ID   CW; MATRIX.
AC   PS51170;
DT   01-DEC-2005 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 23-FEB-2022 INFO UPDATE.
DE   Cell wall-binding repeat profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=20;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=20;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.0656130; R2=0.0082735; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=923; N_SCORE=8.7; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=536; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: M0=-17; D=-80; I=-80; B1=-200; E1=-200; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='Q'; M=12,-41,-20,5,-25,-42,-18,-18,33,-12,-12,-19,-41,42,9,2,9,16,-61,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-23,-54,-5,-24,-37,-19,-45,-3,7,-35,-38,59,-41,-12,-42,10,65,-17,-68,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-13,-62,-14,4,-53,78,-36,-65,-15,-64,-49,-14,-48,9,5,-10,-11,-63,-61,-42;
MA   /M: SY='W'; M=-36,-68,-63,-36,60,-63,-38,-14,-47,3,-21,-52,-53,-34,-58,-39,-45,-26,138,36;
MA   /M: SY='Q'; M=-22,-60,-54,-24,6,-43,0,30,13,0,-22,-27,-59,55,-9,-38,-11,37,-57,12;
MA   /M: SY='Q'; M=-35,-46,-18,14,-9,-51,-12,-19,34,-39,-28,36,-45,44,-9,-3,41,-27,-24,17;
MA   /M: SY='I'; M=-33,-58,37,-6,-16,-39,-21,61,-23,-1,-28,-6,-58,-17,-54,-20,-9,14,-12,11;
MA   /I: I=-21; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65;
MA   /M: SY='N'; M=-17,-60,63,-4,-63,16,-33,-60,3,-61,-51,71,-34,-10,-33,8,-31,-59,-72,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-35,-61,30,-22,-55,72,-39,-69,-13,-61,-58,45,-44,-1,-46,-1,-20,-65,-65,-22;
MA   /I: I=-21; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65;
MA   /M: SY='N'; M=-16,-34,2,-7,-59,-6,6,-28,47,-55,-32,56,-49,24,-17,14,6,-32,-41,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-47,-61,-33,-46,-15,-51,-7,-26,7,-38,-26,-15,-48,-9,-9,-37,24,-38,141,41;
MA   /M: SY='Y'; M=-44,-66,-59,-59,36,-64,2,-36,-45,-17,-21,-57,-68,-30,-21,-38,-35,-26,37,114;
MA   /M: SY='Y'; M=-52,-37,-44,-59,23,-29,14,-41,-50,-25,-32,-46,-68,-48,-48,-48,-52,-45,19,120;
MA   /M: SY='F'; M=-26,-45,-54,-64,95,-64,-47,-5,-57,25,-7,-48,-69,-42,-49,-35,-47,-4,-36,22;
MA   /M: SY='D'; M=-31,-61,75,-5,-38,3,-25,-59,15,-45,-48,59,-44,-15,-11,-7,-17,-62,-73,-32;
MA   /M: SY='S'; M=13,-59,29,25,-57,-12,-22,-53,8,-54,-54,32,24,16,-28,36,-1,-43,-68,-34;
MA   /M: SY='D'; M=-30,-59,69,-10,-53,-22,-38,-53,-6,-47,-57,67,-47,-1,-42,25,4,-56,-30,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-30,-50,-48,-47,-65,91,-40,-71,-45,-63,-59,6,-54,-51,-50,-12,-10,-59,-60,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=9,-47,-39,-5,-36,3,7,15,13,-30,-19,1,-33,11,1,12,11,15,-60,15;
MA   /M: SY='M'; M=12,-29,-22,-26,-25,-30,-21,-1,-18,10,92,-19,-39,20,-13,-31,-33,-1,-49,15;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
NR   /RELEASE=2022_01,566996;
NR   /TOTAL=276(20); /POSITIVE=276(20); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=?B?P?; /MAX-REPEAT=32;
CC   /FT_KEY=REPEAT; /FT_DESC=Cell wall-binding;
CC   /VERSION=4;
DR   O03979    , ALYS_BPDP1 , T; P32762    , ALYS_BPHB3 , T;
DR   P06653    , ALYS_STRPN , T; P11001    , GTF1_STRDO , T;
DR   P27470    , GTF2_STRDO , T; P08987    , GTFB_STRMU , T;
DR   P13470    , GTFC_STRMU , T; P49331    , GTFD_STRMU , T;
DR   P29336    , GTFS_STRDO , T; P15057    , LYS_BPCP1  , T;
DR   P19386    , LYS_BPCP9  , T; P59205    , LYTB_STRPN , T;
DR   P59206    , LYTB_STRR6 , T; P16154    , TCDA_CLODI , T;
DR   Q46149    , TCDA_CLONO , T; Q9EXR0    , TCDB2_CLODI, T;
DR   P18177    , TCDB_CLODI , T; Q46342    , TCSL1_PAESO, T;
DR   P0DUB4    , TCSL2_PAESO, T; T0D3N5    , TCSL3_PAES9, T;
3D   1GVM; 1H09; 1H8G; 1HCX; 1OBA; 2BML; 2F6E; 2G7C; 2IXU; 2IXV; 2J8F; 2J8G;
3D   2QJ6; 4NBX; 4NBZ; 4NC2; 4NP4; 4R04; 4X36; 5UMI; 6AR6; 6OQ5; 7ML7;
PR   PRU00591;
DO   PDOC51170;
//