ID HTH_DEOR_2; MATRIX. AC PS51000; DT 01-JUN-2004 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 23-FEB-2022 INFO UPDATE. DE DeoR-type HTH domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0322731; R2=0.0153820; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2978.6115723; R2=2.5653896; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=557; H_SCORE=4408; N_SCORE=10.6; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=291; H_SCORE=3725; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='R'; M=-7,-9,-24,-11,-2,-17,-17,-11,-15,8,-11,-1,-7,-3,-1,10,-5,1,-11,-24,-12,-3; MA /M: SY='P'; M=1,-1,-24,-3,4,-19,-13,-9,-16,-1,-18,-13,3,5,-1,-5,1,-4,-17,-28,-17,0; MA /M: SY='E'; M=-5,4,-26,9,19,-25,-17,-5,-20,3,-18,-11,-2,-2,10,-2,0,-5,-18,-27,-14,14; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /M: SY='Q'; M=-12,-13,-27,-15,-6,-14,-26,-3,2,-6,4,5,-9,-19,7,2,-12,-8,-5,-22,-4,-2; MA /M: SY='Q'; M=-5,0,-25,0,11,-22,-14,0,-18,3,-16,-7,1,-13,17,0,-1,-7,-18,-24,-11,14; MA /M: SY='Q'; M=1,-10,-22,-13,0,-17,-20,-12,-4,-4,-2,0,-9,-14,7,-6,-3,0,-6,-23,-10,3; MA /M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-36,-26,3,-35,-24,38,-28,29,24,-23,-23,-18,-25,-23,-10,22,-20,0,-25; MA /M: SY='L'; M=-8,-23,-21,-25,-16,1,-28,-19,16,-20,26,14,-21,-24,-14,-14,-18,-6,11,-23,-4,-16; MA /M: SY='E'; M=-8,9,-27,13,25,-31,-15,7,-25,7,-22,-11,5,-8,22,2,3,-7,-25,-29,-14,23; MA /M: SY='M'; M=-10,-18,-25,-19,-8,-2,-23,-5,0,-6,11,13,-17,-22,-2,0,-18,-10,-5,-8,8,-6; MA /M: SY='L'; M=-7,-30,-19,-31,-24,6,-31,-24,27,-27,35,17,-29,-29,-23,-21,-23,-7,23,-23,-3,-24; MA /M: SY='A'; M=5,-5,-21,-9,-5,-17,-12,-11,-12,-1,-12,-8,-2,-16,0,0,0,-4,-9,-15,-11,-3; MA /M: SY='Q'; M=-4,6,-25,6,17,-29,-16,-2,-21,8,-20,-10,5,-10,21,4,2,-4,-21,-26,-14,19; MA /M: SY='Q'; M=-12,-1,-28,2,9,-25,-14,13,-24,4,-19,-9,1,-9,17,10,-3,-9,-24,-24,-6,11; MA /M: SY='G'; M=-6,-3,-28,-3,-6,-27,28,-11,-34,-2,-26,-17,4,-17,-5,5,0,-11,-26,-23,-22,-7; MA /M: SY='T'; M=-8,-9,-21,-12,-4,-2,-23,-5,-8,-3,-8,-4,-7,-17,-4,-5,-2,4,-5,-18,2,-4; MA /M: SY='V'; M=-1,-28,-12,-31,-26,1,-28,-26,21,-23,18,11,-27,-27,-23,-21,-16,-6,26,-17,-6,-25; MA /M: SY='S'; M=4,-2,-15,-5,-3,-18,-10,-3,-17,-8,-19,-13,4,-7,-1,-7,20,17,-10,-33,-13,-3; MA /M: SY='V'; M=-4,-26,-18,-29,-25,0,-26,-26,25,-23,17,11,-23,-25,-23,-21,-13,0,28,-25,-7,-25; MA /M: SY='E'; M=-7,8,-26,10,17,-28,-9,-5,-25,9,-22,-15,6,-10,9,4,1,-5,-22,-28,-17,13; MA /M: SY='E'; M=-8,13,-27,18,28,-26,-16,-1,-27,9,-21,-17,6,-8,13,2,-1,-9,-25,-28,-15,21; MA /M: SY='L'; M=-1,-27,-18,-29,-20,4,-26,-20,17,-25,36,17,-26,-26,-18,-20,-22,-8,12,-21,-4,-19; MA /M: SY='A'; M=24,-13,-5,-19,-14,-14,-10,-20,-2,-13,-8,-4,-11,-15,-12,-18,9,6,7,-27,-16,-13; MA /M: SY='E'; M=1,7,-25,7,13,-28,-5,-6,-22,2,-20,-14,4,-10,9,-5,2,-6,-20,-26,-18,11; MA /M: SY='L'; M=-10,-17,-24,-18,-6,-5,-25,-3,0,-6,5,5,-14,-21,-2,4,-14,-9,-1,-20,-1,-6; MA /M: SY='F'; M=-14,-28,-16,-33,-24,39,-29,-18,8,-28,26,10,-24,-29,-27,-19,-23,-8,4,-7,15,-24; MA /M: SY='G'; M=-3,8,-27,9,-2,-31,21,-9,-32,-2,-27,-18,8,-15,-1,-7,2,-11,-26,-26,-22,-1; MA /M: SY='V'; M=-1,-24,-14,-27,-25,-1,-29,-25,23,-19,7,7,-22,-25,-23,-19,-6,6,33,-25,-3,-25; MA /M: SY='S'; M=11,-1,-10,-3,-2,-18,-3,-12,-18,-10,-26,-18,7,-10,-2,-11,35,24,-8,-37,-18,-2; MA /M: SY='E'; M=-9,0,-27,5,16,-24,-17,-3,-21,3,-18,-13,-4,2,2,-2,-2,-3,-16,-29,-15,8; MA /M: SY='M'; M=1,-8,-20,-12,0,-16,-16,-7,-6,0,-6,6,-6,-15,3,2,-2,-3,-4,-25,-12,1; MA /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10; MA /M: SY='I'; M=1,-28,-19,-33,-27,-2,-31,-28,34,-24,14,13,-23,-23,-23,-24,-13,-5,33,-24,-6,-27; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /M: SY='R'; M=-15,-6,-29,-7,2,-22,-19,-2,-29,30,-22,-10,2,-18,11,56,-8,-9,-20,-21,-11,3; MA /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10; MA /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-34,-25,14,-33,-23,27,-30,35,17,-26,-27,-23,-23,-25,-10,17,-17,3,-25; MA /M: SY='B'; M=-4,17,-23,14,8,-26,-10,-1,-22,3,-22,-15,17,-14,8,4,4,-3,-20,-31,-17,8; MA /M: SY='K'; M=-7,-1,-26,-2,9,-14,-19,-6,-17,11,-15,-7,-2,-12,4,5,-5,-4,-15,-19,-4,6; MA /M: SY='L'; M=-11,-24,-22,-27,-18,5,-28,-14,17,-24,36,17,-21,-27,-16,-15,-25,-10,7,-21,-1,-18; MA /M: SY='E'; M=-2,2,-24,5,21,-23,-16,-3,-19,0,-15,-13,-1,-5,6,-3,2,-3,-17,-29,-16,13; MA /M: SY='E'; M=-4,10,-24,10,17,-26,-6,1,-24,3,-21,-13,9,-10,8,-3,4,-5,-23,-30,-16,12; MA /M: SY='Q'; M=-7,-2,-19,0,6,-22,-19,-2,-16,0,-9,-6,-5,-12,11,-3,-6,-8,-17,-24,-8,8; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; MA /M: SY='G'; M=-2,-10,-27,-9,-14,-25,44,-17,-31,-12,-23,-15,-2,-11,-14,-14,-2,-15,-24,-20,-24,-14; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-21; MA /M: SY='L'; M=-1,-13,-20,-14,-11,-4,-15,-13,-2,-7,4,0,-13,-19,-11,-9,-11,-5,0,-15,0,-12; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-21; MA /M: SY='L'; M=-6,-22,-19,-23,-18,0,-26,-19,18,-22,23,14,-22,-18,-17,-19,-18,-7,14,-21,-5,-18; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-21; MA /M: SY='V'; M=-9,-14,-21,-17,-9,-5,-26,-10,2,-9,2,1,-11,-19,-10,-4,-7,3,5,-24,-4,-11; MA /M: SY='R'; M=-15,-11,-28,-12,-3,-17,-17,-4,-20,18,-15,-7,-4,-20,6,41,-9,-9,-14,-19,-6,-2; MA /M: SY='T'; M=0,-13,-18,-18,-15,-3,-16,-10,-1,-12,-4,-2,-10,-20,-11,-11,-2,6,4,-17,3,-14; MA /M: SY='H'; M=-14,-8,-25,-9,-8,-2,-21,45,-16,-11,-10,-2,-2,-22,-1,-3,-6,-8,-17,-16,23,-8; MA /M: SY='G'; M=-1,-7,-30,-8,-18,-30,63,-18,-39,-16,-30,-20,3,-20,-18,-17,0,-19,-30,-21,-29,-18; MA /M: SY='G'; M=-4,-9,-20,-11,-19,-22,49,-16,-35,-18,-26,-18,0,-22,-19,-16,-2,-17,-26,-19,-21,-19; MA /M: SY='A'; M=25,-13,-7,-19,-11,-14,-11,-13,-5,-13,-5,-6,-13,-17,-12,-18,2,-2,4,-23,-12,-12; MA /M: M=-4,-7,-23,-6,-4,-18,-15,-9,-4,-8,-7,-3,-8,-17,-3,-9,-5,-6,0,-26,-11,-4; MA /M: SY='Y'; M=-4,-14,-21,-14,-8,-4,-15,-10,-6,-9,-5,-4,-10,-15,-7,-8,-2,-3,-4,-18,1,-8; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2022_01,566996; NR /TOTAL=85(85); /POSITIVE=85(85); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=2; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=window20; CC /AUTHOR=PS_Langendijk_Genevaux; CC /TAXO-RANGE=A??P?; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=HTH deoR-type; CC /VERSION=5; DR P32104 , ACCR_AGRFC , T; P0ACK4 , AGAR_ECO57 , T; DR P0ACK3 , AGAR_ECOL6 , T; P0ACK2 , AGAR_ECOLI , T; DR P32144 , CSQR_ECOLI , T; P0ACK7 , DEOR_ECO57 , T; DR P0ACK6 , DEOR_ECOL6 , T; P0ACK5 , DEOR_ECOLI , T; DR O31713 , FRUR_BACSU , T; P0ACK8 , FUCR_ECOLI , T; DR P44780 , FUCR_HAEIN , T; P0ACK9 , FUCR_SHIFL , T; DR P36930 , GATR_ECOLI , T; P94591 , GLCR_BACSU , T; DR P0ACL0 , GLPR_ECOLI , T; P44784 , GLPR_HAEIN , T; DR D4GYE7 , GLPR_HALVD , T; Q51391 , GLPR_PSEAE , T; DR P0ACL1 , GLPR_SHIFL , T; Q92ET8 , GOLR_LISIN , T; DR P46337 , IOLR_BACSU , T; P18816 , LACR_LACLL , T; DR P0A0Q0 , LACR_STAA8 , T; Q5HE08 , LACR_STAAC , T; DR P67743 , LACR_STAAM , T; P67744 , LACR_STAAN , T; DR Q6GEN3 , LACR_STAAR , T; Q6G7B8 , LACR_STAAS , T; DR P0A0P9 , LACR_STAAW , T; Q5HM34 , LACR_STAEQ , T; DR Q8CRJ1 , LACR_STAES , T; P26422 , LACR_STRMU , T; DR P39361 , SGCR_ECOLI , T; P15082 , SRLR_ECOLI , T; DR A7ZV62 , ULAR_ECO24 , T; B7UQK0 , ULAR_ECO27 , T; DR B7MLJ6 , ULAR_ECO45 , T; B7LC45 , ULAR_ECO55 , T; DR P0A9W2 , ULAR_ECO57 , T; B5Z2J7 , ULAR_ECO5E , T; DR B7NTP7 , ULAR_ECO7I , T; B7MSL0 , ULAR_ECO81 , T; DR B7M8V1 , ULAR_ECO8A , T; C4ZR68 , ULAR_ECOBW , T; DR B1XDU2 , ULAR_ECODH , T; A8A7T7 , ULAR_ECOHS , T; DR A1AJ96 , ULAR_ECOK1 , T; Q0T9K2 , ULAR_ECOL5 , T; DR P0A9W1 , ULAR_ECOL6 , T; B1IT15 , ULAR_ECOLC , T; DR P0A9W0 , ULAR_ECOLI , T; B7NGC5 , ULAR_ECOLU , T; DR B6I296 , ULAR_ECOSE , T; B1LQL1 , ULAR_ECOSM , T; DR Q1R369 , ULAR_ECOUT , T; B5F3A7 , ULAR_SALA4 , T; DR A9MFM3 , ULAR_SALAR , T; Q57GK1 , ULAR_SALCH , T; DR B5FS93 , ULAR_SALDC , T; B5R0Q8 , ULAR_SALEP , T; DR B4TFC5 , ULAR_SALHS , T; B4T3E2 , ULAR_SALNS , T; DR Q5PJ50 , ULAR_SALPA , T; A9N507 , ULAR_SALPB , T; DR C0Q6E8 , ULAR_SALPC , T; B5BKJ9 , ULAR_SALPK , T; DR B4TSH1 , ULAR_SALSV , T; Q8XG96 , ULAR_SALTI , T; DR Q7CP93 , ULAR_SALTY , T; B2TY64 , ULAR_SHIB3 , T; DR Q31TC2 , ULAR_SHIBS , T; Q328K6 , ULAR_SHIDS , T; DR Q0SX94 , ULAR_SHIF8 , T; Q83P30 , ULAR_SHIFL , T; DR Q3YUF6 , ULAR_SHISS , T; P44978 , Y1009_HAEIN, T; DR Q8CSL5 , Y1102_STAES, T; P76034 , YCIT_ECOLI , T; DR P94433 , YCNK_BACSU , T; P77721 , YDJF_ECOLI , T; DR P52133 , YFJR_ECOLI , T; P52598 , YGBI_ECOLI , T; DR O34920 , YOBV_BACSU , T; O32067 , YTZE_BACSU , T; DR O05261 , YULB_BACSU , T; DR O34994 , CCPN_BACSU , N; P15281 , SP3D_BACSU , N; PR PRU00349; DO PDOC00696; //