ID   INVERT_DEFENSINS; MATRIX.
AC   PS51378;
DT   01-MAY-2008 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 23-FEB-2022 INFO UPDATE.
DE   Invertebrate defensins family profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=32;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0351765; R2=0.0051399; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3098.6945801; R2=2.0724764; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1297; H_SCORE=5787; N_SCORE=8.7; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=869; H_SCORE=4900; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-18; D=-80; I=-80; B1=-500; E1=-500; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='G'; M=-20,-53,-38,-15,-50,45,-39,-5,-7,-30,-39,-2,-7,-5,42,-30,-13,-42,-52,-45;
MA   /M: SY='Y'; M=21,-41,-42,-18,38,14,-35,3,-37,-1,-22,-36,-45,-36,-15,-13,-7,20,-30,41;
MA   /M: SY='T'; M=10,-37,-33,-36,5,33,-36,-34,-33,-23,-31,-22,-36,-33,-39,12,67,-28,-43,13;
MA   /M: SY='C'; M=-32,143,-51,-52,-42,-47,-51,-49,-47,-39,-40,-38,-62,-55,-54,-34,-32,-36,-72,-53;
MA   /I: I=-8; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-23,-55,58,9,-56,-43,-37,-43,-15,-50,-45,-6,58,-4,-39,-32,2,-5,-64,-48; D=-8;
MA   /I: I=-8; DM=-25;
MA   /M: SY='W'; M=-30,-50,-19,-48,23,-55,-48,11,-44,29,-23,-47,-54,-45,-5,-9,4,-3,61,-26; D=-8;
MA   /I: I=-8; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-33,4,25,-38,9,-6,-39,-34,-20,28,-30,29,-55,-12,-44,-18,-37,-38,-55,-37; D=-8;
MA   /I: I=-8; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=-13,-52,4,20,-59,4,-36,-56,-29,-55,-47,-13,-43,33,-3,38,4,-50,-60,-47; D=-8;
MA   /I: I=-8; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='W'; M=16,-44,2,-32,-33,4,-33,-3,-33,-37,4,-27,-41,14,-37,44,4,-32,53,29; D=-8;
MA   /I: I=-8; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=40,-42,5,-9,-42,-7,-31,-28,7,-15,-32,19,-41,33,-29,-6,-10,-18,-47,0; D=-8;
MA   /I: I=-8; DM=-25;
MA   /M: SY='C'; M=-32,143,-51,-52,-42,-47,-51,-49,-47,-39,-40,-38,-62,-55,-54,-34,-32,-36,-72,-53;
MA   /M: SY='H'; M=42,-39,-26,-1,-10,-20,50,-16,4,-22,-29,38,-39,0,-9,-9,-5,-16,-50,-30;
MA   /M: SY='A'; M=48,-39,16,-28,7,-9,-33,-22,-29,0,2,-12,-10,-2,6,17,-25,-27,-45,-32;
MA   /M: SY='H'; M=-36,-49,-27,-6,-1,-42,110,-39,-27,-33,-25,2,-43,2,-5,-12,-33,-7,-44,47;
MA   /M: SY='C'; M=-32,143,-51,-52,-42,-47,-51,-49,-47,-39,-40,-38,-62,-55,-54,-34,-32,-36,-72,-53;
MA   /M: SY='K'; M=-32,-44,-35,-29,-31,-44,13,30,36,19,-18,9,-43,17,16,-2,-27,12,-47,-30;
MA   /M: SY='S'; M=0,-40,-7,5,6,-17,5,-4,-29,3,27,-26,-39,-3,-7,48,-4,-10,-44,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-32,-45,-33,-8,-13,-44,-15,34,43,5,11,8,-41,-22,31,2,-27,-8,-45,-30;
MA   /I: I=-24; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77;
MA   /M: SY='G'; M=-22,-48,-30,2,-52,81,2,-59,0,-54,-43,-21,-37,-29,-4,-8,-36,-52,-45,-44;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,30,-16,-30,11,-43,-20,-36,29,-21,-28,1,-47,-23,43,-31,-32,-36,-22,75;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-27,6,-45,-13,-28,-42,47,-20,-33,9,-13,5,53,6,-10,-26,-47,-36;
MA   /M: SY='G'; M=7,-46,-36,-40,-44,75,-38,-24,-35,-48,-40,-24,-39,-4,-15,11,-33,-43,34,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-46,-36,-46,-13,89,-41,-58,-40,-53,-44,-22,-39,-38,-47,-20,-38,-52,-42,-44;
MA   /M: SY='Y'; M=-29,-49,-32,-31,7,-41,43,-35,-6,-31,-25,10,-47,24,15,-2,-31,-38,-15,92;
MA   /M: SY='C'; M=-32,143,-51,-52,-42,-47,-51,-49,-47,-39,-40,-38,-62,-55,-54,-34,-32,-36,-72,-53;
MA   /I: I=-19; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61;
MA   /M: SY='N'; M=-24,-51,-39,-47,18,-28,-41,-21,-42,-46,-43,45,-29,-43,-48,11,25,-23,7,-1; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-61;
MA   /M: SY='F'; M=11,-42,3,7,26,-12,-5,-33,6,0,-28,-4,-3,20,-29,25,-6,-23,-40,3;
MA   /I: I=-22; MD=-71;
MA   /M: SY='K'; M=-19,-49,-14,4,-43,-25,-26,-31,60,-46,-36,38,-39,28,25,-26,-29,-44,42,-2; D=-22;
MA   /I: I=-22; MI=-71; MD=-71; IM=-71; DM=-71;
MA   /M: SY='K'; M=6,-43,-2,4,-44,28,-33,-36,32,-10,-32,-4,-38,22,-16,0,13,-8,-49,-39; D=-22;
MA   /I: I=-22; DM=-71;
MA   /M: SY='T'; M=-28,-39,-9,-9,-30,-29,-37,19,-12,-6,-21,24,-41,-32,-6,-24,44,42,-51,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-32,143,-51,-52,-42,-47,-51,-49,-47,-39,-40,-38,-62,-55,-54,-34,-32,-36,-72,-53;
MA   /M: SY='V'; M=-15,-41,-38,-33,-30,-45,8,11,10,-17,-22,-16,-41,-3,17,-26,41,43,35,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-32,143,-51,-52,-42,-47,-51,-49,-47,-39,-40,-38,-62,-55,-54,-34,-32,-36,-72,-53;
MA   /M: SY='Y'; M=-32,-46,-30,-7,1,-21,-22,-34,-6,-34,-29,14,-43,2,52,-6,27,-8,-30,60;
MA   /M: SY='R'; M=-23,-53,-12,7,-52,-44,10,-50,21,-29,5,32,-47,0,32,0,-9,-48,-60,-43;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
NR   /RELEASE=2022_01,566996;
NR   /TOTAL=56(56); /POSITIVE=56(56); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=6; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=PS_Langendijk_Genevaux;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /VERSION=7;
DR   A0A3G5BIB4, ASC3A_DOLGE, T; A0A3G5BIB1, ASC3B_DOLGE, T;
DR   P85008    , DEF1_CRAVI , T; Q86QI5    , DEF1_DERVA , T;
DR   P85213    , DEF1_GALME , T; Q7M426    , DEF1_HOLDI , T;
DR   O16136    , DEF1_STOCA , T; Q5MQL3    , DEF2_APIME , T;
DR   P85215    , DEF2_GALME , T; O16137    , DEF2_STOCA , T;
DR   Q5TWR9    , DEF3_ANOGA , T; P56686    , DEF4_ANDAU , T;
DR   P41965    , DEF4_LEIHE , T; P91793    , DEFA_AEDAE , T;
DR   P83669    , DEFA_ANOCP , T; P81610    , DEFA_MYTED , T;
DR   P80033    , DEFA_ZOPAT , T; P81602    , DEFB_AEDAE , T;
DR   P83668    , DEFB_ANOCP , T; P81611    , DEFB_MYTED , T;
DR   Q4GWV4    , DEFCG_CRAGI, T; P81603    , DEFC_AEDAE , T;
DR   Q20A06    , DEFH1_CRAGI, T; Q20A05    , DEFH2_CRAGI, T;
DR   P80154    , DEFI_AESCY , T; Q17027    , DEFI_ANOGA , T;
DR   Q5J8R1    , DEFI_APICA , T; P17722    , DEFI_APIME , T;
DR   P81462    , DEFI_BOMPA , T; C0HJX7    , DEFI_CALVI , T;
DR   P36192    , DEFI_DROME , T; P80571    , DEFI_MYTGA , T;
DR   B2D2C0    , DEFI_ORNCO , T; O96049    , DEFI_ORYRH , T;
DR   P80407    , DEFI_PALPR , T; P83404    , DEFI_PHLDU , T;
DR   P10891    , DEFI_PROTE , T; P37364    , DEFI_PYRAP , T;
DR   Q86LE4    , DEFI_RHIMP , T; Q27023    , DEFI_TENMO , T;
DR   Q10745    , DEFI_TRYDI , T; Q6GU94    , DEFL1_CENLI, T;
DR   P86471    , DEFLU_LUCSE, T; I1T3C7    , DEFM0_ARTOT, T;
DR   P84156    , DEFN_ARCDE , T; P81544    , DEFN_HELVI , T;
DR   Q53I06    , DEFPL_PSENR, T; A0A084G2W8, DEFS2_PSEDA, T;
DR   A0A059J5P2, DEFTR_TRIIM, T; A9XFZ7    , DEF_COPTR  , T;
DR   Q5BU36    , DEF_FORAQ  , T; Q8WTD4    , DEF_GLOMM  , T;
DR   B3EWY5    , LUCFE_LUCCU, T; P31529    , SAPB_SARPE , T;
DR   P31530    , SAPC_SARPE , T; P18313    , SAPE_SARPE , T;
DR   B2MW54    , DEFLO_HAELO, N; Q8WQZ3    , DEF_MAMBR  , N;
DR   P0CF77    , DEF_TITDI  , N; Q5MGC9    , DFP6_LONON , N;
DR   P93331    , NOD1_MEDTR , N; P0DPW6    , TX21A_ETHRU, N;
3D   1FJN; 1I2U; 1I2V; 1ICA; 1L4V; 1OZZ; 1P00; 1P0A; 1ZFU; 2B68; 2E3E; 2E3F;
3D   2E3G; 2LLD; 2LN4; 2LR5; 2NY8; 2NY9; 2NZ3; 3E7R; 3E7U; 6B9W; 6BAM; 6BB6;
3D   6BI5; 6K50; 6K51; 6PX8;
PR   PRU00710;
DO   PDOC00356;
//
