ID MBD; MATRIX. AC PS50982; DT 01-APR-2004 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 23-FEB-2022 INFO UPDATE. DE Methyl-CpG-binding domain (MBD) profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=72; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=72; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0709381; R2=0.0165134; TEXT='NScore'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=360; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='R'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=148; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='RR'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: M=-9,-11,-26,-11,-12,-7,-18,-14,-3,-10,-2,0,-12,-21,-11,-10,-13,-9,-2,-4,-2,-12; MA /M: SY='A'; M=2,-3,-18,-5,1,-19,-15,-7,-14,-1,-13,-9,-3,-13,-3,-1,0,-2,-8,-26,-12,-2; MA /M: SY='N'; M=-7,2,-24,0,2,-16,-13,-8,-12,-3,-12,-9,5,-15,-3,-1,-1,-2,-11,-27,-12,-1; MA /M: M=-4,-5,-24,-3,-4,-16,-12,-13,-9,-5,-7,-6,-8,-11,-9,-9,-7,-6,-5,-24,-10,-7; MA /M: SY='K'; M=-5,-3,-22,-4,3,-20,-13,-7,-19,4,-18,-10,-2,-12,1,3,-1,-3,-15,-17,-11,1; MA /M: SY='P'; M=-8,-8,-26,-4,7,-14,-17,-10,-16,-5,-15,-10,-9,9,-3,-6,-2,-3,-15,-23,-13,1; MA /M: SY='N'; M=-8,2,-21,0,-5,-13,-13,-8,-11,-7,-7,-7,3,-16,-7,-6,-5,-4,-11,-25,-9,-6; MA /M: M=-7,-7,-11,-6,-4,-21,-15,-2,-18,-9,-15,-11,-6,-3,-7,-7,-8,-11,-16,-26,-14,-8; MA /M: M=-5,-9,-25,-9,-5,-15,-8,-13,-13,-9,-11,-7,-8,-2,-8,-10,-5,-5,-11,-20,-14,-7; MA /M: SY='P'; M=-5,-16,-29,-15,-8,-18,-8,-16,-20,-5,-21,-14,-13,9,-6,-4,-8,-10,-20,1,-11,-9; MA /M: SY='L'; M=-5,-27,-20,-28,-19,4,-27,-21,15,-26,34,14,-26,-19,-19,-20,-23,-7,9,-21,-4,-19; MA /M: SY='P'; M=-8,-16,-36,-9,2,-26,-16,-17,-17,-10,-21,-14,-17,59,-7,-17,-9,-10,-25,-28,-25,-6; MA /M: SY='E'; M=-8,-1,-21,3,4,-23,-16,-4,-21,2,-19,-13,-4,0,1,-2,-4,-7,-18,-25,-10,1; MA /M: SY='G'; M=-1,-7,-29,-5,-15,-30,58,-18,-39,-16,-30,-20,1,-17,-17,-17,1,-18,-29,-22,-28,-16; MA /M: SY='W'; M=-19,-38,-44,-39,-29,12,-21,-29,-19,-20,-18,-19,-38,-28,-21,-20,-37,-27,-27,133,27,-20; MA /M: SY='R'; M=-9,-9,-26,-11,2,-19,-23,-8,-8,7,-10,-3,-6,-14,7,11,-6,-4,-7,-23,-9,2; MA /M: SY='R'; M=-14,-12,-26,-13,-4,-15,-22,-8,-15,21,-13,-1,-6,-19,2,37,-11,-8,-7,-21,-8,-4; MA /M: SY='E'; M=-10,-2,-25,2,23,-20,-21,-1,-16,4,-8,-5,-6,-11,9,1,-6,-9,-15,-27,-12,16; MA /M: SY='V'; M=-8,-15,-20,-17,-8,0,-26,-16,8,-14,7,4,-15,-20,-13,-13,-9,0,10,-22,-3,-11; MA /M: SY='R'; M=-10,-14,-21,-15,-10,-6,-23,-7,-5,4,-8,-2,-11,-22,-7,13,-9,-5,2,-16,4,-11; MA /M: SY='I'; M=-7,-18,-24,-22,-12,-5,-24,-14,5,-13,-1,2,-13,-5,-6,-11,-10,-7,0,-20,-6,-11; MA /M: SY='R'; M=-12,-7,-25,-9,-3,-22,-7,-5,-28,17,-21,-10,1,-17,4,37,-6,-8,-20,-22,-14,-3; MA /I: I=-4; MD=-9; MA /M: SY='K'; M=-7,-1,-21,-3,0,-19,-4,-7,-21,16,-19,-9,3,-9,1,16,-2,-5,-15,-18,-11,0; D=-4; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; MA /M: SY='G'; M=-2,-5,-15,-7,-6,-14,12,-10,-17,-6,-16,-10,1,-14,-8,-7,1,-7,-12,-19,-14,-7; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='G'; M=0,0,-17,-3,-5,-16,6,-9,-17,-4,-13,-10,5,-13,-5,-4,4,1,-13,-22,-14,-5; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='N'; M=-5,7,-20,5,-4,-19,7,-2,-23,-6,-22,-14,11,-15,-4,-4,8,0,-18,-28,-15,-4; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='A'; M=2,-5,-15,-9,-6,-15,-6,-8,-15,-3,-13,-7,-2,-14,-4,-3,0,-1,-10,-21,-9,-6; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='G'; M=-6,-10,-25,-12,-14,-15,9,-13,-13,-9,-12,-5,-5,-19,-11,-8,-5,-8,-10,-15,-11,-13; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='R'; M=-10,-6,-26,-8,0,-15,-17,-4,-21,20,-18,-6,-3,-13,6,21,-7,-6,-15,-18,-5,2; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='M'; M=-1,-15,-20,-18,-14,-5,-8,-15,-4,-9,-6,1,-10,-16,-11,-8,-4,-4,-1,-17,-6,-13; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='D'; M=-15,27,-23,38,19,-28,-14,4,-32,-1,-24,-22,10,-12,2,-8,-2,-10,-26,-31,-10,9; MA /M: SY='V'; M=-3,-20,-18,-22,-18,-7,-26,-22,10,-8,-1,3,-18,-15,-16,-6,-7,2,20,-26,-10,-18; MA /M: SY='Y'; M=-11,-21,-25,-23,-18,19,-27,0,3,-15,3,1,-18,-26,-15,-13,-14,-7,-1,8,36,-18; MA /M: SY='Y'; M=-19,-22,-27,-24,-21,33,-30,9,2,-13,4,1,-20,-30,-15,-11,-20,-10,-5,20,62,-21; MA /M: SY='Y'; M=-10,-20,-20,-25,-20,8,-30,-12,12,-13,3,4,-16,-23,-16,-13,-12,-2,12,-11,15,-20; MA /M: SY='S'; M=5,2,-14,2,1,-19,-5,-10,-19,-8,-19,-15,3,-10,-3,-10,14,6,-13,-31,-15,-2; MA /M: SY='P'; M=-10,-20,-39,-11,-1,-27,-20,-19,-20,-9,-29,-19,-19,83,-10,-17,-10,-10,-29,-29,-28,-10; MA /M: SY='T'; M=-2,-5,5,-9,-10,-19,-13,-17,-14,-11,-17,-12,-2,-14,-9,-12,7,8,-6,-34,-18,-10; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; MA /M: SY='G'; M=-2,-8,-29,-9,-16,-27,54,-16,-35,-16,-27,-16,1,-19,-16,-14,0,-16,-26,-21,-26,-16; MA /M: SY='K'; M=-10,-4,-26,-4,4,-17,-20,-4,-18,19,-15,-6,-2,-15,4,17,-8,-6,-14,-19,-2,3; MA /M: SY='K'; M=-6,-5,-21,-6,4,-22,-19,-10,-20,17,-19,-9,-2,-12,4,17,-2,-2,-12,-25,-13,3; MA /M: SY='F'; M=-12,-27,-21,-33,-24,36,-29,-20,13,-28,24,11,-22,-27,-27,-21,-22,-10,7,-8,12,-24; MA /M: SY='R'; M=-13,-7,-26,-7,2,-17,-18,-1,-25,18,-19,-10,0,-16,7,38,-2,-2,-17,-23,-8,2; MA /M: SY='S'; M=3,1,-10,-3,-2,-20,-5,-9,-18,-8,-24,-14,8,-12,2,-7,25,17,-12,-35,-17,0; MA /M: SY='K'; M=-10,-11,-20,-14,-5,-10,-23,-10,-11,12,-7,1,-8,-18,-1,12,-12,-7,-8,-19,-4,-4; MA /M: SY='P'; M=-5,-5,-26,-4,3,-21,-14,-9,-16,2,-19,-10,-3,4,0,-1,-1,-5,-13,-27,-16,0; MA /M: SY='E'; M=-7,11,-27,18,33,-32,-15,1,-27,5,-23,-16,4,-4,23,-1,5,-6,-27,-30,-18,28; MA /M: SY='V'; M=-2,-26,-17,-28,-24,0,-28,-25,22,-22,18,11,-26,-24,-23,-20,-15,-4,27,-21,-6,-24; MA /M: SY='A'; M=3,-11,-20,-13,-4,-11,-19,-10,-2,-9,0,0,-10,-16,-5,-11,-4,-3,-1,-24,-8,-5; MA /M: SY='R'; M=-7,-7,-23,-8,-1,-18,-18,-2,-18,9,-12,-7,-3,-15,5,20,-6,-6,-15,-22,-8,0; MA /M: SY='Y'; M=-18,-20,-29,-21,-19,27,-27,14,-1,-11,-1,0,-18,-28,-11,-11,-18,-11,-9,20,62,-19; MA /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-29,-21,7,-28,-21,20,-28,37,16,-27,-26,-20,-20,-24,-8,13,-21,-2,-21; MA /M: SY='E'; M=-6,-1,-26,-1,7,-17,-4,-5,-22,0,-15,-11,0,-14,2,-1,-3,-9,-19,-23,-12,4; MA /M: SY='S'; M=0,0,-21,-2,6,-19,-10,-6,-19,0,-19,-13,2,-10,1,-3,7,3,-14,-24,-13,3; MA /M: SY='N'; M=-2,1,-17,-4,-4,-19,-1,-2,-17,-10,-17,-9,7,-16,-3,-10,5,1,-14,-29,-14,-4; MA /M: M=-8,-10,-23,-11,-6,-16,-6,-14,-13,-5,-12,-4,-8,-1,-7,-7,-7,-8,-11,-25,-15,-8; MA /M: SY='D'; M=-9,6,-18,9,2,-21,-12,-12,-13,-9,-14,-12,2,-12,-7,-13,-1,-5,-10,-32,-17,-3; MA /M: M=-8,-5,-16,-7,-5,-12,-13,-5,-12,-8,-8,-6,-3,-16,-5,-8,-2,0,-11,-25,-6,-6; MA /M: M=-8,-9,-23,-10,-5,-11,-15,-9,-13,-2,-13,-8,-4,-6,-6,0,-2,-2,-11,-23,-7,-7; MA /I: I=-7; MD=-15; MA /M: M=-6,-10,-7,-13,-10,-2,-18,-10,-7,-11,-3,-5,-8,-19,-12,-8,-6,-3,-4,-21,-3,-12; D=-7; MA /I: I=-7; MD=-15; MA /M: M=0,-3,-18,-3,-3,-12,-10,-11,-10,-4,-9,-7,-4,-10,-5,-5,0,-1,-6,-21,-10,-4; D=-7; MA /I: I=-7; MD=-15; MA /M: M=-6,-5,-16,-5,-2,-11,-12,-9,-9,-5,-7,-6,-4,-8,-5,-3,-2,-1,-6,-21,-9,-4; D=-7; MA /I: I=-7; MD=-15; MA /M: SY='E'; M=-6,-1,-13,0,2,-13,-14,-8,-6,-1,-7,-4,-2,-9,-2,-3,-3,-4,-4,-21,-9,0; D=-7; MA /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; MA /M: SY='N'; M=-4,9,-19,8,6,-19,-10,6,-15,-4,-14,-8,10,-12,4,-5,3,-4,-14,-28,-11,5; D=-7; MA /I: I=-7; DM=-15; MA /M: SY='F'; M=-15,-24,-7,-31,-24,46,-24,-16,-6,-24,2,-2,-17,-26,-30,-18,-15,-9,-4,-2,18,-24; MA /M: SY='D'; M=-8,25,-19,33,9,-28,-10,-4,-27,-4,-24,-22,14,-13,-1,-10,7,-3,-20,-35,-16,4; MA /M: SY='F'; M=-13,-22,-22,-30,-23,39,-22,-17,-2,-23,4,-2,-14,-26,-26,-16,-14,-7,-3,5,14,-22; MA /M: SY='R'; M=-6,3,-19,1,2,-22,-8,-4,-25,4,-22,-14,6,-13,3,10,5,2,-19,-28,-14,1; MA /M: SY='T'; M=0,-7,-18,-10,-7,-16,-18,-16,-7,-8,-12,-8,-5,0,-6,-9,6,12,-4,-29,-15,-8; MA /M: SY='D'; M=-7,2,-28,5,1,-25,4,-4,-27,-4,-22,-15,1,-4,-2,-5,-1,-9,-23,-25,-14,-2; MA /M: SY='K'; M=-5,-4,-23,-5,-3,-18,-15,-7,-12,4,-10,-4,-4,-16,-3,3,-6,-6,-6,-26,-11,-4; MA /M: SY='P'; M=-6,-9,-24,-12,-8,-14,-19,-10,-6,-4,-10,-1,-5,1,-5,-4,-3,0,-6,-26,-11,-8; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2022_01,566996; NR /TOTAL=47(45); /POSITIVE=47(45); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=4; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=3; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=MBD; CC /VERSION=4; DR Q9UIF9 , BAZ2A_HUMAN, T; Q91YE5 , BAZ2A_MOUSE, T; DR B7ZS37 , BAZ2A_XENLA, T; Q9DE13 , BAZ2B_CHICK, T; DR Q9UIF8 , BAZ2B_HUMAN, T; A2AUY4 , BAZ2B_MOUSE, T; DR Q23590 , BAZ2_CAEEL , T; Q9XI36 , MBD10_ARATH, T; DR Q9LW00 , MBD11_ARATH, T; Q9FZP6 , MBD12_ARATH, T; DR Q9LTJ8 , MBD13_ARATH, T; Q5XEN5 , MBD1_ARATH , T; DR Q9UIS9 , MBD1_HUMAN , T; Q9Z2E2 , MBD1_MOUSE , T; DR Q8LA53 , MBD2_ARATH , T; Q9UBB5 , MBD2_HUMAN , T; DR Q9Z2E1 , MBD2_MOUSE , T; Q4PSK1 , MBD3_ARATH , T; DR O95983 , MBD3_HUMAN , T; Q9Z2D8 , MBD3_MOUSE , T; DR Q9LYB9 , MBD4_ARATH , T; O95243 , MBD4_HUMAN , T; DR Q9Z2D7 , MBD4_MOUSE , T; Q9SNC0 , MBD5_ARATH , T; DR Q9P267 , MBD5_HUMAN , T; B1AYB6 , MBD5_MOUSE , T; DR Q9LTJ1 , MBD6_ARATH , T; Q96DN6 , MBD6_HUMAN , T; DR Q3TY92 , MBD6_MOUSE , T; Q9FJF4 , MBD7_ARATH , T; DR Q9LME6 , MBD8_ARATH , T; Q9SGH2 , MBD9_ARATH , T; DR P51608 , MECP2_HUMAN, T; Q95LG8 , MECP2_MACFA, T; DR Q9Z2D6 , MECP2_MOUSE, T; Q00566 , MECP2_RAT , T; DR P34544 , MET2_CAEEL , T; Q32KD2 , SETB1_DROME, T; DR Q28Z18 , SETB1_DROPS, T; Q15047 , SETB1_HUMAN, T; DR O88974 , SETB1_MOUSE, T; Q6INA9 , SETB1_XENLA, T; DR Q96T68 , SETB2_HUMAN, T; Q8C267 , SETB2_MOUSE, T; DR A4IGY9 , SETB2_XENTR, T; DR Q06ZW3 , SETB2_DANRE, N; Q6YI93 , SETB2_XENLA, N; DR Q1L8U8 , STB1A_DANRE, N; Q08BR4 , STB1B_DANRE, N; 3D 1D9N; 1IG4; 1QK9; 2MB7; 2MOE; 3C2I; 3VXV; 3VXX; 3VYB; 3VYQ; 4LG7; 5AGQ; 3D 5BT2; 6ACV; 6C1A; 6C1T; 6C1U; 6C1V; 6C1Y; 6C2F; 6CC8; 6CCG; 6CEU; 6CEV; 3D 6CNP; 6CNQ; 6D1T; 6OGJ; 6OGK; 6YWW; 7AO8; 7AO9; 7AOA; 7D8K; 7MWK; 7MWL; 3D 7MWM; 7RAY; PR PRU00338; DO PDOC50982; //