ID   DSL; MATRIX.
AC   PS51051;
DT   01-DEC-2004 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 23-FEB-2022 INFO UPDATE.
DE   DSL domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8295677; R2=0.0097802; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2493.5966797; R2=2.9556451; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=764; H_SCORE=4752; N_SCORE=10.3; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=376; H_SCORE=3605; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-17,-19,-25,-25,5,-28,-22,24,-21,6,7,-10,-25,-22,-20,-11,-4,24,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-11,-21,-13,-10,-15,-10,-18,-7,1,-9,-4,-8,-17,-10,-4,-2,1,1,-25,-12,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-15,90,-26,-27,-18,-28,-26,-21,-27,-17,-16,-12,-36,-26,-27,-9,-9,-8,-46,-26,-27;
MA   /M: SY='B'; M=-4,14,-24,14,4,-20,-13,-4,-16,-1,-18,-14,10,-14,-2,-7,0,-5,-15,-25,-7,0;
MA   /M: SY='R'; M=-12,1,-28,5,19,-25,-18,-5,-27,14,-22,-16,0,0,8,21,0,-4,-23,-27,-16,11;
MA   /M: SY='N'; M=-12,14,-22,3,-5,-8,-13,12,-12,-6,-14,-9,25,-21,0,-4,-1,-1,-20,-22,4,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-31,-39,-31,-25,18,-25,-8,-8,-17,-5,-8,-31,-30,-16,-16,-31,-20,-18,83,48,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-16,-27,-19,-14,24,-26,20,-13,-6,-6,-2,-9,-25,-11,1,-16,-12,-13,-1,31,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-28,-9,-15,-29,52,-17,-35,-16,-27,-17,0,-18,-11,-16,2,-12,-27,-21,-26,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-1,-25,-2,10,-15,-8,12,-22,-4,-14,-10,3,-15,1,0,-2,-9,-20,-26,-8,4;
MA   /M: SY='H'; M=-5,1,-25,2,1,-22,-9,11,-25,6,-22,-11,3,-15,6,9,2,-6,-19,-24,-5,2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-3,14,-24,19,21,-28,-4,-5,-29,1,-24,-20,8,-9,4,-2,8,-4,-23,-32,-20,12;
MA   /M: SY='K'; M=-10,1,-25,-1,-1,-21,-19,5,-16,11,-19,-7,4,-15,1,8,-3,-4,-11,-27,-7,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-21,-21,-27,-20,41,-24,-1,-5,-22,3,-1,-14,-26,-23,-16,-11,-7,-5,0,25,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-18,105,-27,-25,-22,-29,-26,-29,-26,-20,-18,-18,-37,-21,-26,-9,-10,-12,-47,-28,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-14,11,-19,12,2,-25,-19,2,-20,8,-20,-12,7,-16,-1,3,-7,-10,-17,-30,-10,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,4,-30,12,18,-31,-15,-8,-26,2,-25,-18,-3,23,7,-7,0,-7,-26,-30,-21,11;
MA   /M: SY='R'; M=-15,7,-28,10,12,-25,-16,7,-30,16,-24,-15,9,-14,8,30,-2,-8,-23,-28,-12,8;
MA   /M: SY='D'; M=-7,8,-25,12,5,-20,-15,-7,-21,-3,-16,-13,1,-5,4,-7,1,-2,-18,-27,-12,4;
MA   /M: SY='D'; M=11,24,-20,27,5,-29,-5,-7,-25,-4,-22,-20,11,-11,-4,-13,5,-5,-17,-32,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-9,-22,-13,-7,-10,-18,9,-12,-4,-10,-4,-3,-17,-3,3,-1,-2,-9,-24,-3,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-9,-21,-15,-11,11,-19,7,-13,-8,-8,-5,-2,-20,-11,-2,-5,-3,-11,-17,6,-11;
MA   /I: I=-14; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=3,-11,-15,-14,-14,-12,12,-14,-4,-13,-7,-1,-7,-14,-12,-14,-1,-6,0,-17,-13,-14; D=-14;
MA   /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-8,0,-21,-2,-5,-17,11,25,-23,-6,-18,-8,8,-14,-2,0,-3,-12,-21,-19,-5,-5; D=-14;
MA   /I: I=-14; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-18,-29,-21,-14,17,-25,-3,-11,4,-8,-1,-14,-24,-9,8,-18,-12,-12,14,29,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-23,-8,2,-16,-20,-3,-14,7,-11,-6,-6,-17,0,17,-3,-2,-6,-26,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-13,36,-24,40,11,-31,-8,1,-29,-1,-28,-23,27,-13,3,-6,7,0,-26,-38,-19,7;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-28,3,12,-20,-18,-3,-19,2,-19,-12,-3,3,5,-4,-3,-8,-19,-25,-12,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,14,-27,15,8,-28,-15,7,-21,7,-18,-6,10,-14,16,3,-4,-9,-23,-28,-10,12;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-30,-2,-16,-31,62,-18,-40,-18,-30,-21,2,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-7,10,-24,7,-1,-25,2,-5,-23,1,-24,-14,14,-16,4,1,4,-2,-20,-29,-17,1;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-20,-26,-22,-13,4,-26,-11,0,-4,8,7,-17,-16,-10,2,-19,-10,-4,-12,6,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-21,-11,-11,-19,6,-16,-18,-2,-18,-11,-4,-18,-10,2,4,3,-6,-26,-17,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-12,-23,-13,-10,-8,-20,-3,0,-18,13,6,-12,-8,-10,-15,-16,-9,-6,-25,-7,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-5,-34,0,11,-26,-21,-12,-13,-6,-20,-14,-6,35,1,-13,-7,-9,-21,-29,-21,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-32,-37,-34,-26,19,-24,-21,-10,-16,-7,-10,-31,-29,-21,-16,-30,-20,-15,82,28,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-10,-8,-1,-18,-17,-1,-17,-2,-14,-5,-2,-14,4,3,7,11,-11,-29,-10,1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-29,-7,-18,-29,63,-17,-38,-18,-30,-20,6,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-9,3,-30,9,2,-27,-8,-12,-24,-6,-25,-19,0,25,-6,-12,0,-6,-24,-32,-23,-4;
MA   /M: SY='B'; M=-15,16,-28,16,4,-18,-14,6,-22,1,-18,-14,13,-17,-1,-2,-7,-10,-23,-16,-4,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-14,106,-25,-27,-20,-27,-26,-29,-27,-21,-20,-12,-38,-27,-27,-8,-9,-12,-49,-29,-27;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2022_01,566996;
NR   /TOTAL=23(23); /POSITIVE=23(23); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=3; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=V_Lesaux;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=DSL;
CC   /VERSION=5;
DR   P41990    , APX1_CAEEL , T; O00548    , DLL1_HUMAN , T;
DR   Q61483    , DLL1_MOUSE , T; P97677    , DLL1_RAT   , T;
DR   Q9NR61    , DLL4_HUMAN , T; Q9JI71    , DLL4_MOUSE , T;
DR   D3ZHH1    , DLL4_RAT   , T; Q6DI48    , DLLA_DANRE , T;
DR   O57409    , DLLB_DANRE , T; Q9IAT6    , DLLC_DANRE , T;
DR   Q8UWJ4    , DLLD_DANRE , T; P10041    , DL_DROME   , T;
DR   O45201    , DSL1_CAEEL , T; Q90Y57    , JAG1A_DANRE, T;
DR   Q90Y54    , JAG1B_DANRE, T; P78504    , JAG1_HUMAN , T;
DR   Q9QXX0    , JAG1_MOUSE , T; Q63722    , JAG1_RAT   , T;
DR   Q9Y219    , JAG2_HUMAN , T; Q9QYE5    , JAG2_MOUSE , T;
DR   P97607    , JAG2_RAT   , T; P45442    , LAG2_CAEEL , T;
DR   P18168    , SERR_DROME , T;
DR   Q9NYJ7    , DLL3_HUMAN , N; O88516    , DLL3_MOUSE , N;
DR   O88671    , DLL3_RAT   , N;
3D   2KB9; 2VJ2; 4CBZ; 4CC0; 4CC1; 4XBM; 4XL1; 4XLW; 5BO1; 5MVX; 5MW5; 5MW7;
3D   5MWF; 5UK5; 7ALK; 7ALT;
PR   PRU00377;
DO   PDOC51051;
//
