GeneMark.hmm PROKARYOTIC (Version 2.6m) Sequence file name: NC_010418.fna, RBS: Y Model file name: GeneMark_hmm_combined.mod Model organism: GeneMarkS_default_gcode_11 Tue Mar 25 10:36:22 2008 Predicted genes Gene Strand LeftEnd RightEnd Gene Class # Length 1 - <3 74 72 1 2 - 219 2561 2343 1 3 - 2655 4643 1989 1 4 - 4717 5172 456 1 5 - 5230 5787 558 1 6 + 5977 7032 1056 1 7 - 7073 7972 900 1 8 - 8129 9019 891 1 9 - 9069 9668 600 1 10 - 9643 9843 201 1 11 - 10019 10243 225 1 12 - 10309 10653 345 1 13 - 10712 10993 282 1 14 - 11036 11470 435 1 15 - 11552 12481 930 1 16 + 12636 13097 462 1 17 - 13236 13508 273 1 18 - 13669 16245 2577 1 19 - 16256 17134 879 1 20 - 17127 17810 684 1 21 - 17829 18173 345 1 22 - 18288 20621 2334 1 23 - 20809 20964 156 2 24 - 21450 23966 2517 1 25 - 24081 24392 312 1 26 - 24448 24810 363 1 27 - 25028 26497 1470 1 28 - 26635 26778 144 1 29 - 26802 27173 372 1 30 - 27445 27690 246 1 31 - 27778 27969 192 2 32 - 28118 28510 393 1 33 - 28588 28980 393 1 34 - 29215 29397 183 2 35 - 29724 30143 420 1 36 - 30226 30474 249 1 37 - 30504 30926 423 1 38 - 30982 31251 270 1 39 - 31319 31504 186 1 40 - 31602 32048 447 1 41 - 32172 32666 495 1 42 - 32719 32784 66 1 43 - 32777 32941 165 1 44 - 33130 33483 354 1 45 - 33549 33929 381 1 46 - 33923 34096 174 1 47 - 34275 35633 1359 1 48 - 35824 36510 687 1 49 - 36570 37100 531 1 50 - 37240 37806 567 1 51 - 37898 38257 360 1 52 - 38502 38942 441 1 53 - 39046 39255 210 1 54 - 39419 39733 315 1 55 - 39803 40219 417 1 56 - 40347 40676 330 1 57 - 40722 40874 153 1 58 - 40914 41117 204 1 59 - 41124 41342 219 1 60 - 41414 41635 222 1 61 - 41790 41963 174 1 62 - 42192 43226 1035 1 63 - 43321 44094 774 1 64 - 44130 44864 735 1 65 - 45032 47125 2094 1 66 - 47122 47433 312 1 67 - 47851 48471 621 1 68 - 48645 48947 303 1 69 + 49430 49561 132 1 70 + 49586 49681 96 1 71 + 49800 50750 951 1 72 - 51634 53106 1473 1 73 - 53145 55397 2253 1 74 - 55411 55839 429 1 75 - 55836 55928 93 1 76 - 57069 57623 555 1 77 + 57804 59054 1251 1 78 + 59070 62549 3480 1 79 + 62593 66471 3879 1 80 - 66611 66790 180 2 81 - 67150 68325 1176 1 82 - 68336 68416 81 1 83 - 68545 68892 348 1 84 - 68915 69172 258 1 85 - 69294 69509 216 1 86 - 69574 69888 315 1 87 - 70093 70983 891 1 88 - 71025 71555 531 1 89 - 71626 72045 420 1 90 - 72233 72436 204 1 91 - 72797 73531 735 1 92 - 73542 74075 534 1 93 - 74072 74131 60 1 94 - 74439 75134 696 1 95 - 75278 75724 447 1 96 - 75770 76315 546 1 97 - 76526 76828 303 1 98 - 76868 77068 201 2 99 - 77182 77754 573 1 100 - 77771 77995 225 1 101 - 78202 78564 363 1 102 - 78643 79407 765 1 103 - 79476 79922 447 1 104 - 79956 80321 366 1 105 - 80462 82285 1824 2 106 - 82888 83163 276 1 107 - 83222 83431 210 1 108 - 83424 83861 438 1 109 - 83923 84195 273 1 110 - 84246 84605 360 1 111 - 84724 85422 699 1 112 - 85475 85645 171 1 113 - 85786 85965 180 1 114 - 86085 86168 84 1 115 - 86519 86608 90 1 116 - 86778 87272 495 1 117 - 87295 87498 204 1 118 - 87581 88039 459 1 119 - 88111 88434 324 1 120 - 88538 88768 231 1 121 - 89138 89305 168 1 122 - 89330 90019 690 1 123 + 90174 90776 603 1 124 + 90876 92021 1146 1 125 + 92430 96050 3621 1 126 - 96142 96810 669 1 127 - 96813 99728 2916 1 128 - 100009 103674 3666 1 129 - 104004 104597 594 1 130 - 104627 104887 261 1 131 - 105126 106169 1044 1 132 - 106265 107059 795 1 133 - 107098 107847 750 1 134 - 108184 108246 63 1 135 + 108323 108421 99 1 136 + 108421 108822 402 1 137 + 108819 111221 2403 1 138 + 111409 112002 594 1 139 + 112257 113768 1512 1 140 + 113746 114948 1203 1 141 - 114967 115113 147 1 142 - 115317 115718 402 1 143 + 116064 116465 402 1 144 + 116484 118004 1521 1 145 - 118479 119051 573 1 146 - 119115 119540 426 1 147 - 119552 120016 465 1 148 - 120177 121763 1587 1 149 - 122028 122291 264 1 150 - 122716 123678 963 1 151 - 123796 124029 234 1 152 - 124105 124689 585 1 153 + 125093 125824 732 1 154 + 125851 127752 1902 1 155 + 127773 128708 936 1 156 + 128798 129559 762 1 157 + 129853 129918 66 1 158 + 130749 131033 285 1 159 + 131839 131976 138 1 160 - 132277 132351 75 1 161 - 132381 132491 111 1 162 - 132521 132607 87 1 163 + 132967 133437 471 1 164 - 133492 134133 642 1 165 - 134155 134388 234 1 166 - 134524 134970 447 1 167 - 135056 136084 1029 1 168 + 136165 136350 186 1 169 - 136376 136768 393 1 170 - 136790 136930 141 1 171 - 137020 137475 456 1 172 + 137607 138197 591 1 173 - 138325 139740 1416 1 174 - 139824 140051 228 1 175 - 140066 140209 144 1 176 - 140259 141242 984 1 177 - 141261 141821 561 1 178 - 141967 142158 192 1 179 - 142197 142325 129 1 180 - 142494 142577 84 1 181 - 142716 142871 156 1 182 - 143066 144379 1314 1 183 - 144656 144877 222 2 184 - 145006 145197 192 2 185 - 145399 145599 201 1 186 - 145654 145812 159 1 187 - 145862 146023 162 1 188 - 146108 146371 264 1 189 - 146421 146609 189 1 190 - 146799 147038 240 1 191 - 147072 147173 102 1 192 - 147202 147315 114 1 193 - 147405 147974 570 1 194 - 148086 148283 198 1 195 - 148423 148782 360 1 196 - 148896 149171 276 1 197 - 149422 149583 162 1 198 - 149564 149917 354 1 199 - 149937 150572 636 1 200 - 150684 150767 84 1 201 - 150904 152454 1551 1 202 - 152544 153953 1410 1 203 - 154096 154233 138 1 204 - 154295 154888 594 1 205 - 154909 155136 228 1 206 - 155521 156174 654 1 207 - 156234 156989 756 1 208 - 157169 157291 123 1 209 - 157509 158576 1068 1 210 - 158694 160118 1425 1 211 + 160398 160790 393 1 212 + 160792 161004 213 1 213 - 161192 161509 318 1 214 - 161763 162200 438 1 215 - 162261 162533 273 1 216 - 162616 162897 282 1 217 - 162976 163323 348 1 218 - 163529 163828 300 1 219 - 164210 164311 102 1 220 - 164342 164539 198 1 221 - 164660 165124 465 1 222 - 165145 165306 162 1 223 - 165363 165839 477 1 224 - 165926 166780 855 1 225 - 166785 166949 165 1 226 - 167172 167987 816 1 227 - 168073 168444 372 1 228 - 168593 169501 909 1 229 - 169704 169919 216 1 230 - 170006 170296 291 1 231 - 170324 170500 177 1 232 - 170511 171131 621 1 233 - 171189 171953 765 1 234 - 171984 172442 459 1 235 - 172514 172870 357 1 236 - 172931 173116 186 1 237 - 173133 173300 168 1 238 - 173336 173548 213 1 239 - 174194 175615 1422 1 240 - 175726 175854 129 1 241 + 176133 177617 1485 1 242 + 178290 179327 1038 1 243 - 179894 180103 210 1 244 - 180124 180372 249 1 245 - 180483 180821 339 1 246 + 181238 181468 231 1 247 - 181510 181827 318 1 248 - 181805 182872 1068 1 249 - 183257 184129 873 1 250 - 184505 185170 666 1 251 - 185327 186079 753 1 252 - 186156 186794 639 1 253 - 186917 187612 696 1 254 - 187928 188089 162 1 255 - 188138 188644 507 1 256 - 188826 189278 453 1 257 - 189323 189670 348 1 258 - 189707 189859 153 2 259 - 189982 190635 654 1 260 - 190702 190884 183 1 261 - 190929 191009 81 1 262 - 191282 191785 504 1 263 - 192061 192567 507 1 264 - 192629 192721 93 1 265 - 192979 193287 309 1 266 - 193355 193678 324 1 267 - 193703 193933 231 1 268 - 193994 194215 222 1 269 - 194246 194797 552 1 270 - 194794 195498 705 1 271 - 195560 195922 363 1 272 - 195958 196443 486 1 273 - 196482 196814 333 1 274 - 196880 197140 261 1 275 - 197196 197540 345 1 276 - 197738 197944 207 1 277 - 198302 199390 1089 1 278 - 199471 199794 324 1 279 - 199916 200620 705 1 280 - 200774 201067 294 1 281 - 201252 202277 1026 1 282 - 202382 202708 327 1 283 - 202837 203226 390 1 284 - 203279 203584 306 1 285 - 203651 203836 186 1 286 - 203907 204086 180 1 287 - 204136 204360 225 1 288 - 204462 204998 537 1 289 - 205061 205522 462 1 290 - 205627 206418 792 1 291 - 206518 206973 456 1 292 - 207357 208799 1443 2 293 - 208824 208952 129 2 294 - 209223 209780 558 1 295 + 210127 210933 807 1 296 + 210970 211059 90 1 297 - 211224 212948 1725 1 298 - 213038 213349 312 1 299 - 213644 214132 489 1 300 - 214146 214613 468 1 301 - 214728 214946 219 2 302 - 215030 215263 234 2 303 - 215729 215902 174 1 304 - 215923 217002 1080 1 305 - 217022 217918 897 1 306 - 217942 219348 1407 1 307 - 219379 220107 729 1 308 - 220308 225056 4749 1 309 - 225300 226628 1329 1 310 - 226618 227436 819 1 311 - 227423 228613 1191 1 312 - 228655 229071 417 1 313 - 229064 229579 516 1 314 - 229744 230628 885 1 315 - 230719 231507 789 1 316 - 231801 232088 288 1 317 - 232425 233642 1218 1 318 - 233753 235699 1947 1 319 - 235699 236595 897 1 320 - 237203 237862 660 1 321 - 237896 238273 378 1 322 - 238748 239800 1053 1 323 - 239931 240374 444 1 324 - 240377 241486 1110 1 325 - 241563 242222 660 1 326 - 242364 243011 648 1 327 - 243016 243483 468 1 328 - 243501 243920 420 2 329 - 243881 244147 267 1 330 - 244155 244343 189 1 331 - 244309 244557 249 1 332 - 244730 244900 171 2 333 - 244996 245748 753 1 334 - 245766 246680 915 1 335 - 246812 247159 348 1 336 - 247184 248443 1260 1 337 - 248511 249974 1464 1 338 - 250048 250674 627 1 339 - 250781 251326 546 1 340 - 251447 253198 1752 1 341 - 253234 255018 1785 1 342 - 255091 255492 402 1 343 - 255710 257572 1863 1 344 - 257562 258347 786 1 345 - 258373 258654 282 2 346 - 258725 259102 378 1 347 - 259142 259258 117 1 348 - 259285 259620 336 2 349 - 259673 260488 816 1 350 - 260443 260754 312 1 351 - 260877 262820 1944 1 352 - 262867 263448 582 1 353 - 263584 265518 1935 1 354 - 265535 265912 378 1 355 - 266044 266466 423 1 356 - 266485 >266784 300 1