GeneMark.hmm PROKARYOTIC (Version 2.6m) Sequence file name: NC_009230.fna, RBS: Y Model file name: GeneMark_hmm_combined.mod Model organism: GeneMarkS_default_gcode_11 Fri Apr 20 15:06:06 2007 Predicted genes Gene Strand LeftEnd RightEnd Gene Class # Length 1 + 49 678 630 1 2 + 675 1712 1038 1 3 + 1660 2391 732 1 4 + 2492 3265 774 1 5 - 3366 3608 243 1 6 - 3716 3859 144 1 7 - 3856 4131 276 1 8 + 4323 5138 816 1 9 - 5246 5950 705 1 10 - 5960 6703 744 1 11 - 6700 8085 1386 1 12 - 8072 8542 471 1 13 + 8559 8819 261 1 14 - 8925 9848 924 1 15 - 9876 10331 456 1 16 - 10374 10694 321 1 17 - 10801 12225 1425 1 18 - 12273 12863 591 1 19 - 12901 13401 501 1 20 - 13551 14738 1188 1 21 - 14735 15646 912 1 22 + 15881 16417 537 1 23 + 16576 16923 348 1 24 + 17072 18214 1143 1 25 + 18476 19423 948 1 26 + 19574 19693 120 1 27 + 19858 20733 876 1 28 + 20730 22577 1848 1 29 + 22752 23018 267 1 30 + 23028 24158 1131 1 31 + 24390 27326 2937 1 32 + 27444 27851 408 1 33 - 27848 29329 1482 1 34 - 29364 30311 948 1 35 - 30818 31723 906 1 36 - 31785 32051 267 1 37 - 32143 32469 327 1 38 + 32576 33025 450 1 39 - 33017 34597 1581 1 40 - 34628 34984 357 1 41 - 34960 35523 564 1 42 + 35813 36151 339 1 43 - 36155 37300 1146 1 44 - 37514 38845 1332 1 45 - 39104 40471 1368 1 46 - 40911 41966 1056 1 47 + 42059 42826 768 1 48 + 43019 43708 690 1 49 + 43705 44418 714 1 50 + 44461 45228 768 1 51 + 45243 45578 336 2 52 + 46043 46429 387 1 53 + 46432 48672 2241 1 54 + 48884 49381 498 1 55 - 49481 50326 846 1 56 + 50910 52175 1266 1 57 + 52376 52630 255 1 58 + 52737 53834 1098 1 59 - 54303 55211 909 1 60 - 55251 56492 1242 1 61 - 56621 57526 906 1 62 + 57686 58714 1029 1 63 + 58716 61694 2979 1 64 - 61643 62296 654 1 65 - 62447 63130 684 1 66 + 63604 64755 1152 1 67 + 65003 66502 1500 1 68 + 66629 67801 1173 1 69 + 68185 69402 1218 1 70 + 69428 70177 750 1 71 + 70186 71127 942 1 72 + 71259 72689 1431 1 73 + 72741 74210 1470 1 74 + 74986 76122 1137 1 75 - 76228 76704 477 1 76 + 76885 78123 1239 1 77 + 78149 79312 1164 1 78 + 79380 80717 1338 1 79 - 81092 82048 957 1 80 + 82273 83046 774 1 81 + 83092 83436 345 1 82 + 83509 84183 675 1 83 + 84180 85316 1137 1 84 + 85360 86589 1230 1 85 + 86727 87977 1251 1 86 + 88043 89614 1572 1 87 - 89723 90520 798 1 88 + 90689 92011 1323 1 89 + 92147 93391 1245 1 90 + 93472 94383 912 1 91 - 94410 95432 1023 1 92 - 95448 95648 201 1 93 + 95844 96095 252 1 94 + 96098 96415 318 1 95 + 96399 97190 792 1 96 - 97924 100668 2745 2 97 - 100810 101253 444 2 98 - 101250 101756 507 1 99 - 101759 102151 393 1 100 - 102415 102576 162 1 101 - 102632 103159 528 1 102 - 103156 103527 372 1 103 - 103773 104087 315 1 104 - 104211 104486 276 1 105 - 104670 105311 642 2 106 - 105385 105924 540 1 107 - 105974 106213 240 1 108 - 106218 108833 2616 1 109 - 108830 111511 2682 1 110 - 111740 112723 984 1 111 + 113003 113635 633 1 112 - 113718 114797 1080 1 113 - 114963 115295 333 1 114 - 115292 115690 399 1 115 + 115885 117513 1629 1 116 + 117510 118280 771 1 117 - 118277 118474 198 2 118 + 118778 118990 213 1 119 - 119303 120367 1065 1 120 - 120560 122431 1872 1 121 - 122601 122951 351 1 122 - 122951 123520 570 1 123 - 123541 125451 1911 1 124 - 125591 126010 420 1 125 - 126223 127917 1695 1 126 - 127943 129166 1224 1 127 - 129163 129582 420 1 128 + 129811 130212 402 1 129 + 130199 130723 525 1 130 + 130769 131140 372 1 131 + 131267 133759 2493 1 132 + 133947 135194 1248 1 133 - 135250 136233 984 1 134 + 136258 136722 465 1 135 + 136719 136985 267 1 136 + 136990 138639 1650 1 137 + 138602 139159 558 1 138 - 139337 142888 3552 1 139 - 142901 144352 1452 1 140 - 144369 145316 948 1 141 - 145361 145924 564 1 142 - 145930 146409 480 1 143 - 146598 149057 2460 1 144 - 149192 149479 288 1 145 - 149509 150177 669 1 146 - 150193 151410 1218 1 147 - 151412 152263 852 1 148 - 152260 152967 708 1 149 - 153048 153332 285 1 150 - 153329 153937 609 1 151 + 154188 155090 903 1 152 + 155229 156983 1755 1 153 + 157012 158355 1344 1 154 + 158385 159281 897 1 155 + 159297 159488 192 2 156 - 159602 160150 549 1 157 - 160137 162563 2427 1 158 - 162580 164544 1965 1 159 - 164868 165380 513 1 160 - 165535 166596 1062 1 161 - 166782 167387 606 1 162 - 167558 167965 408 1 163 - 167978 168310 333 1 164 + 168559 169095 537 1 165 + 169092 170009 918 1 166 + 170035 171492 1458 1 167 + 171664 172650 987 1 168 - 172796 174064 1269 1 169 + 174327 175079 753 1 170 - 175292 175942 651 1 171 - 175981 177036 1056 1 172 - 177068 178465 1398 1 173 + 178592 179155 564 1 174 + 179131 179487 357 1 175 + 179518 181098 1581 1 176 - 181367 182227 861 1 177 - 182448 183836 1389 1 178 - 183873 185252 1380 1 179 + 185455 186312 858 1 180 - 186411 187925 1515 1 181 - 187922 188146 225 2 182 - 188231 189361 1131 1 183 - 189452 189637 186 1 184 + 189636 190589 954 1 185 + 190741 191796 1056 1 186 + 191991 192395 405 1 187 + 192467 194635 2169 1 188 + 195217 196920 1704 1 189 - 197170 197547 378 1 190 - 197548 197799 252 2 191 + 198072 199208 1137 1 192 + 199205 200359 1155 1 193 + 200628 200957 330 1 194 + 201330 201809 480 1 195 + 201966 204548 2583 1 196 + 204652 207306 2655 1 197 + 208917 210416 1500 1 198 - 210425 211660 1236 1 199 + 211797 211985 189 1 200 - 212030 212701 672 1 201 - 212707 213531 825 2 202 - 213616 214587 972 1 203 - 214584 214811 228 1 204 - 214826 216184 1359 1 205 + 216296 217351 1056 1 206 + 217459 218832 1374 1 207 + 218964 219578 615 1 208 + 219760 220476 717 1 209 + 220660 221421 762 1 210 + 221578 222210 633 1 211 + 222307 222723 417 1 212 - 222869 223855 987 1 213 + 223963 224427 465 1 214 + 224619 225671 1053 1 215 + 225845 227419 1575 1 216 + 227663 228310 648 1 217 - 228402 228734 333 1 218 - 228981 229625 645 1 219 + 229743 230123 381 1 220 + 230128 230691 564 1 221 + 230795 231298 504 1 222 + 231440 232114 675 1 223 - 232219 233361 1143 1 224 - 233391 233675 285 1 225 - 233853 234137 285 1 226 - 234512 235141 630 1 227 - 235248 236000 753 1 228 - 236123 237115 993 1 229 + 237428 238147 720 1 230 + 238271 238537 267 1 231 + 238729 239784 1056 1 232 - 239778 240227 450 1 233 + 240256 240966 711 1 234 - 240995 241345 351 1 235 - 241437 242120 684 1 236 + 242119 242292 174 1 237 + 242907 243908 1002 1 238 - 244060 244290 231 1 239 - 244452 244808 357 1 240 - 244918 245991 1074 1 241 - 246082 246489 408 1 242 - 246578 247075 498 1 243 - 247057 247686 630 1 244 - 247784 248374 591 1 245 - 248384 249226 843 1 246 - 249237 249746 510 1 247 - 249743 250420 678 1 248 - 250413 251435 1023 1 249 + 251675 252196 522 1 250 + 252350 252451 102 1 251 + 253360 253518 159 2 252 + 254146 254445 300 1 253 + 254471 256270 1800 1 254 + 256330 256782 453 1 255 + 256927 257538 612 1 256 + 257608 257961 354 1 257 + 258112 258651 540 1 258 + 258793 259314 522 1 259 + 259404 259853 450 1 260 + 259946 260110 165 1 261 + 260128 260334 207 1 262 + 260344 260619 276 1 263 + 260632 261297 666 1 264 + 261331 261477 147 1 265 + 261701 262015 315 1 266 + 262057 262347 291 1 267 + 262513 262677 165 1 268 + 262790 263374 585 1 269 + 263375 263866 492 1 270 + 263934 264260 327 1 271 + 264557 264853 297 1 272 + 264907 265158 252 1 273 + 265243 265491 249 2 274 + 265546 265932 387 1 275 + 266005 266562 558 1 276 + 266686 266949 264 1 277 + 267004 267555 552 1 278 + 267560 268087 528 1 279 + 268080 268820 741 1 280 + 269015 269818 804 1 281 + 269838 270110 273 1 282 + 270220 270606 387 1 283 + 270657 270869 213 1 284 + 270927 272015 1089 1 285 + 272052 272816 765 1 286 - 272805 272942 138 1 287 - 273213 273515 303 1 288 + 273802 274794 993 1 289 + 274920 275237 318 1 290 + 275317 276039 723 1 291 - 276049 276996 948 1 292 - 277145 277858 714 1 293 + 278024 278779 756 1 294 - 278829 280232 1404 1 295 + 280420 282351 1932 1 296 - 282365 282874 510 1 297 + 282997 283218 222 1 298 - 283222 284043 822 1 299 - 284046 284984 939 1 300 + 285134 285370 237 2 301 + 285725 288484 2760 1 302 + 288495 288707 213 1 303 + 288728 289003 276 2 304 - 289078 289413 336 1 305 - 289520 290386 867 1 306 + 290580 290954 375 1 307 + 290976 291413 438 1 308 + 291548 292384 837 1 309 + 292377 292919 543 1 310 + 292922 293224 303 1 311 + 293318 293662 345 1 312 + 293962 295191 1230 1 313 - 295205 295309 105 1 314 + 295330 295764 435 1 315 + 295955 296146 192 1 316 + 296189 296518 330 1 317 - 296657 297250 594 1 318 - 297261 298217 957 1 319 - 298214 298882 669 1 320 + 299211 300497 1287 1 321 + 300608 301798 1191 1 322 + 301795 302448 654 1 323 + 302445 303041 597 2 324 + 303434 304792 1359 1 325 + 304960 310905 5946 1 326 - 310994 311497 504 1 327 + 311626 312105 480 1 328 + 312139 313035 897 1 329 + 313198 313485 288 1 330 + 313597 313776 180 1 331 + 313811 313990 180 1 332 - 314114 314212 99 1 333 - 314274 315854 1581 1 334 - 315887 316240 354 1 335 - 316216 316731 516 1 336 - 316762 317109 348 1 337 + 317273 317977 705 1 338 + 317993 318175 183 2 339 - 318785 318913 129 1 340 + 319238 319588 351 1 341 + 319781 320230 450 1 342 + 320285 321364 1080 1 343 + 321511 322014 504 1 344 + 322163 322711 549 1 345 + 322898 323425 528 1 346 - 323480 324169 690 1 347 + 324288 324602 315 1 348 + 324658 325359 702 1 349 + 325508 326476 969 1 350 - 326530 326814 285 1 351 - 326831 327490 660 1 352 + 327717 328358 642 1 353 + 328355 328822 468 1 354 + 328815 329102 288 2 355 + 329403 329582 180 1 356 + 329976 332456 2481 1 357 + 332533 332778 246 1 358 + 332806 332979 174 1 359 + 333142 333363 222 1 360 + 333398 333859 462 1 361 + 334021 334953 933 1 362 - 335108 335428 321 1 363 + 335563 335856 294 1 364 + 336089 336376 288 2 365 + 336378 336497 120 1 366 + 336801 337346 546 1 367 + 337616 337855 240 1 368 + 337953 338177 225 1 369 + 338183 338500 318 1 370 + 338515 338883 369 1 371 + 338894 339199 306 1 372 + 339270 339551 282 2 373 + 339879 340217 339 1 374 + 340266 340517 252 1 375 + 340980 342062 1083 1 376 + 342074 342814 741 1 377 + 342854 343876 1023 1 378 + 343969 344625 657 1 379 + 344687 345661 975 1 380 + 345717 346070 354 1 381 + 346176 347243 1068 1 382 + 347306 348064 759 1 383 + 348086 348865 780 1 384 + 348870 349139 270 1 385 + 349136 350092 957 1 386 + 350230 350517 288 1 387 + 350605 350949 345 1 388 + 351057 351872 816 1 389 + 351985 352215 231 1 390 + 352221 352844 624 1 391 + 353071 354831 1761 1 392 + 354847 355902 1056 1 393 + 355924 356118 195 1 394 + 356127 356570 444 1 395 + 356718 357260 543 1 396 + 357264 357839 576 1 397 + 357855 358259 405 1 398 + 358391 358777 387 1 399 + 358770 359795 1026 1 400 + 359878 360597 720 1 401 - 361034 361999 966 1 402 - 362126 363100 975 1 403 + 363211 364014 804 1 404 - 364052 364837 786 1 405 + 364942 365496 555 1 406 + 365512 366132 621 1 407 + 366135 366656 522 1 408 - 366709 367242 534 1 409 + 367432 368157 726 1 410 + 368154 368378 225 1 411 + 368573 369097 525 1 412 - 369181 369639 459 1 413 - 369909 372191 2283 1 414 + 372340 372774 435 1 415 + 372783 373385 603 1 416 + 373481 374215 735 1 417 + 374230 374457 228 1 418 + 374593 375042 450 1 419 + 375039 375293 255 1 420 - 375471 377051 1581 1 421 - 377082 377438 357 1 422 - 377414 377977 564 1 423 + 378116 378595 480 1 424 + 378705 378962 258 1 425 + 378997 379344 348 1 426 - 379415 380272 858 1 427 + 380521 380844 324 1 428 + 380913 381548 636 1 429 + 381567 381782 216 1 430 + 382238 383608 1371 1 431 + 383830 385620 1791 1 432 + 385804 386280 477 1 433 - 386346 387266 921 1 434 + 387519 387857 339 1 435 + 387860 388012 153 2 436 + 388160 388624 465 1 437 + 388746 389537 792 1 438 + 389653 390207 555 1 439 + 390318 390437 120 1 440 + 390594 391436 843 1 441 - 391565 392164 600 1 442 + 392477 393418 942 1 443 + 393851 394204 354 1 444 - 394377 394586 210 1 445 + 395058 395480 423 1 446 - 395571 396002 432 1 447 - 396041 396892 852 1 448 + 397035 397751 717 1