GeneMark.hmm PROKARYOTIC (Version 2.6m) Sequence file name: NC_007959.fna, RBS: Y Model file name: GeneMark_hmm_combined.mod Model organism: GeneMarkS_default_gcode_11 Fri Apr 20 18:11:29 2007 Predicted genes Gene Strand LeftEnd RightEnd Gene Class # Length 1 + 99 1436 1338 1 2 - 1509 1676 168 1 3 - 1723 2088 366 1 4 + 2346 2672 327 1 5 - 2613 3593 981 1 6 + 3823 3906 84 1 7 + 4067 5104 1038 1 8 + 5125 5997 873 1 9 + 5994 6131 138 1 10 + 6119 7204 1086 1 11 + 7266 8732 1467 1 12 + 8746 9171 426 1 13 + 9324 10238 915 1 14 + 12046 12357 312 2 15 + 12354 12437 84 1 16 + 12595 12999 405 1 17 - 13284 16730 3447 1 18 + 17282 17419 138 1 19 - 18062 18238 177 1 20 - 18232 18744 513 1 21 + 18739 19026 288 1 22 - 19058 20899 1842 1 23 + 21209 22096 888 1 24 - 22196 23470 1275 1 25 - 23768 23947 180 1 26 - 24401 25291 891 1 27 + 25336 25581 246 1 28 + 25685 25762 78 1 29 - 25759 25914 156 1 30 + 25967 26359 393 1 31 + 26356 26877 522 1 32 - 27131 27433 303 1 33 + 27469 27909 441 2 34 - 28065 28751 687 1 35 + 28772 28819 48 1 36 + 28935 30254 1320 1 37 + 30353 30490 138 1 38 - 30766 31545 780 1 39 - 31484 31936 453 1 40 - 31920 32234 315 1 41 - 32442 32696 255 1 42 + 33953 35374 1422 1 43 + 35378 36388 1011 1 44 + 36385 36492 108 1 45 + 36670 37200 531 1 46 - 37347 37445 99 1 47 + 37862 38227 366 1 48 + 38670 39788 1119 1 49 + 39970 40446 477 1 50 + 40531 43485 2955 1 51 + 43501 43971 471 1 52 + 44217 45602 1386 1 53 + 45608 45973 366 1 54 - 46512 46700 189 1 55 + 46961 47116 156 1 56 - 47255 47785 531 1 57 + 47801 48901 1101 1 58 + 48873 49952 1080 1 59 - 50075 50698 624 1 60 + 50727 51122 396 1 61 - 51261 51428 168 1 62 + 51598 51960 363 1 63 - 52170 52280 111 1 64 - 52324 52605 282 1 65 - 52863 53120 258 2 66 + 53683 54978 1296 1 67 - 55228 55992 765 1 68 - 56802 57275 474 1 69 + 57258 57512 255 1 70 + 57708 58235 528 1 71 - 58366 58917 552 1 72 - 58905 59519 615 1 73 + 59892 60113 222 1 74 + 60274 60627 354 2 75 - 60933 61187 255 1 76 - 61184 61450 267 1 77 - 61517 61891 375 1 78 + 62237 62473 237 1 79 - 62705 63340 636 1 80 - 63787 63924 138 1 81 + 64068 64772 705 1 82 + 65314 65544 231 1 83 - 65559 65735 177 2 84 + 65770 66132 363 1 85 - 66461 66712 252 1 86 - 66725 67234 510 1 87 - 67231 68283 1053 1 88 - 68424 68915 492 1 89 - 69075 69317 243 1 90 - 69576 69830 255 2 91 - 69830 70018 189 1 92 + 70218 70475 258 1 93 + 70472 71398 927 1 94 - 71561 72034 474 1 95 - 72006 72449 444 1 96 - 72563 72934 372 1 97 - 72935 73450 516 1 98 - 73720 73947 228 1 99 + 74177 74464 288 2 100 + 74464 74946 483 1 101 - 75034 75471 438 1 102 - 75542 76864 1323 1 103 - 77047 77190 144 1 104 - 77293 77742 450 1 105 + 77931 78980 1050 1 106 + 79315 79458 144 1 107 - 79502 79672 171 1 108 - 80231 81343 1113 1 109 - 81422 81757 336 1 110 - 81787 82179 393 1 111 + 82237 82773 537 1 112 + 82809 82931 123 1 113 + 83063 83356 294 1 114 + 84693 84914 222 1 115 - 85101 85571 471 1 116 + 86335 86757 423 1 117 + 86971 88041 1071 1 118 + 88120 89232 1113 1 119 - 89483 89911 429 1 120 + 89960 91117 1158 1 121 - 91136 91684 549 1 122 - 91695 92237 543 1 123 + 93425 93742 318 1 124 - 94080 94742 663 1 125 - 95279 95674 396 1 126 - 95865 96104 240 1 127 - 96722 97702 981 1 128 + 97804 98853 1050 1 129 - 99034 99393 360 1 130 + 99910 100458 549 1 131 + 101140 103593 2454 1 132 + 103919 104608 690 2 133 + 105065 105223 159 2 134 - 105526 105750 225 2 135 + 106152 106316 165 2 136 - 106313 107389 1077 1 137 - 107517 108104 588 2 138 - 108552 108701 150 1 139 + 108758 109048 291 1 140 - 109272 109673 402 1 141 + 110926 111318 393 1 142 + 111427 111684 258 1 143 - 111803 112012 210 1 144 - 112224 112595 372 1 145 - 112552 113676 1125 1 146 - 113613 116723 3111 1 147 - 117021 117131 111 1 148 + 117333 117515 183 1 149 - 117797 117964 168 1 150 + 118353 118868 516 1 151 - 119180 119428 249 1 152 - 119668 119814 147 1 153 + 119969 120301 333 1 154 + 120469 120702 234 2 155 - 120835 121170 336 1 156 - 121200 121592 393 1 157 + 121591 121776 186 2 158 - 122447 122752 306 1 159 + 122982 124139 1158 1 160 + 124526 124690 165 1 161 - 124880 125224 345 1 162 + 125332 125559 228 2 163 + 125550 125882 333 1 164 + 125876 127306 1431 1 165 - 127367 127948 582 1 166 - 128351 128641 291 2 167 - 128836 129198 363 1 168 + 129374 129754 381 1 169 - 129741 130022 282 1 170 + 130077 130301 225 1 171 - 130521 132782 2262 1 172 - 133078 134886 1809 1 173 - 134928 135905 978 1 174 - 135943 136284 342 1 175 - 136281 136916 636 1 176 - 136913 138586 1674 1 177 - 138583 139527 945 1 178 - 139527 140315 789 1 179 - 140312 140704 393 1 180 - 140694 141740 1047 1 181 - 141737 142258 522 1 182 - 142255 142779 525 1 183 - 142776 144146 1371 1 184 - 144143 146986 2844 1 185 - 146983 147639 657 1 186 - 147732 148109 378 1 187 + 148434 150281 1848 1 188 + 150283 151377 1095 1 189 + 151387 152391 1005 1 190 + 152384 153040 657 1 191 + 153030 154676 1647 1 192 - 154673 154897 225 1 193 - 154933 155916 984 1 194 - 156134 156439 306 2 195 + 156659 157414 756 1 196 + 157592 159367 1776 1 197 - 159473 159799 327 1 198 - 159871 160101 231 1 199 + 160191 160508 318 1 200 - 160594 160734 141 1 201 - 160952 161419 468 1 202 + 161419 161502 84 1 203 + 161621 161758 138 1 204 + 161763 161915 153 1 205 + 162269 162436 168 1 206 - 162926 163258 333 1 207 - 163427 163564 138 1 208 - 163605 163802 198 2 209 + 164042 164239 198 2 210 + 164653 164835 183 1 211 + 165467 165550 84 1 212 - 165659 165823 165 2 213 - 165790 166116 327 1 214 + 166507 168171 1665 1 215 + 168526 168855 330 1 216 + 168852 169757 906 1 217 - 169759 169914 156 1 218 + 170305 171327 1023 1 219 - 171366 171503 138 1 220 - 171874 172269 396 1 221 - 172266 172634 369 1 222 - 172850 173272 423 1 223 - 173269 174270 1002 1 224 - 174652 176688 2037 1 225 - 176631 177857 1227 1 226 - 177854 179128 1275 1 227 - 179281 179583 303 1 228 - 179705 180802 1098 1 229 - 181028 181171 144 1 230 - 182136 182267 132 1 231 + 182320 183174 855 1 232 - 183399 183713 315 1 233 + 183912 184001 90 1 234 - 183998 184222 225 1 235 - 184289 184510 222 2 236 + 184807 184923 117 1 237 + 185713 186171 459 1 238 + 186158 186760 603 1 239 + 186757 187104 348 1 240 + 187101 187535 435 1 241 - 187560 188663 1104 1 242 + 189420 189917 498 1 243 - 190209 190466 258 1 244 - 190463 190666 204 1 245 + 190726 190893 168 1 246 + 191278 191847 570 2 247 + 191874 192944 1071 1 248 + 193266 193481 216 1 249 - 193508 193729 222 1 250 + 193982 194659 678 1 251 + 194671 196407 1737 1 252 - 196467 196604 138 1 253 + 196613 197692 1080 1 254 - 198091 198321 231 1 255 + 198344 198487 144 2 256 + 198595 199074 480 1 257 - 199071 199169 99 1 258 - 199579 200052 474 1 259 - 200576 200719 144 2 260 - 200980 201738 759 1 261 + 202313 202525 213 2 262 + 202621 202869 249 2 263 + 202987 203079 93 1 264 + 203119 203340 222 1 265 + 203421 203855 435 1 266 + 203950 204327 378 1 267 + 204683 204925 243 1 268 - 205920 206090 171 1 269 + 206400 206513 114 1 270 - 206676 206966 291 1 271 - 206963 207166 204 1 272 + 207381 207599 219 1 273 + 207856 208080 225 1 274 + 208210 209250 1041 1 275 + 209530 209712 183 1 276 + 209813 210907 1095 1 277 + 211021 211476 456 1 278 - 211504 212259 756 1 279 - 212887 212973 87 1 280 - 213163 213378 216 1 281 + 213617 213799 183 1 282 + 213892 214401 510 1 283 + 214477 214686 210 2 284 - 214722 214997 276 1 285 + 215242 215523 282 2 286 + 215578 215997 420 2 287 + 216366 216563 198 2 288 + 216600 216782 183 2 289 + 217111 217245 135 1 290 + 217327 218319 993 1 291 - 218529 220859 2331 1 292 - 220856 221284 429 1 293 + 221881 222570 690 1 294 + 222567 222980 414 1 295 - 223271 224455 1185 1 296 - 224460 224891 432 1 297 + 225228 225428 201 1 298 + 225726 226097 372 1 299 - 226174 226662 489 1 300 - 227124 228287 1164 1 301 - 228625 229626 1002 1 302 - 229626 230849 1224 1 303 - 231055 231846 792 1 304 - 231843 232259 417 1 305 - 232256 232618 363 1 306 - 232652 233089 438 1 307 - 233086 233316 231 1 308 - 233422 233661 240 1 309 - 234109 234216 108 1 310 + 234236 234991 756 1 311 - 234966 236609 1644 1 312 + 236720 237670 951 1 313 + 237757 238155 399 1 314 - 238211 238288 78 1 315 + 238498 238887 390 1 316 + 239005 239832 828 1 317 + 239829 240908 1080 1 318 + 241063 241830 768 2 319 + 242086 242283 198 1 320 - 242252 242572 321 1 321 + 242801 243958 1158 1 322 - 243977 245107 1131 1 323 + 245312 245425 114 1 324 - 245422 245742 321 1 325 - 246224 246508 285 1 326 + 246552 246719 168 1 327 - 247323 247682 360 2 328 + 247807 248316 510 1 329 + 249001 249255 255 2 330 - 249535 249774 240 1 331 + 249773 250108 336 1 332 + 250251 250382 132 1 333 - 250545 250886 342 1 334 + 251152 251604 453 1 335 + 251616 252239 624 1 336 - 252324 252560 237 1 337 - 252698 252979 282 1 338 + 253571 253747 177 1 339 + 253896 254660 765 1 340 + 254657 255172 516 1 341 - 255175 255555 381 1 342 - 255664 256164 501 1 343 - 256250 256711 462 1 344 - 257014 257109 96 1 345 - 257283 257711 429 1 346 - 257708 257962 255 1 347 + 258072 258587 516 1 348 - 258709 259866 1158 1 349 + 260096 260236 141 1 350 - 260780 261370 591 1 351 + 261447 261704 258 1 352 + 261946 262038 93 1 353 - 262445 262726 282 1 354 - 262796 263089 294 1 355 + 263325 264995 1671 1 356 + 265002 265763 762 1 357 + 265748 268861 3114 1 358 + 268858 269184 327 1 359 - 269174 269326 153 1 360 - 269320 269472 153 1 361 - 269476 269562 87 1 362 + 269691 269891 201 1 363 - 269910 270017 108 2 364 + 270244 271914 1671 1 365 + 271921 272682 762 1 366 + 272667 275780 3114 1 367 + 275777 276103 327 1 368 - 276093 277025 933 1 369 + 277219 278658 1440 1 370 + 278735 279061 327 1 371 + 279166 281841 2676 1 372 + 281853 283385 1533 1 373 + 283363 283656 294 1 374 + 283656 283904 249 1 375 + 284006 284305 300 1 376 + 284348 284695 348 1 377 + 285116 285382 267 1 378 + 285386 286021 636 1 379 + 286018 286230 213 1 380 + 286250 287173 924 1 381 + 287217 289625 2409 1 382 + 289639 290271 633 1 383 + 290268 291104 837 1 384 + 291127 291543 417 1 385 + 291803 291949 147 1 386 + 291987 292067 81 1 387 + 292257 292505 249 2 388 + 292690 292983 294 1 389 + 292977 293153 177 1 390 - 293765 294475 711 1 391 - 294475 >294828 354 1