ID   ZF_SWIM; MATRIX.
AC   PS50966;
DT   01-MAR-2004 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 23-FEB-2022 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger SWIM-type profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1868844; R2=0.0123659; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=471; N_SCORE=8.0; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=349; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-100; B1=-150; E0=-100; E1=-110; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-21,-26,-24,-20,30,-28,-9,0,-15,1,1,-17,-27,-16,-13,-17,-9,4,-2,47,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-7,-24,-7,2,-12,-19,-6,-13,2,-11,-6,-6,-14,1,5,-2,13,-10,-20,-6,1;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-25,-9,-28,-26,-3,-29,-26,23,-19,8,8,-24,-26,-24,-19,-8,2,35,-29,-9,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-4,-23,-5,0,-15,-16,-3,-12,-2,-12,-5,-2,-14,2,-1,-1,-1,-10,-22,-7,0;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-23,-20,-26,-20,0,-24,-18,16,-21,12,8,-20,-23,-17,-19,-14,-7,14,-18,-2,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-7,6,-23,8,4,-22,-5,-7,-21,-2,-18,-13,3,-13,-1,-5,0,-5,-17,-26,-13,1;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-8,-20,-9,-6,-6,-14,-11,-4,-9,1,-1,-7,-15,-7,-8,-7,-5,-4,-18,-6,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-6,7,-21,9,6,-20,-7,-4,-20,2,-18,-13,6,-9,1,0,1,-3,-16,-24,-12,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-5,6,-18,7,4,-19,-5,-5,-18,1,-15,-11,6,-8,0,-1,0,-3,-15,-24,-13,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-4,2,-18,3,2,-16,-3,-6,-17,-1,-15,-10,0,-9,-3,-3,-1,-5,-13,-21,-11,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-19,1,2,-12,-11,-5,-13,-2,-11,-8,-1,-10,-2,-2,-1,-1,-10,-18,-5,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21;
MA   /M: M=-4,-8,-15,-9,-5,-6,-10,-10,-2,-7,-2,-2,-7,-13,-7,-7,-5,-4,0,-13,-5,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-18,-1,1,-14,-7,-5,-13,-2,-12,-7,0,-10,-1,-3,0,-2,-10,-20,-8,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: M=0,-10,-13,-13,-12,-11,-9,-11,-11,-10,-13,-8,-6,-16,-10,-9,-1,-3,-7,-19,-7,-12;
MA   /M: SY='S'; M=-6,-2,-21,-3,0,-10,-16,-4,-17,1,-16,-11,0,-15,-1,1,3,3,-13,-20,-1,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-30,-30,140,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=3,5,-15,20,1,-19,-7,-11,-18,-8,-21,-16,15,-10,-3,-10,62,59,-10,-35,-17,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-30,-30,140,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-8,-26,-5,2,-23,-12,-10,-22,1,-22,-14,-6,18,-2,0,-3,-6,-21,-26,-17,-2;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: M=-4,-4,-19,-4,-4,-11,-12,-6,-13,-4,-11,-7,-4,-17,-4,-5,-4,-6,-10,-14,-3,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-18,-22,-21,-18,25,-15,-11,-7,-17,-3,-4,-14,-18,-19,-14,-14,-10,-8,19,16,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-19,3,10,-18,-12,-3,-14,3,-11,-7,1,-8,10,0,-1,-4,-14,-20,-10,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-2,-19,-4,-3,-9,-11,1,-13,-2,-10,-6,0,-16,-2,1,-2,-2,-12,-18,-1,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-26,-5,-6,-23,17,-2,-29,-2,-24,-14,4,-15,-5,-1,0,-10,-23,-23,-15,-6;
MA   /M: M=-8,-12,-26,-15,-14,-4,-9,-10,-4,-13,-4,-3,-7,-17,-12,-11,-10,-8,-7,-13,0,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-15,-26,-14,-10,-10,-22,-14,-5,-13,-6,-4,-15,23,-11,-15,-13,-9,-10,-18,-7,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-30,-30,140,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-6,-22,-7,2,-21,-18,-8,-20,19,-21,-9,-2,-13,4,16,-2,-4,-13,-22,-9,2;
MA   /M: SY='H'; M=-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,140,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=3,-22,-17,-28,-21,-6,-3,-22,19,-19,10,11,-18,-21,-14,-19,-11,-5,17,-22,-7,-19;
MA   /M: SY='L'; M=10,-24,-17,-28,-21,1,-4,-28,16,-21,17,9,-22,-34,-18,-19,-14,-6,16,-18,-1,-21;
MA   /M: SY='A'; M=27,-10,-14,-17,-9,-16,5,-24,-12,-7,-11,-8,-8,-13,-9,-11,-5,-1,-4,-20,-14,-10;
MA   /M: SY='V'; M=15,-24,-13,-26,-22,-10,-3,-24,16,-20,13,7,-23,-24,-21,-20,-8,-5,25,-25,-9,-22;
MA   /M: SY='L'; M=5,-19,-18,-23,-14,4,-23,-13,6,-15,12,7,-17,-22,-13,-13,-14,-7,4,-16,3,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-15,-22,-18,0,1,-24,-8,3,-13,9,5,-12,-22,2,-9,-13,-5,-1,-15,6,-11;
MA   /M: SY='A'; M=1,-8,-18,-11,-6,-11,-14,-1,-5,-5,-5,-4,-5,-17,-3,-4,0,-1,-8,-22,-3,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-17,-14,-20,-14,-3,-22,-11,0,-10,6,6,-15,-22,-10,-7,-12,-7,3,-14,3,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-1,-21,-4,-1,-18,-5,-7,-17,-1,-14,-9,2,-17,-1,-2,-2,-6,-15,-24,-11,-2;
MA   /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2022_01,566996;
NR   /TOTAL=48(47); /POSITIVE=47(46); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=1(1);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=A?EP?; /MAX-REPEAT=2;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=SWIM-type;
CC   /VERSION=4;
DR   Q9SWG3    , FAR1_ARATH , T; Q9LIE5    , FHY3_ARATH , T;
DR   Q9LKR4    , FRS10_ARATH, T; Q9SY66    , FRS11_ARATH, T;
DR   Q3E7I5    , FRS12_ARATH, T; Q5UBY2    , FRS1_ARATH , T;
DR   Q3EBQ3    , FRS2_ARATH , T; Q9ZVC9    , FRS3_ARATH , T;
DR   Q6NQJ7    , FRS4_ARATH , T; Q9SZL8    , FRS5_ARATH , T;
DR   Q9SSQ4    , FRS6_ARATH , T; Q9M8J3    , FRS7_ARATH , T;
DR   Q9S793    , FRS8_ARATH , T; Q9SZL7    , FRS9_ARATH , T;
DR   Q55DJ8    , IRLC_DICDI , T; Q13233    , M3K1_HUMAN , T;
DR   P53349    , M3K1_MOUSE , T; Q62925    , M3K1_RAT   , T;
DR   O13600    , SWS1_SCHPO , T; P47264    , Y018_MYCGE , T;
DR   P75093    , Y020_MYCPN , T; O29156    , Y1109_ARCFU, T;
DR   Q58888    , Y1493_METJA, T; O53500    , Y2102_MYCTU, T;
DR   P33353    , YEHQ_ECOLI , T; P96714    , YWQB_BACSU , T;
DR   Q9BR11    , ZSWM1_HUMAN, T; Q9CWV7    , ZSWM1_MOUSE, T;
DR   Q8NEG5    , ZSWM2_HUMAN, T; Q9D9X6    , ZSWM2_MOUSE, T;
DR   Q96MP5    , ZSWM3_HUMAN, T; Q8CFL8    , ZSWM3_MOUSE, T;
DR   Q9H7M6    , ZSWM4_HUMAN, T; Q8C7B8    , ZSWM4_MOUSE, T;
DR   Q9P217    , ZSWM5_HUMAN, T; Q80TC6    , ZSWM5_MOUSE, T;
DR   Q9HCJ5    , ZSWM6_HUMAN, T; Q80TB7    , ZSWM6_MOUSE, T;
DR   A4FVI0    , ZSWM7_DANRE, T; Q55FI7    , ZSWM7_DICDI, T;
DR   Q19AV6    , ZSWM7_HUMAN, T; Q9CWQ2    , ZSWM7_MOUSE, T;
DR   A7E305    , ZSWM8_BOVIN, T; Q9VWN9    , ZSWM8_DROME, T;
DR   A7E2V4    , ZSWM8_HUMAN, T; Q3UHH1    , ZSWM8_MOUSE, T;
DR   Q5V5N9    , SYE_HALMA  , F;
PR   PRU00325;
DO   PDOC50966;
//
