ID   GATA_ZN_FINGER_2; MATRIX.
AC   PS50114;
DT   01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 23-FEB-2022 INFO UPDATE.
DE   GATA-type zinc finger domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6125000; R2=0.0131851; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4579.0708008; R2=3.0117648; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=599; H_SCORE=6383; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=447; H_SCORE=5925; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-10,-19,-10,-4,-12,-19,-2,-19,6,-17,-9,-5,-7,-2,9,-3,-4,-14,-24,-7,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-15,-6,-5,-19,-11,0,-23,5,-20,-12,4,-18,-1,18,3,4,-15,-29,-12,-5;
MA   /M: SY='E'; M=6,-1,-24,1,18,-25,-10,-10,-20,-2,-17,-13,-6,5,4,-10,1,-4,-17,-27,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=2,-5,-28,-3,-13,-28,45,-18,-33,-17,-25,-19,0,-14,-16,-19,1,-15,-25,-23,-26,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-14,-24,-18,-9,-11,-24,-10,-4,1,2,5,-9,-19,1,18,-10,0,-4,-22,-6,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-15,2,22,-24,-18,-6,-21,5,-18,-12,-2,-11,10,5,4,-2,-16,-30,-17,15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=4,-12,-12,-15,-12,-10,-17,-18,0,-11,-9,-5,-9,-18,-9,-12,11,13,12,-30,-12,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-6,-27,-9,-8,-19,17,5,-27,-10,-20,-10,1,-18,-1,-7,-3,-12,-23,-20,-11,-5;
MA   /M: SY='T'; M=13,-6,-12,-13,-10,-14,-12,-20,-9,-7,-11,-9,-5,-12,-10,-11,12,24,2,-27,-14,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-6,-16,-13,-10,-9,-20,-12,-4,-10,-8,-3,-2,-14,-6,-8,10,25,0,-28,-8,-9;
MA   /M: SY='T'; M=3,3,-15,-4,-4,-17,-12,-4,-15,-4,-18,-11,8,-12,-2,-6,16,21,-9,-31,-12,-4;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-30,-9,-2,-25,-18,-19,-18,-10,-26,-18,-12,57,-9,-17,2,6,-21,-31,-25,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-29,-19,8,-30,-20,18,-26,46,19,-29,-29,-19,-18,-29,-10,9,-20,0,-19;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-9,-30,-9,0,-20,-20,5,-30,28,-20,-9,1,-20,10,66,-10,-11,-21,-21,-8,0;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,31,-21,-10,0,-19,10,67,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='D'; M=-9,35,-24,38,8,-31,0,-1,-31,-3,-29,-24,27,-14,-2,-9,7,-5,-26,-37,-21,3;
MA   /M: SY='P'; M=2,-11,-29,-8,-1,-27,11,-16,-24,-10,-23,-16,-8,20,-9,-15,-2,-11,-23,-25,-26,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-6,14,-21,16,13,-24,-13,-1,-24,-1,-21,-16,7,-9,3,-6,10,10,-18,-33,-14,8;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-29,-8,-19,-29,65,-18,-39,-19,-30,-20,4,-20,-19,-19,1,-19,-30,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-9,12,-24,12,9,-24,-13,29,-24,-4,-21,-12,15,-14,8,-3,4,-5,-24,-33,-6,7;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-17,-30,-15,-11,-3,-24,-6,-7,-11,-9,-6,-16,20,-11,-15,-11,-2,-13,-10,12,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-19,-31,-24,6,-31,-24,27,-27,35,17,-29,-29,-23,-21,-23,-7,23,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,38,-20,19,0,-20,-1,10,-20,1,-30,-20,58,-20,0,2,9,0,-30,-39,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-11,-20,-10,-20,-1,-19,-11,-9,-10,-10,-10,-10,-9,-17,9,0,-1,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,12,-30,-20,19,-30,49,19,-30,-30,-21,-20,-30,-10,10,-19,1,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,40,-30,12,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,70,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-13,-25,-17,-11,6,-24,20,-3,-14,2,7,-7,-23,-2,-9,-14,-10,-9,-12,18,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,49,-30,-10,0,-10,10,31,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-21,-27,-18,2,-25,-5,16,-21,29,28,-21,-24,-11,-16,-20,-9,7,-22,0,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-17,12,-27,6,0,-20,-14,61,-27,-2,-23,-7,25,-20,7,6,-4,-13,-29,-32,4,0;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-28,-5,-11,-28,41,-7,-34,-9,-29,-17,6,-18,-9,-10,3,-14,-27,-24,-22,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-16,-19,-19,-13,-10,-26,-6,9,-11,1,8,-14,-20,-5,-11,-7,0,14,-26,-5,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-3,8,-23,1,-3,-19,-10,9,-15,-6,-21,-11,17,0,-3,-8,2,-2,-18,-33,-14,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-38,-9,0,-29,-19,-19,-20,-10,-30,-20,-18,83,-9,-19,-7,-8,-29,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-28,-19,-30,-21,5,-29,-22,21,-27,36,16,-26,-27,-20,-21,-22,-6,16,-22,-3,-21;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=4,-9,-17,-14,-10,-13,-14,-18,-2,-10,-12,-6,-3,-13,-8,-12,13,14,2,-29,-12,-10;
MA   /I: DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-12,-22,-17,-9,-9,-20,-5,1,2,8,22,-10,-19,2,3,-16,-9,-3,-21,-5,-4; D=-6;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-8,-33,-5,5,-28,-20,-12,-27,26,-28,-13,-7,23,3,19,-10,-10,-23,-23,-17,2;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-25,-5,4,-23,-20,-10,-21,25,-19,-7,-2,-12,9,17,-2,3,-15,-23,-10,6;
MA   /M: SY='D'; M=-10,17,-27,25,17,-31,-13,-4,-32,14,-26,-20,8,-10,6,11,1,-6,-23,-31,-17,11;
MA   /I: I=-10; MI=0; IM=0; DM=-25; MD=-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-19,-18,-22,-19,-8,-8,-20,6,-20,6,4,-16,-22,-16,-18,-5,-2,10,-25,-11,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-18,-26,-22,-17,-8,-28,-22,23,-21,6,7,-12,-14,-12,-20,-9,-5,13,-25,-7,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=4,-3,-23,-5,5,-28,-14,-7,-17,14,-20,-7,-1,-12,18,6,2,-4,-14,-23,-13,11;
MA   /M: SY='T'; M=5,-2,-16,-6,-2,-20,-12,-13,-19,7,-21,-13,2,-11,-1,6,15,16,-9,-29,-14,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2022_01,566996;
NR   /TOTAL=206(156); /POSITIVE=205(155); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=1(1);
NR   /FALSE_NEG=18; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=2;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=GATA-type;
CC   /VERSION=5;
DR   Q9URT4    , AMS2_SCHPO , T; O13412    , AREA_ASPNG , T;
DR   O13415    , AREA_ASPOR , T; P17429    , AREA_EMENI , T;
DR   P78688    , AREA_GIBFU , T; Q01582    , AREA_PENCH , T;
DR   O13508    , AREA_PENRO , T; Q9HEV5    , ASD4_NEUCR , T;
DR   Q5A5Q6    , ASH1_CANAL , T; P34233    , ASH1_YEAST , T;
DR   Q59LY1    , BRG1_CANAL , T; Q6YW48    , CGA1_ORYSJ , T;
DR   Q00858    , CGPB_FUSVN , T; P26343    , DAL80_YEAST, T;
DR   Q02710    , ECM23_YEAST, T; Q09228    , EGL27_CAEEL, T;
DR   P28515    , ELT1_CAEEL , T; Q10655    , ELT2_CAEEL , T;
DR   Q8MQA7    , ELT4_CAEEL , T; O61924    , ELT7_CAEEL , T;
DR   Q10134    , FEP1_SCHPO , T; O94720    , FIL1_SCHPO , T;
DR   Q10280    , GAF1_SCHPO , T; Q8VZP4    , GAT10_ARATH, T;
DR   Q6DBP8    , GAT11_ARATH, T; P69781    , GAT12_ARATH, T;
DR   Q9SKN6    , GAT13_ARATH, T; Q9M1U2    , GAT14_ARATH, T;
DR   Q8LG10    , GAT15_ARATH, T; B8AX51    , GAT15_ORYSI, T;
DR   Q6L5E5    , GAT15_ORYSJ, T; Q9FJ10    , GAT16_ARATH, T;
DR   Q9LIB5    , GAT17_ARATH, T; Q6Z433    , GAT17_ORYSJ, T;
DR   Q8LC79    , GAT18_ARATH, T; A2XKR7    , GAT18_ORYSI, T;
DR   Q10F25    , GAT18_ORYSJ, T; Q6QPM2    , GAT19_ARATH, T;
DR   P23767    , GAT1A_XENLA, T; P23768    , GAT1B_XENLA, T;
DR   Q5A432    , GAT1_CANAL , T; P43574    , GAT1_YEAST , T;
DR   Q9ZPX0    , GAT20_ARATH, T; Q5Z4U5    , GAT20_ORYSJ, T;
DR   Q5HZ36    , GAT21_ARATH, T; Q9SZI6    , GAT22_ARATH, T;
DR   Q8LC59    , GAT23_ARATH, T; Q8GXL7    , GAT24_ARATH, T;
DR   Q9LRH6    , GAT25_ARATH, T; Q8W4H1    , GAT26_ARATH, T;
DR   Q5PP38    , GAT27_ARATH, T; Q8H1G0    , GAT28_ARATH, T;
DR   Q9LT45    , GAT29_ARATH, T; P40209    , GAT2_YEAST , T;
DR   Q07928    , GAT3_YEAST , T; P40569    , GAT4_YEAST , T;
DR   P43695    , GAT5A_XENLA, T; P43696    , GAT5B_XENLA, T;
DR   Q91678    , GAT6A_XENLA, T; P70005    , GAT6B_XENLA, T;
DR   Q8LAU9    , GATA1_ARATH, T; A2VDY6    , GATA1_BOVIN, T;
DR   P17678    , GATA1_CHICK, T; P15976    , GATA1_HUMAN, T;
DR   P17679    , GATA1_MOUSE, T; P43429    , GATA1_RAT  , T;
DR   O49741    , GATA2_ARATH, T; P23824    , GATA2_CHICK, T;
DR   P23769    , GATA2_HUMAN, T; O09100    , GATA2_MOUSE, T;
DR   Q924Y4    , GATA2_RAT  , T; P23770    , GATA2_XENLA, T;
DR   Q8L4M6    , GATA3_ARATH, T; Q08DV0    , GATA3_BOVIN, T;
DR   P23825    , GATA3_CHICK, T; Q91428    , GATA3_DANRE, T;
DR   P23771    , GATA3_HUMAN, T; P23772    , GATA3_MOUSE, T;
DR   P23773    , GATA3_XENLA, T; O49743    , GATA4_ARATH, T;
DR   Q0Q0E4    , GATA4_CANLF, T; P43691    , GATA4_CHICK, T;
DR   P43694    , GATA4_HUMAN, T; Q08369    , GATA4_MOUSE, T;
DR   P46152    , GATA4_RAT  , T; Q91677    , GATA4_XENLA, T;
DR   Q9FH57    , GATA5_ARATH, T; Q3SZJ5    , GATA5_BOVIN, T;
DR   P43692    , GATA5_CHICK, T; Q9BWX5    , GATA5_HUMAN, T;
DR   P97489    , GATA5_MOUSE, T; Q9SD38    , GATA6_ARATH, T;
DR   P43693    , GATA6_CHICK, T; Q92908    , GATA6_HUMAN, T;
DR   Q61169    , GATA6_MOUSE, T; Q95JA5    , GATA6_PIG  , T;
DR   P46153    , GATA6_RAT  , T; O65515    , GATA7_ARATH, T;
DR   Q9SV30    , GATA8_ARATH, T; O82632    , GATA9_ARATH, T;
DR   P52167    , GATAB_BOMMO, T; P91623    , GATAC_DROME, T;
DR   Q1L8G7    , GATD1_DANRE, T; Q8WUU5    , GATD1_HUMAN, T;
DR   Q920S3    , GATD1_MOUSE, T; Q7ZXY4    , GATD1_XENLA, T;
DR   P18494    , GLN3_YEAST , T; Q550D5    , GTAA_DICDI , T;
DR   Q54V32    , GTAB_DICDI , T; Q75JZ1    , GTAC_DICDI , T;
DR   Q54L72    , GTAD_DICDI , T; Q55GK0    , GTAE_DICDI , T;
DR   Q55EQ0    , GTAF_DICDI , T; Q55C49    , GTAG_DICDI , T;
DR   Q75JZ0    , GTAH_DICDI , T; Q54TM6    , GTAI_DICDI , T;
DR   Q54TE3    , GTAJ_DICDI , T; Q5KSV0    , GTAK_DICDI , T;
DR   Q54NM5    , GTAL_DICDI , T; Q54KX0    , GTAN_DICDI , T;
DR   Q54HA4    , GTAO_DICDI , T; B0G188    , GTAP_DICDI , T;
DR   Q54L80    , GTAQ_DICDI , T; Q54WY0    , GTAR_DICDI , T;
DR   Q54V37    , GTAT_DICDI , T; Q54US7    , GTAU_DICDI , T;
DR   Q54L82    , GTAW_DICDI , T; Q54FV1    , GTAX_DICDI , T;
DR   Q5A201    , GZF3_CANAL , T; P42944    , GZF3_YEAST , T;
DR   P19212    , NIT2_NEUCR , T; Q92269    , NRFA_PENUR , T;
DR   Q01168    , NUT1_MAGO7 , T; Q86YP4    , P66A_HUMAN , T;
DR   Q8WXI9    , P66B_HUMAN , T; Q8VHR5    , P66B_MOUSE , T;
DR   P52168    , PNR_DROME  , T; Q18919    , RCOR_CAEEL , T;
DR   Q5AP95    , SFU1_CANAL , T; B4XXY3    , SREA_AJECA , T;
DR   D4B3J8    , SREA_ARTBC , T; Q4WV91    , SREA_ASPFU , T;
DR   N4XMB0    , SREA_COCH4 , T; G5EB20    , SREA_EMENI , T;
DR   Q1K8E7    , SREA_NEUCR , T; Q92259    , SREP_PENCH , T;
DR   P52172    , SRP_DROME  , T; Q9UHF7    , TRPS1_HUMAN, T;
DR   Q925H1    , TRPS1_MOUSE, T; Q90ZS6    , TRPS1_XENLA, T;
DR   P40349    , URB1_USTMA , T; Q01371    , WC1_NEUCR  , T;
DR   P78714    , WC2_NEUCR  , T; P0C6A0    , ZGLP1_HUMAN, T;
DR   Q1WG82    , ZGLP1_MOUSE, T;
DR   B8AR30    , GAT19_ORYSI, N; Q0DNU1    , GAT19_ORYSJ, N;
DR   Q54L83    , GTAM_DICDI , N; Q54UG8    , GTAV_DICDI , N;
DR   Q54X31    , GTAY_DICDI , N; Q13330    , MTA1_HUMAN , N;
DR   Q8K4B0    , MTA1_MOUSE , N; Q62599    , MTA1_RAT   , N;
DR   O94776    , MTA2_HUMAN , N; Q9R190    , MTA2_MOUSE , N;
DR   A6QL72    , MTA3_BOVIN , N; Q9BTC8    , MTA3_HUMAN , N;
DR   Q924K8    , MTA3_MOUSE , N; Q8CHY6    , P66A_MOUSE , N;
DR   Q9P2R6    , RERE_HUMAN , N; Q80TZ9    , RERE_MOUSE , N;
DR   Q62901    , RERE_RAT   , N; P09007    , SRD1_YEAST , N;
DR   Q9HKJ3    , IF2B_THEAC , F;
3D   1GAT; 1GAU; 1GNF; 1Y0J; 2GAT; 2L6Y; 2L6Z; 2M9W; 2VUS; 2VUT; 2VUU; 3DFV;
3D   3DFX; 3GAT; 3VD6; 3VEK; 4GAT; 4HC7; 4HC9; 4HCA; 5GAT; 5O9B; 6GAT; 6ZFV;
3D   7AO8; 7AO9; 7AOA; 7GAT;
PR   PRU00094;
DO   PDOC00300;
//
