GeneMark.hmm PROKARYOTIC (Version 2.6m) Sequence file name: NC_007984.fna, RBS: Y Model file name: GeneMark_hmm_combined.mod Model organism: GeneMarkS_default_gcode_11 Fri Apr 20 14:17:30 2007 Predicted genes Gene Strand LeftEnd RightEnd Gene Class # Length 1 + 182 1720 1539 1 2 + 1933 5826 3894 1 3 + 5853 6356 504 1 4 + 6569 7822 1254 1 5 - 7855 8661 807 1 6 + 8964 10118 1155 1 7 + 10151 10585 435 1 8 + 10933 12054 1122 1 9 + 12077 13369 1293 1 10 + 13482 14615 1134 1 11 + 14634 16052 1419 1 12 + 16150 17811 1662 1 13 - 18124 19740 1617 1 14 + 20049 20594 546 1 15 + 20778 21935 1158 1 16 - 21979 22887 909 1 17 + 22990 25284 2295 1 18 + 25559 27043 1485 1 19 - 27142 28062 921 1 20 - 28316 30781 2466 1 21 - 30959 31975 1017 1 22 - 32055 32744 690 1 23 - 32844 33923 1080 1 24 - 33928 34449 522 1 25 - 34736 36097 1362 1 26 - 36278 36928 651 1 27 + 38198 38455 258 1 28 + 38523 39779 1257 1 29 - 39828 41180 1353 1 30 - 41305 41712 408 1 31 + 41948 42376 429 1 32 + 42396 42794 399 1 33 + 43254 43748 495 1 34 + 44259 45017 759 1 35 + 45160 46740 1581 1 36 + 46761 48035 1275 1 37 - 48145 48624 480 1 38 - 48741 49643 903 1 39 - 49666 50211 546 1 40 - 50301 50585 285 1 41 + 51358 53226 1869 1 42 + 53213 53857 645 1 43 + 53850 54623 774 1 44 + 54623 54823 201 1 45 + 54827 55606 780 1 46 + 55603 56751 1149 1 47 - 56812 57288 477 1 48 - 57447 58313 867 1 49 - 58348 59391 1044 1 50 + 59747 60250 504 1 51 + 60272 60724 453 1 52 + 60733 62082 1350 1 53 - 62339 62974 636 1 54 + 63371 65458 2088 1 55 - 65455 66930 1476 1 56 + 67592 68656 1065 1 57 + 68669 69310 642 1 58 + 69330 70280 951 1 59 + 70343 71203 861 1 60 + 71376 72095 720 1 61 + 72230 73165 936 1 62 + 73173 73913 741 1 63 - 73928 75448 1521 1 64 - 75494 75961 468 1 65 - 76001 77356 1356 1 66 - 77544 79559 2016 1 67 - 79623 80393 771 1 68 + 80668 81633 966 1 69 + 81807 82064 258 1 70 + 82117 83832 1716 1 71 - 84144 84857 714 1 72 + 85387 86463 1077 1 73 + 86454 87113 660 1 74 + 87318 89411 2094 1 75 - 89439 91436 1998 1 76 - 91457 92410 954 1 77 + 92901 93731 831 1 78 + 93734 94582 849 1 79 + 94585 95718 1134 1 80 + 95991 96179 189 1 81 - 96281 97555 1275 1 82 - 97591 98241 651 1 83 - 98475 98909 435 1 84 + 99313 99969 657 1 85 - 100009 100368 360 1 86 - 100574 101197 624 1 87 + 101593 101937 345 1 88 + 102617 104287 1671 1 89 - 104379 104909 531 1 90 + 105072 105818 747 1 91 + 106173 107354 1182 1 92 + 107342 108226 885 1 93 + 109297 109773 477 1 94 + 109881 110597 717 1 95 + 110638 111273 636 2 96 + 111372 111935 564 1 97 + 111993 113039 1047 1 98 - 112996 114456 1461 1 99 - 114465 116123 1659 1 100 - 116503 117357 855 1 101 - 117359 118063 705 1 102 - 118060 118203 144 1 103 - 118286 118783 498 1 104 + 119463 120416 954 1 105 + 120347 120775 429 1 106 + 121415 121840 426 1 107 + 122087 122701 615 1 108 + 122774 122971 198 1 109 + 123268 125367 2100 1 110 + 125425 126033 609 1 111 - 126348 127268 921 1 112 + 127464 128618 1155 1 113 + 128893 129231 339 1 114 + 129409 131304 1896 1 115 + 131401 132042 642 1 116 - 132045 133118 1074 1 117 - 133115 133624 510 1 118 + 134028 135416 1389 1 119 - 135430 136287 858 1 120 + 137224 137427 204 1 121 + 137672 137887 216 1 122 + 137966 138790 825 1 123 + 138903 139619 717 1 124 + 139674 141614 1941 1 125 + 142061 143011 951 1 126 + 143136 144143 1008 1 127 - 144158 146566 2409 1 128 - 146724 147836 1113 1 129 + 148605 148748 144 1 130 + 148760 149107 348 1 131 + 149343 150944 1602 1 132 + 150941 152314 1374 1 133 - 152320 154158 1839 1 134 - 154201 155610 1410 1 135 - 155664 156086 423 1 136 - 156100 157473 1374 1 137 - 157519 158382 864 1 138 - 158429 159970 1542 1 139 - 159992 160525 534 1 140 - 160548 161018 471 1 141 - 161047 161289 243 1 142 - 161326 162147 822 1 143 - 162235 164130 1896 1 144 - 164177 165154 978 1 145 + 165307 167034 1728 1 146 + 167330 168076 747 1 147 + 168085 169605 1521 1 148 + 169659 170483 825 1 149 + 173932 174054 123 2 150 - 175857 177956 2100 1 151 - 177962 178870 909 1 152 - 179601 180392 792 1 153 - 180690 181853 1164 1 154 - 182488 182715 228 1 155 + 182886 185000 2115 1 156 + 185243 185767 525 1 157 + 185771 187111 1341 1 158 + 187374 188144 771 1 159 - 188146 189135 990 1 160 - 189206 190168 963 1 161 - 190415 191230 816 1 162 - 191281 192303 1023 1 163 - 192398 192655 258 2 164 - 192689 193120 432 1 165 + 193317 194444 1128 1 166 + 194725 195207 483 1 167 - 195204 196013 810 1 168 - 196074 196241 168 1 169 - 196291 196518 228 1 170 - 196617 197471 855 1 171 + 197581 198222 642 1 172 - 198277 198729 453 1 173 - 198710 199924 1215 1 174 - 200830 202089 1260 1 175 - 202183 202509 327 2 176 - 202633 202971 339 1 177 + 203364 204299 936 1 178 - 204398 205045 648 1 179 + 205192 206151 960 1 180 + 206278 208878 2601 1 181 - 208875 209222 348 1 182 - 209239 209997 759 1 183 - 210022 210534 513 1 184 - 210539 210805 267 1 185 - 210902 212251 1350 1 186 - 212553 214124 1572 1 187 - 214670 214855 186 1 188 - 215037 217691 2655 1 189 - 217939 218991 1053 1 190 + 219478 220260 783 1 191 + 220287 220943 657 1 192 + 221030 223597 2568 1 193 - 223856 224332 477 1 194 - 224342 225067 726 1 195 - 225382 226005 624 1 196 - 226002 227444 1443 1 197 - 227457 228365 909 1 198 - 228409 229797 1389 1 199 - 229965 230669 705 1 200 - 230716 232416 1701 1 201 - 232416 234203 1788 1 202 + 234505 234894 390 1 203 - 234917 235588 672 1 204 - 235629 236930 1302 1 205 - 236998 238629 1632 1 206 - 238738 239418 681 1 207 + 239976 240665 690 1 208 - 240709 241056 348 1 209 - 241887 242000 114 1 210 + 242468 242923 456 1 211 + 243433 244482 1050 1 212 + 244508 245011 504 1 213 + 245068 245865 798 1 214 + 245884 246741 858 1 215 + 246940 249525 2586 1 216 + 249742 250779 1038 1 217 + 250772 251425 654 1 218 + 251496 253361 1866 1 219 + 253354 254466 1113 1 220 + 254594 255277 684 1 221 + 255313 256197 885 1 222 + 256475 257662 1188 1 223 + 257862 258425 564 1 224 + 258950 259951 1002 1 225 - 259963 261264 1302 1 226 + 261372 262400 1029 1 227 + 262397 263575 1179 1 228 + 263562 264323 762 1 229 + 264316 264993 678 1 230 + 265457 266218 762 1 231 + 266278 266991 714 1 232 + 266998 268089 1092 1 233 + 268184 269470 1287 1 234 + 269532 270209 678 1 235 + 270342 272018 1677 1 236 + 272214 272378 165 1 237 - 272440 273111 672 2 238 + 273549 274484 936 1 239 + 274498 274968 471 1 240 + 275014 275409 396 1 241 - 275505 275714 210 1 242 + 276002 276718 717 1 243 - 276746 279106 2361 1 244 - 279309 280574 1266 1 245 - 280711 281328 618 1 246 - 281550 282812 1263 1 247 + 283346 284260 915 1 248 + 284291 286288 1998 1 249 + 286275 286886 612 1 250 + 286891 287238 348 1 251 + 287238 288104 867 1 252 + 288133 289542 1410 1 253 + 289514 290440 927 1 254 - 290454 290750 297 1 255 + 291155 292048 894 1 256 + 292087 293958 1872 1 257 + 294028 295764 1737 1 258 - 295815 297341 1527 1 259 - 297338 297778 441 1 260 - 297778 298509 732 1 261 - 298643 299548 906 1 262 - 299551 300228 678 1 263 - 300268 301218 951 1 264 - 301212 303020 1809 1 265 - 303301 306174 2874 1 266 - 306184 306588 405 1 267 - 306672 308174 1503 1 268 + 308547 309401 855 1 269 - 309469 310314 846 1 270 - 310311 311411 1101 1 271 + 311719 312366 648 1 272 + 312363 313238 876 1 273 + 313291 314229 939 1 274 + 314339 314920 582 1 275 + 314970 316040 1071 1 276 + 316118 316906 789 1 277 + 317059 318996 1938 1 278 - 319003 319752 750 1 279 - 319787 320083 297 1 280 + 320418 321017 600 1 281 - 321060 322034 975 1 282 - 322283 324856 2574 1 283 + 325306 326070 765 1 284 + 326265 326567 303 1 285 + 326729 328180 1452 1 286 + 328635 329045 411 1 287 - 329091 329978 888 1 288 - 330171 330659 489 1 289 - 330747 332225 1479 1 290 + 332646 334097 1452 1 291 + 334517 335866 1350 1 292 - 336040 337047 1008 1 293 - 337056 337646 591 1 294 - 337688 338209 522 1 295 - 338703 340472 1770 1 296 - 340697 341422 726 1 297 - 341775 343067 1293 1 298 - 343217 343843 627 1 299 - 343945 345945 2001 1 300 + 346139 347098 960 1 301 + 347213 347431 219 1 302 + 347607 348335 729 1 303 + 348356 349084 729 1 304 + 349081 349776 696 1 305 + 349798 350469 672 1 306 + 350805 351116 312 1 307 + 351142 351780 639 1 308 + 351792 352397 606 1 309 + 352394 352696 303 1 310 + 352716 353534 819 1 311 + 353556 353834 279 1 312 + 353865 354197 333 1 313 + 354214 354915 702 1 314 + 354927 355340 414 1 315 + 355337 355528 192 1 316 + 355530 355790 261 1 317 + 355945 356313 369 1 318 + 356325 356639 315 1 319 + 356663 357208 546 1 320 + 357231 357536 306 1 321 + 357569 357967 399 1 322 + 357982 358515 534 1 323 + 358529 358876 348 1 324 + 358888 359391 504 1 325 + 359395 359577 183 1 326 + 359578 360009 432 1 327 + 360025 361359 1335 1 328 + 361397 361513 117 1 329 + 361539 361895 357 1 330 + 361920 362309 390 1 331 + 362356 362976 621 1 332 + 362997 363980 984 1 333 + 364044 364430 387 1 334 + 365098 366036 939 1 335 + 366098 367033 936 1 336 + 367048 368115 1068 1 337 + 368366 369586 1221 1 338 + 369660 370790 1131 1 339 + 370798 371601 804 1 340 + 371713 372600 888 1 341 + 372643 373923 1281 1 342 + 374317 374802 486 1 343 + 374842 376260 1419 1 344 - 376380 377834 1455 1 345 - 377859 379382 1524 1 346 - 379432 381297 1866 1 347 - 381294 381596 303 1 348 - 381644 382141 498 1 349 - 382165 382707 543 1 350 - 382731 383708 978 1 351 - 383705 386434 2730 1 352 - 386516 387850 1335 1 353 - 387847 388350 504 1 354 - 388353 390140 1788 1 355 - 390249 390923 675 1 356 - 390987 391373 387 1 357 + 391621 392823 1203 1 358 + 392877 395012 2136 1 359 - 395031 395324 294 1 360 - 395299 396378 1080 1 361 - 396480 398762 2283 1 362 + 399298 401841 2544 1 363 + 402170 403297 1128 1 364 - 403459 403743 285 1 365 - 403876 404337 462 1 366 - 404495 405373 879 1 367 + 405526 407004 1479 1 368 + 407148 407810 663 1 369 - 407840 408421 582 1 370 + 408614 410257 1644 1 371 - 410283 411689 1407 1 372 - 411892 412515 624 1 373 - 412509 413285 777 1 374 - 413267 414013 747 1 375 - 414016 414609 594 1 376 - 414606 415676 1071 1 377 - 415682 416764 1083 1 378 - 416761 418074 1314 1 379 - 418078 418977 900 1 380 + 419623 420252 630 1 381 - 420279 421469 1191 1 382 - 421550 422953 1404 1 383 + 423379 424389 1011 1 384 - 424522 425043 522 1 385 - 425090 426844 1755 1 386 - 427111 427428 318 1 387 - 427534 427956 423 2 388 - 428219 429154 936 1 389 - 429204 429707 504 1 390 + 429981 430535 555 1 391 + 430694 431383 690 1 392 - 431428 434919 3492 1 393 - 434949 436340 1392 1 394 + 437170 438279 1110 1 395 + 438606 439997 1392 1 396 - 440033 441280 1248 1 397 - 441277 441987 711 1 398 - 441980 443173 1194 1 399 - 443281 443814 534 1 400 - 443829 444194 366 1 401 - 444191 444991 801 1 402 - 445036 446034 999 1 403 - 446037 446675 639 1 404 - 446730 447533 804 1 405 - 447634 447867 234 2 406 - 448023 448757 735 1 407 - 448741 449703 963 1 408 - 449723 450676 954 1 409 - 451081 451251 171 1 410 - 451394 452362 969 1 411 + 452883 454649 1767 1 412 + 455005 456099 1095 1 413 + 456227 458071 1845 1 414 + 458117 459187 1071 1 415 + 459430 460125 696 1 416 + 460142 460954 813 1 417 + 460958 461239 282 1 418 - 461260 461958 699 1 419 - 462025 462777 753 1 420 - 463060 463899 840 1 421 - 463921 464721 801 1 422 - 464758 465726 969 1 423 + 466225 467559 1335 1 424 - 467724 469082 1359 1 425 + 469204 470178 975 1 426 - 470279 471679 1401 1 427 - 472023 473540 1518 1 428 - 473575 474786 1212 1 429 - 475083 475499 417 1 430 - 475533 476756 1224 1 431 - 476753 478051 1299 1 432 - 478032 478772 741 1 433 - 478847 480322 1476 1 434 - 480337 480696 360 1 435 - 480843 483227 2385 1 436 - 483244 484227 984 1 437 - 484295 484657 363 1 438 - 484685 484882 198 1 439 - 484928 485443 516 1 440 - 485475 487403 1929 1 441 - 487653 488375 723 1 442 + 488425 488886 462 1 443 + 488971 489744 774 1 444 - 489766 490602 837 1 445 - 490684 491739 1056 1 446 - 491812 492045 234 1 447 - 492130 493287 1158 1 448 - 493284 493691 408 1 449 - 493691 494254 564 1 450 - 494302 495255 954 1 451 - 495314 495937 624 1 452 - 495970 496542 573 1 453 + 496690 497451 762 1 454 + 497784 498227 444 1 455 + 498343 498714 372 1 456 + 498726 499085 360 1 457 + 499095 499382 288 1 458 + 499440 499814 375 1 459 + 499873 500343 471 1 460 + 500448 502565 2118 1 461 + 502681 503865 1185 1 462 + 503931 504314 384 1 463 + 504315 504860 546 1 464 + 504916 505344 429 1 465 + 505348 506052 705 1 466 + 506232 506732 501 1 467 + 506768 507133 366 1 468 + 507307 511329 4023 1 469 + 511418 515644 4227 1 470 + 515662 516690 1029 1 471 + 516668 517540 873 1 472 - 519149 519271 123 2 473 - 522858 524270 1413 1 474 - 524329 525618 1290 1 475 - 525629 528298 2670 1 476 + 528653 529540 888 1 477 + 529591 530202 612 1 478 - 530326 532893 2568 1 479 + 533136 533657 522 1 480 - 533781 534953 1173 1 481 - 535265 536737 1473 1 482 - 536809 537885 1077 1 483 - 538203 539543 1341 1 484 - 539545 540627 1083 1 485 - 540621 541982 1362 1 486 - 541985 543472 1488 1 487 - 543659 544234 576 1 488 - 544713 545579 867 1 489 - 545764 546558 795 1 490 + 546941 547561 621 1 491 + 547604 548446 843 1 492 + 548506 549255 750 1 493 + 549304 549861 558 1 494 + 550015 551211 1197 1 495 + 551341 552102 762 1 496 + 552112 552966 855 1 497 + 552986 554365 1380 1 498 + 554346 556751 2406 1 499 + 556830 557327 498 1 500 + 557583 558032 450 1 501 + 558257 561748 3492 1 502 + 561765 562724 960 1 503 - 562746 563936 1191 1 504 + 564244 564918 675 1 505 + 565076 565555 480 1 506 + 565763 566620 858 1 507 + 566651 567445 795 1 508 + 567490 570813 3324 1 509 + 570857 574408 3552 1 510 + 574456 576315 1860 1 511 + 576514 577146 633 1 512 - 577230 577820 591 1 513 + 577980 579392 1413 1 514 + 579809 581704 1896 1 515 + 581803 582921 1119 1 516 - 582954 583217 264 1 517 + 583427 584410 984 1 518 + 584422 587238 2817 1 519 + 587238 587741 504 1 520 + 587770 588711 942 1 521 + 588861 590006 1146 1 522 + 590025 593264 3240 1 523 + 593307 593804 498 1 524 - 593806 594672 867 1 525 - 594902 595717 816 1 526 - 595710 596714 1005 1 527 - 596701 598002 1302 1 528 + 598051 598383 333 1 529 - 598411 598686 276 1 530 + 598916 599401 486 1 531 - 599882 600625 744 1 532 - 600646 601098 453 1 533 - 601184 601411 228 1 534 - 601415 601768 354 1 535 - 601772 602149 378 1 536 - 602303 603049 747 1 537 - 603138 605387 2250 1 538 - 605490 606776 1287 1 539 - 606892 607893 1002 1 540 - 607900 609060 1161 1 541 - 609103 610386 1284 1 542 - 610494 610994 501 2 543 - 611067 611996 930 1 544 - 612006 613814 1809 1 545 - 613891 615108 1218 1 546 - 615477 615992 516 1 547 + 616407 617285 879 1 548 - 617561 618544 984 1 549 - 618632 619201 570 1 550 + 619235 620254 1020 1 551 - 620344 621984 1641 1 552 - 622026 622319 294 1 553 + 622572 623990 1419 1 554 - 624393 624995 603 1 555 + 625182 626243 1062 1 556 + 626305 627417 1113 1 557 + 627439 627771 333 1 558 + 627805 629643 1839 1 559 + 629654 630574 921 1 560 + 630832 631986 1155 1 561 + 632101 632574 474 1 562 + 632601 633020 420 1 563 + 633102 634079 978 1 564 + 634087 634593 507 1 565 + 634675 636423 1749 1 566 + 636537 639368 2832 1 567 - 639384 639917 534 1 568 - 640077 641750 1674 1 569 - 642053 642958 906 1 570 + 642976 643638 663 1 571 - 643689 644402 714 1 572 - 644411 646060 1650 1 573 - 646370 648208 1839 1 574 - 648290 650077 1788 1 575 - 650171 650386 216 1 576 + 650587 651612 1026 1 577 + 651654 652019 366 1 578 + 652158 652985 828 1 579 - 653051 654289 1239 1 580 + 655168 655803 636 1 581 - 655968 656717 750 1 582 - 656963 657370 408 1 583 - 657363 659138 1776 1 584 - 659552 661645 2094 1 585 - 661756 662025 270 1 586 - 662146 663099 954 1 587 - 663102 663506 405 1 588 - 663575 666217 2643 1 589 - 666244 667731 1488 1 590 - 668231 668509 279 1 591 - 668611 669948 1338 1 592 - 669945 670820 876 1 593 - 670920 672803 1884 1 594 - 672862 673491 630 1 595 - 673768 674244 477 1 596 + 674447 675874 1428 1 597 - 675884 676894 1011 1 598 - 676946 677200 255 1 599 - 677215 677526 312 1 600 + 677988 679151 1164 1 601 + 679230 680306 1077 1 602 + 680448 681119 672 1 603 - 681172 681780 609 1 604 - 681939 682742 804 1 605 - 682912 684492 1581 1 606 - 684542 685999 1458 1