagaaaactacacaccagtggaaggatgctgaaggatgaattgtatcttcatgaaataaaaagaattttctagcactatgctccatttaaggatcaggaacagacctcctcattagggacagtgGCAAAGCTGGA---TGAAACTCAAGTATTCTTACTTC-TTGCTCAATTTTGAATGGGTATAAACTGGCATTTTTGGCAAGTGGGGGTAATTTTTTAAGCAAAGCAAA-GCAACACATATCAATTGAATGAGAAGCAAATCAAAAATGCCAAATAATTAATTTCTGTAATACATA----CATATGCATATGAATGGATATTAAAAACA--CACTAATTTCAACAAGAAAATCAGTAAAAGATGTGAACAAACTGTTCACAGGAAATTATGACTACAGTAGCTAAAATCATATA a score=19347 s mm7.chr5_random 1281449 856 + 11523536 attatattataATCAGAAAGCTTTAATAAAAACTGATTATTGATTT--TCAGTTTTCTGAATCTATGTTTATGGGACCTACCACATGGCGGTAACAACCTGCTGGGTTTTCTCTGCTGCAGCAGTCTTCTAAGAAGTCCATATACACTTTAGTAATTCTTAGGAGCTCTGGTGTAGACAGGTCAGGATGTCTCCTGGAGTATTCATAAATAAACCTGAGGTGTGCCAAACATTTATGCTGTTAGAACACATACAAAGAAGAAAACACCCAACCCCACTTTCATTGACTCTAGTAAGATC---TAACACTATGTCTTTTGTCAAAGCTAAATGCGGAATTTAGTCTG-------------TTCAGAGAACACTTT--------ACACCACTTTATTTTTAACCCCTTTCCTGTATCATATTTCAGGCTAACGGTCTTTCTTCATCAAAGAGGGCAGAATTGTTCGAATTATTTAGAAACAATTCTTAGAATAATT---------------------------GACATGCGAC--GTGTCATAGGCACTGCATG------------CCTTGGGAGAACACCTCCAGACTTCTGACTTGGAGTGGTGAGAATGTCGGCTCTTGT---TCCCAGAGCGTGCCTGGTGAGACACAGGGTCG----CTTTGCCGATTGCTCCCTCCTGTCACTTGTGAAATATGGGAGTTACACTTCCCTTAACTCCAAATCATAGGCTGCGGTTGGTTTCCACTGCCTAAGAGAAAGGTTCCAAGGGTACAGGTGTGCAGAATAGGAGGA------GTGCAGGGATG----------------TTAATGAAGCCATAGTAGGCGTG-TGCACCGGATCAAATGTCAATCATAAA-----------GACTTCCTGGAC--------ACACTTTCTCAGTCAGCTCC-CTTGGTCCTTAAGATAAACACTACCTTGAATCTGAAGGCACT s bosTau2.chr28 25482359 953 + 34887537 ACCATAATAAAATTTGATAGTTTTTA-----AGTGTTTGCTGTTTTGTTTAATTCTCTGAGCCTATTAGGATGGAACCTACCGCATGACGGTAACACTCAGGAGGGTTTTCCATGTTACAACACTCTTTCAGGAGATCCTTATACACTTTAGCAATTCTTAACAGTTCTGGTGTGGACAGTTCTGGATGTCTCCTTGAGTACTCATAAAGAAACCTGTGATGTGTAAAATATATTGTACATTAGAAC---TTCAAGAAAGAGAACTTCAAATCCTGCTATCTTTTACTCTGGGGAGACCTTTTATTACTGAGTCTGCCTTCAAATCCTCTTTC--ATCTTTCTCTGGCAGAGGAGTGGCTTAAGAGGACATTTTGACAAAAGAGACCATGTTA--CAAAGATTTTCTTCCATATTATGTTTTAAAATAGCAATGTTTTTTACTTGGAG-GGATAGAATGGTTAGAGGTATTTATTATTCATTGTTAAAATAATTTTATCCATAAATCATCAGAAATAGTAGATCATGCTACCAATACTTTAGGAAATACATATCAAGTATAATTCTGTTGGAAAATGCATTCA-ACCTCCATCTTGAGATTTGGGGAATATGGCTTCTCCTCACTCCCGGTGC--ACCTGGGGAAAGATTGTGGAGCAGACTTTGCCCATTACTTCATCCTGTCACTTGTCAGTTATGGGAGTAATCACCCCTGCAGGTCCAAATCATTGGCAG----TCGTTTCCATGGCCTCAGTGAGGCATTATAAGGGTACAGGTGGGTGTGATTAGAGGACAAAGGGGGAAAGGGAGAGGAAGAGGctaacacttattaagcccttagtaggtgcgaggcattggatcaagctttgggcataggagacaaagattggcttcctagcctttataaaacactgtctcatttaacttcacttagccctcaagataagtagtgtttcacagctgaggaaact a score=9512 s mm7.chr5_random 1339054 373 + 11523536 TACATTTGTTATA-AAAATATGAGCAACACTATTTGGTGATAAAATAAAGATGAAGTAAAGTTTGTGTTTGGTCTTTTTCTG----TAGTTTACTTAGAGCTAAAGAAAGTCATCTTTTAGTTTTTAAGACCAAACTATATTTT---TAATATATAG-CTTTTGAAAGCtattt-taatagtttaaacaatt-tttaa------aataatttCTACTCTATAGTAATTGAAATAACAT----CAAAAATCTAAATAATCAGTAATTGAGTGG----------TATTGATTTGACTTTAAAAACTTTAA-------GAATCAATATGGTAGATTTGTT----AGAACTTACATGTTGAATTTTGA---------------CCTCTTGTTGGATAATAAAAATATATTTGAACTACTTTTTTATTGTTAGTA s bosTau2.scaffold294 203384 419 + 560307 TAAGCTTGATATATAAACTATGTGCAGCAGTGGA-AATGGTAAAATGAAGACAAAGTAAAGTTTATATTTGGTCTTTTGCTGTGTTTGGATGATTTAGAAACTAAAGAAGTGAACCCttaattttta-----aaactttattttaagtaatgaatagatttttaaaagctttttaaaatagtttaataatttatttaaactattaataatttCCATTC--TCATTGTTGAAATAACATTTACTGAAAGTTT---TGAGTATTAATTGCATGATGTCAAATTTTATAGACTTGGTTGTAAAAACTTTAACACCTGGGAATTGATGTTATAGATATGTTAAACAGAACTTTAGTATTTACCCTTGGTAATGTGTTTTTGACCCTCTGATTGATTAAGTAAGGCATATTTGAATTATTTTCCTATGATTAATA a score=24789 s mm7.chr5_random 1340496 1241 + 11523536 TTCTCACTAGTAGA--CTCTTCACAATTCATGATCCAAAGTTAGTTTAAATAGAAAAGTAGACCTTAAATTATCTTTGCTCAGATAACTTCATAGGAAAACTTATTAATCAGACAGTACT----TTAATAAAACCACTGAGAACATACT-TGGTGTCCCAGCAAGCTGGAAAGTAAACAGTTCTTGTAAATTATGCAGGGTGGTGTTGGTTTCCATTACCAGC-----TCTCTTTAAAGTTGGGCCAGGAAACAACACTGCTGTACCCTGCTTCTGCTTCTCCCAGCACATGTGAAC--TGCCAACTACTGACAGCCTAGATGTCAGACGGAAAGACTGGCCTGGCCACT------CTCCACAGCAG-----TGTACACAAATATTTCTATTGAGCT-TGTAATATTTATTTTGTTTCATTCTGTTAGTCATACTTTTCTTTGACATTTTT------------TAGGAGGAGACAACCTGCTTGGCTCAGCTGGAGTTGGATGTCTGGCCTTGGGTCTTTGTGGGGTTGGGGGAAGATATGCTGGATCAAATAGCATGGACCTGGAGTGTGGGAGTCA-CTTCAGAACACAGCAGAACTTTAGGCCTTTTATGCTTAGTGATC---TCATTTTCCCTAAGTGTATAAGAGA-TAAGTATGGTACATGC-TTTTAAGATTTAATTC----ATCAAGACCTTATGTATTAAAGTTG-----TTGGCTTT-----------------------------------TCATTAG---TAGTTAAT--------------------------ATGAGACTTGAAATGACACAGTGTAACT-------------------------------------------------------TGTGTCACTACCT-----------TGAGAGTGGAC-------------AGG--------------CAGGA-------------AGGTTATTCATGACTATTTTTGCCTCTCAGGTGG-CAACCATTGTTTGTTGTTATGGAG----------TTAGGAAGG----TTTTCTTTGGCTCCCT-CAGCACTTGGCCATCTCCCAGTCCCACTTTACATCTGTCTGTCAGGCTCTCTTCCCTCTGCTCCCATCTGGTCCTTTGTGAGCCAGCTGAGTCTT--------------------------------TTCTGCCACAAGAATCTTACCTGGAATATGGTGTTTCCTTGTGCAAATGGCATGTGTTAGTGTGTTGGTTCTTCA---TCTTTTTTCTGTTTTGAAATGTTCT-GTGTGTGTGTGACTA--TGTCCTTTTGTGGGATTTAAATATTTGACTGTTTTGTTA---------AGCTTTTTAGCTAAATGGTTC---TCCAAAACCC----AAAACTCTTAACGTGTTTTCTACCAGAGACTTTATTAATGAGCATTT------GTAGCTGCTTTCCCCACTGTGTGGTTCCTTCTACTCGGTCTTCATGTGAGATTGCATTCAAAACCACGCTGCTTAGTCCTAA s bosTau2.scaffold294 203825 1508 + 560307 TTCTCACTAGCAGGGTCTTTTCACAATTTACTGTGCAAAGTTAGGTTAAGTGAAAACGTAGAAGTAAAATTATCTTTGCCAAGATGACTTCTTGGAGAAAGTTTTTAATTGGATAGTGTCTTGATTAATAAATCCACTGAGAATACACTGCCATGTACTAGCACATTGGAAAATAAACAGTCTTCGTAAATTATGCAGAGCGGTGTTGGTTTGCATTAACAGCAACGTTCTCATTAAAGTTGGACCCGGAAAATACACCACTGTGTTCTGCTTCTACTT-TCACTACACATATAAACTGTGCCAACAGCGGACAGCCAAGAGCTGGGATGGAAAGACAAACCAGGACTATGTTAGGCCCCGTAGCAGCAGAATTTCTAGAAACTTCTCTGTAGGGCTCTGTGGTATTAATTTTATTTCCCTCTGTTTGCCATTCTTCTGTTTCTCCTGTTTACCTGACATTGAAATGTAGGGAGAATCTGATTGGTTCAGTTTGAGTCAGCTGTCTCCCCTGAAATCACTGGA-----GGAGGGGCCTGTGCAGGATCAAATTACACAGACCAGGTCCTTTCAAGTCCTCCTCAGAGTGTAGTAGGACTTCAGTCC-TTTATTTTTAGTGATTGAATGATTTTACTTAAGTATTAAAGGCATTAAATCAACTATATACTTTTTAAGCTTTAAGTTACAGATTACAACTCCA--TATTACAGTTGGAAACTTGGCATTCAGGGGCTGTTGAGGACCCCTGATATTACACTGCGTCACTAGATCTCGTTAGTtctgagggtagatttttaatctcttgaggatccctgataccacactgtatcactagctctcagctctgagggtgaacttttaatctcgttagggttcctgatacaacactacatcactagctctcatttgctctgagggtagacttttactctcttgaggatccAAGGGGACACCAGGAGAGGATTCAGAAGAGACAGTCCACGGCTGCTGCTTTCTCCTGTATGTCCAGCCCCCACTGGTGGCTCCAGAGGCCAAAGAACTGATGATGGCCTTTTCTCCTTGGCTTCTTCCAGAACTTGGAGTTCTCCCAGTTCTACCATGGAGCTGTTTGCCAGGCTCCCTTCCTTCTGTTCCCTCCCTTTCCTGTGTGAACCAGTTAATTCCTTCCATCACCACCTAATGCAATTTAAGTTACACTTCTACCACAGGAGTCCT--CTGTGAAATGTTGTTTTCTTGGGCTTTTGA-GTATTTTAGCATTTTGCCTCTTTAACTCCTTTTTTCCCTTGT----TATTCTAGGATGTGGATATCTATCTGCCCTTTCACAGTACTAGAATTTCTGACAGTTTTGTTATTACGGCATAACTTCTCAGCTGAAAATTTCTGTTATATAACTCATAGAAAAAGCCTTATTTATTTTCATAATGAGACTTAA--ATTGATTTTTTAAAATGGCAGTTACTTTTCTTG----ACAGTACTTTC----------CCATGAGAAAATGTATTCAAAACCATCTAGCCCAGTACCTA a score=3750 s mm7.chr5_random 1341737 117 + 11523536 CCTGACACTTACTGGTTCTT-GAGAATATGAACTATTGTTTTCTCTTGATTTTTCTAAATATTCT-GTCACAGTCAGAAAAGTAATACGTGTCTGTAATAGGAAAA-TGGAAAATTCAGG s bosTau2.scaffold294 205835 117 + 560307 cccAATACTTGATGCTATTCAGATAATATGAGCTTCTATTTCCTCTTGATTTTTT--AATGTTTTAGTCATAGTT-TAAAAGTAATATATGTCTCCATTACAAAAAGTGGAAAAGGCAGG a score=2782 s mm7.chr5_random 1342365 138 + 11523536 CCTTAATACAGAGTCTCCTTTCCTATCCC------ATGGATAGCCCAGGCCTGAGCCCCTCTGTGT----------CTGGCAACCTG--------GTGTTA----------GGTCCCAT-AACCCTGTTTCATCCAGTTGCTGTAGCAGTGAATTGTCCGGGAGAAGTAAGGG s bosTau2.scaffold294 206465 172 + 560307 CCTTCCCACAAGGTCCCCTTCTATACCCCTCTTTGGTTGATAACCCAC-CATGGTTACCCCTGTGTGTCAGAGTCTCTGACACCCTGCTTTGCATGTGCCACCCCGCCCCCGGCCCCGGGAACTCTGACCCATCTAATGGCTGTACTCCTGAATTGTTTGGGAGAAGCAGAAG a score=5149 s mm7.chr5_random 1342887 145 + 11523536 TTTGTTCTTGGTTTCTTCAAGTTACTCTGTTTCTCTAGAAATGATCAAATAGGCAATATAACACACAGACAC--AGTTTGTGCTACTGAGTTCTGG-------ACTTTTTACATTTCCATCTCTTGAATTCCGGTTATAATTTCTGCTTGTCTT s bosTau2.scaffold294 207354 152 + 560307 TTTGTTCTTGATCTCACTAAGTTATTCTATTCCTCTGG--ATTATCAAATTGACCACATAATGTCAAAACACCTAGTTTAAGCTTCTGAGTTCCAATTTTTTTTTTTTTTACCTTTTCAACTCTCTGATCTCAGACATAATTCCTAGCTGTCCT a score=9077 s mm7.chr5_random 1343681 203 + 11523536 aGTATTTTTTCTATGG--TACTGACTCCTTAGAGCCAAATCCTCTAGTAATTATTTTTTTTCATTATATTAAAGAGTATTCTTCAAAGCTTGTTTTTCAAAATTTGAATCAGTGTTTC-ACCATATCATTAACTGGTTCTTCCTAAGCTGTAGAAACATGGTCATGATTTGTGAATAGAT--TGTTTATATGGCCTAT-ATATATTATT s bosTau2.scaffold294 207787 208 + 560307 AGTATTTTTTCTTTGGATTTATAATGTCTTAGAAGCACATTCTACCACGATCATCTCTCTTTATTGAATTAAAGAATACCCTTCAAGACTT-TTTTTCTAAACTTGAATCAGTGTTTTTACTATATCATTAACTGGCTTTTCTTAGGCAATAGAAACTTGGTCATGATTCATGATTTGATAATATGTATGTGGCCTGTAATACACTATT a score=4186 s mm7.chr5_random 1344853 200 + 11523536 GTCCTCAGGCCACACCTTGAGGTCTGGCATCATTATCATTCACAAGGAATGATG-----CGGCATGATTAAACCTCTTCCTTTAGTCCTCCTCACTCAAGTCA-CTGAGTGTCTGGCA--TACAAGCATTGATTCCTTTG---GTAAAGGGAAA-CAGATATTTTTAGATTTGTCTGTGAGGCAGTA----GTTAAAAATAAAACACTGTGGAAAA s bosTau2.scaffold294 209346 202 + 560307 GTCTTTATGCCACACATTTTTTTCTGACATTATCATCACTCATAGTTTATATTGTGTAATGAAATGATTTAACTTCTTCATTTGATCCTCATCATTAAAGTTACCTGAGTGACTGACAATTATAGGAGTGTGTCTGTATGTATGTAATGGACAATCAGAAACATT--------------GGACAATATGTTGATTAAAATAAGACATTGTGAAAAA a score=11452 s mm7.chr5_random 1345771 957 + 11523536 ATTTGATACTTATGGGAATTAAAGACTTGTTTCTCAATGTTTCTTACATGATATT-CAGAAAAATAA----GAGCATAGTAGTAGTATTAGGGGGAAAGTTACAACAACATATGCAACTTGAAGGAGTtatagggtttggggatcaaacttaagtcaacaggcttggaagcacctgcatctattgagTTTTTAGTGTGTGGTAGTTTAGTAGTCTGTTTATTAT---AGGAATTGGGTGATAAAAGT-----TGTAAGTCCAGGCCTCCTTTCAC-----TTAAGTACATTTCTAGACTTTTAGTCTTTTATATCATCTAAGCATCCAGTACAATAAATACACTGTGGACAGCTACCTTTGGTAAGATTGCTGCTGCTGTCTCTTGAGCCTTTTGATATCCTAGCTGCTGATCT---AAACGTAGTGACTATAGAAGTAATTTAGCC-CTTAAAAGTAGTGTTTTGGTGTGTTTCTGAGA---ACTACTTTCCTAGAATTCTTGAGTGCTGCCTGTTTACTGTCTCGTGACCCAACCA------TTCTAACATGTGTGTCT--GATACCATCGATT-------AGTTCCGATTGTTCCTGAGGAGCCCGAG-------------------------GCAGTCTTTCTCTGTATCTGCTGGT-----CTTCTCTTTCTTATCT-------------CTTCCCTCCTCTTCCTCTCTGC------CTTCTTCATATTATCCTTTTTATTTTGTTTATATTGTGTGTAGAAAGATACAAAACAAAACTGAGAATCAAAGCAGAAGGGAATTGATTCTTGTTA--GTTACTACGTAGTGGTAATGTGAAACACACTTCCTTTCTTAGATGATTGAGTCATACAGCT----GCTGGAGCAGACCTGGGTTTGAGAACTAGGCTCCCACAGTAGTA--TGTGCACTGTGGGGAAAAAAAAAAATACGGTGTCAGT----ATAAAGCAGCAGGGAAAAGTGCTATTCTTTTC-ATGGGTGTTAGGGATGGTCACTGTTACTAGTTCCTGGGTCCTTTGTATCTGTT s bosTau2.scaffold294 211625 928 + 560307 ATTTGGTGTTTGTGAGAATTAATAGCCTACTTTCCAGAGTTTCTGAAATGAGATTGCAAAAAAATGAAACTGAGCATGAAAGTAGTA-----GGAAAAATTA-------------------------------------AGGCTCTAACATA-----------------------GTAT-TATGGAAT-----------------------GCCCATTCATTAATGAAAGAGCTGAGTGTTTAAAGTATGTGTGCAAATCTGGGCCTCCATTTGCCCTGCTTATATTTATTTGTGAACTCTCAATCTTTTAT-----TTAAGCACTTCATGTAATTAA----CTGTTGGTAACTACATTTT-TGAAACAACACCT----TCTCTTTAGCCTCCTGATATCTGATCCACTGTTCTTGTGAATGTGATGACCTAAGTAGTAATCAGATCACCCAAGAGTAGCTTTTCAAATTGTTTTTCAGAGGTATTTCTTTTCTGGAAT-CATAACTGGTACATATTTCCCACTTCACCATTTAATTACCTAGTTTTTAGTATTTGTATTCTCGATACCTTCATTTTCATTATAATTTC---TTTTCCGGAGAAGCCAGAGCCAAATGACAGACACCTGGACAAAGACAGTCTTTTTCTTTACCTACCAATTCTttcctctcattcccctccatccctgactgtccctcccacctctccctctccttgtcccacccctctat-ttctcTTCCCTATTTTGTCT---CAGTATATAGAAAAATAAAAACTAGAAT----GATTACAAGAAGAGGTAGATGATTCCTTGCAAAGATAATATTCATTGACA----GAAACGTA-TTAGTTTCTTAGATAACCAATTCAAATTACTTTGTGGTTCACTAGACCTGTGTTAGACTCCTGCTTTATAAAAATAGCACATATCCATTGTAGGGAGAAAAAGTGATACAGTATCAGTGAATATAAAGCAGAAAGTAAAAGTGCTGTTCTTTTCTGTACTTTCCAGAGAT----ACTATTAATGGTTTTAA-------TATATCTTTT a score=5683 s mm7.chr5_random 1346982 411 + 11523536 TCAATTCTTTATCTCAGTTTCTT-------TTATATCTGTATTGA-TTTAAGGATGCTG---------CTATGTGCTTGTTTTTCTTGTTATGTTTTTA------TTTTCACATCTGAATAAGCCAACATAAAAATAAGAGCAAAGGGGAAATAAGTTAGATGAGAACGTAGTAGAAATGGAAACTCCAAAAAGGAATTGGATGTCTCTGCACTTCCAGGAGCGCTGATATTCATAGGGATTGGGATTTCAGACTTGTAGGGATGAGACTATAGAGTTATCTTTGCTGTCAATATGAGGAGTATTGCAAG------ATAGAGGATT-GTAGACCTGTTGTTGAAGCTGTAGATAAGGATGAAGGATGCA-ATGTAGAGGGCAGAACACTTG----TATGGTCCCTAGGAGTGAGAAGACAGCAGTAGATAAGCTCTGGTTAGATAA s bosTau2.scaffold294 212701 375 + 560307 TCAATTTCTTTTCTCCTTTTTTCCTTAAAATTATTTTTTTAACCACTTTCAGGACACTGGTCCCTCGAATATTTTCTTTATTTTTTAATTGTTTTTTTAAACCAATCTTAACATTTGCAT-------CATA---------------------TGGCTTAGATG------CAGTTGAAAT------------AATTGATTAAAAGT------GCTTCCAGGAGTGTT-ATGTTC----TGAGTAGGAATTAAAGCCTGTGAGGA-GAAAATTTAGAATTATGCTTGCTGTCATTATGGGGAGTATTGTAAATGATCCATATAAGATTAAAAGACCTCTTGTTGAA------------GATACAGAATGCATCTATAGAGGGCAAAATGTTTGGTCTTCTGGGACCT-GGTGAAAAAGGCTGACTGCTGATTAGCTCTGGTTGGATAA a score=10461 s mm7.chr5_random 1347633 413 + 11523536 CACCTTGGAGGACTGAGGGATGCAAAGGGAAACGGTGATGAAACAGATGAGATT--ACAGAGACAAAAATACTAAGTTTTTTCCCTAGTTGAAGATGTGCTGTCTGTATAAGATTCCTCTTCTACCCAGGGAATATTGCAGTCGAGTTGTTTGTAGG--TTTGTATGACATTAAAACAGTGATATACTTAATGTCTTCCTGATTTTTGATGGAGAATTGTTGTTGAACTTGACCATGCCACTTAATTTTTATATAGTAGAAATA------CAAAAAGAACACCTATCA-GGTTTCTTGACTTAGTCAAATCTTCTAGGTGTTTCTGTGTCAGTGGTAAAACAGAAACT--GAGAAGCCTGTCAAGTTGTTTTTTATATGTTGTCTTT----CAGCTCTGCAAGTTGTTCTTGATCCATGGTCCTAATACT s bosTau2.scaffold294 213720 419 + 560307 CATCTTGTAGGTCAGGGGAGAGCA--GTTAGGCAGTTAGGAGGTAGCTAAAATTTGAAAGTGGCCAAAATATTACATATTTCTC--AGTTAA---CATATTATCTGATTAAAATGCCGTCTCTGTTAGACATGTGTTACTACTGAACTTCTGTTAATATTTTGTATGGTATTAAAAT-GTAATGTAGTTATTGTCTTCCTGATTTTTCAC--AGAACTGTATTGGAACTTGACCTTGACATTTAATTTTT-TGTAGAAGAAATAAATACACAAGAGAAACAGCTATCAAGGTTAGGTGATTTAGTCAAGTCTGTGTAGTATGTATGAGTTAGAAATAGCATGTAACCTTTGGAAAACTTGTCAAGtttttttttttttttttttttGTACACAGCTCTGCAAATTATTCTTGATCTATGACCTTAAGTCT a score=4060 s mm7.chr5_random 1348046 210 + 11523536 CCATAAGGCATTGTATTAGAGTGGAAACTGCCCTTGCTCTCTCCCAT-CAATCTCTGAATAAAAG---AGTCTCCAGTCAAACAACCCAT---TTTACCGTTTGAGTTTGTATAGGAAAACCCTCCCACCAGCCCTTTCATGTTGCT-TTTACAAGAACATCTCAGTGTGAAGTACCTCAGTCTTCAAAAGCCAT--CCACTTTATAAAGCCACTGCTTT s bosTau2.scaffold294 214716 193 + 560307 CCACAAGGTGTTCTGTTATAGCAAAAGTTGTGCCTCCTCTCATCCATGAAATCTTTGAAGAAAAGTTGATTACCCAGTAAAACAAGCCATCATTTTCTTTTTTATATTTTTATAGCAATATTCTAC-ATCA------CCATTCTGCTGTTTGCAAGAAT-----------------TTCAGCCTTCAAAAAACTTTTCCACTTTT---AACCACTGCTTC a score=3440 s mm7.chr5_random 1348323 82 + 11523536 ATACTGGCCTTATTTTCTCTGATTTTAGGGTTGTAGCAAAGGTATTTCTGTGTCTATGTACTTGAATTGCTTTGAAATAAAA s bosTau2.scaffold294 215004 82 + 560307 GTACATGCATTATTTTCCCTGACTTTAGAACCGTGGGGTATATATTCCCATGCCCATATTCTCGAGTCATCTTGAAATAAAA a score=5569 s mm7.chr5_random 1348594 237 + 11523536 CCAGTTTAGtgttttgttttgttttgtttGGGTACAGGGAATTAAGTGGAAACTAAAGACAATAAGATTTAA---ATAAATAACTGAATAAGAACACCAAAGAATGACTGGTCATCCTGCCCTGGTCAAAGCTGAGTTCCGACAACTTCC--------AAGTTCAATAGGGATAG---ACAAGGACCTGTATTTTGCTTCTTGTTTCTTCCTCTGTCTTTTTACCTATTTC-----CTCAGTTTGCTGACTTAAAC s bosTau2.scaffold294 216587 239 + 560307 CCATTTCAGTGTCCT-----------CTTGAATATAGGAAATTGAGTGGAAATTGGAGATAATAGGAGGCAAGAGAAAAGAACTTGGTTAGGAACAGTAAGAATGGTTTGTTCATCCTGCCCAAAT-AAAGGTATATTCAGAGAACTTTCCAGCATGTAAGAGTAATAGGCACAAGCTACAAGGA-----ATTCTACTTCTTGATGCTTTCTCTGTGTCTTCAGTTGCTTTTCTGACTTTATTTTTCAACTTAAAC a score=50131 s mm7.chr5_random 1348963 1890 + 11523536 GAATTTGTCATTTGGGAGATTTTTTGTTTCTTCTTGATTGTACTAGCACTGTGGTAATTTTATTA-TTTAAACTGAAGAATTCTTTAGGG-CATGGTTTTAATCT----GACT----------------ATCATCTTAGGTTTTTTTAA-----------TTAAcctcaccctcatatttcagatccaataatactactgtgaacctggaagtt-----ttctgacaagctgcaaggatggtgctaatactgctcattctgtaggcagctcattgagagccactgCAGCTCAGCACTAACCTCTGACATCCAAGGCAGAGC-----CACATCTGTGTGTGTGTGAGAAAC-----------------ACTGAGGAGCTCT-GAAGACCTGGTGCCAGCAATGCTCATCTAACACAGTATTGTCTTT-------CTTCATAGATTGGAGCCTATGATCAACAAATATGGGAAAAGTCTGTTGAACAAAGAGAAATCAAGGTAACAACTTTGTTTTGTTTATTTTGAAGCAGTTCTCTAAATTGT------CTGTCACTTTGCCATTCCATTTGTGTTGACT-------ATATTAGTTAATATTACTTTATCTG---ACATTTT------AAGAGATAAA----CCTATGATTTCATAGTCCTGTCT-TTTACTTC--GTTTTAC---------TCTGTAGCACCTTCC---CTTCTTTTTACTTCCTTTCTAATGATCATGTTTTTTGCCAGC---TTTCCCCTTTCACTTGTCACCTTATACTTCTAGTTTGCTTTTCCTCTC-TCTGATGCTGTCATTGCTCTGTACAGTTTATTAAACTGGTAAGTGTTTCAGGATGCTCGCCACC-GAGTGATTC--TGCAAGCTCTGCTGTGCTTCTTAGGGATCTGCCTTTTGATGCTACTAACGGAGTGTCTTGGGTGCAAAAAGACTTGCTGAA------------CTTAAAGGGGATTTAGGAAACTAGAATATTAACTCAAATGCTTTTCTGGTAGGCACTTTTCCTCTGGACCGTGTGGTTACTGGTCTTATTCTGATAGGATATTCTCATAGGCTCTCTGGCTAGCATGAAAAACAGTTTTAGAGCTAAATTTG--TTGTTTCTCAGCATTC-------TTTGATAATAAATTGTATATATTTTCATTTGCTTA---GATACTAATCAGTATGTTCTTGCATGAGCTAAATGTAATTTGGGCCTAGAGAAT---------GTCACTTGCTATTTTCTATAGAAATATTAGATTAG---------------------TTACTTAAAAAATCTGCTCAAAAGATTTCTCACTGTT----CAGACTGCATCATCTATAAAAGCGGAAATAATTCTTTGatatttaataattttaatctttaaagttttt---taaataataCATTCATTTAGCAAAGTT-----------CTGACAT---TTTACAATAAGACTAAAGGTCACTAGGTC-AGAAAGACAAGG----CTATAGTT-TCTAAGTCCAATATGTTATTACAGATAAGATAAAAATCTCTGAATAGATGGGCCTAT-GTTCAGTCTCTAAAGGTAAATGCGGAAGGAAAATGTATGAGGAGATTAGGAAAGATTTCATAGACAAAACAGCTTGAGAG-AGGGTTTGACACATTCTGGACAGTCAAATAGGGAAGACATACCAGACAG-ATGAAGGGCGTATGAAAATATCCAGGAAGGAAGGGAGGGCGAGGGCACTGAGGAAGGAAACCTTCAGAATGTGATTTGGTAATTGGCTTGA-GGAAGAAG---ATGAAGGTGATGAGCAATAAAGCAGGAAAGGAAACTGTAAGTCAG--CATGTGAAGGCTGTGAGGCCTGACCCAAG-GCATAAGCATAGCTTTG-TAACAGCCGGGAAGGCACTGAAGGACTTTAAGCAGAAAA----------TTAATATTACATTTTTATAAATTCCTTAAGGCAGTGATAGGTATGATAGGAAATATT------GGAACATAGATTTAAAATTGTTTTGGAAATAGCCAGG------------TAGATCTTATGAGTCCTAGGTGTGTAACCTTTGTG----TGAGTATAGGTATAGGTATG s bosTau2.scaffold294 216910 2067 + 560307 GAGTGTGTCACTTGGGAG--------TTTTTTCTTGAATATACCAGGGCTTTACCAGTTATGTTAGTTTAAAATAAAAGATTCCCTAGGGTCATTGCCCTAGGCTTATaaactttagtagtgtatcaaaatcatctagagggattttaaaaacagattgttgagtatgaaatccgtatttctgattcagtaattctgaggtgaa---gacagttggcatttctatcaagttttgag-atggtgctaaaactgctggtcctacaagc-tttctttgagaaccactgCCATACAGCACTGGTA-CAGAAGTATGAGACAGAGCTGGGTCTAATCTGTGT-TGAATGGACAACTTGTTGCTTGTAATTCAACAGAGTTGTACTTGTTGGATGGGCTCCAATAATGATCATTTAATGTAGTACTGTTTTTATTTTATTTTTATAGATTGGAGCATATGATCAACAAATATGGGAAAAATCTGTTGAACAAAGAGAAATCAAGGTAACGAGTTTATTTTGTATA-----------TTCTATAAATTATTAACCATAGTTAATTTAATATC---TTTCTGCAGACCTTTTAAGGTACAAATTAATAGTACTCATTCTGTCCACACTTTTATATAACAAAGTAAAGTCTTTTATGATGGTATATTCATGTGTCTTCACCTCTGATTTTTCTTTTTGGGATCTTTAGCATCTTTCTGTTTTGTTTTAATTTAATTTCTAATGAT--TATTTTTTGTCAGCTTTTTTCCCCTTTCACTTGTCACCTTATACTTCTAGTTTACTTTTCCTCCCTTTTGATGCTGTCATTGCTCTGTACAGTTTATTAAACTGGTAAGTGTTTCAGGATTTTTCCCGCCTGAGTGATACTGTGCAAACGTTGCTCTGCTTAATCGAGATCTGCTTTTTGGTGCTACTAAC--AATGACTTGGACGCAAACAGAGTCGCTGAAAAGTTGGTCATTTTTGGAAAGAATTTAGGAAAATAAAACATTAATTAAAATGTTTCTATAGTTCGCAA-TTTCTTCTTGAACATGTAATCA-----TTTACAGTGATAAGATATCCTCATAGGCTACCTTGCTAGCATGAAAACTATTTTT-TAACTAAATTTGTTTTGTTTCTCAGCAGTCACACCTTTTCAGTAATAAGATTTATAT-TTTTCATTTGCATAGATGATACTAATCAGTGTTTTCCTGCACGAGCTAAACTTAATATTGGCCCAGAGAATGATACTTTAGTTGCTTTATATTTTGTACAAAAAGTTTACATTAAATTGAAAACCCGTGTCTATATTTGCTT-AAAAATCTGTCAAAAAAAAATCT-AGTGTTTAGACAAACTTAGTCATCTAGAATAAAG--AGCAAGACTCTACCATTTGTCAGTTTTAATCTTTGAACTGTTGTCATGAAGAGTTAATACAGTCAACAAAGTTGCAGTGAGCACTTGCTATGTCTTGAATATAGGATTAAA--TCATGGGGACAAAAAAGATAAAGTATACCATAATTATGTAGACGAGATACATGA-CACAAACGAGAT-AGATTCAGTTGAGAGAGGGATGTATAGTTC--TCTGTTAGGGTACAAATTTGAGAAGCACTGCTAGTGAGGTTAGGAAAGA-TTCACAGACGAAGTGACTCATGAGTTGAGTTTGACACACATTAGTGAG---AATGAGGAAAACATTCCAGACAGAATGAAGAGCTTATGAAAATAAACAGGATGGAAG---GAGCATG---ACTGACTGAGGAATCCTCAAGGAACTTGATGGGTAATAGGTTGGATGGAAGAAGGCAATTAGAGTGATGTGGAGAAAAACAAGAAAGGAAAATG-AAGTCAGATCTTGAAGAGGCTTAACTGCTTTATCCAAGAGTCTAGACATAATCTAGAAAACAACGGAAGAGACATGAAAGAATTTTAAGCAGAAAAGGTTATCTGGTTAGATTTCTATTTCAACAACTTCACTAAGGCAGCACTAAGTATGGTGGGAAATATTAGAAGAGGAGCAGATACATAATTCTGTTTTAGAAGTATTCAGGGTACTTGGCAGAGAGAT-TGAGGAGTCCTCAGTATATAAAgtatgtatgtctgtatatatgtatatgtatg a score=3793 s mm7.chr5_random 1350872 210 + 11523536 TAGGTATTATGTGTCTATTAATCAGGCAGTTTACTTACTATATAGATAGAATCTATATG--TAAGTAGACTTT--CATTGAATGATGAAAGAAAATGGCCAAAACCAGAACATTGAAAAATACCAGTATTTAATGAATAT-----------------------------GAGAAGAAAGAAGGAATAATACGAATTCCATTAGCAGACAGTCTGATGATGTGTCAAGAAGAGCTGAAAGTGAA s bosTau2.scaffold294 219507 232 + 560307 TGGGTGTTATGTA------GATTATATATGGTACACATTATACAGATACGGCC-ATAGGACTCAGTGGATTTTTACATTGAATGATGAGAGAAAAAAGCTGAGAACAAAACATTGGGAAA---CAAGATTTAACAGATAGGTTTATTAAAAAAAAAAAGAGAGATGTAAGTGAAGGAGGAAAGAGAAATGAGAGATCACGAAACA-ATAGTCTGAGAATGTCACAAAGAGGTGGGATAGTAAA a score=4871 s mm7.chr5_random 1353255 313 + 11523536 AGGCTCACAGTTATCGTT-AGTG-TGCAAACTATGCTTGTTTATGTAAATGTATAAACCAAAGAAAATTAAAAGTTTAATTCGAATCAGTGTAAATTT-TCCG-TTTATAATGTCCACTTATTTAGAATCATGTTTCGTGGAATACTCATACCTTGGTGATGGCATCTCTCGTTTTTGTGACTAAAATTA-------------ATTCTTTGGTGAAAGTTTTTGCCTAAA-----------AAATGCTTTAAATATTTTCATAGACTGCCTTCAAGTAGATTTTACTTATTTGCTTGTTTGTTTATttttatttttgagatgtggtctcactgtgtatccc s bosTau2.scaffold294 220904 299 + 560307 AGGCTCATAATTTTTTTTTAGTACTGAAAGCTATGCTGTTTTGTGTAAGTGTA--------------------GTTTACTCAAAACCAATTTAAAGTTGTCCGACTTAAAATATCTACTTAATTAGAATCACATGTTATA-AATG-----ACCTTGGTACTAATATCTTTTGTTTTTGTGAATAAAGTCACTAATGTTAGAAGATTTATCAATAATAATTTT---CTATATCCTTTTTTTTAAACCCTTTAAATACTG--ATAGGCTACCTTGAAG--GGTATTGTCAACTGTGCTGTGACTTTACAAT---------GCTATGATTTCACTTTGTAGCTC a score=5925 s mm7.chr5_random 1353791 476 + 11523536 AGAAGAAGATAGCTTACTGTTCCCCTTACAAGGAGATTGCGCTTACATATAGAACAGTAACTAAATGACACTGAAAATAAACCTGTATGTATACAGCAGGAAATGATGCTACAGATT-----------------GACAGGCTATTATCAAATTGATAAAGAAGTAA-TTATAAAAG----AAGTAAATAAAAATCTGTAA----CCTCAAATAT-TTTATACTAATAAAGATAAAAATCCCTTTATAAGTTTTGTA-CAAATTAAAGTGGTTCTTTATTATTAAA-ATTGTATTCAAATAT------CCAGC------------TTTAGAAAGTGTTGAAAAT-ATGTATAATTTATCAACTGCTCTATAGTAACTTTAAGTGAAAATGAAGTATGGC-TACAGTTTATTATTATTATTAAT---------Cttactttctagatagtcgtcatgaaaatggaat--gtgaatactgaaccactacttgtagtggg---------------tcttctgggcctttggtcactaca-ctgttaactagctagt s bosTau2.scaffold294 221327 528 + 560307 AAATCAAAATACTTTACTATTTCTCTTATAAGGACTTGAAGTT----CTTAAAACAGT------------CTTGAGGTAAAGTT-TAGGTATACAGCAGTAAATTAGGCTTCAGATTTGTTATAAACATTAGCAGTAAGGTTATTTTCAAAGTGCTAGAAAAGCAGTTTATGAAAGATATAAGTAAAAGAAAATATGTTATTGTTTTCAAATTTATTGGCACTAATGAAGGT-AAAATAGCATAATAAACTTCATGCCAAATTTAAATAGTGTTTGATCAGTGAATTTTTTGTTTAAATATGTTTTACTAGTTTACCTTTCCAATTTGCAAAATATTGGGAGTGATTTACAGCCTATGAATGACACTGTCATGAC-----ATGAAAGTGGGAAATGACATACAGATagttgttttttgtgatgtgcagtagttaatgttctttcagctcaccgtgaatgctgatttagtgaatactg-actgttgttcttaggaggaatatagaattaagttcctgcaagcccctagtcacaacagttgtcagctaatcaat a score=23644 s mm7.chr5_random 1354403 1076 + 11523536 gagtcaaggctaacctggTCCAGTTCTTAACTT-----------------AGGGATAATTTATTTTCCCATGGTTTTGTTCTCCTCACTAAGTTTTACCTTGTACTCTT--------------TAGTGATAGCAGAAATTTAGTGCTAATTAAAATCCACTAATCTCAATTTTAAATTAATTCAATTTACGGTAACTGTTTTC--ATAACCCCTGTTCCTGATCATAGGATCTTAAGTTCTGAGGTGATGAGATGACATTACAGTATGGTCAGCAGTTGGCACTCAA----------------GAGATGTCCATCCTCTTGGGGGTTCTGCTGGTATCACCCTACGTGCTAGCATCTGCAGAGAAGTTTGCATCCCTGTCT-----------------------TGTCCTCAGCAGCACCTCCAGCATCA----TCTGCGTGCCTCTGGGCCCAGTGTCCCTCCCT-TAGCTTCACTACTTCCTTACTGCTCTAAGCCTGG-------CAGTCTCCCACATCATCTAGGGCCTAGGCTGTATGCTCATATTGCTTGGTGTATGACATCTTTGATTTGAAAGTTTACTGTCCATAATAAATAGGTTTTGCATGTTGCACATATCTCTAAACATTTCTTTTGGAAAATAATAAAGTTTATTGGAATGCTGTAATGTGTTCCATTTGTAACAAATCTTTAATGTATC--TTTTTGGCTAATAGGTTACTTCAGGATTTTCTTTTAAATTGAAACCCTTA----------------------------TATAAGTTGG---------TTACCTCTTTGCT--------------------------------------------------------ATTTT-----------------------------GTTTGGATTTAAACAAA-----------------ATATATTT--------------AGAATTCTAA-------------------TACTGCTTTTTACTATATTGTAGGGCTTAAGGAATAAACCAAAGAAAACAGCACATGTGAAACCAGACCTCATCGATGTTGATCTTGTGAGAGGTAAGTCCTGGATAAGTA-------ACTGCAGGTA-ACAGTGGTCCTGAGGAGACAGG--TCAGAATAGTGTAGACATGGACCTGTGCAGAAAT-AAGGCAGCTCTAGTGTGCATGCGGACAGGAATAGCATACATGAGAGAGAACA----------CAAACACCA---ACCTGGTTTTCCTTCCTTGAAATATAATTTCAAGGAAT-AGTGTAAAAGAATAACAGTTCCTATTTGCACAGCAAACTGTAAAGCCTTAATATTAAATTTAAATTG s bosTau2.scaffold294 222670 1309 + 560307 GAGTTTAGCCTGGGCTCCTCTAATTCTTAACATCCTAGTCTTAAGTTATAAAGCATAATTTATTTTTTGATAGTTTTTTTTT--TCATCAATTTTGATCTC-TACTCCTACTCTAACTCAGTACACTGAT-GCAGAAACTTAATCTTAGTT------CAATAATTCCAAGTTGAAACTAATTGATTTCATGATTTCTGCTTTCTCCTTCCTCCTCCTCTGGGGCATGGCATCT-AAGTTATGAGGTGATAAGGTGGCATTGTGGTCTGGTTAGTGGTTGGCATGTGAAGACAGTAGCAACCCTGAGATGTGCATCGTCCT--------CTCTGGTCTCACCCTACATGTTGGCATCTGCTAAGAAGTCTGCATTGCTGTCTGTCCTCAGCTCTGTGACCACTGCTTCCTTCAGCATTGCCTCCAGCATCACACCTTAAAGGCCCTTTAGGGCCACTGTTCTCCCAGGCAGCTTCAGCACTTTC---CTGTGCAAAACAAGGGCCACCTCGGTCTCCTGGACCATCT------CAGGCTGTACATCTAAATTGGTGGTGATA----GTCTTTGTTTTAAAATTACGCTTTTAGTAATAAACAGACCCCATGTGTTACATACATCCCTAAAGTTATTCTTTTGGAAATAATAAAATTTATTACACTACTGT--TGTGTTCCGTTTGTCACAAATAT---ATGTGTTAGTTTTTGTCTA---------TTAAAGTTTTTCTTCTTAATCGAAATCTGTAGGCATTGATTTTGGGTATTAAAAATGTACATGTGTTGAATTTCAATACTACTTTtttgctgagttaaaatcgacatataacatattagtttcaggtgtaaaacatagtaattcgatatttttatatattgagaaatgatcccatacttaagtctag-tttaaataattatccccatacatacttacatattttttttcttgtgataagaactttaaagatctactctcttatcaaTACTACTTTT-AATATGTTATAGGGGTTAAGGAATAAACCAAAGAAAACAGCCCATGTGAAACCAGACCTCATAGATGTTGATCTTGTAAGAGGTGAGTCTTGAATAACCAAATATTTAATGAAATTAGAAACTGTTCTCGAAGCAACAGAGTTCAAAATGGGTTAGATGTATATGTTTGCAGGAATAAAAGCAATGTGAGGCTAAATGAAGATAGAAGTAGTAT-TAAAAAAGAGAGCGTGGAGACCTTTAAATACCATTGACTAGTCTTTTCTCTCACTAAAAATCATTCCAATTAATAAGTGTAACAGAAAAGCAGCTCATATTTGCTTAGCAGACTATGAAG-CTTGTTATAAACGTTAAAGTG a score=23961 s mm7.chr5_random 1356118 454 + 11523536 TTTTGCTTTTTTTGAAGGCAGTCCTGCAACTTTATTTGACACTGAGCAGGTTAGTTCTCATTCACATTGACCGTCTGTAGAGTTTTGAATGTAGTAACAGGTA-ATAAATTACCAGTGTGTAGAGCTTGTTTGGGGAATCCTCGTCCTCGTTACGCTTTCTGGACAAACGTACTCGGATGTG--ATGGAACATTCCTTATTTCCTTGACCCAGATGGTTTTATTGAACCTGGTGTCAATACGCACATCTGGTGTCCCCATTTTCTTCATGGCAAACTTCCAAATTTCAGTGAGTGCCCGAGGAGCATGCTTCTTGAAGCCCACTCCATGGACACGCTTGTGAATGTTGATGGTGTATTCTCTAGTCACCACCTCGTTGATGGCAGAATAGCCCTTCTTCTTCTCGCCACCCTTCTTTGCGGGAGCCATTCTGCTGGGCCTAAGTTGGAAAGGCATAA s bosTau2.chrX 9460468 434 - 48857030 TTTTTTTTTTTTTGGAGG---GTCTATAACTTTATTGGAGAATCAGCAG-----TTCTCATCCACATTAACTGTCTGTAGATTTTTGAAAGTGGCAACAGGTACATAGGTAACCAATGTGTAGAGCTTGTTTGGTGAATCTTCACCTTCTTTAGGTTTTCTGGACAACTGCACATGGATATGGTATGGGACATTCCTTATTCTTTTGGCCCAGATGGCTTTACTGAGCCTGGTGT--------ACACCTGGGGCTCCCATCTTCTTGATGACAAATTTCTGGATTTCTTTGAGTGCCTAAGGGGCACGCTTCTTGAA-CTCACTCCATGGATGCGTTTGTGAACGTTGATAGTTTATTCTCTGTTTACCACCTTGTCAATGGCAGACAGGCCCTTCTT------GCTGCCCTTCTTTGTGGGAGCCATTCTGCCGGGCCTGGGTTGGAAAGAGTGTA a score=17965 s mm7.chr5_random 1356572 500 + 11523536 GTCCTGTTTTAATGAAAGATGTGGAAGAAATC---CTGTTACTTCCACTGAAAAT----TTTTTCATAGTATATTTTAAGTATGATAACTGAATGAGTAAGATTGCTTTTGAAAATGACCAT--------ACTAAATATTTTTTAGCCATAG-AAAAGTAAAATTGTATGCCATTTCTTGTTTTTCAAACATG-GAATTTATTTCTGTA-GGAAATTAAAGCTTAGTAAGTGGAGTCTGCCATTATATTTTATTTTTCTCCTCAGGGTCTGCATTTGCTAAGGCAAAGCCTGAAAGTCCTTGGACTTCTCTGACAAGGAAAGGGATTGTTCGAGTTGTCTTTTTCCCTTTCttctcccgctggtggttacaagtaacgtccagagtcatcttctcctggcttcttgttctctatcttctccaaggtataaggaagtcatgcaaa-----------gcTAACTTGGAGGATGTTGTATTT-----------TAATGATTATTAAGGCTTTG---TTCTAAACATGTACTGTTACTGTGCATGAA s bosTau2.scaffold294 224018 533 + 560307 GTCTTGTATTTATAAAATATGTAGGAGAAATTTTGCTGTTATTTCAGTTAAAAATAGTTCTTTTCAAAGTAC--CTGAGTCAATATAAAGGCATATGTGA---TTTTTTTAAAAATGTTTACTACCCACAATTGGACAGTTGACACCCATAGTACAAAAGAAATAATATGT--TGTATTGTTCTTCAGATGTTTAAATTTTTTTCTTTAAGGAAATTAAGAAATAATAAATGTTGTCTTTCATTTTGCATTACTTTTCTT---AGGGTCTGCATTTGCTAAGGCAAAACCCGAAAGTCCGTGGACTTCTTTAACTAGAAAGGGAATTGTTCGAGTTGTATTTTTTCCCTTTTTCTTCCGGTGGTGGTTACAAGTAACATCAAAAGTCATCTTTTTCTGGCTTCTAGTCCTTTATCTTCTTCAAGGTACAACTAAATGAAGGAAATGCATTTTGCTTTTAACTTTCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTAGGATTACTAAGGCTTTGTTATTTTTAAAATATACTGCTATTGAGTATGGA a score=3468 s mm7.chr5_random 1358796 155 + 11523536 TGTGACCTAACAAAAAATAAAC----TTAGATTTGAATTCATACACTGTTCATTACAAAGCTGAGTGTGTATATTTTAG------TGTTG--TGTTATCTTGTTCCAACAATATATTACTAAATACTATGGTTAGGCAATACCAATAATAAGAGTC-GAAAGAGCTTG s bosTau2.scaffold294 227593 162 + 560307 TGTCATCTTACCAGGAATGAATGCCTTTAGATTTATATGTATCTAGTTTTCATTGCAGTGCTAAG-GTGTG-ACTTTAGAGGCCACGTTGGCTGTTACTTAGTTCCAAGAGTTTATTTCTGAATGGCATGATTAGCCAGGGGCAA----AGAAGTCTTGAAGAGCTTG a score=3559 s mm7.chr5_random 1410456 95 + 11523536 ATGAGTCTTCACAGGTACAGTGAAATACTCCTTCATTCCCTACCTTCTTGCTTGTCCCAATCTTTTCAAAGCTATACCACATTAATAGTTCTTTg s bosTau2.chr6 21369837 95 + 69624268 ATAGATCTTCAGAGATAAAGTGAAATGTTCAATCCATCTCTAGTTCCATGACCATCCTAATCTTTCCAGAGGCATCCCATATTATGAATTTGTTG a score=41126 s mm7.chr5_random 1411286 1417 + 11523536 GAATTCCTCTAGGATGCGTAGCAAACAATGAAACTGCTGCTTCATCTGGCATAGACATTTGAAATTTCACTAGGTAATGAAAGCTTAAATATTAACATTTATAATTGACATTAAGTAATATACAAGCGTATTACAAGAGCATATAAATGTTCTCTGCAACTAGTTAAATTCCCAAGTTATATTTCCATTAGTTG-GGATTAGAATTGCTAGTTCCATACGCTCTCCAGTGGGCTGGATTACAGCAACCCTTCTCTTGTTTGACTTTTGATCAACTAGTCAGTAGAGGTTTTCTGGACTCGGTGGAGGTTTTGAAGAATTTTAGGCtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgCGCGCGCGCGCGCATGTCTTACTGCCTGTGTAGTTTGGAGATCTCTCCACCAGAGAAATCTTCAAACCATGAAGATTGTAACTGGCCT-CCAGCAGACCC-AGTATGAAGCTTTTTAAGTGGTAAGAGAGCTAAGGAGAGGAGGAATAAGAGAGTCTGGGCTCTCC-TGATTCTG-AGTCTCTAGTCAA-GCCACT-GCTCTGACTGAAACCTGCAAATAACTCCTTTCACGGTCCCATTGACTCCTGGCTCCCTTTGATGTCTCTATTTGAGCTGGGCCTCTCTCTCACACATAATAAAGTTTTTCTTCTCTTTCCTCTACTGCTCTATTCTCCAGTGTGAAAACTGATGCAAATACATTATTTAGTCTCCCTGCACTTGCCTTATCCTTCCAAACATCTCCTCTGTGCCCAGCTAGTCTCTCCAACCCACTGATCTCTTTGCCGTCGTCTTATTTCTGATATACTTAAAGAATTTAATATTATTTGTTGTGTTATCATTGGCTGTTTGTTTTCAAACACCATTTTTAATCCCTTCTAATCTATACTTTACATCTCACCTGCTAAAGTTGATTTTTCTGTAAGCCTCATACTGGAATGGATTTCAGTGCTTTGAAAAATCCTTTTTCTTTGGTCTCAAAAAACTTTTGAACTTTGATG-------------CTATCTTTTTGGACCACATTTTTAATTTCTTGCTG--------------CTGATTATAGTTTTAAAATTTGGAACCTCTTTCATTCGGGGCATTTTCCAAGACAGAATTATAGGAAGGCTAGTA-TATACTACTCAACTGT-AGATGAAGCAGTAAGCAA------------------------------ATCAACCT------ACCTAGATGTTTTTGATGTTTTAATACATTGTTGCCCTTTGTGCTACTGATGAGATCTGAGTAACAGTTGTAGAGGGAGCTGTTGGGACAGTGAGTTGATGGAGTAGCCACCTT-CCTCTTTTAATAGTTCAATGAGACTCT-------------CTTCTTTTGGGGGATGGATGAAGTCATGGAATTGAGCCAAGGGAATAACAAAATATCAACTTCAGTTTTCTGA---AAAATAAAACCAGGGAGC--CTTCTCTGTCTTCCCTGTTGGTTCTT s bosTau2.chr6 21370517 1340 + 69624268 gagtttctttagcacatgcacctgatg-tgaaattggtgcttcatttggtttatacattttgaatttcattagatatt----------------------------------------------------------------acaaatgttctctaaagatggtgg---taccagtttatactctcactaaacacatatgacaatttccgtttccatacattctGAGATTGGCTGGATTAAAGCT-CCATAATCTTGTTTGACTTTTGAGCAATCAGCCAATTGGGTCACAAGGTACTGACTGGATATTTTG--------------------------------------------------------------------CTGTAT-----GGAGATCATTCTACCATAGAAATC----AAGTAT--ATTTTCCAACTTGCCTTCCAGTTCACCGGAACATGAAGCCTTTTAAGTGGCAAATGA--TAAAGCTATACAGAATCAGGGATTACAAGCATTCCATGCTTCTGGATTCTCTGGTGAATGCCTCTTGCTTTGGCTGGTACATGGCAATACCTTCTTTCACCATTTCCTTGACTCATAATTCTCTTTGATGTCTCAATCTGAGCTGGGCCTGCCTTTCACATAATAAGGTGTTTTCCTCCCTTTTCCTCTATTTCCTGATTCTTCAGTGTGAAAACTGATGCAAATACATTATTTAGTTTCCCTGCAATCTCCTTATCCTTTTGAATATCTCCTCTGTGCACTGCTTGTCTGGCCGATTCACTGATCCCTTTGCAGCAGTCTTATTTCTGATGTACTCATAGAATTTAATATTATTTGTTGTGTTATCATTGGCTGTTTGTTTTCAAACACCATTTTTAATCTTCTCTAATCTTCACTTTACATCTCACCTGCTAAAGTTTATTCTTCTGTAAGCCTCACACTGGAATGGATTTCAGTTTCTTGAAATATCCTTTTTCTTTGGTACCAATAGTCTTCTGAATCTTGCTGGTTTTCTGATTTTTTTTTTCTTTTGGTCACTGTTTTAATTTTTGTCTGGTGTGACTTTTGTTCTGATTCTGG-CTTAAATTTTGGAATCTCTTT--TCCAGGGGATTTTTCATGGTAGAATTCC---TAGGCGAATGTTTTACAGTTTCATTGTGAGATGAAACAATAAACAAAATTAAAAAAAACAACAAAAAAAAACACACAACAACTTCTAGGAAAGTAAATTCCCTTG-TGCTTTAACAAATCACTTCCCTTCATACTACTGATTAGGTCTTAGTAACAG-AGTAGAGACAGAAGTATTGACAGTAGGTCAGT-AAGTTGCAACTTTATTTCTTTTAG----TCAATGAAAGTCCTTTCCGTCATATGCTTTTTTTGGTTCCTATAT----TTGCAGATATAAGAC-AGGGAAAAACAAAACATCAAAGTGGATTTTCTGATGGATAAGAAAATTAAAGCACTTCTTCCCCATTTTCCTTGTGGCTGCTT a score=33200 s mm7.chr5_random 1420339 1645 + 11523536 AAGAAAACATTTGACTTC-------TCTCCATCTCTAATATTACTCTCTGTCCACTGTTGATCTCTTTCCTCTACAAATGCA--AATCTCGTAACCTTGGCCTTCCATGGATCTACCCCACATTCTTTTCAA-TCATTTATAACTGTACCAACTCAGGGTATTCTTCAACGACTACTCACAGTATGCGATTCT-CTGGATAGAATTTCTGAGTGAATCATAT-------------------------GTATT--ACCATTGTCCATATAGCCTG-------CTGATTTTTGTCCAACTTCTCCAACCTCACCTTTGGTACTTTTTCCACCAGGTCCCAGTTGCATCGTTCCTTTCCTACTTCAGAAGCAGTGCCCAGTCCTTCTCATGCCTGCAG--TTTCACACTTAGCATCCTTTTTACTTAGAATTTCCTCTAAGCCCTTTTACATA---GATGCTTTCTCATCTTCCTGCTTGATTTCAAATACGACCCTTCTTAAGTGACCTTTTCTAATCAGTCTACAGAATTAC--TCTGCCTCAtcaccttgttgatttccctcctggtgtgtatcatatttgtaattattttgcttacttattggtttgtcatctcc-----ccttccaaatttggaccgtgagcttgatgaatacagaattatgattctatctgg---gtcatgcttcttcagtgct-ggtgtggcacctcttaggtggtaggtgcataatagtaagtgttgaataaataaCTGAAAAGAGTCAGGAATGCTGGGTTATCTAATTTCTTTAATATATTATCCTCTTAACTCTAAAACTTCTCTTTCTTCTGACACATTATGTTGGGGGTGGTGGTTGGTTGTGGTT-TTCTTTGGGCTGTGAGTTTTCTATGTTGATATCAATCTCCTCTGAGATTTTtcccagtcatgtaattt---attagctga-tggtgttgggtaaaac-gtccttttcttgaggtcctgctt--tctatgtgtaatataag--aatcaaacaacaattaactcttgacaatattgtaagcattaGGAAAACTTCCC-TTTTTCATTCA-AATGAAATCCTGTGTTGAACTTCAACTGGATCCATTGATAGCAAGGTAAGAGACTGTTGCCCAGAAAAATCTCCTGATTGACTCCCTGAGATTCATATTCGGGATCTGAGATCTTCAGAATTCAACCAGGAAATTGTGGTTTTTTTAAGCCCAAGCATCCTCTAACATTATAATATGATCAATTTTGATACGATGAA---------ACATAG---GCAATAAAATTCTGTACTTTTCACTATGGTAAAATATAAATAGTCCTTCTGCAC---------------------------------AAATTAAGACAAGGAAATGTGACTTTTAACCCAGTAAAGTAAATAACA-GTTATCAGAATATAAATGAACCCC----------------CAAAAATGATCTCCACACTATTTTTTAAATCTTTTAAGGGTATCATTTTGCCCTCTCCTCATTAGTTGGACAAAGCAGGAACTTGGGCACCACAGACCTGGAGCAAGTATCTGTGCGCTTTCCCACTCTGTAAAC-ACAAGACACAGAATGCCACA-CTATAGCTCTGTGTTGGGTATTCATTAAAGAAGGAGGGCAGGCTAGTGGGAAGGACCATGGCAACATAGAAGAATGAATGGCTCATGTGTCAGCTGGGATGGTGGTTGCTGCTAATTAATAGCTCAAAGGTATTTCCCCTATGGAACCAGGTCCTCTGC s bosTau2.chr6 21373460 1695 + 69624268 aacataacctttgaattcatatacttctctgtctttagtattac--------caccatt-atctctttccttgattaatgcagtagtctctcaatattagtcttccttgcat-taacccatatcctctacaaagtaggcatcac-acactggct-acagtcttcttcaaatacaattcagactatgtggctctgtttaacaacacttc--agtgatttagattcttggctgttaacataaaatccaggtatttcactgtggtccacctggccaagcgtgatctggtttcttttca-cctgtccaacatcgtgttggccactgtctccaccaggttctagatacactgtccctt--ctgtttcttaaatggattccactctttcttgcttctagggcttttttcacttagagttctttttatctggaatgttctc-----ccttttgcattactgatacctttgtttccttctgctcaattccagatattatctctttaaagtgacctttcctaaccaatttgtagagttacagtctacctcatc---ttgtttatttcccttgtggtgtgtgtcacacctgtaattatttttttta----ttggtttgtaatctttgtttgtctttcacact-ggagtgtgagttccttgga---agtattctt-ttctatcttaaatgctgttcttcctcagtatttggtacagcagctggtatatagaaggtactcaacaatatttattgaataaatgaatGAAA----CTAGGAGTACTGAGGCTTTTT-CTTCTTTAAAATACTAACTCCTTAAGTCT------TTCCCATTTTCCAATACCTCATGCCGAAAG-----GTTGAAAGAAGTCACTGATACAACTGTGATTTTTTTAT--TCATATCAACCCTCTTTGAGATGTTACTT--TCATtccattaccaattagctgggtgttcctgggtaagtctggcatcttcttgagcccccttttattccatctgtgaaatgaACAAACAGAATGAGAATCAGTGGTTTACATTTTTTTAAGCTGCAGGAAACCTTCTCGTCTTTTATTAACAATGAAATCTTATGCAGAACCTCAAATAGCTCTATTTAAAGTGAGATGGTCTACAATCCTTCTTCTCACTCCCCCACTTGAC-CTTTGAGACACCTTGGTAGAGCCTGAGGTCTTTGGC-TGCAGCTTGCAAACCGTTGTCTGTTCA-GCTCAAGCAGCCTTTTAC----TAACACAATTGATTTTTCTGAGATGAACTCTGAGGCAAATAGATGGCAAATAAATTCCATATTGCCCATGTGGTTAGAGTATGATTAATCTCTCTGTACTACATGAATCAAAAAACATTTGCAGTTGTTAAAAAATTAAGTCAAGAGAATATGACCCTAAACTCAGCAAACTAAAAAAAAAGTCAACCTAATTTAAATGTACGTCAGAGAAGATGTGCTTTCAAAGTTGCTTTCCTTTTTCTTTTTC------CCTAAGAGAATAGCTGTACTCCCT----GTTAGTCGGGGAAGGCAGGGCATTGG-------AGCTCTGGAGCCAGGGTCTGTGT-CCTGCCTATTCTGTAAAGGATGAGGCAGTGAGCATCACGGCTACAATACTGTTCTGTGTATTTGTTAAAACAGG----CAGGCTAGTGGAAAGAGGCAGGACTGGATACAAGAGTG---GGCTCATGAGTCAGCCAGGACTCTGGTCATTGTTAATTAATGGCTCCAACA-ACTTAATCTTCTGAACCAGGTCCTCTGC a score=7633 s mm7.chr5_random 1477360 245 + 11523536 TCTCACAGCTACCGAGACAGCCCAGCAGCTGAAGAGAAGTGCTGGGGTCCCATTCCACGCTAAGGGCCGGGGGCTGCTTCGAAAGATGGACACTACAAGTAAGGCT----CCTGTGCTCTCAGGGGGT-------GGTGCTGCCGTTGCTGCCAGGCGGGAGGGT-TTGCC--TTGAAAGGTAGGATTTTTCCTCAC--CAGAAAATGCACTTGGACATTAGTCCTGAGAGGGGAGGCCCACGGCTCTATCGTGAGAAGTT s bosTau2.scaffold610 36106 245 + 409661 TCTTCCAGCCACCGAGACAGCCCAGCAGCTCAAGAGGAGCGCGGGCGTGCCCTTCCACGCCAAAGGCCGGGGGCTGCTCCGCAAGATGGACACCACGAGTAAGGCCGCCACCCGGG---GCGGGGGGTCTGGGAAGGCACGGCCGT--CTG-CAGCCGACAGGGTCCTGCCGTGTGGACTGGGGGGCTCTTCCGCCCTGCCAAGGAGGGACCTGG---CTGGCCC-----GGGACGGCC--CGGCTTCTCCGTGCGAAGTT a score=12146 s mm7.chr5_random 1478951 297 + 11523536 AGCCCCTCTCAAAGGCATTCCGAAGCAAGCCCCCTTCCGAAGTCCCACCACACCCAGCGTCTTCAGTCCTTCTGGGAACCGGACTCCAATACCACCTTCGAGGACGCCACTGCAGAAAGAAAGGGGTGTGAAGGTGAG-ACATCCCTTTTCATGATCCTGCCAAGGCTAAGCATTGATTCTTTGCTCTATAATAAAGTGCGGCATGTATTTATTTTGGCAGCTGCTGGATATTTCTGAGCTGAATACAGTTGGTGCTGGACGAGAGGCAAAGAGGAGGAGGAAGACTTTAGGTGTGTG s bosTau2.scaffold610 36796 288 + 409661 AGCTCCACTCAAAGGCATCCCGAAGCAGGCGCCCTTCAGGAGCCCCACAGCCCCCAGCGTCTTCAGCCCCGCTGGGAACCGCACGCCCATTCCGCCGTCCAGGACGCCCCTGCGGAAGGAGAGGGGTGTGAAGGTGGGCACAGGCCCTGCGCGGCTCCGGGCTGGCCTGG----TGCGCCTTCGCC----AAGGCTGAGGGGCTTCTGTCTGTCT--GCAGCTCCTGGACATCTCCGAGCTGGATGTGGTTGGCGCCGGCCGGGAGGCCAAGAGGCGCAGGAGGGCCCTGGGTGCGTA a score=6888 s mm7.chr5_random 1479533 110 + 11523536 CTTCCTTTATTGGCAGACACAGAAGTGGTAGAAAAGCCCACCAAGGAAGAGACGGTTGTTGAAAACGCTACCCCTGACTATGCTGCTGGCCTGGTATCCACACAGGTAGC s bosTau2.scaffold610 37193 110 + 409661 CGTGCTCTGCCCGCAGACACAGAGGCGGTGGAGAAGCCCGCCAAGGAGGAGACGGTCGTGGAGAATGCCACCCCCGACTACGCAGCCGGCCTGGTGTCCACGCAGGTAGG a score=-358 s mm7.chr5_random 1479850 259 + 11523536 GTTCCTGC-TTGAGGCCCAGGTGCTCTGCAGACCAGGCATGGCATGCATGTGGGAAGGGTGTTTGAGCCAGAGTAGCTCTTTCCCAGGGTTGGTCTGTGGAAATGAGTAGTTAGAGCCAGGTGCGTAGGTTGTGTGTGCGTAGGCAGTGTGGCCGTTCTTGGTATGATCTCTGAGCCCATTTTCT---------TTGCGGTACCCTTTGCATTGCTTAACTATTTTCCCTA-GATG--TCAGTTTGGGAACATAGGGTGGTGGCTGTGGCTT s bosTau2.scaffold610 37487 223 + 409661 GTCCCTGCGCCGAGGCCCCCCTGCTGTGGGGGCCGCACA-GGCGGGCAC------------------CCGGTGTCACCTTGTCC----ATCGGTCTCCTCCGGGGAGC-GTTGCAG-----------AGCTGTGTGTTCTCA-----------CGGTCTTGAAAGGA---CTGGGTTTTCCTTTTATCACATGCTTGTGGTAAGAAAAGCATCGTTGGATTCTTTCCTCAAAGATGGCTCGGTTgggggcgggggggcgggggggggTGTTC a score=8717 s mm7.chr5_random 1480157 272 + 11523536 GCCACTATCCCGGCCCTGGGGATAGAAGTACTTGCCATCTTGCTCTGTTGATGGGCAATGACTGAATGAGGCTGTCCAGGCT-------ACTCCCTGGAAGGTGTACTGAAACCCTTACCTCTGCCTGGAGGAACCATTGTCTCTGTCTTCCAGAAACTTGGGTCTCTGAACAGTGAGCCAACACTGCCCTCCACAAGTTACCTGCCCTCTACACCCAGTGTGGTACCTGCCTCATCTTACATCCCCAGCTCTGAGACTCCCCCAGGTGAGTACCCAGC s bosTau2.scaffold610 37731 226 + 409661 GCCAGGCCCCCAGCCCACGGG----------------------------------------------GAGGCT--CCAGGCTGGGGGTCAGGCCCTGAGGGGT----CAGGGCCCAGGGCTCCTCTGGGAGGAAC-GTGGCCTCTGTCTTCCAGAAACTCGGGTCTCTGAATAGTGAGACCGCGCTGCCCTCCACGAGCTACCTGCCAGCGACGCCCAGCGTGGTCCCGGCCTCGTCCTACGTCCCCAGCTCTGAGACGCCGCCAGGTGAGCGGCCCGC a score=5341 s mm7.chr5_random 1481260 113 + 11523536 CTGCTTTGCCTACAGCTCCACCCTCTCGGGA------------AGCCAGCCGGCCACCTGAGGAACCCAGCGCTCCAAGTCCCACACTGCCAACACAGTTTAAACAAAGGGCACCTATGTATAAC s bosTau2.scaffold610 38078 125 + 409661 CCGCTCTGCTCGCAGCCCCATCTTCGCGGGACGCCAGCCTGCAGGCCAGCCGCCCCCCCGAGGAGCCCGGCGCGCCGAGTCCGGCGCTCCCGGCGCAGTTTAAGCAGCGCGCGCCCCTGTACAAC a score=22499 s mm7.chr5_random 1481891 1171 + 11523536 CCTGCCCAGCAGTCCCTGCTC---CCTACAGAGAACCCATGCCCGGAGCAGGGGGATGTGATCCAGATCAAGCTCAGTGAACACACAGAGGATCTGCCCAAGGCAGACGGCCAGGGCAGTACCACCATGCTAGTGGACACAGTGTTCGAGATGAACTACGCCACAGGCCAGTGGACACGCTTCAAGAAGTACAAGCCTATGACCAATGTGTCCTAAGTGCCATCTCTGCTGCTGACCCTCATCAGACCAGAGGACAAGGTTTGCTGGTTGTGCTGAGTGACCTGAGCAGATACCGAAGGATGTGCTCCACCCAGCACCTGTGATCCACAGGCTCCTGGGCCCAGCCATTTCTCTGGAGAGT-TTAGGCTTATTTTTTATATTCTAATGAGTTAGTTTTCTGTGTGA-TTAAGATACTTTTTTTTATTCAATATTATG-TTTTGAATGCAAA------CCAAAA-------GTTACTTCAAAATTTTAG---------TGCCTGTTCGACTTTTACCTTTT-TTATTTCTTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAGT---ACTGGCTGAGAGGGCTTTCTTTCTCTCTCCTTGTGCATGCCCTCCCTCATGAGGTTGAGGGGACCAAAGGTGACAGCTG-GAAAGTCTAGGGTGTGAGGGGGGCTATGACCAGCCTTGATGCCACTATTTACCA-------------GGGATTTGTA--TGTCTTTTGTACAGTTGTAAACATTTCAAACCTGTGTCTGGGTTCTTATTTTCATTGTAAA-ATGACCTGAGTATTAAAGTTTAGTTTTTCTAAAGAAAGCCCA-CAGAGCTGTGTTTCAGGCGAGCTTGACTCCCT----------------------------------GCTCTGAG---------------------------------ACCAAACCCCTGCATATACAGCTGTCAGAACCTGGGAGAGGAGAGGCAGGGTTGGA----------------------------------------------------------------------------------------------GGTAAGGCTACCTGAAAATAAAGGTTGGTA--------------AATGGGTAGAGCAACT---------GTGGGCACCCAGGAA-------GTTGTGGAGTCAGACACAGTTACATATTAAATAAG----------------------------------------------------TGTAAGAAAAAGGCCTTTAAA-GTTTTTTAATAAAAAAATACTCATTACAGTTTTCCAAACACGATTTTCCACTTT-AAATGCTATTCTTCCCCAACTGGTAATTCTCATCTATATTTCAGTATTAACTCCCCCCTCCCCC-----CAAACTTCAAGTTTTTAAGCCTTCACTATCAGACCTAGTGACAGCACCCAGCATTCCTAAAA-GGAACCTGAC s bosTau2.scaffold610 38689 1327 + 409661 cccgcccagc-gcccccgcccgcccccgcAGAGAACCCGTGCCAGGAGCAGGGCGACGTGATCCAGATCAAGCTGAGCGAGCACACGGAGGACCTGCCCAAGTCGGACGGCCAGGGCAGCACCACCATGCTGGTGGACACGGTCTTCGAGATGAACTACGCCACCGGCCAGTGGACGCGCTTCAAGAAGTACAAGCCCATGGCCAACGTGTCCTAGG--------------------------------------------------------------------------GCCGCCGGGCGCGTCCCCGCC--CACTTACGCT----------TTAGATCCGG---TTTCTCTGGGGCGTCCTGGACTTGTTTTCTAAATTTTAATATGGGTCCTTTTTGTGTGATTTAAGACAC--TTTTGGATTCAGTATTACATTTTTGAATGTTAAACTTAGCCAAAAAAAAGTTGTAACTTCGTAATCTTGGCCACAGCTCCTCCTGTTAGACTTGGAGCTTTTCTTAGTTTTTCTC--------------GAGTCCCGCTGACCTGCAGGGCTTTCCTGCTc-------gggcggcgcggcccccgcgcggcTGAGGG--TCAAAGGTGCCGCCCGTGGTGGTTGAGCGTggggcggggg---ggcccggcccgggACCCAGGGTGGGCCGTGCTCACGCCCGCAGGCTTTGTACTCGCCTTTTGTACAGCTGTGAGCGTGTAAGACCAGTCCTTGGGTACCTGTTTTCATTGTAAAGACCACCTA---ATTAAAGTTTAGCTTTTCTAAGGAACCACCACCGGAGC--TGTTTCCAGCCAGCTCGACCTCTCTGCTTGGGGGGGCGGGGCGGGGCGCACACCAGAGGCTCTGAGTCAGGAGACCCAGGGGCCTTGGCGCTGAGGCGCGCGAAGCCTCCTCTTCTGACTCTGCCACGTTTTGGGGGA-CAGGGGCAGATTCAGAGCCCCCCCGCCACGACCACTTCCGGGGCCACCGTGGCCTTTCCCCGGACGTCAGGATGGTGTCAGATGCTCAGCAACAGACGATTCTGGGACGGGGCGGGACGGCCCGGAGGCCAGGCTTAGTACCCCTGCTTCTGCCGAAGGGGAGTGCGGCTTCAATCCTGGACGGGACCTAGGACTCCACGTGTTGTGCAGCGAGCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTAAGAAAAAAGCCTTTAAATTTTTTTTAATACAAAAATACTCA-TACAATCTTTCAGACACAATTTCCGACCTTAAAATGCTATTTCCCCCCAAACAGCGA-----ATCTACATTTCAGTAT----------ATCCCCCAGAAGTGAAGTTCAAGTTCTTAAGT-----CTGTCAGAACTGGCGGTAGCACCGGGTACCCCAGAGCTGGAGCCTGGC a score=5706 s mm7.chr5_random 1483621 395 + 11523536 GGCAGTTTTCATTTGTTTATG--TCACATTAAGGAAGAAGAAACTGGAGTTGATATTCAGAAAGAAACATCTCTGTCAGATTCAGGACACCTATCACACCCAGAGTCACAGCCCTAGGCCTGTTGGAAAGGCCAATCACC--------------------------CCAGATTTGTAAATAGGTCTTCGGTTGGTTTTTAGAG---------TTAGTGTTATT-ATTCATTA--ATA-CTTTTAGAAAG-GGGAAACTGTCTTAACAT---GTCCACAATCATTTCCTTCAGAAAGACTATAAAATAATTTGGAA-------------CCAAAAATCCCAAGATTTTACTTAAGTTTTTTTTTTAAAGTTAATTT-------------GTTCCCAAAGTGTA-------CTGCAGAATCAGCTCTGCTGCTGTTCTCTTCCGCAGAAGCTACTCAGCTGGTAGGAAAGGATGG s bosTau2.scaffold610 40393 444 + 409661 GGCAGCTTTCTTTTGTTTTGGCCTCACATTACCAACCAAGGA-CTGAGGCTGAGGTTCAGAGCAGACTGAATTCCCCACGTCCAGCACCCCTCT--------GATTCGGGGC---GGCCCCGCCGGGAGGGCCCTTCTCCACTGCTCCTCCAGGCCCGGGTTCTGCTCAGAGCTGTGAATTGGC----------TTCTTAGAGACTCAGAACTTAGTGTTATTTGCTCATTATAATAATTTTTGGAAAGAGGGCAACCACATCTAAATTAAGTTTTCCAGTATTTCCTTCAGAAAAACCATAAAAGAATTTGGAAATATCAGAGTGACTCAAAGATCGCAAAACTTGACT--ACTGTCAAATATAAAAATAAGTTAACCTGCACCCCCGTGCCCAAAGTGGAACAGCGGCTGCAAGAGCAGC---GGCGGTGCTCTGGTGGGCAGAGGCCCCTC--CTGGCAGGAGAGGATGG a score=2401 s mm7.chr5_random 1484907 37 + 11523536 TTTAGCAAAAGTATGTTGGGAATAAATGTCAGAAACA s bosTau2.scaffold610 41720 37 + 409661 TTTAGCAAAAATATATTGAGAGTAAAAGCCAGAAACT a score=23902 s mm7.chr5_random 1485044 885 + 11523536 GGTCATGTCCACAAACAGGGAAGCCACGAGAGGAATC--TTACAACACCA-CAACCACTCA---AAGTGGAAACAAAGCACTTTGAGGAAAAATTCACATTAATACAAAGAA-----CATA-GGCTATTTCA--AACAGAAGAATTACCAATCCTGATCGGAAGGAGCCCAGGG--CTGG--------AGGCCCAGTC---------TGCCCTGAGTA-----GGTGGGCAGTATGTGAATAGAAGCCTGCACCATCAGGACAGAGCTAATG-GTGACCTTTAG---AAAATTCTTTGTTTCAGGTAAGATAAAAGCATTTCACATGCCAGTTAATCTTCAATCATAACTTTAATCTAAAATAGAAATGGGA-GGGCACCTTGACGCTGGGTCTCAGATTCAAGTGTAGAGGTGGCGCTGTGTAGTAAGGCTTGTTTATCCTGGCCCACCAA-------------GCCTGCCTGCAGCTGACAGGCATCAGTGCAGACGCAGCGCA-GCTGCTGAGGATGGCTCAGTGGTGGGAGGAGCTGCCTCCCACCCAAGCAGGCCTATACA-CAGCGCTAGGAGCT------GGGTCCTTGG-----GGTGGGT---GCCGTGCTTGCCTTCCCACTGTCTGCAGGGCTGGCTGCCCCACACCACCCCAGGATCTGACCAAGCGCTATTTGCCATCTGTGACCCTTCGCCAGCACCGCCTTTTCTTCCTCTTTCCTTTTGACTTCAGTGATTCTGGAAAGGGTTTCTCAGTCTTGGTGCTACTTGAAGAGTCTGCCCTCAAGTCATGCTCACAGCAGTAGGACTGCCCATCCTGGGTGGAACGGAAAGCAGTCCCATCTTGGTGTTCCTTACAGAATGAGTTGGGGCAGAGGTGGCAAAATGAGGTAGAAGGTTTGCCACATACATCACAGTGATGCCAAGGACATTCCCACTTCCCTGCAA s bosTau2.scaffold610 41850 909 + 409661 GGCCCGGTCCACAGCCAG---AGCCGCTCCAGGGCTCACTCGCTATACTATCGGCTTCTCACTAGGATGGAAAAGAAGCACTCTGAG-AAAACTTCACATTAGTACAAAAAAAAACCCATACAGCTGTTTCATAAGCGCAACAGTCAA-AACCACGTTCCCAAGGCATCCTGGGTCCCGGTGCTTGCCAGGCCCCACCCTGGGCTCCTCTCCTGAGTGACGCGGGCGGGCGGGAGGTGGGCAA-------CGTCGTGAAGACTGGG--GATGAGAGACCCTCAGGGAAACACTATACCCCTTGGGTGAGAGAAATGCATTTCATGTGCCAGTTAATCTTCAGTCCTAAGTTCGGCCTAGAAGGACAGCGGGGCAGGGAC----------GGGCTGAGGTTCGAGTGTAGCTGTGACGCTGTGTAGTGAGGCT-GTCTGTCCTGGGACGTCGGCGCCTCGCGGGGCGCCCACGTGGCTCGGACGG---TCAGTGCGGGCGCAGCGGGCGCTGCTGAG-ATGGCTCAGTGGCAGGACG------CTCCTCCGCGGGGAGGCCTGTGCGTCTGTGCCGGGGGCCAGGGCGGGGTCCTCTGACACTGCCAGGCCCGGCCCTCCCTGCCCACCCA-------------TGGCCACCCCTGGTCAGACCCAGCCCCAGCCAGGCGCTATTCGCCTTCCATGACCCTGCGCCAACAccgccgccgccgccgccgccCCTTGGCCTTGCTGGGCCCCGGGCAGGGCTGCTCGGTCTGGGCGCTCCGGGCCGGCTCCGCCCGGAAGTCGTGCTCGCTGCAGTACAACCGCCCATCCTGGGTGGAGCTGAAGGCCGCTGTGTCCTGGTGGTCCTTGCAGAAGGAGTTGGGGCAGAAGTGGCAGAAGGCAGTGGAGGGTTTGCCACACACGTCGCAGTGGTGCCAAGGGCACTCCCACTTCCCTGCAA a score=15107 s mm7.chr5_random 1487213 235 + 11523536 ACCTACCAAAGGGCCGCTTGCCCAAACCGAGGCAGGATAGGTGGTAGGCCTTGGTACAGAACTTGCGGTCACACAGCACCAGCTGCCCACCATCACCACAGCGGAAGCACTCATCCTCTGACTGCCGTTTTCCTTCACCCTTGGCTCTGCGCCTTCTGGTTTTCTTCTTGGCCTTTTTACCCTTTTCCTCTGATGAAAGGGATGCTGATGTCTAGAATTAAGAATTAAGCATAGT s bosTau2.scaffold610 43194 235 + 409661 ACCCACCGAAGGGCCGCTTGCCCAAGCCCAGGCAGGGCAGGTGGTAGGCCTTGGTGCAGGACTTGCGGTCGCACAGCACCAGCTGGCCGCCGTCGCCGCAGCGGAAGCATTCGTCCTCGGACGGCTTCTTCCCCTCGCCCTTCGTGCGGCGCCTCCGGGCCTTCTTCTTGGTCTTCTTGCCCTTCTCCTCCGAGGACAGGGGTGCTGACGTCTGGAACGGGGAAGCCAGCACAGT a score=7891 s mm7.chr5_random 1488770 176 + 11523536 TCACGCCCTTAC----CTTTGGTCTGTCTCCAAGGAACCCACTACAGTTGGAGGCTCCACACCGACAGACTGTCTTTTCATTGCCCAAACAATCAAGGTTATAGTTGAAAGTCAGCTCTGTACCTA-AAGGAGACACAATGCTTTGTTAGAGTCCCCCCAACCCCCTGCCCACGTCCTCCT s bosTau2.scaffold610 43905 167 + 409661 TCCCGCCCTCACTCGCCTTCGGCCTGTCACCGAGGAAGCCGCTGCAGTTGGAGGCTCCGCAGCGACACACCGTCTTCTCGTTGCCCAGACAGTCGAGGTTGTAGTTGAAGGTCAGCTCTGTCCCTGCGAGGGGACACGGCACTGGGGGCG--------CAGCCTCC------CGTCCTCCC a score=11587 s mm7.chr5_random 1489165 174 + 11523536 GACCCCAGTG--ATGTACCTGCAGGAATGTCACACACAGCAAACAGGCCAACCCGTGTGTCCCCATTCACTGTCCACTTCAGGGTCTCACAATTGGGCTGGCAGCTATGGTTCATGAATCGTGAATAATTCCCTTTGGGGCCAGCATCAATTATGCGGTCCTGTAGGAAAAAAGTC s bosTau2.scaffold610 44213 176 + 409661 GCCCCGAGTGCAGCGTACCTGCGGGGATGTCACACACGGCGAACAGGCCCACGCGCGTGTCCCCATTCACTGTCCACTTGAGGGTCTCGCAGTTGGGCTGGCAGCTGTGGTTCATGAACCGGGAGTAGTTCCCCTTGGGGCCGGCGTCGATGATGCGGTCCTGCAAGGCACAACTC a score=19676 s mm7.chr5_random 1539467 538 + 11523536 GCTGAAAACCCGAGCTGCTTGTCAAGTGGTTTGGCTCCGGGCGTTGTTCCTGGCGTGAGTTCAGCTCCGGGACCGGTGCGTTTCGGCGCTCGGGTT--TTTCATTCGAAACTTTCTGCTCGGGTCGAGCGTTACTT--GCGTGCTGCGGCTGCGCCCAGGTCGCTTGCTGCAGTGGGC-TGTGGGTGTGTGCGCGGGCGG-------------------GTCCCGCGTGGTGCTCCGGACTGGATCCACCGACT-ATGATATTTCAAATGTGCCAG-CGCCAGCCACCTCCAGCCTGGACCTGCAGCCCAGTTGG-GCAGCTGCTGTCGGAGAAGCCTTTCCCCGAGAGCTGGGTTTTCCTAGGCGTCAGAGCGCCGCCGCGTGTTTCTCTTTCCTCTCTCTCTG---GGTTTGCTGGA--CCAGCTATCAACATCTTTGCTCACATTGTTTGCTTCGCTGTTCCTTTTGCGCAAGAAAT-TTGTGTGGTGTCTTTGGTACTATAGAGAAAGACAGAATTCGCCTTT-AATAAAATTACGAAATATTTGTC-TATCTTTATTTTGCAAGGGGT s bosTau2.chr4 22880690 566 + 69556449 GCTGAAAACCCGAGCTGGTTGTCAAGTGGTTTGCCTC-GGGCGT-GTTCCTGGCGCGAATTCAGCTCCGAGACCTGTGCGTTTCGGTGCTTGGATTCCCCCCCCCCGAAACTTTCTGCCCGGGCCGAGCGTGACTTCGCTGAGCCGTGGCTGCGCCCGGGTCTTGGGCTGCGCGGGGCGGGTGGGCGTGTGCGCAGGCGGTCCCCGAAGCGGCTGCCCAGCCCCTCATTGTGC-CGGGAGGAGATGAATAGGGTGGTGATATTTCAAACGTGCCAGCCGCCAGCCACCTCCAGCTTGGCCGCGGACCGGAGTGGGAGCGGCCGGCGCCCGGGAAGCCTTTCCTGGAGAGCTG----CTCCGAGACCGCAGAGCGCCGCCGCGTCTCCTTTACCCCCCTAATTTTGAAAAATCTACTAGCGTTCAGAATTTTACTCCTCCTCTTAGATTTGTGGCTTCGCTCTTCCATTTGAGCAAGAAATACTCTATGGTTTATTTGGTATTATAGGGATAGTCCGTGATCATCTTTAAATAAAATCACGAAGCATTTCTCGTTGGTTTGTTTTCTTTGGGGC a score=2573 s mm7.chr5_random 1540036 133 + 11523536 TATAATTT-GTATTGGCCCAGCAGGGATTTCCCACACATTTGGTGACATCTAGGAAAACTG-GCAGGATTGTCTTCATTCAAAATTGAATATA-----------ACTTGACTGTATGTATAGGATTTCCTAAGATGTGGATATATA s bosTau2.chr4 22881292 136 + 69556449 TACACTTTGGTGCCTGCCTAGC--GAATTTCATAACCA-TTGGTGGCGTCTATGAAAGCTGCGTAAG-------TCATTACTAATGTGATGTATTATGATATTTACTTGAATGTATGTTCAGGATGTCACAAAATGTTTATCTATA a score=2212 s mm7.chr5_random 1540981 74 + 11523536 accttaaaaaGTAGTGCTGGTTCTAACTAATGAAAACCCTAAGTTT-----TTCTTTTGGTGAACCATGGAAATTTAGC s bosTau2.chr4 22881574 70 + 69556449 ACTTTAAAAATTAACGCT-------ATCAAT--CAATCTTATATTTGAGGTTTCCTTTGGTAAATGATGGAAATTTAGC a score=7513 s mm7.chr5_random 1541209 305 + 11523536 GAAGGGACTTG-AGGAAGCTGGGGTCTT---AGGTTTTCTTCATTTCACAGACAGCTCTGAC--AGGTTAGAATCACCC-----GCCTTGTTTAAATCTACATTGAAGAGTCCTGATGATGAGACATTTTAAGTCT-------------------GGAGG--------AGACTTACTTTTAAACTGTG-----GTAGTGACTGGCAAGCTTGAGTGATGTGGC----TGGGCCTGGCCTGATGCAGTGTGGTCTATGTTCAACATAATTTCCTCCTTATATGCAAACGGAGC-TTTCTTTAATCTTAGTTCA-TTTGTTTCTGTAGGCTTTTATGAATTGCACTCAGCTTCCTG s bosTau2.chr4 22882662 349 + 69556449 GGAGGGACTTCCAGGAGACTGGTAGCCTCAGAGGTTTTCCTCATTTTACAGACATCTCCGATAGAGAGTaaggtcacacagttagcttagtttgaaccaaaattcgggtctccagatgcccagtGTTTTTGGTTTTTACTTTGTTTTCCAGAGCGGGAGAGGGAGTATAGATCTAATTTTAAACTGTATTAGTATAGTGACTGGCACACTTGAATTTTATGACTATATAGGCCTGGCTTGATGCAATATGATCTACTTCTATCATTAT---CTGCTTGTATGTACAAGTGCCACTTCATTCATTTTAATTCAGTTCAGTTCTGTGAGTTTTTATGCCTTGAACC--ACTTCCTG a score=2879 s mm7.chr5_random 1592149 42 + 11523536 TAGGAGCGGTGGCAGGTGCAGCAGCCAGTCTCAGCAATTGTG s bosTau2.chr17 8756285 42 - 45915461 TAGAAGCCGTGGCAGGTGCAAAAGCAAATCTCAGCAGTTGTG a score=26764 s mm7.chr5_random 1592238 1119 + 11523536 GGAAACCAAATGTGAATATGGTGGATGGGAACTTTCCACCGACTGCGCTCAGTTTTCGCATTTGCCTAGAAGTGGGAATGTTGGACTGTGGTGTTTTCATCCAGGCCAGGTGGCTGTTGACCC---CCGCTTCCCCGTGG--------------------------------AGTGTGGTGAAATTCGTATTGTCGCAGGGAGGGGGGGTCCCTGGGGTACACCGCAGACGGGAGGGCCTCCT-----------------ACACTGGGAATCTTTT---GTTTTGCGGTTTTCCATATACTCTGGTATTCAGTACCACCGGCATTTATAGGCATGGGGTAAAATCCCATTGCTGTGCGTTTCTGGAAGCAGCATGGATCTGATCGCGTTCAGCGAGACTTTGGGACATGCTCGAGATGCGAATGCGGTCCGCTGT-TGTTTGTGTCTGGCTTTGAGGTTG---CTTCAGAATTTCCGACTGTGAACTCTTAATTGGCATATTTTACAGTCTAGCCACGATAATATGGGA-------GTCGATAGAGAATCCCTAACGTGGAATCATAATACATTTATGTTTTATTTGAGCCTATTCTATAAAAAGCAAGGTGTGTCTGAG----TTAACCACCTGAAAACTGCAGGGCTCTGATGGTATGATGGTAGACTCTTT--ATTTAATGGGCGCTGCTGTGGAAAGTGGAAAGTGGATGGTGCTCTTTGTTCCTTAGAGACTA---------ACCTAAATTTCTTGAACCCAGACCGTTTGATGTATTC---GGATTAGAAGAGGGTA---TTTTTAAAAACCAAGTTATTCAGTTAACATTACTAAAATGTTTACTGTCT--CTGTCCTGAGTG--------------ACACATACAGCT-------AAGGAAAGA----CTATGGCCGAGTAGATT------AAGTCT------------------------TCTCAAAAAGGA--ACGGTCGTGAGTGATACACACTGGGACCAGCAGGAATAGAGCTGTTTTGTTTTTAGTCTTTTCCAGTTACAGACTAC--AGTATCTAGAGAAGT------AAGTAGTCTGCTAG---------------------TCACACACTTACCTAGTTAATAATAA------TTCTTAACTGTATCCATTCTGTCAGATGCTATCTTGTTAAAGTCTC-----------------------AAAGAACTCTAGAAGGTAAATCTTGTTACTTGTTGCAACAGTTGTATCCAT--------TGTGCAGATGTAGCAAGAGCCGAGCAGAGCAAATGTGCAGTTTGCTCAAGATC s bosTau2.chr17 8756348 1298 - 45915461 GGAAACCAAATATG--CTGGATGGATGGGAACTTTGCACCGACTTCACTTGGTTCCCGTGTTTGCCCCGGGGTGGGA--GCTGCGTTAGGATCGGTTGATCCAGGC------ACTGCCCCCCCACCCCACCTCCACTTTGCGGGATGACATTTTGACGTGTAGGAAGCATCCAGTGGCACGAAATTCTTATTGTCGCAAGGAGGAC---TCTCAGGGGTAGGGCGCAGAGAGGCTGGCCTGTCTGTTGGCTATAAACGGAATGCGAGGAATCTTTTTGTGTTTTGCGGTTTTGCAGGCACTTTGGCTTTCAACACAACGATCATTTATAGAAACGGATTAAA-CCCCATTACTGTGTGTTTCTGGAAAGGGCAGTGACGGGATCCCGTTGGCGGAGACATTTGCATGTGTCTGAGATGGGAATACCGTCCTCTGTATTTTTGTGTCTGGATTCGAGGTTGAGGTTGCAGCATTTCC-ACTGTGAACTCCTAAT-GACTTATTTTACAGTCTAGCTACCAAAAAAAGGCATGTGCATATTGATAGGGAATTCCTAACATGGAATTAGAGGTTTATCATGTCTCATTTGGGCCTTTTCTATAAAAAGCAAGGTGTGTCTGAGTGTCTTATCTGCTTGAAAGCTCAAGGGGCATTATGCTATGATGGTGGAATCTTTGGATTTAATTGGCTCTCTTGTAG---GTGAAATGTGGA--AAGCTCTTTGTTCCTCA-AGACTAAGTTCACAGATCCAAAATTTTTATATGTATGTAGTTT-ATTTATTTTTAGGATTA-AAAAGTGTAGGCTCCATTAAAAATACGTGA---AGTTGGCTTTCCTAAGATGTTTACTGTATAAATGTACTGAATATTTGCCAGGTATTTCCACAGAAGAATGATTTTAAAAGAAAGAACCTCTCTGGCCTGGAAGTTTTTTTAAAACTCTTAAACATTTTTTTGTTGTCTGACCTCTCAGAAACCAATATGTGTATGGATGATAAACACTTCTGACTATAGT--CAGAACTTTTTTCATTTCTTTCCATGTGTGATACAGGCAACATAGTATCAGGAGAAGCTGCTAAGAATGTTTTGTTAGATTTGTGTTTTGTGTGGGTGTATTCACATTTATTTATTTAATAACAATAATGTTGATTAAGTATGTCATATGTGTCAAGCA----TTTATTAAATTCTCAAAGGGATCTTGGCTTTTTTAAAAAAGGATCCTGGTAGCTAAATATTGTTACCTGTTTTAACAGTTGTAAAtattgtatccgtgtacagatgaggcaagtaaactgcagagcaggtatacagtttgctcaggatc a score=3178 s mm7.chr5_random 1593652 84 + 11523536 CTCTGGTTCCT--CTGGCAACTGTTTCTTTTTCATTATTCAGAAAGATTAGAGATGTGTCAGTATTTTAAAAGGTATCTTTTGGGA s bosTau2.chr17 8757790 85 - 45915461 CTTTATTTCCTTTCTAGTGACTTATTCTTTTT-ATTTTTGAGGAAGATTAGAGGTTCATTAACTTTTTAAAAACTAACTTTTGGAA a score=5227 s mm7.chr5_random 1598139 238 + 11523536 AGGAAGTGGAAGGCAGCAAGGGTTTGTATGTTGT----TTGTTTTGCTGTTTAAAATAAG-AACATTT-GGGTTTGGAGCTGCTCAGCTGAAACAGCCAAGGCTTTGTG-GCT---GTGACATGCACACAGAACCTTTGGGATGAGGCTCAGGCTTTGA----TTGGTCTGTTCT------GGAATGCTATCAGCCCT-----------TCAGAACT------AAGCTGCT-------------AGAATTCCAGATTCTAGAATGGAGAGTGATAATAAATAAATGAA s bosTau2.chr17 8762547 288 - 45915461 AGGAAGTGAAAAAGACTAAATATCTCTTTGATTTGGTATTGTCTTGTCATATAAGGGAAGGAACATTTTGGGCTTGGAGGTGGTCAGCTGAAATAGACAAGGCTTTGAATACTTACATTACGCTCAAATAAAATCTTTGAGATGATATTTAAATTCATAAATGTTGATCTATTCTCCTAGGAGGATACTACCACCTGTTTATCCTTTGGTCAGAAATCTTTGGAAAGTGTTTATGTACTTTCAGAGAAATTCAAATTCTAGATTTGGGAGAGTTAATGAGTAAATGAA a score=15533 s mm7.chr5_random 1598962 536 + 11523536 TTTCTTTTCCTAGCAGCAGA-GATAGGTTTCAT-----TTAGTTTTGTTTGAGATCCCT--GCAGTGTTCTTGCCTCACAACCTATTGGCAGTATGGTGAGGTGTGTGAGGTAATGGCTGGTCTCCAGTCCTCCTCCTTCCTCGTGTATGCTCAGAGTCTTTCTGAGTAAAGCAGCCTTGATTAGTATCTGTCTTGTAGGCTTCCATATTGAGTGTCATAAAATGCTCCCTGTTGGCCA--GGGTGGGGTGTTCTTTGCCTGTTCTTCCCTAGGCC--ATAGGGTGCCTATGGTGTCAGTTATATAAGGACTATCAAGTCCC-----CAAAGCATCCTGCTTTTTCTCCTTTCCCCACCTCCAGCTTTCTTT---ACAGCAGTCTTTGTGGGATGCACACTAGGAGTGTGTGAGCCCTCTTCATAAGATGTTCATCAGTCAGTAGTTGCTGATGACTGTAAACAACAGCAAACGACTGATTATGGGATTA--GCACGGTTATTTCAGATGGAGAGGAGGCTGAAGGAACTGTGTAACTGCTACTTTTTTCATGGAGTT s bosTau2.chr17 8763723 545 - 45915461 TTTTTTTTTCTAGTAGTGAATAATGGGTATTGTGCTTTTTTGGTGTGTTTATGATCCCTTTGGAATATTCTTCCTTCCCAGTTTGTTTGGAATCTGGCT-GGCAGATGAGATAATAG----TCTTCATTCAGTTTTCCTCGAATTGTATGCCTAGGCTTTTGCTAAATAAATCAGTTCTGATTATTATCTGTCTTCTTGACTTCCATATTGGCTATCACAATATACCACCAG--GGCTACTGGGTGAATTGTCACGCACCTGTTCTTTCCTAAGTCTGGTAAGGTGCCTGTGGTGATCACTATAAAGGGACTGTCAGTTCCTGCATATACCCCATGCTGTCTTTCCCCTTTGCCCCTCTTTCTGGATTGTTTTTAACAATGGTGGTGGTGGGGTGAACACAAGGAGTGT---AGTCTGCTTTGCAAGATGT---TTAGTCAGTGGTTGTAGACAAATGTAAATAACAGCAGGTGATCAACTATGAGACAAATGCATAATTACTTAGAAAGGAGAGAAACCTGCAGAAATCGTGTAACTATTACTTTGATCCTGCATTT a score=6113 s mm7.chr5_random 1600253 196 + 11523536 GAAGATCA-CGGGGTGTGCAGTTGTT-GATGTACAAATGACCACACATCTGGAAACCTCTGTATAGTTTCTGTGGTAGGAAATGTTACTTTTCTGTAAACTTTCTATGACCTGTTGATGTTGAGC--------AGACCTGGTTTTCTTGTATGATCTGTCTGACTTCCTCCCATTTGCAAAACATTGTACCATTAGTAAGGAAGCT s bosTau2.chr17 8768249 200 - 45915461 GAAGACCAGCATAGTTTGCAATTGTTTGAAATAAAAGTGACCACATGT-TGGAAAATTCTTAATGTTTTCTGTGGTTGCAAATGTTATTCTCCTA-GTTTTTTCCATTACCTACTAACTGTAAGCTTTTAGCTAATAATAATTTTCCTGGGTGATCTG----ATTTTTGCCCATTTGCTAAACATGGTACCATTAAAAAGGAAACT a score=4730 s mm7.chr5_random 1601052 149 + 11523536 TTTGACCTCTGTAGAGTATGATCATGCAATTGTGTTTTC-TTCATTCTTCAAAGTGGGCTTTTAGACTTGCACGGTCAAGG------------------ATCCCTTCAGGAGTTCTGCAGTCCTGC-------TGTCACTGCTGTCC-------GCTGTTGAGCACTAGAAATGTGGCCAGT s bosTau2.chr17 8768721 182 - 45915461 TTTCATCTCTGTAGAGTACAGTTATGTGATTGTGGTTTCTTTTATGGTTCAAAGTGTTATTTTATGCTTGTATTGTCAAAGTTTAGCAGTTTTATTTAAATAGCCTCCAGAActatactgtccagtgggtacatgtggctactgcccacatgtggttattgagcactgcaaatgtggctagt a score=5112 s mm7.chr5_random 1601704 144 + 11523536 CTTGCCTGTCGGTTTTTGGGATGTACAGTAGTGT--GGAGCTTCGCAGACTGCCGTGCCC---GGGCATTAGAGGATGATGATATACTGAGTTAGTGGCA---CCTGAACTTGAGACTGAAGGAGGCTTGAGGGCTTGTGTAGACACAGAGG s bosTau2.chr17 8773552 151 - 45915461 CTTGCCTG-CTGTTTTTAGAATGCATGTTAATATATGGGGCTATGCAGAATATGGTACCCTCTGGGATTTAAAGAATGGTGGTATACTGAGTCAGTGACAGATCTGGGACTTCTAAATGTAGGAGTCATCAGGGGATGTGAAGACACAAAGG a score=20154 s mm7.chr5_random 1606950 1217 + 11523536 TTTTTTCTGTA------TGATCTCAAAATGAGGAACAACATTTTCCTTTCTCTTTCTCTCTAACGGCTGTAACAGGAGAGGGAAGGCCT-TTGTGGAGTGCTCTTC-CTTTCTGG-CCAGAGATGTATAGTCATAGGACAGAGGTCTGAGTTCAGGAGAGGCGTG--AAGCCTGGCTCATGTCCTCCTAAACCTCTATGCTTAAGGTCCTGGAGTTAATTTGGGAAAGGCCCA-AGAGCTCACTGGACAACTGAACAGGACTCA---GCTGGTAGAGCAAAAGTC------------AACATGCATTTGGAGAGGAGGTTCTGGT-----------------CTCAAGCACATG----GACCAATAGCAGCAGCCTGATTGGCTCTGCTCTCTGTCCAGAATGATCTTTTCTGTTCTTGCTTATGAAAGTAATAG-------------------------------------------------------------------------------------AATTCCTCAGTGCTGGGCTCAAATACTGCATCCTTCGTGACACTTTCCCTGGTTCTACATCCCCCACCCCCACCTCTAGCTGCCACACAGAATACCTCACCTATTCTTTAGTTTCTGGAGTCACTTTGACCCCTTAGTTTTTCTGTTTTATTTCTGTACCATGTAAATACCTGCATACCAGTCCTGTCTGGTCAtttagagagggttttgctatgtagccctggctggccttgaactcatggcattgtcttgcctcagtttcctaggttgggattacaggcatgcactgctattctggggctGTGAGGTCAGTGTTAACTCCTTGTTTAGATCAAGGTGAATTTCTTGAGAAGAGAAATTATTTCATCTATTT-TTTTATTGTCCAG-------------TACAGAGTTAGCAACTAGCAAATATCGACTGACCATGTGGCCAGAAATCTTATGTAACAACGGCATCTGTTAGGTGTTCCCTAAATTCATGCATAATGAGGTAACATCGATCTCCAAGCACCTGGTAAATACAAGAAAAATTTT-CCCTGTCTTTGGGATTCAGCTTGAAACCAGCTTCATGAAATCCTTCATTCAATAAAACCTGTCAAAACTTTCATGGGAATAACTATAAAA-GTGCCTTG-GGTATCCATTGCCCAGGCCTCAAATGGACTCAGGTAGATCTTAATTGTGACCAAATATGGCATT-CATTTGTTTTTTCAAT-------TGGCCTCCAAAAGAACTTGAA-TGTCACAGA--ATAGTACATGTTTGTTGACTTTAGATGGTCTTAGTTAGAAGATAGGACCAGTTAGGAAATTTCCTTTCATCAGCGGAATGAGTATTGATTTT s bosTau2.chr3 66748758 1226 - 85360813 TCTTTTCTATAAAGAATTGTGTTCAAAACAAGCAACTATTTCTCTATCTCCGTTTGCTCTTACTGGCTAAAACAGGA-AGCAAAGCCCTGTTTTGGGACCCTTGTCATTTTCTAGTCCAAGGGCACAAAGCTACAGGCTAGAGGTCTGAGTTCAGACAGGTCTTGGCAAGTGCTGCTCATCTCATTCTAAATTTCTGTAGTCAGGCCCCTTGAGTTAATTTGGGAAGGGCCTGCAGAGCTCAGTGGACAACTGAGCAGGACTCACTGACTTACAACAAAGAAGTCTCAGGTAATCTTATAATGCCCCTGCAGAGGAGGC-CTGGCAGGTGGGGCACTGCAACCTTCAGTATATTAAGTGACAGTTAGCAAGAGTCTGATTTGCTCTTTCCTCTTCCTGGAATGCCTCTTTCTAATCTTGCCCATGGAAGTAATATTGGGTTGGCCAAAAAGGTTGTTCAGGTTTTCCTGTAACATCTTATTGAAAAAAAACCCAAAAGAACATTTTGGCCAACGCAATGTAATCCTTTAATGCCACGCTCAAACACCACCTCCTCCACAAAGGTTTTCCTACATCACCACCCACTGTCACCCACTCCCACTGCCATACAGAGTA----------------ATTTCTC---TCACTCTGAACCCTTA------TGGCATCATTTTTGTACC----------------------------------CTTTGAGGCATTTTTGCTG----------------CTTTATCTC-------TGTATTATCTGAATCCC------------------------------------------------AGTATTAACTCTGA---TAGATCAAAGTGAGTTCCTTGAGAAGAGGAATCATTTTATCTATTCCTTTTACTGTTCAGACCTCTTCATAGACACATAATTAGCAACCAATAAACATC---------TGTG-CAATAAATATTTCATGACAGTGACACATAGTAGGCATCCAGCAAATGCATACTGAGTGTAATGACATCCCTCTCCCA-CGACTGGAATTTATAAGGGACTTTTTACCCTACCCTTGATATTTAGATGGAAACCAATTCCACACAACCCTTTGAGTTCTAAAATCTGTCAAAACTTCAATGGAAATAACCATAAAACTTGTCTTGAGGTAGCATGTGAGATGGTCTCAA--GGTGTTACAAATATTCTAA-TATTTCAAAATGTGTCATTGTCTTTGTGTGTATAATATCCCAACTGTCTCCAGAAGAACGTGAAGTGTCACAAAGTACAGTGCGTGTGTGATGATTTAAGATCAAACCAATCAACATTTGG---TTATCAGATATTTCCTGCTTATCAGCAGAATGATCACTGATATT a score=30837 s mm7.chr5_random 1661419 940 + 11523536 CTCTTTGTTCCACTGCTTTGGTTTACTTGGCATATTGAGAACACATTCTGGGCCACACACCAGCGTCTGGATATTATTTTAGAATTTCCTGTTGCCATGGAGTGCGTTGATCACTTGCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCTCCATGTTTCTATTTTAGCTCATTCCGACTTATTCTTTAAGATCCTCATCTTTCC-TTGTCTTTACTCTCTGGCTCA---TTTTTTTTTCCTATTCCACTTTAAGAAGAAAATAAATTTTAAACAGACTTTGAAAGAATTTTTTTCTCTGTGTCTAAGTACTGCTTTTAACTTGGATTTTCTTGTTTTAGCTTTTATCTCTCATCCCTCTAACTTTCATGCTTCCAGCTTTTTATCTCACTGGCTCTGGCCCCTTTATGGTTTCTTTATTTATGCTGGTTTTATCTTTAATCTTTTATCCCCC--ACTTTCATGT-----TTTTCTCATAAATCTCATTGGTTTTAGTTTCTCTTTCCTTTGGTTTTTCTCCTCTTCCCATGGCTTAGGTATCATTTATATTGAATTTTGTCGTTGTT--GGTTAAATTTTGTTTTGTTTTCCTATGTTACCATAGTTTTTAGCCTTAATTTGAGGCTTTGATTTCCCTCAATTTAACTTCTTCTTCTGGTTTTAGCAATTCATCCTAAA----------TTCTTGCTTCTCTGCCCTCTCTTCATATGCTCCTTCTATTTCTTCT-----TCCAGATTC------------------------------------------TTTTAAGGTTCACTTTTGTAGTTACAAGAAGGCTAAAAGCTTGGAGACATGGGGAGGGGGGGGCTACAAACTAAACTTTATGGTTCCATGGCGT--------------TCTCCATTTGGGTTACTA----CCCTTTCAGGGGGCACTCATTTCAATGAAAGTTACCCTCCTTTGAATCATCACACCAGAATGCT------GAAAAAAATTCCCTGCCATGCTACCACATTCTGCTTTCTTTTCTATTGGATG s bosTau2.scaffold25 854812 974 - 1124972 CTCTTTGGCTGATTACTTTTATTTCCTTATTATATCAGGAACATATGCTGAGGTATAAATCAGCATCTCAATATTATTTTAGAATTTCTTGTTGCCATGGTATATGTTGATTACTTAA--------------TTTTTCCCT----ATTTCTATTTTAGTTTGTTTTGCTGAATTCTTTAGATTTCTTGTTTTTCCCTTGTCTTCACTTTCTATTTCAAATTCTTTTTTTTCTATTC-----TAAGAAGAAAATAACTTTTCAACAGTCTTTAAAAGAATTTTATGCTCAACTTCTAAGTAATCCTTTTAACTTGGATTTACTTGTCTTAGCTTTTATCTTTCAACTCTCTGACTTTCATGTTTTCAGCTTTTTGTCTCACTGGTTCTAGCCCTTTTATG--TTTTTTGTTTATGTTGGTTTTATTTTTAATCTTTTATCCCTCTTATTTTCATGTTTTGATTTTTTTAAAAATCTCACTGGTTTTAGGTTTTCTTTCCTTCTAGCCTT-----------------------TAATCTTTGTTGAGCTTTAT-ATTGTTTAGGCTAATTTTTCCTTTATTTTATTCTTTTAATTTTATTCTTAGACTTAATTTCATGCTTTGATTTGCCCC---TGAAATTTCTCCTCTGCCTTCATCATTTTACTGTAAAGCTATCAGTtctcttcctcctct-ctcttccttcctcctcttcttttctttctccttcttctccaacttcctcctctcccttcctcttcctcctcctcttcttcttACTTCATTTTGTAATTTGCTTTTGTCATCACAAGAAGGCAAGAAGCTTGGCGACATGAAGA----AAACCCGTAGAATAAATTGAATGGTTTTCTTCCCTGCACCTGCCCTGCAGCTACTTTTCTGCTACTAATATCCCTT--AATGACCTCTCAGTTCATTAAATGATGACCCTCCCCAAAGCCTCACTCCAGAATTCTCAAGAAGAAAACAATCTACAGCAGTAAAGCCTC-TTCTGGTCCCGTCTCTGGTGGTTG a score=3800 s mm7.chr5_random 1664953 274 + 11523536 TTTATCCCTTTAAACACTCACATTTTCTCTTATTACAAACTCCTAGACCAGG-TACTATTTCTGCTGGAATGTGGA---TTTTTAAGTGTTCATCTTGGCAGTTATTTTACTATCTGTCCATTTGCTATCTTCGCTCATAAGTCTTTGATATATCTCTACAAGAAATTTTATTTATTATCAATGCCAACAGTGTCGTTAGTTCCCGACTGATGACctctctctctctctctctctTTTGTTACTTTGTACACACCAAAAATCCATGAAATGTTTCTTG s bosTau2.scaffold25 857078 268 - 1124972 ttcagctcctcaaacacccacatttcttcttgccacaggtcctttgcacatgcttgtgtttatatctgaatctggaatatttttATGGGTCCCTTT----GGCTAGGTTACTATCAAGCCATAAGATATTTTCATAGGCAAATTTTCATTAAGTCCCCAGGAGAAGTTTCTTTGGCTATTAA-GCCCTCTTCTCCCTAAAATC---ATTGGAGTTCTCTCAATATGCTTGTTTTATTT-TAATCTTGCAGACATGATGAAT-CATGAAATGTACCATG a score=2160 s mm7.chr5_random 1665239 139 + 11523536 ATGGCAGTTTCCTGCTTTgagtctagatccaaaccgattaggttctagttctgacatcagactt--atag-----tgatctctgaggaggtacgcaacagttctagacttgagtgtacttattgataagtgcaaataatggtaata s bosTau2.scaffold25 857386 141 - 1124972 Gtaatggttactggcctgggttctggaactaaattaactaggtttgaattctggctcctgtattcactagctgtttgacttttgtcaaattacttaatatttctatgattttattttctcatttata-----aaatagagataata a score=5953 s mm7.chr5_random 1665683 189 + 11523536 AAATTAGGAAGGGTGCTATTTGTTAGACTCGCAGT---GACACATACGGTTTGTTCCACAGGAGTGCATAACCAAGTTCCTAACAGAAAATATCTCTGAAACAAGGTTTTATTTGCACAGCCACTTCTACCAGTACATTACTGAATTCTATCATTAGAACCCAGGAACAGAGGAATCTTGTATTATTAATGT s bosTau2.scaffold25 860998 191 - 1124972 AAAATGCGAGAGATGCTATTTGTAGGACTAACGGTAAAGGCAT-TATGGTTTGCTCCATAGAACTGTATAATCAAAACACAGGCAGAAAATATCTTTGAAGTAAGGTTATATCCGCACTCCTGCCACAATAGAAATATGGCTGCACACCCTAATTTAGAACCAGGATTAGAGACACATTATATTATCATTAT a score=29086 s mm7.chr5_random 1665872 773 + 11523536 GGGCAGAGT----CATCTATCTTGCTACATGAAATTA----TTTCCTTAGATATAGTAGAAGGTTGGACTCCAATTTT-ATTTTATAAAACCAAATGTGTGGAAAAAATTAAGACTGGACTGTAGCACTCCTGAAACCAAGAGCTTGAAAAACATATTGGCAATGGGGAAGGTTATTTCTTACACTTTTATATCCTAAAAATAATCTTTCTACTCTCTATATTCTTTGTATTTCTGAAAA----ATAATCTTCCTTATCCCACATCACAGATGTCTGCATAGCTACAGACTCCACTAGCAAAATAACAAATGGATTCTCAAGATTACACTGCATCTGTTCGTGGGGAAAAAAAAAAAGCAAAGCACTTCCCTGCAGAGAGTAGGAATAGCCAGTGCCTTGGTTGTACCTCATGTAACTATATTTGGACAAATTAGGTGGTCCTT-------------CCTGTGTCAGTCAATGTAACAAGATCTTAAAGGG-----AAATAAGAATTCATTTTTACTTTGTGTCTGAGGCAGAGAGCACACATGCAGAAGCCCAGATTACTATTGC-TTTAAAAGAGGAACTGCCATCTGTCGTGTGTAGAAACTAATACTCAGGCACCCTTTAACTGTGGAAAGAACTTTGACATTGGGACTTTTTCATCCACAAATAGCCCTCAGATTTTCACT-AAGGGAATGCATAGGTTTGGCTATTAACACAAAAGCAGAATGGGGAATAGGCACACTTTTTTTCGTCTGAAA-ATTTAATGTGTTAAAATTGGACTTGAGAAC-TAGCAATATAGAAAATG s bosTau2.scaffold25 861451 787 - 1124972 AGGCAGTGTGCTAATTCCACATTCTTATATGAACCTAGCTCTTTCCATACATATTTTAGGAGATTGGGTTTCATTTTTTACTTTCTAACACCATATTAATGGAAAAAATCAACTCTGAATTGCAGTACTCCTACAATCAATCATTTAAAAAACATATAGGTAAAGAATCAGGTTATTTCTTATG-TTTTAAATCCTCAAAATGATATTTTTACTCTGCA----CTTTGTACTTCAGAAAAGAAAATGATCTTCTTTATCCCCCATCACAGATGTCTCCTTAACTACAGACATTACCAGCAGAATAACAAGAGCATTCTCAAGATTATTCTGCGTCTGTTCATTTTTTTAAAAA-----------GCTTTCCTGCAGAGAGTCAAAGCAGCCAATGCTTTTGTTGTTACT-GTATGATTATATTTGAACAAATTAGGTGATTCCCTCCCTCCCCACCACCCATGTTGGTCAATGTAATAGGCTCCCAGAGTGAAACAAAATAGAAATTCATTTTTACTTCACGCCTGATGCAGAAGGCACACAGTCAGAAATACAGATCACCATTTTATTTTAAAAAGAGATTACCATCTGCTCTGTGTAGGGAGAACTATTCAGGCCCTGTCTAATTGTGACATGTATTTTTAGTTCAGGATCTTTTGA-CAACAAATTACCTTCAGTTTTTCTTTAAAGGGAATATGTAGGTTTGACTCTTAAGAGAAAGACAGAAT-GATAATGGAGGCA--TGTTTTTGTCTGAAATTTTTAATAAGGTAATATTGGATTTAAGAGCTTAGCCCTATACAAAATG a score=20360 s mm7.chr5_random 1669401 1388 + 11523536 AGGTTGCTTTCTTTTTCACACCACTAATTTCCATTAC-ACGTTTTCAGTAACT-GTGAGTGACTAGTAGAACCTTGGTATGCTTCACA----------------CTAGAGCGAGTATCAGTAGTCTTCAGGCTTGGCAATAGGAGACAAGCTTTGGCTT-----CAAGAT---GGCAAACACGTGAAACAGAAATACTGAGTTCTCAATAAATGGCTAACACATGTTTTGACACACATGAATTGAGATTAGAAAAAACTTACTAATGGCTACAGATTTTTTTTTAAACTTCTGTATTTTTTTGGAACTATATTCCAATTCT--CAACATATTTTATTTTTTATTATCGCTGCTG---GTAGTAATTTCCAAAGACTTATTTAGTTCCCTAA----------CTTGTATGTGTTGA----------GAGTCTTGGTGTGGTGGGTGTTAGATGAAGGA--CCAGCATTGTTTTGTTACCCATGAAGATACTG------AATTTTT--GGAAAATATCTCATTATAAGAGA-AGAGTATATTAAAAAATATGAACTTTTGAGTTAGAAAGATGAGACTTT-------------CTGC------------------------AGGTTTCTCACCTTTGCTCCCAGACTTTCCATTTGTAAAGCAGCAATAAAATCTCTATGCCTGCCCCTGAAGGGGATCTCTGAGAATTGGACATAAT-ACAAGGTATACAAACAGCACTGGATAAAC-TGAGATCCACTGTAATAGTTTGTTTGCTTCCAGGAACACC----AaaacaaacaaaaacaaacaaacaaacaaaataacaaaAAATCCCAGACAATAGTTTTACCTGATTTTGTTTTGTTTTATTTTAATCCATAGATTGAG------------------ATTCTCTGTGTTTCCTTTTT---CTGAGTGATATTATTAATAAACCTGACATGATGGGAACTTTCTAGATAAAAGGAGTAGCTTGAAAGAACAA---CACGAAAACTAGATCGA-ATCTTTCAAACTATTTTTATTAAGGTCAGTGACCTGCTTCTCTATGCTACATCAAAACATCAGCCTCATAACACAAGAAGGAAAAGGTCAATTTACTTATGGCATTTACTCTTCAACCTCAGAATCCAGTATCTCTCCATTGTGTCTTTTGTCTTGAGTACAAGTGAAACTAGCAGAGAGAGCTACAGACAAG----GGCGTATATCAGTTTAGATACAGGCTGT-AGAAAATCTTTGCCCCAAATTTGTTCCTTGGAAGCATCCATCTGCTGAACTGAGCTTGAAAACCAGAGGATGTTCCTATAAACACAA-TTG---TTCCCAGATATATGGATTCAAT--------------AAGAAAATGTTTGT--CATCCCAAAATTCAGTATTAAATCAGACATTTCTGTTTGCTCTTTTTTTTTTTTGGTGGTTATTGGTAAATATATTCAATCAGTTGCTGGTGTATGCTCTGTGCCAGGT-CTGTGCCTGGCACCAATGGTATATGTGAAGGCGAAATATA s bosTau2.scaffold25 867031 1426 - 1124972 aggataatgtttgctgtACATCACTAACTTTTGATGTGATGGTTGCCATAATGAGTGAATGAATGGTGGAACCTATATCTGTCTCATGGCCAGATGCAAGGAGTCCTGGGAAGGTATCTGGTGTTTTCTGTTTTGATAGTGAGAGACAAGCTCTATTTGATACACAGGAGTCAGGGATACATAAGACATAGGAATGCTGGATATTCAAAAAGTGACCAATA-----TTCACCACATATGAATGGACACTACAATCAGGTGACCTGTAATCACGGA----------AACTCTTCTGTTTTTTTATAA-TGCTTTCTAATTCTGTTTCCTTCTATAACCTTCTATAACCACTACCACCTATGACAACTCCCAAACTCTTACT------CCTAAACATATCTTTTTTGTATGTGTTGACTTGGTTTAGGAAATTTGTTGTGATAATGGTGACACGAAGGGGTCTAACATTATTTTATGGCCTATGAAGATATTTTGTTATGATTGTTAGGGAAAATACCCCATAGCAAGAGAGAAAGTAT-TAaaaaaacatgagttttggagtcagaaagaacaggctttgtatcctgcctttctgcttagcattataatcgttagtggcaaggctttaaaccttgggtctccgtttctctatttgtaaaacaggaataacagtaaactgc-tgattttgaagcatgtttgtgagaatcagacataatcatgaagtgta------ggactgggcAAAAACAGGACCTATTGTAATGATTT-TCAGCCTTCAGGGGTATTTTTTAAGGCCAATGAAA-----------------------------------CAATATTTTAA----ATCTGATTTTATCAGATTTTTACCCACAAGACAAGGTCAAATAAATGTCAATTATTTTGAGTGGTTTCTTTTTTTTCTGAATGGCATTATTATTGAACATTACATGATGGAATCTTTCTGGTTAAAAATCCCA--TTTAAAAAATAAATGATCAACATTTAGATCAACATCTCCCAAGGCATTTTTATTAAGGTTTATGACCCACTCTCCCCTGCCAAGTCAAACCAGCA-------------------CAAAGGTCATCTTACCTATGACAGATACTTTCCAACTACTAAACACAGCATTTTCCCA--------TTTATCTTACGCATAAATGCAGCTAG-AGAGGACATGGTGCACAAGACTAAGTGGATAACTGTTAGGCCATGGTCAGTCAAGAAATATTTCCTTAAAATTTACTCCTTGGAAGAGT--GTTTGCAGACCAAATTTGGGGGAATAGCAGATCTTCCTATAATAACAAGCTGACTTTCTTAAATATATACATGCACTCCATAGTTTTCTTGAAAAAAATTTTTTTTGTATCTTGAGAATTAATGTGAAAG-AGATACATCTATTTACTCATTCCTTTACTGAGtcat--ttaatgaatat----------tcgtcaatttcttctatgaaccaggcactttgctcggtacctgggagaca---aaaggaggaataca a score=17309 s mm7.chr5_random 1671390 546 + 11523536 taatgttttccgtgagcctatgaggtatgtattatagtacggaagaagaaatataatgttagaagggatagccagcttgttcaaggtgacaaaacttggaagaagtaga---------tctaTCTGCCTGCAGGATCCCAATGT-AACCTCTGTTCAATAGCCTCTCAGAAGAAGTCTTGCCTGTGACTCACACAGTTGATGAACCAAGCGAATAGATTCATTTAAGTG--CAGCAGGAGAGTTATTGCTCCCTCAGGGTTCTTGATATAGCTGCTCTACTAGTGCTACCAATTTCTATAAATGGGGAAAACAGTAATTAGGCCTACTGAGTTGAAATCTGGGCCCAG-AGTGATGCTATAATAGCTACAGCCCTAAGTAGGGATGCAAACAGCACCAGTAAGCAATGTGCTGCCTTGAAGAATGACCACAGGAAGCTTTCAGAAGATTTTGCTTTTCCATT-----------------------GTAGCCACTGCAAGATCAAACAACTTTA--CCCCCACTTCTATTTCTTTTTAAAGATTGTTTTTGTTTGAGAAAATGGAGTATTTTGGTTCTAAAAGAG s bosTau2.scaffold25 869326 576 - 1124972 taatcttcacaacaaacctatgaagtgcacgttattttatagatgaggaaatacaggtttagaagggttgaatagcttgctgaaggttacataaatagaaagtggaatagttctgggttcTCTCTGAGTGAAGGGCACAAATCTCAATCACTGCTTTACAGCCTTACAAGAGAGGTCCATCTTGTGACTCATACAGTTGATGAAACAAATGACTCTATCAGTTGAAGTGTACAGCAGGAGAATTGCTGACCCCTCAGGGCCCTTGATGTACCAGGACTGATGGTGCTAACGGTGCCTATAAATTAGGAAAACAGTCATCAGGCCTACCAAGTTGAAGCCCAGGGACAGAAATGCTTTTGTAATAGTTACCGCCATAG--AAGGGAGAAAAAAACAT-----AGAAATCCATTGCCTTATTAAATGATTCCAGGAGGTCTTTAGATCATACTGTTTCTCTTTTTGTTGGGGTTGTTTTTTGAGGGGGTGGGGTCTGAAAAAGGAAACAATTTTATGCCCCACCTTCTAGCTCTTTCC-AAGATTATTTTCATTTGTGAAAACTGAGTGTCTTTATTCTGAAAGGG a score=10111 s mm7.chr5_random 1722325 393 + 11523536 TTGTCATTCGTGCTATGATGTTTCGAAACTGAAGAGAAGGTGCTAGCAGTGGCTACACCAGGACGGCAGATTTGAGTTGGGCTATGGCAGACAGACAGCAGTGTGA---CAAGCCATCTTCAAGTCTTCTTCCAGTTCAGAGGTTCTTGGGTCTTCCAACCTCTAAATCTGGGGCTATGTTGCTGACTCCTTGTTGGCATCAGGCAGATTTCTGGGAGAAGCCCCAGAGACAGCAGCCACCATAGACTGCTTCAGGGAATGAAGTCATTAAGCCTTAGCCTCGGGGACGGCAGTCACTGGGGACAGCTCTAGAGACAGAAGCCATCAGGAGGCAGAACCGTGCGTGCTTACCAGAAGCACATGCCATGCGGCTGGAAGAAAGGCACCCATGAGGCC s bosTau2.scaffold8643 19588 352 - 31930 ttatcatccacagtgggacattctgagattgaaaaggagaggctattaataattacactggggcaacagacttaagtgggagtagcccagacaaacagagatgtatgttcaGTTGACCACTGAATCCTATTACAG--CAGAGGGCCTTTGCTTCTCTAGCTTAGAATTCTATGGCTTGATTGAGCTCCTCTTTTTAGCACCAGGCATGGTTCTGTGAGGAGCCCTGGGGACAG-AGGCATCATGAACAGCCTCTGGCAATGAAGTCATCAGGTGACAGTCTCAAGGACAGCAGACAGTG----------------------------GGAGATAGCACCGTGATTGCTCACCAGA---ACATGC------ACTGGAAGAAATG----CATGAAGCC a score=7187 s mm7.chr5_random 1722718 306 + 11523536 ACCTGCAAATGACAGATGGCACTGATTCTGCCTGGTTCTTGTTCAGGAGCATATGAGGATCACAAGCCACATGGTAGAAACATCAGGGAACCAATCAGCCATCACCCACTAGGTAAACATCTATGAGG---TAAGCCCTGGCCGTGAAAAGTAGATTTAAAAGATTTAGCAGACAGCGCCAATCA----------GAATAAAGAAAAGAGTCCCC--AAGGCAAGGTGGAAAAGCACAAATGAAGAT----------GACAGTT---------AAGAATCATATCAAATTAGAAGACAC-----AGGATTTCTGCAAAGGAAACCAAGACAGTAGAGAGGCTGGG s bosTau2.scaffold8643 21014 336 - 31930 acctgCAAATAACAGATGACATGGGTTCAGCCTGGTTCTGGTTCAGAATCATGTGAGAATCATAAGTTTTGTGGCAAAAACATCAACGAACCAACCAGCAATTACCC-----GAAAGTGCCCACAAAGAACTCAGCCCCAGGGGTAGGGTG-GGGTGTGAAAGGTTATGCAAACTGCCCAAATCACGGGTCATCAGAGTAGAGGAAACTGTCTTTGGAGGAGAAAGTCACGAGGCAGAAAGAAGGTTTTCTTTCCCAGGCAGGTTGTCAGATGGAGTGTTGTGCTAAAGTGGAAGAATCTTGGTGGGATTTCTGCAGAGAAAG---AAAATGCAGGGAGTGTGGA a score=2870 s mm7.chr5_random 1723129 190 + 11523536 AGTGTTTGCTGTTATGGTGTCCTA---AGCAGGTTTCTCTGCTCCAGAAATGTCCCTGTGTCAAGTGGCCTGTCCTTTCCCCTTACAGCTTAAGGTCCCACTCATTGAAGATGTCATGACGGAGCAG-ACAGAGGGGCAAGGA-TGGTGGC-----------------AGTGTGTAGAAGCTGTTCCAGTCCCTTTGTTCATCTTTTCCTGG s bosTau2.scaffold8643 21475 190 - 31930 AGTGTTTGTGGTTGTGATGTCCTACCTAGCGG----TTCTGCTCCAGCAG-ACTCTTACATTGAAGG-----------------AAAGCTCTGAGTCTCACTGAGGGTGAAGTTTATAGCAGAACAGCACAGTGAGGAGAGGACTGATGATGTAATAAGTTATAACAAAGTATATAGAAGCTGCTCATTTACTCTTGATTACTTTTTTCTGG a score=9230 s mm7.chr5_random 1723432 1159 + 11523536 TTGCCTTGTAGTCAACAGATCGTGGTCTGGAAGCTTGTAGCAGGGGACAGAATGAAGTTTAGTATCCT-ACTTGGGCTTCCCAACCTGTCAA-----TGGCATTGAACGGACGTGGTAACACGCTTAAGTCTGGGTTTTCTGGTGTGTAGAGTAATGGAGTTATTAAATCATTTGTCCAAACTACCTCACAGGGCTGTGTTTAGGGTTTGCCCGAATGTCACTCCTAGCCTTGGATCTCCCatgaacttccccatcctaggcct----------tgcagttctttggggactcca-----------------------ctcctcaaatgctgttgccttccCAGCTCATCCCTGGCTAATGGCTGTCCTCTGCTCCTGGGGGAGAAAC-------TTCTCTCCAAGTTTGCACAGAACAAACCTTCACTTTGTGCATGCTAGCACGTCAGACTTCAGTGACTGTGAGGAGGCAGAAGCACTTCATATCGCAGCCCTGCAAGCCCCTAACATTAAATCATGGGCTTTG---TGTGTGAAGCA---CCCTCCCCATGTCTGCC-------------------------------------GGCATGACTGAC------AGCTCCTGCTGTCAGTGTGTCTTCCTGGCCCTTCTCTTAGTTATCATGAAACATTTTGCAGG-------------GTGATTCAGCTCTCCTGTTCCCCG-----TTCCCAGGGAACTCTGGGA----------ATTTCTCATCT--------------------CTGGTTTCCCTCAGTGACTCCAAAATTTCATGAACACACTTGG--CCACCCTATGGAC-CACACTCCATGTACttct------tgagacaggatttctcactatgtagaccagg----------------ctgtcctcaaactcacagagatccacctgactctgcctctcaa------------------------gtgctgggattaacggtgcaccaccacgcctagcCATATTCAGTTTTAAACAAGAG------TCAGTTTTTGTAGAAGGACATGCCAATGTCTGACATGAGAGTTGGGTTGGA-TCCACGGGCTTGGAGAACCC-ATGAGCTAAGCCAGGGGAGAGATGGCTGGCTGTTAGCAAAGCAGACATCAGAGCTCTCAACTGAGACCCAGTGAGTATCTCCATGTCAGAAGGAACATACAGTTGTTATGTCATCAGGAGGATCC------TGCCATTAGTGA---AGGCGACTGGCT-ACCTGCAAAGGGTTAATTTAAATCC-CACCCATCTTAGAAGTGGGAGGCACCTAAA-GGAGGCACCAAGGTTTAGGGATCCACAT---------CACTAAGAGCTCTGT s bosTau2.scaffold8643 21665 1309 - 31930 TTGCTTTGTAGCTGGCAAATAGTGGTTAGGAACTTTTTGACTAGGCATA---TGACATGGAACACCCTGatctgaacttctccacttgctaggtgggtgacat-gggcaggtattgtaacctgtctgaagcttggttttctcatctgtcaa---atggggatat---ataaCTTGTCCTGTTTTCTGCACAGGGCTG------GTGAATGTCCCCATGTCAC-CATGACTCTGCTATCACCATGACATCCCCCATCCCATGCCCAGAAGGGTTCTGTAGTTCCCTAGGGATTATTTTTTCGTGGAAAGAAACTTGGTTCTATTCAAACTCTGTCCCCCTTGCATCTCTGTCCT------TGGTTCTCCTCTGCTTCCAGTTGTGAAACACTCCATTTTCCTTACTTTTTGCAGAAAACAGCTCT---CTTTCCTCATGTTAATAAGTCAGAATTTGCCGACTCT-------CAGAAGGACTTCACATCAGAGCCCTGAAAATTA--AAAGTTAAGTATTGGACTTTGATTTCTGTGAATCAGAATCTTGGCCGTTTCTGCCAATTTAGGACTCTGtgtgtgtgtgctaagtcgcttcagtcatgtccgactctttgcgaccccgtggactgta-gcctgccaggctcct------gtgtccatggga--ttttccaggcaagaacactggagtggttgccatttccttctccaggggatcttccca----acccagggatcagactcacatctcttatgtttcctgtgttggcaggcaggctctttaccactagtg-ccacAGAATATTATTATCTCACTGTAATTCATGCTCAGGCCTCTCCCTCTTCTTGGTTCTCAGCAGTGTGGAAACATTTTCTGTTTTGCAGAATAGTTCAGCTCCTCCGGTCCCTATCTCCAAGCTCAAG--------TCTGACTTCTCTTGTCAGCTCCAAGACTTGGAACTCACTAACATGCTTGGCTAAACAATACACCAT--------GCTCCATATGGTTTTAAATAAGTAAGTTTCTCTTCTTTTATGTAAAGATGATATAGCATCTGACTTAGGAATGGGGTTGGAATCCATGGGCTAGGAGGGCCCCATGTGCTGAGCTCAGGGAGAGACTGCTGGCCAATGAAAACATGTCCCCTGCAGCTACTGGC--AGACCGAGAGGGGCCTAGCAT-TGGGAGGGGGCAGGCAGGACCAAGAGGACCAGCAGGCCCTGCTCTGTGCCCTCTGAGAGGCAGGCTGCTGGCTTGGCTGAAAAAGA--AAGTGAAATCCTCAGCCACCTTGAAGGTAGGGGACACCTCAGTGGAGATATCCAACTTAAGAGG-CCACATTACGTGTGGCACTGAGTCCTTTGT a score=53928 s mm7.chr5_random 1724668 2090 + 11523536 CATAGTCCC----------------------------ATTTCAAAGCTTCCTGGAGT---------------------------------CCAGCTCCCTGACCCCAAG-------------------------------AAAAGAAGTTTCAGGTGTGGTGCAGGGATCCGCAACAAAGGTTTCTAGCTGGGCCCCCACTGTCTAATTATATCTGCAAACAAGAGAGTGGATCTGGAAGCTCC--AAAAAGTGGAAAATGGGCTAAGAGGATGGATGGATTTAATTAATCATTATCACTCAGGTGGGATGGATCCAAGGCTTGATGCTAGACT-----TCAAGAAGGGCCCGGGGAGCCCCTGGCATGCTGTCAGGTGTGAAGGG---AAGAAATAAGGCCAGTT----ATTATGGTCTCACTGTAACTAATCAAAATGAGCGAGTGCGGCGAGGTGCGCAGCTCGATCTATTGGCTCTGCAGCCAGAGGCCTCATATAAATGCTAACGAGGCAAGGATGGAGGTCCGGCTGGC-----CAGGGCTGCAGAGCGCTGGG-CTGCAGCTCT-GTCTCCTCGGACACTACTGCAGTCCCACTTTAATTTGCAGACATCTTAAGTTCTTGGTGTCAGCATCTGGAGG-------ACCGGAGGGGAGCAGCTGTCGCCTAATGGATGTAATAGATTAACGCTGTAG-CCACGTGGATCCCTCCCATTT---------TGTTGTCTGGTTTGTG---TCCTATTTATTTTGTTTACTCCCCGCTCCTGTGGGTTTTGGGCAGAGAAGTTTTACATCAGGG-TGACAAGGGAAATCTCCACTAAATGCAGGGTACGCTAGAATGCAGAGGCGAGCACC-GCAGGGGTAGGCTTTAGAATTGGACAGAGTAGgtccccc----ggattatcttgagcaagtagatctgacttctcagggttgtttgtttgtttcatctataaaatgaggttaacagtagtgcctatggggatttgtagggattctttgagacacctatataatggtttagttcagaggtaggcatacagATGGTGCCTCTtcatcatcatcatcaccgtcaccgtcatcatcaccatcaGTTCCCGGCTACTTCTTCACATGCTCCTGCTTTGT---GGACTCCAACCAGGACTAACTCAACAAGGGATTCAGACTTCTGTTTCCCCACTGTCACATGCCTCACTTTCTTCTCCTCAGAAAAACAAAGCATCCTTTGAAAGG-GGAATTGCCTTCATTTCCCATGGGAAGTCATTTCTACAACCCACGAGTAACTGCAGTCTAATGACTAGAATGTGACAGTAGCTATCAAGAATGAAATGTTCCATAAACAGTGCAGCCTCCTAAAATGACTCAATCCCACGAACCCCCATTTGGGTTCTCTCTTGGTGAGCCATTCCTT-TCAGCCGCTCCCCCACACTTCTTACCCTCTGCCACCCAACCTTCCCAGATCATTAGACCCCAGCGATCACTCCCAGAAGTCCTCAGGGAGTGCTCAGCTGTCCTGGGGCTCAGGATTAAGCCTGAAGT-------------------TGAGTAGCCTTGGGGAGGTAGCAG--------GGGTCCTGATGCAGCGCAAGGCGGTTTGCCAACAGGCAGGGCACCGGGCCATGCCTCATGAATTTTCAAGGAGGCACCATCTCATCCCAGAGCATCTGTATTTCATCTCAGAGCATCTGTAACATTCTATCGAATCTTTTCCTTGGGGTTTC------AGCTGATAAAGGATGCAGGATCCACCACCCACAGCTTCTCCACTGTAGCTTGGTGGTGAAGAGCAAACATCATTGAGGGT--GGAGTTGGAGCAGAG-CAAGCTG-------------TCAGCATCCCTCCCACTGCCACCAGAGCC--CAGCTAAACTGCTCACACGCAGAGTCACAAGACTCCCTGAGACAGGACCCTCTTCCTTTCCTCTTTTCAAAAAAGCTTTGCTCGACAGTGGGCCACGCCATCAAG--GCCTTTGGGGTTTATGTGGGCTTTTGCAGAGGAAGCAAGAATTCCGTAGTCAGTTCAACATACCCCCCACGTACA---------------------------TCGGA-------------------------------TCTTCAGCTGTCAAGAGAGC-CTGA--CTAa----------------atactttcatttttaag--aacgagattagggcctagagactttaaattacttcatggacatcacatggacagccaacaacagagcagagct--acagcct-agTGTGGGGCTCGAAGGCTGAAGCT--TTTCTTCCCGGGCCCCTGAACAGGGCCA s bosTau2.scaffold8643 23287 2238 - 31930 ccTAGTCCCTTGCCTTCTATTCTTTGATAAACTCCTAACATCAAAGCAGTTGGGAGTGGGACACTCTCTCCCTCCTCCTTCTAGCTAGCATCAGACCCCCAAACCCAAACCTTTACACATGACTTTCTTTCCGTAGAAATGAGAGGAACCCTTGGTGTGCTGCGGGAGGTAGCACATTAGACTTTTCACTAATCTCCCATTGACTAATTATATC-----ACTGCAAAATGTGTTTGAAAACTCTTTGTAAACTGAAAAATGGTTATGAAGGATGAAAGGGTTTAATTTGTCATTATCGCTCAGGTGGGATTGATCCT-GGCTCGATGCTACACCATAGGGCAGGAAGGGCCTGGGGAGCTGCTAGCATTTGATCATGTGTGAAGGGCAAAAAAAATGAAGCCAGTTTTTCACTGTAACTTCACTGTAACTAATCAAAATGAGAAGACCCAGGGCAGTGGG--GCACAATATATTGGCGCTATAGCTAAAGGTCTTATATAAATGCTAACAAGGCAAGAATGG-GATTCGGCTGGCTTGACCGAGGCGGCAGGGAGCAGAGTCTGCAGCTCCCATATGCTCCCATAGCAGTGCCATCTCATTGTAATTTGCGGATATGTGAGGCTCTGGATGCACATACCTGGGGGTAGGGGCGCAGAAGGGAAGCAGGTGCCACCTAATCGGTATAATAGATTAAAGCTGGAATCCACACGGATGACTCCAGTTTCAAAGATGCTGTTATCTGTTTTGTGCCCTCCTGTTTGTTTCGTTTACTCCTTCTTCCTATAGCATTTTCTGGGAGAACTTTTATTTCAAGAAGGACAAATGTAGTCTC------------------------TTCAGGGGTGGGTACTTACAAGAATGGGCCTCAGA-CAGATCAGGCTTGAGCCCccagctgggttaacttgagtaaatatatgtagcttctttgagcc--tcagtttcctcatctgcaaaacgtggctaatgagagtgccca--ggtatctttagggattcattgaaatacatgtgtaaatgctcagctcagagcttgtcaaatagaaggtgctcaataa-----gtggtagctactattattATCATCGTTATTATTTTTTGGTTGCTTATTCATCTGGTCATGCTGAGTAAGGAACTTGAACTGGGACTGACCTAGCAGGGCACATAGGCTAGAGTTGCTGCACCATCATATGTTTTATTTTCTTCTCCT--AGAAAACAAAGCATCCTTTGAAAGAAGGAATTGCTTTCATTTCCCATGGGAAGTAATTGCTACAACCCACGAGTAAATGCAGCCTAATGGCTAGAATGTGACAGTAGCTATCAAGAATGAAATGTTCCATAAACAGCACTGCCTCCTAAAATTACTCAAATCT-CAGTGCTCTGCTTGAGTCCTCTCTC------CCACTCATTCTCTGCTGCTCCTTCTCA------ACCTCCTTCCA--------TCCCCGATCCCTAAA------------------------------GAGCGTGGGGCTGTCCTGGGATTTCAGATAAAGCTTGAAGTGCTAGCTGTGACTCTGTTCCTAGCAGCCCGGAGAATGGGGCAGGGGGCGGAGGGTCCTGAGGGTGCCAAAGGCAGTTTGCTAACAGGCAAAGCAGCGGACCACGCCTCAGGCATTTGCAGAGAAACATCATTTCATCTCAAAACATCTGCACCTTA-------------------------------TTTTCCCTAGGGTTTTACTCTAAGCTGACAAAAGATGCCGGA--CACC-CCCACAGATCCAGCGACATATCTTGCTATTGTTGAACAAACATCAGTTAGGTTTCTGCCTTGGAGCCGTGTCAGTCTGAATAGGAAACACTCCAACATTCTTATCATCGCTGACACACTCTGTAACTCAACTGCTGATAGTGTCAGTAACGCCTCTCCCTATGGTGGGGGGCTCTTC---TCCCACTTCTTGGAAAGCATTGTTCTCAGGCAGGCCGAATAATGAAGGTGCCTTTGGAGTTTATGTCTACTTTCTCGGAATAAGCAAGAATCCCATGATCAATGCAATGCACCTTGTGGATACACAATAAATGTCAACGAATGCAATATTTTTGGAAACACACCCAGACCTTATTTTTCATTCTGCCCCCTCAGTAATAATGGGAGCTCTGACTCTAAATGAGCAACAAATGTCATGccttcatttcacagataaagaaactaaggcctggagtttttaaattatttccctgaggccacgcagacaattagccgcaaagcagagcctgaaaccctgaacttaggacttcaaggccagtgctccttgcatcacggctcactgGCTACTGCCA a score=1548 s mm7.chr5_random 1726792 133 + 11523536 TTTGCTCCATCTTCCAACCTAGAATCCCCCTGCCCCCATTTATCTCAAAATATCTTTTGTTCTATTCTGTATTCCAGAAGCTCAGAAATATTTTCTGAGTT--TTATGTATGTATATATTGTTTTGTGctctctc s bosTau2.scaffold8643 25556 115 - 31930 TTGTCTCTGTCTTCTAAATTGGAAgccacatac--------agcttgagacatcatttgttt-------gacccctgaagtgtcaaagtatttcctgaattagttaattat-----tattattttttagtttaag a score=18209 s mm7.chr5_random 1727716 1025 + 11523536 TTTTTCTCAATCATTTGCATTTCTGGCTT---CTTTTATATTCCACTGTCT---AGCACGTTGGCTTGCTTTCTTG---------------GTATAGTTCCTGCACTCCGCGGTAAGCACTC----------CACGGTCTCTGCCACTCCCTGCTGGCTCCCAGCCAGCCAGCCTTGTCCCTCAACCTGCTGGACTGCTGTCTGTATTTGAACATGACCCTGAGCCCAAAGCATGTCCAACAGATCCGCAAACATCATTGCTTCAG----GGTAGACATTG--------CCCCCGCTTCCTGGCTG--TGTCTGATATATCATGGAATCCTTGTCTTCATGGTCTGGGA------------CCCCAGCAGAATGGTGTGAATACTGATGGATGCCTATTCTCAGGGGCTTCCTTTGCCTCCAGCACTTAATGGTTTTGACCCATGACAACTTTAAAGGATTTGAATTCCTACTTGATCTCCATCTCTTACCCCAGGCGGTTTCAGATCTGAAGTGAAAATGCGAATGTAGGAGTGTTCTGGG-----------------GTAAAATGTTTCCCAACTCCTTTCCCAGCAGATGTAAATGTAAAGCTC-TCTCCTGTAGAGGGCCTTCCCCAGGC--CCTTTCCACCAAGAGTCCTGGTGCTCTGTCCCCTCCTCCCCTCTCAATGCCCCTACTCAGATG------------CCCA--AGGAAGGTCCCTCAGCCCTCTTCCAGACATACTATGGAGAGGC--TGGAGGTGCC----AAGCCA----------TCTGTCCATTCTTCCCAC-GCCCTTACCAGAAGCAGGGACTCGAGATAAGGAAACGTTTACTCCTTAGACCTCTGAGATCCTTAGCTGCTGGGT-TCAGTTTTACAGGGAAACCCTCTAAAAGGGCCTGACTCTTG--CTGAGTTCGCTGGATTCCC-GACTTGAGACAGGTGTAAATTCTAAACCATGGCTCAGGCCTAAACATCAGAAGGCCGGGTGGTTTAACCGTTCGTGTGTCTGCCTCCTC----------------------------CCTGGGGTAGTATTTCACTAATCTTCCGGTACC---------TACAGTAGAGA-GGCAGAGGGGAGGACCAAGGAGCAAGGATCGGGGACTAGGCGTTCAGTCAAGAA s bosTau2.scaffold8643 25671 1154 - 31930 tttttctcaagcatctacatttctggctttcgcttgaaatgtggactatctgacaacac-tgggtttgcagtcttgtgagttgatggagctgggtggctattgtccccttccactagaactcgccctcttgccacagactccaccactccctattgtctcacagccagcc-tccttaaccctctacctgcttggctgctggatgtatttgaatgtgATCTTATGTAGACATCATGACAAACAACTTTGTAGACATTATTGCCCCAACCTAGATGGATATCAGCTGGGGCCTCCCTATTCCTCATGAGCTGCCTGAAATTGCCTTGAATCCCCAATTTGATGACTTGAGAAATCTAAGACTTTCCCAGTA--ATTGTGTGAATGCTCATAGATTAATATTCTCACGGTCTGC-TTTGCCTCTAGCGCTTA-TGGTTTTGACTCATGACAGCTTAAAAGGATCAAGAGTCTTCCTTGGTCTCCTCGCCTTACCCCAAGCAGTTCTGTATTATGAGTG-GACTGCAATGATATAGGTTTTTTTGGAGTGGGTGGTTAACAGAGTAAAGACTTCAATAGCATCCCTCACAGCACATGTAACTTGAAAATTCATCCTTCATAAATTTTTTTCCTTTGGCCTCTCTTCCATGGAAAGTTCTGTCATTCTGTCTCCTCCCCTGTTCCCCAGTCCCCAACCTGTTTAAAATTTGCTTCTCCCAATAGCAGAGCAATTCACCCTTCTCCCAGACATGCTGTTGCAAACCCATCAAGGTGCTCATAGAGCAAAGGTTCCTTCTCTGTTAACACTGTCCATGGCTCTTTAGAGAGGTCAGGATTCTAGATAC-CAAATGTTTTCTGGTTGCACTTTCAATGCCATCTACCACTGTGCATTGGCCTTGAGGAAATAACTTCC--CAGGCTTTTAGTCCTGGTATGAATCAGCCTGATTCCCTGATTTTTGACACATGTAAATCAT----------TCAGTCCTAAATATCACAA-TCCTAGAGATttatctgcttacatggctacctcccctattgggctgactatacacctcctgaagtcagggacagtgtcttatttatctttggattttcattagttacacagtAGGGAGGGTAGAGGGTAAAGTTGGTGAGCAGAGAACACAGAATAGATATTCAGTAAACAA a score=5158 s mm7.chr5_random 1778885 527 + 11523536 TACCAATATTTGCTTGGAATTT--GCCAAGCC----CTCTCAGAGGCATAT-GCAGTTCCTCAGAGTAGACAGCAGATGGCAGTGTTGGTTCAAGAACCAGT--GTCCTGTTG--TCTCTGAGCTGCAGGCGCCATTGAAACCAGTTCTGATTTTAAAATGTCCCAACTTTAAAAAAAAATCGTA---GGTTAATCTTTACTTTTAGGTCTTGTGATGACTTGTAGTTGAGCTCCTAGGC-GTGGAAGAAGAAATGACAAAACTCCTATCTAAAATGCTAAATTTCTTTGGGGACCTCCAGAGACTTCACTGAGGAACAAACATACCGCCATCGTCACCATCAGCATAATTATCATCACCACTGCCCAAAGAGGGACCAAGACACAGCCGTGCCTTGAGAGCCAGGAAGATAGCGCTGT-GGACCAGGTCTCAAAGAT-------GTT--GCAGAACTGGTCACTTGGG--------------TTTAGGGG-------AAACAACACCCTTTG--------ACTTTCCACCTCTCCAAGCATGA-AGGCTACCTAGACCCTGCCAAGAGAGA-CCACGACGCC s bosTau2.chr6 34582658 539 + 69624268 TGCCACGACTTGCTTAAAATCTCCGCGAAGCCGATGCCAGCAAAGGATCGTTGCAGTTCTCATATAAAACCAGCAGGTGGCAGTATTGGTCCAAGAGACAGGCAGTCCTCCGGGTTCGCGGCGACGTAAACGCTGCT---ACAAGTCCTG-TGTTAACATATCTCAAATCTTCCAATC--TCCTACTTAATTAGGTGGCACGTTTGGGTTTCGTGGTGCCCTCT------GTTCCAAGCCCGTAGAATAGAAGCCGGTGAAA------------AGGCTTAACGTTCCGCTGGGCCCCAAGAGAATTCGC-------CAGACAT-----------CATCACCAGCACCGTCAGCATCATCCCTGCCCGCGGGTCGTCCGGGGCG--ACTGAGCTTCGGGAGCCAGGAAAATGGCGCTGCCATTCCAGGTCGCAAAGGTTTGGAAGGTTCAGCAGGAAAAGCCACTCGGGAGTAGCTCGAGTGGTTCAGGGTTTTGTTTAGCCAATGTTCTCCCCATCTCGCAGTGTCCACCCGTTGAGGGGAGACAGACCACCTGGGCCGCGCTAGGTGGGGTCCCCGACGCC a score=11312 s mm7.chr5_random 1779475 511 + 11523536 TTGGTTAGAAAGGACTATTTCCATTGCTCGGTAACGCGGGGTC-TAAGACA--------GCAACAGGCC-------------AAGGAAGCTTGAGCCGGCCTGGAGCGCACACGCCGGCTACTGTCCCCCAAGATCTCCCTGGATCCGGAATTCCACCGCCTCCACCCACCTTCTGCTAAATTAAGACGCCCCAATTCTCCAGCTCAAACCC-GGACCCTCAGCCCACTCTTGTCCACCCAACGCCTCT-GCGCCAACGCAGTGCCCGCAGGA----------AAACTCAAGA----------GCGACCCAGGTGAGCCCAAATTCCAGGC----GCACTGGGCTCC----CGGCTGGGGACCGCTCGACCGCCCAGGGCTA-CTGGGACAAGGGTCGCGCTGCGGG-AGCCACTAGAGGGCGCGGCAACCCCGCTGATCTTACCCG-CTGGCTCC--GGCGTCGCTCAAAGCTCAGGCTCCGGGTCCCCTACAGCGCTGCGCGCACTGGG----GCCGATTCTCTC---TGAGGTTCCGCGCTAGCACGCTCGGGATCCCGACCACCCCTtctc s bosTau2.chr6 34583269 563 + 69624268 CTGATTGGAAACGACTGTTCCCGTTGCACAATAACGCGGGGTCATAAAACAAACAAACAGCAACAGGCCGCCTGCGCGGCAGAAGGATTTTCGAA--GGGCCAGAAAACAAAAGTCGCCCCATCCCTCCAAAGGAGTGCCCAGGACCCTATATCCTCCGCTTC-GCCCACATTTCACTA--TTATGACACCCCCACCCTTATCACCAAACCCAGGAACCTCCGCCT-CTCTCGCACACCCAGCGCCTCCAGGGCAGACAAAGTGCCTGCAAGGCGTCACTTTGAGGCTCCAGGAGTGGGTAAGGTGACCGAGGTTAGTC-GAGTCCTGGGTCCCAGCACTGCGCTCCGACCCCGCCGCGG--CGC-CGACCTCCCGAGGCTGGCGGGGAGCCGGACGGCGCGCCGGACACCCGCTAGAGGGCGCGGCAGCCGCGCGAATCTTACCCGGCTCACTCCTCGCCTCCGCCGGTCGCTCTGGCTCCGGGTCCCCGACAGCGCAGCGGGGACCGCGCCTCGCCCACCTTCGCAGGGGAGGATCTGCGCTGGCACGGTCCGG--CCCCACCACGCCCCCAC a score=7813 s mm7.chr5_random 1780033 782 + 11523536 gtctccgtctctctgcctctccctcactctctccgtgtgtgtgtgtgagagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatctgtgtctctcacccccctccccaacaccctctctccctgtctccctTAACCCCCGCGCCACAAGATCGCCACCAGATACCAGGCGACACGGATCTACCCGACGATCCCAGGCCCAAGCCCAAGTCCCTTTCCTTCCAGCTCAGGACTGCGGAGGCCGCCGCGCCCCAGGCTCTATGCTCAGCGTTTGCATTGTTTTCAACTGCGACCTGAGA-GGAGACTGGGCAGGGTGGAGGGAGGGGGCC----AGGTTTAGGGTTACAGGCGAGCCACAGCGCCTCCTGCAGGCCAGCCAGCAC--CGACCG----CAGCCGCCAGAACCAAAGGCTGGACCAAGCT----CTGTGATTC--GGGGTCTGGAGTGCCCA-------------------CCTTGCCC--------CTTTGTTTGCCCTGC------------------------------------------------------------CCCTGGGCACCCCTGCTCTACTTCATGCCTCTAGCTTCTCTACCTTCCGGAAGGAAGGG---AACTGAAGTAGAAGAAAGAGACTCTCCAAGTCCGTGGCTTACATTTATCCCCTTTTACTACCGTCTAAGTTCCCAGCTAGTATTGGTGGTCCACCCTTCAGTTTAAAACAAAAGAAAAA-AACATTGAACTACTTCAGAGGGAAAAAAAAAAAAAGGCACCGATGAGGTCGGGAATCAGAATGCAGTCAGCGAAAGCTGCGT--ACTCTGCATCCCACACTGAGTACTCTCCTACAAGACCCACcctcctcctcctcctccccc s bosTau2.chr6 34583851 722 + 69624268 GTCCACGCC-CTCGGCCGCTCAGTCACCTT----------------------------------------GAGGCTGGGGACAACGACCGCCCGCCCCCCGGTTTAGCGTCCTC----------------ATCCGCCGCAC--------------------------------------------------------------------------TCCTAGTTTAGAGCTGCGGCGGCCGCTGCGCCCTAGGCTCGACGCTCGGCGTTTGCATTGTTTTCGACTGAGACCTGAGACGGGGGCCGGACGGGGTGGAGGGAGAAGGATCGAGGGGTTTAGGGTTACAGTCGCACGCCAGCGCCTCCTATGGGCCTGAAAGCGCCACGGCCGCGGACAGCTGCGCGGA--GAAGGCTGCGTGGAGCTGAGGCTGCGCTCCCTTCGCTTTAGAGAACCCAGCCTCACCCACTGCGTCCCCCTCGCCCGACGCTCGCTTTGCCCGGGTTGCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGTTGCCCTGGGCACACACGCTCCGCCT-GCGCCTCTCACTCCT----CTTTCGCGGGGAAGGGGTAGACTGCAATAGGTG---GGGAATTCCGAGGTCC----------TCTATCCCTTT------CAATCTATATTTCCAAC--GGACCCCTGGTTCACTGCTCAGCTGAAAACAAAAGGAAAATGCCACCGATCCATTTCAG--------CAAAATACAAGCACCAGCAGAGCCCTAGAGCACTGTG-GGGAAACGCAATCTGCCCCAGCTCTGCATCCCACA--GAAGAGAAGATCGCAAGACCTTTCCCCTCTCCCCTCGTACCCC a score=10598 s mm7.chr5_random 1882249 643 + 11523536 TCTCCTGCCACATGCTACCTCCAGAAGAGCCATGTCATAGTGAAAATAAGGAATGAGACTGGGTGGCAGAT--GCCCCTCCATCGCCCTCCCAGTGTCTCAGGAAGCATTTGCTAACAGCTACCTCTGCT--GCCCTGGGCTCTACAAGCCTGTGCACA----------------GGAATCCCAAGCCCA-AGGGTAGG-CGAATGCTG-ATCCTCTCACCCAGTTCACCAACCCCTGCCAGCCTTGTGCAGGTCCAGCTGCTTCACATCTGCGAACTGATCT---GTTTTAACACAACTTGAGAGTCCAGGAAGGCATAGAATGTGGGGGAAGGAGTGAAACATGAGGTCTACA------------GCCAGCTCCCAGATCCTT----GAAATGCAGG-----------GGTGTAGTCTGATCAGACTAGGGAAGTGGGCAGGCGCCTGTGTCCGGCACTTTCCTTCCAGAGCCTCCC-ACATCTACCACGTGCA----TAGGTCAGAGTCATGATGCTCCAGAAAGTCTCAATTTCAGTGTCTT-TTTGGCTGTTCAAGCTCTTATAAGTATTTTAAGAAT-CTATTCTACCCTAAGCACTTTGCTACAGGAAAACACCAGCTCCCAGCCACCCATTTTAGGGAAGACTTCCTCCACACTCTCTCCCATGCCCTCAAAAGCTTTCTTTCTGGTCATTTATT s bosTau2.scaffold2512 59956 682 + 112053 TCCCCTGATGTATGCTACCTCGGGAAGGCCCATTTCATGGCAAAAATAAATAATGAGA-TGAGTTCCACGTCTATTCCTCAATCACTCTTCCA-CGTTTCTGGGGAAATCAGCTAATGG--AGCACTGCCTGACTCTGAACTTCACAAACCAGAACGCATGGAGATGCCCCCATAGGGATTCAGATCCCAGAGGGCAGTTCAAACACTGCAGACTTCAGCCCTGTTAGCCACCAGCTCCTGGCCTCACACAGACCCAGCTGTTTAACATTCGCAAACCACTATCAATTTTTAACACGGCACGGATGTCAGGGAGTGGGCAGAAAGCCAGGCAG--------AAATGAAGTTAGCACAATTTGATTTGGCCAGGTTTCCTAATCTGAGGAGAAGTGGAGGAGAAAAGGTAGGGTGTGGTCTGGACCAATT-GGAAAGCAGACAGA-GTACATGTCTGGCAGTTTATTTCCTGGGACTCCCCACAACAAACACCCAAAGTTGCAGGTCACCACTGCGGTGCCCCAGGCAGGCCCACCTCCCAAGTCTGACTTattcattcgctgtttaacaggtagttactgagcactaccatgttcaaggcactgtgctgggT-------CTAATTCCCAAACTCCTCTATCAGGGAAGACTTTCTCCATCTTCTGCCCCATCCTGTCAAGATCTTGCCTTCGGGTCATTTGTT a score=16636 s mm7.chr5_random 1884068 704 + 11523536 TCTCTAGGAGCCTACCTAGAGATAGAAAGATATTGAAGTATG-TTTCATATAATGTAG-----CTGTTTA---ATTGCACCAATAGTAAACAAAATGAAAAGGAAACAGATTATTCTC---ATCTCTTGGTATCTTACTTTTGCTCATTTTACCGGAGGAGGGGGCAT-CATGGAGGAGATTGCCATTCTAACCTGCAGAACCCAAACAGAAGAACAGCGTTCCTTGGAAGAGCAATCGAAAAAGTCaacaat-gtgactgccagctagcaagcacctataataatcccgtcaccgcaccagacacattaaacgtattttctttaaactttccaaaacaagcctacagggtaaatattatttccattttctaaaggaaaatcactaaagctgagagaaattgctgagggtgtgcaaggtcagggagccgagcgaagggcagagtcgagatgttaacccctgc-------------ctgcccaaggccTTTCATGTGAGTCACACC---------CAAGTGTTACGCCAACTACCCGCAAGTGCATATGCCCCGTCCAGGCATCTGTCC----TTGTAGGTAGTGCCCTCGACGGGATCGTGTCTCAAACATAATAGGAGTTTCCCACTCAAGTAGTCTTTCAAAAGCAATTCTCCCTAATGGTA-ATCAGCTCCTTCTAAACAGTGACGTAATGA-CCAAAATCCTTCCATCTCCTGGCTCCAACATCTGCAAACGCAAAATGGCT s bosTau2.scaffold2512 62029 711 + 112053 tctccaggggatcttctggagccaggaa----ttgaactggggtctcccacattgcaggcagattctttaccagctgagctaccaCTAAAAAGAAGACAGGGGCAAATGTTTCCTCTCTCAGTTTTCTGGCATTTTTCTTAAGTTTATTTGA------GAGTGGAAATACACGGAAGGGGTCATTGTTATAACCTGCAGAACCCAAACAGGTGAACAGAA-TCCTTTAAAAAATGATTGGAAAAGTCaataacaatagctaccatttagggagcatctactatatatccatcattgtgccagatatgttaaatgtgtcttctttaa--cttccaaaacaagcctgcaggg----tgttatttccattttctaaaggaaaaacactaaagctaagggagattaagtcaactgcccaagatta-ggagtacagtgaatggcagagccgagaatttaactcatgtatgtcttactctgcagctcatggtctttcaagcacataatattctttctctgCAAGCATTATA--AACACACACCAAGTGCAAACTCCCTGTCCAGACTTTCAGCCAACACGGTAAACAATCCCCT-AAGAGTATAATAACTCAAAA--CATAGCAGTTTCTCACTTATCTAATATTAC-AGGGCAGTGTTCCTGAATGGTAGGGCAGCTCTGGC-AAACTGTAACTCAAGGACCCAGAACCTTTCTATCTC----------CACCTTCAAAATCAAACTGGCT a score=20250 s mm7.chr5_random 1885428 659 + 11523536 TTAACTTCCTCTTCTGTTGCTACCCAAGCCACACCACTTCCT-----------------GGTCAAATATTTTAAGGTCTTTACAAGTTCTCTCTATGACCTTTCTTTCACTCTGGGGTGCGC------------TGCATGCTGTCTTTTGCCTTTATATTTACCCTGACAGCTACTGGGAGT----ATCATT-CCCGACACTATCATTATCCC-CACCCTCTGAGTAGGCAAGAGCCTTGAGTGGCTTCATGCTCTCTTTTCCACGGGTTAGACATGAATA---CCTCCGGAGCAATCCTGCGGAGGACCAGGACAGTCAGACAAAGGCTGCAAAGCGGTCAAAGAGAAGATGCTATGCATGCGTCATCCTACACATCCATCATCCTATGCATGCATCATCCAGAGCTTAGCCTGCAAAAGAGATAAGAAGACC-TACGAGCCGATGCCAAGTGCATATCCCCCAAGGCTATTAAGAAGTTCCCTCTAGTCTGAGTTCCGTTTATGACACAATGAAAATATTAGGGCATGTCAGTAAACCACGACTCTCCACTTCCTGCCAAATCCCTCCCTGCTTTGACATTCAAAGTAGCTAATCCATAGAATAATATCTTCCAGAAGACCTTACC-GATGTGCCTCAGTTTTTCTTAGGTTACCCTTT-TACATAAACAAGAAATGTCACTCTGTTTACTACCAGCA s bosTau2.scaffold2512 63128 667 + 112053 ttcactttcactttcactttcaCTCTCACCACACTGCTTTCCAATAATTCATTTATTCCGGTCATATCTTTTGAG-TACTTGCAAAAGTTCACCAAGGCTTACCTTCCCTCCCGGAATGTTCAAGGAGCTTTTATTCATG-TGCTTTGCATTTTTATATTTACATTGATAGCTATTTTAAGTCTGTATAACTGCTTAACACTATCATTATCTTACATGCTTTGCTGTGGTTGGAGTCTCAGGGAGAGATATGCTTTCTTTTCTGCAGATTAGAAATGAATATAGCCCCCTAAGCAATCTTGGCAAGGACTAAGAAAATGATATAAAGAATGAAAAGCTTTCAAAAGGAAAATATTA------------CTCACATA-------------------GTCATCCAGAGCTAGGTCTGCAAAGGAGATATGAACATAACACAAGCCAATTTCAAGCAAATGTCATCTAAGACACTTCAGAGGTTTCCTCTTGTCAAGTTTCCCTTTATGACACATTGAAAAATTTAGGATATGTCAATAAATCATGATTTGCCATTTCCCTCCAAAACCCTCCCTGTTGTGAAATTCCAAGTAGCTAATCCCTAGAACAATATCTTCTAGAAGATTTTACTGGGTATGTCTGGGTTTACTTTATGTTACCCTTTATGTAAAGAAAAAAACTCTTGCTTTATTCACCACCAGCA a score=3037 s mm7.chr5_random 1886836 188 + 11523536 TAACTGCAGGACTTTTCGCAC---TTGCAT--CAACCAGGG---------TTAGGGGAGCAGGGAAAGATGAATTCTGGAGACAGAAGTATCTACCATCCCTTCAGATCTA-CAGGAGATGCCAGCAGAGAGG-AGCCTGCCTCCAG-------------TAACTCATTTATCCTCCTTCTGAATTTGAAAACGAAA-------GCTCCACTCAAAATATTCCT s bosTau2.scaffold2512 64608 221 + 112053 TAATTTCAGGACTTTCAGAATGTTTTGTATGTTAATTGGGGATTGAATATTTAAGACAG--GGCACAGGTTGACTCTGGAGATAGAAACAGCTGCTCTCCTTTCAAACGGACCAGAAGACACCTACAGAGAGTCATTATGCTTTTAATTTACATATATATTCACATATGTATGATTTTACTGAGCTTGAAAAACAAAGTCCTCTGTTCTGCTCAAAA-ATTCCT a score=1238 s mm7.chr5_random 1887055 615 + 11523536 ATATACAAACCATCACAACTCCTAAATAGAATATTGAATTATTCCATGTTTGTTCTGTTATAAAGCAAAACTTTGGAGATGCAGGAAGCAGGGGGGTAAACCTCTTAGTTCACAGTAACAACAAACATATTGAAATTTTAAAAAAATAAACAAACAAACAAAACAATGGAATcagagacaatgagagggctcagtgcataactgtcttgctaacaagcctggcgacctgagttcaatccctgggtcccacgcagtagaagaaaagaaacaattcctgtgaggtataagcatgacctccacctgcatgTATGTATAAGTGCATGTGCAATAATAAATTTTTAAgacctggatacaaacagaatctttattcttctctcgctctctgatgtctgaactagggtgactctttgggtatcatttcctgcctggggagccatctccttgtgtctgaaatgga------aataacaagaatatctgcctcactaggacatggagagaattaagtgacac-gattctggaaggtgtttaggacac-cgcagacatgcaatGCTCCTCT-CCCTCCAAACTTACCAGCCACAATCACTGTCACCACGGTGTGGTGTTACACTTTCCAGattt s bosTau2.scaffold2512 64844 384 + 112053 AGATACATTCTCTGACAACCCC---ATAGG-------------------------------AAGTCAAGAATTTGGAGA------AAGGAAAAAAAAAAAACTCTTCTTTAA----------------ATTCAAAtt---------------aagaacagaaactttggggtcaaaa----------------------------------------------ggcctgagttcaaatccttatttttccac--------------------------------------------tcacctgc-----------------tgtgcaa---------------------------------------------------ccttcgttaaattaacta----acttctctaagcatcattt----cttgatgtttcatttcctcgcacatgaaatggggtttataataaccattgtccctatttcattgggacactgagagaattaagtgatacaaactcctaaaaatacttagaatgcttgctgacacacataaatcacctgccctccaaaaatattagcccgtatcattGTTACTCTGGTATGCTGT---ATTTCCCAGATTT a score=2648 s mm7.chr5_random 1888560 84 + 11523536 aCATGACACGGAGACATCAT--CAGAGGTCACCCATTATCATCACAGGGAACAGTTCAGAGCAAGGTTTGAGGAATTGGAAGCAAG s bosTau2.scaffold2512 65228 86 + 112053 ATATGACATGGGAACCTTTTAACACAGAATATCCATCAGCATCTCAAAGGATACCACAGAACCAAGTTTGAGAAATGCTAAGTAAG a score=14690 s mm7.chr5_random 1888801 807 + 11523536 TCCTGAGAGCAAGCAACTGTCTGACCCGAGACTCCATCTCCTGAACTGACTTTACCTAAG--AATTTACCCCCTTACTCTTAGAATG---CTCTGTTCCCTGCCTGCTCTCTGCAGTGTGTTTTCCAGGACaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaGTGGGCAGGCCCTGGCTGGGAGGCTAAATACCACCCAGACACATCGATTTTTGGAAAAACAGCTTTCATCTCATGGATGCTCAGCA---TGGCCCATGCTCCAAATCAGAACTCATGGCTGGTGAGCTAATCAACGTAACTGCTAGAAAAGCATCG--------------TTCACTTCATAAGTGTTTGCCTTTTTTTTTCCCAATGGGAAACAGCAATGGGATTTGCAGGCCCACCTCCTGGTTTAGGGAGAAGGTCCTGTC-TGGAGCAGAGAGAGCCTCGTAACGTAGGATTCC--------TTTTTGTCTGTGACAC--------------ACTTCTAAGAGGCAGCTCCAGCTTCCTTAGAGGGGAGCCCTTTAAAAGATGCCCAGG-----------GAGCATGGCTCTCTTTCAGATTTATTTGCGAATGCTTTTTTCTATTAATT------TCTTCAGTTTCCAACTTCCTAATTTGACAGCACTTCTTTAAACCATCTTTTCCAAGTCAGTTTAAAGCATTTAGCTCAACATTCAAGGAGATGGAGTCCCCTCTCTTAACACATATTTTGC---------TTGTAGTGTTTAATTAAATCTTATACT-----TAGAACAAAATGTAAGAGGCAAATTCTACAAGCACATGccagatgtctgcctggctcg-------acatcgccttcagatttttgctcagaagtcactttatag s bosTau2.scaffold2512 65966 819 + 112053 ttctcacagtcagtTATGATCTGAACCTGAGCCAGGTCTCCTGAATGTGGTTCACCTACTTCACATCACCTCCTTTTCCTCATGGTTTCTCTCCCTCTCCTGCCTGCTCTCTGCAATCATCTCT--------------------------------GAGAAAGAACGTGATGGATTTTGGTGGGGAGGGGAAAGGCCAGTCGGACACATTGATTTTCAGAAAAACAGCTTTCTGCTCATTGATGTTCAACAAATTGGCCTGCTTCCAGTATCAGAACTAGTGGTTGGTGGGTAACTCAA-GAAAGTCCCAGTGAAGAATCATAAAACATAATGCCTTTGTGTCCTAACTGTT----TTAGTTTCACCTAAAACAAAGTAA----GTCATTTGTTCACCAATCTTTGGAGGCAGAGAAAAGGCTTTGTCTTGGAGCATTGGAACCCT-----GATGGAATTCCCTGTCTCTTTCTTGCATTAATCACAACGATAATATATTACCTCTGATATGCAATTTCAATTTCTTTAGAGTGGAGCACTTTAAAGAAGGCACACGTGAAGGAACCTGAGTACCACATTCTTTCAGATT--GTTGGGAttttttttttttttttttttGCTAATCTTTAAGTTTTCGTCCCCTAATTTGACAGCATTTCTTTG------------CAAGTCTTTTCAAAGCATTTAACTTAGTTGTCACAGAAAC-GACTCCTCCCTTTTAGCTCTTGTATTTCATCTCTGATTTGTAATAGTTAATTAAACTATATACTCAAAGCAGAACAAGATGTAGGAG-------CTGTGAtcttccaccagacgtctgcccagctggttccttcacat--tcttcaga-ttgtgctcagaggttccttctcag a score=3917 s mm7.chr5_random 1889679 526 + 11523536 AAAGGTTCCAAG-TGGTGACTGGGGCCCAAGGATGATACTTAATAGATCGTTGACACCGTCGTATTTTAAAGGGAACC--TGGCTTCAAGGTCA------CACCTC--------------AGCAGTACTGAA---GAGCCTACTACACTCAACTCCCAACTCCCACCCCACACCCCCTGTGTCTTTCAGAATATTCAAGGGTGCAGCCCAAGCCTGAAAGCAAAGTTTGTAGGCACAGGTTATTGTCAACCTCC-CTACAGGGTAAAT-------ATGGGGAAACC-----GTCTACCCAGAGGCCATAGAAGGAGAGATGTCTTTCTTTGTTTTATCTCCCATGATTATTTTCTGTAATA-------GAATTCTTT-------ATGTTTATTCTTTTGGAG----GTTTACAGAAtgtgatggtttgtatat--gcttggcactattaggaggtgtggccctgttggactaggtgtgtcactgtgggcatgggctttaagaccctcatcctagctgcctggaagccactcttccttcactgccactagcagccttcagatgaagatgtagaactctcagctcct s bosTau2.scaffold2512 67345 521 + 112053 AAAGGCTCCAAAATGGTGACTAGGAATAAAAGCTAATACAAAAGAGATCTTAAGAACCTCGGTGTTTTAAAGTGAGTCACTAATTTGGAAGTCAGACACCTACCTCTAAGTTTCACCAAGAGAAGTAC--AACCTGACCTTAGCGCCCCCAGTTCTCCACTC--ATCCCCCACCTCTT------CCCAGACCAGGAAAGAAGGCAGCCATGGCATGTGAGTCATGTTTCATGGTGATGCTATTTCCCAGCCTCCACTGTAAGGTGAGGTGGTGGAGTGGGGGAGTTATTTTGCCTACCCAGAGGCCAAGTAAGGAAAGCTTTTTCTCTTTATTTTGGTTTTC-TATTTTCTTTCTAGAATGTGCCGAGGTATCCatttttaaaaatatttatttgttttaaacattatttatGTATtttaaatatttatttatttatttggctgcatcagg---------tct-------tagttgcggcact-----cagaagcttcaa--tcttcattc-agcatgctgga-----------------------------tcttcaggtgtggcacgcgaactctgagttgct a score=6230 s mm7.chr5_random 1890232 618 + 11523536 catgttcccaccttaatgataataga--ctgaacctctgagcctgtaagctagccccaattaaatgtcgtccttatgagacttgctttggtcatggtgtctgttcacagaagtagaaccctaaGATACAGAATGTCCTAAGTCTATAGCTTGACAGTTTTTGTCATCTCTGGAGGATTTTCCAGCACTGGCTC---------------CTACCACATTCTCTT--TCTCTTCTCCTCTTGGGCCTCGGATTAGTTCTTTCTG---------------CTCTATTTGTTGGTGTATACTGCTCTACCTGGCAATTTTCTCCTCTCTTGATTAGgaatatttcctttggagccgccttccaattcactaagtctctcttcagactcagtctaatttgAT-----TCTGAGCCATTTGTCTTT--GTGTCTAAAATTCCCAGCTGCTTCT--TTGTTGTTTCTAACTATTCGCC------------TTTGTCTTTTATTTCCTTAAAATTGGTAGGTGCAGTGA-----AAGTTGTTCTTTGGTAATCCTAATATTTAGAA--CCTATAGGTCTGTTATATTAGTCTGTGACTTCTGtttgttttctgttggcttgcttgctttttgtttttgtttggttttgttgttgttgtttattttgtGGGGTTTTTCTTAtgtcttgt s bosTau2.scaffold2512 67903 576 + 112053 catgtcccctgcattgtgaacatggagtcttagcccctgggccaccagggaagtccCAGtt--------tcctcata-------tttagggcttggggtttgt-------------------------agggcatcttaagtct---ggctgaaacctttcatcagatttggaaaacttttagtcattgtctctgcaaatacctccttcagccatagtcccttcttcccttctccttctgaaaccccaatcagatcttctcaatttatgctccaagtctcttcctaatcttatgaagttaccatccttgtg--tctctctattcttaactttgactatattcttctgacttactttccaattgaccaagtctct--tcaaactctgtccaaattgctgtgttcttaagtcattttttttttcatttctagaacttcccattacttctctttactatttctaattttctactgacattcttaatttTGTCTTTTATCTCTTGTACAT-AGTAATCACAGTTATCTTAAGGTCGTTGTCAGATAGCCTCAATATATGGAGGTTCTAGAGATCTGTT--------------------------------------------------CTTTTGTCCATTGTTTATGCTGCTGGTCATTT------ATTTTGCTCACCTCTCAT a score=10582 s mm7.chr5_random 1891269 419 + 11523536 AACAATCTGAAATCACCCAAACCCAAGGTCAGAACCTAGGGCAAGTCAGTAATG---AGCTGTGGCCTCCTCTAGAACCTGGCTCATTCCAAATCACCCTTCCTTCTAGAATCTGGTCTTTTAGGATCAAACACAAAAGTCAAGAGGGTCCAC---AGCCTTCCTCCCCTTGATGGTCCCTAGATGCT--TCTCTGTGCTCTTGGCCT--GGAAGAGCCTTGAAATAACCTGATTTCCTATCTCCCCATAATAACCAGGCCTGTCAGAACCTGGTGCCAACTCCTAGACCTCTGGCAT-CCAAGGTTTTGCAAAATTT----TATTCATTAGCTCTCTGGCATCCTAAAAGGCtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtagatgtgtgGATATACATTTCAGTGCATATGT s bosTau2.scaffold2512 68896 409 + 112053 agtaatctggggtcacctccatataaattCAGGGATT--------TCAGGAATGCTGAGCTTCAGTCCCTGCAAGAACCTGTCTGCTTCCATCTCACCTTTACCACTAGGGTGCAGCCCATCAGGATGCCAACCAAAAGGAAGGAGGGTTCACCAAAGTTCTCTTCCCCTCAGCTAGCCCTAAGTTCTGATCGCTGTGCCCTCAGCCCTAAGAGGATGCT-----CAGCCTGTTCACCTCTCAC------ACACATGGGACGGACAGATACTGTCTCATCTTCCTAGATCTCCAGCCTCCCCAGATTCTGGTGAATTTTCACTACTTGTTAGCTCTCTGATGTCCTAAAGTAAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtACACAtatatgtatacaggtatgtgtatac------gtacatatgt a score=17614 s mm7.chr5_random 1893575 454 + 11523536 CCACAAGCTGAGGCTGTCTCCAGACAGAGCTGCATTGGAAGGAAGGAAGGCTCTGTCAGCCCCTTCTCTGTC-CATCCCTGGCCTTGCTCATATACCTTGACATGCAGGAAAAATGACCAGAGGCCTGTTTCCAAGCCTGTCAAGAGGCCAGACTACAGCC-GGGCCACACTGGTCTGCCTGTCCTTACCAAGTCAGCTGGGACCTGTGTTCATGACATGGTGCGAGACCCCCATTACTCACTCCGTCCTTCCCTGTCCAGCTGTGCCTATAAAGTGATTACTCAGTAGGGGCTTGGGACAGGCTGCTGGGCTCAG---AGGAGACGGAAGCCCGGAGCCTCCCTCACTATATGAAGTCTTAGCATCCAAAATATACACAGCACAATGTCAAATGCTTGGTCCAGGATGTCTGGTTGTCCTAGCcattcattcattcattcattcatcatagttattca s bosTau2.scaffold2512 70749 453 + 112053 CCAATGGTTGAAGTTGCTTCCAGTCCATCCTGAGGCAGGGGAGAAGCAGGGCCTCATGGCCCCTTCTTCTTCACTTCCCTGGCCT-ATTCACGCTCCCCAGCACAGAGGAAAAATGACCCAGGGCCTATTCTCAGATGTGTCCAGGGGCCAGACCACTGCCCGGGCCACATCGGTCTGCCTGTTGTTACCATGTCAACTCCGGCCTTTGTCTGTGACACGGTGCCCGACTCCCATTACTCACTCTGTCCTTTCCTGTCCGGCTGTGCCAATAAAATGATTTATCAGCAGGAGCTCAGGACGGGCTGCCAGGTTCCGGGCAGAGGAAGGAGGCATGGGAACTATTTTATGAAATAAAGGCCTGGCTGCCAAAGGACACAATTCACAGTCTCAAATGCCTCTCCCACACACTCTGGATGTTGCATTCATTCCTTCATTCACTCGttcgt-----ttattca a score=7011 s mm7.chr5_random 1895650 235 + 11523536 ACTTAGCAATC--CTATAGCATGTGTTTCAG----CTTGCCAGGAAGGGCCCTTTTTTCTCCCATCTATCC--ACACTTCTACTTTTGTAAAGTAACACAAAAATCCATttggatgtcacagcaatgtcaaattgctataaaaacttctcg-cacgagctcctggtt-----acttactcattgaggacctagggacagtaagttg-ctttcactggtatatggacgacaatttgaatattactgGTGTA s bosTau2.scaffold2512 72978 247 + 112053 ACTTAAGAACCTACCAcagcactt--ttcagactatttgcagggacaaaccattttctccacaatccatcacaaaaccaatgctcttgtaaaatacaaCCCAAatttgcttggattttacagcaatgtcaaattgttataaaagtttctaaacactaaatcccagtttctctacttactcactgtggacc-agtaatactttgctgactgtcactagtctgtagatgacagttggagtagcactgGGGTA a score=1774 s mm7.chr5_random 1896199 193 + 11523536 ACTGAGCTGGGGTGAAGTCTATTCTCCTCCAAGTCCTTTGTCCTATCTACCTCTCTGCCTGCCTCCAGACGGATCATGTATTTGCCAGTGCTGTGTTCCGTGTGGGAAGATCTTAATGCAGAAGGGGCTGCTGCAGGCACTTGTGGTCCTCTCCTGCAGAACCCATCAATATATCCTCTGTTACCCGGGCCCC s bosTau2.scaffold2512 73537 144 + 112053 CCTGCGCTGGA-CATAACTTGTCCTTCTT--GGTCCTTGAGCTTATCCACTGTCCTAC----------ACCGACCA--------CCACTGATGC----------------------------AGGTGATGCTGCATCCCCCTTCAGTCCTCACCTGTTCAGCTCATCACTGCATCCTCTGCCACACAAGTTCC a score=20796 s mm7.chr5_random 1897520 663 + 11523536 GAATAAGCTGACGGCATCTCCCAGGCCTAAGGGTTCTGAACACGGGAAATCACAATGGTTAAAACGAATAGCCT--ATTCCGAATGCTCCCCAGA---CAGTCT--CGGGTAAAGAATGGGCCTTCTCAGTTAGGTGGAGGATGTTC-ATGGAACACCCAGTAGGGTCCCCACTTTAATCTCTGCCATTTATAACCATCAGGGAAATGCTGAGCTACAAGTCAGGTTGCTGTTCCCCGGGAATCACTGGCATTTGAGCATCTGAAAGAGCTGCCAGCCCTGAGGGTTTGATGGATGGGGAGGCTTGAGGAGAGTACCTGAGTTAATTGTTCATTGTATCAAGTAATTACACAGCACTCATCCATCAACACAGCATG----AAAGGAGGAAAGTCTG-ATGTGGGATGTGGACTCTTGGGCCCTTGGTTC--------TCTTCCATAACCCTGGGCAAGTATCTTCCCCATTCCGGGCTTCCCCAGC----------AAGGTACT--------CTCATGTAA-------GGAGACAGTACAAGGGTCCCCAGCCTGGATCCATAGA-------------ACACTGTTGGAACG------------CACATTAAAGGAAAGGTTCTGAG-CTTCCATCAGGTCCTCAGAGAATCCTGTGGCTTGGCAATAAAGGTCACAAAATGAGA-TGGAGATGGGCACAGTGGGGAGCTGAGGGGAGAGAGGGCTGAGGAGtggg s bosTau2.scaffold2512 75521 727 + 112053 gacCACGCTGACCACATTTCTTGGTCCCAAGAGCTCTGAACATGG---CCCTTAGCAGCTGAAACAAACAGCCTTCATTTTGGGCACTCTCCTGATTCCAGCTTGCAGGCTTGAGGCTGAGCTTTCTCGGTTGTGTGGCAGATGCTCCGAGGAAGAGCCAACAGGA-CTGTGCTGTAATCACTGCCATTAATAACCATCAGGAAAATACCAAACTACAAGGAGGACTGCTGAATTCCAAAAACCGCTGGTATTTGAACACCTGTCAGAGCTGCCAGTGCTGAGGGTTTGATGGATGGAGAAGGCAAAGAAGAGTGTCTCATTTAATCATTCATTGTATCAACTAATTACCTGGCTTTCATCCATCAACAcaggatgtttaaaaggaggaagtcctgaacttgagatccagaggcctggg-tcttggttccaattctgtcattcatgaccctgggccag-gcatttccctctctgggtttcCCCAGCCTTACATGCAGAGGTCCTTCAGCAGGCTCCTGTACGCTCCTTGGAGATCCATGAATGGGCCTTAG---GGATCCCTAGAAATTATATTCAGGACACTGTTTGAGTGTGGAGATGTCTATATATTGAAGAAGAGGGTCCATGCCTTTCATCAGATCCCCAAAGAATTCCATGACCTGAAAAAAAATTTAAACTGCTGAAAGTGGAGACGGACACACCAGAGGGTTGTGGGGAATGAGGCGAAAGGAGTTGG a score=28609 s mm7.chr5_random 1948350 1217 + 11523536 cctctttgcttccttgctttcttcccttctagcctt------agaagtgatagctgcagccacagcagccaccctaaatcatgaaggcacacacatctcattctgagaatagctgcagaaagac------ttgggtctctgGGAACACTG--GGATTGGCACCC---ACAATCCCATAGGATT----------------------------GAAACCAA-ATTCTCTTGGTTAAGC--------TCCTGCTATTTTGACTTCTGCTGTGTGAAGACAACCTCTCCATCcatacacctacacatatacatacacatatactatacatatactatacatacacatacatatacgtatatatCGGTGCCCTCTAATTAACTAATTGTTAACTTCACTGTTCACCAAGTCCCCCGCTCTGTGTAGGTGCTGAACGATTAAGGCAATCCTTGAGAATAATCGTGTCTCCAGGCCACTGGGGCTCATGAAGATGAGCAGAGGATACAACAAACTCAAATGGAAAATCAGGCAAAGTGAGCGT-------CTGGAGTGTCTTCCTGCTTCTGAGGATGGATCTGTCTAGTGACCTACGAGTTCACACGTGCTCAGAGAAAACAAGGAAGAGGCTCTGAGCCACTTTCAGCCATGGTGGTTGTAGGATCGGGAGAGTTCTGGGAACTTATTTTGATTTTGCTTCCTGCTCCTTAGCTCCAAAAATTTTCCTTCCTTTCACCTTTTGTTGGAAATGGTACCA---CTCGTGAGCGGCAGCCTCAAATGAGTGAGTTGTCCTTCATCTCTGTGAC--TGGATATTCCTGGCAAGCTGGCTATCCTTGAGATACTGCAGAAGCTGAAGCACAAAGATAGCAAGGAACCATGGCAACAACAATCCCAGGTCCTCTACCTTTAAA-CACAAATTT-----------GCCAGGCACATAAATGCTTGGGTTATCACATGACTCGTCAGGCTGCTGCCCAGACAGAGAGAGGGAAGCCAGGTCTATCTACACAAAGGAGACCTGGACA-TGAAGTTATAAGGC-TCAGTCACTCAGCCAAACAAT-----TTAGTCCCAGTTACTGACTTGGTACTGAGTACAGGAGAAGGGGGACAG-AAAGTCAGAGTCATCCTTACCCTCGTGTTGCT--GAGTTAGAAATAGCTGCCCCCTTTTTGCCCTTGAAAAAAAATA---AAATTCTCATCCTTCCCTTACTTTAAAATTGTGCAGCTATGGTATGAAGTCTGACCATTATGGTGGAAGTTATGTG----------------TGACCTTTGACTCAGGATAGCCTCCTTC s bosTau2.chr6 36774801 1228 - 69624268 cctttttgtccttctaccttcttatcttctagacttcagtttggatgtgatggtggcaactctagcagccatcctaaatcgtgaaggtacaagc--cacactctgtgcatagcttcagaaagacaggagcctgtgtctctgaagacatcacagaactgctatctgtaacaacctcataacatttgactctggaattctttaatatgagggtaaaatcaatgttttcttggttaagcaaccctaattttgCTTATTCAATACCAGCTGTTGGCAGTCAACCTCTCC----------TGACTCATA------------------ACTCCTACTTTCTGTattcattcat------------------tcattcattgattctttattgattcatgtatttattGAGTCCT--ACTCTGTG--GACCCTGAAGTGTTAAAACAATGTCTTGGTATATTTCCTTCTCCAGGTTACTGGGTCTCATGGAGATGAGTTGTAGCTCCAATAAACCCGAATGGAAAATTATACAAAATAATTGTGTTTGTGTTAGAATATCTTCCTGTTTTTGAAAATGGAGCTGTTTAATGATCTGCAAATTCATGCAAGTTCAGAGGAAAGAATGAAGCTGCACTAAA------GAGGCCTTGGTGACTGTGGGATTCAGAGAGTTCTGGTAACTTGCTTTGATTTTGCTTCCTGCTCCTGTGCTC--------TTCCCTGCATCCATCTTTGGTTAGAAATGACATCATCTCTCACTCTCACCAGTCTGAAA----TGAGTTGTCCTTTATCTTTTTAACTATGAAGTTTCCTGTGACATCTTCTATTTTTAAGACACAGGGGAAACAGATACGAAAGTATATGAGGGAATTGTGATCACAATAACCGTACACTCTCCATCTTTAAAGTAAAAATTTCCAAACATTCAGCTAAGCACATAAATCCTTTAGTTATCTCCTGACGGGTCAGAC----------------ATATTTAGCCTTGGTCTATCTATGAAAAAGGAAACTGTGTGTTGAAGTTCTAAAGCTTCAGGTACTCATTTAAGAAATATTCATGAATATTAACTACAGACTTGGCACCAGAGATAGGGGTAAG----CAGCAAAATCAGAATGATCCTTGCCCTCTTGCTTCTTAGAGTTTTCAACAGCTGTCTTCCTTT---CCCTGACAAAAATTATTCAAAGTCTCACCCAT-CTTTACTTCAAA--CATGCATATACTGTGTTGAATTGGTTCCTTCAAACTGGAGTCATGTGTAAAACTGCCTCAATTTAAACTTTGACCCAATGTAGACTCATTC a score=2721 s mm7.chr5_random 2001287 79 + 11523536 TTTAGGGACTC------AAATAGTAGCT-----CACATA-----------AAGAGTTCTCTTGAGGCAAATGGG-----ATTCTAGTGGCAGAATTTAGCTAGTCA s bosTau2.chr6 49825640 106 - 69624268 TTTAGGGATTCTTAAAAAGACAGCAGCTGCACCCAGATATGCCTAGTGGCAAATATTCACTGGAAGCAAATGTGCTAGTATTTTAGTGGCAGGATTTAGCTAGCCA a score=12658 s mm7.chr5_random 2001536 445 + 11523536 CTATATGCACATCCTGTATATAATTCATTTCATCAAGAAAATCTC---TGTAATATTCATTATG-TAATTAACACTACTTCTGGTCCTTTTTAGACAGCAAAACAATG----TTGAATCACTTGAGACAGACAGTTCTGAAATATGCCCTTTTAAATAAATGCCAATAATCCACCCTTACAGTGTTTTCCAGATTAGGAAAACTGGCTGGCTCTAGGGGGTAGACAAAAACCAACACTCGCACACATGGATTCAACTGGCAAAGTTGAAGTGATTTGAGTAAATTGCAGACAACATAACAAAGAAGAAGTGATGTTTTCAGTTTGGGGACAGATTTAAATGGAGATGGTAAGAGGAGATGGCTCAGCAAGTGTTCATATACACGACTCTCATCCTTGGGGAAAAAATGTGTGTACATATCCAGGTTTCCAATTACCAGTGTAGGAGGCGTTCT s bosTau2.chr6 49825747 432 - 69624268 CTAGTCGCAGGTCATGAATACCACTGATTTCATAAATAAAACCTCCTCTTTAATGTCCATTATGCTAATTAGCAAAACCTGTGATCGTGTTTAAAAAAAAAAAAAAAGATAGCTAAATTACTT----CAAGTAACTCTG--------TCTTTAAATTAAATGCCAA-GACCCATTCTCAAAAAGTTTTCTATATTAGGACAATTGACTGTCCCTAGGATGTGACTGACAACTAATATACACACA------TTATACTGACAATGCTGAAGTGATTTTAACAGATTTAAGACAAAGCAAGACAAGAAAA-TGATGTGTTCATTTTGGG-ACATGTTTAATTGGAGATAGGAAGTGGGGGTAACTCAGCAAATGTTCAATTATACAGGTTTAATTTCTGGAAAAAAGTTATGGCTCCACATTCAATTTGAATATTCCTAGAGTGTGGTACATTCT a score=28740 s mm7.chr5_random 2002762 857 + 11523536 gaatgccttt-caaatgttacaaaatttccaaaactgttttgccaatcactgtttcttaattttataacttaagtggatgtcaagggaaatttaatccttatgtttctggctcttttatatttggcctgtccaagtgtttcataacaaccatttgatgt-tgaaaagtcttacaggctttttGTTTCAAGTATGTTCAAGATAGTTTATTTGGAACAAAGAAGCA-TGTATAAGGATCATGAGGGCAGAAAACTCAAAAGAGCCTTAAATTGTTCAAAAAAATTGAAGACCAGTAAACATCATCAATATCTATTTAGCATTTGAAAGTGTATTCTGGTTAAAATGTAAACACAGCAATGGAATCTTAGGCCACTTT-CTGGTATTTATAAGATGTTAGTATTTTTTTTTCATTCTGAGAATATTAAAAAATTTAAGGCAAGCAAACATTTGAGTAAACAACAAACTAGAGCTTATGTGGTCATATAATTATCTGATGTTATAAGTAAAGATGTTTGTATTGATAGCTAAGATTGTCTG---TCATCCCTAACCAGG---CATTTCCTAAGAGATCTTTAAAGAAACCAAACTGAGGTGAAATGTAGATA-CTAAGCAACAAGACTTTGAGAGTGCCATACTTTGTGTCTCAAATC--AAACATACCACTCTATGGCCTAA---GAAACTCTCACGAATCAAATTGTTCCAGTTTGTGTAGGTTTTGTATCATatggactatgggttcacagtgtttgagttgaatcattttgccatttattagctctatagtattaagtaCTTAGGTGACTCTGAGAAACTTGTAAAATCTGTAGTCCTACATAGGGATGGTCACAATTTTTTTTTGTTATGA s bosTau2.chr6 49829039 813 - 69624268 GAATGCCTTTACAAATGTTAcaaaatttccaaaactgttttgccaatcacagtttcttaattttatagcttaagtggatgtcgagggaaatttaatccttgtgtttctgagtcttttatatttggcccatccaagggtttcataagaaccatttgatgtctaaagggtcttagagattctttgtttcaagcatgtttaagattatttattcagagacaagcagtactttatcagcatcaaacagaaatgaaattcagaag--ccttaaaTTATTTTGAAAATATAAAGACTGATAAATATCATCAATGTATATTTAGCACTTAAGGTTTTATTATGGTCAAAATGTGAATATACCAAAGCAATCTTAGATCACTTTACTTTTTTTTTTAATGTA---------TTTTTTCTTTTTGAGAAAGCAACAGAAACTAGGATTAATAACCATTTGAACAAACACCAAATTGAAACTTAAATGG---TATGA--ACCAAATATGGTAAGCAAACATATTTATTCTGGCATCCAAGATCATCTGATCTTTTCTTTAATCAGTAACTACTTCCTGAAGGGTGGCTAGGGAAAACATATGTAGGAGAACTGTAGTTAGCAAAGCAGC-AGTCTGTTTGAGTGTTACATTTTGGTTCCCAAATCTAACACATAAAACCCTATGACCTAAGCTGAGACT--------------------------TGTAAATAATg-----catgggtcctgggacaagcttgttaggtttgaa--gtttgactaaatgtgatcttagacttatgtaatctcttgatgacctc---aaattcttaag--ctgta-----acatagaggtgatcacagttcttgcttGTTATGA a score=21708 s mm7.chr5_random 2003966 760 + 11523536 TTCTTTCATATATTCAGAAACTCT--------------ATTAATTATG-GTTTAGAAGGTAAAAAGGAGGATGCATTGGAAAGTAGAGA-----AAAACTAGCAAATGAAGGTGGTTTCCTTCTTACAAACACATATTAATAGCTAAACTGTCTTGGTGTATTGGGAAAGGGTTGATATGCCGAGACTTTATTTATTGTTAATGTTTAACCTTGAACAATTTTACACAGGG-AATATGCTATTTTAA-GGTCAGATCTTACAGGCTTTTCATAAACAGAAAAGGTACTGTGTATCTGTTCCAAGCCAAATTTTGGAAGCATTTATTCTTCTTGAAAGTTATTTTTCCCCCCTGTGGCATTTCATGGAAAACAGTTGCTACAGCCAACAAGTTATAGATGCAAGGTTTTTAGACTGAAAAAAATTTTTATTACAAGTATGGTAATTGAAGCCATGGGAATAAACACAATTAAAGGATTTTTTTGTTATTGTTGTTATAATACAATCATGAGGTTGG-AAGAATCTTGAAAAATCATCTACTTTATTCCTTCCATTTTGGCTAAA----------AAGACCCCATTCCACTCTTAATATATA------------------------------------GATACCTGTCTT-GTTTCAAAGATATATGAAAAACATCAGCCAAGCCTACCAGGCATATTCTGCGCCCTTGTTGTCATTGTGACTTGGAAGGCATTTCACAAAATTTATTTGAATATGTTTTGTGGTAAATAAAATGACAATGCATATATAAGTCCTCAATTATTCTTTCTGATTTGCATTTGTGGTATGATTC s bosTau2.chr6 49833311 784 - 69624268 TCTTTTCATATAATCAGTGGCCCTTAATGTGATCTGACATTGATTATGAGCTTAGA--GCTAGTGGCAAAATGACTCAGAAAATGGAGGTATTTCAATGTATCAAATAAAGACATCCTTCCTCATTCAAATCTGGCCCAGCACAGGAACTGTCTAGGGCAAGTGGGAGAAGTTTGATAGTCTCAGCTTTTATTCATTTTCAGAGTTTAACCCTGATTCATTTAACCTAAATCAAGAAGCTATTTTTATGATCTGATCATACATGCTATTCATAAGCAGCAGAGGTACTGCATATCTGTTCCAAGTCAAATTTTGGAAGCACTTATTCTTTTTGAAAGTTACTTTT-ATTCCTGTGGCATTTCATGGAAAACACTTGTTCCTGCCAACAAGTTATGGAT--ATGTTTTTTAAGACCGAAAAGATTCTTAATATGAGTAAGCTAATTGAA-TCATGGGAATAAGGGCAATTAAAGAA-ATTTTGGT--------TTATAATATAATCATGTAGTTGGAAAGAATTTTGAGAA---GTCTACTTCAGCTCTTCTATTTAAGCTAAAGGATACTACCAAGTCTCC--CCCACCTCCAacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacGGATATCTGTCTTAGTTTCAGAGCAATTTAAGAAATGCAATATAAGCCCATATGGGGAATTCTACCTTCTAGTAGTTCTTATGATTGTGAAG--------------TTATTTGAATATCTTTTGTTGTCATGAGAATGTCATTTTAT------------TATTATTATTTTGTATTATCATTTGGAATCTGATTC a score=2756 s mm7.chr5_random 2004804 116 + 11523536 TCAGTGTGGTTATTTATGGTGAGTTGTTTTTTCCCAAATGTCATGATATTTTTGGACATGTTTCATCGAG---GTGGAATACAATGATCAATGTCTCCAGAGCC--AGAGAAGAAGACAGG s bosTau2.chr6 49834246 112 - 69624268 tcaatatg----tctaagctgaactgcctttcccagaatgcc-----ctttttaggtatatttcattggaagcaggggatacagagaagattctatccagagcaggagagaggaaggcagg a score=3242 s mm7.chr5_random 2005120 213 + 11523536 CTGTGGGATTCCAGTTTAGACTTAAGTATTGTGTAGTCTGCTGAAGATTTTCATTTTTGATTGCCTGCTCTGGCCTCTAGCAAGAGATATGGAATCAGACACATGGAGAATTTTAAGACAGCACCTCAAAGTGAGCTACGATAAGCATTGTAATAAACCCCTTAGTGTATGTCAATA-AACATATTGATTCTGCTTTTCTGTTTGA-------Ctgttaca s bosTau2.chr6 49834600 205 - 69624268 ctgtggagttccagatggttctcatggagtg-gcagtggactgatgaccttc--ttttccttagtaacttcgtgctctgacattagatgtgaagtcagccttatggtgacttcttag-------------ttgggcaagcaaattccctgtcatacatttcttagtatgtatctctatatcctaattgttcggcttctttggttgaaccttgtctgttaca a score=18313 s mm7.chr5_random 2115309 469 + 11523536 GAAAGAAGCTTATAATAAATACAAAGTTTAAGGAAATA-TCACAGC-AGTCATAGGTAATTTCAAAGAGA------------------ACTGAGAGATG--TCTGATAATTCTCATGGATTGTTCCTTTGT----CCTTAAATGCAGTCTCTAAACAATTGCACCATCTCAGTATATAGTAAGAATAACATTTTTTAAAAGGGTATTAGCAATTTCACGGCTAGGTGTTCATGCCTTATTAACAGC--CATAACAATATGTCACTTACGAAGGGTATATGCAAAGATTTATCTTCTCAGTAATGTGTTAAATTGGGGCTGTGATGTGAGAGACATAGACTAATGCACTG-TGTCTCTCCCCTCA-TTAGAACTGGGACTTCATCAGAAGATAAATTGGTTCTGTGGTCTCTCCTTAGCCTCAT-CTAGGTAAAATGAGTTTCCCTTTACCAATGTCTTGTCAGTTCACATCTCAAGCTTAGATTCATGATTAAGCCTCTT s bosTau2.scaffold3888 65479 491 + 73697 GAAAAATGAGTATAGTAAATACAAAATTCAGGAGAGTAGTTACAGCTAAATACAGAAAGCTACATAGAGACCCACGAGTGCTTTTCAAACTGAGAAGTAATTTGGTTGATTTTCATGTATTTTTATTATTTTATACCATTAATATACCATATAAATATCTGTGTATACTCAATATTTGATAAGAATAAAAT-----AAAAGAGTGCTAGAAATCCCTAGGCTAATTGTTCATGCTTTATTAACAGTGTCATAATAATATGTTATTTATGCAGGACATAGTCAAAGATTTATCTTCTCAGTAATGTGTGAAATGAGAACTGTGACATTAGAGACATAGACTAATGTATCGCCATTTCTCCTCTCATTTAGAATTGAGACTATATCAGAAGATAAATTAGTTCTGTGGTCT---CTTAGACTTGTGCTAGGTAACATGAGTTT-CTTTTACCAACATACTGTCAGTCACCATCCTGAGTTTAGATTCATGATGATGCTGTTT a score=5221 s mm7.chr5_random 2116076 242 + 11523536 aGGAATTTATTGTTTTAACATCTAAGCAACTCATAAAGACTGTCAATTGTTCACCT---TCATTTCAACATAATTATGGAGATAGAGACAACATCACACCTTATAAA----CAATAGCTTCCCTTTATAATTCACTTTTGGAAAGAGTGTAGAAATAAAATGGGATTGCCTTCAGAATTGCAGAAAATATACAGCATACAATGTATCAGAAGAAAAA-CCATAAT-----TATTGGTATTTCAAG-GTGTTTTCTT s bosTau2.scaffold3888 66039 253 + 73697 AGAAAATTGCTGCTTTAACTTCTTACTAACTGAGATTGACTGGCAATTACTCACCTCTTTCCTATCAGTGTGTATACAGAGATTAATGTGAAACTAAATATTCTAAAGTATCAGTTTCTCACCTTTTCTTTTTACTTCTAAGAA-ATCATTAAAATAAAATGTGGTTACTGCCAGGATTTTGGAAAACATATA--ATACAGAGAAACTGAAGAAAAAGCTAGAATAACAATATCAGCATTTTGAGTGCAATTTCTT a score=8663 s mm7.chr5_random 2490349 316 + 11523536 GTCTCTTCTCACGCTCTGATAGAACTCGTTGCCTTGATAGGGATCATCGGTTTGGGTGCAGACATCACAGGCTAACTGTAACCCAGCACATCTGCTCAGAGCACAGAGTGCAAATATTTTGGTTACCCGCAGAGCAGGGA---GAGCCCTCACGTGCCTTCATCTCAGACTGATCAAT-------GCCGTTTGGGAGGGAGCAGCCTGAAGCATG--CGCGGGGCAGTTTGGAAGTGTGGAGAAAGGGTAAGTTCGGGTTCGAGCCAGACATATTCTAAAATCCAACTCCGCTTCTGACTAAGAACAAGGTCCTTACTATCTAACCTG s bosTau2.chr6 37080307 323 - 69624268 GCTTCTTCTCGCATTCATATTTTACTCGTTGTCTTGATAGGGATCTTCAGTTTGGGCACACACATCACAGGGTAACTGCATCTTTGCACACCTGCTCAGAGTGGGGGTTGCAGACGTTTCAGTTA----AAAGGCAGGGCCATGACTACTAACTTGCCATCTTTTCAAAATAACAGATCTCCTGCACAGTTCTAGAGGGATTAGGTTAAAACTTGTACCCAAAACAATCTGAAATTCTGGAGAGC-TATAAATTTGGATTCAGATAACGTAAGATTCAAATCTCAGTCCCACTTATGAGCAAGGAGGAGGCCCTGATCTTCCCAGCTG a score=9260 s mm7.chr5_random 2490840 503 + 11523536 ACTACACAGTGTGTGGGATGTGGTGGCTACACACTCCATGGGTGCTGTT-ACAGCCACTCGTG---TGAGCGTTTGCCTCCTGGGATCTTTCCTGGTCACCTTTAC-CCCACCTTAAATAATAACTGTTGAATTGTAGGATTGAAGACATTTTGTCAAGCCCCAAATCCTGGTGAGGATAAACTCACAGAAGCCTGCACATCACAGACAAAGTTGCAGTGTCGTATATT-----------CACTTTCAAATTAACTTATTAATTATT-AACAATGTATTAATTTATCAACGCAATAACAGAGTCTCTTAGACATAATATGAAC-ATCATGGAACATCCAAGAATATCTCCTGATGTCAT--------CACACTGTGAATG-CTTAGAATAG--------------TGTTCTCTCTCATTGGGCCCatatctactgaacatt---tttactatttactagacactatgctaggcactaggaaggcag-cgtgtac--caacaaagaaaAAAAAACACAACTTGGTCTTCTGAATTTGCCTGTGGAGACAGT s bosTau2.chr6 37080676 536 - 69624268 GCTATAGAGTCTTTGGAATGTAGTAGACACTCAGTACATGGTGTCTATTCATAATCTATCCTGTTTTGGACTTTCACCTTCTGAAGTTTTTTCCCTCAATTCCTACTCCCTCTTTAAATGATAACTGTTGACTTTCAGAATTTGAGAAGCTTTGCCAA-TGCCAGATTCTGGTT-GAATACAGTTGTACAAGCTTATACACCATGCACAGGATTCTAA-GTCCTATGTTGATTGTCTCAACAGTTTTACATGGTCTAGAAAATTTTTAAACAAATTGTTACT----------GGTAATTTATTCTTTTTG-CACAATTTGAACAATCACGGAATCTCCAGAAACGTCTTCTGAACTCATCTGCTCACCACCCTACAAACATCTTAAGATAAATGAGAATTTATTCTTTCCTTTCtcattcaacaaatatttattgaacccttgctgtaatatttattgagctctgtgttaggcaccagggagacagccgtgaacaataacaaccacaaagtaaaacagcctgctcttgtatatccactggagagaaaagt a score=24131 s mm7.chr5_random 2595851 1874 + 11523536 GAGAAATAGctcagtcatttcctcatttgcaaactgaaaaacaacaaaaattacatcatg---------gggttaga-gagt---------gaaaggatactgcatTGAGATAAGTAGCTCAAAATTTTAGTTTCtttttaataaaatttatttttaGTTTAGCAACAACCTATTTAATGTTGTCCCTAAGCCAAACCCCCTCT---GTTCTGAAACTCACAATCTGAATGGTTGATCTCTTTTTCATAATTTATTCA---TTTATTCAAAATTCTCAAAAGTTATTCTTAATAAACATTCACATGATATTCTTTGGAA---GATTTTTAAAAAGAAATCTTTACATTTTCTTCTTTGGAAGCTGTTAGTCACTACTAATCAAATAACAAAGCTTGAACAGTTAACATTTCCTTTATTTATTCTG-CAGAACACcctgatctgacctga----------ggatgttaagactctttattgatctcacagttgtcaatgctcaggtttcactgaagagacactattgtgtttgactataggaaactgtgtcagaccTA-------ATTCTGTCTGATATGGATCAGAATATGCTCAAGCTTGCTTGTCAAAATCAGAAGTTGA------------GCACATGTGAACATTAGCCTTTTAGATACTGAACGGTGGAGATTTATTTG-----------TGCTTATTTTCCACCAAAGCAGAAAT--TAAGGGACAGAGATCA-------AAACCCA-AAATTAAATAGCAAAAGAACATGAAGG---------CTATGTGTTAAATA--ACAAGAGGCAGGGATTGTTAACAGAGAAATACTCTGAAGAAGGATGTCAA-AAAGATCTTGTAGGAAACAACAACTATGCATATTGTTCTCATAAGAAATATCTTGTATT---------TATTTAATAACGAAACTTAGAT-----------TAAATGTAAAATGAAAGAGTAGGTGTG--GTTGTTCTTTGAAAAGTGATG--ATACAAAATGTTTCTTTCATAGTAAGCATCATTTAAAAGG--------GTGATTGTCATGCA-------CACAGACATGTCTTCTAGAAGTTCTTAAGTATTTGGCAGTGTACAACAGTGTTTGAACTGACATTTTAGATCATTCCCTCAGCTCAGTAAATCTCATTAAAGCCAGCAGTTATTTagagaaagagagggggagagagagagagGCACAGTTCTATGAGATGTAGATAAAAAG------------AATGATAAGATGATACCATTTCAAGGCTCAAA---------------------------------ACAAGAAATTCTATTCAGATTATTACCTCTATTTGAGACAATCCTGTCACTGACCCA--TGGTTAGCATTCTGGAACACAATAAGGTGTTAATAATTGTGGCCATTAATTTGGTCATAGGTGAATGTATGGAGCTACGTTAAAAATCCTTATCAAA-AACATCAT-CTTCCCAAGGAGTT---------------------AGAGAAA------AGTGCAAATTCATTACATTATCTTTTGGCGGCAAAATATCAACTATTTTTCTAATAGCTG-AAACAAATTGACAATATTCTGCTTTTGTAAGGTGAAATGTTTT-TTTTAATGTGATAAGATGAACTTCTATCCATCTGAGTTCTTATATCACTTAAGCTTTCCTGTTTACATATGCAGAGAGGAAATTGAAATAGAAAGTAATCAAAatagattagataagatagataatagagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatgattgatagaGAATGAAAAAAACACTGACATCTAAATTGTTTAATTTCTGGGATATAATCCACATGTAACATGTG-----TAAATCTTTTATATATTTTTGTCTGACTCACTCCATTTTATTTTATAATGACACCCAAATAACTTAAATGCATAATTTGAAGTAGCCTATATCTATTTAACTTTTCACATAGAAACTACACTATTCATGGGTTTGTAATATATTCATTATCATAAACCTTATATGTTCCCTGTTAGGTAA s bosTau2.chr6 35362370 1871 - 69624268 gagatataatcttttaatttcttcatttgtgaaatggacagaaacagcatctaactcatgtaataatgaggattaaatgagttaatcaatggaaagAACAGTCTGTTCAGAGAAGAGACATAAGATACAAGTCACTTTTA--------CTGTTATTCATTTACTAACAGTTTCTTGAATTTTGTCCATGTGCTAGGCACACTACTAGGTCCTAATATTCAAACACAGAATGACAGATCTGTTGTTCACAACTTATTAAACTTTTATTTGACATTTTCATAA--TATTCACT-TAAGCCTTCAGATAATATTTTTATAAACTGTATTTCTT--------TTCTTTTATTTTTATGTCTTGTACCTCTTAGTCATTAAAGATAAAACCACAAAACAAAAATTATGAa----------attcattctggcagcaaaacctgacctgatctgaattgacacgagtatactgagattccttattcaactcactagtgtgaatatatatgttttgctgattaaaaaatattat--ttgattgtaagggactatccaggccctacagaagtatgctgt--gacat---ttggtatatgtttatttttgcatacctaaaataaaaatttatttgaattcttaacatatgtggtcctcagggctttgaataaagaattgAGAAAGTTCATCTGACTTTATCAAGTACTTATTTTGTGCCAGATTAAAAACACCATAAGACAAATATAATTCCAGTGAACCAATAGAGAGAaaaataaaacaaaatgaaatagaataaTTTTAGGTGGTAAAAACTGCCAGAGATAGAGAAAAATGAGTGTTGAGTACTTTCAATAAAGATGTCAGGAAAGACATCATAGTAAAGAAT---TAAACATATTATATGAATAGGTAATATTTTGTGTTCAAATATCTTAACCAATAACAAAAC--AGATACTGAATTTGGTGAATGCAAAATGAAAAAAAAAGTGTGTAATTATGATTAGCTATATAATGGCATGCCAATTTTGTCTTCCAAGGTAAGCATCCCTTAAAAAGCAGTACTTATAATGGTCATACAGAGCTCCTACAGTGATGT----TACAAAGTCATAAATATTCAGTAGTGTATACAAGTGCATAAGCTGAAATTTTAGGGCAATTTCCAAGTTCAATAAAATTCATTAAAACCAGCAGTTATTTAAATATATAGAGA-------------------AAATGTATTAGGTGTAGATAAATAGACAGTCTATTACACTGGTAGGCTAATACCATTTCAAGGCTAAAATACATTCCTTTTCTTATATCTGCAGGGTTCATTGCAATAATTGTTATTCAAATCATCGTATCTA-TTAAATCAATTCAAATGCTGCTCCATCTGATTAGTACAGTGGGTTAGAACAAGGTATTATTAAGTGTGGTCACAGGTCTGGTCTCAGGTTAATGTGGAAGTCTGCATTGCCACCTCCCATAAAACAATGTAATGCACTGCAAGAGGTTGCTAATAGAATGAGGCAAACCAGATAAAGAGCTTAATACAAGTCCATTATATTGTCATT-------AAAAAAACAACT-TTTTTCTGCTAGTTGTGCACA-----ACAGTATTTTGGTTTTATGATTCTGAGTATTTCAAGGAAATGTGAGGAAATAACACTCTG-----------TCTCAGATTACC-------------------------------------------AAATAATC-GAATAGTTT--------CATTTcacacacacacatgcacacacacacaGGTA--------------------------------------AATTTAATAAATATCTAAACCTAAATTCTTTTGGCTCTAGGACTTA----ACATTCAGTATATGAGCTTTAGAGATTTTGTTTG--TTTGTCTTCTTTATGGTAATGCATTTTATAATGATAACTGACTAACTGCAATGTATAA----AAGTAAC------ATACTTAattcttc-------------------taagtgtttg-aatatattaagtatta-aaacctcacaacatccttatgagataa a score=11453 s mm7.chr5_random 2681797 280 + 11523536 AAAAGCCTT---TTCCAAAGCAAACAGAGCTATGATTGTTCTCCTTAGAAAGGGCTGAGGTACAGGCTGT-TTTTAAAGGAATGAACTCCCTGAAGGGTTTCTGAAATCTGAGTCAATTTT-AAAAATTCCTTCTGCATGTTGCTTGTTAGGACCAAAGCAACTGTATAAAATCAGGAGCCGTGTAAGCCCCAGTCCTA--ACCCTGTCCTGTCAAACTGCCACAGGGGT--TTTCCTCGGTGTCAAGCCAAAACATAAACAAACAGGTTAAAGATAACATAGTAAGAT s bosTau2.scaffold168 318195 288 + 679080 AAAAACCTTAATTTTCAAAACAAACAGAAGGGTGATTATTCTCATTCGAAAGGATTTTGGTGCACATTTCCTTTTAAAGAGGTGAACTCTCTCAAGTGTCTTTGAAATATGAGTCAGTTTTTAACAATTCCATCTGTATCCAGCTTGTTAGGAATGAAGCAACTGAATAAAATCAGGCACAGCCCAAGCCACAGCCCCACAGTCCTGTCATGTCAAG-TGTCACGAGGGCGCTTTCAACATTCCCAAGTCAAAAAATAAACAAATCAATCAGAGATAACACACCGAGAG a score=23899 s mm7.chr5_random 2682134 599 + 11523536 TTTAATTTTGTTGGCTTTCAAAGTAACAT---------------------AAACCTAGTGGTCTCTTTCTTGGTCAGTTGCATAGCTTGCTCATGTTCCAGGCTTTTT-------AGATGCAGAAGTATTTT----------------CCCCTTCCAAGCATCTTGTGACACTTCCATCCCCTTACCTAACAGGG-TGGCTGGATTTATTT------AAGAGGATTTTGAAGTTGATCCCTTTTATATAACTCAGAAGACC----GAGTAACAGAAAAGAGCAAAGGAGAGAAGATGTCAGGGAGAGAGATTACAAACACGAGCTTCGCCTCGGAGGTGCTCTCTAAACAAGGAGAGGTCAAAGGTGCTCTTAACGGACA-----------------GACAGAGCTGG-----AGTGTGAGGAGCA--------GGTTAGCTTACATCCATTCATCAAGGGTTAAGCTTTAAGCCT---AAGAGCTTTGGGTGAGTCATGGCCAGAATTTGGCAAAGAAATGCAACACCTTATCTCTAATCAGCCCTGCCTCAAAATAGCTCTGTCTTCCCTCAGGCAGAGACTCATCATCCCAGCTAAGCACAGT------GCATCGAGGTGCTGAGCCCCACTTAATCAGAAAGTCTAGCTGTGCATGTTATTCATCTCTTGCACAAAGTTAGCTCGctct s bosTau2.scaffold168 318603 672 + 679080 CTTAATTTTGTTGGCACTAAAAGCAGCATTAAAAAAAAAAAAAGCCCCATAACTCTAGTGGTCTC---CTGTGTCA-------------TTCATGTTCTGGGCTTTTCCATGCAGAAGTGCCAAAGTATTTTGCAGCTTTGCCCAGTGCCTCTTTCAAGAATCTTGTGACACTTCCATGCCCCAGCCTAACAGGGGTGGCCAGATTTCTTTGCTGTTAAGAGGATTGCTGAGACGTTCTTCTTTATAGAACCCAGAAGACTCTAGGAATAATAGGAAAGAGCAAACAAGAGA---TGTCAAGGAGAAAGTTTACAAGCAAGGGTGATTCTTCAAAGAAGCTCTCTAAGCAAGGAGAGGTCAAAGAATGTTTTAAAGGACACTGATAAGTGGGGGCTTGCTAGTACTGGGCGCCAGTGTCCTAGGCAAGCTGAGGGGTCAGCTTACATCC-TCCATTAAGGGTTAAGCTCCAAGCCCTTCAAGAACTTTGGGTGAGTCAGGGCCAGAGACAGATGAAGAAAGGAGACACCTTATCTCTAATCAGCCCTGCCTCAAAATAGCTCTCTCTTCCCTGGGGCAGAGACCCGTCATCTCTGCACTGCACTGCACGGCAGCGTGGAGGTGTCCCAGCCCACTTAGTCAGAAAGTCAATGAGTGCGCTTGATTCATCTCTTACAC-AAGTTAGAGCTCTCT a score=20037 s mm7.chr5_random 2685240 614 + 11523536 AGTTCAAACCTGAAGCTGTGATGACTGCAGCTCACCTGCTCTGGG-GTTATTTTAAGAAAGCAGAAGCAGCATCATTTGCACACCTCTTATAG---ACACACAGTTGGCCGTGGCTTTTTGGCTTCAGTCTTTCAACAG---TGAAGACAAGATGAAGACCCACCTGCTTCTCTGGGGAGTCCTGGCCATTTTTGTTAAGGCTGTCCTTGTAACAGGTAGGTGGTACCTATACAATAACACCAGATAAAAGGGAAAATG-----------TGTGTTTCAGGTCTAAAGACTTAAATCTACTCTTCTACTGGCTAGCTGGACAGCTAGCTA-------CCTTCTAACCTCATTAGGCAGTGatatatatatatatatatatatatatatatatatGAATGATTCATTGTATTCTCTTTGTTTTTTTTTTTTTTCTTCTGTTTGGCTACTCCAGCCTACAGCATAATAAAATAAATACTTTGGGGGTATCTATAAGTGTGGCTACACT-TATAAATTCCCATGTATAA-CTTTAAAACCAATAGCCCTCCCTTGAGTCTCTTTAATTACTATTCTAGAGAAGTGAGGTAATAACTGTGGTAATTATGATATAGATTGTATTTTGATTTTTATCTCCCCAGAGA s bosTau2.chr6 21300646 614 - 69624268 AGTTCAA--CCGCAGTTGTGATCTTAGTTTGTTAGCTGCCTGGAGTGTTATTTTAAGAAAGCAGAAGCCCCATCATTTGCACACTCCTTATAGCTCACACACC-TTAACCCTGACTTCTTAGCTCCAGTTTTTCAAAAGAAGTGAAGTCAAGATGAAGAATTGTTTGCTTTTTTGGGGAGTCCTGGCCATTTTTGTTATGGCTGTTCTTGTGACAGGTATGTGGTATTTTGAGCATGAACCCAGGTAAAAGGAAAAATAGAATATAGATCTGTTCTTCAGAT-TAAACATTTATGTTTGTGTTT--------TGGTTGGACACCTAGCTGGCTATGTTCTTCTAAC------ATGTCTTAATCTTTGTATGGGCAGTGGTCTTTA---ACATGGACAAGACTCATTGTAATTCTTTTCATTCTTTTTTCTCTTATATGTCTGCCTATTAAAACTTAGAA---AATAAAATAGATAATTTTTAGATAAGTATAG--ATAGTTATACTATGCAAATACCCATATTGAATCTTGAAAATCAGAATTCTCTCCTTGAGTGTCTCAAATTTATAGTCTGGAGAAATGAGGTAATAATTGTTGTAAATACAATATAGAGTGCATTAGGA-TTTTATTTCCCCAGAGA a score=9778 s mm7.chr5_random 2685861 700 + 11523536 TCAGAGAGTGAAAACTGACTCT--CAGTTAAAGCTTCAGCGCACACCTATGCATTTATTCATTT---------TTCTGTATAGTGACACTGTACATCAAATTGAACTCATAGCTAACAATATTTTCTAAATTGTTTTTTTCAGCAAAACTTTGCAGACAGTACTTTACACTGATATATACTCTCACCTTTTATAGAATTCTTCTAGGAAATATTAATACAGGCCTTGTTTCTCTTTCTTGTTGAATC--TGTGTATTGATTGTGATTATTGTTATGAAAA-----AATATCGATAG-TTTAGGAAAGTTTTGGTGGAGAGTATTAAA-TCTTACAAAATAAGATAGTCTTGGGAGAAAAG---ATACTTCTAATACGATTTGAGGGAAATCTTTTTTTTCAGGAAGCAATGGTAGTTGCGGAAGGACTCTGTTTGCAGT--------TGGGTTTAT-----------------AAAGACTGGCTT------TCA---------AGATTTCTTTGATTGGGGAA-----TAGTCTAAATTTCTGCTTTATTTTTCATTTAGGTGTTTT-CACTGAATTTT--ACCATGTGCCCTCACTAAAATA-----------ATTAGAAGCATTAGATATAAATCAGAATTCCTTCAGGCTAGCTGCTCTTGAATTTTTCCAACGAAGAAAAAGAAAATTTCTCTTAAAAATT----------------------------------CTTTGCTCTTTTCGATTAGAAAAGAAAACAAATAGAAAGA-CTAGGACTTATGAACAATAAAAATTAaagtttttgat s bosTau2.chr6 21302571 762 - 69624268 TTGGACAGTAAATGTTGACATTTACAGTTACAGCTTTAATAGTTATTTGTG-ATTTGCTCATTTGTTATTTTTTTCTGTACACATGCATATTAGATTAAATAGAACTTCTACCTAACAACATATTCTAAACTGTTTT----AGCAAGTTT------ATAGCACTT-ACGTCTATAGATACTATATCTTTAAAAATAAGTCTTAT------CCTTAATGAA--------------------TTAAATCATTATGCCATAAACCTGATTGTTATTATGAAAAGGAAGAATATAATTAAATTTAGGGAAATTTTAATGGAGAATTTGAAAGTCTTAGCAAATTAGGTTATCTCGAGGAAAATGTGCATGTTCTTAGCA-----TAAGGGAAAAA---------AAGTATGAATGGGTGTTCAGGAAGGG---TGTTTTTATTataaaaaaccggtttatttgttcacttttgaataaaaaaccggtttatttgttcacttttgaataaaTATCTCTAGTCCGAGAGAAATTCAGTCTAGATGTTTGTTTTCTCTCTCATTTTGGCATTTGGCACTAATTTTTTTACAAAGCTCTATCATTCAGAGGGTTGTGCCTCCATTAAAAGCATTTGATTAAAACCAGAATTCTTTCAGTTCATGTTCCTGTAGACTGGTCCAAGGAAAAATGAGAAAATTCCTTTTGGAGTTCATCTGTATTTCCTTCACTATGCTGTGAGATTCCACTTAGCTAGTTTAGGTTAGGAAAGAGGAAAAATGGAGAAAGCTGAAACTGATCAGCCAATAAACTTAAGTTTTCTGTT a score=-363 s mm7.chr5_random 2686698 81 + 11523536 GGTAAGAAAGGCAAATTATCTCATCTTAGCACATAATGCACTTAAAAAAAAAAAAAGACagacaatacctctttatgtaat s bosTau2.chr6 21303333 39 - 69624268 GGGGAGGGTGATAAATTA---------------------ACTTGATACAAAG---------------------TATGAAAT a score=10269 s mm7.chr5_random 2686895 274 + 11523536 TAGAGTTCTGTTTTCCTTTTTCATGATATAGTTTACCTTTCAAACCCAAGGTGACGACGAAGCGACCATTCTTGCTGACAACAAATGCATGTGTACCCGAGTTACCTCTAGGATCATCCCTTCCACCGAGGATCCTAATGAGGACATTGTGGAGAGAAATATCCGAATTGTGTATGTGACATTCACCTTGCTTTTCTTTTCTCTGTTATAAGAAGGTACTTTGTGTTAGCA--AGCTGT------------------------CTTTTCTTTTTAAAGGGAATCATGCAAGGT---------------------TTTCTGA s bosTau2.chr6 21303372 316 - 69624268 TAGACTTTTGGTTACCTTTCTTCTTAAAATATTTATCTTTCAAGCCCAAGATGAAAATGAAAGGA---TTGTTGTTGACAACAAATGTAAGTGTGCCCGGATTACTTCCAGGATCATCCCTTCTGCTGAAGATCCTAGTCAAGACATTGTGGAGAGAAACGTCAGAATTATGTATGTGGTATT--TCGTGCTTCATATTTTCATTTTGTAAGCAGATACTTTCTGATATTAGTGGTTGTTTGCATGTGATATCTATATCTTTGCTTCTCTTTTCGGTGGGTAACATTTGTGGTGGTTATTTAGTCGCTAagtgatttctga a score=614 s mm7.chr5_random 2687193 40 + 11523536 GCCTTGACAGG-GGTTGCCTT---------------------GTCTAAATGTAGTGTCTTAA s bosTau2.chr6 21303812 62 - 69624268 gcattgacaggtgggttctttaccactagcgccacctgggaagccTAAGTATAACAGCTTaa a score=21294 s mm7.chr5_random 2687261 1119 + 11523536 AAGATTGAGTCATGAGTTAGATGAAATTGAGTTTTGATAACAAGAAGAAATGAGTTTTGATTTTACAGAAGTCGAGGGCAGAAACAA--------AGGGAACC-------------------------------GGAGGTTCCTACTTAGTCACCAACATGCCC-GTTTATAAGCAGCGATTTCAGTTTGAATCAGAATTTTCAGTTATTCTTTATCAGCTTAAGCTGCAACTTCAGATAACAGTAAACACTCAACTTTCATTCCACAGT-TATTGACTCTTGAGTATTATACATTGTGTT----------------CCTAAA--------AGACTAATTAAAATTGATTGAATTGACTT----TTCGCTCATAAATTGGA-GTCACCTATTCATTTTATTTCTCATATAGCCCAGACTTATATACTGGTAGTGCTTAACTAATAGCAAGAATACTGATAATACTTGAGAAATACAATTTCTACTTGAGCCAATCAGTGACAAGTTTTTCTTGTTAAATACTCC--CTCCTT--AATAGTTTTCTCC---AATCAAATACTTCTTGCAGGAAGAGAACATAGCAGTCAATTCCA-GCTATCAATAGGAATATTATG--ATGTTTAAAAAATTGTTTCAAGATTTAGCTGCATCAT------TTTGCAATTGTGCACTCTTAACAAATAT-caaattatttgcccactcgaaatctaaaa-tttctcatctttaaata--gaagaaaaaacaagcctactttataggattattaaaa----aaaatgagaatatctattgtttgtaaagGTTGTGTA-----------------------TACCAGTCGCATATTTTAACAA----TCCTGTTATTTACTTCA------CTATGTGCTTGCTAATCTTATACTGCGGTCCTG-AGAAAATGCTGTGGAGCTCGCTTTCC--GTATTGTTGTCAGTATGCATTACCTCCAGAGTGCCTTACCTC--CCTACCAAGCTTAGCGTAACTCTCCATCGTTCCT---GCTATTTCATTCCTATTGAACAAAATGAAACAGACACCAAGCTCCAGGAGTCCTGGAGTGTGTCTTTATTTCTCTACCTTTGCAGTGGGTTTTACCTTTTCTGTTTTTACATCTACTGGATCCTCTGTTT-AAGAATTCTTTCTGTTACCCCTTTAAAGCTTGGTTAACTCTTCCTTAGTCTGTGTGTCTAAATTTAGCCATTGAGTTCCACGGGAGGTTTTCT s bosTau2.chr6 21304072 1178 - 69624268 aagccCATATAATGGCTTACATGAGGTTGAATCTGGGTAATGGGCTTAAGCCAATTAT---------ATAGTTGGGAGCAGAGACAGACGTTTCCAGGCAACCTAAAACCAGTCAGCTACATCAAATAATAACTGAAGGTTCGGATCTAGTCATCAACATGCCCTGTTTATATGGAGTTATTTCAGTTTGAATCAGAACTTATATTTGCCCTTGATCAGTTCAAAGTGAAACTTGAGATAATTTTAAA----AGGCTTGTTTTGCACCATATATGGACCACAAAGTACTTCACCTTGTATTCAACTTCATCTGTCTGCATAAAAGTATGGTAGACTAATT-AAATTTACTACATTGATTTCATCTCCACTTGTATATTGGACTTCAGATACTCATTTCATTTCACACATAGTCTTAAGTTATAAACTATGAGT-CTTATTCAACAGCAAAAACACTAATAATATTTAAGAACTGAGATTTCTATTGGATCCAGACATTAAT--GTCTCCTTTGTGAAGTACTTCTACTACTTTGAATAGTTTCCGTCCTGAATCAAATACCTCTTATTGAAACAGATCATAGTATTCAATCCCATGTAATCAATAGGAGAAGTATAATATGCTTATGAATTTGTtttgagttctggctg--tcactaaatattagtagctatgtgctat-----ggtatgctagttacttaacccttctaaacttgaacttttctcatctctaaatattaataggaaaataatatgtgttcatcgggttattataaagataaattgag---atCTATTCCTTTTAAAGACTATGTAAAAAAAAAAAAAAGACTATGTAGTTCCTGGCACATTTTCAAAAAATATTTACTGTTATTTA-TTCACCTAACCTATGTGCCAGTTATCATTATGCCACTACCCTTCCTAAAATCCTTTT--GCTGGTTCCCCCAATGTTGTTACTAGGATAAATTAC-----GAATGTTTCAGCCTAACCTACAGTGCTCAGCATAACTCTCAAGCTCTTCCATGGCCACTTCTTTTTCATT-------------------TTATGTTTAAAAATTC----AGTATGTTGCAGTACctctttctt---------------cctctttgtttttgcataatctagttcctctgcttgaaggactctttcttgcacccctct-tagcctggttaactcttc---agcctgcatgtcttagcttagacatcacttccttgagcaagttttct a score=8257 s mm7.chr5_random 2689183 449 + 11523536 AGAGACATGCAATTAGAGGGAATTA-GCCCACAGCATTG-CACATAAACCATATTGAAGAA-------CCACTTATGTTTTGATCTCCAGGGGGACAATTGCCTAAATACACA-------TCTAACTCATCTCTTACTTGT--------------------ATTATATTTTA----CTGATGTCAAATAATTTAGTTA-----------TGACTTGATGTGTCATGATGTTTC-------------CTGACAGTG-TATTGCCTTTGCTGTGTCATTGTGGAACTGTTCCCAACTCCATCGCTTATTGTAATGGTGCAGCCTT--------------------TTGAATCTTATTTCTGACCTGTAAAAAAGAGtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataCCTGA-----CTATATAATAATTTATACAAG-------AACGGTATTTGGCTTGTAGTAGAA--------TCTTA--TAAATGTTTATTTCTCTGTCATTCCCATTACTGAAAACCTTTTCTGGTGTTAAT-gagat s bosTau2.chr6 21305530 547 - 69624268 AGAAGCGTGTATCTTAAGAGAATGGCATCAATGACACTGGCATCTAAACAGTGTTGAAGAGGAGTGTGTCTCTTATATTTAAATCTCCAAGGGCAGATTTAAAATGATACTCCAGGATTCTCTGATTTATCTTTTTTTTTTTTAACGACATGATCTTTTTTATGATATTTTATTTACTGAAATCAGGCAGTTCAGTAACTTCATGCCATTTCCCTGATGTATATTGATGCTTCTTTAATCTTATTTCTGAAAGTTCTATTATCATTGCTGTGTCATTGTGGCATTATtcccaactccatcacttaatg--atgttatgactttgggcaagttacttaactagtttgagcctgttccctaaactgaaaaaaaggg---atatgtataggtatgtatatatacacatatactt-catagggtcgtgaggattaaatatgataatatataaaagcacttagaacagtA----GTCCCCAGTGAAACACTGTTCTCTTACTTATGTGTCTGTTCTCTTACTTTTCTCATTATTTAAAGCATTTTCTGATATTACTAGAGAT a score=15019 s mm7.chr5_random 2690423 396 + 11523536 TATTTAAAGTATAACAAATTATTGTAAAACCCATGTAATGGT-TTAC-AATGAGT------AAGGTGATGA------TGAGTACTGGTATAATTAAATAGTAAATACTAATCTGTTAAGA--CCCACAACCAGAGACAACAATCTTTG-TACTTACCTGTTTTACTGTTCTCTCTCTCT-----TTTCAGTGTCCCTTTGAACAACAGGGAGAATATCTCTGATCCCACCTCCCCACTGAGAAGGAACTTTGTATACCATTTGTCAGACGTGTAAGA--TTTTCCTTCATACT--TACATATGTTGAAGTTAATAACCTTTAATTAACTTTATTAATAATGATATTTCTGAAAATACATTGGGGTGTAAGCATTGACAAATGTC---TGAACTTTAGAATACACCAATTCTTAGGCTAATGACTA s bosTau2.chr6 21307660 421 - 69624268 TGTTTAAAATGTAGCAA-TTATTGTGAAATGTGAGTAATAGTGTTACTAAAGAGTGTTTATAGAGTGCTAAATGTCCTAAATGTCTG---AATGAAATAGTAAGTAGTGTCCTAGCAATATACCTATTACCAAAAACAGCAGTATCTGCTAATTTCATTATTCTTCGTTTTCTCTTTTTCTTTTTTTTAGTGTTCCTCTGAACAGCAGGGAGAATATCTCTGATCCTACCTCACCAATGAGAACCAAATTTGTGTACCATCTGTCTGACCTGTAAGAGATTTTCCTTCACACTAATAAAGATACCTAAGTCAATAACTTTTCATTAAACTTGTTAGTAAGAATGTTTTTGAAAACATATTGGGGTATAAACATTTACCAATATCGTTTGAACTTTTGAATACATTAATTCATATGTTAATTATTG a score=44054 s mm7.chr5_random 2691322 1494 + 11523536 GTCACTGGAACTGAATTTATTGAACCATGC-ACAGAGCTAGGGATAGCCTTA-TGCAGTGGAAGCTGTGGTACAGTATGGGTAAGATGAGCCTCTCATCATAT-CATTAGTTATAGTGCTGAGTTGCAGTATTTTTTACATGAAAGATTCAAGAATTTTGTCAAGTATTCCTTGCTGTGCAGATGATTAGGCCTGGAAAGAATCATCATTTATTGTGCGTCAGAGCTGCAAGAGCAAGCAGACTTCAGACA-ACATTTATAATGACTTGTATATTGAGATAACATTTGCTGAGGGATTTCTAATGCATGCCTAT---TCTCAGCTGTAAGAAATGCGATCCTGTGGAAGTGGAGCTGGAAGATCAGGTTGTTACTGCCACCCAGAGCAACATCTGCAATGAAGACGATGGTGTTCCTGAGACCTGCTACATGTATGACAGAAACAAGTGCTATACCACTATGGTCCCACTTAGGTATCATGGTGAGACCAAAATGGTGCAAGCAGCCTTGACCCCCGATTCTTGCTACCCTGACTAGCTTGAATCA--CTCACCATGCAGCTCGTTGTCCTTAGAGGCTCTCCAT-----TTGCACCCAGAAGTTATACTCACTGCTAATGAATTTGAAACCAGGGTTTTTTTTTTCCCCCTGTGGTATAAAACTAATGTTCCCTTTCAATCATTAGAATATCAGAATTGCTGTCATTATTATGTAACTCTCAATTCGAAGTAGTAAATCCTCATGTCTGCTCAAGGAGATATGTTTAAAAGTTCATTTTCCAGTGTTTAAAATTGTAAGCAAGGGGAGAAAGTAAAATTCCAGGAGT-AAAAGTCAAGAGGT-TAATGAAACCCAACCCTTTCCTTCCTTC--CTTTGCTGTGGAGAGCTGGAGCTTTCGCACATCCTGTACTAGTCTTTCTCTTAACCTCTCACTGTGTAGAGAAAACAGCCA-ATGAACACAGG-AAGTTACGTATCTTCAC--TAGAAGTTATAA----AGGACCTGTTTTGGAAATATTTA-----------------------CTAATATTTATGAAAGACTTTTGTTGAAAGTGATATAATTTGATGCACAAATGAAAAAAAATGGATGTTGATATAATATATAGACTTGGCATTAGATTTCCTTGATAATATTTTTGACAGTGAGATTTTTATCTGAAATTCTTAAGGGGA--GTCTTTGATGTCTCAGCCAAATCTAATGAAATTTGTATTCCAAAATATGTATTCTCTAGTACAGTTTGAACAATTAAATAGAGTGCTAAGCATATACTCGTGTGAAATGACTCGTTGGGAAAAATTTTGTTTGTGTTTAACCTTCTTATATGTAAATT-AAATATAAGTTATTATTGGCAAACAGTTTGTAAGTATGATACAACAGTGCATTCATCACTTAGCTTATATGAGTACATATTTGAGAAATCTTTGTTAATTCACAGGTAAATTTAAGTACAAAGGCAGGGTCCATAGCATGTAGCACCTTTCAGAAGCAGGAGATGTATGTACTCTGTGGTAGGGAG s bosTau2.chr6 21308494 1428 - 69624268 ATTACTGTAAAT-AATTAATTTAATCCTACTATACAGTTGGGAATAAATTTAACAGAGTGGAAGTTACTGAATAGTGTACACAA-------------TCATATATATTAATT-CATTGCTTACTTTCA-----------ATTAAAGGTTGAAAAATTACATCAATAATTCTGTATTATAGAGAAGTTGAAGTCTGAAAGGAGTCATCCTTT-------GTCAGAACT---------AACTGATTTTGGATAGAAATGTATAGTCACTCAGATTCTGAGGCAACATTTGATGGGGAGTGTCTAATGTGTGTATTTGTTTTTCAGGTGCAAAAAATGTGACACTACAGAAGTGGAGCTGGAAGATCAAGTAGTCACTGCCAGCCAGAGCAATATCTGTGATAGTGACG---------CTGAGACCTGTTACACCTATGACAGAAACAAGTGCTACACAAACAGGGTCAAACTTAGTTACCGTGGTCAGACCAAAATGGTGGAGACAGCTCTGACCCCGGATTCCTGCTATCCTGACTAACGCAAGTCATGCTGGCTGCACAACTGCTTATCTTGAAGGGCTCTCCATTTTGATTGCAGGTAGTTAATGTATTTACTCCTGATGAATTTGAAACCATGATTTTTTTTGGGTGGGGATAATATAAAATTAACTACCCCACCC----------------------CTACCACTGGCAAATAA--------TTGAAATAGTAA-----CA---CTGTTA--------ATGTTTTTAAGGTAAATTTCTAGCATTTAAAAAAATAGATGAGGGGAGAAAATAAAATTCAAAAAGTAAAAAATCAGGAGGCATAATTAAATTTTGCTTTTTTTTTTTTTTGGCTTTGCCCTAGAGAGCCTGAGCTTTTGCACTTTCCGTATTATTCTCTTTAAAAAAATATCACTGTGCAGAGAATATTTATATATAAATATAGGTCAATTATTTGTCTTCACTATAAAAATAATAATTGGAAAACATGTTTTGGAAATATTCATAAAATAATTTAAAATGAGATCTCTAATATTTATGAAATAAATTAGCTGAAAGTGACATAATTAAATGTATAATT---CAAAAATACATTTTGATATA----ACAGATTTGGGAGCAAATG---ATAAAAATTTTTTTAATAAGTAGGACAGTATAAGAAATTCCCATTGAAATCACCTCTGTTGT---AACTAAATCTAACAAATTATGTACTCCAAAATATGTATTCTCTAGCACAGTTTGAACAATTAAATAGATTCATAAGCATATACCTGTGTGAAATAATTTATTGGTAAAAAGTTTGCTTGTG-TTAACTTTGCTGTATGTAAGTTAAAATATCATTTATTACTGAGAAACAGGTTATAAGTATAATCTAATTATGCATTAATCACTAAGTTCAAACATG---ATATTTGAGATAGCTTTGTCATTTTATACCTAAAACTAAATAAAAAGACAAAGTCCCTTCTGACAAATATGTTT----ATTATGGCACATATATACTTTATGGCAGAAAG a score=2295 s mm7.chr5_random 2693086 34 + 11523536 TAAGGGCACTATGGAAAGTAGCTGCTGATTCAGA s bosTau2.chr6 21309946 34 - 69624268 TAAGGGTACTGTGGAAAGTAAATGCTGACTCTGA a score=6028 s mm7.chr5_random 2703564 381 + 11523536 gaaattatgaattg-taagcacttaaaaatatttaaagagaaaGTTGTGTTTATGGAACATTCATTTACTTTGCTAGTACAATTGCTAGTTGCTCTGAGAGATA----TGTGA-AGGAAAAACAACT-CTTTTTACTTTCTAGATATGTTCCTATTTCACCTATTGGCAGAACTAATAGGAAAAACTTTGCACACAATATATTACAAATATGG-TTGGAGGTAAGAGATGAGTTGCACTATGAGCCATGAGGGAA----GAGAGTCATTAAGGCTTGGCATAGTCTTGGA------ACAATGTTAACCAAATGGAGATTTTCACACTCAGAGAGTTAGAATCTTC-----TAGAATTATGCAAGCCAGACAAAG----AGGAAGAATCATTAGGGAAGTCTAAGAATA s bosTau2.scaffold2679 3834 378 - 104651 GAAATTCTAAATTTCTATCCATTTA----CGTGTGAAGGAAAAGTGacatttatttagcatctgct--ctgtgctcagcaaaatgccagttattgtgagggatagttacgtgagatgaataagaACTGAGTCTCACTTTCT--------------CTCTTCTATAGGTAGAACTAACTGGGAAAAACCAGCACATGATATAAAACAGCGAGGGATTAAATATAAAAAACTA--TGTGCTGTGAGCTTTAAGGGAAGCTGGGGAGT--TTAGGGCTGGT--TAATCTTGGAGGAGATATAGTATTAACGGAATAG-GGCCTTCATGGATAGAA---TAGAACTTTTTAGAGTAGAACTACACGAGCCAAGCAAAGAGACAGGAAGACGCATAACATACTTGTAAGAATA a score=11513 s mm7.chr5_random 2703992 512 + 11523536 TGAGATGAGGCACTATGGGAGCAGAGGGTCTTGACCTGCGTGCTGTAGGGTCTGGGTTAGTGGGCACAGCTTTATTCATTGAGCAGTTCTTTCTGTGTTAGATTATAGTTCAGCTTGTTCCTTCCTTCTTGTTTGGAGGGCTTCTCCTCTGCTAGCATGGGTTTTTTTTCTTTCTTTCTTGTAATCAGCTGATTGGTGTTTTTAAATTGAATGGCCTCTATATTCAAAACATTCAAAGGGAGAGCAAAAG-----------GCTGTTATTGAATAAGG--TGAGGCAGAGAGGCAAGGAAGTACAGGTGGATAAAAGTAAATATTATATCCTGTGGTAAAATGGTGATTATTT-------------TACATTTCCATTTAGGGGTGAGCTG-----TTAGCCTGAGTCACACTGAAA-CTTTAAGGTTTAATGAAGTAGAAACAGACTTGTCTGTCCACCCCCCCCCTTGTCTGTTTTAAGGTCAACATTTTTGGTTCCCTTTTTGGCTCTTAGTAACGACTTTTGGTTTCATGAGTACATGGT s bosTau2.scaffold2679 4889 478 - 104651 TGACATGGAGCACTATGATGGCAGAGGATCTTTGATTG-----GGGAGCGGATGGGGCACTGAAGGCAGCTTCATCTGTTTCACAGTTATATCTGTGTTGACCAACAGCTTAGTTTCCTCCTTGCTCCTTTTTTTGAAGAGTTCTGCTCCATCAGCATGG---------TATTCTGTTTTGTTACCTGTTTATTTGTGGT----------------------------GAATTCAAAGAGAGAGAAGAAGATCCAGCGACTGATGTTTTGGGGCTAGGGATTAGGTGCAGAGGCATGGAAGAACAGATGGACAAAC-CAAGAACTATAACTCTTTGTGAAATGATGATTACCTATTTTCTACCAAGTACAGTTCT-TCTGAGTTTTAGCTGAATACTTGGCCTGAGTCACAGTGAAACCTTTGAGGTTTTGTGAAGGAAAGACAG----------------------CTGTTGATTTCAAGTCCTTTATTTCTAGTTCCCTTTTGGGTTTTTAGAAATAAAGTTTGGTTTCCTGAGGGCAAGAT a score=8189 s mm7.chr5_random 2705330 669 + 11523536 TTTAGATGATCCAGAAACCTGGAGGAAGAGTCTCCATGATAATGCCTGCCATGTCTAATTCTCATAAGATCAGCTGGACCCTGCGCATCATCATTCTACTTCACCAT--GCACAGAGTGAGAAG----CCCAAGCTTTTCTC-AGAGAACTGACTT---------GTGCCTCTGGAGAT---------------------------GCTGCCACAGATGGTATGTATGGGCCT--CTGGACTGT--CTTATGTTCTGTTACCTTCAGATATGATTTTATTCTGTA---------TAAGTTGTCTTCTTGGGAAATGGAGGTCATACCTAGCTACGTTAGAATCAGCAGAGGGCAACTGTTAGGTTCCGTCATCCACTGTAGAAG-TGGGTAGCAGTAGCAGGGTGGAGATTCGAGAGCTAAGGTAGATGCTGTTGTCAGAACCTG-------TAGCGCATGCCCCTTAACTTTAGACTTCACAAGCTTTGTGGACATCTTAGGCAGGACACAGAATGAGCAATGTATTTAATGAAAGGAACTCATGCCTGTTACGTAGGCTTGGAGAAGCAC-CCTGTACTAATAG------------------GAAGAAGCATCATCTACAGGAA----CAGTTTTCATTCTTTGTACTATG--TTCTCAAGTTTAGTAGATTTTCTTTTGGTTACATTCTTCTTTTTACACTTTGC----------------ATGACAAATGACAGAGATATTATCTCACAGATGTGAATGTACCAACATAT s bosTau2.scaffold2679 5513 738 - 104651 TTCAGGGAATCCAAAAAGCCAG-GGAATAATCTCTGTGATAATGGCTACTAGGCTGAGGTTTAAGGGG--TGGTTCGACCCTATATTTCATCATCCTATTTAGCTTTTTGCTCAAAGTAAAAAAAAAATGTATGTCTTCCTCTGGCCAATTGGCTCAGTGGCCAGGTACCCCTAGAGAGATCTATTATAGGCTATGAGACAGAAAAGCTTATAAAGCAAGTATTTGTTAGCCTTGCTGAATTATTTCCTATGTT-TGTTATCCTCAGATATTATTTTCTCCTTTAATTTATCAATGAGTCATCACC-----------AGGATATATCTAGTTATTTTAGAATCAGGAGGTGATGACCACTAGACATAGGAACTCAGCACAGAAATTGGGCCATGGTGGTCAGATGGGGGCACTCAAGACAAGA-GGGGGTCACTTTCAAGGCCTGCCATCCCCACTGTGTGCACCTTCATCTTAGAGCTGAT--TCTTTG-------CTTAGCAAGGGCACACAA--AATAATTTCTTT-----AAGAAACTCAGCCCTGGTGTCTGGGTTTATGGAAGAATGCCTGTGGTGGTAGTGATGATGGTGGTGAGATGAAGAGTCGTCTTCTACAGAGATGTTCCCTCCCCCCTTTTCTCACTGTGCATTCTCAAATTCAGTAGATGTTTTT---GTTCCACTGTGC-TTTTACATTTTATATTACAGTGGTCTCAGATGACAAATTAAAGCTGTGGTGCCTCATAGATAAAGATTAGTCGACATAT a score=147903 s mm7.chr5_random 2706772 3869 + 11523536 CAGGGCAGGTGCTTCTGA--ACACAAGGCTAGGAAACATGGTGCTTTCCTCTGCATCCC------TGCACACCTCTCACAGGAAGAGTAAGTGGCGGTGTGAGCTTACATGCATTAAAGAGCCAGTGACACTACAGCCAACCAGTAAACGTTTACTAGGAATCTCCTATTGGTAAGACATTATACTGGAGTC-------------AAGGGCAAAGTTAATTTTCTCAGGAAAGTTTCA----------CCAAATTTCTGGGGTCAT---ATAAAATCTATTAAAGGAA-CATTTTCTCAAGACAGTCTTTAGGAATAGAAAGTAACATTGTAGGTAATTTAGAAAAAAAATGTACACCAAGACTCAAAACAGGAAATATTCAGATAACAGGCCAAAATGCCTTTAATAACAGTAAAAATAATATCAATAAAACTCAAATATTTTCTAAGCAAGACAATATAGAAATATCTACTTTACAAAATAATTTACACTATTTAATCATGATACCTGGAAGTTGTGTCTGGGAAAAAT-CTACAAGGATATGAAGCATAAACATAATAGTCATAATATATAATGGTACAATAATTTATACTGAACTAGTAGAGAAAACTAAACATTGAGTGCTTTATCTGCATAAGGTAGTATTTCAAGAAATGTCCTCTGCAGATCTTGGAGATTGAAAATTGATGACACAGTACAGTGAG----AGTCTTTTTTCCTAG-ATGCTCAGTCCCAGAGCGACAATTTCTTCTCTTCTTCATTTTCCACTTTCCTAAGCTCTATGATCTATCTGGT--GTCTAGGC---TGTCTTCCATTCTCCTA-----------GAATGTGCTTTTACAACCAGG--GTGTCTATGTGG-AGAGGTCATGAGAAAATTAACAACAAAAGCA-------------GCTATTTCAGACGTGTTATCTACAGTGATGGTTTGGCTG-----AGAAAAAGA---GAGTAGAATTTGCAGAGTGGATTCAGAGAGTGAAGGTGATGT----ATAGTCTTAACGCACGAAAACTGTATAT---ATAAAGTGAGGGAAAAAGAAATTTAACAAAAAATAGAGAGGAAAGGTTAATTTTGGTAAAAGATCAAAGTTCCACATTTGGAGACAGAACAGAAAATTGAAGGGAAAGGAAATCATGAAGGGGTCATCAGACATAAGGGACTGCCAGTGGTGCCAGTCA---GTATCTCAGCATGTGAGAAACGAC------------GGACAGAGAGAGAATGTGAGGGACACCGAGCTGC--------ATGGAGAAGGAAGCAGAGAGAAGA-------------GAGCAAGGAGACAGTGGGAGGAAACATGCCAAAGAGACTCTTAACTAGAAATAGAACACACAGAAACAACATACAGGAAAGAGTGCATAAGGACCATACTGGTGTGCAGATCTCTGTATG-AAAATGGAAAACTCAACAGCCTGCTAGACGTGCAAAACCAGAGAGCATTGTAAGTA-----ATTTGAGAGAAACAGGATAAGTTAACAAGAAAGAGGGAACTAACTCAGACAATCAAATAGCTTCCAAGTTTCAAGGCAGGAATGGTCATGGCCTTCATGCTTTTTCTT----AAGTGAGCACTAACTTGTTACAGTGCTGGATCCAGCCAGCCCCAGAGGCCCAATCTCATTAACTCTACCTGGGCCACTATTTCTACTGTTGGGAGAGAAAAAGGCTTAGGGGTCAT-AAGAAGGT---------AATCAAGTCTCAGGGTACAAAGTTGCAG--AATCATTGACATAGGATTGCTAGTTTTTTTCTTTTTTTCATCCCCCAAGGATGTTCAGTTGAAGCGATCCCTAAGCCTGAAGCAGTAAGCAGCCTTG------GTCCTGTGGACTGGTTCCT---TGAAAAGATTCGAGTGTAGTGTGTTCATCTGCATTAAGTTTATCTACGTTTATACTTTTAAGTTGTTCCCTAGTAGCTAACCCAACCAATGTGTTAGGACTTTCAGTGGGTGTGGAGAGAGCACCATTAAGTAGGGTTGGTCTTCTGTTGTTAATTGGAGGTCCAGTGGTAGAAGAGTGAAATTTTG---AATTGGAGCCAAAGCATGGCAACTTCATGATGGTAGGTGGCCTTTGTTGCTGCATCTCACCCTCTTTTCCTTGGACTTCACTTTGTATGCTATCTGGGCCAGAGCCTTTATCAGGAATACCAATGACGAGCTGCTCAGGAGTAAGGCCAGCAGTTCTTTCACTCAGCTGGCTGCCTTCAAAAAATTGTTTCAGAACATCCCTCCGATCTCCTCCAAGGTCACTTTTAAGACAGGGCGTGTTTTTTGGCTGAGAAGAGCTGGCTTCAGAAAAGGCCACAATTCCTGTCT---CTAGTTGATTCTTTCCAGAATATGGAGTATTTTTCCTCACAGTAGGCACACCATCTCCAAATGGACTTGGGTTTGGGCTTTCTGCAGTTAGTTTGTTCTCTGAGATATTTCTTTGACTAGGTAGGATGCTTGCTGGGGAAACGTTAGGTCTTGCATACTTGATATAACTGCTTTCTGTATGCACTGGACTGGTTTCTTGGTTCTTCCTTGGTGGAAGACCATAGGATGAAGTGTAGTCTTGTAGAGCCAGCACATTGTCTTTATGTCCTGTGGAGCCACCAATACAGCAAGACCCTCTTTGACTTTGGTGAAATAAGTGTGCTTCATTTTGACCTGTTGGGTAACTTTGAGGCAGGAAGTCTGGGAAAGCCAACTGTTCTCTTTCTGGTGGACTTAAACTAGTAATTTGCAAATCATAGTTCAAATTCTCACCTTCAAACCATGTTGGATCTTTTGGAAATCTAGCAGGGGATGTAGTGGAATAAGGATGGTT-------TGGTATATTAGA-----------TTTGTGTAAATTTATTGACTGATCCCAGACATTTCTGTTAAAATATGGCTCACTCTCTTTCTGCCTCTCAGCTTGATTCCTGTGGTCCCAGGAGGTCCATGAAGGAAAGAGAGTGCTTTCTTCTTGTCCTATGGCATTATTAACATAATAACTTCTGGGGTCCACGGGTGGTGCTATAGTAGGACCTGGGTTATATATTGGAAACGTTTCCTGTGGGTTCCAGGGATAGAATTCACTGTAAGGAAAATCTTCACTGGGTTTTGGTGGATTACTTAAGGAATAAGGAAGGTATTCCTTCGCTAGGGTTGAGGCGTAGTGCTCACCTTCATACTGCCTAACTGTTGGGTTTCCTTTGAAGTTCATCTCTTCATCCCCCCATCTACTTTGTCCTGGAAAAGATTCATCTTCATTTGGATCAATTGGATCCTCTTCATTGTACTGCTCTGTCTCCTTCTGGTCTAGAGAAGTCATGGTGTACTGTGGGTTTTCTGGCCGCATCATAGTACTGGGAGAG------CTCTTATCCCATGGATTGCTTTTAATGTACTGTGATGTTTCTC-ATTATGATAAGGATTGGTATATTCATGGTAAAAAATATTTCCTCTAGAGCCATAGGACGGATGACGTAAATTTTCGTCTTGCCTCCCATAGTCTTCCTTTAAGGGTGGAAGGATTTTTTGACGATTCCAGGTATTTCTTTCAGCAGGGAAATGTTTTCTTGTAGGAGAAGGGATTTTCTTAGGGTATGCAGGCTGGTGTGTACCATGTTTTAACTCAGGTTTTTTAGTTTCTGATTGAAATGGGGTTCTTCTTGGCTCTAAAGCAATTCCTTTGGGCAAATTCTGGCTTTGGATTTGTATATTAGGACTTGGTACTCTTTTGGAAGCTCCTTTTGAGAAGTAGGAGTTTTCTTGTTGATCAAAGGAATTAAAATTTGGGCCTACCATGCTGCCCTCAGAGCGAGGCAAATTATAGTTTGGATTGTTAATTCCATATTGTTTAGCACTTCTCCAGGGGTTGCTTGCATCTTTGGTAGGAGTGACTGTTCTTTCTTTTTGACCTAGTGACTTTTCTTTTGGATTTTGAGTTTTCATATTGTGGCTAACAGTGACCTGTTTAGGACCCACTGAGGCCA s bosTau2.scaffold2679 6533 3922 - 104651 CAATGCAAATGTTGCTGAGTATATAAAGCTATGGAGTATGGCGGCTCATTTAGCATCCCAGATGGTGTAC-----CCACAGGACAAGCTTACTGTGGTATTTTCATGGGAGCTTTCAA-AGCTGTTTAAA----AACcaatcaataaatatttattggctatctactatatgcaagacactgtgccagggactcgagaagactcaaagggaaagattccttttctcaggaagttttcagCGTATTTTCCCAAGGGTCTGAGATCTTCTTATGAAATCTGTCCTAGGAAACTTTCTCCTAATAAACTCCTAAGAGCCAACAGGTAACTTTCTGGATAATTTGGATAATTCTTCCTCTCTGGGA---------AGGAATATACAGAGAGTAGGCCAAAGTGCCATTAATAAAAACAGAAAAAACACC---------TAGATGTATTCTAAGCAAGGCAATATAGAAGTATCTACTTCACAAAATAATTTACACTATTTAAACAAGATACAAAGAGAATGTGTCTGTGAATAATTCTACCAGGGCATGAAGAATAA--------GTAGTAGAATACACTGGTAGGACCACTTATACTGTACTACTAAAGAAA-TTAACCTTTGGGTA-TTTCTCTTATTAGGATAGCATTACCCTAAAGATATTCTCTAGATCCTGCAGATTATGAGTTGATGATGGGGTATGGCAAGTCCTACTTTTTTTTATCAGGATGCTCAGTTGAAGAGAGGGAGTC---------CTTCCCTCTTTACCTTCTTAAGTCTTGTCCCCAGGCTACTAGGTCTGGGTAAATATCCTCTTTTCCCTTATTCTTCCTTTTGAATATGTTCCTCTCACTGAGCTGTGTCTACTTGGTAAAGACCATACGAAAATTAAAAATAAAAATATGTATCAGTGTCTACTATTTCCAAAATATGTTCTGCAATGATGGTTAGGCTGGGCCAAGAAAAAAATCAGTATGGAATTT--AGAGTAAACACAAGGAGGGAGTGAGATGTCCATGCAGTCTTAAGTTATGCAAATGATATAGCAGAGAAAAAGATGAAGAAAGGAGTCAGAGAAGAAAGAGA---------------TTGACAAGTGAT---------ACACTGGGAAACAGAACAGAAAGCTGAGAAGAAAAGAAGAAAAAATTGAGAAATTGGATATAAAG-------ACTAGTGATAGTTAAAGGTATCTTACTACATAAAAAGAGAGAGTGCAAGATGGGGAAGGAAAAATAAAAAGCTAAACACAGAGTGGTTGATAGAAATAAAGAAGGAGGATTAAAAAAGGAAATGATAAAGGTGAAGAAAGAGGTAGTGGAAGAAAAATTGCAAAAGAGAATATTAACCAGGAAAAAGACCAACACAAGGAA-GTAAAAAGTACAGTGCATTAGGATTATATTGATGTATAGATATCCATACATAAAATGGCAAGTTCATCTGCTTTTCTGTCTTGCAAATGCAGACAATTTTGCAAGTATGGAACTTTGAGAGGAAAAGGAAGAATCAGCAAGCACAAAGAAACTAATCCAGACAA----GTGGATTACAAGTTTCAGGGCAATGGTGGTCAGAGCCTTCCTTTTTTTTTTTTTTAAAGTCTGTGCTAATTAGTGACAATACTGACTCTAGCAAACCTCAGAGGCCCAGCCTC-----------CTG---------------TGCTGGAATGGGGAAAAAC--AAGGATCACCAAGAAGGTGAGATACTTAATCAAGTCTTGGGGGAGAAAATGTCTGGAAACCACTG---TAGAATAGCAGGTATTTTCCTT--------CCCCAGAGAATACTTGCTGGAGATGATTCCTAGGCCTGAAGTAGTAAGCAGTCTTGAACCTGGTCCTGTGGATTGGTCCCTACTTGAAGAGGATCAAATGGAGTGTGATCATCTGCATTAAGTGGGTCTACATTTATATTCTGAAACTGTGCCCCAGTGGCTAACTCAGCCAATGAGTTAGGAATTTCAGTAGGCATAATTGGATCCCCATCAAATGAGCCTTGCCTTCCAAGACTAGATGGAGTCCCAGTGCTGGAGGTGTAATACTTTGTTAATTTGGAGTCAAAACATGGTAACTTTAGTATGGTAGATGGTCTTTGTTGCTGCCTTTTGCCCCCATTTCCTTGCACTTCACTTGGAATTCCTTCTGGCTTGGGACCTTCATCAGGTGTATCCATAACAAGCTGCTCAGGAGTAAGATCAACAGGTCTTTCATTGAGCTGGTTGCCTTCTAATGTTTGTTCCAAAACATGGTTTCCATCTTC---AAGATCACTTTTGAGGCAAGGTATATTCTTTGATTGAAGGGAACTGGCTTCAGGAAGGGGCCTAATTCCCCTTTGGCTCAATTGATTATTTATAGAACATGGTGTGTTCCTCCTCAGAGTGGACACGTCATCTCTGAAAGGACTTGGGTTTTGACTTTCTCCAGGAAGTCTTTTTTCTGAGCTGTTTCTTTGGCCAGGTAGGATGCTTGTTGGGGAAATAGTATATCTTTCATGCTTAGTATGACTGTCTTCTGTATAGAGAGGGCTGGTGTCTTGGTTTTCCCCTGGTGCAAGACCAAAAAAAAGAGTGTAGTCTTGTAGAGCAAGTGGATTGTCCTTGGGCCCTATGGAGCCACCAGCACAGCAAGGGCCTCGCTGACTTAGGTGAAATAGACGTGTTTCTTTTTGACTTCCTGGGTAATGTGGAGGAATTAAGTCTGGAAAAGCCAAATGTCCTCCCTCTGGTGAATTTAACCTAGTGATTTGCATGCCATAATTCAAATTCTCACCTTCATGCCATGTTGGATCTTTCTGAAGCCCAGTTGGGGAGTTACTGAAATAAGGCTGATTCTCCTTGTGGTATGGTGGACTAGCAGGGGCTTTGGGTAGATTCGTTGGCTGACCCCAGAAAGTTCTGGTAAAATATGGCCTCCTTTCTTTCTGCCCTTGGACTTGAACCATGTGGTCCCAGGAATTCCAAGAAGGAAACATAGTGTTTTCTTCTTGTCCAACAGCATTAGTAGGATAATAGCCCCTGTTCTCCACAAGCAGTGGTATAGTGGGAGCAGTATTATATGATGGAAAGTTCTCATCTGGGCTCCAGGGGTAAAATTCACCGTAAGGAAAATACTCCCTGGGTTTTGGTAGATTATCTAAGGAATAGGGAGAGTATTCCTTTGGTTGGTTTGAGGTATATTGCTTGCCTTCATAC---CTAGCTGTTGGGGCTGTCTTAAAGTTCGACTCATCTACACTCCATCTCGTTTGTCCTGGGAAAGTTTCATCTCCAGTTGGATCAGCTGGGCCTTCTTCATTATAAGGGATTGTCTCTTTTGGATCTGGAGTATTCATGGGATAGTGTGGATTTTCAGATTGCCCCATTGTATTGGGAGGATCATTTCTTTCATCCCAGCTATTACTTCTAAGGTATGGTGGGTTTTCCCTGCGGTCATAGGGGTTG---TAGTCAGTGTAGTAAATACGTCCTCTAGAGCCAAGGGAAGGATGAGGTAAGTGTTCTTCCTTCCTTCCAGGATCTTCCTTAAAAGGTGGAGAGATTTCTTGTTGGTTCCAAGTATTTCTTCCAGCAGGAAAACGTTCCCTTGCAGGGGAAGGAGATCCCTCAGGGTACACAGGCTGATGTGTACTGTGCTTTATTTCTGGCTGATTAATTTCTGATTCATATGGAATTCTTCTTGGTTCTAAAATAATCCCTTTGGGCAAATTCTGGCTTTGGGTTTGTCCATTAGAATTTGGGGTTCCTCTGGAATCTCCTCTGGGGTAATAAGAGTTTTCATGTTGATCTATAGAATTAAAATTTGGGACTAGAATGTTACCCTCAGGGTGAGGCAGTTTATAGTTTGATTTAGTAACTCCATAGTCTTGAGAGTTTCTCCAGGGGCCATTTGGATCCCTTGTAGGAATGACTATTCTTTCTTTTTGACTTACTGGCTTCTCTTTTGGATTTTGGATGTTTTCATTGTGGCCAGTAGTACCATGTTTGGGACCCAGAGGGGCAA a score=3511 s mm7.chr5_random 2711073 70 + 11523536 TGGCTCCCACAAAGGGTTTATTTGGCCCTGGCAGGTTTCTTCCGAAATGGACTGGATTTCCTGCATAATT s bosTau2.scaffold2679 10455 70 - 104651 TAGTTCCCTCAGGTTGTTTACTGGGCCCCTCAGGCTTTCTTCTGAAATTTACTGGATTTCCTGCATAATT a score=7085 s mm7.chr5_random 2764478 446 + 11523536 CCTTTTTGTTAAAATTTTAGCCACAAAACTAAT---TGGTCTT--TAGTCATCCCAGAGCATAAAAGAGAAAAAGCATTTTTTCT----------CATCTCTGCCTCTTGAAGTGACTCTAAGACTTT--ACTTAACTATTTCTTTCCAGAAA-TGTCTATGTGCACATTATTATGCATACATAGAGAAAGACACTTTCTACTATATGAATGGTACTTACTTGATTAATGCATCACAGAGTGATTGGTTGAAATCTATTCTGTGGAATCTCAGAGTTTCCCTCGTGTTCTCACTCTGGTGACCATTCTTGTGGCCAGGTGTTTGTATACAGCCACAGCTGCTCCCTAAAGCCAGCATCCAGAAGATGATGATC-TGCTAGCTTAAAA-----GTCATGGACAACGTAAGAACATCTCTGCCACTTAGTC-CTCTGTGCCAGCTTCACATTCACACCAGCAGGCAACACtga s bosTau2.scaffold72 704141 411 + 883160 cCTTTTTGCTAG--TTTGAAATACAAAACCAACAGATGCTCTTGTTAAAAATTTCTGAGTATAGAATAGAAA--GTATTTCTCCTACCTTCCAGTCTTCCTTCCTTCCTG---TAACCCTAAGACTGTGTACTTCA-TGTTTCTCTCCAGAAAATTTCTATGGACACAC----------------------------------ACACAAATAGTATTCAATTAATGAATGTATCACAAGGTAGTAAGTAAAATCCTGTTATGTGGAAAATCAGGGTTT--------TTCCAAGTTcagtgaacatctttgtgattaagcatttgcacacagccgtgattatttccctgagataaactccagaaAACAA--ATCGCACCATTTTAGTACGTCTGATATGTGCAGTGCA--------TTCGCCTTTCATTTGATTTATGCCAGTTTCTCACTGTCATCCATAAGCAACTTTGA a score=13659 s mm7.chr5_random 2766920 758 + 11523536 ACGCACCGGAGGCGTACACACCTTTAC-CCAGTCACAGGTGCTGGTCACAGGCAGGTTCTTCTGTCCTCCACCAGCTGCTTCCTGTCATTCCCAGGTCAGAGAGAAATAAATGCAGGCTAAGAGGGAAGAGAGAGGCCTGTGGGTCAAACAGGCGACCC--GATTTCTTTTTGCGGTTCTATTGTTGGCTCACAGTTTGGTCTTTGAATCCCTTTCTCGATGGTCTCAGCTTTACAGTTACAGACACAGCGAGAG------CAAAGCTATCACTTGAAGTATTTTTGGCTCACTTCTGTGC-------TTTGGAATGGGGCCCAAACCCTTCCCTCATTCCATTGTTCCAGTCAAA--AGCCACTGTAAGGAAGCCATCT--GGTGAGAGGACTTAAAACCAAAGCTGTTGTTCCGACCTGTCAGCG---TCATGCCTTTGGTTTTGTTTCGTTTTACTTTTGTGTTAGGTTTAATTGGGGGAGAACTGTGTTCCTAGCCCTTCAGAATGCTCCTCTCAGGTCTCCTTAAAaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaaaaaacTGAGTGCATTAAAGAACTGCTATAATCTTTTTAAAAG---AATGAGCGCTCCCTGTAAATGAAT-------CCCTACACTTGAAGAGGAAGGGGTGTGTCTTA-------------GGTCTGAGGA-------GACGCCATCTTGGCTCCATAACTGTTTTCCCAGTGAGATGAACTGGGGGGCATATAGTCTAAGCCTTCATGTTTGCTGCCGTGAGCAGGAAGCACAGTG-TCCTCTTCCTTC s bosTau2.scaffold72 705601 737 + 883160 ACACACCCTTGGTGCACACACCTTTTCATCAAACACGAATGCTGTTCCCATATTGG--CTTCCACACCCAACCTG------------------AAGT--GTGGAAACAAAATGCAGA-GAAGTAGGAAGAAAAAAACCCTAGGGATTAGCGTGTGACTCTTGCTTCCTTTCTG---TCCTATTGTTGGCTTATGTCTTGTTCTTTGAGTCACTTTTTCATTGGACTCAATTTTAGAGTAAAAAATA-AATAAAAGATTTTTCAAAG-TACATCATAAAGTA-TTTGGGCTCGATTGTATGCTCAATTATTTGGAATGTGGCCAAAATCCTTGCTTCATTCCATTGCTTCACTCAGAGTAGCTTCTGTAGGGAAGGTCTCCAAGGTGAGAGAAATTAAAGAAACATCT-CTGCTGCAACTTGTCCTCATTTTCACTCTTTTGTTGTTG-------------TTATATCATGCTTAATTTTATAAGAATAATGTTTCTAGCCCTTTAGAGCTCTCCACTTAGTTTTTATAAAATTGCATTTTAATAA-----------------------------ATTCAAGAGTCAACATAACCTTTTAACAAGAAAAATGAGACTTCTCTTTCAAAGATTCCCTCTCCCCTGAACTTGAAGGATAAGGGAAATATCTTGTTGAAATGAATGTGAACTAAGAACGGTAAGAGCTCCATCTTTGTTCCGTGATTAAacttac---tagatgaacttgaatacatatcttctaagccttaattttgccatctatgaactggggacaGAGTGTTCCCCCTTCTTC a score=20208 s mm7.chr5_random 2767728 850 + 11523536 CTGCTGAATGAGAACTTCCTCCTGTTCTGGTGAAAAACTATCCAAGACCATGTTTAGGAGTTGGATGTGGGGGGCAGAGACTGTG---TGGGGACAACATGGGGACAAG-------------AGAACCAGAGTGGGCAGTGAGAATAGGTTGGA------------TGGCTGGAACTTTCTGGAAGGGCATCCTGGGGA---TGA-CATTTCACCCAGG-CTGTTTTCCCTCTGTAAAAAAGACATCTTGGGAGTGGGCCAAGGGCCATCAAGCCCACCACAAGCACTCAGAGACATTCGCAGACCCCCATAACACCCGTCGAGGTGTCTTCTTCTCCCACGTTGGGTAGCTGCTGGTCCTCAGGCATCCAGATGTCATTGAGAAGGGCAAGAAGC-TGATGTTGCTGATCTGCTTGCTCTGCTTGCTGACTGTGGTCCAGTTCCAGAGAAAGTGAGTGAATGGATAGCA-----------AAGGGACCAGAAGAGGGGACAAAG--CAGAGGGCTGTAGTCGTACCTCCAGCACAGTCCCCCCACCCCCTCCAGCTGAGCTCATTCTGAGATTGGCTGTCCATTAATCAAATCC-----------------TGTCTGTGTTC--------GTTTTGAATTTGAAGTTTCATATGTGCTGGGTTTCCATTAATCCTGGCCTCATTCCCTCTGATTGGCC---TTGCCTGGCTGATTTCATGAAA----TTTGTCAGTTTTCCGTCTCTTCTGCCTGAGCTACCCTGAGAAGGCAGAG-----GGAGGGGTCCAGCCTTTACATAGTGACACGCTTGATGCCAACACAGCTGAGTCTCTCTC-AGTGCTCTTGTTG-----------------------CCCCA----TGGAAAT-GTGGCACTGGTAGGTTACTGTGTAAAGAAAACGGGACCACATATCAGGGTGCCTCAAAGCACCCATGT s bosTau2.scaffold72 708142 930 + 883160 CTACTAAGTGAGGATGTGTTTCTGTTTGGGTGAAAACCACCCCAAACCAACCCCCGGGGATTGAACTTGAGGTTGAGAGACTGTGAGCTGAGGA-----TGGGAGCAAGTCTGCCAGTggtgaggatggaagtggg-ggtgggagtaggcagggggtgggggAAATTGG--GGAACTTTCAGGAA----ACACCGGGGTGCTTGATCCCTTCACTCAGGTCTGCCTTCTCCCTGCAGAAT-GACATCTTCG-AGTGGTCGAGGGACCACCGAGTCCATCACAAGTACTCGGAGACGGACGCTGACCCACACAATGCCCGCCGGGGCTTCTTCTTCTCCCACATCGGCTGGCTGTTTGTCCGCAAGCATCGGGACGTCATTGAGAAGGGGAGGAAGCTTGACGTTACCGACTTGCTGGCTGACC-------CTGTGGTCCGGTTCCAGAGAAAGTAAGTGAGCAATCACCATTGATGTCCCTGAGGGACAGGACCCAGAGTCAGAGCCCAGTGGGGTGTAATAATATCCCCAG-GCAGT-------TCCCCTGCAGATTGGATC-TTCTTAGGGTCGCTCTCTGTTGATTCATTCCCTTTTGATCATGATGTTTTTCTCTGTTCACACATTTGTTTTGAATTTGACCTTGATTTTGAAATGGAGTTCCTGTAAGCCCA--CTTGTCGTTTCTTTCCGACCCATCTGCGTGACTGATTTCATGGAATGTTTCTGTTGTTTTCCTCACTCGCTCGTCCATGTTTTCCTGGGCTGGCGAGGAGGGCAGAGAGGATTTGCTTTATTTTAGTGACACACTGGACTCCAGCGGGACTG-GCCTCCCTCGAGGTCCCCTGCTGTGTGCTCCGGGAATTCTCCCCTCCCCCACTCCTGGAAATGGTAACACCGGAAGGTTTCTGTGCAGAGAAAACATGCCCGGGTAACAAAGAGCCTCAGAGTGCTTGTGT a score=3992 s mm7.chr5_random 2768942 632 + 11523536 GTCCTTCACCTTCTA----GCCAGGCACCTTCATGCTTCCGTATGTCGAGTTCATGTTAGTCAGGGTCTACAACGGTGGACACTCCAAGAGCATTTATAAGCAGGCTCGTTGCTCCTAAAGCAATAGATTTGTATGTG-ACAAGGACAACCTTGGAGCCATATCTTGCTCAGGGCTTTCTTTGCAATAACATGGGGACTCCGTGGTTATTCAAGACCATCTCA---GACAGGCTGGAGTCAGCTGG---GTACCTTTCAGTTCAGGATCTGTTCAGGCTGAAACTGTGAACAGATGCTGTGCCTTTGGTCAATCCCAAAATCCTTGCATGAAAGGAAGTGCG-----------------------CTGCAGACTGTCCTCC-----------------TGAGCAGAG---GAGTGGAAAATTACTCAGAGGAAACTGCCCTGATCCGGCCATG----CTCCCACTGGCCAGTGAACAGATTA------CTAGTGTCTCCATTTCATC-ATAAAAT-AGGGTAGCAGCGATAC----GCCACAAAGC-TTTGGGAAGATAGCTTGCAAGTAGAAGT--------ATGGCTGGCATATAGTCAGAGCCTGTAAGTCACGTGACATAAGTCACAATGTCACCCAAAGGTAGCTGCTGGGCGTGATGCAGAACTGTGTTTTCCTCTCTGCTTCCGTT-----------------GTCTCTGCTCTTTCGGGC s bosTau2.scaffold72 709418 649 + 883160 attctttaccatctgagccaccaggga---------------------agctcATGTTGGTTTAAATCAGCAGAGTTGGCCACGATGAGAGCACTTATAAATAGATTCCTTGCCCCCAAAACAATGGATTTATGTGCACAGAGAGATGATTTGAGGACAGCATTCTAGTGAGA----TCCTTGAGTTGGTATGGTGGACAAATGGTCCCTGGATACCATCTCCACTGACAGGCAGGAATCATTTGAAGCGTTCTCTCAAA--CAGAATCT------CCTGATAATGGAAATGGAGTCTGTACCTTTG----ACGCAAAGTTCCTTGCGTGAGAGGAAGTATGGCTTAGAAATGTGCCCCTTTGATCCTTAGCCTCTCTTCTCACATCGAAGATGGTGGTGAGAAAAGGGAGGGTGGAAGA----------GAGATTGCACAGGCCTGCACTTGAGCACCTCCACAGCCTTGCAAAAGAGTTGACTGctctcagggctcagttttggctgtaagatgggggtaacagtagtacctgtctcttacagcttttgtgaggacataatgaaaacaaaaaggatgggaaatgcctggcacatagt-aTAG------ATTCATG----ATGACTCACG-------CCCTAGGCAGGAGCT--------------ACTCCAGTCCACCCCCTGCTTTCTTttttttaaggtgtgctgggtctttgctgtggtgggc a score=26647 s mm7.chr5_random 2769851 845 + 11523536 gagagagagagagagagagaTCTTTAGA-----GAAAAGCACAAGGAAGCGGACTCACCCACAGCCCTCACACACAAACACTGCCGCTATTAATAT--CACACTGTC-TCTATGTTTAGGCATAGATTTGATGTA-TTTAGTGTGATGGCAGTCACACTGCAC-TGTGATTTTATGTCTCG-ATTTTAACTTCAGATTACATTATACACACCATTGTCAAAGCCTTC--GGGCCAATCCTTCAGTCAAGTGTGTCATAGTTGATTTAACCA--ACGCTGTGGTTAGATATGTATGTCACTTCCAGTTCTGTGATATAAATGATGTCACTATACAATTTGTCATGCTTTGGGACAATCAACCCTCAGATTGATGTCAAGAGTCTGGATGAGAAGGCAAAGACGCTTCTGTTTTATTAACAAGATG-GAGACGA-TATAATAGCAGTCTGAATT-TCTTAGC----------------CCTCTCCAATCTTGTCCCTTAAA-AATGTTGGAATACAATTCATTATGTGTGTTCTGGCAGGACACATGTCCCAAGGCTGTTTCTAAATGTAAACCGGAGAACAAAGACTATTTTGACAAGTTCCTTGAATCATCAACTGGGAACATCTCTTTCATCACTGGGCCCGTGACGACCAAAGGGGCTCAGCTATCAGGAACCA-CCACTCAGATCATCTCTCCACGGGGCTCCTTGAGCTTCTGCTGGAA-CCAGTGCTGTGAGGATGGCCCTAAAGATTAGCCTCTGTCTCCCCAG-GTGTAGAGAAGGGCAGGGAACCTACAG-------------------------ACAGTGAGAAAGATGCTGCAATACAGGGC------AAGCTCCGAGAAAGCACAGAGGACCAGCTCCTAACTCTCACTGCAAGGGAGAGGAA s bosTau2.scaffold72 710357 887 + 883160 ATGAGGGTAAAATAGAACAATCTGCAGAATTCGGAGAAGTagaaagaa----aatcacccaccgttctaacacgtaaacacaaccgcagtttagattctataatatcttctacatttatgcatacatttgacatatttttacatgatgaaagtcatactgcttatgtaattttatgtcttgccttttaacttcagattatgttag--gcaccattatcaaaggctgcatggg-------ttcact---gagtgtcagagtttatttaaccatcactccgcgacaggatatgtatgtcgtttccaattttgtgatataaatgatgttgcTATACAATTAGTAATGCTTTGGGACAATCAGACCTTAGATTAATTTGAAGAGCTCAGATGAGAAGGCAGAGGATCTTCTATTTTATTCATGAGAAGTGAGCCGAGTATAAT---AGTGTGGTTTCTCTGAGCATAAAAATAGAAAATTTTTTTCAAGTTTTCCCTTTTAAACAATGTGGTAATATGATTCATTAGGTGTATACTCGTGGTACGTATGTCCAAAGACTATCTCTAAAGGCAGGCAGAAGAACAAAGACTGTTTCAGCATGTTCCCTGAATAGATGTCTGAGAACATCTA--TCATTACCAGTTCAGT---GACCGAAGGATTGCAG-TATCAGAAAtcattcattcacagtatcatttcatgta--tcattgagctcctgctggaagtcagagccgaggatacagtcttaaagattggtctcagttcccccagagtttgcagactagcagggaacccacaaattaacttacagataattatattctacagggaggagactgatatataatagggtagagtaaggcaccatgggaacacagagaggggtctcctagcccaccctgcaggctggaagga a score=3545 s mm7.chr5_random 2933195 107 + 11523536 TAGGTAAACACAGGG-----TAAGAACGGGCCTGTGAAGGGGAGAGG----TGGTAATATTAGCGTTTGCCAGTTTTGAACTCAGATGGGATACAGACACTGCATGTTTTATAACA s bosTau2.scaffold2830 2481 116 - 99356 TGGGCTAACACAGAGGCTGCTGGAGAGGGGCAGGCTAAAGGGAGAGGGATTTGGTTACTTTAGTATTTGCCAGCTTCAACTTCAAATCAAATTCAAACATTCCATATTTCATGATA a score=15982 s mm7.chr5_random 2934025 1001 + 11523536 GTCACAAACATTATCTTAAGCCATCTTCACAA-----------ATAGGTACTGAAAAATTAACTCAAGAGTGAAGAGCAAAGTAGAAAACC--ATTTTACAGAGGTCTAGTGACTTGTTT----GTATTACAAACATTATAGGAGA--AAAAAATTTGTTATGTTGTCTGTGAGACATTGGTCTTATCTCTTAATAA-ATCAAAGAATACATAAAGGGTTTTCCCACCAAGAGGGTTTGGAGTGCTCAGATCACCTTAGAAGCAATTTCCAAGCAGAACTT-TGTCCCTGCCAAATAGCACACCTCTGTCATTTTGCCACT-CCAAACCCACAGGGTATGAAAGAAAAAGATAT----GGTGGTTA-CTACTAGGGCCCAAATGGAAGGGGATGAACTGAGGATGGC--TTCAGGTCTTACTTTAACATATATAATTATGGCAAAAATTGAAGCAAATATATAAA-TATCAG-AAATGCTAACTCTGAACAGAGAATATATTGGTGGGTATGTTACATAGTCTTTCTACTTC-CTTGTATATCTGAAAAGTTTTA----AATTTTACAAATCAGTATTATCTAACATATAAAAGTGAGCCTGAGACAAATTAGGACATAAATATTAAGAATTCATTTAAGTTTCAGACTTTGGCTTAAAAGCAATCATTTCTGAAGTTTCTAAGAAGGGAAATTAGA--CCAGGGAATGGTCTAACCCTCACAGCTGTGAGGAAAA---AATGAAACAAGAAAGAGATGAGGGTCA-AGAGGGAAGTGAAAAGCTTACT-GCATATTCATCACAGAAGGTAA---------GGGTATTACA--------------TAAGCAAAGGGAAAGAAAGT--AAGACTTTGGGCAGGAGCTTCA-TGGGACTTCCTGATAAACACACTAAGTACAGGAGTGAGAAGAATAAACATTACCCCAAACTCCCAAGAAAAAGCAGTTAAACTAATGAATA-TCAGGGAGAAACTGTTAGGAGATTGGAAGGAACAATTATCAGCTCAGGACTTGATTCCTATTTAGACGCACCAAAAGAAAagaaaaggt s bosTau2.scaffold2830 2750 996 - 99356 gtcacatacattatctcacataaacatcacaatgatccttgaggtaagtatggtaacattcagtcta----------catatgagaaaactgaattttatagaagttgagcaccttgcttacaagtgtcatagccatgattagaaATTAAAAACTTTGTCGTACTGCCTATT---------CCTCATCTGTCAGTGACATTAA------CATGGAAGTTTTTTCC-------------TGAG---------------AAAAGCTATATCTGCTAAGATCTTCTACCATCCCCAAATCCCAGCCCTCTTTCGTGTCACAGCCACCAAGAACATGGGATGAGAAAGGAAAGGGTAAATGAGGTAGATAGATACCAAGGACAGAGGGAAAGGGGTTGAA---GAGACAGCATTTTAGATTTTACTTTAAAATATGTAAATA----AAAATATGAAACAAATATGGAAAATATCAACAAATGCTAATTATAAGTAGCTGGTGTATTAATT--TCTGTTGTATAATCTTTATACTTAGCCTATATGGTTGAAAGAGTTCATGttaattttttaaatat---ttatttaatata-aaaaGTAGCTCTGGGTCAAATTGGGACATAAACATGACTATCACACTGATGTTTTAGACTGTAATCTAAAAGAAATAGTC----AAGTTTTCCATAAAGAAAATGACAATCTTGAGACTGTGACAactctcatagctgagtgaagaatggattgaaaagggaaagtaa--agggtcagagaaatcagtgaaaaggccactcccacaattatgacagaatatgacaaggtgtgaggcatgatgaggatcgaggaaattgagaagatagaatggaagtgaaaaatttccaggagtggattcgctgtgactttgtgactgatggact--gtcaaggacagagaa-atcaaatataatcccagacttcccaggccagttggttaaattgacaaacagtcaaggaaaaagtggcacaggtctgaaaggaaaagctatcagttcagtctggcactcctatttagaagtgctgacaggatatcaaacgt a score=58293 s mm7.chr5_random 2938042 1995 + 11523536 TTCAGCTTTTCCTCCCAT-----GCAA--TGCTTACTCAATGAAGTAAACTGGCAGCAAACTAGGAGATCCCTGCCTCAG--CCAGCTCTGTGCCTGCCGGCTGTACATGTGAACATAATGGGGGAGAAAGTAAATGC--------CACAATCACTAAATGAAGAATTAGAGAAACCTCAGTGCTG------AACTTCAGCAGGTGCCCCGCAAGACTGCCATTCACTCTAATATACCTAATACTCTCTTCAGTCCTTAGCATAAAAATAGGAGGTGAGAAATATGTTTTAGAAATAGTGATATCTATGATAAATGCTATCTCATACAAATAGAACTTCTGAGGTTAAGCCTTCTGGGCTTAAGGCTTTAATTCCTGATTAGAAGTCAAGACTTCACCC----TAAATGACCTGCTGACAGTTCATTACAGATGCAGAAAGTTTCTGTAAGAGGAAGACTTGTAGGAGATAAT------AAAAAGCAAAACAGAAATCAATATTAGTGTCACTATTCTGGCAGTGGGCAAGATGCTCTAGGGATTTGGGATTGTGAAGTATCAAGAGAAAAATGAAAATGAGCTAAGGCCCAATCTATCTGTGATGATATTTCTGCT--------TGAGATGGAGAATT-----CCAAACTCTCAC-ATTAGCAATTGTTTAAAAC-------TCTGAAATTTAAAAGTAACCACAAACTATATTTTAAA---------AATGTGGCAAAATCCTTAAAATTTATTCCCTAGTCTTAGACAATCACAAATATATCCTAGCA----TGTTGT-------GTCTATGACCCTTAACAAATCATGCATTAAATAAATTTTACATAAAGAGACC-----TGTCTTGTACCTCAGTCATTCATACTGCCAGATGGAAATTTTTAGGAAACTGTAG--------GATTATGACAAA-TCTATATTTGTTTACTGCTGTTCTGGTTGAGCTTCCTGAGATAATAGCATGCAAAGTAGTTAAAGAACATAGAGC---CGGTCTGGCATAATACTGTG---TCGAACAGTTGCAGCTACAATGTTGGTGAAA-GTGTGCAAATCATTCCAGACAGACTCAAGAACTATGCAAATGCTAAGTCATTTTTCTCTCTCATCTGGTATGGAAGTGAG-----AGACTGAAAATCAGCCTTGCATAGATTCCCCATTTTAATGCACAGACTTGTTAATCTAATAGCTTAGTTTTATGGGCCAGCTACTTCAAACCAAGAGTCTCACTTCATGGGCCCATATTTTACAATACCAATTGAGCACTAGATATAAACAAGAACAATAAGCACATGAATCAATGAGCTGCATGAGTAAACATGCCAATGTGGCAGTAA-----TATTCAAAGAAAAGGAAACAGTAGTTGAAGAAAAACAACTCCACTTACAGAAA-TTTATATTCAATCTTTTCCAGCTTCTAATGGGCTTGAAAATTGAAAGCAGAAAGTGACAATACA------AAAAAAATGGTAAATATTCCT---TGATA-TTTTGCATCAAGTATGAATGGTCATTTTGGTAGCTTTGACTATCTCATTGTGATGAATACTACCCAAATCAAAAGAAATACTGAAACCAGTAATGTGCTTTGTGAAGTTTATTTGAACCTTCTAGCTTTGTTTTAATATAAAGATTTTATAAGTTGTAGATTCCACTTCAAGCTATTCACAAGGACAGTAGTACATGCACATATATGAGTACATGTTTTAAATGCTGAAGAAAAAATA--TTTTATCAGCTAATATTTTACAAAGACATTTGAATTTAGATGCAGGTTAAAATTCAGCAGCTTAATACTGGTATTAAGTATTAAGTATGTTCTGGTATGGTTCATAGCTGTGATCAAGAAACAGGTTTATGGAATCTTTGTTCTATACTAATTTTTCAGATTTGGTCCAGCAGAA--AGATGTCTATTGGAATTGCCAATAGGTTCCAAGAAATCAATAATATAAATATGAAATATGGAGAGTCT-GACCACTGCCTC--TACTTTAATTTCAAATTGTCACAGCTCATGGGTGAATTG-AAAATCAGATTCTATAGCTTCTT----AGACTTAATTAG-----AGACATTTTTCTTTCT s bosTau2.scaffold2830 4720 2028 - 99356 TTCAGTTTTTCTTCCACTCTGAAGCAAGGTGTTTAGTCAAAGAAATAA----GCAGTAAACTTTAGAGGCTCTGTCTTAGTGCTGTCCCTATGCCTTATGTCTATA---ATGAA-GTAATAAGTGAGAACATGAAAACAGAGCTTTCAGAATCA------GAAGTAATGGATGAACT---GTGCTGTAATCTGACCTTAGCAGGTGCCCAGTAAGATTGCCATCCACTTTAATA--CCCGCTAAACACTGCAATCCATAGCACATGGA--GTAGGTAAGAAATCTGCTTTAGAAATATCAATGTTGTTTATAAGTCCTGCTCCTTACAAACAGAACCCATGAG-------TACCTGGGTTTAAGCCTCCAATTCCCATGTATAATTTGAGTCTCAGCCCATTTCAAATAGCCCACTGGCAGCTCATACTCAATGCAC----TGTCTATGACA----------TAGAAGGTAAAGCAAAAAAAAAAAAAAATCAAAATCAATACCGTTGTTACCATTCTA-TAATAGGCGTAGTACCTCAGGGATCAAGGCTTCTGAGAGATCAAAAGAAATAAGGAAAAGAGTTAAGTTCCAA---ATCTGTACTTG-GTTTCTGCCACTACCCATGGGGTAGGATAATACTGACCAAGCTCTCCCTATTAGCACTCAATCAGTACCAATTTTTTTAAACCTCAAAATCTGCCACA--CTGTTTTTTAAATGGCTCTTTAATATGGTAGTGTCCTAAA----TATTCC-------------------GATATATTATGTCACCTGTATTGCTCCAAAAACCTATGACCTGAACTGGCCCCCAGACAGAATAAATTTTGCACATAGAAACAGAAAATATTGTGTACCTTGGTCACTGGCCTTGAAGGATGGAAATTATCAGGAAACTACAGTACTAGTGGATTGCTACAAAGTACGTATTTGCTTATTGCTGTTTTGGGTAAACCTTATCATACAGTAGCCTGCAAAATGCTGAGAGGACATGGAATGAATGATCTG----AAGACTATAAGTTTGAACTGTTGCCAGCACA---TCAGTAAAACACACAGAAATCTTTCCAGACAGACCAAAGAACTACGTAAATGCCAAGTCTCTCTTTTCTCTCATCTGGTATGAAAGAGATTAAACAGACTGAAAACCAACCTTGTGTTGATTCCTCCCTTTAATGCACTGACTTTTTAATCTAATAGCTTAGTTTTATGGGCTAGCTATTTCGGATCAAGAGTCGCACTCCACAAACCCATAGTTTATACTACCAACAGTGCACCAGATGTAAATGAGTACAGTAAGCACATGAATCAATGGGACACATGAATAAACATGCCCAAGTGGCAGTAGAATACTGTTAAAAGAAAAAGAAACAGTAGTTGAAGAAAAAAAGCTCTGCTGAGGGGAATTTTATATTCA--CTCTTCCTCTTTTTAATGGCTTTGAAAATTGAAAGCAGAAAGATATGATAGATACATTACTAAAACTGTAAATATTCTTGTATGATATTTTTGCATAAAGTGTATACATTCATTTTGGTTTCTTTAAATCTCTCATTCTTGAAACATTGACTCAAATCAAAAGAAATACTGACAAATGTGAGGTGCTTTGCAGAATTTATTTTAATGTTTTAACTTTGAATTAA---GTAGTTTTTGTAAAT-----GTTCTGTTTTAAGCCAGTTCAGTAAACTGCCATGCATATACATCCATGAGTATATGCTTTGAATGTGTTTTAAAAAATAGGTTTGACTTGCTAGTACCATAGAAAAATAGCATAATTTGAATATGGATTGAAATTCAGCAACTTAAAACCGCTTT-----------CATTTTAGGACATAGTTGATGTCCGTGATCAAGGTACATTTTTGTGGAATGTACAGTACATACAAGTTTTCCAAATTTGGCCCATTTGAAGCAAAAGCCTATTGGTACTGCCAGGAGGATCTGGGAAATCATCAATGTAGCTCAGAAATATGGATGATCTCGCCTGCTGCTTCTGTGTTTTAATCTCAAACTATCACAACTCATGAGTGAAGGGAAAAATCTGACTCATTGATTTTATTACCATATTTCATCAGTTCTAAGACATTTTTGCTTAT a score=15922 s mm7.chr5_random 2940037 657 + 11523536 TAATAGTGTA-AAAATAAATATGTAAGCTATTACTGGTGACATTTTAGATTAAATGAAATATGATATAGTTAAACCTCACTACTTCTCAGTATAATAAATAATAAATATCACTCCAAATTAGTCAAAGCAAAAGATGTGGGCTATAGAGT-TTTTTTTTAAATATAGTTTCATTAGTTTTACCTACTATAAGAGATATTTGCAATTTAAAGGCTATCAGTGAATTTTCAGGCATGACTTTATTAAAGGGACTGTTTGAAAGTAATAATAGTAAATACAAGAGGTAGTTAATATTCACCAAGGTTTATATTATAACACTTCTATATTTGTTTTTCTTTCTTAGCCCTCTTTGTGACCCTA----TCAGAAATCTGAATTAAAA-AGAAAACTTTTCCACGACTATATTATGAACCAATTGAGGAACAAAATAAATGATAATACATTTGGGGTATCACAA---ATCCTTTG-----CTAATGATAGAGGTACATATTGCCATATGGGTTGTTTACAGATA--AGGGTTCATGAAGACAGAAACA---AGATGTAAGAACATAATGCCTGCTTCCTG-----GCAGAGGCTGTAAGTGTGACAT---TCCCATTACAAGGATGAGAGCTGGGATGCAGAAAAGTCCAACAGTCAAGTG-TGAAAAGTAGCAGGATTTATTATCCCTAAA s bosTau2.scaffold2830 7193 664 - 99356 taatggcatataaaataaatgtatatactacttttgcaggcattttggattagatgaagtatgAAATAGTTATATCTCACTATATCTTAGTAAAATAAATAA-------CATTTCCAATTAGTAAAAGCAAAAGATTTGAATCATAGAGTATGGTTTTAAAATGCATTTTTATTCATTTTAACTAGTCTTA-----ATTCACACCTTAATGTTCTTAGAGGAATTTTATAGTATGAATTTGCTATAGGGATTATATTTAAGTCataacagtaaatataataagggcttaataagtaccagattatattttgtaagctttctata--tgcattttttatctagcccttgcatcaaccttatttgttagggactTGAAGGGGAACAAAAACCTTTCCCATGCCTAAGTT-TGAATCAACTGAAAACCAAACT-GATGGTAAGATAGAGGGGAGATTAAAATACAACCTTTGTAGCTTAAATGCTTGATGTGTTGTCAACAATATGGCCTG-TTGCAGTCAACAGGGTTGACACACAAAGAAACATTCAGATGGGAA-----AATACTTGCTCCCTACTAATATACataaagtaggaataatattaatcccattataaagaggaaaactgaggtatggagaggtCCAACTGTCATATGCTTGCATGCAACAAGAGTGACTTTTCTAAAA a score=5743 s mm7.chr5_random 2942945 240 + 11523536 TGCTCACAGAATCTTCTATCATTAATCTGACC----TTTTACTTCA------TGAATACAACAGAGGTAAATTTCATGCCTG-CTCCTTAACTACTATTATTTACTAATActtgtgaagcttctcatcttctctatgcctcagttt-ctcatctgttacacagaaattagg---------tacattgaaggcatgatacaaaga---tgattagcatatataacatg-tttgtaaaacaatctagaagtagtcagtatccaataa s bosTau2.scaffold2830 7860 258 - 99356 TACCAACAATCTCTACAGTCACTAATCTGTTCATACTTTTTCTTCACAGATATCAGTACAACAtgggtgaatttcatagctatcttcctaatcactggca-------acactgggcaagcatcttaacctctctgcacctcagttttctcatctatgaaatgaagaatagtaataggacccaccttaaaaggatgctacgaagaagatgactgatacgtgtgacatggcttatgaaagagtctagcagtaataagcactaaagaa a score=14000 s mm7.chr5_random 2943231 702 + 11523536 GCAAAAAGAG--TAAACATGAGCAATTCTTTTCATTCAATCCTCTAGTCCATTTTTTTGAAAGAATGGTGTATAGCTCCCATTTCAAGAT-AAGTGTTGACTAACTGTAGCTGCCTTAACAAAAGGATGGTGTAGTCATGGAAATGCTTCAGTCTTCTGAATAGAAACTTGC-----CAAGATTTCAACCTTACATAAATGAAGTTTCTCTGATATAATGCAGTCCTATTCAGAAGCCTAGCTAGATGACAATGTTAACTCTGATCAGGTGGCTTCCACTCTATTCTTCTGGCAGATGAGCTGGGCGAGCATAAAAACTAAGTAAAGATAA-----TAAACTGTCCTTTGAAATACATAATGACTCTGAATAACCTCTCTGCCCCCTTTTCCTTTCATGTTCTTTCATGTGCTTGTCAGGAAGATTACT-TGCTT-----AATGTTGTTGTCTGTGGTGGAGTGGGAACTGAGTGTTATCATTTAAGCTTACACACATG---------CACTTTACACTGGAAAGTTCCTGATGCCCTGTGTTTAGGACAGAAAATCAAGTATAAGAAAGTCATTTGTTTCCTTTTCC------TTATCAATGTTGTTGAAATAAAATAGAAAGGAATAAAAA-------TCCATTTGAAAAGTATACCTATTTTTCTAAGATCTAGTCCCCTCAATTGACCCCATTCAAATGCAGTGCTT--TTCT-----ATTTACTAATATACAATTCTATCAGCCA s bosTau2.scaffold2830 8164 699 - 99356 GTAAAAAATGGCCAAGCATGAGCAATG-TCATGGTTCAATTCACTA------TTATCTGAAAGAATCATATTTGGCTATCATCTCAGGGTTAAACATGGATTCACTGTGGTATCTTTAACCAAAGAATGTTACAATCATGAAAATGCTTCGGGTTTCTGAATGGAAACTGGCAAAATCAAGATGTGAACAAAATGAAAAATAAATTTCTCTACTATAATACAATCCCA-TCAGACACCTGACCAGATGAGGACACT-GCTCTGATTATTAGGTTT----TCTA---------CAGCTAAAGCAGTCAGGCATGAAGATTAAGTAACAATACTGCATTAATTTATCCTTTTGAAATTTTAGCAATTCTGAATAAGCTCTTTGGCTCCTGTT-GTTTCAT----CTCAATGTACTTGTCAACAAGAGGATTGTGCTTGTAAGGAAGCTACTGCCTACTGT------AAACCCTAATAATATAATTAAA----ACACTAATGAGAAAGCATAACTTTTTCATTGAAAGTTCTTAGTGCTATGAGTTTAGGAAAG-----CAAATATAA-ATTATCGCTTAATTTATTTTCCATAGCTTTCTCAAATTTGTATAAATAAAGT-GAAAGAAATAAAAGCATTTTTTACATGTTAGGAATGTATCTA-------AAGACCACCTAACCTCAACTGCCCTTTTCTAAAAATAATATTTGATTTTTAAAAATCCACTAATGTTCAGTTCCATCTTCCA a score=14726 s mm7.chr5_random 2952014 1035 + 11523536 GCTTTGTCTGTTTGTCTTTTCATTGT-CTGATGGTAGAACTTGAAG-CAGCACATGCAAAG----GGCAGGCACTGATTATATAATGAATTGAACCCAAGACCAGAGTGCTAGAAGACAGGTCATGTCATTTCTTTGGGAAACAATGTCTTCAAATTTATACATTAAATAATCA--------TAAAAGAAAACTGATTTTATTATTTTTGAAAAATAATCTGGCCATAAATGTTAGTGCATACCTGTAATTTCAGTTTTTAGGAGGGAGCCAGTTTGAGGCTGGTGTACATTACCCCAAAATGCACATGAAAATAATCTATAAATAGTACTTGTACATGGAATGA-----ACTTAGACGTAAT-GATTCTTCAATAAAATTGAAATAATGATTTCATACCCCAAAACCCTAGCA---CATTAAGTTTTTGTCAATTACATTATCAGTGTTGAAGGGAAGTGTTGAATACTGCTCGGTACATACTTGTTCATCATCCAACATCATCTAGTTTGCCCTCAGGTTTCTGT-------TGGTTAAGTTACT-AAGTTCCTTTTTTCACAGTTCTTTCTCTGCTAAGTACAGCCCTGGCAGTTACTATGTGAGGTAGGACTATGCAATCAGAAAACCAGAGAATTTGGGTTAATAAATGTGGTTTTAATCCTCAATAATCCTGAAACCA---ATCTCTTCCTGGAGATTTTACCTTACAACACTGGGGAGCAATTAATTTTCCCAGAAAGGATGGCACGGAGTTATAAATAACA-CAGAGTCCTCTAAATACTCTGTGGAGGGCAAATCAAAGGACAGTAC-ATTTTAGCCCTTGTATCTTAAAAAGTCCCTTGAAGTGAGT-----GATTAAGAAAAAAATTGTTCATGCTGGTTTAAAATTTATATATTTTA---------------------------------------------------------------------------GGGAATAT---GGGAAGAATCCATGA-TGAGT------------------------TTACAGG-----------------------------CACTGGGCTTGGTATTATATAGTAAGAAGAATCCTGTG--GTTTGTCCTTCAGCTTGACTGTGATTCTGCTGCCTTCATGTGCTGTGACTCAGTAGGAATAAGTTCAGCAA--GGATGTAAGCTTCCTATGAGCCT s bosTau2.scaffold2830 10597 1119 - 99356 GCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTTTGCTGGTTGCATAACTCAAAAATAACACAGGCAAAATTGTGAGAGGTATTGCTTACATAATGAATTGAACCAAAGATC-----TTCAGAAGCCAGCTGAT-------CTTTGA-----ACTCCCCTCAAACTTTTGGCTTTGAGGATTACTCATGTTTATATACCAACTATGTTTCTAAATTTCATTAGGAAACC----CATATTTCCAAATGCATACACGTGAT---AGT---------GGGGTCACTT-------------CATTAC------------ATTTTAATAATTTAAATGTAGTGATCCAACATGGTATGAGACTAAATAAGACCCAGTAGAAATTTTAATGTGAC--ACATGATAATTTCACAGGCCAAAACCTTTATATATCATTCTAATTTTGTCAAACATAATAGCA-------AGGGTAAAGTTACTCATAGCCC--TAAAGAGATGTTCTTTATCC-------------TTATTCTTAATTTGCTGTACAAACTCAACCAAGTTATTTAGGTTTCTTCTGCTATGACTCTTTCTCCACCAAACAGAAGATTGGCAATTATACCGTGAGCTAGTTCTATGTGGTCAGTGA----GAGAATTTAGGTTAATAAGTAGAATTTTAATCCTAGATAATCCAGTGACCCTCTCTCTGTTTATGGAAATTTTGCATTAGAAGCAGGAAGAGCAATTAACTTTCAAAGGACAGATGGCATTGGATTACAAATAACACCAGACTTCTCTAAATAATGCATGGAG-------CAAAGGACAGCACTATTTTAACCCCAATAACTCAAAAATCTCTGAAAATCAAGTACCAGAAAGAAAAAAAAAATACCAGACACTTCTTTCAAATGTATATAGTTtgctgctgctaagtcgcttcagttgtgtcctactctgtgcaacccagaatggcagtccaccaggctctcctgtccctgggattctccaggcaagaacactggagtgggttgccatttccttctccagtatatATTACAGGAAACCTCTAAATAAAATAGAGATGAGCGTCACTCAGTTTGATGTTATTTATCCAGAGAGAGGCTATGCAGTTTGTCTTTATGGTTGACCCTGATTTTACTGCCTCTGTGTGTCATGTCTTGGCATGGATGAATTCAGCTACTGAATGCAAGCTTCTGATGGGCCT a score=10456 s mm7.chr5_random 2953143 447 + 11523536 CATTATTTGAAACAAAATACTTATCTCATGAAGGTCGAAGAAGAGACTGTAGTTTGAAAAACTGAGTACTAAGTACTGGGCAATCTGACACAGCCAAAGCAAATGAGCTGACAAATCACTGCCCCCAATAAAGGCACATCGCTGTATGTCTCAGGACATTCTATGATGTGATAACACAACTTGAAACTGCCTATAATTGCATTACAGTAAAAATCCCTTTATCTACACTAGATCCT--TAAACA-TACTAAGTTCTCTGTATTC---TAGGTTTTTGTTGAGCCACATAAAGTGTTATAGACTCTAAGGGAACATGCCTACATATTGATTATATAAATACCGATAGAACCAAACTATAGTCAAATCATCAAGCATGTGCTAGAAATGTGGACAAGGAGTGTGATAATGAGTAGAAGTGGCTCACTAACTCTGGCATGTATACCAGAACCACAA s bosTau2.scaffold2830 12078 424 - 99356 TATTATTTAAGACACAGTACTTGTCCTCAGAAGTGGAAAGAAGAGACT---AATCCAACAGAAGAATATGAAGT-------CATCTGAAACAGCAAAAGCAAAATAGACTCAAAATCACTGACACTGAGAAAA--AGGTCTCTCTATGGCCTAGGACCTTCAGTGGGGTGATACAACAACCTGGGGTTCTCTATAGCTATATTACAGTGAAGATACTTTTTATATCATAGGATTCTTATAAACAGTACTGTGTTCCCTGAATTTTCATAAGTTTCTGCT--GCCACATAAAATGCTGCTGGCACTAGGTG-----TCCAACATATTCATTTTATAAATATCCGTGGAG--AGACTGTGTGGCAAGCATAGTGCATATGCCAAGTTTGAAAACAGGAAAGGCAATAATGAATAAATGTGCTTCCCTAAAT--------TACAAGGGAATCACAA a score=5309 s mm7.chr5_random 2953590 534 + 11523536 CAGGAGAACTCT--GAATGGCATGCAT-GTGACATTTACTGCACAGTAAAAGAAAGAAATGAGAAATCAGCAGCACAGAGTCA--CCTTTTG------AAAGTCATCTCTA--CATCATAGCAGAGATTG------------GTCAGAGA--TTTGGTGAGTTTGTAGAGTGTTATATTGATGATTA-CTAGTGCATCCAAGGACATTGTATTCCCATAAGAGAATATAGGGATCTTATATATGCATTAGAACGCTCACTCAGAAATGTGCTATAGGATAAAATCAAT------GAGATAGAGGATAGAACAAACAAAATAGGTAGATTTAT------AACAAACAAATGGTATGTAATGATAATCTAAAATAAGATAGCTATGAAAAAAGAA----AAAAATGAAAAAAAATATAAAGACaagaagaaaaagaggaagaagaagaagaaagaactaattcgtataatgactgctttgctaggcattatttgaaatgctttatgcattccagtgcatttggt-----tcactttacaatcctataatagattctcttatgtaaccatttttcagaagagaaaa s bosTau2.scaffold2830 12858 541 - 99356 CAGGAAAATTCTTTGAATGTCATGATTCGGGATACATGTTGCACAG----AACAGGCGATGGAGAATCAAAGTTACAGAATCAATCTTTTTGCTATTAGCATTcaggcctaactctcatgggagaggtgaaaaaaaactaaagccagagaggtttagtga-tttgctga-tatcacacaaatgattaactagagaactaCTGAATATT---TTTCAATTGGGTGCCAGAACGATCTGCTTTTGCTTCTGGAATGGTAACTTTAAAATATCTTATGAAATGAAGTAGAATAAGGAAAGATTGAGGATGGAAGAAAACAATTAAAGATATCTATCTTGGGACTGAACAA------------GATATTATGAAACAGGATAGATATGAAAACAGAAGATTAGAggtgatggtgatggtgatgatagtgataatgAGAAGAAGAACAGCAAACATG-------TTACACAGTGATGTCtgtagtaagcactacatgaaatactttacatatgctaacacattcaatcattatcactaca----cccttactagtatc----------ccattttacagaaagtgaaa a score=28932 s mm7.chr5_random 2956864 1074 + 11523536 GCTAAACATACCAGTTATTTTCATTTGGTCAAAGTCATTGTTTATAATATATAAAGACACTTCTCtttatatattaaaat---atattacttctttaaaattataaataaatCTCCACTTTATATAGTATGTCTTAATATCATATGGTATTTGCTTTGGAGAAAGCATCATAGTATCAGCaaatttaaattatttataagaaatatattGCAATGAATTCCTAAGTACATAATTTAAATAGTAGCATGTCAATTTTGGTTTGTGGATAAGTAGAAAGTAAATGCCCATGTAGG--CATTGCTTGACTACAGAGCATCAAA--CAGATTTTTTTCCAGTATAAAACAATTGGCAAACTGTTAACCCAGAATATTGTTGTTTTTCACATTTGTCTGAAAACGCTGAATCAAACTCAATGCCA------------CAGGCTATCAGCTTTGAGGAGCTCAGTGGAAGGAGAGCCTGTCTCCCAAAATCAAAAGGGCAGAGTGCCCAGGAAACAACTTCATGCCTCAAACCCATGAGCTTATTTAATCACTAGACTCGTTCTTACCATAACATAGCTTTGCTATAAAACTACAGAAATTATTTTTAAATATGA--ATTCATCTCTTAATTTTATAAATGTACTTTGTATGCATTCAATACCAGGCAGCACAGCAGCACGAAACTGCCTTTCAACTTTCTCTAGGAAAGACCATCTTGAGCCTAAATTTTAGA-TTTTGCATTACTTA---AGAATTTAGGATTTAAAGCACACTACAATATTAACTTACACCTCAACGCTATTAAGTATCATATACTTCATGATATCTAGAAACAAATGCCAAGGCACTTTAGAGATTAGAGAGAAATCACACAAGTGTTGAATGAGATGTAGCACAAAAATAGA-------AAAAAGCAAATGTATAGATCATAATTTTATATAGAAGATTCTAAATCCCAAATTCCCACTAAGAATATGTTTCAGTGTTGAAGTCTTAATTTGTTTTGTTTCCTGTGTTCTTAAAGTCATTCTACATTTAAATTGAAAAAAAAAACTTTAAAAATAACACCAAATGAT-CGAAATGAAACTCAGTTAACAATGAACTCT s bosTau2.scaffold2830 15675 1012 - 99356 GTTAGGTAGATCATTTGTTTCCCCTTGGTCAATGTCATTATTTCTAATACAAGAAAACA----------TATAAAGAAATTGAATATAATTTCCCTACAGT---AAAGGAGTATCCATTTTACAGAACACGCTTTAATTTAACCTAGTGTT--ATTTGGGAAAGGTATAACGACATTAGCACATTTAGAAC---TATATCGAATATATTGGGATGAAATCCTAAGTACATAGCATAGGTAGTTACATTTCAATTACACTTTGTTGATTAGTGAAAAGAAAAAGGCATTATAAATACACTGCTTAAATATAAAACATCAAAAGCAGAATTTTTTTTTATGTATAACAATTGGCAAAGTGTAAACACAGAATGTTGATGTTTTTCATCTTTCTCTTAAAACGCTGAACTGAGTTCAGTGCCAGAGGCAGAGTGCCAGACTATCGGCTTTGACAAGCTCAGCAGAGGGAAAGCCTACCTTCCAAAATAGGAAGGGCAAGAAGCCCAGAAAAATACCTCATCCCTGAAACACATGAACAC-TTTAAGCACTTGACTCTTCCTTAATACACATCAGTTTTTCAGCACACCTAGAGAAATTATTTTAATATATGAATATGCTTATATGAATCTTATAAATGTGCCTGGTATTGGTAAAATACAAGGCATTAAGTTAGTCTGAAGTATCTTTTTAACCCATACTGGGGAAAAAATTCTTCAACGCAACTTTTAGACTCTTTCATTATTTAATGAAAATTAAGATTTTAATGCATAGT---TTTTTGAAATGTACCTTGACTCTGTTGAGTATCATACACTGAAGAGCACCTAAAAACAAATCCTGGGATTTCCTGAAGGATGCGGAGAGATC-----TGTGATCTCTGCTTATTAATATCAAAATAGAGTTTGACACAAAGCAAACATG-AGA------------------------------------------AAGTAAATGTTAGAAAGTTG---------------------CCTGTGTGAGTAAAATCATTCTATGTTTAATTTGGAAAAAAA----TTAAGAATAACATCAAAAGACATAAGATAAAACTCAGCTGGGAATTTACACT a score=17047 s mm7.chr5_random 2958054 748 + 11523536 ACATACCCCAAGTAATAACGAAGTAGTGAGAGCTCAATTAGGTAAATAAGAGAAATTGTTTACTAGAAAAGTCATTCCCTCAT-ACCATATTATCTCATTTTCCCAGCTCCTTTCA-TGATGCACTGAAGGTTTCCAAAACAAT---------CAACTGTGAGGAGACACGAGCCACTTCCGCTGACAGGGAGCTATCAGCCAAAGTGAGAATTCCAGGGTAAAAAAAATTATCTCCCTCCATCACATACTTGATTTCAATTTGTGATTTTGTACTTTGTCTCATCAATGCAGCTGCTGAAGTAACACAAAGTAGTGGAGGAAAGCAGGAGGTTA--------------------AACACAAGTCGGAG-----------CAAGAGGAGCAGAGAGAAAGC--------CCAGTATTATTGAGCCCTGCAGT-AAATGGCATGTTAGAAAGAACTGAGAGTCAGCCATGCTGC-TGCCTTGCCCACTCACCAGCCTTGTTTTTGCTTACTATTT----AAATAGCATAAAGTAGCTATATACACATGCTGCCAA-AGATAAAACCGAGCCTCCTTGATAAAGATCTGTTTACATTATTTTCAGCTGTTATGTTTAGAAATGTAAAGATGGTAT-----------------GCCAACAATATACACTCATTCACTAATTTATGCAGGATAAGCAACAAGCAACAGCAATTCAGTTTATC-AACCAAGTATGCATCTCCCCGAGGAAGGGAA----CAGAAACACAGCAAAGTGATGAATCATTTGCATTTATTTGGAAAGTTATGCTAAACTGTCTATGATTATTTTC s bosTau2.scaffold2830 16972 798 - 99356 CCCCACCCCCCATAATAACTGAACACTGAGAGCTCAATTA-GCAAGACAGATACATTACTTAGTAGAAGAGTCATCCCCTCATAATCACATTATTTCATTTCTCCACTTTCTTTCACTAAAGCACAGATACTTTTCAAAGTCTTTGGGCTTTCCAAATGAGTAACAAGAGAAGCCACCTTTCTCAAGAGACAGAAATCAGCCAAAATGGGATTCCCAGGGT-GAAAAGTTTATTTGCCTCCAACACCTCCTTGATATAGGCACATGGTCTTGCAGTCTGTCAC-------TAGCTGGCCAGTTAAaa------aagggaggagagtgggaggtaagaagaagagaggaagggcaggaaaagagtaggaggagagaagcataaggaagaggagagaaaaagCAAGCTCAACCAACTTCA--GATACTCACAGTAAAATGAAAAGTTGAAAGAGACT--GAGTCATCCTTGGACCTTGTCTAGTACTTTATTCAACCTTGCTGATGGCTAATATTTATAGAAATGATATAAGATGCTCATATGGACATGCTGCCAAGAGGCAAAACTGAGCCTCCGTGGAAGCAAT---------TTTTAATCAACAATTATGCTTGAGAATCCAAAGAAGATGTCACATTAAAGCAACCTAGCTAATAATACACACTCACTTGATGATTTATAATAGTCCAGTAACAAACAACACCAACTCAATTTATCTAACTGTCTGTGCACCTCCTCAGGGAAGGGAAGACTTATAATTTTGATAGTCTGATAAATGATTTGTATTTATGTAG-TAGCTGTGTTAAGCCATGTTTGATTATTTCC a score=24634 s mm7.chr5_random 2958961 652 + 11523536 TAGACTTAGGGAGCATGAGAATTTATAGACATTTGCCCACTGATTTATTCATTTGTTAAGTATGTATGAATTCTTCCTGA---ATAATCTACTGAATATTTAGAGAAAAGGACCAATAAATCTTGACCTGTTTCAAATTTACTTCAGGATAAAGAAAATGAAAATTATGATATTGTATAGTAGAGGA-----------AAAATAGAAGA-----GATCTGAAAGAATAGAAGCAGGCACCCACCGAAGCCTCACA---AAGGACAC-------------TGAAAGCCTG--------TTGATGCACAGACAAAAAAAGACTTCACACAAAAAGAAAACTAACTTCTTTATGTGTTTTGTATTGTTGGAAAATATCATTAAAATCTTGGCAGTGCTACAGTGAATAGCTAATTGTATAAAGAACAAAAGAACTGATTAAATGCATGGCACTGACAAAGTGACA--CACAAAATCCTAGTTTAGTGCATGTCATCTGTATGCACCAG-CAGGGGACACTTGA----TAGTGATGTGCTCATTGGAGGAGAGATAATTCCGAACCTAAGACCTCATCAGACTCAATTTGCTAACAGTATCGATCTCCTGATATAATCTGCAGATGAAGGGAAAT----TCGGCTGAGTGGCATCCAGAAGAGGAAATA---ATGATTGCACTGACAAG--------AATGACCCTATTTCATCCTGAAAG s bosTau2.scaffold2830 19426 702 - 99356 TAGACTTAGAGA-CATGAAAATGTATAGAAATTTGCCCAGTGatctgttcattcagcaaatatgt--gagtccctatttatatacaagacactgAATATTCAG-GAAAAGGACTAATAAATTTTGACTTGTTGAAAATCTAGTTGGAGAAGTAGAAAATTAGCATTATCAT----TATAATAAAATATATGCTATGTTAAAAGAAACGACACAGGATATGACAGAACAGCTCAGGGCAACAAAAGGGGTTTCCCAGAAAAGGACACCTTGGTCTGTGTCTTAAAGACTAAGTTGTTTCTGATATACAGTGAAAAAAA---TTAAATTAAAAAGAG--TTAACTTCCTGGTTTGCTTTGTATTGTTGGAAAATATCATTAAAATCTTGGCAGTACTGCAGTGAATTGTTAATTGTGTAATGAACAAAAGAGCTGATTGAATGAATGAAACCAGCAAAGT-ACAGTAACAGTTTCATAGTGCAGTTCATATCTTCCCTATGCACCAGCCAGGAGAAATTTGACAATCAATGATGTGTTCATTGG-TGAAAGTTAATTCTTAATCTAAGACTCTATCAGACTTAATTTACTAACAATATTGATTTTCTGATATAATCTGAAAATGAAATGAAATTTACTTGATTGATTGGCCTCAAAGAGGAGAAATAATCATGACTGAATTGACAAAGAATGAATGATAACCCTATTCTGACCTGAAAG a score=6913 s mm7.chr5_random 2962806 391 + 11523536 CTCCTTAGGATGTTAAA-TGCAGAGCTTA--CAAGGGCAA--ATGGGTAATA-----ATTGAGGGAAAGAGCAAACA-CATTCTGAATAGGAACACCAGTCCTGTAGCCCAGTGGTACTCATTTCCTTTGAATTCCTCTCATTACTGCCACAGTTTAATTTTAATCCTTTTTAATTTTTGATATCAGAGGCTCTCAAACATCTTTCGGCTTTCCCATCTGAATTACATGAATGAGGCTACAGTTGACCTAT-TTTGCAGCTAAGCATAGCCTAGCTTTGAAAATTTCC--CTTGATTCT----------CTTCAATTATTAT---CTTCACTTTATTT----GTATCTTA--AGTAA-AACACTGGTACCATTTTTCTGGTCAGGCTCTGTTCTTAATAAATATACAATTTTGTCTTCAAAAACA s bosTau2.scaffold2830 20471 405 - 99356 CTTTTTAAGGGGTTAAAACGGTGATCTTATACAAAAATAATTATGGCTAAAATGTGGATTAAGAAAAATGACAAATAGTATTCTATAAAG----ATAATTTTTATA--CCAATGACAATAATTTCCTTTCAATTTCTCTTATTAC------AATCTAATTCTAAACATATT-AATCCCTGATGTTGTTCATTTCCAAATACCTTTTA-------CATTTGAATGATAAGAACAAGTCTATAATTCACCTACCTTTGCAGCGAAACAGAGGTTAGCCTTGACATTTTTCACCTTTATAATAAATTCAGGCTTTTAGTTATTATGATCCTAATTCTATTTTTTAGTTTTTTGCTAGCAATGATTTCTATACAATTTTTATGGTGAAGTGCATTTCTAAATAAGTGTGAAAATTCATTTGCAAAAACA a score=11707 s mm7.chr5_random 3229854 527 + 11523536 GTTCACACTAGACTTAAAGCATTGGCTAAAGATACATC-AGAAGCCAACAATGATCAAAAGAGAAAATAGTCCGAGAATTTCAGATCATTACAC-------CTGTCCCAGTTGGAT--GTAAAATTTTCTTTTATTTGTTAATTCAAT-----------------------GAATATATGTTAGGT-------------GGATACTATTTCTACCAATATTTTCACAACAGGAAAGTTTAATTAAAGCAAAGAAAATTATAGGATTTGTGGAGTTCATCATAATGGGGTCTT----TTAT-TGTATTTTATTGAGTATATGAATCACCCTGGGAGAGATTTCCCTCAACCTTGTTTT---GGTGCCACTTAGCAATTTGATTGATAAATTTGGTCTACATAAGAGGATAACTTGCACTAACTTTCACAGGTGGTAATGTCTTTATAGATTCGTATTTCATGGTAAATACAGAGATTTTAGAATTCATTTTTTAA-AAAGCTATTAATAA-TTAAATAAGCTATATTGGTGTATTTTTTC--TCATTATAATGTA----ATTTTACATATCAAAAATGGTATCAATGAGT s bosTau2.scaffold775 116296 577 - 351128 GTCCACTCAGGACCTGAAACACCATCTGAGGCTAAACCCAGATTCAAGCAGTAATTGGAAAAGATAAGTTTACAGGATAGTGAGCTCATTATACTTCTCTCCTTTCCCAGTTGGGTTCGAAACATATCTTTTCACTTATTAATTCAAGCAAGAATGGCCACCCATCAGCAGGGATACA-GCTAGAGCTCTTCAGACTAGGGGTAGGATTTCTAGCAATATATTCACAATAACAAATTTCATTAAAGCCAAGGCAGATTATGGGTCCGGTGGAGTTTATTAGAATGGGATCTTACCCATATGTGTATTATATCAAGAATATAAATCAACCTGGAAGAGGTTTCTTTTACTCTTCCTTTCTGGAAGCCACCTGCCAATTTAATTTATATATTTGCTCT-CATGAGAGGTTACTTAG----------GAAAGCCAGTCTTGTCTGCGTATATCAGCATTTCATGACAGATATGAAGTGTGTGCTACTCATTTGATAAGAAAGATATTCACAAGTGAGAGGAGATAGAATGGTGTGATTTTTCTGTTAATATTCTGTAACACACTTTACACTAACAAAATACTTTCAAAAAGT a score=21209 s mm7.chr5_random 3242196 554 + 11523536 TTCATTCTCAAACAAGAAAACAACCAGATAACTCA---GATTTT--AATGCTTATTCTAAATATTCATTTCTTAAAATCACTGCATGCATGTATGCACACTCTATAATGTTCA----GTATTACTTTTCATTTGACTACCAGGCTTATATGGACATGGGTCTTTCCTGTTGTCTGTTTCAAGTTGTAAAACAACTGCAGGTCAGCAGCCCAGAGCTATGCAATTAATTTTCTCAGCACTGAAAGCTTCATGCATGATTAGGTGCTTAAATGATTTTTCATTCTAGGGATGGTACTA-GTGAAGTTTTCATATGAATTTGATTGATGGTCTAAATACATTATGCTTGGTTTTACATAGATTATACTAATGGCTCTATTTAATATAGCAAAAAGGAGATTTTGCTTGTAAGCTTAAACTCTAAATACTAGTGAAAAAATCAAAGGATGGTACACATTGTCCTTTTATTATG-TGTTTGGCCATATGGTCATGAAGACTTAGCTGTTACTGGCTAAA-ATCTGGGATATGGATTGAAGGGGGAGAACTAAATGTGGATTATAAGAACAT s bosTau2.scaffold775 118032 554 - 351128 TTCCCTCTTGAACAATAAAGAAAGGCCATATTTCAATGGACTTGTGGATGCTTACTC-AAATTTCCCCCCTTTAAAAC----ACATGAGGATGTCTAAATTCCTTCATGATTACTGTTTATTACTTTTCTGGTGGCCATATGACCTATATACATATGGCTCTGTTCCATTGTCTGCTTCAGATTATAAAACTACTAGAGGTCAGGGGCCCAGAGCCATGCAATTAATTTTCTCAGTACTGGGAGTTTCATGCATGATTAGGTACTTAAATGCATTTTCATCCTAGGGATGATGCTCTTTGAAGTTTTTCCGTGAATTTGATTGATGGCCTAAATG----ATGCTTGGTTTTACACAGATAATATTAATGACTGTGTTTAATACAGTGTTCAGATGATTGTGCTTATAAGCCAAAGCTTCAAA-ATGAGTTAAGAAACCCATAGATAGCACACATTGTCCTTTTGTTATGTTATAGGGCTATATGCTTATGTCGAGTTAGTTATTTTAGACTAAATTTCTGGGTTTTT--CTGGAGAGTGAGGGATAAAGGTGGAGTATGGAAAGAT a score=17172 s mm7.chr5_random 3309885 844 + 11523536 ACATGGTTAAACAATGAGCCCCTTAACaatttttaataaaaaaaatttaaaaGATGAAAATTCAGAG------CAAGCAT----ATTAAAAAG--------AGTGAATGAGAAAGCCGAAAAGACAATT-----TCTCATACACATTTAGAA-AGTGATTTATAGCATTTTTCACGAAGATATTTGAAGCTTAAAATTATTTAAGAAAACTAGGAAAGTTTCCCAAGAAAAGGATATCATCATTTAAAAATCAGTAAA-CTTTGATGGTAGAACATGAAACAGCTTTCACAACTTACTGAAGAGCTCTGAGTCACAAGGTAACACAATTGTCCTGTCCCATAAAACATTTAGAATTCATTTCATTTGTCAGCTCTTTTGCTTTTAATAATTAATGAGAAACTCACCCTTCCCGTTTAGTGGT---TATGTTATAAAAACATGTCCAAAAAGCACTTCCAGATTCTCTTTATCTTCCCATCAATATG---GATGATTTTCAGttatttttattttta-aaaatattttatttaaaCATGATTATTTAATGCACTAAAGTCACATGTGTGCAAAACTATGTTACTAAAATGTTAG--TGTTGTCATAA-TTCTTGGAATTTTTTTAATAACTTAATGAACACAGGTTTTCAACCTCATTCTACCCCA-ACATGTACCATATGTATATTTCTATAATTTTGTCTTTCTAA---ATTCATTATCTTTACTA---------TAAAGATTATAACAGCTCCATACATG-ATGTAGATTTATGTATGCATTTTCTATTTTCCATACCCAGATATAAATGACATGTTCTATGGCTATCAATCTTTTTGTTTTCGAAAGT----Ctttttaaaataatttaatgtt-ttatattaaaatctattttt s bosTau2.scaffold6230 39 862 + 47205 ACATGTATAATCCAAAAGTCTTTTTTCA----TCAATTAGAATGACTTGAAAAA---ACAATCAGAAAACAATCGAGTATTATCATTAAAAAGTTAGTCATATTTAAGAAGATAGAC-AAAATACAATTAAATGTCTTGCAAAGATTCAGAACAATGATTTATACTATTTTTCATGAGACTATTTACA-CCTAAAAATATTTAAAGAAGTTAAGAAAATTTTACAGATCAGGAATATCATCACTTAAAAATAACCCAATCTTTGATATCAGTACAAGAAACAGCTTTCACACCTCATCAAAGAGATTAGAATTGCAAGCTAACAAAATTGCATTGTATCATAAAATATTTAAAATTCATTTCATTTGTCAG-GATTTTCCCTTTAATAATTAATCAGAGACTCACCCTTTAAGTTTAGTGGGATATACATAGTAAGGGCAACTCCATATAACACTT--AG-------TAATCTTCCCAGAAAAGTGCATGAAGATTCAGTGTAGtttttatttttattaaaaatttta---aaaCA-----GCGTAAAGTACCCAACATACATGTGCATACCAAGCAGATATTAAACCACTAATTTGCTGCCATGCTTTTTTATGATTTCTTAAATTAAAGATTAAAGATAGGCTTTTATCATCCTTATATCATAGACGACTCCATTATCTA-ATTGCTCCACTCCTCTCACTGGAAGGCAGTGGTTATTTTTGCTGCCCATGATTTTAGAGTTATTATAGCTCCATGTCTGTGAATAGTTTCATG-------TTTCTATTTTTAATTTACATATATGTGTTACAC-TCCCAAAATCATTCATCTTCCTTTCTTTTACAATAACGTATTTTAAGATTTTTTAATATCAGTACACATAGATCTGCTTTT a score=12229 s mm7.chr5_random 3314339 404 + 11523536 TTTTCATCTTCATTTAATGCTTACAGTTGAGTTTACTAAGAAGTTGATATCTTATTCAATTGATATAAAGAATATAAACAATTAAATAGTTTGAAATTCTAGGGCTACATGTTATTTAGTAGCACCCTTCCCTTTAAATGAGTCTTTCTTTTAAAACTGTCTGTAGAGGTACTTACATAATTTACATTGCTT----TGTATTGTG---TAAAATTTTATATAAACTGCAGCTTGATACCAACAAGTATTGGTGCTAAGAGAGCTAAAAGAGAATATTGGTGATATTTTTTCAGCTCAACATATGCCCAAGGGTGTGATTATTGATTCTATGATTTGAGGTTTATACCTTAGATAAAATAAAATATGATACTGTCCCTAGATTTCTATTATTACCTTGTTTTTATATTACTC s bosTau2.scaffold6230 17783 397 + 47205 TTGTCATTTTTATTTAGCACTTATCTTTGAGCATATCATCAAATTGATGACTTATTCAAACTAATAGAAGAATACAAACAATTTAATAATTTGATGTAGTATGGCTGCATGTCACATAATAATA-----GCCTTTAAAAAGATCCATGTTTTCAAAAAGTCCCTGGAGGCCCTCATGGAATTTAAATTACTGACTAAGTGTTGTGAACTAAAA---GGTACAAAGTGCAGTTTGATAGCAAGACTCAGTGGCACTGGGAGACCTAAAAAAGAAGAAT--TGGTGTTGTTTCAGCTTAGTACATGCCCATGAGTGCTATTATTGATTTTATGATATGTTGTTTGTAACTGAGATCAAAGCAATTGTAA---TGCCTCCAGGTTGTttctctt-ccttcttccttccttcctc a score=3900 s mm7.chr5_random 3584009 107 + 11523536 CTGCTATTCAGAAACGTGACCACATCTGTATCACCATATTTCTTGGTGTCTACCGAACGTATGCCAGCACTTGGGAGGTGCTGGACCTGCTGATGAGAACGTGAGTG s bosTau2.chr11 3518358 107 - 87172399 CCGCCTTCCAGGGCAGCGACCTCTCCTACGTCACCATCTTCCTGTGCACCTACCGAGCCTTCACCACCACCCAGCAGGTCCTGGACCTGCTGTTCAAGAGGTGAGCG a score=5019 s mm7.chr5_random 3585284 416 + 11523536 GAGAAGCAAGGCCAGGCTTCTGACTCAACTTCCCTCCAACCTTCTCTTCCCCCAGAGCCATATTCAGGTTTCTGTTCGGCTGGTTTAAGAAATACCCCCAGGATTTTTATGAGTCCCCAGACCTGGCTGTTGTGAGGCAGTTCATTGACTATGTGAAGCGCAATGTGCCTTCCTCAGATGTAGATAGAAGCCAGGGAGCTGCTCTCCGTG--------------CTTGAAGATCAG-GAGGCAATAGAGCTACAGATTGAGCAAGGTGAGGAGG--TCTGGA-----GTGGGGTGCC----TGGCAAGGTAGGAGGG----------GGTTTCGGTGTTGGATTCCAGCAGGGTATTCTCCAGAGC-----TTTGGCCTGAAGCCAGGGCTGG---------------------ACTGCAGTCAGGTAAGATGATCCACTGTGAGG-AGAGGACTGGGGATCTTCTGTCATGAAAAGGC s bosTau2.chr11 3519946 462 - 87172399 GGAAGGAAAGGCCAGGCC-CTGACTCTGCTGCCCGCCTGCCCAC-----CCCCAGTGCCATCTCCTCCATCCTGGGCACCTGGCTGGACCAGTACTCGGAGGACTTCTGTCAGCCCCCCGACTTCCCCTGCCTCAGGCAGCTGGTGGCCTACGTGCAGCTCAACATGCCCGGCTCCGACCTGGAGCG----CCGGGCCCACCTCCTCCTGGCCCAGCTGGAGCACGCGGACCTCAGCGAGGC---AGAGCCGGAGGGTGAGGAGGGCGGGGTGGGCGCTGGACTCAGGGGGGGCGCCCCCATGGCAGAGCCAGAGGGTGAGGAGAGTGGGGTAGGCGCTGGACT----CGGGGGAGACCCCATGGCAGCTGCTGGGCTGGGAGCAGAGACTAGCCTCAGAGTGCCTGCGTGGGCACCTCCATCAGGGATGATGTTCTGTTGTGGGGTTTGGGGCCAAGGCTTCTCTGGAAGGCAGAGGC a score=4031 s mm7.chr5_random 3594229 107 + 11523536 CTGCTATTCAGAAACGTGACCACATCTGTATCACCATATTTCTTGGCGTCTACCGAACGTATGCCAGCACTTGGGAGGTGCTGGACCTGCTGATGAGAACGTGAGTG s bosTau2.chr11 3518358 107 - 87172399 CCGCCTTCCAGGGCAGCGACCTCTCCTACGTCACCATCTTCCTGTGCACCTACCGAGCCTTCACCACCACCCAGCAGGTCCTGGACCTGCTGTTCAAGAGGTGAGCG a score=16187 s mm7.chr5_random 3649489 715 + 11523536 attacctacagtaagtggaaaaccaccattgcatggaataaggagaggCTCATTACGAGCAAGATTGGATTTTTGTAATGCCTGCCTGCCTGCCTACAAGACATTGTCAAGAAATCAAAGCCTCAAAGACAAGAAAGCTACCTGAGC-ATGAGCTAGGCCATGAGACACCTCTCTGGGCTACAGCCATGCTGGGCAACTCAGAAGTAGACAGGGTGGTATCATTCAAGTTCATTCAAACATACGTCTGTGTGCCGA-GAACATCATTTGCAGCTCCACCATGGGAACCTCTGTGAAACCCCCACCCA--------AGGGCAAATT--TTACCCAACA---GGCTTTA--TACTTATTTATCTAAGTTTA-----TGCCTTGGCCCGCAAGATTCTGAAAATGCCGAATGGGATCTCG-GGGCAAAGAGCAATTAGCTATTCAGCCGTGGGTTCCAGA------TCTGTGAAGGCA-AATCAAAGCAGATTTGATCGCCG-AGATAACAGCATTAAGATGAGACTCTCTTGGCAAA------------CAAACTTCTTCAAACAA--GGAATATGAACTTGAAGGC-GATAAGAGATCTTCACTAACTCCCGCTGAGTTCATCACTGATACGAAAGTGGCTCCTTA-CCCATGAAATTGCACCTGTCACAGCGACTTCACTTCATTAAGGCGGCTTCCTGATCCAGGCAAGATTATCAGCAACACACAATCTAGGACTCTCCAGCTAATGAAGACTGCCTCTC s bosTau2.chr17 25492247 742 + 45915461 ATTACCTATAATAAATGGAAAAGCAGTATCTTATGAAGTAAATGGA---TAATCATGAGAAAGGATTAAGCCTAACTATGTACTCTTGCTTGTCTACAATCTattaacaaaggatagagacttttaagacatattagccccaaaagagatgaatt-------------tctcttcaattaaaagtcctgctggataactggaaaacacacacatttttgtcatttaagtttatttgatcctgtttctttataccacctaaaatcatttagatagaaactatggcaaactttggaaaacactCATCTATGCAAAGAAGAGCAAAGAAATAAAAAAATACATGACTTTTGTTACACATTTATTTAAGTTTACAAAGTGCTAGAGTGAGCAAGATTTAGAAAATGCCAAATGGAATTTGATGGATAGAGCATAATTAGTTATTC-TCCTTCTGTTCCATAATATTTCCTGGCAATGCTTAGTCAAAACAGATCTGATAGCTGTGGGTAACATTCATATGTTAATACTCTGATGATAAGGCTTTGAATAACCACAGTTCTTTAAAAAAATGAAGGATGTAGTTCAACTTAGATAAAAGATCTTCACTTACTCCTGTTGAGTTCATCACT---AGACAAGCATCTTCTTAATCCATAAAACTACACCTGTCACAGGAACTTAACTTCATTAATGCACCTTCACAGTCCATGGTAAATTATTAGCAATACACAACCCATGATTCTCAAGTTCATTAAGACTGACTCTT a score=465 s mm7.chr5_random 3650204 32 + 11523536 CTGAGTTCCCA------------CAGCTGAGCTCA-GAGTTTTAA s bosTau2.chr17 25493108 45 + 45915461 ctaagatcctacatgccatggggcagcaaagcccatgagctgcaa a score=9358 s mm7.chr5_random 3650236 471 + 11523536 GATAACGGAGAGACGGCCAGAGAGA--AGAAAGGATTTATAAAGCAAAACAACCCCCCCCCCAACCAAAAGCCAAAGCTACCAACATTATCAAAGCATCAACTCAATGAAACATTTTCCAATTATCCTTGAGAAGAAAGGGACC---TCGCCTGGCTTCAGCATCACCTGAAATACCGGACCAAGGTTTCCCTTTGGTTTCCCTTTATTCCCCTCGGGGAAGATAGTA-CAAAATGAAAGGTTTTCAAGTGGGTCAGGGATAACTATTGAAGATGCTAATGAATGTGTGGTACCTGATGAAAACATCTATTTTCATTACGTACATTTTGTTAAGTAG-AAAACAGATACAGGGTGGAAAAAAAAAACAACAACAAAAAACCTCAACCCAAATGTTTCACTGCAAAAATTAATTTACATTCAGCT---TTTCCTGGCATCCCGGCTCTGCCTGCAGGAATCCCAGGTTGTCAGTCTACTCTG s bosTau2.chr17 25493276 431 + 45915461 AATAACTGAAAAACATTCAAAGAGAGTAGGGAGAATGTATAAAGCAAAACTGCTTCT----------GAAGCAAAACCTATTAACATG---AAAATATCCAATCCATCATATGTTCTCCAATTATCCTTCAAGGAAAAGGAAACGGATCTTCTGGTGTGCTCACTACCCCCAAGAGTAGAGCA-----------TGATTCTTCTGCATTTAACCCCATAAAGACAGAAGCAAAATAAAAACAATTTAAAGGG----AGGATAAAAGTTGAACATAGAAATGAATATATCCTATT---CAGAAAAATCTATTTTAACTGTATACATTATATTAAATGGTAATACATGCACATATTA------------------AAAAAATCATAGTCCAAATGGCTCACAGTAAAAAGTAATTTACATTCAGCTTTCTTCCCCAACTTCCCAGCTCATTCCAAAAGAAATTACAGTTGCCAGTCC-CTCTG a score=9758 s mm7.chr5_random 3703102 309 + 11523536 CAGGCTGCTTTACCC-TCATCATAAACTGGATACACAGTTGTCACTCTGTGCCAC-TAACAGGATTTCAGAAT-GAATTGAGAGACATCTGGATAGGGACAGATA---AAAAGATCACAGATCGGAAATCCCAGAATCTCAGACAGCTAAGAGCAGAAGTGGATAGATTAAGCAGTACCTAGAGCGTTTTTTCTTCTAATACCATCAGTAATTTGTTCAAATATATACTCCATGTGTCAATCCAGAGGTCATTTAACTAGGATATCATGTTGAAGAAGATT---AAAACCAGTGTTAATGAAGGATGAGATTACATGC s bosTau2.scaffold3383 31127 313 + 83770 cagactgcctcaaccatctTCCTAATCTGCTCCCACAGCTGACACTCATTACTAAGTAATGTGATGACTGAACAGGATTTAGGGACATCTGGATGAAG-CAGATAGAAAAAAGAACAGACTCCTGGAATG--GGAGTTTCTAGAAGCTAAGAGTAGAAGTGGGAAGACCAAACGGT-CCCAAAG-GGCTCTTCTTTTAACACCTTTACTAATTAGCAGAAATATATAATCCTCATGTTAATCCAGAAGCTATTCAAATAGGATAGCAGATTAAAGAGGATTAAGAAAATCAGTGTTAGGGAAAGATGCAACCACACAC a score=14726 s mm7.chr5_random 3753766 500 + 11523536 CTCTTTCTGTAGTCTGAGTTTG-CAGACCCCTCCC---TGCTACCTG------------CTTACTG-GGTGATACCCACATAGGGTCACATTCTTCTACACCAACTTCTAGAGCTGCGGAGACCAGGGCCAGCTTCCTTGTGTTCCCTAGCAACAGGCACGGTGTGGTGTTCAGGCACCAGTCGTCTGTCCGTCTGGAGGGATCCGGATCCGGGCCAGCTGGTAGTGCAGGCCAATTTTAGCTTCTGCCCCTGACCCCTGGGGGTTGTGTCATCCCCTGCCCCAGCTACACCCTTGCAGGGGTCCCTCAGCCATGCAGCCTTCAGTGGAGTGCCTTCCTGCATCTGAGGGAGCCCCCTGGCAACACCCAACAGGGGTTCTTCTCCAGGCTCCTAACTCAGCAGGGATCAGAGACCTTATCTTCCCATCTCTACCACCCGCCTGCTGCTCCCC---------GGGCCCTGAGCCATGAGCTG--CGGTGGTGGCATCTGGGA---GGATCAACACTCAGGAGCCTGAAGGGC s bosTau2.chr18 17867095 497 - 56508949 CCTCTTCTGGAATCTGAGGTCATCATACCCCCCTCCTTTGCCACCTGGACATGAAGCCACCTACCATGACAACAGCCATGTGGGGTCATGC---------CCAAGTTCCAGGCCCCCTACCACC-----CAGCCTCTGGAGGTTCCCTAGCAACAGGCTCAGTGTTG-----GGGCGCCAGCCG-------GTCAGGAGGGAGCTGG------GCCAGCTGGTGGTGCTCGCCAATTTTAGCTCCCGCCCCCAGCCCCTGGGGGCTTTATCACCCACTGCCCCAGCGGC-CCCTTGCAGGGGTTCCTCAGCCACGCTGCCTTCAGTGGGATGCCAGCCCAGCCCCAGTTGGCTCCCCTGGTGCCACCTAATGGGGATTCTTCTCCAAGCCCTTATCTGGGTGAGAATCAGAGCTGTTATCTGCCAGGATCTCCAACTCCTTTCCCACCTTCCCCTGGGAGGAGGCCCGGGGTTGTGAGCAGCCcagcgg-ggaatgtgggaaagagctgggggctcaggagtctgcagagc a score=4840 s mm7.chr5_random 3814468 295 + 11523536 tattttttttttcatttttGAGACAA--TCTGTTTGTCCCAACACCAAGCAACATATCAGACCAGCTACCAGACATTTATAGGGCCAATTCCTGGTGCTCCTG-GGGCCGGTGGTTCTCAGAGGGAGTTGGTCCTCCTGGCTGTGTTAATGGCACTAAGTTAGAAGGCTCTGGAGCCCAGCTTCTCTTCCAG---CCCCTTCTGTGGG------------CCCGGTGAGAT-----GTTAGTAATTCAGAGCTTCATAAGTGGGAGGCAGTTGTGCTTGTTCACAATCTATTCTGGAGGAAGGAGGAAGACAGTCTAG s bosTau2.chr17 25607638 307 + 45915461 TGTATTGTTTATCATCGTGGAGATTAATTATGCTTGTTGTGACAATAAGCAATGTGTTGAAACAGCTGTCAGGTGTTTTCTGGGTTAATCTCTGGAATTAATGAGGGCTATTGACTCTCAGCGA-ATCTG--CCTCCTGGCTCTGTGGACCCCCCTACACTCTTAGGTTT-------CAGCCTGCCTTTCAGGTCCCACTTCTGTGCGAGTCAAACAGTTCTTGGAGAGCTTTCTTGTACATGGCACAG-GCGTCATAGATAGGAGCTAATTGTGCTTGTTCCTGCTCACTGAGGTGAGAAGGTGGGAAACAGGTCAG a score=10055 s mm7.chr5_random 3816795 461 + 11523536 ATTCACCAGGAAGTGGACTCTCTGT--ACATTCTCCCCACAAGATGAGCAAAGCAGGTCCTTCA---GCCTCATTCTCACTT----GTTCCAGTGGCTCCAAGAAGCCTCTTGCAGGCACATCAGGTGTTTG--TGGGGACAGACATCAACAC--AGATCTCC-------------CCTTCCCTCCTACGAGACCCTAAGGCTCCTCCTGCACACAGTAATGGCTCTCCCACCCCCCCTTCTTTTCTGTTTCTTTTATACAGGTGATAAGGAAACAGAGCCAGGCAGATAATTTAATTTTTTTCAAAACATCTTCTTGTTCTAGAAGGGCTGTTATACATAGCCTCTCAAAAAATAGAAAATAAAAATAATCTTTCCTCCTACCGCCAAGAGACAAGTTTTGACACGTCTATTTCTGA--GCCTTTCTATGCATCTGGCTTGTTTTGAGCAAGATGAGGGTTGTAGATTGCCTTTTAACCTATTCCTCT s bosTau2.chr17 25610922 466 + 45915461 ATTTATCATTATATGGCCTTTCTGTGTACATTTTCCACCCTTAATCCTTAAAACCATCCTGTTAAATGCCTTGATCTCATTTTACTGCTTTA-TGGCTCAGAGATGTATATTGTAG-CAGATGAAGGGTTGGGTTGGGGTCAGAAACCAACCCCTGGGTTTTTGATCCAAGAGCGTATTTCCTTTCCACTAAACT-----GCTTTTCTAGCACAGAATGAAA---------------CCTCTTTTCTGTGTCTTTCATATAAGTGATGAGGGAATTGAGTCAGGCAAATAATTTCACTTTTCACAATATTTTTTCTCATCGAAGAGAATTCATGAAACAGAGACACTTATAAAGAAGAAAATAAAATCATCTTTTTTCCCTATTGCCTAGAGGCGTGTTGTGACACATCTAATTCTAGTTTCTTTTCTGTGTATCTATGTAGTCTTTAACAAGA-GATGATCATATTTTACTTTTTACCCTTTCCattt a score=3650 s mm7.chr5_random 3818385 254 + 11523536 CCCTGAGTGGGCTTGTGTGTTGCAGTCT-GTTGGTGGAAAACCAAAGCCAGC-CATTAAAGGACATCTCAGCTGTCCTACCCTGCCGCCCAGTATGCCCTGCTCTTCACTCG---AGCCCCGCCCACA------------------CTCAGCTCACTTCCTCCTGA--TGCCACCATCTCATTTCTCTGTAGGGTTGGTTGCCT-TGATGTTTGGGTAATGGTTCGACCTTGGAGTAGACACATCCTTCTTCCTCAGCTGCCTTGTCAGTTACTTTGATT s bosTau2.chr17 25613168 267 + 45915461 CCCTGAGACTCCTGCTGTGATGTAATCTCATTGTAAGAAAACTAAAAGTAACACGTCCAAAAAC--------CGCCTCATCATGCT-CCCAG---GCCCTTCCTTGTGCTTGTAGAGACCCCACCAGATGGGCCTCCTTCCTTTTTCTCAGCTTCCTTT-TCTTGAAATGGCACTACTTTATTTCTCTATAAGGTTCTCTGTATCTGTTTCTTGGACAATGGTTTAACCTCAGATTGTAGATAAGCTTCTGGATCAGTGGCTTTGTTGCTTCGTTTCATT a score=8005 s mm7.chr5_random 3819101 421 + 11523536 GTGATCGGCAGGTCCTCATGTGAGAATCCGGGGGAGGGGAGTGTGTATTCAGATTCAGCCCGGGCTGGGCAGGGT-CAGGCTGTGTTCCTGTTGAGTGGCTTTTCAGCCTACTGGGGCTTGAACACGCTCAGGGGTGCATGTAAGTCTGAGAAGGTTG--TGCTGT----GGGCA-----------ATGCCAATCACACTCTTTGACATTG---ATTTGGGGATTCACTAGGTCAGCTGTATTGTAGACAGAAGGACCTTGCTCTCTTAAAAAAAAAAAAAACAAAAAACCCATTACAGCCAACTTTTC--AAGACTGGAAGAGGCACCATCTTAAAATTTGTGTGGGGCTCCTCACCGGCCAGTGGCAGCATCCACACACTGAATACTCTTTAGGGAACTCGCGGATTTCCCTCAACTGT--GGAGTAGCCATTCAACAACACCT s bosTau2.chr17 25613515 416 + 45915461 GTGATGGGCACACTCTTCTGTGAGAGGTTGGGAGAGGGGCATGTGGT----GATCCAATCTG--CAGAAGAGGATTCAGGCTCCGCTCCTGCCAAGTGGCTTCCCAGCCT----------GAGCATGCTcaggactgcaagtaaggttgtccaggttgcttactgctcaagggcacggccacagccatgtcatccacacccca-gacattgcagagttgggaattaagtaggacagttgtatagcagatggcagtaaagtgcgtcattctaacaaaa-------------tCGGTATATTATAATTTTCTGAGGAATGGATGAGGTACCATCTTTTAATTTGCATCAGGCTCTCTGTGGATTAACAATAGCTTTTCTGCAGTAATTGTTTTTTTAGGGAATGTAATATTTCCTGCAGTTATTCAGACTCATCATTCATTAACACTT a score=12882 s mm7.chr5_random 3825317 595 + 11523536 TGAGTCTTTGAGAAAGTATGTCCCCTACCCTTGTCCACTTGCTTAGGAAAAGAGTCGGGGCATTTTGGGTCAAGAATGATCCAGAGTCTTTTTATATTATTTTTAAAAGTCTCTT--CCACAATGC-ATACTGGAAGAAGCAGAATTTGAGTAGAAAGTATACCCAGTGTCTCATTAAAATAAGTAGTAATGAATATGTCCCCAAAGCAATATTTATTCAGCAGTTGGACGGTGTAGGCTCTTTCCCCAGGGAATATTTTATAAGCAGATCTGTGACCTTGAGCAAGCAGGATGCCCTC---GAGTCACAACGTCTTCCTCTGGGTGACGGGAACAGTCATTCCTTCCTGGCCTTGCCTGCCAGGGATGCCTTCAAGCTGTTGACAGGCAGGAAG---GAATGGCGTGGTGTTACTGTGCAAACGAAATCACAGTTACATCCAGCTACATCCAGCTGAGGGCGAAGAGAGCAGGTGCTGGCAGGTGTAATTAGGAGAGGAAAT-GATTACCATCCGTTTTGCAAACAGATGTGGTGGCCCCGGGGTTCTGTTATGGCTGGGAGCCTTGGGTTTATCTATAATTGAGACTGACATCTTGTATTAGG s bosTau2.chr17 25617960 529 + 45915461 TGGGATCTTGAGAAAATAAATCATTTATCCAAGTCCATTC--------AGGAAGTCCAGG-ATTCCAGATCAAGAAAGA---GAGGTAGTATTCTATCAC----AGTATTCTCTTAACTACAGTGCTACACTG---------------------CAAATATACCCATTCCCTTACTGAAATAAGTAATCACAAAAGCGCCCCAGTAGAAATATCACCCCAGAAG--AGAGGGCATAGGTTCCTGTTCT-GGGAAGATTTCATAaccagttctgagaccttgggcaggccaggtgccctcttggagactcagtttcctcctctttatgatggaaatggtcctaacttccctgc-ttacctcccagggaagctgtgaATCTCTTGACGTAAAGGTGGTGTGAATGCCGTGGG--TGCTATGGAAGTGAAGTCACAATTACTTTCAG------------GGGAGGGAAA-----------TGTCAAGGGTAACTAGGAGGAAACATTGATTAGAGCCCACC----------ATGCGGTAGCCCCAGGGCTCTGTTATGCATGAGAGTGCTGGTTTGATCTCTAATTGAGACTGATGTCCTAAGTGAGG a score=15043 s mm7.chr5_random 3827091 918 + 11523536 ACTTTTTAAAAAGACTTATTTAGTTTCTAAAC--TGCTAGTATCTGTGGGCATTGAGCATTAACTTAGAAACGGAGCCTCTATGTAGG------AATCAA-TACTTTGAGAGAgtcctcctggaacctaaggtggtgtctaaacccaccaaccactgttcttatgaaaaaaaaaaaaaggtaacctgaaggcaca--------gagaagacaagcagagcagggggccatgtgaagagg------------agaaggatgctcccatgagccaagtgacacctggaggtgtcagacactgtgagaggcaa-------cccttttctcccttatagtctcctggcagagtatggcctgacca-------gatctcagatttttggcttctagtactctga----ataagtttctgttcgttttaagccattaggtttgtggtagtttgtcatggcagccctgcgaagctTGTCTGAGCTCTCTCATGCCCTTCGTGCCTAGGCAGGGAAAGGATAT-----GCTCTGTTGTAAGGAAGCTGTGAAGACAGGGACGGGGTTTTCAGCCAGCACTTTCTTCCACCTG-GTGTTGAAACAC-GTTTCCTAA--------GCAACACAGCCCTTACTCTGAGTGACAGT-------AGTGGACTAAACTGTTTATGGTCTGTGTTAGTCTCAGCACTCATGTCTAGGAAGGGAGGGTGC----TGCATTAAGCAGACTAGGAAGGAGGGCTTCAGTTCCGACACCATACATTTGGTCTTGGCAGGTTCACTACGGGAAAGAAAAAAAAAGTCCCACAAAACAACTAGGATGTAATTTCCAGAATCCTGCTTCCTGCTACCTTCTTTTAGCATCTCAAGATGTAAGTTCTCAAATACTTT---------------------CTCTCAGGTTTGCTCAGAAAG--GTTCAACTTCCTCTTCTTAACAGACAGATTTTTTTTTTAAATAAAAGTTTCTT-GGTGAATCCTTCTGAGATGACTT s bosTau2.chr17 25620235 938 + 45915461 atctcccaaaaagatatgtccaggttctgacccctccccatatctgt---tattgagaccttatttggaaataggatttttgcatatgtaattaaatcaagcatctcaagaa----------gagattatcttggctggtaaattcagaaaccaatgttcttatgggaaaaaaaagagcaagattt-aaggcacacagatccagagaagaaacacagaacacttggccatgtgaaggtggaggcagagattagagtgatgctaccacaagccaaggggtgcctagagctgcccagagctggaagaggtaaggaagagtcctgccc------aagggccttggagggagtgtagccctgccaaaatgttgagttcggacttctgattgacaggtctgtgagagaattaatttctgct-attttaagttatcaggtttgtggtaatttgttatggcagcactagaaaacaaatacaAGCCCAGTATGGTCTTAAAGATTCAGGCAAAGAGACGAGGCAGCTGGATTTGATATAACGGAGCTAGGAAAGCAAAGATAGG-TTTGCAGCCAGCAGTTCCATTAATTTGAGTCCTGGGGCACTAATTCGTAAATGCTGAGGCAACAC--------TTCAGAGTGACTTTGAATTTTAATATAGTAAGCTGCTTGTTTTACACGTTAATCTTAATACATTTACATAGGGAAAGATGGTGAATAATTTATCAAATAGA-TAGAAAGAATGGCTTCTATCCTGACATCACACATTTCCTCTTGTCAGGTTCAATGTGGAAAATACAGAGAA----------------TGGGATGTAATTTTCA---------------TTGAGTTCTTTCAGCCTT------TAGAAATTCTAAAATGCTTTGAGAAAAAAATGTGGGTTTTGGGGTCATGTTTGCCTATGATGACATGTGGCTT-CTCTTCTTTACAGACAGAGTTC--------ATGAAAATTTCTTAGATAAGTTCTTCCAAAGTGAGTT a score=1093 s mm7.chr5_random 3828855 82 + 11523536 CTCTGTCCATCTCTCTGTCCA---GTGG------CCTGAATGCACAGCTGG---CCAGCAGATGCCCC---------TTCTCA-TACTTACTGTGGTCACTGAG s bosTau2.scaffold720 350073 104 + 366119 ctctcctcatctctcCATCCACCCATGGATAAACCTTGATTGAAAGATTGGGAATCAGCCCAAGCCTCCAGCCAAGGTCCTCACTGCTCAGTGAAGTCACCAAG a score=11165 s mm7.chr5_random 3829027 455 + 11523536 GTTGTCCCCAGTGCTGCCATCAG-CCTGTTTTAGATTTTAATCACACCGATGCC-TTTGCTTGCTAGTTCTGTGGCAACTGGAAGTTGTGTTAGATTTTAATTTAGCTCAAACAGGATGA----GTTTCCC--CCTCCA--CCCAAGACAATGAAGAAACACTCTTAAGAGGTTGCAGTTGTAATTAAGGGAGTGCTAAAGGGTAGAAAGGGG-----ATTAGAGAAAAT-CATGTAATTATTACACACTGTAGGAGCCT-GCTGTGTAGCTAAAACAGCCTTCCCCCCACCCCCTGTATAAGGG---GCACAGGAGAGAGGCTTTCCTGGGAA-------------------CCAGGCTGGCTCAA-----ACCTC-----------------------CTGTGGCTCTGATCTAAG-GTTTAGTGTT-CACTCTGCTGCTTCTATCTCCTGGGGCTTTCTTTAAACCTATGTGTTTGCCTTATCCTGGGCCTATTTTTCCCATGAACCCTGCTCTTTTCTGT s bosTau2.chr17 25626871 501 + 45915461 GTTTTTCTCACTGGTGCCATCAGATCTGGTTTCAATTTTAATTGAATAGATGTCATTTACTTGCTGGGTTTCTGGCAAATGGAAGTTGTGTTAAATTTTAATGTAGCTCAAGTTGGATGAGAAGGTCCCCCAGCCTCCATGCCCCAGACAACAAAGAAACACTATTTACACGTTACAGTTATAATTAAGGAAGTGCTAATAGTTAAGTAGAGGAATGAATTGGAGAAAACACATATAATTACTATTCAGTGTTGGGGCTGAGAGGTGTGAATAAACAGGAC---------CCAGCTGAATCGGGGGAAGCAGAAGAAGCAGGCGAGCCTGAGGATGGGACTCAGCCTCTTTGCCCTGTCTGTCTCCCTGCCTACCTCTCGCATTCTCTATACGACTGTCTCTGTGTCTCCAAGCTGCGCGTGTGCTGTCGCACCCTG-----TCTGTCT-----GGCTTTCTTCAGACTTAGGTGTTTTCTTTGTCTT----CTCTCTCTTTCTTACTCTCTGTTTTGCTCTGT a score=15309 s mm7.chr5_random 3832223 801 + 11523536 TTTGAGATCTTAATATACTCTAGGCAGTATGGGAAGTCGTGGTAAAGATGGGACCGTGGATCCTGCTTCCGTGG-----------------TTATTCATGG---CACTTCTTATTCTCTGTAGAACATCTACATGTGTAGGGAGCTGACTGCATTCCCTGCTTTGTATCTTGCTGGGGTAGACCT-----------------------------------CCAGCTTCCCCATGGGTAACCTTTAGTTCCCTTGGTCAGTTAATGTCATTTTAC------TACTCTGGGCT-TCTGGTATGACGAGCCTGTCCTGGACACTGGATGGAG----ATGGCTGCTGCTTT-AAACAGTTCC--CTTCATCCCTGGGCACTTGT-CCTGGGAATGACAGCCTAGCCCTTCAGTGGAAAGCAGCTTTA------ATCTCTGAGGCCTGTCCTGTTTGAAACAATCCTGTTTGTGTTGATCAAGAACTGGAAAGGAGCTGACTTCTGACATTCTTTCATGCCTTGTGGACAGCACGCTACCACAGTCTAAAACTAGCCACAGAGAATGGGGGAGCTGGGTTGATTTCAGAGGTATATAGCGCACAGCACT-GGCTTGAATGTTGTTATCTAAATTAGAGCCCATGTCATCTTGCTGGTTTCTGAGTAAAGTTTACAACTGCCCTGTAGCTTTAAAACTGAGAAACCATGCTGTCTGGGAGCAAAATGTGGTTAGCATTAGGTTCCTATTCAGA-------ATCC----------------AGGTCTCAGCATGGTGATCTAGAGCCTCATAGGCTGGGGTAGAAGCTAGGATGAAGTACCCCAGGAGCCACAGATGATCATCACCTGCAGCTCTGAGACTACTCAGAGATTTTTATACAATTCTGAT s bosTau2.chr17 25627428 883 + 45915461 TTTGCAATCTTACAGCACCCCAGGCAGTGCAGGGAGTCATAGGAAGAAAAGAAACCTG-CTCCCCATCCCATGGAATTTTGTCTCTTCCTGTCTTTAATGGACTCAGTCCCCATTCCTTGTAGAACCCCCTCCT-TACACGAAGATGTAGGGATCCCCCCACTGATATCCTGTTGTGTCAGACCTGACGATGAACATGACTATGAGACCCACTGCACAAACCATCTTCCCTGTATGTGGCCCCTGAT---CATGTACATTAAGTAGCATTTTCCACATCATGCTCTCGGTTGCCTAGTGTAATGAGGTTGCCCTGACCATTGGGTGATGCCTGATAGAAGCTCCTTCCAAACAGTTTTGGCCTCTTCCCTCAAAGCTCCCACCCAGGGATGCCTGGAGAGTGTTTTCACAGACACACATTTTATTGACCCTCTCTGAGTGTTATCCCGTTTGAGATAACTATCCTCGTATTATTCAGGGATTCACAAAGAGCTGGGTTTTGAAATCACTTACTGCTTTCTGGGTAATAAATGATCAGAATCCAAAAATAGCCATCAAGAGGGGAAGAACGGGGCTGATTTCAGAGTTTTATA--ATACAACAGTGGGATAGAAAACCATCCTTTCAGTTGGAGCCAA---CATCTTGCTTGTCTC--AGCGAAGTTTACACCTGTCTTGCCATTTTAGGTGTCAGCAGTTGAGGTGTCTGAACACAGAATAGGG------TCAGAGTCCTGTTTAGAGACTGGCATCCCTGTGCCAGGGACCAGAGGATGCAAGAGTGTGACTCAGAACCTTACAAGCTGGGGGAGAGGCTGGAATGGAACATACCAGAAGCCACACATGGTCATTGCTTGGGGCTTTGGGGCTACTTGGCTGTTTCTATTAAAATGTAAT a score=10250 s mm7.chr5_random 3989982 313 + 11523536 CCTCTGTCTGGGA--CCTCACCGAGAGCATCAAAGGCTGGCAGGACGTCAAAGTCCACGCTTTGGTCCAGCAGCGTCTGGGATGTCAGCGTGAAGCTGAGCACTCGGGGGTTCTTCC------TCTTGGAGACCTCAAACTTGACATCGAAGCTGTGCATCTGCTGACACGCCTCCAGATGAGCCTGGATCTCCGAGATGATCTCTGCCCGATGGCTGCCTTGCTCA-GAGAACTGGCGGAAGCAGCTGAGAAACACCACCAGGTCGGCATCTGAGCGTCCTTGTAGAGCCGTGCCTTTGGCAGAAGACCCACCCTGGGGAG s bosTau2.scaffold9110 15582 318 - 29600 CCTGTGGCTGGGAGCACTCACCCAGGGCATCAAAGGCGGGCAGGACATCGAACTCCACCTCCTGGTCGAGCTTGG---GGGACCTCAGCACAAAGCTGAGAGCGCGGGGATTCTCCCATTGCCGTTTCTGGACCTCAAACTTCACTTCAAATGTTTTCTCTCTTTGACAGGCTTCCAGCTGTCTCCTGATTTCTTCGATGAATTCTCCTCGGCGCTCAAGCTGTTCCCGAAAACTTGTGAGATTGG-TGAGGAAGACGACGAGGTCAGCATCTGATCGTCCCCTGAGGGTCGTGCCTTTGCCTGAGGAGCCACCCTAAAAAG a score=21414 s mm7.chr5_random 4094110 422 + 11523536 GTGTCAACACTTA-----AAGTCCCTAGATTCGGTTTTCACTGCAGGG-TAAACATCTTCTTAGGGAGCATACAGAACTTACAAT-TGCTGCTGGTTTGTGAGTTGCCGTCCTG-GTGCTAGGGAGCTGATAAATTTGGGTTTTTATAGGAATCACTTGGACCTTGCTTCACGAGATGGATTTCCAGAAATACATTTCTGTGAGGCACGACTACATCCTCCTGCCTGAGGGGGCCCTCACCAACACAACTCGACTTCGCTGGTGGCAGCCTTTTGTCATCAGCAATGGGCTCGTGGTTTCCGGGGTGGAGCGTGCGCAGTGGGCACTGGACAACATTCTGATTGGTGGAGCAGAAATCAATCCAAGCCAACTGGTGGACACTTTCGATGACGGTAAGAAG-AAGGCCCCAAACTGCATTCTC---------TCTGTCCGC s bosTau2.chr4 21764692 437 + 69556449 GTGTGAATACTTACATTAAAGTCAGTGAAATCACTTCTCATTATATGGCTGAAGATCTCTTTGGAGAACTTGCAGTAACTTCAATATATTGGTGGTTTGTTGTGTTTTTTCCAGTATGTTACTATGTTGGTATATTTG---TTTTATAGGAATTACTTGGACTTTGCTCCATGAGATGGATTATCAGAAATACATTTCAGTCAGACATGACTACATACTTCTTCCCGAGGAGGCTCTTACCAACACAACTCGACTCCGCTGGTGGCAGCCTTTTGTGATCAGCAATGGACTTGTGGTCTCCGGGGTAGAGCGTGCTCAGTGGGCACTAGACAACATTTTGATTGGTGGAGCGGAAATCAATCCCAGTCAGCTGGTTGACACTTTTGATGATGGTAAGAAACAAGACATTGAGCAATCTTCCCTGTGTATCTTTTGTCTGC a score=2743 s mm7.chr5_random 4094589 113 + 11523536 TTGATGCTCAACCGCTG--AGCTGTT-CTCGGCC--ACAGTTGATAACTCTTCAAAATTCCTCACTTGCTGAACTGTCGATTGAGAACTTAAAGAACATCGCTAAATAAAGAGTGCTT s bosTau2.chr4 21765187 118 + 69556449 ttactgatcaacgaatgttagctattattTTGCCTAATAGTTTATACATCTTCAAGGTTGACTGCTTGTTGAAATGTCAACAAAGAATTTAATAAATCCCATTAAAGACAAAATGTCT a score=6381 s mm7.chr5_random 4094867 327 + 11523536 TGCTTTTATTATAATTCATAATCACAATA--CCCAGAACATTTTAGTCCTTTTAGTAATTTCTGTTCTATACA---ACACATGCTGCAGAGG-----------CCTAGGAAAAA----------GCAGAATTTCTACCCAGAAAAACAGTTCCCCTTTTATAGCAAAGTGATCATTCTAGCAGCCTTCAGTAGTGCTGTCCTAAGCTTGGGCTCTCCCCCGTGATTTATATATTAAAATAGTCATGTAAAATAAAAACAAGCCTTC--------------------GTAGTAAACACGAAAATAATTTAATATTGAACATCTTAGTTGGAGAAAATAACATACGGCATTGTTTCCTGCTT-TCTTAACAGAAGG s bosTau2.chr4 21765305 361 + 69556449 TGCTCTAAATATAATTTGAAATTTCAGCAGCCCCAAATAATTTCAGTTTCTTTAAGAATTTCTG---TATGCAGAGATACATGTTTTATTGGTTTGAAAGTATTCCAGGAAAAATCTTGCAATGGTAAAAGT--TACCCAGACTAGCAATTATATTTTAAAAGTTGGGTAATTGTT-TACTAGCATTTAATAAT-CTTTTCTAGATTTGATTGCTAT------ATATATATATTATACCAATTAAAGAAAATAAAAATCAATCTTAAAGGGTAAGCAAAGAGCTAGAGAATAGACATTCAAGTAGTTCAACAATAAACCAATTAATTTAAGAGAATAACATGCGGTATTACTTCCAATTTATCTTAACAGAAGG a score=27345 s mm7.chr5_random 4247948 1245 + 11523536 ATTTTTAATAATAAATAGCAATGTAATAAAATAATTCCATTTCTA-TGTCTTCCAAATAATAAAGAAACAGA-TGTTACCCTAAGAAGTCT------TTATATACATTGTTCATAGATATCATAATCATTAAACATTGATAGTT--TTATTTTACTATTAATTTTGGACTCTATACTAGCTCTTTGTCTAGAG--------CTATCCTTCTTAAACAATTTCATAATGCAGTTCTTACATAATATTGGTCtttaaattaaaaataactttaaaactatataattttagaaaaatattgaaatagattttataGTGGCAGC-------------------CTATTTTAAA--CTTGTAACTTAGAAAGTGGGAA--------------AAAGAAAGAAAGTACCCACTAGATAAAGGGTTACATAAAGAGTTAAAGTCTGTCTTTTTCTTCAAAGTAAATGCTTTAAGAATATAAGCAAATTTTACAAGAAAGTTGCCAAGTGTATCTCTACAAATGGTTGTTTTTGTGTCTGTGTCT----ATATGTCTGTGGCTGTGAATCTGTGTGATTGTAGAGAGTAGGGTCCTGAGTTTGTGCTTTTGTGTATGAAAAAAGAAGACA-GAGAAAATGAGAGGAAATTGAGGTTACAAATGAGGCAAGCTCTGGATATTTATAAATACGGGCAAATAGAAATCAATTTCTTGTGGGTTATGCAGCTGAAAGAGCACATACTC------------TGGGCATGCTGA-----------ATCCTGTAAATCATG----TTTCTGTTTTGGAGTCTAGTCTAACAAGTGTTCATGTGCATTACTTTTGCTTATGAGATGAATCAACGTGAAGAGCTCTATCCAAGTACCCAACTTTCTTAGTTTATCCCTTTAGGAATTTTGGTTTTTATAATTCGAATGAAGAGGTGCC--TTTAGGCCATAACTTTTCAGTATTCTGTGTTCTCAAAGCACAGA----AAAACTGGACTCTTCCAGAACTGTG-TTCTCTCCATTGTGCTGTTCAGACTCATGCTCTGGGTTCT-CACTTACTTTGGCAATTGGGTTTCTCTTTGAGTTGTCTTCACCTTCGCGACAGGCTGCAGCAAACTTGATCCATTCTCTTTTCTGCCTTCTGATGGAGTGCCACTTGATGGTACCATTTTTGGCGTTATGATCTCTTACCTTAAATAGGTAAAAT------ATTATGTCTGTTAACTATTACTTAGTATTGTCATTTCACTGGAGATTTTGGAGGAGGAGTAATTATGTCAGGAGGAGAAGATAGATAGTTA-----AGTGGAAAATTAGGAAATCTGATCATTTTAGTAT s bosTau2.chr24 25786681 1317 - 45245742 ATTTTCAGCAGTAAATGACAATGTAATAGAAGAAATTCAGTTTTAGTTTCTACCAAATAAGAAAAAAGTAAACTATCACTCTCATAAATCTAAATCTGTGTAGTTATCATTCATGCAT-TCAC--TCATTCAACAGTTAAAATGGATCATATTATTTTTAATGT------CTGTGCTAATATTGAAGCCAGTAGGGAACTCCTTACCCTCTTAAGGAGTTTCTCAATG---TTATTACATAACTTTGATCTTTTGATTAAATGTTTTTTTAAA--TGTAAAGTTTTTGAAGAAAGTTTTAAGAGGATTTTTGTAGGTAACAAGAGAGAGTTATCCAACTCTATTGTAGAAGTTTTTAATTCTGAAAATAGGAAGTTGTATTAGCATAAAAATCAAAGAGACCGCCCCAAGTAAC---TCTTATGGAAACCAGGGGTCTCTCTG-------AAATTAAAAATTATATGATTGTAAGCAA-TCTCATGGGGGAATGTCTGTGTAAATCtgtgtatatgtatgtatatatgtttgtatgtgtgAATCtgtgtgtggagatgtttccgtgtgtgtgtgta---tgtgcacatgtgcatgtgactgggtgtTTACTAAAGGAAAATAAGGGAAAATGAAGGGAAAAGAGAATGTGAAAGAGGGTACATTGTGAATGTTCATAGAAAGCTAAAAGTAGAAAGTCAATTCTAA--GATTATGAGACAGAAAGAGCACACACTTAAATGGTTCCTGTGAATGTGCTGAGCATTAAATTCATTGTTTAAATCACTATATTTTTTCATCTAGAGTTTAGGGTGACACATGATTGTGTATATTAATTTCACTAATGTTATGAGTCAGTGTTCAACTGTCTACCCAAGTGGATAAATTTCTTAATTTACACTTTTGATGGCTTCAATTTTTCTAATCTGAACAGCTATATTCTGTTCTGTATCATAACTTCTCAGTGAGATATGCTCATAAAATGTTTATTTCAAAGGTAGGTTCTTTTGAAAATTTAACTCTGTCCGTTCTGATTTTTGGTTTTTTGCTTTGGGTTTGATACTTACTTTGGCGATCGGGTTCCTCTTTGAGTTGTCCTCCCCTTCCCGGCAGGCTGCAGCAAACTTGATCCACTCGCGCTTTTGCCTCCTGAGGGAGTGCCACTTGATGGTGCCATTTTTAGTGTTATAATCCCTGACCTGGGGTGGGCAGGACAAAGTAATAGTATCTATTAACTTTTATTCATAATTCACGTTCCACTGGAGATTTTAGAGGTCAGGGCA--GTGTCGGAAAGAGAGGATGTTTAGTTGGAATTATTGGTAATTTTGATAATCCATTAATTTTAGCAT a score=21637 s mm7.chr5_random 4249739 709 + 11523536 GGCAAGGAAGTAACCGGTATTCCAGAAGCTATCTGGCAGGTGTCAATA--CAGTTATAACAAGATAATTCAAACACTGAAGCATTGAAGTTCAAAGCCAATGGCA--GAAAGAAAACTGTGATAGAGAGTTCAAAGTCAGCCAGCAGAAGAAGGAGCTAAT-GCTGATTCTTGAAGCTGTTAATTTGGCTCCTTGAAAGGTTCTGCCTGCATCTCTGGCT-AGGTGGAGCTGCTCTGTGGGTGGAGTCCTAGCTTTGAAGTTCATGGAGACAACCTCAGGGAGAGTG-ATCTTGGTGCAGGTGGAGCCAGCCAGCAAGAGACAAGGGCATCAAAGGCAAACTTGGCTGCTTGGCCCTTTCCTAAGGGTGGGGCCTGCTCAGGTTTCAGCTGCCATAATCCATTGTGCACACCACTGTTTGCTTAGGGTTAACTCC-AGGTAGAATTCTGGTTTTGTTTCTCACTTAGAGAAAAAAAAAATAGCTTTGTAAAGGGAGGTTACTAAATAAAACTTTAAGAACTCTATTCACCTTCAGATGATGACTTGTGCCTTGCAATCTGATCCCTGCTAGGTTACTGTGCAGGTATAGAATTCCCAGGAGACCAAAAGTC--TTGAAAGAGATTCTTGCCAATACCTACCTTTCCTTGGTAACAAC------CATTTAAGGCCTGCCCAGCTCAAGCTTGAGACTCAGGCTGGACCAGCTTCCTATAATTCTTT s bosTau2.scaffold6486 29867 692 + 45174 GGCAGGTGAGGGCCTGGAATGTGTGAGGCCCTCCGACAGGTATCGAGGAGCAGTTGTAAAGAGATAATTCAGGCAGCGAGGAATTGCAGTTCAAAGCCAGTGACACAGAGAGAAACCTGAGATTCCAAGTTCAAAGTC-----GCAGCAGCGAGAACAAATTGCCGTGCGTCTCAGCCGCGAGTATGGCTGGGTGCGCG-CTCCACCGGCTCCCGGGGTTCGGGTGGGGCCAGGCTGGAGGTGCGGCTC-AGCTTTGAAGTCCCCAGAAG-----GCTGGGGGCCTGCATCCCGGTG-GGGCGGGGCC------CAGGAGGACAGAGCATCAAAGAC------GCCTCCCTCCACGTTTGCTCAGGGCCGGGCTTTCTCCAGTTACAGCTGCC-TAAACCATTGTGTAACCCACTGTTTGCTTAGGTTTAACGCAGAGTTAGAATTCTGGTTTTGTTTCTCACTTAGG---AAAGAAAATCACTTTGTAGAGGGAGGTTACTAAATAAAACTTGGAGAACTGTATTCAGCCTCATAAGATGACTTTTGGCTTG-AATTTGATCCCTGGCGGGTGACTGAGAGGGTATAGAATTTCCAGGAGACTAGAAGCCATTTGAAAGACATTCCTCTTGAGTAGTAACCTGCCGTGGTAACCACAGAAGACATTT-CTGCCTGCCCAGCTCCAGGCAGAGTTCTGGG--GGCCCCACATCATGGCATTCCTT a score=16306 s mm7.chr5_random 4255152 327 + 11523536 ACGAAACTTCACAGGCTTCAAAAACCTGAACTGAGGAACTGAGTGTTTTAAGGTCCAAACAGGTTTGAGAACTCCTCTTGAGAAATGCCCATAATATTCAAACAAATAGCTGGATGTTTTGGAAAAGAATAACATTCTTTGCTCC-CAGCATTTTCT--CTAAACCTCAGCTGTCAACACCAGCTAAGATCCCACCTATCAGATGCCGCTGCTGCATGCCTTCCCCTCACCCGCCAGCCACTTAAAATACTTTGCTTCCTTTTAATCAGAATAAGCTCTGATTATCTCCTTTCAAACCAAGATTGATGTTTTCATAACGCTAACAGTCTG s bosTau2.scaffold6486 34157 322 + 45174 ACTAGGTTTCACAGGCTTCAAAAAACTGAACTCAAGGACTCCATATTTGAAG-TCTGCACACATTCTAAAACCCTTCTTGAAAA--GTCGGTAATATTGGAACAA-TGGCTG-ATGTTT-GGAAGAGAAGAGCATTCTTTACTCTGCAGCATTTTCTGCTAAAACCTCAGCTGTCAACACCGGCTGAGATCCTGCCTATCAGATGCCCTGGCCGCCTGACT-CCCCTCGCCCACCAGCCACTTAAAATACTTTGTTTCCTTTTAATCAGAATAAGCTCTGATTATCTCCCTTCAGAGCCAGGCCGCCGTTCT-ATCACGTTGACAGGCTG a score=4576 s mm7.chr5_random 4255714 445 + 11523536 gagagagaaacaggcaggca---ggcagacagacaga----cagacagacag--------------------acagacagacagacagacagaAAAAAAAGACAGATGGAGC------CTTTTGGCCAGAAGGGAATTATTTCTGGGCATCAGT------GGAAGCTCAGGGGGGTAGTAAGTTGGATTTTGTTTTC-------------TAAGCGGATAGAAATAAGAAAAATAATTCACGTGCTCTGAGGAACACAGGCAAACACCTGGGAAGCCAAATAAACTCAGAACTAGAAAGTGAAACACTTACCTAAGGCTCTGAGCTCAATCAGGCTTCATTAAAGTACTAAGTGGTTCCTCTTCCTAAGCTATTTAAAAAAAAAAAAAACAGGAGAAGAATTTATTCCAATTTTCTGTTTAAAAAAATCACTTCTCTCAAGTTATTTTCAAA------AAGGCTACAGTTTCTGAAAATTCTGATTACAGTAGAACAGAGGAA s bosTau2.scaffold6486 34510 478 + 45174 GGGACAGACTCAGGTAGACACCCAGGAGACAGACAGAGCCTCACACAGACAATGGGGGGATATTTCGCAGCTCCAGGGAGCACGGCGTGCTCCAAGAGAACACAAA-GGAGCAGTGCCTTTTTGCCCAGAAGCAACGCGTTTCTGGATGTTTGTTTTCGAGGAGGTGAGGGAGGCGGGCAAGCCAGAATTTGGCTTCCCCAGCTTCGCTCTGAGTTGGTGGGGATTTAAACGGCAGCTCACTCGCTCTGAGCAGCACAGGCCACTATC----AATCTGGAGACAGATGGCACGAGGCA--GGCTCCCTTACATGCGGCTCTT-GATCACTGGAGACCCACGGGGTGAAGAAGTGGTTTCTGTGCC---------GTAAACAGAAAGCAACAGGAGAATGCTGGCTTCCAG---TCCGCCTCAAAAAAACA-----GTCACATTGTTTTCAGAAGAAGCAAAGCTCTATTACCTGCACACTCTGGTTATCTGAGGACAGAAGAA a score=10104 s mm7.chr5_random 4256785 252 + 11523536 ATACTGTGTATGCGAAGTCCATGTCCCTGCAACTGACTTATTATTACCAGGCTTTTGTTAGAGTTTGCCACTGGAATGAGTGGTTTTCAAGATTTTTGTCACATCATTAATAACTTCACTCAAAAATCACACATCCTTATTTCAAACAAAGCATTCAGCCATGTAGTCAACATCTTTTTGACCTCACTTACAAACAA-CCCTGACAG----ACGAATGAATAATTGCTTAT--------TTCATGTCTTTACTT-TAAACTGCTTC s bosTau2.scaffold6486 35852 266 + 45174 ATATTATATTCCCCAAGGCTTTGTCTCGGCAGCTAACCTGTTAGTACAAAGCCTTGACGATAGTTTCCCATTGAAATGGGTGTTTTTCAAGATTTCTGTCACATCATTGATAACGTCTTTCAAAGACCACACATCTCTACTTCAAATAAACCACTCAGTCACGTAGCCAGCAGCCTATTGCCCTTAATTCTAAACAATCTTTGACAGTTCAGCAGAGGTAGGAGTATTTATGGACAGTACTCTTGTCTTTACTGACAAAGTACTTC a score=7370 s mm7.chr5_random 4257037 273 + 11523536 ATGGATATAGTTAATTATCTTTCCACAGCTGCACAAAGAAGGCACATGAAAAGACGCATCTATGTTTTT-TAATCATTTTATAGAAACAAATGTATAAAAGTGTGTGCACAGAGACAGA----TTTTTGCATATTACAATTATTGCTGAACAAAATGATTGGTTCATGTTTTCCCACAAGTTCCCTTAAGTGAGAGA-TCTGTGCAACTTTCTTCAAGCCAC-AAGCTTACATCTGAATGTTGAATTATTTGGT-------AGTTTATACTACAGAAAGATAATTGA s bosTau2.scaffold6486 36444 285 + 45174 ATATATGTTGCTAATTATCCTTCCATGGTTGCACAAGTAGGGCATATAAGAAGATGCATCTGTGTCTTTAAAATTATTTCATAAAAATGCACGTAGACAAGTATATGCATAGAGGCACGTGCTTTTTTGTACACTAT-CTAACTGCAAAACAGAGTGATTATCTCTCACCTTTGACACAGCCATCCTAAACGAGAGAGTCTACGCTGC-TACATCAAGACACTGATTTCACATCCAAAGGTCAGACTGGTTACTTCACCTAAATTTATAAACACTAAAGATAATTGA a score=26955 s mm7.chr5_random 4257523 1169 + 11523536 AAATACCAGTTAGAAAATGATAAGAA---------TCTTGAGCCAACTGACTGGGTTCAGCAGAGTGAGTTAGACCAACAGTGACTCAGACAGCATAGGAAACAAAGGGCATGTAAAACAGCCAGAACTCAAAAGC----------AAAATTACACAGAACTC--AATGAAAAACCCAAAGC---TATGTGACCTCCTCTCTCAT----CAAGCCAGGTGACCTGGAAAATCTTTGGGACGCTCCTGCCCTTC------------CCACACTGTAGCCTCAGAGTTTT-GTAAAT-------------------CTCTAAGGAGGGAA-CATCACTGCCCACGTGCACTGTGGCT-GACAGGTGTGCATGTTACTTCTGTGTAACT--ACATTTTCAG-------------GAGATTGT----AAGACTTTATCAGAAGATGTATACATGTG-CCCAGTTAGACTTTTGTTCCTGAATGTGAGCTATCATTCAGGTCACTG-CCTGTGTCAGCCTCACTTGGCTGGGGGTTG-----------GGGAGAG-----------AAGAAAGGGGA------AATCTTGGAAATCAGAGCTCTATCTATCTCAACAACAGTCAAGTCAGACTTCTTTC-AGAGTCCAGAAATTATTTCAGTGCTCTTTTTAAAA----TTACTGGAAGTACAGAAAGCTCATCTTTATAAAAATTATTATACCTTTAGTTTGCTTCCTGTAGGAAGGTCAGAGGGCCTAGATCCAATTAATGGCAAAAATCTTCTTCAGCCCACAGCATAATTTAGTAGTGACTATGTTTTATTGTTCTTCCAATGCCTTTGAGAAAAAAGCTACTGCTGC---TGTTATCTGAACCCATTTAGACTTTGACTCAGTGTATGGACTGAG-CCTTATATCTGAAACAACAAAATGTAGAAACTCTACAAATTATCTCACAATGGA--TTGGTCATGACAAATAAGCTGCCAAATCCACATTCCTGCTCTATAAGACAGAGGCAAGTGGCCAGCCCTGCCCCACAGTAAACAGCTAATTAGA--TGAATGCTTTGTGT---GAGG--GGAGAAAAGGAC--------AGTACCCGTCGGTCACTG-GTCCC--------CTCCAAGT-TGGCACTGCTTTTTGTCACTTAAGAGTTGAAGT-GGTTTTCCTGCCTTGAATGGTTGGAATTCTTGACGTAGAGAAGAGCTG----AAGTCATGAGTTGTGGATGACAGGAAAGAAAAGCTCCCCAGTCCAGTCAGCGACAGTCATCAACTCTATGGTCCTGTCTGGCTTGCACAACAA s bosTau2.scaffold6486 37277 1292 + 45174 AAACATTAATTAGACAATGATAAAAAAAAAAAAAACCTTGA----ACTCACGGTGTTCAGGAG---------GAACACTGGTGGCCCATCCAATAAGTGGAGCAAAACCCATGAAAAAGAGACAGAACTCAAAAACTAACAATGATAAAAGAAAGCAGAATCTGAAATAAACAAGCTGAGGCCCATGTGCGACTCCCTCCTGCTTAATCCACGCTATCTTATCTCAAAAGCCCACTGGGAGCCTTTGATTTTCTTAGCCTGCTTTCCATATTCTAGTTACTGAGTTTTTGTAAATGTTACATAAAGTATTTAGTCTCAGATGAAAAAAGTGCCACTGAAGATAGGCTTTTAGTTTTGTCAAGTGTTGGTCTGGCTTCTATGTGGCTTGACATTTTGGGAAAGAATCTGAATGAGATCATTTTAAAAACAACATTGGTTGAAATCTAAGTTTGACTCAATTAGATGTTTGTTCCTGAATGTGAGTGATCTTTGCGTTCGTTTTCCTGGATCATCCTCACCTGGTCGGGGGCTGTGGCGGGGGGCAGGAGAGTGACGGTGAGAGAGAAAGAGGAGGTGACAACCCTGAAAACCAAA-CTGTACTTATTTCAAGGACAGTAAAGTCAGAGTTCTTCCCATTGTCTAGAAATTATTTCAGTGTTTTTTTAAAAAAAAATTACTGGAAGTACAGAAAGCTCATCTTTATAAAAATTATTATACCTTTAGTTTGCTTCCTGCAGAAAGGTCAGAGGGCCTACATCCAATTAATGGTGAGAATCTACTTCAGTCCAGGACATAATTCAGTGGTGACTACA-CTTACTATTCTGAC----CGTCTGAGACAAAAGCCTCAGCCGTGTATGTCATCCAGGCCCATTCACAACGAGACTCCTCACACGAACTAAACCCCCATACGTGAAACAA------ACAGAAATTCTACAGTTTCTCCTACAGTGAAATTTTGTTATCACAAGCAAGCTGCAGTGGTCTGGTCGATAAGCCAACAGACCAAACAGAGTGGCCCCCAAGTTCCTACCATTGATGAGTCATTAAAATCACACACTTCATACCCGGAGGACGAAAAGAAGGACATCATGCAAATACCTCCCTTTCTCTGCGTTCCGAGGGCAGCTTTGTGTGTGTCTTTGTTGCTTGTAGCTTAGGAGTTGAAGTGGGTTTTCCTGCCTGGAATGGTTGGAATTCTTGCAGTGGTGAGAGGCGGGGCAGAGCCAGGCCTCACCGATGCTCCGACAG--AAGCACCGCAGAAC--TCAGCAACCACCGGCCGCTCTCCCGCCCCCTCCAGCGCACACAGGAA a score=4761 s mm7.chr5_random 4259566 636 + 11523536 CTGGCAAGAGGTATAGCTTAGCAGATCTCTCAAGGACAAAGTCTGTATGATGGAGTAGAAGTCCCAGCCCAAGACAACCCTAGAACACACTTAAACAACACTTGCTGGATAATTGATGGAGTGAATAAATGTCAGATGATACAATAAAGGGCACACTTCCCTTCC---AGGCTGAAAGATGTAGGTCTCCATTCCACTGTAATGAGATTGCAAGGGAC-AGTTATTAATTCTTTACAGCATG-GTCAGGGTGAAGGCATGGCCTCCA-AGGAACAT-AATTAATATGCAAGTGAGTTTATATCATTCTCCCATCA-GGAAACCTGTCACTAGTACACGGTGTTCATCTTTCTTGATTATTCACTTGGGTGGTAGTCTGCAAATTAAGAGATTGTTCAACCCTGGAAGGAGGATCACCA-----CAGATAAGGAGTT-----TGGGTACAAGAAGCC--TGGAGCACTTTCTCACGGTC--ATGCCGCAAAAACCTGAAATGGGGAAAATTAACAAAGGGAATGAAGAGGGTGGGCAAAAAGACATACTGCACGTGCTCCCAACCCATCTGATCATTCTCAAGGATTTTAAGCTCAAGG-ACTACACTGGCCCACAGCCCTACAGACCTCATCCTACAAATTTTATTTCCAGTGCCCATC s bosTau2.scaffold6486 39897 579 + 45174 CTGGCAGGCAGCATGGCCCACCAGATCCTTTAGGGTC-------GGGTGGTGTCACAGA-GACCTAGCCCAGCGCAGAC--AGGGC-CACC--ATCAATACTCACTGAATGGCTGA----GTCAGTAGACGTCCCGTACTCTAACAAAGGACTTATTTCCCTTCCCACACCGTGAAAAATGCAGGCCTTTATTCCACTGTAATCGGGAGAAGAGGCACCAGAAATCAATGCTTTCAGGTTTTTGCCATGTTACAGACACGGTGTCTATATGAACATTAATTCACATATGAGTTCCTTTACATAATACTCCCATCAAGGAAACCCATCAGTATT----TGAGTCCACCATCA--GATT--TAACTCCAGGGCCTGCCTGAAATTTTAAAACTTATT--ACT-----AGTAAGCCCACTAGTAACCAAGTTTGGGGTGCGGCGTGGGTACAAGGCATCAGCGAAACAC-----CCAGGTCCAAGGGTGCAGAGAGGTGAGGTGGGCAGAA---ACAGAGTCA--GAAGAGCTCCGCCCA----------CGCACGTGTGACCCACGCTT-------GTCTCAGGGCTGTAGACCCCGGGGGACTGTGAGGGCTCCCTGCC---------------------TTCTATCCCCAAAGACCCTC a score=13672 s mm7.chr5_random 4260365 517 + 11523536 TTCACCTCCCTACAGCACCC-TTTGTCTTATGAACAGAGGGATGTG---CAGTCTTGCCCAAGAAAGAAAAGACTCCTCTTAGCCTCAAAATAGAAATTCAGCAGGAGAGGTATTTTGGTAAAAATAAAGGGTCAGCTGGAAGAATGCACAACCCAAGCTGTACTTTCAACAAAGAAGCTGGCCTGATTGCCCGAAGCACCTGTGGGGTGTATTAT-TCTGCGCTAGCTAAAAGAGTAAACAATGCTTTCAAACTGGAGTGCATCAAGTCTAGAAGGACTGCATGCATGTGCACATCACACCCTGTCCCTTTGCTTCACA---CTCCACAGAGTTCAAATCAACGTTCCAACGA-ACGTCACTGTTAATTGTAAGCTCATGATGAACATTCTTAATTGTAATACTCTTATGTACTCAAGGAAAGCCAAATTTG------ATAAATCATATTCAGCCCATCCAGTGGC----------TATCTGCACAGACACAAAGAACACTGGT-AGCCCTAAGTAAATGCAAATGAGGTGTTCTGTTTTGA s bosTau2.scaffold6486 40642 535 + 45174 GTCGTCTTTCTAAAGCACGCGTCTGATTTCAGAACTGAGGGGTGAGAAACATTCCTCTCGGAGACAGAAAAGGTACTTCTTAATCTCAAAATATATGTTCAGCAAGAGGAATATTTTTATAAAAATAAAGGATAACCTGTAAGAACATACACTAGACGCTGTAACTTCAACAATGGAATCTACCCTATCGTTTGAAGCATCAGCAGTACATATTATATCTGCATTAGTGACAATGATAAATAGTGTTTTAGGATTTAAACGCATCAATTATAGCGTTCCTGGAT--ATTCAGATGTCTTTTCCTGTTCCATTTTTACACAGTTCCTCTCTGAATTCAAATCAACGCTCCGAAAACATTTTTTCATTCACTGTAAATTCACGGGGGCCATTCTTAGTTATAGCATTCTTGTGAAAACAAGGAAAACCAAATCTGCCTTGAGCAAGATGTCTTTATCACAGCAAATGACACGGTTTTATTCTGTACCCAGATAAAAAGAACACCGGCGAGATTAGAGTGAAAGTAAGTG------TCAGTCTTGA a score=5935 s mm7.chr5_random 4261246 427 + 11523536 AAGTTTTTCTTCACTGGTTTGTCACCAACAGCCAAGGCTCTGCCAGCAACCCAATCATTTATAT-GAGCATCATTATTT----------ATTCCTCCAGTAAAATA-GCCACTAACATTCTAATACAAATAGCTCTTAGGAAATCACTTTTCAACAGGTTACAAGAAAGAACTTTTTTTTTAAGTTATAAGG----GGATCAAAGGCATCCAAGCTTCGCAGCATACAGCCTCGGGGAGAGTTGCTTCCCTACCACTTTCCCTGAACAT----------------AGAGCC--------------ACAGATGAGAACAGAG---------------CA---TCAGCACAGGCGCTGAACATCTTGTTCGCAAACTGAACAGTAAAACAAATTC--------CCAGAACGCCAGCAGCCGTAA-CCCTAAATTCATTTTTAAAATAA-----TGTGCTAACACAAGTAAAAGAACCTACGT--TGGCGCCCTCTGGTGCCCACAAAGA s bosTau2.scaffold6486 41183 493 + 45174 AAAATCTTCTGAACTGGCTGGTCACCGACAGCTA-TGTTCCATCAGCAATTCAATTCTTTGCTTCAAACGTTATTCTTCCTTTGCACCCATTCCTCTAGTGAAATAAGCCACTAACCTTGTGCTGTGAGTTACTCTTAGTAACTCACTCTCCTGCAGAAGGAAGAGAAGAACAGAACAGAAAAACAGAGAGGCTGTGGGGCAAAGCCACGGAAATTCCACCCCAGACACCCTGTGTGTTACCCCCACCCCCGCCACCT--CGTGAAAATCCACAATTTGTTGGAAAGAGTCTTTCTACCACAACAACAGATGAGAATGGAGATGGGGGAAAAAAAACACACTAAATTCAGTTTTTGACTCTCTGATCTACTATTTGAAATACTGAACAAAATCTATTGAAACTAGGATGCCAGCAGCTATGATTCCCAAATTCATTTTTCAGATGAGATCGTGTTTT-----------AAGGACCTGCACCATAGCGCCATCTGGTGCTGACACAGA a score=23942 s mm7.chr5_random 4610866 709 + 11523536 CTCAAAATTATATAGAAAAGCCCACAGATTAATTTTTAAAATATGAGCGctctttctctctttctttctctttctctctctctctcCGTTTTTCAAACATTGTTTAGCATTTTCTCTTTGTCTTTTGTGTTTGCATACTACTTTGTCAATAGTATGCACACAATTTTAATGGCAGTGACTATTATGCTCTCTGTGGAAATTCAAATTAAACATGGGCTTAGGACCAGTGGAGTTCATCACAATGCTTTTCTTTTCTTATAAAATCATTGCCCCATTAGTGCACAGATTAATATTCT------AATTCAAGAGAGTGTTAACATGTGCAATTGATAGCATTCTGCTGTGTGTTAAATAACACTTCTTAATATTGGTGATACACTGCTCAAATAAC--TGCAT-TTATGTGATCTCACTATGGAGCCACCCACTTACAAGGAGCAGTTGAAATTTATGTGTGGTTGCATAG--AGTGAATAATACAGCATCTCAATTCACAGTCATAATTGCTGTTTGATATTGCTTTCTGGGACTTCATTACTCACACTCACTGCAAGCTAGTGCTTTTTCTTTTGTATTGTTTTTTT-------TTTTTTACTCCTTACAAAGATCATTTATTGTG--ACATGAACG--TAGGA-------TTAATTTTAAGAAATGTATGGGTTTGAGATTATG--TGAATTTTAAACTTT-TATAAATTCAAGTAGAGTGGGTT-TATTAGAAATAATTT s bosTau2.scaffold1023 16757 722 + 296464 CTGGGAAATATGCTGAAAATTCCACACACAGATTTTGACAA-ATGAGGTCTGTTTGCCTGTTTTTATTGTAT--------------AGATGTCAAAATTTTGTTTCACATTTGTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTACTACTTTGTCAAAATGATACACATAATTTTAAAAGCAGTAGAGATTAAATTTTCTGTGGAGAGTAAAAATCAGCATGGTTTTAAGACCAAAGGAGTTTTTCAAAGTATTCACTTTTTCTTAGAAAGTAATTGCTCCATTAGTACACAGATTATTATTCTAAATCCAATTTATGAGAGTGTTACCACGTGCCAGTTATAGCATTCTGCAATACATTAAGTAATA---CTTAATATCACTGATGAATTGCTTAAATATCTTTGCACATTATGCGGTCTCACTATGGAACCACCCACTAACAAATAGCAGTTAAAATATATACATGGTTGCATAGAAAGTGAATAATGTGGCATCTCAATTTATGGTTTTAACTAGGATCTGATTTTCTCTCCTAAAGGTCCATTATGTCAGTTCATTGCTTGTAGGT--TTTTTGTTTTTTTTTGCCTTCTTTGTCATGTTTTTCCCCCCTTAAATAGATCATTTATAGTGACACATGAACACTTACCACTGGCTTTTAATCTTTTGGAATGTATGGCTTTCAGGTTCTGGAGAAACTTAAAGCTTTATATAAAAATAAATGAAGTGGATTCTTTTTGaattaatct a score=9426 s mm7.chr5_random 4668990 327 + 11523536 CTGTTGTGTTATTTTGACTATAACAACAATTTGTTCTCCATAAACACATCCTTGATTATTTATAGAAACCTAATCCCTCAAATGAAATCTTCTAAGCATGAGCCTCATTAATTT-GTTCTTTGCCTTTAGGTTTATATTAATTTCATCAAATATTTATACATTCTCAACTAACAACATAATTTGTCTTTCATGTAATCAGGTCTTAGTCCTCGTTGTAATTTTACACATTATACCAAC---AATTGTTAGGTTTATTGGTT------GTTTTGGACATTCAAGTATATAATCtttttttatttgatattttctttatttaaatttcaattgctatcc s bosTau2.scaffold2874 18417 308 - 97930 CTCTTTTGTT-TTCTGACCATATTAA-AACTTTTTTTCAATAAAC-------TGATTATTTATACAAATCTAATTCCTAGAACAAACTGTTATAGGCATAATCTTCATCAATTTCTTTCTTAGCCTCTGGGTTCATAATAATTTCACTGAGACTTTACTGAATCTAAACTAACAACACAATTTGTCTTTCACATAATAAGGTCCTAGTCCTCTTTATGTCTCTATAGATAAGACCAGCCATACTTTTGAGGCTAAATTACTGACACAGTTTGAGTGATTAAAATAGATA--------------------TGCTTTATTAAAATTTATAGTGAGCTCA a score=1166 s mm7.chr5_random 4669411 74 + 11523536 atactggggcatacaatcttagcaagaccaagaacctctcctcctattgatgGTCCAGTATCTAATAGGAGCTA s bosTau2.scaffold2874 18765 63 - 97930 ATACTTTAAATTATAAGATTACTAAAGTCAAGATTTACT-----------TAGCCCAATATTTATTAAGGGCTA a score=6024 s mm7.chr5_random 4669614 371 + 11523536 AAGAAATGCTCATTACAGTTTGTATGACTCCTTATGAAA-TCAGTGTTATCTATTTCAAAGGCATTGATGTTGTAAAAAGGCATTTTAATGAAAACTTTGAAAAATACAGAAAATTGTATAATTCTTCTGAATTTATTATTAGAAATGAGTGCCTTACCCATTGCTTGAGGAGAAATTGACTGCATTTGTACACACTAAAGCAGAAAAACATGAAAACCAATTCTGAGC----------------------ATGTTCCAGTTTATGAGACTAAACTA--------------ATGTTGAACCCTGTGAATTCTTACAGAAATTCATGGACACTTAAATGTTAGAGAACATCATTCTTGA----------CTGCAACAAAAAGTCTTCTT-----ACAAGAAAAATCTATAAGGCATATTGTTTT s bosTau2.scaffold2874 18894 404 - 97930 AAAAAATGCTTA-TATAGTATATATCTTTTCTTATTAAAGTAAATTTTATCTATTTATAAGATATT-AGGCTGT-GGAATGCATTTC-ATGAAGGTGTGTGTGGAGTTAATACATTTTAACATTCTGCTAA----ATTACTATGAATGAGTGTTTTAACT-TTGCCTGTGGAAAATTATATTACATCTGTACATACTTATGTAGAAATACACAGAAA-GAATACTGAGtttatatatcatatataatttcattatttttatatatGAGACTAAGTTGATAACCAGAAGAATATGTTGAAGTATGTAAAACACTATA-AAGCTCA--------CAAATTTTAGTGATTATCATTTATAGCCACCTACTTCTGCACCATATAGTGTGCTTTGGGAAAAAAAAAAGTCTGTCAAGTAAGTTATTTT a score=10985 s mm7.chr5_random 4726643 612 + 11523536 TGTGGTTGATTTCTTAAAGCTCTCCA-----TTTCCCGTCAAAGATCGATAACCTCACAAGCTTGGTGATCACTCACCACCCTGTCCTTGCCTTTTCTTTGCTTTCTGAAGCTCTTACCACCCTGGACTCACACACACACACACAAACAAAAAACAGCAAACATTGTCAGGGTGATGAGTTGGGAGCTTTTCATGGATACCACATTAAACGCAAGAGAGTTATTAGATGACCACAGAGATAGAGTAGATCTAATTAGCAATAAGACTGCAGGGCCATAAATAAGCCCCGTGCCTCTTCTCGCCAGCGGGGAGCATCACTCAGTCTGATGCCCGGGACACGTACAGATTTACAAACCACTCTCTGCTCCATCGGGTGCATGGGTGCCTGGGTTTAGTGGCAGTAGCCTAACGCAGAGAATCCTGCCCTTTACCAGTCACC----CTG------AAATAAGATCATTGCTCCACTTAATGGGGAACAATGGTAGTTTGAAAAGCAAA---------------GCAGCTTGCCCAC-----------TTAGGCTGGCTTCTCTGTGTCACCAAGA--CACACCTG--GCTATATTTGTTTCCCTTTTTATTAATGTGAATTTAACTGTTTTATCAAAGCCGCACATGTTCACTGTTAAAA s bosTau2.chr17 25135559 611 + 45915461 TGTAGTTAATTTCTTACATCTTTTCAATTCACTTCCCAACAAAGATCAACAACCTAATAAATAGAATAGTGACTCATCATCTTGT--TGATCTCTTGCTTGTTTGGACAAGGTCTGTTATTCCAGCTCCCCCACCTGCACCCTTAAT----GAATACCAAACA----------GGCCAGTTC--------------ATACCACATTAAAC--AGAAGAGCCATTAGATGACCACGGAAATAC--TCTATCTCATTAGTGATAATGCTGCATCATGATAAATCACCTCTGTGCTTCTTTTAACAAGTGGG-AGCATCAGTCAATTTGGCACCTGCTTTGCAAGCAAATTTATAAACCACTCTGTTTTTGA--AGGTACATCAGCCCTCGGGCTTGATGGTA-TAGCATGGTATGGAGAATTAT----TTTAGCAGCCATAAAGGCTGCTAAGAAAATAAAAATTTTCTCCCTCCCAAGGGGAAACAGAGAAATGTCATACCACAGAGCCCACAGGAGACTGGCAGTCTGCTCATGCCTTTCATAGTTAGGCTGTCTTTCGGATGACATTAAGATGCAAACCCAATGCATGGTGTGTTTACTTTTTT----ATGTGAATTAAAAAATCTTATCAAGGTTATATAACCTCATTGTTAAAA a score=13807 s mm7.chr5_random 4730457 495 + 11523536 AAGAGAGAGGTGCTCAGAACTCTTTTCTATCTGTCTAGCCTC--------AGCAGACGTTTCCTCTGGAC-----------TCTCTGGGTCTCCCAGCATCCTCTGCTCTCAGGGACTCCGGCTGCCTTTATTCCAGCCTGTCTGGC-CAGTCTCCCAACACCACCACAGCAAAGTCTTGGTTTTGCATAACTAATTTCAAATCTTACTTATCATCTAGTTTTGGAATTACGCAGAGGAGTGACAGCTGTTTAATTAACTCCTTAAGCTGATTAGACAGTCCTACTGAAGT-CCCTCAAGAAGGAATTTCTGGCTTAGGGGAGAACCCAGGGGCACCATGTCACTGCCGTGGGCTGAGCTTAGAGAGCTTGCTAAACTGCTAGCTCATGCACTTCTGGGGTCCTCGCGGGTGTGGTCAAGCATGtatttttatttttatttttatttACTGTATCAGCTGCTACAGGAGAAGCAAAATGAAGGTAATAAAAGGAAC---CTTGACTCTGCCAAGAAAGC s bosTau2.chr17 25142767 493 + 45915461 AAAAGGGAAGTTC---GAACTCTATACT---TGTCCGCACTCCCCAGCGGGGTAAGCATTTTCCCAGGACCCCAGTTCATCTCTCTGGGTCACCCCATGACCCCTACTGGCTGTGAATAAGGTCCCTTTTATTCTAGGCCATGAGAAGAAATCCCCTGGTATCACAAAAGGACTG-CTTATTTTTGCATCACTAATTTCAAATCTCATTTAGCATCAAGATTCAGAATTAAGAAACTAAGTGACAGCTGTTTAATTAACTCCTTAAGCTGATTAGACAGCATTACTGAAATCCCCTCAAGGGGGAATGCATAGCTATATGGAGAACGCAGG---ACCATGCTGCCGCCACTGTTTAAATTTTGAAAGA-TGCTAAAAT--TGGC-CAAGCGTTCTTGACATCCCCAAGGATGTGGTCAAACAGA------------GATTTTTATTTATTACATTAAGTGCTACAGAACACTCCAAATGATAACAATAACATGAACTTATTTATATCTGCTAAGCAAAC a score=16189 s mm7.chr5_random 4836331 381 + 11523536 CAGAGTGGCCAGCTGATGGTCACTTGACACTCTGGAGAGCCTACCTAAGAGAGAGAGAAAGAATACTATCTATCACCTCCCACACCCCGTAGCTCCGTCTCTCAGGGTAACTTATTAAATTGGCAGTGTGGCTTCTATTCATCAGTTTCTTTGAACTTGGTTCATGCCAGGTCACCTCTGAGAGAGATGGAACCATTTTGCTGTGCCCAGAAAATCAACATCTGGTACAGAGCCACTGCTCAGTAAATAGCACCTGAATGAACAGAAAATTAGATTTCTAAGCCTGTTGGGGGAGGGTCAGT-CCCAGGCAGGCATGAAATCCC-AAGAAAATGGTCGCCTTGTTGAAGCCAGG-TAGGTGAATGGCTGTTCTGGGCTTTGGTT s bosTau2.chr24 42193835 363 + 45245742 CAGAGTGTCCGGCTGATGGTAGCCTGGCTCTC--------ATGCCCGAGAGAGAGAGAGGGCAT-CGATCTGTCAACCCACACAGCCCACAGCTGTATTTCTCAAAGCAATTCACTAAATTGACATTGTGGCTTTTATTTATCACTTTCTTTGAACTTGGTTCATGCCAGCTCACCCCCAAGAGAGATGGGGCCATTTTACAGTGCTCACAGAATC-ACGTCTGGTGCAGAGCCA--------TAAATATCACTCGAAGGAAT-GGAAATTAGACTT-TGAGCCTGCTAGAGAAGGCTGTGCACCCAGACAGGAATGAATTCCCAAAGAAAATGGCCACCTTGAGAGGGACAGACTTGGGGAGCAGCTG-GCTGGGCCTGGGTT a score=2107 s mm7.chr5_random 4939458 108 + 11523536 AGTGGGTAATTCTTCCTTG---TCATTTTATTTCTCTTTGTTCTTTTACATGTGTTTGATATTTAATTTTATTTCTGTTATTTTTTTGTGAAGATTTTGCTTTAATTATGC s bosTau2.scaffold1513 194262 111 + 234231 AGTGGATGTATTTGTCTTGAAGTCATTTTATTCTTCTATACTGTTTTATTAAAGATTGGTATGTAAGTATGCTTCTTGGAATGCAGTGTGAAATGTTGGTCTGAGTTAAGT a score=26510 s mm7.chr5_random 4939566 1055 + 11523536 AGGTATATAAGAATACAGACTATCAAATATTTATTGTGGACACACTGTTTTAAAATACCTTTCTTTGTTCATACCACTAAGAGAATAATGCTTTGTTCCAATCCTAAAGTGACCTCAATGCATGTTTATTCTT---TTACAGCTTTCTCAATTATCAATTAACAATTAGCAATGAAAAAAAATTCTATGAGCCTCTGGTTATCT------TCA---------CTGAAATCGG----AGATTAGAATTGGCATGAGCTAAACTTCTGGAACCTTTACAAAAACCATTGAAATCAGGCCACTCAAG---TCACTCAACGATGAAATAGGATTTACAGGAAATTATTTCTTTTACTTTATTAATAGCAGTGTTAAATTGTTCAGCTGGGCCTCATGTCAAAAGAAAGTTTTTGTTTCTAAAGGGAATAAAAGGTATACAGAAAAAGTTGATCGGGCAGAACTAGAAGAAATAAGATTTTGTAAAATAAGTGGATTTTAATTGCATCAATCGCT--GGCATTGTTTTTCCCTCAAGTGTTCTAAGTCAATTCTTCCTATGCCTCATTGCATAATACCAAGGCTACTTATAGATCTCATCTAGAATATTCAATTCTTAACTCCTTTCCC---TAAACTAGGAAGCTTTTATATTCTACTTGGCTTTTGAGATTAATCAATGCATTTTATTAGCTTCTGCA-GGTCTCTGAAAAATGTTATAGACTTATA---GAGCTCAGGTGAAAGATTTTTAGTTCATTCTCTGAAATCAATTATGTATTGAGAAAATTTTAGTTTTAAA-CTGAAGTGTATGCCAATGAGAAACTGCATGGTGGTTTGTCGTTACAGTGTAGAAGATTAA-AGACAATAGTCTTAGTAATTTACAA-----AGCTCTCCTCACGTCTCCTTTGAATAATTATTT-------TTAGATTA--CACACAAAGCTCAATAGGATGA--------TTTTATCTAATT-TATTAATAAACATCCTCAGTTTAGATTA-------------AATAGGT-----------GAAAATGTTTTGAGAATCTGATATTT-----TGAACTCAAATTTTAAAACCAAGTCAGAAGAAAACTTAAAAATTCTTATTTAAAGCAAAGGAAGAATTATT s bosTau2.scaffold1513 195231 1094 + 234231 aaGGATATCAGAATATAAAATACAAAATTTGTAT--------CAAAGCAATAAACTAATTTT-----TTCATGTTACTAAAAGAAGAATGCTTT-----AATTTCAAAATATTATATTTTCAGCTTTATCATTACTTTATCATTTTCTCAAATATCAATCCACAATTAACAATGGGAAGAGGT---GAAAGAATCTGGTTTTCTGACTAATCATGTAAAAATCTAAAAAGAGCTCAAGATTAGAACAGCCATAAGCTACACTATTGGAACTCTTACAAAAGCTATAGAAATCACTCAACACAAGAATTCACTCAACGATGAAATAACATTTAGAGGAAATTATTTATTTTACTTTATTAATGTTGGTATTAAAATGTTCAGCTGGGC-----------------TTTTTGTTTCTTAAGGGGA-AAAAGGTAGGCAG--AAAGTTGATCAAGCAACACAATAAGAAATAAGATTTTGTAAAATAAGTAGATTTTAATTGCATCAGGTGCTAAAGTGTTATTTTTCCCTCAAGTATTCTAAGCCAATTTTTCATATGCATCATTGCATAGCACCAATGTTGCTTATTGTTCCCCACTTAGATTCTTGTTTCTAATCAAGTTTCTTGAATAAATTAGTAAGTCTATATATTTTACCTGCCTTTCAAGATTATTTTTTTTAGTTTAGCAACTAAATTACTGTTTCTTAAAAGTATTATAGTATTACATATGAATAATTCTGTGAATTTTCTGATTTGTTCTTTAGTAATATTTTTGCATTGTGGGAAATATAACATCAAGTTTGAAGTTTATACCTA-GATAAATT-----ATAATACATATTTTTGATGCAAAATACTAAGAGACATGAATCTATTTAGTTTTCAAGGAAGAGATGCCTTTCCATGCCATTTTGAAAAGTATTTATCTTTATCAAACTAGGTAAAGAAATATTAACGtaattatatttttgttttaattaattaaattaaagaacatatttaagaaaaattattaaGAGAATAATAATAGGCTTGGTTTAAAGAAAGATATTATCAAATGCTAAAATCTCAGTACAATTTCAATTTTTAAGA--ATCTCAACAAAATATTTAAAAATTCCTGTTTAAACCAAGTAATAAACTATT a score=37768 s mm7.chr5_random 4944759 1334 + 11523536 aaggagttagttccctccTTTAGTTATTCAGTGATAAGTCTCAAATATTGAAAACATTTATACTCTGTTCAAAGT-CTATCTCGAGTTACAGCCCAACTATATAAGATAATAACATGACTTAGTTAACACCTGCAAAGAAAGTGTTTTCCTGTCACTAAGAAATTA--TGTGTACAATATTTGGCATTTTGTTAACATTCTCATATATTCCCCCAAGAAATTTATGATATGAAGGCACAAAATCCTGTTTTCTCTATTCATACATTCTTTAAGCCCTCTGAAATAAGAAAAATGTC---------TTTTCTTTATTGGTGTGGTTGTTCTAAGGTTAGAATTAAAATAGAGCCTACACAGTTTTCTGCACAATCTGGCAAATTTCTGTCTGCTTA-TACAAAT-------AGCTTTTCTAAAAGGTTAAAAAAAAAAGCTTGATTTCTGGAAAGTGATTGCAGAAAGTCAATACTGCAGTGAACGATGTTCATCTCATCTTGTTAACTGAAACCATTGGCTAGTTTGAAGGACTACTGTATACACAATTAGGCAAGCATTCTACACTGTTCTCCCTTATTAACTAGTTTTGAGATATTCTGTTGGACAGAAAATTGATAAGCATGGTAAACATGCTCCAGTTTTCTAATTAGCTCAGGTAGTGCAATTACAGATGCTCAATATCCAGTTAAAAAGCAGAGGTGCTTTCAACATCATCCAAATACTAGAAACAAGAGAGAAGCAC-TGGACAGTTCACATGATTGGTCATCTGAAAGAAAACTGATTTCTTGTTAATCTTGACTTGTGTTGGAAGAAACTCAATTTA-GGAAAGAAAGACAGGAGACAAAAC-CTTCCCAGGTTTGTATTTTTCTGTTTTGAACATCAAAAGTGGATTTAAGAAGGCATCTTCTAGATTCCTTTTTTAAAATCTCAC----------------AAAATATTTCTTTAAATAAACCAACTTCCCCCATGCCAGCACAGCTTCTTT--TCCTTCAGTCTCTCTCAACATGCTACAGAGTTTATCAGCAGGCTTCAAGAATAGTGTATATAATTTTACAGGATGCTATGAAATTTCTACAAGTACAAACATG-CAGTGGCTT---TCCTATTCAATT----TATCAATCTTTCTGGAATATTTTTTCTTCTA-------CTGCATTTTACTAATTCTTATATAAAAA--TCATATTATTCCTCCCA-----CCTTTTAGTTATTGAACTAGTACATT-TAAAGAACTATGTTTTGCTAGGGGTGATAGTAGTATGTT----------TGGAAAGGTTTTGTTTTTATGATGAATGGTAGATTTTGTTCTTTGAAGAATAGTCAGGCTTTTATGGAAAGTTACAGCTG--CTTTTCAGTG-TTCATTTGTCCTTCC s bosTau2.scaffold1513 203055 1351 + 234231 AAGGTATTAATGCCATCCCTTCTCTTTTTAATGATAGGTTCTGACCACTGAAA-TATGTAGTCtatattaaaaatatttttttaaGTTATGGAATTAATGTGCAGGATAATGGCATAGCTTATTTAAAGTTTTCAAAGGGGATACATTTCTGTCACTG-TATATTACTTTTGTACAATACCTAGCATTTT---AACATCCTAGTATATCCGCT------GTTCATGATATGAATACATAAAGTTCTATTTTCTGTATTCACATATTCTTAAAGCACTCTGAAA--AGAAAAATAGCATGCTAAAATTGTTTTGTTCTTTGTGGCACTACTCAGGTTTAGGTTACACCCAAATCTTCATAATTTCCCCCATGGTTTGACAA--TTCTCTCTGCTTAGTGCAAACCCATTAAAGCTTCTCTAAAAG-------AGAAAGGCTAGATTTGGGAAAGAAGAAGGCTGCAAAG-GACAGTGAAATGAACAGTGCTAACCTCAGCTTGTTAATTGAGGTCATTGGTTAGCTTTAGAGAATCCTGTATGCACAATTAAGCAAGCATTTCACACGGGTCTTCCTCATGAACTGGTTTTGAGCTATTCGGCTGAACAGACAATTGATAGGCATGGTAAACATGCTCTAGTTGCCTAATTAGCTCAGGTAGTACAATTACTGGTGTTCAATATCTATCAACAAAGCAAAGGTGCTTTAAATGTCATACAAACACTGGGAATAAAAATAAAGCACAAAGGGATTTCACACAACCAGCCATCTGAATGAAAGTCGACTTCTTGCTAATCCTGTCTTGTAATGCAGAAAGCTCAATTTAGGGAAAGAAAGACAAAAACAAAAACACTTATTTGATTTAAAATTGCCATTTCTGAGAGTTAGAGAGTCATTTGAGAGAATGTTTATAAG-----CTTTATAAAACCTCACATTAATTTGGAATAATAAAATAGTTGGTTAAATAAGTCAAACTAAATGATACTAGCAGAAACTCTCTCATTCTGTAGTCTCCCTCCCCATACAGAATGAGCCACCAGTAGGCTTAAGG--------ATTCTATCTTACAGAATGC------AGTACTGTAAGTGAAAACATGTCAGTATATTAGACTGAGTTAAATTCAGGTATAAAT-TTTCAGGATGTTTTTGTCTTCTAGTATCATTTTCATTTTGCAAGTTCTTATATATAGGCTTCCTATTATTCCTACCATTTATCCTTTTGATTACTGAACTAGTACTTTATAAGCAACCGCTTTGTGCTAGGACT-ATGGAAGCATATTCTTGAAATGATTGAAATGCTTTGCACACAGAATG---------------TCTCAGGGTAGTGAACAGACTGTAATTGATAGTC-CAGATGGACTTTTCAGCATTTCATCCCCACTTCC a score=11051 s mm7.chr5_random 4998070 502 + 11523536 ATGACAGAACAAACTGCT-CTGGAACTGGCTTGTGGAATTTTGTTTTGCTTTATTTTGGGAGGAAGTAAGGTAGAAAACATCGCACCCA-GCCCACATCTCAACAAGCCACAGAGCTCTGCC-CTTCTTCCTTCT-GCTAGGCTGCTTCCTCCATTCCTATTTTTATTGGCCTGTAGACTCTGCTCCCATTAAACAAGCAAGACTAGATAGCAAGGCTAATTTACCTAAGGCAATGCAAATGAACCCACCTAGGAAAACAAATGCTCCCAGTCTGTGCTGTTTTCAAAGGAAAACAAAGGAAAGTACAGTCAGAGACCCAGAGAGAGGGCCATCCTGAGCCTGGAGAAGCTTCA------------AGGTTGTGCAAGCGCAGGAAACCTGC---------CATCAGAACACAGACAGGTAGGGCAGCTTAGAC---TGTGTCAGAC--GCCCAAGTTCAAATCCAGACTTAGTGGATGATGTCTCCTAAGCCACACTATCCT-----AAAGTCTACTTCTTCAGCTGTAAAATAAA s bosTau2.chr6 21853985 504 - 69624268 ataatagaacaaaCTGTGATTGGAATCAAGTTACGGGGGTCT--TTTGCTTTGTTTAGAAAGA-------GTAAAAAATGATATGCCTGTATTCATATCATAATAACCATAAAACCTCCGTCACTTCTCCCTTCTTGCTGTGTTGTTTC---------TATTTTTATTGGCATGTGGACT-TGCTCCCATCAAATGAGCTAGACAAGATGGGAGGGTTAATTTATTTAAGGGAATGTGGATAAACAATGCTGAGAAAACAAAAGGCACCAGTGAGTACTGTCTTTAAAATAAAACAAATAAAAGTGGTGATGGAACCCAACCG---TGGTTGCCCAGGGGCTGAAGAA--TTCATGCTGGTATGGGGGTTTGAGCAACCACAGAAAACCAGCTCGCCTGCTCCTCTGAACACCTACTGACTCAAAAGCCTGGACGTTCATGTAAGACAGGCTGGAGCTCAAATTCAAAAT---------GTGTTCCCTTGGCCAGGCTACCCTATGAAAAAGTTTGTTTCCTCTTCCATATAATAGA a score=2416 s mm7.chr5_random 5050777 27 + 11523536 GCTAAACAATTTGAGAGCAAGATCATA s bosTau2.chr4 12044821 27 - 69556449 GCTAAGCAATTTGAGAGCAAGATCATA a score=9364 s mm7.chr5_random 5050804 111 + 11523536 AAGTCCTGCCCCGAATGTCAGATCATGTCTAACTTTGTCATTCTAAGTGAGTACTGGGTGGAGGAGAAAGAAGAGAAGCAGAAACTCATTCAGAAATACAAGGAGGCTATG s bosTau2.chr4 12045576 111 - 69556449 AGGTCCTGCCCAGAATGCCGGATCACATCTAACTTTGTCATTCCAAGTGAGTACTGGGTGGAGGAGAAAGAAGAGAAGCAGAAACTCATTCAGAAATACAAGGAGGCAATG a score=12229 s mm7.chr5_random 5050915 140 + 11523536 AGCAACAAGGCGTGCAGGTATTTTGATGAATGACGTGGGAGCTGCCCATTTGGAGGGAACTGTTTTTACAAGCATGTGTACCCTGATGGCCGTACAGAGGAGCCACAGAGACAGAAAGTGGGAACATTAAGTAGATACCG s bosTau2.chr4 12046244 140 - 69556449 AGCAACAAGGCGTGCAGGTATTTTGATGAAGGCCGTGGGAGCTGCCCATTTGGAGGGAACTGTTTTTACAAGCATGCGTACCCTGATGGCCGTAGAGAGGAGCCACAGAGACAGAAAGTGGGAACATCAAGCAGATGCCG a score=22327 s mm7.chr5_random 5051055 426 + 11523536 GGCCCAACAAAGGAGTCACTTCTGGGAGCTCATTGAGGAGAGAGAGAAC---AACCCCTGTGACAATGAGGAAGAGCAGGTTGTCACCTTTGAGCTGGGTGAGATGT---TTATGCTTTTGGCTGCAGGTAGGGATGAAGACGACGACGAGGAGCTGACAGACTCTGAGGATGAGTGGGACTTGTTTCACTACGAGCTGGAGGACTTTTATGACTTGGCTCTATAGCAGGGTTGCGTGGCGCGGGCACTGGTCTGCGGAGCCTCAGACAGTAGCTGTCCCCTGCGCTGTGTGGCAGTGTGTGTGACTCTCT------TAGGCCTCTCAAACTCCAGGTGCT---GTGATCA---CTACCCAGGGCCTGT-TCCTCTA-CCCTTACTTTTCCCTCAAGAG--TGTTGTTTTCTCTGTTT-CAAATGTTACAAAAATAAATCTTAAAGTTA s bosTau2.chr4 12046744 432 - 69556449 GGCCCAACGAAGGAACCACTTCTGGGAGCTCATCGAGGAACGAGAGAACGGCAACCCTTTTGACGATGA---AGAGGAGGTTGTCACCTTTGAGCTGGGCGAGATGTTGCTTATGCTCTTGGCTGCAGGTGGGGACGACG------------AGCTGACAGACTCTGAAGATGAGTGGGACTTGTTTCACGATGAGCTGGAAGATTTTTATGACTTGGATCTATAGCAGCTCGGCGGGGCGCGTGAACTGGTCTGCCGAGCCTCAGGCGGCAGCGGGCCTCGGGGGTG-GCGGTCGCGCCCAGACCGCTCTCCTAGGCAGGCCTCTC-AACTCCAGGTGCTGTCGTAATCATTTTTACCCAGGGCCTGTCTTCTCAACCCCTCACCTTTCCCCAAGGAGTATGTTGTTTTCTCTGTTTGAAAAAGTTACAAAAATAAATCTGAAAGTTA a score=12434 s mm7.chr5_random 5109204 427 + 11523536 AAGTGGTCCCCGGGCCCCGGGAAACCTCCCTTAGCAAC-GAATCAGGCTGCGGTTGCTA--GGAGCAAAGGAACCGGGGAGGGGTCGTCCGTTCACTATTTCAGTCCGGTGTGACTAACTTCCGGTCCGTC-----------CTCCTGGCTTCTTCCCCCCTCCGCCGAAGCGGGGTCGCCACCGCGGGTTCCTCCACTTTGCGAGCCTCCTGTCTTGGGCTCCTCATTCCGCTGCGGCGGGCGGGCGAGCGGGGggcggcggcggcagcggtagcggcggcggc----------agcgAGCGCGATGCTAAGTTCCCGGGCGCAGGCGGCGAGGACGGCGGCCGACAAGGCCCTGCAGCGCTTCCTGCGCACCGGGGCGGCCGTCAGGTGAGTGGGTGGGGGTGCGGGGTGGCGGTGGCGGCCGCAGGGCCTCCAGGCCTGCGCGGACCC s bosTau2.chr17 35239445 412 + 45915461 AAGCGGTCCCGGGCCACCGGG---CCTCCCTTAGTAACCGACGCCGACATCCGTTGCTAAGGGGGAAAAGGAAGTACAAGGTTGTGGTCCTTCGACTCTAGTCTTCCGGTGAGAGCCACTTCCGGTTCTTCAGGCAGCCCGTCCGTTGG--TCTACCCTCCCCGGAGGAGCTGGGGCTTTGGCCACGGGTTCCGCCGCCTCGGGAACC------CTCGGAGCCCTGGGTccg------------------------gccgcggcgaccgcggcgggggcggcggcTCGCCTCCCGCGCAGCCGCGATGCTGAGCTCCCGGGCCTCGGCGGCGATGACCGCGGCCGACAGGGCCATCCAGCGCTTCCTGCGGACCGGGGCGGCCGTCAGGTGAGC--TCTggggggcggggcggccggggaggccg--gggccggggcgccTGTGGAGGCCC a score=5680 s mm7.chr5_random 5110680 214 + 11523536 CACGTATGTGTGGGTTGCCTTACTT---GGAGATACAGAACTTTGTATAAA-ATTGTGTTTTGAATTACTGCTGCAGTTTTCTTAATTGTGGGAAAAAAGAATAGTGTCCACCTTCAAGTCTAGCCTGGAACGAAGAAATCTTTAAT-CGT-ATGAACATATAGATGTCCTCTTGTGGTATTGTTTCGTATTCTCAAAGAGAAATCCATTTTTAAAGCCA s bosTau2.chr17 35240657 204 + 45915461 CGTATATATATTGTTTGCCTTATTTAGTGGAAATACATAACTGTGTGTGAAGACAGTGTTTTAAACTGCTGGTGAAATTTCTTTATTTGTAGTAAAA--GAATAACTTCAGTGTTGAAGTCAAGCTTCAAATGAAGAAATATTTAATATGTAATAAATATTTAGAAGATCT-TTATATGATTGT-------------ATAAAGatctatttttacatcta a score=11593 s mm7.chr5_random 5111271 442 + 11523536 GTATCCCAAATTCCAAGGCAAGGTCTTATTGGTACATATTACCTTAGATTTCAAGCTTGCTGGTTGGAGGGC-------TTATTTTGATGTAACATGTCACCTT----CCTGCCACTGTCTGTACCAGC-CTGCTGTTGGGAGACAGAGTGACAGTCCACGTCTTCTCCTTTTCAGATACAAAGTCATGAAGAACTGGGGAGTGATCGGTGGGATTGCCGCTGCCCTGGCAGCAGGGATCTATGTTATTTGGGGTCCCATTACAGAGAGGAAGAAGCGGAGAAAAGGTAGGGA-TGGGGCCCT-GCATCGAGGTCT-TGGGTTTGACT---------------------------------------------TGAGCCTCTCTTGTCTGTTTGAGTG-GTTGGCCCTCTTAGCTTTAAAGCGAGGACCATGGTCTACGAAGTAGAACTCCCCACCCTGTGGTGGGAAGGCTCTGTTTttttgttttt---------------------tttgagacagggttt s bosTau2.chr17 35241579 513 + 45915461 GTGTGCAGATTTTCAAGACA-TATCCTAT-ACTGTATATTACTTTAATTTGAAAGCTAGGTATGTGGCGGGCCAATGGGTTATTTTGATGAAATGTTATATCTGTGTACCTGTCCCTATATATACATGTATTGTATTTGTTATGAAGAAAGACAGTCAACTTATTTTCTTTTTTAGATACAAAGTCATGAAGAACTGGGGTGTTATAGGTGGAATTGCCGCTGCTCTTGCAGCAGGAATCTATGTTATTTGGGGTCCCATTACAGAAAGAAAGAAGCGTAGAAAAGGTAAGAAATGAAGCCTTTGCATCATAGTCTGTAGATTTGACCCAAACATTTAATTATTCAAAAACATTACCAAAGGGGGAGGACATGTGTGTTTCTCCTGCGTCTTCAATTTTGTCGACAGTATTTGCTTTTAAGCAGAAGTTAATTTTAATGACTCATTATTTTATATCCTGTAGTAAAAAGA---------TTTATATTTCACCCCCACTAAGGGCGTGAGTTTGAGACATGCTTC a score=17812 s mm7.chr5_random 5112147 866 + 11523536 TGCATGTTTTCATGAGCACTCTTATGTTAAAGAGTTTCTAAACAAGGCCTGGTGGCCAGCCTGGGCTCTGTGTACTGAGCTCATGAGTTTTGGCAGAAGAGGAAATGAGGGCATCTTGTGAGCCAGTCAGTGCTGCTATCTCTGCAGGCAGACTGACCAG--------------TGTCTTTCTCAGTTGCCGTGGGAAGAACAAAAGCACTGTCCCGGGAGG-------CAGTACAGTTGCCAGCTATTGTAGGG-----CACTGCTCTCTAACTAAAGGAGAGAGCGTCCAGGAGCGCATGAGGCAAGGAGGAAGGCATGGCTGCTGCTGCCGCTGCCGCTTTTATCCGTTTCGTAT--------CTGCGCCGGGCAC-CTGG-------AAGGGTTTCAGAGAGAACACAAGACAGAGGCCCACACTGC----------------------------------GGCTCAGTCT--------ACAGCATAGCATGTCCCGTGCCC-----------AGGCTCGCTCAGGGTGAAATCCC--GACTGAGGGCTCCATGCATAGATGCCGGGTCCCAGAAGCGTGAGGAAGAGGAAGGAAGGTCTCCCCAGTGATGCATTGTCCTCTTCCTCCCGCGCCCTCCCTAGGGCTTGTGCCTGGCCTTGTCAATCTGGGGAATACCTGCTTCATGAACTCGCTGCTGCAGGGCCTGTCTGCCTGCCCTGCGTTTGTCAAGTGGCTGGAAGAGTTTACCACCCAGTACTCCAGGGACCAGCAGGGGCCACACACTCACCAGTGCCTGTCCTTAACACTGCTGAACCTCCTGAAAGGTACTGG---GGACCTG---AGGGAA---CGACCATTTTCAGTGTCTAGCTGACAGAATAAGAGGCTTAGGG----GAGCCACTTTGTAGGAAAAGACG------------TTGTGGGGGAGGGGTGTGCACTGAGAACCTAAGAGACAGCATCAGATT s bosTau2.chr17 35242593 907 + 45915461 TGGATGTTT----GAGAACTTTCATAATAAAAATTTT--------------------------GGTTTTGT----TGTTTTCA---GTTTCAGCAGAAGAGGAAA------------GTTTGTCAGATCTTGTTAATCTCTTTGCAGAAAGACTGATCAGAATGGCAGGAGCAGTGTCTTTTCCACTGATTAT---AAGAACAAAATCATTGTCCTGAGGGAGCAAGAACAAAACGATTGTTTTCTTCTGTTGCGAGAAACATTGCTTTCTTAACGAAGgagagag------agagagagtgagggagagaaagagaga-gGTTACTA--------AGTGTTTCTGTACATTTAACGTAAGCCAGGCTGTGCCAGACACTCTGGTGCTCTGATGAGTTTCACGAGTCCCACGTGGCCAGGACCTGCCCTTCTGCAGCCTCCGATCTCCTGAAGGAGCATTATTAGGGCCAGGCCTTGGCTGGGACAGAACACTTGGCCCCCTGGTCCCTGTGGATAAGGGCTTTCTGAGATTGGGATCTCCAGTCCAAGGCCACAGTGCAGGAGCTCTGGGGCCCAGATGGGAGAGGAACAAAGAGCCGG---TCCTGTGTGATGTGCTGTTCTCTTCTCCCC---CCTCACTTAGGGCTTGTGCCTGGCCTTGTCAACTTGGGGAACACCTGCTTCATGAACTCCCTGCTGCAGGGCCTGTCCGCCTGCCCCACCTTCATCAAGTGGCTGGAAGAGTTCACCACCCAGTACACTGGGGGTCACAAGGAGCCCCCCCAACACCAGTACTTATCGTTAACGCTGTTGCACCTCCTGAAAGGTACTGAGTTGGAAATGGAAAGGGGATTGTGTGCGTTTTCAGAG--CAGCAGCCCAGATGGCAGGCGAAGGGTTAATAGCCTTCCTGTAGGAAAAAAAATCACACAGATTCTTATGAAAAAA------GCACTAAGGGCCCAATAGATACACTCAGGCT a score=5678 s mm7.chr5_random 5163464 371 + 11523536 CACCATTTCTTGTTC----AGTCCCGAAGAACTGCATCAAGCAGAA-AGCAGTCAGAGGAGAGTGTGTGCATTTACAGCACAGAATCCCCCAGAGGACTTTTATA---------------TCTGTGCCTCTCAGGAGGT------GACATAAAACTCCCCATTCTGTGT-----------------GGTGACGCACTGT-------CAATATATAACGTTTCACGTAGCAATCTGGATGAAACTTAACATCACTATGGCTTCTGTAAGTTTTGTGGTTCAAGTTACCCAAGCATACAGTGCAGGGTAAGATAGAATTAGCTGAAATCCCATGCTCATAAACACTTTAAA--ATAGCACAAATACAAAATGGTGAAATGCTGTGA--TTTAGACAGTAATTTTAGACTCAGTT--AAAGAAAGACATT s bosTau2.chr6 58033770 403 + 69624268 cagcattttttggtccaagaacctagaacagtt--atcaaaaataagagaaatcagagtgcatcacacacagttatggcaagaattgcttcataacatttttccagcagttaaaacataatttgtgtctctcttggggcatggtggaaaacagacctcttattctgtgtcacagtattaagaaattgaaGAAAGAGTGTTCTGTACCAATATTTAAGATTTTATATGTTCATCTGCGTAACAGATTACACTTATTTTGCCCTTATAAATTTTATAACTCATATTAC----------AATGGAGGGCAATATAAAATTAG------------GTTATTAGACATTTAAAGGTATAACAGAAATACAAAATGGTAAAGTGTTGTGAAGTCTGGACAATGATTTTAAATTCCATTAGAAGGAAAAAAATT a score=10874 s mm7.chr5_random 5164449 309 + 11523536 TCTTCTCCCATGGGTCCCAAATGCACAAAAATCCAAACGTAATGCAC---------AGACAAGCTAGGACAACCTCAAAGCTTGTTCTTGAGCTGGGTAGCGAGATGGCCTTGGCTTCACCAATCCTACCTTGAAGATAGTCCGGACAGGGCTTTCTTGAGAATCTCGGGGGTCCTGTCTGAGGACGGTGGGACCTCAGGCACGTCGGAATCGCCTCTGGCATCGAGATCTCCATACCTGTCATCAATATCTGTTTCCTAAAATT-----AAAAAGGAGAACTATTTGCAAAGTATTAATATATACATttattttgaaacaga s bosTau2.chr6 58034455 296 + 69624268 TCTTCTCTCATAACTCTAAAACTCACAAAAAGTGAAATTTCTTAGACCAGTGTAAGAAATGGTCCAGGATAACCTCACAGCTTAT-CTTGTGC--ACCCCTCAGATTGACCT---TCAACCAATCGTACCTTGAAGACAAACCAGACAGAGCTTTCTTGAGGATCTCGGGGGTTCTATCTAGGGATGGTGGAATTTCTGGAATATCAGAATCTGTTCTGGAATCCAAGTCTCCATATCTGTCATCAATATCTGTTTCCTAAAATTAAAGAAAAAAGAAAATCACTTTGCAAAATA---------------------AAAGGGA a score=6221 s mm7.chr5_random 5164894 296 + 11523536 AAACAGCACATGCTTGCCAGTGTCTCT-CTCATTGCTCAGTGTGCCAAAATGTGGTTGCATAATCTAAGACAAAG---ACAACACTATCAGC-TAGATCGAATGCCTGGGCGCTGCCATAGCTTCTTGCTAAGCAAGCTTTATTATCTTTGGTAAAATT--CCAAAATAAAGGCTTACCTTAAACGAAAGACATAAGAATGGCTCAGATTGCTTCTTAAGTCAGATGTTTACTGACAGAACTAAATATTTATTGTTT-GCTTCTCAACTGGGAGAACAGGGTA-----ATTTCTATAGATTCGAATCAA s bosTau2.chr6 58034751 298 + 69624268 AAAAAGTGCATGCTTGCCAATACATCTATTTATTGCTCAGAGTACCAACTCTCATTTCCATAACTTAAAAAAAAAAACAAAAAACTATTAACTTATTTTGAATATGCAAGCACTGTTGGACATCCTAGTTAGTAAAG--------TTCCTGCTAAAGTCTATCAACATAAAGGATTAATTTCAACAAAAAACACAAAAAGAAATTTCTGTATTATCTAAATCAGAAATGTACC-ACAGAATCAAATATTCATTGTTTCTCTGCTTAAC--AGAAAATAGAGTGTTTGTGTTAATGTAGATTCTGATCAA a score=5953 s mm7.chr5_random 5165767 417 + 11523536 GGACTCTCAACCCAAACTCAAACATCATCAGCTACAAAGCTTAGGCAAATCTTATTGCCGTTT-TAACTGCACCTACATCCCAAGA----GGAAGCATTCA-------------------------ATATGAGGCTGAGGCCATGGCAAATTCAAGCAAGTGGTAAGCTACTAGGGTTA-------GATCAAGTCTGCCCACCCTGCAGGTGGCCTTCCAAGGAAA-----CGTTAGTTAGCAT---TTAGGCAGTGTTTTCAGACTCCATAAAGCAAAGTCAAACGTTAGTATAC-AAATGCAACTCTTAT---AAACAACTATAAAACTAAACATGTCACTATGCCAAAAA----ACAACAAATG--------------------GGACAGACA--TGATCCCAAAACAGCTTCAACAGAGAAATGCTAGTTGGTAACAAGCACACCGACATTAACCCCGAGGAGAGTACCTCCTCAACCAACCCCAAGA s bosTau2.chr6 58038125 474 + 69624268 GAAATCTCCAACCAAACTCAGCCCTCATTAGCACCAAAGCTGTGGCAAATTTCATCACCCTTTCCAACTGTTTCTTTACCCATAAAAACTGGAAACATTAAAAAAAAAAACCCCAAAACTGGAAATATTTAATGCCAAGGACTCGGGTCAGTCAGTGAAATAGTAAGCTATTATTATTATTCATACTATCAAATCGAATTCCTCATTAAGCGGCTTACCAAATAAAATGGGTACCAAATAAAATGCCTTGGGTAGCATTATCAATAATCATAAAGGAATAATAAGCTTTTGATTACTAACTATAAATCTTTTATCAAATAATTACAAAATTAAATGTGACATTATACCAAAAATGACAAAGCAAATGCCGTGTTCCCACTGTAACCCTGAGAGTCAGTTGGCCTCAGAGCAGATTAAACAAA-------TAGCTGTTGACTAGTAAACCACCA-----------GGCAGGACATCTTCTGCAAACTTCAGGA a score=4504 s mm7.chr5_random 5177419 191 + 11523536 TACCACCCGTGTTCCTCGGCCT--TTCACAGCAGAAAGTCTGGTTCCCATTAAGCTCTCTGGCTAAATTC-----TTCACACATCTTAGCTGTCATTCTAAAGTACCTCTGATGGCACCTTCTAAGCAACCCTTCCTCTCTCAGAGCCCAGGACCCTCCATGACTTGGC-TACTCCTTACATCCCTGGCTCTTTTCTAA s bosTau2.chr6 58044657 183 + 69624268 TACGTCTCACATTCCTCGGCCTAATCCTCAGC------------TTCTATGAAGGTCTTTGGCTAAATCCCATGTTCTCCACCTCTT---CCTCATTTCTAAATACGAATGACAATATCTTCTAAGCAAAACCTCCTCCTTTAGCTCTCAGGA-TCTCTCTATCTTGGCGTCTTCCTTACATCTCCACCCCTACTGTAA a score=10577 s mm7.chr5_random 5177972 562 + 11523536 GCTTCTCAGAGTCCATTGAGTAAAGAGGAATGCCAAAGGCCTCAAGGCTCTCAAGAGTTCAACCTTGCCTCCCAACCCAGCAGTTTATAGTCTGGGGTTT-----CTAATTTCTGTGTTCTGTCTCTAGAATGCTGAGTTGGGAGGCACTTCTGAGTGCCTTCTGACTAGAACACCCTGCCCTAACCAGTCCTAACCCCTGTCCACTTGACTGACCTCCCAGGCATCTTC-ACTTCCGAGTTCAACACTCAAGTCCTCCTTAGAGCTTCCCCTACAGTCTCCAT-----GTCCATTCGAGCCCTCTATGCTAACA-----------AGGCCTT-CACGGCTGTCTACTGAAAGCTGCCCACACATGGCTCCAGGGTGGGTAGTAGGCTGAGACGG-GCCCTTGTTCTTGGTCAAGTACTACTTGGGTGTTTCAAGTCCTAGAGCATTCCCCTGCAGAGATGAAGCACTATTTCACATGCTAATTCTCTGGAGCACACAGAGCCTTGTCTGGGCAGAAGTCTCAGGGTCGTGAACAATAGAAATGTCCCATCAACCAGACCATTAT--AAAGGCTACAAAATGGCAAGG s bosTau2.chr6 58045537 540 + 69624268 GCTTCCAGGAGTCCACAGAAGAAAGCTTACCTCCC----TCACAAGACCCTTAAACTCCTAACCCCTCCTTGCAAACTA-TAGTTTATACTCCAGGACTATCAAACTAAGCTCAGTTCACTGTGCCTAGAATGCTGATTCAAGAAACAGTTCCACACAccctttgcctagaatgcctttccctaaca----------cctgtctacctagcaagtctcc-aggcatcttttaattccaaactcaaccctca---tctctttcaagcctttcctgTTGTCTCCATATACTGTCCAGCTATGCTCTCTCTGCTAAGAGCGAAGTAAAGAAGCCTTGTTCTGACATCTATT-AAGTCTAATTATGTGTGTCTCCTGGG---GAAGTTCCTTGAGGGAGTGGTCTTGTTATCTCTTAAGTATTATTCC-----------------AGCATTTAGCAACAGGGA------ACATTTTCACTTGCTAATGCCCTGGAGCACA--GAGCTTTCTTTCCGAATAAGTCTCCAGGTCCTGAAGGAAGAGAAGGTCATGTTAATAGCACCACTGTAAAAAGACTACAAAGTGGCATGG a score=11090 s mm7.chr5_random 5178540 423 + 11523536 AGTTCGGAGTAAGCAGGATGTGAGGTAGTCCTTCAATTCCTGCATTAATTTCTAAAGGTGTGGTTTTTTTTTTTTAAACTGGCTCTTAAACTTAACAACACT-TAAGAGTTTCGATGGACCAAATATTAACCAGCCTCCAACGATGGCAGCTGACTTAAAAATAGCCCTTGACCTGGAAATATAGGTGTGTTCAAATACACACCCTGATAAGAAAGGACACAGAGAGGATGCAGCTCAGAGTCTGAAGGCTCTGAAAGTCAAGGGCTCCTTGAGAAGGGACTCCAGAACCACAGGGATATTTCAG-CACAGTTTG-AACATGCTCACCCTCTTCTA---AGAAACATTGACAAAACCAGTCGCAGATGCAACACACTGCATTTGGAAAAGCCACATCCACCGAG--ATGTGAGACCGACTCAGTGACAGCC s bosTau2.chr6 58046452 416 + 69624268 aattcagagcaag--ggaGGCGAGGTGATCTTTGCTTATTAACTTTAATTTTTTCAGTT-----TCCTCATTTTTAA----GTATTATAATTGGAGGATATTAGAAGAGTTTAAATGAACCAAATATTAACCAGCCTCTGATG-TGCAGGCTGATTTTATAATGGCCCTTAACCTGGAAATTCAGGTGCATTCAAATATACACCCTGATAAGAAAGGAGGAAGAGAGGACAGAGTTCAATGACTCAGAGCTTGCCAAGTCAAAAGTTCCTTGAGATAAG-CTCTAAAAGAAT-GCAATATTTTGGACGTGGTTTGAAAAATGCTCATCCTTGATGATTTAGAAATCTTAACAGAACTGGTTACACATGGCACCATCTAGTCTTAGAAAAGAGA-ATCCAGCTAAgtatgtattaatgacctagagccagac a score=15743 s mm7.chr5_random 5178963 587 + 11523536 AGCAGTGCAGCATTTACAAACAAACAAACAAGCCGGTGGGGTAAGCAAGTCACCGAGGGATCAGG---------CTAATGAGTCAAGACACCACAGAAGCTGTTCCTAATTTAAATACATCCT---GGTGCTTAAAAATAAGACGTTACACTCAAAAGCCGGTTTGTGCGCCGTTTCCCCATTTCCAGAACATGTTTTTTCTTAATAAAAGCTCGTTAGCTTCCTCCAGTTAAGGAAGTCGACATGAGGAGGCTGGTATTTCCTTGATTCTAAAGGATACCAGGGCTAAAACA----AAATCCCAACCTAATTAATTCTATTTTGGGTCTGGTTTCCAAGGCACTCTTCAC-GGAGCTGCTCTCAGCCCATGGCTTTCCGTTTT------TCAACCTTCCACAGCTGGAAAGTGTGTTTATTCTGTGTCACTCCTCGGCAGCACAAATGTT-TCCCAGACTCTCATCTTAACTC-CCTATCCATCAGG---AACAGGGAAGAAG-----CTG---------TGGTTCTAAAATCACGTATTTATTGCTAACCATATTGTTGCGG----------CAGCACAGATTTGTAACTCAAGCTCTATCAAGTTCATCTGTGT-AAGTTTTGGGAGGAACTTCCCC s bosTau2.chr6 58048472 610 + 69624268 AACAGTGCAGCACTTATAAATAAATATGCA-------GTGTTAACCCACTCACAGATAGCTAGGGACAACAGTTCTAATGGCTCCAATCAAACCAGA-GTAGTTTTCATGTTAAATGTAGTATTAGGGTATTAAGAAACTAA---TTAC-TTCAAAAGTTATTTTATGGGTGGCTTCCTT-------GAACATGTTTTTTCTTTTTAAAAGCTTGTTATTTTCTCCCAGTTAAGGAAGTGATCCTGGGGAAGCTGGTATTTCCTTGGTTCTAAACTATACCAGTGCTAAAGCAAAACAAACCCCAACCTCATTAATTCTATTTTTGGTCTAGTTTCCAAGGCAGTTTTCACAAAAACTATTCTCAGCCCACTGTTTTCAGCTTTGTAACATCAACCTTCAGTAGCCAGAAACTGT-TACACTTTGTGTAATCCCTTGACA-CACAAGTTCTATCATAGA---TCACTTTATTCCACCTGCCTCTCAAGGGTAAAGGGGAAAAAAAGGCTCTGTCTTCCCATTGATTTTAAAGT------TTCTTTCTTAAAATCACTGTTGTGAGATGTGTTCCCACCTAAGTTTTATAACCTTGGTTACCTCAAGTTCATCAGCATCAAATTTCTGGTGGAACCCTCCC a score=18551 s mm7.chr5_random 5179790 921 + 11523536 AATACACACCACACTATCT--ATTCCACAAAACAGAAATCCAAGAATGATTCAAAAGTTTTGAGTCTCTCAAGCGAAGAGGAATTCTGTAAGCAAACTCGTATAGCAAATCTATTCTCTGGCCCAATTTCATAATCTACCAAGCTCATGCAGCCATAAAACTTTTATTATT---TTTCCTCCCT----AAGTTCTTACTGGCACTGGTTTATCAGAAAACACACCTAAACGTTTGACTCTTCCTAGCTTCAATTATAATAGTGACCGTAC-------ATATCCGCATATTTTAAAATATGAAGCAAAGTTCATCTATTTTAAAGCGGGGGAGGAGTGGCGTGCTAAAAGTCTGGAATTAGCCTGTTCGGTTAAATGAAATCCACCGATGGGACAACTGCCTGGTTTGAGGCGCACTTA-------------------CATGTTCCCCA-TATATGACAGCCTCAACCCTCCGAAATCTATCAGCCAGAAAAAAAGAACAGA-GAAACGAAAGCGCAGCTTGGAGGAGCTCCAGAAGCCGGTCTGCGCCAGGCTCCAATGACAGGCTAGGACCCAAGGTGCCCGTCTTAAGTTTACTCCCAACTTTGTCGCCCTACCAAGGAAAGGCGAGAGAGGTGACAGCCACTAGACAGCCAGAGCGCCTGCGGGGACG--GGTTCCATCC------------TGACCCCAGAACCAGGAGA--------------TCCGGGAAAGAAGCTAGAGTGCAGTCCGGTTCCGGAACGGC----GGCCCGGCCGCGCACGCCCCGGGA---------------------------------------------CAGAGGACGA----------------------------GCAGGACCCC-----------------CCACGACACGCCCGCTCCA--ggggcgcggcccg---------------gccccgccgcACTCACTCACTTTGTCGCTGGTGCTCTCGGTTTCGTGGTCACCGCCGGCCGCCTCTCCCTcgcggggtggcggcgcccccgctcccccagggccggg---gcagcccccgcggTGCCGCAGCTCCAGCATGTCC s bosTau2.chr6 58049386 1052 + 69624268 AATACAAACTGCAGTACCTGCATTCAAAAAAGAATGCTTCCGGAACTAGCTTCCGTGCTTTGAGTTTCTAAGATAAAATGGAATTTAATAGAAGATTTTATGAAACAATCTTATTGCCCGGCCCAATTTCCTAAACGGTCAAGGATA-------AAAAAAATTGTAAAACTGGATTCCCCCCCTGCCCAAATTTCTACTTGCACCACTGTATTACCAAATAAGCTGAA--GTCTGTCTCTCTCCAACTTT--TTAAAA-----ACCATACTAGCATTATATCTATTTATTCTTCAAGGTGAAGTAAAGGCAATCTGT-----AGAGATGGAA-------ATTTTAAAAGTCCTTATGAATTCAATCAGGTCAGATGAAATCCACTGGTAG---AAGTGCATTCTCTGCCGCGGACTCAAAAGAAGCTGGAGGGTCACAATGTGGTCAAGTGTAGGAGACTCTCAAACCTCTGATATCTATGATTCTGAGAAAA--GACAGAGGAAACAAAAGTCCTGA-TGGGGGAGCGCGAGAAGCCAA---GCGTCAGGGTCCGATGACAGGTTAGAAGGGAAGGTGCGTGTCTTAAGTTTACTCCTAACT--------CTCCCGAGAAGAGGTGTGAGGCG---CGGCTACTAGAGACGCTGCGAACTCTCAGGGTGGGAGGGACCATCCCGGTTCTAGCGTCGGCCCCAGACCCCGGGGAGGAGGGACTGGAATTGCAGAAAGTAAACTGGAGTCAAGTTGAATCCTGCAGCCATCCCGGGAGCGGCCGCGGTCACCCCGAGAAGCGCACCGTCGCTGGAGTCCGGCTCCCACTGAATTTAGCCGGGCCGGAGCGCGGCGCGGCCAGGAGCTTCACCTGACATTCCGCGGGGCCCCACCCTCGCTCCCTCCCTCCCAGGTGTCCCGGCCCCATCGGGACGCAGCCCGGGACGCGGGGGCTGCGCCTCTCGGGCTCCACTTACTTTGTCACTGGTGCTCTCGGTTTCGTGGTCGCCGCCGGCCGCCTCTCCCTCGCGGGGTGGCGACGCCGCCTCTcccccggggccggggccgccgccTCCCCGGTGCCTGAGTTCCCACATCTCC a score=2824 s mm7.chr5_random 5180827 164 + 11523536 GACCGGCGCGGGCGGGGACGCGGCG------------CCGTTGCCAGGTGCGCCGTTCCACGCACTGGCCCCAGGGGGCGGAGGAG----------------------CAGCACGGCCCTCCCTCGCGCCTCGCGACCGCGCCACCCGGCCCGCCCCACCTTCCCGCCGCCGAGCTCCC---------------------------------------------------------GCAGCGCGGTCACGCGCCG s bosTau2.chr6 58050504 255 + 69624268 GAGCGGAGAAGGCGGGGCCGCGGCGGAGGGCGGCCGCTGGTTGCCAGGTGCGCGTCCCCACGCGGAGGCCCAGGTGGGAGAAGGAGAAAGGACCGGGAGGGCAGGAGCAAGCCTGACCTGCTTTAGCGCTccgccggggtgcccgccgcccgggccctgccactccccgccccgccccccggACTCGAGTCAGCCGCTCCAGGCCCCCTACACCTTTCTCCGGGTTCCTGCCTCCTGCAGCCAGGTCACGCGCCG a score=66117 s mm7.chr5_random 5299800 1943 + 11523536 ctcgagtctcgagtcgagcggaaggCTGGAGAACTATTGAGAAGAGTGAGCTTAAGACCGTCCTTAATAA--------------------------TGTCAGATTTCTAAG-TCTGCAACATGAGTTTGC----CTCTAAGAGATCACACTTGAACAT-----GAATGACTT-TGACTAATAATTAAGGCAAAAGGGAATCACATATGCTT-CTATCCTCAGAGTTTGGGAAAGGAATAAG---------AAATGCAAGT---TAATTAGTAACAAAATCAATATAATTTTGTACAACTGTA--TATCTTTTTGCTACCTCCTCAGTC-TGCTTGGTTAACCATGTTTGTCAGGAGC--AATTCACTGAAGCTTAACTCAGTATATGCCTAG-GGCTGTGAATACTGTTGGATCAAGATAATTGCCATGGTCACATTCCTTGCCAAAGCCCTTCAAGGAACAaaacaaacaaacaaacaaaaaccaaacaaacaaaagaaaagaaaagaaacccaaacaaacaaaaaacaaCTTAAACATGAAATAACACC-------TGCCAAGCTTCTGACACCTGACTCTCAACTTTACCAACTTTACCCCGCCTCTCT--CATACACATGC---AGTCCATAGACATtctgggtcttcgcacatgctgttcttgtttctcagaatacactttcttgctAGTTAATTAAGGGTTCTTAGAAATATACAGCTCTGTAACCCTTTCTCTATTATT-TGGAAGCAGA---GTTAGGACTCGGC-CTGTTC-----TTATGTCCCAAGTACACCGTGGTCAAC--CATGTGTTTTAAGAGGGTTTGGAACAGGTACATCCCAGTTGGTCTATAGAAGATTGCAAAATACAATTGAATTAAGGCAGGGCAGAATCCTCTAAAACCTGTGACCTACAAAATTGGATATGTCCTAATAGACCCAGATAATACTGTTATTGGCAAAAATGTGGGGCCAA-CATCTCTTTACGATTCTCTGGGAATTTTACAATGCTCTTAATATAGTTCTGTGTGGTTCCTACAGTTCAGTGATGGGAAGAAGCTAGTTACCTGGTGTTTAACAAAACATCCTGTGGATTGATTTGGGTCTTAAATGCAAGTAATGGTACCTATCAGATGAAATCTGCCA-----CCCAG---ATCTATTTCCA-TGCTCCCTCTGGCATATAAAGGTACCCTCGTGATTAGGTGAGCATATTAATTGCTTCTTTTGTAGGGAGTCCTATAC-TGGGAAATAAACTTGGCTGACCAGCCTATGAACCCAAATCATCTATTTTTGTATTGATTTAGCACTGACTCGCTTAACCTATTAAAGCACCTAATTTTGTTGTGTTATATAGCAGGGTGAAATTTCTTTTATATTTATTGCACCTTCCCAAAGCCCCATGAAGTAAATGGTCATAAATGACAGTTGCAGAAGTTGTGCTCCAAACTTCTCCATTGAAGTTATTATACAGTATTCTCAGACAGAGGCCAATTGAGC-CATTG--CATGTAAATATATATTGATAATTA-ATTCGTCTAGGTTCTGCTTTGTCATTTATT--CACCTCCTTCCATATACTGTGTCGTATATTACAGAAAAAAATGATTTTATGATCTTTCCGCAATTATATTTTCTCATATTTGTGTGCCTCGCATCCAGTGCTGGGATTATTTTTTACACATTCCAATACCAAGTTCACAATACAATTTCATTCCTCCTTTCCCCAACACCAAATGTGTTTCTAAAAATGATGGCAAGAAAAACTTGCTTCTCTGAGAAACACCATTAAGAAAATTCATCCTATTTGTTTTTAGGCCAACATTGCACATTTAGCAGACAATTTTATTGAGCTATG----TACATTGATATGTGCA----TCTTTTGGAAAGTTCATTGTACAGTGACTCCAACATCACTTTCTGGCTATGGACCATGAGGAGAAA-TGTGAGGCTT-TAAAGTGTATAGCTTTCAGAACTAATTCCTACCCATAATCCTATTGAGTCTTGTGGCATGCT-GCTGTTCctctctc s bosTau2.chr6 41662118 1951 + 69624268 CTAGAGTGTCTGGTTGGGGGGA---CTAGTGAACTTCTGTGGAGCATCAGGACAAAACTGTTGTCAGTAAATTAAacctttgaactagctctactggatcagaattccagtctcagcaacataattttgaagaactctgtgatcctgctcaagaaaattaaccaaatgtctcatcagtaaaaattagtcctaa-----------tatacttactgcttttaggattgttgagaggaataaataaggtaacacatgtgaGTGTGTTATCAGTAAATAGTTTAATATAAGTTTGGACAATTCAAATTATGATCTTCACACAGCCCCTGTTGTATATGGCTAACCATGTTTTGCAAGAGTTAAATTCACTGAGGTTTGATCAAGATTCTCTCCAGAGGCAGCAAGCACTGATGGACCAAAATAATTACCTTAATCATTCTCCTGCTAAAAGTCTTTCAAAGATCTCATCA---------------------------------------------CCTGCAGGATAAAATCTGACTGAAATATGGCATGAAACCAATTTGTTGTCTACCTTCTGGGA-----------ATTTTTCCAACATACCTAAGTCTctcttccatacacacactatagcccatccacactcaggatatttgcacatgctattccttcttct-agaatgccctctgctctttGTTC-TTAAGACTGCTGAAAGGTTACTAGCCTTGTGTCACTGTCTCTGTTACTACAGGTGCAGATAGGATAGGATTCTGTGCTATTCGATCATTATTTTCCAAATATAAGACATTCATTTTCATGTGTACTGAG-GCTTTTAGGTTGGGTCTAATTTGACTGGTCCGAATATGATTTTAAAATACAGTTGAATTCAGGCAGGGCAGAATCCTTTAAAACCTGTGACCTACAAAATTGATTGTATCCTAATAGCTCAAGATAATACTGTAATTGGCTGCTGCATTTGGACAGGTATCCCTTTTTGATTCTCTGGGAATTTTACAATG-----------GCATTGTATGGTTCCTACAGTTCAGTT-TAGGAAGCTCATCATTACTTGGTGTTGAAGAAAACCCACTATGAATTGTATTTGGTCTTAAGTGCCATTAATGGTATTTACCAGATGAGATCTGTAAAAATCTACAGGAAATCTATTTTCAGTGTTCCCAGTTGCCTATAAAGGTACTGTCCTGATTTGGTGAACTTATTAATTGCTTTCTTTGTAGAGAGATATATGCCTGGGGAATAAACTTGGCTGACCAGCCTATGAACCCAAATCATCTATTTTTGTATTGATTTAGCACTGACTCGCTTAGCCTATTAAAGCACCTTATTTTGCCGGGCTATATAGCAGGGTAAAATTTCTCTTATATTTATTGCACCTCCCAATAGCCCTGTGAAGTAAGTGATCATAAATGACAGTTGCAGAACTTGTAGGCCAAACTTCTTTTTTGCAGTCATTATACAAACTTCTCAGTCACTAGTTAATCAAGCACTCTGGTTAATTAAGCATATACTGATAATTACATTAGTCTAGGCTTTGTTTTGTCATTTTTTTACATTTCATCCTTTATATTATGCACTGTATTTC--AACAAAATGTTTTTGTGATTGTCCTAAAATTATATTTTATCATATATATGCACCTCATATACAACATTAGGATTATTTTTTATACATTCCAGTCTCAGGTCCACAACACAATTTAATCTTCCCTTCTCCT--CTACAAGTGTATTTCTAGAAACGATGCTAAGAAAAA------TGGTGAAAAAACACCATTAAGAAAGTTCATTCTATTTGTTTTGCGACCAACATTGCCCATTTAGCAGGCAATTTTGTTGAGCTATGTATTTATATGGATGTGTGCATCTTTCTTTTTGGAAGTTCATTGTATGGTGACTCTAACATCACTGTCC-ACTAAAGACCACAAGGAGACATTGTGAAGTTTATAAACTATACAGCTATTAGAGCTAATTCTCACCCATACTTCCACTGTATCAC----CAAGCTGGTTGTTCCTATTTA a score=6598 s mm7.chr5_random 5301915 307 + 11523536 TTTCTCTTTTTCA----TCTCAATTATTTC----AGCAGCAAATCTAAGGTCTGAGATTTACTGAGGAAAATTTTTTCGGACTTGTATATAAAGGTGCTATAAATATTAGCTGTGAAATCACCTATAT-------TTCCAACATGCTTATGCATTGTCAAACAACAATATCTTTGTTTGGGTAGTTTCTAGA--CTAGATCCTCCCTTTATGTGTTCAGATGTCTAACTCAAATTCATTACTCTAATTTACGTTTAGTGTCGGTTCTTCCTAAAAGATATCTTTCATGCACATGCTGATTTTTGTG---CTTTCTCTGCACTCTCAC s bosTau2.chr6 41664069 321 + 69624268 TTACTCTATATCAAAGCTTTTAATTATTTCTATTGGCAGCAAATCTTATGCCTG-GACTTACCTAGCTG---TCTATAAAATTTATATCTGCTAGTGCTTTAAAAAGTATTTGTGAaatttcctacattgagagctttcaacatggcaataagttgtcaagACTCTCTAGCTTGACTTGAGCAACTTTTACAATCTAGgtcctatgtccactgcttcatggatcttattcaaactcattcttccaaattcagattacaggctg--cctccttcaagatgggtttgactgacaggctgattttgatgccccttcctctgctctcttac a score=36530 s mm7.chr5_random 5303195 879 + 11523536 TAGGAGCAAAAGTCAT--TCTCAGCACAAAATAAGATTAATGTATTCTTGATGGTCTTTTAAAATGATAAAGCACAGATG------------------AAAAAGAAGTGACATGAACTGACATTA-AATCCTGCCTGGTCTGAGATTCCAAAACCATTCAACTATCTTATACTCACCATGCACAGAATCTACAAATGGATGCACAGTGTGCTTACATTTTGAAGCTGGGCTATTACAGAACAAAAAAACGAAGTCTGTCAATGATTAACAAAGCATCTT-------AACTTTTTAA-AGCCATGAAGATTTTAGGGGCAAATGCTTTACAAGAGTGAGGTACCCATGGTTGCCAATTAGCCCAGTGTGAAGGAAAGCCAGACACTGG-------------------------CTCCCACCCACATACAGTCCTCGT-CTACCTT-CCACCCGACTGTGGAGATTGATCCAGTGCAAACATGCTGCAGATGAATTGCTCAGAGGGTCTCGGATGGGGATGTTTCTGTGCACATCCTCACACTATTCTGCAATTGTGATTTTTCATGGACATCCACATCCTGGCAATATATCCCTGGATTTGACTGTAATCTTGCTGTAGCACTCACCTGCAAGCCTCGTAAACTTGTTTTAATGTAGCTTTAACTCAGAGATCCTGCACCACCAGACAGATAATGCTACGCCATAGCATCCATTTGAGAGCACATCTGAACTTGCACCTCCTACTGATAAATGTTTTCAAAGGGGAACCACATTCTATTGAATGAA-ACATATTACCCAGCCACCCCATCCTTATTGCCTTTGTAATTGAATTAGCCATTTCTAATGTGTACTAGGTTTTCTGGGATCCCTGTATTCCCTCTTGAATTTTATAACATACTC------ACCATAATGAACACCACTAGATATTTTGTATTTTTT s bosTau2.chr6 41664785 909 + 69624268 TAGGAGTAAG-GACATGGTCTAATTGCAAAATAAAATTAATGTATTCCTGATGATCTTTTTAAATAATAAAGTACAAGTGCAAAACCCAAAAGGGAGAAAAAAAAAACTAAAGGAATTTACTTTACAATTACACCTGTTCTAAGATCCATGTAACTTTCAGACAAATTATGTTCATTGTGCACAGAACCTACAAATGATTTCACAGCAGGCTTATATTTTATAACTTGGTTATTATGGAGAAAATA------GTCTATAAAAGATTAACAAAGCATCTTCAAAAATAATTTTTTAAGAACCTCAGAGAGGTTGTGAACAATTGCTTTATCAAAATGAGATACCCACAGTTGCCAATTAGTATAGTGTTAATGAAAGCCAAGCATTAAGGATCTTAAGGGTGCTTCTTTATTACATCTGCCCACACATAATCCTTATTCTACCTTTCCATCTGGCTATGGAGATTAGTCCAGTAAAAACTTGCTGTAGATGAATTGCTCAGAGGATGTCAGAAGGGAATGTCTCCAAGCACATCCTAACACTATTCTGCAATTGTTATTTTTCATGGGTGTCCACATCCTGGTAATATATCCCTAGATTTGACTGTAATCTTGCCACTGAGCTCGCCTACAGGTCTCATAAACTTGTTTTAGTGTAGCCCTAAGTCACACATTCTGTGAAAGCAGACAGATAGTACTGCCCCATAACATCCATTAGAGAACACATCTGCACTTACATCTCCTACTAATAAATGTTTCCGCAGGGGAACCATATCCTGTTGCATGAACACATACAAT---ATCAC---------AAAGCCTCTGTAATTGGATTAGCCA-TCCTAACACACACCAGGTTT-----------TGCATACC--CTGGATTCATACATCATGGCCTGTTGAACTATAAAAACAAAAGCTGCATATTTTGAATGATTT a score=5225 s mm7.chr5_random 5304176 886 + 11523536 aggggtgctcctctaactgcccacccaaacctgcctcagtgccctagcattctcctgcccagggTTAAAAGTTAGATATAAAATTAGTGATTGTATTT-CAAAGCTTACTGGTTTAAAATTCCAAAGAATAACTGCATCTCAAACTTTAGGCAACTAGTTAATGACCAACTGATGTAGGAACAACATTGTTTCCTTCACAGCTAAGTCATTTAGGATCAGTTTTCTGGCTGTTCCCAATGGCTACAC--------------------CTAAATGGTGATCCTTTATAAAGTGTATTCATA--TCAACTCCCAGATACTATGaatataataatataattttatttGACCAAAACATTTT----GGGGGGACATAACTAAGGACCATGAATTGTTAATACCCTAGGTT-TTGAAGTGGTCCTTAAATCTGA-AATTAATCTGTCCATAAGAAACAGAACA---------------------CCACATGAGAA---AAGCAGGAATTGGAGTTAGGTGGTCACAAACAAAGAAGTGCCTGAAGCTGGGAGTTACTAGATGACACAAAGAAGGACTATCTTCTAGAG----CAGGGGTGGGCAGGAGGACTCTGCCAGCACCTTGATGCC-------------------AGGGATGTAA------------GTTTTAAGTTACAGATCTGGTGAAATGTTAGCACAGCAGCACTAG------------------TTTTCATTGACATATTGTCACCTACAAGGCATGCA-CATGCTCTAGAGTAAAAGATTCTGTCTAAGACACACAGAATTACCAAGAAGCCACAAATA-TTTAACTTGAGGATTTTCAGTTATAGACATCCTTGCCTAGGAAGAGTTTCAGCCACAT----GTTTGTTCATATTTTTATGCAACACTACCTTACTGACTACGAATTTTGATCATAAATGGCTACT-TTTCTTTGTGTTTCTATTTT-GCCTCTGTTACTCATCTATTTCCCC s bosTau2.chr6 41665694 841 + 69624268 AGG---------------------------------------------------------AGGATTGGGTACTAAATAT----TCGGTAATTGCTTTTGGAGGGCTCTCTGGCTTAAAATCT---AGAATA---------TGAAATTTAACCAA------------------------------------------------------------GGTCTATATTCTGACTGTTCTCAAATGATACATGTTAAGGGTAGtgtagtgggttgaatggcagccccttaaaagatatgtccatgttttaactcata-accccatg--------aataaaatcttatctggaaaaagaatctttgtaggtgtgattaagttaagaactttgagataatatcatcctggattatccagatggaccctaaatccaacaacaagtgttcttagaagcgacagaagagaaggacagacagaaaggaggccatgtgaaaatggaagcagagattggagttacagagacataagccacggaatacctggagccaccagaagctggaagagaccaaggaagattctctcctagagccttccagggagagc---aaggcactgctaacatcttgatttcaaactttcagcctaaaagaagagacggaataaatatctactgctttaagccacccagttggtggagatttgttacaacagccctaggaCAGGACCACAGGCAGTTTGTAATGAAGATGCAGCC-TCTGAAAGGCAAGCGTTGTGCTGCATAATAAGGGATCCAG--AAGGGCAGACAAAA-----GAgaacccaaagacacttcagcttcagcaccctcacttacaggagccctttcc----aaggggaccagtcatgtctcagtatactcaaattgctttgtataatttctgtatgtaagat--attttaatcactattgcttaagactgcattccgtttccaccccaacttctcttccacattcattttctc a score=9245 s mm7.chr5_random 5306330 1568 + 11523536 AAGATGTATTTCCTTTGAGATTATTGGATTA-ACTTATATGGTCTTCTCCTAGTTGCATATTG---TTATTGTTTCCTATC-TGATACATGAATTGTTTGTAAGAA-TCTTTCAAACAAGAGTTTTAGTAA-TAAATTGGACAAGCTACCCACAATGTAGGTCCATACATACCATCATCTAAAGATCATTGCCTGACATTTCTAATATAAAATGTATGTTGGTAGAAGAA----------CATGATTTGAAAACTATAAAGTCAGAAGTTTTTCTGAAAATAATTCTTTTCATCTAATATAAACATAAAT----ATCAATGAGAAGTGATGGCTATAAAGTTTTCTTTTCTATCAGGAATATCACATCATAACAATGCAATTGATATGTTTA-AAATCCACTCTCAACT--CTTTGGTGGAAG-TCACAATGAAGAACTA-----TATT-------------TATAGGGCATTAAACCATAACAGCTCTGAAATGGCagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagaAATATATCAGTATGAACTCATGTATTCATGTGCCTTCTATAAGTCAGTTCTCAATGATAGAAAAGGAATGGCCATTGATAAGCTAGCAAAAAACATTATCTTATAGTCATCTATGTTACAAAACTATACTCATGAGAACAGTTGATTTGAAAgtgttgtaatgcatgtctttaattccaggatacaggaggcagagacgggtagatctctgtgagtttgataccagtctggtctataaggtaatttactgaccagccaggactacaaagtaggaactgtcaaaacaaaaAAGTGTGCAGAAGATTAAAAAACAAAAAAC-AAAAAACCTAGTTTA-AAGTGTGATTATAAGATGATGTAATACAGTAAACTGTTTGAAAATATAAGGCTGTTTTTAATTTTTAAAGTTTtgtatgtatataataataattaatgtaaaaataaaccattcataaatttgaaaagagcaaagagggttatatggtagggtttggggggaAAATTAGAGAAATAATTTAAGTATTTTTTATTTTGTTCCTGAGAATCATTAATTTTAATAGTTTGAATTAAAATGAATAGTCATATTTTGTAGCAAATTATATATTTTTTCTTTTTATTGGTCCCACTAAAgtgtgtgtgaatttgtgtgcgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgATATCTTTCACAACACTTGGGCCTGACATTACTGCCAGATTATCATGttatattattttttaatatatttttCCTGGGTGGTAGAATTAATTAAAAAATGGATATATGCCCTTTAATGTATAGAAAAAGAAATTCTCTATTTTGGAACATGATTTTTTGTTGTTTTCAAGTGTACCTCATTCTGTTCTACAAGCAGTAGTGCTATAGATTGTTTTATT--TTGAAATTTTATGACTTTACATGTATTATTTTAACATTTTCCCT---GATGCAAATGTATGGACCACAAGTATCAGTGGCAACTTTTAGATGTGCAAATAATCAATCTATATAATGATCATTTGGCTTA-ACAAATTCACATATTTCAAATTAGA s bosTau2.chr6 41666597 1185 + 69624268 agaatacaccttgtttgggtttatggggttatatttatatggttcttattgatttacacgttgaagttattgctaagtgtcgtgctataggaatggtttccaagaactccctctattgacaactgtgccaactgacctgagttaac--cccaaaatgcagggcc-cacacagcaacaagacaaggccatttcctgagacctctgacttcagaagtacattaatagaagaagggggaaaaaaaaggcttgaaatgtacaaagctagaaactagtctgaaaataaa-----------attgtaaacactaattcttctcgatgcctagtcaaa---atgtaattttctcttctgtcaagaataca----cagagtaatgcaacaaatatgattacaaatatactctacactatttttagtggaaaattacaa----gaactagaagatattagcttccctgtgttgtaggggactaagccatagaaatcctg------------------------------------------------tataggaagaact-tctttgtatgag--------gtcacatgtcttccacaacccaactctcagtaataaaagagaaattgcaatcgat--------------------------------cacgtta---------------gagaaaagtccctatacagatgatgt------tatcttt------------------gtataaactgataa-----------------------------tataaaataattgac----------------------------------attaaaaaagtg--------atcaaaaagcacacagccaaaaagtgtagctaataaatttgattagagagttatgccaggtaataaatt-tttgaacatac-------tttttaaattttataatgttcctggtatattttagct--------------------------------------------------------------------------ttagaaaaaaa-----------ttttatttcatt---gtgatttcttattct---------------aaatgaatatttac-ttttgtgttaaaccttgtattcttt-----------tcctaa-aaaatgcccttcaaattgtatacgttt--------------------------------------------caatccttacaaaacgtgaatgggcccTCGCTATTAGGATATTAGGTTAAATT----TTAAAAATAA----ACTAGGAATTTGTAGGAAGAAATTCAGGGAAATGTGCCCCTGGATGTATATAAAAAAGAATTCTCTACATTGGCAT---ACTTTCATTTATATTAAAA-------------GCCTTGCA-----TGATGCTATGAATTGTTTTATTTCTTAAGGTTCAGTGTCTTCACATG-----ATCCAACTTTCTCTCCAGAGGTCTTAGGTCATCCAGCAtaggtattagtgccaatttttaggtgtgaatata--------atgtgagagttatctggcctgtgcaagttcacatattttgaagcaga a score=14911 s mm7.chr5_random 5308369 726 + 11523536 tgaagtcacttttctgcaggaaATTTTCAATGCATGTTCTTGTGGTTCCCTGGGCGACCAGCAACAGTTTCCA----TTTGTGGTGCTCTAATAAGAAAGGAAAGAGACGAGCTAAGAAAAGCAAGTGCTGGCAGAGACTTTGGAGTTTGACTCTTTATCACTTAAAGATAA--ATGTCTGCAGCCTCTGTTGTGTTCAAGTCCTGGGAACTCATATATATATATAATATC----AGCTCCTATGAGTCTAACAAATTCTGTTTGTATAGCATTGGTTAAATTGAAAATCATTCCAAAAT-------GTGGACTTTTCTCAAAAAAGAAAAAAAAATAGCAGAGTATTGTTAAATACATAGTGTCAGGATGAATCTTGAGGTTCCTTGTCTT------GTCTCCCCAATTCTGA-TGCTGGGAGAGACACATCAGGATCTGTCAC------AAAAAAAGAAGACTGGAAGAAGCAGTAGAGGCATTCCAGCATTTC------CTTGTCGTCTGTGAAACATGTCACTTCTTTCATTCTGAAGAATCTAGGTCTATGGCACTAAATTGGTAAGAATTATGATATAGTAAGAATCCAAATATCACAAACTAAATGACATTTCTTAAAGTGTGCAGAGTCTCTTTGGGTAACTAACAAATGCTAAGGAATACTGCCATCATAGTGTACCTGTCAAGCAGAGAGAAAGGAACTCTGCTCCATGATTATTCTCTCA-GAGAGAAAATGCAGTGCATCT---TTAACACAAt s bosTau2.chr6 41668939 736 + 69624268 TGAAGAGGCTACCCTACAA-AAAGGCTCTGTGCATAGAATTGCGGTTTCCTGGGAGACAACTAAAGAAATTCACAGCTTGCCAGTGCTGCGGCCAGAGAGCCAATA-CCAAGGCAGGAAATGCAAGAAAGGATTAAG--CTCAACACTTGTTGCCTTGTCATTTATAGGAAACAATACCCAAAGTATCTGTTGTATTAGCATCATACGCACTCATTATTTTCTAAGACATTGTTGAACACCTAGCA-------AAATCCTATTTGTGCAGAGTGAGCCAAGACTAGGGTTATTAAAAAAAAAAAAAAGTGGA-TATTCTGAAATAAGGGAAAT---TGGCAAGGTATTCTCAT-------GTGTCAGGACTAATCCTGAGGCTCCTTACATTTCGGCAGTGGCCCGAATCTTGCCTGCCGAGAGAGTCAGGGGAGCACCTGTCACTGTGGAAGGAACTGAAGGCAGGCAGGAG----AGAGGTTTCCTAGAATCTCTGCTTTCTTGTTGCCTGTGAAATGTGTCACTTCGTTCATTTTGAAGACTC-AGGAATATGGCATTAAATTGGTAAGAGTTGTGATATAGTAGAAAGTCATGCAGTGCGAAATGAATGCTATTTCTTAATGTCTGTTTAACCTCT---GAATACTAGTGAAGCCTGAGAGGTGCTGCCACCACAGCACGCCCGTCACACAGGTGGAAATTCTCTGTGTTCTATGACTATGTTCTCAGGGGAAGAAACACACAGCACCTTCATTAACATAAT a score=10072 s mm7.chr5_random 5314509 589 + 11523536 TTTAAAACTCAAGCAAATATTCACCTAAAGTATTAGTCCTTTTAAGATCTACTATTTTTCTCT------ATAAAAGGATTAGAAAGTTTGTAGTTCATTG--ATGCTAAATAATTGATTTCTGGACAATTGAGATTTTTGCTGTTGGCCTAACTCACAGC-----------CTTTTATTCAATTTGCATTGGAAT--------------------------------------------TTCAACTATCGAAAACACATAGGCAGTGCTCAAGCCCATAT---CCAGTCTGATGGCCCTTCTGAGCTCCAG-----TATCTCTTTCTGATTTTCTGCTAGCCATATCCACCTTGACTCACTGCAGGCCCCTCTTATAATGAACATGAAGCTGAACAGGACATGGTCTTC-----ACTTCACTGCCTGTGTTTTCTAGTTCTGTTCATCACATGATTTTACAACCTAGTAAGAACCCAAGGTTCGGTCTTTCTCCAGTACTTTCCATATTTTATTGTAATTTAGCCAGTTACATGGTTAAATATCATCAGATTCA-TTCCTGTGCAATAGTGGAGTCAACCAACCCCCCCCCACCTTCTTC--TACACTCTTAGGTCACTATCCATTA-ATCTCACCTAAACTTGCCC-----CAACAGATCTCCCAAATTATGA s bosTau2.chr6 41670109 650 + 69624268 TTTAAA--TCAGATAGGTGCTGATTGATTGTGTTAGTCCTCCTAAAATCTACTATTTTTTCCTTCACACATAAAA-------AAGGAGTCTAGTTAATTGCAGGGCTAAATAATTGGTTTCTAGATCATCAAATTTTATTCTACTGGCAT-ATTCTTAGCTATATCTGGAGcttttattccctttctactctcattatgttatcttgattatttccaaactatcaaaactatcaaactattcaactatcaaaaatgtacc-ctgatgtccaaatctgtatttcctggccagatctcacttctgagttttggacgcacacttcttcc---ttgtgtgatggcaatctccacctggataaactaaaagtttctcttacaatatatacaaagctaggccagacatatcccttcctaaacctctctacctatattctctacgtctaattgtaatacacaccagaaatttaagaatgaccctagattctgcttctcaccatctctttctatattt-------aatcagtcatttaattggct--atttaaccaggtgtatttcttatgcaataataaaatcaaac-ccttcttctcatctcccctggtacacgactagatcaggacttatcatctctcccttgaacttgcttccttacaatccatcttccacactatga a score=21778 s mm7.chr5_random 5321344 1474 + 11523536 CACATAGTGCAGATATTGGAAAAAAGCTAAA--AATTCTGTA-AGAATGAGAAGAGGAATACACATTTAGCACGCTGCCAACTGGAGCAGGAGGATGCCCCTCACCTCT-------CTGGAAACAG--TGACTAGG---------TGATCCCCTGAAGGATCATACAAAATGATGAAAAGAGTGGGGAAATACATGAGGGAAAAGAGGAGGAA-------GACAG-AAATGATTGAGGCACCAGGACTGAGAAAAGAAATTAGTTAGTCTTAATTGAAGAG--------------------------------------GGAATGATAATCAATTCCCCCTGAAAGACAGGTCAGAATTACAATCAACCTAGTATAATAAGCTTATAAGTACAATTTACATTTA----TTTTAACAATAAAATTACTTGAA--ATGAATTTTCCCAT--TGTGTATAATAGT--AAGACATTTTACTGTTATAGAAAAGTAACATAAAAATCTGAAAACCATTAACTAATAATTTTCTTTCCACTG-TAGACTCTTCAGAATCCAGTAAAGGTCTCCAGATCTCTGGCTCCTATC--------------AGGACCTAGAGTCATCCCTACTAGATAACTCTGCCATCT-CTTTGAACTTGCAGCTTCTGCATTAGATCTTCCACCTTCAGGAGCAGAAAAAGAAAGATCAAACATAT---------------CCATCT------GGGTCCATCTGTCTCCACTCCATGTGTGACCCAGATATTAGCCACACAGACACACAAAATTTCAGCAG-GGGCTGTGAACTAGAGTTTAGCCATGTGCT--AAGAGGGCTACTGAGCCATCTATGaataactatgaaaggtcttctattacagttttccataact-tttagtttaagaaataagcctgctgtcatttcatgaacagagataaaagtcatgatactcttaagtcaaaga-aaaagATGAGTTACACATA-----------AGTTAGAGAATCTGATTGCTTTGTTTTACTTAATTTATTGACAAATCCTGGCATCTTAGTGTCATAAAACTTTGAGAAGGG---CACATGGTATCTATATTAGATTCTATTACAGAAGAggaagc----------------taaatctttcataataagcaacaagaattcttgatctttgctctagca----atgctaccattctgttcctcttttgatttatatacaaacatcttttaaaagaAGATTT-GAATAAATAACCTCTGGTGCCTTAC-TCTAAATTAATCAAAATTCCAAAGGATTCATGAACAAATCCATCCCCAAATAGCCATACATGATTAAACATTTCTCAAGCAAGGTGCTTAGGGTAATTTGAGCAAGCCACACTAACTGAGTTATTAACAGGTTGACATATCTGGGA---TGTTTTAGAAC-------AGGAGA-TACCATCTAGATTGATCTAG-TGCAAGAGAACCACTTCTCTGCCTAGCTACATGAAAGTAGGAAAAAGT---AGTAGCTGTAAAACTCAGGAAATCATAAGT-TGTGCTGCATGGTCAGCAG--ATCCTAAGTGGAGAAGAATCTGATATGTGACTAATAGCATCtttttttttccatttttattaggtatt s bosTau2.chr6 41673096 1567 + 69624268 CATATGTGGGAGAAACTGAAAAACAAACAAACAAACAATGTGTGGGATGGAGTGGAGAATATACTTTCAGTGCTCAGCAGGCTGGGTGGGAAAG-----CCTTAGTTATGTAATAATTGGAGGCAGAGTGATTTAGAGGGATGCATAATCCCCTGAAGTAACATGCAAAGTGATGAAAAAGG---------ACATGAGGACAAAGAAGAGGAAAAACTATGAGAGCAAATGATTAGAACAGCATGGCTAAGACATGGAACTAGTTAGTCTTAATTGGGTAATTAAATATTTAATTGAAAATATTTGCAATTAATTAATTGGAAATATTACCAACTCCCTGTAAAAGATAGGTCAAAATTAAAAGCACACTAGTAAAAT--GCTTCTAAATATCTGTTACATTTAGCAGTTTTAAAAG-------ACTTTAAATATGAAGTTGACCATAGTGTGCACATTAATTAAGAAAGCTTCACT-----------ATAACCCCAAA--TTGGAAATGTCTAATGAAGTTTTTTTTTCCAAATATTAcattcatcataatccagtgaaagtcactagg----aggcacttattcatacagtcatttagagatcaaggatcctccatccagcaattttctgtaatctgctaggttcctggag-gtccgcactagatcatttatatctagccagaagacaaagaagacagaatatatggagtagtgtatgggccagttagaggaaggtagatatgccaacaattcattgg----ccagaactgcatcacatggcctcacaaaactaaaaaaacaggctgtgaaatacagtataactaaatgcccagagaggTCCAGCAAGCCACCTGTCAA-AATT----GAAGTGTCAGACTGAAATTGTAAATCATTCTTCAGATGaataagttagtccaatacagtttcatatatgttggtaaaggacataagattcctggttcagagatgaataatgcattatgcacagcaatagcactaaccagagtat-tggtttcttttttt-------gtttttgccataccccag-agttcaatcccacaaagtaatgggaaaaggttcagaagatgcctgcaataggctgtgttacaggagaggaagcataagcttaaagagcattaactttttagggtgggtaagaatcatgtctaatctttactttagggagacatgctatccctgtcttccattgctgaatgctatacaaacatctttgaaaagattgttcagaacaaatagtagttaatgcatcatatgcaaggtacacagaa-gcaaggggaattatgaagaattttgtccccaaacaGCCACATGGAAATAAATAGTTCTCAA-----TTACTTAGGA-AAATAGAGCAAGCCATTTCTAATAAGTTATTAACATCTTGAAATATCTAGAACTGTGTCCTAAAACTCTTAATAGTATACTGTTACCCAGATTACTTCAGTTACAAAGGAAATA-TGTTCCACCTCTCTCCATGAACGTGAAGAAAAGTAGAAGTAGTTGCAAAACTGAGGTATTCAGAAGTATTTACTTAATGGAAAACAGATATTCAAAGGAGAAAAAAATCTGATTT-------------TTTTGCTTTTTGTATTACTATTCTGTGTT a score=2744 s mm7.chr5_random 5323142 75 + 11523536 CCTGAAATGTTAAAGCAGACTAACATTTGAAAAAAGTTGGGGGCTAAAAGCTATTGTGAGGAAAAAACACATTAT s bosTau2.chr6 41674722 75 + 69624268 CCTAAAATGATAAAGCAAACAAATCCTTGAAGCAAGCTTAGGCATAAAATGTAGCATCTAGGAAAAACAAATTGT a score=3102 s mm7.chr5_random 5327325 117 + 11523536 TATTTTATTCCA---CCTAGTTAATGCATGCCTGGGCTTGGATAAAGTA-----ATCAAACTAAAT-TCAGTTCATTTATTACCACTTGCACCGAAACCTTTCATCTTTTTCTTGCTTAAATTTCA s bosTau2.chr6 41675543 125 + 69624268 TATTTTGTTCCTGGTCCTGCAGAATGCAAGTACAGGTTCACACCAAGTACATTCATCAGTTTGAAGATCAATTCACT-ATTGCCATTTGCACCACAATTTTCAATCTTTTGCTTATTTATATTTTA a score=3088 s mm7.chr5_random 5327727 137 + 11523536 ACAAGTTCA--ACCTAATTCCTATCATAGATTTTAATACACAGGGTAAAATGCAC---AAAGGAACAAATGAATTAATAAATAAAACAACAAGTAATCATTTTGATGCTATTAGACCATTTGTATGAGATAGCACAGGAGTA s bosTau2.chr6 41679297 129 + 69624268 ATGAGTTCATAACTGAATTTCTATAATAAATCA-------------AAAATACATTAAAAAGAAAGTAAGGGATAAATAAATAACATAGCAATTCAGCACTACGATGCAATGGGATTGTATGTGCAAGGTATCATAAAATTA a score=13351 s mm7.chr5_random 5328106 289 + 11523536 GCTTCTGATCCACAGGAAGGCATGCATCACTGTTAATTTCACACAGATTACGCAGGAGGACAAAGGCACTCTGGTTGAGCTAGTAGTAGACTCTATCGGGACCAATTACAAAGACAGATATGACGAGATCTGCAGCCACTGGGGAGGCAAGGTCCTGGGTCCAAAAATCTGGGGCTTACATTACCAACTTGAAAAGGGCAAAGGTGAAACAACTGTCCTCCAAACTGTGTTAAATGAATACAGCTGAGTTTTATGTACATAAACATAATTTTAAAAATG-TCCtttaaaa s bosTau2.chr6 37930791 286 - 69624268 GCGCCTGGTCTACAGGAAGACGTGCACCACTGTAGCCTTCACACAAGTCAACTCGGAGGACAAGAGTGCCCTGGCTAAGCTGGTGGAAG---CCATCAGGACCAATTACAATGACAGATACGATGAGATCCGTCGTCACTGGGGAGGCAGCGTCCTGGGGCC-GAAGTCAGTGGCTTGCATCACCAAGCTGGAAAAGGCGAAGGCCAAAGAGCTGGCCACCAAGCTGGGCTGAGTGTGCACTATGGAGTTTTCTGTGCATAAAAGTAATAAAAAAGATTCTCCTTCAAAA a score=27461 s mm7.chr5_random 5328548 1356 + 11523536 gagagagagagagagagagagagagagagagagagaTCAAATCTGGGATAAAGTAAAAATATATGAAGTATAGGTTTAGATCACCCATTAAGACAACTCCCAGGGATTCCACCTTGACACTAGTCTCAATGAGAGCATAACAAATGCATGAAATGATGCTTGTACCCATAAA-TGTGCTTATTAATCTC--CCTCTATGTAAT--------GCTGGTGGAGGACATCTCTTTATGAGGTTATATGAACTCAATCTCTACTTTGGAAAATTGAAATCATCATTATTAGAGTTTTATTATTATCTACCTGTGGCTAGTACAAGTCTATTCTAGAAGAAGCATAACTCACAATAATAAAGCATAATGCAAACTTCTCCCTGCTTGCTCAACCCAGAATTGAACTCTGAAATACAAATATCATGGAGATGAGTTCATTTTCATAATTGAAAATATGGAAAATACTGCATTGTCCAGCCATATTAAAGTTTCTCATTTAATTTCTAGGCAAAAGATTCC-------ACTCACTTCGTGTGACTCA-TTCTTAATTCCTGTATGGCAGATTATCTCCATGAAGTTCTGAATTCTCAGACATATAAAGTAAAAATTTCCAACAACTTTGTTC--TAGAATTCTTTTATCTATGTATAACTGGGAGCAGATAAGCAATATTCATATTAACCAATGTTCAAAGGAGTTCAAATCCCTGAA--AGAAGGTATTGGAATGACTGTG----TATTTCAGATTTTCATTTCAATTTTCGTTTTCAAA----TTAATTTAT-------TAGCCTAATATACAGACAAAACTTTTGTGTGCTATTATGTGTATGCATGCAATCCTGATTTAATTGT-----CTCTTTCACTCT-----CATA--ATTGTTGGGAAGAGGCTCCAACTGTTTATACATAGTTCTTTCCTTTAAATTTTTCTT-----TCTTTGAGGAAAAAAGTGATCTCAAAACTTAAAGTAATATATATAAATATGACTTTTAAAATAGCTTTCATAAACAAGTTGTATGTCTCTAAATTTTCTCCT------------------AAGTTACAGATAGGCATATATTATTTGCTTTAAATGTGAACAAATTCT--------TAGAAATTACCCCCATGGTG-CTGTTAT---------ATACTGCAGCTCTA-----------TAACAAACAGCTTAGGTGACT-----------ATAGCAAACGTTT-----TCTTCCAAGCCCTT--------AAGCCCCATTCCCAAAGG----------------------------AGAAAATGAAAATCCGAGTCACCCAAGCTGTTTCTTAATTCTCATCACCACCTTCACACAGATGTCATGTTTTAAAATCATGTTTTATTAT-----------------------GCATTTTGAATCACAGTGG--ATGTTTATGACATATGACATCA--TCAGTAAC---------------TTAAAAGGCAGAAGATGGAACCCATAATCT----GACGAGAAAGTGATAATT--------TTTATACAAAGGGAA s bosTau2.chr6 41680468 1469 + 69624268 GAGACATAGATCCAAAGAGAAAGTTGAAAAGATGGGTCCAGTTTTGGACAAAGTACAGAAATATGAAGTGAGGATTTAGAT-AGCTATAAAGGAAACTTCCTTGGACTCCATCTTGTGACTAGTCCAGTTGAGAATATACCAGCTGCATTAAATGCTGCTTGTACCCGTAAAATGTGTTTATTAATCTCTGCTTCTACACAGTCTACTTCTACCTGTGGAGGACTTTTCTTTATGGGGTTATTTGAACTCAATCTCTACTTCAGAAAATTGAAATCGTTATTATTATAGTTTTATTATTA-CTACCTGTAGCTAGTACAAGTCCCTTTTAGAATAGACATAACTCACAAAAATGCAGCATAATGCAAAGTTCTCTCTATTTGCCCTTTCCCAGATAGGTGTCCAAAATATAAATATTATGGAGATGAATTCA-----------------------------ACATTTTCAAACCATAATCAAGTTTCTTATTTAATCTCTTGGCAAAATATCCCTACTGGTACTCATTTCTTCTAATTCAGCTCATCTTTCCTACACAGAGAATTGTCTCCATGAG----------------CA-ACAAAATGTGTATTTGCAACTATTATTGTCAGTGGAATTATTTTATTTGGGTGCAA------ACAGATAAGCAGGGT-CACAGCAATTGATAGTCAATAGA-TCAAAATTTACAAATTAGAAGCTCTTGAAAAGTTTGTGCTCATGTTTAAGGCCTTAATTTAAATTTTGGTGTTCAAGGGATTTAATATATATCAAAGTGCTTTGATA-ATATGTAAAA--------TGCTATTATCTATA--------ATGCTGACATAACTGTGCCACCTCTAAAACTGTGAAAGCATAGTATAGTTAGGGAACGTGTCCAAGGGTAAAGAAATAGTTATTAAA---AAATTTTTTTTACTTCTCTTTGAAGATA----TGTT----AATCTTAAAACAAGATGTAGACAAGAACTTTTTAATATAGTTACCAAAAATAAGGTGAATTTCTATCATTTCTTGCCTTAAGCTATGACTATGACAAAGTTGCTAATGAATACATACTGTTCACTACATATCTAAATAACTTCCAGGAAAAGTAAAAATTGACTACCTGTTATCTGTTACTTTAATATAATAATGCAGCCCTAGAGAGTAGGTTCAATAGTGAGCTTTTATGACTCGAATACAGAAAGAAGAAAAGATGAATAATCTGCCTAACTCTTGCAATCTAAGGCCATATACCTGAATGCATCCAGTCTCATCTGATTCTTGCATTCAGAATGCAAGAAT-----GCATTCAAATAATTTGATAACCCTAAACTGCACCTCAATACAG--TTTGTCTTCTGCATTTTTTTTTCTTTATTGCATTTCCTTTCATTTTCCTTTGTATTTTGTATTTTGGTCATTATATCCAAAGAGCATGACATCACTTCACTGACAATAGGAAAGTTGTCTGAAAAGACAGAAAAAAAAA----TAGTCTTATAAATGACTAAATGCTAACTCTACATAATTTAAAAAGAAGGAA a score=12610 s mm7.chr5_random 5330257 834 + 11523536 TAGAGAAGCCCTTGGGACATGATGCAATGACCTCTCAACAAATCAAAGGCCAGAAGCAGAGCCTTTAAGACTCGACTCAAGGGAAGTCTTATTAATTTAATAACTTTGTTATGGTTGCTTGATCAGAGACTTGCAATATTCTACAAAAGCTCCATTTGCTTTCGAGTTAAATTTTTAGGCATGTCCCATTTCTGAAGAGAAGAAACTGAGGTTAGGAAATGTCAATTCATTCACATAACCCTAGCTAGTTGGGGTTAAAAATGCAGAAGAAT--CTTACTTAAAAACCAAAAGTCAGAG-AAAGGAATCAGAGACGATAAGTCCGGCACTGATACTCTTT--------CTGTCAAATAAGAAGCCTGT-------------ATCTGTAGAACTAAGTATCTTATATGCAATTCAAT-GGTAAAGATTACAGGATACACTGTTGACAGAGAAGGATAATCAAGGGGTCTAGGGCTGATGGATATGTTCCG-TTACTGGTTATTGCATTGCTAT-----CCTCTACTAA--------------------------AAATATAG---AAATAAACATAAAACACTTGAAG---------AACACATAAACACATGATTGT-------------------------------------AGGA-------------------------------------------------------------------------------GTGTAGAAACAGAGCATACTGTTGACAAATAAGACT-TCTAAAGAGACACTTTA-------CAATTTAAGAGCAGTCATTTAGAACCCAAAGTATTCTAATTGCTTGTACTCTCTCTCCTACTTAATTCTAGGAATTGCATTCTCTATAAAGTACTTTTTATTGTacacacacatgcatatactcacagaaacatgtacattcacacacacatacacacatgcacacacacaGGCATGCATGCACACTTTAAAAGACCTGTTGACagccaggcagtggtggcacatgcct s bosTau2.chr6 41682265 962 + 69624268 caGATTATCCCTTATG-CTTGTTCTGACAACTCCTAAATGGCTTACAGACCTAGAGCAGAGCATCTAAACACCTATCCCTGGGAGGTCTTATTAATTTAATGA--------GAGATATTTGATCAGAGACTCACAGTGCT-TAATAAACCTTCATTTATACTCTGGTTAAATTTTCAGGTGTTACCCACTTC---ACTGAAGTGATTGAGCTTGTTAAAGGTGAAATTACTCATATAACCCTAGCCAGCTTGG-TTAAAAATGCAAAGGACTTGCTTGTTAATGGAAAAAGAGTCAGAGTGAAGGAATTAGAGGTGATCAGCCAGAGGCCTATATTATTTTATTATTTCTCTCAACTAAGAAGTTGTTTAGATTTCAGACCATCTGAAAAACTG----TCTTGTTTGCAATTCAAAAgggaaagagagggggatgggctggctacaaagaggaaacaccaaggaatcctggagtaataggactgttctgattgttgattatcccactactctatatacatttgttaatgctaatgaaagtcctgaaaatgagaaaatttagtgtacataaat-taAAATGTATAAAGGGGAAGTGGAATGCCTAAAGAAATTTTTGTCTTGGGACCAAGTTCCAGCTATGCACTGTGGGATCTGAGGACTTATCTGATTCATCAGTGGTTAGAGTTAGATGTAGATTTAGTAGAGAGATTAGTTAGATGTACTCAGATGCAGAGTTAGTGTAGTGATGGGGCATACTATTGGCAAATTATATTCTTTAATTGGCCAGATTAGTATTGCCAATATAAAGGGAGTCTTACAGAACCCAAATTATTCTTAT--CCTGC---CTTGCATCTTCTTAATTTCAGAGATTTGGTTCCTTACAAATTGTTCGCCATT----------------CTCCTCACTAAGacacatgca--cacacacacatgcacacgcacacacacacacCC-------CACATCTCAAGAGGACATCTTACA----------------ACAAGCCT a score=31994 s mm7.chr5_random 5331244 1289 + 11523536 CTACTTGGCATCCCCTGTGACATCCTGATGTAGACTTTGATGACCAT-GGCCATGCAGACTCAAGAATACTATCAATACCCTGACCAAGTATATTCCTCCTGATTTACCCTAACCCAG---CAAGTCTCCCTCATTtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtTTGCATTGCTTTAAATTATCACTGTACT-CGCTCAATGAATAAATAAGCCAGATAAAAT-GCAAACAGGAATCACTTTTTATATACCATGAGTACTTAACCCTTAGGCCAAGCTGAATTCCAGATA--GAATC-CTG------TTCACCATG----GCACTATCCTTCCTCTCTTTTCATCCCCCATTAAACTAAGCACAGAAAAGTCACATACACATATCTAGTATTGCAAACCAGTGTATGGAAGTCTTCATTAAGTATGCCAGAAAGACCAAGGCTTCATTGTACTGAGTATCAATTCACT--CTTAT--------TGCTGCCTTCAAAGGAGGTTAAAAGCAATTCAACCAAGGCATCtaataaaaaaaaaatcaaaaaaaaaaaaaGGAATTTTGAATTTTTACTAAACTCCAAGGGACCAGAAA-TAATAAGTAGA-AAAGTAAGGTGCTCAATTGCTCCAGACCTTGGAAATATCACCCATAGCAGATATTCTCCCTTAAAAGCTTTTGGCAAGTGAAACGAAGTACATTTGGCGTGACTGAATCACTAATATCATGAACAA--TCTCACATACGCACT-CAAAGATGCTCTCTCTGTGTGTTTTGCCAACTCATAGAAGCCTTCCTAAAAGGCTTTGAGAACAAGGTCACAGAAAGCAGTGGCCCATGCAAATTTATCTCATATTTGCTCACATATATGTCCAAGAAAATGCATTGCATATCAATTATGAATGTAATTATTAAGAAATGTTAGACTGTCAAAACCTTAAATGCCAAATATTCTCCATAACACAGAGAGGCATTTGCACTCACCTTCCTTATAAAGGGCTCCATTAGAATAAAAAGGAAACACTGAATGACAATTCTAAAGAGAGTTAGCTAACACTTTATTTGTTTCTCTACATCTTTCTTTAAAACTTCTACTATCTATTCTATTAATGTTGATGTGTAAGTTGTCATCATAGGGCACATATACCTGTATGCTGAACTGCCTGAGACAACAGCCA-TATAAAGAGAGAAAAGCTTTCA-GATATAGCTGTT-TTGCTATAAGCTTCCAGGTAAATTAGTTGCTAGCTGTGTTAGTTCATTACTTATTCGAAACATTCTTAGTAGAAAG s bosTau2.chr6 41683227 1205 + 69624268 CTATTTGGCATCTGCTGAGACAAACTGA------CTTGCATGATCATTGACTATAAGGCCTCAACTCCATTCTCATT-CCTTGACCAGGTAT--TTCCTCTGGTATATGCCAACACAATGCCAGACAGCTCTCAATGCCAAAAAT-----------------------------------------------------CCTACACAGCTTTTAGTAATCACTGTACTGAACTCA--GACTGTCTTACATGCATAAAATTGAGAATAATGTCTCCTTTTTTTGTAGCAATCAGACCTAGAC-TGAGGCCAAACTGAGAATCAGATATTGAACCACTGGACTCTCTCACCAGATGCTGCAC-ACACCTCCTGTCTCTTCTTTCATCCTTAAGTTAAGCACACAAAATCCAT-CAGACAGATCTACTCACACAACTCAATGTCTGTGGGTTTTTCACTGATAC-CCAGGAGCCCTGGGGTTTTCCTGT--------TGACTCCACTACCCTACCTGACTCCTGTTGCATTCCTACATGGTTGGGAGTTAATCAACCAAAGTTTT--------------------AAGAAGAAATGGATTTTG------TGCTAAATCCCAAAAGACCAGAAAATAATGAATAGAGAAAGGGAGGAACCCAATTACTCTAGACCTTAGGAACACATCCCATATAAGGCATTCTCCCCTGAAAGCTTATGACAGATAAAA---AGTACATTTAGCTCAACTGAATGGCTGATATT-TGAACAAATTCTCTTGTATGCATTTCTAAAGTACTAT----ATATTTTCTGCCAGTTCAAAAGAATGTTCTTAAAAGGGTTTTAGAACAAGGTCACAGAAAGCAGTGGCCCATAGAAAGA-AGTTCATATTTGCTCACATATATGGCTAAGGAAATGCATCACAGATCAATTGTGAATCTCATTATTAAGAAATTTTAGGCTGTCAAAACCTTAAAAGCTATATTTTCCCTATAACACACAGATGCATTTCCACTCACCTTTCCTTTAAAGGTCTCCATTAGAATAAAAAT---ACATTGAATGGCAATCCTAAAGAGAACTAG-TCACACTTC-TCTTTTTCCATATGACTTATCTTAAAGCTTCTATTATACATTCCATTAAAACTACTATGTAAGCTATAGCTACAGGCCAGATAAACATGTAAGCTAGCTTTCTTTGGAAAATGAACACTTCAAAGAGAAAAAAACTTCCCTTTTACTGCTTTTATTGTCAAAGTCTCCCAGGTAAATTG-----TATTTATCGTAGTAGGTTGCTCATTCTAAGCAACTGTGTTAGGAAG a score=14009 s mm7.chr5_random 5335045 958 + 11523536 CTCCAAAACCCAGGTCTGTCAAAATGAAATGCAG-TCAGTATATTCTATTGTATAGCAAGTGAAAATAACTTAGCATATGACTATATAGC-TGATGACCTAGCCTTCCAATAGAACTTAAAATCCAAAGACAGG------GACAACATATCCTTC-CTGAGTTTTGTACCAATGA---TCTGATCTGAAACTTCTTTAGGATAAAACATGCACAATAGTAGAAAAAGAG----AATCTGAA----ACAGAAATTTTGAAGCAACAGCATAGTAAGACTTACATTTAATCAGCTTTTGCTTTTGAAATATAATAAGGTGGGGAATTTCAGTTCATTCAAAAACAAATAAATAAACTTGAAGAACAAATCCCCATATATTGTACTAAAGTATATATCCTAAGTAAAGCAGT------TGATTTAGAGACCACTACTTAGCACA--------GTATATGATAGTCTTACCCTAAAGCAGT----ATTACTTCAGATTTATTGT----------TTAGACATGTTAAGAAGAGTTTTTGTATACTGGACAAAAT----AAAACATCCAAAAAGTTGCAAAGGATAT-TTATGGTTATAAATCTAAGAAAAGACATCTTTCCCAGTGTTAAT-AGGAAACCAAACTTCCATAGATATTTTTAATAAAATCATATCTCTGGTAACTAAACC--ACCACCTGCCCTTATC-----ATTAGTTTTAAAGGTCAAATACTGTGATTTTTACAAGCAGCTCAAACTGTGAAATATGTGTTTAAAGAGGTAAATTCA--AGCTCCATAGAAGGCAGGAGGAAAACAAGGCCCATGCTTTGTCATCCAGTGCATCTCATTAGTTTAAATACTATTTTTCTTGCTTTTTTGCATTCAATTCTGAGTTTTCTGATTTTTT--TCACTTGCCTCTCTATCAGTTAATTCTTCTAATGCTCAAAGTCCGTGGCACTCAGCAGGCCCATGAGCATAAGCTTACACCTGTCTTTTCCCCAGTTGATAGAAGGAAAAAGTAA s bosTau2.chr6 41688983 927 + 69624268 ccctaaaggccagtggtataatgataaactacaacttggtaaataccacactatgatgggctaagattacaaagtacatggatacatctccttatctgccagattgacaagaatatttaggatctcaagacgagtaggtgaattgcatgtccttcactggattttccACCAACAGaatccagatttaaaatttcc--aggagaaaacaggcattatagttgaagaataagcacaaaatgaataggactgccattttgatgcaatag------agaattgaccttta--------------taaaaatagagca--ttttggaatttcagtacattcccaaa---------------aaagaacatacc--------------taAAGTAT------TAAGTAAAGCTGTATGCTATGATA-AGAAACCACCAGTCAGAACAATGGGACAGTGAATACTGGTCTTAAGCTAATTCATTTTAAATAAATTTAGCTTCATTTTCCCTGATAAATTAGAAA----AAGAAGAGTAACTGATTTTAGCCTAAAATGTACATAGCATCAATAAAGTCACAAGCAATTTCTTAGGGTTATTAACTGAAGAAAAAGAAGTCTTTCCAGTATTAGTTAAAAAACCAAGCTTTTCCATATTCTCTTAATGAAATCATGTCATTGGTAATTATCTCCTAAAATCTGTCCTAAAGGACAGATTAGTCCTAAAGGTCAAATCCTGAAGTTCCTACAAGATGCTTCAATTCTGAGAAATTTGTTTTAA----TAAATTCAGTAATTTTATGCAAGATAAAAATAAAACAAATTTTATGCTTACTTATTCAATATAACTCAAAACTTAAGA---------------TTTTTTAAATTCACTTTTTGTTTTTCTGATTGTTTGATTAACTTTATTTGTATCAATTCTTTTTTGTTATTCCTAGAGTCTCTGG-ACTGGCAAGACAC---------AGATTCCATCTACCTTTTATGT-GTTGATAGAA--AAAAGGCAA a score=18562 s mm7.chr5_random 5387842 734 + 11523536 TTGAATTACTAGTTTGTATCCCTTAATATCAAAATGATGTTCaattttattttttaattttcattattttaGTATAAGCCGTCTCCGCTTAAAAAATCAAATCCTCCTGGAATTCCATCATCAGGATCCTCCCGACTGCCACAGCCAAGTACTACTAGCAAAACAATTGTAGGTAATGAGATTCCATGTGACCAACTAACCAGAC-------------AAGCAAAGGAAACCATGTTAGTTGAGAAGGATATGCCAAATGTGGTTT-TTTTAGATTATTAAAAAAGTTATACATAAGAAATTTA-------GCTTAGTAGTTATTTCTGGGTAAAATAGAAGTAACTTTGAATAGCATCTAC----------------------------------------------------------------------------------AGCCAAGGTCCTTTCTTTATTACTTGAAGGCCACAATGCTTTCACACATTTTTTGTATGTGTACTTG---AAACTGTCCAATAA---------GACAGGTACT-AACAGTTTAAAGAGGA----AACCACTAAAGTG-------------------------------------AGATGTTATAAAAGGTGAGAACTGGATGC-ATCCCTTACTAATAGTTTTAAATTCTCTATTTTATAACT---------------------------ATAGGTACTAAGGAACTATTTTCCTTGTTAGAGACTCTGTTTTATATGAATTTTCTTT--CATAATATTGTTTAAAATACTGTTGCCTTTTTATTATAAGGTGTGCCCACGGGTAAAGCATCTTCAGTTAACAGTCCTTTGGGAAACAAACCTCAGACCTTATCTCCTTCTCATAGAGCGATAGCAGCCCCCCAGGCAGGGTAAGTC s bosTau2.scaffold630 62149 898 - 400943 TTGAAATACTGGTTTGTAATCCATAATCAAAATGTGATATTGA--TAAAACATTGTGTTTTCATTATTTTAGTATAAGCCGCCTGCACTTAAGAAGTTTAATTCTCCTGGGACCACCTCATCAGGATCATCACGATTACCCCAACCAAGCGGCACTAGCAAAACTGTTGTAGGTAATGAGATCT------GTCAAATAACTTGattttttttttttttaaatatCAGAA------TCAGTAGAGAAGAAAATGAAGACAGTATTCCGTTTTGGATTATTTAAAACTAGGTTTATTAGGAGTTGATGTGGAAGATAAGTAATTATTT-TGGGTAAAAATAGAGTAACTTTCAGTAGCTTCTACTTTTAGATGTTCTGTAGTCCTTTTTTAGCCTAAATGTCTGCCCTCAAGGTAGTTACTGATATATCATCTCTTCAGAGTAGTCAACCAAGGTCCTTTTCTTGATTCTTT--GTCCACAGTATTTTTTTCCCTTGTTTCTGCCTATACCTGTCTGAACTTTATAATTATCTTTAATAGGCAAATATTTAATGGTTTAAAGAAGATCTTGATTGCTGAAGTGTACCTTCATTTGTATGTAAATTGTAAGAAAGAAGTACAGAAATTAGAAATGAAGGATGCTGTATGTTGTCCCataaaaattttatttaatttttGATTTGATAATTCATTTTgattttttgccatgaagatttattgccatgaaAGCATTGTTTT----GTCAGATGCTCTGGTTAATGTGATTTTTCTTTTTCAGAGTGTTGTTAAAACTAATAC--CTTTTTTATTAAAAGGTGCTCCTTCAGGTAAAGTGTCTTCAGTTAGCAGCTCTTCGGGAAACAAACTTCAGACCTTGTCTCCCTCCCATAAAGGGATTCCAGCCCCTCATGTAGGGTAAGTC a score=3363 s mm7.chr5_random 5388961 138 + 11523536 GGCAGCCAGTGGTTTGCTGGAGAAAGACTTAAGAGACATTCTATT-GTAACTCTGTACAGAAGTAATGGGAGCTAGATGGGAGCTACAAAAGGAAGCAATATCTGAAGGGATTAGACAGGCATTCACCTCTTC-CTCCAG s bosTau2.chr29 38278471 139 - 45822729 GACAGCCCGTGGTTTGATAAGGGGAGAGTCGAGGGTCCTTCCATTGGCAGGTCTGTGCGGACGGGACTGGAGTGGGACGGGGCTTAGAAGATGAGGCGGTA-CTAAGGGGGCCCCATGTGAATGAACGTCTTCACTCCGG a score=10086 s mm7.chr5_random 5390422 892 + 11523536 TCTGGCCAGACTGTACTAAAATCCCTTCTGCACATGTTCCGTCATCTATAAGGTGGGATTATGCCTTAAG----------------AGCATGTGGAATGTACCTGGAATTCAGTGAGTGATGAACATCTGTTTCCAAGAATAAACAGCTTCCTGAACCGTGCCTGGTGTT------TCTTGATCCTGGAAAGGACTGTCCTCTGAATCATCCTATCTTGGAGGAAGGAGCCTCTTCCTAGTCCCTACCTGTAGCTCCGGAGCAGGCTGTTAGCTTGGGTTCCACCTCGTTAG-------GCCTAAGTGTTTAATTCTAAGCCATGTCACTTCCTC-TGGGGTGGGCTCCTGGGGAA--CTGGTTGTCTCTGAGTAATCAGTG--------TTCTTTCTCTCCCTCCCAGGGATGGTACTTTGAGTGAATGA--CCACCTT-----------GGAGACCGTTCTTCTGTTTCCCTTGTTACCAGCCAGG------AGGCAGAAGAGTCCACCG-------------------------GTCCAGGAAAGA----CCCATTTCCCTTGAGTTTCCAGAA-------------------------AGTACCTCATGCTTGAGAGATCAGGCCAACAACTATGGCTCTCGTCTTCAGTGCCCTGCTGTTACTGGGGCTGTGTGGAAAGATCTCTTCAGAAGGTCAGCCTGCATTCCATAACACTCCTGGGGCTATGAATTATGAATTGCCTACCACCAAATATGAGACCCAAGATACCTTCAATGCTGGGATTGTTGGCCCTCTCTACAAAATGGTGCACATCTTCCTCAACGTGGTCCAGCCGAATGACTTCCCTCTAGGTGAGTGTTGACCATGGGG------AGCATTGATTT------GCCACTCTTGGTTGC----------------TTCATGACCACGCTATCCAGACAGAAGGCAATC-----AGCACTTTACAAGGTTCAGAAGCACTG-ATTATACACGGGCAAAAAAATATTTATATAGAATTTAGAAAGAt s bosTau2.chr29 38280001 975 - 45822729 tttggcaagtc---actgagattc--tctgagtcagtttcctcatctgtaaaatgggataatgccttaagtgagttcctacctGTGGGCATGTAGAACGTTTTCAGATGTGGTTAAGTG-------TCAGCTTCTGAGACCGCATAGTCACTC---CACTGCCTGGTGTTCCTGGGTCTGGCTCCTGGCGGGGG-------------------ACCTTGTAG----------CTTTCCTGCCCCCGC-----GCTT-GGAGCAGGCT-----CTGTGTTTCTTCCCCAGCAGCGGATTAGGCTGAGCGCTTACTCTAAAGCCTGGCAGCCTCTCCACCAGGCGAGCTGCGGGTGCAGGCAGGCTGC-----AGGCATTAGTGACCCCCCGTCCCTTCTCTCCCTGCCAGGGATGCTGCTTTGATGGACTGAGTCCCCCTCCCCTGCCTGCCGGAGAACTTTCTCTGCTGCCCTTCGCTGCCTGCCAGCCTGGCCAGGAAACTGAGCACACCGTAGGCTCAACCCTCACGACACTTCTGCACAGGAACACGCTCCCGCCGTCCCCAAGGCTTCCAGAACACCCTGACGTGGGCGGCCTCCAGCACCACCTCATGTTTGGGGCATCTTGCTAGC---CATGGCCCTGCTCCTTGGCTTCCTCCTGCTGCTGGGACTCTGTGAGGACACCCTGTCAGAGGAGCTGTCATCATCCGGGTACCGTCCTGATGGTTTGGAATTCCAGTTGCCTCCAACCTCCTATCAGACCAGCGACTCTTATGATCCTGGTCTCGCTGGCTTCTTCTTTCAGATTGTACGCTTCTTTGTCCAAATTGTGCAGCCCAATGCTTTCCCTGAAGGTAAGTCCTGAGGGTGGGAAAAGGTAGAATTTGTCTCCTAACACCACTCTCGGGCACACACGCATTAGTGTTGTTAATGACAGCATGATCGGAGGAGGATATATTCTATGTGGTCAAGTATGAGATTCTGAGTGATTGAATTGCACAGGAGC-AGAAAGCATTTAGATGGAAGTTAAGAAAAT a score=4691 s mm7.chr5_random 5391367 269 + 11523536 GAAACAAAATTGAATCTTTCTGCCTGGTTGCTTTTCCATTTTATC-------------------TTGCTTTGTTTTGCTTAGAGCAACACATTG-CTTCAAATTGCGTGTGCGTGTATACACACAAAGTGAAAATTGGGATAAAAAAAATGCAAGTTCCTTGTCATGAAATGAGAGGTTGATGATCACCAGGCA-----ACTGCTGGTTATATGTCACTTAAGAATTTAACTCTTCTCTACTCACCATGA-AAACAGCTTTGATACCCTCCTTAGGGCAAGGGCAGACATGTCTA s bosTau2.chr29 38281011 263 - 45822729 AAAATGAAACTGAACTGTGTTGCCATGTTGTTCTTCCCATTCTTCACCCTCTGTCCCTGCCTTTTTTGTTTGTGTTGGTTAGAGAACTGAATTATCCTCAAGTTCC-------------TACCAAAGGTAAAAGGTAGGGT---AAAAATGCGAAGTCCCTGCCATCAAATGAGAAGTTAATAATGACCACCCATGCACACTGAAAGTTACA-----------AATTTAAC---TCTCCACCTACCATGATACGCGGTTTTGACA--CTGCTTCGGGCCAGGTCTGGTGAACCAA a score=4397 s mm7.chr5_random 5391690 268 + 11523536 ATTCTCAGG--TAGAGGGCATTTTGTGGTCAGGGTTCTTGTTCTCTGTACACAATACTGCTGCTT--CTTTGACGCT-------GTCTGTAATTCTTTAACCTGGAAGCCCTCTGGTGTGTGTGATCACGAAGACAGTCCTGGGAAGAGGACAGTGGTCCCTGTGACGAATCT----CCAG---TTG---GCCTGCATTTCTGATGAACTTCAGTTGGACCTCTCCTAAGCCTG-TCTTTAAACTACAGAGATTTGAATACTGGTATTGGTTATTCAG----------TTGGTGGCAGTC s bosTau2.chr29 38281318 289 - 45822729 AGTCTGAGGACTGGAGGGAGCTCTGCTGGCCTCGTGCAGCTGCTCTGGGTAT-GTGCCACTGTCTGGCCTTAGCACTGGGGCCAGTCTGT----------CCTGGGAAATCTTCGGGGTGTGTGTTTTCAGGAACAGGATTATGAAAATGTAAGTGGTCTATGGGAAGTGTCTGCTGCCAGGGTTTGGCAGCCTAAATTTTTATTGATTTAATGTTAGATCTAGCTTAGGCTTGTTCTTTTAACTATGAAGATTTGCATACTGTCATTGATTATTAAGTGTTATAAAATTTGTGGTAGTC a score=4535 s mm7.chr5_random 5393998 243 + 11523536 GAGAAGCCCATGTTACATCCTGAAGAGGGCTGAGATGGAATGACCTTGATAGAATGGTACTTGGGACATAGTTTTACTTTTTGGACAGAAGAGAAGAGATATGAATTGATCAGACTATGA------GTAAGTGAGC------CACGGTACAATGTGTTCTAGAACCTGATGTGGCTATCTTATGAATATCTTCCTGGCTTGGAGTTACTGAGACTGTAAGACTGCATGCTAGCCTGAGGCTCACTGAGAAGAGAG s bosTau2.chr6 5178653 247 - 69624268 GAGAAGCACAGGCTGTATCCTGGTAAATAC-AAGATGGAGAGTTCCTGTGCAGGTGGGGCTTGAGACACAGGCCTGTTCCT---GCATAGAAGAAGGGTTTAGCTTAGATTAGACCAGGAAGACAAGCAGGTAAGCATACAGCTCGGCAGAATGTGCTCTAGAACTTGGTCTGGGTATTTCACAAACTCTGCCCTGATCTGAAGCTGCAGGA---GAGATGTAGTGTCCTGGGCTT-GGCCCACGAAGAAGCGAG a score=8135 s mm7.chr5_random 5395798 601 + 11523536 TTAACTTTATTATCTGAGAGGAAAAGTTGGCCAAATATGATGTTTAAGTTGATGTAGGGA-GAGAACATGGAACAATCTGATTCCCTGGGC---ATCATTAAAATGTCCTAGCTGCTACTCCCTCCAGAACATTCTACACAGAATTGGCCTGTTGGAAGCAGTTCTGTGACTTCACAGAGTGTCTTAGGTCATGTCTGGTTGGAAGGCTTCCCAGTAGCAGAATGGGTGCCGAGCAGATCAGAGTAGAAAGGAGAGCAGACCCAGGGCTCACTTGCCATTCTC----AGTGGC-----CTTATAGGCGCTTAAGTTTCCTCAGCTCTCTTCTTTACTAAGGACCCAGTAATCAGTCCATAAGGCCTGCTTTGCCACCTGTGAATTCACTGAAATTGTC--ACAATTTTTGGAGGTAGGTGGAGTGTCATAGGTGCCATAGGCGGAGTGTCAGTTATA---ATCATATATCTCTTCGCTGGTTGGGGGACTGAGGCGGAA--AGAGTACATATTCAAGTT-----GCTAGAAAGAGGCGGACTGAGAAAGACCTTTGTTTTGGGGGACTAGTTATTTCTCTAGTAAACCTTGGTTTCCT--GCAGGTAATCTCTTTTTCCTTTTATTTT s bosTau2.chr6 5179795 598 - 69624268 TTCATATTGTTATTTGCGAGGAAGCATTGACCAAACTTGTTGCCAGAATTATTGTTGGGAAGAATACAGGAAAGAAAAGGTGTCTCCAGGAGGGATCTTTAAAATGTCCTTGCTGCTCTTCCCTTAGTAACATTCTCCATGGCGATGCCTTGTGAGAAGCAGTTCCGTTACTTTTGAAGGTGG-TTGAGCTGTGTCTCCCCAGCAGGCCCCACAGCAACAGAGCTGGT--CTAGAAGCCACGACTTGGATCCAGCGCTGGTTTACGAAGTAGTCTCTACTCCCACAAAGTGTCTGCATCTCATGGGTGCTTGTTTTTCTCTGTTTTTTTCCCCCCCTGCTATCCCCAGGGTCTG-CTGGAAGGCATACTGTGCACCATGGCAGCTTGTTTGAATCCCCCACCAACTTTGAGACGTGGATGGTG----------------------ATCTTATTTCTATTTCTTAcagccccttttacagattggaaaactaagtcaggatgagattacaggttcaaagcatacaactagccagtggcaggttgagaa--ccccgtgtctc-cAGGACTAGTTATTTCTGCCGTATTCTACAGCTTACTTGGTGGGTAAT-TTTTTTCCGTTTTGTTTT a score=57457 s mm7.chr5_random 5711247 1218 + 11523536 TTAAGATTGCTTAAGTGATATAGTGAAAAGAATCTTTGCCTAATGAGACTGCTTCT--TTCCAGGAGCTGACGTTCACAGTCAGGCCTCTGACTCGTCCTCTGTGTTACTTGAAGCTGTTAGAGGAGGGAATCCGGAAGCTGTGAGTCTGTTGTTAGAGTATGGAGCTGATGCCAACATTCCTAAGAGTTCAGGCCACCTGCCCATCCACGTGGCAGCTGACAAAGGCCATTTCCTGTAAGTTAAATTCTGTAATTGTAAATAACAGGAAATTGTAGTAACCA--------------GGTTTTTttgttgttgttgttgttgttgttTCGTTTTG---------------TTTTTAAA-----------------------GAACTGCT--------------------------------------------------------TTCGAAATATAGAAAGCCTTGGGTCTCAGATGACTGCCGCTAATTCAGAGTTTTTAACCTAAAAGAGTGGTTCTTCTAAATTTTACTTGACATCTGAGTTTCTTAACGAAGGAACTCTCACTTCCGTT------------AGGTCT-TAAATACTGGCTGATTAACATAGCACTCAGTGTAGGGATAACAGTATCATAAGCAGGTTAACTCTGCACCGTAACAACCTAA----AGTGCACTTTGAAATTCTTCCTCAGAGCTCTAAAGGTATTGGTCCCAGTCACAGACATCGCAGCCATCAAGAAGAGCGGGATCAGTCCGGTTCACTGCGCAGCAGCTGGGGCGCACCCCCACTGCCTGGAACTTCTCATTCAGGCTGGATTTGATGTGAATTTCATGCTGGATCAGAGAATCCGTAAACATTATGATGATCAACGGAAGTCAGCCTTGTATTTTGCTGTTTCAAACGGTGACCTCCCTTCAGTTAAGCTGCTTCTGAGTGCTGGAGCTCTACCCAATCAAGACCCAGTCAACTGCCTACAGATAGCTCTTAGGATGGGCAACTATGAGCTCATAAGTCTATTACTGAGGCACGGGGCCAACGTCAACTACTTCTGCCGCGTTAACCCTTTGCATTTCCCATCAGCGCTACAATACACATTGAAAGATGAAGTCATGCTCAGGATGCTGTTGAATTATGGCTATGACACTGAGCGATGTTTTGATTGTCCTCATGGAGAAAGGGTTCATCGGTTTTGTACTTTTGAAGGCTGGACATCTACAGTTATTAAAGATACTATGGTAAGCCTACAGTACTGGCATTATT-CCCTAAGCATTTATTGTCTTGTAGCGTTAGAACTGTAACAATCGGCATGATGT--GCCCTTGGAAAAGCTCTGAT s bosTau2.chr22 15148536 1328 - 48330986 TTGAGAATACTTAAGCAATACAGTGAAAAGA--CTCTGCATAACATCACTCTTTCTCCTCCTAGGAGCTAATGCTCTTGGTCAGGCCTCTGACTCTTCTTCCATCTTACTTGAAGCTGCTAGCGGAGGAAATCCAGACTCTGTGACTCTCTTGCTAGAGTATGGAGCTGATGCCAACGTCCCTAAGAATTCAGGTCACCTGCCCATTCATGTAGCAGCTGACAGAGGTCACTTGTTGTAAGTTCAACCACACTATTGCAAATA----GAAATAGTAATAGCTATGGGATTGGGGGGTGGTTTCTGGGAACTTGATATTCTTCATCTCTGATCCTCCAACTTCAACACCACTTTTTAAATTAAGAAACTCTTGACCAGCTAGGAATTGGTAAATTCAGATTCCTCTGTAGCCACTGAAGAGACATAAAACTATCTTATCAGGTCACTTGGCAATGCAGGGAGCCTTGTGTCTCA-CTGACTGG-GATAATTCTGAATTTTTTATTTAGACCTGT----------AACTTTACCTGGTATCAGAGATTTTGCATGCAGGAACTATGCCTTTTTTTTTTTTTTGGTTGGGGTGTCTAAATATTACCTGATACTAATACCACCCAGTGCTAGTATAAAGCAAGTACAAACAGGTCAATGCTGCATCTTAACAAAAAAATTTTAATGCACTTTGAAATTCTGTCTCAGAGCTCTGAAGACTTTGGTTCCCGTTACTGATTTTGCTGCCATTAAGCGGAGTGGCATCAGTCCAATTCACTGTGCAGCAGCAGGAGCACACCCCAAATGCCTGGAACTTCTCATCCAGGCGGGATTTGATGTGAATTTCATGCTCGATCAGAGAATCCGCAAACACTACGATGACCACAGGAAGTCGGCTCTGTATTTCGCTGTATCAAATGGTGACCTCTCTTCAGTTAAGCTGCTTCTGAGTGCTGGAGCTATGCCTAATCAAGACCCAGTTAACTGCCTCCAGATAGCCCTCAGGATGGGCAACTACGAGCTGGTAAGTCTGCTGCTACGGCACGGGGCGAACGTTAATTACTTCTGCAGAGTCAACCCTTTACATTTCCCATCGGCACTGCAATACACACTGAAAGACGAAGTCATGCTCAGGATGCTGCTGAATTATGGGTATGACACAGAGCTATGCTTTGATTGTCCTCATGGAGACAAAGTTCATCGTTTCTCTGCTTCTGAAGGCTGGACATCTACAGTTATCAAAGATACAATGGTAAGTACACACCATAGCAGCTGTCACCCTGTGTCGTTATTAT-TGGTGGCCCT-GAACTACAGCAACAGATAAAATTCCATTCTTTCCAGAAGCTCTGGT a score=8854 s mm7.chr5_random 5713278 537 + 11523536 CTGTAGTCCAGAAGCTTAGCCTACATATTTTTCTAGACAGCAATCACTGCACCTCCCAAACTGTGGTGAGCATTTTC----ATCCAGGGATGTTCCATCATATGGGCACAGGTGTCCATTT----------------GGATTGACCATTAGTATTTACCCACTCCAGAGGTCTGAGAAGCTTAACCTCTCTATTTACTGAGTTGCAACTTGACAGGTAGAAAACTCGGACATGTCAGAACCTCAAAATAAAAGAGCCTCTCACAGGAATCCAACCTTATCCAGCCTTAGCATTCCTTAACCCTTTG-ACACACAAGGGAAGCAAGCCCTGAAGAATTAATTGCTTTAGCTAATGTGCAGAGAGCTGACCCTTTCTTCTAAACTTGGCACTTTAAAT-GGGAGAAGGCAGCAAAGTTGTGTAAACAG-------AATGTAATCTTCAGTCACACATCTGGAAGCAAAGGCTCCCATAACGTTGC-----TCACAA-----------TTATGGAATAGTAATGACAGCGAGAACTCACGAAAGCACTTA--TATAGATGCAGAACTACCCTGAAATGCTGTCTTCT s bosTau2.scaffold7815 33031 554 + 36426 CTAAAGGCCTTGAACTTATGCAATCTTCTCTCCTAGCCAGTAGTTACTATGCTCC----------------ATTTCCCCCCATCCAAGTGTGTTCAGT-----GGGCCCTGGT--CCATTTCATGTACAGAAGCCAAGTAATGGCCATAT---TCTACTTTCTTTAGAGCCAAAGGAAGCTT----TTTCTATTTGCTTCCTTGGAGCTCACCCTGGAGAAAAGTGAGAACTGTCAGAATATCCAAATGAGAGACCCTCCTGTAGGACCTCCGTCTTATCAGACTCGAACATTCCTTAATGGTTTGAACAAACAGGGGAAGCAAGGATCAAATAATTAATTGCTTAAGTTGATGAGGGTATAGCAGCTTCTTTTCATCCAGCTTCAGACCTCAATTCAGGAAAAAGCAACAACACTCTTTAAACAGAAAATTAAATCTAATCTATACACGTAGATCTGAAAATAAAGACTCTACTCCTCTTGTAATTATCACTATGGCTCAATGTTTATCAGATATTGATCACAGGACTGGCATAACAAAGTAGTTACTTTTAGAATCCCAACCACCCAGAAATTCAATCATCT a score=39266 s mm7.chr5_random 5776420 855 + 11523536 CTGAGTGAGACAAGGGTCACACAGTGGCCTGACCGGCTCTGGTCTCTCTCTGCAGGAATGGACCTGTCAGCCAATCAGGATGAAGAGACCGATCAGGAGACCTTCCAGCTGGAGATCGACCGCGACACAAGAAAGTGTGCCTTTCGCACCCACACGGGCAAGTACTGGACACTGACGGCGACCGGAGGTGTGCAATCCACTGCGTCCACCAAGTGAGTGACACCCTACACCCCTTCATCACCTGGCCTGGCTCTTCCCCCAGGACTGGGCAGCCTGCTCGATGCCCCCACGTTGCCAGCCCCTCTTCTCTTCCCCAGGAACGCCAGCTGCTACTTTGACATCGAGTGGTGTGACCGCCGGATCACTCTGAGAGCCTCCAACGGCAAGTTTGTGACCGCCAAGAAAAATGGCCAGCTGGCCGCCTCGGTGGAGACAGCAGGTAGTCACTTGGGGGCACGTACCCTAAGCC-TGTTTCCCTAG-------------TACCCCGTGGTCAACCATCAGTCCCACCTGGACCTCTCTGTGTGTTCAGGGAATCCCTGTAAGCTG----------GTGTACCCTCAGGCCAGCAGCCTGTG-ACCCTTAGCTTCTTGGTATCCCTCTCTGCTGAGCCATTCCCTGACTGG-------------------CCCATCTTTGTTGCTGTGAAGCTCACTGGCT--CCCTTTCCCTGTGGCAGGGGACTCGGAACTCTTCCTCATGAAGCTGATTAACCGCCCCATCATCGTGTTCCGGGGGGAACACGGGTTCATTGGCTGCCGCAAGGTCACGGGCACTCTGGATGCCAACCGTTCCAGTTACGATGTCTTCCAGTTGGAATTCAATGACGGCGCCTACAACATCAAAGGTGGGTTC-------------ACTGGGTGAGG s bosTau2.chr25 4402241 880 - 41414979 CTGGGGGGTGCGGGGGTCCC----TGGTC---CTAGCTGGAGGCTCTCCCCGCAGGTATGGACCTGTCGGCCAATCAGGACGAAGAGACTGACCAAGAGACCTTCCAACTGGAGATCGACCGCGACACCAAAAAATGCGCCTTCCGCACCCACTCGGGCAAGTACTGGACGCTGACAACCACCGGGGGTGTGCAGTCCACCGCATCCACCAAGTGAGTG----CCCGCTGCCCGTGCTCGCCCAGACCGGCCCTTCCC--AGG---GGGCACCTCTCCTGACCCTGTC----------CCCCACCCCCCTACCCCAGGGACGCCAGATGCTACTTTGACATCGAGTGGCGTGATCGGAGGATTATTCTGCGTGCATCCAATGGCAAATTCGTGACGGCCAAGAAGAACGGCCAGCTGGCGGCCTCCGTGGAGACGGCAGGTAGCCACCTTGGG---CACACCTCAAGCCGCAGTTCCCTGGGGCGGGGTCTCGCTGTGCCATGGTCACTTACCAACCCCACTGGAAGCCCGCCCTGTGCCAAGTG--TCCTCCCAGGCCGCCCTCACCCCGCCTCCCCTAGGGCTGGCGTGCTGTGTGACCCCAGGCTCTTGCTGTCCCTCTCTG---AGCCACACACACCCTGGGCGTCGCACCCCCCCGGCCCCCGCCCGGATCCCCCTGAGGCTCACTGCCTTTCCCACCTCTTGGGACAGGGGACTCGGAGCTCTTCCTCATGAAGCTGATCAATCGGCCCATCATTGTGTTCCGCGGGGAGCACGGCTTCATCGGCTGTCGCAAGGTCACGGGCACCCTGGATGCCAACCGCTCCAACTATGACGTCTTCCAGCTGGAGTTCCGAGACGGTGCCTACAACATCAAAGGCAGGTGCCCCTGTGGGCGGGACTGGGTGGGG a score=37889 s mm7.chr5_random 5778457 1363 + 11523536 CCTCCTCAGACTCCACGGGCAAGTACTGGACGGTGGGTAGTGATTCCTCGGTCACCAGCAGCAGCGACACCCCTGTGGATTTCTTCCTTGAGTTCTGTGACTACAATAAGGTGGCTCTCAAGGTGGGCGGCCGCTACCTGAAGGGGGACCACGCTGGGGTCCTGAAGGCCTGCGCGGAGACTATCGACCCCGCCTCACTCTGGGAGTACTAGG-----GCCACCTGCCCTCTGCAGG--CCGCTCTCGTCAGTCCCTCCTGTTATCCTTACTCATCGGGTGGCCCTGCAGCAGGTGGCAAACCCCTTGCCTTTCAAACTGGAAACCCAAGAGAAAACGGTGCCCTTGCT-GTCACCCTCTGTGGACCCCTTTTCCCTAACTCACTGCTCCCCATGGGTCGGTGGCTGCAGACTGTCCCCAGGAGGGACTCTGGTTCCCTCTGTCCCCTTCTTT---CCATGGGGAACTCTGGCAC--CTTTCTTCTGACCTCAGTCAACTCTGAGCCTTATTTCCCCCCAGGAAGTGGCCTAGGAGAAGCTACAGGGCCTAGGGACTTACCCT------------------------GAGCTTGTAACTGGAGAccccgtccctatccccgctcccgcccccaccccacccc----acccctgctctggccccag--cctctgGAGGCCAGCCTTTTGGCGGGACTGAAGCCGGGCATGGCCAAC-CTTGCCCACAAGTGTTTTTCTGGATCTTGGCTGGAAGGCAGTCTGTCCCATCCTGCAGTGTTTGGGCCTGGCTCTTTGACTCAAAGCTAGCTAGGTGGCACTCCGTGTCGCTCCTGCACATTCTGGAAGGGGCGGGCCTCTCACCCACCTCATTCCTTTTCCCCCTGGCCTGACTGGAAGCAGAAAAATGACCAAATCAGTATTTTTTTTTTTTTCTTTAAGGAAATGTTACTGTTGAAAG-GCCCTAGGCAAGCCTGCCCTGTTGGTTGTAGTCGTGAGTGGTCTTGGGGGG----------AGATG-----CTTGGCTCCTG--------------------------------------------------------TCCCTGCCTCCCCAGCGGGTTCCC----TCCCTCCCTCCTGCCTGACCACCCCAGCTCTGGCTC---------------------------------------------TGTGATTGGTGCTCCACGTCTTCCCAGACACCTCGGGGCTCCTGGGCGGGAGAAAGCCGGATGTGCCCCTCC-CTGGGAGCCCTGGAGTAAACCTCAGGGGGCCCTTTCCCAATC------------ACCCCCTTCCACCGACCCCTC----------------AACACCATGCATCTCACTCTGGGTGTCTCGCTCCTTTATTTTTTTGTAACTGTCATTTCTATAACTCTGAAGACCCATGATAGTAAGCTTTGAACTGGAA--AATAAAGTAAAAT----CAAGTCTGCGGCCCG-----TGTGTGTCTCAGGGGAAGTGGATGCTGGAGTGGGCAGAGGGCCGGCTGGGAGGGAGGCAG s bosTau2.chr25 4403392 1373 - 41414979 CCCCTGCAGACTCCACGGGCAAGTACTGGATGGTGGGCAATGACTCGTCGGTGACCAGCAGCAGCGACAGCCCGGTGGACTTCTTCCTGGAGTTCTGCGACTACAACAAGGTGGCCATCAAGGTGGGGGGGCACTACCTGAAGGGGGACCACGCGGGGGTCCTGAAGGCCTGCGCCGACACCATCGACCCCACCACGCTGTGGGAGTACTAGGCCTGCGCCCCTGGCCCCCTCCCTGCCCCGCCCCCG------CCCCACACTAACTCTCTTCTCCTGGGGGCTCTGCTGCGGGTGGCGAGCCCCTTGCCTTTCAAACTGGAAACCC-AGAGCAAACGGTGCCCTCACCGGTCATCCCCTGGGCAGGTCGGCACTCTGAC------CTGGCCCTGG----------GCGGGCTGTCCCGG---------------CCCCCTGCCCTCTCTTCTGCGCCCTGGGCAAGGCTGGAACTTCTCTCTCCTGACCTCAGACAACTCTGAGCCTTATTTCCCC----AAAGAGGCCATGGAGGAGTGGGGGAGCTGGGAGGCCTTCCCGAGCCCCCGCCCCCCTGGAATGGCAGGGTGCGTAACTGGAATC-----TCCTGTCCCCTCCTGATCCTCCCCCACACCCCCAGGAGCCATGCTCTTGCCCCAGGCCTGTCGGTGGCCTCCCCTT----GCAACCGGA-CAGGTCAGGGCCGGCTCCTGCCC------------CTG------------------------CACACCCTGCTGTGAT----CCCGGGTCCCTGCCCC-----------------------TGTCTCTC---------------------------------------TTTGCTTTCCCTCTGGCCTGACTGGAAGCAG-AAAATGACCAAATCAGTATTTTTTT-------TTTAATGAAATGTTATTGCTGGAGGAGCCCCAGGCAAGCC--------TGGTTGTAGCCATGAGTGGGCTTGAGGGGGTCTTGAGACAGAGGACTCTTCTGGCCTCTGCGCCCTCTCCTCCCACTAGTGGTGGGGCAGGCGGGGTGCCTCCCCAAATCCAAACTCCCCCACCTTCCCAGAGGGTTTCTCCAGCCCCACCCTCCCGAGTGCCCACCCCAGGGCCGGGTCTCACCTGGTGGTGCTAGGCCCCTCACCGCCTCACCCAGGGCCCCGTGTGGTCGGTGCTCCTTGTCTGACCAGACTCCTGGG----TCTCAGCGGGATGAAGCTGGGCATCGCCCTCAGCTGGGAGCCCCCTGGAAGCCCCCACTGCCCCCCACCCCCGCCCATGGCTCCCAGCCCCTCCCCTGCCGGCTCCCCTCCCTTCCGGTTAGTGTCCACCATGCATCTCACTCTGGGTGTCTTGGTCTTTTA-TTTTTTGTAAGTGTCATTTGTATAACTCTAAACGCCCATGATAGT-AGCTTCAGACTGGAAAGAGCAAAATAAAATAACGCAAGTCTGCAACCCGGAGGCTGTGT------------GTGTGTGCTCGCGCGTGCG-------CGTTGGGATGAAGGCAG a score=6441 s mm7.chr5_random 5781307 215 + 11523536 GCATTGATTGGCTGCTGATGACGAAATGAAGAGCCCCGCGGTGTGATTGGCGGTCCCAGAGGGAAGGCATGTGGGGAGATTGACAGGGGCAGAT---GGCCACAAAGGGTCCAGTGACTTCCCGCAGGGTGGAAGCTCTGGGCCC------------------------AAGCCAGTAAAGTGTCAATGACATGG-AGAGACAGATGAATCCTTCCCAGTTGAATTCTCAGGCTCTGGTGGGG s bosTau2.chr25 4405412 241 - 41414979 GCGCTGATTGGCTGCCGATGACGAAACTGGGATGCCTGCGCTGTGATTGGTGGCCCCTGGGGGCGGGAGTCT--CGAGATTGACAAGGACAGATGGCGGCCACAAAGGGATGGTGAGCTCCCAGCGGGGTCCTGGCGACCAACCCCCACCGCTGTTCAAGCCAGGCTGGAAGCCAGAAAAGTCTCGGTGACGTGGAAGGAACAGATGAGGATTCCAGAGCCAAGCTCTTACAGACCGTTGGGG a score=18048 s mm7.chr5_random 5786819 1037 + 11523536 TATTGCTGATAAGCTTAGACATCTGTGAAAG-AAAATAAGCC---ATCTTATTTTGAAAAATAAATAAATGAGCTAACAGGCATAGAGAATCCCTTAAGTGCATTTTAAGGCAACCTCTTTCCCCTCCGATGCCCAATGTGGACTCACTTCAGGATCCCGTCAGTGCAGCCTGAGAGCGTCACATCGTTGGGATTCAAATTTGGTGATCTGCCAAAGAAAGAAGCAGTCCCTAAGCCCCGAAATCGATGCCTGGagtcaggggtagtggcttacatctgcaatcccagcacctgccctggaagacaggaggatatcaagttcaaacccagccaaggctatatacctagactctACTCCGCAGTACCTTAAGATATACACCTCACCCCTATATAACAGTTTTGTGACCGATAGCTGTATTACCCTGAGTGCAACCAATCTTGTCGTAATAGAATTATGTGGCCAGAGTACAGCTCAGTGAGAGGATGCTTGCCTAGAAGGACAGAAGGTCTGGGTCCAGTATCTAATAGCATACAGGGGCAAAAAGACTTCAAAGAAAGTCCTAGAAAATTAAATTCAATAGAACTAATAAAGCAAGAAGGCAAGATACAAAACATCAAACAAGTGAGA----------CTTTGACAGGAGCAGACGGGAAAATATGGACAACTGTCTTCAGACGCCGTACAAGAACAACCAGCAACCTTACATGTACTGTGTTTTCTGTAGGAGGACACCAACAAAGAGGCACTTGGAATTCACATGCTGCCAGATAATCTGTTTGGCTACTTTCAGGAGCTCGGTATCCATCCTTTGACCAAACAGGATGACCCTGTCAATCTGTAAGATGAAAAGAG-GAGGCTGAGATCCGGGATCCAGGCTAAAATAGACATGGATGAGCTCAG-------AGCGTCAGGATGCTTAAGGACTGATGGGTT---AGAATGCTGAGGGGAAAGGAAAGTGCAGCTCCTGAGAATGCTTAGAAGG---GATGCCACTACACCCCAACCTAGGGTGGCATCAAA--GAATCAGGGACAGCAGGGATGGGGAAGAAA s bosTau2.chr10 53567474 860 - 70001009 tgttgctgccatgccTAGACAGCTGTAAAAGCAGAATAATCTTTTATCGTGCTTAAAAAATGAAGTGGTTAGAGCAGAAACCACAGATAATCTCTAAAAGATGTTCTAACAAAGCCGCCAACCTCTCCAATGTCCATGCTATACTCACTTCAGTATCCCATCAGTACAGCCTGAGAGTGTCACATCATTGGGATTCAAATCGGTACATCTGCCAAAGAAAGAAGAAGTCACTA-------------------GCAGTTAGAAACAGTG---------------------------CCAGGAACATAG---------------------------------------AGTCACTGCCCC-CACCACCCCCACCTCTGCACCTT--------------------------------------------------------------TAATAGGGTTCCGTG-CTAGACTAGAACT------GGGGTGGACCGTCACAAAGG------GGTACGGGGCCAGGCT--------------------GAAGACTTCCGAGAAGGTTCTAGCACTAGAAGTGCAACAGAGGTAAGAGGCAGAAATGGGAAGGGGC-------CTAGAGAGTGGGAGTATCCCAAGCTTTAGTAGGGATAGACAGGAAA-TATGGATCACTATCTGCCGGCACTGAGCAAGGAACATGAGCGCCCTTACAGGTAACTTGCCCT---TAGGAGAACACCAACAAAGAGGCACTTGGGATTCACATGCTGCCAGAAGAGCTGTTTGGCTGCATTTATCAGTTTCTCATTTGTAGTCTGGCCAAAGACAATGACCCTGTCCACCTGTAAGATGAAAGGGGAGGGGCTGAGACGAGGG--------------AGGTGCCAAAGAGCTCAGGATATCAAGAGACAGGATCTCTGAGGGCAGAGGAACTAGGAGAGCTCTGAGGTGGGTGTAAATGGCCTTTCTGGAGTGTACTTAGGGTGCAAAAAGTCATTGCACCCTGACTTGAAG-AGCATCAAAGTGGAGTAGGGGTTgccaagatatgaaagcaa a score=3702 s mm7.chr5_random 5846123 78 + 11523536 TAACCATGTGGAAGTTACAGATGTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGGGGCGGCACTTGACAGGATATGAAGGGCTACTCC s bosTau2.chr29 18586361 78 + 45822729 TAAACTTACAAAAAATAAAGGTGTGTGTATGTGTGGGGTGGGGGGGGGGGCACCTAATATCATATGAAAGCCTCCACC a score=6395 s mm7.chr5_random 5852979 305 + 11523536 TTTGAGGGACATTATCATGTTGAAACCTTGAACTGGAGACTTGGCACTTCCTTGCCTCAAGGA----GACGGAAGGAAGCTCTAAGTG----------TGGAAAAGACAAGGGAAAAAAAAAAGC------------CACAGTGTATGGTAATACCAGATGATGCTAAGAAAAAAATAGAAAGAACCC-----------TTGACAGTAAACACAATCT--------AAAATAATTCCATGGGAAAATGTTCCaatttaaatagaaaatatttatatgtttattttaatattcaaataaaaaCTAACAATCATATTTTCAGTTACGACTGCTTATATCAAATGCTTAATAT s bosTau2.chr4 14572416 328 + 69556449 TTTTAGAGACATTGCAGTATAGAGTACTTGAGCTAGAAGCTCGAAAT---AGTGTCTCAGGGACAAGGAAGGAAGGAAGCTCTAAGAGAAAAGTGTGATGgaaaaggaaaggaaagaaaaaaaaaagaagaaaTAAGCAGAGTGTATGGCTATAACAGATGAGACTAAGAAAAAAATAGACAACAGTCTTACAACTTGTTTAACTGTAATCTTAATGTAGAAGGGAAAAAAAAT---ATAGGGAAATATTCCAGTTT---------GTATTCTTAGGTGAATACCACTTTT--AATAACTTTTAATACTT-TTTTTTAGGATATGACTATTT---TCACA-GCttaatat a score=4629 s mm7.chr5_random 5854809 391 + 11523536 TACTAAATACATTAATGCTTGTGTTCTACTTAAGAAAACTACAGGGTGGCAGTTATAT--TTAACATATCACTACATATG------ATATGGTATATATAATAGACATTCCATATAATGCA-TAT------TGTAGAAATGTATTATGACAAGTGTCTTGTAGCGTAAATTGAAATTTCCT---CAAG-----------ATATGTGGACATTAGCAAGTGGCTTATTACAGAACTGTAATAAGTTCTGTACAGTTTATAGTACAGTTTAT-CATGGGAGTACCCATTAAAGTCAGGAATAAGTTGTAAACAGATAAGAGTAGATATGGTATT---ATTTTTCAATC-----------------ATGATTGAATTT--AGACCAACATTTAGCTAGAAAATTAAAAATTCTAGATAACAGAAATATATGAAA-AGTGAGAGATGC s bosTau2.chr4 14581291 413 + 69556449 TGCTGaatatggtaatacttgtac--------aataaacaatatggtaatacttgtacaataaaca-atGACAATAAATGTCATTCACATTGtatatttgata-atattatatataatgtaatataaaatataCACAGatatataatgacaattttctggtaaagtacatcacagtattttgaacaagcagttcctttcatttgtacaaattaacca---------catagaccaatagta------gcac---tAACAGTAATTTTTAAACATGAAAGTATTCATTAATTTCA--ATTAAATAGTCTA-GGATGAAGACGAATATATTTTTTAGAGTTTTCAGTGTACACACCACACTAAGGATCATTGAATTTGGAGAGTGGCATTTATATAGACAATTGAAAATTATAGATAGAGGAAATATTTAAAGCAGTGTAAAATGC a score=19801 s mm7.chr5_random 5857429 844 + 11523536 atatataaatctttaaaaaaTACAATA-------------TACCAGAGTATAAA-AATTTTCAA------TGACCATTTTTACAGTTAAAATAGACTTTGTGGATCAAGAAATAAATTTTGG-----ATCATTCTAGAAACACAAACAGAAGCTGAGAGAGGAAAGAGAGAATATTAAAGAAGAAAAAATATAGGAAGAAAAATGAAAGAGTAAGACTAGAAACTAATAGATACCTATATTTAGAATATTCATAGAGCAAAATAGCCCCAACAGGGGATCAAGAAAATACAGGAAAAAAAAAAAAACAACAAAGAAACAAAACAGGAATCTGAACTTTACAAGAAG----------CAGAATAACAATATATTGAAACATATTCTCGTAGCTAAATATGTCAGTGCTAGAGAATTACCG------------TGGACTTCACATCGGTGCTTCTTCACCTGCGTGTATTTCTCTAGAAGAAA--------------AGTGGATCGTGCTGTGTATTGTTGCTCACCAAGCAAATATATCAGAAGTGTGTTTGAAGATGATTATTATTATTGCTGATAAGTTACCTGAACACCTCAAAACAG--TTTTATAAACAGAAAGTGCCTACAATATAA-AAGCAATCACTGTAACAAATGCAGGCTCCGTGTTTGATTTAAAAACCAGTGGGGACATCTGCTTGGCTGCTACCATAATTGGCTAGCAGCCTGTTGTTTTGTTCTGCTGGAAGAGGGACCTTGTGTCCTGTGTATATTCTCTCCCCTTGGTCCAGAGGGACTTGAGTTTCCATTAGATTACAAGC-TCTATACACATACCCAGACGTGTATAAAGCTCTTGCAACATTTCT------TTAAATCAGTTTTGGTTGGTTTTCAAGTACTGGATTATTTTACTT s bosTau2.chr4 14582395 854 + 69556449 atatccagagtttaaaaaaattaaatgagttaatatatgtTACTAGGGTATAGAGAATTCTCAAAAATGCTAAGTAAATTTATCATTAGGGTAGAATTTAGGGGT-AAAAAATAGATTTGGGGATTAACTGTGTGAAAGTGATAAATTGA-GCCCAGACAGTAGC-ATATATTGCCAACAAAGAGAAGACATAGGAAGAAAAAAGAATGGATAGGACAGGAATATAGAGGACTCCTATATTTAGAATGCAGATAGAGCAAGAGAAACACAA-----------------AGATGGACAGGGAAAGGACAATCAAGAAG----ATGGATATTTGATCTTTACATGAAAAATGTATGCACAGAGGAATCCTAT-TTGAAGTATGATCTAAAGTCTGGACATTTTGGTTCTAGAGCTTTGTTAGAACATTTTGATTAGCCTCAGTATCATT-CTGCTTAATCTTCCCCTATC---CTAAAGAAAACAGAGCTACAAGACACTAAATACTGTTTTGTACAATCATTCATCAAGAAAGTACATAAGAATTAT--------CTGATTATTA-----GCTAATTA-TCATGTGATAACATCAAAACAAAATTTCATAAACAGATAATGC-TACAACATGTTAGGTAATAATTATAACAAAG-------CTGTGTCTTATTTAAAAACCAGTGAG-ACATCTGCTTGGCTGCTACCATAATTGGCTACTAGCCTGTTGTTTTGTTGTGCT---AGAAGGACTTCATGTCCTGTGGATATTATTTGCTCTTGGTCCAGGGGGACTAAAATTTCCATTAGATTACAAGCTTCTATACACAGAGCCAGATGTGTGCGAGACACTTGAACAATTTCTAAGTCACTGAAAAATTTTT------CCTTTTAATACTAGGTTCATTCATTT a score=1257 s mm7.chr5_random 5858441 86 + 11523536 AAAAAATTCAtgcttataggcaacacacattctctcctatatctcaacttatctctagattacttataatactttcactaatataa s bosTau2.chr4 14583377 76 + 69556449 AGAAGATACAT-------TGCAACAAGCATTCACTCCTAT---TAACATTCTACCCAACTTCACTGTCACTCATCCATTTATATAA a score=5526 s mm7.chr5_random 5858713 717 + 11523536 ACAATTCCTCAATAACTTGTTCTCTCACTTATTCTCATTTTCATCCATAAAATGGTGTTTCAACACTTGGTCTGTGCCAGCCACTGTAGCTTCATGTTTTCTGGTGATTGCCCAAGGAACACGACTTCTACAACTCCATAGAAGACTTCTTAAATGAACCTCATAATTTCCCTCAT-----ACCAACACATAATTGGATGTCTATTTTGCATTCAAAATACATTTTCAAAAATCCTTATGTGTTCCCTTTTGCTTTTA-GATCCACTTTGGCCAAGTCTCCCTTCTATCCAGCCTCAGTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTCTGGCATCCATTTCTACCTTTCTGT-ATCCACTAGCATTG---CTCACACAGACTTTATC----AATGCAATTGAGATTTTATTA--TGCCTTCCTTAGAGTCCTTCAAAGCATTAAAATACTTCAAAGGATTTTTCTTGTTCCTAGAGTAGGGATAATCCATACATATTCCTATGCCA---------------------------TCTATTCTTACTCTTTGCTCTTCTTTCTCATCCTGCGTCTTTGTGCTTTTAGTTGTTTTAACCTATCATGCTCCTTTCCCTCCATG---GTTCACTGCAGTTGCTTGCCCTTGTCTTTAAATACTTTCCTAATTGTTTGCCCACTAAAACCTATTTACTTTTATACCTCAGTTCATTTCCT---TTATGTGTACACAAATGCAAA---------ACATCCATATATAGATGTGCATTCACCAAATAATAAA s bosTau2.chr4 14583560 611 + 69556449 ATAATTCCTAGATAGCT-----------------TCAGTTT--------AAATAGTttctcaattctt-----------------------------------------------------------------------------cttctt-------ccc-----ttttcctcatatacaaccaccaccaaaat--ctgttgattttacct-----acacattttacaaaacc-----atgttttttcctccatttaccatccatttt-----aggatcttatcattaaagtcactattaattgccctgctggtttccccacatccatccttatctctctttaatccattaataatgaaactatcagagagcttgttcttaaatgtaattcagattcacctatgtgtctctcttg--------------attaaaatttttcaaaggcttcccattgttcttaggataag-----tcactacaaatccctgtaacactccagtctcccccaacccttctgatttctcatattactcttccttaacctctctcatccagtcacagtgggctt--------------ccactgtgctcctTCCTGTCCCTGCCACTTCCTTATAGTGGTGGATCCTTACCTTTGAATGCTTTCTTAATTCTTTGCCAATTAAAAGCAATTCATTTTTAGGTATTTGTGTGTGCTCtatattatatgtatatatatacatacatatatgtacatatatatTTAGGTGTAGTAGAACTAAATGGTAAA a score=16186 s mm7.chr5_random 5860175 1228 + 11523536 AAAGCCTTTGCCGCAAGCTGAGGGTTAGGAAAAGGATATAACATGCATG-GCAGATGTGAG---ACCAAGTTAAGCAGAGAAGTCTAATAGGAAACATTTGCCACAATTCTCCTTTAAGTAA-TGTCTCTTAGGAAGGATGGTTTTGAGTGG-------TATGCAAAGTTGTCTT------ATTAACCTACAGAAAATTCCAACAGGA------TTTTGCTGGCATATTTAGTTGTAAATATTGCCACCAAATATCTTTTTGATCCTATGTTGTTCATGCTTAGCAAGCTGATAATTATCCAAGGGTGTTTCTCAAAAATGTTTTTCTGAAACACAAGTTAGCAAGGTTAAGGTTTTCA--TATCTCAGTGACAATTACACATTGTTTTCAAGTGGGTCAAGGAGTTTATGCCATTTTTTCCCCTAGAAGGCTACAATCTGTTCCTTCCGTGTTATGTTACTGAGCCAAGGATTCGAA-ACAGTTCACCATGAACTCTAAAACAATGGACAAGGGAAT--ACAAAGGAGGATATTTGTAATTTACATTTTTGGCCTGTCTGAAATGA--TTTTGAAAGTG-ACCATGTTATATCACTTTATGTTCCCCAAACATATGCAGCCTGACATATTGATTAA-----------TGAGTAAGGGAACTTC-----------ATTAATAAT--------------------TAATGCTGGTGAAGTGGAAGAGGAAGACATATAAGAGAAAAAGATCCCTCCAG-----------AATAGG-----------------------GAAGAGAGCATAAACG---------------CTACCACAATGTCAACATCAGAGTGGCATTGTCAAGGTCCAGGTGGATTTCCTTGCTTCTTTGGAGTAAGATTTTTCAGACAGGAA-TGAGTAGTACACGATAATGTTCTATGAGAATCTTATT-TCAACAGCTGAA----------------------------GGTTAAGC------------CAGTC-------ATTGAACAACAAAGACCCCCGGAAGGGCTT--ATATTGACTTGTTCAAAGTTTTAGGTTTATAAACACTACAAAAACAATCAACAGGTTAAGTT----------TAGGTTACACTCATATTCCATGGTGAAGTGTT--GTTTTCAAAACTAATACATTAAACAACAAAAACATCTCTGGTGATGACCTGAGCACATGGGGTCAGTGGTCTTGTCCAGTGATATTACAGAGAGCCTCAGCACTTGGAAGTTCAACCCTGGCTATGGGTATTTTGCTCTCAGCCATCACATTCTACTCCCCAGAAACTTATGTACAGAAACCAATGAGCAAATAAT---------ACTCGCCTGTAATTTTTGAATAGAACATTCAAAACT-TCTATTTTTATTTACAGAG s bosTau2.chr4 14585975 1347 + 69556449 AAAATCTTTACCTCAAGCTGATGTTTGGAATAAAGGCATTTCACACATGTATAGATTTGAGGAGAGCAAGTTAAGCAGAGAAGATTATTATTGAC--TTGTCCCCAGCTTTCCTGTAGGAAAATGCTCCTTATGAAGAATG--TCTGAGTGAAATTATTTATTCCACACTAACACGGGAAAATAGACAAATAAAAAAGCCTGGAAAGAAGGGTGTGTTACTGGAAT---CGATGACAAATTAGTCCCCAAAATGTCTTTCAAATACGGAAT-ATACACGTTAAGCAAGCTGATAATAATTCAAGGATGTTTTTCAAATGTGCTTTCCC---CCCAAATTTAGTAAGGTTCACATGTTTAAGTATCTTGGTGAATATT-CTCATTGTTTTCAAGTGTGTACAGAGGTTTAAGCCAACATTTCCT-GATAAGGCCACAAACTGTTCCTTCCCTGTTATGTTACAGAGTCAAGGATTCAAGCACAGATTACTGTTAACACTTATACAGTGAATAGGAATATAAACAAAGGGGCGAATCTTTGATTTAAAATTCGAATTTTTCTGAAGGGGATTTTTAAAAACGCATCATAT--TGTTAATTGAAAAGGCCTAAACCTATTCAGCAGGACATAGTACTTAAGGGTGAAGTGCTAAGAAGGGTGACTTCTAGTCAGTGCTGCTAATACTACTTGATGGAGCACCTTAGATGGTGCTGGTCAGGTAGAGAAGAGGGATCT----GAAAAGATGACCCTCTGAGGGCATCAGGAAAATAGGATTTGAGGGGTGGGATAGAAACTGGGAAGGACAGAAATACGAGTGTGACTACTTCTGCCACTGTATC-----CGTGACGGTAATGCATATGGGCAGATTAATTTGACTGCTGTTCTGAGAAAAACATTTTCACACAGAAATTGGACATTTCACAATAATGTCTTGTGAAGAACATGCTATTAACAGCTGGCAACAGCTGCTGTTAGTGGCTGGGTTGTTGGTTCAACTTTAATTCCTTACAGTTTATGGCACTTGTGCAACAAAA--TCCAGGAGAGGTTTTGATTTTGCCTAGTTTAATACTT---------------------AAAAGGCAACAGTTTGGGGTGAAAAAGTCCTAGGTTTAAGTAATATCCTGTGATGAAATATTTAATTCTGAAGATAACTGC--TTAAGAATGAAAAT-TCTCTGGT--TGA---------AGAGGGTCAGAGGTCTTGTC---TGAGTTACCCCAGAGCCTAATAACTTG------TACCTCAGTCCATCACTATCTT-CCCTCTCCCTCAACATTC-ACCCTTCAGAAGTCAGTGT-----CACCAGGGAGTGAAAAATTCAGTGATAATGAATATATAATTCATAGAAAGGATATTCCACATTCCCTATTCTTATTTAAAAGG a score=47268 s mm7.chr5_random 5861814 3799 + 11523536 ACTGTCTTGCCTTTTTGTGTTTTTTCTGGCTCAATGCTTCTC---AAACTTACCTGGTATCTGAGCAGTTCTTTAGGGGGTGCGGGGTGGGGGGGGAAGATTTCTATGCTTTCTCTAAATTTGCTTAAACAAAAATAAATAGATTAGTATATAACTACAAATACTTGAATGTTGGAATTGCTCATAGAATAACTAATCTGACCAAAGCTAAAGCACAGGTGAAATTGATGGCTAGCCTGCAAC---------------------AACTAAGATCCAGTCAAAACTA----------------------CACAGTTTAG--ACATGCC--------ACATTTATATTTTTTAGTTAAGTTTCTTTACTGTAGA-ATT--GCCTTATAACTATTAAGTTGATT-GAAAGGCTCATTTGGGATAAGGGAACAAAAACT---GATTGTCACTCACACACGGCAAAATGCTAAGCAGATGGAT--TTCTCTGCACATGAGAAC-AGTAGTTAAAATATTA----TGAGAGTGTTGTTTTTAATGATTTGACCAAG----------CATCTGG-----CAAGTACTATTGCATCAGAATT-----TCATATAAGATGTGG-AACTCTAT--GCCCTCTCCTCCCCTTAGTACCTTTTTAGGCCTTTGTAGA-ATTGAATTGTTAAATGAAAATACGTATCATCTCAAAAGAATCACAGGA--GCATGTAGGTCTGATTGTGTTGGGCTTTTTTGGCCTCTCTCAGTTGTTTAACTATGA----AGAAATTCTTAATACATGGATTATTTACTAAACTAGTGATACATTGATAGAATACATGCCCCTATTGGATCAGAGTTTAACTTTTATTACCAGATTTATTCAGATTGAGGGCCATGCTTTAATTCTTGTACCTATTAGTAATATTAAGCCCAG------------CTGCCAAAAAACAT-------CCAAAAGAT--ATTTAAATAACAGTAGTTCAGATGTAACCACCACAGCCATGAGTGGCACATTCTGACACATTAATTGAGTTAAA----GAAGAATGGTGGCACTGTTAAAAATA-----GGGGGAAACATCCTAAGAAAGCTTACAACGTAAATAC--ACATTGTAGGGACTGGCATCTAACAGCTTCCC--CAAGTGGTTAGAGCAAAACCCTATCTGTTGACTAAACTGCAGTCCTGCTATTACGCTTGATCAAGAAAGT---ACCCAAGATTGTCTCTATC-----AAAGCGAATGATCATCAGAAGAGAAGCAAACTGACTA--------------GTATTTCTGTATTTCATAAGCACAGCAACTATTTCTTAAGTAACACAACAGGGTTTCAGCAGAAAGAGGATTAAGGGTTTTATTTTCCTCAACTGAGGCACAAAATGAGGGTGATTTTTCACTTTAGC-TTTCATTTCATTTGGCTCAGGTGTCAGAGACCTATATTTATCTCCTAGTAGGCGTGGGTCTGAAGGACTGGAATGCTCAGGATGTCAATGGCTGTCAGGCGTCAGGATAACCTAGAAGATAGATGAATGGTTGAGACCCCGTGCCTCCTCCCAGAATTCTCAGCTGCTCCGCTGTGGAAATGGTGTGTTTACTTTCTGTGTCTCCTTC---AACAGTCTCCCTGAAGCCAATCTTAAGATCCTGTGACTGGGCAAGCAAGCTGTTCTAGAAGTTGGTGAGCCGA---AATTTTATTTAGGAGTATAGCTGTCTGTGTCTTTGT-GTTGATATCCTGTTATCTA--------TGA-ATTAATTATGTGAACTTTCT------GATGTGTGCCATCTGGTATAATAA-TTAATGTGCAATACTTCTCTTAAGAAGTTTATTTGCTTGCAGTTAAGGAGCTAGGGACATTTTATTTTGAGCCCTTATTTTTACATTGCCAAATCTCCCAGTTGGTTCTGT-AATTTTCTTTTTTTAGGAGGGGGCTAGGGAATTTCATTTTC--------------TTTTGAGAATTTGTGGAAACAGACTTATCCTTGAATTTTATATTTCT-----TTTTTATTTTCAAAATTTATGTTTTATGCCTAAATCTTATTTCATATCTTATTAAAATCTGTTTTTTTTAGACCTTCTT----GAATATTAATATTTTGGTCATATGACTCTAAAACCATGATTTAGACTTTGTAATTTTTGCTTTAAGATTACAAAATGTCGTTCTTAAAAATCAGAAAAGAGGCTGAGTAGACTTTGTTTGCATGCTTTGAAAGCATTTTCTGGCTTTGTGTCACTCCTGATTTAGTGAATAAAAAAAATAATGGGAAAGCTT--GTACTCTTAGCTAGTTAACTCCTAGGAAGAATG-----------GGAAAGACATACTCATCATTGATGATCACACAATTGACACTGACTGTTGTCTCCCAGATAGGTCCTTTGTGGGTCAGTGGAAGGTTTGATTATATAGCAGATATCTTTCTGCA-GGTGTGTTTCATG-TACAGCCAAGTAAACAAAAAGTGTCAACGTTTCATAAAGTAAACTCAACTGTGTGCT----------CACTTATGGATTGA---------------ATAGCTGCTTGTGCAAAAAAAGCAATTCACTCTAACTTTCCAATCGATTTTGTAGAGT-TTAGGACTGAATTAGATATGTTTCTTTAC--TGGGAAAAGGTCACTGGCTTTTTGTCTCTGGATAATGG----------------------CATGGTTGCTTACTTCTGGCTTATTATTATGAAAGTGTAGACATCTGTGTCCCTCTCTGGTTGGAA-------GGAATCTGGATCAAATGGAGACAAACAGGCCACCTGCCTTCTTCTCAGGTGTACCTAAGTAATA-----CAAGTGGATTTGTGGATCA----GTGAGACTCCTGTGAGCCTGAGAATGGG-AAGGAGAAATGCCTCTAAATGATGTACCCCAGAAACACCAATTATTTGAAACTGGATCCTTTCAGAAAGGGCAACAACAGCTTTGTAATGGGCTGATCTGATAACTTAGAAAGGAAATCAAGAAGCAGAGGATAGTAAAACAACATCA--CTTGGGAAGAAAAGCCAAATGACAAGCTCCAGGTCTCCGAAGGTTGTTTGTTGTTAGAAGAAGCAAAAATAAAAGAACAAAAACAAGCAAATGGAAAAAAACATTTCAAGTGCTGCAAAGTTAGTGCCAGAG-------GGAAGTATAGGGTTGGCCGTTCAGCGAGTGACAGC-----------------------AAAGACGACCTACTGTAAGATGGTTGATGTGACGGACATGCATGGTGCTTATGGAGCCTACTCTTCATTAAGATGAACA-CTTAAAAATTTAATCAAATATTACTACTAGTGTCTATAAATTTACCATCGTAGTT--ATTTTATGTTTGATGAAAAAAATTTACTGAATTTAAAATT----AAGAATTTCTGTAAATTGAGGGTCTGTGTGGGTCTGCACcaggccctttacatatacatcatgccatctctggcttccaggttagcttttttatgaggttgctgactatgtgaataagcgggtctctttcttgtggcttctctttgactctttcttctgtttgtttgttttgttcaattccaa---tgtgttactctttg--------------------tcttgtcttttgtattatatg---aattacattata----attgttattatcttttacaatcctctttcttttctaatgagataaacaaagggagtccatctgggtgggaggtgaggagaaggaaggagtagatgatgtcagaaaaaaaaatccattttgaataaaaGAGAAATGTTAAGGACAAAGAATTTCTGTGAATGCGTTTGTGCGTTACTGTGATTTTCCCGATAGCATTGTTTGGAGGGAAGCTGTAGTGTGCCTTACTTTTTACAACAGGAT------ACCAGAAACAGTGTTTAGTCCTAGA-AATCCTTTC-TCTTATAAACAGCTAGT--------GAAAACAGGAAATGGTCTGA-------AACTCTACTGCACAGGAATGTAGAAAGAATTA-AGTTCAGTAAACAGTTCTAGTATATCATTTGTTTTGTGTAGAGATTCAGAAAGTAGCTAAGACACTGTGTATGAAG s bosTau2.chr4 14588122 3731 + 69556449 ATTGTCTATCTTTTCCTTGTGTTA---AGGACAATGCTTCTGGGGAGACTT-TCTAGTGTCATAGCAATACTCCACAGGGACC----------------ACTTCTGTACTTTCCCTAACATTGTTTGCA---------ATAAATTA------------AAACAGTT-----TTGGAATTACTTATAGGTTGATTACTTTGAC-ACAGATAATGTGTGGATGAAAC--ATTTTTAACCTCTAACTATATTTTAGGGTGggaaagaaacacactttcagtcaaaattgggtgttagactctcatatgaaccacttattagccacatgtccattgtcagtatttatcctcttgagtctgctttctttcctgtaaatatttggacctaaaaatattaactagatttgaaaggatgtttcagggttaagaaaagagaatgagagtatatgatatgtacttagcaaaatgccaagaaggtagacagtgctcagtgcacagcatctactaAATAAAATACTAGATATTAAAATACTAGTTTTGGCCATTTGAAAAAAGTCACTCTCCTGCCTGGAATGATAGGTAATACTG-GTTATAGTTCAGCTTCATTTAGAAAGTGGTAACTCCAAAAGCCATCGTTTTTCTCGAGTGCCATTCT--------GTAAAGACTG---TATTAACTGAAAATAATTAATACCTCAAAA---TCTCAGGAAAGCA-----GCATGACTTTTCTAA-TTTCTTTATCCACT-----TTGTTTTGATATAGTATTATAGATTCTTAATAAATAATATGAATCCCAGGA-AGGGACTTATTGTTAGAAATTTTGCAATTATAGCTTCAGAGT------------AACATCTTTCATCAGACTGAGGGTAGATCCTTA-TTCTTATGCTTAACAACAGTACTAAGCACAATTCGATTTAAATCTATCATGTGATACAACTATACCAAAAGATTAATTTAAGCCAGAGTA---------------CCTTGGCAGTGCGTGACACTTTCCACATCATTAAATGAGGCAAACCAAAAAGGACCACATTACTACTTCAACCATGTACGAGAAAAACATACTAGGAA-GTTTACCAAATACATATTTACATTTCAATGACTCACTTGGAA-AACTTCCTGACAAAAGTTTGTAAATAAA-------TATTTAATAATCATTACTGTTTTCTTTCAACTTAATCAAGCAAGAGAAATTCAAACCTGTATCTATACTATGACAACAAATAGACA--------GAAGCAGATTGATTGTGTATGATTGATCTGAATTCCTGTGCTTCATAAGCAAAGGAATTA------AAATAACA------GGTTTTAACAGGAAAAGGATTAAAGGTTTTATTTTCCTCAATGGAGGGCCGAAATGAGCAAGATTTTTCAAGTTAACAGTTCACTTCATCTGGCTCAGGTGTCAGGGATCTATATTTATCTTGGTTTAGGCAT----CTGAAGTGCTGGAAGTCTCAGGATGTCAATGGCT-TCACATGTCAGGAAAACCTTAACGACAGACGAATGGTCAAGACCCTGAGCCTCATTTCTGAGTTCTCAGCTG--------TGGAAATCATGTGTTTATTTTCTGCATCTCCTCCTACAACAGTCACTCTGAAGCCAGTTTTAAGATCCTACATCTGGGCAAGCAAGCTTCTCTAAAAGTTGGTGAGCACAATTATTTTTGTGTAGGGGTGTGGCTATAAATGTCTTTGTAGTTGATGGACTATGATCAAGTAAACATTGATACTTGTTATTTCAAACTCCTTAAGAAGCTAAATACTAACTGGTGTAATAATTTAGTTTATGATA-TTGTTTCAACAGAGTTATAAGCTTTTAACTAAATGGATAGA--------CTTTTAAGACAAAATTTTCATTTCCACTAGTCTCTCAACTGATCCTATGAAATTTCCATTTATA----CATTCTCATATCTTTTATTTTCAAAGTATCAGAAAACTTTAAGTATTTTTAAAAGTACAATTTTGGTGGAACTTTTTCTTCCTTAAGATTCTTAAGTTGATCTGTCATGTCCTGT-TCTAAA-CTGATTTCTTATTTTATTTAAA-----CTTTTGTGTGCCTTGTTTTAAAAATGTTACTCTTTTG-------------AAAAGGATGCTCTCAAATTCA-ATTTTCTGCTTACAAGTTGAAAAAACATGTTTT----AATGAGATTAGAATTTGAATGACCTTTGTTCATGGGACCTAAAAATGTTTTTTGGTGTTTTGTCAAGACTGA-CAAGTATATTTAAGAAATAATCTAAAAGACTCAATCCTCTTAAC----AAAGTCTTAGAAGAAAAAAATATTTCCATAAATAAAATTACTGATCACTAGTGATCATAGAAATTATACTGACTGTTGGC-ACCAGATA-----TTTGAGGG---GAGGGAATTTTG-TTTCATGGCAGAATTTTTGTTATATGGTGTATTTCATACTATGGCTATATAAG-----------ACTTATTCAGACAGGAAACTTAAGGATATGCTTAGAGACAAATAAGTATATAATGATATACTTCTTTAGAGACAACTGCTGATACCAAAAAAGCAGTTCCATCTGACTCTATGCTT--TGTTACAAAGTCTTGAGAATGAAATAAACAGGCTTCTTTACCTTTTAAAAGAGTCACCTTCCATAATTCTTTGGAGAATGGTCTCTTGGAGCCGTGCTGAATACAGGGGAAAGCACTCTGGACTGATACTTTTAAAAGTATTAACTTCTGTTCACTTCCTATGCAAGAACTCAGGTAGGATCTGGATCAGATGGAGAGAAACAAGCAACCTGTCCTGTTCTCAGGTATACCTGACTAAGAAAAAGCAGTAGGGTTTGTGGGACAATATATGAGACTCCTGCAATCCTGGCAAGGGGAAAGGAGAAATATTTTCAAAGGATGTACAATACAAACTGTAATTATTTGGAATTTGATCCTTTTGTAAAGGACAATGACGACTTTGCAATGAATTATTCTGAGAGTTACAGAAAGAAAGCAAACACCTGAGAATAATAAAAAGATTTTAACCTGGGGAA--------AAATGGTAAGCTCCCAAACCCAGAAGAATCATTGTT--------------AGGCAAAAGAGGAAAAACAA--AAAAGGAAAAAAGGCTTTAAAATGCTAACAAATCAGTGGCAAAGACCATATAAGACTGCAGAGTGGACCAATCA---AATGAAAGAATATTTTTTTTCTTGGAATGAAGAAATACATAATAATGTACTGCCCTTGAAGTGATTAGGGCTAATTTTGCTTTTAGCATAGATTGTTGGTTGAGATCACTAGCTAAGGAATTTAA--------TATTCTTAGTATTTACAAACTAAACTTCACAGTTGAATTTTTTA------AGGAAAAATTCACAAAATTTTAAAATGAAAAAGAAGGGCTTTTAGATGAGAA-------GTACTTTTAATTGGTCAGTTGTTTATACATTGTT----------------GATTGCTCTTTGGATGAAAAT----------TGAA-AAGC-------------GTGCCATCACTTT-ACTgctgctactgctaagtcgcttcagtcgtgtccgactctgtgagaccccatagacggaagcccgccaggctcccccgtccctgggattctccaggcaagaacactggagtgggttgccatttccttctcca---------CTTTACT-ATAACCTAAAAGCAGAG-----ATCTGG------AGTGGGGAGGAGGGAGG------TGCTGCTGGA-------------------------------------------------------------------------------------------------GGAGTGATGCTGTG-------------TCTACACCAGGTTCCTGGAATCTGAAATCATGCCTAATCCAAAATGATTCTCTCAAATCACAAACAATGAATTGTTTGCCAGGAAAAGGAAACAGTCTAAACTAGGTAAGTGTGCTG----GGGATATAAAAAGAAATATAGTTTAGTAAATAGTTTTACTGTTTCGTGTGTTGCATGTTGAAGTATACATATTGACTAAGCCACTG-----GAAA a score=6414 s mm7.chr5_random 5865719 458 + 11523536 ctttctctacctcccaattgctgggattataggtatggggttccaagcactttatgcgttgctgcatatcaaaccctgggtttca---tgcaCAGCTATACCCTCAGCTCCAATAAGCTTTTATAAAAGGGAAGAAGAGGTTAAATTCCATTTTGTGTCCTTTAAAAA--TGGACCATGTGCAAAATTACATAGCATTTTTAGTTAGGTGCTTTGTAATTCTCTACTAAGTATTTGAAGATGT-----GGTGTGTCCAGAGATCTTTGTCACAGAAGCACTACCATATGAAAGAAGAAATGACAGAAAACTGGCGA------TGGAAGGGACATCTGAGACAACTTGGCAGCATTCATCAAGGG--CCAGAGCATGATCTTCTAGAAATAAACTGCTTCGCCTTTCAGTGCTTCTAAGGTTTAAAAAATGTGATAAGGACAACTTT--------TGACATt--tatcattgttattgttattatta s bosTau2.chr4 14591853 427 + 69556449 CTTTCTCTCCATTACATCTGGCAAG-TAATAAGTATG------------------------------------CCATTGGTTCCACAGTGCAC-------------TTTCTAGTCA--TTTCTTTATGGATCAGGGCAAGGTGAATTGAGCTTTGTGTCTTCTGACAAATTTAGTCTTCTGGAGAA-TAAATAACACTTTAAAATTAGGGCTTGATATTACATTGTTAAATAGTTTAAGATGTTTTGAAATATACCCAGAGACCTTTGTCACA----CACTGTCATCTCAAGGAGGAAATGAGAGAAAATTGGCAAACGTTCTGGAGGCGACATAGCAGACAGCTTGGCTGCCTTCACCAACGACTCCACAGTGAGCGCAAATAGAAGAGCACCA-TGCATCCTTCAGTGCTTGTGAACTTTAAAAGTCGAG-TGAGGACAGTTTTAAAAGTGATGAGTTTGATCTCAGTGTTGTTTCTCTTATTA a score=5095 s mm7.chr5_random 6121609 132 + 11523536 CTTGGTTTGGAGGCCCTTGCTCCAGCTTCTTTGACCCCAT------CACTCCGCTTCCGGGAA-GCTGC-TTCTCACCTGGCAGGCTCACTTCTTTCTTTGCTGTGTTCTGAGGTATAGGTTTCATTTGTGACCTGGGGA s bosTau2.chr11 54780527 140 + 87172399 CTTTGCTGGAAAGCCCTTTGTGCACTCAGCCTCACCACATGCTATGCATGCTGCCCCTAAGAACACTTCATTTTCACCTGGCATCTTTACTTCTTCCTTTGCTGTGTTCTGAGATGTAGGTTTCATTTGTGGCCTAGGAA a score=10696 s mm7.chr5_random 6121741 588 + 11523536 GAAGTGGAAAGGCCCAGTTG--GGGTGATCATTATTATAGTCCGCCCACCTGTGAAGAGGGCGCATCCATTTTGACATTCTCATTTGCTTTTC-----------CGGGAATTTTGGTATCAACTA-AGTAGATTTCATGGGAGCCCCCCACTCTGTCTTTTCTAATGT------GGAGCAGAGTATTAGATGCAGTAGACCATAGAGAA--CAGTGCCACCAGGCATCCTGG---------TGGTCACAGGAACCCCAA---GTCCCTTGGCTGGAGAAACATAACCTGAAATCTGCTTGCTGTAAAAAGGAC--TCCTAGTGCAGTCCCTAGCACAGTCCT--CTCCTGGCTGGGCCCATGTCTCCCCAGGAGGGC-TGGAAAAT----GGCTGGCCAAATCTCACAGAT--AGCCAAGGCCTGG----TGCAACTCACCATGGAGATGGCAGAGTTAGAGGACCGGCTGCCTCGCAATCGTTTGCGCAAGGCCTCTAGTACCTGAAGGAAAGGTAAATAAATATCTGCTTATGTTGATCACATGAGGGCCTCTAGGTCAGGCGTGTGGGCAGGAGTCAGCTGGGCACTCACCTTCTTGTCTGTGAGGCAGCCAAACACTAATATGAAGACACCCT s bosTau2.chr11 54780883 594 + 87172399 ggGGTGGAAAGGCCCAATTGCAGAGCGATTATTATT---GCCATCTCTCCTTTGATG-GATTGTATCCATTTCTATATTTTCACTTGCCTTCCTGCCTGGGCAGCAGAAACTTTGCTCCCAGCTGCAGTGACTCCCAT----GCATACCTATCCTACTTTTCAAATGCCAACTGGAGGCAGATTTTCAGAGAGGGGGAACAAGGGACAATCCAGAGTTACCAAGAGTCCAGGATACAATCAGGAGCCCGGGAACCTGAATCTGTCCTCTGCCTGGG----------CTGCTTTCT--CTGCTGTTGGAGAGCTGGCCCTA----AATCCCCAGTATTCTCTTGGATTCTAGCTGTGCC--TGTCTCCTTCAAAGGCTGTGGAACATCTACTTCTGACCTGCTCTCAGGGGTCAAAGTAAAACTTGAAGCCAGCAACTCACCAAGGAGAGGGTGGATCTGGGGGGTTGGCTGCAGCAGAAGCGTTTGCGTAAAGCCTCTTGGACCTGCAAGAGAGGTGAATG-----CTG-TTATGCCCGGCCTTCCAGTGC----AAGTCAGGCATGGGGAGACGAG-CAG------ACTCACCTTCTTGTCCATGAGGCAACCAAACAGTAAGATGAAGACACCCT a score=19018 s mm7.chr5_random 6328538 592 + 11523536 AAATAGGAAATTAAAATGACTTGTTTTTCAGT-----------GAAAATCTC--------CTTTGCCACATGTCCTTCCAGAATGTTCTGAGTCATTGGCACAGGC-----CACCCACACATTTTGTTGTTCCTAAATGAAAACGTCAGCGTACAATAATTTGCACTC------ACAAGCTGCTTGTTATTTTTCCTGTACATTGTGAGAACGTGACCCTGTCAGGACACCTGGGTCTCCACCATCATTTTTCCCT----GCAGAATAGTCTATTGTAAGAAAGGGCTTTCATTGAATTGCACCCCTTGGCAGGCTTTTCAGTTCACCCCTCTAA---ACTTTTCCTACTGTAACCAGAG-------TGTGTCCTCAGTCACAAGCCC--GGGCAGTAAGATGGCCCTGCTTAAACTTGGGGGATCATCTCTGATCCCTGACTCACGTCATAAAGGAAATTGATTTTTATTTTCCCAGTCAGCGGTGATTAAATGAACAATGGTTGCCGAGCAACC--TGGAAACTGGACTCTGGGTGGAGGCCAAAGCAAACAGCATCCTCCACCTGCA-CCCCAGGTACCCAGAGCATCTCTCGTGGGGCACAGTGCTTCTAGGGAATGGGTCCATCCCTCAGACTGCC s bosTau2.chr21 13584630 620 - 49724630 AGAAAGGAGATTTAAATT-----CTTTTCAGTCCTATTCCCAGGAAAGTCACAGTTACCGTCTTGCTGTGCATCCTTCCAGAATGTTTTCACTGATAGGCCCATGCGGACGCCCACACACACCTTTTTGTGTGTGTGTGAAACAATAAGAGCGGCACACCATACACTCTGTTCTGTGAACTGCTTGCTATTTTTCAGTTACATCGTGAAA-------CTAGTCAGCACACCCAGATCTCCAGCAGCGTTTTTTCTCAAGGGAAGAATATTCTGTGTTGAGAAAGGGCCTTGACTGAATCTCATCTCCTGACAGATATTTAGGGTCACCCCGCCAAGACACTTTTCCCG-TATAAATAAAGCTCTGTGTACATCCTTGTTCATAAAGCTTTGAGCAATAAAACGGGACTGCTCAAACTTGGGGGTTAATATGGCCTCTCTGACTCAGGTCATGAAGGAAATTGATTTTGATTTTCAAAGTCGGTGGGGATTAAATGAACAATGGTTGCCAGGCAACCTGTGAGAGGAGGCCTCAGAGAGGAGGCCAGAGCAAATGGTAGCCTCCACCCCCACCCCCGGGGACCCAGAGCCTCTC-----AGGCTC--TGTTTCTAGGTAATAAGCCCCT-TCTCACACTGCC a score=8119 s mm7.chr5_random 6896954 214 + 11523536 TTTGTGTACTTCCTGCAGGAGACAACCGCAGAGCGCACCAGCCGCTTCATTATAGTAACTACCAAGGCC--------------TTTTCTATGGCTTGCCGGGAATCGCCAGGAAATGGTAGGTTATTGGTGACTAATGACCCCTTTTCTTTTC-TAAAAAGCCAGCCGGGCCC--CAACTGGATTGTCAGGGCAGGCTTTCTTTGTGACCTTTGTCTGACCTCCTGCTTTT s bosTau2.scaffold70 436103 230 + 907072 TTTGCTTTCTTCCTGGGTGACCAATCCTCGGGGGCCGTAAGACTCTTCATTATATTAACTATCAGGGGCCACTGAACCAGCGCTGTGCTACAGGGCACTGGGAATTGCCAGGAAATGGTAGGTTATTGGTAAATAATGATCCCTTCTCTTTTCTTTAGAAGTCAACAAGACCCTACAGGTGTATTATCATCCCATGCCTTC-TTGTGACCTTTTTATGACCTCCTTCTTTT a score=15340 s mm7.chr5_random 6900304 552 + 11523536 TGGGGATCACGTGAACCTGCCAGCTATACGGAGCCCACTTCCACACAGTTGCCCTTGGGCAGCGATTTTCTTTTTAGTCAGGGCCCTGGGAGATGTGGAGGTGGGTTGTGGTGCTGGTGGGGGTGGGTCCATCGAGGGGGTGTGCGCAGCTTCTCATTTTCATAGCTGGGCAGAGCTGAGGGAGGCAGGTAA-GACCGTGGGCACAGCAGGATGCAGGTTTTATTTCCTTTTAAATAATTCTCTGAAGCTGTATAAACTTTATGCCCGAAAAAGAAAGGACTCTCC---TTAAATAAACACTCCCTCCATCC-ACCGCTGGCGTTCACTGCTCAAGAATGAGCCTCACCCATCCCCAAGCCCAGAAACTCCCACC-ATATCCCAAAACCTCATGTTTTTCTCTGTGACCCT-------CAATAGCCTC------CATCTCCCAGGTGCCTATCAAGG-------------TAGGCAGGGTC-CGATGACAGGTTTGTGTAAATACGGGGTTCATCTTCATGAGTGTCAAAGCCAAGCCGCAATGGGGGGACTGGAAAGGAGGAAGCTGAGAGAAAGGCGGGTGGG s bosTau2.scaffold70 438252 560 + 907072 TGGGGACCAC-TGA----GGCGGCAACGTGGTGCCCATTCCAACA-ACATCCACTTCTGCATCCAGTCTATTGTCAAGCTGGTGGTGGTGAGACCTGG--GTGCGCCGGGG-GCTGGGAGAGGAGGGGT----AAGGGGCTGTCGAC--CTTCTCATTTCCATAGCCCAGCGGGGAGCAGGGAGGTAGATAAAGCCCACAAGCATCATATGCCATGGGTTTCATTTCCTTTCGAATAATTCTCTCAAGCTGTATAAACTTTCTGCCTGAAAAATAAATGACTCCCCCCTTAAAATAAACATTTACACCATCCGAACGCCTGCGTTCACTGCCTAGGAATGAGGCTTACGCATCAGTGTACCCAGAAGCTCCCACCAAAAGCCTGCAAACTTATATTTTTCTCCATGACCCTTGGCAAACAGTATTCTTCAATCACATCTTCCAGTTACCTGTCAGAGAAAAACACATACACAAGTGGAGACGTAATAATAGATTTGTGTGAAAGCAGGGAT--------TGAATCCTAAAGCTCAGCCACATT--TCAAACTTGAAAGGAGAAATCTAAGAGGAAGGTGGGTGAG a score=8269 s mm7.chr5_random 6906146 654 + 11523536 TTGGGAATGTGGCAGTCTACTGACTGAAAGGTTTTGATGGCAAGAGACCAGATTTTTTTTCT--AATGTTACAAGGTACATCTCGAAATT---------AGATGGGGCAAAGGGAGTTTCCA--TCCCATTCTGTCCCGTGTGAAGGTGTGGTGGGGGAGCA-GGGGTGGCCGCCCAACAGGTAGGCATCAG--GCCTGCTCGGTGTGTGGGTGGCTCCCCACAGTTTAAGAGTCCTGAGTTCCTGAGTTGCAATTTTGCAGGTGTGAGAAGCAGGAAGTGTGTGGAGTCAGGGGTTGAGGCAGGAGCTTTGCTGTGTATCTCTGCCCATTTTAGTGTCTGCGGTGGGCAACTTGGCCTTCATTAACTGCTGTCC-TGGCCCAGAGTTTGCACCCCTGGGTGGGGGGTAACCTCATTTGGGTTGAGCCAACGCCTCC----------------------AAAATTAAA---------------------------------------TTTCATAAAAGTGAA-----------TTAGTTAAAG-------GCTTAGAAC-----------TTTCT--------CCAACAGGCTAGAGGGTTGGTCTTATCTGTCCACGGAGAGCAGGTGGGTGGTAACAACAACTCAAAGTCTCCTTCCCTAGAGCACTCTAGAAGCTTCCTTTCAG-------GGCTGTGAAGACACG-TGGAGACAGCCTTCACACTTCTTTTCATCCAGATGGCGTCTCCATTTTAAtttttttctttctttct s bosTau2.scaffold70 440436 719 + 907072 TTGGTGAGGCAGCATGTCAGGGGTTGATGTCTCTGAGTGGCGAGGGATGAGGTCTTTCTTCTCTACTGGGAAAGGGGAGTGTCTAGAATTGCGCAGCCAAGATGGAGCTCAG--AGTTGGCAGGTCTGTTTCT---CTGTGTGGGGGC-TGGAGGTGGAGTAAGGGGTGGCAGGCCAGC-TCTGGGCGTAAGAAGCTATTTCAGTCTAGGGGTGGCTCCCTCCAACTAAGGAGCTGGTTGTTTCTGGCTTATAGCTTTGGAGGCGTGAGGATGAGGAAG--------------------------AACTGGCCTGTGTGTCTCCACGCAGTTTATCGCCTACTTTGGGCAATGCCACCTCC-CTAATGGCCACCCACTGCCCTGGGTCTGCACACCCACAGGTGGGGCAGCCCTACTCGGGTAGAGAAAACTCCTCTGAGACACGCTCTATAAAACGGAAAAAATAAGATTTACAAGTCCCTCTGTCAGTCTGGAGAGTTGTTCCtttttaaaaaaaattaatttatttatttttaattggaggagacttgctttacactattgtgctggtttctgtcatacatcaacttgaTGGAAAGTTGTTCTTATCTGTCCCTAGAGAGCAGGTAGGTG----CA-----TCAGACTTTCTCTTCCCAGAACATTCTAGAAGTTTTTTTCATGAAGCTCAGGCTACAAAAATGAGTTGGAGGCATCTTTCACACTTACTT------AGATACTGTCT---------TTTTTTTTTTTAATTTT a score=18190 s mm7.chr5_random 6968305 836 + 11523536 atgAAGCAAGTCATCTTTAACTGCTTTTTGTCAAGCAGAATAACTGGAGTTGGTC--ATACAAAGGCATAAGCTGCTTTCACAGCCTGCA-AATGTAACGAGGTAGCATGGAGATG--GCACAGGCAGTGTAGGATGTCCTCACCCAAAGTAGGTACCGGGAGCCT--CCAGAGATGCTCCGTGTCTATGCGCAGGATTTCAAAGCTAAGACACAAACTCATAAGCCAGCATTTGCATTATAGACTACATATC-TCCTCTTCCCATAGATGAAGGG---TGCCATTCCTCAAAGGAAATCTGTACTTTAGAAATAGGACCTCTGAAATGTGTGCCAGGATAAAAATAAGTAAGTAAATCTGAGACCAATGACAGCTGTTGATGGATGGGGTTGAATAGTTCTCAATTGCACGTGGTAAGTGCTGGGAAACCAATGAGCTACACTCAGGCCA--ACAGAGTCAAAAC----AAGTAAAACAGAGAACTACGTCTATTATATTTCTATTATAATCAGCATTTATTTTCAAAACATTAAACTTTCTCCCCCTTACCCACTTTGTTCTAACAG------------------------TTTTGGAGGGCAGCTCTTCTGCCTGGAATTCCATCTACTTTCTCTCTTTGCCTTCGAGTCTTGATTTCTTGGAATA----------------CTAAAGAATCT---------------TAATCAGCTCCTTTTTCAATCAGTTGGACTATATACAGGTTGTCATTTTGGCTTAAATGAAGAAAATTATTTCCAACAGCACTTCTCTACACTTTTAAGGGAAAAGAAAGCTTTCTTCTTGATATCTCCATTTC---TATTCCTTCATTAATATAGGCAACCATTCATTTTCTGTCCACTCATTAACTTAACAAATATTT s bosTau2.chr6 57254270 874 + 69624268 ATTAAACAAGTCATTTGTAGTGTATCCTTGTCAAACAGATTAAATGTAGCCGGTCTCACACAAATGCATAAATTGCTTTCAAAATTTTCCCAATTTCAGCAACCAACAAAGAGCTAATGTTTTGGCAAAGAAACATGTCCTCATCTAACACAAAAACTGGGAGCCTTTCCATGGAGGTTTTATTGTCATGCACAGAACTG-AAAACTGAAATATCAATTCGCAAGC-AGCTTTTGTTTTTTACACAGCACAGCATCCCCTTC-------TGCAGGGCTGTGTC-TTTCTAAAAGGAAAGCTGTAATTTAGAAATAGAACCTGTGAAAACAGTGTCGGG-----------TAA--AAACCCAAGACAAATAGCAGGTGCTGATGGCTGATGCTGAATAATCCTTAATTTCAGGTGGCACACGCAAGAAAATGAATCAATTTAACTCAAGACATCACAAGATTAAAGCACATAAATAAAATGAAGAAATTTATGCACTACACTTCTGCTATAATTTTCATTTACTTTCAAAAGATTTTGCTTTCTCCTATGGATAATTTTTATTCAGAAAAGGAAAAGGTCACCTCAAAAATTCCTTTGCAAAGATGACTCTTGCAACTGGGAATTTAATCACAGT---------CCTCTGAGACCTGATTCCTTCAAATAAGTAGTTCATTATCTTCTATAATATCTCTCTCTCTCTGGCAGCACCCATTTTTTTTTTCAACTTATTTGAACATATCCAGATTTCCTCTTTTGTGAAAAAAAGTGAAACCACTTTTAACAGTATTTTCTCTCATATTTATTAGAAAAACAG--TCTATTCTTGGAGTTTCCACTTCCCTTattcattcattagtctatttatgcattca---tctatccattcattaattcaGTAAATATTT a score=5288 s mm7.chr5_random 6969704 281 + 11523536 GTACCACTGATGAAAAGTGATTAATGATATATATATAAAGGTCCCATGTTTATCCTACCATCAACTT-CTGCACAATAG-ATTTTATAACAGCAAATTGTTATAATGTTTAGTCATTGTTAACATATAATTTCACCCATAGATTTGCATGCTTTAAGGCTCTTTGAGGCAGTCTTTCAACTGCTGCTGGTGGTGGATCTTTAGACTCCACAATACAGTGCGCTTTAAAGGACATTAGTACTTCTGTGT---TCTGGCTTAAACTCAAAGATAGATGTGAGTGCTAA s bosTau2.chr6 57255441 273 + 69624268 GTGCTGTTGA-GAAAAATACTTAA--------ATAATCATGTTCTGTGTTTATGCCATCACTTATTTGCCACAAAAAAATATTTATTAAAACCAGATCATTAAAATTTTCAATAATCAATGGCACGACTTTTTTTCCAGAGATTTTCATGCTTTAAGCTTGTTCAAAGCTATCCTTTAA---CTTCTAATGATGGAATTTCAGGTACCAGGAAAGAACATGTTTTGAAAGGGATCCCTGCTTCTGTCTGTGTTAGGGTTAAGTGGAAAGCTAGCTGAGAG-GCTAA a score=11165 s mm7.chr5_random 6969985 633 + 11523536 GCACCCACAACACAGAGG--AGAGCCCCTCCCTC---------------CCCCACATCAATGAGGATTTATCCAGCCTCAGATGCCAATACTG---GGATTGAGAAATCCTGGGTTAGATGAATAAGTATGAATTCTTTATA---TTCTATGCATTCTGTGGCAGTAATGGTCAGGTAACAACTTGTCCATGACTTCA-TGAACCAGCCTACGTATATAAGGAAATAAGTCCTAATAGCCTGCTGTCAACATTCAGGTAACTATGCAGTTATCAC-CAAAAAGAAGG----ATAATAATTTCACTGCAGAGATAGGAAAAG------------GACAGGACATTGGGTAGCTGGTTTCTCAGATATCTGGGTCTGAAGCCATGTTCACATTCATAAAACTTTGTAAAG-----AAAACACTG----GGCCTTTCGTGACTTCTCTTTTAAAAATAATCCAACAAA-----TAAAAAATTAAGTCAAATAGCTTCCA--AGAATTTCCAACATTTACTGGCAATTGTATGTC----AGTTTGGgagctcttacagttta-ttgggtgtcattctaaacatttctcatgtgtgaactcactcattcctcagagtcaaatgtggggtgg--cagtatggacatctcccttatagcagataggcaagttcaggcacagagatgttaagcaatttagttaag s bosTau2.chr6 57255864 677 + 69624268 gcatctagtaggtagagggcaaggatgcttcttcaatgggctggatggtcccca---taaagaagaaccatatagctccacacgtcaatactgcctaaattgagaaaATCAGGATTAGATGAAT-AGTATGAATTGTTTCCATTTTTCCTTGCATGCCACAGCAGTGATGACCAGAAAGTAACTTGTAAATAACCGGAGCTGGCCAACTTGACTGTGTAAG---ACAAGTCTTGAAAACATTTTGTTAACATGCAGGAAACAGCGCAATTGTCCCATACAAAGGAGGTGTCATAAGAACT--AGTGGGAaggggagcaaagagcctcactgttgagaagacagtcctgagctgcttcacaggacacctgggtttgaatctaggttcacatttacacaactctgtaacttggccaagtcactaaaatgtcgcttagtttcctcatctgtgaaaacaatctgacagggtggttaaaggactagaacagataatgcCCAACAAAATAAATAACACATTCTAACAACTACATGGCTTATATTTTAGGGCCTAttattatctgcctgggtg---ttttaagcacttttaatgtattaactgagttaatcctcatgg-caaattccaggtaggttagtgttgtcatctgtttcat--cagataaggacttttaagc-----taagttaagcaacttgttcaag a score=9579 s mm7.chr5_random 6971165 386 + 11523536 TGAGCAAAGCAGACCTAGTATCTGCTCATAC------CACAA-----ACCAGTGAGTACAGAAACACA-----TAGAAGACATGTGTCCT-AGCCTCATCTTAGCGAGTCCTGCCATGTTGCTCTGTAGCAAGGCTTAGGACCAGGTGTTTCTATCAAATACAACAGGGTTGCTAACACCAGTAGTTTGATGGCAACATTTCAAAGACTAATTGGTCACCATTGGCTTTTGTAATGTCTGTCCCTGAA--------GGACCAAAGGAACTCCACATAACTCAGTACCACTCTCTGGGAAA-TAACTCAATATGCACACTACAAGCCAGACA----GTTGGATCACTAATGGGGAGGAGAGTGTCAGAGCAGCCCTTAAGCAAGAGAGATTACCTGACAGACACTGACCCTTGACAA s bosTau2.chr6 57256723 415 + 69624268 tgtgcaaaacagaaattacacctgcccacacaggtctcacaatatcagccagtgTGCACAAAAGAAAAGCTTGTCAAGGATATGGACTCTCAGGCCCATCTCTGAGAGTCCAGGTTGGTTGATCCGAGGTGGTGTTCAGAATTCTGCGTTTCCAACAAACACACCAAGCAC-CTGATACTAACGGTATGATGATAGCCCTTTGCAGAATACTTGGTCAGTCACAGGTTTTGTACTGCATGTCACTGGGTTGAAATGGGAACACAAAAGTCCATTACAACTCAATACCACCTAATGGGAAAGCAATTCAAAATATAAACCACATGCTAGTCACAAAGTCAAGCCAATGAGGGCAGAGAGAGTGTCATGGCAGCACTTAAAGAGGTGAGGTTGTCTGATGGGCACTAACTCCTAACaa a score=4908 s mm7.chr5_random 6971854 122 + 11523536 ATACTCAAAATTATTGTGCAATTACAGCTATGGTCCTGATGCAGTCAAGACATGC-ATTATCCAACAGAAACATTATAAACTAATTAATGCCTCAGGCTACTGATTATGTACT-GTGTTGAGAA s bosTau2.chr6 57258795 119 + 69624268 ATATTAAAAAATGTTATGTAATTACAATTATAATCCTTAAGCAGTCCA-ACATGTAATCATCTAACAGAAACATTGAA----AATTAATGCCCTACATTAATAATTATATACCAGTATTGAGAA a score=25617 s mm7.chr5_random 7079345 982 + 11523536 CTCAGACCTCTT-CTTTCACATATCTTCCAGGGTGATCCTAAGAACGACTTGTGGATCTTTGCCCTCAGTGTGCTTCTGAGCAGCACCTTCATCTACAACAGCATGAACACCATCAGCCATGATTCCCTGGAGAAACTACAGTATCCTTCTGGGATCTGAGCCATCACGTTTCTTTGAGTGCTCTGGAATGAATATTGAGTCGC-TGTCCTGCTCTGTCATTGTGTGGCTTTTGATGGGGCAAAGCCGAGTGTTTAGAATGA------------TTAACTTAATAAGAGAGTCATGAGAGC-ATGTGCATGATGTCCTTTTTTCTTAGCCAAGTGCCAGTTATGTCACAGAACTCACTGAGCTGATCAGAGCAAAGTCTTCACCAAATCCTGATGGAATAAAGAATTCCACAGAGTTTGTGAGTTTCTTTCCAGACTTTGTCTGGACTGTTCGGGATTTCATGCTAGAGCTGAAGTTAAATGGGGAAGACATCACAAGTGATGAGTACCTGGAGAATGCCCTGAAGCTGATCCCAGG-TACAGGAGGGCTGGGGTGGGCAGGCTGGGGAGGGAAGGCTGGGGAGGGAGGGCTCAGGAGAG-GTGCCATCTGTAGAGTGGCTCCCATGCTCAGTGGAGT--CCTTCCTATTCCCAATGGGATGGAAGTCTGCAGAAGTGCTTA-TAGGTAGTTGGTTGATAACATTTGGGAAGTG-CTGTTAATTTCATTTGGAAAGAATAGAGCCCATAGCACAGCAAAATTATTCAAGATGACATTCTTTT-----CAGTTTATACTTTAGCATGTAG-----AGTCAATGT--ATGCATGCTGAAGTCCAGACATTTGTA--------TTTCATTTGTATTGTCCTTTA-----AGAAACTGTTTTCTACCTAATTCTTATTCATGAATTTATTGTAAATAGCCCATCTT--------AAATAATATTTCACAGAGATATACATCATTCTCCTTATGGGGGAATATAGGTTTTTAATGCTGCCTTGATTGTGTTGTCTGCAAAA s bosTau2.scaffold1344 40740 989 - 254589 CTTAAATCTATTGTTTTAATGTACTCTCTAGGGTGACTCCAAGAATGACTCATGGATCTTTTCTTTGGCCGTGCTTCTGTGCAGCACCTTTATCTATAACAGTATGAGCACCATCAACAACCAGGCCCTGGAGCACTTGCAGTATCCTTCTAGGAACTGAACTATCAAGTTTCACTGAATTTATGGGGATGGAGATGGAATCACATTTCCTTCCCTGTCACAAAATTGCCTTTAATGGTGCAAAGGGGA---CTCAGAACTAAAGAGAAGGTTTTTAATTTTTTATTAGGAATGTGGGAATTGTGAGTAAGGAATTTCTTTTCCTTAATCAAGTCCTAGTTATGTGACAGAGCTCACAAAACTAATCAAAGCCAAGTCCTCTCCCAGCCCTGATGGAGAAGAAGATTGCACAGAATTTGTGACTTTCTTTCCAGACTTTATATGGGCTGTACGGGATTTCACCCTGGAGCTAAAGTTAAATGGTCATCCTATCACAGAAGATCAATACCTGGAAAATGCCTTGAAGCTGACTAAAGGTTACAG--GGCATGGCCTAGGCAG----------------------TGGGTGTTTGAATAGAGTGTGGGATCTACTAAATACTGTCCATCATCTCTAGGGTCGCATTTATATT-----TGAGATTAACATCTGTAGAAATGGTGATTAGAAACTGGGTTGCAAAGCTCTAGGGATTGAATTTTAAGTTTACTTAAGAAAAGTATG-----------AGTGAAATTATTCAAAGCCAATTTTTTCTTTATACAAGTTTTAATTTAGCACTGAGATTACATTCAGTGCTAAATCCTTCTGAAGT-CAGACACTTGTGCTCCCTATTTTAGTTTCTGCTTTTCTCCAGTAGGGAAAACAATATACTAGATAATTGCAATATAAGAA---ATTACAAAGAGAAAGTCTGTGTAATAAAAAAAAAATTTCACACAGTTACATGTTATTCTTCTCAAAAAGGGATAAATTGTTCTAATTCTTGTATAGTTATATAATCTACAAAA a score=7681 s mm7.chr5_random 7081634 545 + 11523536 TTTATAAAAATGAATTCTGTTTAGCCTTAAAGTTGTTCTCCTTCAATAATCGTGGAATTGGTCTTAGATTTGCCAATGTTGTTATTCTTAATACT--TGATTACCCTTTATTTGTGGATTTTTTCC-----CCCTAACAACTCTTGTTTTACAAGCAGTGATTAAGCCAGAAATCACCATTAGCCTCTTGTT-GTTCAGTGAACAGGACACCA--CAGCTAC------AGTATGCTTGACACCATGTTCAGGTCTGTGGATTTCAGCCATAGGCTTCTCC-ACTGAATCAAATAACTCCTGAAATATTTCATCAGACTTCTACCAAGTACAGACTTGTTATACCTTTGACAGGCAAAGAAATGTTGCATATTATATGGTAAAGAGTCTGTAAGTGCAGAACTTTTCACATAGAACAGGGCCTCCTTCATCTGT----------------TCTCTGTGCT--AAGACTCCAGTTGTTTTG-----TGTTTTCTCCAACACCAGGTTACAATCCCAGAGTGCAAGCATCCAATTCAGCCAGGGAATGCATCAGATGTTTCTTTCCTAACCGGAAGTGTTTTGTCTTT s bosTau2.scaffold1344 42372 536 - 254589 TTTGTACAAATAA-----TTTTAACATCAAAATAGTTCTCCTTCAATAATC----------------AAATGTCATTCCTAACATTTCTGATATTGTCCACTATCCT--GTTTGTGGCTCTTCTTTTTGGTCCCAGAGATCAGTTCTTACATAAGACTAAGTAGAGCAAACATTTATATTTGACCTTTTATTCTTTTAACCATTAGTACAGCAAACATCTAATAAAGAAATATTCT----ACCATGTTCAGTTCTGGGGATGCTAGCTATAGGTTTCTTTTACTGGATTAGACATCTCCCCAAATATCTCTCTGG--TTATATCA---------TTGGTGTAAGTCTGATGTGCAAAGAAGTACTGAATGTC-TGTTTTAAAGGAGTTATTACCATAAAAGTC---------AACAAGAATACACAAATCTGTCGTGAACACTTTTGGCTCTCT-TGCTGTAAGACTATTTCTGCTTTAATCTCTGTTTCTCCGTCCCTTAGGCAAGAATATGAAGGTACAAACATCAAATTTATGCAAAGAGTGCATCAGGGAGTTCTTTCCAACACGGAAGTGTTTTGTCTTT a score=17982 s mm7.chr5_random 7143433 1031 + 11523536 ATTTCCTCATTTTGATATTTTGCTTGAAGAAATTGAACTTTGTTTTGTGTGTTT-GTGGGGTA------GGAGGT----AGCTGCAAGTGTCCAT--TGCTTAGTCC----GTTGATGGAAAATAATAAAAAATAAATTCAA--ACATTGTCCTAAC---CCTCAAGTTCTGAGGACACTAGCTAATCTG-----TTTCTTTTCTTCTATTCTTCGTGTTACCTTTGCACTGCCTGCTAAATATTTC-------------TAATACAC--------TGCTTGCATTTTGAAGATATTGCATAAAAAAGCATAA-TCTATGTATTCGTTACCTAGAATTTAACATCTTTAACACATCTCTTAATACATCACCAAATAAAAATACAGAAACTTACAGAAAACATCCTGTAAATTTCATTTAGCATC-TTTAACCATTTATGAAAATACTGAATTATATTTAAGCAATGCTTGGCTATAATACAGGTGTTTTCACTG-ATTATGGAAACTTCAGAGAAATC----CAAAGTGC----------TATTTCAATTTTATCTCTGAACGAATACCCTGAGCAAAACTAAGT-ACCAACAGAGTGTATA--------------TGGAGTCCTCATGTTTTGATTTTAAAATTATTAGTCTTATGAGCTAATGTAATCAGTGCACACACATGTTTTAATGACATTCAATATAATTAATTAAATTTCTAAAAGTAAGTAATAA------CTTAAAAACAGTATCATCTAAGGCTAAATTTACTT--------------------GTGAATTTAGGAGTCATTGCATAGGGAATAATGGATATTAATAAGTGTATATAGTTAGGAAGGTACAGATATCTTTTTTT-------------AGAACTAAATGGAGTGT-TTTTGTCTGGAGCACATA-----CAGAGTA----TGTGACTAATGACAAGCTTGATGACTTGTGGAAGACCTTGAATGCTACATTAGAAAATGAGTTCTTAATTTGTGGGGTAATGGAGCATCATGGATAAAGTTAATAGGGAACATTTGTCATTAAAACCATGCCTTTCACAGAAGCATCTTCATGTAAAGAATACAAATTGCAATGGTTGTAACAAGACTGGTTTTCATTGTAAAAAGGAGGCAAAAATAAA s bosTau2.scaffold1137 18940 1128 - 278543 attccctgatctc-----tttgctggagagaac--agtcttgtcttatatattttgtacagtgcctgttggtggttatgggctgcaagcctctctggtacacagtacaagggtttatggcatataaaatgaaa---actcaaggatattcccttatcattcctcaagttttgtgttatctagccaatttgcctcttttttttttttctatttttcagatccctttaatat--cttggttaacatttaatactgtcagttataatttacagagtatttaattgtatttagg-gagagagaataagagaaaataaatctatacaaccttGTTCTAGACTCCACCATTATTCATAAGTC----AGTACACAACTAAGCAAGGTTGTGGAAACCTGTGT------TTCTGTAAATGTTCTCTAACAGGGTTCAGCCACTGATAAAAATACTGACTTGCATTGGAG-AGTCTTTCATTTTTGTACAAATGATTTCACTTCATAACATGATTTTAACAGAAATCATACCAAGGTGCCTATTGTTATTATCAGAATTTTACTGCTGAAGGATGTCCAGGAATAATTCTCAATGACAAATATATTATATGAAAAGGGTTGGAAGTGGAGTTTTAGTCCTGTCATTCCAAA-TTGTGACTTCTGTCGGCTAATCCGGTCAAAGGAAA-ATATGTTTTATAGTGGTTCAAAAGAATTTATTACCTTCttaaa--ttaattataaaatattCTGAGAGGTAATATTGTCTGAGATCAGTCTTAACAAGGATAGAATGTTGACAGGAGTAAATCT--GAGGCATGCAAGAAAGAATAACAGACATTGGTAAATGCATGAGGTGGTAAAGATATGGGAGttttttttttttttttttttAAAGAACTGAATATAATGCATTTTATTTGAAACACATAGTAAAATGAGTAATATTGTGAGTAATTGCAAACTTGGAGATTTATAGAAGGCTTCAAGTGTTATTCTAGAAACTTTGTTCCTAATTTATGAGGCAGTGAAGAATCTTGAATAAATTTAGTAGGGCATATTTGTCATTGCATTCATGCCTTTTTGAGAAGCATCTGAATATGGACTATA-AAACCACAATAGTTGTGACAATAGTGGTTTACATAGT-AAAAGGAGATGAAATAAAA a score=199 s mm7.chr5_random 7925223 43 + 11523536 atgagagctatactttacaacagatggagactattacaaata---a s bosTau2.scaffold17601 884 45 + 4985 ATGAAAG-TAAGTCTTAGATCAAATTCTGCCTAGCACATATATTTG a score=22193 s mm7.chr5_random 7925266 378 + 11523536 tcaaaagtggatcaaaCTTCCTGTCCCGGCCGCCATCGGAGAGCAGCAGCCATGGCTCTGCGCTACCCCATGGCCGTGGGCCTCAACAAGGGCCACAAGGTGACAAA---------CAAGCCGAGACACAGCTGGCGAATCGGGCGCCTCACTAAACACACCAAGTTCGTGCGGGACATGATCCGGGAGGTGTG----------------------CGAGCCATGGAGTTGCTCAAAGTGTCCAAGGCCAGGCGCGCACTCAAGTTCATTAAGAAGAGGGTGGGCACGCACATCCGCGCCAAGAGAAAGCGGGAGGAGCTGAGCAATGTGCTGGCAGCCATGAGGAAGGCGGCGGCCAAGGATTGATGAACCCTCCCC------------CAATAAAAGATGGTTCCTACAAAAAAAAAAA s bosTau2.chr1 62992731 421 + 102834029 tcaaactcatattcaGCCTTCCGCCGCGGCAGCCATTGTGGAACAACAGCCATGGCTCTGTGCTACCCCATGGCCGTGGGCCTCAACAAGGGTCACAAGGTGACCAAGAACATGGGCAAGCCGAGGCACAGCTGCCGCCGCGGGCATCTCACCAAACACACCAAGTTCGTGCGGGACATGATCCGGGAGGTGTGTGGCTTAGCCCCTTACGAGCGACGAGCCATGGAGCTGCTCAAGGTCTCCAAGGACAAGCGGGCCCTCAAGTTCATCAAGAAAAGGGTGGGGACACATATCCACGCGAAGAGGGAAAGAGAGGAGCTGAGCAACGTCTTGGCCGCCATGAGGAAAGCGGCAGCCAAGAAGGACTGAGCCCTTCTCTGTTCACAATCACAATAAATCGTGCCCCCCCCCAAAAAAAAAA a score=11934 s mm7.chr5_random 7926158 379 + 11523536 agagagaga--------ggtggggagcaatgtggtttaGGTGTAGCTATGGGATAACTACAGGGGAGACTCACGGCAGAAGCTGCTGTTCCTCCAGATAGGTGGCTTGAGCCCCTGGTTCTGGCAGGCATCTTCAAAGGACTGCAGAGAATCACAAAGAGCACGGAAGAGCTCTCTGAATTCACAGAAGCTGTTCATACACTTCAGCAAGAAGGGCTTGATGGGTACCCGGGAGGAACAATGGGCCCAGGCAGGACCCTGAAGGGCAGTTTGGCAGTTTGCCTGGGCTTTCTCAAAGTCAATGGGCCTGCATTTTCCATTCATGATCTCCTGCTGTTCCACTTGGAGGTTCTGCCCTTCGATTTTCT-GGCAACTAGAATGGGAAAAG s bosTau2.chr25 32249897 374 + 41414979 AGAGAGAGACACACACAGATGAAAAGAA----GGTTTGGGAGCAGTCTAGGGGTGGCCGGAGGGGACACTCACGGCAGAAGCTGCTGTTTCTCCAGATGGGAGGCCTGATGCCCCGGGCTTGGCAGGCGGTCGCGAAGGCTTGCAGAGACTGGCAGAGGGTGCTGCTCAGGCCTCCAAACTCACAGAGGCTGTCGGTGCATCTGACCAAGAAGGGACTGAGGATCACGCGGCTGGCACACCTTGCCCAGCCTGGAGTCTGAAAGACTGCCTGGCATTGCTCCTTGGCTCTCTCCAGGTCAGCTGGCTGGCAGGT--CGTTTCTGG-CTCCTCCGATTCTTC-------TTCGGCCTTGTCATCATCTCGGCAACTGGGAAGGGAAAGG a score=40453 s mm7.chr5_random 8396624 1490 + 11523536 ACATACTCCTGTGAACTTGGAGACAAAGCCTGCTAGT---CTCTCTTGGAAGCCTATCCTTCAACTTGCTGGGCTATAGTCTAATCTCACCAAATTCCCATCCAATCTACTGTGGTTCCTGCTACTTGCGGACTACTGAAATGAGGACT-----GGATATGGCATTCAGCTGCAAACAGTAAAGTATTGGATTCAACAC------------TTTCTACCATAAGTTTTAAACCTTAGAGATAAAGTACAAAAGATATGATTTTCTCAGATATCAAAAACCCCCTCA---TCATTGGGATGCACAATTTCTTACAAT-TATTACATTTTCAATGACCTAACCAATTCAGTTTTAGTATCTGCATTTTAAAGATGAGGAAGAC----------------AAATCTGGGGTCACATGCTGAGCCTGCAATGAAAGAAAATTCTAATCTACATAGGCCTGG--TACTAAGGATGTTGGTTCCTACACTTCATGATGTTCCCCACCATCCCCACCAAGGTATGCTTAATGGA-------TTATTCCAGGCCAACTCAGCTAGACATGAAAACCCATTATGGGGCCTTTCTCCATCAATGAAAGGCATTTCTTCCCTTCTCACCTTTCAACATGGAAAATTAAGAAATGAATAGCCCATGACAATAGGAAGTCCTAGAACAATGTAGC-ATGCTTCATTTACCTGTTTAACCACAAAGACTATCTCAC-AATAGGTGTCTACAAAGTTCTTGCTGAGTGCACTTTAATATAGAGAGAACTTTAAACTATTTTCTATAATCTAAACTAGCAAGGCTAATGATAAACTGTGAAGAAATAAAAGTAC-------CTCTTTTCATTATTCAGA--CAATTACTGCTAA------------------------------------------ATATTCACATATTAATATTCAT-----------------GCCTGAATGATAGATATGTTTT-AGTCACCATATCATTATATGTTAAAATTAAACA----GTTATTTTTTAATAGTGTCCACTTTCCTTTCATTAGAATAGAGCAAAATTTTTGTGCAGGAAAAAAAATTTTAAATGCAAAGGATAAAATGAATAATATGACTTTTTAAAAACAGTGATAATCAAGTATGTAACTAATGGTAACCAAAAATAGCCAGTTGTGTTT--GCCCTACAGTTTTCCTGTGTGTTTTAATGTGCTTGAAATAATGACATA-ATACTGCTTTTAAGCATAAAGAACTCAGACATGTTCATAGTTCCTAGATGGAAAATAAAATAAAGAGAGGCTTAATGATAGATAATATCTGCCAGTGGGTGGTTTATTTCTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAGCCATGCAGGCTCTTCCTAGTTCCAATATATATTTCTAAAGAAGTAGGAAGTCATTATTCCTGTTCCATGGCAGTGAGAATGGTTATATGTCA--CTTTGCAGTTCAAATTTTATAGAGAAGAAATGGATT-----------GTTTTTGTTGTTTATTAATTTTCTTAGTGGTAGTTTACCTGCTTTTATATTTTAGCAATCATCTCCAAGCGCTTCAGTAAAACAGTAAGAATTATTGTTCCAAGTGGGCATCAGTCACAGACA s bosTau2.scaffold44 69264 1553 - 995992 ACATGCCTCATTGAGCCCTCAGATTGAGCCTGCTGGCTGCCTCTCTTGGGAGCACGATTTGCATCCTACTGAGCTGTCATCTGATACTCCTGAGACCTCCTGACAT--------GCCCTCACTACCTGGGACATTTTG---TGAGAATTATAGAGTATGAGAGATCAGGCTGCAAACTCTGAAGTACTGCAGCAAATATGAGCAACAGTCATTCTTAATTTAAACTTTTAATCCTGCGGATAAA------AAGAGGAAAATTTTTCAAGCATCAGGGACCTCCACAAagttattgcaatatgcactttcttacattatccttgattctcaatgacttagcctgttcagtactaatctccatattttaaaaatagggaaagtgagacatagatagtttaatcctgaatttacatggcaaacctgaggtgaaggaaaat-caaatccaaacaagtctgactttatacagatcatgccttttgaacttca---------ccatactTTCTACCAGGATATGTTTAACAGACCGAATATTATACCAAACCAGTTCAGATTGATCCAAGGGCCCATCCTACTGGTGTTCTCTGTCAGTGAAAAGTGATTCTTCTCTTC---CCTTTTTAAGTGGACAGTCAAGAAAACAATAGCTCATGG-GATGGGAACCCCTGGAATAAAGGGTCTGTGAATCACTCGTGTATGTAATCACAGCAATCTTGTTGCTGAGAGGTTATCTTAAAATTCTTGTTGAATGTAGTTTTAAA-ACCTAAAATTTTAAATTGCTTTTCATAATTAAAAATAGTAAGGTTCTTTATAACATATGAAGAAAGAAAAA-ACAAAACTGCTCTTTTTACTATCCAGATACAGCCACTCTTAATATTTTAGCATATACTATACTAATAGCATATAATACATTAATATTTTAGCACATCAATATTTATTTTAGTAATTTCTTCTAGTTTGAATGATGTGTATGTTTTTAATCATGATGCTAATGTTTGTTAAAATTAAACATACTGTTTTATTTTAAAAGAGAAAATTTCATTCT---TAGAGAAAATTTTAAATTTTAAAAAGGACAAAGAA------------AGGATAAAATATACACTGTGACTTTTTACAAATAATGATAATCAAGTATATAACTAATAATAACCAGAGATTGCTGCCTTTGTTTATGCCCTCCACTTTTACTGTGTATTTTAATCTGTTTGAAATAATGGTGCACATATTGCTTTTAAGTATAAAGAACTCAGACATGTTCATAGTTTCTAGATGAAAAGTAAAATAAAGAGTGGCTTAATGACGGATAATATCTGCCAGTGGGTGGTATATTTCTTTCCAAAA--------------ACTTAGGTGCTTC---------ATATAAATTT-TAAAGATGCAGAAAATCACTATTCAGTTTCTGTAGTATTGGAATTGGCCATATGTCACTCTCTGCAGCTGCATTTTTGTAAAGATGAAATGGATTTGTTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTTATTAATCCCCTCAGGTGCATTAAGCATTCCGGTA---TTTAGCAATAATTACCAAGTGATTGAACAGA--AATAAAAATTATTGTTTTAAATGGGCATCAATCACAGATA a score=5823 s mm7.chr5_random 8400066 305 + 11523536 CCACACTTTCTAAAAAATGCCTAACATGTACCTCTGTGATGAGATTTCCCCTCAGCTTAATTATCTCCTTGGCTGCATCTCAATGCT-AGTGGAATTTTGGTATTGTGCTTTTAGCTTTCC---------TCCTCCGTTTACCTGGTTCCCTCTTCAGTGCCATCGTTTTGTTCTTCTCACTTCATGACAT----CCCGGTTTTGAGAGTCTTATCTTGCCTTGCATGTCATTCTAAGACACTAAATACTTTTCTAAAC----CAAATCAATTTCTTTCACTAGACAATTATGGAAGGTCGGAGCTTATCTCCTTCGTGTTTT s bosTau2.scaffold44 73767 306 - 995992 CCAGAAGTTCTAAATTTTGTCTCTCATG-------ATAATATAATTTTCTGTAACCTCAGCTGTGTTCTTACCTGGTTCTTAATGCTCACTGTTACTCTGCAGTTG-ACTTTTAGTTTCCTAGAAAAGCTTCCTCACATCATCCAGCTCCTT-TTCGATGTCATTTTACTGTTCTTT---CTTTATGACATGTCTCCTATTTTTAAGAGGCT-ATCATTTCTTGCATCTCATCTAAGGATACCAAATAATCTCCTGAAAGAAGAAAATCCATTTCCTGCAGCAGATCTTTGTCAAAGGTTTG----TTTTTCCTTTGAGTTTT a score=2571 s mm7.chr5_random 8400486 110 + 11523536 GTCCAGCTTTGTATTAAAG--------------CCCAGAGTTTGCCAGGAGACCTCAGGGAGGAATGGTTGGTTAGTCCTATTGCTTCTACCTGGCCCTTCCTCTCCACCCGTGTATAACCATC s bosTau2.scaffold44 74163 121 - 995992 TTTCATCTTTAAATAAAAGAAGATATAGCCAAGCCCAGTGTTTACCAGAGGACCTCAAGGATGAAAGCTTCTTGCCTTCACTTCCTTCTAGCCAATTCCTCTTTTTCA---AAGTATAACTACC a score=21247 s mm7.chr5_random 8401321 780 + 11523536 GTTTGTGGCTGTTTTCTGTGTTCATATCTTCCTCGAAGCCTTCCCAGGTATTTTACTGTGCATTCCTGGAAATCTATGTGGGAATATTCCTGGGAATCTATAGCTGACTTTATCTTAAAGCAGAAGTGAGTGAGTTAATTCTAGAAA-----------ACAAGAAAGAAAGTAGAGA-----------CGTTAGAAAGCAAAAGTCTCATTTCTTTTCATCTCCCTGCTTTCACCAACTC---------TTCCAAATCCATCAATCACATGGGTGAC-ATCAGA-AAGATGGGAAG-GTAAGATGGAGTTGCCACCCACCCATGGAACAAAAGCCTGGAGTAGAGTGAGTGGGACTTTATATTGAAAA-GCTGAGGTCTTCTGGCTCTGTACTCT----CTGTACTCTGTATTCATGATGATTAGATAATGAGAACAATGCCAGGTTATGAAAATGTTGCTAATTAGCATCGCACATGCGCTGTTGCCATTGATTTGTGTATTTAGTGGAAAAAAACCTGATTACTGTATATTCATTATTAAATTATAGATAATATTCCATCCAAAAAATGAGAAAATGAATGTCTTCAAAAACAAAAGAAAGAAAAATTCCCTCACTCCTAG-------------AACAGTGTATAAAAGATGAAAGAAATAACATAGAACTTGCTAAGTGCAGCTTTGCAGAC--aggtttagaaagccagaacaattcaccctaagccactcaggtaattggcaatgaaattggatgtatagcctgggcaccctgacttttgagttactctttTCCATGGCAATAACGTA-ATAAATCATTTTAAGCAAGTT s bosTau2.scaffold44 76018 804 - 995992 GTTTATGGCTGTGTTTTGAGTTTATGTCTTCTTCTAAACCTTCATAGGTGTTTTATTGCACATTACAGAGAAGTCGTG-----------CCAGGAGCTGTTGGCAGATACCATTTTAAACCAGCAGTCAGTGAATCAACTTTATAAGCTGCAATTTAGAAAAGAAGGAAAGGAGGAAGCTTTTTTTTTCCCTTCCAAGTACAGTCCTCATTCC-------CTCCCTACTCTTGCCCCTTCAAATTGCCACCCGAAATGCATTGATCACGTGGGTGACTCTCAGGTCACATGGGAAGAGGGATACAAAATTGACATGTAAGTATAAAGCAAAAGACAAGATGAGACTGGGTGACACATTGTGCTACAGCTGCTAAGATCTTTAAATCCTGAGCTCTGAAGCTCTCATTTGT--TAATGTTGATTAAATAATGAAAACAATTCCAGGTTAGGAAAATCTTAGTAATCAGCTCTGCACAATAGCTATTGTCACTG-TTTGTATATTTAATGAAAAAAG---TAATTACTCTATATTCATTATTTTATTATGGTTAATATACCATAGCAAACATGGGAGAATGAAAGCCTTTAAGAACAAGAAAAACA-------TCTTACTCTTGGGAAGACTAAAGGAAAAAATTTGTAAAAGAAAGAACAAATATCTTATACTTTCTATAGCTCTGCTCTGTaaactgaggcctacaatagcaaaaggacttgccctatgtcacccaactagctggcaatgaagttggaaccatagccccggcctcctaccatccaggttactgctctctGCAGAAATAGTGCATTTAAATCATTTAAAGTGAGTT a score=8725 s mm7.chr5_random 8402783 571 + 11523536 ACAGAGACAATGGTATAAAATTACAGAGATCCTTTAAGCCTAAGGTGATTAAAAGAATTTGATC-----ATCCAGGCTAGCAGGCTAATGAAGAACTTTAA-AGAAAAATCTGAAAAGAT---ATTTGTGTCTTAGAAAAACAATGCTTGTA------TGTCTTCTAATTTAGATGC--------------------ATCCTGGCTCAGGCAAGTAGCAAGAAAGTGAAGTA--AAATGATAATATGGACATTAAGGTGTAATGAA--GAGAAACCTGATGACTG--------------GCCCACGCTCATCTTTACCTTTTTGTTG-TTCTGTGTGAGCCAGAGTGGTTGAGTCACTTGAATTTTTAAGAGAAACAGGAAATACGTACTTTCATATGAAAGGGAGGGAATTTTTTCAATTTGGAAAGT------CCAAA--------------------------AATCTTCCTGTGGGCTG-TGTTTACACAGCAACATATTGTTTTTGCACTTGACCTGTGCATAAATTCAAGAGTCTGGAGGCA------GAAATATATTTCAAAGGTATAAACCCAAGACA------------AAT-ACAAGAAAGGAAAT----TTCTGTTA-------------ACAATAGACCTGCTGAGTGATGGATGGAGTGGCCTTGCCAGGTGTTTG-----------------GGGCT s bosTau2.scaffold44 77789 690 - 995992 ACAGAAAGCTTCACATCAGGTTATGAAGGCCTTTCAATGTTAGGGTGA-----AGAGTTTGAACTTACTATGCCAATAAGCAGGCTGGTGAAGGTTTTTAATACAAGAATGTGACATGATCAGAACTGTGTCTTAGAAAAAC---GTCTGTAAAATTATGCCTTCAAATTCAAGTACTCCACACTGGCTCCCTCTCAGCCCAGGTTCGTGCAGATAACAAAAAAGAAAAGTATAAAACAATAGTGAGGCAGAAAgattataacaaatggagaaatctgatgcctgagctaaaaggaagtgccatggtttcacctcatccagctgctgcttccacgtggaccagtgaggtaagattgtgtgaattttcaagagacaccgcaaatgtggatgtttatgcaaaatcatctga--tttttcaattttgacatctTCTCCCCAAAGTGTTTTGAACAAAAGAGAAAAATGAAATGTGCCAGTGAGCTGCTTTTTACCCAGCAAGTCATCATTTT--CACTTGACCTGTG------TTCA---GTGTGGAAGAATGGTTTGAAATCTATTTCTAAAGTATAAACCTAAGGCAGGGCCGGTGAGGAATGAAAAGAAAGGGAATAGATGGCTGTCAGAATATGGAATCCAGAAGAAAGCCACCAAATGGTAGATGAAGCAATGTGACGAGTTGTTTGAACTCTGATTTTTTGAGgggct a score=27754 s mm7.chr5_random 8403354 1005 + 11523536 CTGGAG----------------------------------------------------------TATGGTTTAGTTATTGGTAC--------------CCTTGTTGTCAATGTG---GAGGCTGGATGTTTTGCTTCTCAGC----ATTG-----AAAGAACTTTCAAACAGCAGATTCTGAAAAACA-ACTGTTAATACC-------CTGCAAAACAGC---ACTTTCCCTGAGTCC-CCAAGTGCAGAATGGAGCACAGTATGGCTCCAGTTTGGATACAAAGCAGAGTTCAAAAGGAAGTCTCCAATTCTCTTCATTTATATGCCCCAGTCTCTGAAGTGTCCAGTTAATGTCCCTG-CCATAAAGCAAGAGATGGTTGCTCCCTTTTCCCTAACTGTGATGTCTTTCTGATTTAAGCACTTTTCACCTGCCAGTGTCCTTGATTTCTTCTGAACCGTGTTCTAGCCCATAAAAGGCTCTAAATTAAAAGCTGCTTTGGCCCGGCTTTTTAGTGAAGTGA--TTTTGGAAAATGCTCCCAGATTGTTCCTCCCTTCACAGACCCACTGAGAGTCACCTCTACTGGCATTTCCATTCTGCAATTT-TCCTAAAAGCTCACCcctttaaggctacgttcagatggcctcccctccaggaagcctctgttgatcataccagtccCCTCTACTCCCAGGTAACTCCAAGAGGGTCCAGTGAGCCCTGACAACATGA---ACTATCAGTTGTCATCA-CTTACCCATTTAAACTCCTGAAAACTTACATGCC-TGTTCCACAGAGCAGGCACAG--TTGTCTTGGTAAACATGTCAGGCCATATGCCT--CCATCCTTACTTTC--CTGGTTTCCCTTTGGAGATATGATGTGTTCTGAACTGCTTTAAAAGACCTATAAAACCCCCAACTACCACTCCCTGTCTGTAGCTGCTGCCAGTC------TCTTCTGGTTACAGTCAAGCTTCTCTGGTCCTCTAAGTGACTCTCAGACATCACCAAGGGATC----CACCCCT-------------------TGCTCTTTTTCATGCTTTTCATACATCTGGGTTTTCATGATGCTCTGGTTGCAGGGTTGATGACACCTTTCCAG-GAAACCATCTCTC s bosTau2.scaffold44 78595 1125 - 995992 ctggagaattccatggacagcggagcctggcgggctacagtccgtggggttgcaaagagcctgacatgactgagcgacttgcacTTTCTGTTGTTTTTCCTTGGTGTCATTGTGACTGTGGATACAGGTTTTACCTTTTTGTTGTTATTGTTAACATAGGAGTAGCAAAGAATGGGTTCTGAAAACCAGACCTCCAATATCAGCCCAACTGAAGGTCACCTCAACTTCACCTCAGCCCTCCAAGTTCAAAATGGCGCATGGCA--GTTCCAGTCTGGATTCAGAGCCAAGTCGAGAAGGAAGACAAGTATTCTCTCAGTTTCTTTGCTTTGGCCCCTGAGGTATTCAGTTAATGTTCTGGGCCATAAAAAAAGAAATGGTTGGTCTCCTTTCCCTAACTACTCTGTCTCTCTGATTTAAGTACTTTTCACCTGTGAATGTCCTTGGTTACTTCTGAACTATATTCAGTCCTATAAAAGGCACTAAATTAAAGACTGCTTTGGCTCTGTGTTTCAGTGAAGTGATTTTTTGAAAAGTGCTGTGAGATTGCTCCTCCCTTCAGAAAGCCAGTGAAGTTCACCCTAAATGCCACCTT--TTTTGCAACTTGCCCTGAAATCCCACCCCTTTCATTCTCAGCCCAGAGGCCTTCTCCCTCACAAAGCCTTTTCTCACCACACCAGTA------GCACCCTGCAACCTCCAGATGGGGTCAGTACACCTCGACTGCATCAGTCATCATCACCTGTCACCATCTAATTCActtccactcttgaaaacctatacgccatgctccacacagtggccagagaatcttcttcaaatataagtcagatcgtatccctgcccagcttaattctccactggctttcctttgaagttgcaataaaatctaaactacttaaagcgatttgccaaaccctggattatta--tcctgtgtacagcttctgctgctctgctcttttcctgattacattccagccacactgg-ccttcaagggacccttgggtagcaccacggggtctttgcactgctgctgattcctctacttaaatgctttccccaaagcttttcacatggctggatcttc--------ctcattttaagttaaatgtcatttcaacagagagaccatccATC a score=3819 s mm7.chr5_random 8404611 513 + 11523536 CATAAAGCCTTCTTCTACTTTGCCTCCAGTACCTCCTCATCTTGTGAACTGTATCTCTATGATGAATGCCACCATCTCCACCCCTTTCACAG-TTTTTATGAAGTTCTTTCTCTCCATCCCTAGCTTTCTACCTCTTCCCAGTATCCCAATCCACACCAACAATATCATTTCATTTCTTCTTACCCTGAGAACACCTGCTCTTAAGTCTGTTTAACTGTCCTGACTCTTTATATCTCCTATCTTAGCTCTGATTTAAGCC------TTGGCAAACCCTCACCCCTGCAACAACAACAAAAAAAAAATCC----CCTCCAC---TGC---TCTTCCACATCAGCCCGAGTCCCTTG---------TATTCCTGCACACCAACCATCTGGCCTGCTTAGTTTGGAGATGCCTAAAACCCTTCAGACTCCCACAGGCTGTTGAAGAGGGTTTTCTGAG-CTGCTGTAGAA----CCTTGGCCCTCCTTCTTGGTGACCCCCAAACTGCACAAAT---ACCCCATCTTCCAGTCACATAGAAC----TTG----GCTCC s bosTau2.scaffold44 80515 516 - 995992 CATAAAGCAT----CTGCCTTAACTCCAA-AGATCCTTCTACTCTGCCCTTTATTGCTCTGAG---------TGTCCTCACCATTCTCCTAGGTTTCCATGAA--TTTTCCTCTGTATCACTGACCCTCTACCTCCCTCCAGCATCTCAGGATAGCCAAAGAATCCCACTCTTTTACCTCCTA-------AGTAATTTCT--------TGTTTAATGAGctt--ccctccatttctcctgtgaccatcttggtctaggccacaattttctcttcccttgaccaatgcaaacactgccttaataagctcctcttcctccacatttgcatacctaccatacaatccctaccctacagcaaaaatgttattcctaaaaggcaa--atctgaccaggccacacc----ctgcttagagcccttcaAGTCACAATAGTCTGTTGAAGAGACCTCTTGGAGCCTGATGTCCAGGTTCACTTATCCCTGACTCATCTTTGTCCTCATTCTATACGCGTTTGATCCAGCCTCCCAGCCACAGAGAGCAAGTTTGCTATGCCCC a score=4123 s mm7.chr5_random 8405124 164 + 11523536 AAATCTCTTTCCTTC---CTTGGAGAGCTATATTCTCCAGACTCATTCCAGCCC-CTCAATGCTAACTCCCACAGGAGTCACTTTTTCTGAGAAGTCCTCAGTAGCTAGATTAGGGCTGGAAAGGCTCATTTTTTTCTCTGAATTATTATAGTAACTCAAATCATACT s bosTau2.scaffold44 81309 165 - 995992 AAACCTATCTCCCTCTTTCTTGGAGAATTGTCTTCCTCAAATTTACCCCTGCCTTCATTATACTAATTTT-GCTAATGTCACTTCTTCCAAGAGATCTTCAGTAGAAAAGTTCAATCTGGATAAGATGA--TTTTCCTTTAAATTTCTGTAGGAAAACAACTACTACT a score=35413 s mm7.chr5_random 8405970 1223 + 11523536 ACTAAGGACACATAATACCTATACAAATTTCAGTTCTGTGCCTCATGGCATT-CTTGGTTTATGATTCTG--TCTGTCACTGCTATA-----CAAACTTTTCAAGAGTAGGAGCAAGGTCTTATTTACCTTCCTTTTTCTCTTTTCTGCTACACACAGAGAAGATGTTCAATGCATACTCATTGGAAGGACAAATGAATAAACAACTCCATCCATTTTTCAAGGTTCTACAGTTGTTACGTTTCTGGATATTATTCTTGCTGTGAA----------TCCAACCGCTTTAT---CTGGGTTGTATACATACACAGAATGGCAGTCTTTCTTAGTAAGTCCGAAGCACCCGAGAGCGCAAGGACAAAGCCTAAGCACTTTCTGTTTCTACCTCTGTGCTT-GCACACACAAGGGTCTCAATCTGTGTTTGTTGATTGATTGTTTTTACTCAGTCTATCCTTCCTTTTTGATCCTGCAATGTACTGAAAAGAAAAAGTTAAAAGGAGAGCCTTCTCAGAAATCAAACAACTAAAATCACAAAATGTTCTTTTCTAAAAATAACACATTCCCCAAACACTTGAGGCAGAGCTGTGTGTTTTCTCCTCAACCCTTAATGAGAGCAAGATGCTACCACCTCCTCTTTCATTTTGCCTGCATCACGTCTGTGTTGCCTGGAGATTTGTGACTGTTGTTTCAAGAAAGATCAAATGACAACAGGAGATGGATAGTCTCCTTGATTAAAAAGTGGCACTCAAATACATCAGTGTCTTCTGCGTCCATGGAGGAGAGAACAATTCAACAGCTGGTGTTTGCA----GCAAAGGCATGCATCT-----AGCAATGCTCTAAGGCTGGCTACCACCATATCCTCAGTCCA----GACCCCATCCCCCTATGGGACACATAGCACGCAAGGTTCAATGGTAGCTTCCATAAAGGAG------------CTAGAATTTGGCACTGATGGACTCTGGAG-----------ATGAAAAGCATTGCCATAGCATAgc-agaccatcatacattcaaattccagctcaaacatctactagctgtgtgagcccagaatgtccctcagcctctctga-catctgtgacagcatttggagaatacgggataca---cctagtgaaactgctgaagtgaaggaatgaaataacacagtattaatcatcttgtcacaTAGAGCTCATTAACAGCAGCCGATATCATTAGGTACCCAGACCCATGCCTGTTATTGTACCCAACACCTGATGAACAACTACACAgtgtgtg s bosTau2.scaffold44 82756 1221 - 995992 accatggcctcacattattcatacaaatatctattacttatttcatagcttttcttggattataattctaattctgcgtctgcagtgaactccaagcttttcaagggtagtgacaaggtcttattcagctttctttccccagtgcctcctacatat---gaaggtgctcaatacatatttataaaatcaaCAATGGAA-----GACTTCATGCCTTCTTCAGAGTCCTACAATTACCACCTCACCAGTTATTCTGTCTCCAGTGAACCACAATAGATCAGATTGCCCTATTTTCTGAGCTTTGTACGTGCATAGCTGTATAATTTTTTTTAGTAGATTCCAGGTATCTAA-AGAGCAGGGACAAAGCTTTAGT-CTCTCTGTCTCTACTTCCTCGCTTTGCAGGTAGAAA---CTCAATATACTTTTGTTAATTGATTATTATTGCTCAATCTGCTATTCTTTTTTGATTCAGGAACTTACTGAAAAGAA---TTTTAAAAGAAAGCCCTCTCAGAAATCAACAACGAAAAATCACAAAATGTTCTCTTCTAAAAATAACATGT-CCCCAAACACTCAAGGCAGAAGC---TGCTTTCTCCTCTCCCATTAATGAGAGAAAGATGTGACTTCCTCCATTTTCCTTTTGTCTGCATCACGTCTGCGTTGCCTGGAGATGTGTGGCTGTTGTTTTAAGAAAGATCAGATGACAACGGGAGACGGATCATCTCCTTGATTAAAAAGTGGCCCTCAGAAGCATCCACTTCCTGAG-ATTCAAGGAGGAGAGGGTTATTGCACAGCCAGTGAGTGCCTCGTTCAGAGGCATGAATCCCTGAGAGCAG----CTGAGGCTGGGCTCAGCCAGCATTTCATTTCATATCAACCCCATCCAGAT-TTGATCACACAGTACCACAGATGCCCCGACA-----CATAGAGAAGAATCACAAGGGCTTAGAATTCACCATTGATTGACTCGAGAGCACTTTTTGAAAGACAAAGAAGTGGTATggcttagtgagaccaacccgtgttcaaa-tctggctccgacagttactag-----------------------cagccttgttaagctttggttttatcagatggagaatgggggtggaacttcccagtggagttcctgatgtggttgaatgagatca---agtat---ttaTCCTGTTCTTCAATGATTATTAATGGTAACCACTAGCATTAACTAGCCAGAAGTCTAGCTGTCataatagctgcctattgttgaacacttac----tgtgtg a score=6473 s mm7.chr5_random 8407374 143 + 11523536 TCATGCCTCTGTTTTGTATTCTCATAGGGCTAAGAGTTGATAAGGACCTTGG-TCCCATCAAATTCATACAAGTCCTGGAAGAATTTGTGACACAGGGGCAGACTAGCCATAAGGATTCTCATTAATGCTATGACTTTAAGCTT s bosTau2.scaffold44 84922 144 - 995992 tcatgCCTCTGTTTTCTCTCCTAAAAGGGATGCAATGTGGTCAGGACCTTGAATCCCATCCATTTCCCATGACTTCCAGAGGGATGTGTGACACGGGGGCAGGCTGGCCCAAAGAATTCTCATTAATGTGACTAACTTAggctt a score=7572 s mm7.chr5_random 8407527 523 + 11523536 TCTCAGATTTTCCCACTCCAA--GAAATAGAAAAGAACAGATCAAAA-CTCCTCTCTTGTCACTGTGCCAAACCAGGAGAGAACTGACTTCAACTGCCTCTCATCCCTCATTCCTGTAGATA------------------------------TCTGCTTGACAAATAGGAAAAACGCCA-----TTCTCTGGCCCTTTAAAGATGAACTCTTTAAAGATGAACTATTCTCCTTGCAAG----AAAAAAATCAGAGCCTTTCTTTTTTTCTTTCCCATTAAATATTCCCATA----TATCTTGCATGTAGTTTTTTTTTTT------------------------------------------------------------------------------------CTGTATATATCTGTCATTTAATCCTTAATTTCACAGATTGCTTCTGTCTTTGCAGA--GTAGATGCAGACGGTGGTAAAAGGCCTTGAGCTCCCTCAAGAGGCTATAATGTTATCCACACGTAGTACCATTGCCTTATTGCTGAATAGATAAAGGTATTGGCACCAGGGGCAATGTCTCA-----TTATGCATAAAAAGTCAAGACCTCTAAAGGATGACATTCCAGACACCATATCCTTCTCTGGAAA--TGAACAA s bosTau2.scaffold44 85374 626 - 995992 TCCTAGATCTTCCTACTCCAGTGAAAGAAGAACAGAACAGAGCAGAATCCCCTACACCATCACCA--CTGACCTAGAAGGGAACTCAGTT--GCTCCCTCCTCCCCCCCTTTCCCTCGGACAGCATCCTGCCCGTAGGTTTCCATGGACCAGTCTGTCAATCAAGCAGGAAAGATGCCTAGGCTGTGTCTTGCCCCCACTGGACTCACAGATAAAGAGTGAACCACTAGCCCTTCACTTCTCAACAAAACCTCAGCCTTCCTTGTT--CCTTCCCACTAAATATTCCCATCCTGTTATCTC---TGTGGCTTTTTGTGTTTATCACTCAGTCTTTTATCCATCAAAACATCCGCTCCTTTGGGCAGGAGCTGTGGGAGATGGCAATAAGCTTTGAACTCTGTGGCTTTCTGTGGTTATCGTTCAATCCTTGATCCATCAGA--GCTTCTTTCTTCTAAGGCTGTAGCTGTGGGAGATGGAAACAGGCCTTGAGCTCCCTCTAGAGGCTCCAATGCAACCAATACACAGGACTCT------------------GCGAGGGAAATGG--CCAGGGGGAATGTCACATTCATTTGTGTGTA-----CCAAGAGTCCTAACGGAGTGGATTCAAACTGGCATACCCTCCTCTGGAAAAGTGAACAA a score=11399 s mm7.chr5_random 8409119 706 + 11523536 ATGGCAGACTTAGCAAGCTGGTAGATTAACATATTTCTTCCCCGAG--TGGCCATATGAAAGTCTATAAACAACTACAAAGAAGGTCTCATT----------CCGAGTTCCTTTCAAGAAAGGCAGATTAGCACC-AGTTGTCATGTGTGCTGTTCTCAGTTCCCTGGCTGAAGAT-------------CATGAAAGGATTTTCAGACTCAGAGACTGAGAACATAATCTGGAGGCATC---AGTAGC--------AGGCCAACAGGAATCATAGCTTTTATGTTCTTGAAAACA--TGAGAGAAAAGAAGGCAGAGATTACCAGTACAATATAAGTCCTTCAATATGAGAAAGAGAATAGCAGATATGGTTTTCCAAAATAGCACTGTAAAATATGTGTTTATTTTATTATTACCAGCAGGCTTCCTTCTCAACAGTATCTTTTATTTCACACATTGGACACTCT-------GGTTGCAGAAACAGCTTCTCTTTTGCATAAAAAAAATAAGTGATCATGATGGTCTTTTAGTCTCATCTGAGTCCCAGAGTA--GGAAAATCATCTATCAGAAGTGGCAAAGA--CTCCACATCCACTTTCCCCCAGAAAAAAAATTTGTTTTCCTTAGTGTTCTGCCTTCATAGTACCCTGCTTCACCACAAAGGGAGATTTACAACAGAGGGACAGCCTCTCTTTGATTCTTATAGTACACAATGCCAGGTCTACAGTTCTGTAGGAACTATGGCAATGTCT s bosTau2.scaffold44 87377 707 - 995992 atggcacccccagcaaactaata---caACACTTCTCTTTTTTCAGCATAGTGGAATTAAAATTTCAGAGCACTCACAGAAAGTATATTATTATTATACTCTCTAATTTTTTTCCTCAAAGAGCCAAACAACACCCAGTTGTTATTTGCACTGATTCCAGTTCTCTGCCTGAAGATAGGACTTTTCTATCATGCAATGGTTCTGGGTCTTAGGATTCAAGGGTACACTATGGAGGAGTTTCAGGTAGCTTCCACTAAGCTCTGCAGGCCCCACGGGGCTTCTGTTCTAAGTAGTAGGTGAGAAAGGAGAAAGCAGACATTATGA-TACACTTCAGCTCCCTCA-TGTGAGAGACAAAAGAGCAGTT----TTCTCTCTAACTTTTCTGCAAAAA----------TATATTTTGAAAAGCAGCTATATTTCCGAACAATGCAGGTCACTTTAGACATTACATGCTCTCTTGCCTAGTTGCAGAAATAGCTTATCCTGTGCTTGAGGACGATAAACAATCATTATGGTCTGTTCATCTCATCTGCTTCTCAGGGGAAGGGAAAATCATCACATGGAAGGGACAGAGGGTCTCAACAGCC-----TCCCCAAAAGGGA------TTTTTCTTAGGGGCTTCTGTACAAAGGACCCCG----------------GAGCTTCAAGAGAGGAACAGTCCATTTTTGA--CTTTGAGTCCCTGATGTTTATTCCAGA-TCTTGTAGGTTCTCTGAGAAAGTCT a score=6778 s mm7.chr5_random 8410544 458 + 11523536 TCCCTAACTCATGTGTCTAGGTTCTCTAGAT------------AAACTTAGACTTAGCTGATCTAGTAGCTTGAAATGGAAGAAGAGTGCTGAAGTTAACAATGGGA--ACAACTGGAGAACTCTGGATGGAACTGTTAAAGACATCATCTGAGAGGAGGTGTCAGACTCCTCAGAGTTCACCAGTAGTGTCTAGCATCCCACAGTTATAAGCATG-----------TCTAGAGTATCCA-------GTCAGTACTGTAGCTATATAGGTATTTCA-------AATGCTTTAACAGCAGCAACATCTCTATCGACCTGAGAGATCTCTTGCTACTCAGAGTTGGTAAAATTAGAAGACTACTGAGAATGGCTGCTAAAATTAGAAGACTACTGGGAATGGCTGCTAAAAATCTTTGAAGAGAGTACCAATTCCAAACAATGAGAAGGGATTATGAATGCCTT---GAGAAATTTTTCCCTTCATCTACTGATGGAAAGAA s bosTau2.scaffold44 89702 439 - 995992 TCCCTAGCTTAAGTATCCAGGCTGTTTGGATCTCTTGGTTCTAAAAGATGGG---AGTCAATCTAATGACTTGAAAAGGAGGCAGA--CCTGAAGTTAGTGATAGGAACACAGCAGAGCAAATGCAGACGGAACTGGTAAAGGCAGTTTGTAAGGGCAAGTGAGAAGGTCACCAGAACTTACCAACAGC-TACATCATCCTGTTACCATGATGATGACACCAAGGTCCCAGGAGGACCCAGGAGGAGGCCATTTCTGTACCTA---ATGCAATTCACTTGCAGAATAAGTTGATAATGACAGCTTGCCTATCCA-TTGAGAGGCCC--------------TTGGCAGGATTA----------------------------TATAAGAC-------AGTGGTTGTTAGCAAGCTTTGA--AGAGTACCAATTCCAAACAAGTAGAAACGGTTATACAATTCTCAGGGGAAAAAATCCCCCCTCATCTACTAAAGGCACAAA a score=2073 s mm7.chr5_random 8411029 39 + 11523536 GTTTGGTGGATCAAGGTACCTGCAGAGTAATGCAATTCA s bosTau2.scaffold44 90381 39 - 995992 GCCTGGTGAACCAAGGTGCCTGCAGGGTGAACCACCTCA a score=12500 s mm7.chr5_random 8722610 312 + 11523536 GTCCCACACTGCCATTACTGTAA-AATAGGAAACGTTCTACTGACTACAGCATATCCTCTGAATCCTCCAACAACAGCTGGATCCTGTCTTATCTTCCAATCTTTCCTGAAAGAACAACTTGGCAAATCCAGGGCAATATTGTCCCCGATTTCCCGGAAAAGGAATTGCCCACATCTAGGAACCGAAGCACACCACTGCCTACCTTTCAGCTGACCGACACTGAGAAGTCAGATCTTTTCCAGAATTTTGCTGTCCTTCCTCCTTTACAAGCTCATGGCTCTTTTATTAACTCTAATTTACAATCCCTAGATC s bosTau2.chr11 34250704 310 - 87172399 GTCCTACCCTGTTGTGACTGTAAGAATGCAGAACATTCTACTGACAGTAGCATCTCCTCTGGATCATCCTACA---GCTCGAGCCTGTCTCACCTTCCCGTCTTTTCTGAAGAAACAACTTGGCAATTCCGGAGCCATAGTTTACCTATTTTACCCCAAAATCAACCTCCTGTGTTCAGGAACCAAGGCACATCTCAGCCTTCTTTTATGCTTTCAGAGCTTGGGAAATCAGAACTTTTTCAGAATTTGGAAACTCTTTCATCCTTAAGCCCTCAAAGCACTTTTATCAACTCTCTTTTTGAATCTCCAGATC a score=31827 s mm7.chr5_random 8722922 816 + 11523536 CGTTAGTCAGAAGAGAGCTGCAAGGACATATGTCTCAGAAGGTTTCTACTCTGCAGAAACAAGTGGTACCTCTGCCTGTGAAGAAGTCATGGAAAACACTCAATCATCTGATGGATGTACAAGGAG---TTCCTGAACAGGAGATCTCCCCACACTCAGTTACCTACACCCATCCCTCAGAGCACCAAGCTAAGTACCAACAG---ATCTTCAGGTGTTCCATTGATTCATCTACATGTGAACATCAGTGTCAATTCTGAAGTAAATAGGACAGAAGCCAGAATGTCATGGCCACTTACCTCCAACAAGCAGTTAGAATCTGAGAATGACCACCAAATCATTAGATACAATCCTTTAGTTATATCAATGGACAGGCCATCTTCCAGAAATGTAGAAGTTAATGCAATTCAGGAAGAAACCTCTTTACTGAAAAAGGATCCAAAGCACATGTTAGACCTGAATACAGAACAGAGGGTCATAGGTCTTCCAGAAGAAAGGATAAAGTCACATAAGACACAAGGAACTAATGCGGAGCTGACACCCAAGGCACCATGTCCAGCCACAGACAGAATAAAGATCACTCCAATGGCATTGCTTCAGGTTATGGATTCAATGGGAATAATCCCAGATTCACATTCAGAGGTAACAGACCCTGTGA------------GGAAAACAAAAGATA-AGAGTGACTTATCGCAGCCATCAAACCAAGCTCAAACAGTAAGTATACCTCCCAAGTCATCAAATCCAGTAATTGAATCCATAAAAGTAG---CAAATCCTGAGCATCAAAAAAGGGAACC---AAAGATTACT--AACCCATCAGAAACGAGTCTG s bosTau2.chr11 34251143 832 - 87172399 CTTTGGCTAGGTGGGAGTTAGAGGGACATATGGCTTGGAAGGTTTGTACTTTGCGGGAACAAACAGTGCCTCTGCCTGTGAGGGAATCATGGGCAATGCTGAATTATTTAACTGAGGTGCAAGGAGGAGTCCCTGAACCAGAGAAA-CCCCAAATCCAGTTATCTATGCCCATTCATCAAAGCACTGAGCAAAATATCAACAATGAATCCCCAGACCTTCCATCTCTTCAGCTCCAAAGGAACACTGGAGTGGAATCTGGATTAAATAGAACAGAAACAAGAATTTCTCAGACTCTTATCTCAGGTAAGCAGTCACAACCTGGAGATGGCCCCCAAATCCTTGAATCCAGGCCATTAATGACATCAATAGATATTCTACTTCCCAAAAGCTTAGGAGCTGACATCACTCAAGAGGAAATGACTTTACTGAAGAAGGACCCAAAACATGTGCTAGAGCTTAATATAAAGCAGAGGGTCTTAGGTCTTCCAGAAAAAAGGATACAACCGCAACAGACCCAGGTGCCTAATATGGAGCTGACCCCACAGCTACCATACCAAGTCACAGATAGTGTGAAAGTTACTCCACTGGCATTACTTCAAGTCATGGATTCAATGGGGATGATTCCAGATTCACATTCAGAAGTGATAGAATCTGTGGGTTTGTTCCAATGGCCACCAAATGAAGTTGAAAAACCAATGGAAGCCATGG----------AAACAGTGCATGTAAGCCAAAAACCATCATATCAAGTCATTAAATCAGTGGAGGTAACCCCAAGACCTCAGCAGCAAGTTATGGAATCAAGAAAGATAACTTCAAGACAGTTGAATCAAGTAAT a score=67303 s mm7.chr5_random 8723738 2270 + 11523536 TATGAATACACAGCAAGCACCGAATTGACATTGCCTGATGTTGATAATATCCAGGGAACCATT---GTAGAATCATATTCAGAAATGGGATCTCAGGGGTTGAATCTAGAACCAAGAGTGCAAATTGAGGAATCAGAGTCATTGGTAGAAAA------------------AACCACTGAACCATCTGGACTAGTTGTAGAACCTATAGAGTTAGATACAGGACCCACAACACATATTATAGATGTGATCCCAGGGCCACAGCTCCACAATGTAAAGTCTATGCAAATAGATACAGGACTAGAATTACAAAGTGAGTTATCTGCGGATTTAGTACAACAGTCATCTAT---AGGATTGGTAGATCCTGAAAAGGCAAAACTAGAGCCAGAGCTTCAGAGTTTATCACCAAAGGAGTTGGTTGAGGGGACACAGATTCCAACTGTGAAATCCGTGGATTTGAATCTGGGCCAAGAGCCGCCAGTTGTCAAATCTCCATTGATTCCAGGGCCACACCTGCAAAGAGTCAGATTTCCAAAGTTATGTCAAGGGCAACTTCTTCAAGGGGAAAATCCAGCAAATTCTATCTCGGGCTCCCTATATAATAATTTGAAATCTGATGAAGCAATATCATATTTCCCAGTACAAGAAATCAGGTCCTTTGGTGCTATTCCAGGGCCAAAGGTTC---------------------------TAGAATCACATCTACAACATGTGAAATCTACTGAAATAAATCTAGGACCATGTTTGCAAGATGTGAGATTTTTTGATTCGATGCCAAAACCTAAGCACCATGGCTTCAAATATACACAGTTAATAAAAGGTTTTCCGCTTCAAGAGAGGATATCTCAGGGATTTATGCCAGAATCATTTTGGCCATTAAGCCAAGAGCCAAAGTTCAAAGATAGGAAGCTTGCTATGCCTACACAAGGATCAGAGTTTCACAACATTAAATTTACAACACAAGCCTCTGAACTACAGCATCCACATGTGATATCTGAGGATGTCAGCACAGGACGTCGGGAACAAGATACCAAATTTTCTGAGCTGGCTTCAAGACCGAGACTTCAAGAGGTCAAATTTGGGGAGCAAATCTCAGGATTGATGTGTGATAGTGGAAGTTCTATGA------CTCTAGAGTTAGGGATGCATGACCCCAAATTAGCAAAGATGATGACTGCAGGGCTACAAGATTCAAGGCAAGTTAGTTTTAACTCAGGGCCATGGCTTCAAGATGTCAAATTTTTGGATGTAATACAAGGAACTCCACTTCAAGGTATGGAAACTTCAGAGCTAAACTCAGGGCCATATTTAGAATGTGTAAAAAGTTTTGAGTTGACAACACAGCCA------------------------------------------GAGAGGCAGGGGATGAAGCCAGAATTGATAGGACAAGAGTCCCCATTTCACGGTGTAAAATATGTCATAAGGAATCAAGTACCAAGCTTTGAAGACAAAATGTCTTATAAAATGGTATCTGAGTCACAGGTGCAAATGGCGGAAACAATGAAATTGGCTCCTGGGAGACACTTAGGAAATGCAGATCATTCTGAGTTGATCAGAAGACCGCAGACCCAAGGCAGAGCATTTTCCGAATTGATAGAAGGACAACTTTTGGGACATATAAAACCTGTGGAGAAGAACACAGTCTCAAAGCAAGAAGCTCTGC------------------------------------------CATCTGTGGAATTAACACCAGGGCTACATTTGGGAGACTTTACATCTACAAAGGTAAAGTCAATGTCAGAGCAGAAGCAGGTCAGATCTACGCTGTCAACCCCAGGGATGCAGGCAGGAGATATGAATGTTGAGGAGCTGCCTCCAGGCTCCAGCTTGAAGAGTTTAAAACATAGGTTACTTCCTTCAAGGCCAAAAATAGAAGATAGGAAACCTGTGATCTTAACTGTAGAAGAGTGTCTCAAGATGATAAAATCTACTGTGGAATCCCCAAGT---------------------------------------AGTTCACTGAGAGGAGATATGAAGTCTGTGCAGTTGATTCCAGGTTCAAGAATTCAAGATTTGAAAAACAAGGGGTTGGC-----------------------------CTGTGATACACATGTTCAAGATGTAAATGT-AGATGAAAATGCCATGGACTTGAAACTTGAACCAAAGAAGCAAGAGGAGAGTCCTGTGACTTTTGTACCAAAGATGCTGTTTCAAGAGAAGTCTATGGAGGTGTTTCAAGGGCCTCAACTGCAAGGTATAAAACCCAAGGAACTGAC---TT---CACTGCCACAAATGCAAGATAGGAAACCTGT---GATCACCCTATGTTTGAAACAGCAAAGTGTGAAACCTGTAACTGTAGCCAATACAAAATCAAAACCTGCAA-ATATGAAACC s bosTau2.chr11 34254766 2387 - 87172399 TATGCAAACACAGAAACTGTGGGGTTAGCAACATTTCCAGTTGAAAACATCCAGGAGGTAATACCAGTACAACCATATTCAGAAAAAGGATCTCTGGAGTTGACTTTAGAACCAAGGATGCAATATGAGATATCAGAGCCACTACTACAAAATTTGAAACATGTGAAGCTAACCTCTGAGTCATCCCCATTAGTGGTGGAATCTAAACAGTTTATTACAGGACCAAAACCACAAGTTACAGAGTTGACTCCAGAGCCACAGCTCCAGGAAGTAACATTCAGGCAGTTGGAGTCAGAGCCAAAACTACAAGACGTGAAATATGTTAATTTAATTCAACAGCCAACTACTACCAAAATGGTAGAATCAGAGAAGCCAATACAAGAGCCAGTCCTACAAAGTATGATACCAGAGGAACTGACTCAGGAGGTACAGCTCCAAGGTG---AGTCCCTGG---------------------------------------------------GACCACAGTTGCATAGCGTAAGATTTTCAGAGTTACGTCCTAAACCACCACTTCAAGGAGAAAGACTTTTAGATTTAATCTCAGGGTCTCCACATCACAGTGTGACATCTGATGAATTGACCCCAGGTTCCCCAATGCAAGAAATAAAATTGTCAGATTGTACCCCAGGACCAAAGCATCAAAGTGTTGTATCTATACAGTTGATGGCAAAACCACAAACTCAAAGTACAAAATTCATGGAACTAAGCTCAGGACCGTGCTTACAAGGTGTTAGATTTTCTGATCTGACTCCAGACCCAAAGCATCAAGGTTTTGAACATGTACAGTTAATGCCAGGAACACAGCTTCAAGATACAAAGGCTGTAGGATTTGTAACAGAGTCATCTTTGCAGTTAAGTCAAGGGCTCCTGGTTGAAAATATGAAACCTATTCTGTCTGTTGAAGGGTCACAGTTTAACAGCATGAAATCAGTGAAATTGACCTCAGAACT------TCAAGATATGAAATCTGAGGAACTGAACCTAGGGTCAAGGCAGAAAGATGTCAAATTTTCTGAATTGACCTCAGGGCCAAAGCTTCAAGGTGTCAAATTTGGGAAGCAAATCCCAGAATCACCATTTCATAGTGTGACTTCCATGGAGACAGCTCTAGAGTTAGGGCTTCAGGATTCTAAATCAGCAAAGATGT---CTCCAGGGCTTCAAGGTGTGAAACAGGT------------GGGGCCATGGCTACAAGATGTCAAATTTTGTGATCTAACATCAGGAGTTCAGTCTCAAGGTGTGAAATCCTCTGAGTTAAATTCAGGGCCACAACTACAATATGTGAAGATTTTTGAGTTAACTCCAGAACCAATGATGCAAGGAGAAAGATCTATGAAGTTGGCCTCAGGACCTGAGCAGCAAGGGGTTAAGCCTGAGATGTTAGGGCCAAAGCCACTGTTTCAAGGCATAAAATGTGAAGCATCAGACCAAATGTCAAGCTTTGAAGGTGACATTTCTTATAAATTAGTTTCAGAGCCACAGAGACCAGATGTAAAATCTATGGAGGTGTCTCCTGGACTCCAGTTGCCAAGTGTAAACTTTTCTGAGTTGACCAGAAGACCACTGTTACAAGTTATGAAATCTTCTGGATTGACCCAAAGACCACAGATGCAAGATGTAAAACCTGCAGCAAGGACCCCAATCTCAGAGGTTGAAGGTTTACAATCTGAGGCACTAATGCCAGAACCACAGCTGGAAGATACAAAATCTGTGAAGTTAACCCCAGGACCACATTTAGGAAGTATGAAATCTATTCAGTTAATATCAAAGCCACAATTGGGAAACGTTAAATCTATGGTGTTAACCCCTGGGTCACAGGGGGAAGATGTGAAACCGGTAGAGGTGACCCCAGGCTCAAAACTTCATGGTTTAATATCTGAGTTGCTGTCCTCCGAGTCAGAGTTTAAAGATGTAAACTCTGCAGTCTTAACTCCAGGACAACATCCAAGAGGTATGAAATCTACATTGCTAACCCCAAGTCCACAGCCGGAAGGTAAAAAATCTGTGGAGATAACCTCAGGACCACCGAGAGAAGATGTCAAATCTGTGAAACTCACCTCAGACTCCAAGCTTCAAGGTGTGAAATCTGATGTGTTGGCACTGTCCTTAAGAAATCAAGGATTAAAAACTGTGACGTTCATCCCAAGAACGCAACTGCAAGATGTGAAAGCTGTGGAATTGAAACTTGGGCCAAGGATGCAAGATGAGAATTCTGTGTTTTTGGCACCATGGTCAT------------------------TGCTGCAAGGGCCTAAACTGCAAGGTATGAAACCTCAGGAATTGACAAATTTGACAAAGCCCCAAATGCAAGATATGAAAATTCTGCAGCTAACCCCATGTCCAAAGCTTCAAAGTTTAAAACCTGTAG----AGAAGACTCCAGATCAAGAGCTGCAATTTGCAAAACC a score=3077 s mm7.chr5_random 8726008 96 + 11523536 CACAGATGAAA------------TGAACTCTTACTTACAATTCAAAGGCGCAACCTCATTTGAATTTGCTACTGATCCGGTTGTTCAAAGTGTAAAACCTGAGAAGTT s bosTau2.chr11 34257423 108 - 87172399 TAAAGATGGAAAATTAGTAGATCTCAACTTTGAATTACAGTTGAAAGGTAGGGAATCATCTGAATTGACTCCAGAATCAAATATTCAAGGTATAAAATCTAAAAAGTT a score=1361 s mm7.chr5_random 8726136 72 + 11523536 TCCAAGGAGTAAATTCTTTTGTATACACTGCAGGGCAAAATCCTCTGTGTGAAAATTCTAATAGGTATAATC s bosTau2.chr11 34258787 72 - 87172399 TACAAGGTGTAAACTCTTCTGGGTGGACCTCAAAGGCCAAGCTTCAAGATGTAAAACATAAAGAATTTAGCC a score=7372 s mm7.chr5_random 8726208 288 + 11523536 TTGGGCCACTTTTTCAAGGTATGAATTTTTGTACATTTACATCA---CCACAAATTCTGTGTGTATATCCTGTTTGGTGCAATACTAGAATACATTTGCAAGATATAAATTCTTCTGCAT-------------------------------GTACTCTAAGTCAA-----------GAATTTCAGTCTGTAAATTCTATTGGCTACAACCCTGGGCCACATTTACAAGCTCCAAA----------------------ACTTCAA--------------------------------------------------------------------------------GAGCAACACTTGAAAGATTTGAAGTCTGAATTAACTCCAGGGTCAAACAATTTGGATATAGCACCTATGGAATATAACCCTGGTCCACAAA s bosTau2.chr11 34260665 435 - 87172399 TTGGGCCAGATTTGCAAGGTGTGAATTCTTCTGCATTCATTTCAGAACCAAAACTTCAGTGTGTAAATCCAACTGGATGCAAGCCTGGGTCACATTTGCAAGGTACAAGCTCTTCTGAATTAACTTCAGTTTCAAAATTTCAAGGTATGGAGTCTTCTAAGTTAAATTCAGGGACTGAGCTTCAAAGTGAGACATCTATAGTGTTCAACCCTGGACCACATTGCCAAGGTCTGAAAGGAGCAAAATCATCGGAGCtgacttcagggaaaaaatgtcaacatatgggatctgaggagagactaagcacaaagaatcagtgtgagacatctatggtgttcaaccctggaccacactgccaaggtttgaaacctgaattgagtccagagtcaaagtttctaaatgtaacacccaaagaatgcaaccctgggccacaga a score=14652 s mm7.chr5_random 8726496 461 + 11523536 GTCAAGATATGAATTCTTCTGGGTTTAATCCTGAGTCAAAACCTCAGTGCATAAGTTCTGTAAAGCCCAGTTCAGGGCCACAGTTACAAAGCATAAAGTCCTTTGAGTTGACCCCTGACTCAGAGTCTCAAAGTACAAAATCTGTTCTGTTAAACTCTAGATCACCTTCTCAAGGTGTGGGTTCATCTAACTTAATGCTAGGGGCAAAGTTTCAAAAGAACCCACTTTTGAAGAACCAGCGTGGGTCATGGCAGCAAAGTGCACAACCTATATTAAGTTTGAGGCCTCAGTCAAATGGTGTGAATTCTGTGGC---TTTACCAAGGTCACCACCTGAAGATAGAAAGTTTCCAGAGAGGAGTACACAAATATCATTTTGT---AAAAGTGCTGTAGATCTGACAACTAGCTGTGGTCTGAACGACTTGAGCAATAAGTTGTTTTTTCCAGATCCTTGTTTTCAAAAC s bosTau2.chr11 34262252 455 - 87172399 AGCAAGGTGTAAATTCTACTGGGTTGAATTCAGGGATAGAACTTCAATACTTAAGTTCTGTAAAGTCTAATCCAGGGCCACAGATGCATGGTATGAAACCCTCTGGGC------------CAGAATCTCATGGTACAAAATCTATGTTGTTCAACCTGGAATCACACTTGCAAGAAGCAAAATCTCCTGAGTTAACTTCAGGGACAAAGTTTCCAGAAGTCCAATTTTTGGTCAATCATGCTGGGTCAGAGCAACAAGTTGTGCAGTCTGTGTTCACTTTGGGCCCTCAGTTAAATGTTATGAAACCTATGTTATTTTTACCAGAGCAACTGTTTGAAGATATAAAATCTATGAAGATGAACAAAGAGCCACTGCTTTGTGGTACCAATTCTACAAAACTGATTTCAGACTCTGAGCTTCAGAATTTGAAATGGAATGTGTTTGCTCTAGAGCCATGTTTTCAAAAA a score=179345 s mm7.chr5_random 8726957 5181 + 11523536 CTTCAAAATGTCCATT------------------------------------------------------------------------------TGAAGCCAG------TGCCACAGTCTCAAAGTGTGAGTTCTTCAGAATTGATGCCATGCCACAGTTCACAACATCTTATGTCTT---CCCTTGCACCAAAGCCATGTTTTCAAGATACAAACCCTAAGGAGCTGATAATAGGATCCAAACAGGAAAGTCTGAATTGCCAACTCTTTCCTTCAGAGGAGAAA-----CCAATGATGG-TATTGGCACCACAGTCCACCAGGAAGCTCTTAGCAGGACCAGCACTGACTAGTGTCAAATTTTCAAATTTGTCACTGAAACCACAGCAGCAAAATACAAAATCTTCGGCATTTACTTCAGAGCCAAAATGGCAAGGTGTAAAACAGGTAAAATTGTCATCAGTGTCTCTGCCAGAACCAGGAAAATCTGTGGAGTCACCACCAAAGTCAATTCTTCAAAACATGAAACCTGGGAACCTAATGCCCCAGACAATTGATTCTGTCACAAAATCTGCTACAGTCATATATAGACCAGAGCGACAGGTGGTGTTCTTTGCAGGGATGAGCATGAAGTCTAGGTATCAAGTCCCTAAATCG---AATTTTACTTCACCACCAACTTATCAAGATGTGGGATCTTTAGAAATGACTAAAGAGTTGGGACATAAAAGCAAAGAAATGATGGAGAAATCTGTGAGGTTTAGCTCCAACCCAACACATAAAGTCATAGAATCATTAGAGATGCCCCTGAAGCTAGATCTTCAAGTACCAGAATTTTTTGATCTGACTCCAACACTAAGTGATCAAGATTCAAAATCCTCAGAACTAA---------------ACCAGATCTCAGAAGCTCCTGAGTTGCATTCTTGGTCATGGCCTCAATTTCAAGATTTCAAGGAGTTACACGTAA---------AAGAAGTTACAGAATCTGATAGAATGGCCCTCAACGTCAAGAGTCATGTTGCAGACATGATAGAGGTGACTTGTGAAGCAAGACAGCCAGCGAAAGAATTTCTTAGAATGACTCCAAAGCCAGTAAATAGAGAGCCCGGATTTGTAGAAAAATCTCCAAGGCCATGTCCTCAAGACTTAGGACCTCTGGGGGTGGCCTCTAAGAAAATATCTCAAAGGGAACAATCTGTAATATCAACACCAAGGCCATTCTGTTACATCCCAGATCCTGTTTCAGGAATAACACCAGGACCAGGAACTCAGATTCCCAAATCTAAAAATTTGGCCTCTATGCTGTGGCTGCAAAAAGAATCTTCTGAGTTGTCATGCAAGCAAACCAGTCAAATTGAGGGAAATACAGACTCTGTAGAGCTCACCTTTGGTACACGGCAGCCAGGAGAGGTAGCGGCTAAGCTAACAGAACCTCAAAATCTGAGCCTGGAAAGTGCAAGCATCACTCCAATAGAATCACTGGATCAAACGGTAAACTTTGTAGGCATTAATCCAAAGCCACCAGATCAAGTGACAGAATCTGCAAAGACACCCCTTCCAGTTCCTCAA---------------TCAGTTACCCTCCCCAAAGTTTCTGAAAATGTGGAAGAGATTCCTGGACCACCACTTCAAGTTATAAAGTCTGTGAAG---ATTCCAGAGAGTTACCCTCAAAAGTCAAAATACAATGATTTTACTCCCAGAATACATAATGTGATAAGTTCAGAATTTGCTCCAAGCCTTTGGCTACAAAATGTGCAATCCAATAAATTAACCCTAGTGCCAACACATCAGGTTTTAGAAATAAAACGACAACCAGGATTTCAAATTATAAAGACTGTATTAAATCCCAAACCACTGGTTATGATTGTAAAATCTGAAGAAGTGGCATCAGGACTCA------------------CCATGAGATCGAGCATTAAAATAAAGGAGTGTTTGAATTTACACCCAAGACCACATCTTCAAGGACTGGTAAAACTTGCAGGGTTAACTCCAAAGGCAGATATTCAAGTGACTTCTGCAGAATTAATATTTCAGCAAACATCTCCCCTTAAGGAACCTACGTTGTTAACTCATGAACAAAGGCTTCAGGCTGAAAAATCTCTAGGCCTCACACCAGAATCTCATAAAGTAGTGAAAATGGAGGATTCAAAT---------------CAGAGTAAAGACTC-----AGAGATGATCACATCAGTACTGTTACAGGCAGAGAACTCCTTATCTCGTTTCATACACAGCCCTTCAGCCCCATTTCTTTCTAGCATTGATAAAGCAACCCAATTAGGGCACCTTCAGGGTTCTGGGGTGCCTAAAGATTTAAGAGCTTTTGATATGGAAAACCTTGGTTTGGAAATTTTGCAGTCTTCAAAGTCCTACACAGACACTATTATAATAAAATCTTCAGTTCTTCCCTTGGTCCTTCCAAATCTACCCTCTGATAAGACAGGGGACACCAAGGGAAACCCATATCCTGAGATCTGGAGTATGAATGTCTTATCTAAGGAAGGAATTGAAAAGGGCCAAATGGAGGAAT------------TCCAGAGGTATTCTTCATATTCA---------TTCAAACTACTATCAGAGGAGTTTCAGGCTGGATTAGAGGCTCAAAGAAGCTCTATCCATTCTTTCTTGGGCATACAACAGAATGTCTGGGAAAGTCATGTCTCTAGGCAGCGACTACCTAGGAAATACCTCTCCAGTATGCTAATGCTGGGGAATGTCCTGGGAACCATTATGGAAAAGAAGCCTTGTTCTCAGTCAATTTTAACAGAAGGATCCACTATGGACATCTGCCAGTCTATTCATAATTTATTTGGGGTTCCAGCTGAACTAATGGAATTTTCTCAAAGCCTGCTAGAGAAGGTTCCAAGGACTGTTTCTCAGACTTCAGTGGCTAAAAACTATATTCAGAGACATATTTTATGTCACAGTAATGAGAAAAGAATGCCTTTAAAGATGTGGACACGCGGCTCCACATCTTCCATAATACAGCAATACTCTGGTAGTAGATTGGGTGTCAAGAAAACAAGCTCAAACCTCAGCAATATACTCCAGGATGTCACTGAGCATGTGTCTGTCTCATGTACTGGGGCCAGGTTTCCTGCCTTGATGAAATCAGAGTCTAACTCTGAGATACTTTACACTAGGGGAAGGTTCTCTTTCCAGGGAGCAGAGTAAAATTTCACCATGTGAAAATTTTACTAGGTCTTCCGAGTCTCAGCATTCCCTCAGGACAGGTTCTTTCTCCCAGTCCAAGACAGATATCTCAGAACAGACCCAACTGCTAAAAGAACTACAGGGGAAAATAGCAGGAAATCTCCTAAGAAGTCAAATACAGCACAATATCCCTCTTCCTCTAGCGTCAGGTCTTGTCCTAAAGTATCCCATCTGCTTACAATGTGGTCGATGTTCAGGATTTAATTGCTGTCATAATTTACAGTCTGCTTTTGGACCGTACCTTCTCATCTACCCACAGCTCCACCTTTTAAGCACCCCTGAGGGCCATGGTAGTGAGATTCAGTTGCATCTTAAATTTAAATTACAAACTAGGAAAAGACCTCAAGTCTCAAAGTATCATGCAAGAAACCGAGCAGATCCATGGAAGGGTGCTGCATCACCATCACGAAGGAAAGCCAGCCTCTCTACACCAGCATCCAAGAGTC------CTAGAAGAGATTTCCAGTCCAGTTCTTCCCTGTCTCCTACTTCTGTACAAGTCCACACTCAACAAAAGCAATGGTGCAGCCGTTGTATGGCAGGAAACACAACAGCCAAAG---------ACTCTGTGTTCTGTCAGGGTCATGACTTATCAGAGAGTGAATACAGAAGCAATCTGGATGAAAGATCTGTTAAATCAAGCCCAAGAAAGACTTCTGTCTTAACACATCCAATGAAGAAAATCATCAAGGGACCTCAAACACAAATCACAAGGCTCTACAAAATCAGTACAAGCACAAAAGGCAGTCATCCTAGAACACTGAGGGGTCTATCAAGAAGCAAAATGG--AAAACACCCTAACAAGCA-------CTTCCAAGAGACAGCCTAGGAAATCCTGCCAGCCCAAATTTATCCAATCGCTTTTTCACAGCCTAAGGCAGGCATTCCAAGCAGCACACACAACTGTGAATTTTATAGGACAGAAACTTCAGTACAAGATGAGGCCAGATAATTTGTGGTCAATCAAAAACTTGCACCCCAAACAAAGATCTGAGGATTATGGCTTAATGGGAGATAGCCATGGAGCCAGGACACCAGTTGTCAGGTACATGTCACCAAGCTCAACCCCTAAGCAAAAGGACAAGTTTCAGGGAGCAAGTGAGTGCTTTAGACAACCTCGAAAGCCCAAAGAAGCAAGGTCTCTCCTACCCAGACCAGTGCAATTGCAGAAGATCTTGGCTTGGGGAAGAGATGTCTTTAACCAAGCTACTTCAGTCCCAGAACGTTTGAAGAGAGTTCAAAATGTCTACAGTAT----GGCAACAAAAAGCT--GTAGTGATGAAATATCCAGTCTAGAGTCCAAGAAGTTTTCTAAAGTAGGAGCCAAATTTCAGGCCCAAGAGAGAATTGT---ATCTAACCCTCTCTTGAAGGGAATCCTGCAGAGTCACTTGGGAAAGAAACCCATTAACAAGGAA--GAACAACAA-------GGCTTCTTCATGGAGAGAGCCCTATGTAATAAGTCACCTGAAAGGATCCATCGCAGGCTTCCTCAGAGAATTCACTGGCAAAGTCCTTATGAGAGGAGGCAACACAGCCCTTCTTGGAGAAGGCATAGTAGTCCCGCTGACAGAACCCTTAGAAGTCTTTCTGAGAGGTGTCATCGCAGTCCTTCCCAGAGAAAGAGTCTTAGCTCCTCTCTAAGAACCTACCACAATCTCTCTGACAGACTTCATAACAGTCCCTCAAGGAGGAGCCCTCCCAGGCCCTCAAGAAAGAACCCAAGAAGTCCTTCGAGGATGAGCCCTCACAGTCCCTCATGGAGGACCCCATGCAGTCCCTCAAGCAGGAGCCCTCACAGTCCCTCAAGGAGGACCCCACTCAGTCCCTCAAGGAGAACTCCTCGAAGTTCCTCAAGGAGAAGTCATCACATTCCCTCAAGGAGGCACACTCAAAATCCCTCTGGAAGTAGCCATCACAGTCGCTCAAGGAGTAGTAGCCATCCAAGTTCATCACGGAGGAGCCCTCCCAGGTCCTCAAGAAAGAATCCAAGAAGTCCTTCAAGGATAAGCCCTCACAGTCCCTCAAGGAGGACCCCACTCAGTCCCTCAAGGAGGAGCCCTCACAGTCCCA-CAAGAAGGACCCC--ACTCAG-TCCCTCAAGGAGAACTCC s bosTau2.chr11 34262866 5352 - 87172399 CCTCAAGATGTGAATTCTAATAAACTGATTTCTTGCTTCAGGCAGAAATCTGTAGTGTCTGTATCAGTGCCATGTTCTCAGGATGTGAAATCTATGAAGTCAAACCTACTGCCCCAATCTCAAAGTGTAAATTTTTTAGGATCATCATCATGTCTCAGGTCACAATGTGTTAAATCTGAGATCTCTGCACCAGAGCCATGTCTTCAAAATATGAAATCTGTAGAGTTGACACCAGGGTCTCAAGAACAAGGCATGAATTGCCAGGAGCTGACTTCAGGATTGCAAGGTGTCAAATCAGGAATCTCGGCACCAGAGTCAACTAAGAACTTCATACCAGGACCAATGTTGACTAGTGTCAAATTTTCAAATTTGTCTCCAGAATCACAGCAACAAGGTGTGAAACATTTGGAGTTTACTCCAGAACCAAAGTTGCAAAGCACAAGGCATGCAAAATCATCTTCAGTGTCTCTGCAACAAGCTATAAAACCTGTGGAGTTAGCATCAGAGTCACTGTTTCAAAGACCAAAATCTGAGGATCTAACTCCAAGAACAAGCTCTCAAATGATGGGCTCCTCTGAAATCATCCCTAGGCCAGGGCATCACTTTATAGAACATGAAGAGATGATTCCAAAGCCAATGCATCAAGTCCCTAAATCTGTTAGTTTGACTTCAATACCAATTTATCAAGTTACAGATTCTTCAAAAATGGCAAAAAGTTTGGCACATCAAGACACAGAAACTATAGAGAAATCTGTGAAGTTGACCCAAAAGCCAAAAGGAAAAGCCATGAAAGCTTCAGGAATGCCTCTGAAACTAGATCTTCAAGTACCAGAATTTGTTGATCTGACTCCAGTGCTAAGGAATCAAGATTCAAAATCCTTAAAATTAACACCAAAGAAAAGCCACCGAATCCTGGAAACTCTGGAGTTGCTCTCTCAGTCAGGGTCCCAAGTT---------AAGGAGTTACATACAGGGCAGCTGCAGCAAGTTGTGGAATCTGAAGGGATGACTTCAGGACCCAAGGATCACACTACAGAAACTATGGGGTTGACCTTCAAGACAAAGCTGAAAGGGGAGGAATTTCTTGGAAGGAGTCCAAAACCAATAAATAAAACCACTGA---TGCAGAGAGATATTCAAGGCCCTACCCTCAAGCCCAGGAATCTGTGGAGGTGATCTCCACGCAAAAACTGCCAAGGGGAGAGTCTATAGCATTGATTACAAAGGCATTTCAAGATGTCCCAGAATCT---TCAGAGATGACAGAAGGGATACGATATCAAGTTCCTGGGTCTATAGGTTTGACCTCTAAGC---GATTCCTAAAGGCA------------------AAGCCAACAGGTCAAGTTGCAGGATACGCAGAATCTGCAGAGGTCACCACTGAGACATGGCAACAAGGGGAGGGAAAAATGAAGCTTACACAGTCACAGAATCAAAGTATGAAATATTCAGAAACAGCCCCA---GGACTACTGGGTCAAATTACAGAATTCATGAGGATTAGTCCAAAGCCACTAGAACAAGTCACAAACTCTACAAAGACACAGCTTCAAGTTGCTCAAGCAATAGGGGTAAAGCCAGTAGCTCCCATCAGAGTTGCTACACCTGTGAAAGTGACTCCTGGGCCACCATATCAAGTTGTGAAGTCTGTAACGTTAACATCATGGCCAAACTCTCAAATGGTAGACTGTGCTGAGTTGACTTCAAAACCACAAGATGTGAGACCTTCAGAGTTTACCTCAGGCTTAAGGTTGCAAAATGCAAAATTTAAGAAATTAAGCACAGAACCAAAGTACCAAACTTTGAAAAGAATGGATTTGACAGGGTTTCAAATTGTAAAGACTATG---------GGGCCACCACTGCAAATTGTAAAATCTGAGGAATTAGCACCAGGGCCAATTCCCCAGATTGCAGAACCAATAGGAGTGGGGCTTAAGGCAACAAATTACTTGGATTTATTCCCAAGGCTACATCTTCAAGAACCAGTAGAATCTATAGAATTAACTCCAAGGCCAAATACTGAAGTGAAATCTGCAGAATTAACCACACAGCCAACATCTACACTTGAGGCACCTACAGTGTTAAATCATAAACAAGGGCTTCAGGCTGTGAAATCTACAGGGATAAAAACAGGGCCTCCTCAAGTCATGGAATCTGAGGATTTGAATTTAAGTGAGGTGTGTCAGAATAAGGACTCTGAGGAGGGATCATCAGA--AGAAGAGTTACAAATAGGGAATTATTTCTCTAGGTTTCTAAACAACTCTTCAGACTCACTTAGCTCAAGTTCTGTCAGAACATCTGAATTAG---ATCTTTGGGATTCTGAGATGCCACAAGTATCAAATGTGTTGGATATAAAAAACCTTGTGACAGATATTTTGCAACCTGAGGAGTCTTTTATAGACCTTGATACGATACAATCTTCAACTTTTTCCTTATCCCTTCATAACCAACCCCTTGCCGAGACAGCTATTACTGTAAAAAACTCAAATTCTGAGATCCCAGGAGTGGATGTCATACCTAATGAAAGGACTAAGAGGAAACATGTGGAGGAGTCAGAGAGCTCACTCCAGAGACTCTCACAACATTCACCACAAGACTGGAGATCACCACCTAAGTTTTTCCAGGCAGAGTCAGGGGCTCAAAGAGCCCGTTCCTGGCCTGTCCTGGGCAGGCAACGGAATGTCTGGGAGAGTCGCTCCTCGAGGCCACGACTACCTAGAAAATACCTCTCCAATATGCTAATGATGGGGAATGTCTTGGGGACCACTATGGAAAGGAAGCTTTCTTCTCAAACATCTTTAACAGAAAGAGCCACTGAAGATACCTGTCAATCTATTCAGAATTTATTTGGGGTTCCAGCTGAATTGATGACATGTTCTGAGAGACTGCTTGAGAAGGGTCAAGGTACTATCTCTCAGCCTTCAGTGGTCAAAAACTACATTCAGAGACATACTTCATGCCATGGTTATGAGAAAAAAACACCTTTAAGGATATGGACACGTAGTTCCATGCCCTCCATAATACAGCACTACTCTGGGAGTAGAAAGAGAATAAAGAAAAAG---TCAAAACCCTGCGATATATCTCAGGAAGTCATTCAGTACATGCCTGTTTCATGCACAGGGAGTCAGCCTCCTGCCCCAGCAAAGTCAGAGTCTTCCCTCAACATATTTTTTGCCAGGAG-AGATTCTGTTCCAATGGAAGAGACTGAGAACTCACACAGTGATTCACAGACAAGGATTTTTGAGTCCCAACACTCCCTCAAGCCAAGTTATCTTCCCCAGGCCAAGACTGACTTCTCAGAACAGTTCCAGCTGCTACAAGATTTGCAACTAAAAATAGCAGCAAAACTGTTGAGGAGTCAAATACCCCCCAATGTACCTCCACCTTTAGCTTCAGGTCTGGTCCTAAAATATCCTATCTGCCTACAGTGTGGCCGATGTTCAGGATTTAATTGCTGTCATAAATTACAGGCTGCTTTTGGGCCTCACCTTCTTATTTATCCACAGCTTCAACTTGTAAGCACTCCTGAAGGCCATG---GAGAGATTAGGTTACATCTTGGCTTTAGGTTGCGAACTGGTAAAAGACCCCAGCTCCCAAAGTATCACAGAAGAGACAGACCAGTCACACCAAGGAGCCTTAGATCAACATCATTAAGGAAAGCCAAAGGTTATACACGAGCTTCCAAGAGTCCTACTTCTACAATAAATTTCCAGTCTGGGTCGTCCCAGGCTCCTGCTCCTATAGAAGTCCGTATCAGGCAAAGGCAATATGACAGCTCTAGCCTAATAGAAAAGACAGAAATTAGAGAGCCTGGACACTATGAGTTCACTCAAGTTCACTCTCTATCAGAGAGTGACTCTGAAAGCAATCAGGATGAAAAATGGGCTAAAGTGAGAACCAAAAAGACCTATGATTCAAAATATCCAATGAAAAGAATCCCTAAGGAAGTTAGATCACAAAATACAAAGTTCTACACAAATGGTAGAGCTATAATACAGAGTTCCTCTAGGGAATTACCAAACCAGTTAAGAAGGAAGAGGACTGGAGCATCTCAGACAACGGCCGCCTCTTTAAAAAGACAACCTAAGAAATCCTCCCAACCAAAATTTATTCAACTACTTTTTCAGGGCCTAAAGCAGGCAATTCAAGCAGCACACAGAATTATGGCTTTGGCTGGGCAGAAGCCTGAGGACACAACAAGGTCAGACTACTTCTGGTCAAGCAAAACCTACCTTCCAAAACAAAAAGCCAGAGACTACTGCTCAACAAAAGACAGCAAAAGACACAGGATGCCAACTCTCAAGCTAAGGCATTCAAACTCAGTCACCAAGCAGGAAAGCACGCGGTGGGAAGAAACAGACCAATTCAGACCAGCTCAACAACCAAAAAGGGATAGCTCTTTCCAACTCAGACCTAAGCAATTACCCAAGCCCACAGTTTCCCAAAGAAGTACCACTCTCAAAAACATCTCAACCAGCCAGTGTTTGGGTCCTGTTCAAAATGAGAGTAGTAGCAGAGATAAGAAAAACTTTAACAGAAATGAAATCTCTAACCAGGAGTCCAAGAACTT---CAAACCAGGAATCAGAGTTCATGCTGCAGGGAGACTCTTACAACCTGGTTCTCTTATGAAGAGGACTTCACATAGTCACCTTAAAGGGAAACCCACACACAAGGAACGAAACCACCAGAGCTTCGGCTTCAGTAGGGAAAGAACCCCATGTTAC---TCTTCTGGAAGAAGCCAATAcagtccctctgagaggg---accagcacagtacctctgagaggagccatagaagtacctctgagaggagccatagaagtacctctgagaggagccatagaagtacctctgagaggagccatagaagtgcctctgagagaagccaccgcagcgcctctgaaaggagccatcgcagtgcctctgggagaagccatcgaagcgcctctgagagaagccatcacagcgcctctgagaggagccatcgcagcgcctcagagaggagccatcgcagcgcctctgagaggagccatcgcagcgcctctgagaggagtcatccaagcccttctcagaggagccatcacagtctctctgagaggagctatcgagctccctctgagaggagatgtcgcagtccctctgagagaaggtgtcgcagtccctctgaaagaaggtgtcgcagtccctctgagaggagca---atcgcagtctctttgagaaacttcgtcgcagttcctctgagaggagAGGGCACAGTGCTtctgagagaagacagcacaagccctctgaggggagcagacaaagtccctctgagaggagcCACAACAATCCCCTCAAGGAGAGACTCAAACACAGCTCCCCTAGGGAGAGGCCC a score=8656 s mm7.chr5_random 8741124 333 + 11523536 CACCCCATGATGTCACACAACC---------GGAGCTTTTCTCTCTAT---TTTACATTCCAGGTGATTTTCTAGTT-TCACTTTTAAAATATTTCTGACCAGAGTGCTAAGGATCTTTACCTAAGTTTAAACAAAAGTGTTTGTAACCTTGAAAGCTACCTTAGCTGGACACCA----AACTTTGAGTGGCAAAAGGCCCTTTTAAATGTATTTCAAATAGACTAGTCTGGCAACATTTTTTTTTTTGGCCCAATAAATGACAAAAGCAGCCAAATGTTTCTCTCTGAAGCCTGGCTGGGGAAGTACTGTGTGAGTCCTGATGA--GTCCCCCGTGGATTATCAAAGTAAT s bosTau2.chr4 1486131 339 - 69556449 CATCCCAGAAAGTCATAGAGCAAGACATAAAGGATATTTTTCCTCCAGGTATTAGGATTACCAGTGACTTTTTCATCCTAACTTTTAAAATATCTTCTAACACTCTGGCAGTGATAATAATTCAAATTAAAAACAAAGG---TGTAATTTTGAGAGCT-TTTCAGCCAGAGACGAGCTCACTTCTAGGAGGGAGAAAGCTTCCTTA---GTATTCAAAACAGACTAATTTAGCAACAATATTT-----GGCCCCATAA-TAACAAAAGAAGCCAAATGTTCCTCTTAGAAGTCTGGCTGGAAAAGCACAGCTCTTTTCCTGATGATTGCCCCCCGTGATTTATTAAAGTAAT a score=20902 s mm7.chr5_random 8849090 447 + 11523536 AGACTGAGACAGAATCCTCACTC-------TCAGATGACGCTCAGGCAGCCCCTGAGTTCAGTGAGAGGCCAGTCTCCAGAGAAACACAAACTAGTTACAGCCAGCACTCTGAGAATGCTCACCAGACAAGGGTATTGGTTC-----AGCCCTAACTCGG-----------------------GTACACTCGCACATGCACGCACGAAAGCATACCCGCCCG--CACACACTAATTTTGTGCCAGGTTGTCATAAAACTTAAGACATTTATACGAGGGTCAGAGGTCAAGAGGGGC-CAGCCTTATTTTCTGTTATTAATTACACCTTATCCATTCCACACGGACTGCGCTTGTCTTAGATAAGGTTACAATACTGTTTTATTGGGAAGCCTCCAGGCTCATAGGCTGGGGGTGGGGAGATGGGTTGGGATTGGGACAGGAGACAAAGGAAATCATGGGATGGGGT--AGAGAGAAGGGGGGGGGGC s bosTau2.scaffold70 314769 470 + 907072 AGATCTAGACCAAATCCTGACTTCAAGAAATCAGATCAATTTCAGGCAGTGCCTGGGTTCAGCAAGAGGCCAGTCTACCCAGAAACGTAAACCAATTCCAGTCAGGGCTAGGTGAATACTCAGCAGACAGACGTATTGGCCCCACATAGGCTCAGCTCAGATGcacacactggaacatgcaccgcacactcacacacacacgggcgcatgcacacacatccgtacacacactcaTTTTGGGCCCGGCTGTCATAAAACTTAAGACACTTATATGGGGGTGAGAGGTCAGGAGGGGAGAAACATTATTTTCTGTTATTAATTACACCTTATCCATTCTACATGTGCTGCACTCGTCTTAGATAAAGTTACAGTTCTATTTTATTAGGAAGCCTCCGGGATCAT-------GTAAAGGGGGAT---TTGGGATT-------GAGACAAAGGAAATCGCAGGATGGGGTGCAAGGAGCAGGGGGGTGGGC a score=42506 s mm7.chr5_random 9003669 603 + 11523536 TGGACTGTGGTCATGAGCCCTTCCACAATCCCAAAGTTGTCATGGATGACCTTGGCCAGGGGGGCTAAGCAGTTGGTGGTGCAGGATGCATTGCTGACAATCTGGAGTGAGTTGTCATATTTCTCGTGGTTCACACCCATCACAATCATGGGGGCATCGGCAGAAGGGGCGGAGATGATGACCCTTTTGGCTCCACCCTTCAAGTGGGCCCCGGCCTTCTCCATGGTGGTGAAGACACCAGTAGACTCCACGACATACTCAGCACCGGCCTCACCCCATTTGATGTTAGTGGGGTCTCGCTCCTGGAAGATGGTGATGGGCTTCCCGTTGATGACAAGCTTCCCATTCTCGGCCTTGACTGTGCCGTTGAATTTGCCGTGAGTGGAGTCATACTGGAACATGTAGACCATGTAGTTGAGGTCAATGAAGGGGTCGTTGATGGCAACAATCTCCACTTTGCCACTGCAAATGGCAGCCCTGGTGACCAGGCGCCCAATACGGCCAAATCCGTTCACACCGACCTTCACCATTTTGTCTACGGGACGAGGCTGGCACTGCACAAGAAGATGCGGCTGTCTCTGGAACAGGGAGGAGCAGAGAGCt s bosTau2.chr2 65250713 601 + 86543008 TGGAAAGTGGTCATAAGTCCCTCCACGATGCCAAAGTGGTCATGGATGACCTTGGCT-GGGGGGCCAAGCAGTTGGTGGTGCAGGAGGCATTGCTGACAATCTTGAGGTTGTTGTTATACTTCTCGTGGTTCATGCCCAGCACAAACATGGGGGCATCGGCAGAAGGCGCAGAGATGATGACACTCTTGGCACCACCCTTCAAGTGAGCCCCAGCCTTCTCCATGGTAGTGAAGACCCCAGTGGTCTCCACCACATACTCAGCACCAGCATCACCCCACTTGATGTTGGCAGGATCTCGCTCCTGGAAGATGGTGACGGCCTTTCCATTGATGATGAGCTTCCCGTTCTCTGCCTTGACTGTGCCGTGGAACTTGCCGTGGGTGGTATCATACTGGAACATGTAGACTATGTAGTGAAGGTCAATGAAGGGGTCATTGATGGCGACGACATCCACTTTGCCAGAATTAAAAGCGGCCCTGGTGACCAGGCGCCCGATGTGGCCAAATCCATTCACTCCGACCTTCACCATCTTGTCTCAGGGATGTGGCTGGCACAGCAC-AGAAATTACGGCTATCTGTCGAACAGGCAGGAGCAGAGAGCT a score=18240 s mm7.chr5_random 9210450 828 + 11523536 ATACATAGTCTTATTGAAAAGTATATATTTAATACACTTACTTATTTGGTCTATTTATTTATACATA------CAATGCCTTGCATTTCATGTAATTACTGAATATTTTAATAATTACTATTCAAAAACATG--------AGA-------AAAGTGAATGTTAAATGTGTATGT--GATACATATTTTATATACATACCGACATGTTTTATAAGCTTGTAAAAATT----ACATTTGGTAACATATTCTGTATTA----TCAAATACATGGCACTCAAGATAAATAGCCCAAAA---TTGTTTTTCTAAGAAACATAAAACAAAATCCAAAATGATACCTGTACGCTCCATTCTTAAGAAGACCTGAGAATGTAAAGGGCAGCTGACC-----------TGAGTCACAGTAAGGCAACAGAAGAACACAAAGGATATACCCTGCTGTGGAGTATTACTGTGAGCCATGATAAATGGAACTGA-GGCAGGCACCCAGAAGCCTGCAAAAGAAAAGATATCTAATAAAAGAAAAC--------CAGGGCTCATGAAGGAAGATGTTTTAACTGCATTA-AGATAGATACAGTGTGCATAGGGATGGAGAAAGGCAGAAAGGGGCATCTCAGATGAGAGGaataataataataataataataataataataataataataataataataaCAGAGTTGGCCAGGAAAAGAAACACGTGACTCCAGAGGCAGAGAAGTGACAAGCTTGCCTAGCAGCATCTACTTAAGCCAAAAAAATAATGTTGACAGCTAGGGTTTGCAAAGTGCTTACTGTGCCAGCTTGCTGCTGTGTCTTGTTTTGTTGTGCCAAACGCTTTAAATTCATCAGCATGTCACAGAAATAAGCA s bosTau2.chr4 27723153 804 - 69556449 ACACATAATTTTATGTAAATGCTTACATTTGATATATTTACTTATTTAATCCATTTATTTCTTTATAAATGCATAGTGCCCTGCCtat------attaataaataatgtaacattttctttttaaataaatatttGTGAAAGACCCTGCCAAAATAAATGACAAAAGAAATTTTCAGATGAATGCATTA----CAAACTCACATATTTAATAAAACTGTTAACAATGAACACATGTAGTAG-ATATTCAGTTTTAATTTGCAAATATATGCAGTTAATGGTAAATAATGCAGAACCATTTTTTTTTTAAGAAAAA------ATAATTCAATAACATGCCTGCATGCTCAATTCTTAGGAAGACATGAGAATTTAAAGGGCACTTGAACCTATGGAACTTCAACTCTTATTATGAAAACAGGCAAATACAAAGAATAGATCCCACCAC-ACGTATGACTGAGAGTCATGGTAAATGGAACTGACCATAGGCACATGGAAGCCACAAAAAGAAAAGATCT-TAGTGAATTAGAACAGTCATTTCAGTGTTCATGAAG------GTGCTGAGTTCATTCTTGGAAGACAGAATGTTAGTAGGG-TGGAGAGAGGCAGAGAAAGACATTTCAAATGAGAGGAATAACAA----------------------AACTGGAATTGTAGAAGGGACAAAACTG--------------CAAGTGACTCCAGGGGTCGTGAAAAGATAAGCCTGCCTAGAGCTGAGGGCTAGAGTTGAGGAAATGATACTAACagctagtgcttgtggagggcttatcatgta----tgcagc-------------actgtgctaggtgctttacatgcattaGTAGCTTACTGAAGTGCAca a score=6452 s mm7.chr5_random 10938706 245 + 11523536 CAAGGGACATTCTCAGCCAACCCATTAACCTAAAATTCACTAAGCTGTTCAGTATTTGGTTTTCTTCCACTGTCTTATTTCCAAACATTTTAGATATTTCTTGTC--AATGTGCCCTTTGCTCTAATTAAACTCTAGGCATCTTAGCGCTCATGTCAAGTAATTAAAATGGGTTAATTAAACACATATTAAGAAACCAATACACTTCAGATTTTTTTTGGCTTAGTGTGAGGGAACATTAAATGTTT s bosTau2.scaffold505 40130 242 - 446533 CAAGGGTCTTCTCCTCTCCCCTTACTAATCCAACTTGAACTAAATCCTTCAGGATTTGTTTTCATCCCATCTTCTGCCATTAAATCATCATAAATTGTTTTAGTCTCAATGTCTCCTTCTCTTTAATTACACACCACATAGGCTGACCCTTATGTTAAATAATTGA--TGAATTAATTAAACATGTATTCTGAATACACTATATTCCAGATGTTTT---GCTTAGTCTTAGGTAACAGAATATGTCT a score=4048 s mm7.chr5_random 10939271 255 + 11523536 ctagctccCCCTTTTCCCTCTAGCATTTTATATTCCTGCCTTCATTTTCAATACAATGAT---ATTTCAATGATATTCAAAGGAACA--TTATTCTCCTTTATTTTCGAAACTAAAAAT-ATGATAATTTGTATGACATGCATGTGCctagtattggtagattgtttatggagtact-gcactattctgtgggtgtg---acaggccttcataaatatcttta-----catcaagctgtgcatcatatgactgacctcatttcacatgct s bosTau2.scaffold505 40388 265 - 446533 CTCACTTTTACTATTCACTTCTGTATCTTGCATTTTAATCTTCTTTTGCAATGAAATGATGTGATTTTGCTG-----CATAGGAATATCTTTTTCTCCTGCATCTTCAAAAATACCCATAATGCGGATGTGTGCATTATaataatggctgacatttattgagtgtttactaaatgctggcaccattaagagtttatatgtatatatatccacgtatgtcttcataacccatcaataagcttaccatataattgtcttcattccacaAact a score=17614 s mm7.chr5_random 10940502 596 + 11523536 GCATTGTATCCCAA---CTCTCCAGCCCCTCCTATATATGCCATGGCCTGCACCTTTGGTAGGCAGTAAATTCATCATCTCCAAGGCACTCCCTGGT-TCCTCTGCACCCTATTCCTACAAGGATATTCCTTAATGCATGGCA-------GCAATGTATCTCCATGGCTTCTCTCAGGGGTTGACTTGTTCACA---------AGTAGATAGAGACCTGTGCATTTACTTATAGTTTTAAGCATGTTTAATTTACTCAGGTCATACTGACTGCTCTGTGGCCTCTAGGATCGTGTGTGATTCTCAGAGAGAGTATGCAAACTAAATCCATCTGAAAATGTTACCTTTAAGTAACAATTTACAGATCTAGTAAGCAA-------------GAATAGAGGTGCTGTAAATCTGTTATCATAAGCATCCCACAT--GGACATGATTTTCCCTCACAACTCTGAAATCTTAAGTTTCCTCCAGATGAGCATACATGTATTCCAACAGTTGGCTTGCTCCCTCCTGCCCCCTCTGCCACTGAAGTACCCTCACAATCTCTCACTTTTCATGAGTCATATTGGATTGCTAGAAATATCCTATAAAGAAAAGGCTAAGGGCCTGTGAGATGGCTCTGC s bosTau2.scaffold505 45465 580 - 446533 GCATTGTATCCCAAAGTCTTCCCAG--------AGATGCTCCCTGACCTGCATCTTTG------AGTATGTTTGGTTTTTCTCACAGATAACTAAGTGCCCCCTTCACTTTGTCCCTA---GGTTTTCCCCTGCTGCTTTGTACAAATTCTCAAGCCTTTTTTAGAACTTTCCCCAGAGCATTTTCTATGTACATGGTGCTGGAGTGGGTGGAGACATATGCAGTTATTTATCGATTCAAACATGCCCAATTTATTTAAGTTGTACTGACTGCCCTGTGGCCTCTGGGAATGTGTGTAATTCTCAGAGGCAACGTTTAAACTAAATCAAACTGAAAAATTTATCTTTAAGTAACAACTTACAGATCTAATAACCAAGGAAGTCTGCACTGAACAGAGATGTTGTAAATCTATTATTCTAAGTATCCTCTGTCCTGACACAATTTTCCCTAAAGCCTTTGAAATGTTAAATTTCTCCCAGACAAGCACACATGAATTTCAACAACTGAGTTGATGGATTTT------------------------TCACAGTTT-----TTTCCATGAGTTGAATTGT-CTGCTAGAAATACCCTGTAAGAGGAAAGCTATGA----ATGAAGTGACCCTAC a score=31436 s mm7.chr5_random 11259959 714 + 11523536 gaGGCACCCTTTTAACATACCAG-GACTTGGTTATGAATAAATGTGTACGCAGTTTATTCTTACATTCAGAGGGCTGGCCAATGATTTTGCAATTCTCTTTTCAGTCCAATCTTTTGAGCCTCTGTGTGGGGAAATGGCAAAATAAATGCTCTAATTTGCGTTGAGAAAG--CAGATGTGCAGGCAGTACAAGACATTATCTTAGAGCCACTACAAAAGACCTCTTCCTTCCTTTATTAAAAGTGGCAGGCACTGCCAAAGTGCTGGAGCATCTAGGAGCCAAGGAGATTGCAAGGGCACTCTACAC-ACCACTCAGCACTAACAGGCAACAAGTTCTGATATTTTAAGAATTTCTAATTCATGTCCATTTTCACTG----AGAGGCCAAGCAGATACCTAAATTGATTCTGCCTGCTTCAGACCCAATGTGTGAAAACAGCAAGTGACAGGGACACCGAAGGGGGAGACATCCGCCGAGTGATTGGTTAAACAGCTGTTCCTTTTTTGAAATATATCTCCAAGATGCAGAAT---AGAGGGCCACTGTACTATGCTGCCCATTAATTATACAGTTGACAAGAAAATTACCCTTCATATCAACATGAAGTGGAGAT---------GGGGGCTGGAAGGGAGGGGTGGGTCAAGAACAACATTCAACAGGGTTATCTGCAGCCCGTGAGTGACTGAGGCCCTCTGAGCTCAGGGAGGAGGCAGTTTGTATTCACA s bosTau2.scaffold5874 39631 714 + 50164 GAAGCACCCCTCAGATGCATCAAAGTTTTATTTCTGAATAAACGCCCACCCTCTTTAGCCTTCCCATTCCTGGGCTATCAGAAGTTTTTA-AATTCTCTTGTAAAGCTGCTGCCTGAAGCCTCTGTGAAGGGAAACAGCAGAATAAATGCTCTGATG---ACTGAGAAAGAATAGACACGCCTGCAGTACAAGACATTATCTTAAAGCCACTACAAAAGACCTCGTCCAGC-TTTATTAAAAGTGGCAGACAATGCCAGAGCACCCGAGCGCT---GGGCCAAGGAGCTTGCAAGGGCAATCCTCACCACCATTCAGTGTTAACAGGCGACAAGTTCTGATAGCCCAAGAACGTCTAATTCGTGGCTGCCTTCACTTTCCTAGAG------CAGATACCCAAATTGATTCTGCCTCCTTCAGGCTCGATGTGTGAAAAGGCTGATTGACAGAAACACCTAAGGGTAATACGCCTGCCAAGTGATTGGTTAAACAGCTATTCA--TTTTGAAATATATCTTCGAGAGGCAGAATAACAGAGGGCCGCTGTAGTGTGCAGCCCATTAATTATTCAGTTGACAAGAAAATTACCCTTCGGATCAACATT-AGTGGAGGCTTGTCGGGATGGGGTGGGGTGGGGGAGGCAAGTGGAGGACAACATTCCACAGGGTTATCTGCA--CAGACAGCCAC-GAGGCCCTCCTAGGTCTGGAAGGAGTGGGTTTGTGTATACA a score=4617 s mm7.chr5_random 11261797 222 + 11523536 gactttCTGAAAGGAGATGAGCTTCCAGGTC--TTATCAGTCTCT---AATCTCTTT-TCTTCCCCAAGCTAAGGATGGCCCATTTAAATGTCTGGCTCCCCTCTGAATCCAGGTCTGCCTCATGGGTTTCGTCTCAAATGCCTTTTGGAGTCAGAATCCCACTGTTAAATCTATCCCATCCCAAGGGCGCCTGAGATCTAGATGGTGCATTTGTTACTGGGAAATTG s bosTau2.scaffold5874 41337 223 + 50164 GAATTTCTGGAGGGAACTAAGCCTCGTGTTCATCTGCCAGCTGGTGGCAACCTTTTCATCCTCCCCA--CTGAGTGGGGTCAGTCAAGCTGGCTGGCTCTCCTCTGAGTTCACATCTGTCTCCTGGATCAC-TCTTAGTTTTTCTCTGGGATT-GATCCAGATTGTGAAACCCACTCCGATCCATGGGGGCTCTGGATCTAGCTGGCGCCTTCA-CACTGGGTCACTG a score=3496 s mm7.chr5_random 11262019 82 + 11523536 CTCAGTTCTTGTCTTCTTGAAGTAAATAGTTAAGTTGAGAAACATAGA--CACTTGAAGCAGAAATTTATTTAGGAAAGGAAAA s bosTau2.scaffold6604 30610 84 + 44391 CTCAGTTCTTGTCCTCTTGAGGGAAAGAATTCAGATGAGAAACATAGAAGAATTTTAGGTAGCAAGAGTTTTAAGCAAAGCAAA