ID   CPCD_LIKE; MATRIX.
AC   PS51441;
DT   01-MAR-2009 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 23-FEB-2022 INFO UPDATE.
DE   CpcD-like domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1588817; R2=0.0153242; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2455.7473145; R2=2.6340206; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=414; H_SCORE=3546; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=284; H_SCORE=3204; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=2,7,-23,6,1,-26,11,-9,-26,-5,-25,-18,10,-12,-3,-7,8,-5,-20,-29,-21,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-29,-4,5,-25,-15,-3,-29,28,-23,-10,2,-15,13,41,-6,-8,-21,-21,-12,7;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-18,-19,-22,-15,-1,-23,-16,5,-11,8,7,-15,-21,-11,-4,-8,2,8,-22,-5,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-21,-33,-27,53,-30,-12,5,-24,9,2,-21,-29,-30,-18,-19,-8,4,7,34,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-10,-20,-12,-4,-16,-22,-11,-15,12,-10,-5,-6,-18,0,25,-5,2,-7,-23,-10,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-23,-33,-27,4,-34,-23,35,-25,18,15,-23,-25,-21,-24,-17,-7,28,-18,5,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-5,-23,-4,14,-18,-22,-10,-12,2,-11,-8,-7,-12,5,4,-2,1,-7,-23,-12,9;
MA   /M: SY='V'; M=1,-26,-13,-28,-27,3,-27,-25,21,-19,6,6,-25,-27,-26,-19,-9,-1,35,-20,-4,-27;
MA   /M: SY='T'; M=6,-8,-9,-12,-9,-13,-13,-18,-6,-12,-9,-8,-6,-15,-10,-13,13,20,3,-30,-14,-9;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-25,-11,-9,-24,21,-13,-24,-6,-21,-10,-3,-16,-3,-7,1,-10,-18,-21,-19,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-17,-21,-19,-13,-5,-15,-15,-1,-13,0,2,-13,-12,-11,-10,-5,-3,0,-22,-8,-13;
MA   /M: SY='S'; M=2,-5,-19,-8,-5,-22,0,-10,-21,-1,-20,-13,2,-9,-2,3,4,-3,-16,-26,-18,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-4,-22,-7,-4,-19,-9,-9,-11,-2,-12,-6,0,-17,3,-1,0,-3,-9,-24,-11,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-2,-1,-25,-3,-4,-23,-1,-9,-19,-3,-22,-13,4,0,-1,-4,4,-2,-18,-27,-17,-4;
MA   /I: I=-7; MD=-15;
MA   /M: SY='G'; M=2,-3,-19,-4,-6,-20,11,-11,-22,-4,-19,-13,2,-10,-6,0,5,-1,-15,-23,-17,-7; D=-7;
MA   /I: I=-7; MD=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-2,-16,-3,-1,-10,-7,-3,-12,1,-11,-7,-1,-11,0,5,0,0,-9,-12,0,-2; D=-7;
MA   /I: I=-7; MD=-15;
MA   /M: SY='T'; M=2,-4,-10,-6,-3,-8,-6,-8,-5,-4,-2,-3,-3,-6,-3,-4,0,3,-4,-14,-7,-3; D=-7;
MA   /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-17,-6,-2,-9,-14,-7,-8,3,-7,-3,-4,-8,0,8,-5,-5,-5,-16,-6,-2; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-15;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-15,-15,-18,-14,2,-21,-12,7,-11,5,5,-13,-17,-11,-8,-10,-3,10,-18,-3,-13; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-28,-8,1,-21,-18,-3,-27,24,-21,-11,0,-11,9,50,-5,-6,-19,-22,-12,1; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-4,-23,-7,-3,-16,-17,-6,-19,10,-15,-9,2,-18,3,26,-1,0,-13,-24,-10,-2;
MA   /M: SY='S'; M=10,-4,-12,-6,-5,-20,8,-14,-20,-12,-23,-16,3,-13,-6,-13,23,10,-10,-33,-20,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-2,4,-16,-3,-3,-14,-13,-6,-11,-3,-15,-10,11,-16,-4,-4,7,6,-10,-28,-10,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-8,-21,-11,-4,-9,-19,-5,-10,0,-11,-4,-5,-17,5,3,1,4,-8,-17,2,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-7,-19,-8,4,-12,-20,-9,-10,-1,-11,-7,-7,-14,-2,-1,2,5,-3,-25,-9,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-22,-24,-24,-19,18,-28,-7,6,-12,8,4,-19,-26,-16,-9,-16,-7,4,-2,26,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-16,-21,-20,-13,-2,-27,-14,6,-8,5,4,-13,-21,-12,-6,-10,0,8,-21,-1,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-30,-4,0,-27,-11,-15,-21,-10,-30,-20,-7,50,-7,-16,5,0,-24,-33,-26,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-20,-26,-23,-19,29,-25,9,-3,-15,3,1,-17,-27,-14,-12,-18,-10,-8,11,46,-18;
MA   /M: SY='B'; M=-2,14,-22,14,14,-25,-4,-5,-26,1,-24,-19,14,-10,2,-4,10,2,-21,-33,-19,8;
MA   /M: SY='R'; M=-12,1,-28,0,10,-27,-17,5,-24,16,-21,-8,6,-15,24,28,-2,-8,-24,-24,-11,15;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-22,-31,-21,6,-26,-13,18,-22,35,32,-27,-26,-13,-16,-27,-11,8,-10,2,-16;
MA   /M: SY='S'; M=0,3,-16,-2,-2,-13,-7,-6,-16,-8,-19,-13,13,-15,1,-5,19,10,-13,-33,-14,0;
MA   /M: SY='Q'; M=6,1,-20,0,7,-26,-9,-6,-20,-1,-21,-13,3,-6,13,-3,11,3,-17,-28,-17,10;
MA   /M: SY='E'; M=0,-1,-21,-2,13,-20,-16,-9,-18,3,-16,-11,-3,-9,7,-3,5,8,-14,-24,-11,10;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-23,-21,-28,-19,2,-28,-13,19,-18,20,24,-21,-23,-9,-16,-17,-5,12,-18,2,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-25,-3,12,-33,-20,3,-22,17,-21,-4,0,-13,38,22,-4,-10,-25,-21,-11,24;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-3,-24,-5,3,-19,-18,-3,-19,12,-16,-8,3,-17,9,26,-2,-2,-15,-24,-10,4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-37,-28,4,-37,-27,41,-28,22,19,-21,-22,-21,-27,-20,-8,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-10,5,-24,-1,-1,-18,-13,25,-17,-4,-13,-4,13,-18,8,-2,-2,-6,-20,-27,-2,2;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-27,-6,4,-25,-16,-3,-26,24,-22,-9,1,-15,15,38,-3,-7,-19,-22,-12,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-7,-20,-9,0,-16,-18,-7,-12,2,-7,1,-6,-15,9,5,-2,1,-11,-24,-9,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,68,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,1,-19,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-23,-12,-18,-25,52,-20,-34,-19,-26,-18,-2,-19,-18,-20,3,-15,-24,-21,-26,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-28,-5,4,-24,-20,-7,-28,37,-24,-10,0,-14,8,42,-8,-6,-18,-21,-10,4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='V'; M=3,-23,-16,-26,-20,-3,-24,-22,18,-18,14,9,-21,-24,-18,-18,-11,-4,23,-25,-8,-20;
MA   /M: SY='S'; M=4,5,-16,3,3,-23,-3,-7,-22,1,-28,-18,13,-11,3,-1,23,9,-16,-35,-18,3;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-1,1,-16,-3,2,-17,-16,-13,-16,-2,-17,-13,2,-10,-1,-2,16,26,-8,-30,-13,0;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-12,-28,-8,4,-20,-19,-16,-12,-8,-12,-11,-13,27,-6,-13,-5,-5,-15,-28,-20,-3;
MA   /M: SY='A'; M=17,-19,-16,-25,-17,-10,-16,-21,8,-14,3,5,-17,-16,-15,-16,-5,-3,13,-23,-12,-17;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2022_01,566996;
NR   /TOTAL=34(34); /POSITIVE=34(34); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=???P?; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=CpcD-like;
CC   /VERSION=4;
DR   P58558    , FENR_NOSS1 , T; P21890    , FENR_NOSSO , T;
DR   P31973    , FENR_SYNP2 , T; Q55318    , FENR_SYNY3 , T;
DR   Q93RE3    , FENR_THEVB , T; Q44549    , FENR_TRIV2 , T;
DR   P72506    , PYC1_ARTPT , T; P20116    , PYC1_MASLA , T;
DR   P16569    , PYC1_MICDP , T; P80558    , PYC1_NOSS1 , T;
DR   P06114    , PYC1_SYNP6 , T; Q01950    , PYC1_SYNY3 , T;
DR   Q02925    , PYC1_SYNY4 , T; P50036    , PYC1_THEVB , T;
DR   P11398    , PYR1_MASLA , T; P18542    , PYR1_MICDP , T;
DR   P07123    , PYR1_NOSS1 , T; Q05237    , PYR1_SYNP2 , T;
DR   P73203    , PYR1_SYNY3 , T; P50034    , PYR1_THEVB , T;
DR   P11399    , PYR2_MASLA , T; P18543    , PYR2_MICDP , T;
DR   P31329    , PYR2_NOSS1 , T; P73204    , PYR2_SYNY3 , T;
DR   P11400    , PYR3_MICDP , T; P11401    , PYR5_MICDP , T;
DR   P14880    , PYR6_MICDP , T; P11396    , PYS1_MASLA , T;
DR   P11397    , PYS1_MICDP , T; P07124    , PYS1_NOSS1 , T;
DR   P31966    , PYS1_SYNP2 , T; P73202    , PYS1_SYNY3 , T;
DR   P50035    , PYS1_THEVB , T; P14878    , PYS2_MICDP , T;
3D   1B33; 2B5O; 7EXT; 7EYD;
PR   PRU00771;
DO   PDOC51441;
//
