ID PUM; MATRIX. AC PS50302; DT 01-JAN-2004 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 23-FEB-2022 INFO UPDATE. DE Pumilio RNA-binding repeat profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=36; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4344258; R2=0.0233314; TEXT='NScore'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=218; N_SCORE=7.5; MODE=1; TEXT='R'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=89; N_SCORE=4.5; MODE=1; TEXT='R?'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-30; I=-30; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='E'; M=-2,3,-23,4,15,-24,-12,0,-23,4,-19,-13,3,-9,8,1,3,-4,-19,-27,-13,11; MA /M: SY='L'; M=-9,-27,-21,-32,-24,12,-30,-21,23,-25,25,16,-23,-25,-21,-20,-19,-6,17,-18,2,-23; MA /M: SY='M'; M=-5,-13,-20,-15,-8,-9,-20,-12,-2,-7,0,1,-11,-16,-7,-6,-8,-4,-1,-23,-7,-9; MA /I: I=-8; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='D'; M=-6,4,-26,6,3,-25,3,-8,-26,-2,-24,-16,5,-5,-2,-4,2,-5,-22,-28,-18,0; MA /M: SY='H'; M=-10,6,-22,3,2,-17,-13,14,-20,-1,-18,-10,10,-16,3,1,-1,-6,-20,-26,-3,1; MA /M: SY='L'; M=-6,-25,-12,-29,-22,9,-28,-21,15,-23,17,10,-22,-25,-20,-20,-16,-6,13,-18,1,-22; MA /M: SY='V'; M=-5,-16,-19,-17,-12,-6,-22,-13,4,-12,2,3,-14,-17,-11,-12,-10,-6,6,-22,-3,-13; MA /M: SY='E'; M=-7,0,-24,2,10,-20,-17,-2,-19,4,-17,-10,0,-9,6,2,0,-3,-16,-25,-10,7; MA /M: SY='L'; M=-9,-27,-19,-31,-23,10,-30,-19,21,-25,30,19,-25,-27,-19,-19,-22,-7,14,-18,2,-22; MA /M: SY='A'; M=12,-14,4,-20,-16,-12,-12,-19,-4,-16,-7,-2,-11,-19,-13,-18,4,1,3,-29,-15,-15; MA /M: SY='T'; M=-7,-10,-14,-14,-8,-9,-20,-10,-6,-5,-5,0,-6,-18,-5,-3,-4,2,-3,-25,-7,-7; MA /M: SY='D'; M=-14,28,-25,33,10,-30,-9,15,-30,-2,-26,-19,20,-14,4,-6,3,-6,-27,-35,-12,6; MA /M: SY='K'; M=-8,-6,-27,-5,5,-25,-19,-4,-19,13,-19,-6,-4,0,12,10,-5,-7,-18,-24,-12,7; MA /M: SY='Y'; M=-15,-10,-24,-14,-13,19,-23,11,-7,-14,-5,-4,-5,-24,-11,-10,-11,-8,-11,-2,28,-13; MA /M: SY='G'; M=10,-10,-24,-11,-16,-27,48,-19,-32,-17,-26,-18,-2,-18,-17,-19,4,-12,-22,-21,-27,-16; MA /M: SY='N'; M=-2,7,11,-2,-7,-19,-10,-7,-20,-9,-24,-17,17,-20,-7,-9,14,6,-15,-39,-19,-7; MA /M: SY='Y'; M=-16,-9,-21,-12,-9,0,-22,11,-15,1,-11,-5,-3,-23,-4,10,-12,-10,-15,-8,17,-9; MA /M: SY='V'; M=0,-25,-12,-28,-24,3,-27,-25,20,-20,10,8,-24,-26,-24,-20,-10,-1,30,-24,-5,-24; MA /M: SY='I'; M=-4,-29,-17,-33,-26,4,-31,-26,29,-25,21,15,-26,-26,-23,-23,-18,-6,28,-21,-3,-26; MA /M: SY='Q'; M=-9,0,-27,0,20,-32,-20,4,-18,7,-16,-3,-2,-10,39,5,-2,-9,-24,-22,-11,29; MA /M: SY='K'; M=-9,-4,-24,-5,2,-21,-17,0,-22,19,-20,-8,-1,-14,6,16,-5,-6,-17,-19,-5,3; MA /M: SY='L'; M=-2,-22,2,-28,-21,-1,-25,-20,8,-20,10,7,-19,-25,-18,-19,-13,-6,9,-24,-7,-20; MA /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-33,-24,13,-32,-21,25,-27,30,17,-25,-27,-21,-22,-23,-9,16,-16,5,-23; MA /M: SY='E'; M=-8,9,-27,13,18,-26,-12,-3,-26,7,-21,-15,5,-8,8,2,0,-5,-22,-27,-15,13; MA /M: M=-7,-10,-18,-14,-10,-6,-19,-2,-5,-9,-5,-1,-7,-19,-7,-8,-5,-2,-4,-20,0,-10; MA /M: SY='A'; M=3,-10,-7,-14,-12,-13,-4,-15,-12,-12,-9,-7,-7,-19,-11,-12,-1,-4,-6,-25,-14,-12; MA /M: SY='S'; M=-4,6,-20,6,1,-21,-10,-6,-21,-3,-21,-15,5,-5,-2,-6,7,3,-16,-30,-15,-1; MA /M: SY='E'; M=-5,0,-24,3,6,-20,-12,-9,-19,-1,-17,-13,-3,-3,-1,-5,-1,-3,-15,-26,-13,2; MA /M: SY='E'; M=-3,1,-24,3,8,-23,-12,-6,-20,3,-19,-12,0,-3,1,-1,1,-4,-16,-28,-15,4; MA /M: SY='E'; M=-8,0,-23,1,9,-19,-17,-2,-15,0,-13,-7,-1,-12,9,-2,-3,-6,-14,-24,-8,8; MA /M: SY='R'; M=-8,-9,-24,-11,-2,-16,-21,-9,-10,7,-10,-3,-6,-15,3,11,-7,-6,-8,-22,-8,-1; MA /I: I=-8; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='E'; M=-7,3,-24,5,8,-22,-15,-4,-19,4,-16,-10,1,-11,6,3,-2,-5,-16,-27,-12,6; MA /M: SY='R'; M=-6,-9,-22,-11,-3,-12,-19,-10,-8,-2,-6,-2,-7,-15,-1,2,-6,-4,-7,-22,-8,-3; MA /M: SY='I'; M=-9,-27,-21,-33,-24,7,-32,-21,27,-25,24,18,-23,-25,-19,-22,-20,-8,19,-18,2,-23; MA /M: SY='I'; M=-7,-25,-20,-30,-24,11,-29,-20,20,-22,16,12,-21,-24,-20,-19,-15,-4,18,-16,4,-23; MA /M: SY='D'; M=-6,10,-22,11,11,-25,-10,-3,-24,4,-22,-15,9,-11,6,2,4,-2,-20,-30,-15,8; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2022_01,566996; NR /TOTAL=480(70); /POSITIVE=480(70); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=47; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=P_Bucher, N_Hulo; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=9; CC /FT_KEY=REPEAT; /FT_DESC=Pumilio; CC /VERSION=4; DR Q9N5M6 , FBF1_CAEEL , T; Q09312 , FBF2_CAEEL , T; DR P47135 , JSN1_YEAST , T; O74438 , MCP2_SCHPO , T; DR Q10238 , MPF1_SCHPO , T; P39016 , MPT5_YEAST , T; DR D4AMF9 , NOP9_ARTBC , T; E5QZZ6 , NOP9_ARTGP , T; DR A6S374 , NOP9_BOTFB , T; Q59QH0 , NOP9_CANAL , T; DR C4YEN2 , NOP9_CANAW , T; B9W7H9 , NOP9_CANDC , T; DR C4Y3N8 , NOP9_CLAL4 , T; Q6BRH3 , NOP9_DEBHA , T; DR C4R8S9 , NOP9_KOMPG , T; A3LXG0 , NOP9_PICST , T; DR B6K1Y8 , NOP9_SCHJY , T; D4D9R6 , NOP9_TRIVH , T; DR O61345 , PENG_DROME , T; Q09622 , PUF12_CAEEL, T; DR Q12221 , PUF2_YEAST , T; O94462 , PUF3_SCHPO , T; DR Q07807 , PUF3_YEAST , T; P25339 , PUF4_YEAST , T; DR Q20757 , PUF5_CAEEL , T; O01322 , PUF6_CAEEL , T; DR Q9UU76 , PUF6_SCHPO , T; Q04373 , PUF6_YEAST , T; DR O44169 , PUF7_CAEEL , T; Q9LP21 , PUM10_ARATH, T; DR Q9LDW3 , PUM11_ARATH, T; Q9LVC3 , PUM12_ARATH, T; DR Q9FMH4 , PUM13_ARATH, T; Q4PSD1 , PUM14_ARATH, T; DR P0DN95 , PUM15_ARATH, T; Q9FIE9 , PUM16_ARATH, T; DR Q9C8B8 , PUM17_ARATH, T; Q9LVG3 , PUM18_ARATH, T; DR Q9LSS8 , PUM19_ARATH, T; Q9ZW07 , PUM1_ARATH , T; DR Q2VB19 , PUM1_CHICK , T; Q14671 , PUM1_HUMAN , T; DR Q80U78 , PUM1_MOUSE , T; Q5R5X3 , PUM1_PONAB , T; DR Q66KI6 , PUM1_XENLA , T; Q9XI17 , PUM20_ARATH, T; DR Q9LXC5 , PUM21_ARATH, T; Q9LNI2 , PUM22_ARATH, T; DR Q9C552 , PUM23_ARATH, T; Q9LRZ3 , PUM24_ARATH, T; DR Q9ZW06 , PUM2_ARATH , T; Q8TB72 , PUM2_HUMAN , T; DR Q80U58 , PUM2_MOUSE , T; E3WDQ9 , PUM2_XENLA , T; DR Q9ZW02 , PUM3_ARATH , T; X1WGX5 , PUM3_DANRE , T; DR Q15397 , PUM3_HUMAN , T; Q8BKS9 , PUM3_MOUSE , T; DR Q562C7 , PUM3_RAT , T; Q9SS47 , PUM4_ARATH , T; DR Q9LJX4 , PUM5_ARATH , T; Q9C5E7 , PUM6_ARATH , T; DR Q9C9R6 , PUM7_ARATH , T; Q9LM20 , PUM8_ARATH , T; DR Q1PFN9 , PUM9_ARATH , T; P25822 , PUM_DROME , T; DR Q09829 , YAD3_SCHPO , T; Q92359 , YDHE_SCHPO , T; DR O60059 , YG58_SCHPO , T; Q9P789 , YN8E_SCHPO , T; DR Q9SGH2 , MBD9_ARATH , N; C5G8V2 , NOP9_AJEDR , N; DR Q75C70 , NOP9_ASHGO , N; A1CKL4 , NOP9_ASPCL , N; DR B0XXN5 , NOP9_ASPFC , N; B8N3R8 , NOP9_ASPFN , N; DR Q4WXY3 , NOP9_ASPFU , N; A2R3A7 , NOP9_ASPNC , N; DR Q2UKV0 , NOP9_ASPOR , N; C5JK19 , NOP9_BLAGS , N; DR Q6FUX0 , NOP9_CANGA , N; C5MFB4 , NOP9_CANTT , N; DR C5P9D1 , NOP9_COCP7 , N; E3QZF5 , NOP9_COLGM , N; DR A8P7F7 , NOP9_COPC7 , N; Q5B3J5 , NOP9_EMENI , N; DR C7YQ16 , NOP9_FUSV7 , N; Q86U38 , NOP9_HUMAN , N; DR Q6CNC2 , NOP9_KLULA , N; C5DMC1 , NOP9_LACTC , N; DR E5A2Z3 , NOP9_LEPMJ , N; A5DWG1 , NOP9_LODEL , N; DR Q8BMC4 , NOP9_MOUSE , N; A1D6V7 , NOP9_NEOFI , N; DR Q7S5H0 , NOP9_NEUCR , N; C1H8W8 , NOP9_PARBA , N; DR C1FYU3 , NOP9_PARBD , N; C0S4C4 , NOP9_PARBP , N; DR B6H3T4 , NOP9_PENRW , N; Q0U154 , NOP9_PHANO , N; DR A5DBF4 , NOP9_PICGU , N; B2AL40 , NOP9_PODAN , N; DR B2W8X8 , NOP9_PYRTR , N; E3RP32 , NOP9_PYRTT , N; DR Q92347 , NOP9_SCHPO , N; D1ZSG5 , NOP9_SORMK , N; DR B6Q5P5 , NOP9_TALMQ , N; A7TH34 , NOP9_VANPO , N; DR Q6C9H2 , NOP9_YARLI , N; B3LQ92 , NOP9_YEAS1 , N; DR C7GV42 , NOP9_YEAS2 , N; A6ZPV9 , NOP9_YEAS7 , N; DR C8ZBK1 , NOP9_YEAS8 , N; P47077 , NOP9_YEAST , N; DR C5DQD7 , NOP9_ZYGRC , N; Q9LK18 , PUM25_ARATH, N; DR Q9FGE7 , PUM26_ARATH, N; 3D 1IB2; 1M8W; 1M8X; 1M8Y; 1M8Z; 2YJY; 3BSB; 3BSX; 3BWT; 3BX2; 3BX3; 3GVO; 3D 3GVT; 3H3D; 3K49; 3K4E; 3K5Q; 3K5Y; 3K5Z; 3K61; 3K62; 3K64; 3Q0L; 3Q0M; 3D 3Q0N; 3Q0O; 3Q0P; 3Q0Q; 3Q0R; 3Q0S; 3QG9; 3QGB; 3QGC; 3V6Y; 3V71; 3V74; 3D 4DZS; 4WZR; 4WZW; 5BYM; 5BZ1; 5BZ5; 5BZU; 5BZV; 5KL1; 5KL8; 5KLA; 5SVD; 3D 5WTX; 5WTY; 5WZG; 5WZH; 5WZI; 5WZJ; 5WZK; 5YKH; 5YKI; 6NOC; 6NOF; 6NOH; 3D 6NY5; 6PUN; 6WPI; PR PRU00317; DO PDOC50302; //