ID   G_PATCH; MATRIX.
AC   PS50174;
DT   01-JAN-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 23-FEB-2022 INFO UPDATE.
DE   G-patch domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.0889000; R2=0.0170978; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1365.4576416; R2=4.1952276; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=434; H_SCORE=3186; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=317; H_SCORE=2695; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-23,-4,-2,-19,-12,-11,-13,-5,-15,-10,-5,-2,-4,-9,2,5,-10,-26,-12,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-23,9,10,-25,-2,-4,-24,2,-23,-13,9,-12,5,1,8,-2,-20,-31,-18,7;
MA   /M: SY='N'; M=-5,11,-24,6,-3,-24,7,-7,-25,-4,-28,-19,19,-3,-5,-5,8,0,-24,-32,-22,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-23,-23,-27,-20,1,-30,-23,16,-15,6,6,-19,-11,-18,-14,-13,-3,15,-21,-4,-21;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-24,-11,-15,-25,43,-19,-28,-17,-23,-16,-3,-18,-17,-19,4,-12,-17,-23,-26,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-8,-23,-11,-6,-5,-14,10,-13,-7,-10,-2,-3,-19,-1,-4,-5,-5,-12,-17,5,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-2,-20,-3,6,-28,-17,-7,-26,25,-24,-10,-1,-13,13,23,-4,-8,-19,-23,-13,8;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-24,-20,-29,-20,5,-26,-13,19,-20,28,31,-23,-24,-11,-16,-21,-9,11,-20,0,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-20,-29,-18,4,-26,-11,18,-20,35,35,-25,-25,-8,-15,-25,-10,8,-20,0,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-7,-19,-7,7,-20,-19,-8,-12,-2,-6,-2,-8,-11,9,-1,-5,-5,-11,-25,-13,7;
MA   /M: SY='K'; M=-1,2,-24,0,4,-27,-9,-9,-26,23,-26,-13,4,-12,5,15,2,-3,-18,-25,-14,4;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-17,-16,-24,-16,0,-18,-2,6,-10,8,31,-15,-21,0,-8,-13,-6,0,-16,4,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-34,-43,-35,-27,18,-23,-18,-13,-19,-11,-13,-34,-30,-19,-18,-34,-24,-22,109,40,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-5,-26,-5,5,-20,-19,-8,-21,23,-19,-9,-2,-13,5,23,-3,-1,-14,-22,-8,3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-30,4,25,-27,-15,-9,-22,2,-21,-16,-8,24,6,-7,-4,-9,-23,-27,-21,14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-29,-7,-16,-29,61,-18,-38,-18,-30,-20,3,-19,-17,-18,2,-17,-29,-22,-29,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-27,0,12,-27,-14,1,-21,11,-18,-2,-1,-11,20,8,-3,-6,-20,-24,-11,16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-20,-29,66,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,1,-17,-29,-20,-29,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-9,-24,-9,-1,-17,-19,-6,-15,14,-12,-5,-6,-13,2,11,-6,-5,-11,-21,-5,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-4,6,-23,3,4,-24,-7,4,-23,5,-23,-13,12,-11,6,5,5,-4,-21,-29,-14,4;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-23,3,15,-24,-2,3,-27,-1,-21,-15,5,-8,3,-1,1,-9,-24,-29,-17,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,5,-27,7,13,-31,-17,1,-19,8,-20,-6,3,-7,26,4,-1,-7,-21,-26,-13,19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-29,-7,-13,-29,53,-17,-37,-13,-29,-19,2,-18,-15,-15,0,-17,-28,-21,-27,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-15,-26,-20,-15,-9,-28,-14,18,-17,8,10,-10,-19,-6,-13,-12,-8,7,-24,-4,-13;
MA   /M: SY='K'; M=2,-10,-21,-13,-7,-17,-18,-15,-6,3,-11,-5,-7,-9,-5,1,-2,-1,-1,-25,-13,-7;
MA   /M: SY='B'; M=-8,10,-23,9,8,-20,-15,2,-18,-2,-16,-11,9,-13,5,-4,3,1,-17,-30,-11,6;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-15,-31,-10,-2,-26,-16,-18,-16,-6,-25,-16,-12,49,-7,-13,-1,-4,-20,-29,-24,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-23,-28,-20,0,-31,-18,24,-21,16,11,-19,-23,-17,-16,-16,-7,19,-23,-2,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-3,-26,-2,8,-24,-12,-4,-18,5,-16,-7,-2,-5,6,2,-3,-8,-17,-25,-14,6;
MA   /M: SY='A'; M=11,-16,-11,-20,-17,-10,-9,-20,-2,-12,-3,-3,-15,-20,-16,-15,-1,1,8,-22,-10,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-3,-28,-2,14,-22,-11,-6,-18,8,-18,-10,-3,-11,4,2,-4,-8,-16,-24,-11,8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-11,-21,-12,-10,-15,-14,-18,1,-8,-6,-2,-9,-18,-9,-12,-2,-3,5,-27,-12,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-17,-7,-3,-17,-17,-9,-14,3,-16,-9,4,-18,2,6,0,0,-12,-20,-11,-1;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-6,2,-23,3,3,-22,-13,-6,-18,1,-15,-8,0,-10,2,0,1,1,-13,-28,-13,2;
MA   /M: SY='K'; M=-3,8,-24,9,4,-24,-5,-7,-27,10,-24,-16,8,-13,1,7,1,-6,-20,-26,-15,2;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-2,-28,-5,-3,-21,-5,-3,-25,13,-22,-11,7,-19,6,26,-6,-10,-21,-16,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=0,-9,-23,-9,1,-15,-8,-13,-18,3,-14,-10,-7,-9,-4,3,-3,-4,-12,-22,-13,-2;
MA   /M: SY='G'; M=1,-4,-27,-3,-11,-29,50,-17,-36,-16,-29,-20,2,-17,-14,-17,6,-13,-26,-24,-27,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-20,-28,-20,12,-29,-21,14,-20,22,10,-22,-26,-20,-13,-18,-5,13,-18,1,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-5,-30,-3,-10,-28,42,-16,-32,-12,-25,-17,0,-18,-13,-12,-2,-17,-25,-22,-25,-12;
MA   /M: SY='A'; M=8,-13,-14,-19,-11,-5,-17,-7,-5,-11,-6,-4,-11,-19,-8,-14,-6,-7,-3,-9,3,-10;
MA   /M: SY='S'; M=0,-2,-22,-2,-1,-13,-6,-10,-18,-3,-17,-13,0,-12,-5,-5,2,-4,-12,-23,-11,-3;
MA   /M: M=-2,-10,-23,-11,-5,-15,-1,-14,-16,0,-9,-4,-7,-17,-7,-3,-5,-8,-11,-22,-13,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-2,-27,2,8,-23,-17,-10,-18,4,-19,-11,-4,9,1,-1,0,-2,-17,-29,-17,3;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2022_01,566996;
NR   /TOTAL=201(201); /POSITIVE=201(201); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=2; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E?V; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=G-patch;
CC   /VERSION=5;
DR   Q8N302    , AGGF1_HUMAN, T; Q7TN31    , AGGF1_MOUSE, T;
DR   Q6K687    , C3H18_ORYSJ, T; Q9SK49    , C3H22_ARATH, T;
DR   Q8IWX8    , CHERP_HUMAN, T; Q8CGZ0    , CHERP_MOUSE, T;
DR   D2HRF1    , CMTR1_AILME, T; A2VE39    , CMTR1_BOVIN, T;
DR   Q803R5    , CMTR1_DANRE, T; Q9W4N2    , CMTR1_DROME, T;
DR   Q8N1G2    , CMTR1_HUMAN, T; Q9DBC3    , CMTR1_MOUSE, T;
DR   Q5R981    , CMTR1_PONAB, T; Q5U2Z5    , CMTR1_RAT  , T;
DR   Q6GQ76    , CMTR1_XENLA, T; P42698    , DR111_ARATH, T;
DR   P11365    , GAG_IPMA   , T; Q09655    , GPAN1_CAEEL, T;
DR   Q9V7A7    , GPAN1_DROME, T; O95872    , GPAN1_HUMAN, T;
DR   Q61858    , GPAN1_MOUSE, T; Q940M0    , GPDP1_ARATH, T;
DR   Q21924    , GPKOW_CAEEL, T; Q90X38    , GPKOW_DANRE, T;
DR   Q92917    , GPKOW_HUMAN, T; Q56A08    , GPKOW_MOUSE, T;
DR   Q6NU07    , GPKOW_XENLA, T; Q2KI19    , GPT11_BOVIN, T;
DR   Q6DGZ0    , GPT11_DANRE, T; Q8N954    , GPT11_HUMAN, T;
DR   Q3UFS4    , GPT11_MOUSE, T; Q6DF57    , GPT11_XENTR, T;
DR   Q24K12    , GPTC1_BOVIN, T; Q21827    , GPTC1_CAEEL, T;
DR   Q9VUA0    , GPTC1_DROME, T; Q9BRR8    , GPTC1_HUMAN, T;
DR   Q9DBM1    , GPTC1_MOUSE, T; Q9NW75    , GPTC2_HUMAN, T;
DR   Q7TQC7    , GPTC2_MOUSE, T; Q96I76    , GPTC3_HUMAN, T;
DR   Q8BIY1    , GPTC3_MOUSE, T; Q2KJE1    , GPTC4_BOVIN, T;
DR   Q5T3I0    , GPTC4_HUMAN, T; Q3TFK5    , GPTC4_MOUSE, T;
DR   Q566R3    , GPTC4_RAT  , T; Q4V842    , GPTC4_XENLA, T;
DR   Q6P859    , GPTC4_XENTR, T; Q9UKJ3    , GPTC8_HUMAN, T;
DR   A2A6A1    , GPTC8_MOUSE, T; Q9C801    , MOS2_ARATH , T;
DR   A8XYX2    , MTR1A_CAEBR, T; A8XYX3    , MTR1B_CAEBR, T;
DR   Q9NAA5    , MTR1_CAEEL , T; Q54WR1    , MTR1_DICDI , T;
DR   O15226    , NKRF_HUMAN , T; Q8BY02    , NKRF_MOUSE , T;
DR   Q96BK5    , PINX1_HUMAN, T; Q9CZX5    , PINX1_MOUSE, T;
DR   A4L691    , PINX1_RAT  , T; P63128    , POK9_HUMAN , T;
DR   P31623    , POL_JSRV   , T; P07572    , POL_MPMV   , T;
DR   P03364    , POL_SMRVH  , T; P04025    , POL_SRV1   , T;
DR   P51517    , POL_SRV2   , T; P31625    , PRO_JSRV   , T;
DR   P07570    , PRO_MPMV   , T; P21407    , PRO_SMRVH  , T;
DR   P04024    , PRO_SRV1   , T; P51518    , PRO_SRV2   , T;
DR   A6R371    , PXR1_AJECN , T; Q751P0    , PXR1_ASHGO , T;
DR   A1CD56    , PXR1_ASPCL , T; Q4WG40    , PXR1_ASPFU , T;
DR   A2R156    , PXR1_ASPNC , T; Q2UDW7    , PXR1_ASPOR , T;
DR   Q0CU52    , PXR1_ASPTN , T; A6RIE1    , PXR1_BOTFB , T;
DR   Q5A660    , PXR1_CANAL , T; Q6FTR8    , PXR1_CANGA , T;
DR   Q2HFA6    , PXR1_CHAGB , T; Q1DQE9    , PXR1_COCIM , T;
DR   Q6BUE3    , PXR1_DEBHA , T; Q6CTA7    , PXR1_KLULA , T;
DR   A5E4P1    , PXR1_LODEL , T; A4R0T9    , PXR1_MAGO7 , T;
DR   A1DC33    , PXR1_NEOFI , T; Q7SHT5    , PXR1_NEUCR , T;
DR   Q0UWF6    , PXR1_PHANO , T; A5DRH5    , PXR1_PICGU , T;
DR   Q9URX9    , PXR1_SCHPO , T; A7EFS3    , PXR1_SCLS1 , T;
DR   A7TG30    , PXR1_VANPO , T; Q6C1L3    , PXR1_YARLI , T;
DR   A6ZUT6    , PXR1_YEAS7 , T; P53335    , PXR1_YEAST , T;
DR   P98175    , RBM10_HUMAN, T; Q99KG3    , RBM10_MOUSE, T;
DR   P70501    , RBM10_RAT  , T; A0JMV4    , RBM5A_XENLA, T;
DR   Q6DDU9    , RBM5B_XENLA, T; Q1RMU5    , RBM5_BOVIN , T;
DR   P52756    , RBM5_HUMAN , T; Q91YE7    , RBM5_MOUSE , T;
DR   B2GV05    , RBM5_RAT   , T; A4IGK4    , RBM5_XENTR , T;
DR   P78332    , RBM6_HUMAN , T; Q9VHB0    , SON_DROME  , T;
DR   P18583    , SON_HUMAN  , T; Q9QX47    , SON_MOUSE  , T;
DR   Q06411    , SP382_YEAST, T; Q96I25    , SPF45_HUMAN, T;
DR   Q8JZX4    , SPF45_MOUSE, T; Q4WP02    , SPP2_ASPFU , T;
DR   Q5B4R9    , SPP2_EMENI , T; Q4P9X4    , SPP2_USTMA , T;
DR   Q75E62    , SQS1_ASHGO , T; Q59UG4    , SQS1_CANAL , T;
DR   Q6FP19    , SQS1_CANGA , T; Q6BYP9    , SQS1_DEBHA , T;
DR   Q6CQ59    , SQS1_KLULA , T; A5DSB5    , SQS1_LODEL , T;
DR   A5DEF8    , SQS1_PICGU , T; Q875B6    , SQS1_PODAS , T;
DR   A7TQN2    , SQS1_VANPO , T; Q6C233    , SQS1_YARLI , T;
DR   A6ZRL6    , SQS1_YEAS7 , T; P53866    , SQS1_YEAST , T;
DR   Q9SHG6    , STIP1_ARATH, T; Q9SLC6    , STIP2_ARATH, T;
DR   F4JCU0    , SUA_ARATH  , T; Q94C11    , SUGP1_ARATH, T;
DR   Q8IWZ8    , SUGP1_HUMAN, T; Q8CH02    , SUGP1_MOUSE, T;
DR   Q68FU8    , SUGP1_RAT  , T; Q8IX01    , SUGP2_HUMAN, T;
DR   Q8CH09    , SUGP2_MOUSE, T; Q29RR5    , TFP11_BOVIN, T;
DR   Q17784    , TFP11_CAEEL, T; A1XD97    , TFP11_CANLF, T;
DR   Q5ZII9    , TFP11_CHICK, T; Q6DI35    , TFP11_DANRE, T;
DR   A1XDC0    , TFP11_DICDI, T; Q9Y103    , TFP11_DROME, T;
DR   Q9UBB9    , TFP11_HUMAN, T; A1XD95    , TFP11_MACFA, T;
DR   A1XD94    , TFP11_MACMU, T; A4UMC6    , TFP11_MONDO, T;
DR   Q9ERA6    , TFP11_MOUSE, T; A1XD93    , TFP11_PANTR, T;
DR   Q06AK6    , TFP11_PIG  , T; Q5R5K8    , TFP11_PONAB, T;
DR   A4UMC5    , TFP11_RABIT, T; Q5U2Y6    , TFP11_RAT  , T;
DR   Q66J74    , TFP11_XENLA, T; Q0IIX9    , TFP11_XENTR, T;
DR   B8B2G4    , TGHH_ORYSI , T; Q67VW6    , TGHH_ORYSJ , T;
DR   P63121    , VP113_HUMAN, T; P63124    , VPK04_HUMAN, T;
DR   P10265    , VPK10_HUMAN, T; P63123    , VPK18_HUMAN, T;
DR   P63120    , VPK19_HUMAN, T; P63119    , VPK21_HUMAN, T;
DR   P63129    , VPK24_HUMAN, T; P63125    , VPK25_HUMAN, T;
DR   Q9Y6I0    , VPK6_HUMAN , T; P63131    , VPK7_HUMAN , T;
DR   P63122    , VPK8_HUMAN , T; P63127    , VPK9_HUMAN , T;
DR   Q54XG0    , Y5282_DICDI, T; Q09806    , YAB4_SCHPO , T;
DR   P87143    , YDMD_SCHPO , T; O94728    , YG0G_SCHPO , T;
DR   Q9UTK6    , YKR3_SCHPO , T; Q06152    , YL271_YEAST, T;
DR   O74363    , YND2_SCHPO , T; O94585    , YQ7D_SCHPO , T;
DR   Q17CQ8    , ZGPAT_AEDAE, T; Q7PYU6    , ZGPAT_ANOGA, T;
DR   Q17QX2    , ZGPAT_BOVIN, T; Q7SXW2    , ZGPAT_DANRE, T;
DR   B3MPC0    , ZGPAT_DROAN, T; B3N8L3    , ZGPAT_DROER, T;
DR   B4JCG4    , ZGPAT_DROGR, T; Q9VL59    , ZGPAT_DROME, T;
DR   B4KH32    , ZGPAT_DROMO, T; B4G7U3    , ZGPAT_DROPE, T;
DR   Q29NF3    , ZGPAT_DROPS, T; B4HWD7    , ZGPAT_DROSE, T;
DR   B4Q8A7    , ZGPAT_DROSI, T; B4M9F7    , ZGPAT_DROVI, T;
DR   B4NYQ2    , ZGPAT_DROYA, T; Q8N5A5    , ZGPAT_HUMAN, T;
DR   Q8VDM1    , ZGPAT_MOUSE, T; A7SBN6    , ZGPAT_NEMVE, T;
DR   Q5PPF5    , ZGPAT_RAT  , T; C0HAV3    , ZGPAT_SALSA, T;
DR   C5IJB0    , ZGPAT_SHEEP, T; Q5U4Z3    , ZGPAT_XENLA, T;
DR   Q28H71    , ZGPAT_XENTR, T;
DR   Q02521    , SPP2_YEAST , N; Q8GXN9    , TGH_ARATH  , N;
3D   5Y88; 6SH6; 6SH7; 7DVQ;
PR   PRU00092;
DO   PDOC50174;
//
