GeneMark.hmm PROKARYOTIC (Version 2.6m) Sequence file name: NC_010510.fna, RBS: Y Model file name: GeneMark_hmm_combined.mod Model organism: GeneMarkS_default_gcode_11 Tue Mar 25 11:36:54 2008 Predicted genes Gene Strand LeftEnd RightEnd Gene Class # Length 1 - 142 507 366 1 2 + 614 1360 747 1 3 + 1415 1699 285 2 4 + 1938 2825 888 1 5 + 2904 3053 150 1 6 + 3755 5899 2145 1 7 + 5899 6456 558 1 8 + 6525 8657 2133 1 9 + 8759 9247 489 1 10 - 9269 9583 315 1 11 - 9634 10365 732 2 12 + 10440 10571 132 1 13 - 11067 11780 714 1 14 + 12245 12325 81 1 15 + 12675 12953 279 1 16 - 13103 14062 960 1 17 - 14059 15954 1896 1 18 - 16543 18312 1770 1 19 - 18164 18886 723 1 20 - 19104 20180 1077 1 21 + 20348 20572 225 1 22 + 21022 21228 207 1 23 - 21248 21616 369 1 24 + 21828 22103 276 1 25 - 22505 22723 219 1 26 + 22994 23191 198 1 27 + 23257 23559 303 1 28 + 23659 23766 108 2 29 + 23930 26083 2154 1 30 + 26681 28348 1668 1 31 + 28889 30019 1131 1 32 + 30067 31467 1401 1 33 + 32014 34281 2268 1 34 - 34420 35259 840 1 35 + 35543 38242 2700 1 36 + 38337 39020 684 1 37 + 39253 40539 1287 1 38 - 40551 41870 1320 1 39 - 41884 42564 681 1 40 + 42734 44200 1467 1 41 - 44214 45806 1593 1 42 - 45995 47161 1167 1 43 - 47188 47868 681 1 44 - 47938 48747 810 1 45 - 48814 49497 684 1 46 - 49532 50338 807 1 47 + 50543 50773 231 1 48 + 50770 52026 1257 1 49 + 52053 52826 774 1 50 + 52819 53553 735 1 51 + 53546 54580 1035 1 52 + 54619 55032 414 1 53 - 55084 56679 1596 1 54 - 56813 58336 1524 1 55 - 58333 59142 810 1 56 - 59142 59561 420 1 57 - 59626 60642 1017 1 58 - 60674 61654 981 1 59 - 61716 62531 816 1 60 - 62522 63292 771 1 61 - 63289 64053 765 1 62 - 64419 64949 531 1 63 + 65071 66354 1284 1 64 + 66356 67234 879 1 65 + 67231 69585 2355 1 66 + 69582 70454 873 1 67 + 70451 71650 1200 1 68 + 71685 72833 1149 1 69 + 72916 73788 873 1 70 + 73785 74819 1035 1 71 + 74816 75634 819 1 72 + 75627 76331 705 1 73 + 76324 76770 447 1 74 - 76767 77102 336 1 75 + 77368 77964 597 1 76 + 77961 79826 1866 1 77 - 79979 80422 444 1 78 + 80512 81420 909 1 79 + 81556 82470 915 1 80 + 82596 83759 1164 1 81 + 83936 85435 1500 1 82 + 85601 86350 750 1 83 + 86447 87814 1368 1 84 + 87819 88391 573 1 85 + 88427 88780 354 1 86 + 88786 89298 513 1 87 + 89407 90609 1203 1 88 - 90606 91040 435 1 89 - 91192 91848 657 1 90 + 91983 92855 873 1 91 + 92845 93372 528 1 92 + 93369 95753 2385 1 93 + 95826 97061 1236 1 94 + 97096 97995 900 1 95 + 97992 99020 1029 1 96 + 99014 99832 819 1 97 + 99829 100581 753 1 98 + 100627 101103 477 1 99 - 101172 102323 1152 1 100 - 102824 104170 1347 1 101 - 104388 104837 450 1 102 + 104940 105710 771 1 103 + 105803 106003 201 1 104 - 106077 107414 1338 1 105 - 107428 108480 1053 1 106 - 108485 109474 990 1 107 + 109970 111193 1224 1 108 + 111201 111614 414 1 109 + 111611 112861 1251 1 110 + 112848 113390 543 1 111 + 113987 116056 2070 1 112 + 116256 117320 1065 1 113 - 117411 117659 249 2 114 - 117864 119552 1689 1 115 + 119799 119984 186 1 116 + 120141 120416 276 1 117 - 120492 121814 1323 1 118 - 121903 122439 537 1 119 + 122798 123037 240 1 120 + 123042 123488 447 1 121 - 123534 124145 612 1 122 + 124439 125524 1086 1 123 - 125597 126115 519 1 124 + 126263 127468 1206 1 125 + 127702 128832 1131 1 126 + 128953 130122 1170 1 127 - 130292 131197 906 1 128 + 131375 132715 1341 1 129 + 132722 133381 660 1 130 + 133894 134154 261 1 131 + 134246 135100 855 1 132 + 135177 137006 1830 1 133 + 137084 137587 504 1 134 + 137848 138057 210 1 135 + 138081 138203 123 1 136 + 138309 139505 1197 1 137 - 139685 140455 771 1 138 + 140468 140881 414 1 139 - 140946 143321 2376 1 140 - 143792 145558 1767 1 141 - 152589 153041 453 1 142 + 153072 153164 93 1 143 + 153198 153329 132 1 144 + 155415 155942 528 1 145 - 155996 157360 1365 1 146 - 157364 159127 1764 1 147 + 159493 159819 327 1 148 - 159907 160017 111 2 149 + 160692 161294 603 1 150 + 161870 162007 138 1 151 + 162189 163319 1131 1 152 + 163547 164773 1227 1 153 + 164896 165780 885 1 154 - 166856 167128 273 1 155 - 167511 168698 1188 1 156 - 168695 169834 1140 1 157 - 169993 170580 588 1 158 - 170577 171113 537 1 159 - 171255 172253 999 1 160 + 172493 173800 1308 1 161 + 173804 174712 909 1 162 + 174884 175663 780 1 163 + 175847 176260 414 1 164 - 176379 176648 270 1 165 - 177303 178250 948 1 166 - 178265 178834 570 1 167 - 178831 179220 390 1 168 - 179314 180642 1329 1 169 + 180858 181466 609 1 170 - 181518 181757 240 1 171 - 181854 182639 786 1 172 + 182766 183398 633 1 173 + 183483 185006 1524 1 174 + 185090 186496 1407 1 175 - 186543 186977 435 1 176 - 187044 187550 507 1 177 + 187795 187959 165 1 178 + 188016 190106 2091 1 179 - 190160 190267 108 1 180 - 190434 190550 117 1 181 - 190745 190978 234 1 182 - 190998 191081 84 2 183 - 191347 191694 348 1 184 - 191687 191854 168 1 185 + 192179 192469 291 1 186 - 192521 193435 915 1 187 + 193696 193905 210 2 188 + 194094 195266 1173 1 189 + 195399 196700 1302 1 190 + 196922 198340 1419 1 191 + 199401 200639 1239 1 192 + 200924 201625 702 1 193 + 201653 201835 183 1 194 + 202118 202627 510 1 195 + 202700 203647 948 1 196 + 203764 206397 2634 1 197 + 206410 207618 1209 1 198 + 207615 207815 201 1 199 - 207843 209210 1368 1 200 - 209409 210689 1281 1 201 - 210749 211888 1140 1 202 - 212056 213864 1809 1 203 + 214224 217031 2808 1 204 + 217592 217756 165 2 205 - 217881 218099 219 1 206 + 218281 219117 837 1 207 + 219114 219539 426 1 208 - 219517 220635 1119 1 209 - 220808 221449 642 1 210 - 221635 222816 1182 1 211 + 222912 223865 954 1 212 + 224711 225673 963 1 213 - 225662 227992 2331 1 214 - 228551 228628 78 1 215 - 229103 229870 768 1 216 - 230003 230992 990 1 217 - 230997 231938 942 1 218 - 231951 233315 1365 1 219 - 233468 234748 1281 1 220 - 234756 235073 318 1 221 + 235618 236364 747 1 222 - 236383 237387 1005 1 223 - 237683 239308 1626 1 224 - 239322 241046 1725 1 225 - 241043 241654 612 1 226 - 241916 242788 873 1 227 - 242824 243201 378 1 228 - 243198 243527 330 1 229 - 243524 244279 756 1 230 - 244276 245301 1026 1 231 - 245902 246300 399 1 232 - 246239 247456 1218 1 233 + 247572 250736 3165 1 234 + 250829 251938 1110 1 235 - 251955 252878 924 1 236 + 253328 255025 1698 1 237 - 255173 256633 1461 1 238 - 256745 257290 546 1 239 - 257586 258128 543 1 240 - 258376 261489 3114 1 241 - 261486 262556 1071 1 242 + 262893 263309 417 1 243 + 263497 263625 129 2 244 + 264397 265059 663 1 245 + 265496 265933 438 1 246 + 266282 267274 993 2 247 + 267389 267505 117 1 248 - 268140 268433 294 1 249 + 268432 268476 45 1 250 + 268840 269061 222 1 251 + 269324 269623 300 1 252 + 269624 269716 93 1 253 - 269838 269951 114 1 254 - 270350 271543 1194 1 255 + 272248 273291 1044 1 256 + 273483 274358 876 1 257 + 274355 276190 1836 1 258 + 276187 276954 768 1 259 - 277243 277761 519 1 260 - 277935 278090 156 1 261 + 278684 278977 294 1 262 - 279356 279586 231 1 263 + 280193 281017 825 1 264 + 281122 281343 222 1 265 + 281735 282382 648 2 266 + 282635 283054 420 1 267 + 283120 284370 1251 1 268 + 284716 284994 279 1 269 + 285038 285169 132 1 270 - 285798 286166 369 1 271 - 286457 286852 396 1 272 - 287117 287335 219 1 273 - 287522 287794 273 1 274 - 287915 288109 195 1 275 + 288135 288635 501 1 276 - 288623 288832 210 1 277 + 289388 290023 636 1 278 - 290064 291560 1497 1 279 - 291747 292478 732 2 280 + 292561 292953 393 1 281 - 293050 293199 150 1 282 + 293510 293815 306 1 283 - 294045 295298 1254 1 284 + 295382 296674 1293 1 285 - 296671 297435 765 1 286 - 297470 297655 186 2 287 - 297714 298916 1203 1 288 + 299411 299551 141 2 289 - 299929 301419 1491 1 290 - 301687 301902 216 2 291 + 302427 303845 1419 1 292 + 304135 305115 981 1 293 - 305282 306142 861 1 294 - 306139 306465 327 2 295 + 307694 309778 2085 1 296 - 309823 310302 480 1 297 + 310735 310926 192 1 298 + 311156 311332 177 1 299 + 311698 312015 318 1 300 + 312380 313402 1023 1 301 + 313669 314610 942 1 302 + 314809 315045 237 1 303 + 315045 315344 300 1 304 - 315447 315839 393 2 305 + 316267 316458 192 2 306 + 317365 317517 153 1 307 - 318104 318802 699 1 308 - 319157 320113 957 1 309 - 320215 322365 2151 1 310 - 323133 323384 252 1 311 + 323801 324067 267 1 312 + 324139 324237 99 1 313 - 325265 327322 2058 1 314 - 327484 327945 462 1 315 - 327945 328736 792 2 316 - 328733 329515 783 1 317 - 329512 330339 828 1 318 - 330360 331304 945 1 319 - 331316 332890 1575 1 320 + 333511 335481 1971 1 321 + 335577 336323 747 1 322 + 336320 337366 1047 1 323 + 337363 338178 816 2 324 + 338207 339121 915 1 325 + 339133 339663 531 2 326 - 339879 340511 633 1 327 - 340627 341550 924 2 328 - 341604 342383 780 2 329 - 342717 345194 2478 1 330 - 345373 346371 999 1 331 - 346474 347061 588 1 332 + 347609 347812 204 2 333 + 347813 348307 495 2 334 - 352204 352686 483 2 335 - 353090 353659 570 1 336 - 353698 354780 1083 1 337 + 355036 356100 1065 1 338 - 357536 357898 363 2 339 + 357992 359641 1650 1 340 + 359610 359966 357 2 341 - 360363 362354 1992 1 342 - 362351 362548 198 1 343 - 362532 362894 363 2 344 + 363224 364987 1764 1 345 + 364960 365085 126 1 346 + 365079 365921 843 1 347 - 365942 366145 204 1 348 - 366142 366927 786 1 349 - 366936 368345 1410 1 350 + 369200 369373 174 1 351 + 369407 369907 501 1 352 + 370007 370918 912 1 353 + 371383 371709 327 2 354 + 371706 372566 861 1 355 - 372962 373174 213 1 356 - 373314 374075 762 1 357 - 374017 374751 735 1 358 - 374869 375753 885 2 359 + 378767 379507 741 1 360 + 379880 381199 1320 1 361 + 381270 383402 2133 1 362 + 383392 386073 2682 1 363 + 386207 386374 168 1 364 - 388052 388330 279 1 365 - 388381 388806 426 1 366 - 389245 389376 132 2 367 - 389656 390522 867 1 368 - 390751 393588 2838 1 369 - 397008 397709 702 1 370 + 398400 399461 1062 1 371 + 401104 402021 918 2 372 + 402031 403110 1080 1 373 - 403112 405211 2100 1 374 + 405644 406147 504 2 375 + 406335 406658 324 1 376 - 406864 407319 456 1 377 - 407336 407710 375 1 378 + 407775 407879 105 2 379 + 407939 408850 912 1 380 + 409469 411244 1776 2 381 + 411357 412013 657 1 382 + 412010 413317 1308 2 383 + 413314 414057 744 2 384 + 414230 414652 423 2 385 + 415871 416143 273 1 386 + 416469 417404 936 1 387 + 418780 419157 378 1 388 + 419221 420972 1752 1 389 + 420999 421232 234 1 390 + 421241 422206 966 1 391 + 422448 423218 771 1 392 + 423335 424807 1473 1 393 + 424812 425699 888 1 394 + 425742 426602 861 1 395 + 426627 426965 339 1 396 + 426985 427758 774 1 397 + 427838 428593 756 1 398 + 428866 430179 1314 1 399 + 430234 431265 1032 1 400 + 431262 432125 864 1 401 + 432122 432910 789 1 402 + 432928 434298 1371 1 403 - 435319 436164 846 1 404 - 436137 436847 711 1 405 - 436844 437536 693 1 406 + 437853 439007 1155 1 407 + 439004 440992 1989 1 408 + 440989 441477 489 1 409 - 441739 444708 2970 1 410 - 444764 446482 1719 1 411 - 446541 446861 321 1 412 + 447105 447623 519 1 413 + 447628 448884 1257 1 414 + 449077 449376 300 1 415 + 450423 451592 1170 1 416 + 451576 452001 426 1 417 + 452010 453179 1170 1 418 + 453347 454156 810 1 419 + 454153 457728 3576 1 420 + 457761 458204 444 1 421 + 458503 461253 2751 1 422 + 461914 463038 1125 1 423 + 463304 463723 420 1 424 - 463812 465044 1233 1 425 - 465221 466057 837 1 426 - 466060 466686 627 1 427 - 466729 468441 1713 1 428 - 468452 469147 696 1 429 - 469158 469841 684 1 430 - 469835 470299 465 1 431 - 470457 471251 795 1 432 - 471414 471995 582 1 433 + 472161 473060 900 1 434 - 473113 473466 354 1 435 + 473742 474995 1254 1 436 + 475036 475992 957 1 437 + 475989 476498 510 1 438 - 476509 477438 930 1 439 - 477567 478583 1017 1 440 - 478609 479937 1329 1 441 - 479946 480491 546 1 442 - 480488 483325 2838 1 443 - 483338 484699 1362 1 444 + 485170 486528 1359 1 445 - 486799 487764 966 1 446 - 487915 489093 1179 1 447 - 489107 490066 960 1 448 - 490078 491268 1191 1 449 + 491456 492304 849 1 450 - 492331 492576 246 1 451 + 492945 493466 522 1 452 + 493599 495917 2319 1 453 + 496055 498094 2040 1 454 - 498233 498925 693 1 455 + 499025 499816 792 1 456 + 499828 500328 501 1 457 + 500321 500986 666 1 458 - 501091 502881 1791 1 459 - 503078 504022 945 1 460 + 504321 504980 660 1 461 + 504968 507763 2796 1 462 + 507760 509118 1359 1 463 + 509115 509642 528 1 464 + 509639 510166 528 1 465 + 510163 511128 966 1 466 + 511184 511690 507 1 467 + 511690 512769 1080 1 468 + 512798 514495 1698 1 469 + 514492 515169 678 1 470 + 515166 515462 297 1 471 - 515470 515952 483 1 472 - 516153 516317 165 2 473 - 516355 516579 225 1 474 - 516576 516800 225 1 475 + 516966 517016 51 1 476 + 517912 518658 747 1 477 + 518863 518937 75 2 478 - 519537 519995 459 2 479 + 520075 520449 375 1 480 + 520457 520876 420 1 481 + 521168 523147 1980 1 482 - 523236 523697 462 1 483 - 523878 526427 2550 1 484 + 526622 526744 123 1 485 - 527034 528023 990 1 486 - 528209 529378 1170 1 487 - 529390 529785 396 1 488 + 531054 531125 72 2 489 + 531265 533037 1773 1 490 - 533112 533957 846 1 491 - 534024 535121 1098 1 492 - 535230 535505 276 1 493 + 535675 536835 1161 1 494 + 537070 537321 252 2 495 + 537816 538991 1176 1 496 + 539010 539600 591 1 497 - 540067 541395 1329 1 498 - 541392 541880 489 1 499 + 542063 542479 417 1 500 + 549078 549320 243 1 501 + 549317 550192 876 1 502 + 550561 551277 717 1 503 + 551380 552402 1023 1 504 + 552522 556013 3492 1 505 + 556031 556441 411 1 506 - 556692 556922 231 1 507 + 557761 557967 207 2 508 - 558473 559021 549 1 509 - 559399 560037 639 1 510 + 560740 561102 363 1 511 + 561148 561321 174 1 512 - 561328 561621 294 2 513 + 561777 562034 258 1 514 + 562127 562336 210 1 515 - 562374 562625 252 1 516 + 562785 563453 669 1 517 + 563844 564152 309 1 518 + 564174 564473 300 1 519 - 564957 565151 195 2 520 + 565304 565363 60 1 521 - 565424 565609 186 2 522 - 566637 566921 285 1 523 + 567219 567485 267 1 524 - 568008 568568 561 1 525 - 568782 568853 72 1 526 + 570009 570515 507 2 527 + 571198 572259 1062 1 528 + 572343 573368 1026 1 529 + 573385 575013 1629 1 530 - 575763 577091 1329 1 531 - 577088 578812 1725 1 532 - 578916 581525 2610 1 533 + 582032 583315 1284 1 534 + 583808 584707 900 1 535 - 584801 585031 231 1 536 - 585016 585159 144 1 537 + 585515 585652 138 1