ID   GRAM_POS_ANCHORING; MATRIX.
AC   PS50847;
DT   01-MAY-2002 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 23-FEB-2022 INFO UPDATE.
DE   Gram-positive cocci surface proteins LPxTG motif profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9159126; R2=0.0060830; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3385.1904297; R2=0.9610918; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=918; H_SCORE=4267; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=590; H_SCORE=3952; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-49; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='L'; M=-97,-99,-115,-107,-70,-116,-98,-62,-108,97,-58,-114,-114,-101,-105,-107,-93,-69,-101,-83;
MA   /M: SY='P'; M=5,-117,-97,-86,-115,-95,-99,-103,-93,-112,-99,-101,127,-95,-104,-24,-87,-105,-109,-112;
MA   /M: SY='D'; M=-12,-105,48,42,-104,-96,-3,-101,39,-31,-94,25,-95,41,-7,5,3,-33,-110,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-21,-91,-88,-90,-98,-97,-98,-89,-87,-93,-90,-77,-89,-92,-96,-66,120,-81,-118,-96;
MA   /M: SY='G'; M=-27,-105,-93,-104,-112,104,-99,-119,-98,-115,-104,-9,-98,-96,-105,-32,-96,-112,-104,-107;
MA   /I: I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65;
MA   /M: SY='E'; M=2,-102,60,61,-6,-93,-87,-101,-40,-75,-98,36,-94,-79,-41,32,22,-28,-113,-96;
MA   /M: SY='N'; M=-19,-101,5,42,-106,3,14,-32,30,-103,-96,53,-94,-38,-25,33,32,-52,-113,-97;
MA   /M: SY='D'; M=5,-103,49,4,-101,14,-89,11,-13,-46,-5,30,-30,13,-19,29,4,-64,-110,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-29,-99,-17,9,-61,-38,-20,-25,-19,-50,8,62,7,-39,-90,43,51,-31,-108,14;
MA   /M: SY='N'; M=-1,-102,1,-19,16,-78,-10,0,-21,7,-17,54,11,5,-13,21,-55,11,-8,-38;
MA   /M: SY='F'; M=3,-102,-27,-61,34,-1,-93,13,-18,28,-81,26,8,-6,-19,-10,-7,-25,10,15;
MA   /M: SY='M'; M=18,-100,-101,-98,28,16,-95,-8,-43,40,53,-32,8,-41,-99,3,20,-80,-100,-28;
MA   /M: SY='T'; M=35,-97,-96,-34,2,-27,9,-36,-39,25,2,-56,6,-32,-96,-17,64,-16,9,-89;
MA   /M: SY='L'; M=33,-99,-107,-102,-16,-20,-102,32,-101,55,-24,-101,-105,-98,-103,-61,19,13,38,-24;
MA   /M: SY='G'; M=37,-100,-104,-101,29,38,-101,4,-101,30,-3,-97,19,-98,-104,-27,-88,24,-101,-88;
MA   /I: I=-20; MD=-50;
MA   /M: SY='G'; M=24,-105,-104,-105,30,68,-104,-48,-25,9,-91,-93,-105,-101,-105,-36,-22,-21,14,-93; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-50;
MA   /M: SY='L'; M=38,-105,-73,-106,-94,37,-104,-28,-106,42,-1,-101,-109,-101,-108,2,-93,-4,-109,-28; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-50;
MA   /M: SY='T'; M=21,-118,-125,-122,-43,-34,-124,-7,-120,-1,-6,-117,-123,-119,-124,-40,22,20,-130,-113; D=-20;
MA   /I: I=-20; MI=0; MD=-50; IM=0; DM=-50;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-99,-109,-104,31,-16,-98,18,-103,60,63,-102,-107,-98,-103,-3,-24,9,-100,-81;
MA   /M: SY='L'; M=27,-98,-107,-102,13,-16,-99,6,-101,57,36,-100,-105,-97,-102,7,-21,23,-102,-85;
MA   /M: SY='G'; M=39,10,-99,-99,-25,44,-100,-5,-97,22,-12,-90,-100,-95,-102,16,31,4,-106,-94;
MA   /M: SY='L'; M=36,-98,-107,-102,-33,-9,-102,39,-102,54,5,-100,-105,-97,-103,0,-46,19,-104,-89;
MA   /M: SY='G'; M=26,-100,-100,-100,-7,59,-100,-13,-43,19,4,-90,-101,-95,-101,22,-17,12,-105,-94;
MA   /M: SY='G'; M=12,12,-95,-49,-30,78,-98,-29,-97,-7,-94,-85,-99,-94,-103,31,5,-95,-104,-24;
MA   /M: SY='L'; M=42,-98,-104,-99,-83,-63,9,12,-100,59,-17,-98,-104,-95,-101,7,12,0,-106,-44;
MA   /M: SY='F'; M=9,-17,-108,-104,48,7,-98,-1,-44,34,22,-101,-108,-100,-39,-47,-48,40,-95,23;
MA   /M: SY='L'; M=11,-102,-109,-105,14,-1,-100,36,-101,61,-71,-104,-109,-52,-15,-47,-58,-15,-98,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-104,-108,-102,35,-30,-95,21,-15,41,-12,-102,-37,-97,4,-48,-56,10,-6,55;
MA   /M: SY='K'; M=7,-104,-97,-90,-4,15,11,-39,48,-20,-5,-89,-102,-85,43,-22,-4,18,-102,15;
MA   /M: SY='R'; M=-24,-108,-91,-49,-15,-60,-88,-105,68,-49,-94,-28,-101,-15,84,-11,-29,-55,-105,-93;
MA   /M: SY='K'; M=-39,-109,-33,-80,-29,-37,-86,-109,76,-107,-97,30,-3,-75,75,-33,-90,-105,-105,-36;
MA   /M: SY='R'; M=-55,-110,-87,6,-108,-103,-3,-111,70,-106,-96,-27,-99,7,87,-88,-8,-105,-107,-95;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-112,-5,32,-40,-104,-92,-47,79,-109,-100,-25,-24,-77,46,-91,-43,-105,-110,-100;
MA   /M: SY='N'; M=-56,-112,-12,29,-115,-7,-4,-44,-7,-60,-103,67,-106,34,9,17,-92,-63,-121,-105;
MA   /M: SY='N'; M=-24,-118,29,-24,-121,-16,14,-116,15,-73,-112,31,-113,-11,-58,25,-25,-24,-130,-112;
MA   /M: SY='K'; M=-120,-137,5,-21,-139,-26,-16,-135,38,-137,-129,0,-128,-108,-17,-7,-116,-38,-143,-128;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-144,-11,-123,-146,-135,-131,-32,19,-140,-134,15,-141,-122,-13,-125,-127,-52,-153,-139;
MA   /M: SY='K'; M=-147,-160,-46,8,-18,-155,-140,-158,9,-155,-150,-30,-149,-129,-24,-140,-39,-155,-157,-143;
MA   /M: SY='H'; M=-162,-174,-60,-70,-164,-170,4,-160,-27,-30,-149,-64,-168,-1,-147,-155,-56,-162,-178,-156;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
NR   /RELEASE=2022_01,566996;
NR   /TOTAL=203(203); /POSITIVE=203(203); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=2;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=???P?; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=MOTIF; /FT_DESC=LPXTG sorting signal;
CC   /VERSION=8;
DR   P13050    , ARP4_STRPY , T; P17953    , ASA1_ENTFA , T;
DR   P27951    , BAG_STRAG  , T; Q6GJA6    , BBP_STAAR  , T;
DR   Q14U76    , BBP_STAAU  , T; Q02192    , BCA_STRA1  , T;
DR   P58099    , C5AP_STRP1 , T; P0DD34    , C5AP_STRP3 , T;
DR   Q5X9R0    , C5AP_STRP6 , T; Q8NZ80    , C5AP_STRP8 , T;
DR   P0DD35    , C5AP_STRPQ , T; P15926    , C5AP_STRPY , T;
DR   Q8CJY7    , CHPA_STRCO , T; Q9X7U2    , CHPB_STRCO , T;
DR   Q9AD93    , CHPC_STRCO , T; Q2G015    , CLFA_STAA8 , T;
DR   Q5HHM8    , CLFA_STAAC , T; Q53653    , CLFA_STAAE , T;
DR   Q932C5    , CLFA_STAAM , T; Q99VJ4    , CLFA_STAAN , T;
DR   Q6GIK4    , CLFA_STAAR , T; Q6GB45    , CLFA_STAAS , T;
DR   Q8NXJ1    , CLFA_STAAW , T; Q2FUY2    , CLFB_STAA8 , T;
DR   Q5HCR7    , CLFB_STAAC , T; O86476    , CLFB_STAAE , T;
DR   Q99R07    , CLFB_STAAM , T; Q7A382    , CLFB_STAAN , T;
DR   Q6GDH2    , CLFB_STAAR , T; Q6G644    , CLFB_STAAS , T;
DR   Q8NUL0    , CLFB_STAAW , T; Q53654    , CNA_STAAU  , T;
DR   P39653    , DEXT_STRDO , T; Q54443    , DEXT_STRMU , T;
DR   A1C3L3    , FAP1_STRPA , T; O70022    , FBE_STAEP  , T;
DR   P18477    , FM1_ACTVI  , T; P12616    , FM2_ACTNA  , T;
DR   A7X6I5    , FNBA_STAA1 , T; Q2FE03    , FNBA_STAA3 , T;
DR   P14738    , FNBA_STAA8 , T; Q2YW62    , FNBA_STAAB , T;
DR   Q5HD51    , FNBA_STAAC , T; Q99RD2    , FNBA_STAAM , T;
DR   Q7A3J7    , FNBA_STAAN , T; Q6GDU5    , FNBA_STAAR , T;
DR   Q6G6H3    , FNBA_STAAS , T; Q8NUU7    , FNBA_STAAW , T;
DR   A0A0H2XKG3, FNBB_STAA3 , T; Q03174    , FRUA_STRMU , T;
DR   A9WNA0    , GH101_RENSM, T; Q2MGH6    , GH101_STRPN, T;
DR   Q8DR60    , GH101_STRR6, T; Q939N5    , GSPB_STRGN , T;
DR   A8AWU7    , HSA_STRGC  , T; Q54873    , HYSA_STRPN , T;
DR   Q97QP7    , IGA1A_STRPN, T; Q54875    , IGA1B_STREE, T;
DR   Q59947    , IGA1_STRR6 , T; Q59986    , IGA1_STRSA , T;
DR   G2K3G6    , INLA_LISM4 , T; Q723K6    , INLA_LISMF , T;
DR   P0DJM0    , INLA_LISMO , T; Q723X5    , INLI_LISMF , T;
DR   Q8YA32    , INLI_LISMO , T; Q71VU0    , INLJ_LISMF , T;
DR   Q8Y3L4    , INLJ_LISMO , T; Q74K42    , INUS_LACJO , T;
DR   A7X148    , ISDA_STAA1 , T; A6U0U7    , ISDA_STAA2 , T;
DR   Q2FHV1    , ISDA_STAA3 , T; Q2FZE9    , ISDA_STAA8 , T;
DR   A5IS16    , ISDA_STAA9 , T; Q2YX95    , ISDA_STAAB , T;
DR   Q5HGV4    , ISDA_STAAC , T; A6QG31    , ISDA_STAAE , T;
DR   Q99UX4    , ISDA_STAAM , T; Q7A655    , ISDA_STAAN , T;
DR   Q6GHV6    , ISDA_STAAR , T; Q6GA85    , ISDA_STAAS , T;
DR   A8Z1R0    , ISDA_STAAT , T; P0C1S5    , ISDA_STAAU , T;
DR   Q7A152    , ISDA_STAAW , T; A7X146    , ISDB_STAA1 , T;
DR   A6U0U6    , ISDB_STAA2 , T; Q2FHV2    , ISDB_STAA3 , T;
DR   Q2FZF0    , ISDB_STAA8 , T; A5IS15    , ISDB_STAA9 , T;
DR   Q2YX96    , ISDB_STAAB , T; Q5HGV5    , ISDB_STAAC , T;
DR   A6QG30    , ISDB_STAAE , T; Q99UX5    , ISDB_STAAM , T;
DR   Q7A656    , ISDB_STAAN , T; Q6GHV7    , ISDB_STAAR , T;
DR   Q6GA86    , ISDB_STAAS , T; P0C7J5    , ISDB_STAAT , T;
DR   Q8NX66    , ISDB_STAAW , T; Q2FG07    , ISDH_STAA3 , T;
DR   Q2FXJ2    , ISDH_STAA8 , T; Q2YTF7    , ISDH_STAAB , T;
DR   Q5HF43    , ISDH_STAAC , T; Q931P4    , ISDH_STAAM , T;
DR   Q99TD3    , ISDH_STAAN , T; Q6G8J7    , ISDH_STAAS , T;
DR   Q8NW39    , ISDH_STAAW , T; Q70XJ9    , LEVS_FRUSA , T;
DR   D3WYW0    , LEVS_LACGS , T; P19401    , M12_STRPY  , T;
DR   P50468    , M21_STRPY  , T; P50469    , M22_STRPY  , T;
DR   P12379    , M24_STRPY  , T; P16947    , M49_STRP9  , T;
DR   P02977    , M5_STRP5   , T; Q5X9Q9    , M6A_STRP6  , T;
DR   P08089    , M6B_STRPY  , T; A1A278    , MANA_BIFAA , T;
DR   P30141    , MRP4_STRPY , T; P32653    , MRP_STRSU  , T;
DR   P16946    , MX_STRP9   , T; P62575    , NANA_STREE , T;
DR   P62576    , NANA_STRR6 , T; Q07596    , NISP_LACLL , T;
DR   O34313    , NTPES_BACSU, T; P16271    , P1P_LACLC  , T;
DR   P15293    , P2P_LACLC  , T; Q02470    , P2P_LACPA  , T;
DR   P15292    , P3P_LACLS  , T; Q9LBG3    , PAA_STRCG  , T;
DR   Q51911    , PAB_FINMA  , T; P11657    , PAC_STRMG  , T;
DR   A8AZP4    , PADA_STRGC , T; Q9KW51    , PAS_STRIT  , T;
DR   Q8CYC9    , PFBA_STRR6 , T; Q5HJU7    , PLS_STAAC  , T;
DR   Q931E9    , PLS_STAAM  , T; P61598    , PLS_STAAN  , T;
DR   P80544    , PLS_STAAU  , T; Q8NUV0    , PLS_STAAW  , T;
DR   Q8CQD9    , PLS_STAES  , T; A0A0H2URK1, PSRP_STRPN , T;
DR   Q9F930    , PULA_STREE , T; A0A0H2ZL64, PULA_STRP2 , T;
DR   A0A0H2UNG0, PULA_STRPN , T; Q2G2B2    , SASG_STAA8 , T;
DR   Q2FJ79    , SDRC_STAA3 , T; Q2G0L5    , SDRC_STAA8 , T;
DR   Q5HIB4    , SDRC_STAAC , T; O86487    , SDRC_STAAE , T;
DR   Q99W48    , SDRC_STAAM , T; Q7A781    , SDRC_STAAN , T;
DR   Q6GJA7    , SDRC_STAAR , T; Q6GBS6    , SDRC_STAAS , T;
DR   Q8NXX7    , SDRC_STAAW , T; Q2FJ78    , SDRD_STAA3 , T;
DR   Q2G0L4    , SDRD_STAA8 , T; Q5HIB3    , SDRD_STAAC , T;
DR   O86488    , SDRD_STAAE , T; Q99W47    , SDRD_STAAM , T;
DR   Q7A780    , SDRD_STAAN , T; Q6GBS5    , SDRD_STAAS , T;
DR   Q8NXX6    , SDRD_STAAW , T; Q2FJ77    , SDRE_STAA3 , T;
DR   Q5HIB2    , SDRE_STAAC , T; O86489    , SDRE_STAAE , T;
DR   Q932F7    , SDRE_STAAM , T; Q99W46    , SDRE_STAAN , T;
DR   Q6GBS4    , SDRE_STAAS , T; Q8NXX5    , SDRE_STAAW , T;
DR   Q9KI14    , SDRF_STAEP , T; Q8CMP4    , SDRF_STAES , T;
DR   Q9KI13    , SDRG_STAEP , T; Q8KWM1    , SDRI_STASA , T;
DR   P21979    , SPAA_STRDO , T; P23504    , SPAP_STRMU , T;
DR   P02976    , SPA_STAA8  , T; A0A0H3K686, SPA_STAAE  , T;
DR   P0A015    , SPA_STAAM  , T; P99134    , SPA_STAAN  , T;
DR   P38507    , SPA_STAAU  , T; P06654    , SPG1_STRSG , T;
DR   P19909    , SPG2_STRSG , T; P50470    , SPH_STRP1  , T;
DR   Q2FDK5    , SRAP_STAA3 , T; Q2FUW1    , SRAP_STAA8 , T;
DR   Q5HCP3    , SRAP_STAAC , T; Q99QY4    , SRAP_STAAM , T;
DR   Q7A362    , SRAP_STAAN , T; Q6GDE9    , SRAP_STAAR , T;
DR   Q6G620    , SRAP_STAAS , T; Q8VQ99    , SRAP_STAAU , T;
DR   Q8NUJ3    , SRAP_STAAW , T; Q4L9P0    , SRAP_STAHJ , T;
DR   A8AUS0    , SSPA_STRGC , T; A8AUS1    , SSPB_STRGC , T;
DR   P16952    , SSPB_STRGN , T; P49610    , STRH_STRPN , T;
DR   P18481    , TEE6_STRP6 , T; Q4A0V8    , UAFA_STAS1 , T;
DR   P11000    , WAPA_STRMU , T; P54602    , YHCR_BACSU , T;
DR   Q9L7Q2    , ZMPB_STRPN , T; Q8DQN5    , ZMPB_STRR6 , T;
DR   Q97T80    , ZMPC_STRPN , T;
DR   P83330    , M32_STRTR  , P; P49054    , PAM_STRPY  , P;
PR   PRU00477;
DO   PDOC00373;
//
